Date: 2019-12-25 22:35:39 CET, cola version: 1.3.2
Document is loading...
All available functions which can be applied to this res_list object:
res_list
#> A 'ConsensusPartitionList' object with 24 methods.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows are extracted by 'SD, CV, MAD, ATC' methods.
#> Subgroups are detected by 'hclust, kmeans, skmeans, pam, mclust, NMF' method.
#> Number of partitions are tried for k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> Performed in total 30000 partitions by row resampling.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartitionList' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots" "collect_stats"
#> [5] "colnames" "functional_enrichment" "get_anno_col" "get_anno"
#> [9] "get_classes" "get_matrix" "get_membership" "get_stats"
#> [13] "is_best_k" "is_stable_k" "ncol" "nrow"
#> [17] "rownames" "show" "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
#> [21] "top_rows_heatmap" "top_rows_overlap"
#>
#> You can get result for a single method by, e.g. object["SD", "hclust"] or object["SD:hclust"]
#> or a subset of methods by object[c("SD", "CV")], c("hclust", "kmeans")]
The call of run_all_consensus_partition_methods() was:
#> run_all_consensus_partition_methods(data = mat, mc.cores = 4)
Dimension of the input matrix:
mat = get_matrix(res_list)
dim(mat)
#> [1] 17559 500
The density distribution for each sample is visualized as in one column in the following heatmap. The clustering is based on the distance which is the Kolmogorov-Smirnov statistic between two distributions.
library(ComplexHeatmap)
densityHeatmap(mat, ylab = "value", cluster_columns = TRUE, show_column_names = FALSE,
mc.cores = 4)
Folowing table shows the best k (number of partitions) for each combination
of top-value methods and partition methods. Clicking on the method name in
the table goes to the section for a single combination of methods.
The cola vignette explains the definition of the metrics used for determining the best number of partitions.
suggest_best_k(res_list)
| The best k | 1-PAC | Mean silhouette | Concordance | Optional k | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| CV:mclust | 2 | 1.000 | 0.995 | 0.998 | ** | |
| CV:NMF | 2 | 1.000 | 0.995 | 0.998 | ** | |
| MAD:mclust | 2 | 1.000 | 0.994 | 0.998 | ** | |
| SD:kmeans | 4 | 0.984 | 0.935 | 0.959 | ** | |
| ATC:kmeans | 3 | 0.983 | 0.940 | 0.969 | ** | 2 |
| ATC:pam | 3 | 0.970 | 0.936 | 0.974 | ** | |
| ATC:mclust | 2 | 0.965 | 0.939 | 0.969 | ** | |
| SD:skmeans | 5 | 0.962 | 0.930 | 0.968 | ** | 4 |
| MAD:kmeans | 4 | 0.958 | 0.924 | 0.957 | ** | |
| ATC:skmeans | 5 | 0.936 | 0.875 | 0.952 | * | 2,3,4 |
| ATC:NMF | 2 | 0.933 | 0.923 | 0.963 | * | |
| SD:NMF | 3 | 0.930 | 0.923 | 0.968 | * | |
| SD:mclust | 3 | 0.927 | 0.919 | 0.961 | * | 2 |
| MAD:skmeans | 5 | 0.907 | 0.895 | 0.945 | * | 2,4 |
| CV:skmeans | 5 | 0.904 | 0.847 | 0.935 | * | 2,4 |
| MAD:pam | 4 | 0.830 | 0.871 | 0.943 | ||
| MAD:NMF | 2 | 0.811 | 0.904 | 0.959 | ||
| SD:pam | 4 | 0.788 | 0.850 | 0.933 | ||
| CV:pam | 2 | 0.721 | 0.896 | 0.950 | ||
| CV:kmeans | 4 | 0.697 | 0.840 | 0.870 | ||
| ATC:hclust | 2 | 0.512 | 0.776 | 0.893 | ||
| CV:hclust | 2 | 0.257 | 0.758 | 0.837 | ||
| SD:hclust | 2 | 0.252 | 0.741 | 0.853 | ||
| MAD:hclust | 2 | 0.210 | 0.714 | 0.846 |
**: 1-PAC > 0.95, *: 1-PAC > 0.9
Cumulative distribution function curves of consensus matrix for all methods.
collect_plots(res_list, fun = plot_ecdf)
Consensus heatmaps for all methods. (What is a consensus heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
Membership heatmaps for all methods. (What is a membership heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
Signature heatmaps for all methods. (What is a signature heatmap?)
Note in following heatmaps, rows are scaled.
collect_plots(res_list, k = 2, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
The statistics used for measuring the stability of consensus partitioning. (How are they defined?)
get_stats(res_list, k = 2)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 2 0.370 0.718 0.860 0.491 0.501 0.501
#> CV:NMF 2 1.000 0.995 0.998 0.470 0.531 0.531
#> MAD:NMF 2 0.811 0.904 0.959 0.495 0.505 0.505
#> ATC:NMF 2 0.933 0.923 0.963 0.319 0.687 0.687
#> SD:skmeans 2 0.483 0.820 0.879 0.495 0.499 0.499
#> CV:skmeans 2 1.000 0.990 0.992 0.472 0.528 0.528
#> MAD:skmeans 2 0.918 0.923 0.970 0.501 0.500 0.500
#> ATC:skmeans 2 1.000 0.981 0.992 0.495 0.505 0.505
#> SD:mclust 2 1.000 0.997 0.999 0.471 0.530 0.530
#> CV:mclust 2 1.000 0.995 0.998 0.476 0.525 0.525
#> MAD:mclust 2 1.000 0.994 0.998 0.468 0.533 0.533
#> ATC:mclust 2 0.965 0.939 0.969 0.473 0.519 0.519
#> SD:kmeans 2 0.438 0.727 0.832 0.490 0.500 0.500
#> CV:kmeans 2 0.453 0.852 0.918 0.414 0.609 0.609
#> MAD:kmeans 2 0.458 0.837 0.902 0.495 0.500 0.500
#> ATC:kmeans 2 1.000 0.975 0.990 0.474 0.526 0.526
#> SD:pam 2 0.345 0.567 0.779 0.457 0.548 0.548
#> CV:pam 2 0.721 0.896 0.950 0.440 0.547 0.547
#> MAD:pam 2 0.401 0.678 0.833 0.476 0.500 0.500
#> ATC:pam 2 0.633 0.807 0.918 0.464 0.536 0.536
#> SD:hclust 2 0.252 0.741 0.853 0.470 0.501 0.501
#> CV:hclust 2 0.257 0.758 0.837 0.324 0.747 0.747
#> MAD:hclust 2 0.210 0.714 0.846 0.470 0.503 0.503
#> ATC:hclust 2 0.512 0.776 0.893 0.448 0.516 0.516
get_stats(res_list, k = 3)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 3 0.930 0.923 0.968 0.350 0.678 0.445
#> CV:NMF 3 0.871 0.913 0.960 0.328 0.773 0.597
#> MAD:NMF 3 0.782 0.830 0.927 0.328 0.743 0.533
#> ATC:NMF 3 0.692 0.822 0.920 0.907 0.634 0.489
#> SD:skmeans 3 0.827 0.866 0.940 0.344 0.716 0.491
#> CV:skmeans 3 0.898 0.909 0.962 0.410 0.720 0.510
#> MAD:skmeans 3 0.769 0.865 0.937 0.311 0.758 0.556
#> ATC:skmeans 3 0.960 0.937 0.972 0.240 0.858 0.726
#> SD:mclust 3 0.927 0.919 0.961 0.388 0.814 0.648
#> CV:mclust 3 0.716 0.837 0.879 0.335 0.812 0.642
#> MAD:mclust 3 0.766 0.916 0.934 0.371 0.805 0.635
#> ATC:mclust 3 0.622 0.790 0.880 0.241 0.898 0.807
#> SD:kmeans 3 0.606 0.700 0.837 0.316 0.693 0.461
#> CV:kmeans 3 0.644 0.710 0.847 0.445 0.654 0.474
#> MAD:kmeans 3 0.599 0.652 0.837 0.305 0.761 0.563
#> ATC:kmeans 3 0.983 0.940 0.969 0.340 0.708 0.506
#> SD:pam 3 0.742 0.833 0.926 0.436 0.686 0.479
#> CV:pam 3 0.613 0.819 0.902 0.264 0.892 0.808
#> MAD:pam 3 0.744 0.803 0.920 0.359 0.721 0.505
#> ATC:pam 3 0.970 0.936 0.974 0.398 0.670 0.458
#> SD:hclust 3 0.227 0.539 0.756 0.266 0.921 0.844
#> CV:hclust 3 0.256 0.609 0.780 0.327 0.972 0.963
#> MAD:hclust 3 0.254 0.565 0.771 0.255 0.843 0.703
#> ATC:hclust 3 0.488 0.707 0.836 0.366 0.788 0.617
get_stats(res_list, k = 4)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 4 0.851 0.859 0.928 0.0960 0.856 0.619
#> CV:NMF 4 0.732 0.810 0.892 0.1722 0.817 0.554
#> MAD:NMF 4 0.826 0.847 0.931 0.1165 0.769 0.448
#> ATC:NMF 4 0.575 0.664 0.798 0.1842 0.831 0.592
#> SD:skmeans 4 0.957 0.927 0.971 0.1069 0.890 0.688
#> CV:skmeans 4 0.933 0.916 0.966 0.1047 0.869 0.640
#> MAD:skmeans 4 0.950 0.923 0.969 0.1224 0.843 0.591
#> ATC:skmeans 4 0.958 0.931 0.972 0.1801 0.868 0.667
#> SD:mclust 4 0.705 0.714 0.827 0.0945 0.903 0.729
#> CV:mclust 4 0.576 0.655 0.782 0.1040 0.900 0.728
#> MAD:mclust 4 0.762 0.865 0.903 0.1347 0.872 0.653
#> ATC:mclust 4 0.696 0.784 0.885 0.2100 0.827 0.609
#> SD:kmeans 4 0.984 0.935 0.959 0.1334 0.898 0.710
#> CV:kmeans 4 0.697 0.840 0.870 0.1937 0.817 0.550
#> MAD:kmeans 4 0.958 0.924 0.957 0.1356 0.859 0.629
#> ATC:kmeans 4 0.690 0.592 0.788 0.1506 0.853 0.626
#> SD:pam 4 0.788 0.850 0.933 0.1074 0.875 0.661
#> CV:pam 4 0.758 0.815 0.916 0.2968 0.766 0.520
#> MAD:pam 4 0.830 0.871 0.943 0.1323 0.862 0.632
#> ATC:pam 4 0.703 0.745 0.831 0.1297 0.889 0.698
#> SD:hclust 4 0.313 0.515 0.711 0.1525 0.829 0.615
#> CV:hclust 4 0.240 0.488 0.727 0.3118 0.628 0.498
#> MAD:hclust 4 0.311 0.383 0.679 0.1532 0.861 0.680
#> ATC:hclust 4 0.495 0.674 0.763 0.1033 0.979 0.948
get_stats(res_list, k = 5)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 5 0.733 0.721 0.845 0.0896 0.889 0.628
#> CV:NMF 5 0.830 0.829 0.910 0.0846 0.861 0.545
#> MAD:NMF 5 0.769 0.756 0.877 0.0773 0.869 0.566
#> ATC:NMF 5 0.576 0.567 0.737 0.0862 0.827 0.472
#> SD:skmeans 5 0.962 0.930 0.968 0.0761 0.922 0.717
#> CV:skmeans 5 0.904 0.847 0.935 0.0769 0.914 0.690
#> MAD:skmeans 5 0.907 0.895 0.945 0.0729 0.921 0.714
#> ATC:skmeans 5 0.936 0.875 0.952 0.0700 0.915 0.706
#> SD:mclust 5 0.698 0.659 0.826 0.0874 0.905 0.670
#> CV:mclust 5 0.570 0.652 0.770 0.0786 0.897 0.668
#> MAD:mclust 5 0.749 0.759 0.863 0.0785 0.911 0.681
#> ATC:mclust 5 0.647 0.539 0.758 0.0792 0.856 0.556
#> SD:kmeans 5 0.834 0.833 0.897 0.0780 0.914 0.693
#> CV:kmeans 5 0.770 0.706 0.825 0.0779 0.925 0.732
#> MAD:kmeans 5 0.828 0.814 0.898 0.0781 0.915 0.698
#> ATC:kmeans 5 0.677 0.563 0.745 0.0738 0.826 0.470
#> SD:pam 5 0.809 0.749 0.862 0.0924 0.877 0.589
#> CV:pam 5 0.835 0.837 0.916 0.0995 0.868 0.566
#> MAD:pam 5 0.775 0.675 0.843 0.0851 0.879 0.591
#> ATC:pam 5 0.775 0.797 0.886 0.0814 0.863 0.554
#> SD:hclust 5 0.416 0.515 0.708 0.0826 0.938 0.792
#> CV:hclust 5 0.313 0.522 0.703 0.1171 0.896 0.742
#> MAD:hclust 5 0.385 0.466 0.654 0.0866 0.884 0.669
#> ATC:hclust 5 0.540 0.544 0.752 0.0552 0.922 0.801
get_stats(res_list, k = 6)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 6 0.782 0.721 0.864 0.0452 0.874 0.504
#> CV:NMF 6 0.809 0.766 0.877 0.0383 0.925 0.668
#> MAD:NMF 6 0.697 0.575 0.772 0.0387 0.868 0.480
#> ATC:NMF 6 0.582 0.497 0.697 0.0424 0.895 0.571
#> SD:skmeans 6 0.860 0.749 0.870 0.0388 0.959 0.808
#> CV:skmeans 6 0.868 0.832 0.915 0.0421 0.910 0.615
#> MAD:skmeans 6 0.853 0.707 0.857 0.0398 0.956 0.803
#> ATC:skmeans 6 0.899 0.837 0.921 0.0340 0.944 0.766
#> SD:mclust 6 0.679 0.508 0.753 0.0266 0.914 0.638
#> CV:mclust 6 0.614 0.540 0.729 0.0509 0.897 0.611
#> MAD:mclust 6 0.725 0.658 0.779 0.0296 0.952 0.783
#> ATC:mclust 6 0.777 0.747 0.866 0.0432 0.883 0.572
#> SD:kmeans 6 0.769 0.680 0.826 0.0409 0.992 0.960
#> CV:kmeans 6 0.744 0.670 0.816 0.0433 0.963 0.836
#> MAD:kmeans 6 0.775 0.663 0.815 0.0400 0.980 0.905
#> ATC:kmeans 6 0.711 0.560 0.724 0.0417 0.924 0.680
#> SD:pam 6 0.784 0.761 0.862 0.0450 0.923 0.658
#> CV:pam 6 0.833 0.803 0.906 0.0277 0.959 0.811
#> MAD:pam 6 0.763 0.718 0.819 0.0410 0.915 0.627
#> ATC:pam 6 0.754 0.583 0.762 0.0385 0.920 0.652
#> SD:hclust 6 0.494 0.494 0.703 0.0448 0.969 0.881
#> CV:hclust 6 0.390 0.446 0.684 0.0765 0.944 0.837
#> MAD:hclust 6 0.429 0.461 0.664 0.0498 0.966 0.870
#> ATC:hclust 6 0.545 0.523 0.731 0.0470 0.941 0.820
Following heatmap plots the partition for each combination of methods and the lightness correspond to the silhouette scores for samples in each method. On top the consensus subgroup is inferred from all methods by taking the mean silhouette scores as weight.
collect_stats(res_list, k = 2)
collect_stats(res_list, k = 3)
collect_stats(res_list, k = 4)
collect_stats(res_list, k = 5)
collect_stats(res_list, k = 6)
Collect partitions from all methods:
collect_classes(res_list, k = 2)
collect_classes(res_list, k = 3)
collect_classes(res_list, k = 4)
collect_classes(res_list, k = 5)
collect_classes(res_list, k = 6)
Overlap of top rows from different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 3000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 4000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 5000, method = "euler")
Also visualize the correspondance of rankings between different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 3000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 4000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 5000, method = "correspondance")
Heatmaps of the top rows:
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 1000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 2000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 3000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 4000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 5000)
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.252 0.741 0.853 0.4704 0.501 0.501
#> 3 3 0.227 0.539 0.756 0.2660 0.921 0.844
#> 4 4 0.313 0.515 0.711 0.1525 0.829 0.615
#> 5 5 0.416 0.515 0.708 0.0826 0.938 0.792
#> 6 6 0.494 0.494 0.703 0.0448 0.969 0.881
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 2 0.9866 0.2962 0.432 0.568
#> SRR1331708 1 0.6438 0.8166 0.836 0.164
#> SRR1464258 1 0.5737 0.8388 0.864 0.136
#> SRR1454201 1 0.6623 0.8165 0.828 0.172
#> SRR661589 2 0.5059 0.8232 0.112 0.888
#> SRR1456229 1 0.3431 0.8642 0.936 0.064
#> SRR1315165 1 0.2423 0.8527 0.960 0.040
#> SRR1488960 1 0.2603 0.8613 0.956 0.044
#> SRR1417809 1 0.1843 0.8571 0.972 0.028
#> SRR1094457 1 0.1414 0.8508 0.980 0.020
#> SRR1095575 1 0.9881 0.2553 0.564 0.436
#> SRR1315931 1 0.5737 0.8388 0.864 0.136
#> SRR1430066 2 0.1184 0.8187 0.016 0.984
#> SRR1431037 2 0.1633 0.8223 0.024 0.976
#> SRR1395554 2 0.2236 0.8262 0.036 0.964
#> SRR818002 2 0.9522 0.5342 0.372 0.628
#> SRR1344143 2 0.7376 0.7621 0.208 0.792
#> SRR1486845 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR1362866 1 0.6148 0.8309 0.848 0.152
#> SRR1490740 1 0.3114 0.8640 0.944 0.056
#> SRR1446627 2 0.3274 0.8239 0.060 0.940
#> SRR1456138 2 0.7745 0.7497 0.228 0.772
#> SRR1416248 1 0.4022 0.8614 0.920 0.080
#> SRR1383907 1 0.5629 0.8041 0.868 0.132
#> SRR1311018 1 0.2603 0.8609 0.956 0.044
#> SRR1375699 1 0.9881 0.1504 0.564 0.436
#> SRR1429846 2 0.8207 0.6996 0.256 0.744
#> SRR613550 2 0.5408 0.8178 0.124 0.876
#> SRR1348402 1 0.3431 0.8622 0.936 0.064
#> SRR1345146 1 0.6801 0.7825 0.820 0.180
#> SRR1324025 2 0.8713 0.6459 0.292 0.708
#> SRR1318879 2 0.7299 0.7632 0.204 0.796
#> SRR820755 1 0.9000 0.5984 0.684 0.316
#> SRR1485830 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR599313 1 0.5519 0.8397 0.872 0.128
#> SRR612263 1 0.4161 0.8633 0.916 0.084
#> SRR1415398 2 0.4161 0.8267 0.084 0.916
#> SRR1326205 1 0.1633 0.8557 0.976 0.024
#> SRR1421327 1 0.2236 0.8542 0.964 0.036
#> SRR1083311 2 0.1843 0.8236 0.028 0.972
#> SRR1499303 1 0.1633 0.8551 0.976 0.024
#> SRR1079522 1 0.5059 0.8529 0.888 0.112
#> SRR1452935 2 0.9580 0.4641 0.380 0.620
#> SRR1379495 1 0.3274 0.8639 0.940 0.060
#> SRR1470459 2 0.1633 0.8190 0.024 0.976
#> SRR661361 2 0.5737 0.8131 0.136 0.864
#> SRR615778 1 0.6801 0.8094 0.820 0.180
#> SRR1447564 1 0.2423 0.8598 0.960 0.040
#> SRR1455195 1 0.5842 0.8382 0.860 0.140
#> SRR655182 1 0.4022 0.8647 0.920 0.080
#> SRR1335140 1 0.5059 0.8188 0.888 0.112
#> SRR1433555 2 0.2043 0.8247 0.032 0.968
#> SRR1308650 2 0.6438 0.7957 0.164 0.836
#> SRR1388354 1 0.2778 0.8620 0.952 0.048
#> SRR1317446 2 0.0938 0.8169 0.012 0.988
#> SRR1413602 2 0.3584 0.8306 0.068 0.932
#> SRR1479955 2 0.7299 0.7663 0.204 0.796
#> SRR809853 1 0.3431 0.8651 0.936 0.064
#> SRR661313 2 0.5294 0.8193 0.120 0.880
#> SRR1499935 1 0.1633 0.8551 0.976 0.024
#> SRR1447303 2 0.7883 0.7307 0.236 0.764
#> SRR1429408 2 0.9896 0.3519 0.440 0.560
#> SRR1433950 1 0.2603 0.8612 0.956 0.044
#> SRR1362081 2 0.2236 0.8202 0.036 0.964
#> SRR1409854 1 0.9460 0.4956 0.636 0.364
#> SRR1435229 1 0.9896 0.2372 0.560 0.440
#> SRR1085996 1 0.2778 0.8623 0.952 0.048
#> SRR1414229 1 0.9323 0.5483 0.652 0.348
#> SRR1400974 2 0.0938 0.8169 0.012 0.988
#> SRR1399971 1 0.2603 0.8609 0.956 0.044
#> SRR613927 2 0.6048 0.8081 0.148 0.852
#> SRR1457854 1 0.2778 0.8620 0.952 0.048
#> SRR1473714 1 0.5519 0.8397 0.872 0.128
#> SRR813776 1 0.9000 0.5984 0.684 0.316
#> SRR808196 1 0.2043 0.8591 0.968 0.032
#> SRR1101085 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR614395 1 0.5842 0.8367 0.860 0.140
#> SRR1478251 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.2423 0.8214 0.040 0.960
#> SRR1362310 1 0.2948 0.8622 0.948 0.052
#> SRR665310 2 0.5294 0.8207 0.120 0.880
#> SRR1420109 2 0.7745 0.7419 0.228 0.772
#> SRR1330920 1 0.7453 0.7684 0.788 0.212
#> SRR1419539 2 0.2236 0.8263 0.036 0.964
#> SRR1359447 2 0.1184 0.8171 0.016 0.984
#> SRR1347259 1 0.3584 0.8599 0.932 0.068
#> SRR613915 2 0.6531 0.7971 0.168 0.832
#> SRR1384395 2 0.0376 0.8122 0.004 0.996
#> SRR821715 2 0.4562 0.8252 0.096 0.904
#> SRR1478228 1 0.3733 0.8627 0.928 0.072
#> SRR1445637 1 0.6343 0.8236 0.840 0.160
#> SRR608150 1 0.6247 0.8270 0.844 0.156
#> SRR1096383 2 0.9896 0.2680 0.440 0.560
#> SRR1341480 1 0.1184 0.8509 0.984 0.016
#> SRR1341344 1 0.4298 0.8611 0.912 0.088
#> SRR1326270 2 0.4161 0.8289 0.084 0.916
#> SRR1498838 2 0.1633 0.8217 0.024 0.976
#> SRR1416313 2 0.4431 0.8269 0.092 0.908
#> SRR808566 1 0.6531 0.7841 0.832 0.168
#> SRR1430270 1 0.0672 0.8483 0.992 0.008
#> SRR1367825 2 0.0938 0.8169 0.012 0.988
#> SRR613533 2 0.8608 0.6627 0.284 0.716
#> SRR661267 2 0.9881 0.2868 0.436 0.564
#> SRR810665 2 0.4431 0.8225 0.092 0.908
#> SRR1407250 1 0.7883 0.7527 0.764 0.236
#> SRR1420067 1 0.8207 0.7161 0.744 0.256
#> SRR1473632 1 0.3431 0.8651 0.936 0.064
#> SRR812536 2 0.3584 0.8305 0.068 0.932
#> SRR1370850 2 0.7602 0.7601 0.220 0.780
#> SRR1486195 2 0.2236 0.8212 0.036 0.964
#> SRR1407671 1 0.9881 0.2493 0.564 0.436
#> SRR1446375 2 1.0000 0.0535 0.496 0.504
#> SRR1465230 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR614119 2 0.9850 0.3073 0.428 0.572
#> SRR1356101 2 0.0938 0.8148 0.012 0.988
#> SRR1404209 1 0.8861 0.6329 0.696 0.304
#> SRR1392676 2 0.3879 0.8234 0.076 0.924
#> SRR665538 2 0.9922 0.2434 0.448 0.552
#> SRR660510 2 0.2043 0.8250 0.032 0.968
#> SRR1445655 1 0.0376 0.8455 0.996 0.004
#> SRR658953 1 0.8909 0.5993 0.692 0.308
#> SRR2166459 1 0.5737 0.8398 0.864 0.136
#> SRR1070713 1 0.9795 0.3088 0.584 0.416
#> SRR1485312 2 0.1184 0.8187 0.016 0.984
#> SRR1317631 2 0.9815 0.3286 0.420 0.580
#> SRR1488610 1 0.2948 0.8639 0.948 0.052
#> SRR1330588 2 0.9635 0.4394 0.388 0.612
#> SRR1316367 1 0.3733 0.8642 0.928 0.072
#> SRR1433926 1 0.3114 0.8635 0.944 0.056
#> SRR1091302 1 0.1843 0.8518 0.972 0.028
#> SRR818263 1 0.9393 0.5091 0.644 0.356
#> SRR1404909 1 0.3431 0.8446 0.936 0.064
#> SRR663076 1 0.5294 0.8496 0.880 0.120
#> SRR1323577 2 0.9933 0.3277 0.452 0.548
#> SRR1442422 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.2948 0.8634 0.948 0.052
#> SRR654862 1 0.5946 0.8378 0.856 0.144
#> SRR1407112 1 0.1414 0.8508 0.980 0.020
#> SRR1332969 2 0.4939 0.8236 0.108 0.892
#> SRR1353199 2 0.5294 0.8193 0.120 0.880
#> SRR1378885 2 0.8813 0.6302 0.300 0.700
#> SRR665357 2 0.2948 0.8293 0.052 0.948
#> SRR662186 2 0.1414 0.8175 0.020 0.980
#> SRR1501020 2 0.6148 0.8058 0.152 0.848
#> SRR1347819 2 0.1633 0.8219 0.024 0.976
#> SRR1480813 2 0.8144 0.7257 0.252 0.748
#> SRR1472576 1 0.6712 0.7636 0.824 0.176
#> SRR1431781 1 0.2423 0.8527 0.960 0.040
#> SRR1452270 2 0.2603 0.8268 0.044 0.956
#> SRR1500472 2 0.9983 0.1302 0.476 0.524
#> SRR1417632 1 0.4815 0.8235 0.896 0.104
#> SRR1350153 2 0.2603 0.8222 0.044 0.956
#> SRR1458113 1 0.9460 0.5082 0.636 0.364
#> SRR1326579 1 0.5629 0.8426 0.868 0.132
#> SRR1349363 1 0.9988 -0.0367 0.520 0.480
#> SRR1096712 2 0.2236 0.8265 0.036 0.964
#> SRR1090407 2 0.4431 0.8257 0.092 0.908
#> SRR1083752 2 0.9710 0.4818 0.400 0.600
#> SRR1377599 1 0.0672 0.8481 0.992 0.008
#> SRR1488449 2 0.5178 0.8221 0.116 0.884
#> SRR1318354 2 0.7453 0.7574 0.212 0.788
#> SRR1359062 2 0.1184 0.8190 0.016 0.984
#> SRR1398924 1 0.8713 0.6276 0.708 0.292
#> SRR663783 2 0.1184 0.8187 0.016 0.984
#> SRR1319204 2 0.3733 0.8307 0.072 0.928
#> SRR1369070 2 0.7453 0.7634 0.212 0.788
#> SRR615659 1 0.3114 0.8635 0.944 0.056
#> SRR1337449 2 0.4022 0.8265 0.080 0.920
#> SRR1316982 2 0.0000 0.8099 0.000 1.000
#> SRR1498595 1 0.4939 0.8212 0.892 0.108
#> SRR1377423 2 0.5842 0.8130 0.140 0.860
#> SRR1312310 2 0.2778 0.8210 0.048 0.952
#> SRR1485613 1 0.6712 0.8098 0.824 0.176
#> SRR1338426 2 0.5946 0.8116 0.144 0.856
#> SRR1353309 2 0.5629 0.8176 0.132 0.868
#> SRR658941 2 0.9815 0.3344 0.420 0.580
#> SRR1101643 1 0.2423 0.8617 0.960 0.040
#> SRR1401468 2 0.9866 0.2962 0.432 0.568
#> SRR1368874 2 0.2423 0.8210 0.040 0.960
#> SRR1324085 1 0.8327 0.6487 0.736 0.264
#> SRR1363858 1 0.5519 0.8397 0.872 0.128
#> SRR819820 2 0.7528 0.7412 0.216 0.784
#> SRR1337342 1 0.8267 0.7117 0.740 0.260
#> SRR655206 2 0.2423 0.8273 0.040 0.960
#> SRR1387013 2 0.9993 0.1853 0.484 0.516
#> SRR1317410 1 0.3879 0.8623 0.924 0.076
#> SRR608198 1 0.5629 0.8428 0.868 0.132
#> SRR1440161 2 0.2603 0.8222 0.044 0.956
#> SRR1343741 2 0.7453 0.7634 0.212 0.788
#> SRR1381288 2 0.3274 0.8239 0.060 0.940
#> SRR1415379 1 0.1414 0.8536 0.980 0.020
#> SRR1099622 2 0.5294 0.8189 0.120 0.880
#> SRR663197 2 0.5059 0.8234 0.112 0.888
#> SRR1394836 2 0.2423 0.8273 0.040 0.960
#> SRR661699 2 0.4939 0.8237 0.108 0.892
#> SRR813680 2 0.9881 0.2868 0.436 0.564
#> SRR1410678 1 0.2948 0.8622 0.948 0.052
#> SRR1378109 1 0.1414 0.8508 0.980 0.020
#> SRR1499174 1 0.5178 0.8533 0.884 0.116
#> SRR1311486 2 0.4022 0.8265 0.080 0.920
#> SRR1382851 1 0.8499 0.5922 0.724 0.276
#> SRR1433410 1 0.6048 0.8329 0.852 0.148
#> SRR661167 2 0.2778 0.8275 0.048 0.952
#> SRR1432518 2 0.9580 0.4641 0.380 0.620
#> SRR660462 2 0.0938 0.8169 0.012 0.988
#> SRR1374608 2 0.9710 0.4006 0.400 0.600
#> SRR657949 2 0.6531 0.7971 0.168 0.832
#> SRR1308882 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.9795 0.3279 0.584 0.416
#> SRR1485870 1 0.6801 0.7825 0.820 0.180
#> SRR1444138 1 0.9754 0.3598 0.592 0.408
#> SRR1417342 1 0.4161 0.8573 0.916 0.084
#> SRR1470193 1 0.3114 0.8615 0.944 0.056
#> SRR1091380 2 0.7528 0.7412 0.216 0.784
#> SRR1099096 1 0.2778 0.8621 0.952 0.048
#> SRR1313583 1 0.1184 0.8519 0.984 0.016
#> SRR1467102 2 0.0938 0.8169 0.012 0.988
#> SRR1485416 1 0.1184 0.8509 0.984 0.016
#> SRR818821 2 0.8608 0.6627 0.284 0.716
#> SRR809963 1 0.5842 0.8367 0.860 0.140
#> SRR1072247 1 0.3274 0.8639 0.940 0.060
#> SRR1353710 1 0.2423 0.8606 0.960 0.040
#> SRR1445259 2 0.8608 0.6620 0.284 0.716
#> SRR1408393 1 0.9983 0.1066 0.524 0.476
#> SRR1361522 1 0.3114 0.8635 0.944 0.056
#> SRR1368597 1 0.4939 0.8558 0.892 0.108
#> SRR1309680 2 0.8499 0.6894 0.276 0.724
#> SRR1310542 2 0.0938 0.8169 0.012 0.988
#> SRR1333485 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR1406437 2 0.9087 0.5818 0.324 0.676
#> SRR1354931 2 0.4022 0.8291 0.080 0.920
#> SRR1391856 2 0.1414 0.8205 0.020 0.980
#> SRR1446738 1 0.9922 0.1782 0.552 0.448
#> SRR1309032 2 0.1633 0.8190 0.024 0.976
#> SRR1388145 2 0.5737 0.8092 0.136 0.864
#> SRR1432611 2 0.2423 0.8210 0.040 0.960
#> SRR815869 2 0.0938 0.8169 0.012 0.988
#> SRR613150 2 0.1184 0.8189 0.016 0.984
#> SRR1375329 1 0.9933 0.1971 0.548 0.452
#> SRR1387921 1 0.2603 0.8609 0.956 0.044
#> SRR1466792 2 0.2236 0.8202 0.036 0.964
#> SRR1360478 2 0.2603 0.8222 0.044 0.956
#> SRR1360695 1 0.7950 0.7390 0.760 0.240
#> SRR812943 1 0.4022 0.8637 0.920 0.080
#> SRR1400910 2 0.9850 0.3420 0.428 0.572
#> SRR1444203 1 0.0938 0.8483 0.988 0.012
#> SRR816177 2 0.9944 0.3136 0.456 0.544
#> SRR658754 2 0.2043 0.8253 0.032 0.968
#> SRR1429603 1 0.3584 0.8599 0.932 0.068
#> SRR1397366 2 0.5519 0.8160 0.128 0.872
#> SRR1446028 1 0.3733 0.8636 0.928 0.072
#> SRR1083918 2 0.9993 0.2128 0.484 0.516
#> SRR1337606 1 0.6343 0.8244 0.840 0.160
#> SRR659109 2 0.2043 0.8250 0.032 0.968
#> SRR1337192 1 0.4298 0.8611 0.912 0.088
#> SRR656946 1 0.9833 0.3000 0.576 0.424
#> SRR1476102 1 0.2603 0.8613 0.956 0.044
#> SRR1476447 1 0.4298 0.8611 0.912 0.088
#> SRR1342067 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR1385389 1 0.0376 0.8463 0.996 0.004
#> SRR1075971 1 0.4022 0.8625 0.920 0.080
#> SRR614419 1 0.3274 0.8647 0.940 0.060
#> SRR1322936 1 0.6712 0.8146 0.824 0.176
#> SRR1349121 2 0.9996 0.0595 0.488 0.512
#> SRR1430549 1 0.2423 0.8598 0.960 0.040
#> SRR612935 2 0.7219 0.7684 0.200 0.800
#> SRR661481 2 0.8144 0.7257 0.252 0.748
#> SRR1354117 2 0.1184 0.8171 0.016 0.984
#> SRR1393596 1 0.5408 0.8344 0.876 0.124
#> SRR1452164 1 0.4815 0.8565 0.896 0.104
#> SRR1070503 1 0.9635 0.4184 0.612 0.388
#> SRR1499894 2 0.2043 0.8253 0.032 0.968
#> SRR1082883 1 0.6438 0.8223 0.836 0.164
#> SRR1468271 1 0.6712 0.8098 0.824 0.176
#> SRR1332443 1 0.2423 0.8598 0.960 0.040
#> SRR810295 2 0.2603 0.8199 0.044 0.956
#> SRR662103 1 0.3114 0.8635 0.944 0.056
#> SRR1328620 2 0.7453 0.7574 0.212 0.788
#> SRR1396294 2 0.9815 0.3286 0.420 0.580
#> SRR1419917 1 0.3114 0.8635 0.944 0.056
#> SRR662114 2 0.6247 0.8022 0.156 0.844
#> SRR1489199 1 0.9909 0.2471 0.556 0.444
#> SRR813584 2 0.9896 0.3519 0.440 0.560
#> SRR1069638 1 0.8713 0.6540 0.708 0.292
#> SRR614864 2 0.4690 0.8264 0.100 0.900
#> SRR1433392 1 0.7528 0.7640 0.784 0.216
#> SRR1377777 2 0.7139 0.7734 0.196 0.804
#> SRR2167710 1 0.9833 0.3000 0.576 0.424
#> SRR1401252 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR1309963 1 0.1184 0.8491 0.984 0.016
#> SRR1338031 1 0.2778 0.8626 0.952 0.048
#> SRR1418628 2 0.3584 0.8231 0.068 0.932
#> SRR1486889 1 0.8861 0.6329 0.696 0.304
#> SRR1380393 1 0.2778 0.8620 0.952 0.048
#> SRR1319731 1 0.3733 0.8627 0.928 0.072
#> SRR1356468 1 0.4939 0.8442 0.892 0.108
#> SRR1337010 2 0.2236 0.8194 0.036 0.964
#> SRR1486520 1 0.5059 0.8513 0.888 0.112
#> SRR1486538 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR1340486 1 0.1414 0.8508 0.980 0.020
#> SRR1377696 1 0.4815 0.8235 0.896 0.104
#> SRR1465459 1 0.9393 0.5091 0.644 0.356
#> SRR1080270 2 0.0938 0.8169 0.012 0.988
#> SRR1312501 2 0.7674 0.7423 0.224 0.776
#> SRR1093148 1 0.9996 0.0404 0.512 0.488
#> SRR1467080 2 0.0938 0.8169 0.012 0.988
#> SRR1410866 2 0.8016 0.7360 0.244 0.756
#> SRR816475 1 0.8327 0.6487 0.736 0.264
#> SRR1379198 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR613342 2 0.5519 0.8204 0.128 0.872
#> SRR1452246 2 0.8909 0.6491 0.308 0.692
#> SRR1338836 2 0.2948 0.8231 0.052 0.948
#> SRR1369129 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR1396616 2 0.5294 0.8207 0.120 0.880
#> SRR813824 2 0.2778 0.8277 0.048 0.952
#> SRR1082376 1 0.6438 0.8220 0.836 0.164
#> SRR1500891 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR807543 1 0.7602 0.7599 0.780 0.220
#> SRR1091572 1 0.8443 0.7026 0.728 0.272
#> SRR1346689 1 0.1843 0.8561 0.972 0.028
#> SRR1332424 1 0.6048 0.8329 0.852 0.148
#> SRR663729 1 0.1184 0.8521 0.984 0.016
#> SRR1097013 1 0.5737 0.8398 0.864 0.136
#> SRR613675 1 0.6712 0.8146 0.824 0.176
#> SRR1485357 1 0.1633 0.8516 0.976 0.024
#> SRR655816 2 0.4161 0.8265 0.084 0.916
#> SRR1500113 1 0.5408 0.8474 0.876 0.124
#> SRR1437622 1 0.6712 0.7636 0.824 0.176
#> SRR1355172 2 0.9881 0.2799 0.436 0.564
#> SRR655531 1 0.4690 0.8555 0.900 0.100
#> SRR1338147 2 0.7745 0.7351 0.228 0.772
#> SRR1413329 1 0.9922 0.2325 0.552 0.448
#> SRR1485931 2 0.7376 0.7621 0.208 0.792
#> SRR1420873 1 0.4562 0.8578 0.904 0.096
#> SRR1333308 1 0.1843 0.8571 0.972 0.028
#> SRR1452033 1 0.9209 0.5632 0.664 0.336
#> SRR1467316 2 0.7376 0.7637 0.208 0.792
#> SRR809018 2 0.0938 0.8169 0.012 0.988
#> SRR1375351 2 0.2778 0.8210 0.048 0.952
#> SRR663440 2 0.9580 0.4693 0.380 0.620
#> SRR1471755 2 0.8207 0.7207 0.256 0.744
#> SRR808019 2 0.9815 0.3344 0.420 0.580
#> SRR1479133 2 0.4022 0.8286 0.080 0.920
#> SRR615069 2 0.9358 0.5192 0.352 0.648
#> SRR1456185 2 0.8608 0.6685 0.284 0.716
#> SRR1350069 2 0.9815 0.3286 0.420 0.580
#> SRR816316 1 0.5737 0.8388 0.864 0.136
#> SRR664795 2 0.9881 0.2868 0.436 0.564
#> SRR1490721 1 0.3114 0.8563 0.944 0.056
#> SRR810643 1 0.3733 0.8627 0.928 0.072
#> SRR1430333 1 0.9732 0.3739 0.596 0.404
#> SRR1085285 2 0.4022 0.8286 0.080 0.920
#> SRR1099072 2 0.5294 0.8207 0.120 0.880
#> SRR1317985 1 0.3274 0.8639 0.940 0.060
#> SRR1487340 1 0.2948 0.8629 0.948 0.052
#> SRR1420276 2 0.0376 0.8122 0.004 0.996
#> SRR1351347 2 0.7056 0.7755 0.192 0.808
#> SRR1405525 1 0.2948 0.8639 0.948 0.052
#> SRR1370329 1 0.2423 0.8598 0.960 0.040
#> SRR1465001 1 0.3733 0.8627 0.928 0.072
#> SRR1476525 2 0.4161 0.8209 0.084 0.916
#> SRR819610 2 0.8661 0.6627 0.288 0.712
#> SRR2157314 1 0.4022 0.8620 0.920 0.080
#> SRR1409465 2 0.2948 0.8231 0.052 0.948
#> SRR809987 1 0.1184 0.8519 0.984 0.016
#> SRR613639 2 0.6048 0.8081 0.148 0.852
#> SRR1402285 1 0.0672 0.8467 0.992 0.008
#> SRR1077038 1 0.6531 0.8152 0.832 0.168
#> SRR1405660 2 0.2603 0.8268 0.044 0.956
#> SRR1095455 2 0.8763 0.6459 0.296 0.704
#> SRR1394734 2 0.9993 0.2128 0.484 0.516
#> SRR1317771 1 0.8499 0.6824 0.724 0.276
#> SRR1365894 1 0.6343 0.7984 0.840 0.160
#> SRR1073581 2 0.9996 0.0595 0.488 0.512
#> SRR659804 1 0.4022 0.8620 0.920 0.080
#> SRR1345914 2 0.5294 0.8181 0.120 0.880
#> SRR1432186 2 0.7376 0.7655 0.208 0.792
#> SRR1473529 1 0.4939 0.8212 0.892 0.108
#> SRR660764 2 0.5178 0.8205 0.116 0.884
#> SRR820448 1 0.5737 0.8388 0.864 0.136
#> SRR1328845 2 0.9815 0.3286 0.420 0.580
#> SRR1336415 1 0.0672 0.8473 0.992 0.008
#> SRR1379065 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR1459190 1 0.9983 0.1066 0.524 0.476
#> SRR1346773 1 0.3879 0.8619 0.924 0.076
#> SRR1499521 2 0.9850 0.3115 0.428 0.572
#> SRR1440898 2 0.4298 0.8232 0.088 0.912
#> SRR1347459 2 0.4431 0.8279 0.092 0.908
#> SRR1081209 2 0.5519 0.8126 0.128 0.872
#> SRR1400202 1 0.2423 0.8598 0.960 0.040
#> SRR1333395 1 0.8763 0.5895 0.704 0.296
#> SRR1309248 1 0.6801 0.7797 0.820 0.180
#> SRR809161 2 0.4815 0.8234 0.104 0.896
#> SRR1316320 1 0.6343 0.8168 0.840 0.160
#> SRR1432629 2 0.9970 0.2705 0.468 0.532
#> SRR1498931 1 0.2603 0.8609 0.956 0.044
#> SRR1416578 1 0.1414 0.8536 0.980 0.020
#> SRR1405547 2 0.0938 0.8169 0.012 0.988
#> SRR1470534 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.4431 0.8593 0.908 0.092
#> SRR1309160 2 0.3114 0.8278 0.056 0.944
#> SRR663489 2 0.0938 0.8169 0.012 0.988
#> SRR1500450 1 0.5842 0.8343 0.860 0.140
#> SRR1078489 1 0.9754 0.3847 0.592 0.408
#> SRR1332648 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR660614 2 0.3733 0.8307 0.072 0.928
#> SRR1470420 2 0.1633 0.8190 0.024 0.976
#> SRR1475566 1 0.2423 0.8598 0.960 0.040
#> SRR1477949 1 0.2603 0.8613 0.956 0.044
#> SRR1481419 2 0.6438 0.7932 0.164 0.836
#> SRR1464766 1 0.4161 0.8608 0.916 0.084
#> SRR615946 2 0.4431 0.8269 0.092 0.908
#> SRR1446481 2 0.5629 0.8087 0.132 0.868
#> SRR1467656 2 0.2948 0.8223 0.052 0.948
#> SRR1402962 1 0.6623 0.8165 0.828 0.172
#> SRR660224 2 0.4161 0.8250 0.084 0.916
#> SRR665586 1 0.2603 0.8612 0.956 0.044
#> SRR1347166 1 0.6801 0.8094 0.820 0.180
#> SRR1485722 1 0.7883 0.7527 0.764 0.236
#> SRR1415316 1 0.2423 0.8598 0.960 0.040
#> SRR613390 1 0.4022 0.8633 0.920 0.080
#> SRR661108 2 0.2043 0.8250 0.032 0.968
#> SRR2170173 1 0.9881 0.2553 0.564 0.436
#> SRR817329 1 0.4562 0.8603 0.904 0.096
#> SRR1401990 1 0.8608 0.6689 0.716 0.284
#> SRR1467745 1 0.8327 0.6487 0.736 0.264
#> SRR1471795 2 0.9460 0.5528 0.364 0.636
#> SRR1415637 2 0.3879 0.8234 0.076 0.924
#> SRR813137 1 0.4431 0.8601 0.908 0.092
#> SRR1314873 1 0.2603 0.8612 0.956 0.044
#> SRR1401211 1 0.7950 0.7390 0.760 0.240
#> SRR1419692 1 0.1184 0.8491 0.984 0.016
#> SRR818797 2 0.8443 0.6808 0.272 0.728
#> SRR2164608 2 0.6623 0.7898 0.172 0.828
#> SRR1455586 2 0.0376 0.8112 0.004 0.996
#> SRR819459 2 0.1184 0.8189 0.016 0.984
#> SRR1488939 2 0.7376 0.7637 0.208 0.792
#> SRR1433232 2 0.7815 0.7450 0.232 0.768
#> SRR1385501 1 0.6048 0.8313 0.852 0.148
#> SRR1361652 1 0.8909 0.5993 0.692 0.308
#> SRR1437119 1 0.2603 0.8609 0.956 0.044
#> SRR1478547 2 0.0938 0.8169 0.012 0.988
#> SRR1430910 1 0.9896 0.2372 0.560 0.440
#> SRR1310584 1 0.3584 0.8622 0.932 0.068
#> SRR1500216 1 0.5519 0.8397 0.872 0.128
#> SRR1486762 2 0.6438 0.7976 0.164 0.836
#> SRR1480854 1 0.0672 0.8481 0.992 0.008
#> SRR1489394 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR1418085 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR1340221 1 0.0672 0.8483 0.992 0.008
#> SRR1473058 1 0.8327 0.6487 0.736 0.264
#> SRR1405165 2 0.5842 0.8105 0.140 0.860
#> SRR1433004 1 0.3584 0.8650 0.932 0.068
#> SRR1471477 1 0.8443 0.6911 0.728 0.272
#> SRR1098567 2 0.4298 0.8234 0.088 0.912
#> SRR1098712 2 0.9815 0.3286 0.420 0.580
#> SRR1455038 1 0.3584 0.8644 0.932 0.068
#> SRR1375248 2 0.0376 0.8112 0.004 0.996
#> SRR1403005 2 0.4939 0.8228 0.108 0.892
#> SRR1348378 2 0.9710 0.4818 0.400 0.600
#> SRR1413541 1 0.2603 0.8612 0.956 0.044
#> SRR1392943 1 0.2603 0.8624 0.956 0.044
#> SRR1475192 2 0.1184 0.8187 0.016 0.984
#> SRR1432085 2 0.3431 0.8272 0.064 0.936
#> SRR1452468 1 0.9522 0.4685 0.628 0.372
#> SRR1347060 2 0.1633 0.8224 0.024 0.976
#> SRR1414139 2 0.2603 0.8260 0.044 0.956
#> SRR1447962 2 0.1843 0.8207 0.028 0.972
#> SRR1444324 2 0.0672 0.8127 0.008 0.992
#> SRR1415004 1 0.2603 0.8610 0.956 0.044
#> SRR1413436 1 0.8661 0.6614 0.712 0.288
#> SRR1311266 1 0.9608 0.4370 0.616 0.384
#> SRR1343302 1 0.1414 0.8508 0.980 0.020
#> SRR1373746 1 0.2778 0.8619 0.952 0.048
#> SRR1429678 1 0.3274 0.8631 0.940 0.060
#> SRR1469413 2 0.4298 0.8258 0.088 0.912
#> SRR1405331 1 0.7528 0.7640 0.784 0.216
#> SRR1345609 1 0.2423 0.8598 0.960 0.040
#> SRR1380208 1 0.7602 0.7499 0.780 0.220
#> SRR1322840 1 0.0000 0.8441 1.000 0.000
#> SRR1399797 2 0.5059 0.8234 0.112 0.888
#> SRR1416654 2 0.4298 0.8289 0.088 0.912
#> SRR1315081 2 0.0672 0.8146 0.008 0.992
#> SRR1369196 2 0.0938 0.8169 0.012 0.988
#> SRR1400847 1 0.4161 0.8608 0.916 0.084
#> SRR1365291 2 0.9815 0.3509 0.420 0.580
#> SRR1367920 1 0.0672 0.8481 0.992 0.008
#> SRR1366648 2 0.0938 0.8169 0.012 0.988
#> SRR1441679 2 0.2778 0.8224 0.048 0.952
#> SRR1082173 2 0.6623 0.7898 0.172 0.828
#> SRR1363968 1 0.7815 0.7496 0.768 0.232
#> SRR814387 1 0.3733 0.8627 0.928 0.072
#> SRR657599 2 0.9815 0.3344 0.420 0.580
#> SRR1386689 1 0.1414 0.8508 0.980 0.020
#> SRR1395575 2 0.3879 0.8298 0.076 0.924
#> SRR1453811 2 0.7674 0.7462 0.224 0.776
#> SRR1441159 1 0.3431 0.8648 0.936 0.064
#> SRR1403154 1 0.1414 0.8508 0.980 0.020
#> SRR1468722 2 0.1184 0.8187 0.016 0.984
#> SRR1310275 2 0.9850 0.3245 0.428 0.572
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 3 0.7400 0.26663 0.412 0.036 0.552
#> SRR1331708 1 0.6506 0.70635 0.720 0.236 0.044
#> SRR1464258 1 0.4217 0.76492 0.868 0.032 0.100
#> SRR1454201 1 0.6519 0.72811 0.760 0.108 0.132
#> SRR661589 3 0.3686 0.60351 0.140 0.000 0.860
#> SRR1456229 1 0.3181 0.77934 0.912 0.064 0.024
#> SRR1315165 1 0.6168 0.72674 0.740 0.224 0.036
#> SRR1488960 1 0.1170 0.78054 0.976 0.016 0.008
#> SRR1417809 1 0.4326 0.76378 0.844 0.144 0.012
#> SRR1094457 1 0.5503 0.73413 0.772 0.208 0.020
#> SRR1095575 1 0.7866 0.25757 0.552 0.060 0.388
#> SRR1315931 1 0.4217 0.76492 0.868 0.032 0.100
#> SRR1430066 3 0.0237 0.59217 0.004 0.000 0.996
#> SRR1431037 3 0.0829 0.59715 0.012 0.004 0.984
#> SRR1395554 3 0.1620 0.60407 0.024 0.012 0.964
#> SRR818002 2 0.9061 0.57076 0.188 0.548 0.264
#> SRR1344143 2 0.5680 0.62449 0.024 0.764 0.212
#> SRR1486845 1 0.5058 0.72094 0.756 0.244 0.000
#> SRR1362866 1 0.5961 0.74553 0.792 0.112 0.096
#> SRR1490740 1 0.1774 0.78136 0.960 0.016 0.024
#> SRR1446627 2 0.6565 0.54153 0.008 0.576 0.416
#> SRR1456138 2 0.6820 0.66199 0.052 0.700 0.248
#> SRR1416248 1 0.3253 0.78097 0.912 0.036 0.052
#> SRR1383907 1 0.8020 0.61405 0.604 0.308 0.088
#> SRR1311018 1 0.1337 0.77811 0.972 0.016 0.012
#> SRR1375699 1 0.9544 -0.08970 0.420 0.388 0.192
#> SRR1429846 3 0.6141 0.50548 0.232 0.032 0.736
#> SRR613550 3 0.4261 0.60059 0.140 0.012 0.848
#> SRR1348402 1 0.2443 0.78297 0.940 0.028 0.032
#> SRR1345146 1 0.7265 0.65815 0.684 0.240 0.076
#> SRR1324025 3 0.6416 0.46964 0.260 0.032 0.708
#> SRR1318879 3 0.5688 0.54888 0.168 0.044 0.788
#> SRR820755 1 0.7128 0.55201 0.664 0.052 0.284
#> SRR1485830 1 0.4605 0.73498 0.796 0.204 0.000
#> SRR599313 1 0.5780 0.75726 0.800 0.120 0.080
#> SRR612263 1 0.2918 0.78520 0.924 0.044 0.032
#> SRR1415398 3 0.3043 0.61431 0.084 0.008 0.908
#> SRR1326205 1 0.3879 0.75769 0.848 0.152 0.000
#> SRR1421327 1 0.6307 0.67440 0.660 0.328 0.012
#> SRR1083311 3 0.0829 0.59904 0.012 0.004 0.984
#> SRR1499303 1 0.5899 0.71749 0.736 0.244 0.020
#> SRR1079522 1 0.3765 0.77672 0.888 0.084 0.028
#> SRR1452935 3 0.8155 0.30955 0.332 0.088 0.580
#> SRR1379495 1 0.2187 0.78272 0.948 0.024 0.028
#> SRR1470459 3 0.6215 -0.23751 0.000 0.428 0.572
#> SRR661361 3 0.3644 0.60632 0.124 0.004 0.872
#> SRR615778 1 0.6726 0.71568 0.748 0.132 0.120
#> SRR1447564 1 0.0829 0.77903 0.984 0.012 0.004
#> SRR1455195 1 0.6100 0.74668 0.784 0.120 0.096
#> SRR655182 1 0.2773 0.78139 0.928 0.024 0.048
#> SRR1335140 1 0.6274 0.52124 0.544 0.456 0.000
#> SRR1433555 3 0.0983 0.60107 0.016 0.004 0.980
#> SRR1308650 3 0.8685 0.11186 0.156 0.260 0.584
#> SRR1388354 1 0.1015 0.77977 0.980 0.008 0.012
#> SRR1317446 3 0.0237 0.58755 0.000 0.004 0.996
#> SRR1413602 3 0.2200 0.61338 0.056 0.004 0.940
#> SRR1479955 2 0.5945 0.63641 0.024 0.740 0.236
#> SRR809853 1 0.2297 0.78339 0.944 0.036 0.020
#> SRR661313 3 0.4099 0.60106 0.140 0.008 0.852
#> SRR1499935 1 0.5899 0.71749 0.736 0.244 0.020
#> SRR1447303 3 0.5551 0.53093 0.212 0.020 0.768
#> SRR1429408 3 0.9452 0.00767 0.284 0.220 0.496
#> SRR1433950 1 0.0848 0.77978 0.984 0.008 0.008
#> SRR1362081 3 0.6669 -0.35283 0.008 0.468 0.524
#> SRR1409854 1 0.7401 0.46440 0.612 0.048 0.340
#> SRR1435229 1 0.8936 0.21802 0.500 0.132 0.368
#> SRR1085996 1 0.1182 0.78174 0.976 0.012 0.012
#> SRR1414229 1 0.9066 0.43122 0.540 0.176 0.284
#> SRR1400974 3 0.0000 0.58904 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399971 1 0.1337 0.77811 0.972 0.016 0.012
#> SRR613927 3 0.4634 0.58906 0.164 0.012 0.824
#> SRR1457854 1 0.1015 0.77977 0.980 0.008 0.012
#> SRR1473714 1 0.5780 0.75726 0.800 0.120 0.080
#> SRR813776 1 0.7128 0.55201 0.664 0.052 0.284
#> SRR808196 1 0.4390 0.76063 0.840 0.148 0.012
#> SRR1101085 1 0.5216 0.71589 0.740 0.260 0.000
#> SRR614395 1 0.4413 0.76259 0.860 0.036 0.104
#> SRR1478251 1 0.4654 0.73372 0.792 0.208 0.000
#> SRR1370551 3 0.6600 -0.16190 0.012 0.384 0.604
#> SRR1362310 1 0.1919 0.78096 0.956 0.024 0.020
#> SRR665310 3 0.3983 0.60107 0.144 0.004 0.852
#> SRR1420109 3 0.5772 0.52832 0.220 0.024 0.756
#> SRR1330920 1 0.5901 0.70308 0.776 0.048 0.176
#> SRR1419539 3 0.1781 0.59695 0.020 0.020 0.960
#> SRR1359447 3 0.6180 -0.16444 0.000 0.416 0.584
#> SRR1347259 1 0.5356 0.74818 0.784 0.196 0.020
#> SRR613915 3 0.4897 0.57974 0.172 0.016 0.812
#> SRR1384395 3 0.1163 0.57068 0.000 0.028 0.972
#> SRR821715 3 0.3375 0.61253 0.100 0.008 0.892
#> SRR1478228 1 0.2918 0.78209 0.924 0.032 0.044
#> SRR1445637 1 0.4848 0.75255 0.836 0.036 0.128
#> SRR608150 1 0.6546 0.72863 0.756 0.148 0.096
#> SRR1096383 3 0.7400 0.26381 0.412 0.036 0.552
#> SRR1341480 1 0.5591 0.69242 0.696 0.304 0.000
#> SRR1341344 1 0.3590 0.77676 0.896 0.076 0.028
#> SRR1326270 3 0.2772 0.61497 0.080 0.004 0.916
#> SRR1498838 3 0.0848 0.59547 0.008 0.008 0.984
#> SRR1416313 3 0.3207 0.61514 0.084 0.012 0.904
#> SRR808566 1 0.8404 0.59606 0.592 0.288 0.120
#> SRR1430270 1 0.4452 0.74226 0.808 0.192 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.58904 0.000 0.000 1.000
#> SRR613533 3 0.9400 0.14878 0.228 0.264 0.508
#> SRR661267 3 0.7487 0.27138 0.408 0.040 0.552
#> SRR810665 2 0.7578 0.48133 0.040 0.500 0.460
#> SRR1407250 1 0.7756 0.65742 0.672 0.128 0.200
#> SRR1420067 1 0.6806 0.66399 0.712 0.060 0.228
#> SRR1473632 1 0.2297 0.78339 0.944 0.036 0.020
#> SRR812536 3 0.2947 0.61166 0.060 0.020 0.920
#> SRR1370850 2 0.8437 0.58413 0.092 0.520 0.388
#> SRR1486195 3 0.6608 -0.26679 0.008 0.432 0.560
#> SRR1407671 1 0.9722 0.06584 0.444 0.244 0.312
#> SRR1446375 1 0.8859 0.02567 0.480 0.120 0.400
#> SRR1465230 1 0.4654 0.73569 0.792 0.208 0.000
#> SRR614119 3 0.7366 0.29336 0.400 0.036 0.564
#> SRR1356101 3 0.4002 0.42651 0.000 0.160 0.840
#> SRR1404209 1 0.6388 0.58373 0.692 0.024 0.284
#> SRR1392676 2 0.6379 0.58195 0.008 0.624 0.368
#> SRR665538 3 0.7420 0.24143 0.420 0.036 0.544
#> SRR660510 3 0.1170 0.60086 0.016 0.008 0.976
#> SRR1445655 1 0.5024 0.73069 0.776 0.220 0.004
#> SRR658953 1 0.8590 0.45214 0.560 0.320 0.120
#> SRR2166459 1 0.3769 0.76398 0.880 0.016 0.104
#> SRR1070713 1 0.9651 -0.07060 0.400 0.392 0.208
#> SRR1485312 3 0.0237 0.59217 0.004 0.000 0.996
#> SRR1317631 3 0.7841 0.27476 0.360 0.064 0.576
#> SRR1488610 1 0.2152 0.78470 0.948 0.036 0.016
#> SRR1330588 3 0.7104 0.33564 0.360 0.032 0.608
#> SRR1316367 1 0.4526 0.77557 0.856 0.104 0.040
#> SRR1433926 1 0.1919 0.77930 0.956 0.020 0.024
#> SRR1091302 1 0.5253 0.74617 0.792 0.188 0.020
#> SRR818263 1 0.7285 0.47509 0.632 0.048 0.320
#> SRR1404909 1 0.6026 0.62736 0.624 0.376 0.000
#> SRR663076 1 0.4289 0.76780 0.868 0.040 0.092
#> SRR1323577 2 0.9581 0.47551 0.268 0.480 0.252
#> SRR1442422 1 0.4654 0.73569 0.792 0.208 0.000
#> SRR1465893 1 0.1636 0.78213 0.964 0.016 0.020
#> SRR654862 1 0.4920 0.76040 0.840 0.052 0.108
#> SRR1407112 1 0.5503 0.73413 0.772 0.208 0.020
#> SRR1332969 3 0.3267 0.61154 0.116 0.000 0.884
#> SRR1353199 3 0.4033 0.60280 0.136 0.008 0.856
#> SRR1378885 3 0.6475 0.45539 0.280 0.028 0.692
#> SRR665357 3 0.5111 0.51664 0.036 0.144 0.820
#> SRR662186 3 0.6274 -0.27631 0.000 0.456 0.544
#> SRR1501020 3 0.4465 0.57710 0.176 0.004 0.820
#> SRR1347819 3 0.0848 0.59533 0.008 0.008 0.984
#> SRR1480813 2 0.8535 0.62431 0.112 0.556 0.332
#> SRR1472576 1 0.8434 0.54851 0.560 0.336 0.104
#> SRR1431781 1 0.6168 0.72674 0.740 0.224 0.036
#> SRR1452270 3 0.1399 0.60653 0.028 0.004 0.968
#> SRR1500472 3 0.9068 0.11439 0.420 0.136 0.444
#> SRR1417632 1 0.6260 0.53366 0.552 0.448 0.000
#> SRR1350153 3 0.6678 -0.37713 0.008 0.480 0.512
#> SRR1458113 1 0.9111 0.40371 0.532 0.176 0.292
#> SRR1326579 1 0.5625 0.75187 0.808 0.116 0.076
#> SRR1349363 2 0.9138 0.21645 0.376 0.476 0.148
#> SRR1096712 3 0.1129 0.60310 0.020 0.004 0.976
#> SRR1090407 3 0.3129 0.61407 0.088 0.008 0.904
#> SRR1083752 2 0.9334 0.49750 0.200 0.508 0.292
#> SRR1377599 1 0.5706 0.68070 0.680 0.320 0.000
#> SRR1488449 3 0.3619 0.60523 0.136 0.000 0.864
#> SRR1318354 3 0.8792 0.27353 0.176 0.244 0.580
#> SRR1359062 3 0.0661 0.59399 0.008 0.004 0.988
#> SRR1398924 1 0.8107 0.50165 0.604 0.300 0.096
#> SRR663783 3 0.0424 0.58992 0.000 0.008 0.992
#> SRR1319204 3 0.7128 0.08572 0.036 0.344 0.620
#> SRR1369070 2 0.6490 0.66017 0.036 0.708 0.256
#> SRR615659 1 0.1919 0.77930 0.956 0.020 0.024
#> SRR1337449 3 0.7430 -0.31390 0.036 0.424 0.540
#> SRR1316982 3 0.3482 0.47818 0.000 0.128 0.872
#> SRR1498595 1 0.6260 0.53213 0.552 0.448 0.000
#> SRR1377423 3 0.4413 0.58433 0.160 0.008 0.832
#> SRR1312310 3 0.6823 -0.39599 0.012 0.484 0.504
#> SRR1485613 1 0.5466 0.73077 0.800 0.040 0.160
#> SRR1338426 3 0.4848 0.59354 0.128 0.036 0.836
#> SRR1353309 3 0.4446 0.60242 0.112 0.032 0.856
#> SRR658941 3 0.7339 0.31551 0.392 0.036 0.572
#> SRR1101643 1 0.1999 0.78189 0.952 0.036 0.012
#> SRR1401468 3 0.7400 0.26663 0.412 0.036 0.552
#> SRR1368874 3 0.6682 -0.39647 0.008 0.488 0.504
#> SRR1324085 1 0.9503 0.37739 0.476 0.316 0.208
#> SRR1363858 1 0.5780 0.75726 0.800 0.120 0.080
#> SRR819820 3 0.5486 0.53481 0.196 0.024 0.780
#> SRR1337342 1 0.6936 0.65757 0.704 0.064 0.232
#> SRR655206 3 0.1781 0.59895 0.020 0.020 0.960
#> SRR1387013 2 0.9147 0.47650 0.260 0.540 0.200
#> SRR1317410 1 0.2903 0.78188 0.924 0.028 0.048
#> SRR608198 1 0.5625 0.75195 0.808 0.116 0.076
#> SRR1440161 3 0.6678 -0.37713 0.008 0.480 0.512
#> SRR1343741 2 0.6490 0.66017 0.036 0.708 0.256
#> SRR1381288 2 0.6565 0.54153 0.008 0.576 0.416
#> SRR1415379 1 0.3816 0.75765 0.852 0.148 0.000
#> SRR1099622 3 0.7656 -0.20214 0.052 0.376 0.572
#> SRR663197 3 0.4217 0.60826 0.100 0.032 0.868
#> SRR1394836 3 0.1919 0.59722 0.020 0.024 0.956
#> SRR661699 3 0.3459 0.60725 0.096 0.012 0.892
#> SRR813680 3 0.7487 0.26991 0.408 0.040 0.552
#> SRR1410678 1 0.1919 0.78096 0.956 0.024 0.020
#> SRR1378109 1 0.5503 0.73413 0.772 0.208 0.020
#> SRR1499174 1 0.3637 0.77490 0.892 0.024 0.084
#> SRR1311486 3 0.7430 -0.31390 0.036 0.424 0.540
#> SRR1382851 2 0.8742 -0.25604 0.436 0.456 0.108
#> SRR1433410 1 0.6510 0.73321 0.756 0.156 0.088
#> SRR661167 3 0.1525 0.60702 0.032 0.004 0.964
#> SRR1432518 3 0.8155 0.30955 0.332 0.088 0.580
#> SRR660462 3 0.0237 0.58755 0.000 0.004 0.996
#> SRR1374608 3 0.8204 0.27221 0.316 0.096 0.588
#> SRR657949 3 0.4953 0.57677 0.176 0.016 0.808
#> SRR1308882 1 0.4796 0.73138 0.780 0.220 0.000
#> SRR655768 1 0.7724 0.26545 0.552 0.052 0.396
#> SRR1485870 1 0.7265 0.65815 0.684 0.240 0.076
#> SRR1444138 1 0.7982 0.30716 0.556 0.068 0.376
#> SRR1417342 1 0.5267 0.75912 0.816 0.140 0.044
#> SRR1470193 1 0.5060 0.75623 0.816 0.156 0.028
#> SRR1091380 3 0.5486 0.53481 0.196 0.024 0.780
#> SRR1099096 1 0.1491 0.78095 0.968 0.016 0.016
#> SRR1313583 1 0.3340 0.76796 0.880 0.120 0.000
#> SRR1467102 3 0.2066 0.54652 0.000 0.060 0.940
#> SRR1485416 1 0.5591 0.69242 0.696 0.304 0.000
#> SRR818821 3 0.9400 0.14878 0.228 0.264 0.508
#> SRR809963 1 0.4413 0.76259 0.860 0.036 0.104
#> SRR1072247 1 0.2187 0.78272 0.948 0.024 0.028
#> SRR1353710 1 0.4634 0.75812 0.824 0.164 0.012
#> SRR1445259 3 0.9405 0.15252 0.232 0.260 0.508
#> SRR1408393 1 0.6925 0.13856 0.532 0.016 0.452
#> SRR1361522 1 0.2056 0.77916 0.952 0.024 0.024
#> SRR1368597 1 0.3031 0.77881 0.912 0.012 0.076
#> SRR1309680 2 0.8491 0.64300 0.128 0.588 0.284
#> SRR1310542 3 0.0237 0.58755 0.000 0.004 0.996
#> SRR1333485 1 0.5216 0.71589 0.740 0.260 0.000
#> SRR1406437 3 0.8094 0.32878 0.240 0.124 0.636
#> SRR1354931 3 0.2496 0.61485 0.068 0.004 0.928
#> SRR1391856 3 0.4228 0.45867 0.008 0.148 0.844
#> SRR1446738 1 0.9926 -0.14828 0.376 0.348 0.276
#> SRR1309032 3 0.6215 -0.23751 0.000 0.428 0.572
#> SRR1388145 3 0.7819 -0.37636 0.052 0.440 0.508
#> SRR1432611 3 0.6654 -0.32219 0.008 0.456 0.536
#> SRR815869 3 0.0237 0.58755 0.000 0.004 0.996
#> SRR613150 3 0.0475 0.59124 0.004 0.004 0.992
#> SRR1375329 1 0.8887 0.18943 0.488 0.124 0.388
#> SRR1387921 1 0.0848 0.77824 0.984 0.008 0.008
#> SRR1466792 3 0.6664 -0.34327 0.008 0.464 0.528
#> SRR1360478 3 0.6678 -0.37713 0.008 0.480 0.512
#> SRR1360695 1 0.6124 0.67578 0.744 0.036 0.220
#> SRR812943 1 0.2681 0.78386 0.932 0.040 0.028
#> SRR1400910 2 0.9949 0.27978 0.356 0.360 0.284
#> SRR1444203 1 0.5220 0.73546 0.780 0.208 0.012
#> SRR816177 2 0.9581 0.47015 0.268 0.480 0.252
#> SRR658754 3 0.1337 0.59965 0.016 0.012 0.972
#> SRR1429603 1 0.5356 0.74818 0.784 0.196 0.020
#> SRR1397366 3 0.4164 0.59963 0.144 0.008 0.848
#> SRR1446028 1 0.3039 0.78242 0.920 0.036 0.044
#> SRR1083918 2 0.9846 0.40647 0.304 0.420 0.276
#> SRR1337606 1 0.6922 0.71593 0.720 0.200 0.080
#> SRR659109 3 0.1170 0.60086 0.016 0.008 0.976
#> SRR1337192 1 0.3590 0.77676 0.896 0.076 0.028
#> SRR656946 1 0.7741 0.29597 0.568 0.056 0.376
#> SRR1476102 1 0.1170 0.78054 0.976 0.016 0.008
#> SRR1476447 1 0.3590 0.77676 0.896 0.076 0.028
#> SRR1342067 1 0.5216 0.71589 0.740 0.260 0.000
#> SRR1385389 1 0.4978 0.73345 0.780 0.216 0.004
#> SRR1075971 1 0.3669 0.77944 0.896 0.064 0.040
#> SRR614419 1 0.4217 0.77757 0.868 0.100 0.032
#> SRR1322936 1 0.6807 0.71548 0.736 0.172 0.092
#> SRR1349121 3 0.7487 0.06693 0.464 0.036 0.500
#> SRR1430549 1 0.1170 0.77966 0.976 0.016 0.008
#> SRR612935 3 0.8673 0.28944 0.160 0.252 0.588
#> SRR661481 2 0.8535 0.62431 0.112 0.556 0.332
#> SRR1354117 3 0.6215 -0.19810 0.000 0.428 0.572
#> SRR1393596 1 0.6556 0.69053 0.692 0.276 0.032
#> SRR1452164 1 0.3461 0.77712 0.900 0.024 0.076
#> SRR1070503 1 0.7481 0.38678 0.596 0.048 0.356
#> SRR1499894 3 0.1170 0.60006 0.016 0.008 0.976
#> SRR1082883 1 0.6634 0.72674 0.752 0.144 0.104
#> SRR1468271 1 0.5466 0.73077 0.800 0.040 0.160
#> SRR1332443 1 0.0829 0.77869 0.984 0.012 0.004
#> SRR810295 3 0.6680 -0.38497 0.008 0.484 0.508
#> SRR662103 1 0.2056 0.77916 0.952 0.024 0.024
#> SRR1328620 3 0.8792 0.27353 0.176 0.244 0.580
#> SRR1396294 3 0.7841 0.27476 0.360 0.064 0.576
#> SRR1419917 1 0.2056 0.77916 0.952 0.024 0.024
#> SRR662114 3 0.5094 0.58592 0.136 0.040 0.824
#> SRR1489199 1 0.7793 0.20015 0.524 0.052 0.424
#> SRR813584 3 0.9452 0.00767 0.284 0.220 0.496
#> SRR1069638 1 0.7372 0.62060 0.688 0.092 0.220
#> SRR614864 3 0.3031 0.61416 0.076 0.012 0.912
#> SRR1433392 1 0.5955 0.69974 0.772 0.048 0.180
#> SRR1377777 2 0.6226 0.64661 0.028 0.720 0.252
#> SRR2167710 1 0.7741 0.29597 0.568 0.056 0.376
#> SRR1401252 1 0.5058 0.72065 0.756 0.244 0.000
#> SRR1309963 1 0.5318 0.73606 0.780 0.204 0.016
#> SRR1338031 1 0.1491 0.77929 0.968 0.016 0.016
#> SRR1418628 3 0.7389 -0.40331 0.032 0.464 0.504
#> SRR1486889 1 0.6388 0.58373 0.692 0.024 0.284
#> SRR1380393 1 0.1015 0.77977 0.980 0.008 0.012
#> SRR1319731 1 0.3039 0.78170 0.920 0.036 0.044
#> SRR1356468 1 0.6431 0.73877 0.760 0.156 0.084
#> SRR1337010 3 0.6669 -0.34823 0.008 0.468 0.524
#> SRR1486520 1 0.4370 0.77486 0.868 0.056 0.076
#> SRR1486538 1 0.4654 0.73500 0.792 0.208 0.000
#> SRR1340486 1 0.5503 0.73413 0.772 0.208 0.020
#> SRR1377696 1 0.6267 0.52732 0.548 0.452 0.000
#> SRR1465459 1 0.7310 0.46874 0.628 0.048 0.324
#> SRR1080270 3 0.0237 0.58755 0.000 0.004 0.996
#> SRR1312501 3 0.6007 0.53217 0.192 0.044 0.764
#> SRR1093148 3 0.9187 0.01578 0.412 0.148 0.440
#> SRR1467080 3 0.0237 0.58755 0.000 0.004 0.996
#> SRR1410866 2 0.8817 0.55890 0.120 0.500 0.380
#> SRR816475 1 0.9503 0.37739 0.476 0.316 0.208
#> SRR1379198 1 0.4654 0.73372 0.792 0.208 0.000
#> SRR613342 3 0.5069 0.59687 0.128 0.044 0.828
#> SRR1452246 2 0.7124 0.63409 0.088 0.708 0.204
#> SRR1338836 2 0.6608 0.52397 0.008 0.560 0.432
#> SRR1369129 1 0.4702 0.73262 0.788 0.212 0.000
#> SRR1396616 3 0.3983 0.60107 0.144 0.004 0.852
#> SRR813824 3 0.1525 0.60734 0.032 0.004 0.964
#> SRR1082376 1 0.5403 0.75075 0.816 0.060 0.124
#> SRR1500891 1 0.4887 0.72773 0.772 0.228 0.000
#> SRR807543 1 0.6007 0.69619 0.768 0.048 0.184
#> SRR1091572 1 0.7381 0.65892 0.704 0.132 0.164
#> SRR1346689 1 0.5115 0.74653 0.796 0.188 0.016
#> SRR1332424 1 0.6510 0.73321 0.756 0.156 0.088
#> SRR663729 1 0.5178 0.72832 0.744 0.256 0.000
#> SRR1097013 1 0.3769 0.76398 0.880 0.016 0.104
#> SRR613675 1 0.6807 0.71548 0.736 0.172 0.092
#> SRR1485357 1 0.5633 0.73351 0.768 0.208 0.024
#> SRR655816 3 0.2584 0.60701 0.064 0.008 0.928
#> SRR1500113 1 0.4479 0.76640 0.860 0.044 0.096
#> SRR1437622 1 0.8434 0.54851 0.560 0.336 0.104
#> SRR1355172 3 0.7400 0.26183 0.412 0.036 0.552
#> SRR655531 1 0.4475 0.77532 0.864 0.072 0.064
#> SRR1338147 3 0.5455 0.54304 0.204 0.020 0.776
#> SRR1413329 1 0.7715 0.18881 0.524 0.048 0.428
#> SRR1485931 2 0.5680 0.62449 0.024 0.764 0.212
#> SRR1420873 1 0.3649 0.77786 0.896 0.036 0.068
#> SRR1333308 1 0.5061 0.74964 0.784 0.208 0.008
#> SRR1452033 1 0.6906 0.49509 0.644 0.032 0.324
#> SRR1467316 2 0.6067 0.63868 0.028 0.736 0.236
#> SRR809018 3 0.0000 0.58904 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375351 3 0.6823 -0.39599 0.012 0.484 0.504
#> SRR663440 3 0.7328 0.34776 0.364 0.040 0.596
#> SRR1471755 2 0.8573 0.62401 0.116 0.556 0.328
#> SRR808019 3 0.7339 0.31551 0.392 0.036 0.572
#> SRR1479133 3 0.2682 0.61544 0.076 0.004 0.920
#> SRR615069 3 0.8777 0.27780 0.288 0.148 0.564
#> SRR1456185 3 0.9771 -0.21131 0.256 0.308 0.436
#> SRR1350069 3 0.7841 0.27476 0.360 0.064 0.576
#> SRR816316 1 0.4217 0.76492 0.868 0.032 0.100
#> SRR664795 3 0.7487 0.26991 0.408 0.040 0.552
#> SRR1490721 1 0.6677 0.67291 0.652 0.324 0.024
#> SRR810643 1 0.3039 0.78170 0.920 0.036 0.044
#> SRR1430333 1 0.8841 0.33529 0.528 0.132 0.340
#> SRR1085285 3 0.2682 0.61544 0.076 0.004 0.920
#> SRR1099072 3 0.3983 0.60107 0.144 0.004 0.852
#> SRR1317985 1 0.1905 0.78036 0.956 0.016 0.028
#> SRR1487340 1 0.2050 0.78276 0.952 0.028 0.020
#> SRR1420276 3 0.1163 0.57068 0.000 0.028 0.972
#> SRR1351347 3 0.5677 0.56933 0.160 0.048 0.792
#> SRR1405525 1 0.2152 0.78470 0.948 0.036 0.016
#> SRR1370329 1 0.1170 0.77776 0.976 0.016 0.008
#> SRR1465001 1 0.3039 0.78170 0.920 0.036 0.044
#> SRR1476525 2 0.6879 0.54274 0.016 0.556 0.428
#> SRR819610 3 0.9783 -0.22020 0.256 0.312 0.432
#> SRR2157314 1 0.3253 0.78115 0.912 0.036 0.052
#> SRR1409465 2 0.6608 0.52397 0.008 0.560 0.432
#> SRR809987 1 0.3784 0.76388 0.864 0.132 0.004
#> SRR613639 3 0.4575 0.59158 0.160 0.012 0.828
#> SRR1402285 1 0.5061 0.73593 0.784 0.208 0.008
#> SRR1077038 1 0.5028 0.74444 0.828 0.040 0.132
#> SRR1405660 3 0.1399 0.60653 0.028 0.004 0.968
#> SRR1095455 3 0.9484 0.13087 0.240 0.264 0.496
#> SRR1394734 2 0.9846 0.40647 0.304 0.420 0.276
#> SRR1317771 1 0.6143 0.62914 0.720 0.024 0.256
#> SRR1365894 1 0.7378 0.62155 0.628 0.320 0.052
#> SRR1073581 3 0.7487 0.06693 0.464 0.036 0.500
#> SRR659804 1 0.3253 0.78115 0.912 0.036 0.052
#> SRR1345914 2 0.7835 0.49184 0.052 0.492 0.456
#> SRR1432186 2 0.8091 0.63208 0.080 0.572 0.348
#> SRR1473529 1 0.6260 0.53213 0.552 0.448 0.000
#> SRR660764 3 0.7344 0.38435 0.084 0.232 0.684
#> SRR820448 1 0.4217 0.76492 0.868 0.032 0.100
#> SRR1328845 3 0.7841 0.27476 0.360 0.064 0.576
#> SRR1336415 1 0.5061 0.73587 0.784 0.208 0.008
#> SRR1379065 1 0.4887 0.72773 0.772 0.228 0.000
#> SRR1459190 1 0.6925 0.13856 0.532 0.016 0.452
#> SRR1346773 1 0.3253 0.78187 0.912 0.036 0.052
#> SRR1499521 3 0.7366 0.29439 0.400 0.036 0.564
#> SRR1440898 2 0.7262 0.51539 0.028 0.528 0.444
#> SRR1347459 3 0.3637 0.61278 0.084 0.024 0.892
#> SRR1081209 2 0.6422 0.61698 0.016 0.660 0.324
#> SRR1400202 1 0.0848 0.77794 0.984 0.008 0.008
#> SRR1333395 1 0.8181 0.44160 0.584 0.324 0.092
#> SRR1309248 1 0.7622 0.59548 0.608 0.332 0.060
#> SRR809161 3 0.3618 0.61267 0.104 0.012 0.884
#> SRR1316320 1 0.6482 0.69885 0.716 0.244 0.040
#> SRR1432629 2 0.9175 0.49323 0.244 0.540 0.216
#> SRR1498931 1 0.1482 0.77892 0.968 0.020 0.012
#> SRR1416578 1 0.3816 0.75765 0.852 0.148 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.58904 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470534 1 0.4702 0.73262 0.788 0.212 0.000
#> SRR1380764 1 0.3649 0.77844 0.896 0.036 0.068
#> SRR1309160 3 0.1989 0.61168 0.048 0.004 0.948
#> SRR663489 3 0.0000 0.58904 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500450 1 0.5069 0.75312 0.828 0.044 0.128
#> SRR1078489 1 0.9027 0.37366 0.532 0.160 0.308
#> SRR1332648 1 0.4654 0.73569 0.792 0.208 0.000
#> SRR660614 3 0.7128 0.08572 0.036 0.344 0.620
#> SRR1470420 3 0.6215 -0.23751 0.000 0.428 0.572
#> SRR1475566 1 0.0848 0.77794 0.984 0.008 0.008
#> SRR1477949 1 0.1170 0.78054 0.976 0.016 0.008
#> SRR1481419 2 0.8169 0.59408 0.076 0.536 0.388
#> SRR1464766 1 0.2773 0.78327 0.928 0.024 0.048
#> SRR615946 3 0.3207 0.61514 0.084 0.012 0.904
#> SRR1446481 3 0.7672 -0.43994 0.044 0.468 0.488
#> SRR1467656 2 0.6641 0.49835 0.008 0.544 0.448
#> SRR1402962 1 0.6519 0.72811 0.760 0.108 0.132
#> SRR660224 2 0.6754 0.53140 0.012 0.556 0.432
#> SRR665586 1 0.1170 0.77951 0.976 0.016 0.008
#> SRR1347166 1 0.6726 0.71568 0.748 0.132 0.120
#> SRR1485722 1 0.7756 0.65742 0.672 0.128 0.200
#> SRR1415316 1 0.0829 0.77903 0.984 0.012 0.004
#> SRR613390 1 0.3572 0.78131 0.900 0.060 0.040
#> SRR661108 3 0.0983 0.60067 0.016 0.004 0.980
#> SRR2170173 1 0.7866 0.25757 0.552 0.060 0.388
#> SRR817329 1 0.2749 0.78084 0.924 0.012 0.064
#> SRR1401990 1 0.7512 0.60104 0.656 0.076 0.268
#> SRR1467745 1 0.9503 0.37739 0.476 0.316 0.208
#> SRR1471795 2 0.9048 0.57330 0.184 0.548 0.268
#> SRR1415637 2 0.6379 0.58195 0.008 0.624 0.368
#> SRR813137 1 0.3083 0.77791 0.916 0.024 0.060
#> SRR1314873 1 0.1170 0.77951 0.976 0.016 0.008
#> SRR1401211 1 0.6124 0.67578 0.744 0.036 0.220
#> SRR1419692 1 0.5366 0.73349 0.776 0.208 0.016
#> SRR818797 3 0.6490 0.47932 0.256 0.036 0.708
#> SRR2164608 3 0.4663 0.58210 0.156 0.016 0.828
#> SRR1455586 3 0.3752 0.44891 0.000 0.144 0.856
#> SRR819459 3 0.0475 0.59124 0.004 0.004 0.992
#> SRR1488939 2 0.6067 0.63868 0.028 0.736 0.236
#> SRR1433232 2 0.6546 0.65976 0.044 0.716 0.240
#> SRR1385501 1 0.4892 0.75474 0.840 0.048 0.112
#> SRR1361652 1 0.8590 0.45214 0.560 0.320 0.120
#> SRR1437119 1 0.1337 0.77811 0.972 0.016 0.012
#> SRR1478547 3 0.0000 0.58904 0.000 0.000 1.000
#> SRR1430910 1 0.8936 0.21802 0.500 0.132 0.368
#> SRR1310584 1 0.2297 0.78285 0.944 0.020 0.036
#> SRR1500216 1 0.5780 0.75726 0.800 0.120 0.080
#> SRR1486762 3 0.5062 0.56461 0.184 0.016 0.800
#> SRR1480854 1 0.5706 0.68070 0.680 0.320 0.000
#> SRR1489394 1 0.4654 0.73569 0.792 0.208 0.000
#> SRR1418085 1 0.4654 0.73569 0.792 0.208 0.000
#> SRR1340221 1 0.4452 0.74226 0.808 0.192 0.000
#> SRR1473058 1 0.9503 0.37739 0.476 0.316 0.208
#> SRR1405165 3 0.4136 0.59167 0.116 0.020 0.864
#> SRR1433004 1 0.3213 0.78186 0.912 0.060 0.028
#> SRR1471477 1 0.6526 0.61817 0.704 0.036 0.260
#> SRR1098567 3 0.7442 -0.18017 0.044 0.368 0.588
#> SRR1098712 3 0.7841 0.27476 0.360 0.064 0.576
#> SRR1455038 1 0.3310 0.77930 0.908 0.064 0.028
#> SRR1375248 3 0.3752 0.44891 0.000 0.144 0.856
#> SRR1403005 3 0.3682 0.60909 0.116 0.008 0.876
#> SRR1348378 2 0.9334 0.49750 0.200 0.508 0.292
#> SRR1413541 1 0.0848 0.77996 0.984 0.008 0.008
#> SRR1392943 1 0.5506 0.74617 0.764 0.220 0.016
#> SRR1475192 3 0.0424 0.59529 0.008 0.000 0.992
#> SRR1432085 3 0.6522 0.17404 0.032 0.272 0.696
#> SRR1452468 1 0.8801 0.43679 0.564 0.152 0.284
#> SRR1347060 3 0.1015 0.59514 0.008 0.012 0.980
#> SRR1414139 3 0.6056 0.30771 0.032 0.224 0.744
#> SRR1447962 3 0.6247 -0.11560 0.004 0.376 0.620
#> SRR1444324 3 0.5835 0.03350 0.000 0.340 0.660
#> SRR1415004 1 0.0848 0.77923 0.984 0.008 0.008
#> SRR1413436 1 0.6252 0.60834 0.708 0.024 0.268
#> SRR1311266 1 0.8126 0.37489 0.564 0.080 0.356
#> SRR1343302 1 0.5503 0.73413 0.772 0.208 0.020
#> SRR1373746 1 0.1636 0.78034 0.964 0.020 0.016
#> SRR1429678 1 0.2443 0.78319 0.940 0.032 0.028
#> SRR1469413 3 0.7271 -0.11182 0.040 0.352 0.608
#> SRR1405331 1 0.5955 0.69974 0.772 0.048 0.180
#> SRR1345609 1 0.0983 0.77840 0.980 0.016 0.004
#> SRR1380208 1 0.8591 0.53886 0.572 0.300 0.128
#> SRR1322840 1 0.4842 0.72944 0.776 0.224 0.000
#> SRR1399797 3 0.4217 0.60826 0.100 0.032 0.868
#> SRR1416654 3 0.2749 0.61327 0.064 0.012 0.924
#> SRR1315081 3 0.0747 0.58071 0.000 0.016 0.984
#> SRR1369196 3 0.0237 0.58755 0.000 0.004 0.996
#> SRR1400847 1 0.2773 0.78327 0.928 0.024 0.048
#> SRR1365291 3 0.7389 0.29017 0.408 0.036 0.556
#> SRR1367920 1 0.5706 0.68070 0.680 0.320 0.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.58904 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441679 2 0.6647 0.49013 0.008 0.540 0.452
#> SRR1082173 3 0.4663 0.58210 0.156 0.016 0.828
#> SRR1363968 1 0.6124 0.67613 0.744 0.036 0.220
#> SRR814387 1 0.3039 0.78170 0.920 0.036 0.044
#> SRR657599 3 0.7339 0.31551 0.392 0.036 0.572
#> SRR1386689 1 0.5503 0.73413 0.772 0.208 0.020
#> SRR1395575 3 0.2625 0.61509 0.084 0.000 0.916
#> SRR1453811 3 0.5597 0.54001 0.216 0.020 0.764
#> SRR1441159 1 0.3370 0.78543 0.904 0.072 0.024
#> SRR1403154 1 0.5503 0.73413 0.772 0.208 0.020
#> SRR1468722 3 0.0237 0.59217 0.004 0.000 0.996
#> SRR1310275 3 0.7420 0.27211 0.420 0.036 0.544
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 3 0.5933 0.306314 0.408 0.000 0.552 0.040
#> SRR1331708 4 0.7499 0.165498 0.400 0.100 0.024 0.476
#> SRR1464258 1 0.4426 0.617019 0.812 0.000 0.092 0.096
#> SRR1454201 1 0.7378 0.431312 0.568 0.032 0.100 0.300
#> SRR661589 3 0.3142 0.723886 0.132 0.000 0.860 0.008
#> SRR1456229 1 0.4395 0.557538 0.776 0.004 0.016 0.204
#> SRR1315165 4 0.6177 0.651807 0.388 0.020 0.024 0.568
#> SRR1488960 1 0.2124 0.614849 0.924 0.000 0.008 0.068
#> SRR1417809 1 0.5573 -0.270052 0.584 0.012 0.008 0.396
#> SRR1094457 4 0.5888 0.626761 0.440 0.012 0.016 0.532
#> SRR1095575 1 0.6576 0.245269 0.548 0.012 0.384 0.056
#> SRR1315931 1 0.4364 0.618463 0.816 0.000 0.092 0.092
#> SRR1430066 3 0.0376 0.703477 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR1431037 3 0.0804 0.708873 0.012 0.008 0.980 0.000
#> SRR1395554 3 0.1362 0.716961 0.020 0.012 0.964 0.004
#> SRR818002 2 0.7241 0.571352 0.024 0.568 0.100 0.308
#> SRR1344143 2 0.3737 0.621553 0.004 0.840 0.020 0.136
#> SRR1486845 4 0.5364 0.660132 0.392 0.016 0.000 0.592
#> SRR1362866 1 0.6984 0.434343 0.600 0.028 0.080 0.292
#> SRR1490740 1 0.1510 0.625221 0.956 0.000 0.016 0.028
#> SRR1446627 2 0.4225 0.736868 0.000 0.792 0.184 0.024
#> SRR1456138 2 0.4744 0.676194 0.004 0.788 0.056 0.152
#> SRR1416248 1 0.3194 0.633675 0.888 0.004 0.052 0.056
#> SRR1383907 4 0.6279 0.603212 0.188 0.072 0.036 0.704
#> SRR1311018 1 0.1284 0.625078 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1375699 2 0.9171 -0.000574 0.296 0.376 0.076 0.252
#> SRR1429846 3 0.5636 0.649046 0.196 0.008 0.724 0.072
#> SRR613550 3 0.3717 0.721630 0.132 0.008 0.844 0.016
#> SRR1348402 1 0.2871 0.630217 0.896 0.000 0.032 0.072
#> SRR1345146 1 0.8279 -0.261313 0.440 0.156 0.040 0.364
#> SRR1324025 3 0.5971 0.623037 0.212 0.008 0.696 0.084
#> SRR1318879 3 0.5481 0.678808 0.108 0.028 0.772 0.092
#> SRR820755 1 0.7065 0.453741 0.592 0.012 0.268 0.128
#> SRR1485830 4 0.5147 0.611116 0.460 0.004 0.000 0.536
#> SRR599313 1 0.6306 0.416478 0.660 0.040 0.036 0.264
#> SRR612263 1 0.3541 0.613350 0.876 0.024 0.024 0.076
#> SRR1415398 3 0.2473 0.729193 0.080 0.000 0.908 0.012
#> SRR1326205 1 0.5345 -0.357573 0.560 0.012 0.000 0.428
#> SRR1421327 4 0.5849 0.594118 0.220 0.072 0.008 0.700
#> SRR1083311 3 0.0657 0.712357 0.012 0.004 0.984 0.000
#> SRR1499303 4 0.6006 0.666918 0.328 0.036 0.012 0.624
#> SRR1079522 1 0.5298 0.530657 0.768 0.068 0.016 0.148
#> SRR1452935 3 0.8141 0.466941 0.220 0.064 0.556 0.160
#> SRR1379495 1 0.2385 0.631694 0.920 0.000 0.028 0.052
#> SRR1470459 2 0.5150 0.604937 0.000 0.596 0.396 0.008
#> SRR661361 3 0.3429 0.727065 0.100 0.004 0.868 0.028
#> SRR615778 1 0.7586 0.356972 0.540 0.040 0.096 0.324
#> SRR1447564 1 0.1305 0.614277 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1455195 1 0.6988 0.418207 0.592 0.036 0.064 0.308
#> SRR655182 1 0.2675 0.614467 0.908 0.000 0.048 0.044
#> SRR1335140 4 0.5628 0.557789 0.132 0.144 0.000 0.724
#> SRR1433555 3 0.0992 0.712315 0.012 0.008 0.976 0.004
#> SRR1308650 3 0.8562 -0.230128 0.116 0.360 0.440 0.084
#> SRR1388354 1 0.1174 0.619101 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR1317446 3 0.0336 0.698732 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1413602 3 0.2207 0.725326 0.040 0.004 0.932 0.024
#> SRR1479955 2 0.3707 0.647922 0.004 0.852 0.032 0.112
#> SRR809853 1 0.2725 0.618246 0.912 0.016 0.016 0.056
#> SRR661313 3 0.3390 0.721408 0.132 0.000 0.852 0.016
#> SRR1499935 4 0.6006 0.666918 0.328 0.036 0.012 0.624
#> SRR1447303 3 0.5280 0.667412 0.168 0.004 0.752 0.076
#> SRR1429408 3 0.9140 0.023091 0.120 0.160 0.436 0.284
#> SRR1433950 1 0.1356 0.621153 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR1362081 2 0.4877 0.684628 0.000 0.664 0.328 0.008
#> SRR1409854 1 0.7361 0.396974 0.536 0.016 0.328 0.120
#> SRR1435229 1 0.9294 0.114387 0.336 0.084 0.324 0.256
#> SRR1085996 1 0.1488 0.620714 0.956 0.000 0.012 0.032
#> SRR1414229 4 0.9327 -0.124841 0.324 0.096 0.224 0.356
#> SRR1400974 3 0.0188 0.700487 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1399971 1 0.1284 0.625078 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR613927 3 0.3878 0.714772 0.156 0.004 0.824 0.016
#> SRR1457854 1 0.1174 0.619101 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR1473714 1 0.6306 0.416478 0.660 0.040 0.036 0.264
#> SRR813776 1 0.7065 0.453741 0.592 0.012 0.268 0.128
#> SRR808196 1 0.5648 -0.360047 0.552 0.008 0.012 0.428
#> SRR1101085 4 0.5090 0.666402 0.324 0.016 0.000 0.660
#> SRR614395 1 0.4724 0.610085 0.792 0.000 0.096 0.112
#> SRR1478251 4 0.5137 0.621312 0.452 0.004 0.000 0.544
#> SRR1370551 2 0.5337 0.571229 0.000 0.564 0.424 0.012
#> SRR1362310 1 0.2335 0.628657 0.920 0.000 0.020 0.060
#> SRR665310 3 0.3380 0.722508 0.136 0.004 0.852 0.008
#> SRR1420109 3 0.4908 0.666574 0.216 0.004 0.748 0.032
#> SRR1330920 1 0.6116 0.555669 0.700 0.008 0.164 0.128
#> SRR1419539 3 0.1854 0.703081 0.020 0.024 0.948 0.008
#> SRR1359447 2 0.5724 0.463909 0.000 0.548 0.424 0.028
#> SRR1347259 1 0.6417 -0.458924 0.476 0.040 0.012 0.472
#> SRR613915 3 0.4186 0.707074 0.164 0.004 0.808 0.024
#> SRR1384395 3 0.1118 0.681891 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR821715 3 0.2741 0.728780 0.096 0.000 0.892 0.012
#> SRR1478228 1 0.3104 0.633739 0.892 0.004 0.044 0.060
#> SRR1445637 1 0.3842 0.596699 0.836 0.000 0.128 0.036
#> SRR608150 1 0.7417 0.314937 0.524 0.048 0.064 0.364
#> SRR1096383 3 0.5999 0.301644 0.404 0.000 0.552 0.044
#> SRR1341480 4 0.5188 0.645753 0.240 0.044 0.000 0.716
#> SRR1341344 1 0.4996 0.528900 0.748 0.020 0.016 0.216
#> SRR1326270 3 0.2329 0.729867 0.072 0.000 0.916 0.012
#> SRR1498838 3 0.0859 0.706003 0.008 0.008 0.980 0.004
#> SRR1416313 3 0.2708 0.729812 0.076 0.004 0.904 0.016
#> SRR808566 4 0.6939 0.580004 0.184 0.092 0.056 0.668
#> SRR1430270 4 0.5244 0.627320 0.436 0.008 0.000 0.556
#> SRR1367825 3 0.0188 0.700487 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR613533 3 0.9322 0.189151 0.180 0.248 0.432 0.140
#> SRR661267 3 0.5999 0.308517 0.404 0.000 0.552 0.044
#> SRR810665 2 0.5666 0.731928 0.016 0.696 0.252 0.036
#> SRR1407250 1 0.8254 0.308877 0.456 0.036 0.168 0.340
#> SRR1420067 1 0.7103 0.498359 0.620 0.020 0.216 0.144
#> SRR1473632 1 0.2725 0.618246 0.912 0.016 0.016 0.056
#> SRR812536 3 0.2695 0.726094 0.056 0.024 0.912 0.008
#> SRR1370850 2 0.7144 0.722104 0.024 0.620 0.220 0.136
#> SRR1486195 2 0.5055 0.643518 0.000 0.624 0.368 0.008
#> SRR1407671 4 0.9690 0.084309 0.180 0.196 0.252 0.372
#> SRR1446375 1 0.8203 0.123722 0.468 0.112 0.360 0.060
#> SRR1465230 4 0.5137 0.620055 0.452 0.004 0.000 0.544
#> SRR614119 3 0.5905 0.333852 0.396 0.000 0.564 0.040
#> SRR1356101 3 0.3945 0.443653 0.000 0.216 0.780 0.004
#> SRR1404209 1 0.5485 0.478069 0.680 0.004 0.280 0.036
#> SRR1392676 2 0.3598 0.728494 0.000 0.848 0.124 0.028
#> SRR665538 3 0.6016 0.280524 0.412 0.000 0.544 0.044
#> SRR660510 3 0.1059 0.713256 0.016 0.012 0.972 0.000
#> SRR1445655 4 0.5339 0.659666 0.384 0.016 0.000 0.600
#> SRR658953 1 0.8872 0.119547 0.404 0.188 0.068 0.340
#> SRR2166459 1 0.3205 0.615830 0.872 0.000 0.104 0.024
#> SRR1070713 4 0.8891 -0.046248 0.136 0.320 0.104 0.440
#> SRR1485312 3 0.0376 0.703477 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR1317631 3 0.7189 0.383427 0.320 0.024 0.564 0.092
#> SRR1488610 1 0.3317 0.610209 0.868 0.008 0.012 0.112
#> SRR1330588 3 0.7019 0.452521 0.292 0.020 0.592 0.096
#> SRR1316367 1 0.5997 0.455148 0.660 0.032 0.024 0.284
#> SRR1433926 1 0.1406 0.626128 0.960 0.000 0.016 0.024
#> SRR1091302 1 0.5914 -0.512216 0.504 0.012 0.016 0.468
#> SRR818263 1 0.7203 0.421899 0.560 0.012 0.304 0.124
#> SRR1404909 4 0.5250 0.624642 0.176 0.080 0.000 0.744
#> SRR663076 1 0.3652 0.589214 0.856 0.000 0.092 0.052
#> SRR1323577 2 0.7625 0.454706 0.040 0.500 0.088 0.372
#> SRR1442422 4 0.5137 0.620055 0.452 0.004 0.000 0.544
#> SRR1465893 1 0.2089 0.624437 0.932 0.000 0.020 0.048
#> SRR654862 1 0.5873 0.570544 0.712 0.008 0.092 0.188
#> SRR1407112 4 0.5888 0.626761 0.440 0.012 0.016 0.532
#> SRR1332969 3 0.2799 0.729307 0.108 0.000 0.884 0.008
#> SRR1353199 3 0.3335 0.722624 0.128 0.000 0.856 0.016
#> SRR1378885 3 0.6073 0.610235 0.232 0.008 0.680 0.080
#> SRR665357 3 0.4810 0.594500 0.032 0.168 0.784 0.016
#> SRR662186 2 0.5548 0.544261 0.000 0.588 0.388 0.024
#> SRR1501020 3 0.3881 0.702901 0.172 0.000 0.812 0.016
#> SRR1347819 3 0.0712 0.708527 0.008 0.004 0.984 0.004
#> SRR1480813 2 0.6750 0.686845 0.016 0.652 0.136 0.196
#> SRR1472576 4 0.6812 0.565281 0.164 0.120 0.040 0.676
#> SRR1431781 4 0.6177 0.651807 0.388 0.020 0.024 0.568
#> SRR1452270 3 0.1191 0.718309 0.024 0.004 0.968 0.004
#> SRR1500472 3 0.8763 0.085954 0.368 0.080 0.408 0.144
#> SRR1417632 4 0.5533 0.564738 0.132 0.136 0.000 0.732
#> SRR1350153 2 0.4769 0.700088 0.000 0.684 0.308 0.008
#> SRR1458113 4 0.9386 -0.118267 0.320 0.100 0.232 0.348
#> SRR1326579 1 0.6736 0.437812 0.620 0.032 0.060 0.288
#> SRR1349363 2 0.8558 0.063915 0.256 0.432 0.036 0.276
#> SRR1096712 3 0.1262 0.714700 0.016 0.008 0.968 0.008
#> SRR1090407 3 0.2727 0.729182 0.084 0.004 0.900 0.012
#> SRR1083752 2 0.8593 0.437942 0.048 0.404 0.184 0.364
#> SRR1377599 4 0.4801 0.625894 0.188 0.048 0.000 0.764
#> SRR1488449 3 0.3088 0.725345 0.128 0.000 0.864 0.008
#> SRR1318354 3 0.8688 0.293606 0.136 0.252 0.504 0.108
#> SRR1359062 3 0.0524 0.708451 0.008 0.004 0.988 0.000
#> SRR1398924 1 0.8475 0.110212 0.420 0.188 0.040 0.352
#> SRR663783 3 0.0524 0.701397 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1319204 3 0.6964 -0.179281 0.028 0.424 0.496 0.052
#> SRR1369070 2 0.4312 0.682240 0.000 0.812 0.056 0.132
#> SRR615659 1 0.1406 0.626128 0.960 0.000 0.016 0.024
#> SRR1337449 2 0.6281 0.663601 0.016 0.596 0.348 0.040
#> SRR1316982 3 0.3355 0.551169 0.000 0.160 0.836 0.004
#> SRR1498595 4 0.5533 0.563601 0.132 0.136 0.000 0.732
#> SRR1377423 3 0.3806 0.707245 0.156 0.000 0.824 0.020
#> SRR1312310 2 0.4697 0.707925 0.000 0.696 0.296 0.008
#> SRR1485613 1 0.4680 0.589277 0.788 0.004 0.160 0.048
#> SRR1338426 3 0.4536 0.712817 0.096 0.032 0.828 0.044
#> SRR1353309 3 0.4233 0.719376 0.088 0.032 0.844 0.036
#> SRR658941 3 0.6079 0.359211 0.380 0.000 0.568 0.052
#> SRR1101643 1 0.2186 0.607513 0.932 0.008 0.012 0.048
#> SRR1401468 3 0.5933 0.306314 0.408 0.000 0.552 0.040
#> SRR1368874 2 0.4697 0.707523 0.000 0.696 0.296 0.008
#> SRR1324085 4 0.7790 0.440967 0.128 0.112 0.140 0.620
#> SRR1363858 1 0.6306 0.416478 0.660 0.040 0.036 0.264
#> SRR819820 3 0.5084 0.670722 0.180 0.012 0.764 0.044
#> SRR1337342 1 0.7215 0.490873 0.608 0.020 0.220 0.152
#> SRR655206 3 0.2089 0.701530 0.020 0.028 0.940 0.012
#> SRR1387013 2 0.7380 0.374283 0.056 0.520 0.052 0.372
#> SRR1317410 1 0.3081 0.637588 0.888 0.000 0.048 0.064
#> SRR608198 1 0.6736 0.438844 0.620 0.032 0.060 0.288
#> SRR1440161 2 0.4814 0.694082 0.000 0.676 0.316 0.008
#> SRR1343741 2 0.4312 0.682240 0.000 0.812 0.056 0.132
#> SRR1381288 2 0.4225 0.736868 0.000 0.792 0.184 0.024
#> SRR1415379 1 0.5229 -0.353495 0.564 0.008 0.000 0.428
#> SRR1099622 2 0.7108 0.553309 0.024 0.496 0.412 0.068
#> SRR663197 3 0.3931 0.724797 0.088 0.036 0.856 0.020
#> SRR1394836 3 0.2188 0.698911 0.020 0.032 0.936 0.012
#> SRR661699 3 0.2796 0.725316 0.092 0.000 0.892 0.016
#> SRR813680 3 0.5999 0.307634 0.404 0.000 0.552 0.044
#> SRR1410678 1 0.2335 0.628657 0.920 0.000 0.020 0.060
#> SRR1378109 4 0.5888 0.626761 0.440 0.012 0.016 0.532
#> SRR1499174 1 0.3030 0.635394 0.892 0.004 0.076 0.028
#> SRR1311486 2 0.6281 0.663601 0.016 0.596 0.348 0.040
#> SRR1382851 4 0.7696 0.326838 0.136 0.252 0.040 0.572
#> SRR1433410 1 0.7341 0.276804 0.508 0.044 0.060 0.388
#> SRR661167 3 0.1256 0.719116 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1432518 3 0.8141 0.466941 0.220 0.064 0.556 0.160
#> SRR660462 3 0.0336 0.698732 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1374608 3 0.8065 0.421081 0.248 0.068 0.556 0.128
#> SRR657949 3 0.4232 0.704638 0.168 0.004 0.804 0.024
#> SRR1308882 4 0.5172 0.651830 0.404 0.008 0.000 0.588
#> SRR655768 1 0.6576 0.254862 0.548 0.012 0.384 0.056
#> SRR1485870 1 0.8279 -0.261313 0.440 0.156 0.040 0.364
#> SRR1444138 1 0.6906 0.292774 0.552 0.028 0.364 0.056
#> SRR1417342 1 0.6222 0.263478 0.684 0.052 0.032 0.232
#> SRR1470193 1 0.6319 -0.356713 0.544 0.024 0.024 0.408
#> SRR1091380 3 0.5084 0.670722 0.180 0.012 0.764 0.044
#> SRR1099096 1 0.2060 0.622282 0.932 0.000 0.016 0.052
#> SRR1313583 1 0.4872 -0.140124 0.640 0.004 0.000 0.356
#> SRR1467102 3 0.2216 0.629174 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1485416 4 0.5188 0.645753 0.240 0.044 0.000 0.716
#> SRR818821 3 0.9322 0.189151 0.180 0.248 0.432 0.140
#> SRR809963 1 0.4724 0.610085 0.792 0.000 0.096 0.112
#> SRR1072247 1 0.2385 0.631694 0.920 0.000 0.028 0.052
#> SRR1353710 1 0.5938 -0.379024 0.544 0.024 0.008 0.424
#> SRR1445259 3 0.9331 0.195878 0.184 0.244 0.432 0.140
#> SRR1408393 1 0.5586 0.056075 0.528 0.000 0.452 0.020
#> SRR1361522 1 0.1510 0.626265 0.956 0.000 0.016 0.028
#> SRR1368597 1 0.3037 0.629374 0.888 0.000 0.076 0.036
#> SRR1309680 2 0.6628 0.669490 0.020 0.660 0.104 0.216
#> SRR1310542 3 0.0188 0.701380 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1333485 4 0.5167 0.667388 0.340 0.016 0.000 0.644
#> SRR1406437 3 0.7942 0.418601 0.128 0.084 0.592 0.196
#> SRR1354931 3 0.2287 0.728621 0.060 0.004 0.924 0.012
#> SRR1391856 3 0.4359 0.508454 0.008 0.176 0.796 0.020
#> SRR1446738 4 0.9366 -0.089538 0.128 0.276 0.188 0.408
#> SRR1309032 2 0.5138 0.608958 0.000 0.600 0.392 0.008
#> SRR1388145 2 0.6967 0.655443 0.020 0.560 0.344 0.076
#> SRR1432611 2 0.4897 0.679988 0.000 0.660 0.332 0.008
#> SRR815869 3 0.0336 0.698732 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR613150 3 0.0524 0.704937 0.004 0.008 0.988 0.000
#> SRR1375329 3 0.9167 -0.100046 0.344 0.076 0.344 0.236
#> SRR1387921 1 0.1042 0.616124 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR1466792 2 0.4877 0.683901 0.000 0.664 0.328 0.008
#> SRR1360478 2 0.4769 0.700088 0.000 0.684 0.308 0.008
#> SRR1360695 1 0.5397 0.493987 0.716 0.000 0.220 0.064
#> SRR812943 1 0.3328 0.614097 0.884 0.020 0.020 0.076
#> SRR1400910 2 0.9764 0.210159 0.260 0.352 0.184 0.204
#> SRR1444203 4 0.5667 0.628073 0.440 0.012 0.008 0.540
#> SRR816177 2 0.7641 0.441989 0.040 0.492 0.088 0.380
#> SRR658754 3 0.1124 0.712361 0.012 0.012 0.972 0.004
#> SRR1429603 1 0.6417 -0.458924 0.476 0.040 0.012 0.472
#> SRR1397366 3 0.3508 0.720985 0.136 0.004 0.848 0.012
#> SRR1446028 1 0.3025 0.635031 0.896 0.004 0.044 0.056
#> SRR1083918 2 0.8449 0.362139 0.076 0.432 0.112 0.380
#> SRR1337606 4 0.7511 -0.095518 0.440 0.068 0.044 0.448
#> SRR659109 3 0.0927 0.714514 0.016 0.008 0.976 0.000
#> SRR1337192 1 0.4996 0.528900 0.748 0.020 0.016 0.216
#> SRR656946 1 0.6371 0.277109 0.564 0.008 0.376 0.052
#> SRR1476102 1 0.2342 0.613678 0.912 0.000 0.008 0.080
#> SRR1476447 1 0.4996 0.528900 0.748 0.020 0.016 0.216
#> SRR1342067 4 0.5090 0.666402 0.324 0.016 0.000 0.660
#> SRR1385389 4 0.5297 0.629412 0.444 0.004 0.004 0.548
#> SRR1075971 1 0.4908 0.563352 0.748 0.004 0.032 0.216
#> SRR614419 1 0.5733 0.471561 0.680 0.028 0.020 0.272
#> SRR1322936 1 0.7552 0.298633 0.516 0.060 0.060 0.364
#> SRR1349121 3 0.6240 0.127460 0.452 0.004 0.500 0.044
#> SRR1430549 1 0.2124 0.620753 0.924 0.000 0.008 0.068
#> SRR612935 3 0.8629 0.306934 0.132 0.248 0.512 0.108
#> SRR661481 2 0.6750 0.686845 0.016 0.652 0.136 0.196
#> SRR1354117 2 0.5517 0.497428 0.000 0.568 0.412 0.020
#> SRR1393596 4 0.6975 0.572826 0.316 0.100 0.012 0.572
#> SRR1452164 1 0.3222 0.639031 0.884 0.004 0.076 0.036
#> SRR1070503 1 0.7339 0.356093 0.524 0.012 0.340 0.124
#> SRR1499894 3 0.1059 0.712394 0.016 0.012 0.972 0.000
#> SRR1082883 1 0.7524 0.326926 0.520 0.048 0.072 0.360
#> SRR1468271 1 0.4680 0.589277 0.788 0.004 0.160 0.048
#> SRR1332443 1 0.2125 0.612509 0.920 0.000 0.004 0.076
#> SRR810295 2 0.4584 0.704170 0.000 0.696 0.300 0.004
#> SRR662103 1 0.1510 0.626265 0.956 0.000 0.016 0.028
#> SRR1328620 3 0.8688 0.293606 0.136 0.252 0.504 0.108
#> SRR1396294 3 0.7189 0.383427 0.320 0.024 0.564 0.092
#> SRR1419917 1 0.1510 0.626265 0.956 0.000 0.016 0.028
#> SRR662114 3 0.4832 0.708449 0.104 0.036 0.812 0.048
#> SRR1489199 1 0.7349 0.158983 0.472 0.012 0.404 0.112
#> SRR813584 3 0.9140 0.023091 0.120 0.160 0.436 0.284
#> SRR1069638 1 0.7913 0.440083 0.560 0.040 0.192 0.208
#> SRR614864 3 0.2731 0.730383 0.060 0.004 0.908 0.028
#> SRR1433392 1 0.6109 0.556222 0.700 0.008 0.168 0.124
#> SRR1377777 2 0.3889 0.662178 0.004 0.844 0.040 0.112
#> SRR2167710 1 0.6371 0.277109 0.564 0.008 0.376 0.052
#> SRR1401252 4 0.5355 0.665503 0.360 0.020 0.000 0.620
#> SRR1309963 4 0.5673 0.625027 0.444 0.008 0.012 0.536
#> SRR1338031 1 0.1042 0.622273 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR1418628 2 0.5450 0.714180 0.012 0.676 0.292 0.020
#> SRR1486889 1 0.5485 0.478069 0.680 0.004 0.280 0.036
#> SRR1380393 1 0.1174 0.619101 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR1319731 1 0.3104 0.633392 0.892 0.004 0.044 0.060
#> SRR1356468 1 0.7218 -0.301336 0.516 0.024 0.080 0.380
#> SRR1337010 2 0.5291 0.687791 0.000 0.652 0.324 0.024
#> SRR1486520 1 0.5461 0.573698 0.736 0.008 0.064 0.192
#> SRR1486538 4 0.5050 0.647033 0.408 0.004 0.000 0.588
#> SRR1340486 4 0.5888 0.626761 0.440 0.012 0.016 0.532
#> SRR1377696 4 0.5581 0.560877 0.132 0.140 0.000 0.728
#> SRR1465459 1 0.7221 0.417310 0.556 0.012 0.308 0.124
#> SRR1080270 3 0.0188 0.701380 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1312501 3 0.5893 0.665532 0.132 0.032 0.744 0.092
#> SRR1093148 3 0.9143 0.115779 0.264 0.076 0.392 0.268
#> SRR1467080 3 0.0188 0.701380 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1410866 2 0.7551 0.693907 0.024 0.580 0.196 0.200
#> SRR816475 4 0.7790 0.440967 0.128 0.112 0.140 0.620
#> SRR1379198 4 0.5137 0.621312 0.452 0.004 0.000 0.544
#> SRR613342 3 0.4414 0.717072 0.120 0.036 0.824 0.020
#> SRR1452246 2 0.5019 0.607092 0.004 0.728 0.028 0.240
#> SRR1338836 2 0.4574 0.736604 0.000 0.756 0.220 0.024
#> SRR1369129 4 0.5132 0.626840 0.448 0.004 0.000 0.548
#> SRR1396616 3 0.3380 0.722508 0.136 0.004 0.852 0.008
#> SRR813824 3 0.1443 0.719022 0.028 0.004 0.960 0.008
#> SRR1082376 1 0.6193 0.548753 0.676 0.004 0.112 0.208
#> SRR1500891 4 0.5099 0.658993 0.380 0.008 0.000 0.612
#> SRR807543 1 0.6199 0.549522 0.692 0.008 0.172 0.128
#> SRR1091572 1 0.7880 0.453754 0.584 0.064 0.136 0.216
#> SRR1346689 1 0.6014 -0.533750 0.484 0.020 0.012 0.484
#> SRR1332424 1 0.7341 0.276804 0.508 0.044 0.060 0.388
#> SRR663729 4 0.5161 0.623392 0.300 0.024 0.000 0.676
#> SRR1097013 1 0.3205 0.615830 0.872 0.000 0.104 0.024
#> SRR613675 1 0.7552 0.298633 0.516 0.060 0.060 0.364
#> SRR1485357 4 0.5980 0.626460 0.436 0.012 0.020 0.532
#> SRR655816 3 0.2234 0.719828 0.064 0.004 0.924 0.008
#> SRR1500113 1 0.3818 0.610452 0.852 0.004 0.096 0.048
#> SRR1437622 4 0.6812 0.565281 0.164 0.120 0.040 0.676
#> SRR1355172 3 0.5999 0.300479 0.404 0.000 0.552 0.044
#> SRR655531 1 0.5925 0.526285 0.688 0.016 0.052 0.244
#> SRR1338147 3 0.5219 0.678398 0.156 0.008 0.764 0.072
#> SRR1413329 1 0.7353 0.147549 0.468 0.012 0.408 0.112
#> SRR1485931 2 0.3737 0.621553 0.004 0.840 0.020 0.136
#> SRR1420873 1 0.3504 0.632555 0.872 0.004 0.068 0.056
#> SRR1333308 4 0.5648 0.531919 0.444 0.016 0.004 0.536
#> SRR1452033 1 0.6040 0.440081 0.620 0.004 0.324 0.052
#> SRR1467316 2 0.3707 0.649332 0.004 0.852 0.032 0.112
#> SRR809018 3 0.0188 0.700487 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1375351 2 0.4697 0.707925 0.000 0.696 0.296 0.008
#> SRR663440 3 0.6853 0.438055 0.312 0.012 0.584 0.092
#> SRR1471755 2 0.6739 0.682710 0.016 0.652 0.132 0.200
#> SRR808019 3 0.6079 0.359211 0.380 0.000 0.568 0.052
#> SRR1479133 3 0.2238 0.730313 0.072 0.004 0.920 0.004
#> SRR615069 3 0.8799 0.385430 0.180 0.112 0.508 0.200
#> SRR1456185 2 0.9409 0.417717 0.172 0.404 0.280 0.144
#> SRR1350069 3 0.7189 0.383427 0.320 0.024 0.564 0.092
#> SRR816316 1 0.4364 0.618463 0.816 0.000 0.092 0.092
#> SRR664795 3 0.5999 0.307634 0.404 0.000 0.552 0.044
#> SRR1490721 4 0.6244 0.581375 0.224 0.080 0.016 0.680
#> SRR810643 1 0.3025 0.633614 0.896 0.004 0.044 0.056
#> SRR1430333 1 0.9173 0.211336 0.360 0.072 0.296 0.272
#> SRR1085285 3 0.2238 0.730313 0.072 0.004 0.920 0.004
#> SRR1099072 3 0.3380 0.722508 0.136 0.004 0.852 0.008
#> SRR1317985 1 0.1411 0.629380 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1487340 1 0.2489 0.625964 0.912 0.000 0.020 0.068
#> SRR1420276 3 0.1118 0.681891 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1351347 3 0.5346 0.694190 0.124 0.036 0.780 0.060
#> SRR1405525 1 0.3317 0.610209 0.868 0.008 0.012 0.112
#> SRR1370329 1 0.1151 0.622170 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR1465001 1 0.3104 0.633392 0.892 0.004 0.044 0.060
#> SRR1476525 2 0.5247 0.742137 0.000 0.720 0.228 0.052
#> SRR819610 2 0.9428 0.421358 0.172 0.404 0.276 0.148
#> SRR2157314 1 0.3113 0.633797 0.892 0.004 0.052 0.052
#> SRR1409465 2 0.4574 0.736604 0.000 0.756 0.220 0.024
#> SRR809987 1 0.5272 -0.229297 0.608 0.008 0.004 0.380
#> SRR613639 3 0.3829 0.716795 0.152 0.004 0.828 0.016
#> SRR1402285 4 0.5433 0.620615 0.448 0.004 0.008 0.540
#> SRR1077038 1 0.5277 0.589896 0.752 0.000 0.116 0.132
#> SRR1405660 3 0.1191 0.718309 0.024 0.004 0.968 0.004
#> SRR1095455 3 0.9378 0.179049 0.192 0.244 0.424 0.140
#> SRR1394734 2 0.8449 0.362139 0.076 0.432 0.112 0.380
#> SRR1317771 1 0.5292 0.503141 0.708 0.004 0.252 0.036
#> SRR1365894 4 0.8067 0.481043 0.316 0.184 0.024 0.476
#> SRR1073581 3 0.6240 0.127460 0.452 0.004 0.500 0.044
#> SRR659804 1 0.3113 0.633797 0.892 0.004 0.052 0.052
#> SRR1345914 2 0.6088 0.732019 0.020 0.676 0.252 0.052
#> SRR1432186 2 0.6594 0.730570 0.012 0.664 0.172 0.152
#> SRR1473529 4 0.5533 0.563601 0.132 0.136 0.000 0.732
#> SRR660764 3 0.7415 0.391418 0.068 0.240 0.612 0.080
#> SRR820448 1 0.4426 0.617019 0.812 0.000 0.092 0.096
#> SRR1328845 3 0.7189 0.383427 0.320 0.024 0.564 0.092
#> SRR1336415 4 0.5433 0.623745 0.448 0.004 0.008 0.540
#> SRR1379065 4 0.5099 0.658993 0.380 0.008 0.000 0.612
#> SRR1459190 1 0.5586 0.056075 0.528 0.000 0.452 0.020
#> SRR1346773 1 0.3113 0.634060 0.892 0.004 0.052 0.052
#> SRR1499521 3 0.6101 0.337789 0.388 0.000 0.560 0.052
#> SRR1440898 2 0.5261 0.742341 0.012 0.736 0.216 0.036
#> SRR1347459 3 0.3174 0.728770 0.076 0.028 0.888 0.008
#> SRR1081209 2 0.4041 0.718624 0.004 0.840 0.100 0.056
#> SRR1400202 1 0.1151 0.620193 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR1333395 1 0.8468 -0.138613 0.456 0.252 0.036 0.256
#> SRR1309248 4 0.8029 0.462627 0.296 0.188 0.024 0.492
#> SRR809161 3 0.2989 0.729912 0.100 0.004 0.884 0.012
#> SRR1316320 4 0.7493 0.178487 0.396 0.108 0.020 0.476
#> SRR1432629 2 0.6908 0.415250 0.032 0.536 0.048 0.384
#> SRR1498931 1 0.1388 0.624379 0.960 0.000 0.012 0.028
#> SRR1416578 1 0.5229 -0.353495 0.564 0.008 0.000 0.428
#> SRR1405547 3 0.0188 0.700487 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1470534 4 0.5132 0.626840 0.448 0.004 0.000 0.548
#> SRR1380764 1 0.3504 0.631330 0.872 0.004 0.068 0.056
#> SRR1309160 3 0.1675 0.724281 0.044 0.004 0.948 0.004
#> SRR663489 3 0.0188 0.700487 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1500450 1 0.5121 0.509967 0.772 0.004 0.128 0.096
#> SRR1078489 1 0.9396 0.213391 0.368 0.100 0.268 0.264
#> SRR1332648 4 0.5137 0.620055 0.452 0.004 0.000 0.544
#> SRR660614 3 0.6964 -0.179281 0.028 0.424 0.496 0.052
#> SRR1470420 2 0.5150 0.604937 0.000 0.596 0.396 0.008
#> SRR1475566 1 0.1151 0.620193 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR1477949 1 0.2124 0.614849 0.924 0.000 0.008 0.068
#> SRR1481419 2 0.6484 0.740839 0.012 0.668 0.200 0.120
#> SRR1464766 1 0.3917 0.623244 0.844 0.004 0.044 0.108
#> SRR615946 3 0.2708 0.729812 0.076 0.004 0.904 0.016
#> SRR1446481 2 0.6614 0.694236 0.016 0.604 0.312 0.068
#> SRR1467656 2 0.4838 0.731368 0.000 0.724 0.252 0.024
#> SRR1402962 1 0.7378 0.431312 0.568 0.032 0.100 0.300
#> SRR660224 2 0.4669 0.739808 0.000 0.764 0.200 0.036
#> SRR665586 1 0.1042 0.618621 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR1347166 1 0.7586 0.356972 0.540 0.040 0.096 0.324
#> SRR1485722 1 0.8254 0.308877 0.456 0.036 0.168 0.340
#> SRR1415316 1 0.1305 0.614277 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR613390 1 0.4720 0.573236 0.768 0.004 0.032 0.196
#> SRR661108 3 0.0967 0.712944 0.016 0.004 0.976 0.004
#> SRR2170173 1 0.6576 0.245269 0.548 0.012 0.384 0.056
#> SRR817329 1 0.2816 0.627687 0.900 0.000 0.064 0.036
#> SRR1401990 1 0.8212 -0.029570 0.472 0.024 0.256 0.248
#> SRR1467745 4 0.7835 0.438559 0.132 0.112 0.140 0.616
#> SRR1471795 2 0.7321 0.581647 0.024 0.564 0.108 0.304
#> SRR1415637 2 0.3598 0.728494 0.000 0.848 0.124 0.028
#> SRR813137 1 0.2483 0.635975 0.916 0.000 0.052 0.032
#> SRR1314873 1 0.1151 0.619883 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR1401211 1 0.5397 0.493987 0.716 0.000 0.220 0.064
#> SRR1419692 4 0.5783 0.629182 0.440 0.012 0.012 0.536
#> SRR818797 3 0.5977 0.623460 0.220 0.008 0.692 0.080
#> SRR2164608 3 0.3958 0.710377 0.144 0.000 0.824 0.032
#> SRR1455586 3 0.3539 0.509922 0.000 0.176 0.820 0.004
#> SRR819459 3 0.0524 0.704937 0.004 0.008 0.988 0.000
#> SRR1488939 2 0.3707 0.649332 0.004 0.852 0.032 0.112
#> SRR1433232 2 0.4356 0.669861 0.000 0.804 0.048 0.148
#> SRR1385501 1 0.5591 0.577800 0.732 0.004 0.096 0.168
#> SRR1361652 1 0.8872 0.119547 0.404 0.188 0.068 0.340
#> SRR1437119 1 0.1284 0.625078 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1478547 3 0.0188 0.700487 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1430910 1 0.9294 0.114387 0.336 0.084 0.324 0.256
#> SRR1310584 1 0.3001 0.633695 0.896 0.004 0.036 0.064
#> SRR1500216 1 0.6306 0.416478 0.660 0.040 0.036 0.264
#> SRR1486762 3 0.4364 0.693406 0.180 0.004 0.792 0.024
#> SRR1480854 4 0.4801 0.625894 0.188 0.048 0.000 0.764
#> SRR1489394 4 0.5143 0.614395 0.456 0.004 0.000 0.540
#> SRR1418085 4 0.5137 0.620055 0.452 0.004 0.000 0.544
#> SRR1340221 4 0.5244 0.627320 0.436 0.008 0.000 0.556
#> SRR1473058 4 0.7790 0.440967 0.128 0.112 0.140 0.620
#> SRR1405165 3 0.4175 0.705035 0.084 0.016 0.844 0.056
#> SRR1433004 1 0.4426 0.568590 0.780 0.004 0.020 0.196
#> SRR1471477 1 0.5565 0.469506 0.684 0.000 0.260 0.056
#> SRR1098567 2 0.6463 0.573940 0.016 0.532 0.412 0.040
#> SRR1098712 3 0.7189 0.383427 0.320 0.024 0.564 0.092
#> SRR1455038 1 0.4579 0.551659 0.764 0.004 0.020 0.212
#> SRR1375248 3 0.3583 0.503777 0.000 0.180 0.816 0.004
#> SRR1403005 3 0.2988 0.726464 0.112 0.000 0.876 0.012
#> SRR1348378 2 0.8593 0.437942 0.048 0.404 0.184 0.364
#> SRR1413541 1 0.1256 0.618839 0.964 0.000 0.008 0.028
#> SRR1392943 4 0.5522 0.599030 0.324 0.016 0.012 0.648
#> SRR1475192 3 0.0672 0.706802 0.008 0.008 0.984 0.000
#> SRR1432085 3 0.6272 -0.219607 0.016 0.396 0.556 0.032
#> SRR1452468 1 0.9216 0.211133 0.384 0.084 0.240 0.292
#> SRR1347060 3 0.0804 0.709561 0.008 0.012 0.980 0.000
#> SRR1414139 3 0.5974 0.103142 0.016 0.316 0.636 0.032
#> SRR1447962 2 0.5372 0.530462 0.000 0.544 0.444 0.012
#> SRR1444324 3 0.5353 -0.213147 0.000 0.432 0.556 0.012
#> SRR1415004 1 0.1042 0.615167 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR1413436 1 0.5378 0.495992 0.696 0.004 0.264 0.036
#> SRR1311266 1 0.7822 0.322271 0.492 0.024 0.340 0.144
#> SRR1343302 4 0.5888 0.626761 0.440 0.012 0.016 0.532
#> SRR1373746 1 0.2300 0.627960 0.920 0.000 0.016 0.064
#> SRR1429678 1 0.2809 0.632375 0.904 0.004 0.028 0.064
#> SRR1469413 2 0.6503 0.519435 0.016 0.504 0.440 0.040
#> SRR1405331 1 0.6158 0.553158 0.696 0.008 0.168 0.128
#> SRR1345609 1 0.1109 0.618040 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1380208 4 0.8005 0.436040 0.208 0.136 0.076 0.580
#> SRR1322840 4 0.5112 0.658326 0.384 0.008 0.000 0.608
#> SRR1399797 3 0.3931 0.724797 0.088 0.036 0.856 0.020
#> SRR1416654 3 0.2383 0.728212 0.048 0.004 0.924 0.024
#> SRR1315081 3 0.0707 0.692653 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1369196 3 0.0469 0.697958 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1400847 1 0.3917 0.623244 0.844 0.004 0.044 0.108
#> SRR1365291 3 0.7235 0.334964 0.344 0.020 0.540 0.096
#> SRR1367920 4 0.4801 0.625894 0.188 0.048 0.000 0.764
#> SRR1366648 3 0.0188 0.700487 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1441679 2 0.4737 0.728761 0.000 0.728 0.252 0.020
#> SRR1082173 3 0.3958 0.710377 0.144 0.000 0.824 0.032
#> SRR1363968 1 0.5179 0.510781 0.728 0.000 0.220 0.052
#> SRR814387 1 0.3104 0.633392 0.892 0.004 0.044 0.060
#> SRR657599 3 0.6135 0.355931 0.376 0.000 0.568 0.056
#> SRR1386689 4 0.5888 0.626761 0.440 0.012 0.016 0.532
#> SRR1395575 3 0.2197 0.730903 0.080 0.000 0.916 0.004
#> SRR1453811 3 0.5242 0.671788 0.184 0.004 0.748 0.064
#> SRR1441159 1 0.4479 0.592088 0.804 0.016 0.024 0.156
#> SRR1403154 4 0.5888 0.626761 0.440 0.012 0.016 0.532
#> SRR1468722 3 0.0376 0.703477 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR1310275 3 0.7272 0.300303 0.356 0.020 0.528 0.096
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 3 0.6320 0.326104 0.356 0.000 0.536 0.056 0.052
#> SRR1331708 5 0.7915 0.330204 0.236 0.048 0.012 0.336 0.368
#> SRR1464258 1 0.4663 0.561152 0.780 0.000 0.068 0.040 0.112
#> SRR1454201 1 0.7340 -0.243782 0.464 0.020 0.072 0.072 0.372
#> SRR661589 3 0.3031 0.732160 0.120 0.000 0.856 0.004 0.020
#> SRR1456229 1 0.4651 0.440661 0.728 0.000 0.004 0.060 0.208
#> SRR1315165 4 0.4862 0.708556 0.180 0.012 0.016 0.748 0.044
#> SRR1488960 1 0.2863 0.617235 0.876 0.000 0.000 0.064 0.060
#> SRR1417809 4 0.5583 0.552513 0.336 0.004 0.000 0.584 0.076
#> SRR1094457 4 0.3996 0.709692 0.208 0.004 0.008 0.768 0.012
#> SRR1095575 1 0.6794 0.158928 0.512 0.012 0.348 0.028 0.100
#> SRR1315931 1 0.4539 0.569368 0.788 0.000 0.068 0.036 0.108
#> SRR1430066 3 0.0566 0.724321 0.004 0.012 0.984 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0854 0.726406 0.008 0.012 0.976 0.000 0.004
#> SRR1395554 3 0.1716 0.736261 0.024 0.016 0.944 0.000 0.016
#> SRR818002 2 0.6844 0.538786 0.004 0.584 0.052 0.212 0.148
#> SRR1344143 2 0.4301 0.531830 0.000 0.712 0.000 0.028 0.260
#> SRR1486845 4 0.4125 0.713684 0.172 0.008 0.000 0.780 0.040
#> SRR1362866 1 0.7048 -0.241160 0.476 0.012 0.036 0.108 0.368
#> SRR1490740 1 0.2227 0.631658 0.916 0.000 0.004 0.032 0.048
#> SRR1446627 2 0.2813 0.699675 0.000 0.868 0.108 0.000 0.024
#> SRR1456138 2 0.4326 0.616578 0.000 0.784 0.008 0.084 0.124
#> SRR1416248 1 0.3007 0.634342 0.884 0.000 0.028 0.044 0.044
#> SRR1383907 4 0.5783 0.510598 0.028 0.056 0.028 0.696 0.192
#> SRR1311018 1 0.1216 0.635367 0.960 0.000 0.000 0.020 0.020
#> SRR1375699 2 0.9144 0.065576 0.196 0.332 0.048 0.152 0.272
#> SRR1429846 3 0.5175 0.629256 0.172 0.004 0.724 0.016 0.084
#> SRR613550 3 0.3498 0.725619 0.124 0.004 0.836 0.004 0.032
#> SRR1348402 1 0.2625 0.636647 0.900 0.000 0.012 0.040 0.048
#> SRR1345146 4 0.8431 0.192782 0.244 0.084 0.020 0.364 0.288
#> SRR1324025 3 0.5482 0.589839 0.184 0.004 0.696 0.016 0.100
#> SRR1318879 3 0.5339 0.672394 0.088 0.020 0.748 0.028 0.116
#> SRR820755 1 0.6889 0.188760 0.544 0.004 0.256 0.032 0.164
#> SRR1485830 4 0.3659 0.706434 0.220 0.000 0.000 0.768 0.012
#> SRR599313 1 0.6609 0.056059 0.544 0.004 0.012 0.176 0.264
#> SRR612263 1 0.4390 0.555760 0.792 0.016 0.008 0.048 0.136
#> SRR1415398 3 0.2208 0.742303 0.072 0.000 0.908 0.000 0.020
#> SRR1326205 4 0.5304 0.589293 0.292 0.000 0.000 0.628 0.080
#> SRR1421327 4 0.5561 0.465076 0.036 0.040 0.004 0.660 0.260
#> SRR1083311 3 0.0854 0.731162 0.008 0.004 0.976 0.000 0.012
#> SRR1499303 4 0.4622 0.681089 0.112 0.024 0.008 0.788 0.068
#> SRR1079522 1 0.6437 0.298223 0.632 0.036 0.008 0.144 0.180
#> SRR1452935 3 0.7596 0.305269 0.192 0.056 0.540 0.028 0.184
#> SRR1379495 1 0.1978 0.641755 0.932 0.000 0.012 0.032 0.024
#> SRR1470459 2 0.4625 0.631366 0.000 0.652 0.324 0.004 0.020
#> SRR661361 3 0.3131 0.737934 0.084 0.004 0.868 0.004 0.040
#> SRR615778 1 0.7698 -0.427913 0.416 0.028 0.056 0.112 0.388
#> SRR1447564 1 0.2450 0.625285 0.900 0.000 0.000 0.048 0.052
#> SRR1455195 1 0.6834 -0.234404 0.480 0.020 0.028 0.080 0.392
#> SRR655182 1 0.3724 0.611058 0.844 0.000 0.036 0.068 0.052
#> SRR1335140 4 0.5685 0.456637 0.012 0.084 0.000 0.620 0.284
#> SRR1433555 3 0.1200 0.732560 0.012 0.008 0.964 0.000 0.016
#> SRR1308650 2 0.8267 0.315433 0.116 0.388 0.368 0.044 0.084
#> SRR1388354 1 0.2172 0.630403 0.916 0.000 0.004 0.060 0.020
#> SRR1317446 3 0.0771 0.718256 0.000 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR1413602 3 0.2443 0.742366 0.036 0.008 0.912 0.004 0.040
#> SRR1479955 2 0.3381 0.580118 0.000 0.808 0.000 0.016 0.176
#> SRR809853 1 0.3523 0.600545 0.844 0.012 0.000 0.048 0.096
#> SRR661313 3 0.3209 0.728001 0.120 0.000 0.848 0.004 0.028
#> SRR1499935 4 0.4622 0.681089 0.112 0.024 0.008 0.788 0.068
#> SRR1447303 3 0.4793 0.657616 0.148 0.004 0.756 0.012 0.080
#> SRR1429408 3 0.8961 -0.059419 0.052 0.160 0.388 0.256 0.144
#> SRR1433950 1 0.2153 0.631361 0.916 0.000 0.000 0.040 0.044
#> SRR1362081 2 0.4321 0.698970 0.000 0.720 0.252 0.004 0.024
#> SRR1409854 1 0.7648 0.110517 0.464 0.008 0.296 0.064 0.168
#> SRR1435229 5 0.8935 0.395005 0.256 0.064 0.300 0.072 0.308
#> SRR1085996 1 0.2376 0.628362 0.904 0.000 0.000 0.044 0.052
#> SRR1414229 5 0.8804 0.540372 0.220 0.084 0.176 0.084 0.436
#> SRR1400974 3 0.0566 0.720657 0.000 0.012 0.984 0.000 0.004
#> SRR1399971 1 0.1216 0.635367 0.960 0.000 0.000 0.020 0.020
#> SRR613927 3 0.3834 0.715170 0.140 0.000 0.812 0.012 0.036
#> SRR1457854 1 0.2172 0.630403 0.916 0.000 0.004 0.060 0.020
#> SRR1473714 1 0.6609 0.056059 0.544 0.004 0.012 0.176 0.264
#> SRR813776 1 0.6889 0.188760 0.544 0.004 0.256 0.032 0.164
#> SRR808196 4 0.5622 0.587456 0.292 0.000 0.012 0.620 0.076
#> SRR1101085 4 0.3911 0.680931 0.104 0.008 0.000 0.816 0.072
#> SRR614395 1 0.4908 0.541994 0.760 0.000 0.072 0.040 0.128
#> SRR1478251 4 0.3398 0.709249 0.216 0.000 0.000 0.780 0.004
#> SRR1370551 2 0.4682 0.593740 0.000 0.620 0.356 0.000 0.024
#> SRR1362310 1 0.1996 0.638350 0.928 0.000 0.004 0.036 0.032
#> SRR665310 3 0.3246 0.730273 0.120 0.000 0.848 0.008 0.024
#> SRR1420109 3 0.4873 0.649823 0.204 0.012 0.728 0.004 0.052
#> SRR1330920 1 0.6177 0.398041 0.648 0.000 0.144 0.044 0.164
#> SRR1419539 3 0.2429 0.718933 0.020 0.032 0.916 0.004 0.028
#> SRR1359447 2 0.5530 0.457937 0.000 0.556 0.368 0.000 0.076
#> SRR1347259 4 0.6245 0.608566 0.224 0.020 0.008 0.624 0.124
#> SRR613915 3 0.3804 0.697765 0.160 0.000 0.796 0.000 0.044
#> SRR1384395 3 0.1597 0.702644 0.000 0.048 0.940 0.000 0.012
#> SRR821715 3 0.2561 0.740837 0.096 0.000 0.884 0.000 0.020
#> SRR1478228 1 0.2901 0.635578 0.888 0.000 0.020 0.048 0.044
#> SRR1445637 1 0.4580 0.579298 0.784 0.000 0.108 0.076 0.032
#> SRR608150 5 0.7346 0.463359 0.384 0.028 0.024 0.128 0.436
#> SRR1096383 3 0.6422 0.308826 0.352 0.000 0.532 0.056 0.060
#> SRR1341480 4 0.4550 0.591183 0.044 0.024 0.000 0.764 0.168
#> SRR1341344 1 0.5777 0.266240 0.632 0.008 0.004 0.100 0.256
#> SRR1326270 3 0.2172 0.743071 0.060 0.000 0.916 0.004 0.020
#> SRR1498838 3 0.1087 0.725816 0.008 0.016 0.968 0.000 0.008
#> SRR1416313 3 0.2673 0.743906 0.072 0.008 0.892 0.000 0.028
#> SRR808566 4 0.6375 0.469299 0.028 0.084 0.032 0.648 0.208
#> SRR1430270 4 0.3734 0.712141 0.168 0.000 0.000 0.796 0.036
#> SRR1367825 3 0.0566 0.720657 0.000 0.012 0.984 0.000 0.004
#> SRR613533 3 0.8263 0.032266 0.148 0.228 0.384 0.000 0.240
#> SRR661267 3 0.6411 0.328331 0.348 0.000 0.536 0.056 0.060
#> SRR810665 2 0.4532 0.715062 0.004 0.756 0.192 0.024 0.024
#> SRR1407250 5 0.8212 0.434554 0.352 0.024 0.132 0.100 0.392
#> SRR1420067 1 0.7351 0.263296 0.544 0.008 0.180 0.068 0.200
#> SRR1473632 1 0.3523 0.600545 0.844 0.012 0.000 0.048 0.096
#> SRR812536 3 0.2765 0.741424 0.044 0.024 0.896 0.000 0.036
#> SRR1370850 2 0.6410 0.683211 0.004 0.652 0.160 0.104 0.080
#> SRR1486195 2 0.4492 0.664561 0.000 0.680 0.296 0.004 0.020
#> SRR1407671 4 0.9220 -0.010239 0.060 0.164 0.212 0.364 0.200
#> SRR1446375 1 0.7963 -0.021247 0.440 0.092 0.332 0.024 0.112
#> SRR1465230 4 0.3487 0.710194 0.212 0.000 0.000 0.780 0.008
#> SRR614119 3 0.6333 0.351518 0.340 0.000 0.548 0.056 0.056
#> SRR1356101 3 0.3999 0.463744 0.000 0.240 0.740 0.000 0.020
#> SRR1404209 1 0.6146 0.388854 0.624 0.004 0.260 0.060 0.052
#> SRR1392676 2 0.2227 0.668872 0.000 0.916 0.048 0.004 0.032
#> SRR665538 3 0.6441 0.286644 0.360 0.000 0.524 0.056 0.060
#> SRR660510 3 0.1314 0.731031 0.012 0.012 0.960 0.000 0.016
#> SRR1445655 4 0.3799 0.702335 0.144 0.012 0.000 0.812 0.032
#> SRR658953 5 0.7714 0.498494 0.316 0.132 0.032 0.048 0.472
#> SRR2166459 1 0.4063 0.606450 0.820 0.000 0.096 0.044 0.040
#> SRR1070713 2 0.8529 0.096958 0.036 0.308 0.060 0.296 0.300
#> SRR1485312 3 0.0566 0.724321 0.004 0.012 0.984 0.000 0.000
#> SRR1317631 3 0.7828 0.353641 0.200 0.024 0.528 0.152 0.096
#> SRR1488610 1 0.4025 0.564953 0.796 0.004 0.000 0.060 0.140
#> SRR1330588 3 0.6524 0.402593 0.244 0.008 0.592 0.024 0.132
#> SRR1316367 1 0.5980 0.053250 0.556 0.004 0.008 0.084 0.348
#> SRR1433926 1 0.1493 0.632873 0.948 0.000 0.000 0.024 0.028
#> SRR1091302 4 0.5263 0.658787 0.252 0.012 0.008 0.680 0.048
#> SRR818263 1 0.7018 0.126322 0.508 0.004 0.284 0.028 0.176
#> SRR1404909 4 0.4948 0.574709 0.028 0.048 0.000 0.728 0.196
#> SRR663076 1 0.4967 0.554192 0.764 0.000 0.080 0.100 0.056
#> SRR1323577 2 0.7391 0.448297 0.008 0.500 0.048 0.268 0.176
#> SRR1442422 4 0.3487 0.710194 0.212 0.000 0.000 0.780 0.008
#> SRR1465893 1 0.2214 0.640520 0.916 0.000 0.004 0.052 0.028
#> SRR654862 1 0.5623 0.367115 0.656 0.000 0.056 0.036 0.252
#> SRR1407112 4 0.3996 0.709692 0.208 0.004 0.008 0.768 0.012
#> SRR1332969 3 0.2623 0.741400 0.096 0.000 0.884 0.004 0.016
#> SRR1353199 3 0.3160 0.729552 0.116 0.000 0.852 0.004 0.028
#> SRR1378885 3 0.5590 0.569717 0.204 0.004 0.680 0.016 0.096
#> SRR665357 3 0.4863 0.604854 0.028 0.164 0.748 0.000 0.060
#> SRR662186 2 0.5420 0.533071 0.000 0.592 0.332 0.000 0.076
#> SRR1501020 3 0.3887 0.701900 0.168 0.004 0.796 0.004 0.028
#> SRR1347819 3 0.0740 0.726972 0.004 0.008 0.980 0.000 0.008
#> SRR1480813 2 0.6094 0.644708 0.004 0.684 0.084 0.136 0.092
#> SRR1472576 4 0.6504 0.446313 0.024 0.116 0.028 0.636 0.196
#> SRR1431781 4 0.4862 0.708556 0.180 0.012 0.016 0.748 0.044
#> SRR1452270 3 0.1059 0.734928 0.020 0.004 0.968 0.000 0.008
#> SRR1500472 3 0.8641 -0.164966 0.312 0.080 0.356 0.040 0.212
#> SRR1417632 4 0.5615 0.464219 0.012 0.080 0.000 0.628 0.280
#> SRR1350153 2 0.4125 0.704785 0.000 0.740 0.236 0.004 0.020
#> SRR1458113 5 0.8940 0.538232 0.216 0.100 0.176 0.084 0.424
#> SRR1326579 1 0.6732 -0.211766 0.492 0.012 0.020 0.104 0.372
#> SRR1349363 5 0.8256 -0.138159 0.148 0.336 0.004 0.156 0.356
#> SRR1096712 3 0.1518 0.734956 0.016 0.012 0.952 0.000 0.020
#> SRR1090407 3 0.2429 0.742111 0.076 0.004 0.900 0.000 0.020
#> SRR1083752 2 0.8099 0.399778 0.004 0.408 0.152 0.304 0.132
#> SRR1377599 4 0.4314 0.551296 0.016 0.028 0.000 0.760 0.196
#> SRR1488449 3 0.3056 0.735402 0.112 0.000 0.860 0.008 0.020
#> SRR1318354 3 0.8017 0.234577 0.112 0.232 0.448 0.004 0.204
#> SRR1359062 3 0.1087 0.726682 0.008 0.016 0.968 0.000 0.008
#> SRR1398924 5 0.7670 0.512323 0.308 0.140 0.016 0.064 0.472
#> SRR663783 3 0.0798 0.722118 0.000 0.016 0.976 0.000 0.008
#> SRR1319204 3 0.6550 -0.206847 0.028 0.436 0.436 0.000 0.100
#> SRR1369070 2 0.3866 0.627548 0.000 0.820 0.008 0.076 0.096
#> SRR615659 1 0.1493 0.632873 0.948 0.000 0.000 0.024 0.028
#> SRR1337449 2 0.5600 0.681319 0.004 0.644 0.280 0.036 0.036
#> SRR1316982 3 0.3565 0.569253 0.000 0.176 0.800 0.000 0.024
#> SRR1498595 4 0.5595 0.467923 0.012 0.080 0.000 0.632 0.276
#> SRR1377423 3 0.4050 0.708698 0.156 0.008 0.796 0.004 0.036
#> SRR1312310 2 0.3944 0.708192 0.000 0.756 0.224 0.004 0.016
#> SRR1485613 1 0.4890 0.557912 0.760 0.000 0.136 0.056 0.048
#> SRR1338426 3 0.4276 0.725732 0.072 0.028 0.820 0.012 0.068
#> SRR1353309 3 0.3953 0.731477 0.068 0.028 0.840 0.012 0.052
#> SRR658941 3 0.6446 0.377464 0.324 0.000 0.552 0.056 0.068
#> SRR1101643 1 0.2974 0.604163 0.868 0.000 0.000 0.052 0.080
#> SRR1401468 3 0.6320 0.326104 0.356 0.000 0.536 0.056 0.052
#> SRR1368874 2 0.4007 0.708563 0.000 0.756 0.220 0.004 0.020
#> SRR1324085 4 0.7578 0.351048 0.020 0.108 0.108 0.548 0.216
#> SRR1363858 1 0.6609 0.056059 0.544 0.004 0.012 0.176 0.264
#> SRR819820 3 0.5128 0.656609 0.156 0.008 0.740 0.020 0.076
#> SRR1337342 1 0.7427 0.243451 0.532 0.008 0.184 0.068 0.208
#> SRR655206 3 0.2627 0.714930 0.020 0.040 0.908 0.008 0.024
#> SRR1387013 2 0.7160 0.372465 0.016 0.508 0.016 0.228 0.232
#> SRR1317410 1 0.2839 0.637531 0.892 0.000 0.024 0.036 0.048
#> SRR608198 1 0.6624 -0.210139 0.492 0.012 0.016 0.100 0.380
#> SRR1440161 2 0.4181 0.701686 0.000 0.732 0.244 0.004 0.020
#> SRR1343741 2 0.3866 0.627548 0.000 0.820 0.008 0.076 0.096
#> SRR1381288 2 0.2813 0.699675 0.000 0.868 0.108 0.000 0.024
#> SRR1415379 4 0.5308 0.586503 0.304 0.000 0.000 0.620 0.076
#> SRR1099622 2 0.6568 0.576137 0.004 0.528 0.352 0.060 0.056
#> SRR663197 3 0.3832 0.735960 0.068 0.024 0.840 0.004 0.064
#> SRR1394836 3 0.2715 0.713348 0.020 0.040 0.904 0.008 0.028
#> SRR661699 3 0.2954 0.738173 0.080 0.004 0.880 0.008 0.028
#> SRR813680 3 0.6366 0.326995 0.352 0.000 0.536 0.056 0.056
#> SRR1410678 1 0.1911 0.637866 0.932 0.000 0.004 0.036 0.028
#> SRR1378109 4 0.3996 0.709692 0.208 0.004 0.008 0.768 0.012
#> SRR1499174 1 0.3463 0.632249 0.864 0.004 0.056 0.032 0.044
#> SRR1311486 2 0.5600 0.681319 0.004 0.644 0.280 0.036 0.036
#> SRR1382851 4 0.7635 0.180422 0.024 0.208 0.024 0.440 0.304
#> SRR1433410 5 0.7334 0.477256 0.372 0.024 0.020 0.148 0.436
#> SRR661167 3 0.1211 0.736681 0.024 0.000 0.960 0.000 0.016
#> SRR1432518 3 0.7596 0.305269 0.192 0.056 0.540 0.028 0.184
#> SRR660462 3 0.0771 0.718256 0.000 0.020 0.976 0.000 0.004
#> SRR1374608 3 0.8188 0.322323 0.160 0.076 0.516 0.184 0.064
#> SRR657949 3 0.3844 0.693977 0.164 0.000 0.792 0.000 0.044
#> SRR1308882 4 0.3495 0.711585 0.152 0.000 0.000 0.816 0.032
#> SRR655768 1 0.6879 0.187585 0.496 0.004 0.360 0.056 0.084
#> SRR1485870 4 0.8426 0.196029 0.240 0.084 0.020 0.364 0.292
#> SRR1444138 1 0.7098 0.179337 0.500 0.012 0.340 0.048 0.100
#> SRR1417342 1 0.6721 0.140256 0.532 0.012 0.004 0.208 0.244
#> SRR1470193 4 0.6054 0.575516 0.292 0.004 0.020 0.600 0.084
#> SRR1091380 3 0.5128 0.656609 0.156 0.008 0.740 0.020 0.076
#> SRR1099096 1 0.2067 0.638843 0.920 0.000 0.000 0.048 0.032
#> SRR1313583 4 0.5229 0.464474 0.404 0.000 0.000 0.548 0.048
#> SRR1467102 3 0.2616 0.652395 0.000 0.100 0.880 0.000 0.020
#> SRR1485416 4 0.4550 0.591183 0.044 0.024 0.000 0.764 0.168
#> SRR818821 3 0.8263 0.032266 0.148 0.228 0.384 0.000 0.240
#> SRR809963 1 0.4908 0.541994 0.760 0.000 0.072 0.040 0.128
#> SRR1072247 1 0.1978 0.641755 0.932 0.000 0.012 0.032 0.024
#> SRR1353710 4 0.5739 0.601258 0.296 0.008 0.004 0.612 0.080
#> SRR1445259 3 0.8273 0.026988 0.152 0.224 0.384 0.000 0.240
#> SRR1408393 1 0.5825 0.049025 0.488 0.000 0.444 0.024 0.044
#> SRR1361522 1 0.1579 0.633646 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1368597 1 0.3931 0.620386 0.832 0.000 0.072 0.056 0.040
#> SRR1309680 2 0.5816 0.622411 0.004 0.696 0.044 0.144 0.112
#> SRR1310542 3 0.0798 0.720647 0.000 0.016 0.976 0.000 0.008
#> SRR1333485 4 0.3936 0.694182 0.116 0.008 0.000 0.812 0.064
#> SRR1406437 3 0.8057 0.356112 0.064 0.096 0.540 0.180 0.120
#> SRR1354931 3 0.2022 0.742612 0.048 0.004 0.928 0.004 0.016
#> SRR1391856 3 0.4378 0.527069 0.000 0.188 0.760 0.012 0.040
#> SRR1446738 5 0.9086 -0.117866 0.044 0.272 0.124 0.264 0.296
#> SRR1309032 2 0.4607 0.634967 0.000 0.656 0.320 0.004 0.020
#> SRR1388145 2 0.6278 0.672684 0.004 0.604 0.276 0.068 0.048
#> SRR1432611 2 0.4194 0.695720 0.000 0.720 0.260 0.004 0.016
#> SRR815869 3 0.0671 0.719164 0.000 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR613150 3 0.0693 0.722668 0.000 0.012 0.980 0.000 0.008
#> SRR1375329 3 0.8635 -0.396954 0.288 0.052 0.312 0.052 0.296
#> SRR1387921 1 0.2012 0.628373 0.920 0.000 0.000 0.060 0.020
#> SRR1466792 2 0.4321 0.698635 0.000 0.720 0.252 0.004 0.024
#> SRR1360478 2 0.4125 0.704785 0.000 0.740 0.236 0.004 0.020
#> SRR1360695 1 0.6447 0.411400 0.628 0.000 0.196 0.100 0.076
#> SRR812943 1 0.4179 0.565144 0.804 0.016 0.004 0.048 0.128
#> SRR1400910 2 0.8577 -0.253888 0.200 0.328 0.140 0.012 0.320
#> SRR1444203 4 0.4189 0.713406 0.208 0.004 0.008 0.760 0.020
#> SRR816177 2 0.7421 0.439087 0.008 0.492 0.048 0.276 0.176
#> SRR658754 3 0.1200 0.730458 0.008 0.012 0.964 0.000 0.016
#> SRR1429603 4 0.6245 0.608566 0.224 0.020 0.008 0.624 0.124
#> SRR1397366 3 0.3257 0.726592 0.124 0.000 0.844 0.004 0.028
#> SRR1446028 1 0.3066 0.639716 0.880 0.000 0.024 0.048 0.048
#> SRR1083918 2 0.7706 0.402845 0.004 0.448 0.072 0.296 0.180
#> SRR1337606 5 0.8074 0.518159 0.312 0.052 0.024 0.208 0.404
#> SRR659109 3 0.1200 0.732195 0.012 0.008 0.964 0.000 0.016
#> SRR1337192 1 0.5777 0.266240 0.632 0.008 0.004 0.100 0.256
#> SRR656946 1 0.6646 0.182416 0.520 0.004 0.344 0.032 0.100
#> SRR1476102 1 0.3116 0.610040 0.860 0.000 0.000 0.064 0.076
#> SRR1476447 1 0.5777 0.266240 0.632 0.008 0.004 0.100 0.256
#> SRR1342067 4 0.3911 0.680931 0.104 0.008 0.000 0.816 0.072
#> SRR1385389 4 0.3455 0.711858 0.208 0.000 0.000 0.784 0.008
#> SRR1075971 1 0.4962 0.424009 0.704 0.000 0.012 0.056 0.228
#> SRR614419 1 0.5832 0.131413 0.580 0.004 0.008 0.076 0.332
#> SRR1322936 5 0.7469 0.482107 0.376 0.036 0.024 0.128 0.436
#> SRR1349121 3 0.6409 0.163355 0.404 0.000 0.488 0.056 0.052
#> SRR1430549 1 0.2228 0.630207 0.912 0.000 0.000 0.040 0.048
#> SRR612935 3 0.7820 0.267819 0.112 0.224 0.464 0.000 0.200
#> SRR661481 2 0.6094 0.644708 0.004 0.684 0.084 0.136 0.092
#> SRR1354117 2 0.5353 0.483710 0.000 0.576 0.360 0.000 0.064
#> SRR1393596 4 0.6586 0.531109 0.124 0.044 0.008 0.616 0.208
#> SRR1452164 1 0.3605 0.637051 0.852 0.000 0.060 0.044 0.044
#> SRR1070503 1 0.7101 0.054057 0.476 0.004 0.320 0.028 0.172
#> SRR1499894 3 0.1314 0.730358 0.012 0.012 0.960 0.000 0.016
#> SRR1082883 5 0.7318 0.451463 0.388 0.028 0.024 0.124 0.436
#> SRR1468271 1 0.4890 0.557912 0.760 0.000 0.136 0.056 0.048
#> SRR1332443 1 0.3056 0.613317 0.864 0.000 0.000 0.068 0.068
#> SRR810295 2 0.3797 0.707000 0.000 0.756 0.232 0.004 0.008
#> SRR662103 1 0.1579 0.633646 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1328620 3 0.8017 0.234577 0.112 0.232 0.448 0.004 0.204
#> SRR1396294 3 0.7828 0.353641 0.200 0.024 0.528 0.152 0.096
#> SRR1419917 1 0.1579 0.633646 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR662114 3 0.4682 0.715794 0.080 0.024 0.796 0.020 0.080
#> SRR1489199 1 0.7403 0.030423 0.412 0.004 0.384 0.052 0.148
#> SRR813584 3 0.8961 -0.059419 0.052 0.160 0.388 0.256 0.144
#> SRR1069638 1 0.7720 0.006659 0.500 0.028 0.172 0.048 0.252
#> SRR614864 3 0.2308 0.744451 0.048 0.000 0.912 0.004 0.036
#> SRR1433392 1 0.6180 0.401967 0.648 0.000 0.148 0.044 0.160
#> SRR1377777 2 0.3477 0.598994 0.000 0.824 0.000 0.040 0.136
#> SRR2167710 1 0.6646 0.182416 0.520 0.004 0.344 0.032 0.100
#> SRR1401252 4 0.3951 0.695278 0.128 0.016 0.000 0.812 0.044
#> SRR1309963 4 0.3920 0.709305 0.212 0.004 0.008 0.768 0.008
#> SRR1338031 1 0.1750 0.633056 0.936 0.000 0.000 0.036 0.028
#> SRR1418628 2 0.4601 0.713324 0.000 0.732 0.220 0.024 0.024
#> SRR1486889 1 0.6146 0.388854 0.624 0.004 0.260 0.060 0.052
#> SRR1380393 1 0.2172 0.630403 0.916 0.000 0.004 0.060 0.020
#> SRR1319731 1 0.2975 0.634906 0.884 0.000 0.020 0.048 0.048
#> SRR1356468 4 0.6994 0.493946 0.296 0.004 0.072 0.536 0.092
#> SRR1337010 2 0.4689 0.693329 0.000 0.688 0.264 0.000 0.048
#> SRR1486520 1 0.5265 0.412071 0.676 0.000 0.024 0.048 0.252
#> SRR1486538 4 0.3495 0.706910 0.160 0.000 0.000 0.812 0.028
#> SRR1340486 4 0.3996 0.709692 0.208 0.004 0.008 0.768 0.012
#> SRR1377696 4 0.5635 0.460318 0.012 0.080 0.000 0.624 0.284
#> SRR1465459 1 0.7032 0.118078 0.504 0.004 0.288 0.028 0.176
#> SRR1080270 3 0.0798 0.720647 0.000 0.016 0.976 0.000 0.008
#> SRR1312501 3 0.5530 0.654525 0.116 0.024 0.736 0.028 0.096
#> SRR1093148 3 0.8651 -0.317001 0.176 0.064 0.348 0.064 0.348
#> SRR1467080 3 0.0671 0.720951 0.000 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR1410866 2 0.6927 0.647476 0.000 0.592 0.160 0.152 0.096
#> SRR816475 4 0.7578 0.351048 0.020 0.108 0.108 0.548 0.216
#> SRR1379198 4 0.3398 0.709249 0.216 0.000 0.000 0.780 0.004
#> SRR613342 3 0.4247 0.723270 0.100 0.036 0.808 0.000 0.056
#> SRR1452246 2 0.4909 0.567976 0.000 0.716 0.000 0.120 0.164
#> SRR1338836 2 0.3454 0.712532 0.000 0.816 0.156 0.000 0.028
#> SRR1369129 4 0.3366 0.710965 0.212 0.000 0.000 0.784 0.004
#> SRR1396616 3 0.3246 0.730273 0.120 0.000 0.848 0.008 0.024
#> SRR813824 3 0.1460 0.734376 0.020 0.008 0.956 0.004 0.012
#> SRR1082376 1 0.6203 0.339519 0.632 0.000 0.092 0.052 0.224
#> SRR1500891 4 0.3523 0.700990 0.140 0.004 0.000 0.824 0.032
#> SRR807543 1 0.6250 0.386797 0.640 0.000 0.152 0.044 0.164
#> SRR1091572 1 0.7600 0.051863 0.540 0.048 0.112 0.052 0.248
#> SRR1346689 4 0.5120 0.664643 0.248 0.004 0.012 0.688 0.048
#> SRR1332424 5 0.7334 0.477256 0.372 0.024 0.020 0.148 0.436
#> SRR663729 4 0.5361 0.572281 0.104 0.008 0.000 0.680 0.208
#> SRR1097013 1 0.4063 0.606450 0.820 0.000 0.096 0.044 0.040
#> SRR613675 5 0.7469 0.482107 0.376 0.036 0.024 0.128 0.436
#> SRR1485357 4 0.4071 0.709560 0.204 0.004 0.012 0.768 0.012
#> SRR655816 3 0.2200 0.735185 0.056 0.008 0.920 0.008 0.008
#> SRR1500113 1 0.4763 0.588006 0.780 0.000 0.076 0.084 0.060
#> SRR1437622 4 0.6504 0.446313 0.024 0.116 0.028 0.636 0.196
#> SRR1355172 3 0.6422 0.308969 0.352 0.000 0.532 0.056 0.060
#> SRR655531 1 0.5714 0.221237 0.604 0.004 0.012 0.064 0.316
#> SRR1338147 3 0.4768 0.671222 0.136 0.004 0.764 0.016 0.080
#> SRR1413329 1 0.7403 0.027612 0.412 0.004 0.384 0.052 0.148
#> SRR1485931 2 0.4301 0.531830 0.000 0.712 0.000 0.028 0.260
#> SRR1420873 1 0.3394 0.629677 0.864 0.000 0.040 0.044 0.052
#> SRR1333308 4 0.6190 0.624821 0.236 0.008 0.000 0.584 0.172
#> SRR1452033 1 0.5883 0.328628 0.608 0.000 0.300 0.044 0.048
#> SRR1467316 2 0.3438 0.581308 0.000 0.808 0.000 0.020 0.172
#> SRR809018 3 0.0566 0.720657 0.000 0.012 0.984 0.000 0.004
#> SRR1375351 2 0.3944 0.708192 0.000 0.756 0.224 0.004 0.016
#> SRR663440 3 0.6420 0.374708 0.272 0.004 0.572 0.016 0.136
#> SRR1471755 2 0.6090 0.640681 0.004 0.684 0.080 0.136 0.096
#> SRR808019 3 0.6446 0.377464 0.324 0.000 0.552 0.056 0.068
#> SRR1479133 3 0.2141 0.743047 0.064 0.000 0.916 0.004 0.016
#> SRR615069 3 0.8193 0.215584 0.128 0.088 0.488 0.048 0.248
#> SRR1456185 2 0.8747 0.359980 0.160 0.456 0.200 0.072 0.112
#> SRR1350069 3 0.7828 0.353641 0.200 0.024 0.528 0.152 0.096
#> SRR816316 1 0.4539 0.569368 0.788 0.000 0.068 0.036 0.108
#> SRR664795 3 0.6366 0.326995 0.352 0.000 0.536 0.056 0.056
#> SRR1490721 4 0.5846 0.426632 0.036 0.052 0.004 0.632 0.276
#> SRR810643 1 0.2827 0.635543 0.892 0.000 0.020 0.044 0.044
#> SRR1430333 5 0.8925 0.424585 0.272 0.056 0.272 0.080 0.320
#> SRR1085285 3 0.2074 0.742789 0.060 0.000 0.920 0.004 0.016
#> SRR1099072 3 0.3246 0.730273 0.120 0.000 0.848 0.008 0.024
#> SRR1317985 1 0.1869 0.637404 0.936 0.000 0.008 0.028 0.028
#> SRR1487340 1 0.2237 0.638335 0.916 0.000 0.004 0.040 0.040
#> SRR1420276 3 0.1597 0.702644 0.000 0.048 0.940 0.000 0.012
#> SRR1351347 3 0.5001 0.699345 0.096 0.028 0.772 0.016 0.088
#> SRR1405525 1 0.4025 0.564953 0.796 0.004 0.000 0.060 0.140
#> SRR1370329 1 0.1310 0.634935 0.956 0.000 0.000 0.024 0.020
#> SRR1465001 1 0.2975 0.634906 0.884 0.000 0.020 0.048 0.048
#> SRR1476525 2 0.4237 0.718415 0.000 0.784 0.160 0.020 0.036
#> SRR819610 2 0.8772 0.358197 0.160 0.456 0.196 0.076 0.112
#> SRR2157314 1 0.3154 0.636813 0.876 0.000 0.028 0.048 0.048
#> SRR1409465 2 0.3454 0.712532 0.000 0.816 0.156 0.000 0.028
#> SRR809987 4 0.5474 0.531940 0.348 0.000 0.000 0.576 0.076
#> SRR613639 3 0.3790 0.717497 0.136 0.000 0.816 0.012 0.036
#> SRR1402285 4 0.3764 0.708412 0.212 0.000 0.008 0.772 0.008
#> SRR1077038 1 0.5445 0.482235 0.712 0.000 0.096 0.036 0.156
#> SRR1405660 3 0.1059 0.734928 0.020 0.004 0.968 0.000 0.008
#> SRR1095455 3 0.8434 0.004032 0.156 0.224 0.376 0.004 0.240
#> SRR1394734 2 0.7706 0.402845 0.004 0.448 0.072 0.296 0.180
#> SRR1317771 1 0.5920 0.431899 0.656 0.004 0.232 0.056 0.052
#> SRR1365894 4 0.8021 0.342369 0.136 0.112 0.016 0.468 0.268
#> SRR1073581 3 0.6409 0.163355 0.404 0.000 0.488 0.056 0.052
#> SRR659804 1 0.3154 0.636813 0.876 0.000 0.028 0.048 0.048
#> SRR1345914 2 0.5190 0.712436 0.004 0.728 0.180 0.036 0.052
#> SRR1432186 2 0.5995 0.685977 0.004 0.692 0.128 0.104 0.072
#> SRR1473529 4 0.5595 0.467923 0.012 0.080 0.000 0.632 0.276
#> SRR660764 3 0.6827 0.397727 0.060 0.220 0.576 0.000 0.144
#> SRR820448 1 0.4663 0.561152 0.780 0.000 0.068 0.040 0.112
#> SRR1328845 3 0.7828 0.353641 0.200 0.024 0.528 0.152 0.096
#> SRR1336415 4 0.3643 0.710137 0.212 0.000 0.004 0.776 0.008
#> SRR1379065 4 0.3523 0.700990 0.140 0.004 0.000 0.824 0.032
#> SRR1459190 1 0.5825 0.049025 0.488 0.000 0.444 0.024 0.044
#> SRR1346773 1 0.3154 0.634712 0.876 0.000 0.028 0.048 0.048
#> SRR1499521 3 0.6471 0.356713 0.332 0.000 0.544 0.056 0.068
#> SRR1440898 2 0.3869 0.714037 0.000 0.812 0.140 0.020 0.028
#> SRR1347459 3 0.3183 0.741375 0.060 0.020 0.872 0.000 0.048
#> SRR1081209 2 0.3310 0.649565 0.000 0.860 0.040 0.016 0.084
#> SRR1400202 1 0.1469 0.635926 0.948 0.000 0.000 0.036 0.016
#> SRR1333395 5 0.8577 -0.036376 0.284 0.168 0.004 0.228 0.316
#> SRR1309248 4 0.8067 0.274839 0.128 0.116 0.016 0.448 0.292
#> SRR809161 3 0.2740 0.740703 0.096 0.000 0.876 0.000 0.028
#> SRR1316320 5 0.7823 0.322989 0.236 0.048 0.008 0.332 0.376
#> SRR1432629 2 0.6837 0.413072 0.004 0.520 0.016 0.260 0.200
#> SRR1498931 1 0.1310 0.635960 0.956 0.000 0.000 0.024 0.020
#> SRR1416578 4 0.5308 0.586503 0.304 0.000 0.000 0.620 0.076
#> SRR1405547 3 0.0566 0.720657 0.000 0.012 0.984 0.000 0.004
#> SRR1470534 4 0.3366 0.710965 0.212 0.000 0.000 0.784 0.004
#> SRR1380764 1 0.3398 0.628189 0.864 0.000 0.044 0.044 0.048
#> SRR1309160 3 0.1469 0.739330 0.036 0.000 0.948 0.000 0.016
#> SRR663489 3 0.0566 0.720657 0.000 0.012 0.984 0.000 0.004
#> SRR1500450 1 0.6263 0.443197 0.660 0.000 0.120 0.136 0.084
#> SRR1078489 1 0.9059 -0.416935 0.308 0.080 0.240 0.072 0.300
#> SRR1332648 4 0.3487 0.710194 0.212 0.000 0.000 0.780 0.008
#> SRR660614 2 0.6550 0.191429 0.028 0.436 0.436 0.000 0.100
#> SRR1470420 2 0.4625 0.631366 0.000 0.652 0.324 0.004 0.020
#> SRR1475566 1 0.1469 0.635926 0.948 0.000 0.000 0.036 0.016
#> SRR1477949 1 0.2863 0.617235 0.876 0.000 0.000 0.064 0.060
#> SRR1481419 2 0.5667 0.703112 0.004 0.712 0.148 0.072 0.064
#> SRR1464766 1 0.3999 0.599144 0.812 0.000 0.020 0.044 0.124
#> SRR615946 3 0.2673 0.743906 0.072 0.008 0.892 0.000 0.028
#> SRR1446481 2 0.5925 0.692409 0.004 0.648 0.244 0.060 0.044
#> SRR1467656 2 0.3961 0.716845 0.000 0.780 0.184 0.004 0.032
#> SRR1402962 1 0.7340 -0.243782 0.464 0.020 0.072 0.072 0.372
#> SRR660224 2 0.3495 0.704974 0.000 0.836 0.120 0.008 0.036
#> SRR665586 1 0.2074 0.630279 0.920 0.000 0.000 0.036 0.044
#> SRR1347166 1 0.7698 -0.427913 0.416 0.028 0.056 0.112 0.388
#> SRR1485722 5 0.8212 0.434554 0.352 0.024 0.132 0.100 0.392
#> SRR1415316 1 0.2450 0.625285 0.900 0.000 0.000 0.048 0.052
#> SRR613390 1 0.4815 0.462078 0.724 0.000 0.012 0.056 0.208
#> SRR661108 3 0.0902 0.729990 0.008 0.008 0.976 0.004 0.004
#> SRR2170173 1 0.6794 0.158928 0.512 0.012 0.348 0.028 0.100
#> SRR817329 1 0.3741 0.621417 0.844 0.000 0.060 0.056 0.040
#> SRR1401990 4 0.8235 0.252238 0.252 0.016 0.232 0.416 0.084
#> SRR1467745 4 0.7601 0.344696 0.020 0.108 0.108 0.544 0.220
#> SRR1471795 2 0.6901 0.549290 0.004 0.584 0.060 0.208 0.144
#> SRR1415637 2 0.2227 0.668872 0.000 0.916 0.048 0.004 0.032
#> SRR813137 1 0.2597 0.638777 0.904 0.000 0.036 0.020 0.040
#> SRR1314873 1 0.2376 0.624758 0.904 0.000 0.000 0.044 0.052
#> SRR1401211 1 0.6447 0.411400 0.628 0.000 0.196 0.100 0.076
#> SRR1419692 4 0.3888 0.710508 0.208 0.004 0.008 0.772 0.008
#> SRR818797 3 0.5498 0.589090 0.192 0.004 0.692 0.016 0.096
#> SRR2164608 3 0.3902 0.706901 0.136 0.000 0.808 0.008 0.048
#> SRR1455586 3 0.3745 0.530066 0.000 0.196 0.780 0.000 0.024
#> SRR819459 3 0.0693 0.722668 0.000 0.012 0.980 0.000 0.008
#> SRR1488939 2 0.3438 0.581308 0.000 0.808 0.000 0.020 0.172
#> SRR1433232 2 0.4063 0.613833 0.000 0.800 0.004 0.084 0.112
#> SRR1385501 1 0.5560 0.451721 0.700 0.000 0.080 0.044 0.176
#> SRR1361652 5 0.7714 0.498494 0.316 0.132 0.032 0.048 0.472
#> SRR1437119 1 0.1216 0.635367 0.960 0.000 0.000 0.020 0.020
#> SRR1478547 3 0.0566 0.720657 0.000 0.012 0.984 0.000 0.004
#> SRR1430910 5 0.8935 0.395005 0.256 0.064 0.300 0.072 0.308
#> SRR1310584 1 0.2705 0.636189 0.900 0.004 0.012 0.036 0.048
#> SRR1500216 1 0.6609 0.056059 0.544 0.004 0.012 0.176 0.264
#> SRR1486762 3 0.4352 0.690566 0.176 0.012 0.772 0.004 0.036
#> SRR1480854 4 0.4314 0.551296 0.016 0.028 0.000 0.760 0.196
#> SRR1489394 4 0.3519 0.708450 0.216 0.000 0.000 0.776 0.008
#> SRR1418085 4 0.3487 0.710194 0.212 0.000 0.000 0.780 0.008
#> SRR1340221 4 0.3734 0.712141 0.168 0.000 0.000 0.796 0.036
#> SRR1473058 4 0.7578 0.351048 0.020 0.108 0.108 0.548 0.216
#> SRR1405165 3 0.3972 0.721144 0.072 0.020 0.836 0.012 0.060
#> SRR1433004 1 0.4682 0.465038 0.724 0.000 0.004 0.060 0.212
#> SRR1471477 1 0.6568 0.374180 0.596 0.000 0.240 0.100 0.064
#> SRR1098567 2 0.5811 0.600290 0.004 0.580 0.348 0.036 0.032
#> SRR1098712 3 0.7828 0.353641 0.200 0.024 0.528 0.152 0.096
#> SRR1455038 1 0.4863 0.414092 0.716 0.000 0.008 0.064 0.212
#> SRR1375248 3 0.3724 0.521298 0.000 0.204 0.776 0.000 0.020
#> SRR1403005 3 0.2773 0.735285 0.112 0.000 0.868 0.000 0.020
#> SRR1348378 2 0.8099 0.399778 0.004 0.408 0.152 0.304 0.132
#> SRR1413541 1 0.2304 0.628516 0.908 0.000 0.000 0.048 0.044
#> SRR1392943 4 0.5693 0.575273 0.112 0.008 0.008 0.668 0.204
#> SRR1475192 3 0.1074 0.725217 0.004 0.012 0.968 0.000 0.016
#> SRR1432085 3 0.5886 -0.208007 0.004 0.412 0.520 0.028 0.036
#> SRR1452468 5 0.8998 0.446470 0.288 0.060 0.212 0.096 0.344
#> SRR1347060 3 0.1200 0.728419 0.008 0.016 0.964 0.000 0.012
#> SRR1414139 3 0.5651 0.128535 0.004 0.324 0.608 0.028 0.036
#> SRR1447962 2 0.4779 0.540460 0.000 0.588 0.388 0.000 0.024
#> SRR1444324 3 0.5103 -0.188894 0.000 0.452 0.512 0.000 0.036
#> SRR1415004 1 0.2141 0.631019 0.916 0.000 0.004 0.064 0.016
#> SRR1413436 1 0.6116 0.408825 0.636 0.004 0.244 0.060 0.056
#> SRR1311266 1 0.7988 -0.009286 0.432 0.024 0.296 0.052 0.196
#> SRR1343302 4 0.3996 0.709692 0.208 0.004 0.008 0.768 0.012
#> SRR1373746 1 0.1836 0.635961 0.932 0.000 0.000 0.032 0.036
#> SRR1429678 1 0.2451 0.637088 0.904 0.000 0.004 0.036 0.056
#> SRR1469413 2 0.5975 0.539574 0.004 0.540 0.384 0.036 0.036
#> SRR1405331 1 0.6214 0.393629 0.644 0.000 0.148 0.044 0.164
#> SRR1345609 1 0.2446 0.624381 0.900 0.000 0.000 0.044 0.056
#> SRR1380208 4 0.8209 0.000679 0.088 0.112 0.040 0.408 0.352
#> SRR1322840 4 0.3567 0.702299 0.144 0.004 0.000 0.820 0.032
#> SRR1399797 3 0.3832 0.735960 0.068 0.024 0.840 0.004 0.064
#> SRR1416654 3 0.1990 0.743305 0.040 0.000 0.928 0.004 0.028
#> SRR1315081 3 0.0955 0.714749 0.000 0.028 0.968 0.000 0.004
#> SRR1369196 3 0.1012 0.717078 0.000 0.020 0.968 0.000 0.012
#> SRR1400847 1 0.3999 0.599144 0.812 0.000 0.020 0.044 0.124
#> SRR1365291 3 0.6864 0.278770 0.296 0.008 0.528 0.024 0.144
#> SRR1367920 4 0.4314 0.551296 0.016 0.028 0.000 0.760 0.196
#> SRR1366648 3 0.0566 0.720657 0.000 0.012 0.984 0.000 0.004
#> SRR1441679 2 0.3760 0.714942 0.000 0.784 0.188 0.000 0.028
#> SRR1082173 3 0.3902 0.706901 0.136 0.000 0.808 0.008 0.048
#> SRR1363968 1 0.6218 0.438347 0.644 0.000 0.200 0.092 0.064
#> SRR814387 1 0.2975 0.634906 0.884 0.000 0.020 0.048 0.048
#> SRR657599 3 0.6488 0.375002 0.320 0.000 0.552 0.060 0.068
#> SRR1386689 4 0.3996 0.709692 0.208 0.004 0.008 0.768 0.012
#> SRR1395575 3 0.2449 0.743603 0.080 0.004 0.900 0.004 0.012
#> SRR1453811 3 0.4836 0.658871 0.164 0.004 0.748 0.012 0.072
#> SRR1441159 1 0.4900 0.487140 0.740 0.008 0.008 0.068 0.176
#> SRR1403154 4 0.3996 0.709692 0.208 0.004 0.008 0.768 0.012
#> SRR1468722 3 0.0566 0.724321 0.004 0.012 0.984 0.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.6905 0.251994 0.308 0.008 0.516 0.024 0.144
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 3 0.6802 0.40168 0.272 0.000 0.532 0.072 0.080 0.044
#> SRR1331708 5 0.7906 0.01038 0.160 0.028 0.004 0.264 0.396 0.148
#> SRR1464258 1 0.4691 0.51710 0.724 0.000 0.064 0.012 0.184 0.016
#> SRR1454201 5 0.5699 0.45930 0.328 0.012 0.056 0.036 0.568 0.000
#> SRR661589 3 0.2981 0.73796 0.100 0.000 0.852 0.000 0.040 0.008
#> SRR1456229 1 0.4513 0.38764 0.652 0.000 0.000 0.020 0.304 0.024
#> SRR1315165 4 0.4494 0.63302 0.112 0.008 0.012 0.780 0.048 0.040
#> SRR1488960 1 0.3327 0.61328 0.832 0.000 0.000 0.036 0.112 0.020
#> SRR1417809 4 0.5563 0.38330 0.236 0.004 0.000 0.612 0.016 0.132
#> SRR1094457 4 0.3061 0.64128 0.128 0.000 0.004 0.840 0.020 0.008
#> SRR1095575 1 0.6734 0.14495 0.476 0.008 0.348 0.016 0.104 0.048
#> SRR1315931 1 0.4628 0.52730 0.732 0.000 0.064 0.012 0.176 0.016
#> SRR1430066 3 0.0508 0.74544 0.004 0.012 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.1121 0.74556 0.004 0.016 0.964 0.000 0.008 0.008
#> SRR1395554 3 0.1540 0.75389 0.012 0.012 0.948 0.000 0.016 0.012
#> SRR818002 2 0.6767 0.40542 0.000 0.580 0.028 0.136 0.116 0.140
#> SRR1344143 2 0.5059 0.15280 0.000 0.540 0.000 0.012 0.052 0.396
#> SRR1486845 4 0.3136 0.64466 0.096 0.004 0.000 0.852 0.020 0.028
#> SRR1362866 5 0.5451 0.40347 0.384 0.008 0.020 0.044 0.540 0.004
#> SRR1490740 1 0.2316 0.62919 0.900 0.000 0.004 0.004 0.064 0.028
#> SRR1446627 2 0.2553 0.60910 0.000 0.888 0.056 0.000 0.012 0.044
#> SRR1456138 2 0.4964 0.49091 0.000 0.724 0.004 0.060 0.072 0.140
#> SRR1416248 1 0.3596 0.61927 0.828 0.000 0.024 0.032 0.104 0.012
#> SRR1383907 4 0.6772 0.34794 0.016 0.060 0.012 0.568 0.188 0.156
#> SRR1311018 1 0.1313 0.63438 0.952 0.000 0.000 0.016 0.028 0.004
#> SRR1375699 6 0.8413 0.47532 0.148 0.272 0.036 0.084 0.064 0.396
#> SRR1429846 3 0.4702 0.63649 0.140 0.004 0.716 0.000 0.132 0.008
#> SRR613550 3 0.3391 0.73370 0.088 0.004 0.836 0.000 0.060 0.012
#> SRR1348402 1 0.3029 0.62846 0.852 0.000 0.004 0.032 0.104 0.008
#> SRR1345146 6 0.8173 0.55861 0.156 0.040 0.016 0.304 0.116 0.368
#> SRR1324025 3 0.4845 0.59617 0.152 0.004 0.692 0.000 0.148 0.004
#> SRR1318879 3 0.4823 0.67764 0.064 0.016 0.744 0.012 0.148 0.016
#> SRR820755 1 0.6654 0.13860 0.480 0.004 0.248 0.012 0.236 0.020
#> SRR1485830 4 0.2704 0.63740 0.140 0.000 0.000 0.844 0.000 0.016
#> SRR599313 1 0.6973 -0.04560 0.472 0.000 0.004 0.100 0.268 0.156
#> SRR612263 1 0.4256 0.52495 0.744 0.004 0.000 0.016 0.192 0.044
#> SRR1415398 3 0.2251 0.75213 0.052 0.000 0.904 0.000 0.036 0.008
#> SRR1326205 4 0.5284 0.43924 0.204 0.000 0.000 0.648 0.020 0.128
#> SRR1421327 4 0.5925 0.35209 0.008 0.020 0.000 0.556 0.292 0.124
#> SRR1083311 3 0.0767 0.75011 0.004 0.000 0.976 0.000 0.012 0.008
#> SRR1499303 4 0.4250 0.59459 0.040 0.012 0.008 0.804 0.068 0.068
#> SRR1079522 1 0.6576 0.24510 0.580 0.020 0.000 0.112 0.196 0.092
#> SRR1452935 3 0.6558 0.31847 0.120 0.052 0.536 0.008 0.276 0.008
#> SRR1379495 1 0.2543 0.63629 0.892 0.000 0.004 0.024 0.064 0.016
#> SRR1470459 2 0.4371 0.60348 0.000 0.708 0.236 0.000 0.020 0.036
#> SRR661361 3 0.2767 0.74501 0.056 0.004 0.868 0.000 0.072 0.000
#> SRR615778 5 0.6008 0.54876 0.312 0.024 0.036 0.048 0.572 0.008
#> SRR1447564 1 0.2747 0.61648 0.868 0.000 0.000 0.016 0.096 0.020
#> SRR1455195 5 0.5180 0.44468 0.360 0.012 0.008 0.040 0.576 0.004
#> SRR655182 1 0.3677 0.61038 0.840 0.000 0.036 0.032 0.052 0.040
#> SRR1335140 4 0.6173 0.29121 0.000 0.032 0.000 0.536 0.208 0.224
#> SRR1433555 3 0.1007 0.75200 0.004 0.004 0.968 0.000 0.016 0.008
#> SRR1308650 2 0.7929 0.33314 0.080 0.436 0.300 0.028 0.092 0.064
#> SRR1388354 1 0.1893 0.63285 0.928 0.000 0.004 0.036 0.024 0.008
#> SRR1317446 3 0.0909 0.73966 0.000 0.020 0.968 0.000 0.000 0.012
#> SRR1413602 3 0.2423 0.75600 0.016 0.012 0.900 0.004 0.064 0.004
#> SRR1479955 2 0.4370 0.34886 0.000 0.672 0.000 0.008 0.036 0.284
#> SRR809853 1 0.3763 0.58928 0.808 0.000 0.000 0.028 0.108 0.056
#> SRR661313 3 0.3105 0.73656 0.080 0.000 0.848 0.000 0.064 0.008
#> SRR1499935 4 0.4250 0.59459 0.040 0.012 0.008 0.804 0.068 0.068
#> SRR1447303 3 0.4184 0.66209 0.124 0.004 0.752 0.000 0.120 0.000
#> SRR1429408 3 0.8815 -0.10297 0.020 0.152 0.364 0.212 0.148 0.104
#> SRR1433950 1 0.2784 0.62327 0.868 0.000 0.000 0.020 0.092 0.020
#> SRR1362081 2 0.3888 0.63677 0.000 0.776 0.168 0.000 0.028 0.028
#> SRR1409854 1 0.7288 -0.00464 0.384 0.008 0.296 0.044 0.256 0.012
#> SRR1435229 5 0.7874 0.40829 0.176 0.056 0.288 0.032 0.416 0.032
#> SRR1085996 1 0.2747 0.62159 0.868 0.000 0.000 0.016 0.096 0.020
#> SRR1414229 5 0.6158 0.46839 0.100 0.076 0.144 0.016 0.652 0.012
#> SRR1400974 3 0.0767 0.74107 0.000 0.012 0.976 0.000 0.004 0.008
#> SRR1399971 1 0.1313 0.63438 0.952 0.000 0.000 0.016 0.028 0.004
#> SRR613927 3 0.3654 0.72443 0.104 0.000 0.812 0.004 0.072 0.008
#> SRR1457854 1 0.1893 0.63285 0.928 0.000 0.004 0.036 0.024 0.008
#> SRR1473714 1 0.6973 -0.04560 0.472 0.000 0.004 0.100 0.268 0.156
#> SRR813776 1 0.6654 0.13860 0.480 0.004 0.248 0.012 0.236 0.020
#> SRR808196 4 0.5618 0.42759 0.204 0.000 0.012 0.636 0.020 0.128
#> SRR1101085 4 0.3300 0.60137 0.032 0.004 0.000 0.852 0.052 0.060
#> SRR614395 1 0.4963 0.49722 0.704 0.000 0.068 0.012 0.192 0.024
#> SRR1478251 4 0.2473 0.64105 0.136 0.000 0.000 0.856 0.000 0.008
#> SRR1370551 2 0.4576 0.58530 0.000 0.676 0.264 0.000 0.016 0.044
#> SRR1362310 1 0.2288 0.63321 0.896 0.000 0.000 0.028 0.072 0.004
#> SRR665310 3 0.3113 0.73543 0.100 0.000 0.844 0.000 0.048 0.008
#> SRR1420109 3 0.4581 0.66417 0.164 0.000 0.732 0.000 0.076 0.028
#> SRR1330920 1 0.5903 0.32971 0.592 0.000 0.140 0.012 0.236 0.020
#> SRR1419539 3 0.3528 0.71483 0.012 0.040 0.848 0.004 0.036 0.060
#> SRR1359447 2 0.5883 0.39400 0.000 0.552 0.300 0.000 0.036 0.112
#> SRR1347259 4 0.6190 0.38968 0.136 0.008 0.008 0.612 0.048 0.188
#> SRR613915 3 0.3685 0.71103 0.120 0.000 0.796 0.000 0.080 0.004
#> SRR1384395 3 0.2103 0.71725 0.000 0.056 0.912 0.000 0.012 0.020
#> SRR821715 3 0.2644 0.74874 0.060 0.000 0.880 0.000 0.052 0.008
#> SRR1478228 1 0.3196 0.62566 0.848 0.000 0.016 0.036 0.096 0.004
#> SRR1445637 1 0.4980 0.55741 0.748 0.000 0.108 0.052 0.056 0.036
#> SRR608150 5 0.5208 0.57733 0.264 0.020 0.004 0.056 0.648 0.008
#> SRR1096383 3 0.6858 0.39465 0.268 0.000 0.532 0.076 0.056 0.068
#> SRR1341480 4 0.4835 0.49508 0.008 0.016 0.000 0.712 0.176 0.088
#> SRR1341344 1 0.5305 0.12138 0.548 0.008 0.000 0.056 0.376 0.012
#> SRR1326270 3 0.1934 0.75372 0.040 0.000 0.916 0.000 0.044 0.000
#> SRR1498838 3 0.1121 0.74617 0.008 0.016 0.964 0.000 0.004 0.008
#> SRR1416313 3 0.2527 0.75465 0.056 0.008 0.892 0.000 0.040 0.004
#> SRR808566 4 0.7177 0.29020 0.016 0.084 0.012 0.520 0.212 0.156
#> SRR1430270 4 0.3554 0.63629 0.112 0.000 0.000 0.820 0.028 0.040
#> SRR1367825 3 0.0881 0.74049 0.000 0.012 0.972 0.000 0.008 0.008
#> SRR613533 3 0.8002 -0.06322 0.084 0.232 0.340 0.000 0.288 0.056
#> SRR661267 3 0.6854 0.39929 0.264 0.000 0.532 0.072 0.088 0.044
#> SRR810665 2 0.3679 0.64534 0.000 0.812 0.128 0.020 0.008 0.032
#> SRR1407250 5 0.6187 0.53962 0.224 0.016 0.116 0.040 0.600 0.004
#> SRR1420067 1 0.7097 0.12637 0.456 0.008 0.180 0.052 0.292 0.012
#> SRR1473632 1 0.3763 0.58928 0.808 0.000 0.000 0.028 0.108 0.056
#> SRR812536 3 0.2609 0.75544 0.028 0.024 0.892 0.000 0.052 0.004
#> SRR1370850 2 0.5978 0.58544 0.000 0.672 0.112 0.068 0.048 0.100
#> SRR1486195 2 0.4146 0.62229 0.000 0.736 0.212 0.000 0.020 0.032
#> SRR1407671 4 0.9182 -0.19981 0.020 0.160 0.188 0.288 0.200 0.144
#> SRR1446375 1 0.7863 -0.03449 0.396 0.092 0.304 0.008 0.160 0.040
#> SRR1465230 4 0.2462 0.64271 0.132 0.000 0.000 0.860 0.004 0.004
#> SRR614119 3 0.6797 0.41322 0.260 0.000 0.540 0.072 0.084 0.044
#> SRR1356101 3 0.4774 0.36447 0.000 0.288 0.648 0.000 0.020 0.044
#> SRR1404209 1 0.6315 0.34606 0.576 0.004 0.264 0.052 0.084 0.020
#> SRR1392676 2 0.2362 0.56125 0.000 0.892 0.012 0.000 0.016 0.080
#> SRR665538 3 0.6887 0.37916 0.276 0.000 0.524 0.076 0.056 0.068
#> SRR660510 3 0.1140 0.75016 0.008 0.008 0.964 0.000 0.008 0.012
#> SRR1445655 4 0.3331 0.62622 0.064 0.008 0.000 0.852 0.028 0.048
#> SRR658953 5 0.7159 0.38354 0.232 0.076 0.012 0.012 0.504 0.164
#> SRR2166459 1 0.4050 0.59528 0.804 0.000 0.100 0.016 0.052 0.028
#> SRR1070713 2 0.8198 -0.02568 0.012 0.316 0.024 0.192 0.308 0.148
#> SRR1485312 3 0.0508 0.74544 0.004 0.012 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317631 3 0.7709 0.34112 0.124 0.012 0.520 0.140 0.068 0.136
#> SRR1488610 1 0.4046 0.53768 0.748 0.000 0.000 0.036 0.200 0.016
#> SRR1330588 3 0.5847 0.40793 0.208 0.012 0.588 0.004 0.184 0.004
#> SRR1316367 5 0.5254 0.13570 0.464 0.000 0.000 0.032 0.468 0.036
#> SRR1433926 1 0.1889 0.63289 0.920 0.000 0.000 0.004 0.056 0.020
#> SRR1091302 4 0.5334 0.54393 0.160 0.012 0.004 0.696 0.032 0.096
#> SRR818263 1 0.6677 0.05772 0.432 0.004 0.276 0.008 0.264 0.016
#> SRR1404909 4 0.5318 0.45737 0.008 0.020 0.000 0.672 0.156 0.144
#> SRR663076 1 0.5122 0.53536 0.744 0.000 0.080 0.072 0.044 0.060
#> SRR1323577 2 0.7330 0.30551 0.000 0.492 0.020 0.160 0.168 0.160
#> SRR1442422 4 0.2462 0.64271 0.132 0.000 0.000 0.860 0.004 0.004
#> SRR1465893 1 0.2605 0.64095 0.888 0.000 0.004 0.032 0.064 0.012
#> SRR654862 1 0.5351 0.27130 0.568 0.000 0.044 0.016 0.356 0.016
#> SRR1407112 4 0.3061 0.64128 0.128 0.000 0.004 0.840 0.020 0.008
#> SRR1332969 3 0.2547 0.74745 0.080 0.000 0.880 0.000 0.036 0.004
#> SRR1353199 3 0.3052 0.73770 0.076 0.000 0.852 0.000 0.064 0.008
#> SRR1378885 3 0.5046 0.57980 0.168 0.004 0.676 0.000 0.144 0.008
#> SRR665357 3 0.4999 0.60387 0.004 0.164 0.712 0.000 0.072 0.048
#> SRR662186 2 0.5732 0.43980 0.000 0.584 0.268 0.000 0.032 0.116
#> SRR1501020 3 0.3706 0.71034 0.140 0.000 0.800 0.000 0.032 0.028
#> SRR1347819 3 0.1026 0.74646 0.004 0.012 0.968 0.000 0.008 0.008
#> SRR1480813 2 0.5826 0.54081 0.000 0.688 0.052 0.084 0.072 0.104
#> SRR1472576 4 0.7261 0.26454 0.012 0.108 0.012 0.512 0.200 0.156
#> SRR1431781 4 0.4494 0.63302 0.112 0.008 0.012 0.780 0.048 0.040
#> SRR1452270 3 0.1053 0.75436 0.020 0.004 0.964 0.000 0.012 0.000
#> SRR1500472 3 0.8331 -0.19596 0.232 0.072 0.316 0.028 0.308 0.044
#> SRR1417632 4 0.6133 0.30357 0.000 0.032 0.000 0.544 0.208 0.216
#> SRR1350153 2 0.3594 0.64063 0.000 0.800 0.152 0.000 0.024 0.024
#> SRR1458113 5 0.6340 0.45840 0.100 0.092 0.144 0.016 0.636 0.012
#> SRR1326579 5 0.5132 0.37527 0.400 0.008 0.004 0.044 0.540 0.004
#> SRR1349363 6 0.7188 0.56539 0.100 0.224 0.000 0.076 0.072 0.528
#> SRR1096712 3 0.1621 0.75373 0.008 0.012 0.944 0.004 0.028 0.004
#> SRR1090407 3 0.2465 0.75114 0.052 0.004 0.896 0.000 0.040 0.008
#> SRR1083752 2 0.8384 0.23700 0.004 0.400 0.116 0.216 0.116 0.148
#> SRR1377599 4 0.5126 0.45644 0.004 0.012 0.000 0.668 0.196 0.120
#> SRR1488449 3 0.2951 0.74113 0.092 0.000 0.856 0.000 0.044 0.008
#> SRR1318354 3 0.7666 0.14076 0.048 0.232 0.392 0.000 0.268 0.060
#> SRR1359062 3 0.1312 0.74531 0.004 0.020 0.956 0.000 0.008 0.012
#> SRR1398924 5 0.6601 0.42440 0.220 0.100 0.000 0.016 0.564 0.100
#> SRR663783 3 0.1078 0.74374 0.000 0.016 0.964 0.000 0.012 0.008
#> SRR1319204 2 0.6680 0.25719 0.004 0.432 0.376 0.000 0.096 0.092
#> SRR1369070 2 0.4104 0.51856 0.000 0.788 0.000 0.056 0.048 0.108
#> SRR615659 1 0.1889 0.63289 0.920 0.000 0.000 0.004 0.056 0.020
#> SRR1337449 2 0.4995 0.61857 0.000 0.692 0.212 0.024 0.012 0.060
#> SRR1316982 3 0.4412 0.52637 0.000 0.200 0.728 0.000 0.028 0.044
#> SRR1498595 4 0.6112 0.30814 0.000 0.032 0.000 0.548 0.204 0.216
#> SRR1377423 3 0.3871 0.71711 0.128 0.004 0.800 0.000 0.036 0.032
#> SRR1312310 2 0.3318 0.64265 0.000 0.820 0.140 0.000 0.020 0.020
#> SRR1485613 1 0.5496 0.52902 0.700 0.000 0.132 0.052 0.088 0.028
#> SRR1338426 3 0.3878 0.72976 0.036 0.028 0.812 0.004 0.112 0.008
#> SRR1353309 3 0.3684 0.73924 0.032 0.028 0.832 0.008 0.092 0.008
#> SRR658941 3 0.6876 0.42515 0.240 0.000 0.544 0.076 0.096 0.044
#> SRR1101643 1 0.3301 0.60472 0.844 0.000 0.000 0.024 0.068 0.064
#> SRR1401468 3 0.6802 0.40168 0.272 0.000 0.532 0.072 0.080 0.044
#> SRR1368874 2 0.3440 0.64045 0.000 0.816 0.136 0.000 0.024 0.024
#> SRR1324085 4 0.8350 0.15957 0.012 0.108 0.080 0.408 0.224 0.168
#> SRR1363858 1 0.6973 -0.04560 0.472 0.000 0.004 0.100 0.268 0.156
#> SRR819820 3 0.5237 0.66160 0.132 0.012 0.720 0.020 0.096 0.020
#> SRR1337342 1 0.7136 0.10221 0.444 0.008 0.184 0.052 0.300 0.012
#> SRR655206 3 0.3647 0.70981 0.012 0.048 0.840 0.004 0.032 0.064
#> SRR1387013 2 0.7127 0.21638 0.008 0.492 0.000 0.156 0.204 0.140
#> SRR1317410 1 0.3367 0.62664 0.832 0.000 0.020 0.028 0.116 0.004
#> SRR608198 5 0.5138 0.37260 0.404 0.008 0.004 0.044 0.536 0.004
#> SRR1440161 2 0.3666 0.63876 0.000 0.792 0.160 0.000 0.024 0.024
#> SRR1343741 2 0.4104 0.51856 0.000 0.788 0.000 0.056 0.048 0.108
#> SRR1381288 2 0.2553 0.60910 0.000 0.888 0.056 0.000 0.012 0.044
#> SRR1415379 4 0.5310 0.44174 0.208 0.000 0.000 0.644 0.020 0.128
#> SRR1099622 2 0.5998 0.54926 0.000 0.580 0.280 0.032 0.020 0.088
#> SRR663197 3 0.3552 0.74220 0.036 0.028 0.832 0.000 0.096 0.008
#> SRR1394836 3 0.3718 0.70718 0.012 0.048 0.836 0.004 0.036 0.064
#> SRR661699 3 0.2943 0.74718 0.060 0.004 0.876 0.012 0.040 0.008
#> SRR813680 3 0.6829 0.40096 0.268 0.000 0.532 0.072 0.084 0.044
#> SRR1410678 1 0.2231 0.63249 0.900 0.000 0.000 0.028 0.068 0.004
#> SRR1378109 4 0.3061 0.64128 0.128 0.000 0.004 0.840 0.020 0.008
#> SRR1499174 1 0.3473 0.62373 0.832 0.000 0.056 0.004 0.092 0.016
#> SRR1311486 2 0.4995 0.61857 0.000 0.692 0.212 0.024 0.012 0.060
#> SRR1382851 4 0.7852 -0.02696 0.008 0.196 0.008 0.344 0.296 0.148
#> SRR1433410 5 0.5311 0.57286 0.268 0.016 0.000 0.072 0.632 0.012
#> SRR661167 3 0.1232 0.75479 0.016 0.000 0.956 0.000 0.024 0.004
#> SRR1432518 3 0.6558 0.31847 0.120 0.052 0.536 0.008 0.276 0.008
#> SRR660462 3 0.0909 0.73966 0.000 0.020 0.968 0.000 0.000 0.012
#> SRR1374608 3 0.8084 0.29273 0.100 0.068 0.496 0.192 0.096 0.048
#> SRR657949 3 0.3735 0.70868 0.120 0.000 0.792 0.000 0.084 0.004
#> SRR1308882 4 0.3007 0.64052 0.080 0.000 0.000 0.860 0.020 0.040
#> SRR655768 1 0.7068 0.14294 0.436 0.004 0.352 0.044 0.132 0.032
#> SRR1485870 6 0.8179 0.55809 0.152 0.040 0.016 0.304 0.120 0.368
#> SRR1444138 1 0.7313 0.13187 0.432 0.008 0.328 0.036 0.152 0.044
#> SRR1417342 1 0.6500 -0.24481 0.472 0.000 0.000 0.120 0.072 0.336
#> SRR1470193 4 0.6292 0.41003 0.184 0.004 0.016 0.608 0.052 0.136
#> SRR1091380 3 0.5237 0.66160 0.132 0.012 0.720 0.020 0.096 0.020
#> SRR1099096 1 0.2476 0.63798 0.888 0.000 0.000 0.032 0.072 0.008
#> SRR1313583 4 0.4776 0.30832 0.348 0.000 0.000 0.600 0.012 0.040
#> SRR1467102 3 0.3196 0.64810 0.000 0.128 0.832 0.000 0.020 0.020
#> SRR1485416 4 0.4881 0.49236 0.008 0.016 0.000 0.708 0.176 0.092
#> SRR818821 3 0.8002 -0.06322 0.084 0.232 0.340 0.000 0.288 0.056
#> SRR809963 1 0.4963 0.49722 0.704 0.000 0.068 0.012 0.192 0.024
#> SRR1072247 1 0.2543 0.63629 0.892 0.000 0.004 0.024 0.064 0.016
#> SRR1353710 4 0.5590 0.45364 0.188 0.008 0.004 0.648 0.020 0.132
#> SRR1445259 3 0.8024 -0.06965 0.088 0.228 0.340 0.000 0.288 0.056
#> SRR1408393 1 0.5812 -0.01668 0.452 0.000 0.440 0.012 0.080 0.016
#> SRR1361522 1 0.1972 0.63292 0.916 0.000 0.000 0.004 0.056 0.024
#> SRR1368597 1 0.3898 0.61372 0.820 0.000 0.076 0.020 0.056 0.028
#> SRR1309680 2 0.5902 0.48422 0.004 0.672 0.020 0.104 0.076 0.124
#> SRR1310542 3 0.0909 0.74121 0.000 0.020 0.968 0.000 0.000 0.012
#> SRR1333485 4 0.3127 0.61614 0.040 0.004 0.000 0.864 0.044 0.048
#> SRR1406437 3 0.7861 0.32418 0.024 0.084 0.512 0.144 0.160 0.076
#> SRR1354931 3 0.1788 0.75615 0.028 0.004 0.928 0.000 0.040 0.000
#> SRR1391856 3 0.5162 0.46325 0.000 0.216 0.676 0.004 0.048 0.056
#> SRR1446738 5 0.8720 -0.20262 0.008 0.276 0.092 0.180 0.300 0.144
#> SRR1309032 2 0.4346 0.60531 0.000 0.712 0.232 0.000 0.020 0.036
#> SRR1388145 2 0.5794 0.60740 0.000 0.640 0.212 0.044 0.020 0.084
#> SRR1432611 2 0.3800 0.63602 0.000 0.776 0.176 0.000 0.020 0.028
#> SRR815869 3 0.0976 0.73891 0.000 0.016 0.968 0.000 0.008 0.008
#> SRR613150 3 0.1262 0.74130 0.000 0.020 0.956 0.000 0.008 0.016
#> SRR1375329 5 0.7684 0.38713 0.208 0.044 0.296 0.016 0.400 0.036
#> SRR1387921 1 0.1577 0.63000 0.940 0.000 0.000 0.036 0.016 0.008
#> SRR1466792 2 0.3888 0.63637 0.000 0.776 0.168 0.000 0.028 0.028
#> SRR1360478 2 0.3594 0.64063 0.000 0.800 0.152 0.000 0.024 0.024
#> SRR1360695 1 0.6831 0.36838 0.576 0.000 0.196 0.076 0.068 0.084
#> SRR812943 1 0.4097 0.54489 0.764 0.004 0.000 0.016 0.172 0.044
#> SRR1400910 5 0.8377 0.06468 0.140 0.316 0.092 0.004 0.328 0.120
#> SRR1444203 4 0.3116 0.64480 0.132 0.000 0.004 0.836 0.016 0.012
#> SRR816177 2 0.7378 0.29286 0.000 0.484 0.020 0.168 0.168 0.160
#> SRR658754 3 0.1325 0.74975 0.004 0.012 0.956 0.000 0.016 0.012
#> SRR1429603 4 0.6190 0.38968 0.136 0.008 0.008 0.612 0.048 0.188
#> SRR1397366 3 0.3158 0.73486 0.084 0.000 0.844 0.000 0.064 0.008
#> SRR1446028 1 0.3211 0.62968 0.852 0.000 0.016 0.028 0.092 0.012
#> SRR1083918 2 0.7663 0.25123 0.000 0.456 0.032 0.176 0.176 0.160
#> SRR1337606 5 0.6787 0.48613 0.216 0.036 0.004 0.124 0.564 0.056
#> SRR659109 3 0.1129 0.75079 0.008 0.004 0.964 0.000 0.012 0.012
#> SRR1337192 1 0.5305 0.12138 0.548 0.008 0.000 0.056 0.376 0.012
#> SRR656946 1 0.6436 0.16757 0.492 0.000 0.348 0.016 0.096 0.048
#> SRR1476102 1 0.3674 0.60128 0.804 0.000 0.000 0.044 0.132 0.020
#> SRR1476447 1 0.5305 0.12138 0.548 0.008 0.000 0.056 0.376 0.012
#> SRR1342067 4 0.3300 0.60137 0.032 0.004 0.000 0.852 0.052 0.060
#> SRR1385389 4 0.2685 0.64371 0.132 0.000 0.000 0.852 0.008 0.008
#> SRR1075971 1 0.4682 0.37778 0.640 0.000 0.004 0.024 0.312 0.020
#> SRR614419 1 0.5007 -0.09093 0.484 0.000 0.000 0.028 0.464 0.024
#> SRR1322936 5 0.5791 0.58171 0.264 0.024 0.004 0.064 0.616 0.028
#> SRR1349121 3 0.6892 0.27316 0.324 0.000 0.484 0.064 0.088 0.040
#> SRR1430549 1 0.2815 0.62240 0.864 0.000 0.000 0.028 0.096 0.012
#> SRR612935 3 0.7645 0.18699 0.048 0.228 0.412 0.000 0.248 0.064
#> SRR661481 2 0.5826 0.54081 0.000 0.688 0.052 0.084 0.072 0.104
#> SRR1354117 2 0.5803 0.41726 0.000 0.568 0.288 0.000 0.036 0.108
#> SRR1393596 4 0.7246 0.20941 0.080 0.024 0.008 0.512 0.164 0.212
#> SRR1452164 1 0.3776 0.63114 0.816 0.000 0.060 0.020 0.096 0.008
#> SRR1070503 1 0.6737 -0.00900 0.400 0.004 0.312 0.008 0.260 0.016
#> SRR1499894 3 0.1129 0.74925 0.004 0.008 0.964 0.000 0.012 0.012
#> SRR1082883 5 0.5040 0.57638 0.252 0.020 0.004 0.056 0.664 0.004
#> SRR1468271 1 0.5496 0.52902 0.700 0.000 0.132 0.052 0.088 0.028
#> SRR1332443 1 0.3465 0.60583 0.820 0.000 0.000 0.044 0.120 0.016
#> SRR810295 2 0.3310 0.64316 0.000 0.816 0.148 0.000 0.016 0.020
#> SRR662103 1 0.1972 0.63292 0.916 0.000 0.000 0.004 0.056 0.024
#> SRR1328620 3 0.7666 0.14076 0.048 0.232 0.392 0.000 0.268 0.060
#> SRR1396294 3 0.7709 0.34112 0.124 0.012 0.520 0.140 0.068 0.136
#> SRR1419917 1 0.1972 0.63292 0.916 0.000 0.000 0.004 0.056 0.024
#> SRR662114 3 0.4175 0.71633 0.048 0.028 0.784 0.004 0.132 0.004
#> SRR1489199 3 0.7310 -0.07067 0.336 0.004 0.372 0.040 0.224 0.024
#> SRR813584 3 0.8815 -0.10297 0.020 0.152 0.364 0.212 0.148 0.104
#> SRR1069638 1 0.7073 -0.07599 0.424 0.028 0.160 0.012 0.352 0.024
#> SRR614864 3 0.1995 0.75539 0.036 0.000 0.912 0.000 0.052 0.000
#> SRR1433392 1 0.5903 0.33568 0.592 0.000 0.140 0.012 0.236 0.020
#> SRR1377777 2 0.4356 0.41915 0.000 0.712 0.000 0.024 0.032 0.232
#> SRR2167710 1 0.6436 0.16757 0.492 0.000 0.348 0.016 0.096 0.048
#> SRR1401252 4 0.3574 0.61616 0.056 0.004 0.000 0.836 0.048 0.056
#> SRR1309963 4 0.3017 0.64111 0.132 0.000 0.004 0.840 0.016 0.008
#> SRR1338031 1 0.1536 0.63074 0.940 0.000 0.000 0.004 0.040 0.016
#> SRR1418628 2 0.3688 0.64856 0.000 0.804 0.144 0.012 0.012 0.028
#> SRR1486889 1 0.6315 0.34606 0.576 0.004 0.264 0.052 0.084 0.020
#> SRR1380393 1 0.1893 0.63285 0.928 0.000 0.004 0.036 0.024 0.008
#> SRR1319731 1 0.3355 0.62334 0.840 0.000 0.016 0.036 0.100 0.008
#> SRR1356468 4 0.7200 0.26888 0.200 0.004 0.068 0.536 0.052 0.140
#> SRR1337010 2 0.4295 0.63068 0.000 0.740 0.192 0.000 0.036 0.032
#> SRR1486520 1 0.5041 0.31054 0.580 0.000 0.016 0.028 0.364 0.012
#> SRR1486538 4 0.3089 0.63124 0.080 0.000 0.000 0.856 0.024 0.040
#> SRR1340486 4 0.3061 0.64128 0.128 0.000 0.004 0.840 0.020 0.008
#> SRR1377696 4 0.6155 0.29749 0.000 0.032 0.000 0.540 0.212 0.216
#> SRR1465459 1 0.6687 0.04974 0.428 0.004 0.280 0.008 0.264 0.016
#> SRR1080270 3 0.0909 0.74121 0.000 0.020 0.968 0.000 0.000 0.012
#> SRR1312501 3 0.4989 0.66443 0.080 0.020 0.732 0.012 0.144 0.012
#> SRR1093148 5 0.6758 0.31743 0.080 0.056 0.320 0.028 0.508 0.008
#> SRR1467080 3 0.0820 0.74153 0.000 0.016 0.972 0.000 0.000 0.012
#> SRR1410866 2 0.6686 0.54934 0.000 0.608 0.104 0.080 0.068 0.140
#> SRR816475 4 0.8350 0.15957 0.012 0.108 0.080 0.408 0.224 0.168
#> SRR1379198 4 0.2473 0.64105 0.136 0.000 0.000 0.856 0.000 0.008
#> SRR613342 3 0.4142 0.72943 0.068 0.036 0.800 0.000 0.084 0.012
#> SRR1452246 2 0.5457 0.44832 0.000 0.676 0.000 0.076 0.116 0.132
#> SRR1338836 2 0.2747 0.63500 0.000 0.860 0.096 0.000 0.000 0.044
#> SRR1369129 4 0.2572 0.64161 0.136 0.000 0.000 0.852 0.000 0.012
#> SRR1396616 3 0.3113 0.73543 0.100 0.000 0.844 0.000 0.048 0.008
#> SRR813824 3 0.1198 0.75245 0.012 0.004 0.960 0.000 0.020 0.004
#> SRR1082376 1 0.6039 0.26169 0.556 0.000 0.088 0.024 0.308 0.024
#> SRR1500891 4 0.3077 0.62633 0.064 0.004 0.000 0.864 0.024 0.044
#> SRR807543 1 0.5935 0.32138 0.588 0.000 0.144 0.012 0.236 0.020
#> SRR1091572 1 0.7263 -0.01886 0.460 0.048 0.096 0.020 0.336 0.040
#> SRR1346689 4 0.4738 0.56470 0.164 0.004 0.012 0.732 0.012 0.076
#> SRR1332424 5 0.5311 0.57286 0.268 0.016 0.000 0.072 0.632 0.012
#> SRR663729 4 0.5839 0.44707 0.064 0.000 0.000 0.616 0.208 0.112
#> SRR1097013 1 0.4050 0.59528 0.804 0.000 0.100 0.016 0.052 0.028
#> SRR613675 5 0.5791 0.58171 0.264 0.024 0.004 0.064 0.616 0.028
#> SRR1485357 4 0.3172 0.63919 0.128 0.000 0.008 0.836 0.020 0.008
#> SRR655816 3 0.2239 0.75292 0.044 0.008 0.916 0.012 0.012 0.008
#> SRR1500113 1 0.5245 0.55481 0.732 0.000 0.072 0.068 0.092 0.036
#> SRR1437622 4 0.7261 0.26454 0.012 0.108 0.012 0.512 0.200 0.156
#> SRR1355172 3 0.6858 0.39351 0.268 0.000 0.532 0.076 0.056 0.068
#> SRR655531 1 0.4783 0.03319 0.500 0.000 0.000 0.028 0.460 0.012
#> SRR1338147 3 0.4193 0.67723 0.104 0.004 0.760 0.000 0.128 0.004
#> SRR1413329 3 0.7319 -0.06735 0.332 0.004 0.372 0.040 0.228 0.024
#> SRR1485931 2 0.5059 0.15280 0.000 0.540 0.000 0.012 0.052 0.396
#> SRR1420873 1 0.3999 0.61099 0.804 0.000 0.032 0.036 0.112 0.016
#> SRR1333308 4 0.6114 0.51233 0.148 0.004 0.000 0.620 0.124 0.104
#> SRR1452033 1 0.6327 0.30882 0.548 0.000 0.296 0.036 0.088 0.032
#> SRR1467316 2 0.4350 0.35682 0.000 0.676 0.000 0.008 0.036 0.280
#> SRR809018 3 0.0767 0.74107 0.000 0.012 0.976 0.000 0.004 0.008
#> SRR1375351 2 0.3318 0.64265 0.000 0.820 0.140 0.000 0.020 0.020
#> SRR663440 3 0.5812 0.40334 0.216 0.004 0.564 0.000 0.208 0.008
#> SRR1471755 2 0.5817 0.53524 0.000 0.688 0.048 0.084 0.076 0.104
#> SRR808019 3 0.6876 0.42515 0.240 0.000 0.544 0.076 0.096 0.044
#> SRR1479133 3 0.2138 0.75332 0.052 0.004 0.908 0.000 0.036 0.000
#> SRR615069 3 0.7294 0.21079 0.056 0.080 0.472 0.020 0.324 0.048
#> SRR1456185 2 0.8488 0.21707 0.124 0.468 0.148 0.056 0.084 0.120
#> SRR1350069 3 0.7709 0.34112 0.124 0.012 0.520 0.140 0.068 0.136
#> SRR816316 1 0.4628 0.52730 0.732 0.000 0.064 0.012 0.176 0.016
#> SRR664795 3 0.6829 0.40096 0.268 0.000 0.532 0.072 0.084 0.044
#> SRR1490721 4 0.6210 0.31415 0.008 0.036 0.000 0.528 0.308 0.120
#> SRR810643 1 0.3335 0.62387 0.844 0.000 0.016 0.032 0.096 0.012
#> SRR1430333 5 0.7462 0.45462 0.180 0.048 0.256 0.028 0.468 0.020
#> SRR1085285 3 0.2074 0.75332 0.048 0.004 0.912 0.000 0.036 0.000
#> SRR1099072 3 0.3113 0.73543 0.100 0.000 0.844 0.000 0.048 0.008
#> SRR1317985 1 0.1628 0.63591 0.940 0.000 0.008 0.004 0.036 0.012
#> SRR1487340 1 0.2728 0.63147 0.864 0.000 0.000 0.032 0.100 0.004
#> SRR1420276 3 0.2103 0.71725 0.000 0.056 0.912 0.000 0.012 0.020
#> SRR1351347 3 0.4574 0.70111 0.060 0.032 0.760 0.004 0.136 0.008
#> SRR1405525 1 0.4046 0.53768 0.748 0.000 0.000 0.036 0.200 0.016
#> SRR1370329 1 0.1464 0.63386 0.944 0.000 0.000 0.016 0.036 0.004
#> SRR1465001 1 0.3355 0.62334 0.840 0.000 0.016 0.036 0.100 0.008
#> SRR1476525 2 0.3824 0.64473 0.000 0.812 0.104 0.016 0.012 0.056
#> SRR819610 2 0.8535 0.21174 0.124 0.464 0.148 0.060 0.084 0.120
#> SRR2157314 1 0.3394 0.62651 0.840 0.000 0.020 0.028 0.100 0.012
#> SRR1409465 2 0.2747 0.63500 0.000 0.860 0.096 0.000 0.000 0.044
#> SRR809987 4 0.5396 0.35694 0.268 0.000 0.000 0.600 0.012 0.120
#> SRR613639 3 0.3607 0.72641 0.100 0.000 0.816 0.004 0.072 0.008
#> SRR1402285 4 0.2757 0.64067 0.136 0.000 0.004 0.848 0.008 0.004
#> SRR1077038 1 0.5416 0.42834 0.652 0.000 0.088 0.012 0.224 0.024
#> SRR1405660 3 0.1053 0.75436 0.020 0.004 0.964 0.000 0.012 0.000
#> SRR1095455 3 0.8109 -0.09332 0.100 0.228 0.328 0.000 0.288 0.056
#> SRR1394734 2 0.7663 0.25123 0.000 0.456 0.032 0.176 0.176 0.160
#> SRR1317771 1 0.5955 0.39792 0.620 0.004 0.236 0.032 0.084 0.024
#> SRR1365894 4 0.7970 -0.20526 0.072 0.060 0.012 0.416 0.164 0.276
#> SRR1073581 3 0.6892 0.27316 0.324 0.000 0.484 0.064 0.088 0.040
#> SRR659804 1 0.3394 0.62651 0.840 0.000 0.020 0.028 0.100 0.012
#> SRR1345914 2 0.4661 0.63434 0.000 0.752 0.128 0.024 0.016 0.080
#> SRR1432186 2 0.5538 0.59478 0.000 0.712 0.088 0.084 0.048 0.068
#> SRR1473529 4 0.6112 0.30814 0.000 0.032 0.000 0.548 0.204 0.216
#> SRR660764 3 0.6731 0.37460 0.016 0.220 0.536 0.000 0.164 0.064
#> SRR820448 1 0.4691 0.51710 0.724 0.000 0.064 0.012 0.184 0.016
#> SRR1328845 3 0.7709 0.34112 0.124 0.012 0.520 0.140 0.068 0.136
#> SRR1336415 4 0.2716 0.64291 0.132 0.000 0.004 0.852 0.008 0.004
#> SRR1379065 4 0.3077 0.62633 0.064 0.004 0.000 0.864 0.024 0.044
#> SRR1459190 1 0.5812 -0.01668 0.452 0.000 0.440 0.012 0.080 0.016
#> SRR1346773 1 0.3641 0.62045 0.828 0.000 0.024 0.032 0.100 0.016
#> SRR1499521 3 0.6932 0.41312 0.244 0.000 0.536 0.076 0.100 0.044
#> SRR1440898 2 0.3393 0.63249 0.000 0.844 0.084 0.016 0.012 0.044
#> SRR1347459 3 0.3010 0.75157 0.032 0.020 0.868 0.000 0.072 0.008
#> SRR1081209 2 0.3404 0.53048 0.000 0.812 0.016 0.004 0.016 0.152
#> SRR1400202 1 0.1418 0.63449 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032 0.000
#> SRR1333395 6 0.7640 0.64436 0.228 0.092 0.000 0.128 0.076 0.476
#> SRR1309248 4 0.8050 -0.25865 0.060 0.064 0.012 0.388 0.200 0.276
#> SRR809161 3 0.2806 0.74842 0.060 0.000 0.872 0.000 0.056 0.012
#> SRR1316320 5 0.7772 -0.00930 0.160 0.028 0.000 0.260 0.404 0.148
#> SRR1432629 2 0.6972 0.26516 0.000 0.492 0.000 0.152 0.188 0.168
#> SRR1498931 1 0.1426 0.63507 0.948 0.000 0.000 0.016 0.028 0.008
#> SRR1416578 4 0.5310 0.44174 0.208 0.000 0.000 0.644 0.020 0.128
#> SRR1405547 3 0.0881 0.74049 0.000 0.012 0.972 0.000 0.008 0.008
#> SRR1470534 4 0.2572 0.64161 0.136 0.000 0.000 0.852 0.000 0.012
#> SRR1380764 1 0.3994 0.61224 0.808 0.000 0.036 0.032 0.104 0.020
#> SRR1309160 3 0.1565 0.75325 0.028 0.004 0.940 0.000 0.028 0.000
#> SRR663489 3 0.0881 0.74049 0.000 0.012 0.972 0.000 0.008 0.008
#> SRR1500450 1 0.6507 0.40491 0.620 0.000 0.120 0.080 0.048 0.132
#> SRR1078489 5 0.8120 0.44363 0.224 0.072 0.224 0.032 0.412 0.036
#> SRR1332648 4 0.2462 0.64271 0.132 0.000 0.000 0.860 0.004 0.004
#> SRR660614 2 0.6680 0.25719 0.004 0.432 0.376 0.000 0.096 0.092
#> SRR1470420 2 0.4371 0.60348 0.000 0.708 0.236 0.000 0.020 0.036
#> SRR1475566 1 0.1418 0.63449 0.944 0.000 0.000 0.024 0.032 0.000
#> SRR1477949 1 0.3327 0.61328 0.832 0.000 0.000 0.036 0.112 0.020
#> SRR1481419 2 0.5029 0.62001 0.000 0.748 0.096 0.056 0.040 0.060
#> SRR1464766 1 0.4145 0.58044 0.756 0.000 0.008 0.020 0.188 0.028
#> SRR615946 3 0.2527 0.75465 0.056 0.008 0.892 0.000 0.040 0.004
#> SRR1446481 2 0.5331 0.62267 0.000 0.688 0.184 0.044 0.016 0.068
#> SRR1467656 2 0.3486 0.64456 0.000 0.812 0.128 0.000 0.008 0.052
#> SRR1402962 5 0.5699 0.45930 0.328 0.012 0.056 0.036 0.568 0.000
#> SRR660224 2 0.3564 0.61336 0.000 0.824 0.076 0.004 0.012 0.084
#> SRR665586 1 0.2444 0.62766 0.892 0.000 0.000 0.012 0.068 0.028
#> SRR1347166 5 0.6008 0.54876 0.312 0.024 0.036 0.048 0.572 0.008
#> SRR1485722 5 0.6187 0.53962 0.224 0.016 0.116 0.040 0.600 0.004
#> SRR1415316 1 0.2747 0.61648 0.868 0.000 0.000 0.016 0.096 0.020
#> SRR613390 1 0.4830 0.42160 0.656 0.000 0.012 0.020 0.284 0.028
#> SRR661108 3 0.0653 0.74794 0.000 0.004 0.980 0.000 0.012 0.004
#> SRR2170173 1 0.6734 0.14495 0.476 0.008 0.348 0.016 0.104 0.048
#> SRR817329 1 0.3906 0.61670 0.820 0.000 0.064 0.020 0.068 0.028
#> SRR1401990 4 0.8152 0.01817 0.156 0.008 0.224 0.420 0.056 0.136
#> SRR1467745 4 0.8369 0.15361 0.012 0.108 0.080 0.404 0.224 0.172
#> SRR1471795 2 0.6664 0.41797 0.000 0.592 0.028 0.128 0.112 0.140
#> SRR1415637 2 0.2362 0.56125 0.000 0.892 0.012 0.000 0.016 0.080
#> SRR813137 1 0.2945 0.63286 0.872 0.000 0.032 0.004 0.064 0.028
#> SRR1314873 1 0.2699 0.62374 0.880 0.000 0.000 0.020 0.068 0.032
#> SRR1401211 1 0.6831 0.36838 0.576 0.000 0.196 0.076 0.068 0.084
#> SRR1419692 4 0.2976 0.64200 0.128 0.000 0.004 0.844 0.016 0.008
#> SRR818797 3 0.4983 0.59837 0.160 0.004 0.684 0.000 0.144 0.008
#> SRR2164608 3 0.4165 0.71744 0.092 0.004 0.792 0.012 0.088 0.012
#> SRR1455586 3 0.4600 0.45537 0.000 0.240 0.692 0.000 0.024 0.044
#> SRR819459 3 0.1262 0.74130 0.000 0.020 0.956 0.000 0.008 0.016
#> SRR1488939 2 0.4350 0.35682 0.000 0.676 0.000 0.008 0.036 0.280
#> SRR1433232 2 0.4509 0.49320 0.000 0.756 0.000 0.060 0.060 0.124
#> SRR1385501 1 0.5519 0.39473 0.632 0.000 0.076 0.016 0.252 0.024
#> SRR1361652 5 0.7159 0.38354 0.232 0.076 0.012 0.012 0.504 0.164
#> SRR1437119 1 0.1313 0.63438 0.952 0.000 0.000 0.016 0.028 0.004
#> SRR1478547 3 0.0767 0.74107 0.000 0.012 0.976 0.000 0.004 0.008
#> SRR1430910 5 0.7874 0.40829 0.176 0.056 0.288 0.032 0.416 0.032
#> SRR1310584 1 0.3067 0.62521 0.840 0.000 0.004 0.028 0.124 0.004
#> SRR1500216 1 0.6973 -0.04560 0.472 0.000 0.004 0.100 0.268 0.156
#> SRR1486762 3 0.4063 0.69884 0.148 0.000 0.776 0.000 0.040 0.036
#> SRR1480854 4 0.5126 0.45644 0.004 0.012 0.000 0.668 0.196 0.120
#> SRR1489394 4 0.2504 0.64122 0.136 0.000 0.000 0.856 0.004 0.004
#> SRR1418085 4 0.2462 0.64271 0.132 0.000 0.000 0.860 0.004 0.004
#> SRR1340221 4 0.3554 0.63629 0.112 0.000 0.000 0.820 0.028 0.040
#> SRR1473058 4 0.8350 0.15957 0.012 0.108 0.080 0.408 0.224 0.168
#> SRR1405165 3 0.3781 0.72559 0.040 0.020 0.828 0.004 0.088 0.020
#> SRR1433004 1 0.4668 0.42138 0.656 0.000 0.004 0.020 0.292 0.028
#> SRR1471477 1 0.6974 0.32072 0.540 0.000 0.240 0.080 0.068 0.072
#> SRR1098567 2 0.5149 0.57300 0.000 0.644 0.272 0.020 0.012 0.052
#> SRR1098712 3 0.7709 0.34112 0.124 0.012 0.520 0.140 0.068 0.136
#> SRR1455038 1 0.4621 0.35411 0.640 0.000 0.000 0.024 0.312 0.024
#> SRR1375248 3 0.4570 0.44456 0.000 0.248 0.688 0.000 0.020 0.044
#> SRR1403005 3 0.2879 0.74333 0.072 0.000 0.864 0.000 0.056 0.008
#> SRR1348378 2 0.8384 0.23700 0.004 0.400 0.116 0.216 0.116 0.148
#> SRR1413541 1 0.2647 0.62114 0.876 0.000 0.000 0.016 0.088 0.020
#> SRR1392943 4 0.6182 0.43919 0.056 0.008 0.004 0.604 0.208 0.120
#> SRR1475192 3 0.1180 0.74446 0.000 0.016 0.960 0.000 0.012 0.012
#> SRR1432085 2 0.5611 0.28877 0.000 0.464 0.452 0.016 0.020 0.048
#> SRR1452468 5 0.7973 0.47419 0.192 0.052 0.196 0.048 0.468 0.044
#> SRR1347060 3 0.1015 0.74786 0.004 0.012 0.968 0.000 0.004 0.012
#> SRR1414139 3 0.5566 0.05602 0.000 0.360 0.552 0.016 0.024 0.048
#> SRR1447962 2 0.4729 0.55574 0.000 0.644 0.296 0.000 0.016 0.044
#> SRR1444324 2 0.5666 0.29793 0.000 0.472 0.428 0.000 0.040 0.060
#> SRR1415004 1 0.1780 0.63092 0.932 0.000 0.004 0.036 0.024 0.004
#> SRR1413436 1 0.6326 0.35977 0.584 0.004 0.248 0.052 0.092 0.020
#> SRR1311266 1 0.7696 -0.10035 0.340 0.016 0.272 0.036 0.304 0.032
#> SRR1343302 4 0.3061 0.64128 0.128 0.000 0.004 0.840 0.020 0.008
#> SRR1373746 1 0.2288 0.63172 0.896 0.000 0.000 0.028 0.072 0.004
#> SRR1429678 1 0.3024 0.62888 0.844 0.000 0.000 0.032 0.116 0.008
#> SRR1469413 2 0.5347 0.53562 0.000 0.604 0.312 0.020 0.016 0.048
#> SRR1405331 1 0.5923 0.32611 0.588 0.000 0.140 0.012 0.240 0.020
#> SRR1345609 1 0.2736 0.61905 0.876 0.000 0.000 0.020 0.076 0.028
#> SRR1380208 5 0.7965 -0.15811 0.032 0.104 0.016 0.304 0.392 0.152
#> SRR1322840 4 0.3142 0.62654 0.064 0.004 0.000 0.860 0.024 0.048
#> SRR1399797 3 0.3552 0.74220 0.036 0.028 0.832 0.000 0.096 0.008
#> SRR1416654 3 0.1720 0.75654 0.032 0.000 0.928 0.000 0.040 0.000
#> SRR1315081 3 0.1332 0.73441 0.000 0.028 0.952 0.000 0.008 0.012
#> SRR1369196 3 0.1401 0.73530 0.000 0.028 0.948 0.000 0.004 0.020
#> SRR1400847 1 0.4145 0.58044 0.756 0.000 0.008 0.020 0.188 0.028
#> SRR1365291 3 0.6276 0.29527 0.232 0.012 0.524 0.004 0.220 0.008
#> SRR1367920 4 0.5126 0.45644 0.004 0.012 0.000 0.668 0.196 0.120
#> SRR1366648 3 0.0881 0.74049 0.000 0.012 0.972 0.000 0.008 0.008
#> SRR1441679 2 0.3355 0.64320 0.000 0.816 0.132 0.000 0.004 0.048
#> SRR1082173 3 0.4165 0.71744 0.092 0.004 0.792 0.012 0.088 0.012
#> SRR1363968 1 0.6474 0.40297 0.604 0.000 0.200 0.072 0.068 0.056
#> SRR814387 1 0.3355 0.62334 0.840 0.000 0.016 0.036 0.100 0.008
#> SRR657599 3 0.6869 0.42166 0.240 0.000 0.544 0.072 0.100 0.044
#> SRR1386689 4 0.3061 0.64128 0.128 0.000 0.004 0.840 0.020 0.008
#> SRR1395575 3 0.2058 0.75379 0.056 0.000 0.908 0.000 0.036 0.000
#> SRR1453811 3 0.4361 0.66723 0.132 0.004 0.744 0.000 0.116 0.004
#> SRR1441159 1 0.4489 0.43638 0.680 0.000 0.000 0.044 0.264 0.012
#> SRR1403154 4 0.3061 0.64128 0.128 0.000 0.004 0.840 0.020 0.008
#> SRR1468722 3 0.0653 0.74553 0.004 0.012 0.980 0.000 0.004 0.000
#> SRR1310275 3 0.6328 0.27032 0.244 0.012 0.512 0.004 0.220 0.008
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.438 0.727 0.832 0.4904 0.500 0.500
#> 3 3 0.606 0.700 0.837 0.3157 0.693 0.461
#> 4 4 0.984 0.935 0.959 0.1334 0.898 0.710
#> 5 5 0.834 0.833 0.897 0.0780 0.914 0.693
#> 6 6 0.769 0.680 0.826 0.0409 0.992 0.960
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.8608 0.34166 0.716 0.284
#> SRR1331708 1 0.1843 0.81000 0.972 0.028
#> SRR1464258 1 0.2948 0.77382 0.948 0.052
#> SRR1454201 1 0.4022 0.74354 0.920 0.080
#> SRR661589 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1456229 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1315165 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1488960 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1094457 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1095575 2 0.9963 0.53770 0.464 0.536
#> SRR1315931 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1430066 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1431037 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1395554 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR818002 2 0.4562 0.64023 0.096 0.904
#> SRR1344143 2 0.9608 -0.01652 0.384 0.616
#> SRR1486845 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1362866 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1456138 2 0.4690 0.63591 0.100 0.900
#> SRR1416248 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1383907 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1311018 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1375699 1 0.9993 0.40537 0.516 0.484
#> SRR1429846 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR613550 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1348402 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1324025 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1318879 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR820755 1 0.9635 -0.05087 0.612 0.388
#> SRR1485830 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR599313 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1415398 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1326205 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1421327 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1083311 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1499303 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1079522 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1452935 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1379495 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR661361 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR615778 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.9522 0.02857 0.372 0.628
#> SRR1433555 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1308650 2 0.4690 0.75412 0.100 0.900
#> SRR1388354 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1317446 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1413602 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1479955 2 0.5629 0.59679 0.132 0.868
#> SRR809853 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR661313 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1499935 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1447303 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1429408 2 0.9491 -0.01074 0.368 0.632
#> SRR1433950 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1409854 1 0.8555 0.35353 0.720 0.280
#> SRR1435229 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1414229 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1400974 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1399971 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR613927 2 0.8763 0.79484 0.296 0.704
#> SRR1457854 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0376 0.81636 0.996 0.004
#> SRR813776 1 0.9732 -0.11785 0.596 0.404
#> SRR808196 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1101085 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR614395 1 0.4562 0.72370 0.904 0.096
#> SRR1478251 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1370551 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR665310 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1420109 2 0.8713 0.79920 0.292 0.708
#> SRR1330920 1 0.0672 0.81355 0.992 0.008
#> SRR1419539 2 0.6531 0.77271 0.168 0.832
#> SRR1359447 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1347259 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR613915 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1384395 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR821715 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1478228 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.5519 0.67852 0.872 0.128
#> SRR1341480 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1341344 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1326270 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1498838 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1416313 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR808566 2 0.9909 -0.23745 0.444 0.556
#> SRR1430270 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1367825 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR613533 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR661267 1 0.9580 -0.01584 0.620 0.380
#> SRR810665 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1407250 1 0.8763 0.30488 0.704 0.296
#> SRR1420067 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR812536 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1370850 2 0.0938 0.71369 0.012 0.988
#> SRR1486195 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1407671 1 0.9044 0.66913 0.680 0.320
#> SRR1446375 2 0.9933 0.56082 0.452 0.548
#> SRR1465230 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR614119 1 0.4690 0.71830 0.900 0.100
#> SRR1356101 2 0.0376 0.72160 0.004 0.996
#> SRR1404209 1 0.1843 0.79680 0.972 0.028
#> SRR1392676 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR665538 1 0.1414 0.80370 0.980 0.020
#> SRR660510 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1445655 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR658953 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1485312 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1317631 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1488610 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1330588 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1316367 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1091302 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR818263 1 0.3879 0.74808 0.924 0.076
#> SRR1404909 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR663076 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0672 0.71607 0.008 0.992
#> SRR1442422 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1465893 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR654862 1 0.3584 0.75703 0.932 0.068
#> SRR1407112 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1332969 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1353199 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1378885 2 0.9833 0.60965 0.424 0.576
#> SRR665357 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR662186 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1501020 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1347819 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1480813 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1472576 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1431781 1 0.8909 0.68265 0.692 0.308
#> SRR1452270 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1500472 2 0.9661 0.67209 0.392 0.608
#> SRR1417632 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1350153 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1458113 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1326579 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.9580 -0.00132 0.380 0.620
#> SRR1096712 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1090407 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1083752 2 0.4562 0.64023 0.096 0.904
#> SRR1377599 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1488449 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1318354 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1359062 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1398924 1 0.9170 0.10043 0.668 0.332
#> SRR663783 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1319204 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1369070 2 0.0672 0.71607 0.008 0.992
#> SRR615659 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1316982 2 0.6343 0.77061 0.160 0.840
#> SRR1498595 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1377423 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1312310 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1485613 1 0.0376 0.81636 0.996 0.004
#> SRR1338426 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1353309 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR658941 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1101643 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.4562 0.72351 0.904 0.096
#> SRR1368874 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1324085 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1363858 1 0.3114 0.79876 0.944 0.056
#> SRR819820 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1337342 1 0.1414 0.80375 0.980 0.020
#> SRR655206 2 0.3879 0.74707 0.076 0.924
#> SRR1387013 2 0.4562 0.64023 0.096 0.904
#> SRR1317410 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1343741 2 0.0938 0.71369 0.012 0.988
#> SRR1381288 2 0.0672 0.71607 0.008 0.992
#> SRR1415379 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1099622 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR663197 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1394836 2 0.1843 0.73073 0.028 0.972
#> SRR661699 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR813680 1 0.8763 0.30500 0.704 0.296
#> SRR1410678 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1378109 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1499174 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1382851 2 0.5294 0.61357 0.120 0.880
#> SRR1433410 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR661167 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1432518 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR660462 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1374608 1 0.9881 0.52485 0.564 0.436
#> SRR657949 2 0.9866 0.59362 0.432 0.568
#> SRR1308882 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR655768 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1485870 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1444138 1 0.4431 0.72969 0.908 0.092
#> SRR1417342 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1470193 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1091380 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1099096 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1467102 2 0.5629 0.76306 0.132 0.868
#> SRR1485416 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR818821 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR809963 1 0.4562 0.72370 0.904 0.096
#> SRR1072247 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1353710 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1445259 2 0.9358 0.73087 0.352 0.648
#> SRR1408393 1 0.8144 0.42978 0.748 0.252
#> SRR1361522 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.4690 0.63591 0.100 0.900
#> SRR1310542 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1333485 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1406437 2 0.3733 0.74579 0.072 0.928
#> SRR1354931 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1391856 2 0.3733 0.74579 0.072 0.928
#> SRR1446738 2 0.0376 0.71796 0.004 0.996
#> SRR1309032 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1388145 2 0.0672 0.71607 0.008 0.992
#> SRR1432611 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR815869 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR613150 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1375329 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1387921 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1400910 2 0.9661 0.69192 0.392 0.608
#> SRR1444203 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR816177 2 0.3879 0.66072 0.076 0.924
#> SRR658754 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1429603 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1397366 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1446028 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0938 0.71369 0.012 0.988
#> SRR1337606 1 0.1843 0.81000 0.972 0.028
#> SRR659109 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1337192 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1342067 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1385389 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1075971 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.0672 0.81317 0.992 0.008
#> SRR1430549 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR612935 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR661481 2 0.0938 0.71369 0.012 0.988
#> SRR1354117 2 0.0376 0.72160 0.004 0.996
#> SRR1393596 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1452164 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1070503 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1499894 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1082883 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.3879 0.74828 0.924 0.076
#> SRR1332443 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1328620 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1396294 2 0.9732 -0.05933 0.404 0.596
#> SRR1419917 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR662114 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1489199 1 0.6712 0.59715 0.824 0.176
#> SRR813584 2 0.1414 0.70817 0.020 0.980
#> SRR1069638 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR614864 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1433392 1 0.4815 0.71314 0.896 0.104
#> SRR1377777 2 0.5408 0.60719 0.124 0.876
#> SRR2167710 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1401252 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1309963 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1338031 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1486889 1 0.4815 0.71314 0.896 0.104
#> SRR1380393 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1337010 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1486538 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1340486 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1377696 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1465459 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1080270 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1312501 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1093148 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1467080 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1410866 2 0.0672 0.71607 0.008 0.992
#> SRR816475 2 0.9286 0.07139 0.344 0.656
#> SRR1379198 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR613342 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1452246 2 0.4690 0.63591 0.100 0.900
#> SRR1338836 2 0.0938 0.71369 0.012 0.988
#> SRR1369129 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1396616 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR813824 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1082376 1 0.3879 0.74808 0.924 0.076
#> SRR1500891 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR807543 2 0.9922 0.56022 0.448 0.552
#> SRR1091572 1 0.3584 0.75699 0.932 0.068
#> SRR1346689 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1332424 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR663729 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1097013 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1485357 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR655816 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1500113 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.5178 0.61721 0.116 0.884
#> SRR1355172 1 0.8713 0.31745 0.708 0.292
#> SRR655531 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1338147 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1413329 1 0.9996 -0.40613 0.512 0.488
#> SRR1485931 2 0.4815 0.63156 0.104 0.896
#> SRR1420873 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1333308 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1452033 1 0.2043 0.79320 0.968 0.032
#> SRR1467316 2 0.6148 0.56837 0.152 0.848
#> SRR809018 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1375351 2 0.0672 0.71607 0.008 0.992
#> SRR663440 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1471755 2 0.3431 0.67188 0.064 0.936
#> SRR808019 1 0.8499 0.36516 0.724 0.276
#> SRR1479133 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR615069 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1456185 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1350069 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR816316 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR664795 1 0.7453 0.52458 0.788 0.212
#> SRR1490721 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR810643 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1430333 2 0.9850 0.60161 0.428 0.572
#> SRR1085285 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1099072 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1317985 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1351347 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1405525 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0672 0.71607 0.008 0.992
#> SRR819610 2 0.7299 0.48213 0.204 0.796
#> SRR2157314 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR809987 1 0.6801 0.74350 0.820 0.180
#> SRR613639 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1402285 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1077038 1 0.3879 0.74808 0.924 0.076
#> SRR1405660 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1095455 1 0.9993 -0.42631 0.516 0.484
#> SRR1394734 2 0.0938 0.71369 0.012 0.988
#> SRR1317771 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1365894 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1073581 1 0.5059 0.70202 0.888 0.112
#> SRR659804 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0672 0.71607 0.008 0.992
#> SRR1432186 2 0.0672 0.71607 0.008 0.992
#> SRR1473529 2 0.9580 -0.00132 0.380 0.620
#> SRR660764 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR820448 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1328845 1 0.7602 0.72582 0.780 0.220
#> SRR1336415 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1379065 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1459190 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1346773 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.4562 0.72351 0.904 0.096
#> SRR1440898 2 0.0672 0.71607 0.008 0.992
#> SRR1347459 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1081209 2 0.0672 0.71607 0.008 0.992
#> SRR1400202 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1333395 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1309248 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR809161 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1316320 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1432629 2 0.4431 0.64443 0.092 0.908
#> SRR1498931 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1416578 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1405547 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1470534 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1380764 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1309160 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR663489 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1500450 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1078489 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1332648 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR660614 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1470420 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0672 0.71607 0.008 0.992
#> SRR1464766 1 0.2236 0.78952 0.964 0.036
#> SRR615946 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1446481 2 0.0672 0.71607 0.008 0.992
#> SRR1467656 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1402962 1 0.1184 0.80693 0.984 0.016
#> SRR660224 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.8443 0.37654 0.728 0.272
#> SRR1415316 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR661108 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR2170173 2 0.9608 0.68863 0.384 0.616
#> SRR817329 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1401990 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1467745 2 0.0938 0.71369 0.012 0.988
#> SRR1471795 2 0.0938 0.71369 0.012 0.988
#> SRR1415637 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR813137 1 0.3879 0.74808 0.924 0.076
#> SRR1314873 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0376 0.81636 0.996 0.004
#> SRR1419692 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR818797 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR2164608 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1455586 2 0.3274 0.74181 0.060 0.940
#> SRR819459 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1488939 2 0.7674 0.44103 0.224 0.776
#> SRR1433232 2 0.4562 0.64023 0.096 0.904
#> SRR1385501 1 0.4161 0.73956 0.916 0.084
#> SRR1361652 1 0.1184 0.80732 0.984 0.016
#> SRR1437119 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1478547 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1430910 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1310584 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1486762 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1480854 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1489394 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1418085 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1340221 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1473058 2 0.0938 0.71369 0.012 0.988
#> SRR1405165 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1433004 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.4562 0.72351 0.904 0.096
#> SRR1098567 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1098712 2 0.9491 -0.02968 0.368 0.632
#> SRR1455038 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.4022 0.74830 0.080 0.920
#> SRR1403005 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1348378 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1475192 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1432085 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1452468 1 0.0376 0.81655 0.996 0.004
#> SRR1347060 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1414139 2 0.4298 0.75072 0.088 0.912
#> SRR1447962 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1444324 2 0.0376 0.72160 0.004 0.996
#> SRR1415004 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1343302 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1373746 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1405331 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1345609 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1380208 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1322840 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1399797 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1416654 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1315081 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1369196 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1400847 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1365291 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1367920 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1366648 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1441679 2 0.0000 0.71972 0.000 1.000
#> SRR1082173 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1363968 1 0.0672 0.81317 0.992 0.008
#> SRR814387 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR657599 1 0.8386 0.38769 0.732 0.268
#> SRR1386689 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1395575 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1453811 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1441159 1 0.0000 0.81934 1.000 0.000
#> SRR1403154 1 0.8661 0.69847 0.712 0.288
#> SRR1468722 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
#> SRR1310275 2 0.8661 0.80291 0.288 0.712
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 3 0.6111 0.3856 0.396 0.000 0.604
#> SRR1331708 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464258 1 0.3038 0.8015 0.896 0.000 0.104
#> SRR1454201 1 0.5621 0.4937 0.692 0.000 0.308
#> SRR661589 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1456229 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315165 2 0.5678 0.6127 0.316 0.684 0.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.6309 -0.2862 0.500 0.500 0.000
#> SRR1094457 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1095575 1 0.5835 0.4262 0.660 0.000 0.340
#> SRR1315931 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1431037 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1395554 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR818002 2 0.1964 0.6458 0.000 0.944 0.056
#> SRR1344143 2 0.3686 0.6120 0.000 0.860 0.140
#> SRR1486845 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.6192 0.2832 0.000 0.580 0.420
#> SRR1456138 2 0.4555 0.5805 0.000 0.800 0.200
#> SRR1416248 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 2 0.5098 0.6439 0.248 0.752 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.4702 0.5731 0.000 0.788 0.212
#> SRR1429846 3 0.5098 0.6719 0.248 0.000 0.752
#> SRR613550 3 0.3412 0.8138 0.124 0.000 0.876
#> SRR1348402 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324025 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1318879 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR820755 3 0.6215 0.2966 0.428 0.000 0.572
#> SRR1485830 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR599313 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1326205 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1421327 2 0.5431 0.6297 0.284 0.716 0.000
#> SRR1083311 3 0.1860 0.8660 0.052 0.000 0.948
#> SRR1499303 2 0.4346 0.6590 0.184 0.816 0.000
#> SRR1079522 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452935 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 3 0.5968 0.3350 0.000 0.364 0.636
#> SRR661361 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR615778 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.1163 0.6503 0.000 0.972 0.028
#> SRR1433555 3 0.1860 0.8660 0.052 0.000 0.948
#> SRR1308650 3 0.5591 0.4470 0.000 0.304 0.696
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1413602 3 0.1860 0.8660 0.052 0.000 0.948
#> SRR1479955 2 0.4750 0.5700 0.000 0.784 0.216
#> SRR809853 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1499935 2 0.5098 0.6439 0.248 0.752 0.000
#> SRR1447303 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1429408 2 0.4636 0.6720 0.104 0.852 0.044
#> SRR1433950 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 3 0.6008 0.3173 0.000 0.372 0.628
#> SRR1409854 1 0.6309 -0.0543 0.504 0.000 0.496
#> SRR1435229 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1400974 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1399971 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.6062 0.4116 0.384 0.000 0.616
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR813776 3 0.6192 0.3193 0.420 0.000 0.580
#> SRR808196 2 0.6192 0.4727 0.420 0.580 0.000
#> SRR1101085 2 0.5621 0.6175 0.308 0.692 0.000
#> SRR614395 1 0.5254 0.5807 0.736 0.000 0.264
#> SRR1478251 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1370551 2 0.6280 0.1819 0.000 0.540 0.460
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1420109 3 0.5397 0.6296 0.280 0.000 0.720
#> SRR1330920 1 0.1529 0.8681 0.960 0.000 0.040
#> SRR1419539 3 0.1529 0.8561 0.040 0.000 0.960
#> SRR1359447 3 0.4526 0.7703 0.040 0.104 0.856
#> SRR1347259 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR613915 3 0.5178 0.6599 0.256 0.000 0.744
#> SRR1384395 3 0.1529 0.8561 0.040 0.000 0.960
#> SRR821715 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1478228 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.6168 0.2454 0.588 0.000 0.412
#> SRR1341480 2 0.5098 0.6439 0.248 0.752 0.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.5178 0.6599 0.256 0.000 0.744
#> SRR1498838 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1416313 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR808566 2 0.3846 0.6709 0.108 0.876 0.016
#> SRR1430270 2 0.6215 0.4559 0.428 0.572 0.000
#> SRR1367825 3 0.1860 0.8660 0.052 0.000 0.948
#> SRR613533 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR661267 3 0.5810 0.5173 0.336 0.000 0.664
#> SRR810665 2 0.6192 0.2832 0.000 0.580 0.420
#> SRR1407250 1 0.6215 0.1911 0.572 0.000 0.428
#> SRR1420067 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1370850 2 0.4750 0.5700 0.000 0.784 0.216
#> SRR1486195 3 0.5968 0.3350 0.000 0.364 0.636
#> SRR1407671 2 0.2066 0.6446 0.000 0.940 0.060
#> SRR1446375 1 0.5835 0.4262 0.660 0.000 0.340
#> SRR1465230 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR614119 1 0.5760 0.4544 0.672 0.000 0.328
#> SRR1356101 3 0.5650 0.4331 0.000 0.312 0.688
#> SRR1404209 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.5926 0.4040 0.000 0.644 0.356
#> SRR665538 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1445655 2 0.5098 0.6439 0.248 0.752 0.000
#> SRR658953 1 0.1163 0.8800 0.972 0.000 0.028
#> SRR2166459 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.5591 0.4816 0.000 0.696 0.304
#> SRR1485312 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1317631 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1316367 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 2 0.5706 0.6100 0.320 0.680 0.000
#> SRR818263 1 0.4178 0.7282 0.828 0.000 0.172
#> SRR1404909 2 0.3551 0.6672 0.132 0.868 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.5327 0.5197 0.000 0.728 0.272
#> SRR1442422 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.5706 0.4693 0.680 0.000 0.320
#> SRR1407112 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1332969 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1353199 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1378885 3 0.5397 0.6210 0.280 0.000 0.720
#> SRR665357 3 0.1529 0.8561 0.040 0.000 0.960
#> SRR662186 2 0.6180 0.2917 0.000 0.584 0.416
#> SRR1501020 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1347819 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1480813 2 0.5678 0.4659 0.000 0.684 0.316
#> SRR1472576 2 0.0000 0.6535 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431781 2 0.4887 0.6492 0.228 0.772 0.000
#> SRR1452270 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1500472 1 0.6154 0.2641 0.592 0.000 0.408
#> SRR1417632 2 0.5529 0.6239 0.296 0.704 0.000
#> SRR1350153 2 0.6192 0.2832 0.000 0.580 0.420
#> SRR1458113 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1326579 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.4654 0.5745 0.000 0.792 0.208
#> SRR1096712 3 0.1860 0.8660 0.052 0.000 0.948
#> SRR1090407 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1083752 2 0.1163 0.6503 0.000 0.972 0.028
#> SRR1377599 2 0.5098 0.6439 0.248 0.752 0.000
#> SRR1488449 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1318354 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1359062 3 0.1860 0.8660 0.052 0.000 0.948
#> SRR1398924 1 0.5940 0.6011 0.760 0.204 0.036
#> SRR663783 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1319204 3 0.1860 0.8660 0.052 0.000 0.948
#> SRR1369070 2 0.5431 0.5064 0.000 0.716 0.284
#> SRR615659 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.6244 0.2355 0.000 0.560 0.440
#> SRR1316982 3 0.2261 0.7589 0.000 0.068 0.932
#> SRR1498595 2 0.0000 0.6535 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377423 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1312310 2 0.6280 0.1819 0.000 0.540 0.460
#> SRR1485613 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.1860 0.8660 0.052 0.000 0.948
#> SRR1353309 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR658941 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.1411 0.8720 0.964 0.000 0.036
#> SRR1368874 3 0.6008 0.3173 0.000 0.372 0.628
#> SRR1324085 2 0.5098 0.6439 0.248 0.752 0.000
#> SRR1363858 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR819820 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1337342 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR655206 3 0.1163 0.8444 0.028 0.000 0.972
#> SRR1387013 2 0.1964 0.6458 0.000 0.944 0.056
#> SRR1317410 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440161 3 0.5810 0.3895 0.000 0.336 0.664
#> SRR1343741 2 0.5363 0.5155 0.000 0.724 0.276
#> SRR1381288 2 0.5706 0.4604 0.000 0.680 0.320
#> SRR1415379 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1099622 2 0.6280 0.1819 0.000 0.540 0.460
#> SRR663197 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1394836 3 0.0000 0.8148 0.000 0.000 1.000
#> SRR661699 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR813680 3 0.6180 0.3301 0.416 0.000 0.584
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 2 0.5882 0.5880 0.348 0.652 0.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.6192 0.2832 0.000 0.580 0.420
#> SRR1382851 2 0.1860 0.6466 0.000 0.948 0.052
#> SRR1433410 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR661167 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1432518 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR660462 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1374608 2 0.9138 0.3990 0.376 0.476 0.148
#> SRR657949 3 0.6274 0.2138 0.456 0.000 0.544
#> SRR1308882 2 0.5810 0.5984 0.336 0.664 0.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 2 0.5497 0.6259 0.292 0.708 0.000
#> SRR1444138 1 0.5810 0.4340 0.664 0.000 0.336
#> SRR1417342 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 2 0.5760 0.6044 0.328 0.672 0.000
#> SRR1091380 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1099096 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.5560 0.3756 0.700 0.300 0.000
#> SRR1467102 3 0.0000 0.8148 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485416 2 0.5621 0.6175 0.308 0.692 0.000
#> SRR818821 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR809963 1 0.5254 0.5807 0.736 0.000 0.264
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 2 0.5810 0.5984 0.336 0.664 0.000
#> SRR1445259 1 0.5968 0.3660 0.636 0.000 0.364
#> SRR1408393 1 0.6307 -0.0239 0.512 0.000 0.488
#> SRR1361522 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.4702 0.5731 0.000 0.788 0.212
#> SRR1310542 3 0.1529 0.8561 0.040 0.000 0.960
#> SRR1333485 2 0.5706 0.6100 0.320 0.680 0.000
#> SRR1406437 3 0.2486 0.8576 0.060 0.008 0.932
#> SRR1354931 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1391856 3 0.5810 0.3895 0.000 0.336 0.664
#> SRR1446738 2 0.5291 0.5238 0.000 0.732 0.268
#> SRR1309032 3 0.6111 0.2592 0.000 0.396 0.604
#> SRR1388145 2 0.5948 0.3973 0.000 0.640 0.360
#> SRR1432611 2 0.6252 0.2252 0.000 0.556 0.444
#> SRR815869 3 0.1529 0.8561 0.040 0.000 0.960
#> SRR613150 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1375329 1 0.6299 0.0305 0.524 0.000 0.476
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 3 0.6008 0.3173 0.000 0.372 0.628
#> SRR1360478 2 0.6154 0.3083 0.000 0.592 0.408
#> SRR1360695 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400910 3 0.9470 0.3580 0.324 0.200 0.476
#> SRR1444203 2 0.5859 0.5916 0.344 0.656 0.000
#> SRR816177 2 0.1964 0.6458 0.000 0.944 0.056
#> SRR658754 3 0.1860 0.8660 0.052 0.000 0.948
#> SRR1429603 2 0.5760 0.6044 0.328 0.672 0.000
#> SRR1397366 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1446028 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.4702 0.5731 0.000 0.788 0.212
#> SRR1337606 1 0.0892 0.8855 0.980 0.020 0.000
#> SRR659109 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1337192 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 2 0.5706 0.6100 0.320 0.680 0.000
#> SRR1385389 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR661481 2 0.5363 0.5155 0.000 0.724 0.276
#> SRR1354117 3 0.5810 0.3895 0.000 0.336 0.664
#> SRR1393596 2 0.5431 0.6297 0.284 0.716 0.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.5465 0.6075 0.288 0.000 0.712
#> SRR1499894 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1082883 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.6291 0.1588 0.000 0.532 0.468
#> SRR662103 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1396294 3 0.9936 -0.2434 0.280 0.348 0.372
#> SRR1419917 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1489199 1 0.5948 0.3762 0.640 0.000 0.360
#> SRR813584 2 0.1964 0.6458 0.000 0.944 0.056
#> SRR1069638 3 0.5497 0.6074 0.292 0.000 0.708
#> SRR614864 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1433392 1 0.5810 0.4342 0.664 0.000 0.336
#> SRR1377777 2 0.4702 0.5731 0.000 0.788 0.212
#> SRR2167710 1 0.1411 0.8714 0.964 0.000 0.036
#> SRR1401252 2 0.5650 0.6151 0.312 0.688 0.000
#> SRR1309963 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.6192 0.2832 0.000 0.580 0.420
#> SRR1486889 1 0.4931 0.6528 0.768 0.000 0.232
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 2 0.5988 0.5669 0.368 0.632 0.000
#> SRR1337010 3 0.6111 0.2592 0.000 0.396 0.604
#> SRR1486520 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1340486 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1377696 2 0.0000 0.6535 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465459 3 0.5216 0.6537 0.260 0.000 0.740
#> SRR1080270 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1312501 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1093148 3 0.1860 0.8660 0.052 0.000 0.948
#> SRR1467080 3 0.1860 0.8660 0.052 0.000 0.948
#> SRR1410866 2 0.5706 0.4604 0.000 0.680 0.320
#> SRR816475 2 0.4605 0.6548 0.204 0.796 0.000
#> SRR1379198 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR613342 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1452246 2 0.4702 0.5731 0.000 0.788 0.212
#> SRR1338836 2 0.5397 0.5110 0.000 0.720 0.280
#> SRR1369129 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1396616 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR813824 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1082376 1 0.5733 0.4607 0.676 0.000 0.324
#> SRR1500891 2 0.5621 0.6175 0.308 0.692 0.000
#> SRR807543 1 0.6295 0.0379 0.528 0.000 0.472
#> SRR1091572 1 0.1643 0.8643 0.956 0.000 0.044
#> SRR1346689 2 0.5810 0.5984 0.336 0.664 0.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR663729 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485357 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR655816 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1500113 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.1860 0.6466 0.000 0.948 0.052
#> SRR1355172 3 0.5835 0.5091 0.340 0.000 0.660
#> SRR655531 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1413329 3 0.6140 0.3623 0.404 0.000 0.596
#> SRR1485931 2 0.5216 0.5316 0.000 0.740 0.260
#> SRR1420873 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.4702 0.5731 0.000 0.788 0.212
#> SRR809018 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1375351 2 0.5760 0.4486 0.000 0.672 0.328
#> SRR663440 3 0.3816 0.7926 0.148 0.000 0.852
#> SRR1471755 2 0.1964 0.6458 0.000 0.944 0.056
#> SRR808019 3 0.6140 0.3652 0.404 0.000 0.596
#> SRR1479133 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR615069 3 0.1860 0.8660 0.052 0.000 0.948
#> SRR1456185 2 0.6204 0.2741 0.000 0.576 0.424
#> SRR1350069 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR664795 3 0.6235 0.2733 0.436 0.000 0.564
#> SRR1490721 2 0.5465 0.6278 0.288 0.712 0.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 3 0.5216 0.6537 0.260 0.000 0.740
#> SRR1085285 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1099072 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.1529 0.8561 0.040 0.000 0.960
#> SRR1351347 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1405525 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.5363 0.5155 0.000 0.724 0.276
#> SRR819610 2 0.1964 0.6458 0.000 0.944 0.056
#> SRR2157314 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.5760 0.4486 0.000 0.672 0.328
#> SRR809987 1 0.5621 0.3542 0.692 0.308 0.000
#> SRR613639 3 0.5178 0.6599 0.256 0.000 0.744
#> SRR1402285 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1077038 1 0.2959 0.8057 0.900 0.000 0.100
#> SRR1405660 3 0.1860 0.8660 0.052 0.000 0.948
#> SRR1095455 1 0.5785 0.4459 0.668 0.000 0.332
#> SRR1394734 2 0.1964 0.6458 0.000 0.944 0.056
#> SRR1317771 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.6034 0.6554 0.212 0.752 0.036
#> SRR1073581 1 0.5678 0.4945 0.684 0.000 0.316
#> SRR659804 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.5706 0.4604 0.000 0.680 0.320
#> SRR1432186 2 0.5098 0.5429 0.000 0.752 0.248
#> SRR1473529 2 0.0000 0.6535 0.000 1.000 0.000
#> SRR660764 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR820448 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328845 2 0.6280 0.3834 0.460 0.540 0.000
#> SRR1336415 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1379065 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1459190 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1346773 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0424 0.8984 0.992 0.000 0.008
#> SRR1440898 2 0.5678 0.4659 0.000 0.684 0.316
#> SRR1347459 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1081209 2 0.5678 0.4659 0.000 0.684 0.316
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 2 0.6026 0.5541 0.376 0.624 0.000
#> SRR1309248 2 0.5178 0.6410 0.256 0.744 0.000
#> SRR809161 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1316320 2 0.3091 0.6738 0.072 0.912 0.016
#> SRR1432629 2 0.4702 0.5731 0.000 0.788 0.212
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1405547 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1470534 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR663489 3 0.1860 0.8660 0.052 0.000 0.948
#> SRR1500450 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 3 0.2261 0.8598 0.068 0.000 0.932
#> SRR1332648 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR660614 3 0.4749 0.7579 0.040 0.116 0.844
#> SRR1470420 3 0.6126 0.2487 0.000 0.400 0.600
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.5397 0.5110 0.000 0.720 0.280
#> SRR1464766 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR615946 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1446481 2 0.5397 0.5110 0.000 0.720 0.280
#> SRR1467656 2 0.6235 0.2454 0.000 0.564 0.436
#> SRR1402962 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR660224 2 0.6244 0.2352 0.000 0.560 0.440
#> SRR665586 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.6126 0.2748 0.600 0.000 0.400
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR2170173 1 0.6204 0.2107 0.576 0.000 0.424
#> SRR817329 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401990 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1467745 2 0.1964 0.6458 0.000 0.944 0.056
#> SRR1471795 2 0.5058 0.5465 0.000 0.756 0.244
#> SRR1415637 2 0.6192 0.2832 0.000 0.580 0.420
#> SRR813137 1 0.5835 0.4247 0.660 0.000 0.340
#> SRR1314873 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR818797 3 0.5098 0.6719 0.248 0.000 0.752
#> SRR2164608 3 0.2165 0.8628 0.064 0.000 0.936
#> SRR1455586 3 0.0000 0.8148 0.000 0.000 1.000
#> SRR819459 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1488939 2 0.4702 0.5731 0.000 0.788 0.212
#> SRR1433232 2 0.4702 0.5731 0.000 0.788 0.212
#> SRR1385501 1 0.5810 0.4340 0.664 0.000 0.336
#> SRR1361652 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1430910 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1310584 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486762 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1480854 2 0.5560 0.6218 0.300 0.700 0.000
#> SRR1489394 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1418085 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1340221 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1473058 2 0.0237 0.6532 0.000 0.996 0.004
#> SRR1405165 3 0.1860 0.8660 0.052 0.000 0.948
#> SRR1433004 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0424 0.8984 0.992 0.000 0.008
#> SRR1098567 3 0.6126 0.2487 0.000 0.400 0.600
#> SRR1098712 2 0.8842 0.6021 0.308 0.548 0.144
#> SRR1455038 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375248 3 0.4842 0.5721 0.000 0.224 0.776
#> SRR1403005 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1348378 2 0.6140 0.3162 0.000 0.596 0.404
#> SRR1413541 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1475192 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1432085 3 0.6008 0.3173 0.000 0.372 0.628
#> SRR1452468 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347060 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1414139 3 0.0000 0.8148 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447962 3 0.6095 0.2692 0.000 0.392 0.608
#> SRR1444324 3 0.5810 0.3895 0.000 0.336 0.664
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 2 0.5810 0.5984 0.336 0.664 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 3 0.6126 0.2487 0.000 0.400 0.600
#> SRR1405331 3 0.6204 0.3080 0.424 0.000 0.576
#> SRR1345609 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.5634 0.6682 0.144 0.800 0.056
#> SRR1322840 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1399797 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1416654 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1315081 3 0.1529 0.8561 0.040 0.000 0.960
#> SRR1369196 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.4346 0.7568 0.184 0.000 0.816
#> SRR1367920 2 0.5138 0.6425 0.252 0.748 0.000
#> SRR1366648 3 0.1860 0.8660 0.052 0.000 0.948
#> SRR1441679 3 0.6111 0.2592 0.000 0.396 0.604
#> SRR1082173 3 0.3941 0.7853 0.156 0.000 0.844
#> SRR1363968 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR657599 3 0.6244 0.2644 0.440 0.000 0.560
#> SRR1386689 2 0.5968 0.5730 0.364 0.636 0.000
#> SRR1395575 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1453811 3 0.5098 0.6719 0.248 0.000 0.752
#> SRR1441159 1 0.0000 0.9057 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 2 0.5810 0.5984 0.336 0.664 0.000
#> SRR1468722 3 0.1964 0.8684 0.056 0.000 0.944
#> SRR1310275 3 0.3482 0.8104 0.128 0.000 0.872
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 3 0.5827 0.2738 0.396 0.036 0.568 0.000
#> SRR1331708 1 0.1557 0.9546 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1464258 1 0.0336 0.9650 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR661589 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.0336 0.9650 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1315165 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.0469 0.9650 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1417809 4 0.1211 0.9320 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1094457 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095575 1 0.0592 0.9652 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1315931 1 0.0188 0.9647 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818002 2 0.1716 0.9519 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1344143 2 0.1557 0.9534 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1486845 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362866 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.2032 0.9551 0.000 0.936 0.036 0.028
#> SRR1456138 2 0.1824 0.9551 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR1416248 1 0.0469 0.9650 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1383907 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.1824 0.9551 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR1429846 3 0.0469 0.9635 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR613550 3 0.0188 0.9656 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1348402 1 0.0592 0.9649 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.1389 0.9582 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1324025 3 0.0336 0.9642 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1318879 3 0.0592 0.9616 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR820755 3 0.1474 0.9414 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1485830 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR599313 1 0.0469 0.9649 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR612263 1 0.1118 0.9591 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.0188 0.9656 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1326205 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421327 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079522 1 0.1302 0.9568 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1452935 3 0.1637 0.9357 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.1716 0.9389 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.1716 0.9523 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.4040 0.7333 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1433555 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.1792 0.9356 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.1824 0.9551 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR809853 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.0188 0.9656 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1499935 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447303 3 0.0707 0.9593 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1429408 4 0.4624 0.4660 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR1433950 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.1716 0.9389 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1409854 1 0.6013 0.5052 0.624 0.064 0.312 0.000
#> SRR1435229 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0469 0.9650 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1414229 3 0.1637 0.9341 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1400974 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.1174 0.9525 0.020 0.012 0.968 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0188 0.9647 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR813776 3 0.1398 0.9475 0.004 0.040 0.956 0.000
#> SRR808196 4 0.0895 0.9476 0.020 0.004 0.000 0.976
#> SRR1101085 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614395 1 0.0524 0.9643 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1478251 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370551 2 0.1938 0.9467 0.000 0.936 0.052 0.012
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.0188 0.9656 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1420109 3 0.3743 0.7840 0.160 0.016 0.824 0.000
#> SRR1330920 1 0.1389 0.9572 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1419539 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359447 3 0.3610 0.7285 0.000 0.200 0.800 0.000
#> SRR1347259 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613915 3 0.0817 0.9583 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1384395 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821715 3 0.0188 0.9656 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1478228 1 0.0469 0.9650 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0188 0.9647 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.5420 0.4421 0.624 0.024 0.352 0.000
#> SRR1341480 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1341344 1 0.1474 0.9558 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.0524 0.9623 0.008 0.004 0.988 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808566 4 0.3123 0.7971 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR1430270 4 0.0921 0.9426 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1367825 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661267 3 0.1211 0.9484 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR810665 2 0.2032 0.9551 0.000 0.936 0.036 0.028
#> SRR1407250 1 0.5361 0.6819 0.716 0.060 0.224 0.000
#> SRR1420067 1 0.1118 0.9617 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.1824 0.9551 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR1486195 2 0.1716 0.9389 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1407671 2 0.1557 0.9534 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1446375 1 0.0707 0.9646 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1465230 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.2443 0.9153 0.916 0.024 0.060 0.000
#> SRR1356101 2 0.1716 0.9389 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1404209 1 0.0817 0.9643 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.1929 0.9571 0.000 0.940 0.024 0.036
#> SRR665538 1 0.0817 0.9634 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658953 1 0.1389 0.9558 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.1302 0.9507 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1485312 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488610 1 0.1474 0.9558 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.0336 0.9642 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1316367 1 0.1211 0.9575 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0188 0.9647 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1091302 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818263 1 0.1557 0.9557 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1404909 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.1890 0.9567 0.000 0.936 0.008 0.056
#> SRR1442422 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465893 1 0.0469 0.9650 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.1557 0.9557 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1407112 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332969 3 0.0188 0.9656 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1353199 3 0.0188 0.9656 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1378885 3 0.0921 0.9564 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR665357 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662186 2 0.1936 0.9555 0.000 0.940 0.032 0.028
#> SRR1501020 3 0.0188 0.9656 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.1975 0.9577 0.000 0.936 0.016 0.048
#> SRR1472576 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1417632 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350153 2 0.2032 0.9551 0.000 0.936 0.036 0.028
#> SRR1458113 3 0.1211 0.9487 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1326579 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.1824 0.9551 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR1096712 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.4072 0.7268 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1377599 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488449 3 0.0188 0.9656 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1318354 3 0.1211 0.9491 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1359062 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398924 1 0.3907 0.7319 0.768 0.232 0.000 0.000
#> SRR663783 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319204 3 0.0336 0.9640 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1369070 2 0.1890 0.9567 0.000 0.936 0.008 0.056
#> SRR615659 1 0.0188 0.9647 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.2021 0.9534 0.000 0.936 0.040 0.024
#> SRR1316982 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498595 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377423 3 0.0188 0.9656 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1312310 2 0.1975 0.9490 0.000 0.936 0.048 0.016
#> SRR1485613 1 0.0817 0.9634 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658941 3 0.1211 0.9484 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.1389 0.9576 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.1716 0.9389 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363858 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819820 3 0.0188 0.9655 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1337342 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR655206 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387013 2 0.1637 0.9531 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1317410 1 0.0469 0.9650 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.1716 0.9389 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1343741 2 0.1890 0.9567 0.000 0.936 0.008 0.056
#> SRR1381288 2 0.1975 0.9577 0.000 0.936 0.016 0.048
#> SRR1415379 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099622 2 0.1938 0.9467 0.000 0.936 0.052 0.012
#> SRR663197 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394836 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661699 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813680 3 0.1629 0.9408 0.024 0.024 0.952 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499174 1 0.0188 0.9647 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.2032 0.9551 0.000 0.936 0.036 0.028
#> SRR1382851 2 0.3528 0.8160 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1433410 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.0817 0.9575 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.4267 0.7255 0.000 0.024 0.188 0.788
#> SRR657949 3 0.1637 0.9356 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1308882 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655768 1 0.0817 0.9634 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1485870 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444138 1 0.0707 0.9646 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091380 3 0.0188 0.9655 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1099096 1 0.0469 0.9650 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1313583 4 0.1716 0.9062 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR1467102 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809963 1 0.0524 0.9643 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445259 1 0.1902 0.9505 0.932 0.064 0.004 0.000
#> SRR1408393 3 0.1888 0.9302 0.044 0.016 0.940 0.000
#> SRR1361522 1 0.0188 0.9647 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.1824 0.9551 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR1310542 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406437 3 0.1022 0.9531 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1354931 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391856 2 0.4103 0.6957 0.000 0.744 0.256 0.000
#> SRR1446738 2 0.1474 0.9530 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1309032 2 0.1716 0.9389 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1388145 2 0.2021 0.9574 0.000 0.936 0.024 0.040
#> SRR1432611 2 0.2021 0.9534 0.000 0.936 0.040 0.024
#> SRR815869 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375329 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.1716 0.9389 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1360478 2 0.2032 0.9551 0.000 0.936 0.036 0.028
#> SRR1360695 1 0.0592 0.9646 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0707 0.9637 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1400910 1 0.4967 0.2885 0.548 0.452 0.000 0.000
#> SRR1444203 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR816177 2 0.1716 0.9519 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR658754 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1397366 3 0.0188 0.9656 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.1824 0.9551 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR1337606 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.1474 0.9558 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0817 0.9645 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0188 0.9654 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1342067 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.1118 0.9584 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.0707 0.9642 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661481 2 0.1890 0.9567 0.000 0.936 0.008 0.056
#> SRR1354117 2 0.1716 0.9389 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1393596 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452164 1 0.0188 0.9656 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.1211 0.9497 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1499894 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082883 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.0817 0.9634 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.1890 0.9444 0.000 0.936 0.056 0.008
#> SRR662103 1 0.0188 0.9647 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.1211 0.9489 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1396294 4 0.3351 0.7942 0.000 0.008 0.148 0.844
#> SRR1419917 1 0.0188 0.9647 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.0817 0.9575 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1489199 1 0.2623 0.9318 0.908 0.064 0.028 0.000
#> SRR813584 2 0.1716 0.9519 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1069638 3 0.6278 0.1913 0.408 0.060 0.532 0.000
#> SRR614864 3 0.0707 0.9593 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1433392 1 0.3105 0.8481 0.868 0.012 0.120 0.000
#> SRR1377777 2 0.1824 0.9551 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR2167710 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401252 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.2032 0.9551 0.000 0.936 0.036 0.028
#> SRR1486889 1 0.4446 0.7452 0.776 0.028 0.196 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0336 0.9654 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1356468 4 0.0657 0.9548 0.004 0.012 0.000 0.984
#> SRR1337010 2 0.1716 0.9389 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1486520 1 0.1557 0.9549 0.944 0.056 0.000 0.000
#> SRR1486538 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377696 4 0.3764 0.6962 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1465459 3 0.0817 0.9583 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0469 0.9627 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1093148 3 0.1389 0.9431 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1467080 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.2002 0.9578 0.000 0.936 0.020 0.044
#> SRR816475 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613342 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.1637 0.9531 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1338836 2 0.1890 0.9567 0.000 0.936 0.008 0.056
#> SRR1369129 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396616 3 0.0188 0.9656 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.1022 0.9612 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1500891 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR807543 3 0.1820 0.9389 0.020 0.036 0.944 0.000
#> SRR1091572 1 0.1302 0.9575 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1346689 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332424 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR663729 4 0.0188 0.9646 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1097013 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613675 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1485357 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0592 0.9646 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.1716 0.9519 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1355172 3 0.1297 0.9477 0.020 0.016 0.964 0.000
#> SRR655531 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.0336 0.9642 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1413329 3 0.1557 0.9372 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1485931 2 0.1807 0.9568 0.000 0.940 0.008 0.052
#> SRR1420873 1 0.0817 0.9634 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1333308 4 0.0188 0.9646 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1452033 1 0.0707 0.9642 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.1743 0.9556 0.000 0.940 0.004 0.056
#> SRR809018 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.2002 0.9578 0.000 0.936 0.020 0.044
#> SRR663440 3 0.0817 0.9583 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1471755 2 0.1716 0.9519 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR808019 3 0.6209 0.0323 0.456 0.052 0.492 0.000
#> SRR1479133 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615069 3 0.1118 0.9514 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1456185 2 0.2032 0.9551 0.000 0.936 0.036 0.028
#> SRR1350069 4 0.0592 0.9539 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR816316 1 0.0469 0.9649 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR664795 3 0.3117 0.8658 0.092 0.028 0.880 0.000
#> SRR1490721 4 0.0188 0.9650 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR810643 1 0.0921 0.9629 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1430333 3 0.2739 0.9007 0.036 0.060 0.904 0.000
#> SRR1085285 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.0188 0.9656 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0707 0.9593 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1405525 1 0.1118 0.9617 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0469 0.9650 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.1890 0.9567 0.000 0.936 0.008 0.056
#> SRR819610 2 0.1716 0.9519 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR2157314 1 0.0336 0.9654 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.2002 0.9578 0.000 0.936 0.020 0.044
#> SRR809987 4 0.1792 0.9024 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR613639 3 0.0376 0.9645 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR1402285 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077038 1 0.0469 0.9652 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.1389 0.9558 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1394734 2 0.1716 0.9519 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1317771 1 0.0817 0.9650 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1365894 4 0.4679 0.4431 0.000 0.352 0.000 0.648
#> SRR1073581 1 0.5384 0.5051 0.648 0.028 0.324 0.000
#> SRR659804 1 0.0336 0.9654 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.1888 0.9577 0.000 0.940 0.016 0.044
#> SRR1432186 2 0.1824 0.9551 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR1473529 4 0.4855 0.2669 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR660764 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820448 1 0.0188 0.9647 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1328845 4 0.0895 0.9476 0.020 0.004 0.000 0.976
#> SRR1336415 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1459190 3 0.0188 0.9656 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1346773 1 0.0921 0.9634 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.1936 0.9427 0.940 0.028 0.032 0.000
#> SRR1440898 2 0.1938 0.9574 0.000 0.936 0.012 0.052
#> SRR1347459 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.1888 0.9577 0.000 0.940 0.016 0.044
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.0817 0.9481 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1309248 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR809161 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316320 2 0.4957 0.6881 0.204 0.748 0.000 0.048
#> SRR1432629 2 0.1824 0.9551 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.1389 0.9578 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.0592 0.9646 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1078489 3 0.1389 0.9444 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1332648 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660614 3 0.4830 0.3445 0.000 0.392 0.608 0.000
#> SRR1470420 2 0.1716 0.9389 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.1890 0.9567 0.000 0.936 0.008 0.056
#> SRR1464766 1 0.0707 0.9642 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR615946 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.1890 0.9567 0.000 0.936 0.008 0.056
#> SRR1467656 2 0.2021 0.9534 0.000 0.936 0.040 0.024
#> SRR1402962 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR660224 2 0.2032 0.9551 0.000 0.936 0.036 0.028
#> SRR665586 1 0.0188 0.9647 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.1716 0.9523 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.4227 0.8328 0.820 0.060 0.120 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0336 0.9650 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2170173 3 0.5512 0.0378 0.488 0.016 0.496 0.000
#> SRR817329 1 0.0336 0.9650 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1401990 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467745 2 0.2216 0.9310 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1471795 2 0.1824 0.9551 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR1415637 2 0.1936 0.9555 0.000 0.940 0.032 0.028
#> SRR813137 1 0.0524 0.9622 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR1314873 1 0.0188 0.9647 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0592 0.9646 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1419692 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818797 3 0.0817 0.9583 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR2164608 3 0.1389 0.9431 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1455586 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.1743 0.9556 0.000 0.940 0.004 0.056
#> SRR1433232 2 0.1824 0.9551 0.000 0.936 0.004 0.060
#> SRR1385501 1 0.1211 0.9585 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1361652 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430910 3 0.1389 0.9436 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1310584 1 0.0469 0.9650 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0469 0.9649 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1486762 3 0.0188 0.9656 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1480854 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1473058 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405165 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.0336 0.9650 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.1733 0.9469 0.948 0.024 0.028 0.000
#> SRR1098567 2 0.1716 0.9389 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1098712 4 0.5040 0.4226 0.000 0.364 0.008 0.628
#> SRR1455038 1 0.1118 0.9591 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1375248 3 0.3837 0.6892 0.000 0.224 0.776 0.000
#> SRR1403005 3 0.0336 0.9649 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1348378 2 0.2797 0.9417 0.000 0.900 0.032 0.068
#> SRR1413541 1 0.0188 0.9654 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1392943 4 0.0779 0.9524 0.004 0.016 0.000 0.980
#> SRR1475192 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.1716 0.9389 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1452468 1 0.1716 0.9523 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR1347060 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414139 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.1716 0.9389 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1444324 2 0.1716 0.9389 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.1118 0.9617 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.1637 0.9532 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.1716 0.9389 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1405331 3 0.1584 0.9448 0.012 0.036 0.952 0.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.2401 0.8799 0.004 0.904 0.000 0.092
#> SRR1322840 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0336 0.9642 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9652 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.0817 0.9583 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1367920 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.1716 0.9389 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1082173 3 0.1389 0.9431 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1363968 1 0.0817 0.9634 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0469 0.9650 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.6067 0.3559 0.572 0.052 0.376 0.000
#> SRR1386689 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453811 3 0.0817 0.9583 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1441159 1 0.0592 0.9653 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.9666 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.1302 0.9472 0.000 0.044 0.956 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 1 0.7045 -0.1163 0.364 0.004 0.356 0.004 0.272
#> SRR1331708 5 0.3461 0.7433 0.224 0.004 0.000 0.000 0.772
#> SRR1464258 1 0.1965 0.8409 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1454201 5 0.3210 0.7386 0.212 0.000 0.000 0.000 0.788
#> SRR661589 3 0.0703 0.9514 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1456229 1 0.1792 0.8445 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1315165 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1488960 1 0.1124 0.8559 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1417809 4 0.2597 0.8563 0.092 0.000 0.000 0.884 0.024
#> SRR1094457 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1095575 5 0.5153 0.4101 0.388 0.004 0.028 0.004 0.576
#> SRR1315931 1 0.1608 0.8531 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1430066 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0162 0.9536 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR818002 2 0.0579 0.9558 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1344143 2 0.2930 0.8190 0.000 0.832 0.000 0.004 0.164
#> SRR1486845 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1362866 5 0.3366 0.7433 0.212 0.004 0.000 0.000 0.784
#> SRR1490740 1 0.1341 0.8551 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1446627 2 0.0324 0.9567 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1456138 2 0.0798 0.9526 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1416248 1 0.1124 0.8559 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1383907 4 0.1082 0.9339 0.000 0.008 0.000 0.964 0.028
#> SRR1311018 1 0.0162 0.8664 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1375699 2 0.1082 0.9484 0.000 0.964 0.000 0.008 0.028
#> SRR1429846 3 0.0794 0.9500 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR613550 3 0.0794 0.9501 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1348402 1 0.1671 0.8356 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1345146 5 0.3365 0.7375 0.180 0.008 0.000 0.004 0.808
#> SRR1324025 3 0.0703 0.9514 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1318879 3 0.4426 0.3315 0.000 0.004 0.612 0.004 0.380
#> SRR820755 3 0.1952 0.9081 0.004 0.000 0.912 0.000 0.084
#> SRR1485830 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR599313 1 0.3857 0.5010 0.688 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR612263 5 0.4310 0.4873 0.392 0.004 0.000 0.000 0.604
#> SRR1415398 3 0.0703 0.9514 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1326205 4 0.0798 0.9353 0.000 0.008 0.000 0.976 0.016
#> SRR1421327 4 0.1331 0.9302 0.000 0.008 0.000 0.952 0.040
#> SRR1083311 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0898 0.9359 0.000 0.008 0.000 0.972 0.020
#> SRR1079522 5 0.3838 0.6677 0.280 0.004 0.000 0.000 0.716
#> SRR1452935 5 0.3452 0.6435 0.000 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR1379495 1 0.0162 0.8664 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1470459 2 0.1444 0.9463 0.000 0.948 0.012 0.000 0.040
#> SRR661361 3 0.0703 0.9514 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR615778 5 0.3266 0.7402 0.200 0.004 0.000 0.000 0.796
#> SRR1447564 1 0.1341 0.8571 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1455195 5 0.4088 0.5869 0.368 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR655182 1 0.0955 0.8646 0.968 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1335140 2 0.4335 0.7327 0.000 0.760 0.000 0.168 0.072
#> SRR1433555 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.1872 0.9376 0.000 0.928 0.020 0.000 0.052
#> SRR1388354 1 0.0162 0.8664 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0162 0.9525 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1479955 2 0.0798 0.9526 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR809853 1 0.1908 0.8389 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR661313 3 0.0703 0.9514 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1499935 4 0.0579 0.9379 0.000 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1447303 3 0.0880 0.9486 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1429408 4 0.4572 0.5988 0.000 0.280 0.000 0.684 0.036
#> SRR1433950 1 0.1341 0.8565 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1362081 2 0.1444 0.9463 0.000 0.948 0.012 0.000 0.040
#> SRR1409854 5 0.4183 0.7254 0.136 0.000 0.084 0.000 0.780
#> SRR1435229 5 0.3196 0.7409 0.192 0.004 0.000 0.000 0.804
#> SRR1085996 1 0.1792 0.8478 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1414229 5 0.3333 0.6828 0.000 0.004 0.208 0.000 0.788
#> SRR1400974 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0451 0.8669 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR613927 3 0.1571 0.9274 0.004 0.000 0.936 0.000 0.060
#> SRR1457854 1 0.0162 0.8664 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1473714 1 0.2570 0.8331 0.880 0.004 0.000 0.008 0.108
#> SRR813776 3 0.2179 0.8919 0.004 0.000 0.896 0.000 0.100
#> SRR808196 4 0.2103 0.8935 0.020 0.004 0.000 0.920 0.056
#> SRR1101085 4 0.1082 0.9339 0.000 0.008 0.000 0.964 0.028
#> SRR614395 1 0.2361 0.8360 0.892 0.000 0.012 0.000 0.096
#> SRR1478251 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1370551 2 0.1443 0.9493 0.000 0.948 0.004 0.004 0.044
#> SRR1362310 1 0.0162 0.8664 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR665310 3 0.0703 0.9514 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1420109 3 0.4657 0.6706 0.152 0.000 0.740 0.000 0.108
#> SRR1330920 5 0.3816 0.6377 0.304 0.000 0.000 0.000 0.696
#> SRR1419539 3 0.2011 0.8959 0.000 0.000 0.908 0.004 0.088
#> SRR1359447 3 0.3449 0.7592 0.000 0.164 0.812 0.000 0.024
#> SRR1347259 4 0.1628 0.9279 0.000 0.008 0.000 0.936 0.056
#> SRR613915 3 0.0963 0.9468 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1384395 3 0.0794 0.9395 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR821715 3 0.0703 0.9514 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1478228 1 0.1124 0.8559 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1445637 1 0.0609 0.8659 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR608150 5 0.3398 0.7420 0.216 0.004 0.000 0.000 0.780
#> SRR1096383 1 0.5980 0.4098 0.612 0.004 0.140 0.004 0.240
#> SRR1341480 4 0.1082 0.9339 0.000 0.008 0.000 0.964 0.028
#> SRR1341344 5 0.4135 0.6488 0.340 0.004 0.000 0.000 0.656
#> SRR1326270 3 0.0703 0.9514 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1498838 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0162 0.9537 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR808566 4 0.2971 0.8126 0.000 0.156 0.000 0.836 0.008
#> SRR1430270 4 0.0290 0.9334 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0404 0.9533 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR661267 3 0.2858 0.8733 0.024 0.004 0.880 0.004 0.088
#> SRR810665 2 0.0324 0.9567 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1407250 5 0.3731 0.7419 0.160 0.000 0.040 0.000 0.800
#> SRR1420067 1 0.3534 0.6052 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256
#> SRR1473632 1 0.1768 0.8508 0.924 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR812536 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0579 0.9558 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1486195 2 0.1444 0.9463 0.000 0.948 0.012 0.000 0.040
#> SRR1407671 5 0.4015 0.3802 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1446375 5 0.4938 0.5001 0.368 0.004 0.020 0.004 0.604
#> SRR1465230 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR614119 1 0.4393 0.5608 0.696 0.004 0.012 0.004 0.284
#> SRR1356101 2 0.1992 0.9313 0.000 0.924 0.032 0.000 0.044
#> SRR1404209 1 0.2833 0.7783 0.852 0.004 0.000 0.004 0.140
#> SRR1392676 2 0.0486 0.9564 0.000 0.988 0.004 0.004 0.004
#> SRR665538 1 0.3920 0.5958 0.724 0.004 0.000 0.004 0.268
#> SRR660510 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0693 0.9373 0.000 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR658953 5 0.3398 0.7268 0.216 0.004 0.000 0.000 0.780
#> SRR2166459 1 0.0609 0.8659 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1070713 2 0.0794 0.9543 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1485312 3 0.0404 0.9534 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1317631 4 0.1697 0.9085 0.000 0.008 0.000 0.932 0.060
#> SRR1488610 5 0.3884 0.7034 0.288 0.004 0.000 0.000 0.708
#> SRR1330588 3 0.0609 0.9523 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1316367 5 0.4009 0.6404 0.312 0.004 0.000 0.000 0.684
#> SRR1433926 1 0.1410 0.8530 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1091302 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR818263 1 0.4307 -0.0294 0.504 0.000 0.000 0.000 0.496
#> SRR1404909 4 0.1168 0.9328 0.000 0.008 0.000 0.960 0.032
#> SRR663076 1 0.0451 0.8653 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1323577 2 0.0579 0.9558 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1442422 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1465893 1 0.0955 0.8586 0.968 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR654862 5 0.3366 0.7134 0.232 0.000 0.000 0.000 0.768
#> SRR1407112 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1332969 3 0.0703 0.9514 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1353199 3 0.0703 0.9514 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1378885 3 0.0963 0.9468 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR665357 3 0.0865 0.9396 0.000 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR662186 2 0.0671 0.9550 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1501020 3 0.0703 0.9514 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1347819 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.1285 0.9516 0.000 0.956 0.004 0.004 0.036
#> SRR1472576 4 0.2074 0.9123 0.000 0.044 0.000 0.920 0.036
#> SRR1431781 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.3666 0.7382 0.196 0.004 0.008 0.004 0.788
#> SRR1417632 4 0.1697 0.9188 0.000 0.008 0.000 0.932 0.060
#> SRR1350153 2 0.1202 0.9516 0.000 0.960 0.004 0.004 0.032
#> SRR1458113 5 0.3730 0.6057 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1326579 5 0.3607 0.7352 0.244 0.004 0.000 0.000 0.752
#> SRR1349363 2 0.1557 0.9350 0.000 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR1096712 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0703 0.9514 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1083752 2 0.4552 0.6046 0.000 0.696 0.000 0.264 0.040
#> SRR1377599 4 0.2612 0.8637 0.000 0.008 0.000 0.868 0.124
#> SRR1488449 3 0.0703 0.9514 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1318354 5 0.4030 0.5022 0.000 0.000 0.352 0.000 0.648
#> SRR1359062 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.4370 0.6879 0.236 0.040 0.000 0.000 0.724
#> SRR663783 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319204 5 0.4491 0.4442 0.000 0.008 0.364 0.004 0.624
#> SRR1369070 2 0.0324 0.9567 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR615659 1 0.1410 0.8530 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1337449 2 0.1365 0.9494 0.000 0.952 0.004 0.004 0.040
#> SRR1316982 3 0.1701 0.9135 0.000 0.016 0.936 0.000 0.048
#> SRR1498595 4 0.1836 0.9197 0.000 0.032 0.000 0.932 0.036
#> SRR1377423 3 0.0510 0.9529 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1312310 2 0.1202 0.9516 0.000 0.960 0.004 0.004 0.032
#> SRR1485613 1 0.3920 0.5958 0.724 0.004 0.000 0.004 0.268
#> SRR1338426 3 0.0290 0.9511 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1353309 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658941 3 0.4389 0.3730 0.000 0.004 0.624 0.004 0.368
#> SRR1101643 1 0.1732 0.8461 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1401468 5 0.4737 0.2133 0.476 0.004 0.004 0.004 0.512
#> SRR1368874 2 0.1364 0.9479 0.000 0.952 0.012 0.000 0.036
#> SRR1324085 4 0.0451 0.9382 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR1363858 1 0.3928 0.5248 0.700 0.000 0.000 0.004 0.296
#> SRR819820 3 0.2741 0.8307 0.000 0.004 0.860 0.004 0.132
#> SRR1337342 5 0.3274 0.7401 0.220 0.000 0.000 0.000 0.780
#> SRR655206 3 0.2392 0.8791 0.000 0.004 0.888 0.004 0.104
#> SRR1387013 2 0.0992 0.9509 0.000 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR1317410 1 0.1124 0.8559 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR608198 5 0.3366 0.7415 0.212 0.004 0.000 0.000 0.784
#> SRR1440161 2 0.1626 0.9422 0.000 0.940 0.016 0.000 0.044
#> SRR1343741 2 0.0290 0.9563 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1381288 2 0.0486 0.9564 0.000 0.988 0.004 0.004 0.004
#> SRR1415379 4 0.0671 0.9327 0.004 0.000 0.000 0.980 0.016
#> SRR1099622 2 0.1717 0.9458 0.000 0.936 0.008 0.004 0.052
#> SRR663197 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394836 3 0.2305 0.8855 0.000 0.012 0.896 0.000 0.092
#> SRR661699 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813680 3 0.4451 0.7377 0.132 0.004 0.776 0.004 0.084
#> SRR1410678 1 0.0162 0.8664 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1378109 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1499174 1 0.1478 0.8518 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1311486 2 0.0486 0.9564 0.000 0.988 0.004 0.004 0.004
#> SRR1382851 2 0.6315 0.2069 0.000 0.468 0.000 0.160 0.372
#> SRR1433410 5 0.3550 0.7382 0.236 0.004 0.000 0.000 0.760
#> SRR661167 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.1121 0.9311 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR660462 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.4995 0.5443 0.000 0.004 0.048 0.656 0.292
#> SRR657949 3 0.2719 0.8497 0.004 0.000 0.852 0.000 0.144
#> SRR1308882 4 0.0451 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR655768 1 0.3920 0.5958 0.724 0.004 0.000 0.004 0.268
#> SRR1485870 4 0.2361 0.8998 0.000 0.012 0.000 0.892 0.096
#> SRR1444138 1 0.3006 0.7699 0.836 0.004 0.000 0.004 0.156
#> SRR1417342 1 0.0865 0.8615 0.972 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1470193 4 0.1168 0.9342 0.000 0.008 0.000 0.960 0.032
#> SRR1091380 3 0.2741 0.8307 0.000 0.004 0.860 0.004 0.132
#> SRR1099096 1 0.1124 0.8559 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1313583 4 0.4310 0.3443 0.392 0.000 0.000 0.604 0.004
#> SRR1467102 3 0.1357 0.9226 0.000 0.004 0.948 0.000 0.048
#> SRR1485416 4 0.1082 0.9339 0.000 0.008 0.000 0.964 0.028
#> SRR818821 3 0.0290 0.9534 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR809963 1 0.2361 0.8360 0.892 0.000 0.012 0.000 0.096
#> SRR1072247 1 0.0324 0.8663 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1353710 4 0.1168 0.9351 0.000 0.008 0.000 0.960 0.032
#> SRR1445259 5 0.3039 0.7517 0.152 0.000 0.012 0.000 0.836
#> SRR1408393 3 0.2416 0.8849 0.012 0.000 0.888 0.000 0.100
#> SRR1361522 1 0.1478 0.8518 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1368597 1 0.1270 0.8576 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1309680 2 0.0579 0.9558 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1310542 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0798 0.9366 0.000 0.008 0.000 0.976 0.016
#> SRR1406437 5 0.4535 0.5719 0.020 0.004 0.276 0.004 0.696
#> SRR1354931 3 0.0703 0.9514 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1391856 2 0.4548 0.6628 0.000 0.716 0.232 0.000 0.052
#> SRR1446738 2 0.4489 0.3682 0.000 0.572 0.000 0.008 0.420
#> SRR1309032 2 0.1444 0.9463 0.000 0.948 0.012 0.000 0.040
#> SRR1388145 2 0.0613 0.9564 0.000 0.984 0.004 0.004 0.008
#> SRR1432611 2 0.1116 0.9526 0.000 0.964 0.004 0.004 0.028
#> SRR815869 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375329 5 0.2877 0.7497 0.144 0.004 0.004 0.000 0.848
#> SRR1387921 1 0.0162 0.8664 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1466792 2 0.1444 0.9463 0.000 0.948 0.012 0.000 0.040
#> SRR1360478 2 0.0324 0.9567 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1360695 1 0.1788 0.8389 0.932 0.004 0.000 0.008 0.056
#> SRR812943 5 0.4321 0.4772 0.396 0.004 0.000 0.000 0.600
#> SRR1400910 5 0.3806 0.7317 0.096 0.072 0.008 0.000 0.824
#> SRR1444203 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR816177 2 0.0693 0.9551 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR658754 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.1168 0.9351 0.000 0.008 0.000 0.960 0.032
#> SRR1397366 3 0.0703 0.9514 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1446028 1 0.0324 0.8663 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1083918 2 0.0579 0.9558 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1337606 5 0.3010 0.7444 0.172 0.004 0.000 0.000 0.824
#> SRR659109 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337192 5 0.3949 0.6955 0.300 0.004 0.000 0.000 0.696
#> SRR656946 1 0.2352 0.8410 0.896 0.004 0.000 0.008 0.092
#> SRR1476102 1 0.2011 0.8332 0.908 0.004 0.000 0.000 0.088
#> SRR1476447 1 0.0880 0.8649 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1342067 4 0.0579 0.9380 0.000 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1385389 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1075971 1 0.0324 0.8663 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR614419 5 0.4135 0.5973 0.340 0.004 0.000 0.000 0.656
#> SRR1322936 5 0.3366 0.7432 0.212 0.004 0.000 0.000 0.784
#> SRR1349121 1 0.2787 0.7819 0.856 0.004 0.000 0.004 0.136
#> SRR1430549 1 0.0671 0.8668 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR612935 3 0.2280 0.8490 0.000 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR661481 2 0.0451 0.9563 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1354117 2 0.1725 0.9400 0.000 0.936 0.020 0.000 0.044
#> SRR1393596 4 0.1484 0.9306 0.000 0.008 0.000 0.944 0.048
#> SRR1452164 1 0.0566 0.8667 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1070503 3 0.1197 0.9403 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1499894 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082883 5 0.3398 0.7420 0.216 0.004 0.000 0.000 0.780
#> SRR1468271 1 0.3992 0.5768 0.712 0.004 0.000 0.004 0.280
#> SRR1332443 1 0.0324 0.8668 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR810295 2 0.1331 0.9482 0.000 0.952 0.008 0.000 0.040
#> SRR662103 1 0.1478 0.8518 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1328620 5 0.4253 0.5305 0.000 0.004 0.332 0.004 0.660
#> SRR1396294 4 0.4101 0.7966 0.012 0.004 0.052 0.808 0.124
#> SRR1419917 1 0.1544 0.8504 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR662114 3 0.3857 0.5000 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1489199 5 0.3282 0.7471 0.188 0.000 0.008 0.000 0.804
#> SRR813584 2 0.0693 0.9556 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1069638 5 0.3555 0.7175 0.052 0.000 0.124 0.000 0.824
#> SRR614864 3 0.0880 0.9486 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1433392 1 0.4343 0.6803 0.768 0.000 0.136 0.000 0.096
#> SRR1377777 2 0.0798 0.9526 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR2167710 1 0.2352 0.8410 0.896 0.004 0.000 0.008 0.092
#> SRR1401252 4 0.1168 0.9328 0.000 0.008 0.000 0.960 0.032
#> SRR1309963 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1338031 1 0.0771 0.8658 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1418628 2 0.1026 0.9535 0.000 0.968 0.004 0.004 0.024
#> SRR1486889 1 0.6016 0.4402 0.600 0.004 0.132 0.004 0.260
#> SRR1380393 1 0.0162 0.8664 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1319731 1 0.1041 0.8576 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1356468 4 0.2228 0.8890 0.012 0.008 0.000 0.912 0.068
#> SRR1337010 2 0.1444 0.9463 0.000 0.948 0.012 0.000 0.040
#> SRR1486520 5 0.4307 0.1973 0.496 0.000 0.000 0.000 0.504
#> SRR1486538 4 0.0579 0.9380 0.000 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1340486 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1377696 4 0.4865 0.6418 0.000 0.064 0.000 0.684 0.252
#> SRR1465459 3 0.0963 0.9468 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1080270 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0290 0.9534 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1093148 5 0.3522 0.6750 0.000 0.004 0.212 0.004 0.780
#> SRR1467080 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.1285 0.9516 0.000 0.956 0.004 0.004 0.036
#> SRR816475 4 0.0798 0.9366 0.000 0.008 0.000 0.976 0.016
#> SRR1379198 4 0.0162 0.9354 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR613342 3 0.0290 0.9536 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1452246 2 0.0798 0.9526 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1338836 2 0.0324 0.9567 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1369129 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1396616 3 0.0703 0.9514 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR813824 3 0.0510 0.9529 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1082376 1 0.2280 0.8326 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1500891 4 0.1082 0.9339 0.000 0.008 0.000 0.964 0.028
#> SRR807543 3 0.2233 0.8880 0.004 0.000 0.892 0.000 0.104
#> SRR1091572 5 0.3707 0.6594 0.284 0.000 0.000 0.000 0.716
#> SRR1346689 4 0.0992 0.9350 0.000 0.008 0.000 0.968 0.024
#> SRR1332424 5 0.3607 0.7359 0.244 0.004 0.000 0.000 0.752
#> SRR663729 4 0.1285 0.9302 0.004 0.004 0.000 0.956 0.036
#> SRR1097013 1 0.0000 0.8670 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613675 5 0.3366 0.7432 0.212 0.004 0.000 0.000 0.784
#> SRR1485357 4 0.0451 0.9379 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR655816 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.2865 0.7842 0.856 0.004 0.000 0.008 0.132
#> SRR1437622 2 0.1106 0.9491 0.000 0.964 0.000 0.012 0.024
#> SRR1355172 3 0.4045 0.7769 0.112 0.004 0.808 0.004 0.072
#> SRR655531 5 0.3480 0.7340 0.248 0.000 0.000 0.000 0.752
#> SRR1338147 3 0.0703 0.9514 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1413329 5 0.4373 0.5665 0.008 0.004 0.300 0.004 0.684
#> SRR1485931 2 0.1124 0.9426 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1420873 1 0.3944 0.5886 0.720 0.004 0.000 0.004 0.272
#> SRR1333308 4 0.1251 0.9321 0.000 0.008 0.000 0.956 0.036
#> SRR1452033 1 0.2833 0.7800 0.852 0.004 0.000 0.004 0.140
#> SRR1467316 2 0.0771 0.9506 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR809018 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0324 0.9567 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR663440 3 0.0963 0.9468 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1471755 2 0.0579 0.9558 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR808019 5 0.5753 0.6395 0.216 0.004 0.132 0.004 0.644
#> SRR1479133 3 0.0703 0.9514 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR615069 5 0.3906 0.5985 0.000 0.004 0.292 0.000 0.704
#> SRR1456185 2 0.0613 0.9564 0.000 0.984 0.004 0.004 0.008
#> SRR1350069 4 0.1731 0.9041 0.004 0.004 0.000 0.932 0.060
#> SRR816316 1 0.1908 0.8441 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR664795 3 0.5843 0.3986 0.292 0.004 0.600 0.004 0.100
#> SRR1490721 5 0.4436 0.2119 0.000 0.008 0.000 0.396 0.596
#> SRR810643 1 0.3636 0.5798 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR1430333 5 0.3421 0.6980 0.016 0.004 0.164 0.000 0.816
#> SRR1085285 3 0.0510 0.9529 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1099072 3 0.0794 0.9501 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1317985 1 0.0865 0.8653 0.972 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1487340 1 0.0510 0.8667 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1420276 3 0.0794 0.9395 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1351347 3 0.1341 0.9203 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1405525 5 0.4122 0.6954 0.304 0.004 0.000 0.004 0.688
#> SRR1370329 1 0.0451 0.8669 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1465001 1 0.1124 0.8559 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1476525 2 0.0579 0.9558 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR819610 2 0.0579 0.9558 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR2157314 1 0.0324 0.8663 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1409465 2 0.0324 0.9567 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR809987 4 0.4161 0.6084 0.280 0.000 0.000 0.704 0.016
#> SRR613639 3 0.1041 0.9477 0.000 0.004 0.964 0.000 0.032
#> SRR1402285 4 0.0162 0.9372 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1077038 1 0.1965 0.8409 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1405660 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 5 0.3366 0.7309 0.212 0.000 0.004 0.000 0.784
#> SRR1394734 2 0.0579 0.9558 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1317771 1 0.1270 0.8610 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1365894 4 0.6206 0.4423 0.000 0.296 0.000 0.532 0.172
#> SRR1073581 1 0.5995 0.4004 0.604 0.004 0.132 0.004 0.256
#> SRR659804 1 0.0451 0.8658 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1345914 2 0.0486 0.9564 0.000 0.988 0.004 0.004 0.004
#> SRR1432186 2 0.0579 0.9558 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1473529 4 0.5415 0.3133 0.000 0.384 0.000 0.552 0.064
#> SRR660764 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820448 1 0.1732 0.8446 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1328845 4 0.2632 0.8733 0.032 0.004 0.000 0.892 0.072
#> SRR1336415 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1379065 4 0.0579 0.9380 0.000 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1459190 3 0.0703 0.9514 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1346773 1 0.4211 0.2762 0.636 0.000 0.000 0.004 0.360
#> SRR1499521 1 0.4333 0.4897 0.672 0.004 0.004 0.004 0.316
#> SRR1440898 2 0.0486 0.9564 0.000 0.988 0.004 0.004 0.004
#> SRR1347459 3 0.0404 0.9534 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1081209 2 0.0324 0.9558 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1400202 1 0.0162 0.8664 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1333395 4 0.3527 0.8222 0.116 0.000 0.000 0.828 0.056
#> SRR1309248 4 0.3488 0.8214 0.000 0.024 0.000 0.808 0.168
#> SRR809161 3 0.0794 0.9500 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1316320 5 0.4316 0.6709 0.056 0.152 0.000 0.012 0.780
#> SRR1432629 2 0.0898 0.9524 0.000 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR1498931 1 0.0324 0.8667 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1416578 4 0.0566 0.9338 0.004 0.000 0.000 0.984 0.012
#> SRR1405547 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1380764 5 0.4219 0.4640 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584
#> SRR1309160 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.2352 0.8232 0.896 0.004 0.000 0.008 0.092
#> SRR1078489 5 0.3387 0.6752 0.004 0.004 0.196 0.000 0.796
#> SRR1332648 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR660614 5 0.5045 0.6415 0.000 0.112 0.172 0.004 0.712
#> SRR1470420 2 0.1444 0.9463 0.000 0.948 0.012 0.000 0.040
#> SRR1475566 1 0.0162 0.8664 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1477949 1 0.0162 0.8664 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1481419 2 0.0486 0.9564 0.000 0.988 0.004 0.004 0.004
#> SRR1464766 1 0.2583 0.7855 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR615946 3 0.0609 0.9520 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1446481 2 0.0613 0.9564 0.000 0.984 0.004 0.004 0.008
#> SRR1467656 2 0.1365 0.9494 0.000 0.952 0.004 0.004 0.040
#> SRR1402962 5 0.4101 0.5557 0.372 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR660224 2 0.0486 0.9564 0.000 0.988 0.004 0.004 0.004
#> SRR665586 1 0.1671 0.8479 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1347166 5 0.3266 0.7402 0.200 0.004 0.000 0.000 0.796
#> SRR1485722 5 0.3612 0.7425 0.172 0.000 0.028 0.000 0.800
#> SRR1415316 1 0.1341 0.8571 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR613390 1 0.1544 0.8511 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR661108 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2170173 5 0.6766 0.4371 0.256 0.004 0.248 0.004 0.488
#> SRR817329 1 0.1671 0.8479 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1401990 4 0.1251 0.9243 0.000 0.008 0.000 0.956 0.036
#> SRR1467745 2 0.3201 0.8728 0.000 0.852 0.000 0.096 0.052
#> SRR1471795 2 0.0579 0.9558 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1415637 2 0.0324 0.9567 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR813137 1 0.2511 0.8225 0.892 0.000 0.028 0.000 0.080
#> SRR1314873 1 0.1608 0.8495 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1401211 1 0.2116 0.8287 0.912 0.004 0.000 0.008 0.076
#> SRR1419692 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR818797 3 0.0880 0.9485 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR2164608 5 0.4572 0.2270 0.000 0.004 0.452 0.004 0.540
#> SRR1455586 3 0.1800 0.9090 0.000 0.020 0.932 0.000 0.048
#> SRR819459 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0955 0.9469 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1433232 2 0.0693 0.9540 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1385501 1 0.4060 0.3981 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1361652 5 0.3160 0.7397 0.188 0.004 0.000 0.000 0.808
#> SRR1437119 1 0.0324 0.8667 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1478547 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 5 0.3741 0.6295 0.000 0.004 0.264 0.000 0.732
#> SRR1310584 1 0.1124 0.8559 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1500216 1 0.3857 0.5010 0.688 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR1486762 3 0.0510 0.9529 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1480854 4 0.1168 0.9328 0.000 0.008 0.000 0.960 0.032
#> SRR1489394 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1418085 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1340221 4 0.0162 0.9354 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1473058 4 0.1310 0.9290 0.000 0.024 0.000 0.956 0.020
#> SRR1405165 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.1544 0.8511 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1471477 1 0.4015 0.5820 0.708 0.004 0.000 0.004 0.284
#> SRR1098567 2 0.1281 0.9493 0.000 0.956 0.012 0.000 0.032
#> SRR1098712 4 0.7339 0.3825 0.048 0.196 0.004 0.500 0.252
#> SRR1455038 5 0.4403 0.3851 0.436 0.004 0.000 0.000 0.560
#> SRR1375248 3 0.4325 0.6554 0.000 0.220 0.736 0.000 0.044
#> SRR1403005 3 0.0880 0.9485 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1348378 2 0.2536 0.9217 0.000 0.900 0.004 0.044 0.052
#> SRR1413541 1 0.1608 0.8495 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1392943 4 0.1571 0.9188 0.000 0.004 0.000 0.936 0.060
#> SRR1475192 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.1597 0.9451 0.000 0.940 0.012 0.000 0.048
#> SRR1452468 5 0.3123 0.7433 0.184 0.004 0.000 0.000 0.812
#> SRR1347060 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414139 3 0.1484 0.9194 0.000 0.008 0.944 0.000 0.048
#> SRR1447962 2 0.1522 0.9462 0.000 0.944 0.012 0.000 0.044
#> SRR1444324 2 0.1818 0.9374 0.000 0.932 0.024 0.000 0.044
#> SRR1415004 1 0.0162 0.8664 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1413436 1 0.3990 0.5037 0.688 0.004 0.000 0.000 0.308
#> SRR1311266 5 0.3398 0.7360 0.216 0.004 0.000 0.000 0.780
#> SRR1343302 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1373746 1 0.0162 0.8664 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1429678 1 0.0609 0.8667 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1469413 2 0.1701 0.9433 0.000 0.936 0.016 0.000 0.048
#> SRR1405331 3 0.2233 0.8880 0.004 0.000 0.892 0.000 0.104
#> SRR1345609 1 0.0566 0.8669 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1380208 5 0.2971 0.6528 0.000 0.156 0.000 0.008 0.836
#> SRR1322840 4 0.0451 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR1399797 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0794 0.9395 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1369196 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0162 0.8664 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1365291 3 0.0963 0.9468 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1367920 4 0.2612 0.8637 0.000 0.008 0.000 0.868 0.124
#> SRR1366648 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0912 0.9529 0.000 0.972 0.012 0.000 0.016
#> SRR1082173 5 0.4218 0.5266 0.000 0.004 0.324 0.004 0.668
#> SRR1363968 1 0.3944 0.5886 0.720 0.004 0.000 0.004 0.272
#> SRR814387 1 0.1124 0.8559 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR657599 5 0.5387 0.6707 0.220 0.004 0.096 0.004 0.676
#> SRR1386689 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1395575 3 0.0609 0.9523 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1453811 3 0.0963 0.9468 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1441159 1 0.4390 -0.0726 0.568 0.000 0.000 0.004 0.428
#> SRR1403154 4 0.0290 0.9383 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.9537 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 5 0.4256 0.2671 0.000 0.000 0.436 0.000 0.564
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 5 0.7595 0.0195 0.280 0.000 0.168 0.000 0.316 0.236
#> SRR1331708 5 0.3213 0.6019 0.048 0.000 0.000 0.000 0.820 0.132
#> SRR1464258 1 0.4131 0.4452 0.624 0.000 0.000 0.000 0.020 0.356
#> SRR1454201 5 0.2389 0.6289 0.052 0.000 0.000 0.000 0.888 0.060
#> SRR661589 3 0.2378 0.8313 0.000 0.000 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1456229 1 0.3734 0.5634 0.716 0.000 0.000 0.000 0.020 0.264
#> SRR1315165 4 0.0291 0.8258 0.000 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1488960 1 0.1643 0.7406 0.924 0.000 0.000 0.000 0.068 0.008
#> SRR1417809 4 0.3830 0.6338 0.148 0.000 0.000 0.788 0.020 0.044
#> SRR1094457 4 0.0000 0.8270 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095575 5 0.6512 0.1742 0.268 0.000 0.024 0.000 0.416 0.292
#> SRR1315931 1 0.2980 0.6774 0.808 0.000 0.000 0.000 0.012 0.180
#> SRR1430066 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0790 0.8519 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR818002 2 0.1387 0.8690 0.000 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1344143 2 0.5783 0.1438 0.000 0.496 0.000 0.000 0.212 0.292
#> SRR1486845 4 0.0632 0.8270 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1362866 5 0.1152 0.6398 0.044 0.000 0.000 0.000 0.952 0.004
#> SRR1490740 1 0.2446 0.7098 0.864 0.000 0.000 0.000 0.012 0.124
#> SRR1446627 2 0.0806 0.8792 0.000 0.972 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR1456138 2 0.1802 0.8496 0.000 0.916 0.000 0.000 0.012 0.072
#> SRR1416248 1 0.1745 0.7387 0.920 0.000 0.000 0.000 0.068 0.012
#> SRR1383907 4 0.2632 0.7839 0.000 0.000 0.000 0.832 0.004 0.164
#> SRR1311018 1 0.0260 0.7610 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1375699 2 0.1700 0.8597 0.000 0.916 0.000 0.000 0.004 0.080
#> SRR1429846 3 0.2996 0.7983 0.000 0.000 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR613550 3 0.2793 0.8130 0.000 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1348402 1 0.2331 0.7252 0.888 0.000 0.000 0.000 0.080 0.032
#> SRR1345146 5 0.4011 0.5687 0.056 0.000 0.000 0.000 0.732 0.212
#> SRR1324025 3 0.2562 0.8252 0.000 0.000 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1318879 3 0.5813 -0.1074 0.000 0.000 0.432 0.000 0.384 0.184
#> SRR820755 3 0.4872 0.6248 0.004 0.000 0.596 0.000 0.064 0.336
#> SRR1485830 4 0.0000 0.8270 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR599313 1 0.5571 0.2895 0.552 0.000 0.000 0.000 0.224 0.224
#> SRR612263 5 0.5553 0.1573 0.324 0.000 0.000 0.000 0.520 0.156
#> SRR1415398 3 0.2664 0.8203 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1326205 4 0.1074 0.8148 0.000 0.000 0.000 0.960 0.012 0.028
#> SRR1421327 4 0.4067 0.7012 0.000 0.000 0.000 0.728 0.060 0.212
#> SRR1083311 3 0.0146 0.8507 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1499303 4 0.2558 0.7888 0.000 0.000 0.000 0.840 0.004 0.156
#> SRR1079522 5 0.4977 0.4149 0.128 0.000 0.000 0.000 0.636 0.236
#> SRR1452935 5 0.3367 0.5854 0.000 0.000 0.104 0.000 0.816 0.080
#> SRR1379495 1 0.0260 0.7610 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1470459 2 0.2320 0.8612 0.000 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR661361 3 0.2562 0.8252 0.000 0.000 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR615778 5 0.1333 0.6398 0.048 0.000 0.000 0.000 0.944 0.008
#> SRR1447564 1 0.1682 0.7454 0.928 0.000 0.000 0.000 0.020 0.052
#> SRR1455195 5 0.3652 0.5390 0.188 0.000 0.000 0.000 0.768 0.044
#> SRR655182 1 0.0622 0.7593 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1335140 2 0.6456 0.1702 0.000 0.504 0.000 0.120 0.076 0.300
#> SRR1433555 3 0.0146 0.8507 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1308650 2 0.2979 0.8302 0.000 0.804 0.004 0.000 0.004 0.188
#> SRR1388354 1 0.0405 0.7608 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1317446 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0405 0.8484 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1479955 2 0.1913 0.8442 0.000 0.908 0.000 0.000 0.012 0.080
#> SRR809853 1 0.3683 0.6447 0.768 0.000 0.000 0.000 0.048 0.184
#> SRR661313 3 0.2697 0.8187 0.000 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1499935 4 0.1908 0.8114 0.000 0.000 0.000 0.900 0.004 0.096
#> SRR1447303 3 0.3376 0.7938 0.000 0.000 0.764 0.000 0.016 0.220
#> SRR1429408 4 0.5735 0.3568 0.000 0.260 0.000 0.568 0.016 0.156
#> SRR1433950 1 0.1719 0.7418 0.924 0.000 0.000 0.000 0.016 0.060
#> SRR1362081 2 0.2346 0.8628 0.000 0.868 0.000 0.000 0.008 0.124
#> SRR1409854 5 0.4587 0.4408 0.036 0.000 0.016 0.000 0.656 0.292
#> SRR1435229 5 0.2563 0.6269 0.052 0.000 0.000 0.000 0.876 0.072
#> SRR1085996 1 0.3416 0.6811 0.804 0.000 0.000 0.000 0.056 0.140
#> SRR1414229 5 0.1745 0.6248 0.000 0.000 0.056 0.000 0.924 0.020
#> SRR1400974 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0458 0.7598 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR613927 3 0.4031 0.6894 0.008 0.000 0.652 0.000 0.008 0.332
#> SRR1457854 1 0.0405 0.7608 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1473714 1 0.3978 0.6169 0.700 0.000 0.000 0.000 0.032 0.268
#> SRR813776 3 0.4543 0.6317 0.004 0.000 0.604 0.000 0.036 0.356
#> SRR808196 4 0.3737 0.6559 0.036 0.000 0.000 0.800 0.028 0.136
#> SRR1101085 4 0.2558 0.7880 0.000 0.000 0.000 0.840 0.004 0.156
#> SRR614395 1 0.4266 0.4409 0.620 0.000 0.004 0.000 0.020 0.356
#> SRR1478251 4 0.0000 0.8270 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.2402 0.8601 0.000 0.856 0.000 0.000 0.004 0.140
#> SRR1362310 1 0.0405 0.7608 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR665310 3 0.2697 0.8187 0.000 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1420109 3 0.5728 0.4478 0.128 0.000 0.512 0.000 0.012 0.348
#> SRR1330920 5 0.5774 0.1188 0.180 0.000 0.000 0.000 0.456 0.364
#> SRR1419539 3 0.3470 0.6330 0.000 0.000 0.740 0.000 0.012 0.248
#> SRR1359447 3 0.3929 0.6803 0.000 0.072 0.776 0.000 0.008 0.144
#> SRR1347259 4 0.3404 0.7511 0.000 0.000 0.000 0.760 0.016 0.224
#> SRR613915 3 0.3368 0.7887 0.000 0.000 0.756 0.000 0.012 0.232
#> SRR1384395 3 0.0937 0.8345 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR821715 3 0.2697 0.8187 0.000 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1478228 1 0.1745 0.7387 0.920 0.000 0.000 0.000 0.068 0.012
#> SRR1445637 1 0.0622 0.7590 0.980 0.000 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR608150 5 0.1152 0.6397 0.044 0.000 0.000 0.000 0.952 0.004
#> SRR1096383 1 0.6243 0.3016 0.524 0.000 0.036 0.000 0.256 0.184
#> SRR1341480 4 0.2738 0.7772 0.000 0.000 0.000 0.820 0.004 0.176
#> SRR1341344 5 0.3231 0.5337 0.200 0.000 0.000 0.000 0.784 0.016
#> SRR1326270 3 0.2854 0.8094 0.000 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1498838 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0363 0.8520 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR808566 4 0.4407 0.6050 0.000 0.184 0.000 0.720 0.004 0.092
#> SRR1430270 4 0.0000 0.8270 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.2070 0.8452 0.000 0.000 0.896 0.000 0.012 0.092
#> SRR661267 3 0.6461 0.3951 0.060 0.000 0.488 0.000 0.140 0.312
#> SRR810665 2 0.0000 0.8833 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 5 0.2325 0.6331 0.044 0.000 0.008 0.000 0.900 0.048
#> SRR1420067 1 0.4747 0.3175 0.568 0.000 0.000 0.000 0.376 0.056
#> SRR1473632 1 0.3027 0.6924 0.824 0.000 0.000 0.000 0.028 0.148
#> SRR812536 3 0.0146 0.8507 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1370850 2 0.0632 0.8828 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1486195 2 0.2402 0.8601 0.000 0.856 0.000 0.000 0.004 0.140
#> SRR1407671 5 0.5309 0.2630 0.000 0.228 0.000 0.000 0.596 0.176
#> SRR1446375 5 0.6313 0.3108 0.240 0.000 0.028 0.000 0.496 0.236
#> SRR1465230 4 0.0146 0.8263 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR614119 1 0.5776 0.2963 0.520 0.000 0.004 0.000 0.288 0.188
#> SRR1356101 2 0.4494 0.7093 0.000 0.720 0.136 0.000 0.004 0.140
#> SRR1404209 1 0.4765 0.5272 0.676 0.000 0.000 0.000 0.152 0.172
#> SRR1392676 2 0.0622 0.8798 0.000 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR665538 1 0.5503 0.3449 0.552 0.000 0.000 0.000 0.276 0.172
#> SRR660510 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.2100 0.8066 0.000 0.000 0.000 0.884 0.004 0.112
#> SRR658953 5 0.4166 0.5395 0.076 0.000 0.000 0.000 0.728 0.196
#> SRR2166459 1 0.0520 0.7607 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1070713 2 0.2320 0.8698 0.000 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR1485312 3 0.1141 0.8496 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1317631 4 0.2664 0.7158 0.000 0.000 0.000 0.848 0.016 0.136
#> SRR1488610 5 0.3336 0.5843 0.132 0.000 0.000 0.000 0.812 0.056
#> SRR1330588 3 0.2378 0.8327 0.000 0.000 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1316367 5 0.3896 0.4926 0.204 0.000 0.000 0.000 0.744 0.052
#> SRR1433926 1 0.2783 0.6924 0.836 0.000 0.000 0.000 0.016 0.148
#> SRR1091302 4 0.0291 0.8271 0.000 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR818263 5 0.5934 0.0424 0.216 0.000 0.000 0.000 0.420 0.364
#> SRR1404909 4 0.3161 0.7466 0.000 0.000 0.000 0.776 0.008 0.216
#> SRR663076 1 0.0520 0.7603 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1323577 2 0.0632 0.8828 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1442422 4 0.0000 0.8270 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.1297 0.7510 0.948 0.000 0.000 0.000 0.040 0.012
#> SRR654862 5 0.4917 0.3300 0.076 0.000 0.000 0.000 0.576 0.348
#> SRR1407112 4 0.0260 0.8257 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1332969 3 0.2664 0.8203 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1353199 3 0.2697 0.8187 0.000 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1378885 3 0.3349 0.7823 0.000 0.000 0.748 0.000 0.008 0.244
#> SRR665357 3 0.1387 0.8182 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR662186 2 0.2357 0.8723 0.000 0.872 0.000 0.000 0.012 0.116
#> SRR1501020 3 0.2631 0.8219 0.000 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1347819 3 0.0146 0.8507 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1480813 2 0.1910 0.8751 0.000 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1472576 4 0.4643 0.6578 0.000 0.120 0.000 0.700 0.004 0.176
#> SRR1431781 4 0.0291 0.8270 0.000 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1452270 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.2954 0.6269 0.048 0.000 0.004 0.000 0.852 0.096
#> SRR1417632 4 0.4173 0.6816 0.000 0.000 0.000 0.712 0.060 0.228
#> SRR1350153 2 0.2006 0.8721 0.000 0.892 0.000 0.000 0.004 0.104
#> SRR1458113 5 0.2726 0.5880 0.000 0.000 0.112 0.000 0.856 0.032
#> SRR1326579 5 0.1657 0.6403 0.056 0.000 0.000 0.000 0.928 0.016
#> SRR1349363 2 0.2968 0.7592 0.000 0.816 0.000 0.000 0.016 0.168
#> SRR1096712 3 0.0146 0.8507 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090407 3 0.2562 0.8246 0.000 0.000 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1083752 2 0.6015 0.1945 0.000 0.496 0.000 0.240 0.008 0.256
#> SRR1377599 4 0.5002 0.5647 0.000 0.000 0.000 0.636 0.136 0.228
#> SRR1488449 3 0.2597 0.8233 0.000 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1318354 5 0.4301 0.4612 0.000 0.000 0.240 0.000 0.696 0.064
#> SRR1359062 3 0.0146 0.8507 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1398924 5 0.4646 0.5190 0.084 0.028 0.000 0.000 0.728 0.160
#> SRR663783 3 0.0146 0.8507 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1319204 5 0.6261 0.2819 0.000 0.020 0.228 0.000 0.480 0.272
#> SRR1369070 2 0.0806 0.8792 0.000 0.972 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR615659 1 0.2553 0.6993 0.848 0.000 0.000 0.000 0.008 0.144
#> SRR1337449 2 0.2320 0.8621 0.000 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR1316982 3 0.3576 0.6909 0.000 0.060 0.800 0.000 0.004 0.136
#> SRR1498595 4 0.4305 0.6896 0.000 0.052 0.000 0.712 0.008 0.228
#> SRR1377423 3 0.2135 0.8394 0.000 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1312310 2 0.2053 0.8709 0.000 0.888 0.000 0.000 0.004 0.108
#> SRR1485613 1 0.5612 0.2959 0.524 0.000 0.000 0.000 0.300 0.176
#> SRR1338426 3 0.1334 0.8312 0.000 0.000 0.948 0.000 0.032 0.020
#> SRR1353309 3 0.0260 0.8496 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR658941 5 0.5823 0.1710 0.000 0.000 0.372 0.000 0.440 0.188
#> SRR1101643 1 0.2988 0.6884 0.824 0.000 0.000 0.000 0.024 0.152
#> SRR1401468 5 0.5742 0.2060 0.332 0.000 0.000 0.000 0.484 0.184
#> SRR1368874 2 0.2446 0.8650 0.000 0.864 0.000 0.000 0.012 0.124
#> SRR1324085 4 0.1524 0.8210 0.000 0.000 0.000 0.932 0.008 0.060
#> SRR1363858 1 0.5551 0.2874 0.556 0.000 0.000 0.000 0.224 0.220
#> SRR819820 3 0.4703 0.5569 0.000 0.000 0.684 0.000 0.152 0.164
#> SRR1337342 5 0.1549 0.6388 0.044 0.000 0.000 0.000 0.936 0.020
#> SRR655206 3 0.4934 0.4991 0.000 0.032 0.648 0.000 0.044 0.276
#> SRR1387013 2 0.2669 0.7954 0.000 0.836 0.000 0.000 0.008 0.156
#> SRR1317410 1 0.1745 0.7387 0.920 0.000 0.000 0.000 0.068 0.012
#> SRR608198 5 0.1462 0.6394 0.056 0.000 0.000 0.000 0.936 0.008
#> SRR1440161 2 0.2488 0.8614 0.000 0.864 0.004 0.000 0.008 0.124
#> SRR1343741 2 0.0806 0.8792 0.000 0.972 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR1381288 2 0.0717 0.8786 0.000 0.976 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1415379 4 0.0891 0.8174 0.000 0.000 0.000 0.968 0.008 0.024
#> SRR1099622 2 0.2624 0.8573 0.000 0.844 0.004 0.000 0.004 0.148
#> SRR663197 3 0.0260 0.8512 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1394836 3 0.5163 0.4485 0.000 0.088 0.628 0.000 0.016 0.268
#> SRR661699 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813680 3 0.5899 0.4863 0.080 0.000 0.516 0.000 0.048 0.356
#> SRR1410678 1 0.0405 0.7608 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1378109 4 0.0146 0.8263 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1499174 1 0.2821 0.6902 0.832 0.000 0.000 0.000 0.016 0.152
#> SRR1311486 2 0.0547 0.8848 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1382851 5 0.7487 -0.2782 0.000 0.300 0.000 0.132 0.308 0.260
#> SRR1433410 5 0.1462 0.6394 0.056 0.000 0.000 0.000 0.936 0.008
#> SRR661167 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.3102 0.7455 0.000 0.000 0.816 0.000 0.156 0.028
#> SRR660462 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.6325 -0.1307 0.004 0.000 0.016 0.456 0.324 0.200
#> SRR657949 3 0.4887 0.6656 0.000 0.000 0.624 0.000 0.096 0.280
#> SRR1308882 4 0.1588 0.8186 0.000 0.000 0.000 0.924 0.004 0.072
#> SRR655768 1 0.5316 0.3998 0.592 0.000 0.000 0.000 0.240 0.168
#> SRR1485870 4 0.5535 0.4103 0.000 0.000 0.000 0.532 0.160 0.308
#> SRR1444138 1 0.5008 0.4729 0.644 0.000 0.000 0.000 0.168 0.188
#> SRR1417342 1 0.1334 0.7555 0.948 0.000 0.000 0.000 0.020 0.032
#> SRR1470193 4 0.1967 0.8183 0.000 0.000 0.000 0.904 0.012 0.084
#> SRR1091380 3 0.4703 0.5569 0.000 0.000 0.684 0.000 0.152 0.164
#> SRR1099096 1 0.1686 0.7406 0.924 0.000 0.000 0.000 0.064 0.012
#> SRR1313583 4 0.3810 0.0651 0.428 0.000 0.000 0.572 0.000 0.000
#> SRR1467102 3 0.3050 0.7271 0.000 0.028 0.832 0.000 0.004 0.136
#> SRR1485416 4 0.2632 0.7839 0.000 0.000 0.000 0.832 0.004 0.164
#> SRR818821 3 0.2070 0.8452 0.000 0.000 0.896 0.000 0.012 0.092
#> SRR809963 1 0.4266 0.4409 0.620 0.000 0.004 0.000 0.020 0.356
#> SRR1072247 1 0.0622 0.7598 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1353710 4 0.2613 0.8023 0.000 0.000 0.000 0.848 0.012 0.140
#> SRR1445259 5 0.2756 0.6386 0.032 0.000 0.020 0.000 0.876 0.072
#> SRR1408393 3 0.4637 0.6233 0.020 0.000 0.600 0.000 0.020 0.360
#> SRR1361522 1 0.2783 0.6924 0.836 0.000 0.000 0.000 0.016 0.148
#> SRR1368597 1 0.2060 0.7332 0.900 0.000 0.000 0.000 0.016 0.084
#> SRR1309680 2 0.0937 0.8799 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1310542 3 0.0146 0.8507 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1333485 4 0.2100 0.8063 0.000 0.000 0.000 0.884 0.004 0.112
#> SRR1406437 5 0.5984 0.3021 0.012 0.016 0.092 0.008 0.548 0.324
#> SRR1354931 3 0.2219 0.8357 0.000 0.000 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1391856 2 0.5754 0.3850 0.000 0.528 0.304 0.000 0.008 0.160
#> SRR1446738 2 0.5911 0.1169 0.000 0.432 0.000 0.000 0.356 0.212
#> SRR1309032 2 0.2346 0.8628 0.000 0.868 0.000 0.000 0.008 0.124
#> SRR1388145 2 0.0790 0.8831 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1432611 2 0.2234 0.8628 0.000 0.872 0.000 0.000 0.004 0.124
#> SRR815869 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0146 0.8507 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1375329 5 0.2398 0.6239 0.028 0.000 0.004 0.000 0.888 0.080
#> SRR1387921 1 0.0260 0.7610 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1466792 2 0.2346 0.8628 0.000 0.868 0.000 0.000 0.008 0.124
#> SRR1360478 2 0.0972 0.8812 0.000 0.964 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR1360695 1 0.3213 0.6697 0.820 0.000 0.000 0.000 0.048 0.132
#> SRR812943 5 0.5621 0.2038 0.288 0.000 0.000 0.000 0.528 0.184
#> SRR1400910 5 0.3373 0.5730 0.012 0.032 0.000 0.000 0.816 0.140
#> SRR1444203 4 0.0146 0.8263 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR816177 2 0.1814 0.8537 0.000 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR658754 3 0.0146 0.8507 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1429603 4 0.2768 0.7961 0.000 0.000 0.000 0.832 0.012 0.156
#> SRR1397366 3 0.2697 0.8187 0.000 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1446028 1 0.1007 0.7570 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1083918 2 0.0790 0.8831 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1337606 5 0.2740 0.6014 0.028 0.000 0.000 0.000 0.852 0.120
#> SRR659109 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337192 5 0.3104 0.5448 0.184 0.000 0.000 0.000 0.800 0.016
#> SRR656946 1 0.3025 0.6883 0.820 0.000 0.000 0.000 0.024 0.156
#> SRR1476102 1 0.3345 0.6395 0.776 0.000 0.000 0.000 0.204 0.020
#> SRR1476447 1 0.1528 0.7539 0.936 0.000 0.000 0.000 0.016 0.048
#> SRR1342067 4 0.1908 0.8120 0.000 0.000 0.000 0.900 0.004 0.096
#> SRR1385389 4 0.0000 0.8270 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0405 0.7617 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR614419 5 0.4455 0.4058 0.240 0.000 0.000 0.000 0.684 0.076
#> SRR1322936 5 0.1644 0.6376 0.040 0.000 0.000 0.000 0.932 0.028
#> SRR1349121 1 0.4390 0.5802 0.720 0.000 0.000 0.000 0.148 0.132
#> SRR1430549 1 0.0820 0.7611 0.972 0.000 0.000 0.000 0.016 0.012
#> SRR612935 3 0.3892 0.6753 0.000 0.000 0.752 0.000 0.188 0.060
#> SRR661481 2 0.0713 0.8839 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1354117 2 0.2961 0.8526 0.000 0.840 0.020 0.000 0.008 0.132
#> SRR1393596 4 0.3688 0.7202 0.000 0.000 0.000 0.724 0.020 0.256
#> SRR1452164 1 0.0405 0.7627 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1070503 3 0.4325 0.7372 0.000 0.000 0.692 0.000 0.064 0.244
#> SRR1499894 3 0.0146 0.8507 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1082883 5 0.1152 0.6397 0.044 0.000 0.000 0.000 0.952 0.004
#> SRR1468271 1 0.5682 0.2611 0.504 0.000 0.000 0.000 0.316 0.180
#> SRR1332443 1 0.0622 0.7612 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR810295 2 0.2234 0.8628 0.000 0.872 0.000 0.000 0.004 0.124
#> SRR662103 1 0.2783 0.6924 0.836 0.000 0.000 0.000 0.016 0.148
#> SRR1328620 5 0.4815 0.4741 0.000 0.000 0.188 0.000 0.668 0.144
#> SRR1396294 4 0.5360 0.4443 0.016 0.000 0.048 0.668 0.048 0.220
#> SRR1419917 1 0.2869 0.6905 0.832 0.000 0.000 0.000 0.020 0.148
#> SRR662114 3 0.5346 0.4166 0.000 0.000 0.548 0.000 0.324 0.128
#> SRR1489199 5 0.3168 0.6099 0.056 0.000 0.000 0.000 0.828 0.116
#> SRR813584 2 0.1204 0.8779 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1069638 5 0.3957 0.5193 0.012 0.000 0.036 0.000 0.752 0.200
#> SRR614864 3 0.3348 0.7998 0.000 0.000 0.768 0.000 0.016 0.216
#> SRR1433392 1 0.5954 0.2082 0.492 0.000 0.116 0.000 0.028 0.364
#> SRR1377777 2 0.1858 0.8468 0.000 0.912 0.000 0.000 0.012 0.076
#> SRR2167710 1 0.3062 0.6854 0.816 0.000 0.000 0.000 0.024 0.160
#> SRR1401252 4 0.3103 0.7528 0.000 0.000 0.000 0.784 0.008 0.208
#> SRR1309963 4 0.0146 0.8263 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1338031 1 0.0622 0.7584 0.980 0.000 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1418628 2 0.1531 0.8813 0.000 0.928 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR1486889 1 0.7043 0.0730 0.388 0.000 0.088 0.000 0.188 0.336
#> SRR1380393 1 0.0405 0.7608 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1319731 1 0.1367 0.7497 0.944 0.000 0.000 0.000 0.044 0.012
#> SRR1356468 4 0.3603 0.6693 0.012 0.000 0.000 0.808 0.056 0.124
#> SRR1337010 2 0.2346 0.8628 0.000 0.868 0.000 0.000 0.008 0.124
#> SRR1486520 5 0.4703 0.3487 0.312 0.000 0.000 0.000 0.620 0.068
#> SRR1486538 4 0.0632 0.8269 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1340486 4 0.0146 0.8263 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1377696 4 0.7243 0.0235 0.000 0.108 0.000 0.396 0.232 0.264
#> SRR1465459 3 0.3445 0.7794 0.000 0.000 0.744 0.000 0.012 0.244
#> SRR1080270 3 0.0146 0.8507 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1312501 3 0.1957 0.8450 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1093148 5 0.4094 0.5364 0.000 0.000 0.088 0.000 0.744 0.168
#> SRR1467080 3 0.0146 0.8507 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1410866 2 0.2092 0.8709 0.000 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR816475 4 0.1644 0.8196 0.000 0.000 0.000 0.920 0.004 0.076
#> SRR1379198 4 0.0000 0.8270 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613342 3 0.1957 0.8449 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1452246 2 0.1643 0.8571 0.000 0.924 0.000 0.000 0.008 0.068
#> SRR1338836 2 0.0806 0.8792 0.000 0.972 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR1369129 4 0.0000 0.8270 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.2697 0.8187 0.000 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR813824 3 0.1814 0.8440 0.000 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1082376 1 0.4769 0.3804 0.576 0.000 0.000 0.000 0.060 0.364
#> SRR1500891 4 0.2706 0.7844 0.000 0.000 0.000 0.832 0.008 0.160
#> SRR807543 3 0.4760 0.6083 0.012 0.000 0.588 0.000 0.036 0.364
#> SRR1091572 5 0.5625 0.2404 0.192 0.000 0.000 0.000 0.532 0.276
#> SRR1346689 4 0.2558 0.7883 0.000 0.000 0.000 0.840 0.004 0.156
#> SRR1332424 5 0.1349 0.6395 0.056 0.000 0.000 0.000 0.940 0.004
#> SRR663729 4 0.2915 0.7744 0.000 0.000 0.000 0.808 0.008 0.184
#> SRR1097013 1 0.0291 0.7612 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR613675 5 0.1644 0.6376 0.040 0.000 0.000 0.000 0.932 0.028
#> SRR1485357 4 0.0260 0.8257 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.4243 0.5923 0.736 0.000 0.000 0.000 0.132 0.132
#> SRR1437622 2 0.2513 0.8048 0.000 0.852 0.000 0.008 0.000 0.140
#> SRR1355172 3 0.5603 0.4712 0.164 0.000 0.616 0.000 0.024 0.196
#> SRR655531 5 0.2237 0.6344 0.068 0.000 0.000 0.000 0.896 0.036
#> SRR1338147 3 0.2597 0.8245 0.000 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1413329 5 0.4663 0.4840 0.000 0.000 0.124 0.000 0.684 0.192
#> SRR1485931 2 0.3003 0.7595 0.000 0.812 0.000 0.000 0.016 0.172
#> SRR1420873 1 0.5548 0.3237 0.540 0.000 0.000 0.000 0.288 0.172
#> SRR1333308 4 0.2821 0.7966 0.000 0.000 0.000 0.832 0.016 0.152
#> SRR1452033 1 0.4583 0.5501 0.696 0.000 0.000 0.000 0.128 0.176
#> SRR1467316 2 0.1967 0.8413 0.000 0.904 0.000 0.000 0.012 0.084
#> SRR809018 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0508 0.8838 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR663440 3 0.3445 0.7794 0.000 0.000 0.744 0.000 0.012 0.244
#> SRR1471755 2 0.0632 0.8828 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR808019 5 0.5924 0.4110 0.152 0.000 0.052 0.000 0.604 0.192
#> SRR1479133 3 0.2664 0.8206 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR615069 5 0.3297 0.5768 0.000 0.000 0.112 0.000 0.820 0.068
#> SRR1456185 2 0.0937 0.8841 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1350069 4 0.3107 0.6979 0.016 0.000 0.000 0.832 0.016 0.136
#> SRR816316 1 0.4034 0.4804 0.652 0.000 0.000 0.000 0.020 0.328
#> SRR664795 3 0.6638 0.2709 0.164 0.000 0.424 0.000 0.056 0.356
#> SRR1490721 5 0.5237 0.1598 0.000 0.000 0.000 0.172 0.608 0.220
#> SRR810643 1 0.4682 0.2803 0.556 0.000 0.000 0.000 0.396 0.048
#> SRR1430333 5 0.1555 0.6327 0.008 0.000 0.040 0.000 0.940 0.012
#> SRR1085285 3 0.1814 0.8441 0.000 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1099072 3 0.2823 0.8110 0.000 0.000 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1317985 1 0.0806 0.7565 0.972 0.000 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR1487340 1 0.0520 0.7616 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1420276 3 0.0937 0.8345 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1351347 3 0.2488 0.8046 0.000 0.000 0.880 0.000 0.076 0.044
#> SRR1405525 5 0.3490 0.5555 0.176 0.000 0.000 0.000 0.784 0.040
#> SRR1370329 1 0.0458 0.7598 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1465001 1 0.1745 0.7387 0.920 0.000 0.000 0.000 0.068 0.012
#> SRR1476525 2 0.0000 0.8833 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819610 2 0.1556 0.8678 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR2157314 1 0.1151 0.7541 0.956 0.000 0.000 0.000 0.032 0.012
#> SRR1409465 2 0.0806 0.8792 0.000 0.972 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR809987 4 0.4311 0.3518 0.296 0.000 0.000 0.668 0.012 0.024
#> SRR613639 3 0.3271 0.7920 0.000 0.000 0.760 0.000 0.008 0.232
#> SRR1402285 4 0.0000 0.8270 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.4131 0.4478 0.624 0.000 0.000 0.000 0.020 0.356
#> SRR1405660 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 5 0.3955 0.5788 0.092 0.000 0.004 0.000 0.772 0.132
#> SRR1394734 2 0.1267 0.8766 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1317771 1 0.2433 0.7407 0.884 0.000 0.000 0.000 0.072 0.044
#> SRR1365894 6 0.7646 0.0296 0.000 0.184 0.000 0.244 0.264 0.308
#> SRR1073581 1 0.6725 0.1516 0.436 0.000 0.048 0.000 0.280 0.236
#> SRR659804 1 0.1151 0.7541 0.956 0.000 0.000 0.000 0.032 0.012
#> SRR1345914 2 0.0146 0.8836 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1432186 2 0.0632 0.8828 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1473529 4 0.7023 -0.0100 0.000 0.296 0.000 0.368 0.064 0.272
#> SRR660764 3 0.0458 0.8494 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR820448 1 0.3819 0.5033 0.672 0.000 0.000 0.000 0.012 0.316
#> SRR1328845 4 0.3956 0.6339 0.040 0.000 0.000 0.784 0.032 0.144
#> SRR1336415 4 0.0146 0.8263 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1379065 4 0.0790 0.8264 0.000 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1459190 3 0.2631 0.8223 0.000 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1346773 1 0.4037 0.3409 0.608 0.000 0.000 0.000 0.380 0.012
#> SRR1499521 1 0.5711 0.2287 0.492 0.000 0.000 0.000 0.328 0.180
#> SRR1440898 2 0.0000 0.8833 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.1957 0.8436 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1081209 2 0.0717 0.8786 0.000 0.976 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1400202 1 0.0405 0.7612 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1333395 4 0.6516 0.2162 0.224 0.000 0.000 0.476 0.040 0.260
#> SRR1309248 4 0.6088 0.1711 0.000 0.004 0.000 0.440 0.244 0.312
#> SRR809161 3 0.2631 0.8224 0.000 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1316320 5 0.4553 0.3535 0.012 0.036 0.000 0.000 0.648 0.304
#> SRR1432629 2 0.1349 0.8728 0.000 0.940 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1498931 1 0.0146 0.7608 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1416578 4 0.0777 0.8191 0.000 0.000 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR1405547 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.8270 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380764 5 0.4725 0.3306 0.332 0.000 0.000 0.000 0.604 0.064
#> SRR1309160 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.3624 0.6443 0.784 0.000 0.000 0.000 0.060 0.156
#> SRR1078489 5 0.3785 0.5557 0.004 0.000 0.064 0.000 0.780 0.152
#> SRR1332648 4 0.0000 0.8270 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660614 5 0.6022 0.4012 0.000 0.068 0.124 0.000 0.596 0.212
#> SRR1470420 2 0.2320 0.8612 0.000 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR1475566 1 0.0405 0.7612 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1477949 1 0.0405 0.7608 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1481419 2 0.0000 0.8833 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.4760 0.5143 0.668 0.000 0.000 0.000 0.212 0.120
#> SRR615946 3 0.2300 0.8345 0.000 0.000 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1446481 2 0.0790 0.8831 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1467656 2 0.2234 0.8628 0.000 0.872 0.000 0.000 0.004 0.124
#> SRR1402962 5 0.3841 0.5330 0.168 0.000 0.000 0.000 0.764 0.068
#> SRR660224 2 0.0146 0.8836 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR665586 1 0.2945 0.6868 0.824 0.000 0.000 0.000 0.020 0.156
#> SRR1347166 5 0.1333 0.6398 0.048 0.000 0.000 0.000 0.944 0.008
#> SRR1485722 5 0.2672 0.6226 0.052 0.000 0.000 0.000 0.868 0.080
#> SRR1415316 1 0.1807 0.7422 0.920 0.000 0.000 0.000 0.020 0.060
#> SRR613390 1 0.2821 0.6902 0.832 0.000 0.000 0.000 0.016 0.152
#> SRR661108 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2170173 5 0.7502 0.1120 0.152 0.000 0.216 0.000 0.336 0.296
#> SRR817329 1 0.2945 0.6868 0.824 0.000 0.000 0.000 0.020 0.156
#> SRR1401990 4 0.2572 0.7206 0.000 0.000 0.000 0.852 0.012 0.136
#> SRR1467745 2 0.4647 0.7023 0.000 0.700 0.000 0.096 0.008 0.196
#> SRR1471795 2 0.0458 0.8832 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1415637 2 0.0806 0.8792 0.000 0.972 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR813137 1 0.3984 0.4877 0.664 0.000 0.008 0.000 0.008 0.320
#> SRR1314873 1 0.2907 0.6892 0.828 0.000 0.000 0.000 0.020 0.152
#> SRR1401211 1 0.3395 0.6610 0.808 0.000 0.000 0.000 0.060 0.132
#> SRR1419692 4 0.0146 0.8263 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR818797 3 0.3076 0.7905 0.000 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR2164608 5 0.5727 0.2680 0.000 0.000 0.308 0.000 0.500 0.192
#> SRR1455586 3 0.4153 0.6242 0.000 0.096 0.752 0.000 0.004 0.148
#> SRR819459 3 0.0146 0.8507 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1488939 2 0.2358 0.8195 0.000 0.876 0.000 0.000 0.016 0.108
#> SRR1433232 2 0.0972 0.8750 0.000 0.964 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR1385501 6 0.6089 -0.1459 0.360 0.000 0.000 0.000 0.276 0.364
#> SRR1361652 5 0.3370 0.5892 0.044 0.004 0.000 0.000 0.812 0.140
#> SRR1437119 1 0.0146 0.7608 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1478547 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 5 0.3032 0.5867 0.000 0.000 0.104 0.000 0.840 0.056
#> SRR1310584 1 0.1745 0.7387 0.920 0.000 0.000 0.000 0.068 0.012
#> SRR1500216 1 0.5571 0.2895 0.552 0.000 0.000 0.000 0.224 0.224
#> SRR1486762 3 0.2003 0.8419 0.000 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1480854 4 0.3023 0.7528 0.000 0.000 0.000 0.784 0.004 0.212
#> SRR1489394 4 0.0000 0.8270 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.8270 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.8270 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473058 4 0.3662 0.7437 0.000 0.060 0.000 0.804 0.012 0.124
#> SRR1405165 3 0.0146 0.8507 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1433004 1 0.2821 0.6902 0.832 0.000 0.000 0.000 0.016 0.152
#> SRR1471477 1 0.5587 0.3306 0.540 0.000 0.000 0.000 0.272 0.188
#> SRR1098567 2 0.2100 0.8713 0.000 0.884 0.000 0.000 0.004 0.112
#> SRR1098712 6 0.8868 0.1371 0.104 0.100 0.024 0.260 0.196 0.316
#> SRR1455038 5 0.5590 0.1129 0.352 0.000 0.000 0.000 0.496 0.152
#> SRR1375248 3 0.5007 0.4462 0.000 0.212 0.652 0.000 0.004 0.132
#> SRR1403005 3 0.2823 0.8110 0.000 0.000 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1348378 2 0.3516 0.8367 0.000 0.804 0.012 0.024 0.004 0.156
#> SRR1413541 1 0.2945 0.6868 0.824 0.000 0.000 0.000 0.020 0.156
#> SRR1392943 4 0.4200 0.7057 0.000 0.000 0.000 0.740 0.120 0.140
#> SRR1475192 3 0.0146 0.8507 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1432085 2 0.2442 0.8596 0.000 0.852 0.000 0.000 0.004 0.144
#> SRR1452468 5 0.2595 0.6234 0.044 0.000 0.000 0.000 0.872 0.084
#> SRR1347060 3 0.0146 0.8507 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1414139 3 0.3756 0.6728 0.000 0.076 0.788 0.000 0.004 0.132
#> SRR1447962 2 0.2482 0.8586 0.000 0.848 0.000 0.000 0.004 0.148
#> SRR1444324 2 0.3182 0.8400 0.000 0.832 0.036 0.000 0.008 0.124
#> SRR1415004 1 0.0405 0.7608 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1413436 1 0.4639 0.1681 0.512 0.000 0.000 0.000 0.448 0.040
#> SRR1311266 5 0.3020 0.6110 0.080 0.000 0.000 0.000 0.844 0.076
#> SRR1343302 4 0.0146 0.8263 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1373746 1 0.0291 0.7612 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1429678 1 0.0692 0.7608 0.976 0.000 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1469413 2 0.2695 0.8565 0.000 0.844 0.008 0.000 0.004 0.144
#> SRR1405331 3 0.4749 0.6143 0.012 0.000 0.592 0.000 0.036 0.360
#> SRR1345609 1 0.0717 0.7608 0.976 0.000 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR1380208 5 0.2968 0.5465 0.000 0.016 0.000 0.000 0.816 0.168
#> SRR1322840 4 0.0632 0.8270 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1399797 3 0.0260 0.8512 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1416654 3 0.0146 0.8507 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1315081 3 0.0865 0.8357 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1369196 3 0.0146 0.8507 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1400847 1 0.0260 0.7610 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1365291 3 0.3617 0.7734 0.000 0.000 0.736 0.000 0.020 0.244
#> SRR1367920 4 0.4908 0.5850 0.000 0.000 0.000 0.648 0.128 0.224
#> SRR1366648 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.2218 0.8749 0.000 0.884 0.000 0.000 0.012 0.104
#> SRR1082173 5 0.4809 0.4690 0.000 0.000 0.140 0.000 0.668 0.192
#> SRR1363968 1 0.5471 0.3576 0.560 0.000 0.000 0.000 0.268 0.172
#> SRR814387 1 0.1745 0.7387 0.920 0.000 0.000 0.000 0.068 0.012
#> SRR657599 5 0.5591 0.4404 0.140 0.000 0.036 0.000 0.632 0.192
#> SRR1386689 4 0.0146 0.8263 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1395575 3 0.1267 0.8492 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1453811 3 0.3534 0.7766 0.000 0.000 0.740 0.000 0.016 0.244
#> SRR1441159 1 0.4018 0.2415 0.580 0.000 0.000 0.000 0.412 0.008
#> SRR1403154 4 0.0000 0.8270 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.8514 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 5 0.5805 0.1876 0.000 0.000 0.300 0.000 0.488 0.212
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.483 0.820 0.879 0.4950 0.499 0.499
#> 3 3 0.827 0.866 0.940 0.3436 0.716 0.491
#> 4 4 0.957 0.927 0.971 0.1069 0.890 0.688
#> 5 5 0.962 0.930 0.968 0.0761 0.922 0.717
#> 6 6 0.860 0.749 0.870 0.0388 0.959 0.808
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
#> attr(,"optional")
#> [1] 4
There is also optional best \(k\) = 4 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 2 0.9993 -0.32069 0.484 0.516
#> SRR1331708 1 0.6801 0.88358 0.820 0.180
#> SRR1464258 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1454201 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR661589 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1456229 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1315165 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1417809 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1094457 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1095575 2 0.6148 0.69449 0.152 0.848
#> SRR1315931 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1430066 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1431037 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1395554 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR818002 2 0.7219 0.82247 0.200 0.800
#> SRR1344143 1 0.9686 -0.00973 0.604 0.396
#> SRR1486845 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1362866 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1490740 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1446627 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1456138 2 0.7219 0.82247 0.200 0.800
#> SRR1416248 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1383907 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1375699 1 0.8499 0.39151 0.724 0.276
#> SRR1429846 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR613550 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1348402 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1345146 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1324025 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1318879 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR820755 2 0.7219 0.60183 0.200 0.800
#> SRR1485830 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR599313 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR612263 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1415398 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1326205 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1421327 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1083311 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1499303 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1079522 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1452935 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1379495 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1470459 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR661361 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR615778 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1447564 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1455195 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR655182 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1335140 1 0.9881 -0.16245 0.564 0.436
#> SRR1433555 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1308650 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1388354 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1317446 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1413602 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1479955 2 0.7602 0.80985 0.220 0.780
#> SRR809853 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR661313 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1499935 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1447303 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1429408 1 0.9850 -0.12332 0.572 0.428
#> SRR1433950 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1362081 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1409854 2 0.9963 -0.25507 0.464 0.536
#> SRR1435229 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1085996 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1414229 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1400974 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1399971 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR613927 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1457854 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1473714 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR813776 2 0.6973 0.62551 0.188 0.812
#> SRR808196 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1101085 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR614395 1 0.7219 0.88557 0.800 0.200
#> SRR1478251 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1362310 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR665310 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1420109 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1330920 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1419539 2 0.7056 0.82577 0.192 0.808
#> SRR1359447 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1347259 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR613915 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1384395 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR821715 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1478228 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1445637 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR608150 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1096383 1 0.7815 0.85696 0.768 0.232
#> SRR1341480 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1341344 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1326270 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1498838 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1416313 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR808566 2 0.9977 0.43042 0.472 0.528
#> SRR1430270 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1367825 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR613533 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR661267 2 0.9710 -0.00805 0.400 0.600
#> SRR810665 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1407250 2 0.9988 -0.30816 0.480 0.520
#> SRR1420067 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1473632 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR812536 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1370850 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1486195 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1407671 1 0.3879 0.75358 0.924 0.076
#> SRR1446375 2 0.6438 0.67457 0.164 0.836
#> SRR1465230 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR614119 1 0.7219 0.88557 0.800 0.200
#> SRR1356101 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1404209 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1392676 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR665538 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR660510 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1445655 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR658953 1 0.8499 0.80944 0.724 0.276
#> SRR2166459 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1070713 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1485312 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1317631 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1488610 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1330588 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1316367 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1433926 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1091302 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR818263 1 0.7219 0.88557 0.800 0.200
#> SRR1404909 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR663076 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1323577 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1442422 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR654862 1 0.7219 0.88557 0.800 0.200
#> SRR1407112 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1332969 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1353199 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1378885 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR665357 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR662186 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1501020 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1347819 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1480813 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1472576 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1431781 1 0.4431 0.73832 0.908 0.092
#> SRR1452270 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1500472 2 0.5737 0.72032 0.136 0.864
#> SRR1417632 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1350153 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1458113 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1326579 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1349363 1 0.9710 -0.02606 0.600 0.400
#> SRR1096712 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1090407 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1083752 2 0.7219 0.82247 0.200 0.800
#> SRR1377599 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1488449 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1318354 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1359062 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1398924 2 0.9732 -0.01204 0.404 0.596
#> SRR663783 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1319204 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1369070 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR615659 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1337449 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1316982 2 0.2778 0.86394 0.048 0.952
#> SRR1498595 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1377423 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1312310 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1485613 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1338426 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1353309 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR658941 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1101643 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1401468 1 0.7219 0.88557 0.800 0.200
#> SRR1368874 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1324085 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1363858 1 0.5294 0.86250 0.880 0.120
#> SRR819820 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1337342 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR655206 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1387013 2 0.7219 0.82247 0.200 0.800
#> SRR1317410 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR608198 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1440161 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1343741 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1381288 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1415379 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR663197 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1394836 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR661699 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR813680 2 0.9850 -0.12337 0.428 0.572
#> SRR1410678 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1378109 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1311486 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1382851 2 0.7299 0.82025 0.204 0.796
#> SRR1433410 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR661167 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1432518 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR660462 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1374608 1 0.5946 0.67132 0.856 0.144
#> SRR657949 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1308882 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1485870 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1444138 1 0.7219 0.88561 0.800 0.200
#> SRR1417342 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1470193 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1091380 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1099096 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1313583 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1467102 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1485416 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR818821 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR809963 1 0.7219 0.88557 0.800 0.200
#> SRR1072247 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1353710 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1445259 2 0.1184 0.86267 0.016 0.984
#> SRR1408393 2 0.9896 -0.16891 0.440 0.560
#> SRR1361522 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1368597 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1309680 2 0.7219 0.82247 0.200 0.800
#> SRR1310542 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1333485 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1406437 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1354931 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1391856 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1446738 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1309032 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1388145 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1432611 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR815869 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR613150 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1375329 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1387921 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1466792 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1360478 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1360695 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR812943 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1400910 2 0.0672 0.86997 0.008 0.992
#> SRR1444203 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR816177 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR658754 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1429603 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1397366 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1446028 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1083918 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1337606 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR659109 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1337192 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR656946 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1476102 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1476447 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1342067 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1385389 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR614419 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1322936 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1349121 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1430549 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR612935 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR661481 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1354117 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1393596 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1452164 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1070503 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1499894 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1082883 1 0.6531 0.87955 0.832 0.168
#> SRR1468271 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1332443 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR810295 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR662103 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1328620 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1396294 1 0.9686 0.00436 0.604 0.396
#> SRR1419917 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR662114 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1489199 1 0.8813 0.77836 0.700 0.300
#> SRR813584 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1069638 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR614864 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1433392 1 0.7219 0.88557 0.800 0.200
#> SRR1377777 2 0.7453 0.81525 0.212 0.788
#> SRR2167710 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1401252 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1309963 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1418628 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1486889 1 0.7219 0.88557 0.800 0.200
#> SRR1380393 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1319731 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1356468 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1486520 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1486538 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1340486 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1377696 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1465459 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1080270 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1312501 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1093148 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1467080 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1410866 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR816475 2 0.9983 0.41812 0.476 0.524
#> SRR1379198 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR613342 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1452246 2 0.7219 0.82247 0.200 0.800
#> SRR1338836 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1369129 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1396616 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR813824 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1082376 1 0.7219 0.88557 0.800 0.200
#> SRR1500891 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR807543 2 0.0376 0.87262 0.004 0.996
#> SRR1091572 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1346689 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1332424 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR663729 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR613675 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1485357 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR655816 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1500113 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1437622 2 0.7299 0.82022 0.204 0.796
#> SRR1355172 2 0.9850 -0.12337 0.428 0.572
#> SRR655531 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1338147 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1413329 2 0.0672 0.86933 0.008 0.992
#> SRR1485931 2 0.7219 0.82247 0.200 0.800
#> SRR1420873 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1333308 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1467316 2 0.8713 0.74507 0.292 0.708
#> SRR809018 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1375351 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR663440 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1471755 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR808019 1 0.9922 0.50582 0.552 0.448
#> SRR1479133 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR615069 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1456185 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1350069 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR816316 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR664795 1 0.9754 0.59578 0.592 0.408
#> SRR1490721 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR810643 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1430333 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1085285 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1099072 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1317985 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1487340 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1420276 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1351347 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1405525 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1370329 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1465001 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1476525 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR819610 2 0.8081 0.78821 0.248 0.752
#> SRR2157314 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1409465 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR809987 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR613639 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1402285 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.7219 0.88557 0.800 0.200
#> SRR1405660 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1095455 2 0.7453 0.58522 0.212 0.788
#> SRR1394734 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1317771 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1365894 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1073581 1 0.7453 0.87554 0.788 0.212
#> SRR659804 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1345914 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1432186 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1473529 1 0.9710 -0.02606 0.600 0.400
#> SRR660764 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR820448 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1328845 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1336415 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1379065 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1459190 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1346773 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1499521 1 0.7219 0.88557 0.800 0.200
#> SRR1440898 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1347459 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1081209 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1400202 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1333395 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1309248 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR809161 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1316320 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1432629 2 0.7219 0.82247 0.200 0.800
#> SRR1498931 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1416578 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1405547 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1470534 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1309160 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR663489 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1500450 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1078489 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1332648 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR660614 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1470420 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1475566 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1477949 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1481419 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1464766 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR615946 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1446481 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1467656 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1402962 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR660224 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR665586 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1347166 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1485722 1 0.9815 0.57041 0.580 0.420
#> SRR1415316 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR613390 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR661108 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR2170173 2 0.2778 0.83295 0.048 0.952
#> SRR817329 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1401990 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1467745 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1471795 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1415637 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR813137 1 0.7219 0.88557 0.800 0.200
#> SRR1314873 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1401211 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1419692 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR818797 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR2164608 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1455586 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR819459 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1488939 2 0.9850 0.53035 0.428 0.572
#> SRR1433232 2 0.7219 0.82247 0.200 0.800
#> SRR1385501 1 0.9248 0.72016 0.660 0.340
#> SRR1361652 1 0.8763 0.78400 0.704 0.296
#> SRR1437119 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1478547 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1430910 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1310584 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1500216 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1486762 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1480854 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1489394 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1418085 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1340221 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1473058 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1405165 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1433004 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1471477 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1098567 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1098712 1 0.9710 -0.01202 0.600 0.400
#> SRR1455038 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1375248 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1403005 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1348378 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1413541 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1392943 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1475192 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1432085 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1452468 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1347060 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1414139 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1447962 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1444324 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1415004 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1413436 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1311266 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1343302 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1429678 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1469413 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1405331 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1345609 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1380208 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1322840 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1399797 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1416654 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1315081 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1369196 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1400847 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1365291 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1367920 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1366648 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1441679 2 0.7139 0.82454 0.196 0.804
#> SRR1082173 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1363968 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR814387 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR657599 1 0.9815 0.57042 0.580 0.420
#> SRR1386689 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1395575 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1453811 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1441159 1 0.7139 0.88848 0.804 0.196
#> SRR1403154 1 0.0000 0.81802 1.000 0.000
#> SRR1468722 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
#> SRR1310275 2 0.0000 0.87580 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 3 0.6062 0.370 0.384 0.000 0.616
#> SRR1331708 1 0.3752 0.810 0.856 0.144 0.000
#> SRR1464258 1 0.0237 0.954 0.996 0.000 0.004
#> SRR1454201 1 0.1860 0.913 0.948 0.000 0.052
#> SRR661589 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315165 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 2 0.2066 0.908 0.060 0.940 0.000
#> SRR1094457 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1095575 1 0.5327 0.626 0.728 0.000 0.272
#> SRR1315931 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486845 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.5859 0.508 0.000 0.656 0.344
#> SRR1456138 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR613550 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324025 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318879 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR820755 3 0.5859 0.454 0.344 0.000 0.656
#> SRR1485830 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR599313 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326205 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1421327 2 0.1860 0.912 0.052 0.948 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499303 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079522 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452935 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 3 0.4796 0.694 0.000 0.220 0.780
#> SRR661361 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR615778 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308650 3 0.2356 0.872 0.000 0.072 0.928
#> SRR1388354 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499935 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429408 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433950 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 3 0.5178 0.636 0.000 0.256 0.744
#> SRR1409854 1 0.6111 0.363 0.604 0.000 0.396
#> SRR1435229 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400974 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.4399 0.731 0.188 0.000 0.812
#> SRR1457854 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR813776 3 0.5859 0.454 0.344 0.000 0.656
#> SRR808196 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1101085 2 0.1860 0.912 0.052 0.948 0.000
#> SRR614395 1 0.0424 0.951 0.992 0.000 0.008
#> SRR1478251 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1370551 3 0.6180 0.269 0.000 0.416 0.584
#> SRR1362310 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420109 3 0.1289 0.901 0.032 0.000 0.968
#> SRR1330920 1 0.0424 0.951 0.992 0.000 0.008
#> SRR1419539 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1359447 3 0.0592 0.916 0.000 0.012 0.988
#> SRR1347259 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR613915 3 0.3340 0.815 0.120 0.000 0.880
#> SRR1384395 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR821715 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.5835 0.484 0.660 0.000 0.340
#> SRR1341480 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR808566 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430270 2 0.6168 0.303 0.412 0.588 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR661267 3 0.5859 0.454 0.344 0.000 0.656
#> SRR810665 2 0.5859 0.508 0.000 0.656 0.344
#> SRR1407250 1 0.6062 0.392 0.616 0.000 0.384
#> SRR1420067 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486195 3 0.5058 0.656 0.000 0.244 0.756
#> SRR1407671 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446375 1 0.4887 0.701 0.772 0.000 0.228
#> SRR1465230 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR614119 1 0.1964 0.912 0.944 0.000 0.056
#> SRR1356101 3 0.1860 0.888 0.000 0.052 0.948
#> SRR1404209 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.5650 0.570 0.000 0.688 0.312
#> SRR665538 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445655 2 0.0592 0.915 0.012 0.988 0.000
#> SRR658953 1 0.2050 0.922 0.952 0.028 0.020
#> SRR2166459 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317631 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316367 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR818263 1 0.0237 0.954 0.996 0.000 0.004
#> SRR1404909 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442422 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.1163 0.935 0.972 0.000 0.028
#> SRR1407112 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1332969 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353199 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1378885 3 0.3879 0.777 0.152 0.000 0.848
#> SRR665357 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR662186 2 0.5859 0.508 0.000 0.656 0.344
#> SRR1501020 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480813 2 0.3816 0.806 0.000 0.852 0.148
#> SRR1472576 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431781 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500472 1 0.6443 0.626 0.720 0.040 0.240
#> SRR1417632 2 0.0237 0.916 0.004 0.996 0.000
#> SRR1350153 2 0.5859 0.508 0.000 0.656 0.344
#> SRR1458113 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326579 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1083752 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377599 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488449 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318354 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1359062 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398924 1 0.5696 0.749 0.796 0.056 0.148
#> SRR663783 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319204 3 0.1411 0.900 0.000 0.036 0.964
#> SRR1369070 2 0.3816 0.806 0.000 0.852 0.148
#> SRR615659 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.5882 0.499 0.000 0.652 0.348
#> SRR1316982 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498595 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377423 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312310 3 0.6274 0.135 0.000 0.456 0.544
#> SRR1485613 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR658941 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0237 0.954 0.996 0.000 0.004
#> SRR1368874 3 0.5178 0.636 0.000 0.256 0.744
#> SRR1324085 2 0.1411 0.914 0.036 0.964 0.000
#> SRR1363858 1 0.6045 0.385 0.620 0.380 0.000
#> SRR819820 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337342 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR655206 3 0.1753 0.891 0.000 0.048 0.952
#> SRR1387013 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440161 3 0.1964 0.885 0.000 0.056 0.944
#> SRR1343741 2 0.3816 0.806 0.000 0.852 0.148
#> SRR1381288 2 0.3879 0.802 0.000 0.848 0.152
#> SRR1415379 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1099622 3 0.6252 0.178 0.000 0.444 0.556
#> SRR663197 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394836 3 0.1860 0.888 0.000 0.052 0.948
#> SRR661699 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR813680 3 0.5859 0.454 0.344 0.000 0.656
#> SRR1410678 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.5859 0.508 0.000 0.656 0.344
#> SRR1382851 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433410 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432518 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374608 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR657949 3 0.4750 0.691 0.216 0.000 0.784
#> SRR1308882 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444138 1 0.1964 0.909 0.944 0.000 0.056
#> SRR1417342 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 2 0.1031 0.915 0.024 0.976 0.000
#> SRR1091380 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.3619 0.820 0.864 0.136 0.000
#> SRR1467102 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485416 2 0.1289 0.914 0.032 0.968 0.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR809963 1 0.0424 0.951 0.992 0.000 0.008
#> SRR1072247 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1445259 1 0.4750 0.720 0.784 0.000 0.216
#> SRR1408393 3 0.5926 0.426 0.356 0.000 0.644
#> SRR1361522 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1333485 2 0.1860 0.912 0.052 0.948 0.000
#> SRR1406437 2 0.0892 0.908 0.000 0.980 0.020
#> SRR1354931 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1391856 3 0.1964 0.885 0.000 0.056 0.944
#> SRR1446738 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309032 3 0.5968 0.412 0.000 0.364 0.636
#> SRR1388145 2 0.5138 0.671 0.000 0.748 0.252
#> SRR1432611 2 0.5882 0.499 0.000 0.652 0.348
#> SRR815869 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375329 1 0.7693 0.321 0.580 0.056 0.364
#> SRR1387921 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 3 0.5178 0.636 0.000 0.256 0.744
#> SRR1360478 2 0.5859 0.508 0.000 0.656 0.344
#> SRR1360695 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400910 3 0.7831 0.263 0.404 0.056 0.540
#> SRR1444203 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429603 2 0.1860 0.912 0.052 0.948 0.000
#> SRR1397366 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337606 1 0.6111 0.399 0.604 0.396 0.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1385389 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR661481 2 0.3551 0.822 0.000 0.868 0.132
#> SRR1354117 3 0.1964 0.885 0.000 0.056 0.944
#> SRR1393596 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.3752 0.787 0.144 0.000 0.856
#> SRR1499894 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082883 1 0.2537 0.884 0.920 0.080 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR810295 3 0.6235 0.205 0.000 0.436 0.564
#> SRR662103 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396294 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1419917 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489199 1 0.3482 0.839 0.872 0.000 0.128
#> SRR813584 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069638 3 0.0237 0.922 0.000 0.004 0.996
#> SRR614864 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433392 1 0.4842 0.711 0.776 0.000 0.224
#> SRR1377777 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.0747 0.945 0.984 0.000 0.016
#> SRR1401252 2 0.1860 0.912 0.052 0.948 0.000
#> SRR1309963 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.5859 0.508 0.000 0.656 0.344
#> SRR1486889 1 0.4702 0.723 0.788 0.000 0.212
#> SRR1380393 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1337010 3 0.6180 0.269 0.000 0.416 0.584
#> SRR1486520 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1340486 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1377696 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465459 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093148 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467080 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1410866 2 0.3879 0.802 0.000 0.848 0.152
#> SRR816475 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379198 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR613342 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.3816 0.806 0.000 0.852 0.148
#> SRR1369129 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1396616 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082376 1 0.1163 0.935 0.972 0.000 0.028
#> SRR1500891 2 0.0747 0.915 0.016 0.984 0.000
#> SRR807543 3 0.5835 0.463 0.340 0.000 0.660
#> SRR1091572 1 0.0237 0.954 0.996 0.000 0.004
#> SRR1346689 2 0.1860 0.912 0.052 0.948 0.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR663729 2 0.2261 0.902 0.068 0.932 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485357 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355172 3 0.5810 0.471 0.336 0.000 0.664
#> SRR655531 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413329 3 0.3941 0.774 0.156 0.000 0.844
#> SRR1485931 2 0.3816 0.806 0.000 0.852 0.148
#> SRR1420873 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375351 2 0.4702 0.728 0.000 0.788 0.212
#> SRR663440 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR808019 1 0.6286 0.137 0.536 0.000 0.464
#> SRR1479133 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR615069 3 0.1964 0.885 0.000 0.056 0.944
#> SRR1456185 2 0.5835 0.516 0.000 0.660 0.340
#> SRR1350069 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR664795 3 0.5882 0.445 0.348 0.000 0.652
#> SRR1490721 2 0.1753 0.913 0.048 0.952 0.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 3 0.3752 0.787 0.144 0.000 0.856
#> SRR1085285 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099072 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.3551 0.822 0.000 0.868 0.132
#> SRR819610 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.3879 0.802 0.000 0.848 0.152
#> SRR809987 1 0.5363 0.608 0.724 0.276 0.000
#> SRR613639 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402285 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1077038 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095455 1 0.4796 0.714 0.780 0.000 0.220
#> SRR1394734 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073581 1 0.5733 0.520 0.676 0.000 0.324
#> SRR659804 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.3816 0.806 0.000 0.852 0.148
#> SRR1432186 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR660764 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328845 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1336415 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1379065 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1459190 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1346773 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.1163 0.936 0.972 0.000 0.028
#> SRR1440898 2 0.3816 0.806 0.000 0.852 0.148
#> SRR1347459 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081209 2 0.3816 0.806 0.000 0.852 0.148
#> SRR1400202 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1309248 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR809161 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316320 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432629 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470534 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332648 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR660614 3 0.1753 0.891 0.000 0.048 0.952
#> SRR1470420 3 0.6204 0.244 0.000 0.424 0.576
#> SRR1475566 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.3816 0.806 0.000 0.852 0.148
#> SRR1464766 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR615946 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446481 2 0.3482 0.825 0.000 0.872 0.128
#> SRR1467656 2 0.5859 0.508 0.000 0.656 0.344
#> SRR1402962 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR660224 2 0.5926 0.481 0.000 0.644 0.356
#> SRR665586 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.4887 0.706 0.772 0.000 0.228
#> SRR1415316 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR2170173 3 0.6008 0.399 0.372 0.000 0.628
#> SRR817329 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401990 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1467745 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.5859 0.508 0.000 0.656 0.344
#> SRR813137 1 0.2537 0.889 0.920 0.000 0.080
#> SRR1314873 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR818797 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR2164608 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455586 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385501 1 0.1964 0.909 0.944 0.000 0.056
#> SRR1361652 1 0.1964 0.908 0.944 0.056 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1430910 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486762 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480854 2 0.1860 0.912 0.052 0.948 0.000
#> SRR1489394 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1418085 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1340221 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1473058 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405165 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.1289 0.933 0.968 0.000 0.032
#> SRR1098567 3 0.5988 0.402 0.000 0.368 0.632
#> SRR1098712 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455038 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375248 3 0.0747 0.914 0.000 0.016 0.984
#> SRR1403005 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348378 2 0.5859 0.508 0.000 0.656 0.344
#> SRR1413541 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1475192 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432085 3 0.5178 0.636 0.000 0.256 0.744
#> SRR1452468 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347060 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414139 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447962 3 0.5178 0.636 0.000 0.256 0.744
#> SRR1444324 3 0.1964 0.885 0.000 0.056 0.944
#> SRR1415004 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 3 0.5706 0.513 0.000 0.320 0.680
#> SRR1405331 3 0.2537 0.856 0.080 0.000 0.920
#> SRR1345609 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322840 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367920 2 0.0000 0.916 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441679 3 0.6225 0.218 0.000 0.432 0.568
#> SRR1082173 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363968 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.6180 0.292 0.584 0.000 0.416
#> SRR1386689 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453811 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.957 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 2 0.1964 0.911 0.056 0.944 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310275 3 0.0000 0.924 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 3 0.4746 0.4024 0.368 0.000 0.632 0.000
#> SRR1331708 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464258 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661589 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315165 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094457 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095575 1 0.3486 0.7637 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1315931 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.1022 0.9360 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1486845 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613550 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324025 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318879 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820755 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485830 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR599313 1 0.0336 0.9578 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR612263 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326205 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421327 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079522 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452935 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.3837 0.7032 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1433555 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499935 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429408 4 0.4661 0.4877 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR1433950 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 1 0.4961 0.2033 0.552 0.000 0.448 0.000
#> SRR1435229 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 3 0.3219 0.7849 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR1400974 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0469 0.9546 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR813776 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808196 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101085 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614395 1 0.1302 0.9245 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1478251 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420109 3 0.0707 0.9522 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1330920 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419539 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359447 3 0.4072 0.6488 0.000 0.252 0.748 0.000
#> SRR1347259 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613915 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384395 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821715 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.4877 0.3239 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1341480 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808566 4 0.1940 0.9004 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR1430270 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661267 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 1 0.4790 0.3977 0.620 0.000 0.380 0.000
#> SRR1420067 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446375 1 0.3172 0.8006 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1465230 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.2589 0.8506 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658953 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818263 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404909 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407112 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332969 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353199 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378885 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR665357 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.4072 0.6513 0.748 0.252 0.000 0.000
#> SRR1417632 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326579 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.1022 0.9361 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1096712 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.4193 0.6296 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1377599 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488449 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318354 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359062 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398924 1 0.4855 0.3275 0.600 0.400 0.000 0.000
#> SRR663783 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319204 2 0.1792 0.8941 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.1118 0.9388 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1498595 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377423 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658941 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0336 0.9575 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363858 4 0.3764 0.7137 0.216 0.000 0.000 0.784
#> SRR819820 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337342 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655206 3 0.4961 0.1582 0.000 0.448 0.552 0.000
#> SRR1387013 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663197 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394836 2 0.4761 0.4096 0.000 0.628 0.372 0.000
#> SRR661699 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813680 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.2589 0.8497 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1433410 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR657949 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308882 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444138 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091380 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467102 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809963 1 0.1302 0.9245 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445259 1 0.3764 0.7228 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR1408393 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406437 4 0.4454 0.5696 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR1354931 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391856 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446738 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375329 2 0.2469 0.8442 0.108 0.892 0.000 0.000
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400910 2 0.3942 0.6798 0.236 0.764 0.000 0.000
#> SRR1444203 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1397366 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337606 1 0.4972 0.1589 0.544 0.456 0.000 0.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499894 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082883 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396294 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419917 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489199 1 0.2704 0.8416 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR813584 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069638 3 0.4406 0.5587 0.000 0.300 0.700 0.000
#> SRR614864 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.3764 0.7211 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401252 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.4804 0.3885 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377696 4 0.4500 0.5259 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR1465459 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093148 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467080 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613342 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396616 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500891 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR807543 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346689 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663729 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485357 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0921 0.9395 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1355172 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413329 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808019 3 0.4955 0.1815 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR1479133 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615069 3 0.4967 0.1674 0.000 0.452 0.548 0.000
#> SRR1456185 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350069 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR664795 3 0.1022 0.9397 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1490721 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085285 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613639 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402285 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077038 1 0.0188 0.9610 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.3681 0.7627 0.816 0.176 0.008 0.000
#> SRR1394734 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 4 0.3907 0.7017 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR1073581 1 0.4855 0.3461 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473529 4 0.4866 0.3082 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR660764 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328845 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1336415 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1459190 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1346773 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.1022 0.9358 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309248 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR809161 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316320 2 0.4500 0.5352 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1432629 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 3 0.0707 0.9544 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1332648 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660614 2 0.1211 0.9237 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615946 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.4134 0.6490 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2170173 3 0.4643 0.4564 0.344 0.000 0.656 0.000
#> SRR817329 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401990 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467745 2 0.1792 0.9017 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813137 1 0.4776 0.4131 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818797 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2164608 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455586 2 0.4999 0.0475 0.000 0.508 0.492 0.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361652 1 0.3569 0.7406 0.804 0.196 0.000 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430910 3 0.3311 0.7738 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0336 0.9578 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1486762 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480854 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1473058 4 0.0188 0.9700 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1405165 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.1118 0.9321 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 4 0.4746 0.4417 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR1455038 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.4356 0.5847 0.000 0.708 0.292 0.000
#> SRR1403005 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.1389 0.9212 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1413541 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475192 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347060 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.4989 0.1201 0.000 0.528 0.472 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322840 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367920 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9620 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363968 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657599 3 0.4994 0.0529 0.480 0.000 0.520 0.000
#> SRR1386689 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453811 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.9643 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.9735 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.0000 0.9731 0.000 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 3 0.5272 0.2565 0.396 0.000 0.552 0.000 0.052
#> SRR1331708 5 0.0609 0.9241 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR1464258 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454201 5 0.0000 0.9214 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR661589 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315165 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.0162 0.9713 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1417809 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094457 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.0955 0.9463 0.968 0.000 0.028 0.000 0.004
#> SRR1315931 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.0703 0.9529 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1486845 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362866 5 0.0162 0.9225 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0404 0.9683 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1383907 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613550 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.0510 0.9661 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1345146 5 0.3966 0.4914 0.336 0.000 0.000 0.000 0.664
#> SRR1324025 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318879 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820755 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485830 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR599313 1 0.0771 0.9568 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR612263 5 0.1410 0.9128 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940
#> SRR1415398 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326205 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421327 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079522 5 0.1410 0.9128 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940
#> SRR1452935 5 0.0880 0.9143 0.000 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615778 5 0.0609 0.9241 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR1447564 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 5 0.0510 0.9243 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR655182 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.3274 0.7184 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499935 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429408 4 0.4074 0.4493 0.000 0.364 0.000 0.636 0.000
#> SRR1433950 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 5 0.2929 0.7833 0.000 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1435229 5 0.0609 0.9241 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR1085996 1 0.1908 0.8884 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1414229 5 0.0000 0.9214 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400974 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0290 0.9693 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR813776 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808196 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101085 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614395 1 0.0162 0.9705 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1478251 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420109 3 0.1270 0.9192 0.052 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR1330920 5 0.2966 0.8032 0.184 0.000 0.000 0.000 0.816
#> SRR1419539 3 0.0290 0.9663 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1359447 3 0.3837 0.5489 0.000 0.308 0.692 0.000 0.000
#> SRR1347259 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613915 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384395 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821715 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0290 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1445637 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608150 5 0.0000 0.9214 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096383 1 0.3409 0.7722 0.816 0.000 0.160 0.000 0.024
#> SRR1341480 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1341344 5 0.1043 0.9201 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1326270 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808566 4 0.1965 0.8729 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1430270 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661267 3 0.1300 0.9332 0.028 0.000 0.956 0.000 0.016
#> SRR810665 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 5 0.0000 0.9214 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420067 1 0.1043 0.9501 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1473632 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446375 1 0.1282 0.9468 0.952 0.000 0.004 0.000 0.044
#> SRR1465230 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614119 1 0.1697 0.9309 0.932 0.000 0.008 0.000 0.060
#> SRR1356101 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.0510 0.9661 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.1410 0.9362 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR660510 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658953 5 0.1410 0.9128 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940
#> SRR2166459 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488610 5 0.1121 0.9188 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1330588 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316367 5 0.1410 0.9128 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940
#> SRR1433926 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818263 5 0.4227 0.3406 0.420 0.000 0.000 0.000 0.580
#> SRR1404909 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0290 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR654862 5 0.1043 0.9201 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1407112 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353199 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378885 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665357 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.0000 0.9214 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417632 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 5 0.0703 0.9172 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1326579 5 0.0510 0.9241 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1349363 2 0.0794 0.9494 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.3508 0.6653 0.000 0.748 0.000 0.252 0.000
#> SRR1377599 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488449 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318354 5 0.1270 0.8993 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1359062 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.1502 0.9137 0.056 0.004 0.000 0.000 0.940
#> SRR663783 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319204 2 0.2149 0.8993 0.000 0.916 0.048 0.000 0.036
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.3586 0.6338 0.000 0.264 0.736 0.000 0.000
#> SRR1498595 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377423 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.1410 0.9362 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1338426 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658941 3 0.1410 0.9184 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.1965 0.9044 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363858 4 0.4161 0.3740 0.392 0.000 0.000 0.608 0.000
#> SRR819820 3 0.0510 0.9594 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1337342 5 0.0000 0.9214 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655206 2 0.2997 0.7947 0.000 0.840 0.148 0.000 0.012
#> SRR1387013 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0404 0.9683 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR608198 5 0.0510 0.9241 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663197 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394836 2 0.0609 0.9542 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR661699 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813680 3 0.3807 0.6621 0.240 0.000 0.748 0.000 0.012
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.3274 0.7174 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1433410 5 0.0510 0.9241 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR661167 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.0510 0.9531 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR657949 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308882 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.0963 0.9532 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1485870 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444138 1 0.0609 0.9631 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1417342 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091380 3 0.0510 0.9594 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1099096 1 0.0290 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1313583 4 0.3109 0.7284 0.200 0.000 0.000 0.800 0.000
#> SRR1467102 3 0.0794 0.9460 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809963 1 0.0162 0.9705 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0162 0.9714 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1353710 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445259 5 0.0162 0.9213 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1408393 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406437 4 0.4677 0.5475 0.000 0.300 0.000 0.664 0.036
#> SRR1354931 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391856 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446738 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375329 5 0.0609 0.9169 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0609 0.9631 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR812943 5 0.1608 0.9070 0.072 0.000 0.000 0.000 0.928
#> SRR1400910 5 0.0566 0.9238 0.012 0.004 0.000 0.000 0.984
#> SRR1444203 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397366 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337606 5 0.0609 0.9241 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR659109 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337192 5 0.1043 0.9201 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR656946 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.2852 0.7921 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR1476447 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614419 5 0.1410 0.9128 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940
#> SRR1322936 5 0.0000 0.9214 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349121 1 0.0880 0.9574 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.0290 0.9661 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR661481 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499894 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082883 5 0.0000 0.9214 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468271 1 0.1410 0.9362 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1332443 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 5 0.1608 0.8841 0.000 0.000 0.072 0.000 0.928
#> SRR1396294 4 0.0404 0.9565 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1419917 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.3949 0.4788 0.000 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR1489199 5 0.0000 0.9214 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR813584 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069638 5 0.1357 0.9047 0.000 0.004 0.048 0.000 0.948
#> SRR614864 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.3109 0.7312 0.800 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401252 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.3521 0.6818 0.764 0.000 0.232 0.000 0.004
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0290 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1356468 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 5 0.2813 0.7931 0.168 0.000 0.000 0.000 0.832
#> SRR1486538 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377696 4 0.1741 0.9120 0.000 0.040 0.000 0.936 0.024
#> SRR1465459 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093148 5 0.1197 0.9006 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1467080 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613342 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500891 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR807543 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091572 5 0.1851 0.8971 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1346689 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332424 5 0.0404 0.9239 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR663729 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613675 5 0.0290 0.9234 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1485357 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0794 0.9597 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1437622 2 0.0703 0.9529 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1355172 3 0.4152 0.5631 0.296 0.000 0.692 0.000 0.012
#> SRR655531 5 0.0290 0.9234 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1338147 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413329 5 0.2561 0.8175 0.000 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.1410 0.9362 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1333308 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.0609 0.9631 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808019 5 0.5083 0.7019 0.160 0.000 0.140 0.000 0.700
#> SRR1479133 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615069 5 0.1357 0.9052 0.000 0.004 0.048 0.000 0.948
#> SRR1456185 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350069 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR664795 3 0.4444 0.4100 0.364 0.000 0.624 0.000 0.012
#> SRR1490721 5 0.3366 0.6962 0.000 0.000 0.000 0.232 0.768
#> SRR810643 1 0.1410 0.9362 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1430333 5 0.0000 0.9214 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085285 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405525 5 0.1197 0.9177 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0290 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0162 0.9714 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.2732 0.7853 0.160 0.000 0.000 0.840 0.000
#> SRR613639 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402285 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 5 0.1410 0.9128 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940
#> SRR1394734 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0162 0.9713 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1365894 4 0.3366 0.7011 0.000 0.232 0.000 0.768 0.000
#> SRR1073581 1 0.3779 0.7142 0.776 0.000 0.200 0.000 0.024
#> SRR659804 1 0.0162 0.9714 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473529 4 0.4182 0.3235 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR660764 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328845 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1336415 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459190 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346773 5 0.3684 0.6460 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR1499521 1 0.1764 0.9279 0.928 0.000 0.008 0.000 0.064
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309248 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809161 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316320 5 0.1591 0.8968 0.004 0.004 0.000 0.052 0.940
#> SRR1432629 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380764 5 0.3109 0.7577 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1309160 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.0609 0.9631 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1078489 5 0.1410 0.8973 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR1332648 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660614 2 0.3355 0.7650 0.000 0.804 0.012 0.000 0.184
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.0794 0.9597 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR615946 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 5 0.2020 0.8647 0.100 0.000 0.000 0.000 0.900
#> SRR660224 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 5 0.0609 0.9241 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR1485722 5 0.0000 0.9214 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2170173 3 0.4273 0.1990 0.448 0.000 0.552 0.000 0.000
#> SRR817329 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401990 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467745 2 0.1341 0.9226 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 1 0.0290 0.9677 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0703 0.9616 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1419692 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818797 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164608 3 0.1851 0.8893 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1455586 2 0.3561 0.6512 0.000 0.740 0.260 0.000 0.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 1 0.4287 0.0721 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR1361652 5 0.0703 0.9236 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 5 0.0771 0.9182 0.000 0.004 0.020 0.000 0.976
#> SRR1310584 1 0.0290 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1500216 1 0.0771 0.9568 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1486762 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480854 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473058 4 0.0162 0.9631 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1405165 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.1410 0.9362 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 4 0.4403 0.3913 0.000 0.384 0.000 0.608 0.008
#> SRR1455038 5 0.1608 0.9068 0.072 0.000 0.000 0.000 0.928
#> SRR1375248 2 0.3210 0.7192 0.000 0.788 0.212 0.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.1197 0.9308 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475192 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 5 0.0609 0.9241 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR1347060 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.4182 0.3429 0.000 0.600 0.400 0.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.2813 0.8045 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1311266 5 0.0000 0.9214 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 5 0.0963 0.9093 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1322840 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9727 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367920 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 5 0.3109 0.7464 0.000 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1363968 1 0.1410 0.9362 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR814387 1 0.0290 0.9702 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR657599 5 0.4723 0.7432 0.136 0.000 0.128 0.000 0.736
#> SRR1386689 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453811 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441159 5 0.3586 0.6987 0.264 0.000 0.000 0.000 0.736
#> SRR1403154 4 0.0000 0.9666 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.9732 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 5 0.3966 0.5208 0.000 0.000 0.336 0.000 0.664
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 6 0.5384 0.5147 0.396 0.000 0.080 0.000 0.012 0.512
#> SRR1331708 5 0.0363 0.8428 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1464258 1 0.3862 0.4027 0.524 0.000 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1454201 5 0.0713 0.8344 0.000 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR661589 3 0.2793 0.7955 0.000 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1456229 1 0.3843 0.4305 0.548 0.000 0.000 0.000 0.000 0.452
#> SRR1315165 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.0363 0.7386 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1417809 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094457 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.5381 0.4617 0.604 0.000 0.140 0.000 0.008 0.248
#> SRR1315931 1 0.3198 0.6388 0.740 0.000 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1430066 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.1555 0.9223 0.000 0.940 0.000 0.008 0.040 0.012
#> SRR1486845 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362866 5 0.0146 0.8448 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1490740 1 0.2912 0.6633 0.784 0.000 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0713 0.7293 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1383907 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.7437 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.3023 0.7768 0.000 0.000 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR613550 3 0.2941 0.7849 0.000 0.000 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1348402 1 0.0713 0.7293 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1345146 5 0.5630 0.2148 0.204 0.000 0.000 0.000 0.536 0.260
#> SRR1324025 3 0.2912 0.7874 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1318879 3 0.0692 0.8529 0.000 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR820755 3 0.3838 0.5336 0.000 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1485830 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR599313 1 0.5354 0.4663 0.580 0.000 0.000 0.000 0.160 0.260
#> SRR612263 5 0.4705 0.5506 0.088 0.000 0.000 0.000 0.652 0.260
#> SRR1415398 3 0.2912 0.7874 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1326205 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421327 4 0.0146 0.9551 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079522 5 0.2135 0.7759 0.000 0.000 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1452935 5 0.1092 0.8303 0.000 0.000 0.020 0.000 0.960 0.020
#> SRR1379495 1 0.0000 0.7437 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.2912 0.7874 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR615778 5 0.0146 0.8448 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1447564 1 0.1910 0.7153 0.892 0.000 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1455195 5 0.1219 0.8144 0.048 0.000 0.000 0.000 0.948 0.004
#> SRR655182 1 0.0000 0.7437 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.3559 0.6609 0.000 0.744 0.000 0.240 0.004 0.012
#> SRR1433555 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.0146 0.7424 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1317446 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.3956 0.6099 0.704 0.000 0.000 0.000 0.032 0.264
#> SRR661313 3 0.2912 0.7874 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1499935 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447303 3 0.2912 0.7874 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1429408 4 0.3499 0.5367 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000 0.000
#> SRR1433950 1 0.2378 0.6961 0.848 0.000 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 5 0.5902 0.2395 0.000 0.000 0.204 0.000 0.404 0.392
#> SRR1435229 5 0.0363 0.8428 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1085996 1 0.4749 0.5672 0.648 0.000 0.000 0.000 0.092 0.260
#> SRR1414229 5 0.0146 0.8448 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1400974 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0458 0.7434 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR613927 3 0.3804 0.5674 0.000 0.000 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1457854 1 0.0146 0.7424 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473714 1 0.3446 0.5327 0.692 0.000 0.000 0.000 0.000 0.308
#> SRR813776 3 0.3857 0.5046 0.000 0.000 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR808196 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101085 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614395 1 0.3862 0.4027 0.524 0.000 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1478251 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.7437 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.2912 0.7874 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1420109 3 0.5556 0.3008 0.152 0.000 0.512 0.000 0.000 0.336
#> SRR1330920 6 0.5885 -0.0983 0.276 0.000 0.000 0.000 0.248 0.476
#> SRR1419539 3 0.3864 -0.0407 0.000 0.000 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR1359447 3 0.2002 0.7962 0.000 0.076 0.908 0.000 0.004 0.012
#> SRR1347259 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613915 3 0.3151 0.7623 0.000 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1384395 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821715 3 0.2912 0.7874 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1478228 1 0.0713 0.7293 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1445637 1 0.0000 0.7437 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608150 5 0.0146 0.8448 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1096383 6 0.4465 0.4805 0.460 0.000 0.028 0.000 0.000 0.512
#> SRR1341480 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341344 5 0.0520 0.8419 0.008 0.000 0.000 0.000 0.984 0.008
#> SRR1326270 3 0.2941 0.7849 0.000 0.000 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1498838 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0363 0.8631 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR808566 4 0.2003 0.8282 0.000 0.116 0.000 0.884 0.000 0.000
#> SRR1430270 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0508 0.8574 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR661267 6 0.4838 0.4762 0.136 0.000 0.168 0.000 0.008 0.688
#> SRR810665 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 5 0.1204 0.8162 0.000 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1420067 1 0.2487 0.6371 0.876 0.000 0.000 0.000 0.092 0.032
#> SRR1473632 1 0.2912 0.6642 0.784 0.000 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR812536 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.0146 0.9709 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1446375 6 0.5584 0.4972 0.368 0.000 0.116 0.000 0.008 0.508
#> SRR1465230 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614119 6 0.4224 0.4648 0.476 0.000 0.004 0.000 0.008 0.512
#> SRR1356101 2 0.0865 0.9357 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.2003 0.6208 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 6 0.3867 0.4485 0.488 0.000 0.000 0.000 0.000 0.512
#> SRR660510 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658953 5 0.2048 0.7822 0.000 0.000 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR2166459 1 0.0146 0.7424 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0547 0.8616 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1317631 4 0.2219 0.8205 0.000 0.000 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1488610 5 0.0146 0.8448 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1330588 3 0.2597 0.8041 0.000 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1316367 5 0.0363 0.8425 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1433926 1 0.3198 0.6388 0.740 0.000 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1091302 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818263 6 0.5863 -0.0909 0.236 0.000 0.000 0.000 0.284 0.480
#> SRR1404909 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663076 1 0.0632 0.7314 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0632 0.7314 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR654862 5 0.3993 0.4193 0.004 0.000 0.000 0.000 0.520 0.476
#> SRR1407112 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.2912 0.7874 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1353199 3 0.2912 0.7874 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1378885 3 0.3151 0.7623 0.000 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR665357 3 0.0146 0.8634 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR662186 2 0.0405 0.9644 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1501020 3 0.2883 0.7896 0.000 0.000 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1347819 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.3023 0.6501 0.000 0.000 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1417632 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 5 0.0725 0.8385 0.000 0.000 0.012 0.000 0.976 0.012
#> SRR1326579 5 0.0146 0.8448 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1349363 2 0.0363 0.9631 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.2912 0.7874 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1083752 2 0.3409 0.5748 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000 0.000
#> SRR1377599 4 0.0632 0.9372 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1488449 3 0.2664 0.8028 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1318354 5 0.5533 0.3110 0.000 0.000 0.284 0.000 0.544 0.172
#> SRR1359062 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.0632 0.8406 0.000 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR663783 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319204 6 0.6120 0.3080 0.000 0.284 0.244 0.000 0.008 0.464
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.3198 0.6388 0.740 0.000 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.0937 0.8374 0.000 0.040 0.960 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498595 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377423 3 0.0937 0.8558 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 6 0.4181 0.4628 0.476 0.000 0.000 0.000 0.012 0.512
#> SRR1338426 3 0.0508 0.8574 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1353309 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658941 6 0.5009 0.2487 0.004 0.000 0.424 0.000 0.060 0.512
#> SRR1101643 1 0.3198 0.6388 0.740 0.000 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1401468 6 0.4181 0.4628 0.476 0.000 0.000 0.000 0.012 0.512
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363858 1 0.6541 0.2974 0.488 0.000 0.000 0.252 0.048 0.212
#> SRR819820 3 0.3866 -0.0532 0.000 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1337342 5 0.0146 0.8448 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR655206 6 0.5608 0.2752 0.000 0.148 0.380 0.000 0.000 0.472
#> SRR1387013 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0713 0.7293 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR608198 5 0.0146 0.8448 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663197 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394836 2 0.5002 0.3040 0.000 0.556 0.364 0.000 0.000 0.080
#> SRR661699 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813680 6 0.4319 0.4639 0.168 0.000 0.108 0.000 0.000 0.724
#> SRR1410678 1 0.0547 0.7341 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1378109 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.3198 0.6388 0.740 0.000 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.3342 0.6831 0.000 0.760 0.000 0.228 0.012 0.000
#> SRR1433410 5 0.0146 0.8448 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR661167 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.0508 0.8574 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR660462 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.3868 0.1093 0.000 0.000 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR657949 3 0.3330 0.7353 0.000 0.000 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1308882 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655768 1 0.3867 -0.4220 0.512 0.000 0.000 0.000 0.000 0.488
#> SRR1485870 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444138 1 0.3765 -0.1902 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR1417342 1 0.0000 0.7437 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091380 3 0.3866 -0.0532 0.000 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1099096 1 0.0713 0.7293 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1313583 4 0.3547 0.4499 0.332 0.000 0.000 0.668 0.000 0.000
#> SRR1467102 3 0.0547 0.8530 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818821 3 0.0508 0.8574 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR809963 1 0.3862 0.4027 0.524 0.000 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1072247 1 0.0632 0.7314 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1353710 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445259 5 0.0363 0.8428 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1408393 3 0.3993 0.4861 0.004 0.000 0.520 0.000 0.000 0.476
#> SRR1361522 1 0.3198 0.6388 0.740 0.000 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1368597 1 0.1957 0.7138 0.888 0.000 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1309680 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406437 6 0.5496 0.1030 0.000 0.028 0.044 0.408 0.008 0.512
#> SRR1354931 3 0.2793 0.7945 0.000 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1391856 2 0.0937 0.9316 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446738 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375329 5 0.0363 0.8428 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1387921 1 0.0000 0.7437 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 6 0.3868 0.4435 0.492 0.000 0.000 0.000 0.000 0.508
#> SRR812943 5 0.5504 0.4048 0.204 0.000 0.000 0.000 0.564 0.232
#> SRR1400910 5 0.0363 0.8428 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1444203 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397366 3 0.2912 0.7874 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1446028 1 0.0000 0.7437 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337606 5 0.0000 0.8444 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337192 5 0.0146 0.8448 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR656946 1 0.0713 0.7359 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1476102 1 0.3778 0.3425 0.696 0.000 0.000 0.000 0.288 0.016
#> SRR1476447 1 0.2053 0.7146 0.888 0.000 0.000 0.000 0.004 0.108
#> SRR1342067 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.7437 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614419 5 0.1219 0.8235 0.004 0.000 0.000 0.000 0.948 0.048
#> SRR1322936 5 0.0146 0.8448 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1349121 1 0.3221 0.3028 0.736 0.000 0.000 0.000 0.000 0.264
#> SRR1430549 1 0.0000 0.7437 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.0508 0.8574 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR661481 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452164 1 0.0146 0.7439 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1070503 3 0.3351 0.7303 0.000 0.000 0.712 0.000 0.000 0.288
#> SRR1499894 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082883 5 0.0146 0.8448 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1468271 6 0.4181 0.4628 0.476 0.000 0.000 0.000 0.012 0.512
#> SRR1332443 1 0.0146 0.7424 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR810295 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.3198 0.6388 0.740 0.000 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1328620 6 0.5994 0.0173 0.000 0.000 0.232 0.000 0.384 0.384
#> SRR1396294 6 0.3997 -0.0976 0.000 0.000 0.004 0.488 0.000 0.508
#> SRR1419917 1 0.3198 0.6388 0.740 0.000 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR662114 3 0.3534 0.6298 0.000 0.000 0.740 0.000 0.244 0.016
#> SRR1489199 5 0.3337 0.6046 0.004 0.000 0.000 0.000 0.736 0.260
#> SRR813584 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069638 5 0.3151 0.6480 0.000 0.000 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR614864 3 0.2854 0.7912 0.000 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1433392 6 0.5623 -0.1982 0.372 0.000 0.152 0.000 0.000 0.476
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.0865 0.7326 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1401252 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0363 0.7438 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.5756 -0.1874 0.508 0.000 0.220 0.000 0.000 0.272
#> SRR1380393 1 0.0363 0.7386 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1319731 1 0.0713 0.7293 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1356468 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 5 0.5432 0.0498 0.376 0.000 0.000 0.000 0.500 0.124
#> SRR1486538 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377696 4 0.3424 0.6996 0.000 0.024 0.000 0.772 0.204 0.000
#> SRR1465459 3 0.3309 0.7379 0.000 0.000 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1080270 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093148 6 0.5642 0.1424 0.000 0.000 0.160 0.000 0.352 0.488
#> SRR1467080 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613342 3 0.0458 0.8606 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.2912 0.7874 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR813824 3 0.0260 0.8639 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1082376 1 0.3862 0.4027 0.524 0.000 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1500891 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR807543 3 0.3993 0.4862 0.004 0.000 0.520 0.000 0.000 0.476
#> SRR1091572 5 0.5701 0.3119 0.164 0.000 0.000 0.000 0.460 0.376
#> SRR1346689 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332424 5 0.0146 0.8448 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR663729 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.0260 0.7406 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR613675 5 0.0146 0.8448 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1485357 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.3578 0.0514 0.660 0.000 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR1437622 2 0.0713 0.9470 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1355172 6 0.5254 0.5114 0.392 0.000 0.100 0.000 0.000 0.508
#> SRR655531 5 0.0146 0.8448 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1338147 3 0.2912 0.7874 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1413329 6 0.5767 0.2685 0.000 0.000 0.232 0.000 0.260 0.508
#> SRR1485931 2 0.0291 0.9678 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1420873 6 0.4183 0.4575 0.480 0.000 0.000 0.000 0.012 0.508
#> SRR1333308 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452033 6 0.3868 0.4435 0.492 0.000 0.000 0.000 0.000 0.508
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.3151 0.7623 0.000 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1471755 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808019 6 0.5890 0.5210 0.364 0.000 0.060 0.000 0.064 0.512
#> SRR1479133 3 0.2912 0.7874 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR615069 5 0.1967 0.7780 0.000 0.000 0.084 0.000 0.904 0.012
#> SRR1456185 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350069 4 0.1610 0.8794 0.000 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR816316 1 0.3862 0.4027 0.524 0.000 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR664795 6 0.4818 0.4970 0.364 0.000 0.064 0.000 0.000 0.572
#> SRR1490721 5 0.2416 0.7034 0.000 0.000 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR810643 1 0.3834 0.4727 0.776 0.000 0.000 0.000 0.108 0.116
#> SRR1430333 5 0.0146 0.8448 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1085285 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.3151 0.7623 0.000 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1317985 1 0.0458 0.7434 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1487340 1 0.0260 0.7442 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1420276 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405525 5 0.0405 0.8426 0.008 0.000 0.000 0.000 0.988 0.004
#> SRR1370329 1 0.0363 0.7438 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1465001 1 0.0713 0.7293 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0547 0.7342 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.3221 0.5837 0.264 0.000 0.000 0.736 0.000 0.000
#> SRR613639 3 0.2941 0.7858 0.000 0.000 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1402285 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.3862 0.4027 0.524 0.000 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1405660 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 5 0.2358 0.7817 0.016 0.000 0.000 0.000 0.876 0.108
#> SRR1394734 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0790 0.7419 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1365894 4 0.3023 0.6970 0.000 0.212 0.000 0.784 0.004 0.000
#> SRR1073581 6 0.4639 0.4870 0.448 0.000 0.040 0.000 0.000 0.512
#> SRR659804 1 0.0632 0.7314 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473529 4 0.4181 0.3414 0.000 0.384 0.000 0.600 0.004 0.012
#> SRR660764 3 0.0363 0.8595 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR820448 1 0.3862 0.4027 0.524 0.000 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1328845 4 0.3578 0.4936 0.000 0.000 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR1336415 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459190 3 0.0937 0.8558 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1346773 5 0.4396 0.0766 0.456 0.000 0.000 0.000 0.520 0.024
#> SRR1499521 6 0.4494 0.4764 0.464 0.000 0.012 0.000 0.012 0.512
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.0865 0.8570 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.7437 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309248 4 0.0713 0.9343 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR809161 3 0.1501 0.8447 0.000 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1316320 5 0.0363 0.8428 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1432629 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0260 0.7440 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1416578 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.5481 -0.1635 0.440 0.000 0.000 0.000 0.436 0.124
#> SRR1309160 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.3857 -0.3747 0.532 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1078489 5 0.1010 0.8364 0.000 0.000 0.004 0.000 0.960 0.036
#> SRR1332648 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660614 2 0.6699 0.2279 0.000 0.504 0.216 0.000 0.080 0.200
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.7437 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0260 0.7406 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.3494 0.3128 0.736 0.000 0.000 0.000 0.012 0.252
#> SRR615946 3 0.1327 0.8486 0.000 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 5 0.3602 0.5784 0.208 0.000 0.000 0.000 0.760 0.032
#> SRR660224 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.3198 0.6388 0.740 0.000 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1347166 5 0.0146 0.8448 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1485722 5 0.2969 0.6506 0.000 0.000 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR1415316 1 0.1957 0.7138 0.888 0.000 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR613390 1 0.3198 0.6388 0.740 0.000 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR661108 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.5923 0.0702 0.428 0.000 0.404 0.000 0.008 0.160
#> SRR817329 1 0.3198 0.6388 0.740 0.000 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1401990 4 0.0458 0.9453 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1467745 2 0.1267 0.9120 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 1 0.3862 0.4027 0.524 0.000 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1314873 1 0.3198 0.6388 0.740 0.000 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1401211 6 0.3868 0.4435 0.492 0.000 0.000 0.000 0.000 0.508
#> SRR1419692 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818797 3 0.3175 0.7590 0.000 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR2164608 6 0.4702 0.1536 0.000 0.000 0.460 0.000 0.044 0.496
#> SRR1455586 3 0.3706 0.3452 0.000 0.380 0.620 0.000 0.000 0.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 6 0.4856 -0.3629 0.468 0.000 0.000 0.000 0.056 0.476
#> SRR1361652 5 0.0363 0.8428 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1437119 1 0.0260 0.7440 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1478547 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 5 0.0363 0.8428 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1310584 1 0.1074 0.7217 0.960 0.000 0.000 0.000 0.012 0.028
#> SRR1500216 1 0.5354 0.4663 0.580 0.000 0.000 0.000 0.160 0.260
#> SRR1486762 3 0.0937 0.8558 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1480854 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473058 4 0.0146 0.9547 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1405165 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.3198 0.6388 0.740 0.000 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1471477 6 0.4095 0.4608 0.480 0.000 0.008 0.000 0.000 0.512
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 6 0.5050 0.0560 0.000 0.076 0.000 0.416 0.000 0.508
#> SRR1455038 5 0.4954 0.5206 0.112 0.000 0.000 0.000 0.628 0.260
#> SRR1375248 3 0.3288 0.5293 0.000 0.276 0.724 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.3151 0.7623 0.000 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1348378 2 0.1075 0.9255 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1413541 1 0.3198 0.6388 0.740 0.000 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1392943 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475192 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 5 0.0363 0.8428 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1347060 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414139 3 0.3817 0.1914 0.000 0.432 0.568 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0146 0.9703 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0260 0.7406 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1413436 1 0.3835 0.3309 0.684 0.000 0.000 0.000 0.300 0.016
#> SRR1311266 5 0.3271 0.6334 0.008 0.000 0.000 0.000 0.760 0.232
#> SRR1343302 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0260 0.7440 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1429678 1 0.1556 0.7258 0.920 0.000 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.3993 0.4862 0.004 0.000 0.520 0.000 0.000 0.476
#> SRR1345609 1 0.0000 0.7437 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 5 0.0146 0.8441 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1322840 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.7437 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.3151 0.7623 0.000 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1367920 4 0.0632 0.9372 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9741 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 6 0.5770 0.2759 0.000 0.000 0.240 0.000 0.252 0.508
#> SRR1363968 6 0.3867 0.4485 0.488 0.000 0.000 0.000 0.000 0.512
#> SRR814387 1 0.0713 0.7293 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR657599 6 0.5890 0.5210 0.364 0.000 0.060 0.000 0.064 0.512
#> SRR1386689 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453811 3 0.3175 0.7590 0.000 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR1441159 5 0.3468 0.5266 0.284 0.000 0.000 0.000 0.712 0.004
#> SRR1403154 4 0.0000 0.9584 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.8651 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 5 0.5937 -0.0389 0.000 0.000 0.368 0.000 0.416 0.216
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.345 0.567 0.779 0.4566 0.548 0.548
#> 3 3 0.742 0.833 0.926 0.4359 0.686 0.479
#> 4 4 0.788 0.850 0.933 0.1074 0.875 0.661
#> 5 5 0.809 0.749 0.862 0.0924 0.877 0.589
#> 6 6 0.784 0.761 0.862 0.0450 0.923 0.658
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.8443 0.6927 0.728 0.272
#> SRR1331708 1 0.9661 0.5963 0.608 0.392
#> SRR1464258 1 0.6048 0.6931 0.852 0.148
#> SRR1454201 1 0.8081 0.6924 0.752 0.248
#> SRR661589 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1315165 2 0.6438 0.4572 0.164 0.836
#> SRR1488960 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1417809 1 0.9044 0.6908 0.680 0.320
#> SRR1094457 2 0.8955 0.1717 0.312 0.688
#> SRR1095575 1 0.2236 0.6822 0.964 0.036
#> SRR1315931 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1430066 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1431037 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1395554 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR818002 2 0.8499 0.6576 0.276 0.724
#> SRR1344143 2 0.8016 0.6510 0.244 0.756
#> SRR1486845 2 0.9248 0.0906 0.340 0.660
#> SRR1362866 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1490740 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1446627 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1456138 2 0.8499 0.6576 0.276 0.724
#> SRR1416248 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1383907 2 0.6148 0.4685 0.152 0.848
#> SRR1311018 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1375699 2 0.2236 0.5796 0.036 0.964
#> SRR1429846 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR613550 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1345146 1 1.0000 0.3719 0.500 0.500
#> SRR1324025 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1318879 1 0.2236 0.6822 0.964 0.036
#> SRR820755 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1485830 2 0.9977 -0.3106 0.472 0.528
#> SRR599313 1 0.3584 0.6862 0.932 0.068
#> SRR612263 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1415398 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1326205 2 0.7139 0.4130 0.196 0.804
#> SRR1421327 2 0.6531 0.4530 0.168 0.832
#> SRR1083311 1 0.8713 0.1607 0.708 0.292
#> SRR1499303 2 0.0000 0.5615 0.000 1.000
#> SRR1079522 1 0.3584 0.6862 0.932 0.068
#> SRR1452935 1 0.0376 0.6752 0.996 0.004
#> SRR1379495 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1470459 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR661361 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1447564 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1455195 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR655182 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1335140 2 0.8555 0.6581 0.280 0.720
#> SRR1433555 1 0.6148 0.4740 0.848 0.152
#> SRR1308650 1 0.9866 -0.2643 0.568 0.432
#> SRR1388354 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1317446 1 0.6531 0.4453 0.832 0.168
#> SRR1413602 1 0.9996 -0.3904 0.512 0.488
#> SRR1479955 2 0.8081 0.6518 0.248 0.752
#> SRR809853 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR661313 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1499935 2 0.0000 0.5615 0.000 1.000
#> SRR1447303 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1429408 2 0.1414 0.5701 0.020 0.980
#> SRR1433950 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1362081 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1409854 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1435229 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1085996 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1414229 1 0.4562 0.5618 0.904 0.096
#> SRR1400974 1 0.2043 0.6423 0.968 0.032
#> SRR1399971 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR613927 1 0.1414 0.6803 0.980 0.020
#> SRR1457854 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1473714 1 0.8813 0.6962 0.700 0.300
#> SRR813776 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR808196 2 1.0000 -0.3671 0.496 0.504
#> SRR1101085 2 0.6438 0.4573 0.164 0.836
#> SRR614395 1 0.3584 0.6862 0.932 0.068
#> SRR1478251 2 1.0000 -0.3671 0.496 0.504
#> SRR1370551 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1362310 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR665310 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1420109 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1330920 1 0.1843 0.6828 0.972 0.028
#> SRR1419539 1 0.9427 -0.0634 0.640 0.360
#> SRR1359447 1 0.8763 0.1492 0.704 0.296
#> SRR1347259 2 0.9998 -0.3611 0.492 0.508
#> SRR613915 1 0.0376 0.6755 0.996 0.004
#> SRR1384395 1 0.8763 0.1492 0.704 0.296
#> SRR821715 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1445637 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR608150 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1096383 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1341480 2 0.5519 0.4886 0.128 0.872
#> SRR1341344 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1326270 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1498838 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1416313 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR808566 2 0.2423 0.5764 0.040 0.960
#> SRR1430270 1 0.9983 0.4314 0.524 0.476
#> SRR1367825 1 0.3274 0.6094 0.940 0.060
#> SRR613533 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR661267 1 0.8499 0.6925 0.724 0.276
#> SRR810665 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1407250 1 0.8081 0.6924 0.752 0.248
#> SRR1420067 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1473632 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR812536 1 0.6712 0.4303 0.824 0.176
#> SRR1370850 2 0.8081 0.6518 0.248 0.752
#> SRR1486195 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1407671 2 0.0000 0.5615 0.000 1.000
#> SRR1446375 1 0.2236 0.6822 0.964 0.036
#> SRR1465230 2 0.6623 0.4485 0.172 0.828
#> SRR614119 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1356101 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1404209 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1392676 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR665538 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR660510 1 0.5294 0.5271 0.880 0.120
#> SRR1445655 2 0.8443 0.5208 0.272 0.728
#> SRR658953 1 0.2603 0.6838 0.956 0.044
#> SRR2166459 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1070713 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1485312 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1317631 2 1.0000 -0.3671 0.496 0.504
#> SRR1488610 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1330588 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1433926 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1091302 2 0.6531 0.4530 0.168 0.832
#> SRR818263 1 0.7674 0.6934 0.776 0.224
#> SRR1404909 2 0.0000 0.5615 0.000 1.000
#> SRR663076 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1323577 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1442422 2 0.6712 0.4430 0.176 0.824
#> SRR1465893 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR654862 1 0.3879 0.6909 0.924 0.076
#> SRR1407112 2 1.0000 -0.3671 0.496 0.504
#> SRR1332969 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1353199 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1378885 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR665357 1 0.8763 0.1492 0.704 0.296
#> SRR662186 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1501020 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1347819 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1472576 2 0.0000 0.5615 0.000 1.000
#> SRR1431781 2 0.1633 0.5709 0.024 0.976
#> SRR1452270 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.2236 0.6822 0.964 0.036
#> SRR1417632 2 0.6343 0.4612 0.160 0.840
#> SRR1350153 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1458113 1 0.5059 0.5385 0.888 0.112
#> SRR1326579 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1349363 2 0.8081 0.6518 0.248 0.752
#> SRR1096712 1 0.6531 0.4448 0.832 0.168
#> SRR1090407 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1377599 2 0.5842 0.4789 0.140 0.860
#> SRR1488449 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1318354 1 0.6531 0.4448 0.832 0.168
#> SRR1359062 1 0.8661 0.1719 0.712 0.288
#> SRR1398924 1 0.2778 0.6832 0.952 0.048
#> SRR663783 1 0.1184 0.6592 0.984 0.016
#> SRR1319204 1 0.8016 0.4026 0.756 0.244
#> SRR1369070 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR615659 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1337449 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1316982 2 0.9044 0.6597 0.320 0.680
#> SRR1498595 2 0.0672 0.5659 0.008 0.992
#> SRR1377423 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1485613 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1338426 1 0.6343 0.4596 0.840 0.160
#> SRR1353309 1 0.4562 0.5627 0.904 0.096
#> SRR658941 1 0.0672 0.6770 0.992 0.008
#> SRR1101643 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1401468 1 0.8861 0.6949 0.696 0.304
#> SRR1368874 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1324085 2 0.7139 0.4720 0.196 0.804
#> SRR1363858 1 0.8763 0.6964 0.704 0.296
#> SRR819820 1 0.1414 0.6803 0.980 0.020
#> SRR1337342 1 0.8955 0.6952 0.688 0.312
#> SRR655206 1 0.6801 0.4239 0.820 0.180
#> SRR1387013 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1317410 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR608198 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1440161 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1343741 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1381288 2 0.8713 0.6602 0.292 0.708
#> SRR1415379 2 1.0000 -0.3671 0.496 0.504
#> SRR1099622 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR663197 1 0.8608 0.1830 0.716 0.284
#> SRR1394836 2 0.9323 0.6353 0.348 0.652
#> SRR661699 1 0.4298 0.5908 0.912 0.088
#> SRR813680 1 0.8207 0.6978 0.744 0.256
#> SRR1410678 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1378109 2 0.6623 0.4485 0.172 0.828
#> SRR1499174 1 0.4690 0.6890 0.900 0.100
#> SRR1311486 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1382851 2 0.8555 0.6589 0.280 0.720
#> SRR1433410 1 0.8909 0.6953 0.692 0.308
#> SRR661167 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1432518 1 0.0376 0.6706 0.996 0.004
#> SRR660462 1 0.6343 0.4599 0.840 0.160
#> SRR1374608 1 1.0000 0.3719 0.500 0.500
#> SRR657949 1 0.2603 0.6838 0.956 0.044
#> SRR1308882 2 0.6623 0.4485 0.172 0.828
#> SRR655768 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1485870 2 0.0000 0.5615 0.000 1.000
#> SRR1444138 1 0.8763 0.6956 0.704 0.296
#> SRR1417342 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1470193 2 0.6887 0.4556 0.184 0.816
#> SRR1091380 1 0.2778 0.6293 0.952 0.048
#> SRR1099096 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1313583 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1467102 2 0.9248 0.6417 0.340 0.660
#> SRR1485416 2 0.6438 0.4573 0.164 0.836
#> SRR818821 1 0.0376 0.6706 0.996 0.004
#> SRR809963 1 0.3584 0.6862 0.932 0.068
#> SRR1072247 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1353710 2 0.6801 0.4376 0.180 0.820
#> SRR1445259 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1408393 1 0.3584 0.6862 0.932 0.068
#> SRR1361522 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1368597 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1309680 2 0.8499 0.6576 0.276 0.724
#> SRR1310542 1 0.7815 0.3140 0.768 0.232
#> SRR1333485 2 0.6623 0.4485 0.172 0.828
#> SRR1406437 1 0.9732 0.5112 0.596 0.404
#> SRR1354931 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1391856 1 0.8861 0.1266 0.696 0.304
#> SRR1446738 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1309032 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1388145 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1432611 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR815869 1 0.8763 0.1492 0.704 0.296
#> SRR613150 1 0.4161 0.5780 0.916 0.084
#> SRR1375329 1 0.6247 0.6002 0.844 0.156
#> SRR1387921 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1466792 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1360478 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1360695 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR812943 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1400910 1 0.5178 0.5524 0.884 0.116
#> SRR1444203 2 0.6623 0.4485 0.172 0.828
#> SRR816177 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR658754 1 0.8555 0.1938 0.720 0.280
#> SRR1429603 2 0.6531 0.4532 0.168 0.832
#> SRR1397366 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1083918 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1337606 1 0.2423 0.6808 0.960 0.040
#> SRR659109 1 0.5737 0.5009 0.864 0.136
#> SRR1337192 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR656946 1 0.7056 0.6954 0.808 0.192
#> SRR1476102 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1476447 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1342067 2 0.6623 0.4485 0.172 0.828
#> SRR1385389 2 1.0000 -0.3671 0.496 0.504
#> SRR1075971 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR614419 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1322936 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1349121 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1430549 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR612935 1 0.5629 0.5094 0.868 0.132
#> SRR661481 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1354117 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1393596 2 0.6623 0.4399 0.172 0.828
#> SRR1452164 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1070503 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1499894 1 0.4562 0.5621 0.904 0.096
#> SRR1082883 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1468271 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1332443 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR810295 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR662103 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1328620 1 0.4431 0.5674 0.908 0.092
#> SRR1396294 1 0.9775 0.3940 0.588 0.412
#> SRR1419917 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR662114 1 0.5408 0.5200 0.876 0.124
#> SRR1489199 1 0.2948 0.6865 0.948 0.052
#> SRR813584 2 0.7745 0.6474 0.228 0.772
#> SRR1069638 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR614864 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.8443 0.6927 0.728 0.272
#> SRR1377777 2 0.8207 0.6538 0.256 0.744
#> SRR2167710 1 0.3584 0.6862 0.932 0.068
#> SRR1401252 2 0.6531 0.4530 0.168 0.832
#> SRR1309963 2 0.9998 -0.3578 0.492 0.508
#> SRR1338031 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1418628 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1486889 1 0.3584 0.6862 0.932 0.068
#> SRR1380393 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1319731 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1356468 1 1.0000 0.3719 0.500 0.500
#> SRR1337010 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1486520 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1486538 2 0.9209 0.1029 0.336 0.664
#> SRR1340486 2 0.9983 -0.3203 0.476 0.524
#> SRR1377696 2 0.0000 0.5615 0.000 1.000
#> SRR1465459 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1080270 1 0.4431 0.5672 0.908 0.092
#> SRR1312501 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1093148 1 0.0938 0.6629 0.988 0.012
#> SRR1467080 1 0.8661 0.1719 0.712 0.288
#> SRR1410866 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR816475 2 0.9988 0.5276 0.480 0.520
#> SRR1379198 2 1.0000 -0.3671 0.496 0.504
#> SRR613342 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1338836 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1369129 2 0.8555 0.2506 0.280 0.720
#> SRR1396616 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR813824 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.8016 0.6927 0.756 0.244
#> SRR1500891 2 0.6343 0.4612 0.160 0.840
#> SRR807543 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1346689 2 0.6623 0.4485 0.172 0.828
#> SRR1332424 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR663729 1 0.9850 0.5334 0.572 0.428
#> SRR1097013 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR613675 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1485357 2 0.7815 0.3500 0.232 0.768
#> SRR655816 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1437622 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1355172 1 0.7883 0.6961 0.764 0.236
#> SRR655531 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1338147 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1413329 1 0.2236 0.6822 0.964 0.036
#> SRR1485931 2 0.8555 0.6581 0.280 0.720
#> SRR1420873 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1333308 2 1.0000 -0.3671 0.496 0.504
#> SRR1452033 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1467316 2 0.7528 0.6440 0.216 0.784
#> SRR809018 1 0.1633 0.6509 0.976 0.024
#> SRR1375351 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR663440 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR808019 1 0.8499 0.6925 0.724 0.276
#> SRR1479133 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR615069 1 0.8608 0.1830 0.716 0.284
#> SRR1456185 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1350069 2 1.0000 -0.3671 0.496 0.504
#> SRR816316 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR664795 1 0.8499 0.6972 0.724 0.276
#> SRR1490721 2 0.9795 -0.1720 0.416 0.584
#> SRR810643 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1430333 1 0.2948 0.6849 0.948 0.052
#> SRR1085285 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1099072 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1487340 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1420276 1 0.8763 0.1492 0.704 0.296
#> SRR1351347 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1370329 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1465001 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1476525 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR819610 2 0.0000 0.5615 0.000 1.000
#> SRR2157314 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1409465 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR809987 1 0.9087 0.6866 0.676 0.324
#> SRR613639 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1402285 2 1.0000 -0.3671 0.496 0.504
#> SRR1077038 1 0.6531 0.6950 0.832 0.168
#> SRR1405660 1 0.7602 0.3412 0.780 0.220
#> SRR1095455 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1394734 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1317771 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1365894 2 0.2236 0.5795 0.036 0.964
#> SRR1073581 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR659804 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1345914 2 0.8861 0.6616 0.304 0.696
#> SRR1432186 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1473529 2 0.8267 0.6547 0.260 0.740
#> SRR660764 1 0.7453 0.3586 0.788 0.212
#> SRR820448 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1328845 1 0.9996 0.4024 0.512 0.488
#> SRR1336415 2 1.0000 -0.3671 0.496 0.504
#> SRR1379065 2 0.8713 0.2225 0.292 0.708
#> SRR1459190 1 0.2236 0.6822 0.964 0.036
#> SRR1346773 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1499521 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1440898 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1347459 1 0.5178 0.5332 0.884 0.116
#> SRR1081209 2 0.8713 0.6602 0.292 0.708
#> SRR1400202 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1333395 2 1.0000 -0.3671 0.496 0.504
#> SRR1309248 2 0.5294 0.4953 0.120 0.880
#> SRR809161 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1316320 2 0.5737 0.4495 0.136 0.864
#> SRR1432629 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1498931 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1416578 2 0.9248 0.0907 0.340 0.660
#> SRR1405547 1 0.2423 0.6333 0.960 0.040
#> SRR1470534 2 0.9996 -0.3486 0.488 0.512
#> SRR1380764 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1309160 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR663489 1 0.8016 0.2856 0.756 0.244
#> SRR1500450 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1078489 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1332648 2 0.8763 0.2127 0.296 0.704
#> SRR660614 1 0.9933 -0.3108 0.548 0.452
#> SRR1470420 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1475566 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1477949 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1481419 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1464766 1 0.8144 0.6930 0.748 0.252
#> SRR615946 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1467656 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1402962 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR660224 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR665586 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1347166 1 0.8386 0.6977 0.732 0.268
#> SRR1485722 1 0.8081 0.6924 0.752 0.248
#> SRR1415316 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR613390 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR661108 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.2423 0.6830 0.960 0.040
#> SRR817329 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1401990 2 0.8661 0.2320 0.288 0.712
#> SRR1467745 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1471795 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1415637 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR813137 1 0.7528 0.6970 0.784 0.216
#> SRR1314873 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1401211 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1419692 2 0.7299 0.3999 0.204 0.796
#> SRR818797 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR2164608 1 0.2236 0.6822 0.964 0.036
#> SRR1455586 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR819459 1 0.5408 0.5200 0.876 0.124
#> SRR1488939 2 0.7056 0.6367 0.192 0.808
#> SRR1433232 2 0.8661 0.6596 0.288 0.712
#> SRR1385501 1 0.2236 0.6822 0.964 0.036
#> SRR1361652 1 0.3584 0.6862 0.932 0.068
#> SRR1437119 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1478547 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1430910 1 0.4815 0.5511 0.896 0.104
#> SRR1310584 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1500216 1 0.3431 0.6859 0.936 0.064
#> SRR1486762 1 0.0376 0.6708 0.996 0.004
#> SRR1480854 2 0.6712 0.4433 0.176 0.824
#> SRR1489394 2 0.6623 0.4485 0.172 0.828
#> SRR1418085 2 1.0000 -0.3671 0.496 0.504
#> SRR1340221 2 1.0000 -0.3671 0.496 0.504
#> SRR1473058 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1405165 1 0.6623 0.4375 0.828 0.172
#> SRR1433004 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1471477 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1098567 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1098712 2 0.9996 -0.3552 0.488 0.512
#> SRR1455038 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1375248 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1403005 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1413541 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1392943 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1475192 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1452468 1 0.7299 0.6964 0.796 0.204
#> SRR1347060 1 0.6048 0.4803 0.852 0.148
#> SRR1414139 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1447962 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1444324 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1415004 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1413436 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1311266 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1343302 2 0.6623 0.4485 0.172 0.828
#> SRR1373746 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1429678 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1469413 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1405331 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1380208 2 0.7950 0.2481 0.240 0.760
#> SRR1322840 2 0.8813 0.2028 0.300 0.700
#> SRR1399797 1 0.7528 0.3500 0.784 0.216
#> SRR1416654 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1315081 1 0.8763 0.1492 0.704 0.296
#> SRR1369196 1 0.4690 0.5560 0.900 0.100
#> SRR1400847 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1365291 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1367920 2 0.4690 0.5091 0.100 0.900
#> SRR1366648 1 0.6048 0.4814 0.852 0.148
#> SRR1441679 2 0.9000 0.6627 0.316 0.684
#> SRR1082173 1 0.2236 0.6822 0.964 0.036
#> SRR1363968 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR814387 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR657599 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1386689 2 0.8955 0.1716 0.312 0.688
#> SRR1395575 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1453811 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1441159 1 0.9000 0.6948 0.684 0.316
#> SRR1403154 2 0.6623 0.4485 0.172 0.828
#> SRR1468722 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
#> SRR1310275 1 0.0000 0.6741 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 1 0.5968 0.4410 0.636 0.000 0.364
#> SRR1331708 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464258 3 0.6154 0.2963 0.408 0.000 0.592
#> SRR1454201 1 0.6260 0.2254 0.552 0.000 0.448
#> SRR661589 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456229 1 0.3551 0.8272 0.868 0.000 0.132
#> SRR1315165 2 0.3715 0.8413 0.128 0.868 0.004
#> SRR1488960 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094457 1 0.3941 0.7625 0.844 0.156 0.000
#> SRR1095575 3 0.6140 0.2771 0.404 0.000 0.596
#> SRR1315931 1 0.2537 0.8672 0.920 0.000 0.080
#> SRR1430066 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.2878 0.8524 0.096 0.904 0.000
#> SRR1486845 1 0.1163 0.8971 0.972 0.028 0.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 2 0.4379 0.8468 0.072 0.868 0.060
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0892 0.9070 0.020 0.980 0.000
#> SRR1429846 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR613550 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.2356 0.8728 0.928 0.000 0.072
#> SRR1324025 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318879 3 0.1753 0.8952 0.048 0.000 0.952
#> SRR820755 3 0.1031 0.9110 0.024 0.000 0.976
#> SRR1485830 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR599313 1 0.6954 0.4685 0.620 0.028 0.352
#> SRR612263 1 0.2796 0.8609 0.908 0.000 0.092
#> SRR1415398 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326205 2 0.5882 0.5321 0.348 0.652 0.000
#> SRR1421327 2 0.5988 0.4779 0.368 0.632 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499303 2 0.0592 0.9105 0.012 0.988 0.000
#> SRR1079522 1 0.4121 0.7958 0.832 0.000 0.168
#> SRR1452935 3 0.1163 0.9088 0.028 0.000 0.972
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR615778 1 0.4291 0.7810 0.820 0.000 0.180
#> SRR1447564 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308650 3 0.4796 0.7106 0.000 0.220 0.780
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413602 3 0.2959 0.8536 0.000 0.100 0.900
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499935 2 0.2796 0.8680 0.092 0.908 0.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429408 2 0.0661 0.9113 0.008 0.988 0.004
#> SRR1433950 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409854 3 0.2356 0.8761 0.072 0.000 0.928
#> SRR1435229 1 0.2537 0.8669 0.920 0.000 0.080
#> SRR1085996 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 3 0.2313 0.8998 0.024 0.032 0.944
#> SRR1400974 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.5835 0.5001 0.660 0.000 0.340
#> SRR813776 3 0.1031 0.9110 0.024 0.000 0.976
#> SRR808196 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101085 2 0.3551 0.8390 0.132 0.868 0.000
#> SRR614395 3 0.6295 0.1059 0.472 0.000 0.528
#> SRR1478251 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420109 3 0.4235 0.7553 0.176 0.000 0.824
#> SRR1330920 1 0.5621 0.6034 0.692 0.000 0.308
#> SRR1419539 3 0.2959 0.8514 0.000 0.100 0.900
#> SRR1359447 3 0.3038 0.8513 0.000 0.104 0.896
#> SRR1347259 1 0.6140 0.2420 0.596 0.404 0.000
#> SRR613915 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384395 3 0.2625 0.8643 0.000 0.084 0.916
#> SRR821715 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.1950 0.8921 0.952 0.008 0.040
#> SRR1096383 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341480 2 0.3412 0.8450 0.124 0.876 0.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR808566 2 0.0592 0.9090 0.000 0.988 0.012
#> SRR1430270 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR661267 3 0.2878 0.8563 0.096 0.000 0.904
#> SRR810665 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407250 1 0.6168 0.3343 0.588 0.000 0.412
#> SRR1420067 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.6111 0.3544 0.396 0.604 0.000
#> SRR1446375 1 0.4121 0.7958 0.832 0.000 0.168
#> SRR1465230 2 0.5733 0.5777 0.324 0.676 0.000
#> SRR614119 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356101 3 0.6308 0.0836 0.000 0.492 0.508
#> SRR1404209 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445655 2 0.3921 0.8245 0.016 0.872 0.112
#> SRR658953 1 0.5327 0.6612 0.728 0.000 0.272
#> SRR2166459 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317631 2 0.6280 0.2484 0.460 0.540 0.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316367 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.2537 0.8672 0.920 0.000 0.080
#> SRR1091302 2 0.3551 0.8390 0.132 0.868 0.000
#> SRR818263 1 0.5327 0.6633 0.728 0.000 0.272
#> SRR1404909 2 0.0747 0.9090 0.016 0.984 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442422 2 0.4121 0.8070 0.168 0.832 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.5650 0.5915 0.688 0.000 0.312
#> SRR1407112 1 0.3752 0.7831 0.856 0.144 0.000
#> SRR1332969 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353199 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1378885 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR665357 3 0.3116 0.8459 0.000 0.108 0.892
#> SRR662186 2 0.0747 0.9050 0.000 0.984 0.016
#> SRR1501020 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472576 2 0.0424 0.9118 0.008 0.992 0.000
#> SRR1431781 2 0.0661 0.9113 0.008 0.988 0.004
#> SRR1452270 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500472 1 0.4521 0.7802 0.816 0.004 0.180
#> SRR1417632 2 0.4346 0.7881 0.184 0.816 0.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.0592 0.9184 0.000 0.012 0.988
#> SRR1326579 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.0747 0.9085 0.016 0.984 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1083752 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377599 2 0.3340 0.8479 0.120 0.880 0.000
#> SRR1488449 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318354 3 0.1289 0.9065 0.000 0.032 0.968
#> SRR1359062 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398924 1 0.6527 0.5541 0.660 0.020 0.320
#> SRR663783 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319204 3 0.8635 0.0814 0.100 0.440 0.460
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.3192 0.8411 0.000 0.112 0.888
#> SRR1498595 2 0.0424 0.9118 0.008 0.992 0.000
#> SRR1377423 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.2448 0.8705 0.000 0.076 0.924
#> SRR1353309 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR658941 3 0.3359 0.8627 0.084 0.016 0.900
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.1643 0.8922 0.956 0.000 0.044
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324085 2 0.3889 0.8454 0.032 0.884 0.084
#> SRR1363858 1 0.2537 0.8672 0.920 0.000 0.080
#> SRR819820 3 0.3038 0.8477 0.104 0.000 0.896
#> SRR1337342 1 0.4178 0.7867 0.828 0.000 0.172
#> SRR655206 3 0.6217 0.6472 0.024 0.264 0.712
#> SRR1387013 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0237 0.9136 0.996 0.000 0.004
#> SRR1440161 2 0.4346 0.7259 0.000 0.816 0.184
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415379 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.0424 0.9107 0.000 0.992 0.008
#> SRR663197 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394836 3 0.3879 0.8034 0.000 0.152 0.848
#> SRR661699 3 0.0747 0.9156 0.016 0.000 0.984
#> SRR813680 3 0.4235 0.7663 0.176 0.000 0.824
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 2 0.6286 0.2177 0.464 0.536 0.000
#> SRR1499174 1 0.2711 0.8622 0.912 0.000 0.088
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.0237 0.9125 0.000 0.996 0.004
#> SRR1433410 1 0.2537 0.8669 0.920 0.000 0.080
#> SRR661167 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432518 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374608 1 0.5858 0.6209 0.740 0.240 0.020
#> SRR657949 3 0.1964 0.8893 0.056 0.000 0.944
#> SRR1308882 1 0.6168 0.2290 0.588 0.412 0.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 2 0.5058 0.6993 0.244 0.756 0.000
#> SRR1444138 1 0.2448 0.8699 0.924 0.000 0.076
#> SRR1417342 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 2 0.3851 0.8351 0.136 0.860 0.004
#> SRR1091380 3 0.2711 0.8572 0.088 0.000 0.912
#> SRR1099096 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467102 3 0.3192 0.8411 0.000 0.112 0.888
#> SRR1485416 2 0.5016 0.7146 0.240 0.760 0.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR809963 3 0.6307 0.0438 0.488 0.000 0.512
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 2 0.3686 0.8330 0.140 0.860 0.000
#> SRR1445259 3 0.6225 0.1508 0.432 0.000 0.568
#> SRR1408393 3 0.1753 0.8952 0.048 0.000 0.952
#> SRR1361522 1 0.2537 0.8672 0.920 0.000 0.080
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1333485 2 0.4178 0.8009 0.172 0.828 0.000
#> SRR1406437 1 0.8934 0.4563 0.568 0.236 0.196
#> SRR1354931 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1391856 3 0.5621 0.5866 0.000 0.308 0.692
#> SRR1446738 2 0.0592 0.9090 0.000 0.988 0.012
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0237 0.9227 0.000 0.004 0.996
#> SRR613150 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375329 3 0.9857 -0.0282 0.252 0.368 0.380
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0892 0.9053 0.980 0.000 0.020
#> SRR1400910 3 0.5956 0.7133 0.188 0.044 0.768
#> SRR1444203 2 0.6140 0.4014 0.404 0.596 0.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429603 2 0.3340 0.8511 0.120 0.880 0.000
#> SRR1397366 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337606 1 0.9411 0.3638 0.508 0.252 0.240
#> SRR659109 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0237 0.9136 0.996 0.000 0.004
#> SRR1476102 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 2 0.3551 0.8390 0.132 0.868 0.000
#> SRR1385389 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.0592 0.9190 0.000 0.012 0.988
#> SRR661481 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.5785 0.4533 0.000 0.668 0.332
#> SRR1393596 2 0.6235 0.2687 0.436 0.564 0.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499894 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082883 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR662103 1 0.2537 0.8672 0.920 0.000 0.080
#> SRR1328620 3 0.1620 0.9088 0.024 0.012 0.964
#> SRR1396294 3 0.9987 -0.0697 0.308 0.344 0.348
#> SRR1419917 1 0.2165 0.8785 0.936 0.000 0.064
#> SRR662114 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489199 1 0.5397 0.6485 0.720 0.000 0.280
#> SRR813584 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069638 3 0.0237 0.9227 0.004 0.000 0.996
#> SRR614864 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433392 3 0.3192 0.8406 0.112 0.000 0.888
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.2448 0.8730 0.924 0.000 0.076
#> SRR1401252 2 0.3686 0.8330 0.140 0.860 0.000
#> SRR1309963 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486889 3 0.6225 0.2379 0.432 0.000 0.568
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 1 0.0592 0.9072 0.988 0.012 0.000
#> SRR1340486 1 0.4291 0.7295 0.820 0.180 0.000
#> SRR1377696 2 0.0592 0.9105 0.012 0.988 0.000
#> SRR1465459 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093148 3 0.4324 0.8343 0.028 0.112 0.860
#> SRR1467080 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR816475 2 0.3551 0.8116 0.000 0.868 0.132
#> SRR1379198 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR613342 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369129 1 0.1411 0.8895 0.964 0.036 0.000
#> SRR1396616 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082376 1 0.6215 0.3326 0.572 0.000 0.428
#> SRR1500891 2 0.3551 0.8390 0.132 0.868 0.000
#> SRR807543 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091572 3 0.2066 0.8875 0.060 0.000 0.940
#> SRR1346689 2 0.6095 0.4282 0.392 0.608 0.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR663729 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485357 1 0.6252 0.1076 0.556 0.444 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355172 3 0.5216 0.6528 0.260 0.000 0.740
#> SRR655531 1 0.0747 0.9075 0.984 0.000 0.016
#> SRR1338147 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413329 3 0.1964 0.8894 0.056 0.000 0.944
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR663440 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR808019 1 0.4062 0.7817 0.836 0.000 0.164
#> SRR1479133 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR615069 3 0.2448 0.8762 0.000 0.076 0.924
#> SRR1456185 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350069 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR816316 1 0.3116 0.8468 0.892 0.000 0.108
#> SRR664795 3 0.6267 0.1640 0.452 0.000 0.548
#> SRR1490721 1 0.6235 0.1582 0.564 0.436 0.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.6763 0.2808 0.552 0.012 0.436
#> SRR1085285 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099072 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.2625 0.8643 0.000 0.084 0.916
#> SRR1351347 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0892 0.9035 0.000 0.980 0.020
#> SRR2157314 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR809987 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR613639 3 0.1031 0.9110 0.024 0.000 0.976
#> SRR1402285 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.3816 0.8124 0.852 0.000 0.148
#> SRR1405660 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095455 1 0.6062 0.4460 0.616 0.000 0.384
#> SRR1394734 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.0892 0.9074 0.020 0.980 0.000
#> SRR1073581 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR660764 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR820448 1 0.3192 0.8432 0.888 0.000 0.112
#> SRR1328845 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336415 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379065 1 0.1031 0.8982 0.976 0.024 0.000
#> SRR1459190 3 0.1753 0.8952 0.048 0.000 0.952
#> SRR1346773 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 1 0.1643 0.8847 0.956 0.044 0.000
#> SRR1309248 2 0.3482 0.8440 0.128 0.872 0.000
#> SRR809161 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316320 1 0.6075 0.5144 0.676 0.316 0.008
#> SRR1432629 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 1 0.0424 0.9101 0.992 0.008 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470534 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 3 0.0892 0.9135 0.020 0.000 0.980
#> SRR1332648 1 0.4504 0.7048 0.804 0.196 0.000
#> SRR660614 3 0.7004 0.2850 0.020 0.428 0.552
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.3038 0.8536 0.896 0.000 0.104
#> SRR615946 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.4504 0.7541 0.804 0.000 0.196
#> SRR660224 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR665586 1 0.2066 0.8821 0.940 0.000 0.060
#> SRR1347166 1 0.5016 0.7062 0.760 0.000 0.240
#> SRR1485722 1 0.5835 0.5129 0.660 0.000 0.340
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR2170173 1 0.6244 0.2852 0.560 0.000 0.440
#> SRR817329 1 0.3192 0.8432 0.888 0.000 0.112
#> SRR1401990 2 0.6126 0.4122 0.400 0.600 0.000
#> SRR1467745 2 0.1031 0.9025 0.000 0.976 0.024
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR813137 3 0.6295 0.1059 0.472 0.000 0.528
#> SRR1314873 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 1 0.4750 0.6797 0.784 0.216 0.000
#> SRR818797 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR2164608 1 0.5363 0.6551 0.724 0.000 0.276
#> SRR1455586 3 0.3816 0.8078 0.000 0.148 0.852
#> SRR819459 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.5058 0.6509 0.244 0.000 0.756
#> SRR1361652 1 0.4551 0.8113 0.844 0.024 0.132
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1430910 3 0.1999 0.9031 0.012 0.036 0.952
#> SRR1310584 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.6432 0.3122 0.568 0.004 0.428
#> SRR1486762 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480854 2 0.6215 0.3236 0.428 0.572 0.000
#> SRR1489394 1 0.2537 0.8507 0.920 0.080 0.000
#> SRR1418085 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340221 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473058 2 0.0747 0.9064 0.000 0.984 0.016
#> SRR1405165 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433004 1 0.2261 0.8758 0.932 0.000 0.068
#> SRR1471477 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098712 2 0.6299 0.1285 0.476 0.524 0.000
#> SRR1455038 1 0.3941 0.7993 0.844 0.000 0.156
#> SRR1375248 3 0.3340 0.8350 0.000 0.120 0.880
#> SRR1403005 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348378 2 0.1643 0.8876 0.000 0.956 0.044
#> SRR1413541 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475192 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452468 1 0.5016 0.7062 0.760 0.000 0.240
#> SRR1347060 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414139 2 0.6154 0.2612 0.000 0.592 0.408
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444324 3 0.6192 0.3226 0.000 0.420 0.580
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0424 0.9117 0.992 0.000 0.008
#> SRR1343302 2 0.3941 0.8175 0.156 0.844 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9142 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.0892 0.9135 0.020 0.000 0.980
#> SRR1345609 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.6818 0.4738 0.348 0.628 0.024
#> SRR1322840 1 0.4452 0.7152 0.808 0.192 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315081 3 0.0237 0.9227 0.000 0.004 0.996
#> SRR1369196 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367920 2 0.3752 0.8297 0.144 0.856 0.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441679 2 0.0747 0.9050 0.000 0.984 0.016
#> SRR1082173 1 0.5465 0.6371 0.712 0.000 0.288
#> SRR1363968 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1386689 1 0.4654 0.6881 0.792 0.208 0.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453811 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.9155 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 2 0.4178 0.8012 0.172 0.828 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310275 3 0.0000 0.9247 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 1 0.4477 0.5431 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR1331708 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464258 3 0.4790 0.4172 0.380 0.000 0.620 0.000
#> SRR1454201 1 0.3528 0.7610 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR661589 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.3486 0.7805 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1315165 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.3266 0.7601 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1094457 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095575 3 0.4985 0.0963 0.468 0.000 0.532 0.000
#> SRR1315931 1 0.2149 0.8746 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818002 2 0.1211 0.9014 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1344143 2 0.0707 0.9147 0.020 0.980 0.000 0.000
#> SRR1486845 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0817 0.9117 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613550 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.1211 0.9018 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1324025 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318879 3 0.3610 0.7383 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR820755 3 0.3649 0.7322 0.204 0.000 0.796 0.000
#> SRR1485830 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR599313 1 0.5306 0.4810 0.632 0.000 0.348 0.020
#> SRR612263 1 0.2345 0.8673 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1415398 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326205 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421327 4 0.0469 0.9273 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1083311 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079522 1 0.2868 0.8392 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR1452935 3 0.3610 0.7375 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.3123 0.8189 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.4817 0.3465 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1433555 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308650 3 0.3873 0.6715 0.000 0.228 0.772 0.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413602 2 0.4624 0.4982 0.000 0.660 0.340 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499935 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429408 2 0.3486 0.7442 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1433950 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 3 0.3873 0.6998 0.228 0.000 0.772 0.000
#> SRR1435229 1 0.1302 0.8995 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 3 0.4261 0.7985 0.112 0.068 0.820 0.000
#> SRR1400974 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.4905 0.4391 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR813776 3 0.3400 0.7627 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR808196 1 0.4907 0.2361 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1101085 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614395 3 0.4843 0.3855 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR1478251 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420109 3 0.4072 0.6649 0.252 0.000 0.748 0.000
#> SRR1330920 1 0.4331 0.6418 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR1419539 3 0.4103 0.6088 0.000 0.256 0.744 0.000
#> SRR1359447 3 0.3444 0.7345 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1347259 4 0.0188 0.9336 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR613915 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384395 3 0.2408 0.8216 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR821715 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0817 0.9108 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1096383 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341480 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808566 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1430270 4 0.4103 0.6592 0.256 0.000 0.000 0.744
#> SRR1367825 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661267 3 0.3975 0.6916 0.240 0.000 0.760 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 1 0.3528 0.7643 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1420067 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.4898 0.2821 0.416 0.584 0.000 0.000
#> SRR1446375 1 0.2921 0.8358 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1465230 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.2814 0.8076 0.000 0.868 0.132 0.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658953 1 0.4134 0.6878 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR2166459 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.0921 0.9121 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1488610 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.2149 0.8746 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1091302 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818263 1 0.4103 0.6939 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR1404909 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.3528 0.7797 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1407112 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332969 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353199 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378885 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR665357 3 0.2814 0.7958 0.000 0.132 0.868 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.0469 0.9281 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1431781 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.3105 0.8340 0.856 0.004 0.140 0.000
#> SRR1417632 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.0188 0.9103 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1326579 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.3870 0.7093 0.004 0.788 0.000 0.208
#> SRR1096712 3 0.0188 0.9101 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083752 4 0.4454 0.5445 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR1377599 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488449 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318354 3 0.1940 0.8524 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1359062 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398924 1 0.4630 0.7505 0.768 0.036 0.196 0.000
#> SRR663783 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319204 2 0.5582 0.6481 0.168 0.724 0.108 0.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.4193 0.5872 0.000 0.268 0.732 0.000
#> SRR1498595 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377423 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.1211 0.8812 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658941 3 0.5250 0.5625 0.316 0.024 0.660 0.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0921 0.9083 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363858 1 0.2334 0.8736 0.908 0.000 0.088 0.004
#> SRR819820 3 0.3610 0.7613 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1337342 1 0.2589 0.8547 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR655206 2 0.6464 0.4210 0.096 0.596 0.308 0.000
#> SRR1387013 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0188 0.9195 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099622 2 0.2081 0.8605 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR663197 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394836 2 0.3873 0.6971 0.000 0.772 0.228 0.000
#> SRR661699 3 0.0336 0.9083 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR813680 3 0.4304 0.6267 0.284 0.000 0.716 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499174 1 0.2216 0.8720 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.3172 0.7780 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1433410 1 0.1302 0.8995 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.3801 0.6892 0.220 0.000 0.000 0.780
#> SRR657949 3 0.3764 0.7168 0.216 0.000 0.784 0.000
#> SRR1308882 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 4 0.2611 0.8490 0.008 0.096 0.000 0.896
#> SRR1444138 1 0.1211 0.9019 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 4 0.1637 0.8815 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1091380 3 0.2647 0.8287 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 4 0.3486 0.7529 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR1467102 2 0.4992 0.1442 0.000 0.524 0.476 0.000
#> SRR1485416 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809963 3 0.4855 0.3746 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445259 1 0.4730 0.4864 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR1408393 3 0.3688 0.7273 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1361522 1 0.2149 0.8746 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406437 2 0.5372 0.1631 0.444 0.544 0.000 0.012
#> SRR1354931 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391856 2 0.3873 0.7102 0.000 0.772 0.228 0.000
#> SRR1446738 2 0.2868 0.8093 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.1389 0.8743 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375329 1 0.7224 0.4689 0.548 0.236 0.216 0.000
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0921 0.9089 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1400910 3 0.7490 0.2524 0.328 0.196 0.476 0.000
#> SRR1444203 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1397366 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337606 1 0.6142 0.6574 0.676 0.140 0.184 0.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0188 0.9195 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.2704 0.8073 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0188 0.9289 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1393596 4 0.0188 0.9336 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499894 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082883 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.2149 0.8746 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1328620 3 0.3581 0.8171 0.116 0.032 0.852 0.000
#> SRR1396294 4 0.7753 0.3119 0.292 0.004 0.232 0.472
#> SRR1419917 1 0.2081 0.8774 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR662114 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489199 1 0.3569 0.7756 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR813584 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069638 3 0.0817 0.8983 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR614864 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433392 3 0.3873 0.7129 0.228 0.000 0.772 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.2216 0.8739 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1401252 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 3 0.4866 0.3616 0.404 0.000 0.596 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.2345 0.8372 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377696 4 0.4008 0.6535 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR1465459 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093148 3 0.7674 0.1875 0.224 0.340 0.436 0.000
#> SRR1467080 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613342 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396616 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.4406 0.6212 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1500891 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR807543 3 0.0336 0.9083 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1091572 3 0.3528 0.7594 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR1346689 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663729 1 0.3975 0.6346 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1097013 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485357 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 4 0.0707 0.9224 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1355172 3 0.4746 0.4897 0.368 0.000 0.632 0.000
#> SRR655531 1 0.0592 0.9146 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1338147 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413329 3 0.3801 0.7133 0.220 0.000 0.780 0.000
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 4 0.4008 0.6690 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1452033 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808019 1 0.2011 0.8709 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1479133 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615069 3 0.4040 0.6333 0.000 0.248 0.752 0.000
#> SRR1456185 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350069 4 0.3400 0.7512 0.180 0.000 0.000 0.820
#> SRR816316 1 0.3074 0.8192 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR664795 3 0.4972 0.1905 0.456 0.000 0.544 0.000
#> SRR1490721 1 0.5237 0.4003 0.628 0.016 0.000 0.356
#> SRR810643 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.6747 0.5127 0.596 0.140 0.264 0.000
#> SRR1085285 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.2408 0.8209 0.000 0.104 0.896 0.000
#> SRR1351347 3 0.0188 0.9106 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.4999 0.0577 0.492 0.000 0.000 0.508
#> SRR613639 3 0.3528 0.7479 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR1402285 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077038 1 0.3569 0.7708 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.4406 0.6254 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1394734 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.3074 0.7861 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1073581 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473529 4 0.4624 0.4828 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR660764 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820448 1 0.3311 0.7972 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1328845 4 0.4804 0.3717 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR1336415 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1459190 3 0.2921 0.8077 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR1346773 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.2530 0.8363 0.112 0.000 0.000 0.888
#> SRR1309248 4 0.5630 0.6848 0.136 0.140 0.000 0.724
#> SRR809161 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316320 1 0.5127 0.4255 0.632 0.356 0.000 0.012
#> SRR1432629 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 3 0.2149 0.8525 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1332648 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660614 2 0.2675 0.8372 0.008 0.892 0.100 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.2216 0.8726 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR615946 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.2345 0.8620 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.1867 0.8850 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1347166 1 0.3400 0.7933 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1485722 1 0.2973 0.8206 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0469 0.9164 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.4916 0.3121 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR817329 1 0.3266 0.8017 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1401990 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467745 4 0.7249 0.3628 0.000 0.260 0.200 0.540
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813137 3 0.4843 0.3855 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818797 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2164608 1 0.4193 0.6753 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR1455586 2 0.3311 0.7698 0.000 0.828 0.172 0.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.4713 0.4442 0.360 0.000 0.640 0.000
#> SRR1361652 1 0.1867 0.8828 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430910 3 0.3910 0.7588 0.024 0.156 0.820 0.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.6223 0.3344 0.556 0.000 0.384 0.060
#> SRR1486762 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480854 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1473058 4 0.2868 0.8054 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR1405165 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.2011 0.8799 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 1 0.5452 0.3000 0.584 0.400 0.004 0.012
#> SRR1455038 1 0.2704 0.8470 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1375248 2 0.3764 0.7181 0.000 0.784 0.216 0.000
#> SRR1403005 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.6798 0.5217 0.000 0.604 0.224 0.172
#> SRR1413541 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.0707 0.9103 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1475192 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 1 0.3356 0.7978 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1347060 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.2469 0.8399 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0336 0.9263 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0188 0.9195 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.2081 0.8556 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.3764 0.6944 0.216 0.784 0.000 0.000
#> SRR1322840 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.1474 0.8712 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367920 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9318 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 1 0.4250 0.6633 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR1363968 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1386689 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453811 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.9211 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.9366 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.0000 0.9129 0.000 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 1 0.6298 0.0571 0.520 0.000 0.188 0.000 0.292
#> SRR1331708 1 0.4192 0.6192 0.596 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR1464258 5 0.4331 0.4803 0.400 0.000 0.004 0.000 0.596
#> SRR1454201 1 0.4171 0.6183 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR661589 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456229 5 0.3876 0.5288 0.316 0.000 0.000 0.000 0.684
#> SRR1315165 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.2124 0.7676 0.900 0.000 0.000 0.096 0.004
#> SRR1094457 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095575 5 0.4854 0.5965 0.260 0.000 0.060 0.000 0.680
#> SRR1315931 5 0.4210 0.4664 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1430066 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR818002 2 0.1197 0.9034 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1344143 2 0.3039 0.7741 0.000 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1486845 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362866 1 0.4171 0.6196 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR1490740 1 0.0404 0.8411 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.1670 0.8891 0.052 0.936 0.000 0.000 0.012
#> SRR1429846 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR613550 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1348402 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.4182 0.6179 0.600 0.000 0.000 0.000 0.400
#> SRR1324025 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1318879 3 0.4436 0.3724 0.008 0.000 0.596 0.000 0.396
#> SRR820755 5 0.4537 0.5770 0.012 0.000 0.396 0.000 0.592
#> SRR1485830 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR599313 5 0.0703 0.6065 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR612263 5 0.0000 0.5990 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415398 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326205 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421327 4 0.2124 0.8614 0.004 0.000 0.000 0.900 0.096
#> SRR1083311 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079522 5 0.0794 0.5886 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR1452935 5 0.0290 0.5996 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1379495 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR615778 5 0.0290 0.5996 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1447564 1 0.0963 0.8353 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1455195 1 0.4150 0.6254 0.612 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR655182 1 0.0404 0.8411 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1335140 2 0.5518 0.2712 0.000 0.544 0.000 0.384 0.072
#> SRR1433555 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308650 3 0.6669 -0.2554 0.000 0.232 0.400 0.000 0.368
#> SRR1388354 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1317446 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.4348 0.4368 0.000 0.316 0.668 0.000 0.016
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.2020 0.8027 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR661313 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1499935 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447303 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1429408 2 0.3534 0.6414 0.000 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR1433950 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 5 0.0807 0.6035 0.012 0.000 0.012 0.000 0.976
#> SRR1435229 1 0.4210 0.6133 0.588 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR1085996 1 0.4138 0.6389 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR1414229 5 0.0451 0.6000 0.008 0.000 0.004 0.000 0.988
#> SRR1400974 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR613927 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1457854 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 5 0.4210 0.4664 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR813776 5 0.4527 0.5785 0.012 0.000 0.392 0.000 0.596
#> SRR808196 1 0.3424 0.5909 0.760 0.000 0.000 0.240 0.000
#> SRR1101085 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614395 5 0.4341 0.4774 0.404 0.000 0.004 0.000 0.592
#> SRR1478251 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR665310 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1420109 5 0.4028 0.6246 0.048 0.000 0.176 0.000 0.776
#> SRR1330920 5 0.4060 0.5026 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640
#> SRR1419539 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359447 3 0.5792 0.3602 0.000 0.224 0.612 0.000 0.164
#> SRR1347259 4 0.0162 0.9408 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR613915 3 0.3109 0.5731 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1384395 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821715 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1445637 1 0.0162 0.8421 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR608150 1 0.4182 0.6156 0.600 0.000 0.000 0.000 0.400
#> SRR1096383 1 0.0162 0.8417 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1341480 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1341344 1 0.4074 0.6489 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1326270 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR808566 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430270 4 0.3913 0.5040 0.324 0.000 0.000 0.676 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.3816 0.2883 0.000 0.000 0.696 0.000 0.304
#> SRR661267 3 0.0912 0.8646 0.012 0.000 0.972 0.000 0.016
#> SRR810665 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 1 0.4287 0.5337 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR1420067 1 0.3752 0.6878 0.708 0.000 0.000 0.000 0.292
#> SRR1473632 1 0.0510 0.8403 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR812536 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 1 0.4829 0.1109 0.496 0.484 0.000 0.000 0.020
#> SRR1446375 5 0.4210 0.4640 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1465230 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614119 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.0162 0.8421 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658953 5 0.0000 0.5990 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166459 1 0.0162 0.8421 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488610 1 0.4201 0.6174 0.592 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR1330588 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1316367 1 0.4030 0.6617 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR1433926 5 0.4182 0.4692 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR1091302 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818263 5 0.2286 0.6092 0.108 0.000 0.004 0.000 0.888
#> SRR1404909 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654862 5 0.0404 0.6006 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1407112 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332969 5 0.4219 0.5615 0.000 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR1353199 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1378885 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR665357 3 0.3109 0.6664 0.000 0.200 0.800 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347819 5 0.4307 0.3940 0.000 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.0162 0.9408 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.2329 0.5498 0.124 0.000 0.000 0.000 0.876
#> SRR1417632 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 5 0.0510 0.6011 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1326579 1 0.4182 0.6219 0.600 0.000 0.000 0.000 0.400
#> SRR1349363 2 0.4548 0.7133 0.000 0.748 0.000 0.156 0.096
#> SRR1096712 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083752 4 0.3730 0.5744 0.000 0.288 0.000 0.712 0.000
#> SRR1377599 4 0.0162 0.9407 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1488449 3 0.2329 0.7259 0.000 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1318354 5 0.3274 0.6052 0.000 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1359062 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.0162 0.5991 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR663783 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319204 2 0.7041 0.1784 0.012 0.416 0.272 0.000 0.300
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0290 0.8421 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.3534 0.5979 0.000 0.256 0.744 0.000 0.000
#> SRR1498595 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377423 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.3949 0.4672 0.000 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR1353309 3 0.0404 0.8750 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR658941 3 0.4269 0.4913 0.016 0.000 0.684 0.000 0.300
#> SRR1101643 1 0.0404 0.8411 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1401468 1 0.3752 0.6878 0.708 0.000 0.000 0.000 0.292
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363858 5 0.4126 0.4900 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620
#> SRR819820 3 0.0404 0.8740 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1337342 5 0.4045 -0.1119 0.356 0.000 0.000 0.000 0.644
#> SRR655206 3 0.4193 0.5124 0.012 0.304 0.684 0.000 0.000
#> SRR1387013 2 0.0162 0.9379 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1317410 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.4201 0.6152 0.592 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663197 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1394836 2 0.3534 0.6510 0.000 0.744 0.256 0.000 0.000
#> SRR661699 3 0.2648 0.7138 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR813680 3 0.1670 0.8263 0.012 0.000 0.936 0.000 0.052
#> SRR1410678 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499174 5 0.4201 0.4690 0.408 0.000 0.000 0.000 0.592
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.3878 0.6592 0.000 0.748 0.000 0.236 0.016
#> SRR1433410 1 0.4201 0.6152 0.592 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR661167 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.4171 0.3811 0.000 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR660462 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.4382 0.6168 0.024 0.000 0.000 0.688 0.288
#> SRR657949 5 0.0912 0.6052 0.012 0.000 0.016 0.000 0.972
#> SRR1308882 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 4 0.5837 0.4144 0.004 0.084 0.000 0.512 0.400
#> SRR1444138 1 0.0671 0.8380 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1417342 1 0.0510 0.8403 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1470193 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091380 3 0.0290 0.8778 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 4 0.4171 0.3917 0.396 0.000 0.000 0.604 0.000
#> SRR1467102 3 0.4227 0.2572 0.000 0.420 0.580 0.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809963 5 0.4192 0.4746 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR1072247 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445259 5 0.4216 0.5850 0.100 0.000 0.120 0.000 0.780
#> SRR1408393 3 0.2416 0.7755 0.012 0.000 0.888 0.000 0.100
#> SRR1361522 5 0.4182 0.4692 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR1368597 1 0.3707 0.6994 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284
#> SRR1309680 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406437 2 0.4240 0.5411 0.284 0.700 0.000 0.004 0.012
#> SRR1354931 3 0.0290 0.8779 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1391856 2 0.3039 0.7086 0.000 0.808 0.192 0.000 0.000
#> SRR1446738 2 0.3336 0.6608 0.000 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375329 5 0.1670 0.5673 0.012 0.052 0.000 0.000 0.936
#> SRR1387921 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.3210 0.7098 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR1400910 5 0.0162 0.5994 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1444203 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397366 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1446028 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337606 5 0.0290 0.5996 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR659109 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.4192 0.6192 0.596 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR656946 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.3395 0.7321 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236
#> SRR1476447 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1342067 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR614419 1 0.4201 0.6176 0.592 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR1322936 1 0.4171 0.6196 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR1349121 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR612935 5 0.6458 0.3322 0.000 0.180 0.396 0.000 0.424
#> SRR661481 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0162 0.9375 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1499894 5 0.4210 0.5674 0.000 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR1082883 1 0.4161 0.6220 0.608 0.000 0.000 0.000 0.392
#> SRR1468271 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR810295 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 5 0.4182 0.4692 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR1328620 5 0.2414 0.6070 0.012 0.008 0.080 0.000 0.900
#> SRR1396294 3 0.5039 0.2960 0.028 0.008 0.604 0.360 0.000
#> SRR1419917 5 0.4262 0.3919 0.440 0.000 0.000 0.000 0.560
#> SRR662114 5 0.2020 0.6067 0.000 0.000 0.100 0.000 0.900
#> SRR1489199 5 0.1408 0.6083 0.044 0.000 0.008 0.000 0.948
#> SRR813584 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069638 5 0.4161 0.5787 0.000 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR614864 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1433392 5 0.4537 0.5770 0.012 0.000 0.396 0.000 0.592
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.3304 0.6345 0.816 0.000 0.016 0.000 0.168
#> SRR1401252 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0162 0.8421 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 3 0.5341 0.4195 0.080 0.000 0.620 0.000 0.300
#> SRR1380393 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.1444 0.8235 0.948 0.000 0.000 0.040 0.012
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.3730 0.6932 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288
#> SRR1486538 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377696 4 0.3615 0.7569 0.000 0.156 0.000 0.808 0.036
#> SRR1465459 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1080270 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1093148 2 0.7175 0.1306 0.016 0.380 0.276 0.000 0.328
#> SRR1467080 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613342 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396616 5 0.4262 0.5216 0.000 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR813824 5 0.4227 0.5554 0.000 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1082376 5 0.5896 0.5939 0.168 0.000 0.236 0.000 0.596
#> SRR1500891 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR807543 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1091572 5 0.4392 0.5830 0.008 0.000 0.380 0.000 0.612
#> SRR1346689 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332424 1 0.4192 0.6192 0.596 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR663729 1 0.1281 0.8265 0.956 0.000 0.000 0.032 0.012
#> SRR1097013 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613675 1 0.4171 0.6196 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR1485357 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 4 0.0290 0.9379 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1355172 3 0.0404 0.8740 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR655531 1 0.4268 0.5634 0.556 0.000 0.000 0.000 0.444
#> SRR1338147 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1413329 5 0.2233 0.6095 0.016 0.000 0.080 0.000 0.904
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 4 0.4540 0.5172 0.320 0.000 0.000 0.656 0.024
#> SRR1452033 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0404 0.9327 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR809018 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1471755 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808019 1 0.4960 0.6535 0.668 0.000 0.064 0.000 0.268
#> SRR1479133 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615069 5 0.2470 0.5344 0.000 0.104 0.012 0.000 0.884
#> SRR1456185 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350069 4 0.1544 0.8858 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000
#> SRR816316 5 0.4192 0.4746 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR664795 3 0.3452 0.5529 0.244 0.000 0.756 0.000 0.000
#> SRR1490721 1 0.4630 0.6086 0.588 0.000 0.000 0.016 0.396
#> SRR810643 1 0.0162 0.8428 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1430333 5 0.1670 0.5726 0.012 0.052 0.000 0.000 0.936
#> SRR1085285 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099072 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1317985 1 0.0162 0.8421 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1487340 1 0.0162 0.8428 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1420276 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 5 0.4161 0.5791 0.000 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1405525 1 0.4192 0.6192 0.596 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR1370329 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1465001 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0162 0.8428 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 1 0.4283 0.3581 0.644 0.000 0.000 0.348 0.008
#> SRR613639 5 0.4537 0.5770 0.012 0.000 0.396 0.000 0.592
#> SRR1402285 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077038 5 0.4331 0.4803 0.400 0.000 0.004 0.000 0.596
#> SRR1405660 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 5 0.0955 0.6087 0.028 0.000 0.004 0.000 0.968
#> SRR1394734 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0290 0.8423 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1365894 2 0.6631 0.2417 0.000 0.420 0.000 0.224 0.356
#> SRR1073581 1 0.0290 0.8421 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR659804 1 0.0162 0.8428 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473529 4 0.3990 0.5315 0.000 0.308 0.000 0.688 0.004
#> SRR660764 5 0.4302 0.4415 0.000 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR820448 5 0.4171 0.4747 0.396 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR1328845 4 0.4192 0.3768 0.404 0.000 0.000 0.596 0.000
#> SRR1336415 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459190 3 0.0566 0.8716 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1346773 1 0.0880 0.8366 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1499521 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1333395 4 0.3883 0.7325 0.184 0.000 0.000 0.780 0.036
#> SRR1309248 4 0.7271 0.2750 0.144 0.056 0.000 0.436 0.364
#> SRR809161 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1316320 1 0.5401 0.5605 0.536 0.060 0.000 0.000 0.404
#> SRR1432629 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.3707 0.6934 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284
#> SRR1309160 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 5 0.0290 0.5996 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1332648 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660614 2 0.3999 0.5745 0.000 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1477949 1 0.0162 0.8428 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 5 0.4219 0.4598 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584
#> SRR615946 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.4171 0.6183 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR660224 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665586 5 0.4210 0.3502 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1347166 5 0.0290 0.5996 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1485722 1 0.4171 0.6183 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR1415316 1 0.4045 0.6602 0.644 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR613390 1 0.1270 0.8120 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR661108 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2170173 5 0.4135 0.5239 0.340 0.000 0.004 0.000 0.656
#> SRR817329 5 0.3932 0.5223 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR1401990 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467745 4 0.4767 0.6750 0.000 0.180 0.004 0.732 0.084
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 5 0.4331 0.4803 0.400 0.000 0.004 0.000 0.596
#> SRR1314873 1 0.0794 0.8373 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1401211 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818797 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR2164608 5 0.5686 0.0940 0.092 0.000 0.356 0.000 0.552
#> SRR1455586 2 0.1478 0.8858 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR819459 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1488939 2 0.0880 0.9179 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 5 0.4793 0.6163 0.068 0.000 0.232 0.000 0.700
#> SRR1361652 1 0.4210 0.6133 0.588 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR1437119 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1478547 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 5 0.1788 0.5711 0.004 0.056 0.008 0.000 0.932
#> SRR1310584 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1500216 5 0.0510 0.6044 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1486762 3 0.3796 0.3035 0.000 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR1480854 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473058 4 0.1410 0.8909 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1405165 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433004 5 0.4242 0.3104 0.428 0.000 0.000 0.000 0.572
#> SRR1471477 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 1 0.4446 0.0541 0.520 0.476 0.000 0.004 0.000
#> SRR1455038 5 0.3109 0.3298 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1375248 2 0.2471 0.8068 0.000 0.864 0.136 0.000 0.000
#> SRR1403005 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1348378 2 0.5111 0.6619 0.000 0.716 0.028 0.200 0.056
#> SRR1413541 1 0.1851 0.8090 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1392943 1 0.4067 0.6852 0.692 0.000 0.000 0.008 0.300
#> SRR1475192 3 0.1965 0.7691 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 5 0.0703 0.5944 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR1347060 3 0.1197 0.8347 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1414139 2 0.3395 0.6809 0.000 0.764 0.236 0.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0290 0.9342 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1413436 1 0.3999 0.6577 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1311266 1 0.3857 0.6750 0.688 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR1343302 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1429678 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 5 0.4537 0.5770 0.012 0.000 0.396 0.000 0.592
#> SRR1345609 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1380208 5 0.6721 -0.1800 0.252 0.352 0.000 0.000 0.396
#> SRR1322840 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399797 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1416654 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0290 0.8422 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1365291 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1367920 4 0.0404 0.9351 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1366648 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9407 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 5 0.2136 0.6088 0.088 0.000 0.008 0.000 0.904
#> SRR1363968 1 0.0290 0.8421 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR814387 1 0.0000 0.8430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.3816 0.6802 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1386689 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453811 5 0.4201 0.5731 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1441159 1 0.1965 0.8044 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1403154 4 0.0000 0.9435 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.8849 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 5 0.4171 0.5780 0.000 0.000 0.396 0.000 0.604
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 1 0.4881 0.4932 0.604 0.000 0.044 0.000 0.016 0.336
#> SRR1331708 5 0.1327 0.7688 0.064 0.000 0.000 0.000 0.936 0.000
#> SRR1464258 6 0.2664 0.6871 0.184 0.000 0.000 0.000 0.000 0.816
#> SRR1454201 5 0.3681 0.7633 0.156 0.000 0.000 0.000 0.780 0.064
#> SRR661589 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456229 6 0.2730 0.6883 0.012 0.000 0.000 0.000 0.152 0.836
#> SRR1315165 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.0547 0.8836 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1417809 1 0.1501 0.8501 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1094457 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095575 6 0.4633 -0.0813 0.036 0.000 0.004 0.000 0.392 0.568
#> SRR1315931 1 0.2454 0.7412 0.840 0.000 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1430066 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 6 0.3221 0.7508 0.000 0.000 0.264 0.000 0.000 0.736
#> SRR818002 2 0.3614 0.8361 0.000 0.812 0.000 0.048 0.120 0.020
#> SRR1344143 5 0.3743 0.4653 0.000 0.252 0.000 0.000 0.724 0.024
#> SRR1486845 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362866 5 0.2581 0.7794 0.128 0.000 0.000 0.000 0.856 0.016
#> SRR1490740 1 0.0972 0.8811 0.964 0.000 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.1867 0.9121 0.000 0.916 0.000 0.000 0.064 0.020
#> SRR1416248 1 0.0000 0.8870 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 4 0.1204 0.9016 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.8870 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.4116 0.7782 0.120 0.776 0.000 0.000 0.084 0.020
#> SRR1429846 6 0.3076 0.7656 0.000 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR613550 6 0.3076 0.7656 0.000 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1348402 1 0.0790 0.8766 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1345146 5 0.2178 0.7780 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868 0.000
#> SRR1324025 6 0.2912 0.7752 0.000 0.000 0.216 0.000 0.000 0.784
#> SRR1318879 5 0.5712 0.3795 0.008 0.000 0.308 0.000 0.532 0.152
#> SRR820755 6 0.1970 0.7617 0.008 0.000 0.092 0.000 0.000 0.900
#> SRR1485830 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR599313 6 0.3578 0.5067 0.000 0.000 0.000 0.000 0.340 0.660
#> SRR612263 6 0.3547 0.5154 0.000 0.000 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1415398 3 0.1556 0.8305 0.000 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1326205 4 0.1204 0.9016 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1421327 4 0.5081 0.0838 0.056 0.000 0.000 0.480 0.456 0.008
#> SRR1083311 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.1204 0.9016 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1079522 5 0.1444 0.7357 0.000 0.000 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1452935 5 0.4072 0.0589 0.008 0.000 0.000 0.000 0.544 0.448
#> SRR1379495 1 0.0000 0.8870 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 6 0.3101 0.7637 0.000 0.000 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR615778 5 0.2302 0.7134 0.008 0.000 0.000 0.000 0.872 0.120
#> SRR1447564 1 0.2941 0.6775 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1455195 5 0.3213 0.7674 0.160 0.000 0.000 0.000 0.808 0.032
#> SRR655182 1 0.1124 0.8816 0.956 0.000 0.000 0.000 0.036 0.008
#> SRR1335140 5 0.6118 0.2149 0.000 0.248 0.000 0.232 0.504 0.016
#> SRR1433555 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308650 6 0.5667 0.5434 0.000 0.228 0.240 0.000 0.000 0.532
#> SRR1388354 1 0.0458 0.8858 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.3887 0.7272 0.000 0.112 0.780 0.000 0.004 0.104
#> SRR1479955 2 0.1867 0.9121 0.000 0.916 0.000 0.000 0.064 0.020
#> SRR809853 5 0.4161 0.2102 0.448 0.000 0.000 0.000 0.540 0.012
#> SRR661313 6 0.2883 0.7763 0.000 0.000 0.212 0.000 0.000 0.788
#> SRR1499935 4 0.1141 0.9026 0.000 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1447303 6 0.2912 0.7753 0.000 0.000 0.216 0.000 0.000 0.784
#> SRR1429408 2 0.3448 0.6364 0.000 0.716 0.000 0.280 0.000 0.004
#> SRR1433950 1 0.0520 0.8850 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 6 0.3789 0.3215 0.008 0.000 0.000 0.000 0.332 0.660
#> SRR1435229 5 0.2048 0.7773 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880 0.000
#> SRR1085996 5 0.2972 0.7748 0.128 0.000 0.000 0.000 0.836 0.036
#> SRR1414229 5 0.2593 0.6920 0.008 0.000 0.000 0.000 0.844 0.148
#> SRR1400974 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0260 0.8863 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR613927 6 0.2823 0.7779 0.000 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1457854 1 0.0146 0.8868 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473714 6 0.3966 0.0780 0.444 0.000 0.000 0.000 0.004 0.552
#> SRR813776 6 0.2431 0.7792 0.008 0.000 0.132 0.000 0.000 0.860
#> SRR808196 1 0.2823 0.7101 0.796 0.000 0.000 0.204 0.000 0.000
#> SRR1101085 4 0.1204 0.9016 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR614395 6 0.2664 0.6865 0.184 0.000 0.000 0.000 0.000 0.816
#> SRR1478251 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0146 0.9369 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1362310 1 0.0260 0.8863 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR665310 6 0.2823 0.7779 0.000 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1420109 6 0.2001 0.7156 0.012 0.000 0.008 0.000 0.068 0.912
#> SRR1330920 6 0.1757 0.7120 0.076 0.000 0.000 0.000 0.008 0.916
#> SRR1419539 3 0.1075 0.8579 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1359447 3 0.5356 0.3588 0.000 0.248 0.584 0.000 0.000 0.168
#> SRR1347259 4 0.1387 0.8979 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR613915 3 0.3765 0.1596 0.000 0.000 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR1384395 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821715 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0260 0.8863 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1445637 1 0.1334 0.8752 0.948 0.000 0.000 0.000 0.020 0.032
#> SRR608150 5 0.3101 0.7769 0.148 0.000 0.000 0.000 0.820 0.032
#> SRR1096383 1 0.3122 0.7650 0.804 0.000 0.000 0.000 0.020 0.176
#> SRR1341480 4 0.1204 0.9016 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1341344 5 0.3629 0.6532 0.276 0.000 0.000 0.000 0.712 0.012
#> SRR1326270 3 0.0260 0.8799 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1498838 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 6 0.3330 0.7340 0.000 0.000 0.284 0.000 0.000 0.716
#> SRR808566 4 0.0146 0.9099 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1430270 4 0.1814 0.8285 0.100 0.000 0.000 0.900 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.3464 0.3534 0.000 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR661267 3 0.2593 0.7831 0.008 0.000 0.844 0.000 0.000 0.148
#> SRR810665 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 5 0.4313 0.7440 0.148 0.000 0.000 0.000 0.728 0.124
#> SRR1420067 1 0.4020 0.4935 0.692 0.000 0.000 0.000 0.276 0.032
#> SRR1473632 1 0.2118 0.8295 0.888 0.000 0.000 0.000 0.104 0.008
#> SRR812536 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0146 0.9369 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.5263 0.2801 0.012 0.556 0.000 0.000 0.356 0.076
#> SRR1446375 6 0.2996 0.5586 0.228 0.000 0.000 0.000 0.000 0.772
#> SRR1465230 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614119 1 0.1910 0.8285 0.892 0.000 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1356101 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.2536 0.8191 0.864 0.000 0.000 0.000 0.020 0.116
#> SRR1392676 2 0.1327 0.9185 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR665538 1 0.3122 0.7650 0.804 0.000 0.000 0.000 0.020 0.176
#> SRR660510 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658953 5 0.3659 0.3241 0.000 0.000 0.000 0.000 0.636 0.364
#> SRR2166459 1 0.1334 0.8752 0.948 0.000 0.000 0.000 0.020 0.032
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.1411 0.8686 0.004 0.000 0.000 0.936 0.000 0.060
#> SRR1488610 5 0.2092 0.7772 0.124 0.000 0.000 0.000 0.876 0.000
#> SRR1330588 6 0.3288 0.7408 0.000 0.000 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1316367 5 0.3102 0.7710 0.156 0.000 0.000 0.000 0.816 0.028
#> SRR1433926 1 0.2706 0.7405 0.832 0.000 0.000 0.000 0.008 0.160
#> SRR1091302 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818263 6 0.2907 0.6955 0.152 0.000 0.000 0.000 0.020 0.828
#> SRR1404909 4 0.2302 0.8622 0.000 0.000 0.000 0.872 0.120 0.008
#> SRR663076 1 0.0146 0.8872 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.8870 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654862 6 0.1812 0.7050 0.008 0.000 0.000 0.000 0.080 0.912
#> SRR1407112 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332969 6 0.3244 0.7467 0.000 0.000 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR1353199 6 0.3126 0.7616 0.000 0.000 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR1378885 6 0.2854 0.7772 0.000 0.000 0.208 0.000 0.000 0.792
#> SRR665357 3 0.2260 0.7599 0.000 0.140 0.860 0.000 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0146 0.9360 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1501020 3 0.0260 0.8803 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1347819 6 0.3868 0.3554 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1480813 2 0.0146 0.9369 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1472576 4 0.2636 0.8547 0.000 0.004 0.000 0.860 0.120 0.016
#> SRR1431781 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.4300 0.6131 0.036 0.000 0.000 0.000 0.640 0.324
#> SRR1417632 4 0.3071 0.8073 0.000 0.000 0.000 0.804 0.180 0.016
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 6 0.4076 0.1128 0.000 0.000 0.008 0.000 0.452 0.540
#> SRR1326579 5 0.3062 0.7729 0.144 0.000 0.000 0.000 0.824 0.032
#> SRR1349363 2 0.5063 0.4410 0.000 0.572 0.000 0.052 0.360 0.016
#> SRR1096712 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0632 0.8702 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1083752 4 0.4961 0.3271 0.000 0.368 0.000 0.564 0.064 0.004
#> SRR1377599 4 0.3797 0.6703 0.000 0.000 0.000 0.692 0.292 0.016
#> SRR1488449 3 0.2793 0.6737 0.000 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1318354 6 0.2812 0.7501 0.000 0.000 0.096 0.000 0.048 0.856
#> SRR1359062 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.3607 0.3405 0.000 0.000 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR663783 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319204 5 0.7626 0.3229 0.008 0.220 0.216 0.000 0.392 0.164
#> SRR1369070 2 0.1867 0.9121 0.000 0.916 0.000 0.000 0.064 0.020
#> SRR615659 1 0.0632 0.8833 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.3244 0.6128 0.000 0.268 0.732 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498595 4 0.2494 0.8570 0.000 0.000 0.000 0.864 0.120 0.016
#> SRR1377423 6 0.3076 0.7656 0.000 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0146 0.8866 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1338426 3 0.3532 0.7385 0.000 0.000 0.796 0.000 0.064 0.140
#> SRR1353309 3 0.1610 0.8349 0.000 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR658941 3 0.5777 0.3053 0.008 0.000 0.536 0.000 0.280 0.176
#> SRR1101643 1 0.0713 0.8824 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1401468 1 0.5578 0.2267 0.540 0.000 0.000 0.000 0.276 0.184
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0146 0.9099 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1363858 6 0.4229 0.6100 0.220 0.000 0.000 0.000 0.068 0.712
#> SRR819820 3 0.2743 0.7631 0.008 0.000 0.828 0.000 0.000 0.164
#> SRR1337342 5 0.2446 0.7793 0.124 0.000 0.000 0.000 0.864 0.012
#> SRR655206 3 0.4615 0.6773 0.008 0.116 0.712 0.000 0.000 0.164
#> SRR1387013 2 0.3189 0.8097 0.000 0.796 0.000 0.000 0.184 0.020
#> SRR1317410 1 0.0000 0.8870 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608198 5 0.2300 0.7765 0.144 0.000 0.000 0.000 0.856 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.1867 0.9121 0.000 0.916 0.000 0.000 0.064 0.020
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.1204 0.9016 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663197 6 0.3101 0.7637 0.000 0.000 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1394836 2 0.3746 0.7478 0.000 0.780 0.140 0.000 0.000 0.080
#> SRR661699 3 0.3062 0.7681 0.000 0.000 0.824 0.000 0.032 0.144
#> SRR813680 3 0.3490 0.6892 0.008 0.000 0.724 0.000 0.000 0.268
#> SRR1410678 1 0.0146 0.8873 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.3881 0.2486 0.600 0.000 0.000 0.000 0.004 0.396
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.3958 0.7001 0.000 0.740 0.000 0.012 0.220 0.028
#> SRR1433410 5 0.2260 0.7772 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.4837 0.4651 0.000 0.000 0.624 0.000 0.288 0.088
#> SRR660462 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 5 0.6087 0.1712 0.012 0.000 0.000 0.400 0.412 0.176
#> SRR657949 6 0.2225 0.7109 0.008 0.000 0.008 0.000 0.092 0.892
#> SRR1308882 4 0.1204 0.9016 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.8870 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 5 0.1524 0.7357 0.000 0.008 0.000 0.060 0.932 0.000
#> SRR1444138 6 0.4341 0.1969 0.412 0.000 0.000 0.000 0.024 0.564
#> SRR1417342 1 0.0713 0.8824 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1470193 4 0.4064 0.7319 0.004 0.000 0.000 0.740 0.200 0.056
#> SRR1091380 3 0.2558 0.7745 0.004 0.000 0.840 0.000 0.000 0.156
#> SRR1099096 1 0.0790 0.8766 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1313583 1 0.2527 0.7525 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR1467102 3 0.3847 0.1515 0.000 0.456 0.544 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.1267 0.9001 0.000 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR818821 3 0.1714 0.8371 0.000 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR809963 6 0.2730 0.6841 0.192 0.000 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1072247 1 0.0000 0.8870 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.1204 0.9016 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1445259 6 0.4652 0.0822 0.012 0.000 0.020 0.000 0.472 0.496
#> SRR1408393 3 0.4643 0.5795 0.008 0.000 0.640 0.000 0.048 0.304
#> SRR1361522 1 0.2949 0.7545 0.832 0.000 0.000 0.000 0.028 0.140
#> SRR1368597 1 0.3929 0.5675 0.700 0.000 0.000 0.000 0.272 0.028
#> SRR1309680 2 0.1867 0.9121 0.000 0.916 0.000 0.000 0.064 0.020
#> SRR1310542 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.1204 0.9016 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1406437 2 0.6321 0.4968 0.016 0.576 0.000 0.160 0.040 0.208
#> SRR1354931 3 0.0260 0.8795 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1391856 2 0.3123 0.7869 0.000 0.824 0.136 0.000 0.000 0.040
#> SRR1446738 2 0.3602 0.7398 0.000 0.792 0.000 0.000 0.072 0.136
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375329 5 0.1387 0.7360 0.000 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1387921 1 0.0260 0.8863 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.1686 0.9146 0.000 0.924 0.000 0.000 0.064 0.012
#> SRR1360695 1 0.0713 0.8785 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR812943 5 0.4367 0.4181 0.364 0.000 0.000 0.000 0.604 0.032
#> SRR1400910 5 0.2234 0.7099 0.004 0.000 0.000 0.000 0.872 0.124
#> SRR1444203 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816177 2 0.1867 0.8993 0.000 0.916 0.000 0.000 0.064 0.020
#> SRR658754 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.1204 0.9016 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1397366 6 0.3101 0.7637 0.000 0.000 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1446028 1 0.0260 0.8863 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1083918 2 0.0146 0.9369 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1337606 5 0.2513 0.6988 0.008 0.000 0.000 0.000 0.852 0.140
#> SRR659109 3 0.0713 0.8670 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1337192 5 0.2300 0.7765 0.144 0.000 0.000 0.000 0.856 0.000
#> SRR656946 1 0.0547 0.8836 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1476102 5 0.4015 0.4649 0.372 0.000 0.000 0.000 0.616 0.012
#> SRR1476447 1 0.0260 0.8863 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1342067 4 0.1204 0.9016 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.1196 0.8771 0.952 0.000 0.000 0.000 0.008 0.040
#> SRR614419 5 0.3268 0.7701 0.144 0.000 0.000 0.000 0.812 0.044
#> SRR1322936 5 0.2340 0.7777 0.148 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1349121 1 0.2257 0.8210 0.876 0.000 0.000 0.000 0.008 0.116
#> SRR1430549 1 0.0260 0.8863 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR612935 6 0.4755 0.6686 0.000 0.132 0.132 0.000 0.020 0.716
#> SRR661481 2 0.0363 0.9355 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1354117 2 0.0146 0.9360 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1393596 4 0.3046 0.7857 0.000 0.000 0.000 0.800 0.188 0.012
#> SRR1452164 1 0.1257 0.8770 0.952 0.000 0.000 0.000 0.020 0.028
#> SRR1070503 6 0.2823 0.7779 0.000 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1499894 6 0.3428 0.6188 0.000 0.000 0.304 0.000 0.000 0.696
#> SRR1082883 5 0.4765 0.7120 0.152 0.000 0.000 0.000 0.676 0.172
#> SRR1468271 1 0.0458 0.8840 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1332443 1 0.0260 0.8863 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.2868 0.7591 0.840 0.000 0.000 0.000 0.028 0.132
#> SRR1328620 6 0.4844 0.2617 0.008 0.000 0.064 0.000 0.300 0.628
#> SRR1396294 3 0.5607 0.5095 0.008 0.000 0.576 0.240 0.000 0.176
#> SRR1419917 1 0.2651 0.7894 0.860 0.000 0.000 0.000 0.028 0.112
#> SRR662114 6 0.2706 0.7747 0.000 0.000 0.124 0.000 0.024 0.852
#> SRR1489199 6 0.0622 0.7045 0.008 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980
#> SRR813584 2 0.0146 0.9369 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1069638 6 0.3136 0.7807 0.000 0.000 0.188 0.000 0.016 0.796
#> SRR614864 6 0.3288 0.7408 0.000 0.000 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1433392 6 0.2302 0.7754 0.008 0.000 0.120 0.000 0.000 0.872
#> SRR1377777 2 0.1867 0.9121 0.000 0.916 0.000 0.000 0.064 0.020
#> SRR2167710 1 0.2001 0.8479 0.920 0.000 0.016 0.000 0.020 0.044
#> SRR1401252 4 0.1957 0.8641 0.000 0.000 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0547 0.8836 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 3 0.7274 -0.0105 0.192 0.000 0.388 0.000 0.296 0.124
#> SRR1380393 1 0.0000 0.8870 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.8870 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.5957 0.4811 0.624 0.000 0.000 0.152 0.132 0.092
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 5 0.5203 0.4665 0.348 0.000 0.000 0.000 0.548 0.104
#> SRR1486538 4 0.1204 0.9016 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377696 5 0.4457 -0.0674 0.000 0.008 0.000 0.432 0.544 0.016
#> SRR1465459 6 0.2823 0.7779 0.000 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1080270 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 6 0.2219 0.7757 0.000 0.000 0.136 0.000 0.000 0.864
#> SRR1093148 5 0.6602 0.5756 0.008 0.116 0.132 0.000 0.568 0.176
#> SRR1467080 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0363 0.9355 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR816475 4 0.0865 0.8920 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1379198 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613342 6 0.3101 0.7637 0.000 0.000 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1452246 2 0.1779 0.9129 0.000 0.920 0.000 0.000 0.064 0.016
#> SRR1338836 2 0.1779 0.9129 0.000 0.920 0.000 0.000 0.064 0.016
#> SRR1369129 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396616 6 0.3547 0.6597 0.000 0.000 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR813824 6 0.3737 0.5899 0.000 0.000 0.392 0.000 0.000 0.608
#> SRR1082376 6 0.2801 0.7552 0.072 0.000 0.068 0.000 0.000 0.860
#> SRR1500891 4 0.1610 0.8896 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR807543 6 0.2793 0.7788 0.000 0.000 0.200 0.000 0.000 0.800
#> SRR1091572 6 0.2624 0.7801 0.000 0.000 0.124 0.000 0.020 0.856
#> SRR1346689 4 0.1267 0.9006 0.000 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1332424 5 0.2300 0.7765 0.144 0.000 0.000 0.000 0.856 0.000
#> SRR663729 1 0.2688 0.8029 0.868 0.000 0.000 0.068 0.064 0.000
#> SRR1097013 1 0.1616 0.8684 0.932 0.000 0.000 0.000 0.020 0.048
#> SRR613675 5 0.2482 0.7782 0.148 0.000 0.000 0.000 0.848 0.004
#> SRR1485357 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0790 0.8766 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1437622 4 0.3483 0.8270 0.000 0.040 0.000 0.820 0.120 0.020
#> SRR1355172 3 0.2257 0.7983 0.008 0.000 0.876 0.000 0.000 0.116
#> SRR655531 5 0.5658 0.2888 0.156 0.000 0.000 0.000 0.464 0.380
#> SRR1338147 6 0.3076 0.7656 0.000 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1413329 5 0.4135 0.5002 0.008 0.000 0.004 0.000 0.584 0.404
#> SRR1485931 2 0.1779 0.9129 0.000 0.920 0.000 0.000 0.064 0.016
#> SRR1420873 1 0.0000 0.8870 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 4 0.5874 0.2801 0.268 0.000 0.000 0.480 0.252 0.000
#> SRR1452033 1 0.2003 0.8215 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1467316 2 0.2250 0.8971 0.000 0.888 0.000 0.000 0.092 0.020
#> SRR809018 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.1471 0.9179 0.000 0.932 0.000 0.000 0.064 0.004
#> SRR663440 6 0.2823 0.7779 0.000 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1471755 2 0.0363 0.9355 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR808019 1 0.6475 0.0914 0.488 0.000 0.048 0.000 0.288 0.176
#> SRR1479133 3 0.1007 0.8597 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR615069 5 0.3637 0.7052 0.000 0.040 0.008 0.000 0.788 0.164
#> SRR1456185 2 0.0146 0.9369 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1350069 4 0.4332 0.6592 0.156 0.000 0.000 0.740 0.008 0.096
#> SRR816316 6 0.2491 0.6921 0.164 0.000 0.000 0.000 0.000 0.836
#> SRR664795 3 0.4362 0.6569 0.036 0.000 0.688 0.000 0.012 0.264
#> SRR1490721 5 0.1956 0.7693 0.080 0.000 0.000 0.008 0.908 0.004
#> SRR810643 1 0.0146 0.8870 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1430333 5 0.3133 0.6883 0.008 0.000 0.000 0.000 0.780 0.212
#> SRR1085285 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099072 6 0.2823 0.7779 0.000 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1317985 1 0.0547 0.8836 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1487340 1 0.0146 0.8870 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1420276 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 6 0.3175 0.7495 0.000 0.000 0.256 0.000 0.000 0.744
#> SRR1405525 5 0.2300 0.7765 0.144 0.000 0.000 0.000 0.856 0.000
#> SRR1370329 1 0.0260 0.8863 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.8870 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0146 0.9369 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR819610 2 0.2536 0.8785 0.000 0.864 0.000 0.000 0.116 0.020
#> SRR2157314 1 0.0146 0.8870 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1409465 2 0.1327 0.9185 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR809987 1 0.3202 0.7333 0.800 0.000 0.000 0.176 0.024 0.000
#> SRR613639 6 0.1398 0.7289 0.008 0.000 0.052 0.000 0.000 0.940
#> SRR1402285 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077038 6 0.1610 0.7085 0.084 0.000 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR1405660 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 6 0.3565 0.5436 0.004 0.000 0.000 0.000 0.304 0.692
#> SRR1394734 2 0.0146 0.9369 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1317771 1 0.2480 0.8282 0.872 0.000 0.000 0.000 0.024 0.104
#> SRR1365894 5 0.1765 0.7283 0.000 0.096 0.000 0.000 0.904 0.000
#> SRR1073581 1 0.3460 0.7276 0.760 0.000 0.000 0.000 0.020 0.220
#> SRR659804 1 0.0146 0.8870 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0146 0.9369 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473529 4 0.5185 0.4922 0.000 0.064 0.000 0.572 0.348 0.016
#> SRR660764 6 0.3797 0.4947 0.000 0.000 0.420 0.000 0.000 0.580
#> SRR820448 6 0.2948 0.6819 0.188 0.000 0.000 0.000 0.008 0.804
#> SRR1328845 1 0.4613 0.6456 0.700 0.000 0.000 0.204 0.008 0.088
#> SRR1336415 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.1204 0.9016 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1459190 3 0.2915 0.7607 0.008 0.000 0.808 0.000 0.000 0.184
#> SRR1346773 1 0.4388 0.1525 0.572 0.000 0.000 0.000 0.400 0.028
#> SRR1499521 1 0.2048 0.8187 0.880 0.000 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 6 0.2823 0.7779 0.000 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1081209 2 0.1686 0.9144 0.000 0.924 0.000 0.000 0.064 0.012
#> SRR1400202 1 0.0260 0.8863 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1333395 4 0.6073 0.1118 0.352 0.000 0.000 0.380 0.268 0.000
#> SRR1309248 5 0.0717 0.7334 0.000 0.000 0.000 0.008 0.976 0.016
#> SRR809161 6 0.3076 0.7656 0.000 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1316320 5 0.0767 0.7358 0.004 0.008 0.000 0.000 0.976 0.012
#> SRR1432629 2 0.1867 0.9121 0.000 0.916 0.000 0.000 0.064 0.020
#> SRR1498931 1 0.0000 0.8870 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.4356 0.2766 0.608 0.000 0.000 0.000 0.360 0.032
#> SRR1309160 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.0547 0.8836 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1078489 5 0.4091 -0.0135 0.008 0.000 0.000 0.000 0.520 0.472
#> SRR1332648 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660614 5 0.5359 0.1647 0.000 0.432 0.000 0.000 0.460 0.108
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0260 0.8863 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1477949 1 0.0632 0.8833 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 6 0.3330 0.5876 0.284 0.000 0.000 0.000 0.000 0.716
#> SRR615946 6 0.3198 0.7537 0.000 0.000 0.260 0.000 0.000 0.740
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 5 0.3213 0.7674 0.160 0.000 0.000 0.000 0.808 0.032
#> SRR660224 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665586 6 0.4873 0.4379 0.080 0.000 0.000 0.000 0.320 0.600
#> SRR1347166 5 0.2302 0.7134 0.008 0.000 0.000 0.000 0.872 0.120
#> SRR1485722 5 0.4828 0.7065 0.156 0.000 0.000 0.000 0.668 0.176
#> SRR1415316 5 0.2513 0.7720 0.140 0.000 0.000 0.000 0.852 0.008
#> SRR613390 6 0.4362 0.3228 0.388 0.000 0.000 0.000 0.028 0.584
#> SRR661108 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2170173 6 0.1492 0.6917 0.024 0.000 0.000 0.000 0.036 0.940
#> SRR817329 6 0.4067 0.6199 0.060 0.000 0.000 0.000 0.212 0.728
#> SRR1401990 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467745 4 0.3897 0.5610 0.000 0.280 0.000 0.696 0.000 0.024
#> SRR1471795 2 0.1867 0.9121 0.000 0.916 0.000 0.000 0.064 0.020
#> SRR1415637 2 0.0937 0.9270 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR813137 6 0.2854 0.6759 0.208 0.000 0.000 0.000 0.000 0.792
#> SRR1314873 1 0.1204 0.8737 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.8870 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818797 6 0.2823 0.7779 0.000 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR2164608 6 0.5376 0.0189 0.008 0.000 0.372 0.000 0.092 0.528
#> SRR1455586 2 0.0547 0.9268 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR819459 6 0.3288 0.7408 0.000 0.000 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1488939 2 0.2404 0.8830 0.000 0.872 0.000 0.000 0.112 0.016
#> SRR1433232 2 0.1867 0.9121 0.000 0.916 0.000 0.000 0.064 0.020
#> SRR1385501 6 0.2833 0.6977 0.004 0.000 0.012 0.000 0.148 0.836
#> SRR1361652 5 0.1124 0.7595 0.036 0.000 0.000 0.000 0.956 0.008
#> SRR1437119 1 0.0260 0.8863 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 5 0.2716 0.7024 0.004 0.008 0.004 0.000 0.852 0.132
#> SRR1310584 1 0.0260 0.8863 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1500216 6 0.3563 0.5116 0.000 0.000 0.000 0.000 0.336 0.664
#> SRR1486762 3 0.3428 0.3620 0.000 0.000 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1480854 4 0.1327 0.8985 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0146 0.9108 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1473058 4 0.3445 0.7367 0.000 0.156 0.000 0.796 0.000 0.048
#> SRR1405165 3 0.1556 0.8282 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1433004 6 0.4462 0.5247 0.060 0.000 0.000 0.000 0.280 0.660
#> SRR1471477 1 0.2536 0.8191 0.864 0.000 0.000 0.000 0.020 0.116
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 1 0.6900 0.4698 0.540 0.088 0.000 0.176 0.020 0.176
#> SRR1455038 6 0.5262 0.3424 0.124 0.000 0.000 0.000 0.308 0.568
#> SRR1375248 2 0.2048 0.8389 0.000 0.880 0.120 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 6 0.2883 0.7763 0.000 0.000 0.212 0.000 0.000 0.788
#> SRR1348378 2 0.3658 0.7306 0.000 0.776 0.020 0.188 0.000 0.016
#> SRR1413541 1 0.3490 0.5974 0.724 0.000 0.000 0.000 0.268 0.008
#> SRR1392943 5 0.5481 0.5479 0.308 0.000 0.000 0.024 0.580 0.088
#> SRR1475192 3 0.1765 0.7914 0.000 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 5 0.2431 0.7081 0.008 0.000 0.000 0.000 0.860 0.132
#> SRR1347060 3 0.1075 0.8455 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1414139 2 0.2941 0.7119 0.000 0.780 0.220 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0405 0.9328 0.000 0.988 0.004 0.000 0.000 0.008
#> SRR1415004 1 0.0260 0.8863 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1413436 5 0.4931 0.6086 0.248 0.000 0.000 0.000 0.636 0.116
#> SRR1311266 5 0.5481 0.5669 0.264 0.000 0.000 0.000 0.560 0.176
#> SRR1343302 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0260 0.8863 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1429678 1 0.0713 0.8824 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9374 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 6 0.2165 0.7718 0.008 0.000 0.108 0.000 0.000 0.884
#> SRR1345609 1 0.0713 0.8824 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1380208 5 0.1863 0.7581 0.036 0.044 0.000 0.000 0.920 0.000
#> SRR1322840 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399797 6 0.3151 0.7590 0.000 0.000 0.252 0.000 0.000 0.748
#> SRR1416654 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0260 0.8863 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1365291 6 0.2823 0.7779 0.000 0.000 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1367920 4 0.4212 0.4094 0.000 0.000 0.000 0.560 0.424 0.016
#> SRR1366648 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.1075 0.9243 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1082173 6 0.3955 0.0219 0.008 0.000 0.000 0.000 0.384 0.608
#> SRR1363968 1 0.2053 0.8265 0.888 0.000 0.000 0.000 0.004 0.108
#> SRR814387 1 0.0000 0.8870 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.5778 0.1136 0.508 0.000 0.004 0.000 0.312 0.176
#> SRR1386689 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0790 0.8673 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1453811 6 0.2854 0.7772 0.000 0.000 0.208 0.000 0.000 0.792
#> SRR1441159 1 0.3706 0.3223 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.9112 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.8842 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 6 0.2631 0.7812 0.000 0.000 0.180 0.000 0.000 0.820
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.997 0.999 0.4705 0.530 0.530
#> 3 3 0.927 0.919 0.961 0.3880 0.814 0.648
#> 4 4 0.705 0.714 0.827 0.0945 0.903 0.729
#> 5 5 0.698 0.659 0.826 0.0874 0.905 0.670
#> 6 6 0.679 0.508 0.753 0.0266 0.914 0.638
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1331708 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1464258 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR661589 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1315165 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1417809 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1094457 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1095575 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1315931 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1430066 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1431037 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1395554 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR818002 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1344143 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1486845 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1362866 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1456138 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1416248 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1383907 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1311018 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1429846 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR613550 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1324025 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1318879 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR820755 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485830 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR599313 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR612263 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1415398 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326205 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1421327 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1083311 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1499303 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1079522 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1452935 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1379495 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR661361 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655182 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1433555 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1388354 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317446 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413602 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR809853 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR661313 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1499935 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1447303 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1429408 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1433950 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1409854 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1435229 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1414229 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1400974 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR613927 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.430 0.904 0.912 0.088
#> SRR813776 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR808196 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1101085 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR614395 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1478251 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1370551 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1362310 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR665310 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1420109 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1330920 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1419539 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1359447 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347259 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR613915 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1384395 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR821715 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR608150 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1341480 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1341344 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326270 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1498838 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416313 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR808566 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1430270 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1367825 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR613533 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR661267 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR810665 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1407250 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1420067 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR812536 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1486195 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1407671 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1446375 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1465230 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1404209 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR665538 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR660510 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1445655 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR658953 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1485312 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317631 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1488610 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1330588 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1091302 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR818263 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1404909 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR663076 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1442422 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1465893 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR654862 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1407112 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1332969 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353199 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1378885 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR665357 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR662186 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1501020 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347819 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1472576 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1431781 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1452270 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1417632 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1350153 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1458113 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1326579 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1096712 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1090407 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1377599 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1488449 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1318354 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1359062 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1398924 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR663783 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1319204 1 0.118 0.984 0.984 0.016
#> SRR1369070 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR615659 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1316982 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1498595 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1377423 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1485613 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1338426 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353309 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR658941 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1101643 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1324085 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1363858 2 0.955 0.397 0.376 0.624
#> SRR819820 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1337342 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655206 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1387013 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1317410 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR608198 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1343741 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1381288 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1415379 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1099622 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR663197 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1394836 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR661699 1 0.242 0.958 0.960 0.040
#> SRR813680 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1378109 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1499174 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1382851 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1433410 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR661167 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432518 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR660462 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1374608 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR657949 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1308882 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR655768 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485870 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1444138 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470193 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1091380 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1313583 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1467102 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1485416 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR818821 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR809963 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1353710 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1445259 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1408393 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1310542 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333485 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1406437 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1354931 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1391856 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1446738 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1309032 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1388145 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1432611 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR815869 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR613150 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1375329 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1387921 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1360478 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1360695 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR812943 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1400910 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1444203 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR816177 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR658754 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1429603 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1397366 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1337606 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659109 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR656946 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1342067 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1385389 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1075971 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR614419 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR612935 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR661481 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1354117 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1393596 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1452164 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1070503 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1499894 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082883 1 0.141 0.979 0.980 0.020
#> SRR1468271 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR810295 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR662103 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1328620 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1396294 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1419917 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR662114 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1489199 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR813584 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1069638 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR614864 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR2167710 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1401252 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1309963 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1486889 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1356468 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1337010 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1486520 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1486538 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1340486 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1377696 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1465459 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1080270 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1312501 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1093148 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1467080 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR816475 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1379198 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR613342 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1338836 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1369129 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1396616 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR813824 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1500891 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR807543 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1346689 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1332424 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR663729 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1097013 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR613675 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485357 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR655816 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1355172 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR655531 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1338147 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413329 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485931 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1420873 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333308 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1452033 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR809018 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR663440 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR808019 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1479133 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615069 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1456185 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1350069 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR816316 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR664795 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1490721 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR810643 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1085285 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1099072 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1420276 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1351347 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR819610 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR2157314 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR809987 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR613639 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1402285 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1077038 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1405660 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1394734 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1317771 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1073581 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR659804 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1432186 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1473529 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR660764 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR820448 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1328845 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1336415 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1379065 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1459190 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1346773 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1347459 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1400202 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1333395 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1309248 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR809161 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1316320 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1432629 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1498931 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416578 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1405547 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470534 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1309160 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR663489 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1078489 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1332648 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR660614 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1475566 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1464766 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR615946 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1467656 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1402962 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR660224 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR665586 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR613390 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR661108 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR817329 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1401990 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1467745 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1471795 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1415637 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR813137 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR818797 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR2164608 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1455586 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR819459 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1433232 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1385501 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1361652 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1437119 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1478547 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1430910 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1310584 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1486762 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1480854 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1489394 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1418085 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1340221 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1473058 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1405165 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1098712 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1455038 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1403005 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1413541 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1392943 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1475192 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1452468 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1347060 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1447962 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1444324 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1415004 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1343302 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1373746 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1405331 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1322840 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1399797 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1416654 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1315081 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1369196 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1365291 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1367920 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1366648 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1082173 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1363968 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR814387 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR657599 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1386689 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1395575 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1453811 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1441159 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1403154 2 0.000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1468722 1 0.000 0.999 1.000 0.000
#> SRR1310275 1 0.000 0.999 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 1 0.0424 0.9474 0.992 0.000 0.008
#> SRR1331708 1 0.1163 0.9447 0.972 0.000 0.028
#> SRR1464258 1 0.6180 0.2670 0.584 0.000 0.416
#> SRR1454201 1 0.1289 0.9406 0.968 0.000 0.032
#> SRR661589 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1456229 1 0.5529 0.5751 0.704 0.000 0.296
#> SRR1315165 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1094457 2 0.0237 0.9949 0.000 0.996 0.004
#> SRR1095575 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1315931 1 0.0237 0.9473 0.996 0.000 0.004
#> SRR1430066 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1431037 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1395554 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR818002 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1486845 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1362866 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1490740 1 0.0592 0.9466 0.988 0.000 0.012
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0237 0.9949 0.000 0.996 0.004
#> SRR1429846 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR613550 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1348402 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1324025 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1318879 1 0.2537 0.9001 0.920 0.000 0.080
#> SRR820755 3 0.0592 0.9233 0.012 0.000 0.988
#> SRR1485830 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR599313 1 0.1031 0.9461 0.976 0.000 0.024
#> SRR612263 1 0.1163 0.9424 0.972 0.000 0.028
#> SRR1415398 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1326205 2 0.0237 0.9949 0.000 0.996 0.004
#> SRR1421327 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1083311 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1499303 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079522 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1452935 1 0.5397 0.6209 0.720 0.000 0.280
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR615778 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1447564 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0424 0.9475 0.992 0.000 0.008
#> SRR655182 1 0.0592 0.9474 0.988 0.000 0.012
#> SRR1335140 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1433555 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1308650 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1413602 3 0.5706 0.5523 0.320 0.000 0.680
#> SRR1479955 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR809853 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR661313 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1499935 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447303 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1429408 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433950 1 0.0237 0.9473 0.996 0.000 0.004
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409854 3 0.4974 0.7064 0.236 0.000 0.764
#> SRR1435229 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1085996 1 0.0892 0.9445 0.980 0.000 0.020
#> SRR1414229 1 0.1163 0.9432 0.972 0.000 0.028
#> SRR1400974 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1399971 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.1620 0.9307 0.964 0.024 0.012
#> SRR813776 3 0.0592 0.9233 0.012 0.000 0.988
#> SRR808196 2 0.0237 0.9949 0.000 0.996 0.004
#> SRR1101085 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR614395 3 0.5733 0.5667 0.324 0.000 0.676
#> SRR1478251 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1420109 1 0.3482 0.8489 0.872 0.000 0.128
#> SRR1330920 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1419539 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359447 3 0.6267 0.2209 0.452 0.000 0.548
#> SRR1347259 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR613915 3 0.1411 0.9080 0.036 0.000 0.964
#> SRR1384395 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR821715 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1478228 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.1964 0.9169 0.944 0.000 0.056
#> SRR608150 1 0.1163 0.9447 0.972 0.000 0.028
#> SRR1096383 1 0.0237 0.9474 0.996 0.000 0.004
#> SRR1341480 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1341344 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1326270 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1498838 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1416313 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR808566 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430270 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1367825 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR613533 3 0.3686 0.8214 0.140 0.000 0.860
#> SRR661267 3 0.6180 0.3516 0.416 0.000 0.584
#> SRR810665 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407250 1 0.1163 0.9432 0.972 0.000 0.028
#> SRR1420067 1 0.0237 0.9474 0.996 0.000 0.004
#> SRR1473632 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR812536 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1446375 1 0.2878 0.8840 0.904 0.000 0.096
#> SRR1465230 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR614119 1 0.0892 0.9440 0.980 0.000 0.020
#> SRR1356101 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.0237 0.9474 0.996 0.000 0.004
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0237 0.9474 0.996 0.000 0.004
#> SRR660510 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1445655 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR658953 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR2166459 1 0.3816 0.8222 0.852 0.000 0.148
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1317631 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488610 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1330588 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1316367 1 0.0747 0.9471 0.984 0.000 0.016
#> SRR1433926 1 0.0747 0.9452 0.984 0.000 0.016
#> SRR1091302 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR818263 3 0.6252 0.2605 0.444 0.000 0.556
#> SRR1404909 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR663076 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442422 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.6299 0.0638 0.524 0.000 0.476
#> SRR1407112 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1353199 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1378885 3 0.0592 0.9233 0.012 0.000 0.988
#> SRR665357 3 0.3038 0.8548 0.104 0.000 0.896
#> SRR662186 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.2448 0.8772 0.076 0.000 0.924
#> SRR1347819 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472576 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1431781 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1500472 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1417632 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458113 1 0.4750 0.7318 0.784 0.000 0.216
#> SRR1326579 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1349363 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1096712 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1090407 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1083752 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377599 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1488449 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1318354 3 0.6267 0.2195 0.452 0.000 0.548
#> SRR1359062 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1398924 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR663783 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1319204 1 0.1525 0.9399 0.964 0.004 0.032
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0747 0.9452 0.984 0.000 0.016
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498595 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1377423 3 0.4605 0.7380 0.204 0.000 0.796
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0237 0.9474 0.996 0.000 0.004
#> SRR1338426 1 0.5810 0.5018 0.664 0.000 0.336
#> SRR1353309 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR658941 1 0.1031 0.9450 0.976 0.000 0.024
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0237 0.9474 0.996 0.000 0.004
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324085 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363858 2 0.6200 0.5276 0.312 0.676 0.012
#> SRR819820 1 0.6192 0.2891 0.580 0.000 0.420
#> SRR1337342 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR655206 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387013 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415379 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1099622 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR663197 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1394836 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR661699 1 0.6396 0.5329 0.664 0.320 0.016
#> SRR813680 3 0.6140 0.3860 0.404 0.000 0.596
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.1163 0.9431 0.972 0.000 0.028
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433410 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR661167 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1432518 3 0.5497 0.6179 0.292 0.000 0.708
#> SRR660462 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1374608 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR657949 3 0.4452 0.7649 0.192 0.000 0.808
#> SRR1308882 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR655768 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1485870 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1444138 1 0.6267 0.1820 0.548 0.000 0.452
#> SRR1417342 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091380 1 0.5810 0.5127 0.664 0.000 0.336
#> SRR1099096 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1467102 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485416 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR818821 3 0.5291 0.6644 0.268 0.000 0.732
#> SRR809963 3 0.6225 0.2992 0.432 0.000 0.568
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1445259 1 0.3879 0.8196 0.848 0.000 0.152
#> SRR1408393 3 0.0592 0.9233 0.012 0.000 0.988
#> SRR1361522 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1333485 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1406437 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354931 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1391856 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446738 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR613150 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1375329 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1400910 1 0.1163 0.9447 0.972 0.000 0.028
#> SRR1444203 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1429603 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397366 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1446028 1 0.0747 0.9471 0.984 0.000 0.016
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337606 1 0.1163 0.9447 0.972 0.000 0.028
#> SRR659109 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1337192 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR656946 1 0.0747 0.9471 0.984 0.000 0.016
#> SRR1476102 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1385389 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1075971 1 0.0892 0.9445 0.980 0.000 0.020
#> SRR614419 1 0.0747 0.9471 0.984 0.000 0.016
#> SRR1322936 1 0.1163 0.9447 0.972 0.000 0.028
#> SRR1349121 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR612935 1 0.6235 0.2094 0.564 0.000 0.436
#> SRR661481 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1393596 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1499894 3 0.0592 0.9237 0.012 0.000 0.988
#> SRR1082883 1 0.2050 0.9287 0.952 0.020 0.028
#> SRR1468271 1 0.0237 0.9474 0.996 0.000 0.004
#> SRR1332443 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 1 0.5650 0.5562 0.688 0.000 0.312
#> SRR1396294 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419917 1 0.1753 0.9240 0.952 0.000 0.048
#> SRR662114 1 0.5968 0.4313 0.636 0.000 0.364
#> SRR1489199 3 0.6126 0.3761 0.400 0.000 0.600
#> SRR813584 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069638 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR614864 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1433392 3 0.5621 0.5971 0.308 0.000 0.692
#> SRR1377777 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR2167710 1 0.0892 0.9469 0.980 0.000 0.020
#> SRR1401252 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1309963 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.0592 0.9472 0.988 0.000 0.012
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1340486 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1465459 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1080270 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1312501 3 0.3340 0.8409 0.120 0.000 0.880
#> SRR1093148 1 0.1031 0.9450 0.976 0.000 0.024
#> SRR1467080 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR816475 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379198 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR613342 3 0.3412 0.8368 0.124 0.000 0.876
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369129 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1396616 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR813824 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1082376 3 0.4002 0.8071 0.160 0.000 0.840
#> SRR1500891 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR807543 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1091572 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1346689 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1332424 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR663729 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1097013 1 0.0592 0.9451 0.988 0.000 0.012
#> SRR613675 1 0.1163 0.9447 0.972 0.000 0.028
#> SRR1485357 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR655816 3 0.3551 0.8244 0.132 0.000 0.868
#> SRR1500113 1 0.0237 0.9474 0.996 0.000 0.004
#> SRR1437622 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355172 1 0.1289 0.9363 0.968 0.000 0.032
#> SRR655531 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1338147 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1413329 1 0.1163 0.9431 0.972 0.000 0.028
#> SRR1485931 2 0.0237 0.9949 0.000 0.996 0.004
#> SRR1420873 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1452033 1 0.0237 0.9474 0.996 0.000 0.004
#> SRR1467316 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR809018 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR663440 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1471755 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR808019 1 0.0592 0.9475 0.988 0.000 0.012
#> SRR1479133 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR615069 1 0.1031 0.9450 0.976 0.000 0.024
#> SRR1456185 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350069 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR816316 1 0.4974 0.6871 0.764 0.000 0.236
#> SRR664795 1 0.4654 0.7366 0.792 0.000 0.208
#> SRR1490721 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR810643 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1085285 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1099072 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1351347 3 0.0747 0.9215 0.016 0.000 0.984
#> SRR1405525 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0237 0.9473 0.996 0.000 0.004
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR809987 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR613639 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1402285 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1077038 1 0.6180 0.2671 0.584 0.000 0.416
#> SRR1405660 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1095455 1 0.2796 0.8879 0.908 0.000 0.092
#> SRR1394734 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1073581 1 0.0237 0.9474 0.996 0.000 0.004
#> SRR659804 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR660764 3 0.5098 0.6884 0.248 0.000 0.752
#> SRR820448 1 0.3941 0.8062 0.844 0.000 0.156
#> SRR1328845 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1336415 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379065 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1459190 3 0.5760 0.5352 0.328 0.000 0.672
#> SRR1346773 1 0.0424 0.9473 0.992 0.000 0.008
#> SRR1499521 1 0.0237 0.9474 0.996 0.000 0.004
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.5591 0.5965 0.304 0.000 0.696
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1309248 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR809161 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1316320 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1432629 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1405547 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1470534 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1380764 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR663489 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1500450 1 0.0237 0.9474 0.996 0.000 0.004
#> SRR1078489 1 0.1031 0.9450 0.976 0.000 0.024
#> SRR1332648 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR660614 1 0.1529 0.9352 0.960 0.000 0.040
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.4062 0.7994 0.836 0.000 0.164
#> SRR615946 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.0747 0.9473 0.984 0.000 0.016
#> SRR660224 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR665586 1 0.1163 0.9399 0.972 0.000 0.028
#> SRR1347166 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1485722 1 0.1860 0.9262 0.948 0.000 0.052
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.4504 0.7514 0.804 0.000 0.196
#> SRR661108 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR2170173 1 0.3038 0.8755 0.896 0.000 0.104
#> SRR817329 1 0.0892 0.9445 0.980 0.000 0.020
#> SRR1401990 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467745 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR813137 3 0.5497 0.6080 0.292 0.000 0.708
#> SRR1314873 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR818797 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR2164608 1 0.5810 0.5036 0.664 0.000 0.336
#> SRR1455586 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR819459 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1488939 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.6204 0.3106 0.424 0.000 0.576
#> SRR1361652 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1430910 1 0.1411 0.9380 0.964 0.000 0.036
#> SRR1310584 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1486762 3 0.2537 0.8745 0.080 0.000 0.920
#> SRR1480854 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1489394 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1418085 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1340221 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1473058 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405165 3 0.5835 0.5266 0.340 0.000 0.660
#> SRR1433004 1 0.3116 0.8665 0.892 0.000 0.108
#> SRR1471477 1 0.0237 0.9474 0.996 0.000 0.004
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098712 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455038 1 0.1163 0.9424 0.972 0.000 0.028
#> SRR1375248 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1348378 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413541 1 0.0892 0.9445 0.980 0.000 0.020
#> SRR1392943 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1475192 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452468 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1347060 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1414139 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0237 0.9474 0.996 0.000 0.004
#> SRR1311266 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1343302 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.4002 0.8018 0.160 0.000 0.840
#> SRR1345609 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1322840 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1399797 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1416654 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1315081 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1369196 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1367920 2 0.0424 0.9939 0.000 0.992 0.008
#> SRR1366648 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082173 1 0.2711 0.8923 0.912 0.000 0.088
#> SRR1363968 1 0.0237 0.9474 0.996 0.000 0.004
#> SRR814387 1 0.0000 0.9467 1.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0892 0.9465 0.980 0.000 0.020
#> SRR1386689 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1453811 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1441159 1 0.0892 0.9466 0.980 0.000 0.020
#> SRR1403154 2 0.0000 0.9958 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0424 0.9261 0.008 0.000 0.992
#> SRR1310275 3 0.4796 0.7283 0.220 0.000 0.780
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 1 0.1576 0.87194 0.948 0.000 0.048 0.004
#> SRR1331708 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR1464258 1 0.4868 0.70790 0.748 0.000 0.212 0.040
#> SRR1454201 1 0.4595 0.84899 0.776 0.000 0.040 0.184
#> SRR661589 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.4292 0.83096 0.820 0.000 0.100 0.080
#> SRR1315165 4 0.4730 0.78905 0.000 0.364 0.000 0.636
#> SRR1488960 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1417809 2 0.4996 -0.53678 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR1094457 4 0.3649 0.74438 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1095575 1 0.4549 0.84957 0.776 0.000 0.036 0.188
#> SRR1315931 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1430066 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818002 2 0.2011 0.70172 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1344143 2 0.4955 -0.39090 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1486845 4 0.3649 0.74438 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1362866 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR1490740 1 0.0336 0.87833 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1446627 2 0.0000 0.72323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.1557 0.71944 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1416248 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1383907 4 0.4790 0.77981 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR1311018 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1375699 2 0.4955 -0.39090 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1429846 3 0.0336 0.90646 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR613550 3 0.0336 0.90646 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1348402 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1345146 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR1324025 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318879 1 0.6316 0.74557 0.660 0.000 0.156 0.184
#> SRR820755 3 0.3444 0.75416 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR1485830 4 0.3801 0.75209 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR599313 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR612263 1 0.4204 0.85287 0.788 0.000 0.020 0.192
#> SRR1415398 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326205 4 0.4972 0.70438 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR1421327 4 0.4955 0.70325 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1083311 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.4761 0.78468 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR1079522 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR1452935 1 0.6580 0.69503 0.632 0.000 0.196 0.172
#> SRR1379495 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1470459 2 0.0000 0.72323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR1447564 1 0.0707 0.88049 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1455195 1 0.3142 0.86984 0.860 0.000 0.008 0.132
#> SRR655182 1 0.1584 0.88175 0.952 0.000 0.012 0.036
#> SRR1335140 2 0.4994 -0.45592 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1433555 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.4677 0.14457 0.004 0.680 0.000 0.316
#> SRR1388354 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1317446 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.5473 0.64443 0.192 0.000 0.724 0.084
#> SRR1479955 2 0.4746 -0.06324 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR809853 1 0.4284 0.85080 0.780 0.000 0.020 0.200
#> SRR661313 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499935 4 0.4713 0.79028 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR1447303 3 0.0188 0.90756 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1429408 4 0.4941 0.71557 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1433950 1 0.0707 0.88022 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1362081 2 0.0000 0.72323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 3 0.5453 0.32042 0.388 0.000 0.592 0.020
#> SRR1435229 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR1085996 1 0.2924 0.87375 0.884 0.000 0.016 0.100
#> SRR1414229 1 0.4919 0.83907 0.752 0.000 0.048 0.200
#> SRR1400974 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR613927 3 0.3074 0.78905 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1457854 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473714 1 0.3039 0.87398 0.900 0.012 0.036 0.052
#> SRR813776 3 0.3528 0.74431 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR808196 4 0.4972 0.70438 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR1101085 4 0.4713 0.79028 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR614395 1 0.5050 0.29209 0.588 0.000 0.408 0.004
#> SRR1478251 4 0.3688 0.74662 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1370551 2 0.0000 0.72323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR665310 3 0.0188 0.90738 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1420109 1 0.6236 0.75286 0.668 0.000 0.152 0.180
#> SRR1330920 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR1419539 2 0.2814 0.63340 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1359447 3 0.6675 0.47332 0.228 0.000 0.616 0.156
#> SRR1347259 4 0.4985 0.67953 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR613915 3 0.3074 0.79239 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1384395 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821715 3 0.0336 0.90646 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1478228 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1445637 1 0.0672 0.88035 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR608150 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR1096383 1 0.1305 0.87607 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1341480 4 0.4790 0.77981 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR1341344 1 0.4284 0.85080 0.780 0.000 0.020 0.200
#> SRR1326270 3 0.0336 0.90646 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808566 4 0.4888 0.74808 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR1430270 4 0.4955 0.72230 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1367825 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613533 3 0.3706 0.79917 0.112 0.000 0.848 0.040
#> SRR661267 3 0.5263 0.17446 0.448 0.000 0.544 0.008
#> SRR810665 2 0.0336 0.72476 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1407250 1 0.4669 0.84437 0.764 0.000 0.036 0.200
#> SRR1420067 1 0.0779 0.88134 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1473632 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR812536 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.1302 0.71962 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1486195 2 0.0000 0.72323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.4955 -0.39090 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1446375 1 0.4633 0.85053 0.780 0.000 0.048 0.172
#> SRR1465230 4 0.3649 0.74438 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR614119 1 0.1398 0.87488 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR1356101 2 0.1022 0.72212 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1404209 1 0.0188 0.87859 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1392676 2 0.0336 0.72522 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR665538 1 0.0895 0.87917 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR660510 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.4679 0.79199 0.000 0.352 0.000 0.648
#> SRR658953 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR2166459 1 0.0895 0.87829 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1070713 2 0.3123 0.59961 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1485312 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.4907 0.74261 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1488610 1 0.4284 0.85080 0.780 0.000 0.020 0.200
#> SRR1330588 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.4284 0.85080 0.780 0.000 0.020 0.200
#> SRR1433926 1 0.0672 0.87951 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1091302 4 0.4697 0.79167 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR818263 1 0.6089 0.48290 0.608 0.000 0.328 0.064
#> SRR1404909 4 0.4866 0.75864 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR663076 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1323577 2 0.1211 0.71986 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1442422 4 0.3649 0.74438 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1465893 1 0.0524 0.87896 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR654862 1 0.6158 0.60617 0.640 0.000 0.272 0.088
#> SRR1407112 4 0.3649 0.74438 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1332969 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353199 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378885 3 0.2814 0.80849 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR665357 3 0.1118 0.89177 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR662186 2 0.1637 0.70760 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1501020 3 0.1867 0.86516 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.1211 0.71986 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1472576 4 0.4843 0.76700 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1431781 4 0.4697 0.79135 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR1452270 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.4485 0.84800 0.772 0.000 0.028 0.200
#> SRR1417632 4 0.4933 0.71528 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1350153 2 0.0921 0.72396 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1458113 1 0.7128 0.57892 0.556 0.000 0.260 0.184
#> SRR1326579 1 0.4284 0.85080 0.780 0.000 0.020 0.200
#> SRR1349363 2 0.4955 -0.39090 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1096712 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.3356 0.61355 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1377599 4 0.5000 0.53326 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1488449 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318354 3 0.7166 0.30931 0.280 0.000 0.544 0.176
#> SRR1359062 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398924 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR663783 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319204 1 0.6436 0.74997 0.660 0.004 0.144 0.192
#> SRR1369070 2 0.1211 0.71986 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR615659 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1337449 2 0.0000 0.72323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.1118 0.72088 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1498595 4 0.4916 0.73004 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR1377423 3 0.3123 0.77715 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.72323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0524 0.87953 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1338426 3 0.7397 -0.15609 0.408 0.000 0.428 0.164
#> SRR1353309 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658941 1 0.5677 0.78584 0.720 0.000 0.140 0.140
#> SRR1101643 1 0.0921 0.88052 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1401468 1 0.1004 0.87890 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1368874 2 0.0188 0.72450 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1324085 4 0.4730 0.78878 0.000 0.364 0.000 0.636
#> SRR1363858 2 0.8219 -0.10969 0.276 0.432 0.016 0.276
#> SRR819820 3 0.6926 0.02958 0.392 0.000 0.496 0.112
#> SRR1337342 1 0.4406 0.85126 0.780 0.000 0.028 0.192
#> SRR655206 2 0.3444 0.55017 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1387013 2 0.3610 0.57341 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1317410 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR608198 1 0.4284 0.85080 0.780 0.000 0.020 0.200
#> SRR1440161 2 0.0000 0.72323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.1302 0.72035 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1381288 2 0.0817 0.72484 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1415379 4 0.4624 0.79227 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR1099622 2 0.0817 0.72484 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR663197 3 0.0336 0.90583 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1394836 2 0.1637 0.70727 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR661699 1 0.7792 0.45354 0.540 0.312 0.064 0.084
#> SRR813680 1 0.5132 0.17207 0.548 0.000 0.448 0.004
#> SRR1410678 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1378109 4 0.3649 0.74438 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1499174 1 0.2775 0.87783 0.896 0.000 0.020 0.084
#> SRR1311486 2 0.0000 0.72323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.4977 -0.41638 0.000 0.540 0.000 0.460
#> SRR1433410 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR661167 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.6119 0.60499 0.168 0.000 0.680 0.152
#> SRR660462 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374608 2 0.4994 -0.52244 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR657949 3 0.5444 0.21058 0.424 0.000 0.560 0.016
#> SRR1308882 4 0.4643 0.79230 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR655768 1 0.2949 0.87589 0.888 0.000 0.024 0.088
#> SRR1485870 2 0.4999 -0.56979 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR1444138 1 0.4567 0.68338 0.740 0.000 0.244 0.016
#> SRR1417342 1 0.1356 0.88130 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR1470193 2 0.4972 -0.43678 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR1091380 3 0.7153 -0.15001 0.424 0.000 0.444 0.132
#> SRR1099096 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313583 4 0.4977 0.69359 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1467102 2 0.1118 0.72088 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1485416 4 0.4830 0.77083 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR818821 3 0.5332 0.66950 0.184 0.000 0.736 0.080
#> SRR809963 1 0.4857 0.50845 0.668 0.000 0.324 0.008
#> SRR1072247 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1353710 4 0.4967 0.71017 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR1445259 1 0.5318 0.82262 0.732 0.000 0.072 0.196
#> SRR1408393 3 0.3907 0.68969 0.232 0.000 0.768 0.000
#> SRR1361522 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1368597 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1309680 2 0.3649 0.56613 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1310542 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.4679 0.79199 0.000 0.352 0.000 0.648
#> SRR1406437 2 0.4967 -0.41766 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR1354931 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391856 2 0.1211 0.71924 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1446738 2 0.4916 -0.32188 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1309032 2 0.0000 0.72323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0921 0.72630 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1432611 2 0.0000 0.72323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375329 1 0.4485 0.84800 0.772 0.000 0.028 0.200
#> SRR1387921 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1466792 2 0.0000 0.72323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0817 0.72484 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1360695 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR812943 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR1400910 1 0.4485 0.84800 0.772 0.000 0.028 0.200
#> SRR1444203 4 0.3688 0.74662 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR816177 2 0.2704 0.66389 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR658754 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.4961 0.71758 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR1397366 3 0.0188 0.90738 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1446028 1 0.2222 0.87998 0.924 0.000 0.016 0.060
#> SRR1083918 2 0.1302 0.71962 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1337606 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR659109 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.4284 0.85080 0.780 0.000 0.020 0.200
#> SRR656946 1 0.2313 0.87813 0.924 0.000 0.032 0.044
#> SRR1476102 1 0.0817 0.88110 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1476447 1 0.0707 0.88049 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1342067 4 0.4477 0.78552 0.000 0.312 0.000 0.688
#> SRR1385389 4 0.3649 0.74438 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1075971 1 0.0657 0.87967 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR614419 1 0.4284 0.85080 0.780 0.000 0.020 0.200
#> SRR1322936 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR1349121 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1430549 1 0.0469 0.87913 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR612935 3 0.7474 -0.14265 0.400 0.000 0.424 0.176
#> SRR661481 2 0.1211 0.71986 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1354117 2 0.1118 0.72088 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1393596 4 0.4998 0.62578 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR1452164 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1070503 3 0.2973 0.79822 0.144 0.000 0.856 0.000
#> SRR1499894 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082883 1 0.4872 0.84347 0.760 0.012 0.024 0.204
#> SRR1468271 1 0.1004 0.87890 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1332443 1 0.0336 0.87841 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR810295 2 0.0000 0.72323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1328620 1 0.7412 0.27576 0.444 0.000 0.388 0.168
#> SRR1396294 2 0.4999 -0.56430 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR1419917 1 0.1677 0.88127 0.948 0.000 0.012 0.040
#> SRR662114 1 0.7521 0.22350 0.420 0.000 0.396 0.184
#> SRR1489199 1 0.6315 0.34230 0.540 0.000 0.396 0.064
#> SRR813584 2 0.2704 0.64235 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1069638 1 0.4755 0.84222 0.760 0.000 0.040 0.200
#> SRR614864 3 0.0188 0.90756 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1433392 1 0.5132 0.16844 0.548 0.000 0.448 0.004
#> SRR1377777 2 0.3569 0.57999 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR2167710 1 0.2483 0.87802 0.916 0.000 0.032 0.052
#> SRR1401252 4 0.4888 0.74758 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR1309963 4 0.3649 0.74438 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1338031 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418628 2 0.0817 0.72484 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1486889 1 0.1545 0.87747 0.952 0.000 0.040 0.008
#> SRR1380393 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1319731 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1356468 4 0.4972 0.70438 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR1337010 2 0.0188 0.72426 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1486520 1 0.0376 0.87867 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1486538 4 0.4356 0.77931 0.000 0.292 0.000 0.708
#> SRR1340486 4 0.3649 0.74438 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1377696 2 0.4996 -0.46963 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR1465459 3 0.1792 0.86947 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.1798 0.88004 0.040 0.000 0.944 0.016
#> SRR1093148 1 0.6811 0.78294 0.676 0.064 0.072 0.188
#> SRR1467080 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.1211 0.71986 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR816475 4 0.4843 0.76698 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1379198 4 0.3688 0.74662 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR613342 3 0.2610 0.84221 0.088 0.000 0.900 0.012
#> SRR1452246 2 0.3486 0.59015 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1338836 2 0.1211 0.71986 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1369129 4 0.3649 0.74438 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1396616 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082376 3 0.5512 -0.01088 0.492 0.000 0.492 0.016
#> SRR1500891 4 0.4830 0.77058 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR807543 3 0.3400 0.75744 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR1091572 1 0.4540 0.84848 0.772 0.000 0.032 0.196
#> SRR1346689 4 0.4888 0.74758 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR1332424 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR663729 4 0.4981 0.68731 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR1097013 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR613675 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR1485357 4 0.3649 0.74438 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR655816 3 0.2149 0.84781 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1500113 1 0.0592 0.87951 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1437622 2 0.4454 0.28927 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR1355172 1 0.1902 0.86550 0.932 0.000 0.064 0.004
#> SRR655531 1 0.4204 0.85287 0.788 0.000 0.020 0.192
#> SRR1338147 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413329 1 0.5050 0.83723 0.756 0.000 0.068 0.176
#> SRR1485931 2 0.3400 0.55777 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1420873 1 0.0336 0.87805 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1333308 4 0.4972 0.70438 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR1452033 1 0.0657 0.87936 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1467316 2 0.4925 -0.33599 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR809018 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.1211 0.71986 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR663440 3 0.0921 0.89665 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1471755 2 0.1474 0.71593 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR808019 1 0.1975 0.87533 0.936 0.000 0.048 0.016
#> SRR1479133 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615069 1 0.5537 0.82408 0.728 0.008 0.064 0.200
#> SRR1456185 2 0.4948 -0.37759 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR1350069 4 0.4972 0.70438 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR816316 1 0.3972 0.84846 0.840 0.000 0.080 0.080
#> SRR664795 1 0.2412 0.85415 0.908 0.000 0.084 0.008
#> SRR1490721 2 0.4999 -0.57034 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR810643 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1430333 1 0.4669 0.84441 0.764 0.000 0.036 0.200
#> SRR1085285 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.0188 0.90738 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1317985 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1487340 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1420276 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0779 0.90121 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR1405525 1 0.4284 0.85080 0.780 0.000 0.020 0.200
#> SRR1370329 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1465001 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1476525 2 0.1211 0.71986 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR819610 2 0.4955 -0.39090 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR2157314 1 0.0779 0.88069 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1409465 2 0.0817 0.72484 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR809987 4 0.4967 0.70944 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR613639 3 0.0336 0.90646 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1402285 4 0.4643 0.79255 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1077038 1 0.4361 0.71474 0.772 0.000 0.208 0.020
#> SRR1405660 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.4579 0.84669 0.768 0.000 0.032 0.200
#> SRR1394734 2 0.1474 0.71593 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1317771 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1365894 2 0.4961 -0.40618 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1073581 1 0.1305 0.87607 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR659804 1 0.0469 0.87909 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1345914 2 0.3024 0.61213 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1432186 2 0.1211 0.71986 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1473529 2 0.4994 -0.45482 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR660764 3 0.4388 0.75864 0.132 0.000 0.808 0.060
#> SRR820448 1 0.2623 0.86538 0.908 0.000 0.064 0.028
#> SRR1328845 4 0.4972 0.70438 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR1336415 4 0.3688 0.74693 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1379065 4 0.3801 0.75218 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1459190 3 0.4175 0.69207 0.212 0.000 0.776 0.012
#> SRR1346773 1 0.2271 0.88056 0.916 0.000 0.008 0.076
#> SRR1499521 1 0.1305 0.87607 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1440898 2 0.0817 0.72484 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1347459 3 0.6155 0.59491 0.176 0.000 0.676 0.148
#> SRR1081209 2 0.3123 0.59924 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1400202 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1333395 2 0.4967 -0.41766 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR1309248 2 0.4955 -0.39090 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR809161 3 0.0188 0.90738 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1316320 2 0.4955 -0.39090 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1432629 2 0.1302 0.72035 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1498931 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1416578 4 0.4454 0.78484 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR1405547 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.3688 0.74662 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1380764 1 0.0592 0.87951 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1309160 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.1004 0.87890 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1078489 1 0.4755 0.84222 0.760 0.000 0.040 0.200
#> SRR1332648 4 0.3649 0.74438 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR660614 1 0.6098 0.76987 0.676 0.000 0.124 0.200
#> SRR1470420 2 0.0000 0.72323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1477949 1 0.0336 0.87805 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1481419 2 0.1118 0.72156 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1464766 1 0.2124 0.86200 0.924 0.000 0.068 0.008
#> SRR615946 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.1211 0.71986 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1467656 2 0.0707 0.72512 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1402962 1 0.3659 0.86644 0.840 0.000 0.024 0.136
#> SRR660224 2 0.1557 0.71066 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR665586 1 0.2255 0.87953 0.920 0.000 0.012 0.068
#> SRR1347166 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR1485722 1 0.4595 0.84899 0.776 0.000 0.040 0.184
#> SRR1415316 1 0.0921 0.88074 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR613390 1 0.3323 0.86361 0.876 0.000 0.060 0.064
#> SRR661108 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.5062 0.83593 0.752 0.000 0.064 0.184
#> SRR817329 1 0.1888 0.88060 0.940 0.000 0.016 0.044
#> SRR1401990 4 0.4661 0.79257 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR1467745 2 0.3486 0.59668 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1471795 2 0.1211 0.71986 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1415637 2 0.0188 0.72450 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR813137 1 0.5168 -0.00231 0.500 0.000 0.496 0.004
#> SRR1314873 1 0.0336 0.87844 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1401211 1 0.0895 0.87917 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1419692 4 0.3649 0.74438 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR818797 3 0.0592 0.90299 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR2164608 1 0.6980 0.30337 0.484 0.000 0.400 0.116
#> SRR1455586 2 0.1118 0.72088 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR819459 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.4955 -0.39090 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1433232 2 0.1302 0.72035 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1385501 1 0.6520 0.35964 0.536 0.000 0.384 0.080
#> SRR1361652 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR1437119 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1478547 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430910 1 0.5894 0.78750 0.692 0.000 0.108 0.200
#> SRR1310584 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1500216 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR1486762 3 0.1118 0.89055 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1480854 4 0.4855 0.76283 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR1489394 4 0.3649 0.74438 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1418085 4 0.3649 0.74438 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1340221 4 0.4661 0.79312 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR1473058 4 0.4955 0.69195 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1405165 3 0.5100 0.69384 0.168 0.000 0.756 0.076
#> SRR1433004 1 0.3215 0.87273 0.876 0.000 0.032 0.092
#> SRR1471477 1 0.1004 0.87890 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1098567 2 0.0469 0.72498 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1098712 2 0.4981 -0.46286 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR1455038 1 0.4204 0.85287 0.788 0.000 0.020 0.192
#> SRR1375248 2 0.1118 0.72088 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1403005 3 0.0592 0.90296 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1348378 2 0.2973 0.63614 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1413541 1 0.2662 0.87726 0.900 0.000 0.016 0.084
#> SRR1392943 4 0.4999 0.60959 0.000 0.492 0.000 0.508
#> SRR1475192 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.1389 0.71541 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1452468 1 0.4387 0.84971 0.776 0.000 0.024 0.200
#> SRR1347060 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.1118 0.72088 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1447962 2 0.0000 0.72323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0921 0.72306 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1415004 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1413436 1 0.2412 0.87854 0.908 0.000 0.008 0.084
#> SRR1311266 1 0.4284 0.85080 0.780 0.000 0.020 0.200
#> SRR1343302 4 0.3649 0.74438 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1373746 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1429678 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1469413 2 0.0000 0.72323 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.5478 0.42663 0.344 0.000 0.628 0.028
#> SRR1345609 1 0.0707 0.88035 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1380208 2 0.4955 -0.39090 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1322840 4 0.3649 0.74438 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1399797 3 0.0188 0.90735 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1416654 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0188 0.90739 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1365291 3 0.1302 0.88673 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1367920 4 0.4961 0.68140 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR1366648 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.1389 0.71545 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1082173 1 0.6511 0.70889 0.640 0.000 0.188 0.172
#> SRR1363968 1 0.0895 0.87917 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR814387 1 0.0188 0.87752 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR657599 1 0.3439 0.87053 0.868 0.000 0.048 0.084
#> SRR1386689 4 0.3649 0.74438 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1395575 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453811 3 0.0707 0.90096 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1441159 1 0.4012 0.85856 0.800 0.000 0.016 0.184
#> SRR1403154 4 0.3649 0.74438 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1468722 3 0.0000 0.90859 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.5696 0.59211 0.232 0.000 0.692 0.076
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 1 0.6362 0.36292 0.496 0.000 0.184 0.000 0.320
#> SRR1331708 5 0.1282 0.78302 0.044 0.000 0.004 0.000 0.952
#> SRR1464258 1 0.5691 0.46204 0.536 0.000 0.088 0.000 0.376
#> SRR1454201 5 0.2932 0.75353 0.104 0.000 0.032 0.000 0.864
#> SRR661589 3 0.0510 0.85199 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1456229 1 0.5148 0.39114 0.528 0.000 0.040 0.000 0.432
#> SRR1315165 4 0.2280 0.73143 0.000 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1488960 1 0.0794 0.74703 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1417809 4 0.4989 0.47934 0.000 0.416 0.000 0.552 0.032
#> SRR1094457 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1095575 5 0.3255 0.75009 0.052 0.000 0.100 0.000 0.848
#> SRR1315931 1 0.2732 0.74106 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1430066 3 0.0162 0.85137 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1431037 3 0.0162 0.85137 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1395554 3 0.0510 0.85068 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR818002 2 0.3109 0.68340 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1344143 2 0.4836 0.34556 0.000 0.628 0.000 0.336 0.036
#> SRR1486845 4 0.0609 0.71631 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1362866 5 0.1571 0.78809 0.060 0.000 0.004 0.000 0.936
#> SRR1490740 1 0.2732 0.74270 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1446627 2 0.0162 0.79343 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1456138 2 0.1792 0.79456 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.74229 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 4 0.4088 0.63045 0.000 0.304 0.000 0.688 0.008
#> SRR1311018 1 0.0000 0.74229 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.4430 0.33607 0.000 0.628 0.000 0.360 0.012
#> SRR1429846 3 0.2773 0.75256 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR613550 3 0.2516 0.77624 0.000 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1348402 1 0.1270 0.75325 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1345146 5 0.1914 0.78909 0.060 0.000 0.016 0.000 0.924
#> SRR1324025 3 0.0290 0.85223 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1318879 5 0.3809 0.59607 0.008 0.000 0.256 0.000 0.736
#> SRR820755 3 0.5325 0.43802 0.076 0.000 0.616 0.000 0.308
#> SRR1485830 4 0.0955 0.71700 0.000 0.004 0.000 0.968 0.028
#> SRR599313 5 0.1571 0.78809 0.060 0.000 0.004 0.000 0.936
#> SRR612263 5 0.2416 0.76914 0.100 0.000 0.012 0.000 0.888
#> SRR1415398 3 0.1197 0.83933 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1326205 4 0.4084 0.63513 0.000 0.328 0.000 0.668 0.004
#> SRR1421327 4 0.4949 0.46506 0.000 0.396 0.000 0.572 0.032
#> SRR1083311 3 0.0290 0.85176 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1499303 4 0.4029 0.61895 0.000 0.316 0.000 0.680 0.004
#> SRR1079522 5 0.1571 0.78809 0.060 0.000 0.004 0.000 0.936
#> SRR1452935 5 0.3160 0.69036 0.004 0.000 0.188 0.000 0.808
#> SRR1379495 1 0.0000 0.74229 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0162 0.79343 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR661361 3 0.0162 0.85227 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR615778 5 0.1697 0.78858 0.060 0.000 0.008 0.000 0.932
#> SRR1447564 1 0.3074 0.72747 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1455195 1 0.4437 0.32494 0.532 0.000 0.004 0.000 0.464
#> SRR655182 1 0.3949 0.56510 0.668 0.000 0.000 0.000 0.332
#> SRR1335140 2 0.4527 0.32149 0.000 0.596 0.000 0.392 0.012
#> SRR1433555 3 0.0703 0.85043 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1308650 2 0.4177 0.65735 0.004 0.760 0.000 0.200 0.036
#> SRR1388354 1 0.0000 0.74229 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0162 0.85137 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1413602 3 0.3109 0.71616 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1479955 2 0.4268 0.42101 0.000 0.648 0.000 0.344 0.008
#> SRR809853 5 0.1571 0.78809 0.060 0.000 0.004 0.000 0.936
#> SRR661313 3 0.0609 0.84985 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1499935 4 0.3300 0.70400 0.000 0.204 0.000 0.792 0.004
#> SRR1447303 3 0.1732 0.82281 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1429408 4 0.4182 0.46604 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1433950 1 0.4030 0.59018 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR1362081 2 0.0162 0.79343 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409854 3 0.5423 0.26301 0.064 0.000 0.548 0.000 0.388
#> SRR1435229 5 0.1571 0.78809 0.060 0.000 0.004 0.000 0.936
#> SRR1085996 1 0.4452 0.25881 0.500 0.000 0.004 0.000 0.496
#> SRR1414229 5 0.1469 0.77733 0.016 0.000 0.036 0.000 0.948
#> SRR1400974 3 0.0162 0.85137 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1399971 1 0.0000 0.74229 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.4522 0.59105 0.044 0.000 0.708 0.000 0.248
#> SRR1457854 1 0.0290 0.74565 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1473714 5 0.6805 0.26255 0.324 0.068 0.072 0.004 0.532
#> SRR813776 3 0.4891 0.47588 0.044 0.000 0.640 0.000 0.316
#> SRR808196 4 0.4047 0.64314 0.000 0.320 0.000 0.676 0.004
#> SRR1101085 4 0.4073 0.69506 0.000 0.216 0.000 0.752 0.032
#> SRR614395 1 0.6366 0.42047 0.512 0.000 0.204 0.000 0.284
#> SRR1478251 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1370551 2 0.0162 0.79343 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1362310 1 0.0000 0.74229 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.1792 0.82017 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1420109 5 0.4130 0.53786 0.012 0.000 0.292 0.000 0.696
#> SRR1330920 5 0.2193 0.77411 0.092 0.000 0.008 0.000 0.900
#> SRR1419539 2 0.2233 0.78129 0.000 0.892 0.000 0.104 0.004
#> SRR1359447 3 0.4201 0.36381 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR1347259 4 0.5003 0.45973 0.000 0.424 0.000 0.544 0.032
#> SRR613915 3 0.3700 0.64983 0.008 0.000 0.752 0.000 0.240
#> SRR1384395 3 0.0404 0.85140 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR821715 3 0.2280 0.79358 0.000 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1478228 1 0.0000 0.74229 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.4169 0.69497 0.732 0.000 0.028 0.000 0.240
#> SRR608150 5 0.1502 0.78748 0.056 0.000 0.004 0.000 0.940
#> SRR1096383 1 0.5714 0.52444 0.580 0.000 0.108 0.000 0.312
#> SRR1341480 4 0.4661 0.61296 0.000 0.312 0.000 0.656 0.032
#> SRR1341344 5 0.2389 0.75403 0.116 0.000 0.004 0.000 0.880
#> SRR1326270 3 0.3123 0.72736 0.004 0.000 0.812 0.000 0.184
#> SRR1498838 3 0.0162 0.85137 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1416313 3 0.0000 0.85167 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808566 4 0.4182 0.56093 0.000 0.352 0.000 0.644 0.004
#> SRR1430270 4 0.4697 0.63788 0.000 0.320 0.000 0.648 0.032
#> SRR1367825 3 0.0290 0.85176 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR613533 3 0.3684 0.62848 0.000 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR661267 3 0.6759 -0.11291 0.328 0.000 0.396 0.000 0.276
#> SRR810665 2 0.0671 0.79643 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1407250 5 0.2927 0.76721 0.060 0.000 0.068 0.000 0.872
#> SRR1420067 1 0.3983 0.61434 0.660 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR1473632 5 0.1571 0.78809 0.060 0.000 0.004 0.000 0.936
#> SRR812536 3 0.0290 0.85179 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1370850 2 0.1341 0.79150 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1486195 2 0.0162 0.79343 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1407671 2 0.4585 0.33997 0.000 0.628 0.000 0.352 0.020
#> SRR1446375 5 0.4295 0.65268 0.044 0.000 0.216 0.000 0.740
#> SRR1465230 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR614119 1 0.5285 0.60448 0.632 0.000 0.080 0.000 0.288
#> SRR1356101 2 0.1502 0.79939 0.000 0.940 0.000 0.056 0.004
#> SRR1404209 1 0.4290 0.64808 0.680 0.000 0.016 0.000 0.304
#> SRR1392676 2 0.1270 0.80101 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR665538 1 0.4404 0.65184 0.684 0.000 0.024 0.000 0.292
#> SRR660510 3 0.0000 0.85167 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.2124 0.73320 0.000 0.096 0.000 0.900 0.004
#> SRR658953 5 0.1571 0.78809 0.060 0.000 0.004 0.000 0.936
#> SRR2166459 1 0.4297 0.69130 0.728 0.000 0.036 0.000 0.236
#> SRR1070713 2 0.2280 0.76589 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.85167 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.3534 0.68370 0.000 0.256 0.000 0.744 0.000
#> SRR1488610 5 0.1571 0.78809 0.060 0.000 0.004 0.000 0.936
#> SRR1330588 3 0.0162 0.85227 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1316367 5 0.2179 0.76923 0.100 0.000 0.004 0.000 0.896
#> SRR1433926 1 0.3242 0.71346 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR1091302 4 0.2074 0.73359 0.000 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR818263 5 0.6367 -0.04359 0.372 0.000 0.168 0.000 0.460
#> SRR1404909 4 0.4982 0.40840 0.000 0.412 0.000 0.556 0.032
#> SRR663076 1 0.1197 0.75373 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1323577 2 0.1341 0.79150 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1442422 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1465893 1 0.3480 0.69526 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR654862 5 0.6024 0.02403 0.364 0.000 0.124 0.000 0.512
#> SRR1407112 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1332969 3 0.0510 0.85127 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1353199 3 0.0404 0.85175 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1378885 3 0.4398 0.60720 0.040 0.000 0.720 0.000 0.240
#> SRR665357 3 0.3109 0.69597 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR662186 2 0.1831 0.79399 0.000 0.920 0.000 0.076 0.004
#> SRR1501020 3 0.1571 0.83612 0.004 0.000 0.936 0.000 0.060
#> SRR1347819 3 0.0000 0.85167 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.1341 0.79150 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1472576 4 0.4949 0.45420 0.000 0.396 0.000 0.572 0.032
#> SRR1431781 4 0.2068 0.73351 0.000 0.092 0.000 0.904 0.004
#> SRR1452270 3 0.0000 0.85167 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.1872 0.78844 0.052 0.000 0.020 0.000 0.928
#> SRR1417632 4 0.4996 0.38534 0.000 0.420 0.000 0.548 0.032
#> SRR1350153 2 0.1043 0.79617 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1458113 5 0.3395 0.62168 0.000 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR1326579 5 0.2488 0.74734 0.124 0.000 0.004 0.000 0.872
#> SRR1349363 2 0.4654 0.34164 0.000 0.628 0.000 0.348 0.024
#> SRR1096712 3 0.0510 0.85059 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1090407 3 0.0404 0.85199 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1083752 2 0.2966 0.74515 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR1377599 2 0.5049 -0.13674 0.000 0.488 0.000 0.480 0.032
#> SRR1488449 3 0.0880 0.84882 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1318354 5 0.4201 0.24015 0.000 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1359062 3 0.0290 0.85176 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1398924 5 0.1571 0.78809 0.060 0.000 0.004 0.000 0.936
#> SRR663783 3 0.0290 0.85179 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1319204 5 0.4089 0.61764 0.016 0.004 0.244 0.000 0.736
#> SRR1369070 2 0.1341 0.79150 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR615659 1 0.2424 0.74883 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1337449 2 0.0162 0.79343 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1316982 2 0.1831 0.79399 0.000 0.920 0.000 0.076 0.004
#> SRR1498595 4 0.4632 0.31083 0.000 0.448 0.000 0.540 0.012
#> SRR1377423 3 0.2136 0.81555 0.008 0.000 0.904 0.000 0.088
#> SRR1312310 2 0.0162 0.79343 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1485613 1 0.3636 0.68205 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR1338426 3 0.4182 0.35455 0.000 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1353309 3 0.0609 0.85111 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR658941 5 0.4793 0.58845 0.056 0.000 0.260 0.000 0.684
#> SRR1101643 1 0.3210 0.68279 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR1401468 1 0.5507 0.54923 0.596 0.000 0.088 0.000 0.316
#> SRR1368874 2 0.1571 0.79869 0.000 0.936 0.000 0.060 0.004
#> SRR1324085 4 0.3231 0.70776 0.000 0.196 0.000 0.800 0.004
#> SRR1363858 5 0.7192 -0.19041 0.040 0.400 0.004 0.140 0.416
#> SRR819820 3 0.3707 0.61196 0.000 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1337342 5 0.2513 0.75505 0.116 0.000 0.008 0.000 0.876
#> SRR655206 2 0.2806 0.74429 0.000 0.844 0.000 0.152 0.004
#> SRR1387013 2 0.3039 0.73408 0.000 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.74229 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608198 5 0.1952 0.77658 0.084 0.000 0.004 0.000 0.912
#> SRR1440161 2 0.0324 0.79492 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1343741 2 0.1341 0.79150 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1381288 2 0.0880 0.79751 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1415379 4 0.2079 0.73214 0.000 0.064 0.000 0.916 0.020
#> SRR1099622 2 0.1205 0.80060 0.000 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR663197 3 0.0703 0.85043 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1394836 2 0.2179 0.78444 0.000 0.896 0.000 0.100 0.004
#> SRR661699 5 0.7017 0.41851 0.024 0.240 0.184 0.012 0.540
#> SRR813680 1 0.6732 0.21850 0.416 0.000 0.300 0.000 0.284
#> SRR1410678 1 0.0000 0.74229 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1499174 5 0.4211 0.32304 0.360 0.000 0.004 0.000 0.636
#> SRR1311486 2 0.0162 0.79343 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1382851 2 0.4238 0.36818 0.000 0.628 0.000 0.368 0.004
#> SRR1433410 5 0.1571 0.78809 0.060 0.000 0.004 0.000 0.936
#> SRR661167 3 0.0290 0.85223 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1432518 3 0.4278 0.23723 0.000 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR660462 3 0.0162 0.85137 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1374608 4 0.4420 0.40535 0.000 0.448 0.000 0.548 0.004
#> SRR657949 3 0.4905 0.44128 0.040 0.000 0.624 0.000 0.336
#> SRR1308882 4 0.2873 0.72899 0.000 0.128 0.000 0.856 0.016
#> SRR655768 5 0.4718 0.37027 0.344 0.000 0.028 0.000 0.628
#> SRR1485870 2 0.4826 -0.19250 0.000 0.508 0.000 0.472 0.020
#> SRR1444138 3 0.6792 -0.15875 0.288 0.000 0.372 0.000 0.340
#> SRR1417342 1 0.3684 0.61689 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1470193 4 0.4451 0.24897 0.000 0.492 0.000 0.504 0.004
#> SRR1091380 3 0.3876 0.54968 0.000 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1099096 1 0.0000 0.74229 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 4 0.4697 0.63788 0.000 0.320 0.000 0.648 0.032
#> SRR1467102 2 0.1831 0.79399 0.000 0.920 0.000 0.076 0.004
#> SRR1485416 4 0.4508 0.59026 0.000 0.332 0.000 0.648 0.020
#> SRR818821 3 0.3983 0.52402 0.000 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR809963 1 0.6204 0.46538 0.536 0.000 0.176 0.000 0.288
#> SRR1072247 1 0.0162 0.74422 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1353710 4 0.4101 0.62981 0.000 0.332 0.000 0.664 0.004
#> SRR1445259 5 0.1628 0.76780 0.008 0.000 0.056 0.000 0.936
#> SRR1408393 3 0.5594 0.41846 0.108 0.000 0.608 0.000 0.284
#> SRR1361522 1 0.0510 0.74718 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1368597 1 0.0794 0.74926 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1309680 2 0.3003 0.73827 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1310542 3 0.0290 0.85176 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1333485 4 0.2932 0.73096 0.000 0.104 0.000 0.864 0.032
#> SRR1406437 2 0.4331 0.22772 0.000 0.596 0.000 0.400 0.004
#> SRR1354931 3 0.0162 0.85227 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1391856 2 0.1831 0.79399 0.000 0.920 0.000 0.076 0.004
#> SRR1446738 2 0.4151 0.39201 0.000 0.652 0.000 0.344 0.004
#> SRR1309032 2 0.0162 0.79343 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1388145 2 0.1341 0.80419 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1432611 2 0.0162 0.79343 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR815869 3 0.0404 0.85140 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR613150 3 0.0162 0.85137 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1375329 5 0.1628 0.78845 0.056 0.000 0.008 0.000 0.936
#> SRR1387921 1 0.0000 0.74229 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0162 0.79343 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1360478 2 0.0880 0.79751 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1360695 1 0.3074 0.73034 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR812943 5 0.1571 0.78809 0.060 0.000 0.004 0.000 0.936
#> SRR1400910 5 0.1571 0.78809 0.060 0.000 0.004 0.000 0.936
#> SRR1444203 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR816177 2 0.3534 0.60127 0.000 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR658754 3 0.0510 0.85059 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1429603 4 0.4084 0.62910 0.000 0.328 0.000 0.668 0.004
#> SRR1397366 3 0.1341 0.83835 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1446028 5 0.4249 0.08326 0.432 0.000 0.000 0.000 0.568
#> SRR1083918 2 0.1410 0.79058 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1337606 5 0.1502 0.78748 0.056 0.000 0.004 0.000 0.940
#> SRR659109 3 0.0290 0.85176 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1337192 5 0.1952 0.77709 0.084 0.000 0.004 0.000 0.912
#> SRR656946 5 0.5329 0.00763 0.432 0.000 0.052 0.000 0.516
#> SRR1476102 1 0.3424 0.67221 0.760 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR1476447 1 0.3336 0.70741 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228
#> SRR1342067 4 0.2511 0.73273 0.000 0.080 0.000 0.892 0.028
#> SRR1385389 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1075971 1 0.3424 0.69849 0.760 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR614419 5 0.1952 0.77745 0.084 0.000 0.004 0.000 0.912
#> SRR1322936 5 0.1430 0.78636 0.052 0.000 0.004 0.000 0.944
#> SRR1349121 1 0.2329 0.75136 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1430549 1 0.3508 0.69789 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252
#> SRR612935 5 0.3796 0.51856 0.000 0.000 0.300 0.000 0.700
#> SRR661481 2 0.1341 0.79150 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1354117 2 0.1831 0.79399 0.000 0.920 0.000 0.076 0.004
#> SRR1393596 4 0.4747 0.26511 0.000 0.488 0.000 0.496 0.016
#> SRR1452164 1 0.2377 0.75024 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1070503 3 0.4318 0.56090 0.020 0.000 0.688 0.000 0.292
#> SRR1499894 3 0.0510 0.85087 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1082883 5 0.1202 0.77479 0.032 0.000 0.004 0.004 0.960
#> SRR1468271 1 0.4716 0.62512 0.656 0.000 0.036 0.000 0.308
#> SRR1332443 1 0.1121 0.75313 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR810295 2 0.0162 0.79343 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR662103 1 0.0404 0.74761 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1328620 5 0.4249 0.18197 0.000 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1396294 4 0.4066 0.63913 0.000 0.324 0.000 0.672 0.004
#> SRR1419917 1 0.4009 0.63491 0.684 0.000 0.004 0.000 0.312
#> SRR662114 5 0.3913 0.46309 0.000 0.000 0.324 0.000 0.676
#> SRR1489199 3 0.5650 -0.01135 0.076 0.000 0.464 0.000 0.460
#> SRR813584 2 0.3336 0.63384 0.000 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR1069638 5 0.1469 0.78492 0.036 0.000 0.016 0.000 0.948
#> SRR614864 3 0.1608 0.82789 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1433392 1 0.6694 0.25672 0.432 0.000 0.276 0.000 0.292
#> SRR1377777 2 0.3003 0.73807 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR2167710 5 0.5396 -0.03716 0.444 0.000 0.056 0.000 0.500
#> SRR1401252 4 0.4862 0.52938 0.000 0.364 0.000 0.604 0.032
#> SRR1309963 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1338031 1 0.1270 0.75317 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1418628 2 0.1124 0.79615 0.000 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1486889 1 0.5996 0.38850 0.512 0.000 0.120 0.000 0.368
#> SRR1380393 1 0.0000 0.74229 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.74229 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 4 0.4835 0.55527 0.000 0.380 0.000 0.592 0.028
#> SRR1337010 2 0.1041 0.80080 0.000 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR1486520 1 0.1121 0.75248 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1486538 4 0.2054 0.73009 0.000 0.052 0.000 0.920 0.028
#> SRR1340486 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1377696 2 0.4949 0.26055 0.000 0.572 0.000 0.396 0.032
#> SRR1465459 3 0.3783 0.63292 0.008 0.000 0.740 0.000 0.252
#> SRR1080270 3 0.0162 0.85137 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1312501 3 0.1544 0.83432 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1093148 5 0.4039 0.68557 0.036 0.004 0.184 0.000 0.776
#> SRR1467080 3 0.0162 0.85137 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1410866 2 0.1341 0.79150 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR816475 4 0.3561 0.67273 0.000 0.260 0.000 0.740 0.000
#> SRR1379198 4 0.0609 0.71631 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR613342 3 0.3452 0.67645 0.000 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1452246 2 0.2929 0.74473 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1338836 2 0.1341 0.79150 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1369129 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1396616 3 0.0609 0.84985 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR813824 3 0.0162 0.85227 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1082376 5 0.6557 -0.07547 0.368 0.000 0.204 0.000 0.428
#> SRR1500891 4 0.4583 0.63562 0.000 0.296 0.000 0.672 0.032
#> SRR807543 3 0.4984 0.47699 0.052 0.000 0.640 0.000 0.308
#> SRR1091572 5 0.1894 0.78315 0.072 0.000 0.008 0.000 0.920
#> SRR1346689 4 0.4679 0.61158 0.000 0.316 0.000 0.652 0.032
#> SRR1332424 5 0.1571 0.78809 0.060 0.000 0.004 0.000 0.936
#> SRR663729 4 0.4996 0.46965 0.000 0.420 0.000 0.548 0.032
#> SRR1097013 1 0.3366 0.70251 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232
#> SRR613675 5 0.1430 0.78636 0.052 0.000 0.004 0.000 0.944
#> SRR1485357 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR655816 3 0.1341 0.83014 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1500113 1 0.3395 0.70857 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236
#> SRR1437622 2 0.4088 0.33343 0.000 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1355172 1 0.6299 0.40980 0.508 0.000 0.176 0.000 0.316
#> SRR655531 5 0.3491 0.61391 0.228 0.000 0.004 0.000 0.768
#> SRR1338147 3 0.0162 0.85227 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1413329 5 0.4878 0.58266 0.060 0.000 0.264 0.000 0.676
#> SRR1485931 2 0.2424 0.75526 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1420873 1 0.1671 0.75423 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1333308 4 0.4949 0.52281 0.000 0.396 0.000 0.572 0.032
#> SRR1452033 1 0.4161 0.66865 0.704 0.000 0.016 0.000 0.280
#> SRR1467316 2 0.4836 0.34556 0.000 0.628 0.000 0.336 0.036
#> SRR809018 3 0.0290 0.85176 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1375351 2 0.1341 0.79150 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR663440 3 0.3424 0.65972 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1471755 2 0.1732 0.78709 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR808019 1 0.6532 0.15302 0.420 0.000 0.196 0.000 0.384
#> SRR1479133 3 0.0510 0.85098 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR615069 5 0.2291 0.77464 0.036 0.000 0.056 0.000 0.908
#> SRR1456185 2 0.4444 0.33693 0.000 0.624 0.000 0.364 0.012
#> SRR1350069 4 0.4047 0.64314 0.000 0.320 0.000 0.676 0.004
#> SRR816316 1 0.5206 0.39392 0.528 0.000 0.044 0.000 0.428
#> SRR664795 1 0.6275 0.42661 0.520 0.000 0.180 0.000 0.300
#> SRR1490721 2 0.5088 -0.09239 0.000 0.528 0.000 0.436 0.036
#> SRR810643 1 0.0290 0.74565 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1430333 5 0.1444 0.78582 0.040 0.000 0.012 0.000 0.948
#> SRR1085285 3 0.0404 0.85218 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1099072 3 0.2516 0.77630 0.000 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1317985 1 0.0404 0.74732 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1487340 1 0.0404 0.74677 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1420276 3 0.0404 0.85140 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1351347 3 0.0880 0.84899 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1405525 5 0.1638 0.78557 0.064 0.000 0.004 0.000 0.932
#> SRR1370329 1 0.0162 0.74422 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1465001 1 0.0000 0.74229 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.1341 0.79150 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR819610 2 0.4354 0.32539 0.000 0.624 0.000 0.368 0.008
#> SRR2157314 1 0.2471 0.74544 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1409465 2 0.0880 0.79751 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR809987 4 0.4697 0.63788 0.000 0.320 0.000 0.648 0.032
#> SRR613639 3 0.2891 0.74630 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1402285 4 0.2450 0.73268 0.000 0.076 0.000 0.896 0.028
#> SRR1077038 1 0.5825 0.52019 0.564 0.000 0.116 0.000 0.320
#> SRR1405660 3 0.0510 0.85059 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1095455 5 0.1800 0.77627 0.020 0.000 0.048 0.000 0.932
#> SRR1394734 2 0.1851 0.78422 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1317771 1 0.2329 0.74636 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1365894 2 0.5000 0.14759 0.000 0.576 0.000 0.388 0.036
#> SRR1073581 1 0.5915 0.47715 0.552 0.000 0.124 0.000 0.324
#> SRR659804 1 0.0609 0.73826 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1345914 2 0.2179 0.77235 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1432186 2 0.1341 0.79150 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1473529 2 0.4547 0.29695 0.000 0.588 0.000 0.400 0.012
#> SRR660764 3 0.3424 0.66012 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR820448 1 0.4716 0.62599 0.656 0.000 0.036 0.000 0.308
#> SRR1328845 4 0.4047 0.64314 0.000 0.320 0.000 0.676 0.004
#> SRR1336415 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1379065 4 0.1211 0.72208 0.000 0.016 0.000 0.960 0.024
#> SRR1459190 3 0.3160 0.74298 0.004 0.000 0.808 0.000 0.188
#> SRR1346773 5 0.4307 -0.20546 0.500 0.000 0.000 0.000 0.500
#> SRR1499521 1 0.5180 0.58804 0.624 0.000 0.064 0.000 0.312
#> SRR1440898 2 0.0880 0.79751 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1347459 3 0.4227 0.32629 0.000 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR1081209 2 0.2280 0.76559 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1400202 1 0.0404 0.74728 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1333395 2 0.5009 -0.02404 0.000 0.540 0.000 0.428 0.032
#> SRR1309248 2 0.4851 0.33277 0.000 0.624 0.000 0.340 0.036
#> SRR809161 3 0.1792 0.82010 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1316320 2 0.4836 0.34556 0.000 0.628 0.000 0.336 0.036
#> SRR1432629 2 0.1341 0.79150 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1498931 1 0.0290 0.74565 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1416578 4 0.2124 0.73074 0.000 0.056 0.000 0.916 0.028
#> SRR1405547 3 0.0162 0.85137 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1470534 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1380764 1 0.2852 0.74022 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR1309160 3 0.0000 0.85167 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0290 0.85176 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1500450 1 0.4445 0.63850 0.676 0.000 0.024 0.000 0.300
#> SRR1078489 5 0.1549 0.78578 0.040 0.000 0.016 0.000 0.944
#> SRR1332648 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR660614 5 0.2843 0.72391 0.008 0.000 0.144 0.000 0.848
#> SRR1470420 2 0.0162 0.79343 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1475566 1 0.0162 0.74423 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1477949 1 0.1341 0.74297 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1481419 2 0.1270 0.79296 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1464766 1 0.4645 0.66668 0.688 0.000 0.044 0.000 0.268
#> SRR615946 3 0.0000 0.85167 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.1341 0.79150 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1467656 2 0.0703 0.79779 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1402962 5 0.4392 0.15613 0.380 0.000 0.008 0.000 0.612
#> SRR660224 2 0.1952 0.79036 0.000 0.912 0.000 0.084 0.004
#> SRR665586 1 0.4321 0.50228 0.600 0.000 0.004 0.000 0.396
#> SRR1347166 5 0.1571 0.78809 0.060 0.000 0.004 0.000 0.936
#> SRR1485722 5 0.4069 0.71534 0.096 0.000 0.112 0.000 0.792
#> SRR1415316 1 0.4135 0.60035 0.656 0.000 0.004 0.000 0.340
#> SRR613390 1 0.5059 0.43724 0.548 0.000 0.036 0.000 0.416
#> SRR661108 3 0.0162 0.85137 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2170173 5 0.3535 0.70712 0.028 0.000 0.164 0.000 0.808
#> SRR817329 1 0.4151 0.59487 0.652 0.000 0.004 0.000 0.344
#> SRR1401990 4 0.1851 0.73391 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1467745 2 0.3534 0.65158 0.000 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR1471795 2 0.1341 0.79150 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1415637 2 0.0703 0.80090 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR813137 3 0.6775 -0.14748 0.336 0.000 0.384 0.000 0.280
#> SRR1314873 1 0.2074 0.73074 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1401211 1 0.4161 0.66884 0.704 0.000 0.016 0.000 0.280
#> SRR1419692 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR818797 3 0.3424 0.65670 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR2164608 3 0.4268 0.27084 0.000 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1455586 2 0.1768 0.79535 0.000 0.924 0.000 0.072 0.004
#> SRR819459 3 0.0162 0.85137 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1488939 2 0.4836 0.34556 0.000 0.628 0.000 0.336 0.036
#> SRR1433232 2 0.1341 0.79150 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1385501 5 0.5334 0.55226 0.148 0.000 0.180 0.000 0.672
#> SRR1361652 5 0.1571 0.78809 0.060 0.000 0.004 0.000 0.936
#> SRR1437119 1 0.0162 0.74422 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1478547 3 0.0162 0.85137 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1430910 5 0.1638 0.76529 0.004 0.000 0.064 0.000 0.932
#> SRR1310584 1 0.0162 0.74422 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1500216 5 0.1571 0.78809 0.060 0.000 0.004 0.000 0.936
#> SRR1486762 3 0.1270 0.83909 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1480854 4 0.4874 0.52020 0.000 0.368 0.000 0.600 0.032
#> SRR1489394 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1418085 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1340221 4 0.3099 0.72898 0.000 0.124 0.000 0.848 0.028
#> SRR1473058 4 0.4210 0.43240 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR1405165 3 0.3508 0.63403 0.000 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1433004 1 0.5115 0.26838 0.484 0.000 0.036 0.000 0.480
#> SRR1471477 1 0.5744 0.51261 0.572 0.000 0.108 0.000 0.320
#> SRR1098567 2 0.1041 0.80085 0.000 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR1098712 4 0.4434 0.36785 0.000 0.460 0.000 0.536 0.004
#> SRR1455038 5 0.3366 0.64121 0.212 0.000 0.004 0.000 0.784
#> SRR1375248 2 0.1768 0.79535 0.000 0.924 0.000 0.072 0.004
#> SRR1403005 3 0.3305 0.68194 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1348378 2 0.2329 0.78032 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1413541 1 0.4425 0.38106 0.544 0.000 0.004 0.000 0.452
#> SRR1392943 4 0.5028 0.40391 0.000 0.444 0.000 0.524 0.032
#> SRR1475192 3 0.0162 0.85137 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1432085 2 0.1831 0.79399 0.000 0.920 0.000 0.076 0.004
#> SRR1452468 5 0.1571 0.78809 0.060 0.000 0.004 0.000 0.936
#> SRR1347060 3 0.0162 0.85137 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1414139 2 0.1831 0.79399 0.000 0.920 0.000 0.076 0.004
#> SRR1447962 2 0.0162 0.79343 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444324 2 0.1205 0.80100 0.000 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR1415004 1 0.0000 0.74229 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.4300 0.30034 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1311266 5 0.2612 0.75053 0.124 0.000 0.008 0.000 0.868
#> SRR1343302 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1373746 1 0.0000 0.74229 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0404 0.74677 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1469413 2 0.0162 0.79343 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1405331 3 0.4341 0.45067 0.008 0.000 0.628 0.000 0.364
#> SRR1345609 1 0.2929 0.73432 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1380208 2 0.4836 0.34556 0.000 0.628 0.000 0.336 0.036
#> SRR1322840 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1399797 3 0.0510 0.85132 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1416654 3 0.0162 0.85227 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1315081 3 0.0880 0.84488 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1369196 3 0.0162 0.85137 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1400847 1 0.0290 0.74565 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1365291 3 0.3480 0.64920 0.000 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1367920 4 0.5028 0.30443 0.000 0.444 0.000 0.524 0.032
#> SRR1366648 3 0.0162 0.85137 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1441679 2 0.1831 0.79399 0.000 0.920 0.000 0.076 0.004
#> SRR1082173 5 0.4108 0.50860 0.008 0.000 0.308 0.000 0.684
#> SRR1363968 1 0.4339 0.64908 0.684 0.000 0.020 0.000 0.296
#> SRR814387 1 0.0000 0.74229 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657599 5 0.6026 0.46107 0.228 0.000 0.192 0.000 0.580
#> SRR1386689 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1395575 3 0.0290 0.85260 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1453811 3 0.3336 0.67443 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1441159 5 0.3838 0.53851 0.280 0.000 0.004 0.000 0.716
#> SRR1403154 4 0.0162 0.71837 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1468722 3 0.0162 0.85137 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1310275 3 0.4300 0.17176 0.000 0.000 0.524 0.000 0.476
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 6 0.7330 3.30e-01 0.148 0.000 0.164 0.000 0.340 0.348
#> SRR1331708 5 0.0862 4.87e-01 0.008 0.000 0.004 0.000 0.972 0.016
#> SRR1464258 5 0.6473 -3.60e-02 0.292 0.000 0.016 0.000 0.356 0.336
#> SRR1454201 5 0.4871 3.02e-01 0.048 0.000 0.032 0.000 0.668 0.252
#> SRR661589 3 0.2623 7.41e-01 0.000 0.000 0.852 0.000 0.016 0.132
#> SRR1456229 5 0.5840 2.27e-01 0.312 0.000 0.012 0.000 0.520 0.156
#> SRR1315165 4 0.2544 7.08e-01 0.000 0.140 0.000 0.852 0.004 0.004
#> SRR1488960 1 0.0260 7.66e-01 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1417809 2 0.4805 3.07e-03 0.000 0.516 0.000 0.440 0.008 0.036
#> SRR1094457 4 0.0632 7.56e-01 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1095575 5 0.4648 3.17e-01 0.020 0.000 0.076 0.000 0.712 0.192
#> SRR1315931 1 0.4765 4.84e-01 0.672 0.000 0.000 0.000 0.196 0.132
#> SRR1430066 3 0.0146 7.69e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1431037 3 0.0291 7.70e-01 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1395554 3 0.4052 5.96e-01 0.000 0.000 0.628 0.000 0.016 0.356
#> SRR818002 2 0.2455 7.59e-01 0.000 0.872 0.000 0.112 0.004 0.012
#> SRR1344143 2 0.2685 7.63e-01 0.000 0.872 0.000 0.080 0.004 0.044
#> SRR1486845 4 0.0790 7.55e-01 0.000 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1362866 5 0.0653 4.93e-01 0.012 0.000 0.004 0.000 0.980 0.004
#> SRR1490740 1 0.4305 5.88e-01 0.708 0.000 0.000 0.000 0.216 0.076
#> SRR1446627 2 0.1075 7.91e-01 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1456138 2 0.1429 7.88e-01 0.000 0.940 0.000 0.052 0.004 0.004
#> SRR1416248 1 0.0000 7.63e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 4 0.4356 4.48e-01 0.000 0.360 0.000 0.608 0.000 0.032
#> SRR1311018 1 0.0146 7.65e-01 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1375699 2 0.3462 7.50e-01 0.000 0.816 0.000 0.100 0.004 0.080
#> SRR1429846 6 0.5224 -2.15e-01 0.000 0.000 0.440 0.000 0.092 0.468
#> SRR613550 3 0.4899 3.47e-01 0.000 0.000 0.488 0.000 0.060 0.452
#> SRR1348402 1 0.1812 7.43e-01 0.912 0.000 0.000 0.000 0.080 0.008
#> SRR1345146 5 0.3254 4.17e-01 0.016 0.000 0.008 0.000 0.804 0.172
#> SRR1324025 3 0.4052 6.00e-01 0.000 0.000 0.628 0.000 0.016 0.356
#> SRR1318879 5 0.5621 -6.61e-02 0.000 0.000 0.288 0.000 0.528 0.184
#> SRR820755 6 0.6723 3.46e-01 0.108 0.000 0.120 0.000 0.288 0.484
#> SRR1485830 4 0.0692 7.56e-01 0.000 0.004 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR599313 5 0.0748 4.92e-01 0.016 0.000 0.004 0.000 0.976 0.004
#> SRR612263 5 0.3936 4.43e-01 0.140 0.000 0.004 0.000 0.772 0.084
#> SRR1415398 3 0.4543 5.20e-01 0.000 0.000 0.576 0.000 0.040 0.384
#> SRR1326205 4 0.4274 3.36e-01 0.000 0.432 0.000 0.552 0.004 0.012
#> SRR1421327 2 0.4721 -2.72e-02 0.000 0.496 0.000 0.464 0.004 0.036
#> SRR1083311 3 0.0000 7.69e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.4224 4.84e-01 0.000 0.340 0.000 0.632 0.000 0.028
#> SRR1079522 5 0.0767 4.88e-01 0.008 0.000 0.004 0.000 0.976 0.012
#> SRR1452935 5 0.4513 2.70e-01 0.000 0.000 0.096 0.000 0.692 0.212
#> SRR1379495 1 0.0000 7.63e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.2003 7.82e-01 0.000 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR661361 3 0.3509 6.90e-01 0.000 0.000 0.744 0.000 0.016 0.240
#> SRR615778 5 0.1552 4.99e-01 0.036 0.000 0.004 0.000 0.940 0.020
#> SRR1447564 1 0.3684 5.22e-01 0.664 0.000 0.000 0.000 0.332 0.004
#> SRR1455195 5 0.4791 1.79e-01 0.384 0.000 0.004 0.000 0.564 0.048
#> SRR655182 1 0.4645 4.26e-01 0.648 0.000 0.000 0.000 0.276 0.076
#> SRR1335140 2 0.2882 7.52e-01 0.000 0.848 0.000 0.120 0.004 0.028
#> SRR1433555 3 0.1970 7.40e-01 0.000 0.000 0.900 0.000 0.008 0.092
#> SRR1308650 2 0.3756 7.68e-01 0.000 0.788 0.000 0.076 0.004 0.132
#> SRR1388354 1 0.0146 7.65e-01 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 7.69e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.2704 7.07e-01 0.000 0.000 0.844 0.000 0.016 0.140
#> SRR1479955 2 0.2320 7.75e-01 0.000 0.892 0.000 0.080 0.004 0.024
#> SRR809853 5 0.2452 4.88e-01 0.084 0.000 0.004 0.000 0.884 0.028
#> SRR661313 3 0.4141 5.65e-01 0.000 0.000 0.596 0.000 0.016 0.388
#> SRR1499935 4 0.3645 6.24e-01 0.000 0.236 0.000 0.740 0.000 0.024
#> SRR1447303 3 0.4649 3.96e-01 0.000 0.000 0.492 0.000 0.040 0.468
#> SRR1429408 2 0.4314 -5.75e-02 0.000 0.500 0.000 0.484 0.004 0.012
#> SRR1433950 5 0.4822 -1.71e-03 0.444 0.000 0.004 0.000 0.508 0.044
#> SRR1362081 2 0.1910 7.84e-01 0.000 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1409854 6 0.6716 2.19e-01 0.104 0.000 0.104 0.000 0.376 0.416
#> SRR1435229 5 0.1511 4.99e-01 0.044 0.000 0.004 0.000 0.940 0.012
#> SRR1085996 5 0.5108 3.18e-01 0.264 0.000 0.004 0.000 0.620 0.112
#> SRR1414229 5 0.3338 4.13e-01 0.008 0.000 0.020 0.000 0.800 0.172
#> SRR1400974 3 0.0000 7.69e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0000 7.63e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613927 6 0.6526 3.78e-01 0.084 0.000 0.140 0.000 0.252 0.524
#> SRR1457854 1 0.0603 7.64e-01 0.980 0.000 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1473714 5 0.7827 -9.16e-02 0.128 0.096 0.080 0.000 0.436 0.260
#> SRR813776 6 0.6710 3.26e-01 0.104 0.000 0.116 0.000 0.308 0.472
#> SRR808196 4 0.4268 3.47e-01 0.000 0.428 0.000 0.556 0.004 0.012
#> SRR1101085 4 0.4098 5.50e-01 0.000 0.292 0.000 0.676 0.000 0.032
#> SRR614395 6 0.6521 5.34e-02 0.276 0.000 0.020 0.000 0.344 0.360
#> SRR1478251 4 0.0632 7.56e-01 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1370551 2 0.2003 7.82e-01 0.000 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1362310 1 0.0000 7.63e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.4681 4.42e-01 0.000 0.000 0.524 0.000 0.044 0.432
#> SRR1420109 5 0.5630 2.75e-02 0.004 0.000 0.184 0.000 0.556 0.256
#> SRR1330920 5 0.4656 3.55e-01 0.068 0.000 0.016 0.000 0.696 0.220
#> SRR1419539 2 0.2608 7.94e-01 0.000 0.872 0.000 0.048 0.000 0.080
#> SRR1359447 3 0.5751 1.67e-01 0.000 0.000 0.504 0.000 0.288 0.208
#> SRR1347259 2 0.4593 -3.23e-02 0.000 0.512 0.000 0.456 0.004 0.028
#> SRR613915 6 0.5966 1.79e-01 0.012 0.000 0.332 0.000 0.168 0.488
#> SRR1384395 3 0.0603 7.64e-01 0.000 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR821715 3 0.4753 3.67e-01 0.000 0.000 0.496 0.000 0.048 0.456
#> SRR1478228 1 0.0000 7.63e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.6155 -8.74e-02 0.432 0.000 0.008 0.000 0.336 0.224
#> SRR608150 5 0.0862 4.87e-01 0.008 0.000 0.004 0.000 0.972 0.016
#> SRR1096383 6 0.7296 3.20e-01 0.204 0.000 0.116 0.000 0.328 0.352
#> SRR1341480 4 0.4389 4.20e-01 0.000 0.372 0.000 0.596 0.000 0.032
#> SRR1341344 5 0.3460 4.49e-01 0.164 0.000 0.004 0.000 0.796 0.036
#> SRR1326270 3 0.6027 1.50e-01 0.020 0.000 0.528 0.000 0.184 0.268
#> SRR1498838 3 0.0405 7.70e-01 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1416313 3 0.0806 7.70e-01 0.000 0.000 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR808566 4 0.4432 2.72e-01 0.000 0.432 0.000 0.544 0.004 0.020
#> SRR1430270 4 0.4361 3.45e-01 0.000 0.424 0.000 0.552 0.000 0.024
#> SRR1367825 3 0.0260 7.67e-01 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR613533 3 0.5871 -9.78e-05 0.000 0.000 0.464 0.000 0.320 0.216
#> SRR661267 5 0.7365 -3.44e-01 0.108 0.000 0.292 0.000 0.328 0.272
#> SRR810665 2 0.1863 7.85e-01 0.000 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1407250 5 0.4979 2.87e-01 0.040 0.000 0.048 0.000 0.664 0.248
#> SRR1420067 1 0.5965 -9.26e-02 0.448 0.000 0.004 0.000 0.352 0.196
#> SRR1473632 5 0.1442 4.94e-01 0.040 0.000 0.004 0.000 0.944 0.012
#> SRR812536 3 0.0363 7.70e-01 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1370850 2 0.1364 7.88e-01 0.000 0.944 0.000 0.048 0.004 0.004
#> SRR1486195 2 0.2003 7.82e-01 0.000 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1407671 2 0.2685 7.65e-01 0.000 0.872 0.000 0.080 0.004 0.044
#> SRR1446375 5 0.6173 5.88e-02 0.056 0.000 0.148 0.000 0.564 0.232
#> SRR1465230 4 0.0632 7.56e-01 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR614119 6 0.7268 2.93e-01 0.256 0.000 0.096 0.000 0.300 0.348
#> SRR1356101 2 0.2538 7.84e-01 0.000 0.860 0.000 0.016 0.000 0.124
#> SRR1404209 1 0.6584 -2.60e-01 0.388 0.000 0.028 0.000 0.336 0.248
#> SRR1392676 2 0.1333 7.95e-01 0.000 0.944 0.000 0.008 0.000 0.048
#> SRR665538 6 0.7096 1.94e-01 0.316 0.000 0.068 0.000 0.292 0.324
#> SRR660510 3 0.0146 7.70e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1445655 4 0.2250 7.32e-01 0.000 0.092 0.000 0.888 0.000 0.020
#> SRR658953 5 0.0665 4.91e-01 0.008 0.000 0.004 0.000 0.980 0.008
#> SRR2166459 1 0.5932 8.61e-03 0.468 0.000 0.004 0.000 0.332 0.196
#> SRR1070713 2 0.2001 7.99e-01 0.000 0.912 0.000 0.040 0.000 0.048
#> SRR1485312 3 0.1049 7.67e-01 0.000 0.000 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR1317631 4 0.3954 4.60e-01 0.000 0.372 0.000 0.620 0.004 0.004
#> SRR1488610 5 0.2095 4.91e-01 0.076 0.000 0.004 0.000 0.904 0.016
#> SRR1330588 3 0.3629 6.79e-01 0.000 0.000 0.724 0.000 0.016 0.260
#> SRR1316367 5 0.2926 4.74e-01 0.124 0.000 0.004 0.000 0.844 0.028
#> SRR1433926 1 0.5150 3.18e-01 0.580 0.000 0.004 0.000 0.324 0.092
#> SRR1091302 4 0.2584 7.06e-01 0.000 0.144 0.000 0.848 0.004 0.004
#> SRR818263 5 0.6544 4.43e-02 0.216 0.000 0.032 0.000 0.416 0.336
#> SRR1404909 2 0.4535 -1.01e-01 0.000 0.484 0.000 0.484 0.000 0.032
#> SRR663076 1 0.2201 7.45e-01 0.900 0.000 0.000 0.000 0.052 0.048
#> SRR1323577 2 0.1155 7.91e-01 0.000 0.956 0.000 0.036 0.004 0.004
#> SRR1442422 4 0.0632 7.56e-01 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1465893 1 0.5046 4.55e-01 0.620 0.000 0.000 0.000 0.256 0.124
#> SRR654862 5 0.6470 1.12e-01 0.180 0.000 0.040 0.000 0.460 0.320
#> SRR1407112 4 0.0632 7.56e-01 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1332969 3 0.3922 6.29e-01 0.000 0.000 0.664 0.000 0.016 0.320
#> SRR1353199 3 0.3984 6.17e-01 0.000 0.000 0.648 0.000 0.016 0.336
#> SRR1378885 6 0.6248 4.07e-01 0.044 0.000 0.204 0.000 0.208 0.544
#> SRR665357 3 0.1421 7.43e-01 0.000 0.000 0.944 0.000 0.028 0.028
#> SRR662186 2 0.1780 7.99e-01 0.000 0.924 0.000 0.028 0.000 0.048
#> SRR1501020 3 0.4738 5.58e-01 0.004 0.000 0.684 0.000 0.112 0.200
#> SRR1347819 3 0.0717 7.70e-01 0.000 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1480813 2 0.1296 7.88e-01 0.000 0.948 0.000 0.044 0.004 0.004
#> SRR1472576 4 0.4532 1.34e-01 0.000 0.468 0.000 0.500 0.000 0.032
#> SRR1431781 4 0.2163 7.32e-01 0.000 0.096 0.000 0.892 0.004 0.008
#> SRR1452270 3 0.0146 7.69e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1500472 5 0.3626 3.87e-01 0.008 0.000 0.028 0.000 0.776 0.188
#> SRR1417632 2 0.4644 1.40e-03 0.000 0.504 0.000 0.456 0.000 0.040
#> SRR1350153 2 0.1719 7.95e-01 0.000 0.924 0.000 0.016 0.000 0.060
#> SRR1458113 5 0.5351 1.08e-01 0.000 0.000 0.208 0.000 0.592 0.200
#> SRR1326579 5 0.3670 4.48e-01 0.152 0.000 0.004 0.000 0.788 0.056
#> SRR1349363 2 0.2600 7.63e-01 0.000 0.876 0.000 0.084 0.004 0.036
#> SRR1096712 3 0.0000 7.69e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.3778 6.55e-01 0.000 0.000 0.696 0.000 0.016 0.288
#> SRR1083752 2 0.2544 7.65e-01 0.000 0.864 0.000 0.120 0.004 0.012
#> SRR1377599 2 0.4534 2.70e-01 0.000 0.580 0.000 0.380 0.000 0.040
#> SRR1488449 3 0.3688 6.59e-01 0.000 0.000 0.724 0.000 0.020 0.256
#> SRR1318354 5 0.5798 -7.94e-02 0.000 0.000 0.312 0.000 0.484 0.204
#> SRR1359062 3 0.0363 7.70e-01 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1398924 5 0.0862 4.87e-01 0.008 0.000 0.004 0.000 0.972 0.016
#> SRR663783 3 0.0146 7.70e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1319204 5 0.5755 1.02e-02 0.004 0.004 0.260 0.000 0.552 0.180
#> SRR1369070 2 0.1364 7.87e-01 0.000 0.944 0.000 0.048 0.004 0.004
#> SRR615659 1 0.3746 6.55e-01 0.780 0.000 0.000 0.000 0.140 0.080
#> SRR1337449 2 0.1765 7.87e-01 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1316982 2 0.2848 7.85e-01 0.000 0.848 0.004 0.024 0.000 0.124
#> SRR1498595 2 0.4409 2.91e-01 0.000 0.588 0.000 0.380 0.000 0.032
#> SRR1377423 3 0.3641 6.70e-01 0.000 0.000 0.732 0.000 0.020 0.248
#> SRR1312310 2 0.1910 7.84e-01 0.000 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1485613 1 0.6039 -1.46e-01 0.436 0.000 0.004 0.000 0.344 0.216
#> SRR1338426 3 0.4535 5.45e-01 0.000 0.000 0.704 0.000 0.148 0.148
#> SRR1353309 3 0.0891 7.67e-01 0.000 0.000 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR658941 5 0.5887 -1.98e-01 0.000 0.000 0.392 0.000 0.408 0.200
#> SRR1101643 1 0.2664 6.97e-01 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR1401468 6 0.7151 2.89e-01 0.220 0.000 0.088 0.000 0.340 0.352
#> SRR1368874 2 0.2170 7.90e-01 0.000 0.888 0.000 0.012 0.000 0.100
#> SRR1324085 4 0.3608 6.11e-01 0.000 0.248 0.000 0.736 0.004 0.012
#> SRR1363858 2 0.6342 2.17e-01 0.032 0.472 0.004 0.048 0.400 0.044
#> SRR819820 3 0.5571 2.52e-01 0.000 0.000 0.552 0.000 0.224 0.224
#> SRR1337342 5 0.5286 3.31e-01 0.120 0.000 0.020 0.000 0.644 0.216
#> SRR655206 2 0.2685 7.90e-01 0.000 0.868 0.000 0.060 0.000 0.072
#> SRR1387013 2 0.2113 7.79e-01 0.000 0.896 0.000 0.092 0.004 0.008
#> SRR1317410 1 0.0000 7.63e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608198 5 0.3029 4.72e-01 0.120 0.000 0.004 0.000 0.840 0.036
#> SRR1440161 2 0.2191 7.83e-01 0.000 0.876 0.000 0.004 0.000 0.120
#> SRR1343741 2 0.1226 7.90e-01 0.000 0.952 0.000 0.040 0.004 0.004
#> SRR1381288 2 0.0291 7.95e-01 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1415379 4 0.1074 7.54e-01 0.000 0.028 0.000 0.960 0.000 0.012
#> SRR1099622 2 0.1686 8.00e-01 0.000 0.924 0.000 0.012 0.000 0.064
#> SRR663197 3 0.2706 7.01e-01 0.000 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1394836 2 0.2651 7.90e-01 0.000 0.860 0.000 0.028 0.000 0.112
#> SRR661699 5 0.7834 -1.44e-01 0.000 0.224 0.264 0.008 0.316 0.188
#> SRR813680 5 0.7609 -3.61e-01 0.188 0.000 0.208 0.000 0.316 0.288
#> SRR1410678 1 0.0146 7.64e-01 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1378109 4 0.0632 7.56e-01 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1499174 5 0.5946 1.39e-01 0.312 0.000 0.004 0.000 0.476 0.208
#> SRR1311486 2 0.1610 7.89e-01 0.000 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1382851 2 0.2547 7.63e-01 0.000 0.868 0.000 0.112 0.004 0.016
#> SRR1433410 5 0.1605 4.96e-01 0.044 0.000 0.004 0.000 0.936 0.016
#> SRR661167 3 0.3136 7.17e-01 0.000 0.000 0.796 0.000 0.016 0.188
#> SRR1432518 5 0.5943 -1.80e-01 0.000 0.000 0.380 0.000 0.404 0.216
#> SRR660462 3 0.0000 7.69e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 2 0.4450 2.99e-02 0.000 0.528 0.000 0.448 0.004 0.020
#> SRR657949 6 0.6396 2.44e-01 0.064 0.000 0.108 0.000 0.400 0.428
#> SRR1308882 4 0.2487 7.29e-01 0.000 0.092 0.000 0.876 0.000 0.032
#> SRR655768 5 0.6308 2.05e-02 0.256 0.000 0.024 0.000 0.484 0.236
#> SRR1485870 2 0.4676 1.96e-01 0.000 0.572 0.000 0.384 0.004 0.040
#> SRR1444138 5 0.7214 -2.93e-01 0.212 0.000 0.100 0.000 0.360 0.328
#> SRR1417342 1 0.2597 7.02e-01 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1470193 2 0.4536 1.69e-01 0.000 0.560 0.000 0.408 0.004 0.028
#> SRR1091380 3 0.5468 2.51e-01 0.000 0.000 0.568 0.000 0.244 0.188
#> SRR1099096 1 0.0000 7.63e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 4 0.4756 2.34e-01 0.000 0.456 0.000 0.504 0.008 0.032
#> SRR1467102 2 0.2706 7.85e-01 0.000 0.852 0.000 0.024 0.000 0.124
#> SRR1485416 4 0.4499 2.81e-01 0.000 0.428 0.000 0.540 0.000 0.032
#> SRR818821 3 0.5862 2.05e-02 0.000 0.000 0.468 0.000 0.316 0.216
#> SRR809963 6 0.6461 3.88e-02 0.280 0.000 0.016 0.000 0.348 0.356
#> SRR1072247 1 0.0508 7.65e-01 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1353710 4 0.4289 2.95e-01 0.000 0.444 0.000 0.540 0.004 0.012
#> SRR1445259 5 0.4048 3.89e-01 0.032 0.000 0.024 0.000 0.756 0.188
#> SRR1408393 6 0.6598 2.75e-01 0.136 0.000 0.076 0.000 0.308 0.480
#> SRR1361522 1 0.0291 7.65e-01 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1368597 1 0.1007 7.61e-01 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1309680 2 0.2062 7.81e-01 0.000 0.900 0.000 0.088 0.004 0.008
#> SRR1310542 3 0.0000 7.69e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.1921 7.45e-01 0.000 0.052 0.000 0.916 0.000 0.032
#> SRR1406437 2 0.4314 6.17e-01 0.000 0.712 0.000 0.220 0.004 0.064
#> SRR1354931 3 0.2510 7.48e-01 0.000 0.000 0.872 0.000 0.028 0.100
#> SRR1391856 2 0.2618 7.87e-01 0.000 0.860 0.000 0.024 0.000 0.116
#> SRR1446738 2 0.2647 7.78e-01 0.000 0.868 0.000 0.088 0.000 0.044
#> SRR1309032 2 0.1910 7.84e-01 0.000 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1388145 2 0.1285 7.99e-01 0.000 0.944 0.000 0.004 0.000 0.052
#> SRR1432611 2 0.1814 7.86e-01 0.000 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR815869 3 0.0000 7.69e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0146 7.69e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1375329 5 0.1900 4.75e-01 0.008 0.000 0.008 0.000 0.916 0.068
#> SRR1387921 1 0.0146 7.65e-01 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1466792 2 0.1910 7.84e-01 0.000 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1360478 2 0.1007 7.92e-01 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1360695 1 0.5863 3.13e-01 0.576 0.000 0.032 0.000 0.140 0.252
#> SRR812943 5 0.1370 4.96e-01 0.036 0.000 0.004 0.000 0.948 0.012
#> SRR1400910 5 0.0862 4.88e-01 0.008 0.000 0.004 0.000 0.972 0.016
#> SRR1444203 4 0.0713 7.55e-01 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR816177 2 0.2673 7.48e-01 0.000 0.852 0.000 0.132 0.004 0.012
#> SRR658754 3 0.0260 7.69e-01 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1429603 4 0.4457 3.15e-01 0.000 0.432 0.000 0.544 0.008 0.016
#> SRR1397366 3 0.4567 5.54e-01 0.000 0.000 0.616 0.000 0.052 0.332
#> SRR1446028 5 0.4914 2.05e-01 0.428 0.000 0.004 0.000 0.516 0.052
#> SRR1083918 2 0.1845 7.80e-01 0.000 0.916 0.000 0.072 0.004 0.008
#> SRR1337606 5 0.0862 4.87e-01 0.008 0.000 0.004 0.000 0.972 0.016
#> SRR659109 3 0.0146 7.69e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1337192 5 0.2766 4.76e-01 0.124 0.000 0.004 0.000 0.852 0.020
#> SRR656946 5 0.6827 -1.58e-01 0.228 0.000 0.056 0.000 0.420 0.296
#> SRR1476102 1 0.3619 5.43e-01 0.680 0.000 0.000 0.000 0.316 0.004
#> SRR1476447 1 0.4191 3.91e-01 0.596 0.000 0.004 0.000 0.388 0.012
#> SRR1342067 4 0.1367 7.53e-01 0.000 0.012 0.000 0.944 0.000 0.044
#> SRR1385389 4 0.0632 7.56e-01 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1075971 1 0.5094 3.38e-01 0.596 0.000 0.004 0.000 0.308 0.092
#> SRR614419 5 0.3224 4.65e-01 0.132 0.000 0.004 0.000 0.824 0.040
#> SRR1322936 5 0.0862 4.87e-01 0.008 0.000 0.004 0.000 0.972 0.016
#> SRR1349121 1 0.4348 5.83e-01 0.748 0.000 0.012 0.000 0.116 0.124
#> SRR1430549 1 0.4176 3.63e-01 0.580 0.000 0.000 0.000 0.404 0.016
#> SRR612935 5 0.5565 2.72e-02 0.000 0.000 0.240 0.000 0.552 0.208
#> SRR661481 2 0.1364 7.87e-01 0.000 0.944 0.000 0.048 0.004 0.004
#> SRR1354117 2 0.2573 7.88e-01 0.000 0.864 0.000 0.024 0.000 0.112
#> SRR1393596 2 0.4641 1.64e-01 0.000 0.564 0.000 0.396 0.004 0.036
#> SRR1452164 1 0.4183 5.97e-01 0.752 0.000 0.004 0.000 0.128 0.116
#> SRR1070503 6 0.6038 3.90e-01 0.032 0.000 0.172 0.000 0.240 0.556
#> SRR1499894 3 0.0146 7.70e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1082883 5 0.1180 4.86e-01 0.008 0.004 0.004 0.000 0.960 0.024
#> SRR1468271 6 0.7065 2.70e-01 0.240 0.000 0.072 0.000 0.336 0.352
#> SRR1332443 1 0.2491 7.08e-01 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR810295 2 0.1910 7.84e-01 0.000 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR662103 1 0.0914 7.63e-01 0.968 0.000 0.000 0.000 0.016 0.016
#> SRR1328620 3 0.5871 -1.34e-01 0.000 0.000 0.408 0.000 0.396 0.196
#> SRR1396294 4 0.4289 3.04e-01 0.000 0.444 0.000 0.540 0.004 0.012
#> SRR1419917 5 0.5498 1.40e-01 0.400 0.000 0.004 0.000 0.484 0.112
#> SRR662114 5 0.5702 -3.88e-02 0.000 0.000 0.292 0.000 0.512 0.196
#> SRR1489199 5 0.6544 -1.17e-01 0.112 0.000 0.076 0.000 0.420 0.392
#> SRR813584 2 0.3370 6.50e-01 0.000 0.772 0.000 0.212 0.004 0.012
#> SRR1069638 5 0.3354 4.01e-01 0.008 0.000 0.016 0.000 0.792 0.184
#> SRR614864 3 0.4753 3.99e-01 0.000 0.000 0.496 0.000 0.048 0.456
#> SRR1433392 6 0.6600 9.57e-02 0.256 0.000 0.028 0.000 0.332 0.384
#> SRR1377777 2 0.2062 7.81e-01 0.000 0.900 0.000 0.088 0.004 0.008
#> SRR2167710 5 0.6725 -1.22e-01 0.236 0.000 0.048 0.000 0.436 0.280
#> SRR1401252 4 0.4589 1.64e-01 0.000 0.460 0.000 0.504 0.000 0.036
#> SRR1309963 4 0.0632 7.56e-01 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1338031 1 0.1789 7.46e-01 0.924 0.000 0.000 0.000 0.032 0.044
#> SRR1418628 2 0.1970 7.90e-01 0.000 0.900 0.000 0.008 0.000 0.092
#> SRR1486889 6 0.7141 2.82e-01 0.196 0.000 0.096 0.000 0.348 0.360
#> SRR1380393 1 0.0291 7.66e-01 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1319731 1 0.0000 7.63e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 2 0.4602 -1.36e-01 0.000 0.488 0.000 0.480 0.004 0.028
#> SRR1337010 2 0.1958 7.87e-01 0.000 0.896 0.000 0.004 0.000 0.100
#> SRR1486520 1 0.2680 7.16e-01 0.868 0.000 0.000 0.000 0.076 0.056
#> SRR1486538 4 0.1320 7.51e-01 0.000 0.036 0.000 0.948 0.000 0.016
#> SRR1340486 4 0.0632 7.56e-01 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1377696 2 0.3278 7.22e-01 0.000 0.808 0.000 0.152 0.000 0.040
#> SRR1465459 6 0.5626 3.24e-01 0.008 0.000 0.244 0.000 0.176 0.572
#> SRR1080270 3 0.0000 7.69e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.5420 3.55e-01 0.000 0.000 0.572 0.000 0.172 0.256
#> SRR1093148 5 0.5969 3.32e-02 0.004 0.016 0.236 0.000 0.556 0.188
#> SRR1467080 3 0.0000 7.69e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.1364 7.87e-01 0.000 0.944 0.000 0.048 0.004 0.004
#> SRR816475 4 0.3850 4.91e-01 0.000 0.340 0.000 0.652 0.004 0.004
#> SRR1379198 4 0.0713 7.55e-01 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR613342 3 0.5751 1.46e-01 0.000 0.000 0.508 0.000 0.276 0.216
#> SRR1452246 2 0.1787 7.90e-01 0.000 0.920 0.000 0.068 0.004 0.008
#> SRR1338836 2 0.1364 7.87e-01 0.000 0.944 0.000 0.048 0.004 0.004
#> SRR1369129 4 0.0790 7.55e-01 0.000 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1396616 3 0.4110 5.72e-01 0.000 0.000 0.608 0.000 0.016 0.376
#> SRR813824 3 0.2783 7.34e-01 0.000 0.000 0.836 0.000 0.016 0.148
#> SRR1082376 5 0.6563 7.19e-03 0.240 0.000 0.028 0.000 0.396 0.336
#> SRR1500891 4 0.4445 3.63e-01 0.000 0.396 0.000 0.572 0.000 0.032
#> SRR807543 6 0.6695 3.18e-01 0.100 0.000 0.116 0.000 0.316 0.468
#> SRR1091572 5 0.3329 3.98e-01 0.004 0.000 0.020 0.000 0.792 0.184
#> SRR1346689 4 0.4561 2.68e-01 0.000 0.428 0.000 0.536 0.000 0.036
#> SRR1332424 5 0.0951 4.90e-01 0.020 0.000 0.004 0.000 0.968 0.008
#> SRR663729 2 0.4593 -3.23e-02 0.000 0.512 0.000 0.456 0.004 0.028
#> SRR1097013 1 0.5009 4.08e-01 0.624 0.000 0.000 0.000 0.256 0.120
#> SRR613675 5 0.0862 4.87e-01 0.008 0.000 0.004 0.000 0.972 0.016
#> SRR1485357 4 0.0632 7.56e-01 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR655816 3 0.0458 7.68e-01 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1500113 1 0.3211 6.99e-01 0.824 0.000 0.000 0.000 0.120 0.056
#> SRR1437622 2 0.3398 6.49e-01 0.000 0.768 0.000 0.216 0.004 0.012
#> SRR1355172 6 0.7325 3.35e-01 0.132 0.000 0.184 0.000 0.332 0.352
#> SRR655531 5 0.3936 4.34e-01 0.176 0.000 0.004 0.000 0.760 0.060
#> SRR1338147 3 0.4039 6.04e-01 0.000 0.000 0.632 0.000 0.016 0.352
#> SRR1413329 5 0.6118 -1.32e-01 0.012 0.000 0.244 0.000 0.488 0.256
#> SRR1485931 2 0.1523 7.92e-01 0.000 0.940 0.000 0.044 0.008 0.008
#> SRR1420873 1 0.1528 7.54e-01 0.936 0.000 0.000 0.000 0.048 0.016
#> SRR1333308 2 0.4596 -5.06e-02 0.000 0.508 0.000 0.460 0.004 0.028
#> SRR1452033 1 0.6903 -3.38e-01 0.336 0.000 0.048 0.000 0.292 0.324
#> SRR1467316 2 0.2398 7.69e-01 0.000 0.888 0.000 0.080 0.004 0.028
#> SRR809018 3 0.0260 7.67e-01 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1375351 2 0.1155 7.91e-01 0.000 0.956 0.000 0.036 0.004 0.004
#> SRR663440 6 0.5230 2.69e-02 0.000 0.000 0.344 0.000 0.108 0.548
#> SRR1471755 2 0.2113 7.72e-01 0.000 0.896 0.000 0.092 0.004 0.008
#> SRR808019 6 0.7302 3.23e-01 0.136 0.000 0.172 0.000 0.340 0.352
#> SRR1479133 3 0.3922 6.29e-01 0.000 0.000 0.664 0.000 0.016 0.320
#> SRR615069 5 0.3974 3.67e-01 0.004 0.000 0.056 0.000 0.752 0.188
#> SRR1456185 2 0.3927 7.60e-01 0.000 0.776 0.000 0.100 0.004 0.120
#> SRR1350069 4 0.4268 3.47e-01 0.000 0.428 0.000 0.556 0.004 0.012
#> SRR816316 5 0.6063 1.86e-01 0.308 0.000 0.012 0.000 0.484 0.196
#> SRR664795 6 0.7462 3.33e-01 0.212 0.000 0.144 0.000 0.308 0.336
#> SRR1490721 2 0.4675 2.71e-01 0.000 0.592 0.000 0.360 0.004 0.044
#> SRR810643 1 0.0405 7.66e-01 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1430333 5 0.3254 4.10e-01 0.008 0.000 0.016 0.000 0.804 0.172
#> SRR1085285 3 0.2404 7.48e-01 0.000 0.000 0.872 0.000 0.016 0.112
#> SRR1099072 3 0.5077 3.71e-01 0.000 0.000 0.516 0.000 0.080 0.404
#> SRR1317985 1 0.0260 7.66e-01 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1487340 1 0.0547 7.65e-01 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1420276 3 0.0692 7.63e-01 0.000 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1351347 3 0.4503 5.77e-01 0.000 0.000 0.700 0.000 0.108 0.192
#> SRR1405525 5 0.2760 4.77e-01 0.116 0.000 0.004 0.000 0.856 0.024
#> SRR1370329 1 0.0260 7.66e-01 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 7.63e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.1364 7.87e-01 0.000 0.944 0.000 0.048 0.004 0.004
#> SRR819610 2 0.3848 6.39e-01 0.000 0.752 0.000 0.204 0.004 0.040
#> SRR2157314 1 0.3370 6.57e-01 0.804 0.000 0.000 0.000 0.148 0.048
#> SRR1409465 2 0.0551 7.95e-01 0.000 0.984 0.000 0.008 0.004 0.004
#> SRR809987 4 0.4504 3.25e-01 0.000 0.432 0.000 0.540 0.004 0.024
#> SRR613639 3 0.5134 3.55e-01 0.000 0.000 0.524 0.000 0.088 0.388
#> SRR1402285 4 0.0717 7.56e-01 0.000 0.008 0.000 0.976 0.000 0.016
#> SRR1077038 5 0.6398 -4.63e-02 0.288 0.000 0.012 0.000 0.352 0.348
#> SRR1405660 3 0.0363 7.68e-01 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1095455 5 0.1890 4.83e-01 0.008 0.000 0.024 0.000 0.924 0.044
#> SRR1394734 2 0.2163 7.69e-01 0.000 0.892 0.000 0.096 0.004 0.008
#> SRR1317771 1 0.3787 6.36e-01 0.780 0.000 0.000 0.000 0.100 0.120
#> SRR1365894 2 0.4268 4.99e-01 0.000 0.684 0.000 0.272 0.004 0.040
#> SRR1073581 6 0.7262 3.12e-01 0.200 0.000 0.112 0.000 0.340 0.348
#> SRR659804 1 0.0291 7.65e-01 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1345914 2 0.2197 7.99e-01 0.000 0.900 0.000 0.044 0.000 0.056
#> SRR1432186 2 0.1364 7.87e-01 0.000 0.944 0.000 0.048 0.004 0.004
#> SRR1473529 2 0.3125 7.38e-01 0.000 0.828 0.000 0.136 0.004 0.032
#> SRR660764 3 0.4815 5.09e-01 0.000 0.000 0.668 0.000 0.144 0.188
#> SRR820448 5 0.6292 5.29e-02 0.372 0.000 0.012 0.000 0.384 0.232
#> SRR1328845 4 0.4274 3.36e-01 0.000 0.432 0.000 0.552 0.004 0.012
#> SRR1336415 4 0.0632 7.56e-01 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1379065 4 0.1341 7.55e-01 0.000 0.024 0.000 0.948 0.000 0.028
#> SRR1459190 3 0.5199 4.36e-01 0.000 0.000 0.580 0.000 0.120 0.300
#> SRR1346773 5 0.4468 -8.36e-02 0.484 0.000 0.004 0.000 0.492 0.020
#> SRR1499521 6 0.7117 2.77e-01 0.232 0.000 0.080 0.000 0.340 0.348
#> SRR1440898 2 0.0405 7.95e-01 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1347459 3 0.5836 5.96e-02 0.000 0.000 0.472 0.000 0.320 0.208
#> SRR1081209 2 0.2209 7.99e-01 0.000 0.904 0.000 0.040 0.004 0.052
#> SRR1400202 1 0.0458 7.65e-01 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1333395 2 0.4961 3.44e-01 0.000 0.604 0.000 0.332 0.024 0.040
#> SRR1309248 2 0.3381 6.98e-01 0.000 0.808 0.000 0.148 0.004 0.040
#> SRR809161 3 0.4639 4.21e-01 0.000 0.000 0.512 0.000 0.040 0.448
#> SRR1316320 2 0.2750 7.63e-01 0.000 0.868 0.000 0.080 0.004 0.048
#> SRR1432629 2 0.1364 7.87e-01 0.000 0.944 0.000 0.048 0.004 0.004
#> SRR1498931 1 0.0405 7.66e-01 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1416578 4 0.0909 7.56e-01 0.000 0.012 0.000 0.968 0.000 0.020
#> SRR1405547 3 0.0260 7.67e-01 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1470534 4 0.0632 7.56e-01 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1380764 1 0.3488 6.47e-01 0.780 0.000 0.000 0.000 0.184 0.036
#> SRR1309160 3 0.2121 7.53e-01 0.000 0.000 0.892 0.000 0.012 0.096
#> SRR663489 3 0.0146 7.68e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1500450 5 0.6951 -2.02e-01 0.304 0.000 0.052 0.000 0.328 0.316
#> SRR1078489 5 0.3236 3.96e-01 0.000 0.000 0.024 0.000 0.796 0.180
#> SRR1332648 4 0.0632 7.56e-01 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR660614 5 0.4223 3.46e-01 0.004 0.000 0.072 0.000 0.732 0.192
#> SRR1470420 2 0.1910 7.84e-01 0.000 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1475566 1 0.0458 7.65e-01 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1477949 1 0.0632 7.65e-01 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1481419 2 0.1003 7.93e-01 0.000 0.964 0.000 0.028 0.004 0.004
#> SRR1464766 1 0.6728 -2.67e-01 0.364 0.000 0.036 0.000 0.336 0.264
#> SRR615946 3 0.2669 7.39e-01 0.000 0.000 0.836 0.000 0.008 0.156
#> SRR1446481 2 0.1477 7.88e-01 0.000 0.940 0.000 0.048 0.004 0.008
#> SRR1467656 2 0.1387 7.94e-01 0.000 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1402962 5 0.6186 1.68e-01 0.212 0.000 0.024 0.000 0.512 0.252
#> SRR660224 2 0.2480 7.91e-01 0.000 0.872 0.000 0.024 0.000 0.104
#> SRR665586 5 0.5377 2.54e-01 0.336 0.000 0.004 0.000 0.548 0.112
#> SRR1347166 5 0.1237 4.97e-01 0.020 0.000 0.004 0.000 0.956 0.020
#> SRR1485722 5 0.5542 2.13e-01 0.056 0.000 0.068 0.000 0.616 0.260
#> SRR1415316 5 0.5052 7.48e-02 0.420 0.000 0.004 0.000 0.512 0.064
#> SRR613390 5 0.5710 2.24e-01 0.340 0.000 0.012 0.000 0.520 0.128
#> SRR661108 3 0.0146 7.69e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2170173 5 0.5058 2.33e-01 0.012 0.000 0.104 0.000 0.652 0.232
#> SRR817329 5 0.5498 2.00e-01 0.376 0.000 0.004 0.000 0.504 0.116
#> SRR1401990 4 0.2051 7.32e-01 0.000 0.096 0.000 0.896 0.004 0.004
#> SRR1467745 2 0.3426 6.68e-01 0.000 0.764 0.000 0.220 0.004 0.012
#> SRR1471795 2 0.1364 7.87e-01 0.000 0.944 0.000 0.048 0.004 0.004
#> SRR1415637 2 0.1219 7.93e-01 0.000 0.948 0.000 0.004 0.000 0.048
#> SRR813137 5 0.7255 -1.51e-01 0.296 0.000 0.092 0.000 0.344 0.268
#> SRR1314873 1 0.2823 6.66e-01 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204 0.000
#> SRR1401211 1 0.7002 -2.97e-01 0.356 0.000 0.060 0.000 0.276 0.308
#> SRR1419692 4 0.0632 7.56e-01 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR818797 6 0.5434 3.47e-02 0.004 0.000 0.360 0.000 0.112 0.524
#> SRR2164608 3 0.5934 -1.25e-01 0.000 0.000 0.444 0.000 0.328 0.228
#> SRR1455586 2 0.2538 7.84e-01 0.000 0.860 0.000 0.016 0.000 0.124
#> SRR819459 3 0.0146 7.69e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1488939 2 0.2474 7.70e-01 0.000 0.884 0.000 0.080 0.004 0.032
#> SRR1433232 2 0.1364 7.87e-01 0.000 0.944 0.000 0.048 0.004 0.004
#> SRR1385501 5 0.6093 2.49e-01 0.144 0.000 0.044 0.000 0.556 0.256
#> SRR1361652 5 0.0665 4.89e-01 0.008 0.000 0.004 0.000 0.980 0.008
#> SRR1437119 1 0.0146 7.65e-01 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1478547 3 0.0260 7.69e-01 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1430910 5 0.3481 3.84e-01 0.000 0.000 0.032 0.000 0.776 0.192
#> SRR1310584 1 0.0146 7.65e-01 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1500216 5 0.0837 4.93e-01 0.020 0.000 0.004 0.000 0.972 0.004
#> SRR1486762 3 0.2234 7.23e-01 0.000 0.000 0.872 0.000 0.004 0.124
#> SRR1480854 4 0.4531 1.57e-01 0.000 0.464 0.000 0.504 0.000 0.032
#> SRR1489394 4 0.0713 7.55e-01 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1418085 4 0.0632 7.56e-01 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1340221 4 0.2346 7.14e-01 0.000 0.124 0.000 0.868 0.000 0.008
#> SRR1473058 2 0.4217 5.13e-02 0.000 0.524 0.000 0.464 0.004 0.008
#> SRR1405165 3 0.3395 6.77e-01 0.000 0.000 0.808 0.000 0.060 0.132
#> SRR1433004 5 0.5289 3.01e-01 0.280 0.000 0.004 0.000 0.592 0.124
#> SRR1471477 6 0.7183 2.94e-01 0.200 0.000 0.100 0.000 0.348 0.352
#> SRR1098567 2 0.2212 7.86e-01 0.000 0.880 0.000 0.008 0.000 0.112
#> SRR1098712 2 0.4370 5.07e-02 0.000 0.536 0.000 0.444 0.004 0.016
#> SRR1455038 5 0.4059 4.36e-01 0.148 0.000 0.004 0.000 0.760 0.088
#> SRR1375248 2 0.2538 7.84e-01 0.000 0.860 0.000 0.016 0.000 0.124
#> SRR1403005 6 0.5146 -1.31e-01 0.000 0.000 0.396 0.000 0.088 0.516
#> SRR1348378 2 0.2066 8.01e-01 0.000 0.908 0.000 0.040 0.000 0.052
#> SRR1413541 5 0.5163 3.07e-01 0.276 0.000 0.004 0.000 0.608 0.112
#> SRR1392943 2 0.4640 4.66e-02 0.000 0.528 0.000 0.436 0.004 0.032
#> SRR1475192 3 0.0000 7.69e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.2706 7.85e-01 0.000 0.852 0.000 0.024 0.000 0.124
#> SRR1452468 5 0.0951 4.91e-01 0.008 0.000 0.004 0.000 0.968 0.020
#> SRR1347060 3 0.0146 7.69e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1414139 2 0.2748 7.84e-01 0.000 0.848 0.000 0.024 0.000 0.128
#> SRR1447962 2 0.2003 7.82e-01 0.000 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1444324 2 0.2266 7.88e-01 0.000 0.880 0.000 0.012 0.000 0.108
#> SRR1415004 1 0.0000 7.63e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.5379 1.51e-01 0.508 0.000 0.004 0.000 0.388 0.100
#> SRR1311266 5 0.4713 3.94e-01 0.124 0.000 0.004 0.000 0.692 0.180
#> SRR1343302 4 0.0632 7.56e-01 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1373746 1 0.0909 7.65e-01 0.968 0.000 0.000 0.000 0.020 0.012
#> SRR1429678 1 0.0000 7.63e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.2003 7.82e-01 0.000 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1405331 6 0.6083 2.58e-01 0.016 0.000 0.160 0.000 0.408 0.416
#> SRR1345609 1 0.3468 5.86e-01 0.712 0.000 0.000 0.000 0.284 0.004
#> SRR1380208 2 0.3497 7.54e-01 0.000 0.832 0.000 0.080 0.032 0.056
#> SRR1322840 4 0.0713 7.55e-01 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1399797 3 0.2234 7.31e-01 0.000 0.000 0.872 0.000 0.004 0.124
#> SRR1416654 3 0.3200 7.13e-01 0.000 0.000 0.788 0.000 0.016 0.196
#> SRR1315081 3 0.0363 7.67e-01 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1369196 3 0.0000 7.69e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0146 7.65e-01 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1365291 6 0.5408 1.74e-01 0.000 0.000 0.304 0.000 0.144 0.552
#> SRR1367920 2 0.4574 8.11e-02 0.000 0.524 0.000 0.440 0.000 0.036
#> SRR1366648 3 0.0146 7.68e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1441679 2 0.2480 7.90e-01 0.000 0.872 0.000 0.024 0.000 0.104
#> SRR1082173 5 0.5922 -1.91e-01 0.000 0.000 0.340 0.000 0.440 0.220
#> SRR1363968 1 0.6860 -3.36e-01 0.340 0.000 0.044 0.000 0.296 0.320
#> SRR814387 1 0.0000 7.63e-01 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657599 5 0.7224 -2.58e-01 0.132 0.000 0.172 0.000 0.408 0.288
#> SRR1386689 4 0.0632 7.56e-01 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1395575 3 0.2046 7.58e-01 0.000 0.000 0.908 0.000 0.032 0.060
#> SRR1453811 6 0.5186 1.47e-02 0.000 0.000 0.356 0.000 0.100 0.544
#> SRR1441159 5 0.4283 3.79e-01 0.252 0.000 0.004 0.000 0.696 0.048
#> SRR1403154 4 0.0713 7.55e-01 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1468722 3 0.0603 7.70e-01 0.000 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1310275 5 0.5860 -1.28e-01 0.000 0.000 0.268 0.000 0.484 0.248
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.370 0.718 0.860 0.4912 0.501 0.501
#> 3 3 0.930 0.923 0.968 0.3497 0.678 0.445
#> 4 4 0.851 0.859 0.928 0.0960 0.856 0.619
#> 5 5 0.733 0.721 0.845 0.0896 0.889 0.628
#> 6 6 0.782 0.721 0.864 0.0452 0.874 0.504
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 2 0.9795 0.0625 0.416 0.584
#> SRR1331708 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1464258 1 0.9552 0.5790 0.624 0.376
#> SRR1454201 1 0.9977 0.3490 0.528 0.472
#> SRR661589 2 0.0938 0.8356 0.012 0.988
#> SRR1456229 1 0.7453 0.7969 0.788 0.212
#> SRR1315165 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1488960 1 0.7219 0.8044 0.800 0.200
#> SRR1417809 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1094457 1 0.0376 0.7988 0.996 0.004
#> SRR1095575 2 0.9998 -0.2388 0.492 0.508
#> SRR1315931 1 0.7528 0.7937 0.784 0.216
#> SRR1430066 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1431037 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1395554 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR818002 1 0.9635 0.1236 0.612 0.388
#> SRR1344143 1 0.2778 0.7707 0.952 0.048
#> SRR1486845 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1362866 1 0.7376 0.7999 0.792 0.208
#> SRR1490740 1 0.7219 0.8044 0.800 0.200
#> SRR1446627 2 0.7299 0.7188 0.204 0.796
#> SRR1456138 1 0.9954 -0.1231 0.540 0.460
#> SRR1416248 1 0.6623 0.8126 0.828 0.172
#> SRR1383907 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1311018 1 0.6623 0.8126 0.828 0.172
#> SRR1375699 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1429846 2 0.6973 0.6474 0.188 0.812
#> SRR613550 2 0.1843 0.8262 0.028 0.972
#> SRR1348402 1 0.7376 0.7999 0.792 0.208
#> SRR1345146 1 0.7376 0.8000 0.792 0.208
#> SRR1324025 2 0.0672 0.8375 0.008 0.992
#> SRR1318879 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR820755 2 0.9710 0.1240 0.400 0.600
#> SRR1485830 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR599313 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR612263 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1415398 2 0.0938 0.8356 0.012 0.988
#> SRR1326205 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1421327 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1083311 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1499303 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1079522 1 0.1633 0.8050 0.976 0.024
#> SRR1452935 2 0.1633 0.8290 0.024 0.976
#> SRR1379495 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1470459 2 0.4298 0.7953 0.088 0.912
#> SRR661361 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR615778 1 0.8861 0.6953 0.696 0.304
#> SRR1447564 1 0.5842 0.8148 0.860 0.140
#> SRR1455195 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR655182 1 0.6801 0.8109 0.820 0.180
#> SRR1335140 1 0.7602 0.5413 0.780 0.220
#> SRR1433555 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1308650 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1388354 1 0.6343 0.8139 0.840 0.160
#> SRR1317446 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1413602 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1479955 1 0.9881 -0.0423 0.564 0.436
#> SRR809853 1 0.4562 0.8130 0.904 0.096
#> SRR661313 2 0.0938 0.8356 0.012 0.988
#> SRR1499935 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1447303 2 0.0938 0.8356 0.012 0.988
#> SRR1429408 1 0.4161 0.7381 0.916 0.084
#> SRR1433950 1 0.6623 0.8126 0.828 0.172
#> SRR1362081 2 0.5842 0.7629 0.140 0.860
#> SRR1409854 2 0.9754 0.0939 0.408 0.592
#> SRR1435229 1 0.7376 0.7999 0.792 0.208
#> SRR1085996 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1414229 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1400974 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1399971 1 0.7056 0.8074 0.808 0.192
#> SRR613927 2 0.9044 0.3719 0.320 0.680
#> SRR1457854 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1473714 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR813776 2 0.9608 0.1799 0.384 0.616
#> SRR808196 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1101085 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR614395 1 0.9635 0.5562 0.612 0.388
#> SRR1478251 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.6973 0.7303 0.188 0.812
#> SRR1362310 1 0.7056 0.8074 0.808 0.192
#> SRR665310 2 0.1184 0.8337 0.016 0.984
#> SRR1420109 2 0.9286 0.3051 0.344 0.656
#> SRR1330920 1 0.9608 0.5640 0.616 0.384
#> SRR1419539 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1359447 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1347259 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR613915 2 0.6973 0.6473 0.188 0.812
#> SRR1384395 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR821715 2 0.1633 0.8290 0.024 0.976
#> SRR1478228 1 0.7056 0.8074 0.808 0.192
#> SRR1445637 1 0.8207 0.7550 0.744 0.256
#> SRR608150 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1096383 1 0.9850 0.4668 0.572 0.428
#> SRR1341480 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1341344 1 0.6623 0.8126 0.828 0.172
#> SRR1326270 2 0.8144 0.5314 0.252 0.748
#> SRR1498838 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1416313 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR808566 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1430270 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1367825 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR613533 2 0.0672 0.8375 0.008 0.992
#> SRR661267 2 0.9686 0.1383 0.396 0.604
#> SRR810665 2 0.7299 0.7188 0.204 0.796
#> SRR1407250 2 0.9710 0.1240 0.400 0.600
#> SRR1420067 1 0.7376 0.7999 0.792 0.208
#> SRR1473632 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR812536 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1370850 2 0.9552 0.5134 0.376 0.624
#> SRR1486195 2 0.3274 0.8111 0.060 0.940
#> SRR1407671 1 0.7528 0.5488 0.784 0.216
#> SRR1446375 2 0.9635 0.1669 0.388 0.612
#> SRR1465230 1 0.0672 0.7976 0.992 0.008
#> SRR614119 1 0.9909 0.4264 0.556 0.444
#> SRR1356101 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1404209 1 0.9087 0.6657 0.676 0.324
#> SRR1392676 2 0.7299 0.7188 0.204 0.796
#> SRR665538 1 0.8909 0.6894 0.692 0.308
#> SRR660510 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1445655 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR658953 1 0.7453 0.7969 0.788 0.212
#> SRR2166459 1 0.7674 0.7868 0.776 0.224
#> SRR1070713 2 0.7299 0.7188 0.204 0.796
#> SRR1485312 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1317631 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1488610 1 0.3114 0.8093 0.944 0.056
#> SRR1330588 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1316367 1 0.6623 0.8126 0.828 0.172
#> SRR1433926 1 0.7219 0.8044 0.800 0.200
#> SRR1091302 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR818263 1 0.9686 0.5396 0.604 0.396
#> SRR1404909 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR663076 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1323577 2 0.8499 0.6541 0.276 0.724
#> SRR1442422 1 0.0672 0.7976 0.992 0.008
#> SRR1465893 1 0.6531 0.8131 0.832 0.168
#> SRR654862 1 0.9795 0.4952 0.584 0.416
#> SRR1407112 1 0.0672 0.7976 0.992 0.008
#> SRR1332969 2 0.1414 0.8314 0.020 0.980
#> SRR1353199 2 0.0938 0.8356 0.012 0.988
#> SRR1378885 2 0.7815 0.5710 0.232 0.768
#> SRR665357 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR662186 2 0.7299 0.7188 0.204 0.796
#> SRR1501020 2 0.6148 0.6990 0.152 0.848
#> SRR1347819 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1480813 2 0.7453 0.7129 0.212 0.788
#> SRR1472576 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1431781 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1452270 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1500472 2 0.1184 0.8343 0.016 0.984
#> SRR1417632 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1350153 2 0.7299 0.7188 0.204 0.796
#> SRR1458113 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1326579 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1349363 1 0.5946 0.6641 0.856 0.144
#> SRR1096712 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1090407 2 0.0938 0.8356 0.012 0.988
#> SRR1083752 1 0.9686 0.0975 0.604 0.396
#> SRR1377599 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1488449 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1318354 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1359062 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1398924 1 0.5059 0.8140 0.888 0.112
#> SRR663783 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1319204 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1369070 2 0.8763 0.6306 0.296 0.704
#> SRR615659 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1337449 2 0.7219 0.7219 0.200 0.800
#> SRR1316982 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1498595 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1377423 2 0.0938 0.8356 0.012 0.988
#> SRR1312310 2 0.7299 0.7188 0.204 0.796
#> SRR1485613 1 0.8267 0.7506 0.740 0.260
#> SRR1338426 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1353309 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR658941 2 0.0938 0.8362 0.012 0.988
#> SRR1101643 1 0.2043 0.8062 0.968 0.032
#> SRR1401468 1 0.9635 0.5562 0.612 0.388
#> SRR1368874 2 0.6148 0.7548 0.152 0.848
#> SRR1324085 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1363858 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR819820 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1337342 1 0.9635 0.5562 0.612 0.388
#> SRR655206 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1387013 1 0.9954 -0.1231 0.540 0.460
#> SRR1317410 1 0.7056 0.8074 0.808 0.192
#> SRR608198 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1440161 2 0.3431 0.8090 0.064 0.936
#> SRR1343741 2 0.9286 0.5653 0.344 0.656
#> SRR1381288 2 0.7815 0.6973 0.232 0.768
#> SRR1415379 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.6973 0.7302 0.188 0.812
#> SRR663197 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1394836 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR661699 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR813680 2 0.9775 0.0783 0.412 0.588
#> SRR1410678 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1378109 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1499174 1 0.7528 0.7937 0.784 0.216
#> SRR1311486 2 0.7299 0.7188 0.204 0.796
#> SRR1382851 1 0.9087 0.3099 0.676 0.324
#> SRR1433410 1 0.7139 0.8059 0.804 0.196
#> SRR661167 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1432518 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR660462 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1374608 1 0.6438 0.7640 0.836 0.164
#> SRR657949 2 0.9710 0.1240 0.400 0.600
#> SRR1308882 1 0.0376 0.7988 0.996 0.004
#> SRR655768 1 0.7745 0.7835 0.772 0.228
#> SRR1485870 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1444138 2 0.9988 -0.1964 0.480 0.520
#> SRR1417342 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1470193 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1091380 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1099096 1 0.6973 0.8087 0.812 0.188
#> SRR1313583 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1467102 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1485416 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR818821 2 0.0672 0.8375 0.008 0.992
#> SRR809963 1 0.9635 0.5562 0.612 0.388
#> SRR1072247 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1353710 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1445259 2 0.7883 0.5645 0.236 0.764
#> SRR1408393 2 0.9815 0.0462 0.420 0.580
#> SRR1361522 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1368597 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1309680 1 0.9996 -0.2101 0.512 0.488
#> SRR1310542 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1333485 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1406437 2 0.2603 0.8164 0.044 0.956
#> SRR1354931 2 0.0938 0.8356 0.012 0.988
#> SRR1391856 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1446738 2 0.7528 0.7101 0.216 0.784
#> SRR1309032 2 0.6712 0.7384 0.176 0.824
#> SRR1388145 2 0.7528 0.7100 0.216 0.784
#> SRR1432611 2 0.7219 0.7219 0.200 0.800
#> SRR815869 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR613150 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1375329 2 0.3879 0.7856 0.076 0.924
#> SRR1387921 1 0.6148 0.8145 0.848 0.152
#> SRR1466792 2 0.5408 0.7732 0.124 0.876
#> SRR1360478 2 0.7299 0.7188 0.204 0.796
#> SRR1360695 1 0.7376 0.7999 0.792 0.208
#> SRR812943 1 0.3879 0.8114 0.924 0.076
#> SRR1400910 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1444203 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR816177 2 0.9922 0.3719 0.448 0.552
#> SRR658754 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1429603 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1397366 2 0.0938 0.8356 0.012 0.988
#> SRR1446028 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1083918 2 0.9427 0.5403 0.360 0.640
#> SRR1337606 1 0.6887 0.8102 0.816 0.184
#> SRR659109 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1337192 1 0.6148 0.8146 0.848 0.152
#> SRR656946 1 0.7376 0.7999 0.792 0.208
#> SRR1476102 1 0.5946 0.8148 0.856 0.144
#> SRR1476447 1 0.6887 0.8099 0.816 0.184
#> SRR1342067 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1385389 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR614419 1 0.6623 0.8126 0.828 0.172
#> SRR1322936 1 0.6623 0.8129 0.828 0.172
#> SRR1349121 1 0.8207 0.7550 0.744 0.256
#> SRR1430549 1 0.6623 0.8126 0.828 0.172
#> SRR612935 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR661481 2 0.9286 0.5653 0.344 0.656
#> SRR1354117 2 0.5629 0.7682 0.132 0.868
#> SRR1393596 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1452164 1 0.7745 0.7833 0.772 0.228
#> SRR1070503 2 0.5408 0.7341 0.124 0.876
#> SRR1499894 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1082883 1 0.6438 0.8142 0.836 0.164
#> SRR1468271 1 0.9635 0.5562 0.612 0.388
#> SRR1332443 1 0.3879 0.8114 0.924 0.076
#> SRR810295 2 0.6801 0.7357 0.180 0.820
#> SRR662103 1 0.7219 0.8044 0.800 0.200
#> SRR1328620 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1396294 1 0.5737 0.7302 0.864 0.136
#> SRR1419917 1 0.6801 0.8109 0.820 0.180
#> SRR662114 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1489199 2 0.9833 0.0295 0.424 0.576
#> SRR813584 2 0.9866 0.4069 0.432 0.568
#> SRR1069638 2 0.1184 0.8338 0.016 0.984
#> SRR614864 2 0.0938 0.8356 0.012 0.988
#> SRR1433392 1 0.9970 0.3606 0.532 0.468
#> SRR1377777 1 0.9850 -0.0140 0.572 0.428
#> SRR2167710 1 0.8144 0.7593 0.748 0.252
#> SRR1401252 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1309963 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.6973 0.8086 0.812 0.188
#> SRR1418628 2 0.7299 0.7188 0.204 0.796
#> SRR1486889 1 0.9635 0.5562 0.612 0.388
#> SRR1380393 1 0.6712 0.8118 0.824 0.176
#> SRR1319731 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1356468 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.6531 0.7439 0.168 0.832
#> SRR1486520 1 0.7528 0.7937 0.784 0.216
#> SRR1486538 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1340486 1 0.0376 0.7988 0.996 0.004
#> SRR1377696 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1465459 2 0.7219 0.6280 0.200 0.800
#> SRR1080270 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1312501 2 0.0938 0.8356 0.012 0.988
#> SRR1093148 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1467080 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1410866 2 0.7883 0.6938 0.236 0.764
#> SRR816475 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1379198 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR613342 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1452246 2 0.9998 0.2611 0.492 0.508
#> SRR1338836 2 0.9491 0.5270 0.368 0.632
#> SRR1369129 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1396616 2 0.0938 0.8356 0.012 0.988
#> SRR813824 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1082376 1 0.9635 0.5562 0.612 0.388
#> SRR1500891 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR807543 2 0.9732 0.1091 0.404 0.596
#> SRR1091572 1 0.9580 0.5716 0.620 0.380
#> SRR1346689 1 0.0672 0.7976 0.992 0.008
#> SRR1332424 1 0.6148 0.8146 0.848 0.152
#> SRR663729 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.7453 0.7969 0.788 0.212
#> SRR613675 1 0.6623 0.8129 0.828 0.172
#> SRR1485357 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR655816 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1500113 1 0.7139 0.8059 0.804 0.196
#> SRR1437622 1 0.7745 0.5269 0.772 0.228
#> SRR1355172 2 0.9815 0.0461 0.420 0.580
#> SRR655531 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1338147 2 0.0672 0.8375 0.008 0.992
#> SRR1413329 2 0.8763 0.4329 0.296 0.704
#> SRR1485931 2 0.9970 0.3238 0.468 0.532
#> SRR1420873 1 0.7376 0.7999 0.792 0.208
#> SRR1333308 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.8909 0.6895 0.692 0.308
#> SRR1467316 1 0.9944 -0.1100 0.544 0.456
#> SRR809018 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1375351 2 0.7745 0.7006 0.228 0.772
#> SRR663440 2 0.2236 0.8202 0.036 0.964
#> SRR1471755 1 0.9993 -0.1984 0.516 0.484
#> SRR808019 2 0.9775 0.0783 0.412 0.588
#> SRR1479133 2 0.0672 0.8375 0.008 0.992
#> SRR615069 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1456185 2 0.7299 0.7188 0.204 0.796
#> SRR1350069 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR816316 1 0.7950 0.7717 0.760 0.240
#> SRR664795 2 0.9933 -0.0895 0.452 0.548
#> SRR1490721 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR810643 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1430333 2 0.6438 0.6817 0.164 0.836
#> SRR1085285 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1099072 2 0.1633 0.8290 0.024 0.976
#> SRR1317985 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1487340 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1420276 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1351347 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1405525 1 0.5519 0.8147 0.872 0.128
#> SRR1370329 1 0.5629 0.8147 0.868 0.132
#> SRR1465001 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1476525 2 0.8955 0.6102 0.312 0.688
#> SRR819610 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR2157314 1 0.7219 0.8044 0.800 0.200
#> SRR1409465 2 0.7528 0.7100 0.216 0.784
#> SRR809987 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR613639 2 0.7299 0.6213 0.204 0.796
#> SRR1402285 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.9635 0.5562 0.612 0.388
#> SRR1405660 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1095455 2 0.7139 0.6414 0.196 0.804
#> SRR1394734 2 0.9608 0.4993 0.384 0.616
#> SRR1317771 1 0.7528 0.7937 0.784 0.216
#> SRR1365894 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1073581 1 0.9954 0.3834 0.540 0.460
#> SRR659804 1 0.7219 0.8044 0.800 0.200
#> SRR1345914 2 0.7528 0.7102 0.216 0.784
#> SRR1432186 2 0.9248 0.5713 0.340 0.660
#> SRR1473529 1 0.5842 0.6695 0.860 0.140
#> SRR660764 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR820448 1 0.8016 0.7676 0.756 0.244
#> SRR1328845 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1336415 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1379065 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1459190 2 0.6531 0.6771 0.168 0.832
#> SRR1346773 1 0.6623 0.8126 0.828 0.172
#> SRR1499521 1 0.9635 0.5562 0.612 0.388
#> SRR1440898 2 0.7815 0.6973 0.232 0.768
#> SRR1347459 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1081209 2 0.7815 0.6975 0.232 0.768
#> SRR1400202 1 0.6623 0.8126 0.828 0.172
#> SRR1333395 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1309248 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR809161 2 0.0938 0.8356 0.012 0.988
#> SRR1316320 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1432629 2 0.9754 0.4552 0.408 0.592
#> SRR1498931 1 0.7219 0.8044 0.800 0.200
#> SRR1416578 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1405547 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1470534 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1309160 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR663489 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1500450 1 0.7219 0.8044 0.800 0.200
#> SRR1078489 2 0.7219 0.6282 0.200 0.800
#> SRR1332648 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR660614 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1470420 2 0.6623 0.7411 0.172 0.828
#> SRR1475566 1 0.6343 0.8139 0.840 0.160
#> SRR1477949 1 0.7139 0.8059 0.804 0.196
#> SRR1481419 2 0.8016 0.6867 0.244 0.756
#> SRR1464766 1 0.9460 0.6005 0.636 0.364
#> SRR615946 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1446481 2 0.8555 0.6497 0.280 0.720
#> SRR1467656 2 0.7299 0.7188 0.204 0.796
#> SRR1402962 1 0.9635 0.5562 0.612 0.388
#> SRR660224 2 0.7299 0.7188 0.204 0.796
#> SRR665586 1 0.6801 0.8109 0.820 0.180
#> SRR1347166 1 0.8955 0.6839 0.688 0.312
#> SRR1485722 2 0.9710 0.1240 0.400 0.600
#> SRR1415316 1 0.6623 0.8126 0.828 0.172
#> SRR613390 1 0.7376 0.7999 0.792 0.208
#> SRR661108 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR2170173 2 0.9833 0.0294 0.424 0.576
#> SRR817329 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1401990 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1467745 2 0.9963 0.3347 0.464 0.536
#> SRR1471795 2 0.9393 0.5467 0.356 0.644
#> SRR1415637 2 0.7299 0.7188 0.204 0.796
#> SRR813137 1 0.9635 0.5562 0.612 0.388
#> SRR1314873 1 0.6531 0.8132 0.832 0.168
#> SRR1401211 1 0.7453 0.7969 0.788 0.212
#> SRR1419692 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR818797 2 0.6973 0.6474 0.188 0.812
#> SRR2164608 2 0.1633 0.8290 0.024 0.976
#> SRR1455586 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR819459 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1488939 1 0.9754 0.0571 0.592 0.408
#> SRR1433232 2 0.9850 0.4152 0.428 0.572
#> SRR1385501 1 0.9977 0.3488 0.528 0.472
#> SRR1361652 1 0.3114 0.8094 0.944 0.056
#> SRR1437119 1 0.6343 0.8142 0.840 0.160
#> SRR1478547 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1430910 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1310584 1 0.6801 0.8109 0.820 0.180
#> SRR1500216 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1486762 2 0.0938 0.8356 0.012 0.988
#> SRR1480854 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1489394 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1418085 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1340221 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1473058 1 0.9522 0.1738 0.628 0.372
#> SRR1405165 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1433004 1 0.7376 0.7999 0.792 0.208
#> SRR1471477 1 0.9580 0.5716 0.620 0.380
#> SRR1098567 2 0.6623 0.7411 0.172 0.828
#> SRR1098712 1 0.1843 0.7910 0.972 0.028
#> SRR1455038 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1375248 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1403005 2 0.1184 0.8337 0.016 0.984
#> SRR1348378 2 0.7299 0.7188 0.204 0.796
#> SRR1413541 1 0.6887 0.8099 0.816 0.184
#> SRR1392943 1 0.0000 0.8002 1.000 0.000
#> SRR1475192 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1432085 2 0.3584 0.8069 0.068 0.932
#> SRR1452468 1 0.8267 0.7508 0.740 0.260
#> SRR1347060 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1414139 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1447962 2 0.6343 0.7494 0.160 0.840
#> SRR1444324 2 0.0376 0.8384 0.004 0.996
#> SRR1415004 1 0.6623 0.8126 0.828 0.172
#> SRR1413436 1 0.7376 0.7999 0.792 0.208
#> SRR1311266 1 0.7528 0.7937 0.784 0.216
#> SRR1343302 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1373746 1 0.6623 0.8126 0.828 0.172
#> SRR1429678 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1469413 2 0.6531 0.7439 0.168 0.832
#> SRR1405331 2 0.7219 0.6282 0.200 0.800
#> SRR1345609 1 0.0376 0.8013 0.996 0.004
#> SRR1380208 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1322840 1 0.0376 0.7988 0.996 0.004
#> SRR1399797 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1416654 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1315081 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1369196 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1400847 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR1365291 2 0.1414 0.8314 0.020 0.980
#> SRR1367920 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1366648 2 0.0000 0.8397 0.000 1.000
#> SRR1441679 2 0.6712 0.7384 0.176 0.824
#> SRR1082173 2 0.1184 0.8338 0.016 0.984
#> SRR1363968 1 0.7602 0.7903 0.780 0.220
#> SRR814387 1 0.7299 0.8025 0.796 0.204
#> SRR657599 2 0.9833 0.0294 0.424 0.576
#> SRR1386689 1 0.0376 0.7988 0.996 0.004
#> SRR1395575 2 0.0672 0.8375 0.008 0.992
#> SRR1453811 2 0.5629 0.7245 0.132 0.868
#> SRR1441159 1 0.6148 0.8145 0.848 0.152
#> SRR1403154 1 0.0938 0.7963 0.988 0.012
#> SRR1468722 2 0.0376 0.8392 0.004 0.996
#> SRR1310275 2 0.0938 0.8356 0.012 0.988
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 1 0.0747 0.95576 0.984 0.000 0.016
#> SRR1331708 1 0.3941 0.79865 0.844 0.156 0.000
#> SRR1464258 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR661589 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315165 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.6126 0.29560 0.600 0.400 0.000
#> SRR1094457 2 0.0424 0.94934 0.008 0.992 0.000
#> SRR1095575 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315931 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486845 2 0.0237 0.95191 0.004 0.996 0.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.0592 0.96436 0.012 0.000 0.988
#> SRR613550 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324025 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318879 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR820755 1 0.2261 0.90931 0.932 0.000 0.068
#> SRR1485830 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR599313 1 0.1031 0.94809 0.976 0.024 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326205 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421327 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499303 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079522 1 0.1529 0.93342 0.960 0.040 0.000
#> SRR1452935 3 0.2261 0.91180 0.068 0.000 0.932
#> SRR1379495 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR615778 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308650 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499935 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429408 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433950 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 3 0.2448 0.90674 0.000 0.076 0.924
#> SRR1409854 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435229 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 3 0.0424 0.96782 0.008 0.000 0.992
#> SRR1400974 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR613927 1 0.3412 0.84910 0.876 0.000 0.124
#> SRR1457854 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR813776 1 0.2711 0.89003 0.912 0.000 0.088
#> SRR808196 1 0.1964 0.91696 0.944 0.056 0.000
#> SRR1101085 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR614395 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478251 2 0.4654 0.74917 0.208 0.792 0.000
#> SRR1370551 3 0.6260 0.20050 0.000 0.448 0.552
#> SRR1362310 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420109 1 0.2066 0.91533 0.940 0.000 0.060
#> SRR1330920 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419539 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1359447 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347259 2 0.0237 0.95191 0.004 0.996 0.000
#> SRR613915 3 0.0747 0.96086 0.016 0.000 0.984
#> SRR1384395 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR821715 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341480 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.3038 0.87229 0.104 0.000 0.896
#> SRR1498838 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR808566 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430270 1 0.5291 0.61094 0.732 0.268 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR661267 1 0.5785 0.51239 0.668 0.000 0.332
#> SRR810665 2 0.0424 0.94836 0.000 0.992 0.008
#> SRR1407250 1 0.0424 0.96233 0.992 0.000 0.008
#> SRR1420067 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486195 3 0.0237 0.97114 0.000 0.004 0.996
#> SRR1407671 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446375 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465230 2 0.0237 0.95191 0.004 0.996 0.000
#> SRR614119 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356101 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445655 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR658953 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317631 2 0.5098 0.68972 0.248 0.752 0.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316367 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 2 0.0424 0.94934 0.008 0.992 0.000
#> SRR818263 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404909 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442422 2 0.2537 0.89316 0.080 0.920 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407112 2 0.4121 0.80078 0.168 0.832 0.000
#> SRR1332969 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353199 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1378885 3 0.3619 0.83331 0.136 0.000 0.864
#> SRR665357 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0237 0.97089 0.004 0.000 0.996
#> SRR1347819 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472576 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431781 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500472 1 0.4504 0.74528 0.804 0.000 0.196
#> SRR1417632 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326579 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1083752 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377599 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488449 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318354 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1359062 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398924 1 0.6244 0.20330 0.560 0.440 0.000
#> SRR663783 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319204 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0237 0.95138 0.000 0.996 0.004
#> SRR1316982 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498595 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377423 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312310 2 0.0892 0.93838 0.000 0.980 0.020
#> SRR1485613 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR658941 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368874 3 0.4235 0.79032 0.000 0.176 0.824
#> SRR1324085 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363858 2 0.6192 0.32264 0.420 0.580 0.000
#> SRR819820 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337342 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR655206 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387013 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440161 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415379 2 0.6079 0.40509 0.388 0.612 0.000
#> SRR1099622 3 0.6302 0.06745 0.000 0.480 0.520
#> SRR663197 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394836 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR661699 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR813680 1 0.2066 0.91671 0.940 0.000 0.060
#> SRR1410678 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 2 0.0424 0.94934 0.008 0.992 0.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433410 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432518 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374608 1 0.9736 0.00928 0.416 0.356 0.228
#> SRR657949 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308882 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444138 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 2 0.0237 0.95190 0.004 0.996 0.000
#> SRR1091380 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.1964 0.91668 0.944 0.056 0.000
#> SRR1467102 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485416 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR809963 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 2 0.0424 0.94934 0.008 0.992 0.000
#> SRR1445259 1 0.0424 0.96210 0.992 0.000 0.008
#> SRR1408393 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1333485 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406437 3 0.0661 0.96571 0.008 0.004 0.988
#> SRR1354931 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1391856 3 0.5760 0.53500 0.000 0.328 0.672
#> SRR1446738 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309032 3 0.4974 0.70074 0.000 0.236 0.764
#> SRR1388145 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375329 1 0.2537 0.89738 0.920 0.000 0.080
#> SRR1387921 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 3 0.2625 0.89868 0.000 0.084 0.916
#> SRR1360478 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400910 2 0.7552 0.40099 0.352 0.596 0.052
#> SRR1444203 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429603 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397366 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337606 2 0.5733 0.52487 0.324 0.676 0.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385389 2 0.1643 0.92291 0.044 0.956 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0592 0.95884 0.988 0.012 0.000
#> SRR1349121 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354117 3 0.0892 0.95861 0.000 0.020 0.980
#> SRR1393596 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.1860 0.92792 0.052 0.000 0.948
#> SRR1499894 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082883 1 0.1529 0.93332 0.960 0.040 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.3551 0.82013 0.000 0.868 0.132
#> SRR662103 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396294 2 0.9285 0.17521 0.392 0.448 0.160
#> SRR1419917 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489199 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR813584 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069638 3 0.2878 0.88228 0.096 0.000 0.904
#> SRR614864 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433392 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401252 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309963 2 0.4750 0.73785 0.216 0.784 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.6154 0.27102 0.592 0.408 0.000
#> SRR1337010 2 0.2796 0.86709 0.000 0.908 0.092
#> SRR1486520 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 2 0.3340 0.85432 0.120 0.880 0.000
#> SRR1340486 2 0.4291 0.78598 0.180 0.820 0.000
#> SRR1377696 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465459 3 0.1643 0.93531 0.044 0.000 0.956
#> SRR1080270 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093148 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467080 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR816475 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379198 2 0.6180 0.33072 0.416 0.584 0.000
#> SRR613342 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369129 2 0.1031 0.93783 0.024 0.976 0.000
#> SRR1396616 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082376 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500891 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR807543 1 0.0424 0.96225 0.992 0.000 0.008
#> SRR1091572 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346689 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR663729 2 0.4121 0.80126 0.168 0.832 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485357 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355172 1 0.4452 0.75980 0.808 0.000 0.192
#> SRR655531 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413329 1 0.3192 0.86355 0.888 0.000 0.112
#> SRR1485931 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 2 0.2066 0.91035 0.060 0.940 0.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR663440 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR808019 1 0.5016 0.68644 0.760 0.000 0.240
#> SRR1479133 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR615069 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456185 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350069 1 0.6307 -0.01339 0.512 0.488 0.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR664795 1 0.1643 0.93131 0.956 0.000 0.044
#> SRR1490721 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 3 0.4121 0.78646 0.168 0.000 0.832
#> SRR1085285 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099072 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR809987 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR613639 3 0.1163 0.94992 0.028 0.000 0.972
#> SRR1402285 1 0.6308 -0.02878 0.508 0.492 0.000
#> SRR1077038 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095455 1 0.0424 0.96207 0.992 0.000 0.008
#> SRR1394734 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073581 1 0.0592 0.95906 0.988 0.000 0.012
#> SRR659804 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR660764 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328845 1 0.3644 0.83505 0.872 0.124 0.004
#> SRR1336415 2 0.3619 0.83749 0.136 0.864 0.000
#> SRR1379065 2 0.1753 0.91994 0.048 0.952 0.000
#> SRR1459190 3 0.0747 0.96086 0.016 0.000 0.984
#> SRR1346773 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 2 0.0237 0.95191 0.004 0.996 0.000
#> SRR1309248 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR809161 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316320 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432629 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 2 0.6192 0.31934 0.420 0.580 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470534 2 0.4750 0.73789 0.216 0.784 0.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 3 0.6204 0.24732 0.424 0.000 0.576
#> SRR1332648 2 0.2959 0.87418 0.100 0.900 0.000
#> SRR660614 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470420 3 0.5859 0.49601 0.000 0.344 0.656
#> SRR1475566 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR615946 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR2170173 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR817329 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401990 2 0.4452 0.77067 0.192 0.808 0.000
#> SRR1467745 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR813137 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR818797 3 0.0592 0.96468 0.012 0.000 0.988
#> SRR2164608 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455586 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385501 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361652 1 0.1529 0.93374 0.960 0.040 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1430910 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0237 0.96520 0.996 0.004 0.000
#> SRR1486762 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480854 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489394 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418085 2 0.3619 0.83731 0.136 0.864 0.000
#> SRR1340221 2 0.5138 0.68316 0.252 0.748 0.000
#> SRR1473058 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405165 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098567 3 0.5706 0.54527 0.000 0.320 0.680
#> SRR1098712 2 0.5621 0.58356 0.308 0.692 0.000
#> SRR1455038 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375248 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403005 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348378 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 2 0.5138 0.68306 0.252 0.748 0.000
#> SRR1475192 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432085 3 0.0424 0.96788 0.000 0.008 0.992
#> SRR1452468 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347060 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414139 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447962 3 0.0747 0.96118 0.000 0.016 0.984
#> SRR1444324 3 0.0892 0.95859 0.000 0.020 0.980
#> SRR1415004 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 3 0.2878 0.88058 0.000 0.096 0.904
#> SRR1405331 1 0.6286 0.13356 0.536 0.000 0.464
#> SRR1345609 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322840 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367920 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363968 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0747 0.95587 0.984 0.000 0.016
#> SRR1386689 2 0.1860 0.91677 0.052 0.948 0.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453811 3 0.0237 0.97089 0.004 0.000 0.996
#> SRR1441159 1 0.0000 0.96834 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 2 0.0000 0.95424 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310275 3 0.0000 0.97395 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 1 0.5632 0.46639 0.624 0.000 0.340 0.036
#> SRR1331708 2 0.3356 0.74543 0.176 0.824 0.000 0.000
#> SRR1464258 1 0.0524 0.93598 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1454201 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR661589 3 0.0188 0.91636 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1456229 1 0.0188 0.93557 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1315165 4 0.0707 0.93449 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1488960 1 0.0592 0.93580 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1417809 4 0.0336 0.92310 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1094457 4 0.0188 0.93034 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1095575 1 0.0188 0.93557 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1315931 1 0.0657 0.93584 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1430066 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0336 0.91395 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR818002 4 0.2814 0.88928 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1344143 2 0.0469 0.88053 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1486845 4 0.1302 0.93471 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1362866 1 0.0592 0.93286 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0657 0.93584 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1446627 2 0.0592 0.88123 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1456138 2 0.0592 0.88123 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1416248 1 0.1389 0.92848 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1383907 4 0.2149 0.92090 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1311018 1 0.2149 0.90924 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1375699 2 0.3486 0.72422 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1429846 3 0.4456 0.61338 0.280 0.004 0.716 0.000
#> SRR613550 3 0.5143 0.15335 0.456 0.004 0.540 0.000
#> SRR1348402 1 0.0336 0.93606 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1345146 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1324025 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318879 1 0.5203 0.24598 0.576 0.008 0.416 0.000
#> SRR820755 1 0.1059 0.92919 0.972 0.012 0.016 0.000
#> SRR1485830 4 0.0592 0.93385 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR599313 1 0.0469 0.93452 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR612263 1 0.0592 0.93370 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.0188 0.91636 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1326205 4 0.0469 0.93300 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1421327 4 0.2589 0.90380 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1083311 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.2081 0.92276 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1079522 2 0.3873 0.67940 0.228 0.772 0.000 0.000
#> SRR1452935 1 0.1174 0.92669 0.968 0.012 0.020 0.000
#> SRR1379495 1 0.2266 0.91170 0.912 0.004 0.000 0.084
#> SRR1470459 3 0.1118 0.89108 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.0592 0.93286 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0469 0.93584 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1455195 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.1211 0.93100 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1335140 2 0.0817 0.87880 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1433555 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308650 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.2081 0.91158 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1317446 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0592 0.88123 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR809853 1 0.0592 0.93370 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.0188 0.91636 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1499935 4 0.2081 0.92276 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1447303 3 0.1792 0.86923 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1429408 4 0.2149 0.92090 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1433950 1 0.0336 0.93519 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.2053 0.84402 0.000 0.924 0.072 0.004
#> SRR1409854 1 0.0657 0.93389 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1435229 1 0.0592 0.93286 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0592 0.93370 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1414229 2 0.4542 0.68487 0.228 0.752 0.020 0.000
#> SRR1400974 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.2266 0.91170 0.912 0.004 0.000 0.084
#> SRR613927 1 0.0895 0.93144 0.976 0.004 0.020 0.000
#> SRR1457854 1 0.2053 0.91866 0.924 0.004 0.000 0.072
#> SRR1473714 4 0.0779 0.91327 0.016 0.004 0.000 0.980
#> SRR813776 1 0.0672 0.93373 0.984 0.008 0.008 0.000
#> SRR808196 4 0.0592 0.91662 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1101085 4 0.2081 0.92276 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR614395 1 0.0524 0.93598 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1478251 4 0.0188 0.92622 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1370551 3 0.3836 0.73653 0.000 0.168 0.816 0.016
#> SRR1362310 1 0.1792 0.92045 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR665310 3 0.4819 0.48312 0.344 0.004 0.652 0.000
#> SRR1420109 1 0.0779 0.93318 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1330920 1 0.0592 0.93370 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1419539 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359447 3 0.4560 0.55535 0.004 0.296 0.700 0.000
#> SRR1347259 4 0.1302 0.93471 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR613915 1 0.4304 0.58240 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR1384395 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821715 3 0.0524 0.91193 0.008 0.004 0.988 0.000
#> SRR1478228 1 0.1389 0.92851 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1445637 1 0.0895 0.93538 0.976 0.004 0.000 0.020
#> SRR608150 1 0.4967 0.14382 0.548 0.452 0.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.2843 0.90123 0.892 0.000 0.020 0.088
#> SRR1341480 4 0.2216 0.91872 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR1341344 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.1902 0.86546 0.064 0.004 0.932 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808566 4 0.1867 0.92788 0.000 0.072 0.000 0.928
#> SRR1430270 4 0.0469 0.91971 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1367825 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613533 3 0.4585 0.55681 0.332 0.000 0.668 0.000
#> SRR661267 3 0.5000 -0.00812 0.496 0.000 0.504 0.000
#> SRR810665 2 0.0707 0.88034 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1407250 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1420067 1 0.0336 0.93463 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0779 0.93582 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR812536 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370850 4 0.3024 0.87391 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR1486195 3 0.3569 0.71771 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR1407671 2 0.0657 0.88035 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1446375 1 0.0937 0.93502 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR1465230 4 0.0188 0.93034 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR614119 1 0.1867 0.91865 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1356101 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.0895 0.93551 0.976 0.004 0.000 0.020
#> SRR1392676 2 0.0592 0.88123 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR665538 1 0.2149 0.90909 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR660510 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.1792 0.92919 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR658953 1 0.4008 0.68484 0.756 0.244 0.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.0895 0.93538 0.976 0.004 0.000 0.020
#> SRR1070713 2 0.0657 0.88070 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1485312 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.0188 0.92622 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1488610 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.1305 0.93217 0.960 0.004 0.000 0.036
#> SRR1091302 4 0.1211 0.93502 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR818263 1 0.0469 0.93452 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1404909 4 0.2647 0.89979 0.000 0.120 0.000 0.880
#> SRR663076 1 0.2281 0.90365 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1323577 2 0.0707 0.88034 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1442422 4 0.0592 0.93399 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1465893 1 0.2760 0.87633 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR654862 1 0.0592 0.93370 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1407112 4 0.0188 0.92622 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1332969 3 0.0188 0.91636 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1353199 3 0.0188 0.91636 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1378885 1 0.3908 0.71960 0.784 0.004 0.212 0.000
#> SRR665357 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0657 0.88070 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1501020 3 0.0188 0.91636 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.1557 0.85862 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1472576 4 0.2216 0.91872 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR1431781 4 0.1637 0.93150 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR1452270 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.1022 0.92543 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1417632 4 0.2760 0.89287 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR1350153 2 0.0895 0.88003 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR1458113 2 0.5816 0.60074 0.088 0.688 0.224 0.000
#> SRR1326579 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.1022 0.87479 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1096712 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083752 4 0.2647 0.89995 0.000 0.120 0.000 0.880
#> SRR1377599 4 0.3837 0.77342 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1488449 3 0.0376 0.91486 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR1318354 3 0.6280 0.44633 0.084 0.304 0.612 0.000
#> SRR1359062 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398924 2 0.2647 0.79802 0.120 0.880 0.000 0.000
#> SRR663783 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319204 2 0.4888 0.29491 0.000 0.588 0.412 0.000
#> SRR1369070 2 0.0592 0.88123 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR615659 1 0.1978 0.92062 0.928 0.004 0.000 0.068
#> SRR1337449 2 0.1488 0.86974 0.000 0.956 0.032 0.012
#> SRR1316982 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498595 4 0.2647 0.89995 0.000 0.120 0.000 0.880
#> SRR1377423 3 0.0188 0.91636 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1312310 2 0.0779 0.88088 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1485613 1 0.0921 0.93401 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1338426 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658941 3 0.0188 0.91602 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1101643 1 0.1743 0.92513 0.940 0.004 0.000 0.056
#> SRR1401468 1 0.2011 0.91401 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1368874 2 0.0672 0.87939 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1324085 4 0.1792 0.92919 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR1363858 4 0.0804 0.92632 0.012 0.008 0.000 0.980
#> SRR819820 3 0.0336 0.91349 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1337342 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR655206 3 0.4972 0.16665 0.000 0.000 0.544 0.456
#> SRR1387013 2 0.0707 0.88034 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1317410 1 0.1118 0.93208 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR608198 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1440161 3 0.0188 0.91604 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1343741 2 0.0592 0.88123 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1381288 2 0.0592 0.88123 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1415379 4 0.0188 0.92622 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1099622 3 0.4050 0.73081 0.000 0.036 0.820 0.144
#> SRR663197 3 0.0188 0.91618 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1394836 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661699 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813680 1 0.3680 0.81322 0.828 0.004 0.160 0.008
#> SRR1410678 1 0.2081 0.91158 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1378109 4 0.0469 0.93291 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1499174 1 0.0524 0.93598 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1311486 2 0.0592 0.88123 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1382851 2 0.4843 0.30603 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1433410 1 0.0592 0.93286 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.3591 0.76932 0.168 0.008 0.824 0.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.1004 0.91902 0.004 0.000 0.024 0.972
#> SRR657949 1 0.0657 0.93389 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1308882 4 0.1716 0.93046 0.000 0.064 0.000 0.936
#> SRR655768 1 0.0921 0.93399 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1485870 4 0.3801 0.77830 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1444138 1 0.0469 0.93584 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1417342 1 0.2216 0.90644 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1470193 4 0.1302 0.93471 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1091380 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.1940 0.91639 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1313583 4 0.0469 0.91971 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1467102 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.2081 0.92276 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR818821 3 0.3172 0.78187 0.160 0.000 0.840 0.000
#> SRR809963 1 0.0524 0.93598 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1072247 1 0.2011 0.91401 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1353710 4 0.1302 0.93471 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1445259 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1408393 1 0.0524 0.93462 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR1361522 1 0.2053 0.91863 0.924 0.004 0.000 0.072
#> SRR1368597 1 0.1398 0.93073 0.956 0.004 0.000 0.040
#> SRR1309680 2 0.4916 0.21403 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1310542 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.1792 0.92919 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR1406437 4 0.3945 0.68457 0.004 0.000 0.216 0.780
#> SRR1354931 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391856 3 0.2224 0.86614 0.000 0.040 0.928 0.032
#> SRR1446738 4 0.2530 0.91443 0.000 0.100 0.004 0.896
#> SRR1309032 2 0.1635 0.86287 0.000 0.948 0.044 0.008
#> SRR1388145 4 0.5696 0.07499 0.000 0.480 0.024 0.496
#> SRR1432611 2 0.0592 0.88123 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR815869 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375329 2 0.2647 0.79523 0.120 0.880 0.000 0.000
#> SRR1387921 1 0.2149 0.90924 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1466792 2 0.1209 0.86897 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR1360478 2 0.0592 0.88123 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1360695 1 0.2216 0.90644 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR812943 1 0.2281 0.87876 0.904 0.096 0.000 0.000
#> SRR1400910 2 0.2149 0.82031 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR1444203 4 0.0707 0.93449 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR816177 4 0.2408 0.91165 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR658754 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.1389 0.93409 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1397366 3 0.3157 0.78395 0.144 0.004 0.852 0.000
#> SRR1446028 1 0.0469 0.93584 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1083918 4 0.2868 0.88586 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR1337606 2 0.2216 0.81738 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR656946 1 0.2266 0.91170 0.912 0.004 0.000 0.084
#> SRR1476102 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0336 0.93463 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1342067 4 0.1716 0.93046 0.000 0.064 0.000 0.936
#> SRR1385389 4 0.0469 0.93291 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1075971 1 0.0469 0.93619 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR614419 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.4331 0.58109 0.712 0.288 0.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.1792 0.92044 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1430549 1 0.0376 0.93583 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR612935 3 0.6785 0.29727 0.108 0.352 0.540 0.000
#> SRR661481 2 0.4713 0.40671 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1354117 2 0.1557 0.85247 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1393596 4 0.2081 0.92276 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1452164 1 0.0657 0.93584 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1070503 1 0.2402 0.88080 0.912 0.012 0.076 0.000
#> SRR1499894 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082883 2 0.4989 0.12255 0.472 0.528 0.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.2081 0.91158 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1332443 1 0.1302 0.92969 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR810295 2 0.0779 0.88088 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR662103 1 0.1978 0.92066 0.928 0.004 0.000 0.068
#> SRR1328620 3 0.2909 0.83608 0.092 0.020 0.888 0.000
#> SRR1396294 4 0.0779 0.91866 0.004 0.000 0.016 0.980
#> SRR1419917 1 0.0524 0.93598 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR662114 3 0.4710 0.74985 0.088 0.120 0.792 0.000
#> SRR1489199 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR813584 4 0.2469 0.90892 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR1069638 1 0.0707 0.93280 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR614864 3 0.4277 0.63923 0.280 0.000 0.720 0.000
#> SRR1433392 1 0.0524 0.93598 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1377777 2 0.0592 0.88123 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR2167710 1 0.1940 0.91631 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1401252 4 0.2149 0.92090 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1309963 4 0.0000 0.92861 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.1978 0.92062 0.928 0.004 0.000 0.068
#> SRR1418628 2 0.0707 0.88034 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1486889 1 0.1847 0.92656 0.940 0.004 0.004 0.052
#> SRR1380393 1 0.2281 0.90365 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1319731 1 0.1940 0.91631 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1356468 4 0.0469 0.92030 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1337010 2 0.0672 0.87939 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1486520 1 0.0336 0.93463 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1486538 4 0.1118 0.93524 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1340486 4 0.0000 0.92861 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377696 2 0.2011 0.83986 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1465459 1 0.3626 0.75620 0.812 0.004 0.184 0.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.4193 0.65542 0.268 0.000 0.732 0.000
#> SRR1093148 3 0.0937 0.90472 0.012 0.012 0.976 0.000
#> SRR1467080 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410866 4 0.4509 0.65915 0.000 0.288 0.004 0.708
#> SRR816475 4 0.1389 0.93409 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1379198 4 0.0188 0.92622 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR613342 3 0.2408 0.83855 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR1452246 2 0.0592 0.88123 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1338836 2 0.0817 0.87880 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1369129 4 0.0817 0.93489 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1396616 3 0.0376 0.91486 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.0336 0.93519 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1500891 4 0.2081 0.92276 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR807543 1 0.0524 0.93462 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR1091572 1 0.0469 0.93452 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1346689 4 0.1940 0.92627 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR1332424 1 0.0707 0.93150 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR663729 4 0.2882 0.90076 0.024 0.084 0.000 0.892
#> SRR1097013 1 0.1489 0.92993 0.952 0.004 0.000 0.044
#> SRR613675 1 0.2149 0.87814 0.912 0.088 0.000 0.000
#> SRR1485357 4 0.0000 0.92861 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.1867 0.91846 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1437622 4 0.2345 0.91420 0.000 0.100 0.000 0.900
#> SRR1355172 3 0.5939 0.58933 0.248 0.000 0.668 0.084
#> SRR655531 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413329 1 0.1452 0.91639 0.956 0.008 0.036 0.000
#> SRR1485931 2 0.0592 0.88123 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1420873 1 0.1022 0.93308 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1333308 4 0.0376 0.92913 0.004 0.004 0.000 0.992
#> SRR1452033 1 0.2266 0.91170 0.912 0.004 0.000 0.084
#> SRR1467316 2 0.0469 0.88053 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR809018 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0707 0.88034 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR663440 1 0.5203 0.22625 0.576 0.008 0.416 0.000
#> SRR1471755 4 0.2814 0.88928 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR808019 1 0.4454 0.57001 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1479133 3 0.0188 0.91636 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR615069 2 0.2984 0.81410 0.084 0.888 0.028 0.000
#> SRR1456185 2 0.7185 0.45800 0.000 0.540 0.284 0.176
#> SRR1350069 4 0.0336 0.92310 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR816316 1 0.0336 0.93519 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR664795 1 0.4439 0.81556 0.808 0.004 0.140 0.048
#> SRR1490721 2 0.4632 0.51072 0.004 0.688 0.000 0.308
#> SRR810643 1 0.0376 0.93583 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1430333 1 0.5352 0.35114 0.596 0.388 0.016 0.000
#> SRR1085285 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.4819 0.48476 0.344 0.004 0.652 0.000
#> SRR1317985 1 0.2266 0.91170 0.912 0.004 0.000 0.084
#> SRR1487340 1 0.0779 0.93578 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1420276 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.2197 0.85633 0.080 0.004 0.916 0.000
#> SRR1405525 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.2266 0.91170 0.912 0.004 0.000 0.084
#> SRR1465001 1 0.1940 0.91631 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1476525 2 0.2973 0.77737 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR819610 4 0.2149 0.92090 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR2157314 1 0.1118 0.93224 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1409465 2 0.0707 0.88034 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR809987 4 0.0779 0.91327 0.016 0.004 0.000 0.980
#> SRR613639 3 0.4356 0.59388 0.292 0.000 0.708 0.000
#> SRR1402285 4 0.0188 0.92622 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1077038 1 0.0524 0.93598 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1405660 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.0707 0.93280 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1394734 4 0.2760 0.89287 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR1317771 1 0.0376 0.93590 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1365894 2 0.4277 0.56759 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1073581 1 0.2840 0.90602 0.900 0.000 0.044 0.056
#> SRR659804 1 0.1211 0.93106 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1345914 2 0.0592 0.88123 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1432186 2 0.4746 0.38888 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1473529 2 0.5000 -0.05461 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR660764 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820448 1 0.0524 0.93598 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1328845 4 0.0592 0.91662 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1336415 4 0.0188 0.92622 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1379065 4 0.1302 0.93471 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1459190 3 0.4509 0.59640 0.288 0.004 0.708 0.000
#> SRR1346773 1 0.0657 0.93490 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1499521 1 0.2081 0.91158 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1440898 2 0.0707 0.88034 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1347459 3 0.1474 0.88204 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1081209 2 0.0469 0.88053 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1400202 1 0.2125 0.91643 0.920 0.004 0.000 0.076
#> SRR1333395 4 0.0592 0.93416 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1309248 2 0.2704 0.79713 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR809161 3 0.0707 0.90532 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1316320 2 0.0188 0.87720 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1432629 2 0.0707 0.88034 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1498931 1 0.2401 0.90658 0.904 0.004 0.000 0.092
#> SRR1416578 4 0.0336 0.92310 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1405547 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.92861 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.0524 0.93547 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1309160 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.2760 0.87633 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1078489 1 0.1209 0.92664 0.964 0.032 0.004 0.000
#> SRR1332648 4 0.0707 0.93449 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR660614 2 0.2521 0.82952 0.064 0.912 0.024 0.000
#> SRR1470420 2 0.5281 0.14361 0.000 0.528 0.464 0.008
#> SRR1475566 1 0.1978 0.92062 0.928 0.004 0.000 0.068
#> SRR1477949 1 0.1637 0.92381 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1481419 2 0.0707 0.88034 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1464766 1 0.0707 0.93532 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR615946 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446481 4 0.2921 0.88182 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1467656 2 0.5355 0.40505 0.000 0.620 0.360 0.020
#> SRR1402962 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0657 0.88071 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR665586 1 0.0336 0.93536 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0592 0.93286 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.0336 0.93463 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0188 0.93557 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.0188 0.93557 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR817329 1 0.0188 0.93557 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1401990 4 0.0000 0.92861 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467745 4 0.2081 0.92276 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1471795 2 0.4431 0.53448 0.000 0.696 0.000 0.304
#> SRR1415637 2 0.0592 0.88123 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR813137 1 0.2125 0.91643 0.920 0.004 0.000 0.076
#> SRR1314873 1 0.0895 0.93562 0.976 0.004 0.000 0.020
#> SRR1401211 1 0.2469 0.89408 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1419692 4 0.0000 0.92861 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818797 3 0.3208 0.78239 0.148 0.004 0.848 0.000
#> SRR2164608 1 0.4897 0.46443 0.660 0.008 0.332 0.000
#> SRR1455586 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0469 0.88053 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1433232 2 0.0592 0.88123 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1385501 1 0.0592 0.93370 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1361652 2 0.2469 0.80521 0.108 0.892 0.000 0.000
#> SRR1437119 1 0.2081 0.91158 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1478547 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430910 2 0.3015 0.80989 0.092 0.884 0.024 0.000
#> SRR1310584 1 0.0592 0.93568 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1500216 1 0.0336 0.93536 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1486762 3 0.0188 0.91636 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1480854 4 0.2216 0.91872 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR1489394 4 0.0336 0.93172 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1418085 4 0.0188 0.93034 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1340221 4 0.0188 0.92672 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1473058 4 0.1792 0.92919 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR1405165 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.0336 0.93519 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.3074 0.85203 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1098567 2 0.0672 0.87939 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1098712 4 0.0376 0.92734 0.004 0.000 0.004 0.992
#> SRR1455038 1 0.0592 0.93370 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1375248 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.5155 0.14871 0.468 0.004 0.528 0.000
#> SRR1348378 4 0.3082 0.90687 0.000 0.084 0.032 0.884
#> SRR1413541 1 0.0469 0.93452 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1392943 4 0.1305 0.93548 0.004 0.036 0.000 0.960
#> SRR1475192 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432085 3 0.3444 0.73116 0.000 0.184 0.816 0.000
#> SRR1452468 1 0.0592 0.93286 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1347060 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414139 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447962 3 0.2530 0.81904 0.000 0.112 0.888 0.000
#> SRR1444324 2 0.4382 0.56197 0.000 0.704 0.296 0.000
#> SRR1415004 1 0.2081 0.91158 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1413436 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0469 0.93388 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1343302 4 0.0592 0.93385 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1373746 1 0.0592 0.93568 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1429678 1 0.1109 0.93400 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1469413 3 0.1356 0.88546 0.000 0.032 0.960 0.008
#> SRR1405331 1 0.0672 0.93373 0.984 0.008 0.008 0.000
#> SRR1345609 1 0.0707 0.93551 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1380208 2 0.0469 0.87132 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1322840 4 0.1022 0.93523 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1399797 3 0.0188 0.91618 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.1792 0.92045 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1365291 1 0.5263 0.11156 0.544 0.008 0.448 0.000
#> SRR1367920 4 0.3486 0.82582 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1366648 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0672 0.87939 0.000 0.984 0.008 0.008
#> SRR1082173 1 0.4697 0.56302 0.696 0.008 0.296 0.000
#> SRR1363968 1 0.2081 0.91158 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR814387 1 0.1389 0.92851 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR657599 1 0.2773 0.85733 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1386689 4 0.0000 0.92861 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453811 3 0.4584 0.59478 0.300 0.004 0.696 0.000
#> SRR1441159 1 0.0657 0.93490 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1403154 4 0.0817 0.93494 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1468722 3 0.0000 0.91809 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310275 1 0.4990 0.41647 0.640 0.008 0.352 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 3 0.5278 0.265608 0.016 0.000 0.552 0.024 0.408
#> SRR1331708 5 0.3932 0.417593 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1464258 1 0.1430 0.701028 0.944 0.000 0.004 0.000 0.052
#> SRR1454201 5 0.0963 0.744575 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR661589 3 0.2929 0.803764 0.180 0.000 0.820 0.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.1430 0.701028 0.944 0.000 0.004 0.000 0.052
#> SRR1315165 4 0.0290 0.918087 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1488960 1 0.4522 0.658919 0.660 0.000 0.000 0.024 0.316
#> SRR1417809 4 0.2962 0.826853 0.084 0.000 0.000 0.868 0.048
#> SRR1094457 4 0.0000 0.916974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.2280 0.748255 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1315931 1 0.1478 0.715894 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1430066 3 0.0510 0.878722 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.1270 0.871334 0.052 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.1764 0.865369 0.064 0.000 0.928 0.000 0.008
#> SRR818002 4 0.1043 0.910048 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1344143 2 0.0162 0.859503 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486845 4 0.0290 0.918222 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1362866 5 0.1568 0.746152 0.020 0.036 0.000 0.000 0.944
#> SRR1490740 1 0.1792 0.744379 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1446627 2 0.0000 0.860118 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.860118 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.4897 0.470611 0.516 0.000 0.000 0.024 0.460
#> SRR1383907 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1311018 1 0.4338 0.686063 0.696 0.000 0.000 0.024 0.280
#> SRR1375699 2 0.2952 0.804856 0.036 0.872 0.000 0.088 0.004
#> SRR1429846 3 0.4114 0.693523 0.272 0.000 0.712 0.000 0.016
#> SRR613550 1 0.3424 0.486447 0.760 0.000 0.240 0.000 0.000
#> SRR1348402 5 0.4906 -0.347762 0.480 0.000 0.000 0.024 0.496
#> SRR1345146 1 0.4166 0.646375 0.648 0.000 0.000 0.004 0.348
#> SRR1324025 3 0.2519 0.846114 0.100 0.000 0.884 0.000 0.016
#> SRR1318879 3 0.4950 0.115620 0.424 0.016 0.552 0.000 0.008
#> SRR820755 5 0.5165 0.507312 0.376 0.000 0.048 0.000 0.576
#> SRR1485830 4 0.0162 0.917746 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR599313 1 0.1430 0.701028 0.944 0.000 0.004 0.000 0.052
#> SRR612263 1 0.1792 0.703610 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1415398 3 0.3336 0.756992 0.228 0.000 0.772 0.000 0.000
#> SRR1326205 4 0.1493 0.892419 0.024 0.000 0.000 0.948 0.028
#> SRR1421327 4 0.1018 0.915409 0.000 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR1083311 3 0.0404 0.878980 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1079522 2 0.2519 0.775769 0.100 0.884 0.000 0.000 0.016
#> SRR1452935 5 0.4840 0.580889 0.320 0.000 0.040 0.000 0.640
#> SRR1379495 1 0.3496 0.733552 0.788 0.000 0.000 0.012 0.200
#> SRR1470459 3 0.3398 0.672385 0.000 0.216 0.780 0.000 0.004
#> SRR661361 3 0.2193 0.853343 0.092 0.000 0.900 0.000 0.008
#> SRR615778 5 0.3949 0.611664 0.300 0.000 0.004 0.000 0.696
#> SRR1447564 1 0.2513 0.746706 0.876 0.000 0.000 0.008 0.116
#> SRR1455195 5 0.1544 0.743106 0.068 0.000 0.000 0.000 0.932
#> SRR655182 1 0.3519 0.730300 0.776 0.000 0.000 0.008 0.216
#> SRR1335140 2 0.0162 0.860044 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1433555 3 0.0162 0.878646 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1308650 3 0.1285 0.862889 0.004 0.036 0.956 0.000 0.004
#> SRR1388354 1 0.4065 0.701421 0.720 0.000 0.000 0.016 0.264
#> SRR1317446 3 0.0000 0.877930 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1479955 2 0.0000 0.860118 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.1544 0.740658 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR661313 3 0.3715 0.719833 0.260 0.000 0.736 0.000 0.004
#> SRR1499935 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1447303 3 0.4583 0.732753 0.140 0.000 0.748 0.000 0.112
#> SRR1429408 4 0.0510 0.918326 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1433950 1 0.2424 0.741554 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1362081 2 0.2329 0.792809 0.000 0.876 0.124 0.000 0.000
#> SRR1409854 1 0.2563 0.661901 0.872 0.000 0.008 0.000 0.120
#> SRR1435229 5 0.5429 0.320956 0.368 0.068 0.000 0.000 0.564
#> SRR1085996 1 0.2179 0.730640 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1414229 5 0.4085 0.627946 0.028 0.208 0.004 0.000 0.760
#> SRR1400974 3 0.0609 0.878609 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.2818 0.746793 0.856 0.000 0.000 0.012 0.132
#> SRR613927 1 0.1399 0.702272 0.952 0.000 0.020 0.000 0.028
#> SRR1457854 1 0.3690 0.725211 0.764 0.000 0.000 0.012 0.224
#> SRR1473714 4 0.4270 0.491049 0.320 0.000 0.000 0.668 0.012
#> SRR813776 1 0.2450 0.668512 0.896 0.000 0.028 0.000 0.076
#> SRR808196 4 0.4885 0.535577 0.056 0.000 0.000 0.668 0.276
#> SRR1101085 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR614395 1 0.1041 0.710522 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1478251 4 0.0000 0.916974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.4310 0.396736 0.000 0.604 0.392 0.000 0.004
#> SRR1362310 1 0.4181 0.694577 0.712 0.000 0.000 0.020 0.268
#> SRR665310 1 0.2377 0.622606 0.872 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1420109 1 0.0671 0.713479 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1330920 1 0.3766 0.391521 0.728 0.000 0.004 0.000 0.268
#> SRR1419539 3 0.0865 0.867465 0.000 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR1359447 3 0.4551 0.139370 0.004 0.436 0.556 0.000 0.004
#> SRR1347259 4 0.1865 0.903277 0.032 0.024 0.000 0.936 0.008
#> SRR613915 1 0.5185 0.079360 0.568 0.000 0.384 0.000 0.048
#> SRR1384395 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR821715 3 0.3662 0.730436 0.252 0.000 0.744 0.000 0.004
#> SRR1478228 1 0.4757 0.597399 0.596 0.000 0.000 0.024 0.380
#> SRR1445637 1 0.0794 0.730079 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR608150 5 0.1430 0.743080 0.004 0.052 0.000 0.000 0.944
#> SRR1096383 1 0.5283 0.648435 0.636 0.000 0.032 0.024 0.308
#> SRR1341480 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1341344 5 0.2813 0.699284 0.168 0.000 0.000 0.000 0.832
#> SRR1326270 1 0.4235 0.000334 0.576 0.000 0.424 0.000 0.000
#> SRR1498838 3 0.0510 0.878722 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.1851 0.857874 0.088 0.000 0.912 0.000 0.000
#> SRR808566 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1430270 4 0.0162 0.915759 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1367825 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR613533 3 0.2891 0.800924 0.176 0.000 0.824 0.000 0.000
#> SRR661267 3 0.4338 0.527190 0.008 0.000 0.684 0.008 0.300
#> SRR810665 2 0.0703 0.856012 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1407250 5 0.0963 0.744575 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1420067 1 0.4437 0.489803 0.532 0.000 0.000 0.004 0.464
#> SRR1473632 1 0.2583 0.747537 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR812536 3 0.0609 0.878369 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.4302 0.140683 0.000 0.520 0.000 0.480 0.000
#> SRR1486195 2 0.3816 0.580434 0.000 0.696 0.304 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.3282 0.694005 0.000 0.804 0.000 0.008 0.188
#> SRR1446375 1 0.3990 0.718557 0.740 0.000 0.012 0.004 0.244
#> SRR1465230 4 0.0000 0.916974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614119 1 0.5253 0.470675 0.500 0.000 0.012 0.024 0.464
#> SRR1356101 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1404209 1 0.3421 0.735441 0.788 0.000 0.000 0.008 0.204
#> SRR1392676 2 0.0162 0.859503 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR665538 1 0.4846 0.580312 0.588 0.000 0.000 0.028 0.384
#> SRR660510 3 0.1792 0.859825 0.084 0.000 0.916 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR658953 1 0.5338 0.191437 0.544 0.400 0.000 0.000 0.056
#> SRR2166459 1 0.3048 0.743331 0.820 0.000 0.000 0.004 0.176
#> SRR1070713 2 0.4294 0.065853 0.000 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1485312 3 0.1197 0.872486 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.2270 0.861185 0.020 0.000 0.000 0.904 0.076
#> SRR1488610 5 0.4288 0.321733 0.324 0.012 0.000 0.000 0.664
#> SRR1330588 3 0.2359 0.856499 0.060 0.000 0.904 0.000 0.036
#> SRR1316367 5 0.2891 0.691540 0.176 0.000 0.000 0.000 0.824
#> SRR1433926 1 0.1043 0.721426 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1091302 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR818263 5 0.4264 0.534483 0.376 0.000 0.004 0.000 0.620
#> SRR1404909 4 0.0963 0.912453 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR663076 1 0.4382 0.679439 0.688 0.000 0.000 0.024 0.288
#> SRR1323577 2 0.0290 0.859515 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1442422 4 0.0290 0.918165 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1465893 1 0.4763 0.630913 0.632 0.000 0.000 0.032 0.336
#> SRR654862 5 0.4084 0.587972 0.328 0.000 0.004 0.000 0.668
#> SRR1407112 4 0.0000 0.916974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.3424 0.746281 0.240 0.000 0.760 0.000 0.000
#> SRR1353199 3 0.3586 0.720790 0.264 0.000 0.736 0.000 0.000
#> SRR1378885 3 0.5450 0.324038 0.444 0.000 0.496 0.000 0.060
#> SRR665357 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR662186 2 0.0404 0.856245 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1501020 3 0.3857 0.663636 0.312 0.000 0.688 0.000 0.000
#> SRR1347819 3 0.0290 0.879092 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.2605 0.780337 0.000 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1472576 4 0.0963 0.912453 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1431781 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1452270 3 0.0404 0.878980 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.1485 0.737696 0.020 0.032 0.000 0.000 0.948
#> SRR1417632 4 0.0880 0.914491 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1350153 2 0.1571 0.838814 0.000 0.936 0.060 0.004 0.000
#> SRR1458113 5 0.4998 0.573064 0.000 0.196 0.104 0.000 0.700
#> SRR1326579 5 0.1478 0.743855 0.064 0.000 0.000 0.000 0.936
#> SRR1349363 2 0.2077 0.821846 0.008 0.908 0.000 0.084 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.877930 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.2230 0.844109 0.116 0.000 0.884 0.000 0.000
#> SRR1083752 4 0.0963 0.912453 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1377599 4 0.0963 0.912877 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1488449 3 0.3707 0.697075 0.284 0.000 0.716 0.000 0.000
#> SRR1318354 5 0.4773 0.605528 0.004 0.064 0.216 0.000 0.716
#> SRR1359062 3 0.0510 0.878722 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.4848 0.252772 0.024 0.420 0.000 0.000 0.556
#> SRR663783 3 0.0162 0.878646 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1319204 2 0.4197 0.686684 0.004 0.752 0.212 0.000 0.032
#> SRR1369070 2 0.0000 0.860118 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.1043 0.736712 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1337449 2 0.1410 0.839868 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1498595 4 0.0963 0.912453 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1377423 3 0.3983 0.626198 0.340 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.0609 0.857184 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.4907 0.434975 0.492 0.000 0.000 0.024 0.484
#> SRR1338426 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1353309 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658941 5 0.3353 0.653256 0.000 0.000 0.196 0.008 0.796
#> SRR1101643 1 0.0609 0.729297 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1401468 5 0.2075 0.710833 0.040 0.000 0.004 0.032 0.924
#> SRR1368874 2 0.0566 0.856343 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1324085 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1363858 4 0.1524 0.906397 0.016 0.016 0.000 0.952 0.016
#> SRR819820 3 0.1544 0.843008 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1337342 5 0.1197 0.745887 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR655206 3 0.4734 0.328796 0.000 0.000 0.604 0.372 0.024
#> SRR1387013 2 0.1638 0.827998 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1317410 1 0.4890 0.489904 0.524 0.000 0.000 0.024 0.452
#> SRR608198 5 0.2612 0.722559 0.124 0.008 0.000 0.000 0.868
#> SRR1440161 3 0.4383 0.175979 0.000 0.424 0.572 0.000 0.004
#> SRR1343741 2 0.0000 0.860118 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.860118 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.2409 0.857716 0.032 0.000 0.000 0.900 0.068
#> SRR1099622 3 0.2848 0.762039 0.000 0.004 0.840 0.156 0.000
#> SRR663197 3 0.2233 0.856382 0.080 0.000 0.904 0.000 0.016
#> SRR1394836 3 0.0290 0.875923 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR661699 3 0.0671 0.879082 0.016 0.000 0.980 0.000 0.004
#> SRR813680 1 0.5123 0.407297 0.572 0.000 0.384 0.000 0.044
#> SRR1410678 1 0.4297 0.681969 0.692 0.000 0.000 0.020 0.288
#> SRR1378109 4 0.0000 0.916974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.0963 0.735376 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1311486 2 0.0000 0.860118 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 4 0.6767 -0.013330 0.000 0.276 0.000 0.388 0.336
#> SRR1433410 5 0.2074 0.747558 0.044 0.036 0.000 0.000 0.920
#> SRR661167 3 0.1544 0.866626 0.068 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.3950 0.762742 0.048 0.004 0.796 0.000 0.152
#> SRR660462 3 0.0703 0.877825 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.5166 0.604468 0.000 0.000 0.108 0.680 0.212
#> SRR657949 1 0.1597 0.697354 0.940 0.000 0.012 0.000 0.048
#> SRR1308882 4 0.0865 0.908669 0.000 0.004 0.000 0.972 0.024
#> SRR655768 1 0.3934 0.701209 0.716 0.000 0.000 0.008 0.276
#> SRR1485870 4 0.5059 0.539440 0.004 0.292 0.000 0.652 0.052
#> SRR1444138 1 0.3160 0.741061 0.808 0.000 0.000 0.004 0.188
#> SRR1417342 1 0.3878 0.717344 0.748 0.000 0.000 0.016 0.236
#> SRR1470193 4 0.1251 0.904736 0.000 0.008 0.000 0.956 0.036
#> SRR1091380 3 0.1671 0.836577 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1099096 5 0.4974 -0.367528 0.464 0.000 0.000 0.028 0.508
#> SRR1313583 4 0.2471 0.807787 0.136 0.000 0.000 0.864 0.000
#> SRR1467102 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1485416 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR818821 3 0.1270 0.866690 0.052 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR809963 1 0.1041 0.710522 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1072247 1 0.4687 0.648907 0.636 0.000 0.000 0.028 0.336
#> SRR1353710 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1445259 5 0.4276 0.315180 0.380 0.004 0.000 0.000 0.616
#> SRR1408393 1 0.0671 0.711908 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1361522 1 0.0609 0.729479 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1368597 1 0.1197 0.738080 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1309680 2 0.3612 0.641083 0.000 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.877930 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0510 0.918326 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1406437 4 0.5875 0.470596 0.000 0.000 0.152 0.592 0.256
#> SRR1354931 3 0.0404 0.879369 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1391856 3 0.1216 0.864210 0.000 0.000 0.960 0.020 0.020
#> SRR1446738 5 0.6298 0.298523 0.000 0.004 0.152 0.324 0.520
#> SRR1309032 2 0.1908 0.817195 0.000 0.908 0.092 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.4114 0.628365 0.000 0.712 0.016 0.272 0.000
#> SRR1432611 2 0.0162 0.859865 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0162 0.878564 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1375329 2 0.1041 0.843777 0.004 0.964 0.000 0.000 0.032
#> SRR1387921 1 0.3759 0.725147 0.764 0.000 0.000 0.016 0.220
#> SRR1466792 2 0.1478 0.836302 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.860118 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.4484 0.663509 0.668 0.000 0.000 0.024 0.308
#> SRR812943 1 0.4134 0.598546 0.744 0.224 0.000 0.000 0.032
#> SRR1400910 2 0.3508 0.602878 0.000 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1444203 4 0.0000 0.916974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816177 4 0.0880 0.914475 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR658754 3 0.1121 0.873501 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1397366 1 0.4256 -0.026410 0.564 0.000 0.436 0.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.4387 0.635601 0.640 0.000 0.000 0.012 0.348
#> SRR1083918 4 0.1270 0.901881 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1337606 5 0.3816 0.496723 0.000 0.304 0.000 0.000 0.696
#> SRR659109 3 0.1270 0.871916 0.052 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR1337192 5 0.2338 0.727877 0.112 0.004 0.000 0.000 0.884
#> SRR656946 1 0.3318 0.738472 0.800 0.000 0.000 0.008 0.192
#> SRR1476102 1 0.4627 0.502520 0.544 0.000 0.000 0.012 0.444
#> SRR1476447 1 0.2773 0.732155 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR1342067 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.916974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.4323 0.600141 0.656 0.000 0.000 0.012 0.332
#> SRR614419 5 0.3774 0.597389 0.296 0.000 0.000 0.000 0.704
#> SRR1322936 5 0.1082 0.738243 0.008 0.028 0.000 0.000 0.964
#> SRR1349121 1 0.4558 0.653240 0.652 0.000 0.000 0.024 0.324
#> SRR1430549 1 0.3774 0.662759 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296
#> SRR612935 2 0.5051 0.367363 0.012 0.584 0.384 0.000 0.020
#> SRR661481 2 0.3752 0.604689 0.000 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR1354117 2 0.1205 0.846461 0.000 0.956 0.040 0.000 0.004
#> SRR1393596 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1452164 1 0.2563 0.746491 0.872 0.000 0.000 0.008 0.120
#> SRR1070503 5 0.5559 0.517633 0.344 0.000 0.084 0.000 0.572
#> SRR1499894 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1082883 5 0.1502 0.741889 0.004 0.056 0.000 0.000 0.940
#> SRR1468271 5 0.3880 0.510885 0.184 0.000 0.004 0.028 0.784
#> SRR1332443 1 0.4206 0.699761 0.708 0.000 0.000 0.020 0.272
#> SRR810295 2 0.0963 0.851596 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0290 0.723917 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1328620 5 0.3141 0.699897 0.000 0.016 0.152 0.000 0.832
#> SRR1396294 4 0.4886 0.704320 0.016 0.000 0.088 0.744 0.152
#> SRR1419917 1 0.0609 0.724351 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR662114 5 0.6333 0.476890 0.140 0.024 0.244 0.000 0.592
#> SRR1489199 5 0.2230 0.728844 0.116 0.000 0.000 0.000 0.884
#> SRR813584 4 0.0794 0.916252 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1069638 5 0.4491 0.622929 0.280 0.024 0.004 0.000 0.692
#> SRR614864 3 0.5852 0.248345 0.104 0.000 0.524 0.000 0.372
#> SRR1433392 1 0.1430 0.701028 0.944 0.000 0.004 0.000 0.052
#> SRR1377777 2 0.0000 0.860118 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.3421 0.735092 0.788 0.000 0.000 0.008 0.204
#> SRR1401252 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.916974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.3093 0.743351 0.824 0.000 0.000 0.008 0.168
#> SRR1418628 2 0.1282 0.847479 0.000 0.952 0.044 0.004 0.000
#> SRR1486889 1 0.1908 0.743339 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1380393 1 0.4338 0.686110 0.696 0.000 0.000 0.024 0.280
#> SRR1319731 1 0.4789 0.587747 0.584 0.000 0.000 0.024 0.392
#> SRR1356468 4 0.4679 0.497067 0.032 0.000 0.000 0.652 0.316
#> SRR1337010 2 0.0451 0.857837 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1486520 5 0.1408 0.743245 0.044 0.000 0.000 0.008 0.948
#> SRR1486538 4 0.0609 0.918137 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.916974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.2753 0.780169 0.000 0.856 0.000 0.136 0.008
#> SRR1465459 1 0.5399 -0.192066 0.496 0.000 0.448 0.000 0.056
#> SRR1080270 3 0.0162 0.878660 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.2464 0.848352 0.096 0.000 0.888 0.000 0.016
#> SRR1093148 5 0.2763 0.693755 0.000 0.004 0.148 0.000 0.848
#> SRR1467080 3 0.0000 0.877930 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.4307 0.095752 0.000 0.504 0.000 0.496 0.000
#> SRR816475 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.916974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613342 3 0.3636 0.711115 0.272 0.000 0.728 0.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.0794 0.851122 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1338836 2 0.0963 0.850719 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1369129 4 0.0510 0.918331 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1396616 3 0.3715 0.720343 0.260 0.000 0.736 0.000 0.004
#> SRR813824 3 0.1908 0.856259 0.092 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.2536 0.640087 0.868 0.000 0.004 0.000 0.128
#> SRR1500891 4 0.0794 0.916283 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR807543 1 0.2286 0.659705 0.888 0.000 0.004 0.000 0.108
#> SRR1091572 1 0.4451 -0.307467 0.504 0.000 0.004 0.000 0.492
#> SRR1346689 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1332424 5 0.1399 0.746256 0.020 0.028 0.000 0.000 0.952
#> SRR663729 4 0.3797 0.665046 0.008 0.004 0.000 0.756 0.232
#> SRR1097013 1 0.3421 0.734598 0.788 0.000 0.000 0.008 0.204
#> SRR613675 5 0.1469 0.738337 0.016 0.036 0.000 0.000 0.948
#> SRR1485357 4 0.0162 0.915888 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR655816 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1500113 1 0.4668 0.620951 0.624 0.000 0.000 0.024 0.352
#> SRR1437622 4 0.0963 0.912453 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1355172 1 0.6452 0.529619 0.584 0.000 0.224 0.024 0.168
#> SRR655531 5 0.1341 0.745182 0.056 0.000 0.000 0.000 0.944
#> SRR1338147 3 0.2754 0.844343 0.080 0.000 0.880 0.000 0.040
#> SRR1413329 5 0.2053 0.736328 0.024 0.000 0.048 0.004 0.924
#> SRR1485931 2 0.0162 0.859503 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1420873 5 0.3527 0.538694 0.172 0.000 0.000 0.024 0.804
#> SRR1333308 4 0.3642 0.669704 0.008 0.000 0.000 0.760 0.232
#> SRR1452033 1 0.4425 0.677432 0.680 0.000 0.000 0.024 0.296
#> SRR1467316 2 0.0162 0.859503 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR809018 3 0.0290 0.879106 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.860118 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 5 0.6798 0.163800 0.300 0.000 0.324 0.000 0.376
#> SRR1471755 4 0.1478 0.892195 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR808019 5 0.1800 0.724887 0.000 0.000 0.048 0.020 0.932
#> SRR1479133 3 0.3086 0.797276 0.180 0.000 0.816 0.000 0.004
#> SRR615069 2 0.4269 0.500011 0.000 0.684 0.016 0.000 0.300
#> SRR1456185 2 0.4888 0.655112 0.004 0.700 0.064 0.232 0.000
#> SRR1350069 4 0.1430 0.889008 0.004 0.000 0.000 0.944 0.052
#> SRR816316 1 0.2179 0.667035 0.896 0.000 0.004 0.000 0.100
#> SRR664795 1 0.4890 0.616950 0.708 0.000 0.216 0.004 0.072
#> SRR1490721 5 0.4588 0.567677 0.000 0.220 0.000 0.060 0.720
#> SRR810643 5 0.1774 0.710199 0.052 0.000 0.000 0.016 0.932
#> SRR1430333 5 0.3398 0.618354 0.004 0.216 0.000 0.000 0.780
#> SRR1085285 3 0.1478 0.868564 0.064 0.000 0.936 0.000 0.000
#> SRR1099072 1 0.3209 0.547509 0.812 0.000 0.180 0.000 0.008
#> SRR1317985 1 0.2411 0.748018 0.884 0.000 0.000 0.008 0.108
#> SRR1487340 1 0.2536 0.740474 0.868 0.000 0.000 0.004 0.128
#> SRR1420276 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1351347 3 0.3452 0.639260 0.000 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1405525 1 0.4557 0.565934 0.584 0.012 0.000 0.000 0.404
#> SRR1370329 1 0.2358 0.746319 0.888 0.000 0.000 0.008 0.104
#> SRR1465001 1 0.4817 0.571400 0.572 0.000 0.000 0.024 0.404
#> SRR1476525 2 0.2891 0.753579 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR819610 4 0.2690 0.791657 0.000 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR2157314 1 0.4339 0.676383 0.684 0.000 0.000 0.020 0.296
#> SRR1409465 2 0.0000 0.860118 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.3812 0.765575 0.092 0.000 0.000 0.812 0.096
#> SRR613639 3 0.2516 0.813587 0.140 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1402285 4 0.0404 0.912438 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1077038 1 0.1205 0.707128 0.956 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR1405660 3 0.0404 0.878980 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.5369 0.498257 0.660 0.216 0.000 0.000 0.124
#> SRR1394734 4 0.0963 0.912453 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1317771 1 0.1341 0.737213 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1365894 2 0.3010 0.735827 0.000 0.824 0.000 0.172 0.004
#> SRR1073581 1 0.6126 0.606427 0.596 0.000 0.112 0.020 0.272
#> SRR659804 1 0.4503 0.664089 0.664 0.000 0.000 0.024 0.312
#> SRR1345914 2 0.0162 0.859503 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1432186 2 0.4182 0.387462 0.000 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR1473529 2 0.4307 0.091756 0.000 0.504 0.000 0.496 0.000
#> SRR660764 3 0.0000 0.877930 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820448 1 0.1041 0.710522 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1328845 4 0.3688 0.762667 0.036 0.000 0.004 0.812 0.148
#> SRR1336415 4 0.0000 0.916974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1459190 1 0.2304 0.669667 0.892 0.000 0.100 0.000 0.008
#> SRR1346773 5 0.2719 0.614935 0.144 0.000 0.000 0.004 0.852
#> SRR1499521 5 0.1996 0.706027 0.036 0.000 0.004 0.032 0.928
#> SRR1440898 2 0.0162 0.859743 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1347459 3 0.3650 0.784132 0.176 0.000 0.796 0.000 0.028
#> SRR1081209 2 0.0162 0.859503 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1400202 1 0.3123 0.743284 0.828 0.000 0.000 0.012 0.160
#> SRR1333395 1 0.7331 0.307668 0.492 0.168 0.000 0.276 0.064
#> SRR1309248 2 0.0880 0.852767 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR809161 3 0.3835 0.719684 0.260 0.000 0.732 0.000 0.008
#> SRR1316320 2 0.0963 0.844829 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1432629 2 0.0963 0.850632 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1498931 1 0.3318 0.739682 0.808 0.000 0.000 0.012 0.180
#> SRR1416578 4 0.2230 0.867365 0.044 0.000 0.000 0.912 0.044
#> SRR1405547 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1470534 4 0.0000 0.916974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380764 5 0.1041 0.726471 0.032 0.000 0.000 0.004 0.964
#> SRR1309160 3 0.1270 0.871916 0.052 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.877930 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.4526 0.668485 0.672 0.000 0.000 0.028 0.300
#> SRR1078489 5 0.4975 0.584197 0.316 0.028 0.012 0.000 0.644
#> SRR1332648 4 0.0162 0.917679 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR660614 2 0.0794 0.848197 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1470420 2 0.3048 0.747344 0.000 0.820 0.176 0.000 0.004
#> SRR1475566 1 0.3039 0.743702 0.836 0.000 0.000 0.012 0.152
#> SRR1477949 1 0.4040 0.704152 0.724 0.000 0.000 0.016 0.260
#> SRR1481419 2 0.0510 0.857496 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1464766 5 0.4668 0.174328 0.352 0.000 0.000 0.024 0.624
#> SRR615946 3 0.2583 0.831897 0.132 0.000 0.864 0.000 0.004
#> SRR1446481 4 0.4114 0.351543 0.000 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1467656 2 0.3579 0.680051 0.000 0.756 0.240 0.000 0.004
#> SRR1402962 5 0.1357 0.742733 0.048 0.000 0.000 0.004 0.948
#> SRR660224 2 0.0162 0.859503 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR665586 1 0.0703 0.722945 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1347166 5 0.4080 0.649023 0.252 0.020 0.000 0.000 0.728
#> SRR1485722 5 0.0880 0.743792 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1415316 1 0.2329 0.745546 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR613390 1 0.1121 0.712186 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR661108 3 0.0880 0.876255 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.2011 0.746710 0.908 0.000 0.000 0.004 0.088
#> SRR817329 1 0.0404 0.716097 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1401990 4 0.2411 0.838199 0.008 0.000 0.000 0.884 0.108
#> SRR1467745 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1471795 2 0.3895 0.556994 0.000 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR1415637 2 0.0162 0.859503 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR813137 1 0.0324 0.715604 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1314873 1 0.0404 0.722456 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1401211 1 0.4565 0.661277 0.664 0.000 0.000 0.028 0.308
#> SRR1419692 4 0.0000 0.916974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818797 3 0.4908 0.592774 0.320 0.000 0.636 0.000 0.044
#> SRR2164608 3 0.5348 0.007835 0.052 0.000 0.492 0.000 0.456
#> SRR1455586 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR819459 3 0.0324 0.878264 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1488939 2 0.0162 0.859503 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1433232 2 0.0000 0.860118 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 1 0.1952 0.680122 0.912 0.000 0.004 0.000 0.084
#> SRR1361652 2 0.2068 0.799752 0.004 0.904 0.000 0.000 0.092
#> SRR1437119 1 0.3759 0.724934 0.764 0.000 0.000 0.016 0.220
#> SRR1478547 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1430910 2 0.4304 0.020819 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1310584 5 0.3359 0.631244 0.164 0.000 0.000 0.020 0.816
#> SRR1500216 1 0.1357 0.703006 0.948 0.000 0.004 0.000 0.048
#> SRR1486762 3 0.3857 0.667614 0.312 0.000 0.688 0.000 0.000
#> SRR1480854 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1489394 4 0.0290 0.918159 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.916974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.1341 0.884881 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1473058 4 0.0703 0.917567 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1405165 3 0.0404 0.878980 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.1410 0.721177 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1471477 1 0.5579 0.596095 0.588 0.000 0.024 0.040 0.348
#> SRR1098567 2 0.0609 0.854017 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1098712 4 0.5737 0.587645 0.024 0.000 0.104 0.664 0.208
#> SRR1455038 1 0.4060 0.151656 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1375248 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1403005 1 0.4668 0.207616 0.624 0.000 0.352 0.000 0.024
#> SRR1348378 4 0.0865 0.916516 0.000 0.024 0.004 0.972 0.000
#> SRR1413541 1 0.1197 0.721493 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1392943 4 0.4278 0.223759 0.000 0.000 0.000 0.548 0.452
#> SRR1475192 3 0.0162 0.878660 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1432085 3 0.2852 0.758377 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1452468 1 0.5778 0.396924 0.596 0.132 0.000 0.000 0.272
#> SRR1347060 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1414139 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1447962 3 0.2561 0.784391 0.000 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.3579 0.681142 0.000 0.756 0.240 0.000 0.004
#> SRR1415004 1 0.4181 0.696438 0.712 0.000 0.000 0.020 0.268
#> SRR1413436 1 0.3636 0.709618 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR1311266 5 0.0880 0.728176 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1343302 4 0.0000 0.916974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.3596 0.732630 0.776 0.000 0.000 0.012 0.212
#> SRR1429678 1 0.2439 0.743260 0.876 0.000 0.000 0.004 0.120
#> SRR1469413 3 0.1704 0.846126 0.000 0.068 0.928 0.000 0.004
#> SRR1405331 1 0.2046 0.684380 0.916 0.000 0.016 0.000 0.068
#> SRR1345609 1 0.3163 0.742380 0.824 0.000 0.000 0.012 0.164
#> SRR1380208 5 0.4015 0.419669 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1322840 4 0.0609 0.918137 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1399797 3 0.1502 0.869391 0.056 0.000 0.940 0.000 0.004
#> SRR1416654 3 0.0510 0.873421 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1315081 3 0.0162 0.877076 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1369196 3 0.0162 0.877530 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1400847 1 0.4252 0.696575 0.700 0.000 0.000 0.020 0.280
#> SRR1365291 5 0.6637 0.335907 0.280 0.000 0.268 0.000 0.452
#> SRR1367920 4 0.3016 0.812969 0.000 0.020 0.000 0.848 0.132
#> SRR1366648 3 0.0290 0.879106 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.860118 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 5 0.3336 0.637592 0.000 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR1363968 1 0.4924 0.524485 0.552 0.000 0.000 0.028 0.420
#> SRR814387 1 0.4872 0.517841 0.540 0.000 0.000 0.024 0.436
#> SRR657599 5 0.1710 0.720612 0.012 0.000 0.020 0.024 0.944
#> SRR1386689 4 0.0000 0.916974 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0290 0.878943 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1453811 3 0.5026 0.622828 0.280 0.000 0.656 0.000 0.064
#> SRR1441159 5 0.1704 0.730015 0.068 0.000 0.000 0.004 0.928
#> SRR1403154 4 0.0162 0.917679 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.877930 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 5 0.5422 0.604978 0.212 0.000 0.132 0.000 0.656
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 1 0.4011 0.5594 0.672 0.000 0.304 0.000 0.024 0.000
#> SRR1331708 1 0.3841 0.6484 0.764 0.068 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1464258 6 0.0146 0.7733 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1454201 5 0.0146 0.8745 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR661589 6 0.3464 0.3736 0.000 0.000 0.312 0.000 0.000 0.688
#> SRR1456229 6 0.0622 0.7727 0.008 0.000 0.000 0.000 0.012 0.980
#> SRR1315165 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.0458 0.7955 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1417809 1 0.2696 0.7507 0.856 0.000 0.000 0.116 0.000 0.028
#> SRR1094457 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095575 6 0.4062 0.1794 0.440 0.008 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR1315931 6 0.1584 0.7504 0.064 0.000 0.000 0.000 0.008 0.928
#> SRR1430066 3 0.2048 0.8272 0.000 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1431037 3 0.2912 0.7726 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1395554 3 0.3240 0.7461 0.000 0.000 0.752 0.000 0.004 0.244
#> SRR818002 4 0.0260 0.9374 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.0146 0.9024 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486845 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362866 5 0.0146 0.8745 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1490740 6 0.3620 0.4068 0.352 0.000 0.000 0.000 0.000 0.648
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.1367 0.7931 0.944 0.000 0.000 0.000 0.044 0.012
#> SRR1383907 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.1387 0.7902 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1375699 2 0.0820 0.8898 0.016 0.972 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1429846 6 0.3215 0.5367 0.000 0.000 0.240 0.000 0.004 0.756
#> SRR613550 6 0.1075 0.7609 0.000 0.000 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1348402 1 0.4672 0.4465 0.596 0.000 0.000 0.000 0.348 0.056
#> SRR1345146 1 0.0260 0.7947 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1324025 3 0.3668 0.6469 0.000 0.000 0.668 0.000 0.004 0.328
#> SRR1318879 3 0.5486 -0.0313 0.096 0.440 0.456 0.000 0.000 0.008
#> SRR820755 6 0.2431 0.7103 0.000 0.000 0.008 0.000 0.132 0.860
#> SRR1485830 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR599313 6 0.0725 0.7693 0.012 0.000 0.000 0.012 0.000 0.976
#> SRR612263 6 0.1176 0.7672 0.024 0.000 0.000 0.000 0.020 0.956
#> SRR1415398 6 0.2883 0.5892 0.000 0.000 0.212 0.000 0.000 0.788
#> SRR1326205 1 0.3867 0.0502 0.512 0.000 0.000 0.488 0.000 0.000
#> SRR1421327 4 0.0713 0.9221 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1083311 3 0.1957 0.8297 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1499303 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079522 2 0.1320 0.8775 0.036 0.948 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1452935 5 0.1644 0.8405 0.000 0.000 0.004 0.000 0.920 0.076
#> SRR1379495 1 0.3390 0.5558 0.704 0.000 0.000 0.000 0.000 0.296
#> SRR1470459 3 0.3607 0.4525 0.000 0.348 0.652 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.3862 0.5457 0.000 0.000 0.608 0.000 0.004 0.388
#> SRR615778 5 0.0458 0.8719 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1447564 1 0.3868 0.0330 0.504 0.000 0.000 0.000 0.000 0.496
#> SRR1455195 5 0.0000 0.8750 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655182 1 0.1814 0.7718 0.900 0.000 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1335140 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433555 3 0.1663 0.8363 0.000 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1308650 3 0.2491 0.7484 0.000 0.164 0.836 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.1075 0.7926 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1317446 3 0.1007 0.8387 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1413602 3 0.0000 0.8284 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809853 6 0.3330 0.5291 0.284 0.000 0.000 0.000 0.000 0.716
#> SRR661313 6 0.2320 0.6927 0.000 0.000 0.132 0.000 0.004 0.864
#> SRR1499935 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447303 3 0.5208 0.5305 0.000 0.000 0.556 0.000 0.108 0.336
#> SRR1429408 4 0.0260 0.9372 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1433950 6 0.3923 0.3524 0.372 0.000 0.000 0.000 0.008 0.620
#> SRR1362081 2 0.0632 0.8905 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 6 0.1296 0.7700 0.004 0.000 0.004 0.000 0.044 0.948
#> SRR1435229 5 0.1296 0.8595 0.004 0.004 0.000 0.000 0.948 0.044
#> SRR1085996 6 0.2821 0.6856 0.152 0.000 0.000 0.000 0.016 0.832
#> SRR1414229 5 0.0146 0.8748 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1400974 3 0.2664 0.7959 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1399971 6 0.3854 0.1013 0.464 0.000 0.000 0.000 0.000 0.536
#> SRR613927 6 0.0146 0.7735 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1457854 1 0.1714 0.7804 0.908 0.000 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1473714 4 0.6074 -0.1851 0.340 0.000 0.000 0.388 0.000 0.272
#> SRR813776 6 0.0717 0.7722 0.000 0.000 0.016 0.000 0.008 0.976
#> SRR808196 1 0.0547 0.7944 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1101085 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614395 6 0.0000 0.7731 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478251 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370551 3 0.3866 0.1214 0.000 0.484 0.516 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.2048 0.7660 0.880 0.000 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR665310 6 0.0865 0.7665 0.000 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1420109 6 0.0000 0.7731 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1330920 6 0.0632 0.7725 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1419539 3 0.1285 0.7960 0.052 0.000 0.944 0.000 0.004 0.000
#> SRR1359447 2 0.4591 0.2149 0.000 0.552 0.408 0.000 0.000 0.040
#> SRR1347259 4 0.2883 0.7234 0.212 0.000 0.000 0.788 0.000 0.000
#> SRR613915 6 0.2613 0.6818 0.000 0.000 0.140 0.000 0.012 0.848
#> SRR1384395 3 0.0363 0.8331 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR821715 6 0.2520 0.6717 0.000 0.000 0.152 0.000 0.004 0.844
#> SRR1478228 1 0.1261 0.7967 0.952 0.000 0.000 0.000 0.024 0.024
#> SRR1445637 6 0.3266 0.5491 0.272 0.000 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR608150 5 0.0146 0.8745 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1096383 1 0.0767 0.7948 0.976 0.000 0.012 0.000 0.008 0.004
#> SRR1341480 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341344 5 0.0260 0.8741 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1326270 6 0.1267 0.7544 0.000 0.000 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1498838 3 0.2697 0.7932 0.000 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1416313 3 0.3565 0.6792 0.000 0.000 0.692 0.000 0.004 0.304
#> SRR808566 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430270 4 0.0547 0.9276 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0790 0.8374 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR613533 6 0.3833 -0.0327 0.000 0.000 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR661267 3 0.2237 0.7785 0.036 0.000 0.896 0.000 0.068 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 5 0.0146 0.8745 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1420067 1 0.1745 0.7860 0.920 0.000 0.000 0.000 0.068 0.012
#> SRR1473632 6 0.4855 0.0119 0.460 0.056 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR812536 3 0.2260 0.8189 0.000 0.000 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1370850 2 0.3823 0.2311 0.000 0.564 0.000 0.436 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.3823 0.1581 0.000 0.564 0.436 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.3198 0.6245 0.260 0.740 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446375 1 0.3265 0.6097 0.748 0.000 0.004 0.000 0.000 0.248
#> SRR1465230 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614119 1 0.2190 0.7784 0.908 0.000 0.040 0.000 0.044 0.008
#> SRR1356101 3 0.1204 0.8182 0.000 0.056 0.944 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.1444 0.7859 0.928 0.000 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0922 0.7927 0.968 0.000 0.004 0.000 0.024 0.004
#> SRR660510 3 0.3531 0.6502 0.000 0.000 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1445655 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658953 6 0.4045 0.4487 0.008 0.336 0.000 0.000 0.008 0.648
#> SRR2166459 1 0.3547 0.4795 0.668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.332
#> SRR1070713 5 0.3244 0.6102 0.000 0.268 0.000 0.000 0.732 0.000
#> SRR1485312 3 0.2805 0.7945 0.000 0.000 0.812 0.000 0.004 0.184
#> SRR1317631 1 0.3565 0.5041 0.692 0.000 0.004 0.304 0.000 0.000
#> SRR1488610 5 0.3778 0.5257 0.288 0.000 0.000 0.000 0.696 0.016
#> SRR1330588 3 0.3403 0.7692 0.000 0.000 0.768 0.000 0.020 0.212
#> SRR1316367 5 0.0363 0.8728 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1433926 6 0.2416 0.6837 0.156 0.000 0.000 0.000 0.000 0.844
#> SRR1091302 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818263 6 0.2562 0.6821 0.000 0.000 0.000 0.000 0.172 0.828
#> SRR1404909 4 0.0146 0.9401 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR663076 1 0.0632 0.7955 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1323577 2 0.0458 0.8959 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0665 0.7957 0.980 0.000 0.000 0.004 0.008 0.008
#> SRR654862 5 0.2730 0.7261 0.000 0.000 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1407112 4 0.0146 0.9397 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1332969 6 0.2941 0.5743 0.000 0.000 0.220 0.000 0.000 0.780
#> SRR1353199 6 0.1663 0.7349 0.000 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1378885 6 0.2214 0.7228 0.000 0.000 0.096 0.000 0.016 0.888
#> SRR665357 3 0.0260 0.8316 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR662186 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 6 0.3266 0.4597 0.000 0.000 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1347819 3 0.2006 0.8324 0.000 0.000 0.892 0.000 0.004 0.104
#> SRR1480813 2 0.3620 0.4547 0.000 0.648 0.000 0.352 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.0146 0.9401 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.2135 0.8238 0.000 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1500472 5 0.2135 0.7957 0.128 0.000 0.000 0.000 0.872 0.000
#> SRR1417632 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 5 0.0363 0.8726 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1326579 5 0.0000 0.8750 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.1151 0.8825 0.032 0.956 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1096712 3 0.0790 0.8374 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1090407 3 0.3854 0.3783 0.000 0.000 0.536 0.000 0.000 0.464
#> SRR1083752 4 0.0146 0.9401 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1377599 4 0.0146 0.9401 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1488449 6 0.2762 0.6161 0.000 0.000 0.196 0.000 0.000 0.804
#> SRR1318354 5 0.0508 0.8725 0.000 0.012 0.004 0.000 0.984 0.000
#> SRR1359062 3 0.1444 0.8383 0.000 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1398924 5 0.2003 0.8024 0.000 0.116 0.000 0.000 0.884 0.000
#> SRR663783 3 0.1267 0.8396 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1319204 2 0.3384 0.7694 0.068 0.812 0.120 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 6 0.3221 0.5595 0.264 0.000 0.000 0.000 0.000 0.736
#> SRR1337449 2 0.0632 0.8902 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.0146 0.8269 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498595 4 0.0146 0.9401 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1377423 6 0.1501 0.7443 0.000 0.000 0.076 0.000 0.000 0.924
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.1333 0.7904 0.944 0.000 0.000 0.000 0.048 0.008
#> SRR1338426 3 0.0508 0.8276 0.012 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004
#> SRR1353309 3 0.0260 0.8315 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR658941 3 0.6033 -0.0740 0.364 0.000 0.388 0.000 0.248 0.000
#> SRR1101643 6 0.2941 0.6179 0.220 0.000 0.000 0.000 0.000 0.780
#> SRR1401468 1 0.4521 0.1098 0.524 0.000 0.024 0.004 0.448 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363858 4 0.1610 0.8596 0.084 0.000 0.000 0.916 0.000 0.000
#> SRR819820 3 0.2491 0.7001 0.164 0.000 0.836 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337342 5 0.0000 0.8750 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655206 3 0.1049 0.8095 0.032 0.000 0.960 0.008 0.000 0.000
#> SRR1387013 2 0.5449 0.1770 0.000 0.504 0.000 0.128 0.368 0.000
#> SRR1317410 1 0.1549 0.7938 0.936 0.000 0.000 0.000 0.044 0.020
#> SRR608198 5 0.0146 0.8748 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1440161 2 0.3838 0.1214 0.000 0.552 0.448 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 1 0.3023 0.6298 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1099622 3 0.2092 0.7710 0.000 0.000 0.876 0.124 0.000 0.000
#> SRR663197 3 0.3240 0.7459 0.000 0.000 0.752 0.000 0.004 0.244
#> SRR1394836 3 0.0363 0.8236 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR661699 3 0.3190 0.8154 0.044 0.000 0.820 0.000 0.000 0.136
#> SRR813680 3 0.4493 0.5642 0.132 0.000 0.708 0.000 0.000 0.160
#> SRR1410678 1 0.1075 0.7943 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1378109 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499174 6 0.3198 0.5654 0.260 0.000 0.000 0.000 0.000 0.740
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 4 0.2494 0.8203 0.000 0.016 0.000 0.864 0.120 0.000
#> SRR1433410 5 0.0000 0.8750 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661167 3 0.3620 0.6131 0.000 0.000 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1432518 3 0.5314 0.5829 0.000 0.000 0.584 0.000 0.264 0.152
#> SRR660462 3 0.2300 0.8173 0.000 0.000 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1374608 1 0.5862 0.4441 0.568 0.000 0.212 0.200 0.020 0.000
#> SRR657949 6 0.0767 0.7737 0.012 0.000 0.004 0.000 0.008 0.976
#> SRR1308882 4 0.0260 0.9371 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR655768 1 0.1663 0.7817 0.912 0.000 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1485870 1 0.4902 -0.0165 0.480 0.460 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1444138 1 0.3847 0.1397 0.544 0.000 0.000 0.000 0.000 0.456
#> SRR1417342 1 0.1444 0.7845 0.928 0.000 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1470193 4 0.3747 0.3422 0.396 0.000 0.000 0.604 0.000 0.000
#> SRR1091380 3 0.2491 0.6992 0.164 0.000 0.836 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.1500 0.7910 0.936 0.000 0.000 0.000 0.052 0.012
#> SRR1313583 1 0.4325 0.2358 0.524 0.000 0.000 0.456 0.000 0.020
#> SRR1467102 3 0.0000 0.8284 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818821 3 0.2912 0.7645 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR809963 6 0.0000 0.7731 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1072247 1 0.2744 0.7371 0.840 0.000 0.000 0.000 0.016 0.144
#> SRR1353710 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445259 5 0.2632 0.7377 0.000 0.004 0.000 0.000 0.832 0.164
#> SRR1408393 6 0.0291 0.7736 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004 0.992
#> SRR1361522 6 0.3050 0.5979 0.236 0.000 0.000 0.000 0.000 0.764
#> SRR1368597 6 0.3737 0.3530 0.392 0.000 0.000 0.000 0.000 0.608
#> SRR1309680 2 0.0363 0.8981 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.1075 0.8393 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1333485 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406437 3 0.4730 -0.0648 0.468 0.000 0.496 0.016 0.020 0.000
#> SRR1354931 3 0.1863 0.8331 0.000 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1391856 3 0.0508 0.8244 0.004 0.000 0.984 0.000 0.012 0.000
#> SRR1446738 5 0.4199 0.6021 0.020 0.000 0.020 0.256 0.704 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0972 0.8862 0.000 0.964 0.008 0.028 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.1267 0.8394 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR613150 3 0.0260 0.8315 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1375329 2 0.0547 0.8947 0.020 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387921 1 0.2003 0.7680 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0458 0.7956 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR812943 6 0.5212 0.3397 0.100 0.368 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1400910 2 0.3774 0.2705 0.000 0.592 0.000 0.000 0.408 0.000
#> SRR1444203 4 0.0260 0.9372 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR816177 4 0.0146 0.9401 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR658754 3 0.2730 0.7902 0.000 0.000 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1429603 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397366 6 0.1663 0.7363 0.000 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1446028 1 0.4473 0.5630 0.676 0.000 0.000 0.000 0.072 0.252
#> SRR1083918 4 0.0632 0.9252 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1337606 5 0.0146 0.8747 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR659109 3 0.2823 0.7819 0.000 0.000 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1337192 5 0.0146 0.8748 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR656946 1 0.1610 0.7827 0.916 0.000 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1476102 1 0.2980 0.7073 0.808 0.000 0.000 0.000 0.180 0.012
#> SRR1476447 6 0.5057 0.3527 0.324 0.000 0.000 0.000 0.096 0.580
#> SRR1342067 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075971 6 0.5887 0.2606 0.272 0.000 0.000 0.000 0.252 0.476
#> SRR614419 5 0.1610 0.8293 0.000 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1322936 5 0.0790 0.8646 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1349121 1 0.1151 0.7964 0.956 0.000 0.000 0.000 0.012 0.032
#> SRR1430549 1 0.6035 0.0393 0.376 0.000 0.000 0.000 0.248 0.376
#> SRR612935 2 0.3564 0.6069 0.000 0.724 0.264 0.000 0.000 0.012
#> SRR661481 2 0.3446 0.5476 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.0405 0.9359 0.004 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1452164 6 0.3823 0.1877 0.436 0.000 0.000 0.000 0.000 0.564
#> SRR1070503 6 0.3284 0.6642 0.000 0.000 0.032 0.000 0.168 0.800
#> SRR1499894 3 0.0632 0.8363 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1082883 5 0.0146 0.8745 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1468271 1 0.2126 0.7715 0.904 0.000 0.020 0.000 0.072 0.004
#> SRR1332443 1 0.2494 0.7676 0.864 0.000 0.000 0.000 0.016 0.120
#> SRR810295 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 6 0.2631 0.6624 0.180 0.000 0.000 0.000 0.000 0.820
#> SRR1328620 5 0.1995 0.8452 0.036 0.000 0.052 0.000 0.912 0.000
#> SRR1396294 1 0.4099 0.5710 0.696 0.000 0.272 0.024 0.008 0.000
#> SRR1419917 6 0.2340 0.6910 0.148 0.000 0.000 0.000 0.000 0.852
#> SRR662114 5 0.3927 0.6604 0.000 0.008 0.040 0.000 0.752 0.200
#> SRR1489199 5 0.0713 0.8680 0.000 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR813584 4 0.0520 0.9333 0.008 0.008 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1069638 5 0.1327 0.8471 0.000 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR614864 5 0.4464 0.6008 0.000 0.000 0.148 0.000 0.712 0.140
#> SRR1433392 6 0.0291 0.7735 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.1267 0.7905 0.940 0.000 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1401252 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309963 4 0.0260 0.9372 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.3867 0.0629 0.512 0.000 0.000 0.000 0.000 0.488
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.3050 0.6469 0.764 0.000 0.000 0.000 0.000 0.236
#> SRR1380393 1 0.0865 0.7948 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1319731 1 0.1780 0.7939 0.924 0.000 0.000 0.000 0.028 0.048
#> SRR1356468 1 0.1464 0.7835 0.944 0.000 0.004 0.036 0.016 0.000
#> SRR1337010 2 0.0146 0.9021 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 5 0.0146 0.8745 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1486538 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377696 4 0.3867 0.0448 0.000 0.488 0.000 0.512 0.000 0.000
#> SRR1465459 6 0.1297 0.7622 0.000 0.000 0.040 0.000 0.012 0.948
#> SRR1080270 3 0.1075 0.8394 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1312501 3 0.3668 0.6467 0.000 0.000 0.668 0.000 0.004 0.328
#> SRR1093148 5 0.2331 0.8273 0.080 0.000 0.032 0.000 0.888 0.000
#> SRR1467080 3 0.0865 0.8385 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1410866 4 0.2378 0.7844 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613342 6 0.2697 0.6312 0.000 0.000 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR1452246 2 0.0937 0.8794 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396616 6 0.2762 0.6138 0.000 0.000 0.196 0.000 0.000 0.804
#> SRR813824 3 0.3795 0.5894 0.000 0.000 0.632 0.000 0.004 0.364
#> SRR1082376 6 0.0458 0.7735 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1500891 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR807543 6 0.0508 0.7737 0.000 0.000 0.004 0.000 0.012 0.984
#> SRR1091572 6 0.2092 0.7253 0.000 0.000 0.000 0.000 0.124 0.876
#> SRR1346689 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332424 5 0.0146 0.8745 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR663729 1 0.4726 0.2775 0.528 0.000 0.000 0.424 0.048 0.000
#> SRR1097013 1 0.2300 0.7474 0.856 0.000 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR613675 5 0.0713 0.8664 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1485357 4 0.2300 0.7991 0.144 0.000 0.000 0.856 0.000 0.000
#> SRR655816 3 0.0777 0.8362 0.004 0.000 0.972 0.000 0.000 0.024
#> SRR1500113 1 0.0520 0.7954 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1437622 4 0.0146 0.9401 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1355172 1 0.1910 0.7570 0.892 0.000 0.108 0.000 0.000 0.000
#> SRR655531 5 0.0146 0.8748 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1338147 3 0.3717 0.7063 0.000 0.000 0.708 0.000 0.016 0.276
#> SRR1413329 5 0.2509 0.8217 0.088 0.000 0.036 0.000 0.876 0.000
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.1908 0.7653 0.900 0.000 0.000 0.000 0.096 0.004
#> SRR1333308 1 0.3221 0.6120 0.736 0.000 0.000 0.264 0.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.1958 0.7720 0.896 0.000 0.000 0.000 0.004 0.100
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.1610 0.8371 0.000 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 6 0.4143 0.6109 0.000 0.000 0.084 0.000 0.180 0.736
#> SRR1471755 4 0.1610 0.8673 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000 0.000
#> SRR808019 5 0.4029 0.5600 0.292 0.000 0.028 0.000 0.680 0.000
#> SRR1479133 6 0.3782 0.2274 0.000 0.000 0.360 0.000 0.004 0.636
#> SRR615069 5 0.3851 0.1382 0.000 0.460 0.000 0.000 0.540 0.000
#> SRR1456185 2 0.1226 0.8746 0.000 0.952 0.040 0.004 0.000 0.004
#> SRR1350069 1 0.3515 0.4766 0.676 0.000 0.000 0.324 0.000 0.000
#> SRR816316 6 0.0458 0.7734 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR664795 1 0.4638 0.5323 0.636 0.000 0.296 0.000 0.000 0.068
#> SRR1490721 5 0.0405 0.8728 0.004 0.000 0.000 0.008 0.988 0.000
#> SRR810643 1 0.3672 0.4107 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368 0.000
#> SRR1430333 5 0.0000 0.8750 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085285 3 0.3409 0.6871 0.000 0.000 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1099072 6 0.1010 0.7655 0.000 0.000 0.036 0.000 0.004 0.960
#> SRR1317985 6 0.3782 0.2589 0.412 0.000 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1487340 6 0.3728 0.4180 0.344 0.000 0.000 0.000 0.004 0.652
#> SRR1420276 3 0.0363 0.8329 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1351347 3 0.3758 0.5428 0.000 0.000 0.668 0.000 0.324 0.008
#> SRR1405525 1 0.3560 0.7595 0.820 0.016 0.000 0.000 0.092 0.072
#> SRR1370329 6 0.3659 0.3762 0.364 0.000 0.000 0.000 0.000 0.636
#> SRR1465001 1 0.1341 0.7964 0.948 0.000 0.000 0.000 0.024 0.028
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819610 4 0.0937 0.9112 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.1556 0.7845 0.920 0.000 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 1 0.1682 0.7898 0.928 0.000 0.000 0.052 0.000 0.020
#> SRR613639 6 0.3823 0.1185 0.000 0.000 0.436 0.000 0.000 0.564
#> SRR1402285 4 0.2562 0.7567 0.172 0.000 0.000 0.828 0.000 0.000
#> SRR1077038 6 0.0000 0.7731 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405660 3 0.1714 0.8352 0.000 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1095455 6 0.4789 0.6016 0.144 0.124 0.000 0.000 0.020 0.712
#> SRR1394734 4 0.0146 0.9401 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1317771 6 0.3847 0.1466 0.456 0.000 0.000 0.000 0.000 0.544
#> SRR1365894 2 0.0937 0.8835 0.040 0.960 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073581 1 0.1858 0.7628 0.904 0.000 0.092 0.000 0.004 0.000
#> SRR659804 1 0.1584 0.7903 0.928 0.000 0.000 0.000 0.008 0.064
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 4 0.3756 0.3128 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000 0.000
#> SRR1473529 4 0.3868 0.0139 0.000 0.496 0.000 0.504 0.000 0.000
#> SRR660764 3 0.2003 0.8288 0.000 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR820448 6 0.0000 0.7731 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1328845 1 0.2020 0.7563 0.896 0.000 0.008 0.096 0.000 0.000
#> SRR1336415 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459190 6 0.2325 0.7477 0.060 0.000 0.048 0.000 0.000 0.892
#> SRR1346773 1 0.2703 0.7150 0.824 0.000 0.000 0.000 0.172 0.004
#> SRR1499521 1 0.2696 0.7331 0.856 0.000 0.028 0.000 0.116 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.4045 0.4621 0.000 0.000 0.564 0.000 0.008 0.428
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.3966 0.2223 0.552 0.000 0.000 0.000 0.004 0.444
#> SRR1333395 1 0.2250 0.7607 0.888 0.092 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1309248 2 0.2009 0.8416 0.024 0.908 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR809161 6 0.3163 0.5551 0.000 0.000 0.232 0.000 0.004 0.764
#> SRR1316320 2 0.0291 0.9008 0.004 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1432629 2 0.3647 0.4437 0.000 0.640 0.000 0.360 0.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.3717 0.3673 0.616 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR1416578 1 0.2762 0.6877 0.804 0.000 0.000 0.196 0.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0790 0.8374 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1470534 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380764 5 0.3756 0.3070 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600 0.000
#> SRR1309160 3 0.3126 0.7443 0.000 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR663489 3 0.1327 0.8390 0.000 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1500450 1 0.0260 0.7947 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1078489 5 0.3508 0.5709 0.000 0.000 0.004 0.000 0.704 0.292
#> SRR1332648 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660614 2 0.0260 0.9006 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.2402 0.7900 0.004 0.856 0.140 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.3737 0.3680 0.608 0.000 0.000 0.000 0.000 0.392
#> SRR1477949 1 0.0865 0.7943 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.5784 0.2219 0.460 0.000 0.000 0.000 0.356 0.184
#> SRR615946 3 0.3944 0.4631 0.000 0.000 0.568 0.000 0.004 0.428
#> SRR1446481 4 0.3869 -0.0403 0.000 0.500 0.000 0.500 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.1501 0.8454 0.000 0.924 0.076 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 5 0.0000 0.8750 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665586 6 0.2178 0.7048 0.132 0.000 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1347166 5 0.0260 0.8741 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1485722 5 0.0458 0.8714 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1415316 6 0.3843 0.1611 0.452 0.000 0.000 0.000 0.000 0.548
#> SRR613390 6 0.0858 0.7665 0.028 0.000 0.000 0.000 0.004 0.968
#> SRR661108 3 0.2597 0.8003 0.000 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR2170173 6 0.3717 0.3614 0.384 0.000 0.000 0.000 0.000 0.616
#> SRR817329 6 0.0790 0.7639 0.032 0.000 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1401990 1 0.3508 0.5301 0.704 0.000 0.000 0.292 0.004 0.000
#> SRR1467745 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.3854 0.1564 0.000 0.536 0.000 0.464 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 6 0.0713 0.7675 0.028 0.000 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR1314873 6 0.2260 0.6998 0.140 0.000 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1401211 1 0.0363 0.7957 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1419692 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818797 6 0.1866 0.7354 0.000 0.000 0.084 0.000 0.008 0.908
#> SRR2164608 3 0.4771 0.5159 0.116 0.000 0.664 0.000 0.220 0.000
#> SRR1455586 3 0.0000 0.8284 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819459 3 0.0790 0.8384 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1488939 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 6 0.0458 0.7734 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1361652 2 0.2772 0.7173 0.004 0.816 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1437119 1 0.3482 0.5197 0.684 0.000 0.000 0.000 0.000 0.316
#> SRR1478547 3 0.0632 0.8363 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1430910 5 0.3508 0.5507 0.000 0.292 0.004 0.000 0.704 0.000
#> SRR1310584 5 0.4067 0.1406 0.444 0.000 0.000 0.000 0.548 0.008
#> SRR1500216 6 0.0725 0.7693 0.012 0.000 0.000 0.012 0.000 0.976
#> SRR1486762 6 0.2340 0.6809 0.000 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR1480854 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.3081 0.6781 0.220 0.000 0.000 0.776 0.004 0.000
#> SRR1473058 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405165 3 0.1610 0.8366 0.000 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1433004 6 0.1910 0.7227 0.108 0.000 0.000 0.000 0.000 0.892
#> SRR1471477 1 0.0520 0.7944 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 1 0.3855 0.6376 0.748 0.000 0.216 0.024 0.012 0.000
#> SRR1455038 6 0.2300 0.7132 0.000 0.000 0.000 0.000 0.144 0.856
#> SRR1375248 3 0.0000 0.8284 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 6 0.1082 0.7633 0.000 0.000 0.040 0.000 0.004 0.956
#> SRR1348378 4 0.0146 0.9392 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1413541 6 0.2178 0.7045 0.132 0.000 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1392943 5 0.1926 0.8341 0.020 0.000 0.000 0.068 0.912 0.000
#> SRR1475192 3 0.1007 0.8390 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1432085 3 0.2854 0.6978 0.000 0.208 0.792 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 5 0.5919 0.1595 0.080 0.408 0.000 0.000 0.468 0.044
#> SRR1347060 3 0.0547 0.8353 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1414139 3 0.0000 0.8284 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447962 3 0.3151 0.6395 0.000 0.252 0.748 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.2454 0.7653 0.000 0.840 0.160 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.1387 0.7886 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1413436 1 0.1075 0.7924 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1311266 5 0.3309 0.5938 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720 0.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.3991 0.1124 0.524 0.000 0.000 0.000 0.004 0.472
#> SRR1429678 6 0.3795 0.3746 0.364 0.000 0.000 0.000 0.004 0.632
#> SRR1469413 3 0.2003 0.7856 0.000 0.116 0.884 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 6 0.0508 0.7737 0.000 0.000 0.004 0.000 0.012 0.984
#> SRR1345609 1 0.2969 0.6670 0.776 0.000 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1380208 5 0.1141 0.8557 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1322840 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.2772 0.7968 0.000 0.000 0.816 0.000 0.004 0.180
#> SRR1416654 3 0.1549 0.8315 0.000 0.000 0.936 0.000 0.044 0.020
#> SRR1315081 3 0.0547 0.8354 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1369196 3 0.0547 0.8353 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1400847 1 0.3426 0.5717 0.720 0.000 0.000 0.000 0.004 0.276
#> SRR1365291 6 0.4747 0.4319 0.000 0.000 0.080 0.000 0.288 0.632
#> SRR1367920 4 0.0260 0.9371 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1366648 3 0.1267 0.8396 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9040 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.5716 0.1187 0.188 0.000 0.500 0.000 0.312 0.000
#> SRR1363968 1 0.1003 0.7915 0.964 0.000 0.004 0.000 0.028 0.004
#> SRR814387 1 0.2009 0.7883 0.908 0.000 0.000 0.000 0.068 0.024
#> SRR657599 1 0.4166 0.6028 0.728 0.000 0.076 0.000 0.196 0.000
#> SRR1386689 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.1387 0.8393 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1453811 6 0.2896 0.6563 0.000 0.000 0.160 0.000 0.016 0.824
#> SRR1441159 5 0.3592 0.4225 0.344 0.000 0.000 0.000 0.656 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.9419 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.1714 0.8354 0.000 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1310275 5 0.1806 0.8249 0.000 0.000 0.004 0.000 0.908 0.088
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.257 0.758 0.837 0.3240 0.747 0.747
#> 3 3 0.256 0.609 0.780 0.3274 0.972 0.963
#> 4 4 0.240 0.488 0.727 0.3118 0.628 0.498
#> 5 5 0.313 0.522 0.703 0.1171 0.896 0.742
#> 6 6 0.390 0.446 0.684 0.0765 0.944 0.837
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.7745 0.79887 0.772 0.228
#> SRR1331708 1 0.5059 0.84158 0.888 0.112
#> SRR1464258 2 0.9129 0.42820 0.328 0.672
#> SRR1454201 1 0.5946 0.83450 0.856 0.144
#> SRR661589 1 0.1184 0.82917 0.984 0.016
#> SRR1456229 1 0.8207 0.78382 0.744 0.256
#> SRR1315165 2 0.5946 0.75350 0.144 0.856
#> SRR1488960 1 0.7674 0.80476 0.776 0.224
#> SRR1417809 1 0.8955 0.68483 0.688 0.312
#> SRR1094457 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR1095575 1 0.1414 0.83095 0.980 0.020
#> SRR1315931 2 0.9129 0.42820 0.328 0.672
#> SRR1430066 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1431037 1 0.0376 0.82527 0.996 0.004
#> SRR1395554 1 0.0376 0.82476 0.996 0.004
#> SRR818002 1 0.9998 0.06056 0.508 0.492
#> SRR1344143 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1486845 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR1362866 1 0.6343 0.83006 0.840 0.160
#> SRR1490740 1 0.8813 0.73747 0.700 0.300
#> SRR1446627 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1456138 1 0.8081 0.64899 0.752 0.248
#> SRR1416248 1 0.8144 0.78064 0.748 0.252
#> SRR1383907 2 0.9635 0.37734 0.388 0.612
#> SRR1311018 1 0.8909 0.72644 0.692 0.308
#> SRR1375699 1 0.1633 0.83262 0.976 0.024
#> SRR1429846 1 0.4431 0.84099 0.908 0.092
#> SRR613550 1 0.5842 0.83717 0.860 0.140
#> SRR1348402 1 0.8016 0.78848 0.756 0.244
#> SRR1345146 1 0.0672 0.82551 0.992 0.008
#> SRR1324025 1 0.4161 0.84080 0.916 0.084
#> SRR1318879 1 0.0376 0.82311 0.996 0.004
#> SRR820755 1 0.5408 0.83928 0.876 0.124
#> SRR1485830 2 0.6973 0.70104 0.188 0.812
#> SRR599313 2 0.6801 0.70190 0.180 0.820
#> SRR612263 1 0.5946 0.83730 0.856 0.144
#> SRR1415398 1 0.2603 0.83696 0.956 0.044
#> SRR1326205 1 0.9248 0.64028 0.660 0.340
#> SRR1421327 2 0.0672 0.81757 0.008 0.992
#> SRR1083311 1 0.0376 0.82463 0.996 0.004
#> SRR1499303 2 0.5519 0.76200 0.128 0.872
#> SRR1079522 1 0.1414 0.83042 0.980 0.020
#> SRR1452935 1 0.0376 0.82311 0.996 0.004
#> SRR1379495 1 0.8909 0.72692 0.692 0.308
#> SRR1470459 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR661361 1 0.8016 0.78832 0.756 0.244
#> SRR615778 1 0.5294 0.83850 0.880 0.120
#> SRR1447564 1 0.8763 0.74182 0.704 0.296
#> SRR1455195 1 0.7299 0.81294 0.796 0.204
#> SRR655182 1 0.6148 0.83259 0.848 0.152
#> SRR1335140 1 0.9393 0.45893 0.644 0.356
#> SRR1433555 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1308650 1 0.4022 0.84280 0.920 0.080
#> SRR1388354 1 0.8443 0.76378 0.728 0.272
#> SRR1317446 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1413602 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1479955 1 0.1633 0.81946 0.976 0.024
#> SRR809853 1 0.8763 0.74168 0.704 0.296
#> SRR661313 1 0.7950 0.79486 0.760 0.240
#> SRR1499935 2 0.5294 0.76952 0.120 0.880
#> SRR1447303 1 0.4022 0.84076 0.920 0.080
#> SRR1429408 2 0.9944 0.14553 0.456 0.544
#> SRR1433950 1 0.7745 0.80286 0.772 0.228
#> SRR1362081 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1409854 1 0.5519 0.84157 0.872 0.128
#> SRR1435229 1 0.0938 0.82727 0.988 0.012
#> SRR1085996 1 0.7883 0.80121 0.764 0.236
#> SRR1414229 1 0.6148 0.83228 0.848 0.152
#> SRR1400974 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.8909 0.72644 0.692 0.308
#> SRR613927 1 0.8081 0.78892 0.752 0.248
#> SRR1457854 1 0.8443 0.76378 0.728 0.272
#> SRR1473714 2 0.6801 0.70190 0.180 0.820
#> SRR813776 1 0.5408 0.83928 0.876 0.124
#> SRR808196 1 0.9000 0.68167 0.684 0.316
#> SRR1101085 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR614395 1 0.8861 0.73271 0.696 0.304
#> SRR1478251 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR1370551 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.8909 0.72692 0.692 0.308
#> SRR665310 1 0.3733 0.84008 0.928 0.072
#> SRR1420109 1 0.2603 0.83412 0.956 0.044
#> SRR1330920 1 0.6343 0.83287 0.840 0.160
#> SRR1419539 1 0.3114 0.83982 0.944 0.056
#> SRR1359447 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1347259 1 0.9732 0.46734 0.596 0.404
#> SRR613915 1 0.6343 0.83517 0.840 0.160
#> SRR1384395 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR821715 1 0.3431 0.84006 0.936 0.064
#> SRR1478228 1 0.8386 0.76721 0.732 0.268
#> SRR1445637 1 0.4022 0.84135 0.920 0.080
#> SRR608150 1 0.7299 0.81544 0.796 0.204
#> SRR1096383 1 0.8081 0.78471 0.752 0.248
#> SRR1341480 2 0.0672 0.81777 0.008 0.992
#> SRR1341344 1 0.7602 0.80474 0.780 0.220
#> SRR1326270 1 0.8499 0.75416 0.724 0.276
#> SRR1498838 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1416313 1 0.0376 0.82476 0.996 0.004
#> SRR808566 2 0.9635 0.37734 0.388 0.612
#> SRR1430270 2 0.1414 0.81555 0.020 0.980
#> SRR1367825 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR613533 1 0.1184 0.82874 0.984 0.016
#> SRR661267 1 0.7453 0.80826 0.788 0.212
#> SRR810665 1 0.4161 0.79152 0.916 0.084
#> SRR1407250 1 0.6438 0.82849 0.836 0.164
#> SRR1420067 1 0.6801 0.82307 0.820 0.180
#> SRR1473632 1 0.8763 0.74168 0.704 0.296
#> SRR812536 1 0.6048 0.83581 0.852 0.148
#> SRR1370850 1 0.7056 0.74789 0.808 0.192
#> SRR1486195 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1407671 1 0.7376 0.80271 0.792 0.208
#> SRR1446375 1 0.1184 0.82785 0.984 0.016
#> SRR1465230 2 0.0672 0.81793 0.008 0.992
#> SRR614119 1 0.7815 0.80524 0.768 0.232
#> SRR1356101 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.7219 0.81669 0.800 0.200
#> SRR1392676 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR665538 1 0.7453 0.80826 0.788 0.212
#> SRR660510 1 0.1184 0.82917 0.984 0.016
#> SRR1445655 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR658953 1 0.3114 0.83824 0.944 0.056
#> SRR2166459 1 0.7453 0.81147 0.788 0.212
#> SRR1070713 1 0.9044 0.65381 0.680 0.320
#> SRR1485312 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1317631 1 0.7745 0.79232 0.772 0.228
#> SRR1488610 1 0.6887 0.82191 0.816 0.184
#> SRR1330588 1 0.2948 0.83843 0.948 0.052
#> SRR1316367 1 0.5946 0.83882 0.856 0.144
#> SRR1433926 1 0.8955 0.72158 0.688 0.312
#> SRR1091302 2 0.9491 0.41363 0.368 0.632
#> SRR818263 1 0.6247 0.83423 0.844 0.156
#> SRR1404909 2 0.5519 0.76216 0.128 0.872
#> SRR663076 1 0.8608 0.75256 0.716 0.284
#> SRR1323577 1 0.8443 0.63682 0.728 0.272
#> SRR1442422 2 0.0672 0.81793 0.008 0.992
#> SRR1465893 1 0.8144 0.78012 0.748 0.252
#> SRR654862 1 0.6438 0.83249 0.836 0.164
#> SRR1407112 2 0.0672 0.81793 0.008 0.992
#> SRR1332969 1 0.2778 0.83806 0.952 0.048
#> SRR1353199 1 0.3733 0.84008 0.928 0.072
#> SRR1378885 1 0.4298 0.84112 0.912 0.088
#> SRR665357 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR662186 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1501020 1 0.2423 0.83439 0.960 0.040
#> SRR1347819 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1480813 1 0.6712 0.72674 0.824 0.176
#> SRR1472576 2 0.9998 0.00858 0.492 0.508
#> SRR1431781 2 0.5629 0.76192 0.132 0.868
#> SRR1452270 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.2236 0.83538 0.964 0.036
#> SRR1417632 2 0.9710 0.42704 0.400 0.600
#> SRR1350153 1 0.2603 0.80222 0.956 0.044
#> SRR1458113 1 0.5294 0.84027 0.880 0.120
#> SRR1326579 1 0.6973 0.81955 0.812 0.188
#> SRR1349363 1 0.0938 0.82866 0.988 0.012
#> SRR1096712 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1090407 1 0.2778 0.83779 0.952 0.048
#> SRR1083752 1 0.9815 0.29249 0.580 0.420
#> SRR1377599 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR1488449 1 0.1633 0.83131 0.976 0.024
#> SRR1318354 1 0.0672 0.82689 0.992 0.008
#> SRR1359062 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1398924 1 0.4690 0.84308 0.900 0.100
#> SRR663783 1 0.1184 0.82791 0.984 0.016
#> SRR1319204 1 0.0938 0.82759 0.988 0.012
#> SRR1369070 1 0.6623 0.71838 0.828 0.172
#> SRR615659 1 0.8955 0.72158 0.688 0.312
#> SRR1337449 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1316982 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1498595 1 0.9427 0.44667 0.640 0.360
#> SRR1377423 1 0.2603 0.83412 0.956 0.044
#> SRR1312310 1 0.0376 0.82494 0.996 0.004
#> SRR1485613 1 0.7950 0.79014 0.760 0.240
#> SRR1338426 1 0.0376 0.82311 0.996 0.004
#> SRR1353309 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR658941 1 0.5294 0.84037 0.880 0.120
#> SRR1101643 2 0.7883 0.62144 0.236 0.764
#> SRR1401468 1 0.7745 0.79887 0.772 0.228
#> SRR1368874 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1324085 2 0.9795 0.29745 0.416 0.584
#> SRR1363858 2 0.6801 0.70190 0.180 0.820
#> SRR819820 1 0.4562 0.84158 0.904 0.096
#> SRR1337342 1 0.6801 0.82307 0.820 0.180
#> SRR655206 1 0.2778 0.83840 0.952 0.048
#> SRR1387013 1 0.8144 0.64105 0.748 0.252
#> SRR1317410 1 0.8499 0.76007 0.724 0.276
#> SRR608198 1 0.7299 0.81273 0.796 0.204
#> SRR1440161 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1343741 1 0.6712 0.71251 0.824 0.176
#> SRR1381288 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1415379 1 0.9170 0.65616 0.668 0.332
#> SRR1099622 1 0.6623 0.72072 0.828 0.172
#> SRR663197 1 0.7376 0.81445 0.792 0.208
#> SRR1394836 1 0.3114 0.83982 0.944 0.056
#> SRR661699 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR813680 1 0.7674 0.80371 0.776 0.224
#> SRR1410678 1 0.8909 0.72692 0.692 0.308
#> SRR1378109 2 0.0672 0.81793 0.008 0.992
#> SRR1499174 1 0.8813 0.73711 0.700 0.300
#> SRR1311486 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1382851 1 0.9248 0.61253 0.660 0.340
#> SRR1433410 1 0.6973 0.81978 0.812 0.188
#> SRR661167 1 0.3733 0.84055 0.928 0.072
#> SRR1432518 1 0.0376 0.82311 0.996 0.004
#> SRR660462 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1374608 1 0.7883 0.78517 0.764 0.236
#> SRR657949 1 0.3274 0.83854 0.940 0.060
#> SRR1308882 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR655768 1 0.9954 0.39260 0.540 0.460
#> SRR1485870 1 0.8661 0.69685 0.712 0.288
#> SRR1444138 1 0.5178 0.84122 0.884 0.116
#> SRR1417342 1 0.7815 0.79934 0.768 0.232
#> SRR1470193 1 0.8267 0.76218 0.740 0.260
#> SRR1091380 1 0.4562 0.84158 0.904 0.096
#> SRR1099096 1 0.8267 0.77560 0.740 0.260
#> SRR1313583 2 0.9209 0.42645 0.336 0.664
#> SRR1467102 1 0.0938 0.82880 0.988 0.012
#> SRR1485416 2 0.2603 0.80551 0.044 0.956
#> SRR818821 1 0.1184 0.82874 0.984 0.016
#> SRR809963 1 0.8861 0.73271 0.696 0.304
#> SRR1072247 1 0.8499 0.76007 0.724 0.276
#> SRR1353710 1 0.9795 0.43672 0.584 0.416
#> SRR1445259 1 0.0672 0.82689 0.992 0.008
#> SRR1408393 1 0.3733 0.83902 0.928 0.072
#> SRR1361522 1 0.8955 0.72158 0.688 0.312
#> SRR1368597 1 0.6801 0.82856 0.820 0.180
#> SRR1309680 1 0.4939 0.77734 0.892 0.108
#> SRR1310542 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1333485 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR1406437 1 0.7139 0.81365 0.804 0.196
#> SRR1354931 1 0.5946 0.83812 0.856 0.144
#> SRR1391856 1 0.8713 0.69682 0.708 0.292
#> SRR1446738 1 0.8861 0.67428 0.696 0.304
#> SRR1309032 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1388145 1 0.6343 0.73916 0.840 0.160
#> SRR1432611 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR815869 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR613150 1 0.6343 0.83279 0.840 0.160
#> SRR1375329 1 0.2236 0.83538 0.964 0.036
#> SRR1387921 1 0.8661 0.74901 0.712 0.288
#> SRR1466792 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1360478 1 0.3274 0.78996 0.940 0.060
#> SRR1360695 1 0.7674 0.80081 0.776 0.224
#> SRR812943 1 0.8763 0.74168 0.704 0.296
#> SRR1400910 1 0.1414 0.83062 0.980 0.020
#> SRR1444203 2 0.0938 0.81754 0.012 0.988
#> SRR816177 1 0.9866 0.29916 0.568 0.432
#> SRR658754 1 0.0376 0.82476 0.996 0.004
#> SRR1429603 1 0.9754 0.45593 0.592 0.408
#> SRR1397366 1 0.4022 0.84009 0.920 0.080
#> SRR1446028 1 0.8661 0.74971 0.712 0.288
#> SRR1083918 1 0.9896 0.29755 0.560 0.440
#> SRR1337606 1 0.6148 0.83228 0.848 0.152
#> SRR659109 1 0.0376 0.82463 0.996 0.004
#> SRR1337192 1 0.7602 0.80474 0.780 0.220
#> SRR656946 1 0.5408 0.83903 0.876 0.124
#> SRR1476102 1 0.7602 0.80590 0.780 0.220
#> SRR1476447 1 0.7602 0.80474 0.780 0.220
#> SRR1342067 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR1385389 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR1075971 1 0.8081 0.79019 0.752 0.248
#> SRR614419 1 0.7299 0.81328 0.796 0.204
#> SRR1322936 1 0.7883 0.79435 0.764 0.236
#> SRR1349121 1 0.7602 0.80489 0.780 0.220
#> SRR1430549 1 0.8909 0.72692 0.692 0.308
#> SRR612935 1 0.0376 0.82505 0.996 0.004
#> SRR661481 1 0.6712 0.72674 0.824 0.176
#> SRR1354117 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1393596 1 0.9732 0.46848 0.596 0.404
#> SRR1452164 1 0.8909 0.72609 0.692 0.308
#> SRR1070503 1 0.5842 0.83928 0.860 0.140
#> SRR1499894 1 0.0672 0.82638 0.992 0.008
#> SRR1082883 1 0.7056 0.81765 0.808 0.192
#> SRR1468271 1 0.8016 0.78597 0.756 0.244
#> SRR1332443 1 0.8144 0.78321 0.748 0.252
#> SRR810295 1 0.0376 0.82494 0.996 0.004
#> SRR662103 1 0.9998 0.29343 0.508 0.492
#> SRR1328620 1 0.0672 0.82689 0.992 0.008
#> SRR1396294 1 0.7745 0.79232 0.772 0.228
#> SRR1419917 1 0.8955 0.72158 0.688 0.312
#> SRR662114 1 0.5737 0.84014 0.864 0.136
#> SRR1489199 1 0.4815 0.84271 0.896 0.104
#> SRR813584 2 0.9970 0.08453 0.468 0.532
#> SRR1069638 1 0.5737 0.83695 0.864 0.136
#> SRR614864 1 0.5842 0.83527 0.860 0.140
#> SRR1433392 1 0.6148 0.83445 0.848 0.152
#> SRR1377777 1 0.1843 0.81260 0.972 0.028
#> SRR2167710 1 0.5408 0.83903 0.876 0.124
#> SRR1401252 2 0.5946 0.75070 0.144 0.856
#> SRR1309963 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR1338031 1 0.8813 0.73747 0.700 0.300
#> SRR1418628 1 0.2236 0.81305 0.964 0.036
#> SRR1486889 1 0.4815 0.84253 0.896 0.104
#> SRR1380393 1 0.8608 0.75256 0.716 0.284
#> SRR1319731 1 0.8608 0.75376 0.716 0.284
#> SRR1356468 1 0.8608 0.72715 0.716 0.284
#> SRR1337010 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.7815 0.79769 0.768 0.232
#> SRR1486538 2 0.1633 0.81447 0.024 0.976
#> SRR1340486 2 0.0672 0.81793 0.008 0.992
#> SRR1377696 1 0.9000 0.53132 0.684 0.316
#> SRR1465459 1 0.3879 0.84000 0.924 0.076
#> SRR1080270 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1312501 1 0.0376 0.82476 0.996 0.004
#> SRR1093148 1 0.5059 0.84007 0.888 0.112
#> SRR1467080 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1410866 1 0.9491 0.45475 0.632 0.368
#> SRR816475 2 0.9833 0.26900 0.424 0.576
#> SRR1379198 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR613342 1 0.5842 0.83717 0.860 0.140
#> SRR1452246 1 0.8144 0.64105 0.748 0.252
#> SRR1338836 1 0.4815 0.77905 0.896 0.104
#> SRR1369129 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR1396616 1 0.2236 0.83472 0.964 0.036
#> SRR813824 1 0.8499 0.75416 0.724 0.276
#> SRR1082376 1 0.8081 0.79105 0.752 0.248
#> SRR1500891 2 0.0672 0.81784 0.008 0.992
#> SRR807543 1 0.6343 0.83287 0.840 0.160
#> SRR1091572 1 0.7602 0.80980 0.780 0.220
#> SRR1346689 2 0.9795 0.22394 0.416 0.584
#> SRR1332424 1 0.6973 0.81978 0.812 0.188
#> SRR663729 2 0.9970 -0.10871 0.468 0.532
#> SRR1097013 1 0.7453 0.81147 0.788 0.212
#> SRR613675 1 0.7883 0.79435 0.764 0.236
#> SRR1485357 2 0.0938 0.81754 0.012 0.988
#> SRR655816 1 0.0672 0.82696 0.992 0.008
#> SRR1500113 1 0.7815 0.79576 0.768 0.232
#> SRR1437622 1 1.0000 0.04013 0.504 0.496
#> SRR1355172 1 0.7602 0.80337 0.780 0.220
#> SRR655531 1 0.7453 0.80822 0.788 0.212
#> SRR1338147 1 0.1414 0.83106 0.980 0.020
#> SRR1413329 1 0.6973 0.82281 0.812 0.188
#> SRR1485931 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.8267 0.77407 0.740 0.260
#> SRR1333308 1 0.9044 0.67498 0.680 0.320
#> SRR1452033 1 0.8386 0.76640 0.732 0.268
#> SRR1467316 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR809018 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1375351 1 0.2603 0.81473 0.956 0.044
#> SRR663440 1 0.5737 0.83820 0.864 0.136
#> SRR1471755 1 0.9608 0.43303 0.616 0.384
#> SRR808019 1 0.6801 0.82304 0.820 0.180
#> SRR1479133 1 0.8499 0.75416 0.724 0.276
#> SRR615069 1 0.5294 0.83927 0.880 0.120
#> SRR1456185 1 0.2236 0.83509 0.964 0.036
#> SRR1350069 1 0.7815 0.78829 0.768 0.232
#> SRR816316 2 0.9087 0.43880 0.324 0.676
#> SRR664795 1 0.7453 0.80826 0.788 0.212
#> SRR1490721 1 0.9998 0.24757 0.508 0.492
#> SRR810643 1 0.8207 0.77754 0.744 0.256
#> SRR1430333 1 0.4690 0.84205 0.900 0.100
#> SRR1085285 1 0.8499 0.75416 0.724 0.276
#> SRR1099072 1 0.2423 0.83475 0.960 0.040
#> SRR1317985 1 0.8909 0.72620 0.692 0.308
#> SRR1487340 1 0.8555 0.75851 0.720 0.280
#> SRR1420276 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1351347 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.6973 0.82131 0.812 0.188
#> SRR1370329 2 0.6801 0.70190 0.180 0.820
#> SRR1465001 1 0.8267 0.77589 0.740 0.260
#> SRR1476525 1 0.5178 0.77345 0.884 0.116
#> SRR819610 1 0.3431 0.82150 0.936 0.064
#> SRR2157314 1 0.8499 0.76007 0.724 0.276
#> SRR1409465 1 0.4939 0.78165 0.892 0.108
#> SRR809987 1 0.9286 0.63823 0.656 0.344
#> SRR613639 1 0.9044 0.69828 0.680 0.320
#> SRR1402285 2 0.1414 0.81555 0.020 0.980
#> SRR1077038 1 0.6623 0.82960 0.828 0.172
#> SRR1405660 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.1414 0.83062 0.980 0.020
#> SRR1394734 1 0.9896 0.29755 0.560 0.440
#> SRR1317771 1 0.7219 0.81669 0.800 0.200
#> SRR1365894 1 0.8661 0.70188 0.712 0.288
#> SRR1073581 1 0.8386 0.76640 0.732 0.268
#> SRR659804 1 0.8499 0.76007 0.724 0.276
#> SRR1345914 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1432186 1 0.5059 0.77235 0.888 0.112
#> SRR1473529 1 0.9427 0.44667 0.640 0.360
#> SRR660764 1 0.7376 0.81445 0.792 0.208
#> SRR820448 2 0.9129 0.42820 0.328 0.672
#> SRR1328845 1 0.8713 0.71689 0.708 0.292
#> SRR1336415 2 0.0672 0.81793 0.008 0.992
#> SRR1379065 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR1459190 1 0.3274 0.83850 0.940 0.060
#> SRR1346773 1 0.8016 0.78597 0.756 0.244
#> SRR1499521 1 0.6887 0.82124 0.816 0.184
#> SRR1440898 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1347459 1 0.1184 0.82895 0.984 0.016
#> SRR1081209 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.8661 0.74901 0.712 0.288
#> SRR1333395 1 0.2236 0.83656 0.964 0.036
#> SRR1309248 1 0.8555 0.70695 0.720 0.280
#> SRR809161 1 0.6887 0.82657 0.816 0.184
#> SRR1316320 1 0.4022 0.83336 0.920 0.080
#> SRR1432629 1 0.8267 0.62420 0.740 0.260
#> SRR1498931 1 0.8861 0.73151 0.696 0.304
#> SRR1416578 2 0.9996 -0.12359 0.488 0.512
#> SRR1405547 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1470534 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR1380764 1 0.6801 0.82307 0.820 0.180
#> SRR1309160 1 0.2043 0.83479 0.968 0.032
#> SRR663489 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.7602 0.80337 0.780 0.220
#> SRR1078489 1 0.1414 0.83042 0.980 0.020
#> SRR1332648 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR660614 1 0.0938 0.82759 0.988 0.012
#> SRR1470420 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.8661 0.74901 0.712 0.288
#> SRR1477949 1 0.7815 0.80054 0.768 0.232
#> SRR1481419 1 0.5059 0.77235 0.888 0.112
#> SRR1464766 1 0.7950 0.79014 0.760 0.240
#> SRR615946 1 0.7376 0.81445 0.792 0.208
#> SRR1446481 1 0.5408 0.76613 0.876 0.124
#> SRR1467656 1 0.4161 0.79152 0.916 0.084
#> SRR1402962 1 0.5946 0.83450 0.856 0.144
#> SRR660224 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR665586 1 0.7056 0.82310 0.808 0.192
#> SRR1347166 1 0.5294 0.83850 0.880 0.120
#> SRR1485722 1 0.6438 0.82849 0.836 0.164
#> SRR1415316 1 0.6973 0.82551 0.812 0.188
#> SRR613390 1 0.8144 0.78821 0.748 0.252
#> SRR661108 1 0.7139 0.82065 0.804 0.196
#> SRR2170173 1 0.1414 0.83095 0.980 0.020
#> SRR817329 1 0.3879 0.84074 0.924 0.076
#> SRR1401990 1 0.9000 0.68270 0.684 0.316
#> SRR1467745 2 0.9795 0.29745 0.416 0.584
#> SRR1471795 1 0.9552 0.45077 0.624 0.376
#> SRR1415637 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR813137 1 0.8955 0.72158 0.688 0.312
#> SRR1314873 1 0.8861 0.73251 0.696 0.304
#> SRR1401211 1 0.7674 0.80027 0.776 0.224
#> SRR1419692 2 0.1184 0.81638 0.016 0.984
#> SRR818797 1 0.8499 0.75765 0.724 0.276
#> SRR2164608 1 0.3733 0.84213 0.928 0.072
#> SRR1455586 1 0.1184 0.82952 0.984 0.016
#> SRR819459 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1488939 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1433232 1 0.6623 0.71838 0.828 0.172
#> SRR1385501 1 0.6531 0.83162 0.832 0.168
#> SRR1361652 1 0.0938 0.82727 0.988 0.012
#> SRR1437119 1 0.8909 0.72644 0.692 0.308
#> SRR1478547 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1430910 1 0.0938 0.82727 0.988 0.012
#> SRR1310584 1 0.8386 0.76746 0.732 0.268
#> SRR1500216 2 0.6801 0.70190 0.180 0.820
#> SRR1486762 1 0.1843 0.83167 0.972 0.028
#> SRR1480854 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR1489394 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR1418085 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR1340221 2 0.1414 0.81555 0.020 0.980
#> SRR1473058 2 0.9996 -0.00698 0.488 0.512
#> SRR1405165 1 0.4815 0.84081 0.896 0.104
#> SRR1433004 1 0.8327 0.77711 0.736 0.264
#> SRR1471477 1 0.7528 0.80596 0.784 0.216
#> SRR1098567 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1098712 1 0.7602 0.80092 0.780 0.220
#> SRR1455038 2 0.9881 0.06291 0.436 0.564
#> SRR1375248 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1403005 1 0.3274 0.83916 0.940 0.060
#> SRR1348378 1 0.9754 0.33865 0.592 0.408
#> SRR1413541 1 0.7453 0.81285 0.788 0.212
#> SRR1392943 1 0.8144 0.76866 0.748 0.252
#> SRR1475192 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1432085 1 0.1184 0.82952 0.984 0.016
#> SRR1452468 1 0.4161 0.84246 0.916 0.084
#> SRR1347060 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1414139 1 0.2423 0.83344 0.960 0.040
#> SRR1447962 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1444324 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.8555 0.75537 0.720 0.280
#> SRR1413436 1 0.6438 0.83073 0.836 0.164
#> SRR1311266 1 0.6887 0.82191 0.816 0.184
#> SRR1343302 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR1373746 1 0.8909 0.72692 0.692 0.308
#> SRR1429678 1 0.7453 0.81288 0.788 0.212
#> SRR1469413 1 0.0376 0.82536 0.996 0.004
#> SRR1405331 1 0.6438 0.83238 0.836 0.164
#> SRR1345609 1 0.8763 0.74135 0.704 0.296
#> SRR1380208 1 0.8499 0.71348 0.724 0.276
#> SRR1322840 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR1399797 1 0.0376 0.82476 0.996 0.004
#> SRR1416654 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1315081 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1369196 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.8267 0.77605 0.740 0.260
#> SRR1365291 1 0.4298 0.84104 0.912 0.088
#> SRR1367920 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR1366648 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1441679 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1082173 1 0.3733 0.84213 0.928 0.072
#> SRR1363968 1 0.6887 0.82124 0.816 0.184
#> SRR814387 1 0.8267 0.77589 0.740 0.260
#> SRR657599 1 0.9833 0.49512 0.576 0.424
#> SRR1386689 2 0.0672 0.81793 0.008 0.992
#> SRR1395575 1 0.2948 0.83824 0.948 0.052
#> SRR1453811 1 0.8499 0.75416 0.724 0.276
#> SRR1441159 1 0.7883 0.79578 0.764 0.236
#> SRR1403154 2 0.0376 0.81713 0.004 0.996
#> SRR1468722 1 0.0000 0.82335 1.000 0.000
#> SRR1310275 1 0.4298 0.84104 0.912 0.088
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 1 0.6102 0.61311 0.672 0.008 0.320
#> SRR1331708 1 0.4539 0.72236 0.836 0.016 0.148
#> SRR1464258 3 0.8120 0.69550 0.224 0.136 0.640
#> SRR1454201 1 0.5220 0.69954 0.780 0.012 0.208
#> SRR661589 1 0.1163 0.72046 0.972 0.000 0.028
#> SRR1456229 1 0.6033 0.60238 0.660 0.004 0.336
#> SRR1315165 2 0.5212 0.60599 0.108 0.828 0.064
#> SRR1488960 1 0.6229 0.64491 0.700 0.020 0.280
#> SRR1417809 1 0.8985 0.41946 0.564 0.220 0.216
#> SRR1094457 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR1095575 1 0.1860 0.72438 0.948 0.000 0.052
#> SRR1315931 3 0.8195 0.69452 0.232 0.136 0.632
#> SRR1430066 1 0.0892 0.71510 0.980 0.000 0.020
#> SRR1431037 1 0.0892 0.71817 0.980 0.000 0.020
#> SRR1395554 1 0.0892 0.71445 0.980 0.000 0.020
#> SRR818002 2 0.8976 0.13085 0.416 0.456 0.128
#> SRR1344143 1 0.2959 0.66948 0.900 0.000 0.100
#> SRR1486845 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR1362866 1 0.5318 0.69943 0.780 0.016 0.204
#> SRR1490740 1 0.6661 0.47895 0.588 0.012 0.400
#> SRR1446627 1 0.2959 0.66948 0.900 0.000 0.100
#> SRR1456138 1 0.8192 0.40054 0.636 0.220 0.144
#> SRR1416248 1 0.6553 0.59487 0.656 0.020 0.324
#> SRR1383907 2 0.8222 0.26966 0.332 0.576 0.092
#> SRR1311018 1 0.6553 0.45775 0.580 0.008 0.412
#> SRR1375699 1 0.3192 0.68771 0.888 0.000 0.112
#> SRR1429846 1 0.3500 0.72755 0.880 0.004 0.116
#> SRR613550 1 0.4784 0.70353 0.796 0.004 0.200
#> SRR1348402 1 0.6228 0.60776 0.672 0.012 0.316
#> SRR1345146 1 0.1031 0.72094 0.976 0.000 0.024
#> SRR1324025 1 0.3192 0.72767 0.888 0.000 0.112
#> SRR1318879 1 0.0592 0.71631 0.988 0.000 0.012
#> SRR820755 1 0.4409 0.71544 0.824 0.004 0.172
#> SRR1485830 2 0.5497 0.54989 0.148 0.804 0.048
#> SRR599313 3 0.6093 0.57268 0.068 0.156 0.776
#> SRR612263 1 0.4978 0.69937 0.780 0.004 0.216
#> SRR1415398 1 0.2165 0.72861 0.936 0.000 0.064
#> SRR1326205 1 0.9197 0.35698 0.536 0.252 0.212
#> SRR1421327 2 0.0661 0.72954 0.004 0.988 0.008
#> SRR1083311 1 0.0892 0.71425 0.980 0.000 0.020
#> SRR1499303 2 0.4217 0.62989 0.100 0.868 0.032
#> SRR1079522 1 0.1411 0.72694 0.964 0.000 0.036
#> SRR1452935 1 0.0747 0.71806 0.984 0.000 0.016
#> SRR1379495 1 0.6688 0.46175 0.580 0.012 0.408
#> SRR1470459 1 0.2796 0.67477 0.908 0.000 0.092
#> SRR661361 1 0.6180 0.56088 0.660 0.008 0.332
#> SRR615778 1 0.4808 0.71047 0.804 0.008 0.188
#> SRR1447564 1 0.6314 0.51377 0.604 0.004 0.392
#> SRR1455195 1 0.6226 0.66561 0.720 0.028 0.252
#> SRR655182 1 0.5115 0.68104 0.768 0.004 0.228
#> SRR1335140 1 0.8858 0.22555 0.532 0.332 0.136
#> SRR1433555 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR1308650 1 0.4235 0.71423 0.824 0.000 0.176
#> SRR1388354 1 0.6359 0.54886 0.628 0.008 0.364
#> SRR1317446 1 0.0892 0.71510 0.980 0.000 0.020
#> SRR1413602 1 0.0592 0.71472 0.988 0.000 0.012
#> SRR1479955 1 0.3987 0.65729 0.872 0.020 0.108
#> SRR809853 1 0.6359 0.48756 0.592 0.004 0.404
#> SRR661313 1 0.5810 0.57957 0.664 0.000 0.336
#> SRR1499935 2 0.4709 0.62824 0.092 0.852 0.056
#> SRR1447303 1 0.3193 0.73035 0.896 0.004 0.100
#> SRR1429408 2 0.8869 0.15440 0.380 0.496 0.124
#> SRR1433950 1 0.5650 0.63037 0.688 0.000 0.312
#> SRR1362081 1 0.2796 0.67477 0.908 0.000 0.092
#> SRR1409854 1 0.4531 0.72132 0.824 0.008 0.168
#> SRR1435229 1 0.1163 0.72521 0.972 0.000 0.028
#> SRR1085996 1 0.5902 0.62879 0.680 0.004 0.316
#> SRR1414229 1 0.5268 0.69759 0.776 0.012 0.212
#> SRR1400974 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR1399971 1 0.6553 0.45775 0.580 0.008 0.412
#> SRR613927 1 0.5882 0.56143 0.652 0.000 0.348
#> SRR1457854 1 0.6359 0.54886 0.628 0.008 0.364
#> SRR1473714 3 0.6093 0.57268 0.068 0.156 0.776
#> SRR813776 1 0.4409 0.71544 0.824 0.004 0.172
#> SRR808196 1 0.9019 0.41314 0.560 0.224 0.216
#> SRR1101085 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR614395 1 0.6386 0.47095 0.584 0.004 0.412
#> SRR1478251 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR1370551 1 0.2711 0.67760 0.912 0.000 0.088
#> SRR1362310 1 0.6688 0.46175 0.580 0.012 0.408
#> SRR665310 1 0.3116 0.72581 0.892 0.000 0.108
#> SRR1420109 1 0.2165 0.72346 0.936 0.000 0.064
#> SRR1330920 1 0.4978 0.69671 0.780 0.004 0.216
#> SRR1419539 1 0.4677 0.71095 0.840 0.028 0.132
#> SRR1359447 1 0.1031 0.71073 0.976 0.000 0.024
#> SRR1347259 1 0.9098 0.18229 0.492 0.360 0.148
#> SRR613915 1 0.4796 0.69962 0.780 0.000 0.220
#> SRR1384395 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR821715 1 0.2590 0.73073 0.924 0.004 0.072
#> SRR1478228 1 0.6673 0.56777 0.636 0.020 0.344
#> SRR1445637 1 0.3349 0.72844 0.888 0.004 0.108
#> SRR608150 1 0.6523 0.67118 0.724 0.048 0.228
#> SRR1096383 1 0.6057 0.59334 0.656 0.004 0.340
#> SRR1341480 2 0.0475 0.73206 0.004 0.992 0.004
#> SRR1341344 1 0.6770 0.64269 0.692 0.044 0.264
#> SRR1326270 1 0.6540 0.37908 0.584 0.008 0.408
#> SRR1498838 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR1416313 1 0.1031 0.71637 0.976 0.000 0.024
#> SRR808566 2 0.8222 0.26966 0.332 0.576 0.092
#> SRR1430270 2 0.0983 0.72609 0.016 0.980 0.004
#> SRR1367825 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR613533 1 0.1163 0.71955 0.972 0.000 0.028
#> SRR661267 1 0.5763 0.65339 0.716 0.008 0.276
#> SRR810665 1 0.5339 0.60625 0.824 0.080 0.096
#> SRR1407250 1 0.5406 0.69108 0.764 0.012 0.224
#> SRR1420067 1 0.5578 0.68167 0.748 0.012 0.240
#> SRR1473632 1 0.6359 0.48756 0.592 0.004 0.404
#> SRR812536 1 0.4883 0.70065 0.788 0.004 0.208
#> SRR1370850 1 0.7595 0.50865 0.688 0.176 0.136
#> SRR1486195 1 0.2796 0.67477 0.908 0.000 0.092
#> SRR1407671 1 0.7816 0.59181 0.668 0.132 0.200
#> SRR1446375 1 0.1529 0.72228 0.960 0.000 0.040
#> SRR1465230 2 0.0592 0.73150 0.000 0.988 0.012
#> SRR614119 1 0.5929 0.61992 0.676 0.004 0.320
#> SRR1356101 1 0.2711 0.67760 0.912 0.000 0.088
#> SRR1404209 1 0.5775 0.66640 0.728 0.012 0.260
#> SRR1392676 1 0.2959 0.66948 0.900 0.000 0.100
#> SRR665538 1 0.5797 0.65094 0.712 0.008 0.280
#> SRR660510 1 0.1163 0.72046 0.972 0.000 0.028
#> SRR1445655 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR658953 1 0.2878 0.73075 0.904 0.000 0.096
#> SRR2166459 1 0.5656 0.65185 0.712 0.004 0.284
#> SRR1070713 1 0.8645 0.39313 0.584 0.268 0.148
#> SRR1485312 1 0.1163 0.71844 0.972 0.000 0.028
#> SRR1317631 1 0.7902 0.59422 0.660 0.132 0.208
#> SRR1488610 1 0.5772 0.68662 0.756 0.024 0.220
#> SRR1330588 1 0.2261 0.73010 0.932 0.000 0.068
#> SRR1316367 1 0.4883 0.70611 0.788 0.004 0.208
#> SRR1433926 1 0.6410 0.45365 0.576 0.004 0.420
#> SRR1091302 2 0.8089 0.29856 0.308 0.600 0.092
#> SRR818263 1 0.4834 0.70360 0.792 0.004 0.204
#> SRR1404909 2 0.4217 0.62967 0.100 0.868 0.032
#> SRR663076 1 0.6451 0.51439 0.608 0.008 0.384
#> SRR1323577 1 0.8321 0.38450 0.620 0.240 0.140
#> SRR1442422 2 0.0592 0.73150 0.000 0.988 0.012
#> SRR1465893 1 0.6422 0.59620 0.660 0.016 0.324
#> SRR654862 1 0.5115 0.69304 0.768 0.004 0.228
#> SRR1407112 2 0.0592 0.73150 0.000 0.988 0.012
#> SRR1332969 1 0.2261 0.72902 0.932 0.000 0.068
#> SRR1353199 1 0.3116 0.72581 0.892 0.000 0.108
#> SRR1378885 1 0.3500 0.72800 0.880 0.004 0.116
#> SRR665357 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR662186 1 0.2959 0.67495 0.900 0.000 0.100
#> SRR1501020 1 0.1964 0.72458 0.944 0.000 0.056
#> SRR1347819 1 0.0892 0.71510 0.980 0.000 0.020
#> SRR1480813 1 0.7180 0.49570 0.716 0.168 0.116
#> SRR1472576 2 0.8779 0.13724 0.416 0.472 0.112
#> SRR1431781 2 0.4945 0.61432 0.104 0.840 0.056
#> SRR1452270 1 0.1163 0.71844 0.972 0.000 0.028
#> SRR1500472 1 0.2066 0.73061 0.940 0.000 0.060
#> SRR1417632 2 0.8091 0.27283 0.348 0.572 0.080
#> SRR1350153 1 0.4399 0.63624 0.864 0.044 0.092
#> SRR1458113 1 0.4645 0.71871 0.816 0.008 0.176
#> SRR1326579 1 0.5899 0.67445 0.736 0.020 0.244
#> SRR1349363 1 0.3038 0.68183 0.896 0.000 0.104
#> SRR1096712 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR1090407 1 0.2261 0.72939 0.932 0.000 0.068
#> SRR1083752 1 0.8927 0.07458 0.488 0.384 0.128
#> SRR1377599 2 0.0424 0.72892 0.000 0.992 0.008
#> SRR1488449 1 0.1411 0.72435 0.964 0.000 0.036
#> SRR1318354 1 0.0892 0.72154 0.980 0.000 0.020
#> SRR1359062 1 0.0892 0.71510 0.980 0.000 0.020
#> SRR1398924 1 0.3816 0.72603 0.852 0.000 0.148
#> SRR663783 1 0.1529 0.71764 0.960 0.000 0.040
#> SRR1319204 1 0.1163 0.72086 0.972 0.000 0.028
#> SRR1369070 1 0.7126 0.49396 0.720 0.164 0.116
#> SRR615659 1 0.6410 0.45365 0.576 0.004 0.420
#> SRR1337449 1 0.2878 0.67274 0.904 0.000 0.096
#> SRR1316982 1 0.1529 0.70402 0.960 0.000 0.040
#> SRR1498595 1 0.8825 0.22243 0.532 0.336 0.132
#> SRR1377423 1 0.2261 0.72315 0.932 0.000 0.068
#> SRR1312310 1 0.2945 0.67751 0.908 0.004 0.088
#> SRR1485613 1 0.6228 0.61006 0.672 0.012 0.316
#> SRR1338426 1 0.0592 0.71631 0.988 0.000 0.012
#> SRR1353309 1 0.0747 0.71658 0.984 0.000 0.016
#> SRR658941 1 0.4782 0.71970 0.820 0.016 0.164
#> SRR1101643 3 0.6979 0.63840 0.128 0.140 0.732
#> SRR1401468 1 0.6102 0.61311 0.672 0.008 0.320
#> SRR1368874 1 0.2796 0.67477 0.908 0.000 0.092
#> SRR1324085 2 0.8503 0.24497 0.352 0.544 0.104
#> SRR1363858 3 0.6093 0.57268 0.068 0.156 0.776
#> SRR819820 1 0.4033 0.72521 0.856 0.008 0.136
#> SRR1337342 1 0.5578 0.68167 0.748 0.012 0.240
#> SRR655206 1 0.4324 0.71121 0.860 0.028 0.112
#> SRR1387013 1 0.8284 0.39088 0.628 0.224 0.148
#> SRR1317410 1 0.6629 0.54849 0.624 0.016 0.360
#> SRR608198 1 0.6341 0.66136 0.716 0.032 0.252
#> SRR1440161 1 0.2711 0.67760 0.912 0.000 0.088
#> SRR1343741 1 0.7180 0.48602 0.716 0.168 0.116
#> SRR1381288 1 0.2959 0.66948 0.900 0.000 0.100
#> SRR1415379 1 0.9141 0.37561 0.544 0.244 0.212
#> SRR1099622 1 0.7072 0.51371 0.724 0.160 0.116
#> SRR663197 1 0.5465 0.64004 0.712 0.000 0.288
#> SRR1394836 1 0.4609 0.71353 0.844 0.028 0.128
#> SRR661699 1 0.1031 0.71496 0.976 0.000 0.024
#> SRR813680 1 0.5896 0.63998 0.700 0.008 0.292
#> SRR1410678 1 0.6688 0.46175 0.580 0.012 0.408
#> SRR1378109 2 0.0592 0.73150 0.000 0.988 0.012
#> SRR1499174 1 0.6373 0.47901 0.588 0.004 0.408
#> SRR1311486 1 0.2878 0.67274 0.904 0.000 0.096
#> SRR1382851 1 0.8777 0.34847 0.564 0.288 0.148
#> SRR1433410 1 0.6025 0.67891 0.740 0.028 0.232
#> SRR661167 1 0.3038 0.72105 0.896 0.000 0.104
#> SRR1432518 1 0.0592 0.71631 0.988 0.000 0.012
#> SRR660462 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR1374608 1 0.8072 0.57287 0.648 0.144 0.208
#> SRR657949 1 0.2537 0.72974 0.920 0.000 0.080
#> SRR1308882 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR655768 3 0.6483 0.27480 0.392 0.008 0.600
#> SRR1485870 1 0.8460 0.43181 0.608 0.244 0.148
#> SRR1444138 1 0.4233 0.71776 0.836 0.004 0.160
#> SRR1417342 1 0.5956 0.60251 0.672 0.004 0.324
#> SRR1470193 1 0.8410 0.52741 0.620 0.164 0.216
#> SRR1091380 1 0.4033 0.72521 0.856 0.008 0.136
#> SRR1099096 1 0.6627 0.58425 0.644 0.020 0.336
#> SRR1313583 2 0.8263 0.24205 0.268 0.612 0.120
#> SRR1467102 1 0.2384 0.70611 0.936 0.008 0.056
#> SRR1485416 2 0.1919 0.71314 0.020 0.956 0.024
#> SRR818821 1 0.1163 0.71955 0.972 0.000 0.028
#> SRR809963 1 0.6386 0.47095 0.584 0.004 0.412
#> SRR1072247 1 0.6629 0.54849 0.624 0.016 0.360
#> SRR1353710 1 0.9059 0.14100 0.480 0.380 0.140
#> SRR1445259 1 0.0892 0.72154 0.980 0.000 0.020
#> SRR1408393 1 0.2625 0.72753 0.916 0.000 0.084
#> SRR1361522 1 0.6410 0.45365 0.576 0.004 0.420
#> SRR1368597 1 0.5291 0.67007 0.732 0.000 0.268
#> SRR1309680 1 0.5961 0.59339 0.792 0.096 0.112
#> SRR1310542 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR1333485 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR1406437 1 0.7569 0.62025 0.684 0.116 0.200
#> SRR1354931 1 0.4452 0.70876 0.808 0.000 0.192
#> SRR1391856 1 0.8609 0.42368 0.596 0.244 0.160
#> SRR1446738 1 0.8483 0.41770 0.600 0.260 0.140
#> SRR1309032 1 0.2796 0.67477 0.908 0.000 0.092
#> SRR1388145 1 0.6902 0.53497 0.736 0.148 0.116
#> SRR1432611 1 0.2796 0.67477 0.908 0.000 0.092
#> SRR815869 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR613150 1 0.4931 0.68868 0.768 0.000 0.232
#> SRR1375329 1 0.2066 0.73061 0.940 0.000 0.060
#> SRR1387921 1 0.6584 0.51826 0.608 0.012 0.380
#> SRR1466792 1 0.2796 0.67477 0.908 0.000 0.092
#> SRR1360478 1 0.4725 0.62404 0.852 0.060 0.088
#> SRR1360695 1 0.5722 0.64026 0.704 0.004 0.292
#> SRR812943 1 0.6359 0.48756 0.592 0.004 0.404
#> SRR1400910 1 0.1411 0.72583 0.964 0.000 0.036
#> SRR1444203 2 0.0747 0.73136 0.000 0.984 0.016
#> SRR816177 1 0.9235 0.05426 0.460 0.384 0.156
#> SRR658754 1 0.0747 0.71614 0.984 0.000 0.016
#> SRR1429603 1 0.9109 0.17269 0.488 0.364 0.148
#> SRR1397366 1 0.3412 0.72282 0.876 0.000 0.124
#> SRR1446028 1 0.6796 0.52811 0.612 0.020 0.368
#> SRR1083918 1 0.9140 0.00631 0.452 0.404 0.144
#> SRR1337606 1 0.5268 0.69759 0.776 0.012 0.212
#> SRR659109 1 0.1031 0.71464 0.976 0.000 0.024
#> SRR1337192 1 0.6735 0.64625 0.696 0.044 0.260
#> SRR656946 1 0.4733 0.70203 0.800 0.004 0.196
#> SRR1476102 1 0.6301 0.65952 0.712 0.028 0.260
#> SRR1476447 1 0.6735 0.64625 0.696 0.044 0.260
#> SRR1342067 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR1385389 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR1075971 1 0.6155 0.61174 0.664 0.008 0.328
#> SRR614419 1 0.6341 0.66245 0.716 0.032 0.252
#> SRR1322936 1 0.7485 0.63347 0.680 0.096 0.224
#> SRR1349121 1 0.6019 0.64274 0.700 0.012 0.288
#> SRR1430549 1 0.6688 0.46175 0.580 0.012 0.408
#> SRR612935 1 0.0747 0.72035 0.984 0.000 0.016
#> SRR661481 1 0.7180 0.49570 0.716 0.168 0.116
#> SRR1354117 1 0.2711 0.67760 0.912 0.000 0.088
#> SRR1393596 1 0.9098 0.18341 0.492 0.360 0.148
#> SRR1452164 1 0.6540 0.46691 0.584 0.008 0.408
#> SRR1070503 1 0.4700 0.71483 0.812 0.008 0.180
#> SRR1499894 1 0.1031 0.71796 0.976 0.000 0.024
#> SRR1082883 1 0.6295 0.67258 0.728 0.036 0.236
#> SRR1468271 1 0.6255 0.60501 0.668 0.012 0.320
#> SRR1332443 1 0.6769 0.59760 0.652 0.028 0.320
#> SRR810295 1 0.2945 0.67751 0.908 0.004 0.088
#> SRR662103 3 0.6318 0.38679 0.356 0.008 0.636
#> SRR1328620 1 0.0892 0.72154 0.980 0.000 0.020
#> SRR1396294 1 0.7902 0.59422 0.660 0.132 0.208
#> SRR1419917 1 0.6410 0.45365 0.576 0.004 0.420
#> SRR662114 1 0.4931 0.70228 0.784 0.004 0.212
#> SRR1489199 1 0.3983 0.72465 0.852 0.004 0.144
#> SRR813584 2 0.9014 0.14855 0.380 0.484 0.136
#> SRR1069638 1 0.4682 0.70687 0.804 0.004 0.192
#> SRR614864 1 0.4968 0.70921 0.800 0.012 0.188
#> SRR1433392 1 0.4883 0.70227 0.788 0.004 0.208
#> SRR1377777 1 0.4094 0.64549 0.872 0.028 0.100
#> SRR2167710 1 0.4733 0.70203 0.800 0.004 0.196
#> SRR1401252 2 0.4519 0.61056 0.116 0.852 0.032
#> SRR1309963 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR1338031 1 0.6661 0.47895 0.588 0.012 0.400
#> SRR1418628 1 0.4174 0.64837 0.872 0.036 0.092
#> SRR1486889 1 0.3412 0.72871 0.876 0.000 0.124
#> SRR1380393 1 0.6451 0.51439 0.608 0.008 0.384
#> SRR1319731 1 0.6777 0.53743 0.616 0.020 0.364
#> SRR1356468 1 0.8688 0.48526 0.596 0.196 0.208
#> SRR1337010 1 0.2796 0.67477 0.908 0.000 0.092
#> SRR1486520 1 0.6570 0.61614 0.668 0.024 0.308
#> SRR1486538 2 0.1315 0.72649 0.008 0.972 0.020
#> SRR1340486 2 0.0592 0.73150 0.000 0.988 0.012
#> SRR1377696 1 0.8677 0.29256 0.572 0.288 0.140
#> SRR1465459 1 0.3038 0.72897 0.896 0.000 0.104
#> SRR1080270 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR1312501 1 0.1031 0.71637 0.976 0.000 0.024
#> SRR1093148 1 0.4602 0.71938 0.832 0.016 0.152
#> SRR1467080 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR1410866 1 0.8756 0.22928 0.540 0.332 0.128
#> SRR816475 2 0.8577 0.23529 0.356 0.536 0.108
#> SRR1379198 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR613342 1 0.4784 0.70353 0.796 0.004 0.200
#> SRR1452246 1 0.8284 0.39088 0.628 0.224 0.148
#> SRR1338836 1 0.5892 0.59194 0.796 0.100 0.104
#> SRR1369129 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR1396616 1 0.2066 0.72708 0.940 0.000 0.060
#> SRR813824 1 0.6540 0.37908 0.584 0.008 0.408
#> SRR1082376 1 0.5982 0.61408 0.668 0.004 0.328
#> SRR1500891 2 0.0475 0.73208 0.004 0.992 0.004
#> SRR807543 1 0.4978 0.69671 0.780 0.004 0.216
#> SRR1091572 1 0.5785 0.63222 0.696 0.004 0.300
#> SRR1346689 2 0.8553 0.19180 0.336 0.552 0.112
#> SRR1332424 1 0.6067 0.67676 0.736 0.028 0.236
#> SRR663729 2 0.9573 -0.09873 0.364 0.436 0.200
#> SRR1097013 1 0.5656 0.65185 0.712 0.004 0.284
#> SRR613675 1 0.7485 0.63347 0.680 0.096 0.224
#> SRR1485357 2 0.0747 0.73136 0.000 0.984 0.016
#> SRR655816 1 0.1163 0.71988 0.972 0.000 0.028
#> SRR1500113 1 0.6143 0.62306 0.684 0.012 0.304
#> SRR1437622 2 0.8972 0.13862 0.412 0.460 0.128
#> SRR1355172 1 0.5656 0.64825 0.712 0.004 0.284
#> SRR655531 1 0.6441 0.64421 0.696 0.028 0.276
#> SRR1338147 1 0.1643 0.72460 0.956 0.000 0.044
#> SRR1413329 1 0.5461 0.67934 0.748 0.008 0.244
#> SRR1485931 1 0.2959 0.66948 0.900 0.000 0.100
#> SRR1420873 1 0.6603 0.58305 0.648 0.020 0.332
#> SRR1333308 1 0.9049 0.39857 0.556 0.232 0.212
#> SRR1452033 1 0.6339 0.55402 0.632 0.008 0.360
#> SRR1467316 1 0.2959 0.66948 0.900 0.000 0.100
#> SRR809018 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR1375351 1 0.4526 0.65245 0.856 0.040 0.104
#> SRR663440 1 0.4629 0.71057 0.808 0.004 0.188
#> SRR1471755 1 0.8983 0.17953 0.508 0.352 0.140
#> SRR808019 1 0.5493 0.68476 0.756 0.012 0.232
#> SRR1479133 1 0.6540 0.37908 0.584 0.008 0.408
#> SRR615069 1 0.4963 0.70940 0.792 0.008 0.200
#> SRR1456185 1 0.3192 0.70022 0.888 0.000 0.112
#> SRR1350069 1 0.7932 0.58826 0.660 0.140 0.200
#> SRR816316 3 0.8266 0.69029 0.240 0.136 0.624
#> SRR664795 1 0.5728 0.65694 0.720 0.008 0.272
#> SRR1490721 2 0.9522 -0.11839 0.404 0.408 0.188
#> SRR810643 1 0.6603 0.58453 0.648 0.020 0.332
#> SRR1430333 1 0.4059 0.72720 0.860 0.012 0.128
#> SRR1085285 1 0.6540 0.37908 0.584 0.008 0.408
#> SRR1099072 1 0.1860 0.72584 0.948 0.000 0.052
#> SRR1317985 1 0.6553 0.45766 0.580 0.008 0.412
#> SRR1487340 1 0.6717 0.55863 0.628 0.020 0.352
#> SRR1420276 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR1351347 1 0.0892 0.71847 0.980 0.000 0.020
#> SRR1405525 1 0.5774 0.68302 0.748 0.020 0.232
#> SRR1370329 3 0.5913 0.58226 0.068 0.144 0.788
#> SRR1465001 1 0.6521 0.57856 0.644 0.016 0.340
#> SRR1476525 1 0.6111 0.57905 0.784 0.112 0.104
#> SRR819610 1 0.4749 0.65234 0.844 0.040 0.116
#> SRR2157314 1 0.6629 0.54849 0.624 0.016 0.360
#> SRR1409465 1 0.5966 0.59041 0.792 0.104 0.104
#> SRR809987 1 0.9191 0.35288 0.536 0.256 0.208
#> SRR613639 1 0.6225 0.35860 0.568 0.000 0.432
#> SRR1402285 2 0.0983 0.72609 0.016 0.980 0.004
#> SRR1077038 1 0.5016 0.68743 0.760 0.000 0.240
#> SRR1405660 1 0.0592 0.71472 0.988 0.000 0.012
#> SRR1095455 1 0.1411 0.72583 0.964 0.000 0.036
#> SRR1394734 1 0.9140 0.00631 0.452 0.404 0.144
#> SRR1317771 1 0.5775 0.66640 0.728 0.012 0.260
#> SRR1365894 1 0.8511 0.43004 0.604 0.244 0.152
#> SRR1073581 1 0.6339 0.55402 0.632 0.008 0.360
#> SRR659804 1 0.6629 0.54849 0.624 0.016 0.360
#> SRR1345914 1 0.2959 0.66948 0.900 0.000 0.100
#> SRR1432186 1 0.6111 0.58313 0.784 0.104 0.112
#> SRR1473529 1 0.8825 0.22243 0.532 0.336 0.132
#> SRR660764 1 0.5497 0.63554 0.708 0.000 0.292
#> SRR820448 3 0.8120 0.69550 0.224 0.136 0.640
#> SRR1328845 1 0.8873 0.46074 0.576 0.200 0.224
#> SRR1336415 2 0.0592 0.73150 0.000 0.988 0.012
#> SRR1379065 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR1459190 1 0.2537 0.72831 0.920 0.000 0.080
#> SRR1346773 1 0.6255 0.60501 0.668 0.012 0.320
#> SRR1499521 1 0.5619 0.67709 0.744 0.012 0.244
#> SRR1440898 1 0.2959 0.66948 0.900 0.000 0.100
#> SRR1347459 1 0.1289 0.72285 0.968 0.000 0.032
#> SRR1081209 1 0.2959 0.66948 0.900 0.000 0.100
#> SRR1400202 1 0.6584 0.51826 0.608 0.012 0.380
#> SRR1333395 1 0.3551 0.70214 0.868 0.000 0.132
#> SRR1309248 1 0.8392 0.44955 0.616 0.236 0.148
#> SRR809161 1 0.5098 0.67835 0.752 0.000 0.248
#> SRR1316320 1 0.5558 0.67255 0.800 0.048 0.152
#> SRR1432629 1 0.8357 0.37318 0.620 0.232 0.148
#> SRR1498931 1 0.6527 0.47646 0.588 0.008 0.404
#> SRR1416578 2 0.9561 -0.05013 0.376 0.428 0.196
#> SRR1405547 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR1470534 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR1380764 1 0.5619 0.67956 0.744 0.012 0.244
#> SRR1309160 1 0.1411 0.72658 0.964 0.000 0.036
#> SRR663489 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR1500450 1 0.5656 0.64825 0.712 0.004 0.284
#> SRR1078489 1 0.1411 0.72694 0.964 0.000 0.036
#> SRR1332648 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR660614 1 0.1163 0.72086 0.972 0.000 0.028
#> SRR1470420 1 0.2796 0.67477 0.908 0.000 0.092
#> SRR1475566 1 0.6584 0.51826 0.608 0.012 0.380
#> SRR1477949 1 0.6075 0.62119 0.676 0.008 0.316
#> SRR1481419 1 0.6111 0.58313 0.784 0.104 0.112
#> SRR1464766 1 0.6228 0.61006 0.672 0.012 0.316
#> SRR615946 1 0.5465 0.64004 0.712 0.000 0.288
#> SRR1446481 1 0.6325 0.58359 0.772 0.112 0.116
#> SRR1467656 1 0.5339 0.60625 0.824 0.080 0.096
#> SRR1402962 1 0.5220 0.69954 0.780 0.012 0.208
#> SRR660224 1 0.2959 0.66948 0.900 0.000 0.100
#> SRR665586 1 0.5397 0.66044 0.720 0.000 0.280
#> SRR1347166 1 0.4808 0.71047 0.804 0.008 0.188
#> SRR1485722 1 0.5406 0.69108 0.764 0.012 0.224
#> SRR1415316 1 0.5363 0.66396 0.724 0.000 0.276
#> SRR613390 1 0.6081 0.59186 0.652 0.004 0.344
#> SRR661108 1 0.5363 0.65564 0.724 0.000 0.276
#> SRR2170173 1 0.1860 0.72438 0.948 0.000 0.052
#> SRR817329 1 0.3038 0.72941 0.896 0.000 0.104
#> SRR1401990 1 0.9019 0.41270 0.560 0.224 0.216
#> SRR1467745 2 0.8503 0.24497 0.352 0.544 0.104
#> SRR1471795 1 0.8955 0.19028 0.516 0.344 0.140
#> SRR1415637 1 0.2959 0.66948 0.900 0.000 0.100
#> SRR813137 1 0.6410 0.45365 0.576 0.004 0.420
#> SRR1314873 1 0.6540 0.46854 0.584 0.008 0.408
#> SRR1401211 1 0.5690 0.64431 0.708 0.004 0.288
#> SRR1419692 2 0.0983 0.72870 0.004 0.980 0.016
#> SRR818797 1 0.6548 0.47809 0.616 0.012 0.372
#> SRR2164608 1 0.3129 0.73292 0.904 0.008 0.088
#> SRR1455586 1 0.3375 0.68762 0.892 0.008 0.100
#> SRR819459 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR1488939 1 0.2959 0.66948 0.900 0.000 0.100
#> SRR1433232 1 0.7126 0.49396 0.720 0.164 0.116
#> SRR1385501 1 0.4974 0.68989 0.764 0.000 0.236
#> SRR1361652 1 0.1411 0.72712 0.964 0.000 0.036
#> SRR1437119 1 0.6553 0.45775 0.580 0.008 0.412
#> SRR1478547 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR1430910 1 0.1163 0.72521 0.972 0.000 0.028
#> SRR1310584 1 0.6796 0.56415 0.632 0.024 0.344
#> SRR1500216 3 0.6093 0.57268 0.068 0.156 0.776
#> SRR1486762 1 0.1860 0.72075 0.948 0.000 0.052
#> SRR1480854 2 0.0424 0.72892 0.000 0.992 0.008
#> SRR1489394 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR1418085 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR1340221 2 0.0983 0.72609 0.016 0.980 0.004
#> SRR1473058 2 0.8957 0.14788 0.400 0.472 0.128
#> SRR1405165 1 0.4539 0.72503 0.836 0.016 0.148
#> SRR1433004 1 0.6081 0.59142 0.652 0.004 0.344
#> SRR1471477 1 0.5623 0.65290 0.716 0.004 0.280
#> SRR1098567 1 0.2878 0.67274 0.904 0.000 0.096
#> SRR1098712 1 0.7248 0.64789 0.708 0.108 0.184
#> SRR1455038 3 0.8456 0.56181 0.328 0.108 0.564
#> SRR1375248 1 0.2711 0.67760 0.912 0.000 0.088
#> SRR1403005 1 0.2537 0.73078 0.920 0.000 0.080
#> SRR1348378 1 0.8947 0.11807 0.496 0.372 0.132
#> SRR1413541 1 0.5431 0.65639 0.716 0.000 0.284
#> SRR1392943 1 0.8290 0.54346 0.632 0.164 0.204
#> SRR1475192 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR1432085 1 0.3375 0.68762 0.892 0.008 0.100
#> SRR1452468 1 0.3682 0.73034 0.876 0.008 0.116
#> SRR1347060 1 0.0892 0.71510 0.980 0.000 0.020
#> SRR1414139 1 0.3406 0.70952 0.904 0.028 0.068
#> SRR1447962 1 0.2796 0.67477 0.908 0.000 0.092
#> SRR1444324 1 0.2711 0.67760 0.912 0.000 0.088
#> SRR1415004 1 0.6398 0.53581 0.620 0.008 0.372
#> SRR1413436 1 0.5171 0.70158 0.784 0.012 0.204
#> SRR1311266 1 0.5772 0.68662 0.756 0.024 0.220
#> SRR1343302 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR1373746 1 0.6688 0.46175 0.580 0.012 0.408
#> SRR1429678 1 0.5785 0.63522 0.696 0.004 0.300
#> SRR1469413 1 0.3112 0.67370 0.900 0.004 0.096
#> SRR1405331 1 0.5070 0.69374 0.772 0.004 0.224
#> SRR1345609 1 0.6737 0.50453 0.600 0.016 0.384
#> SRR1380208 1 0.8357 0.45749 0.620 0.232 0.148
#> SRR1322840 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR1399797 1 0.0892 0.71445 0.980 0.000 0.020
#> SRR1416654 1 0.0747 0.71658 0.984 0.000 0.016
#> SRR1315081 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR1369196 1 0.1163 0.71844 0.972 0.000 0.028
#> SRR1400847 1 0.6381 0.57958 0.648 0.012 0.340
#> SRR1365291 1 0.3272 0.72895 0.892 0.004 0.104
#> SRR1367920 2 0.0424 0.72892 0.000 0.992 0.008
#> SRR1366648 1 0.0747 0.71301 0.984 0.000 0.016
#> SRR1441679 1 0.2796 0.67495 0.908 0.000 0.092
#> SRR1082173 1 0.3129 0.73292 0.904 0.008 0.088
#> SRR1363968 1 0.5536 0.68214 0.752 0.012 0.236
#> SRR814387 1 0.6521 0.57856 0.644 0.016 0.340
#> SRR657599 3 0.6816 -0.10451 0.472 0.012 0.516
#> SRR1386689 2 0.0592 0.73150 0.000 0.988 0.012
#> SRR1395575 1 0.2356 0.72649 0.928 0.000 0.072
#> SRR1453811 1 0.6540 0.37908 0.584 0.008 0.408
#> SRR1441159 1 0.6684 0.62721 0.676 0.032 0.292
#> SRR1403154 2 0.0237 0.73237 0.000 0.996 0.004
#> SRR1468722 1 0.0892 0.71510 0.980 0.000 0.020
#> SRR1310275 1 0.3272 0.72895 0.892 0.004 0.104
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 1 0.2197 0.71832 0.928 0.048 0.024 0.000
#> SRR1331708 1 0.5487 0.50673 0.644 0.328 0.024 0.004
#> SRR1464258 3 0.5751 0.69636 0.352 0.012 0.616 0.020
#> SRR1454201 1 0.4818 0.65047 0.748 0.216 0.036 0.000
#> SRR661589 2 0.4977 0.17302 0.460 0.540 0.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.3818 0.72327 0.844 0.108 0.048 0.000
#> SRR1315165 4 0.5146 0.67292 0.080 0.092 0.032 0.796
#> SRR1488960 1 0.3108 0.72413 0.872 0.112 0.016 0.000
#> SRR1417809 2 0.8444 0.20735 0.380 0.408 0.044 0.168
#> SRR1094457 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1095575 1 0.4994 0.05895 0.520 0.480 0.000 0.000
#> SRR1315931 3 0.5783 0.68591 0.360 0.012 0.608 0.020
#> SRR1430066 2 0.4898 0.28161 0.416 0.584 0.000 0.000
#> SRR1431037 2 0.4955 0.20771 0.444 0.556 0.000 0.000
#> SRR1395554 2 0.4907 0.27105 0.420 0.580 0.000 0.000
#> SRR818002 2 0.8337 -0.22903 0.144 0.428 0.048 0.380
#> SRR1344143 2 0.2814 0.53886 0.132 0.868 0.000 0.000
#> SRR1486845 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1362866 1 0.4764 0.65290 0.748 0.220 0.032 0.000
#> SRR1490740 1 0.1975 0.67848 0.936 0.016 0.048 0.000
#> SRR1446627 2 0.3024 0.53903 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.6644 0.32294 0.108 0.696 0.048 0.148
#> SRR1416248 1 0.1888 0.71172 0.940 0.044 0.016 0.000
#> SRR1383907 4 0.8038 0.40997 0.136 0.308 0.044 0.512
#> SRR1311018 1 0.2021 0.67112 0.932 0.012 0.056 0.000
#> SRR1375699 2 0.4086 0.52113 0.216 0.776 0.008 0.000
#> SRR1429846 1 0.4761 0.41715 0.628 0.372 0.000 0.000
#> SRR613550 1 0.5088 0.58365 0.688 0.288 0.024 0.000
#> SRR1348402 1 0.2402 0.72403 0.912 0.076 0.012 0.000
#> SRR1345146 2 0.4972 0.17839 0.456 0.544 0.000 0.000
#> SRR1324025 1 0.4830 0.37695 0.608 0.392 0.000 0.000
#> SRR1318879 2 0.4916 0.26677 0.424 0.576 0.000 0.000
#> SRR820755 1 0.4331 0.58981 0.712 0.288 0.000 0.000
#> SRR1485830 4 0.4928 0.66526 0.072 0.132 0.008 0.788
#> SRR599313 3 0.2877 0.71122 0.060 0.008 0.904 0.028
#> SRR612263 1 0.4262 0.66434 0.756 0.236 0.008 0.000
#> SRR1415398 1 0.4985 0.10017 0.532 0.468 0.000 0.000
#> SRR1326205 2 0.8530 0.21192 0.364 0.400 0.040 0.196
#> SRR1421327 4 0.1182 0.80357 0.000 0.016 0.016 0.968
#> SRR1083311 2 0.4898 0.28103 0.416 0.584 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.4108 0.72238 0.052 0.092 0.012 0.844
#> SRR1079522 2 0.4999 0.04114 0.492 0.508 0.000 0.000
#> SRR1452935 2 0.4916 0.26431 0.424 0.576 0.000 0.000
#> SRR1379495 1 0.1722 0.67256 0.944 0.008 0.048 0.000
#> SRR1470459 2 0.3444 0.53119 0.184 0.816 0.000 0.000
#> SRR661361 1 0.5783 0.61683 0.704 0.188 0.108 0.000
#> SRR615778 1 0.4610 0.64825 0.744 0.236 0.020 0.000
#> SRR1447564 1 0.2131 0.69960 0.932 0.036 0.032 0.000
#> SRR1455195 1 0.4463 0.69148 0.808 0.144 0.040 0.008
#> SRR655182 1 0.4262 0.63969 0.756 0.236 0.008 0.000
#> SRR1335140 2 0.7867 0.09495 0.136 0.560 0.048 0.256
#> SRR1433555 2 0.4866 0.30340 0.404 0.596 0.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.5161 0.31217 0.400 0.592 0.008 0.000
#> SRR1388354 1 0.2021 0.71122 0.936 0.040 0.024 0.000
#> SRR1317446 2 0.4898 0.28161 0.416 0.584 0.000 0.000
#> SRR1413602 2 0.4888 0.29527 0.412 0.588 0.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.2589 0.53506 0.116 0.884 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.1929 0.68056 0.940 0.024 0.036 0.000
#> SRR661313 1 0.4937 0.65626 0.764 0.172 0.064 0.000
#> SRR1499935 4 0.4652 0.69640 0.076 0.072 0.028 0.824
#> SRR1447303 1 0.4877 0.32137 0.592 0.408 0.000 0.000
#> SRR1429408 4 0.8539 0.31434 0.140 0.380 0.064 0.416
#> SRR1433950 1 0.3037 0.72801 0.880 0.100 0.020 0.000
#> SRR1362081 2 0.3266 0.53593 0.168 0.832 0.000 0.000
#> SRR1409854 1 0.4844 0.57423 0.688 0.300 0.012 0.000
#> SRR1435229 2 0.4996 0.07601 0.484 0.516 0.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.4100 0.72658 0.824 0.128 0.048 0.000
#> SRR1414229 1 0.4745 0.65592 0.756 0.208 0.036 0.000
#> SRR1400974 2 0.4877 0.29623 0.408 0.592 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.2021 0.67112 0.932 0.012 0.056 0.000
#> SRR613927 1 0.5208 0.64644 0.748 0.172 0.080 0.000
#> SRR1457854 1 0.2111 0.71286 0.932 0.044 0.024 0.000
#> SRR1473714 3 0.2877 0.71122 0.060 0.008 0.904 0.028
#> SRR813776 1 0.4331 0.58981 0.712 0.288 0.000 0.000
#> SRR808196 2 0.8467 0.20579 0.376 0.408 0.044 0.172
#> SRR1101085 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR614395 1 0.2197 0.67691 0.928 0.024 0.048 0.000
#> SRR1478251 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1370551 2 0.3400 0.53251 0.180 0.820 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.1722 0.67256 0.944 0.008 0.048 0.000
#> SRR665310 1 0.5060 0.29161 0.584 0.412 0.004 0.000
#> SRR1420109 1 0.5168 -0.00560 0.504 0.492 0.004 0.000
#> SRR1330920 1 0.4123 0.67038 0.772 0.220 0.008 0.000
#> SRR1419539 2 0.5723 0.37522 0.340 0.624 0.032 0.004
#> SRR1359447 2 0.4661 0.37055 0.348 0.652 0.000 0.000
#> SRR1347259 2 0.8751 0.05512 0.200 0.440 0.060 0.300
#> SRR613915 1 0.5228 0.62314 0.696 0.268 0.036 0.000
#> SRR1384395 2 0.4866 0.30340 0.404 0.596 0.000 0.000
#> SRR821715 1 0.5119 0.18976 0.556 0.440 0.004 0.000
#> SRR1478228 1 0.2021 0.71023 0.936 0.040 0.024 0.000
#> SRR1445637 1 0.5085 0.38976 0.616 0.376 0.008 0.000
#> SRR608150 1 0.5223 0.66437 0.764 0.172 0.044 0.020
#> SRR1096383 1 0.1890 0.72065 0.936 0.056 0.008 0.000
#> SRR1341480 4 0.0779 0.81116 0.004 0.016 0.000 0.980
#> SRR1341344 1 0.4272 0.70629 0.832 0.108 0.048 0.012
#> SRR1326270 1 0.6282 0.53743 0.664 0.160 0.176 0.000
#> SRR1498838 2 0.4925 0.25364 0.428 0.572 0.000 0.000
#> SRR1416313 2 0.4907 0.27005 0.420 0.580 0.000 0.000
#> SRR808566 4 0.8038 0.40997 0.136 0.308 0.044 0.512
#> SRR1430270 4 0.0779 0.81171 0.004 0.016 0.000 0.980
#> SRR1367825 2 0.4877 0.29623 0.408 0.592 0.000 0.000
#> SRR613533 2 0.4967 0.19728 0.452 0.548 0.000 0.000
#> SRR661267 1 0.2888 0.72189 0.872 0.124 0.004 0.000
#> SRR810665 2 0.3981 0.52167 0.100 0.848 0.012 0.040
#> SRR1407250 1 0.4549 0.67178 0.776 0.188 0.036 0.000
#> SRR1420067 1 0.4466 0.67931 0.784 0.180 0.036 0.000
#> SRR1473632 1 0.1929 0.68056 0.940 0.024 0.036 0.000
#> SRR812536 1 0.5062 0.58804 0.692 0.284 0.024 0.000
#> SRR1370850 2 0.6147 0.43788 0.132 0.720 0.024 0.124
#> SRR1486195 2 0.3400 0.53257 0.180 0.820 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.7539 0.27074 0.380 0.496 0.032 0.092
#> SRR1446375 2 0.4999 0.02957 0.492 0.508 0.000 0.000
#> SRR1465230 4 0.0524 0.81283 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR614119 1 0.4776 0.69485 0.776 0.176 0.044 0.004
#> SRR1356101 2 0.3764 0.51470 0.216 0.784 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.3161 0.72412 0.864 0.124 0.012 0.000
#> SRR1392676 2 0.2868 0.53903 0.136 0.864 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.2831 0.72211 0.876 0.120 0.004 0.000
#> SRR660510 2 0.4977 0.17302 0.460 0.540 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR658953 1 0.4991 0.37221 0.608 0.388 0.004 0.000
#> SRR2166459 1 0.3271 0.72275 0.856 0.132 0.012 0.000
#> SRR1070713 2 0.8535 0.25450 0.220 0.504 0.064 0.212
#> SRR1485312 2 0.4916 0.26606 0.424 0.576 0.000 0.000
#> SRR1317631 2 0.7686 0.17807 0.416 0.456 0.040 0.088
#> SRR1488610 1 0.4599 0.68244 0.780 0.184 0.032 0.004
#> SRR1330588 1 0.4985 0.11879 0.532 0.468 0.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.4501 0.67256 0.764 0.212 0.024 0.000
#> SRR1433926 1 0.2060 0.67092 0.932 0.016 0.052 0.000
#> SRR1091302 4 0.7840 0.44136 0.132 0.272 0.044 0.552
#> SRR818263 1 0.4353 0.66001 0.756 0.232 0.012 0.000
#> SRR1404909 4 0.4108 0.72170 0.052 0.092 0.012 0.844
#> SRR663076 1 0.1837 0.69092 0.944 0.028 0.028 0.000
#> SRR1323577 2 0.7029 0.30549 0.128 0.660 0.044 0.168
#> SRR1442422 4 0.0524 0.81283 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR1465893 1 0.1975 0.71703 0.936 0.048 0.016 0.000
#> SRR654862 1 0.3982 0.67762 0.776 0.220 0.004 0.000
#> SRR1407112 4 0.0672 0.81264 0.008 0.008 0.000 0.984
#> SRR1332969 1 0.4989 0.09105 0.528 0.472 0.000 0.000
#> SRR1353199 1 0.5060 0.29161 0.584 0.412 0.004 0.000
#> SRR1378885 1 0.4761 0.41516 0.628 0.372 0.000 0.000
#> SRR665357 2 0.4888 0.28915 0.412 0.588 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.3088 0.53763 0.128 0.864 0.008 0.000
#> SRR1501020 2 0.4996 0.07670 0.484 0.516 0.000 0.000
#> SRR1347819 2 0.4888 0.28993 0.412 0.588 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.5664 0.41366 0.092 0.764 0.036 0.108
#> SRR1472576 2 0.8347 -0.26366 0.144 0.408 0.048 0.400
#> SRR1431781 4 0.4952 0.68321 0.080 0.080 0.032 0.808
#> SRR1452270 2 0.4916 0.26606 0.424 0.576 0.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.4925 0.25386 0.572 0.428 0.000 0.000
#> SRR1417632 4 0.7802 0.38691 0.120 0.308 0.040 0.532
#> SRR1350153 2 0.3335 0.53713 0.120 0.860 0.000 0.020
#> SRR1458113 1 0.5222 0.57529 0.688 0.280 0.032 0.000
#> SRR1326579 1 0.4197 0.69755 0.808 0.156 0.036 0.000
#> SRR1349363 2 0.3668 0.53286 0.188 0.808 0.004 0.000
#> SRR1096712 2 0.4877 0.29623 0.408 0.592 0.000 0.000
#> SRR1090407 1 0.4967 0.16618 0.548 0.452 0.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.8182 -0.01241 0.152 0.496 0.044 0.308
#> SRR1377599 4 0.1059 0.80462 0.000 0.012 0.016 0.972
#> SRR1488449 2 0.5000 0.01160 0.500 0.500 0.000 0.000
#> SRR1318354 2 0.4981 0.14931 0.464 0.536 0.000 0.000
#> SRR1359062 2 0.4907 0.27215 0.420 0.580 0.000 0.000
#> SRR1398924 1 0.4957 0.55196 0.684 0.300 0.016 0.000
#> SRR663783 2 0.4977 0.18326 0.460 0.540 0.000 0.000
#> SRR1319204 2 0.4998 0.05565 0.488 0.512 0.000 0.000
#> SRR1369070 2 0.5455 0.42299 0.088 0.776 0.032 0.104
#> SRR615659 1 0.2060 0.67092 0.932 0.016 0.052 0.000
#> SRR1337449 2 0.3306 0.53890 0.156 0.840 0.004 0.000
#> SRR1316982 2 0.4624 0.39067 0.340 0.660 0.000 0.000
#> SRR1498595 2 0.7889 0.08851 0.136 0.556 0.048 0.260
#> SRR1377423 1 0.5167 0.00843 0.508 0.488 0.004 0.000
#> SRR1312310 2 0.3591 0.53853 0.168 0.824 0.008 0.000
#> SRR1485613 1 0.2101 0.71999 0.928 0.060 0.012 0.000
#> SRR1338426 2 0.4925 0.25842 0.428 0.572 0.000 0.000
#> SRR1353309 2 0.4888 0.29209 0.412 0.588 0.000 0.000
#> SRR658941 1 0.5343 0.51304 0.656 0.316 0.028 0.000
#> SRR1101643 3 0.4567 0.73106 0.196 0.008 0.776 0.020
#> SRR1401468 1 0.2197 0.71832 0.928 0.048 0.024 0.000
#> SRR1368874 2 0.3311 0.53497 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.8259 0.37490 0.136 0.336 0.052 0.476
#> SRR1363858 3 0.2877 0.71122 0.060 0.008 0.904 0.028
#> SRR819820 1 0.5423 0.48311 0.640 0.332 0.028 0.000
#> SRR1337342 1 0.4466 0.67931 0.784 0.180 0.036 0.000
#> SRR655206 2 0.5598 0.39493 0.332 0.636 0.028 0.004
#> SRR1387013 2 0.6793 0.31374 0.116 0.684 0.048 0.152
#> SRR1317410 1 0.1411 0.70056 0.960 0.020 0.020 0.000
#> SRR608198 1 0.4113 0.70837 0.828 0.128 0.040 0.004
#> SRR1440161 2 0.3400 0.53251 0.180 0.820 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.5512 0.41968 0.088 0.772 0.032 0.108
#> SRR1381288 2 0.3024 0.53903 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1415379 2 0.8490 0.21163 0.368 0.404 0.040 0.188
#> SRR1099622 2 0.5682 0.47492 0.112 0.752 0.020 0.116
#> SRR663197 1 0.5184 0.64674 0.732 0.212 0.056 0.000
#> SRR1394836 2 0.5804 0.34608 0.360 0.604 0.032 0.004
#> SRR661699 2 0.5080 0.28462 0.420 0.576 0.004 0.000
#> SRR813680 1 0.2773 0.72656 0.880 0.116 0.004 0.000
#> SRR1410678 1 0.1722 0.67256 0.944 0.008 0.048 0.000
#> SRR1378109 4 0.0524 0.81283 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR1499174 1 0.2021 0.67951 0.936 0.024 0.040 0.000
#> SRR1311486 2 0.3306 0.53890 0.156 0.840 0.004 0.000
#> SRR1382851 2 0.8453 0.18470 0.196 0.516 0.064 0.224
#> SRR1433410 1 0.4745 0.67801 0.784 0.168 0.040 0.008
#> SRR661167 1 0.5337 0.24456 0.564 0.424 0.012 0.000
#> SRR1432518 2 0.4925 0.25842 0.428 0.572 0.000 0.000
#> SRR660462 2 0.4888 0.28915 0.412 0.588 0.000 0.000
#> SRR1374608 2 0.7824 0.16877 0.420 0.440 0.040 0.100
#> SRR657949 1 0.4866 0.32646 0.596 0.404 0.000 0.000
#> SRR1308882 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR655768 1 0.5263 0.25212 0.704 0.032 0.260 0.004
#> SRR1485870 2 0.8007 0.34136 0.184 0.552 0.044 0.220
#> SRR1444138 1 0.4820 0.56189 0.692 0.296 0.012 0.000
#> SRR1417342 1 0.3080 0.70695 0.880 0.096 0.024 0.000
#> SRR1470193 2 0.8048 0.17830 0.408 0.432 0.044 0.116
#> SRR1091380 1 0.5423 0.48311 0.640 0.332 0.028 0.000
#> SRR1099096 1 0.2224 0.71208 0.928 0.040 0.032 0.000
#> SRR1313583 4 0.7497 0.43627 0.156 0.228 0.028 0.588
#> SRR1467102 2 0.4883 0.45866 0.288 0.696 0.016 0.000
#> SRR1485416 4 0.1661 0.79176 0.004 0.052 0.000 0.944
#> SRR818821 2 0.4967 0.19728 0.452 0.548 0.000 0.000
#> SRR809963 1 0.2197 0.67691 0.928 0.024 0.048 0.000
#> SRR1072247 1 0.1411 0.70056 0.960 0.020 0.020 0.000
#> SRR1353710 2 0.8792 0.00811 0.192 0.432 0.064 0.312
#> SRR1445259 2 0.4977 0.16331 0.460 0.540 0.000 0.000
#> SRR1408393 1 0.5050 0.30375 0.588 0.408 0.004 0.000
#> SRR1361522 1 0.2060 0.67092 0.932 0.016 0.052 0.000
#> SRR1368597 1 0.3498 0.71981 0.832 0.160 0.008 0.000
#> SRR1309680 2 0.4626 0.51137 0.108 0.816 0.016 0.060
#> SRR1310542 2 0.4877 0.29623 0.408 0.592 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1406437 2 0.7545 0.16323 0.428 0.456 0.040 0.076
#> SRR1354931 1 0.5228 0.52702 0.664 0.312 0.024 0.000
#> SRR1391856 2 0.8342 0.36440 0.228 0.516 0.052 0.204
#> SRR1446738 2 0.8319 0.26211 0.224 0.520 0.052 0.204
#> SRR1309032 2 0.3444 0.53119 0.184 0.816 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.5838 0.49383 0.128 0.740 0.020 0.112
#> SRR1432611 2 0.3266 0.53601 0.168 0.832 0.000 0.000
#> SRR815869 2 0.4877 0.29623 0.408 0.592 0.000 0.000
#> SRR613150 1 0.4964 0.62340 0.716 0.256 0.028 0.000
#> SRR1375329 1 0.4925 0.25386 0.572 0.428 0.000 0.000
#> SRR1387921 1 0.1510 0.68906 0.956 0.016 0.028 0.000
#> SRR1466792 2 0.3266 0.53601 0.168 0.832 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.3581 0.53435 0.116 0.852 0.000 0.032
#> SRR1360695 1 0.2589 0.72561 0.884 0.116 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.1929 0.68056 0.940 0.024 0.036 0.000
#> SRR1400910 2 0.4999 0.03824 0.492 0.508 0.000 0.000
#> SRR1444203 4 0.0804 0.81261 0.008 0.012 0.000 0.980
#> SRR816177 2 0.8345 -0.07856 0.144 0.496 0.060 0.300
#> SRR658754 2 0.4898 0.28129 0.416 0.584 0.000 0.000
#> SRR1429603 2 0.8762 0.04209 0.200 0.436 0.060 0.304
#> SRR1397366 1 0.4978 0.36386 0.612 0.384 0.004 0.000
#> SRR1446028 1 0.2214 0.69645 0.928 0.028 0.044 0.000
#> SRR1083918 2 0.8243 -0.13419 0.144 0.480 0.048 0.328
#> SRR1337606 1 0.4745 0.65592 0.756 0.208 0.036 0.000
#> SRR659109 2 0.4907 0.27634 0.420 0.580 0.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.4272 0.70801 0.832 0.108 0.048 0.012
#> SRR656946 1 0.4401 0.59451 0.724 0.272 0.004 0.000
#> SRR1476102 1 0.4130 0.70989 0.824 0.136 0.036 0.004
#> SRR1476447 1 0.4272 0.70801 0.832 0.108 0.048 0.012
#> SRR1342067 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1385389 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1075971 1 0.3796 0.72321 0.848 0.096 0.056 0.000
#> SRR614419 1 0.4059 0.71251 0.832 0.124 0.040 0.004
#> SRR1322936 1 0.6134 0.57755 0.716 0.180 0.068 0.036
#> SRR1349121 1 0.2799 0.72471 0.884 0.108 0.008 0.000
#> SRR1430549 1 0.1807 0.67315 0.940 0.008 0.052 0.000
#> SRR612935 2 0.4977 0.16327 0.460 0.540 0.000 0.000
#> SRR661481 2 0.5664 0.41366 0.092 0.764 0.036 0.108
#> SRR1354117 2 0.3569 0.52527 0.196 0.804 0.000 0.000
#> SRR1393596 2 0.8751 0.04869 0.200 0.440 0.060 0.300
#> SRR1452164 1 0.2197 0.68347 0.928 0.024 0.048 0.000
#> SRR1070503 1 0.4606 0.63358 0.724 0.264 0.012 0.000
#> SRR1499894 2 0.4925 0.25816 0.428 0.572 0.000 0.000
#> SRR1082883 1 0.4830 0.67401 0.780 0.168 0.044 0.008
#> SRR1468271 1 0.1807 0.71768 0.940 0.052 0.008 0.000
#> SRR1332443 1 0.2772 0.71426 0.908 0.048 0.040 0.004
#> SRR810295 2 0.3591 0.53853 0.168 0.824 0.008 0.000
#> SRR662103 1 0.5215 0.13077 0.680 0.020 0.296 0.004
#> SRR1328620 2 0.4981 0.14931 0.464 0.536 0.000 0.000
#> SRR1396294 2 0.7684 0.18376 0.412 0.460 0.040 0.088
#> SRR1419917 1 0.2060 0.67092 0.932 0.016 0.052 0.000
#> SRR662114 1 0.5366 0.61260 0.684 0.276 0.040 0.000
#> SRR1489199 1 0.4914 0.53920 0.676 0.312 0.012 0.000
#> SRR813584 2 0.8482 -0.30671 0.132 0.404 0.064 0.400
#> SRR1069638 1 0.4252 0.63853 0.744 0.252 0.004 0.000
#> SRR614864 1 0.5055 0.60630 0.712 0.256 0.032 0.000
#> SRR1433392 1 0.4262 0.65555 0.756 0.236 0.008 0.000
#> SRR1377777 2 0.2737 0.53390 0.104 0.888 0.000 0.008
#> SRR2167710 1 0.4401 0.59451 0.724 0.272 0.004 0.000
#> SRR1401252 4 0.4412 0.70989 0.052 0.104 0.016 0.828
#> SRR1309963 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1338031 1 0.1975 0.67848 0.936 0.016 0.048 0.000
#> SRR1418628 2 0.3375 0.53578 0.116 0.864 0.008 0.012
#> SRR1486889 1 0.4679 0.46178 0.648 0.352 0.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.1837 0.69092 0.944 0.028 0.028 0.000
#> SRR1319731 1 0.1624 0.69596 0.952 0.020 0.028 0.000
#> SRR1356468 2 0.8311 0.20173 0.392 0.416 0.044 0.148
#> SRR1337010 2 0.3266 0.53593 0.168 0.832 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.3181 0.71220 0.888 0.064 0.044 0.004
#> SRR1486538 4 0.1297 0.80453 0.020 0.016 0.000 0.964
#> SRR1340486 4 0.0524 0.81283 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR1377696 2 0.7445 0.19638 0.128 0.612 0.044 0.216
#> SRR1465459 1 0.5016 0.35138 0.600 0.396 0.004 0.000
#> SRR1080270 2 0.4888 0.28915 0.412 0.588 0.000 0.000
#> SRR1312501 2 0.4925 0.25454 0.428 0.572 0.000 0.000
#> SRR1093148 1 0.5453 0.49929 0.648 0.320 0.032 0.000
#> SRR1467080 2 0.4877 0.29623 0.408 0.592 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.7835 0.09205 0.140 0.560 0.044 0.256
#> SRR816475 4 0.8278 0.36855 0.136 0.344 0.052 0.468
#> SRR1379198 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR613342 1 0.5088 0.58365 0.688 0.288 0.024 0.000
#> SRR1452246 2 0.6793 0.31374 0.116 0.684 0.048 0.152
#> SRR1338836 2 0.4641 0.50762 0.120 0.812 0.016 0.052
#> SRR1369129 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1396616 1 0.4994 0.05776 0.520 0.480 0.000 0.000
#> SRR813824 1 0.6282 0.53743 0.664 0.160 0.176 0.000
#> SRR1082376 1 0.3818 0.72473 0.844 0.108 0.048 0.000
#> SRR1500891 4 0.0376 0.81397 0.004 0.004 0.000 0.992
#> SRR807543 1 0.4123 0.67038 0.772 0.220 0.008 0.000
#> SRR1091572 1 0.3278 0.72463 0.864 0.116 0.020 0.000
#> SRR1346689 4 0.8223 0.37189 0.168 0.284 0.044 0.504
#> SRR1332424 1 0.4655 0.68404 0.792 0.160 0.040 0.008
#> SRR663729 4 0.9172 0.19317 0.248 0.304 0.076 0.372
#> SRR1097013 1 0.3271 0.72275 0.856 0.132 0.012 0.000
#> SRR613675 1 0.6134 0.57755 0.716 0.180 0.068 0.036
#> SRR1485357 4 0.0804 0.81261 0.008 0.012 0.000 0.980
#> SRR655816 2 0.5143 0.19950 0.456 0.540 0.004 0.000
#> SRR1500113 1 0.2342 0.72400 0.912 0.080 0.008 0.000
#> SRR1437622 2 0.8340 -0.23386 0.144 0.424 0.048 0.384
#> SRR1355172 1 0.2921 0.72031 0.860 0.140 0.000 0.000
#> SRR655531 1 0.3889 0.70626 0.844 0.112 0.040 0.004
#> SRR1338147 2 0.4998 0.05026 0.488 0.512 0.000 0.000
#> SRR1413329 1 0.3494 0.70919 0.824 0.172 0.004 0.000
#> SRR1485931 2 0.2814 0.53886 0.132 0.868 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.2111 0.71207 0.932 0.044 0.024 0.000
#> SRR1333308 2 0.8536 0.21146 0.372 0.400 0.044 0.184
#> SRR1452033 1 0.1520 0.70487 0.956 0.024 0.020 0.000
#> SRR1467316 2 0.2814 0.53886 0.132 0.868 0.000 0.000
#> SRR809018 2 0.4877 0.29623 0.408 0.592 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.3703 0.53229 0.140 0.840 0.008 0.012
#> SRR663440 1 0.4482 0.62419 0.728 0.264 0.008 0.000
#> SRR1471755 2 0.7972 0.02196 0.136 0.540 0.048 0.276
#> SRR808019 1 0.4406 0.68158 0.780 0.192 0.028 0.000
#> SRR1479133 1 0.6282 0.53743 0.664 0.160 0.176 0.000
#> SRR615069 1 0.4675 0.65254 0.736 0.244 0.020 0.000
#> SRR1456185 2 0.4546 0.49235 0.256 0.732 0.012 0.000
#> SRR1350069 2 0.7773 0.19181 0.408 0.456 0.040 0.096
#> SRR816316 3 0.5812 0.66572 0.368 0.012 0.600 0.020
#> SRR664795 1 0.2944 0.72077 0.868 0.128 0.004 0.000
#> SRR1490721 2 0.9097 -0.17918 0.244 0.344 0.068 0.344
#> SRR810643 1 0.1706 0.70949 0.948 0.036 0.016 0.000
#> SRR1430333 1 0.5339 0.46111 0.624 0.356 0.020 0.000
#> SRR1085285 1 0.6282 0.53743 0.664 0.160 0.176 0.000
#> SRR1099072 1 0.4992 0.06801 0.524 0.476 0.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.1854 0.67370 0.940 0.012 0.048 0.000
#> SRR1487340 1 0.1936 0.70430 0.940 0.032 0.028 0.000
#> SRR1420276 2 0.4877 0.29623 0.408 0.592 0.000 0.000
#> SRR1351347 2 0.4925 0.25604 0.428 0.572 0.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.4508 0.68348 0.780 0.184 0.036 0.000
#> SRR1370329 3 0.3158 0.72249 0.096 0.004 0.880 0.020
#> SRR1465001 1 0.1488 0.70807 0.956 0.032 0.012 0.000
#> SRR1476525 2 0.4814 0.50585 0.116 0.804 0.016 0.064
#> SRR819610 2 0.4186 0.53371 0.164 0.808 0.004 0.024
#> SRR2157314 1 0.1411 0.70056 0.960 0.020 0.020 0.000
#> SRR1409465 2 0.4720 0.50842 0.120 0.808 0.016 0.056
#> SRR809987 2 0.8613 0.21487 0.360 0.396 0.044 0.200
#> SRR613639 1 0.5862 0.58075 0.704 0.148 0.148 0.000
#> SRR1402285 4 0.0779 0.81171 0.004 0.016 0.000 0.980
#> SRR1077038 1 0.3893 0.69195 0.796 0.196 0.008 0.000
#> SRR1405660 2 0.4907 0.27866 0.420 0.580 0.000 0.000
#> SRR1095455 2 0.4999 0.03824 0.492 0.508 0.000 0.000
#> SRR1394734 2 0.8243 -0.13419 0.144 0.480 0.048 0.328
#> SRR1317771 1 0.3105 0.72604 0.868 0.120 0.012 0.000
#> SRR1365894 2 0.7975 0.33467 0.180 0.556 0.044 0.220
#> SRR1073581 1 0.1520 0.70487 0.956 0.024 0.020 0.000
#> SRR659804 1 0.1411 0.70056 0.960 0.020 0.020 0.000
#> SRR1345914 2 0.2973 0.53932 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.4449 0.50675 0.104 0.824 0.012 0.060
#> SRR1473529 2 0.7889 0.08851 0.136 0.556 0.048 0.260
#> SRR660764 1 0.5148 0.64885 0.736 0.208 0.056 0.000
#> SRR820448 3 0.5751 0.69636 0.352 0.012 0.616 0.020
#> SRR1328845 2 0.8309 0.20208 0.388 0.420 0.044 0.148
#> SRR1336415 4 0.0672 0.81264 0.008 0.008 0.000 0.984
#> SRR1379065 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1459190 1 0.5126 0.17997 0.552 0.444 0.004 0.000
#> SRR1346773 1 0.1807 0.71768 0.940 0.052 0.008 0.000
#> SRR1499521 1 0.4104 0.70643 0.808 0.164 0.028 0.000
#> SRR1440898 2 0.3024 0.53903 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1347459 2 0.4992 0.10231 0.476 0.524 0.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.2868 0.53903 0.136 0.864 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.1510 0.68906 0.956 0.016 0.028 0.000
#> SRR1333395 2 0.4188 0.50365 0.244 0.752 0.004 0.000
#> SRR1309248 2 0.8059 0.34854 0.192 0.552 0.048 0.208
#> SRR809161 1 0.5168 0.62598 0.712 0.248 0.040 0.000
#> SRR1316320 2 0.5583 0.49333 0.216 0.724 0.024 0.036
#> SRR1432629 2 0.6878 0.30731 0.116 0.676 0.048 0.160
#> SRR1498931 1 0.1888 0.67588 0.940 0.016 0.044 0.000
#> SRR1416578 4 0.8638 0.17104 0.300 0.288 0.032 0.380
#> SRR1405547 2 0.4877 0.29623 0.408 0.592 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1380764 1 0.4423 0.68294 0.788 0.176 0.036 0.000
#> SRR1309160 2 0.5000 0.03771 0.496 0.504 0.000 0.000
#> SRR663489 2 0.4877 0.29623 0.408 0.592 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.2921 0.72042 0.860 0.140 0.000 0.000
#> SRR1078489 2 0.4999 0.04114 0.492 0.508 0.000 0.000
#> SRR1332648 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR660614 2 0.4998 0.05565 0.488 0.512 0.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.3266 0.53638 0.168 0.832 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.1510 0.68906 0.956 0.016 0.028 0.000
#> SRR1477949 1 0.2805 0.72833 0.888 0.100 0.012 0.000
#> SRR1481419 2 0.4449 0.50675 0.104 0.824 0.012 0.060
#> SRR1464766 1 0.2101 0.71999 0.928 0.060 0.012 0.000
#> SRR615946 1 0.5184 0.64674 0.732 0.212 0.056 0.000
#> SRR1446481 2 0.5054 0.50731 0.132 0.784 0.012 0.072
#> SRR1467656 2 0.3981 0.52167 0.100 0.848 0.012 0.040
#> SRR1402962 1 0.4818 0.65047 0.748 0.216 0.036 0.000
#> SRR660224 2 0.2973 0.53932 0.144 0.856 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.3545 0.71558 0.828 0.164 0.008 0.000
#> SRR1347166 1 0.4610 0.64825 0.744 0.236 0.020 0.000
#> SRR1485722 1 0.4549 0.67178 0.776 0.188 0.036 0.000
#> SRR1415316 1 0.3479 0.72101 0.840 0.148 0.012 0.000
#> SRR613390 1 0.4286 0.70845 0.812 0.136 0.052 0.000
#> SRR661108 1 0.5102 0.64909 0.732 0.220 0.048 0.000
#> SRR2170173 1 0.4994 0.05895 0.520 0.480 0.000 0.000
#> SRR817329 1 0.4936 0.41031 0.624 0.372 0.004 0.000
#> SRR1401990 2 0.8467 0.20471 0.376 0.408 0.044 0.172
#> SRR1467745 4 0.8259 0.37490 0.136 0.336 0.052 0.476
#> SRR1471795 2 0.7849 0.04020 0.128 0.556 0.048 0.268
#> SRR1415637 2 0.2814 0.53886 0.132 0.868 0.000 0.000
#> SRR813137 1 0.2060 0.67092 0.932 0.016 0.052 0.000
#> SRR1314873 1 0.2002 0.67504 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR1401211 1 0.2704 0.72445 0.876 0.124 0.000 0.000
#> SRR1419692 4 0.0927 0.80816 0.016 0.008 0.000 0.976
#> SRR818797 1 0.5859 0.60075 0.704 0.156 0.140 0.000
#> SRR2164608 1 0.5244 0.36653 0.600 0.388 0.012 0.000
#> SRR1455586 2 0.4284 0.51882 0.224 0.764 0.012 0.000
#> SRR819459 2 0.4888 0.28869 0.412 0.588 0.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.2814 0.53886 0.132 0.868 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.5391 0.41580 0.084 0.780 0.032 0.104
#> SRR1385501 1 0.4212 0.68226 0.772 0.216 0.012 0.000
#> SRR1361652 1 0.5000 -0.00168 0.504 0.496 0.000 0.000
#> SRR1437119 1 0.2021 0.67112 0.932 0.012 0.056 0.000
#> SRR1478547 2 0.4888 0.28915 0.412 0.588 0.000 0.000
#> SRR1430910 2 0.4996 0.07601 0.484 0.516 0.000 0.000
#> SRR1310584 1 0.1936 0.70705 0.940 0.032 0.028 0.000
#> SRR1500216 3 0.2877 0.71122 0.060 0.008 0.904 0.028
#> SRR1486762 2 0.4996 0.08318 0.484 0.516 0.000 0.000
#> SRR1480854 4 0.1059 0.80462 0.000 0.012 0.016 0.972
#> SRR1489394 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1418085 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1340221 4 0.0779 0.81171 0.004 0.016 0.000 0.980
#> SRR1473058 2 0.8375 -0.25564 0.140 0.416 0.052 0.392
#> SRR1405165 1 0.5543 0.40818 0.612 0.360 0.028 0.000
#> SRR1433004 1 0.3778 0.72076 0.848 0.100 0.052 0.000
#> SRR1471477 1 0.3024 0.71731 0.852 0.148 0.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.3306 0.53890 0.156 0.840 0.004 0.000
#> SRR1098712 1 0.7101 0.22829 0.560 0.340 0.032 0.068
#> SRR1455038 1 0.6369 -0.39253 0.484 0.032 0.468 0.016
#> SRR1375248 2 0.3764 0.51470 0.216 0.784 0.000 0.000
#> SRR1403005 1 0.4925 0.24498 0.572 0.428 0.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.8172 0.00802 0.156 0.504 0.044 0.296
#> SRR1413541 1 0.3495 0.72212 0.844 0.140 0.016 0.000
#> SRR1392943 2 0.8016 0.18756 0.404 0.436 0.040 0.120
#> SRR1475192 2 0.4877 0.29704 0.408 0.592 0.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.4284 0.51882 0.224 0.764 0.012 0.000
#> SRR1452468 1 0.5174 0.42172 0.620 0.368 0.012 0.000
#> SRR1347060 2 0.4888 0.28993 0.412 0.588 0.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.5408 0.46538 0.296 0.672 0.028 0.004
#> SRR1447962 2 0.3688 0.51986 0.208 0.792 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.3444 0.53131 0.184 0.816 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.1624 0.70082 0.952 0.020 0.028 0.000
#> SRR1413436 1 0.4502 0.65125 0.748 0.236 0.016 0.000
#> SRR1311266 1 0.4599 0.68244 0.780 0.184 0.032 0.004
#> SRR1343302 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1373746 1 0.1807 0.67315 0.940 0.008 0.052 0.000
#> SRR1429678 1 0.3224 0.72218 0.864 0.120 0.016 0.000
#> SRR1469413 2 0.3636 0.53589 0.172 0.820 0.008 0.000
#> SRR1405331 1 0.4212 0.67459 0.772 0.216 0.012 0.000
#> SRR1345609 1 0.1892 0.68822 0.944 0.016 0.036 0.004
#> SRR1380208 2 0.8118 0.36413 0.200 0.544 0.048 0.208
#> SRR1322840 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1399797 2 0.4916 0.26030 0.424 0.576 0.000 0.000
#> SRR1416654 2 0.4907 0.27635 0.420 0.580 0.000 0.000
#> SRR1315081 2 0.4877 0.29623 0.408 0.592 0.000 0.000
#> SRR1369196 2 0.4916 0.26606 0.424 0.576 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.1798 0.71136 0.944 0.040 0.016 0.000
#> SRR1365291 1 0.4790 0.40796 0.620 0.380 0.000 0.000
#> SRR1367920 4 0.1059 0.80462 0.000 0.012 0.016 0.972
#> SRR1366648 2 0.4877 0.29623 0.408 0.592 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.3400 0.53490 0.180 0.820 0.000 0.000
#> SRR1082173 1 0.5244 0.36653 0.600 0.388 0.012 0.000
#> SRR1363968 1 0.4194 0.69618 0.800 0.172 0.028 0.000
#> SRR814387 1 0.1488 0.70807 0.956 0.032 0.012 0.000
#> SRR657599 1 0.5094 0.50474 0.744 0.044 0.208 0.004
#> SRR1386689 4 0.0524 0.81283 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR1395575 1 0.4998 0.02656 0.512 0.488 0.000 0.000
#> SRR1453811 1 0.6282 0.53743 0.664 0.160 0.176 0.000
#> SRR1441159 1 0.4136 0.71278 0.840 0.092 0.060 0.008
#> SRR1403154 4 0.0188 0.81384 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1468722 2 0.4898 0.28161 0.416 0.584 0.000 0.000
#> SRR1310275 1 0.4790 0.40796 0.620 0.380 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 1 0.2863 0.7269 0.876 0.064 0.060 0.000 0.000
#> SRR1331708 1 0.5448 0.4633 0.584 0.076 0.340 0.000 0.000
#> SRR1464258 5 0.5107 0.6462 0.316 0.048 0.004 0.000 0.632
#> SRR1454201 1 0.5110 0.6411 0.680 0.096 0.224 0.000 0.000
#> SRR661589 3 0.4219 0.3748 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.4084 0.7278 0.800 0.024 0.144 0.000 0.032
#> SRR1315165 4 0.5036 0.6027 0.044 0.164 0.052 0.740 0.000
#> SRR1488960 1 0.3821 0.7266 0.800 0.052 0.148 0.000 0.000
#> SRR1417809 2 0.7828 0.5725 0.272 0.440 0.188 0.100 0.000
#> SRR1094457 4 0.0000 0.8949 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095575 3 0.4306 0.1507 0.492 0.000 0.508 0.000 0.000
#> SRR1315931 5 0.5140 0.6357 0.324 0.048 0.004 0.000 0.624
#> SRR1430066 3 0.4015 0.4932 0.348 0.000 0.652 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.4114 0.4461 0.376 0.000 0.624 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.4030 0.4879 0.352 0.000 0.648 0.000 0.000
#> SRR818002 2 0.7379 0.5982 0.072 0.500 0.172 0.256 0.000
#> SRR1344143 3 0.0960 0.4446 0.008 0.016 0.972 0.000 0.004
#> SRR1486845 4 0.0000 0.8949 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362866 1 0.5010 0.6466 0.688 0.088 0.224 0.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.1894 0.6675 0.920 0.072 0.008 0.000 0.000
#> SRR1446627 3 0.1173 0.4681 0.020 0.012 0.964 0.000 0.004
#> SRR1456138 2 0.5938 0.5764 0.040 0.516 0.408 0.036 0.000
#> SRR1416248 1 0.2592 0.7232 0.892 0.052 0.056 0.000 0.000
#> SRR1383907 2 0.7010 0.3524 0.064 0.444 0.096 0.396 0.000
#> SRR1311018 1 0.2102 0.6594 0.916 0.068 0.004 0.000 0.012
#> SRR1375699 3 0.3117 0.5213 0.100 0.036 0.860 0.000 0.004
#> SRR1429846 1 0.4219 0.2957 0.584 0.000 0.416 0.000 0.000
#> SRR613550 1 0.5410 0.4995 0.604 0.056 0.332 0.000 0.008
#> SRR1348402 1 0.2685 0.7307 0.880 0.028 0.092 0.000 0.000
#> SRR1345146 3 0.4392 0.4297 0.380 0.008 0.612 0.000 0.000
#> SRR1324025 1 0.4262 0.2375 0.560 0.000 0.440 0.000 0.000
#> SRR1318879 3 0.4341 0.4714 0.364 0.008 0.628 0.000 0.000
#> SRR820755 1 0.4066 0.5389 0.672 0.004 0.324 0.000 0.000
#> SRR1485830 4 0.4863 0.6147 0.040 0.184 0.036 0.740 0.000
#> SRR599313 5 0.1768 0.6351 0.000 0.072 0.000 0.004 0.924
#> SRR612263 1 0.4268 0.6430 0.708 0.024 0.268 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.4300 0.1701 0.476 0.000 0.524 0.000 0.000
#> SRR1326205 2 0.7880 0.5888 0.256 0.452 0.160 0.132 0.000
#> SRR1421327 4 0.2286 0.8366 0.000 0.108 0.004 0.888 0.000
#> SRR1083311 3 0.4015 0.4934 0.348 0.000 0.652 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.3818 0.7221 0.016 0.144 0.028 0.812 0.000
#> SRR1079522 3 0.4497 0.3206 0.424 0.008 0.568 0.000 0.000
#> SRR1452935 3 0.4225 0.4732 0.364 0.004 0.632 0.000 0.000
#> SRR1379495 1 0.1697 0.6666 0.932 0.060 0.000 0.000 0.008
#> SRR1470459 3 0.1924 0.5292 0.064 0.008 0.924 0.000 0.004
#> SRR661361 1 0.6136 0.5882 0.644 0.056 0.212 0.000 0.088
#> SRR615778 1 0.4933 0.6509 0.688 0.076 0.236 0.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.2230 0.7133 0.912 0.044 0.044 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.4717 0.6895 0.736 0.120 0.144 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.4354 0.6212 0.712 0.032 0.256 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.7016 0.6577 0.056 0.528 0.276 0.140 0.000
#> SRR1433555 3 0.3949 0.5073 0.332 0.000 0.668 0.000 0.000
#> SRR1308650 3 0.4623 0.3988 0.304 0.032 0.664 0.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.2193 0.7203 0.912 0.028 0.060 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.4015 0.4932 0.348 0.000 0.652 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.4015 0.4974 0.348 0.000 0.652 0.000 0.000
#> SRR1479955 3 0.2166 0.3893 0.012 0.072 0.912 0.000 0.004
#> SRR809853 1 0.2144 0.6826 0.912 0.068 0.020 0.000 0.000
#> SRR661313 1 0.5549 0.6198 0.692 0.088 0.188 0.000 0.032
#> SRR1499935 4 0.4480 0.6790 0.040 0.124 0.048 0.788 0.000
#> SRR1447303 1 0.4273 0.1860 0.552 0.000 0.448 0.000 0.000
#> SRR1429408 2 0.7238 0.5498 0.052 0.492 0.176 0.280 0.000
#> SRR1433950 1 0.2964 0.7337 0.856 0.024 0.120 0.000 0.000
#> SRR1362081 3 0.1644 0.5113 0.048 0.008 0.940 0.000 0.004
#> SRR1409854 1 0.5097 0.5188 0.624 0.056 0.320 0.000 0.000
#> SRR1435229 3 0.4497 0.3192 0.424 0.008 0.568 0.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.3900 0.7308 0.808 0.016 0.144 0.000 0.032
#> SRR1414229 1 0.5073 0.6516 0.688 0.100 0.212 0.000 0.000
#> SRR1400974 3 0.3983 0.5016 0.340 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.2102 0.6594 0.916 0.068 0.004 0.000 0.012
#> SRR613927 1 0.5815 0.6094 0.676 0.092 0.188 0.000 0.044
#> SRR1457854 1 0.2325 0.7228 0.904 0.028 0.068 0.000 0.000
#> SRR1473714 5 0.1768 0.6351 0.000 0.072 0.000 0.004 0.924
#> SRR813776 1 0.4066 0.5389 0.672 0.004 0.324 0.000 0.000
#> SRR808196 2 0.7737 0.5793 0.268 0.460 0.168 0.104 0.000
#> SRR1101085 4 0.0000 0.8949 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614395 1 0.2291 0.6660 0.908 0.072 0.012 0.000 0.008
#> SRR1478251 4 0.0000 0.8949 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370551 3 0.1970 0.5250 0.060 0.012 0.924 0.000 0.004
#> SRR1362310 1 0.1697 0.6666 0.932 0.060 0.000 0.000 0.008
#> SRR665310 1 0.4781 0.1494 0.552 0.020 0.428 0.000 0.000
#> SRR1420109 3 0.4440 0.2364 0.468 0.004 0.528 0.000 0.000
#> SRR1330920 1 0.3728 0.6506 0.748 0.008 0.244 0.000 0.000
#> SRR1419539 3 0.6514 0.2067 0.236 0.244 0.516 0.004 0.000
#> SRR1359447 3 0.3844 0.5378 0.256 0.004 0.736 0.000 0.004
#> SRR1347259 2 0.7316 0.6453 0.080 0.524 0.228 0.168 0.000
#> SRR613915 1 0.5370 0.5674 0.640 0.040 0.296 0.000 0.024
#> SRR1384395 3 0.3949 0.5073 0.332 0.000 0.668 0.000 0.000
#> SRR821715 1 0.4450 -0.0443 0.508 0.004 0.488 0.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.2605 0.7236 0.896 0.044 0.056 0.000 0.004
#> SRR1445637 1 0.4446 0.3012 0.592 0.008 0.400 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.5386 0.6575 0.680 0.148 0.168 0.004 0.000
#> SRR1096383 1 0.3076 0.7329 0.868 0.036 0.088 0.000 0.008
#> SRR1341480 4 0.1121 0.8781 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1341344 1 0.4158 0.7115 0.784 0.124 0.092 0.000 0.000
#> SRR1326270 1 0.6431 0.5241 0.632 0.060 0.152 0.000 0.156
#> SRR1498838 3 0.4114 0.4498 0.376 0.000 0.624 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.4030 0.4874 0.352 0.000 0.648 0.000 0.000
#> SRR808566 2 0.7010 0.3524 0.064 0.444 0.096 0.396 0.000
#> SRR1430270 4 0.0794 0.8848 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1367825 3 0.3983 0.5016 0.340 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.4150 0.4377 0.388 0.000 0.612 0.000 0.000
#> SRR661267 1 0.3535 0.7190 0.808 0.028 0.164 0.000 0.000
#> SRR810665 3 0.4403 0.1474 0.032 0.240 0.724 0.000 0.004
#> SRR1407250 1 0.4934 0.6666 0.708 0.104 0.188 0.000 0.000
#> SRR1420067 1 0.4914 0.6736 0.712 0.108 0.180 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.1942 0.6721 0.920 0.068 0.012 0.000 0.000
#> SRR812536 1 0.5394 0.5059 0.608 0.056 0.328 0.000 0.008
#> SRR1370850 3 0.6388 -0.4072 0.048 0.372 0.524 0.052 0.004
#> SRR1486195 3 0.1970 0.5230 0.060 0.012 0.924 0.000 0.004
#> SRR1407671 3 0.7633 -0.4218 0.256 0.292 0.400 0.052 0.000
#> SRR1446375 3 0.4533 0.2692 0.448 0.008 0.544 0.000 0.000
#> SRR1465230 4 0.0324 0.8936 0.004 0.004 0.000 0.992 0.000
#> SRR614119 1 0.5183 0.6762 0.708 0.064 0.204 0.000 0.024
#> SRR1356101 3 0.2339 0.5612 0.100 0.004 0.892 0.000 0.004
#> SRR1404209 1 0.3723 0.7246 0.804 0.044 0.152 0.000 0.000
#> SRR1392676 3 0.1074 0.4517 0.012 0.016 0.968 0.000 0.004
#> SRR665538 1 0.3283 0.7265 0.832 0.028 0.140 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.4227 0.3656 0.420 0.000 0.580 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.8949 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658953 1 0.4597 0.2392 0.564 0.012 0.424 0.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.3616 0.7218 0.804 0.032 0.164 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.7355 0.6404 0.080 0.448 0.352 0.120 0.000
#> SRR1485312 3 0.4060 0.4802 0.360 0.000 0.640 0.000 0.000
#> SRR1317631 2 0.7731 0.4774 0.312 0.368 0.264 0.056 0.000
#> SRR1488610 1 0.4681 0.6831 0.728 0.084 0.188 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.4300 0.1471 0.476 0.000 0.524 0.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.4224 0.6764 0.744 0.040 0.216 0.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.2054 0.6561 0.916 0.072 0.004 0.000 0.008
#> SRR1091302 4 0.6807 -0.2312 0.060 0.408 0.080 0.452 0.000
#> SRR818263 1 0.4132 0.6343 0.720 0.020 0.260 0.000 0.000
#> SRR1404909 4 0.3938 0.7049 0.016 0.164 0.024 0.796 0.000
#> SRR663076 1 0.2036 0.6961 0.920 0.056 0.024 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.6320 0.6085 0.056 0.536 0.356 0.052 0.000
#> SRR1442422 4 0.0324 0.8936 0.004 0.004 0.000 0.992 0.000
#> SRR1465893 1 0.2426 0.7272 0.900 0.036 0.064 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.3890 0.6538 0.736 0.012 0.252 0.000 0.000
#> SRR1407112 4 0.0451 0.8928 0.004 0.008 0.000 0.988 0.000
#> SRR1332969 3 0.4297 0.1769 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000
#> SRR1353199 1 0.4781 0.1494 0.552 0.020 0.428 0.000 0.000
#> SRR1378885 1 0.4192 0.3276 0.596 0.000 0.404 0.000 0.000
#> SRR665357 3 0.3999 0.4976 0.344 0.000 0.656 0.000 0.000
#> SRR662186 3 0.3037 0.3554 0.032 0.100 0.864 0.000 0.004
#> SRR1501020 3 0.4397 0.3292 0.432 0.004 0.564 0.000 0.000
#> SRR1347819 3 0.3999 0.4980 0.344 0.000 0.656 0.000 0.000
#> SRR1480813 3 0.5564 -0.4386 0.028 0.444 0.504 0.024 0.000
#> SRR1472576 2 0.7468 0.5776 0.072 0.476 0.172 0.280 0.000
#> SRR1431781 4 0.4622 0.6617 0.044 0.124 0.052 0.780 0.000
#> SRR1452270 3 0.4045 0.4831 0.356 0.000 0.644 0.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.4882 0.1406 0.532 0.024 0.444 0.000 0.000
#> SRR1417632 4 0.7439 -0.2385 0.056 0.276 0.204 0.464 0.000
#> SRR1350153 3 0.3950 0.4008 0.048 0.152 0.796 0.000 0.004
#> SRR1458113 1 0.5233 0.5703 0.636 0.076 0.288 0.000 0.000
#> SRR1326579 1 0.4573 0.6958 0.744 0.092 0.164 0.000 0.000
#> SRR1349363 3 0.2792 0.5100 0.072 0.040 0.884 0.000 0.004
#> SRR1096712 3 0.3983 0.5016 0.340 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.4307 0.0717 0.496 0.000 0.504 0.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.7312 0.6520 0.072 0.520 0.220 0.188 0.000
#> SRR1377599 4 0.2127 0.8395 0.000 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1488449 3 0.4262 0.2864 0.440 0.000 0.560 0.000 0.000
#> SRR1318354 3 0.4192 0.3912 0.404 0.000 0.596 0.000 0.000
#> SRR1359062 3 0.4030 0.4875 0.352 0.000 0.648 0.000 0.000
#> SRR1398924 1 0.4768 0.5359 0.656 0.040 0.304 0.000 0.000
#> SRR663783 3 0.4321 0.4229 0.396 0.004 0.600 0.000 0.000
#> SRR1319204 3 0.4256 0.3072 0.436 0.000 0.564 0.000 0.000
#> SRR1369070 3 0.5768 -0.4154 0.028 0.428 0.512 0.028 0.004
#> SRR615659 1 0.2054 0.6561 0.916 0.072 0.004 0.000 0.008
#> SRR1337449 3 0.1728 0.4897 0.036 0.020 0.940 0.000 0.004
#> SRR1316982 3 0.3700 0.5451 0.240 0.008 0.752 0.000 0.000
#> SRR1498595 2 0.7049 0.6567 0.056 0.524 0.276 0.144 0.000
#> SRR1377423 3 0.4443 0.2253 0.472 0.004 0.524 0.000 0.000
#> SRR1312310 3 0.2605 0.4928 0.056 0.044 0.896 0.000 0.004
#> SRR1485613 1 0.2853 0.7283 0.880 0.040 0.076 0.000 0.004
#> SRR1338426 3 0.4354 0.4655 0.368 0.008 0.624 0.000 0.000
#> SRR1353309 3 0.3999 0.4993 0.344 0.000 0.656 0.000 0.000
#> SRR658941 1 0.5664 0.4194 0.560 0.092 0.348 0.000 0.000
#> SRR1101643 5 0.3649 0.6711 0.152 0.040 0.000 0.000 0.808
#> SRR1401468 1 0.2863 0.7269 0.876 0.064 0.060 0.000 0.000
#> SRR1368874 3 0.1717 0.5159 0.052 0.008 0.936 0.000 0.004
#> SRR1324085 2 0.7211 0.4519 0.072 0.456 0.112 0.360 0.000
#> SRR1363858 5 0.1768 0.6351 0.000 0.072 0.000 0.004 0.924
#> SRR819820 1 0.5395 0.4178 0.576 0.068 0.356 0.000 0.000
#> SRR1337342 1 0.4914 0.6736 0.712 0.108 0.180 0.000 0.000
#> SRR655206 3 0.6349 0.3050 0.228 0.220 0.548 0.004 0.000
#> SRR1387013 2 0.5966 0.5895 0.044 0.532 0.388 0.036 0.000
#> SRR1317410 1 0.2193 0.7134 0.920 0.044 0.028 0.000 0.008
#> SRR608198 1 0.4450 0.7113 0.760 0.108 0.132 0.000 0.000
#> SRR1440161 3 0.1857 0.5248 0.060 0.008 0.928 0.000 0.004
#> SRR1343741 3 0.5698 -0.4087 0.028 0.432 0.512 0.024 0.004
#> SRR1381288 3 0.1173 0.4681 0.020 0.012 0.964 0.000 0.004
#> SRR1415379 2 0.7930 0.5871 0.256 0.444 0.168 0.132 0.000
#> SRR1099622 3 0.6018 -0.3500 0.036 0.408 0.516 0.036 0.004
#> SRR663197 1 0.5781 0.5812 0.640 0.076 0.256 0.000 0.028
#> SRR1394836 3 0.6542 0.2971 0.264 0.224 0.508 0.004 0.000
#> SRR661699 3 0.4435 0.4984 0.336 0.016 0.648 0.000 0.000
#> SRR813680 1 0.3477 0.7294 0.824 0.040 0.136 0.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.1697 0.6666 0.932 0.060 0.000 0.000 0.008
#> SRR1378109 4 0.0324 0.8936 0.004 0.004 0.000 0.992 0.000
#> SRR1499174 1 0.2102 0.6699 0.916 0.068 0.012 0.000 0.004
#> SRR1311486 3 0.1728 0.4897 0.036 0.020 0.940 0.000 0.004
#> SRR1382851 2 0.7185 0.6626 0.068 0.488 0.320 0.124 0.000
#> SRR1433410 1 0.4946 0.6747 0.712 0.120 0.168 0.000 0.000
#> SRR661167 1 0.5047 0.0552 0.504 0.024 0.468 0.000 0.004
#> SRR1432518 3 0.4354 0.4655 0.368 0.008 0.624 0.000 0.000
#> SRR660462 3 0.4030 0.4894 0.352 0.000 0.648 0.000 0.000
#> SRR1374608 2 0.7859 0.5017 0.296 0.380 0.252 0.072 0.000
#> SRR657949 1 0.4283 0.1281 0.544 0.000 0.456 0.000 0.000
#> SRR1308882 4 0.0162 0.8938 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR655768 1 0.6058 0.1013 0.632 0.156 0.020 0.000 0.192
#> SRR1485870 3 0.7265 -0.5376 0.060 0.364 0.440 0.136 0.000
#> SRR1444138 1 0.4830 0.5356 0.648 0.032 0.316 0.000 0.004
#> SRR1417342 1 0.2903 0.7025 0.872 0.048 0.080 0.000 0.000
#> SRR1470193 2 0.7935 0.5206 0.284 0.388 0.244 0.084 0.000
#> SRR1091380 1 0.5395 0.4178 0.576 0.068 0.356 0.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.2820 0.7259 0.884 0.056 0.056 0.000 0.004
#> SRR1313583 4 0.7006 0.1225 0.104 0.292 0.056 0.540 0.008
#> SRR1467102 3 0.3724 0.5582 0.184 0.028 0.788 0.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.1732 0.8494 0.000 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR818821 3 0.4150 0.4377 0.388 0.000 0.612 0.000 0.000
#> SRR809963 1 0.2291 0.6660 0.908 0.072 0.012 0.000 0.008
#> SRR1072247 1 0.2193 0.7134 0.920 0.044 0.028 0.000 0.008
#> SRR1353710 2 0.7389 0.6368 0.080 0.516 0.212 0.192 0.000
#> SRR1445259 3 0.4192 0.3925 0.404 0.000 0.596 0.000 0.000
#> SRR1408393 1 0.4644 0.0918 0.528 0.012 0.460 0.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.2054 0.6561 0.916 0.072 0.004 0.000 0.008
#> SRR1368597 1 0.3876 0.7130 0.776 0.032 0.192 0.000 0.000
#> SRR1309680 3 0.5342 -0.1049 0.044 0.324 0.620 0.008 0.004
#> SRR1310542 3 0.3983 0.5016 0.340 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.8949 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406437 2 0.7596 0.4664 0.304 0.376 0.276 0.044 0.000
#> SRR1354931 1 0.5419 0.3987 0.580 0.032 0.368 0.000 0.020
#> SRR1391856 3 0.7412 -0.4908 0.088 0.336 0.456 0.120 0.000
#> SRR1446738 2 0.7415 0.6485 0.096 0.460 0.332 0.112 0.000
#> SRR1309032 3 0.1924 0.5292 0.064 0.008 0.924 0.000 0.004
#> SRR1388145 3 0.5938 -0.2891 0.036 0.368 0.556 0.036 0.004
#> SRR1432611 3 0.1644 0.5118 0.048 0.008 0.940 0.000 0.004
#> SRR815869 3 0.3983 0.5016 0.340 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR613150 1 0.5533 0.5493 0.624 0.060 0.300 0.000 0.016
#> SRR1375329 1 0.4882 0.1406 0.532 0.024 0.444 0.000 0.000
#> SRR1387921 1 0.1444 0.6974 0.948 0.040 0.012 0.000 0.000
#> SRR1466792 3 0.1644 0.5118 0.048 0.008 0.940 0.000 0.004
#> SRR1360478 3 0.4078 0.3617 0.040 0.180 0.776 0.000 0.004
#> SRR1360695 1 0.3283 0.7281 0.832 0.028 0.140 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.2144 0.6826 0.912 0.068 0.020 0.000 0.000
#> SRR1400910 3 0.4464 0.3499 0.408 0.008 0.584 0.000 0.000
#> SRR1444203 4 0.0771 0.8898 0.004 0.020 0.000 0.976 0.000
#> SRR816177 2 0.6894 0.6516 0.064 0.576 0.196 0.164 0.000
#> SRR658754 3 0.4015 0.4935 0.348 0.000 0.652 0.000 0.000
#> SRR1429603 2 0.7295 0.6443 0.080 0.528 0.224 0.168 0.000
#> SRR1397366 1 0.4789 0.2626 0.584 0.024 0.392 0.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.2693 0.7062 0.896 0.060 0.028 0.000 0.016
#> SRR1083918 2 0.7195 0.6318 0.072 0.540 0.184 0.204 0.000
#> SRR1337606 1 0.5073 0.6516 0.688 0.100 0.212 0.000 0.000
#> SRR659109 3 0.4030 0.4918 0.352 0.000 0.648 0.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.4266 0.7136 0.776 0.120 0.104 0.000 0.000
#> SRR656946 1 0.4498 0.5574 0.688 0.032 0.280 0.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.4612 0.7104 0.752 0.092 0.152 0.000 0.004
#> SRR1476447 1 0.4266 0.7136 0.776 0.120 0.104 0.000 0.000
#> SRR1342067 4 0.0000 0.8949 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.8949 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.3989 0.7341 0.820 0.040 0.108 0.000 0.032
#> SRR614419 1 0.4351 0.7162 0.768 0.100 0.132 0.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.5956 0.4970 0.564 0.296 0.140 0.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.3355 0.7283 0.832 0.036 0.132 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.1764 0.6675 0.928 0.064 0.000 0.000 0.008
#> SRR612935 3 0.4182 0.4018 0.400 0.000 0.600 0.000 0.000
#> SRR661481 3 0.5564 -0.4386 0.028 0.444 0.504 0.024 0.000
#> SRR1354117 3 0.2116 0.5412 0.076 0.008 0.912 0.000 0.004
#> SRR1393596 2 0.7287 0.6457 0.080 0.528 0.228 0.164 0.000
#> SRR1452164 1 0.2437 0.6986 0.904 0.060 0.032 0.000 0.004
#> SRR1070503 1 0.4885 0.6052 0.668 0.056 0.276 0.000 0.000
#> SRR1499894 3 0.4060 0.4801 0.360 0.000 0.640 0.000 0.000
#> SRR1082883 1 0.5198 0.6606 0.688 0.148 0.164 0.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.2645 0.7264 0.888 0.044 0.068 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.3274 0.7270 0.856 0.076 0.064 0.000 0.004
#> SRR810295 3 0.2369 0.4991 0.056 0.032 0.908 0.000 0.004
#> SRR662103 1 0.5930 -0.0274 0.620 0.152 0.008 0.000 0.220
#> SRR1328620 3 0.4192 0.3912 0.404 0.000 0.596 0.000 0.000
#> SRR1396294 2 0.7723 0.4821 0.312 0.372 0.260 0.056 0.000
#> SRR1419917 1 0.2054 0.6561 0.916 0.072 0.004 0.000 0.008
#> SRR662114 1 0.5503 0.5813 0.644 0.048 0.280 0.000 0.028
#> SRR1489199 1 0.4822 0.5091 0.636 0.028 0.332 0.000 0.004
#> SRR813584 2 0.7161 0.5692 0.052 0.512 0.176 0.260 0.000
#> SRR1069638 1 0.3957 0.6065 0.712 0.008 0.280 0.000 0.000
#> SRR614864 1 0.5309 0.5876 0.644 0.092 0.264 0.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.3809 0.6399 0.736 0.008 0.256 0.000 0.000
#> SRR1377777 3 0.2054 0.4001 0.008 0.072 0.916 0.000 0.004
#> SRR2167710 1 0.4498 0.5574 0.688 0.032 0.280 0.000 0.000
#> SRR1401252 4 0.4146 0.6807 0.020 0.176 0.024 0.780 0.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.8949 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.1894 0.6675 0.920 0.072 0.008 0.000 0.000
#> SRR1418628 3 0.3496 0.3937 0.040 0.124 0.832 0.000 0.004
#> SRR1486889 1 0.4574 0.2935 0.576 0.012 0.412 0.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.2036 0.6961 0.920 0.056 0.024 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.1990 0.7136 0.928 0.040 0.028 0.000 0.004
#> SRR1356468 2 0.7785 0.5683 0.276 0.440 0.192 0.092 0.000
#> SRR1337010 3 0.1644 0.5113 0.048 0.008 0.940 0.000 0.004
#> SRR1486520 1 0.3392 0.7228 0.852 0.080 0.060 0.000 0.008
#> SRR1486538 4 0.1364 0.8770 0.012 0.036 0.000 0.952 0.000
#> SRR1340486 4 0.0324 0.8936 0.004 0.004 0.000 0.992 0.000
#> SRR1377696 2 0.6734 0.6454 0.052 0.532 0.316 0.100 0.000
#> SRR1465459 1 0.4622 0.1855 0.548 0.012 0.440 0.000 0.000
#> SRR1080270 3 0.4030 0.4894 0.352 0.000 0.648 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.4074 0.4712 0.364 0.000 0.636 0.000 0.000
#> SRR1093148 1 0.5744 0.4433 0.564 0.104 0.332 0.000 0.000
#> SRR1467080 3 0.3983 0.5016 0.340 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.7139 0.6623 0.064 0.516 0.280 0.140 0.000
#> SRR816475 2 0.7198 0.4641 0.072 0.464 0.112 0.352 0.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.8949 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613342 1 0.5410 0.4995 0.604 0.056 0.332 0.000 0.008
#> SRR1452246 2 0.5966 0.5895 0.044 0.532 0.388 0.036 0.000
#> SRR1338836 3 0.4882 -0.1161 0.032 0.328 0.636 0.000 0.004
#> SRR1369129 4 0.0000 0.8949 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.4297 0.1997 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000
#> SRR813824 1 0.6431 0.5241 0.632 0.060 0.152 0.000 0.156
#> SRR1082376 1 0.3767 0.7301 0.820 0.016 0.132 0.000 0.032
#> SRR1500891 4 0.0162 0.8946 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR807543 1 0.3728 0.6506 0.748 0.008 0.244 0.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.3012 0.7299 0.852 0.024 0.124 0.000 0.000
#> SRR1346689 4 0.7358 -0.3123 0.084 0.376 0.112 0.428 0.000
#> SRR1332424 1 0.4872 0.6808 0.720 0.120 0.160 0.000 0.000
#> SRR663729 2 0.6851 0.4424 0.068 0.568 0.120 0.244 0.000
#> SRR1097013 1 0.3616 0.7218 0.804 0.032 0.164 0.000 0.000
#> SRR613675 1 0.5956 0.4970 0.564 0.296 0.140 0.000 0.000
#> SRR1485357 4 0.0771 0.8898 0.004 0.020 0.000 0.976 0.000
#> SRR655816 3 0.4599 0.4340 0.384 0.016 0.600 0.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.3037 0.7313 0.860 0.040 0.100 0.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.7369 0.5950 0.072 0.500 0.168 0.260 0.000
#> SRR1355172 1 0.3687 0.7144 0.792 0.028 0.180 0.000 0.000
#> SRR655531 1 0.4221 0.7098 0.780 0.108 0.112 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.4262 0.2816 0.440 0.000 0.560 0.000 0.000
#> SRR1413329 1 0.3821 0.6952 0.764 0.020 0.216 0.000 0.000
#> SRR1485931 3 0.0960 0.4446 0.008 0.016 0.972 0.000 0.004
#> SRR1420873 1 0.2729 0.7248 0.884 0.056 0.060 0.000 0.000
#> SRR1333308 2 0.7801 0.5871 0.256 0.460 0.168 0.116 0.000
#> SRR1452033 1 0.1918 0.7147 0.928 0.036 0.036 0.000 0.000
#> SRR1467316 3 0.0960 0.4446 0.008 0.016 0.972 0.000 0.004
#> SRR809018 3 0.3983 0.5016 0.340 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR1375351 3 0.4019 0.3368 0.052 0.152 0.792 0.000 0.004
#> SRR663440 1 0.4249 0.5879 0.688 0.016 0.296 0.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.7105 0.6567 0.060 0.532 0.248 0.160 0.000
#> SRR808019 1 0.4766 0.6637 0.708 0.072 0.220 0.000 0.000
#> SRR1479133 1 0.6431 0.5241 0.632 0.060 0.152 0.000 0.156
#> SRR615069 1 0.4890 0.6452 0.680 0.064 0.256 0.000 0.000
#> SRR1456185 3 0.3764 0.5413 0.148 0.040 0.808 0.000 0.004
#> SRR1350069 2 0.7813 0.4878 0.304 0.368 0.264 0.064 0.000
#> SRR816316 5 0.5272 0.6190 0.328 0.048 0.008 0.000 0.616
#> SRR664795 1 0.3535 0.7191 0.808 0.028 0.164 0.000 0.000
#> SRR1490721 2 0.6915 0.5034 0.056 0.564 0.168 0.212 0.000
#> SRR810643 1 0.2592 0.7226 0.892 0.056 0.052 0.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.5351 0.3706 0.560 0.060 0.380 0.000 0.000
#> SRR1085285 1 0.6431 0.5241 0.632 0.060 0.152 0.000 0.156
#> SRR1099072 3 0.4302 0.1794 0.480 0.000 0.520 0.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.1981 0.6868 0.920 0.064 0.016 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.2313 0.7220 0.912 0.040 0.044 0.000 0.004
#> SRR1420276 3 0.3983 0.5016 0.340 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.4088 0.4671 0.368 0.000 0.632 0.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.4725 0.6908 0.732 0.076 0.188 0.000 0.004
#> SRR1370329 5 0.2284 0.6578 0.056 0.028 0.004 0.000 0.912
#> SRR1465001 1 0.2378 0.7217 0.904 0.048 0.048 0.000 0.000
#> SRR1476525 3 0.4897 -0.1749 0.028 0.352 0.616 0.000 0.004
#> SRR819610 3 0.4732 0.3658 0.084 0.176 0.736 0.000 0.004
#> SRR2157314 1 0.2193 0.7134 0.920 0.044 0.028 0.000 0.008
#> SRR1409465 3 0.4806 -0.1006 0.028 0.328 0.640 0.000 0.004
#> SRR809987 2 0.7921 0.5896 0.252 0.448 0.164 0.136 0.000
#> SRR613639 1 0.6514 0.5505 0.636 0.104 0.156 0.000 0.104
#> SRR1402285 4 0.0794 0.8848 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1077038 1 0.3690 0.6777 0.764 0.012 0.224 0.000 0.000
#> SRR1405660 3 0.4211 0.4810 0.360 0.004 0.636 0.000 0.000
#> SRR1095455 3 0.4473 0.3389 0.412 0.008 0.580 0.000 0.000
#> SRR1394734 2 0.7195 0.6318 0.072 0.540 0.184 0.204 0.000
#> SRR1317771 1 0.3844 0.7220 0.792 0.044 0.164 0.000 0.000
#> SRR1365894 3 0.7209 -0.5347 0.056 0.360 0.448 0.136 0.000
#> SRR1073581 1 0.1918 0.7147 0.928 0.036 0.036 0.000 0.000
#> SRR659804 1 0.2193 0.7134 0.920 0.044 0.028 0.000 0.008
#> SRR1345914 3 0.1074 0.4615 0.016 0.012 0.968 0.000 0.004
#> SRR1432186 3 0.4957 -0.1015 0.028 0.328 0.636 0.004 0.004
#> SRR1473529 2 0.7049 0.6567 0.056 0.524 0.276 0.144 0.000
#> SRR660764 1 0.5758 0.5853 0.644 0.076 0.252 0.000 0.028
#> SRR820448 5 0.5107 0.6462 0.316 0.048 0.004 0.000 0.632
#> SRR1328845 2 0.7653 0.5625 0.288 0.448 0.184 0.080 0.000
#> SRR1336415 4 0.0451 0.8928 0.004 0.008 0.000 0.988 0.000
#> SRR1379065 4 0.0162 0.8938 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1459190 3 0.4659 0.0979 0.488 0.012 0.500 0.000 0.000
#> SRR1346773 1 0.2645 0.7264 0.888 0.044 0.068 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.4349 0.7061 0.756 0.068 0.176 0.000 0.000
#> SRR1440898 3 0.1173 0.4681 0.020 0.012 0.964 0.000 0.004
#> SRR1347459 3 0.4219 0.3543 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1081209 3 0.1074 0.4517 0.012 0.016 0.968 0.000 0.004
#> SRR1400202 1 0.1444 0.6974 0.948 0.040 0.012 0.000 0.000
#> SRR1333395 3 0.4036 0.4962 0.144 0.068 0.788 0.000 0.000
#> SRR1309248 3 0.7246 -0.5749 0.064 0.392 0.420 0.124 0.000
#> SRR809161 1 0.5743 0.5442 0.616 0.064 0.296 0.000 0.024
#> SRR1316320 3 0.5422 0.1084 0.108 0.196 0.684 0.012 0.000
#> SRR1432629 2 0.6087 0.5935 0.044 0.528 0.384 0.044 0.000
#> SRR1498931 1 0.1857 0.6694 0.928 0.060 0.004 0.000 0.008
#> SRR1416578 2 0.7974 0.4681 0.228 0.364 0.088 0.320 0.000
#> SRR1405547 3 0.3983 0.5016 0.340 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.8949 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.4772 0.6853 0.728 0.108 0.164 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.4256 0.3021 0.436 0.000 0.564 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.3983 0.5016 0.340 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.3650 0.7174 0.796 0.028 0.176 0.000 0.000
#> SRR1078489 3 0.4489 0.3323 0.420 0.008 0.572 0.000 0.000
#> SRR1332648 4 0.0000 0.8949 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660614 3 0.4256 0.3072 0.436 0.000 0.564 0.000 0.000
#> SRR1470420 3 0.1644 0.5112 0.048 0.008 0.940 0.000 0.004
#> SRR1475566 1 0.1444 0.6974 0.948 0.040 0.012 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.3291 0.7343 0.840 0.040 0.120 0.000 0.000
#> SRR1481419 3 0.4940 -0.0965 0.028 0.324 0.640 0.004 0.004
#> SRR1464766 1 0.2853 0.7283 0.880 0.040 0.076 0.000 0.004
#> SRR615946 1 0.5781 0.5812 0.640 0.076 0.256 0.000 0.028
#> SRR1446481 3 0.5101 -0.1181 0.032 0.328 0.628 0.012 0.000
#> SRR1467656 3 0.4403 0.1474 0.032 0.240 0.724 0.000 0.004
#> SRR1402962 1 0.5110 0.6411 0.680 0.096 0.224 0.000 0.000
#> SRR660224 3 0.1173 0.4676 0.020 0.012 0.964 0.000 0.004
#> SRR665586 1 0.3812 0.7088 0.772 0.024 0.204 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.4933 0.6509 0.688 0.076 0.236 0.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.4934 0.6666 0.708 0.104 0.188 0.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.3343 0.7196 0.812 0.016 0.172 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.4985 0.6942 0.740 0.068 0.164 0.000 0.028
#> SRR661108 1 0.5637 0.5841 0.644 0.068 0.264 0.000 0.024
#> SRR2170173 3 0.4306 0.1507 0.492 0.000 0.508 0.000 0.000
#> SRR817329 1 0.4375 0.2625 0.576 0.004 0.420 0.000 0.000
#> SRR1401990 2 0.7819 0.5794 0.264 0.452 0.172 0.112 0.000
#> SRR1467745 2 0.7211 0.4519 0.072 0.456 0.112 0.360 0.000
#> SRR1471795 2 0.7086 0.6595 0.060 0.528 0.264 0.148 0.000
#> SRR1415637 3 0.0960 0.4446 0.008 0.016 0.972 0.000 0.004
#> SRR813137 1 0.2054 0.6561 0.916 0.072 0.004 0.000 0.008
#> SRR1314873 1 0.2054 0.6631 0.916 0.072 0.008 0.000 0.004
#> SRR1401211 1 0.3326 0.7257 0.824 0.024 0.152 0.000 0.000
#> SRR1419692 4 0.0693 0.8864 0.012 0.008 0.000 0.980 0.000
#> SRR818797 1 0.6130 0.5878 0.660 0.056 0.164 0.000 0.120
#> SRR2164608 1 0.4855 0.2422 0.552 0.024 0.424 0.000 0.000
#> SRR1455586 3 0.3064 0.5350 0.108 0.036 0.856 0.000 0.000
#> SRR819459 3 0.3999 0.4974 0.344 0.000 0.656 0.000 0.000
#> SRR1488939 3 0.0960 0.4446 0.008 0.016 0.972 0.000 0.004
#> SRR1433232 3 0.5694 -0.4234 0.024 0.428 0.516 0.028 0.004
#> SRR1385501 1 0.3961 0.6786 0.760 0.028 0.212 0.000 0.000
#> SRR1361652 3 0.4522 0.2603 0.440 0.008 0.552 0.000 0.000
#> SRR1437119 1 0.2102 0.6594 0.916 0.068 0.004 0.000 0.012
#> SRR1478547 3 0.4015 0.4941 0.348 0.000 0.652 0.000 0.000
#> SRR1430910 3 0.4497 0.3192 0.424 0.008 0.568 0.000 0.000
#> SRR1310584 1 0.2605 0.7201 0.896 0.056 0.044 0.000 0.004
#> SRR1500216 5 0.1768 0.6351 0.000 0.072 0.000 0.004 0.924
#> SRR1486762 3 0.4637 0.2902 0.452 0.012 0.536 0.000 0.000
#> SRR1480854 4 0.2127 0.8395 0.000 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.8949 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.8949 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0794 0.8848 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1473058 2 0.7209 0.5714 0.072 0.516 0.140 0.272 0.000
#> SRR1405165 1 0.5697 0.2486 0.512 0.084 0.404 0.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.3898 0.7263 0.820 0.028 0.120 0.000 0.032
#> SRR1471477 1 0.3795 0.7083 0.780 0.028 0.192 0.000 0.000
#> SRR1098567 3 0.1630 0.4896 0.036 0.016 0.944 0.000 0.004
#> SRR1098712 1 0.7306 0.0341 0.448 0.284 0.232 0.036 0.000
#> SRR1455038 5 0.5257 0.3922 0.476 0.024 0.012 0.000 0.488
#> SRR1375248 3 0.2339 0.5612 0.100 0.004 0.892 0.000 0.004
#> SRR1403005 1 0.4300 0.0361 0.524 0.000 0.476 0.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.7275 0.6584 0.072 0.524 0.228 0.176 0.000
#> SRR1413541 1 0.3399 0.7184 0.812 0.012 0.172 0.000 0.004
#> SRR1392943 2 0.7866 0.5369 0.276 0.404 0.240 0.080 0.000
#> SRR1475192 3 0.3966 0.5046 0.336 0.000 0.664 0.000 0.000
#> SRR1432085 3 0.3064 0.5350 0.108 0.036 0.856 0.000 0.000
#> SRR1452468 1 0.5052 0.2783 0.552 0.036 0.412 0.000 0.000
#> SRR1347060 3 0.3999 0.4980 0.344 0.000 0.656 0.000 0.000
#> SRR1414139 3 0.4630 0.5379 0.176 0.088 0.736 0.000 0.000
#> SRR1447962 3 0.2228 0.5543 0.092 0.004 0.900 0.000 0.004
#> SRR1444324 3 0.1924 0.5293 0.064 0.008 0.924 0.000 0.004
#> SRR1415004 1 0.1914 0.7110 0.932 0.032 0.032 0.000 0.004
#> SRR1413436 1 0.4706 0.6321 0.692 0.052 0.256 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.4681 0.6831 0.728 0.084 0.188 0.000 0.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.8949 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.1830 0.6632 0.924 0.068 0.000 0.000 0.008
#> SRR1429678 1 0.2771 0.7271 0.860 0.012 0.128 0.000 0.000
#> SRR1469413 3 0.1845 0.5188 0.056 0.016 0.928 0.000 0.000
#> SRR1405331 1 0.3700 0.6555 0.752 0.008 0.240 0.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.1557 0.6937 0.940 0.052 0.008 0.000 0.000
#> SRR1380208 3 0.7239 -0.5530 0.064 0.380 0.432 0.124 0.000
#> SRR1322840 4 0.0000 0.8949 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.4060 0.4760 0.360 0.000 0.640 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.4045 0.4857 0.356 0.000 0.644 0.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.3983 0.5016 0.340 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.4060 0.4802 0.360 0.000 0.640 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.2308 0.7214 0.912 0.036 0.048 0.000 0.004
#> SRR1365291 1 0.4227 0.3000 0.580 0.000 0.420 0.000 0.000
#> SRR1367920 4 0.2127 0.8395 0.000 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1366648 3 0.3983 0.5016 0.340 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR1441679 3 0.2032 0.5041 0.052 0.020 0.924 0.000 0.004
#> SRR1082173 1 0.4855 0.2422 0.552 0.024 0.424 0.000 0.000
#> SRR1363968 1 0.4547 0.6916 0.736 0.072 0.192 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.2378 0.7217 0.904 0.048 0.048 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.6266 0.4477 0.652 0.132 0.064 0.000 0.152
#> SRR1386689 4 0.0324 0.8936 0.004 0.004 0.000 0.992 0.000
#> SRR1395575 3 0.4437 0.2352 0.464 0.004 0.532 0.000 0.000
#> SRR1453811 1 0.6431 0.5241 0.632 0.060 0.152 0.000 0.156
#> SRR1441159 1 0.4091 0.7213 0.804 0.096 0.092 0.000 0.008
#> SRR1403154 4 0.0000 0.8949 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.4015 0.4932 0.348 0.000 0.652 0.000 0.000
#> SRR1310275 1 0.4227 0.3000 0.580 0.000 0.420 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 1 0.2265 0.5523 0.900 0.024 0.008 0.000 0.068 0.000
#> SRR1331708 1 0.5418 0.4697 0.616 0.072 0.272 0.000 0.040 0.000
#> SRR1464258 6 0.5937 0.3518 0.188 0.004 0.000 0.000 0.360 0.448
#> SRR1454201 1 0.4917 0.5939 0.720 0.072 0.144 0.000 0.064 0.000
#> SRR661589 3 0.4204 0.3481 0.448 0.008 0.540 0.000 0.004 0.000
#> SRR1456229 1 0.3767 0.5807 0.804 0.008 0.088 0.000 0.096 0.004
#> SRR1315165 4 0.4163 0.6188 0.024 0.228 0.016 0.728 0.004 0.000
#> SRR1488960 1 0.3423 0.6133 0.832 0.024 0.096 0.000 0.048 0.000
#> SRR1417809 2 0.7804 0.4482 0.220 0.452 0.088 0.076 0.164 0.000
#> SRR1094457 4 0.0000 0.9041 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.4461 -0.1164 0.512 0.004 0.464 0.000 0.020 0.000
#> SRR1315931 6 0.5988 0.2968 0.200 0.004 0.000 0.000 0.356 0.440
#> SRR1430066 3 0.3852 0.4884 0.384 0.004 0.612 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.3915 0.4392 0.412 0.004 0.584 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.3881 0.4758 0.396 0.004 0.600 0.000 0.000 0.000
#> SRR818002 2 0.5192 0.5321 0.032 0.672 0.080 0.212 0.004 0.000
#> SRR1344143 3 0.2549 0.3447 0.008 0.072 0.884 0.000 0.036 0.000
#> SRR1486845 4 0.0260 0.9032 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1362866 1 0.4835 0.6071 0.720 0.052 0.160 0.000 0.068 0.000
#> SRR1490740 1 0.3298 0.2542 0.756 0.008 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR1446627 3 0.2537 0.3794 0.016 0.068 0.888 0.000 0.028 0.000
#> SRR1456138 2 0.4164 0.5200 0.016 0.688 0.280 0.000 0.016 0.000
#> SRR1416248 1 0.2136 0.5422 0.908 0.016 0.012 0.000 0.064 0.000
#> SRR1383907 2 0.4912 0.3212 0.028 0.588 0.028 0.356 0.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.3265 0.2225 0.748 0.004 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1375699 3 0.3774 0.4764 0.096 0.072 0.808 0.000 0.024 0.000
#> SRR1429846 1 0.4394 0.2945 0.608 0.008 0.364 0.000 0.020 0.000
#> SRR613550 1 0.5877 0.4034 0.548 0.020 0.276 0.000 0.156 0.000
#> SRR1348402 1 0.2401 0.5744 0.892 0.004 0.044 0.000 0.060 0.000
#> SRR1345146 3 0.4205 0.4152 0.420 0.016 0.564 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324025 1 0.4294 0.2263 0.592 0.008 0.388 0.000 0.012 0.000
#> SRR1318879 3 0.3993 0.4681 0.400 0.008 0.592 0.000 0.000 0.000
#> SRR820755 1 0.4173 0.5009 0.692 0.008 0.272 0.000 0.028 0.000
#> SRR1485830 4 0.4350 0.6101 0.016 0.216 0.000 0.720 0.048 0.000
#> SRR599313 6 0.0000 0.6409 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612263 1 0.4234 0.6130 0.732 0.016 0.208 0.000 0.044 0.000
#> SRR1415398 1 0.4226 -0.1703 0.504 0.004 0.484 0.000 0.008 0.000
#> SRR1326205 2 0.7734 0.4528 0.196 0.456 0.052 0.108 0.188 0.000
#> SRR1421327 4 0.3706 0.7564 0.000 0.172 0.000 0.772 0.056 0.000
#> SRR1083311 3 0.3862 0.4856 0.388 0.004 0.608 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.3301 0.7030 0.000 0.216 0.004 0.772 0.008 0.000
#> SRR1079522 3 0.4331 0.2933 0.464 0.020 0.516 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452935 3 0.3890 0.4693 0.400 0.004 0.596 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379495 1 0.3215 0.2481 0.756 0.004 0.000 0.000 0.240 0.000
#> SRR1470459 3 0.2520 0.5074 0.068 0.032 0.888 0.000 0.012 0.000
#> SRR661361 1 0.6553 0.2422 0.548 0.008 0.176 0.000 0.204 0.064
#> SRR615778 1 0.4953 0.5996 0.712 0.052 0.156 0.000 0.080 0.000
#> SRR1447564 1 0.3268 0.4525 0.808 0.008 0.020 0.000 0.164 0.000
#> SRR1455195 1 0.4422 0.5796 0.768 0.060 0.076 0.000 0.096 0.000
#> SRR655182 1 0.5051 0.5057 0.656 0.008 0.208 0.000 0.128 0.000
#> SRR1335140 2 0.5173 0.5825 0.016 0.700 0.164 0.096 0.024 0.000
#> SRR1433555 3 0.3672 0.5030 0.368 0.000 0.632 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308650 3 0.4695 0.3642 0.296 0.024 0.648 0.000 0.032 0.000
#> SRR1388354 1 0.2926 0.5076 0.844 0.004 0.028 0.000 0.124 0.000
#> SRR1317446 3 0.3852 0.4884 0.384 0.004 0.612 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.3986 0.4884 0.384 0.004 0.608 0.000 0.004 0.000
#> SRR1479955 3 0.3010 0.2685 0.004 0.132 0.836 0.000 0.028 0.000
#> SRR809853 1 0.3493 0.2711 0.756 0.008 0.008 0.000 0.228 0.000
#> SRR661313 1 0.5683 0.2245 0.572 0.008 0.152 0.000 0.264 0.004
#> SRR1499935 4 0.3640 0.7029 0.024 0.176 0.016 0.784 0.000 0.000
#> SRR1447303 1 0.4521 0.1758 0.568 0.004 0.400 0.000 0.028 0.000
#> SRR1429408 2 0.5619 0.5312 0.024 0.668 0.092 0.180 0.036 0.000
#> SRR1433950 1 0.3052 0.5869 0.852 0.008 0.064 0.000 0.076 0.000
#> SRR1362081 3 0.2213 0.4838 0.048 0.032 0.908 0.000 0.012 0.000
#> SRR1409854 1 0.4833 0.5106 0.668 0.032 0.256 0.000 0.044 0.000
#> SRR1435229 3 0.4403 0.2849 0.468 0.024 0.508 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.3956 0.6013 0.796 0.016 0.092 0.000 0.092 0.004
#> SRR1414229 1 0.4843 0.5900 0.728 0.064 0.136 0.000 0.072 0.000
#> SRR1400974 3 0.3841 0.4952 0.380 0.004 0.616 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.3265 0.2225 0.748 0.004 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR613927 1 0.5777 0.1486 0.548 0.008 0.152 0.000 0.288 0.004
#> SRR1457854 1 0.3000 0.5131 0.840 0.004 0.032 0.000 0.124 0.000
#> SRR1473714 6 0.0000 0.6409 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR813776 1 0.4173 0.5009 0.692 0.008 0.272 0.000 0.028 0.000
#> SRR808196 2 0.7643 0.4455 0.216 0.456 0.056 0.080 0.192 0.000
#> SRR1101085 4 0.0363 0.9024 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR614395 1 0.3488 0.2258 0.744 0.004 0.008 0.000 0.244 0.000
#> SRR1478251 4 0.0000 0.9041 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370551 3 0.2390 0.4900 0.052 0.044 0.896 0.000 0.008 0.000
#> SRR1362310 1 0.3215 0.2481 0.756 0.004 0.000 0.000 0.240 0.000
#> SRR665310 1 0.5247 0.1823 0.528 0.012 0.392 0.000 0.068 0.000
#> SRR1420109 3 0.4636 0.1857 0.484 0.008 0.484 0.000 0.024 0.000
#> SRR1330920 1 0.4054 0.6022 0.748 0.008 0.192 0.000 0.052 0.000
#> SRR1419539 3 0.7138 0.1042 0.232 0.212 0.440 0.000 0.116 0.000
#> SRR1359447 3 0.4009 0.5216 0.288 0.028 0.684 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347259 2 0.6753 0.5401 0.040 0.588 0.104 0.108 0.160 0.000
#> SRR613915 1 0.5322 0.4956 0.624 0.008 0.244 0.000 0.120 0.004
#> SRR1384395 3 0.3807 0.5024 0.368 0.004 0.628 0.000 0.000 0.000
#> SRR821715 1 0.4624 -0.0399 0.516 0.008 0.452 0.000 0.024 0.000
#> SRR1478228 1 0.2395 0.5385 0.892 0.012 0.020 0.000 0.076 0.000
#> SRR1445637 1 0.4582 0.2995 0.604 0.008 0.356 0.000 0.032 0.000
#> SRR608150 1 0.5152 0.5533 0.708 0.084 0.100 0.000 0.108 0.000
#> SRR1096383 1 0.2908 0.5689 0.872 0.016 0.044 0.000 0.064 0.004
#> SRR1341480 4 0.1411 0.8802 0.000 0.060 0.000 0.936 0.004 0.000
#> SRR1341344 1 0.4065 0.5442 0.784 0.048 0.040 0.000 0.128 0.000
#> SRR1326270 1 0.6957 -0.2239 0.500 0.008 0.132 0.000 0.244 0.116
#> SRR1498838 3 0.3923 0.4423 0.416 0.004 0.580 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.3872 0.4801 0.392 0.004 0.604 0.000 0.000 0.000
#> SRR808566 2 0.4912 0.3212 0.028 0.588 0.028 0.356 0.000 0.000
#> SRR1430270 4 0.0713 0.8953 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.3830 0.4969 0.376 0.004 0.620 0.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.4039 0.4253 0.424 0.008 0.568 0.000 0.000 0.000
#> SRR661267 1 0.3396 0.6129 0.828 0.016 0.108 0.000 0.048 0.000
#> SRR810665 3 0.4179 0.0361 0.016 0.324 0.652 0.000 0.008 0.000
#> SRR1407250 1 0.4656 0.5931 0.748 0.064 0.112 0.000 0.076 0.000
#> SRR1420067 1 0.4550 0.5940 0.756 0.056 0.108 0.000 0.080 0.000
#> SRR1473632 1 0.3411 0.2452 0.756 0.008 0.004 0.000 0.232 0.000
#> SRR812536 1 0.5855 0.3956 0.544 0.016 0.276 0.000 0.164 0.000
#> SRR1370850 2 0.5374 0.4351 0.024 0.492 0.440 0.032 0.012 0.000
#> SRR1486195 3 0.2164 0.4980 0.056 0.028 0.908 0.000 0.008 0.000
#> SRR1407671 2 0.7750 0.3487 0.224 0.332 0.328 0.036 0.080 0.000
#> SRR1446375 3 0.4314 0.2301 0.484 0.004 0.500 0.000 0.012 0.000
#> SRR1465230 4 0.0520 0.9023 0.000 0.008 0.000 0.984 0.008 0.000
#> SRR614119 1 0.5232 0.4438 0.644 0.012 0.144 0.000 0.200 0.000
#> SRR1356101 3 0.2196 0.5587 0.108 0.004 0.884 0.000 0.004 0.000
#> SRR1404209 1 0.3707 0.6218 0.808 0.028 0.120 0.000 0.044 0.000
#> SRR1392676 3 0.2611 0.3652 0.012 0.080 0.880 0.000 0.028 0.000
#> SRR665538 1 0.3117 0.6038 0.852 0.016 0.080 0.000 0.052 0.000
#> SRR660510 3 0.4211 0.3318 0.456 0.008 0.532 0.000 0.004 0.000
#> SRR1445655 4 0.0146 0.9040 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR658953 1 0.4643 0.2603 0.596 0.016 0.364 0.000 0.024 0.000
#> SRR2166459 1 0.3767 0.6021 0.800 0.016 0.120 0.000 0.064 0.000
#> SRR1070713 2 0.6817 0.5448 0.040 0.540 0.232 0.048 0.140 0.000
#> SRR1485312 3 0.3881 0.4751 0.396 0.004 0.600 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317631 2 0.8119 0.3448 0.272 0.352 0.156 0.044 0.176 0.000
#> SRR1488610 1 0.4575 0.6094 0.748 0.048 0.132 0.000 0.072 0.000
#> SRR1330588 1 0.4312 -0.1459 0.508 0.004 0.476 0.000 0.012 0.000
#> SRR1316367 1 0.4219 0.6214 0.764 0.032 0.152 0.000 0.052 0.000
#> SRR1433926 1 0.3290 0.2020 0.744 0.004 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1091302 2 0.5085 0.1764 0.024 0.524 0.016 0.424 0.012 0.000
#> SRR818263 1 0.4325 0.5933 0.724 0.012 0.208 0.000 0.056 0.000
#> SRR1404909 4 0.3411 0.6816 0.000 0.232 0.004 0.756 0.008 0.000
#> SRR663076 1 0.3104 0.3347 0.788 0.004 0.004 0.000 0.204 0.000
#> SRR1323577 2 0.4282 0.5422 0.024 0.712 0.244 0.012 0.008 0.000
#> SRR1442422 4 0.0520 0.9023 0.000 0.008 0.000 0.984 0.008 0.000
#> SRR1465893 1 0.2151 0.5462 0.904 0.008 0.016 0.000 0.072 0.000
#> SRR654862 1 0.4119 0.6069 0.728 0.004 0.216 0.000 0.052 0.000
#> SRR1407112 4 0.0622 0.9015 0.000 0.012 0.000 0.980 0.008 0.000
#> SRR1332969 1 0.4127 -0.1771 0.508 0.004 0.484 0.000 0.004 0.000
#> SRR1353199 1 0.5247 0.1823 0.528 0.012 0.392 0.000 0.068 0.000
#> SRR1378885 1 0.4358 0.3198 0.620 0.008 0.352 0.000 0.020 0.000
#> SRR665357 3 0.3841 0.4943 0.380 0.004 0.616 0.000 0.000 0.000
#> SRR662186 3 0.4084 0.2386 0.020 0.132 0.776 0.000 0.072 0.000
#> SRR1501020 3 0.4384 0.2953 0.460 0.004 0.520 0.000 0.016 0.000
#> SRR1347819 3 0.3841 0.4932 0.380 0.004 0.616 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.4446 0.4541 0.012 0.580 0.396 0.004 0.008 0.000
#> SRR1472576 2 0.5223 0.5094 0.032 0.648 0.080 0.240 0.000 0.000
#> SRR1431781 4 0.3737 0.6842 0.024 0.188 0.016 0.772 0.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.3872 0.4792 0.392 0.004 0.604 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.4840 0.1807 0.568 0.028 0.384 0.000 0.020 0.000
#> SRR1417632 4 0.6059 -0.1851 0.016 0.428 0.120 0.428 0.008 0.000
#> SRR1350153 3 0.3819 0.3616 0.040 0.200 0.756 0.000 0.004 0.000
#> SRR1458113 1 0.4969 0.5542 0.684 0.048 0.216 0.000 0.052 0.000
#> SRR1326579 1 0.4298 0.5997 0.776 0.048 0.092 0.000 0.084 0.000
#> SRR1349363 3 0.3205 0.4576 0.060 0.060 0.852 0.000 0.028 0.000
#> SRR1096712 3 0.3830 0.4969 0.376 0.004 0.620 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 1 0.4384 -0.0743 0.520 0.004 0.460 0.000 0.016 0.000
#> SRR1083752 2 0.5022 0.5873 0.032 0.708 0.108 0.148 0.004 0.000
#> SRR1377599 4 0.3672 0.7599 0.000 0.168 0.000 0.776 0.056 0.000
#> SRR1488449 3 0.3996 0.2583 0.484 0.004 0.512 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318354 3 0.4152 0.3866 0.440 0.012 0.548 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359062 3 0.3862 0.4830 0.388 0.004 0.608 0.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 1 0.4650 0.5349 0.692 0.044 0.236 0.000 0.028 0.000
#> SRR663783 3 0.4503 0.4122 0.412 0.008 0.560 0.000 0.020 0.000
#> SRR1319204 3 0.3995 0.2734 0.480 0.004 0.516 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369070 2 0.4370 0.4334 0.008 0.552 0.428 0.000 0.012 0.000
#> SRR615659 1 0.3290 0.2020 0.744 0.004 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1337449 3 0.2917 0.4118 0.032 0.072 0.868 0.000 0.028 0.000
#> SRR1316982 3 0.3499 0.5324 0.264 0.004 0.728 0.000 0.004 0.000
#> SRR1498595 2 0.5216 0.5832 0.016 0.696 0.164 0.100 0.024 0.000
#> SRR1377423 1 0.4635 -0.1828 0.488 0.008 0.480 0.000 0.024 0.000
#> SRR1312310 3 0.3142 0.4350 0.044 0.092 0.848 0.000 0.016 0.000
#> SRR1485613 1 0.2094 0.5527 0.908 0.004 0.024 0.000 0.064 0.000
#> SRR1338426 3 0.4002 0.4618 0.404 0.008 0.588 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353309 3 0.3841 0.4947 0.380 0.004 0.616 0.000 0.000 0.000
#> SRR658941 1 0.5553 0.4277 0.608 0.080 0.268 0.000 0.044 0.000
#> SRR1101643 6 0.4900 0.5897 0.080 0.004 0.000 0.000 0.292 0.624
#> SRR1401468 1 0.2265 0.5523 0.900 0.024 0.008 0.000 0.068 0.000
#> SRR1368874 3 0.2213 0.4850 0.048 0.032 0.908 0.000 0.012 0.000
#> SRR1324085 2 0.4995 0.3965 0.032 0.612 0.036 0.320 0.000 0.000
#> SRR1363858 6 0.0000 0.6409 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR819820 1 0.5275 0.4353 0.628 0.056 0.272 0.000 0.044 0.000
#> SRR1337342 1 0.4550 0.5940 0.756 0.056 0.108 0.000 0.080 0.000
#> SRR655206 3 0.6906 0.2386 0.228 0.180 0.484 0.000 0.108 0.000
#> SRR1387013 2 0.4117 0.5309 0.020 0.708 0.256 0.000 0.016 0.000
#> SRR1317410 1 0.2263 0.4877 0.884 0.016 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR608198 1 0.4344 0.5877 0.772 0.052 0.072 0.000 0.104 0.000
#> SRR1440161 3 0.2321 0.4902 0.052 0.040 0.900 0.000 0.008 0.000
#> SRR1343741 2 0.4370 0.4304 0.008 0.552 0.428 0.000 0.012 0.000
#> SRR1381288 3 0.2537 0.3794 0.016 0.068 0.888 0.000 0.028 0.000
#> SRR1415379 2 0.7828 0.4518 0.196 0.448 0.060 0.108 0.188 0.000
#> SRR1099622 2 0.4681 0.3973 0.020 0.520 0.448 0.008 0.004 0.000
#> SRR663197 1 0.5914 0.3405 0.544 0.008 0.212 0.000 0.232 0.004
#> SRR1394836 3 0.6982 0.2388 0.260 0.192 0.452 0.000 0.096 0.000
#> SRR661699 3 0.4069 0.4911 0.376 0.008 0.612 0.000 0.004 0.000
#> SRR813680 1 0.3367 0.6020 0.836 0.020 0.088 0.000 0.056 0.000
#> SRR1410678 1 0.3215 0.2481 0.756 0.004 0.000 0.000 0.240 0.000
#> SRR1378109 4 0.0520 0.9023 0.000 0.008 0.000 0.984 0.008 0.000
#> SRR1499174 1 0.3411 0.2460 0.756 0.008 0.004 0.000 0.232 0.000
#> SRR1311486 3 0.2917 0.4118 0.032 0.072 0.868 0.000 0.028 0.000
#> SRR1382851 2 0.6656 0.5563 0.032 0.568 0.188 0.052 0.160 0.000
#> SRR1433410 1 0.4711 0.5848 0.744 0.060 0.100 0.000 0.096 0.000
#> SRR661167 1 0.5506 0.0253 0.480 0.008 0.412 0.000 0.100 0.000
#> SRR1432518 3 0.4135 0.4570 0.404 0.008 0.584 0.000 0.004 0.000
#> SRR660462 3 0.3872 0.4828 0.392 0.004 0.604 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 2 0.8086 0.3906 0.256 0.384 0.136 0.056 0.168 0.000
#> SRR657949 1 0.4242 0.1178 0.572 0.004 0.412 0.000 0.012 0.000
#> SRR1308882 4 0.0291 0.9036 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR655768 5 0.4470 0.8594 0.408 0.004 0.008 0.000 0.568 0.012
#> SRR1485870 2 0.7510 0.4449 0.028 0.388 0.320 0.080 0.184 0.000
#> SRR1444138 1 0.4354 0.5166 0.684 0.008 0.268 0.000 0.040 0.000
#> SRR1417342 1 0.4433 0.3503 0.720 0.012 0.068 0.000 0.200 0.000
#> SRR1470193 2 0.8130 0.4207 0.240 0.396 0.136 0.068 0.160 0.000
#> SRR1091380 1 0.5275 0.4353 0.628 0.056 0.272 0.000 0.044 0.000
#> SRR1099096 1 0.2666 0.5365 0.872 0.028 0.008 0.000 0.092 0.000
#> SRR1313583 4 0.6471 0.2100 0.048 0.256 0.004 0.520 0.172 0.000
#> SRR1467102 3 0.3875 0.5392 0.196 0.028 0.760 0.000 0.016 0.000
#> SRR1485416 4 0.2006 0.8464 0.000 0.104 0.000 0.892 0.004 0.000
#> SRR818821 3 0.4039 0.4253 0.424 0.008 0.568 0.000 0.000 0.000
#> SRR809963 1 0.3488 0.2258 0.744 0.004 0.008 0.000 0.244 0.000
#> SRR1072247 1 0.2263 0.4877 0.884 0.016 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1353710 2 0.6871 0.5440 0.040 0.576 0.100 0.140 0.144 0.000
#> SRR1445259 3 0.4161 0.3707 0.448 0.012 0.540 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408393 1 0.4249 0.0939 0.568 0.004 0.416 0.000 0.012 0.000
#> SRR1361522 1 0.3290 0.2020 0.744 0.004 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1368597 1 0.4092 0.6036 0.772 0.016 0.136 0.000 0.076 0.000
#> SRR1309680 3 0.4619 -0.2028 0.024 0.420 0.548 0.004 0.004 0.000
#> SRR1310542 3 0.3830 0.4969 0.376 0.004 0.620 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0363 0.9024 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1406437 2 0.8020 0.3439 0.272 0.352 0.180 0.032 0.164 0.000
#> SRR1354931 1 0.5642 0.2966 0.536 0.004 0.324 0.000 0.132 0.004
#> SRR1391856 2 0.7297 0.4095 0.052 0.404 0.372 0.072 0.100 0.000
#> SRR1446738 2 0.7085 0.5439 0.060 0.524 0.200 0.044 0.172 0.000
#> SRR1309032 3 0.2520 0.5074 0.068 0.032 0.888 0.000 0.012 0.000
#> SRR1388145 3 0.4794 -0.3618 0.020 0.480 0.484 0.008 0.008 0.000
#> SRR1432611 3 0.2147 0.4802 0.044 0.032 0.912 0.000 0.012 0.000
#> SRR815869 3 0.3830 0.4969 0.376 0.004 0.620 0.000 0.000 0.000
#> SRR613150 1 0.5871 0.4257 0.548 0.008 0.252 0.000 0.188 0.004
#> SRR1375329 1 0.4840 0.1807 0.568 0.028 0.384 0.000 0.020 0.000
#> SRR1387921 1 0.2737 0.4147 0.832 0.004 0.004 0.000 0.160 0.000
#> SRR1466792 3 0.2147 0.4802 0.044 0.032 0.912 0.000 0.012 0.000
#> SRR1360478 3 0.4105 0.2971 0.036 0.236 0.720 0.000 0.008 0.000
#> SRR1360695 1 0.3000 0.6013 0.856 0.012 0.088 0.000 0.044 0.000
#> SRR812943 1 0.3493 0.2711 0.756 0.008 0.008 0.000 0.228 0.000
#> SRR1400910 3 0.4456 0.3293 0.448 0.028 0.524 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444203 4 0.0909 0.8985 0.000 0.020 0.000 0.968 0.012 0.000
#> SRR816177 2 0.4269 0.5805 0.032 0.772 0.104 0.092 0.000 0.000
#> SRR658754 3 0.3862 0.4872 0.388 0.004 0.608 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 2 0.6724 0.5416 0.040 0.592 0.104 0.108 0.156 0.000
#> SRR1397366 1 0.5316 0.2738 0.548 0.012 0.360 0.000 0.080 0.000
#> SRR1446028 1 0.2865 0.4478 0.848 0.016 0.004 0.000 0.128 0.004
#> SRR1083918 2 0.4751 0.5628 0.032 0.720 0.084 0.164 0.000 0.000
#> SRR1337606 1 0.4843 0.5900 0.728 0.064 0.136 0.000 0.072 0.000
#> SRR659109 3 0.3986 0.4848 0.384 0.004 0.608 0.000 0.004 0.000
#> SRR1337192 1 0.4006 0.5612 0.792 0.048 0.044 0.000 0.116 0.000
#> SRR656946 1 0.5087 0.5007 0.628 0.004 0.252 0.000 0.116 0.000
#> SRR1476102 1 0.4361 0.6032 0.768 0.040 0.096 0.000 0.096 0.000
#> SRR1476447 1 0.4006 0.5612 0.792 0.048 0.044 0.000 0.116 0.000
#> SRR1342067 4 0.0260 0.9032 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.9041 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.3612 0.5694 0.824 0.024 0.048 0.000 0.100 0.004
#> SRR614419 1 0.4220 0.5944 0.780 0.044 0.072 0.000 0.104 0.000
#> SRR1322936 1 0.6180 0.2767 0.580 0.208 0.072 0.000 0.140 0.000
#> SRR1349121 1 0.3074 0.6072 0.856 0.020 0.080 0.000 0.044 0.000
#> SRR1430549 1 0.3271 0.2573 0.760 0.008 0.000 0.000 0.232 0.000
#> SRR612935 3 0.4147 0.3978 0.436 0.012 0.552 0.000 0.000 0.000
#> SRR661481 2 0.4437 0.4562 0.012 0.584 0.392 0.004 0.008 0.000
#> SRR1354117 3 0.2639 0.5258 0.084 0.032 0.876 0.000 0.008 0.000
#> SRR1393596 2 0.6724 0.5422 0.040 0.592 0.108 0.104 0.156 0.000
#> SRR1452164 1 0.3455 0.3826 0.776 0.004 0.020 0.000 0.200 0.000
#> SRR1070503 1 0.4636 0.5619 0.700 0.028 0.224 0.000 0.048 0.000
#> SRR1499894 3 0.4006 0.4722 0.392 0.004 0.600 0.000 0.004 0.000
#> SRR1082883 1 0.5102 0.5570 0.712 0.080 0.096 0.000 0.112 0.000
#> SRR1468271 1 0.2239 0.5482 0.900 0.008 0.020 0.000 0.072 0.000
#> SRR1332443 1 0.2958 0.5436 0.852 0.028 0.012 0.000 0.108 0.000
#> SRR810295 3 0.2988 0.4424 0.044 0.080 0.860 0.000 0.016 0.000
#> SRR662103 5 0.4199 0.8478 0.360 0.004 0.000 0.000 0.620 0.016
#> SRR1328620 3 0.4157 0.3786 0.444 0.012 0.544 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396294 2 0.8119 0.3493 0.272 0.352 0.156 0.044 0.176 0.000
#> SRR1419917 1 0.3290 0.2020 0.744 0.004 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR662114 1 0.6198 0.4900 0.568 0.024 0.228 0.000 0.164 0.016
#> SRR1489199 1 0.4358 0.5030 0.680 0.012 0.276 0.000 0.032 0.000
#> SRR813584 2 0.5430 0.5446 0.024 0.688 0.092 0.164 0.032 0.000
#> SRR1069638 1 0.4219 0.5691 0.720 0.008 0.224 0.000 0.048 0.000
#> SRR614864 1 0.5224 0.5553 0.676 0.064 0.196 0.000 0.064 0.000
#> SRR1433392 1 0.4229 0.6003 0.728 0.008 0.208 0.000 0.056 0.000
#> SRR1377777 3 0.2983 0.2769 0.000 0.136 0.832 0.000 0.032 0.000
#> SRR2167710 1 0.5087 0.5007 0.628 0.004 0.252 0.000 0.116 0.000
#> SRR1401252 4 0.3512 0.6552 0.000 0.248 0.004 0.740 0.008 0.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.9041 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.3298 0.2542 0.756 0.008 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR1418628 3 0.3558 0.3266 0.028 0.168 0.792 0.000 0.012 0.000
#> SRR1486889 1 0.4395 0.3016 0.612 0.016 0.360 0.000 0.012 0.000
#> SRR1380393 1 0.3104 0.3347 0.788 0.004 0.004 0.000 0.204 0.000
#> SRR1319731 1 0.2361 0.4920 0.880 0.012 0.004 0.000 0.104 0.000
#> SRR1356468 2 0.7724 0.4385 0.228 0.444 0.072 0.068 0.188 0.000
#> SRR1337010 3 0.2213 0.4838 0.048 0.032 0.908 0.000 0.012 0.000
#> SRR1486520 1 0.3075 0.5403 0.856 0.040 0.012 0.000 0.088 0.004
#> SRR1486538 4 0.1245 0.8898 0.000 0.032 0.000 0.952 0.016 0.000
#> SRR1340486 4 0.0520 0.9023 0.000 0.008 0.000 0.984 0.008 0.000
#> SRR1377696 2 0.4786 0.5691 0.016 0.712 0.200 0.056 0.016 0.000
#> SRR1465459 1 0.4833 0.1684 0.556 0.012 0.396 0.000 0.036 0.000
#> SRR1080270 3 0.3872 0.4841 0.392 0.004 0.604 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.3890 0.4667 0.400 0.004 0.596 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093148 1 0.5716 0.4561 0.604 0.080 0.256 0.000 0.060 0.000
#> SRR1467080 3 0.3841 0.4952 0.380 0.004 0.616 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.5124 0.5895 0.032 0.696 0.160 0.108 0.004 0.000
#> SRR816475 2 0.4965 0.4074 0.032 0.620 0.036 0.312 0.000 0.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.9041 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613342 1 0.5905 0.3997 0.544 0.020 0.276 0.000 0.160 0.000
#> SRR1452246 2 0.4117 0.5309 0.020 0.708 0.256 0.000 0.016 0.000
#> SRR1338836 3 0.4357 -0.2174 0.012 0.420 0.560 0.000 0.008 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.9041 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396616 1 0.4325 -0.1684 0.504 0.008 0.480 0.000 0.008 0.000
#> SRR813824 1 0.6957 -0.2239 0.500 0.008 0.132 0.000 0.244 0.116
#> SRR1082376 1 0.3759 0.5754 0.808 0.012 0.076 0.000 0.100 0.004
#> SRR1500891 4 0.0146 0.9045 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR807543 1 0.4054 0.6022 0.748 0.008 0.192 0.000 0.052 0.000
#> SRR1091572 1 0.3516 0.5727 0.812 0.004 0.088 0.000 0.096 0.000
#> SRR1346689 2 0.6709 0.1834 0.056 0.424 0.040 0.412 0.068 0.000
#> SRR1332424 1 0.4619 0.5844 0.752 0.060 0.092 0.000 0.096 0.000
#> SRR663729 2 0.6996 0.3411 0.032 0.472 0.040 0.172 0.284 0.000
#> SRR1097013 1 0.3767 0.6021 0.800 0.016 0.120 0.000 0.064 0.000
#> SRR613675 1 0.6180 0.2767 0.580 0.208 0.072 0.000 0.140 0.000
#> SRR1485357 4 0.0909 0.8985 0.000 0.020 0.000 0.968 0.012 0.000
#> SRR655816 3 0.4280 0.4041 0.428 0.008 0.556 0.000 0.008 0.000
#> SRR1500113 1 0.2644 0.5817 0.880 0.008 0.052 0.000 0.060 0.000
#> SRR1437622 2 0.5169 0.5286 0.032 0.672 0.076 0.216 0.004 0.000
#> SRR1355172 1 0.3343 0.6171 0.824 0.016 0.128 0.000 0.032 0.000
#> SRR655531 1 0.3906 0.5687 0.804 0.052 0.048 0.000 0.096 0.000
#> SRR1338147 3 0.4225 0.2517 0.480 0.008 0.508 0.000 0.004 0.000
#> SRR1413329 1 0.3729 0.6261 0.788 0.012 0.156 0.000 0.044 0.000
#> SRR1485931 3 0.2549 0.3447 0.008 0.072 0.884 0.000 0.036 0.000
#> SRR1420873 1 0.2463 0.5505 0.892 0.020 0.020 0.000 0.068 0.000
#> SRR1333308 2 0.7720 0.4519 0.208 0.452 0.056 0.092 0.192 0.000
#> SRR1452033 1 0.1908 0.4890 0.900 0.004 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1467316 3 0.2658 0.3368 0.008 0.080 0.876 0.000 0.036 0.000
#> SRR809018 3 0.3830 0.4969 0.376 0.004 0.620 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 3 0.4002 0.2292 0.032 0.216 0.740 0.000 0.012 0.000
#> SRR663440 1 0.4436 0.5574 0.696 0.008 0.240 0.000 0.056 0.000
#> SRR1471755 2 0.5112 0.5857 0.028 0.704 0.136 0.124 0.008 0.000
#> SRR808019 1 0.4232 0.6156 0.764 0.040 0.152 0.000 0.044 0.000
#> SRR1479133 1 0.6957 -0.2239 0.500 0.008 0.132 0.000 0.244 0.116
#> SRR615069 1 0.5072 0.5945 0.696 0.044 0.168 0.000 0.092 0.000
#> SRR1456185 3 0.4190 0.5079 0.144 0.060 0.768 0.000 0.028 0.000
#> SRR1350069 2 0.8196 0.3611 0.264 0.352 0.156 0.052 0.176 0.000
#> SRR816316 6 0.6022 0.2507 0.208 0.004 0.000 0.000 0.356 0.432
#> SRR664795 1 0.3396 0.6151 0.828 0.016 0.108 0.000 0.048 0.000
#> SRR1490721 2 0.7046 0.3861 0.024 0.492 0.076 0.140 0.268 0.000
#> SRR810643 1 0.2252 0.5378 0.900 0.016 0.012 0.000 0.072 0.000
#> SRR1430333 1 0.5251 0.3697 0.592 0.048 0.324 0.000 0.036 0.000
#> SRR1085285 1 0.6957 -0.2239 0.500 0.008 0.132 0.000 0.244 0.116
#> SRR1099072 1 0.4411 -0.1484 0.504 0.008 0.476 0.000 0.012 0.000
#> SRR1317985 1 0.2902 0.3520 0.800 0.004 0.000 0.000 0.196 0.000
#> SRR1487340 1 0.2665 0.5208 0.868 0.012 0.016 0.000 0.104 0.000
#> SRR1420276 3 0.3830 0.4969 0.376 0.004 0.620 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.3899 0.4646 0.404 0.004 0.592 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.4564 0.6128 0.748 0.044 0.132 0.000 0.076 0.000
#> SRR1370329 6 0.3780 0.6263 0.020 0.004 0.000 0.000 0.248 0.728
#> SRR1465001 1 0.2151 0.5275 0.904 0.016 0.008 0.000 0.072 0.000
#> SRR1476525 3 0.4380 -0.2556 0.012 0.436 0.544 0.000 0.008 0.000
#> SRR819610 3 0.4855 0.2888 0.076 0.236 0.672 0.000 0.016 0.000
#> SRR2157314 1 0.2311 0.4852 0.880 0.016 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1409465 3 0.4344 -0.2031 0.012 0.412 0.568 0.000 0.008 0.000
#> SRR809987 2 0.7814 0.4527 0.192 0.448 0.056 0.112 0.192 0.000
#> SRR613639 1 0.5919 -0.2414 0.480 0.008 0.128 0.000 0.376 0.008
#> SRR1402285 4 0.0713 0.8953 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.3878 0.6078 0.764 0.004 0.176 0.000 0.056 0.000
#> SRR1405660 3 0.4118 0.4716 0.396 0.008 0.592 0.000 0.004 0.000
#> SRR1095455 3 0.4460 0.3178 0.452 0.028 0.520 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394734 2 0.4751 0.5628 0.032 0.720 0.084 0.164 0.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.3630 0.6224 0.812 0.024 0.120 0.000 0.044 0.000
#> SRR1365894 2 0.7441 0.4377 0.024 0.388 0.328 0.080 0.180 0.000
#> SRR1073581 1 0.1908 0.4890 0.900 0.004 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR659804 1 0.2311 0.4852 0.880 0.016 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1345914 3 0.2501 0.3743 0.012 0.072 0.888 0.000 0.028 0.000
#> SRR1432186 3 0.4364 -0.2132 0.012 0.424 0.556 0.000 0.008 0.000
#> SRR1473529 2 0.5216 0.5832 0.016 0.696 0.164 0.100 0.024 0.000
#> SRR660764 1 0.5893 0.3364 0.548 0.008 0.208 0.000 0.232 0.004
#> SRR820448 6 0.5937 0.3518 0.188 0.004 0.000 0.000 0.360 0.448
#> SRR1328845 2 0.7613 0.4329 0.240 0.444 0.068 0.056 0.192 0.000
#> SRR1336415 4 0.0622 0.9015 0.000 0.012 0.000 0.980 0.008 0.000
#> SRR1379065 4 0.0363 0.9026 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1459190 1 0.4331 -0.0925 0.516 0.000 0.464 0.000 0.020 0.000
#> SRR1346773 1 0.2265 0.5535 0.900 0.008 0.024 0.000 0.068 0.000
#> SRR1499521 1 0.3720 0.6209 0.812 0.036 0.108 0.000 0.044 0.000
#> SRR1440898 3 0.2537 0.3794 0.016 0.068 0.888 0.000 0.028 0.000
#> SRR1347459 3 0.3982 0.3302 0.460 0.004 0.536 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081209 3 0.2611 0.3652 0.012 0.080 0.880 0.000 0.028 0.000
#> SRR1400202 1 0.2737 0.4147 0.832 0.004 0.004 0.000 0.160 0.000
#> SRR1333395 3 0.4495 0.4364 0.144 0.036 0.748 0.000 0.072 0.000
#> SRR1309248 2 0.7382 0.4706 0.024 0.416 0.292 0.072 0.196 0.000
#> SRR809161 1 0.5900 0.4193 0.544 0.008 0.248 0.000 0.196 0.004
#> SRR1316320 3 0.6205 -0.0846 0.088 0.244 0.576 0.004 0.088 0.000
#> SRR1432629 2 0.4339 0.5364 0.020 0.704 0.252 0.008 0.016 0.000
#> SRR1498931 1 0.3081 0.2970 0.776 0.004 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1416578 2 0.7665 0.3484 0.176 0.364 0.012 0.296 0.152 0.000
#> SRR1405547 3 0.3830 0.4969 0.376 0.004 0.620 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.9041 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.4511 0.5919 0.760 0.056 0.100 0.000 0.084 0.000
#> SRR1309160 3 0.4222 0.2888 0.472 0.004 0.516 0.000 0.008 0.000
#> SRR663489 3 0.3830 0.4969 0.376 0.004 0.620 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.3258 0.6163 0.832 0.016 0.120 0.000 0.032 0.000
#> SRR1078489 3 0.4328 0.3061 0.460 0.020 0.520 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332648 4 0.0000 0.9041 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660614 3 0.3995 0.2734 0.480 0.004 0.516 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470420 3 0.2147 0.4800 0.044 0.032 0.912 0.000 0.012 0.000
#> SRR1475566 1 0.2737 0.4147 0.832 0.004 0.004 0.000 0.160 0.000
#> SRR1477949 1 0.3301 0.5892 0.840 0.016 0.072 0.000 0.072 0.000
#> SRR1481419 3 0.4357 -0.2085 0.012 0.420 0.560 0.000 0.008 0.000
#> SRR1464766 1 0.2094 0.5527 0.908 0.004 0.024 0.000 0.064 0.000
#> SRR615946 1 0.5914 0.3405 0.544 0.008 0.212 0.000 0.232 0.004
#> SRR1446481 3 0.4669 -0.2347 0.020 0.436 0.532 0.004 0.008 0.000
#> SRR1467656 3 0.4179 0.0361 0.016 0.324 0.652 0.000 0.008 0.000
#> SRR1402962 1 0.4917 0.5939 0.720 0.072 0.144 0.000 0.064 0.000
#> SRR660224 3 0.2594 0.3818 0.016 0.072 0.884 0.000 0.028 0.000
#> SRR665586 1 0.3505 0.6184 0.808 0.008 0.136 0.000 0.048 0.000
#> SRR1347166 1 0.4953 0.5996 0.712 0.052 0.156 0.000 0.080 0.000
#> SRR1485722 1 0.4656 0.5931 0.748 0.064 0.112 0.000 0.076 0.000
#> SRR1415316 1 0.3504 0.6182 0.820 0.016 0.112 0.000 0.052 0.000
#> SRR613390 1 0.4790 0.4527 0.680 0.004 0.120 0.000 0.196 0.000
#> SRR661108 1 0.5834 0.3683 0.560 0.008 0.212 0.000 0.216 0.004
#> SRR2170173 1 0.4461 -0.1164 0.512 0.004 0.464 0.000 0.020 0.000
#> SRR817329 1 0.4245 0.2398 0.604 0.004 0.376 0.000 0.016 0.000
#> SRR1401990 2 0.7747 0.4453 0.212 0.448 0.060 0.088 0.192 0.000
#> SRR1467745 2 0.4995 0.3965 0.032 0.612 0.036 0.320 0.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.5062 0.5866 0.028 0.700 0.156 0.112 0.004 0.000
#> SRR1415637 3 0.2658 0.3368 0.008 0.080 0.876 0.000 0.036 0.000
#> SRR813137 1 0.3290 0.2020 0.744 0.004 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1314873 1 0.3380 0.2246 0.748 0.004 0.004 0.000 0.244 0.000
#> SRR1401211 1 0.2829 0.6139 0.864 0.016 0.096 0.000 0.024 0.000
#> SRR1419692 4 0.0862 0.8977 0.004 0.016 0.000 0.972 0.008 0.000
#> SRR818797 1 0.6591 0.0724 0.552 0.008 0.132 0.000 0.220 0.088
#> SRR2164608 1 0.4702 0.2714 0.596 0.028 0.360 0.000 0.016 0.000
#> SRR1455586 3 0.3174 0.5183 0.104 0.056 0.836 0.000 0.004 0.000
#> SRR819459 3 0.3862 0.4869 0.388 0.004 0.608 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488939 3 0.2658 0.3368 0.008 0.080 0.876 0.000 0.036 0.000
#> SRR1433232 2 0.4364 0.4378 0.008 0.556 0.424 0.000 0.012 0.000
#> SRR1385501 1 0.4579 0.5783 0.716 0.012 0.180 0.000 0.092 0.000
#> SRR1361652 3 0.4602 0.2167 0.484 0.028 0.484 0.000 0.004 0.000
#> SRR1437119 1 0.3265 0.2225 0.748 0.004 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1478547 3 0.3852 0.4911 0.384 0.004 0.612 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 3 0.4403 0.2849 0.468 0.024 0.508 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310584 1 0.2255 0.5201 0.892 0.016 0.004 0.000 0.088 0.000
#> SRR1500216 6 0.0000 0.6409 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1486762 3 0.4699 0.2450 0.468 0.008 0.496 0.000 0.028 0.000
#> SRR1480854 4 0.3672 0.7599 0.000 0.168 0.000 0.776 0.056 0.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.9041 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.9041 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0713 0.8953 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1473058 2 0.4814 0.5020 0.032 0.684 0.052 0.232 0.000 0.000
#> SRR1405165 1 0.5720 0.2618 0.544 0.072 0.340 0.000 0.044 0.000
#> SRR1433004 1 0.3924 0.5411 0.788 0.008 0.076 0.000 0.124 0.004
#> SRR1471477 1 0.3455 0.6192 0.816 0.016 0.132 0.000 0.036 0.000
#> SRR1098567 3 0.2860 0.4123 0.032 0.068 0.872 0.000 0.028 0.000
#> SRR1098712 1 0.7301 -0.0585 0.432 0.308 0.160 0.028 0.072 0.000
#> SRR1455038 6 0.6420 -0.4345 0.352 0.008 0.004 0.000 0.272 0.364
#> SRR1375248 3 0.2196 0.5587 0.108 0.004 0.884 0.000 0.004 0.000
#> SRR1403005 1 0.4522 0.0592 0.548 0.008 0.424 0.000 0.020 0.000
#> SRR1348378 2 0.4895 0.5904 0.032 0.712 0.116 0.140 0.000 0.000
#> SRR1413541 1 0.3368 0.6101 0.820 0.004 0.116 0.000 0.060 0.000
#> SRR1392943 2 0.8131 0.4206 0.236 0.392 0.132 0.064 0.176 0.000
#> SRR1475192 3 0.3819 0.4997 0.372 0.004 0.624 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432085 3 0.3174 0.5183 0.104 0.056 0.836 0.000 0.004 0.000
#> SRR1452468 1 0.4949 0.3050 0.588 0.040 0.352 0.000 0.020 0.000
#> SRR1347060 3 0.3841 0.4932 0.380 0.004 0.616 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414139 3 0.4799 0.5117 0.180 0.104 0.700 0.000 0.016 0.000
#> SRR1447962 3 0.2113 0.5445 0.092 0.008 0.896 0.000 0.004 0.000
#> SRR1444324 3 0.2375 0.5022 0.060 0.036 0.896 0.000 0.008 0.000
#> SRR1415004 1 0.2278 0.4621 0.868 0.004 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1413436 1 0.4523 0.6044 0.724 0.044 0.196 0.000 0.036 0.000
#> SRR1311266 1 0.4635 0.6079 0.744 0.052 0.132 0.000 0.072 0.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.9041 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.3323 0.2399 0.752 0.008 0.000 0.000 0.240 0.000
#> SRR1429678 1 0.3368 0.5724 0.824 0.004 0.084 0.000 0.088 0.000
#> SRR1469413 3 0.2541 0.4777 0.052 0.032 0.892 0.000 0.024 0.000
#> SRR1405331 1 0.4082 0.6018 0.748 0.008 0.188 0.000 0.056 0.000
#> SRR1345609 1 0.2871 0.3650 0.804 0.004 0.000 0.000 0.192 0.000
#> SRR1380208 2 0.7380 0.4663 0.024 0.412 0.300 0.072 0.192 0.000
#> SRR1322840 4 0.0146 0.9040 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.3899 0.4627 0.404 0.004 0.592 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.3872 0.4803 0.392 0.004 0.604 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.3830 0.4969 0.376 0.004 0.620 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.4015 0.4708 0.396 0.004 0.596 0.000 0.004 0.000
#> SRR1400847 1 0.2255 0.5203 0.892 0.004 0.016 0.000 0.088 0.000
#> SRR1365291 1 0.4468 0.2808 0.604 0.008 0.364 0.000 0.024 0.000
#> SRR1367920 4 0.3672 0.7599 0.000 0.168 0.000 0.776 0.056 0.000
#> SRR1366648 3 0.3830 0.4969 0.376 0.004 0.620 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 3 0.2220 0.4796 0.044 0.036 0.908 0.000 0.012 0.000
#> SRR1082173 1 0.4702 0.2714 0.596 0.028 0.360 0.000 0.016 0.000
#> SRR1363968 1 0.3893 0.6198 0.796 0.036 0.124 0.000 0.044 0.000
#> SRR814387 1 0.2151 0.5275 0.904 0.016 0.008 0.000 0.072 0.000
#> SRR657599 1 0.4688 -0.3850 0.572 0.004 0.020 0.000 0.392 0.012
#> SRR1386689 4 0.0520 0.9023 0.000 0.008 0.000 0.984 0.008 0.000
#> SRR1395575 3 0.4653 0.1784 0.484 0.012 0.484 0.000 0.020 0.000
#> SRR1453811 1 0.6957 -0.2239 0.500 0.008 0.132 0.000 0.244 0.116
#> SRR1441159 1 0.3743 0.5696 0.808 0.036 0.040 0.000 0.116 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.9041 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.3852 0.4884 0.384 0.004 0.612 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 1 0.4468 0.2808 0.604 0.008 0.364 0.000 0.024 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.453 0.852 0.918 0.4137 0.609 0.609
#> 3 3 0.644 0.710 0.847 0.4449 0.654 0.474
#> 4 4 0.697 0.840 0.870 0.1937 0.817 0.550
#> 5 5 0.770 0.706 0.825 0.0779 0.925 0.732
#> 6 6 0.744 0.670 0.816 0.0433 0.963 0.836
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1331708 1 0.4562 0.887 0.904 0.096
#> SRR1464258 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1454201 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR661589 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.4939 0.884 0.892 0.108
#> SRR1315165 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1417809 2 0.8081 0.616 0.248 0.752
#> SRR1094457 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1095575 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1315931 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1430066 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1431037 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1395554 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR818002 2 0.3274 0.887 0.060 0.940
#> SRR1344143 1 0.9044 0.461 0.680 0.320
#> SRR1486845 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1446627 1 0.8608 0.544 0.716 0.284
#> SRR1456138 2 0.5737 0.847 0.136 0.864
#> SRR1416248 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1383907 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1311018 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1375699 1 0.8443 0.569 0.728 0.272
#> SRR1429846 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR613550 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1345146 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1324025 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1318879 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR820755 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1485830 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR599313 2 0.9580 0.308 0.380 0.620
#> SRR612263 1 0.5294 0.881 0.880 0.120
#> SRR1415398 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1326205 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1421327 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1083311 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1499303 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1079522 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1452935 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1379495 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1470459 1 0.5294 0.807 0.880 0.120
#> SRR661361 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.5059 0.883 0.888 0.112
#> SRR1447564 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1455195 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR655182 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.5408 0.854 0.124 0.876
#> SRR1433555 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1308650 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1317446 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1413602 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.8661 0.701 0.288 0.712
#> SRR809853 1 0.5294 0.880 0.880 0.120
#> SRR661313 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1499935 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1447303 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1429408 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1433950 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1362081 1 0.5842 0.784 0.860 0.140
#> SRR1409854 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1435229 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.5059 0.883 0.888 0.112
#> SRR1414229 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1400974 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR613927 1 0.4939 0.884 0.892 0.108
#> SRR1457854 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1473714 2 0.9286 0.411 0.344 0.656
#> SRR813776 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR808196 2 0.7219 0.704 0.200 0.800
#> SRR1101085 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR614395 1 0.5294 0.880 0.880 0.120
#> SRR1478251 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1370551 1 0.7056 0.713 0.808 0.192
#> SRR1362310 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR665310 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1420109 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1330920 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1419539 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1359447 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1347259 2 0.0376 0.906 0.004 0.996
#> SRR613915 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1384395 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR821715 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1445637 1 0.4939 0.884 0.892 0.108
#> SRR608150 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1096383 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1341480 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1341344 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1326270 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1498838 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1416313 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR808566 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1430270 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1367825 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR613533 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR661267 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR810665 1 0.9044 0.461 0.680 0.320
#> SRR1407250 1 0.4562 0.887 0.904 0.096
#> SRR1420067 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1473632 1 0.0376 0.903 0.996 0.004
#> SRR812536 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.5737 0.847 0.136 0.864
#> SRR1486195 1 0.6048 0.774 0.852 0.148
#> SRR1407671 1 0.8713 0.546 0.708 0.292
#> SRR1446375 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1465230 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1356101 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1392676 1 0.9044 0.461 0.680 0.320
#> SRR665538 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR660510 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1445655 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR658953 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.3733 0.892 0.928 0.072
#> SRR1070713 2 0.9209 0.620 0.336 0.664
#> SRR1485312 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1317631 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1488610 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1330588 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.5294 0.880 0.880 0.120
#> SRR1433926 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1091302 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR818263 1 0.5294 0.880 0.880 0.120
#> SRR1404909 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR663076 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1323577 2 0.5737 0.847 0.136 0.864
#> SRR1442422 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1465893 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR654862 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1407112 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1332969 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1353199 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1378885 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR665357 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR662186 1 0.5946 0.779 0.856 0.144
#> SRR1501020 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1347819 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.5737 0.847 0.136 0.864
#> SRR1472576 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1431781 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1452270 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1417632 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1350153 2 0.8661 0.701 0.288 0.712
#> SRR1458113 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1326579 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1349363 1 0.8555 0.553 0.720 0.280
#> SRR1096712 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1090407 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.5178 0.858 0.116 0.884
#> SRR1377599 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1488449 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1318354 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1359062 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1398924 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR663783 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1319204 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1369070 2 0.5737 0.847 0.136 0.864
#> SRR615659 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1337449 1 0.9000 0.471 0.684 0.316
#> SRR1316982 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1498595 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1377423 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1312310 1 0.7056 0.713 0.808 0.192
#> SRR1485613 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1338426 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1353309 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR658941 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1101643 1 0.8386 0.719 0.732 0.268
#> SRR1401468 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1368874 1 0.4431 0.836 0.908 0.092
#> SRR1324085 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1363858 2 0.8909 0.501 0.308 0.692
#> SRR819820 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1337342 1 0.1843 0.899 0.972 0.028
#> SRR655206 1 0.3879 0.851 0.924 0.076
#> SRR1387013 2 0.5737 0.847 0.136 0.864
#> SRR1317410 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR608198 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1440161 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.6048 0.842 0.148 0.852
#> SRR1381288 1 0.9323 0.386 0.652 0.348
#> SRR1415379 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1099622 2 0.8813 0.682 0.300 0.700
#> SRR663197 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1394836 1 0.5178 0.811 0.884 0.116
#> SRR661699 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR813680 1 0.4161 0.890 0.916 0.084
#> SRR1410678 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1378109 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1499174 1 0.5059 0.883 0.888 0.112
#> SRR1311486 1 0.9427 0.351 0.640 0.360
#> SRR1382851 2 0.0376 0.907 0.004 0.996
#> SRR1433410 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR661167 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1432518 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR660462 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1374608 2 0.7299 0.697 0.204 0.796
#> SRR657949 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1308882 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR655768 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1485870 2 0.6712 0.740 0.176 0.824
#> SRR1444138 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1470193 1 0.8608 0.544 0.716 0.284
#> SRR1091380 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1313583 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1467102 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1485416 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR818821 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR809963 1 0.5294 0.880 0.880 0.120
#> SRR1072247 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1353710 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1445259 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1408393 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1368597 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1309680 2 0.5737 0.847 0.136 0.864
#> SRR1310542 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1333485 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1406437 1 0.6247 0.798 0.844 0.156
#> SRR1354931 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1391856 1 0.9000 0.473 0.684 0.316
#> SRR1446738 2 0.5737 0.847 0.136 0.864
#> SRR1309032 1 0.6048 0.774 0.852 0.148
#> SRR1388145 2 0.8661 0.701 0.288 0.712
#> SRR1432611 1 0.7299 0.694 0.796 0.204
#> SRR815869 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR613150 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1375329 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1387921 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1466792 1 0.6048 0.774 0.852 0.148
#> SRR1360478 2 0.9686 0.488 0.396 0.604
#> SRR1360695 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR812943 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1400910 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1444203 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR816177 2 0.3114 0.889 0.056 0.944
#> SRR658754 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1429603 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1397366 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1083918 2 0.5737 0.847 0.136 0.864
#> SRR1337606 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR659109 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR656946 1 0.5294 0.880 0.880 0.120
#> SRR1476102 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1476447 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1342067 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1385389 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1075971 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR614419 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1322936 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1349121 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1430549 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR612935 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR661481 2 0.5737 0.847 0.136 0.864
#> SRR1354117 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1393596 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1452164 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1070503 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1499894 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1082883 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1468271 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1332443 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR810295 1 0.6048 0.774 0.852 0.148
#> SRR662103 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1328620 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1396294 1 0.9815 0.450 0.580 0.420
#> SRR1419917 1 0.5408 0.879 0.876 0.124
#> SRR662114 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1489199 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR813584 2 0.3274 0.887 0.060 0.940
#> SRR1069638 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR614864 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.4939 0.884 0.892 0.108
#> SRR1377777 2 0.5737 0.847 0.136 0.864
#> SRR2167710 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1401252 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1309963 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.5629 0.875 0.868 0.132
#> SRR1418628 2 0.9608 0.517 0.384 0.616
#> SRR1486889 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1319731 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1356468 2 0.7219 0.704 0.200 0.800
#> SRR1337010 1 0.5294 0.807 0.880 0.120
#> SRR1486520 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1486538 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1340486 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1377696 2 0.4022 0.877 0.080 0.920
#> SRR1465459 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1080270 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1312501 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1093148 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1467080 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.5737 0.847 0.136 0.864
#> SRR816475 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1379198 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR613342 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.6048 0.842 0.148 0.852
#> SRR1338836 2 0.6343 0.834 0.160 0.840
#> SRR1369129 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1396616 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR813824 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.5059 0.883 0.888 0.112
#> SRR1500891 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR807543 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.5294 0.880 0.880 0.120
#> SRR1346689 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1332424 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR663729 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1097013 1 0.4690 0.886 0.900 0.100
#> SRR613675 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1485357 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR655816 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1437622 2 0.3274 0.887 0.060 0.940
#> SRR1355172 1 0.4022 0.890 0.920 0.080
#> SRR655531 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1338147 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1413329 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1485931 1 0.8608 0.544 0.716 0.284
#> SRR1420873 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1333308 2 0.5519 0.802 0.128 0.872
#> SRR1452033 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1467316 1 0.9248 0.409 0.660 0.340
#> SRR809018 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.8955 0.662 0.312 0.688
#> SRR663440 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.3274 0.887 0.060 0.940
#> SRR808019 1 0.5629 0.875 0.868 0.132
#> SRR1479133 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR615069 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1456185 1 0.6973 0.719 0.812 0.188
#> SRR1350069 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR816316 1 0.5629 0.875 0.868 0.132
#> SRR664795 1 0.5059 0.883 0.888 0.112
#> SRR1490721 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR810643 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1430333 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1085285 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1099072 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1487340 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1420276 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1351347 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.5408 0.879 0.876 0.124
#> SRR1370329 1 0.7815 0.771 0.768 0.232
#> SRR1465001 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1476525 2 0.5737 0.847 0.136 0.864
#> SRR819610 2 0.3114 0.889 0.056 0.944
#> SRR2157314 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1409465 2 0.8661 0.701 0.288 0.712
#> SRR809987 2 0.7219 0.704 0.200 0.800
#> SRR613639 1 0.5294 0.880 0.880 0.120
#> SRR1402285 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1077038 1 0.4939 0.884 0.892 0.108
#> SRR1405660 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1394734 2 0.5059 0.860 0.112 0.888
#> SRR1317771 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1365894 2 0.6438 0.757 0.164 0.836
#> SRR1073581 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR659804 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1345914 1 0.9000 0.471 0.684 0.316
#> SRR1432186 2 0.5737 0.847 0.136 0.864
#> SRR1473529 2 0.5178 0.858 0.116 0.884
#> SRR660764 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR820448 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1328845 2 0.8813 0.500 0.300 0.700
#> SRR1336415 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1379065 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1459190 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1346773 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1499521 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1440898 2 0.8661 0.701 0.288 0.712
#> SRR1347459 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1081209 1 0.8955 0.480 0.688 0.312
#> SRR1400202 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1333395 1 0.5737 0.794 0.864 0.136
#> SRR1309248 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR809161 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1316320 1 0.8608 0.544 0.716 0.284
#> SRR1432629 2 0.5737 0.847 0.136 0.864
#> SRR1498931 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1416578 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1405547 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1470534 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1309160 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR663489 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1078489 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1332648 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR660614 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1470420 1 0.6343 0.758 0.840 0.160
#> SRR1475566 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1477949 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1481419 2 0.8608 0.706 0.284 0.716
#> SRR1464766 1 0.5294 0.880 0.880 0.120
#> SRR615946 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.5737 0.847 0.136 0.864
#> SRR1467656 2 0.9983 0.255 0.476 0.524
#> SRR1402962 1 0.5059 0.883 0.888 0.112
#> SRR660224 1 0.6247 0.764 0.844 0.156
#> SRR665586 1 0.5294 0.880 0.880 0.120
#> SRR1347166 1 0.4298 0.889 0.912 0.088
#> SRR1485722 1 0.4562 0.887 0.904 0.096
#> SRR1415316 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR613390 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR661108 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR817329 1 0.0376 0.903 0.996 0.004
#> SRR1401990 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1467745 2 0.2236 0.896 0.036 0.964
#> SRR1471795 2 0.5737 0.847 0.136 0.864
#> SRR1415637 1 0.9044 0.461 0.680 0.320
#> SRR813137 1 0.4939 0.884 0.892 0.108
#> SRR1314873 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1401211 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1419692 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR818797 1 0.5408 0.879 0.876 0.124
#> SRR2164608 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1455586 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR819459 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1488939 1 0.8608 0.544 0.716 0.284
#> SRR1433232 2 0.5737 0.847 0.136 0.864
#> SRR1385501 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1361652 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1437119 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1478547 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1430910 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1310584 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1500216 1 1.0000 0.164 0.504 0.496
#> SRR1486762 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1480854 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1489394 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1418085 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1340221 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1473058 2 0.3114 0.889 0.056 0.944
#> SRR1405165 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.5294 0.880 0.880 0.120
#> SRR1471477 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1098567 1 0.6048 0.774 0.852 0.148
#> SRR1098712 1 0.9815 0.450 0.580 0.420
#> SRR1455038 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1375248 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1403005 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.8608 0.707 0.284 0.716
#> SRR1413541 1 0.5294 0.880 0.880 0.120
#> SRR1392943 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1475192 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1432085 1 0.6148 0.769 0.848 0.152
#> SRR1452468 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1347060 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1414139 1 0.3114 0.868 0.944 0.056
#> SRR1447962 1 0.6048 0.774 0.852 0.148
#> SRR1444324 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1413436 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1311266 1 0.5519 0.877 0.872 0.128
#> SRR1343302 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1373746 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1429678 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1469413 1 0.9000 0.471 0.684 0.316
#> SRR1405331 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1380208 1 0.9358 0.408 0.648 0.352
#> SRR1322840 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1399797 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1416654 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1315081 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1369196 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1365291 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1367920 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1366648 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1441679 1 0.5629 0.793 0.868 0.132
#> SRR1082173 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1363968 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR814387 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR657599 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1386689 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1395575 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1453811 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1441159 1 0.5737 0.873 0.864 0.136
#> SRR1403154 2 0.0000 0.908 0.000 1.000
#> SRR1468722 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
#> SRR1310275 1 0.0000 0.903 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1331708 1 0.4399 0.6372 0.812 0.000 0.188
#> SRR1464258 1 0.1337 0.9136 0.972 0.012 0.016
#> SRR1454201 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR661589 3 0.6274 0.5551 0.456 0.000 0.544
#> SRR1456229 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315165 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1488960 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR1417809 2 0.7653 0.7136 0.080 0.644 0.276
#> SRR1094457 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.0237 0.9248 0.996 0.000 0.004
#> SRR1315931 1 0.1337 0.9136 0.972 0.012 0.016
#> SRR1430066 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1431037 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1395554 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR818002 2 0.3192 0.8668 0.000 0.888 0.112
#> SRR1344143 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR1486845 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362866 1 0.3686 0.7329 0.860 0.000 0.140
#> SRR1490740 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1446627 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR1456138 3 0.6274 -0.4342 0.000 0.456 0.544
#> SRR1416248 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1383907 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1311018 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1375699 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR1429846 1 0.3879 0.7063 0.848 0.000 0.152
#> SRR613550 1 0.6286 -0.3481 0.536 0.000 0.464
#> SRR1348402 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1345146 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1324025 3 0.6244 0.5838 0.440 0.000 0.560
#> SRR1318879 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR820755 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485830 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR599313 1 0.2152 0.8881 0.948 0.036 0.016
#> SRR612263 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.6274 0.5550 0.456 0.000 0.544
#> SRR1326205 2 0.4178 0.8395 0.000 0.828 0.172
#> SRR1421327 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1083311 3 0.6204 0.6007 0.424 0.000 0.576
#> SRR1499303 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1079522 3 0.6260 0.5702 0.448 0.000 0.552
#> SRR1452935 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1379495 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1470459 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR661361 3 0.6309 0.4307 0.500 0.000 0.500
#> SRR615778 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1455195 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.6180 0.6548 0.000 0.584 0.416
#> SRR1433555 3 0.6204 0.6007 0.424 0.000 0.576
#> SRR1308650 3 0.1163 0.5838 0.028 0.000 0.972
#> SRR1388354 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1317446 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1413602 3 0.6204 0.6007 0.424 0.000 0.576
#> SRR1479955 3 0.0747 0.5578 0.000 0.016 0.984
#> SRR809853 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR661313 1 0.4887 0.5226 0.772 0.000 0.228
#> SRR1499935 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1447303 3 0.6267 0.5628 0.452 0.000 0.548
#> SRR1429408 2 0.1643 0.8995 0.000 0.956 0.044
#> SRR1433950 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1362081 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR1409854 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435229 1 0.0592 0.9171 0.988 0.000 0.012
#> SRR1085996 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 3 0.6267 0.5628 0.452 0.000 0.548
#> SRR1400974 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1399971 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR613927 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1473714 1 0.3091 0.8400 0.912 0.072 0.016
#> SRR813776 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR808196 2 0.6521 0.7718 0.040 0.712 0.248
#> SRR1101085 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR614395 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478251 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370551 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR1362310 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR665310 1 0.6140 -0.1396 0.596 0.000 0.404
#> SRR1420109 3 0.6252 0.5772 0.444 0.000 0.556
#> SRR1330920 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419539 3 0.2959 0.6147 0.100 0.000 0.900
#> SRR1359447 3 0.6168 0.6035 0.412 0.000 0.588
#> SRR1347259 2 0.5706 0.7442 0.000 0.680 0.320
#> SRR613915 1 0.4178 0.6666 0.828 0.000 0.172
#> SRR1384395 3 0.6168 0.6035 0.412 0.000 0.588
#> SRR821715 1 0.2261 0.8446 0.932 0.000 0.068
#> SRR1478228 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR1096383 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1341480 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1341344 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1326270 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498838 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1416313 3 0.6252 0.5772 0.444 0.000 0.556
#> SRR808566 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1430270 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.6215 0.5985 0.428 0.000 0.572
#> SRR613533 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR661267 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR810665 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR1407250 1 0.0237 0.9249 0.996 0.000 0.004
#> SRR1420067 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1370850 3 0.6280 -0.4428 0.000 0.460 0.540
#> SRR1486195 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR1407671 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR1446375 1 0.3879 0.6946 0.848 0.000 0.152
#> SRR1465230 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR614119 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR1356101 3 0.1163 0.5838 0.028 0.000 0.972
#> SRR1404209 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR665538 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR660510 3 0.6274 0.5550 0.456 0.000 0.544
#> SRR1445655 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR658953 1 0.6302 -0.3986 0.520 0.000 0.480
#> SRR2166459 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 3 0.1832 0.5385 0.008 0.036 0.956
#> SRR1485312 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1317631 2 0.4291 0.8355 0.000 0.820 0.180
#> SRR1488610 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR1330588 3 0.6244 0.5838 0.440 0.000 0.560
#> SRR1316367 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1091302 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR818263 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404909 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR663076 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1323577 3 0.4178 0.3349 0.000 0.172 0.828
#> SRR1442422 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407112 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.6274 0.5550 0.456 0.000 0.544
#> SRR1353199 1 0.5431 0.3551 0.716 0.000 0.284
#> SRR1378885 1 0.4121 0.6749 0.832 0.000 0.168
#> SRR665357 3 0.6168 0.6035 0.412 0.000 0.588
#> SRR662186 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR1501020 3 0.6267 0.5628 0.452 0.000 0.548
#> SRR1347819 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1480813 3 0.4654 0.2590 0.000 0.208 0.792
#> SRR1472576 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1431781 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1452270 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1500472 1 0.5785 0.1694 0.668 0.000 0.332
#> SRR1417632 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1350153 3 0.0747 0.5578 0.000 0.016 0.984
#> SRR1458113 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1326579 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR1349363 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR1096712 3 0.6204 0.6007 0.424 0.000 0.576
#> SRR1090407 3 0.6244 0.5838 0.440 0.000 0.560
#> SRR1083752 2 0.3267 0.8648 0.000 0.884 0.116
#> SRR1377599 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1488449 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1318354 3 0.6260 0.5701 0.448 0.000 0.552
#> SRR1359062 3 0.6204 0.6007 0.424 0.000 0.576
#> SRR1398924 1 0.5465 0.3331 0.712 0.000 0.288
#> SRR663783 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1319204 3 0.6204 0.6007 0.424 0.000 0.576
#> SRR1369070 3 0.4399 0.3034 0.000 0.188 0.812
#> SRR615659 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1337449 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR1316982 3 0.4399 0.6364 0.188 0.000 0.812
#> SRR1498595 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1377423 1 0.6280 -0.3414 0.540 0.000 0.460
#> SRR1312310 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR1485613 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR1338426 3 0.6204 0.6007 0.424 0.000 0.576
#> SRR1353309 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR658941 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1101643 1 0.1636 0.9050 0.964 0.020 0.016
#> SRR1401468 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1368874 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR1324085 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1363858 1 0.4209 0.7617 0.856 0.128 0.016
#> SRR819820 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1337342 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR655206 3 0.1860 0.5949 0.052 0.000 0.948
#> SRR1387013 2 0.6252 0.6158 0.000 0.556 0.444
#> SRR1317410 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR608198 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR1440161 3 0.1163 0.5838 0.028 0.000 0.972
#> SRR1343741 3 0.4399 0.3034 0.000 0.188 0.812
#> SRR1381288 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR1415379 2 0.3038 0.8721 0.000 0.896 0.104
#> SRR1099622 3 0.0747 0.5578 0.000 0.016 0.984
#> SRR663197 3 0.6215 0.5956 0.428 0.000 0.572
#> SRR1394836 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR661699 3 0.6204 0.6007 0.424 0.000 0.576
#> SRR813680 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1378109 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311486 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR1382851 2 0.6154 0.6631 0.000 0.592 0.408
#> SRR1433410 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR661167 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1432518 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR660462 3 0.6235 0.5901 0.436 0.000 0.564
#> SRR1374608 2 0.5988 0.7365 0.008 0.688 0.304
#> SRR657949 1 0.6295 -0.3726 0.528 0.000 0.472
#> SRR1308882 2 0.0237 0.9075 0.000 0.996 0.004
#> SRR655768 1 0.0829 0.9255 0.984 0.012 0.004
#> SRR1485870 3 0.6359 -0.2193 0.008 0.364 0.628
#> SRR1444138 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1470193 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR1091380 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1099096 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1313583 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467102 3 0.1163 0.5838 0.028 0.000 0.972
#> SRR1485416 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR818821 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR809963 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1353710 2 0.5016 0.8030 0.000 0.760 0.240
#> SRR1445259 3 0.6274 0.5544 0.456 0.000 0.544
#> SRR1408393 1 0.6305 -0.4083 0.516 0.000 0.484
#> SRR1361522 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1368597 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR1309680 3 0.5016 0.1787 0.000 0.240 0.760
#> SRR1310542 3 0.6180 0.6027 0.416 0.000 0.584
#> SRR1333485 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1406437 3 0.3112 0.6135 0.096 0.004 0.900
#> SRR1354931 3 0.6309 0.4595 0.496 0.000 0.504
#> SRR1391856 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR1446738 3 0.3482 0.4063 0.000 0.128 0.872
#> SRR1309032 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR1388145 3 0.0747 0.5578 0.000 0.016 0.984
#> SRR1432611 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR815869 3 0.6204 0.6007 0.424 0.000 0.576
#> SRR613150 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1375329 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1387921 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1466792 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR1360478 3 0.0829 0.5635 0.004 0.012 0.984
#> SRR1360695 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400910 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1444203 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR816177 2 0.6180 0.6548 0.000 0.584 0.416
#> SRR658754 3 0.6204 0.6007 0.424 0.000 0.576
#> SRR1429603 2 0.4346 0.8368 0.000 0.816 0.184
#> SRR1397366 1 0.6204 -0.2163 0.576 0.000 0.424
#> SRR1446028 1 0.0829 0.9255 0.984 0.012 0.004
#> SRR1083918 2 0.6260 0.6097 0.000 0.552 0.448
#> SRR1337606 3 0.6267 0.5604 0.452 0.000 0.548
#> SRR659109 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1337192 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR656946 1 0.0237 0.9287 0.996 0.004 0.000
#> SRR1476102 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1476447 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1342067 2 0.0237 0.9075 0.000 0.996 0.004
#> SRR1385389 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR614419 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR1322936 1 0.0475 0.9273 0.992 0.004 0.004
#> SRR1349121 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1430549 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR612935 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR661481 3 0.6225 -0.3800 0.000 0.432 0.568
#> SRR1354117 3 0.1163 0.5838 0.028 0.000 0.972
#> SRR1393596 2 0.5882 0.7196 0.000 0.652 0.348
#> SRR1452164 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1070503 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499894 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1082883 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR1468271 1 0.0424 0.9289 0.992 0.008 0.000
#> SRR1332443 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR810295 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR662103 1 0.1015 0.9219 0.980 0.012 0.008
#> SRR1328620 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1396294 3 0.7097 0.4827 0.108 0.172 0.720
#> SRR1419917 1 0.0424 0.9289 0.992 0.008 0.000
#> SRR662114 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1489199 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR813584 2 0.6140 0.6668 0.000 0.596 0.404
#> SRR1069638 1 0.6252 -0.2867 0.556 0.000 0.444
#> SRR614864 1 0.4062 0.6831 0.836 0.000 0.164
#> SRR1433392 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377777 3 0.6280 -0.4428 0.000 0.460 0.540
#> SRR2167710 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401252 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1309963 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1418628 3 0.0829 0.5635 0.004 0.012 0.984
#> SRR1486889 1 0.5678 0.2617 0.684 0.000 0.316
#> SRR1380393 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1319731 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1356468 2 0.5728 0.7697 0.008 0.720 0.272
#> SRR1337010 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR1486520 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1486538 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340486 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.5560 0.7536 0.000 0.700 0.300
#> SRR1465459 1 0.1753 0.8729 0.952 0.000 0.048
#> SRR1080270 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1312501 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1093148 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1467080 3 0.6204 0.6007 0.424 0.000 0.576
#> SRR1410866 3 0.5254 0.1114 0.000 0.264 0.736
#> SRR816475 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1379198 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR613342 3 0.6299 0.5107 0.476 0.000 0.524
#> SRR1452246 3 0.4178 0.3349 0.000 0.172 0.828
#> SRR1338836 3 0.3340 0.4275 0.000 0.120 0.880
#> SRR1369129 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.6274 0.5550 0.456 0.000 0.544
#> SRR813824 3 0.6267 0.5341 0.452 0.000 0.548
#> SRR1082376 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500891 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR807543 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346689 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1332424 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR663729 2 0.4121 0.8416 0.000 0.832 0.168
#> SRR1097013 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1485357 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR655816 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1500113 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1437622 2 0.1031 0.9050 0.000 0.976 0.024
#> SRR1355172 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR655531 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR1338147 3 0.6252 0.5772 0.444 0.000 0.556
#> SRR1413329 1 0.0237 0.9248 0.996 0.000 0.004
#> SRR1485931 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR1420873 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1333308 2 0.5618 0.7793 0.008 0.732 0.260
#> SRR1452033 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1467316 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR809018 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1375351 3 0.0747 0.5578 0.000 0.016 0.984
#> SRR663440 1 0.1964 0.8615 0.944 0.000 0.056
#> SRR1471755 2 0.6180 0.6548 0.000 0.584 0.416
#> SRR808019 1 0.0424 0.9288 0.992 0.008 0.000
#> SRR1479133 1 0.6274 -0.2803 0.544 0.000 0.456
#> SRR615069 3 0.6215 0.5985 0.428 0.000 0.572
#> SRR1456185 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR1350069 2 0.5178 0.7880 0.000 0.744 0.256
#> SRR816316 1 0.1337 0.9136 0.972 0.012 0.016
#> SRR664795 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490721 2 0.5178 0.7917 0.000 0.744 0.256
#> SRR810643 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1430333 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1085285 3 0.6252 0.5772 0.444 0.000 0.556
#> SRR1099072 1 0.6192 -0.2016 0.580 0.000 0.420
#> SRR1317985 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1487340 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1420276 3 0.6154 0.6040 0.408 0.000 0.592
#> SRR1351347 3 0.6235 0.5901 0.436 0.000 0.564
#> SRR1405525 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR1370329 1 0.1491 0.9095 0.968 0.016 0.016
#> SRR1465001 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1476525 3 0.5178 0.1346 0.000 0.256 0.744
#> SRR819610 2 0.6307 0.5411 0.000 0.512 0.488
#> SRR2157314 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1409465 3 0.0747 0.5578 0.000 0.016 0.984
#> SRR809987 2 0.6880 0.7714 0.108 0.736 0.156
#> SRR613639 1 0.0237 0.9268 0.996 0.000 0.004
#> SRR1402285 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405660 3 0.6204 0.6007 0.424 0.000 0.576
#> SRR1095455 1 0.0237 0.9248 0.996 0.000 0.004
#> SRR1394734 2 0.4654 0.8122 0.000 0.792 0.208
#> SRR1317771 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR1365894 3 0.6598 -0.3925 0.008 0.428 0.564
#> SRR1073581 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR659804 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1345914 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR1432186 3 0.5291 0.0997 0.000 0.268 0.732
#> SRR1473529 2 0.3192 0.8668 0.000 0.888 0.112
#> SRR660764 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR820448 1 0.1337 0.9136 0.972 0.012 0.016
#> SRR1328845 2 0.7384 0.7303 0.068 0.660 0.272
#> SRR1336415 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379065 2 0.0237 0.9075 0.000 0.996 0.004
#> SRR1459190 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1346773 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1499521 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1440898 3 0.0747 0.5578 0.000 0.016 0.984
#> SRR1347459 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1081209 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR1400202 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1333395 3 0.1411 0.5884 0.036 0.000 0.964
#> SRR1309248 2 0.6095 0.6792 0.000 0.608 0.392
#> SRR809161 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316320 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR1432629 2 0.5733 0.7298 0.000 0.676 0.324
#> SRR1498931 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1416578 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1470534 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1309160 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR663489 3 0.6204 0.6007 0.424 0.000 0.576
#> SRR1500450 1 0.1129 0.9119 0.976 0.004 0.020
#> SRR1078489 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1332648 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR660614 3 0.6204 0.6007 0.424 0.000 0.576
#> SRR1470420 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR1475566 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1477949 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1481419 3 0.0747 0.5578 0.000 0.016 0.984
#> SRR1464766 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR615946 1 0.6215 -0.2332 0.572 0.000 0.428
#> SRR1446481 3 0.4235 0.3271 0.000 0.176 0.824
#> SRR1467656 3 0.0829 0.5635 0.004 0.012 0.984
#> SRR1402962 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR660224 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR665586 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR613390 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR661108 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR2170173 1 0.0237 0.9248 0.996 0.000 0.004
#> SRR817329 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401990 2 0.4121 0.8416 0.000 0.832 0.168
#> SRR1467745 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1471795 3 0.6280 -0.4428 0.000 0.460 0.540
#> SRR1415637 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR813137 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1401211 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1419692 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR818797 1 0.0747 0.9180 0.984 0.000 0.016
#> SRR2164608 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1455586 3 0.1163 0.5838 0.028 0.000 0.972
#> SRR819459 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1488939 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR1433232 3 0.6235 -0.3893 0.000 0.436 0.564
#> SRR1385501 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361652 3 0.6274 0.5550 0.456 0.000 0.544
#> SRR1437119 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1478547 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1430910 3 0.6204 0.6007 0.424 0.000 0.576
#> SRR1310584 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1500216 1 0.2031 0.8920 0.952 0.032 0.016
#> SRR1486762 3 0.6274 0.5550 0.456 0.000 0.544
#> SRR1480854 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1489394 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418085 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340221 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473058 2 0.0747 0.9073 0.000 0.984 0.016
#> SRR1405165 3 0.6204 0.6007 0.424 0.000 0.576
#> SRR1433004 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0829 0.9201 0.984 0.004 0.012
#> SRR1098567 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR1098712 3 0.3472 0.5797 0.056 0.040 0.904
#> SRR1455038 1 0.1337 0.9136 0.972 0.012 0.016
#> SRR1375248 3 0.1163 0.5838 0.028 0.000 0.972
#> SRR1403005 1 0.6286 -0.3530 0.536 0.000 0.464
#> SRR1348378 3 0.3941 0.3673 0.000 0.156 0.844
#> SRR1413541 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 2 0.5058 0.7964 0.000 0.756 0.244
#> SRR1475192 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1432085 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR1452468 3 0.6307 0.4793 0.488 0.000 0.512
#> SRR1347060 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1414139 3 0.0892 0.5801 0.020 0.000 0.980
#> SRR1447962 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR1444324 3 0.1163 0.5838 0.028 0.000 0.972
#> SRR1415004 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1413436 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR1311266 1 0.0237 0.9288 0.996 0.004 0.000
#> SRR1343302 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1429678 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1469413 3 0.0829 0.5740 0.012 0.004 0.984
#> SRR1405331 1 0.0000 0.9277 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1380208 3 0.1620 0.5539 0.012 0.024 0.964
#> SRR1322840 2 0.0237 0.9075 0.000 0.996 0.004
#> SRR1399797 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1416654 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1315081 3 0.6204 0.6007 0.424 0.000 0.576
#> SRR1369196 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1400847 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1365291 3 0.6302 0.5005 0.480 0.000 0.520
#> SRR1367920 2 0.0592 0.9081 0.000 0.988 0.012
#> SRR1366648 3 0.6215 0.5985 0.428 0.000 0.572
#> SRR1441679 3 0.0747 0.5781 0.016 0.000 0.984
#> SRR1082173 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1363968 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR814387 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR657599 1 0.1015 0.9219 0.980 0.012 0.008
#> SRR1386689 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.6274 0.5550 0.456 0.000 0.544
#> SRR1453811 1 0.0747 0.9180 0.984 0.000 0.016
#> SRR1441159 1 0.0592 0.9286 0.988 0.012 0.000
#> SRR1403154 2 0.0000 0.9070 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.6225 0.5960 0.432 0.000 0.568
#> SRR1310275 3 0.6252 0.5772 0.444 0.000 0.556
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 1 0.4236 0.89866 0.824 0.088 0.088 0.000
#> SRR1331708 1 0.6634 0.59012 0.564 0.100 0.336 0.000
#> SRR1464258 1 0.2919 0.86226 0.896 0.044 0.060 0.000
#> SRR1454201 1 0.6370 0.68974 0.620 0.100 0.280 0.000
#> SRR661589 3 0.1557 0.89144 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1456229 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1315165 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.5309 0.85003 0.744 0.092 0.164 0.000
#> SRR1417809 4 0.7396 0.33720 0.156 0.340 0.004 0.500
#> SRR1094457 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095575 3 0.4961 0.13934 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1315931 1 0.3004 0.86319 0.892 0.048 0.060 0.000
#> SRR1430066 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1431037 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1395554 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR818002 4 0.5643 0.18846 0.024 0.428 0.000 0.548
#> SRR1344143 2 0.2921 0.91829 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1486845 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362866 1 0.6634 0.58930 0.564 0.100 0.336 0.000
#> SRR1490740 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1446627 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1456138 2 0.4271 0.83726 0.020 0.836 0.040 0.104
#> SRR1416248 1 0.4236 0.89866 0.824 0.088 0.088 0.000
#> SRR1383907 4 0.0336 0.90136 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1311018 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1375699 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1429846 3 0.3239 0.84884 0.052 0.068 0.880 0.000
#> SRR613550 3 0.2589 0.84595 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1348402 1 0.4236 0.89866 0.824 0.088 0.088 0.000
#> SRR1345146 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1324025 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1318879 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR820755 3 0.3833 0.81331 0.072 0.080 0.848 0.000
#> SRR1485830 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR599313 1 0.2675 0.84749 0.908 0.048 0.044 0.000
#> SRR612263 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1415398 3 0.0657 0.90987 0.012 0.004 0.984 0.000
#> SRR1326205 4 0.4562 0.71190 0.028 0.208 0.000 0.764
#> SRR1421327 4 0.0592 0.89906 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1083311 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1499303 4 0.0336 0.90136 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1079522 3 0.1004 0.90653 0.024 0.004 0.972 0.000
#> SRR1452935 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1379495 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1470459 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR661361 3 0.3144 0.85863 0.072 0.044 0.884 0.000
#> SRR615778 1 0.4487 0.89276 0.808 0.100 0.092 0.000
#> SRR1447564 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1455195 1 0.4487 0.89408 0.808 0.100 0.092 0.000
#> SRR655182 1 0.2611 0.90511 0.896 0.008 0.096 0.000
#> SRR1335140 2 0.3910 0.76195 0.024 0.820 0.000 0.156
#> SRR1433555 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1308650 2 0.3554 0.91533 0.020 0.844 0.136 0.000
#> SRR1388354 1 0.2611 0.90511 0.896 0.008 0.096 0.000
#> SRR1317446 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1413602 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1479955 2 0.3300 0.91763 0.008 0.848 0.144 0.000
#> SRR809853 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR661313 3 0.3219 0.79637 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR1499935 4 0.0336 0.90136 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1447303 3 0.1022 0.90722 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1429408 4 0.3486 0.82346 0.044 0.092 0.000 0.864
#> SRR1433950 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1362081 2 0.3300 0.91688 0.008 0.848 0.144 0.000
#> SRR1409854 3 0.5572 0.60329 0.196 0.088 0.716 0.000
#> SRR1435229 3 0.6497 0.30198 0.304 0.100 0.596 0.000
#> SRR1085996 1 0.4591 0.89013 0.800 0.084 0.116 0.000
#> SRR1414229 3 0.3612 0.83338 0.044 0.100 0.856 0.000
#> SRR1400974 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1399971 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR613927 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1457854 1 0.2611 0.90511 0.896 0.008 0.096 0.000
#> SRR1473714 1 0.2825 0.83848 0.908 0.048 0.036 0.008
#> SRR813776 3 0.3525 0.82779 0.100 0.040 0.860 0.000
#> SRR808196 4 0.6537 0.59757 0.164 0.200 0.000 0.636
#> SRR1101085 4 0.0336 0.90136 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR614395 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1478251 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370551 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1362310 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR665310 3 0.2868 0.82807 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR1420109 3 0.1661 0.89353 0.052 0.004 0.944 0.000
#> SRR1330920 1 0.4525 0.89830 0.804 0.080 0.116 0.000
#> SRR1419539 3 0.2623 0.81385 0.028 0.064 0.908 0.000
#> SRR1359447 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1347259 4 0.5991 0.25056 0.032 0.432 0.004 0.532
#> SRR613915 3 0.3144 0.84976 0.044 0.072 0.884 0.000
#> SRR1384395 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR821715 3 0.2973 0.81548 0.144 0.000 0.856 0.000
#> SRR1478228 1 0.4236 0.89866 0.824 0.088 0.088 0.000
#> SRR1445637 1 0.2675 0.90506 0.892 0.008 0.100 0.000
#> SRR608150 1 0.4549 0.89298 0.804 0.100 0.096 0.000
#> SRR1096383 1 0.4104 0.90061 0.832 0.080 0.088 0.000
#> SRR1341480 4 0.0336 0.90136 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1341344 1 0.4362 0.89501 0.816 0.096 0.088 0.000
#> SRR1326270 3 0.3157 0.81279 0.144 0.004 0.852 0.000
#> SRR1498838 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1416313 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR808566 4 0.0817 0.89586 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1430270 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367825 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR613533 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR661267 1 0.5998 0.74956 0.664 0.088 0.248 0.000
#> SRR810665 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1407250 1 0.6663 0.56805 0.556 0.100 0.344 0.000
#> SRR1420067 1 0.4784 0.88590 0.788 0.100 0.112 0.000
#> SRR1473632 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR812536 3 0.0336 0.91349 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1370850 2 0.4160 0.83936 0.016 0.840 0.040 0.104
#> SRR1486195 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1407671 2 0.2915 0.86289 0.028 0.892 0.080 0.000
#> SRR1446375 3 0.4955 0.15270 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR1465230 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.4236 0.89866 0.824 0.088 0.088 0.000
#> SRR1356101 2 0.5125 0.58067 0.008 0.604 0.388 0.000
#> SRR1404209 3 0.4609 0.73788 0.156 0.056 0.788 0.000
#> SRR1392676 2 0.2921 0.91829 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR665538 1 0.4483 0.89490 0.808 0.088 0.104 0.000
#> SRR660510 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1445655 4 0.0336 0.90136 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR658953 3 0.2198 0.87882 0.072 0.008 0.920 0.000
#> SRR2166459 1 0.3711 0.88975 0.836 0.024 0.140 0.000
#> SRR1070713 2 0.3659 0.90840 0.024 0.840 0.136 0.000
#> SRR1485312 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1317631 4 0.4635 0.70153 0.028 0.216 0.000 0.756
#> SRR1488610 1 0.4894 0.88122 0.780 0.100 0.120 0.000
#> SRR1330588 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1316367 1 0.4364 0.89639 0.816 0.092 0.092 0.000
#> SRR1433926 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1091302 4 0.0336 0.90136 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR818263 1 0.4235 0.89919 0.824 0.084 0.092 0.000
#> SRR1404909 4 0.0336 0.90136 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR663076 1 0.2676 0.90579 0.896 0.012 0.092 0.000
#> SRR1323577 2 0.3853 0.90802 0.016 0.848 0.116 0.020
#> SRR1442422 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465893 1 0.4236 0.89866 0.824 0.088 0.088 0.000
#> SRR654862 1 0.6660 0.28085 0.464 0.084 0.452 0.000
#> SRR1407112 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332969 3 0.0376 0.91205 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR1353199 3 0.3569 0.75669 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR1378885 3 0.3198 0.84515 0.040 0.080 0.880 0.000
#> SRR665357 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR662186 2 0.3300 0.91688 0.008 0.848 0.144 0.000
#> SRR1501020 3 0.1557 0.89144 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1347819 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1480813 2 0.4097 0.90350 0.016 0.840 0.112 0.032
#> SRR1472576 4 0.0817 0.89586 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1431781 4 0.0188 0.90176 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1452270 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1500472 3 0.6220 0.46935 0.248 0.104 0.648 0.000
#> SRR1417632 4 0.0336 0.90136 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1350153 2 0.3547 0.91539 0.016 0.840 0.144 0.000
#> SRR1458113 3 0.0707 0.91069 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1326579 1 0.5151 0.86650 0.760 0.100 0.140 0.000
#> SRR1349363 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1096712 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1090407 3 0.0188 0.91289 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1083752 4 0.5495 0.41211 0.028 0.348 0.000 0.624
#> SRR1377599 4 0.0592 0.89906 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1488449 3 0.0188 0.91289 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1318354 3 0.1474 0.89996 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1359062 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1398924 1 0.6773 0.49871 0.532 0.104 0.364 0.000
#> SRR663783 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1319204 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1369070 2 0.4058 0.90585 0.016 0.840 0.116 0.028
#> SRR615659 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1337449 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1316982 3 0.1722 0.86384 0.008 0.048 0.944 0.000
#> SRR1498595 4 0.0592 0.89906 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1377423 3 0.2831 0.84568 0.120 0.004 0.876 0.000
#> SRR1312310 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1485613 1 0.4236 0.89866 0.824 0.088 0.088 0.000
#> SRR1338426 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1353309 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR658941 3 0.2675 0.86039 0.008 0.100 0.892 0.000
#> SRR1101643 1 0.2919 0.86226 0.896 0.044 0.060 0.000
#> SRR1401468 1 0.4487 0.89408 0.808 0.100 0.092 0.000
#> SRR1368874 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1324085 4 0.0336 0.90136 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1363858 1 0.2956 0.83626 0.904 0.048 0.036 0.012
#> SRR819820 3 0.2412 0.87138 0.008 0.084 0.908 0.000
#> SRR1337342 1 0.6677 0.55936 0.552 0.100 0.348 0.000
#> SRR655206 3 0.5495 0.20973 0.028 0.348 0.624 0.000
#> SRR1387013 2 0.4126 0.80569 0.024 0.836 0.020 0.120
#> SRR1317410 1 0.4236 0.89866 0.824 0.088 0.088 0.000
#> SRR608198 1 0.4487 0.89408 0.808 0.100 0.092 0.000
#> SRR1440161 2 0.4295 0.82229 0.008 0.752 0.240 0.000
#> SRR1343741 2 0.4015 0.90789 0.016 0.840 0.120 0.024
#> SRR1381288 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1415379 4 0.3427 0.81054 0.028 0.112 0.000 0.860
#> SRR1099622 2 0.3300 0.91773 0.008 0.848 0.144 0.000
#> SRR663197 3 0.0779 0.91088 0.004 0.016 0.980 0.000
#> SRR1394836 2 0.4671 0.83915 0.028 0.752 0.220 0.000
#> SRR661699 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR813680 3 0.5038 0.52464 0.296 0.020 0.684 0.000
#> SRR1410678 1 0.2216 0.90473 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499174 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1311486 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1382851 2 0.4578 0.74448 0.052 0.788 0.000 0.160
#> SRR1433410 1 0.4840 0.88362 0.784 0.100 0.116 0.000
#> SRR661167 3 0.0188 0.91289 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1432518 3 0.0336 0.91349 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR660462 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1374608 4 0.6036 0.46293 0.028 0.380 0.012 0.580
#> SRR657949 3 0.1854 0.89118 0.048 0.012 0.940 0.000
#> SRR1308882 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655768 1 0.2216 0.90289 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1485870 2 0.4906 0.83916 0.028 0.808 0.068 0.096
#> SRR1444138 1 0.5038 0.67459 0.684 0.020 0.296 0.000
#> SRR1417342 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1470193 2 0.3863 0.91024 0.028 0.828 0.144 0.000
#> SRR1091380 3 0.1867 0.88908 0.000 0.072 0.928 0.000
#> SRR1099096 1 0.4236 0.89866 0.824 0.088 0.088 0.000
#> SRR1313583 4 0.0336 0.89991 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1467102 3 0.3015 0.78314 0.024 0.092 0.884 0.000
#> SRR1485416 4 0.0336 0.90136 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR818821 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR809963 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1072247 1 0.2334 0.90529 0.908 0.004 0.088 0.000
#> SRR1353710 4 0.5646 0.56267 0.048 0.296 0.000 0.656
#> SRR1445259 3 0.3099 0.85404 0.020 0.104 0.876 0.000
#> SRR1408393 3 0.1938 0.89008 0.052 0.012 0.936 0.000
#> SRR1361522 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1368597 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1309680 2 0.4131 0.90079 0.016 0.840 0.108 0.036
#> SRR1310542 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1333485 4 0.0188 0.90176 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1406437 2 0.4323 0.79091 0.028 0.788 0.184 0.000
#> SRR1354931 3 0.1661 0.89342 0.052 0.004 0.944 0.000
#> SRR1391856 2 0.3760 0.90678 0.028 0.836 0.136 0.000
#> SRR1446738 2 0.4052 0.90472 0.028 0.836 0.124 0.012
#> SRR1309032 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1388145 2 0.3300 0.91763 0.008 0.848 0.144 0.000
#> SRR1432611 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR815869 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR613150 3 0.0336 0.91349 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1375329 3 0.0469 0.91275 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1387921 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1466792 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1360478 2 0.3300 0.91763 0.008 0.848 0.144 0.000
#> SRR1360695 1 0.3080 0.90602 0.880 0.024 0.096 0.000
#> SRR812943 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1400910 3 0.0592 0.91169 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1444203 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR816177 2 0.3910 0.76195 0.024 0.820 0.000 0.156
#> SRR658754 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1429603 4 0.4877 0.70934 0.044 0.204 0.000 0.752
#> SRR1397366 3 0.2589 0.84592 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1446028 1 0.2412 0.90525 0.908 0.008 0.084 0.000
#> SRR1083918 2 0.4076 0.81197 0.020 0.836 0.020 0.124
#> SRR1337606 3 0.6898 0.02726 0.360 0.116 0.524 0.000
#> SRR659109 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1337192 1 0.4487 0.89408 0.808 0.100 0.092 0.000
#> SRR656946 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1476102 1 0.4610 0.89156 0.800 0.100 0.100 0.000
#> SRR1476447 1 0.3667 0.90391 0.856 0.056 0.088 0.000
#> SRR1342067 4 0.0188 0.90176 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1385389 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075971 1 0.4236 0.89866 0.824 0.088 0.088 0.000
#> SRR614419 1 0.4364 0.89639 0.816 0.092 0.092 0.000
#> SRR1322936 1 0.5051 0.87267 0.768 0.100 0.132 0.000
#> SRR1349121 1 0.4236 0.89866 0.824 0.088 0.088 0.000
#> SRR1430549 1 0.3667 0.90377 0.856 0.056 0.088 0.000
#> SRR612935 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR661481 2 0.4271 0.83726 0.020 0.836 0.040 0.104
#> SRR1354117 2 0.4792 0.72840 0.008 0.680 0.312 0.000
#> SRR1393596 2 0.5308 0.54876 0.036 0.684 0.000 0.280
#> SRR1452164 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1070503 3 0.3796 0.81856 0.056 0.096 0.848 0.000
#> SRR1499894 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1082883 1 0.4549 0.89298 0.804 0.100 0.096 0.000
#> SRR1468271 1 0.4364 0.89639 0.816 0.092 0.092 0.000
#> SRR1332443 1 0.4236 0.89866 0.824 0.088 0.088 0.000
#> SRR810295 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR662103 1 0.2610 0.89768 0.900 0.012 0.088 0.000
#> SRR1328620 3 0.1022 0.90707 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1396294 3 0.8598 -0.32589 0.028 0.328 0.356 0.288
#> SRR1419917 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR662114 3 0.0524 0.91216 0.004 0.008 0.988 0.000
#> SRR1489199 3 0.6686 -0.00842 0.388 0.092 0.520 0.000
#> SRR813584 2 0.4004 0.75417 0.024 0.812 0.000 0.164
#> SRR1069638 3 0.2635 0.87772 0.020 0.076 0.904 0.000
#> SRR614864 3 0.3525 0.83042 0.040 0.100 0.860 0.000
#> SRR1433392 1 0.2530 0.89945 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1377777 2 0.4160 0.83936 0.016 0.840 0.040 0.104
#> SRR2167710 1 0.4999 0.11260 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR1401252 4 0.0336 0.90136 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1309963 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1418628 2 0.3300 0.91763 0.008 0.848 0.144 0.000
#> SRR1486889 3 0.2722 0.86961 0.064 0.032 0.904 0.000
#> SRR1380393 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1319731 1 0.3745 0.90343 0.852 0.060 0.088 0.000
#> SRR1356468 4 0.5527 0.51054 0.028 0.356 0.000 0.616
#> SRR1337010 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1486520 1 0.4300 0.89621 0.820 0.092 0.088 0.000
#> SRR1486538 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377696 2 0.4348 0.71726 0.024 0.780 0.000 0.196
#> SRR1465459 3 0.2973 0.81548 0.144 0.000 0.856 0.000
#> SRR1080270 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1312501 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1093148 3 0.2805 0.86016 0.012 0.100 0.888 0.000
#> SRR1467080 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1410866 2 0.4337 0.88749 0.020 0.836 0.092 0.052
#> SRR816475 4 0.0336 0.90136 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1379198 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613342 3 0.1867 0.88168 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1452246 2 0.3853 0.90802 0.016 0.848 0.116 0.020
#> SRR1338836 2 0.3770 0.91445 0.016 0.840 0.136 0.008
#> SRR1369129 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396616 3 0.0524 0.91121 0.008 0.004 0.988 0.000
#> SRR813824 3 0.3004 0.86258 0.060 0.048 0.892 0.000
#> SRR1082376 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1500891 4 0.0336 0.90136 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR807543 1 0.4948 0.31058 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR1091572 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1346689 4 0.0707 0.89826 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1332424 1 0.4549 0.89298 0.804 0.100 0.096 0.000
#> SRR663729 4 0.4540 0.72573 0.032 0.196 0.000 0.772
#> SRR1097013 1 0.3711 0.88975 0.836 0.024 0.140 0.000
#> SRR613675 1 0.4487 0.89276 0.808 0.100 0.092 0.000
#> SRR1485357 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655816 3 0.0188 0.91289 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1500113 1 0.4236 0.89866 0.824 0.088 0.088 0.000
#> SRR1437622 4 0.4225 0.71904 0.024 0.184 0.000 0.792
#> SRR1355172 3 0.3390 0.81474 0.132 0.016 0.852 0.000
#> SRR655531 1 0.4487 0.89408 0.808 0.100 0.092 0.000
#> SRR1338147 3 0.0336 0.91349 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1413329 3 0.3810 0.81621 0.060 0.092 0.848 0.000
#> SRR1485931 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1420873 1 0.4236 0.89866 0.824 0.088 0.088 0.000
#> SRR1333308 4 0.5364 0.53743 0.028 0.320 0.000 0.652
#> SRR1452033 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1467316 2 0.2868 0.91720 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR809018 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1375351 2 0.3300 0.91763 0.008 0.848 0.144 0.000
#> SRR663440 3 0.3533 0.82909 0.056 0.080 0.864 0.000
#> SRR1471755 2 0.3806 0.76518 0.020 0.824 0.000 0.156
#> SRR808019 1 0.6370 0.69457 0.620 0.100 0.280 0.000
#> SRR1479133 3 0.3793 0.83345 0.112 0.044 0.844 0.000
#> SRR615069 3 0.0707 0.91069 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1456185 2 0.3300 0.91688 0.008 0.848 0.144 0.000
#> SRR1350069 4 0.5628 0.53085 0.032 0.320 0.004 0.644
#> SRR816316 1 0.2919 0.86226 0.896 0.044 0.060 0.000
#> SRR664795 1 0.5511 0.20169 0.500 0.016 0.484 0.000
#> SRR1490721 4 0.6141 0.37614 0.044 0.392 0.004 0.560
#> SRR810643 1 0.4364 0.89639 0.816 0.092 0.092 0.000
#> SRR1430333 3 0.2342 0.87549 0.008 0.080 0.912 0.000
#> SRR1085285 3 0.0672 0.91052 0.008 0.008 0.984 0.000
#> SRR1099072 3 0.2408 0.85706 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR1317985 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1487340 1 0.2610 0.90607 0.900 0.012 0.088 0.000
#> SRR1420276 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1351347 3 0.0336 0.91349 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1405525 1 0.4426 0.89529 0.812 0.096 0.092 0.000
#> SRR1370329 1 0.2919 0.86226 0.896 0.044 0.060 0.000
#> SRR1465001 1 0.4171 0.89960 0.828 0.084 0.088 0.000
#> SRR1476525 2 0.4337 0.88749 0.020 0.836 0.092 0.052
#> SRR819610 2 0.3850 0.83279 0.008 0.848 0.032 0.112
#> SRR2157314 1 0.2610 0.90581 0.900 0.012 0.088 0.000
#> SRR1409465 2 0.3547 0.91539 0.016 0.840 0.144 0.000
#> SRR809987 4 0.5755 0.52509 0.332 0.044 0.000 0.624
#> SRR613639 1 0.2546 0.90086 0.900 0.008 0.092 0.000
#> SRR1402285 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077038 1 0.3726 0.81654 0.788 0.000 0.212 0.000
#> SRR1405660 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1095455 1 0.4661 0.56196 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1394734 2 0.5560 0.32731 0.024 0.584 0.000 0.392
#> SRR1317771 1 0.5314 0.84016 0.740 0.084 0.176 0.000
#> SRR1365894 2 0.4736 0.81437 0.028 0.812 0.044 0.116
#> SRR1073581 1 0.5248 0.85109 0.748 0.088 0.164 0.000
#> SRR659804 1 0.2610 0.90581 0.900 0.012 0.088 0.000
#> SRR1345914 2 0.2921 0.91829 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1432186 2 0.4363 0.88067 0.020 0.836 0.084 0.060
#> SRR1473529 4 0.5420 0.40786 0.024 0.352 0.000 0.624
#> SRR660764 3 0.0657 0.91144 0.004 0.012 0.984 0.000
#> SRR820448 1 0.2919 0.86226 0.896 0.044 0.060 0.000
#> SRR1328845 4 0.6375 0.53380 0.080 0.300 0.004 0.616
#> SRR1336415 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1459190 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1346773 1 0.4487 0.89408 0.808 0.100 0.092 0.000
#> SRR1499521 1 0.4727 0.88793 0.792 0.100 0.108 0.000
#> SRR1440898 2 0.3300 0.91763 0.008 0.848 0.144 0.000
#> SRR1347459 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1081209 2 0.2921 0.91829 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1400202 1 0.2149 0.90507 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1333395 2 0.3907 0.90996 0.032 0.828 0.140 0.000
#> SRR1309248 2 0.4332 0.73031 0.032 0.792 0.000 0.176
#> SRR809161 3 0.2973 0.81548 0.144 0.000 0.856 0.000
#> SRR1316320 2 0.3760 0.90678 0.028 0.836 0.136 0.000
#> SRR1432629 2 0.4547 0.74099 0.024 0.784 0.008 0.184
#> SRR1498931 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1416578 4 0.0336 0.89991 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1405547 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.4487 0.89408 0.808 0.100 0.092 0.000
#> SRR1309160 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR663489 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1500450 1 0.6546 0.35957 0.492 0.076 0.432 0.000
#> SRR1078489 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1332648 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660614 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1470420 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1475566 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1477949 1 0.2861 0.90566 0.888 0.016 0.096 0.000
#> SRR1481419 2 0.3300 0.91763 0.008 0.848 0.144 0.000
#> SRR1464766 1 0.3966 0.90192 0.840 0.072 0.088 0.000
#> SRR615946 3 0.2480 0.86814 0.088 0.008 0.904 0.000
#> SRR1446481 2 0.3965 0.90993 0.016 0.840 0.124 0.020
#> SRR1467656 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1402962 1 0.6783 0.46557 0.512 0.100 0.388 0.000
#> SRR660224 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR665586 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1347166 1 0.5151 0.86687 0.760 0.100 0.140 0.000
#> SRR1485722 1 0.6195 0.73424 0.648 0.100 0.252 0.000
#> SRR1415316 1 0.3978 0.90371 0.836 0.056 0.108 0.000
#> SRR613390 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR661108 3 0.0336 0.91349 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR2170173 3 0.4961 0.13934 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR817329 1 0.4790 0.52501 0.620 0.000 0.380 0.000
#> SRR1401990 4 0.4406 0.73103 0.028 0.192 0.000 0.780
#> SRR1467745 4 0.0469 0.90038 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1471795 2 0.4271 0.83726 0.020 0.836 0.040 0.104
#> SRR1415637 2 0.3157 0.91823 0.004 0.852 0.144 0.000
#> SRR813137 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1314873 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1401211 1 0.3149 0.90572 0.880 0.032 0.088 0.000
#> SRR1419692 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818797 1 0.3004 0.86319 0.892 0.048 0.060 0.000
#> SRR2164608 3 0.2412 0.87138 0.008 0.084 0.908 0.000
#> SRR1455586 2 0.5172 0.54511 0.008 0.588 0.404 0.000
#> SRR819459 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1488939 2 0.2868 0.91720 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR1433232 2 0.4271 0.83726 0.020 0.836 0.040 0.104
#> SRR1385501 1 0.4916 0.35909 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1361652 3 0.3004 0.86865 0.048 0.060 0.892 0.000
#> SRR1437119 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1478547 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1430910 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1310584 1 0.4236 0.89866 0.824 0.088 0.088 0.000
#> SRR1500216 1 0.2675 0.84749 0.908 0.048 0.044 0.000
#> SRR1486762 3 0.1059 0.91130 0.016 0.012 0.972 0.000
#> SRR1480854 4 0.0336 0.90136 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1489394 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1473058 4 0.1677 0.88472 0.040 0.012 0.000 0.948
#> SRR1405165 3 0.0707 0.91069 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1433004 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1471477 1 0.6626 0.48125 0.528 0.088 0.384 0.000
#> SRR1098567 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1098712 2 0.4424 0.79748 0.100 0.812 0.088 0.000
#> SRR1455038 1 0.3004 0.86319 0.892 0.048 0.060 0.000
#> SRR1375248 3 0.2546 0.79698 0.008 0.092 0.900 0.000
#> SRR1403005 3 0.2216 0.86736 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR1348378 2 0.4412 0.91029 0.036 0.820 0.128 0.016
#> SRR1413541 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1392943 4 0.5517 0.54612 0.036 0.316 0.000 0.648
#> SRR1475192 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1432085 2 0.3300 0.91688 0.008 0.848 0.144 0.000
#> SRR1452468 3 0.3117 0.85053 0.028 0.092 0.880 0.000
#> SRR1347060 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1414139 2 0.5085 0.72734 0.020 0.676 0.304 0.000
#> SRR1447962 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1444324 2 0.4194 0.83650 0.008 0.764 0.228 0.000
#> SRR1415004 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1413436 1 0.4549 0.89298 0.804 0.100 0.096 0.000
#> SRR1311266 1 0.4549 0.89298 0.804 0.100 0.096 0.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1373746 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1429678 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1469413 2 0.2973 0.91858 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1405331 1 0.3074 0.87380 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1345609 1 0.2334 0.90529 0.908 0.004 0.088 0.000
#> SRR1380208 2 0.2722 0.84079 0.032 0.904 0.064 0.000
#> SRR1322840 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399797 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1416654 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1315081 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1369196 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1400847 1 0.2281 0.90424 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1365291 3 0.1807 0.89202 0.008 0.052 0.940 0.000
#> SRR1367920 4 0.0592 0.89906 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1366648 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1441679 2 0.3300 0.91688 0.008 0.848 0.144 0.000
#> SRR1082173 3 0.2334 0.87417 0.004 0.088 0.908 0.000
#> SRR1363968 1 0.4894 0.88119 0.780 0.100 0.120 0.000
#> SRR814387 1 0.4236 0.89866 0.824 0.088 0.088 0.000
#> SRR657599 1 0.4535 0.88986 0.804 0.112 0.084 0.000
#> SRR1386689 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395575 3 0.0524 0.91121 0.008 0.004 0.988 0.000
#> SRR1453811 1 0.4994 0.74196 0.744 0.048 0.208 0.000
#> SRR1441159 1 0.4487 0.89408 0.808 0.100 0.092 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.90216 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468722 3 0.0469 0.91387 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1310275 3 0.0469 0.91283 0.000 0.012 0.988 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 1 0.4640 -0.08570 0.584 0.000 0.016 0.000 0.400
#> SRR1331708 5 0.5309 0.58687 0.240 0.000 0.104 0.000 0.656
#> SRR1464258 1 0.3584 0.60796 0.828 0.028 0.012 0.000 0.132
#> SRR1454201 5 0.5639 0.62727 0.340 0.000 0.092 0.000 0.568
#> SRR661589 3 0.0290 0.92148 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.0798 0.73652 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR1315165 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1488960 1 0.5175 -0.41386 0.496 0.000 0.040 0.000 0.464
#> SRR1417809 4 0.8368 0.17983 0.168 0.300 0.000 0.336 0.196
#> SRR1094457 4 0.0000 0.88475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.3934 0.37811 0.716 0.000 0.276 0.000 0.008
#> SRR1315931 1 0.3584 0.60796 0.828 0.028 0.012 0.000 0.132
#> SRR1430066 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818002 2 0.6187 0.22222 0.008 0.508 0.000 0.372 0.112
#> SRR1344143 2 0.0794 0.89522 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1486845 4 0.0162 0.88453 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1362866 5 0.5699 0.61999 0.308 0.000 0.108 0.000 0.584
#> SRR1490740 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0794 0.89522 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.2681 0.87102 0.008 0.896 0.004 0.024 0.068
#> SRR1416248 1 0.4630 -0.07181 0.588 0.000 0.016 0.000 0.396
#> SRR1383907 4 0.1430 0.87575 0.004 0.000 0.000 0.944 0.052
#> SRR1311018 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0794 0.89522 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.0912 0.91246 0.012 0.000 0.972 0.000 0.016
#> SRR613550 3 0.0703 0.91267 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.4620 -0.05442 0.592 0.000 0.016 0.000 0.392
#> SRR1345146 3 0.0162 0.92316 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1324025 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318879 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820755 3 0.1469 0.89906 0.016 0.000 0.948 0.000 0.036
#> SRR1485830 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR599313 1 0.3929 0.52396 0.764 0.028 0.000 0.000 0.208
#> SRR612263 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.0162 0.92316 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1326205 4 0.5852 0.60584 0.004 0.192 0.000 0.624 0.180
#> SRR1421327 4 0.2249 0.86016 0.008 0.000 0.000 0.896 0.096
#> SRR1083311 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.1197 0.87736 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1079522 3 0.2592 0.84584 0.056 0.000 0.892 0.000 0.052
#> SRR1452935 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379495 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.1082 0.89452 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR661361 3 0.2193 0.87466 0.000 0.028 0.912 0.000 0.060
#> SRR615778 5 0.4817 0.63809 0.404 0.000 0.024 0.000 0.572
#> SRR1447564 1 0.1018 0.73401 0.968 0.000 0.016 0.000 0.016
#> SRR1455195 5 0.4674 0.62997 0.416 0.000 0.016 0.000 0.568
#> SRR655182 1 0.2293 0.68228 0.900 0.000 0.016 0.000 0.084
#> SRR1335140 2 0.3283 0.84554 0.008 0.848 0.000 0.028 0.116
#> SRR1433555 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.1780 0.88867 0.008 0.940 0.028 0.000 0.024
#> SRR1388354 1 0.1300 0.72817 0.956 0.000 0.016 0.000 0.028
#> SRR1317446 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.1493 0.89306 0.000 0.948 0.028 0.000 0.024
#> SRR809853 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.2179 0.84249 0.112 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1499935 4 0.1121 0.87843 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1447303 3 0.0510 0.91791 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1429408 4 0.5330 0.70371 0.008 0.068 0.000 0.648 0.276
#> SRR1433950 1 0.0798 0.73652 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR1362081 2 0.1082 0.89452 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1409854 3 0.6068 0.11491 0.140 0.000 0.532 0.000 0.328
#> SRR1435229 5 0.6054 0.50413 0.172 0.000 0.260 0.000 0.568
#> SRR1085996 5 0.4974 0.51782 0.464 0.000 0.028 0.000 0.508
#> SRR1414229 5 0.5284 0.35447 0.056 0.000 0.376 0.000 0.568
#> SRR1400974 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR613927 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.1549 0.72040 0.944 0.000 0.016 0.000 0.040
#> SRR1473714 1 0.3454 0.57293 0.816 0.028 0.000 0.000 0.156
#> SRR813776 3 0.1012 0.91143 0.012 0.000 0.968 0.000 0.020
#> SRR808196 4 0.7245 0.50576 0.060 0.192 0.000 0.516 0.232
#> SRR1101085 4 0.0963 0.88014 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR614395 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1478251 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1370551 2 0.1082 0.89452 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1362310 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.1270 0.89691 0.052 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR1420109 3 0.0290 0.92148 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1330920 1 0.5831 -0.36420 0.496 0.000 0.096 0.000 0.408
#> SRR1419539 3 0.4418 0.68998 0.004 0.060 0.756 0.000 0.180
#> SRR1359447 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347259 2 0.6778 -0.00632 0.004 0.420 0.000 0.348 0.228
#> SRR613915 3 0.0992 0.91166 0.008 0.000 0.968 0.000 0.024
#> SRR1384395 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821715 3 0.0794 0.90973 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.4599 -0.01856 0.600 0.000 0.016 0.000 0.384
#> SRR1445637 1 0.2426 0.68883 0.900 0.000 0.064 0.000 0.036
#> SRR608150 5 0.4576 0.62558 0.376 0.000 0.016 0.000 0.608
#> SRR1096383 1 0.4538 0.06049 0.620 0.000 0.016 0.000 0.364
#> SRR1341480 4 0.1197 0.87736 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1341344 5 0.4727 0.56349 0.452 0.000 0.016 0.000 0.532
#> SRR1326270 3 0.0865 0.91118 0.024 0.004 0.972 0.000 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808566 4 0.2411 0.85454 0.008 0.000 0.000 0.884 0.108
#> SRR1430270 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1367825 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661267 1 0.6402 -0.26050 0.472 0.000 0.180 0.000 0.348
#> SRR810665 2 0.0794 0.89522 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1407250 5 0.5880 0.60903 0.304 0.000 0.128 0.000 0.568
#> SRR1420067 5 0.4893 0.63880 0.404 0.000 0.028 0.000 0.568
#> SRR1473632 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.2681 0.87102 0.008 0.896 0.004 0.024 0.068
#> SRR1486195 2 0.1082 0.89452 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1407671 2 0.3551 0.77591 0.000 0.772 0.008 0.000 0.220
#> SRR1446375 1 0.4542 0.10893 0.536 0.000 0.456 0.000 0.008
#> SRR1465230 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR614119 1 0.4599 -0.01856 0.600 0.000 0.016 0.000 0.384
#> SRR1356101 2 0.4561 0.08226 0.000 0.504 0.488 0.000 0.008
#> SRR1404209 3 0.3849 0.62083 0.232 0.000 0.752 0.000 0.016
#> SRR1392676 2 0.0794 0.89522 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.4610 -0.03666 0.596 0.000 0.016 0.000 0.388
#> SRR660510 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0794 0.88170 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR658953 3 0.2569 0.85418 0.040 0.000 0.892 0.000 0.068
#> SRR2166459 1 0.4021 0.53569 0.780 0.000 0.052 0.000 0.168
#> SRR1070713 2 0.3596 0.79310 0.000 0.784 0.016 0.000 0.200
#> SRR1485312 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.5852 0.60584 0.004 0.192 0.000 0.624 0.180
#> SRR1488610 5 0.4893 0.63880 0.404 0.000 0.028 0.000 0.568
#> SRR1330588 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316367 5 0.4689 0.61713 0.424 0.000 0.016 0.000 0.560
#> SRR1433926 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1091302 4 0.0865 0.88228 0.004 0.000 0.000 0.972 0.024
#> SRR818263 1 0.4740 -0.39782 0.516 0.000 0.016 0.000 0.468
#> SRR1404909 4 0.1831 0.86876 0.004 0.000 0.000 0.920 0.076
#> SRR663076 1 0.1549 0.72040 0.944 0.000 0.016 0.000 0.040
#> SRR1323577 2 0.2713 0.87873 0.008 0.896 0.020 0.008 0.068
#> SRR1442422 4 0.0000 0.88475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.4599 -0.01856 0.600 0.000 0.016 0.000 0.384
#> SRR654862 5 0.6349 0.53693 0.268 0.000 0.212 0.000 0.520
#> SRR1407112 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1332969 3 0.0162 0.92316 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1353199 3 0.3003 0.75086 0.188 0.000 0.812 0.000 0.000
#> SRR1378885 3 0.0898 0.91243 0.008 0.000 0.972 0.000 0.020
#> SRR665357 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.1082 0.89452 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1501020 3 0.0510 0.91750 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.2713 0.87873 0.008 0.896 0.020 0.008 0.068
#> SRR1472576 4 0.2746 0.84787 0.008 0.008 0.000 0.872 0.112
#> SRR1431781 4 0.0162 0.88453 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1452270 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.6253 0.48187 0.188 0.000 0.280 0.000 0.532
#> SRR1417632 4 0.1892 0.86755 0.004 0.000 0.000 0.916 0.080
#> SRR1350153 2 0.1911 0.89038 0.004 0.932 0.028 0.000 0.036
#> SRR1458113 3 0.3074 0.75349 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1326579 5 0.4893 0.63880 0.404 0.000 0.028 0.000 0.568
#> SRR1349363 2 0.0794 0.89522 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083752 4 0.6347 0.24986 0.008 0.364 0.000 0.496 0.132
#> SRR1377599 4 0.2193 0.86136 0.008 0.000 0.000 0.900 0.092
#> SRR1488449 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318354 3 0.3177 0.73292 0.000 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1359062 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.5958 0.57580 0.288 0.000 0.144 0.000 0.568
#> SRR663783 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319204 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369070 2 0.2713 0.87873 0.008 0.896 0.020 0.008 0.068
#> SRR615659 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.1082 0.89452 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1316982 3 0.0898 0.90363 0.000 0.020 0.972 0.000 0.008
#> SRR1498595 4 0.2249 0.85955 0.008 0.000 0.000 0.896 0.096
#> SRR1377423 3 0.2329 0.82610 0.124 0.000 0.876 0.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.1082 0.89452 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1485613 1 0.4610 -0.03666 0.596 0.000 0.016 0.000 0.388
#> SRR1338426 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658941 5 0.4262 0.15862 0.000 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1101643 1 0.3474 0.60338 0.832 0.028 0.008 0.000 0.132
#> SRR1401468 5 0.4702 0.60254 0.432 0.000 0.016 0.000 0.552
#> SRR1368874 2 0.1082 0.89452 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1324085 4 0.1121 0.87844 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1363858 1 0.4085 0.51950 0.760 0.028 0.000 0.004 0.208
#> SRR819820 3 0.1544 0.88273 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1337342 5 0.5958 0.59782 0.288 0.000 0.144 0.000 0.568
#> SRR655206 3 0.6389 0.21375 0.004 0.284 0.528 0.000 0.184
#> SRR1387013 2 0.3197 0.84957 0.008 0.852 0.000 0.024 0.116
#> SRR1317410 1 0.4451 0.14209 0.644 0.000 0.016 0.000 0.340
#> SRR608198 5 0.4674 0.62997 0.416 0.000 0.016 0.000 0.568
#> SRR1440161 2 0.3910 0.63327 0.000 0.720 0.272 0.000 0.008
#> SRR1343741 2 0.2713 0.87873 0.008 0.896 0.020 0.008 0.068
#> SRR1381288 2 0.0794 0.89522 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.4972 0.71832 0.004 0.100 0.000 0.716 0.180
#> SRR1099622 2 0.1743 0.89470 0.004 0.940 0.028 0.000 0.028
#> SRR663197 3 0.0579 0.91954 0.000 0.008 0.984 0.000 0.008
#> SRR1394836 2 0.5502 0.66550 0.000 0.652 0.156 0.000 0.192
#> SRR661699 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813680 3 0.3612 0.57264 0.268 0.000 0.732 0.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1499174 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0794 0.89522 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.4936 0.72074 0.008 0.668 0.000 0.040 0.284
#> SRR1433410 5 0.4825 0.63690 0.408 0.000 0.024 0.000 0.568
#> SRR661167 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 5 0.6731 -0.21713 0.004 0.240 0.004 0.256 0.496
#> SRR657949 3 0.0671 0.91634 0.016 0.000 0.980 0.000 0.004
#> SRR1308882 4 0.0162 0.88453 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR655768 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1485870 2 0.4648 0.73914 0.004 0.724 0.012 0.028 0.232
#> SRR1444138 1 0.5466 0.28466 0.640 0.000 0.244 0.000 0.116
#> SRR1417342 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1470193 2 0.4228 0.77640 0.004 0.748 0.032 0.000 0.216
#> SRR1091380 3 0.1478 0.88567 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1099096 1 0.4599 -0.01856 0.600 0.000 0.016 0.000 0.384
#> SRR1313583 4 0.1831 0.85952 0.004 0.000 0.000 0.920 0.076
#> SRR1467102 3 0.2017 0.85177 0.000 0.080 0.912 0.000 0.008
#> SRR1485416 4 0.1892 0.86746 0.004 0.000 0.000 0.916 0.080
#> SRR818821 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809963 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.6658 0.47639 0.008 0.216 0.000 0.500 0.276
#> SRR1445259 3 0.3774 0.58528 0.000 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1408393 3 0.0671 0.91634 0.016 0.000 0.980 0.000 0.004
#> SRR1361522 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.1626 0.71813 0.940 0.000 0.016 0.000 0.044
#> SRR1309680 2 0.2663 0.87908 0.008 0.900 0.016 0.012 0.064
#> SRR1310542 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0162 0.88453 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1406437 5 0.5531 -0.30048 0.004 0.432 0.056 0.000 0.508
#> SRR1354931 3 0.0510 0.91750 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1391856 2 0.3999 0.76319 0.000 0.740 0.020 0.000 0.240
#> SRR1446738 2 0.4270 0.75450 0.004 0.728 0.016 0.004 0.248
#> SRR1309032 2 0.1082 0.89452 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1388145 2 0.1300 0.89466 0.000 0.956 0.028 0.000 0.016
#> SRR1432611 2 0.1082 0.89452 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR815869 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0162 0.92317 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1375329 3 0.2852 0.78179 0.000 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1387921 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.1082 0.89452 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1360478 2 0.1300 0.89398 0.000 0.956 0.028 0.000 0.016
#> SRR1360695 1 0.2625 0.65376 0.876 0.000 0.016 0.000 0.108
#> SRR812943 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1400910 3 0.2852 0.78264 0.000 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1444203 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR816177 2 0.3283 0.84554 0.008 0.848 0.000 0.028 0.116
#> SRR658754 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.6162 0.59712 0.004 0.172 0.000 0.572 0.252
#> SRR1397366 3 0.0703 0.91267 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.0798 0.73571 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR1083918 2 0.2744 0.86937 0.008 0.892 0.004 0.024 0.072
#> SRR1337606 5 0.5769 0.51390 0.144 0.004 0.224 0.000 0.628
#> SRR659109 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337192 5 0.4674 0.62997 0.416 0.000 0.016 0.000 0.568
#> SRR656946 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1476102 5 0.4674 0.62997 0.416 0.000 0.016 0.000 0.568
#> SRR1476447 1 0.4114 0.35858 0.712 0.000 0.016 0.000 0.272
#> SRR1342067 4 0.0162 0.88453 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1385389 4 0.0000 0.88475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.4538 0.06033 0.620 0.000 0.016 0.000 0.364
#> SRR614419 5 0.4713 0.58604 0.440 0.000 0.016 0.000 0.544
#> SRR1322936 5 0.4849 0.63381 0.360 0.000 0.032 0.000 0.608
#> SRR1349121 1 0.4599 -0.01856 0.600 0.000 0.016 0.000 0.384
#> SRR1430549 1 0.1774 0.70868 0.932 0.000 0.016 0.000 0.052
#> SRR612935 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661481 2 0.2713 0.87327 0.008 0.896 0.008 0.020 0.068
#> SRR1354117 2 0.4283 0.49911 0.000 0.644 0.348 0.000 0.008
#> SRR1393596 2 0.5621 0.61978 0.004 0.632 0.000 0.112 0.252
#> SRR1452164 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.3895 0.53137 0.000 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1499894 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082883 5 0.4551 0.62181 0.368 0.000 0.016 0.000 0.616
#> SRR1468271 1 0.4723 -0.29688 0.536 0.000 0.016 0.000 0.448
#> SRR1332443 1 0.4640 -0.08754 0.584 0.000 0.016 0.000 0.400
#> SRR810295 2 0.1082 0.89452 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR662103 1 0.1278 0.72447 0.960 0.004 0.016 0.000 0.020
#> SRR1328620 3 0.2127 0.85078 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1396294 3 0.8608 -0.20027 0.004 0.276 0.320 0.192 0.208
#> SRR1419917 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.0162 0.92317 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1489199 5 0.6661 0.43837 0.256 0.000 0.304 0.000 0.440
#> SRR813584 2 0.3380 0.84301 0.008 0.840 0.000 0.028 0.124
#> SRR1069638 3 0.2338 0.84301 0.004 0.000 0.884 0.000 0.112
#> SRR614864 5 0.4297 0.05301 0.000 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1433392 1 0.2233 0.65757 0.892 0.000 0.104 0.000 0.004
#> SRR1377777 2 0.2681 0.87102 0.008 0.896 0.004 0.024 0.068
#> SRR2167710 1 0.2929 0.52290 0.820 0.000 0.180 0.000 0.000
#> SRR1401252 4 0.1197 0.87736 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1309963 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1338031 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.1300 0.89398 0.000 0.956 0.028 0.000 0.016
#> SRR1486889 3 0.0510 0.91750 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.3011 0.60956 0.844 0.000 0.016 0.000 0.140
#> SRR1356468 5 0.6797 -0.34981 0.004 0.232 0.000 0.352 0.412
#> SRR1337010 2 0.1082 0.89452 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1486520 5 0.4713 0.58485 0.440 0.000 0.016 0.000 0.544
#> SRR1486538 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1340486 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1377696 2 0.3669 0.82960 0.008 0.828 0.000 0.048 0.116
#> SRR1465459 3 0.0794 0.90973 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093148 5 0.3983 0.34344 0.000 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR1467080 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.2728 0.87734 0.008 0.896 0.016 0.012 0.068
#> SRR816475 4 0.0794 0.88170 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1379198 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR613342 3 0.0290 0.92148 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.2713 0.87873 0.008 0.896 0.020 0.008 0.068
#> SRR1338836 2 0.2544 0.88201 0.008 0.900 0.028 0.000 0.064
#> SRR1369129 4 0.0000 0.88475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.0162 0.92316 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR813824 3 0.3160 0.82296 0.004 0.028 0.852 0.000 0.116
#> SRR1082376 1 0.0798 0.73652 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR1500891 4 0.0963 0.88014 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR807543 1 0.4383 0.15321 0.572 0.000 0.424 0.000 0.004
#> SRR1091572 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1346689 4 0.3430 0.79507 0.004 0.000 0.000 0.776 0.220
#> SRR1332424 5 0.4674 0.62997 0.416 0.000 0.016 0.000 0.568
#> SRR663729 4 0.6141 0.59797 0.004 0.172 0.000 0.576 0.248
#> SRR1097013 1 0.3885 0.53587 0.784 0.000 0.040 0.000 0.176
#> SRR613675 5 0.4726 0.63757 0.400 0.000 0.020 0.000 0.580
#> SRR1485357 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR655816 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.4610 -0.03666 0.596 0.000 0.016 0.000 0.388
#> SRR1437622 4 0.5591 0.58474 0.008 0.228 0.000 0.652 0.112
#> SRR1355172 3 0.1792 0.86271 0.084 0.000 0.916 0.000 0.000
#> SRR655531 5 0.4682 0.62410 0.420 0.000 0.016 0.000 0.564
#> SRR1338147 3 0.0162 0.92317 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1413329 3 0.3942 0.62030 0.012 0.000 0.728 0.000 0.260
#> SRR1485931 2 0.0794 0.89522 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.4649 -0.10466 0.580 0.000 0.016 0.000 0.404
#> SRR1333308 4 0.6588 0.42550 0.004 0.276 0.000 0.496 0.224
#> SRR1452033 1 0.1018 0.73401 0.968 0.000 0.016 0.000 0.016
#> SRR1467316 2 0.0794 0.89522 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.1582 0.89188 0.000 0.944 0.028 0.000 0.028
#> SRR663440 3 0.0898 0.91243 0.008 0.000 0.972 0.000 0.020
#> SRR1471755 2 0.2673 0.86670 0.008 0.892 0.000 0.028 0.072
#> SRR808019 5 0.5901 0.60140 0.300 0.000 0.132 0.000 0.568
#> SRR1479133 3 0.3304 0.81139 0.004 0.028 0.840 0.000 0.128
#> SRR615069 3 0.2929 0.77378 0.000 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1456185 2 0.1195 0.89496 0.000 0.960 0.028 0.000 0.012
#> SRR1350069 4 0.7196 0.38870 0.044 0.280 0.000 0.488 0.188
#> SRR816316 1 0.3584 0.60796 0.828 0.028 0.012 0.000 0.132
#> SRR664795 3 0.4425 0.23604 0.392 0.000 0.600 0.000 0.008
#> SRR1490721 5 0.6065 -0.20433 0.004 0.304 0.000 0.132 0.560
#> SRR810643 5 0.4718 0.57660 0.444 0.000 0.016 0.000 0.540
#> SRR1430333 3 0.4297 0.13008 0.000 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1085285 3 0.0162 0.92345 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.0703 0.91267 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.1300 0.72886 0.956 0.000 0.016 0.000 0.028
#> SRR1420276 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405525 5 0.4708 0.59522 0.436 0.000 0.016 0.000 0.548
#> SRR1370329 1 0.3474 0.60338 0.832 0.028 0.008 0.000 0.132
#> SRR1465001 1 0.4482 0.11872 0.636 0.000 0.016 0.000 0.348
#> SRR1476525 2 0.2728 0.87734 0.008 0.896 0.016 0.012 0.068
#> SRR819610 2 0.1871 0.88486 0.012 0.940 0.004 0.024 0.020
#> SRR2157314 1 0.1300 0.72836 0.956 0.000 0.016 0.000 0.028
#> SRR1409465 2 0.2419 0.88302 0.004 0.904 0.028 0.000 0.064
#> SRR809987 4 0.6978 0.36670 0.340 0.024 0.000 0.456 0.180
#> SRR613639 1 0.1179 0.72712 0.964 0.004 0.016 0.000 0.016
#> SRR1402285 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1077038 1 0.3003 0.53743 0.812 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.3492 0.50790 0.796 0.000 0.188 0.000 0.016
#> SRR1394734 2 0.5407 0.63012 0.008 0.680 0.000 0.196 0.116
#> SRR1317771 1 0.5751 -0.18629 0.540 0.000 0.096 0.000 0.364
#> SRR1365894 2 0.4411 0.74619 0.000 0.732 0.012 0.024 0.232
#> SRR1073581 1 0.5865 -0.18463 0.532 0.000 0.108 0.000 0.360
#> SRR659804 1 0.1211 0.73027 0.960 0.000 0.016 0.000 0.024
#> SRR1345914 2 0.0794 0.89522 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.2728 0.87734 0.008 0.896 0.016 0.012 0.068
#> SRR1473529 4 0.6400 0.21092 0.008 0.376 0.000 0.480 0.136
#> SRR660764 3 0.0324 0.92230 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR820448 1 0.3584 0.60796 0.828 0.028 0.012 0.000 0.132
#> SRR1328845 4 0.7882 0.38356 0.112 0.244 0.000 0.448 0.196
#> SRR1336415 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1379065 4 0.0162 0.88453 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1459190 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346773 5 0.4682 0.62410 0.420 0.000 0.016 0.000 0.564
#> SRR1499521 5 0.4674 0.62997 0.416 0.000 0.016 0.000 0.568
#> SRR1440898 2 0.1300 0.89398 0.000 0.956 0.028 0.000 0.016
#> SRR1347459 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.0794 0.89522 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0912 0.73537 0.972 0.000 0.016 0.000 0.012
#> SRR1333395 2 0.4096 0.78772 0.012 0.772 0.024 0.000 0.192
#> SRR1309248 2 0.4756 0.71062 0.004 0.704 0.000 0.052 0.240
#> SRR809161 3 0.0794 0.90973 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1316320 2 0.3819 0.76953 0.000 0.756 0.016 0.000 0.228
#> SRR1432629 2 0.3827 0.82992 0.008 0.824 0.004 0.048 0.116
#> SRR1498931 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.1831 0.85952 0.004 0.000 0.000 0.920 0.076
#> SRR1405547 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1380764 5 0.4674 0.62997 0.416 0.000 0.016 0.000 0.568
#> SRR1309160 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 3 0.6754 -0.41876 0.356 0.000 0.380 0.000 0.264
#> SRR1078489 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332648 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR660614 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.1082 0.89452 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1475566 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.1469 0.72328 0.948 0.000 0.016 0.000 0.036
#> SRR1481419 2 0.1300 0.89398 0.000 0.956 0.028 0.000 0.016
#> SRR1464766 1 0.4511 0.08954 0.628 0.000 0.016 0.000 0.356
#> SRR615946 3 0.0981 0.91509 0.012 0.008 0.972 0.000 0.008
#> SRR1446481 2 0.2648 0.88022 0.008 0.900 0.020 0.008 0.064
#> SRR1467656 2 0.1195 0.89480 0.000 0.960 0.028 0.000 0.012
#> SRR1402962 5 0.6108 0.54417 0.224 0.000 0.208 0.000 0.568
#> SRR660224 2 0.0794 0.89522 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.1117 0.73339 0.964 0.000 0.020 0.000 0.016
#> SRR1347166 5 0.5077 0.63972 0.392 0.000 0.040 0.000 0.568
#> SRR1485722 5 0.5535 0.63159 0.352 0.000 0.080 0.000 0.568
#> SRR1415316 1 0.4309 0.25666 0.676 0.000 0.016 0.000 0.308
#> SRR613390 1 0.0798 0.73652 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR661108 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.3980 0.36529 0.708 0.000 0.284 0.000 0.008
#> SRR817329 1 0.4066 0.29503 0.672 0.000 0.324 0.000 0.004
#> SRR1401990 4 0.5630 0.64063 0.004 0.164 0.000 0.652 0.180
#> SRR1467745 4 0.1952 0.86610 0.004 0.000 0.000 0.912 0.084
#> SRR1471795 2 0.2681 0.87102 0.008 0.896 0.004 0.024 0.068
#> SRR1415637 2 0.1082 0.89492 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR813137 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.2727 0.64513 0.868 0.000 0.016 0.000 0.116
#> SRR1419692 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR818797 1 0.3818 0.60035 0.812 0.028 0.016 0.000 0.144
#> SRR2164608 3 0.1197 0.89918 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1455586 3 0.4497 0.19700 0.000 0.424 0.568 0.000 0.008
#> SRR819459 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0794 0.89522 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.2681 0.87102 0.008 0.896 0.004 0.024 0.068
#> SRR1385501 1 0.3242 0.46571 0.784 0.000 0.216 0.000 0.000
#> SRR1361652 3 0.5492 0.14538 0.068 0.000 0.536 0.000 0.396
#> SRR1437119 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 3 0.1478 0.88468 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1310584 1 0.4576 0.01560 0.608 0.000 0.016 0.000 0.376
#> SRR1500216 1 0.3929 0.52396 0.764 0.028 0.000 0.000 0.208
#> SRR1486762 3 0.0162 0.92316 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1480854 4 0.1197 0.87736 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1489394 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1418085 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1340221 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1473058 4 0.4216 0.77075 0.008 0.012 0.000 0.720 0.260
#> SRR1405165 3 0.1732 0.87529 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1433004 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1471477 5 0.6810 0.32210 0.348 0.000 0.300 0.000 0.352
#> SRR1098567 2 0.1082 0.89452 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1098712 2 0.5380 0.58782 0.036 0.588 0.016 0.000 0.360
#> SRR1455038 1 0.4145 0.56138 0.772 0.028 0.012 0.000 0.188
#> SRR1375248 3 0.2249 0.83722 0.000 0.096 0.896 0.000 0.008
#> SRR1403005 3 0.0703 0.91267 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.3514 0.86714 0.012 0.840 0.024 0.004 0.120
#> SRR1413541 1 0.1117 0.73221 0.964 0.000 0.016 0.000 0.020
#> SRR1392943 4 0.6651 0.42401 0.004 0.268 0.000 0.484 0.244
#> SRR1475192 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.1082 0.89452 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1452468 3 0.4138 0.39435 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1347060 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.4106 0.65100 0.000 0.724 0.256 0.000 0.020
#> SRR1447962 2 0.1082 0.89452 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1444324 2 0.3282 0.74269 0.000 0.804 0.188 0.000 0.008
#> SRR1415004 1 0.1117 0.73221 0.964 0.000 0.016 0.000 0.020
#> SRR1413436 5 0.4674 0.62997 0.416 0.000 0.016 0.000 0.568
#> SRR1311266 5 0.4674 0.62997 0.416 0.000 0.016 0.000 0.568
#> SRR1343302 4 0.0000 0.88475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.1018 0.73401 0.968 0.000 0.016 0.000 0.016
#> SRR1469413 2 0.1082 0.89452 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1405331 1 0.3388 0.51560 0.792 0.000 0.200 0.000 0.008
#> SRR1345609 1 0.0510 0.73833 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.4278 0.52855 0.000 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR1322840 4 0.0162 0.88453 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1399797 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.1018 0.73401 0.968 0.000 0.016 0.000 0.016
#> SRR1365291 3 0.0510 0.91791 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1367920 4 0.2193 0.86136 0.008 0.000 0.000 0.900 0.092
#> SRR1366648 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.1082 0.89452 0.000 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1082173 3 0.1197 0.89918 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1363968 5 0.4752 0.63396 0.412 0.000 0.020 0.000 0.568
#> SRR814387 1 0.4525 0.07525 0.624 0.000 0.016 0.000 0.360
#> SRR657599 5 0.4903 0.62293 0.400 0.008 0.016 0.000 0.576
#> SRR1386689 4 0.0162 0.88492 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1395575 3 0.0162 0.92316 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1453811 3 0.7184 -0.03256 0.300 0.028 0.448 0.000 0.224
#> SRR1441159 5 0.4674 0.62997 0.416 0.000 0.016 0.000 0.568
#> SRR1403154 4 0.0000 0.88475 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.92445 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.0404 0.91985 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 5 0.4787 0.12973 0.480 0.000 0.012 0.000 0.480 0.028
#> SRR1331708 5 0.3602 0.77079 0.068 0.000 0.044 0.000 0.828 0.060
#> SRR1464258 1 0.4935 0.50633 0.556 0.000 0.012 0.000 0.044 0.388
#> SRR1454201 5 0.2901 0.80676 0.128 0.000 0.032 0.000 0.840 0.000
#> SRR661589 3 0.1858 0.87423 0.000 0.000 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR1456229 1 0.2613 0.71254 0.848 0.000 0.012 0.000 0.000 0.140
#> SRR1315165 4 0.0146 0.85166 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1488960 5 0.4706 0.54170 0.336 0.000 0.020 0.000 0.616 0.028
#> SRR1417809 6 0.7343 0.56017 0.256 0.176 0.000 0.140 0.004 0.424
#> SRR1094457 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.4345 0.62586 0.748 0.000 0.128 0.000 0.012 0.112
#> SRR1315931 1 0.4890 0.51504 0.576 0.000 0.012 0.000 0.044 0.368
#> SRR1430066 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818002 2 0.6746 0.17873 0.000 0.476 0.000 0.296 0.112 0.116
#> SRR1344143 2 0.0000 0.81563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486845 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362866 5 0.3076 0.80124 0.112 0.000 0.044 0.000 0.840 0.004
#> SRR1490740 1 0.1074 0.72918 0.960 0.000 0.012 0.000 0.000 0.028
#> SRR1446627 2 0.0000 0.81563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.3148 0.77256 0.004 0.840 0.000 0.000 0.092 0.064
#> SRR1416248 1 0.4650 -0.10690 0.500 0.000 0.012 0.000 0.468 0.020
#> SRR1383907 4 0.2476 0.81112 0.004 0.000 0.000 0.880 0.024 0.092
#> SRR1311018 1 0.0622 0.72799 0.980 0.000 0.012 0.000 0.000 0.008
#> SRR1375699 2 0.0000 0.81563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.1700 0.87990 0.000 0.000 0.916 0.000 0.004 0.080
#> SRR613550 3 0.2191 0.85779 0.000 0.000 0.876 0.000 0.004 0.120
#> SRR1348402 1 0.4721 -0.11670 0.492 0.000 0.012 0.000 0.472 0.024
#> SRR1345146 3 0.0603 0.89611 0.000 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1324025 3 0.0508 0.89827 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1318879 3 0.0363 0.89629 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR820755 3 0.2747 0.85242 0.004 0.000 0.860 0.000 0.028 0.108
#> SRR1485830 4 0.0146 0.85166 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR599313 1 0.5183 0.44832 0.528 0.000 0.004 0.000 0.080 0.388
#> SRR612263 1 0.2833 0.70974 0.836 0.000 0.012 0.000 0.004 0.148
#> SRR1415398 3 0.1285 0.89038 0.000 0.000 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR1326205 4 0.5578 -0.31384 0.000 0.140 0.000 0.456 0.000 0.404
#> SRR1421327 4 0.3248 0.77463 0.004 0.000 0.000 0.828 0.052 0.116
#> SRR1083311 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.2320 0.81776 0.004 0.000 0.000 0.892 0.024 0.080
#> SRR1079522 3 0.4346 0.77153 0.040 0.000 0.768 0.000 0.080 0.112
#> SRR1452935 3 0.0458 0.89699 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1379495 1 0.0508 0.72777 0.984 0.000 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR1470459 2 0.0603 0.81153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR661361 3 0.3740 0.74292 0.000 0.000 0.740 0.000 0.032 0.228
#> SRR615778 5 0.3056 0.80588 0.140 0.000 0.012 0.000 0.832 0.016
#> SRR1447564 1 0.0964 0.72637 0.968 0.000 0.012 0.000 0.016 0.004
#> SRR1455195 5 0.2833 0.80783 0.148 0.000 0.012 0.000 0.836 0.004
#> SRR655182 1 0.4087 0.66784 0.772 0.000 0.012 0.000 0.096 0.120
#> SRR1335140 2 0.4016 0.71376 0.004 0.768 0.000 0.000 0.108 0.120
#> SRR1433555 3 0.0146 0.89813 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1308650 2 0.2854 0.71004 0.048 0.860 0.000 0.000 0.004 0.088
#> SRR1388354 1 0.1838 0.71033 0.928 0.000 0.012 0.000 0.040 0.020
#> SRR1317446 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0146 0.89813 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1479955 2 0.0717 0.81491 0.000 0.976 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR809853 1 0.2357 0.71591 0.872 0.000 0.012 0.000 0.000 0.116
#> SRR661313 3 0.4727 0.66982 0.132 0.000 0.692 0.000 0.004 0.172
#> SRR1499935 4 0.2094 0.82537 0.004 0.000 0.000 0.908 0.024 0.064
#> SRR1447303 3 0.1082 0.89375 0.000 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1429408 6 0.6030 0.04877 0.004 0.048 0.000 0.436 0.072 0.440
#> SRR1433950 1 0.1275 0.72753 0.956 0.000 0.012 0.000 0.016 0.016
#> SRR1362081 2 0.0603 0.81153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1409854 5 0.6015 0.32665 0.052 0.000 0.348 0.000 0.512 0.088
#> SRR1435229 5 0.3599 0.77591 0.084 0.000 0.076 0.000 0.820 0.020
#> SRR1085996 5 0.3770 0.74821 0.204 0.000 0.012 0.000 0.760 0.024
#> SRR1414229 5 0.3010 0.72089 0.028 0.000 0.132 0.000 0.836 0.004
#> SRR1400974 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0993 0.72872 0.964 0.000 0.012 0.000 0.000 0.024
#> SRR613927 1 0.3018 0.70069 0.816 0.000 0.012 0.000 0.004 0.168
#> SRR1457854 1 0.2071 0.70953 0.916 0.000 0.012 0.000 0.044 0.028
#> SRR1473714 1 0.5043 0.46365 0.544 0.000 0.004 0.000 0.068 0.384
#> SRR813776 3 0.2278 0.85346 0.000 0.000 0.868 0.000 0.004 0.128
#> SRR808196 6 0.7688 0.52251 0.160 0.128 0.000 0.276 0.028 0.408
#> SRR1101085 4 0.2034 0.82729 0.004 0.000 0.000 0.912 0.024 0.060
#> SRR614395 1 0.2872 0.70636 0.832 0.000 0.012 0.000 0.004 0.152
#> SRR1478251 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0603 0.81153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1362310 1 0.0622 0.72799 0.980 0.000 0.012 0.000 0.000 0.008
#> SRR665310 3 0.3608 0.79640 0.068 0.000 0.800 0.000 0.004 0.128
#> SRR1420109 3 0.1610 0.88040 0.000 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1330920 5 0.6724 0.33804 0.300 0.000 0.088 0.000 0.472 0.140
#> SRR1419539 3 0.5177 0.02701 0.000 0.068 0.520 0.000 0.008 0.404
#> SRR1359447 3 0.0363 0.89629 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1347259 6 0.5823 0.45700 0.000 0.332 0.000 0.200 0.000 0.468
#> SRR613915 3 0.2118 0.86675 0.000 0.000 0.888 0.000 0.008 0.104
#> SRR1384395 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821715 3 0.1411 0.88847 0.000 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1478228 1 0.4712 -0.05811 0.512 0.000 0.012 0.000 0.452 0.024
#> SRR1445637 1 0.3720 0.68505 0.816 0.000 0.036 0.000 0.056 0.092
#> SRR608150 5 0.3060 0.80479 0.132 0.000 0.012 0.000 0.836 0.020
#> SRR1096383 1 0.4832 -0.02307 0.516 0.000 0.012 0.000 0.440 0.032
#> SRR1341480 4 0.2265 0.81972 0.004 0.000 0.000 0.896 0.024 0.076
#> SRR1341344 5 0.3231 0.78753 0.180 0.000 0.012 0.000 0.800 0.008
#> SRR1326270 3 0.2632 0.82703 0.000 0.000 0.832 0.000 0.004 0.164
#> SRR1498838 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0146 0.89877 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR808566 4 0.3838 0.73142 0.004 0.000 0.000 0.784 0.096 0.116
#> SRR1430270 4 0.0146 0.85166 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0937 0.89682 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR661267 5 0.6487 0.22783 0.372 0.000 0.160 0.000 0.424 0.044
#> SRR810665 2 0.0000 0.81563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 5 0.3141 0.79982 0.112 0.000 0.048 0.000 0.836 0.004
#> SRR1420067 5 0.2833 0.80783 0.148 0.000 0.012 0.000 0.836 0.004
#> SRR1473632 1 0.1745 0.72699 0.920 0.000 0.012 0.000 0.000 0.068
#> SRR812536 3 0.1082 0.89372 0.000 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1370850 2 0.2866 0.78342 0.004 0.860 0.000 0.000 0.084 0.052
#> SRR1486195 2 0.0603 0.81153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1407671 2 0.4192 0.14804 0.000 0.572 0.000 0.000 0.016 0.412
#> SRR1446375 1 0.5128 0.38347 0.600 0.000 0.312 0.000 0.012 0.076
#> SRR1465230 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614119 1 0.5016 -0.09439 0.488 0.000 0.012 0.000 0.456 0.044
#> SRR1356101 3 0.4284 0.25482 0.000 0.392 0.588 0.000 0.004 0.016
#> SRR1404209 3 0.5721 0.35172 0.324 0.000 0.548 0.000 0.028 0.100
#> SRR1392676 2 0.0000 0.81563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.4844 -0.07360 0.500 0.000 0.012 0.000 0.456 0.032
#> SRR660510 3 0.0790 0.89651 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1445655 4 0.1844 0.83226 0.004 0.000 0.000 0.924 0.024 0.048
#> SRR658953 3 0.4387 0.75864 0.012 0.000 0.744 0.000 0.116 0.128
#> SRR2166459 1 0.4577 0.58903 0.736 0.000 0.028 0.000 0.152 0.084
#> SRR1070713 2 0.4131 0.30588 0.000 0.624 0.000 0.000 0.020 0.356
#> SRR1485312 3 0.0405 0.89833 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1317631 4 0.5598 -0.31609 0.000 0.144 0.000 0.460 0.000 0.396
#> SRR1488610 5 0.2692 0.80734 0.148 0.000 0.012 0.000 0.840 0.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316367 5 0.2946 0.80284 0.160 0.000 0.012 0.000 0.824 0.004
#> SRR1433926 1 0.2312 0.71614 0.876 0.000 0.012 0.000 0.000 0.112
#> SRR1091302 4 0.2022 0.83187 0.008 0.000 0.000 0.916 0.024 0.052
#> SRR818263 5 0.5015 0.57013 0.284 0.000 0.012 0.000 0.628 0.076
#> SRR1404909 4 0.2838 0.79130 0.004 0.000 0.000 0.852 0.028 0.116
#> SRR663076 1 0.2071 0.70582 0.916 0.000 0.012 0.000 0.044 0.028
#> SRR1323577 2 0.2918 0.78213 0.004 0.856 0.000 0.000 0.088 0.052
#> SRR1442422 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.4772 -0.03420 0.516 0.000 0.012 0.000 0.444 0.028
#> SRR654862 5 0.5022 0.69174 0.084 0.000 0.128 0.000 0.716 0.072
#> SRR1407112 4 0.0146 0.85166 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.1285 0.89038 0.000 0.000 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR1353199 3 0.5066 0.55801 0.248 0.000 0.632 0.000 0.004 0.116
#> SRR1378885 3 0.1471 0.88669 0.000 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR665357 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0603 0.81153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1501020 3 0.1349 0.88956 0.000 0.000 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1347819 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.2866 0.78342 0.004 0.860 0.000 0.000 0.084 0.052
#> SRR1472576 4 0.4362 0.70264 0.004 0.016 0.000 0.760 0.100 0.120
#> SRR1431781 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.4352 0.72204 0.084 0.000 0.144 0.000 0.752 0.020
#> SRR1417632 4 0.3121 0.78069 0.004 0.000 0.000 0.836 0.044 0.116
#> SRR1350153 2 0.1194 0.81244 0.004 0.956 0.000 0.000 0.032 0.008
#> SRR1458113 3 0.4209 0.38361 0.000 0.000 0.596 0.000 0.384 0.020
#> SRR1326579 5 0.2833 0.80783 0.148 0.000 0.012 0.000 0.836 0.004
#> SRR1349363 2 0.0000 0.81563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0935 0.89539 0.000 0.000 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR1083752 4 0.7300 -0.09749 0.008 0.344 0.000 0.356 0.084 0.208
#> SRR1377599 4 0.3248 0.77463 0.004 0.000 0.000 0.828 0.052 0.116
#> SRR1488449 3 0.1285 0.89038 0.000 0.000 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR1318354 3 0.4159 0.32913 0.000 0.000 0.588 0.000 0.396 0.016
#> SRR1359062 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.4050 0.77804 0.124 0.000 0.064 0.000 0.784 0.028
#> SRR663783 3 0.0146 0.89813 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1319204 3 0.0363 0.89629 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1369070 2 0.2737 0.78678 0.004 0.868 0.000 0.000 0.084 0.044
#> SRR615659 1 0.2170 0.71907 0.888 0.000 0.012 0.000 0.000 0.100
#> SRR1337449 2 0.0603 0.81153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1316982 3 0.1232 0.87189 0.000 0.024 0.956 0.000 0.004 0.016
#> SRR1498595 4 0.3845 0.73839 0.008 0.000 0.000 0.788 0.084 0.120
#> SRR1377423 3 0.4206 0.69247 0.176 0.000 0.732 0.000 0.000 0.092
#> SRR1312310 2 0.0603 0.81153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1485613 1 0.4784 -0.09454 0.496 0.000 0.012 0.000 0.464 0.028
#> SRR1338426 3 0.0260 0.89719 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1353309 3 0.0146 0.89813 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR658941 5 0.2668 0.67362 0.000 0.000 0.168 0.000 0.828 0.004
#> SRR1101643 1 0.4900 0.51260 0.572 0.000 0.012 0.000 0.044 0.372
#> SRR1401468 5 0.4216 0.64162 0.292 0.000 0.012 0.000 0.676 0.020
#> SRR1368874 2 0.0603 0.81153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1324085 4 0.2094 0.82563 0.004 0.000 0.000 0.908 0.024 0.064
#> SRR1363858 1 0.5176 0.44906 0.532 0.000 0.004 0.000 0.080 0.384
#> SRR819820 3 0.2106 0.86189 0.000 0.000 0.904 0.000 0.064 0.032
#> SRR1337342 5 0.3112 0.79630 0.104 0.000 0.052 0.000 0.840 0.004
#> SRR655206 6 0.5944 0.32562 0.000 0.184 0.392 0.000 0.004 0.420
#> SRR1387013 2 0.4016 0.71376 0.004 0.768 0.000 0.000 0.108 0.120
#> SRR1317410 1 0.4546 0.14916 0.580 0.000 0.012 0.000 0.388 0.020
#> SRR608198 5 0.2833 0.80783 0.148 0.000 0.012 0.000 0.836 0.004
#> SRR1440161 2 0.4265 0.18626 0.000 0.596 0.384 0.000 0.004 0.016
#> SRR1343741 2 0.2737 0.78678 0.004 0.868 0.000 0.000 0.084 0.044
#> SRR1381288 2 0.0000 0.81563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.4658 0.04625 0.000 0.048 0.000 0.568 0.000 0.384
#> SRR1099622 2 0.2011 0.80965 0.004 0.912 0.000 0.000 0.064 0.020
#> SRR663197 3 0.2402 0.85648 0.000 0.000 0.868 0.000 0.012 0.120
#> SRR1394836 6 0.5946 0.22428 0.000 0.400 0.184 0.000 0.004 0.412
#> SRR661699 3 0.0146 0.89812 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR813680 3 0.5014 0.53083 0.264 0.000 0.640 0.000 0.012 0.084
#> SRR1410678 1 0.0820 0.72569 0.972 0.000 0.012 0.000 0.000 0.016
#> SRR1378109 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.2357 0.71591 0.872 0.000 0.012 0.000 0.000 0.116
#> SRR1311486 2 0.0000 0.81563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.5571 0.03933 0.008 0.456 0.000 0.012 0.072 0.452
#> SRR1433410 5 0.2833 0.80783 0.148 0.000 0.012 0.000 0.836 0.004
#> SRR661167 3 0.0937 0.89465 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1432518 3 0.0363 0.89784 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR660462 3 0.0146 0.89877 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1374608 6 0.7716 0.56533 0.040 0.160 0.000 0.120 0.244 0.436
#> SRR657949 3 0.1471 0.88676 0.000 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1308882 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655768 1 0.1625 0.72680 0.928 0.000 0.012 0.000 0.000 0.060
#> SRR1485870 2 0.4727 -0.03729 0.000 0.504 0.000 0.020 0.016 0.460
#> SRR1444138 1 0.5428 0.52784 0.680 0.000 0.136 0.000 0.092 0.092
#> SRR1417342 1 0.1074 0.72713 0.960 0.000 0.012 0.000 0.000 0.028
#> SRR1470193 2 0.4304 0.07780 0.000 0.536 0.008 0.000 0.008 0.448
#> SRR1091380 3 0.1745 0.86650 0.000 0.000 0.924 0.000 0.056 0.020
#> SRR1099096 1 0.4647 -0.07831 0.508 0.000 0.012 0.000 0.460 0.020
#> SRR1313583 4 0.4267 0.54436 0.116 0.000 0.000 0.732 0.000 0.152
#> SRR1467102 3 0.2633 0.77959 0.000 0.112 0.864 0.000 0.004 0.020
#> SRR1485416 4 0.2622 0.80305 0.004 0.000 0.000 0.868 0.024 0.104
#> SRR818821 3 0.0458 0.89699 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR809963 1 0.2872 0.70636 0.832 0.000 0.012 0.000 0.004 0.152
#> SRR1072247 1 0.0820 0.72569 0.972 0.000 0.012 0.000 0.000 0.016
#> SRR1353710 6 0.5931 0.35460 0.004 0.124 0.000 0.360 0.016 0.496
#> SRR1445259 3 0.4423 0.25051 0.000 0.000 0.552 0.000 0.420 0.028
#> SRR1408393 3 0.1349 0.88956 0.000 0.000 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1361522 1 0.2266 0.71702 0.880 0.000 0.012 0.000 0.000 0.108
#> SRR1368597 1 0.3147 0.71740 0.844 0.000 0.012 0.000 0.044 0.100
#> SRR1309680 2 0.2737 0.78734 0.004 0.868 0.000 0.000 0.084 0.044
#> SRR1310542 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406437 6 0.7351 0.49182 0.064 0.212 0.028 0.000 0.260 0.436
#> SRR1354931 3 0.1219 0.89145 0.000 0.000 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR1391856 2 0.4828 -0.01920 0.000 0.500 0.004 0.000 0.044 0.452
#> SRR1446738 2 0.4262 0.03400 0.000 0.508 0.000 0.000 0.016 0.476
#> SRR1309032 2 0.0603 0.81153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1388145 2 0.1296 0.81165 0.004 0.948 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1432611 2 0.0603 0.81153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR815869 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.1082 0.89372 0.000 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1375329 3 0.3998 0.48127 0.000 0.000 0.644 0.000 0.340 0.016
#> SRR1387921 1 0.0725 0.72590 0.976 0.000 0.012 0.000 0.000 0.012
#> SRR1466792 2 0.0603 0.81153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1360478 2 0.0508 0.81537 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1360695 1 0.2715 0.67320 0.872 0.000 0.012 0.000 0.088 0.028
#> SRR812943 1 0.2402 0.71561 0.868 0.000 0.012 0.000 0.000 0.120
#> SRR1400910 3 0.3998 0.48636 0.000 0.000 0.644 0.000 0.340 0.016
#> SRR1444203 4 0.0146 0.85166 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR816177 2 0.4016 0.71376 0.004 0.768 0.000 0.000 0.108 0.120
#> SRR658754 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 6 0.5406 0.32834 0.000 0.120 0.000 0.380 0.000 0.500
#> SRR1397366 3 0.2420 0.85055 0.004 0.000 0.864 0.000 0.004 0.128
#> SRR1446028 1 0.1251 0.72463 0.956 0.000 0.012 0.000 0.024 0.008
#> SRR1083918 2 0.3148 0.77228 0.004 0.840 0.000 0.000 0.092 0.064
#> SRR1337606 5 0.3305 0.74322 0.040 0.000 0.104 0.000 0.836 0.020
#> SRR659109 3 0.0146 0.89877 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1337192 5 0.2833 0.80783 0.148 0.000 0.012 0.000 0.836 0.004
#> SRR656946 1 0.1802 0.72677 0.916 0.000 0.012 0.000 0.000 0.072
#> SRR1476102 5 0.2692 0.80734 0.148 0.000 0.012 0.000 0.840 0.000
#> SRR1476447 1 0.4408 -0.07557 0.512 0.000 0.012 0.000 0.468 0.008
#> SRR1342067 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.4586 0.09564 0.560 0.000 0.012 0.000 0.408 0.020
#> SRR614419 5 0.3230 0.75617 0.212 0.000 0.012 0.000 0.776 0.000
#> SRR1322936 5 0.3060 0.80479 0.132 0.000 0.012 0.000 0.836 0.020
#> SRR1349121 1 0.4784 -0.09454 0.496 0.000 0.012 0.000 0.464 0.028
#> SRR1430549 1 0.1296 0.72273 0.952 0.000 0.012 0.000 0.032 0.004
#> SRR612935 3 0.0547 0.89766 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR661481 2 0.3098 0.77464 0.004 0.844 0.000 0.000 0.088 0.064
#> SRR1354117 2 0.4591 0.05853 0.000 0.516 0.452 0.000 0.004 0.028
#> SRR1393596 6 0.5299 0.17479 0.000 0.440 0.000 0.068 0.012 0.480
#> SRR1452164 1 0.1225 0.72883 0.952 0.000 0.012 0.000 0.000 0.036
#> SRR1070503 5 0.5105 0.05542 0.000 0.000 0.432 0.000 0.488 0.080
#> SRR1499894 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082883 5 0.2975 0.80519 0.132 0.000 0.012 0.000 0.840 0.016
#> SRR1468271 5 0.4713 0.39286 0.400 0.000 0.012 0.000 0.560 0.028
#> SRR1332443 1 0.4653 -0.13287 0.492 0.000 0.012 0.000 0.476 0.020
#> SRR810295 2 0.0603 0.81153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR662103 1 0.2758 0.71151 0.860 0.000 0.012 0.000 0.016 0.112
#> SRR1328620 3 0.2932 0.76753 0.000 0.000 0.820 0.000 0.164 0.016
#> SRR1396294 6 0.8236 0.53374 0.068 0.180 0.188 0.120 0.012 0.432
#> SRR1419917 1 0.2357 0.71591 0.872 0.000 0.012 0.000 0.000 0.116
#> SRR662114 3 0.2019 0.87563 0.000 0.000 0.900 0.000 0.012 0.088
#> SRR1489199 5 0.6417 0.52575 0.148 0.000 0.216 0.000 0.552 0.084
#> SRR813584 2 0.4057 0.70956 0.004 0.764 0.000 0.000 0.108 0.124
#> SRR1069638 3 0.4141 0.76186 0.008 0.000 0.760 0.000 0.140 0.092
#> SRR614864 5 0.3012 0.62932 0.000 0.000 0.196 0.000 0.796 0.008
#> SRR1433392 1 0.4348 0.63895 0.732 0.000 0.104 0.000 0.004 0.160
#> SRR1377777 2 0.2866 0.78342 0.004 0.860 0.000 0.000 0.084 0.052
#> SRR2167710 1 0.2724 0.70011 0.864 0.000 0.052 0.000 0.000 0.084
#> SRR1401252 4 0.2456 0.81786 0.008 0.000 0.000 0.888 0.028 0.076
#> SRR1309963 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0622 0.72829 0.980 0.000 0.012 0.000 0.000 0.008
#> SRR1418628 2 0.0862 0.81460 0.004 0.972 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR1486889 3 0.1700 0.88397 0.000 0.000 0.916 0.000 0.004 0.080
#> SRR1380393 1 0.0909 0.72485 0.968 0.000 0.012 0.000 0.000 0.020
#> SRR1319731 1 0.3777 0.52401 0.752 0.000 0.012 0.000 0.216 0.020
#> SRR1356468 6 0.7968 0.56892 0.048 0.156 0.000 0.176 0.200 0.420
#> SRR1337010 2 0.0603 0.81153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1486520 5 0.3093 0.80000 0.164 0.000 0.012 0.000 0.816 0.008
#> SRR1486538 4 0.0146 0.85166 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.4156 0.70971 0.004 0.764 0.000 0.004 0.108 0.120
#> SRR1465459 3 0.2278 0.85281 0.000 0.000 0.868 0.000 0.004 0.128
#> SRR1080270 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093148 5 0.3270 0.68129 0.000 0.000 0.120 0.000 0.820 0.060
#> SRR1467080 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.3148 0.77228 0.004 0.840 0.000 0.000 0.092 0.064
#> SRR816475 4 0.1844 0.83226 0.004 0.000 0.000 0.924 0.024 0.048
#> SRR1379198 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613342 3 0.2584 0.84607 0.004 0.000 0.848 0.000 0.004 0.144
#> SRR1452246 2 0.2918 0.78213 0.004 0.856 0.000 0.000 0.088 0.052
#> SRR1338836 2 0.2265 0.79721 0.004 0.896 0.000 0.000 0.076 0.024
#> SRR1369129 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.1349 0.88956 0.000 0.000 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR813824 3 0.4265 0.64267 0.000 0.000 0.660 0.000 0.040 0.300
#> SRR1082376 1 0.3056 0.71317 0.832 0.000 0.012 0.000 0.016 0.140
#> SRR1500891 4 0.1972 0.82909 0.004 0.000 0.000 0.916 0.024 0.056
#> SRR807543 1 0.6005 0.12458 0.428 0.000 0.400 0.000 0.012 0.160
#> SRR1091572 1 0.2872 0.70636 0.832 0.000 0.012 0.000 0.004 0.152
#> SRR1346689 4 0.3975 0.15466 0.004 0.000 0.000 0.544 0.000 0.452
#> SRR1332424 5 0.2833 0.80783 0.148 0.000 0.012 0.000 0.836 0.004
#> SRR663729 6 0.5788 0.34320 0.000 0.128 0.000 0.384 0.012 0.476
#> SRR1097013 1 0.4462 0.59239 0.744 0.000 0.028 0.000 0.156 0.072
#> SRR613675 5 0.2905 0.80734 0.144 0.000 0.012 0.000 0.836 0.008
#> SRR1485357 4 0.0146 0.85166 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR655816 3 0.0632 0.89754 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1500113 1 0.4781 -0.06699 0.504 0.000 0.012 0.000 0.456 0.028
#> SRR1437622 4 0.6624 0.28337 0.004 0.236 0.000 0.536 0.104 0.120
#> SRR1355172 3 0.4337 0.66718 0.200 0.000 0.724 0.000 0.008 0.068
#> SRR655531 5 0.2692 0.80734 0.148 0.000 0.012 0.000 0.840 0.000
#> SRR1338147 3 0.0777 0.89673 0.000 0.000 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1413329 3 0.5188 0.27702 0.024 0.000 0.556 0.000 0.372 0.048
#> SRR1485931 2 0.0000 0.81563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 5 0.4719 0.19313 0.464 0.000 0.012 0.000 0.500 0.024
#> SRR1333308 6 0.6492 0.44861 0.036 0.164 0.000 0.340 0.004 0.456
#> SRR1452033 1 0.1448 0.72016 0.948 0.000 0.012 0.000 0.016 0.024
#> SRR1467316 2 0.0000 0.81563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.1036 0.81354 0.004 0.964 0.000 0.000 0.024 0.008
#> SRR663440 3 0.1918 0.87526 0.000 0.000 0.904 0.000 0.008 0.088
#> SRR1471755 2 0.3148 0.77228 0.004 0.840 0.000 0.000 0.092 0.064
#> SRR808019 5 0.3757 0.78995 0.104 0.000 0.064 0.000 0.808 0.024
#> SRR1479133 3 0.4634 0.48344 0.000 0.000 0.556 0.000 0.044 0.400
#> SRR615069 3 0.4573 0.41805 0.000 0.000 0.584 0.000 0.372 0.044
#> SRR1456185 2 0.0146 0.81492 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1350069 6 0.7465 0.55844 0.184 0.168 0.000 0.232 0.004 0.412
#> SRR816316 1 0.4851 0.51502 0.572 0.000 0.012 0.000 0.040 0.376
#> SRR664795 3 0.5710 0.17088 0.384 0.000 0.500 0.000 0.024 0.092
#> SRR1490721 6 0.6112 0.47215 0.000 0.204 0.000 0.012 0.312 0.472
#> SRR810643 5 0.4178 0.65371 0.284 0.000 0.012 0.000 0.684 0.020
#> SRR1430333 5 0.3653 0.49157 0.000 0.000 0.300 0.000 0.692 0.008
#> SRR1085285 3 0.1644 0.88203 0.000 0.000 0.920 0.000 0.004 0.076
#> SRR1099072 3 0.2053 0.86541 0.000 0.000 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR1317985 1 0.0820 0.72885 0.972 0.000 0.012 0.000 0.000 0.016
#> SRR1487340 1 0.1452 0.71985 0.948 0.000 0.012 0.000 0.020 0.020
#> SRR1420276 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0260 0.89861 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1405525 5 0.3087 0.79200 0.176 0.000 0.012 0.000 0.808 0.004
#> SRR1370329 1 0.4763 0.52750 0.604 0.000 0.012 0.000 0.040 0.344
#> SRR1465001 1 0.4651 0.18336 0.588 0.000 0.012 0.000 0.372 0.028
#> SRR1476525 2 0.3098 0.77464 0.004 0.844 0.000 0.000 0.088 0.064
#> SRR819610 2 0.2344 0.79685 0.004 0.892 0.000 0.000 0.076 0.028
#> SRR2157314 1 0.1700 0.71535 0.936 0.000 0.012 0.000 0.028 0.024
#> SRR1409465 2 0.1909 0.80399 0.004 0.920 0.000 0.000 0.052 0.024
#> SRR809987 6 0.6311 0.39320 0.360 0.016 0.000 0.216 0.000 0.408
#> SRR613639 1 0.3436 0.69594 0.796 0.000 0.012 0.000 0.020 0.172
#> SRR1402285 4 0.0146 0.85166 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.4962 0.55784 0.664 0.000 0.180 0.000 0.004 0.152
#> SRR1405660 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.4726 0.64121 0.740 0.000 0.084 0.000 0.056 0.120
#> SRR1394734 2 0.5951 0.49795 0.000 0.628 0.000 0.144 0.112 0.116
#> SRR1317771 1 0.6196 -0.08237 0.444 0.000 0.064 0.000 0.408 0.084
#> SRR1365894 2 0.4722 -0.00489 0.000 0.512 0.000 0.016 0.020 0.452
#> SRR1073581 1 0.5910 -0.18279 0.436 0.000 0.096 0.000 0.436 0.032
#> SRR659804 1 0.1364 0.72121 0.952 0.000 0.012 0.000 0.016 0.020
#> SRR1345914 2 0.0000 0.81563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.3098 0.77464 0.004 0.844 0.000 0.000 0.088 0.064
#> SRR1473529 4 0.7333 -0.11404 0.008 0.340 0.000 0.348 0.084 0.220
#> SRR660764 3 0.1765 0.87913 0.000 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR820448 1 0.4909 0.51155 0.568 0.000 0.012 0.000 0.044 0.376
#> SRR1328845 6 0.7440 0.52847 0.244 0.124 0.000 0.208 0.008 0.416
#> SRR1336415 4 0.0146 0.85166 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459190 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346773 5 0.3093 0.79700 0.164 0.000 0.012 0.000 0.816 0.008
#> SRR1499521 5 0.3936 0.72653 0.228 0.000 0.012 0.000 0.736 0.024
#> SRR1440898 2 0.0508 0.81537 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1347459 3 0.0632 0.89780 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1081209 2 0.0000 0.81563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.1275 0.72177 0.956 0.000 0.012 0.000 0.016 0.016
#> SRR1333395 2 0.4837 -0.03509 0.056 0.512 0.000 0.000 0.000 0.432
#> SRR1309248 2 0.4927 -0.08025 0.000 0.484 0.000 0.032 0.016 0.468
#> SRR809161 3 0.2191 0.85779 0.000 0.000 0.876 0.000 0.004 0.120
#> SRR1316320 2 0.4597 0.10664 0.000 0.548 0.000 0.000 0.040 0.412
#> SRR1432629 2 0.4114 0.71177 0.004 0.768 0.000 0.004 0.108 0.116
#> SRR1498931 1 0.0363 0.72743 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.2632 0.68381 0.004 0.000 0.000 0.832 0.000 0.164
#> SRR1405547 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380764 5 0.2833 0.80783 0.148 0.000 0.012 0.000 0.836 0.004
#> SRR1309160 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.6723 -0.07255 0.364 0.000 0.340 0.000 0.260 0.036
#> SRR1078489 3 0.0458 0.89699 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1332648 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660614 3 0.0363 0.89629 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1470420 2 0.0603 0.81153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1475566 1 0.0508 0.72710 0.984 0.000 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR1477949 1 0.2202 0.70263 0.908 0.000 0.012 0.000 0.052 0.028
#> SRR1481419 2 0.0862 0.81460 0.004 0.972 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR1464766 1 0.4935 0.24217 0.592 0.000 0.012 0.000 0.344 0.052
#> SRR615946 3 0.3030 0.81470 0.008 0.000 0.816 0.000 0.008 0.168
#> SRR1446481 2 0.2600 0.79027 0.004 0.876 0.000 0.000 0.084 0.036
#> SRR1467656 2 0.0748 0.81239 0.004 0.976 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1402962 5 0.3063 0.78697 0.092 0.000 0.068 0.000 0.840 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.81563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.2933 0.71664 0.844 0.000 0.012 0.000 0.016 0.128
#> SRR1347166 5 0.2794 0.80808 0.144 0.000 0.012 0.000 0.840 0.004
#> SRR1485722 5 0.2973 0.80836 0.136 0.000 0.024 0.000 0.836 0.004
#> SRR1415316 1 0.4530 0.14433 0.552 0.000 0.012 0.000 0.420 0.016
#> SRR613390 1 0.3004 0.71269 0.832 0.000 0.012 0.000 0.012 0.144
#> SRR661108 3 0.1588 0.88466 0.000 0.000 0.924 0.000 0.004 0.072
#> SRR2170173 1 0.4464 0.61386 0.736 0.000 0.136 0.000 0.012 0.116
#> SRR817329 1 0.5692 0.34301 0.512 0.000 0.344 0.000 0.008 0.136
#> SRR1401990 4 0.5423 -0.24606 0.000 0.120 0.000 0.488 0.000 0.392
#> SRR1467745 4 0.3368 0.76666 0.004 0.000 0.000 0.820 0.060 0.116
#> SRR1471795 2 0.3098 0.77464 0.004 0.844 0.000 0.000 0.088 0.064
#> SRR1415637 2 0.0508 0.81537 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR813137 1 0.2755 0.70978 0.844 0.000 0.012 0.000 0.004 0.140
#> SRR1314873 1 0.2357 0.71591 0.872 0.000 0.012 0.000 0.000 0.116
#> SRR1401211 1 0.2912 0.66096 0.856 0.000 0.012 0.000 0.104 0.028
#> SRR1419692 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818797 1 0.5280 0.46679 0.496 0.000 0.016 0.000 0.060 0.428
#> SRR2164608 3 0.2066 0.87044 0.000 0.000 0.908 0.000 0.052 0.040
#> SRR1455586 3 0.4134 0.38038 0.000 0.340 0.640 0.000 0.004 0.016
#> SRR819459 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.81563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.3098 0.77464 0.004 0.844 0.000 0.000 0.088 0.064
#> SRR1385501 1 0.4572 0.60702 0.708 0.000 0.116 0.000 0.004 0.172
#> SRR1361652 5 0.4913 0.44910 0.040 0.000 0.340 0.000 0.600 0.020
#> SRR1437119 1 0.0622 0.72799 0.980 0.000 0.012 0.000 0.000 0.008
#> SRR1478547 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 3 0.2266 0.82295 0.000 0.000 0.880 0.000 0.108 0.012
#> SRR1310584 1 0.4631 -0.01014 0.528 0.000 0.012 0.000 0.440 0.020
#> SRR1500216 1 0.5183 0.44832 0.528 0.000 0.004 0.000 0.080 0.388
#> SRR1486762 3 0.0790 0.89696 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1480854 4 0.2344 0.81822 0.004 0.000 0.000 0.892 0.028 0.076
#> SRR1489394 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0146 0.85166 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1473058 4 0.5786 0.21525 0.008 0.020 0.000 0.508 0.084 0.380
#> SRR1405165 3 0.2793 0.73647 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1433004 1 0.2357 0.71684 0.872 0.000 0.012 0.000 0.000 0.116
#> SRR1471477 5 0.6551 0.30656 0.312 0.000 0.228 0.000 0.428 0.032
#> SRR1098567 2 0.0603 0.81153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1098712 6 0.6686 0.37937 0.080 0.348 0.000 0.000 0.132 0.440
#> SRR1455038 1 0.5179 0.49609 0.544 0.000 0.012 0.000 0.064 0.380
#> SRR1375248 3 0.2963 0.73285 0.000 0.152 0.828 0.000 0.004 0.016
#> SRR1403005 3 0.1531 0.88553 0.000 0.000 0.928 0.000 0.004 0.068
#> SRR1348378 2 0.4329 0.62016 0.004 0.700 0.000 0.000 0.056 0.240
#> SRR1413541 1 0.2933 0.71664 0.844 0.000 0.012 0.000 0.016 0.128
#> SRR1392943 6 0.6195 0.44366 0.000 0.168 0.000 0.336 0.024 0.472
#> SRR1475192 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0603 0.81153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1452468 5 0.4593 -0.04131 0.000 0.000 0.472 0.000 0.492 0.036
#> SRR1347060 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.4559 0.27101 0.000 0.628 0.324 0.000 0.004 0.044
#> SRR1447962 2 0.0603 0.81153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1444324 2 0.3915 0.36290 0.000 0.692 0.288 0.000 0.004 0.016
#> SRR1415004 1 0.1364 0.72077 0.952 0.000 0.012 0.000 0.016 0.020
#> SRR1413436 5 0.2833 0.80783 0.148 0.000 0.012 0.000 0.836 0.004
#> SRR1311266 5 0.2692 0.80734 0.148 0.000 0.012 0.000 0.840 0.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0622 0.72799 0.980 0.000 0.012 0.000 0.000 0.008
#> SRR1429678 1 0.1078 0.72401 0.964 0.000 0.012 0.000 0.016 0.008
#> SRR1469413 2 0.0603 0.81153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1405331 1 0.5699 0.41716 0.548 0.000 0.280 0.000 0.008 0.164
#> SRR1345609 1 0.0508 0.72710 0.984 0.000 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR1380208 6 0.5971 0.40770 0.000 0.304 0.000 0.000 0.252 0.444
#> SRR1322840 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0146 0.89813 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1315081 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.1275 0.72177 0.956 0.000 0.012 0.000 0.016 0.016
#> SRR1365291 3 0.1285 0.89038 0.000 0.000 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR1367920 4 0.3248 0.77463 0.004 0.000 0.000 0.828 0.052 0.116
#> SRR1366648 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0603 0.81153 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1082173 3 0.2066 0.87044 0.000 0.000 0.908 0.000 0.052 0.040
#> SRR1363968 5 0.3958 0.73398 0.220 0.000 0.012 0.000 0.740 0.028
#> SRR814387 1 0.4579 0.10466 0.564 0.000 0.012 0.000 0.404 0.020
#> SRR657599 5 0.3056 0.79913 0.140 0.000 0.012 0.000 0.832 0.016
#> SRR1386689 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.1219 0.89154 0.000 0.000 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR1453811 6 0.6732 -0.13228 0.120 0.000 0.368 0.000 0.092 0.420
#> SRR1441159 5 0.2833 0.80783 0.148 0.000 0.012 0.000 0.836 0.004
#> SRR1403154 4 0.0000 0.85236 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.89865 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.1398 0.89028 0.000 0.000 0.940 0.000 0.008 0.052
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.990 0.992 0.4725 0.528 0.528
#> 3 3 0.898 0.909 0.962 0.4103 0.720 0.510
#> 4 4 0.933 0.916 0.966 0.1047 0.869 0.640
#> 5 5 0.904 0.847 0.935 0.0769 0.914 0.690
#> 6 6 0.868 0.832 0.915 0.0421 0.910 0.615
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
#> attr(,"optional")
#> [1] 2 4
There is also optional best \(k\) = 2 4 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1331708 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1464258 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1454201 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR661589 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1315165 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1417809 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1094457 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1095575 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1315931 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1430066 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1431037 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1395554 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR818002 2 0.0376 0.991 0.004 0.996
#> SRR1344143 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1486845 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1446627 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1456138 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1416248 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1383907 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1311018 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1375699 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1429846 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR613550 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1345146 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1324025 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1318879 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR820755 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1485830 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR599313 2 0.1184 0.979 0.016 0.984
#> SRR612263 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1415398 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1326205 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1421327 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1083311 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1499303 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1079522 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1452935 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1379495 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1470459 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR661361 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1447564 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1455195 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR655182 1 0.0376 0.993 0.996 0.004
#> SRR1335140 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1433555 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1388354 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1317446 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1413602 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR809853 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR661313 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1499935 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1447303 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1429408 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1433950 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1362081 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1409854 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1435229 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1414229 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1400974 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR613927 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1457854 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1473714 2 0.1633 0.971 0.024 0.976
#> SRR813776 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR808196 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1101085 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR614395 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1478251 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1370551 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1362310 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR665310 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1420109 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1330920 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1419539 2 0.2043 0.975 0.032 0.968
#> SRR1359447 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1347259 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR613915 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1384395 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR821715 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1445637 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR608150 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1096383 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1341480 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1341344 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1326270 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1498838 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1416313 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR808566 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1430270 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1367825 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR613533 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR661267 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR810665 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1407250 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1420067 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1473632 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR812536 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1486195 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1407671 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR1446375 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1465230 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1356101 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1404209 1 0.0376 0.993 0.996 0.004
#> SRR1392676 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR665538 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR660510 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1445655 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR658953 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.0672 0.993 0.992 0.008
#> SRR1070713 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1485312 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1317631 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1488610 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1330588 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1433926 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1091302 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR818263 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1404909 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR663076 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1323577 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1442422 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1465893 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR654862 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1407112 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1332969 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1353199 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1378885 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR665357 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1501020 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1347819 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1472576 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1431781 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1452270 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1417632 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1350153 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1458113 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1326579 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1349363 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1096712 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1090407 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1377599 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1488449 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1318354 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1359062 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1398924 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR663783 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1319204 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1369070 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR615659 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1337449 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1316982 1 0.6531 0.794 0.832 0.168
#> SRR1498595 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1377423 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1485613 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1338426 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1353309 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR658941 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1101643 1 0.3114 0.952 0.944 0.056
#> SRR1401468 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1368874 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1324085 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1363858 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR819820 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1337342 1 0.0376 0.993 0.996 0.004
#> SRR655206 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1387013 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1317410 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR608198 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1440161 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1343741 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1381288 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1415379 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1099622 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR663197 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1394836 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR661699 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR813680 1 0.0672 0.993 0.992 0.008
#> SRR1410678 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1378109 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1499174 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1311486 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1382851 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1433410 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR661167 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1432518 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR660462 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1374608 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR657949 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1308882 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR655768 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1485870 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1444138 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1470193 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1091380 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1313583 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1467102 2 0.5519 0.866 0.128 0.872
#> SRR1485416 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR818821 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR809963 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1072247 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1353710 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1445259 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1408393 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1368597 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1309680 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1310542 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1333485 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1406437 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1354931 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1391856 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1446738 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1309032 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1388145 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1432611 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR815869 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR613150 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1375329 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1387921 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1466792 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1360478 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1360695 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR812943 1 0.0672 0.993 0.992 0.008
#> SRR1400910 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1444203 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR816177 2 0.0376 0.991 0.004 0.996
#> SRR658754 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1429603 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1397366 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1083918 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1337606 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR659109 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR656946 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1476102 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1476447 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1342067 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1385389 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1075971 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR614419 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1322936 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1349121 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1430549 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR612935 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR661481 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1354117 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1393596 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1452164 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1070503 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1499894 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1082883 1 0.1184 0.991 0.984 0.016
#> SRR1468271 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1332443 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR810295 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR662103 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1328620 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1396294 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1419917 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR662114 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1489199 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR813584 2 0.0376 0.991 0.004 0.996
#> SRR1069638 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR614864 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1377777 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR2167710 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1401252 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1309963 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1418628 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1486889 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1319731 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1356468 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1337010 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1486520 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1486538 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1340486 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1377696 2 0.0376 0.991 0.004 0.996
#> SRR1465459 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1080270 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1312501 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1093148 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1467080 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR816475 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1379198 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR613342 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1338836 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1369129 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1396616 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR813824 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1500891 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR807543 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1346689 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1332424 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR663729 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1097013 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR613675 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1485357 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR655816 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1437622 2 0.0376 0.991 0.004 0.996
#> SRR1355172 1 0.0672 0.993 0.992 0.008
#> SRR655531 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1338147 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1413329 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1485931 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1420873 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1333308 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1452033 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1467316 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR809018 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR663440 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.0376 0.991 0.004 0.996
#> SRR808019 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1479133 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR615069 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1456185 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1350069 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR816316 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR664795 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1490721 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR810643 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1430333 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1085285 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1099072 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1487340 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1420276 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1351347 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1370329 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1465001 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1476525 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR819610 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR2157314 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1409465 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR809987 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR613639 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1402285 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1077038 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1405660 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1394734 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1317771 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1365894 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1073581 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR659804 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1345914 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1432186 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1473529 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR660764 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR820448 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1328845 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1336415 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1379065 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1459190 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1346773 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1499521 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1440898 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1347459 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1400202 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1333395 2 0.0672 0.990 0.008 0.992
#> SRR1309248 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR809161 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1316320 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1432629 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1498931 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1416578 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1405547 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1470534 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1309160 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR663489 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1078489 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1332648 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR660614 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1475566 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1477949 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1481419 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1464766 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR615946 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1467656 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1402962 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR660224 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR665586 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1347166 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1485722 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1415316 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR613390 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR661108 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR817329 1 0.0376 0.993 0.996 0.004
#> SRR1401990 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1467745 2 0.0376 0.991 0.004 0.996
#> SRR1471795 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1415637 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR813137 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1314873 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1401211 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1419692 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR818797 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR2164608 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1455586 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR819459 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1433232 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1385501 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1361652 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1437119 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1478547 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1430910 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1310584 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1500216 2 0.3114 0.938 0.056 0.944
#> SRR1486762 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1480854 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1489394 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1418085 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1340221 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1473058 2 0.0376 0.991 0.004 0.996
#> SRR1405165 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1471477 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1098567 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1098712 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1455038 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1375248 2 0.9358 0.478 0.352 0.648
#> SRR1403005 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1413541 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1392943 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1475192 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1452468 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1347060 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.6531 0.813 0.168 0.832
#> SRR1447962 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1444324 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1415004 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1413436 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1311266 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1343302 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1373746 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1429678 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1469413 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1405331 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1380208 2 0.0376 0.991 0.004 0.996
#> SRR1322840 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1399797 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1416654 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1315081 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1369196 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1365291 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1367920 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1366648 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0938 0.990 0.012 0.988
#> SRR1082173 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1363968 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR814387 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR657599 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1386689 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1395575 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1453811 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1441159 1 0.0938 0.993 0.988 0.012
#> SRR1403154 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1468722 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1310275 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331708 1 0.3340 0.853 0.880 0.000 0.120
#> SRR1464258 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.0424 0.959 0.992 0.000 0.008
#> SRR661589 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315165 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094457 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.5678 0.524 0.684 0.000 0.316
#> SRR1315931 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.0592 0.960 0.000 0.988 0.012
#> SRR1486845 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362866 1 0.2959 0.875 0.900 0.000 0.100
#> SRR1490740 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 3 0.6192 0.286 0.000 0.420 0.580
#> SRR1456138 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0747 0.957 0.000 0.984 0.016
#> SRR1429846 3 0.4555 0.723 0.200 0.000 0.800
#> SRR613550 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324025 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318879 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR820755 1 0.4750 0.725 0.784 0.000 0.216
#> SRR1485830 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR599313 1 0.6154 0.303 0.592 0.408 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326205 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421327 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499303 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079522 3 0.3482 0.836 0.128 0.000 0.872
#> SRR1452935 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 3 0.1163 0.925 0.000 0.028 0.972
#> SRR661361 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR615778 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308650 3 0.6126 0.343 0.000 0.400 0.600
#> SRR1388354 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1479955 2 0.0747 0.957 0.000 0.984 0.016
#> SRR809853 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.1753 0.912 0.048 0.000 0.952
#> SRR1499935 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429408 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433950 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 3 0.3116 0.852 0.000 0.108 0.892
#> SRR1409854 1 0.0237 0.961 0.996 0.000 0.004
#> SRR1435229 1 0.1411 0.935 0.964 0.000 0.036
#> SRR1085996 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 3 0.3941 0.804 0.156 0.000 0.844
#> SRR1400974 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR613927 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.6126 0.325 0.600 0.400 0.000
#> SRR813776 3 0.5948 0.411 0.360 0.000 0.640
#> SRR808196 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101085 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR614395 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478251 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370551 3 0.6126 0.343 0.000 0.400 0.600
#> SRR1362310 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.1031 0.930 0.024 0.000 0.976
#> SRR1420109 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1330920 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419539 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1359447 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347259 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR613915 3 0.4555 0.723 0.200 0.000 0.800
#> SRR1384395 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR821715 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1478228 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341480 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.1964 0.901 0.056 0.000 0.944
#> SRR1498838 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR808566 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430270 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR661267 1 0.2066 0.914 0.940 0.000 0.060
#> SRR810665 2 0.6126 0.335 0.000 0.600 0.400
#> SRR1407250 1 0.1529 0.932 0.960 0.000 0.040
#> SRR1420067 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486195 3 0.2537 0.880 0.000 0.080 0.920
#> SRR1407671 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446375 1 0.6286 0.103 0.536 0.000 0.464
#> SRR1465230 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR614119 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356101 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.4654 0.738 0.000 0.792 0.208
#> SRR665538 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445655 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR658953 3 0.1860 0.909 0.052 0.000 0.948
#> SRR2166459 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317631 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316367 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR818263 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404909 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442422 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407112 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353199 3 0.2711 0.877 0.088 0.000 0.912
#> SRR1378885 3 0.4452 0.735 0.192 0.000 0.808
#> SRR665357 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR662186 3 0.4796 0.711 0.000 0.220 0.780
#> SRR1501020 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472576 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431781 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500472 1 0.6180 0.263 0.584 0.000 0.416
#> SRR1417632 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350153 2 0.4555 0.750 0.000 0.800 0.200
#> SRR1458113 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326579 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.4555 0.750 0.000 0.800 0.200
#> SRR1096712 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1083752 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377599 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488449 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318354 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1359062 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398924 1 0.5497 0.572 0.708 0.000 0.292
#> SRR663783 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319204 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369070 2 0.0747 0.957 0.000 0.984 0.016
#> SRR615659 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.6126 0.335 0.000 0.600 0.400
#> SRR1316982 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498595 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377423 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1312310 3 0.6126 0.343 0.000 0.400 0.600
#> SRR1485613 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR658941 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368874 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324085 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363858 1 0.6244 0.213 0.560 0.440 0.000
#> SRR819820 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337342 1 0.1411 0.936 0.964 0.000 0.036
#> SRR655206 3 0.6062 0.386 0.000 0.384 0.616
#> SRR1387013 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440161 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1343741 2 0.0747 0.957 0.000 0.984 0.016
#> SRR1381288 2 0.4702 0.732 0.000 0.788 0.212
#> SRR1415379 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.4605 0.744 0.000 0.796 0.204
#> SRR663197 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394836 3 0.1411 0.919 0.000 0.036 0.964
#> SRR661699 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR813680 1 0.2796 0.883 0.908 0.000 0.092
#> SRR1410678 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.4654 0.738 0.000 0.792 0.208
#> SRR1382851 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433410 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432518 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374608 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR657949 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308882 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444138 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091380 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467102 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485416 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR809963 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445259 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408393 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1333485 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406437 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354931 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1391856 2 0.1031 0.949 0.000 0.976 0.024
#> SRR1446738 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309032 3 0.4346 0.762 0.000 0.184 0.816
#> SRR1388145 2 0.0747 0.957 0.000 0.984 0.016
#> SRR1432611 3 0.6180 0.298 0.000 0.416 0.584
#> SRR815869 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375329 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387921 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 3 0.4555 0.740 0.000 0.200 0.800
#> SRR1360478 2 0.6140 0.324 0.000 0.596 0.404
#> SRR1360695 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400910 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444203 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429603 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397366 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337606 3 0.5431 0.585 0.284 0.000 0.716
#> SRR659109 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385389 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354117 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1393596 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.6079 0.339 0.388 0.000 0.612
#> SRR1499894 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082883 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR810295 3 0.4555 0.740 0.000 0.200 0.800
#> SRR662103 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396294 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419917 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489199 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR813584 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069638 3 0.1529 0.918 0.040 0.000 0.960
#> SRR614864 3 0.4931 0.673 0.232 0.000 0.768
#> SRR1433392 1 0.0237 0.961 0.996 0.000 0.004
#> SRR1377777 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.4931 0.681 0.768 0.000 0.232
#> SRR1401252 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309963 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.4842 0.713 0.000 0.776 0.224
#> SRR1486889 3 0.1289 0.922 0.032 0.000 0.968
#> SRR1380393 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337010 3 0.4504 0.746 0.000 0.196 0.804
#> SRR1486520 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340486 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465459 3 0.1289 0.924 0.032 0.000 0.968
#> SRR1080270 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093148 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467080 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR816475 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379198 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR613342 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452246 2 0.0237 0.966 0.000 0.996 0.004
#> SRR1338836 2 0.1031 0.951 0.000 0.976 0.024
#> SRR1369129 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082376 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500891 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR807543 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346689 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR663729 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485357 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355172 1 0.5926 0.473 0.644 0.000 0.356
#> SRR655531 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413329 3 0.5291 0.636 0.268 0.000 0.732
#> SRR1485931 3 0.6286 0.143 0.000 0.464 0.536
#> SRR1420873 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0237 0.966 0.000 0.996 0.004
#> SRR809018 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375351 2 0.4654 0.738 0.000 0.792 0.208
#> SRR663440 3 0.0892 0.931 0.020 0.000 0.980
#> SRR1471755 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR808019 1 0.4062 0.802 0.836 0.000 0.164
#> SRR1479133 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR615069 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456185 2 0.0892 0.954 0.000 0.980 0.020
#> SRR1350069 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR664795 1 0.3116 0.867 0.892 0.000 0.108
#> SRR1490721 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085285 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099072 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.2537 0.896 0.000 0.920 0.080
#> SRR809987 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR613639 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402285 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.0424 0.958 0.992 0.000 0.008
#> SRR1405660 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095455 1 0.2796 0.874 0.908 0.000 0.092
#> SRR1394734 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073581 1 0.0424 0.958 0.992 0.000 0.008
#> SRR659804 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0892 0.954 0.000 0.980 0.020
#> SRR1432186 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR660764 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328845 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1336415 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379065 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459190 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1346773 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0892 0.954 0.000 0.980 0.020
#> SRR1347459 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081209 2 0.4750 0.727 0.000 0.784 0.216
#> SRR1400202 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309248 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR809161 3 0.2165 0.894 0.064 0.000 0.936
#> SRR1316320 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432629 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470534 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500450 1 0.5650 0.568 0.688 0.000 0.312
#> SRR1078489 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332648 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR660614 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470420 3 0.4452 0.751 0.000 0.192 0.808
#> SRR1475566 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0892 0.954 0.000 0.980 0.020
#> SRR1464766 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR615946 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467656 3 0.6225 0.250 0.000 0.432 0.568
#> SRR1402962 1 0.4346 0.776 0.816 0.000 0.184
#> SRR660224 3 0.2448 0.884 0.000 0.076 0.924
#> SRR665586 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR2170173 1 0.5621 0.541 0.692 0.000 0.308
#> SRR817329 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401990 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467745 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.6095 0.358 0.000 0.608 0.392
#> SRR813137 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR818797 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164608 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455586 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488939 2 0.0892 0.954 0.000 0.980 0.020
#> SRR1433232 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385501 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361652 3 0.4555 0.747 0.200 0.000 0.800
#> SRR1437119 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1430910 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.6140 0.314 0.596 0.404 0.000
#> SRR1486762 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480854 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489394 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418085 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340221 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473058 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405165 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.4750 0.732 0.784 0.000 0.216
#> SRR1098567 3 0.1964 0.902 0.000 0.056 0.944
#> SRR1098712 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455038 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375248 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403005 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348378 2 0.4555 0.750 0.000 0.800 0.200
#> SRR1413541 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475192 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432085 3 0.5968 0.435 0.000 0.364 0.636
#> SRR1452468 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1347060 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414139 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447962 3 0.4555 0.740 0.000 0.200 0.800
#> SRR1444324 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.6126 0.335 0.000 0.600 0.400
#> SRR1405331 1 0.0237 0.961 0.996 0.000 0.004
#> SRR1345609 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322840 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367920 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441679 3 0.3551 0.826 0.000 0.132 0.868
#> SRR1082173 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363968 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1386689 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453811 1 0.1643 0.929 0.956 0.000 0.044
#> SRR1441159 1 0.0000 0.964 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 2 0.0000 0.969 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310275 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331708 1 0.2704 0.84286 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1464258 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.2081 0.88240 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR661589 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315165 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.0469 0.94647 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1417809 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094457 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095575 3 0.4877 0.31382 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1315931 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818002 4 0.4500 0.50579 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR1344143 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486845 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362866 1 0.3266 0.79634 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613550 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324025 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318879 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820755 3 0.0336 0.96150 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1485830 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR599313 4 0.2647 0.84004 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR612263 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326205 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421327 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079522 3 0.2814 0.83068 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR1452935 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.4866 0.36260 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1433555 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499935 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429408 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433950 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 3 0.3688 0.72871 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1435229 3 0.5000 -0.00319 0.496 0.000 0.504 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 3 0.2704 0.83952 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1400974 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613927 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 4 0.2647 0.84004 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR813776 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808196 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101085 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614395 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478251 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420109 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330920 1 0.0469 0.94642 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1419539 3 0.1716 0.90723 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1359447 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347259 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613915 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384395 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821715 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341480 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808566 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1430270 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661267 1 0.3486 0.76950 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 1 0.3975 0.69259 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR1420067 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446375 3 0.4888 0.30318 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR1465230 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.4888 0.32379 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658953 3 0.0921 0.94229 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR2166459 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818263 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404909 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.3801 0.71940 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1407112 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332969 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353199 3 0.1302 0.92638 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1378885 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR665357 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.4999 0.02896 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR1417632 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326579 1 0.0188 0.95272 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1349363 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083752 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377599 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488449 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318354 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359062 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398924 1 0.6400 0.56224 0.652 0.180 0.168 0.000
#> SRR663783 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319204 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498595 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377423 3 0.0336 0.96158 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658941 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101643 1 0.0188 0.95253 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1401468 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363858 4 0.2281 0.86988 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR819820 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337342 1 0.4331 0.60895 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR655206 2 0.2999 0.82305 0.000 0.864 0.004 0.132
#> SRR1387013 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663197 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394836 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661699 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813680 3 0.4843 0.30664 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 4 0.0469 0.96944 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1433410 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR657949 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308882 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 4 0.1118 0.94620 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1444138 1 0.1118 0.92540 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 4 0.0592 0.96572 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1091380 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467102 2 0.4454 0.55364 0.000 0.692 0.308 0.000
#> SRR1485416 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809963 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445259 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408393 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406437 4 0.3610 0.73426 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1354931 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391856 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446738 2 0.4998 0.10378 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR1309032 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375329 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387921 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400910 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444203 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR816177 2 0.4643 0.50419 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR658754 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1397366 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0188 0.94266 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1337606 2 0.5728 0.39763 0.036 0.600 0.364 0.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499894 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082883 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396294 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419917 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489199 1 0.3219 0.79695 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR813584 4 0.4103 0.63100 0.000 0.256 0.000 0.744
#> SRR1069638 3 0.0188 0.96520 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR614864 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.1557 0.90826 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.4585 0.50233 0.668 0.000 0.332 0.000
#> SRR1401252 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377696 2 0.4998 0.10529 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR1465459 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093148 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467080 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.3610 0.74258 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR816475 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613342 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396616 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500891 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR807543 3 0.4916 0.26570 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR1091572 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346689 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663729 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485357 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355172 3 0.0469 0.95755 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413329 3 0.0336 0.96156 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1485931 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.0336 0.93961 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR808019 1 0.3610 0.75350 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1479133 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615069 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456185 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350069 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR664795 1 0.4304 0.62478 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR1490721 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085285 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613639 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402285 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077038 1 0.3569 0.76135 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.4661 0.46478 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1394734 2 0.4907 0.31987 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR1317771 1 0.0336 0.94961 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1365894 2 0.4843 0.35370 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1073581 1 0.1792 0.89735 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.3486 0.75828 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1473529 4 0.0336 0.97314 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR660764 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328845 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1336415 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1459190 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1346773 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 2 0.3569 0.74000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1309248 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR809161 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316320 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432629 2 0.3688 0.73200 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1498931 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.4855 0.36875 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR1078489 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332648 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660614 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615946 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.4843 0.37933 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0188 0.95272 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1485722 1 0.0921 0.93300 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2170173 3 0.4877 0.31382 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR817329 1 0.4304 0.62314 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR1401990 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467745 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813137 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818797 1 0.1118 0.92620 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR2164608 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455586 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.4948 0.21780 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR1361652 3 0.3444 0.76347 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430910 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 4 0.2647 0.84004 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1486762 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480854 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1473058 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405165 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.4697 0.47664 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 4 0.4804 0.35047 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR1455038 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375248 3 0.4040 0.66086 0.000 0.248 0.752 0.000
#> SRR1403005 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.4855 0.37275 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1413541 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475192 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347060 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.0592 0.93119 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 1 0.4961 0.20275 0.552 0.000 0.448 0.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.2345 0.85707 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1322840 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367920 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.94564 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363968 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1386689 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453811 3 0.2408 0.86345 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.95575 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.98028 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 5 0.4235 0.4391 0.424 0.000 0.000 0.000 0.576
#> SRR1331708 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464258 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454201 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR661589 3 0.0162 0.9423 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315165 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488960 5 0.3210 0.6752 0.212 0.000 0.000 0.000 0.788
#> SRR1417809 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094457 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1315931 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818002 4 0.3966 0.4618 0.000 0.336 0.000 0.664 0.000
#> SRR1344143 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486845 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362866 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 5 0.4161 0.4917 0.392 0.000 0.000 0.000 0.608
#> SRR1383907 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1375699 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613550 3 0.0162 0.9423 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1348402 5 0.4210 0.4617 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1345146 3 0.1121 0.9090 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1324025 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318879 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820755 3 0.0324 0.9403 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1485830 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR599313 4 0.4287 0.2059 0.460 0.000 0.000 0.540 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326205 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421327 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079522 3 0.5006 0.6464 0.156 0.000 0.708 0.000 0.136
#> SRR1452935 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379495 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0162 0.9423 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR615778 5 0.0162 0.7938 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1447564 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1455195 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655182 1 0.0290 0.9525 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1335140 2 0.4210 0.3273 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1317446 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.3636 0.6277 0.272 0.000 0.728 0.000 0.000
#> SRR1499935 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429408 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433950 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 5 0.4430 0.2963 0.012 0.000 0.360 0.000 0.628
#> SRR1435229 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085996 5 0.0794 0.7869 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR1414229 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400974 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR613927 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473714 4 0.4283 0.2151 0.456 0.000 0.000 0.544 0.000
#> SRR813776 3 0.0162 0.9423 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR808196 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101085 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614395 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478251 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR665310 3 0.3366 0.6869 0.232 0.000 0.768 0.000 0.000
#> SRR1420109 3 0.0162 0.9423 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1330920 1 0.4497 0.0567 0.568 0.000 0.008 0.000 0.424
#> SRR1419539 3 0.0794 0.9214 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1359447 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347259 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613915 3 0.0162 0.9423 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1384395 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821715 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478228 5 0.4227 0.4469 0.420 0.000 0.000 0.000 0.580
#> SRR1445637 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR608150 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096383 5 0.4306 0.2760 0.492 0.000 0.000 0.000 0.508
#> SRR1341480 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1341344 5 0.1270 0.7778 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1326270 3 0.0162 0.9423 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808566 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430270 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661267 5 0.6166 0.4922 0.272 0.000 0.180 0.000 0.548
#> SRR810665 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420067 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1473632 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR812536 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446375 1 0.1831 0.8621 0.920 0.000 0.076 0.000 0.004
#> SRR1465230 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614119 5 0.4210 0.4617 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1356101 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.4450 0.0186 0.508 0.000 0.488 0.000 0.004
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 5 0.4210 0.4617 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR660510 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658953 3 0.3171 0.7657 0.008 0.000 0.816 0.000 0.176
#> SRR2166459 1 0.0510 0.9451 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488610 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316367 5 0.0404 0.7925 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1433926 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818263 5 0.4182 0.4256 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR1404909 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663076 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465893 5 0.4201 0.4682 0.408 0.000 0.000 0.000 0.592
#> SRR654862 5 0.0898 0.7879 0.008 0.000 0.020 0.000 0.972
#> SRR1407112 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353199 3 0.4242 0.2751 0.428 0.000 0.572 0.000 0.000
#> SRR1378885 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665357 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417632 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.4294 0.2311 0.000 0.000 0.532 0.000 0.468
#> SRR1326579 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349363 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083752 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377599 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488449 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318354 3 0.4294 0.2089 0.000 0.000 0.532 0.000 0.468
#> SRR1359062 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.0290 0.7919 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR663783 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319204 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498595 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377423 3 0.3999 0.4877 0.344 0.000 0.656 0.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 5 0.4210 0.4617 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1338426 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658941 5 0.0162 0.7936 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 5 0.2648 0.7231 0.152 0.000 0.000 0.000 0.848
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363858 4 0.3949 0.5204 0.332 0.000 0.000 0.668 0.000
#> SRR819820 3 0.0404 0.9362 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1337342 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655206 2 0.3098 0.8014 0.000 0.836 0.016 0.148 0.000
#> SRR1387013 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317410 5 0.4283 0.3707 0.456 0.000 0.000 0.000 0.544
#> SRR608198 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663197 3 0.0162 0.9423 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1394836 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661699 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813680 3 0.4030 0.4490 0.352 0.000 0.648 0.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1378109 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433410 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR657949 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308882 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 4 0.0510 0.9466 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1444138 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1417342 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1470193 4 0.0404 0.9502 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1091380 3 0.0404 0.9362 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1099096 5 0.4219 0.4544 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584
#> SRR1313583 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467102 3 0.4291 0.1309 0.000 0.464 0.536 0.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809963 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1353710 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445259 5 0.4291 0.0212 0.000 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR1408393 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406437 4 0.3039 0.7334 0.000 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR1354931 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391856 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446738 4 0.4256 0.1828 0.000 0.436 0.000 0.564 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375329 3 0.4297 0.2192 0.000 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1387921 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0290 0.9524 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR812943 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400910 3 0.4273 0.2850 0.000 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1444203 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816177 2 0.3837 0.5671 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397366 3 0.0703 0.9260 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337606 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337192 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476102 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1476447 5 0.4210 0.4369 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1342067 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075971 5 0.4294 0.3413 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR614419 5 0.2891 0.7077 0.176 0.000 0.000 0.000 0.824
#> SRR1322936 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1349121 5 0.4227 0.4469 0.420 0.000 0.000 0.000 0.580
#> SRR1430549 1 0.2773 0.7333 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR612935 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 5 0.4302 -0.0298 0.000 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1499894 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082883 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468271 5 0.3983 0.5585 0.340 0.000 0.000 0.000 0.660
#> SRR1332443 5 0.4201 0.4683 0.408 0.000 0.000 0.000 0.592
#> SRR810295 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.3837 0.5767 0.000 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR1396294 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419917 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.0162 0.9423 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1489199 5 0.3944 0.6846 0.200 0.000 0.032 0.000 0.768
#> SRR813584 4 0.3395 0.6627 0.000 0.236 0.000 0.764 0.000
#> SRR1069638 3 0.3010 0.7681 0.004 0.000 0.824 0.000 0.172
#> SRR614864 5 0.1671 0.7497 0.000 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR1433392 1 0.0703 0.9306 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1401252 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1319731 1 0.4101 0.2072 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1356468 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 5 0.0703 0.7886 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR1486538 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.4297 0.1407 0.000 0.528 0.000 0.472 0.000
#> SRR1465459 3 0.0404 0.9367 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093148 5 0.0162 0.7936 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1467080 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.3109 0.7434 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR816475 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613342 3 0.0290 0.9398 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.0162 0.9423 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR813824 3 0.0162 0.9423 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500891 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR807543 1 0.2813 0.7247 0.832 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346689 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332424 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR663729 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.0609 0.9409 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR613675 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485357 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500113 5 0.4201 0.4682 0.408 0.000 0.000 0.000 0.592
#> SRR1437622 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355172 3 0.3395 0.6662 0.236 0.000 0.764 0.000 0.000
#> SRR655531 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338147 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413329 5 0.4283 0.0941 0.000 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 5 0.4182 0.4804 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR1333308 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.0162 0.9423 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.0162 0.9488 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR808019 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1479133 3 0.0162 0.9423 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR615069 3 0.4210 0.3725 0.000 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1456185 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350069 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR664795 1 0.3586 0.5750 0.736 0.000 0.264 0.000 0.000
#> SRR1490721 4 0.2605 0.8058 0.000 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR810643 5 0.2179 0.7474 0.112 0.000 0.000 0.000 0.888
#> SRR1430333 5 0.3003 0.6396 0.000 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1085285 3 0.0162 0.9423 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1487340 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1420276 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0162 0.9419 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1405525 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 5 0.4297 0.3310 0.472 0.000 0.000 0.000 0.528
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613639 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402285 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.1341 0.8910 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.1012 0.9262 0.968 0.000 0.020 0.000 0.012
#> SRR1394734 2 0.4249 0.2698 0.000 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1317771 5 0.4867 0.4006 0.432 0.000 0.024 0.000 0.544
#> SRR1365894 2 0.4171 0.3540 0.000 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1073581 5 0.5571 0.4868 0.348 0.000 0.084 0.000 0.568
#> SRR659804 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.3003 0.7597 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1473529 4 0.0162 0.9575 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR660764 3 0.0162 0.9423 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328845 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1336415 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459190 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346773 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499521 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1333395 2 0.3143 0.7323 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1309248 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809161 3 0.0290 0.9398 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1316320 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432629 2 0.3177 0.7323 0.000 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR1498931 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1416578 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380764 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 3 0.6728 -0.1353 0.336 0.000 0.404 0.000 0.260
#> SRR1078489 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332648 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660614 3 0.0290 0.9391 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1477949 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 5 0.4306 0.2762 0.492 0.000 0.000 0.000 0.508
#> SRR615946 3 0.0290 0.9398 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485722 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415316 1 0.4273 0.0548 0.552 0.000 0.000 0.000 0.448
#> SRR613390 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0162 0.9423 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR817329 1 0.1478 0.8800 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1401990 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467745 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0510 0.9451 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1419692 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818797 1 0.0794 0.9264 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR2164608 3 0.0162 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1455586 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 1 0.1478 0.8772 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1361652 5 0.3508 0.5320 0.000 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1437119 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1478547 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 3 0.3109 0.7404 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1310584 5 0.4283 0.3705 0.456 0.000 0.000 0.000 0.544
#> SRR1500216 4 0.4291 0.1935 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1486762 3 0.0290 0.9398 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1480854 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473058 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405165 3 0.3837 0.5795 0.000 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR1433004 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 5 0.6085 0.5263 0.216 0.000 0.212 0.000 0.572
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 4 0.4126 0.3544 0.000 0.380 0.000 0.620 0.000
#> SRR1455038 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375248 3 0.1410 0.8913 0.000 0.060 0.940 0.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.4182 0.3577 0.000 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.9554 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475192 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 5 0.4278 0.0488 0.000 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR1347060 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.0963 0.9160 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1413436 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311266 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1429678 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 1 0.2179 0.8140 0.888 0.000 0.112 0.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1380208 2 0.5779 0.5270 0.000 0.616 0.000 0.172 0.212
#> SRR1322840 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0162 0.9556 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1365291 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367920 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9522 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.0162 0.9418 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1363968 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR814387 5 0.4294 0.3413 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR657599 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1386689 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453811 3 0.2233 0.8507 0.004 0.000 0.892 0.000 0.104
#> SRR1441159 5 0.0000 0.7957 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.9610 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 1 0.1141 0.84823 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1331708 5 0.0146 0.91252 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1464258 6 0.0790 0.77604 0.032 0.000 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1454201 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661589 3 0.3050 0.68788 0.000 0.000 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1456229 6 0.2135 0.77127 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000 0.872
#> SRR1315165 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.2234 0.79733 0.872 0.000 0.004 0.000 0.124 0.000
#> SRR1417809 4 0.0692 0.96156 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1094457 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.4310 0.27680 0.580 0.000 0.024 0.000 0.000 0.396
#> SRR1315931 6 0.1327 0.77638 0.064 0.000 0.000 0.000 0.000 0.936
#> SRR1430066 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818002 4 0.3841 0.34704 0.000 0.380 0.000 0.616 0.000 0.004
#> SRR1344143 2 0.0000 0.93503 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486845 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362866 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.3446 0.56153 0.692 0.000 0.000 0.000 0.000 0.308
#> SRR1446627 2 0.0000 0.93503 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1416248 1 0.1267 0.84383 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1383907 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.2340 0.78134 0.852 0.000 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1375699 2 0.0000 0.93503 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.3288 0.62004 0.000 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR613550 6 0.3351 0.59749 0.000 0.000 0.288 0.000 0.000 0.712
#> SRR1348402 1 0.1141 0.84823 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1345146 3 0.1219 0.89820 0.000 0.000 0.948 0.000 0.048 0.004
#> SRR1324025 3 0.0363 0.93204 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1318879 3 0.0146 0.93619 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR820755 6 0.4284 0.21585 0.012 0.000 0.440 0.000 0.004 0.544
#> SRR1485830 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR599313 6 0.2320 0.71370 0.004 0.000 0.000 0.132 0.000 0.864
#> SRR612263 6 0.2260 0.76466 0.140 0.000 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1415398 3 0.0790 0.92152 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1326205 4 0.0692 0.96156 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1421327 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079522 6 0.5592 0.59740 0.032 0.000 0.232 0.000 0.120 0.616
#> SRR1452935 3 0.0146 0.93619 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1379495 1 0.2378 0.77793 0.848 0.000 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1470459 2 0.0146 0.93435 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR661361 6 0.3151 0.61836 0.000 0.000 0.252 0.000 0.000 0.748
#> SRR615778 5 0.0260 0.91072 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1447564 1 0.2527 0.75879 0.832 0.000 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1455195 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655182 1 0.2697 0.72522 0.812 0.000 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1335140 2 0.3872 0.38571 0.000 0.604 0.000 0.392 0.000 0.004
#> SRR1433555 3 0.0146 0.93619 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1308650 2 0.0363 0.92998 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1388354 1 0.0146 0.85384 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0146 0.93619 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1479955 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR809853 6 0.3023 0.69334 0.232 0.000 0.000 0.000 0.000 0.768
#> SRR661313 6 0.2798 0.75999 0.036 0.000 0.112 0.000 0.000 0.852
#> SRR1499935 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447303 3 0.0937 0.91467 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1429408 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433950 1 0.2527 0.75935 0.832 0.000 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1362081 2 0.0146 0.93435 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409854 5 0.2932 0.78871 0.004 0.000 0.020 0.000 0.836 0.140
#> SRR1435229 5 0.0146 0.91252 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1085996 5 0.2568 0.83041 0.056 0.000 0.000 0.000 0.876 0.068
#> SRR1414229 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400974 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.3515 0.52903 0.676 0.000 0.000 0.000 0.000 0.324
#> SRR613927 6 0.1814 0.77801 0.100 0.000 0.000 0.000 0.000 0.900
#> SRR1457854 1 0.0146 0.85332 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473714 6 0.3217 0.62855 0.008 0.000 0.000 0.224 0.000 0.768
#> SRR813776 6 0.3371 0.58809 0.000 0.000 0.292 0.000 0.000 0.708
#> SRR808196 4 0.0692 0.96156 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1101085 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614395 6 0.1910 0.77622 0.108 0.000 0.000 0.000 0.000 0.892
#> SRR1478251 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0260 0.93474 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1362310 1 0.2340 0.78134 0.852 0.000 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR665310 6 0.3523 0.73652 0.040 0.000 0.180 0.000 0.000 0.780
#> SRR1420109 3 0.3789 0.20730 0.000 0.000 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR1330920 6 0.3592 0.75932 0.116 0.000 0.008 0.000 0.068 0.808
#> SRR1419539 3 0.1138 0.91036 0.004 0.012 0.960 0.000 0.000 0.024
#> SRR1359447 3 0.0146 0.93619 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1347259 4 0.0692 0.96156 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR613915 3 0.3869 -0.02410 0.000 0.000 0.500 0.000 0.000 0.500
#> SRR1384395 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821715 3 0.1387 0.89351 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1478228 1 0.1141 0.84823 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1445637 1 0.0458 0.85213 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR608150 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.1984 0.83042 0.912 0.000 0.000 0.000 0.032 0.056
#> SRR1341480 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341344 5 0.0603 0.90437 0.016 0.000 0.000 0.000 0.980 0.004
#> SRR1326270 6 0.2664 0.70474 0.000 0.000 0.184 0.000 0.000 0.816
#> SRR1498838 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808566 4 0.0146 0.96957 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1430270 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0146 0.93619 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR661267 1 0.2318 0.81036 0.892 0.000 0.064 0.000 0.044 0.000
#> SRR810665 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1407250 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420067 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.3838 0.18664 0.552 0.000 0.000 0.000 0.000 0.448
#> SRR812536 3 0.0146 0.93598 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1370850 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486195 2 0.0146 0.93435 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1407671 2 0.0692 0.92277 0.004 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1446375 1 0.5237 0.45213 0.608 0.000 0.172 0.000 0.000 0.220
#> SRR1465230 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614119 1 0.1141 0.84823 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1356101 2 0.3136 0.67877 0.000 0.768 0.228 0.000 0.000 0.004
#> SRR1404209 1 0.1257 0.84283 0.952 0.000 0.020 0.000 0.000 0.028
#> SRR1392676 2 0.0000 0.93503 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.1075 0.84952 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR660510 3 0.1007 0.91164 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1445655 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658953 6 0.4765 0.60232 0.000 0.000 0.132 0.000 0.196 0.672
#> SRR2166459 1 0.0291 0.85412 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1070713 2 0.0000 0.93503 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.0692 0.96156 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1488610 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316367 5 0.1267 0.87907 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1433926 6 0.3023 0.69334 0.232 0.000 0.000 0.000 0.000 0.768
#> SRR1091302 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818263 6 0.4983 0.36587 0.080 0.000 0.000 0.000 0.356 0.564
#> SRR1404909 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663076 1 0.0146 0.85332 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1323577 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1442422 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.1141 0.84823 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR654862 5 0.4238 0.67899 0.048 0.000 0.016 0.000 0.736 0.200
#> SRR1407112 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.0790 0.92152 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1353199 6 0.3928 0.74164 0.080 0.000 0.160 0.000 0.000 0.760
#> SRR1378885 3 0.2003 0.85047 0.000 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR665357 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0146 0.93435 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1501020 3 0.0790 0.92152 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1347819 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1472576 4 0.0291 0.96714 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1431781 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.0551 0.90981 0.004 0.000 0.008 0.000 0.984 0.004
#> SRR1417632 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350153 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1458113 5 0.1219 0.88231 0.000 0.000 0.048 0.000 0.948 0.004
#> SRR1326579 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1096712 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0363 0.93204 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1083752 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377599 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488449 3 0.1141 0.90717 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1318354 5 0.3314 0.64702 0.000 0.000 0.256 0.000 0.740 0.004
#> SRR1359062 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.0146 0.91252 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR663783 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319204 3 0.0146 0.93619 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1369070 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR615659 6 0.3175 0.66032 0.256 0.000 0.000 0.000 0.000 0.744
#> SRR1337449 2 0.0146 0.93435 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1316982 3 0.0146 0.93574 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1498595 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377423 6 0.4780 0.41046 0.056 0.000 0.392 0.000 0.000 0.552
#> SRR1312310 2 0.0146 0.93435 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1485613 1 0.1141 0.84823 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1338426 3 0.0146 0.93619 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1353309 3 0.0146 0.93619 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR658941 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101643 6 0.1444 0.77557 0.072 0.000 0.000 0.000 0.000 0.928
#> SRR1401468 1 0.2631 0.74496 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1368874 2 0.0146 0.93435 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1324085 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363858 6 0.3405 0.56439 0.004 0.000 0.000 0.272 0.000 0.724
#> SRR819820 3 0.0837 0.91993 0.020 0.000 0.972 0.000 0.004 0.004
#> SRR1337342 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655206 2 0.6251 0.38831 0.004 0.504 0.296 0.172 0.000 0.024
#> SRR1387013 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1317410 1 0.1007 0.85033 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR608198 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.1908 0.84526 0.000 0.900 0.096 0.000 0.000 0.004
#> SRR1343741 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1381288 2 0.0000 0.93503 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0692 0.96156 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1099622 2 0.0260 0.93474 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR663197 6 0.3789 0.24431 0.000 0.000 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1394836 2 0.0777 0.92201 0.004 0.972 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR661699 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813680 1 0.2994 0.66360 0.788 0.000 0.208 0.000 0.000 0.004
#> SRR1410678 1 0.1387 0.83241 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1378109 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499174 6 0.3023 0.69334 0.232 0.000 0.000 0.000 0.000 0.768
#> SRR1311486 2 0.0000 0.93503 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 4 0.0146 0.96949 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1433410 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.0146 0.93619 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR660462 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.0692 0.96156 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR657949 3 0.1267 0.90106 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1308882 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655768 1 0.3371 0.60813 0.708 0.000 0.000 0.000 0.000 0.292
#> SRR1485870 4 0.1053 0.95321 0.004 0.012 0.000 0.964 0.000 0.020
#> SRR1444138 1 0.0291 0.85389 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1417342 1 0.2416 0.77601 0.844 0.000 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1470193 4 0.0922 0.95696 0.004 0.004 0.000 0.968 0.000 0.024
#> SRR1091380 3 0.0436 0.93218 0.004 0.000 0.988 0.000 0.004 0.004
#> SRR1099096 1 0.1141 0.84823 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1313583 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467102 3 0.1588 0.86511 0.000 0.072 0.924 0.000 0.000 0.004
#> SRR1485416 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818821 3 0.0146 0.93619 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR809963 6 0.1910 0.77622 0.108 0.000 0.000 0.000 0.000 0.892
#> SRR1072247 1 0.0632 0.84911 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1353710 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445259 5 0.3023 0.71574 0.000 0.000 0.212 0.000 0.784 0.004
#> SRR1408393 3 0.0458 0.93072 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1361522 6 0.3023 0.69334 0.232 0.000 0.000 0.000 0.000 0.768
#> SRR1368597 6 0.3765 0.34095 0.404 0.000 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR1309680 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1310542 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406437 4 0.2890 0.81862 0.004 0.128 0.000 0.844 0.000 0.024
#> SRR1354931 3 0.1267 0.89986 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1391856 2 0.0922 0.91976 0.004 0.968 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1446738 4 0.4407 0.32609 0.004 0.380 0.000 0.592 0.000 0.024
#> SRR1309032 2 0.0146 0.93435 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1388145 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1432611 2 0.0146 0.93435 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR815869 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0146 0.93598 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1375329 5 0.2772 0.75191 0.000 0.000 0.180 0.000 0.816 0.004
#> SRR1387921 1 0.0458 0.85129 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1466792 2 0.0146 0.93435 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1360478 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1360695 1 0.0146 0.85384 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR812943 6 0.3023 0.69334 0.232 0.000 0.000 0.000 0.000 0.768
#> SRR1400910 5 0.2146 0.82365 0.000 0.000 0.116 0.000 0.880 0.004
#> SRR1444203 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816177 2 0.3426 0.62931 0.000 0.720 0.000 0.276 0.000 0.004
#> SRR658754 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0260 0.96858 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1397366 6 0.3023 0.70543 0.004 0.000 0.212 0.000 0.000 0.784
#> SRR1446028 1 0.2003 0.80356 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1083918 2 0.0291 0.93338 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1337606 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337192 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656946 6 0.3868 0.00629 0.496 0.000 0.000 0.000 0.000 0.504
#> SRR1476102 5 0.2219 0.80852 0.136 0.000 0.000 0.000 0.864 0.000
#> SRR1476447 1 0.4751 0.57602 0.624 0.000 0.000 0.000 0.300 0.076
#> SRR1342067 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0937 0.85117 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR614419 5 0.2520 0.78422 0.152 0.000 0.000 0.000 0.844 0.004
#> SRR1322936 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.1141 0.84823 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1430549 1 0.2070 0.81959 0.892 0.000 0.000 0.000 0.008 0.100
#> SRR612935 3 0.0146 0.93619 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR661481 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1354117 2 0.3189 0.66804 0.000 0.760 0.236 0.000 0.000 0.004
#> SRR1393596 4 0.0692 0.96156 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1452164 1 0.3706 0.39593 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1070503 5 0.4557 0.53282 0.000 0.000 0.072 0.000 0.660 0.268
#> SRR1499894 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082883 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.1387 0.83919 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1332443 1 0.1141 0.84823 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR810295 2 0.0146 0.93435 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR662103 6 0.2597 0.73953 0.176 0.000 0.000 0.000 0.000 0.824
#> SRR1328620 3 0.3405 0.60785 0.000 0.000 0.724 0.000 0.272 0.004
#> SRR1396294 4 0.0692 0.96156 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1419917 6 0.3023 0.69334 0.232 0.000 0.000 0.000 0.000 0.768
#> SRR662114 3 0.3747 0.39655 0.000 0.000 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1489199 1 0.4628 0.64544 0.704 0.000 0.016 0.000 0.208 0.072
#> SRR813584 4 0.3314 0.63127 0.000 0.256 0.000 0.740 0.000 0.004
#> SRR1069638 6 0.6163 0.26453 0.008 0.000 0.260 0.000 0.280 0.452
#> SRR614864 5 0.0547 0.90227 0.000 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1433392 6 0.2473 0.77264 0.136 0.000 0.008 0.000 0.000 0.856
#> SRR1377777 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2167710 1 0.3175 0.65120 0.744 0.000 0.000 0.000 0.000 0.256
#> SRR1401252 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.2697 0.74275 0.812 0.000 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1418628 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486889 3 0.0363 0.93204 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1380393 1 0.0146 0.85332 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1319731 1 0.0632 0.85345 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1356468 4 0.0692 0.96156 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1337010 2 0.0146 0.93435 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486520 5 0.3766 0.63807 0.256 0.000 0.000 0.000 0.720 0.024
#> SRR1486538 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.3950 0.27360 0.000 0.564 0.000 0.432 0.000 0.004
#> SRR1465459 6 0.3189 0.66920 0.004 0.000 0.236 0.000 0.000 0.760
#> SRR1080270 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093148 5 0.0146 0.91252 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1467080 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.2902 0.74751 0.000 0.800 0.000 0.196 0.000 0.004
#> SRR816475 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613342 6 0.3490 0.63970 0.008 0.000 0.268 0.000 0.000 0.724
#> SRR1452246 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1338836 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1369129 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.2527 0.78729 0.000 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR813824 3 0.3857 0.17435 0.000 0.000 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1082376 6 0.2300 0.76717 0.144 0.000 0.000 0.000 0.000 0.856
#> SRR1500891 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR807543 6 0.2266 0.78032 0.108 0.000 0.012 0.000 0.000 0.880
#> SRR1091572 6 0.1714 0.77899 0.092 0.000 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1346689 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332424 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663729 4 0.0692 0.96156 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1097013 1 0.0146 0.85384 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR613675 5 0.0146 0.91242 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1485357 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.1141 0.84823 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1437622 4 0.0291 0.96714 0.000 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1355172 1 0.2793 0.67599 0.800 0.000 0.200 0.000 0.000 0.000
#> SRR655531 5 0.0865 0.89588 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1338147 3 0.0547 0.92768 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1413329 3 0.4908 0.55040 0.124 0.000 0.664 0.000 0.208 0.004
#> SRR1485931 2 0.0000 0.93503 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.1141 0.84823 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1333308 4 0.0692 0.96156 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1452033 1 0.0146 0.85332 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1467316 2 0.0000 0.93503 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR663440 3 0.3727 0.36912 0.000 0.000 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1471755 2 0.0291 0.93338 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR808019 5 0.2912 0.71389 0.216 0.000 0.000 0.000 0.784 0.000
#> SRR1479133 6 0.3126 0.62422 0.000 0.000 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR615069 5 0.1341 0.88877 0.000 0.000 0.024 0.000 0.948 0.028
#> SRR1456185 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1350069 4 0.0692 0.96156 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR816316 6 0.0865 0.77646 0.036 0.000 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR664795 1 0.2679 0.77611 0.864 0.000 0.096 0.000 0.000 0.040
#> SRR1490721 4 0.4004 0.40670 0.000 0.000 0.000 0.620 0.368 0.012
#> SRR810643 1 0.2664 0.73825 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR1430333 5 0.0935 0.89308 0.000 0.000 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1085285 3 0.3244 0.66996 0.000 0.000 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR1099072 6 0.3409 0.58384 0.000 0.000 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1317985 1 0.3409 0.57031 0.700 0.000 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR1487340 1 0.0146 0.85332 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1420276 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0146 0.93619 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1405525 5 0.1007 0.88704 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956 0.000
#> SRR1370329 6 0.3266 0.58449 0.272 0.000 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1465001 1 0.0937 0.85117 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1476525 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR819610 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2157314 1 0.0146 0.85332 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409465 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR809987 4 0.0692 0.96156 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR613639 6 0.0790 0.77604 0.032 0.000 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1402285 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077038 6 0.2633 0.78187 0.104 0.000 0.032 0.000 0.000 0.864
#> SRR1405660 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 6 0.4319 0.70241 0.196 0.000 0.040 0.000 0.028 0.736
#> SRR1394734 2 0.3890 0.36422 0.000 0.596 0.000 0.400 0.000 0.004
#> SRR1317771 1 0.2138 0.83087 0.908 0.000 0.004 0.000 0.036 0.052
#> SRR1365894 2 0.4159 0.32910 0.000 0.588 0.000 0.396 0.000 0.016
#> SRR1073581 1 0.1863 0.83115 0.920 0.000 0.036 0.000 0.044 0.000
#> SRR659804 1 0.0146 0.85332 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1345914 2 0.0000 0.93503 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.2838 0.75649 0.000 0.808 0.000 0.188 0.000 0.004
#> SRR1473529 4 0.0260 0.96629 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR660764 3 0.3428 0.59322 0.000 0.000 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR820448 6 0.0865 0.77646 0.036 0.000 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1328845 4 0.0692 0.96156 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1336415 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459190 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346773 5 0.3464 0.54727 0.312 0.000 0.000 0.000 0.688 0.000
#> SRR1499521 1 0.3737 0.37103 0.608 0.000 0.000 0.000 0.392 0.000
#> SRR1440898 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1347459 3 0.0937 0.91457 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1081209 2 0.0000 0.93503 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0146 0.85332 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1333395 2 0.3705 0.66317 0.004 0.740 0.000 0.236 0.000 0.020
#> SRR1309248 4 0.0692 0.96156 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR809161 6 0.3592 0.49128 0.000 0.000 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR1316320 2 0.1806 0.85635 0.000 0.908 0.000 0.000 0.088 0.004
#> SRR1432629 2 0.2964 0.73912 0.000 0.792 0.000 0.204 0.000 0.004
#> SRR1498931 1 0.2260 0.78349 0.860 0.000 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR1416578 4 0.0692 0.96156 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1405547 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380764 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.2933 0.67365 0.796 0.000 0.200 0.000 0.000 0.004
#> SRR1078489 3 0.0146 0.93619 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1332648 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660614 3 0.0603 0.92604 0.000 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1470420 2 0.0146 0.93435 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1475566 1 0.0458 0.85129 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1477949 1 0.0260 0.85290 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1481419 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1464766 1 0.0865 0.85183 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR615946 6 0.2135 0.74407 0.000 0.000 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1446481 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1467656 2 0.0260 0.93474 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1402962 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.93503 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665586 6 0.2854 0.72166 0.208 0.000 0.000 0.000 0.000 0.792
#> SRR1347166 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485722 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.5209 0.26618 0.492 0.000 0.000 0.000 0.416 0.092
#> SRR613390 6 0.2416 0.75887 0.156 0.000 0.000 0.000 0.000 0.844
#> SRR661108 3 0.2883 0.74960 0.000 0.000 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR2170173 1 0.4310 0.27680 0.580 0.000 0.024 0.000 0.000 0.396
#> SRR817329 6 0.2696 0.78039 0.116 0.000 0.028 0.000 0.000 0.856
#> SRR1401990 4 0.0692 0.96156 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1467745 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1415637 2 0.0000 0.93503 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 6 0.2092 0.77216 0.124 0.000 0.000 0.000 0.000 0.876
#> SRR1314873 6 0.3023 0.69334 0.232 0.000 0.000 0.000 0.000 0.768
#> SRR1401211 1 0.0146 0.85384 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1419692 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818797 6 0.1528 0.77719 0.048 0.000 0.016 0.000 0.000 0.936
#> SRR2164608 3 0.0146 0.93619 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1455586 2 0.2442 0.78984 0.000 0.852 0.144 0.000 0.000 0.004
#> SRR819459 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.93503 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0146 0.93510 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1385501 6 0.1714 0.77887 0.092 0.000 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1361652 5 0.1411 0.87462 0.000 0.000 0.060 0.000 0.936 0.004
#> SRR1437119 1 0.2454 0.77111 0.840 0.000 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1478547 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 3 0.3619 0.52139 0.000 0.000 0.680 0.000 0.316 0.004
#> SRR1310584 1 0.1075 0.84949 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1500216 6 0.2278 0.71669 0.004 0.000 0.000 0.128 0.000 0.868
#> SRR1486762 3 0.3081 0.70172 0.004 0.000 0.776 0.000 0.000 0.220
#> SRR1480854 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473058 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405165 5 0.3864 0.09817 0.000 0.000 0.480 0.000 0.520 0.000
#> SRR1433004 6 0.2969 0.70164 0.224 0.000 0.000 0.000 0.000 0.776
#> SRR1471477 1 0.3522 0.69778 0.784 0.000 0.172 0.000 0.044 0.000
#> SRR1098567 2 0.0146 0.93435 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1098712 4 0.4230 0.47105 0.004 0.324 0.000 0.648 0.000 0.024
#> SRR1455038 6 0.1007 0.77720 0.044 0.000 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1375248 3 0.0508 0.92749 0.000 0.012 0.984 0.000 0.000 0.004
#> SRR1403005 3 0.1765 0.87024 0.000 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1348378 2 0.3890 0.36639 0.000 0.596 0.000 0.400 0.000 0.004
#> SRR1413541 6 0.2912 0.71800 0.216 0.000 0.000 0.000 0.000 0.784
#> SRR1392943 4 0.0692 0.96156 0.004 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1475192 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0146 0.93435 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1452468 5 0.1753 0.85397 0.000 0.000 0.084 0.000 0.912 0.004
#> SRR1347060 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.2278 0.81055 0.000 0.868 0.128 0.000 0.000 0.004
#> SRR1447962 2 0.0146 0.93435 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444324 2 0.1531 0.87477 0.000 0.928 0.068 0.000 0.000 0.004
#> SRR1415004 1 0.0363 0.85218 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1413436 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311266 5 0.0260 0.91074 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.2454 0.77111 0.840 0.000 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1429678 1 0.1444 0.82778 0.928 0.000 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1469413 2 0.0146 0.93435 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1405331 6 0.1594 0.77852 0.052 0.000 0.016 0.000 0.000 0.932
#> SRR1345609 1 0.1863 0.81037 0.896 0.000 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1380208 5 0.4603 0.45708 0.004 0.332 0.000 0.016 0.628 0.020
#> SRR1322840 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0146 0.93619 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1315081 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0146 0.85332 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1365291 3 0.2092 0.84248 0.000 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1367920 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0146 0.93435 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1082173 3 0.0146 0.93619 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1363968 1 0.3765 0.33740 0.596 0.000 0.000 0.000 0.404 0.000
#> SRR814387 1 0.0937 0.85117 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR657599 5 0.3416 0.78130 0.140 0.000 0.000 0.000 0.804 0.056
#> SRR1386689 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0790 0.92068 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1453811 6 0.2218 0.75265 0.000 0.000 0.104 0.000 0.012 0.884
#> SRR1441159 5 0.0000 0.91369 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.97173 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.93735 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.1814 0.86654 0.000 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.721 0.896 0.950 0.4401 0.547 0.547
#> 3 3 0.613 0.819 0.902 0.2635 0.892 0.808
#> 4 4 0.758 0.815 0.916 0.2968 0.766 0.520
#> 5 5 0.835 0.837 0.916 0.0995 0.868 0.566
#> 6 6 0.833 0.803 0.906 0.0277 0.959 0.811
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1331708 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1464258 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR661589 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1315165 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.5059 0.8496 0.888 0.112
#> SRR1094457 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1095575 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1315931 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1430066 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1431037 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1395554 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1344143 2 0.7950 0.7588 0.240 0.760
#> SRR1486845 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1456138 2 0.0938 0.9013 0.012 0.988
#> SRR1416248 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1383907 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1429846 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR613550 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1324025 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1318879 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR820755 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1485830 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR599313 1 0.9248 0.4126 0.660 0.340
#> SRR612263 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1415398 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1326205 2 0.5842 0.8290 0.140 0.860
#> SRR1421327 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1083311 1 0.0938 0.9584 0.988 0.012
#> SRR1499303 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1079522 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1452935 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR661361 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.0672 0.9619 0.992 0.008
#> SRR1447564 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.0672 0.9013 0.008 0.992
#> SRR1433555 1 0.1843 0.9432 0.972 0.028
#> SRR1308650 2 0.8386 0.7193 0.268 0.732
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1317446 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1413602 1 0.1414 0.9510 0.980 0.020
#> SRR1479955 2 0.4022 0.8807 0.080 0.920
#> SRR809853 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR661313 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1499935 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1447303 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1429408 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1433950 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1409854 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1435229 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1414229 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1400974 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR613927 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.9944 0.0836 0.544 0.456
#> SRR813776 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR808196 1 0.7674 0.6768 0.776 0.224
#> SRR1101085 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR614395 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1478251 2 0.2423 0.8891 0.040 0.960
#> SRR1370551 2 0.5629 0.8569 0.132 0.868
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR665310 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1420109 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1330920 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1419539 1 0.6343 0.7849 0.840 0.160
#> SRR1359447 1 0.6531 0.7732 0.832 0.168
#> SRR1347259 2 0.8713 0.6820 0.292 0.708
#> SRR613915 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1384395 1 0.5059 0.8490 0.888 0.112
#> SRR821715 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR608150 1 0.2603 0.9275 0.956 0.044
#> SRR1096383 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1341480 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1326270 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1498838 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1416313 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR808566 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1430270 2 0.9170 0.5558 0.332 0.668
#> SRR1367825 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR613533 1 0.2236 0.9351 0.964 0.036
#> SRR661267 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR810665 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1407250 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1420067 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR812536 1 0.8813 0.5300 0.700 0.300
#> SRR1370850 2 0.0938 0.9013 0.012 0.988
#> SRR1486195 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1407671 2 0.7376 0.7975 0.208 0.792
#> SRR1446375 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1465230 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.8909 0.6550 0.308 0.692
#> SRR1404209 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR665538 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR660510 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1445655 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR658953 1 0.0672 0.9619 0.992 0.008
#> SRR2166459 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.5629 0.8569 0.132 0.868
#> SRR1485312 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1317631 2 0.8267 0.6903 0.260 0.740
#> SRR1488610 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1330588 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1091302 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR818263 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1404909 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.1184 0.9009 0.016 0.984
#> SRR1442422 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1407112 2 0.4939 0.8494 0.108 0.892
#> SRR1332969 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1353199 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1378885 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR665357 1 0.0376 0.9653 0.996 0.004
#> SRR662186 2 0.7219 0.8062 0.200 0.800
#> SRR1501020 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1347819 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0938 0.9013 0.012 0.988
#> SRR1472576 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1431781 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1452270 1 0.3733 0.8972 0.928 0.072
#> SRR1500472 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1417632 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1350153 2 0.1184 0.9009 0.016 0.984
#> SRR1458113 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1326579 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1096712 1 0.1843 0.9435 0.972 0.028
#> SRR1090407 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1377599 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1488449 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1318354 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1359062 1 0.0672 0.9619 0.992 0.008
#> SRR1398924 1 0.8207 0.6147 0.744 0.256
#> SRR663783 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1319204 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1369070 2 0.0938 0.9013 0.012 0.988
#> SRR615659 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1316982 2 0.9686 0.4701 0.396 0.604
#> SRR1498595 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1377423 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1485613 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1338426 1 0.5178 0.8441 0.884 0.116
#> SRR1353309 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR658941 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1324085 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1363858 2 0.9881 0.3135 0.436 0.564
#> SRR819820 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1337342 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR655206 1 0.9732 0.2223 0.596 0.404
#> SRR1387013 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.7453 0.7926 0.212 0.788
#> SRR1343741 2 0.0938 0.9013 0.012 0.988
#> SRR1381288 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1415379 2 0.9896 0.2831 0.440 0.560
#> SRR1099622 2 0.1184 0.9009 0.016 0.984
#> SRR663197 1 0.9248 0.4256 0.660 0.340
#> SRR1394836 2 0.9850 0.3848 0.428 0.572
#> SRR661699 1 0.4939 0.8540 0.892 0.108
#> SRR813680 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1378109 2 0.2236 0.8909 0.036 0.964
#> SRR1499174 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1382851 2 0.0672 0.9013 0.008 0.992
#> SRR1433410 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR661167 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1432518 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR660462 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1374608 1 0.9044 0.4809 0.680 0.320
#> SRR657949 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1308882 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1485870 2 0.9044 0.6340 0.320 0.680
#> SRR1444138 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1470193 1 0.9635 0.2882 0.612 0.388
#> SRR1091380 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.9970 0.0565 0.532 0.468
#> SRR1467102 2 0.9209 0.6027 0.336 0.664
#> SRR1485416 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR818821 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR809963 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1353710 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1445259 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1408393 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0938 0.9013 0.012 0.988
#> SRR1310542 1 0.4939 0.8540 0.892 0.108
#> SRR1333485 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1406437 1 0.9286 0.4051 0.656 0.344
#> SRR1354931 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1391856 2 0.7883 0.7634 0.236 0.764
#> SRR1446738 2 0.2043 0.8973 0.032 0.968
#> SRR1309032 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1388145 2 0.1414 0.9002 0.020 0.980
#> SRR1432611 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR815869 1 0.5629 0.8240 0.868 0.132
#> SRR613150 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1375329 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1360478 2 0.1184 0.9009 0.016 0.984
#> SRR1360695 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1400910 1 0.3274 0.9107 0.940 0.060
#> SRR1444203 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR658754 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1429603 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1397366 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1337606 1 0.4022 0.8886 0.920 0.080
#> SRR659109 1 0.0672 0.9619 0.992 0.008
#> SRR1337192 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1342067 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1385389 2 0.3584 0.8759 0.068 0.932
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.2948 0.9192 0.948 0.052
#> SRR1349121 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR612935 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1354117 2 0.9460 0.5449 0.364 0.636
#> SRR1393596 2 0.1184 0.9010 0.016 0.984
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1070503 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1499894 1 0.0376 0.9653 0.996 0.004
#> SRR1082883 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR810295 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR662103 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1328620 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1396294 1 0.9286 0.4076 0.656 0.344
#> SRR1419917 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR662114 1 0.7815 0.6686 0.768 0.232
#> SRR1489199 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR813584 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1069638 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR614864 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.0938 0.9013 0.012 0.988
#> SRR2167710 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1401252 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1309963 2 0.2778 0.8854 0.048 0.952
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.1414 0.9002 0.020 0.980
#> SRR1486889 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.6438 0.7747 0.836 0.164
#> SRR1337010 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1486520 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1486538 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1340486 2 0.4815 0.8520 0.104 0.896
#> SRR1377696 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1465459 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1080270 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1312501 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1093148 1 0.0938 0.9583 0.988 0.012
#> SRR1467080 1 0.1633 0.9473 0.976 0.024
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR816475 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1379198 2 0.4298 0.8642 0.088 0.912
#> SRR613342 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.0938 0.9013 0.012 0.988
#> SRR1338836 2 0.0938 0.9013 0.012 0.988
#> SRR1369129 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1396616 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR813824 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1500891 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR807543 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1346689 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR663729 2 0.6148 0.8459 0.152 0.848
#> SRR1097013 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR613675 1 0.9129 0.4604 0.672 0.328
#> SRR1485357 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR655816 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1355172 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1338147 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1413329 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1485931 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1420873 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1333308 1 0.9323 0.3955 0.652 0.348
#> SRR1452033 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR809018 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.1184 0.9009 0.016 0.984
#> SRR663440 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR808019 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1479133 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR615069 1 0.8813 0.5286 0.700 0.300
#> SRR1456185 2 0.6343 0.8413 0.160 0.840
#> SRR1350069 2 0.9993 0.1359 0.484 0.516
#> SRR816316 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR664795 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1490721 2 0.2778 0.8926 0.048 0.952
#> SRR810643 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1085285 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1099072 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1420276 1 0.9732 0.2325 0.596 0.404
#> SRR1351347 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0376 0.9011 0.004 0.996
#> SRR819610 2 0.0938 0.9013 0.012 0.988
#> SRR2157314 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.1184 0.9009 0.016 0.984
#> SRR809987 1 0.0672 0.9617 0.992 0.008
#> SRR613639 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1402285 2 0.9170 0.5548 0.332 0.668
#> SRR1077038 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1405660 1 0.0672 0.9622 0.992 0.008
#> SRR1095455 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1394734 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.7056 0.8142 0.192 0.808
#> SRR1073581 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1432186 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1473529 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR660764 1 0.2603 0.9277 0.956 0.044
#> SRR820448 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1328845 1 0.0672 0.9616 0.992 0.008
#> SRR1336415 2 0.0376 0.9004 0.004 0.996
#> SRR1379065 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1459190 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1346773 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.3274 0.8883 0.060 0.940
#> SRR1347459 1 0.5178 0.8442 0.884 0.116
#> SRR1081209 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1333395 1 0.8955 0.4996 0.688 0.312
#> SRR1309248 2 0.2778 0.8930 0.048 0.952
#> SRR809161 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1316320 2 0.8763 0.6756 0.296 0.704
#> SRR1432629 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1416578 2 0.8267 0.6845 0.260 0.740
#> SRR1405547 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1470534 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1309160 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR663489 1 0.5178 0.8440 0.884 0.116
#> SRR1500450 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1078489 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1332648 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR660614 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.1414 0.9002 0.020 0.980
#> SRR1464766 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR615946 1 0.3584 0.9017 0.932 0.068
#> SRR1446481 2 0.0938 0.9013 0.012 0.988
#> SRR1467656 2 0.1633 0.8993 0.024 0.976
#> SRR1402962 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR660224 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR665586 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR661108 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR817329 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1401990 2 0.9209 0.5461 0.336 0.664
#> SRR1467745 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1415637 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR813137 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR818797 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR2164608 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1455586 2 0.7219 0.8055 0.200 0.800
#> SRR819459 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1385501 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1361652 1 0.1633 0.9470 0.976 0.024
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1478547 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1430910 1 0.2423 0.9310 0.960 0.040
#> SRR1310584 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.6801 0.7549 0.820 0.180
#> SRR1486762 1 0.0938 0.9584 0.988 0.012
#> SRR1480854 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1489394 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1418085 2 0.2778 0.8854 0.048 0.952
#> SRR1340221 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1473058 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1405165 1 0.5294 0.8388 0.880 0.120
#> SRR1433004 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1098712 2 0.9909 0.3461 0.444 0.556
#> SRR1455038 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.8386 0.7193 0.268 0.732
#> SRR1403005 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.9993 -0.1072 0.516 0.484
#> SRR1475192 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1452468 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1347060 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.8443 0.7145 0.272 0.728
#> SRR1447962 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1444324 2 0.7883 0.7635 0.236 0.764
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1343302 2 0.0938 0.8991 0.012 0.988
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.6531 0.8367 0.168 0.832
#> SRR1405331 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.7950 0.7583 0.240 0.760
#> SRR1322840 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1399797 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1416654 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1315081 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1369196 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1365291 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1367920 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1366648 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.7453 0.7922 0.212 0.788
#> SRR1082173 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1363968 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0376 0.9653 0.996 0.004
#> SRR1386689 2 0.1843 0.8941 0.028 0.972
#> SRR1395575 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1453811 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1403154 2 0.0000 0.9009 0.000 1.000
#> SRR1468722 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
#> SRR1310275 1 0.0000 0.9686 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 1 0.0237 0.8739 0.996 0.004 0.000
#> SRR1331708 1 0.1031 0.8752 0.976 0.024 0.000
#> SRR1464258 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.3412 0.8598 0.876 0.124 0.000
#> SRR661589 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1456229 1 0.0747 0.8750 0.984 0.016 0.000
#> SRR1315165 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.0747 0.8667 0.984 0.016 0.000
#> SRR1094457 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095575 1 0.3879 0.8512 0.848 0.152 0.000
#> SRR1315931 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1431037 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1395554 1 0.5760 0.6731 0.672 0.328 0.000
#> SRR818002 3 0.5785 0.4830 0.000 0.332 0.668
#> SRR1344143 2 0.2959 0.8114 0.100 0.900 0.000
#> SRR1486845 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362866 1 0.0892 0.8752 0.980 0.020 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.1015 0.8868 0.012 0.980 0.008
#> SRR1416248 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.3752 0.7593 0.144 0.856 0.000
#> SRR1429846 1 0.4121 0.8458 0.832 0.168 0.000
#> SRR613550 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.2959 0.8662 0.900 0.100 0.000
#> SRR1324025 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1318879 1 0.5926 0.6259 0.644 0.356 0.000
#> SRR820755 1 0.3551 0.8585 0.868 0.132 0.000
#> SRR1485830 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR599313 1 0.0424 0.8700 0.992 0.000 0.008
#> SRR612263 1 0.0424 0.8742 0.992 0.008 0.000
#> SRR1415398 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1326205 3 0.0661 0.9378 0.004 0.008 0.988
#> SRR1421327 3 0.1031 0.9265 0.000 0.024 0.976
#> SRR1083311 1 0.6168 0.5183 0.588 0.412 0.000
#> SRR1499303 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079522 1 0.2796 0.8668 0.908 0.092 0.000
#> SRR1452935 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR661361 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR615778 1 0.1163 0.8752 0.972 0.028 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.3267 0.7779 0.000 0.884 0.116
#> SRR1433555 1 0.4504 0.8310 0.804 0.196 0.000
#> SRR1308650 2 0.3116 0.7880 0.108 0.892 0.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 1 0.4702 0.8166 0.788 0.212 0.000
#> SRR1413602 1 0.6307 0.3170 0.512 0.488 0.000
#> SRR1479955 2 0.1170 0.8845 0.016 0.976 0.008
#> SRR809853 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR661313 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1499935 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447303 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1429408 3 0.4654 0.7153 0.000 0.208 0.792
#> SRR1433950 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409854 1 0.3686 0.8561 0.860 0.140 0.000
#> SRR1435229 1 0.1964 0.8741 0.944 0.056 0.000
#> SRR1085996 1 0.0424 0.8742 0.992 0.008 0.000
#> SRR1414229 1 0.4399 0.8358 0.812 0.188 0.000
#> SRR1400974 1 0.5016 0.7890 0.760 0.240 0.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR613927 1 0.1031 0.8752 0.976 0.024 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.2625 0.8122 0.916 0.000 0.084
#> SRR813776 1 0.3038 0.8652 0.896 0.104 0.000
#> SRR808196 3 0.5585 0.6469 0.204 0.024 0.772
#> SRR1101085 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR614395 1 0.1031 0.8752 0.976 0.024 0.000
#> SRR1478251 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR665310 1 0.3941 0.8503 0.844 0.156 0.000
#> SRR1420109 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1330920 1 0.3482 0.8596 0.872 0.128 0.000
#> SRR1419539 2 0.2878 0.8057 0.096 0.904 0.000
#> SRR1359447 1 0.6260 0.4350 0.552 0.448 0.000
#> SRR1347259 1 0.6703 0.5443 0.692 0.268 0.040
#> SRR613915 1 0.4121 0.8458 0.832 0.168 0.000
#> SRR1384395 2 0.6168 0.0520 0.412 0.588 0.000
#> SRR821715 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.2537 0.8692 0.920 0.080 0.000
#> SRR608150 1 0.0424 0.8742 0.992 0.008 0.000
#> SRR1096383 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341480 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 1 0.4178 0.8442 0.828 0.172 0.000
#> SRR1498838 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1416313 1 0.4842 0.8060 0.776 0.224 0.000
#> SRR808566 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1430270 3 0.0237 0.9412 0.004 0.000 0.996
#> SRR1367825 1 0.5859 0.6466 0.656 0.344 0.000
#> SRR613533 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR661267 1 0.0424 0.8742 0.992 0.008 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407250 1 0.2796 0.8671 0.908 0.092 0.000
#> SRR1420067 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR812536 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1370850 2 0.3043 0.8253 0.084 0.908 0.008
#> SRR1486195 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.4178 0.7248 0.172 0.828 0.000
#> SRR1446375 1 0.1289 0.8755 0.968 0.032 0.000
#> SRR1465230 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.0424 0.8742 0.992 0.008 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.1289 0.8749 0.968 0.032 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0424 0.8742 0.992 0.008 0.000
#> SRR660510 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1445655 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR658953 1 0.1411 0.8749 0.964 0.036 0.000
#> SRR2166459 1 0.1529 0.8752 0.960 0.040 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485312 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1317631 3 0.0848 0.9348 0.008 0.008 0.984
#> SRR1488610 1 0.0237 0.8739 0.996 0.004 0.000
#> SRR1330588 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1316367 1 0.0237 0.8740 0.996 0.004 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR818263 1 0.0424 0.8742 0.992 0.008 0.000
#> SRR1404909 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR1442422 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.1860 0.8739 0.948 0.052 0.000
#> SRR1407112 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332969 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1353199 1 0.4178 0.8442 0.828 0.172 0.000
#> SRR1378885 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR665357 2 0.6299 -0.2096 0.476 0.524 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501020 1 0.4121 0.8458 0.832 0.168 0.000
#> SRR1347819 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1480813 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR1472576 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431781 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452270 1 0.5948 0.6187 0.640 0.360 0.000
#> SRR1500472 1 0.1529 0.8752 0.960 0.040 0.000
#> SRR1417632 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350153 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR1458113 1 0.6192 0.4992 0.580 0.420 0.000
#> SRR1326579 1 0.0424 0.8742 0.992 0.008 0.000
#> SRR1349363 2 0.1163 0.8818 0.028 0.972 0.000
#> SRR1096712 1 0.6180 0.5081 0.584 0.416 0.000
#> SRR1090407 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1083752 3 0.4750 0.6866 0.000 0.216 0.784
#> SRR1377599 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488449 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1318354 1 0.5138 0.7783 0.748 0.252 0.000
#> SRR1359062 1 0.6126 0.5443 0.600 0.400 0.000
#> SRR1398924 1 0.4399 0.8341 0.812 0.188 0.000
#> SRR663783 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1319204 1 0.6280 0.3920 0.540 0.460 0.000
#> SRR1369070 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR615659 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.0424 0.8885 0.008 0.992 0.000
#> SRR1498595 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377423 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 1 0.6274 0.4105 0.544 0.456 0.000
#> SRR1353309 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR658941 1 0.4654 0.8122 0.792 0.208 0.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324085 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363858 1 0.2261 0.8291 0.932 0.000 0.068
#> SRR819820 1 0.3752 0.8519 0.856 0.144 0.000
#> SRR1337342 1 0.3192 0.8631 0.888 0.112 0.000
#> SRR655206 2 0.3038 0.8027 0.104 0.896 0.000
#> SRR1387013 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR1317410 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0424 0.8742 0.992 0.008 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR1381288 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415379 3 0.0424 0.9378 0.008 0.000 0.992
#> SRR1099622 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR663197 1 0.4887 0.8049 0.772 0.228 0.000
#> SRR1394836 2 0.0237 0.8928 0.004 0.996 0.000
#> SRR661699 1 0.6215 0.4810 0.572 0.428 0.000
#> SRR813680 1 0.0892 0.8752 0.980 0.020 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499174 1 0.0592 0.8749 0.988 0.012 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.3692 0.8160 0.056 0.896 0.048
#> SRR1433410 1 0.0424 0.8742 0.992 0.008 0.000
#> SRR661167 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1432518 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR660462 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1374608 1 0.9496 0.0845 0.492 0.232 0.276
#> SRR657949 1 0.3941 0.8503 0.844 0.156 0.000
#> SRR1308882 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 2 0.5650 0.6133 0.312 0.688 0.000
#> SRR1444138 1 0.0237 0.8743 0.996 0.004 0.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 1 0.6286 0.1612 0.536 0.464 0.000
#> SRR1091380 1 0.4887 0.8057 0.772 0.228 0.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 3 0.0424 0.9378 0.008 0.000 0.992
#> SRR1467102 2 0.1031 0.8756 0.024 0.976 0.000
#> SRR1485416 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR818821 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR809963 1 0.0592 0.8749 0.988 0.012 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 3 0.1411 0.9156 0.000 0.036 0.964
#> SRR1445259 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1408393 1 0.3879 0.8519 0.848 0.152 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0892 0.8752 0.980 0.020 0.000
#> SRR1309680 2 0.0848 0.8891 0.008 0.984 0.008
#> SRR1310542 2 0.6192 0.0176 0.420 0.580 0.000
#> SRR1333485 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406437 2 0.5138 0.6804 0.252 0.748 0.000
#> SRR1354931 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1391856 2 0.3551 0.7595 0.132 0.868 0.000
#> SRR1446738 2 0.2625 0.8278 0.084 0.916 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR1432611 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR815869 1 0.6295 0.3692 0.528 0.472 0.000
#> SRR613150 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1375329 1 0.4291 0.8415 0.820 0.180 0.000
#> SRR1387921 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR1360695 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0592 0.8749 0.988 0.012 0.000
#> SRR1400910 1 0.6026 0.5903 0.624 0.376 0.000
#> SRR1444203 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR816177 2 0.3267 0.7793 0.000 0.884 0.116
#> SRR658754 1 0.6045 0.5871 0.620 0.380 0.000
#> SRR1429603 3 0.4605 0.7119 0.000 0.204 0.796
#> SRR1397366 1 0.4121 0.8461 0.832 0.168 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.3116 0.7890 0.000 0.892 0.108
#> SRR1337606 1 0.6026 0.5798 0.624 0.376 0.000
#> SRR659109 1 0.5397 0.7432 0.720 0.280 0.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0892 0.8753 0.980 0.020 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385389 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0237 0.8739 0.996 0.004 0.000
#> SRR1349121 1 0.0424 0.8742 0.992 0.008 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR612935 1 0.4605 0.8247 0.796 0.204 0.000
#> SRR661481 2 0.2297 0.8600 0.036 0.944 0.020
#> SRR1354117 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1393596 2 0.7138 0.5792 0.312 0.644 0.044
#> SRR1452164 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1499894 1 0.4931 0.7983 0.768 0.232 0.000
#> SRR1082883 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 1 0.5138 0.7809 0.748 0.252 0.000
#> SRR1396294 2 0.8675 0.1774 0.108 0.504 0.388
#> SRR1419917 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR662114 1 0.6235 0.4629 0.564 0.436 0.000
#> SRR1489199 1 0.1411 0.8758 0.964 0.036 0.000
#> SRR813584 2 0.4235 0.6843 0.000 0.824 0.176
#> SRR1069638 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR614864 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1433392 1 0.1860 0.8738 0.948 0.052 0.000
#> SRR1377777 2 0.3043 0.8233 0.084 0.908 0.008
#> SRR2167710 1 0.1031 0.8752 0.976 0.024 0.000
#> SRR1401252 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309963 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR1486889 1 0.2878 0.8671 0.904 0.096 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.8771 0.0817 0.544 0.324 0.132
#> SRR1337010 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340486 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377696 2 0.4676 0.7745 0.112 0.848 0.040
#> SRR1465459 1 0.3686 0.8561 0.860 0.140 0.000
#> SRR1080270 1 0.4796 0.8090 0.780 0.220 0.000
#> SRR1312501 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1093148 1 0.5882 0.5015 0.652 0.348 0.000
#> SRR1467080 1 0.6215 0.4833 0.572 0.428 0.000
#> SRR1410866 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR816475 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379198 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR613342 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1452246 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR1338836 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR1369129 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396616 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR813824 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1082376 1 0.0892 0.8758 0.980 0.020 0.000
#> SRR1500891 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR807543 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1091572 1 0.2625 0.8676 0.916 0.084 0.000
#> SRR1346689 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR663729 3 0.8924 0.4234 0.268 0.172 0.560
#> SRR1097013 1 0.1964 0.8723 0.944 0.056 0.000
#> SRR613675 1 0.0237 0.8739 0.996 0.004 0.000
#> SRR1485357 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR655816 1 0.4121 0.8458 0.832 0.168 0.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 3 0.2261 0.8808 0.000 0.068 0.932
#> SRR1355172 1 0.2796 0.8673 0.908 0.092 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1413329 1 0.1289 0.8749 0.968 0.032 0.000
#> SRR1485931 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 1 0.9864 -0.1907 0.416 0.288 0.296
#> SRR1452033 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0892 0.8847 0.020 0.980 0.000
#> SRR809018 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1375351 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR663440 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1471755 2 0.4235 0.6843 0.000 0.824 0.176
#> SRR808019 1 0.0424 0.8742 0.992 0.008 0.000
#> SRR1479133 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR615069 1 0.6267 0.4226 0.548 0.452 0.000
#> SRR1456185 2 0.3752 0.7405 0.144 0.856 0.000
#> SRR1350069 3 0.4848 0.7551 0.128 0.036 0.836
#> SRR816316 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR664795 1 0.0892 0.8752 0.980 0.020 0.000
#> SRR1490721 2 0.6521 0.6423 0.248 0.712 0.040
#> SRR810643 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.3038 0.8666 0.896 0.104 0.000
#> SRR1085285 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1099072 1 0.3941 0.8508 0.844 0.156 0.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.5988 0.2227 0.368 0.632 0.000
#> SRR1351347 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0237 0.8718 0.996 0.000 0.004
#> SRR1465001 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR819610 2 0.4164 0.7545 0.144 0.848 0.008
#> SRR2157314 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR809987 3 0.6305 0.1149 0.484 0.000 0.516
#> SRR613639 1 0.1163 0.8752 0.972 0.028 0.000
#> SRR1402285 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077038 1 0.0892 0.8752 0.980 0.020 0.000
#> SRR1405660 1 0.6095 0.5598 0.608 0.392 0.000
#> SRR1095455 1 0.4121 0.8445 0.832 0.168 0.000
#> SRR1394734 3 0.6307 0.0524 0.000 0.488 0.512
#> SRR1317771 1 0.0747 0.8750 0.984 0.016 0.000
#> SRR1365894 2 0.3879 0.7559 0.152 0.848 0.000
#> SRR1073581 1 0.0424 0.8742 0.992 0.008 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR1473529 3 0.5397 0.5809 0.000 0.280 0.720
#> SRR660764 1 0.4399 0.8357 0.812 0.188 0.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328845 3 0.8213 0.3434 0.344 0.088 0.568
#> SRR1336415 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379065 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1459190 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1346773 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0237 0.8928 0.000 0.996 0.004
#> SRR1347459 1 0.4291 0.8403 0.820 0.180 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 1 0.5327 0.6201 0.728 0.272 0.000
#> SRR1309248 2 0.5623 0.6461 0.280 0.716 0.004
#> SRR809161 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1316320 2 0.4291 0.7605 0.180 0.820 0.000
#> SRR1432629 2 0.1411 0.8744 0.000 0.964 0.036
#> SRR1498931 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 3 0.0237 0.9412 0.004 0.000 0.996
#> SRR1405547 1 0.5621 0.7026 0.692 0.308 0.000
#> SRR1470534 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR663489 1 0.6192 0.4991 0.580 0.420 0.000
#> SRR1500450 1 0.0237 0.8741 0.996 0.004 0.000
#> SRR1078489 1 0.5968 0.6124 0.636 0.364 0.000
#> SRR1332648 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR660614 1 0.6291 0.3805 0.532 0.468 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR1464766 1 0.0237 0.8741 0.996 0.004 0.000
#> SRR615946 1 0.4452 0.8326 0.808 0.192 0.000
#> SRR1446481 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR1467656 2 0.0237 0.8929 0.000 0.996 0.004
#> SRR1402962 1 0.2537 0.8690 0.920 0.080 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR665586 1 0.0892 0.8752 0.980 0.020 0.000
#> SRR1347166 1 0.1289 0.8749 0.968 0.032 0.000
#> SRR1485722 1 0.2537 0.8698 0.920 0.080 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0424 0.8742 0.992 0.008 0.000
#> SRR661108 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR2170173 1 0.3619 0.8566 0.864 0.136 0.000
#> SRR817329 1 0.1289 0.8749 0.968 0.032 0.000
#> SRR1401990 3 0.0237 0.9412 0.004 0.000 0.996
#> SRR1467745 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1471795 2 0.2066 0.8469 0.000 0.940 0.060
#> SRR1415637 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR813137 1 0.0592 0.8749 0.988 0.012 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR818797 1 0.2625 0.8683 0.916 0.084 0.000
#> SRR2164608 1 0.3038 0.8652 0.896 0.104 0.000
#> SRR1455586 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR819459 1 0.4887 0.8049 0.772 0.228 0.000
#> SRR1488939 2 0.0892 0.8844 0.020 0.980 0.000
#> SRR1433232 2 0.0424 0.8917 0.000 0.992 0.008
#> SRR1385501 1 0.1529 0.8748 0.960 0.040 0.000
#> SRR1361652 1 0.5363 0.7495 0.724 0.276 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1430910 1 0.6154 0.5277 0.592 0.408 0.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0237 0.8718 0.996 0.000 0.004
#> SRR1486762 1 0.4504 0.8294 0.804 0.196 0.000
#> SRR1480854 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489394 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418085 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340221 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1473058 3 0.0747 0.9316 0.000 0.016 0.984
#> SRR1405165 2 0.6309 -0.2886 0.500 0.500 0.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098712 2 0.4974 0.6874 0.236 0.764 0.000
#> SRR1455038 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403005 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1348378 2 0.5656 0.6042 0.008 0.728 0.264
#> SRR1413541 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.8501 0.0317 0.532 0.368 0.100
#> SRR1475192 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452468 1 0.1411 0.8750 0.964 0.036 0.000
#> SRR1347060 1 0.6008 0.5983 0.628 0.372 0.000
#> SRR1414139 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405331 1 0.3619 0.8573 0.864 0.136 0.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.4178 0.7278 0.172 0.828 0.000
#> SRR1322840 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399797 1 0.4796 0.8118 0.780 0.220 0.000
#> SRR1416654 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1315081 1 0.6295 0.3695 0.528 0.472 0.000
#> SRR1369196 1 0.5706 0.6850 0.680 0.320 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1367920 3 0.0424 0.9375 0.008 0.000 0.992
#> SRR1366648 1 0.5926 0.6264 0.644 0.356 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.8937 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082173 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1363968 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1386689 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395575 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1453811 1 0.3192 0.8631 0.888 0.112 0.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.8733 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468722 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
#> SRR1310275 1 0.4235 0.8424 0.824 0.176 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 1 0.2530 0.8235 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1331708 1 0.4981 0.0264 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1464258 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454201 3 0.4916 0.2124 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR661589 3 0.2973 0.8305 0.144 0.000 0.856 0.000
#> SRR1456229 1 0.3942 0.6531 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR1315165 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.1584 0.8698 0.952 0.036 0.012 0.000
#> SRR1094457 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095575 1 0.4933 0.1354 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1315931 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818002 2 0.5000 0.0203 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR1344143 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486845 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362866 3 0.4855 0.4092 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.2647 0.8465 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR613550 3 0.2868 0.8366 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 3 0.2814 0.8395 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR1324025 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318879 3 0.1302 0.8706 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR820755 3 0.4222 0.6679 0.272 0.000 0.728 0.000
#> SRR1485830 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR599313 1 0.0336 0.8881 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR612263 1 0.2216 0.8292 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1415398 3 0.2149 0.8609 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1326205 4 0.0336 0.9621 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1421327 4 0.1118 0.9377 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1083311 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079522 1 0.4981 0.0280 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1452935 3 0.2408 0.8517 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.2216 0.8609 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR615778 3 0.4999 0.1088 0.492 0.000 0.508 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0817 0.8799 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1335140 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.1833 0.8977 0.032 0.944 0.024 0.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.3123 0.8208 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR1499935 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429408 4 0.2408 0.8637 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR1433950 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 3 0.3975 0.7265 0.240 0.000 0.760 0.000
#> SRR1435229 1 0.4955 0.1462 0.556 0.000 0.444 0.000
#> SRR1085996 1 0.1867 0.8467 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1414229 3 0.0188 0.8726 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1400974 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613927 1 0.4866 0.2381 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0336 0.8872 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR813776 3 0.3024 0.8273 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR808196 4 0.5256 0.3379 0.392 0.012 0.000 0.596
#> SRR1101085 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614395 1 0.4661 0.3987 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1478251 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.3486 0.7914 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1420109 3 0.2589 0.8471 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1330920 3 0.4866 0.4242 0.404 0.000 0.596 0.000
#> SRR1419539 3 0.2469 0.8047 0.000 0.108 0.892 0.000
#> SRR1359447 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347259 2 0.9419 0.1370 0.272 0.384 0.232 0.112
#> SRR613915 3 0.2530 0.8511 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1384395 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821715 3 0.1474 0.8634 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 3 0.4998 0.1695 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR608150 1 0.3400 0.7622 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1096383 1 0.0707 0.8819 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1341480 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.1302 0.8654 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0188 0.8726 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR808566 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1430270 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0469 0.8734 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR661267 1 0.4992 0.1259 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 3 0.4898 0.3141 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR1420067 1 0.2760 0.7884 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1473632 1 0.0336 0.8879 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR812536 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446375 1 0.4406 0.5034 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1465230 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.3610 0.7431 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1356101 2 0.0921 0.9166 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1404209 3 0.4888 0.4068 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.3311 0.7432 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR660510 3 0.1940 0.8633 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658953 3 0.4977 0.2199 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR2166459 3 0.4985 0.2317 0.468 0.000 0.532 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.0657 0.9574 0.004 0.012 0.000 0.984
#> SRR1488610 1 0.1474 0.8613 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818263 1 0.4164 0.5946 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR1404909 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654862 3 0.4866 0.4003 0.404 0.000 0.596 0.000
#> SRR1407112 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332969 3 0.2216 0.8585 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR1353199 3 0.3123 0.8214 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR1378885 3 0.1716 0.8654 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR665357 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.2647 0.8465 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500472 3 0.4746 0.4060 0.368 0.000 0.632 0.000
#> SRR1417632 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326579 1 0.2973 0.7884 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1349363 2 0.0188 0.9350 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.1389 0.8654 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1083752 4 0.0707 0.9524 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1377599 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488449 3 0.2647 0.8465 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1318354 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359062 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398924 1 0.4996 -0.0817 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR663783 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319204 3 0.2216 0.8404 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.1716 0.8407 0.000 0.064 0.936 0.000
#> SRR1498595 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377423 3 0.3123 0.8208 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658941 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363858 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819820 3 0.0707 0.8714 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1337342 3 0.2647 0.8454 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR655206 3 0.5158 0.0822 0.004 0.472 0.524 0.000
#> SRR1387013 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.2530 0.8157 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1440161 2 0.3975 0.6784 0.000 0.760 0.240 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663197 3 0.1940 0.8632 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1394836 2 0.2081 0.8576 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR661699 3 0.1867 0.8657 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR813680 3 0.3975 0.6884 0.240 0.000 0.760 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433410 1 0.2530 0.8204 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR661167 3 0.1302 0.8654 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1432518 3 0.1792 0.8654 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374608 1 0.9995 -0.0432 0.260 0.236 0.256 0.248
#> SRR657949 3 0.2647 0.8453 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1308882 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 2 0.2704 0.8193 0.124 0.876 0.000 0.000
#> SRR1444138 1 0.0921 0.8807 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 2 0.6705 0.4544 0.148 0.608 0.244 0.000
#> SRR1091380 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 4 0.0592 0.9535 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1467102 3 0.4564 0.4352 0.000 0.328 0.672 0.000
#> SRR1485416 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818821 3 0.1940 0.8630 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR809963 1 0.4304 0.5362 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.0921 0.9446 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1445259 3 0.1474 0.8634 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1408393 3 0.2921 0.8337 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.4843 0.2738 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406437 2 0.4804 0.7412 0.148 0.780 0.072 0.000
#> SRR1354931 3 0.1302 0.8654 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1391856 2 0.5057 0.4809 0.012 0.648 0.340 0.000
#> SRR1446738 2 0.1042 0.9192 0.020 0.972 0.008 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375329 3 0.2149 0.8593 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1387921 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.1211 0.8670 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR812943 1 0.2021 0.8603 0.936 0.040 0.024 0.000
#> SRR1400910 3 0.1637 0.8694 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1444203 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.1211 0.9336 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1397366 3 0.2760 0.8423 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337606 3 0.3760 0.8220 0.136 0.028 0.836 0.000
#> SRR659109 3 0.1867 0.8640 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656946 1 0.3074 0.7574 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.2814 0.8085 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1349121 1 0.2589 0.8230 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.2281 0.8596 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.3569 0.7455 0.000 0.804 0.196 0.000
#> SRR1393596 2 0.3547 0.7871 0.144 0.840 0.000 0.016
#> SRR1452164 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.2530 0.8488 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1499894 3 0.1637 0.8674 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1082883 1 0.1489 0.8665 0.952 0.004 0.044 0.000
#> SRR1468271 1 0.0817 0.8781 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396294 4 0.8224 0.2456 0.020 0.272 0.256 0.452
#> SRR1419917 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.2345 0.8538 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1489199 1 0.3528 0.7238 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR813584 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069638 3 0.3311 0.7993 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR614864 3 0.0469 0.8720 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1433392 3 0.5000 0.1649 0.496 0.000 0.504 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.4564 0.4401 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1401252 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 3 0.2081 0.8562 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.4807 0.7112 0.788 0.152 0.052 0.008
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0188 0.8898 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1486538 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377696 2 0.0817 0.9205 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1465459 3 0.3172 0.8171 0.160 0.000 0.840 0.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0188 0.8726 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1093148 3 0.2408 0.8228 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR1467080 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613342 3 0.2921 0.8339 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396616 3 0.0817 0.8727 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR813824 3 0.2011 0.8618 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1082376 1 0.2589 0.8111 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1500891 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR807543 3 0.4406 0.6363 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1091572 1 0.2011 0.8446 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1346689 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332424 1 0.0188 0.8897 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR663729 1 0.3732 0.7734 0.852 0.056 0.000 0.092
#> SRR1097013 1 0.2469 0.8120 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR613675 1 0.2741 0.8282 0.892 0.012 0.096 0.000
#> SRR1485357 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.1940 0.8382 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1437622 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355172 3 0.2149 0.8480 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413329 3 0.3649 0.7203 0.204 0.000 0.796 0.000
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0707 0.8805 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1333308 1 0.5148 0.6326 0.736 0.208 0.000 0.056
#> SRR1452033 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.3024 0.8273 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808019 1 0.4998 0.0949 0.512 0.000 0.488 0.000
#> SRR1479133 3 0.0188 0.8726 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR615069 3 0.1940 0.8632 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1456185 2 0.2002 0.8859 0.044 0.936 0.020 0.000
#> SRR1350069 4 0.3958 0.7764 0.160 0.024 0.000 0.816
#> SRR816316 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR664795 3 0.4624 0.5229 0.340 0.000 0.660 0.000
#> SRR1490721 2 0.4605 0.4952 0.336 0.664 0.000 0.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 3 0.2704 0.8418 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1085285 3 0.2469 0.8533 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1099072 3 0.2704 0.8438 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0707 0.8725 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809987 1 0.4193 0.6017 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR613639 1 0.3873 0.6704 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR1402285 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077038 3 0.4967 0.2925 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.4679 0.3956 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR1394734 2 0.4477 0.5365 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1317771 1 0.4804 0.3145 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR1365894 2 0.2149 0.8555 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR1073581 1 0.4790 0.3645 0.620 0.000 0.380 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473529 4 0.4866 0.3064 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR660764 3 0.1940 0.8630 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328845 4 0.6101 0.2993 0.388 0.052 0.000 0.560
#> SRR1336415 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1459190 3 0.1940 0.8630 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1346773 1 0.0188 0.8896 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1499521 1 0.4040 0.6609 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.2345 0.8539 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 3 0.6953 0.2084 0.412 0.112 0.476 0.000
#> SRR1309248 2 0.3311 0.7640 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR809161 3 0.2814 0.8394 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR1316320 2 0.1557 0.8909 0.056 0.944 0.000 0.000
#> SRR1432629 2 0.0592 0.9268 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1498931 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.4941 0.2727 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR1078489 3 0.2408 0.8517 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR1332648 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660614 3 0.2271 0.8629 0.076 0.008 0.916 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.0188 0.8898 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR615946 3 0.2345 0.8538 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 3 0.4804 0.3346 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.4776 0.3344 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR1347166 3 0.4843 0.4161 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR1485722 3 0.4977 0.1586 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.2149 0.8329 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.4948 0.1079 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR817329 3 0.4916 0.3710 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR1401990 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467745 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813137 1 0.4605 0.4223 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1314873 1 0.0707 0.8822 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818797 3 0.4164 0.7017 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR2164608 3 0.1716 0.8664 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1455586 2 0.2469 0.8370 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.4972 0.2747 0.456 0.000 0.544 0.000
#> SRR1361652 3 0.4647 0.6367 0.288 0.008 0.704 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430910 3 0.0469 0.8728 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0188 0.8898 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486762 3 0.2149 0.8603 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1480854 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1473058 4 0.0188 0.9652 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1405165 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.4040 0.6609 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 2 0.4776 0.3990 0.376 0.624 0.000 0.000
#> SRR1455038 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375248 3 0.4356 0.5699 0.000 0.292 0.708 0.000
#> SRR1403005 3 0.3123 0.8208 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR1348378 3 0.7565 0.2901 0.004 0.292 0.504 0.200
#> SRR1413541 1 0.0188 0.8898 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1392943 1 0.5535 0.5167 0.672 0.288 0.004 0.036
#> SRR1475192 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 3 0.4164 0.6931 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR1347060 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.4989 0.1683 0.000 0.528 0.472 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.1302 0.9029 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.1940 0.8415 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9382 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.4776 0.4911 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.2999 0.8088 0.132 0.864 0.004 0.000
#> SRR1322840 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.0707 0.8729 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1367920 4 0.0376 0.9626 0.004 0.004 0.000 0.992
#> SRR1366648 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0188 0.9353 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1082173 3 0.0707 0.8730 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1363968 1 0.3975 0.6730 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.1716 0.8512 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1386689 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395575 3 0.0188 0.8725 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1453811 3 0.1302 0.8703 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.8914 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.9682 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.8722 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.1389 0.8700 0.048 0.000 0.952 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 1 0.0963 0.8921 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1331708 5 0.4730 0.6592 0.260 0.000 0.052 0.000 0.688
#> SRR1464258 5 0.0963 0.8780 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1454201 1 0.3689 0.6769 0.740 0.000 0.256 0.000 0.004
#> SRR661589 3 0.4219 0.3576 0.000 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR1456229 5 0.1041 0.8821 0.004 0.000 0.032 0.000 0.964
#> SRR1315165 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.1544 0.8747 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1417809 5 0.1485 0.8758 0.032 0.020 0.000 0.000 0.948
#> SRR1094457 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095575 5 0.2236 0.8676 0.068 0.000 0.024 0.000 0.908
#> SRR1315931 1 0.2605 0.7951 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1430066 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818002 4 0.5242 0.1277 0.004 0.444 0.000 0.516 0.036
#> SRR1344143 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486845 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362866 5 0.1251 0.8816 0.008 0.000 0.036 0.000 0.956
#> SRR1490740 5 0.3612 0.6848 0.268 0.000 0.000 0.000 0.732
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.1041 0.9291 0.004 0.964 0.000 0.000 0.032
#> SRR1416248 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1383907 4 0.0290 0.9536 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1311018 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1375699 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.2732 0.8203 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR613550 3 0.3607 0.7073 0.004 0.000 0.752 0.000 0.244
#> SRR1348402 1 0.1341 0.8877 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1345146 3 0.4088 0.6137 0.008 0.000 0.688 0.000 0.304
#> SRR1324025 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318879 3 0.0963 0.9009 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR820755 5 0.0963 0.8811 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1485830 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR599313 5 0.0880 0.8785 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR612263 5 0.1168 0.8824 0.008 0.000 0.032 0.000 0.960
#> SRR1415398 3 0.1608 0.8849 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1326205 4 0.0613 0.9496 0.004 0.008 0.000 0.984 0.004
#> SRR1421327 4 0.1728 0.9260 0.004 0.020 0.000 0.940 0.036
#> SRR1083311 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0290 0.9536 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1079522 5 0.1041 0.8821 0.004 0.000 0.032 0.000 0.964
#> SRR1452935 5 0.3074 0.7390 0.000 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1379495 1 0.0510 0.9043 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.1732 0.8796 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR615778 5 0.1121 0.8792 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1447564 5 0.3612 0.6854 0.268 0.000 0.000 0.000 0.732
#> SRR1455195 1 0.0703 0.9037 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR655182 5 0.2329 0.8320 0.124 0.000 0.000 0.000 0.876
#> SRR1335140 2 0.1282 0.9251 0.004 0.952 0.000 0.000 0.044
#> SRR1433555 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.2746 0.8328 0.008 0.872 0.008 0.000 0.112
#> SRR1388354 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1317446 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809853 5 0.1197 0.8761 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR661313 5 0.3730 0.5598 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1499935 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429408 4 0.3117 0.8442 0.004 0.100 0.000 0.860 0.036
#> SRR1433950 5 0.2074 0.8492 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 5 0.0963 0.8811 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1435229 5 0.1124 0.8821 0.004 0.000 0.036 0.000 0.960
#> SRR1085996 5 0.1195 0.8828 0.012 0.000 0.028 0.000 0.960
#> SRR1414229 3 0.0794 0.9019 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1400974 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.3274 0.6735 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR613927 5 0.1195 0.8816 0.028 0.000 0.012 0.000 0.960
#> SRR1457854 1 0.2377 0.8069 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1473714 1 0.0404 0.9067 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR813776 5 0.0963 0.8811 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR808196 1 0.4359 0.2498 0.584 0.000 0.000 0.412 0.004
#> SRR1101085 4 0.0162 0.9546 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR614395 5 0.1281 0.8814 0.032 0.000 0.012 0.000 0.956
#> SRR1478251 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0290 0.9074 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR665310 5 0.0963 0.8811 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1420109 5 0.0963 0.8811 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1330920 5 0.0963 0.8811 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1419539 3 0.1341 0.8788 0.000 0.056 0.944 0.000 0.000
#> SRR1359447 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347259 5 0.1790 0.8726 0.004 0.016 0.036 0.004 0.940
#> SRR613915 3 0.2230 0.8574 0.000 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1384395 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821715 3 0.0404 0.9079 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1478228 1 0.0404 0.9067 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1445637 5 0.3424 0.7160 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR608150 1 0.4588 0.7288 0.748 0.000 0.116 0.000 0.136
#> SRR1096383 1 0.0510 0.9061 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1341480 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1341344 1 0.3684 0.6411 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1326270 3 0.0404 0.9079 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1498838 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0404 0.9080 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR808566 4 0.1041 0.9423 0.004 0.000 0.000 0.964 0.032
#> SRR1430270 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0290 0.9093 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR661267 1 0.5470 0.5866 0.628 0.000 0.268 0.000 0.104
#> SRR810665 2 0.0162 0.9353 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 1 0.4872 0.6963 0.720 0.000 0.160 0.000 0.120
#> SRR1420067 1 0.0880 0.9003 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1473632 5 0.3586 0.6890 0.264 0.000 0.000 0.000 0.736
#> SRR812536 3 0.0162 0.9099 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1370850 2 0.0162 0.9353 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446375 5 0.6286 0.4980 0.264 0.000 0.204 0.000 0.532
#> SRR1465230 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614119 1 0.2561 0.8080 0.856 0.000 0.144 0.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0880 0.9171 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1404209 5 0.1386 0.8824 0.032 0.000 0.016 0.000 0.952
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.3182 0.8066 0.844 0.000 0.032 0.000 0.124
#> SRR660510 3 0.1965 0.8699 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1445655 4 0.0290 0.9536 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR658953 5 0.1041 0.8821 0.004 0.000 0.032 0.000 0.964
#> SRR2166459 5 0.2813 0.7945 0.168 0.000 0.000 0.000 0.832
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.0566 0.9491 0.004 0.012 0.000 0.984 0.000
#> SRR1488610 5 0.2519 0.8382 0.100 0.000 0.016 0.000 0.884
#> SRR1330588 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1433926 5 0.1121 0.8770 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1091302 4 0.0290 0.9536 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR818263 5 0.0963 0.8811 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1404909 4 0.0963 0.9422 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR663076 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1323577 2 0.0771 0.9319 0.004 0.976 0.000 0.000 0.020
#> SRR1442422 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0404 0.9067 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR654862 5 0.0963 0.8811 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1407112 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.2966 0.7969 0.000 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1353199 3 0.4415 0.4319 0.008 0.000 0.604 0.000 0.388
#> SRR1378885 3 0.1478 0.8886 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR665357 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.2732 0.8204 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1347819 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0955 0.9302 0.004 0.968 0.000 0.000 0.028
#> SRR1472576 4 0.1124 0.9402 0.004 0.000 0.000 0.960 0.036
#> SRR1431781 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 3 0.3882 0.6798 0.224 0.000 0.756 0.000 0.020
#> SRR1417632 4 0.0963 0.9422 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1350153 2 0.0865 0.9313 0.004 0.972 0.000 0.000 0.024
#> SRR1458113 3 0.0510 0.9067 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1326579 1 0.4192 0.6838 0.736 0.000 0.032 0.000 0.232
#> SRR1349363 2 0.1410 0.8922 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1096712 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.1270 0.8904 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1083752 4 0.0912 0.9445 0.000 0.016 0.000 0.972 0.012
#> SRR1377599 4 0.1124 0.9402 0.004 0.000 0.000 0.960 0.036
#> SRR1488449 3 0.2773 0.8165 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1318354 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359062 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.1638 0.8701 0.064 0.000 0.004 0.000 0.932
#> SRR663783 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319204 3 0.2036 0.8784 0.024 0.000 0.920 0.000 0.056
#> SRR1369070 2 0.0955 0.9302 0.004 0.968 0.000 0.000 0.028
#> SRR615659 5 0.1851 0.8576 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.1478 0.8708 0.000 0.064 0.936 0.000 0.000
#> SRR1498595 4 0.0794 0.9460 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1377423 5 0.4517 0.1332 0.008 0.000 0.436 0.000 0.556
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0404 0.9067 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1338426 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658941 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101643 5 0.3586 0.6878 0.264 0.000 0.000 0.000 0.736
#> SRR1401468 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0162 0.9546 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1363858 1 0.0510 0.9063 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR819820 3 0.0404 0.9063 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1337342 5 0.1043 0.8804 0.000 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR655206 2 0.4443 0.0981 0.000 0.524 0.472 0.000 0.004
#> SRR1387013 2 0.0955 0.9302 0.004 0.968 0.000 0.000 0.028
#> SRR1317410 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR608198 1 0.5049 0.0759 0.488 0.000 0.032 0.000 0.480
#> SRR1440161 2 0.2966 0.7621 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.1124 0.9278 0.004 0.960 0.000 0.000 0.036
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.0324 0.9347 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR663197 3 0.2280 0.8536 0.000 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1394836 2 0.1410 0.8927 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR661699 3 0.2424 0.8435 0.000 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR813680 5 0.2329 0.8312 0.000 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1410678 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1378109 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499174 5 0.1197 0.8761 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.0955 0.9302 0.004 0.968 0.000 0.000 0.028
#> SRR1433410 1 0.3841 0.7435 0.780 0.000 0.032 0.000 0.188
#> SRR661167 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.1478 0.8860 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR660462 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.9113 0.0272 0.276 0.184 0.192 0.312 0.036
#> SRR657949 5 0.0963 0.8811 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1308882 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1485870 2 0.4304 0.1113 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1444138 1 0.0671 0.9047 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1417342 5 0.3612 0.6848 0.268 0.000 0.000 0.000 0.732
#> SRR1470193 5 0.3741 0.7933 0.000 0.108 0.076 0.000 0.816
#> SRR1091380 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313583 4 0.0963 0.9293 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1467102 3 0.3395 0.6562 0.000 0.236 0.764 0.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.0290 0.9536 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR818821 3 0.2280 0.8500 0.000 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR809963 5 0.1043 0.8777 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1072247 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1353710 4 0.3122 0.8484 0.004 0.024 0.000 0.852 0.120
#> SRR1445259 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408393 3 0.3932 0.5830 0.000 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR1361522 5 0.1478 0.8699 0.064 0.000 0.000 0.000 0.936
#> SRR1368597 5 0.1041 0.8821 0.004 0.000 0.032 0.000 0.964
#> SRR1309680 2 0.0290 0.9348 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1310542 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406437 2 0.4761 0.6932 0.144 0.732 0.124 0.000 0.000
#> SRR1354931 3 0.0162 0.9099 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1391856 2 0.4590 0.2537 0.000 0.568 0.420 0.000 0.012
#> SRR1446738 2 0.1471 0.9205 0.004 0.952 0.024 0.000 0.020
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0324 0.9349 0.004 0.992 0.000 0.000 0.004
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0162 0.9099 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1375329 3 0.3395 0.7235 0.000 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1387921 1 0.0290 0.9071 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0510 0.9338 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1360695 1 0.0162 0.9058 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR812943 5 0.1197 0.8761 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1400910 5 0.3816 0.5852 0.000 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR1444203 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816177 2 0.1124 0.9278 0.004 0.960 0.000 0.000 0.036
#> SRR658754 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.1996 0.9155 0.004 0.032 0.000 0.928 0.036
#> SRR1397366 3 0.4300 0.1746 0.000 0.000 0.524 0.000 0.476
#> SRR1446028 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1083918 2 0.1124 0.9278 0.004 0.960 0.000 0.000 0.036
#> SRR1337606 5 0.1043 0.8806 0.000 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR659109 3 0.1608 0.8813 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1337192 1 0.3561 0.6776 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR656946 5 0.2773 0.7999 0.164 0.000 0.000 0.000 0.836
#> SRR1476102 1 0.0963 0.8984 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1476447 5 0.4273 0.1801 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR1342067 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR614419 5 0.0963 0.8780 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1322936 1 0.1965 0.8745 0.924 0.000 0.024 0.000 0.052
#> SRR1349121 1 0.2248 0.8514 0.900 0.000 0.088 0.000 0.012
#> SRR1430549 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR612935 3 0.1121 0.8960 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR661481 2 0.1124 0.9278 0.004 0.960 0.000 0.000 0.036
#> SRR1354117 2 0.2471 0.8212 0.000 0.864 0.136 0.000 0.000
#> SRR1393596 5 0.4430 0.0650 0.004 0.456 0.000 0.000 0.540
#> SRR1452164 5 0.3895 0.5970 0.320 0.000 0.000 0.000 0.680
#> SRR1070503 5 0.1478 0.8687 0.000 0.000 0.064 0.000 0.936
#> SRR1499894 3 0.1197 0.8941 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1082883 1 0.3086 0.7762 0.816 0.000 0.004 0.000 0.180
#> SRR1468271 1 0.0451 0.9060 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1332443 1 0.0404 0.9067 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR810295 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 5 0.1121 0.8770 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1328620 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396294 4 0.6991 0.2870 0.016 0.268 0.256 0.460 0.000
#> SRR1419917 5 0.2127 0.8447 0.108 0.000 0.000 0.000 0.892
#> SRR662114 3 0.4302 0.1223 0.000 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1489199 5 0.5803 0.2554 0.368 0.000 0.100 0.000 0.532
#> SRR813584 2 0.1124 0.9278 0.004 0.960 0.000 0.000 0.036
#> SRR1069638 5 0.1851 0.8551 0.000 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR614864 3 0.0162 0.9099 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1433392 5 0.1041 0.8794 0.032 0.000 0.004 0.000 0.964
#> SRR1377777 2 0.0566 0.9338 0.004 0.984 0.000 0.000 0.012
#> SRR2167710 5 0.3305 0.7382 0.224 0.000 0.000 0.000 0.776
#> SRR1401252 4 0.0880 0.9442 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1309963 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338031 5 0.3612 0.6848 0.268 0.000 0.000 0.000 0.732
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 5 0.2732 0.7979 0.000 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR1380393 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1319731 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1356468 1 0.1251 0.8883 0.956 0.036 0.008 0.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.3305 0.7253 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1486538 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.1822 0.9122 0.004 0.936 0.000 0.024 0.036
#> SRR1465459 5 0.2074 0.8348 0.000 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR1080270 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0290 0.9090 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1093148 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467080 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.1124 0.9278 0.004 0.960 0.000 0.000 0.036
#> SRR816475 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613342 3 0.3550 0.7156 0.004 0.000 0.760 0.000 0.236
#> SRR1452246 2 0.0955 0.9302 0.004 0.968 0.000 0.000 0.028
#> SRR1338836 2 0.1124 0.9278 0.004 0.960 0.000 0.000 0.036
#> SRR1369129 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.2127 0.8587 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR813824 3 0.2424 0.8424 0.000 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1082376 5 0.1106 0.8825 0.012 0.000 0.024 0.000 0.964
#> SRR1500891 4 0.0290 0.9536 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR807543 5 0.0963 0.8811 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1091572 5 0.2504 0.8652 0.040 0.000 0.064 0.000 0.896
#> SRR1346689 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332424 1 0.0404 0.9067 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR663729 1 0.0290 0.9035 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1097013 5 0.3684 0.6656 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR613675 1 0.1800 0.8806 0.932 0.000 0.048 0.000 0.020
#> SRR1485357 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655816 3 0.0162 0.9099 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1500113 1 0.0162 0.9058 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1437622 4 0.1124 0.9402 0.004 0.000 0.000 0.960 0.036
#> SRR1355172 3 0.1121 0.8883 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR655531 1 0.3424 0.7046 0.760 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR1338147 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413329 3 0.3885 0.6246 0.008 0.000 0.724 0.000 0.268
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1333308 1 0.4021 0.7537 0.780 0.168 0.000 0.000 0.052
#> SRR1452033 1 0.1851 0.8657 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0162 0.9353 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR663440 3 0.4283 0.2571 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR1471755 2 0.1124 0.9278 0.004 0.960 0.000 0.000 0.036
#> SRR808019 1 0.3612 0.6609 0.732 0.000 0.268 0.000 0.000
#> SRR1479133 3 0.0609 0.9068 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR615069 3 0.2329 0.8487 0.000 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1456185 2 0.2942 0.8289 0.008 0.856 0.008 0.000 0.128
#> SRR1350069 4 0.3811 0.7770 0.148 0.036 0.000 0.808 0.008
#> SRR816316 5 0.0963 0.8780 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR664795 5 0.2798 0.8162 0.008 0.000 0.140 0.000 0.852
#> SRR1490721 2 0.5168 0.1059 0.452 0.508 0.000 0.000 0.040
#> SRR810643 1 0.0404 0.9067 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1430333 3 0.2891 0.8047 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1085285 3 0.1732 0.8782 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1099072 5 0.1041 0.8823 0.004 0.000 0.032 0.000 0.964
#> SRR1317985 5 0.4287 0.2935 0.460 0.000 0.000 0.000 0.540
#> SRR1487340 1 0.2966 0.7765 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1420276 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.2648 0.8040 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1405525 1 0.2732 0.7988 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1370329 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1465001 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1476525 2 0.1124 0.9278 0.004 0.960 0.000 0.000 0.036
#> SRR819610 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409465 2 0.0955 0.9302 0.004 0.968 0.000 0.000 0.028
#> SRR809987 1 0.4009 0.5048 0.684 0.000 0.000 0.312 0.004
#> SRR613639 5 0.1764 0.8694 0.008 0.000 0.064 0.000 0.928
#> SRR1402285 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077038 5 0.0963 0.8811 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1405660 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 5 0.3756 0.7068 0.248 0.000 0.008 0.000 0.744
#> SRR1394734 2 0.4789 0.5376 0.004 0.668 0.000 0.292 0.036
#> SRR1317771 5 0.1041 0.8821 0.004 0.000 0.032 0.000 0.964
#> SRR1365894 2 0.3039 0.7401 0.000 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1073581 1 0.4766 0.7207 0.732 0.000 0.132 0.000 0.136
#> SRR659804 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.1124 0.9278 0.004 0.960 0.000 0.000 0.036
#> SRR1473529 4 0.5184 0.2628 0.004 0.404 0.000 0.556 0.036
#> SRR660764 3 0.2516 0.8366 0.000 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR820448 5 0.0963 0.8780 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1328845 4 0.5453 0.4423 0.328 0.060 0.000 0.604 0.008
#> SRR1336415 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459190 3 0.2424 0.8445 0.000 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1346773 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1499521 1 0.0404 0.9037 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0162 0.9353 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.3932 0.5727 0.000 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1333395 5 0.1774 0.8763 0.016 0.000 0.052 0.000 0.932
#> SRR1309248 2 0.4273 0.2493 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR809161 3 0.2773 0.8178 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1316320 2 0.3586 0.6295 0.000 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR1432629 2 0.1630 0.9185 0.004 0.944 0.000 0.016 0.036
#> SRR1498931 1 0.0290 0.9072 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1416578 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.0404 0.9067 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1309160 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 3 0.4283 0.1478 0.456 0.000 0.544 0.000 0.000
#> SRR1078489 5 0.1043 0.8806 0.000 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1332648 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660614 3 0.3013 0.8150 0.000 0.008 0.832 0.000 0.160
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1477949 5 0.1851 0.8578 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1481419 2 0.0162 0.9353 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.2424 0.8109 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR615946 5 0.4294 0.0713 0.000 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1446481 2 0.0955 0.9302 0.004 0.968 0.000 0.000 0.028
#> SRR1467656 2 0.0771 0.9319 0.004 0.976 0.000 0.000 0.020
#> SRR1402962 1 0.4291 0.2293 0.536 0.000 0.464 0.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665586 5 0.1041 0.8821 0.004 0.000 0.032 0.000 0.964
#> SRR1347166 5 0.1270 0.8761 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1485722 1 0.4535 0.7248 0.748 0.000 0.160 0.000 0.092
#> SRR1415316 5 0.1043 0.8773 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR613390 5 0.1195 0.8828 0.012 0.000 0.028 0.000 0.960
#> SRR661108 3 0.0162 0.9099 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2170173 5 0.1043 0.8777 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR817329 5 0.0963 0.8811 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1401990 4 0.0162 0.9543 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1467745 4 0.0290 0.9536 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1471795 2 0.1124 0.9278 0.004 0.960 0.000 0.000 0.036
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 5 0.0963 0.8780 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1314873 5 0.1205 0.8791 0.040 0.000 0.004 0.000 0.956
#> SRR1401211 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1419692 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818797 5 0.1668 0.8783 0.032 0.000 0.028 0.000 0.940
#> SRR2164608 3 0.1732 0.8800 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1455586 2 0.2020 0.8568 0.000 0.900 0.100 0.000 0.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.1124 0.9278 0.004 0.960 0.000 0.000 0.036
#> SRR1385501 5 0.1041 0.8821 0.004 0.000 0.032 0.000 0.964
#> SRR1361652 5 0.1282 0.8802 0.004 0.000 0.044 0.000 0.952
#> SRR1437119 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1478547 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 3 0.2230 0.8416 0.000 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1310584 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1500216 5 0.0963 0.8780 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1486762 5 0.4533 0.1726 0.008 0.000 0.448 0.000 0.544
#> SRR1480854 4 0.0963 0.9422 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1489394 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473058 4 0.0451 0.9525 0.000 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1405165 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433004 5 0.0963 0.8780 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1471477 1 0.0404 0.9037 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 2 0.4030 0.4182 0.352 0.648 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455038 5 0.4304 0.0116 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1375248 3 0.4219 0.2893 0.000 0.416 0.584 0.000 0.000
#> SRR1403005 5 0.0963 0.8811 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1348378 3 0.7227 0.0297 0.004 0.380 0.424 0.156 0.036
#> SRR1413541 5 0.0963 0.8780 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964
#> SRR1392943 1 0.4910 0.7150 0.740 0.172 0.012 0.004 0.072
#> SRR1475192 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 5 0.0963 0.8811 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1347060 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414139 3 0.4227 0.2384 0.000 0.420 0.580 0.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0609 0.9259 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.1270 0.8817 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1413436 5 0.2127 0.8441 0.108 0.000 0.000 0.000 0.892
#> SRR1311266 1 0.0290 0.9074 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1343302 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1429678 5 0.1043 0.8773 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 5 0.0963 0.8811 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1345609 5 0.4101 0.5133 0.372 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR1380208 2 0.2376 0.8728 0.052 0.904 0.000 0.000 0.044
#> SRR1322840 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1365291 3 0.0880 0.9031 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1367920 4 0.1124 0.9402 0.004 0.000 0.000 0.960 0.036
#> SRR1366648 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9356 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.0609 0.9063 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1363968 1 0.0404 0.9040 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0404 0.9067 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR657599 1 0.1043 0.8964 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1386689 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0880 0.9018 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1453811 3 0.3534 0.6686 0.000 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1441159 1 0.0162 0.9078 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1403154 4 0.0000 0.9554 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.9106 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.1197 0.8958 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 1 0.0713 0.8800 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331708 6 0.5077 0.6270 0.244 0.000 0.052 0.000 0.044 0.660
#> SRR1464258 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454201 1 0.3314 0.6549 0.740 0.000 0.256 0.000 0.000 0.004
#> SRR661589 3 0.3789 0.3641 0.000 0.000 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR1456229 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315165 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.1387 0.8628 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1417809 6 0.1092 0.8612 0.020 0.020 0.000 0.000 0.000 0.960
#> SRR1094457 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095575 6 0.1564 0.8557 0.040 0.000 0.024 0.000 0.000 0.936
#> SRR1315931 1 0.2300 0.7912 0.856 0.000 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1430066 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818002 5 0.1265 0.8444 0.000 0.044 0.000 0.008 0.948 0.000
#> SRR1344143 2 0.0260 0.8943 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1486845 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362866 6 0.1285 0.8502 0.004 0.000 0.000 0.000 0.052 0.944
#> SRR1490740 6 0.3266 0.6608 0.272 0.000 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1446627 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 5 0.1327 0.8412 0.000 0.064 0.000 0.000 0.936 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 5 0.3823 0.2829 0.000 0.000 0.000 0.436 0.564 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0146 0.8956 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1429846 3 0.2664 0.8038 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR613550 3 0.3240 0.7158 0.004 0.000 0.752 0.000 0.000 0.244
#> SRR1348402 1 0.1444 0.8649 0.928 0.000 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1345146 3 0.3563 0.5795 0.000 0.000 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1324025 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318879 3 0.0865 0.9021 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR820755 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485830 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR599313 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612263 6 0.0363 0.8666 0.012 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1415398 3 0.1267 0.8923 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1326205 4 0.0865 0.9203 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1421327 5 0.0260 0.8301 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0865 0.9241 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1079522 6 0.0146 0.8676 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1452935 6 0.2597 0.7386 0.000 0.000 0.176 0.000 0.000 0.824
#> SRR1379495 1 0.0260 0.8884 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1470459 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.1610 0.8785 0.000 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR615778 6 0.1682 0.8470 0.000 0.000 0.020 0.000 0.052 0.928
#> SRR1447564 6 0.3266 0.6615 0.272 0.000 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1455195 1 0.0790 0.8841 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR655182 6 0.1610 0.8356 0.084 0.000 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR1335140 5 0.1141 0.8440 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.0984 0.8821 0.012 0.968 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1388354 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0632 0.8874 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR809853 6 0.0547 0.8651 0.020 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR661313 6 0.3126 0.6092 0.000 0.000 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR1499935 4 0.0260 0.9416 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429408 5 0.1411 0.8304 0.000 0.004 0.000 0.060 0.936 0.000
#> SRR1433950 6 0.1501 0.8440 0.076 0.000 0.000 0.000 0.000 0.924
#> SRR1362081 2 0.0146 0.8956 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1409854 6 0.0291 0.8679 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992
#> SRR1435229 6 0.0363 0.8665 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1085996 6 0.0146 0.8680 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1414229 3 0.1845 0.8781 0.000 0.000 0.920 0.000 0.052 0.028
#> SRR1400974 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.2941 0.6675 0.780 0.000 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR613927 6 0.0363 0.8666 0.012 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1457854 1 0.2135 0.7965 0.872 0.000 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1473714 1 0.0458 0.8877 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR813776 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR808196 1 0.3782 0.2508 0.588 0.000 0.000 0.412 0.000 0.000
#> SRR1101085 4 0.0458 0.9375 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR614395 6 0.0458 0.8655 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1478251 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0713 0.8848 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1362310 1 0.0146 0.8898 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR665310 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420109 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1330920 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419539 3 0.0458 0.9053 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359447 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347259 6 0.1498 0.8505 0.000 0.000 0.028 0.000 0.032 0.940
#> SRR613915 3 0.1957 0.8619 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1384395 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821715 3 0.0146 0.9108 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1478228 1 0.0458 0.8877 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1445637 6 0.3076 0.6925 0.240 0.000 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR608150 1 0.5211 0.6819 0.692 0.000 0.116 0.000 0.052 0.140
#> SRR1096383 1 0.0547 0.8873 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1341480 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341344 1 0.4508 0.5355 0.632 0.000 0.000 0.000 0.052 0.316
#> SRR1326270 3 0.0146 0.9108 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1498838 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0363 0.9090 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR808566 5 0.3409 0.5640 0.000 0.000 0.000 0.300 0.700 0.000
#> SRR1430270 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0260 0.9102 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR661267 1 0.4934 0.5748 0.628 0.000 0.264 0.000 0.000 0.108
#> SRR810665 2 0.0458 0.8894 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1407250 1 0.4593 0.6878 0.716 0.000 0.124 0.000 0.008 0.152
#> SRR1420067 1 0.1367 0.8768 0.944 0.000 0.000 0.000 0.012 0.044
#> SRR1473632 6 0.3244 0.6648 0.268 0.000 0.000 0.000 0.000 0.732
#> SRR812536 3 0.0146 0.9106 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1370850 5 0.3838 0.2975 0.000 0.448 0.000 0.000 0.552 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.0363 0.8887 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446375 6 0.5646 0.4777 0.264 0.000 0.204 0.000 0.000 0.532
#> SRR1465230 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614119 1 0.2300 0.7855 0.856 0.000 0.144 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0146 0.8946 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 6 0.0622 0.8674 0.012 0.000 0.008 0.000 0.000 0.980
#> SRR1392676 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.2868 0.7991 0.840 0.000 0.028 0.000 0.000 0.132
#> SRR660510 3 0.1814 0.8689 0.000 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1445655 4 0.0790 0.9263 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR658953 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166459 6 0.2260 0.7966 0.140 0.000 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1070713 5 0.3266 0.6284 0.000 0.272 0.000 0.000 0.728 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.0260 0.9406 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1488610 6 0.1556 0.8285 0.080 0.000 0.000 0.000 0.000 0.920
#> SRR1330588 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433926 6 0.0458 0.8655 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1091302 4 0.1007 0.9184 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR818263 6 0.0363 0.8662 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1404909 5 0.1663 0.8165 0.000 0.000 0.000 0.088 0.912 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 5 0.3175 0.6828 0.000 0.256 0.000 0.000 0.744 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0458 0.8877 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR654862 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407112 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.2823 0.7821 0.000 0.000 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1353199 3 0.4199 0.3642 0.016 0.000 0.568 0.000 0.000 0.416
#> SRR1378885 3 0.1141 0.8954 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR665357 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.2597 0.8101 0.000 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1347819 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480813 5 0.1765 0.8262 0.000 0.096 0.000 0.000 0.904 0.000
#> SRR1472576 5 0.1267 0.8292 0.000 0.000 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 3 0.3593 0.6721 0.228 0.000 0.748 0.000 0.000 0.024
#> SRR1417632 5 0.1957 0.7989 0.000 0.000 0.000 0.112 0.888 0.000
#> SRR1350153 2 0.2969 0.6821 0.000 0.776 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1458113 3 0.1549 0.8869 0.000 0.000 0.936 0.000 0.044 0.020
#> SRR1326579 1 0.4291 0.6291 0.680 0.000 0.000 0.000 0.052 0.268
#> SRR1349363 2 0.0622 0.8893 0.000 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1096712 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.1327 0.8826 0.000 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1083752 5 0.2883 0.6997 0.000 0.000 0.000 0.212 0.788 0.000
#> SRR1377599 5 0.1267 0.8292 0.000 0.000 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1488449 3 0.2664 0.8028 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1318354 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359062 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 6 0.0790 0.8622 0.032 0.000 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR663783 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319204 3 0.2207 0.8678 0.016 0.008 0.900 0.000 0.000 0.076
#> SRR1369070 2 0.3789 0.3090 0.000 0.584 0.000 0.000 0.416 0.000
#> SRR615659 6 0.1610 0.8381 0.084 0.000 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR1337449 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.1387 0.8658 0.000 0.068 0.932 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498595 4 0.3727 0.3708 0.000 0.000 0.000 0.612 0.388 0.000
#> SRR1377423 6 0.4184 0.1945 0.016 0.000 0.408 0.000 0.000 0.576
#> SRR1312310 2 0.0146 0.8956 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1485613 1 0.0458 0.8877 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1338426 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658941 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101643 6 0.3221 0.6669 0.264 0.000 0.000 0.000 0.000 0.736
#> SRR1401468 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.0146 0.8956 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1324085 4 0.0713 0.9291 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1363858 1 0.0603 0.8881 0.980 0.000 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR819820 3 0.0146 0.9102 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337342 6 0.1141 0.8512 0.000 0.000 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR655206 2 0.2340 0.7371 0.000 0.852 0.148 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387013 5 0.1141 0.8328 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608198 6 0.4783 0.0586 0.428 0.000 0.000 0.000 0.052 0.520
#> SRR1440161 2 0.1285 0.8519 0.000 0.944 0.052 0.000 0.004 0.000
#> SRR1343741 2 0.3810 0.2832 0.000 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.0806 0.8844 0.000 0.972 0.008 0.000 0.020 0.000
#> SRR663197 3 0.2362 0.8433 0.000 0.000 0.860 0.000 0.004 0.136
#> SRR1394836 2 0.0937 0.8629 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000 0.000
#> SRR661699 3 0.2135 0.8509 0.000 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR813680 6 0.1863 0.8099 0.000 0.000 0.104 0.000 0.000 0.896
#> SRR1410678 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499174 6 0.0547 0.8651 0.020 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR1311486 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 5 0.1141 0.8328 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1433410 1 0.4033 0.6946 0.724 0.000 0.000 0.000 0.052 0.224
#> SRR661167 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.1387 0.8849 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR660462 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 1 0.7386 0.1265 0.388 0.024 0.224 0.316 0.008 0.040
#> SRR657949 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308882 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 6 0.4716 0.5559 0.000 0.136 0.000 0.000 0.184 0.680
#> SRR1444138 1 0.0508 0.8881 0.984 0.000 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR1417342 6 0.3266 0.6608 0.272 0.000 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1470193 6 0.3790 0.7114 0.000 0.156 0.072 0.000 0.000 0.772
#> SRR1091380 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 4 0.0937 0.9095 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1467102 3 0.0363 0.9069 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.1501 0.8864 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR818821 3 0.2378 0.8268 0.000 0.000 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR809963 6 0.0260 0.8674 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1072247 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 5 0.2704 0.7722 0.000 0.000 0.000 0.140 0.844 0.016
#> SRR1445259 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408393 3 0.3563 0.5753 0.000 0.000 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1361522 6 0.1075 0.8565 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1368597 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309680 5 0.3838 0.2689 0.000 0.448 0.000 0.000 0.552 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406437 2 0.5758 0.1175 0.368 0.456 0.176 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354931 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391856 3 0.6012 0.0741 0.000 0.336 0.448 0.000 0.212 0.004
#> SRR1446738 5 0.3539 0.6832 0.000 0.220 0.024 0.000 0.756 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.3288 0.5648 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0146 0.9108 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1375329 3 0.3076 0.7278 0.000 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1387921 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0146 0.8956 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1360478 2 0.2631 0.7412 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812943 6 0.0547 0.8651 0.020 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR1400910 6 0.3371 0.5860 0.000 0.000 0.292 0.000 0.000 0.708
#> SRR1444203 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816177 5 0.0713 0.8365 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.3789 0.2991 0.000 0.000 0.000 0.584 0.416 0.000
#> SRR1397366 3 0.3868 0.1223 0.000 0.000 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1446028 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 5 0.1204 0.8439 0.000 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR1337606 6 0.1141 0.8512 0.000 0.000 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR659109 3 0.1501 0.8802 0.000 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1337192 1 0.4426 0.5839 0.652 0.000 0.000 0.000 0.052 0.296
#> SRR656946 6 0.2260 0.7999 0.140 0.000 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1476102 1 0.1141 0.8752 0.948 0.000 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1476447 6 0.4736 0.2365 0.396 0.000 0.000 0.000 0.052 0.552
#> SRR1342067 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614419 6 0.1141 0.8512 0.000 0.000 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1322936 1 0.2862 0.8365 0.872 0.000 0.020 0.000 0.052 0.056
#> SRR1349121 1 0.2019 0.8352 0.900 0.000 0.088 0.000 0.000 0.012
#> SRR1430549 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.1007 0.8972 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR661481 5 0.1141 0.8440 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1354117 2 0.1349 0.8485 0.000 0.940 0.056 0.000 0.004 0.000
#> SRR1393596 5 0.1265 0.8267 0.000 0.044 0.000 0.000 0.948 0.008
#> SRR1452164 6 0.3409 0.6120 0.300 0.000 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1070503 6 0.0632 0.8601 0.000 0.000 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1499894 3 0.1204 0.8922 0.000 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1082883 1 0.3896 0.7204 0.744 0.000 0.000 0.000 0.052 0.204
#> SRR1468271 1 0.0508 0.8870 0.984 0.000 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR1332443 1 0.0458 0.8877 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR810295 2 0.0146 0.8956 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR662103 6 0.0458 0.8655 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1328620 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396294 4 0.5415 0.2605 0.020 0.068 0.400 0.512 0.000 0.000
#> SRR1419917 6 0.1863 0.8253 0.104 0.000 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR662114 6 0.4808 -0.0421 0.000 0.000 0.468 0.000 0.052 0.480
#> SRR1489199 6 0.5045 0.2651 0.364 0.000 0.084 0.000 0.000 0.552
#> SRR813584 5 0.1501 0.8390 0.000 0.076 0.000 0.000 0.924 0.000
#> SRR1069638 6 0.0937 0.8524 0.000 0.000 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR614864 3 0.1219 0.8891 0.000 0.000 0.948 0.000 0.048 0.004
#> SRR1433392 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377777 5 0.2854 0.7328 0.000 0.208 0.000 0.000 0.792 0.000
#> SRR2167710 6 0.2912 0.7277 0.216 0.000 0.000 0.000 0.000 0.784
#> SRR1401252 4 0.3126 0.6590 0.000 0.000 0.000 0.752 0.248 0.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338031 6 0.3266 0.6608 0.272 0.000 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1418628 2 0.0146 0.8956 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1486889 6 0.2454 0.7593 0.000 0.000 0.160 0.000 0.000 0.840
#> SRR1380393 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.0622 0.8857 0.980 0.012 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.3337 0.6754 0.736 0.000 0.000 0.000 0.004 0.260
#> SRR1486538 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377696 5 0.0363 0.8352 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1465459 6 0.1327 0.8323 0.000 0.000 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR1080270 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0260 0.9100 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1093148 3 0.0146 0.9102 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467080 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 5 0.1267 0.8421 0.000 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR816475 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613342 3 0.3265 0.7080 0.004 0.000 0.748 0.000 0.000 0.248
#> SRR1452246 5 0.3244 0.6241 0.000 0.268 0.000 0.000 0.732 0.000
#> SRR1338836 2 0.3797 0.3035 0.000 0.580 0.000 0.000 0.420 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.2135 0.8443 0.000 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR813824 3 0.2491 0.8189 0.000 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1082376 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500891 4 0.1007 0.9176 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR807543 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091572 6 0.3049 0.8240 0.040 0.000 0.052 0.000 0.044 0.864
#> SRR1346689 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332424 1 0.1528 0.8713 0.936 0.000 0.000 0.000 0.048 0.016
#> SRR663729 1 0.1398 0.8680 0.940 0.008 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1097013 6 0.3288 0.6475 0.276 0.000 0.000 0.000 0.000 0.724
#> SRR613675 1 0.2583 0.8477 0.888 0.000 0.044 0.000 0.052 0.016
#> SRR1485357 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0146 0.8892 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 5 0.1141 0.8314 0.000 0.000 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1355172 3 0.0790 0.8951 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000
#> SRR655531 1 0.4332 0.6174 0.672 0.000 0.000 0.000 0.052 0.276
#> SRR1338147 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413329 3 0.3650 0.6227 0.004 0.000 0.716 0.000 0.008 0.272
#> SRR1485931 2 0.0146 0.8956 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 1 0.3897 0.7059 0.756 0.196 0.000 0.000 0.008 0.040
#> SRR1452033 1 0.1610 0.8548 0.916 0.000 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1467316 2 0.0146 0.8956 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0632 0.8876 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR663440 3 0.3868 0.1573 0.000 0.000 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1471755 5 0.1267 0.8432 0.000 0.060 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR808019 1 0.3244 0.6415 0.732 0.000 0.268 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479133 3 0.0458 0.9091 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR615069 3 0.3276 0.8161 0.000 0.000 0.816 0.000 0.052 0.132
#> SRR1456185 2 0.2315 0.8306 0.016 0.892 0.000 0.000 0.084 0.008
#> SRR1350069 4 0.3592 0.7541 0.116 0.068 0.000 0.808 0.000 0.008
#> SRR816316 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR664795 6 0.2553 0.7734 0.008 0.000 0.144 0.000 0.000 0.848
#> SRR1490721 5 0.4901 -0.0616 0.456 0.060 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR810643 1 0.0458 0.8877 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1430333 3 0.3776 0.7649 0.000 0.000 0.760 0.000 0.052 0.188
#> SRR1085285 3 0.1556 0.8784 0.000 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1099072 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317985 6 0.3854 0.2731 0.464 0.000 0.000 0.000 0.000 0.536
#> SRR1487340 1 0.2883 0.7424 0.788 0.000 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR1420276 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.2416 0.8064 0.000 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1405525 1 0.2762 0.7578 0.804 0.000 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1370329 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 5 0.1204 0.8434 0.000 0.056 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR819610 5 0.3860 0.2231 0.000 0.472 0.000 0.000 0.528 0.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.3717 0.3769 0.000 0.616 0.000 0.000 0.384 0.000
#> SRR809987 1 0.3464 0.5047 0.688 0.000 0.000 0.312 0.000 0.000
#> SRR613639 6 0.1219 0.8476 0.004 0.000 0.048 0.000 0.000 0.948
#> SRR1402285 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077038 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 6 0.3398 0.6825 0.252 0.000 0.008 0.000 0.000 0.740
#> SRR1394734 5 0.1141 0.8440 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1317771 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365894 2 0.5961 0.1305 0.000 0.452 0.000 0.000 0.264 0.284
#> SRR1073581 1 0.4343 0.7036 0.724 0.000 0.120 0.000 0.000 0.156
#> SRR659804 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 5 0.1387 0.8413 0.000 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000
#> SRR1473529 5 0.1391 0.8437 0.000 0.040 0.000 0.016 0.944 0.000
#> SRR660764 3 0.2597 0.8100 0.000 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR820448 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1328845 4 0.5272 0.4706 0.268 0.128 0.000 0.600 0.000 0.004
#> SRR1336415 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459190 3 0.2178 0.8476 0.000 0.000 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1346773 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0547 0.8840 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0363 0.8916 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1347459 3 0.3684 0.5038 0.000 0.000 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1081209 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 6 0.1693 0.8473 0.020 0.004 0.044 0.000 0.000 0.932
#> SRR1309248 6 0.5087 0.2931 0.000 0.092 0.000 0.000 0.348 0.560
#> SRR809161 3 0.2527 0.8206 0.000 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1316320 6 0.5564 0.2753 0.000 0.328 0.000 0.000 0.156 0.516
#> SRR1432629 5 0.1141 0.8440 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1498931 1 0.0146 0.8894 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1416578 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.1461 0.8735 0.940 0.000 0.000 0.000 0.044 0.016
#> SRR1309160 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 3 0.3833 0.1935 0.444 0.000 0.556 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332648 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660614 3 0.3012 0.7860 0.000 0.008 0.796 0.000 0.000 0.196
#> SRR1470420 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 6 0.1387 0.8468 0.068 0.000 0.000 0.000 0.000 0.932
#> SRR1481419 2 0.0458 0.8894 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1464766 1 0.2260 0.7994 0.860 0.000 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR615946 6 0.3847 0.1003 0.000 0.000 0.456 0.000 0.000 0.544
#> SRR1446481 5 0.2260 0.7971 0.000 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1467656 2 0.2562 0.7485 0.000 0.828 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1402962 1 0.3854 0.2368 0.536 0.000 0.464 0.000 0.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665586 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347166 6 0.1845 0.8436 0.000 0.000 0.028 0.000 0.052 0.920
#> SRR1485722 1 0.4095 0.7103 0.748 0.000 0.152 0.000 0.000 0.100
#> SRR1415316 6 0.0146 0.8680 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR613390 6 0.0146 0.8680 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR661108 3 0.0146 0.9108 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2170173 6 0.0146 0.8683 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR817329 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401990 4 0.0547 0.9326 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1467745 5 0.3823 0.2829 0.000 0.000 0.000 0.436 0.564 0.000
#> SRR1471795 5 0.1141 0.8440 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1314873 6 0.0458 0.8655 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1401211 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818797 6 0.0713 0.8590 0.000 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR2164608 3 0.1556 0.8802 0.000 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1455586 2 0.1204 0.8489 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000 0.000
#> SRR819459 3 0.0146 0.9108 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1488939 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 5 0.1141 0.8440 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1385501 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361652 6 0.0291 0.8675 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992
#> SRR1437119 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 3 0.2048 0.8413 0.000 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1310584 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 6 0.0146 0.8684 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1486762 6 0.4224 0.1989 0.016 0.000 0.432 0.000 0.000 0.552
#> SRR1480854 4 0.3151 0.6589 0.000 0.000 0.000 0.748 0.252 0.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473058 5 0.3823 0.2862 0.000 0.000 0.000 0.436 0.564 0.000
#> SRR1405165 3 0.0260 0.9095 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1433004 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1471477 1 0.0458 0.8854 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 2 0.3351 0.5183 0.288 0.712 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455038 6 0.3843 0.0960 0.452 0.000 0.000 0.000 0.000 0.548
#> SRR1375248 2 0.2048 0.7725 0.000 0.880 0.120 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348378 2 0.4027 0.5400 0.000 0.672 0.012 0.008 0.308 0.000
#> SRR1413541 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1392943 1 0.4831 0.7157 0.744 0.076 0.004 0.000 0.084 0.092
#> SRR1475192 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 6 0.0146 0.8676 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1347060 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414139 3 0.1141 0.8816 0.000 0.052 0.948 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0291 0.8943 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR1415004 1 0.1141 0.8654 0.948 0.000 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1413436 6 0.2776 0.8167 0.088 0.000 0.000 0.000 0.052 0.860
#> SRR1311266 1 0.0363 0.8886 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1343302 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 6 0.0146 0.8680 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1469413 2 0.0000 0.8960 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 6 0.0000 0.8681 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345609 6 0.3684 0.4979 0.372 0.000 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR1380208 2 0.4951 0.2454 0.032 0.572 0.000 0.000 0.372 0.024
#> SRR1322840 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0146 0.8897 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1365291 3 0.0865 0.9032 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1367920 5 0.0260 0.8301 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0260 0.8943 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1082173 3 0.0547 0.9073 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1363968 1 0.0547 0.8845 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0458 0.8877 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR657599 1 0.1267 0.8710 0.940 0.000 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1386689 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0865 0.9007 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1453811 3 0.3309 0.6413 0.000 0.000 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1441159 1 0.0000 0.8899 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.9464 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.9116 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.1075 0.8970 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.995 0.998 0.4755 0.525 0.525
#> 3 3 0.716 0.837 0.879 0.3354 0.812 0.642
#> 4 4 0.576 0.655 0.782 0.1040 0.900 0.728
#> 5 5 0.570 0.652 0.770 0.0786 0.897 0.668
#> 6 6 0.614 0.540 0.729 0.0509 0.897 0.611
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1331708 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1464258 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR661589 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1315165 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1417809 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1094457 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1095575 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1315931 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1430066 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1431037 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1395554 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR818002 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1344143 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1486845 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1362866 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1456138 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1416248 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1383907 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1311018 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1429846 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR613550 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1324025 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1318879 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR820755 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1485830 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR599313 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR612263 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1415398 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326205 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1421327 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1083311 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1499303 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1079522 1 0.118 0.982 0.984 0.016
#> SRR1452935 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1379495 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR661361 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR655182 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1433555 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1388354 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1317446 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1413602 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR809853 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR661313 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1499935 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1447303 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1429408 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1433950 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1409854 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1435229 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1414229 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1400974 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR613927 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473714 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR813776 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR808196 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1101085 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR614395 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1478251 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1370551 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1362310 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR665310 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1420109 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1330920 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1419539 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1359447 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1347259 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR613915 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1384395 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR821715 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR608150 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1341480 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1341344 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326270 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1498838 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416313 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR808566 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1430270 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1367825 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR613533 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR661267 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR810665 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1407250 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1420067 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR812536 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1486195 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1407671 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1446375 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1465230 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1404209 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR665538 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR660510 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1445655 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR658953 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1485312 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1317631 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1488610 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1330588 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1091302 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR818263 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1404909 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR663076 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1442422 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1465893 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR654862 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1407112 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1332969 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1353199 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1378885 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR665357 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR662186 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1501020 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1347819 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1472576 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1431781 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1452270 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1417632 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1350153 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1458113 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1326579 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1096712 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1090407 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1377599 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1488449 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1318354 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1359062 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1398924 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR663783 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1319204 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1369070 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR615659 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1316982 2 0.278 0.948 0.048 0.952
#> SRR1498595 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1377423 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1485613 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1338426 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1353309 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR658941 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1101643 2 0.722 0.751 0.200 0.800
#> SRR1401468 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1324085 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1363858 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR819820 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1337342 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR655206 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1387013 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1317410 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR608198 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1343741 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1381288 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1415379 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1099622 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR663197 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1394836 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR661699 2 0.808 0.672 0.248 0.752
#> SRR813680 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1378109 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1499174 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1382851 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1433410 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR661167 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432518 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR660462 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1374608 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR657949 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1308882 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR655768 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1485870 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1444138 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1470193 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1091380 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1313583 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1467102 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1485416 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR818821 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR809963 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1353710 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1445259 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1408393 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1310542 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333485 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1406437 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1354931 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1391856 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1446738 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1309032 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1388145 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1432611 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR815869 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR613150 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1375329 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1387921 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1360478 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1360695 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR812943 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1400910 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1444203 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR816177 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR658754 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1429603 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1397366 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1337606 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR659109 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR656946 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1342067 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1385389 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1075971 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR614419 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR612935 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR661481 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1354117 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1393596 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1452164 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1070503 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1499894 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1082883 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR810295 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR662103 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1328620 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1396294 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1419917 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR662114 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1489199 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR813584 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1069638 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR614864 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR2167710 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1401252 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1309963 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1486889 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1356468 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1337010 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1486520 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1486538 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1340486 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1377696 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1465459 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1080270 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1312501 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1093148 1 0.760 0.718 0.780 0.220
#> SRR1467080 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR816475 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1379198 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR613342 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1338836 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1369129 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1396616 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR813824 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1500891 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR807543 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1346689 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1332424 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR663729 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1097013 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR613675 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1485357 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR655816 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1355172 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR655531 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1338147 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1413329 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1485931 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1420873 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333308 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1452033 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR809018 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR663440 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR808019 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1479133 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR615069 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1456185 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1350069 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR816316 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR664795 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1490721 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR810643 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1085285 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1099072 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1420276 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1351347 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.881 0.571 0.700 0.300
#> SRR1465001 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR819610 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR2157314 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR809987 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR613639 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1402285 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1077038 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1405660 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1394734 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1317771 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1073581 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR659804 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1432186 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1473529 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR660764 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR820448 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1328845 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1336415 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1379065 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1459190 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1346773 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1347459 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1400202 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1333395 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1309248 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR809161 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1316320 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1432629 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1498931 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416578 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1405547 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1470534 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1309160 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR663489 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1078489 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1332648 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR660614 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1475566 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1464766 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR615946 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1467656 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1402962 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR660224 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR665586 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR613390 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR661108 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR817329 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1401990 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1467745 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1471795 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1415637 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR813137 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR818797 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR2164608 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1455586 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR819459 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1433232 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1385501 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1361652 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1437119 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1478547 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1430910 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310584 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1500216 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1486762 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1480854 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1489394 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1418085 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1340221 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1473058 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1405165 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1098712 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1455038 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1403005 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1413541 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1392943 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1475192 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1452468 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1347060 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1447962 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1444324 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1415004 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1343302 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1373746 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1405331 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1322840 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1399797 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1416654 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1315081 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1369196 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1365291 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1367920 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1366648 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1082173 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1363968 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR814387 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR657599 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1386689 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1395575 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1453811 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1441159 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1403154 2 0.000 0.997 0.000 1.000
#> SRR1468722 1 0.000 0.998 1.000 0.000
#> SRR1310275 1 0.000 0.998 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 1 0.5058 0.8507 0.756 0.000 0.244
#> SRR1331708 1 0.4654 0.7837 0.792 0.000 0.208
#> SRR1464258 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1454201 1 0.4750 0.8175 0.784 0.000 0.216
#> SRR661589 3 0.1163 0.8475 0.028 0.000 0.972
#> SRR1456229 1 0.6305 0.3299 0.516 0.000 0.484
#> SRR1315165 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1488960 1 0.5098 0.8514 0.752 0.000 0.248
#> SRR1417809 2 0.1411 0.9691 0.036 0.964 0.000
#> SRR1094457 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1095575 3 0.5363 0.5633 0.276 0.000 0.724
#> SRR1315931 1 0.4346 0.8574 0.816 0.000 0.184
#> SRR1430066 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR818002 2 0.0592 0.9779 0.012 0.988 0.000
#> SRR1344143 2 0.1753 0.9708 0.048 0.952 0.000
#> SRR1486845 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1362866 1 0.4702 0.7863 0.788 0.000 0.212
#> SRR1490740 1 0.5178 0.8431 0.744 0.000 0.256
#> SRR1446627 2 0.1643 0.9713 0.044 0.956 0.000
#> SRR1456138 2 0.1753 0.9711 0.048 0.952 0.000
#> SRR1416248 1 0.3816 0.8436 0.852 0.000 0.148
#> SRR1383907 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1311018 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1375699 2 0.1529 0.9672 0.040 0.960 0.000
#> SRR1429846 3 0.4002 0.7531 0.160 0.000 0.840
#> SRR613550 3 0.2261 0.8353 0.068 0.000 0.932
#> SRR1348402 1 0.5138 0.8450 0.748 0.000 0.252
#> SRR1345146 3 0.2711 0.8230 0.088 0.000 0.912
#> SRR1324025 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318879 3 0.0747 0.8481 0.016 0.000 0.984
#> SRR820755 3 0.5216 0.5903 0.260 0.000 0.740
#> SRR1485830 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR599313 2 0.2537 0.9428 0.080 0.920 0.000
#> SRR612263 1 0.5058 0.8566 0.756 0.000 0.244
#> SRR1415398 3 0.0424 0.8467 0.008 0.000 0.992
#> SRR1326205 2 0.0000 0.9779 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421327 2 0.0237 0.9776 0.004 0.996 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499303 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1079522 3 0.8401 -0.2323 0.444 0.084 0.472
#> SRR1452935 3 0.0424 0.8483 0.008 0.000 0.992
#> SRR1379495 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1470459 2 0.2165 0.9673 0.064 0.936 0.000
#> SRR661361 3 0.6252 -0.1472 0.444 0.000 0.556
#> SRR615778 1 0.4555 0.7958 0.800 0.000 0.200
#> SRR1447564 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1455195 1 0.4121 0.8202 0.832 0.000 0.168
#> SRR655182 3 0.6267 -0.0485 0.452 0.000 0.548
#> SRR1335140 2 0.0747 0.9776 0.016 0.984 0.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308650 2 0.1643 0.9653 0.044 0.956 0.000
#> SRR1388354 1 0.4887 0.8589 0.772 0.000 0.228
#> SRR1317446 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413602 3 0.0592 0.8482 0.012 0.000 0.988
#> SRR1479955 2 0.1643 0.9713 0.044 0.956 0.000
#> SRR809853 1 0.4796 0.8619 0.780 0.000 0.220
#> SRR661313 3 0.3116 0.8139 0.108 0.000 0.892
#> SRR1499935 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1447303 3 0.0424 0.8461 0.008 0.000 0.992
#> SRR1429408 2 0.0237 0.9776 0.004 0.996 0.000
#> SRR1433950 1 0.4842 0.8602 0.776 0.000 0.224
#> SRR1362081 2 0.2066 0.9685 0.060 0.940 0.000
#> SRR1409854 3 0.5968 0.3052 0.364 0.000 0.636
#> SRR1435229 1 0.5291 0.7814 0.732 0.000 0.268
#> SRR1085996 1 0.4399 0.8531 0.812 0.000 0.188
#> SRR1414229 1 0.4654 0.7898 0.792 0.000 0.208
#> SRR1400974 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399971 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR613927 1 0.6309 0.2742 0.504 0.000 0.496
#> SRR1457854 1 0.5291 0.8309 0.732 0.000 0.268
#> SRR1473714 2 0.2537 0.9428 0.080 0.920 0.000
#> SRR813776 3 0.4346 0.7195 0.184 0.000 0.816
#> SRR808196 2 0.1289 0.9707 0.032 0.968 0.000
#> SRR1101085 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR614395 1 0.5678 0.7725 0.684 0.000 0.316
#> SRR1478251 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1370551 2 0.1643 0.9713 0.044 0.956 0.000
#> SRR1362310 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR665310 3 0.2878 0.8211 0.096 0.000 0.904
#> SRR1420109 3 0.2261 0.8340 0.068 0.000 0.932
#> SRR1330920 1 0.5678 0.7872 0.684 0.000 0.316
#> SRR1419539 2 0.0892 0.9743 0.020 0.980 0.000
#> SRR1359447 3 0.1031 0.8473 0.024 0.000 0.976
#> SRR1347259 2 0.0000 0.9779 0.000 1.000 0.000
#> SRR613915 3 0.4750 0.6622 0.216 0.000 0.784
#> SRR1384395 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR821715 3 0.2356 0.8350 0.072 0.000 0.928
#> SRR1478228 1 0.4555 0.8606 0.800 0.000 0.200
#> SRR1445637 3 0.6168 0.1697 0.412 0.000 0.588
#> SRR608150 1 0.4555 0.7839 0.800 0.000 0.200
#> SRR1096383 1 0.5058 0.8507 0.756 0.000 0.244
#> SRR1341480 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1341344 1 0.3192 0.8199 0.888 0.000 0.112
#> SRR1326270 3 0.4654 0.7063 0.208 0.000 0.792
#> SRR1498838 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR808566 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1430270 2 0.0424 0.9771 0.008 0.992 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR613533 3 0.1753 0.8417 0.048 0.000 0.952
#> SRR661267 1 0.5905 0.7080 0.648 0.000 0.352
#> SRR810665 2 0.1643 0.9713 0.044 0.956 0.000
#> SRR1407250 1 0.4555 0.8059 0.800 0.000 0.200
#> SRR1420067 1 0.4121 0.8343 0.832 0.000 0.168
#> SRR1473632 1 0.5835 0.7402 0.660 0.000 0.340
#> SRR812536 3 0.2261 0.8329 0.068 0.000 0.932
#> SRR1370850 2 0.1643 0.9723 0.044 0.956 0.000
#> SRR1486195 2 0.2165 0.9673 0.064 0.936 0.000
#> SRR1407671 2 0.1289 0.9708 0.032 0.968 0.000
#> SRR1446375 3 0.3482 0.7997 0.128 0.000 0.872
#> SRR1465230 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR614119 1 0.5327 0.8274 0.728 0.000 0.272
#> SRR1356101 2 0.2165 0.9673 0.064 0.936 0.000
#> SRR1404209 3 0.5058 0.6489 0.244 0.000 0.756
#> SRR1392676 2 0.1643 0.9713 0.044 0.956 0.000
#> SRR665538 1 0.5397 0.8190 0.720 0.000 0.280
#> SRR660510 3 0.0237 0.8464 0.004 0.000 0.996
#> SRR1445655 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR658953 3 0.5905 0.3004 0.352 0.000 0.648
#> SRR2166459 3 0.5905 0.3953 0.352 0.000 0.648
#> SRR1070713 2 0.0237 0.9776 0.004 0.996 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317631 2 0.0000 0.9779 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488610 1 0.4750 0.7886 0.784 0.000 0.216
#> SRR1330588 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316367 1 0.4702 0.8242 0.788 0.000 0.212
#> SRR1433926 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1091302 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR818263 1 0.4399 0.8506 0.812 0.000 0.188
#> SRR1404909 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR663076 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1323577 2 0.1643 0.9713 0.044 0.956 0.000
#> SRR1442422 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1465893 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR654862 1 0.6305 0.4051 0.516 0.000 0.484
#> SRR1407112 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1332969 3 0.0424 0.8467 0.008 0.000 0.992
#> SRR1353199 3 0.3116 0.8141 0.108 0.000 0.892
#> SRR1378885 3 0.2066 0.8324 0.060 0.000 0.940
#> SRR665357 3 0.0237 0.8475 0.004 0.000 0.996
#> SRR662186 2 0.1964 0.9695 0.056 0.944 0.000
#> SRR1501020 3 0.3038 0.8152 0.104 0.000 0.896
#> SRR1347819 3 0.0237 0.8470 0.004 0.000 0.996
#> SRR1480813 2 0.1753 0.9711 0.048 0.952 0.000
#> SRR1472576 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1431781 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500472 1 0.5835 0.7092 0.660 0.000 0.340
#> SRR1417632 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1350153 2 0.1753 0.9711 0.048 0.952 0.000
#> SRR1458113 1 0.5621 0.7172 0.692 0.000 0.308
#> SRR1326579 1 0.4555 0.8101 0.800 0.000 0.200
#> SRR1349363 2 0.2165 0.9675 0.064 0.936 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1090407 3 0.0237 0.8470 0.004 0.000 0.996
#> SRR1083752 2 0.0592 0.9779 0.012 0.988 0.000
#> SRR1377599 2 0.0237 0.9776 0.004 0.996 0.000
#> SRR1488449 3 0.0424 0.8480 0.008 0.000 0.992
#> SRR1318354 1 0.6225 0.5383 0.568 0.000 0.432
#> SRR1359062 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398924 1 0.4842 0.7930 0.776 0.000 0.224
#> SRR663783 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319204 3 0.1643 0.8435 0.044 0.000 0.956
#> SRR1369070 2 0.1753 0.9711 0.048 0.952 0.000
#> SRR615659 1 0.4842 0.8602 0.776 0.000 0.224
#> SRR1337449 2 0.1753 0.9709 0.048 0.952 0.000
#> SRR1316982 2 0.4269 0.9062 0.052 0.872 0.076
#> SRR1498595 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1377423 3 0.2959 0.8192 0.100 0.000 0.900
#> SRR1312310 2 0.1753 0.9709 0.048 0.952 0.000
#> SRR1485613 1 0.5591 0.7888 0.696 0.000 0.304
#> SRR1338426 3 0.0892 0.8478 0.020 0.000 0.980
#> SRR1353309 3 0.0424 0.8480 0.008 0.000 0.992
#> SRR658941 1 0.5706 0.7391 0.680 0.000 0.320
#> SRR1101643 2 0.6168 0.4218 0.412 0.588 0.000
#> SRR1401468 1 0.3340 0.8258 0.880 0.000 0.120
#> SRR1368874 2 0.1860 0.9702 0.052 0.948 0.000
#> SRR1324085 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1363858 2 0.2448 0.9458 0.076 0.924 0.000
#> SRR819820 3 0.5621 0.4168 0.308 0.000 0.692
#> SRR1337342 1 0.4654 0.8142 0.792 0.000 0.208
#> SRR655206 2 0.0892 0.9743 0.020 0.980 0.000
#> SRR1387013 2 0.0424 0.9782 0.008 0.992 0.000
#> SRR1317410 1 0.3816 0.8435 0.852 0.000 0.148
#> SRR608198 1 0.4399 0.8026 0.812 0.000 0.188
#> SRR1440161 2 0.2165 0.9673 0.064 0.936 0.000
#> SRR1343741 2 0.1753 0.9711 0.048 0.952 0.000
#> SRR1381288 2 0.1643 0.9713 0.044 0.956 0.000
#> SRR1415379 2 0.0000 0.9779 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.1643 0.9713 0.044 0.956 0.000
#> SRR663197 3 0.6079 0.2040 0.388 0.000 0.612
#> SRR1394836 2 0.0892 0.9743 0.020 0.980 0.000
#> SRR661699 2 0.6423 0.6327 0.044 0.728 0.228
#> SRR813680 3 0.5835 0.4327 0.340 0.000 0.660
#> SRR1410678 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1378109 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1499174 1 0.4974 0.8566 0.764 0.000 0.236
#> SRR1311486 2 0.1643 0.9713 0.044 0.956 0.000
#> SRR1382851 2 0.0237 0.9776 0.004 0.996 0.000
#> SRR1433410 1 0.4346 0.7997 0.816 0.000 0.184
#> SRR661167 3 0.0424 0.8480 0.008 0.000 0.992
#> SRR1432518 3 0.0592 0.8444 0.012 0.000 0.988
#> SRR660462 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374608 2 0.0592 0.9767 0.012 0.988 0.000
#> SRR657949 3 0.1529 0.8455 0.040 0.000 0.960
#> SRR1308882 2 0.0237 0.9776 0.004 0.996 0.000
#> SRR655768 1 0.4654 0.8608 0.792 0.000 0.208
#> SRR1485870 2 0.0892 0.9746 0.020 0.980 0.000
#> SRR1444138 3 0.5016 0.6566 0.240 0.000 0.760
#> SRR1417342 1 0.4974 0.8555 0.764 0.000 0.236
#> SRR1470193 2 0.0747 0.9754 0.016 0.984 0.000
#> SRR1091380 3 0.3879 0.7431 0.152 0.000 0.848
#> SRR1099096 1 0.4002 0.8494 0.840 0.000 0.160
#> SRR1313583 2 0.1529 0.9673 0.040 0.960 0.000
#> SRR1467102 2 0.2165 0.9673 0.064 0.936 0.000
#> SRR1485416 2 0.0237 0.9776 0.004 0.996 0.000
#> SRR818821 3 0.0424 0.8480 0.008 0.000 0.992
#> SRR809963 1 0.5529 0.8000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1072247 1 0.4555 0.8597 0.800 0.000 0.200
#> SRR1353710 2 0.0000 0.9779 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445259 3 0.6192 -0.0332 0.420 0.000 0.580
#> SRR1408393 3 0.0424 0.8467 0.008 0.000 0.992
#> SRR1361522 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1368597 1 0.5529 0.7994 0.704 0.000 0.296
#> SRR1309680 2 0.1529 0.9734 0.040 0.960 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1333485 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1406437 2 0.1031 0.9735 0.024 0.976 0.000
#> SRR1354931 3 0.1643 0.8443 0.044 0.000 0.956
#> SRR1391856 2 0.1031 0.9735 0.024 0.976 0.000
#> SRR1446738 2 0.0000 0.9779 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309032 2 0.2165 0.9673 0.064 0.936 0.000
#> SRR1388145 2 0.1643 0.9713 0.044 0.956 0.000
#> SRR1432611 2 0.2261 0.9661 0.068 0.932 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR613150 3 0.0237 0.8475 0.004 0.000 0.996
#> SRR1375329 1 0.6008 0.6180 0.628 0.000 0.372
#> SRR1387921 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1466792 2 0.1753 0.9709 0.048 0.952 0.000
#> SRR1360478 2 0.1753 0.9711 0.048 0.952 0.000
#> SRR1360695 1 0.5216 0.8388 0.740 0.000 0.260
#> SRR812943 1 0.5835 0.7575 0.660 0.000 0.340
#> SRR1400910 1 0.6095 0.5703 0.608 0.000 0.392
#> SRR1444203 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.9779 0.000 1.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0237 0.8475 0.004 0.000 0.996
#> SRR1429603 2 0.0000 0.9779 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397366 3 0.2711 0.8258 0.088 0.000 0.912
#> SRR1446028 1 0.3482 0.8327 0.872 0.000 0.128
#> SRR1083918 2 0.1753 0.9711 0.048 0.952 0.000
#> SRR1337606 1 0.4555 0.7776 0.800 0.000 0.200
#> SRR659109 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337192 1 0.4346 0.7997 0.816 0.000 0.184
#> SRR656946 1 0.4974 0.8585 0.764 0.000 0.236
#> SRR1476102 1 0.3340 0.8218 0.880 0.000 0.120
#> SRR1476447 1 0.3941 0.8476 0.844 0.000 0.156
#> SRR1342067 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1385389 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1075971 1 0.4235 0.8555 0.824 0.000 0.176
#> SRR614419 1 0.4605 0.8210 0.796 0.000 0.204
#> SRR1322936 1 0.4605 0.7806 0.796 0.000 0.204
#> SRR1349121 1 0.5216 0.8384 0.740 0.000 0.260
#> SRR1430549 1 0.3551 0.8340 0.868 0.000 0.132
#> SRR612935 3 0.2066 0.8371 0.060 0.000 0.940
#> SRR661481 2 0.1529 0.9734 0.040 0.960 0.000
#> SRR1354117 2 0.2165 0.9673 0.064 0.936 0.000
#> SRR1393596 2 0.0000 0.9779 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452164 1 0.4842 0.8602 0.776 0.000 0.224
#> SRR1070503 1 0.6302 0.3996 0.520 0.000 0.480
#> SRR1499894 3 0.0237 0.8475 0.004 0.000 0.996
#> SRR1082883 1 0.4605 0.7806 0.796 0.000 0.204
#> SRR1468271 1 0.5138 0.8451 0.748 0.000 0.252
#> SRR1332443 1 0.3267 0.8227 0.884 0.000 0.116
#> SRR810295 2 0.1964 0.9695 0.056 0.944 0.000
#> SRR662103 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1328620 3 0.5810 0.3457 0.336 0.000 0.664
#> SRR1396294 2 0.0747 0.9754 0.016 0.984 0.000
#> SRR1419917 1 0.4931 0.8577 0.768 0.000 0.232
#> SRR662114 1 0.6305 0.2818 0.516 0.000 0.484
#> SRR1489199 3 0.6008 0.3071 0.372 0.000 0.628
#> SRR813584 2 0.0592 0.9779 0.012 0.988 0.000
#> SRR1069638 1 0.6274 0.4527 0.544 0.000 0.456
#> SRR614864 1 0.4974 0.8160 0.764 0.000 0.236
#> SRR1433392 3 0.6267 -0.0369 0.452 0.000 0.548
#> SRR1377777 2 0.1643 0.9713 0.044 0.956 0.000
#> SRR2167710 3 0.6252 -0.0338 0.444 0.000 0.556
#> SRR1401252 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1309963 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1338031 1 0.5138 0.8452 0.748 0.000 0.252
#> SRR1418628 2 0.1753 0.9711 0.048 0.952 0.000
#> SRR1486889 3 0.5431 0.5187 0.284 0.000 0.716
#> SRR1380393 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1319731 1 0.4605 0.8609 0.796 0.000 0.204
#> SRR1356468 2 0.0892 0.9748 0.020 0.980 0.000
#> SRR1337010 2 0.2356 0.9645 0.072 0.928 0.000
#> SRR1486520 1 0.3340 0.8258 0.880 0.000 0.120
#> SRR1486538 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1340486 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1377696 2 0.0237 0.9776 0.004 0.996 0.000
#> SRR1465459 3 0.3192 0.8114 0.112 0.000 0.888
#> SRR1080270 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093148 1 0.8265 0.5401 0.636 0.180 0.184
#> SRR1467080 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1410866 2 0.1753 0.9711 0.048 0.952 0.000
#> SRR816475 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1379198 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR613342 3 0.3267 0.8049 0.116 0.000 0.884
#> SRR1452246 2 0.1643 0.9713 0.044 0.956 0.000
#> SRR1338836 2 0.1753 0.9711 0.048 0.952 0.000
#> SRR1369129 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1396616 3 0.2537 0.8284 0.080 0.000 0.920
#> SRR813824 3 0.3038 0.8141 0.104 0.000 0.896
#> SRR1082376 1 0.5859 0.7076 0.656 0.000 0.344
#> SRR1500891 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR807543 3 0.5016 0.6568 0.240 0.000 0.760
#> SRR1091572 1 0.5216 0.8483 0.740 0.000 0.260
#> SRR1346689 2 0.0000 0.9779 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332424 1 0.4399 0.8026 0.812 0.000 0.188
#> SRR663729 2 0.1860 0.9613 0.052 0.948 0.000
#> SRR1097013 3 0.6126 0.2210 0.400 0.000 0.600
#> SRR613675 1 0.4555 0.7776 0.800 0.000 0.200
#> SRR1485357 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR655816 3 0.2066 0.8392 0.060 0.000 0.940
#> SRR1500113 1 0.5058 0.8507 0.756 0.000 0.244
#> SRR1437622 2 0.0424 0.9781 0.008 0.992 0.000
#> SRR1355172 3 0.6215 0.0969 0.428 0.000 0.572
#> SRR655531 1 0.4062 0.8254 0.836 0.000 0.164
#> SRR1338147 3 0.0424 0.8461 0.008 0.000 0.992
#> SRR1413329 3 0.5968 0.2512 0.364 0.000 0.636
#> SRR1485931 2 0.1643 0.9713 0.044 0.956 0.000
#> SRR1420873 1 0.4062 0.8504 0.836 0.000 0.164
#> SRR1333308 2 0.1529 0.9674 0.040 0.960 0.000
#> SRR1452033 1 0.4931 0.8574 0.768 0.000 0.232
#> SRR1467316 2 0.1529 0.9713 0.040 0.960 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375351 2 0.1753 0.9711 0.048 0.952 0.000
#> SRR663440 3 0.3482 0.7969 0.128 0.000 0.872
#> SRR1471755 2 0.0892 0.9771 0.020 0.980 0.000
#> SRR808019 1 0.4750 0.8184 0.784 0.000 0.216
#> SRR1479133 3 0.3879 0.7670 0.152 0.000 0.848
#> SRR615069 1 0.5363 0.7457 0.724 0.000 0.276
#> SRR1456185 2 0.1643 0.9653 0.044 0.956 0.000
#> SRR1350069 2 0.0000 0.9779 0.000 1.000 0.000
#> SRR816316 1 0.4750 0.8616 0.784 0.000 0.216
#> SRR664795 3 0.6286 -0.0963 0.464 0.000 0.536
#> SRR1490721 2 0.0237 0.9776 0.004 0.996 0.000
#> SRR810643 1 0.3412 0.8286 0.876 0.000 0.124
#> SRR1430333 1 0.4931 0.7922 0.768 0.000 0.232
#> SRR1085285 3 0.2261 0.8344 0.068 0.000 0.932
#> SRR1099072 3 0.2878 0.8207 0.096 0.000 0.904
#> SRR1317985 1 0.4842 0.8602 0.776 0.000 0.224
#> SRR1487340 1 0.4796 0.8617 0.780 0.000 0.220
#> SRR1420276 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351347 3 0.0424 0.8480 0.008 0.000 0.992
#> SRR1405525 1 0.4931 0.8257 0.768 0.000 0.232
#> SRR1370329 1 0.6788 0.6342 0.744 0.136 0.120
#> SRR1465001 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1476525 2 0.1753 0.9711 0.048 0.952 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.9779 0.000 1.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1409465 2 0.1643 0.9713 0.044 0.956 0.000
#> SRR809987 2 0.1529 0.9673 0.040 0.960 0.000
#> SRR613639 1 0.5098 0.8486 0.752 0.000 0.248
#> SRR1402285 2 0.0000 0.9779 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077038 3 0.6079 0.2709 0.388 0.000 0.612
#> SRR1405660 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095455 3 0.5810 0.3588 0.336 0.000 0.664
#> SRR1394734 2 0.1643 0.9724 0.044 0.956 0.000
#> SRR1317771 1 0.5733 0.7602 0.676 0.000 0.324
#> SRR1365894 2 0.0237 0.9777 0.004 0.996 0.000
#> SRR1073581 1 0.5058 0.8509 0.756 0.000 0.244
#> SRR659804 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1345914 2 0.1643 0.9724 0.044 0.956 0.000
#> SRR1432186 2 0.1753 0.9711 0.048 0.952 0.000
#> SRR1473529 2 0.0424 0.9781 0.008 0.992 0.000
#> SRR660764 3 0.3340 0.8052 0.120 0.000 0.880
#> SRR820448 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1328845 2 0.1031 0.9733 0.024 0.976 0.000
#> SRR1336415 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1379065 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1459190 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1346773 1 0.3752 0.8354 0.856 0.000 0.144
#> SRR1499521 1 0.3816 0.8403 0.852 0.000 0.148
#> SRR1440898 2 0.1643 0.9713 0.044 0.956 0.000
#> SRR1347459 3 0.2448 0.8290 0.076 0.000 0.924
#> SRR1081209 2 0.1753 0.9709 0.048 0.952 0.000
#> SRR1400202 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1333395 2 0.1163 0.9719 0.028 0.972 0.000
#> SRR1309248 2 0.0000 0.9779 0.000 1.000 0.000
#> SRR809161 3 0.3752 0.7834 0.144 0.000 0.856
#> SRR1316320 2 0.1753 0.9635 0.048 0.952 0.000
#> SRR1432629 2 0.1753 0.9711 0.048 0.952 0.000
#> SRR1498931 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1416578 2 0.0000 0.9779 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470534 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1380764 1 0.3686 0.8271 0.860 0.000 0.140
#> SRR1309160 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500450 1 0.6295 0.3853 0.528 0.000 0.472
#> SRR1078489 3 0.1529 0.8450 0.040 0.000 0.960
#> SRR1332648 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR660614 3 0.3116 0.8123 0.108 0.000 0.892
#> SRR1470420 2 0.2165 0.9673 0.064 0.936 0.000
#> SRR1475566 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1477949 1 0.5058 0.8507 0.756 0.000 0.244
#> SRR1481419 2 0.1753 0.9711 0.048 0.952 0.000
#> SRR1464766 1 0.5835 0.7275 0.660 0.000 0.340
#> SRR615946 3 0.2878 0.8174 0.096 0.000 0.904
#> SRR1446481 2 0.1753 0.9711 0.048 0.952 0.000
#> SRR1467656 2 0.1643 0.9713 0.044 0.956 0.000
#> SRR1402962 1 0.4931 0.8036 0.768 0.000 0.232
#> SRR660224 2 0.2066 0.9685 0.060 0.940 0.000
#> SRR665586 1 0.6260 0.4582 0.552 0.000 0.448
#> SRR1347166 1 0.4702 0.7863 0.788 0.000 0.212
#> SRR1485722 1 0.4555 0.8101 0.800 0.000 0.200
#> SRR1415316 1 0.5016 0.8605 0.760 0.000 0.240
#> SRR613390 1 0.4931 0.8574 0.768 0.000 0.232
#> SRR661108 3 0.1643 0.8437 0.044 0.000 0.956
#> SRR2170173 3 0.4121 0.7541 0.168 0.000 0.832
#> SRR817329 3 0.5431 0.5686 0.284 0.000 0.716
#> SRR1401990 2 0.0000 0.9779 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467745 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1471795 2 0.1753 0.9711 0.048 0.952 0.000
#> SRR1415637 2 0.1643 0.9713 0.044 0.956 0.000
#> SRR813137 1 0.5138 0.8458 0.748 0.000 0.252
#> SRR1314873 1 0.4796 0.8617 0.780 0.000 0.220
#> SRR1401211 1 0.5016 0.8532 0.760 0.000 0.240
#> SRR1419692 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR818797 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR2164608 3 0.3482 0.7759 0.128 0.000 0.872
#> SRR1455586 2 0.2165 0.9673 0.064 0.936 0.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488939 2 0.1411 0.9691 0.036 0.964 0.000
#> SRR1433232 2 0.1753 0.9711 0.048 0.952 0.000
#> SRR1385501 3 0.3482 0.7986 0.128 0.000 0.872
#> SRR1361652 1 0.5859 0.6744 0.656 0.000 0.344
#> SRR1437119 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1478547 3 0.0424 0.8483 0.008 0.000 0.992
#> SRR1430910 3 0.6192 0.0804 0.420 0.000 0.580
#> SRR1310584 1 0.3267 0.8227 0.884 0.000 0.116
#> SRR1500216 2 0.2711 0.9365 0.088 0.912 0.000
#> SRR1486762 3 0.1031 0.8475 0.024 0.000 0.976
#> SRR1480854 2 0.0237 0.9776 0.004 0.996 0.000
#> SRR1489394 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1418085 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1340221 2 0.0237 0.9776 0.004 0.996 0.000
#> SRR1473058 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1405165 1 0.7256 0.4378 0.532 0.028 0.440
#> SRR1433004 1 0.5216 0.8388 0.740 0.000 0.260
#> SRR1471477 1 0.5529 0.8078 0.704 0.000 0.296
#> SRR1098567 2 0.2165 0.9673 0.064 0.936 0.000
#> SRR1098712 2 0.0892 0.9743 0.020 0.980 0.000
#> SRR1455038 1 0.3551 0.8360 0.868 0.000 0.132
#> SRR1375248 2 0.2165 0.9673 0.064 0.936 0.000
#> SRR1403005 3 0.1163 0.8463 0.028 0.000 0.972
#> SRR1348378 2 0.0892 0.9768 0.020 0.980 0.000
#> SRR1413541 1 0.5882 0.7179 0.652 0.000 0.348
#> SRR1392943 2 0.0592 0.9767 0.012 0.988 0.000
#> SRR1475192 3 0.0237 0.8476 0.004 0.000 0.996
#> SRR1432085 2 0.0892 0.9743 0.020 0.980 0.000
#> SRR1452468 1 0.5859 0.7044 0.656 0.000 0.344
#> SRR1347060 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414139 2 0.0892 0.9743 0.020 0.980 0.000
#> SRR1447962 2 0.2066 0.9685 0.060 0.940 0.000
#> SRR1444324 2 0.2165 0.9673 0.064 0.936 0.000
#> SRR1415004 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1413436 1 0.3941 0.8399 0.844 0.000 0.156
#> SRR1311266 1 0.4605 0.8167 0.796 0.000 0.204
#> SRR1343302 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1373746 1 0.4796 0.8614 0.780 0.000 0.220
#> SRR1429678 1 0.5016 0.8532 0.760 0.000 0.240
#> SRR1469413 2 0.1753 0.9709 0.048 0.952 0.000
#> SRR1405331 3 0.6111 0.1414 0.396 0.000 0.604
#> SRR1345609 1 0.4291 0.8550 0.820 0.000 0.180
#> SRR1380208 2 0.1163 0.9723 0.028 0.972 0.000
#> SRR1322840 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1399797 3 0.2165 0.8354 0.064 0.000 0.936
#> SRR1416654 3 0.0237 0.8470 0.004 0.000 0.996
#> SRR1315081 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400847 1 0.4842 0.8602 0.776 0.000 0.224
#> SRR1365291 3 0.1529 0.8461 0.040 0.000 0.960
#> SRR1367920 2 0.0237 0.9776 0.004 0.996 0.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441679 2 0.2165 0.9673 0.064 0.936 0.000
#> SRR1082173 3 0.5016 0.5964 0.240 0.000 0.760
#> SRR1363968 1 0.4121 0.8475 0.832 0.000 0.168
#> SRR814387 1 0.4235 0.8553 0.824 0.000 0.176
#> SRR657599 1 0.2959 0.8079 0.900 0.000 0.100
#> SRR1386689 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1395575 3 0.2356 0.8341 0.072 0.000 0.928
#> SRR1453811 1 0.5678 0.7804 0.684 0.000 0.316
#> SRR1441159 1 0.3619 0.8184 0.864 0.000 0.136
#> SRR1403154 2 0.0237 0.9780 0.004 0.996 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.8463 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310275 3 0.3412 0.7972 0.124 0.000 0.876
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 1 0.3833 0.6171 0.848 0.000 0.080 0.072
#> SRR1331708 4 0.7039 0.8021 0.256 0.000 0.176 0.568
#> SRR1464258 1 0.2412 0.6672 0.908 0.000 0.084 0.008
#> SRR1454201 4 0.7133 0.8106 0.344 0.000 0.144 0.512
#> SRR661589 3 0.4456 0.5541 0.280 0.000 0.716 0.004
#> SRR1456229 1 0.4655 0.5205 0.684 0.000 0.312 0.004
#> SRR1315165 2 0.2124 0.8908 0.008 0.924 0.000 0.068
#> SRR1488960 1 0.5128 0.5184 0.760 0.000 0.092 0.148
#> SRR1417809 2 0.3143 0.8901 0.024 0.876 0.000 0.100
#> SRR1094457 2 0.3523 0.8728 0.032 0.856 0.000 0.112
#> SRR1095575 3 0.5290 0.1172 0.476 0.000 0.516 0.008
#> SRR1315931 1 0.5968 0.2331 0.664 0.000 0.084 0.252
#> SRR1430066 3 0.0657 0.7455 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR1431037 3 0.0779 0.7468 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR1395554 3 0.0657 0.7455 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR818002 2 0.3032 0.8967 0.008 0.868 0.000 0.124
#> SRR1344143 2 0.3498 0.8913 0.008 0.832 0.000 0.160
#> SRR1486845 2 0.3616 0.8726 0.036 0.852 0.000 0.112
#> SRR1362866 4 0.6970 0.8106 0.256 0.000 0.168 0.576
#> SRR1490740 1 0.2530 0.6687 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1446627 2 0.3764 0.8769 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1456138 2 0.3257 0.8931 0.004 0.844 0.000 0.152
#> SRR1416248 1 0.6299 -0.0338 0.600 0.000 0.080 0.320
#> SRR1383907 2 0.2742 0.8865 0.024 0.900 0.000 0.076
#> SRR1311018 1 0.2593 0.6650 0.904 0.000 0.080 0.016
#> SRR1375699 2 0.3245 0.8948 0.028 0.872 0.000 0.100
#> SRR1429846 3 0.4817 0.3591 0.388 0.000 0.612 0.000
#> SRR613550 3 0.4720 0.4995 0.324 0.000 0.672 0.004
#> SRR1348402 1 0.5369 0.4755 0.740 0.000 0.096 0.164
#> SRR1345146 3 0.4155 0.6855 0.100 0.000 0.828 0.072
#> SRR1324025 3 0.0657 0.7455 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR1318879 3 0.3004 0.7191 0.048 0.000 0.892 0.060
#> SRR820755 3 0.4948 0.2192 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR1485830 2 0.2843 0.8865 0.020 0.892 0.000 0.088
#> SRR599313 2 0.5035 0.8231 0.056 0.748 0.000 0.196
#> SRR612263 1 0.4205 0.6256 0.820 0.000 0.124 0.056
#> SRR1415398 3 0.3300 0.6916 0.144 0.000 0.848 0.008
#> SRR1326205 2 0.1888 0.9013 0.016 0.940 0.000 0.044
#> SRR1421327 2 0.2256 0.9009 0.020 0.924 0.000 0.056
#> SRR1083311 3 0.0657 0.7460 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR1499303 2 0.2741 0.8901 0.012 0.892 0.000 0.096
#> SRR1079522 3 0.6959 0.4606 0.172 0.032 0.656 0.140
#> SRR1452935 3 0.1209 0.7490 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR1379495 1 0.2342 0.6684 0.912 0.000 0.080 0.008
#> SRR1470459 2 0.3907 0.8724 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR661361 3 0.6083 0.5013 0.216 0.000 0.672 0.112
#> SRR615778 4 0.6704 0.8357 0.264 0.000 0.136 0.600
#> SRR1447564 1 0.3107 0.6556 0.884 0.000 0.080 0.036
#> SRR1455195 4 0.6867 0.7526 0.384 0.000 0.108 0.508
#> SRR655182 1 0.4819 0.4523 0.652 0.000 0.344 0.004
#> SRR1335140 2 0.2546 0.9021 0.008 0.900 0.000 0.092
#> SRR1433555 3 0.2399 0.7287 0.032 0.000 0.920 0.048
#> SRR1308650 2 0.3245 0.8904 0.028 0.872 0.000 0.100
#> SRR1388354 1 0.2011 0.6709 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1317446 3 0.0657 0.7455 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR1413602 3 0.2816 0.7175 0.036 0.000 0.900 0.064
#> SRR1479955 2 0.3172 0.8904 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR809853 1 0.4312 0.6261 0.812 0.000 0.132 0.056
#> SRR661313 3 0.5016 0.3508 0.396 0.000 0.600 0.004
#> SRR1499935 2 0.2473 0.8869 0.012 0.908 0.000 0.080
#> SRR1447303 3 0.1545 0.7473 0.040 0.000 0.952 0.008
#> SRR1429408 2 0.1807 0.9014 0.008 0.940 0.000 0.052
#> SRR1433950 1 0.2342 0.6697 0.912 0.000 0.080 0.008
#> SRR1362081 2 0.3942 0.8715 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1409854 1 0.4961 0.2058 0.552 0.000 0.448 0.000
#> SRR1435229 4 0.7816 0.5652 0.260 0.000 0.340 0.400
#> SRR1085996 1 0.6791 -0.2036 0.564 0.000 0.120 0.316
#> SRR1414229 4 0.6661 0.8353 0.264 0.000 0.132 0.604
#> SRR1400974 3 0.0672 0.7448 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1399971 1 0.2342 0.6684 0.912 0.000 0.080 0.008
#> SRR613927 1 0.4608 0.5314 0.692 0.000 0.304 0.004
#> SRR1457854 1 0.3105 0.6577 0.856 0.000 0.140 0.004
#> SRR1473714 2 0.4761 0.8405 0.048 0.768 0.000 0.184
#> SRR813776 3 0.4817 0.3719 0.388 0.000 0.612 0.000
#> SRR808196 2 0.3215 0.8910 0.032 0.876 0.000 0.092
#> SRR1101085 2 0.3082 0.8833 0.032 0.884 0.000 0.084
#> SRR614395 1 0.3710 0.6260 0.804 0.000 0.192 0.004
#> SRR1478251 2 0.3523 0.8728 0.032 0.856 0.000 0.112
#> SRR1370551 2 0.3751 0.8834 0.004 0.800 0.000 0.196
#> SRR1362310 1 0.2342 0.6684 0.912 0.000 0.080 0.008
#> SRR665310 3 0.4920 0.4208 0.368 0.000 0.628 0.004
#> SRR1420109 3 0.4509 0.5691 0.288 0.000 0.708 0.004
#> SRR1330920 1 0.7828 -0.3536 0.396 0.000 0.340 0.264
#> SRR1419539 2 0.3037 0.8939 0.020 0.880 0.000 0.100
#> SRR1359447 3 0.1743 0.7452 0.056 0.000 0.940 0.004
#> SRR1347259 2 0.2282 0.8993 0.024 0.924 0.000 0.052
#> SRR613915 3 0.4244 0.6906 0.168 0.000 0.800 0.032
#> SRR1384395 3 0.0524 0.7440 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR821715 3 0.4978 0.3539 0.384 0.000 0.612 0.004
#> SRR1478228 1 0.6065 0.1409 0.644 0.000 0.080 0.276
#> SRR1445637 1 0.4761 0.4808 0.664 0.000 0.332 0.004
#> SRR608150 4 0.6637 0.8284 0.260 0.000 0.132 0.608
#> SRR1096383 1 0.2342 0.6693 0.912 0.000 0.080 0.008
#> SRR1341480 2 0.3117 0.8885 0.028 0.880 0.000 0.092
#> SRR1341344 1 0.6574 -0.3101 0.532 0.000 0.084 0.384
#> SRR1326270 3 0.5165 0.0748 0.484 0.000 0.512 0.004
#> SRR1498838 3 0.0804 0.7457 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1416313 3 0.0927 0.7469 0.016 0.000 0.976 0.008
#> SRR808566 2 0.2198 0.8892 0.008 0.920 0.000 0.072
#> SRR1430270 2 0.3342 0.8921 0.032 0.868 0.000 0.100
#> SRR1367825 3 0.0672 0.7448 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR613533 3 0.1978 0.7418 0.068 0.000 0.928 0.004
#> SRR661267 1 0.3444 0.6336 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR810665 2 0.3649 0.8810 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1407250 4 0.6835 0.8358 0.288 0.000 0.136 0.576
#> SRR1420067 4 0.7001 0.6976 0.420 0.000 0.116 0.464
#> SRR1473632 1 0.5393 0.5327 0.688 0.000 0.268 0.044
#> SRR812536 3 0.3761 0.7064 0.068 0.000 0.852 0.080
#> SRR1370850 2 0.3401 0.8908 0.008 0.840 0.000 0.152
#> SRR1486195 2 0.3942 0.8715 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1407671 2 0.2973 0.8916 0.020 0.884 0.000 0.096
#> SRR1446375 3 0.5143 0.2063 0.456 0.000 0.540 0.004
#> SRR1465230 2 0.3523 0.8728 0.032 0.856 0.000 0.112
#> SRR614119 1 0.2760 0.6646 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1356101 2 0.4198 0.8728 0.004 0.768 0.004 0.224
#> SRR1404209 1 0.5168 -0.0149 0.500 0.000 0.496 0.004
#> SRR1392676 2 0.3873 0.8762 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR665538 1 0.3196 0.6627 0.856 0.000 0.136 0.008
#> SRR660510 3 0.1042 0.7474 0.020 0.000 0.972 0.008
#> SRR1445655 2 0.2915 0.8849 0.028 0.892 0.000 0.080
#> SRR658953 3 0.5495 0.5778 0.176 0.000 0.728 0.096
#> SRR2166459 1 0.4855 0.4353 0.644 0.000 0.352 0.004
#> SRR1070713 2 0.3032 0.8973 0.008 0.868 0.000 0.124
#> SRR1485312 3 0.0937 0.7451 0.012 0.000 0.976 0.012
#> SRR1317631 2 0.1706 0.9035 0.016 0.948 0.000 0.036
#> SRR1488610 4 0.6770 0.8355 0.268 0.000 0.140 0.592
#> SRR1330588 3 0.0779 0.7468 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR1316367 4 0.7009 0.7432 0.392 0.000 0.120 0.488
#> SRR1433926 1 0.2197 0.6699 0.916 0.000 0.080 0.004
#> SRR1091302 2 0.2271 0.8882 0.008 0.916 0.000 0.076
#> SRR818263 1 0.6765 -0.0246 0.576 0.000 0.124 0.300
#> SRR1404909 2 0.2450 0.8886 0.016 0.912 0.000 0.072
#> SRR663076 1 0.2473 0.6681 0.908 0.000 0.080 0.012
#> SRR1323577 2 0.3311 0.8959 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1442422 2 0.3523 0.8728 0.032 0.856 0.000 0.112
#> SRR1465893 1 0.2915 0.6608 0.892 0.000 0.080 0.028
#> SRR654862 1 0.6064 0.1766 0.512 0.000 0.444 0.044
#> SRR1407112 2 0.3215 0.8809 0.032 0.876 0.000 0.092
#> SRR1332969 3 0.1807 0.7415 0.052 0.000 0.940 0.008
#> SRR1353199 3 0.5039 0.3299 0.404 0.000 0.592 0.004
#> SRR1378885 3 0.4964 0.3394 0.380 0.000 0.616 0.004
#> SRR665357 3 0.0524 0.7440 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR662186 2 0.4008 0.8696 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1501020 3 0.4905 0.4143 0.364 0.000 0.632 0.004
#> SRR1347819 3 0.0779 0.7465 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR1480813 2 0.3306 0.8908 0.004 0.840 0.000 0.156
#> SRR1472576 2 0.2124 0.8901 0.008 0.924 0.000 0.068
#> SRR1431781 2 0.3404 0.8761 0.032 0.864 0.000 0.104
#> SRR1452270 3 0.1824 0.7191 0.004 0.000 0.936 0.060
#> SRR1500472 3 0.7803 -0.4305 0.252 0.000 0.396 0.352
#> SRR1417632 2 0.2473 0.8893 0.012 0.908 0.000 0.080
#> SRR1350153 2 0.3311 0.8888 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1458113 4 0.7745 0.4748 0.232 0.000 0.372 0.396
#> SRR1326579 4 0.6924 0.8066 0.340 0.000 0.124 0.536
#> SRR1349363 2 0.3900 0.8907 0.020 0.816 0.000 0.164
#> SRR1096712 3 0.1807 0.7235 0.008 0.000 0.940 0.052
#> SRR1090407 3 0.1635 0.7447 0.044 0.000 0.948 0.008
#> SRR1083752 2 0.2546 0.8976 0.008 0.900 0.000 0.092
#> SRR1377599 2 0.2142 0.8995 0.016 0.928 0.000 0.056
#> SRR1488449 3 0.1576 0.7476 0.048 0.000 0.948 0.004
#> SRR1318354 3 0.7380 -0.0177 0.200 0.000 0.512 0.288
#> SRR1359062 3 0.0524 0.7450 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR1398924 4 0.7733 0.6275 0.256 0.000 0.304 0.440
#> SRR663783 3 0.0804 0.7466 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1319204 3 0.3935 0.7002 0.100 0.000 0.840 0.060
#> SRR1369070 2 0.3355 0.8902 0.004 0.836 0.000 0.160
#> SRR615659 1 0.2011 0.6709 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1337449 2 0.3873 0.8737 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1316982 2 0.5238 0.8608 0.016 0.752 0.040 0.192
#> SRR1498595 2 0.2546 0.8938 0.008 0.900 0.000 0.092
#> SRR1377423 3 0.4872 0.4522 0.356 0.000 0.640 0.004
#> SRR1312310 2 0.3801 0.8757 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1485613 1 0.3356 0.6380 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1338426 3 0.3521 0.6987 0.052 0.000 0.864 0.084
#> SRR1353309 3 0.2313 0.7375 0.044 0.000 0.924 0.032
#> SRR658941 3 0.7591 -0.3092 0.204 0.000 0.444 0.352
#> SRR1101643 1 0.7964 -0.0598 0.392 0.352 0.004 0.252
#> SRR1401468 1 0.6280 -0.0331 0.604 0.000 0.080 0.316
#> SRR1368874 2 0.3873 0.8737 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1324085 2 0.2593 0.8864 0.016 0.904 0.000 0.080
#> SRR1363858 2 0.4677 0.8473 0.048 0.776 0.000 0.176
#> SRR819820 3 0.4982 0.6346 0.136 0.000 0.772 0.092
#> SRR1337342 4 0.6835 0.8368 0.288 0.000 0.136 0.576
#> SRR655206 2 0.2563 0.8976 0.020 0.908 0.000 0.072
#> SRR1387013 2 0.2466 0.9073 0.004 0.900 0.000 0.096
#> SRR1317410 1 0.6299 -0.0338 0.600 0.000 0.080 0.320
#> SRR608198 4 0.6910 0.8209 0.324 0.000 0.128 0.548
#> SRR1440161 2 0.4198 0.8728 0.004 0.768 0.004 0.224
#> SRR1343741 2 0.3219 0.8906 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1381288 2 0.3356 0.8850 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1415379 2 0.2174 0.8998 0.020 0.928 0.000 0.052
#> SRR1099622 2 0.3172 0.8888 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR663197 3 0.6576 0.3789 0.168 0.000 0.632 0.200
#> SRR1394836 2 0.2988 0.8950 0.012 0.876 0.000 0.112
#> SRR661699 2 0.7795 0.4383 0.092 0.564 0.276 0.068
#> SRR813680 1 0.4978 0.3645 0.612 0.000 0.384 0.004
#> SRR1410678 1 0.2473 0.6681 0.908 0.000 0.080 0.012
#> SRR1378109 2 0.3523 0.8728 0.032 0.856 0.000 0.112
#> SRR1499174 1 0.3969 0.6382 0.804 0.000 0.180 0.016
#> SRR1311486 2 0.3801 0.8781 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1382851 2 0.2401 0.9074 0.004 0.904 0.000 0.092
#> SRR1433410 4 0.6639 0.8342 0.284 0.000 0.120 0.596
#> SRR661167 3 0.1042 0.7489 0.020 0.000 0.972 0.008
#> SRR1432518 3 0.3485 0.6802 0.028 0.000 0.856 0.116
#> SRR660462 3 0.0804 0.7457 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1374608 2 0.2489 0.8969 0.020 0.912 0.000 0.068
#> SRR657949 3 0.4647 0.5470 0.288 0.000 0.704 0.008
#> SRR1308882 2 0.2882 0.8930 0.024 0.892 0.000 0.084
#> SRR655768 1 0.4039 0.6114 0.836 0.000 0.084 0.080
#> SRR1485870 2 0.2730 0.8940 0.016 0.896 0.000 0.088
#> SRR1444138 1 0.5050 0.2986 0.588 0.000 0.408 0.004
#> SRR1417342 1 0.2859 0.6702 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR1470193 2 0.2706 0.8940 0.020 0.900 0.000 0.080
#> SRR1091380 3 0.4022 0.6957 0.096 0.000 0.836 0.068
#> SRR1099096 1 0.6158 0.0878 0.628 0.000 0.080 0.292
#> SRR1313583 2 0.4070 0.8784 0.044 0.824 0.000 0.132
#> SRR1467102 2 0.4034 0.8834 0.008 0.796 0.004 0.192
#> SRR1485416 2 0.2376 0.8971 0.016 0.916 0.000 0.068
#> SRR818821 3 0.1211 0.7476 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR809963 1 0.3402 0.6456 0.832 0.000 0.164 0.004
#> SRR1072247 1 0.4292 0.5767 0.820 0.000 0.080 0.100
#> SRR1353710 2 0.1151 0.9019 0.008 0.968 0.000 0.024
#> SRR1445259 3 0.6063 0.4797 0.124 0.000 0.680 0.196
#> SRR1408393 3 0.4313 0.5591 0.260 0.000 0.736 0.004
#> SRR1361522 1 0.2342 0.6684 0.912 0.000 0.080 0.008
#> SRR1368597 1 0.3257 0.6555 0.844 0.000 0.152 0.004
#> SRR1309680 2 0.3249 0.8931 0.008 0.852 0.000 0.140
#> SRR1310542 3 0.0376 0.7428 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1333485 2 0.3279 0.8791 0.032 0.872 0.000 0.096
#> SRR1406437 2 0.2775 0.8931 0.020 0.896 0.000 0.084
#> SRR1354931 3 0.4761 0.4655 0.332 0.000 0.664 0.004
#> SRR1391856 2 0.2861 0.8955 0.016 0.888 0.000 0.096
#> SRR1446738 2 0.2053 0.8998 0.004 0.924 0.000 0.072
#> SRR1309032 2 0.3873 0.8735 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1388145 2 0.2921 0.8935 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1432611 2 0.4008 0.8700 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR815869 3 0.0524 0.7435 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR613150 3 0.1610 0.7488 0.032 0.000 0.952 0.016
#> SRR1375329 3 0.7609 -0.1981 0.224 0.000 0.464 0.312
#> SRR1387921 1 0.2011 0.6709 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1466792 2 0.3837 0.8747 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1360478 2 0.3266 0.8891 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1360695 1 0.2530 0.6694 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR812943 1 0.6595 0.3153 0.608 0.000 0.268 0.124
#> SRR1400910 3 0.7519 -0.1329 0.208 0.000 0.480 0.312
#> SRR1444203 2 0.2813 0.8854 0.024 0.896 0.000 0.080
#> SRR816177 2 0.2773 0.9052 0.004 0.880 0.000 0.116
#> SRR658754 3 0.1677 0.7329 0.012 0.000 0.948 0.040
#> SRR1429603 2 0.1109 0.9024 0.004 0.968 0.000 0.028
#> SRR1397366 3 0.4800 0.4689 0.340 0.000 0.656 0.004
#> SRR1446028 1 0.6259 0.0787 0.616 0.000 0.084 0.300
#> SRR1083918 2 0.3450 0.8901 0.008 0.836 0.000 0.156
#> SRR1337606 4 0.6612 0.8242 0.256 0.000 0.132 0.612
#> SRR659109 3 0.0804 0.7457 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1337192 4 0.6813 0.7520 0.380 0.000 0.104 0.516
#> SRR656946 1 0.3913 0.6420 0.824 0.000 0.148 0.028
#> SRR1476102 1 0.6844 -0.5955 0.456 0.000 0.100 0.444
#> SRR1476447 1 0.6299 -0.0323 0.600 0.000 0.080 0.320
#> SRR1342067 2 0.3404 0.8761 0.032 0.864 0.000 0.104
#> SRR1385389 2 0.3616 0.8726 0.036 0.852 0.000 0.112
#> SRR1075971 1 0.6158 0.0704 0.628 0.000 0.080 0.292
#> SRR614419 4 0.7001 0.6601 0.420 0.000 0.116 0.464
#> SRR1322936 4 0.6637 0.8284 0.260 0.000 0.132 0.608
#> SRR1349121 1 0.2345 0.6716 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1430549 1 0.6316 -0.0500 0.596 0.000 0.080 0.324
#> SRR612935 3 0.2466 0.7301 0.096 0.000 0.900 0.004
#> SRR661481 2 0.3196 0.8951 0.008 0.856 0.000 0.136
#> SRR1354117 2 0.4018 0.8740 0.004 0.772 0.000 0.224
#> SRR1393596 2 0.2489 0.8969 0.020 0.912 0.000 0.068
#> SRR1452164 1 0.2011 0.6709 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1070503 3 0.6831 0.2653 0.352 0.000 0.536 0.112
#> SRR1499894 3 0.1151 0.7490 0.024 0.000 0.968 0.008
#> SRR1082883 4 0.6661 0.8311 0.264 0.000 0.132 0.604
#> SRR1468271 1 0.2882 0.6661 0.892 0.000 0.084 0.024
#> SRR1332443 1 0.6316 -0.0487 0.596 0.000 0.080 0.324
#> SRR810295 2 0.3873 0.8735 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR662103 1 0.2542 0.6652 0.904 0.000 0.084 0.012
#> SRR1328620 3 0.6381 0.4247 0.152 0.000 0.652 0.196
#> SRR1396294 2 0.2335 0.8988 0.020 0.920 0.000 0.060
#> SRR1419917 1 0.2593 0.6718 0.892 0.000 0.104 0.004
#> SRR662114 3 0.7337 0.0411 0.204 0.000 0.524 0.272
#> SRR1489199 1 0.4907 0.2702 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR813584 2 0.3401 0.8929 0.008 0.840 0.000 0.152
#> SRR1069638 3 0.7199 0.1456 0.216 0.000 0.552 0.232
#> SRR614864 3 0.7861 -0.5078 0.272 0.000 0.368 0.360
#> SRR1433392 1 0.4677 0.5097 0.680 0.000 0.316 0.004
#> SRR1377777 2 0.2921 0.8964 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR2167710 1 0.5508 0.2747 0.572 0.000 0.408 0.020
#> SRR1401252 2 0.2563 0.8888 0.020 0.908 0.000 0.072
#> SRR1309963 2 0.3523 0.8728 0.032 0.856 0.000 0.112
#> SRR1338031 1 0.2081 0.6718 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1418628 2 0.3219 0.8893 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1486889 3 0.5459 0.2551 0.432 0.000 0.552 0.016
#> SRR1380393 1 0.2011 0.6709 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1319731 1 0.5962 0.2023 0.660 0.000 0.080 0.260
#> SRR1356468 2 0.3107 0.8933 0.036 0.884 0.000 0.080
#> SRR1337010 2 0.4008 0.8695 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1486520 1 0.6334 -0.0860 0.592 0.000 0.080 0.328
#> SRR1486538 2 0.2813 0.8854 0.024 0.896 0.000 0.080
#> SRR1340486 2 0.3523 0.8728 0.032 0.856 0.000 0.112
#> SRR1377696 2 0.2053 0.9069 0.004 0.924 0.000 0.072
#> SRR1465459 3 0.5151 0.1486 0.464 0.000 0.532 0.004
#> SRR1080270 3 0.0657 0.7455 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR1312501 3 0.0779 0.7468 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR1093148 4 0.8771 0.6504 0.212 0.076 0.232 0.480
#> SRR1467080 3 0.0657 0.7455 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR1410866 2 0.3498 0.8896 0.008 0.832 0.000 0.160
#> SRR816475 2 0.2342 0.8874 0.008 0.912 0.000 0.080
#> SRR1379198 2 0.3616 0.8726 0.036 0.852 0.000 0.112
#> SRR613342 3 0.3791 0.6754 0.200 0.000 0.796 0.004
#> SRR1452246 2 0.3311 0.8972 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1338836 2 0.3402 0.8894 0.004 0.832 0.000 0.164
#> SRR1369129 2 0.3523 0.8728 0.032 0.856 0.000 0.112
#> SRR1396616 3 0.2799 0.7308 0.108 0.000 0.884 0.008
#> SRR813824 3 0.3791 0.6747 0.200 0.000 0.796 0.004
#> SRR1082376 1 0.4420 0.5917 0.748 0.000 0.240 0.012
#> SRR1500891 2 0.2882 0.8843 0.024 0.892 0.000 0.084
#> SRR807543 1 0.5088 0.2518 0.572 0.000 0.424 0.004
#> SRR1091572 1 0.4274 0.6286 0.808 0.000 0.148 0.044
#> SRR1346689 2 0.1488 0.9006 0.012 0.956 0.000 0.032
#> SRR1332424 4 0.6664 0.8370 0.272 0.000 0.128 0.600
#> SRR663729 2 0.4499 0.8607 0.048 0.792 0.000 0.160
#> SRR1097013 1 0.4837 0.4422 0.648 0.000 0.348 0.004
#> SRR613675 4 0.6617 0.8236 0.264 0.000 0.128 0.608
#> SRR1485357 2 0.2984 0.8839 0.028 0.888 0.000 0.084
#> SRR655816 3 0.4511 0.5755 0.268 0.000 0.724 0.008
#> SRR1500113 1 0.2266 0.6719 0.912 0.000 0.084 0.004
#> SRR1437622 2 0.2737 0.8934 0.008 0.888 0.000 0.104
#> SRR1355172 1 0.4837 0.4565 0.648 0.000 0.348 0.004
#> SRR655531 4 0.6716 0.7188 0.404 0.000 0.092 0.504
#> SRR1338147 3 0.1489 0.7452 0.044 0.000 0.952 0.004
#> SRR1413329 3 0.5808 0.2532 0.424 0.000 0.544 0.032
#> SRR1485931 2 0.3764 0.8783 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1420873 1 0.6180 0.0525 0.624 0.000 0.080 0.296
#> SRR1333308 2 0.3497 0.8875 0.036 0.860 0.000 0.104
#> SRR1452033 1 0.2197 0.6703 0.916 0.000 0.080 0.004
#> SRR1467316 2 0.3351 0.8921 0.008 0.844 0.000 0.148
#> SRR809018 3 0.0672 0.7448 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1375351 2 0.3311 0.8878 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR663440 3 0.4543 0.4995 0.324 0.000 0.676 0.000
#> SRR1471755 2 0.3498 0.8908 0.008 0.832 0.000 0.160
#> SRR808019 4 0.6918 0.6700 0.420 0.000 0.108 0.472
#> SRR1479133 3 0.5203 0.4760 0.348 0.000 0.636 0.016
#> SRR615069 3 0.7820 -0.4684 0.256 0.000 0.384 0.360
#> SRR1456185 2 0.3182 0.8899 0.028 0.876 0.000 0.096
#> SRR1350069 2 0.2363 0.8995 0.024 0.920 0.000 0.056
#> SRR816316 1 0.4535 0.5648 0.804 0.000 0.084 0.112
#> SRR664795 1 0.4837 0.4588 0.648 0.000 0.348 0.004
#> SRR1490721 2 0.2662 0.8978 0.016 0.900 0.000 0.084
#> SRR810643 1 0.6508 -0.2422 0.556 0.000 0.084 0.360
#> SRR1430333 3 0.7832 -0.4807 0.260 0.000 0.380 0.360
#> SRR1085285 3 0.3791 0.6746 0.200 0.000 0.796 0.004
#> SRR1099072 3 0.4872 0.4456 0.356 0.000 0.640 0.004
#> SRR1317985 1 0.2011 0.6709 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1487340 1 0.5522 0.3619 0.716 0.000 0.080 0.204
#> SRR1420276 3 0.0927 0.7410 0.008 0.000 0.976 0.016
#> SRR1351347 3 0.1305 0.7487 0.036 0.000 0.960 0.004
#> SRR1405525 4 0.7026 0.7186 0.404 0.000 0.120 0.476
#> SRR1370329 1 0.7391 0.2382 0.616 0.104 0.052 0.228
#> SRR1465001 1 0.3833 0.6159 0.848 0.000 0.080 0.072
#> SRR1476525 2 0.3450 0.8903 0.008 0.836 0.000 0.156
#> SRR819610 2 0.1284 0.9034 0.012 0.964 0.000 0.024
#> SRR2157314 1 0.2706 0.6644 0.900 0.000 0.080 0.020
#> SRR1409465 2 0.3074 0.8899 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR809987 2 0.3706 0.8860 0.040 0.848 0.000 0.112
#> SRR613639 1 0.3647 0.6537 0.832 0.000 0.152 0.016
#> SRR1402285 2 0.3037 0.8947 0.036 0.888 0.000 0.076
#> SRR1077038 1 0.4819 0.4613 0.652 0.000 0.344 0.004
#> SRR1405660 3 0.2699 0.7145 0.028 0.000 0.904 0.068
#> SRR1095455 3 0.6407 0.1700 0.412 0.000 0.520 0.068
#> SRR1394734 2 0.3498 0.8907 0.008 0.832 0.000 0.160
#> SRR1317771 1 0.3969 0.6402 0.804 0.000 0.180 0.016
#> SRR1365894 2 0.2714 0.8976 0.004 0.884 0.000 0.112
#> SRR1073581 1 0.3935 0.6491 0.840 0.000 0.100 0.060
#> SRR659804 1 0.2915 0.6600 0.892 0.000 0.080 0.028
#> SRR1345914 2 0.3649 0.8833 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1432186 2 0.3402 0.8896 0.004 0.832 0.000 0.164
#> SRR1473529 2 0.2546 0.8967 0.008 0.900 0.000 0.092
#> SRR660764 3 0.4017 0.6871 0.128 0.000 0.828 0.044
#> SRR820448 1 0.2662 0.6654 0.900 0.000 0.084 0.016
#> SRR1328845 2 0.2882 0.8945 0.024 0.892 0.000 0.084
#> SRR1336415 2 0.3523 0.8728 0.032 0.856 0.000 0.112
#> SRR1379065 2 0.3215 0.8805 0.032 0.876 0.000 0.092
#> SRR1459190 3 0.1004 0.7492 0.024 0.000 0.972 0.004
#> SRR1346773 1 0.6752 -0.5833 0.468 0.000 0.092 0.440
#> SRR1499521 1 0.6280 -0.0370 0.604 0.000 0.080 0.316
#> SRR1440898 2 0.3123 0.8895 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1347459 3 0.3616 0.7073 0.112 0.000 0.852 0.036
#> SRR1081209 2 0.3942 0.8723 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1400202 1 0.3013 0.6585 0.888 0.000 0.080 0.032
#> SRR1333395 2 0.2706 0.8948 0.020 0.900 0.000 0.080
#> SRR1309248 2 0.2053 0.8994 0.004 0.924 0.000 0.072
#> SRR809161 3 0.5143 0.1696 0.456 0.000 0.540 0.004
#> SRR1316320 2 0.3143 0.8902 0.024 0.876 0.000 0.100
#> SRR1432629 2 0.3355 0.8928 0.004 0.836 0.000 0.160
#> SRR1498931 1 0.2011 0.6709 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1416578 2 0.2623 0.9003 0.028 0.908 0.000 0.064
#> SRR1405547 3 0.0672 0.7448 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1470534 2 0.3616 0.8726 0.036 0.852 0.000 0.112
#> SRR1380764 4 0.6795 0.6624 0.432 0.000 0.096 0.472
#> SRR1309160 3 0.0657 0.7455 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR663489 3 0.0376 0.7428 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1500450 1 0.5203 0.4552 0.636 0.000 0.348 0.016
#> SRR1078489 3 0.3505 0.7033 0.048 0.000 0.864 0.088
#> SRR1332648 2 0.3523 0.8728 0.032 0.856 0.000 0.112
#> SRR660614 3 0.4388 0.6721 0.132 0.000 0.808 0.060
#> SRR1470420 2 0.3907 0.8724 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1475566 1 0.3370 0.6485 0.872 0.000 0.080 0.048
#> SRR1477949 1 0.2882 0.6654 0.892 0.000 0.084 0.024
#> SRR1481419 2 0.3311 0.8888 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1464766 1 0.4053 0.5968 0.768 0.000 0.228 0.004
#> SRR615946 3 0.4905 0.4400 0.364 0.000 0.632 0.004
#> SRR1446481 2 0.3257 0.8921 0.004 0.844 0.000 0.152
#> SRR1467656 2 0.3266 0.8888 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1402962 4 0.7016 0.8196 0.320 0.000 0.140 0.540
#> SRR660224 2 0.3942 0.8723 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR665586 1 0.4252 0.5779 0.744 0.000 0.252 0.004
#> SRR1347166 4 0.6747 0.8340 0.264 0.000 0.140 0.596
#> SRR1485722 4 0.6783 0.8316 0.304 0.000 0.124 0.572
#> SRR1415316 1 0.3796 0.6319 0.848 0.000 0.096 0.056
#> SRR613390 1 0.2334 0.6720 0.908 0.000 0.088 0.004
#> SRR661108 3 0.3439 0.7183 0.084 0.000 0.868 0.048
#> SRR2170173 3 0.5290 0.1225 0.476 0.000 0.516 0.008
#> SRR817329 1 0.5151 0.1162 0.532 0.000 0.464 0.004
#> SRR1401990 2 0.1510 0.9022 0.016 0.956 0.000 0.028
#> SRR1467745 2 0.2859 0.8918 0.008 0.880 0.000 0.112
#> SRR1471795 2 0.3498 0.8895 0.008 0.832 0.000 0.160
#> SRR1415637 2 0.3837 0.8776 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR813137 1 0.3271 0.6651 0.856 0.000 0.132 0.012
#> SRR1314873 1 0.2984 0.6601 0.888 0.000 0.084 0.028
#> SRR1401211 1 0.2011 0.6709 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1419692 2 0.3404 0.8772 0.032 0.864 0.000 0.104
#> SRR818797 1 0.2843 0.6654 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR2164608 3 0.3474 0.7186 0.064 0.000 0.868 0.068
#> SRR1455586 2 0.4198 0.8740 0.004 0.768 0.004 0.224
#> SRR819459 3 0.0592 0.7475 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1488939 2 0.3300 0.8924 0.008 0.848 0.000 0.144
#> SRR1433232 2 0.3498 0.8915 0.008 0.832 0.000 0.160
#> SRR1385501 1 0.5161 0.0588 0.520 0.000 0.476 0.004
#> SRR1361652 3 0.7717 -0.4462 0.224 0.000 0.388 0.388
#> SRR1437119 1 0.2342 0.6684 0.912 0.000 0.080 0.008
#> SRR1478547 3 0.1256 0.7496 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1430910 3 0.7211 0.1119 0.192 0.000 0.544 0.264
#> SRR1310584 1 0.6334 -0.0654 0.592 0.000 0.080 0.328
#> SRR1500216 2 0.5564 0.7813 0.076 0.708 0.000 0.216
#> SRR1486762 3 0.2125 0.7426 0.076 0.000 0.920 0.004
#> SRR1480854 2 0.2742 0.8954 0.024 0.900 0.000 0.076
#> SRR1489394 2 0.3523 0.8728 0.032 0.856 0.000 0.112
#> SRR1418085 2 0.3523 0.8728 0.032 0.856 0.000 0.112
#> SRR1340221 2 0.3182 0.8923 0.028 0.876 0.000 0.096
#> SRR1473058 2 0.1722 0.8952 0.008 0.944 0.000 0.048
#> SRR1405165 3 0.7542 -0.1631 0.176 0.004 0.484 0.336
#> SRR1433004 1 0.3300 0.6569 0.848 0.000 0.144 0.008
#> SRR1471477 1 0.4868 0.5592 0.720 0.000 0.256 0.024
#> SRR1098567 2 0.3942 0.8715 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1098712 2 0.2775 0.8931 0.020 0.896 0.000 0.084
#> SRR1455038 1 0.6382 -0.1212 0.580 0.000 0.080 0.340
#> SRR1375248 2 0.4303 0.8731 0.004 0.768 0.008 0.220
#> SRR1403005 3 0.4535 0.5256 0.292 0.000 0.704 0.004
#> SRR1348378 2 0.1902 0.9084 0.004 0.932 0.000 0.064
#> SRR1413541 1 0.4122 0.5934 0.760 0.000 0.236 0.004
#> SRR1392943 2 0.3107 0.8934 0.036 0.884 0.000 0.080
#> SRR1475192 3 0.1042 0.7487 0.020 0.000 0.972 0.008
#> SRR1432085 2 0.3448 0.8899 0.004 0.828 0.000 0.168
#> SRR1452468 3 0.7715 -0.3024 0.240 0.000 0.436 0.324
#> SRR1347060 3 0.0657 0.7460 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR1414139 2 0.3432 0.8927 0.004 0.848 0.008 0.140
#> SRR1447962 2 0.3907 0.8724 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1444324 2 0.4053 0.8729 0.004 0.768 0.000 0.228
#> SRR1415004 1 0.2011 0.6709 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1413436 1 0.6652 -0.4198 0.516 0.000 0.088 0.396
#> SRR1311266 4 0.6919 0.7957 0.352 0.000 0.120 0.528
#> SRR1343302 2 0.3523 0.8728 0.032 0.856 0.000 0.112
#> SRR1373746 1 0.3198 0.6520 0.880 0.000 0.080 0.040
#> SRR1429678 1 0.2011 0.6709 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1469413 2 0.3837 0.8753 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1405331 1 0.5372 0.1688 0.544 0.000 0.444 0.012
#> SRR1345609 1 0.4938 0.4905 0.772 0.000 0.080 0.148
#> SRR1380208 2 0.2796 0.8933 0.016 0.892 0.000 0.092
#> SRR1322840 2 0.3523 0.8728 0.032 0.856 0.000 0.112
#> SRR1399797 3 0.2401 0.7343 0.092 0.000 0.904 0.004
#> SRR1416654 3 0.0895 0.7478 0.020 0.000 0.976 0.004
#> SRR1315081 3 0.1510 0.7412 0.016 0.000 0.956 0.028
#> SRR1369196 3 0.0657 0.7455 0.012 0.000 0.984 0.004
#> SRR1400847 1 0.2197 0.6703 0.916 0.000 0.080 0.004
#> SRR1365291 3 0.2654 0.7314 0.108 0.000 0.888 0.004
#> SRR1367920 2 0.2335 0.9004 0.020 0.920 0.000 0.060
#> SRR1366648 3 0.0804 0.7457 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1441679 2 0.3942 0.8718 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1082173 3 0.5010 0.6373 0.108 0.000 0.772 0.120
#> SRR1363968 1 0.6334 -0.0923 0.592 0.000 0.080 0.328
#> SRR814387 1 0.6136 0.0883 0.632 0.000 0.080 0.288
#> SRR657599 1 0.6599 -0.4873 0.488 0.000 0.080 0.432
#> SRR1386689 2 0.3404 0.8766 0.032 0.864 0.000 0.104
#> SRR1395575 3 0.4632 0.5243 0.308 0.000 0.688 0.004
#> SRR1453811 1 0.4468 0.5905 0.752 0.000 0.232 0.016
#> SRR1441159 4 0.6758 0.7133 0.400 0.000 0.096 0.504
#> SRR1403154 2 0.3523 0.8728 0.032 0.856 0.000 0.112
#> SRR1468722 3 0.0804 0.7457 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1310275 3 0.4227 0.6824 0.060 0.000 0.820 0.120
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 1 0.3019 0.81271 0.864 0.000 0.088 0.000 0.048
#> SRR1331708 5 0.5303 0.77321 0.108 0.000 0.232 0.000 0.660
#> SRR1464258 1 0.2628 0.81721 0.884 0.000 0.088 0.000 0.028
#> SRR1454201 5 0.5222 0.80306 0.196 0.000 0.124 0.000 0.680
#> SRR661589 3 0.2574 0.79619 0.112 0.000 0.876 0.012 0.000
#> SRR1456229 1 0.2471 0.79802 0.864 0.000 0.136 0.000 0.000
#> SRR1315165 4 0.2629 0.69319 0.000 0.136 0.000 0.860 0.004
#> SRR1488960 1 0.3812 0.77461 0.812 0.000 0.092 0.000 0.096
#> SRR1417809 4 0.6307 0.54469 0.020 0.404 0.000 0.484 0.092
#> SRR1094457 4 0.1195 0.66236 0.000 0.012 0.000 0.960 0.028
#> SRR1095575 3 0.4607 0.45380 0.368 0.000 0.616 0.012 0.004
#> SRR1315931 1 0.4923 0.64612 0.700 0.000 0.088 0.000 0.212
#> SRR1430066 3 0.0671 0.81818 0.016 0.000 0.980 0.000 0.004
#> SRR1431037 3 0.0671 0.81818 0.016 0.000 0.980 0.000 0.004
#> SRR1395554 3 0.0955 0.81955 0.028 0.000 0.968 0.000 0.004
#> SRR818002 2 0.4491 0.41741 0.000 0.624 0.004 0.364 0.008
#> SRR1344143 2 0.5359 0.01446 0.000 0.616 0.000 0.304 0.080
#> SRR1486845 4 0.1739 0.66761 0.000 0.024 0.004 0.940 0.032
#> SRR1362866 5 0.5205 0.77779 0.104 0.000 0.224 0.000 0.672
#> SRR1490740 1 0.2408 0.81967 0.892 0.000 0.092 0.000 0.016
#> SRR1446627 2 0.1928 0.76729 0.000 0.920 0.004 0.004 0.072
#> SRR1456138 2 0.3643 0.64305 0.000 0.776 0.004 0.212 0.008
#> SRR1416248 1 0.5422 0.44689 0.616 0.000 0.088 0.000 0.296
#> SRR1383907 4 0.2972 0.68158 0.000 0.108 0.004 0.864 0.024
#> SRR1311018 1 0.2871 0.81433 0.872 0.000 0.088 0.000 0.040
#> SRR1375699 4 0.6287 0.49981 0.016 0.432 0.000 0.456 0.096
#> SRR1429846 3 0.4383 0.29218 0.424 0.000 0.572 0.004 0.000
#> SRR613550 3 0.3391 0.74178 0.188 0.000 0.800 0.012 0.000
#> SRR1348402 1 0.3255 0.80922 0.848 0.000 0.100 0.000 0.052
#> SRR1345146 3 0.2124 0.79889 0.056 0.000 0.916 0.000 0.028
#> SRR1324025 3 0.0671 0.81838 0.016 0.000 0.980 0.000 0.004
#> SRR1318879 3 0.1300 0.81031 0.028 0.000 0.956 0.000 0.016
#> SRR820755 3 0.5178 0.00394 0.476 0.000 0.484 0.000 0.040
#> SRR1485830 4 0.2575 0.69735 0.012 0.100 0.000 0.884 0.004
#> SRR599313 4 0.7335 0.53185 0.088 0.332 0.000 0.468 0.112
#> SRR612263 1 0.4038 0.77577 0.792 0.000 0.128 0.000 0.080
#> SRR1415398 3 0.2575 0.78577 0.100 0.000 0.884 0.012 0.004
#> SRR1326205 4 0.6154 0.56347 0.020 0.388 0.000 0.512 0.080
#> SRR1421327 4 0.4880 0.66148 0.016 0.240 0.004 0.708 0.032
#> SRR1083311 3 0.0566 0.81673 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1499303 4 0.2497 0.68121 0.000 0.112 0.004 0.880 0.004
#> SRR1079522 3 0.4582 0.70659 0.084 0.000 0.792 0.060 0.064
#> SRR1452935 3 0.1124 0.81870 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1379495 1 0.2628 0.81721 0.884 0.000 0.088 0.000 0.028
#> SRR1470459 2 0.1608 0.76512 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR661361 3 0.3485 0.76624 0.124 0.000 0.828 0.000 0.048
#> SRR615778 5 0.4734 0.80085 0.160 0.000 0.108 0.000 0.732
#> SRR1447564 1 0.3291 0.80237 0.848 0.000 0.088 0.000 0.064
#> SRR1455195 5 0.5037 0.76575 0.228 0.000 0.088 0.000 0.684
#> SRR655182 1 0.3210 0.72337 0.788 0.000 0.212 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.3797 0.60582 0.000 0.756 0.004 0.232 0.008
#> SRR1433555 3 0.0693 0.80922 0.008 0.000 0.980 0.000 0.012
#> SRR1308650 4 0.6491 0.52252 0.016 0.408 0.004 0.468 0.104
#> SRR1388354 1 0.2628 0.81721 0.884 0.000 0.088 0.000 0.028
#> SRR1317446 3 0.0566 0.81673 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1413602 3 0.1668 0.80015 0.032 0.000 0.940 0.000 0.028
#> SRR1479955 2 0.1798 0.74914 0.000 0.928 0.004 0.064 0.004
#> SRR809853 1 0.4016 0.76653 0.796 0.000 0.112 0.000 0.092
#> SRR661313 3 0.4470 0.43468 0.372 0.000 0.616 0.012 0.000
#> SRR1499935 4 0.3006 0.68456 0.000 0.156 0.004 0.836 0.004
#> SRR1447303 3 0.2077 0.80126 0.084 0.000 0.908 0.000 0.008
#> SRR1429408 4 0.4533 0.65046 0.000 0.260 0.004 0.704 0.032
#> SRR1433950 1 0.2628 0.81721 0.884 0.000 0.088 0.000 0.028
#> SRR1362081 2 0.1965 0.75967 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1409854 1 0.5080 0.43371 0.588 0.000 0.368 0.000 0.044
#> SRR1435229 5 0.5618 0.72875 0.112 0.000 0.280 0.000 0.608
#> SRR1085996 1 0.6172 0.01369 0.500 0.000 0.144 0.000 0.356
#> SRR1414229 5 0.4855 0.79752 0.112 0.000 0.168 0.000 0.720
#> SRR1400974 3 0.0854 0.81708 0.012 0.000 0.976 0.008 0.004
#> SRR1399971 1 0.2628 0.81721 0.884 0.000 0.088 0.000 0.028
#> SRR613927 1 0.2561 0.79140 0.856 0.000 0.144 0.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.2280 0.80789 0.880 0.000 0.120 0.000 0.000
#> SRR1473714 4 0.7328 0.53231 0.084 0.332 0.000 0.468 0.116
#> SRR813776 3 0.4650 0.10752 0.468 0.000 0.520 0.000 0.012
#> SRR808196 4 0.6488 0.54757 0.028 0.396 0.000 0.480 0.096
#> SRR1101085 4 0.2919 0.67821 0.000 0.104 0.004 0.868 0.024
#> SRR614395 1 0.2612 0.80996 0.868 0.000 0.124 0.000 0.008
#> SRR1478251 4 0.1195 0.66236 0.000 0.012 0.000 0.960 0.028
#> SRR1370551 2 0.2473 0.76508 0.000 0.896 0.000 0.032 0.072
#> SRR1362310 1 0.2712 0.81619 0.880 0.000 0.088 0.000 0.032
#> SRR665310 3 0.4044 0.67095 0.252 0.000 0.732 0.012 0.004
#> SRR1420109 3 0.2833 0.79318 0.120 0.000 0.864 0.012 0.004
#> SRR1330920 5 0.6754 0.49895 0.272 0.000 0.332 0.000 0.396
#> SRR1419539 4 0.5893 0.50259 0.000 0.436 0.000 0.464 0.100
#> SRR1359447 3 0.1408 0.81825 0.044 0.000 0.948 0.000 0.008
#> SRR1347259 4 0.6312 0.53499 0.020 0.408 0.000 0.480 0.092
#> SRR613915 3 0.4589 0.61017 0.248 0.000 0.704 0.000 0.048
#> SRR1384395 3 0.0613 0.81520 0.008 0.000 0.984 0.004 0.004
#> SRR821715 3 0.4517 0.33189 0.388 0.000 0.600 0.012 0.000
#> SRR1478228 1 0.4482 0.70542 0.752 0.000 0.088 0.000 0.160
#> SRR1445637 1 0.2806 0.78338 0.844 0.000 0.152 0.000 0.004
#> SRR608150 5 0.4884 0.80326 0.128 0.000 0.152 0.000 0.720
#> SRR1096383 1 0.2351 0.81869 0.896 0.000 0.088 0.000 0.016
#> SRR1341480 4 0.3355 0.68247 0.008 0.116 0.004 0.848 0.024
#> SRR1341344 5 0.5691 0.42832 0.376 0.000 0.088 0.000 0.536
#> SRR1326270 1 0.4610 0.26285 0.556 0.000 0.432 0.012 0.000
#> SRR1498838 3 0.1074 0.81757 0.016 0.000 0.968 0.012 0.004
#> SRR1416313 3 0.1267 0.81793 0.024 0.000 0.960 0.012 0.004
#> SRR808566 4 0.3365 0.67858 0.000 0.180 0.004 0.808 0.008
#> SRR1430270 4 0.5936 0.64418 0.044 0.252 0.000 0.636 0.068
#> SRR1367825 3 0.0727 0.81704 0.012 0.000 0.980 0.004 0.004
#> SRR613533 3 0.1638 0.81709 0.064 0.000 0.932 0.000 0.004
#> SRR661267 1 0.2536 0.80456 0.868 0.000 0.128 0.000 0.004
#> SRR810665 2 0.1877 0.76925 0.000 0.924 0.000 0.012 0.064
#> SRR1407250 5 0.5144 0.80666 0.176 0.000 0.132 0.000 0.692
#> SRR1420067 5 0.5354 0.75864 0.240 0.000 0.108 0.000 0.652
#> SRR1473632 1 0.5082 0.64431 0.680 0.000 0.244 0.004 0.072
#> SRR812536 3 0.1809 0.80688 0.060 0.000 0.928 0.000 0.012
#> SRR1370850 2 0.3001 0.71313 0.000 0.844 0.004 0.144 0.008
#> SRR1486195 2 0.1732 0.76398 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1407671 4 0.5932 0.49547 0.000 0.440 0.000 0.456 0.104
#> SRR1446375 3 0.4403 0.56981 0.316 0.000 0.668 0.012 0.004
#> SRR1465230 4 0.1195 0.66236 0.000 0.012 0.000 0.960 0.028
#> SRR614119 1 0.2179 0.81136 0.888 0.000 0.112 0.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.2612 0.74739 0.000 0.868 0.000 0.008 0.124
#> SRR1404209 1 0.4426 0.42098 0.612 0.000 0.380 0.004 0.004
#> SRR1392676 2 0.2069 0.76882 0.000 0.912 0.000 0.012 0.076
#> SRR665538 1 0.2389 0.81002 0.880 0.000 0.116 0.000 0.004
#> SRR660510 3 0.1442 0.81668 0.032 0.000 0.952 0.012 0.004
#> SRR1445655 4 0.2482 0.68018 0.000 0.084 0.000 0.892 0.024
#> SRR658953 3 0.2597 0.79340 0.092 0.000 0.884 0.000 0.024
#> SRR2166459 1 0.2970 0.77080 0.828 0.000 0.168 0.000 0.004
#> SRR1070713 2 0.5492 -0.41403 0.000 0.504 0.000 0.432 0.064
#> SRR1485312 3 0.0566 0.81673 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1317631 4 0.5963 0.59024 0.020 0.348 0.000 0.560 0.072
#> SRR1488610 5 0.4916 0.80549 0.160 0.000 0.124 0.000 0.716
#> SRR1330588 3 0.0771 0.81920 0.020 0.000 0.976 0.000 0.004
#> SRR1316367 5 0.5060 0.76228 0.224 0.000 0.092 0.000 0.684
#> SRR1433926 1 0.2628 0.81721 0.884 0.000 0.088 0.000 0.028
#> SRR1091302 4 0.3048 0.68471 0.000 0.176 0.000 0.820 0.004
#> SRR818263 5 0.5985 0.34021 0.408 0.000 0.112 0.000 0.480
#> SRR1404909 4 0.2956 0.67556 0.000 0.140 0.004 0.848 0.008
#> SRR663076 1 0.2793 0.81548 0.876 0.000 0.088 0.000 0.036
#> SRR1323577 2 0.2720 0.73559 0.000 0.880 0.004 0.096 0.020
#> SRR1442422 4 0.1300 0.66391 0.000 0.016 0.000 0.956 0.028
#> SRR1465893 1 0.3019 0.81292 0.864 0.000 0.088 0.000 0.048
#> SRR654862 1 0.5851 0.42246 0.580 0.000 0.288 0.000 0.132
#> SRR1407112 4 0.1300 0.66391 0.000 0.016 0.000 0.956 0.028
#> SRR1332969 3 0.1970 0.80932 0.060 0.000 0.924 0.012 0.004
#> SRR1353199 3 0.4507 0.51548 0.340 0.000 0.644 0.012 0.004
#> SRR1378885 3 0.4787 0.13654 0.432 0.000 0.548 0.000 0.020
#> SRR665357 3 0.0566 0.81673 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR662186 2 0.2536 0.74703 0.000 0.868 0.000 0.004 0.128
#> SRR1501020 3 0.3720 0.69170 0.228 0.000 0.760 0.012 0.000
#> SRR1347819 3 0.0771 0.81913 0.020 0.000 0.976 0.000 0.004
#> SRR1480813 2 0.2672 0.73087 0.000 0.872 0.004 0.116 0.008
#> SRR1472576 4 0.3170 0.68117 0.000 0.160 0.004 0.828 0.008
#> SRR1431781 4 0.2304 0.67874 0.000 0.068 0.004 0.908 0.020
#> SRR1452270 3 0.0404 0.80663 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1500472 5 0.5959 0.48269 0.108 0.000 0.420 0.000 0.472
#> SRR1417632 4 0.3511 0.67782 0.000 0.184 0.004 0.800 0.012
#> SRR1350153 2 0.2463 0.73891 0.000 0.888 0.004 0.100 0.008
#> SRR1458113 5 0.5688 0.65608 0.100 0.000 0.328 0.000 0.572
#> SRR1326579 5 0.5076 0.79195 0.200 0.000 0.108 0.000 0.692
#> SRR1349363 2 0.3838 0.63649 0.008 0.820 0.000 0.108 0.064
#> SRR1096712 3 0.0794 0.79043 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1090407 3 0.1605 0.81747 0.040 0.000 0.944 0.012 0.004
#> SRR1083752 2 0.4538 0.24437 0.000 0.564 0.004 0.428 0.004
#> SRR1377599 4 0.4440 0.67292 0.008 0.208 0.004 0.748 0.032
#> SRR1488449 3 0.1670 0.81969 0.052 0.000 0.936 0.012 0.000
#> SRR1318354 3 0.5867 -0.25653 0.100 0.000 0.496 0.000 0.404
#> SRR1359062 3 0.0566 0.81673 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1398924 5 0.5211 0.77144 0.100 0.000 0.232 0.000 0.668
#> SRR663783 3 0.0960 0.81862 0.016 0.000 0.972 0.008 0.004
#> SRR1319204 3 0.1943 0.80563 0.056 0.000 0.924 0.000 0.020
#> SRR1369070 2 0.2865 0.72125 0.000 0.856 0.004 0.132 0.008
#> SRR615659 1 0.2540 0.81801 0.888 0.000 0.088 0.000 0.024
#> SRR1337449 2 0.1704 0.76675 0.000 0.928 0.000 0.004 0.068
#> SRR1316982 2 0.3752 0.69397 0.000 0.828 0.072 0.008 0.092
#> SRR1498595 4 0.3797 0.63870 0.000 0.232 0.004 0.756 0.008
#> SRR1377423 3 0.3596 0.72167 0.212 0.000 0.776 0.012 0.000
#> SRR1312310 2 0.1792 0.76305 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1485613 1 0.2439 0.80637 0.876 0.000 0.120 0.000 0.004
#> SRR1338426 3 0.2370 0.77940 0.040 0.000 0.904 0.000 0.056
#> SRR1353309 3 0.1444 0.81500 0.040 0.000 0.948 0.000 0.012
#> SRR658941 5 0.5915 0.55350 0.108 0.000 0.384 0.000 0.508
#> SRR1101643 1 0.7887 -0.02131 0.468 0.196 0.000 0.140 0.196
#> SRR1401468 1 0.5785 0.03877 0.504 0.000 0.092 0.000 0.404
#> SRR1368874 2 0.1671 0.76467 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1324085 4 0.2052 0.68581 0.000 0.080 0.004 0.912 0.004
#> SRR1363858 4 0.7301 0.53397 0.084 0.336 0.000 0.468 0.112
#> SRR819820 3 0.2359 0.79280 0.060 0.000 0.904 0.000 0.036
#> SRR1337342 5 0.4946 0.80442 0.168 0.000 0.120 0.000 0.712
#> SRR655206 4 0.5959 0.52163 0.000 0.420 0.000 0.472 0.108
#> SRR1387013 4 0.5192 0.41376 0.000 0.472 0.004 0.492 0.032
#> SRR1317410 1 0.5282 0.51527 0.644 0.000 0.088 0.000 0.268
#> SRR608198 5 0.4797 0.79732 0.172 0.000 0.104 0.000 0.724
#> SRR1440161 2 0.2624 0.74967 0.000 0.872 0.000 0.012 0.116
#> SRR1343741 2 0.2784 0.73906 0.000 0.872 0.004 0.108 0.016
#> SRR1381288 2 0.2331 0.76850 0.000 0.908 0.004 0.024 0.064
#> SRR1415379 4 0.6174 0.58866 0.024 0.360 0.000 0.536 0.080
#> SRR1099622 2 0.2024 0.74629 0.004 0.920 0.004 0.068 0.004
#> SRR663197 3 0.3798 0.68914 0.064 0.000 0.808 0.000 0.128
#> SRR1394836 4 0.5895 0.49059 0.000 0.444 0.000 0.456 0.100
#> SRR661699 3 0.7742 0.23908 0.056 0.184 0.524 0.204 0.032
#> SRR813680 1 0.3333 0.73097 0.788 0.000 0.208 0.004 0.000
#> SRR1410678 1 0.2793 0.81574 0.876 0.000 0.088 0.000 0.036
#> SRR1378109 4 0.1300 0.66391 0.000 0.016 0.000 0.956 0.028
#> SRR1499174 1 0.2787 0.81812 0.880 0.000 0.088 0.004 0.028
#> SRR1311486 2 0.2166 0.76844 0.000 0.912 0.004 0.012 0.072
#> SRR1382851 4 0.5149 0.49971 0.000 0.424 0.004 0.540 0.032
#> SRR1433410 5 0.4761 0.79861 0.168 0.000 0.104 0.000 0.728
#> SRR661167 3 0.1153 0.81974 0.024 0.000 0.964 0.008 0.004
#> SRR1432518 3 0.1211 0.80912 0.024 0.000 0.960 0.000 0.016
#> SRR660462 3 0.1173 0.81818 0.020 0.000 0.964 0.012 0.004
#> SRR1374608 4 0.6307 0.54191 0.020 0.404 0.000 0.484 0.092
#> SRR657949 3 0.3635 0.66902 0.248 0.000 0.748 0.000 0.004
#> SRR1308882 4 0.4218 0.68910 0.016 0.168 0.004 0.784 0.028
#> SRR655768 1 0.4104 0.75804 0.788 0.000 0.088 0.000 0.124
#> SRR1485870 4 0.6075 0.48847 0.004 0.444 0.000 0.448 0.104
#> SRR1444138 1 0.3737 0.70558 0.764 0.000 0.224 0.008 0.004
#> SRR1417342 1 0.2616 0.82017 0.880 0.000 0.100 0.000 0.020
#> SRR1470193 4 0.5959 0.52163 0.000 0.420 0.000 0.472 0.108
#> SRR1091380 3 0.1943 0.80334 0.056 0.000 0.924 0.000 0.020
#> SRR1099096 1 0.5010 0.60611 0.688 0.000 0.088 0.000 0.224
#> SRR1313583 4 0.6520 0.56854 0.060 0.348 0.000 0.528 0.064
#> SRR1467102 2 0.4049 0.68432 0.000 0.780 0.000 0.056 0.164
#> SRR1485416 4 0.4211 0.67773 0.008 0.200 0.004 0.764 0.024
#> SRR818821 3 0.1121 0.81827 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR809963 1 0.2280 0.80796 0.880 0.000 0.120 0.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.3649 0.78664 0.824 0.000 0.088 0.000 0.088
#> SRR1353710 4 0.5410 0.59596 0.016 0.348 0.000 0.596 0.040
#> SRR1445259 3 0.5440 0.20530 0.088 0.000 0.612 0.000 0.300
#> SRR1408393 3 0.3280 0.72011 0.176 0.000 0.812 0.012 0.000
#> SRR1361522 1 0.2628 0.81721 0.884 0.000 0.088 0.000 0.028
#> SRR1368597 1 0.2230 0.80889 0.884 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.2621 0.73340 0.000 0.876 0.004 0.112 0.008
#> SRR1310542 3 0.0566 0.81673 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1333485 4 0.2484 0.67926 0.000 0.068 0.004 0.900 0.028
#> SRR1406437 4 0.5959 0.52163 0.000 0.420 0.000 0.472 0.108
#> SRR1354931 3 0.4109 0.57842 0.288 0.000 0.700 0.012 0.000
#> SRR1391856 2 0.5895 -0.48277 0.000 0.456 0.000 0.444 0.100
#> SRR1446738 4 0.6323 0.49816 0.024 0.436 0.000 0.456 0.084
#> SRR1309032 2 0.1544 0.76554 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1388145 2 0.1891 0.74718 0.004 0.928 0.004 0.060 0.004
#> SRR1432611 2 0.2068 0.76318 0.000 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR815869 3 0.0854 0.81502 0.012 0.000 0.976 0.004 0.008
#> SRR613150 3 0.1502 0.81933 0.056 0.000 0.940 0.000 0.004
#> SRR1375329 3 0.5884 -0.30761 0.100 0.000 0.480 0.000 0.420
#> SRR1387921 1 0.2628 0.81721 0.884 0.000 0.088 0.000 0.028
#> SRR1466792 2 0.1732 0.76404 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1360478 2 0.2885 0.76282 0.000 0.880 0.004 0.052 0.064
#> SRR1360695 1 0.2286 0.81435 0.888 0.000 0.108 0.000 0.004
#> SRR812943 3 0.6229 0.04068 0.392 0.000 0.464 0.000 0.144
#> SRR1400910 3 0.5831 -0.24584 0.096 0.000 0.496 0.000 0.408
#> SRR1444203 4 0.2011 0.69252 0.000 0.088 0.004 0.908 0.000
#> SRR816177 2 0.4618 0.39915 0.000 0.636 0.004 0.344 0.016
#> SRR658754 3 0.0798 0.81797 0.016 0.000 0.976 0.000 0.008
#> SRR1429603 4 0.5868 0.59954 0.016 0.332 0.004 0.584 0.064
#> SRR1397366 3 0.3783 0.71255 0.216 0.000 0.768 0.012 0.004
#> SRR1446028 1 0.5422 0.49833 0.616 0.000 0.088 0.000 0.296
#> SRR1083918 2 0.3737 0.63050 0.000 0.764 0.004 0.224 0.008
#> SRR1337606 5 0.4886 0.78826 0.100 0.000 0.188 0.000 0.712
#> SRR659109 3 0.0727 0.81704 0.012 0.000 0.980 0.004 0.004
#> SRR1337192 5 0.4752 0.78651 0.184 0.000 0.092 0.000 0.724
#> SRR656946 1 0.4564 0.60047 0.696 0.000 0.272 0.008 0.024
#> SRR1476102 5 0.5639 0.70614 0.260 0.000 0.124 0.000 0.616
#> SRR1476447 1 0.5238 0.53698 0.652 0.000 0.088 0.000 0.260
#> SRR1342067 4 0.2152 0.67113 0.000 0.044 0.004 0.920 0.032
#> SRR1385389 4 0.1356 0.66239 0.000 0.012 0.004 0.956 0.028
#> SRR1075971 1 0.4832 0.64930 0.712 0.000 0.088 0.000 0.200
#> SRR614419 5 0.5237 0.75561 0.236 0.000 0.100 0.000 0.664
#> SRR1322936 5 0.4855 0.79752 0.112 0.000 0.168 0.000 0.720
#> SRR1349121 1 0.2361 0.81759 0.892 0.000 0.096 0.000 0.012
#> SRR1430549 1 0.5700 0.16919 0.532 0.000 0.088 0.000 0.380
#> SRR612935 3 0.1704 0.81369 0.068 0.000 0.928 0.000 0.004
#> SRR661481 2 0.3402 0.67815 0.000 0.804 0.004 0.184 0.008
#> SRR1354117 2 0.2771 0.74356 0.000 0.860 0.000 0.012 0.128
#> SRR1393596 4 0.6415 0.54239 0.028 0.404 0.000 0.480 0.088
#> SRR1452164 1 0.2448 0.81837 0.892 0.000 0.088 0.000 0.020
#> SRR1070503 3 0.6756 -0.24323 0.364 0.000 0.372 0.000 0.264
#> SRR1499894 3 0.0932 0.81927 0.020 0.000 0.972 0.004 0.004
#> SRR1082883 5 0.4879 0.79456 0.108 0.000 0.176 0.000 0.716
#> SRR1468271 1 0.2408 0.81798 0.892 0.000 0.092 0.000 0.016
#> SRR1332443 1 0.5691 0.18110 0.536 0.000 0.088 0.000 0.376
#> SRR810295 2 0.1671 0.76467 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR662103 1 0.3159 0.80564 0.856 0.000 0.088 0.000 0.056
#> SRR1328620 3 0.4679 0.51261 0.068 0.000 0.716 0.000 0.216
#> SRR1396294 4 0.6307 0.53961 0.020 0.404 0.000 0.484 0.092
#> SRR1419917 1 0.2740 0.81919 0.876 0.000 0.096 0.000 0.028
#> SRR662114 3 0.5579 -0.01121 0.080 0.000 0.552 0.000 0.368
#> SRR1489199 1 0.4400 0.56970 0.672 0.000 0.308 0.000 0.020
#> SRR813584 2 0.4156 0.54544 0.000 0.700 0.004 0.288 0.008
#> SRR1069638 3 0.5708 0.21505 0.112 0.000 0.588 0.000 0.300
#> SRR614864 5 0.6155 0.74602 0.212 0.000 0.228 0.000 0.560
#> SRR1433392 1 0.2719 0.78978 0.852 0.000 0.144 0.000 0.004
#> SRR1377777 2 0.3365 0.67946 0.000 0.808 0.004 0.180 0.008
#> SRR2167710 1 0.4783 0.17010 0.532 0.000 0.452 0.012 0.004
#> SRR1401252 4 0.2770 0.68730 0.000 0.124 0.004 0.864 0.008
#> SRR1309963 4 0.1300 0.66391 0.000 0.016 0.000 0.956 0.028
#> SRR1338031 1 0.2011 0.81807 0.908 0.000 0.088 0.000 0.004
#> SRR1418628 2 0.2888 0.76153 0.000 0.880 0.004 0.060 0.056
#> SRR1486889 3 0.4003 0.63048 0.288 0.000 0.704 0.008 0.000
#> SRR1380393 1 0.2628 0.81721 0.884 0.000 0.088 0.000 0.028
#> SRR1319731 1 0.4767 0.65985 0.720 0.000 0.088 0.000 0.192
#> SRR1356468 4 0.6493 0.54454 0.028 0.400 0.000 0.476 0.096
#> SRR1337010 2 0.2280 0.75007 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1486520 1 0.5778 -0.15839 0.464 0.000 0.088 0.000 0.448
#> SRR1486538 4 0.1892 0.68978 0.000 0.080 0.000 0.916 0.004
#> SRR1340486 4 0.1300 0.66391 0.000 0.016 0.000 0.956 0.028
#> SRR1377696 4 0.4929 0.59477 0.000 0.340 0.004 0.624 0.032
#> SRR1465459 3 0.4545 0.26597 0.432 0.000 0.560 0.004 0.004
#> SRR1080270 3 0.0566 0.81673 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1312501 3 0.0566 0.81673 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1093148 5 0.6846 0.69768 0.084 0.040 0.236 0.036 0.604
#> SRR1467080 3 0.0727 0.81704 0.012 0.000 0.980 0.004 0.004
#> SRR1410866 2 0.3365 0.68446 0.000 0.808 0.004 0.180 0.008
#> SRR816475 4 0.1851 0.68986 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1379198 4 0.1300 0.66474 0.000 0.016 0.000 0.956 0.028
#> SRR613342 3 0.2536 0.78795 0.128 0.000 0.868 0.000 0.004
#> SRR1452246 2 0.3248 0.72583 0.000 0.852 0.004 0.104 0.040
#> SRR1338836 2 0.2621 0.73292 0.000 0.876 0.004 0.112 0.008
#> SRR1369129 4 0.1195 0.66236 0.000 0.012 0.000 0.960 0.028
#> SRR1396616 3 0.2833 0.78315 0.140 0.000 0.852 0.004 0.004
#> SRR813824 3 0.3242 0.75505 0.172 0.000 0.816 0.012 0.000
#> SRR1082376 1 0.2969 0.80613 0.852 0.000 0.128 0.000 0.020
#> SRR1500891 4 0.2582 0.68187 0.000 0.080 0.004 0.892 0.024
#> SRR807543 1 0.3480 0.67690 0.752 0.000 0.248 0.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.4280 0.76668 0.772 0.000 0.140 0.000 0.088
#> SRR1346689 4 0.4209 0.66906 0.000 0.224 0.004 0.744 0.028
#> SRR1332424 5 0.4781 0.80253 0.160 0.000 0.112 0.000 0.728
#> SRR663729 4 0.7201 0.54260 0.088 0.340 0.000 0.476 0.096
#> SRR1097013 1 0.2930 0.77402 0.832 0.000 0.164 0.000 0.004
#> SRR613675 5 0.4761 0.79698 0.124 0.000 0.144 0.000 0.732
#> SRR1485357 4 0.1106 0.67382 0.000 0.024 0.000 0.964 0.012
#> SRR655816 3 0.2771 0.78329 0.128 0.000 0.860 0.012 0.000
#> SRR1500113 1 0.2193 0.81675 0.900 0.000 0.092 0.000 0.008
#> SRR1437622 2 0.4664 0.26625 0.000 0.552 0.004 0.436 0.008
#> SRR1355172 1 0.3659 0.71430 0.768 0.000 0.220 0.012 0.000
#> SRR655531 5 0.5117 0.75053 0.240 0.000 0.088 0.000 0.672
#> SRR1338147 3 0.2727 0.75789 0.116 0.000 0.868 0.000 0.016
#> SRR1413329 3 0.3969 0.60326 0.304 0.000 0.692 0.000 0.004
#> SRR1485931 2 0.1830 0.76752 0.000 0.924 0.000 0.008 0.068
#> SRR1420873 1 0.5064 0.58119 0.680 0.000 0.088 0.000 0.232
#> SRR1333308 4 0.6617 0.55205 0.044 0.392 0.000 0.480 0.084
#> SRR1452033 1 0.2248 0.81903 0.900 0.000 0.088 0.000 0.012
#> SRR1467316 2 0.5559 -0.16622 0.000 0.572 0.000 0.344 0.084
#> SRR809018 3 0.0727 0.81731 0.012 0.000 0.980 0.004 0.004
#> SRR1375351 2 0.3277 0.75382 0.000 0.856 0.004 0.072 0.068
#> SRR663440 3 0.5236 0.24715 0.408 0.000 0.544 0.000 0.048
#> SRR1471755 2 0.4199 0.53124 0.000 0.692 0.004 0.296 0.008
#> SRR808019 5 0.5382 0.74542 0.260 0.000 0.100 0.000 0.640
#> SRR1479133 3 0.3740 0.73414 0.196 0.000 0.784 0.008 0.012
#> SRR615069 5 0.5744 0.55759 0.092 0.000 0.380 0.000 0.528
#> SRR1456185 4 0.6354 0.51422 0.016 0.416 0.000 0.464 0.104
#> SRR1350069 4 0.6327 0.55330 0.024 0.392 0.000 0.496 0.088
#> SRR816316 1 0.3535 0.79457 0.832 0.000 0.088 0.000 0.080
#> SRR664795 1 0.3231 0.74466 0.800 0.000 0.196 0.004 0.000
#> SRR1490721 4 0.6709 0.52965 0.056 0.404 0.000 0.464 0.076
#> SRR810643 5 0.5831 0.36647 0.408 0.000 0.096 0.000 0.496
#> SRR1430333 5 0.5970 0.60225 0.120 0.000 0.356 0.000 0.524
#> SRR1085285 3 0.2629 0.80127 0.104 0.000 0.880 0.012 0.004
#> SRR1099072 3 0.3659 0.71060 0.220 0.000 0.768 0.012 0.000
#> SRR1317985 1 0.2351 0.81895 0.896 0.000 0.088 0.000 0.016
#> SRR1487340 1 0.3535 0.79230 0.832 0.000 0.088 0.000 0.080
#> SRR1420276 3 0.0833 0.80456 0.004 0.000 0.976 0.004 0.016
#> SRR1351347 3 0.1043 0.81917 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1405525 5 0.5341 0.77398 0.212 0.000 0.124 0.000 0.664
#> SRR1370329 1 0.6341 0.37841 0.664 0.052 0.020 0.084 0.180
#> SRR1465001 1 0.3416 0.79812 0.840 0.000 0.088 0.000 0.072
#> SRR1476525 2 0.2865 0.72211 0.000 0.856 0.004 0.132 0.008
#> SRR819610 4 0.6255 0.55509 0.036 0.392 0.000 0.508 0.064
#> SRR2157314 1 0.2871 0.81455 0.872 0.000 0.088 0.000 0.040
#> SRR1409465 2 0.3151 0.75767 0.000 0.864 0.004 0.064 0.068
#> SRR809987 4 0.6560 0.56144 0.040 0.368 0.000 0.504 0.088
#> SRR613639 1 0.2193 0.81845 0.900 0.000 0.092 0.000 0.008
#> SRR1402285 4 0.4833 0.68630 0.040 0.144 0.000 0.760 0.056
#> SRR1077038 1 0.3006 0.77987 0.836 0.000 0.156 0.004 0.004
#> SRR1405660 3 0.1168 0.79127 0.008 0.000 0.960 0.000 0.032
#> SRR1095455 3 0.5701 0.34714 0.332 0.000 0.568 0.000 0.100
#> SRR1394734 2 0.4220 0.52382 0.000 0.688 0.004 0.300 0.008
#> SRR1317771 1 0.2825 0.80834 0.860 0.000 0.124 0.000 0.016
#> SRR1365894 2 0.5733 -0.45572 0.000 0.476 0.000 0.440 0.084
#> SRR1073581 1 0.3255 0.80647 0.848 0.000 0.100 0.000 0.052
#> SRR659804 1 0.3159 0.80749 0.856 0.000 0.088 0.000 0.056
#> SRR1345914 2 0.2573 0.75510 0.000 0.880 0.000 0.016 0.104
#> SRR1432186 2 0.2865 0.72269 0.000 0.856 0.004 0.132 0.008
#> SRR1473529 2 0.4698 0.08722 0.000 0.520 0.004 0.468 0.008
#> SRR660764 3 0.2006 0.80752 0.072 0.000 0.916 0.000 0.012
#> SRR820448 1 0.2871 0.81538 0.872 0.000 0.088 0.000 0.040
#> SRR1328845 4 0.6307 0.54469 0.020 0.404 0.000 0.484 0.092
#> SRR1336415 4 0.1743 0.67013 0.004 0.028 0.000 0.940 0.028
#> SRR1379065 4 0.2369 0.67595 0.000 0.056 0.004 0.908 0.032
#> SRR1459190 3 0.1281 0.82071 0.032 0.000 0.956 0.012 0.000
#> SRR1346773 5 0.5379 0.70817 0.268 0.000 0.096 0.000 0.636
#> SRR1499521 1 0.5803 -0.13193 0.488 0.000 0.092 0.000 0.420
#> SRR1440898 2 0.2888 0.76131 0.000 0.880 0.004 0.060 0.056
#> SRR1347459 3 0.1981 0.80820 0.064 0.000 0.920 0.000 0.016
#> SRR1081209 2 0.1732 0.76472 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1400202 1 0.3090 0.81151 0.860 0.000 0.088 0.000 0.052
#> SRR1333395 4 0.5959 0.52140 0.000 0.420 0.000 0.472 0.108
#> SRR1309248 4 0.6346 0.52060 0.028 0.424 0.000 0.468 0.080
#> SRR809161 1 0.4794 0.11533 0.520 0.000 0.464 0.012 0.004
#> SRR1316320 4 0.6432 0.48491 0.016 0.432 0.000 0.440 0.112
#> SRR1432629 2 0.3737 0.62833 0.000 0.764 0.004 0.224 0.008
#> SRR1498931 1 0.2628 0.81721 0.884 0.000 0.088 0.000 0.028
#> SRR1416578 4 0.5172 0.68011 0.024 0.188 0.000 0.716 0.072
#> SRR1405547 3 0.0854 0.81708 0.012 0.000 0.976 0.008 0.004
#> SRR1470534 4 0.1195 0.66236 0.000 0.012 0.000 0.960 0.028
#> SRR1380764 5 0.5216 0.73853 0.248 0.000 0.092 0.000 0.660
#> SRR1309160 3 0.0566 0.81673 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR663489 3 0.0854 0.81502 0.012 0.000 0.976 0.004 0.008
#> SRR1500450 1 0.3766 0.64898 0.728 0.000 0.268 0.004 0.000
#> SRR1078489 3 0.1915 0.79745 0.040 0.000 0.928 0.000 0.032
#> SRR1332648 4 0.1195 0.66236 0.000 0.012 0.000 0.960 0.028
#> SRR660614 3 0.1809 0.80740 0.060 0.000 0.928 0.000 0.012
#> SRR1470420 2 0.1671 0.76467 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1475566 1 0.3090 0.81188 0.860 0.000 0.088 0.000 0.052
#> SRR1477949 1 0.2505 0.81908 0.888 0.000 0.092 0.000 0.020
#> SRR1481419 2 0.2408 0.74038 0.000 0.892 0.004 0.096 0.008
#> SRR1464766 1 0.2377 0.80317 0.872 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR615946 3 0.3618 0.73360 0.196 0.000 0.788 0.012 0.004
#> SRR1446481 2 0.2570 0.73485 0.000 0.880 0.004 0.108 0.008
#> SRR1467656 2 0.2398 0.76914 0.004 0.908 0.004 0.020 0.064
#> SRR1402962 5 0.5460 0.79721 0.196 0.000 0.148 0.000 0.656
#> SRR660224 2 0.2377 0.74737 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR665586 1 0.2424 0.80095 0.868 0.000 0.132 0.000 0.000
#> SRR1347166 5 0.4887 0.80421 0.132 0.000 0.148 0.000 0.720
#> SRR1485722 5 0.5076 0.79545 0.200 0.000 0.108 0.000 0.692
#> SRR1415316 1 0.3641 0.79554 0.820 0.000 0.120 0.000 0.060
#> SRR613390 1 0.2616 0.81974 0.880 0.000 0.100 0.000 0.020
#> SRR661108 3 0.1877 0.81085 0.064 0.000 0.924 0.000 0.012
#> SRR2170173 3 0.4604 0.27399 0.428 0.000 0.560 0.012 0.000
#> SRR817329 1 0.4151 0.52177 0.652 0.000 0.344 0.000 0.004
#> SRR1401990 4 0.6036 0.58390 0.020 0.356 0.000 0.548 0.076
#> SRR1467745 4 0.4698 -0.07422 0.000 0.468 0.004 0.520 0.008
#> SRR1471795 2 0.3707 0.63392 0.000 0.768 0.004 0.220 0.008
#> SRR1415637 2 0.2074 0.76930 0.000 0.920 0.004 0.016 0.060
#> SRR813137 1 0.2570 0.81487 0.880 0.000 0.108 0.004 0.008
#> SRR1314873 1 0.2871 0.81715 0.872 0.000 0.088 0.000 0.040
#> SRR1401211 1 0.2248 0.81881 0.900 0.000 0.088 0.000 0.012
#> SRR1419692 4 0.2379 0.68086 0.012 0.048 0.000 0.912 0.028
#> SRR818797 1 0.2946 0.81590 0.868 0.000 0.088 0.000 0.044
#> SRR2164608 3 0.1774 0.81099 0.052 0.000 0.932 0.000 0.016
#> SRR1455586 2 0.2719 0.73812 0.000 0.852 0.000 0.004 0.144
#> SRR819459 3 0.0404 0.81774 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.6059 -0.36730 0.000 0.468 0.000 0.412 0.120
#> SRR1433232 2 0.3707 0.63331 0.000 0.768 0.004 0.220 0.008
#> SRR1385501 1 0.4151 0.51570 0.652 0.000 0.344 0.004 0.000
#> SRR1361652 5 0.5786 0.56722 0.096 0.000 0.380 0.000 0.524
#> SRR1437119 1 0.2793 0.81546 0.876 0.000 0.088 0.000 0.036
#> SRR1478547 3 0.1356 0.82141 0.028 0.000 0.956 0.012 0.004
#> SRR1430910 3 0.5136 0.37842 0.080 0.000 0.660 0.000 0.260
#> SRR1310584 1 0.5775 -0.09750 0.472 0.000 0.088 0.000 0.440
#> SRR1500216 4 0.7436 0.51955 0.092 0.328 0.000 0.460 0.120
#> SRR1486762 3 0.2305 0.80298 0.092 0.000 0.896 0.012 0.000
#> SRR1480854 4 0.4140 0.68767 0.016 0.152 0.004 0.796 0.032
#> SRR1489394 4 0.1195 0.66236 0.000 0.012 0.000 0.960 0.028
#> SRR1418085 4 0.1195 0.66236 0.000 0.012 0.000 0.960 0.028
#> SRR1340221 4 0.5665 0.66308 0.040 0.220 0.000 0.672 0.068
#> SRR1473058 4 0.4029 0.62764 0.000 0.316 0.000 0.680 0.004
#> SRR1405165 5 0.5779 0.45116 0.076 0.004 0.428 0.000 0.492
#> SRR1433004 1 0.2879 0.81910 0.868 0.000 0.100 0.000 0.032
#> SRR1471477 1 0.3456 0.75396 0.800 0.000 0.184 0.000 0.016
#> SRR1098567 2 0.1671 0.76467 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1098712 4 0.5962 0.51708 0.000 0.424 0.000 0.468 0.108
#> SRR1455038 1 0.5630 0.33524 0.560 0.000 0.088 0.000 0.352
#> SRR1375248 2 0.2771 0.74369 0.000 0.860 0.000 0.012 0.128
#> SRR1403005 3 0.3391 0.73384 0.188 0.000 0.800 0.012 0.000
#> SRR1348378 2 0.4115 0.60410 0.016 0.764 0.000 0.204 0.016
#> SRR1413541 1 0.2536 0.80638 0.868 0.000 0.128 0.000 0.004
#> SRR1392943 4 0.6712 0.55138 0.048 0.388 0.000 0.476 0.088
#> SRR1475192 3 0.0932 0.81997 0.020 0.000 0.972 0.004 0.004
#> SRR1432085 2 0.6144 -0.07621 0.000 0.520 0.000 0.332 0.148
#> SRR1452468 5 0.5956 0.47651 0.108 0.000 0.416 0.000 0.476
#> SRR1347060 3 0.0566 0.81673 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1414139 2 0.6321 -0.24460 0.000 0.464 0.000 0.376 0.160
#> SRR1447962 2 0.1608 0.76512 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1444324 2 0.2389 0.75172 0.000 0.880 0.000 0.004 0.116
#> SRR1415004 1 0.2628 0.81721 0.884 0.000 0.088 0.000 0.028
#> SRR1413436 5 0.5674 0.59549 0.324 0.000 0.100 0.000 0.576
#> SRR1311266 5 0.4981 0.80077 0.172 0.000 0.120 0.000 0.708
#> SRR1343302 4 0.1195 0.66236 0.000 0.012 0.000 0.960 0.028
#> SRR1373746 1 0.3704 0.78345 0.820 0.000 0.088 0.000 0.092
#> SRR1429678 1 0.2248 0.81881 0.900 0.000 0.088 0.000 0.012
#> SRR1469413 2 0.1704 0.76675 0.000 0.928 0.000 0.004 0.068
#> SRR1405331 1 0.4383 0.28060 0.572 0.000 0.424 0.000 0.004
#> SRR1345609 1 0.4404 0.71984 0.760 0.000 0.088 0.000 0.152
#> SRR1380208 2 0.5895 -0.48277 0.000 0.456 0.000 0.444 0.100
#> SRR1322840 4 0.1281 0.66231 0.000 0.012 0.000 0.956 0.032
#> SRR1399797 3 0.1638 0.81680 0.064 0.000 0.932 0.000 0.004
#> SRR1416654 3 0.0771 0.81944 0.020 0.000 0.976 0.000 0.004
#> SRR1315081 3 0.1200 0.81031 0.012 0.000 0.964 0.008 0.016
#> SRR1369196 3 0.0671 0.81838 0.016 0.000 0.980 0.000 0.004
#> SRR1400847 1 0.2540 0.81874 0.888 0.000 0.088 0.000 0.024
#> SRR1365291 3 0.3318 0.72328 0.192 0.000 0.800 0.000 0.008
#> SRR1367920 4 0.4797 0.66594 0.016 0.228 0.004 0.720 0.032
#> SRR1366648 3 0.0854 0.81708 0.012 0.000 0.976 0.008 0.004
#> SRR1441679 2 0.2873 0.74147 0.000 0.856 0.000 0.016 0.128
#> SRR1082173 3 0.2344 0.79737 0.064 0.000 0.904 0.000 0.032
#> SRR1363968 1 0.5751 0.14725 0.540 0.000 0.096 0.000 0.364
#> SRR814387 1 0.4923 0.62735 0.700 0.000 0.088 0.000 0.212
#> SRR657599 5 0.5458 0.59041 0.304 0.000 0.088 0.000 0.608
#> SRR1386689 4 0.1300 0.66391 0.000 0.016 0.000 0.956 0.028
#> SRR1395575 3 0.3280 0.75215 0.176 0.000 0.812 0.012 0.000
#> SRR1453811 1 0.3081 0.78766 0.832 0.000 0.156 0.000 0.012
#> SRR1441159 5 0.4974 0.76279 0.212 0.000 0.092 0.000 0.696
#> SRR1403154 4 0.1195 0.66236 0.000 0.012 0.000 0.960 0.028
#> SRR1468722 3 0.0671 0.81818 0.016 0.000 0.980 0.000 0.004
#> SRR1310275 3 0.3339 0.72837 0.048 0.000 0.840 0.000 0.112
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 1 0.3434 0.7683 0.836 0.000 0.072 0.000 0.064 0.028
#> SRR1331708 5 0.3004 0.5669 0.012 0.000 0.112 0.000 0.848 0.028
#> SRR1464258 1 0.2742 0.7629 0.876 0.000 0.072 0.000 0.036 0.016
#> SRR1454201 5 0.3740 0.6499 0.100 0.000 0.072 0.000 0.808 0.020
#> SRR661589 3 0.3873 0.5395 0.044 0.000 0.804 0.000 0.048 0.104
#> SRR1456229 1 0.4633 0.7191 0.736 0.000 0.120 0.000 0.028 0.116
#> SRR1315165 4 0.4064 0.7737 0.000 0.080 0.000 0.776 0.016 0.128
#> SRR1488960 1 0.4987 0.7125 0.708 0.000 0.080 0.000 0.160 0.052
#> SRR1417809 2 0.6273 0.5869 0.032 0.588 0.000 0.228 0.032 0.120
#> SRR1094457 4 0.0508 0.8101 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1095575 3 0.5530 0.2877 0.160 0.000 0.656 0.000 0.052 0.132
#> SRR1315931 1 0.5688 0.2257 0.548 0.000 0.056 0.000 0.340 0.056
#> SRR1430066 3 0.1168 0.6077 0.016 0.000 0.956 0.000 0.000 0.028
#> SRR1431037 3 0.3231 0.5086 0.016 0.000 0.784 0.000 0.000 0.200
#> SRR1395554 3 0.1500 0.6051 0.012 0.000 0.936 0.000 0.000 0.052
#> SRR818002 4 0.5756 0.4127 0.000 0.344 0.000 0.492 0.004 0.160
#> SRR1344143 2 0.4367 0.6837 0.004 0.752 0.000 0.144 0.012 0.088
#> SRR1486845 4 0.0964 0.8138 0.000 0.012 0.000 0.968 0.004 0.016
#> SRR1362866 5 0.2844 0.5734 0.012 0.000 0.112 0.000 0.856 0.020
#> SRR1490740 1 0.3351 0.7735 0.840 0.000 0.084 0.000 0.028 0.048
#> SRR1446627 2 0.1141 0.7142 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1456138 2 0.5536 0.1546 0.000 0.540 0.000 0.292 0.000 0.168
#> SRR1416248 5 0.5418 0.3951 0.396 0.000 0.052 0.000 0.520 0.032
#> SRR1383907 4 0.1909 0.8150 0.000 0.052 0.000 0.920 0.004 0.024
#> SRR1311018 1 0.2968 0.7484 0.868 0.000 0.056 0.000 0.044 0.032
#> SRR1375699 2 0.5294 0.6531 0.008 0.676 0.000 0.176 0.024 0.116
#> SRR1429846 1 0.6426 -0.1997 0.424 0.000 0.304 0.000 0.020 0.252
#> SRR613550 3 0.4518 0.4718 0.100 0.000 0.752 0.000 0.036 0.112
#> SRR1348402 1 0.5250 0.6607 0.676 0.000 0.084 0.000 0.188 0.052
#> SRR1345146 3 0.5607 0.1605 0.008 0.000 0.544 0.000 0.136 0.312
#> SRR1324025 3 0.3702 0.4234 0.012 0.000 0.720 0.000 0.004 0.264
#> SRR1318879 3 0.4482 0.4744 0.004 0.000 0.712 0.000 0.096 0.188
#> SRR820755 1 0.6303 0.5477 0.584 0.000 0.168 0.000 0.108 0.140
#> SRR1485830 4 0.4004 0.7919 0.012 0.076 0.004 0.808 0.016 0.084
#> SRR599313 2 0.7439 0.5260 0.076 0.512 0.004 0.164 0.056 0.188
#> SRR612263 1 0.6229 0.5945 0.584 0.000 0.116 0.000 0.200 0.100
#> SRR1415398 3 0.2213 0.5833 0.048 0.000 0.904 0.000 0.004 0.044
#> SRR1326205 2 0.6458 0.5028 0.008 0.516 0.000 0.264 0.036 0.176
#> SRR1421327 4 0.5744 0.5613 0.008 0.200 0.000 0.576 0.004 0.212
#> SRR1083311 3 0.1599 0.6012 0.008 0.000 0.940 0.000 0.028 0.024
#> SRR1499303 4 0.2094 0.8125 0.000 0.064 0.000 0.908 0.004 0.024
#> SRR1079522 3 0.6273 0.1223 0.016 0.000 0.540 0.016 0.200 0.228
#> SRR1452935 3 0.4273 0.4388 0.012 0.000 0.704 0.000 0.036 0.248
#> SRR1379495 1 0.2763 0.7608 0.876 0.000 0.072 0.000 0.028 0.024
#> SRR1470459 2 0.1152 0.7154 0.000 0.952 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR661361 3 0.6667 -0.2175 0.056 0.000 0.428 0.000 0.172 0.344
#> SRR615778 5 0.2618 0.6369 0.052 0.000 0.076 0.000 0.872 0.000
#> SRR1447564 1 0.3185 0.7561 0.852 0.000 0.060 0.000 0.064 0.024
#> SRR1455195 5 0.4210 0.6470 0.168 0.000 0.052 0.000 0.756 0.024
#> SRR655182 1 0.4746 0.6924 0.720 0.000 0.144 0.000 0.024 0.112
#> SRR1335140 2 0.5113 0.5341 0.000 0.628 0.000 0.204 0.000 0.168
#> SRR1433555 3 0.2579 0.5922 0.000 0.000 0.872 0.000 0.088 0.040
#> SRR1308650 2 0.5425 0.6480 0.012 0.664 0.000 0.176 0.020 0.128
#> SRR1388354 1 0.2415 0.7712 0.888 0.000 0.084 0.000 0.016 0.012
#> SRR1317446 3 0.0951 0.6070 0.008 0.000 0.968 0.000 0.004 0.020
#> SRR1413602 3 0.4406 0.5198 0.008 0.000 0.736 0.000 0.116 0.140
#> SRR1479955 2 0.1624 0.7175 0.000 0.936 0.000 0.020 0.004 0.040
#> SRR809853 1 0.5503 0.6526 0.664 0.000 0.096 0.000 0.168 0.072
#> SRR661313 3 0.5725 0.2192 0.188 0.000 0.620 0.000 0.040 0.152
#> SRR1499935 4 0.3663 0.7848 0.000 0.072 0.000 0.796 0.004 0.128
#> SRR1447303 3 0.5513 0.1678 0.076 0.000 0.576 0.000 0.032 0.316
#> SRR1429408 4 0.5501 0.4896 0.000 0.236 0.000 0.564 0.000 0.200
#> SRR1433950 1 0.3025 0.7750 0.860 0.000 0.080 0.000 0.028 0.032
#> SRR1362081 2 0.1082 0.7154 0.000 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR1409854 1 0.6424 0.5075 0.564 0.000 0.184 0.000 0.152 0.100
#> SRR1435229 5 0.4123 0.5209 0.020 0.000 0.136 0.000 0.772 0.072
#> SRR1085996 5 0.6093 0.4264 0.284 0.000 0.100 0.000 0.552 0.064
#> SRR1414229 5 0.2070 0.6083 0.012 0.000 0.092 0.000 0.896 0.000
#> SRR1400974 3 0.1321 0.6020 0.004 0.000 0.952 0.000 0.020 0.024
#> SRR1399971 1 0.2815 0.7517 0.876 0.000 0.056 0.000 0.044 0.024
#> SRR613927 1 0.4505 0.7242 0.748 0.000 0.120 0.000 0.028 0.104
#> SRR1457854 1 0.3316 0.7695 0.840 0.000 0.084 0.000 0.020 0.056
#> SRR1473714 2 0.7261 0.5447 0.072 0.524 0.004 0.164 0.044 0.192
#> SRR813776 1 0.6837 0.0770 0.468 0.000 0.220 0.000 0.076 0.236
#> SRR808196 2 0.6347 0.5846 0.032 0.584 0.000 0.232 0.040 0.112
#> SRR1101085 4 0.1890 0.8137 0.000 0.060 0.000 0.916 0.000 0.024
#> SRR614395 1 0.3996 0.7518 0.792 0.000 0.104 0.000 0.028 0.076
#> SRR1478251 4 0.0508 0.8101 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1370551 2 0.1768 0.7235 0.004 0.932 0.000 0.020 0.004 0.040
#> SRR1362310 1 0.2867 0.7553 0.872 0.000 0.064 0.000 0.040 0.024
#> SRR665310 3 0.5032 0.3685 0.136 0.000 0.704 0.000 0.040 0.120
#> SRR1420109 3 0.4447 0.5084 0.052 0.000 0.764 0.000 0.080 0.104
#> SRR1330920 5 0.7491 -0.3613 0.172 0.000 0.188 0.000 0.356 0.284
#> SRR1419539 2 0.4966 0.6424 0.000 0.680 0.000 0.204 0.020 0.096
#> SRR1359447 3 0.2711 0.5936 0.008 0.000 0.872 0.000 0.084 0.036
#> SRR1347259 2 0.6014 0.6090 0.024 0.604 0.000 0.224 0.024 0.124
#> SRR613915 3 0.7256 -0.4638 0.184 0.000 0.360 0.000 0.120 0.336
#> SRR1384395 3 0.1908 0.6005 0.000 0.000 0.916 0.000 0.056 0.028
#> SRR821715 3 0.6087 -0.2555 0.408 0.000 0.424 0.000 0.020 0.148
#> SRR1478228 1 0.5250 0.3069 0.604 0.000 0.052 0.000 0.308 0.036
#> SRR1445637 1 0.4477 0.7170 0.740 0.000 0.120 0.000 0.016 0.124
#> SRR608150 5 0.2019 0.6089 0.012 0.000 0.088 0.000 0.900 0.000
#> SRR1096383 1 0.3139 0.7746 0.852 0.000 0.080 0.000 0.020 0.048
#> SRR1341480 4 0.2830 0.8082 0.000 0.068 0.000 0.864 0.004 0.064
#> SRR1341344 5 0.5003 0.6055 0.252 0.000 0.044 0.000 0.660 0.044
#> SRR1326270 3 0.6149 -0.2245 0.396 0.000 0.432 0.000 0.024 0.148
#> SRR1498838 3 0.0717 0.6055 0.008 0.000 0.976 0.000 0.000 0.016
#> SRR1416313 3 0.0909 0.6037 0.012 0.000 0.968 0.000 0.000 0.020
#> SRR808566 4 0.4250 0.7509 0.000 0.108 0.000 0.744 0.004 0.144
#> SRR1430270 4 0.6744 0.4068 0.016 0.228 0.004 0.516 0.036 0.200
#> SRR1367825 3 0.1405 0.6005 0.004 0.000 0.948 0.000 0.024 0.024
#> SRR613533 3 0.4341 0.4638 0.012 0.000 0.712 0.000 0.048 0.228
#> SRR661267 1 0.4548 0.7410 0.744 0.000 0.108 0.000 0.028 0.120
#> SRR810665 2 0.1411 0.7139 0.000 0.936 0.000 0.004 0.000 0.060
#> SRR1407250 5 0.3409 0.6467 0.076 0.000 0.076 0.000 0.832 0.016
#> SRR1420067 5 0.4368 0.6457 0.164 0.000 0.060 0.000 0.748 0.028
#> SRR1473632 1 0.6644 0.2471 0.504 0.000 0.268 0.000 0.132 0.096
#> SRR812536 3 0.5125 0.3870 0.008 0.000 0.644 0.000 0.128 0.220
#> SRR1370850 2 0.4734 0.5000 0.000 0.680 0.000 0.152 0.000 0.168
#> SRR1486195 2 0.1082 0.7154 0.000 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR1407671 2 0.5174 0.6485 0.008 0.684 0.000 0.188 0.024 0.096
#> SRR1446375 3 0.5749 0.1190 0.224 0.000 0.596 0.000 0.028 0.152
#> SRR1465230 4 0.0508 0.8101 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR614119 1 0.4075 0.7627 0.788 0.000 0.080 0.000 0.032 0.100
#> SRR1356101 2 0.1605 0.7164 0.000 0.936 0.000 0.004 0.016 0.044
#> SRR1404209 1 0.5524 0.5674 0.632 0.000 0.192 0.000 0.028 0.148
#> SRR1392676 2 0.1204 0.7232 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR665538 1 0.3958 0.7509 0.784 0.000 0.096 0.000 0.012 0.108
#> SRR660510 3 0.1232 0.6044 0.016 0.000 0.956 0.000 0.004 0.024
#> SRR1445655 4 0.1788 0.8170 0.000 0.040 0.000 0.928 0.004 0.028
#> SRR658953 3 0.6388 -0.0666 0.036 0.000 0.480 0.000 0.184 0.300
#> SRR2166459 1 0.4924 0.6719 0.704 0.000 0.156 0.000 0.028 0.112
#> SRR1070713 2 0.4379 0.6869 0.008 0.748 0.000 0.136 0.004 0.104
#> SRR1485312 3 0.2488 0.5693 0.008 0.000 0.864 0.000 0.004 0.124
#> SRR1317631 2 0.6613 0.4392 0.012 0.484 0.000 0.300 0.036 0.168
#> SRR1488610 5 0.2854 0.6358 0.048 0.000 0.088 0.000 0.860 0.004
#> SRR1330588 3 0.3608 0.4459 0.012 0.000 0.736 0.000 0.004 0.248
#> SRR1316367 5 0.4256 0.6454 0.176 0.000 0.056 0.000 0.748 0.020
#> SRR1433926 1 0.2681 0.7622 0.880 0.000 0.072 0.000 0.028 0.020
#> SRR1091302 4 0.4303 0.7560 0.000 0.108 0.000 0.752 0.012 0.128
#> SRR818263 5 0.6052 0.3950 0.320 0.000 0.084 0.000 0.532 0.064
#> SRR1404909 4 0.2373 0.8058 0.000 0.084 0.000 0.888 0.004 0.024
#> SRR663076 1 0.2950 0.7619 0.868 0.000 0.064 0.000 0.036 0.032
#> SRR1323577 2 0.2923 0.7065 0.000 0.848 0.000 0.052 0.000 0.100
#> SRR1442422 4 0.0508 0.8101 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1465893 1 0.3338 0.7691 0.844 0.000 0.064 0.000 0.060 0.032
#> SRR654862 1 0.6713 0.3165 0.472 0.000 0.160 0.000 0.292 0.076
#> SRR1407112 4 0.0405 0.8110 0.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1332969 3 0.1642 0.5948 0.028 0.000 0.936 0.000 0.004 0.032
#> SRR1353199 3 0.5232 0.2965 0.176 0.000 0.672 0.000 0.032 0.120
#> SRR1378885 1 0.6484 0.1429 0.468 0.000 0.348 0.000 0.092 0.092
#> SRR665357 3 0.1857 0.6038 0.004 0.000 0.924 0.000 0.044 0.028
#> SRR662186 2 0.1757 0.7191 0.000 0.916 0.000 0.000 0.008 0.076
#> SRR1501020 3 0.4829 0.4041 0.132 0.000 0.724 0.000 0.040 0.104
#> SRR1347819 3 0.3345 0.5217 0.028 0.000 0.788 0.000 0.000 0.184
#> SRR1480813 2 0.3612 0.6334 0.000 0.780 0.000 0.052 0.000 0.168
#> SRR1472576 4 0.3875 0.7744 0.000 0.092 0.000 0.780 0.004 0.124
#> SRR1431781 4 0.1245 0.8178 0.000 0.032 0.000 0.952 0.000 0.016
#> SRR1452270 3 0.3777 0.4976 0.008 0.000 0.756 0.000 0.028 0.208
#> SRR1500472 5 0.5953 -0.1243 0.008 0.000 0.216 0.000 0.508 0.268
#> SRR1417632 4 0.4361 0.7524 0.004 0.116 0.000 0.744 0.004 0.132
#> SRR1350153 2 0.2066 0.7050 0.000 0.908 0.000 0.040 0.000 0.052
#> SRR1458113 5 0.4882 0.4060 0.016 0.000 0.180 0.000 0.692 0.112
#> SRR1326579 5 0.3776 0.6528 0.132 0.000 0.056 0.000 0.796 0.016
#> SRR1349363 2 0.3281 0.7167 0.004 0.848 0.000 0.080 0.020 0.048
#> SRR1096712 3 0.2145 0.5974 0.000 0.000 0.900 0.000 0.072 0.028
#> SRR1090407 3 0.1924 0.6013 0.028 0.000 0.920 0.000 0.004 0.048
#> SRR1083752 4 0.5850 0.3583 0.004 0.352 0.000 0.488 0.004 0.152
#> SRR1377599 4 0.5392 0.6164 0.004 0.180 0.000 0.620 0.004 0.192
#> SRR1488449 3 0.2918 0.5906 0.020 0.000 0.868 0.000 0.048 0.064
#> SRR1318354 5 0.6243 -0.2505 0.012 0.000 0.288 0.000 0.448 0.252
#> SRR1359062 3 0.3273 0.4988 0.008 0.000 0.776 0.000 0.004 0.212
#> SRR1398924 5 0.3208 0.5614 0.008 0.000 0.120 0.000 0.832 0.040
#> SRR663783 3 0.1890 0.6079 0.008 0.000 0.924 0.000 0.044 0.024
#> SRR1319204 3 0.3376 0.5603 0.004 0.000 0.816 0.000 0.128 0.052
#> SRR1369070 2 0.4328 0.5669 0.000 0.724 0.000 0.112 0.000 0.164
#> SRR615659 1 0.2793 0.7668 0.872 0.000 0.080 0.000 0.024 0.024
#> SRR1337449 2 0.1204 0.7138 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1316982 2 0.3118 0.6932 0.000 0.860 0.020 0.004 0.068 0.048
#> SRR1498595 4 0.4371 0.7474 0.000 0.116 0.000 0.732 0.004 0.148
#> SRR1377423 3 0.4818 0.4112 0.120 0.000 0.728 0.000 0.044 0.108
#> SRR1312310 2 0.1010 0.7154 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1485613 1 0.4088 0.7517 0.780 0.000 0.096 0.000 0.020 0.104
#> SRR1338426 3 0.4957 0.4215 0.004 0.000 0.664 0.000 0.148 0.184
#> SRR1353309 3 0.4568 0.4342 0.008 0.000 0.684 0.000 0.064 0.244
#> SRR658941 5 0.5503 0.1850 0.008 0.000 0.220 0.000 0.596 0.176
#> SRR1101643 2 0.8634 0.1105 0.256 0.284 0.004 0.068 0.184 0.204
#> SRR1401468 5 0.5332 0.5168 0.332 0.000 0.052 0.000 0.580 0.036
#> SRR1368874 2 0.0865 0.7156 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1324085 4 0.2437 0.8155 0.000 0.036 0.000 0.888 0.004 0.072
#> SRR1363858 2 0.7227 0.5433 0.072 0.524 0.004 0.164 0.040 0.196
#> SRR819820 3 0.6188 -0.0442 0.028 0.000 0.480 0.000 0.156 0.336
#> SRR1337342 5 0.3382 0.6484 0.080 0.000 0.064 0.000 0.836 0.020
#> SRR655206 2 0.5347 0.6368 0.012 0.660 0.000 0.204 0.016 0.108
#> SRR1387013 2 0.5562 0.5655 0.008 0.588 0.000 0.192 0.000 0.212
#> SRR1317410 5 0.5473 0.4021 0.392 0.000 0.052 0.000 0.520 0.036
#> SRR608198 5 0.2680 0.6477 0.076 0.000 0.056 0.000 0.868 0.000
#> SRR1440161 2 0.1391 0.7154 0.000 0.944 0.000 0.000 0.016 0.040
#> SRR1343741 2 0.3470 0.6436 0.000 0.796 0.000 0.052 0.000 0.152
#> SRR1381288 2 0.1524 0.7133 0.000 0.932 0.000 0.008 0.000 0.060
#> SRR1415379 2 0.6561 0.2401 0.000 0.404 0.000 0.360 0.036 0.200
#> SRR1099622 2 0.1794 0.7113 0.000 0.924 0.000 0.036 0.000 0.040
#> SRR663197 3 0.6081 -0.2867 0.000 0.000 0.384 0.000 0.276 0.340
#> SRR1394836 2 0.4647 0.6520 0.000 0.700 0.000 0.196 0.008 0.096
#> SRR661699 3 0.8060 -0.0242 0.008 0.324 0.380 0.084 0.112 0.092
#> SRR813680 1 0.4961 0.6676 0.688 0.000 0.148 0.000 0.016 0.148
#> SRR1410678 1 0.3020 0.7533 0.864 0.000 0.064 0.000 0.040 0.032
#> SRR1378109 4 0.0508 0.8101 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1499174 1 0.4189 0.7555 0.780 0.000 0.112 0.000 0.040 0.068
#> SRR1311486 2 0.1462 0.7134 0.000 0.936 0.000 0.008 0.000 0.056
#> SRR1382851 2 0.5894 0.4228 0.004 0.500 0.000 0.280 0.000 0.216
#> SRR1433410 5 0.2629 0.6451 0.068 0.000 0.060 0.000 0.872 0.000
#> SRR661167 3 0.2665 0.6051 0.024 0.000 0.884 0.000 0.032 0.060
#> SRR1432518 3 0.5270 0.1822 0.008 0.000 0.560 0.000 0.088 0.344
#> SRR660462 3 0.0909 0.6038 0.012 0.000 0.968 0.000 0.000 0.020
#> SRR1374608 2 0.5963 0.6240 0.020 0.624 0.000 0.200 0.036 0.120
#> SRR657949 3 0.6071 -0.0422 0.168 0.000 0.520 0.000 0.024 0.288
#> SRR1308882 4 0.4483 0.7533 0.004 0.092 0.000 0.724 0.004 0.176
#> SRR655768 1 0.4051 0.7235 0.788 0.000 0.068 0.000 0.112 0.032
#> SRR1485870 2 0.5437 0.6432 0.020 0.660 0.000 0.188 0.012 0.120
#> SRR1444138 1 0.4961 0.6595 0.688 0.000 0.152 0.000 0.016 0.144
#> SRR1417342 1 0.3717 0.7595 0.808 0.000 0.092 0.000 0.016 0.084
#> SRR1470193 2 0.5507 0.6323 0.016 0.656 0.000 0.204 0.024 0.100
#> SRR1091380 3 0.5929 0.0845 0.028 0.000 0.516 0.000 0.120 0.336
#> SRR1099096 5 0.5523 0.2307 0.452 0.000 0.052 0.000 0.460 0.036
#> SRR1313583 2 0.6808 0.5346 0.032 0.532 0.004 0.264 0.048 0.120
#> SRR1467102 2 0.3548 0.7114 0.000 0.816 0.000 0.052 0.016 0.116
#> SRR1485416 4 0.4686 0.7281 0.004 0.120 0.000 0.708 0.004 0.164
#> SRR818821 3 0.4497 0.4380 0.012 0.000 0.692 0.000 0.052 0.244
#> SRR809963 1 0.3827 0.7575 0.804 0.000 0.096 0.000 0.024 0.076
#> SRR1072247 1 0.3739 0.7218 0.816 0.000 0.056 0.000 0.088 0.040
#> SRR1353710 2 0.6330 0.3819 0.008 0.472 0.000 0.336 0.020 0.164
#> SRR1445259 5 0.6554 -0.4928 0.020 0.000 0.328 0.000 0.336 0.316
#> SRR1408393 3 0.4734 0.4193 0.104 0.000 0.692 0.000 0.008 0.196
#> SRR1361522 1 0.2838 0.7593 0.872 0.000 0.072 0.000 0.032 0.024
#> SRR1368597 1 0.4167 0.7466 0.776 0.000 0.096 0.000 0.024 0.104
#> SRR1309680 2 0.3730 0.6331 0.000 0.772 0.000 0.060 0.000 0.168
#> SRR1310542 3 0.1565 0.5997 0.004 0.000 0.940 0.000 0.028 0.028
#> SRR1333485 4 0.1498 0.8170 0.000 0.032 0.000 0.940 0.000 0.028
#> SRR1406437 2 0.5346 0.6397 0.012 0.664 0.000 0.192 0.016 0.116
#> SRR1354931 3 0.4849 0.3629 0.156 0.000 0.700 0.000 0.016 0.128
#> SRR1391856 2 0.4792 0.6552 0.004 0.704 0.000 0.184 0.012 0.096
#> SRR1446738 2 0.5280 0.6460 0.016 0.664 0.000 0.196 0.008 0.116
#> SRR1309032 2 0.1007 0.7149 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1388145 2 0.1633 0.7146 0.000 0.932 0.000 0.024 0.000 0.044
#> SRR1432611 2 0.1124 0.7158 0.000 0.956 0.000 0.000 0.008 0.036
#> SRR815869 3 0.1565 0.5995 0.004 0.000 0.940 0.000 0.028 0.028
#> SRR613150 3 0.4871 0.3772 0.024 0.000 0.648 0.000 0.048 0.280
#> SRR1375329 5 0.6223 -0.4252 0.004 0.000 0.292 0.000 0.376 0.328
#> SRR1387921 1 0.2684 0.7618 0.880 0.000 0.072 0.000 0.024 0.024
#> SRR1466792 2 0.1010 0.7154 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1360478 2 0.2237 0.7037 0.000 0.896 0.000 0.036 0.000 0.068
#> SRR1360695 1 0.3367 0.7717 0.836 0.000 0.088 0.000 0.020 0.056
#> SRR812943 3 0.7689 -0.5066 0.216 0.000 0.304 0.000 0.232 0.248
#> SRR1400910 5 0.6209 -0.4116 0.004 0.000 0.288 0.000 0.388 0.320
#> SRR1444203 4 0.2789 0.8070 0.000 0.044 0.000 0.864 0.004 0.088
#> SRR816177 2 0.5716 0.1370 0.000 0.500 0.000 0.312 0.000 0.188
#> SRR658754 3 0.2285 0.6024 0.008 0.000 0.900 0.000 0.064 0.028
#> SRR1429603 2 0.6342 0.1922 0.008 0.408 0.000 0.388 0.012 0.184
#> SRR1397366 3 0.4771 0.4502 0.100 0.000 0.732 0.000 0.044 0.124
#> SRR1446028 5 0.6203 0.3349 0.372 0.000 0.052 0.000 0.472 0.104
#> SRR1083918 2 0.5650 0.0192 0.000 0.500 0.000 0.332 0.000 0.168
#> SRR1337606 5 0.2520 0.5804 0.008 0.000 0.108 0.000 0.872 0.012
#> SRR659109 3 0.0881 0.6076 0.008 0.000 0.972 0.000 0.008 0.012
#> SRR1337192 5 0.3758 0.6546 0.112 0.000 0.048 0.000 0.808 0.032
#> SRR656946 3 0.5714 -0.2030 0.412 0.000 0.484 0.000 0.048 0.056
#> SRR1476102 5 0.4258 0.6470 0.172 0.000 0.048 0.000 0.752 0.028
#> SRR1476447 5 0.5426 0.3289 0.412 0.000 0.056 0.000 0.504 0.028
#> SRR1342067 4 0.1341 0.8167 0.000 0.028 0.000 0.948 0.000 0.024
#> SRR1385389 4 0.0508 0.8101 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1075971 1 0.5648 -0.0034 0.504 0.000 0.072 0.000 0.392 0.032
#> SRR614419 5 0.4544 0.6383 0.184 0.000 0.056 0.000 0.728 0.032
#> SRR1322936 5 0.2020 0.5999 0.008 0.000 0.096 0.000 0.896 0.000
#> SRR1349121 1 0.3577 0.7739 0.828 0.000 0.080 0.000 0.040 0.052
#> SRR1430549 5 0.5346 0.4967 0.340 0.000 0.056 0.000 0.572 0.032
#> SRR612935 3 0.4132 0.5049 0.008 0.000 0.748 0.000 0.064 0.180
#> SRR661481 2 0.4923 0.4953 0.000 0.656 0.000 0.176 0.000 0.168
#> SRR1354117 2 0.1605 0.7170 0.000 0.936 0.000 0.004 0.016 0.044
#> SRR1393596 2 0.6020 0.5711 0.020 0.568 0.000 0.236 0.008 0.168
#> SRR1452164 1 0.2449 0.7712 0.888 0.000 0.080 0.000 0.020 0.012
#> SRR1070503 5 0.6536 0.2209 0.332 0.000 0.152 0.000 0.460 0.056
#> SRR1499894 3 0.1887 0.6097 0.012 0.000 0.924 0.000 0.048 0.016
#> SRR1082883 5 0.2020 0.5999 0.008 0.000 0.096 0.000 0.896 0.000
#> SRR1468271 1 0.3742 0.7730 0.816 0.000 0.080 0.000 0.036 0.068
#> SRR1332443 5 0.5313 0.5240 0.324 0.000 0.048 0.000 0.588 0.040
#> SRR810295 2 0.1082 0.7154 0.000 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR662103 1 0.3242 0.7534 0.848 0.000 0.068 0.000 0.060 0.024
#> SRR1328620 3 0.6309 -0.3689 0.008 0.000 0.372 0.000 0.284 0.336
#> SRR1396294 2 0.5892 0.6163 0.016 0.620 0.000 0.220 0.036 0.108
#> SRR1419917 1 0.3552 0.7727 0.828 0.000 0.088 0.000 0.040 0.044
#> SRR662114 5 0.6246 -0.4914 0.004 0.000 0.312 0.000 0.352 0.332
#> SRR1489199 1 0.6077 0.6007 0.612 0.000 0.156 0.000 0.128 0.104
#> SRR813584 2 0.5696 -0.1106 0.000 0.464 0.000 0.372 0.000 0.164
#> SRR1069638 6 0.6815 0.0962 0.040 0.000 0.316 0.000 0.300 0.344
#> SRR614864 5 0.4944 0.5598 0.104 0.000 0.152 0.000 0.708 0.036
#> SRR1433392 1 0.4477 0.7178 0.740 0.000 0.124 0.000 0.016 0.120
#> SRR1377777 2 0.5138 0.3881 0.000 0.624 0.000 0.208 0.000 0.168
#> SRR2167710 3 0.5619 0.2242 0.188 0.000 0.636 0.000 0.044 0.132
#> SRR1401252 4 0.3253 0.7971 0.000 0.068 0.000 0.832 0.004 0.096
#> SRR1309963 4 0.0508 0.8101 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1338031 1 0.2778 0.7731 0.872 0.000 0.080 0.000 0.016 0.032
#> SRR1418628 2 0.2237 0.7047 0.000 0.896 0.000 0.036 0.000 0.068
#> SRR1486889 3 0.5707 0.2787 0.160 0.000 0.628 0.000 0.044 0.168
#> SRR1380393 1 0.2684 0.7618 0.880 0.000 0.072 0.000 0.024 0.024
#> SRR1319731 1 0.5562 -0.1412 0.480 0.000 0.056 0.000 0.428 0.036
#> SRR1356468 2 0.6176 0.5983 0.020 0.596 0.000 0.212 0.036 0.136
#> SRR1337010 2 0.1524 0.7176 0.000 0.932 0.000 0.000 0.008 0.060
#> SRR1486520 5 0.5214 0.5175 0.332 0.000 0.048 0.000 0.588 0.032
#> SRR1486538 4 0.2721 0.8108 0.000 0.040 0.000 0.868 0.004 0.088
#> SRR1340486 4 0.0508 0.8101 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1377696 4 0.6080 0.2087 0.004 0.332 0.000 0.460 0.004 0.200
#> SRR1465459 1 0.6084 0.2932 0.544 0.000 0.268 0.000 0.036 0.152
#> SRR1080270 3 0.1218 0.6080 0.012 0.000 0.956 0.000 0.004 0.028
#> SRR1312501 3 0.2615 0.5636 0.008 0.000 0.852 0.000 0.004 0.136
#> SRR1093148 5 0.3853 0.5373 0.008 0.012 0.128 0.012 0.808 0.032
#> SRR1467080 3 0.1426 0.6047 0.008 0.000 0.948 0.000 0.028 0.016
#> SRR1410866 2 0.5202 0.3717 0.000 0.612 0.000 0.224 0.000 0.164
#> SRR816475 4 0.2721 0.8124 0.000 0.040 0.000 0.868 0.004 0.088
#> SRR1379198 4 0.0748 0.8089 0.004 0.000 0.000 0.976 0.004 0.016
#> SRR613342 3 0.5667 0.3331 0.048 0.000 0.612 0.000 0.096 0.244
#> SRR1452246 2 0.3196 0.7113 0.004 0.836 0.000 0.064 0.000 0.096
#> SRR1338836 2 0.3542 0.6381 0.000 0.788 0.000 0.052 0.000 0.160
#> SRR1369129 4 0.0508 0.8101 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1396616 3 0.4430 0.5089 0.084 0.000 0.748 0.000 0.024 0.144
#> SRR813824 3 0.4990 0.4370 0.100 0.000 0.716 0.000 0.056 0.128
#> SRR1082376 1 0.5413 0.6945 0.680 0.000 0.108 0.000 0.136 0.076
#> SRR1500891 4 0.1478 0.8175 0.000 0.032 0.000 0.944 0.004 0.020
#> SRR807543 1 0.4980 0.6808 0.700 0.000 0.140 0.000 0.028 0.132
#> SRR1091572 1 0.5838 0.6267 0.636 0.000 0.156 0.000 0.120 0.088
#> SRR1346689 4 0.5399 0.6030 0.000 0.188 0.000 0.624 0.012 0.176
#> SRR1332424 5 0.2733 0.6406 0.056 0.000 0.080 0.000 0.864 0.000
#> SRR663729 2 0.7226 0.5377 0.060 0.512 0.004 0.176 0.040 0.208
#> SRR1097013 1 0.4639 0.7111 0.732 0.000 0.124 0.000 0.024 0.120
#> SRR613675 5 0.2060 0.6126 0.016 0.000 0.084 0.000 0.900 0.000
#> SRR1485357 4 0.0653 0.8150 0.000 0.004 0.000 0.980 0.004 0.012
#> SRR655816 3 0.4341 0.4949 0.080 0.000 0.772 0.000 0.048 0.100
#> SRR1500113 1 0.3902 0.7711 0.804 0.000 0.080 0.000 0.036 0.080
#> SRR1437622 4 0.5494 0.5558 0.000 0.268 0.000 0.572 0.004 0.156
#> SRR1355172 1 0.5862 0.3755 0.556 0.000 0.276 0.000 0.024 0.144
#> SRR655531 5 0.4557 0.6300 0.212 0.000 0.048 0.000 0.712 0.028
#> SRR1338147 3 0.5473 0.1883 0.088 0.000 0.608 0.000 0.032 0.272
#> SRR1413329 6 0.7022 0.2111 0.312 0.000 0.292 0.000 0.060 0.336
#> SRR1485931 2 0.1141 0.7142 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1420873 1 0.5385 -0.1744 0.476 0.000 0.056 0.000 0.444 0.024
#> SRR1333308 2 0.6376 0.5813 0.032 0.576 0.000 0.228 0.032 0.132
#> SRR1452033 1 0.2649 0.7670 0.880 0.000 0.076 0.000 0.016 0.028
#> SRR1467316 2 0.4269 0.6825 0.004 0.760 0.000 0.144 0.012 0.080
#> SRR809018 3 0.1421 0.6032 0.000 0.000 0.944 0.000 0.028 0.028
#> SRR1375351 2 0.2474 0.7004 0.000 0.880 0.000 0.040 0.000 0.080
#> SRR663440 1 0.7169 -0.0587 0.432 0.000 0.232 0.000 0.116 0.220
#> SRR1471755 2 0.5723 -0.2254 0.000 0.428 0.000 0.408 0.000 0.164
#> SRR808019 5 0.4131 0.6382 0.168 0.000 0.052 0.000 0.760 0.020
#> SRR1479133 3 0.6166 0.2005 0.116 0.000 0.568 0.000 0.072 0.244
#> SRR615069 5 0.5466 0.1871 0.008 0.000 0.192 0.000 0.604 0.196
#> SRR1456185 2 0.5583 0.6434 0.016 0.652 0.000 0.176 0.020 0.136
#> SRR1350069 2 0.6014 0.5795 0.012 0.588 0.000 0.252 0.036 0.112
#> SRR816316 1 0.3677 0.7439 0.816 0.000 0.072 0.000 0.088 0.024
#> SRR664795 1 0.5140 0.6429 0.672 0.000 0.164 0.000 0.020 0.144
#> SRR1490721 2 0.5891 0.6168 0.028 0.612 0.000 0.208 0.012 0.140
#> SRR810643 5 0.5145 0.5425 0.312 0.000 0.048 0.000 0.608 0.032
#> SRR1430333 5 0.4771 0.3808 0.008 0.000 0.184 0.000 0.692 0.116
#> SRR1085285 3 0.4191 0.5299 0.048 0.000 0.784 0.000 0.072 0.096
#> SRR1099072 3 0.4958 0.4013 0.124 0.000 0.712 0.000 0.040 0.124
#> SRR1317985 1 0.2519 0.7640 0.888 0.000 0.072 0.000 0.020 0.020
#> SRR1487340 1 0.4440 0.6732 0.752 0.000 0.076 0.000 0.140 0.032
#> SRR1420276 3 0.1970 0.5999 0.000 0.000 0.912 0.000 0.060 0.028
#> SRR1351347 3 0.4592 0.3599 0.008 0.000 0.652 0.000 0.048 0.292
#> SRR1405525 5 0.3840 0.6531 0.104 0.000 0.076 0.000 0.800 0.020
#> SRR1370329 1 0.7497 0.1773 0.520 0.052 0.016 0.064 0.188 0.160
#> SRR1465001 1 0.3569 0.7313 0.828 0.000 0.056 0.000 0.080 0.036
#> SRR1476525 2 0.4319 0.5692 0.000 0.724 0.000 0.108 0.000 0.168
#> SRR819610 2 0.6014 0.6107 0.028 0.604 0.000 0.240 0.028 0.100
#> SRR2157314 1 0.2950 0.7550 0.868 0.000 0.064 0.000 0.036 0.032
#> SRR1409465 2 0.2420 0.7010 0.000 0.884 0.000 0.040 0.000 0.076
#> SRR809987 2 0.6523 0.5647 0.036 0.560 0.000 0.248 0.040 0.116
#> SRR613639 1 0.3923 0.7626 0.796 0.000 0.112 0.000 0.028 0.064
#> SRR1402285 4 0.5403 0.7110 0.016 0.088 0.004 0.680 0.024 0.188
#> SRR1077038 1 0.4747 0.6982 0.712 0.000 0.132 0.000 0.016 0.140
#> SRR1405660 3 0.3159 0.5819 0.004 0.000 0.836 0.000 0.108 0.052
#> SRR1095455 3 0.7677 -0.5284 0.280 0.000 0.280 0.000 0.192 0.248
#> SRR1394734 4 0.5827 0.2737 0.000 0.404 0.000 0.432 0.004 0.160
#> SRR1317771 1 0.4148 0.7579 0.780 0.000 0.088 0.000 0.028 0.104
#> SRR1365894 2 0.4985 0.6687 0.008 0.692 0.000 0.156 0.008 0.136
#> SRR1073581 1 0.4882 0.7232 0.728 0.000 0.116 0.000 0.096 0.060
#> SRR659804 1 0.3159 0.7430 0.856 0.000 0.056 0.000 0.056 0.032
#> SRR1345914 2 0.2288 0.7220 0.000 0.896 0.000 0.028 0.004 0.072
#> SRR1432186 2 0.4154 0.5973 0.000 0.740 0.000 0.096 0.000 0.164
#> SRR1473529 4 0.5499 0.5206 0.000 0.284 0.000 0.564 0.004 0.148
#> SRR660764 3 0.5235 0.3305 0.004 0.000 0.608 0.000 0.128 0.260
#> SRR820448 1 0.2924 0.7589 0.868 0.000 0.068 0.000 0.040 0.024
#> SRR1328845 2 0.6122 0.5838 0.020 0.592 0.000 0.244 0.040 0.104
#> SRR1336415 4 0.1223 0.8139 0.004 0.012 0.000 0.960 0.008 0.016
#> SRR1379065 4 0.1341 0.8161 0.000 0.028 0.000 0.948 0.000 0.024
#> SRR1459190 3 0.2818 0.5948 0.024 0.000 0.876 0.000 0.048 0.052
#> SRR1346773 5 0.4826 0.6139 0.244 0.000 0.048 0.000 0.676 0.032
#> SRR1499521 5 0.5486 0.4696 0.344 0.000 0.052 0.000 0.560 0.044
#> SRR1440898 2 0.2119 0.7058 0.000 0.904 0.000 0.036 0.000 0.060
#> SRR1347459 3 0.5004 0.3231 0.008 0.000 0.620 0.000 0.080 0.292
#> SRR1081209 2 0.1007 0.7146 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1400202 1 0.3329 0.7525 0.844 0.000 0.072 0.000 0.052 0.032
#> SRR1333395 2 0.5451 0.6342 0.012 0.660 0.000 0.204 0.028 0.096
#> SRR1309248 2 0.5634 0.6149 0.016 0.612 0.000 0.204 0.004 0.164
#> SRR809161 1 0.6231 0.1664 0.492 0.000 0.316 0.000 0.032 0.160
#> SRR1316320 2 0.5246 0.6584 0.008 0.684 0.000 0.160 0.024 0.124
#> SRR1432629 2 0.5641 0.0346 0.000 0.504 0.000 0.328 0.000 0.168
#> SRR1498931 1 0.2706 0.7602 0.880 0.000 0.068 0.000 0.028 0.024
#> SRR1416578 4 0.5554 0.6808 0.008 0.120 0.004 0.672 0.036 0.160
#> SRR1405547 3 0.1321 0.6047 0.004 0.000 0.952 0.000 0.024 0.020
#> SRR1470534 4 0.0508 0.8101 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1380764 5 0.4740 0.6274 0.220 0.000 0.052 0.000 0.696 0.032
#> SRR1309160 3 0.1116 0.6079 0.008 0.000 0.960 0.000 0.004 0.028
#> SRR663489 3 0.1716 0.5997 0.004 0.000 0.932 0.000 0.036 0.028
#> SRR1500450 1 0.6025 0.4659 0.580 0.000 0.224 0.000 0.048 0.148
#> SRR1078489 3 0.5354 0.2854 0.008 0.000 0.588 0.000 0.116 0.288
#> SRR1332648 4 0.0508 0.8101 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR660614 3 0.4097 0.5385 0.004 0.000 0.760 0.000 0.108 0.128
#> SRR1470420 2 0.1082 0.7151 0.000 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR1475566 1 0.3390 0.7506 0.840 0.000 0.072 0.000 0.056 0.032
#> SRR1477949 1 0.3645 0.7730 0.824 0.000 0.080 0.000 0.048 0.048
#> SRR1481419 2 0.2527 0.6929 0.000 0.876 0.000 0.040 0.000 0.084
#> SRR1464766 1 0.4285 0.7558 0.772 0.000 0.116 0.000 0.040 0.072
#> SRR615946 3 0.4762 0.4651 0.076 0.000 0.740 0.000 0.072 0.112
#> SRR1446481 2 0.3578 0.6359 0.000 0.784 0.000 0.052 0.000 0.164
#> SRR1467656 2 0.1643 0.7126 0.000 0.924 0.000 0.008 0.000 0.068
#> SRR1402962 5 0.3965 0.6481 0.108 0.000 0.076 0.000 0.792 0.024
#> SRR660224 2 0.1411 0.7186 0.000 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR665586 1 0.4347 0.7338 0.760 0.000 0.108 0.000 0.024 0.108
#> SRR1347166 5 0.2019 0.6093 0.012 0.000 0.088 0.000 0.900 0.000
#> SRR1485722 5 0.3603 0.6528 0.124 0.000 0.056 0.000 0.808 0.012
#> SRR1415316 1 0.5406 0.7052 0.684 0.000 0.096 0.000 0.124 0.096
#> SRR613390 1 0.4039 0.7695 0.796 0.000 0.092 0.000 0.052 0.060
#> SRR661108 3 0.5435 0.2503 0.020 0.000 0.576 0.000 0.088 0.316
#> SRR2170173 3 0.5643 0.1932 0.200 0.000 0.624 0.000 0.036 0.140
#> SRR817329 1 0.5224 0.6428 0.676 0.000 0.156 0.000 0.032 0.136
#> SRR1401990 2 0.6525 0.4079 0.004 0.468 0.000 0.312 0.036 0.180
#> SRR1467745 4 0.4882 0.6829 0.000 0.188 0.000 0.672 0.004 0.136
#> SRR1471795 2 0.5667 -0.0111 0.000 0.492 0.000 0.340 0.000 0.168
#> SRR1415637 2 0.1333 0.7160 0.000 0.944 0.000 0.008 0.000 0.048
#> SRR813137 1 0.3822 0.7628 0.800 0.000 0.112 0.000 0.020 0.068
#> SRR1314873 1 0.3270 0.7722 0.844 0.000 0.088 0.000 0.040 0.028
#> SRR1401211 1 0.2602 0.7674 0.884 0.000 0.072 0.000 0.020 0.024
#> SRR1419692 4 0.2563 0.8134 0.008 0.028 0.004 0.900 0.016 0.044
#> SRR818797 1 0.4058 0.7715 0.796 0.000 0.076 0.000 0.052 0.076
#> SRR2164608 3 0.5587 0.1191 0.016 0.000 0.540 0.000 0.104 0.340
#> SRR1455586 2 0.2149 0.7183 0.000 0.900 0.000 0.004 0.016 0.080
#> SRR819459 3 0.2308 0.5824 0.008 0.000 0.880 0.000 0.004 0.108
#> SRR1488939 2 0.4423 0.6824 0.004 0.748 0.000 0.140 0.012 0.096
#> SRR1433232 2 0.5631 0.0455 0.000 0.508 0.000 0.324 0.000 0.168
#> SRR1385501 1 0.5693 0.5357 0.612 0.000 0.208 0.000 0.032 0.148
#> SRR1361652 5 0.5599 0.0440 0.004 0.000 0.212 0.000 0.568 0.216
#> SRR1437119 1 0.2893 0.7499 0.872 0.000 0.056 0.000 0.044 0.028
#> SRR1478547 3 0.1616 0.6080 0.012 0.000 0.940 0.000 0.020 0.028
#> SRR1430910 3 0.6199 -0.2954 0.004 0.000 0.392 0.000 0.280 0.324
#> SRR1310584 5 0.5174 0.5360 0.320 0.000 0.048 0.000 0.600 0.032
#> SRR1500216 2 0.7487 0.5211 0.076 0.508 0.004 0.164 0.060 0.188
#> SRR1486762 3 0.4133 0.5264 0.060 0.000 0.788 0.000 0.052 0.100
#> SRR1480854 4 0.4464 0.7569 0.004 0.096 0.000 0.728 0.004 0.168
#> SRR1489394 4 0.0508 0.8101 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1418085 4 0.0508 0.8101 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1340221 4 0.6507 0.5277 0.016 0.184 0.004 0.560 0.036 0.200
#> SRR1473058 4 0.6005 0.1294 0.004 0.356 0.000 0.472 0.008 0.160
#> SRR1405165 5 0.5977 -0.1571 0.004 0.000 0.252 0.000 0.484 0.260
#> SRR1433004 1 0.4541 0.7475 0.752 0.000 0.108 0.000 0.040 0.100
#> SRR1471477 1 0.5807 0.5760 0.624 0.000 0.188 0.000 0.060 0.128
#> SRR1098567 2 0.1010 0.7154 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1098712 2 0.5615 0.6322 0.016 0.648 0.000 0.196 0.024 0.116
#> SRR1455038 5 0.6185 0.3832 0.352 0.000 0.056 0.000 0.492 0.100
#> SRR1375248 2 0.2137 0.7171 0.000 0.912 0.000 0.012 0.028 0.048
#> SRR1403005 3 0.4311 0.4657 0.108 0.000 0.760 0.000 0.020 0.112
#> SRR1348378 2 0.4135 0.6857 0.000 0.764 0.000 0.152 0.016 0.068
#> SRR1413541 1 0.4313 0.7437 0.768 0.000 0.108 0.000 0.032 0.092
#> SRR1392943 2 0.6211 0.5952 0.028 0.592 0.000 0.216 0.028 0.136
#> SRR1475192 3 0.1622 0.6125 0.016 0.000 0.940 0.000 0.028 0.016
#> SRR1432085 2 0.4036 0.6958 0.000 0.772 0.000 0.100 0.008 0.120
#> SRR1452468 5 0.6317 -0.3516 0.012 0.000 0.256 0.000 0.412 0.320
#> SRR1347060 3 0.1036 0.6078 0.008 0.000 0.964 0.000 0.004 0.024
#> SRR1414139 2 0.4791 0.6782 0.000 0.716 0.000 0.140 0.024 0.120
#> SRR1447962 2 0.1007 0.7155 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1444324 2 0.1367 0.7160 0.000 0.944 0.000 0.000 0.012 0.044
#> SRR1415004 1 0.2706 0.7602 0.880 0.000 0.068 0.000 0.028 0.024
#> SRR1413436 5 0.4848 0.6061 0.240 0.000 0.056 0.000 0.676 0.028
#> SRR1311266 5 0.3151 0.6513 0.076 0.000 0.064 0.000 0.848 0.012
#> SRR1343302 4 0.0508 0.8101 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1373746 1 0.3516 0.7321 0.832 0.000 0.056 0.000 0.076 0.036
#> SRR1429678 1 0.2395 0.7680 0.892 0.000 0.076 0.000 0.012 0.020
#> SRR1469413 2 0.1204 0.7138 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1405331 1 0.6633 0.2358 0.508 0.000 0.220 0.000 0.072 0.200
#> SRR1345609 1 0.4963 0.4778 0.664 0.000 0.056 0.000 0.248 0.032
#> SRR1380208 2 0.5030 0.6540 0.008 0.692 0.000 0.184 0.016 0.100
#> SRR1322840 4 0.0653 0.8114 0.000 0.004 0.000 0.980 0.004 0.012
#> SRR1399797 3 0.4405 0.4370 0.024 0.000 0.696 0.000 0.028 0.252
#> SRR1416654 3 0.3833 0.4098 0.016 0.000 0.708 0.000 0.004 0.272
#> SRR1315081 3 0.2488 0.5996 0.000 0.000 0.880 0.000 0.076 0.044
#> SRR1369196 3 0.3281 0.5100 0.012 0.000 0.784 0.000 0.004 0.200
#> SRR1400847 1 0.2488 0.7652 0.888 0.000 0.076 0.000 0.016 0.020
#> SRR1365291 3 0.6292 -0.1934 0.156 0.000 0.480 0.000 0.036 0.328
#> SRR1367920 4 0.5647 0.5907 0.008 0.188 0.000 0.592 0.004 0.208
#> SRR1366648 3 0.1518 0.6005 0.008 0.000 0.944 0.000 0.024 0.024
#> SRR1441679 2 0.1957 0.7191 0.000 0.912 0.000 0.008 0.008 0.072
#> SRR1082173 3 0.5865 0.0622 0.020 0.000 0.512 0.000 0.128 0.340
#> SRR1363968 5 0.5482 0.4475 0.348 0.000 0.060 0.000 0.556 0.036
#> SRR814387 1 0.5513 -0.1517 0.484 0.000 0.052 0.000 0.428 0.036
#> SRR657599 5 0.5139 0.6225 0.160 0.000 0.044 0.000 0.692 0.104
#> SRR1386689 4 0.0508 0.8101 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1395575 3 0.4548 0.4337 0.120 0.000 0.744 0.000 0.028 0.108
#> SRR1453811 1 0.4914 0.7242 0.716 0.000 0.132 0.000 0.040 0.112
#> SRR1441159 5 0.4467 0.6398 0.180 0.000 0.040 0.000 0.736 0.044
#> SRR1403154 4 0.0508 0.8101 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1468722 3 0.0622 0.6072 0.008 0.000 0.980 0.000 0.000 0.012
#> SRR1310275 3 0.6101 -0.1192 0.020 0.000 0.488 0.000 0.168 0.324
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.995 0.998 0.4702 0.531 0.531
#> 3 3 0.871 0.913 0.960 0.3282 0.773 0.597
#> 4 4 0.732 0.810 0.892 0.1722 0.817 0.554
#> 5 5 0.830 0.829 0.910 0.0846 0.861 0.545
#> 6 6 0.809 0.766 0.877 0.0383 0.925 0.668
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1331708 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1464258 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR661589 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1315165 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1417809 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1094457 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1095575 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1315931 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1430066 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1431037 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1395554 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1344143 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1486845 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1383907 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1429846 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR613550 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1324025 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1318879 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR820755 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1485830 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR599313 1 0.6973 0.769 0.812 0.188
#> SRR612263 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1415398 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1326205 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1421327 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1083311 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1499303 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1079522 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1452935 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR661361 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1433555 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.5842 0.838 0.140 0.860
#> SRR1388354 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1317446 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1413602 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR661313 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1499935 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1447303 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1429408 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1433950 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1409854 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1435229 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1414229 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1400974 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR613927 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.3114 0.939 0.944 0.056
#> SRR813776 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR808196 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1101085 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR614395 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1478251 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR665310 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1420109 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1330920 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1419539 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1359447 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1347259 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR613915 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1384395 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR821715 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1341480 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1326270 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1498838 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1416313 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR808566 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1430270 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1367825 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR613533 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR661267 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1407250 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1420067 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR812536 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1407671 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1446375 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1465230 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0376 0.994 0.004 0.996
#> SRR1404209 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR660510 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1445655 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR658953 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1485312 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1317631 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1330588 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1091302 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR818263 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1404909 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1442422 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1407112 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1332969 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1353199 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1378885 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR665357 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1501020 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1347819 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1472576 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1431781 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1452270 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1417632 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1458113 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1326579 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1096712 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1090407 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1377599 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1488449 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1318354 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1359062 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1398924 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR663783 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1319204 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1316982 1 0.9248 0.484 0.660 0.340
#> SRR1498595 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1377423 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1338426 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1353309 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR658941 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1324085 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1363858 2 0.0376 0.994 0.004 0.996
#> SRR819820 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1337342 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR655206 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1387013 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1415379 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR663197 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1394836 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR661699 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR813680 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1378109 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1382851 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1433410 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR661167 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1432518 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR660462 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1374608 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR657949 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1308882 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1485870 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1444138 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1470193 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1091380 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1313583 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1467102 2 0.6048 0.827 0.148 0.852
#> SRR1485416 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR818821 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR809963 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1353710 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1445259 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1408393 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1310542 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1333485 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1406437 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1354931 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1391856 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1446738 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR815869 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR613150 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1375329 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1387921 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1400910 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1444203 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR658754 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1429603 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1397366 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1337606 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR659109 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1342067 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1385389 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR612935 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1393596 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1070503 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1499894 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1082883 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1328620 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1396294 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1419917 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR662114 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1489199 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR813584 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1069638 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR614864 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR2167710 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1401252 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1309963 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1486889 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1356468 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1486538 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1340486 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1377696 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1465459 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1080270 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1312501 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1093148 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1467080 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR816475 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1379198 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR613342 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1369129 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1396616 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR813824 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1500891 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR807543 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1346689 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR663729 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1485357 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR655816 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1355172 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1338147 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1413329 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1485931 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1333308 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR809018 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR663440 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR808019 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1479133 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR615069 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1456185 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1350069 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR664795 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1490721 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1085285 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1099072 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1420276 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1351347 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR809987 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR613639 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1402285 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1077038 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1405660 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1394734 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1073581 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1473529 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR660764 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1328845 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1336415 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1379065 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1459190 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1346773 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1347459 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1333395 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1309248 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR809161 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1316320 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1432629 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1416578 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1405547 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1470534 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1309160 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR663489 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1078489 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1332648 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR660614 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR615946 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR661108 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR817329 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1401990 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1467745 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR813137 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR818797 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR2164608 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1455586 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR819459 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1385501 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1361652 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1478547 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1430910 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.8016 0.679 0.756 0.244
#> SRR1486762 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1480854 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1489394 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1418085 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1340221 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1473058 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1405165 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1098712 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1455038 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.1414 0.978 0.020 0.980
#> SRR1403005 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1392943 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1475192 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1452468 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1347060 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.2043 0.966 0.032 0.968
#> SRR1447962 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1343302 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1405331 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1322840 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1399797 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1416654 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1315081 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1369196 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1365291 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1367920 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1366648 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1082173 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1363968 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1386689 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1395575 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1453811 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1403154 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1468722 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1310275 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331708 1 0.2066 0.920 0.940 0.000 0.060
#> SRR1464258 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR661589 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315165 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094457 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315931 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.6126 0.445 0.400 0.000 0.600
#> SRR1431037 3 0.5327 0.699 0.272 0.000 0.728
#> SRR1395554 3 0.6244 0.336 0.440 0.000 0.560
#> SRR818002 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.6235 0.314 0.000 0.564 0.436
#> SRR1486845 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362866 3 0.6111 0.388 0.396 0.000 0.604
#> SRR1490740 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456138 2 0.6215 0.334 0.000 0.572 0.428
#> SRR1416248 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.6225 0.325 0.000 0.568 0.432
#> SRR1429846 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR613550 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.4654 0.723 0.792 0.000 0.208
#> SRR1324025 3 0.5465 0.674 0.288 0.000 0.712
#> SRR1318879 3 0.0424 0.883 0.008 0.000 0.992
#> SRR820755 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485830 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR599313 1 0.3551 0.829 0.868 0.132 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326205 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421327 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083311 3 0.1529 0.872 0.040 0.000 0.960
#> SRR1499303 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079522 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452935 1 0.1411 0.948 0.964 0.000 0.036
#> SRR1379495 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR661361 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR615778 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308650 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.4555 0.786 0.200 0.000 0.800
#> SRR1413602 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1479955 3 0.6215 0.148 0.000 0.428 0.572
#> SRR809853 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR661313 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499935 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447303 1 0.3192 0.860 0.888 0.000 0.112
#> SRR1429408 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433950 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1409854 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435229 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 3 0.4702 0.776 0.212 0.000 0.788
#> SRR1400974 3 0.4555 0.786 0.200 0.000 0.800
#> SRR1399971 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR613927 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.1289 0.949 0.968 0.032 0.000
#> SRR813776 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR808196 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101085 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR614395 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478251 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370551 3 0.0747 0.875 0.000 0.016 0.984
#> SRR1362310 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR665310 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420109 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330920 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419539 3 0.0892 0.873 0.000 0.020 0.980
#> SRR1359447 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347259 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR613915 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384395 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR821715 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0424 0.975 0.992 0.000 0.008
#> SRR1096383 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341480 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498838 1 0.3619 0.829 0.864 0.000 0.136
#> SRR1416313 1 0.0747 0.967 0.984 0.000 0.016
#> SRR808566 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430270 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.3752 0.820 0.144 0.000 0.856
#> SRR613533 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR661267 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR810665 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407250 1 0.0237 0.978 0.996 0.000 0.004
#> SRR1420067 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.5882 0.565 0.348 0.000 0.652
#> SRR1370850 2 0.0747 0.956 0.000 0.984 0.016
#> SRR1486195 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407671 2 0.6168 0.378 0.000 0.588 0.412
#> SRR1446375 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465230 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR614119 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356101 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR660510 1 0.3551 0.834 0.868 0.000 0.132
#> SRR1445655 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR658953 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 3 0.1860 0.846 0.000 0.052 0.948
#> SRR1485312 3 0.5178 0.722 0.256 0.000 0.744
#> SRR1317631 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330588 1 0.5926 0.383 0.644 0.000 0.356
#> SRR1316367 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR818263 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404909 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 3 0.0237 0.882 0.000 0.004 0.996
#> SRR1442422 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407112 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332969 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353199 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378885 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR665357 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR662186 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1501020 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347819 3 0.4605 0.783 0.204 0.000 0.796
#> SRR1480813 3 0.6045 0.314 0.000 0.380 0.620
#> SRR1472576 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431781 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.4121 0.806 0.168 0.000 0.832
#> SRR1500472 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417632 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350153 3 0.0892 0.872 0.000 0.020 0.980
#> SRR1458113 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326579 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.2796 0.888 0.000 0.908 0.092
#> SRR1096712 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1090407 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377599 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488449 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318354 3 0.5431 0.681 0.284 0.000 0.716
#> SRR1359062 3 0.2537 0.855 0.080 0.000 0.920
#> SRR1398924 1 0.0237 0.978 0.996 0.000 0.004
#> SRR663783 1 0.5760 0.460 0.672 0.000 0.328
#> SRR1319204 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369070 3 0.3412 0.778 0.000 0.124 0.876
#> SRR615659 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316982 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498595 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377423 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312310 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353309 3 0.1411 0.874 0.036 0.000 0.964
#> SRR658941 1 0.5968 0.368 0.636 0.000 0.364
#> SRR1101643 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368874 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324085 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363858 2 0.0892 0.946 0.020 0.980 0.000
#> SRR819820 1 0.4555 0.735 0.800 0.000 0.200
#> SRR1337342 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR655206 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387013 2 0.3941 0.820 0.000 0.844 0.156
#> SRR1317410 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440161 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1343741 2 0.5948 0.428 0.000 0.640 0.360
#> SRR1381288 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415379 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099622 3 0.5098 0.626 0.000 0.248 0.752
#> SRR663197 3 0.4452 0.792 0.192 0.000 0.808
#> SRR1394836 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR661699 3 0.2448 0.856 0.076 0.000 0.924
#> SRR813680 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311486 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1382851 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433410 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR661167 1 0.0892 0.964 0.980 0.000 0.020
#> SRR1432518 3 0.4399 0.794 0.188 0.000 0.812
#> SRR660462 1 0.3941 0.798 0.844 0.000 0.156
#> SRR1374608 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR657949 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308882 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 2 0.4452 0.776 0.000 0.808 0.192
#> SRR1444138 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091380 1 0.2625 0.896 0.916 0.000 0.084
#> SRR1099096 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467102 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485416 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR818821 1 0.2356 0.911 0.928 0.000 0.072
#> SRR809963 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445259 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408393 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0424 0.962 0.000 0.992 0.008
#> SRR1310542 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1333485 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406437 2 0.2261 0.911 0.000 0.932 0.068
#> SRR1354931 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391856 3 0.1289 0.863 0.000 0.032 0.968
#> SRR1446738 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309032 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1388145 3 0.5948 0.364 0.000 0.360 0.640
#> SRR1432611 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR815869 3 0.1753 0.869 0.048 0.000 0.952
#> SRR613150 1 0.5529 0.538 0.704 0.000 0.296
#> SRR1375329 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387921 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1360478 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400910 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444203 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR816177 2 0.0747 0.956 0.000 0.984 0.016
#> SRR658754 3 0.2796 0.849 0.092 0.000 0.908
#> SRR1429603 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397366 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337606 3 0.0424 0.883 0.008 0.000 0.992
#> SRR659109 3 0.4555 0.786 0.200 0.000 0.800
#> SRR1337192 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385389 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.1411 0.949 0.964 0.000 0.036
#> SRR1349121 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR612935 1 0.5760 0.461 0.672 0.000 0.328
#> SRR661481 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354117 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1393596 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499894 3 0.5497 0.668 0.292 0.000 0.708
#> SRR1082883 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR810295 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.4555 0.786 0.200 0.000 0.800
#> SRR1396294 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419917 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.4002 0.811 0.160 0.000 0.840
#> SRR1489199 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR813584 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069638 1 0.0747 0.968 0.984 0.000 0.016
#> SRR614864 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1433392 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.5178 0.688 0.000 0.744 0.256
#> SRR2167710 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401252 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309963 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1486889 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337010 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340486 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465459 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080270 3 0.5098 0.733 0.248 0.000 0.752
#> SRR1312501 1 0.4002 0.794 0.840 0.000 0.160
#> SRR1093148 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467080 3 0.4555 0.786 0.200 0.000 0.800
#> SRR1410866 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR816475 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379198 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR613342 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452246 3 0.3412 0.777 0.000 0.124 0.876
#> SRR1338836 2 0.0424 0.961 0.000 0.992 0.008
#> SRR1369129 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396616 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR813824 1 0.0747 0.967 0.984 0.000 0.016
#> SRR1082376 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500891 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR807543 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346689 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR663729 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485357 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR655816 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355172 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 1 0.5178 0.627 0.744 0.000 0.256
#> SRR1413329 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485931 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR809018 3 0.4842 0.764 0.224 0.000 0.776
#> SRR1375351 3 0.1031 0.869 0.000 0.024 0.976
#> SRR663440 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR808019 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479133 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR615069 3 0.3482 0.829 0.128 0.000 0.872
#> SRR1456185 2 0.2066 0.915 0.000 0.940 0.060
#> SRR1350069 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR664795 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490721 2 0.0237 0.965 0.000 0.996 0.004
#> SRR810643 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 3 0.0237 0.883 0.004 0.000 0.996
#> SRR1085285 1 0.0592 0.971 0.988 0.000 0.012
#> SRR1099072 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351347 1 0.3116 0.866 0.892 0.000 0.108
#> SRR1405525 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0237 0.964 0.000 0.996 0.004
#> SRR819610 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 3 0.0592 0.877 0.000 0.012 0.988
#> SRR809987 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR613639 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402285 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095455 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394734 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.6126 0.409 0.000 0.600 0.400
#> SRR1073581 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432186 2 0.0237 0.964 0.000 0.996 0.004
#> SRR1473529 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR660764 3 0.4654 0.780 0.208 0.000 0.792
#> SRR820448 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328845 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1336415 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379065 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459190 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346773 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347459 3 0.4504 0.789 0.196 0.000 0.804
#> SRR1081209 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309248 2 0.1753 0.929 0.000 0.952 0.048
#> SRR809161 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316320 3 0.5905 0.373 0.000 0.352 0.648
#> SRR1432629 2 0.0237 0.964 0.000 0.996 0.004
#> SRR1498931 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.4504 0.789 0.196 0.000 0.804
#> SRR1470534 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.4605 0.783 0.204 0.000 0.796
#> SRR663489 3 0.1411 0.874 0.036 0.000 0.964
#> SRR1500450 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 1 0.3116 0.865 0.892 0.000 0.108
#> SRR1332648 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR660614 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470420 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 3 0.1163 0.866 0.000 0.028 0.972
#> SRR1464766 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR615946 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.0424 0.961 0.000 0.992 0.008
#> SRR1467656 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR660224 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.5216 0.716 0.260 0.000 0.740
#> SRR2170173 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR817329 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401990 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467745 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415637 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR813137 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR818797 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164608 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455586 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR819459 3 0.4605 0.783 0.204 0.000 0.796
#> SRR1488939 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433232 2 0.1753 0.925 0.000 0.952 0.048
#> SRR1385501 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361652 1 0.0237 0.978 0.996 0.000 0.004
#> SRR1437119 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 1 0.1289 0.952 0.968 0.000 0.032
#> SRR1430910 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.4452 0.749 0.808 0.192 0.000
#> SRR1486762 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480854 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489394 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418085 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340221 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473058 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405165 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098567 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1098712 2 0.4452 0.777 0.000 0.808 0.192
#> SRR1455038 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375248 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403005 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475192 3 0.4555 0.786 0.200 0.000 0.800
#> SRR1432085 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452468 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347060 3 0.2711 0.851 0.088 0.000 0.912
#> SRR1414139 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447962 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444324 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405331 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.6180 0.368 0.000 0.584 0.416
#> SRR1322840 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.4555 0.786 0.200 0.000 0.800
#> SRR1416654 3 0.4702 0.776 0.212 0.000 0.788
#> SRR1315081 3 0.1289 0.875 0.032 0.000 0.968
#> SRR1369196 3 0.4555 0.786 0.200 0.000 0.800
#> SRR1400847 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367920 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366648 3 0.5591 0.647 0.304 0.000 0.696
#> SRR1441679 3 0.0000 0.884 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082173 1 0.0424 0.975 0.992 0.000 0.008
#> SRR1363968 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1386689 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395575 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453811 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.981 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 2 0.0000 0.967 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.5678 0.626 0.316 0.000 0.684
#> SRR1310275 3 0.5988 0.522 0.368 0.000 0.632
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 1 0.1059 0.88164 0.972 0.012 0.016 0.000
#> SRR1331708 2 0.5399 -0.12048 0.468 0.520 0.012 0.000
#> SRR1464258 1 0.4103 0.65175 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR1454201 1 0.5351 0.76670 0.744 0.152 0.104 0.000
#> SRR661589 3 0.3356 0.80767 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR1456229 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1315165 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.5102 0.73856 0.748 0.064 0.188 0.000
#> SRR1417809 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094457 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095575 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1315931 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1430066 3 0.0817 0.85359 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1431037 3 0.0672 0.84914 0.008 0.008 0.984 0.000
#> SRR1395554 3 0.0817 0.85359 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR818002 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344143 2 0.3439 0.81916 0.000 0.868 0.048 0.084
#> SRR1486845 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362866 2 0.2060 0.77392 0.016 0.932 0.052 0.000
#> SRR1490740 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1446627 2 0.3074 0.84196 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1456138 2 0.3674 0.80153 0.000 0.848 0.036 0.116
#> SRR1416248 1 0.2021 0.86438 0.932 0.056 0.012 0.000
#> SRR1383907 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311018 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1375699 2 0.3931 0.83762 0.000 0.832 0.128 0.040
#> SRR1429846 3 0.3123 0.81653 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR613550 3 0.4406 0.65376 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1348402 1 0.1677 0.87113 0.948 0.040 0.012 0.000
#> SRR1345146 1 0.7359 0.42119 0.508 0.188 0.304 0.000
#> SRR1324025 3 0.0469 0.85203 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1318879 3 0.0707 0.83975 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR820755 1 0.4843 0.37689 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1485830 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR599313 1 0.5036 0.61491 0.696 0.000 0.024 0.280
#> SRR612263 1 0.0469 0.88581 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1415398 3 0.3266 0.81146 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1326205 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421327 4 0.0469 0.96342 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1083311 3 0.0817 0.83904 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1499303 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079522 1 0.1042 0.88308 0.972 0.020 0.008 0.000
#> SRR1452935 1 0.5604 0.09616 0.504 0.020 0.476 0.000
#> SRR1379495 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1470459 2 0.3569 0.81200 0.000 0.804 0.196 0.000
#> SRR661361 3 0.3172 0.81806 0.160 0.000 0.840 0.000
#> SRR615778 1 0.3547 0.81132 0.840 0.144 0.016 0.000
#> SRR1447564 1 0.0469 0.88556 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1455195 1 0.3479 0.80609 0.840 0.148 0.012 0.000
#> SRR655182 1 0.0817 0.88395 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1335140 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433555 3 0.0817 0.83830 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1308650 3 0.5643 -0.03723 0.024 0.428 0.548 0.000
#> SRR1388354 1 0.0188 0.88527 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1317446 3 0.0469 0.84504 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1413602 3 0.0592 0.84087 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1479955 2 0.3638 0.84035 0.000 0.848 0.120 0.032
#> SRR809853 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR661313 3 0.3444 0.80253 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR1499935 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447303 3 0.2149 0.84624 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1429408 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433950 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1362081 2 0.3074 0.84196 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1409854 1 0.1474 0.87470 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1435229 1 0.3577 0.79988 0.832 0.156 0.012 0.000
#> SRR1085996 1 0.3557 0.83020 0.856 0.036 0.108 0.000
#> SRR1414229 2 0.3907 0.69263 0.120 0.836 0.044 0.000
#> SRR1400974 3 0.1109 0.85323 0.028 0.004 0.968 0.000
#> SRR1399971 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR613927 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1457854 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1473714 1 0.7784 0.10054 0.412 0.000 0.252 0.336
#> SRR813776 1 0.4955 0.20081 0.556 0.000 0.444 0.000
#> SRR808196 4 0.0188 0.96915 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1101085 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614395 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1478251 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370551 2 0.7540 0.39231 0.000 0.444 0.364 0.192
#> SRR1362310 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR665310 1 0.0921 0.88244 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1420109 3 0.3172 0.81796 0.160 0.000 0.840 0.000
#> SRR1330920 1 0.1211 0.87899 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1419539 3 0.5100 0.62541 0.004 0.152 0.768 0.076
#> SRR1359447 3 0.0921 0.83577 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1347259 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613915 3 0.4761 0.46630 0.372 0.000 0.628 0.000
#> SRR1384395 3 0.0921 0.83577 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR821715 3 0.3400 0.80099 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR1478228 1 0.1584 0.87267 0.952 0.036 0.012 0.000
#> SRR1445637 1 0.0817 0.88493 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR608150 2 0.4978 0.39716 0.324 0.664 0.012 0.000
#> SRR1096383 1 0.3486 0.75663 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1341480 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1341344 1 0.2888 0.82663 0.872 0.124 0.004 0.000
#> SRR1326270 3 0.3356 0.80630 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR1498838 3 0.2011 0.84835 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1416313 3 0.2647 0.83683 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR808566 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1430270 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367825 3 0.0469 0.84504 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR613533 1 0.4500 0.53636 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR661267 1 0.3444 0.76395 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR810665 2 0.3074 0.84196 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1407250 1 0.7692 0.34717 0.456 0.268 0.276 0.000
#> SRR1420067 1 0.3598 0.82426 0.848 0.124 0.028 0.000
#> SRR1473632 1 0.0469 0.88556 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR812536 3 0.1635 0.85227 0.044 0.008 0.948 0.000
#> SRR1370850 4 0.2081 0.89432 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1486195 2 0.3123 0.84027 0.000 0.844 0.156 0.000
#> SRR1407671 2 0.0672 0.79459 0.008 0.984 0.008 0.000
#> SRR1446375 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1465230 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.0921 0.88534 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1356101 3 0.3688 0.60353 0.000 0.208 0.792 0.000
#> SRR1404209 1 0.0817 0.88548 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1392676 2 0.2704 0.84232 0.000 0.876 0.124 0.000
#> SRR665538 1 0.1174 0.87814 0.968 0.020 0.012 0.000
#> SRR660510 3 0.2345 0.84452 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658953 1 0.0672 0.88533 0.984 0.008 0.008 0.000
#> SRR2166459 1 0.0817 0.88525 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1070713 2 0.0707 0.81071 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1485312 3 0.0376 0.84889 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR1317631 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488610 1 0.3529 0.80282 0.836 0.152 0.012 0.000
#> SRR1330588 3 0.1118 0.85410 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1316367 1 0.3428 0.80919 0.844 0.144 0.012 0.000
#> SRR1433926 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1091302 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818263 1 0.0895 0.88606 0.976 0.004 0.020 0.000
#> SRR1404909 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR663076 1 0.0336 0.88554 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1323577 2 0.2888 0.84313 0.000 0.872 0.124 0.004
#> SRR1442422 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465893 1 0.1388 0.87549 0.960 0.028 0.012 0.000
#> SRR654862 1 0.1356 0.88339 0.960 0.008 0.032 0.000
#> SRR1407112 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332969 3 0.3172 0.81556 0.160 0.000 0.840 0.000
#> SRR1353199 1 0.3123 0.76606 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1378885 3 0.5000 0.00698 0.496 0.000 0.504 0.000
#> SRR665357 3 0.0921 0.83577 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR662186 2 0.2589 0.84125 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1501020 3 0.3219 0.81440 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR1347819 3 0.0336 0.84682 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1480813 2 0.4181 0.83251 0.000 0.820 0.128 0.052
#> SRR1472576 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452270 3 0.0469 0.84504 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1500472 1 0.6078 0.70667 0.684 0.152 0.164 0.000
#> SRR1417632 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350153 2 0.3806 0.83669 0.000 0.824 0.156 0.020
#> SRR1458113 2 0.1938 0.77994 0.012 0.936 0.052 0.000
#> SRR1326579 1 0.4485 0.79593 0.796 0.152 0.052 0.000
#> SRR1349363 2 0.3873 0.68690 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1096712 3 0.0817 0.83830 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1090407 3 0.2921 0.82596 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR1083752 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377599 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488449 3 0.2773 0.83877 0.116 0.004 0.880 0.000
#> SRR1318354 2 0.5670 0.57340 0.152 0.720 0.128 0.000
#> SRR1359062 3 0.0707 0.84118 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1398924 2 0.5018 0.37818 0.332 0.656 0.012 0.000
#> SRR663783 3 0.1576 0.85287 0.048 0.004 0.948 0.000
#> SRR1319204 3 0.2149 0.77968 0.000 0.088 0.912 0.000
#> SRR1369070 2 0.3501 0.84230 0.000 0.848 0.132 0.020
#> SRR615659 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1337449 2 0.3074 0.84196 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1316982 3 0.1302 0.82323 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1498595 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377423 3 0.4679 0.56339 0.352 0.000 0.648 0.000
#> SRR1312310 2 0.3123 0.84027 0.000 0.844 0.156 0.000
#> SRR1485613 1 0.1174 0.87814 0.968 0.020 0.012 0.000
#> SRR1338426 3 0.0817 0.83830 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1353309 3 0.0592 0.84259 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR658941 3 0.4237 0.75711 0.040 0.152 0.808 0.000
#> SRR1101643 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1401468 1 0.2329 0.85601 0.916 0.072 0.012 0.000
#> SRR1368874 2 0.3074 0.84196 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363858 4 0.1940 0.87994 0.076 0.000 0.000 0.924
#> SRR819820 3 0.2521 0.84632 0.064 0.024 0.912 0.000
#> SRR1337342 1 0.4782 0.78939 0.780 0.152 0.068 0.000
#> SRR655206 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387013 2 0.2197 0.80333 0.000 0.916 0.004 0.080
#> SRR1317410 1 0.1256 0.87605 0.964 0.028 0.008 0.000
#> SRR608198 1 0.3529 0.80282 0.836 0.152 0.012 0.000
#> SRR1440161 3 0.4948 -0.04058 0.000 0.440 0.560 0.000
#> SRR1343741 2 0.3935 0.81382 0.000 0.840 0.060 0.100
#> SRR1381288 2 0.3074 0.84196 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1415379 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099622 4 0.4990 0.66499 0.000 0.060 0.184 0.756
#> SRR663197 3 0.1004 0.84228 0.004 0.024 0.972 0.000
#> SRR1394836 3 0.4964 0.17452 0.000 0.380 0.616 0.004
#> SRR661699 3 0.2053 0.80101 0.004 0.072 0.924 0.000
#> SRR813680 1 0.4605 0.51561 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1410678 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499174 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1311486 2 0.3074 0.84196 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1382851 2 0.4661 0.49466 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1433410 1 0.3577 0.79988 0.832 0.156 0.012 0.000
#> SRR661167 3 0.2888 0.83472 0.124 0.004 0.872 0.000
#> SRR1432518 3 0.2773 0.80260 0.004 0.116 0.880 0.000
#> SRR660462 3 0.2469 0.84111 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1374608 4 0.0188 0.96956 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR657949 1 0.3400 0.76044 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1308882 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655768 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1485870 2 0.5039 0.35745 0.004 0.592 0.000 0.404
#> SRR1444138 1 0.0817 0.88545 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.88473 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091380 3 0.2919 0.83768 0.060 0.044 0.896 0.000
#> SRR1099096 1 0.1677 0.87113 0.948 0.040 0.012 0.000
#> SRR1313583 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467102 3 0.1302 0.82323 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1485416 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818821 3 0.3161 0.83698 0.124 0.012 0.864 0.000
#> SRR809963 1 0.0817 0.88365 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1072247 1 0.0469 0.88556 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1353710 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445259 1 0.4322 0.79856 0.804 0.152 0.044 0.000
#> SRR1408393 1 0.3688 0.73785 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR1361522 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1368597 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1309680 4 0.1867 0.90690 0.000 0.072 0.000 0.928
#> SRR1310542 3 0.0817 0.83830 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406437 4 0.4132 0.76752 0.012 0.176 0.008 0.804
#> SRR1354931 3 0.3172 0.81556 0.160 0.000 0.840 0.000
#> SRR1391856 2 0.2216 0.83388 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1446738 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309032 2 0.3219 0.83620 0.000 0.836 0.164 0.000
#> SRR1388145 2 0.7149 0.27535 0.000 0.452 0.132 0.416
#> SRR1432611 2 0.3074 0.84196 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR815869 3 0.0707 0.84185 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR613150 3 0.1716 0.85133 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1375329 2 0.1151 0.79067 0.008 0.968 0.024 0.000
#> SRR1387921 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1466792 2 0.3172 0.83837 0.000 0.840 0.160 0.000
#> SRR1360478 2 0.3074 0.84196 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1360695 1 0.0592 0.88423 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR812943 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1400910 2 0.1174 0.78948 0.012 0.968 0.020 0.000
#> SRR1444203 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR816177 4 0.1182 0.94418 0.000 0.016 0.016 0.968
#> SRR658754 3 0.0817 0.83904 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1429603 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1397366 3 0.3356 0.80741 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR1446028 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1083918 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337606 2 0.1059 0.78879 0.016 0.972 0.012 0.000
#> SRR659109 3 0.0937 0.84993 0.012 0.012 0.976 0.000
#> SRR1337192 1 0.3529 0.80282 0.836 0.152 0.012 0.000
#> SRR656946 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1476102 1 0.3479 0.80609 0.840 0.148 0.012 0.000
#> SRR1476447 1 0.0895 0.87985 0.976 0.020 0.004 0.000
#> SRR1342067 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075971 1 0.1584 0.87267 0.952 0.036 0.012 0.000
#> SRR614419 1 0.3324 0.81531 0.852 0.136 0.012 0.000
#> SRR1322936 2 0.3718 0.66868 0.168 0.820 0.012 0.000
#> SRR1349121 1 0.1388 0.88286 0.960 0.012 0.028 0.000
#> SRR1430549 1 0.2124 0.85897 0.924 0.068 0.008 0.000
#> SRR612935 3 0.6644 0.23285 0.392 0.088 0.520 0.000
#> SRR661481 4 0.4746 0.38163 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR1354117 2 0.3356 0.82821 0.000 0.824 0.176 0.000
#> SRR1393596 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452164 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1070503 1 0.4889 0.46471 0.636 0.004 0.360 0.000
#> SRR1499894 3 0.1209 0.85347 0.032 0.004 0.964 0.000
#> SRR1082883 1 0.5189 0.49275 0.616 0.372 0.012 0.000
#> SRR1468271 1 0.1488 0.87414 0.956 0.032 0.012 0.000
#> SRR1332443 1 0.2928 0.83473 0.880 0.108 0.012 0.000
#> SRR810295 2 0.3219 0.83620 0.000 0.836 0.164 0.000
#> SRR662103 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1328620 3 0.4364 0.71527 0.016 0.220 0.764 0.000
#> SRR1396294 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419917 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR662114 3 0.3688 0.63165 0.000 0.208 0.792 0.000
#> SRR1489199 1 0.0817 0.88492 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR813584 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069638 1 0.4579 0.73258 0.768 0.032 0.200 0.000
#> SRR614864 1 0.6934 0.52755 0.572 0.152 0.276 0.000
#> SRR1433392 1 0.4477 0.55186 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR1377777 2 0.3638 0.79799 0.000 0.848 0.032 0.120
#> SRR2167710 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1401252 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.0469 0.88556 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1418628 2 0.3266 0.83375 0.000 0.832 0.168 0.000
#> SRR1486889 1 0.4431 0.58166 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR1380393 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1319731 1 0.1059 0.88164 0.972 0.012 0.016 0.000
#> SRR1356468 4 0.1985 0.91630 0.016 0.040 0.004 0.940
#> SRR1337010 2 0.3074 0.84196 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1486520 1 0.2915 0.85810 0.892 0.028 0.080 0.000
#> SRR1486538 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377696 2 0.4804 0.41311 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1465459 1 0.4746 0.40486 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1080270 3 0.0524 0.84836 0.004 0.008 0.988 0.000
#> SRR1312501 3 0.1389 0.85373 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1093148 2 0.3790 0.67171 0.016 0.820 0.164 0.000
#> SRR1467080 3 0.0592 0.84380 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1410866 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR816475 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613342 1 0.4989 -0.03193 0.528 0.000 0.472 0.000
#> SRR1452246 2 0.2089 0.82657 0.000 0.932 0.048 0.020
#> SRR1338836 2 0.4391 0.65813 0.000 0.740 0.008 0.252
#> SRR1369129 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396616 3 0.3219 0.81458 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR813824 3 0.2647 0.83680 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1082376 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1500891 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR807543 1 0.1940 0.85520 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1091572 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1346689 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332424 1 0.3852 0.77985 0.808 0.180 0.012 0.000
#> SRR663729 4 0.5480 0.66833 0.140 0.124 0.000 0.736
#> SRR1097013 1 0.1302 0.88090 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR613675 2 0.5366 0.02997 0.440 0.548 0.012 0.000
#> SRR1485357 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655816 3 0.3074 0.82065 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1500113 1 0.1388 0.87549 0.960 0.028 0.012 0.000
#> SRR1437622 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355172 3 0.3444 0.79750 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR655531 1 0.3271 0.81829 0.856 0.132 0.012 0.000
#> SRR1338147 3 0.1389 0.85389 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1413329 1 0.5130 0.54949 0.668 0.020 0.312 0.000
#> SRR1485931 2 0.2814 0.84289 0.000 0.868 0.132 0.000
#> SRR1420873 1 0.1584 0.87267 0.952 0.036 0.012 0.000
#> SRR1333308 4 0.3626 0.75578 0.004 0.184 0.000 0.812
#> SRR1452033 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1467316 2 0.2814 0.84289 0.000 0.868 0.132 0.000
#> SRR809018 3 0.1305 0.85362 0.036 0.004 0.960 0.000
#> SRR1375351 2 0.3074 0.84196 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR663440 1 0.4967 0.16591 0.548 0.000 0.452 0.000
#> SRR1471755 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR808019 1 0.6952 0.36610 0.516 0.120 0.364 0.000
#> SRR1479133 3 0.2868 0.82907 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR615069 2 0.4560 0.55890 0.004 0.700 0.296 0.000
#> SRR1456185 2 0.4440 0.78950 0.000 0.804 0.060 0.136
#> SRR1350069 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR816316 1 0.1022 0.88065 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR664795 1 0.2408 0.83739 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1490721 2 0.1059 0.79236 0.016 0.972 0.000 0.012
#> SRR810643 1 0.2867 0.83738 0.884 0.104 0.012 0.000
#> SRR1430333 2 0.3791 0.62186 0.004 0.796 0.200 0.000
#> SRR1085285 3 0.2589 0.83825 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1099072 3 0.3266 0.81204 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1317985 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1487340 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1420276 3 0.0921 0.83577 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1351347 3 0.3048 0.83219 0.108 0.016 0.876 0.000
#> SRR1405525 1 0.3377 0.81233 0.848 0.140 0.012 0.000
#> SRR1370329 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1465001 1 0.1059 0.88164 0.972 0.012 0.016 0.000
#> SRR1476525 4 0.4843 0.27133 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR819610 4 0.2281 0.87982 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR2157314 1 0.0188 0.88527 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1409465 2 0.3324 0.84344 0.000 0.852 0.136 0.012
#> SRR809987 4 0.0336 0.96536 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR613639 1 0.1940 0.85490 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1402285 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077038 1 0.3528 0.74304 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1405660 3 0.0817 0.83904 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1095455 1 0.0336 0.88540 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1394734 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317771 1 0.0817 0.88537 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1365894 2 0.2466 0.82069 0.000 0.916 0.028 0.056
#> SRR1073581 1 0.3764 0.72439 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.88473 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.2647 0.84182 0.000 0.880 0.120 0.000
#> SRR1432186 4 0.2345 0.87014 0.000 0.100 0.000 0.900
#> SRR1473529 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660764 3 0.1256 0.85257 0.028 0.008 0.964 0.000
#> SRR820448 1 0.0921 0.88226 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1328845 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1336415 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1459190 3 0.3074 0.82197 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1346773 1 0.3377 0.81233 0.848 0.140 0.012 0.000
#> SRR1499521 1 0.4332 0.81446 0.816 0.072 0.112 0.000
#> SRR1440898 2 0.3074 0.84196 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1347459 3 0.0707 0.84192 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1081209 2 0.2868 0.84292 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR1400202 1 0.0469 0.88556 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1333395 4 0.2469 0.86425 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR1309248 2 0.4972 0.21979 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR809161 3 0.4866 0.39878 0.404 0.000 0.596 0.000
#> SRR1316320 2 0.0000 0.80204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432629 2 0.4981 0.21489 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR1498931 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1416578 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405547 3 0.0336 0.84682 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.3271 0.81829 0.856 0.132 0.012 0.000
#> SRR1309160 3 0.0469 0.84504 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR663489 3 0.0707 0.84118 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1500450 1 0.5271 0.50241 0.640 0.020 0.340 0.000
#> SRR1078489 1 0.7587 0.20990 0.412 0.392 0.196 0.000
#> SRR1332648 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660614 2 0.4040 0.75773 0.000 0.752 0.248 0.000
#> SRR1470420 2 0.3074 0.84196 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1475566 1 0.0469 0.88556 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1477949 1 0.0592 0.88549 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1481419 2 0.3257 0.84173 0.000 0.844 0.152 0.004
#> SRR1464766 1 0.0817 0.88545 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR615946 3 0.3528 0.79690 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR1446481 4 0.1284 0.94303 0.000 0.024 0.012 0.964
#> SRR1467656 2 0.3172 0.83837 0.000 0.840 0.160 0.000
#> SRR1402962 1 0.5568 0.75358 0.728 0.152 0.120 0.000
#> SRR660224 2 0.3074 0.84196 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR665586 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1347166 1 0.3577 0.79988 0.832 0.156 0.012 0.000
#> SRR1485722 1 0.3647 0.80256 0.832 0.152 0.016 0.000
#> SRR1415316 1 0.2179 0.86032 0.924 0.064 0.012 0.000
#> SRR613390 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR661108 3 0.0927 0.85183 0.016 0.008 0.976 0.000
#> SRR2170173 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR817329 1 0.1022 0.88082 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1401990 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467745 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1471795 4 0.0188 0.96972 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1415637 2 0.3074 0.84196 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR813137 1 0.1118 0.87919 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1314873 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1401211 1 0.0707 0.88481 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1419692 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818797 3 0.3975 0.73281 0.240 0.000 0.760 0.000
#> SRR2164608 1 0.5756 0.41988 0.592 0.036 0.372 0.000
#> SRR1455586 3 0.4730 0.23498 0.000 0.364 0.636 0.000
#> SRR819459 3 0.0592 0.84380 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1488939 2 0.2081 0.83377 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR1433232 2 0.3401 0.76726 0.000 0.840 0.008 0.152
#> SRR1385501 1 0.0817 0.88365 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1361652 2 0.4718 0.49225 0.280 0.708 0.012 0.000
#> SRR1437119 1 0.0469 0.88556 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1478547 3 0.2647 0.83459 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1430910 2 0.1297 0.78704 0.016 0.964 0.020 0.000
#> SRR1310584 1 0.2255 0.85819 0.920 0.068 0.012 0.000
#> SRR1500216 1 0.5003 0.57110 0.676 0.000 0.016 0.308
#> SRR1486762 3 0.4382 0.66751 0.296 0.000 0.704 0.000
#> SRR1480854 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1473058 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405165 3 0.3123 0.77071 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1433004 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1471477 3 0.5271 0.49619 0.340 0.020 0.640 0.000
#> SRR1098567 2 0.3074 0.84196 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1098712 4 0.3726 0.71583 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1455038 1 0.2408 0.83406 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1375248 3 0.3649 0.61110 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1403005 3 0.3444 0.79973 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR1348378 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413541 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1392943 4 0.0469 0.96341 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1475192 3 0.0469 0.84504 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1432085 2 0.3074 0.84196 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1452468 1 0.6555 0.64653 0.632 0.156 0.212 0.000
#> SRR1347060 3 0.0592 0.84259 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1414139 2 0.3610 0.80829 0.000 0.800 0.200 0.000
#> SRR1447962 2 0.4996 0.28644 0.000 0.516 0.484 0.000
#> SRR1444324 2 0.3219 0.83620 0.000 0.836 0.164 0.000
#> SRR1415004 1 0.0469 0.88556 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1413436 1 0.2988 0.83210 0.876 0.112 0.012 0.000
#> SRR1311266 1 0.3479 0.80609 0.840 0.148 0.012 0.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1373746 1 0.0469 0.88556 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1429678 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1469413 2 0.3311 0.83109 0.000 0.828 0.172 0.000
#> SRR1405331 1 0.3942 0.68434 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR1345609 1 0.0592 0.88151 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.0992 0.79203 0.012 0.976 0.008 0.004
#> SRR1322840 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399797 3 0.0592 0.84380 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1416654 3 0.2730 0.81032 0.016 0.088 0.896 0.000
#> SRR1315081 3 0.0469 0.84590 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1369196 3 0.0336 0.84561 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1400847 1 0.0592 0.88553 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1365291 3 0.3074 0.81709 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1367920 4 0.2011 0.89786 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR1366648 3 0.1209 0.85347 0.032 0.004 0.964 0.000
#> SRR1441679 2 0.3074 0.84196 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1082173 3 0.4610 0.70800 0.236 0.020 0.744 0.000
#> SRR1363968 1 0.2805 0.83979 0.888 0.100 0.012 0.000
#> SRR814387 1 0.1406 0.87834 0.960 0.024 0.016 0.000
#> SRR657599 1 0.3479 0.80086 0.840 0.012 0.148 0.000
#> SRR1386689 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395575 3 0.3074 0.82065 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1453811 3 0.3400 0.80099 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR1441159 1 0.3529 0.80282 0.836 0.152 0.012 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.97286 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468722 3 0.0779 0.85216 0.016 0.004 0.980 0.000
#> SRR1310275 3 0.0376 0.85041 0.004 0.004 0.992 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 5 0.3612 0.8159 0.172 0.000 0.028 0.000 0.800
#> SRR1331708 5 0.2221 0.8428 0.036 0.052 0.000 0.000 0.912
#> SRR1464258 1 0.2929 0.7633 0.820 0.000 0.180 0.000 0.000
#> SRR1454201 5 0.2408 0.8408 0.008 0.004 0.096 0.000 0.892
#> SRR661589 3 0.3895 0.5201 0.320 0.000 0.680 0.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315165 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488960 5 0.1106 0.8431 0.024 0.000 0.012 0.000 0.964
#> SRR1417809 4 0.1560 0.9364 0.020 0.004 0.000 0.948 0.028
#> SRR1094457 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315931 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818002 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.0000 0.9256 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486845 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362866 5 0.1502 0.8285 0.000 0.056 0.004 0.000 0.940
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0162 0.9260 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0162 0.9263 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1416248 5 0.3366 0.7563 0.232 0.000 0.000 0.000 0.768
#> SRR1383907 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0290 0.9257 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1429846 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613550 1 0.2179 0.8294 0.888 0.000 0.112 0.000 0.000
#> SRR1348402 5 0.2891 0.8136 0.176 0.000 0.000 0.000 0.824
#> SRR1345146 5 0.1282 0.8438 0.000 0.004 0.044 0.000 0.952
#> SRR1324025 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318879 3 0.0794 0.8869 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR820755 3 0.4040 0.5907 0.016 0.000 0.724 0.000 0.260
#> SRR1485830 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR599313 1 0.3800 0.7748 0.812 0.000 0.080 0.108 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.0162 0.8993 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1326205 4 0.0404 0.9603 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1421327 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079522 1 0.1082 0.8870 0.964 0.008 0.000 0.000 0.028
#> SRR1452935 5 0.4497 0.3222 0.008 0.000 0.424 0.000 0.568
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0510 0.9209 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0880 0.8844 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR615778 5 0.3577 0.8354 0.084 0.004 0.076 0.000 0.836
#> SRR1447564 1 0.0162 0.9020 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1455195 5 0.2550 0.8562 0.084 0.004 0.020 0.000 0.892
#> SRR655182 1 0.0290 0.9011 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.4304 0.1544 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1433555 3 0.1732 0.8541 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1308650 2 0.1928 0.8710 0.072 0.920 0.004 0.004 0.000
#> SRR1388354 1 0.1544 0.8570 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1317446 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.1732 0.8541 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1479955 2 0.0162 0.9263 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661313 1 0.3837 0.5806 0.692 0.000 0.308 0.000 0.000
#> SRR1499935 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429408 4 0.0162 0.9636 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1433950 1 0.0162 0.9020 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1362081 2 0.0162 0.9260 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1409854 5 0.5115 0.6886 0.232 0.000 0.092 0.000 0.676
#> SRR1435229 5 0.2971 0.8583 0.072 0.016 0.032 0.000 0.880
#> SRR1085996 5 0.4890 0.6933 0.256 0.000 0.064 0.000 0.680
#> SRR1414229 5 0.2922 0.8484 0.024 0.016 0.080 0.000 0.880
#> SRR1400974 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613927 1 0.1732 0.8511 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0290 0.9001 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1473714 1 0.5697 0.6166 0.660 0.000 0.208 0.116 0.016
#> SRR813776 3 0.1082 0.8835 0.028 0.000 0.964 0.000 0.008
#> SRR808196 4 0.2708 0.8735 0.072 0.000 0.000 0.884 0.044
#> SRR1101085 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614395 1 0.0162 0.9019 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1478251 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0566 0.9240 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 1 0.1544 0.8615 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1420109 1 0.3003 0.7558 0.812 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR1330920 1 0.1981 0.8673 0.924 0.000 0.048 0.000 0.028
#> SRR1419539 3 0.4381 0.7601 0.000 0.064 0.788 0.020 0.128
#> SRR1359447 3 0.0794 0.8876 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1347259 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613915 3 0.1168 0.8826 0.032 0.000 0.960 0.000 0.008
#> SRR1384395 3 0.1121 0.8783 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR821715 3 0.0290 0.8973 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1478228 5 0.3837 0.6325 0.308 0.000 0.000 0.000 0.692
#> SRR1445637 1 0.0566 0.8973 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR608150 5 0.2463 0.8510 0.100 0.008 0.004 0.000 0.888
#> SRR1096383 1 0.5876 0.4716 0.604 0.000 0.204 0.000 0.192
#> SRR1341480 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1341344 1 0.4101 0.3072 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1326270 3 0.0963 0.8811 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808566 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430270 4 0.0703 0.9541 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1367825 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.4306 -0.0240 0.492 0.000 0.508 0.000 0.000
#> SRR661267 3 0.4756 0.4755 0.044 0.000 0.668 0.000 0.288
#> SRR810665 2 0.0162 0.9260 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1407250 5 0.2408 0.8392 0.004 0.008 0.096 0.000 0.892
#> SRR1420067 5 0.2673 0.8579 0.060 0.004 0.044 0.000 0.892
#> SRR1473632 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.0404 0.8960 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.1908 0.8732 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1486195 2 0.0162 0.9260 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.1732 0.8745 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1446375 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465230 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614119 1 0.6060 0.0656 0.492 0.000 0.124 0.000 0.384
#> SRR1356101 3 0.5498 0.3706 0.000 0.340 0.580 0.000 0.080
#> SRR1404209 1 0.2914 0.8228 0.872 0.000 0.052 0.000 0.076
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9256 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 5 0.4074 0.5419 0.364 0.000 0.000 0.000 0.636
#> SRR660510 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658953 1 0.3301 0.8142 0.848 0.000 0.072 0.000 0.080
#> SRR2166459 1 0.3876 0.6886 0.776 0.000 0.032 0.000 0.192
#> SRR1070713 2 0.2280 0.8201 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1485312 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.2179 0.8954 0.000 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1488610 5 0.2193 0.8505 0.092 0.008 0.000 0.000 0.900
#> SRR1330588 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316367 5 0.2439 0.8461 0.120 0.004 0.000 0.000 0.876
#> SRR1433926 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818263 5 0.5199 0.6296 0.292 0.000 0.072 0.000 0.636
#> SRR1404909 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663076 1 0.0510 0.8957 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9256 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465893 5 0.4242 0.3624 0.428 0.000 0.000 0.000 0.572
#> SRR654862 5 0.3649 0.8398 0.088 0.000 0.088 0.000 0.824
#> SRR1407112 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353199 1 0.0404 0.8982 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1378885 3 0.1357 0.8701 0.004 0.000 0.948 0.000 0.048
#> SRR665357 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.9256 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0162 0.8993 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0510 0.9229 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1472576 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.2228 0.8558 0.056 0.008 0.020 0.000 0.916
#> SRR1417632 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350153 2 0.0510 0.9229 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1458113 5 0.3003 0.8346 0.000 0.044 0.092 0.000 0.864
#> SRR1326579 5 0.2582 0.8491 0.024 0.004 0.080 0.000 0.892
#> SRR1349363 2 0.0510 0.9229 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083752 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377599 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488449 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318354 5 0.2850 0.8455 0.016 0.016 0.088 0.000 0.880
#> SRR1359062 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.3375 0.8413 0.104 0.056 0.000 0.000 0.840
#> SRR663783 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319204 3 0.4558 0.6919 0.000 0.180 0.740 0.000 0.080
#> SRR1369070 2 0.0162 0.9263 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0162 0.9260 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.2130 0.8481 0.000 0.012 0.908 0.000 0.080
#> SRR1498595 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377423 1 0.0404 0.8984 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.0324 0.9261 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1485613 5 0.4150 0.5052 0.388 0.000 0.000 0.000 0.612
#> SRR1338426 3 0.0404 0.8959 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1353309 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658941 5 0.2074 0.8348 0.000 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 5 0.2179 0.8466 0.112 0.000 0.000 0.000 0.888
#> SRR1368874 2 0.0162 0.9260 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363858 4 0.4126 0.3399 0.380 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR819820 3 0.1732 0.8541 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1337342 5 0.2635 0.8455 0.016 0.008 0.088 0.000 0.888
#> SRR655206 4 0.0992 0.9501 0.000 0.000 0.008 0.968 0.024
#> SRR1387013 2 0.0162 0.9241 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1317410 1 0.4300 -0.1124 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR608198 5 0.2879 0.8578 0.080 0.008 0.032 0.000 0.880
#> SRR1440161 2 0.0963 0.9075 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0162 0.9263 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9256 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0794 0.9519 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1099622 2 0.3596 0.7402 0.000 0.776 0.012 0.212 0.000
#> SRR663197 3 0.0865 0.8894 0.004 0.024 0.972 0.000 0.000
#> SRR1394836 3 0.4321 0.3329 0.000 0.396 0.600 0.000 0.004
#> SRR661699 3 0.1469 0.8746 0.000 0.016 0.948 0.000 0.036
#> SRR813680 3 0.1571 0.8655 0.060 0.000 0.936 0.000 0.004
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0162 0.9260 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.3752 0.6089 0.000 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR1433410 5 0.2804 0.8559 0.048 0.008 0.056 0.000 0.888
#> SRR661167 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.4305 -0.0463 0.000 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR660462 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.1197 0.9392 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR657949 3 0.4455 0.2794 0.404 0.000 0.588 0.000 0.008
#> SRR1308882 4 0.0510 0.9582 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR655768 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 2 0.4565 0.5327 0.000 0.664 0.000 0.308 0.028
#> SRR1444138 1 0.1671 0.8490 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1417342 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 4 0.0880 0.9498 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1091380 3 0.3774 0.6177 0.000 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1099096 5 0.3707 0.6772 0.284 0.000 0.000 0.000 0.716
#> SRR1313583 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467102 3 0.2249 0.8399 0.000 0.008 0.896 0.000 0.096
#> SRR1485416 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818821 3 0.1430 0.8742 0.004 0.000 0.944 0.000 0.052
#> SRR809963 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445259 5 0.2707 0.8502 0.024 0.008 0.080 0.000 0.888
#> SRR1408393 3 0.6247 -0.1940 0.144 0.000 0.432 0.000 0.424
#> SRR1361522 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.1270 0.9014 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406437 4 0.4701 0.6981 0.000 0.060 0.000 0.704 0.236
#> SRR1354931 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391856 2 0.3586 0.6474 0.000 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR1446738 4 0.0880 0.9498 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1309032 2 0.0290 0.9249 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0703 0.9186 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1432611 2 0.0162 0.9260 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375329 5 0.2984 0.8128 0.000 0.108 0.032 0.000 0.860
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0290 0.9249 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0324 0.9261 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1360695 1 0.2280 0.8092 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR812943 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400910 5 0.2921 0.8028 0.000 0.124 0.020 0.000 0.856
#> SRR1444203 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816177 4 0.2020 0.8708 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397366 3 0.4305 -0.0203 0.488 0.000 0.512 0.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.3857 0.5960 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR1337606 5 0.2646 0.8022 0.004 0.124 0.004 0.000 0.868
#> SRR659109 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337192 5 0.2358 0.8489 0.104 0.008 0.000 0.000 0.888
#> SRR656946 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476102 5 0.1732 0.8490 0.080 0.000 0.000 0.000 0.920
#> SRR1476447 1 0.3109 0.7059 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1342067 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075971 5 0.4268 0.3818 0.444 0.000 0.000 0.000 0.556
#> SRR614419 5 0.3242 0.7892 0.216 0.000 0.000 0.000 0.784
#> SRR1322936 5 0.2595 0.8337 0.032 0.080 0.000 0.000 0.888
#> SRR1349121 5 0.5052 0.5705 0.340 0.000 0.048 0.000 0.612
#> SRR1430549 5 0.4305 0.2545 0.488 0.000 0.000 0.000 0.512
#> SRR612935 3 0.5904 0.4922 0.232 0.172 0.596 0.000 0.000
#> SRR661481 2 0.0510 0.9229 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1354117 2 0.0404 0.9231 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 5 0.4689 0.3041 0.016 0.000 0.424 0.000 0.560
#> SRR1499894 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082883 5 0.2017 0.8498 0.080 0.008 0.000 0.000 0.912
#> SRR1468271 5 0.2358 0.8467 0.104 0.000 0.008 0.000 0.888
#> SRR1332443 5 0.2605 0.8251 0.148 0.000 0.000 0.000 0.852
#> SRR810295 2 0.0290 0.9249 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 5 0.2513 0.8278 0.000 0.008 0.116 0.000 0.876
#> SRR1396294 4 0.2230 0.8924 0.000 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1419917 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.4420 0.2130 0.000 0.448 0.548 0.000 0.004
#> SRR1489199 5 0.3916 0.8283 0.104 0.000 0.092 0.000 0.804
#> SRR813584 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069638 5 0.4956 0.5485 0.048 0.000 0.316 0.000 0.636
#> SRR614864 5 0.2770 0.8230 0.004 0.008 0.124 0.000 0.864
#> SRR1433392 1 0.3990 0.5843 0.688 0.000 0.308 0.000 0.004
#> SRR1377777 2 0.0162 0.9263 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR2167710 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401252 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0451 0.9255 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR1486889 3 0.1872 0.8634 0.020 0.000 0.928 0.000 0.052
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.3707 0.5520 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284
#> SRR1356468 4 0.3561 0.7227 0.000 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9256 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 5 0.3454 0.8504 0.100 0.000 0.064 0.000 0.836
#> SRR1486538 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.3612 0.6598 0.000 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR1465459 3 0.4306 -0.0169 0.492 0.000 0.508 0.000 0.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093148 5 0.0579 0.8352 0.000 0.008 0.008 0.000 0.984
#> SRR1467080 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 4 0.1478 0.9097 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR816475 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613342 1 0.2424 0.8132 0.868 0.000 0.132 0.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9256 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0510 0.9229 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.0162 0.8993 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.0510 0.8962 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1500891 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR807543 1 0.1792 0.8484 0.916 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346689 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332424 5 0.2408 0.8517 0.096 0.008 0.004 0.000 0.892
#> SRR663729 4 0.4435 0.7792 0.012 0.084 0.000 0.780 0.124
#> SRR1097013 1 0.4766 0.6007 0.708 0.000 0.072 0.000 0.220
#> SRR613675 5 0.2899 0.8268 0.028 0.096 0.004 0.000 0.872
#> SRR1485357 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500113 5 0.3932 0.5938 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR1437622 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355172 3 0.1792 0.8528 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR655531 5 0.2127 0.8483 0.108 0.000 0.000 0.000 0.892
#> SRR1338147 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413329 5 0.3300 0.7504 0.004 0.000 0.204 0.000 0.792
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9256 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 5 0.2561 0.8330 0.144 0.000 0.000 0.000 0.856
#> SRR1333308 4 0.3844 0.7913 0.008 0.144 0.000 0.808 0.040
#> SRR1452033 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9256 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0290 0.9257 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR663440 3 0.2505 0.8239 0.020 0.000 0.888 0.000 0.092
#> SRR1471755 2 0.4300 0.1814 0.000 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR808019 5 0.2605 0.7930 0.000 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR1479133 3 0.0162 0.8993 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR615069 2 0.6285 0.3233 0.000 0.536 0.220 0.000 0.244
#> SRR1456185 2 0.0404 0.9245 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1350069 4 0.0703 0.9539 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR816316 1 0.1671 0.8542 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR664795 1 0.3336 0.7131 0.772 0.000 0.228 0.000 0.000
#> SRR1490721 5 0.2280 0.8026 0.000 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR810643 5 0.1908 0.8494 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1430333 5 0.3051 0.8220 0.000 0.028 0.120 0.000 0.852
#> SRR1085285 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.1877 0.8577 0.064 0.000 0.924 0.000 0.012
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0162 0.9020 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1420276 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.3123 0.7271 0.004 0.000 0.812 0.000 0.184
#> SRR1405525 5 0.3861 0.6888 0.284 0.004 0.000 0.000 0.712
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.3983 0.4117 0.660 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR1476525 2 0.3074 0.7699 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR819610 2 0.1671 0.8850 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR2157314 1 0.0162 0.9019 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409465 2 0.0162 0.9263 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR809987 4 0.2423 0.8802 0.080 0.000 0.000 0.896 0.024
#> SRR613639 1 0.1732 0.8511 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1402285 4 0.0162 0.9636 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1077038 1 0.2690 0.7876 0.844 0.000 0.156 0.000 0.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.0290 0.9000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1394734 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317771 5 0.3847 0.8076 0.180 0.000 0.036 0.000 0.784
#> SRR1365894 2 0.0162 0.9254 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1073581 3 0.3551 0.7415 0.008 0.000 0.772 0.000 0.220
#> SRR659804 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9256 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.4291 0.2214 0.000 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1473529 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660764 3 0.0162 0.8996 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR820448 1 0.1410 0.8676 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1328845 4 0.2233 0.8987 0.004 0.000 0.000 0.892 0.104
#> SRR1336415 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459190 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346773 5 0.2020 0.8492 0.100 0.000 0.000 0.000 0.900
#> SRR1499521 5 0.2036 0.8562 0.056 0.000 0.024 0.000 0.920
#> SRR1440898 2 0.0162 0.9263 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1347459 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9256 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.3548 0.7511 0.012 0.188 0.000 0.796 0.004
#> SRR1309248 4 0.5615 0.3969 0.000 0.320 0.000 0.584 0.096
#> SRR809161 1 0.3684 0.6372 0.720 0.000 0.280 0.000 0.000
#> SRR1316320 2 0.0794 0.9088 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1432629 2 0.3242 0.7424 0.000 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.0290 0.9621 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1405547 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380764 5 0.2249 0.8523 0.096 0.000 0.008 0.000 0.896
#> SRR1309160 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 5 0.6718 0.1357 0.260 0.000 0.328 0.000 0.412
#> SRR1078489 5 0.3425 0.8232 0.004 0.044 0.112 0.000 0.840
#> SRR1332648 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660614 2 0.2930 0.7690 0.000 0.832 0.164 0.000 0.004
#> SRR1470420 2 0.0162 0.9260 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.2563 0.8193 0.872 0.000 0.008 0.000 0.120
#> SRR1481419 2 0.0290 0.9257 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1464766 1 0.3003 0.7155 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR615946 1 0.4088 0.4414 0.632 0.000 0.368 0.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.2732 0.8111 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1467656 2 0.0451 0.9255 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR1402962 5 0.2233 0.8345 0.000 0.004 0.104 0.000 0.892
#> SRR660224 2 0.0162 0.9260 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 5 0.3003 0.8537 0.040 0.016 0.064 0.000 0.880
#> SRR1485722 5 0.2597 0.8554 0.040 0.004 0.060 0.000 0.896
#> SRR1415316 1 0.4114 0.3263 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR613390 1 0.1341 0.8705 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817329 1 0.1671 0.8576 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1401990 4 0.0880 0.9498 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1467745 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.3003 0.7801 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9256 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.2648 0.7865 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1419692 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818797 3 0.3109 0.7104 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR2164608 5 0.3366 0.7157 0.000 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR1455586 3 0.4182 0.3288 0.000 0.400 0.600 0.000 0.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.9256 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0162 0.9263 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1385501 1 0.1197 0.8759 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1361652 5 0.3164 0.8558 0.068 0.040 0.020 0.000 0.872
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 5 0.2983 0.8363 0.000 0.056 0.076 0.000 0.868
#> SRR1310584 5 0.3074 0.7990 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR1500216 1 0.4059 0.7260 0.776 0.000 0.052 0.172 0.000
#> SRR1486762 1 0.3074 0.7432 0.804 0.000 0.196 0.000 0.000
#> SRR1480854 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0794 0.9519 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1473058 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405165 3 0.4283 0.0856 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR1433004 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 3 0.2813 0.8007 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1098567 2 0.0162 0.9260 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1098712 4 0.4743 0.7178 0.000 0.156 0.000 0.732 0.112
#> SRR1455038 1 0.2377 0.8150 0.872 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1375248 3 0.5233 0.4952 0.000 0.288 0.636 0.000 0.076
#> SRR1403005 3 0.3816 0.5240 0.304 0.000 0.696 0.000 0.000
#> SRR1348378 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 4 0.1792 0.9104 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1475192 3 0.0880 0.8854 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1432085 2 0.0162 0.9260 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1452468 5 0.3201 0.8100 0.008 0.016 0.132 0.000 0.844
#> SRR1347060 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.3534 0.6389 0.000 0.744 0.256 0.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.0963 0.9075 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0290 0.9249 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 5 0.2482 0.8570 0.084 0.000 0.024 0.000 0.892
#> SRR1311266 5 0.2233 0.8487 0.104 0.004 0.000 0.000 0.892
#> SRR1343302 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0290 0.9249 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1405331 1 0.3109 0.7426 0.800 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.0290 0.9000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1380208 5 0.3707 0.5869 0.000 0.284 0.000 0.000 0.716
#> SRR1322840 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.1341 0.8687 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1315081 3 0.1410 0.8677 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1369196 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9036 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.0162 0.8993 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1367920 4 0.0798 0.9512 0.000 0.008 0.000 0.976 0.016
#> SRR1366648 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0162 0.9260 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.3661 0.5710 0.000 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1363968 5 0.1892 0.8510 0.080 0.000 0.004 0.000 0.916
#> SRR814387 5 0.4287 0.3244 0.460 0.000 0.000 0.000 0.540
#> SRR657599 5 0.3454 0.8362 0.064 0.000 0.100 0.000 0.836
#> SRR1386689 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453811 3 0.0609 0.8909 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1441159 5 0.2233 0.8487 0.104 0.004 0.000 0.000 0.892
#> SRR1403154 4 0.0000 0.9657 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.9011 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.2648 0.7681 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 6 0.4449 0.6730 0.216 0.000 0.000 0.000 0.088 0.696
#> SRR1331708 5 0.1910 0.7737 0.000 0.000 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1464258 1 0.3652 0.5909 0.720 0.000 0.264 0.000 0.000 0.016
#> SRR1454201 5 0.0260 0.8435 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR661589 3 0.3717 0.6276 0.276 0.000 0.708 0.000 0.000 0.016
#> SRR1456229 1 0.1320 0.7929 0.948 0.000 0.036 0.000 0.000 0.016
#> SRR1315165 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488960 6 0.3215 0.5941 0.004 0.000 0.000 0.000 0.240 0.756
#> SRR1417809 6 0.4250 0.7116 0.108 0.004 0.000 0.144 0.000 0.744
#> SRR1094457 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.1007 0.8123 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1315931 1 0.1528 0.7873 0.936 0.000 0.048 0.000 0.000 0.016
#> SRR1430066 3 0.1075 0.8735 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1431037 3 0.0363 0.8764 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1395554 3 0.0146 0.8749 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR818002 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486845 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362866 5 0.0260 0.8435 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1490740 1 0.1007 0.8123 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 6 0.5002 0.6090 0.136 0.000 0.000 0.000 0.228 0.636
#> SRR1383907 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.2260 0.7611 0.860 0.000 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR1375699 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.0891 0.8684 0.024 0.000 0.968 0.000 0.000 0.008
#> SRR613550 1 0.3695 0.5809 0.712 0.000 0.272 0.000 0.000 0.016
#> SRR1348402 6 0.5296 0.5818 0.168 0.000 0.000 0.000 0.236 0.596
#> SRR1345146 5 0.3961 0.0898 0.004 0.000 0.000 0.000 0.556 0.440
#> SRR1324025 3 0.0146 0.8759 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1318879 3 0.1528 0.8711 0.000 0.000 0.936 0.000 0.016 0.048
#> SRR820755 3 0.4711 0.5807 0.052 0.000 0.676 0.000 0.252 0.020
#> SRR1485830 4 0.0547 0.9340 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR599313 1 0.6349 0.3991 0.544 0.000 0.204 0.212 0.012 0.028
#> SRR612263 1 0.1391 0.7913 0.944 0.000 0.040 0.000 0.000 0.016
#> SRR1415398 3 0.0777 0.8701 0.024 0.000 0.972 0.000 0.000 0.004
#> SRR1326205 6 0.3833 0.2931 0.000 0.000 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1421327 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083311 3 0.0937 0.8751 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1499303 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079522 1 0.3745 0.6730 0.784 0.116 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1452935 5 0.4183 0.1053 0.012 0.000 0.480 0.000 0.508 0.000
#> SRR1379495 1 0.1610 0.7983 0.916 0.000 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.2747 0.8220 0.096 0.000 0.868 0.000 0.016 0.020
#> SRR615778 5 0.2428 0.7864 0.024 0.000 0.060 0.000 0.896 0.020
#> SRR1447564 1 0.1387 0.8052 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1455195 5 0.0260 0.8435 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR655182 1 0.1462 0.8128 0.936 0.000 0.008 0.000 0.000 0.056
#> SRR1335140 4 0.1663 0.8601 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000 0.000
#> SRR1433555 3 0.2793 0.7600 0.000 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1308650 2 0.0790 0.9054 0.032 0.968 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.3499 0.4780 0.680 0.000 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1317446 3 0.1007 0.8744 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1413602 3 0.2854 0.7516 0.000 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0260 0.8125 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR661313 1 0.4205 0.2269 0.564 0.000 0.420 0.000 0.000 0.016
#> SRR1499935 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447303 3 0.1065 0.8699 0.020 0.000 0.964 0.000 0.008 0.008
#> SRR1429408 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433950 1 0.1141 0.8108 0.948 0.000 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 5 0.5042 0.5702 0.160 0.000 0.168 0.000 0.664 0.008
#> SRR1435229 5 0.0000 0.8436 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085996 5 0.3838 0.6900 0.156 0.000 0.040 0.000 0.784 0.020
#> SRR1414229 5 0.0000 0.8436 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400974 3 0.1141 0.8724 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1399971 1 0.1007 0.8123 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR613927 1 0.2489 0.7328 0.860 0.000 0.128 0.000 0.000 0.012
#> SRR1457854 1 0.2378 0.7506 0.848 0.000 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1473714 4 0.7022 -0.0385 0.332 0.000 0.236 0.372 0.004 0.056
#> SRR813776 3 0.3499 0.7843 0.128 0.000 0.816 0.000 0.036 0.020
#> SRR808196 6 0.3728 0.7120 0.060 0.000 0.000 0.152 0.004 0.784
#> SRR1101085 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614395 1 0.1074 0.7981 0.960 0.000 0.028 0.000 0.000 0.012
#> SRR1478251 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.1863 0.7881 0.896 0.000 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR665310 1 0.2402 0.7406 0.868 0.000 0.120 0.000 0.000 0.012
#> SRR1420109 1 0.3509 0.6165 0.744 0.000 0.240 0.000 0.000 0.016
#> SRR1330920 1 0.2515 0.7689 0.888 0.000 0.072 0.000 0.024 0.016
#> SRR1419539 6 0.3709 0.6022 0.000 0.028 0.148 0.000 0.028 0.796
#> SRR1359447 3 0.1714 0.8608 0.024 0.024 0.936 0.000 0.000 0.016
#> SRR1347259 4 0.1204 0.8957 0.000 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR613915 3 0.2488 0.8355 0.076 0.000 0.888 0.000 0.016 0.020
#> SRR1384395 3 0.1204 0.8711 0.000 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR821715 3 0.1219 0.8627 0.048 0.000 0.948 0.000 0.000 0.004
#> SRR1478228 6 0.3979 0.7063 0.172 0.000 0.000 0.000 0.076 0.752
#> SRR1445637 1 0.2006 0.7909 0.892 0.000 0.004 0.000 0.000 0.104
#> SRR608150 5 0.0146 0.8438 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1096383 6 0.4427 0.6745 0.192 0.000 0.072 0.000 0.012 0.724
#> SRR1341480 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341344 5 0.3151 0.5967 0.252 0.000 0.000 0.000 0.748 0.000
#> SRR1326270 3 0.2704 0.7957 0.140 0.000 0.844 0.000 0.000 0.016
#> SRR1498838 3 0.1007 0.8746 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1416313 3 0.0717 0.8709 0.016 0.000 0.976 0.000 0.000 0.008
#> SRR808566 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430270 4 0.1327 0.8920 0.000 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1367825 3 0.1141 0.8724 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR613533 3 0.4378 0.3543 0.388 0.000 0.588 0.000 0.008 0.016
#> SRR661267 6 0.5321 0.4506 0.080 0.000 0.308 0.000 0.020 0.592
#> SRR810665 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 5 0.0146 0.8438 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1420067 5 0.0547 0.8397 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1473632 1 0.1007 0.8123 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR812536 3 0.1624 0.8588 0.040 0.000 0.936 0.000 0.004 0.020
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.4109 0.4578 0.000 0.648 0.000 0.000 0.024 0.328
#> SRR1446375 1 0.2092 0.7754 0.876 0.000 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1465230 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614119 6 0.5694 0.5354 0.164 0.000 0.224 0.000 0.020 0.592
#> SRR1356101 2 0.5466 0.4309 0.000 0.556 0.280 0.000 0.000 0.164
#> SRR1404209 6 0.5077 0.3424 0.404 0.000 0.068 0.000 0.004 0.524
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 6 0.3896 0.6947 0.196 0.000 0.000 0.000 0.056 0.748
#> SRR660510 3 0.1461 0.8587 0.044 0.000 0.940 0.000 0.000 0.016
#> SRR1445655 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658953 1 0.5354 0.3638 0.572 0.000 0.084 0.000 0.328 0.016
#> SRR2166459 1 0.4179 0.6665 0.744 0.000 0.016 0.000 0.048 0.192
#> SRR1070713 2 0.2738 0.7603 0.000 0.820 0.000 0.000 0.176 0.004
#> SRR1485312 3 0.0790 0.8761 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1317631 6 0.3050 0.5976 0.000 0.000 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR1488610 5 0.0260 0.8435 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1330588 3 0.0291 0.8760 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1316367 5 0.0146 0.8438 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1433926 1 0.0547 0.8136 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1091302 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818263 5 0.5298 0.4892 0.252 0.000 0.140 0.000 0.604 0.004
#> SRR1404909 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663076 6 0.3634 0.5119 0.356 0.000 0.000 0.000 0.000 0.644
#> SRR1323577 2 0.0146 0.9308 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1442422 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465893 6 0.3695 0.7105 0.164 0.000 0.000 0.000 0.060 0.776
#> SRR654862 5 0.3885 0.6993 0.100 0.000 0.116 0.000 0.780 0.004
#> SRR1407112 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.0717 0.8731 0.016 0.000 0.976 0.000 0.000 0.008
#> SRR1353199 1 0.0692 0.8138 0.976 0.000 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR1378885 3 0.2034 0.8484 0.024 0.000 0.912 0.000 0.060 0.004
#> SRR665357 3 0.1141 0.8724 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR662186 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.1141 0.8724 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1347819 3 0.0291 0.8745 0.004 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.1075 0.8735 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1500472 5 0.1556 0.7999 0.000 0.000 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1417632 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 5 0.0790 0.8313 0.000 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1326579 5 0.0260 0.8435 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1349363 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.1141 0.8724 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1090407 3 0.0547 0.8770 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1083752 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377599 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488449 3 0.1297 0.8623 0.040 0.000 0.948 0.000 0.000 0.012
#> SRR1318354 5 0.0000 0.8436 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359062 3 0.0363 0.8764 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1398924 5 0.0260 0.8427 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR663783 3 0.0891 0.8776 0.008 0.000 0.968 0.000 0.000 0.024
#> SRR1319204 2 0.5173 0.5233 0.000 0.620 0.200 0.000 0.000 0.180
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0713 0.8134 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.3230 0.7359 0.000 0.012 0.776 0.000 0.000 0.212
#> SRR1498595 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377423 1 0.0692 0.8137 0.976 0.000 0.004 0.000 0.000 0.020
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 6 0.4382 0.6671 0.228 0.000 0.000 0.000 0.076 0.696
#> SRR1338426 3 0.2724 0.8140 0.000 0.000 0.864 0.000 0.084 0.052
#> SRR1353309 3 0.0458 0.8769 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR658941 5 0.1007 0.8276 0.000 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1101643 1 0.1765 0.7839 0.924 0.000 0.052 0.000 0.000 0.024
#> SRR1401468 5 0.4703 0.1156 0.048 0.000 0.000 0.000 0.544 0.408
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363858 4 0.3997 0.7093 0.112 0.000 0.052 0.800 0.008 0.028
#> SRR819820 3 0.3221 0.6950 0.000 0.000 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR1337342 5 0.0146 0.8434 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR655206 6 0.5064 0.5516 0.000 0.000 0.152 0.216 0.000 0.632
#> SRR1387013 2 0.0603 0.9199 0.000 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1317410 1 0.3745 0.6064 0.732 0.000 0.000 0.000 0.028 0.240
#> SRR608198 5 0.0000 0.8436 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 6 0.3607 0.5054 0.000 0.000 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR1099622 2 0.1806 0.8536 0.000 0.908 0.004 0.088 0.000 0.000
#> SRR663197 3 0.2502 0.8322 0.084 0.000 0.884 0.000 0.012 0.020
#> SRR1394836 2 0.5790 0.2478 0.000 0.512 0.184 0.004 0.000 0.300
#> SRR661699 3 0.1531 0.8664 0.000 0.000 0.928 0.000 0.004 0.068
#> SRR813680 3 0.2912 0.8073 0.072 0.000 0.852 0.000 0.000 0.076
#> SRR1410678 1 0.3101 0.6271 0.756 0.000 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1378109 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.0547 0.8136 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 4 0.2416 0.7715 0.000 0.156 0.000 0.844 0.000 0.000
#> SRR1433410 5 0.0000 0.8436 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661167 3 0.1320 0.8622 0.036 0.000 0.948 0.000 0.000 0.016
#> SRR1432518 5 0.3833 0.1829 0.000 0.000 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR660462 3 0.0547 0.8766 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1374608 6 0.4026 0.4955 0.000 0.000 0.000 0.348 0.016 0.636
#> SRR657949 3 0.4714 0.5825 0.268 0.000 0.664 0.000 0.052 0.016
#> SRR1308882 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655768 1 0.1007 0.8123 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1485870 2 0.4335 0.7206 0.000 0.768 0.000 0.036 0.088 0.108
#> SRR1444138 1 0.3078 0.6972 0.796 0.000 0.000 0.000 0.012 0.192
#> SRR1417342 1 0.3547 0.4370 0.668 0.000 0.000 0.000 0.000 0.332
#> SRR1470193 6 0.3782 0.4749 0.000 0.004 0.000 0.360 0.000 0.636
#> SRR1091380 3 0.4563 0.4369 0.000 0.000 0.588 0.000 0.044 0.368
#> SRR1099096 6 0.4154 0.7075 0.164 0.000 0.000 0.000 0.096 0.740
#> SRR1313583 4 0.2856 0.7806 0.068 0.000 0.000 0.856 0.000 0.076
#> SRR1467102 3 0.4537 0.5999 0.000 0.072 0.664 0.000 0.000 0.264
#> SRR1485416 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818821 3 0.2121 0.8416 0.012 0.000 0.892 0.000 0.000 0.096
#> SRR809963 1 0.0806 0.8027 0.972 0.000 0.020 0.000 0.000 0.008
#> SRR1072247 1 0.1957 0.7827 0.888 0.000 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1353710 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445259 5 0.0603 0.8425 0.000 0.000 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR1408393 3 0.3461 0.8025 0.048 0.000 0.836 0.000 0.076 0.040
#> SRR1361522 1 0.0632 0.8135 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1368597 1 0.1082 0.8159 0.956 0.000 0.004 0.000 0.000 0.040
#> SRR1309680 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.1075 0.8735 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1333485 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406437 6 0.3140 0.6733 0.000 0.044 0.048 0.020 0.020 0.868
#> SRR1354931 3 0.0632 0.8764 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1391856 2 0.3778 0.6010 0.000 0.708 0.000 0.000 0.272 0.020
#> SRR1446738 4 0.6820 0.2110 0.000 0.196 0.000 0.504 0.108 0.192
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.1141 0.8724 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR613150 3 0.0458 0.8763 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1375329 5 0.1599 0.8274 0.000 0.024 0.028 0.000 0.940 0.008
#> SRR1387921 1 0.2178 0.7680 0.868 0.000 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 6 0.3489 0.6142 0.288 0.000 0.000 0.000 0.004 0.708
#> SRR812943 1 0.0405 0.8127 0.988 0.004 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1400910 5 0.0146 0.8431 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1444203 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816177 4 0.2260 0.7897 0.000 0.140 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0363 0.8760 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1429603 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397366 3 0.4176 0.3265 0.404 0.000 0.580 0.000 0.000 0.016
#> SRR1446028 1 0.1141 0.8110 0.948 0.000 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1083918 2 0.2996 0.6869 0.000 0.772 0.000 0.228 0.000 0.000
#> SRR1337606 5 0.0000 0.8436 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659109 3 0.0146 0.8749 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1337192 5 0.0146 0.8438 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR656946 1 0.1007 0.8123 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1476102 5 0.3101 0.5933 0.000 0.000 0.000 0.000 0.756 0.244
#> SRR1476447 1 0.2956 0.7469 0.840 0.000 0.000 0.000 0.120 0.040
#> SRR1342067 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.4863 0.5377 0.664 0.000 0.000 0.000 0.168 0.168
#> SRR614419 5 0.2442 0.7222 0.144 0.000 0.004 0.000 0.852 0.000
#> SRR1322936 5 0.0146 0.8438 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1349121 6 0.4542 0.6715 0.224 0.000 0.012 0.000 0.064 0.700
#> SRR1430549 1 0.3834 0.6963 0.776 0.000 0.000 0.000 0.116 0.108
#> SRR612935 3 0.5125 0.5009 0.288 0.064 0.628 0.000 0.012 0.008
#> SRR661481 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.0937 0.9129 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1452164 1 0.0937 0.8127 0.960 0.000 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1070503 5 0.4641 0.4263 0.028 0.000 0.340 0.000 0.616 0.016
#> SRR1499894 3 0.1075 0.8738 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1082883 5 0.0363 0.8424 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1468271 6 0.4003 0.6829 0.092 0.000 0.000 0.000 0.152 0.756
#> SRR1332443 6 0.4392 0.6874 0.136 0.000 0.000 0.000 0.144 0.720
#> SRR810295 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0717 0.8044 0.976 0.000 0.008 0.000 0.000 0.016
#> SRR1328620 5 0.2070 0.7847 0.000 0.000 0.100 0.000 0.892 0.008
#> SRR1396294 6 0.2553 0.6743 0.000 0.000 0.008 0.144 0.000 0.848
#> SRR1419917 1 0.0458 0.8134 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR662114 3 0.4924 0.5065 0.052 0.000 0.632 0.000 0.296 0.020
#> SRR1489199 5 0.4683 0.6162 0.060 0.000 0.216 0.000 0.700 0.024
#> SRR813584 2 0.3756 0.3271 0.000 0.600 0.000 0.400 0.000 0.000
#> SRR1069638 5 0.5084 0.3943 0.052 0.000 0.340 0.000 0.588 0.020
#> SRR614864 5 0.2558 0.7213 0.000 0.000 0.156 0.000 0.840 0.004
#> SRR1433392 1 0.4057 0.3317 0.600 0.000 0.388 0.000 0.000 0.012
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.2854 0.6819 0.792 0.000 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1401252 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.1610 0.7983 0.916 0.000 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 3 0.3921 0.5416 0.012 0.000 0.676 0.000 0.004 0.308
#> SRR1380393 1 0.2300 0.7574 0.856 0.000 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1319731 6 0.4099 0.4643 0.372 0.000 0.000 0.000 0.016 0.612
#> SRR1356468 6 0.3588 0.6576 0.000 0.000 0.000 0.060 0.152 0.788
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 5 0.2315 0.7795 0.084 0.000 0.008 0.000 0.892 0.016
#> SRR1486538 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377696 4 0.1957 0.8299 0.000 0.112 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1465459 1 0.4260 0.0387 0.512 0.000 0.472 0.000 0.000 0.016
#> SRR1080270 3 0.0865 0.8755 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1312501 3 0.0291 0.8750 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1093148 5 0.0547 0.8397 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1467080 3 0.1075 0.8735 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1410866 4 0.0260 0.9431 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613342 1 0.3990 0.5232 0.676 0.000 0.304 0.000 0.004 0.016
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.1693 0.8568 0.044 0.000 0.932 0.000 0.004 0.020
#> SRR813824 3 0.2034 0.8486 0.060 0.000 0.912 0.000 0.004 0.024
#> SRR1082376 1 0.1686 0.7822 0.924 0.000 0.064 0.000 0.000 0.012
#> SRR1500891 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR807543 1 0.3200 0.6665 0.788 0.000 0.196 0.000 0.000 0.016
#> SRR1091572 1 0.1391 0.7911 0.944 0.000 0.040 0.000 0.000 0.016
#> SRR1346689 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332424 5 0.0146 0.8438 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR663729 6 0.6721 0.3215 0.004 0.032 0.000 0.236 0.324 0.404
#> SRR1097013 1 0.4466 0.6417 0.724 0.000 0.020 0.000 0.060 0.196
#> SRR613675 5 0.0000 0.8436 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485357 4 0.0146 0.9473 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR655816 3 0.1141 0.8724 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1500113 6 0.4061 0.7093 0.164 0.000 0.000 0.000 0.088 0.748
#> SRR1437622 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355172 6 0.4116 0.0404 0.012 0.000 0.416 0.000 0.000 0.572
#> SRR655531 5 0.0520 0.8420 0.008 0.000 0.000 0.000 0.984 0.008
#> SRR1338147 3 0.0551 0.8740 0.004 0.000 0.984 0.000 0.008 0.004
#> SRR1413329 3 0.5812 0.0915 0.000 0.000 0.460 0.000 0.348 0.192
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 6 0.4641 0.6450 0.116 0.000 0.000 0.000 0.200 0.684
#> SRR1333308 6 0.4695 0.6756 0.000 0.052 0.000 0.144 0.068 0.736
#> SRR1452033 1 0.1910 0.7855 0.892 0.000 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.1141 0.8724 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.4523 0.6458 0.056 0.000 0.712 0.000 0.212 0.020
#> SRR1471755 2 0.1501 0.8671 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR808019 5 0.4899 0.1770 0.000 0.000 0.064 0.000 0.532 0.404
#> SRR1479133 3 0.2152 0.8443 0.068 0.000 0.904 0.000 0.004 0.024
#> SRR615069 5 0.4085 0.6199 0.016 0.004 0.228 0.000 0.732 0.020
#> SRR1456185 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350069 6 0.3684 0.4448 0.000 0.000 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR816316 1 0.3183 0.6948 0.812 0.000 0.164 0.000 0.008 0.016
#> SRR664795 1 0.6118 -0.0679 0.360 0.000 0.304 0.000 0.000 0.336
#> SRR1490721 5 0.0146 0.8427 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR810643 5 0.4543 0.2229 0.040 0.000 0.000 0.000 0.576 0.384
#> SRR1430333 5 0.0260 0.8425 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1085285 3 0.1320 0.8622 0.036 0.000 0.948 0.000 0.000 0.016
#> SRR1099072 3 0.2907 0.7855 0.152 0.000 0.828 0.000 0.000 0.020
#> SRR1317985 1 0.1007 0.8123 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1487340 1 0.1765 0.7930 0.904 0.000 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1420276 3 0.1141 0.8724 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1351347 3 0.3087 0.7395 0.012 0.000 0.808 0.000 0.176 0.004
#> SRR1405525 5 0.4392 0.5727 0.136 0.000 0.000 0.000 0.720 0.144
#> SRR1370329 1 0.0363 0.8083 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1465001 6 0.3734 0.6399 0.264 0.000 0.000 0.000 0.020 0.716
#> SRR1476525 2 0.1075 0.8931 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.3076 0.6390 0.760 0.000 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 6 0.4062 0.6930 0.196 0.000 0.000 0.068 0.000 0.736
#> SRR613639 1 0.3231 0.6600 0.784 0.000 0.200 0.000 0.000 0.016
#> SRR1402285 4 0.2664 0.7242 0.000 0.000 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1077038 1 0.3394 0.6258 0.752 0.000 0.236 0.000 0.000 0.012
#> SRR1405660 3 0.1141 0.8724 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1095455 1 0.0551 0.8085 0.984 0.000 0.008 0.000 0.004 0.004
#> SRR1394734 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317771 6 0.6865 0.4340 0.132 0.000 0.136 0.000 0.240 0.492
#> SRR1365894 2 0.0790 0.9084 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1073581 6 0.1864 0.6968 0.040 0.000 0.032 0.000 0.004 0.924
#> SRR659804 1 0.2454 0.7427 0.840 0.000 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.3409 0.5572 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000 0.000
#> SRR1473529 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660764 3 0.2476 0.8284 0.092 0.000 0.880 0.000 0.004 0.024
#> SRR820448 1 0.1657 0.7836 0.928 0.000 0.056 0.000 0.000 0.016
#> SRR1328845 6 0.3003 0.6922 0.016 0.000 0.000 0.172 0.000 0.812
#> SRR1336415 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459190 3 0.1141 0.8724 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1346773 5 0.2491 0.7122 0.000 0.000 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1499521 6 0.3499 0.4995 0.000 0.000 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.2220 0.8478 0.052 0.000 0.908 0.000 0.020 0.020
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.2092 0.7746 0.876 0.000 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1333395 6 0.5431 0.3795 0.076 0.360 0.000 0.020 0.000 0.544
#> SRR1309248 4 0.6324 0.1413 0.000 0.352 0.000 0.436 0.024 0.188
#> SRR809161 3 0.4260 0.1012 0.472 0.000 0.512 0.000 0.000 0.016
#> SRR1316320 2 0.2454 0.7853 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1432629 4 0.3930 0.2652 0.000 0.420 0.000 0.576 0.000 0.004
#> SRR1498931 1 0.1075 0.8115 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1416578 6 0.3851 0.2550 0.000 0.000 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1405547 3 0.1141 0.8724 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1470534 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380764 5 0.0632 0.8381 0.000 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1309160 3 0.1007 0.8744 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR663489 3 0.1075 0.8735 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1500450 6 0.1565 0.6977 0.028 0.000 0.004 0.000 0.028 0.940
#> SRR1078489 5 0.2113 0.7938 0.028 0.000 0.060 0.000 0.908 0.004
#> SRR1332648 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660614 2 0.3807 0.6311 0.000 0.740 0.228 0.000 0.028 0.004
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.1714 0.7947 0.908 0.000 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1477949 6 0.3360 0.6402 0.264 0.000 0.000 0.000 0.004 0.732
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.3037 0.7156 0.808 0.000 0.000 0.000 0.016 0.176
#> SRR615946 3 0.4256 0.1362 0.464 0.000 0.520 0.000 0.000 0.016
#> SRR1446481 2 0.0260 0.9272 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 5 0.0508 0.8435 0.000 0.000 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR660224 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.0260 0.8094 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 5 0.0291 0.8419 0.000 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1485722 5 0.0260 0.8435 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1415316 1 0.5205 0.2440 0.496 0.000 0.000 0.000 0.412 0.092
#> SRR613390 1 0.2214 0.7590 0.888 0.000 0.096 0.000 0.000 0.016
#> SRR661108 3 0.1088 0.8663 0.024 0.000 0.960 0.000 0.000 0.016
#> SRR2170173 1 0.1007 0.8123 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR817329 1 0.2613 0.7240 0.848 0.000 0.140 0.000 0.000 0.012
#> SRR1401990 6 0.3607 0.5032 0.000 0.000 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR1467745 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.0790 0.9084 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 1 0.0508 0.8127 0.984 0.000 0.004 0.000 0.000 0.012
#> SRR1314873 1 0.0632 0.8135 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1401211 6 0.3189 0.6652 0.236 0.000 0.000 0.000 0.004 0.760
#> SRR1419692 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818797 3 0.3806 0.7044 0.212 0.000 0.752 0.000 0.008 0.028
#> SRR2164608 3 0.5285 0.2572 0.000 0.000 0.536 0.000 0.112 0.352
#> SRR1455586 2 0.4632 0.1676 0.000 0.520 0.440 0.000 0.000 0.040
#> SRR819459 3 0.1075 0.8735 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1488939 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 1 0.1951 0.7726 0.908 0.000 0.076 0.000 0.000 0.016
#> SRR1361652 5 0.0000 0.8436 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437119 1 0.1765 0.7926 0.904 0.000 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1478547 3 0.1141 0.8724 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1430910 5 0.0146 0.8431 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1310584 5 0.6050 -0.1186 0.276 0.000 0.000 0.000 0.412 0.312
#> SRR1500216 1 0.6446 0.2467 0.468 0.000 0.144 0.348 0.012 0.028
#> SRR1486762 1 0.2778 0.7048 0.824 0.000 0.168 0.000 0.000 0.008
#> SRR1480854 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.1204 0.9006 0.000 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1473058 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405165 5 0.4034 0.4583 0.000 0.000 0.328 0.000 0.652 0.020
#> SRR1433004 1 0.0622 0.8083 0.980 0.000 0.012 0.000 0.000 0.008
#> SRR1471477 6 0.1584 0.6663 0.000 0.000 0.064 0.000 0.008 0.928
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 6 0.1816 0.6902 0.000 0.048 0.004 0.016 0.004 0.928
#> SRR1455038 1 0.4860 0.5565 0.668 0.000 0.252 0.000 0.052 0.028
#> SRR1375248 2 0.4396 0.4265 0.000 0.612 0.352 0.000 0.000 0.036
#> SRR1403005 3 0.3586 0.6304 0.268 0.000 0.720 0.000 0.000 0.012
#> SRR1348378 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413541 1 0.0146 0.8118 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1392943 6 0.4760 0.5044 0.000 0.000 0.000 0.328 0.068 0.604
#> SRR1475192 3 0.1267 0.8693 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1432085 2 0.0146 0.9308 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1452468 5 0.0603 0.8407 0.000 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR1347060 3 0.0937 0.8750 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1414139 2 0.1461 0.8852 0.000 0.940 0.044 0.000 0.000 0.016
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.2092 0.7741 0.876 0.000 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1413436 5 0.0458 0.8417 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1311266 5 0.1765 0.7843 0.000 0.000 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1343302 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.1444 0.8037 0.928 0.000 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1429678 1 0.1075 0.8118 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1469413 2 0.0146 0.9308 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1405331 1 0.3816 0.5401 0.688 0.000 0.296 0.000 0.000 0.016
#> SRR1345609 1 0.1957 0.7833 0.888 0.000 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1380208 5 0.2020 0.7660 0.000 0.096 0.000 0.000 0.896 0.008
#> SRR1322840 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.0551 0.8742 0.004 0.000 0.984 0.000 0.004 0.008
#> SRR1416654 3 0.2302 0.8181 0.000 0.000 0.872 0.000 0.120 0.008
#> SRR1315081 3 0.2003 0.8354 0.000 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1369196 3 0.1007 0.8744 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1400847 1 0.2260 0.7623 0.860 0.000 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR1365291 3 0.1710 0.8608 0.028 0.000 0.936 0.000 0.020 0.016
#> SRR1367920 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366648 3 0.1141 0.8724 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9330 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.1951 0.8579 0.000 0.000 0.908 0.000 0.016 0.076
#> SRR1363968 6 0.3647 0.4361 0.000 0.000 0.000 0.000 0.360 0.640
#> SRR814387 6 0.4598 0.4799 0.360 0.000 0.000 0.000 0.048 0.592
#> SRR657599 5 0.2537 0.7841 0.028 0.000 0.068 0.000 0.888 0.016
#> SRR1386689 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.1141 0.8724 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1453811 3 0.3050 0.8096 0.108 0.000 0.848 0.000 0.016 0.028
#> SRR1441159 5 0.0363 0.8427 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1403154 4 0.0000 0.9504 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.1141 0.8724 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1310275 3 0.4274 0.5510 0.024 0.000 0.676 0.000 0.288 0.012
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
#> Error in mat[ceiling(1:nr/h_ratio), ceiling(1:nc/w_ratio), drop = FALSE]: subscript out of bounds
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.210 0.714 0.846 0.4696 0.503 0.503
#> 3 3 0.254 0.565 0.771 0.2554 0.843 0.703
#> 4 4 0.311 0.383 0.679 0.1532 0.861 0.680
#> 5 5 0.385 0.466 0.654 0.0866 0.884 0.669
#> 6 6 0.429 0.461 0.664 0.0498 0.966 0.870
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.9944 0.1352 0.544 0.456
#> SRR1331708 1 0.5737 0.7924 0.864 0.136
#> SRR1464258 1 0.6148 0.7800 0.848 0.152
#> SRR1454201 1 0.5842 0.7960 0.860 0.140
#> SRR661589 2 0.7453 0.7837 0.212 0.788
#> SRR1456229 1 0.0938 0.8348 0.988 0.012
#> SRR1315165 1 0.7602 0.7238 0.780 0.220
#> SRR1488960 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.0672 0.8338 0.992 0.008
#> SRR1094457 1 0.2948 0.8317 0.948 0.052
#> SRR1095575 1 0.9983 0.0124 0.524 0.476
#> SRR1315931 1 0.6048 0.7835 0.852 0.148
#> SRR1430066 2 0.3879 0.8270 0.076 0.924
#> SRR1431037 2 0.4562 0.8303 0.096 0.904
#> SRR1395554 2 0.4022 0.8288 0.080 0.920
#> SRR818002 2 0.7299 0.7693 0.204 0.796
#> SRR1344143 2 0.7815 0.7052 0.232 0.768
#> SRR1486845 1 0.0376 0.8326 0.996 0.004
#> SRR1362866 1 0.5629 0.8012 0.868 0.132
#> SRR1490740 1 0.0376 0.8325 0.996 0.004
#> SRR1446627 2 0.4022 0.8106 0.080 0.920
#> SRR1456138 2 0.7453 0.7365 0.212 0.788
#> SRR1416248 1 0.0376 0.8324 0.996 0.004
#> SRR1383907 1 0.7453 0.7129 0.788 0.212
#> SRR1311018 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1375699 1 0.9522 0.3855 0.628 0.372
#> SRR1429846 2 0.9087 0.6186 0.324 0.676
#> SRR613550 2 0.6973 0.7983 0.188 0.812
#> SRR1348402 1 0.0938 0.8349 0.988 0.012
#> SRR1345146 1 0.7219 0.7259 0.800 0.200
#> SRR1324025 2 0.9460 0.5301 0.364 0.636
#> SRR1318879 2 0.8144 0.7424 0.252 0.748
#> SRR820755 1 0.8955 0.5599 0.688 0.312
#> SRR1485830 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR599313 1 0.4431 0.8194 0.908 0.092
#> SRR612263 1 0.2423 0.8325 0.960 0.040
#> SRR1415398 2 0.6148 0.8145 0.152 0.848
#> SRR1326205 1 0.2603 0.8344 0.956 0.044
#> SRR1421327 1 0.3114 0.8319 0.944 0.056
#> SRR1083311 2 0.3879 0.8294 0.076 0.924
#> SRR1499303 1 0.5178 0.8139 0.884 0.116
#> SRR1079522 1 0.4298 0.8162 0.912 0.088
#> SRR1452935 2 0.9044 0.6314 0.320 0.680
#> SRR1379495 1 0.1414 0.8358 0.980 0.020
#> SRR1470459 2 0.1184 0.8019 0.016 0.984
#> SRR661361 2 0.6247 0.8198 0.156 0.844
#> SRR615778 1 0.8661 0.6168 0.712 0.288
#> SRR1447564 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.5629 0.8011 0.868 0.132
#> SRR655182 1 0.3274 0.8287 0.940 0.060
#> SRR1335140 1 0.9129 0.5006 0.672 0.328
#> SRR1433555 2 0.4161 0.8314 0.084 0.916
#> SRR1308650 2 0.8608 0.6899 0.284 0.716
#> SRR1388354 1 0.1414 0.8355 0.980 0.020
#> SRR1317446 2 0.3584 0.8255 0.068 0.932
#> SRR1413602 2 0.5059 0.8314 0.112 0.888
#> SRR1479955 2 0.7950 0.6999 0.240 0.760
#> SRR809853 1 0.1633 0.8339 0.976 0.024
#> SRR661313 2 0.6531 0.8083 0.168 0.832
#> SRR1499935 1 0.5178 0.8139 0.884 0.116
#> SRR1447303 2 0.9393 0.5649 0.356 0.644
#> SRR1429408 2 0.9393 0.5638 0.356 0.644
#> SRR1433950 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.2778 0.8081 0.048 0.952
#> SRR1409854 1 0.9170 0.5191 0.668 0.332
#> SRR1435229 1 0.9996 -0.0761 0.512 0.488
#> SRR1085996 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1414229 1 0.9732 0.3390 0.596 0.404
#> SRR1400974 2 0.3584 0.8255 0.068 0.932
#> SRR1399971 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR613927 2 0.7674 0.7661 0.224 0.776
#> SRR1457854 1 0.1414 0.8355 0.980 0.020
#> SRR1473714 1 0.4562 0.8166 0.904 0.096
#> SRR813776 1 0.8955 0.5599 0.688 0.312
#> SRR808196 1 0.5629 0.8011 0.868 0.132
#> SRR1101085 1 0.0376 0.8326 0.996 0.004
#> SRR614395 1 0.6148 0.7800 0.848 0.152
#> SRR1478251 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.3274 0.8139 0.060 0.940
#> SRR1362310 1 0.0672 0.8339 0.992 0.008
#> SRR665310 2 0.7453 0.7832 0.212 0.788
#> SRR1420109 2 0.8713 0.6925 0.292 0.708
#> SRR1330920 1 0.7056 0.7420 0.808 0.192
#> SRR1419539 2 0.3274 0.8248 0.060 0.940
#> SRR1359447 2 0.1414 0.8011 0.020 0.980
#> SRR1347259 1 0.2603 0.8324 0.956 0.044
#> SRR613915 2 0.7950 0.7489 0.240 0.760
#> SRR1384395 2 0.3114 0.8226 0.056 0.944
#> SRR821715 2 0.6438 0.8107 0.164 0.836
#> SRR1478228 1 0.0672 0.8339 0.992 0.008
#> SRR1445637 1 0.4939 0.8130 0.892 0.108
#> SRR608150 1 0.7056 0.7497 0.808 0.192
#> SRR1096383 1 0.9970 0.0806 0.532 0.468
#> SRR1341480 1 0.1414 0.8350 0.980 0.020
#> SRR1341344 1 0.0672 0.8339 0.992 0.008
#> SRR1326270 2 0.5519 0.8259 0.128 0.872
#> SRR1498838 2 0.4431 0.8298 0.092 0.908
#> SRR1416313 2 0.5178 0.8266 0.116 0.884
#> SRR808566 1 0.9427 0.4431 0.640 0.360
#> SRR1430270 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1367825 2 0.3584 0.8255 0.068 0.932
#> SRR613533 2 0.7219 0.7862 0.200 0.800
#> SRR661267 1 0.9977 0.0702 0.528 0.472
#> SRR810665 2 0.4562 0.8174 0.096 0.904
#> SRR1407250 1 0.8555 0.6386 0.720 0.280
#> SRR1420067 1 0.7299 0.7364 0.796 0.204
#> SRR1473632 1 0.1633 0.8339 0.976 0.024
#> SRR812536 2 0.5178 0.8298 0.116 0.884
#> SRR1370850 2 0.6973 0.7835 0.188 0.812
#> SRR1486195 2 0.3274 0.8119 0.060 0.940
#> SRR1407671 2 0.9954 0.2585 0.460 0.540
#> SRR1446375 2 0.9833 0.3987 0.424 0.576
#> SRR1465230 1 0.1843 0.8349 0.972 0.028
#> SRR614119 1 0.9754 0.3048 0.592 0.408
#> SRR1356101 2 0.0672 0.7979 0.008 0.992
#> SRR1404209 1 0.7674 0.7099 0.776 0.224
#> SRR1392676 2 0.4431 0.8052 0.092 0.908
#> SRR665538 1 0.9977 0.0686 0.528 0.472
#> SRR660510 2 0.4562 0.8291 0.096 0.904
#> SRR1445655 1 0.1184 0.8359 0.984 0.016
#> SRR658953 1 0.9286 0.4687 0.656 0.344
#> SRR2166459 1 0.4815 0.8137 0.896 0.104
#> SRR1070713 2 0.9795 0.3845 0.416 0.584
#> SRR1485312 2 0.3879 0.8270 0.076 0.924
#> SRR1317631 2 1.0000 0.0975 0.496 0.504
#> SRR1488610 1 0.0938 0.8347 0.988 0.012
#> SRR1330588 2 0.9998 0.1048 0.492 0.508
#> SRR1316367 1 0.2948 0.8312 0.948 0.052
#> SRR1433926 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1091302 1 0.2236 0.8363 0.964 0.036
#> SRR818263 1 0.8661 0.6081 0.712 0.288
#> SRR1404909 1 0.5519 0.7907 0.872 0.128
#> SRR663076 1 0.4815 0.8131 0.896 0.104
#> SRR1323577 2 0.7453 0.7632 0.212 0.788
#> SRR1442422 1 0.1843 0.8349 0.972 0.028
#> SRR1465893 1 0.0672 0.8339 0.992 0.008
#> SRR654862 1 0.5737 0.7994 0.864 0.136
#> SRR1407112 1 0.5294 0.8069 0.880 0.120
#> SRR1332969 2 0.7453 0.7837 0.212 0.788
#> SRR1353199 2 0.6531 0.8083 0.168 0.832
#> SRR1378885 2 0.9732 0.4177 0.404 0.596
#> SRR665357 2 0.3274 0.8256 0.060 0.940
#> SRR662186 2 0.1843 0.8054 0.028 0.972
#> SRR1501020 2 0.8144 0.7444 0.252 0.748
#> SRR1347819 2 0.4298 0.8295 0.088 0.912
#> SRR1480813 2 0.5059 0.8122 0.112 0.888
#> SRR1472576 1 0.8813 0.5744 0.700 0.300
#> SRR1431781 1 0.7602 0.7238 0.780 0.220
#> SRR1452270 2 0.4161 0.8287 0.084 0.916
#> SRR1500472 2 0.9833 0.3867 0.424 0.576
#> SRR1417632 1 0.8386 0.6209 0.732 0.268
#> SRR1350153 2 0.2948 0.8086 0.052 0.948
#> SRR1458113 1 0.9881 0.2191 0.564 0.436
#> SRR1326579 1 0.4562 0.8199 0.904 0.096
#> SRR1349363 1 0.9661 0.3282 0.608 0.392
#> SRR1096712 2 0.4298 0.8305 0.088 0.912
#> SRR1090407 2 0.6148 0.8149 0.152 0.848
#> SRR1083752 2 0.6712 0.7927 0.176 0.824
#> SRR1377599 1 0.2423 0.8336 0.960 0.040
#> SRR1488449 2 0.6887 0.8000 0.184 0.816
#> SRR1318354 2 0.7139 0.7921 0.196 0.804
#> SRR1359062 2 0.3733 0.8279 0.072 0.928
#> SRR1398924 1 0.8813 0.5582 0.700 0.300
#> SRR663783 2 0.3584 0.8261 0.068 0.932
#> SRR1319204 2 0.4562 0.8296 0.096 0.904
#> SRR1369070 2 0.5946 0.7872 0.144 0.856
#> SRR615659 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.5059 0.8164 0.112 0.888
#> SRR1316982 2 0.0000 0.7924 0.000 1.000
#> SRR1498595 1 0.8555 0.6019 0.720 0.280
#> SRR1377423 2 0.7674 0.7751 0.224 0.776
#> SRR1312310 2 0.3114 0.8079 0.056 0.944
#> SRR1485613 1 0.5842 0.7955 0.860 0.140
#> SRR1338426 2 0.6247 0.8171 0.156 0.844
#> SRR1353309 2 0.6623 0.8072 0.172 0.828
#> SRR658941 1 0.9993 0.0131 0.516 0.484
#> SRR1101643 1 0.0938 0.8352 0.988 0.012
#> SRR1401468 1 0.9944 0.1352 0.544 0.456
#> SRR1368874 2 0.2948 0.8077 0.052 0.948
#> SRR1324085 1 0.9963 0.0821 0.536 0.464
#> SRR1363858 1 0.4431 0.8179 0.908 0.092
#> SRR819820 2 0.8443 0.7093 0.272 0.728
#> SRR1337342 1 0.8081 0.6850 0.752 0.248
#> SRR655206 2 0.3274 0.8248 0.060 0.940
#> SRR1387013 2 0.9710 0.4264 0.400 0.600
#> SRR1317410 1 0.0672 0.8339 0.992 0.008
#> SRR608198 1 0.4690 0.8178 0.900 0.100
#> SRR1440161 2 0.2948 0.8086 0.052 0.948
#> SRR1343741 2 0.5946 0.7872 0.144 0.856
#> SRR1381288 2 0.4022 0.8106 0.080 0.920
#> SRR1415379 1 0.0376 0.8323 0.996 0.004
#> SRR1099622 2 0.2236 0.8132 0.036 0.964
#> SRR663197 2 0.4939 0.8284 0.108 0.892
#> SRR1394836 2 0.3274 0.8248 0.060 0.940
#> SRR661699 2 0.6531 0.8087 0.168 0.832
#> SRR813680 1 0.9970 0.0852 0.532 0.468
#> SRR1410678 1 0.0672 0.8339 0.992 0.008
#> SRR1378109 1 0.2948 0.8317 0.948 0.052
#> SRR1499174 1 0.5629 0.8007 0.868 0.132
#> SRR1311486 2 0.5059 0.8164 0.112 0.888
#> SRR1382851 1 0.9909 0.1556 0.556 0.444
#> SRR1433410 1 0.6438 0.7695 0.836 0.164
#> SRR661167 2 0.5519 0.8230 0.128 0.872
#> SRR1432518 2 0.9044 0.6314 0.320 0.680
#> SRR660462 2 0.3733 0.8268 0.072 0.928
#> SRR1374608 2 0.9996 0.1384 0.488 0.512
#> SRR657949 2 0.8267 0.7283 0.260 0.740
#> SRR1308882 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.9815 0.2547 0.580 0.420
#> SRR1485870 1 0.7219 0.7259 0.800 0.200
#> SRR1444138 1 0.9881 0.1887 0.564 0.436
#> SRR1417342 1 0.4022 0.8219 0.920 0.080
#> SRR1470193 1 0.2603 0.8344 0.956 0.044
#> SRR1091380 2 0.8443 0.7093 0.272 0.728
#> SRR1099096 1 0.0672 0.8339 0.992 0.008
#> SRR1313583 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1467102 2 0.3431 0.8247 0.064 0.936
#> SRR1485416 1 0.1414 0.8350 0.980 0.020
#> SRR818821 2 0.7219 0.7862 0.200 0.800
#> SRR809963 1 0.6148 0.7800 0.848 0.152
#> SRR1072247 1 0.1414 0.8358 0.980 0.020
#> SRR1353710 1 0.0672 0.8337 0.992 0.008
#> SRR1445259 2 0.7376 0.7788 0.208 0.792
#> SRR1408393 2 0.9775 0.4195 0.412 0.588
#> SRR1361522 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.2043 0.8354 0.968 0.032
#> SRR1309680 2 0.6973 0.7693 0.188 0.812
#> SRR1310542 2 0.3584 0.8265 0.068 0.932
#> SRR1333485 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1406437 2 0.9248 0.5929 0.340 0.660
#> SRR1354931 2 0.5408 0.8267 0.124 0.876
#> SRR1391856 2 0.4161 0.8310 0.084 0.916
#> SRR1446738 2 0.9635 0.4761 0.388 0.612
#> SRR1309032 2 0.1414 0.8030 0.020 0.980
#> SRR1388145 2 0.4815 0.8158 0.104 0.896
#> SRR1432611 2 0.3274 0.8086 0.060 0.940
#> SRR815869 2 0.3584 0.8255 0.068 0.932
#> SRR613150 2 0.3879 0.8284 0.076 0.924
#> SRR1375329 1 0.9993 -0.0532 0.516 0.484
#> SRR1387921 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.2948 0.8077 0.052 0.948
#> SRR1360478 2 0.2948 0.8086 0.052 0.948
#> SRR1360695 1 0.7299 0.7320 0.796 0.204
#> SRR812943 1 0.2603 0.8314 0.956 0.044
#> SRR1400910 2 0.9635 0.4618 0.388 0.612
#> SRR1444203 1 0.2948 0.8329 0.948 0.052
#> SRR816177 2 0.7528 0.7599 0.216 0.784
#> SRR658754 2 0.4161 0.8285 0.084 0.916
#> SRR1429603 1 0.2603 0.8324 0.956 0.044
#> SRR1397366 2 0.6887 0.7989 0.184 0.816
#> SRR1446028 1 0.1184 0.8355 0.984 0.016
#> SRR1083918 2 0.9970 0.2415 0.468 0.532
#> SRR1337606 1 0.6623 0.7627 0.828 0.172
#> SRR659109 2 0.4161 0.8278 0.084 0.916
#> SRR1337192 1 0.0672 0.8339 0.992 0.008
#> SRR656946 1 0.9977 0.0242 0.528 0.472
#> SRR1476102 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1342067 1 0.0376 0.8326 0.996 0.004
#> SRR1385389 1 0.0376 0.8326 0.996 0.004
#> SRR1075971 1 0.1184 0.8354 0.984 0.016
#> SRR614419 1 0.2423 0.8332 0.960 0.040
#> SRR1322936 1 0.6531 0.7660 0.832 0.168
#> SRR1349121 1 0.9710 0.3378 0.600 0.400
#> SRR1430549 1 0.0376 0.8324 0.996 0.004
#> SRR612935 2 0.6801 0.8025 0.180 0.820
#> SRR661481 2 0.4939 0.8128 0.108 0.892
#> SRR1354117 2 0.1414 0.8011 0.020 0.980
#> SRR1393596 1 0.2948 0.8319 0.948 0.052
#> SRR1452164 1 0.5294 0.8060 0.880 0.120
#> SRR1070503 1 0.9129 0.5273 0.672 0.328
#> SRR1499894 2 0.4562 0.8280 0.096 0.904
#> SRR1082883 1 0.7139 0.7460 0.804 0.196
#> SRR1468271 1 0.7883 0.6950 0.764 0.236
#> SRR1332443 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR810295 2 0.3114 0.8079 0.056 0.944
#> SRR662103 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1328620 2 0.7139 0.7921 0.196 0.804
#> SRR1396294 2 1.0000 0.0975 0.496 0.504
#> SRR1419917 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR662114 2 0.7139 0.7951 0.196 0.804
#> SRR1489199 1 0.9963 0.0968 0.536 0.464
#> SRR813584 2 0.9393 0.5638 0.356 0.644
#> SRR1069638 1 0.8081 0.6837 0.752 0.248
#> SRR614864 2 0.6247 0.8152 0.156 0.844
#> SRR1433392 1 0.7299 0.7293 0.796 0.204
#> SRR1377777 2 0.7602 0.7247 0.220 0.780
#> SRR2167710 1 0.9977 0.0242 0.528 0.472
#> SRR1401252 1 0.1414 0.8359 0.980 0.020
#> SRR1309963 1 0.4022 0.8244 0.920 0.080
#> SRR1338031 1 0.0672 0.8343 0.992 0.008
#> SRR1418628 2 0.3114 0.8079 0.056 0.944
#> SRR1486889 1 0.7745 0.7048 0.772 0.228
#> SRR1380393 1 0.1414 0.8355 0.980 0.020
#> SRR1319731 1 0.0672 0.8339 0.992 0.008
#> SRR1356468 1 0.5519 0.8043 0.872 0.128
#> SRR1337010 2 0.3879 0.8150 0.076 0.924
#> SRR1486520 1 0.4690 0.8196 0.900 0.100
#> SRR1486538 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1340486 1 0.5294 0.8069 0.880 0.120
#> SRR1377696 1 0.8386 0.6209 0.732 0.268
#> SRR1465459 1 0.9323 0.4772 0.652 0.348
#> SRR1080270 2 0.3733 0.8280 0.072 0.928
#> SRR1312501 2 0.8386 0.7190 0.268 0.732
#> SRR1093148 2 0.9522 0.5096 0.372 0.628
#> SRR1467080 2 0.3584 0.8255 0.068 0.932
#> SRR1410866 2 0.3274 0.8092 0.060 0.940
#> SRR816475 1 0.9963 0.0821 0.536 0.464
#> SRR1379198 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR613342 2 0.6712 0.8163 0.176 0.824
#> SRR1452246 2 0.7139 0.7618 0.196 0.804
#> SRR1338836 2 0.3274 0.8086 0.060 0.940
#> SRR1369129 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1396616 2 0.7056 0.7994 0.192 0.808
#> SRR813824 2 0.4690 0.8295 0.100 0.900
#> SRR1082376 1 0.4562 0.8177 0.904 0.096
#> SRR1500891 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR807543 1 0.7139 0.7378 0.804 0.196
#> SRR1091572 1 0.8555 0.6380 0.720 0.280
#> SRR1346689 1 0.0376 0.8320 0.996 0.004
#> SRR1332424 1 0.6438 0.7695 0.836 0.164
#> SRR663729 1 0.1414 0.8350 0.980 0.020
#> SRR1097013 1 0.4815 0.8137 0.896 0.104
#> SRR613675 1 0.6531 0.7660 0.832 0.168
#> SRR1485357 1 0.5629 0.7987 0.868 0.132
#> SRR655816 2 0.6343 0.8128 0.160 0.840
#> SRR1500113 1 0.2423 0.8350 0.960 0.040
#> SRR1437622 1 0.9491 0.4151 0.632 0.368
#> SRR1355172 1 0.9977 0.0611 0.528 0.472
#> SRR655531 1 0.4562 0.8211 0.904 0.096
#> SRR1338147 2 0.7883 0.7559 0.236 0.764
#> SRR1413329 2 0.9922 0.2939 0.448 0.552
#> SRR1485931 2 0.7815 0.7052 0.232 0.768
#> SRR1420873 1 0.4939 0.8148 0.892 0.108
#> SRR1333308 1 0.1184 0.8360 0.984 0.016
#> SRR1452033 1 0.6247 0.7797 0.844 0.156
#> SRR1467316 2 0.7950 0.6999 0.240 0.760
#> SRR809018 2 0.3584 0.8255 0.068 0.932
#> SRR1375351 2 0.3114 0.8079 0.056 0.944
#> SRR663440 2 0.9248 0.5964 0.340 0.660
#> SRR1471755 2 0.5178 0.8118 0.116 0.884
#> SRR808019 1 0.9988 0.0309 0.520 0.480
#> SRR1479133 2 0.6048 0.8179 0.148 0.852
#> SRR615069 2 0.9491 0.5129 0.368 0.632
#> SRR1456185 2 0.8763 0.6613 0.296 0.704
#> SRR1350069 2 1.0000 0.0975 0.496 0.504
#> SRR816316 1 0.6048 0.7835 0.852 0.148
#> SRR664795 1 0.9970 0.0852 0.532 0.468
#> SRR1490721 1 0.3114 0.8319 0.944 0.056
#> SRR810643 1 0.0376 0.8324 0.996 0.004
#> SRR1430333 1 0.9710 0.3452 0.600 0.400
#> SRR1085285 2 0.6048 0.8179 0.148 0.852
#> SRR1099072 2 0.7453 0.7832 0.212 0.788
#> SRR1317985 1 0.1184 0.8354 0.984 0.016
#> SRR1487340 1 0.0672 0.8339 0.992 0.008
#> SRR1420276 2 0.3114 0.8226 0.056 0.944
#> SRR1351347 2 0.6712 0.8052 0.176 0.824
#> SRR1405525 1 0.1184 0.8351 0.984 0.016
#> SRR1370329 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0672 0.8339 0.992 0.008
#> SRR1476525 2 0.4562 0.8166 0.096 0.904
#> SRR819610 2 0.8763 0.6613 0.296 0.704
#> SRR2157314 1 0.2043 0.8351 0.968 0.032
#> SRR1409465 2 0.3274 0.8086 0.060 0.940
#> SRR809987 1 0.0376 0.8323 0.996 0.004
#> SRR613639 2 0.7950 0.7494 0.240 0.760
#> SRR1402285 1 0.1184 0.8347 0.984 0.016
#> SRR1077038 1 0.6247 0.7765 0.844 0.156
#> SRR1405660 2 0.4161 0.8287 0.084 0.916
#> SRR1095455 2 0.7376 0.7788 0.208 0.792
#> SRR1394734 2 0.9970 0.2415 0.468 0.532
#> SRR1317771 1 0.7674 0.7099 0.776 0.224
#> SRR1365894 1 0.6438 0.7658 0.836 0.164
#> SRR1073581 1 0.9710 0.3378 0.600 0.400
#> SRR659804 1 0.2043 0.8351 0.968 0.032
#> SRR1345914 2 0.6712 0.7922 0.176 0.824
#> SRR1432186 2 0.6148 0.7951 0.152 0.848
#> SRR1473529 1 0.8555 0.6019 0.720 0.280
#> SRR660764 2 0.5408 0.8278 0.124 0.876
#> SRR820448 1 0.6148 0.7800 0.848 0.152
#> SRR1328845 2 1.0000 0.0975 0.496 0.504
#> SRR1336415 1 0.1184 0.8347 0.984 0.016
#> SRR1379065 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1459190 2 0.9710 0.4537 0.400 0.600
#> SRR1346773 1 0.0376 0.8324 0.996 0.004
#> SRR1499521 1 0.9977 0.0624 0.528 0.472
#> SRR1440898 2 0.5059 0.8162 0.112 0.888
#> SRR1347459 2 0.6712 0.8100 0.176 0.824
#> SRR1081209 2 0.6973 0.7597 0.188 0.812
#> SRR1400202 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1333395 1 0.7299 0.7146 0.796 0.204
#> SRR1309248 1 0.7056 0.7334 0.808 0.192
#> SRR809161 2 0.6531 0.8084 0.168 0.832
#> SRR1316320 1 0.5629 0.7953 0.868 0.132
#> SRR1432629 2 0.7299 0.7552 0.204 0.796
#> SRR1498931 1 0.0672 0.8337 0.992 0.008
#> SRR1416578 1 0.0376 0.8323 0.996 0.004
#> SRR1405547 2 0.3584 0.8255 0.068 0.932
#> SRR1470534 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.2603 0.8358 0.956 0.044
#> SRR1309160 2 0.4690 0.8290 0.100 0.900
#> SRR663489 2 0.3584 0.8255 0.068 0.932
#> SRR1500450 1 0.6148 0.7824 0.848 0.152
#> SRR1078489 2 0.9993 0.1237 0.484 0.516
#> SRR1332648 1 0.1414 0.8349 0.980 0.020
#> SRR660614 2 0.4562 0.8296 0.096 0.904
#> SRR1470420 2 0.1184 0.8019 0.016 0.984
#> SRR1475566 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.5946 0.8005 0.144 0.856
#> SRR1464766 1 0.1633 0.8362 0.976 0.024
#> SRR615946 2 0.5178 0.8266 0.116 0.884
#> SRR1446481 2 0.5059 0.8164 0.112 0.888
#> SRR1467656 2 0.3114 0.8095 0.056 0.944
#> SRR1402962 1 0.5629 0.8011 0.868 0.132
#> SRR660224 2 0.5629 0.8130 0.132 0.868
#> SRR665586 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.8661 0.6168 0.712 0.288
#> SRR1485722 1 0.8555 0.6386 0.720 0.280
#> SRR1415316 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR661108 2 0.4161 0.8290 0.084 0.916
#> SRR2170173 1 0.9983 0.0124 0.524 0.476
#> SRR817329 1 0.1414 0.8350 0.980 0.020
#> SRR1401990 1 0.8267 0.6534 0.740 0.260
#> SRR1467745 2 1.0000 0.0719 0.500 0.500
#> SRR1471795 2 0.7299 0.7693 0.204 0.796
#> SRR1415637 2 0.4431 0.8052 0.092 0.908
#> SRR813137 1 0.4690 0.8176 0.900 0.100
#> SRR1314873 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.7299 0.7320 0.796 0.204
#> SRR1419692 1 0.2778 0.8326 0.952 0.048
#> SRR818797 2 0.9323 0.5714 0.348 0.652
#> SRR2164608 2 0.7950 0.7510 0.240 0.760
#> SRR1455586 2 0.0672 0.7979 0.008 0.992
#> SRR819459 2 0.3879 0.8284 0.076 0.924
#> SRR1488939 2 0.7950 0.6999 0.240 0.760
#> SRR1433232 2 0.6801 0.7632 0.180 0.820
#> SRR1385501 1 0.6247 0.7765 0.844 0.156
#> SRR1361652 1 0.9209 0.4832 0.664 0.336
#> SRR1437119 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1478547 2 0.3584 0.8255 0.068 0.932
#> SRR1430910 2 0.9988 0.1871 0.480 0.520
#> SRR1310584 1 0.0376 0.8324 0.996 0.004
#> SRR1500216 1 0.4431 0.8194 0.908 0.092
#> SRR1486762 2 0.8267 0.7314 0.260 0.740
#> SRR1480854 1 0.2423 0.8336 0.960 0.040
#> SRR1489394 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1418085 1 0.1633 0.8350 0.976 0.024
#> SRR1340221 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1473058 1 0.9963 0.0821 0.536 0.464
#> SRR1405165 2 0.6343 0.8163 0.160 0.840
#> SRR1433004 1 0.0376 0.8325 0.996 0.004
#> SRR1471477 1 0.7528 0.7181 0.784 0.216
#> SRR1098567 2 0.4690 0.8207 0.100 0.900
#> SRR1098712 2 1.0000 0.0975 0.496 0.504
#> SRR1455038 1 0.0938 0.8348 0.988 0.012
#> SRR1375248 2 0.0672 0.7979 0.008 0.992
#> SRR1403005 2 0.6623 0.8058 0.172 0.828
#> SRR1348378 2 0.6712 0.7925 0.176 0.824
#> SRR1413541 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.1633 0.8363 0.976 0.024
#> SRR1475192 2 0.4161 0.8298 0.084 0.916
#> SRR1432085 2 0.3274 0.8241 0.060 0.940
#> SRR1452468 1 0.9552 0.4157 0.624 0.376
#> SRR1347060 2 0.3733 0.8268 0.072 0.928
#> SRR1414139 2 0.2948 0.8226 0.052 0.948
#> SRR1447962 2 0.2043 0.8089 0.032 0.968
#> SRR1444324 2 0.0938 0.7979 0.012 0.988
#> SRR1415004 1 0.1184 0.8351 0.984 0.016
#> SRR1413436 1 0.7674 0.7099 0.776 0.224
#> SRR1311266 1 0.9833 0.2395 0.576 0.424
#> SRR1343302 1 0.2948 0.8317 0.948 0.052
#> SRR1373746 1 0.0376 0.8324 0.996 0.004
#> SRR1429678 1 0.1184 0.8358 0.984 0.016
#> SRR1469413 2 0.3584 0.8249 0.068 0.932
#> SRR1405331 1 0.7056 0.7420 0.808 0.192
#> SRR1345609 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1380208 1 0.8661 0.6085 0.712 0.288
#> SRR1322840 1 0.0000 0.8307 1.000 0.000
#> SRR1399797 2 0.4939 0.8284 0.108 0.892
#> SRR1416654 2 0.6247 0.8152 0.156 0.844
#> SRR1315081 2 0.3431 0.8248 0.064 0.936
#> SRR1369196 2 0.3431 0.8247 0.064 0.936
#> SRR1400847 1 0.1633 0.8362 0.976 0.024
#> SRR1365291 2 0.9998 0.1048 0.492 0.508
#> SRR1367920 1 0.2423 0.8336 0.960 0.040
#> SRR1366648 2 0.3584 0.8255 0.068 0.932
#> SRR1441679 2 0.3274 0.8086 0.060 0.940
#> SRR1082173 2 0.7950 0.7510 0.240 0.760
#> SRR1363968 1 0.6438 0.7738 0.836 0.164
#> SRR814387 1 0.0376 0.8324 0.996 0.004
#> SRR657599 1 0.9993 0.0131 0.516 0.484
#> SRR1386689 1 0.5294 0.8069 0.880 0.120
#> SRR1395575 2 0.5408 0.8282 0.124 0.876
#> SRR1453811 2 0.8499 0.7050 0.276 0.724
#> SRR1441159 1 0.0938 0.8352 0.988 0.012
#> SRR1403154 1 0.2948 0.8317 0.948 0.052
#> SRR1468722 2 0.3733 0.8265 0.072 0.928
#> SRR1310275 2 0.9998 0.1048 0.492 0.508
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 3 0.7174 0.1501 0.460 0.024 0.516
#> SRR1331708 1 0.6451 0.6665 0.684 0.292 0.024
#> SRR1464258 1 0.5147 0.7249 0.800 0.020 0.180
#> SRR1454201 1 0.5944 0.7623 0.792 0.088 0.120
#> SRR661589 3 0.3983 0.6181 0.144 0.004 0.852
#> SRR1456229 1 0.1585 0.8172 0.964 0.028 0.008
#> SRR1315165 1 0.7862 0.6697 0.668 0.148 0.184
#> SRR1488960 1 0.0592 0.8147 0.988 0.012 0.000
#> SRR1417809 1 0.3607 0.8057 0.880 0.112 0.008
#> SRR1094457 1 0.4357 0.8094 0.868 0.080 0.052
#> SRR1095575 3 0.7919 0.1388 0.464 0.056 0.480
#> SRR1315931 1 0.5092 0.7294 0.804 0.020 0.176
#> SRR1430066 3 0.0661 0.6049 0.008 0.004 0.988
#> SRR1431037 3 0.1399 0.6182 0.028 0.004 0.968
#> SRR1395554 3 0.0829 0.6093 0.012 0.004 0.984
#> SRR818002 2 0.8228 0.5813 0.084 0.552 0.364
#> SRR1344143 2 0.3459 0.5520 0.012 0.892 0.096
#> SRR1486845 1 0.3619 0.7971 0.864 0.136 0.000
#> SRR1362866 1 0.5966 0.7676 0.792 0.104 0.104
#> SRR1490740 1 0.0848 0.8162 0.984 0.008 0.008
#> SRR1446627 2 0.5810 0.6355 0.000 0.664 0.336
#> SRR1456138 2 0.5526 0.6111 0.036 0.792 0.172
#> SRR1416248 1 0.0747 0.8154 0.984 0.016 0.000
#> SRR1383907 1 0.8399 0.5872 0.608 0.256 0.136
#> SRR1311018 1 0.0424 0.8135 0.992 0.008 0.000
#> SRR1375699 2 0.9191 -0.0481 0.420 0.432 0.148
#> SRR1429846 3 0.5884 0.5272 0.272 0.012 0.716
#> SRR613550 3 0.3500 0.6285 0.116 0.004 0.880
#> SRR1348402 1 0.1482 0.8180 0.968 0.020 0.012
#> SRR1345146 1 0.7084 0.5884 0.628 0.336 0.036
#> SRR1324025 3 0.6341 0.4871 0.312 0.016 0.672
#> SRR1318879 3 0.6677 0.5588 0.180 0.080 0.740
#> SRR820755 1 0.6796 0.4363 0.632 0.024 0.344
#> SRR1485830 1 0.2959 0.8053 0.900 0.100 0.000
#> SRR599313 1 0.4786 0.7969 0.844 0.112 0.044
#> SRR612263 1 0.2804 0.8157 0.924 0.060 0.016
#> SRR1415398 3 0.2772 0.6319 0.080 0.004 0.916
#> SRR1326205 1 0.4636 0.8069 0.852 0.104 0.044
#> SRR1421327 1 0.5493 0.7447 0.756 0.232 0.012
#> SRR1083311 3 0.1877 0.6033 0.012 0.032 0.956
#> SRR1499303 1 0.5944 0.7821 0.792 0.120 0.088
#> SRR1079522 1 0.3987 0.8004 0.872 0.108 0.020
#> SRR1452935 3 0.8137 0.4211 0.252 0.120 0.628
#> SRR1379495 1 0.1482 0.8175 0.968 0.012 0.020
#> SRR1470459 3 0.6045 -0.1298 0.000 0.380 0.620
#> SRR661361 3 0.3445 0.6294 0.088 0.016 0.896
#> SRR615778 1 0.8298 0.5660 0.628 0.152 0.220
#> SRR1447564 1 0.0237 0.8139 0.996 0.004 0.000
#> SRR1455195 1 0.5722 0.7708 0.804 0.084 0.112
#> SRR655182 1 0.2947 0.8123 0.920 0.020 0.060
#> SRR1335140 2 0.6701 -0.0659 0.412 0.576 0.012
#> SRR1433555 3 0.2414 0.6045 0.020 0.040 0.940
#> SRR1308650 3 0.9479 -0.1245 0.192 0.348 0.460
#> SRR1388354 1 0.1781 0.8176 0.960 0.020 0.020
#> SRR1317446 3 0.0237 0.5977 0.000 0.004 0.996
#> SRR1413602 3 0.3039 0.6173 0.044 0.036 0.920
#> SRR1479955 2 0.4270 0.5783 0.024 0.860 0.116
#> SRR809853 1 0.1832 0.8176 0.956 0.036 0.008
#> SRR661313 3 0.3112 0.6316 0.096 0.004 0.900
#> SRR1499935 1 0.5944 0.7821 0.792 0.120 0.088
#> SRR1447303 3 0.6262 0.5119 0.284 0.020 0.696
#> SRR1429408 3 0.9120 0.2764 0.256 0.200 0.544
#> SRR1433950 1 0.0237 0.8139 0.996 0.004 0.000
#> SRR1362081 3 0.6305 -0.4171 0.000 0.484 0.516
#> SRR1409854 1 0.7442 0.4065 0.604 0.048 0.348
#> SRR1435229 1 0.9266 -0.1433 0.424 0.156 0.420
#> SRR1085996 1 0.0592 0.8140 0.988 0.012 0.000
#> SRR1414229 1 0.9131 0.2816 0.520 0.168 0.312
#> SRR1400974 3 0.0237 0.5977 0.000 0.004 0.996
#> SRR1399971 1 0.0424 0.8135 0.992 0.008 0.000
#> SRR613927 3 0.4663 0.6129 0.156 0.016 0.828
#> SRR1457854 1 0.1781 0.8176 0.960 0.020 0.020
#> SRR1473714 1 0.5393 0.7822 0.808 0.148 0.044
#> SRR813776 1 0.6796 0.4363 0.632 0.024 0.344
#> SRR808196 1 0.5631 0.7775 0.804 0.064 0.132
#> SRR1101085 1 0.3752 0.7933 0.856 0.144 0.000
#> SRR614395 1 0.5147 0.7249 0.800 0.020 0.180
#> SRR1478251 1 0.3038 0.8035 0.896 0.104 0.000
#> SRR1370551 3 0.6498 -0.1978 0.008 0.396 0.596
#> SRR1362310 1 0.1015 0.8161 0.980 0.012 0.008
#> SRR665310 3 0.3918 0.6185 0.140 0.004 0.856
#> SRR1420109 3 0.5849 0.5626 0.216 0.028 0.756
#> SRR1330920 1 0.5726 0.6799 0.760 0.024 0.216
#> SRR1419539 3 0.2173 0.5761 0.008 0.048 0.944
#> SRR1359447 2 0.6307 0.4476 0.000 0.512 0.488
#> SRR1347259 1 0.4351 0.7892 0.828 0.168 0.004
#> SRR613915 3 0.4589 0.6054 0.172 0.008 0.820
#> SRR1384395 3 0.1289 0.5843 0.000 0.032 0.968
#> SRR821715 3 0.3030 0.6315 0.092 0.004 0.904
#> SRR1478228 1 0.0661 0.8157 0.988 0.008 0.004
#> SRR1445637 1 0.4139 0.7832 0.860 0.016 0.124
#> SRR608150 1 0.7082 0.6947 0.724 0.156 0.120
#> SRR1096383 3 0.7043 0.2013 0.448 0.020 0.532
#> SRR1341480 1 0.4235 0.7793 0.824 0.176 0.000
#> SRR1341344 1 0.1529 0.8165 0.960 0.040 0.000
#> SRR1326270 3 0.2200 0.6291 0.056 0.004 0.940
#> SRR1498838 3 0.1267 0.6165 0.024 0.004 0.972
#> SRR1416313 3 0.1878 0.6254 0.044 0.004 0.952
#> SRR808566 1 0.9484 0.2882 0.496 0.264 0.240
#> SRR1430270 1 0.3038 0.8035 0.896 0.104 0.000
#> SRR1367825 3 0.0237 0.5977 0.000 0.004 0.996
#> SRR613533 3 0.8544 0.2839 0.152 0.248 0.600
#> SRR661267 3 0.7152 0.2053 0.444 0.024 0.532
#> SRR810665 2 0.6688 0.6067 0.012 0.580 0.408
#> SRR1407250 1 0.7944 0.5969 0.656 0.132 0.212
#> SRR1420067 1 0.6255 0.6982 0.748 0.048 0.204
#> SRR1473632 1 0.1832 0.8176 0.956 0.036 0.008
#> SRR812536 3 0.2681 0.6168 0.040 0.028 0.932
#> SRR1370850 2 0.7945 0.5828 0.064 0.548 0.388
#> SRR1486195 3 0.6291 -0.3906 0.000 0.468 0.532
#> SRR1407671 3 0.9481 0.1610 0.384 0.184 0.432
#> SRR1446375 3 0.8643 0.3146 0.376 0.108 0.516
#> SRR1465230 1 0.3850 0.8105 0.884 0.088 0.028
#> SRR614119 1 0.7181 0.0347 0.508 0.024 0.468
#> SRR1356101 3 0.4504 0.3703 0.000 0.196 0.804
#> SRR1404209 1 0.6026 0.6570 0.732 0.024 0.244
#> SRR1392676 2 0.5591 0.6389 0.000 0.696 0.304
#> SRR665538 3 0.7036 0.2105 0.444 0.020 0.536
#> SRR660510 3 0.1585 0.6175 0.028 0.008 0.964
#> SRR1445655 1 0.3965 0.8026 0.860 0.132 0.008
#> SRR658953 1 0.8331 0.2211 0.484 0.436 0.080
#> SRR2166459 1 0.4342 0.7857 0.856 0.024 0.120
#> SRR1070713 2 0.9931 0.2233 0.300 0.392 0.308
#> SRR1485312 3 0.0661 0.6049 0.008 0.004 0.988
#> SRR1317631 3 0.7192 0.2910 0.412 0.028 0.560
#> SRR1488610 1 0.2173 0.8183 0.944 0.048 0.008
#> SRR1330588 3 0.7029 0.2563 0.440 0.020 0.540
#> SRR1316367 1 0.5047 0.7862 0.824 0.140 0.036
#> SRR1433926 1 0.0829 0.8151 0.984 0.012 0.004
#> SRR1091302 1 0.4485 0.8015 0.844 0.136 0.020
#> SRR818263 1 0.6625 0.5056 0.660 0.024 0.316
#> SRR1404909 1 0.6155 0.6394 0.664 0.328 0.008
#> SRR663076 1 0.4810 0.7686 0.832 0.028 0.140
#> SRR1323577 2 0.8295 0.5620 0.084 0.532 0.384
#> SRR1442422 1 0.3850 0.8105 0.884 0.088 0.028
#> SRR1465893 1 0.1015 0.8170 0.980 0.012 0.008
#> SRR654862 1 0.5047 0.7720 0.824 0.036 0.140
#> SRR1407112 1 0.5036 0.7870 0.832 0.048 0.120
#> SRR1332969 3 0.3983 0.6181 0.144 0.004 0.852
#> SRR1353199 3 0.3112 0.6316 0.096 0.004 0.900
#> SRR1378885 3 0.6587 0.4428 0.352 0.016 0.632
#> SRR665357 3 0.4059 0.5189 0.012 0.128 0.860
#> SRR662186 2 0.6307 0.4463 0.000 0.512 0.488
#> SRR1501020 3 0.4749 0.5976 0.172 0.012 0.816
#> SRR1347819 3 0.1129 0.6142 0.020 0.004 0.976
#> SRR1480813 2 0.7378 0.5871 0.036 0.560 0.404
#> SRR1472576 1 0.9099 0.4365 0.544 0.264 0.192
#> SRR1431781 1 0.7862 0.6697 0.668 0.148 0.184
#> SRR1452270 3 0.1482 0.6097 0.012 0.020 0.968
#> SRR1500472 3 0.8700 0.3432 0.344 0.120 0.536
#> SRR1417632 2 0.6819 -0.2761 0.476 0.512 0.012
#> SRR1350153 2 0.6280 0.5180 0.000 0.540 0.460
#> SRR1458113 1 0.9243 0.1740 0.492 0.168 0.340
#> SRR1326579 1 0.4995 0.7944 0.840 0.092 0.068
#> SRR1349363 2 0.7901 0.0105 0.400 0.540 0.060
#> SRR1096712 3 0.1919 0.6129 0.020 0.024 0.956
#> SRR1090407 3 0.2955 0.6319 0.080 0.008 0.912
#> SRR1083752 3 0.8414 -0.2021 0.092 0.380 0.528
#> SRR1377599 1 0.4887 0.7484 0.772 0.228 0.000
#> SRR1488449 3 0.3500 0.6279 0.116 0.004 0.880
#> SRR1318354 3 0.8452 0.2648 0.140 0.256 0.604
#> SRR1359062 3 0.1170 0.6020 0.008 0.016 0.976
#> SRR1398924 1 0.8010 0.3646 0.548 0.384 0.068
#> SRR663783 3 0.0983 0.5998 0.004 0.016 0.980
#> SRR1319204 3 0.7388 0.0114 0.044 0.356 0.600
#> SRR1369070 2 0.5285 0.6344 0.004 0.752 0.244
#> SRR615659 1 0.0829 0.8151 0.984 0.012 0.004
#> SRR1337449 2 0.6962 0.5984 0.020 0.568 0.412
#> SRR1316982 3 0.4605 0.3776 0.000 0.204 0.796
#> SRR1498595 2 0.6804 -0.2327 0.460 0.528 0.012
#> SRR1377423 3 0.4679 0.6040 0.148 0.020 0.832
#> SRR1312310 2 0.6280 0.5202 0.000 0.540 0.460
#> SRR1485613 1 0.4897 0.7455 0.812 0.016 0.172
#> SRR1338426 3 0.4902 0.6073 0.092 0.064 0.844
#> SRR1353309 3 0.4818 0.6135 0.108 0.048 0.844
#> SRR658941 3 0.7130 0.2415 0.432 0.024 0.544
#> SRR1101643 1 0.1525 0.8195 0.964 0.032 0.004
#> SRR1401468 3 0.7174 0.1501 0.460 0.024 0.516
#> SRR1368874 2 0.6126 0.5953 0.000 0.600 0.400
#> SRR1324085 1 0.9760 0.0273 0.420 0.236 0.344
#> SRR1363858 1 0.5285 0.7833 0.812 0.148 0.040
#> SRR819820 3 0.5842 0.5717 0.196 0.036 0.768
#> SRR1337342 1 0.7222 0.6487 0.696 0.084 0.220
#> SRR655206 3 0.2173 0.5761 0.008 0.048 0.944
#> SRR1387013 2 0.9019 0.4204 0.224 0.560 0.216
#> SRR1317410 1 0.0829 0.8163 0.984 0.012 0.004
#> SRR608198 1 0.4995 0.7942 0.840 0.092 0.068
#> SRR1440161 2 0.6280 0.5180 0.000 0.540 0.460
#> SRR1343741 2 0.5285 0.6344 0.004 0.752 0.244
#> SRR1381288 2 0.5810 0.6355 0.000 0.664 0.336
#> SRR1415379 1 0.3112 0.8068 0.900 0.096 0.004
#> SRR1099622 3 0.6307 0.0625 0.012 0.328 0.660
#> SRR663197 3 0.2152 0.6203 0.036 0.016 0.948
#> SRR1394836 3 0.2173 0.5761 0.008 0.048 0.944
#> SRR661699 3 0.3207 0.6298 0.084 0.012 0.904
#> SRR813680 3 0.7159 0.1930 0.448 0.024 0.528
#> SRR1410678 1 0.1015 0.8161 0.980 0.012 0.008
#> SRR1378109 1 0.4269 0.8104 0.872 0.076 0.052
#> SRR1499174 1 0.4280 0.7847 0.856 0.020 0.124
#> SRR1311486 2 0.6962 0.5984 0.020 0.568 0.412
#> SRR1382851 2 0.9593 0.1158 0.380 0.420 0.200
#> SRR1433410 1 0.6882 0.7118 0.732 0.172 0.096
#> SRR661167 3 0.1964 0.6282 0.056 0.000 0.944
#> SRR1432518 3 0.8137 0.4211 0.252 0.120 0.628
#> SRR660462 3 0.0475 0.6020 0.004 0.004 0.992
#> SRR1374608 3 0.8549 0.2996 0.384 0.100 0.516
#> SRR657949 3 0.4861 0.5939 0.192 0.008 0.800
#> SRR1308882 1 0.3551 0.7955 0.868 0.132 0.000
#> SRR655768 1 0.7480 0.0373 0.508 0.036 0.456
#> SRR1485870 1 0.7084 0.5884 0.628 0.336 0.036
#> SRR1444138 1 0.7755 -0.0199 0.492 0.048 0.460
#> SRR1417342 1 0.6124 0.7423 0.744 0.220 0.036
#> SRR1470193 1 0.4636 0.8069 0.852 0.104 0.044
#> SRR1091380 3 0.5842 0.5717 0.196 0.036 0.768
#> SRR1099096 1 0.1015 0.8170 0.980 0.012 0.008
#> SRR1313583 1 0.2959 0.8053 0.900 0.100 0.000
#> SRR1467102 3 0.1529 0.5796 0.000 0.040 0.960
#> SRR1485416 1 0.4235 0.7793 0.824 0.176 0.000
#> SRR818821 3 0.8544 0.2839 0.152 0.248 0.600
#> SRR809963 1 0.5147 0.7249 0.800 0.020 0.180
#> SRR1072247 1 0.1482 0.8175 0.968 0.012 0.020
#> SRR1353710 1 0.3644 0.8033 0.872 0.124 0.004
#> SRR1445259 3 0.8703 0.2576 0.160 0.256 0.584
#> SRR1408393 3 0.6629 0.4351 0.360 0.016 0.624
#> SRR1361522 1 0.0829 0.8151 0.984 0.012 0.004
#> SRR1368597 1 0.2636 0.8174 0.932 0.020 0.048
#> SRR1309680 2 0.7851 0.6250 0.080 0.616 0.304
#> SRR1310542 3 0.0661 0.6008 0.004 0.008 0.988
#> SRR1333485 1 0.3619 0.7955 0.864 0.136 0.000
#> SRR1406437 3 0.8625 0.3620 0.252 0.156 0.592
#> SRR1354931 3 0.2096 0.6281 0.052 0.004 0.944
#> SRR1391856 3 0.5285 0.4717 0.040 0.148 0.812
#> SRR1446738 3 0.9883 -0.1583 0.264 0.344 0.392
#> SRR1309032 3 0.6062 -0.1458 0.000 0.384 0.616
#> SRR1388145 2 0.6675 0.6075 0.012 0.584 0.404
#> SRR1432611 3 0.6309 -0.4494 0.000 0.496 0.504
#> SRR815869 3 0.0424 0.5962 0.000 0.008 0.992
#> SRR613150 3 0.0848 0.6045 0.008 0.008 0.984
#> SRR1375329 1 0.9367 -0.1180 0.428 0.168 0.404
#> SRR1387921 1 0.0592 0.8142 0.988 0.012 0.000
#> SRR1466792 3 0.6307 -0.4278 0.000 0.488 0.512
#> SRR1360478 2 0.6280 0.5180 0.000 0.540 0.460
#> SRR1360695 1 0.6108 0.6624 0.732 0.028 0.240
#> SRR812943 1 0.2902 0.8145 0.920 0.064 0.016
#> SRR1400910 2 0.9145 0.4336 0.240 0.544 0.216
#> SRR1444203 1 0.4443 0.8106 0.864 0.084 0.052
#> SRR816177 2 0.8350 0.5589 0.088 0.532 0.380
#> SRR658754 3 0.1170 0.6125 0.016 0.008 0.976
#> SRR1429603 1 0.4351 0.7892 0.828 0.168 0.004
#> SRR1397366 3 0.3425 0.6287 0.112 0.004 0.884
#> SRR1446028 1 0.1182 0.8172 0.976 0.012 0.012
#> SRR1083918 2 0.9975 0.1886 0.332 0.364 0.304
#> SRR1337606 1 0.7266 0.6741 0.688 0.232 0.080
#> SRR659109 3 0.0983 0.6116 0.016 0.004 0.980
#> SRR1337192 1 0.1529 0.8165 0.960 0.040 0.000
#> SRR656946 3 0.7841 0.1269 0.468 0.052 0.480
#> SRR1476102 1 0.0592 0.8147 0.988 0.012 0.000
#> SRR1476447 1 0.1289 0.8162 0.968 0.032 0.000
#> SRR1342067 1 0.3752 0.7933 0.856 0.144 0.000
#> SRR1385389 1 0.3193 0.8055 0.896 0.100 0.004
#> SRR1075971 1 0.1950 0.8160 0.952 0.040 0.008
#> SRR614419 1 0.4485 0.7920 0.844 0.136 0.020
#> SRR1322936 1 0.7169 0.6901 0.704 0.208 0.088
#> SRR1349121 1 0.7059 0.0881 0.520 0.020 0.460
#> SRR1430549 1 0.0424 0.8146 0.992 0.008 0.000
#> SRR612935 3 0.8221 0.3035 0.128 0.248 0.624
#> SRR661481 2 0.7156 0.5940 0.028 0.572 0.400
#> SRR1354117 2 0.6305 0.4520 0.000 0.516 0.484
#> SRR1393596 1 0.4861 0.7820 0.808 0.180 0.012
#> SRR1452164 1 0.3845 0.7901 0.872 0.012 0.116
#> SRR1070503 1 0.6879 0.3959 0.616 0.024 0.360
#> SRR1499894 3 0.1267 0.6157 0.024 0.004 0.972
#> SRR1082883 1 0.7147 0.6901 0.720 0.156 0.124
#> SRR1468271 1 0.6126 0.6133 0.712 0.020 0.268
#> SRR1332443 1 0.0592 0.8147 0.988 0.012 0.000
#> SRR810295 2 0.6280 0.5202 0.000 0.540 0.460
#> SRR662103 1 0.0829 0.8151 0.984 0.012 0.004
#> SRR1328620 3 0.8452 0.2648 0.140 0.256 0.604
#> SRR1396294 3 0.7192 0.2910 0.412 0.028 0.560
#> SRR1419917 1 0.0829 0.8151 0.984 0.012 0.004
#> SRR662114 3 0.5138 0.6004 0.120 0.052 0.828
#> SRR1489199 1 0.7758 -0.0407 0.484 0.048 0.468
#> SRR813584 3 0.9120 0.2764 0.256 0.200 0.544
#> SRR1069638 1 0.6981 0.6317 0.704 0.068 0.228
#> SRR614864 3 0.3359 0.6323 0.084 0.016 0.900
#> SRR1433392 1 0.5860 0.6638 0.748 0.024 0.228
#> SRR1377777 2 0.4618 0.5913 0.024 0.840 0.136
#> SRR2167710 3 0.7841 0.1269 0.468 0.052 0.480
#> SRR1401252 1 0.4178 0.7856 0.828 0.172 0.000
#> SRR1309963 1 0.4556 0.8062 0.860 0.060 0.080
#> SRR1338031 1 0.1015 0.8177 0.980 0.008 0.012
#> SRR1418628 2 0.6280 0.5202 0.000 0.540 0.460
#> SRR1486889 1 0.6066 0.6518 0.728 0.024 0.248
#> SRR1380393 1 0.1781 0.8176 0.960 0.020 0.020
#> SRR1319731 1 0.0829 0.8161 0.984 0.012 0.004
#> SRR1356468 1 0.6625 0.7385 0.744 0.080 0.176
#> SRR1337010 2 0.6398 0.6170 0.008 0.620 0.372
#> SRR1486520 1 0.4206 0.8042 0.872 0.040 0.088
#> SRR1486538 1 0.3038 0.8041 0.896 0.104 0.000
#> SRR1340486 1 0.5036 0.7870 0.832 0.048 0.120
#> SRR1377696 2 0.6819 -0.2761 0.476 0.512 0.012
#> SRR1465459 1 0.6985 0.3223 0.592 0.024 0.384
#> SRR1080270 3 0.0848 0.6042 0.008 0.008 0.984
#> SRR1312501 3 0.6449 0.5578 0.204 0.056 0.740
#> SRR1093148 3 0.8421 0.3513 0.300 0.116 0.584
#> SRR1467080 3 0.0237 0.5977 0.000 0.004 0.996
#> SRR1410866 2 0.6267 0.5271 0.000 0.548 0.452
#> SRR816475 1 0.9760 0.0273 0.420 0.236 0.344
#> SRR1379198 1 0.3038 0.8035 0.896 0.104 0.000
#> SRR613342 3 0.5585 0.5795 0.096 0.092 0.812
#> SRR1452246 2 0.6276 0.6266 0.040 0.736 0.224
#> SRR1338836 2 0.5988 0.6210 0.000 0.632 0.368
#> SRR1369129 1 0.3038 0.8035 0.896 0.104 0.000
#> SRR1396616 3 0.3826 0.6239 0.124 0.008 0.868
#> SRR813824 3 0.1711 0.6200 0.032 0.008 0.960
#> SRR1082376 1 0.4206 0.7997 0.872 0.040 0.088
#> SRR1500891 1 0.3551 0.7970 0.868 0.132 0.000
#> SRR807543 1 0.5772 0.6745 0.756 0.024 0.220
#> SRR1091572 1 0.7651 0.5940 0.672 0.108 0.220
#> SRR1346689 1 0.3573 0.8018 0.876 0.120 0.004
#> SRR1332424 1 0.6882 0.7118 0.732 0.172 0.096
#> SRR663729 1 0.4235 0.7793 0.824 0.176 0.000
#> SRR1097013 1 0.4342 0.7857 0.856 0.024 0.120
#> SRR613675 1 0.7169 0.6901 0.704 0.208 0.088
#> SRR1485357 1 0.5136 0.7784 0.824 0.044 0.132
#> SRR655816 3 0.3031 0.6299 0.076 0.012 0.912
#> SRR1500113 1 0.3370 0.8102 0.904 0.024 0.072
#> SRR1437622 1 0.9496 0.2667 0.492 0.276 0.232
#> SRR1355172 3 0.7036 0.2151 0.444 0.020 0.536
#> SRR655531 1 0.4925 0.7970 0.844 0.076 0.080
#> SRR1338147 3 0.4692 0.6061 0.168 0.012 0.820
#> SRR1413329 3 0.7582 0.3895 0.380 0.048 0.572
#> SRR1485931 2 0.3459 0.5520 0.012 0.892 0.096
#> SRR1420873 1 0.4411 0.7741 0.844 0.016 0.140
#> SRR1333308 1 0.4261 0.7981 0.848 0.140 0.012
#> SRR1452033 1 0.4663 0.7609 0.828 0.016 0.156
#> SRR1467316 2 0.4270 0.5786 0.024 0.860 0.116
#> SRR809018 3 0.0237 0.5977 0.000 0.004 0.996
#> SRR1375351 2 0.6280 0.5202 0.000 0.540 0.460
#> SRR663440 3 0.6062 0.5213 0.276 0.016 0.708
#> SRR1471755 2 0.7366 0.5883 0.036 0.564 0.400
#> SRR808019 3 0.7138 0.2308 0.436 0.024 0.540
#> SRR1479133 3 0.2955 0.6330 0.080 0.008 0.912
#> SRR615069 3 0.8487 0.3602 0.292 0.124 0.584
#> SRR1456185 3 0.9574 -0.2538 0.196 0.392 0.412
#> SRR1350069 3 0.7192 0.2910 0.412 0.028 0.560
#> SRR816316 1 0.5092 0.7294 0.804 0.020 0.176
#> SRR664795 3 0.7159 0.1930 0.448 0.024 0.528
#> SRR1490721 1 0.5493 0.7447 0.756 0.232 0.012
#> SRR810643 1 0.0592 0.8150 0.988 0.012 0.000
#> SRR1430333 1 0.9167 0.2618 0.512 0.168 0.320
#> SRR1085285 3 0.2955 0.6330 0.080 0.008 0.912
#> SRR1099072 3 0.3918 0.6185 0.140 0.004 0.856
#> SRR1317985 1 0.1315 0.8191 0.972 0.008 0.020
#> SRR1487340 1 0.1315 0.8172 0.972 0.020 0.008
#> SRR1420276 3 0.1289 0.5843 0.000 0.032 0.968
#> SRR1351347 3 0.4964 0.6088 0.116 0.048 0.836
#> SRR1405525 1 0.2280 0.8177 0.940 0.052 0.008
#> SRR1370329 1 0.0424 0.8135 0.992 0.008 0.000
#> SRR1465001 1 0.0829 0.8161 0.984 0.012 0.004
#> SRR1476525 2 0.6701 0.6000 0.012 0.576 0.412
#> SRR819610 3 0.9574 -0.2538 0.196 0.392 0.412
#> SRR2157314 1 0.1774 0.8183 0.960 0.024 0.016
#> SRR1409465 2 0.5988 0.6210 0.000 0.632 0.368
#> SRR809987 1 0.3193 0.8065 0.896 0.100 0.004
#> SRR613639 3 0.4897 0.6038 0.172 0.016 0.812
#> SRR1402285 1 0.3528 0.8096 0.892 0.092 0.016
#> SRR1077038 1 0.5200 0.7204 0.796 0.020 0.184
#> SRR1405660 3 0.1482 0.6097 0.012 0.020 0.968
#> SRR1095455 3 0.8733 0.2463 0.160 0.260 0.580
#> SRR1394734 2 0.9975 0.1886 0.332 0.364 0.304
#> SRR1317771 1 0.6026 0.6570 0.732 0.024 0.244
#> SRR1365894 1 0.6473 0.6287 0.652 0.332 0.016
#> SRR1073581 1 0.7059 0.0881 0.520 0.020 0.460
#> SRR659804 1 0.1774 0.8183 0.960 0.024 0.016
#> SRR1345914 2 0.7980 0.5733 0.064 0.536 0.400
#> SRR1432186 2 0.7424 0.6275 0.044 0.592 0.364
#> SRR1473529 2 0.6804 -0.2327 0.460 0.528 0.012
#> SRR660764 3 0.7064 0.3838 0.076 0.220 0.704
#> SRR820448 1 0.5147 0.7249 0.800 0.020 0.180
#> SRR1328845 3 0.7192 0.2910 0.412 0.028 0.560
#> SRR1336415 1 0.3528 0.8096 0.892 0.092 0.016
#> SRR1379065 1 0.3551 0.7984 0.868 0.132 0.000
#> SRR1459190 3 0.6566 0.4463 0.348 0.016 0.636
#> SRR1346773 1 0.0592 0.8150 0.988 0.012 0.000
#> SRR1499521 3 0.7152 0.2051 0.444 0.024 0.532
#> SRR1440898 2 0.6881 0.6199 0.020 0.592 0.388
#> SRR1347459 3 0.4399 0.6140 0.092 0.044 0.864
#> SRR1081209 2 0.5061 0.6216 0.008 0.784 0.208
#> SRR1400202 1 0.0424 0.8135 0.992 0.008 0.000
#> SRR1333395 1 0.7379 0.5584 0.616 0.336 0.048
#> SRR1309248 1 0.6629 0.5810 0.624 0.360 0.016
#> SRR809161 3 0.3112 0.6319 0.096 0.004 0.900
#> SRR1316320 1 0.6597 0.6548 0.664 0.312 0.024
#> SRR1432629 2 0.7340 0.6202 0.076 0.676 0.248
#> SRR1498931 1 0.1015 0.8170 0.980 0.008 0.012
#> SRR1416578 1 0.3112 0.8068 0.900 0.096 0.004
#> SRR1405547 3 0.0237 0.5977 0.000 0.004 0.996
#> SRR1470534 1 0.3038 0.8035 0.896 0.104 0.000
#> SRR1380764 1 0.2599 0.8191 0.932 0.016 0.052
#> SRR1309160 3 0.1711 0.6216 0.032 0.008 0.960
#> SRR663489 3 0.0237 0.5977 0.000 0.004 0.996
#> SRR1500450 1 0.5631 0.7487 0.792 0.044 0.164
#> SRR1078489 3 0.9336 0.1493 0.412 0.164 0.424
#> SRR1332648 1 0.3670 0.8097 0.888 0.092 0.020
#> SRR660614 3 0.7388 0.0114 0.044 0.356 0.600
#> SRR1470420 3 0.6045 -0.1298 0.000 0.380 0.620
#> SRR1475566 1 0.0424 0.8135 0.992 0.008 0.000
#> SRR1477949 1 0.0592 0.8147 0.988 0.012 0.000
#> SRR1481419 2 0.7459 0.6237 0.044 0.584 0.372
#> SRR1464766 1 0.1919 0.8189 0.956 0.020 0.024
#> SRR615946 3 0.1878 0.6254 0.044 0.004 0.952
#> SRR1446481 2 0.6962 0.5984 0.020 0.568 0.412
#> SRR1467656 2 0.6008 0.6185 0.000 0.628 0.372
#> SRR1402962 1 0.5722 0.7708 0.804 0.084 0.112
#> SRR660224 2 0.6962 0.5922 0.020 0.568 0.412
#> SRR665586 1 0.0983 0.8161 0.980 0.016 0.004
#> SRR1347166 1 0.8298 0.5660 0.628 0.152 0.220
#> SRR1485722 1 0.7944 0.5969 0.656 0.132 0.212
#> SRR1415316 1 0.0424 0.8145 0.992 0.008 0.000
#> SRR613390 1 0.0892 0.8149 0.980 0.020 0.000
#> SRR661108 3 0.1170 0.6125 0.016 0.008 0.976
#> SRR2170173 3 0.7919 0.1388 0.464 0.056 0.480
#> SRR817329 1 0.2297 0.8178 0.944 0.020 0.036
#> SRR1401990 1 0.6416 0.6260 0.708 0.032 0.260
#> SRR1467745 1 0.9880 -0.1089 0.384 0.260 0.356
#> SRR1471795 2 0.8228 0.5813 0.084 0.552 0.364
#> SRR1415637 2 0.5591 0.6389 0.000 0.696 0.304
#> SRR813137 1 0.3690 0.7991 0.884 0.016 0.100
#> SRR1314873 1 0.0424 0.8135 0.992 0.008 0.000
#> SRR1401211 1 0.6108 0.6624 0.732 0.028 0.240
#> SRR1419692 1 0.4253 0.8101 0.872 0.080 0.048
#> SRR818797 3 0.5928 0.5070 0.296 0.008 0.696
#> SRR2164608 3 0.5239 0.5961 0.160 0.032 0.808
#> SRR1455586 3 0.4291 0.4039 0.000 0.180 0.820
#> SRR819459 3 0.0848 0.6045 0.008 0.008 0.984
#> SRR1488939 2 0.4270 0.5786 0.024 0.860 0.116
#> SRR1433232 2 0.5008 0.6161 0.016 0.804 0.180
#> SRR1385501 1 0.5277 0.7234 0.796 0.024 0.180
#> SRR1361652 1 0.8179 0.2675 0.504 0.424 0.072
#> SRR1437119 1 0.0424 0.8135 0.992 0.008 0.000
#> SRR1478547 3 0.0237 0.5977 0.000 0.004 0.996
#> SRR1430910 3 0.9172 0.2187 0.396 0.148 0.456
#> SRR1310584 1 0.0592 0.8142 0.988 0.012 0.000
#> SRR1500216 1 0.4786 0.7969 0.844 0.112 0.044
#> SRR1486762 3 0.5253 0.5859 0.188 0.020 0.792
#> SRR1480854 1 0.4887 0.7484 0.772 0.228 0.000
#> SRR1489394 1 0.2959 0.8053 0.900 0.100 0.000
#> SRR1418085 1 0.3722 0.8108 0.888 0.088 0.024
#> SRR1340221 1 0.3038 0.8035 0.896 0.104 0.000
#> SRR1473058 1 0.9760 0.0273 0.420 0.236 0.344
#> SRR1405165 3 0.4712 0.6100 0.108 0.044 0.848
#> SRR1433004 1 0.1129 0.8167 0.976 0.020 0.004
#> SRR1471477 1 0.6226 0.6434 0.720 0.028 0.252
#> SRR1098567 3 0.7063 -0.4407 0.020 0.464 0.516
#> SRR1098712 3 0.7192 0.2910 0.412 0.028 0.560
#> SRR1455038 1 0.1711 0.8171 0.960 0.032 0.008
#> SRR1375248 3 0.4346 0.3954 0.000 0.184 0.816
#> SRR1403005 3 0.3193 0.6310 0.100 0.004 0.896
#> SRR1348378 3 0.8307 -0.2185 0.084 0.388 0.528
#> SRR1413541 1 0.0592 0.8140 0.988 0.012 0.000
#> SRR1392943 1 0.4634 0.7884 0.824 0.164 0.012
#> SRR1475192 3 0.1482 0.6138 0.020 0.012 0.968
#> SRR1432085 3 0.6062 0.1739 0.016 0.276 0.708
#> SRR1452468 1 0.9028 0.3511 0.540 0.168 0.292
#> SRR1347060 3 0.0475 0.6017 0.004 0.004 0.992
#> SRR1414139 3 0.5881 0.2378 0.016 0.256 0.728
#> SRR1447962 3 0.6180 0.0214 0.008 0.332 0.660
#> SRR1444324 3 0.6140 -0.1822 0.000 0.404 0.596
#> SRR1415004 1 0.1491 0.8175 0.968 0.016 0.016
#> SRR1413436 1 0.6026 0.6570 0.732 0.024 0.244
#> SRR1311266 1 0.8107 0.0867 0.508 0.068 0.424
#> SRR1343302 1 0.4357 0.8094 0.868 0.080 0.052
#> SRR1373746 1 0.0424 0.8146 0.992 0.008 0.000
#> SRR1429678 1 0.1491 0.8184 0.968 0.016 0.016
#> SRR1469413 3 0.6255 0.0864 0.016 0.300 0.684
#> SRR1405331 1 0.5726 0.6799 0.760 0.024 0.216
#> SRR1345609 1 0.0424 0.8135 0.992 0.008 0.000
#> SRR1380208 1 0.8790 0.4379 0.540 0.328 0.132
#> SRR1322840 1 0.3482 0.7985 0.872 0.128 0.000
#> SRR1399797 3 0.2152 0.6203 0.036 0.016 0.948
#> SRR1416654 3 0.3359 0.6323 0.084 0.016 0.900
#> SRR1315081 3 0.0747 0.5920 0.000 0.016 0.984
#> SRR1369196 3 0.0592 0.5954 0.000 0.012 0.988
#> SRR1400847 1 0.1919 0.8189 0.956 0.020 0.024
#> SRR1365291 3 0.7029 0.2563 0.440 0.020 0.540
#> SRR1367920 1 0.4887 0.7484 0.772 0.228 0.000
#> SRR1366648 3 0.0424 0.5962 0.000 0.008 0.992
#> SRR1441679 2 0.5988 0.6210 0.000 0.632 0.368
#> SRR1082173 3 0.5239 0.5961 0.160 0.032 0.808
#> SRR1363968 1 0.5728 0.7169 0.772 0.032 0.196
#> SRR814387 1 0.0592 0.8150 0.988 0.012 0.000
#> SRR657599 3 0.7130 0.2415 0.432 0.024 0.544
#> SRR1386689 1 0.5036 0.7870 0.832 0.048 0.120
#> SRR1395575 3 0.2384 0.6271 0.056 0.008 0.936
#> SRR1453811 3 0.5220 0.5792 0.208 0.012 0.780
#> SRR1441159 1 0.1647 0.8178 0.960 0.036 0.004
#> SRR1403154 1 0.4357 0.8094 0.868 0.080 0.052
#> SRR1468722 3 0.0475 0.6018 0.004 0.004 0.992
#> SRR1310275 3 0.7036 0.2456 0.444 0.020 0.536
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 3 0.7520 0.11872 0.384 0.024 0.488 0.104
#> SRR1331708 1 0.7369 -0.15599 0.492 0.148 0.004 0.356
#> SRR1464258 1 0.7997 -0.16690 0.432 0.028 0.144 0.396
#> SRR1454201 4 0.7618 0.36349 0.404 0.052 0.068 0.476
#> SRR661589 3 0.3993 0.65414 0.092 0.004 0.844 0.060
#> SRR1456229 1 0.5147 0.25595 0.536 0.004 0.000 0.460
#> SRR1315165 1 0.7825 -0.04381 0.616 0.108 0.128 0.148
#> SRR1488960 1 0.4543 0.45266 0.676 0.000 0.000 0.324
#> SRR1417809 1 0.1733 0.45386 0.948 0.024 0.000 0.028
#> SRR1094457 1 0.2010 0.43974 0.940 0.008 0.040 0.012
#> SRR1095575 3 0.8477 0.02732 0.316 0.040 0.444 0.200
#> SRR1315931 1 0.7965 -0.14860 0.436 0.028 0.140 0.396
#> SRR1430066 3 0.0967 0.64161 0.004 0.016 0.976 0.004
#> SRR1431037 3 0.1749 0.65255 0.024 0.012 0.952 0.012
#> SRR1395554 3 0.1484 0.64353 0.004 0.020 0.960 0.016
#> SRR818002 2 0.6988 0.71201 0.060 0.664 0.188 0.088
#> SRR1344143 2 0.4850 0.57550 0.052 0.776 0.004 0.168
#> SRR1486845 1 0.2670 0.42568 0.908 0.040 0.000 0.052
#> SRR1362866 1 0.7807 -0.32764 0.448 0.072 0.060 0.420
#> SRR1490740 1 0.4855 0.44352 0.644 0.000 0.004 0.352
#> SRR1446627 2 0.3401 0.73274 0.000 0.840 0.152 0.008
#> SRR1456138 2 0.3934 0.65292 0.036 0.860 0.028 0.076
#> SRR1416248 1 0.4836 0.44286 0.672 0.008 0.000 0.320
#> SRR1383907 1 0.8612 -0.22532 0.500 0.164 0.080 0.256
#> SRR1311018 1 0.4605 0.44498 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1375699 1 0.9187 -0.17620 0.404 0.280 0.088 0.228
#> SRR1429846 3 0.6077 0.54458 0.168 0.012 0.708 0.112
#> SRR613550 3 0.3313 0.66221 0.084 0.008 0.880 0.028
#> SRR1348402 1 0.5270 0.43300 0.660 0.008 0.012 0.320
#> SRR1345146 1 0.7313 0.01762 0.544 0.148 0.008 0.300
#> SRR1324025 3 0.6926 0.46896 0.188 0.024 0.648 0.140
#> SRR1318879 3 0.6643 0.58684 0.104 0.076 0.708 0.112
#> SRR820755 4 0.8618 0.35235 0.316 0.028 0.312 0.344
#> SRR1485830 1 0.1174 0.45852 0.968 0.012 0.000 0.020
#> SRR599313 1 0.6251 0.16831 0.564 0.052 0.004 0.380
#> SRR612263 1 0.5626 0.35925 0.588 0.020 0.004 0.388
#> SRR1415398 3 0.2467 0.66315 0.052 0.004 0.920 0.024
#> SRR1326205 1 0.2845 0.44258 0.912 0.028 0.032 0.028
#> SRR1421327 1 0.6352 0.05680 0.632 0.108 0.000 0.260
#> SRR1083311 3 0.1985 0.63733 0.004 0.040 0.940 0.016
#> SRR1499303 1 0.5932 0.27481 0.752 0.088 0.052 0.108
#> SRR1079522 1 0.6094 0.29920 0.608 0.052 0.004 0.336
#> SRR1452935 3 0.8109 0.44445 0.128 0.104 0.584 0.184
#> SRR1379495 1 0.5306 0.44029 0.664 0.004 0.020 0.312
#> SRR1470459 3 0.5696 -0.30399 0.000 0.480 0.496 0.024
#> SRR661361 3 0.3638 0.66320 0.044 0.024 0.876 0.056
#> SRR615778 4 0.9238 0.49019 0.324 0.124 0.156 0.396
#> SRR1447564 1 0.4500 0.46045 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1455195 4 0.7518 0.32719 0.420 0.052 0.060 0.468
#> SRR655182 1 0.5697 0.42800 0.656 0.000 0.052 0.292
#> SRR1335140 1 0.7932 -0.17438 0.392 0.364 0.004 0.240
#> SRR1433555 3 0.2467 0.63567 0.004 0.052 0.920 0.024
#> SRR1308650 2 0.9009 0.40869 0.136 0.440 0.304 0.120
#> SRR1388354 1 0.4933 0.46247 0.688 0.000 0.016 0.296
#> SRR1317446 3 0.1004 0.63376 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1413602 3 0.3178 0.64735 0.020 0.052 0.896 0.032
#> SRR1479955 2 0.4387 0.61131 0.048 0.824 0.012 0.116
#> SRR809853 1 0.4955 0.43716 0.648 0.008 0.000 0.344
#> SRR661313 3 0.2927 0.66313 0.068 0.008 0.900 0.024
#> SRR1499935 1 0.5932 0.27481 0.752 0.088 0.052 0.108
#> SRR1447303 3 0.6701 0.52755 0.144 0.024 0.672 0.160
#> SRR1429408 3 0.9349 0.03555 0.148 0.252 0.428 0.172
#> SRR1433950 1 0.4679 0.44241 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1362081 2 0.5467 0.57935 0.000 0.612 0.364 0.024
#> SRR1409854 1 0.8676 -0.22543 0.428 0.048 0.308 0.216
#> SRR1435229 3 0.9585 -0.20166 0.220 0.136 0.364 0.280
#> SRR1085996 1 0.4679 0.44219 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1414229 4 0.9277 0.40225 0.172 0.176 0.196 0.456
#> SRR1400974 3 0.1059 0.63393 0.000 0.016 0.972 0.012
#> SRR1399971 1 0.4624 0.44723 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR613927 3 0.4241 0.65375 0.124 0.012 0.828 0.036
#> SRR1457854 1 0.4933 0.46247 0.688 0.000 0.016 0.296
#> SRR1473714 1 0.6401 0.14573 0.572 0.056 0.008 0.364
#> SRR813776 4 0.8618 0.35235 0.316 0.028 0.312 0.344
#> SRR808196 1 0.3850 0.36132 0.848 0.008 0.112 0.032
#> SRR1101085 1 0.3706 0.37294 0.848 0.040 0.000 0.112
#> SRR614395 1 0.7997 -0.16690 0.432 0.028 0.144 0.396
#> SRR1478251 1 0.0804 0.45607 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1370551 2 0.6005 0.40127 0.000 0.500 0.460 0.040
#> SRR1362310 1 0.4991 0.44288 0.672 0.004 0.008 0.316
#> SRR665310 3 0.3994 0.65505 0.088 0.008 0.848 0.056
#> SRR1420109 3 0.6039 0.61278 0.116 0.028 0.732 0.124
#> SRR1330920 4 0.8241 0.28468 0.392 0.028 0.180 0.400
#> SRR1419539 3 0.2820 0.61165 0.008 0.068 0.904 0.020
#> SRR1359447 2 0.6014 0.53399 0.000 0.588 0.360 0.052
#> SRR1347259 1 0.4070 0.37584 0.824 0.044 0.000 0.132
#> SRR613915 3 0.4602 0.64755 0.120 0.012 0.812 0.056
#> SRR1384395 3 0.2060 0.61889 0.000 0.052 0.932 0.016
#> SRR821715 3 0.2896 0.66316 0.056 0.008 0.904 0.032
#> SRR1478228 1 0.4897 0.44018 0.668 0.004 0.004 0.324
#> SRR1445637 1 0.6606 0.34568 0.636 0.008 0.112 0.244
#> SRR608150 4 0.8042 0.47160 0.348 0.124 0.044 0.484
#> SRR1096383 3 0.7090 0.17310 0.384 0.012 0.512 0.092
#> SRR1341480 1 0.5221 0.23235 0.732 0.060 0.000 0.208
#> SRR1341344 1 0.5355 0.36173 0.620 0.020 0.000 0.360
#> SRR1326270 3 0.1911 0.66027 0.032 0.004 0.944 0.020
#> SRR1498838 3 0.1762 0.65067 0.020 0.016 0.952 0.012
#> SRR1416313 3 0.1962 0.65594 0.024 0.008 0.944 0.024
#> SRR808566 1 0.9669 -0.32269 0.336 0.276 0.136 0.252
#> SRR1430270 1 0.1059 0.45384 0.972 0.012 0.000 0.016
#> SRR1367825 3 0.1059 0.63393 0.000 0.016 0.972 0.012
#> SRR613533 3 0.8339 0.21405 0.056 0.272 0.508 0.164
#> SRR661267 3 0.7413 0.16268 0.376 0.024 0.504 0.096
#> SRR810665 2 0.4779 0.73237 0.004 0.756 0.212 0.028
#> SRR1407250 4 0.8801 0.52015 0.276 0.112 0.132 0.480
#> SRR1420067 1 0.8131 0.03820 0.540 0.052 0.164 0.244
#> SRR1473632 1 0.4955 0.43716 0.648 0.008 0.000 0.344
#> SRR812536 3 0.2660 0.64803 0.024 0.048 0.916 0.012
#> SRR1370850 2 0.6797 0.71236 0.036 0.660 0.212 0.092
#> SRR1486195 2 0.5453 0.54656 0.000 0.592 0.388 0.020
#> SRR1407671 3 0.9844 -0.15100 0.268 0.224 0.324 0.184
#> SRR1446375 3 0.9171 0.15884 0.248 0.120 0.448 0.184
#> SRR1465230 1 0.1509 0.44979 0.960 0.008 0.020 0.012
#> SRR614119 3 0.7516 -0.02522 0.420 0.020 0.452 0.108
#> SRR1356101 3 0.4855 0.31770 0.000 0.268 0.712 0.020
#> SRR1404209 1 0.7755 0.09936 0.552 0.024 0.216 0.208
#> SRR1392676 2 0.2466 0.72225 0.000 0.900 0.096 0.004
#> SRR665538 3 0.7040 0.18089 0.384 0.012 0.516 0.088
#> SRR660510 3 0.1394 0.64860 0.012 0.008 0.964 0.016
#> SRR1445655 1 0.3726 0.39382 0.860 0.040 0.008 0.092
#> SRR658953 4 0.8273 0.29308 0.216 0.292 0.028 0.464
#> SRR2166459 1 0.6596 0.34385 0.612 0.004 0.104 0.280
#> SRR1070713 2 0.9081 0.36047 0.128 0.452 0.148 0.272
#> SRR1485312 3 0.0967 0.64161 0.004 0.016 0.976 0.004
#> SRR1317631 3 0.6682 0.23933 0.400 0.020 0.532 0.048
#> SRR1488610 1 0.5284 0.39480 0.616 0.016 0.000 0.368
#> SRR1330588 3 0.8008 0.13853 0.228 0.024 0.512 0.236
#> SRR1316367 4 0.6222 0.20100 0.412 0.056 0.000 0.532
#> SRR1433926 1 0.4713 0.43795 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1091302 1 0.3442 0.42203 0.880 0.040 0.012 0.068
#> SRR818263 4 0.8597 0.34364 0.340 0.028 0.284 0.348
#> SRR1404909 1 0.6683 0.06087 0.620 0.176 0.000 0.204
#> SRR663076 1 0.6327 0.33475 0.652 0.000 0.132 0.216
#> SRR1323577 2 0.7142 0.70591 0.044 0.640 0.208 0.108
#> SRR1442422 1 0.1509 0.44979 0.960 0.008 0.020 0.012
#> SRR1465893 1 0.5012 0.44916 0.668 0.004 0.008 0.320
#> SRR654862 4 0.7623 0.22701 0.436 0.036 0.088 0.440
#> SRR1407112 1 0.3383 0.38173 0.872 0.012 0.100 0.016
#> SRR1332969 3 0.3993 0.65414 0.092 0.004 0.844 0.060
#> SRR1353199 3 0.2927 0.66313 0.068 0.008 0.900 0.024
#> SRR1378885 3 0.7337 0.37365 0.208 0.024 0.604 0.164
#> SRR665357 3 0.4456 0.54308 0.004 0.148 0.804 0.044
#> SRR662186 2 0.5848 0.57349 0.000 0.616 0.336 0.048
#> SRR1501020 3 0.4750 0.64042 0.092 0.008 0.804 0.096
#> SRR1347819 3 0.1762 0.64812 0.016 0.020 0.952 0.012
#> SRR1480813 2 0.5846 0.72691 0.016 0.708 0.216 0.060
#> SRR1472576 1 0.9263 -0.28845 0.404 0.256 0.096 0.244
#> SRR1431781 1 0.7825 -0.04381 0.616 0.108 0.128 0.148
#> SRR1452270 3 0.1690 0.64418 0.008 0.032 0.952 0.008
#> SRR1500472 3 0.9188 0.20355 0.220 0.128 0.456 0.196
#> SRR1417632 1 0.7799 -0.16626 0.420 0.308 0.000 0.272
#> SRR1350153 2 0.5322 0.64938 0.000 0.660 0.312 0.028
#> SRR1458113 4 0.9492 0.34524 0.168 0.188 0.228 0.416
#> SRR1326579 1 0.6935 -0.21897 0.464 0.060 0.020 0.456
#> SRR1349363 1 0.8236 -0.11028 0.392 0.300 0.012 0.296
#> SRR1096712 3 0.1953 0.64696 0.012 0.032 0.944 0.012
#> SRR1090407 3 0.2549 0.66352 0.056 0.004 0.916 0.024
#> SRR1083752 2 0.7831 0.45598 0.056 0.468 0.396 0.080
#> SRR1377599 1 0.6056 0.10058 0.660 0.092 0.000 0.248
#> SRR1488449 3 0.3436 0.66173 0.080 0.008 0.876 0.036
#> SRR1318354 3 0.8274 0.17289 0.052 0.296 0.500 0.152
#> SRR1359062 3 0.1892 0.63526 0.004 0.036 0.944 0.016
#> SRR1398924 4 0.7701 0.34587 0.240 0.268 0.004 0.488
#> SRR663783 3 0.1593 0.63953 0.004 0.024 0.956 0.016
#> SRR1319204 3 0.7126 -0.03131 0.016 0.376 0.520 0.088
#> SRR1369070 2 0.2474 0.69420 0.008 0.920 0.056 0.016
#> SRR615659 1 0.4713 0.43795 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1337449 2 0.5334 0.72372 0.004 0.716 0.236 0.044
#> SRR1316982 3 0.4775 0.39767 0.000 0.232 0.740 0.028
#> SRR1498595 1 0.7844 -0.17249 0.404 0.308 0.000 0.288
#> SRR1377423 3 0.4843 0.64281 0.076 0.020 0.808 0.096
#> SRR1312310 2 0.5161 0.66041 0.000 0.676 0.300 0.024
#> SRR1485613 1 0.7349 0.20213 0.564 0.012 0.156 0.268
#> SRR1338426 3 0.4769 0.63285 0.036 0.076 0.820 0.068
#> SRR1353309 3 0.4968 0.63703 0.056 0.060 0.812 0.072
#> SRR658941 3 0.7404 0.18610 0.372 0.024 0.508 0.096
#> SRR1101643 1 0.4957 0.45629 0.668 0.012 0.000 0.320
#> SRR1401468 3 0.7520 0.11872 0.384 0.024 0.488 0.104
#> SRR1368874 2 0.4194 0.71308 0.000 0.764 0.228 0.008
#> SRR1324085 2 0.9980 -0.08120 0.248 0.276 0.224 0.252
#> SRR1363858 1 0.6269 0.14732 0.576 0.056 0.004 0.364
#> SRR819820 3 0.6099 0.60722 0.156 0.040 0.728 0.076
#> SRR1337342 1 0.8723 -0.21586 0.484 0.080 0.176 0.260
#> SRR655206 3 0.2820 0.61165 0.008 0.068 0.904 0.020
#> SRR1387013 2 0.7522 0.47965 0.108 0.612 0.060 0.220
#> SRR1317410 1 0.5012 0.43862 0.668 0.008 0.004 0.320
#> SRR608198 4 0.6934 0.23674 0.452 0.060 0.020 0.468
#> SRR1440161 2 0.5322 0.64938 0.000 0.660 0.312 0.028
#> SRR1343741 2 0.2474 0.69420 0.008 0.920 0.056 0.016
#> SRR1381288 2 0.3401 0.73274 0.000 0.840 0.152 0.008
#> SRR1415379 1 0.1584 0.45917 0.952 0.012 0.000 0.036
#> SRR1099622 3 0.6201 -0.18826 0.004 0.420 0.532 0.044
#> SRR663197 3 0.2319 0.64877 0.016 0.028 0.932 0.024
#> SRR1394836 3 0.2820 0.61165 0.008 0.068 0.904 0.020
#> SRR661699 3 0.3544 0.66096 0.072 0.016 0.876 0.036
#> SRR813680 3 0.7460 0.15426 0.376 0.024 0.500 0.100
#> SRR1410678 1 0.4991 0.44288 0.672 0.004 0.008 0.316
#> SRR1378109 1 0.2131 0.44004 0.936 0.008 0.040 0.016
#> SRR1499174 1 0.7031 0.27276 0.572 0.016 0.096 0.316
#> SRR1311486 2 0.5334 0.72372 0.004 0.716 0.236 0.044
#> SRR1382851 2 0.9383 0.04022 0.236 0.360 0.100 0.304
#> SRR1433410 4 0.7715 0.45606 0.340 0.116 0.032 0.512
#> SRR661167 3 0.2261 0.66038 0.036 0.008 0.932 0.024
#> SRR1432518 3 0.8109 0.44445 0.128 0.104 0.584 0.184
#> SRR660462 3 0.1191 0.63613 0.004 0.024 0.968 0.004
#> SRR1374608 3 0.8357 0.12961 0.360 0.116 0.456 0.068
#> SRR657949 3 0.5133 0.63746 0.124 0.016 0.784 0.076
#> SRR1308882 1 0.2943 0.40660 0.892 0.032 0.000 0.076
#> SRR655768 3 0.8236 -0.13014 0.380 0.028 0.412 0.180
#> SRR1485870 1 0.7313 0.01762 0.544 0.148 0.008 0.300
#> SRR1444138 3 0.8524 -0.13064 0.356 0.040 0.408 0.196
#> SRR1417342 1 0.5488 0.26537 0.692 0.028 0.012 0.268
#> SRR1470193 1 0.2845 0.44258 0.912 0.028 0.032 0.028
#> SRR1091380 3 0.6099 0.60722 0.156 0.040 0.728 0.076
#> SRR1099096 1 0.4991 0.44810 0.672 0.004 0.008 0.316
#> SRR1313583 1 0.1174 0.45852 0.968 0.012 0.000 0.020
#> SRR1467102 3 0.2542 0.60725 0.000 0.084 0.904 0.012
#> SRR1485416 1 0.5184 0.23671 0.736 0.060 0.000 0.204
#> SRR818821 3 0.8339 0.21405 0.056 0.272 0.508 0.164
#> SRR809963 1 0.7997 -0.16690 0.432 0.028 0.144 0.396
#> SRR1072247 1 0.5306 0.44029 0.664 0.004 0.020 0.312
#> SRR1353710 1 0.2111 0.44834 0.932 0.024 0.000 0.044
#> SRR1445259 3 0.8451 0.19154 0.060 0.276 0.496 0.168
#> SRR1408393 3 0.6904 0.39437 0.264 0.012 0.608 0.116
#> SRR1361522 1 0.4713 0.43795 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1368597 1 0.5947 0.41032 0.616 0.004 0.044 0.336
#> SRR1309680 2 0.6031 0.70996 0.056 0.744 0.124 0.076
#> SRR1310542 3 0.1151 0.63624 0.000 0.024 0.968 0.008
#> SRR1333485 1 0.3037 0.40559 0.888 0.036 0.000 0.076
#> SRR1406437 3 0.8914 0.25215 0.152 0.188 0.504 0.156
#> SRR1354931 3 0.1796 0.65969 0.032 0.004 0.948 0.016
#> SRR1391856 3 0.5142 0.47634 0.008 0.168 0.764 0.060
#> SRR1446738 2 0.9271 0.38968 0.104 0.416 0.240 0.240
#> SRR1309032 3 0.5696 -0.31720 0.000 0.484 0.492 0.024
#> SRR1388145 2 0.5047 0.73270 0.004 0.744 0.212 0.040
#> SRR1432611 2 0.5306 0.60785 0.000 0.632 0.348 0.020
#> SRR815869 3 0.1174 0.63268 0.000 0.020 0.968 0.012
#> SRR613150 3 0.1339 0.64223 0.004 0.024 0.964 0.008
#> SRR1375329 3 0.9614 -0.21449 0.220 0.136 0.344 0.300
#> SRR1387921 1 0.4406 0.46754 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1466792 2 0.5436 0.59006 0.000 0.620 0.356 0.024
#> SRR1360478 2 0.5322 0.64938 0.000 0.660 0.312 0.028
#> SRR1360695 1 0.6885 0.17874 0.620 0.008 0.220 0.152
#> SRR812943 1 0.5614 0.36022 0.592 0.020 0.004 0.384
#> SRR1400910 2 0.8680 0.38730 0.140 0.504 0.104 0.252
#> SRR1444203 1 0.2245 0.43904 0.932 0.008 0.040 0.020
#> SRR816177 2 0.7160 0.70465 0.044 0.640 0.204 0.112
#> SRR658754 3 0.1617 0.64621 0.012 0.024 0.956 0.008
#> SRR1429603 1 0.4070 0.37584 0.824 0.044 0.000 0.132
#> SRR1397366 3 0.3245 0.66212 0.080 0.008 0.884 0.028
#> SRR1446028 1 0.5154 0.43667 0.660 0.004 0.012 0.324
#> SRR1083918 2 0.9334 0.28406 0.204 0.444 0.156 0.196
#> SRR1337606 4 0.7850 0.36063 0.396 0.136 0.024 0.444
#> SRR659109 3 0.1247 0.64412 0.004 0.016 0.968 0.012
#> SRR1337192 1 0.5355 0.36173 0.620 0.020 0.000 0.360
#> SRR656946 3 0.8416 0.02191 0.320 0.036 0.444 0.200
#> SRR1476102 1 0.4643 0.43290 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR1476447 1 0.5143 0.37458 0.628 0.012 0.000 0.360
#> SRR1342067 1 0.3706 0.37294 0.848 0.040 0.000 0.112
#> SRR1385389 1 0.1471 0.45111 0.960 0.012 0.004 0.024
#> SRR1075971 1 0.5427 0.21607 0.544 0.008 0.004 0.444
#> SRR614419 4 0.6125 0.12725 0.436 0.048 0.000 0.516
#> SRR1322936 4 0.7811 0.39988 0.384 0.124 0.028 0.464
#> SRR1349121 3 0.7857 -0.06792 0.408 0.024 0.432 0.136
#> SRR1430549 1 0.4781 0.43553 0.660 0.004 0.000 0.336
#> SRR612935 3 0.7959 0.26443 0.044 0.272 0.540 0.144
#> SRR661481 2 0.5625 0.72934 0.012 0.720 0.212 0.056
#> SRR1354117 2 0.5985 0.54433 0.000 0.596 0.352 0.052
#> SRR1393596 1 0.4984 0.31229 0.772 0.064 0.004 0.160
#> SRR1452164 1 0.6943 0.30248 0.584 0.016 0.092 0.308
#> SRR1070503 4 0.8622 0.34885 0.312 0.028 0.328 0.332
#> SRR1499894 3 0.1114 0.64902 0.008 0.004 0.972 0.016
#> SRR1082883 4 0.8100 0.47466 0.344 0.124 0.048 0.484
#> SRR1468271 1 0.7705 0.00968 0.536 0.016 0.248 0.200
#> SRR1332443 1 0.4624 0.43809 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR810295 2 0.5184 0.65604 0.000 0.672 0.304 0.024
#> SRR662103 1 0.4713 0.43795 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1328620 3 0.8274 0.17289 0.052 0.296 0.500 0.152
#> SRR1396294 3 0.6682 0.23933 0.400 0.020 0.532 0.048
#> SRR1419917 1 0.4713 0.43795 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR662114 3 0.5316 0.61806 0.056 0.068 0.792 0.084
#> SRR1489199 3 0.8851 -0.11721 0.316 0.060 0.412 0.212
#> SRR813584 3 0.9349 0.03555 0.148 0.252 0.428 0.172
#> SRR1069638 4 0.8678 0.40187 0.344 0.052 0.192 0.412
#> SRR614864 3 0.3135 0.66236 0.044 0.012 0.896 0.048
#> SRR1433392 4 0.8306 0.29702 0.388 0.028 0.192 0.392
#> SRR1377777 2 0.4331 0.63006 0.040 0.832 0.020 0.108
#> SRR2167710 3 0.8416 0.02191 0.320 0.036 0.444 0.200
#> SRR1401252 1 0.4203 0.35486 0.824 0.068 0.000 0.108
#> SRR1309963 1 0.2716 0.42110 0.908 0.012 0.068 0.012
#> SRR1338031 1 0.4936 0.44823 0.652 0.000 0.008 0.340
#> SRR1418628 2 0.5161 0.66041 0.000 0.676 0.300 0.024
#> SRR1486889 1 0.7754 0.09366 0.552 0.024 0.220 0.204
#> SRR1380393 1 0.4933 0.46247 0.688 0.000 0.016 0.296
#> SRR1319731 1 0.4917 0.43963 0.664 0.004 0.004 0.328
#> SRR1356468 1 0.4328 0.28158 0.804 0.008 0.164 0.024
#> SRR1337010 2 0.4663 0.73682 0.000 0.788 0.148 0.064
#> SRR1486520 1 0.6936 -0.12198 0.476 0.040 0.036 0.448
#> SRR1486538 1 0.2741 0.41957 0.892 0.012 0.000 0.096
#> SRR1340486 1 0.3383 0.38173 0.872 0.012 0.100 0.016
#> SRR1377696 1 0.7799 -0.16626 0.420 0.308 0.000 0.272
#> SRR1465459 3 0.8601 -0.40653 0.292 0.028 0.356 0.324
#> SRR1080270 3 0.1284 0.63913 0.000 0.024 0.964 0.012
#> SRR1312501 3 0.6539 0.59187 0.112 0.052 0.708 0.128
#> SRR1093148 3 0.8795 0.29595 0.124 0.136 0.500 0.240
#> SRR1467080 3 0.1004 0.63376 0.000 0.024 0.972 0.004
#> SRR1410866 2 0.5272 0.66940 0.000 0.680 0.288 0.032
#> SRR816475 2 0.9974 -0.08195 0.248 0.280 0.220 0.252
#> SRR1379198 1 0.0804 0.45607 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR613342 3 0.5389 0.60133 0.044 0.120 0.780 0.056
#> SRR1452246 2 0.3892 0.65571 0.024 0.852 0.020 0.104
#> SRR1338836 2 0.3494 0.72985 0.000 0.824 0.172 0.004
#> SRR1369129 1 0.1059 0.45384 0.972 0.012 0.000 0.016
#> SRR1396616 3 0.3849 0.65907 0.072 0.012 0.860 0.056
#> SRR813824 3 0.1509 0.65058 0.012 0.008 0.960 0.020
#> SRR1082376 1 0.7005 0.03437 0.492 0.024 0.060 0.424
#> SRR1500891 1 0.3279 0.39575 0.872 0.032 0.000 0.096
#> SRR807543 4 0.8263 0.28890 0.392 0.028 0.184 0.396
#> SRR1091572 4 0.9090 0.43624 0.308 0.108 0.160 0.424
#> SRR1346689 1 0.2023 0.45047 0.940 0.028 0.004 0.028
#> SRR1332424 4 0.7715 0.45606 0.340 0.116 0.032 0.512
#> SRR663729 1 0.5147 0.24208 0.740 0.060 0.000 0.200
#> SRR1097013 1 0.6596 0.34385 0.612 0.004 0.104 0.280
#> SRR613675 4 0.7811 0.39988 0.384 0.124 0.028 0.464
#> SRR1485357 1 0.3564 0.36412 0.860 0.012 0.112 0.016
#> SRR655816 3 0.2982 0.66054 0.068 0.004 0.896 0.032
#> SRR1500113 1 0.5949 0.41779 0.668 0.004 0.068 0.260
#> SRR1437622 1 0.9523 -0.30464 0.352 0.300 0.120 0.228
#> SRR1355172 3 0.7081 0.18380 0.380 0.012 0.516 0.092
#> SRR655531 4 0.6906 0.20320 0.432 0.048 0.028 0.492
#> SRR1338147 3 0.5007 0.64379 0.100 0.024 0.800 0.076
#> SRR1413329 3 0.8328 0.26531 0.260 0.068 0.524 0.148
#> SRR1485931 2 0.4805 0.57518 0.052 0.780 0.004 0.164
#> SRR1420873 1 0.6968 0.27266 0.596 0.008 0.132 0.264
#> SRR1333308 1 0.3877 0.40334 0.852 0.044 0.008 0.096
#> SRR1452033 1 0.7290 0.23783 0.588 0.020 0.136 0.256
#> SRR1467316 2 0.4505 0.61684 0.048 0.820 0.016 0.116
#> SRR809018 3 0.1059 0.63393 0.000 0.016 0.972 0.012
#> SRR1375351 2 0.5161 0.66041 0.000 0.676 0.300 0.024
#> SRR663440 3 0.6709 0.52663 0.152 0.032 0.680 0.136
#> SRR1471755 2 0.5812 0.72763 0.016 0.712 0.212 0.060
#> SRR808019 3 0.7413 0.17575 0.376 0.024 0.504 0.096
#> SRR1479133 3 0.2613 0.66430 0.052 0.008 0.916 0.024
#> SRR615069 3 0.8480 0.34451 0.124 0.104 0.528 0.244
#> SRR1456185 2 0.8955 0.48272 0.152 0.476 0.252 0.120
#> SRR1350069 3 0.6682 0.23933 0.400 0.020 0.532 0.048
#> SRR816316 1 0.7965 -0.14860 0.436 0.028 0.140 0.396
#> SRR664795 3 0.7460 0.15426 0.376 0.024 0.500 0.100
#> SRR1490721 1 0.6352 0.05680 0.632 0.108 0.000 0.260
#> SRR810643 1 0.4761 0.43776 0.664 0.004 0.000 0.332
#> SRR1430333 4 0.9686 0.44020 0.272 0.136 0.264 0.328
#> SRR1085285 3 0.2613 0.66430 0.052 0.008 0.916 0.024
#> SRR1099072 3 0.3994 0.65505 0.088 0.008 0.848 0.056
#> SRR1317985 1 0.5250 0.44241 0.640 0.004 0.012 0.344
#> SRR1487340 1 0.5170 0.43814 0.660 0.008 0.008 0.324
#> SRR1420276 3 0.2060 0.61889 0.000 0.052 0.932 0.016
#> SRR1351347 3 0.5159 0.62886 0.056 0.056 0.800 0.088
#> SRR1405525 1 0.5298 0.38864 0.612 0.016 0.000 0.372
#> SRR1370329 1 0.4564 0.44330 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1465001 1 0.4917 0.43963 0.664 0.004 0.004 0.328
#> SRR1476525 2 0.5118 0.72935 0.004 0.736 0.220 0.040
#> SRR819610 2 0.8955 0.48272 0.152 0.476 0.252 0.120
#> SRR2157314 1 0.5360 0.44111 0.660 0.008 0.016 0.316
#> SRR1409465 2 0.3448 0.73054 0.000 0.828 0.168 0.004
#> SRR809987 1 0.1584 0.45663 0.952 0.012 0.000 0.036
#> SRR613639 3 0.4579 0.64933 0.124 0.012 0.812 0.052
#> SRR1402285 1 0.1114 0.45374 0.972 0.004 0.016 0.008
#> SRR1077038 1 0.8030 -0.20416 0.424 0.028 0.148 0.400
#> SRR1405660 3 0.1690 0.64418 0.008 0.032 0.952 0.008
#> SRR1095455 3 0.8468 0.17954 0.060 0.280 0.492 0.168
#> SRR1394734 2 0.9334 0.28406 0.204 0.444 0.156 0.196
#> SRR1317771 1 0.7755 0.09936 0.552 0.024 0.216 0.208
#> SRR1365894 1 0.7021 0.03876 0.588 0.160 0.004 0.248
#> SRR1073581 3 0.7857 -0.06792 0.408 0.024 0.432 0.136
#> SRR659804 1 0.5360 0.44111 0.660 0.008 0.016 0.316
#> SRR1345914 2 0.6807 0.70986 0.032 0.652 0.224 0.092
#> SRR1432186 2 0.5937 0.73378 0.024 0.720 0.188 0.068
#> SRR1473529 1 0.7844 -0.17249 0.404 0.308 0.000 0.288
#> SRR660764 3 0.6871 0.37488 0.024 0.228 0.640 0.108
#> SRR820448 1 0.7997 -0.16690 0.432 0.028 0.144 0.396
#> SRR1328845 3 0.6682 0.23933 0.400 0.020 0.532 0.048
#> SRR1336415 1 0.1114 0.45374 0.972 0.004 0.016 0.008
#> SRR1379065 1 0.3215 0.39781 0.876 0.032 0.000 0.092
#> SRR1459190 3 0.6806 0.41772 0.256 0.012 0.620 0.112
#> SRR1346773 1 0.4720 0.44450 0.672 0.004 0.000 0.324
#> SRR1499521 3 0.7378 0.15806 0.380 0.020 0.500 0.100
#> SRR1440898 2 0.5019 0.73620 0.004 0.752 0.200 0.044
#> SRR1347459 3 0.4583 0.63296 0.048 0.068 0.832 0.052
#> SRR1081209 2 0.4382 0.69233 0.032 0.840 0.072 0.056
#> SRR1400202 1 0.4564 0.44330 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1333395 1 0.7119 0.06971 0.576 0.140 0.008 0.276
#> SRR1309248 1 0.7222 -0.01039 0.560 0.172 0.004 0.264
#> SRR809161 3 0.3240 0.66337 0.056 0.016 0.892 0.036
#> SRR1316320 1 0.7418 -0.14300 0.500 0.160 0.004 0.336
#> SRR1432629 2 0.5034 0.68235 0.032 0.800 0.060 0.108
#> SRR1498931 1 0.5018 0.44506 0.656 0.000 0.012 0.332
#> SRR1416578 1 0.1584 0.45917 0.952 0.012 0.000 0.036
#> SRR1405547 3 0.1059 0.63393 0.000 0.016 0.972 0.012
#> SRR1470534 1 0.0804 0.45607 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1380764 1 0.6023 0.40674 0.636 0.008 0.048 0.308
#> SRR1309160 3 0.1394 0.65293 0.012 0.008 0.964 0.016
#> SRR663489 3 0.1059 0.63393 0.000 0.016 0.972 0.012
#> SRR1500450 1 0.6214 0.30518 0.684 0.004 0.152 0.160
#> SRR1078489 3 0.9470 -0.15724 0.180 0.140 0.380 0.300
#> SRR1332648 1 0.1262 0.45177 0.968 0.008 0.016 0.008
#> SRR660614 3 0.7126 -0.03131 0.016 0.376 0.520 0.088
#> SRR1470420 3 0.5696 -0.30399 0.000 0.480 0.496 0.024
#> SRR1475566 1 0.4564 0.44330 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1477949 1 0.4543 0.45266 0.676 0.000 0.000 0.324
#> SRR1481419 2 0.5950 0.73294 0.020 0.712 0.200 0.068
#> SRR1464766 1 0.5541 0.43093 0.656 0.008 0.024 0.312
#> SRR615946 3 0.1962 0.65594 0.024 0.008 0.944 0.024
#> SRR1446481 2 0.5269 0.72656 0.004 0.724 0.228 0.044
#> SRR1467656 2 0.3626 0.72841 0.000 0.812 0.184 0.004
#> SRR1402962 4 0.7518 0.32719 0.420 0.052 0.060 0.468
#> SRR660224 2 0.5638 0.72246 0.008 0.708 0.228 0.056
#> SRR665586 1 0.4776 0.42610 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1347166 4 0.9238 0.49019 0.324 0.124 0.156 0.396
#> SRR1485722 4 0.8801 0.52015 0.276 0.112 0.132 0.480
#> SRR1415316 1 0.4543 0.45746 0.676 0.000 0.000 0.324
#> SRR613390 1 0.4866 0.38856 0.596 0.000 0.000 0.404
#> SRR661108 3 0.1509 0.64729 0.008 0.020 0.960 0.012
#> SRR2170173 3 0.8477 0.02732 0.316 0.040 0.444 0.200
#> SRR817329 1 0.5577 0.43064 0.636 0.000 0.036 0.328
#> SRR1401990 1 0.5751 0.16078 0.708 0.020 0.228 0.044
#> SRR1467745 2 0.9924 0.03723 0.220 0.312 0.224 0.244
#> SRR1471795 2 0.6988 0.71201 0.060 0.664 0.188 0.088
#> SRR1415637 2 0.2466 0.72225 0.000 0.900 0.096 0.004
#> SRR813137 1 0.6757 0.32103 0.564 0.008 0.084 0.344
#> SRR1314873 1 0.4624 0.45198 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1401211 1 0.6885 0.17874 0.620 0.008 0.220 0.152
#> SRR1419692 1 0.1917 0.44115 0.944 0.008 0.036 0.012
#> SRR818797 3 0.6386 0.50530 0.188 0.016 0.684 0.112
#> SRR2164608 3 0.5517 0.62702 0.124 0.044 0.772 0.060
#> SRR1455586 3 0.4711 0.38910 0.000 0.236 0.740 0.024
#> SRR819459 3 0.1339 0.64223 0.004 0.024 0.964 0.008
#> SRR1488939 2 0.4505 0.61684 0.048 0.820 0.016 0.116
#> SRR1433232 2 0.2780 0.65323 0.024 0.912 0.016 0.048
#> SRR1385501 1 0.8026 -0.19405 0.432 0.028 0.148 0.392
#> SRR1361652 4 0.8315 0.33186 0.232 0.280 0.028 0.460
#> SRR1437119 1 0.4624 0.44723 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1478547 3 0.0937 0.63521 0.000 0.012 0.976 0.012
#> SRR1430910 3 0.9462 -0.07716 0.196 0.136 0.396 0.272
#> SRR1310584 1 0.4741 0.43676 0.668 0.004 0.000 0.328
#> SRR1500216 1 0.6251 0.16831 0.564 0.052 0.004 0.380
#> SRR1486762 3 0.5344 0.62946 0.096 0.016 0.772 0.116
#> SRR1480854 1 0.6056 0.10058 0.660 0.092 0.000 0.248
#> SRR1489394 1 0.1174 0.45852 0.968 0.012 0.000 0.020
#> SRR1418085 1 0.1362 0.45189 0.964 0.004 0.020 0.012
#> SRR1340221 1 0.1059 0.45384 0.972 0.012 0.000 0.016
#> SRR1473058 2 0.9974 -0.08195 0.248 0.280 0.220 0.252
#> SRR1405165 3 0.5001 0.62377 0.048 0.056 0.808 0.088
#> SRR1433004 1 0.5039 0.38683 0.592 0.000 0.004 0.404
#> SRR1471477 1 0.7011 0.15664 0.604 0.008 0.232 0.156
#> SRR1098567 2 0.6291 0.61279 0.008 0.588 0.352 0.052
#> SRR1098712 3 0.6682 0.23933 0.400 0.020 0.532 0.048
#> SRR1455038 1 0.5151 0.24763 0.532 0.004 0.000 0.464
#> SRR1375248 3 0.4642 0.37869 0.000 0.240 0.740 0.020
#> SRR1403005 3 0.3182 0.66286 0.064 0.012 0.892 0.032
#> SRR1348378 2 0.7704 0.46451 0.048 0.476 0.396 0.080
#> SRR1413541 1 0.4697 0.43995 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR1392943 1 0.5240 0.24891 0.748 0.052 0.008 0.192
#> SRR1475192 3 0.1739 0.64685 0.008 0.024 0.952 0.016
#> SRR1432085 3 0.6140 -0.03197 0.008 0.372 0.580 0.040
#> SRR1452468 4 0.9658 0.44814 0.300 0.136 0.236 0.328
#> SRR1347060 3 0.1174 0.63707 0.000 0.020 0.968 0.012
#> SRR1414139 3 0.6004 0.10317 0.008 0.336 0.616 0.040
#> SRR1447962 3 0.5964 -0.19630 0.000 0.424 0.536 0.040
#> SRR1444324 2 0.5781 0.31108 0.000 0.492 0.480 0.028
#> SRR1415004 1 0.4844 0.46414 0.688 0.000 0.012 0.300
#> SRR1413436 1 0.7755 0.09936 0.552 0.024 0.216 0.208
#> SRR1311266 3 0.9285 -0.26813 0.300 0.084 0.356 0.260
#> SRR1343302 1 0.2010 0.43974 0.940 0.008 0.040 0.012
#> SRR1373746 1 0.4781 0.43553 0.660 0.004 0.000 0.336
#> SRR1429678 1 0.5360 0.43449 0.660 0.016 0.008 0.316
#> SRR1469413 3 0.6258 -0.20570 0.008 0.420 0.532 0.040
#> SRR1405331 4 0.8241 0.28468 0.392 0.028 0.180 0.400
#> SRR1345609 1 0.4406 0.46379 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1380208 1 0.9086 -0.35444 0.352 0.240 0.068 0.340
#> SRR1322840 1 0.3015 0.40049 0.884 0.024 0.000 0.092
#> SRR1399797 3 0.2319 0.64877 0.016 0.028 0.932 0.024
#> SRR1416654 3 0.3050 0.66256 0.044 0.012 0.900 0.044
#> SRR1315081 3 0.1388 0.62899 0.000 0.028 0.960 0.012
#> SRR1369196 3 0.1118 0.63255 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1400847 1 0.5541 0.43093 0.656 0.008 0.024 0.312
#> SRR1365291 3 0.8008 0.13853 0.228 0.024 0.512 0.236
#> SRR1367920 1 0.6056 0.10058 0.660 0.092 0.000 0.248
#> SRR1366648 3 0.1174 0.63268 0.000 0.020 0.968 0.012
#> SRR1441679 2 0.3583 0.72885 0.000 0.816 0.180 0.004
#> SRR1082173 3 0.5517 0.62702 0.124 0.044 0.772 0.060
#> SRR1363968 1 0.6929 0.24137 0.620 0.008 0.180 0.192
#> SRR814387 1 0.4761 0.43776 0.664 0.004 0.000 0.332
#> SRR657599 3 0.7451 0.18088 0.372 0.024 0.504 0.100
#> SRR1386689 1 0.3383 0.38173 0.872 0.012 0.100 0.016
#> SRR1395575 3 0.2165 0.66024 0.032 0.008 0.936 0.024
#> SRR1453811 3 0.5317 0.62680 0.128 0.016 0.772 0.084
#> SRR1441159 1 0.5125 0.36897 0.604 0.008 0.000 0.388
#> SRR1403154 1 0.2010 0.43974 0.940 0.008 0.040 0.012
#> SRR1468722 3 0.1247 0.63717 0.004 0.016 0.968 0.012
#> SRR1310275 3 0.8031 0.12445 0.232 0.024 0.508 0.236
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 3 0.7953 0.2571 0.296 0.012 0.452 0.108 0.132
#> SRR1331708 4 0.8063 -0.2171 0.212 0.092 0.004 0.396 0.296
#> SRR1464258 1 0.6614 0.4012 0.628 0.012 0.144 0.044 0.172
#> SRR1454201 1 0.7499 -0.1787 0.468 0.028 0.052 0.100 0.352
#> SRR661589 3 0.3787 0.6678 0.104 0.000 0.824 0.008 0.064
#> SRR1456229 1 0.4173 0.5661 0.784 0.004 0.000 0.064 0.148
#> SRR1315165 4 0.9117 0.2518 0.280 0.104 0.096 0.372 0.148
#> SRR1488960 1 0.2984 0.6204 0.860 0.000 0.000 0.108 0.032
#> SRR1417809 4 0.4696 0.6235 0.400 0.004 0.000 0.584 0.012
#> SRR1094457 4 0.5839 0.6215 0.392 0.012 0.020 0.544 0.032
#> SRR1095575 3 0.8159 0.1755 0.312 0.020 0.420 0.088 0.160
#> SRR1315931 1 0.6544 0.4114 0.636 0.012 0.140 0.044 0.168
#> SRR1430066 3 0.0992 0.6590 0.000 0.008 0.968 0.000 0.024
#> SRR1431037 3 0.1299 0.6693 0.012 0.008 0.960 0.000 0.020
#> SRR1395554 3 0.1471 0.6630 0.004 0.020 0.952 0.000 0.024
#> SRR818002 2 0.5939 0.6317 0.024 0.700 0.136 0.028 0.112
#> SRR1344143 2 0.5766 0.3742 0.000 0.616 0.000 0.164 0.220
#> SRR1486845 4 0.5343 0.6467 0.368 0.008 0.000 0.580 0.044
#> SRR1362866 1 0.7876 -0.3245 0.416 0.032 0.040 0.164 0.348
#> SRR1490740 1 0.2158 0.6581 0.920 0.000 0.008 0.052 0.020
#> SRR1446627 2 0.2573 0.6678 0.000 0.880 0.104 0.000 0.016
#> SRR1456138 2 0.3872 0.5421 0.000 0.816 0.008 0.060 0.116
#> SRR1416248 1 0.2790 0.6465 0.880 0.000 0.000 0.068 0.052
#> SRR1383907 4 0.9147 -0.1302 0.192 0.136 0.060 0.360 0.252
#> SRR1311018 1 0.0703 0.6551 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1375699 4 0.8780 -0.1373 0.088 0.236 0.072 0.428 0.176
#> SRR1429846 3 0.5368 0.5694 0.188 0.004 0.700 0.012 0.096
#> SRR613550 3 0.3038 0.6769 0.080 0.000 0.872 0.008 0.040
#> SRR1348402 1 0.2663 0.6588 0.896 0.000 0.008 0.048 0.048
#> SRR1345146 4 0.7332 0.1473 0.168 0.108 0.004 0.560 0.160
#> SRR1324025 3 0.6090 0.5060 0.224 0.016 0.648 0.020 0.092
#> SRR1318879 3 0.6497 0.5979 0.080 0.072 0.680 0.040 0.128
#> SRR820755 1 0.7578 0.0970 0.456 0.012 0.296 0.040 0.196
#> SRR1485830 4 0.4383 0.6205 0.424 0.000 0.000 0.572 0.004
#> SRR599313 1 0.7268 0.0268 0.460 0.028 0.008 0.324 0.180
#> SRR612263 1 0.4877 0.5695 0.732 0.004 0.000 0.136 0.128
#> SRR1415398 3 0.2012 0.6770 0.060 0.000 0.920 0.000 0.020
#> SRR1326205 4 0.5573 0.6322 0.376 0.012 0.020 0.572 0.020
#> SRR1421327 4 0.7221 0.1960 0.164 0.060 0.000 0.508 0.268
#> SRR1083311 3 0.2067 0.6582 0.004 0.028 0.924 0.000 0.044
#> SRR1499303 4 0.7684 0.5512 0.296 0.092 0.040 0.504 0.068
#> SRR1079522 1 0.6798 0.1511 0.536 0.028 0.004 0.288 0.144
#> SRR1452935 3 0.7739 0.3908 0.120 0.072 0.544 0.044 0.220
#> SRR1379495 1 0.1904 0.6601 0.936 0.000 0.020 0.028 0.016
#> SRR1470459 2 0.5313 0.3375 0.000 0.504 0.452 0.004 0.040
#> SRR661361 3 0.3005 0.6788 0.052 0.012 0.884 0.004 0.048
#> SRR615778 5 0.9004 0.6173 0.260 0.076 0.116 0.152 0.396
#> SRR1447564 1 0.3193 0.6119 0.840 0.000 0.000 0.132 0.028
#> SRR1455195 1 0.7416 -0.1440 0.476 0.028 0.044 0.104 0.348
#> SRR655182 1 0.4823 0.5380 0.756 0.000 0.044 0.156 0.044
#> SRR1335140 4 0.7944 -0.1113 0.084 0.260 0.000 0.388 0.268
#> SRR1433555 3 0.2536 0.6582 0.004 0.044 0.900 0.000 0.052
#> SRR1308650 2 0.8430 0.3653 0.080 0.456 0.256 0.056 0.152
#> SRR1388354 1 0.3666 0.5654 0.824 0.000 0.012 0.132 0.032
#> SRR1317446 3 0.1310 0.6544 0.000 0.020 0.956 0.000 0.024
#> SRR1413602 3 0.3247 0.6630 0.012 0.052 0.864 0.000 0.072
#> SRR1479955 2 0.4962 0.4690 0.000 0.720 0.004 0.108 0.168
#> SRR809853 1 0.4049 0.5996 0.792 0.000 0.000 0.124 0.084
#> SRR661313 3 0.2569 0.6769 0.068 0.000 0.896 0.004 0.032
#> SRR1499935 4 0.7684 0.5512 0.296 0.092 0.040 0.504 0.068
#> SRR1447303 3 0.5952 0.5492 0.180 0.016 0.672 0.016 0.116
#> SRR1429408 3 0.8838 -0.0743 0.048 0.256 0.376 0.096 0.224
#> SRR1433950 1 0.2795 0.6422 0.872 0.000 0.000 0.100 0.028
#> SRR1362081 2 0.5008 0.5891 0.000 0.632 0.324 0.004 0.040
#> SRR1409854 1 0.8226 0.1312 0.436 0.024 0.292 0.100 0.148
#> SRR1435229 3 0.9138 -0.2705 0.192 0.096 0.336 0.080 0.296
#> SRR1085996 1 0.2653 0.6414 0.880 0.000 0.000 0.096 0.024
#> SRR1414229 5 0.8255 0.5353 0.140 0.148 0.128 0.060 0.524
#> SRR1400974 3 0.1331 0.6543 0.000 0.008 0.952 0.000 0.040
#> SRR1399971 1 0.0963 0.6554 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR613927 3 0.4036 0.6686 0.108 0.000 0.816 0.024 0.052
#> SRR1457854 1 0.3666 0.5654 0.824 0.000 0.012 0.132 0.032
#> SRR1473714 1 0.7422 -0.0806 0.416 0.028 0.012 0.364 0.180
#> SRR813776 1 0.7578 0.0970 0.456 0.012 0.296 0.040 0.196
#> SRR808196 4 0.7053 0.5072 0.356 0.008 0.096 0.488 0.052
#> SRR1101085 4 0.5497 0.6203 0.328 0.012 0.000 0.604 0.056
#> SRR614395 1 0.6614 0.4012 0.628 0.012 0.144 0.044 0.172
#> SRR1478251 4 0.4219 0.6260 0.416 0.000 0.000 0.584 0.000
#> SRR1370551 2 0.5359 0.4427 0.000 0.532 0.412 0.000 0.056
#> SRR1362310 1 0.1498 0.6580 0.952 0.000 0.008 0.024 0.016
#> SRR665310 3 0.3735 0.6681 0.100 0.000 0.828 0.008 0.064
#> SRR1420109 3 0.5585 0.6225 0.136 0.016 0.720 0.024 0.104
#> SRR1330920 1 0.7011 0.3080 0.572 0.012 0.172 0.040 0.204
#> SRR1419539 3 0.3244 0.6223 0.004 0.068 0.864 0.004 0.060
#> SRR1359447 2 0.6335 0.5091 0.000 0.552 0.312 0.020 0.116
#> SRR1347259 4 0.5360 0.6128 0.296 0.012 0.000 0.636 0.056
#> SRR613915 3 0.4020 0.6662 0.128 0.008 0.812 0.008 0.044
#> SRR1384395 3 0.2522 0.6337 0.000 0.052 0.896 0.000 0.052
#> SRR821715 3 0.2519 0.6765 0.060 0.000 0.900 0.004 0.036
#> SRR1478228 1 0.2464 0.6517 0.904 0.000 0.004 0.048 0.044
#> SRR1445637 1 0.6068 0.4999 0.672 0.000 0.108 0.152 0.068
#> SRR608150 5 0.7908 0.6382 0.272 0.072 0.020 0.164 0.472
#> SRR1096383 3 0.7653 0.2907 0.284 0.004 0.480 0.116 0.116
#> SRR1341480 4 0.6654 0.4160 0.220 0.024 0.000 0.556 0.200
#> SRR1341344 1 0.4577 0.5464 0.748 0.000 0.000 0.144 0.108
#> SRR1326270 3 0.1822 0.6764 0.036 0.000 0.936 0.004 0.024
#> SRR1498838 3 0.1314 0.6681 0.012 0.012 0.960 0.000 0.016
#> SRR1416313 3 0.2109 0.6735 0.016 0.012 0.928 0.004 0.040
#> SRR808566 2 0.9588 -0.3006 0.152 0.284 0.092 0.216 0.256
#> SRR1430270 4 0.4350 0.6317 0.408 0.000 0.000 0.588 0.004
#> SRR1367825 3 0.1331 0.6543 0.000 0.008 0.952 0.000 0.040
#> SRR613533 3 0.7807 0.2340 0.068 0.236 0.460 0.008 0.228
#> SRR661267 3 0.7938 0.2809 0.280 0.012 0.464 0.108 0.136
#> SRR810665 2 0.3804 0.6831 0.000 0.796 0.160 0.000 0.044
#> SRR1407250 5 0.8478 0.6216 0.264 0.076 0.092 0.108 0.460
#> SRR1420067 1 0.7762 0.3718 0.544 0.020 0.148 0.132 0.156
#> SRR1473632 1 0.4049 0.5996 0.792 0.000 0.000 0.124 0.084
#> SRR812536 3 0.2684 0.6659 0.024 0.044 0.900 0.000 0.032
#> SRR1370850 2 0.5724 0.6382 0.004 0.692 0.156 0.028 0.120
#> SRR1486195 2 0.5030 0.5630 0.000 0.612 0.348 0.004 0.036
#> SRR1407671 3 0.9652 -0.3256 0.088 0.228 0.280 0.196 0.208
#> SRR1446375 3 0.8924 0.1627 0.244 0.104 0.400 0.064 0.188
#> SRR1465230 4 0.5250 0.6306 0.400 0.008 0.008 0.564 0.020
#> SRR614119 3 0.7998 0.1366 0.332 0.008 0.412 0.116 0.132
#> SRR1356101 3 0.4657 0.2949 0.000 0.296 0.668 0.000 0.036
#> SRR1404209 1 0.7377 0.3790 0.560 0.012 0.204 0.136 0.088
#> SRR1392676 2 0.1943 0.6407 0.000 0.924 0.056 0.000 0.020
#> SRR665538 3 0.7708 0.2896 0.280 0.004 0.476 0.116 0.124
#> SRR660510 3 0.1363 0.6665 0.004 0.004 0.956 0.004 0.032
#> SRR1445655 4 0.5546 0.6412 0.344 0.016 0.004 0.596 0.040
#> SRR658953 5 0.8656 0.4946 0.188 0.192 0.016 0.212 0.392
#> SRR2166459 1 0.5939 0.4977 0.684 0.000 0.088 0.152 0.076
#> SRR1070713 2 0.8067 0.1716 0.044 0.456 0.096 0.088 0.316
#> SRR1485312 3 0.0992 0.6590 0.000 0.008 0.968 0.000 0.024
#> SRR1317631 3 0.7898 0.2906 0.192 0.008 0.492 0.192 0.116
#> SRR1488610 1 0.4262 0.6041 0.776 0.000 0.000 0.124 0.100
#> SRR1330588 3 0.7299 0.2665 0.288 0.016 0.508 0.036 0.152
#> SRR1316367 1 0.6910 -0.1085 0.492 0.028 0.000 0.168 0.312
#> SRR1433926 1 0.2585 0.6502 0.896 0.000 0.004 0.064 0.036
#> SRR1091302 4 0.5771 0.6407 0.364 0.020 0.012 0.572 0.032
#> SRR818263 1 0.7466 0.1484 0.488 0.012 0.268 0.040 0.192
#> SRR1404909 4 0.7427 0.3030 0.180 0.112 0.000 0.532 0.176
#> SRR663076 1 0.6304 0.3970 0.640 0.000 0.124 0.180 0.056
#> SRR1323577 2 0.6084 0.6265 0.004 0.660 0.152 0.032 0.152
#> SRR1442422 4 0.5250 0.6306 0.400 0.008 0.008 0.564 0.020
#> SRR1465893 1 0.2456 0.6502 0.904 0.000 0.008 0.064 0.024
#> SRR654862 1 0.6976 0.3354 0.584 0.024 0.076 0.064 0.252
#> SRR1407112 4 0.6840 0.5490 0.364 0.008 0.080 0.500 0.048
#> SRR1332969 3 0.3787 0.6678 0.104 0.000 0.824 0.008 0.064
#> SRR1353199 3 0.2569 0.6769 0.068 0.000 0.896 0.004 0.032
#> SRR1378885 3 0.6536 0.4332 0.256 0.016 0.600 0.028 0.100
#> SRR665357 3 0.4234 0.5673 0.004 0.148 0.780 0.000 0.068
#> SRR662186 2 0.6131 0.5469 0.000 0.580 0.292 0.016 0.112
#> SRR1501020 3 0.4590 0.6504 0.116 0.000 0.776 0.020 0.088
#> SRR1347819 3 0.1405 0.6647 0.008 0.016 0.956 0.000 0.020
#> SRR1480813 2 0.5139 0.6774 0.004 0.728 0.168 0.016 0.084
#> SRR1472576 4 0.9462 -0.2636 0.172 0.244 0.064 0.272 0.248
#> SRR1431781 4 0.9117 0.2518 0.280 0.104 0.096 0.372 0.148
#> SRR1452270 3 0.1728 0.6640 0.004 0.020 0.940 0.000 0.036
#> SRR1500472 3 0.8845 0.1569 0.188 0.112 0.404 0.052 0.244
#> SRR1417632 4 0.7853 -0.0931 0.088 0.208 0.000 0.416 0.288
#> SRR1350153 2 0.4842 0.6481 0.000 0.684 0.264 0.004 0.048
#> SRR1458113 5 0.8566 0.4808 0.140 0.160 0.164 0.056 0.480
#> SRR1326579 1 0.7201 -0.1615 0.464 0.024 0.012 0.160 0.340
#> SRR1349363 4 0.6830 -0.0505 0.044 0.200 0.000 0.564 0.192
#> SRR1096712 3 0.2104 0.6644 0.008 0.024 0.924 0.000 0.044
#> SRR1090407 3 0.2124 0.6769 0.056 0.000 0.916 0.000 0.028
#> SRR1083752 2 0.7230 0.4979 0.008 0.476 0.344 0.048 0.124
#> SRR1377599 4 0.6969 0.2521 0.168 0.044 0.000 0.532 0.256
#> SRR1488449 3 0.3229 0.6766 0.088 0.000 0.860 0.008 0.044
#> SRR1318354 3 0.7675 0.1600 0.056 0.276 0.440 0.004 0.224
#> SRR1359062 3 0.2300 0.6577 0.000 0.040 0.908 0.000 0.052
#> SRR1398924 5 0.8255 0.5358 0.212 0.180 0.004 0.176 0.428
#> SRR663783 3 0.1549 0.6587 0.000 0.016 0.944 0.000 0.040
#> SRR1319204 3 0.6893 -0.0218 0.012 0.352 0.484 0.016 0.136
#> SRR1369070 2 0.2807 0.6076 0.000 0.892 0.032 0.020 0.056
#> SRR615659 1 0.2585 0.6502 0.896 0.000 0.004 0.064 0.036
#> SRR1337449 2 0.4298 0.6807 0.000 0.756 0.184 0.000 0.060
#> SRR1316982 3 0.4915 0.3979 0.000 0.236 0.696 0.004 0.064
#> SRR1498595 4 0.7853 -0.1007 0.088 0.208 0.000 0.416 0.288
#> SRR1377423 3 0.4620 0.6594 0.092 0.008 0.788 0.020 0.092
#> SRR1312310 2 0.4605 0.6582 0.000 0.708 0.248 0.004 0.040
#> SRR1485613 1 0.5583 0.5456 0.720 0.004 0.140 0.060 0.076
#> SRR1338426 3 0.4593 0.6517 0.048 0.064 0.796 0.004 0.088
#> SRR1353309 3 0.4652 0.6522 0.060 0.052 0.784 0.000 0.104
#> SRR658941 3 0.8148 0.2857 0.256 0.020 0.464 0.112 0.148
#> SRR1101643 1 0.3649 0.6007 0.808 0.000 0.000 0.152 0.040
#> SRR1401468 3 0.7953 0.2571 0.296 0.012 0.452 0.108 0.132
#> SRR1368874 2 0.3550 0.6793 0.000 0.796 0.184 0.000 0.020
#> SRR1324085 2 0.9647 -0.1617 0.112 0.288 0.172 0.160 0.268
#> SRR1363858 1 0.7353 -0.0885 0.412 0.028 0.008 0.368 0.184
#> SRR819820 3 0.6164 0.6171 0.104 0.044 0.700 0.036 0.116
#> SRR1337342 1 0.8535 0.1076 0.456 0.040 0.152 0.132 0.220
#> SRR655206 3 0.3244 0.6223 0.004 0.068 0.864 0.004 0.060
#> SRR1387013 2 0.6758 0.3225 0.024 0.576 0.032 0.088 0.280
#> SRR1317410 1 0.2538 0.6513 0.900 0.000 0.004 0.048 0.048
#> SRR608198 1 0.7201 -0.2001 0.452 0.024 0.012 0.156 0.356
#> SRR1440161 2 0.4842 0.6481 0.000 0.684 0.264 0.004 0.048
#> SRR1343741 2 0.2807 0.6076 0.000 0.892 0.032 0.020 0.056
#> SRR1381288 2 0.2573 0.6678 0.000 0.880 0.104 0.000 0.016
#> SRR1415379 4 0.4604 0.5976 0.428 0.000 0.000 0.560 0.012
#> SRR1099622 3 0.5293 -0.2426 0.000 0.460 0.492 0.000 0.048
#> SRR663197 3 0.2308 0.6648 0.004 0.036 0.912 0.000 0.048
#> SRR1394836 3 0.3244 0.6223 0.004 0.068 0.864 0.004 0.060
#> SRR661699 3 0.3509 0.6770 0.056 0.016 0.860 0.008 0.060
#> SRR813680 3 0.7919 0.2801 0.284 0.012 0.464 0.108 0.132
#> SRR1410678 1 0.1498 0.6580 0.952 0.000 0.008 0.024 0.016
#> SRR1378109 4 0.5919 0.6183 0.392 0.012 0.024 0.540 0.032
#> SRR1499174 1 0.5434 0.5934 0.740 0.004 0.084 0.080 0.092
#> SRR1311486 2 0.4298 0.6807 0.000 0.756 0.184 0.000 0.060
#> SRR1382851 5 0.8681 0.1661 0.056 0.336 0.068 0.196 0.344
#> SRR1433410 5 0.7961 0.6333 0.288 0.068 0.020 0.172 0.452
#> SRR661167 3 0.2029 0.6733 0.028 0.008 0.932 0.004 0.028
#> SRR1432518 3 0.7739 0.3908 0.120 0.072 0.544 0.044 0.220
#> SRR660462 3 0.1399 0.6561 0.000 0.020 0.952 0.000 0.028
#> SRR1374608 3 0.9150 0.1350 0.172 0.116 0.420 0.176 0.116
#> SRR657949 3 0.4508 0.6464 0.148 0.008 0.776 0.008 0.060
#> SRR1308882 4 0.5408 0.6510 0.356 0.012 0.000 0.588 0.044
#> SRR655768 3 0.8017 0.0720 0.360 0.012 0.380 0.080 0.168
#> SRR1485870 4 0.7332 0.1473 0.168 0.108 0.004 0.560 0.160
#> SRR1444138 3 0.8179 0.0654 0.352 0.024 0.376 0.068 0.180
#> SRR1417342 4 0.5991 0.3256 0.304 0.000 0.004 0.568 0.124
#> SRR1470193 4 0.5573 0.6322 0.376 0.012 0.020 0.572 0.020
#> SRR1091380 3 0.6164 0.6171 0.104 0.044 0.700 0.036 0.116
#> SRR1099096 1 0.2390 0.6511 0.908 0.000 0.008 0.060 0.024
#> SRR1313583 4 0.4390 0.6162 0.428 0.000 0.000 0.568 0.004
#> SRR1467102 3 0.2850 0.6151 0.000 0.092 0.872 0.000 0.036
#> SRR1485416 4 0.6651 0.4137 0.224 0.024 0.000 0.556 0.196
#> SRR818821 3 0.7807 0.2340 0.068 0.236 0.460 0.008 0.228
#> SRR809963 1 0.6614 0.4012 0.628 0.012 0.144 0.044 0.172
#> SRR1072247 1 0.1904 0.6601 0.936 0.000 0.020 0.028 0.016
#> SRR1353710 4 0.4737 0.6351 0.380 0.004 0.000 0.600 0.016
#> SRR1445259 3 0.7902 0.2046 0.072 0.240 0.444 0.008 0.236
#> SRR1408393 3 0.6686 0.4504 0.248 0.004 0.592 0.076 0.080
#> SRR1361522 1 0.2650 0.6496 0.892 0.000 0.004 0.068 0.036
#> SRR1368597 1 0.4617 0.6267 0.784 0.000 0.048 0.112 0.056
#> SRR1309680 2 0.5209 0.6194 0.016 0.764 0.076 0.048 0.096
#> SRR1310542 3 0.1579 0.6534 0.000 0.024 0.944 0.000 0.032
#> SRR1333485 4 0.5472 0.6491 0.356 0.012 0.000 0.584 0.048
#> SRR1406437 3 0.8576 0.1515 0.048 0.184 0.448 0.100 0.220
#> SRR1354931 3 0.1739 0.6760 0.032 0.000 0.940 0.004 0.024
#> SRR1391856 3 0.5090 0.4525 0.000 0.172 0.708 0.004 0.116
#> SRR1446738 2 0.8452 0.2131 0.040 0.424 0.184 0.080 0.272
#> SRR1309032 2 0.5310 0.3499 0.000 0.508 0.448 0.004 0.040
#> SRR1388145 2 0.4010 0.6835 0.000 0.784 0.160 0.000 0.056
#> SRR1432611 2 0.4867 0.6143 0.000 0.652 0.308 0.004 0.036
#> SRR815869 3 0.1444 0.6532 0.000 0.012 0.948 0.000 0.040
#> SRR613150 3 0.1701 0.6618 0.012 0.016 0.944 0.000 0.028
#> SRR1375329 3 0.9200 -0.2599 0.212 0.088 0.320 0.088 0.292
#> SRR1387921 1 0.2248 0.6136 0.900 0.000 0.000 0.088 0.012
#> SRR1466792 2 0.4974 0.6006 0.000 0.640 0.316 0.004 0.040
#> SRR1360478 2 0.4818 0.6497 0.000 0.688 0.260 0.004 0.048
#> SRR1360695 1 0.7405 0.2703 0.524 0.000 0.196 0.188 0.092
#> SRR812943 1 0.4918 0.5653 0.728 0.004 0.000 0.140 0.128
#> SRR1400910 2 0.8615 0.0393 0.104 0.428 0.064 0.120 0.284
#> SRR1444203 4 0.5869 0.6175 0.380 0.008 0.032 0.552 0.028
#> SRR816177 2 0.6083 0.6222 0.004 0.660 0.148 0.032 0.156
#> SRR658754 3 0.1756 0.6617 0.008 0.016 0.940 0.000 0.036
#> SRR1429603 4 0.5360 0.6128 0.296 0.012 0.000 0.636 0.056
#> SRR1397366 3 0.2960 0.6762 0.080 0.000 0.876 0.008 0.036
#> SRR1446028 1 0.2149 0.6609 0.924 0.000 0.012 0.036 0.028
#> SRR1083918 2 0.8753 0.1750 0.100 0.460 0.108 0.116 0.216
#> SRR1337606 5 0.8279 0.5273 0.216 0.080 0.020 0.276 0.408
#> SRR659109 3 0.1442 0.6609 0.004 0.012 0.952 0.000 0.032
#> SRR1337192 1 0.4577 0.5464 0.748 0.000 0.000 0.144 0.108
#> SRR656946 3 0.8119 0.1725 0.312 0.016 0.420 0.092 0.160
#> SRR1476102 1 0.3141 0.6241 0.852 0.000 0.000 0.108 0.040
#> SRR1476447 1 0.4343 0.5588 0.768 0.000 0.000 0.136 0.096
#> SRR1342067 4 0.5497 0.6203 0.328 0.012 0.000 0.604 0.056
#> SRR1385389 4 0.4640 0.6374 0.400 0.000 0.000 0.584 0.016
#> SRR1075971 1 0.4270 0.5546 0.772 0.004 0.000 0.060 0.164
#> SRR614419 1 0.6680 0.0107 0.524 0.020 0.000 0.168 0.288
#> SRR1322936 5 0.8205 0.5713 0.260 0.076 0.016 0.240 0.408
#> SRR1349121 3 0.7958 0.0890 0.360 0.012 0.400 0.100 0.128
#> SRR1430549 1 0.2036 0.6486 0.920 0.000 0.000 0.056 0.024
#> SRR612935 3 0.7483 0.2733 0.056 0.244 0.488 0.004 0.208
#> SRR661481 2 0.4992 0.6786 0.004 0.740 0.164 0.016 0.076
#> SRR1354117 2 0.6259 0.5215 0.000 0.560 0.304 0.016 0.120
#> SRR1393596 4 0.6428 0.5401 0.264 0.032 0.004 0.592 0.108
#> SRR1452164 1 0.4534 0.6182 0.796 0.004 0.080 0.032 0.088
#> SRR1070503 1 0.7584 0.0749 0.444 0.012 0.316 0.040 0.188
#> SRR1499894 3 0.1490 0.6676 0.004 0.008 0.952 0.004 0.032
#> SRR1082883 5 0.7881 0.6396 0.272 0.072 0.020 0.160 0.476
#> SRR1468271 1 0.7005 0.3749 0.584 0.004 0.204 0.084 0.124
#> SRR1332443 1 0.2932 0.6289 0.864 0.000 0.000 0.104 0.032
#> SRR810295 2 0.4675 0.6574 0.000 0.704 0.248 0.004 0.044
#> SRR662103 1 0.2650 0.6496 0.892 0.000 0.004 0.068 0.036
#> SRR1328620 3 0.7675 0.1600 0.056 0.276 0.440 0.004 0.224
#> SRR1396294 3 0.7898 0.2906 0.192 0.008 0.492 0.192 0.116
#> SRR1419917 1 0.2650 0.6496 0.892 0.000 0.004 0.068 0.036
#> SRR662114 3 0.4959 0.6333 0.048 0.056 0.764 0.004 0.128
#> SRR1489199 3 0.8572 0.0221 0.312 0.048 0.368 0.064 0.208
#> SRR813584 3 0.8838 -0.0743 0.048 0.256 0.376 0.096 0.224
#> SRR1069638 1 0.7894 0.0849 0.476 0.028 0.172 0.056 0.268
#> SRR614864 3 0.2788 0.6779 0.040 0.008 0.888 0.000 0.064
#> SRR1433392 1 0.7125 0.2821 0.556 0.012 0.188 0.040 0.204
#> SRR1377777 2 0.4572 0.4979 0.000 0.756 0.004 0.092 0.148
#> SRR2167710 3 0.8119 0.1725 0.312 0.016 0.420 0.092 0.160
#> SRR1401252 4 0.6080 0.6168 0.324 0.036 0.000 0.576 0.064
#> SRR1309963 4 0.6245 0.5930 0.380 0.008 0.056 0.528 0.028
#> SRR1338031 1 0.1808 0.6597 0.936 0.000 0.004 0.040 0.020
#> SRR1418628 2 0.4605 0.6582 0.000 0.708 0.248 0.004 0.040
#> SRR1486889 1 0.7402 0.3725 0.556 0.012 0.208 0.136 0.088
#> SRR1380393 1 0.3666 0.5654 0.824 0.000 0.012 0.132 0.032
#> SRR1319731 1 0.2605 0.6489 0.896 0.000 0.004 0.056 0.044
#> SRR1356468 4 0.7535 0.4278 0.344 0.012 0.144 0.448 0.052
#> SRR1337010 2 0.4295 0.6642 0.000 0.796 0.104 0.016 0.084
#> SRR1486520 1 0.6502 0.3315 0.600 0.024 0.024 0.084 0.268
#> SRR1486538 4 0.4709 0.6458 0.364 0.000 0.000 0.612 0.024
#> SRR1340486 4 0.6840 0.5490 0.364 0.008 0.080 0.500 0.048
#> SRR1377696 4 0.7853 -0.0931 0.088 0.208 0.000 0.416 0.288
#> SRR1465459 1 0.7610 0.0347 0.420 0.012 0.344 0.040 0.184
#> SRR1080270 3 0.1560 0.6583 0.004 0.020 0.948 0.000 0.028
#> SRR1312501 3 0.6278 0.6069 0.088 0.048 0.692 0.040 0.132
#> SRR1093148 3 0.8176 0.1496 0.076 0.120 0.432 0.044 0.328
#> SRR1467080 3 0.1493 0.6521 0.000 0.024 0.948 0.000 0.028
#> SRR1410866 2 0.4847 0.6607 0.000 0.704 0.240 0.012 0.044
#> SRR816475 2 0.9645 -0.1584 0.112 0.292 0.172 0.160 0.264
#> SRR1379198 4 0.4219 0.6260 0.416 0.000 0.000 0.584 0.000
#> SRR613342 3 0.5234 0.6202 0.044 0.100 0.748 0.004 0.104
#> SRR1452246 2 0.3771 0.5461 0.004 0.804 0.000 0.036 0.156
#> SRR1338836 2 0.2771 0.6749 0.000 0.860 0.128 0.000 0.012
#> SRR1369129 4 0.4350 0.6317 0.408 0.000 0.000 0.588 0.004
#> SRR1396616 3 0.3450 0.6728 0.084 0.000 0.848 0.008 0.060
#> SRR813824 3 0.1490 0.6687 0.008 0.004 0.952 0.004 0.032
#> SRR1082376 1 0.5912 0.4924 0.676 0.012 0.048 0.056 0.208
#> SRR1500891 4 0.5117 0.6424 0.340 0.008 0.000 0.616 0.036
#> SRR807543 1 0.7041 0.3017 0.568 0.012 0.176 0.040 0.204
#> SRR1091572 1 0.8681 -0.0378 0.444 0.088 0.148 0.076 0.244
#> SRR1346689 4 0.4817 0.6384 0.384 0.008 0.004 0.596 0.008
#> SRR1332424 5 0.7961 0.6333 0.288 0.068 0.020 0.172 0.452
#> SRR663729 4 0.6620 0.4239 0.228 0.024 0.000 0.560 0.188
#> SRR1097013 1 0.5939 0.4977 0.684 0.000 0.088 0.152 0.076
#> SRR613675 5 0.8205 0.5713 0.260 0.076 0.016 0.240 0.408
#> SRR1485357 4 0.6981 0.5379 0.356 0.008 0.084 0.496 0.056
#> SRR655816 3 0.2820 0.6756 0.052 0.004 0.892 0.008 0.044
#> SRR1500113 1 0.5034 0.5564 0.752 0.000 0.068 0.132 0.048
#> SRR1437622 2 0.9568 -0.2836 0.156 0.296 0.088 0.224 0.236
#> SRR1355172 3 0.7617 0.2967 0.284 0.004 0.484 0.112 0.116
#> SRR655531 1 0.6617 0.1580 0.556 0.024 0.016 0.092 0.312
#> SRR1338147 3 0.4229 0.6599 0.116 0.016 0.808 0.008 0.052
#> SRR1413329 3 0.8055 0.3033 0.240 0.056 0.480 0.040 0.184
#> SRR1485931 2 0.5740 0.3740 0.000 0.620 0.000 0.164 0.216
#> SRR1420873 1 0.5358 0.5777 0.736 0.000 0.112 0.072 0.080
#> SRR1333308 4 0.6186 0.6425 0.340 0.020 0.004 0.556 0.080
#> SRR1452033 1 0.4825 0.5802 0.772 0.008 0.108 0.020 0.092
#> SRR1467316 2 0.4791 0.4814 0.000 0.736 0.004 0.100 0.160
#> SRR809018 3 0.1331 0.6543 0.000 0.008 0.952 0.000 0.040
#> SRR1375351 2 0.4605 0.6582 0.000 0.708 0.248 0.004 0.040
#> SRR663440 3 0.5843 0.5419 0.208 0.016 0.668 0.012 0.096
#> SRR1471755 2 0.5102 0.6763 0.004 0.732 0.164 0.016 0.084
#> SRR808019 3 0.8081 0.2836 0.260 0.016 0.464 0.112 0.148
#> SRR1479133 3 0.1857 0.6786 0.060 0.000 0.928 0.004 0.008
#> SRR615069 3 0.8077 0.2257 0.076 0.092 0.484 0.064 0.284
#> SRR1456185 2 0.8438 0.3953 0.068 0.488 0.208 0.092 0.144
#> SRR1350069 3 0.7898 0.2906 0.192 0.008 0.492 0.192 0.116
#> SRR816316 1 0.6544 0.4114 0.636 0.012 0.140 0.044 0.168
#> SRR664795 3 0.7919 0.2801 0.284 0.012 0.464 0.108 0.132
#> SRR1490721 4 0.7221 0.1960 0.164 0.060 0.000 0.508 0.268
#> SRR810643 1 0.2588 0.6482 0.892 0.000 0.000 0.060 0.048
#> SRR1430333 5 0.9384 0.5162 0.216 0.088 0.224 0.128 0.344
#> SRR1085285 3 0.1857 0.6786 0.060 0.000 0.928 0.004 0.008
#> SRR1099072 3 0.3735 0.6681 0.100 0.000 0.828 0.008 0.064
#> SRR1317985 1 0.2116 0.6631 0.924 0.000 0.008 0.040 0.028
#> SRR1487340 1 0.2434 0.6562 0.908 0.000 0.008 0.048 0.036
#> SRR1420276 3 0.2522 0.6337 0.000 0.052 0.896 0.000 0.052
#> SRR1351347 3 0.4928 0.6398 0.060 0.060 0.764 0.000 0.116
#> SRR1405525 1 0.4312 0.6020 0.772 0.000 0.000 0.124 0.104
#> SRR1370329 1 0.0671 0.6539 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1465001 1 0.2605 0.6489 0.896 0.000 0.004 0.056 0.044
#> SRR1476525 2 0.4021 0.6830 0.000 0.780 0.168 0.000 0.052
#> SRR819610 2 0.8438 0.3953 0.068 0.488 0.208 0.092 0.144
#> SRR2157314 1 0.2774 0.6630 0.892 0.000 0.012 0.048 0.048
#> SRR1409465 2 0.2723 0.6742 0.000 0.864 0.124 0.000 0.012
#> SRR809987 4 0.4590 0.6054 0.420 0.000 0.000 0.568 0.012
#> SRR613639 3 0.4463 0.6565 0.112 0.000 0.788 0.024 0.076
#> SRR1402285 4 0.4976 0.6279 0.408 0.004 0.008 0.568 0.012
#> SRR1077038 1 0.6743 0.3789 0.612 0.012 0.148 0.044 0.184
#> SRR1405660 3 0.1728 0.6640 0.004 0.020 0.940 0.000 0.036
#> SRR1095455 3 0.7917 0.1930 0.072 0.244 0.440 0.008 0.236
#> SRR1394734 2 0.8753 0.1750 0.100 0.460 0.108 0.116 0.216
#> SRR1317771 1 0.7377 0.3790 0.560 0.012 0.204 0.136 0.088
#> SRR1365894 4 0.7476 0.2235 0.176 0.120 0.000 0.528 0.176
#> SRR1073581 3 0.7958 0.0890 0.360 0.012 0.400 0.100 0.128
#> SRR659804 1 0.2774 0.6630 0.892 0.000 0.012 0.048 0.048
#> SRR1345914 2 0.5750 0.6441 0.004 0.684 0.168 0.024 0.120
#> SRR1432186 2 0.4916 0.6657 0.004 0.756 0.136 0.020 0.084
#> SRR1473529 4 0.7853 -0.1007 0.088 0.208 0.000 0.416 0.288
#> SRR660764 3 0.6263 0.4022 0.028 0.208 0.616 0.000 0.148
#> SRR820448 1 0.6614 0.4012 0.628 0.012 0.144 0.044 0.172
#> SRR1328845 3 0.7898 0.2906 0.192 0.008 0.492 0.192 0.116
#> SRR1336415 4 0.4976 0.6279 0.408 0.004 0.008 0.568 0.012
#> SRR1379065 4 0.5016 0.6444 0.344 0.004 0.000 0.616 0.036
#> SRR1459190 3 0.6619 0.4680 0.236 0.004 0.604 0.076 0.080
#> SRR1346773 1 0.2719 0.6472 0.884 0.000 0.000 0.068 0.048
#> SRR1499521 3 0.8043 0.2718 0.264 0.012 0.460 0.116 0.148
#> SRR1440898 2 0.3953 0.6804 0.000 0.792 0.148 0.000 0.060
#> SRR1347459 3 0.4428 0.6505 0.040 0.056 0.804 0.004 0.096
#> SRR1081209 2 0.3706 0.5959 0.000 0.844 0.032 0.052 0.072
#> SRR1400202 1 0.0771 0.6527 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1333395 4 0.6662 0.1988 0.164 0.080 0.000 0.616 0.140
#> SRR1309248 4 0.7517 0.1676 0.164 0.128 0.000 0.524 0.184
#> SRR809161 3 0.2869 0.6772 0.064 0.008 0.888 0.004 0.036
#> SRR1316320 4 0.8022 -0.1705 0.192 0.100 0.004 0.420 0.284
#> SRR1432629 2 0.4351 0.5678 0.000 0.776 0.020 0.040 0.164
#> SRR1498931 1 0.1299 0.6607 0.960 0.000 0.012 0.020 0.008
#> SRR1416578 4 0.4604 0.5976 0.428 0.000 0.000 0.560 0.012
#> SRR1405547 3 0.1331 0.6543 0.000 0.008 0.952 0.000 0.040
#> SRR1470534 4 0.4219 0.6260 0.416 0.000 0.000 0.584 0.000
#> SRR1380764 1 0.4045 0.6441 0.824 0.000 0.036 0.064 0.076
#> SRR1309160 3 0.1012 0.6719 0.020 0.000 0.968 0.000 0.012
#> SRR663489 3 0.1331 0.6543 0.000 0.008 0.952 0.000 0.040
#> SRR1500450 1 0.7132 0.2080 0.540 0.000 0.132 0.248 0.080
#> SRR1078489 3 0.9184 -0.2432 0.224 0.096 0.344 0.080 0.256
#> SRR1332648 4 0.5081 0.6315 0.404 0.008 0.008 0.568 0.012
#> SRR660614 3 0.6893 -0.0218 0.012 0.352 0.484 0.016 0.136
#> SRR1470420 2 0.5313 0.3375 0.000 0.504 0.452 0.004 0.040
#> SRR1475566 1 0.0771 0.6527 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1477949 1 0.2984 0.6204 0.860 0.000 0.000 0.108 0.032
#> SRR1481419 2 0.4947 0.6705 0.004 0.748 0.148 0.016 0.084
#> SRR1464766 1 0.2507 0.6623 0.908 0.000 0.020 0.028 0.044
#> SRR615946 3 0.2109 0.6735 0.016 0.012 0.928 0.004 0.040
#> SRR1446481 2 0.4226 0.6807 0.000 0.764 0.176 0.000 0.060
#> SRR1467656 2 0.2909 0.6769 0.000 0.848 0.140 0.000 0.012
#> SRR1402962 1 0.7378 -0.1326 0.480 0.028 0.044 0.100 0.348
#> SRR660224 2 0.4797 0.6667 0.000 0.736 0.176 0.008 0.080
#> SRR665586 1 0.2889 0.6523 0.872 0.000 0.000 0.084 0.044
#> SRR1347166 5 0.9004 0.6173 0.260 0.076 0.116 0.152 0.396
#> SRR1485722 5 0.8478 0.6216 0.264 0.076 0.092 0.108 0.460
#> SRR1415316 1 0.3051 0.6188 0.852 0.000 0.000 0.120 0.028
#> SRR613390 1 0.3239 0.6461 0.852 0.000 0.000 0.068 0.080
#> SRR661108 3 0.1314 0.6665 0.012 0.012 0.960 0.000 0.016
#> SRR2170173 3 0.8159 0.1755 0.312 0.020 0.420 0.088 0.160
#> SRR817329 1 0.4460 0.6226 0.792 0.000 0.044 0.116 0.048
#> SRR1401990 4 0.8197 0.2640 0.328 0.008 0.192 0.372 0.100
#> SRR1467745 2 0.9476 -0.0656 0.096 0.324 0.176 0.144 0.260
#> SRR1471795 2 0.5939 0.6317 0.024 0.700 0.136 0.028 0.112
#> SRR1415637 2 0.1943 0.6407 0.000 0.924 0.056 0.000 0.020
#> SRR813137 1 0.4523 0.6139 0.796 0.000 0.080 0.068 0.056
#> SRR1314873 1 0.2653 0.6377 0.880 0.000 0.000 0.096 0.024
#> SRR1401211 1 0.7405 0.2703 0.524 0.000 0.196 0.188 0.092
#> SRR1419692 4 0.5746 0.6279 0.388 0.012 0.016 0.552 0.032
#> SRR818797 3 0.5620 0.5374 0.208 0.004 0.676 0.016 0.096
#> SRR2164608 3 0.5541 0.6380 0.088 0.036 0.736 0.020 0.120
#> SRR1455586 3 0.4597 0.3652 0.000 0.260 0.696 0.000 0.044
#> SRR819459 3 0.1701 0.6618 0.012 0.016 0.944 0.000 0.028
#> SRR1488939 2 0.4791 0.4814 0.000 0.736 0.004 0.100 0.160
#> SRR1433232 2 0.3130 0.5505 0.000 0.856 0.000 0.048 0.096
#> SRR1385501 1 0.6571 0.3916 0.624 0.012 0.144 0.036 0.184
#> SRR1361652 5 0.8623 0.5008 0.196 0.184 0.016 0.204 0.400
#> SRR1437119 1 0.0963 0.6554 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1478547 3 0.1251 0.6554 0.000 0.008 0.956 0.000 0.036
#> SRR1430910 3 0.8988 -0.1746 0.180 0.088 0.360 0.076 0.296
#> SRR1310584 1 0.1750 0.6562 0.936 0.000 0.000 0.036 0.028
#> SRR1500216 1 0.7268 0.0268 0.460 0.028 0.008 0.324 0.180
#> SRR1486762 3 0.5075 0.6395 0.112 0.008 0.752 0.020 0.108
#> SRR1480854 4 0.6969 0.2521 0.168 0.044 0.000 0.532 0.256
#> SRR1489394 4 0.4390 0.6162 0.428 0.000 0.000 0.568 0.004
#> SRR1418085 4 0.5145 0.6272 0.404 0.004 0.008 0.564 0.020
#> SRR1340221 4 0.4350 0.6317 0.408 0.000 0.000 0.588 0.004
#> SRR1473058 2 0.9645 -0.1584 0.112 0.292 0.172 0.160 0.264
#> SRR1405165 3 0.4791 0.6317 0.032 0.044 0.784 0.020 0.120
#> SRR1433004 1 0.3397 0.6478 0.848 0.000 0.004 0.068 0.080
#> SRR1471477 1 0.7406 0.2752 0.520 0.000 0.208 0.184 0.088
#> SRR1098567 2 0.5333 0.6280 0.000 0.628 0.300 0.004 0.068
#> SRR1098712 3 0.7898 0.2906 0.192 0.008 0.492 0.192 0.116
#> SRR1455038 1 0.4254 0.5589 0.776 0.004 0.000 0.064 0.156
#> SRR1375248 3 0.4552 0.3566 0.000 0.264 0.696 0.000 0.040
#> SRR1403005 3 0.2728 0.6765 0.068 0.000 0.888 0.004 0.040
#> SRR1348378 2 0.7068 0.5132 0.008 0.492 0.340 0.040 0.120
#> SRR1413541 1 0.2685 0.6417 0.880 0.000 0.000 0.092 0.028
#> SRR1392943 4 0.6609 0.4450 0.224 0.020 0.004 0.572 0.180
#> SRR1475192 3 0.1772 0.6638 0.008 0.020 0.940 0.000 0.032
#> SRR1432085 3 0.5601 -0.0980 0.000 0.404 0.528 0.004 0.064
#> SRR1452468 5 0.9407 0.5187 0.240 0.088 0.196 0.136 0.340
#> SRR1347060 3 0.1568 0.6559 0.000 0.020 0.944 0.000 0.036
#> SRR1414139 3 0.5512 0.0454 0.000 0.364 0.568 0.004 0.064
#> SRR1447962 3 0.5350 -0.2602 0.000 0.460 0.488 0.000 0.052
#> SRR1444324 2 0.5479 0.3370 0.000 0.508 0.436 0.004 0.052
#> SRR1415004 1 0.3427 0.5705 0.836 0.000 0.008 0.128 0.028
#> SRR1413436 1 0.7377 0.3790 0.560 0.012 0.204 0.136 0.088
#> SRR1311266 3 0.8964 -0.1854 0.300 0.068 0.312 0.072 0.248
#> SRR1343302 4 0.5839 0.6215 0.392 0.012 0.020 0.544 0.032
#> SRR1373746 1 0.1943 0.6490 0.924 0.000 0.000 0.056 0.020
#> SRR1429678 1 0.2680 0.6630 0.904 0.008 0.012 0.036 0.040
#> SRR1469413 3 0.5600 -0.2728 0.000 0.456 0.480 0.004 0.060
#> SRR1405331 1 0.7011 0.3080 0.572 0.012 0.172 0.040 0.204
#> SRR1345609 1 0.2249 0.6242 0.896 0.000 0.000 0.096 0.008
#> SRR1380208 5 0.9047 0.4295 0.124 0.200 0.052 0.272 0.352
#> SRR1322840 4 0.4880 0.6449 0.348 0.000 0.000 0.616 0.036
#> SRR1399797 3 0.2308 0.6648 0.004 0.036 0.912 0.000 0.048
#> SRR1416654 3 0.2722 0.6781 0.040 0.008 0.892 0.000 0.060
#> SRR1315081 3 0.1648 0.6503 0.000 0.020 0.940 0.000 0.040
#> SRR1369196 3 0.1753 0.6510 0.000 0.032 0.936 0.000 0.032
#> SRR1400847 1 0.2507 0.6623 0.908 0.000 0.020 0.028 0.044
#> SRR1365291 3 0.7299 0.2665 0.288 0.016 0.508 0.036 0.152
#> SRR1367920 4 0.6969 0.2521 0.168 0.044 0.000 0.532 0.256
#> SRR1366648 3 0.1444 0.6532 0.000 0.012 0.948 0.000 0.040
#> SRR1441679 2 0.2864 0.6763 0.000 0.852 0.136 0.000 0.012
#> SRR1082173 3 0.5541 0.6380 0.088 0.036 0.736 0.020 0.120
#> SRR1363968 1 0.6860 0.3840 0.588 0.000 0.168 0.172 0.072
#> SRR814387 1 0.2588 0.6482 0.892 0.000 0.000 0.060 0.048
#> SRR657599 3 0.8176 0.2812 0.256 0.020 0.460 0.112 0.152
#> SRR1386689 4 0.6840 0.5490 0.364 0.008 0.080 0.500 0.048
#> SRR1395575 3 0.2075 0.6791 0.032 0.000 0.924 0.004 0.040
#> SRR1453811 3 0.4761 0.6322 0.132 0.004 0.768 0.020 0.076
#> SRR1441159 1 0.3689 0.6194 0.828 0.004 0.000 0.092 0.076
#> SRR1403154 4 0.5839 0.6215 0.392 0.012 0.020 0.544 0.032
#> SRR1468722 3 0.1331 0.6554 0.000 0.008 0.952 0.000 0.040
#> SRR1310275 3 0.7313 0.2572 0.292 0.016 0.504 0.036 0.152
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 3 0.775 0.2249 0.212 0.000 0.420 0.172 0.172 0.024
#> SRR1331708 5 0.796 0.0584 0.128 0.040 0.004 0.332 0.352 0.144
#> SRR1464258 1 0.575 0.4087 0.624 0.004 0.132 0.020 0.212 0.008
#> SRR1454201 5 0.610 0.2270 0.388 0.008 0.032 0.072 0.492 0.008
#> SRR661589 3 0.387 0.6490 0.080 0.004 0.808 0.024 0.084 0.000
#> SRR1456229 1 0.377 0.5811 0.780 0.000 0.000 0.048 0.164 0.008
#> SRR1315165 4 0.802 0.2813 0.132 0.108 0.076 0.468 0.204 0.012
#> SRR1488960 1 0.329 0.6624 0.824 0.000 0.000 0.132 0.032 0.012
#> SRR1417809 4 0.419 0.6912 0.244 0.004 0.000 0.716 0.020 0.016
#> SRR1094457 4 0.434 0.6957 0.220 0.012 0.008 0.724 0.036 0.000
#> SRR1095575 3 0.790 0.1331 0.288 0.012 0.392 0.072 0.196 0.040
#> SRR1315931 1 0.569 0.4190 0.632 0.004 0.128 0.020 0.208 0.008
#> SRR1430066 3 0.154 0.6659 0.000 0.012 0.944 0.000 0.020 0.024
#> SRR1431037 3 0.200 0.6722 0.004 0.016 0.928 0.004 0.024 0.024
#> SRR1395554 3 0.221 0.6669 0.004 0.024 0.916 0.004 0.012 0.040
#> SRR818002 2 0.540 0.5451 0.012 0.728 0.088 0.032 0.100 0.040
#> SRR1344143 6 0.443 0.4483 0.000 0.352 0.000 0.024 0.008 0.616
#> SRR1486845 4 0.450 0.6963 0.204 0.008 0.000 0.720 0.060 0.008
#> SRR1362866 5 0.657 0.3622 0.328 0.020 0.024 0.136 0.488 0.004
#> SRR1490740 1 0.203 0.6851 0.912 0.000 0.004 0.060 0.024 0.000
#> SRR1446627 2 0.296 0.5635 0.000 0.864 0.064 0.000 0.016 0.056
#> SRR1456138 2 0.507 0.1794 0.000 0.648 0.008 0.016 0.060 0.268
#> SRR1416248 1 0.299 0.6776 0.852 0.000 0.000 0.084 0.060 0.004
#> SRR1383907 4 0.822 -0.1056 0.096 0.116 0.052 0.376 0.328 0.032
#> SRR1311018 1 0.184 0.6847 0.916 0.000 0.000 0.072 0.008 0.004
#> SRR1375699 6 0.908 0.3377 0.064 0.188 0.068 0.264 0.108 0.308
#> SRR1429846 3 0.529 0.5507 0.168 0.016 0.688 0.024 0.104 0.000
#> SRR613550 3 0.318 0.6671 0.060 0.008 0.860 0.020 0.052 0.000
#> SRR1348402 1 0.324 0.6842 0.848 0.000 0.008 0.080 0.056 0.008
#> SRR1345146 4 0.745 -0.2334 0.088 0.048 0.004 0.436 0.096 0.328
#> SRR1324025 3 0.589 0.4897 0.200 0.024 0.636 0.024 0.112 0.004
#> SRR1318879 3 0.621 0.5720 0.052 0.088 0.656 0.040 0.152 0.012
#> SRR820755 1 0.676 0.0955 0.440 0.008 0.284 0.024 0.240 0.004
#> SRR1485830 4 0.372 0.6993 0.248 0.000 0.000 0.732 0.012 0.008
#> SRR599313 1 0.778 -0.0108 0.420 0.016 0.008 0.204 0.220 0.132
#> SRR612263 1 0.479 0.5849 0.732 0.000 0.000 0.096 0.124 0.048
#> SRR1415398 3 0.221 0.6736 0.044 0.004 0.912 0.012 0.028 0.000
#> SRR1326205 4 0.492 0.6888 0.224 0.012 0.016 0.700 0.028 0.020
#> SRR1421327 4 0.663 0.2605 0.080 0.036 0.000 0.500 0.332 0.052
#> SRR1083311 3 0.238 0.6670 0.000 0.028 0.908 0.008 0.032 0.024
#> SRR1499303 4 0.677 0.5904 0.148 0.084 0.024 0.620 0.084 0.040
#> SRR1079522 1 0.716 0.0728 0.464 0.012 0.004 0.292 0.132 0.096
#> SRR1452935 3 0.731 0.3198 0.076 0.088 0.504 0.032 0.276 0.024
#> SRR1379495 1 0.260 0.6871 0.888 0.000 0.024 0.068 0.016 0.004
#> SRR1470459 2 0.572 0.4600 0.000 0.540 0.352 0.004 0.036 0.068
#> SRR661361 3 0.304 0.6805 0.036 0.020 0.876 0.008 0.052 0.008
#> SRR615778 5 0.750 0.5040 0.160 0.060 0.092 0.112 0.552 0.024
#> SRR1447564 1 0.330 0.6621 0.832 0.000 0.000 0.116 0.032 0.020
#> SRR1455195 5 0.603 0.2027 0.396 0.008 0.024 0.076 0.488 0.008
#> SRR655182 1 0.524 0.5739 0.700 0.000 0.040 0.184 0.040 0.036
#> SRR1335140 6 0.801 0.2753 0.036 0.132 0.000 0.312 0.196 0.324
#> SRR1433555 3 0.279 0.6672 0.000 0.048 0.884 0.008 0.040 0.020
#> SRR1308650 2 0.775 0.3359 0.052 0.488 0.216 0.040 0.164 0.040
#> SRR1388354 1 0.433 0.6062 0.756 0.000 0.012 0.172 0.024 0.036
#> SRR1317446 3 0.239 0.6516 0.000 0.032 0.900 0.000 0.020 0.048
#> SRR1413602 3 0.339 0.6696 0.000 0.064 0.844 0.008 0.068 0.016
#> SRR1479955 2 0.496 -0.1959 0.000 0.520 0.000 0.016 0.036 0.428
#> SRR809853 1 0.390 0.6449 0.804 0.000 0.000 0.096 0.060 0.040
#> SRR661313 3 0.277 0.6705 0.048 0.008 0.884 0.016 0.044 0.000
#> SRR1499935 4 0.677 0.5904 0.148 0.084 0.024 0.620 0.084 0.040
#> SRR1447303 3 0.571 0.5251 0.160 0.024 0.656 0.016 0.140 0.004
#> SRR1429408 3 0.824 -0.1881 0.012 0.268 0.316 0.096 0.268 0.040
#> SRR1433950 1 0.253 0.6772 0.884 0.000 0.000 0.080 0.024 0.012
#> SRR1362081 2 0.503 0.5562 0.000 0.660 0.236 0.000 0.020 0.084
#> SRR1409854 1 0.784 0.0979 0.388 0.016 0.272 0.108 0.204 0.012
#> SRR1435229 5 0.814 0.2823 0.136 0.076 0.308 0.056 0.396 0.028
#> SRR1085996 1 0.253 0.6758 0.884 0.000 0.000 0.080 0.024 0.012
#> SRR1414229 5 0.541 0.4004 0.060 0.136 0.088 0.016 0.700 0.000
#> SRR1400974 3 0.248 0.6479 0.000 0.016 0.892 0.000 0.028 0.064
#> SRR1399971 1 0.195 0.6852 0.912 0.000 0.000 0.072 0.004 0.012
#> SRR613927 3 0.413 0.6521 0.088 0.008 0.804 0.040 0.056 0.004
#> SRR1457854 1 0.433 0.6062 0.756 0.000 0.012 0.172 0.024 0.036
#> SRR1473714 1 0.813 -0.1158 0.352 0.016 0.012 0.240 0.216 0.164
#> SRR813776 1 0.676 0.0955 0.440 0.008 0.284 0.024 0.240 0.004
#> SRR808196 4 0.601 0.5799 0.204 0.008 0.080 0.632 0.068 0.008
#> SRR1101085 4 0.496 0.6527 0.172 0.008 0.000 0.712 0.076 0.032
#> SRR614395 1 0.575 0.4087 0.624 0.004 0.132 0.020 0.212 0.008
#> SRR1478251 4 0.324 0.7015 0.244 0.000 0.000 0.752 0.004 0.000
#> SRR1370551 2 0.562 0.5068 0.000 0.572 0.316 0.000 0.056 0.056
#> SRR1362310 1 0.218 0.6856 0.908 0.000 0.008 0.064 0.016 0.004
#> SRR665310 3 0.379 0.6474 0.084 0.004 0.812 0.020 0.080 0.000
#> SRR1420109 3 0.538 0.6051 0.104 0.016 0.720 0.036 0.108 0.016
#> SRR1330920 1 0.616 0.3075 0.552 0.004 0.160 0.024 0.256 0.004
#> SRR1419539 3 0.438 0.6006 0.004 0.080 0.792 0.012 0.052 0.060
#> SRR1359447 2 0.650 0.3276 0.000 0.472 0.248 0.000 0.036 0.244
#> SRR1347259 4 0.500 0.6192 0.156 0.004 0.000 0.716 0.056 0.068
#> SRR613915 3 0.429 0.6470 0.096 0.016 0.788 0.028 0.072 0.000
#> SRR1384395 3 0.374 0.6070 0.000 0.076 0.816 0.000 0.036 0.072
#> SRR821715 3 0.268 0.6704 0.048 0.008 0.888 0.012 0.044 0.000
#> SRR1478228 1 0.283 0.6789 0.868 0.000 0.004 0.080 0.044 0.004
#> SRR1445637 1 0.648 0.5276 0.608 0.000 0.096 0.176 0.084 0.036
#> SRR608150 5 0.585 0.4873 0.168 0.036 0.012 0.124 0.652 0.008
#> SRR1096383 3 0.760 0.2615 0.200 0.000 0.448 0.184 0.144 0.024
#> SRR1341480 4 0.611 0.4598 0.120 0.016 0.000 0.588 0.240 0.036
#> SRR1341344 1 0.484 0.5468 0.696 0.000 0.000 0.152 0.140 0.012
#> SRR1326270 3 0.237 0.6789 0.032 0.008 0.912 0.008 0.028 0.012
#> SRR1498838 3 0.209 0.6702 0.004 0.020 0.924 0.004 0.020 0.028
#> SRR1416313 3 0.262 0.6783 0.016 0.028 0.900 0.004 0.036 0.016
#> SRR808566 5 0.851 0.1585 0.076 0.288 0.068 0.220 0.324 0.024
#> SRR1430270 4 0.319 0.7034 0.236 0.000 0.000 0.760 0.004 0.000
#> SRR1367825 3 0.248 0.6479 0.000 0.016 0.892 0.000 0.028 0.064
#> SRR613533 3 0.784 0.1773 0.032 0.236 0.392 0.012 0.260 0.068
#> SRR661267 3 0.781 0.2453 0.200 0.004 0.432 0.172 0.168 0.024
#> SRR810665 2 0.344 0.6027 0.000 0.828 0.108 0.000 0.036 0.028
#> SRR1407250 5 0.597 0.5124 0.168 0.040 0.072 0.064 0.656 0.000
#> SRR1420067 1 0.725 0.3469 0.496 0.004 0.136 0.140 0.212 0.012
#> SRR1473632 1 0.390 0.6449 0.804 0.000 0.000 0.096 0.060 0.040
#> SRR812536 3 0.282 0.6656 0.008 0.060 0.880 0.000 0.036 0.016
#> SRR1370850 2 0.554 0.5522 0.004 0.704 0.112 0.020 0.096 0.064
#> SRR1486195 2 0.504 0.5520 0.000 0.656 0.260 0.004 0.028 0.052
#> SRR1407671 2 0.905 -0.2187 0.036 0.236 0.232 0.212 0.232 0.052
#> SRR1446375 3 0.863 0.1122 0.212 0.092 0.364 0.060 0.236 0.036
#> SRR1465230 4 0.383 0.7034 0.232 0.004 0.000 0.736 0.028 0.000
#> SRR614119 3 0.798 0.1448 0.240 0.004 0.384 0.180 0.168 0.024
#> SRR1356101 3 0.597 0.0860 0.000 0.336 0.532 0.004 0.044 0.084
#> SRR1404209 1 0.740 0.3684 0.496 0.004 0.192 0.168 0.116 0.024
#> SRR1392676 2 0.250 0.5034 0.000 0.884 0.020 0.000 0.012 0.084
#> SRR665538 3 0.773 0.2576 0.200 0.004 0.444 0.180 0.148 0.024
#> SRR660510 3 0.176 0.6695 0.004 0.024 0.936 0.000 0.012 0.024
#> SRR1445655 4 0.495 0.6756 0.180 0.016 0.004 0.720 0.052 0.028
#> SRR658953 5 0.821 0.0124 0.144 0.096 0.012 0.072 0.392 0.284
#> SRR2166459 1 0.635 0.5345 0.620 0.000 0.080 0.176 0.088 0.036
#> SRR1070713 2 0.704 0.1549 0.012 0.452 0.068 0.056 0.368 0.044
#> SRR1485312 3 0.154 0.6659 0.000 0.012 0.944 0.000 0.020 0.024
#> SRR1317631 3 0.795 0.2313 0.132 0.008 0.436 0.244 0.132 0.048
#> SRR1488610 1 0.441 0.6200 0.760 0.000 0.000 0.100 0.108 0.032
#> SRR1330588 3 0.692 0.2494 0.264 0.024 0.492 0.036 0.180 0.004
#> SRR1316367 1 0.644 -0.0765 0.456 0.012 0.000 0.100 0.384 0.048
#> SRR1433926 1 0.221 0.6782 0.912 0.000 0.004 0.048 0.020 0.016
#> SRR1091302 4 0.500 0.6861 0.212 0.016 0.012 0.700 0.048 0.012
#> SRR818263 1 0.670 0.1419 0.464 0.008 0.248 0.024 0.252 0.004
#> SRR1404909 4 0.714 0.2786 0.084 0.052 0.000 0.544 0.168 0.152
#> SRR663076 1 0.661 0.4499 0.580 0.000 0.112 0.204 0.072 0.032
#> SRR1323577 2 0.580 0.5353 0.004 0.672 0.108 0.016 0.140 0.060
#> SRR1442422 4 0.383 0.7034 0.232 0.004 0.000 0.736 0.028 0.000
#> SRR1465893 1 0.281 0.6858 0.868 0.000 0.008 0.092 0.028 0.004
#> SRR654862 1 0.606 0.3248 0.548 0.008 0.060 0.040 0.332 0.012
#> SRR1407112 4 0.535 0.6411 0.200 0.008 0.064 0.680 0.044 0.004
#> SRR1332969 3 0.387 0.6490 0.080 0.004 0.808 0.024 0.084 0.000
#> SRR1353199 3 0.277 0.6705 0.048 0.008 0.884 0.016 0.044 0.000
#> SRR1378885 3 0.629 0.4180 0.232 0.024 0.588 0.032 0.120 0.004
#> SRR665357 3 0.496 0.5523 0.000 0.152 0.720 0.004 0.072 0.052
#> SRR662186 2 0.636 0.3775 0.000 0.528 0.232 0.004 0.036 0.200
#> SRR1501020 3 0.442 0.6315 0.100 0.000 0.772 0.024 0.092 0.012
#> SRR1347819 3 0.240 0.6640 0.004 0.028 0.908 0.004 0.020 0.036
#> SRR1480813 2 0.495 0.6034 0.000 0.736 0.120 0.012 0.084 0.048
#> SRR1472576 5 0.844 0.1307 0.080 0.236 0.048 0.296 0.312 0.028
#> SRR1431781 4 0.802 0.2813 0.132 0.108 0.076 0.468 0.204 0.012
#> SRR1452270 3 0.219 0.6703 0.000 0.024 0.916 0.004 0.032 0.024
#> SRR1500472 3 0.854 0.0673 0.140 0.096 0.364 0.068 0.296 0.036
#> SRR1417632 4 0.792 -0.3071 0.040 0.096 0.000 0.340 0.236 0.288
#> SRR1350153 2 0.465 0.5792 0.000 0.716 0.188 0.000 0.024 0.072
#> SRR1458113 5 0.594 0.3805 0.060 0.152 0.120 0.012 0.652 0.004
#> SRR1326579 5 0.605 0.2180 0.388 0.004 0.004 0.128 0.464 0.012
#> SRR1349363 6 0.660 0.4737 0.040 0.076 0.000 0.296 0.056 0.532
#> SRR1096712 3 0.245 0.6693 0.000 0.028 0.904 0.008 0.036 0.024
#> SRR1090407 3 0.233 0.6748 0.040 0.008 0.908 0.012 0.032 0.000
#> SRR1083752 2 0.707 0.4647 0.000 0.504 0.268 0.048 0.120 0.060
#> SRR1377599 4 0.642 0.3071 0.088 0.024 0.000 0.528 0.312 0.048
#> SRR1488449 3 0.357 0.6653 0.068 0.012 0.836 0.020 0.064 0.000
#> SRR1318354 3 0.761 0.0931 0.024 0.280 0.372 0.008 0.260 0.056
#> SRR1359062 3 0.330 0.6594 0.000 0.060 0.852 0.004 0.052 0.032
#> SRR1398924 5 0.789 0.1725 0.164 0.100 0.004 0.084 0.476 0.172
#> SRR663783 3 0.267 0.6577 0.000 0.024 0.888 0.004 0.028 0.056
#> SRR1319204 3 0.742 -0.0863 0.012 0.316 0.420 0.008 0.100 0.144
#> SRR1369070 2 0.339 0.4229 0.000 0.820 0.012 0.008 0.020 0.140
#> SRR615659 1 0.221 0.6782 0.912 0.000 0.004 0.048 0.020 0.016
#> SRR1337449 2 0.382 0.6086 0.000 0.796 0.128 0.000 0.056 0.020
#> SRR1316982 3 0.605 0.2607 0.000 0.256 0.580 0.004 0.056 0.104
#> SRR1498595 4 0.787 -0.3649 0.036 0.096 0.000 0.332 0.228 0.308
#> SRR1377423 3 0.465 0.6439 0.080 0.008 0.772 0.024 0.096 0.020
#> SRR1312310 2 0.436 0.5923 0.000 0.748 0.172 0.004 0.020 0.056
#> SRR1485613 1 0.595 0.5370 0.648 0.004 0.136 0.116 0.092 0.004
#> SRR1338426 3 0.469 0.6481 0.028 0.080 0.768 0.008 0.100 0.016
#> SRR1353309 3 0.490 0.6419 0.032 0.064 0.752 0.012 0.124 0.016
#> SRR658941 3 0.795 0.2462 0.180 0.012 0.432 0.164 0.188 0.024
#> SRR1101643 1 0.388 0.6426 0.800 0.000 0.000 0.116 0.040 0.044
#> SRR1401468 3 0.775 0.2249 0.212 0.000 0.420 0.172 0.172 0.024
#> SRR1368874 2 0.355 0.5937 0.000 0.808 0.108 0.000 0.004 0.080
#> SRR1324085 5 0.849 0.1787 0.056 0.296 0.136 0.148 0.344 0.020
#> SRR1363858 1 0.807 -0.1204 0.348 0.016 0.008 0.244 0.220 0.164
#> SRR819820 3 0.625 0.5865 0.064 0.064 0.668 0.052 0.132 0.020
#> SRR1337342 1 0.779 0.0398 0.396 0.020 0.140 0.124 0.308 0.012
#> SRR655206 3 0.432 0.6012 0.004 0.080 0.796 0.012 0.052 0.056
#> SRR1387013 2 0.649 0.1721 0.004 0.528 0.016 0.048 0.304 0.100
#> SRR1317410 1 0.275 0.6790 0.868 0.000 0.004 0.080 0.048 0.000
#> SRR608198 5 0.600 0.2531 0.372 0.004 0.004 0.124 0.484 0.012
#> SRR1440161 2 0.465 0.5792 0.000 0.716 0.188 0.000 0.024 0.072
#> SRR1343741 2 0.339 0.4229 0.000 0.820 0.012 0.008 0.020 0.140
#> SRR1381288 2 0.296 0.5635 0.000 0.864 0.064 0.000 0.016 0.056
#> SRR1415379 4 0.446 0.6712 0.264 0.000 0.000 0.684 0.032 0.020
#> SRR1099622 2 0.606 0.3753 0.000 0.480 0.392 0.004 0.068 0.056
#> SRR663197 3 0.270 0.6690 0.000 0.056 0.884 0.004 0.044 0.012
#> SRR1394836 3 0.432 0.6012 0.004 0.080 0.796 0.012 0.052 0.056
#> SRR661699 3 0.405 0.6743 0.036 0.024 0.828 0.020 0.056 0.036
#> SRR813680 3 0.770 0.2451 0.204 0.000 0.432 0.172 0.168 0.024
#> SRR1410678 1 0.218 0.6856 0.908 0.000 0.008 0.064 0.016 0.004
#> SRR1378109 4 0.444 0.6933 0.220 0.012 0.012 0.720 0.036 0.000
#> SRR1499174 1 0.516 0.6021 0.724 0.000 0.068 0.068 0.124 0.016
#> SRR1311486 2 0.382 0.6086 0.000 0.796 0.128 0.000 0.056 0.020
#> SRR1382851 5 0.794 0.0710 0.024 0.312 0.048 0.148 0.404 0.064
#> SRR1433410 5 0.610 0.4862 0.184 0.028 0.020 0.116 0.636 0.016
#> SRR661167 3 0.211 0.6803 0.024 0.008 0.924 0.008 0.028 0.008
#> SRR1432518 3 0.731 0.3198 0.076 0.088 0.504 0.032 0.276 0.024
#> SRR660462 3 0.239 0.6526 0.000 0.032 0.900 0.000 0.020 0.048
#> SRR1374608 3 0.906 0.0305 0.116 0.132 0.352 0.216 0.144 0.040
#> SRR657949 3 0.474 0.6239 0.116 0.016 0.752 0.032 0.084 0.000
#> SRR1308882 4 0.454 0.6877 0.192 0.008 0.000 0.728 0.056 0.016
#> SRR655768 3 0.790 0.0722 0.308 0.012 0.348 0.108 0.208 0.016
#> SRR1485870 4 0.745 -0.2334 0.088 0.048 0.004 0.436 0.096 0.328
#> SRR1444138 3 0.807 0.0478 0.296 0.020 0.340 0.096 0.228 0.020
#> SRR1417342 4 0.702 0.0269 0.252 0.000 0.000 0.404 0.072 0.272
#> SRR1470193 4 0.492 0.6888 0.224 0.012 0.016 0.700 0.028 0.020
#> SRR1091380 3 0.625 0.5865 0.064 0.064 0.668 0.052 0.132 0.020
#> SRR1099096 1 0.276 0.6852 0.872 0.000 0.008 0.088 0.028 0.004
#> SRR1313583 4 0.376 0.6973 0.256 0.000 0.000 0.724 0.012 0.008
#> SRR1467102 3 0.414 0.5762 0.000 0.112 0.788 0.004 0.032 0.064
#> SRR1485416 4 0.610 0.4547 0.124 0.016 0.000 0.584 0.244 0.032
#> SRR818821 3 0.784 0.1773 0.032 0.236 0.392 0.012 0.260 0.068
#> SRR809963 1 0.575 0.4087 0.624 0.004 0.132 0.020 0.212 0.008
#> SRR1072247 1 0.260 0.6871 0.888 0.000 0.024 0.068 0.016 0.004
#> SRR1353710 4 0.426 0.6918 0.220 0.004 0.000 0.728 0.016 0.032
#> SRR1445259 3 0.792 0.1465 0.036 0.240 0.376 0.012 0.268 0.068
#> SRR1408393 3 0.668 0.4185 0.212 0.008 0.572 0.072 0.120 0.016
#> SRR1361522 1 0.223 0.6768 0.912 0.000 0.004 0.044 0.020 0.020
#> SRR1368597 1 0.450 0.6490 0.772 0.000 0.044 0.116 0.052 0.016
#> SRR1309680 2 0.545 0.4756 0.008 0.724 0.044 0.040 0.080 0.104
#> SRR1310542 3 0.256 0.6518 0.000 0.036 0.892 0.000 0.028 0.044
#> SRR1333485 4 0.460 0.6862 0.192 0.008 0.000 0.724 0.060 0.016
#> SRR1406437 3 0.818 -0.0554 0.012 0.204 0.372 0.108 0.264 0.040
#> SRR1354931 3 0.229 0.6791 0.028 0.008 0.916 0.008 0.028 0.012
#> SRR1391856 3 0.583 0.3671 0.000 0.196 0.632 0.004 0.100 0.068
#> SRR1446738 2 0.738 0.1667 0.008 0.412 0.144 0.056 0.348 0.032
#> SRR1309032 2 0.570 0.4672 0.000 0.548 0.344 0.004 0.036 0.068
#> SRR1388145 2 0.361 0.6071 0.000 0.816 0.112 0.000 0.048 0.024
#> SRR1432611 2 0.469 0.5730 0.000 0.696 0.224 0.000 0.028 0.052
#> SRR815869 3 0.265 0.6458 0.000 0.024 0.884 0.000 0.028 0.064
#> SRR613150 3 0.262 0.6586 0.004 0.028 0.892 0.000 0.028 0.048
#> SRR1375329 5 0.862 0.2801 0.184 0.084 0.288 0.052 0.344 0.048
#> SRR1387921 1 0.302 0.6589 0.840 0.000 0.000 0.128 0.020 0.012
#> SRR1466792 2 0.498 0.5621 0.000 0.668 0.228 0.000 0.020 0.084
#> SRR1360478 2 0.462 0.5804 0.000 0.720 0.184 0.000 0.024 0.072
#> SRR1360695 1 0.757 0.3204 0.456 0.000 0.172 0.224 0.116 0.032
#> SRR812943 1 0.479 0.5847 0.732 0.000 0.000 0.100 0.120 0.048
#> SRR1400910 2 0.840 -0.3246 0.060 0.308 0.040 0.044 0.248 0.300
#> SRR1444203 4 0.449 0.6926 0.208 0.008 0.016 0.728 0.036 0.004
#> SRR816177 2 0.582 0.5287 0.004 0.672 0.104 0.016 0.140 0.064
#> SRR658754 3 0.211 0.6650 0.000 0.028 0.920 0.004 0.028 0.020
#> SRR1429603 4 0.500 0.6192 0.156 0.004 0.000 0.716 0.056 0.068
#> SRR1397366 3 0.311 0.6664 0.064 0.008 0.864 0.020 0.044 0.000
#> SRR1446028 1 0.255 0.6861 0.892 0.000 0.012 0.060 0.032 0.004
#> SRR1083918 2 0.767 0.1686 0.048 0.480 0.064 0.104 0.272 0.032
#> SRR1337606 5 0.704 0.3541 0.120 0.040 0.016 0.228 0.548 0.048
#> SRR659109 3 0.188 0.6633 0.000 0.024 0.928 0.000 0.020 0.028
#> SRR1337192 1 0.484 0.5468 0.696 0.000 0.000 0.152 0.140 0.012
#> SRR656946 3 0.784 0.1323 0.288 0.008 0.392 0.072 0.200 0.040
#> SRR1476102 1 0.350 0.6630 0.808 0.000 0.000 0.136 0.048 0.008
#> SRR1476447 1 0.470 0.5686 0.712 0.000 0.000 0.144 0.132 0.012
#> SRR1342067 4 0.496 0.6527 0.172 0.008 0.000 0.712 0.076 0.032
#> SRR1385389 4 0.351 0.7053 0.228 0.000 0.000 0.752 0.020 0.000
#> SRR1075971 1 0.424 0.5699 0.740 0.000 0.000 0.060 0.188 0.012
#> SRR614419 1 0.627 0.0201 0.488 0.008 0.000 0.100 0.360 0.044
#> SRR1322936 5 0.719 0.4233 0.164 0.036 0.016 0.204 0.532 0.048
#> SRR1349121 3 0.773 0.1295 0.284 0.000 0.380 0.148 0.168 0.020
#> SRR1430549 1 0.260 0.6764 0.876 0.000 0.000 0.084 0.036 0.004
#> SRR612935 3 0.763 0.2382 0.028 0.240 0.428 0.012 0.232 0.060
#> SRR661481 2 0.481 0.6023 0.000 0.748 0.116 0.012 0.076 0.048
#> SRR1354117 2 0.642 0.3493 0.000 0.492 0.240 0.000 0.036 0.232
#> SRR1393596 4 0.623 0.5590 0.156 0.020 0.004 0.636 0.104 0.080
#> SRR1452164 1 0.456 0.6285 0.760 0.000 0.064 0.056 0.116 0.004
#> SRR1070503 1 0.681 0.0640 0.420 0.008 0.296 0.024 0.248 0.004
#> SRR1499894 3 0.226 0.6708 0.004 0.036 0.912 0.000 0.020 0.028
#> SRR1082883 5 0.592 0.4886 0.168 0.040 0.012 0.124 0.648 0.008
#> SRR1468271 1 0.723 0.3368 0.496 0.004 0.184 0.144 0.164 0.008
#> SRR1332443 1 0.333 0.6663 0.820 0.000 0.000 0.132 0.040 0.008
#> SRR810295 2 0.442 0.5917 0.000 0.744 0.172 0.004 0.020 0.060
#> SRR662103 1 0.223 0.6768 0.912 0.000 0.004 0.044 0.020 0.020
#> SRR1328620 3 0.761 0.0931 0.024 0.280 0.372 0.008 0.260 0.056
#> SRR1396294 3 0.795 0.2313 0.132 0.008 0.436 0.244 0.132 0.048
#> SRR1419917 1 0.223 0.6768 0.912 0.000 0.004 0.044 0.020 0.020
#> SRR662114 3 0.522 0.6130 0.020 0.088 0.720 0.020 0.140 0.012
#> SRR1489199 3 0.823 -0.0184 0.260 0.036 0.336 0.076 0.268 0.024
#> SRR813584 3 0.824 -0.1881 0.012 0.268 0.316 0.096 0.268 0.040
#> SRR1069638 1 0.703 0.1021 0.448 0.016 0.164 0.036 0.324 0.012
#> SRR614864 3 0.302 0.6769 0.020 0.024 0.876 0.016 0.060 0.004
#> SRR1433392 1 0.626 0.2827 0.536 0.004 0.176 0.024 0.256 0.004
#> SRR1377777 2 0.485 -0.0516 0.000 0.580 0.000 0.016 0.036 0.368
#> SRR2167710 3 0.784 0.1323 0.288 0.008 0.392 0.072 0.200 0.040
#> SRR1401252 4 0.534 0.6489 0.176 0.016 0.000 0.692 0.056 0.060
#> SRR1309963 4 0.481 0.6782 0.216 0.004 0.036 0.704 0.036 0.004
#> SRR1338031 1 0.215 0.6882 0.904 0.000 0.004 0.068 0.024 0.000
#> SRR1418628 2 0.436 0.5923 0.000 0.748 0.172 0.004 0.020 0.056
#> SRR1486889 1 0.742 0.3614 0.492 0.004 0.196 0.168 0.116 0.024
#> SRR1380393 1 0.433 0.6062 0.756 0.000 0.012 0.172 0.024 0.036
#> SRR1319731 1 0.295 0.6770 0.860 0.000 0.004 0.084 0.048 0.004
#> SRR1356468 4 0.699 0.4529 0.224 0.012 0.128 0.540 0.080 0.016
#> SRR1337010 2 0.407 0.5692 0.000 0.796 0.060 0.000 0.076 0.068
#> SRR1486520 1 0.585 0.3206 0.536 0.008 0.012 0.080 0.352 0.012
#> SRR1486538 4 0.426 0.6810 0.196 0.000 0.000 0.740 0.032 0.032
#> SRR1340486 4 0.535 0.6411 0.200 0.008 0.064 0.680 0.044 0.004
#> SRR1377696 4 0.792 -0.3071 0.040 0.096 0.000 0.340 0.236 0.288
#> SRR1465459 1 0.684 0.0200 0.396 0.008 0.324 0.024 0.244 0.004
#> SRR1080270 3 0.256 0.6549 0.000 0.032 0.892 0.000 0.028 0.048
#> SRR1312501 3 0.591 0.5819 0.056 0.056 0.672 0.052 0.160 0.004
#> SRR1093148 5 0.742 -0.0131 0.040 0.132 0.372 0.032 0.400 0.024
#> SRR1467080 3 0.248 0.6501 0.000 0.036 0.896 0.000 0.024 0.044
#> SRR1410866 2 0.452 0.5934 0.000 0.740 0.168 0.004 0.024 0.064
#> SRR816475 5 0.849 0.1756 0.056 0.300 0.136 0.148 0.340 0.020
#> SRR1379198 4 0.324 0.7015 0.244 0.000 0.000 0.752 0.004 0.000
#> SRR613342 3 0.530 0.6249 0.024 0.088 0.724 0.012 0.124 0.028
#> SRR1452246 2 0.477 0.3456 0.000 0.704 0.000 0.012 0.132 0.152
#> SRR1338836 2 0.275 0.5770 0.000 0.868 0.080 0.000 0.004 0.048
#> SRR1369129 4 0.319 0.7034 0.236 0.000 0.000 0.760 0.004 0.000
#> SRR1396616 3 0.353 0.6567 0.068 0.004 0.832 0.020 0.076 0.000
#> SRR813824 3 0.196 0.6712 0.008 0.024 0.928 0.000 0.012 0.028
#> SRR1082376 1 0.519 0.4887 0.652 0.000 0.036 0.040 0.260 0.012
#> SRR1500891 4 0.452 0.6762 0.180 0.008 0.000 0.740 0.040 0.032
#> SRR807543 1 0.617 0.3067 0.552 0.004 0.164 0.024 0.252 0.004
#> SRR1091572 1 0.783 0.0149 0.424 0.068 0.140 0.040 0.304 0.024
#> SRR1346689 4 0.449 0.6984 0.228 0.008 0.004 0.716 0.024 0.020
#> SRR1332424 5 0.610 0.4862 0.184 0.028 0.020 0.116 0.636 0.016
#> SRR663729 4 0.605 0.4637 0.128 0.016 0.000 0.588 0.240 0.028
#> SRR1097013 1 0.635 0.5345 0.620 0.000 0.080 0.176 0.088 0.036
#> SRR613675 5 0.719 0.4233 0.164 0.036 0.016 0.204 0.532 0.048
#> SRR1485357 4 0.549 0.6293 0.196 0.008 0.068 0.672 0.052 0.004
#> SRR655816 3 0.327 0.6770 0.036 0.008 0.868 0.016 0.032 0.040
#> SRR1500113 1 0.546 0.5844 0.692 0.000 0.060 0.164 0.060 0.024
#> SRR1437622 2 0.856 -0.2618 0.072 0.300 0.056 0.236 0.300 0.036
#> SRR1355172 3 0.758 0.2676 0.200 0.000 0.452 0.180 0.144 0.024
#> SRR655531 1 0.551 0.1577 0.520 0.008 0.004 0.052 0.400 0.016
#> SRR1338147 3 0.450 0.6430 0.092 0.028 0.784 0.012 0.072 0.012
#> SRR1413329 3 0.784 0.2487 0.196 0.044 0.444 0.060 0.236 0.020
#> SRR1485931 6 0.444 0.4476 0.000 0.356 0.000 0.024 0.008 0.612
#> SRR1420873 1 0.585 0.5574 0.660 0.004 0.112 0.120 0.100 0.004
#> SRR1333308 4 0.550 0.6778 0.200 0.020 0.004 0.660 0.104 0.012
#> SRR1452033 1 0.512 0.5926 0.716 0.000 0.092 0.068 0.120 0.004
#> SRR1467316 2 0.491 -0.1131 0.000 0.556 0.000 0.016 0.036 0.392
#> SRR809018 3 0.248 0.6479 0.000 0.016 0.892 0.000 0.028 0.064
#> SRR1375351 2 0.436 0.5923 0.000 0.748 0.172 0.004 0.020 0.056
#> SRR663440 3 0.577 0.5201 0.176 0.020 0.652 0.024 0.124 0.004
#> SRR1471755 2 0.491 0.6003 0.000 0.740 0.116 0.012 0.084 0.048
#> SRR808019 3 0.789 0.2458 0.184 0.008 0.432 0.168 0.184 0.024
#> SRR1479133 3 0.199 0.6775 0.040 0.004 0.924 0.016 0.016 0.000
#> SRR615069 3 0.701 0.1493 0.032 0.100 0.456 0.028 0.360 0.024
#> SRR1456185 2 0.819 0.3179 0.040 0.488 0.176 0.088 0.116 0.092
#> SRR1350069 3 0.795 0.2313 0.132 0.008 0.436 0.244 0.132 0.048
#> SRR816316 1 0.569 0.4190 0.632 0.004 0.128 0.020 0.208 0.008
#> SRR664795 3 0.770 0.2451 0.204 0.000 0.432 0.172 0.168 0.024
#> SRR1490721 4 0.663 0.2605 0.080 0.036 0.000 0.500 0.332 0.052
#> SRR810643 1 0.288 0.6749 0.860 0.000 0.000 0.080 0.056 0.004
#> SRR1430333 5 0.820 0.4465 0.148 0.076 0.196 0.096 0.460 0.024
#> SRR1085285 3 0.199 0.6775 0.040 0.004 0.924 0.016 0.016 0.000
#> SRR1099072 3 0.379 0.6474 0.084 0.004 0.812 0.020 0.080 0.000
#> SRR1317985 1 0.219 0.6875 0.904 0.000 0.004 0.060 0.032 0.000
#> SRR1487340 1 0.310 0.6852 0.856 0.000 0.008 0.084 0.044 0.008
#> SRR1420276 3 0.374 0.6070 0.000 0.076 0.816 0.000 0.036 0.072
#> SRR1351347 3 0.525 0.6300 0.032 0.072 0.724 0.016 0.140 0.016
#> SRR1405525 1 0.440 0.6202 0.760 0.000 0.000 0.096 0.112 0.032
#> SRR1370329 1 0.169 0.6829 0.924 0.000 0.000 0.064 0.012 0.000
#> SRR1465001 1 0.295 0.6770 0.860 0.000 0.004 0.084 0.048 0.004
#> SRR1476525 2 0.361 0.6093 0.000 0.812 0.120 0.000 0.048 0.020
#> SRR819610 2 0.819 0.3179 0.040 0.488 0.176 0.088 0.116 0.092
#> SRR2157314 1 0.304 0.6890 0.864 0.000 0.012 0.072 0.044 0.008
#> SRR1409465 2 0.270 0.5757 0.000 0.872 0.076 0.000 0.004 0.048
#> SRR809987 4 0.430 0.6790 0.260 0.000 0.000 0.696 0.024 0.020
#> SRR613639 3 0.462 0.6322 0.096 0.008 0.768 0.044 0.080 0.004
#> SRR1402285 4 0.373 0.7030 0.240 0.004 0.000 0.736 0.020 0.000
#> SRR1077038 1 0.585 0.3877 0.608 0.004 0.136 0.020 0.224 0.008
#> SRR1405660 3 0.219 0.6703 0.000 0.024 0.916 0.004 0.032 0.024
#> SRR1095455 3 0.793 0.1356 0.036 0.244 0.372 0.012 0.268 0.068
#> SRR1394734 2 0.767 0.1686 0.048 0.480 0.064 0.104 0.272 0.032
#> SRR1317771 1 0.740 0.3684 0.496 0.004 0.192 0.168 0.116 0.024
#> SRR1365894 4 0.723 -0.0325 0.064 0.052 0.000 0.492 0.132 0.260
#> SRR1073581 3 0.773 0.1295 0.284 0.000 0.380 0.148 0.168 0.020
#> SRR659804 1 0.304 0.6890 0.864 0.000 0.012 0.072 0.044 0.008
#> SRR1345914 2 0.558 0.5643 0.004 0.696 0.124 0.016 0.096 0.064
#> SRR1432186 2 0.423 0.5761 0.000 0.796 0.084 0.016 0.068 0.036
#> SRR1473529 4 0.787 -0.3649 0.036 0.096 0.000 0.332 0.228 0.308
#> SRR660764 3 0.638 0.3939 0.008 0.204 0.584 0.004 0.140 0.060
#> SRR820448 1 0.575 0.4087 0.624 0.004 0.132 0.020 0.212 0.008
#> SRR1328845 3 0.795 0.2313 0.132 0.008 0.436 0.244 0.132 0.048
#> SRR1336415 4 0.373 0.7030 0.240 0.004 0.000 0.736 0.020 0.000
#> SRR1379065 4 0.440 0.6766 0.180 0.004 0.000 0.744 0.044 0.028
#> SRR1459190 3 0.658 0.4344 0.208 0.008 0.584 0.068 0.116 0.016
#> SRR1346773 1 0.293 0.6781 0.856 0.000 0.000 0.084 0.056 0.004
#> SRR1499521 3 0.791 0.2392 0.184 0.008 0.428 0.172 0.184 0.024
#> SRR1440898 2 0.380 0.5990 0.000 0.808 0.104 0.000 0.052 0.036
#> SRR1347459 3 0.468 0.6436 0.020 0.088 0.768 0.016 0.096 0.012
#> SRR1081209 2 0.416 0.3735 0.000 0.748 0.020 0.008 0.024 0.200
#> SRR1400202 1 0.174 0.6826 0.920 0.000 0.000 0.068 0.012 0.000
#> SRR1333395 4 0.683 -0.2502 0.116 0.016 0.000 0.416 0.064 0.388
#> SRR1309248 4 0.733 -0.1206 0.060 0.056 0.000 0.468 0.136 0.280
#> SRR809161 3 0.310 0.6709 0.052 0.016 0.868 0.016 0.048 0.000
#> SRR1316320 4 0.796 -0.0852 0.108 0.052 0.004 0.356 0.340 0.140
#> SRR1432629 2 0.449 0.4158 0.000 0.740 0.004 0.012 0.152 0.092
#> SRR1498931 1 0.200 0.6895 0.912 0.000 0.012 0.068 0.008 0.000
#> SRR1416578 4 0.446 0.6712 0.264 0.000 0.000 0.684 0.032 0.020
#> SRR1405547 3 0.248 0.6479 0.000 0.016 0.892 0.000 0.028 0.064
#> SRR1470534 4 0.324 0.7015 0.244 0.000 0.000 0.752 0.004 0.000
#> SRR1380764 1 0.440 0.6547 0.772 0.004 0.040 0.100 0.084 0.000
#> SRR1309160 3 0.154 0.6768 0.012 0.004 0.948 0.004 0.024 0.008
#> SRR663489 3 0.248 0.6479 0.000 0.016 0.892 0.000 0.028 0.064
#> SRR1500450 1 0.755 0.2670 0.460 0.000 0.120 0.268 0.092 0.060
#> SRR1078489 3 0.857 -0.2461 0.176 0.100 0.324 0.068 0.308 0.024
#> SRR1332648 4 0.371 0.7040 0.236 0.004 0.000 0.740 0.020 0.000
#> SRR660614 3 0.742 -0.0863 0.012 0.316 0.420 0.008 0.100 0.144
#> SRR1470420 2 0.572 0.4600 0.000 0.540 0.352 0.004 0.036 0.068
#> SRR1475566 1 0.174 0.6826 0.920 0.000 0.000 0.068 0.012 0.000
#> SRR1477949 1 0.329 0.6624 0.824 0.000 0.000 0.132 0.032 0.012
#> SRR1481419 2 0.429 0.5865 0.000 0.788 0.096 0.012 0.068 0.036
#> SRR1464766 1 0.319 0.6833 0.860 0.000 0.024 0.064 0.044 0.008
#> SRR615946 3 0.262 0.6783 0.016 0.028 0.900 0.004 0.036 0.016
#> SRR1446481 2 0.372 0.6084 0.000 0.804 0.124 0.000 0.052 0.020
#> SRR1467656 2 0.292 0.5793 0.000 0.856 0.088 0.000 0.004 0.052
#> SRR1402962 5 0.599 0.1925 0.400 0.008 0.024 0.072 0.488 0.008
#> SRR660224 2 0.471 0.5852 0.000 0.744 0.136 0.004 0.060 0.056
#> SRR665586 1 0.246 0.6801 0.892 0.000 0.000 0.064 0.032 0.012
#> SRR1347166 5 0.750 0.5040 0.160 0.060 0.092 0.112 0.552 0.024
#> SRR1485722 5 0.597 0.5124 0.168 0.040 0.072 0.064 0.656 0.000
#> SRR1415316 1 0.317 0.6659 0.840 0.000 0.000 0.112 0.032 0.016
#> SRR613390 1 0.294 0.6629 0.860 0.000 0.000 0.060 0.072 0.008
#> SRR661108 3 0.192 0.6705 0.004 0.020 0.932 0.004 0.024 0.016
#> SRR2170173 3 0.790 0.1331 0.288 0.012 0.392 0.072 0.196 0.040
#> SRR817329 1 0.422 0.6527 0.788 0.000 0.044 0.116 0.040 0.012
#> SRR1401990 4 0.742 0.3536 0.208 0.008 0.164 0.492 0.108 0.020
#> SRR1467745 5 0.842 0.0929 0.044 0.328 0.136 0.132 0.332 0.028
#> SRR1471795 2 0.540 0.5451 0.012 0.728 0.088 0.032 0.100 0.040
#> SRR1415637 2 0.250 0.5034 0.000 0.884 0.020 0.000 0.012 0.084
#> SRR813137 1 0.428 0.6286 0.796 0.000 0.084 0.056 0.044 0.020
#> SRR1314873 1 0.251 0.6753 0.884 0.000 0.000 0.084 0.016 0.016
#> SRR1401211 1 0.757 0.3204 0.456 0.000 0.172 0.224 0.116 0.032
#> SRR1419692 4 0.421 0.6991 0.216 0.012 0.004 0.732 0.036 0.000
#> SRR818797 3 0.544 0.5204 0.188 0.012 0.664 0.024 0.112 0.000
#> SRR2164608 3 0.587 0.5971 0.060 0.044 0.700 0.044 0.124 0.028
#> SRR1455586 3 0.587 0.1958 0.000 0.288 0.576 0.004 0.048 0.084
#> SRR819459 3 0.262 0.6586 0.004 0.028 0.892 0.000 0.028 0.048
#> SRR1488939 2 0.492 -0.1236 0.000 0.552 0.000 0.016 0.036 0.396
#> SRR1433232 2 0.425 0.2499 0.000 0.724 0.000 0.016 0.040 0.220
#> SRR1385501 1 0.591 0.3912 0.604 0.004 0.132 0.024 0.228 0.008
#> SRR1361652 5 0.816 0.0391 0.156 0.088 0.012 0.068 0.400 0.276
#> SRR1437119 1 0.195 0.6852 0.912 0.000 0.000 0.072 0.004 0.012
#> SRR1478547 3 0.228 0.6539 0.000 0.016 0.904 0.000 0.024 0.056
#> SRR1430910 5 0.800 0.2160 0.120 0.084 0.324 0.056 0.396 0.020
#> SRR1310584 1 0.236 0.6837 0.896 0.000 0.000 0.064 0.032 0.008
#> SRR1500216 1 0.778 -0.0108 0.420 0.016 0.008 0.204 0.220 0.132
#> SRR1486762 3 0.485 0.6212 0.092 0.008 0.752 0.024 0.108 0.016
#> SRR1480854 4 0.642 0.3071 0.088 0.024 0.000 0.528 0.312 0.048
#> SRR1489394 4 0.376 0.6973 0.256 0.000 0.000 0.724 0.012 0.008
#> SRR1418085 4 0.386 0.7025 0.236 0.004 0.000 0.732 0.028 0.000
#> SRR1340221 4 0.319 0.7034 0.236 0.000 0.000 0.760 0.004 0.000
#> SRR1473058 5 0.849 0.1756 0.056 0.300 0.136 0.148 0.340 0.020
#> SRR1405165 3 0.491 0.6232 0.016 0.068 0.740 0.008 0.144 0.024
#> SRR1433004 1 0.299 0.6624 0.856 0.000 0.000 0.060 0.076 0.008
#> SRR1471477 1 0.757 0.3153 0.456 0.000 0.188 0.212 0.112 0.032
#> SRR1098567 2 0.507 0.5865 0.000 0.676 0.224 0.004 0.064 0.032
#> SRR1098712 3 0.795 0.2313 0.132 0.008 0.436 0.244 0.132 0.048
#> SRR1455038 1 0.383 0.5750 0.772 0.000 0.000 0.048 0.172 0.008
#> SRR1375248 3 0.586 0.1800 0.000 0.300 0.568 0.004 0.044 0.084
#> SRR1403005 3 0.297 0.6689 0.052 0.008 0.872 0.016 0.052 0.000
#> SRR1348378 2 0.690 0.4768 0.000 0.520 0.264 0.040 0.120 0.056
#> SRR1413541 1 0.256 0.6752 0.884 0.000 0.000 0.076 0.028 0.012
#> SRR1392943 4 0.602 0.4829 0.116 0.020 0.004 0.608 0.228 0.024
#> SRR1475192 3 0.219 0.6675 0.000 0.024 0.916 0.004 0.024 0.032
#> SRR1432085 2 0.604 0.2755 0.000 0.452 0.428 0.008 0.064 0.048
#> SRR1452468 5 0.841 0.4535 0.180 0.076 0.176 0.104 0.436 0.028
#> SRR1347060 3 0.218 0.6581 0.000 0.028 0.912 0.000 0.020 0.040
#> SRR1414139 3 0.608 -0.1701 0.000 0.408 0.468 0.008 0.064 0.052
#> SRR1447962 2 0.600 0.3892 0.000 0.492 0.384 0.004 0.064 0.056
#> SRR1444324 2 0.608 0.4278 0.000 0.504 0.348 0.004 0.032 0.112
#> SRR1415004 1 0.413 0.6109 0.768 0.000 0.008 0.168 0.024 0.032
#> SRR1413436 1 0.740 0.3684 0.496 0.004 0.192 0.168 0.116 0.024
#> SRR1311266 5 0.843 0.1882 0.248 0.060 0.284 0.076 0.312 0.020
#> SRR1343302 4 0.434 0.6957 0.220 0.012 0.008 0.724 0.036 0.000
#> SRR1373746 1 0.265 0.6776 0.872 0.000 0.000 0.088 0.036 0.004
#> SRR1429678 1 0.306 0.6871 0.860 0.000 0.012 0.072 0.052 0.004
#> SRR1469413 2 0.585 0.4052 0.000 0.508 0.384 0.008 0.060 0.040
#> SRR1405331 1 0.616 0.3075 0.552 0.004 0.160 0.024 0.256 0.004
#> SRR1345609 1 0.293 0.6678 0.848 0.000 0.000 0.120 0.012 0.020
#> SRR1380208 5 0.822 0.1840 0.056 0.172 0.044 0.212 0.448 0.068
#> SRR1322840 4 0.435 0.6794 0.184 0.000 0.000 0.740 0.048 0.028
#> SRR1399797 3 0.270 0.6690 0.000 0.056 0.884 0.004 0.044 0.012
#> SRR1416654 3 0.307 0.6780 0.020 0.024 0.876 0.016 0.056 0.008
#> SRR1315081 3 0.295 0.6379 0.000 0.040 0.868 0.000 0.028 0.064
#> SRR1369196 3 0.262 0.6510 0.000 0.044 0.888 0.000 0.024 0.044
#> SRR1400847 1 0.319 0.6833 0.860 0.000 0.024 0.064 0.044 0.008
#> SRR1365291 3 0.692 0.2494 0.264 0.024 0.492 0.036 0.180 0.004
#> SRR1367920 4 0.642 0.3071 0.088 0.024 0.000 0.528 0.312 0.048
#> SRR1366648 3 0.257 0.6460 0.000 0.020 0.888 0.000 0.028 0.064
#> SRR1441679 2 0.287 0.5780 0.000 0.860 0.084 0.000 0.004 0.052
#> SRR1082173 3 0.587 0.5971 0.060 0.044 0.700 0.044 0.124 0.028
#> SRR1363968 1 0.713 0.4203 0.524 0.000 0.148 0.200 0.096 0.032
#> SRR814387 1 0.288 0.6749 0.860 0.000 0.000 0.080 0.056 0.004
#> SRR657599 3 0.797 0.2412 0.180 0.012 0.428 0.164 0.192 0.024
#> SRR1386689 4 0.535 0.6411 0.200 0.008 0.064 0.680 0.044 0.004
#> SRR1395575 3 0.263 0.6812 0.024 0.008 0.896 0.008 0.052 0.012
#> SRR1453811 3 0.453 0.6157 0.116 0.012 0.756 0.016 0.100 0.000
#> SRR1441159 1 0.370 0.6307 0.796 0.000 0.000 0.088 0.112 0.004
#> SRR1403154 4 0.434 0.6957 0.220 0.012 0.008 0.724 0.036 0.000
#> SRR1468722 3 0.224 0.6563 0.000 0.016 0.908 0.000 0.032 0.044
#> SRR1310275 3 0.698 0.2417 0.264 0.024 0.488 0.040 0.180 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.458 0.837 0.902 0.4946 0.500 0.500
#> 3 3 0.599 0.652 0.837 0.3048 0.761 0.563
#> 4 4 0.958 0.924 0.957 0.1356 0.859 0.629
#> 5 5 0.828 0.814 0.898 0.0781 0.915 0.698
#> 6 6 0.775 0.663 0.815 0.0400 0.980 0.905
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.8081 0.5738 0.752 0.248
#> SRR1331708 1 0.3114 0.8869 0.944 0.056
#> SRR1464258 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR661589 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1456229 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1315165 1 0.6438 0.8432 0.836 0.164
#> SRR1488960 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1094457 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1095575 1 0.9795 0.0214 0.584 0.416
#> SRR1315931 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1430066 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1431037 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1395554 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR818002 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1344143 2 0.9954 -0.0894 0.460 0.540
#> SRR1486845 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1362866 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1383907 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.9998 -0.2069 0.492 0.508
#> SRR1429846 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR613550 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1348402 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1324025 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1318879 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR820755 1 0.9954 -0.1172 0.540 0.460
#> SRR1485830 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR599313 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1415398 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1326205 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1421327 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1083311 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1499303 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1079522 1 0.0672 0.9036 0.992 0.008
#> SRR1452935 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR661361 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR615778 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.9087 0.3861 0.324 0.676
#> SRR1433555 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1308650 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1317446 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1413602 2 0.6247 0.8876 0.156 0.844
#> SRR1479955 2 0.6247 0.7146 0.156 0.844
#> SRR809853 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR661313 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1499935 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1447303 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1429408 2 0.9393 0.2635 0.356 0.644
#> SRR1433950 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1409854 1 0.7602 0.6301 0.780 0.220
#> SRR1435229 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1414229 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1400974 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1399971 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR613927 2 0.7299 0.8504 0.204 0.796
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR813776 1 0.9954 -0.1172 0.540 0.460
#> SRR808196 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1101085 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR614395 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1478251 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1370551 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR665310 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1420109 2 0.7219 0.8562 0.200 0.800
#> SRR1330920 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1419539 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1359447 2 0.5946 0.8856 0.144 0.856
#> SRR1347259 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR613915 2 0.7745 0.8250 0.228 0.772
#> SRR1384395 2 0.6048 0.8858 0.148 0.852
#> SRR821715 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1478228 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0672 0.9036 0.992 0.008
#> SRR1096383 1 0.4562 0.8163 0.904 0.096
#> SRR1341480 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1341344 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1326270 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1498838 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1416313 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR808566 2 0.9170 0.3380 0.332 0.668
#> SRR1430270 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1367825 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR613533 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR661267 1 0.9552 0.2223 0.624 0.376
#> SRR810665 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1407250 1 0.7602 0.6301 0.780 0.220
#> SRR1420067 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR812536 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1370850 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1407671 1 0.6623 0.8351 0.828 0.172
#> SRR1446375 1 0.9775 0.0387 0.588 0.412
#> SRR1465230 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR614119 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR660510 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1445655 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR658953 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1485312 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1317631 1 0.7139 0.8215 0.804 0.196
#> SRR1488610 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1330588 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1316367 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1091302 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR818263 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1404909 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR663076 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1442422 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1465893 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1407112 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1332969 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1353199 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1378885 2 0.9358 0.6396 0.352 0.648
#> SRR665357 2 0.6048 0.8858 0.148 0.852
#> SRR662186 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1501020 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1347819 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1480813 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1472576 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1431781 1 0.9933 0.4098 0.548 0.452
#> SRR1452270 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1500472 1 0.9896 -0.0814 0.560 0.440
#> SRR1417632 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1350153 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1458113 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1326579 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.9954 -0.0894 0.460 0.540
#> SRR1096712 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1090407 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1083752 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1377599 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1488449 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1318354 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1359062 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1398924 1 0.9608 0.1656 0.616 0.384
#> SRR663783 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1319204 2 0.6247 0.8876 0.156 0.844
#> SRR1369070 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1316982 2 0.0672 0.8594 0.008 0.992
#> SRR1498595 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1377423 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1312310 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1338426 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1353309 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR658941 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1324085 1 0.8608 0.7304 0.716 0.284
#> SRR1363858 1 0.0376 0.9047 0.996 0.004
#> SRR819820 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1337342 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR655206 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1387013 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1415379 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1099622 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR663197 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1394836 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR661699 2 0.6148 0.8874 0.152 0.848
#> SRR813680 1 0.8016 0.5822 0.756 0.244
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1378109 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1499174 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1382851 2 0.0376 0.8558 0.004 0.996
#> SRR1433410 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR661167 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1432518 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR660462 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1374608 1 0.9209 0.6410 0.664 0.336
#> SRR657949 2 0.9754 0.5211 0.408 0.592
#> SRR1308882 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR655768 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1485870 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1444138 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1470193 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1091380 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1099096 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.5294 0.8617 0.880 0.120
#> SRR1467102 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1485416 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR818821 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR809963 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1353710 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1445259 2 0.9944 0.4241 0.456 0.544
#> SRR1408393 1 0.6531 0.7191 0.832 0.168
#> SRR1361522 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1310542 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1333485 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1406437 2 0.1414 0.8561 0.020 0.980
#> SRR1354931 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1391856 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1446738 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR815869 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR613150 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1375329 2 0.9732 0.5497 0.404 0.596
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1400910 2 0.9393 0.6343 0.356 0.644
#> SRR1444203 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR816177 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR658754 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1429603 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1397366 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1446028 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1337606 1 0.2043 0.8956 0.968 0.032
#> SRR659109 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1337192 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1342067 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1385389 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0672 0.9036 0.992 0.008
#> SRR1349121 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR612935 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR661481 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1393596 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1070503 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1499894 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1082883 1 0.1414 0.8997 0.980 0.020
#> SRR1468271 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1328620 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1396294 1 0.9922 0.4030 0.552 0.448
#> SRR1419917 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR662114 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1489199 1 0.0938 0.8974 0.988 0.012
#> SRR813584 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1069638 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR614864 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1433392 1 0.0376 0.9032 0.996 0.004
#> SRR1377777 2 0.6148 0.7201 0.152 0.848
#> SRR2167710 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1401252 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1309963 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1486889 1 0.0938 0.8975 0.988 0.012
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1337010 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1486538 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1340486 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1377696 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1465459 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1080270 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1312501 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1093148 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1467080 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1410866 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR816475 2 0.9209 0.3261 0.336 0.664
#> SRR1379198 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR613342 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1452246 2 0.0376 0.8558 0.004 0.996
#> SRR1338836 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1369129 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1396616 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR813824 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1082376 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1500891 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR807543 2 0.9686 0.5489 0.396 0.604
#> SRR1091572 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1346689 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1332424 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR663729 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1097013 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0672 0.9036 0.992 0.008
#> SRR1485357 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR655816 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1500113 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1355172 1 0.7815 0.6067 0.768 0.232
#> SRR655531 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1338147 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1413329 1 0.9209 0.3521 0.664 0.336
#> SRR1485931 2 0.6048 0.7254 0.148 0.852
#> SRR1420873 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1333308 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1452033 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.7299 0.6410 0.204 0.796
#> SRR809018 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1375351 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR663440 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1471755 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR808019 1 0.7528 0.6375 0.784 0.216
#> SRR1479133 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR615069 2 0.5737 0.8847 0.136 0.864
#> SRR1456185 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1350069 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR816316 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR664795 1 0.6623 0.7125 0.828 0.172
#> SRR1490721 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR810643 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1430333 2 0.9580 0.5837 0.380 0.620
#> SRR1085285 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1099072 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.6048 0.8858 0.148 0.852
#> SRR1351347 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1405525 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR819610 2 0.4815 0.7789 0.104 0.896
#> SRR2157314 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR809987 1 0.5737 0.8553 0.864 0.136
#> SRR613639 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1402285 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1077038 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1405660 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1095455 2 0.9998 0.3210 0.492 0.508
#> SRR1394734 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1365894 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1073581 1 0.6048 0.7483 0.852 0.148
#> SRR659804 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1473529 2 0.9944 -0.0738 0.456 0.544
#> SRR660764 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR820448 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1328845 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1336415 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1379065 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1459190 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1346773 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1347459 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1081209 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1333395 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1309248 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR809161 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1316320 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1432629 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1416578 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1405547 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1470534 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1380764 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1309160 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR663489 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1500450 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1078489 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1332648 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR660614 2 0.5946 0.8856 0.144 0.856
#> SRR1470420 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR615946 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1446481 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.7453 0.6449 0.788 0.212
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR661108 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR2170173 2 0.9922 0.4458 0.448 0.552
#> SRR817329 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1401990 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1467745 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR813137 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1419692 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR818797 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR2164608 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1455586 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR819459 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1488939 2 0.8763 0.4567 0.296 0.704
#> SRR1433232 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1385501 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1361652 1 0.1184 0.8945 0.984 0.016
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1478547 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1430910 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1310584 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1486762 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1480854 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1489394 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1418085 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1340221 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1473058 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1405165 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1433004 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1098712 1 0.9850 0.4652 0.572 0.428
#> SRR1455038 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1403005 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1348378 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1475192 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1432085 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1452468 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1347060 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1414139 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1343302 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1405331 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1345609 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1380208 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1322840 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1399797 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1416654 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1315081 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1369196 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1365291 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1367920 1 0.6343 0.8413 0.840 0.160
#> SRR1366648 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1441679 2 0.0000 0.8576 0.000 1.000
#> SRR1082173 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1363968 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR657599 1 0.7453 0.6448 0.788 0.212
#> SRR1386689 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1395575 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1453811 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1441159 1 0.0000 0.9059 1.000 0.000
#> SRR1403154 1 0.6048 0.8501 0.852 0.148
#> SRR1468722 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
#> SRR1310275 2 0.6343 0.8883 0.160 0.840
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 3 0.6111 0.4330 0.396 0.000 0.604
#> SRR1331708 1 0.0747 0.8074 0.984 0.016 0.000
#> SRR1464258 1 0.5070 0.5700 0.772 0.004 0.224
#> SRR1454201 1 0.5754 0.4192 0.700 0.004 0.296
#> SRR661589 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456229 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1315165 2 0.6274 -0.2132 0.456 0.544 0.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.6225 0.4394 0.568 0.432 0.000
#> SRR1094457 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR1095575 1 0.6330 0.1493 0.600 0.004 0.396
#> SRR1315931 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR818002 2 0.1643 0.6593 0.000 0.956 0.044
#> SRR1344143 2 0.0848 0.6332 0.008 0.984 0.008
#> SRR1486845 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR1362866 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.5733 0.6386 0.000 0.676 0.324
#> SRR1456138 2 0.3816 0.6853 0.000 0.852 0.148
#> SRR1416248 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 2 0.6267 -0.2110 0.452 0.548 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.3038 0.6775 0.000 0.896 0.104
#> SRR1429846 3 0.3879 0.7446 0.152 0.000 0.848
#> SRR613550 3 0.2261 0.8172 0.068 0.000 0.932
#> SRR1348402 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1324025 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318879 3 0.0237 0.8705 0.000 0.004 0.996
#> SRR820755 3 0.5902 0.5747 0.316 0.004 0.680
#> SRR1485830 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR599313 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR612263 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1415398 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326205 1 0.6260 0.4169 0.552 0.448 0.000
#> SRR1421327 2 0.6308 -0.3082 0.492 0.508 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499303 2 0.5397 0.2426 0.280 0.720 0.000
#> SRR1079522 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1452935 3 0.0475 0.8681 0.004 0.004 0.992
#> SRR1379495 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.6215 0.4781 0.000 0.572 0.428
#> SRR661361 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR615778 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1447564 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1455195 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR655182 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1335140 2 0.0000 0.6311 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308650 2 0.6204 0.4867 0.000 0.576 0.424
#> SRR1388354 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1479955 2 0.3941 0.6860 0.000 0.844 0.156
#> SRR809853 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR661313 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499935 2 0.6192 -0.1299 0.420 0.580 0.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429408 2 0.3482 0.5093 0.128 0.872 0.000
#> SRR1433950 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1362081 2 0.6180 0.5019 0.000 0.584 0.416
#> SRR1409854 3 0.6081 0.5295 0.344 0.004 0.652
#> SRR1435229 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1085996 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1414229 3 0.0237 0.8705 0.000 0.004 0.996
#> SRR1400974 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.5656 0.6078 0.284 0.004 0.712
#> SRR1457854 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR813776 3 0.5845 0.5832 0.308 0.004 0.688
#> SRR808196 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR1101085 1 0.6309 0.3273 0.504 0.496 0.000
#> SRR614395 1 0.6008 0.3496 0.664 0.004 0.332
#> SRR1478251 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR1370551 2 0.5882 0.6129 0.000 0.652 0.348
#> SRR1362310 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420109 3 0.3500 0.7709 0.116 0.004 0.880
#> SRR1330920 1 0.1267 0.7933 0.972 0.004 0.024
#> SRR1419539 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1359447 3 0.4887 0.5240 0.000 0.228 0.772
#> SRR1347259 1 0.6260 0.4169 0.552 0.448 0.000
#> SRR613915 3 0.4110 0.7416 0.152 0.004 0.844
#> SRR1384395 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR821715 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1096383 1 0.6095 0.2321 0.608 0.000 0.392
#> SRR1341480 2 0.6305 -0.2892 0.484 0.516 0.000
#> SRR1341344 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1326270 3 0.3879 0.7446 0.152 0.000 0.848
#> SRR1498838 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR808566 2 0.4178 0.4478 0.172 0.828 0.000
#> SRR1430270 1 0.5678 0.5689 0.684 0.316 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR661267 3 0.5465 0.6077 0.288 0.000 0.712
#> SRR810665 2 0.5785 0.6310 0.000 0.668 0.332
#> SRR1407250 3 0.6373 0.4053 0.408 0.004 0.588
#> SRR1420067 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR812536 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370850 2 0.4291 0.6848 0.000 0.820 0.180
#> SRR1486195 2 0.6204 0.4867 0.000 0.576 0.424
#> SRR1407671 2 0.0000 0.6311 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446375 1 0.6442 0.0271 0.564 0.004 0.432
#> SRR1465230 1 0.6260 0.4169 0.552 0.448 0.000
#> SRR614119 1 0.6225 0.0399 0.568 0.000 0.432
#> SRR1356101 2 0.6267 0.4238 0.000 0.548 0.452
#> SRR1404209 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.5497 0.6623 0.000 0.708 0.292
#> SRR665538 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445655 2 0.6235 -0.1622 0.436 0.564 0.000
#> SRR658953 1 0.0661 0.8069 0.988 0.004 0.008
#> SRR2166459 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1070713 2 0.5397 0.6690 0.000 0.720 0.280
#> SRR1485312 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317631 1 0.6291 0.3802 0.532 0.468 0.000
#> SRR1488610 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316367 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 2 0.6295 -0.2519 0.472 0.528 0.000
#> SRR818263 1 0.5244 0.5432 0.756 0.004 0.240
#> SRR1404909 2 0.5926 0.0533 0.356 0.644 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.5397 0.6690 0.000 0.720 0.280
#> SRR1442422 1 0.6280 0.3953 0.540 0.460 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.4733 0.6097 0.800 0.004 0.196
#> SRR1407112 1 0.6260 0.4169 0.552 0.448 0.000
#> SRR1332969 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353199 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1378885 3 0.5158 0.6613 0.232 0.004 0.764
#> SRR665357 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR662186 2 0.5529 0.6599 0.000 0.704 0.296
#> SRR1501020 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480813 2 0.5529 0.6599 0.000 0.704 0.296
#> SRR1472576 2 0.0000 0.6311 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431781 2 0.5882 0.0827 0.348 0.652 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500472 1 0.6451 0.0731 0.560 0.004 0.436
#> SRR1417632 1 0.6309 0.3273 0.504 0.496 0.000
#> SRR1350153 2 0.5835 0.6227 0.000 0.660 0.340
#> SRR1458113 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326579 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1349363 2 0.4228 0.6851 0.008 0.844 0.148
#> SRR1096712 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1083752 2 0.2878 0.6753 0.000 0.904 0.096
#> SRR1377599 2 0.6252 -0.1909 0.444 0.556 0.000
#> SRR1488449 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318354 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1359062 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398924 1 0.7351 0.3664 0.664 0.268 0.068
#> SRR663783 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319204 3 0.0747 0.8576 0.000 0.016 0.984
#> SRR1369070 2 0.5465 0.6647 0.000 0.712 0.288
#> SRR615659 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.5835 0.6227 0.000 0.660 0.340
#> SRR1316982 3 0.4555 0.5838 0.000 0.200 0.800
#> SRR1498595 2 0.0000 0.6311 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377423 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312310 2 0.5859 0.6180 0.000 0.656 0.344
#> SRR1485613 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR658941 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0747 0.8015 0.984 0.000 0.016
#> SRR1368874 2 0.6180 0.5019 0.000 0.584 0.416
#> SRR1324085 2 0.6225 -0.1520 0.432 0.568 0.000
#> SRR1363858 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR819820 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337342 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR655206 3 0.0892 0.8534 0.000 0.020 0.980
#> SRR1387013 2 0.2878 0.6756 0.000 0.904 0.096
#> SRR1317410 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1440161 2 0.6260 0.4324 0.000 0.552 0.448
#> SRR1343741 2 0.5397 0.6690 0.000 0.720 0.280
#> SRR1381288 2 0.5397 0.6690 0.000 0.720 0.280
#> SRR1415379 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR1099622 2 0.6204 0.4867 0.000 0.576 0.424
#> SRR663197 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394836 3 0.4121 0.6386 0.000 0.168 0.832
#> SRR661699 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR813680 3 0.5733 0.5687 0.324 0.000 0.676
#> SRR1410678 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 1 0.6280 0.3953 0.540 0.460 0.000
#> SRR1499174 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1311486 2 0.5733 0.6386 0.000 0.676 0.324
#> SRR1382851 2 0.0000 0.6311 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433410 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432518 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374608 1 0.8691 0.2676 0.452 0.444 0.104
#> SRR657949 3 0.5929 0.5692 0.320 0.004 0.676
#> SRR1308882 1 0.6280 0.3953 0.540 0.460 0.000
#> SRR655768 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1485870 2 0.6302 -0.2796 0.480 0.520 0.000
#> SRR1444138 1 0.6476 -0.0352 0.548 0.004 0.448
#> SRR1417342 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 2 0.6274 -0.2132 0.456 0.544 0.000
#> SRR1091380 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.5098 0.6337 0.752 0.248 0.000
#> SRR1467102 3 0.0424 0.8657 0.000 0.008 0.992
#> SRR1485416 1 0.6309 0.3273 0.504 0.496 0.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR809963 1 0.6008 0.3496 0.664 0.004 0.332
#> SRR1072247 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 1 0.6291 0.3796 0.532 0.468 0.000
#> SRR1445259 1 0.6520 -0.1677 0.508 0.004 0.488
#> SRR1408393 3 0.6104 0.5229 0.348 0.004 0.648
#> SRR1361522 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.3941 0.6860 0.000 0.844 0.156
#> SRR1310542 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1333485 1 0.6295 0.3714 0.528 0.472 0.000
#> SRR1406437 3 0.7400 0.0974 0.036 0.412 0.552
#> SRR1354931 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1391856 2 0.6308 0.3269 0.000 0.508 0.492
#> SRR1446738 2 0.4842 0.6801 0.000 0.776 0.224
#> SRR1309032 2 0.6026 0.5708 0.000 0.624 0.376
#> SRR1388145 2 0.5621 0.6513 0.000 0.692 0.308
#> SRR1432611 2 0.5835 0.6227 0.000 0.660 0.340
#> SRR815869 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375329 1 0.6608 0.3048 0.628 0.016 0.356
#> SRR1387921 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.6204 0.4867 0.000 0.576 0.424
#> SRR1360478 2 0.5733 0.6386 0.000 0.676 0.324
#> SRR1360695 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1400910 2 0.9982 0.3028 0.344 0.352 0.304
#> SRR1444203 1 0.6280 0.3953 0.540 0.460 0.000
#> SRR816177 2 0.2625 0.6720 0.000 0.916 0.084
#> SRR658754 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429603 1 0.6286 0.3876 0.536 0.464 0.000
#> SRR1397366 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446028 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1083918 2 0.4605 0.6827 0.000 0.796 0.204
#> SRR1337606 1 0.0892 0.8047 0.980 0.020 0.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337192 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR656946 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1342067 1 0.6302 0.3546 0.520 0.480 0.000
#> SRR1385389 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1322936 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1349121 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR661481 2 0.5397 0.6690 0.000 0.720 0.280
#> SRR1354117 2 0.6225 0.4693 0.000 0.568 0.432
#> SRR1393596 2 0.6302 -0.2796 0.480 0.520 0.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.4575 0.7102 0.184 0.004 0.812
#> SRR1499894 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082883 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.5882 0.6129 0.000 0.652 0.348
#> SRR662103 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396294 2 0.9172 -0.1767 0.396 0.456 0.148
#> SRR1419917 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR662114 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489199 3 0.6468 0.3327 0.444 0.004 0.552
#> SRR813584 2 0.2625 0.6720 0.000 0.916 0.084
#> SRR1069638 3 0.4883 0.6867 0.208 0.004 0.788
#> SRR614864 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433392 3 0.6521 0.1897 0.496 0.004 0.500
#> SRR1377777 2 0.3752 0.6851 0.000 0.856 0.144
#> SRR2167710 1 0.1267 0.7934 0.972 0.004 0.024
#> SRR1401252 1 0.6309 0.3273 0.504 0.496 0.000
#> SRR1309963 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.5835 0.6227 0.000 0.660 0.340
#> SRR1486889 1 0.4842 0.5987 0.776 0.000 0.224
#> SRR1380393 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR1337010 2 0.5882 0.6129 0.000 0.652 0.348
#> SRR1486520 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR1340486 1 0.6260 0.4169 0.552 0.448 0.000
#> SRR1377696 2 0.1289 0.6092 0.032 0.968 0.000
#> SRR1465459 3 0.4110 0.7416 0.152 0.004 0.844
#> SRR1080270 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093148 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467080 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1410866 2 0.5678 0.6451 0.000 0.684 0.316
#> SRR816475 2 0.7340 0.2721 0.248 0.676 0.076
#> SRR1379198 1 0.6192 0.4546 0.580 0.420 0.000
#> SRR613342 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452246 2 0.3941 0.6860 0.000 0.844 0.156
#> SRR1338836 2 0.5397 0.6690 0.000 0.720 0.280
#> SRR1369129 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR1396616 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082376 1 0.6359 0.1288 0.592 0.004 0.404
#> SRR1500891 1 0.6309 0.3273 0.504 0.496 0.000
#> SRR807543 3 0.5982 0.5569 0.328 0.004 0.668
#> SRR1091572 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1346689 1 0.6291 0.3869 0.532 0.468 0.000
#> SRR1332424 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR663729 1 0.6180 0.4595 0.584 0.416 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1485357 1 0.6280 0.3953 0.540 0.460 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0237 0.6336 0.000 0.996 0.004
#> SRR1355172 3 0.5529 0.5994 0.296 0.000 0.704
#> SRR655531 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1338147 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413329 3 0.6008 0.5498 0.332 0.004 0.664
#> SRR1485931 2 0.3941 0.6860 0.000 0.844 0.156
#> SRR1420873 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.3752 0.6851 0.000 0.856 0.144
#> SRR809018 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375351 2 0.5529 0.6599 0.000 0.704 0.296
#> SRR663440 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1471755 2 0.2796 0.6743 0.000 0.908 0.092
#> SRR808019 3 0.6274 0.2834 0.456 0.000 0.544
#> SRR1479133 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR615069 3 0.1289 0.8407 0.000 0.032 0.968
#> SRR1456185 2 0.5785 0.6310 0.000 0.668 0.332
#> SRR1350069 1 0.6260 0.4169 0.552 0.448 0.000
#> SRR816316 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR664795 3 0.5835 0.5424 0.340 0.000 0.660
#> SRR1490721 2 0.6307 -0.2988 0.488 0.512 0.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 3 0.4978 0.6780 0.216 0.004 0.780
#> SRR1085285 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099072 3 0.0424 0.8677 0.008 0.000 0.992
#> SRR1317985 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405525 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.5397 0.6690 0.000 0.720 0.280
#> SRR819610 2 0.0592 0.6403 0.000 0.988 0.012
#> SRR2157314 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.5529 0.6599 0.000 0.704 0.296
#> SRR809987 1 0.5465 0.5967 0.712 0.288 0.000
#> SRR613639 3 0.3879 0.7446 0.152 0.000 0.848
#> SRR1402285 1 0.6045 0.5011 0.620 0.380 0.000
#> SRR1077038 1 0.3784 0.6866 0.864 0.004 0.132
#> SRR1405660 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095455 1 0.6460 0.0128 0.556 0.004 0.440
#> SRR1394734 2 0.3816 0.6853 0.000 0.852 0.148
#> SRR1317771 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.5397 0.2424 0.280 0.720 0.000
#> SRR1073581 1 0.5529 0.4779 0.704 0.000 0.296
#> SRR659804 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.5397 0.6690 0.000 0.720 0.280
#> SRR1432186 2 0.5363 0.6700 0.000 0.724 0.276
#> SRR1473529 2 0.0000 0.6311 0.000 1.000 0.000
#> SRR660764 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR820448 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1328845 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR1336415 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR1379065 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR1459190 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1346773 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1499521 1 0.0747 0.8015 0.984 0.000 0.016
#> SRR1440898 2 0.5397 0.6690 0.000 0.720 0.280
#> SRR1347459 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081209 2 0.5397 0.6690 0.000 0.720 0.280
#> SRR1400202 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 1 0.6260 0.4226 0.552 0.448 0.000
#> SRR1309248 2 0.6260 -0.2012 0.448 0.552 0.000
#> SRR809161 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316320 2 0.4121 0.4569 0.168 0.832 0.000
#> SRR1432629 2 0.3941 0.6860 0.000 0.844 0.156
#> SRR1498931 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 1 0.6204 0.4496 0.576 0.424 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470534 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 3 0.0983 0.8594 0.016 0.004 0.980
#> SRR1332648 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR660614 3 0.5810 0.2352 0.000 0.336 0.664
#> SRR1470420 2 0.5882 0.6129 0.000 0.652 0.348
#> SRR1475566 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.5397 0.6690 0.000 0.720 0.280
#> SRR1464766 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR615946 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446481 2 0.5397 0.6690 0.000 0.720 0.280
#> SRR1467656 2 0.5859 0.6180 0.000 0.656 0.344
#> SRR1402962 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR660224 2 0.5760 0.6349 0.000 0.672 0.328
#> SRR665586 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1347166 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1485722 3 0.6421 0.3717 0.424 0.004 0.572
#> SRR1415316 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR613390 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR2170173 3 0.6509 0.2356 0.472 0.004 0.524
#> SRR817329 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1401990 1 0.6280 0.3953 0.540 0.460 0.000
#> SRR1467745 2 0.4796 0.6807 0.000 0.780 0.220
#> SRR1471795 2 0.5397 0.6690 0.000 0.720 0.280
#> SRR1415637 2 0.5733 0.6386 0.000 0.676 0.324
#> SRR813137 3 0.6274 0.3122 0.456 0.000 0.544
#> SRR1314873 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR818797 3 0.3879 0.7446 0.152 0.000 0.848
#> SRR2164608 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455586 3 0.4346 0.6127 0.000 0.184 0.816
#> SRR819459 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488939 2 0.3752 0.6851 0.000 0.856 0.144
#> SRR1433232 2 0.3941 0.6860 0.000 0.844 0.156
#> SRR1385501 3 0.6521 0.2071 0.492 0.004 0.504
#> SRR1361652 1 0.0424 0.8101 0.992 0.008 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1430910 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1486762 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480854 1 0.6309 0.3273 0.504 0.496 0.000
#> SRR1489394 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR1418085 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR1340221 1 0.6180 0.4595 0.584 0.416 0.000
#> SRR1473058 2 0.0237 0.6336 0.000 0.996 0.004
#> SRR1405165 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433004 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1471477 1 0.0237 0.8107 0.996 0.000 0.004
#> SRR1098567 2 0.5882 0.6129 0.000 0.652 0.348
#> SRR1098712 2 0.5988 0.0264 0.368 0.632 0.000
#> SRR1455038 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1375248 3 0.6286 -0.2111 0.000 0.464 0.536
#> SRR1403005 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348378 2 0.5835 0.6227 0.000 0.660 0.340
#> SRR1413541 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1392943 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR1475192 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432085 2 0.6204 0.4867 0.000 0.576 0.424
#> SRR1452468 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1347060 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414139 3 0.3116 0.7389 0.000 0.108 0.892
#> SRR1447962 2 0.6204 0.4867 0.000 0.576 0.424
#> SRR1444324 2 0.6260 0.4324 0.000 0.552 0.448
#> SRR1415004 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1343302 1 0.6286 0.3876 0.536 0.464 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.6204 0.4867 0.000 0.576 0.424
#> SRR1405331 3 0.5845 0.5832 0.308 0.004 0.688
#> SRR1345609 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.4555 0.3998 0.200 0.800 0.000
#> SRR1322840 1 0.6252 0.4234 0.556 0.444 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.4110 0.7416 0.152 0.004 0.844
#> SRR1367920 2 0.6305 -0.2892 0.484 0.516 0.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441679 2 0.5859 0.6180 0.000 0.656 0.344
#> SRR1082173 3 0.3752 0.7517 0.144 0.000 0.856
#> SRR1363968 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.8128 1.000 0.000 0.000
#> SRR657599 3 0.6168 0.4002 0.412 0.000 0.588
#> SRR1386689 1 0.6260 0.4169 0.552 0.448 0.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453811 3 0.3879 0.7446 0.152 0.000 0.848
#> SRR1441159 1 0.0237 0.8124 0.996 0.004 0.000
#> SRR1403154 1 0.6280 0.3953 0.540 0.460 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.8735 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310275 3 0.1399 0.8494 0.028 0.004 0.968
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 3 0.5760 0.1588 0.432 0.016 0.544 0.008
#> SRR1331708 1 0.1732 0.9482 0.948 0.008 0.004 0.040
#> SRR1464258 1 0.1489 0.9412 0.952 0.004 0.044 0.000
#> SRR1454201 1 0.2324 0.9446 0.932 0.020 0.020 0.028
#> SRR661589 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1456229 1 0.0376 0.9602 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1315165 4 0.1118 0.9423 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1488960 1 0.0524 0.9605 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1417809 4 0.1302 0.9426 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1094457 4 0.1211 0.9429 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1095575 1 0.3257 0.8688 0.872 0.012 0.108 0.008
#> SRR1315931 1 0.0000 0.9609 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1431037 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1395554 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR818002 2 0.0817 0.9509 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1344143 2 0.4546 0.6604 0.012 0.732 0.000 0.256
#> SRR1486845 4 0.0469 0.9424 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1362866 1 0.1892 0.9477 0.944 0.016 0.004 0.036
#> SRR1490740 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1446627 2 0.0779 0.9589 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1456138 2 0.0817 0.9509 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1416248 1 0.0524 0.9605 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1383907 4 0.0657 0.9398 0.012 0.004 0.000 0.984
#> SRR1311018 1 0.0376 0.9605 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1375699 2 0.0817 0.9509 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1429846 3 0.0188 0.9655 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR613550 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1348402 1 0.0524 0.9605 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1345146 1 0.1706 0.9513 0.948 0.016 0.000 0.036
#> SRR1324025 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1318879 3 0.0336 0.9640 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR820755 3 0.0672 0.9585 0.008 0.008 0.984 0.000
#> SRR1485830 4 0.1022 0.9445 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR599313 1 0.1396 0.9497 0.960 0.004 0.004 0.032
#> SRR612263 1 0.1492 0.9483 0.956 0.004 0.004 0.036
#> SRR1415398 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1326205 4 0.1211 0.9429 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1421327 4 0.0469 0.9393 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1083311 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1499303 4 0.0592 0.9353 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1079522 1 0.1492 0.9483 0.956 0.004 0.004 0.036
#> SRR1452935 3 0.0657 0.9599 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1379495 1 0.0376 0.9605 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1470459 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR661361 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR615778 1 0.1639 0.9481 0.952 0.008 0.004 0.036
#> SRR1447564 1 0.0000 0.9609 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.1362 0.9555 0.964 0.012 0.004 0.020
#> SRR655182 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1335140 2 0.4103 0.6758 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1433555 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1308650 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1388354 1 0.0376 0.9605 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1317446 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1413602 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1479955 2 0.0817 0.9509 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR809853 1 0.0188 0.9607 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1499935 4 0.0336 0.9391 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1447303 3 0.0188 0.9655 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1429408 4 0.4643 0.5027 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1433950 1 0.0000 0.9609 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1409854 1 0.5112 0.5599 0.668 0.012 0.316 0.004
#> SRR1435229 1 0.1639 0.9481 0.952 0.008 0.004 0.036
#> SRR1085996 1 0.0376 0.9603 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1414229 3 0.1471 0.9441 0.004 0.012 0.960 0.024
#> SRR1400974 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1399971 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR613927 3 0.0657 0.9581 0.012 0.004 0.984 0.000
#> SRR1457854 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473714 1 0.0937 0.9571 0.976 0.012 0.000 0.012
#> SRR813776 3 0.0672 0.9585 0.008 0.008 0.984 0.000
#> SRR808196 4 0.1584 0.9371 0.036 0.012 0.000 0.952
#> SRR1101085 4 0.0469 0.9393 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR614395 1 0.1489 0.9403 0.952 0.004 0.044 0.000
#> SRR1478251 4 0.1302 0.9426 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1370551 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1362310 1 0.0376 0.9605 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR665310 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1420109 3 0.1743 0.9153 0.056 0.004 0.940 0.000
#> SRR1330920 1 0.1590 0.9485 0.956 0.008 0.028 0.008
#> SRR1419539 3 0.0524 0.9647 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR1359447 3 0.4855 0.3218 0.000 0.400 0.600 0.000
#> SRR1347259 4 0.0469 0.9424 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR613915 3 0.0188 0.9655 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1384395 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR821715 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1478228 1 0.0524 0.9605 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1445637 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR608150 1 0.1985 0.9472 0.940 0.016 0.004 0.040
#> SRR1096383 1 0.4978 0.6773 0.732 0.016 0.240 0.012
#> SRR1341480 4 0.0469 0.9393 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1341344 1 0.1639 0.9481 0.952 0.008 0.004 0.036
#> SRR1326270 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1498838 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1416313 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR808566 4 0.4790 0.4193 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR1430270 4 0.1576 0.9392 0.048 0.004 0.000 0.948
#> SRR1367825 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR613533 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR661267 3 0.0895 0.9546 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR810665 2 0.0779 0.9589 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1407250 1 0.5438 0.6911 0.720 0.020 0.232 0.028
#> SRR1420067 1 0.0657 0.9606 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1473632 1 0.0000 0.9609 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1370850 2 0.0927 0.9557 0.000 0.976 0.008 0.016
#> SRR1486195 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1407671 2 0.4072 0.6864 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1446375 1 0.3375 0.8622 0.864 0.012 0.116 0.008
#> SRR1465230 4 0.1118 0.9423 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR614119 1 0.1526 0.9540 0.960 0.016 0.012 0.012
#> SRR1356101 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1404209 1 0.1059 0.9567 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR1392676 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR665538 1 0.1059 0.9567 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR660510 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1445655 4 0.0469 0.9379 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR658953 1 0.1492 0.9483 0.956 0.004 0.004 0.036
#> SRR2166459 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1070713 2 0.0937 0.9577 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR1485312 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1317631 4 0.1584 0.9371 0.036 0.012 0.000 0.952
#> SRR1488610 1 0.1639 0.9481 0.952 0.008 0.004 0.036
#> SRR1330588 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.1492 0.9483 0.956 0.004 0.004 0.036
#> SRR1433926 1 0.0000 0.9609 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 4 0.1302 0.9426 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR818263 1 0.1732 0.9425 0.948 0.008 0.040 0.004
#> SRR1404909 4 0.0657 0.9398 0.012 0.004 0.000 0.984
#> SRR663076 1 0.0657 0.9592 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1323577 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1442422 4 0.1211 0.9429 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1465893 1 0.0524 0.9605 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR654862 1 0.1690 0.9458 0.952 0.008 0.032 0.008
#> SRR1407112 4 0.1118 0.9423 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1332969 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1353199 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1378885 3 0.0336 0.9635 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR665357 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR662186 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1501020 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1347819 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1480813 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1472576 4 0.0817 0.9328 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1431781 4 0.1211 0.9248 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1452270 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1500472 1 0.4053 0.8598 0.844 0.020 0.108 0.028
#> SRR1417632 4 0.0469 0.9393 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1350153 2 0.0779 0.9589 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1458113 3 0.0376 0.9640 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1326579 1 0.1771 0.9483 0.948 0.012 0.004 0.036
#> SRR1349363 2 0.3945 0.7235 0.004 0.780 0.000 0.216
#> SRR1096712 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1090407 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1083752 2 0.0817 0.9509 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1377599 4 0.0469 0.9393 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1488449 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1318354 3 0.0376 0.9644 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1359062 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1398924 1 0.5672 0.5077 0.648 0.312 0.004 0.036
#> SRR663783 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1319204 3 0.2737 0.8749 0.000 0.104 0.888 0.008
#> SRR1369070 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR615659 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1337449 2 0.0779 0.9589 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1316982 3 0.4277 0.6048 0.000 0.280 0.720 0.000
#> SRR1498595 4 0.0592 0.9353 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1377423 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1312310 2 0.0779 0.9589 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1485613 1 0.1059 0.9567 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR1338426 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1353309 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR658941 3 0.0927 0.9544 0.000 0.016 0.976 0.008
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9609 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.1369 0.9568 0.964 0.016 0.004 0.016
#> SRR1368874 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1324085 4 0.0469 0.9379 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1363858 1 0.0844 0.9578 0.980 0.004 0.004 0.012
#> SRR819820 3 0.0804 0.9608 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1337342 1 0.1985 0.9472 0.940 0.016 0.004 0.040
#> SRR655206 3 0.1256 0.9513 0.000 0.028 0.964 0.008
#> SRR1387013 2 0.0817 0.9509 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1317410 1 0.0524 0.9605 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR608198 1 0.1639 0.9481 0.952 0.008 0.004 0.036
#> SRR1440161 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1343741 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1381288 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1415379 4 0.1211 0.9429 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1099622 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR663197 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1394836 3 0.4356 0.5830 0.000 0.292 0.708 0.000
#> SRR661699 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR813680 3 0.1114 0.9533 0.008 0.016 0.972 0.004
#> SRR1410678 1 0.0376 0.9605 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1378109 4 0.1118 0.9423 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1499174 1 0.0000 0.9609 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0779 0.9589 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1382851 2 0.4356 0.6004 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1433410 1 0.1771 0.9483 0.948 0.012 0.004 0.036
#> SRR661167 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1432518 3 0.0188 0.9655 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR660462 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1374608 4 0.4229 0.7860 0.020 0.016 0.144 0.820
#> SRR657949 3 0.0804 0.9566 0.008 0.012 0.980 0.000
#> SRR1308882 4 0.0469 0.9424 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR655768 1 0.1059 0.9567 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR1485870 4 0.0657 0.9398 0.012 0.004 0.000 0.984
#> SRR1444138 1 0.1509 0.9521 0.960 0.012 0.020 0.008
#> SRR1417342 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1470193 4 0.0376 0.9410 0.004 0.004 0.000 0.992
#> SRR1091380 3 0.0804 0.9608 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1099096 1 0.0524 0.9605 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1313583 4 0.1792 0.9271 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1467102 3 0.0469 0.9632 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1485416 4 0.0469 0.9393 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR818821 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR809963 1 0.1489 0.9403 0.952 0.004 0.044 0.000
#> SRR1072247 1 0.0376 0.9605 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1353710 4 0.0469 0.9424 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1445259 1 0.3791 0.8454 0.844 0.012 0.128 0.016
#> SRR1408393 3 0.0779 0.9552 0.016 0.004 0.980 0.000
#> SRR1361522 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1368597 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1309680 2 0.0817 0.9509 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1310542 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1333485 4 0.0469 0.9424 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1406437 4 0.6428 0.5477 0.000 0.112 0.264 0.624
#> SRR1354931 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1391856 2 0.0817 0.9538 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1446738 2 0.0895 0.9534 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR1309032 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1388145 2 0.0779 0.9589 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1432611 2 0.0779 0.9589 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR815869 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR613150 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1375329 1 0.2049 0.9448 0.940 0.012 0.012 0.036
#> SRR1387921 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1466792 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1360478 2 0.0779 0.9589 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1360695 1 0.1059 0.9567 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR812943 1 0.1492 0.9483 0.956 0.004 0.004 0.036
#> SRR1400910 2 0.6332 0.0925 0.448 0.504 0.012 0.036
#> SRR1444203 4 0.1118 0.9423 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR816177 2 0.0817 0.9509 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR658754 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1429603 4 0.0469 0.9424 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1397366 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1446028 1 0.0188 0.9611 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0927 0.9557 0.000 0.976 0.008 0.016
#> SRR1337606 1 0.1732 0.9473 0.948 0.008 0.004 0.040
#> SRR659109 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1337192 1 0.1639 0.9481 0.952 0.008 0.004 0.036
#> SRR656946 1 0.0804 0.9580 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR1476102 1 0.0336 0.9610 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.9609 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 4 0.0469 0.9424 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1385389 4 0.1302 0.9426 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9609 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.1492 0.9483 0.956 0.004 0.004 0.036
#> SRR1322936 1 0.1892 0.9477 0.944 0.016 0.004 0.036
#> SRR1349121 1 0.1059 0.9567 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9609 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.0336 0.9670 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR661481 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1354117 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1393596 4 0.0524 0.9412 0.008 0.004 0.000 0.988
#> SRR1452164 1 0.0469 0.9597 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1070503 3 0.0336 0.9635 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1499894 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1082883 1 0.1985 0.9472 0.940 0.016 0.004 0.040
#> SRR1468271 1 0.1059 0.9567 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR1332443 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR810295 2 0.0779 0.9589 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR662103 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1328620 3 0.0804 0.9578 0.000 0.008 0.980 0.012
#> SRR1396294 4 0.1584 0.9371 0.036 0.012 0.000 0.952
#> SRR1419917 1 0.0000 0.9609 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.0188 0.9655 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1489199 1 0.2284 0.9400 0.932 0.020 0.036 0.012
#> SRR813584 2 0.0817 0.9509 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1069638 3 0.5478 0.2613 0.404 0.008 0.580 0.008
#> SRR614864 3 0.0188 0.9655 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1433392 1 0.1743 0.9328 0.940 0.004 0.056 0.000
#> SRR1377777 2 0.0817 0.9509 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR2167710 1 0.0804 0.9580 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR1401252 4 0.0592 0.9411 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1309963 4 0.1305 0.9409 0.036 0.004 0.000 0.960
#> SRR1338031 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418628 2 0.0779 0.9589 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1486889 1 0.4504 0.7439 0.772 0.020 0.204 0.004
#> SRR1380393 1 0.0376 0.9605 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1319731 1 0.0524 0.9605 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1356468 4 0.1305 0.9409 0.036 0.004 0.000 0.960
#> SRR1337010 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1486520 1 0.1114 0.9590 0.972 0.016 0.004 0.008
#> SRR1486538 4 0.1022 0.9445 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1340486 4 0.1118 0.9423 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1377696 4 0.4744 0.5718 0.012 0.284 0.000 0.704
#> SRR1465459 3 0.0188 0.9655 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1080270 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1312501 3 0.0188 0.9655 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1093148 3 0.1174 0.9504 0.000 0.012 0.968 0.020
#> SRR1467080 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1410866 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR816475 4 0.4018 0.7131 0.000 0.224 0.004 0.772
#> SRR1379198 4 0.1302 0.9426 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR613342 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1452246 2 0.0817 0.9509 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1338836 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1369129 4 0.1022 0.9445 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1396616 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR813824 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1082376 1 0.1585 0.9428 0.952 0.004 0.040 0.004
#> SRR1500891 4 0.0592 0.9411 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR807543 3 0.0779 0.9552 0.016 0.004 0.980 0.000
#> SRR1091572 1 0.1575 0.9494 0.956 0.004 0.012 0.028
#> SRR1346689 4 0.0469 0.9424 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1332424 1 0.1771 0.9483 0.948 0.012 0.004 0.036
#> SRR663729 4 0.0469 0.9424 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1097013 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR613675 1 0.1892 0.9477 0.944 0.016 0.004 0.036
#> SRR1485357 4 0.1118 0.9423 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR655816 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1500113 1 0.1059 0.9567 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR1437622 2 0.0817 0.9509 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1355172 3 0.1262 0.9507 0.008 0.016 0.968 0.008
#> SRR655531 1 0.1771 0.9483 0.948 0.012 0.004 0.036
#> SRR1338147 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1413329 3 0.1174 0.9500 0.000 0.020 0.968 0.012
#> SRR1485931 2 0.0921 0.9490 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1420873 1 0.1059 0.9567 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR1333308 4 0.0469 0.9424 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1452033 1 0.1059 0.9567 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR1467316 2 0.0921 0.9490 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR809018 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1375351 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR663440 3 0.0188 0.9655 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1471755 2 0.0817 0.9509 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR808019 1 0.5738 0.4059 0.596 0.016 0.376 0.012
#> SRR1479133 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR615069 3 0.2928 0.8535 0.000 0.108 0.880 0.012
#> SRR1456185 2 0.0779 0.9589 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1350069 4 0.1584 0.9371 0.036 0.012 0.000 0.952
#> SRR816316 1 0.0564 0.9596 0.988 0.004 0.004 0.004
#> SRR664795 3 0.4377 0.7376 0.188 0.016 0.788 0.008
#> SRR1490721 4 0.0469 0.9393 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR810643 1 0.0804 0.9605 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR1430333 3 0.4100 0.8231 0.100 0.016 0.844 0.040
#> SRR1085285 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1099072 3 0.0336 0.9671 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1317985 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1487340 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1420276 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.9671 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.1022 0.9524 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1370329 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1465001 1 0.0672 0.9600 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1476525 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR819610 2 0.0817 0.9509 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR2157314 1 0.0524 0.9603 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1409465 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR809987 4 0.1743 0.9337 0.056 0.004 0.000 0.940
#> SRR613639 3 0.0336 0.9639 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1402285 4 0.1489 0.9415 0.044 0.004 0.000 0.952
#> SRR1077038 1 0.1004 0.9531 0.972 0.004 0.024 0.000
#> SRR1405660 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1095455 1 0.2960 0.8930 0.892 0.004 0.084 0.020
#> SRR1394734 2 0.0817 0.9509 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1317771 1 0.0376 0.9609 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1365894 4 0.0657 0.9365 0.004 0.012 0.000 0.984
#> SRR1073581 1 0.4912 0.6946 0.740 0.016 0.232 0.012
#> SRR659804 1 0.0524 0.9603 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1345914 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1432186 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1473529 2 0.4877 0.3465 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR660764 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR820448 1 0.0188 0.9607 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1328845 4 0.1584 0.9371 0.036 0.012 0.000 0.952
#> SRR1336415 4 0.1211 0.9429 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1379065 4 0.0707 0.9438 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1459190 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1346773 1 0.0524 0.9608 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1499521 1 0.1059 0.9567 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR1440898 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1347459 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1081209 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1400202 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1333395 4 0.1022 0.9445 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1309248 4 0.0657 0.9398 0.012 0.004 0.000 0.984
#> SRR809161 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1316320 4 0.5244 0.3196 0.012 0.388 0.000 0.600
#> SRR1432629 2 0.0817 0.9509 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1498931 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1416578 4 0.1302 0.9426 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1405547 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1470534 4 0.1302 0.9426 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1380764 1 0.0937 0.9597 0.976 0.012 0.000 0.012
#> SRR1309160 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR663489 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1500450 1 0.1059 0.9567 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR1078489 3 0.1443 0.9416 0.008 0.004 0.960 0.028
#> SRR1332648 4 0.1302 0.9426 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR660614 2 0.5183 0.2938 0.000 0.584 0.408 0.008
#> SRR1470420 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1475566 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1477949 1 0.0376 0.9605 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1481419 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1464766 1 0.0937 0.9580 0.976 0.012 0.000 0.012
#> SRR615946 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1446481 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1467656 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1402962 1 0.1631 0.9550 0.956 0.016 0.008 0.020
#> SRR660224 2 0.0779 0.9589 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR665586 1 0.0188 0.9607 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.1639 0.9481 0.952 0.008 0.004 0.036
#> SRR1485722 1 0.5031 0.7360 0.752 0.020 0.208 0.020
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9609 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0188 0.9607 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR2170173 3 0.5595 0.2732 0.404 0.012 0.576 0.008
#> SRR817329 1 0.0188 0.9607 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1401990 4 0.1452 0.9393 0.036 0.008 0.000 0.956
#> SRR1467745 2 0.0927 0.9557 0.000 0.976 0.008 0.016
#> SRR1471795 2 0.0804 0.9593 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1415637 2 0.0779 0.9589 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR813137 1 0.2011 0.9095 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.9609 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.1059 0.9567 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR1419692 4 0.1211 0.9429 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR818797 3 0.0188 0.9655 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR2164608 3 0.1059 0.9531 0.000 0.016 0.972 0.012
#> SRR1455586 3 0.4585 0.4989 0.000 0.332 0.668 0.000
#> SRR819459 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1488939 2 0.0921 0.9490 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1433232 2 0.0817 0.9509 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1385501 1 0.1675 0.9397 0.948 0.004 0.044 0.004
#> SRR1361652 1 0.1492 0.9483 0.956 0.004 0.004 0.036
#> SRR1437119 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1478547 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1430910 3 0.0657 0.9596 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1310584 1 0.0524 0.9605 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1500216 1 0.1396 0.9497 0.960 0.004 0.004 0.032
#> SRR1486762 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1480854 4 0.0469 0.9393 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1489394 4 0.1302 0.9426 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1418085 4 0.1302 0.9426 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1340221 4 0.1302 0.9426 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1473058 4 0.4431 0.5835 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR1405165 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1433004 1 0.0564 0.9596 0.988 0.004 0.004 0.004
#> SRR1471477 1 0.1059 0.9567 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR1098567 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1098712 4 0.3842 0.8397 0.036 0.128 0.000 0.836
#> SRR1455038 1 0.1492 0.9483 0.956 0.004 0.004 0.036
#> SRR1375248 2 0.1716 0.9120 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1403005 3 0.0188 0.9655 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1348378 2 0.0779 0.9589 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1413541 1 0.0188 0.9607 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1392943 4 0.0469 0.9393 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1475192 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1432085 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1452468 1 0.1639 0.9481 0.952 0.008 0.004 0.036
#> SRR1347060 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1414139 3 0.4040 0.6630 0.000 0.248 0.752 0.000
#> SRR1447962 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1444324 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1415004 1 0.0376 0.9605 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1413436 1 0.0657 0.9606 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1311266 1 0.1484 0.9559 0.960 0.016 0.004 0.020
#> SRR1343302 4 0.1118 0.9423 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1373746 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1429678 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1469413 2 0.0707 0.9569 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1405331 3 0.0657 0.9581 0.012 0.004 0.984 0.000
#> SRR1345609 1 0.0188 0.9607 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1380208 4 0.5152 0.3626 0.004 0.384 0.004 0.608
#> SRR1322840 4 0.0707 0.9438 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1399797 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1416654 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1315081 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1369196 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1400847 1 0.0376 0.9605 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1365291 3 0.0188 0.9655 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1367920 4 0.0469 0.9393 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1366648 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1441679 2 0.0779 0.9589 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1082173 3 0.1174 0.9500 0.000 0.020 0.968 0.012
#> SRR1363968 1 0.1059 0.9567 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR814387 1 0.0524 0.9605 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR657599 1 0.5710 0.4267 0.604 0.016 0.368 0.012
#> SRR1386689 4 0.1118 0.9423 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1395575 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1453811 3 0.0188 0.9655 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1441159 1 0.0657 0.9600 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1403154 4 0.0921 0.9440 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1468722 3 0.0188 0.9686 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1310275 3 0.0524 0.9618 0.000 0.008 0.988 0.004
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 1 0.6797 -0.0258 0.420 0.004 0.340 0.000 0.236
#> SRR1331708 5 0.2674 0.7228 0.140 0.000 0.000 0.004 0.856
#> SRR1464258 1 0.2488 0.8260 0.872 0.000 0.004 0.000 0.124
#> SRR1454201 5 0.3039 0.7155 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR661589 3 0.0880 0.9288 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1456229 1 0.2179 0.8354 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1315165 4 0.0324 0.9282 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1488960 1 0.0703 0.8691 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1417809 4 0.0290 0.9277 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1094457 4 0.0162 0.9286 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1095575 5 0.4999 0.4027 0.360 0.004 0.032 0.000 0.604
#> SRR1315931 1 0.1831 0.8535 0.920 0.000 0.004 0.000 0.076
#> SRR1430066 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0162 0.9324 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR818002 2 0.0451 0.9550 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1344143 2 0.6272 0.2520 0.000 0.492 0.000 0.160 0.348
#> SRR1486845 4 0.0000 0.9279 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362866 5 0.3231 0.7150 0.196 0.000 0.000 0.004 0.800
#> SRR1490740 1 0.1608 0.8551 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1446627 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1456138 2 0.1830 0.9127 0.000 0.924 0.000 0.008 0.068
#> SRR1416248 1 0.0880 0.8661 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1383907 4 0.1544 0.9036 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1311018 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.1764 0.9157 0.000 0.928 0.000 0.008 0.064
#> SRR1429846 3 0.1121 0.9254 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR613550 3 0.1043 0.9268 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1348402 1 0.0880 0.8661 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1345146 5 0.3422 0.7134 0.200 0.004 0.000 0.004 0.792
#> SRR1324025 3 0.1043 0.9268 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1318879 3 0.3906 0.5845 0.000 0.004 0.704 0.000 0.292
#> SRR820755 3 0.2424 0.8600 0.000 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1485830 4 0.0290 0.9277 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR599313 1 0.4288 0.3028 0.612 0.000 0.000 0.004 0.384
#> SRR612263 5 0.4030 0.5267 0.352 0.000 0.000 0.000 0.648
#> SRR1415398 3 0.1043 0.9268 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1326205 4 0.0162 0.9286 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1421327 4 0.3210 0.7653 0.000 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1083311 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0794 0.9211 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1079522 5 0.3647 0.6368 0.228 0.004 0.000 0.004 0.764
#> SRR1452935 5 0.2929 0.6799 0.000 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1379495 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0566 0.9550 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR661361 3 0.1043 0.9268 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR615778 5 0.2583 0.7250 0.132 0.000 0.000 0.004 0.864
#> SRR1447564 1 0.1197 0.8661 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1455195 1 0.4306 -0.1188 0.508 0.000 0.000 0.000 0.492
#> SRR655182 1 0.1043 0.8678 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1335140 2 0.6162 0.3513 0.000 0.532 0.000 0.160 0.308
#> SRR1433555 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.0693 0.9545 0.000 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR1388354 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.1830 0.9127 0.000 0.924 0.000 0.008 0.068
#> SRR809853 1 0.3039 0.7360 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR661313 3 0.1043 0.9268 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1499935 4 0.0000 0.9279 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447303 3 0.1197 0.9239 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1429408 4 0.4238 0.4373 0.000 0.368 0.000 0.628 0.004
#> SRR1433950 1 0.0963 0.8701 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1362081 2 0.0566 0.9550 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1409854 5 0.5006 0.6176 0.156 0.000 0.136 0.000 0.708
#> SRR1435229 5 0.2719 0.7212 0.144 0.000 0.000 0.004 0.852
#> SRR1085996 1 0.1908 0.8490 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1414229 5 0.2929 0.6820 0.000 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1400974 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.2020 0.8842 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1457854 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.1952 0.8592 0.912 0.004 0.000 0.000 0.084
#> SRR813776 3 0.2516 0.8496 0.000 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR808196 4 0.0613 0.9255 0.008 0.004 0.000 0.984 0.004
#> SRR1101085 4 0.1544 0.9038 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR614395 1 0.2629 0.8227 0.860 0.000 0.004 0.000 0.136
#> SRR1478251 4 0.0290 0.9277 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1370551 2 0.0566 0.9550 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1362310 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.1043 0.9268 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1420109 3 0.3368 0.8066 0.024 0.000 0.820 0.000 0.156
#> SRR1330920 5 0.4238 0.4086 0.368 0.000 0.004 0.000 0.628
#> SRR1419539 3 0.0865 0.9235 0.000 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR1359447 3 0.4430 0.4191 0.000 0.360 0.628 0.000 0.012
#> SRR1347259 4 0.1478 0.9056 0.000 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR613915 3 0.1197 0.9239 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1384395 3 0.0566 0.9277 0.000 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR821715 3 0.1043 0.9268 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1478228 1 0.0880 0.8661 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1445637 1 0.1043 0.8678 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR608150 5 0.2970 0.7235 0.168 0.000 0.000 0.004 0.828
#> SRR1096383 1 0.5023 0.5912 0.708 0.004 0.096 0.000 0.192
#> SRR1341480 4 0.1732 0.8969 0.000 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1341344 5 0.4410 0.4077 0.440 0.000 0.000 0.004 0.556
#> SRR1326270 3 0.1205 0.9257 0.000 0.004 0.956 0.000 0.040
#> SRR1498838 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0162 0.9327 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR808566 4 0.4150 0.3911 0.000 0.388 0.000 0.612 0.000
#> SRR1430270 4 0.0290 0.9277 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1367825 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0880 0.9273 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR661267 3 0.5070 0.6434 0.124 0.004 0.712 0.000 0.160
#> SRR810665 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1407250 5 0.3849 0.7211 0.112 0.000 0.080 0.000 0.808
#> SRR1420067 1 0.2929 0.7410 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1473632 1 0.2179 0.8317 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR812536 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0290 0.9560 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1486195 2 0.0566 0.9550 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1407671 5 0.4865 0.4960 0.000 0.252 0.000 0.064 0.684
#> SRR1446375 5 0.4984 0.3938 0.380 0.004 0.028 0.000 0.588
#> SRR1465230 4 0.0324 0.9282 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR614119 1 0.3522 0.7054 0.780 0.004 0.004 0.000 0.212
#> SRR1356101 2 0.1195 0.9371 0.000 0.960 0.028 0.000 0.012
#> SRR1404209 1 0.2694 0.7967 0.864 0.004 0.004 0.000 0.128
#> SRR1392676 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR665538 1 0.3196 0.7243 0.804 0.004 0.000 0.000 0.192
#> SRR660510 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0404 0.9258 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR658953 5 0.2170 0.7208 0.088 0.004 0.000 0.004 0.904
#> SRR2166459 1 0.1043 0.8678 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1070713 2 0.0290 0.9560 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1485312 3 0.0324 0.9328 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1317631 4 0.0613 0.9253 0.004 0.004 0.000 0.984 0.008
#> SRR1488610 5 0.4047 0.6231 0.320 0.000 0.000 0.004 0.676
#> SRR1330588 3 0.1121 0.9254 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1316367 5 0.3969 0.5939 0.304 0.000 0.000 0.004 0.692
#> SRR1433926 1 0.1608 0.8551 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1091302 4 0.0162 0.9286 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR818263 1 0.4420 0.3070 0.548 0.000 0.004 0.000 0.448
#> SRR1404909 4 0.1732 0.8969 0.000 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR663076 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1442422 4 0.0162 0.9286 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1465893 1 0.0609 0.8702 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR654862 5 0.3636 0.5662 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1407112 4 0.0324 0.9282 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1332969 3 0.1043 0.9268 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1353199 3 0.1043 0.9268 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1378885 3 0.1197 0.9239 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR665357 3 0.0566 0.9277 0.000 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR662186 2 0.0486 0.9568 0.000 0.988 0.004 0.004 0.004
#> SRR1501020 3 0.0880 0.9288 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1347819 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0727 0.9560 0.000 0.980 0.004 0.004 0.012
#> SRR1472576 4 0.2069 0.8930 0.000 0.012 0.000 0.912 0.076
#> SRR1431781 4 0.0324 0.9271 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1452270 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.3086 0.7207 0.180 0.000 0.004 0.000 0.816
#> SRR1417632 4 0.3837 0.6176 0.000 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR1350153 2 0.0727 0.9560 0.000 0.980 0.004 0.004 0.012
#> SRR1458113 5 0.3561 0.6184 0.000 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR1326579 5 0.3430 0.7059 0.220 0.000 0.000 0.004 0.776
#> SRR1349363 2 0.4179 0.7435 0.000 0.776 0.000 0.152 0.072
#> SRR1096712 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.1043 0.9268 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1083752 2 0.0798 0.9504 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1377599 5 0.4302 -0.1032 0.000 0.000 0.000 0.480 0.520
#> SRR1488449 3 0.0963 0.9280 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1318354 5 0.4210 0.3406 0.000 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR1359062 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.3663 0.6912 0.132 0.044 0.000 0.004 0.820
#> SRR663783 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1319204 5 0.5778 0.3542 0.000 0.096 0.376 0.000 0.528
#> SRR1369070 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR615659 1 0.1608 0.8551 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1337449 2 0.0566 0.9550 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1316982 3 0.4063 0.5888 0.000 0.280 0.708 0.000 0.012
#> SRR1498595 4 0.2305 0.8822 0.000 0.012 0.000 0.896 0.092
#> SRR1377423 3 0.0609 0.9309 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1312310 2 0.0727 0.9560 0.000 0.980 0.004 0.004 0.012
#> SRR1485613 1 0.3196 0.7243 0.804 0.004 0.000 0.000 0.192
#> SRR1338426 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1353309 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR658941 3 0.3700 0.6619 0.000 0.008 0.752 0.000 0.240
#> SRR1101643 1 0.1671 0.8543 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1401468 1 0.4286 0.4423 0.652 0.004 0.004 0.000 0.340
#> SRR1368874 2 0.0566 0.9550 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1324085 4 0.0162 0.9279 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1363858 1 0.4101 0.3395 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR819820 3 0.2798 0.8074 0.000 0.008 0.852 0.000 0.140
#> SRR1337342 5 0.3266 0.7114 0.200 0.000 0.000 0.004 0.796
#> SRR655206 3 0.2580 0.8590 0.000 0.064 0.892 0.000 0.044
#> SRR1387013 2 0.2077 0.9004 0.000 0.908 0.000 0.008 0.084
#> SRR1317410 1 0.0880 0.8661 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR608198 5 0.3048 0.7216 0.176 0.000 0.000 0.004 0.820
#> SRR1440161 2 0.0566 0.9550 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1343741 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1381288 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1415379 4 0.0290 0.9277 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1099622 2 0.1012 0.9440 0.000 0.968 0.020 0.000 0.012
#> SRR663197 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1394836 3 0.4384 0.5049 0.000 0.324 0.660 0.000 0.016
#> SRR661699 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR813680 3 0.5384 0.5335 0.228 0.004 0.664 0.000 0.104
#> SRR1410678 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.0324 0.9282 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1499174 1 0.1831 0.8535 0.920 0.000 0.004 0.000 0.076
#> SRR1311486 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1382851 5 0.5232 0.3003 0.000 0.340 0.000 0.060 0.600
#> SRR1433410 5 0.3333 0.7133 0.208 0.000 0.000 0.004 0.788
#> SRR661167 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.1124 0.9229 0.000 0.004 0.960 0.000 0.036
#> SRR660462 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.4056 0.6877 0.004 0.004 0.024 0.772 0.196
#> SRR657949 3 0.3143 0.7820 0.000 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1308882 4 0.0000 0.9279 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.3160 0.7293 0.808 0.004 0.000 0.000 0.188
#> SRR1485870 4 0.1851 0.8921 0.000 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1444138 1 0.3243 0.7586 0.812 0.004 0.004 0.000 0.180
#> SRR1417342 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 4 0.0162 0.9279 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1091380 3 0.2798 0.8074 0.000 0.008 0.852 0.000 0.140
#> SRR1099096 1 0.0880 0.8661 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1313583 4 0.4297 0.0965 0.472 0.000 0.000 0.528 0.000
#> SRR1467102 3 0.1012 0.9174 0.000 0.020 0.968 0.000 0.012
#> SRR1485416 4 0.1608 0.9017 0.000 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR818821 3 0.0880 0.9273 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR809963 1 0.2629 0.8227 0.860 0.000 0.004 0.000 0.136
#> SRR1072247 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.0963 0.9177 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1445259 5 0.2411 0.7281 0.108 0.000 0.008 0.000 0.884
#> SRR1408393 3 0.2997 0.8290 0.012 0.000 0.840 0.000 0.148
#> SRR1361522 1 0.1608 0.8551 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1368597 1 0.1478 0.8592 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1309680 2 0.0451 0.9550 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1310542 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.9279 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406437 4 0.5654 0.3340 0.008 0.024 0.028 0.584 0.356
#> SRR1354931 3 0.0794 0.9297 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1391856 2 0.1364 0.9301 0.000 0.952 0.036 0.000 0.012
#> SRR1446738 2 0.4341 0.4181 0.000 0.628 0.000 0.008 0.364
#> SRR1309032 2 0.0566 0.9550 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1388145 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1432611 2 0.0727 0.9560 0.000 0.980 0.004 0.004 0.012
#> SRR815869 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1375329 5 0.2054 0.7310 0.072 0.008 0.000 0.004 0.916
#> SRR1387921 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0566 0.9550 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1360478 2 0.0486 0.9574 0.000 0.988 0.004 0.004 0.004
#> SRR1360695 1 0.0865 0.8690 0.972 0.004 0.000 0.000 0.024
#> SRR812943 5 0.4084 0.5604 0.328 0.000 0.000 0.004 0.668
#> SRR1400910 5 0.2589 0.7063 0.020 0.076 0.004 0.004 0.896
#> SRR1444203 4 0.0162 0.9286 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR816177 2 0.0451 0.9550 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR658754 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.1043 0.9162 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1397366 3 0.1043 0.9268 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1446028 1 0.0162 0.8741 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1083918 2 0.0290 0.9560 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1337606 5 0.1901 0.7245 0.056 0.012 0.000 0.004 0.928
#> SRR659109 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1337192 5 0.4151 0.5936 0.344 0.000 0.000 0.004 0.652
#> SRR656946 1 0.1704 0.8630 0.928 0.004 0.000 0.000 0.068
#> SRR1476102 1 0.1270 0.8651 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1476447 1 0.0510 0.8738 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1342067 4 0.0000 0.9279 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0162 0.9286 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1075971 1 0.0162 0.8741 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR614419 5 0.4009 0.5831 0.312 0.000 0.000 0.004 0.684
#> SRR1322936 5 0.3086 0.7215 0.180 0.000 0.000 0.004 0.816
#> SRR1349121 1 0.2338 0.8132 0.884 0.004 0.000 0.000 0.112
#> SRR1430549 1 0.0290 0.8744 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR612935 3 0.2179 0.8517 0.000 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR661481 2 0.0486 0.9574 0.000 0.988 0.004 0.004 0.004
#> SRR1354117 2 0.0566 0.9550 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1393596 4 0.1732 0.8969 0.000 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1452164 1 0.0162 0.8746 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.1608 0.9096 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1499894 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1082883 5 0.2970 0.7235 0.168 0.000 0.000 0.004 0.828
#> SRR1468271 1 0.3456 0.7080 0.788 0.004 0.004 0.000 0.204
#> SRR1332443 1 0.0290 0.8744 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR810295 2 0.0566 0.9550 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR662103 1 0.1608 0.8551 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1328620 5 0.4219 0.3381 0.000 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR1396294 4 0.1059 0.9154 0.000 0.008 0.004 0.968 0.020
#> SRR1419917 1 0.1608 0.8551 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR662114 3 0.3534 0.6443 0.000 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1489199 5 0.3461 0.6883 0.224 0.000 0.004 0.000 0.772
#> SRR813584 2 0.0290 0.9560 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1069638 5 0.2561 0.7162 0.020 0.000 0.096 0.000 0.884
#> SRR614864 3 0.1197 0.9239 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1433392 1 0.3888 0.7632 0.796 0.000 0.056 0.000 0.148
#> SRR1377777 2 0.1830 0.9127 0.000 0.924 0.000 0.008 0.068
#> SRR2167710 1 0.1991 0.8586 0.916 0.004 0.004 0.000 0.076
#> SRR1401252 4 0.1732 0.8969 0.000 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1309963 4 0.0324 0.9282 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1338031 1 0.0880 0.8702 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1418628 2 0.0727 0.9560 0.000 0.980 0.004 0.004 0.012
#> SRR1486889 1 0.5530 0.5564 0.644 0.004 0.108 0.000 0.244
#> SRR1380393 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0880 0.8661 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1356468 4 0.0162 0.9286 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1337010 2 0.0566 0.9550 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1486520 1 0.4161 0.3022 0.608 0.000 0.000 0.000 0.392
#> SRR1486538 4 0.0290 0.9277 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1340486 4 0.0324 0.9282 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1377696 5 0.5313 0.1399 0.000 0.056 0.000 0.388 0.556
#> SRR1465459 3 0.1197 0.9239 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1080270 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0963 0.9274 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1093148 5 0.3582 0.6520 0.000 0.008 0.224 0.000 0.768
#> SRR1467080 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0727 0.9560 0.000 0.980 0.004 0.004 0.012
#> SRR816475 4 0.3123 0.7602 0.000 0.184 0.000 0.812 0.004
#> SRR1379198 4 0.0290 0.9277 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR613342 3 0.0510 0.9316 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1452246 2 0.1764 0.9162 0.000 0.928 0.000 0.008 0.064
#> SRR1338836 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1369129 4 0.0162 0.9286 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1396616 3 0.1043 0.9268 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR813824 3 0.0290 0.9324 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1082376 1 0.2970 0.8046 0.828 0.000 0.004 0.000 0.168
#> SRR1500891 4 0.1608 0.9015 0.000 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR807543 3 0.2605 0.8410 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1091572 5 0.3461 0.6619 0.224 0.000 0.004 0.000 0.772
#> SRR1346689 4 0.1197 0.9128 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1332424 5 0.3333 0.7133 0.208 0.000 0.000 0.004 0.788
#> SRR663729 4 0.1704 0.9039 0.004 0.000 0.000 0.928 0.068
#> SRR1097013 1 0.0162 0.8746 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR613675 5 0.3086 0.7215 0.180 0.000 0.000 0.004 0.816
#> SRR1485357 4 0.0324 0.9282 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR655816 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.1282 0.8602 0.952 0.004 0.000 0.000 0.044
#> SRR1437622 2 0.0451 0.9550 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1355172 3 0.4468 0.6064 0.228 0.004 0.728 0.000 0.040
#> SRR655531 5 0.3210 0.7101 0.212 0.000 0.000 0.000 0.788
#> SRR1338147 3 0.1043 0.9268 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1413329 5 0.4333 0.4354 0.004 0.004 0.352 0.000 0.640
#> SRR1485931 2 0.2017 0.9027 0.000 0.912 0.000 0.008 0.080
#> SRR1420873 1 0.3160 0.7284 0.808 0.004 0.000 0.000 0.188
#> SRR1333308 4 0.0000 0.9279 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.2597 0.8061 0.872 0.004 0.004 0.000 0.120
#> SRR1467316 2 0.2017 0.9027 0.000 0.912 0.000 0.008 0.080
#> SRR809018 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0486 0.9574 0.000 0.988 0.004 0.004 0.004
#> SRR663440 3 0.1197 0.9239 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1471755 2 0.0290 0.9560 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR808019 5 0.6397 0.3752 0.352 0.004 0.156 0.000 0.488
#> SRR1479133 3 0.1043 0.9268 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR615069 5 0.4465 0.6552 0.000 0.056 0.212 0.000 0.732
#> SRR1456185 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1350069 4 0.0613 0.9255 0.008 0.004 0.000 0.984 0.004
#> SRR816316 1 0.2488 0.8271 0.872 0.000 0.004 0.000 0.124
#> SRR664795 3 0.6129 0.2919 0.312 0.004 0.548 0.000 0.136
#> SRR1490721 5 0.4030 0.2912 0.000 0.000 0.000 0.352 0.648
#> SRR810643 1 0.2732 0.7634 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1430333 5 0.3239 0.6999 0.012 0.000 0.156 0.004 0.828
#> SRR1085285 3 0.0451 0.9325 0.000 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1099072 3 0.1043 0.9268 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1317985 1 0.0794 0.8714 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1487340 1 0.0290 0.8744 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1420276 3 0.0566 0.9277 0.000 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1351347 3 0.1544 0.8918 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1405525 5 0.4251 0.5770 0.372 0.000 0.000 0.004 0.624
#> SRR1370329 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0880 0.8661 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1476525 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR819610 2 0.0451 0.9550 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR2157314 1 0.0162 0.8741 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409465 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR809987 4 0.0609 0.9206 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR613639 3 0.1282 0.9241 0.000 0.004 0.952 0.000 0.044
#> SRR1402285 4 0.0290 0.9277 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1077038 1 0.2536 0.8238 0.868 0.000 0.004 0.000 0.128
#> SRR1405660 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1095455 5 0.2848 0.7147 0.156 0.000 0.004 0.000 0.840
#> SRR1394734 2 0.0290 0.9560 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1317771 1 0.1121 0.8718 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1365894 4 0.3707 0.6595 0.000 0.000 0.000 0.716 0.284
#> SRR1073581 1 0.5319 0.5418 0.676 0.004 0.108 0.000 0.212
#> SRR659804 1 0.0162 0.8741 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1345914 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1432186 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1473529 2 0.6651 0.1654 0.000 0.440 0.000 0.312 0.248
#> SRR660764 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR820448 1 0.2286 0.8344 0.888 0.000 0.004 0.000 0.108
#> SRR1328845 4 0.0740 0.9237 0.008 0.004 0.000 0.980 0.008
#> SRR1336415 4 0.0451 0.9271 0.008 0.000 0.000 0.988 0.004
#> SRR1379065 4 0.0404 0.9258 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1459190 3 0.0963 0.9280 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1346773 1 0.1671 0.8439 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1499521 1 0.3616 0.6800 0.768 0.004 0.004 0.000 0.224
#> SRR1440898 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1347459 3 0.0609 0.9313 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1081209 2 0.1116 0.9437 0.000 0.964 0.004 0.004 0.028
#> SRR1400202 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.1830 0.9050 0.008 0.000 0.000 0.924 0.068
#> SRR1309248 4 0.4327 0.5080 0.000 0.008 0.000 0.632 0.360
#> SRR809161 3 0.1121 0.9255 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1316320 5 0.4958 0.4801 0.000 0.084 0.000 0.224 0.692
#> SRR1432629 2 0.0451 0.9550 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1498931 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.0290 0.9277 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1405547 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0290 0.9277 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1380764 1 0.4225 0.3650 0.632 0.004 0.000 0.000 0.364
#> SRR1309160 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.1041 0.8662 0.964 0.004 0.000 0.000 0.032
#> SRR1078489 5 0.2516 0.6989 0.000 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1332648 4 0.0162 0.9286 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR660614 5 0.6114 0.3931 0.000 0.312 0.152 0.000 0.536
#> SRR1470420 2 0.0566 0.9550 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1475566 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1464766 1 0.2833 0.7911 0.852 0.004 0.004 0.000 0.140
#> SRR615946 3 0.0609 0.9309 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1446481 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1467656 2 0.0566 0.9550 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1402962 5 0.4304 0.1481 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR660224 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR665586 1 0.1732 0.8528 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1347166 5 0.2583 0.7250 0.132 0.000 0.000 0.004 0.864
#> SRR1485722 5 0.3840 0.7220 0.116 0.000 0.076 0.000 0.808
#> SRR1415316 1 0.1478 0.8592 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR613390 1 0.1792 0.8515 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR661108 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR2170173 5 0.6706 0.3976 0.224 0.004 0.316 0.000 0.456
#> SRR817329 1 0.1792 0.8515 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1401990 4 0.0486 0.9270 0.004 0.004 0.000 0.988 0.004
#> SRR1467745 2 0.0798 0.9546 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1471795 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1415637 2 0.0324 0.9575 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR813137 1 0.2574 0.8249 0.876 0.000 0.012 0.000 0.112
#> SRR1314873 1 0.1608 0.8551 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1401211 1 0.1205 0.8624 0.956 0.004 0.000 0.000 0.040
#> SRR1419692 4 0.0162 0.9286 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR818797 3 0.1197 0.9239 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR2164608 3 0.4299 0.3374 0.000 0.004 0.608 0.000 0.388
#> SRR1455586 3 0.4574 0.2866 0.000 0.412 0.576 0.000 0.012
#> SRR819459 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.2017 0.9027 0.000 0.912 0.000 0.008 0.080
#> SRR1433232 2 0.0451 0.9550 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1385501 5 0.4452 0.0497 0.496 0.000 0.004 0.000 0.500
#> SRR1361652 5 0.2408 0.7210 0.096 0.008 0.000 0.004 0.892
#> SRR1437119 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1430910 5 0.3452 0.6308 0.000 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR1310584 1 0.0880 0.8661 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1500216 1 0.4288 0.3028 0.612 0.000 0.000 0.004 0.384
#> SRR1486762 3 0.0510 0.9315 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1480854 4 0.2020 0.8836 0.000 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1489394 4 0.0290 0.9277 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1418085 4 0.0162 0.9286 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1340221 4 0.0290 0.9277 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1473058 4 0.3949 0.5822 0.000 0.300 0.000 0.696 0.004
#> SRR1405165 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.1908 0.8488 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1471477 1 0.3196 0.7272 0.804 0.004 0.000 0.000 0.192
#> SRR1098567 2 0.0162 0.9566 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1098712 4 0.3636 0.7993 0.004 0.084 0.000 0.832 0.080
#> SRR1455038 5 0.4074 0.5052 0.364 0.000 0.000 0.000 0.636
#> SRR1375248 2 0.3280 0.7523 0.000 0.812 0.176 0.000 0.012
#> SRR1403005 3 0.1197 0.9239 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1348378 2 0.0833 0.9554 0.000 0.976 0.004 0.004 0.016
#> SRR1413541 1 0.1732 0.8528 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1392943 4 0.1197 0.9103 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1475192 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0566 0.9550 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1452468 5 0.2338 0.7289 0.112 0.000 0.000 0.004 0.884
#> SRR1347060 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1414139 3 0.4016 0.6063 0.000 0.272 0.716 0.000 0.012
#> SRR1447962 2 0.0566 0.9550 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1444324 2 0.0566 0.9550 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1415004 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.3336 0.6938 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228
#> SRR1311266 5 0.3689 0.6684 0.256 0.004 0.000 0.000 0.740
#> SRR1343302 4 0.0324 0.9282 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1373746 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0404 0.8741 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1469413 2 0.1012 0.9440 0.000 0.968 0.020 0.000 0.012
#> SRR1405331 3 0.2605 0.8410 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1345609 1 0.0290 0.8744 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1380208 5 0.3242 0.6651 0.000 0.072 0.000 0.076 0.852
#> SRR1322840 4 0.0000 0.9279 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0324 0.9326 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1315081 3 0.0566 0.9277 0.000 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1369196 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.8744 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.1197 0.9239 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1367920 4 0.4235 0.3704 0.000 0.000 0.000 0.576 0.424
#> SRR1366648 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0162 0.9566 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1082173 5 0.4321 0.3535 0.000 0.004 0.396 0.000 0.600
#> SRR1363968 1 0.3196 0.7243 0.804 0.004 0.000 0.000 0.192
#> SRR814387 1 0.0880 0.8661 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR657599 5 0.6269 0.4271 0.336 0.004 0.144 0.000 0.516
#> SRR1386689 4 0.0324 0.9282 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1395575 3 0.0566 0.9325 0.000 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1453811 3 0.1197 0.9239 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1441159 1 0.3586 0.5302 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264
#> SRR1403154 4 0.0162 0.9286 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1468722 3 0.0162 0.9327 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1310275 5 0.4304 0.0521 0.000 0.000 0.484 0.000 0.516
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 5 0.7281 0.16423 0.300 0.000 0.108 0.000 0.368 0.224
#> SRR1331708 5 0.4002 0.36598 0.036 0.000 0.000 0.000 0.704 0.260
#> SRR1464258 1 0.4707 0.46606 0.584 0.000 0.000 0.000 0.056 0.360
#> SRR1454201 5 0.2660 0.54408 0.048 0.000 0.000 0.000 0.868 0.084
#> SRR661589 3 0.2527 0.80351 0.000 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1456229 1 0.4151 0.58582 0.684 0.000 0.000 0.000 0.040 0.276
#> SRR1315165 4 0.0146 0.84909 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1488960 1 0.0692 0.78781 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1417809 4 0.0260 0.84936 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1094457 4 0.0000 0.84933 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095575 5 0.6349 0.27763 0.180 0.000 0.028 0.000 0.440 0.352
#> SRR1315931 1 0.3351 0.71612 0.800 0.000 0.000 0.000 0.040 0.160
#> SRR1430066 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0790 0.83311 0.000 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR818002 2 0.1082 0.89143 0.000 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR1344143 6 0.7140 0.29010 0.000 0.244 0.000 0.084 0.292 0.380
#> SRR1486845 4 0.0405 0.84890 0.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1362866 5 0.1152 0.55002 0.044 0.000 0.000 0.000 0.952 0.004
#> SRR1490740 1 0.2651 0.74294 0.860 0.000 0.000 0.000 0.028 0.112
#> SRR1446627 2 0.1010 0.88791 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1456138 2 0.3136 0.69162 0.000 0.768 0.000 0.000 0.004 0.228
#> SRR1416248 1 0.1116 0.78419 0.960 0.000 0.000 0.004 0.028 0.008
#> SRR1383907 4 0.3103 0.74746 0.000 0.000 0.000 0.784 0.008 0.208
#> SRR1311018 1 0.0146 0.79004 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.3052 0.70326 0.000 0.780 0.000 0.000 0.004 0.216
#> SRR1429846 3 0.2912 0.78198 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR613550 3 0.2762 0.79302 0.000 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1348402 1 0.1367 0.77907 0.944 0.000 0.000 0.000 0.044 0.012
#> SRR1345146 5 0.4699 0.48440 0.104 0.000 0.000 0.000 0.668 0.228
#> SRR1324025 3 0.2664 0.79844 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1318879 3 0.5925 -0.05088 0.000 0.000 0.416 0.000 0.372 0.212
#> SRR820755 3 0.5590 0.48591 0.004 0.000 0.532 0.000 0.144 0.320
#> SRR1485830 4 0.0146 0.84962 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR599313 1 0.5921 0.15515 0.460 0.000 0.000 0.000 0.300 0.240
#> SRR612263 5 0.5683 0.18524 0.348 0.000 0.000 0.000 0.484 0.168
#> SRR1415398 3 0.2664 0.79844 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1326205 4 0.0146 0.84867 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1421327 4 0.5778 0.33240 0.000 0.000 0.000 0.504 0.228 0.268
#> SRR1083311 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.2980 0.76164 0.000 0.000 0.000 0.800 0.008 0.192
#> SRR1079522 5 0.4994 0.18930 0.076 0.000 0.000 0.000 0.544 0.380
#> SRR1452935 5 0.3221 0.51650 0.000 0.000 0.076 0.000 0.828 0.096
#> SRR1379495 1 0.0291 0.79021 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1470459 2 0.1863 0.88114 0.000 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR661361 3 0.2664 0.79844 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR615778 5 0.1845 0.54019 0.028 0.000 0.000 0.000 0.920 0.052
#> SRR1447564 1 0.1616 0.77652 0.932 0.000 0.000 0.000 0.020 0.048
#> SRR1455195 5 0.4371 0.28361 0.392 0.000 0.000 0.000 0.580 0.028
#> SRR655182 1 0.1074 0.78638 0.960 0.000 0.000 0.000 0.012 0.028
#> SRR1335140 6 0.7159 0.30699 0.000 0.276 0.000 0.084 0.264 0.376
#> SRR1433555 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.2006 0.87912 0.000 0.892 0.000 0.000 0.004 0.104
#> SRR1388354 1 0.0146 0.79004 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0622 0.82662 0.000 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1479955 2 0.3298 0.67374 0.000 0.756 0.000 0.000 0.008 0.236
#> SRR809853 1 0.4516 0.60849 0.700 0.000 0.000 0.000 0.112 0.188
#> SRR661313 3 0.2664 0.79844 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1499935 4 0.1196 0.84121 0.000 0.000 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1447303 3 0.3403 0.77170 0.000 0.000 0.768 0.000 0.020 0.212
#> SRR1429408 4 0.5415 0.22555 0.000 0.400 0.000 0.512 0.020 0.068
#> SRR1433950 1 0.1700 0.77717 0.928 0.000 0.000 0.000 0.024 0.048
#> SRR1362081 2 0.1765 0.88283 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1409854 5 0.5100 0.35421 0.036 0.000 0.036 0.000 0.596 0.332
#> SRR1435229 5 0.3044 0.51467 0.048 0.000 0.000 0.000 0.836 0.116
#> SRR1085996 1 0.3278 0.71805 0.808 0.000 0.000 0.000 0.040 0.152
#> SRR1414229 5 0.1863 0.53959 0.000 0.000 0.044 0.000 0.920 0.036
#> SRR1400974 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0748 0.78914 0.976 0.000 0.000 0.004 0.004 0.016
#> SRR613927 3 0.3758 0.71072 0.000 0.000 0.700 0.000 0.016 0.284
#> SRR1457854 1 0.0146 0.79004 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.4435 0.65470 0.672 0.000 0.000 0.000 0.064 0.264
#> SRR813776 3 0.5047 0.56652 0.004 0.000 0.584 0.000 0.080 0.332
#> SRR808196 4 0.0363 0.84520 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1101085 4 0.2980 0.75978 0.000 0.000 0.000 0.800 0.008 0.192
#> SRR614395 1 0.4938 0.45148 0.568 0.000 0.000 0.000 0.076 0.356
#> SRR1478251 4 0.0146 0.84962 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1370551 2 0.1814 0.88026 0.000 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1362310 1 0.0291 0.78975 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR665310 3 0.2664 0.79844 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1420109 3 0.5557 0.47647 0.020 0.000 0.532 0.000 0.088 0.360
#> SRR1330920 5 0.5809 0.17654 0.188 0.000 0.000 0.000 0.452 0.360
#> SRR1419539 3 0.3839 0.61485 0.000 0.036 0.748 0.004 0.000 0.212
#> SRR1359447 3 0.4614 0.56066 0.000 0.148 0.720 0.000 0.012 0.120
#> SRR1347259 4 0.3394 0.72383 0.000 0.000 0.000 0.752 0.012 0.236
#> SRR613915 3 0.3287 0.77175 0.000 0.000 0.768 0.000 0.012 0.220
#> SRR1384395 3 0.1082 0.81200 0.000 0.004 0.956 0.000 0.000 0.040
#> SRR821715 3 0.2664 0.79844 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1478228 1 0.1116 0.78419 0.960 0.000 0.000 0.004 0.028 0.008
#> SRR1445637 1 0.0820 0.78737 0.972 0.000 0.000 0.000 0.016 0.012
#> SRR608150 5 0.1391 0.54847 0.040 0.000 0.000 0.000 0.944 0.016
#> SRR1096383 1 0.5833 0.36232 0.564 0.000 0.020 0.000 0.252 0.164
#> SRR1341480 4 0.3947 0.70527 0.000 0.000 0.000 0.732 0.048 0.220
#> SRR1341344 5 0.4301 0.29082 0.392 0.000 0.000 0.000 0.584 0.024
#> SRR1326270 3 0.2697 0.79679 0.000 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1498838 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0260 0.83369 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR808566 4 0.4262 0.26862 0.000 0.424 0.000 0.560 0.004 0.012
#> SRR1430270 4 0.0146 0.84962 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1367825 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.2798 0.79905 0.000 0.000 0.852 0.000 0.036 0.112
#> SRR661267 3 0.7267 0.00234 0.096 0.000 0.344 0.000 0.252 0.308
#> SRR810665 2 0.0632 0.89263 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1407250 5 0.2604 0.54584 0.036 0.000 0.008 0.000 0.880 0.076
#> SRR1420067 1 0.3794 0.57912 0.724 0.000 0.000 0.000 0.248 0.028
#> SRR1473632 1 0.3247 0.71860 0.808 0.000 0.000 0.000 0.036 0.156
#> SRR812536 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0713 0.89441 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1486195 2 0.1814 0.88026 0.000 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1407671 5 0.5679 0.08571 0.000 0.172 0.000 0.004 0.536 0.288
#> SRR1446375 5 0.6153 0.36455 0.196 0.000 0.028 0.000 0.528 0.248
#> SRR1465230 4 0.0000 0.84933 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614119 1 0.5716 0.24349 0.504 0.000 0.000 0.000 0.304 0.192
#> SRR1356101 2 0.3045 0.82942 0.000 0.840 0.060 0.000 0.000 0.100
#> SRR1404209 1 0.4589 0.56722 0.696 0.000 0.000 0.000 0.172 0.132
#> SRR1392676 2 0.1010 0.88791 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR665538 1 0.5220 0.41586 0.596 0.000 0.000 0.000 0.264 0.140
#> SRR660510 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.1757 0.82822 0.000 0.000 0.000 0.916 0.008 0.076
#> SRR658953 5 0.3993 0.37421 0.024 0.000 0.000 0.000 0.676 0.300
#> SRR2166459 1 0.0914 0.78693 0.968 0.000 0.000 0.000 0.016 0.016
#> SRR1070713 2 0.1745 0.88960 0.000 0.924 0.000 0.000 0.020 0.056
#> SRR1485312 3 0.1444 0.82745 0.000 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1317631 4 0.1556 0.79663 0.000 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1488610 5 0.4339 0.39084 0.256 0.000 0.000 0.000 0.684 0.060
#> SRR1330588 3 0.2902 0.79113 0.000 0.000 0.800 0.000 0.004 0.196
#> SRR1316367 5 0.3925 0.38990 0.236 0.000 0.000 0.000 0.724 0.040
#> SRR1433926 1 0.2988 0.72574 0.828 0.000 0.000 0.000 0.028 0.144
#> SRR1091302 4 0.0405 0.84927 0.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR818263 5 0.5956 0.13719 0.224 0.000 0.000 0.000 0.420 0.356
#> SRR1404909 4 0.4460 0.60056 0.000 0.000 0.000 0.644 0.052 0.304
#> SRR663076 1 0.0291 0.78987 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1323577 2 0.0713 0.89435 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1442422 4 0.0000 0.84933 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.1036 0.78517 0.964 0.000 0.000 0.004 0.024 0.008
#> SRR654862 5 0.5285 0.27655 0.112 0.000 0.000 0.000 0.536 0.352
#> SRR1407112 4 0.0146 0.84867 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1332969 3 0.2664 0.79844 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1353199 3 0.2664 0.79844 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1378885 3 0.3487 0.76309 0.000 0.000 0.756 0.000 0.020 0.224
#> SRR665357 3 0.1563 0.79972 0.000 0.012 0.932 0.000 0.000 0.056
#> SRR662186 2 0.1908 0.89037 0.000 0.900 0.000 0.000 0.004 0.096
#> SRR1501020 3 0.2527 0.80351 0.000 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1347819 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.1814 0.88158 0.000 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1472576 4 0.4929 0.60082 0.000 0.100 0.000 0.644 0.004 0.252
#> SRR1431781 4 0.0291 0.84918 0.000 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1452270 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.2867 0.54105 0.040 0.000 0.000 0.000 0.848 0.112
#> SRR1417632 4 0.6112 -0.01344 0.000 0.000 0.000 0.372 0.320 0.308
#> SRR1350153 2 0.1765 0.88283 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1458113 5 0.3270 0.49645 0.000 0.000 0.120 0.000 0.820 0.060
#> SRR1326579 5 0.2070 0.54776 0.092 0.000 0.000 0.000 0.896 0.012
#> SRR1349363 2 0.5224 0.40924 0.004 0.620 0.000 0.084 0.012 0.280
#> SRR1096712 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.2664 0.79844 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1083752 2 0.2872 0.83413 0.000 0.832 0.000 0.004 0.012 0.152
#> SRR1377599 5 0.6069 -0.13819 0.000 0.000 0.000 0.288 0.404 0.308
#> SRR1488449 3 0.2631 0.79982 0.000 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1318354 5 0.4887 0.31247 0.000 0.000 0.300 0.000 0.612 0.088
#> SRR1359062 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.4779 0.34448 0.072 0.008 0.000 0.000 0.656 0.264
#> SRR663783 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319204 5 0.6671 0.22808 0.000 0.044 0.248 0.000 0.444 0.264
#> SRR1369070 2 0.1010 0.88791 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR615659 1 0.2988 0.72574 0.828 0.000 0.000 0.000 0.028 0.144
#> SRR1337449 2 0.1814 0.88026 0.000 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1316982 3 0.4892 0.36668 0.000 0.272 0.628 0.000 0.000 0.100
#> SRR1498595 4 0.5684 0.47412 0.000 0.048 0.000 0.560 0.068 0.324
#> SRR1377423 3 0.1387 0.82947 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1312310 2 0.1663 0.88567 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1485613 1 0.5351 0.35631 0.568 0.000 0.000 0.000 0.288 0.144
#> SRR1338426 3 0.1649 0.80223 0.000 0.000 0.932 0.000 0.036 0.032
#> SRR1353309 3 0.0508 0.82788 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR658941 5 0.5999 0.14739 0.008 0.000 0.388 0.000 0.428 0.176
#> SRR1101643 1 0.3175 0.71639 0.808 0.000 0.000 0.000 0.028 0.164
#> SRR1401468 5 0.5719 0.17042 0.372 0.000 0.000 0.000 0.460 0.168
#> SRR1368874 2 0.2092 0.88606 0.000 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1324085 4 0.0405 0.84903 0.000 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1363858 1 0.5894 0.18858 0.472 0.000 0.000 0.000 0.284 0.244
#> SRR819820 3 0.4858 0.50177 0.000 0.000 0.664 0.000 0.180 0.156
#> SRR1337342 5 0.2201 0.54991 0.048 0.000 0.000 0.000 0.900 0.052
#> SRR655206 3 0.6413 0.26335 0.000 0.168 0.540 0.004 0.052 0.236
#> SRR1387013 2 0.3894 0.69433 0.000 0.760 0.000 0.000 0.072 0.168
#> SRR1317410 1 0.1116 0.78419 0.960 0.000 0.000 0.004 0.028 0.008
#> SRR608198 5 0.1890 0.54722 0.060 0.000 0.000 0.000 0.916 0.024
#> SRR1440161 2 0.1765 0.88283 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1343741 2 0.1010 0.88791 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1381288 2 0.1010 0.88791 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1415379 4 0.0260 0.84936 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1099622 2 0.2558 0.86082 0.000 0.868 0.028 0.000 0.000 0.104
#> SRR663197 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394836 3 0.5808 0.05046 0.000 0.360 0.472 0.000 0.004 0.164
#> SRR661699 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813680 3 0.7197 0.12140 0.156 0.000 0.388 0.000 0.132 0.324
#> SRR1410678 1 0.0436 0.78940 0.988 0.000 0.000 0.004 0.004 0.004
#> SRR1378109 4 0.0000 0.84933 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.3210 0.71675 0.812 0.000 0.000 0.000 0.036 0.152
#> SRR1311486 2 0.0260 0.89610 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1382851 5 0.5751 -0.05237 0.000 0.156 0.000 0.008 0.524 0.312
#> SRR1433410 5 0.1802 0.54789 0.072 0.000 0.000 0.000 0.916 0.012
#> SRR661167 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.3078 0.75215 0.000 0.000 0.836 0.000 0.108 0.056
#> SRR660462 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.5484 0.30624 0.004 0.000 0.000 0.568 0.280 0.148
#> SRR657949 3 0.5347 0.55339 0.004 0.000 0.572 0.000 0.120 0.304
#> SRR1308882 4 0.0935 0.84425 0.000 0.000 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR655768 1 0.5234 0.41773 0.596 0.000 0.000 0.000 0.260 0.144
#> SRR1485870 4 0.4844 0.55176 0.000 0.000 0.000 0.608 0.080 0.312
#> SRR1444138 1 0.5625 0.34019 0.540 0.000 0.000 0.000 0.244 0.216
#> SRR1417342 1 0.0405 0.79027 0.988 0.000 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1470193 4 0.0405 0.84902 0.000 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1091380 3 0.4858 0.50177 0.000 0.000 0.664 0.000 0.180 0.156
#> SRR1099096 1 0.1116 0.78419 0.960 0.000 0.000 0.004 0.028 0.008
#> SRR1313583 1 0.3993 0.12869 0.520 0.000 0.000 0.476 0.000 0.004
#> SRR1467102 3 0.3953 0.60352 0.000 0.132 0.764 0.000 0.000 0.104
#> SRR1485416 4 0.3738 0.72391 0.000 0.000 0.000 0.752 0.040 0.208
#> SRR818821 3 0.2798 0.79905 0.000 0.000 0.852 0.000 0.036 0.112
#> SRR809963 1 0.4938 0.45148 0.568 0.000 0.000 0.000 0.076 0.356
#> SRR1072247 1 0.0665 0.78850 0.980 0.000 0.000 0.004 0.008 0.008
#> SRR1353710 4 0.2053 0.81521 0.000 0.000 0.000 0.888 0.004 0.108
#> SRR1445259 5 0.2622 0.54972 0.024 0.000 0.004 0.000 0.868 0.104
#> SRR1408393 3 0.5325 0.52492 0.016 0.000 0.560 0.000 0.076 0.348
#> SRR1361522 1 0.3027 0.72383 0.824 0.000 0.000 0.000 0.028 0.148
#> SRR1368597 1 0.2309 0.75961 0.888 0.000 0.000 0.000 0.028 0.084
#> SRR1309680 2 0.1082 0.88863 0.000 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR1310542 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.1644 0.82933 0.000 0.000 0.000 0.920 0.004 0.076
#> SRR1406437 5 0.6967 0.13374 0.008 0.032 0.008 0.304 0.424 0.224
#> SRR1354931 3 0.2416 0.80768 0.000 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1391856 2 0.3952 0.76690 0.000 0.780 0.108 0.000 0.008 0.104
#> SRR1446738 2 0.5400 0.15518 0.000 0.492 0.000 0.004 0.404 0.100
#> SRR1309032 2 0.1765 0.88283 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1388145 2 0.0363 0.89563 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1432611 2 0.1610 0.88694 0.000 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR815869 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375329 5 0.2513 0.51356 0.008 0.000 0.000 0.000 0.852 0.140
#> SRR1387921 1 0.0146 0.79004 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.1765 0.88283 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1360478 2 0.1075 0.89295 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1360695 1 0.3395 0.70089 0.816 0.000 0.000 0.004 0.056 0.124
#> SRR812943 5 0.5731 0.22836 0.276 0.000 0.000 0.000 0.512 0.212
#> SRR1400910 5 0.3163 0.45080 0.004 0.004 0.000 0.000 0.780 0.212
#> SRR1444203 4 0.0000 0.84933 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816177 2 0.0692 0.89466 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR658754 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.2778 0.77949 0.000 0.000 0.000 0.824 0.008 0.168
#> SRR1397366 3 0.2664 0.79844 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1446028 1 0.1141 0.78131 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1083918 2 0.0508 0.89533 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1337606 5 0.3245 0.40419 0.008 0.000 0.000 0.000 0.764 0.228
#> SRR659109 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337192 5 0.3898 0.34903 0.336 0.000 0.000 0.000 0.652 0.012
#> SRR656946 1 0.3953 0.68425 0.744 0.000 0.000 0.000 0.060 0.196
#> SRR1476102 1 0.1082 0.78561 0.956 0.000 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1476447 1 0.1564 0.78155 0.936 0.000 0.000 0.000 0.024 0.040
#> SRR1342067 4 0.1471 0.83388 0.000 0.000 0.000 0.932 0.004 0.064
#> SRR1385389 4 0.0146 0.84962 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1075971 1 0.0405 0.79068 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR614419 5 0.4684 0.33075 0.256 0.000 0.000 0.000 0.656 0.088
#> SRR1322936 5 0.1633 0.54745 0.044 0.000 0.000 0.000 0.932 0.024
#> SRR1349121 1 0.3717 0.66086 0.780 0.000 0.000 0.000 0.148 0.072
#> SRR1430549 1 0.0291 0.79047 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR612935 3 0.3877 0.67741 0.000 0.000 0.764 0.000 0.160 0.076
#> SRR661481 2 0.0260 0.89602 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1354117 2 0.1814 0.88302 0.000 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1393596 4 0.4420 0.60540 0.000 0.000 0.000 0.644 0.048 0.308
#> SRR1452164 1 0.1219 0.78335 0.948 0.000 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR1070503 3 0.4881 0.65541 0.000 0.000 0.648 0.000 0.120 0.232
#> SRR1499894 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082883 5 0.1297 0.54913 0.040 0.000 0.000 0.000 0.948 0.012
#> SRR1468271 1 0.5480 0.30619 0.540 0.000 0.000 0.000 0.308 0.152
#> SRR1332443 1 0.0291 0.78975 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR810295 2 0.1765 0.88283 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR662103 1 0.3027 0.72383 0.824 0.000 0.000 0.000 0.028 0.148
#> SRR1328620 5 0.5336 0.34126 0.000 0.000 0.244 0.000 0.588 0.168
#> SRR1396294 4 0.3388 0.68054 0.004 0.000 0.000 0.804 0.036 0.156
#> SRR1419917 1 0.3065 0.72150 0.820 0.000 0.000 0.000 0.028 0.152
#> SRR662114 3 0.5240 0.48852 0.000 0.000 0.584 0.000 0.284 0.132
#> SRR1489199 5 0.3978 0.50985 0.084 0.000 0.000 0.000 0.756 0.160
#> SRR813584 2 0.1010 0.89483 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1069638 5 0.3839 0.43513 0.004 0.000 0.036 0.000 0.748 0.212
#> SRR614864 3 0.3403 0.77170 0.000 0.000 0.768 0.000 0.020 0.212
#> SRR1433392 1 0.5811 0.37053 0.520 0.000 0.036 0.000 0.088 0.356
#> SRR1377777 2 0.3298 0.67374 0.000 0.756 0.000 0.000 0.008 0.236
#> SRR2167710 1 0.4037 0.67652 0.736 0.000 0.000 0.000 0.064 0.200
#> SRR1401252 4 0.4229 0.63151 0.000 0.000 0.000 0.668 0.040 0.292
#> SRR1309963 4 0.0000 0.84933 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0820 0.78722 0.972 0.000 0.000 0.000 0.012 0.016
#> SRR1418628 2 0.1327 0.89127 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1486889 1 0.6365 0.36034 0.512 0.000 0.044 0.000 0.180 0.264
#> SRR1380393 1 0.0146 0.79004 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.1116 0.78419 0.960 0.000 0.000 0.004 0.028 0.008
#> SRR1356468 4 0.0146 0.84867 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1337010 2 0.1863 0.88114 0.000 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1486520 5 0.4715 0.18213 0.416 0.000 0.000 0.000 0.536 0.048
#> SRR1486538 4 0.1007 0.84169 0.000 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1340486 4 0.0000 0.84933 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377696 5 0.6921 -0.20407 0.000 0.068 0.000 0.204 0.396 0.332
#> SRR1465459 3 0.3487 0.76309 0.000 0.000 0.756 0.000 0.020 0.224
#> SRR1080270 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.2632 0.80692 0.000 0.000 0.832 0.000 0.004 0.164
#> SRR1093148 5 0.3876 0.49449 0.004 0.000 0.068 0.000 0.772 0.156
#> SRR1467080 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.1765 0.88164 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR816475 4 0.3695 0.64306 0.000 0.176 0.000 0.776 0.004 0.044
#> SRR1379198 4 0.0146 0.84962 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR613342 3 0.2257 0.81528 0.000 0.000 0.876 0.000 0.008 0.116
#> SRR1452246 2 0.2572 0.79734 0.000 0.852 0.000 0.000 0.012 0.136
#> SRR1338836 2 0.1010 0.88791 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1369129 4 0.0146 0.84962 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1396616 3 0.2664 0.79844 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR813824 3 0.0713 0.83331 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1082376 1 0.5465 0.36313 0.508 0.000 0.000 0.000 0.132 0.360
#> SRR1500891 4 0.3349 0.71761 0.000 0.000 0.000 0.748 0.008 0.244
#> SRR807543 3 0.5249 0.50054 0.004 0.000 0.544 0.000 0.092 0.360
#> SRR1091572 5 0.5084 0.34236 0.124 0.000 0.000 0.000 0.612 0.264
#> SRR1346689 4 0.3023 0.74898 0.000 0.000 0.000 0.784 0.004 0.212
#> SRR1332424 5 0.1858 0.54635 0.076 0.000 0.000 0.000 0.912 0.012
#> SRR663729 4 0.3649 0.73456 0.000 0.000 0.000 0.764 0.040 0.196
#> SRR1097013 1 0.0000 0.79041 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613675 5 0.1633 0.54745 0.044 0.000 0.000 0.000 0.932 0.024
#> SRR1485357 4 0.0146 0.84867 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR655816 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.3482 0.69865 0.812 0.000 0.000 0.004 0.068 0.116
#> SRR1437622 2 0.1285 0.88525 0.000 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR1355172 3 0.6470 0.21097 0.252 0.000 0.508 0.000 0.052 0.188
#> SRR655531 5 0.2487 0.54833 0.092 0.000 0.000 0.000 0.876 0.032
#> SRR1338147 3 0.2697 0.79680 0.000 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1413329 5 0.5144 0.41590 0.012 0.000 0.128 0.000 0.652 0.208
#> SRR1485931 2 0.3950 0.57810 0.000 0.696 0.000 0.000 0.028 0.276
#> SRR1420873 1 0.5255 0.39505 0.588 0.000 0.000 0.000 0.272 0.140
#> SRR1333308 4 0.0935 0.84423 0.000 0.000 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR1452033 1 0.4693 0.55792 0.684 0.000 0.000 0.000 0.176 0.140
#> SRR1467316 2 0.3592 0.64856 0.000 0.740 0.000 0.000 0.020 0.240
#> SRR809018 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0865 0.89197 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR663440 3 0.3460 0.76610 0.000 0.000 0.760 0.000 0.020 0.220
#> SRR1471755 2 0.0363 0.89563 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR808019 5 0.6165 0.31575 0.268 0.000 0.024 0.000 0.512 0.196
#> SRR1479133 3 0.2664 0.79844 0.000 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR615069 5 0.3438 0.50321 0.000 0.004 0.068 0.000 0.816 0.112
#> SRR1456185 2 0.0508 0.89533 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1350069 4 0.1556 0.79663 0.000 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR816316 1 0.4758 0.46094 0.580 0.000 0.000 0.000 0.060 0.360
#> SRR664795 6 0.7545 -0.09997 0.212 0.000 0.304 0.000 0.164 0.320
#> SRR1490721 5 0.5138 0.13791 0.000 0.000 0.000 0.128 0.604 0.268
#> SRR810643 1 0.3934 0.55241 0.708 0.000 0.000 0.000 0.260 0.032
#> SRR1430333 5 0.1749 0.54311 0.008 0.000 0.036 0.000 0.932 0.024
#> SRR1085285 3 0.1501 0.82713 0.000 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1099072 3 0.2823 0.78889 0.000 0.000 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1317985 1 0.1168 0.78345 0.956 0.000 0.000 0.000 0.016 0.028
#> SRR1487340 1 0.0291 0.79047 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1420276 3 0.1082 0.81200 0.000 0.004 0.956 0.000 0.000 0.040
#> SRR1351347 3 0.3506 0.71090 0.000 0.000 0.792 0.000 0.156 0.052
#> SRR1405525 5 0.4658 0.30030 0.384 0.000 0.000 0.000 0.568 0.048
#> SRR1370329 1 0.0748 0.78914 0.976 0.000 0.000 0.004 0.004 0.016
#> SRR1465001 1 0.1116 0.78419 0.960 0.000 0.000 0.004 0.028 0.008
#> SRR1476525 2 0.0632 0.89263 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR819610 2 0.0777 0.89403 0.000 0.972 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR2157314 1 0.0972 0.78503 0.964 0.000 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR1409465 2 0.1010 0.88791 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR809987 4 0.0858 0.83192 0.028 0.000 0.000 0.968 0.000 0.004
#> SRR613639 3 0.3163 0.77366 0.000 0.000 0.764 0.000 0.004 0.232
#> SRR1402285 4 0.0000 0.84933 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.4808 0.46024 0.576 0.000 0.000 0.000 0.064 0.360
#> SRR1405660 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 5 0.4278 0.46974 0.076 0.000 0.000 0.000 0.712 0.212
#> SRR1394734 2 0.0508 0.89533 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1317771 1 0.1794 0.78627 0.924 0.000 0.000 0.000 0.040 0.036
#> SRR1365894 4 0.6305 0.03496 0.000 0.008 0.000 0.384 0.292 0.316
#> SRR1073581 1 0.6490 0.20800 0.476 0.000 0.040 0.000 0.280 0.204
#> SRR659804 1 0.1036 0.78517 0.964 0.000 0.000 0.004 0.024 0.008
#> SRR1345914 2 0.0713 0.89225 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1432186 2 0.0935 0.89316 0.000 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1473529 6 0.7521 0.28683 0.000 0.208 0.000 0.188 0.232 0.372
#> SRR660764 3 0.1124 0.81546 0.000 0.000 0.956 0.000 0.008 0.036
#> SRR820448 1 0.4285 0.53943 0.644 0.000 0.000 0.000 0.036 0.320
#> SRR1328845 4 0.1556 0.79663 0.000 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1336415 4 0.0000 0.84933 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.1285 0.83792 0.000 0.000 0.000 0.944 0.004 0.052
#> SRR1459190 3 0.2378 0.81061 0.000 0.000 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1346773 1 0.2257 0.73997 0.876 0.000 0.000 0.000 0.116 0.008
#> SRR1499521 1 0.5537 0.25910 0.520 0.000 0.000 0.000 0.328 0.152
#> SRR1440898 2 0.0713 0.89155 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1347459 3 0.1610 0.82710 0.000 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1081209 2 0.1858 0.85136 0.000 0.904 0.000 0.000 0.004 0.092
#> SRR1400202 1 0.0291 0.79021 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1333395 4 0.3954 0.65549 0.004 0.000 0.000 0.684 0.016 0.296
#> SRR1309248 4 0.6124 -0.05515 0.000 0.000 0.000 0.356 0.328 0.316
#> SRR809161 3 0.2697 0.79749 0.000 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1316320 5 0.5486 0.08230 0.000 0.020 0.000 0.088 0.560 0.332
#> SRR1432629 2 0.1219 0.88761 0.000 0.948 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR1498931 1 0.0291 0.79021 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1416578 4 0.0260 0.84936 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1405547 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0146 0.84962 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1380764 5 0.4903 0.03413 0.464 0.000 0.000 0.000 0.476 0.060
#> SRR1309160 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.3376 0.69954 0.816 0.000 0.000 0.004 0.052 0.128
#> SRR1078489 5 0.3424 0.48407 0.004 0.000 0.032 0.000 0.796 0.168
#> SRR1332648 4 0.0146 0.84962 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR660614 5 0.6676 0.26664 0.000 0.132 0.108 0.000 0.512 0.248
#> SRR1470420 2 0.1814 0.88202 0.000 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1475566 1 0.0291 0.79021 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1477949 1 0.0000 0.79041 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0713 0.89155 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1464766 1 0.4537 0.50566 0.664 0.000 0.000 0.000 0.264 0.072
#> SRR615946 3 0.1610 0.82712 0.000 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1446481 2 0.0363 0.89563 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1467656 2 0.1765 0.88283 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1402962 5 0.4975 0.34819 0.312 0.000 0.000 0.000 0.596 0.092
#> SRR660224 2 0.0713 0.89155 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR665586 1 0.3247 0.71449 0.808 0.000 0.000 0.000 0.036 0.156
#> SRR1347166 5 0.1845 0.54019 0.028 0.000 0.000 0.000 0.920 0.052
#> SRR1485722 5 0.3251 0.53142 0.040 0.000 0.008 0.000 0.828 0.124
#> SRR1415316 1 0.1908 0.77054 0.916 0.000 0.000 0.000 0.028 0.056
#> SRR613390 1 0.3210 0.71675 0.812 0.000 0.000 0.000 0.036 0.152
#> SRR661108 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2170173 5 0.6978 0.18807 0.076 0.000 0.196 0.000 0.380 0.348
#> SRR817329 1 0.3210 0.71675 0.812 0.000 0.000 0.000 0.036 0.152
#> SRR1401990 4 0.1141 0.81904 0.000 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1467745 2 0.2006 0.87912 0.000 0.892 0.000 0.000 0.004 0.104
#> SRR1471795 2 0.0632 0.89309 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1415637 2 0.1010 0.88791 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR813137 1 0.4196 0.53101 0.640 0.000 0.000 0.000 0.028 0.332
#> SRR1314873 1 0.3139 0.71934 0.816 0.000 0.000 0.000 0.032 0.152
#> SRR1401211 1 0.3454 0.69739 0.812 0.000 0.000 0.004 0.060 0.124
#> SRR1419692 4 0.0000 0.84933 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818797 3 0.3109 0.77429 0.000 0.000 0.772 0.000 0.004 0.224
#> SRR2164608 5 0.5737 0.23417 0.000 0.000 0.304 0.000 0.500 0.196
#> SRR1455586 3 0.5319 -0.05777 0.000 0.420 0.476 0.000 0.000 0.104
#> SRR819459 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.3886 0.59486 0.000 0.708 0.000 0.000 0.028 0.264
#> SRR1433232 2 0.1349 0.87845 0.000 0.940 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1385501 6 0.6119 -0.19700 0.324 0.000 0.000 0.000 0.312 0.364
#> SRR1361652 5 0.3695 0.40864 0.024 0.000 0.000 0.000 0.732 0.244
#> SRR1437119 1 0.0291 0.79021 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1478547 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 5 0.3328 0.50819 0.000 0.000 0.064 0.000 0.816 0.120
#> SRR1310584 1 0.1268 0.78221 0.952 0.000 0.000 0.004 0.036 0.008
#> SRR1500216 1 0.5921 0.15515 0.460 0.000 0.000 0.000 0.300 0.240
#> SRR1486762 3 0.1204 0.83076 0.000 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1480854 4 0.5048 0.55866 0.000 0.000 0.000 0.616 0.120 0.264
#> SRR1489394 4 0.0146 0.84962 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1418085 4 0.0000 0.84933 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0146 0.84962 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1473058 4 0.4963 0.26065 0.000 0.392 0.000 0.544 0.004 0.060
#> SRR1405165 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.3351 0.70944 0.800 0.000 0.000 0.000 0.040 0.160
#> SRR1471477 1 0.5183 0.43185 0.604 0.000 0.000 0.000 0.256 0.140
#> SRR1098567 2 0.1007 0.89438 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1098712 4 0.5355 0.52400 0.008 0.036 0.000 0.676 0.096 0.184
#> SRR1455038 5 0.5666 0.18112 0.352 0.000 0.000 0.000 0.484 0.164
#> SRR1375248 2 0.4946 0.47187 0.000 0.616 0.284 0.000 0.000 0.100
#> SRR1403005 3 0.2854 0.78682 0.000 0.000 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1348378 2 0.2006 0.87912 0.000 0.892 0.000 0.000 0.004 0.104
#> SRR1413541 1 0.3210 0.71675 0.812 0.000 0.000 0.000 0.036 0.152
#> SRR1392943 4 0.3112 0.78007 0.000 0.000 0.000 0.836 0.096 0.068
#> SRR1475192 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.1863 0.87957 0.000 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1452468 5 0.2573 0.52105 0.024 0.000 0.000 0.000 0.864 0.112
#> SRR1347060 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414139 3 0.5083 0.27035 0.000 0.320 0.580 0.000 0.000 0.100
#> SRR1447962 2 0.1863 0.87957 0.000 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1444324 2 0.1765 0.88283 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1415004 1 0.0146 0.79004 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.3929 0.56385 0.700 0.000 0.000 0.000 0.272 0.028
#> SRR1311266 5 0.3953 0.50206 0.132 0.000 0.000 0.000 0.764 0.104
#> SRR1343302 4 0.0000 0.84933 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0291 0.79047 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1429678 1 0.1168 0.78571 0.956 0.000 0.000 0.000 0.016 0.028
#> SRR1469413 2 0.2558 0.86082 0.000 0.868 0.028 0.000 0.000 0.104
#> SRR1405331 3 0.5327 0.48738 0.004 0.000 0.536 0.000 0.100 0.360
#> SRR1345609 1 0.0291 0.79021 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1380208 5 0.3875 0.30800 0.000 0.016 0.000 0.004 0.700 0.280
#> SRR1322840 4 0.1152 0.84058 0.000 0.000 0.000 0.952 0.004 0.044
#> SRR1399797 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.1082 0.81200 0.000 0.004 0.956 0.000 0.000 0.040
#> SRR1369196 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0436 0.79017 0.988 0.000 0.000 0.004 0.004 0.004
#> SRR1365291 3 0.3641 0.75690 0.000 0.000 0.748 0.000 0.028 0.224
#> SRR1367920 5 0.6122 -0.17083 0.000 0.000 0.000 0.336 0.356 0.308
#> SRR1366648 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.1349 0.89346 0.000 0.940 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1082173 5 0.5195 0.37196 0.000 0.000 0.176 0.000 0.616 0.208
#> SRR1363968 1 0.5096 0.44801 0.616 0.000 0.000 0.000 0.252 0.132
#> SRR814387 1 0.1116 0.78419 0.960 0.000 0.000 0.004 0.028 0.008
#> SRR657599 5 0.6042 0.33037 0.260 0.000 0.020 0.000 0.528 0.192
#> SRR1386689 4 0.0000 0.84933 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.1387 0.82813 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1453811 3 0.3487 0.76309 0.000 0.000 0.756 0.000 0.020 0.224
#> SRR1441159 1 0.2664 0.67044 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.84933 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.83366 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 5 0.5708 0.18496 0.000 0.000 0.264 0.000 0.520 0.216
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.918 0.923 0.970 0.5010 0.500 0.500
#> 3 3 0.769 0.865 0.937 0.3114 0.758 0.556
#> 4 4 0.950 0.923 0.969 0.1224 0.843 0.591
#> 5 5 0.907 0.895 0.945 0.0729 0.921 0.714
#> 6 6 0.853 0.707 0.857 0.0398 0.956 0.803
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
#> attr(,"optional")
#> [1] 2 4
There is also optional best \(k\) = 2 4 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.9686 0.3642 0.604 0.396
#> SRR1331708 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1464258 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR661589 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1315165 1 0.2043 0.9354 0.968 0.032
#> SRR1488960 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1094457 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1095575 2 0.9815 0.2813 0.420 0.580
#> SRR1315931 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1430066 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1431037 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1395554 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1344143 1 0.9710 0.3237 0.600 0.400
#> SRR1486845 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1456138 2 0.0376 0.9689 0.004 0.996
#> SRR1416248 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1383907 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1375699 1 0.9635 0.3564 0.612 0.388
#> SRR1429846 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR613550 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1324025 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1318879 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR820755 2 0.9286 0.4559 0.344 0.656
#> SRR1485830 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR599313 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1415398 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1326205 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1421327 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1083311 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1499303 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1079522 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1452935 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR661361 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR615778 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.9732 0.3264 0.404 0.596
#> SRR1433555 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1308650 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1317446 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1413602 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1479955 2 0.7219 0.7415 0.200 0.800
#> SRR809853 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR661313 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1499935 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1447303 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1429408 2 0.8207 0.6414 0.256 0.744
#> SRR1433950 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1409854 1 0.9775 0.3219 0.588 0.412
#> SRR1435229 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1414229 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1400974 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR613927 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR813776 2 0.7299 0.7294 0.204 0.796
#> SRR808196 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1101085 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR614395 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1478251 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR665310 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1420109 2 0.0376 0.9689 0.004 0.996
#> SRR1330920 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1419539 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1359447 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1347259 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR613915 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1384395 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR821715 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.5629 0.8288 0.868 0.132
#> SRR1341480 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1326270 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1498838 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1416313 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR808566 2 0.3733 0.9014 0.072 0.928
#> SRR1430270 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1367825 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR613533 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR661267 2 0.9795 0.2598 0.416 0.584
#> SRR810665 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1407250 1 0.9635 0.3844 0.612 0.388
#> SRR1420067 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR812536 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1407671 1 0.3114 0.9115 0.944 0.056
#> SRR1446375 2 0.9963 0.1411 0.464 0.536
#> SRR1465230 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR614119 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR660510 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1445655 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR658953 1 0.1414 0.9463 0.980 0.020
#> SRR2166459 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1485312 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1317631 1 0.3733 0.8961 0.928 0.072
#> SRR1488610 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1330588 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1316367 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1091302 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR818263 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1404909 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1442422 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1407112 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1332969 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1353199 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1378885 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR665357 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1501020 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1347819 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1472576 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1431781 1 0.9970 0.1507 0.532 0.468
#> SRR1452270 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1500472 2 0.9909 0.2080 0.444 0.556
#> SRR1417632 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1458113 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1326579 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1349363 1 0.9881 0.2168 0.564 0.436
#> SRR1096712 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1090407 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1083752 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1377599 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1488449 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1318354 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1359062 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1398924 1 0.9732 0.3125 0.596 0.404
#> SRR663783 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1319204 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1498595 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1377423 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1338426 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1353309 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR658941 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1324085 1 0.7219 0.7389 0.800 0.200
#> SRR1363858 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR819820 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1337342 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR655206 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1387013 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1415379 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR663197 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1394836 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR661699 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR813680 1 0.9732 0.3434 0.596 0.404
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1378109 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1382851 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1433410 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR661167 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1432518 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR660462 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1374608 1 0.9000 0.5440 0.684 0.316
#> SRR657949 2 0.1843 0.9465 0.028 0.972
#> SRR1308882 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1485870 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1444138 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1470193 1 0.1414 0.9465 0.980 0.020
#> SRR1091380 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1467102 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1485416 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR818821 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR809963 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1353710 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1445259 2 0.8081 0.6654 0.248 0.752
#> SRR1408393 1 0.9970 0.1506 0.532 0.468
#> SRR1361522 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0376 0.9689 0.004 0.996
#> SRR1310542 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1333485 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1406437 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1354931 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1391856 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1446738 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR815869 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR613150 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1375329 2 0.7219 0.7419 0.200 0.800
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1400910 2 0.7674 0.7047 0.224 0.776
#> SRR1444203 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR658754 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1429603 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1397366 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1337606 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR659109 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1342067 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1385389 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR612935 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1393596 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1070503 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1499894 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1082883 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1328620 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1396294 1 1.0000 0.0486 0.504 0.496
#> SRR1419917 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR662114 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1489199 1 0.1184 0.9500 0.984 0.016
#> SRR813584 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1069638 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR614864 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1433392 1 0.4022 0.8877 0.920 0.080
#> SRR1377777 2 0.7056 0.7531 0.192 0.808
#> SRR2167710 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1401252 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1309963 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1486889 1 0.4939 0.8570 0.892 0.108
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1486538 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1340486 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1377696 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1465459 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1080270 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1312501 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1093148 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1467080 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR816475 2 0.7219 0.7356 0.200 0.800
#> SRR1379198 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR613342 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1452246 2 0.0376 0.9689 0.004 0.996
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1369129 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1396616 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR813824 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1082376 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1500891 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR807543 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1091572 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1346689 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR663729 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1485357 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR655816 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1355172 1 0.9710 0.3538 0.600 0.400
#> SRR655531 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1338147 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1413329 2 0.5178 0.8514 0.116 0.884
#> SRR1485931 2 0.7219 0.7415 0.200 0.800
#> SRR1420873 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1333308 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.8608 0.6003 0.284 0.716
#> SRR809018 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR663440 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR808019 1 0.9580 0.4042 0.620 0.380
#> SRR1479133 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR615069 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1456185 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1350069 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR664795 1 0.8861 0.5673 0.696 0.304
#> SRR1490721 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1430333 2 0.3879 0.8971 0.076 0.924
#> SRR1085285 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1099072 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1351347 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR819610 2 0.2423 0.9350 0.040 0.960
#> SRR2157314 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR809987 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR613639 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1402285 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1405660 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1095455 2 0.9686 0.3479 0.396 0.604
#> SRR1394734 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1365894 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1073581 1 0.7219 0.7389 0.800 0.200
#> SRR659804 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1473529 1 0.9993 0.0490 0.516 0.484
#> SRR660764 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1328845 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1336415 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1379065 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1459190 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1346773 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1347459 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1333395 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1309248 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR809161 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1316320 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1432629 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1416578 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1405547 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1470534 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1309160 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR663489 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1078489 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1332648 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR660614 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR615946 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.9552 0.4136 0.624 0.376
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR661108 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR2170173 2 0.9358 0.4576 0.352 0.648
#> SRR817329 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1401990 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1467745 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR813137 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1419692 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR818797 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR2164608 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1455586 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR819459 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1488939 2 0.9732 0.3264 0.404 0.596
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1385501 1 0.4690 0.8652 0.900 0.100
#> SRR1361652 1 0.4939 0.8548 0.892 0.108
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1478547 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1430910 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1486762 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1480854 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1489394 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1418085 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1340221 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1473058 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1405165 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1098712 1 0.9922 0.2166 0.552 0.448
#> SRR1455038 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1403005 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1348378 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1475192 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1452468 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1347060 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1414139 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1343302 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1405331 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1380208 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1322840 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1399797 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1416654 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1315081 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1369196 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1365291 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1367920 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1366648 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1082173 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1363968 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR657599 1 0.9580 0.4042 0.620 0.380
#> SRR1386689 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1395575 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1453811 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1403154 1 0.0000 0.9639 1.000 0.000
#> SRR1468722 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
#> SRR1310275 2 0.0000 0.9724 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 3 0.4504 0.7397 0.196 0.000 0.804
#> SRR1331708 1 0.0237 0.9054 0.996 0.004 0.000
#> SRR1464258 1 0.6286 0.0600 0.536 0.000 0.464
#> SRR1454201 3 0.6295 0.1831 0.472 0.000 0.528
#> SRR661589 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315165 2 0.4235 0.7387 0.176 0.824 0.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.4504 0.7876 0.804 0.196 0.000
#> SRR1094457 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR1095575 3 0.5810 0.5407 0.336 0.000 0.664
#> SRR1315931 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486845 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 2 0.4842 0.6562 0.224 0.776 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR613550 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324025 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318879 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR820755 3 0.0237 0.9454 0.004 0.000 0.996
#> SRR1485830 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR599313 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326205 1 0.4605 0.7807 0.796 0.204 0.000
#> SRR1421327 1 0.6204 0.4027 0.576 0.424 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499303 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079522 1 0.0237 0.9054 0.996 0.004 0.000
#> SRR1452935 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0592 0.9416 0.000 0.988 0.012
#> SRR661361 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR615778 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308650 2 0.0747 0.9384 0.000 0.984 0.016
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499935 2 0.0424 0.9404 0.008 0.992 0.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429408 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433950 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1409854 3 0.0424 0.9424 0.008 0.000 0.992
#> SRR1435229 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 3 0.3482 0.8282 0.000 0.128 0.872
#> SRR1400974 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.0237 0.9454 0.004 0.000 0.996
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR813776 3 0.0237 0.9454 0.004 0.000 0.996
#> SRR808196 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR1101085 1 0.5291 0.7034 0.732 0.268 0.000
#> SRR614395 3 0.6286 0.1967 0.464 0.000 0.536
#> SRR1478251 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR1370551 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420109 3 0.0237 0.9454 0.004 0.000 0.996
#> SRR1330920 1 0.5859 0.4281 0.656 0.000 0.344
#> SRR1419539 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1359447 3 0.4887 0.6967 0.000 0.228 0.772
#> SRR1347259 1 0.4654 0.7768 0.792 0.208 0.000
#> SRR613915 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384395 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR821715 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0237 0.9054 0.996 0.004 0.000
#> SRR1096383 1 0.6008 0.4384 0.628 0.000 0.372
#> SRR1341480 2 0.5497 0.5146 0.292 0.708 0.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR808566 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430270 1 0.0237 0.9054 0.996 0.004 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR661267 3 0.0237 0.9454 0.004 0.000 0.996
#> SRR810665 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1407250 3 0.3482 0.8285 0.128 0.000 0.872
#> SRR1420067 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1407671 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446375 3 0.5706 0.5724 0.320 0.000 0.680
#> SRR1465230 1 0.4605 0.7807 0.796 0.204 0.000
#> SRR614119 1 0.5733 0.4762 0.676 0.000 0.324
#> SRR1356101 2 0.4555 0.7287 0.000 0.800 0.200
#> SRR1404209 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR665538 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445655 2 0.4887 0.6487 0.228 0.772 0.000
#> SRR658953 1 0.7784 0.2110 0.556 0.388 0.056
#> SRR2166459 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317631 1 0.4654 0.7768 0.792 0.208 0.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316367 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 1 0.5621 0.6432 0.692 0.308 0.000
#> SRR818263 1 0.6126 0.2758 0.600 0.000 0.400
#> SRR1404909 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1442422 1 0.4654 0.7768 0.792 0.208 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.6215 0.1855 0.572 0.000 0.428
#> SRR1407112 1 0.4605 0.7807 0.796 0.204 0.000
#> SRR1332969 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353199 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1378885 3 0.0237 0.9454 0.004 0.000 0.996
#> SRR665357 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR662186 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1501020 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480813 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1472576 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431781 2 0.3551 0.8034 0.132 0.868 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500472 2 0.8740 0.1493 0.432 0.460 0.108
#> SRR1417632 1 0.5760 0.6097 0.672 0.328 0.000
#> SRR1350153 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1458113 3 0.1411 0.9188 0.000 0.036 0.964
#> SRR1326579 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1083752 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377599 2 0.0747 0.9334 0.016 0.984 0.000
#> SRR1488449 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318354 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1359062 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398924 2 0.5948 0.4722 0.360 0.640 0.000
#> SRR663783 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319204 2 0.4750 0.7057 0.000 0.784 0.216
#> SRR1369070 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR615659 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1316982 3 0.5254 0.6370 0.000 0.264 0.736
#> SRR1498595 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377423 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312310 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1485613 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR658941 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1324085 2 0.5968 0.3185 0.364 0.636 0.000
#> SRR1363858 1 0.0237 0.9054 0.996 0.004 0.000
#> SRR819820 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337342 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR655206 2 0.4654 0.7172 0.000 0.792 0.208
#> SRR1387013 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.4504 0.7346 0.000 0.804 0.196
#> SRR1343741 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1381288 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1415379 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR1099622 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR663197 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394836 2 0.4178 0.7682 0.000 0.828 0.172
#> SRR661699 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR813680 3 0.0237 0.9454 0.004 0.000 0.996
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 1 0.4654 0.7768 0.792 0.208 0.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1382851 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433410 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432518 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374608 1 0.5948 0.5477 0.640 0.360 0.000
#> SRR657949 3 0.0237 0.9454 0.004 0.000 0.996
#> SRR1308882 1 0.4654 0.7768 0.792 0.208 0.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 2 0.3619 0.7979 0.136 0.864 0.000
#> SRR1444138 3 0.5016 0.7054 0.240 0.000 0.760
#> SRR1417342 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 2 0.4504 0.7062 0.196 0.804 0.000
#> SRR1091380 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467102 3 0.4291 0.7643 0.000 0.180 0.820
#> SRR1485416 1 0.5905 0.5648 0.648 0.352 0.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR809963 3 0.6286 0.1967 0.464 0.000 0.536
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 1 0.4654 0.7768 0.792 0.208 0.000
#> SRR1445259 3 0.4654 0.7480 0.208 0.000 0.792
#> SRR1408393 3 0.0237 0.9454 0.004 0.000 0.996
#> SRR1361522 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1333485 1 0.4702 0.7725 0.788 0.212 0.000
#> SRR1406437 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354931 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1391856 2 0.4555 0.7287 0.000 0.800 0.200
#> SRR1446738 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309032 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1388145 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1432611 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR815869 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375329 2 0.4629 0.7459 0.188 0.808 0.004
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1360478 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1360695 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400910 2 0.4834 0.7250 0.204 0.792 0.004
#> SRR1444203 1 0.4654 0.7768 0.792 0.208 0.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429603 1 0.5560 0.6563 0.700 0.300 0.000
#> SRR1397366 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337606 2 0.4555 0.7302 0.200 0.800 0.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 1 0.4654 0.7768 0.792 0.208 0.000
#> SRR1385389 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0237 0.9054 0.996 0.004 0.000
#> SRR1349121 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR661481 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1354117 2 0.3267 0.8381 0.000 0.884 0.116
#> SRR1393596 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499894 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082883 1 0.0237 0.9054 0.996 0.004 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR662103 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396294 1 0.6291 0.2768 0.532 0.468 0.000
#> SRR1419917 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489199 3 0.4555 0.7580 0.200 0.000 0.800
#> SRR813584 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069638 3 0.4346 0.7601 0.000 0.184 0.816
#> SRR614864 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433392 3 0.3879 0.8115 0.152 0.000 0.848
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.3192 0.8121 0.888 0.000 0.112
#> SRR1401252 1 0.5327 0.6979 0.728 0.272 0.000
#> SRR1309963 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1486889 1 0.5621 0.5732 0.692 0.000 0.308
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR1337010 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1486520 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR1340486 1 0.4605 0.7807 0.796 0.204 0.000
#> SRR1377696 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465459 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093148 3 0.5254 0.6319 0.000 0.264 0.736
#> SRR1467080 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1410866 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR816475 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379198 1 0.1643 0.8858 0.956 0.044 0.000
#> SRR613342 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1369129 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR1396616 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082376 3 0.5760 0.5545 0.328 0.000 0.672
#> SRR1500891 1 0.5497 0.6689 0.708 0.292 0.000
#> SRR807543 3 0.0237 0.9454 0.004 0.000 0.996
#> SRR1091572 1 0.4002 0.7590 0.840 0.000 0.160
#> SRR1346689 1 0.4702 0.7725 0.788 0.212 0.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR663729 1 0.1529 0.8879 0.960 0.040 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0237 0.9054 0.996 0.004 0.000
#> SRR1485357 1 0.4654 0.7768 0.792 0.208 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355172 3 0.0237 0.9454 0.004 0.000 0.996
#> SRR655531 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413329 3 0.0237 0.9454 0.004 0.000 0.996
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375351 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR663440 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR808019 3 0.6045 0.3618 0.380 0.000 0.620
#> SRR1479133 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR615069 2 0.5621 0.5471 0.000 0.692 0.308
#> SRR1456185 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1350069 1 0.4605 0.7807 0.796 0.204 0.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR664795 3 0.0237 0.9454 0.004 0.000 0.996
#> SRR1490721 1 0.6309 0.1887 0.504 0.496 0.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085285 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099072 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR819610 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR809987 1 0.0237 0.9054 0.996 0.004 0.000
#> SRR613639 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402285 1 0.1031 0.8961 0.976 0.024 0.000
#> SRR1077038 1 0.4931 0.6552 0.768 0.000 0.232
#> SRR1405660 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095455 3 0.5858 0.6931 0.240 0.020 0.740
#> SRR1394734 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073581 1 0.5988 0.4479 0.632 0.000 0.368
#> SRR659804 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1432186 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1473529 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR660764 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328845 1 0.4605 0.7807 0.796 0.204 0.000
#> SRR1336415 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR1379065 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR1459190 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1346773 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1347459 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081209 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR1309248 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR809161 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316320 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432629 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 1 0.4178 0.8053 0.828 0.172 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470534 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 3 0.4062 0.7858 0.000 0.164 0.836
#> SRR1332648 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR660614 2 0.4702 0.7115 0.000 0.788 0.212
#> SRR1470420 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1464766 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR615946 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446481 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1467656 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1402962 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR665586 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485722 3 0.3752 0.8153 0.144 0.000 0.856
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR2170173 3 0.4605 0.7523 0.204 0.000 0.796
#> SRR817329 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401990 1 0.4654 0.7768 0.792 0.208 0.000
#> SRR1467745 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1415637 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR813137 3 0.4178 0.7895 0.172 0.000 0.828
#> SRR1314873 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR818797 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR2164608 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455586 3 0.6225 0.2272 0.000 0.432 0.568
#> SRR819459 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.4605 0.7530 0.204 0.000 0.796
#> SRR1361652 1 0.6286 0.0619 0.536 0.464 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1430910 3 0.4605 0.7326 0.000 0.204 0.796
#> SRR1310584 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486762 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480854 1 0.5327 0.6979 0.728 0.272 0.000
#> SRR1489394 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR1418085 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR1340221 1 0.1411 0.8900 0.964 0.036 0.000
#> SRR1473058 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405165 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1098712 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455038 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.5760 0.5062 0.000 0.672 0.328
#> SRR1403005 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348378 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1413541 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.4555 0.7844 0.800 0.200 0.000
#> SRR1475192 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432085 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1452468 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347060 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414139 3 0.5431 0.5820 0.000 0.284 0.716
#> SRR1447962 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1444324 2 0.4555 0.7287 0.000 0.800 0.200
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 1 0.4654 0.7768 0.792 0.208 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0424 0.9445 0.000 0.992 0.008
#> SRR1405331 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.0000 0.9461 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322840 1 0.4605 0.7807 0.796 0.204 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367920 2 0.2796 0.8545 0.092 0.908 0.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441679 2 0.0237 0.9464 0.000 0.996 0.004
#> SRR1082173 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363968 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR657599 3 0.4974 0.6763 0.236 0.000 0.764
#> SRR1386689 1 0.4605 0.7807 0.796 0.204 0.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453811 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.9070 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 1 0.4654 0.7768 0.792 0.208 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310275 3 0.0000 0.9481 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 3 0.4843 0.331 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR1331708 1 0.3219 0.788 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1464258 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661589 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315165 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094457 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095575 1 0.4608 0.571 0.692 0.004 0.304 0.000
#> SRR1315931 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.3569 0.748 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1486845 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613550 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324025 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318879 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820755 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485830 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR599313 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326205 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421327 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079522 1 0.2216 0.873 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1452935 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.3486 0.760 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1433555 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499935 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429408 4 0.4866 0.357 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR1433950 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 1 0.4941 0.238 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR1435229 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 3 0.4855 0.350 0.000 0.400 0.600 0.000
#> SRR1400974 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813776 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808196 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101085 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614395 1 0.0336 0.954 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1478251 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420109 3 0.0188 0.965 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1330920 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419539 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359447 3 0.4877 0.328 0.000 0.408 0.592 0.000
#> SRR1347259 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613915 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384395 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821715 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.4624 0.490 0.660 0.000 0.340 0.000
#> SRR1341480 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808566 4 0.4855 0.367 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR1430270 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661267 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 1 0.4661 0.472 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1420067 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.0188 0.961 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1446375 1 0.3219 0.795 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1465230 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.0469 0.950 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658953 1 0.1389 0.917 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818263 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404909 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407112 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332969 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353199 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378885 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR665357 3 0.0817 0.947 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.4855 0.322 0.600 0.400 0.000 0.000
#> SRR1417632 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.3123 0.801 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1326579 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.3569 0.748 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1096712 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377599 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488449 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318354 3 0.2281 0.873 0.000 0.096 0.904 0.000
#> SRR1359062 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398924 1 0.4916 0.253 0.576 0.424 0.000 0.000
#> SRR663783 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319204 2 0.0336 0.957 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.4948 0.234 0.000 0.440 0.560 0.000
#> SRR1498595 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377423 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658941 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0188 0.957 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363858 1 0.3400 0.767 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR819820 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337342 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655206 2 0.2216 0.869 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1387013 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663197 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394836 2 0.2281 0.865 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR661699 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813680 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433410 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR657949 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308882 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444138 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091380 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467102 3 0.3907 0.693 0.000 0.232 0.768 0.000
#> SRR1485416 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809963 1 0.0336 0.954 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445259 1 0.4746 0.439 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1408393 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406437 4 0.3486 0.766 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1354931 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391856 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446738 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375329 2 0.2814 0.818 0.132 0.868 0.000 0.000
#> SRR1387921 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400910 2 0.3726 0.717 0.212 0.788 0.000 0.000
#> SRR1444203 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1397366 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337606 2 0.5839 0.414 0.352 0.604 0.000 0.044
#> SRR659109 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.0336 0.962 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499894 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082883 1 0.3024 0.809 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1468271 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.0336 0.962 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1396294 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419917 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489199 1 0.0188 0.957 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR813584 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069638 3 0.4948 0.236 0.000 0.440 0.560 0.000
#> SRR614864 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.4164 0.639 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.0469 0.950 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1401252 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.4193 0.632 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377696 4 0.4776 0.365 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1465459 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093148 3 0.4761 0.417 0.000 0.372 0.628 0.000
#> SRR1467080 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.3569 0.755 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1379198 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613342 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396616 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500891 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR807543 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346689 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663729 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485357 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355172 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413329 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485931 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808019 1 0.4866 0.332 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1479133 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615069 2 0.4454 0.532 0.000 0.692 0.308 0.000
#> SRR1456185 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350069 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR664795 3 0.1389 0.919 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1490721 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 3 0.0469 0.957 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1085285 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613639 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402285 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077038 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.3982 0.698 0.776 0.220 0.004 0.000
#> SRR1394734 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 4 0.0188 0.971 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1073581 1 0.4730 0.435 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.4855 0.351 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR660764 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328845 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1336415 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1459190 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1346773 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309248 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR809161 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316320 2 0.4933 0.262 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR1432629 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 3 0.3907 0.693 0.000 0.232 0.768 0.000
#> SRR1332648 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660614 2 0.0469 0.953 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615946 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.3907 0.692 0.768 0.000 0.232 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2170173 3 0.4605 0.464 0.336 0.000 0.664 0.000
#> SRR817329 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401990 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467745 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813137 3 0.3486 0.754 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818797 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2164608 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455586 2 0.3024 0.805 0.000 0.852 0.148 0.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361652 1 0.4697 0.436 0.644 0.356 0.000 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430910 3 0.4855 0.350 0.000 0.400 0.600 0.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486762 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480854 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1473058 4 0.4746 0.445 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR1405165 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 4 0.3801 0.721 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1455038 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475192 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347060 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.4564 0.501 0.000 0.672 0.328 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.1637 0.910 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1322840 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367920 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.964 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363968 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.4866 0.332 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1386689 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453811 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.960 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.975 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.0000 0.968 0.000 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 1 0.6028 0.1547 0.468 0.000 0.416 0.000 0.116
#> SRR1331708 5 0.2439 0.8680 0.120 0.000 0.000 0.004 0.876
#> SRR1464258 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1454201 5 0.0703 0.8434 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR661589 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1315165 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.0162 0.9331 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1417809 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094457 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.4101 0.6875 0.768 0.000 0.184 0.000 0.048
#> SRR1315931 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1430066 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.4725 0.6644 0.000 0.720 0.000 0.200 0.080
#> SRR1486845 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362866 5 0.2074 0.8672 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1490740 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0794 0.9267 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1383907 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613550 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.0794 0.9267 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1345146 1 0.3966 0.5691 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1324025 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318879 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820755 3 0.0162 0.9628 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1485830 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR599313 1 0.3336 0.6787 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228
#> SRR612263 5 0.2280 0.8637 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1415398 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326205 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421327 4 0.1197 0.9112 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1083311 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079522 5 0.2280 0.8637 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1452935 5 0.2424 0.8087 0.000 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1379495 1 0.0162 0.9332 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615778 5 0.2074 0.8683 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1447564 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1455195 5 0.3336 0.7665 0.228 0.000 0.000 0.000 0.772
#> SRR655182 1 0.0162 0.9331 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1335140 2 0.3074 0.7488 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.1671 0.8898 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR661313 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499935 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429408 4 0.4192 0.3461 0.000 0.404 0.000 0.596 0.000
#> SRR1433950 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 5 0.5423 0.6781 0.124 0.000 0.224 0.000 0.652
#> SRR1435229 5 0.2127 0.8673 0.108 0.000 0.000 0.000 0.892
#> SRR1085996 1 0.0794 0.9274 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1414229 5 0.1484 0.8408 0.000 0.008 0.048 0.000 0.944
#> SRR1400974 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.0162 0.9628 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.1851 0.8931 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR813776 3 0.0162 0.9628 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR808196 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101085 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614395 1 0.0865 0.9278 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1478251 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420109 3 0.1579 0.9102 0.032 0.000 0.944 0.000 0.024
#> SRR1330920 5 0.3336 0.7737 0.228 0.000 0.000 0.000 0.772
#> SRR1419539 3 0.1341 0.9146 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1359447 3 0.4192 0.3210 0.000 0.404 0.596 0.000 0.000
#> SRR1347259 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613915 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384395 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821715 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0794 0.9267 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1445637 1 0.0162 0.9331 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR608150 5 0.1197 0.8557 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1096383 1 0.2727 0.8638 0.868 0.000 0.016 0.000 0.116
#> SRR1341480 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1341344 5 0.2329 0.8642 0.124 0.000 0.000 0.000 0.876
#> SRR1326270 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808566 4 0.4182 0.3567 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1430270 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661267 3 0.4851 0.6115 0.196 0.000 0.712 0.000 0.092
#> SRR810665 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 5 0.0703 0.8434 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR1420067 1 0.0794 0.9267 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1473632 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR812536 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446375 1 0.3242 0.8485 0.844 0.000 0.040 0.000 0.116
#> SRR1465230 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614119 1 0.2230 0.8753 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1356101 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.1851 0.8951 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.2230 0.8753 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR660510 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658953 5 0.2230 0.8650 0.116 0.000 0.000 0.000 0.884
#> SRR2166459 1 0.0162 0.9331 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488610 5 0.2280 0.8656 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1330588 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316367 5 0.2280 0.8637 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1433926 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1091302 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818263 5 0.4283 0.3297 0.456 0.000 0.000 0.000 0.544
#> SRR1404909 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663076 1 0.0290 0.9326 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0794 0.9267 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR654862 5 0.2732 0.8401 0.160 0.000 0.000 0.000 0.840
#> SRR1407112 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353199 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378885 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665357 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.0771 0.8430 0.020 0.004 0.000 0.000 0.976
#> SRR1417632 4 0.1792 0.8755 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 5 0.2424 0.8087 0.000 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1326579 5 0.2127 0.8676 0.108 0.000 0.000 0.000 0.892
#> SRR1349363 2 0.3074 0.7488 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377599 4 0.3774 0.5704 0.000 0.000 0.000 0.704 0.296
#> SRR1488449 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318354 5 0.3730 0.6030 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1359062 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.2462 0.8661 0.112 0.008 0.000 0.000 0.880
#> SRR663783 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319204 2 0.1732 0.9012 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.4283 0.1479 0.000 0.544 0.456 0.000 0.000
#> SRR1498595 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377423 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.2230 0.8753 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1338426 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658941 3 0.2280 0.8486 0.000 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1101643 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1401468 1 0.2280 0.8724 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363858 1 0.3819 0.6585 0.756 0.000 0.000 0.016 0.228
#> SRR819820 3 0.1732 0.8900 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1337342 5 0.1197 0.8557 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR655206 2 0.1270 0.9292 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1387013 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0794 0.9267 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR608198 5 0.1851 0.8699 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663197 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394836 2 0.0162 0.9717 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR661699 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813680 3 0.5552 0.3664 0.328 0.000 0.584 0.000 0.088
#> SRR1410678 1 0.0290 0.9326 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1378109 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.3003 0.7545 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1433410 5 0.2127 0.8676 0.108 0.000 0.000 0.000 0.892
#> SRR661167 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.2179 0.8515 0.000 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR657949 3 0.0162 0.9628 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1308882 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.2179 0.8780 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1485870 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444138 1 0.2074 0.8823 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1417342 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091380 3 0.1732 0.8900 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1099096 1 0.0794 0.9267 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1313583 4 0.4302 0.0224 0.480 0.000 0.000 0.520 0.000
#> SRR1467102 3 0.4283 0.1587 0.000 0.456 0.544 0.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809963 1 0.0865 0.9278 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1072247 1 0.0609 0.9295 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1353710 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445259 5 0.1282 0.8573 0.044 0.000 0.004 0.000 0.952
#> SRR1408393 3 0.0865 0.9406 0.004 0.000 0.972 0.000 0.024
#> SRR1361522 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1368597 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1309680 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406437 4 0.3866 0.7803 0.000 0.096 0.000 0.808 0.096
#> SRR1354931 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391856 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446738 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375329 5 0.2554 0.8618 0.072 0.036 0.000 0.000 0.892
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.2127 0.8805 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR812943 5 0.2280 0.8637 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1400910 5 0.2358 0.8678 0.104 0.008 0.000 0.000 0.888
#> SRR1444203 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397366 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337606 5 0.2233 0.8686 0.104 0.000 0.000 0.004 0.892
#> SRR659109 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337192 5 0.2280 0.8656 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR656946 1 0.0703 0.9295 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1476102 1 0.0794 0.9242 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1476447 1 0.0609 0.9296 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1342067 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614419 5 0.2280 0.8637 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1322936 5 0.1341 0.8587 0.056 0.000 0.000 0.000 0.944
#> SRR1349121 1 0.2127 0.8805 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452164 1 0.0162 0.9332 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1070503 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499894 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082883 5 0.1197 0.8557 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1468271 1 0.2230 0.8753 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1332443 1 0.0162 0.9331 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR810295 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1328620 5 0.3534 0.6335 0.000 0.000 0.256 0.000 0.744
#> SRR1396294 4 0.1732 0.8823 0.000 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1419917 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR662114 3 0.3508 0.6254 0.000 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1489199 5 0.1410 0.8399 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940
#> SRR813584 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069638 5 0.2462 0.8193 0.000 0.008 0.112 0.000 0.880
#> SRR614864 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.3565 0.7370 0.800 0.000 0.176 0.000 0.024
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.0703 0.9295 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1401252 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0162 0.9331 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.3266 0.7160 0.796 0.000 0.200 0.000 0.004
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0794 0.9267 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1356468 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 5 0.4201 0.3330 0.408 0.000 0.000 0.000 0.592
#> SRR1486538 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377696 4 0.4481 0.2705 0.000 0.008 0.000 0.576 0.416
#> SRR1465459 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093148 5 0.1410 0.8290 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR1467080 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.3109 0.7384 0.000 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613342 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1500891 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR807543 3 0.0703 0.9440 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1091572 5 0.2329 0.8620 0.124 0.000 0.000 0.000 0.876
#> SRR1346689 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332424 5 0.2074 0.8672 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR663729 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613675 5 0.1608 0.8638 0.072 0.000 0.000 0.000 0.928
#> SRR1485357 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.1851 0.8941 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1437622 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355172 3 0.5652 0.2771 0.360 0.000 0.552 0.000 0.088
#> SRR655531 5 0.2074 0.8672 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1338147 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413329 5 0.3636 0.6058 0.000 0.000 0.272 0.000 0.728
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.2230 0.8753 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1333308 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.2127 0.8805 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808019 5 0.5518 0.2743 0.384 0.000 0.072 0.000 0.544
#> SRR1479133 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615069 5 0.3098 0.7945 0.000 0.016 0.148 0.000 0.836
#> SRR1456185 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350069 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816316 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR664795 3 0.5708 0.2025 0.384 0.000 0.528 0.000 0.088
#> SRR1490721 5 0.2813 0.7421 0.000 0.000 0.000 0.168 0.832
#> SRR810643 1 0.1410 0.9115 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1430333 5 0.1430 0.8412 0.004 0.000 0.052 0.000 0.944
#> SRR1085285 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.0162 0.9331 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1487340 1 0.0290 0.9326 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1420276 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405525 5 0.2561 0.8624 0.144 0.000 0.000 0.000 0.856
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0794 0.9267 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0703 0.9280 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613639 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402285 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1405660 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 5 0.2280 0.8637 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1394734 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0703 0.9303 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1365894 4 0.0290 0.9455 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1073581 1 0.4016 0.7894 0.796 0.000 0.092 0.000 0.112
#> SRR659804 1 0.0794 0.9267 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.4192 0.3209 0.000 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR660764 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820448 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1328845 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1336415 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459190 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346773 1 0.1671 0.8981 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1499521 1 0.2280 0.8724 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309248 4 0.1792 0.8755 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR809161 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316320 5 0.2753 0.7721 0.000 0.008 0.000 0.136 0.856
#> SRR1432629 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.4302 0.0443 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480
#> SRR1309160 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.2074 0.8836 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1078489 5 0.2338 0.8198 0.000 0.004 0.112 0.000 0.884
#> SRR1332648 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660614 2 0.2127 0.8759 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.2127 0.8805 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR615946 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 5 0.4045 0.4660 0.356 0.000 0.000 0.000 0.644
#> SRR660224 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1347166 5 0.2074 0.8683 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1485722 5 0.0703 0.8434 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR1415316 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR613390 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR661108 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2170173 3 0.5043 0.3760 0.356 0.000 0.600 0.000 0.044
#> SRR817329 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1401990 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467745 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 1 0.1741 0.9044 0.936 0.000 0.040 0.000 0.024
#> SRR1314873 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1401211 1 0.2127 0.8805 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1419692 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818797 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164608 3 0.2280 0.8497 0.000 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1455586 2 0.0404 0.9635 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 5 0.3586 0.7280 0.264 0.000 0.000 0.000 0.736
#> SRR1361652 5 0.2127 0.8673 0.108 0.000 0.000 0.000 0.892
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 5 0.2612 0.8121 0.000 0.008 0.124 0.000 0.868
#> SRR1310584 1 0.0794 0.9267 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1500216 1 0.3336 0.6787 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228
#> SRR1486762 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480854 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473058 4 0.4249 0.2670 0.000 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR1405165 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1471477 1 0.2230 0.8753 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 4 0.4238 0.7290 0.000 0.164 0.000 0.768 0.068
#> SRR1455038 5 0.2280 0.8637 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1375248 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413541 1 0.0703 0.9287 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1392943 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475192 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 5 0.2074 0.8683 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1347060 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.1792 0.8794 0.000 0.916 0.084 0.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0290 0.9328 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1311266 5 0.0880 0.8442 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968
#> SRR1343302 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0609 0.9296 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.0703 0.9440 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1345609 1 0.0000 0.9335 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 5 0.2424 0.7867 0.000 0.132 0.000 0.000 0.868
#> SRR1322840 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0290 0.9327 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1365291 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367920 4 0.3730 0.5855 0.000 0.000 0.000 0.712 0.288
#> SRR1366648 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9759 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 5 0.4060 0.4262 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR1363968 1 0.2230 0.8753 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR814387 1 0.0794 0.9267 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR657599 5 0.5729 0.2189 0.396 0.000 0.088 0.000 0.516
#> SRR1386689 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453811 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441159 1 0.3730 0.5313 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288
#> SRR1403154 4 0.0000 0.9520 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.9662 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 5 0.3796 0.6107 0.000 0.000 0.300 0.000 0.700
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 1 0.5040 0.40583 0.528 0.000 0.056 0.000 0.008 0.408
#> SRR1331708 5 0.0291 0.81600 0.004 0.000 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1464258 6 0.3782 0.41449 0.412 0.000 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1454201 5 0.2100 0.76364 0.004 0.000 0.000 0.000 0.884 0.112
#> SRR661589 3 0.3050 0.67490 0.000 0.000 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1456229 6 0.3915 0.40962 0.412 0.000 0.000 0.000 0.004 0.584
#> SRR1315165 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.0405 0.73781 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1417809 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094457 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.6194 -0.04856 0.484 0.000 0.236 0.000 0.016 0.264
#> SRR1315931 1 0.3531 0.38158 0.672 0.000 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1430066 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344143 5 0.5850 0.11038 0.000 0.412 0.000 0.164 0.420 0.004
#> SRR1486845 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362866 5 0.0692 0.81710 0.004 0.000 0.000 0.000 0.976 0.020
#> SRR1490740 1 0.3337 0.48817 0.736 0.000 0.000 0.000 0.004 0.260
#> SRR1446627 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0363 0.94265 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1416248 1 0.1152 0.73274 0.952 0.000 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1383907 4 0.0363 0.92464 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.73760 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0363 0.94265 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1429846 3 0.3464 0.59466 0.000 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR613550 3 0.3266 0.64399 0.000 0.000 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR1348402 1 0.1219 0.73148 0.948 0.000 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR1345146 5 0.5137 0.41951 0.284 0.000 0.000 0.000 0.596 0.120
#> SRR1324025 3 0.3288 0.63999 0.000 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1318879 3 0.0405 0.81575 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR820755 6 0.3868 -0.17233 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR1485830 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR599313 1 0.5944 -0.05796 0.452 0.000 0.000 0.000 0.244 0.304
#> SRR612263 5 0.5027 0.39625 0.100 0.000 0.000 0.000 0.596 0.304
#> SRR1415398 3 0.3288 0.63999 0.000 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1326205 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421327 4 0.3782 0.29811 0.000 0.000 0.000 0.588 0.412 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079522 5 0.2489 0.73699 0.012 0.000 0.000 0.000 0.860 0.128
#> SRR1452935 5 0.1643 0.77501 0.000 0.000 0.068 0.000 0.924 0.008
#> SRR1379495 1 0.0000 0.73760 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.3198 0.65513 0.000 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR615778 5 0.0458 0.81680 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1447564 1 0.2212 0.66203 0.880 0.000 0.000 0.000 0.008 0.112
#> SRR1455195 5 0.4482 0.39507 0.324 0.000 0.000 0.000 0.628 0.048
#> SRR655182 1 0.0146 0.73700 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1335140 2 0.3980 0.68627 0.000 0.760 0.000 0.168 0.068 0.004
#> SRR1433555 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.73760 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0363 0.94265 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR809853 1 0.5535 0.10788 0.532 0.000 0.000 0.000 0.160 0.308
#> SRR661313 3 0.3330 0.63154 0.000 0.000 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1499935 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447303 3 0.3330 0.63154 0.000 0.000 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1429408 4 0.3797 0.29491 0.000 0.420 0.000 0.580 0.000 0.000
#> SRR1433950 1 0.2473 0.63876 0.856 0.000 0.000 0.000 0.008 0.136
#> SRR1362081 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 6 0.5939 0.31084 0.036 0.000 0.296 0.000 0.120 0.548
#> SRR1435229 5 0.0291 0.81600 0.004 0.000 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1085996 1 0.3766 0.41533 0.684 0.000 0.000 0.000 0.012 0.304
#> SRR1414229 5 0.0692 0.81549 0.000 0.000 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR1400974 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0363 0.73418 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR613927 3 0.3854 0.26011 0.000 0.000 0.536 0.000 0.000 0.464
#> SRR1457854 1 0.0000 0.73760 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.3547 0.56897 0.696 0.000 0.000 0.000 0.004 0.300
#> SRR813776 6 0.3857 -0.07889 0.000 0.000 0.468 0.000 0.000 0.532
#> SRR808196 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101085 4 0.0363 0.92464 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR614395 6 0.3782 0.41449 0.412 0.000 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1478251 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.73760 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.3244 0.64826 0.000 0.000 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR1420109 3 0.4902 0.12133 0.060 0.000 0.572 0.000 0.004 0.364
#> SRR1330920 6 0.5319 0.44754 0.220 0.000 0.000 0.000 0.184 0.596
#> SRR1419539 3 0.3833 0.37521 0.000 0.008 0.648 0.000 0.000 0.344
#> SRR1359447 3 0.2615 0.67014 0.000 0.136 0.852 0.000 0.008 0.004
#> SRR1347259 4 0.0363 0.92464 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR613915 3 0.3464 0.59466 0.000 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1384395 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821715 3 0.3288 0.63999 0.000 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1478228 1 0.1152 0.73274 0.952 0.000 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1445637 1 0.0458 0.73270 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR608150 5 0.0547 0.81623 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1096383 1 0.4218 0.47250 0.584 0.000 0.012 0.000 0.004 0.400
#> SRR1341480 4 0.0363 0.92464 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1341344 5 0.1528 0.79872 0.048 0.000 0.000 0.000 0.936 0.016
#> SRR1326270 3 0.3288 0.63999 0.000 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1498838 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808566 4 0.3756 0.34807 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000 0.000
#> SRR1430270 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0291 0.81845 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR661267 6 0.4988 0.27895 0.136 0.000 0.188 0.000 0.008 0.668
#> SRR810665 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 5 0.2053 0.76703 0.004 0.000 0.000 0.000 0.888 0.108
#> SRR1420067 1 0.1657 0.72482 0.928 0.000 0.000 0.000 0.016 0.056
#> SRR1473632 1 0.3541 0.48629 0.728 0.000 0.000 0.000 0.012 0.260
#> SRR812536 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.0405 0.94294 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1446375 6 0.6275 -0.17305 0.376 0.000 0.204 0.000 0.016 0.404
#> SRR1465230 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614119 1 0.3899 0.48208 0.592 0.000 0.000 0.000 0.004 0.404
#> SRR1356101 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.1588 0.72189 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1392676 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.3890 0.48546 0.596 0.000 0.000 0.000 0.004 0.400
#> SRR660510 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658953 5 0.2165 0.75681 0.008 0.000 0.000 0.000 0.884 0.108
#> SRR2166459 1 0.0000 0.73760 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.1556 0.78265 0.000 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1317631 4 0.0632 0.91386 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1488610 5 0.0806 0.81338 0.020 0.000 0.000 0.000 0.972 0.008
#> SRR1330588 3 0.3244 0.64776 0.000 0.000 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR1316367 5 0.1168 0.80648 0.028 0.000 0.000 0.000 0.956 0.016
#> SRR1433926 1 0.3565 0.41988 0.692 0.000 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1091302 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818263 6 0.5315 0.45308 0.224 0.000 0.000 0.000 0.180 0.596
#> SRR1404909 4 0.0458 0.92246 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR663076 1 0.0632 0.73674 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1323577 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.1082 0.73376 0.956 0.000 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR654862 6 0.5080 0.26981 0.112 0.000 0.000 0.000 0.288 0.600
#> SRR1407112 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.3288 0.63999 0.000 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1353199 3 0.3266 0.64451 0.000 0.000 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR1378885 3 0.3499 0.58289 0.000 0.000 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR665357 3 0.0146 0.82034 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0146 0.94802 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1501020 3 0.3126 0.66544 0.000 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1347819 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.2613 0.77975 0.000 0.140 0.000 0.848 0.012 0.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.3601 0.58477 0.004 0.000 0.000 0.000 0.684 0.312
#> SRR1417632 4 0.3789 0.27712 0.000 0.000 0.000 0.584 0.416 0.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 5 0.1700 0.76555 0.000 0.000 0.080 0.000 0.916 0.004
#> SRR1326579 5 0.0820 0.81649 0.012 0.000 0.000 0.000 0.972 0.016
#> SRR1349363 2 0.2980 0.73381 0.000 0.808 0.000 0.180 0.012 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.3244 0.64776 0.000 0.000 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR1083752 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377599 5 0.3672 0.37982 0.000 0.000 0.000 0.368 0.632 0.000
#> SRR1488449 3 0.2969 0.68429 0.000 0.000 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1318354 3 0.5042 0.28278 0.000 0.000 0.592 0.000 0.308 0.100
#> SRR1359062 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.0692 0.81327 0.004 0.000 0.000 0.000 0.976 0.020
#> SRR663783 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319204 2 0.6466 0.15861 0.000 0.412 0.280 0.000 0.020 0.288
#> SRR1369070 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.3565 0.41988 0.692 0.000 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1337449 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.2562 0.62508 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498595 4 0.0458 0.92246 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1377423 3 0.0146 0.82152 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1312310 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.4002 0.47873 0.588 0.000 0.000 0.000 0.008 0.404
#> SRR1338426 3 0.0291 0.81845 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1353309 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658941 3 0.4939 0.18030 0.004 0.000 0.532 0.000 0.056 0.408
#> SRR1101643 1 0.3528 0.43335 0.700 0.000 0.000 0.000 0.004 0.296
#> SRR1401468 1 0.4101 0.47134 0.580 0.000 0.000 0.000 0.012 0.408
#> SRR1368874 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363858 1 0.6128 -0.00045 0.484 0.000 0.000 0.012 0.236 0.268
#> SRR819820 3 0.3782 0.35332 0.000 0.000 0.636 0.000 0.004 0.360
#> SRR1337342 5 0.0632 0.81542 0.000 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR655206 2 0.6058 0.13206 0.000 0.404 0.324 0.000 0.000 0.272
#> SRR1387013 2 0.0363 0.94265 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1317410 1 0.1152 0.73274 0.952 0.000 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR608198 5 0.0717 0.81728 0.008 0.000 0.000 0.000 0.976 0.016
#> SRR1440161 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663197 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394836 2 0.3464 0.55116 0.000 0.688 0.312 0.000 0.000 0.000
#> SRR661699 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813680 6 0.4990 0.27792 0.152 0.000 0.184 0.000 0.004 0.660
#> SRR1410678 1 0.0547 0.73719 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1378109 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.3565 0.41988 0.692 0.000 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1311486 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 5 0.3867 0.04431 0.000 0.488 0.000 0.000 0.512 0.000
#> SRR1433410 5 0.0717 0.81728 0.008 0.000 0.000 0.000 0.976 0.016
#> SRR661167 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.0291 0.81845 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR660462 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.3830 0.52342 0.000 0.000 0.000 0.620 0.004 0.376
#> SRR657949 3 0.3563 0.55751 0.000 0.000 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1308882 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655768 1 0.3890 0.48546 0.596 0.000 0.000 0.000 0.004 0.400
#> SRR1485870 4 0.0547 0.91994 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1444138 1 0.3819 0.50791 0.624 0.000 0.000 0.000 0.004 0.372
#> SRR1417342 1 0.0146 0.73700 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1470193 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091380 3 0.3782 0.35332 0.000 0.000 0.636 0.000 0.004 0.360
#> SRR1099096 1 0.1082 0.73376 0.956 0.000 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR1313583 4 0.3482 0.48342 0.316 0.000 0.000 0.684 0.000 0.000
#> SRR1467102 3 0.2219 0.67540 0.000 0.136 0.864 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.0363 0.92464 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR818821 3 0.0291 0.81845 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR809963 6 0.3782 0.41449 0.412 0.000 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1072247 1 0.0865 0.73495 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1353710 4 0.0146 0.92812 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1445259 5 0.0692 0.81667 0.004 0.000 0.000 0.000 0.976 0.020
#> SRR1408393 6 0.4129 0.07382 0.012 0.000 0.424 0.000 0.000 0.564
#> SRR1361522 1 0.3565 0.41988 0.692 0.000 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1368597 1 0.2191 0.65712 0.876 0.000 0.000 0.000 0.004 0.120
#> SRR1309680 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406437 4 0.4861 0.44036 0.000 0.044 0.000 0.552 0.008 0.396
#> SRR1354931 3 0.3198 0.65490 0.000 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1391856 2 0.0260 0.94390 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446738 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375329 5 0.0291 0.81600 0.004 0.000 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1387921 1 0.0000 0.73760 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.3881 0.48830 0.600 0.000 0.000 0.000 0.004 0.396
#> SRR812943 5 0.4911 0.44552 0.100 0.000 0.000 0.000 0.624 0.276
#> SRR1400910 5 0.0291 0.81600 0.004 0.000 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1444203 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0146 0.92814 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1397366 3 0.3244 0.64826 0.000 0.000 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR1446028 1 0.0508 0.73794 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1083918 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337606 5 0.0405 0.81678 0.004 0.000 0.000 0.000 0.988 0.008
#> SRR659109 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337192 5 0.1088 0.81179 0.024 0.000 0.000 0.000 0.960 0.016
#> SRR656946 1 0.0260 0.73785 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1476102 1 0.1858 0.70092 0.904 0.000 0.000 0.000 0.092 0.004
#> SRR1476447 1 0.2312 0.66299 0.876 0.000 0.000 0.000 0.012 0.112
#> SRR1342067 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0291 0.73736 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR614419 5 0.1984 0.78239 0.032 0.000 0.000 0.000 0.912 0.056
#> SRR1322936 5 0.0603 0.81745 0.004 0.000 0.000 0.000 0.980 0.016
#> SRR1349121 1 0.2006 0.70582 0.892 0.000 0.000 0.000 0.004 0.104
#> SRR1430549 1 0.0508 0.73561 0.984 0.000 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR612935 3 0.0405 0.81575 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR661481 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.0363 0.92464 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.73760 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.3620 0.52870 0.000 0.000 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1499894 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082883 5 0.0547 0.81623 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1468271 1 0.4010 0.47515 0.584 0.000 0.000 0.000 0.008 0.408
#> SRR1332443 1 0.0260 0.73731 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.3565 0.41988 0.692 0.000 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR1328620 3 0.5914 -0.02143 0.000 0.000 0.412 0.000 0.208 0.380
#> SRR1396294 4 0.3769 0.54898 0.000 0.000 0.000 0.640 0.004 0.356
#> SRR1419917 1 0.3565 0.41988 0.692 0.000 0.000 0.000 0.004 0.304
#> SRR662114 3 0.1501 0.76351 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1489199 5 0.5691 0.31588 0.164 0.000 0.000 0.000 0.468 0.368
#> SRR813584 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069638 5 0.4292 0.33672 0.000 0.000 0.024 0.000 0.588 0.388
#> SRR614864 3 0.3221 0.65143 0.000 0.000 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR1433392 6 0.5003 0.47885 0.320 0.000 0.092 0.000 0.000 0.588
#> SRR1377777 2 0.0363 0.94265 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR2167710 1 0.0508 0.73703 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1401252 4 0.0458 0.92246 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0146 0.73679 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418628 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.3776 0.48783 0.760 0.000 0.188 0.000 0.000 0.052
#> SRR1380393 1 0.0146 0.73783 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1319731 1 0.1152 0.73274 0.952 0.000 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1356468 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.5391 0.42917 0.580 0.000 0.000 0.000 0.244 0.176
#> SRR1486538 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377696 5 0.3714 0.43861 0.000 0.000 0.000 0.340 0.656 0.004
#> SRR1465459 3 0.3578 0.55022 0.000 0.000 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1080270 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093148 6 0.6043 -0.19751 0.000 0.000 0.252 0.000 0.364 0.384
#> SRR1467080 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.2730 0.72396 0.000 0.192 0.000 0.808 0.000 0.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613342 3 0.0291 0.81845 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1452246 2 0.0363 0.94265 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.3266 0.64399 0.000 0.000 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR813824 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082376 6 0.3782 0.41449 0.412 0.000 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1500891 4 0.0363 0.92464 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR807543 6 0.3782 0.10747 0.000 0.000 0.412 0.000 0.000 0.588
#> SRR1091572 5 0.5309 0.18516 0.104 0.000 0.000 0.000 0.488 0.408
#> SRR1346689 4 0.0363 0.92464 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1332424 5 0.0692 0.81710 0.004 0.000 0.000 0.000 0.976 0.020
#> SRR663729 4 0.0363 0.92464 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.73760 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613675 5 0.0603 0.81745 0.004 0.000 0.000 0.000 0.980 0.016
#> SRR1485357 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.2933 0.64377 0.796 0.000 0.000 0.000 0.004 0.200
#> SRR1437622 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355172 1 0.5455 0.34966 0.496 0.000 0.108 0.000 0.004 0.392
#> SRR655531 5 0.1245 0.81129 0.016 0.000 0.000 0.000 0.952 0.032
#> SRR1338147 3 0.3288 0.63999 0.000 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1413329 6 0.6119 0.02418 0.008 0.000 0.380 0.000 0.204 0.408
#> SRR1485931 2 0.0547 0.93654 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1420873 1 0.4076 0.48407 0.592 0.000 0.000 0.000 0.012 0.396
#> SRR1333308 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.3890 0.48546 0.596 0.000 0.000 0.000 0.004 0.400
#> SRR1467316 2 0.0547 0.93654 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.3446 0.60025 0.000 0.000 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1471755 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808019 1 0.5696 0.37134 0.488 0.000 0.040 0.000 0.064 0.408
#> SRR1479133 3 0.3198 0.65513 0.000 0.000 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR615069 5 0.2101 0.73917 0.000 0.004 0.100 0.000 0.892 0.004
#> SRR1456185 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350069 4 0.0458 0.91975 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR816316 6 0.3782 0.41449 0.412 0.000 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR664795 1 0.5353 0.29763 0.464 0.000 0.092 0.000 0.004 0.440
#> SRR1490721 5 0.1049 0.80477 0.000 0.000 0.000 0.032 0.960 0.008
#> SRR810643 1 0.2513 0.68270 0.852 0.000 0.000 0.000 0.008 0.140
#> SRR1430333 5 0.0692 0.81549 0.000 0.000 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR1085285 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.3482 0.58893 0.000 0.000 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1317985 1 0.0260 0.73572 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1487340 1 0.0547 0.73099 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1420276 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405525 5 0.1349 0.79850 0.056 0.000 0.000 0.000 0.940 0.004
#> SRR1370329 1 0.0146 0.73679 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1465001 1 0.1219 0.73148 0.948 0.000 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR1476525 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.1007 0.73338 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1409465 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613639 3 0.3244 0.64776 0.000 0.000 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR1402285 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077038 6 0.3782 0.41449 0.412 0.000 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1405660 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 5 0.3947 0.60497 0.048 0.000 0.000 0.000 0.732 0.220
#> SRR1394734 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0858 0.72928 0.968 0.000 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1365894 4 0.3136 0.67700 0.000 0.004 0.000 0.768 0.228 0.000
#> SRR1073581 1 0.4586 0.45187 0.564 0.000 0.032 0.000 0.004 0.400
#> SRR659804 1 0.1007 0.73338 0.956 0.000 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1345914 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.4486 0.30116 0.000 0.584 0.000 0.384 0.028 0.004
#> SRR660764 3 0.0291 0.81845 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR820448 6 0.3782 0.41449 0.412 0.000 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1328845 4 0.0632 0.91386 0.000 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1336415 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459190 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346773 1 0.2625 0.69279 0.872 0.000 0.000 0.000 0.072 0.056
#> SRR1499521 1 0.4101 0.47134 0.580 0.000 0.000 0.000 0.012 0.408
#> SRR1440898 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.0260 0.81992 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1081209 2 0.0260 0.94545 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.73760 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.0363 0.92464 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1309248 4 0.3823 0.22113 0.000 0.000 0.000 0.564 0.436 0.000
#> SRR809161 3 0.1387 0.79040 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1316320 5 0.0858 0.80548 0.000 0.000 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR1432629 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.73760 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.4587 0.55993 0.688 0.000 0.000 0.000 0.108 0.204
#> SRR1309160 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.3555 0.58016 0.712 0.000 0.000 0.008 0.000 0.280
#> SRR1078489 5 0.1461 0.80092 0.000 0.000 0.016 0.000 0.940 0.044
#> SRR1332648 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660614 2 0.6251 0.37654 0.000 0.536 0.260 0.000 0.048 0.156
#> SRR1470420 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.73760 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.73760 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.3575 0.57812 0.708 0.000 0.000 0.000 0.008 0.284
#> SRR615946 3 0.0865 0.80670 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1446481 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 5 0.5531 -0.02920 0.416 0.000 0.000 0.000 0.452 0.132
#> SRR660224 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.3672 0.41538 0.688 0.000 0.000 0.000 0.008 0.304
#> SRR1347166 5 0.0458 0.81680 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1485722 5 0.3684 0.56204 0.004 0.000 0.000 0.000 0.664 0.332
#> SRR1415316 1 0.2212 0.66203 0.880 0.000 0.000 0.000 0.008 0.112
#> SRR613390 1 0.3672 0.41538 0.688 0.000 0.000 0.000 0.008 0.304
#> SRR661108 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2170173 3 0.5950 -0.18371 0.336 0.000 0.488 0.000 0.012 0.164
#> SRR817329 1 0.3672 0.41538 0.688 0.000 0.000 0.000 0.008 0.304
#> SRR1401990 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467745 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 6 0.3782 0.41449 0.412 0.000 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1314873 1 0.3672 0.41538 0.688 0.000 0.000 0.000 0.008 0.304
#> SRR1401211 1 0.3890 0.48546 0.596 0.000 0.000 0.000 0.004 0.400
#> SRR1419692 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818797 3 0.3499 0.58289 0.000 0.000 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR2164608 3 0.4872 0.21157 0.000 0.000 0.548 0.000 0.064 0.388
#> SRR1455586 2 0.3727 0.41993 0.000 0.612 0.388 0.000 0.000 0.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0547 0.93654 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 6 0.5206 0.46319 0.284 0.000 0.000 0.000 0.128 0.588
#> SRR1361652 5 0.0291 0.81600 0.004 0.000 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1437119 1 0.0146 0.73679 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1478547 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 5 0.1082 0.79818 0.000 0.000 0.040 0.000 0.956 0.004
#> SRR1310584 1 0.1196 0.73324 0.952 0.000 0.000 0.000 0.008 0.040
#> SRR1500216 1 0.5944 -0.05796 0.452 0.000 0.000 0.000 0.244 0.304
#> SRR1486762 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480854 4 0.1501 0.87103 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473058 4 0.3828 0.23707 0.000 0.440 0.000 0.560 0.000 0.000
#> SRR1405165 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.3766 0.40935 0.684 0.000 0.000 0.000 0.012 0.304
#> SRR1471477 1 0.3890 0.48546 0.596 0.000 0.000 0.000 0.004 0.400
#> SRR1098567 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 4 0.4653 0.49299 0.000 0.052 0.000 0.588 0.000 0.360
#> SRR1455038 5 0.4986 0.40371 0.096 0.000 0.000 0.000 0.600 0.304
#> SRR1375248 2 0.3515 0.53389 0.000 0.676 0.324 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.3464 0.59491 0.000 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1348378 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413541 1 0.3672 0.41538 0.688 0.000 0.000 0.000 0.008 0.304
#> SRR1392943 4 0.0146 0.92812 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1475192 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 5 0.0291 0.81600 0.004 0.000 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1347060 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.3823 0.29691 0.000 0.564 0.436 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.73760 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.1643 0.71663 0.924 0.000 0.000 0.000 0.068 0.008
#> SRR1311266 5 0.6066 0.13577 0.268 0.000 0.000 0.000 0.392 0.340
#> SRR1343302 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0146 0.73679 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1429678 1 0.1714 0.68327 0.908 0.000 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1469413 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 6 0.3782 0.10747 0.000 0.000 0.412 0.000 0.000 0.588
#> SRR1345609 1 0.0291 0.73584 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1380208 5 0.0363 0.81327 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1322840 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0260 0.73803 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1365291 3 0.3482 0.58894 0.000 0.000 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1367920 5 0.3684 0.37168 0.000 0.000 0.000 0.372 0.628 0.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.95084 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.5744 -0.00638 0.000 0.000 0.424 0.000 0.168 0.408
#> SRR1363968 1 0.3890 0.48546 0.596 0.000 0.000 0.000 0.004 0.400
#> SRR814387 1 0.1152 0.73274 0.952 0.000 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR657599 1 0.5650 0.37558 0.492 0.000 0.040 0.000 0.060 0.408
#> SRR1386689 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453811 3 0.3499 0.58289 0.000 0.000 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1441159 1 0.3833 0.12983 0.556 0.000 0.000 0.000 0.444 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.92965 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.82298 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.5979 0.13705 0.000 0.000 0.440 0.000 0.252 0.308
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.401 0.678 0.833 0.4761 0.500 0.500
#> 3 3 0.744 0.803 0.920 0.3588 0.721 0.505
#> 4 4 0.830 0.871 0.943 0.1323 0.862 0.632
#> 5 5 0.775 0.675 0.843 0.0851 0.879 0.591
#> 6 6 0.763 0.718 0.819 0.0410 0.915 0.627
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 2 0.8955 -0.1889 0.312 0.688
#> SRR1331708 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1464258 2 0.6438 0.3593 0.164 0.836
#> SRR1454201 2 0.7299 0.2325 0.204 0.796
#> SRR661589 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1456229 1 0.9881 0.8061 0.564 0.436
#> SRR1315165 1 0.7139 0.7179 0.804 0.196
#> SRR1488960 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1417809 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1094457 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1095575 2 0.5178 0.4876 0.116 0.884
#> SRR1315931 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1430066 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1431037 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1395554 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR818002 2 0.9896 0.6755 0.440 0.560
#> SRR1344143 1 0.8267 -0.1745 0.740 0.260
#> SRR1486845 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1362866 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1490740 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1446627 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1456138 2 1.0000 0.6280 0.496 0.504
#> SRR1416248 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1383907 1 0.6801 0.7064 0.820 0.180
#> SRR1311018 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1375699 1 0.3584 0.3387 0.932 0.068
#> SRR1429846 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR613550 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1348402 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1345146 1 0.9635 0.8624 0.612 0.388
#> SRR1324025 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1318879 2 0.3584 0.5743 0.068 0.932
#> SRR820755 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1485830 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR599313 2 0.7376 0.2394 0.208 0.792
#> SRR612263 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1415398 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1326205 1 0.8081 0.7808 0.752 0.248
#> SRR1421327 1 0.7299 0.7340 0.796 0.204
#> SRR1083311 2 0.9286 0.7159 0.344 0.656
#> SRR1499303 1 0.4690 0.2759 0.900 0.100
#> SRR1079522 2 0.9552 -0.4001 0.376 0.624
#> SRR1452935 2 0.2948 0.5985 0.052 0.948
#> SRR1379495 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1470459 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR661361 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR615778 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1447564 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1455195 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR655182 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1335140 2 0.9988 0.6436 0.480 0.520
#> SRR1433555 2 0.7745 0.7238 0.228 0.772
#> SRR1308650 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1388354 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1317446 2 0.7376 0.7222 0.208 0.792
#> SRR1413602 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1479955 1 0.8661 -0.2510 0.712 0.288
#> SRR809853 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR661313 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1499935 1 0.0672 0.4390 0.992 0.008
#> SRR1447303 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1429408 1 0.4431 0.2967 0.908 0.092
#> SRR1433950 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1362081 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1409854 2 0.0938 0.6505 0.012 0.988
#> SRR1435229 1 0.9815 0.8250 0.580 0.420
#> SRR1085996 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1414229 2 0.6531 0.7194 0.168 0.832
#> SRR1400974 2 0.6887 0.7207 0.184 0.816
#> SRR1399971 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR613927 2 0.0672 0.6549 0.008 0.992
#> SRR1457854 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1473714 1 0.9686 0.8534 0.604 0.396
#> SRR813776 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR808196 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1101085 1 0.7219 0.7296 0.800 0.200
#> SRR614395 2 0.8909 -0.1763 0.308 0.692
#> SRR1478251 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1370551 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1362310 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR665310 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1420109 2 0.4161 0.5481 0.084 0.916
#> SRR1330920 2 0.0938 0.6504 0.012 0.988
#> SRR1419539 2 0.8144 0.7236 0.252 0.748
#> SRR1359447 2 0.9170 0.7173 0.332 0.668
#> SRR1347259 1 0.9286 0.8708 0.656 0.344
#> SRR613915 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1384395 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR821715 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1478228 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1445637 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR608150 1 0.9580 0.8701 0.620 0.380
#> SRR1096383 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1341480 1 0.7299 0.7340 0.796 0.204
#> SRR1341344 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1326270 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1498838 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1416313 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR808566 1 0.8861 -0.2776 0.696 0.304
#> SRR1430270 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1367825 2 0.7219 0.7222 0.200 0.800
#> SRR613533 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR661267 2 0.9996 -0.6794 0.488 0.512
#> SRR810665 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1407250 2 0.7299 0.2325 0.204 0.796
#> SRR1420067 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1473632 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR812536 2 0.8016 0.7233 0.244 0.756
#> SRR1370850 1 0.8267 -0.1745 0.740 0.260
#> SRR1486195 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1407671 1 0.1184 0.4281 0.984 0.016
#> SRR1446375 2 0.5178 0.4876 0.116 0.884
#> SRR1465230 1 0.8016 0.7766 0.756 0.244
#> SRR614119 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1356101 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1404209 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1392676 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR665538 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR660510 2 0.7219 0.7229 0.200 0.800
#> SRR1445655 1 0.9635 0.2431 0.612 0.388
#> SRR658953 2 0.5408 0.4705 0.124 0.876
#> SRR2166459 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1070713 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1485312 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1317631 1 0.9427 0.8826 0.640 0.360
#> SRR1488610 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1330588 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1316367 1 0.9580 0.8704 0.620 0.380
#> SRR1433926 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1091302 1 0.6801 0.7064 0.820 0.180
#> SRR818263 2 0.8207 0.0453 0.256 0.744
#> SRR1404909 1 0.0000 0.4492 1.000 0.000
#> SRR663076 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1323577 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1442422 1 0.8763 0.8286 0.704 0.296
#> SRR1465893 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR654862 2 0.5737 0.4444 0.136 0.864
#> SRR1407112 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1332969 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1353199 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1378885 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR665357 2 0.9393 0.7140 0.356 0.644
#> SRR662186 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1501020 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1347819 2 0.0938 0.6699 0.012 0.988
#> SRR1480813 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1472576 1 0.0000 0.4492 1.000 0.000
#> SRR1431781 1 0.5946 0.1788 0.856 0.144
#> SRR1452270 2 0.7299 0.7230 0.204 0.796
#> SRR1500472 2 0.5178 0.4876 0.116 0.884
#> SRR1417632 1 0.7299 0.7340 0.796 0.204
#> SRR1350153 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1458113 2 0.6801 0.7209 0.180 0.820
#> SRR1326579 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1349363 1 0.7815 -0.0986 0.768 0.232
#> SRR1096712 2 0.8327 0.7230 0.264 0.736
#> SRR1090407 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1083752 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1377599 1 0.4815 0.4979 0.896 0.104
#> SRR1488449 2 0.0938 0.6696 0.012 0.988
#> SRR1318354 2 0.6438 0.7171 0.164 0.836
#> SRR1359062 2 0.9393 0.7140 0.356 0.644
#> SRR1398924 2 0.4431 0.5337 0.092 0.908
#> SRR663783 2 0.1843 0.6762 0.028 0.972
#> SRR1319204 2 0.9000 0.6593 0.316 0.684
#> SRR1369070 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR615659 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1337449 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1316982 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1498595 1 0.7139 0.0159 0.804 0.196
#> SRR1377423 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1312310 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1485613 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1338426 2 0.7299 0.7219 0.204 0.796
#> SRR1353309 2 0.7139 0.7216 0.196 0.804
#> SRR658941 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1101643 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1401468 1 0.9963 0.7552 0.536 0.464
#> SRR1368874 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1324085 1 0.9209 0.4539 0.664 0.336
#> SRR1363858 1 0.9732 0.8453 0.596 0.404
#> SRR819820 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1337342 1 0.9815 0.8250 0.580 0.420
#> SRR655206 2 0.7602 0.7231 0.220 0.780
#> SRR1387013 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1317410 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR608198 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1440161 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1343741 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1381288 2 0.9775 0.6926 0.412 0.588
#> SRR1415379 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1099622 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR663197 2 0.8763 0.7210 0.296 0.704
#> SRR1394836 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR661699 2 0.4939 0.6913 0.108 0.892
#> SRR813680 1 0.9815 0.8265 0.580 0.420
#> SRR1410678 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1378109 1 0.9248 0.8674 0.660 0.340
#> SRR1499174 2 0.9866 -0.5444 0.432 0.568
#> SRR1311486 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1382851 2 0.9732 0.6967 0.404 0.596
#> SRR1433410 1 0.9815 0.8250 0.580 0.420
#> SRR661167 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1432518 2 0.1843 0.6769 0.028 0.972
#> SRR660462 2 0.7056 0.7213 0.192 0.808
#> SRR1374608 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR657949 2 0.7376 0.2338 0.208 0.792
#> SRR1308882 1 0.7745 0.7609 0.772 0.228
#> SRR655768 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1485870 1 0.0000 0.4492 1.000 0.000
#> SRR1444138 2 0.9129 -0.2251 0.328 0.672
#> SRR1417342 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1470193 1 0.8861 0.5850 0.696 0.304
#> SRR1091380 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1099096 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1313583 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1467102 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1485416 1 0.8499 0.8108 0.724 0.276
#> SRR818821 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR809963 2 0.9522 -0.3933 0.372 0.628
#> SRR1072247 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1353710 1 0.8207 0.7903 0.744 0.256
#> SRR1445259 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1408393 2 0.9491 -0.3784 0.368 0.632
#> SRR1361522 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1368597 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1309680 1 0.9998 -0.6182 0.508 0.492
#> SRR1310542 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1333485 1 0.7299 0.7340 0.796 0.204
#> SRR1406437 2 0.8909 0.3304 0.308 0.692
#> SRR1354931 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1391856 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1446738 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1309032 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1388145 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1432611 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR815869 2 0.9129 0.7178 0.328 0.672
#> SRR613150 2 0.5178 0.7063 0.116 0.884
#> SRR1375329 2 0.9552 -0.4001 0.376 0.624
#> SRR1387921 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1466792 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1360478 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1360695 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR812943 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1400910 2 0.4939 0.5918 0.108 0.892
#> SRR1444203 1 0.7950 0.7723 0.760 0.240
#> SRR816177 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR658754 2 0.9358 0.7147 0.352 0.648
#> SRR1429603 1 0.7376 0.7409 0.792 0.208
#> SRR1397366 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1446028 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1083918 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1337606 2 0.6148 0.5216 0.152 0.848
#> SRR659109 2 0.7139 0.7216 0.196 0.804
#> SRR1337192 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR656946 2 0.9909 -0.5733 0.444 0.556
#> SRR1476102 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1476447 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1342067 1 0.7299 0.7340 0.796 0.204
#> SRR1385389 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1075971 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR614419 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1322936 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1349121 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1430549 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR612935 2 0.5946 0.7131 0.144 0.856
#> SRR661481 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1354117 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1393596 1 0.7299 0.7367 0.796 0.204
#> SRR1452164 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1070503 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1499894 2 0.5629 0.7109 0.132 0.868
#> SRR1082883 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1468271 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1332443 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR810295 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR662103 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1328620 2 0.6343 0.7164 0.160 0.840
#> SRR1396294 2 0.9248 -0.1972 0.340 0.660
#> SRR1419917 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR662114 2 0.7674 0.7239 0.224 0.776
#> SRR1489199 2 0.6148 0.4053 0.152 0.848
#> SRR813584 1 0.8267 -0.1745 0.740 0.260
#> SRR1069638 2 0.0938 0.6682 0.012 0.988
#> SRR614864 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1433392 2 0.9427 -0.3561 0.360 0.640
#> SRR1377777 1 0.9732 -0.4977 0.596 0.404
#> SRR2167710 2 0.9850 -0.5351 0.428 0.572
#> SRR1401252 1 0.6801 0.7064 0.820 0.180
#> SRR1309963 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1338031 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1418628 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1486889 2 0.9896 -0.5640 0.440 0.560
#> SRR1380393 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1319731 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1356468 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1337010 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1486520 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1486538 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1340486 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1377696 1 0.6623 0.0898 0.828 0.172
#> SRR1465459 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1080270 2 0.6887 0.7205 0.184 0.816
#> SRR1312501 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1093148 2 0.2948 0.6860 0.052 0.948
#> SRR1467080 2 0.9358 0.7149 0.352 0.648
#> SRR1410866 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR816475 2 0.6973 0.6997 0.188 0.812
#> SRR1379198 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR613342 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1452246 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1338836 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1369129 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1396616 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR813824 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1082376 2 0.7376 0.2197 0.208 0.792
#> SRR1500891 1 0.7139 0.7251 0.804 0.196
#> SRR807543 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1091572 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1346689 1 0.7299 0.7340 0.796 0.204
#> SRR1332424 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR663729 1 0.9393 0.8796 0.644 0.356
#> SRR1097013 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR613675 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1485357 1 0.9427 0.8826 0.640 0.360
#> SRR655816 2 0.0938 0.6696 0.012 0.988
#> SRR1500113 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1437622 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1355172 1 0.9896 0.7977 0.560 0.440
#> SRR655531 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1338147 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1413329 2 0.3584 0.5743 0.068 0.932
#> SRR1485931 2 0.9988 0.6436 0.480 0.520
#> SRR1420873 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1333308 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1452033 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1467316 1 0.8267 -0.1745 0.740 0.260
#> SRR809018 2 0.6531 0.7189 0.168 0.832
#> SRR1375351 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR663440 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1471755 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR808019 1 1.0000 0.7067 0.504 0.496
#> SRR1479133 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR615069 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1456185 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1350069 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR816316 1 0.9608 0.8660 0.616 0.384
#> SRR664795 1 0.9491 0.8817 0.632 0.368
#> SRR1490721 1 0.8763 0.8302 0.704 0.296
#> SRR810643 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1430333 2 0.7453 0.2185 0.212 0.788
#> SRR1085285 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1099072 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1317985 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1487340 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1420276 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1351347 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1405525 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1370329 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1465001 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1476525 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR819610 1 0.0672 0.4388 0.992 0.008
#> SRR2157314 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1409465 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR809987 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR613639 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1402285 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1077038 1 0.9850 0.8162 0.572 0.428
#> SRR1405660 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1095455 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1394734 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1317771 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1365894 1 0.3274 0.3567 0.940 0.060
#> SRR1073581 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR659804 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1345914 2 0.9866 0.6800 0.432 0.568
#> SRR1432186 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1473529 1 0.8608 -0.2404 0.716 0.284
#> SRR660764 2 0.7219 0.7222 0.200 0.800
#> SRR820448 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1328845 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1336415 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1379065 1 0.9427 0.8825 0.640 0.360
#> SRR1459190 2 0.5178 0.4876 0.116 0.884
#> SRR1346773 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1499521 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1440898 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1347459 2 0.6887 0.7211 0.184 0.816
#> SRR1081209 2 0.9815 0.6882 0.420 0.580
#> SRR1400202 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1333395 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1309248 1 0.3733 0.3925 0.928 0.072
#> SRR809161 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1316320 1 0.3274 0.3980 0.940 0.060
#> SRR1432629 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1498931 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1416578 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1405547 2 0.6887 0.7207 0.184 0.816
#> SRR1470534 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1380764 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1309160 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR663489 2 0.9129 0.7178 0.328 0.672
#> SRR1500450 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1078489 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1332648 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR660614 2 0.9129 0.7178 0.328 0.672
#> SRR1470420 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1475566 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1477949 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1481419 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1464766 2 0.9358 -0.3028 0.352 0.648
#> SRR615946 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1446481 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1467656 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1402962 1 0.9552 0.8744 0.624 0.376
#> SRR660224 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR665586 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1347166 1 0.9795 0.8308 0.584 0.416
#> SRR1485722 2 0.7299 0.2325 0.204 0.796
#> SRR1415316 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR613390 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR661108 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR2170173 2 0.7056 0.2910 0.192 0.808
#> SRR817329 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1401990 1 0.8144 0.7850 0.748 0.252
#> SRR1467745 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1471795 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1415637 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR813137 1 0.9909 0.7962 0.556 0.444
#> SRR1314873 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1401211 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1419692 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR818797 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR2164608 2 0.3584 0.5743 0.068 0.932
#> SRR1455586 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR819459 2 0.6531 0.7179 0.168 0.832
#> SRR1488939 1 0.7883 -0.1096 0.764 0.236
#> SRR1433232 2 0.9815 0.6882 0.420 0.580
#> SRR1385501 2 0.3584 0.5743 0.068 0.932
#> SRR1361652 2 0.9552 -0.4001 0.376 0.624
#> SRR1437119 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1478547 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1430910 2 0.7299 0.7240 0.204 0.796
#> SRR1310584 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1500216 2 0.6438 0.3731 0.164 0.836
#> SRR1486762 2 0.0376 0.6658 0.004 0.996
#> SRR1480854 1 0.8909 0.8404 0.692 0.308
#> SRR1489394 1 0.9087 0.8540 0.676 0.324
#> SRR1418085 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1340221 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1473058 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1405165 2 0.7950 0.7232 0.240 0.760
#> SRR1433004 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1471477 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1098567 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1098712 1 0.9170 0.8611 0.668 0.332
#> SRR1455038 1 0.9815 0.8250 0.580 0.420
#> SRR1375248 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1403005 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1348378 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1413541 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1392943 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1475192 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1432085 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1452468 1 0.9977 0.7490 0.528 0.472
#> SRR1347060 2 0.7219 0.7218 0.200 0.800
#> SRR1414139 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1447962 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1444324 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1415004 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1413436 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1311266 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1343302 1 0.9427 0.8826 0.640 0.360
#> SRR1373746 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1429678 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1469413 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1405331 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1345609 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1380208 1 0.5946 0.2040 0.856 0.144
#> SRR1322840 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1399797 2 0.8016 0.7236 0.244 0.756
#> SRR1416654 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1315081 2 0.9129 0.7178 0.328 0.672
#> SRR1369196 2 0.6623 0.7187 0.172 0.828
#> SRR1400847 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1365291 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1367920 1 0.4939 0.6106 0.892 0.108
#> SRR1366648 2 0.8207 0.7233 0.256 0.744
#> SRR1441679 2 0.9460 0.7126 0.364 0.636
#> SRR1082173 2 0.3584 0.5743 0.068 0.932
#> SRR1363968 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR814387 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR657599 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1386689 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1395575 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1453811 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
#> SRR1441159 1 0.9460 0.8852 0.636 0.364
#> SRR1403154 1 0.7376 0.7384 0.792 0.208
#> SRR1468722 2 0.1184 0.6712 0.016 0.984
#> SRR1310275 2 0.0000 0.6638 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 1 0.6192 0.23407 0.580 0.000 0.420
#> SRR1331708 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464258 3 0.1753 0.87313 0.048 0.000 0.952
#> SRR1454201 1 0.5859 0.45897 0.656 0.000 0.344
#> SRR661589 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456229 3 0.5254 0.65650 0.264 0.000 0.736
#> SRR1315165 2 0.6126 0.37746 0.400 0.600 0.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094457 1 0.0592 0.91754 0.988 0.012 0.000
#> SRR1095575 3 0.6154 0.34893 0.408 0.000 0.592
#> SRR1315931 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.5650 0.55938 0.312 0.688 0.000
#> SRR1486845 1 0.0747 0.91457 0.984 0.016 0.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 2 0.6359 0.36368 0.404 0.592 0.004
#> SRR1311018 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.5650 0.55467 0.312 0.688 0.000
#> SRR1429846 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR613550 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0237 0.92281 0.996 0.000 0.004
#> SRR1324025 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318879 3 0.5397 0.61946 0.280 0.000 0.720
#> SRR820755 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485830 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR599313 3 0.6062 0.41985 0.384 0.000 0.616
#> SRR612263 1 0.1163 0.90489 0.972 0.000 0.028
#> SRR1415398 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326205 1 0.1860 0.88459 0.948 0.052 0.000
#> SRR1421327 1 0.6280 0.07558 0.540 0.460 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499303 2 0.4931 0.67141 0.232 0.768 0.000
#> SRR1079522 1 0.0475 0.92117 0.992 0.004 0.004
#> SRR1452935 3 0.1860 0.86853 0.052 0.000 0.948
#> SRR1379495 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR615778 1 0.3816 0.78827 0.852 0.000 0.148
#> SRR1447564 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308650 2 0.5529 0.54491 0.000 0.704 0.296
#> SRR1388354 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413602 3 0.5988 0.43168 0.000 0.368 0.632
#> SRR1479955 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499935 2 0.1529 0.85777 0.040 0.960 0.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429408 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433950 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409854 3 0.0237 0.90337 0.004 0.000 0.996
#> SRR1435229 1 0.1860 0.88439 0.948 0.000 0.052
#> SRR1085996 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 3 0.0237 0.90331 0.000 0.004 0.996
#> SRR1400974 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 3 0.6126 0.38635 0.400 0.000 0.600
#> SRR813776 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR808196 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101085 2 0.6180 0.33706 0.416 0.584 0.000
#> SRR614395 3 0.6302 0.13323 0.480 0.000 0.520
#> SRR1478251 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420109 3 0.4796 0.71144 0.220 0.000 0.780
#> SRR1330920 3 0.4121 0.76992 0.168 0.000 0.832
#> SRR1419539 3 0.5733 0.51893 0.000 0.324 0.676
#> SRR1359447 3 0.0424 0.90013 0.000 0.008 0.992
#> SRR1347259 1 0.1529 0.89533 0.960 0.040 0.000
#> SRR613915 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384395 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR821715 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.1182 0.91089 0.976 0.012 0.012
#> SRR1096383 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341480 2 0.6180 0.33684 0.416 0.584 0.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR808566 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430270 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR661267 3 0.2711 0.83929 0.088 0.000 0.912
#> SRR810665 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407250 3 0.5760 0.50871 0.328 0.000 0.672
#> SRR1420067 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.6026 0.43684 0.376 0.624 0.000
#> SRR1446375 1 0.2356 0.86698 0.928 0.000 0.072
#> SRR1465230 1 0.3116 0.82835 0.892 0.108 0.000
#> SRR614119 1 0.0592 0.91703 0.988 0.000 0.012
#> SRR1356101 2 0.1860 0.84334 0.000 0.948 0.052
#> SRR1404209 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445655 2 0.8148 0.50230 0.296 0.604 0.100
#> SRR658953 3 0.6079 0.39791 0.388 0.000 0.612
#> SRR2166459 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317631 1 0.2625 0.85456 0.916 0.084 0.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316367 1 0.0237 0.92281 0.996 0.000 0.004
#> SRR1433926 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 2 0.6192 0.32658 0.420 0.580 0.000
#> SRR818263 1 0.6308 -0.00694 0.508 0.000 0.492
#> SRR1404909 2 0.5497 0.58573 0.292 0.708 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442422 1 0.4062 0.75967 0.836 0.164 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR654862 3 0.3686 0.79627 0.140 0.000 0.860
#> SRR1407112 1 0.0592 0.91722 0.988 0.012 0.000
#> SRR1332969 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353199 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1378885 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR665357 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR662186 2 0.0237 0.87715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1501020 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472576 2 0.5254 0.62781 0.264 0.736 0.000
#> SRR1431781 2 0.0237 0.87726 0.000 0.996 0.004
#> SRR1452270 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500472 1 0.6159 0.67633 0.756 0.048 0.196
#> SRR1417632 1 0.5882 0.41944 0.652 0.348 0.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326579 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.5621 0.56245 0.308 0.692 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1083752 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377599 2 0.6026 0.43138 0.376 0.624 0.000
#> SRR1488449 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318354 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1359062 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398924 1 0.7744 0.02797 0.504 0.048 0.448
#> SRR663783 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319204 3 0.8718 0.31592 0.364 0.116 0.520
#> SRR1369070 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.5968 0.43983 0.000 0.364 0.636
#> SRR1498595 2 0.5431 0.59782 0.284 0.716 0.000
#> SRR1377423 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR658941 3 0.9417 0.22425 0.364 0.180 0.456
#> SRR1101643 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.2261 0.86729 0.932 0.000 0.068
#> SRR1368874 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324085 2 0.5165 0.77646 0.072 0.832 0.096
#> SRR1363858 3 0.6302 0.14397 0.480 0.000 0.520
#> SRR819820 3 0.4605 0.72583 0.204 0.000 0.796
#> SRR1337342 1 0.1643 0.89253 0.956 0.000 0.044
#> SRR655206 2 0.4399 0.69932 0.000 0.812 0.188
#> SRR1387013 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.4291 0.69854 0.000 0.820 0.180
#> SRR1343741 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415379 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR663197 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394836 2 0.1753 0.84604 0.000 0.952 0.048
#> SRR661699 3 0.0237 0.90337 0.004 0.000 0.996
#> SRR813680 3 0.4399 0.74766 0.188 0.000 0.812
#> SRR1410678 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 1 0.3038 0.83334 0.896 0.104 0.000
#> SRR1499174 1 0.1964 0.87993 0.944 0.000 0.056
#> SRR1311486 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433410 1 0.0237 0.92281 0.996 0.000 0.004
#> SRR661167 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432518 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374608 1 0.3690 0.82963 0.884 0.100 0.016
#> SRR657949 3 0.5058 0.67805 0.244 0.000 0.756
#> SRR1308882 1 0.0892 0.91195 0.980 0.020 0.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 2 0.6286 0.19999 0.464 0.536 0.000
#> SRR1444138 1 0.1753 0.88795 0.952 0.000 0.048
#> SRR1417342 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 2 0.6717 0.46879 0.352 0.628 0.020
#> SRR1091380 3 0.4062 0.76863 0.164 0.000 0.836
#> SRR1099096 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467102 3 0.6168 0.33591 0.000 0.412 0.588
#> SRR1485416 1 0.6260 0.10443 0.552 0.448 0.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR809963 1 0.6154 0.25539 0.592 0.000 0.408
#> SRR1072247 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 1 0.6309 -0.08823 0.500 0.500 0.000
#> SRR1445259 3 0.4399 0.74985 0.188 0.000 0.812
#> SRR1408393 3 0.5859 0.49704 0.344 0.000 0.656
#> SRR1361522 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1333485 1 0.6192 0.21204 0.580 0.420 0.000
#> SRR1406437 2 0.1411 0.85500 0.000 0.964 0.036
#> SRR1354931 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1391856 2 0.3941 0.73884 0.000 0.844 0.156
#> SRR1446738 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375329 3 0.8058 0.33459 0.376 0.072 0.552
#> SRR1387921 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400910 3 0.6302 0.69410 0.208 0.048 0.744
#> SRR1444203 1 0.2165 0.87426 0.936 0.064 0.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429603 1 0.6291 0.03982 0.532 0.468 0.000
#> SRR1397366 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337606 2 0.9069 0.14754 0.424 0.440 0.136
#> SRR659109 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 1 0.6291 0.04476 0.532 0.468 0.000
#> SRR1385389 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0237 0.92281 0.996 0.000 0.004
#> SRR1349121 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.1529 0.85280 0.000 0.960 0.040
#> SRR1393596 2 0.6309 0.09698 0.496 0.504 0.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499894 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082883 1 0.1753 0.88783 0.952 0.048 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.3192 0.81209 0.000 0.112 0.888
#> SRR1396294 1 0.7186 -0.01416 0.500 0.476 0.024
#> SRR1419917 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489199 3 0.6295 0.14951 0.472 0.000 0.528
#> SRR813584 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069638 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR614864 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433392 3 0.0237 0.90324 0.004 0.000 0.996
#> SRR1377777 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401252 1 0.6235 0.15854 0.564 0.436 0.000
#> SRR1309963 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.4121 0.76156 0.832 0.000 0.168
#> SRR1380393 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340486 1 0.0237 0.92291 0.996 0.004 0.000
#> SRR1377696 2 0.1031 0.86662 0.024 0.976 0.000
#> SRR1465459 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093148 2 0.9707 0.10490 0.224 0.424 0.352
#> SRR1467080 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR816475 2 0.6225 0.26741 0.000 0.568 0.432
#> SRR1379198 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR613342 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369129 1 0.0237 0.92291 0.996 0.004 0.000
#> SRR1396616 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082376 3 0.4974 0.67666 0.236 0.000 0.764
#> SRR1500891 2 0.6302 0.14522 0.480 0.520 0.000
#> SRR807543 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091572 3 0.1964 0.86699 0.056 0.000 0.944
#> SRR1346689 1 0.5397 0.56776 0.720 0.280 0.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR663729 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485357 1 0.0892 0.91147 0.980 0.020 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355172 3 0.5098 0.67287 0.248 0.000 0.752
#> SRR655531 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413329 3 0.5529 0.59134 0.296 0.000 0.704
#> SRR1485931 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR663440 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR808019 1 0.5178 0.62185 0.744 0.000 0.256
#> SRR1479133 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR615069 3 0.4654 0.70050 0.000 0.208 0.792
#> SRR1456185 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350069 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR816316 1 0.5431 0.56336 0.716 0.000 0.284
#> SRR664795 1 0.6168 0.25336 0.588 0.000 0.412
#> SRR1490721 1 0.5905 0.41509 0.648 0.352 0.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.7699 0.14921 0.532 0.048 0.420
#> SRR1085285 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099072 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR809987 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR613639 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402285 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.6260 0.12347 0.552 0.000 0.448
#> SRR1405660 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095455 3 0.4555 0.74294 0.200 0.000 0.800
#> SRR1394734 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.0892 0.86971 0.020 0.980 0.000
#> SRR1073581 1 0.0237 0.92283 0.996 0.000 0.004
#> SRR659804 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.2959 0.81385 0.100 0.900 0.000
#> SRR660764 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR820448 1 0.5733 0.47348 0.676 0.000 0.324
#> SRR1328845 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336415 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379065 1 0.0237 0.92291 0.996 0.004 0.000
#> SRR1459190 3 0.5905 0.47989 0.352 0.000 0.648
#> SRR1346773 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309248 2 0.6154 0.35769 0.408 0.592 0.000
#> SRR809161 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316320 2 0.6308 0.09979 0.492 0.508 0.000
#> SRR1432629 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470534 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332648 1 0.0237 0.92291 0.996 0.004 0.000
#> SRR660614 2 0.7389 -0.02907 0.032 0.504 0.464
#> SRR1470420 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.3412 0.80561 0.876 0.000 0.124
#> SRR615946 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.0892 0.91127 0.980 0.000 0.020
#> SRR660224 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.3879 0.78396 0.848 0.000 0.152
#> SRR1485722 1 0.5254 0.61714 0.736 0.000 0.264
#> SRR1415316 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR2170173 3 0.6140 0.36006 0.404 0.000 0.596
#> SRR817329 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401990 1 0.3619 0.79604 0.864 0.136 0.000
#> SRR1467745 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR813137 3 0.6126 0.37833 0.400 0.000 0.600
#> SRR1314873 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 1 0.2625 0.85359 0.916 0.084 0.000
#> SRR818797 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR2164608 3 0.5058 0.67726 0.244 0.000 0.756
#> SRR1455586 2 0.3340 0.78094 0.000 0.880 0.120
#> SRR819459 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488939 2 0.0424 0.87565 0.008 0.992 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.4062 0.77270 0.164 0.000 0.836
#> SRR1361652 1 0.6562 0.67086 0.744 0.072 0.184
#> SRR1437119 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1430910 3 0.1163 0.88467 0.000 0.028 0.972
#> SRR1310584 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 3 0.6026 0.43879 0.376 0.000 0.624
#> SRR1486762 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480854 1 0.5216 0.60421 0.740 0.260 0.000
#> SRR1489394 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418085 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340221 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473058 2 0.1753 0.84626 0.000 0.952 0.048
#> SRR1405165 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098712 2 0.5560 0.58740 0.300 0.700 0.000
#> SRR1455038 1 0.5882 0.43497 0.652 0.000 0.348
#> SRR1375248 3 0.6307 0.11272 0.000 0.488 0.512
#> SRR1403005 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348378 2 0.4504 0.70213 0.000 0.804 0.196
#> SRR1413541 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475192 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452468 1 0.3879 0.78417 0.848 0.000 0.152
#> SRR1347060 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414139 2 0.6168 0.19958 0.000 0.588 0.412
#> SRR1447962 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.1163 0.86128 0.000 0.972 0.028
#> SRR1415004 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 1 0.6299 0.00558 0.524 0.476 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.87957 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.5760 0.53072 0.328 0.672 0.000
#> SRR1322840 1 0.4887 0.65338 0.772 0.228 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367920 2 0.6215 0.30406 0.428 0.572 0.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441679 2 0.0237 0.87715 0.000 0.996 0.004
#> SRR1082173 3 0.3038 0.82681 0.104 0.000 0.896
#> SRR1363968 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1386689 1 0.0747 0.91483 0.984 0.016 0.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453811 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.92531 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 1 0.4452 0.72243 0.808 0.192 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310275 3 0.0000 0.90597 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 1 0.3400 0.7622 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1331708 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464258 3 0.3266 0.8134 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1454201 1 0.3024 0.8065 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR661589 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456229 3 0.4040 0.7214 0.248 0.000 0.752 0.000
#> SRR1315165 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 4 0.0707 0.9271 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1094457 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095575 3 0.4072 0.7136 0.252 0.000 0.748 0.000
#> SRR1315931 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.4544 0.7330 0.048 0.788 0.000 0.164
#> SRR1486845 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.5690 0.6483 0.116 0.716 0.000 0.168
#> SRR1429846 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613550 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324025 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318879 3 0.3311 0.8081 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR820755 3 0.2345 0.8632 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1485830 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR599313 3 0.4103 0.7107 0.256 0.000 0.744 0.000
#> SRR612263 1 0.0921 0.9240 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1415398 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326205 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421327 4 0.0188 0.9407 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1083311 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079522 1 0.4981 0.1144 0.536 0.000 0.000 0.464
#> SRR1452935 3 0.2469 0.8583 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.3649 0.7266 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.3837 0.6906 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1433555 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.4585 0.5191 0.000 0.668 0.332 0.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413602 2 0.4888 0.2729 0.000 0.588 0.412 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499935 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429408 2 0.2921 0.7977 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1433950 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 3 0.2921 0.8346 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR1435229 1 0.0188 0.9428 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 3 0.1182 0.9087 0.016 0.016 0.968 0.000
#> SRR1400974 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 3 0.4830 0.4602 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR813776 3 0.1211 0.9007 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR808196 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101085 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614395 3 0.4193 0.6947 0.268 0.000 0.732 0.000
#> SRR1478251 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420109 3 0.3311 0.8081 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR1330920 3 0.3528 0.7869 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR1419539 2 0.4331 0.6152 0.000 0.712 0.288 0.000
#> SRR1359447 3 0.3123 0.7704 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1347259 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613915 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384395 3 0.0188 0.9205 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR821715 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0707 0.9306 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1096383 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341480 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808566 4 0.4164 0.6380 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1430270 1 0.4730 0.4390 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1367825 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661267 3 0.3610 0.7787 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 1 0.3569 0.7453 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1420067 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0921 0.9218 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR812536 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.4999 0.0279 0.492 0.508 0.000 0.000
#> SRR1446375 1 0.1022 0.9217 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1465230 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658953 3 0.3528 0.7869 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR2166459 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488610 1 0.0188 0.9426 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1330588 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818263 1 0.4040 0.6619 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR1404909 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654862 3 0.3528 0.7880 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR1407112 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332969 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353199 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378885 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR665357 3 0.2973 0.7852 0.000 0.144 0.856 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.0188 0.9408 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1431781 4 0.0188 0.9410 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1452270 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.4098 0.6972 0.784 0.012 0.204 0.000
#> SRR1417632 4 0.0188 0.9407 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326579 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.5860 0.3232 0.040 0.580 0.000 0.380
#> SRR1096712 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.3801 0.6874 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1377599 4 0.0188 0.9407 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1488449 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318354 3 0.0336 0.9178 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1359062 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398924 1 0.4795 0.5502 0.696 0.012 0.292 0.000
#> SRR663783 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319204 2 0.6570 0.3756 0.100 0.580 0.320 0.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.3219 0.7770 0.000 0.836 0.164 0.000
#> SRR1498595 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377423 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.0188 0.9205 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658941 1 0.7874 0.0208 0.380 0.336 0.284 0.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0707 0.9300 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363858 3 0.4992 0.2247 0.476 0.000 0.524 0.000
#> SRR819820 3 0.2469 0.8612 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1337342 1 0.1637 0.8963 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR655206 2 0.0921 0.9131 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1387013 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663197 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394836 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661699 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813680 3 0.3074 0.8266 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499174 1 0.1940 0.8786 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.2973 0.7935 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1433410 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.4315 0.7433 0.172 0.020 0.008 0.800
#> SRR657949 3 0.3123 0.8222 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR1308882 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444138 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.2011 0.8685 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1470193 4 0.0188 0.9410 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1091380 3 0.2011 0.8784 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 4 0.2589 0.8357 0.116 0.000 0.000 0.884
#> SRR1467102 2 0.0188 0.9348 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1485416 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809963 3 0.4605 0.5799 0.336 0.000 0.664 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445259 3 0.5000 0.0814 0.496 0.000 0.504 0.000
#> SRR1408393 3 0.3400 0.7994 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406437 2 0.4364 0.6790 0.220 0.764 0.000 0.016
#> SRR1354931 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391856 2 0.0188 0.9348 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1446738 2 0.0188 0.9349 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375329 3 0.4214 0.7667 0.204 0.016 0.780 0.000
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400910 3 0.4204 0.7790 0.192 0.020 0.788 0.000
#> SRR1444203 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1397366 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337606 1 0.6339 0.5870 0.656 0.148 0.196 0.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499894 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082883 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.6133 0.6366 0.124 0.204 0.672 0.000
#> SRR1396294 4 0.5722 0.6717 0.136 0.148 0.000 0.716
#> SRR1419917 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489199 1 0.3649 0.7272 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR813584 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069638 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614864 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433392 3 0.2868 0.8381 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1401252 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 4 0.6552 0.4016 0.328 0.000 0.096 0.576
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.4661 0.4748 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377696 4 0.4624 0.4638 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR1465459 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093148 2 0.5864 0.5611 0.264 0.664 0.072 0.000
#> SRR1467080 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.6171 0.6718 0.048 0.052 0.188 0.712
#> SRR1379198 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613342 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396616 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082376 3 0.4996 0.1197 0.484 0.000 0.516 0.000
#> SRR1500891 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR807543 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091572 3 0.4454 0.6099 0.308 0.000 0.692 0.000
#> SRR1346689 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663729 1 0.4382 0.5730 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1097013 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485357 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 4 0.4193 0.6321 0.000 0.268 0.000 0.732
#> SRR1355172 3 0.4406 0.6410 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413329 3 0.3486 0.7912 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808019 1 0.1867 0.8858 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1479133 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615069 3 0.4746 0.3655 0.000 0.368 0.632 0.000
#> SRR1456185 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350069 4 0.4164 0.6279 0.264 0.000 0.000 0.736
#> SRR816316 1 0.4999 -0.1123 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR664795 3 0.4277 0.6759 0.280 0.000 0.720 0.000
#> SRR1490721 1 0.4713 0.4482 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR810643 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.5110 0.4142 0.636 0.012 0.352 0.000
#> SRR1085285 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819610 2 0.4961 0.1381 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR2157314 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.2011 0.8719 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR613639 3 0.2760 0.8441 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR1402285 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077038 3 0.4454 0.6304 0.308 0.000 0.692 0.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095455 3 0.4790 0.4569 0.380 0.000 0.620 0.000
#> SRR1394734 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 4 0.4888 0.3249 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR1073581 1 0.0188 0.9428 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473529 4 0.4855 0.3157 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR660764 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820448 3 0.4605 0.5800 0.336 0.000 0.664 0.000
#> SRR1328845 4 0.3074 0.7905 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1336415 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1459190 3 0.2868 0.8409 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR1346773 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.0817 0.9232 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1309248 4 0.1256 0.9170 0.028 0.008 0.000 0.964
#> SRR809161 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316320 1 0.6547 0.4735 0.616 0.124 0.000 0.260
#> SRR1432629 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 3 0.0336 0.9190 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1332648 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660614 2 0.1356 0.9043 0.008 0.960 0.032 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615946 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.0817 0.9273 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.3649 0.7266 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1485722 1 0.2973 0.8074 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2170173 3 0.3726 0.7656 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR817329 1 0.0336 0.9399 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1401990 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467745 2 0.0188 0.9349 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813137 3 0.4356 0.6549 0.292 0.000 0.708 0.000
#> SRR1314873 1 0.4406 0.5538 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1401211 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818797 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2164608 3 0.3219 0.8147 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR1455586 2 0.0188 0.9348 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0336 0.9305 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.3444 0.7956 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR1361652 1 0.2101 0.8899 0.928 0.012 0.060 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430910 3 0.0707 0.9096 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 3 0.4134 0.7050 0.260 0.000 0.740 0.000
#> SRR1486762 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480854 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1473058 4 0.4331 0.5966 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1405165 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 4 0.7584 0.1966 0.204 0.348 0.000 0.448
#> SRR1455038 1 0.2408 0.8522 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1375248 2 0.0336 0.9316 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1403005 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.5004 0.3259 0.000 0.604 0.392 0.004
#> SRR1413541 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.4679 0.4655 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1475192 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 1 0.3528 0.7442 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1347060 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.1474 0.8986 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1380208 2 0.3311 0.7527 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1322840 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367920 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9378 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.3219 0.8148 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR1363968 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1386689 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453811 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.9457 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.9436 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.0000 0.9231 0.000 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 1 0.8259 -0.20212 0.380 0.000 0.144 0.224 0.252
#> SRR1331708 5 0.4060 0.52077 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640
#> SRR1464258 1 0.7023 -0.02605 0.392 0.000 0.240 0.356 0.012
#> SRR1454201 5 0.4114 0.52119 0.376 0.000 0.000 0.000 0.624
#> SRR661589 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.7676 0.00103 0.368 0.000 0.216 0.356 0.060
#> SRR1315165 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1488960 1 0.0290 0.80254 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1417809 4 0.6724 0.60149 0.252 0.000 0.000 0.392 0.356
#> SRR1094457 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1095575 4 0.8313 -0.45609 0.156 0.000 0.200 0.356 0.288
#> SRR1315931 1 0.4045 0.41553 0.644 0.000 0.000 0.356 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR818002 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.5726 0.49837 0.000 0.612 0.000 0.140 0.248
#> SRR1486845 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1362866 5 0.4101 0.51990 0.372 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR1490740 1 0.0404 0.80154 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1446627 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0290 0.80230 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1383907 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1311018 1 0.0162 0.80307 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1375699 2 0.5820 0.51034 0.192 0.612 0.000 0.196 0.000
#> SRR1429846 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR613550 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1348402 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 5 0.4126 0.51657 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620
#> SRR1324025 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1318879 5 0.4576 0.39907 0.016 0.000 0.376 0.000 0.608
#> SRR820755 3 0.4464 0.69970 0.008 0.000 0.632 0.356 0.004
#> SRR1485830 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR599313 5 0.6092 0.50309 0.016 0.000 0.088 0.356 0.540
#> SRR612263 5 0.4182 0.59868 0.004 0.000 0.000 0.352 0.644
#> SRR1415398 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326205 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1421327 5 0.3300 -0.15490 0.004 0.000 0.000 0.204 0.792
#> SRR1083311 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.4227 0.83148 0.000 0.000 0.000 0.580 0.420
#> SRR1079522 5 0.4218 0.60564 0.008 0.000 0.000 0.332 0.660
#> SRR1452935 5 0.6486 0.40165 0.008 0.000 0.152 0.356 0.484
#> SRR1379495 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR615778 5 0.4416 0.59637 0.012 0.000 0.000 0.356 0.632
#> SRR1447564 1 0.2329 0.70334 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1455195 5 0.4126 0.51657 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620
#> SRR655182 1 0.1341 0.76975 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1335140 2 0.5525 0.54222 0.000 0.636 0.000 0.240 0.124
#> SRR1433555 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.6253 0.02728 0.000 0.504 0.356 0.136 0.004
#> SRR1388354 1 0.0510 0.80041 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1317446 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.4297 -0.11247 0.000 0.472 0.528 0.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.2690 0.66681 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR661313 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1499935 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1447303 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1429408 2 0.5211 0.51039 0.000 0.668 0.000 0.100 0.232
#> SRR1433950 1 0.0609 0.79918 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1362081 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 5 0.5711 0.55304 0.020 0.000 0.052 0.356 0.572
#> SRR1435229 5 0.4045 0.52483 0.356 0.000 0.000 0.000 0.644
#> SRR1085996 5 0.4074 0.51652 0.364 0.000 0.000 0.000 0.636
#> SRR1414229 5 0.4599 0.58367 0.000 0.000 0.020 0.356 0.624
#> SRR1400974 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0510 0.80070 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR613927 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1457854 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.6510 0.11503 0.444 0.000 0.196 0.360 0.000
#> SRR813776 3 0.4347 0.70296 0.004 0.000 0.636 0.356 0.004
#> SRR808196 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1101085 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR614395 1 0.4464 0.40133 0.632 0.000 0.008 0.356 0.004
#> SRR1478251 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1370551 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0404 0.80154 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR665310 3 0.4166 0.70857 0.000 0.000 0.648 0.348 0.004
#> SRR1420109 3 0.6698 0.48512 0.016 0.000 0.472 0.356 0.156
#> SRR1330920 5 0.7161 0.41634 0.060 0.000 0.124 0.356 0.460
#> SRR1419539 3 0.2891 0.61228 0.000 0.176 0.824 0.000 0.000
#> SRR1359447 3 0.4403 0.38195 0.000 0.384 0.608 0.008 0.000
#> SRR1347259 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR613915 3 0.3048 0.75031 0.000 0.000 0.820 0.176 0.004
#> SRR1384395 3 0.0404 0.76267 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR821715 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0404 0.80154 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1445637 1 0.0404 0.79751 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR608150 5 0.4088 0.52427 0.368 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR1096383 1 0.0290 0.79971 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1341480 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1341344 5 0.4101 0.50794 0.372 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR1326270 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR808566 4 0.6416 0.71187 0.000 0.180 0.000 0.464 0.356
#> SRR1430270 1 0.4653 0.10376 0.516 0.000 0.000 0.472 0.012
#> SRR1367825 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.3074 0.74884 0.000 0.000 0.804 0.196 0.000
#> SRR661267 3 0.4986 0.69601 0.084 0.000 0.688 0.228 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 5 0.4668 0.53806 0.352 0.000 0.000 0.024 0.624
#> SRR1420067 1 0.4297 -0.23406 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR1473632 1 0.1732 0.75197 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR812536 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.5804 0.31319 0.304 0.576 0.000 0.000 0.120
#> SRR1446375 1 0.6488 0.24351 0.516 0.000 0.032 0.356 0.096
#> SRR1465230 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR614119 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR658953 5 0.4045 0.59556 0.000 0.000 0.000 0.356 0.644
#> SRR2166459 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1488610 5 0.4060 0.52077 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640
#> SRR1330588 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1316367 5 0.4150 0.48105 0.388 0.000 0.000 0.000 0.612
#> SRR1433926 1 0.4585 0.41834 0.628 0.000 0.000 0.352 0.020
#> SRR1091302 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR818263 5 0.6583 0.52422 0.152 0.000 0.012 0.356 0.480
#> SRR1404909 4 0.4210 0.83904 0.000 0.000 0.000 0.588 0.412
#> SRR663076 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1465893 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654862 5 0.5859 0.52436 0.012 0.000 0.076 0.356 0.556
#> SRR1407112 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1332969 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1353199 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1378885 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR665357 3 0.3752 0.53886 0.000 0.292 0.708 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347819 3 0.4135 0.71119 0.000 0.000 0.656 0.340 0.004
#> SRR1480813 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1431781 4 0.4196 0.88208 0.000 0.004 0.000 0.640 0.356
#> SRR1452270 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.4682 0.59636 0.024 0.000 0.000 0.356 0.620
#> SRR1417632 4 0.4420 0.79675 0.004 0.000 0.000 0.548 0.448
#> SRR1350153 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 5 0.6140 0.43153 0.000 0.000 0.140 0.356 0.504
#> SRR1326579 5 0.4060 0.52077 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640
#> SRR1349363 2 0.5019 0.28416 0.000 0.568 0.000 0.396 0.036
#> SRR1096712 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.4572 0.53269 0.000 0.684 0.000 0.280 0.036
#> SRR1377599 5 0.4321 -0.59162 0.004 0.000 0.000 0.396 0.600
#> SRR1488449 3 0.1671 0.76725 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1318354 3 0.6611 0.49183 0.000 0.012 0.476 0.356 0.156
#> SRR1359062 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.4045 0.59556 0.000 0.000 0.000 0.356 0.644
#> SRR663783 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319204 2 0.4380 0.59908 0.000 0.708 0.032 0.000 0.260
#> SRR1369070 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0510 0.80070 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1337449 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.4307 -0.00496 0.000 0.496 0.504 0.000 0.000
#> SRR1498595 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1377423 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1312310 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.3932 0.29892 0.000 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR1353309 3 0.0404 0.76309 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR658941 5 0.4958 0.36189 0.032 0.000 0.400 0.000 0.568
#> SRR1101643 1 0.0609 0.79918 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1401468 1 0.5527 -0.32304 0.476 0.000 0.012 0.040 0.472
#> SRR1368874 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1363858 4 0.7782 -0.33411 0.368 0.000 0.180 0.368 0.084
#> SRR819820 3 0.2624 0.66281 0.012 0.000 0.872 0.000 0.116
#> SRR1337342 5 0.5441 0.57001 0.280 0.000 0.000 0.096 0.624
#> SRR655206 2 0.1831 0.86586 0.000 0.920 0.076 0.004 0.000
#> SRR1387013 2 0.1544 0.87069 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1317410 1 0.0162 0.80295 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR608198 5 0.4045 0.52483 0.356 0.000 0.000 0.000 0.644
#> SRR1440161 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1099622 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663197 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1394836 2 0.1478 0.87864 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR661699 3 0.3074 0.56765 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR813680 3 0.3375 0.74240 0.056 0.000 0.840 0.104 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1499174 1 0.4196 0.41471 0.640 0.000 0.000 0.356 0.004
#> SRR1311486 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.4182 0.54221 0.000 0.644 0.000 0.004 0.352
#> SRR1433410 5 0.4045 0.52483 0.356 0.000 0.000 0.000 0.644
#> SRR661167 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.4114 0.17506 0.000 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR660462 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 5 0.5140 -0.65272 0.020 0.012 0.000 0.428 0.540
#> SRR657949 5 0.7022 0.25589 0.016 0.000 0.216 0.356 0.412
#> SRR1308882 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR655768 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 5 0.3074 -0.14839 0.000 0.000 0.000 0.196 0.804
#> SRR1444138 1 0.2358 0.70253 0.888 0.000 0.104 0.000 0.008
#> SRR1417342 1 0.0609 0.79918 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1470193 4 0.4196 0.88208 0.000 0.004 0.000 0.640 0.356
#> SRR1091380 3 0.3706 0.56670 0.012 0.012 0.796 0.000 0.180
#> SRR1099096 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.5970 0.06780 0.524 0.000 0.000 0.120 0.356
#> SRR1467102 2 0.3452 0.69339 0.000 0.756 0.244 0.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR818821 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809963 1 0.4464 0.40244 0.632 0.000 0.008 0.356 0.004
#> SRR1072247 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1445259 5 0.5523 0.57177 0.024 0.000 0.036 0.352 0.588
#> SRR1408393 3 0.2720 0.68599 0.020 0.000 0.880 0.004 0.096
#> SRR1361522 1 0.4599 0.41315 0.624 0.000 0.000 0.356 0.020
#> SRR1368597 1 0.4074 0.15005 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1309680 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1406437 2 0.6176 0.47792 0.236 0.612 0.000 0.128 0.024
#> SRR1354931 3 0.1478 0.76765 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1391856 2 0.0162 0.92541 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1446738 2 0.5167 0.53568 0.000 0.668 0.000 0.240 0.092
#> SRR1309032 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375329 5 0.4298 0.59933 0.008 0.000 0.000 0.352 0.640
#> SRR1387921 1 0.0609 0.79918 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1466792 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.3304 0.64373 0.816 0.000 0.000 0.016 0.168
#> SRR1400910 5 0.4045 0.59556 0.000 0.000 0.000 0.356 0.644
#> SRR1444203 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR816177 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1397366 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1446028 1 0.0404 0.80189 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1083918 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337606 5 0.4313 0.59633 0.008 0.000 0.000 0.356 0.636
#> SRR659109 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337192 5 0.4060 0.52077 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640
#> SRR656946 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.4219 -0.02378 0.584 0.000 0.000 0.000 0.416
#> SRR1476447 1 0.0609 0.79918 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1342067 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1385389 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1075971 1 0.0404 0.80154 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR614419 5 0.4088 0.51165 0.368 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR1322936 5 0.4101 0.52008 0.372 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR1349121 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0609 0.79918 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR612935 3 0.6040 0.63320 0.000 0.192 0.620 0.176 0.012
#> SRR661481 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.4192 0.84621 0.000 0.000 0.000 0.596 0.404
#> SRR1452164 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1499894 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1082883 5 0.4101 0.52304 0.372 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR1468271 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0609 0.79918 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR810295 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.4599 0.41315 0.624 0.000 0.000 0.356 0.020
#> SRR1328620 5 0.6559 0.46097 0.016 0.004 0.120 0.356 0.504
#> SRR1396294 4 0.7294 0.71458 0.032 0.152 0.012 0.460 0.344
#> SRR1419917 1 0.3724 0.60220 0.776 0.000 0.000 0.204 0.020
#> SRR662114 4 0.6813 -0.48744 0.000 0.000 0.340 0.356 0.304
#> SRR1489199 5 0.5383 0.58284 0.032 0.000 0.020 0.356 0.592
#> SRR813584 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069638 3 0.4908 0.67680 0.000 0.000 0.608 0.356 0.036
#> SRR614864 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1433392 3 0.4749 0.68982 0.020 0.000 0.620 0.356 0.004
#> SRR1377777 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.3169 0.69263 0.856 0.000 0.084 0.060 0.000
#> SRR1401252 4 0.4227 0.83148 0.000 0.000 0.000 0.580 0.420
#> SRR1309963 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1338031 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 5 0.6149 0.38717 0.140 0.000 0.360 0.000 0.500
#> SRR1380393 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 4 0.4403 0.26952 0.384 0.000 0.000 0.608 0.008
#> SRR1337010 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 5 0.4294 0.36316 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1486538 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1340486 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1377696 5 0.6060 -0.43980 0.000 0.124 0.000 0.384 0.492
#> SRR1465459 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1080270 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.4313 0.70241 0.000 0.000 0.636 0.356 0.008
#> SRR1093148 5 0.7316 0.51653 0.020 0.160 0.156 0.080 0.584
#> SRR1467080 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.7321 0.71431 0.004 0.064 0.120 0.456 0.356
#> SRR1379198 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR613342 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1452246 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1396616 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR813824 3 0.4066 0.71566 0.000 0.000 0.672 0.324 0.004
#> SRR1082376 3 0.7179 0.45959 0.156 0.000 0.444 0.356 0.044
#> SRR1500891 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR807543 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1091572 4 0.7448 -0.50380 0.032 0.000 0.340 0.356 0.272
#> SRR1346689 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1332424 5 0.4060 0.52077 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640
#> SRR663729 1 0.3074 0.60519 0.804 0.000 0.000 0.196 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613675 5 0.4101 0.52008 0.372 0.000 0.000 0.000 0.628
#> SRR1485357 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR655816 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 4 0.6752 0.59299 0.000 0.264 0.000 0.384 0.352
#> SRR1355172 3 0.2179 0.67898 0.112 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR655531 5 0.5254 0.56691 0.272 0.000 0.000 0.084 0.644
#> SRR1338147 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1413329 5 0.5454 0.56973 0.020 0.000 0.036 0.356 0.588
#> SRR1485931 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1452033 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.1043 0.89802 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR809018 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1471755 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808019 1 0.4305 -0.27459 0.512 0.000 0.000 0.000 0.488
#> SRR1479133 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615069 5 0.6074 0.58005 0.000 0.100 0.028 0.256 0.616
#> SRR1456185 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350069 4 0.6504 0.67565 0.196 0.000 0.000 0.448 0.356
#> SRR816316 1 0.4880 0.39042 0.616 0.000 0.016 0.356 0.012
#> SRR664795 1 0.4219 0.34656 0.584 0.000 0.416 0.000 0.000
#> SRR1490721 5 0.4682 0.52356 0.356 0.000 0.000 0.024 0.620
#> SRR810643 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 5 0.4599 0.59596 0.020 0.000 0.000 0.356 0.624
#> SRR1085285 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1317985 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0510 0.80070 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1420276 3 0.0404 0.76267 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.5107 0.66419 0.000 0.000 0.596 0.356 0.048
#> SRR1405525 5 0.4088 0.51164 0.368 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR1370329 1 0.0609 0.79918 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1465001 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819610 2 0.5769 0.24987 0.000 0.556 0.000 0.340 0.104
#> SRR2157314 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 1 0.6771 -0.35849 0.372 0.000 0.000 0.272 0.356
#> SRR613639 3 0.4661 0.69293 0.016 0.000 0.624 0.356 0.004
#> SRR1402285 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1077038 1 0.4986 0.37371 0.608 0.000 0.032 0.356 0.004
#> SRR1405660 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 5 0.6544 0.27580 0.000 0.000 0.204 0.356 0.440
#> SRR1394734 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0162 0.80170 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1365894 5 0.1502 0.28820 0.000 0.056 0.000 0.004 0.940
#> SRR1073581 1 0.1549 0.76666 0.944 0.000 0.016 0.000 0.040
#> SRR659804 1 0.0290 0.80271 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1345914 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473529 4 0.6343 0.32800 0.000 0.332 0.000 0.492 0.176
#> SRR660764 3 0.3284 0.75472 0.000 0.024 0.828 0.148 0.000
#> SRR820448 1 0.4682 0.40783 0.620 0.000 0.000 0.356 0.024
#> SRR1328845 4 0.5894 0.77913 0.112 0.000 0.000 0.532 0.356
#> SRR1336415 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1379065 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1459190 3 0.0290 0.76522 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1346773 1 0.3424 0.52776 0.760 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR1499521 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1081209 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0609 0.79918 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1333395 4 0.4848 0.81726 0.024 0.000 0.000 0.556 0.420
#> SRR1309248 5 0.4211 -0.52728 0.004 0.000 0.000 0.360 0.636
#> SRR809161 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1316320 5 0.5733 0.48314 0.348 0.012 0.000 0.068 0.572
#> SRR1432629 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1405547 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1380764 1 0.4273 -0.14790 0.552 0.000 0.000 0.000 0.448
#> SRR1309160 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 5 0.5932 0.46970 0.000 0.000 0.116 0.356 0.528
#> SRR1332648 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR660614 2 0.3480 0.65271 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1470420 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0609 0.79918 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1477949 1 0.0290 0.80254 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1481419 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.4196 0.41041 0.640 0.000 0.000 0.356 0.004
#> SRR615946 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1446481 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 5 0.4114 0.52119 0.376 0.000 0.000 0.000 0.624
#> SRR660224 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.5759 0.41367 0.616 0.000 0.000 0.224 0.160
#> SRR1347166 5 0.4416 0.59637 0.012 0.000 0.000 0.356 0.632
#> SRR1485722 5 0.4114 0.52119 0.376 0.000 0.000 0.000 0.624
#> SRR1415316 5 0.4235 0.41571 0.424 0.000 0.000 0.000 0.576
#> SRR613390 1 0.1518 0.78631 0.952 0.000 0.012 0.016 0.020
#> SRR661108 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2170173 4 0.8429 -0.42424 0.240 0.000 0.184 0.352 0.224
#> SRR817329 1 0.5757 0.34209 0.564 0.000 0.012 0.356 0.068
#> SRR1401990 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1467745 2 0.4462 0.57497 0.000 0.672 0.016 0.308 0.004
#> SRR1471795 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 1 0.5057 0.37114 0.604 0.000 0.036 0.356 0.004
#> SRR1314873 1 0.3143 0.62322 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1401211 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR818797 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR2164608 5 0.6638 0.42174 0.024 0.000 0.296 0.148 0.532
#> SRR1455586 2 0.0162 0.92541 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR819459 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1488939 2 0.0963 0.90107 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1433232 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.6520 0.57912 0.048 0.000 0.520 0.356 0.076
#> SRR1361652 5 0.4045 0.52483 0.356 0.000 0.000 0.000 0.644
#> SRR1437119 1 0.0609 0.79918 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1478547 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 5 0.4599 0.58367 0.000 0.000 0.020 0.356 0.624
#> SRR1310584 1 0.0609 0.79918 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1500216 5 0.6001 0.50399 0.012 0.000 0.088 0.356 0.544
#> SRR1486762 3 0.2424 0.75969 0.000 0.000 0.868 0.132 0.000
#> SRR1480854 4 0.4273 0.80422 0.000 0.000 0.000 0.552 0.448
#> SRR1489394 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1418085 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1340221 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1473058 4 0.6504 0.68927 0.000 0.196 0.000 0.448 0.356
#> SRR1405165 3 0.0404 0.76277 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1433004 1 0.6396 0.20540 0.488 0.000 0.000 0.324 0.188
#> SRR1471477 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 4 0.8310 0.55026 0.168 0.184 0.000 0.360 0.288
#> SRR1455038 5 0.6961 0.59478 0.120 0.000 0.080 0.236 0.564
#> SRR1375248 2 0.0162 0.92541 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1348378 2 0.2522 0.81572 0.000 0.880 0.108 0.012 0.000
#> SRR1413541 1 0.1341 0.77530 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1392943 5 0.6504 0.38110 0.356 0.000 0.000 0.196 0.448
#> SRR1475192 3 0.2179 0.76230 0.000 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 5 0.4585 0.59935 0.020 0.000 0.000 0.352 0.628
#> SRR1347060 3 0.1671 0.76657 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1414139 2 0.3452 0.69305 0.000 0.756 0.244 0.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0609 0.79918 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1413436 5 0.4150 0.50717 0.388 0.000 0.000 0.000 0.612
#> SRR1311266 5 0.4219 0.46536 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584
#> SRR1343302 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1373746 1 0.0609 0.79918 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1429678 1 0.0609 0.79918 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1469413 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1345609 1 0.0609 0.79918 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1380208 5 0.5725 0.52166 0.224 0.156 0.000 0.000 0.620
#> SRR1322840 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1399797 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1416654 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0404 0.76267 0.000 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0290 0.80248 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1365291 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1367920 5 0.3561 -0.30919 0.000 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR1366648 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.92857 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 5 0.5469 0.57665 0.028 0.000 0.028 0.356 0.588
#> SRR1363968 1 0.1792 0.72693 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR814387 1 0.0000 0.80336 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.4305 -0.27489 0.512 0.000 0.000 0.000 0.488
#> SRR1386689 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1395575 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453811 3 0.4196 0.70592 0.000 0.000 0.640 0.356 0.004
#> SRR1441159 1 0.2230 0.71760 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1403154 4 0.4045 0.88498 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1468722 3 0.0000 0.76925 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.6462 0.44623 0.000 0.000 0.456 0.356 0.188
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 1 0.6426 0.02656 0.428 0.000 0.024 0.000 0.220 0.328
#> SRR1331708 5 0.1910 0.75733 0.108 0.000 0.000 0.000 0.892 0.000
#> SRR1464258 6 0.4389 0.66950 0.188 0.000 0.100 0.000 0.000 0.712
#> SRR1454201 5 0.3530 0.74684 0.152 0.000 0.000 0.000 0.792 0.056
#> SRR661589 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456229 6 0.4909 0.65443 0.032 0.000 0.092 0.000 0.172 0.704
#> SRR1315165 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.0146 0.90029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1417809 4 0.4629 0.20035 0.436 0.000 0.000 0.524 0.040 0.000
#> SRR1094457 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095575 6 0.5115 0.27356 0.012 0.000 0.088 0.000 0.276 0.624
#> SRR1315931 1 0.2527 0.72270 0.832 0.000 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1430066 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 6 0.3634 0.70902 0.000 0.000 0.356 0.000 0.000 0.644
#> SRR818002 2 0.4240 0.75296 0.000 0.736 0.000 0.000 0.140 0.124
#> SRR1344143 5 0.5304 0.30571 0.000 0.216 0.000 0.008 0.624 0.152
#> SRR1486845 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362866 5 0.2593 0.75305 0.148 0.000 0.000 0.000 0.844 0.008
#> SRR1490740 1 0.0858 0.88623 0.968 0.000 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1446627 2 0.0260 0.86411 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1456138 2 0.3918 0.77412 0.000 0.768 0.000 0.000 0.108 0.124
#> SRR1416248 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 4 0.1297 0.87407 0.000 0.000 0.000 0.948 0.040 0.012
#> SRR1311018 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.8472 0.29776 0.176 0.376 0.000 0.188 0.136 0.124
#> SRR1429846 6 0.3592 0.72031 0.000 0.000 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR613550 6 0.3607 0.71704 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1348402 1 0.0363 0.89696 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1345146 5 0.2340 0.75215 0.148 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1324025 6 0.3592 0.72031 0.000 0.000 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR1318879 5 0.5162 0.57171 0.000 0.000 0.212 0.000 0.620 0.168
#> SRR820755 6 0.3126 0.72035 0.000 0.000 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR1485830 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR599313 6 0.3531 0.45881 0.000 0.000 0.000 0.000 0.328 0.672
#> SRR612263 6 0.3607 0.41840 0.000 0.000 0.000 0.000 0.348 0.652
#> SRR1415398 3 0.0458 0.86497 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1326205 4 0.0937 0.87849 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1421327 5 0.4488 0.50642 0.052 0.000 0.000 0.280 0.664 0.004
#> SRR1083311 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.2854 0.71917 0.000 0.000 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1079522 5 0.0713 0.71665 0.000 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1452935 5 0.4189 0.28734 0.000 0.000 0.020 0.000 0.604 0.376
#> SRR1379495 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 6 0.3592 0.72031 0.000 0.000 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR615778 5 0.2378 0.67878 0.000 0.000 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1447564 1 0.2912 0.64823 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000
#> SRR1455195 5 0.2821 0.75132 0.152 0.000 0.000 0.000 0.832 0.016
#> SRR655182 1 0.1913 0.83153 0.908 0.000 0.000 0.000 0.080 0.012
#> SRR1335140 5 0.6696 0.01011 0.000 0.292 0.000 0.100 0.484 0.124
#> SRR1433555 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.5949 -0.22356 0.000 0.416 0.220 0.000 0.000 0.364
#> SRR1388354 1 0.0146 0.90029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.4044 0.53652 0.000 0.256 0.704 0.000 0.000 0.040
#> SRR1479955 2 0.3961 0.77172 0.000 0.764 0.000 0.000 0.112 0.124
#> SRR809853 1 0.4763 0.13839 0.536 0.000 0.000 0.000 0.412 0.052
#> SRR661313 6 0.3547 0.72644 0.000 0.000 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR1499935 4 0.0937 0.87849 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1447303 6 0.3547 0.72601 0.000 0.000 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR1429408 2 0.3898 0.46569 0.000 0.652 0.000 0.336 0.012 0.000
#> SRR1433950 1 0.0858 0.88623 0.968 0.000 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1362081 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 5 0.3868 0.20262 0.000 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1435229 5 0.2340 0.75215 0.148 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1085996 5 0.3278 0.74702 0.152 0.000 0.000 0.000 0.808 0.040
#> SRR1414229 5 0.2631 0.65891 0.000 0.000 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1400974 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613927 6 0.3531 0.72754 0.000 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1457854 1 0.0146 0.90029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1473714 6 0.5179 0.41199 0.348 0.000 0.088 0.000 0.004 0.560
#> SRR813776 6 0.3499 0.72955 0.000 0.000 0.320 0.000 0.000 0.680
#> SRR808196 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101085 4 0.0937 0.87849 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR614395 6 0.3482 0.54443 0.316 0.000 0.000 0.000 0.000 0.684
#> SRR1478251 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 6 0.3592 0.71832 0.000 0.000 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR1420109 6 0.3914 0.69987 0.000 0.000 0.128 0.000 0.104 0.768
#> SRR1330920 6 0.4048 0.67544 0.048 0.000 0.080 0.000 0.076 0.796
#> SRR1419539 3 0.3376 0.71303 0.000 0.092 0.816 0.000 0.000 0.092
#> SRR1359447 3 0.3965 0.37696 0.000 0.388 0.604 0.000 0.000 0.008
#> SRR1347259 4 0.0937 0.87849 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR613915 3 0.3727 -0.00669 0.000 0.000 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1384395 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821715 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0508 0.89686 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR608150 5 0.2988 0.75228 0.152 0.000 0.000 0.000 0.824 0.024
#> SRR1096383 1 0.2738 0.76177 0.820 0.000 0.000 0.000 0.004 0.176
#> SRR1341480 4 0.1082 0.87729 0.000 0.000 0.000 0.956 0.040 0.004
#> SRR1341344 5 0.2933 0.72494 0.200 0.000 0.000 0.000 0.796 0.004
#> SRR1326270 3 0.0146 0.87283 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1498838 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 6 0.3634 0.70902 0.000 0.000 0.356 0.000 0.000 0.644
#> SRR808566 4 0.3198 0.59778 0.000 0.260 0.000 0.740 0.000 0.000
#> SRR1430270 4 0.3101 0.64003 0.244 0.000 0.000 0.756 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.3371 0.33854 0.000 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR661267 6 0.3984 0.32431 0.008 0.000 0.396 0.000 0.000 0.596
#> SRR810665 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 5 0.4716 0.70804 0.136 0.000 0.000 0.000 0.680 0.184
#> SRR1420067 1 0.4141 0.04081 0.556 0.000 0.000 0.000 0.432 0.012
#> SRR1473632 1 0.3027 0.73762 0.824 0.000 0.000 0.000 0.148 0.028
#> SRR812536 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.5973 0.25864 0.028 0.516 0.000 0.000 0.328 0.128
#> SRR1446375 6 0.3134 0.52878 0.208 0.000 0.004 0.000 0.004 0.784
#> SRR1465230 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614119 1 0.1765 0.83884 0.904 0.000 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1356101 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.1908 0.83879 0.900 0.000 0.000 0.000 0.004 0.096
#> SRR1392676 2 0.3792 0.78037 0.000 0.780 0.000 0.000 0.108 0.112
#> SRR665538 1 0.2597 0.76175 0.824 0.000 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR660510 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658953 5 0.3266 0.56056 0.000 0.000 0.000 0.000 0.728 0.272
#> SRR2166459 1 0.0508 0.89686 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1070713 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.1556 0.83223 0.000 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1488610 5 0.2340 0.75215 0.148 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1330588 6 0.3592 0.72031 0.000 0.000 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR1316367 5 0.3247 0.74739 0.156 0.000 0.000 0.000 0.808 0.036
#> SRR1433926 1 0.2664 0.71463 0.816 0.000 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1091302 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818263 6 0.4808 0.55898 0.160 0.000 0.004 0.000 0.152 0.684
#> SRR1404909 4 0.5204 0.50773 0.000 0.000 0.000 0.584 0.292 0.124
#> SRR663076 1 0.0146 0.90029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654862 6 0.3420 0.53535 0.000 0.000 0.012 0.000 0.240 0.748
#> SRR1407112 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332969 6 0.3607 0.71693 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1353199 6 0.3592 0.72031 0.000 0.000 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR1378885 6 0.3578 0.72251 0.000 0.000 0.340 0.000 0.000 0.660
#> SRR665357 3 0.3244 0.55464 0.000 0.268 0.732 0.000 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347819 3 0.3868 -0.42035 0.000 0.000 0.508 0.000 0.000 0.492
#> SRR1480813 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.4273 0.70485 0.000 0.000 0.000 0.732 0.148 0.120
#> SRR1431781 4 0.0146 0.88494 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.3652 0.62547 0.004 0.000 0.000 0.000 0.672 0.324
#> SRR1417632 4 0.5319 0.37927 0.000 0.000 0.000 0.520 0.368 0.112
#> SRR1350153 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 5 0.4333 0.20884 0.000 0.000 0.020 0.000 0.512 0.468
#> SRR1326579 5 0.2730 0.75004 0.152 0.000 0.000 0.000 0.836 0.012
#> SRR1349363 4 0.7282 -0.07881 0.000 0.344 0.000 0.348 0.184 0.124
#> SRR1096712 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0146 0.87290 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1083752 2 0.6221 0.57965 0.000 0.588 0.000 0.192 0.108 0.112
#> SRR1377599 5 0.4931 0.39627 0.000 0.000 0.000 0.200 0.652 0.148
#> SRR1488449 3 0.1814 0.76972 0.000 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1318354 6 0.3269 0.69878 0.000 0.000 0.184 0.000 0.024 0.792
#> SRR1359062 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.3869 0.13997 0.000 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR663783 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319204 2 0.6352 0.13377 0.000 0.480 0.036 0.000 0.312 0.172
#> SRR1369070 2 0.3918 0.77412 0.000 0.768 0.000 0.000 0.108 0.124
#> SRR615659 1 0.0146 0.90029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.3847 0.20446 0.000 0.456 0.544 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498595 4 0.4313 0.70117 0.000 0.000 0.000 0.728 0.148 0.124
#> SRR1377423 6 0.3620 0.71316 0.000 0.000 0.352 0.000 0.000 0.648
#> SRR1312310 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0458 0.89554 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1338426 3 0.3754 0.66241 0.000 0.000 0.776 0.000 0.072 0.152
#> SRR1353309 3 0.1204 0.83176 0.000 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR658941 5 0.5781 0.20524 0.000 0.000 0.396 0.000 0.428 0.176
#> SRR1101643 1 0.0146 0.90029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1401468 5 0.6952 0.42378 0.308 0.000 0.000 0.088 0.428 0.176
#> SRR1368874 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363858 6 0.6077 0.59134 0.168 0.000 0.068 0.008 0.136 0.620
#> SRR819820 3 0.2778 0.71380 0.000 0.000 0.824 0.000 0.008 0.168
#> SRR1337342 5 0.2937 0.74833 0.096 0.000 0.000 0.000 0.848 0.056
#> SRR655206 2 0.5314 0.50130 0.000 0.612 0.220 0.004 0.000 0.164
#> SRR1387013 2 0.5234 0.55540 0.000 0.576 0.000 0.000 0.300 0.124
#> SRR1317410 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608198 5 0.2378 0.75063 0.152 0.000 0.000 0.000 0.848 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.3918 0.77412 0.000 0.768 0.000 0.000 0.108 0.124
#> SRR1381288 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0458 0.88395 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663197 6 0.3592 0.72031 0.000 0.000 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR1394836 2 0.1753 0.81000 0.000 0.912 0.084 0.000 0.000 0.004
#> SRR661699 3 0.2527 0.76274 0.000 0.000 0.868 0.000 0.024 0.108
#> SRR813680 3 0.3620 0.49402 0.000 0.000 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1410678 1 0.0146 0.90029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.4062 0.10240 0.552 0.000 0.000 0.000 0.008 0.440
#> SRR1311486 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.5527 0.34406 0.000 0.484 0.000 0.000 0.380 0.136
#> SRR1433410 5 0.2482 0.75312 0.148 0.000 0.000 0.000 0.848 0.004
#> SRR661167 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.4045 0.52819 0.000 0.000 0.696 0.000 0.268 0.036
#> SRR660462 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.4682 0.59613 0.000 0.004 0.000 0.696 0.124 0.176
#> SRR657949 6 0.4156 0.63635 0.000 0.000 0.080 0.000 0.188 0.732
#> SRR1308882 4 0.0937 0.87849 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR655768 1 0.0146 0.90029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1485870 5 0.2631 0.64215 0.000 0.000 0.000 0.180 0.820 0.000
#> SRR1444138 6 0.4308 -0.00377 0.468 0.000 0.004 0.000 0.012 0.516
#> SRR1417342 1 0.0146 0.90029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1470193 4 0.1082 0.87786 0.000 0.004 0.000 0.956 0.040 0.000
#> SRR1091380 3 0.3841 0.64752 0.000 0.000 0.764 0.000 0.068 0.168
#> SRR1099096 1 0.0363 0.89696 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1313583 1 0.3446 0.53969 0.692 0.000 0.000 0.308 0.000 0.000
#> SRR1467102 2 0.3409 0.54140 0.000 0.700 0.300 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.0937 0.87849 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR818821 3 0.0632 0.86315 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR809963 6 0.3619 0.54903 0.316 0.000 0.004 0.000 0.000 0.680
#> SRR1072247 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.0937 0.87849 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1445259 5 0.3971 0.17167 0.000 0.000 0.004 0.000 0.548 0.448
#> SRR1408393 3 0.4747 0.47709 0.000 0.000 0.632 0.000 0.080 0.288
#> SRR1361522 1 0.2805 0.71432 0.812 0.000 0.000 0.000 0.004 0.184
#> SRR1368597 1 0.3993 0.23645 0.592 0.000 0.000 0.000 0.400 0.008
#> SRR1309680 2 0.3918 0.77412 0.000 0.768 0.000 0.000 0.108 0.124
#> SRR1310542 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0937 0.87849 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1406437 2 0.6616 0.17823 0.004 0.448 0.000 0.336 0.044 0.168
#> SRR1354931 3 0.1814 0.76636 0.000 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1391856 2 0.0146 0.86430 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1446738 2 0.4442 0.58380 0.000 0.712 0.000 0.000 0.120 0.168
#> SRR1309032 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0146 0.87314 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1375329 5 0.0547 0.72267 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1387921 1 0.0146 0.90029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.3918 0.77412 0.000 0.768 0.000 0.000 0.108 0.124
#> SRR1360695 1 0.0363 0.89696 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR812943 1 0.4574 0.10914 0.524 0.000 0.000 0.000 0.440 0.036
#> SRR1400910 5 0.1007 0.71805 0.000 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1444203 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816177 2 0.2499 0.82717 0.000 0.880 0.000 0.000 0.048 0.072
#> SRR658754 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0790 0.88052 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1397366 6 0.3592 0.72031 0.000 0.000 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR1446028 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337606 5 0.1910 0.70375 0.000 0.000 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR659109 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337192 5 0.2378 0.75063 0.152 0.000 0.000 0.000 0.848 0.000
#> SRR656946 1 0.0363 0.89685 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1476102 5 0.3843 0.26701 0.452 0.000 0.000 0.000 0.548 0.000
#> SRR1476447 1 0.0146 0.90029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1342067 4 0.0937 0.87849 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0937 0.88470 0.960 0.000 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR614419 5 0.3315 0.74469 0.156 0.000 0.000 0.000 0.804 0.040
#> SRR1322936 5 0.2340 0.75215 0.148 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1349121 1 0.1908 0.83879 0.900 0.000 0.000 0.000 0.004 0.096
#> SRR1430549 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612935 6 0.6055 0.41553 0.000 0.248 0.236 0.000 0.012 0.504
#> SRR661481 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.2454 0.77759 0.000 0.000 0.000 0.840 0.160 0.000
#> SRR1452164 1 0.0508 0.89686 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1070503 6 0.3531 0.72754 0.000 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1499894 6 0.3695 0.61464 0.000 0.000 0.376 0.000 0.000 0.624
#> SRR1082883 5 0.4798 0.69475 0.156 0.000 0.000 0.000 0.672 0.172
#> SRR1468271 1 0.0363 0.89696 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1332443 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.2558 0.73245 0.840 0.000 0.000 0.000 0.004 0.156
#> SRR1328620 6 0.3841 0.01159 0.000 0.000 0.004 0.000 0.380 0.616
#> SRR1396294 4 0.4725 0.67042 0.008 0.020 0.080 0.728 0.000 0.164
#> SRR1419917 1 0.2118 0.81559 0.888 0.000 0.000 0.000 0.008 0.104
#> SRR662114 6 0.3982 0.71537 0.000 0.000 0.200 0.000 0.060 0.740
#> SRR1489199 6 0.2178 0.55016 0.000 0.000 0.000 0.000 0.132 0.868
#> SRR813584 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069638 6 0.4294 0.72946 0.000 0.000 0.280 0.000 0.048 0.672
#> SRR614864 6 0.3607 0.71721 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1433392 6 0.3446 0.73059 0.000 0.000 0.308 0.000 0.000 0.692
#> SRR1377777 2 0.3918 0.77412 0.000 0.768 0.000 0.000 0.108 0.124
#> SRR2167710 1 0.2038 0.84738 0.920 0.000 0.020 0.000 0.028 0.032
#> SRR1401252 4 0.3403 0.70004 0.000 0.000 0.000 0.768 0.212 0.020
#> SRR1309963 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0146 0.90029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 5 0.6832 0.47221 0.224 0.000 0.176 0.000 0.496 0.104
#> SRR1380393 1 0.0146 0.90029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 4 0.3281 0.67441 0.200 0.000 0.000 0.784 0.012 0.004
#> SRR1337010 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 5 0.4282 0.58800 0.304 0.000 0.000 0.000 0.656 0.040
#> SRR1486538 4 0.0937 0.87849 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377696 5 0.5357 0.10403 0.000 0.000 0.000 0.340 0.536 0.124
#> SRR1465459 6 0.3531 0.72754 0.000 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1080270 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 6 0.3309 0.72499 0.000 0.000 0.280 0.000 0.000 0.720
#> SRR1093148 5 0.5250 0.64866 0.000 0.120 0.028 0.000 0.664 0.188
#> SRR1467080 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.4146 0.67231 0.000 0.020 0.032 0.736 0.000 0.212
#> SRR1379198 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613342 6 0.3592 0.72031 0.000 0.000 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR1452246 2 0.3873 0.77631 0.000 0.772 0.000 0.000 0.104 0.124
#> SRR1338836 2 0.3918 0.77412 0.000 0.768 0.000 0.000 0.108 0.124
#> SRR1369129 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396616 6 0.3659 0.69614 0.000 0.000 0.364 0.000 0.000 0.636
#> SRR813824 3 0.3866 -0.39659 0.000 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR1082376 6 0.4418 0.69860 0.128 0.000 0.140 0.000 0.004 0.728
#> SRR1500891 4 0.2333 0.83491 0.000 0.000 0.000 0.884 0.092 0.024
#> SRR807543 6 0.3464 0.72985 0.000 0.000 0.312 0.000 0.000 0.688
#> SRR1091572 6 0.3748 0.63602 0.004 0.000 0.064 0.000 0.148 0.784
#> SRR1346689 4 0.0937 0.87849 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1332424 5 0.2378 0.75201 0.152 0.000 0.000 0.000 0.848 0.000
#> SRR663729 1 0.4089 0.56258 0.696 0.000 0.000 0.264 0.040 0.000
#> SRR1097013 1 0.0692 0.89371 0.976 0.000 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR613675 5 0.2340 0.75215 0.148 0.000 0.000 0.000 0.852 0.000
#> SRR1485357 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0260 0.89857 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1437622 2 0.7066 0.26833 0.000 0.428 0.000 0.300 0.148 0.124
#> SRR1355172 3 0.1958 0.78446 0.004 0.000 0.896 0.000 0.000 0.100
#> SRR655531 5 0.5009 0.54668 0.120 0.000 0.000 0.000 0.624 0.256
#> SRR1338147 6 0.3592 0.72031 0.000 0.000 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR1413329 5 0.3699 0.61403 0.004 0.000 0.000 0.000 0.660 0.336
#> SRR1485931 2 0.3918 0.77412 0.000 0.768 0.000 0.000 0.108 0.124
#> SRR1420873 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 4 0.0937 0.87849 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1452033 1 0.1814 0.83591 0.900 0.000 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1467316 2 0.5103 0.60539 0.000 0.608 0.000 0.000 0.268 0.124
#> SRR809018 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.3464 0.79403 0.000 0.808 0.000 0.000 0.108 0.084
#> SRR663440 6 0.3531 0.72754 0.000 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1471755 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808019 5 0.5774 0.32771 0.384 0.000 0.000 0.000 0.440 0.176
#> SRR1479133 3 0.0363 0.86738 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR615069 5 0.4053 0.69347 0.000 0.104 0.004 0.000 0.764 0.128
#> SRR1456185 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350069 4 0.4280 0.65499 0.168 0.000 0.000 0.736 0.004 0.092
#> SRR816316 6 0.3351 0.55767 0.288 0.000 0.000 0.000 0.000 0.712
#> SRR664795 3 0.5377 0.42531 0.156 0.000 0.572 0.000 0.000 0.272
#> SRR1490721 5 0.2006 0.75682 0.104 0.000 0.000 0.004 0.892 0.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 5 0.3023 0.66759 0.000 0.000 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1085285 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099072 6 0.3547 0.72601 0.000 0.000 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR1317985 1 0.0146 0.90029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 6 0.3714 0.71977 0.000 0.000 0.340 0.000 0.004 0.656
#> SRR1405525 5 0.3065 0.74917 0.152 0.000 0.000 0.000 0.820 0.028
#> SRR1370329 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819610 2 0.6764 0.47783 0.000 0.516 0.000 0.212 0.148 0.124
#> SRR2157314 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.3657 0.78636 0.000 0.792 0.000 0.000 0.108 0.100
#> SRR809987 4 0.3717 0.35289 0.384 0.000 0.000 0.616 0.000 0.000
#> SRR613639 6 0.2527 0.68955 0.000 0.000 0.168 0.000 0.000 0.832
#> SRR1402285 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077038 6 0.3103 0.59066 0.208 0.000 0.008 0.000 0.000 0.784
#> SRR1405660 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 6 0.4549 0.61328 0.000 0.000 0.088 0.000 0.232 0.680
#> SRR1394734 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.1010 0.88639 0.960 0.000 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1365894 5 0.2519 0.71883 0.000 0.044 0.000 0.048 0.892 0.016
#> SRR1073581 1 0.2871 0.75017 0.804 0.000 0.000 0.000 0.004 0.192
#> SRR659804 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473529 4 0.6623 0.21535 0.000 0.076 0.000 0.420 0.380 0.124
#> SRR660764 3 0.3618 0.57111 0.000 0.040 0.768 0.000 0.000 0.192
#> SRR820448 6 0.3409 0.55411 0.300 0.000 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1328845 4 0.3472 0.74104 0.100 0.000 0.000 0.808 0.000 0.092
#> SRR1336415 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0937 0.87849 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1459190 3 0.2100 0.78241 0.000 0.000 0.884 0.000 0.004 0.112
#> SRR1346773 1 0.3727 0.23493 0.612 0.000 0.000 0.000 0.388 0.000
#> SRR1499521 1 0.1765 0.83884 0.904 0.000 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1440898 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 6 0.3547 0.72601 0.000 0.000 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR1081209 2 0.3918 0.77412 0.000 0.768 0.000 0.000 0.108 0.124
#> SRR1400202 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.4198 0.64716 0.060 0.000 0.000 0.708 0.232 0.000
#> SRR1309248 5 0.4634 0.43284 0.000 0.000 0.000 0.188 0.688 0.124
#> SRR809161 6 0.3592 0.72031 0.000 0.000 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR1316320 5 0.2234 0.65726 0.000 0.000 0.000 0.004 0.872 0.124
#> SRR1432629 2 0.3918 0.77412 0.000 0.768 0.000 0.000 0.108 0.124
#> SRR1498931 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.4039 0.06326 0.568 0.000 0.000 0.000 0.424 0.008
#> SRR1309160 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.0146 0.90029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1078489 5 0.3747 0.28468 0.000 0.000 0.000 0.000 0.604 0.396
#> SRR1332648 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660614 2 0.4569 0.58816 0.000 0.700 0.000 0.000 0.144 0.156
#> SRR1470420 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0146 0.90029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 6 0.3607 0.50082 0.348 0.000 0.000 0.000 0.000 0.652
#> SRR615946 6 0.3620 0.71332 0.000 0.000 0.352 0.000 0.000 0.648
#> SRR1446481 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 5 0.2907 0.75121 0.152 0.000 0.000 0.000 0.828 0.020
#> SRR660224 2 0.0146 0.86519 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR665586 6 0.5571 0.35587 0.228 0.000 0.000 0.000 0.220 0.552
#> SRR1347166 5 0.2378 0.67878 0.000 0.000 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1485722 5 0.4825 0.69397 0.152 0.000 0.000 0.000 0.668 0.180
#> SRR1415316 5 0.3279 0.73221 0.176 0.000 0.000 0.000 0.796 0.028
#> SRR613390 6 0.3991 0.13146 0.472 0.000 0.000 0.000 0.004 0.524
#> SRR661108 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2170173 6 0.3078 0.67138 0.016 0.000 0.104 0.000 0.032 0.848
#> SRR817329 6 0.4701 0.54287 0.128 0.000 0.000 0.000 0.192 0.680
#> SRR1401990 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467745 2 0.4452 0.47220 0.000 0.636 0.000 0.316 0.000 0.048
#> SRR1471795 2 0.1531 0.84323 0.000 0.928 0.000 0.000 0.068 0.004
#> SRR1415637 2 0.0935 0.85566 0.000 0.964 0.000 0.000 0.032 0.004
#> SRR813137 6 0.3741 0.55147 0.320 0.000 0.008 0.000 0.000 0.672
#> SRR1314873 1 0.2384 0.82687 0.884 0.000 0.000 0.032 0.084 0.000
#> SRR1401211 1 0.0146 0.89986 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1419692 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818797 6 0.3531 0.72754 0.000 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR2164608 6 0.6105 -0.16345 0.000 0.000 0.308 0.000 0.312 0.380
#> SRR1455586 2 0.0146 0.86395 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR819459 6 0.3620 0.71332 0.000 0.000 0.352 0.000 0.000 0.648
#> SRR1488939 2 0.5313 0.53441 0.000 0.552 0.000 0.000 0.324 0.124
#> SRR1433232 2 0.3918 0.77412 0.000 0.768 0.000 0.000 0.108 0.124
#> SRR1385501 6 0.4526 0.68015 0.000 0.000 0.132 0.000 0.164 0.704
#> SRR1361652 5 0.0713 0.71665 0.000 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1437119 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 5 0.2378 0.67878 0.000 0.000 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1310584 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 6 0.3515 0.46419 0.000 0.000 0.000 0.000 0.324 0.676
#> SRR1486762 3 0.2912 0.54963 0.000 0.000 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1480854 4 0.3383 0.63162 0.000 0.000 0.000 0.728 0.268 0.004
#> SRR1489394 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0260 0.88537 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1473058 4 0.4125 0.65588 0.000 0.184 0.000 0.736 0.000 0.080
#> SRR1405165 3 0.0865 0.84764 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1433004 6 0.4718 0.53658 0.124 0.000 0.000 0.000 0.200 0.676
#> SRR1471477 1 0.1908 0.83879 0.900 0.000 0.000 0.000 0.004 0.096
#> SRR1098567 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 4 0.6377 0.47412 0.196 0.080 0.000 0.560 0.000 0.164
#> SRR1455038 6 0.4452 0.40951 0.048 0.000 0.000 0.000 0.316 0.636
#> SRR1375248 2 0.0146 0.86395 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 6 0.3547 0.72601 0.000 0.000 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR1348378 2 0.1753 0.80853 0.000 0.912 0.084 0.004 0.000 0.000
#> SRR1413541 1 0.3481 0.67868 0.776 0.000 0.000 0.000 0.192 0.032
#> SRR1392943 5 0.5194 0.58030 0.140 0.000 0.000 0.232 0.624 0.004
#> SRR1475192 3 0.2631 0.62857 0.000 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1432085 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 5 0.2340 0.68093 0.000 0.000 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1347060 3 0.1957 0.74821 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1414139 2 0.3351 0.56203 0.000 0.712 0.288 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0146 0.90029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1413436 5 0.4108 0.71990 0.164 0.000 0.000 0.000 0.744 0.092
#> SRR1311266 5 0.4892 0.68542 0.164 0.000 0.000 0.000 0.660 0.176
#> SRR1343302 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0146 0.90029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.86616 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 6 0.3175 0.72915 0.000 0.000 0.256 0.000 0.000 0.744
#> SRR1345609 1 0.0146 0.90029 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1380208 5 0.0146 0.71881 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1322840 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399797 6 0.3607 0.71721 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652
#> SRR1416654 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 6 0.3547 0.72601 0.000 0.000 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR1367920 5 0.5084 0.31363 0.000 0.000 0.000 0.264 0.612 0.124
#> SRR1366648 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.3657 0.78636 0.000 0.792 0.000 0.000 0.108 0.100
#> SRR1082173 5 0.3868 0.35328 0.000 0.000 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1363968 1 0.2020 0.83644 0.896 0.000 0.000 0.000 0.008 0.096
#> SRR814387 1 0.0000 0.90065 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657599 5 0.5794 0.32239 0.384 0.000 0.000 0.000 0.436 0.180
#> SRR1386689 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0146 0.87300 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1453811 6 0.3531 0.72754 0.000 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1441159 1 0.3468 0.54663 0.712 0.000 0.000 0.000 0.284 0.004
#> SRR1403154 4 0.0000 0.88651 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.87562 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 6 0.4407 0.71936 0.000 0.000 0.232 0.000 0.076 0.692
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.994 0.998 0.4681 0.533 0.533
#> 3 3 0.766 0.916 0.934 0.3709 0.805 0.635
#> 4 4 0.762 0.865 0.903 0.1347 0.872 0.653
#> 5 5 0.749 0.759 0.863 0.0785 0.911 0.681
#> 6 6 0.725 0.658 0.779 0.0296 0.952 0.783
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1331708 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1464258 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR661589 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1315165 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1417809 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1094457 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1095575 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1315931 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1430066 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1431037 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1395554 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1344143 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1486845 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1383907 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1429846 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR613550 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1324025 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1318879 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR820755 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1485830 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR599313 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1415398 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1326205 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1421327 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1083311 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1499303 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1079522 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1452935 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR661361 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1433555 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1308650 1 0.9460 0.428 0.636 0.364
#> SRR1388354 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1317446 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1413602 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR661313 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1499935 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1447303 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1429408 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1433950 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1409854 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1435229 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1414229 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1400974 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR613927 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR813776 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR808196 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1101085 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR614395 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1478251 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR665310 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1420109 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1330920 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1419539 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1359447 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1347259 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR613915 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1384395 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR821715 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1341480 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1326270 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1498838 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1416313 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR808566 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1430270 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1367825 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR613533 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR661267 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1407250 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1420067 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR812536 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1407671 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1446375 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1465230 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR660510 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1445655 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR658953 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1485312 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1317631 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1330588 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1091302 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR818263 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1404909 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1442422 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1407112 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1332969 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1353199 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1378885 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR665357 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1501020 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1347819 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1472576 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1431781 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1452270 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1417632 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1458113 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1326579 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1096712 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1090407 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1377599 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1488449 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1318354 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1359062 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1398924 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR663783 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1319204 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR1369070 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1498595 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1377423 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1338426 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1353309 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR658941 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1324085 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1363858 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR819820 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1337342 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR655206 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1387013 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1415379 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR663197 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1394836 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR661699 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR813680 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1378109 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1382851 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1433410 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR661167 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1432518 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR660462 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1374608 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR657949 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1308882 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1485870 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1444138 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1470193 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1091380 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.9775 0.299 0.588 0.412
#> SRR1467102 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1485416 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR818821 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR809963 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1353710 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1445259 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1408393 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1310542 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1333485 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1406437 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1354931 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1391856 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1446738 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR815869 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR613150 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1375329 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1387921 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1400910 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1444203 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR658754 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1429603 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1397366 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1337606 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR659109 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1342067 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1385389 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR612935 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1393596 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1070503 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1499894 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1082883 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1328620 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1396294 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1419917 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR662114 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1489199 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR813584 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1069638 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR614864 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR2167710 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1401252 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1309963 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1486889 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1356468 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1486538 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1340486 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1377696 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1465459 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1080270 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1312501 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1093148 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1467080 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR816475 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1379198 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR613342 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1369129 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1396616 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR813824 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1500891 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR807543 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1346689 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR663729 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1485357 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR655816 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1355172 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1338147 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1413329 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1485931 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1333308 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR809018 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR663440 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR808019 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1479133 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR615069 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1456185 2 0.2423 0.957 0.040 0.960
#> SRR1350069 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR664795 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1490721 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1085285 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1099072 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1420276 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1351347 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR809987 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR613639 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1402285 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1077038 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1405660 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1394734 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1073581 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1473529 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR660764 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1328845 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1336415 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1379065 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1459190 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1346773 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1347459 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1333395 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1309248 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR809161 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1316320 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1432629 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1416578 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1405547 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1470534 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1309160 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR663489 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.0376 0.993 0.996 0.004
#> SRR1078489 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1332648 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR660614 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR615946 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR661108 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR817329 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1401990 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1467745 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR813137 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR818797 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR2164608 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1455586 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR819459 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1385501 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1361652 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1478547 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1430910 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1486762 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1480854 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1489394 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1418085 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1340221 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1473058 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1405165 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1098712 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1455038 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1403005 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1392943 2 0.2043 0.966 0.032 0.968
#> SRR1475192 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1452468 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1347060 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.8763 0.578 0.296 0.704
#> SRR1447962 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1343302 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1405331 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1322840 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1399797 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1416654 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1315081 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1369196 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1365291 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1367920 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1366648 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1082173 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1363968 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1386689 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1395575 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1453811 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1403154 2 0.0000 0.998 0.000 1.000
#> SRR1468722 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
#> SRR1310275 1 0.0000 0.997 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331708 1 0.3610 0.8500 0.888 0.096 0.016
#> SRR1464258 3 0.4750 0.8433 0.216 0.000 0.784
#> SRR1454201 1 0.1031 0.9478 0.976 0.000 0.024
#> SRR661589 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1456229 3 0.5760 0.6921 0.328 0.000 0.672
#> SRR1315165 2 0.2796 0.9426 0.000 0.908 0.092
#> SRR1488960 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 2 0.2448 0.9493 0.000 0.924 0.076
#> SRR1094457 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1095575 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1315931 1 0.0747 0.9499 0.984 0.000 0.016
#> SRR1430066 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1431037 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1395554 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR818002 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1486845 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1362866 1 0.0747 0.9502 0.984 0.000 0.016
#> SRR1490740 1 0.1163 0.9415 0.972 0.000 0.028
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1429846 3 0.3038 0.9362 0.104 0.000 0.896
#> SRR613550 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1348402 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1324025 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1318879 1 0.1163 0.9462 0.972 0.000 0.028
#> SRR820755 3 0.3192 0.9321 0.112 0.000 0.888
#> SRR1485830 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR599313 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR612263 1 0.1964 0.9243 0.944 0.000 0.056
#> SRR1415398 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1326205 2 0.2796 0.9426 0.000 0.908 0.092
#> SRR1421327 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1083311 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1499303 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1079522 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1452935 1 0.3412 0.8479 0.876 0.000 0.124
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR661361 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR615778 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1447564 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0424 0.9507 0.992 0.000 0.008
#> SRR655182 1 0.0592 0.9507 0.988 0.000 0.012
#> SRR1335140 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1433555 3 0.4002 0.8946 0.160 0.000 0.840
#> SRR1308650 2 0.6704 0.3534 0.376 0.608 0.016
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1413602 1 0.6309 -0.1732 0.504 0.000 0.496
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR661313 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1499935 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1447303 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1429408 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433950 1 0.0424 0.9507 0.992 0.000 0.008
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409854 3 0.4974 0.8209 0.236 0.000 0.764
#> SRR1435229 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1085996 1 0.1753 0.9313 0.952 0.000 0.048
#> SRR1414229 1 0.1289 0.9438 0.968 0.000 0.032
#> SRR1400974 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1399971 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.3192 0.9321 0.112 0.000 0.888
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0424 0.9507 0.992 0.000 0.008
#> SRR813776 3 0.3192 0.9321 0.112 0.000 0.888
#> SRR808196 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1101085 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR614395 3 0.5098 0.8062 0.248 0.000 0.752
#> SRR1478251 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1420109 1 0.2878 0.8855 0.904 0.000 0.096
#> SRR1330920 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1419539 2 0.1753 0.9593 0.000 0.952 0.048
#> SRR1359447 1 0.5098 0.6415 0.752 0.000 0.248
#> SRR1347259 2 0.0747 0.9703 0.000 0.984 0.016
#> SRR613915 3 0.3192 0.9321 0.112 0.000 0.888
#> SRR1384395 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR821715 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1478228 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.1753 0.9293 0.952 0.000 0.048
#> SRR608150 1 0.1491 0.9430 0.968 0.016 0.016
#> SRR1096383 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341480 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1341344 1 0.0592 0.9507 0.988 0.000 0.012
#> SRR1326270 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1498838 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1416313 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR808566 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430270 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1367825 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR613533 3 0.5882 0.6500 0.348 0.000 0.652
#> SRR661267 1 0.5926 0.3374 0.644 0.000 0.356
#> SRR810665 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407250 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1420067 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR812536 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1446375 1 0.1643 0.9351 0.956 0.000 0.044
#> SRR1465230 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR614119 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1445655 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR658953 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR2166459 1 0.2625 0.8937 0.916 0.000 0.084
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1317631 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1488610 1 0.0747 0.9502 0.984 0.000 0.016
#> SRR1330588 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1316367 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1433926 1 0.1753 0.9293 0.952 0.000 0.048
#> SRR1091302 2 0.1643 0.9614 0.000 0.956 0.044
#> SRR818263 3 0.5591 0.7260 0.304 0.000 0.696
#> SRR1404909 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR663076 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442422 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1465893 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR654862 3 0.6260 0.4076 0.448 0.000 0.552
#> SRR1407112 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1332969 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1353199 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1378885 3 0.3192 0.9321 0.112 0.000 0.888
#> SRR665357 3 0.3941 0.8983 0.156 0.000 0.844
#> SRR662186 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.3038 0.9362 0.104 0.000 0.896
#> SRR1347819 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472576 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1431781 2 0.1411 0.9641 0.000 0.964 0.036
#> SRR1452270 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1500472 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1417632 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458113 1 0.4178 0.7837 0.828 0.000 0.172
#> SRR1326579 1 0.0747 0.9502 0.984 0.000 0.016
#> SRR1349363 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1096712 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1090407 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1083752 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377599 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1488449 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1318354 1 0.6291 -0.0909 0.532 0.000 0.468
#> SRR1359062 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1398924 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR663783 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1319204 1 0.5239 0.7481 0.808 0.160 0.032
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR615659 1 0.1163 0.9415 0.972 0.000 0.028
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498595 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1377423 3 0.4842 0.8275 0.224 0.000 0.776
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 1 0.2625 0.8986 0.916 0.000 0.084
#> SRR1353309 3 0.4842 0.8278 0.224 0.000 0.776
#> SRR658941 1 0.1399 0.9444 0.968 0.004 0.028
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324085 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1363858 1 0.0983 0.9495 0.980 0.004 0.016
#> SRR819820 1 0.5016 0.6702 0.760 0.000 0.240
#> SRR1337342 1 0.0747 0.9502 0.984 0.000 0.016
#> SRR655206 2 0.1529 0.9621 0.000 0.960 0.040
#> SRR1387013 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0747 0.9502 0.984 0.000 0.016
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415379 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1099622 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR663197 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1394836 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR661699 1 0.3112 0.8940 0.916 0.056 0.028
#> SRR813680 1 0.5859 0.3920 0.656 0.000 0.344
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1499174 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433410 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR661167 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1432518 3 0.6307 0.2719 0.488 0.000 0.512
#> SRR660462 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1374608 2 0.1753 0.9593 0.000 0.952 0.048
#> SRR657949 3 0.4974 0.8233 0.236 0.000 0.764
#> SRR1308882 2 0.2261 0.9527 0.000 0.932 0.068
#> SRR655768 1 0.0592 0.9507 0.988 0.000 0.012
#> SRR1485870 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1444138 1 0.6026 0.3121 0.624 0.000 0.376
#> SRR1417342 1 0.1031 0.9323 0.976 0.024 0.000
#> SRR1470193 2 0.0592 0.9714 0.000 0.988 0.012
#> SRR1091380 1 0.3879 0.8167 0.848 0.000 0.152
#> SRR1099096 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 2 0.8608 0.2054 0.412 0.488 0.100
#> SRR1467102 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485416 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR818821 3 0.6192 0.4862 0.420 0.000 0.580
#> SRR809963 3 0.5621 0.7186 0.308 0.000 0.692
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 2 0.0892 0.9692 0.000 0.980 0.020
#> SRR1445259 1 0.2959 0.8773 0.900 0.000 0.100
#> SRR1408393 3 0.3192 0.9321 0.112 0.000 0.888
#> SRR1361522 1 0.0237 0.9504 0.996 0.000 0.004
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1333485 2 0.1163 0.9668 0.000 0.972 0.028
#> SRR1406437 2 0.1753 0.9593 0.000 0.952 0.048
#> SRR1354931 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1391856 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446738 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR815869 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR613150 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1375329 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1400910 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1444203 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR816177 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR658754 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1429603 2 0.2066 0.9557 0.000 0.940 0.060
#> SRR1397366 3 0.3038 0.9361 0.104 0.000 0.896
#> SRR1446028 1 0.0592 0.9507 0.988 0.000 0.012
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337606 1 0.1636 0.9399 0.964 0.020 0.016
#> SRR659109 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1337192 1 0.0747 0.9502 0.984 0.000 0.016
#> SRR656946 1 0.0592 0.9507 0.988 0.000 0.012
#> SRR1476102 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 2 0.1163 0.9668 0.000 0.972 0.028
#> SRR1385389 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1075971 1 0.1643 0.9311 0.956 0.000 0.044
#> SRR614419 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1322936 1 0.1905 0.9328 0.956 0.028 0.016
#> SRR1349121 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR612935 1 0.5785 0.4300 0.668 0.000 0.332
#> SRR661481 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1393596 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.3192 0.9321 0.112 0.000 0.888
#> SRR1499894 3 0.3340 0.9262 0.120 0.000 0.880
#> SRR1082883 1 0.1905 0.9328 0.956 0.028 0.016
#> SRR1468271 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR662103 1 0.1163 0.9415 0.972 0.000 0.028
#> SRR1328620 1 0.4796 0.6965 0.780 0.000 0.220
#> SRR1396294 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1419917 1 0.1964 0.9234 0.944 0.000 0.056
#> SRR662114 1 0.6062 0.2736 0.616 0.000 0.384
#> SRR1489199 3 0.6274 0.3819 0.456 0.000 0.544
#> SRR813584 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069638 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR614864 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1433392 3 0.4399 0.8713 0.188 0.000 0.812
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.0592 0.9507 0.988 0.000 0.012
#> SRR1401252 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1309963 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1338031 1 0.1031 0.9441 0.976 0.000 0.024
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1340486 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1377696 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1465459 3 0.3116 0.9343 0.108 0.000 0.892
#> SRR1080270 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1312501 3 0.5465 0.7480 0.288 0.000 0.712
#> SRR1093148 1 0.2050 0.9343 0.952 0.020 0.028
#> SRR1467080 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR816475 2 0.1529 0.9621 0.000 0.960 0.040
#> SRR1379198 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR613342 3 0.4842 0.8315 0.224 0.000 0.776
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369129 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1396616 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR813824 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1082376 3 0.3192 0.9321 0.112 0.000 0.888
#> SRR1500891 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR807543 3 0.3192 0.9321 0.112 0.000 0.888
#> SRR1091572 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1346689 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1332424 1 0.0747 0.9502 0.984 0.000 0.016
#> SRR663729 2 0.0747 0.9703 0.000 0.984 0.016
#> SRR1097013 1 0.0892 0.9464 0.980 0.000 0.020
#> SRR613675 1 0.1636 0.9399 0.964 0.020 0.016
#> SRR1485357 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR655816 3 0.6154 0.4838 0.408 0.000 0.592
#> SRR1500113 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355172 1 0.1031 0.9425 0.976 0.000 0.024
#> SRR655531 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1338147 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1413329 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 2 0.2796 0.9426 0.000 0.908 0.092
#> SRR1452033 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR809018 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR663440 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1471755 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR808019 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479133 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR615069 1 0.1289 0.9438 0.968 0.000 0.032
#> SRR1456185 2 0.0983 0.9599 0.016 0.980 0.004
#> SRR1350069 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR816316 3 0.4702 0.8474 0.212 0.000 0.788
#> SRR664795 1 0.1964 0.9190 0.944 0.000 0.056
#> SRR1490721 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR810643 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1085285 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1099072 3 0.3038 0.9361 0.104 0.000 0.896
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1351347 3 0.4121 0.8873 0.168 0.000 0.832
#> SRR1405525 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR2157314 1 0.0592 0.9507 0.988 0.000 0.012
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR809987 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR613639 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1402285 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1077038 3 0.6295 0.3280 0.472 0.000 0.528
#> SRR1405660 3 0.3038 0.9361 0.104 0.000 0.896
#> SRR1095455 1 0.2356 0.9091 0.928 0.000 0.072
#> SRR1394734 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073581 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR660764 3 0.5810 0.6639 0.336 0.000 0.664
#> SRR820448 3 0.5465 0.7567 0.288 0.000 0.712
#> SRR1328845 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1336415 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1379065 2 0.2356 0.9510 0.000 0.928 0.072
#> SRR1459190 1 0.6274 0.0029 0.544 0.000 0.456
#> SRR1346773 1 0.0424 0.9507 0.992 0.000 0.008
#> SRR1499521 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.6126 0.5248 0.400 0.000 0.600
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 2 0.2711 0.9444 0.000 0.912 0.088
#> SRR1309248 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR809161 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1316320 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1432629 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1405547 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1470534 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1380764 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR663489 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1500450 1 0.3043 0.8520 0.908 0.084 0.008
#> SRR1078489 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1332648 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR660614 1 0.1289 0.9438 0.968 0.000 0.032
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.3340 0.8497 0.880 0.000 0.120
#> SRR615946 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR660224 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR665586 1 0.1964 0.9245 0.944 0.000 0.056
#> SRR1347166 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1485722 1 0.1163 0.9457 0.972 0.000 0.028
#> SRR1415316 1 0.0237 0.9504 0.996 0.000 0.004
#> SRR613390 3 0.6274 0.3912 0.456 0.000 0.544
#> SRR661108 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR2170173 1 0.2261 0.9129 0.932 0.000 0.068
#> SRR817329 1 0.1753 0.9313 0.952 0.000 0.048
#> SRR1401990 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1467745 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR813137 3 0.3879 0.9043 0.152 0.000 0.848
#> SRR1314873 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR818797 3 0.3116 0.9343 0.108 0.000 0.892
#> SRR2164608 1 0.3619 0.8352 0.864 0.000 0.136
#> SRR1455586 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR819459 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1488939 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.5733 0.6939 0.324 0.000 0.676
#> SRR1361652 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1430910 1 0.1289 0.9438 0.968 0.000 0.032
#> SRR1310584 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1486762 3 0.5291 0.7685 0.268 0.000 0.732
#> SRR1480854 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1489394 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1418085 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1340221 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1473058 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405165 1 0.5098 0.6385 0.752 0.000 0.248
#> SRR1433004 1 0.3116 0.8679 0.892 0.000 0.108
#> SRR1471477 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098712 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1455038 1 0.1964 0.9243 0.944 0.000 0.056
#> SRR1375248 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1348378 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413541 1 0.1753 0.9313 0.952 0.000 0.048
#> SRR1392943 2 0.0661 0.9709 0.004 0.988 0.008
#> SRR1475192 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452468 1 0.0892 0.9495 0.980 0.000 0.020
#> SRR1347060 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1414139 2 0.0983 0.9609 0.004 0.980 0.016
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0747 0.9502 0.984 0.000 0.016
#> SRR1343302 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.3412 0.9249 0.124 0.000 0.876
#> SRR1345609 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1322840 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1399797 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1416654 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1315081 3 0.3116 0.9341 0.108 0.000 0.892
#> SRR1369196 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.3116 0.9343 0.108 0.000 0.892
#> SRR1367920 2 0.0237 0.9731 0.000 0.996 0.004
#> SRR1366648 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9734 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082173 1 0.1289 0.9438 0.968 0.000 0.032
#> SRR1363968 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.9502 1.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0592 0.9507 0.988 0.000 0.012
#> SRR1386689 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1395575 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1453811 3 0.3038 0.9362 0.104 0.000 0.896
#> SRR1441159 1 0.0747 0.9502 0.984 0.000 0.016
#> SRR1403154 2 0.2959 0.9392 0.000 0.900 0.100
#> SRR1468722 3 0.2959 0.9377 0.100 0.000 0.900
#> SRR1310275 3 0.5291 0.7752 0.268 0.000 0.732
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 1 0.1890 0.8855 0.936 0.008 0.056 0.000
#> SRR1331708 1 0.7175 0.6397 0.632 0.052 0.088 0.228
#> SRR1464258 3 0.1902 0.8984 0.064 0.004 0.932 0.000
#> SRR1454201 1 0.4417 0.8183 0.796 0.044 0.160 0.000
#> SRR661589 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456229 3 0.3808 0.8061 0.176 0.012 0.812 0.000
#> SRR1315165 4 0.1637 0.8906 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR1488960 1 0.1118 0.8972 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1417809 4 0.2149 0.8865 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1094457 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095575 1 0.3734 0.8633 0.848 0.044 0.108 0.000
#> SRR1315931 1 0.2593 0.8854 0.904 0.016 0.080 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818002 2 0.2530 0.9506 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1344143 4 0.3569 0.8329 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1486845 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362866 1 0.3570 0.8713 0.860 0.048 0.092 0.000
#> SRR1490740 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1456138 2 0.2281 0.9620 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1416248 1 0.1211 0.8964 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1383907 4 0.3266 0.8586 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1311018 1 0.1211 0.8964 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1375699 4 0.3400 0.8496 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1429846 3 0.1211 0.9103 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR613550 3 0.0188 0.9186 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1348402 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.2844 0.8861 0.900 0.048 0.052 0.000
#> SRR1324025 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318879 1 0.5446 0.6663 0.680 0.044 0.276 0.000
#> SRR820755 3 0.1474 0.9058 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1485830 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR599313 1 0.3634 0.8695 0.856 0.048 0.096 0.000
#> SRR612263 3 0.6214 -0.0185 0.468 0.052 0.480 0.000
#> SRR1415398 3 0.0592 0.9145 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1326205 4 0.1637 0.8906 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR1421327 4 0.3311 0.8558 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR1083311 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.3266 0.8586 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1079522 1 0.3634 0.8695 0.856 0.048 0.096 0.000
#> SRR1452935 3 0.5090 0.6763 0.228 0.044 0.728 0.000
#> SRR1379495 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR661361 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.3674 0.8653 0.852 0.044 0.104 0.000
#> SRR1447564 1 0.0921 0.8990 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.2773 0.8869 0.900 0.028 0.072 0.000
#> SRR655182 1 0.0469 0.8998 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.3726 0.8225 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1433555 3 0.1936 0.8983 0.032 0.028 0.940 0.000
#> SRR1308650 2 0.6335 0.5036 0.256 0.664 0.040 0.040
#> SRR1388354 1 0.1211 0.8964 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.4677 0.7239 0.192 0.040 0.768 0.000
#> SRR1479955 2 0.3266 0.8866 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR809853 1 0.3505 0.8735 0.864 0.048 0.088 0.000
#> SRR661313 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499935 4 0.3266 0.8586 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1447303 3 0.0336 0.9184 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1429408 4 0.4713 0.5431 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR1433950 1 0.1398 0.8976 0.956 0.040 0.004 0.000
#> SRR1362081 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1409854 3 0.1474 0.9062 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1435229 1 0.3697 0.8675 0.852 0.048 0.100 0.000
#> SRR1085996 1 0.5055 0.6686 0.712 0.032 0.256 0.000
#> SRR1414229 1 0.5936 0.4019 0.576 0.044 0.380 0.000
#> SRR1400974 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.1474 0.9058 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1457854 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0927 0.8999 0.976 0.016 0.008 0.000
#> SRR813776 3 0.1474 0.9058 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR808196 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101085 4 0.3266 0.8586 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR614395 3 0.2048 0.8967 0.064 0.008 0.928 0.000
#> SRR1478251 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370551 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1362310 1 0.1211 0.8964 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.0188 0.9186 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1420109 3 0.6077 0.0250 0.460 0.044 0.496 0.000
#> SRR1330920 1 0.3793 0.8600 0.844 0.044 0.112 0.000
#> SRR1419539 2 0.3400 0.8790 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1359447 3 0.4370 0.7713 0.156 0.044 0.800 0.000
#> SRR1347259 4 0.2589 0.8796 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR613915 3 0.0817 0.9153 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1384395 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821715 3 0.0817 0.9131 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1478228 1 0.1211 0.8964 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.4933 0.5206 0.688 0.016 0.296 0.000
#> SRR608150 1 0.3570 0.8713 0.860 0.048 0.092 0.000
#> SRR1096383 1 0.0657 0.8999 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR1341480 4 0.3266 0.8586 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1341344 1 0.3587 0.8741 0.860 0.052 0.088 0.000
#> SRR1326270 3 0.1302 0.9083 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808566 4 0.4454 0.6588 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR1430270 4 0.0707 0.8898 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1367825 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613533 3 0.2843 0.8633 0.088 0.020 0.892 0.000
#> SRR661267 3 0.3681 0.8126 0.176 0.008 0.816 0.000
#> SRR810665 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1407250 1 0.4123 0.8416 0.820 0.044 0.136 0.000
#> SRR1420067 1 0.0469 0.8991 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.2197 0.8910 0.928 0.048 0.024 0.000
#> SRR812536 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.2216 0.9637 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1486195 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1407671 4 0.3444 0.8456 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR1446375 1 0.5522 0.5807 0.668 0.044 0.288 0.000
#> SRR1465230 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.2412 0.8600 0.908 0.008 0.084 0.000
#> SRR1356101 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1404209 1 0.0469 0.8994 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.2281 0.9616 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR665538 1 0.0336 0.8989 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.3266 0.8586 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR658953 1 0.3697 0.8675 0.852 0.048 0.100 0.000
#> SRR2166459 1 0.5217 0.2845 0.608 0.012 0.380 0.000
#> SRR1070713 2 0.2281 0.9616 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1485312 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488610 1 0.3370 0.8769 0.872 0.048 0.080 0.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.3634 0.8720 0.856 0.048 0.096 0.000
#> SRR1433926 1 0.4988 0.5445 0.692 0.020 0.288 0.000
#> SRR1091302 4 0.2216 0.8859 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR818263 3 0.1902 0.8984 0.064 0.004 0.932 0.000
#> SRR1404909 4 0.3528 0.8376 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR663076 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1442422 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465893 1 0.0336 0.8996 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR654862 3 0.2888 0.8619 0.124 0.004 0.872 0.000
#> SRR1407112 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332969 3 0.0592 0.9145 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1353199 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378885 3 0.1474 0.9058 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR665357 3 0.0779 0.9143 0.004 0.016 0.980 0.000
#> SRR662186 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1501020 3 0.2081 0.8825 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1472576 4 0.3266 0.8586 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1431781 4 0.2868 0.8735 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR1452270 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.3674 0.8657 0.852 0.044 0.104 0.000
#> SRR1417632 4 0.3356 0.8527 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR1350153 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1458113 3 0.4951 0.6906 0.212 0.044 0.744 0.000
#> SRR1326579 1 0.3505 0.8731 0.864 0.048 0.088 0.000
#> SRR1349363 2 0.4996 0.0711 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR1096712 3 0.0469 0.9169 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1090407 3 0.0592 0.9145 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1083752 2 0.2469 0.9537 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1377599 4 0.3400 0.8494 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1488449 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318354 3 0.2644 0.8798 0.060 0.032 0.908 0.000
#> SRR1359062 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398924 1 0.3758 0.8654 0.848 0.048 0.104 0.000
#> SRR663783 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319204 1 0.6242 0.7099 0.692 0.204 0.084 0.020
#> SRR1369070 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR615659 1 0.3674 0.8222 0.848 0.036 0.116 0.000
#> SRR1337449 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1316982 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1498595 4 0.4730 0.5248 0.000 0.364 0.000 0.636
#> SRR1377423 3 0.2593 0.8585 0.104 0.004 0.892 0.000
#> SRR1312310 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1485613 1 0.0336 0.8989 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.5022 0.6737 0.220 0.044 0.736 0.000
#> SRR1353309 3 0.3107 0.8608 0.080 0.036 0.884 0.000
#> SRR658941 1 0.3674 0.8670 0.852 0.044 0.104 0.000
#> SRR1101643 1 0.0921 0.8984 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0188 0.8998 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1368874 2 0.2408 0.9565 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1324085 4 0.3356 0.8536 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR1363858 1 0.2300 0.8905 0.924 0.048 0.028 0.000
#> SRR819820 3 0.5392 0.5704 0.280 0.040 0.680 0.000
#> SRR1337342 1 0.3674 0.8653 0.852 0.044 0.104 0.000
#> SRR655206 2 0.3024 0.9190 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1387013 2 0.2589 0.9474 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1317410 1 0.1211 0.8964 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.3634 0.8695 0.856 0.048 0.096 0.000
#> SRR1440161 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1343741 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1381288 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1415379 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099622 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR663197 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394836 2 0.2345 0.9591 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR661699 1 0.5602 0.7911 0.736 0.116 0.144 0.004
#> SRR813680 3 0.4422 0.7226 0.256 0.008 0.736 0.000
#> SRR1410678 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499174 1 0.2722 0.8849 0.904 0.032 0.064 0.000
#> SRR1311486 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1382851 2 0.3311 0.8803 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1433410 1 0.3634 0.8695 0.856 0.048 0.096 0.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.3435 0.8441 0.100 0.036 0.864 0.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.2868 0.8705 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR657949 3 0.1389 0.9091 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1308882 4 0.1118 0.8914 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR655768 1 0.1022 0.8975 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1485870 4 0.3266 0.8586 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1444138 3 0.5570 0.3251 0.440 0.020 0.540 0.000
#> SRR1417342 1 0.1059 0.8993 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR1470193 4 0.3356 0.8536 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR1091380 3 0.5639 0.4666 0.324 0.040 0.636 0.000
#> SRR1099096 1 0.1211 0.8964 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1313583 4 0.2443 0.8455 0.060 0.024 0.000 0.916
#> SRR1467102 2 0.1940 0.9578 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1485416 4 0.3266 0.8586 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR818821 3 0.3427 0.8348 0.112 0.028 0.860 0.000
#> SRR809963 3 0.2124 0.8948 0.068 0.008 0.924 0.000
#> SRR1072247 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.2408 0.8829 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR1445259 3 0.5839 0.4180 0.352 0.044 0.604 0.000
#> SRR1408393 3 0.1474 0.9058 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1361522 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.2530 0.9510 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1310542 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.1118 0.8915 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1406437 4 0.3942 0.7546 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR1354931 3 0.0469 0.9158 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1391856 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1446738 2 0.2530 0.9506 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1309032 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1388145 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1432611 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR815869 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375329 1 0.3697 0.8676 0.852 0.048 0.100 0.000
#> SRR1387921 1 0.1211 0.8964 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1360478 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1360695 1 0.0707 0.8987 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.3634 0.8695 0.856 0.048 0.096 0.000
#> SRR1400910 1 0.3758 0.8654 0.848 0.048 0.104 0.000
#> SRR1444203 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR816177 2 0.2469 0.9540 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR658754 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.2216 0.8857 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR1397366 3 0.0188 0.9186 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1446028 1 0.0921 0.8981 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1337606 1 0.3697 0.8676 0.852 0.048 0.100 0.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.3570 0.8713 0.860 0.048 0.092 0.000
#> SRR656946 1 0.1004 0.8985 0.972 0.024 0.004 0.000
#> SRR1476102 1 0.1211 0.8995 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.1798 0.8992 0.944 0.040 0.016 0.000
#> SRR1342067 4 0.1302 0.8912 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1385389 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075971 1 0.3900 0.7660 0.816 0.020 0.164 0.000
#> SRR614419 1 0.3796 0.8712 0.848 0.056 0.096 0.000
#> SRR1322936 1 0.4427 0.8654 0.836 0.048 0.084 0.032
#> SRR1349121 1 0.1209 0.8979 0.964 0.032 0.004 0.000
#> SRR1430549 1 0.1118 0.8972 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.4070 0.8019 0.132 0.044 0.824 0.000
#> SRR661481 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1354117 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1393596 4 0.3266 0.8586 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1452164 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.1211 0.9110 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1499894 3 0.1820 0.9006 0.036 0.020 0.944 0.000
#> SRR1082883 1 0.5064 0.8461 0.804 0.048 0.092 0.056
#> SRR1468271 1 0.0524 0.8994 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1332443 1 0.1118 0.8972 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR662103 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.4720 0.7259 0.188 0.044 0.768 0.000
#> SRR1396294 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419917 1 0.5355 0.3545 0.620 0.020 0.360 0.000
#> SRR662114 3 0.3176 0.8583 0.084 0.036 0.880 0.000
#> SRR1489199 3 0.3636 0.8109 0.172 0.008 0.820 0.000
#> SRR813584 2 0.3074 0.9069 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1069638 1 0.4123 0.8420 0.820 0.044 0.136 0.000
#> SRR614864 3 0.0188 0.9186 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1433392 3 0.2048 0.8967 0.064 0.008 0.928 0.000
#> SRR1377777 2 0.2530 0.9510 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR2167710 1 0.1109 0.8980 0.968 0.028 0.004 0.000
#> SRR1401252 4 0.3266 0.8586 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1309963 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1486889 1 0.1970 0.8915 0.932 0.008 0.060 0.000
#> SRR1380393 1 0.1211 0.8964 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1356468 4 0.1118 0.8911 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1337010 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1486520 1 0.2131 0.8989 0.932 0.032 0.036 0.000
#> SRR1486538 4 0.0188 0.8874 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1340486 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377696 4 0.3528 0.8374 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1465459 3 0.1389 0.9078 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0895 0.9138 0.004 0.020 0.976 0.000
#> SRR1093148 1 0.4123 0.8458 0.820 0.044 0.136 0.000
#> SRR1467080 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR816475 4 0.4454 0.6568 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR1379198 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613342 3 0.0188 0.9183 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1452246 2 0.2530 0.9510 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1338836 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1369129 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396616 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082376 3 0.1716 0.8998 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1500891 4 0.3266 0.8586 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR807543 3 0.1474 0.9058 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1091572 1 0.3907 0.8540 0.836 0.044 0.120 0.000
#> SRR1346689 4 0.3024 0.8679 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR1332424 1 0.3570 0.8713 0.860 0.048 0.092 0.000
#> SRR663729 4 0.2149 0.8867 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1097013 1 0.0592 0.8986 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR613675 1 0.3439 0.8750 0.868 0.048 0.084 0.000
#> SRR1485357 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655816 3 0.3803 0.8113 0.132 0.032 0.836 0.000
#> SRR1500113 1 0.0336 0.8996 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.2530 0.9513 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1355172 1 0.4283 0.6271 0.740 0.004 0.256 0.000
#> SRR655531 1 0.3505 0.8741 0.864 0.048 0.088 0.000
#> SRR1338147 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413329 1 0.4370 0.8243 0.800 0.044 0.156 0.000
#> SRR1485931 2 0.2530 0.9510 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1420873 1 0.0921 0.8981 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1333308 4 0.1867 0.8892 0.000 0.072 0.000 0.928
#> SRR1452033 1 0.0469 0.8986 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.3873 0.7973 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR809018 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR663440 3 0.0469 0.9173 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1471755 2 0.2149 0.9654 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR808019 1 0.1938 0.8944 0.936 0.012 0.052 0.000
#> SRR1479133 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615069 1 0.4322 0.8328 0.804 0.044 0.152 0.000
#> SRR1456185 2 0.4622 0.8482 0.060 0.800 0.004 0.136
#> SRR1350069 4 0.0336 0.8882 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR816316 3 0.2402 0.8906 0.076 0.012 0.912 0.000
#> SRR664795 3 0.5172 0.4536 0.404 0.008 0.588 0.000
#> SRR1490721 4 0.3356 0.8527 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR810643 1 0.1022 0.8974 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.4017 0.8492 0.828 0.044 0.128 0.000
#> SRR1085285 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.0188 0.9186 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1317985 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.2142 0.8898 0.056 0.016 0.928 0.000
#> SRR1405525 1 0.2844 0.8862 0.900 0.048 0.052 0.000
#> SRR1370329 1 0.1211 0.8964 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR819610 4 0.3942 0.7813 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR2157314 1 0.0817 0.8985 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR809987 4 0.0707 0.8898 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR613639 3 0.1211 0.9098 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1402285 4 0.0188 0.8874 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1077038 3 0.2329 0.8916 0.072 0.012 0.916 0.000
#> SRR1405660 3 0.0927 0.9138 0.016 0.008 0.976 0.000
#> SRR1095455 3 0.5839 0.4194 0.352 0.044 0.604 0.000
#> SRR1394734 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1317771 1 0.2021 0.8985 0.936 0.024 0.040 0.000
#> SRR1365894 4 0.4356 0.6890 0.000 0.292 0.000 0.708
#> SRR1073581 1 0.0524 0.9001 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR659804 1 0.1022 0.8974 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.2216 0.9637 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1432186 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1473529 2 0.4134 0.7408 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR660764 3 0.0895 0.9135 0.004 0.020 0.976 0.000
#> SRR820448 3 0.3271 0.8504 0.132 0.012 0.856 0.000
#> SRR1328845 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1336415 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379065 4 0.1557 0.8908 0.000 0.056 0.000 0.944
#> SRR1459190 3 0.4379 0.7608 0.172 0.036 0.792 0.000
#> SRR1346773 1 0.1118 0.8995 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0376 0.8997 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1440898 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1347459 3 0.1004 0.9119 0.004 0.024 0.972 0.000
#> SRR1081209 2 0.2469 0.9537 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1400202 1 0.1022 0.8974 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.1716 0.8902 0.000 0.064 0.000 0.936
#> SRR1309248 4 0.3400 0.8494 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR809161 3 0.0707 0.9148 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1316320 4 0.3444 0.8456 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR1432629 2 0.2216 0.9639 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1498931 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.0817 0.8988 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.1722 0.8895 0.944 0.008 0.000 0.048
#> SRR1078489 1 0.4174 0.8387 0.816 0.044 0.140 0.000
#> SRR1332648 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660614 1 0.5472 0.6595 0.676 0.044 0.280 0.000
#> SRR1470420 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1475566 1 0.1118 0.8972 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0817 0.8995 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1464766 3 0.5339 0.4877 0.384 0.016 0.600 0.000
#> SRR615946 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1467656 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1402962 1 0.3037 0.8801 0.888 0.036 0.076 0.000
#> SRR660224 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR665586 1 0.5713 0.4074 0.604 0.036 0.360 0.000
#> SRR1347166 1 0.3697 0.8678 0.852 0.048 0.100 0.000
#> SRR1485722 1 0.4914 0.7584 0.748 0.044 0.208 0.000
#> SRR1415316 1 0.1211 0.8964 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR613390 3 0.4327 0.7535 0.216 0.016 0.768 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.6071 0.1511 0.504 0.044 0.452 0.000
#> SRR817329 1 0.4868 0.6658 0.720 0.024 0.256 0.000
#> SRR1401990 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467745 2 0.2469 0.9537 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1471795 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1415637 2 0.2281 0.9616 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR813137 3 0.2921 0.8455 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR1314873 1 0.2124 0.8999 0.932 0.040 0.028 0.000
#> SRR1401211 1 0.0592 0.8986 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1419692 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818797 3 0.1389 0.9070 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR2164608 3 0.5312 0.5932 0.268 0.040 0.692 0.000
#> SRR1455586 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR819459 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.4193 0.7257 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1433232 2 0.2149 0.9651 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1385501 3 0.2412 0.8900 0.084 0.008 0.908 0.000
#> SRR1361652 1 0.3697 0.8675 0.852 0.048 0.100 0.000
#> SRR1437119 1 0.1211 0.8964 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430910 1 0.5056 0.7500 0.732 0.044 0.224 0.000
#> SRR1310584 1 0.1211 0.8964 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.3634 0.8695 0.856 0.048 0.096 0.000
#> SRR1486762 3 0.2909 0.8604 0.092 0.020 0.888 0.000
#> SRR1480854 4 0.3311 0.8558 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR1489394 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1473058 4 0.5000 0.0693 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1405165 3 0.3962 0.8083 0.124 0.044 0.832 0.000
#> SRR1433004 3 0.5980 0.3326 0.396 0.044 0.560 0.000
#> SRR1471477 1 0.0188 0.8993 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1098712 4 0.1022 0.8909 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1455038 3 0.6130 0.2612 0.400 0.052 0.548 0.000
#> SRR1375248 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1403005 3 0.0336 0.9184 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1348378 2 0.2469 0.9537 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1413541 1 0.4964 0.6906 0.724 0.032 0.244 0.000
#> SRR1392943 4 0.3881 0.8543 0.016 0.172 0.000 0.812
#> SRR1475192 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1452468 1 0.3634 0.8695 0.856 0.048 0.096 0.000
#> SRR1347060 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.1970 0.9387 0.000 0.932 0.008 0.060
#> SRR1447962 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1444324 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1415004 1 0.1211 0.8964 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.2335 0.8913 0.920 0.020 0.060 0.000
#> SRR1311266 1 0.2675 0.8875 0.908 0.044 0.048 0.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1373746 1 0.1211 0.8964 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1405331 3 0.1022 0.9129 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1345609 1 0.1022 0.8989 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1380208 4 0.4284 0.8342 0.020 0.200 0.000 0.780
#> SRR1322840 4 0.0336 0.8882 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1399797 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.0336 0.9181 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.0817 0.9153 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1367920 4 0.3356 0.8527 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR1366648 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.2081 0.9670 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1082173 1 0.4761 0.7841 0.764 0.044 0.192 0.000
#> SRR1363968 1 0.0188 0.8992 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.1118 0.8968 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.1929 0.8961 0.940 0.036 0.024 0.000
#> SRR1386689 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395575 3 0.0469 0.9184 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1453811 3 0.1211 0.9103 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1441159 1 0.1302 0.8975 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.8864 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.9189 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.0779 0.9161 0.016 0.004 0.980 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 1 0.2006 0.7620 0.916 0.000 0.012 0.000 0.072
#> SRR1331708 5 0.4633 0.6596 0.068 0.004 0.028 0.116 0.784
#> SRR1464258 3 0.6724 -0.0690 0.356 0.000 0.392 0.000 0.252
#> SRR1454201 5 0.4593 0.7562 0.124 0.000 0.128 0.000 0.748
#> SRR661589 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.6534 0.1995 0.436 0.000 0.200 0.000 0.364
#> SRR1315165 4 0.0404 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1488960 1 0.0609 0.7723 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1417809 4 0.2278 0.8337 0.000 0.060 0.000 0.908 0.032
#> SRR1094457 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1095575 5 0.4934 0.7296 0.188 0.000 0.104 0.000 0.708
#> SRR1315931 1 0.3885 0.6273 0.724 0.000 0.008 0.000 0.268
#> SRR1430066 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818002 2 0.0794 0.9395 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1344143 4 0.5449 0.5506 0.000 0.376 0.000 0.556 0.068
#> SRR1486845 4 0.0000 0.8392 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362866 5 0.3152 0.7814 0.136 0.000 0.024 0.000 0.840
#> SRR1490740 1 0.2377 0.7511 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0162 0.9617 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1416248 1 0.0290 0.7680 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1383907 4 0.3916 0.7566 0.000 0.256 0.000 0.732 0.012
#> SRR1311018 1 0.0609 0.7715 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1375699 4 0.4761 0.6175 0.000 0.356 0.000 0.616 0.028
#> SRR1429846 3 0.1557 0.8788 0.008 0.000 0.940 0.000 0.052
#> SRR613550 3 0.0880 0.8875 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1348402 1 0.1792 0.7707 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1345146 5 0.4276 0.6960 0.256 0.000 0.028 0.000 0.716
#> SRR1324025 3 0.0290 0.8952 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1318879 5 0.5404 0.7014 0.152 0.000 0.184 0.000 0.664
#> SRR820755 3 0.4059 0.7473 0.052 0.000 0.776 0.000 0.172
#> SRR1485830 4 0.0162 0.8387 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR599313 5 0.3909 0.7356 0.216 0.000 0.024 0.000 0.760
#> SRR612263 5 0.5093 0.5677 0.180 0.000 0.124 0.000 0.696
#> SRR1415398 3 0.1043 0.8884 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1326205 4 0.0290 0.8392 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1421327 4 0.4430 0.7514 0.000 0.256 0.000 0.708 0.036
#> SRR1083311 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.3885 0.7475 0.000 0.268 0.000 0.724 0.008
#> SRR1079522 5 0.2707 0.7777 0.100 0.000 0.024 0.000 0.876
#> SRR1452935 3 0.4555 0.0866 0.008 0.000 0.520 0.000 0.472
#> SRR1379495 1 0.0609 0.7723 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615778 5 0.3197 0.7808 0.140 0.000 0.024 0.000 0.836
#> SRR1447564 1 0.3949 0.4546 0.668 0.000 0.000 0.000 0.332
#> SRR1455195 1 0.4494 0.4169 0.608 0.000 0.012 0.000 0.380
#> SRR655182 1 0.4074 0.3831 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1335140 2 0.2966 0.7919 0.000 0.848 0.000 0.136 0.016
#> SRR1433555 3 0.0404 0.8945 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1308650 2 0.5423 0.3856 0.036 0.616 0.024 0.000 0.324
#> SRR1388354 1 0.0510 0.7706 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1317446 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.3728 0.6395 0.008 0.000 0.748 0.000 0.244
#> SRR1479955 2 0.1809 0.8988 0.000 0.928 0.000 0.060 0.012
#> SRR809853 5 0.2864 0.7744 0.112 0.000 0.024 0.000 0.864
#> SRR661313 3 0.0703 0.8921 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1499935 4 0.3809 0.7577 0.000 0.256 0.000 0.736 0.008
#> SRR1447303 3 0.0963 0.8899 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1429408 4 0.4436 0.5563 0.000 0.396 0.000 0.596 0.008
#> SRR1433950 1 0.3752 0.6025 0.708 0.000 0.000 0.000 0.292
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 3 0.3513 0.7723 0.020 0.000 0.800 0.000 0.180
#> SRR1435229 5 0.2570 0.7736 0.084 0.000 0.028 0.000 0.888
#> SRR1085996 1 0.4963 0.4841 0.608 0.000 0.040 0.000 0.352
#> SRR1414229 5 0.5252 0.4691 0.056 0.000 0.364 0.000 0.580
#> SRR1400974 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0609 0.7723 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR613927 3 0.3016 0.8171 0.020 0.000 0.848 0.000 0.132
#> SRR1457854 1 0.1043 0.7716 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1473714 1 0.4815 -0.1052 0.524 0.000 0.020 0.000 0.456
#> SRR813776 3 0.3565 0.7729 0.024 0.000 0.800 0.000 0.176
#> SRR808196 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1101085 4 0.4430 0.7514 0.000 0.256 0.000 0.708 0.036
#> SRR614395 1 0.6719 0.1272 0.380 0.000 0.372 0.000 0.248
#> SRR1478251 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0510 0.7718 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR665310 3 0.0290 0.8964 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1420109 5 0.5894 0.4771 0.112 0.000 0.356 0.000 0.532
#> SRR1330920 5 0.3412 0.7780 0.152 0.000 0.028 0.000 0.820
#> SRR1419539 2 0.1597 0.9097 0.000 0.940 0.000 0.048 0.012
#> SRR1359447 3 0.3582 0.6695 0.008 0.000 0.768 0.000 0.224
#> SRR1347259 4 0.3132 0.8037 0.000 0.172 0.000 0.820 0.008
#> SRR613915 3 0.2233 0.8565 0.016 0.000 0.904 0.000 0.080
#> SRR1384395 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821715 3 0.1851 0.8638 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1478228 1 0.0510 0.7718 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1445637 1 0.4073 0.6698 0.752 0.000 0.032 0.000 0.216
#> SRR608150 5 0.2171 0.7629 0.064 0.000 0.024 0.000 0.912
#> SRR1096383 1 0.1697 0.7671 0.932 0.000 0.008 0.000 0.060
#> SRR1341480 4 0.4503 0.7502 0.000 0.256 0.000 0.704 0.040
#> SRR1341344 5 0.3819 0.7220 0.228 0.000 0.016 0.000 0.756
#> SRR1326270 3 0.1764 0.8715 0.008 0.000 0.928 0.000 0.064
#> SRR1498838 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808566 4 0.4298 0.6366 0.000 0.352 0.000 0.640 0.008
#> SRR1430270 4 0.1386 0.8236 0.016 0.000 0.000 0.952 0.032
#> SRR1367825 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.1124 0.8852 0.004 0.000 0.960 0.000 0.036
#> SRR661267 1 0.6311 0.2649 0.504 0.000 0.320 0.000 0.176
#> SRR810665 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 5 0.3950 0.7858 0.136 0.000 0.068 0.000 0.796
#> SRR1420067 1 0.4425 0.2856 0.600 0.000 0.008 0.000 0.392
#> SRR1473632 5 0.4003 0.6490 0.288 0.000 0.008 0.000 0.704
#> SRR812536 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 4 0.4525 0.6193 0.000 0.360 0.000 0.624 0.016
#> SRR1446375 5 0.6231 0.5602 0.252 0.000 0.204 0.000 0.544
#> SRR1465230 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR614119 1 0.1571 0.7683 0.936 0.000 0.004 0.000 0.060
#> SRR1356101 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.2389 0.7556 0.880 0.000 0.004 0.000 0.116
#> SRR1392676 2 0.0162 0.9617 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR665538 1 0.1571 0.7683 0.936 0.000 0.004 0.000 0.060
#> SRR660510 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.3700 0.7693 0.000 0.240 0.000 0.752 0.008
#> SRR658953 5 0.2450 0.7732 0.076 0.000 0.028 0.000 0.896
#> SRR2166459 1 0.3460 0.7166 0.828 0.000 0.044 0.000 0.128
#> SRR1070713 2 0.0162 0.9617 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1488610 5 0.3152 0.7815 0.136 0.000 0.024 0.000 0.840
#> SRR1330588 3 0.0290 0.8952 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1316367 5 0.2351 0.7693 0.088 0.000 0.016 0.000 0.896
#> SRR1433926 1 0.4269 0.6439 0.732 0.000 0.036 0.000 0.232
#> SRR1091302 4 0.2583 0.8185 0.000 0.132 0.000 0.864 0.004
#> SRR818263 3 0.6712 0.0157 0.332 0.000 0.412 0.000 0.256
#> SRR1404909 4 0.4573 0.7488 0.000 0.256 0.000 0.700 0.044
#> SRR663076 1 0.0703 0.7736 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1465893 1 0.2411 0.7390 0.884 0.000 0.008 0.000 0.108
#> SRR654862 3 0.6392 0.1928 0.176 0.000 0.468 0.000 0.356
#> SRR1407112 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1332969 3 0.0510 0.8952 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1353199 3 0.0290 0.8952 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1378885 3 0.2921 0.8225 0.020 0.000 0.856 0.000 0.124
#> SRR665357 3 0.0609 0.8911 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR662186 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.2304 0.8421 0.008 0.000 0.892 0.000 0.100
#> SRR1347819 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.3967 0.7501 0.000 0.264 0.000 0.724 0.012
#> SRR1431781 4 0.3551 0.7823 0.000 0.220 0.000 0.772 0.008
#> SRR1452270 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.3946 0.7683 0.080 0.000 0.120 0.000 0.800
#> SRR1417632 4 0.4730 0.7412 0.000 0.260 0.000 0.688 0.052
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.4003 0.5747 0.008 0.000 0.704 0.000 0.288
#> SRR1326579 5 0.3098 0.7771 0.148 0.000 0.016 0.000 0.836
#> SRR1349363 2 0.4825 0.0254 0.000 0.568 0.000 0.408 0.024
#> SRR1096712 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0794 0.8917 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1083752 2 0.0290 0.9590 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1377599 4 0.5396 0.6176 0.000 0.340 0.000 0.588 0.072
#> SRR1488449 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318354 3 0.2583 0.8030 0.004 0.000 0.864 0.000 0.132
#> SRR1359062 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.2473 0.7745 0.072 0.000 0.032 0.000 0.896
#> SRR663783 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319204 5 0.6980 0.5503 0.104 0.220 0.104 0.000 0.572
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.3238 0.7342 0.836 0.000 0.028 0.000 0.136
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498595 4 0.4599 0.5789 0.000 0.384 0.000 0.600 0.016
#> SRR1377423 3 0.2629 0.7974 0.004 0.000 0.860 0.000 0.136
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.1732 0.7673 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1338426 3 0.4640 0.2406 0.016 0.000 0.584 0.000 0.400
#> SRR1353309 3 0.1571 0.8670 0.004 0.000 0.936 0.000 0.060
#> SRR658941 5 0.4877 0.7185 0.236 0.000 0.072 0.000 0.692
#> SRR1101643 1 0.3177 0.6478 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1401468 1 0.3942 0.5428 0.728 0.000 0.012 0.000 0.260
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.3728 0.7670 0.000 0.244 0.000 0.748 0.008
#> SRR1363858 5 0.4654 0.5402 0.348 0.000 0.024 0.000 0.628
#> SRR819820 5 0.6118 0.3553 0.128 0.000 0.404 0.000 0.468
#> SRR1337342 5 0.3615 0.7807 0.156 0.000 0.036 0.000 0.808
#> SRR655206 2 0.0807 0.9481 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR1387013 2 0.0162 0.9617 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1317410 1 0.0609 0.7715 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR608198 5 0.3011 0.7787 0.140 0.000 0.016 0.000 0.844
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1099622 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663197 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394836 2 0.0162 0.9614 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR661699 5 0.5921 0.7216 0.156 0.088 0.072 0.000 0.684
#> SRR813680 1 0.6052 0.3805 0.572 0.000 0.248 0.000 0.180
#> SRR1410678 1 0.0609 0.7723 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1378109 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1499174 5 0.4016 0.6339 0.272 0.000 0.012 0.000 0.716
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.3074 0.7081 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1433410 5 0.3152 0.7813 0.136 0.000 0.024 0.000 0.840
#> SRR661167 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.1768 0.8628 0.004 0.000 0.924 0.000 0.072
#> SRR660462 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.3583 0.7958 0.004 0.192 0.000 0.792 0.012
#> SRR657949 3 0.3550 0.7716 0.020 0.000 0.796 0.000 0.184
#> SRR1308882 4 0.0693 0.8405 0.000 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR655768 5 0.4656 0.2687 0.480 0.000 0.012 0.000 0.508
#> SRR1485870 4 0.3835 0.7543 0.000 0.260 0.000 0.732 0.008
#> SRR1444138 1 0.6290 0.2649 0.500 0.000 0.332 0.000 0.168
#> SRR1417342 1 0.3737 0.6063 0.764 0.000 0.008 0.004 0.224
#> SRR1470193 4 0.3700 0.7693 0.000 0.240 0.000 0.752 0.008
#> SRR1091380 5 0.6031 0.4924 0.128 0.000 0.352 0.000 0.520
#> SRR1099096 1 0.0290 0.7681 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1313583 4 0.4964 0.5415 0.204 0.000 0.000 0.700 0.096
#> SRR1467102 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.4014 0.7557 0.000 0.256 0.000 0.728 0.016
#> SRR818821 3 0.1502 0.8732 0.004 0.000 0.940 0.000 0.056
#> SRR809963 1 0.6712 0.1543 0.396 0.000 0.356 0.000 0.248
#> SRR1072247 1 0.0609 0.7723 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1353710 4 0.3013 0.8084 0.000 0.160 0.000 0.832 0.008
#> SRR1445259 5 0.4855 0.1511 0.024 0.000 0.424 0.000 0.552
#> SRR1408393 3 0.4800 0.6692 0.088 0.000 0.716 0.000 0.196
#> SRR1361522 1 0.1965 0.7645 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1368597 1 0.2230 0.7472 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1309680 2 0.0324 0.9595 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1310542 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.2632 0.8299 0.000 0.072 0.000 0.888 0.040
#> SRR1406437 4 0.3992 0.7311 0.000 0.268 0.000 0.720 0.012
#> SRR1354931 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391856 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446738 2 0.1124 0.9331 0.000 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375329 5 0.3579 0.7732 0.072 0.000 0.100 0.000 0.828
#> SRR1387921 1 0.0794 0.7726 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.1341 0.7717 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR812943 5 0.2482 0.7726 0.084 0.000 0.024 0.000 0.892
#> SRR1400910 5 0.3346 0.7729 0.064 0.000 0.092 0.000 0.844
#> SRR1444203 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR816177 2 0.1341 0.9134 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.2660 0.8194 0.000 0.128 0.000 0.864 0.008
#> SRR1397366 3 0.0404 0.8955 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1446028 5 0.4497 0.4078 0.424 0.000 0.008 0.000 0.568
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337606 5 0.2590 0.7562 0.060 0.000 0.028 0.012 0.900
#> SRR659109 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337192 5 0.3055 0.7774 0.144 0.000 0.016 0.000 0.840
#> SRR656946 1 0.4560 -0.1863 0.508 0.000 0.008 0.000 0.484
#> SRR1476102 1 0.3003 0.6809 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1476447 1 0.3999 0.4636 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1342067 4 0.0798 0.8406 0.000 0.016 0.000 0.976 0.008
#> SRR1385389 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1075971 1 0.3929 0.6752 0.764 0.000 0.028 0.000 0.208
#> SRR614419 5 0.2248 0.7662 0.088 0.000 0.012 0.000 0.900
#> SRR1322936 5 0.3013 0.7494 0.068 0.000 0.028 0.024 0.880
#> SRR1349121 1 0.0703 0.7723 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1430549 1 0.3074 0.6885 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR612935 3 0.3086 0.7540 0.004 0.000 0.816 0.000 0.180
#> SRR661481 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.3809 0.7576 0.000 0.256 0.000 0.736 0.008
#> SRR1452164 1 0.1908 0.7599 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1070503 3 0.2771 0.8277 0.012 0.000 0.860 0.000 0.128
#> SRR1499894 3 0.0703 0.8893 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1082883 5 0.3279 0.7383 0.064 0.000 0.028 0.040 0.868
#> SRR1468271 1 0.1571 0.7683 0.936 0.000 0.004 0.000 0.060
#> SRR1332443 1 0.0609 0.7709 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR810295 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.2561 0.7460 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1328620 3 0.4025 0.5570 0.008 0.000 0.700 0.000 0.292
#> SRR1396294 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1419917 1 0.4576 0.5996 0.692 0.000 0.040 0.000 0.268
#> SRR662114 3 0.3430 0.7000 0.004 0.000 0.776 0.000 0.220
#> SRR1489199 3 0.4420 0.6314 0.028 0.000 0.692 0.000 0.280
#> SRR813584 2 0.2890 0.7694 0.000 0.836 0.000 0.160 0.004
#> SRR1069638 5 0.3828 0.7675 0.072 0.000 0.120 0.000 0.808
#> SRR614864 3 0.0404 0.8955 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1433392 3 0.6694 -0.0153 0.348 0.000 0.408 0.000 0.244
#> SRR1377777 2 0.0451 0.9568 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR2167710 1 0.4559 -0.1712 0.512 0.000 0.008 0.000 0.480
#> SRR1401252 4 0.4503 0.7502 0.000 0.256 0.000 0.704 0.040
#> SRR1309963 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1338031 1 0.1671 0.7611 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 5 0.4659 0.1032 0.492 0.000 0.012 0.000 0.496
#> SRR1380393 1 0.0609 0.7723 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1319731 1 0.0703 0.7724 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1356468 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.3160 0.6952 0.808 0.000 0.004 0.000 0.188
#> SRR1486538 4 0.0609 0.8341 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1340486 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1377696 4 0.5395 0.5911 0.000 0.356 0.000 0.576 0.068
#> SRR1465459 3 0.2707 0.8279 0.008 0.000 0.860 0.000 0.132
#> SRR1080270 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0609 0.8940 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1093148 5 0.4374 0.7812 0.144 0.008 0.072 0.000 0.776
#> SRR1467080 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.4283 0.6424 0.000 0.348 0.000 0.644 0.008
#> SRR1379198 4 0.0000 0.8392 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613342 3 0.0290 0.8964 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1452246 2 0.0162 0.9617 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.8392 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813824 3 0.0162 0.8966 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1082376 3 0.6627 0.1655 0.296 0.000 0.452 0.000 0.252
#> SRR1500891 4 0.4573 0.7486 0.000 0.256 0.000 0.700 0.044
#> SRR807543 3 0.4028 0.7381 0.040 0.000 0.768 0.000 0.192
#> SRR1091572 5 0.3193 0.7852 0.132 0.000 0.028 0.000 0.840
#> SRR1346689 4 0.3912 0.7756 0.000 0.228 0.000 0.752 0.020
#> SRR1332424 5 0.3012 0.7812 0.124 0.000 0.024 0.000 0.852
#> SRR663729 4 0.3409 0.8124 0.000 0.144 0.000 0.824 0.032
#> SRR1097013 1 0.2068 0.7634 0.904 0.000 0.004 0.000 0.092
#> SRR613675 5 0.2325 0.7623 0.068 0.000 0.028 0.000 0.904
#> SRR1485357 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR655816 3 0.3582 0.6714 0.008 0.000 0.768 0.000 0.224
#> SRR1500113 1 0.3700 0.5719 0.752 0.000 0.008 0.000 0.240
#> SRR1437622 2 0.1831 0.8860 0.000 0.920 0.000 0.076 0.004
#> SRR1355172 1 0.2359 0.7577 0.904 0.000 0.036 0.000 0.060
#> SRR655531 5 0.3163 0.7412 0.164 0.000 0.012 0.000 0.824
#> SRR1338147 3 0.0609 0.8919 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1413329 5 0.5064 0.7143 0.232 0.000 0.088 0.000 0.680
#> SRR1485931 2 0.0162 0.9617 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1420873 1 0.0880 0.7724 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1333308 4 0.0579 0.8402 0.000 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1452033 1 0.1410 0.7691 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1467316 2 0.2707 0.8387 0.000 0.876 0.000 0.100 0.024
#> SRR809018 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.1478 0.8784 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1471755 2 0.0162 0.9612 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR808019 1 0.4520 0.4647 0.684 0.000 0.032 0.000 0.284
#> SRR1479133 3 0.0162 0.8972 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR615069 5 0.3752 0.7631 0.064 0.000 0.124 0.000 0.812
#> SRR1456185 2 0.3332 0.8132 0.008 0.844 0.000 0.028 0.120
#> SRR1350069 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR816316 1 0.6740 0.1565 0.404 0.000 0.268 0.000 0.328
#> SRR664795 1 0.4297 0.6740 0.764 0.000 0.072 0.000 0.164
#> SRR1490721 4 0.4573 0.7488 0.000 0.256 0.000 0.700 0.044
#> SRR810643 1 0.1478 0.7622 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1430333 5 0.3767 0.7866 0.120 0.000 0.068 0.000 0.812
#> SRR1085285 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.0963 0.8854 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1317985 1 0.0880 0.7728 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1487340 1 0.2230 0.7497 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1420276 3 0.0162 0.8973 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1351347 3 0.0566 0.8933 0.004 0.000 0.984 0.000 0.012
#> SRR1405525 5 0.3319 0.7746 0.160 0.000 0.020 0.000 0.820
#> SRR1370329 1 0.0880 0.7729 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1465001 1 0.0609 0.7723 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819610 4 0.4752 0.5099 0.000 0.412 0.000 0.568 0.020
#> SRR2157314 1 0.2966 0.7130 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.0451 0.8354 0.008 0.000 0.000 0.988 0.004
#> SRR613639 3 0.1270 0.8813 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1402285 4 0.0000 0.8392 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.6718 0.1721 0.412 0.000 0.328 0.000 0.260
#> SRR1405660 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 5 0.4808 0.1923 0.024 0.000 0.400 0.000 0.576
#> SRR1394734 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.2773 0.7075 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR1365894 4 0.4327 0.6237 0.000 0.360 0.000 0.632 0.008
#> SRR1073581 1 0.2674 0.7366 0.868 0.000 0.012 0.000 0.120
#> SRR659804 1 0.2424 0.7090 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.3602 0.7086 0.000 0.796 0.000 0.180 0.024
#> SRR660764 3 0.1341 0.8682 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR820448 1 0.6699 0.1958 0.428 0.000 0.304 0.000 0.268
#> SRR1328845 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1336415 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1379065 4 0.0162 0.8401 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1459190 3 0.5515 0.4038 0.108 0.000 0.624 0.000 0.268
#> SRR1346773 1 0.3999 0.3389 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1499521 1 0.1697 0.7671 0.932 0.000 0.008 0.000 0.060
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.1732 0.8613 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1081209 2 0.0162 0.9617 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1400202 1 0.1410 0.7652 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1333395 4 0.1830 0.8352 0.000 0.028 0.000 0.932 0.040
#> SRR1309248 4 0.5202 0.6160 0.000 0.348 0.000 0.596 0.056
#> SRR809161 3 0.1197 0.8853 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1316320 4 0.5498 0.5843 0.000 0.356 0.000 0.568 0.076
#> SRR1432629 2 0.0162 0.9617 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1498931 1 0.0703 0.7723 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1416578 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1405547 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1380764 1 0.3366 0.5739 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232
#> SRR1309160 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.2912 0.7510 0.876 0.000 0.008 0.028 0.088
#> SRR1078489 5 0.3810 0.7828 0.100 0.000 0.088 0.000 0.812
#> SRR1332648 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR660614 5 0.4252 0.7308 0.064 0.000 0.172 0.000 0.764
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0794 0.7726 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1477949 1 0.2471 0.7066 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.5210 0.5740 0.684 0.000 0.132 0.000 0.184
#> SRR615946 3 0.0162 0.8966 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.4980 0.3058 0.584 0.000 0.036 0.000 0.380
#> SRR660224 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.4840 0.5401 0.640 0.000 0.040 0.000 0.320
#> SRR1347166 5 0.3197 0.7808 0.140 0.000 0.024 0.000 0.836
#> SRR1485722 5 0.5159 0.7340 0.164 0.000 0.144 0.000 0.692
#> SRR1415316 1 0.3366 0.6790 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232
#> SRR613390 1 0.6215 0.3078 0.500 0.000 0.152 0.000 0.348
#> SRR661108 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2170173 5 0.5834 0.5961 0.136 0.000 0.276 0.000 0.588
#> SRR817329 1 0.4747 0.5425 0.636 0.000 0.032 0.000 0.332
#> SRR1401990 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1467745 2 0.0798 0.9469 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 3 0.5082 0.6294 0.096 0.000 0.684 0.000 0.220
#> SRR1314873 1 0.3966 0.4725 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1401211 1 0.1831 0.7669 0.920 0.000 0.004 0.000 0.076
#> SRR1419692 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR818797 3 0.2563 0.8389 0.008 0.000 0.872 0.000 0.120
#> SRR2164608 3 0.5723 0.0402 0.088 0.000 0.520 0.000 0.392
#> SRR1455586 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.3194 0.7694 0.000 0.832 0.000 0.148 0.020
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.4622 0.6317 0.044 0.000 0.692 0.000 0.264
#> SRR1361652 5 0.2325 0.7709 0.068 0.000 0.028 0.000 0.904
#> SRR1437119 1 0.0609 0.7715 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1478547 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 5 0.4058 0.7468 0.064 0.000 0.152 0.000 0.784
#> SRR1310584 1 0.0609 0.7715 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1500216 5 0.3909 0.7356 0.216 0.000 0.024 0.000 0.760
#> SRR1486762 3 0.1430 0.8727 0.004 0.000 0.944 0.000 0.052
#> SRR1480854 4 0.4430 0.7514 0.000 0.256 0.000 0.708 0.036
#> SRR1489394 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1418085 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1340221 4 0.0000 0.8392 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473058 2 0.4425 0.1445 0.000 0.600 0.000 0.392 0.008
#> SRR1405165 3 0.3671 0.6351 0.008 0.000 0.756 0.000 0.236
#> SRR1433004 1 0.5906 0.2929 0.492 0.000 0.104 0.000 0.404
#> SRR1471477 1 0.3132 0.6709 0.820 0.000 0.008 0.000 0.172
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 4 0.0290 0.8393 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1455038 5 0.5982 0.2442 0.312 0.000 0.136 0.000 0.552
#> SRR1375248 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.1792 0.8663 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1348378 2 0.0290 0.9590 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1413541 1 0.4763 0.5208 0.632 0.000 0.032 0.000 0.336
#> SRR1392943 4 0.4851 0.7683 0.004 0.224 0.008 0.716 0.048
#> SRR1475192 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 5 0.3106 0.7814 0.132 0.000 0.024 0.000 0.844
#> SRR1347060 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0609 0.7700 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1413436 5 0.4644 0.2779 0.460 0.000 0.012 0.000 0.528
#> SRR1311266 5 0.4540 0.6269 0.320 0.000 0.024 0.000 0.656
#> SRR1343302 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1373746 1 0.1197 0.7679 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1429678 1 0.1197 0.7734 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.3203 0.7927 0.012 0.000 0.820 0.000 0.168
#> SRR1345609 1 0.2127 0.7303 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1380208 4 0.6296 0.4788 0.000 0.360 0.000 0.480 0.160
#> SRR1322840 4 0.0000 0.8392 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.1197 0.8777 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1369196 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0794 0.7724 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1365291 3 0.1732 0.8701 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1367920 4 0.4645 0.7363 0.000 0.268 0.000 0.688 0.044
#> SRR1366648 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9638 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 5 0.5507 0.6933 0.160 0.000 0.188 0.000 0.652
#> SRR1363968 1 0.1764 0.7671 0.928 0.000 0.008 0.000 0.064
#> SRR814387 1 0.0609 0.7723 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR657599 5 0.5036 0.3482 0.452 0.000 0.032 0.000 0.516
#> SRR1386689 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1395575 3 0.0510 0.8953 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1453811 3 0.2179 0.8542 0.004 0.000 0.896 0.000 0.100
#> SRR1441159 5 0.4538 0.3444 0.452 0.000 0.008 0.000 0.540
#> SRR1403154 4 0.0162 0.8391 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1468722 3 0.0000 0.8977 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.1732 0.8682 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 1 0.2702 0.7824 0.868 0.000 0.004 0.000 0.092 0.036
#> SRR1331708 5 0.4710 0.6214 0.136 0.016 0.000 0.000 0.716 0.132
#> SRR1464258 3 0.7412 -0.1145 0.192 0.000 0.332 0.000 0.332 0.144
#> SRR1454201 5 0.4631 0.6522 0.112 0.000 0.140 0.000 0.728 0.020
#> SRR661589 3 0.0146 0.8654 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1456229 5 0.7321 0.2424 0.264 0.000 0.240 0.000 0.380 0.116
#> SRR1315165 4 0.2053 0.7581 0.000 0.004 0.000 0.888 0.000 0.108
#> SRR1488960 1 0.0865 0.8205 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1417809 4 0.3278 0.6862 0.000 0.040 0.000 0.808 0.000 0.152
#> SRR1094457 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095575 5 0.4590 0.5823 0.224 0.000 0.096 0.000 0.680 0.000
#> SRR1315931 1 0.5887 0.3118 0.540 0.000 0.044 0.000 0.324 0.092
#> SRR1430066 3 0.0146 0.8644 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1431037 3 0.0146 0.8644 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1395554 3 0.0000 0.8645 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818002 2 0.2941 0.5546 0.000 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1344143 2 0.4632 -0.2706 0.000 0.520 0.000 0.040 0.000 0.440
#> SRR1486845 4 0.0790 0.8089 0.000 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1362866 5 0.2454 0.6326 0.160 0.000 0.000 0.000 0.840 0.000
#> SRR1490740 1 0.3624 0.6857 0.784 0.000 0.000 0.000 0.156 0.060
#> SRR1446627 2 0.1444 0.7578 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1456138 2 0.1387 0.7274 0.000 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1416248 1 0.0146 0.8124 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1383907 6 0.5852 0.8004 0.000 0.208 0.000 0.328 0.000 0.464
#> SRR1311018 1 0.0717 0.8177 0.976 0.000 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1375699 2 0.5449 -0.5235 0.000 0.456 0.000 0.120 0.000 0.424
#> SRR1429846 3 0.2737 0.8218 0.004 0.000 0.868 0.000 0.044 0.084
#> SRR613550 3 0.0858 0.8636 0.000 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1348402 1 0.1265 0.8225 0.948 0.000 0.000 0.000 0.044 0.008
#> SRR1345146 5 0.4134 0.4534 0.316 0.000 0.000 0.000 0.656 0.028
#> SRR1324025 3 0.1265 0.8586 0.000 0.000 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1318879 5 0.4310 0.3154 0.004 0.000 0.404 0.000 0.576 0.016
#> SRR820755 3 0.6440 0.3767 0.064 0.000 0.520 0.000 0.264 0.152
#> SRR1485830 4 0.1910 0.7392 0.000 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR599313 5 0.2416 0.6367 0.156 0.000 0.000 0.000 0.844 0.000
#> SRR612263 5 0.4426 0.5408 0.112 0.000 0.036 0.000 0.760 0.092
#> SRR1415398 3 0.3453 0.7721 0.000 0.000 0.792 0.000 0.044 0.164
#> SRR1326205 4 0.1858 0.7704 0.000 0.004 0.000 0.904 0.000 0.092
#> SRR1421327 6 0.5844 0.8134 0.000 0.216 0.000 0.308 0.000 0.476
#> SRR1083311 3 0.0508 0.8648 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1499303 6 0.5894 0.7972 0.000 0.216 0.000 0.332 0.000 0.452
#> SRR1079522 5 0.3023 0.6415 0.140 0.000 0.000 0.000 0.828 0.032
#> SRR1452935 3 0.2697 0.7478 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1379495 1 0.0713 0.8194 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1470459 2 0.2762 0.7514 0.000 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR661361 3 0.0260 0.8646 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR615778 5 0.2664 0.6259 0.184 0.000 0.000 0.000 0.816 0.000
#> SRR1447564 1 0.2165 0.7986 0.884 0.000 0.000 0.000 0.108 0.008
#> SRR1455195 1 0.4697 0.2285 0.548 0.000 0.000 0.000 0.404 0.048
#> SRR655182 1 0.3136 0.7119 0.768 0.000 0.000 0.000 0.228 0.004
#> SRR1335140 2 0.3695 0.1498 0.000 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR1433555 3 0.0717 0.8651 0.000 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1308650 2 0.6396 0.2894 0.000 0.416 0.016 0.000 0.288 0.280
#> SRR1388354 1 0.0508 0.8170 0.984 0.000 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1317446 3 0.0363 0.8641 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1413602 3 0.2450 0.8109 0.000 0.000 0.868 0.000 0.116 0.016
#> SRR1479955 2 0.3647 0.2040 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR809853 5 0.2001 0.6202 0.048 0.000 0.000 0.000 0.912 0.040
#> SRR661313 3 0.1926 0.8456 0.000 0.000 0.912 0.000 0.020 0.068
#> SRR1499935 6 0.5784 0.7543 0.000 0.184 0.000 0.356 0.000 0.460
#> SRR1447303 3 0.2983 0.7979 0.000 0.000 0.832 0.000 0.032 0.136
#> SRR1429408 2 0.6059 -0.6380 0.000 0.380 0.000 0.360 0.000 0.260
#> SRR1433950 1 0.3052 0.7095 0.780 0.000 0.000 0.000 0.216 0.004
#> SRR1362081 2 0.2697 0.7545 0.000 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1409854 3 0.6241 0.3602 0.044 0.000 0.516 0.000 0.296 0.144
#> SRR1435229 5 0.2039 0.6382 0.072 0.000 0.004 0.000 0.908 0.016
#> SRR1085996 5 0.5408 -0.0176 0.412 0.000 0.004 0.000 0.484 0.100
#> SRR1414229 5 0.3717 0.3474 0.000 0.000 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR1400974 3 0.0508 0.8648 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1399971 1 0.0632 0.8193 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR613927 3 0.5940 0.4940 0.040 0.000 0.584 0.000 0.224 0.152
#> SRR1457854 1 0.0858 0.8205 0.968 0.000 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1473714 1 0.4453 0.4361 0.624 0.000 0.000 0.000 0.332 0.044
#> SRR813776 3 0.6207 0.4234 0.048 0.000 0.544 0.000 0.256 0.152
#> SRR808196 4 0.0146 0.8218 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1101085 6 0.5855 0.7701 0.000 0.200 0.000 0.352 0.000 0.448
#> SRR614395 5 0.7513 0.1639 0.228 0.000 0.300 0.000 0.324 0.148
#> SRR1478251 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.2793 0.7497 0.000 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1362310 1 0.0547 0.8191 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR665310 3 0.0520 0.8654 0.000 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1420109 5 0.4600 0.1022 0.028 0.000 0.468 0.000 0.500 0.004
#> SRR1330920 5 0.3869 0.6292 0.184 0.000 0.024 0.000 0.768 0.024
#> SRR1419539 2 0.3888 0.6662 0.000 0.672 0.000 0.016 0.000 0.312
#> SRR1359447 3 0.1958 0.8303 0.000 0.000 0.896 0.000 0.100 0.004
#> SRR1347259 4 0.4619 0.3905 0.000 0.088 0.000 0.668 0.000 0.244
#> SRR613915 3 0.3653 0.7796 0.028 0.000 0.820 0.000 0.076 0.076
#> SRR1384395 3 0.1625 0.8473 0.000 0.000 0.928 0.000 0.060 0.012
#> SRR821715 3 0.3728 0.7591 0.004 0.000 0.784 0.000 0.060 0.152
#> SRR1478228 1 0.0632 0.8193 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1445637 1 0.4479 0.5754 0.684 0.000 0.000 0.000 0.236 0.080
#> SRR608150 5 0.3962 0.6408 0.128 0.004 0.000 0.000 0.772 0.096
#> SRR1096383 1 0.2560 0.7841 0.872 0.000 0.000 0.000 0.092 0.036
#> SRR1341480 6 0.5831 0.7737 0.000 0.196 0.000 0.348 0.000 0.456
#> SRR1341344 5 0.3470 0.5805 0.248 0.000 0.000 0.000 0.740 0.012
#> SRR1326270 3 0.2814 0.8181 0.004 0.000 0.864 0.000 0.080 0.052
#> SRR1498838 3 0.0000 0.8645 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.8645 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808566 4 0.5618 -0.2250 0.000 0.252 0.000 0.540 0.000 0.208
#> SRR1430270 4 0.1633 0.7941 0.024 0.000 0.000 0.932 0.000 0.044
#> SRR1367825 3 0.1074 0.8617 0.000 0.000 0.960 0.000 0.028 0.012
#> SRR613533 3 0.0790 0.8642 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR661267 1 0.5894 -0.0212 0.464 0.000 0.368 0.000 0.160 0.008
#> SRR810665 2 0.2378 0.7625 0.000 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1407250 5 0.4893 0.6216 0.172 0.000 0.168 0.000 0.660 0.000
#> SRR1420067 1 0.2300 0.7847 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1473632 5 0.4057 0.3106 0.388 0.000 0.000 0.000 0.600 0.012
#> SRR812536 3 0.0291 0.8653 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1370850 2 0.0865 0.7451 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1486195 2 0.2823 0.7478 0.000 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1407671 6 0.4882 0.5206 0.000 0.428 0.000 0.060 0.000 0.512
#> SRR1446375 5 0.6288 0.3444 0.316 0.000 0.248 0.000 0.424 0.012
#> SRR1465230 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614119 1 0.2443 0.7866 0.880 0.000 0.004 0.000 0.096 0.020
#> SRR1356101 2 0.2854 0.7457 0.000 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1404209 1 0.1643 0.8089 0.924 0.000 0.000 0.000 0.068 0.008
#> SRR1392676 2 0.1007 0.7463 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR665538 1 0.2237 0.7989 0.896 0.000 0.000 0.000 0.068 0.036
#> SRR660510 3 0.0146 0.8644 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1445655 4 0.5426 -0.3015 0.000 0.128 0.000 0.516 0.000 0.356
#> SRR658953 5 0.1644 0.6571 0.028 0.000 0.040 0.000 0.932 0.000
#> SRR2166459 1 0.4091 0.6202 0.732 0.000 0.000 0.000 0.200 0.068
#> SRR1070713 2 0.1075 0.7557 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1485312 3 0.0146 0.8660 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1317631 4 0.0508 0.8187 0.000 0.004 0.000 0.984 0.000 0.012
#> SRR1488610 5 0.3342 0.5926 0.228 0.000 0.000 0.000 0.760 0.012
#> SRR1330588 3 0.0858 0.8632 0.000 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1316367 5 0.2070 0.6199 0.048 0.000 0.000 0.000 0.908 0.044
#> SRR1433926 1 0.4873 0.5010 0.632 0.000 0.000 0.000 0.268 0.100
#> SRR1091302 4 0.3229 0.6716 0.000 0.044 0.000 0.816 0.000 0.140
#> SRR818263 3 0.7288 -0.0194 0.160 0.000 0.368 0.000 0.328 0.144
#> SRR1404909 6 0.5767 0.8031 0.000 0.260 0.000 0.232 0.000 0.508
#> SRR663076 1 0.1341 0.8197 0.948 0.000 0.000 0.000 0.024 0.028
#> SRR1323577 2 0.1075 0.7392 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1442422 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.2457 0.7906 0.880 0.000 0.000 0.000 0.084 0.036
#> SRR654862 3 0.7022 0.0791 0.116 0.000 0.404 0.000 0.340 0.140
#> SRR1407112 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.1074 0.8635 0.000 0.000 0.960 0.000 0.012 0.028
#> SRR1353199 3 0.0508 0.8652 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1378885 3 0.5459 0.6001 0.036 0.000 0.652 0.000 0.160 0.152
#> SRR665357 3 0.1625 0.8473 0.000 0.000 0.928 0.000 0.060 0.012
#> SRR662186 2 0.1075 0.7392 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1501020 3 0.1556 0.8431 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1347819 3 0.0146 0.8656 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1480813 2 0.0146 0.7541 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1472576 6 0.5894 0.8166 0.000 0.244 0.000 0.284 0.000 0.472
#> SRR1431781 4 0.4046 0.5474 0.000 0.084 0.000 0.748 0.000 0.168
#> SRR1452270 3 0.0363 0.8641 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1500472 5 0.3225 0.6627 0.092 0.000 0.080 0.000 0.828 0.000
#> SRR1417632 6 0.5705 0.7891 0.000 0.280 0.000 0.204 0.000 0.516
#> SRR1350153 2 0.2340 0.7632 0.000 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1458113 3 0.2520 0.7884 0.000 0.000 0.844 0.000 0.152 0.004
#> SRR1326579 5 0.3050 0.5856 0.236 0.000 0.000 0.000 0.764 0.000
#> SRR1349363 2 0.4593 -0.3141 0.000 0.492 0.000 0.036 0.000 0.472
#> SRR1096712 3 0.1686 0.8460 0.000 0.000 0.924 0.000 0.064 0.012
#> SRR1090407 3 0.2255 0.8338 0.000 0.000 0.892 0.000 0.028 0.080
#> SRR1083752 2 0.2527 0.6334 0.000 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1377599 6 0.4985 0.5831 0.000 0.400 0.000 0.072 0.000 0.528
#> SRR1488449 3 0.0000 0.8645 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318354 3 0.2006 0.8303 0.000 0.000 0.892 0.000 0.104 0.004
#> SRR1359062 3 0.0508 0.8648 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1398924 5 0.1578 0.6508 0.004 0.000 0.048 0.000 0.936 0.012
#> SRR663783 3 0.0405 0.8657 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1319204 5 0.7236 0.4404 0.024 0.124 0.156 0.000 0.508 0.188
#> SRR1369070 2 0.1204 0.7350 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR615659 1 0.3730 0.6774 0.772 0.000 0.000 0.000 0.168 0.060
#> SRR1337449 2 0.2260 0.7638 0.000 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR1316982 2 0.2854 0.7457 0.000 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1498595 6 0.5547 0.6949 0.000 0.344 0.000 0.148 0.000 0.508
#> SRR1377423 3 0.0937 0.8609 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1312310 2 0.2454 0.7613 0.000 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1485613 1 0.1757 0.8165 0.916 0.000 0.000 0.000 0.076 0.008
#> SRR1338426 3 0.3136 0.6652 0.000 0.000 0.768 0.000 0.228 0.004
#> SRR1353309 3 0.0909 0.8638 0.000 0.000 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR658941 5 0.6710 0.4156 0.308 0.004 0.168 0.000 0.464 0.056
#> SRR1101643 1 0.1556 0.8114 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1401468 1 0.3023 0.7669 0.828 0.000 0.000 0.000 0.140 0.032
#> SRR1368874 2 0.2697 0.7546 0.000 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1324085 4 0.5219 0.0889 0.000 0.176 0.000 0.612 0.000 0.212
#> SRR1363858 5 0.5141 0.2053 0.420 0.004 0.000 0.000 0.504 0.072
#> SRR819820 3 0.4392 0.3641 0.040 0.000 0.628 0.000 0.332 0.000
#> SRR1337342 5 0.3483 0.5916 0.236 0.000 0.016 0.000 0.748 0.000
#> SRR655206 2 0.3636 0.6681 0.000 0.676 0.000 0.004 0.000 0.320
#> SRR1387013 2 0.2793 0.5761 0.000 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1317410 1 0.0632 0.8193 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR608198 5 0.3168 0.6198 0.192 0.000 0.000 0.000 0.792 0.016
#> SRR1440161 2 0.2854 0.7457 0.000 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1343741 2 0.1204 0.7350 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1381288 2 0.1075 0.7392 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1415379 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.2854 0.7457 0.000 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR663197 3 0.0291 0.8653 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1394836 2 0.3198 0.7230 0.000 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR661699 5 0.7074 0.4736 0.024 0.096 0.136 0.000 0.512 0.232
#> SRR813680 1 0.5484 0.2277 0.568 0.000 0.280 0.000 0.148 0.004
#> SRR1410678 1 0.0713 0.8194 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499174 5 0.3923 0.1683 0.416 0.000 0.000 0.000 0.580 0.004
#> SRR1311486 2 0.2219 0.7640 0.000 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1382851 2 0.3795 0.1754 0.000 0.632 0.000 0.004 0.000 0.364
#> SRR1433410 5 0.2778 0.6354 0.168 0.000 0.000 0.000 0.824 0.008
#> SRR661167 3 0.0405 0.8653 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1432518 3 0.1204 0.8574 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR660462 3 0.0146 0.8644 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1374608 4 0.5019 0.2806 0.000 0.104 0.000 0.604 0.000 0.292
#> SRR657949 3 0.6004 0.4097 0.040 0.000 0.548 0.000 0.288 0.124
#> SRR1308882 4 0.3240 0.5385 0.000 0.004 0.000 0.752 0.000 0.244
#> SRR655768 1 0.3911 0.3880 0.624 0.000 0.000 0.000 0.368 0.008
#> SRR1485870 6 0.5841 0.7969 0.000 0.204 0.000 0.332 0.000 0.464
#> SRR1444138 1 0.6817 0.1733 0.476 0.000 0.200 0.000 0.244 0.080
#> SRR1417342 1 0.3580 0.7513 0.812 0.000 0.000 0.024 0.128 0.036
#> SRR1470193 4 0.4929 0.2837 0.000 0.100 0.000 0.620 0.000 0.280
#> SRR1091380 3 0.5578 0.0592 0.080 0.000 0.520 0.000 0.376 0.024
#> SRR1099096 1 0.0146 0.8124 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313583 4 0.4572 0.5773 0.124 0.000 0.000 0.744 0.032 0.100
#> SRR1467102 2 0.2854 0.7457 0.000 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1485416 6 0.5852 0.8004 0.000 0.208 0.000 0.328 0.000 0.464
#> SRR818821 3 0.0937 0.8624 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR809963 5 0.7539 0.2168 0.256 0.000 0.272 0.000 0.324 0.148
#> SRR1072247 1 0.0632 0.8193 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1353710 4 0.4200 0.5110 0.000 0.072 0.000 0.720 0.000 0.208
#> SRR1445259 5 0.5173 0.1554 0.036 0.000 0.384 0.000 0.548 0.032
#> SRR1408393 3 0.6633 0.2887 0.072 0.000 0.480 0.000 0.296 0.152
#> SRR1361522 1 0.1434 0.8122 0.940 0.000 0.000 0.000 0.048 0.012
#> SRR1368597 1 0.1444 0.8142 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1309680 2 0.1556 0.7196 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1310542 3 0.0820 0.8647 0.000 0.000 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR1333485 4 0.4065 0.3584 0.000 0.028 0.000 0.672 0.000 0.300
#> SRR1406437 4 0.5470 0.0882 0.000 0.136 0.000 0.516 0.000 0.348
#> SRR1354931 3 0.0146 0.8654 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1391856 2 0.2854 0.7457 0.000 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1446738 2 0.3394 0.6584 0.000 0.752 0.000 0.012 0.000 0.236
#> SRR1309032 2 0.2664 0.7557 0.000 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1388145 2 0.2378 0.7625 0.000 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1432611 2 0.2454 0.7613 0.000 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR815869 3 0.0820 0.8645 0.000 0.000 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR613150 3 0.0363 0.8641 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1375329 5 0.3718 0.6512 0.084 0.000 0.132 0.000 0.784 0.000
#> SRR1387921 1 0.0713 0.8194 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1466792 2 0.2697 0.7545 0.000 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1360478 2 0.1610 0.7616 0.000 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1360695 1 0.1421 0.8214 0.944 0.000 0.000 0.000 0.028 0.028
#> SRR812943 5 0.2230 0.6474 0.084 0.000 0.000 0.000 0.892 0.024
#> SRR1400910 5 0.3213 0.6616 0.084 0.000 0.076 0.000 0.836 0.004
#> SRR1444203 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816177 2 0.2165 0.6805 0.000 0.884 0.000 0.008 0.000 0.108
#> SRR658754 3 0.1297 0.8572 0.000 0.000 0.948 0.000 0.040 0.012
#> SRR1429603 4 0.4236 0.3818 0.000 0.036 0.000 0.656 0.000 0.308
#> SRR1397366 3 0.0547 0.8658 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1446028 1 0.3727 0.3444 0.612 0.000 0.000 0.000 0.388 0.000
#> SRR1083918 2 0.1204 0.7343 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1337606 5 0.4336 0.6513 0.120 0.004 0.024 0.000 0.768 0.084
#> SRR659109 3 0.0260 0.8644 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1337192 5 0.3368 0.5912 0.232 0.000 0.000 0.000 0.756 0.012
#> SRR656946 1 0.4362 0.3236 0.584 0.000 0.000 0.000 0.388 0.028
#> SRR1476102 1 0.1584 0.8067 0.928 0.000 0.000 0.000 0.064 0.008
#> SRR1476447 1 0.2793 0.7184 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1342067 4 0.3330 0.4840 0.000 0.000 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1385389 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.4727 0.5367 0.660 0.000 0.000 0.000 0.240 0.100
#> SRR614419 5 0.2070 0.6180 0.048 0.000 0.000 0.000 0.908 0.044
#> SRR1322936 5 0.4117 0.6361 0.144 0.004 0.000 0.000 0.756 0.096
#> SRR1349121 1 0.0790 0.8205 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1430549 1 0.1714 0.8012 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR612935 3 0.2178 0.8074 0.000 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR661481 2 0.0458 0.7503 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1354117 2 0.2854 0.7457 0.000 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1393596 6 0.5862 0.8029 0.000 0.212 0.000 0.324 0.000 0.464
#> SRR1452164 1 0.0858 0.8178 0.968 0.000 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR1070503 3 0.4971 0.6556 0.020 0.000 0.692 0.000 0.136 0.152
#> SRR1499894 3 0.1686 0.8460 0.000 0.000 0.924 0.000 0.064 0.012
#> SRR1082883 5 0.4036 0.6409 0.120 0.008 0.000 0.000 0.772 0.100
#> SRR1468271 1 0.2560 0.7841 0.872 0.000 0.000 0.000 0.092 0.036
#> SRR1332443 1 0.0146 0.8124 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR810295 2 0.2491 0.7606 0.000 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR662103 1 0.2750 0.7458 0.844 0.000 0.000 0.000 0.136 0.020
#> SRR1328620 3 0.2234 0.8146 0.000 0.000 0.872 0.000 0.124 0.004
#> SRR1396294 4 0.0692 0.8158 0.000 0.004 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1419917 1 0.5266 0.3758 0.560 0.000 0.004 0.000 0.336 0.100
#> SRR662114 3 0.2442 0.7970 0.000 0.000 0.852 0.000 0.144 0.004
#> SRR1489199 3 0.6199 0.2677 0.044 0.000 0.484 0.000 0.352 0.120
#> SRR813584 2 0.4493 0.4074 0.000 0.708 0.000 0.132 0.000 0.160
#> SRR1069638 5 0.4205 0.6363 0.084 0.000 0.188 0.000 0.728 0.000
#> SRR614864 3 0.0777 0.8645 0.000 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1433392 5 0.7483 0.1283 0.212 0.000 0.316 0.000 0.324 0.148
#> SRR1377777 2 0.2664 0.6058 0.000 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR2167710 1 0.4468 0.3818 0.612 0.000 0.016 0.000 0.356 0.016
#> SRR1401252 6 0.5836 0.8102 0.000 0.212 0.000 0.312 0.000 0.476
#> SRR1309963 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.2358 0.7503 0.876 0.000 0.000 0.000 0.108 0.016
#> SRR1418628 2 0.2260 0.7636 0.000 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR1486889 1 0.3997 0.6037 0.688 0.000 0.004 0.000 0.288 0.020
#> SRR1380393 1 0.1168 0.8207 0.956 0.000 0.000 0.000 0.028 0.016
#> SRR1319731 1 0.0790 0.8193 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1356468 4 0.0260 0.8208 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1337010 2 0.2664 0.7562 0.000 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1486520 1 0.2699 0.7667 0.856 0.000 0.012 0.000 0.124 0.008
#> SRR1486538 4 0.1327 0.7992 0.000 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1340486 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377696 6 0.4735 0.4921 0.000 0.432 0.000 0.048 0.000 0.520
#> SRR1465459 3 0.4364 0.7043 0.004 0.000 0.732 0.000 0.112 0.152
#> SRR1080270 3 0.0363 0.8641 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1312501 3 0.0790 0.8642 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1093148 5 0.6114 0.6220 0.104 0.040 0.124 0.000 0.656 0.076
#> SRR1467080 3 0.0508 0.8648 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1410866 2 0.0713 0.7601 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR816475 4 0.5289 0.2055 0.000 0.140 0.000 0.580 0.000 0.280
#> SRR1379198 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613342 3 0.0632 0.8652 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1452246 2 0.2003 0.6873 0.000 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1338836 2 0.1204 0.7350 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1369129 4 0.0260 0.8205 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1396616 3 0.0000 0.8645 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813824 3 0.0260 0.8646 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1082376 3 0.7292 -0.0200 0.156 0.000 0.364 0.000 0.332 0.148
#> SRR1500891 6 0.5844 0.8134 0.000 0.216 0.000 0.308 0.000 0.476
#> SRR807543 3 0.6427 0.3390 0.056 0.000 0.504 0.000 0.288 0.152
#> SRR1091572 5 0.3678 0.6628 0.128 0.000 0.084 0.000 0.788 0.000
#> SRR1346689 6 0.5498 0.5814 0.000 0.128 0.000 0.408 0.000 0.464
#> SRR1332424 5 0.2932 0.6327 0.164 0.000 0.000 0.000 0.820 0.016
#> SRR663729 4 0.4996 0.1423 0.000 0.100 0.000 0.604 0.000 0.296
#> SRR1097013 1 0.1434 0.8113 0.940 0.000 0.000 0.000 0.048 0.012
#> SRR613675 5 0.4117 0.6361 0.144 0.004 0.000 0.000 0.756 0.096
#> SRR1485357 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655816 3 0.2165 0.8208 0.000 0.000 0.884 0.000 0.108 0.008
#> SRR1500113 1 0.2651 0.7912 0.860 0.000 0.000 0.000 0.112 0.028
#> SRR1437622 2 0.2996 0.5400 0.000 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228
#> SRR1355172 1 0.3466 0.7535 0.832 0.000 0.040 0.000 0.092 0.036
#> SRR655531 5 0.3652 0.5991 0.188 0.000 0.000 0.000 0.768 0.044
#> SRR1338147 3 0.1926 0.8456 0.000 0.000 0.912 0.000 0.020 0.068
#> SRR1413329 5 0.5468 0.5537 0.160 0.000 0.288 0.000 0.552 0.000
#> SRR1485931 2 0.1663 0.7129 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1420873 1 0.0260 0.8168 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1333308 4 0.3081 0.6350 0.000 0.004 0.000 0.776 0.000 0.220
#> SRR1452033 1 0.1418 0.8139 0.944 0.000 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1467316 2 0.3634 0.2173 0.000 0.644 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR809018 3 0.0622 0.8651 0.000 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1375351 2 0.1007 0.7414 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR663440 3 0.2726 0.8160 0.000 0.000 0.856 0.000 0.032 0.112
#> SRR1471755 2 0.2260 0.6653 0.000 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR808019 1 0.3883 0.7127 0.788 0.000 0.040 0.000 0.144 0.028
#> SRR1479133 3 0.0405 0.8653 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR615069 5 0.4304 0.5999 0.040 0.000 0.228 0.000 0.716 0.016
#> SRR1456185 2 0.5378 0.5173 0.000 0.556 0.000 0.000 0.140 0.304
#> SRR1350069 4 0.0603 0.8173 0.000 0.004 0.000 0.980 0.000 0.016
#> SRR816316 5 0.7413 0.2484 0.248 0.000 0.264 0.000 0.360 0.128
#> SRR664795 1 0.4233 0.6369 0.752 0.000 0.100 0.000 0.140 0.008
#> SRR1490721 6 0.5889 0.8160 0.000 0.260 0.000 0.264 0.000 0.476
#> SRR810643 1 0.1075 0.8157 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1430333 5 0.4731 0.6350 0.108 0.000 0.156 0.000 0.716 0.020
#> SRR1085285 3 0.0146 0.8654 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1099072 3 0.0865 0.8617 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1317985 1 0.0777 0.8204 0.972 0.000 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1487340 1 0.1501 0.8147 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1420276 3 0.1625 0.8473 0.000 0.000 0.928 0.000 0.060 0.012
#> SRR1351347 3 0.0260 0.8662 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1405525 5 0.3445 0.5815 0.244 0.000 0.000 0.000 0.744 0.012
#> SRR1370329 1 0.0865 0.8188 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1465001 1 0.0632 0.8193 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1476525 2 0.0937 0.7427 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR819610 2 0.6089 -0.5217 0.000 0.392 0.000 0.308 0.000 0.300
#> SRR2157314 1 0.2020 0.8124 0.896 0.000 0.000 0.000 0.096 0.008
#> SRR1409465 2 0.1007 0.7415 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR809987 4 0.0713 0.8165 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR613639 3 0.1921 0.8488 0.000 0.000 0.916 0.000 0.052 0.032
#> SRR1402285 4 0.0146 0.8216 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1077038 5 0.7514 0.1974 0.288 0.000 0.232 0.000 0.332 0.148
#> SRR1405660 3 0.1500 0.8515 0.000 0.000 0.936 0.000 0.052 0.012
#> SRR1095455 5 0.4619 0.3569 0.020 0.000 0.296 0.000 0.652 0.032
#> SRR1394734 2 0.1444 0.7218 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1317771 1 0.2048 0.7768 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1365894 6 0.5962 0.8072 0.000 0.280 0.000 0.268 0.000 0.452
#> SRR1073581 1 0.2798 0.7770 0.852 0.000 0.000 0.000 0.112 0.036
#> SRR659804 1 0.1204 0.8123 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1345914 2 0.0363 0.7522 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1432186 2 0.0632 0.7480 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1473529 2 0.3851 -0.1728 0.000 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR660764 3 0.1152 0.8611 0.000 0.000 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR820448 5 0.7361 0.2308 0.272 0.000 0.240 0.000 0.368 0.120
#> SRR1328845 4 0.0692 0.8158 0.000 0.004 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1336415 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0937 0.8080 0.000 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1459190 3 0.1908 0.8302 0.004 0.000 0.900 0.000 0.096 0.000
#> SRR1346773 1 0.2006 0.7972 0.892 0.000 0.000 0.000 0.104 0.004
#> SRR1499521 1 0.2560 0.7841 0.872 0.000 0.000 0.000 0.092 0.036
#> SRR1440898 2 0.0458 0.7508 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1347459 3 0.1858 0.8391 0.000 0.000 0.904 0.000 0.092 0.004
#> SRR1081209 2 0.1141 0.7387 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1400202 1 0.0937 0.8180 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1333395 4 0.4044 0.5543 0.000 0.040 0.000 0.704 0.000 0.256
#> SRR1309248 6 0.4829 0.5288 0.000 0.424 0.000 0.056 0.000 0.520
#> SRR809161 3 0.3344 0.7760 0.000 0.000 0.804 0.000 0.044 0.152
#> SRR1316320 2 0.4589 -0.3160 0.000 0.504 0.000 0.036 0.000 0.460
#> SRR1432629 2 0.1267 0.7326 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1498931 1 0.0891 0.8204 0.968 0.000 0.000 0.000 0.024 0.008
#> SRR1416578 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0820 0.8645 0.000 0.000 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR1470534 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.1267 0.8107 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.8645 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.1367 0.8556 0.000 0.000 0.944 0.000 0.044 0.012
#> SRR1500450 1 0.3493 0.7658 0.828 0.000 0.000 0.036 0.100 0.036
#> SRR1078489 5 0.4576 0.6271 0.084 0.000 0.192 0.000 0.712 0.012
#> SRR1332648 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660614 5 0.3894 0.4617 0.004 0.000 0.324 0.000 0.664 0.008
#> SRR1470420 2 0.2454 0.7616 0.000 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1475566 1 0.0632 0.8193 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1477949 1 0.1267 0.8132 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1481419 2 0.0937 0.7427 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1464766 1 0.6060 0.4048 0.596 0.000 0.084 0.000 0.212 0.108
#> SRR615946 3 0.0000 0.8645 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.0458 0.7569 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1467656 2 0.2527 0.7607 0.000 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1402962 1 0.5037 0.1776 0.540 0.000 0.080 0.000 0.380 0.000
#> SRR660224 2 0.2562 0.7610 0.000 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR665586 1 0.5387 0.1477 0.464 0.000 0.004 0.000 0.436 0.096
#> SRR1347166 5 0.2454 0.6357 0.160 0.000 0.000 0.000 0.840 0.000
#> SRR1485722 5 0.5591 0.5547 0.196 0.000 0.232 0.000 0.568 0.004
#> SRR1415316 1 0.2631 0.7698 0.840 0.000 0.000 0.000 0.152 0.008
#> SRR613390 5 0.7077 0.1601 0.328 0.000 0.152 0.000 0.404 0.116
#> SRR661108 3 0.0146 0.8644 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2170173 5 0.5328 0.5000 0.132 0.000 0.308 0.000 0.560 0.000
#> SRR817329 1 0.5317 0.1848 0.464 0.000 0.004 0.000 0.444 0.088
#> SRR1401990 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467745 2 0.2730 0.7196 0.000 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1471795 2 0.0632 0.7480 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1415637 2 0.1910 0.7618 0.000 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR813137 3 0.6969 0.1859 0.180 0.000 0.456 0.000 0.264 0.100
#> SRR1314873 1 0.3076 0.6568 0.760 0.000 0.000 0.000 0.240 0.000
#> SRR1401211 1 0.2537 0.8004 0.872 0.000 0.000 0.000 0.096 0.032
#> SRR1419692 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818797 3 0.4322 0.7085 0.004 0.000 0.736 0.000 0.108 0.152
#> SRR2164608 3 0.3470 0.6354 0.000 0.000 0.740 0.000 0.248 0.012
#> SRR1455586 2 0.2854 0.7457 0.000 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR819459 3 0.0508 0.8650 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1488939 2 0.3706 0.1357 0.000 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1433232 2 0.1327 0.7300 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1385501 3 0.6251 0.2431 0.052 0.000 0.476 0.000 0.360 0.112
#> SRR1361652 5 0.1679 0.6519 0.016 0.000 0.036 0.000 0.936 0.012
#> SRR1437119 1 0.0458 0.8185 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1478547 3 0.0291 0.8653 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1430910 5 0.3756 0.4772 0.004 0.000 0.316 0.000 0.676 0.004
#> SRR1310584 1 0.0363 0.8178 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1500216 5 0.2664 0.6262 0.184 0.000 0.000 0.000 0.816 0.000
#> SRR1486762 3 0.0993 0.8637 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR1480854 6 0.5877 0.7980 0.000 0.212 0.000 0.332 0.000 0.456
#> SRR1489394 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0260 0.8205 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1473058 4 0.5982 -0.2158 0.000 0.288 0.000 0.444 0.000 0.268
#> SRR1405165 3 0.2480 0.8123 0.000 0.000 0.872 0.000 0.104 0.024
#> SRR1433004 5 0.6865 0.1885 0.308 0.000 0.128 0.000 0.452 0.112
#> SRR1471477 1 0.2752 0.7774 0.856 0.000 0.000 0.000 0.108 0.036
#> SRR1098567 2 0.2730 0.7530 0.000 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1098712 4 0.1701 0.7818 0.000 0.008 0.000 0.920 0.000 0.072
#> SRR1455038 5 0.5439 0.3925 0.224 0.000 0.040 0.000 0.640 0.096
#> SRR1375248 2 0.2854 0.7457 0.000 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1403005 3 0.3408 0.7725 0.000 0.000 0.800 0.000 0.048 0.152
#> SRR1348378 2 0.3023 0.7367 0.000 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232
#> SRR1413541 5 0.5295 -0.0987 0.440 0.000 0.000 0.000 0.460 0.100
#> SRR1392943 4 0.5727 -0.0853 0.000 0.156 0.000 0.532 0.008 0.304
#> SRR1475192 3 0.0622 0.8652 0.000 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1432085 2 0.2854 0.7457 0.000 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1452468 5 0.2520 0.6377 0.152 0.000 0.004 0.000 0.844 0.000
#> SRR1347060 3 0.0363 0.8641 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1414139 2 0.3217 0.7337 0.000 0.768 0.000 0.000 0.008 0.224
#> SRR1447962 2 0.2823 0.7478 0.000 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1444324 2 0.2854 0.7457 0.000 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1415004 1 0.0508 0.8169 0.984 0.000 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1413436 1 0.3446 0.5478 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1311266 5 0.3782 0.2947 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588 0.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0790 0.8194 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1429678 1 0.1075 0.8194 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1469413 2 0.2823 0.7478 0.000 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1405331 3 0.5102 0.6218 0.012 0.000 0.664 0.000 0.172 0.152
#> SRR1345609 1 0.0603 0.8177 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1380208 2 0.4293 -0.0733 0.000 0.536 0.000 0.004 0.012 0.448
#> SRR1322840 4 0.0260 0.8205 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1399797 3 0.0291 0.8653 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1416654 3 0.0000 0.8645 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.1802 0.8428 0.000 0.000 0.916 0.000 0.072 0.012
#> SRR1369196 3 0.0363 0.8641 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1400847 1 0.0713 0.8197 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1365291 3 0.3276 0.7862 0.000 0.000 0.816 0.000 0.052 0.132
#> SRR1367920 6 0.5770 0.7923 0.000 0.288 0.000 0.212 0.000 0.500
#> SRR1366648 3 0.0622 0.8651 0.000 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1441679 2 0.2631 0.7569 0.000 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1082173 5 0.5453 0.2894 0.076 0.000 0.424 0.000 0.484 0.016
#> SRR1363968 1 0.2179 0.7997 0.900 0.000 0.000 0.000 0.064 0.036
#> SRR814387 1 0.0632 0.8193 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR657599 1 0.4105 0.4599 0.648 0.000 0.004 0.000 0.332 0.016
#> SRR1386689 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.1700 0.8414 0.000 0.000 0.916 0.000 0.080 0.004
#> SRR1453811 3 0.4047 0.7348 0.004 0.000 0.760 0.000 0.084 0.152
#> SRR1441159 1 0.4109 0.2285 0.576 0.000 0.000 0.000 0.412 0.012
#> SRR1403154 4 0.0000 0.8224 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.8645 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.2384 0.8352 0.000 0.000 0.888 0.000 0.064 0.048
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.811 0.904 0.959 0.4953 0.505 0.505
#> 3 3 0.782 0.830 0.927 0.3283 0.743 0.533
#> 4 4 0.826 0.847 0.931 0.1165 0.769 0.448
#> 5 5 0.769 0.756 0.877 0.0773 0.869 0.566
#> 6 6 0.697 0.575 0.772 0.0387 0.868 0.480
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.9522 0.432 0.628 0.372
#> SRR1331708 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1464258 1 0.0938 0.947 0.988 0.012
#> SRR1454201 1 0.0672 0.951 0.992 0.008
#> SRR661589 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1315165 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1094457 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1315931 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1430066 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1431037 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1395554 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR818002 2 0.7056 0.763 0.192 0.808
#> SRR1344143 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1486845 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1456138 2 0.7139 0.757 0.196 0.804
#> SRR1416248 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1383907 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1375699 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1429846 2 0.7674 0.708 0.224 0.776
#> SRR613550 2 0.4815 0.864 0.104 0.896
#> SRR1348402 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1324025 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1318879 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR820755 1 0.9850 0.280 0.572 0.428
#> SRR1485830 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR599313 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1415398 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1326205 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1421327 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1083311 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1499303 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1079522 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1452935 2 0.1414 0.941 0.020 0.980
#> SRR1379495 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR661361 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR615778 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1335140 1 0.9580 0.368 0.620 0.380
#> SRR1433555 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1308650 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1317446 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1413602 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1479955 2 0.9044 0.549 0.320 0.680
#> SRR809853 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR661313 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1499935 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1447303 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1429408 2 0.7602 0.736 0.220 0.780
#> SRR1433950 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1409854 1 0.9170 0.523 0.668 0.332
#> SRR1435229 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1414229 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1400974 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR613927 2 0.9850 0.238 0.428 0.572
#> SRR1457854 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR813776 1 0.9896 0.243 0.560 0.440
#> SRR808196 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1101085 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR614395 1 0.4815 0.862 0.896 0.104
#> SRR1478251 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR665310 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1420109 1 0.9000 0.556 0.684 0.316
#> SRR1330920 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1419539 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1359447 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1347259 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR613915 2 0.7602 0.714 0.220 0.780
#> SRR1384395 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR821715 2 0.0672 0.950 0.008 0.992
#> SRR1478228 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.7139 0.751 0.804 0.196
#> SRR1341480 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1326270 2 0.9393 0.444 0.356 0.644
#> SRR1498838 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1416313 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR808566 1 0.9710 0.312 0.600 0.400
#> SRR1430270 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1367825 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR613533 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR661267 1 0.9963 0.163 0.536 0.464
#> SRR810665 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1407250 1 0.9248 0.506 0.660 0.340
#> SRR1420067 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR812536 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1370850 2 0.0672 0.950 0.008 0.992
#> SRR1486195 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1407671 1 0.6887 0.754 0.816 0.184
#> SRR1446375 1 0.1633 0.938 0.976 0.024
#> SRR1465230 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR614119 1 0.5842 0.822 0.860 0.140
#> SRR1356101 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR660510 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1445655 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR658953 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1485312 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1317631 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1330588 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1316367 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1091302 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR818263 1 0.1414 0.941 0.980 0.020
#> SRR1404909 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1442422 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1407112 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1332969 2 0.0938 0.947 0.012 0.988
#> SRR1353199 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1378885 2 0.9661 0.348 0.392 0.608
#> SRR665357 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1501020 2 0.7139 0.750 0.196 0.804
#> SRR1347819 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1472576 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1431781 1 0.4298 0.879 0.912 0.088
#> SRR1452270 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1500472 1 0.9815 0.253 0.580 0.420
#> SRR1417632 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1458113 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1326579 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1349363 1 0.0938 0.947 0.988 0.012
#> SRR1096712 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1090407 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1083752 2 0.6343 0.803 0.160 0.840
#> SRR1377599 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1488449 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1318354 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1359062 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1398924 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR663783 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1319204 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1498595 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1377423 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1338426 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1353309 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR658941 2 0.0672 0.950 0.008 0.992
#> SRR1101643 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.2423 0.924 0.960 0.040
#> SRR1368874 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1324085 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1363858 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR819820 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1337342 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR655206 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1387013 2 0.7299 0.747 0.204 0.796
#> SRR1317410 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1343741 2 0.3879 0.893 0.076 0.924
#> SRR1381288 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1415379 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR663197 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1394836 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR661699 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR813680 1 0.9491 0.442 0.632 0.368
#> SRR1410678 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1378109 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1382851 2 0.8813 0.589 0.300 0.700
#> SRR1433410 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR661167 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1432518 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR660462 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1374608 1 0.8207 0.663 0.744 0.256
#> SRR657949 1 0.9754 0.339 0.592 0.408
#> SRR1308882 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1485870 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1444138 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1470193 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1091380 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1467102 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1485416 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR818821 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR809963 1 0.4939 0.858 0.892 0.108
#> SRR1072247 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1353710 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1445259 1 0.5059 0.857 0.888 0.112
#> SRR1408393 1 0.8443 0.636 0.728 0.272
#> SRR1361522 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.7219 0.752 0.200 0.800
#> SRR1310542 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1333485 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1406437 2 0.2948 0.915 0.052 0.948
#> SRR1354931 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1391856 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1446738 2 0.0376 0.953 0.004 0.996
#> SRR1309032 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR815869 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR613150 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1375329 1 0.8555 0.603 0.720 0.280
#> SRR1387921 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1400910 2 0.9286 0.498 0.344 0.656
#> SRR1444203 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR816177 2 0.4690 0.870 0.100 0.900
#> SRR658754 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1429603 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1397366 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0672 0.950 0.008 0.992
#> SRR1337606 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR659109 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1342067 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1385389 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR612935 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR661481 2 0.1184 0.944 0.016 0.984
#> SRR1354117 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1393596 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1070503 2 0.6712 0.778 0.176 0.824
#> SRR1499894 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1082883 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1328620 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1396294 1 0.9710 0.361 0.600 0.400
#> SRR1419917 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR662114 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1489199 1 0.6712 0.778 0.824 0.176
#> SRR813584 2 0.4431 0.878 0.092 0.908
#> SRR1069638 2 0.1633 0.939 0.024 0.976
#> SRR614864 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1433392 1 0.6887 0.767 0.816 0.184
#> SRR1377777 2 0.8327 0.654 0.264 0.736
#> SRR2167710 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1401252 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1309963 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1486889 1 0.7219 0.746 0.800 0.200
#> SRR1380393 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1486538 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1340486 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1377696 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1465459 2 0.8661 0.595 0.288 0.712
#> SRR1080270 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1312501 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1093148 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1467080 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR816475 2 0.9491 0.414 0.368 0.632
#> SRR1379198 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR613342 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1452246 2 0.7299 0.746 0.204 0.796
#> SRR1338836 2 0.1414 0.941 0.020 0.980
#> SRR1369129 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1396616 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR813824 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1082376 1 0.1184 0.944 0.984 0.016
#> SRR1500891 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR807543 1 0.9393 0.470 0.644 0.356
#> SRR1091572 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1346689 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR663729 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR613675 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1485357 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR655816 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.8016 0.687 0.244 0.756
#> SRR1355172 1 0.8861 0.579 0.696 0.304
#> SRR655531 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1338147 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1413329 1 0.9988 0.104 0.520 0.480
#> SRR1485931 2 0.7528 0.729 0.216 0.784
#> SRR1420873 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1333308 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.9460 0.451 0.364 0.636
#> SRR809018 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR663440 2 0.2778 0.918 0.048 0.952
#> SRR1471755 2 0.5629 0.836 0.132 0.868
#> SRR808019 1 0.9427 0.461 0.640 0.360
#> SRR1479133 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR615069 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1456185 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1350069 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR664795 1 0.7528 0.723 0.784 0.216
#> SRR1490721 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1430333 2 0.8443 0.626 0.272 0.728
#> SRR1085285 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1099072 2 0.2603 0.922 0.044 0.956
#> SRR1317985 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1351347 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR819610 1 0.1843 0.934 0.972 0.028
#> SRR2157314 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR809987 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR613639 2 0.8016 0.676 0.244 0.756
#> SRR1402285 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.2043 0.931 0.968 0.032
#> SRR1405660 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1095455 1 0.5519 0.829 0.872 0.128
#> SRR1394734 2 0.0376 0.953 0.004 0.996
#> SRR1317771 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1365894 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1073581 1 0.7219 0.746 0.800 0.200
#> SRR659804 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.1184 0.944 0.016 0.984
#> SRR1432186 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1473529 1 0.7674 0.694 0.776 0.224
#> SRR660764 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1328845 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1336415 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1379065 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1459190 2 0.7299 0.738 0.204 0.796
#> SRR1346773 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.2778 0.917 0.952 0.048
#> SRR1440898 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1347459 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1081209 2 0.1414 0.941 0.020 0.980
#> SRR1400202 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1333395 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1309248 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR809161 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1316320 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1432629 2 0.6438 0.798 0.164 0.836
#> SRR1498931 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1416578 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1405547 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1470534 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1309160 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR663489 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1078489 2 0.9635 0.359 0.388 0.612
#> SRR1332648 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR660614 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR615946 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.9044 0.548 0.680 0.320
#> SRR1415316 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR661108 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR2170173 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR817329 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1401990 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1467745 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1471795 2 0.0672 0.950 0.008 0.992
#> SRR1415637 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR813137 1 0.4939 0.858 0.892 0.108
#> SRR1314873 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1419692 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR818797 2 0.7950 0.682 0.240 0.760
#> SRR2164608 2 0.2948 0.915 0.052 0.948
#> SRR1455586 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR819459 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1488939 1 0.9850 0.228 0.572 0.428
#> SRR1433232 2 0.6887 0.773 0.184 0.816
#> SRR1385501 1 0.1633 0.938 0.976 0.024
#> SRR1361652 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1478547 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1430910 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1486762 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1480854 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1489394 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1418085 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1340221 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1473058 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1405165 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.1843 0.934 0.972 0.028
#> SRR1098567 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1098712 1 0.5946 0.818 0.856 0.144
#> SRR1455038 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1403005 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1348378 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1475192 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1452468 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1347060 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1414139 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1343302 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1405331 2 0.8955 0.546 0.312 0.688
#> SRR1345609 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1380208 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1322840 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1399797 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1416654 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1315081 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1369196 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1365291 2 0.1184 0.944 0.016 0.984
#> SRR1367920 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1366648 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1082173 2 0.0938 0.947 0.012 0.988
#> SRR1363968 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR657599 1 0.8713 0.601 0.708 0.292
#> SRR1386689 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1395575 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1453811 2 0.5408 0.842 0.124 0.876
#> SRR1441159 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1403154 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1468722 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
#> SRR1310275 2 0.0000 0.955 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 1 0.4062 0.7881 0.836 0.000 0.164
#> SRR1331708 2 0.4062 0.7832 0.164 0.836 0.000
#> SRR1464258 1 0.1031 0.9068 0.976 0.000 0.024
#> SRR1454201 1 0.1289 0.9015 0.968 0.000 0.032
#> SRR661589 3 0.0424 0.9430 0.008 0.000 0.992
#> SRR1456229 1 0.0424 0.9156 0.992 0.000 0.008
#> SRR1315165 2 0.4178 0.7680 0.172 0.828 0.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.5529 0.5580 0.704 0.296 0.000
#> SRR1094457 1 0.6235 0.1980 0.564 0.436 0.000
#> SRR1095575 1 0.0592 0.9137 0.988 0.000 0.012
#> SRR1315931 1 0.0237 0.9173 0.996 0.000 0.004
#> SRR1430066 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1431037 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1395554 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR818002 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486845 2 0.5905 0.4886 0.352 0.648 0.000
#> SRR1362866 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0892 0.8808 0.000 0.980 0.020
#> SRR1456138 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 2 0.1163 0.8818 0.028 0.972 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0592 0.8865 0.012 0.988 0.000
#> SRR1429846 3 0.1643 0.9176 0.044 0.000 0.956
#> SRR613550 3 0.1031 0.9335 0.024 0.000 0.976
#> SRR1348402 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR1324025 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1318879 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR820755 1 0.6308 0.0349 0.508 0.000 0.492
#> SRR1485830 2 0.5760 0.5399 0.328 0.672 0.000
#> SRR599313 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.0424 0.9430 0.008 0.000 0.992
#> SRR1326205 2 0.5465 0.6114 0.288 0.712 0.000
#> SRR1421327 2 0.0892 0.8845 0.020 0.980 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499303 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079522 2 0.3941 0.7869 0.156 0.844 0.000
#> SRR1452935 3 0.1289 0.9276 0.032 0.000 0.968
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 3 0.4399 0.7631 0.000 0.188 0.812
#> SRR661361 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR615778 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308650 3 0.3340 0.8442 0.000 0.120 0.880
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1499935 2 0.0237 0.8878 0.004 0.996 0.000
#> SRR1447303 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1429408 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433950 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.6274 0.1001 0.000 0.544 0.456
#> SRR1409854 1 0.4291 0.7623 0.820 0.000 0.180
#> SRR1435229 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 3 0.0592 0.9382 0.000 0.012 0.988
#> SRR1400974 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1399971 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.4842 0.7050 0.224 0.000 0.776
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0237 0.9173 0.996 0.000 0.004
#> SRR813776 3 0.6267 0.1659 0.452 0.000 0.548
#> SRR808196 1 0.4750 0.6924 0.784 0.216 0.000
#> SRR1101085 2 0.1753 0.8724 0.048 0.952 0.000
#> SRR614395 1 0.1529 0.8959 0.960 0.000 0.040
#> SRR1478251 1 0.5650 0.5267 0.688 0.312 0.000
#> SRR1370551 3 0.6307 0.0795 0.000 0.488 0.512
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.0592 0.9409 0.012 0.000 0.988
#> SRR1420109 1 0.5529 0.5780 0.704 0.000 0.296
#> SRR1330920 1 0.0592 0.9137 0.988 0.000 0.012
#> SRR1419539 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1359447 3 0.0592 0.9377 0.000 0.012 0.988
#> SRR1347259 2 0.4750 0.7159 0.216 0.784 0.000
#> SRR613915 3 0.1643 0.9176 0.044 0.000 0.956
#> SRR1384395 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR821715 3 0.1031 0.9335 0.024 0.000 0.976
#> SRR1478228 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0424 0.9156 0.992 0.000 0.008
#> SRR608150 2 0.5760 0.5564 0.328 0.672 0.000
#> SRR1096383 1 0.1411 0.8999 0.964 0.000 0.036
#> SRR1341480 2 0.0747 0.8856 0.016 0.984 0.000
#> SRR1341344 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR1326270 3 0.2448 0.8877 0.076 0.000 0.924
#> SRR1498838 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1416313 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR808566 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430270 1 0.1643 0.8888 0.956 0.044 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR613533 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR661267 3 0.6045 0.3696 0.380 0.000 0.620
#> SRR810665 2 0.1964 0.8576 0.000 0.944 0.056
#> SRR1407250 1 0.3941 0.7954 0.844 0.000 0.156
#> SRR1420067 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.0424 0.9147 0.992 0.008 0.000
#> SRR812536 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370850 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1486195 3 0.5785 0.5257 0.000 0.332 0.668
#> SRR1407671 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446375 1 0.2066 0.8800 0.940 0.000 0.060
#> SRR1465230 1 0.6302 0.0331 0.520 0.480 0.000
#> SRR614119 1 0.1860 0.8864 0.948 0.000 0.052
#> SRR1356101 3 0.1411 0.9207 0.000 0.036 0.964
#> SRR1404209 1 0.0424 0.9156 0.992 0.000 0.008
#> SRR1392676 2 0.0592 0.8846 0.000 0.988 0.012
#> SRR665538 1 0.0424 0.9156 0.992 0.000 0.008
#> SRR660510 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445655 2 0.1643 0.8745 0.044 0.956 0.000
#> SRR658953 1 0.0424 0.9147 0.992 0.008 0.000
#> SRR2166459 1 0.0424 0.9156 0.992 0.000 0.008
#> SRR1070713 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1485312 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1317631 1 0.6295 0.0694 0.528 0.472 0.000
#> SRR1488610 1 0.0747 0.9097 0.984 0.016 0.000
#> SRR1330588 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1316367 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 2 0.6111 0.3809 0.396 0.604 0.000
#> SRR818263 1 0.1289 0.9020 0.968 0.000 0.032
#> SRR1404909 2 0.0424 0.8873 0.008 0.992 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1442422 1 0.6235 0.1977 0.564 0.436 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0892 0.9091 0.980 0.000 0.020
#> SRR1407112 1 0.5431 0.5805 0.716 0.284 0.000
#> SRR1332969 3 0.0892 0.9362 0.020 0.000 0.980
#> SRR1353199 3 0.0424 0.9430 0.008 0.000 0.992
#> SRR1378885 3 0.3340 0.8420 0.120 0.000 0.880
#> SRR665357 3 0.0424 0.9400 0.000 0.008 0.992
#> SRR662186 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1501020 3 0.1031 0.9335 0.024 0.000 0.976
#> SRR1347819 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1480813 2 0.0592 0.8846 0.000 0.988 0.012
#> SRR1472576 2 0.0424 0.8873 0.008 0.992 0.000
#> SRR1431781 2 0.0237 0.8878 0.004 0.996 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500472 1 0.5696 0.7382 0.800 0.136 0.064
#> SRR1417632 2 0.0892 0.8846 0.020 0.980 0.000
#> SRR1350153 2 0.2165 0.8506 0.000 0.936 0.064
#> SRR1458113 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326579 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR1349363 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1090407 3 0.0424 0.9430 0.008 0.000 0.992
#> SRR1083752 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377599 2 0.0424 0.8873 0.008 0.992 0.000
#> SRR1488449 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1318354 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1359062 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398924 2 0.4291 0.7496 0.180 0.820 0.000
#> SRR663783 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319204 3 0.2261 0.8943 0.000 0.068 0.932
#> SRR1369070 2 0.0424 0.8861 0.000 0.992 0.008
#> SRR615659 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.2066 0.8537 0.000 0.940 0.060
#> SRR1316982 3 0.0747 0.9351 0.000 0.016 0.984
#> SRR1498595 2 0.0237 0.8878 0.004 0.996 0.000
#> SRR1377423 3 0.0424 0.9430 0.008 0.000 0.992
#> SRR1312310 2 0.2878 0.8222 0.000 0.904 0.096
#> SRR1485613 1 0.0424 0.9156 0.992 0.000 0.008
#> SRR1338426 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR658941 3 0.0592 0.9410 0.012 0.000 0.988
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0592 0.9136 0.988 0.000 0.012
#> SRR1368874 2 0.5905 0.3984 0.000 0.648 0.352
#> SRR1324085 2 0.2356 0.8571 0.072 0.928 0.000
#> SRR1363858 1 0.0424 0.9147 0.992 0.008 0.000
#> SRR819820 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1337342 1 0.0237 0.9173 0.996 0.000 0.004
#> SRR655206 3 0.1289 0.9238 0.000 0.032 0.968
#> SRR1387013 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR1440161 3 0.3816 0.8126 0.000 0.148 0.852
#> SRR1343741 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1381288 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1415379 1 0.5882 0.4484 0.652 0.348 0.000
#> SRR1099622 3 0.4504 0.7486 0.000 0.196 0.804
#> SRR663197 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394836 3 0.2165 0.8966 0.000 0.064 0.936
#> SRR661699 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR813680 1 0.5058 0.6725 0.756 0.000 0.244
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 2 0.6260 0.2296 0.448 0.552 0.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.1031 0.8788 0.000 0.976 0.024
#> SRR1382851 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433410 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR661167 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1432518 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374608 1 0.7410 0.3436 0.576 0.040 0.384
#> SRR657949 1 0.5254 0.6412 0.736 0.000 0.264
#> SRR1308882 2 0.3619 0.8050 0.136 0.864 0.000
#> SRR655768 1 0.0237 0.9173 0.996 0.000 0.004
#> SRR1485870 2 0.0892 0.8845 0.020 0.980 0.000
#> SRR1444138 1 0.1860 0.8863 0.948 0.000 0.052
#> SRR1417342 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR1470193 2 0.2959 0.8361 0.100 0.900 0.000
#> SRR1091380 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1099096 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR1467102 3 0.0424 0.9400 0.000 0.008 0.992
#> SRR1485416 2 0.1964 0.8677 0.056 0.944 0.000
#> SRR818821 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR809963 1 0.1529 0.8959 0.960 0.000 0.040
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 2 0.5905 0.4868 0.352 0.648 0.000
#> SRR1445259 1 0.3482 0.8159 0.872 0.000 0.128
#> SRR1408393 1 0.3116 0.8383 0.892 0.000 0.108
#> SRR1361522 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1333485 2 0.1753 0.8724 0.048 0.952 0.000
#> SRR1406437 3 0.6054 0.7141 0.052 0.180 0.768
#> SRR1354931 3 0.0424 0.9430 0.008 0.000 0.992
#> SRR1391856 2 0.6168 0.2368 0.000 0.588 0.412
#> SRR1446738 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1309032 2 0.5431 0.5542 0.000 0.716 0.284
#> SRR1388145 2 0.1163 0.8767 0.000 0.972 0.028
#> SRR1432611 2 0.1411 0.8715 0.000 0.964 0.036
#> SRR815869 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375329 2 0.0592 0.8859 0.012 0.988 0.000
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.6291 0.0539 0.000 0.532 0.468
#> SRR1360478 2 0.1031 0.8788 0.000 0.976 0.024
#> SRR1360695 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR812943 1 0.1643 0.8890 0.956 0.044 0.000
#> SRR1400910 2 0.3551 0.7943 0.132 0.868 0.000
#> SRR1444203 2 0.5560 0.5883 0.300 0.700 0.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429603 2 0.2537 0.8514 0.080 0.920 0.000
#> SRR1397366 3 0.0424 0.9430 0.008 0.000 0.992
#> SRR1446028 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1337606 2 0.0892 0.8845 0.020 0.980 0.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337192 1 0.0424 0.9147 0.992 0.008 0.000
#> SRR656946 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 2 0.3879 0.7894 0.152 0.848 0.000
#> SRR1385389 1 0.6079 0.3452 0.612 0.388 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR1322936 2 0.6204 0.3375 0.424 0.576 0.000
#> SRR1349121 1 0.0237 0.9173 0.996 0.000 0.004
#> SRR1430549 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR612935 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR661481 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1354117 3 0.5882 0.4953 0.000 0.348 0.652
#> SRR1393596 2 0.0424 0.8873 0.008 0.992 0.000
#> SRR1452164 1 0.0237 0.9173 0.996 0.000 0.004
#> SRR1070503 3 0.1529 0.9210 0.040 0.000 0.960
#> SRR1499894 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082883 2 0.5926 0.5074 0.356 0.644 0.000
#> SRR1468271 1 0.0892 0.9091 0.980 0.000 0.020
#> SRR1332443 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR810295 2 0.2959 0.8182 0.000 0.900 0.100
#> SRR662103 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396294 3 0.7395 -0.0012 0.476 0.032 0.492
#> SRR1419917 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489199 1 0.1860 0.8866 0.948 0.000 0.052
#> SRR813584 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069638 3 0.3816 0.8073 0.148 0.000 0.852
#> SRR614864 3 0.0424 0.9430 0.008 0.000 0.992
#> SRR1433392 1 0.2261 0.8741 0.932 0.000 0.068
#> SRR1377777 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.0237 0.9173 0.996 0.000 0.004
#> SRR1401252 2 0.1860 0.8702 0.052 0.948 0.000
#> SRR1309963 1 0.5431 0.5805 0.716 0.284 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.2356 0.8441 0.000 0.928 0.072
#> SRR1486889 1 0.0892 0.9103 0.980 0.000 0.020
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.5926 0.4279 0.644 0.356 0.000
#> SRR1337010 2 0.2165 0.8508 0.000 0.936 0.064
#> SRR1486520 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 1 0.6168 0.2734 0.588 0.412 0.000
#> SRR1340486 1 0.5760 0.4926 0.672 0.328 0.000
#> SRR1377696 2 0.0237 0.8878 0.004 0.996 0.000
#> SRR1465459 3 0.1753 0.9142 0.048 0.000 0.952
#> SRR1080270 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312501 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1093148 3 0.0592 0.9378 0.000 0.012 0.988
#> SRR1467080 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1410866 2 0.0747 0.8828 0.000 0.984 0.016
#> SRR816475 2 0.3752 0.7938 0.144 0.856 0.000
#> SRR1379198 1 0.4178 0.7533 0.828 0.172 0.000
#> SRR613342 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1452246 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1338836 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1369129 1 0.6291 0.0808 0.532 0.468 0.000
#> SRR1396616 3 0.0424 0.9430 0.008 0.000 0.992
#> SRR813824 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1082376 1 0.1031 0.9068 0.976 0.000 0.024
#> SRR1500891 2 0.1860 0.8702 0.052 0.948 0.000
#> SRR807543 1 0.5327 0.6158 0.728 0.000 0.272
#> SRR1091572 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346689 2 0.1860 0.8702 0.052 0.948 0.000
#> SRR1332424 1 0.2261 0.8677 0.932 0.068 0.000
#> SRR663729 2 0.6244 0.2620 0.440 0.560 0.000
#> SRR1097013 1 0.0237 0.9173 0.996 0.000 0.004
#> SRR613675 1 0.5733 0.4885 0.676 0.324 0.000
#> SRR1485357 2 0.6291 0.1587 0.468 0.532 0.000
#> SRR655816 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1500113 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355172 1 0.5016 0.6857 0.760 0.000 0.240
#> SRR655531 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1413329 1 0.6252 0.2049 0.556 0.000 0.444
#> SRR1485931 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 2 0.5529 0.5961 0.296 0.704 0.000
#> SRR1452033 1 0.0424 0.9156 0.992 0.000 0.008
#> SRR1467316 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1375351 2 0.0592 0.8846 0.000 0.988 0.012
#> SRR663440 3 0.1031 0.9335 0.024 0.000 0.976
#> SRR1471755 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR808019 1 0.5678 0.5559 0.684 0.000 0.316
#> SRR1479133 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR615069 3 0.5859 0.5082 0.000 0.344 0.656
#> SRR1456185 2 0.1643 0.8662 0.000 0.956 0.044
#> SRR1350069 1 0.4002 0.7681 0.840 0.160 0.000
#> SRR816316 1 0.0592 0.9136 0.988 0.000 0.012
#> SRR664795 1 0.3116 0.8395 0.892 0.000 0.108
#> SRR1490721 2 0.0892 0.8845 0.020 0.980 0.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 3 0.5650 0.5268 0.312 0.000 0.688
#> SRR1085285 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1099072 3 0.0892 0.9362 0.020 0.000 0.980
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351347 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1405525 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR819610 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0424 0.8861 0.000 0.992 0.008
#> SRR809987 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR613639 3 0.1860 0.9107 0.052 0.000 0.948
#> SRR1402285 1 0.2878 0.8411 0.904 0.096 0.000
#> SRR1077038 1 0.1031 0.9068 0.976 0.000 0.024
#> SRR1405660 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095455 1 0.1289 0.9020 0.968 0.000 0.032
#> SRR1394734 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1317771 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.0424 0.8873 0.008 0.992 0.000
#> SRR1073581 1 0.1860 0.8891 0.948 0.000 0.052
#> SRR659804 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1432186 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1473529 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR660764 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR820448 1 0.0424 0.9156 0.992 0.000 0.008
#> SRR1328845 1 0.3193 0.8350 0.896 0.100 0.004
#> SRR1336415 1 0.4796 0.6866 0.780 0.220 0.000
#> SRR1379065 2 0.6305 0.1047 0.484 0.516 0.000
#> SRR1459190 3 0.1529 0.9210 0.040 0.000 0.960
#> SRR1346773 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR1499521 1 0.0747 0.9114 0.984 0.000 0.016
#> SRR1440898 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1347459 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081209 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 2 0.4887 0.7010 0.228 0.772 0.000
#> SRR1309248 2 0.0592 0.8865 0.012 0.988 0.000
#> SRR809161 3 0.0747 0.9387 0.016 0.000 0.984
#> SRR1316320 2 0.0424 0.8873 0.008 0.992 0.000
#> SRR1432629 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 1 0.5621 0.5349 0.692 0.308 0.000
#> SRR1405547 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1470534 1 0.5650 0.5260 0.688 0.312 0.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR663489 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 3 0.6286 0.1027 0.464 0.000 0.536
#> SRR1332648 1 0.6299 0.0496 0.524 0.476 0.000
#> SRR660614 3 0.5591 0.5847 0.000 0.304 0.696
#> SRR1470420 2 0.4974 0.6420 0.000 0.764 0.236
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1464766 1 0.0747 0.9114 0.984 0.000 0.016
#> SRR615946 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1446481 2 0.0424 0.8861 0.000 0.992 0.008
#> SRR1467656 2 0.3686 0.7718 0.000 0.860 0.140
#> SRR1402962 1 0.0747 0.9114 0.984 0.000 0.016
#> SRR660224 2 0.1031 0.8788 0.000 0.976 0.024
#> SRR665586 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR1485722 1 0.3116 0.8395 0.892 0.000 0.108
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0237 0.9173 0.996 0.000 0.004
#> SRR661108 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR2170173 1 0.1289 0.9013 0.968 0.000 0.032
#> SRR817329 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401990 2 0.6307 0.0836 0.488 0.512 0.000
#> SRR1467745 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1471795 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1415637 2 0.1031 0.8788 0.000 0.976 0.024
#> SRR813137 1 0.1643 0.8928 0.956 0.000 0.044
#> SRR1314873 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0237 0.9173 0.996 0.000 0.004
#> SRR1419692 2 0.5497 0.6063 0.292 0.708 0.000
#> SRR818797 3 0.2261 0.8964 0.068 0.000 0.932
#> SRR2164608 3 0.1031 0.9335 0.024 0.000 0.976
#> SRR1455586 3 0.0747 0.9351 0.000 0.016 0.984
#> SRR819459 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0237 0.8874 0.000 0.996 0.004
#> SRR1385501 1 0.1753 0.8899 0.952 0.000 0.048
#> SRR1361652 2 0.3340 0.8255 0.120 0.880 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1430910 3 0.1411 0.9213 0.000 0.036 0.964
#> SRR1310584 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR1486762 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480854 2 0.2796 0.8425 0.092 0.908 0.000
#> SRR1489394 2 0.6154 0.3520 0.408 0.592 0.000
#> SRR1418085 1 0.6008 0.3879 0.628 0.372 0.000
#> SRR1340221 1 0.5859 0.4564 0.656 0.344 0.000
#> SRR1473058 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405165 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0424 0.9156 0.992 0.000 0.008
#> SRR1098567 2 0.3686 0.7755 0.000 0.860 0.140
#> SRR1098712 2 0.6095 0.3909 0.392 0.608 0.000
#> SRR1455038 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375248 3 0.0892 0.9323 0.000 0.020 0.980
#> SRR1403005 3 0.0892 0.9363 0.020 0.000 0.980
#> SRR1348378 2 0.2959 0.8200 0.000 0.900 0.100
#> SRR1413541 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 2 0.6168 0.3400 0.412 0.588 0.000
#> SRR1475192 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432085 3 0.5363 0.6248 0.000 0.276 0.724
#> SRR1452468 1 0.0424 0.9147 0.992 0.008 0.000
#> SRR1347060 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414139 3 0.0747 0.9352 0.000 0.016 0.984
#> SRR1447962 3 0.3482 0.8331 0.000 0.128 0.872
#> SRR1444324 3 0.6026 0.4327 0.000 0.376 0.624
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 2 0.5926 0.4777 0.356 0.644 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 3 0.4062 0.7901 0.000 0.164 0.836
#> SRR1405331 3 0.4702 0.7265 0.212 0.000 0.788
#> SRR1345609 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR1380208 2 0.0000 0.8879 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322840 2 0.5882 0.4972 0.348 0.652 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416654 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1315081 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.1031 0.9335 0.024 0.000 0.976
#> SRR1367920 2 0.0747 0.8856 0.016 0.984 0.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.9442 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441679 2 0.1031 0.8788 0.000 0.976 0.024
#> SRR1082173 3 0.0892 0.9362 0.020 0.000 0.980
#> SRR1363968 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.9185 1.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.4002 0.7929 0.840 0.000 0.160
#> SRR1386689 1 0.5926 0.4292 0.644 0.356 0.000
#> SRR1395575 3 0.0424 0.9430 0.008 0.000 0.992
#> SRR1453811 3 0.1031 0.9335 0.024 0.000 0.976
#> SRR1441159 1 0.0237 0.9169 0.996 0.004 0.000
#> SRR1403154 2 0.5397 0.6224 0.280 0.720 0.000
#> SRR1468722 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
#> SRR1310275 3 0.0237 0.9445 0.004 0.000 0.996
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 3 0.3710 0.73734 0.004 0.000 0.804 0.192
#> SRR1331708 2 0.0469 0.91968 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1464258 1 0.0188 0.92599 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1454201 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR661589 3 0.0188 0.94360 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315165 4 0.0336 0.89149 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1488960 1 0.1302 0.91312 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1417809 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094457 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095575 1 0.0524 0.92581 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1315931 1 0.0336 0.92565 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1430066 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0921 0.92889 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR818002 2 0.0336 0.92347 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1344143 2 0.0000 0.92511 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486845 4 0.0188 0.89319 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1362866 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0707 0.92292 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1446627 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.92511 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.4543 0.56919 0.676 0.000 0.000 0.324
#> SRR1383907 4 0.4304 0.60731 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR1311018 4 0.3024 0.77170 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR1375699 4 0.4830 0.39220 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1429846 1 0.2081 0.88180 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR613550 1 0.3172 0.80771 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1348402 1 0.0188 0.92599 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1345146 1 0.1792 0.90043 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1324025 3 0.0817 0.93247 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1318879 1 0.4996 0.11735 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR820755 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485830 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR599313 1 0.0188 0.92599 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612263 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.3074 0.79925 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1326205 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421327 2 0.4713 0.38384 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1083311 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.2814 0.79986 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1079522 2 0.0817 0.91236 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1452935 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379495 1 0.3219 0.81650 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1470459 3 0.0707 0.93204 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR661361 3 0.0817 0.93247 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR615778 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.1022 0.91864 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1455195 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR655182 1 0.2281 0.87966 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1335140 2 0.0000 0.92511 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308650 3 0.0188 0.94296 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1388354 1 0.4989 0.19783 0.528 0.000 0.000 0.472
#> SRR1317446 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0188 0.92461 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR809853 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.3801 0.71711 0.220 0.000 0.780 0.000
#> SRR1499935 4 0.1474 0.86556 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1447303 1 0.2647 0.84570 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1429408 4 0.3074 0.77982 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR1433950 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.4250 0.62529 0.000 0.724 0.276 0.000
#> SRR1409854 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435229 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 2 0.4804 0.42060 0.384 0.616 0.000 0.000
#> SRR1400974 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.3074 0.82964 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR613927 1 0.0336 0.92509 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1457854 1 0.2408 0.87411 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1473714 4 0.0188 0.89233 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR813776 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808196 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101085 4 0.3801 0.70234 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR614395 1 0.0336 0.92565 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1478251 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370551 3 0.3266 0.76840 0.000 0.168 0.832 0.000
#> SRR1362310 1 0.2530 0.86712 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR665310 1 0.3837 0.72085 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR1420109 1 0.0469 0.92411 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1330920 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419539 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359447 3 0.3448 0.77646 0.004 0.168 0.828 0.000
#> SRR1347259 4 0.2216 0.83739 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR613915 1 0.0336 0.92493 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1384395 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821715 1 0.4431 0.59188 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR1478228 1 0.2704 0.85722 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1445637 1 0.0592 0.92409 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR608150 2 0.3942 0.69334 0.236 0.764 0.000 0.000
#> SRR1096383 4 0.3667 0.80102 0.088 0.000 0.056 0.856
#> SRR1341480 4 0.3486 0.73984 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1341344 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.4730 0.40122 0.364 0.000 0.636 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808566 4 0.2704 0.80741 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1430270 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613533 1 0.1022 0.91392 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR661267 1 0.5000 0.07622 0.504 0.000 0.496 0.000
#> SRR810665 2 0.0336 0.92474 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1407250 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1420067 1 0.0188 0.92599 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1473632 1 0.1557 0.90680 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR812536 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0817 0.91477 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1486195 3 0.2704 0.82938 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR1407671 2 0.2408 0.84573 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1446375 1 0.1833 0.90982 0.944 0.000 0.032 0.024
#> SRR1465230 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.1837 0.91196 0.944 0.000 0.028 0.028
#> SRR1356101 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.0817 0.92165 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1392676 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR665538 4 0.2647 0.80229 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR660510 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.1867 0.85187 0.000 0.072 0.000 0.928
#> SRR658953 1 0.0817 0.91722 0.976 0.024 0.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.0707 0.92292 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1070713 2 0.0000 0.92511 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0188 0.94360 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1317631 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488610 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.1022 0.92696 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1316367 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0707 0.92292 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1091302 4 0.0188 0.89319 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR818263 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404909 2 0.1022 0.90929 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR663076 4 0.0592 0.88606 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1323577 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465893 4 0.0188 0.89233 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR654862 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407112 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332969 3 0.0707 0.93533 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1353199 3 0.1118 0.92287 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1378885 1 0.0336 0.92509 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR665357 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1501020 3 0.0188 0.94360 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1347819 3 0.0188 0.94366 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1480813 2 0.0336 0.92474 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1472576 4 0.4999 0.08345 0.000 0.492 0.000 0.508
#> SRR1431781 4 0.0707 0.88556 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1452270 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.1302 0.90250 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1417632 2 0.0592 0.91977 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1350153 2 0.0469 0.92313 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1458113 2 0.5929 0.62338 0.108 0.688 0.204 0.000
#> SRR1326579 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.1118 0.90732 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1096712 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.1118 0.92193 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1083752 2 0.0921 0.91284 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1377599 2 0.0000 0.92511 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488449 3 0.1211 0.91834 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1318354 3 0.7626 0.15828 0.384 0.204 0.412 0.000
#> SRR1359062 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398924 2 0.3569 0.74254 0.196 0.804 0.000 0.000
#> SRR663783 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319204 3 0.4817 0.36114 0.000 0.388 0.612 0.000
#> SRR1369070 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR615659 1 0.1022 0.91875 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1337449 2 0.3873 0.70795 0.000 0.772 0.228 0.000
#> SRR1316982 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498595 2 0.1474 0.89463 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1377423 3 0.0707 0.93439 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1312310 2 0.0336 0.92474 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1485613 1 0.2868 0.84445 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1338426 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658941 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101643 1 0.1118 0.91699 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1401468 4 0.2973 0.78198 0.144 0.000 0.000 0.856
#> SRR1368874 2 0.0336 0.92456 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1324085 4 0.1118 0.87644 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1363858 4 0.0921 0.87986 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR819820 3 0.0188 0.94360 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1337342 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR655206 3 0.0188 0.94310 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1387013 2 0.0000 0.92511 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.2469 0.87093 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR608198 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1440161 3 0.0592 0.93553 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1343741 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1381288 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1415379 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099622 3 0.0188 0.94284 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR663197 3 0.0336 0.94182 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1394836 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661699 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR813680 1 0.3982 0.73487 0.776 0.000 0.220 0.004
#> SRR1410678 4 0.4999 -0.04469 0.492 0.000 0.000 0.508
#> SRR1378109 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499174 1 0.0469 0.92488 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1311486 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1382851 2 0.0000 0.92511 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433410 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR661167 3 0.0469 0.93957 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1432518 1 0.4948 0.22688 0.560 0.000 0.440 0.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.0817 0.88267 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR657949 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308882 4 0.0469 0.88954 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR655768 1 0.1557 0.90681 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1485870 4 0.3907 0.68661 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR1444138 1 0.0336 0.92574 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1417342 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470193 4 0.0707 0.88569 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1091380 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.4804 0.43369 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1313583 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467102 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.3873 0.69218 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR818821 1 0.2868 0.82722 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR809963 1 0.0336 0.92565 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1072247 4 0.4985 0.06043 0.468 0.000 0.000 0.532
#> SRR1353710 4 0.0336 0.89188 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1445259 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1408393 1 0.0188 0.92599 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1361522 1 0.0817 0.92165 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1368597 1 0.1022 0.91879 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1309680 2 0.0188 0.92461 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1310542 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0817 0.88317 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1406437 4 0.1209 0.87603 0.000 0.004 0.032 0.964
#> SRR1354931 3 0.0188 0.94360 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1391856 3 0.1022 0.92312 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1446738 4 0.7140 0.11421 0.000 0.404 0.132 0.464
#> SRR1309032 3 0.4981 0.10695 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1388145 2 0.1118 0.90931 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1432611 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR815869 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375329 2 0.2011 0.86830 0.080 0.920 0.000 0.000
#> SRR1387921 4 0.4730 0.37125 0.364 0.000 0.000 0.636
#> SRR1466792 2 0.1022 0.91165 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1360478 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1360695 4 0.3942 0.64882 0.236 0.000 0.000 0.764
#> SRR812943 1 0.1118 0.91072 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1400910 2 0.2281 0.85211 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR1444203 4 0.0188 0.89319 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR816177 2 0.2814 0.80841 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR658754 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0469 0.88954 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1397366 3 0.4994 0.01887 0.480 0.000 0.520 0.000
#> SRR1446028 1 0.0336 0.92574 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1083918 2 0.0376 0.92494 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1337606 2 0.1118 0.90387 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR656946 4 0.4992 0.01424 0.476 0.000 0.000 0.524
#> SRR1476102 1 0.1940 0.88930 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1476447 1 0.0188 0.92599 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1342067 4 0.0592 0.88773 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1385389 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075971 1 0.0188 0.92599 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR614419 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1322936 2 0.3801 0.71238 0.220 0.780 0.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.1716 0.90138 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1430549 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR612935 1 0.1888 0.89322 0.940 0.044 0.016 0.000
#> SRR661481 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1354117 2 0.4406 0.57318 0.000 0.700 0.300 0.000
#> SRR1393596 4 0.2345 0.82927 0.000 0.100 0.000 0.900
#> SRR1452164 1 0.0592 0.92406 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1070503 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499894 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082883 2 0.2868 0.80944 0.136 0.864 0.000 0.000
#> SRR1468271 4 0.4356 0.55086 0.292 0.000 0.000 0.708
#> SRR1332443 1 0.4406 0.59275 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR810295 2 0.0817 0.91682 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR662103 1 0.0817 0.92165 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1328620 3 0.4313 0.65563 0.260 0.004 0.736 0.000
#> SRR1396294 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419917 1 0.0469 0.92488 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR662114 1 0.5607 0.00489 0.496 0.020 0.484 0.000
#> SRR1489199 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813584 2 0.4888 0.25310 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1069638 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR614864 1 0.1557 0.89826 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1433392 1 0.0188 0.92599 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1377777 2 0.0000 0.92511 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.4304 0.65084 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1401252 4 0.4925 0.29602 0.000 0.428 0.000 0.572
#> SRR1309963 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.2760 0.85335 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1418628 2 0.0336 0.92474 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1486889 1 0.4343 0.63823 0.732 0.000 0.004 0.264
#> SRR1380393 4 0.1302 0.86577 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1319731 1 0.3123 0.82574 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1356468 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337010 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1486520 1 0.0188 0.92599 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486538 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377696 2 0.0000 0.92511 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465459 1 0.0188 0.92564 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312501 1 0.2973 0.81999 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1093148 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467080 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0921 0.91470 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR816475 4 0.2329 0.84254 0.000 0.012 0.072 0.916
#> SRR1379198 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613342 1 0.2216 0.87224 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.92511 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396616 3 0.2149 0.87384 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR813824 3 0.0188 0.94360 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1082376 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500891 4 0.4331 0.60012 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR807543 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1346689 4 0.1867 0.85229 0.000 0.072 0.000 0.928
#> SRR1332424 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR663729 4 0.0336 0.89227 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1097013 1 0.1022 0.91889 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR613675 2 0.3975 0.68774 0.240 0.760 0.000 0.000
#> SRR1485357 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655816 3 0.0188 0.94360 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1500113 4 0.4072 0.62002 0.252 0.000 0.000 0.748
#> SRR1437622 2 0.3024 0.79054 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1355172 3 0.2401 0.86549 0.004 0.000 0.904 0.092
#> SRR655531 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.0707 0.93526 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1413329 1 0.1022 0.91367 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1485931 2 0.0000 0.92511 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.2647 0.85909 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1333308 4 0.0188 0.89319 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1452033 1 0.3907 0.73312 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1467316 2 0.0000 0.92511 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR663440 1 0.0188 0.92564 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1471755 2 0.0469 0.92189 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR808019 3 0.1913 0.90843 0.040 0.000 0.940 0.020
#> SRR1479133 3 0.2408 0.85428 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR615069 2 0.1059 0.91430 0.012 0.972 0.016 0.000
#> SRR1456185 2 0.3569 0.73988 0.000 0.804 0.196 0.000
#> SRR1350069 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR664795 1 0.3447 0.83909 0.852 0.000 0.128 0.020
#> SRR1490721 2 0.3400 0.73902 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR810643 1 0.0592 0.92379 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1430333 1 0.2704 0.82940 0.876 0.124 0.000 0.000
#> SRR1085285 3 0.0188 0.94360 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1099072 1 0.2868 0.83496 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR1317985 1 0.3024 0.83359 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1487340 1 0.0592 0.92406 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1420276 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351347 1 0.4500 0.55135 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR1405525 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.2081 0.88888 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1465001 1 0.3688 0.76372 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1476525 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR819610 4 0.4431 0.57335 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR2157314 1 0.2704 0.85547 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1409465 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR809987 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613639 1 0.4222 0.65198 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR1402285 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077038 1 0.0188 0.92599 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1405660 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1394734 2 0.0779 0.91934 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1317771 1 0.0921 0.92041 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1365894 2 0.4500 0.49272 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1073581 4 0.6677 0.34677 0.100 0.000 0.348 0.552
#> SRR659804 1 0.2814 0.84937 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1345914 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1432186 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1473529 2 0.0469 0.92182 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR660764 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820448 1 0.0336 0.92565 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1328845 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1336415 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379065 4 0.0188 0.89319 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1459190 3 0.3975 0.66779 0.240 0.000 0.760 0.000
#> SRR1346773 1 0.0895 0.92191 0.976 0.004 0.000 0.020
#> SRR1499521 4 0.2334 0.83116 0.088 0.000 0.004 0.908
#> SRR1440898 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1347459 3 0.2281 0.86882 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1081209 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1400202 1 0.1637 0.90446 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1333395 4 0.0188 0.89319 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1309248 2 0.0336 0.92339 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR809161 1 0.2704 0.84473 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1316320 2 0.0000 0.92511 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432629 2 0.0000 0.92511 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.4994 0.17367 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR1416578 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500450 4 0.0188 0.89233 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1078489 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1332648 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660614 2 0.2412 0.86167 0.008 0.908 0.084 0.000
#> SRR1470420 3 0.1637 0.89887 0.000 0.060 0.940 0.000
#> SRR1475566 1 0.2281 0.87998 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1477949 1 0.2973 0.83760 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1481419 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1464766 1 0.0336 0.92565 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR615946 3 0.0469 0.94027 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1446481 2 0.0707 0.91920 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1467656 2 0.4855 0.33261 0.000 0.600 0.400 0.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR665586 1 0.0188 0.92599 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1347166 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.0188 0.92599 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR613390 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.0336 0.92574 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR817329 1 0.0188 0.92599 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1401990 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467745 4 0.6182 0.52531 0.000 0.088 0.276 0.636
#> SRR1471795 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1415637 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR813137 1 0.1004 0.92140 0.972 0.000 0.004 0.024
#> SRR1314873 1 0.0817 0.92165 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1401211 4 0.0707 0.88353 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1419692 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818797 1 0.0707 0.92116 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR2164608 1 0.4643 0.50198 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR1455586 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.92511 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.92511 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361652 2 0.2081 0.86483 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1437119 1 0.4948 0.30259 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR1478547 3 0.0188 0.94360 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1430910 2 0.2714 0.83571 0.112 0.884 0.004 0.000
#> SRR1310584 1 0.1211 0.91543 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1500216 1 0.0188 0.92599 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486762 3 0.0188 0.94360 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1480854 4 0.4985 0.17851 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1489394 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1473058 4 0.2521 0.84275 0.000 0.024 0.064 0.912
#> SRR1405165 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 4 0.0188 0.89233 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1098567 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1098712 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455038 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1375248 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403005 1 0.0469 0.92411 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1348378 3 0.0895 0.92988 0.000 0.020 0.976 0.004
#> SRR1413541 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 4 0.0336 0.89160 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1475192 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432085 3 0.4008 0.65034 0.000 0.244 0.756 0.000
#> SRR1452468 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1347060 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414139 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447962 3 0.1389 0.90832 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1444324 2 0.5000 0.01381 0.000 0.504 0.496 0.000
#> SRR1415004 4 0.4103 0.63006 0.256 0.000 0.000 0.744
#> SRR1413436 1 0.0592 0.92421 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1311266 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1343302 4 0.0188 0.89319 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1373746 1 0.0817 0.92198 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1429678 1 0.0817 0.92165 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1469413 3 0.0469 0.93813 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1405331 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.3873 0.72908 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1380208 2 0.0188 0.92380 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1322840 4 0.0188 0.89319 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1399797 3 0.0336 0.94182 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1416654 3 0.0469 0.93987 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1315081 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.1867 0.89692 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1365291 1 0.0000 0.92574 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367920 2 0.0336 0.92302 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1366648 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0188 0.92575 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1082173 3 0.4776 0.37305 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1363968 4 0.3444 0.73751 0.184 0.000 0.000 0.816
#> SRR814387 1 0.1302 0.91302 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR657599 1 0.5220 0.29163 0.568 0.000 0.424 0.008
#> SRR1386689 4 0.0000 0.89405 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395575 3 0.0188 0.94360 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1453811 1 0.0336 0.92509 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1441159 1 0.0657 0.92442 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1403154 4 0.0188 0.89319 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1468722 3 0.0000 0.94509 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310275 1 0.0188 0.92525 0.996 0.004 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 3 0.4792 0.65298 0.004 0.000 0.724 0.196 0.076
#> SRR1331708 5 0.4288 0.35196 0.000 0.384 0.000 0.004 0.612
#> SRR1464258 1 0.1408 0.82031 0.948 0.000 0.008 0.000 0.044
#> SRR1454201 5 0.0703 0.81277 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR661589 3 0.4196 0.47610 0.356 0.000 0.640 0.000 0.004
#> SRR1456229 1 0.1197 0.82033 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1315165 4 0.0000 0.87199 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.3386 0.78438 0.832 0.000 0.000 0.040 0.128
#> SRR1417809 4 0.1195 0.86258 0.028 0.000 0.000 0.960 0.012
#> SRR1094457 4 0.0000 0.87199 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.0955 0.81755 0.968 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1315931 1 0.2179 0.80887 0.896 0.000 0.000 0.004 0.100
#> SRR1430066 3 0.0162 0.91703 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0451 0.91596 0.008 0.000 0.988 0.000 0.004
#> SRR1395554 3 0.0324 0.91660 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR818002 2 0.0510 0.92080 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1344143 2 0.0162 0.92226 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486845 4 0.0162 0.87177 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1362866 5 0.0992 0.81280 0.024 0.008 0.000 0.000 0.968
#> SRR1490740 1 0.1251 0.82188 0.956 0.000 0.000 0.008 0.036
#> SRR1446627 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 4 0.4857 0.46797 0.040 0.000 0.000 0.636 0.324
#> SRR1383907 4 0.4045 0.41963 0.000 0.356 0.000 0.644 0.000
#> SRR1311018 4 0.4629 0.61238 0.244 0.000 0.000 0.704 0.052
#> SRR1375699 2 0.3021 0.85723 0.052 0.880 0.000 0.052 0.016
#> SRR1429846 1 0.4624 0.50211 0.636 0.000 0.340 0.000 0.024
#> SRR613550 1 0.1168 0.81354 0.960 0.000 0.032 0.000 0.008
#> SRR1348402 1 0.4425 0.31714 0.544 0.000 0.000 0.004 0.452
#> SRR1345146 1 0.4012 0.74930 0.788 0.008 0.000 0.036 0.168
#> SRR1324025 3 0.1168 0.90455 0.032 0.000 0.960 0.000 0.008
#> SRR1318879 1 0.4599 0.40334 0.600 0.000 0.384 0.000 0.016
#> SRR820755 1 0.3857 0.58142 0.688 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR1485830 4 0.0000 0.87199 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR599313 1 0.1041 0.82102 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR612263 1 0.2074 0.80783 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1415398 3 0.4549 0.12742 0.464 0.000 0.528 0.000 0.008
#> SRR1326205 4 0.0912 0.86682 0.016 0.000 0.000 0.972 0.012
#> SRR1421327 5 0.5693 0.46533 0.000 0.236 0.000 0.144 0.620
#> SRR1083311 3 0.0451 0.91582 0.008 0.000 0.988 0.000 0.004
#> SRR1499303 4 0.1410 0.84419 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1079522 2 0.1704 0.87777 0.068 0.928 0.000 0.000 0.004
#> SRR1452935 5 0.4273 0.01904 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR1379495 1 0.3934 0.76154 0.800 0.000 0.000 0.124 0.076
#> SRR1470459 3 0.0510 0.91103 0.000 0.016 0.984 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.1168 0.90455 0.032 0.000 0.960 0.000 0.008
#> SRR615778 5 0.1205 0.80962 0.040 0.004 0.000 0.000 0.956
#> SRR1447564 1 0.1697 0.81732 0.932 0.000 0.000 0.008 0.060
#> SRR1455195 5 0.0794 0.81271 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR655182 1 0.2149 0.80693 0.916 0.000 0.000 0.048 0.036
#> SRR1335140 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433555 3 0.0771 0.91200 0.020 0.000 0.976 0.000 0.004
#> SRR1308650 3 0.0671 0.91191 0.000 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR1388354 1 0.4622 0.60638 0.692 0.000 0.000 0.264 0.044
#> SRR1317446 3 0.0000 0.91693 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0324 0.91514 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1479955 2 0.0162 0.92306 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR809853 1 0.1124 0.82146 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR661313 3 0.4108 0.57210 0.308 0.000 0.684 0.000 0.008
#> SRR1499935 4 0.0404 0.86899 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1447303 3 0.3876 0.69328 0.032 0.000 0.776 0.000 0.192
#> SRR1429408 4 0.2464 0.81983 0.000 0.096 0.000 0.888 0.016
#> SRR1433950 1 0.2127 0.80580 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1362081 2 0.1270 0.89433 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1409854 1 0.2280 0.80053 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1435229 1 0.4196 0.52968 0.640 0.004 0.000 0.000 0.356
#> SRR1085996 1 0.1851 0.81319 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1414229 5 0.1117 0.81180 0.020 0.016 0.000 0.000 0.964
#> SRR1400974 3 0.0955 0.90825 0.028 0.000 0.968 0.000 0.004
#> SRR1399971 1 0.2922 0.80483 0.872 0.000 0.000 0.072 0.056
#> SRR613927 1 0.1082 0.82002 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1457854 1 0.2446 0.80720 0.900 0.000 0.000 0.044 0.056
#> SRR1473714 4 0.1830 0.84140 0.068 0.000 0.000 0.924 0.008
#> SRR813776 1 0.1557 0.81890 0.940 0.000 0.008 0.000 0.052
#> SRR808196 4 0.0609 0.86977 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1101085 4 0.2648 0.76826 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR614395 1 0.1041 0.82074 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1478251 4 0.0000 0.87199 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.3554 0.71037 0.000 0.776 0.216 0.004 0.004
#> SRR1362310 1 0.4428 0.73013 0.760 0.000 0.000 0.144 0.096
#> SRR665310 1 0.0771 0.81064 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1420109 1 0.0898 0.81837 0.972 0.000 0.008 0.000 0.020
#> SRR1330920 1 0.3013 0.76157 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1419539 3 0.0324 0.91514 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1359447 3 0.3521 0.68787 0.000 0.232 0.764 0.000 0.004
#> SRR1347259 4 0.3978 0.76308 0.036 0.144 0.000 0.804 0.016
#> SRR613915 1 0.3413 0.75995 0.832 0.000 0.124 0.000 0.044
#> SRR1384395 3 0.0000 0.91693 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821715 1 0.3970 0.66913 0.752 0.000 0.224 0.000 0.024
#> SRR1478228 1 0.6692 0.24822 0.432 0.000 0.000 0.296 0.272
#> SRR1445637 1 0.1124 0.82141 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR608150 5 0.1074 0.81167 0.016 0.012 0.000 0.004 0.968
#> SRR1096383 4 0.4606 0.76375 0.096 0.000 0.068 0.788 0.048
#> SRR1341480 4 0.2325 0.83196 0.000 0.068 0.000 0.904 0.028
#> SRR1341344 5 0.1341 0.80367 0.056 0.000 0.000 0.000 0.944
#> SRR1326270 1 0.2338 0.77206 0.884 0.000 0.112 0.000 0.004
#> SRR1498838 3 0.0324 0.91660 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1416313 3 0.0771 0.91145 0.020 0.000 0.976 0.000 0.004
#> SRR808566 4 0.2813 0.74839 0.000 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1430270 4 0.0162 0.87177 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1367825 3 0.0000 0.91693 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613533 1 0.4645 0.63640 0.688 0.000 0.268 0.000 0.044
#> SRR661267 3 0.4276 0.59266 0.028 0.000 0.716 0.000 0.256
#> SRR810665 2 0.0566 0.92036 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1407250 5 0.0703 0.81277 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR1420067 1 0.4375 0.40166 0.576 0.000 0.000 0.004 0.420
#> SRR1473632 1 0.1653 0.81390 0.944 0.004 0.000 0.028 0.024
#> SRR812536 3 0.0162 0.91703 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0609 0.91932 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1486195 3 0.2852 0.76584 0.000 0.172 0.828 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.3563 0.70827 0.000 0.780 0.000 0.208 0.012
#> SRR1446375 1 0.4341 0.77284 0.796 0.000 0.088 0.020 0.096
#> SRR1465230 4 0.0000 0.87199 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614119 1 0.7465 0.05175 0.348 0.000 0.284 0.032 0.336
#> SRR1356101 3 0.0162 0.91621 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1404209 1 0.1571 0.81917 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR1392676 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 4 0.3317 0.79400 0.044 0.000 0.000 0.840 0.116
#> SRR660510 3 0.1205 0.90110 0.040 0.000 0.956 0.000 0.004
#> SRR1445655 4 0.1851 0.82428 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR658953 1 0.3906 0.73988 0.800 0.132 0.000 0.000 0.068
#> SRR2166459 1 0.1408 0.81707 0.948 0.000 0.000 0.008 0.044
#> SRR1070713 5 0.4161 0.29125 0.000 0.392 0.000 0.000 0.608
#> SRR1485312 3 0.0162 0.91703 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.0898 0.86959 0.008 0.000 0.000 0.972 0.020
#> SRR1488610 5 0.4102 0.46078 0.300 0.004 0.000 0.004 0.692
#> SRR1330588 3 0.1041 0.90035 0.004 0.000 0.964 0.000 0.032
#> SRR1316367 5 0.1041 0.81191 0.032 0.004 0.000 0.000 0.964
#> SRR1433926 1 0.1205 0.82092 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR1091302 4 0.1197 0.85215 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR818263 1 0.4219 0.33632 0.584 0.000 0.000 0.000 0.416
#> SRR1404909 2 0.1608 0.88700 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR663076 4 0.3193 0.78285 0.132 0.000 0.000 0.840 0.028
#> SRR1323577 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.87199 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465893 4 0.1522 0.85852 0.012 0.000 0.000 0.944 0.044
#> SRR654862 5 0.3074 0.67041 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR1407112 4 0.0000 0.87199 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.4403 0.25164 0.436 0.000 0.560 0.000 0.004
#> SRR1353199 1 0.4415 0.19864 0.552 0.000 0.444 0.000 0.004
#> SRR1378885 1 0.2843 0.80268 0.876 0.000 0.048 0.000 0.076
#> SRR665357 3 0.0162 0.91621 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR662186 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 1 0.4420 0.13179 0.548 0.000 0.448 0.000 0.004
#> SRR1347819 3 0.0000 0.91693 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0451 0.92245 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR1472576 2 0.1671 0.88248 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1431781 4 0.0404 0.86889 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1452270 3 0.0162 0.91703 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.0703 0.81277 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR1417632 2 0.0404 0.92234 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1350153 2 0.0566 0.92036 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1458113 5 0.1623 0.80670 0.016 0.016 0.020 0.000 0.948
#> SRR1326579 5 0.0794 0.81271 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR1349363 2 0.2575 0.87566 0.044 0.904 0.000 0.036 0.016
#> SRR1096712 3 0.0000 0.91693 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.2488 0.83138 0.124 0.000 0.872 0.000 0.004
#> SRR1083752 2 0.0963 0.91218 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1377599 2 0.3123 0.75130 0.000 0.812 0.000 0.004 0.184
#> SRR1488449 1 0.4299 0.35669 0.608 0.000 0.388 0.000 0.004
#> SRR1318354 5 0.1547 0.80689 0.016 0.004 0.032 0.000 0.948
#> SRR1359062 3 0.0162 0.91703 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.3508 0.60724 0.000 0.252 0.000 0.000 0.748
#> SRR663783 3 0.0671 0.91366 0.016 0.000 0.980 0.000 0.004
#> SRR1319204 2 0.4972 0.49225 0.024 0.648 0.312 0.000 0.016
#> SRR1369070 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0671 0.82085 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1337449 2 0.2280 0.82980 0.000 0.880 0.120 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.0324 0.91514 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1498595 2 0.0794 0.91598 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1377423 1 0.3838 0.58966 0.716 0.000 0.280 0.000 0.004
#> SRR1312310 2 0.0566 0.92036 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1485613 5 0.6622 0.12015 0.328 0.000 0.000 0.232 0.440
#> SRR1338426 3 0.0324 0.91514 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1353309 3 0.0324 0.91514 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR658941 5 0.4443 0.09531 0.004 0.000 0.472 0.000 0.524
#> SRR1101643 1 0.0693 0.81999 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1401468 5 0.3779 0.60270 0.012 0.000 0.000 0.236 0.752
#> SRR1368874 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0703 0.86393 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1363858 4 0.1661 0.85241 0.024 0.000 0.000 0.940 0.036
#> SRR819820 3 0.0451 0.91451 0.004 0.000 0.988 0.000 0.008
#> SRR1337342 5 0.0703 0.81277 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR655206 3 0.2170 0.84776 0.004 0.000 0.904 0.088 0.004
#> SRR1387013 2 0.4235 0.28271 0.000 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1317410 5 0.6229 0.23460 0.320 0.000 0.000 0.164 0.516
#> SRR608198 5 0.1041 0.81191 0.032 0.004 0.000 0.000 0.964
#> SRR1440161 3 0.3123 0.75405 0.000 0.184 0.812 0.000 0.004
#> SRR1343741 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0162 0.92306 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1415379 4 0.0912 0.86682 0.016 0.000 0.000 0.972 0.012
#> SRR1099622 3 0.0324 0.91500 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR663197 3 0.0324 0.91660 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1394836 3 0.0486 0.91420 0.004 0.000 0.988 0.004 0.004
#> SRR661699 3 0.1549 0.89781 0.040 0.000 0.944 0.000 0.016
#> SRR813680 1 0.4966 0.40391 0.564 0.000 0.404 0.000 0.032
#> SRR1410678 4 0.5508 -0.00823 0.460 0.000 0.000 0.476 0.064
#> SRR1378109 4 0.0000 0.87199 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.0955 0.82132 0.968 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1311486 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 5 0.4752 0.20250 0.000 0.412 0.000 0.020 0.568
#> SRR1433410 5 0.0992 0.81280 0.024 0.008 0.000 0.000 0.968
#> SRR661167 3 0.1704 0.88235 0.068 0.000 0.928 0.000 0.004
#> SRR1432518 3 0.4610 0.69648 0.128 0.004 0.756 0.000 0.112
#> SRR660462 3 0.0324 0.91660 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1374608 4 0.1739 0.85445 0.004 0.000 0.032 0.940 0.024
#> SRR657949 1 0.0865 0.82263 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1308882 4 0.0671 0.86975 0.000 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR655768 1 0.3641 0.78199 0.820 0.000 0.000 0.060 0.120
#> SRR1485870 4 0.3940 0.70242 0.008 0.208 0.000 0.768 0.016
#> SRR1444138 1 0.2193 0.81112 0.900 0.000 0.000 0.008 0.092
#> SRR1417342 4 0.4760 0.30401 0.416 0.000 0.000 0.564 0.020
#> SRR1470193 4 0.1200 0.86798 0.008 0.016 0.000 0.964 0.012
#> SRR1091380 3 0.0566 0.91295 0.004 0.000 0.984 0.000 0.012
#> SRR1099096 4 0.4404 0.59588 0.036 0.000 0.000 0.712 0.252
#> SRR1313583 4 0.0771 0.86862 0.020 0.000 0.000 0.976 0.004
#> SRR1467102 3 0.0324 0.91514 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1485416 4 0.3182 0.77839 0.000 0.124 0.000 0.844 0.032
#> SRR818821 1 0.4757 0.45578 0.596 0.000 0.380 0.000 0.024
#> SRR809963 1 0.1082 0.82002 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1072247 4 0.3141 0.78288 0.040 0.000 0.000 0.852 0.108
#> SRR1353710 4 0.2569 0.83219 0.016 0.076 0.000 0.896 0.012
#> SRR1445259 1 0.4390 0.37382 0.568 0.004 0.000 0.000 0.428
#> SRR1408393 1 0.0579 0.81622 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1361522 1 0.0324 0.81849 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1368597 1 0.0671 0.81191 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1309680 2 0.0404 0.92190 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.91693 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0324 0.87178 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1406437 4 0.2632 0.82319 0.004 0.000 0.072 0.892 0.032
#> SRR1354931 3 0.0000 0.91693 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391856 3 0.1758 0.89210 0.004 0.008 0.944 0.020 0.024
#> SRR1446738 5 0.5175 0.65076 0.000 0.032 0.152 0.084 0.732
#> SRR1309032 2 0.2329 0.82205 0.000 0.876 0.124 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0693 0.92080 0.000 0.980 0.008 0.012 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0451 0.91582 0.008 0.000 0.988 0.000 0.004
#> SRR613150 3 0.0324 0.91514 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1375329 2 0.2124 0.84338 0.004 0.900 0.000 0.000 0.096
#> SRR1387921 1 0.4583 0.55209 0.672 0.000 0.000 0.296 0.032
#> SRR1466792 2 0.1043 0.90259 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0162 0.92306 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1360695 4 0.5181 0.35785 0.360 0.000 0.000 0.588 0.052
#> SRR812943 1 0.2889 0.79044 0.872 0.084 0.000 0.000 0.044
#> SRR1400910 2 0.4305 0.00693 0.000 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR1444203 4 0.0000 0.87199 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816177 2 0.3336 0.70763 0.000 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR658754 3 0.0451 0.91582 0.008 0.000 0.988 0.000 0.004
#> SRR1429603 4 0.0807 0.86993 0.000 0.012 0.000 0.976 0.012
#> SRR1397366 1 0.2583 0.75827 0.864 0.000 0.132 0.000 0.004
#> SRR1446028 1 0.4708 0.33505 0.548 0.000 0.000 0.016 0.436
#> SRR1083918 2 0.0703 0.91807 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1337606 5 0.2329 0.73601 0.000 0.124 0.000 0.000 0.876
#> SRR659109 3 0.0324 0.91660 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1337192 5 0.1124 0.81136 0.036 0.004 0.000 0.000 0.960
#> SRR656946 1 0.2172 0.79372 0.908 0.000 0.000 0.076 0.016
#> SRR1476102 5 0.5296 -0.12701 0.472 0.000 0.000 0.048 0.480
#> SRR1476447 1 0.2966 0.75662 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR1342067 4 0.0404 0.86889 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1385389 4 0.0290 0.87117 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1075971 1 0.4276 0.47830 0.616 0.000 0.000 0.004 0.380
#> SRR614419 5 0.4088 0.31190 0.368 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR1322936 5 0.1357 0.79570 0.004 0.048 0.000 0.000 0.948
#> SRR1349121 1 0.3764 0.76642 0.800 0.000 0.000 0.044 0.156
#> SRR1430549 1 0.4101 0.57498 0.664 0.000 0.000 0.004 0.332
#> SRR612935 1 0.7678 0.31817 0.452 0.248 0.224 0.000 0.076
#> SRR661481 2 0.0404 0.92190 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1354117 2 0.2488 0.82380 0.004 0.872 0.124 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.1197 0.85626 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1452164 1 0.2193 0.81092 0.900 0.000 0.000 0.008 0.092
#> SRR1070503 1 0.4232 0.56130 0.676 0.000 0.012 0.000 0.312
#> SRR1499894 3 0.0162 0.91621 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1082883 5 0.1278 0.80450 0.004 0.016 0.000 0.020 0.960
#> SRR1468271 4 0.4749 0.44340 0.016 0.000 0.008 0.628 0.348
#> SRR1332443 4 0.6100 -0.02455 0.428 0.000 0.000 0.448 0.124
#> SRR810295 2 0.0566 0.92036 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR662103 1 0.0324 0.81635 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1328620 5 0.2046 0.79140 0.016 0.000 0.068 0.000 0.916
#> SRR1396294 4 0.0727 0.87035 0.004 0.000 0.004 0.980 0.012
#> SRR1419917 1 0.0324 0.81849 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR662114 5 0.4704 0.58555 0.036 0.012 0.240 0.000 0.712
#> SRR1489199 5 0.2605 0.71881 0.148 0.000 0.000 0.000 0.852
#> SRR813584 4 0.4305 0.03657 0.000 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR1069638 5 0.1168 0.81188 0.032 0.008 0.000 0.000 0.960
#> SRR614864 3 0.4909 0.31395 0.032 0.000 0.588 0.000 0.380
#> SRR1433392 1 0.1331 0.82006 0.952 0.000 0.008 0.000 0.040
#> SRR1377777 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.1914 0.80158 0.924 0.000 0.000 0.060 0.016
#> SRR1401252 2 0.4227 0.28463 0.000 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR1309963 4 0.0404 0.87029 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1338031 1 0.1907 0.81066 0.928 0.000 0.000 0.044 0.028
#> SRR1418628 2 0.0566 0.92036 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR1486889 1 0.1934 0.79198 0.928 0.000 0.004 0.052 0.016
#> SRR1380393 4 0.4546 0.52933 0.304 0.000 0.000 0.668 0.028
#> SRR1319731 4 0.6719 -0.16333 0.372 0.000 0.000 0.380 0.248
#> SRR1356468 4 0.0510 0.87007 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1337010 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 5 0.1041 0.81099 0.032 0.000 0.000 0.004 0.964
#> SRR1486538 4 0.0854 0.86930 0.012 0.004 0.000 0.976 0.008
#> SRR1340486 4 0.0000 0.87199 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.0290 0.92014 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1465459 1 0.1956 0.81338 0.916 0.000 0.008 0.000 0.076
#> SRR1080270 3 0.0000 0.91693 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.4909 0.18880 0.412 0.000 0.560 0.000 0.028
#> SRR1093148 5 0.2011 0.77116 0.004 0.000 0.088 0.000 0.908
#> SRR1467080 3 0.0000 0.91693 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0807 0.91930 0.000 0.976 0.012 0.012 0.000
#> SRR816475 4 0.1124 0.85564 0.000 0.004 0.036 0.960 0.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.87199 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613342 1 0.3861 0.63540 0.728 0.000 0.264 0.000 0.008
#> SRR1452246 2 0.2605 0.79973 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1338836 2 0.0290 0.92277 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.87199 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.4166 0.47819 0.348 0.000 0.648 0.000 0.004
#> SRR813824 3 0.1205 0.90110 0.040 0.000 0.956 0.000 0.004
#> SRR1082376 1 0.2377 0.79428 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1500891 2 0.4278 0.19579 0.000 0.548 0.000 0.452 0.000
#> SRR807543 1 0.1956 0.81400 0.916 0.000 0.008 0.000 0.076
#> SRR1091572 5 0.4300 0.04308 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1346689 4 0.1768 0.83673 0.000 0.072 0.000 0.924 0.004
#> SRR1332424 5 0.0703 0.81277 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR663729 4 0.0451 0.87166 0.000 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1097013 1 0.1725 0.81953 0.936 0.000 0.000 0.020 0.044
#> SRR613675 5 0.1251 0.80190 0.008 0.036 0.000 0.000 0.956
#> SRR1485357 4 0.0162 0.87185 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR655816 3 0.0451 0.91631 0.008 0.000 0.988 0.000 0.004
#> SRR1500113 4 0.4886 0.64254 0.188 0.000 0.000 0.712 0.100
#> SRR1437622 2 0.1282 0.90574 0.000 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR1355172 3 0.4922 0.71482 0.104 0.000 0.756 0.112 0.028
#> SRR655531 5 0.0703 0.81277 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR1338147 3 0.1282 0.89057 0.004 0.000 0.952 0.000 0.044
#> SRR1413329 5 0.2769 0.77187 0.032 0.000 0.092 0.000 0.876
#> SRR1485931 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 5 0.3165 0.74341 0.036 0.000 0.000 0.116 0.848
#> SRR1333308 4 0.0404 0.87029 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1452033 1 0.5623 0.53204 0.596 0.000 0.000 0.300 0.104
#> SRR1467316 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0566 0.91475 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1375351 2 0.0162 0.92306 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR663440 1 0.6186 0.08961 0.452 0.000 0.136 0.000 0.412
#> SRR1471755 2 0.1121 0.90696 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR808019 5 0.1808 0.79679 0.004 0.000 0.040 0.020 0.936
#> SRR1479133 3 0.4101 0.51092 0.332 0.000 0.664 0.000 0.004
#> SRR615069 2 0.4392 0.35355 0.000 0.612 0.008 0.000 0.380
#> SRR1456185 2 0.1334 0.91285 0.004 0.960 0.012 0.020 0.004
#> SRR1350069 4 0.0290 0.87193 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR816316 1 0.1732 0.81277 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR664795 1 0.4141 0.66931 0.736 0.000 0.236 0.000 0.028
#> SRR1490721 5 0.3291 0.72845 0.000 0.088 0.000 0.064 0.848
#> SRR810643 5 0.1106 0.81081 0.024 0.000 0.000 0.012 0.964
#> SRR1430333 5 0.1117 0.81181 0.020 0.016 0.000 0.000 0.964
#> SRR1085285 3 0.1831 0.87627 0.076 0.000 0.920 0.000 0.004
#> SRR1099072 1 0.1124 0.80950 0.960 0.000 0.036 0.000 0.004
#> SRR1317985 1 0.1444 0.80986 0.948 0.000 0.000 0.040 0.012
#> SRR1487340 1 0.2338 0.80380 0.884 0.000 0.000 0.004 0.112
#> SRR1420276 3 0.0000 0.91693 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.4654 0.39237 0.024 0.000 0.628 0.000 0.348
#> SRR1405525 1 0.4341 0.44427 0.592 0.000 0.000 0.004 0.404
#> SRR1370329 1 0.2228 0.81842 0.912 0.000 0.000 0.040 0.048
#> SRR1465001 4 0.5848 0.43593 0.168 0.000 0.000 0.604 0.228
#> SRR1476525 2 0.0290 0.92277 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR819610 2 0.3832 0.69586 0.004 0.756 0.004 0.232 0.004
#> SRR2157314 1 0.5046 0.68618 0.704 0.000 0.000 0.156 0.140
#> SRR1409465 2 0.0162 0.92306 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR809987 4 0.0404 0.87115 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR613639 3 0.4436 0.23346 0.396 0.000 0.596 0.000 0.008
#> SRR1402285 4 0.0404 0.87029 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1077038 1 0.1082 0.82002 0.964 0.000 0.008 0.000 0.028
#> SRR1405660 3 0.0451 0.91582 0.008 0.000 0.988 0.000 0.004
#> SRR1095455 1 0.3171 0.76259 0.816 0.008 0.000 0.000 0.176
#> SRR1394734 2 0.1478 0.89289 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1317771 1 0.0955 0.81656 0.968 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1365894 2 0.3452 0.66156 0.000 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR1073581 4 0.6007 0.19161 0.048 0.000 0.420 0.500 0.032
#> SRR659804 1 0.5236 0.66426 0.684 0.000 0.000 0.164 0.152
#> SRR1345914 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0290 0.92277 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1473529 2 0.0162 0.92306 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR660764 3 0.0162 0.91621 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR820448 1 0.1168 0.81946 0.960 0.000 0.008 0.000 0.032
#> SRR1328845 4 0.0404 0.87121 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1336415 4 0.0000 0.87199 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0510 0.86802 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1459190 1 0.1216 0.80738 0.960 0.000 0.020 0.000 0.020
#> SRR1346773 5 0.1331 0.80707 0.040 0.000 0.000 0.008 0.952
#> SRR1499521 4 0.4586 0.17994 0.004 0.000 0.004 0.524 0.468
#> SRR1440898 2 0.0290 0.92277 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1347459 3 0.2172 0.86993 0.076 0.000 0.908 0.000 0.016
#> SRR1081209 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.3192 0.79442 0.848 0.000 0.000 0.040 0.112
#> SRR1333395 4 0.4081 0.77791 0.080 0.092 0.000 0.812 0.016
#> SRR1309248 2 0.0290 0.92285 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR809161 1 0.4687 0.51677 0.636 0.000 0.336 0.000 0.028
#> SRR1316320 2 0.0703 0.91130 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1432629 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.4248 0.66904 0.728 0.000 0.000 0.240 0.032
#> SRR1416578 4 0.0912 0.86682 0.016 0.000 0.000 0.972 0.012
#> SRR1405547 3 0.0000 0.91693 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0162 0.87177 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1380764 5 0.0955 0.81176 0.028 0.000 0.000 0.004 0.968
#> SRR1309160 3 0.1124 0.90411 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR663489 3 0.0451 0.91582 0.008 0.000 0.988 0.000 0.004
#> SRR1500450 4 0.2685 0.81934 0.092 0.000 0.000 0.880 0.028
#> SRR1078489 5 0.3578 0.67516 0.204 0.008 0.004 0.000 0.784
#> SRR1332648 4 0.0000 0.87199 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660614 2 0.3122 0.79035 0.004 0.852 0.120 0.000 0.024
#> SRR1470420 3 0.2583 0.81007 0.000 0.132 0.864 0.000 0.004
#> SRR1475566 1 0.3297 0.79564 0.848 0.000 0.000 0.068 0.084
#> SRR1477949 1 0.2708 0.79389 0.884 0.000 0.000 0.072 0.044
#> SRR1481419 2 0.0290 0.92277 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1464766 5 0.4443 -0.07059 0.472 0.000 0.000 0.004 0.524
#> SRR615946 3 0.1124 0.90340 0.036 0.000 0.960 0.000 0.004
#> SRR1446481 2 0.0510 0.92080 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1467656 2 0.0794 0.91188 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1402962 5 0.1410 0.79613 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940
#> SRR660224 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.0162 0.81741 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1347166 5 0.1124 0.81096 0.036 0.004 0.000 0.000 0.960
#> SRR1485722 5 0.0703 0.81277 0.024 0.000 0.000 0.000 0.976
#> SRR1415316 1 0.1792 0.81377 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR613390 1 0.1121 0.82067 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR661108 3 0.0162 0.91703 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.0865 0.81432 0.972 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR817329 1 0.0324 0.81634 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1401990 4 0.0404 0.87135 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1467745 4 0.5206 0.17950 0.000 0.044 0.428 0.528 0.000
#> SRR1471795 2 0.0404 0.92190 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 1 0.0579 0.81370 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1314873 1 0.0451 0.81491 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1401211 4 0.2843 0.81927 0.076 0.000 0.000 0.876 0.048
#> SRR1419692 4 0.0000 0.87199 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818797 1 0.3255 0.77580 0.848 0.000 0.100 0.000 0.052
#> SRR2164608 5 0.6439 0.26575 0.184 0.000 0.356 0.000 0.460
#> SRR1455586 3 0.0324 0.91514 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR819459 3 0.0162 0.91621 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1488939 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 1 0.1671 0.81416 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1361652 2 0.3160 0.72148 0.004 0.808 0.000 0.000 0.188
#> SRR1437119 1 0.5316 0.46691 0.588 0.000 0.000 0.348 0.064
#> SRR1478547 3 0.0162 0.91621 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1430910 5 0.4291 0.12996 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536
#> SRR1310584 5 0.1750 0.80163 0.036 0.000 0.000 0.028 0.936
#> SRR1500216 1 0.1041 0.82102 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1486762 1 0.3766 0.58761 0.728 0.000 0.268 0.000 0.004
#> SRR1480854 4 0.6510 0.27225 0.000 0.232 0.000 0.484 0.284
#> SRR1489394 4 0.0000 0.87199 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.87199 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0404 0.87029 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1473058 4 0.1216 0.85889 0.000 0.020 0.020 0.960 0.000
#> SRR1405165 3 0.0162 0.91703 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.1341 0.81986 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1471477 4 0.2116 0.85454 0.028 0.000 0.008 0.924 0.040
#> SRR1098567 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 4 0.0671 0.87000 0.004 0.000 0.000 0.980 0.016
#> SRR1455038 1 0.3366 0.70611 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232
#> SRR1375248 3 0.0000 0.91693 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 1 0.1668 0.81579 0.940 0.000 0.032 0.000 0.028
#> SRR1348378 3 0.1074 0.90517 0.000 0.016 0.968 0.012 0.004
#> SRR1413541 1 0.0963 0.82135 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1392943 4 0.4182 0.47833 0.000 0.004 0.000 0.644 0.352
#> SRR1475192 3 0.0000 0.91693 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432085 3 0.1908 0.85245 0.000 0.092 0.908 0.000 0.000
#> SRR1452468 1 0.3988 0.67391 0.732 0.016 0.000 0.000 0.252
#> SRR1347060 3 0.0324 0.91514 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1414139 3 0.0324 0.91514 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1447962 3 0.1851 0.85388 0.000 0.088 0.912 0.000 0.000
#> SRR1444324 3 0.3741 0.63377 0.000 0.264 0.732 0.000 0.004
#> SRR1415004 4 0.4938 0.50264 0.312 0.000 0.000 0.640 0.048
#> SRR1413436 1 0.2286 0.80644 0.888 0.000 0.000 0.004 0.108
#> SRR1311266 5 0.0865 0.81219 0.024 0.000 0.000 0.004 0.972
#> SRR1343302 4 0.0404 0.87029 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1373746 1 0.3438 0.76185 0.808 0.000 0.000 0.020 0.172
#> SRR1429678 1 0.2189 0.81329 0.904 0.000 0.000 0.012 0.084
#> SRR1469413 3 0.0703 0.90723 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1405331 1 0.1697 0.81716 0.932 0.000 0.008 0.000 0.060
#> SRR1345609 1 0.4021 0.71202 0.780 0.000 0.000 0.168 0.052
#> SRR1380208 5 0.3039 0.65810 0.000 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1322840 4 0.0162 0.87123 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1399797 3 0.0162 0.91703 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0510 0.91254 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1315081 3 0.0162 0.91695 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1369196 3 0.0324 0.91514 0.004 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1400847 1 0.4138 0.75272 0.776 0.000 0.000 0.064 0.160
#> SRR1365291 5 0.6491 0.19828 0.336 0.000 0.200 0.000 0.464
#> SRR1367920 5 0.5245 0.37037 0.000 0.328 0.000 0.064 0.608
#> SRR1366648 3 0.0451 0.91582 0.008 0.000 0.988 0.000 0.004
#> SRR1441679 2 0.0000 0.92293 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 5 0.4387 0.42463 0.012 0.000 0.348 0.000 0.640
#> SRR1363968 4 0.3366 0.77640 0.032 0.000 0.000 0.828 0.140
#> SRR814387 5 0.5752 0.12795 0.384 0.000 0.000 0.092 0.524
#> SRR657599 5 0.2228 0.79705 0.020 0.000 0.044 0.016 0.920
#> SRR1386689 4 0.0000 0.87199 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0162 0.91703 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1453811 1 0.5719 0.42985 0.552 0.000 0.352 0.000 0.096
#> SRR1441159 5 0.1124 0.80952 0.036 0.000 0.000 0.004 0.960
#> SRR1403154 4 0.0000 0.87199 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0290 0.91667 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1310275 5 0.1408 0.80875 0.044 0.000 0.008 0.000 0.948
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 3 0.5571 0.22546 0.320 0.000 0.568 0.080 0.032 0.000
#> SRR1331708 1 0.5267 0.20561 0.588 0.292 0.000 0.000 0.116 0.004
#> SRR1464258 6 0.1858 0.55958 0.092 0.000 0.000 0.000 0.004 0.904
#> SRR1454201 5 0.1349 0.75822 0.056 0.000 0.000 0.000 0.940 0.004
#> SRR661589 6 0.3547 0.09629 0.000 0.000 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR1456229 6 0.2933 0.43881 0.200 0.000 0.000 0.000 0.004 0.796
#> SRR1315165 4 0.0146 0.86175 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.1588 0.68498 0.924 0.000 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1417809 4 0.2595 0.78166 0.160 0.000 0.000 0.836 0.004 0.000
#> SRR1094457 4 0.0260 0.86210 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.3937 0.45619 0.572 0.004 0.000 0.000 0.000 0.424
#> SRR1315931 6 0.4138 0.06033 0.368 0.000 0.000 0.004 0.012 0.616
#> SRR1430066 3 0.3930 0.60243 0.004 0.000 0.628 0.000 0.004 0.364
#> SRR1431037 3 0.3862 0.57212 0.000 0.000 0.608 0.000 0.004 0.388
#> SRR1395554 3 0.3807 0.58798 0.000 0.000 0.628 0.000 0.004 0.368
#> SRR818002 2 0.3989 0.15240 0.000 0.528 0.004 0.468 0.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.0458 0.88351 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486845 4 0.0146 0.86199 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1362866 5 0.2362 0.70600 0.136 0.000 0.000 0.000 0.860 0.004
#> SRR1490740 1 0.3862 0.36918 0.524 0.000 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1446627 2 0.0146 0.88643 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.88674 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.3507 0.67277 0.820 0.000 0.000 0.020 0.116 0.044
#> SRR1383907 4 0.0777 0.85107 0.000 0.024 0.000 0.972 0.000 0.004
#> SRR1311018 1 0.3003 0.69024 0.812 0.000 0.000 0.016 0.000 0.172
#> SRR1375699 2 0.1419 0.87728 0.016 0.952 0.000 0.016 0.004 0.012
#> SRR1429846 6 0.2738 0.45461 0.000 0.000 0.176 0.000 0.004 0.820
#> SRR613550 6 0.2134 0.60129 0.052 0.000 0.044 0.000 0.000 0.904
#> SRR1348402 1 0.5383 0.59690 0.584 0.000 0.000 0.000 0.232 0.184
#> SRR1345146 1 0.0870 0.66040 0.972 0.012 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1324025 6 0.4091 -0.34097 0.000 0.000 0.472 0.000 0.008 0.520
#> SRR1318879 1 0.6822 0.14821 0.464 0.252 0.224 0.000 0.004 0.056
#> SRR820755 6 0.1983 0.59198 0.000 0.000 0.020 0.000 0.072 0.908
#> SRR1485830 4 0.0260 0.86205 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR599313 6 0.3351 0.28610 0.288 0.000 0.000 0.000 0.000 0.712
#> SRR612263 6 0.4332 0.07044 0.352 0.000 0.000 0.000 0.032 0.616
#> SRR1415398 6 0.3052 0.38021 0.000 0.000 0.216 0.000 0.004 0.780
#> SRR1326205 4 0.3109 0.73045 0.224 0.000 0.000 0.772 0.004 0.000
#> SRR1421327 5 0.3937 0.16621 0.000 0.004 0.000 0.424 0.572 0.000
#> SRR1083311 3 0.3607 0.61953 0.000 0.000 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1499303 4 0.0146 0.86107 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1079522 2 0.2636 0.81208 0.120 0.860 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1452935 5 0.4768 0.51925 0.140 0.000 0.004 0.000 0.688 0.168
#> SRR1379495 1 0.3499 0.60552 0.680 0.000 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1470459 3 0.2697 0.63722 0.000 0.188 0.812 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 6 0.3989 -0.31892 0.000 0.000 0.468 0.000 0.004 0.528
#> SRR615778 5 0.0790 0.76546 0.000 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1447564 1 0.3756 0.49297 0.600 0.000 0.000 0.000 0.000 0.400
#> SRR1455195 5 0.0622 0.76903 0.012 0.000 0.000 0.000 0.980 0.008
#> SRR655182 1 0.2003 0.68326 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1335140 2 0.0363 0.88448 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433555 3 0.3756 0.67250 0.020 0.000 0.712 0.000 0.000 0.268
#> SRR1308650 3 0.4562 0.60654 0.004 0.180 0.732 0.024 0.000 0.060
#> SRR1388354 1 0.1700 0.68663 0.916 0.000 0.000 0.004 0.000 0.080
#> SRR1317446 3 0.2191 0.72696 0.000 0.000 0.876 0.000 0.004 0.120
#> SRR1413602 3 0.2103 0.72371 0.020 0.000 0.912 0.000 0.012 0.056
#> SRR1479955 2 0.0000 0.88674 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809853 6 0.4328 -0.23440 0.460 0.020 0.000 0.000 0.000 0.520
#> SRR661313 6 0.2520 0.49812 0.000 0.000 0.152 0.000 0.004 0.844
#> SRR1499935 4 0.0146 0.86107 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1447303 6 0.4975 -0.28887 0.000 0.000 0.428 0.000 0.068 0.504
#> SRR1429408 4 0.1396 0.85160 0.024 0.004 0.008 0.952 0.012 0.000
#> SRR1433950 1 0.4253 0.40145 0.524 0.000 0.000 0.000 0.016 0.460
#> SRR1362081 2 0.3050 0.66157 0.000 0.764 0.236 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 6 0.4604 0.19490 0.300 0.000 0.000 0.000 0.064 0.636
#> SRR1435229 5 0.5966 -0.02163 0.344 0.012 0.000 0.000 0.480 0.164
#> SRR1085996 6 0.4018 -0.07004 0.412 0.000 0.000 0.000 0.008 0.580
#> SRR1414229 5 0.0291 0.76888 0.000 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1400974 3 0.3841 0.58164 0.004 0.000 0.616 0.000 0.000 0.380
#> SRR1399971 1 0.4103 0.42480 0.544 0.000 0.000 0.004 0.004 0.448
#> SRR613927 6 0.1967 0.57349 0.084 0.000 0.012 0.000 0.000 0.904
#> SRR1457854 1 0.2527 0.68913 0.832 0.000 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1473714 1 0.5027 0.58896 0.640 0.000 0.000 0.200 0.000 0.160
#> SRR813776 6 0.0520 0.60699 0.000 0.000 0.008 0.000 0.008 0.984
#> SRR808196 4 0.3819 0.51740 0.372 0.000 0.000 0.624 0.004 0.000
#> SRR1101085 4 0.0146 0.86107 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR614395 6 0.2762 0.44735 0.196 0.000 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR1478251 4 0.0146 0.86199 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.3807 0.38391 0.000 0.628 0.368 0.004 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.3050 0.66675 0.764 0.000 0.000 0.000 0.000 0.236
#> SRR665310 6 0.1500 0.59295 0.012 0.000 0.052 0.000 0.000 0.936
#> SRR1420109 6 0.0935 0.59625 0.032 0.000 0.004 0.000 0.000 0.964
#> SRR1330920 6 0.1155 0.60170 0.004 0.000 0.004 0.000 0.036 0.956
#> SRR1419539 3 0.1563 0.67630 0.056 0.000 0.932 0.000 0.012 0.000
#> SRR1359447 3 0.4300 -0.00472 0.012 0.456 0.528 0.000 0.000 0.004
#> SRR1347259 4 0.3497 0.73876 0.224 0.008 0.000 0.760 0.004 0.004
#> SRR613915 6 0.2846 0.49271 0.016 0.000 0.140 0.000 0.004 0.840
#> SRR1384395 3 0.1267 0.72766 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR821715 6 0.2355 0.54788 0.008 0.000 0.112 0.000 0.004 0.876
#> SRR1478228 1 0.3220 0.69773 0.832 0.000 0.000 0.004 0.056 0.108
#> SRR1445637 6 0.3847 -0.20016 0.456 0.000 0.000 0.000 0.000 0.544
#> SRR608150 5 0.0291 0.76846 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1096383 1 0.2993 0.61000 0.844 0.000 0.120 0.028 0.008 0.000
#> SRR1341480 4 0.0405 0.86020 0.000 0.004 0.000 0.988 0.008 0.000
#> SRR1341344 5 0.2887 0.68469 0.120 0.000 0.000 0.000 0.844 0.036
#> SRR1326270 6 0.2199 0.58038 0.020 0.000 0.088 0.000 0.000 0.892
#> SRR1498838 3 0.3647 0.60068 0.000 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR1416313 3 0.3993 0.42641 0.000 0.000 0.520 0.000 0.004 0.476
#> SRR808566 4 0.0363 0.85781 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1430270 4 0.0363 0.86161 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.2431 0.72573 0.008 0.000 0.860 0.000 0.000 0.132
#> SRR613533 3 0.5888 -0.09053 0.220 0.000 0.460 0.000 0.000 0.320
#> SRR661267 3 0.4490 0.49703 0.128 0.000 0.720 0.000 0.148 0.004
#> SRR810665 2 0.0146 0.88676 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 5 0.0146 0.76828 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1420067 1 0.3284 0.64531 0.800 0.000 0.000 0.000 0.168 0.032
#> SRR1473632 1 0.4720 0.49230 0.560 0.052 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR812536 3 0.3841 0.58697 0.000 0.000 0.616 0.000 0.004 0.380
#> SRR1370850 2 0.2456 0.82754 0.000 0.880 0.012 0.100 0.004 0.004
#> SRR1486195 3 0.3860 0.11278 0.000 0.472 0.528 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.2531 0.79557 0.132 0.856 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1446375 1 0.3668 0.63622 0.728 0.000 0.008 0.000 0.008 0.256
#> SRR1465230 4 0.0260 0.86210 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR614119 1 0.4254 0.60474 0.764 0.000 0.124 0.000 0.092 0.020
#> SRR1356101 3 0.0260 0.71097 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.2146 0.66523 0.880 0.000 0.000 0.000 0.004 0.116
#> SRR1392676 2 0.0000 0.88674 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.2624 0.63800 0.884 0.000 0.020 0.068 0.028 0.000
#> SRR660510 3 0.3997 0.40345 0.000 0.000 0.508 0.000 0.004 0.488
#> SRR1445655 4 0.0000 0.86121 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658953 2 0.5428 0.32221 0.140 0.540 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR2166459 1 0.2941 0.64846 0.780 0.000 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1070713 5 0.3259 0.60906 0.000 0.216 0.000 0.012 0.772 0.000
#> SRR1485312 3 0.4158 0.53689 0.004 0.000 0.572 0.000 0.008 0.416
#> SRR1317631 4 0.3741 0.61880 0.320 0.000 0.000 0.672 0.008 0.000
#> SRR1488610 1 0.4996 0.35680 0.548 0.004 0.000 0.000 0.384 0.064
#> SRR1330588 3 0.4417 0.50963 0.000 0.000 0.556 0.000 0.028 0.416
#> SRR1316367 5 0.1713 0.75270 0.044 0.000 0.000 0.000 0.928 0.028
#> SRR1433926 6 0.3899 -0.03513 0.404 0.000 0.000 0.004 0.000 0.592
#> SRR1091302 4 0.0146 0.86146 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR818263 6 0.3709 0.48312 0.040 0.000 0.000 0.000 0.204 0.756
#> SRR1404909 4 0.2562 0.73304 0.000 0.172 0.000 0.828 0.000 0.000
#> SRR663076 1 0.2046 0.67250 0.908 0.000 0.000 0.060 0.000 0.032
#> SRR1323577 2 0.0622 0.88491 0.000 0.980 0.008 0.012 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0146 0.86199 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.3265 0.49853 0.748 0.000 0.000 0.248 0.004 0.000
#> SRR654862 5 0.4400 0.33909 0.032 0.000 0.000 0.000 0.592 0.376
#> SRR1407112 4 0.0865 0.85451 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1332969 6 0.3528 0.18437 0.004 0.000 0.296 0.000 0.000 0.700
#> SRR1353199 6 0.2667 0.54633 0.020 0.000 0.128 0.000 0.000 0.852
#> SRR1378885 6 0.2011 0.58049 0.004 0.000 0.064 0.000 0.020 0.912
#> SRR665357 3 0.0622 0.71546 0.008 0.000 0.980 0.000 0.000 0.012
#> SRR662186 2 0.0260 0.88553 0.008 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 6 0.3797 0.24849 0.016 0.000 0.292 0.000 0.000 0.692
#> SRR1347819 3 0.2520 0.72168 0.000 0.000 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR1480813 2 0.1995 0.85772 0.000 0.912 0.036 0.052 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.2631 0.72465 0.000 0.180 0.000 0.820 0.000 0.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.86121 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.3965 0.59286 0.004 0.000 0.616 0.000 0.004 0.376
#> SRR1500472 5 0.4045 0.42967 0.336 0.008 0.008 0.000 0.648 0.000
#> SRR1417632 2 0.4088 0.39226 0.016 0.616 0.000 0.368 0.000 0.000
#> SRR1350153 2 0.0632 0.88247 0.000 0.976 0.024 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 5 0.0260 0.76843 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1326579 5 0.0622 0.76907 0.012 0.000 0.000 0.000 0.980 0.008
#> SRR1349363 2 0.2476 0.81940 0.120 0.868 0.000 0.004 0.004 0.004
#> SRR1096712 3 0.3201 0.70420 0.012 0.000 0.780 0.000 0.000 0.208
#> SRR1090407 6 0.3852 -0.08983 0.000 0.000 0.384 0.000 0.004 0.612
#> SRR1083752 4 0.3499 0.49568 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000 0.000
#> SRR1377599 4 0.5819 0.09437 0.000 0.188 0.000 0.444 0.368 0.000
#> SRR1488449 6 0.3595 0.20228 0.008 0.000 0.288 0.000 0.000 0.704
#> SRR1318354 5 0.2699 0.73255 0.008 0.012 0.124 0.000 0.856 0.000
#> SRR1359062 3 0.2964 0.70382 0.000 0.000 0.792 0.000 0.004 0.204
#> SRR1398924 5 0.2883 0.62647 0.000 0.212 0.000 0.000 0.788 0.000
#> SRR663783 3 0.1398 0.72675 0.008 0.000 0.940 0.000 0.000 0.052
#> SRR1319204 2 0.5622 0.41586 0.332 0.520 0.144 0.000 0.004 0.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.88674 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 6 0.3930 -0.09170 0.420 0.000 0.000 0.004 0.000 0.576
#> SRR1337449 2 0.2883 0.69711 0.000 0.788 0.212 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.0000 0.71284 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498595 4 0.3620 0.45656 0.000 0.352 0.000 0.648 0.000 0.000
#> SRR1377423 6 0.3213 0.57174 0.048 0.000 0.132 0.000 0.000 0.820
#> SRR1312310 2 0.0363 0.88563 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.3587 0.66970 0.804 0.000 0.000 0.008 0.132 0.056
#> SRR1338426 3 0.2358 0.71393 0.040 0.000 0.900 0.000 0.012 0.048
#> SRR1353309 3 0.1873 0.72375 0.020 0.000 0.924 0.000 0.008 0.048
#> SRR658941 3 0.5734 0.03460 0.256 0.000 0.516 0.000 0.228 0.000
#> SRR1101643 6 0.3961 -0.14938 0.440 0.000 0.000 0.004 0.000 0.556
#> SRR1401468 5 0.6807 0.10767 0.384 0.000 0.116 0.104 0.396 0.000
#> SRR1368874 2 0.0146 0.88665 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.86121 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363858 4 0.5026 0.17112 0.356 0.000 0.000 0.568 0.004 0.072
#> SRR819820 3 0.3934 0.29680 0.376 0.000 0.616 0.000 0.008 0.000
#> SRR1337342 5 0.1010 0.76407 0.036 0.000 0.000 0.000 0.960 0.004
#> SRR655206 3 0.2036 0.66223 0.064 0.000 0.912 0.016 0.008 0.000
#> SRR1387013 5 0.4246 0.24183 0.000 0.400 0.000 0.020 0.580 0.000
#> SRR1317410 1 0.3746 0.67645 0.780 0.000 0.000 0.000 0.140 0.080
#> SRR608198 5 0.0508 0.76852 0.004 0.000 0.000 0.000 0.984 0.012
#> SRR1440161 2 0.3828 0.19682 0.000 0.560 0.440 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.88674 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0146 0.88643 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.3684 0.61343 0.332 0.000 0.000 0.664 0.004 0.000
#> SRR1099622 3 0.0508 0.71324 0.000 0.012 0.984 0.000 0.000 0.004
#> SRR663197 3 0.3872 0.56456 0.000 0.000 0.604 0.000 0.004 0.392
#> SRR1394836 3 0.1065 0.70298 0.020 0.000 0.964 0.008 0.008 0.000
#> SRR661699 6 0.5870 -0.37972 0.168 0.000 0.404 0.000 0.004 0.424
#> SRR813680 1 0.6321 0.24889 0.456 0.000 0.300 0.000 0.020 0.224
#> SRR1410678 1 0.2980 0.68805 0.808 0.000 0.000 0.012 0.000 0.180
#> SRR1378109 4 0.0260 0.86210 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1499174 6 0.3843 -0.18768 0.452 0.000 0.000 0.000 0.000 0.548
#> SRR1311486 2 0.0000 0.88674 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 5 0.4148 0.62669 0.000 0.108 0.000 0.148 0.744 0.000
#> SRR1433410 5 0.0508 0.76853 0.012 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR661167 6 0.3866 -0.34766 0.000 0.000 0.484 0.000 0.000 0.516
#> SRR1432518 3 0.6307 0.42336 0.040 0.000 0.428 0.000 0.136 0.396
#> SRR660462 3 0.3601 0.63886 0.000 0.000 0.684 0.000 0.004 0.312
#> SRR1374608 4 0.4415 0.64677 0.268 0.000 0.020 0.684 0.028 0.000
#> SRR657949 6 0.2377 0.57798 0.124 0.000 0.004 0.000 0.004 0.868
#> SRR1308882 4 0.1327 0.84284 0.064 0.000 0.000 0.936 0.000 0.000
#> SRR655768 1 0.2520 0.69087 0.844 0.000 0.000 0.000 0.004 0.152
#> SRR1485870 4 0.6062 0.37734 0.320 0.232 0.000 0.444 0.004 0.000
#> SRR1444138 1 0.3830 0.53407 0.620 0.000 0.000 0.000 0.004 0.376
#> SRR1417342 1 0.2290 0.67526 0.892 0.000 0.000 0.020 0.004 0.084
#> SRR1470193 4 0.2196 0.81992 0.108 0.004 0.000 0.884 0.004 0.000
#> SRR1091380 3 0.3653 0.41158 0.300 0.000 0.692 0.000 0.008 0.000
#> SRR1099096 1 0.4360 0.65403 0.768 0.000 0.000 0.092 0.100 0.040
#> SRR1313583 4 0.2700 0.75699 0.156 0.000 0.000 0.836 0.004 0.004
#> SRR1467102 3 0.0291 0.71404 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1485416 4 0.0363 0.85914 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR818821 3 0.5384 0.33584 0.208 0.004 0.604 0.000 0.000 0.184
#> SRR809963 6 0.2454 0.49309 0.160 0.000 0.000 0.000 0.000 0.840
#> SRR1072247 1 0.4805 0.65734 0.696 0.000 0.000 0.116 0.012 0.176
#> SRR1353710 4 0.0291 0.86187 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR1445259 5 0.6114 -0.23376 0.348 0.004 0.000 0.000 0.412 0.236
#> SRR1408393 6 0.1444 0.58955 0.072 0.000 0.000 0.000 0.000 0.928
#> SRR1361522 6 0.3756 -0.02184 0.400 0.000 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR1368597 1 0.3966 0.29896 0.552 0.000 0.000 0.000 0.004 0.444
#> SRR1309680 2 0.0632 0.88217 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.2703 0.71617 0.000 0.000 0.824 0.000 0.004 0.172
#> SRR1333485 4 0.0146 0.86107 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1406437 4 0.6354 0.17742 0.164 0.000 0.384 0.420 0.032 0.000
#> SRR1354931 3 0.2234 0.72794 0.004 0.000 0.872 0.000 0.000 0.124
#> SRR1391856 3 0.1608 0.70515 0.000 0.016 0.940 0.004 0.036 0.004
#> SRR1446738 5 0.3084 0.69721 0.004 0.000 0.032 0.132 0.832 0.000
#> SRR1309032 2 0.1141 0.87285 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.1563 0.86314 0.000 0.932 0.056 0.012 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0146 0.88675 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.3189 0.69058 0.004 0.000 0.760 0.000 0.000 0.236
#> SRR613150 3 0.1167 0.71797 0.008 0.000 0.960 0.000 0.012 0.020
#> SRR1375329 2 0.2377 0.81387 0.124 0.868 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1387921 1 0.3023 0.67726 0.784 0.000 0.000 0.004 0.000 0.212
#> SRR1466792 2 0.1957 0.82983 0.000 0.888 0.112 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.88674 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.1957 0.68802 0.920 0.000 0.000 0.024 0.008 0.048
#> SRR812943 6 0.5986 -0.21927 0.360 0.232 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR1400910 2 0.3916 0.50111 0.020 0.680 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR1444203 4 0.1007 0.85180 0.044 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR816177 4 0.3245 0.65462 0.000 0.228 0.008 0.764 0.000 0.000
#> SRR658754 3 0.3852 0.57837 0.000 0.000 0.612 0.000 0.004 0.384
#> SRR1429603 4 0.0748 0.86059 0.016 0.004 0.000 0.976 0.004 0.000
#> SRR1397366 6 0.2006 0.55708 0.004 0.000 0.104 0.000 0.000 0.892
#> SRR1446028 1 0.4931 0.62774 0.636 0.000 0.000 0.000 0.116 0.248
#> SRR1083918 2 0.4682 0.27867 0.000 0.548 0.020 0.416 0.000 0.016
#> SRR1337606 5 0.0632 0.76574 0.000 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR659109 3 0.3890 0.55693 0.000 0.000 0.596 0.000 0.004 0.400
#> SRR1337192 5 0.1594 0.75473 0.052 0.000 0.000 0.000 0.932 0.016
#> SRR656946 1 0.1663 0.68883 0.912 0.000 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1476102 1 0.4446 0.59098 0.752 0.000 0.000 0.048 0.148 0.052
#> SRR1476447 1 0.4990 0.37013 0.480 0.000 0.000 0.000 0.068 0.452
#> SRR1342067 4 0.0000 0.86121 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0146 0.86199 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.5505 0.38794 0.452 0.000 0.000 0.000 0.128 0.420
#> SRR614419 5 0.3493 0.64441 0.056 0.000 0.000 0.000 0.796 0.148
#> SRR1322936 5 0.2402 0.71028 0.140 0.004 0.000 0.000 0.856 0.000
#> SRR1349121 1 0.2825 0.69550 0.844 0.000 0.000 0.008 0.012 0.136
#> SRR1430549 1 0.5442 0.48472 0.508 0.000 0.000 0.000 0.128 0.364
#> SRR612935 2 0.5043 0.61297 0.064 0.680 0.220 0.000 0.004 0.032
#> SRR661481 2 0.1500 0.86721 0.000 0.936 0.012 0.052 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.1957 0.83389 0.000 0.888 0.112 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.1036 0.85664 0.008 0.024 0.000 0.964 0.004 0.000
#> SRR1452164 1 0.3966 0.43885 0.552 0.000 0.000 0.000 0.004 0.444
#> SRR1070503 6 0.2714 0.57113 0.004 0.000 0.064 0.000 0.060 0.872
#> SRR1499894 3 0.1364 0.72660 0.004 0.000 0.944 0.000 0.004 0.048
#> SRR1082883 5 0.0291 0.76846 0.000 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1468271 1 0.4894 0.55270 0.724 0.000 0.064 0.076 0.136 0.000
#> SRR1332443 1 0.4517 0.67927 0.720 0.000 0.000 0.056 0.024 0.200
#> SRR810295 2 0.0458 0.88456 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 6 0.3747 0.00383 0.396 0.000 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR1328620 5 0.5252 0.31650 0.096 0.000 0.424 0.000 0.480 0.000
#> SRR1396294 4 0.5048 0.51479 0.344 0.000 0.068 0.580 0.008 0.000
#> SRR1419917 6 0.3747 -0.00765 0.396 0.000 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR662114 5 0.5260 0.28252 0.000 0.004 0.096 0.000 0.552 0.348
#> SRR1489199 5 0.4368 0.39667 0.296 0.000 0.000 0.000 0.656 0.048
#> SRR813584 4 0.4702 0.56786 0.024 0.276 0.024 0.668 0.008 0.000
#> SRR1069638 5 0.2573 0.71638 0.000 0.004 0.008 0.000 0.856 0.132
#> SRR614864 5 0.6049 -0.12760 0.000 0.000 0.264 0.000 0.404 0.332
#> SRR1433392 6 0.0922 0.60102 0.024 0.000 0.004 0.000 0.004 0.968
#> SRR1377777 2 0.0000 0.88674 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.1471 0.68118 0.932 0.000 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1401252 4 0.1477 0.83678 0.008 0.048 0.000 0.940 0.004 0.000
#> SRR1309963 4 0.0713 0.85785 0.028 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.3765 0.50584 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR1418628 2 0.0547 0.88334 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.4181 0.27554 0.616 0.000 0.004 0.008 0.004 0.368
#> SRR1380393 1 0.2250 0.69386 0.888 0.000 0.000 0.020 0.000 0.092
#> SRR1319731 1 0.4084 0.67927 0.744 0.000 0.000 0.008 0.052 0.196
#> SRR1356468 4 0.4039 0.45735 0.424 0.000 0.000 0.568 0.008 0.000
#> SRR1337010 2 0.1141 0.87033 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 5 0.1606 0.75801 0.056 0.000 0.000 0.004 0.932 0.008
#> SRR1486538 4 0.0405 0.86174 0.008 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000
#> SRR1340486 4 0.0260 0.86210 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.1078 0.87966 0.008 0.964 0.000 0.012 0.016 0.000
#> SRR1465459 6 0.1605 0.60775 0.016 0.000 0.032 0.000 0.012 0.940
#> SRR1080270 3 0.2442 0.72291 0.000 0.000 0.852 0.000 0.004 0.144
#> SRR1312501 6 0.4199 -0.28499 0.008 0.000 0.444 0.000 0.004 0.544
#> SRR1093148 5 0.4931 0.57561 0.116 0.000 0.248 0.000 0.636 0.000
#> SRR1467080 3 0.2442 0.72358 0.000 0.000 0.852 0.000 0.004 0.144
#> SRR1410866 2 0.3730 0.73529 0.000 0.772 0.060 0.168 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.0146 0.86067 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1379198 4 0.0260 0.86186 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR613342 6 0.5563 0.43606 0.184 0.000 0.272 0.000 0.000 0.544
#> SRR1452246 2 0.2048 0.80872 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.88674 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.86121 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396616 6 0.3584 0.15681 0.000 0.000 0.308 0.000 0.004 0.688
#> SRR813824 6 0.3995 -0.35236 0.000 0.000 0.480 0.000 0.004 0.516
#> SRR1082376 6 0.3440 0.43173 0.196 0.000 0.000 0.000 0.028 0.776
#> SRR1500891 4 0.0790 0.84883 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR807543 6 0.0881 0.60607 0.008 0.000 0.008 0.000 0.012 0.972
#> SRR1091572 6 0.5880 0.18328 0.200 0.000 0.012 0.000 0.248 0.540
#> SRR1346689 4 0.0436 0.86178 0.004 0.004 0.000 0.988 0.004 0.000
#> SRR1332424 5 0.0508 0.76853 0.012 0.000 0.000 0.000 0.984 0.004
#> SRR663729 4 0.0436 0.86178 0.004 0.004 0.000 0.988 0.004 0.000
#> SRR1097013 1 0.2854 0.67872 0.792 0.000 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR613675 5 0.2632 0.69036 0.164 0.004 0.000 0.000 0.832 0.000
#> SRR1485357 4 0.1957 0.81358 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR655816 3 0.2752 0.72070 0.036 0.000 0.856 0.000 0.000 0.108
#> SRR1500113 1 0.1620 0.68140 0.940 0.000 0.000 0.024 0.012 0.024
#> SRR1437622 4 0.3563 0.46064 0.000 0.336 0.000 0.664 0.000 0.000
#> SRR1355172 1 0.4045 0.39145 0.648 0.000 0.336 0.008 0.008 0.000
#> SRR655531 5 0.0291 0.76854 0.000 0.000 0.000 0.004 0.992 0.004
#> SRR1338147 3 0.4310 0.53904 0.000 0.000 0.580 0.000 0.024 0.396
#> SRR1413329 5 0.5438 0.47106 0.260 0.000 0.172 0.000 0.568 0.000
#> SRR1485931 2 0.0363 0.88448 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.3866 0.56681 0.736 0.000 0.000 0.024 0.232 0.008
#> SRR1333308 4 0.0458 0.86108 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.3301 0.66659 0.772 0.000 0.000 0.004 0.008 0.216
#> SRR1467316 2 0.0000 0.88674 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.3741 0.63876 0.008 0.000 0.672 0.000 0.000 0.320
#> SRR1375351 2 0.0000 0.88674 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 6 0.3424 0.51093 0.000 0.000 0.096 0.000 0.092 0.812
#> SRR1471755 2 0.4095 0.11407 0.000 0.512 0.008 0.480 0.000 0.000
#> SRR808019 5 0.5608 0.45679 0.260 0.000 0.200 0.000 0.540 0.000
#> SRR1479133 6 0.3954 -0.05958 0.004 0.000 0.372 0.000 0.004 0.620
#> SRR615069 5 0.4462 0.15795 0.008 0.436 0.016 0.000 0.540 0.000
#> SRR1456185 2 0.3765 0.76845 0.000 0.808 0.112 0.036 0.000 0.044
#> SRR1350069 4 0.3081 0.72657 0.220 0.000 0.000 0.776 0.004 0.000
#> SRR816316 6 0.2531 0.52168 0.132 0.000 0.000 0.000 0.012 0.856
#> SRR664795 1 0.4866 0.56945 0.704 0.000 0.136 0.000 0.020 0.140
#> SRR1490721 5 0.1168 0.76179 0.000 0.016 0.000 0.028 0.956 0.000
#> SRR810643 1 0.4168 0.31796 0.584 0.000 0.000 0.000 0.400 0.016
#> SRR1430333 5 0.0291 0.76867 0.000 0.004 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR1085285 3 0.4076 0.47721 0.008 0.000 0.540 0.000 0.000 0.452
#> SRR1099072 6 0.1349 0.58637 0.004 0.000 0.056 0.000 0.000 0.940
#> SRR1317985 1 0.3851 0.40566 0.540 0.000 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR1487340 6 0.4378 -0.22685 0.452 0.000 0.000 0.004 0.016 0.528
#> SRR1420276 3 0.1327 0.72810 0.000 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1351347 3 0.3642 0.53717 0.008 0.000 0.744 0.000 0.236 0.012
#> SRR1405525 1 0.4584 0.67951 0.724 0.012 0.000 0.000 0.128 0.136
#> SRR1370329 1 0.4111 0.40755 0.536 0.000 0.000 0.004 0.004 0.456
#> SRR1465001 1 0.3869 0.69611 0.804 0.000 0.000 0.040 0.052 0.104
#> SRR1476525 2 0.0000 0.88674 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819610 4 0.3296 0.74862 0.000 0.132 0.004 0.824 0.004 0.036
#> SRR2157314 1 0.2871 0.68388 0.804 0.000 0.000 0.000 0.004 0.192
#> SRR1409465 2 0.0146 0.88643 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.3023 0.73166 0.212 0.000 0.000 0.784 0.004 0.000
#> SRR613639 3 0.5812 -0.05523 0.180 0.000 0.500 0.000 0.004 0.316
#> SRR1402285 4 0.1444 0.83653 0.072 0.000 0.000 0.928 0.000 0.000
#> SRR1077038 6 0.1075 0.58640 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1405660 3 0.4009 0.61098 0.008 0.000 0.632 0.000 0.004 0.356
#> SRR1095455 6 0.5571 -0.26460 0.424 0.048 0.000 0.000 0.044 0.484
#> SRR1394734 4 0.4689 0.28063 0.000 0.380 0.020 0.580 0.000 0.020
#> SRR1317771 6 0.3728 0.37277 0.344 0.000 0.000 0.000 0.004 0.652
#> SRR1365894 2 0.4046 0.70035 0.068 0.752 0.000 0.176 0.004 0.000
#> SRR1073581 1 0.4305 0.50948 0.752 0.000 0.148 0.084 0.016 0.000
#> SRR659804 1 0.3141 0.68071 0.788 0.000 0.000 0.000 0.012 0.200
#> SRR1345914 2 0.0000 0.88674 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.2828 0.83006 0.000 0.872 0.036 0.072 0.000 0.020
#> SRR1473529 2 0.1858 0.84555 0.012 0.912 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR660764 3 0.1080 0.72436 0.004 0.000 0.960 0.000 0.004 0.032
#> SRR820448 6 0.2003 0.53890 0.116 0.000 0.000 0.000 0.000 0.884
#> SRR1328845 4 0.3373 0.69633 0.248 0.000 0.000 0.744 0.008 0.000
#> SRR1336415 4 0.0146 0.86199 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.86121 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459190 6 0.4223 0.46846 0.192 0.000 0.072 0.000 0.004 0.732
#> SRR1346773 1 0.3859 0.52190 0.692 0.000 0.000 0.000 0.288 0.020
#> SRR1499521 1 0.5986 0.35375 0.600 0.000 0.084 0.096 0.220 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.88674 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 6 0.4107 -0.29416 0.000 0.004 0.452 0.000 0.004 0.540
#> SRR1081209 2 0.0146 0.88647 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.4151 0.49273 0.576 0.000 0.000 0.004 0.008 0.412
#> SRR1333395 1 0.5368 -0.06504 0.544 0.080 0.000 0.364 0.004 0.008
#> SRR1309248 2 0.4373 0.66587 0.084 0.720 0.000 0.192 0.004 0.000
#> SRR809161 6 0.3087 0.47524 0.012 0.000 0.176 0.000 0.004 0.808
#> SRR1316320 2 0.1225 0.86777 0.012 0.952 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1432629 2 0.0632 0.88216 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.3620 0.57201 0.648 0.000 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR1416578 4 0.3163 0.71422 0.232 0.000 0.000 0.764 0.004 0.000
#> SRR1405547 3 0.2631 0.72264 0.008 0.000 0.840 0.000 0.000 0.152
#> SRR1470534 4 0.0260 0.86186 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.3991 0.11199 0.524 0.000 0.000 0.000 0.472 0.004
#> SRR1309160 3 0.4211 0.47281 0.008 0.000 0.532 0.000 0.004 0.456
#> SRR663489 3 0.3690 0.65031 0.008 0.000 0.684 0.000 0.000 0.308
#> SRR1500450 1 0.1949 0.61721 0.904 0.000 0.000 0.088 0.004 0.004
#> SRR1078489 5 0.4226 0.18241 0.004 0.000 0.008 0.000 0.504 0.484
#> SRR1332648 4 0.0146 0.86199 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR660614 2 0.2088 0.85113 0.068 0.904 0.028 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470420 3 0.3930 0.15133 0.000 0.420 0.576 0.000 0.004 0.000
#> SRR1475566 1 0.3965 0.54495 0.616 0.000 0.000 0.004 0.004 0.376
#> SRR1477949 1 0.1501 0.68343 0.924 0.000 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1481419 2 0.0291 0.88643 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.5701 0.52527 0.524 0.000 0.000 0.000 0.228 0.248
#> SRR615946 6 0.3995 -0.34234 0.000 0.000 0.480 0.000 0.004 0.516
#> SRR1446481 2 0.1257 0.87805 0.000 0.952 0.020 0.028 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.1610 0.84119 0.000 0.916 0.084 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 5 0.0972 0.76690 0.028 0.000 0.000 0.000 0.964 0.008
#> SRR660224 2 0.0260 0.88611 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR665586 6 0.3782 0.08490 0.360 0.000 0.000 0.000 0.004 0.636
#> SRR1347166 5 0.0547 0.76757 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1485722 5 0.1501 0.75224 0.076 0.000 0.000 0.000 0.924 0.000
#> SRR1415316 1 0.3695 0.50273 0.624 0.000 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR613390 6 0.3409 0.26016 0.300 0.000 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR661108 3 0.3819 0.59024 0.000 0.000 0.624 0.000 0.004 0.372
#> SRR2170173 1 0.3634 0.51337 0.644 0.000 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR817329 6 0.2597 0.48551 0.176 0.000 0.000 0.000 0.000 0.824
#> SRR1401990 4 0.3512 0.66928 0.272 0.000 0.000 0.720 0.008 0.000
#> SRR1467745 4 0.1390 0.83815 0.000 0.016 0.032 0.948 0.000 0.004
#> SRR1471795 2 0.1333 0.87023 0.000 0.944 0.008 0.048 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.88674 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 6 0.2838 0.45762 0.188 0.000 0.000 0.004 0.000 0.808
#> SRR1314873 6 0.3565 0.24050 0.304 0.000 0.000 0.000 0.004 0.692
#> SRR1401211 1 0.2118 0.65123 0.888 0.000 0.000 0.104 0.008 0.000
#> SRR1419692 4 0.0260 0.86210 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR818797 6 0.2123 0.59219 0.020 0.000 0.064 0.000 0.008 0.908
#> SRR2164608 3 0.5784 -0.02574 0.408 0.000 0.416 0.000 0.176 0.000
#> SRR1455586 3 0.0692 0.71976 0.000 0.004 0.976 0.000 0.000 0.020
#> SRR819459 3 0.0858 0.72325 0.000 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1488939 2 0.0363 0.88448 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.88674 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 6 0.2019 0.56469 0.088 0.000 0.000 0.000 0.012 0.900
#> SRR1361652 2 0.1794 0.85278 0.036 0.924 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1437119 1 0.3772 0.60431 0.672 0.000 0.000 0.004 0.004 0.320
#> SRR1478547 3 0.1297 0.72427 0.012 0.000 0.948 0.000 0.000 0.040
#> SRR1430910 5 0.4542 0.35523 0.016 0.360 0.008 0.000 0.608 0.008
#> SRR1310584 5 0.5005 -0.01445 0.420 0.000 0.000 0.008 0.520 0.052
#> SRR1500216 6 0.3330 0.29442 0.284 0.000 0.000 0.000 0.000 0.716
#> SRR1486762 6 0.4338 0.23556 0.036 0.000 0.300 0.000 0.004 0.660
#> SRR1480854 4 0.2558 0.74815 0.000 0.004 0.000 0.840 0.156 0.000
#> SRR1489394 4 0.0146 0.86199 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0146 0.86199 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.1141 0.84710 0.052 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000
#> SRR1473058 4 0.0291 0.86004 0.000 0.004 0.004 0.992 0.000 0.000
#> SRR1405165 3 0.4278 0.60707 0.004 0.000 0.616 0.000 0.020 0.360
#> SRR1433004 6 0.3965 0.01158 0.388 0.000 0.000 0.000 0.008 0.604
#> SRR1471477 1 0.4040 0.52147 0.772 0.000 0.076 0.140 0.012 0.000
#> SRR1098567 2 0.0146 0.88665 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 4 0.5416 0.45880 0.340 0.000 0.104 0.548 0.008 0.000
#> SRR1455038 6 0.5071 0.24784 0.212 0.000 0.000 0.000 0.156 0.632
#> SRR1375248 3 0.0777 0.72096 0.000 0.004 0.972 0.000 0.000 0.024
#> SRR1403005 6 0.1410 0.59752 0.008 0.000 0.044 0.000 0.004 0.944
#> SRR1348378 4 0.4289 0.24814 0.000 0.020 0.424 0.556 0.000 0.000
#> SRR1413541 6 0.3747 -0.01019 0.396 0.000 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR1392943 4 0.3843 0.21794 0.000 0.000 0.000 0.548 0.452 0.000
#> SRR1475192 3 0.2402 0.72435 0.000 0.000 0.856 0.000 0.004 0.140
#> SRR1432085 3 0.3763 0.67569 0.000 0.144 0.788 0.000 0.008 0.060
#> SRR1452468 1 0.7085 0.21308 0.464 0.224 0.000 0.000 0.172 0.140
#> SRR1347060 3 0.0922 0.72171 0.004 0.000 0.968 0.000 0.004 0.024
#> SRR1414139 3 0.1007 0.72722 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1447962 3 0.3348 0.61714 0.000 0.216 0.768 0.000 0.000 0.016
#> SRR1444324 3 0.3864 -0.01293 0.000 0.480 0.520 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.2624 0.69443 0.856 0.000 0.000 0.020 0.000 0.124
#> SRR1413436 1 0.1858 0.66800 0.904 0.000 0.000 0.000 0.004 0.092
#> SRR1311266 1 0.3989 0.12758 0.528 0.000 0.000 0.000 0.468 0.004
#> SRR1343302 4 0.0405 0.86187 0.008 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000
#> SRR1373746 1 0.4002 0.50800 0.588 0.000 0.000 0.000 0.008 0.404
#> SRR1429678 1 0.3995 0.35859 0.516 0.000 0.000 0.000 0.004 0.480
#> SRR1469413 3 0.2852 0.70995 0.000 0.080 0.856 0.000 0.000 0.064
#> SRR1405331 6 0.0984 0.60628 0.012 0.000 0.012 0.000 0.008 0.968
#> SRR1345609 1 0.3665 0.62578 0.696 0.000 0.000 0.004 0.004 0.296
#> SRR1380208 5 0.0790 0.76383 0.000 0.032 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1322840 4 0.0000 0.86121 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.3795 0.59800 0.000 0.000 0.632 0.000 0.004 0.364
#> SRR1416654 3 0.2672 0.71597 0.020 0.000 0.884 0.000 0.048 0.048
#> SRR1315081 3 0.1010 0.72473 0.004 0.000 0.960 0.000 0.000 0.036
#> SRR1369196 3 0.1719 0.72862 0.000 0.000 0.924 0.000 0.016 0.060
#> SRR1400847 1 0.3852 0.59931 0.664 0.000 0.000 0.000 0.012 0.324
#> SRR1365291 6 0.3953 0.46139 0.000 0.000 0.104 0.000 0.132 0.764
#> SRR1367920 5 0.3956 0.51143 0.000 0.032 0.000 0.264 0.704 0.000
#> SRR1366648 3 0.2703 0.71596 0.004 0.000 0.824 0.000 0.000 0.172
#> SRR1441679 2 0.0146 0.88643 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.6061 -0.23059 0.284 0.000 0.408 0.000 0.308 0.000
#> SRR1363968 1 0.2277 0.63802 0.892 0.000 0.000 0.076 0.032 0.000
#> SRR814387 1 0.4361 0.66876 0.720 0.000 0.000 0.000 0.168 0.112
#> SRR657599 1 0.5787 0.13431 0.504 0.000 0.248 0.000 0.248 0.000
#> SRR1386689 4 0.0260 0.86210 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.3081 0.69994 0.004 0.000 0.776 0.000 0.000 0.220
#> SRR1453811 6 0.2494 0.53178 0.000 0.000 0.120 0.000 0.016 0.864
#> SRR1441159 1 0.4660 0.31744 0.540 0.000 0.000 0.000 0.416 0.044
#> SRR1403154 4 0.0146 0.86175 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.3833 0.61959 0.008 0.000 0.648 0.000 0.000 0.344
#> SRR1310275 5 0.2006 0.73952 0.000 0.000 0.016 0.000 0.904 0.080
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.512 0.776 0.893 0.4475 0.516 0.516
#> 3 3 0.488 0.707 0.836 0.3656 0.788 0.617
#> 4 4 0.495 0.674 0.763 0.1033 0.979 0.948
#> 5 5 0.540 0.544 0.752 0.0552 0.922 0.801
#> 6 6 0.545 0.523 0.731 0.0470 0.941 0.820
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1331708 1 0.9044 0.4535 0.680 0.320
#> SRR1464258 1 0.1184 0.9111 0.984 0.016
#> SRR1454201 1 0.9963 -0.1116 0.536 0.464
#> SRR661589 1 0.9608 0.2205 0.616 0.384
#> SRR1456229 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1315165 1 0.2948 0.8863 0.948 0.052
#> SRR1488960 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.0376 0.9156 0.996 0.004
#> SRR1094457 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1095575 2 0.9988 0.3204 0.480 0.520
#> SRR1315931 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1430066 2 0.9248 0.6343 0.340 0.660
#> SRR1431037 2 0.9754 0.5167 0.408 0.592
#> SRR1395554 2 0.7883 0.7449 0.236 0.764
#> SRR818002 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1344143 2 0.3584 0.8120 0.068 0.932
#> SRR1486845 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1362866 1 0.1184 0.9112 0.984 0.016
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1383907 1 0.1414 0.9089 0.980 0.020
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0938 0.8102 0.012 0.988
#> SRR1429846 1 0.1414 0.9090 0.980 0.020
#> SRR613550 1 0.5059 0.8241 0.888 0.112
#> SRR1348402 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1345146 2 0.9881 0.4475 0.436 0.564
#> SRR1324025 2 0.9866 0.4609 0.432 0.568
#> SRR1318879 2 0.9993 0.3068 0.484 0.516
#> SRR820755 1 0.0376 0.9155 0.996 0.004
#> SRR1485830 1 0.3431 0.8754 0.936 0.064
#> SRR599313 1 0.1184 0.9112 0.984 0.016
#> SRR612263 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1415398 1 0.6247 0.7657 0.844 0.156
#> SRR1326205 1 0.8081 0.6136 0.752 0.248
#> SRR1421327 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1083311 2 0.9608 0.5631 0.384 0.616
#> SRR1499303 1 0.6438 0.7556 0.836 0.164
#> SRR1079522 1 0.3879 0.8641 0.924 0.076
#> SRR1452935 2 0.9608 0.5640 0.384 0.616
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR661361 2 0.9983 0.3383 0.476 0.524
#> SRR615778 1 0.1633 0.9068 0.976 0.024
#> SRR1447564 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR655182 2 0.9209 0.6395 0.336 0.664
#> SRR1335140 2 0.8861 0.6804 0.304 0.696
#> SRR1433555 2 0.9732 0.5234 0.404 0.596
#> SRR1308650 2 0.3431 0.8122 0.064 0.936
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1317446 2 0.1633 0.8119 0.024 0.976
#> SRR1413602 2 0.9044 0.6636 0.320 0.680
#> SRR1479955 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR809853 1 0.3733 0.8669 0.928 0.072
#> SRR661313 2 0.9815 0.4899 0.420 0.580
#> SRR1499935 1 0.4161 0.8567 0.916 0.084
#> SRR1447303 2 0.9686 0.5404 0.396 0.604
#> SRR1429408 1 0.9129 0.4317 0.672 0.328
#> SRR1433950 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1409854 1 0.1184 0.9113 0.984 0.016
#> SRR1435229 2 0.8327 0.7220 0.264 0.736
#> SRR1085996 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1414229 2 0.3879 0.8102 0.076 0.924
#> SRR1400974 2 0.9129 0.6519 0.328 0.672
#> SRR1399971 1 0.0938 0.9130 0.988 0.012
#> SRR613927 1 0.1184 0.9111 0.984 0.016
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.1184 0.9112 0.984 0.016
#> SRR813776 1 0.0376 0.9155 0.996 0.004
#> SRR808196 1 0.2236 0.8983 0.964 0.036
#> SRR1101085 1 0.1633 0.9067 0.976 0.024
#> SRR614395 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1478251 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR665310 1 0.6712 0.7365 0.824 0.176
#> SRR1420109 2 0.9608 0.5632 0.384 0.616
#> SRR1330920 1 0.2236 0.8990 0.964 0.036
#> SRR1419539 2 0.8763 0.6936 0.296 0.704
#> SRR1359447 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1347259 1 0.3879 0.8635 0.924 0.076
#> SRR613915 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1384395 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR821715 1 0.1184 0.9111 0.984 0.016
#> SRR1478228 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR608150 1 0.3879 0.8649 0.924 0.076
#> SRR1096383 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1341480 1 0.0938 0.9127 0.988 0.012
#> SRR1341344 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1326270 1 0.9732 0.1440 0.596 0.404
#> SRR1498838 2 0.9881 0.4512 0.436 0.564
#> SRR1416313 2 0.9661 0.5500 0.392 0.608
#> SRR808566 1 0.2043 0.9019 0.968 0.032
#> SRR1430270 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1367825 2 0.8955 0.6716 0.312 0.688
#> SRR613533 2 0.8661 0.7000 0.288 0.712
#> SRR661267 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1407250 1 0.4298 0.8482 0.912 0.088
#> SRR1420067 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1473632 2 0.7815 0.7474 0.232 0.768
#> SRR812536 1 0.0938 0.9127 0.988 0.012
#> SRR1370850 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1407671 1 0.9922 -0.0196 0.552 0.448
#> SRR1446375 2 0.8608 0.7027 0.284 0.716
#> SRR1465230 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR614119 1 0.0376 0.9155 0.996 0.004
#> SRR1356101 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR660510 2 0.9710 0.5321 0.400 0.600
#> SRR1445655 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR658953 1 0.0672 0.9140 0.992 0.008
#> SRR2166459 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.7602 0.7574 0.220 0.780
#> SRR1485312 1 0.9933 -0.0686 0.548 0.452
#> SRR1317631 1 0.0938 0.9129 0.988 0.012
#> SRR1488610 1 0.0376 0.9157 0.996 0.004
#> SRR1330588 2 1.0000 0.2579 0.500 0.500
#> SRR1316367 2 0.9608 0.5615 0.384 0.616
#> SRR1433926 1 0.0938 0.9130 0.988 0.012
#> SRR1091302 1 0.0938 0.9129 0.988 0.012
#> SRR818263 1 0.0938 0.9129 0.988 0.012
#> SRR1404909 1 0.3733 0.8675 0.928 0.072
#> SRR663076 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1442422 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR654862 1 0.1633 0.9067 0.976 0.024
#> SRR1407112 1 0.0672 0.9144 0.992 0.008
#> SRR1332969 1 0.9427 0.3087 0.640 0.360
#> SRR1353199 2 0.9850 0.4696 0.428 0.572
#> SRR1378885 1 0.0938 0.9127 0.988 0.012
#> SRR665357 2 0.1414 0.8114 0.020 0.980
#> SRR662186 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1501020 1 0.9686 0.1801 0.604 0.396
#> SRR1347819 2 0.9248 0.6351 0.340 0.660
#> SRR1480813 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1472576 2 0.7299 0.7675 0.204 0.796
#> SRR1431781 1 0.2603 0.8924 0.956 0.044
#> SRR1452270 1 0.7950 0.6247 0.760 0.240
#> SRR1500472 2 0.6801 0.7799 0.180 0.820
#> SRR1417632 2 0.4562 0.8075 0.096 0.904
#> SRR1350153 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1458113 2 0.8713 0.6959 0.292 0.708
#> SRR1326579 1 0.0376 0.9155 0.996 0.004
#> SRR1349363 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1096712 2 0.8661 0.6994 0.288 0.712
#> SRR1090407 1 0.9000 0.4448 0.684 0.316
#> SRR1083752 2 0.8016 0.7394 0.244 0.756
#> SRR1377599 1 0.4690 0.8467 0.900 0.100
#> SRR1488449 1 0.7950 0.6247 0.760 0.240
#> SRR1318354 2 0.2236 0.8127 0.036 0.964
#> SRR1359062 2 0.1633 0.8119 0.024 0.976
#> SRR1398924 2 0.5737 0.7968 0.136 0.864
#> SRR663783 2 0.4815 0.8060 0.104 0.896
#> SRR1319204 2 0.6887 0.7782 0.184 0.816
#> SRR1369070 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1498595 2 0.3733 0.8115 0.072 0.928
#> SRR1377423 2 0.9686 0.5393 0.396 0.604
#> SRR1312310 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1338426 2 0.8909 0.6787 0.308 0.692
#> SRR1353309 1 0.9732 0.1519 0.596 0.404
#> SRR658941 2 0.8763 0.6936 0.296 0.704
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0672 0.9144 0.992 0.008
#> SRR1368874 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1324085 1 0.1843 0.9041 0.972 0.028
#> SRR1363858 1 0.1184 0.9112 0.984 0.016
#> SRR819820 2 0.9922 0.4206 0.448 0.552
#> SRR1337342 1 0.0672 0.9142 0.992 0.008
#> SRR655206 2 0.9286 0.6296 0.344 0.656
#> SRR1387013 2 0.6623 0.7839 0.172 0.828
#> SRR1317410 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR608198 1 0.3733 0.8684 0.928 0.072
#> SRR1440161 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1415379 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.2423 0.8128 0.040 0.960
#> SRR663197 2 0.9044 0.6638 0.320 0.680
#> SRR1394836 1 0.9608 0.2512 0.616 0.384
#> SRR661699 1 0.4161 0.8567 0.916 0.084
#> SRR813680 1 0.0376 0.9155 0.996 0.004
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1378109 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.5946 0.7872 0.856 0.144
#> SRR1311486 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1382851 1 0.9491 0.3081 0.632 0.368
#> SRR1433410 1 0.0672 0.9142 0.992 0.008
#> SRR661167 1 0.9491 0.2887 0.632 0.368
#> SRR1432518 2 0.9686 0.5399 0.396 0.604
#> SRR660462 2 0.9491 0.5895 0.368 0.632
#> SRR1374608 1 0.0672 0.9144 0.992 0.008
#> SRR657949 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1308882 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.2236 0.8975 0.964 0.036
#> SRR1485870 1 0.3733 0.8682 0.928 0.072
#> SRR1444138 2 0.8144 0.7318 0.252 0.748
#> SRR1417342 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1470193 1 0.8081 0.6136 0.752 0.248
#> SRR1091380 2 0.9922 0.4206 0.448 0.552
#> SRR1099096 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1467102 2 0.1633 0.8120 0.024 0.976
#> SRR1485416 1 0.0938 0.9127 0.988 0.012
#> SRR818821 2 0.8661 0.7000 0.288 0.712
#> SRR809963 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1353710 1 0.1633 0.9064 0.976 0.024
#> SRR1445259 2 0.6712 0.7815 0.176 0.824
#> SRR1408393 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0376 0.8086 0.004 0.996
#> SRR1310542 2 0.7376 0.7635 0.208 0.792
#> SRR1333485 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1406437 1 0.9460 0.3106 0.636 0.364
#> SRR1354931 2 0.9522 0.5878 0.372 0.628
#> SRR1391856 1 0.6531 0.7484 0.832 0.168
#> SRR1446738 2 0.9286 0.6223 0.344 0.656
#> SRR1309032 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1388145 2 0.4690 0.8064 0.100 0.900
#> SRR1432611 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR815869 2 0.1633 0.8119 0.024 0.976
#> SRR613150 2 0.9983 0.3386 0.476 0.524
#> SRR1375329 2 0.9850 0.4695 0.428 0.572
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR812943 2 0.8813 0.6859 0.300 0.700
#> SRR1400910 2 0.6048 0.7928 0.148 0.852
#> SRR1444203 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR816177 2 0.5408 0.8008 0.124 0.876
#> SRR658754 2 0.7299 0.7657 0.204 0.796
#> SRR1429603 1 0.4022 0.8593 0.920 0.080
#> SRR1397366 1 0.9635 0.2057 0.612 0.388
#> SRR1446028 1 0.0672 0.9143 0.992 0.008
#> SRR1083918 2 0.4939 0.8046 0.108 0.892
#> SRR1337606 1 0.6623 0.7428 0.828 0.172
#> SRR659109 2 0.8661 0.6994 0.288 0.712
#> SRR1337192 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR656946 2 0.8555 0.7065 0.280 0.720
#> SRR1476102 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1342067 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1385389 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.9044 0.4452 0.680 0.320
#> SRR1349121 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR612935 2 0.3584 0.8120 0.068 0.932
#> SRR661481 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1393596 1 0.7815 0.6426 0.768 0.232
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1070503 1 0.1414 0.9090 0.980 0.020
#> SRR1499894 2 0.8267 0.7260 0.260 0.740
#> SRR1082883 1 0.4298 0.8516 0.912 0.088
#> SRR1468271 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1328620 2 0.3584 0.8120 0.068 0.932
#> SRR1396294 1 0.8327 0.5809 0.736 0.264
#> SRR1419917 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR662114 2 0.9996 0.2994 0.488 0.512
#> SRR1489199 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR813584 2 0.5408 0.8008 0.124 0.876
#> SRR1069638 2 0.5294 0.8016 0.120 0.880
#> SRR614864 1 0.7299 0.6909 0.796 0.204
#> SRR1433392 1 0.0938 0.9129 0.988 0.012
#> SRR1377777 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR2167710 1 0.0376 0.9154 0.996 0.004
#> SRR1401252 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1309963 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1486889 1 0.1633 0.9064 0.976 0.024
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.2948 0.8856 0.948 0.052
#> SRR1337010 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1486538 1 0.1843 0.9039 0.972 0.028
#> SRR1340486 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.2603 0.8128 0.044 0.956
#> SRR1465459 1 0.2043 0.9013 0.968 0.032
#> SRR1080270 2 0.7376 0.7635 0.208 0.792
#> SRR1312501 1 0.9998 -0.2350 0.508 0.492
#> SRR1093148 1 0.9850 0.0489 0.572 0.428
#> SRR1467080 2 0.1633 0.8119 0.024 0.976
#> SRR1410866 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR816475 1 0.1843 0.9040 0.972 0.028
#> SRR1379198 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR613342 2 0.7602 0.7579 0.220 0.780
#> SRR1452246 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1369129 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1396616 2 0.9686 0.5422 0.396 0.604
#> SRR813824 2 0.9983 0.3383 0.476 0.524
#> SRR1082376 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1500891 1 0.6973 0.7230 0.812 0.188
#> SRR807543 1 0.1414 0.9090 0.980 0.020
#> SRR1091572 1 0.9286 0.3835 0.656 0.344
#> SRR1346689 1 0.8081 0.6136 0.752 0.248
#> SRR1332424 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR663729 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR613675 1 0.9044 0.4452 0.680 0.320
#> SRR1485357 1 0.2778 0.8892 0.952 0.048
#> SRR655816 1 0.0938 0.9127 0.988 0.012
#> SRR1500113 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.8267 0.7278 0.260 0.740
#> SRR1355172 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1338147 2 0.9815 0.4897 0.420 0.580
#> SRR1413329 1 0.8813 0.4950 0.700 0.300
#> SRR1485931 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1333308 1 0.3274 0.8791 0.940 0.060
#> SRR1452033 1 0.0376 0.9155 0.996 0.004
#> SRR1467316 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR809018 2 0.9129 0.6519 0.328 0.672
#> SRR1375351 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR663440 1 0.0938 0.9127 0.988 0.012
#> SRR1471755 2 0.4562 0.8081 0.096 0.904
#> SRR808019 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1479133 1 0.9552 0.2579 0.624 0.376
#> SRR615069 2 0.7602 0.7579 0.220 0.780
#> SRR1456185 2 0.0938 0.8102 0.012 0.988
#> SRR1350069 1 0.4815 0.8361 0.896 0.104
#> SRR816316 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR664795 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1490721 1 0.0938 0.9127 0.988 0.012
#> SRR810643 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.2423 0.8962 0.960 0.040
#> SRR1085285 2 0.9983 0.3378 0.476 0.524
#> SRR1099072 1 0.9635 0.2057 0.612 0.388
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1351347 1 0.9775 0.1209 0.588 0.412
#> SRR1405525 1 0.2603 0.8915 0.956 0.044
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR819610 2 0.7453 0.7628 0.212 0.788
#> SRR2157314 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR809987 1 0.3431 0.8754 0.936 0.064
#> SRR613639 1 0.4431 0.8470 0.908 0.092
#> SRR1402285 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1405660 2 0.9710 0.5319 0.400 0.600
#> SRR1095455 2 0.6801 0.7799 0.180 0.820
#> SRR1394734 2 0.4939 0.8046 0.108 0.892
#> SRR1317771 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1365894 1 0.6623 0.7428 0.828 0.172
#> SRR1073581 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1473529 2 0.2236 0.8125 0.036 0.964
#> SRR660764 2 0.1843 0.8121 0.028 0.972
#> SRR820448 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1328845 1 0.8327 0.5809 0.736 0.264
#> SRR1336415 1 0.0672 0.9144 0.992 0.008
#> SRR1379065 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1459190 2 0.9996 0.2976 0.488 0.512
#> SRR1346773 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1347459 2 0.7299 0.7657 0.204 0.796
#> SRR1081209 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1333395 1 0.3584 0.8719 0.932 0.068
#> SRR1309248 2 0.4939 0.8047 0.108 0.892
#> SRR809161 1 0.5178 0.8190 0.884 0.116
#> SRR1316320 1 0.9963 -0.0839 0.536 0.464
#> SRR1432629 2 0.2603 0.8130 0.044 0.956
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1416578 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1405547 2 0.9209 0.6402 0.336 0.664
#> SRR1470534 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1309160 2 0.9754 0.5151 0.408 0.592
#> SRR663489 2 0.8813 0.6872 0.300 0.700
#> SRR1500450 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1078489 1 0.9209 0.4076 0.664 0.336
#> SRR1332648 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR660614 2 0.1414 0.8114 0.020 0.980
#> SRR1470420 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR615946 2 0.7528 0.7600 0.216 0.784
#> SRR1446481 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR660224 2 0.3584 0.8117 0.068 0.932
#> SRR665586 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.1633 0.9068 0.976 0.024
#> SRR1485722 1 0.4298 0.8482 0.912 0.088
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR661108 2 0.9896 0.4410 0.440 0.560
#> SRR2170173 1 0.0376 0.9154 0.996 0.004
#> SRR817329 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1401990 1 0.2236 0.8983 0.964 0.036
#> SRR1467745 2 0.3733 0.8110 0.072 0.928
#> SRR1471795 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR813137 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.4431 0.8073 0.092 0.908
#> SRR818797 1 0.1414 0.9090 0.980 0.020
#> SRR2164608 1 0.0376 0.9154 0.996 0.004
#> SRR1455586 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR819459 2 0.7453 0.7609 0.212 0.788
#> SRR1488939 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1385501 1 0.1414 0.9093 0.980 0.020
#> SRR1361652 2 0.2043 0.8124 0.032 0.968
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1478547 2 0.9170 0.6463 0.332 0.668
#> SRR1430910 2 0.5737 0.7969 0.136 0.864
#> SRR1310584 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.1184 0.9112 0.984 0.016
#> SRR1486762 2 0.2603 0.8122 0.044 0.956
#> SRR1480854 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1489394 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1418085 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1340221 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1473058 1 0.9608 0.2512 0.616 0.384
#> SRR1405165 2 0.9922 0.4199 0.448 0.552
#> SRR1433004 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.1184 0.8107 0.016 0.984
#> SRR1098712 2 0.8763 0.6936 0.296 0.704
#> SRR1455038 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1403005 1 0.9491 0.2887 0.632 0.368
#> SRR1348378 2 0.3274 0.8123 0.060 0.940
#> SRR1413541 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1475192 2 0.3584 0.8112 0.068 0.932
#> SRR1432085 2 0.1414 0.8115 0.020 0.980
#> SRR1452468 1 0.1414 0.9093 0.980 0.020
#> SRR1347060 2 0.7376 0.7635 0.208 0.792
#> SRR1414139 2 0.3274 0.8123 0.060 0.940
#> SRR1447962 2 0.1414 0.8115 0.020 0.980
#> SRR1444324 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1343302 1 0.0672 0.9144 0.992 0.008
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.1414 0.8115 0.020 0.980
#> SRR1405331 2 0.9977 0.3500 0.472 0.528
#> SRR1345609 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1380208 1 0.9248 0.3850 0.660 0.340
#> SRR1322840 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1399797 2 0.9044 0.6638 0.320 0.680
#> SRR1416654 2 0.9686 0.5404 0.396 0.604
#> SRR1315081 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1369196 2 0.6887 0.7770 0.184 0.816
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1365291 1 0.2778 0.8897 0.952 0.048
#> SRR1367920 1 0.4690 0.8467 0.900 0.100
#> SRR1366648 2 0.8955 0.6716 0.312 0.688
#> SRR1441679 2 0.0000 0.8077 0.000 1.000
#> SRR1082173 2 0.9993 0.3124 0.484 0.516
#> SRR1363968 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1386689 1 0.0672 0.9144 0.992 0.008
#> SRR1395575 1 0.9954 -0.1035 0.540 0.460
#> SRR1453811 1 0.8555 0.5323 0.720 0.280
#> SRR1441159 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1403154 1 0.0000 0.9166 1.000 0.000
#> SRR1468722 1 0.9732 0.1564 0.596 0.404
#> SRR1310275 2 1.0000 0.2742 0.496 0.504
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 1 0.0237 0.89015 0.996 0.000 0.004
#> SRR1331708 3 0.7448 0.44014 0.332 0.052 0.616
#> SRR1464258 1 0.3340 0.86658 0.880 0.000 0.120
#> SRR1454201 3 0.7024 0.63413 0.224 0.072 0.704
#> SRR661589 3 0.5775 0.59905 0.260 0.012 0.728
#> SRR1456229 1 0.2537 0.88328 0.920 0.000 0.080
#> SRR1315165 1 0.5929 0.63884 0.676 0.004 0.320
#> SRR1488960 1 0.0829 0.89172 0.984 0.004 0.012
#> SRR1417809 1 0.1525 0.89313 0.964 0.004 0.032
#> SRR1094457 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1095575 3 0.5428 0.68090 0.120 0.064 0.816
#> SRR1315931 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1430066 3 0.4099 0.64553 0.008 0.140 0.852
#> SRR1431037 3 0.4712 0.67684 0.044 0.108 0.848
#> SRR1395554 3 0.5722 0.51776 0.004 0.292 0.704
#> SRR818002 2 0.3482 0.79541 0.000 0.872 0.128
#> SRR1344143 2 0.6309 0.12212 0.000 0.504 0.496
#> SRR1486845 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1362866 1 0.4062 0.83867 0.836 0.000 0.164
#> SRR1490740 1 0.0592 0.89181 0.988 0.000 0.012
#> SRR1446627 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1456138 2 0.0592 0.84068 0.000 0.988 0.012
#> SRR1416248 1 0.0000 0.88889 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 1 0.5115 0.76878 0.768 0.004 0.228
#> SRR1311018 1 0.1411 0.89241 0.964 0.000 0.036
#> SRR1375699 2 0.3752 0.78463 0.000 0.856 0.144
#> SRR1429846 1 0.3816 0.84933 0.852 0.000 0.148
#> SRR613550 1 0.6126 0.56863 0.644 0.004 0.352
#> SRR1348402 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1345146 3 0.5426 0.68369 0.092 0.088 0.820
#> SRR1324025 3 0.4642 0.68219 0.060 0.084 0.856
#> SRR1318879 3 0.5334 0.68019 0.120 0.060 0.820
#> SRR820755 1 0.2261 0.88850 0.932 0.000 0.068
#> SRR1485830 1 0.6209 0.55007 0.628 0.004 0.368
#> SRR599313 1 0.5621 0.67517 0.692 0.000 0.308
#> SRR612263 1 0.1399 0.89348 0.968 0.004 0.028
#> SRR1415398 1 0.6225 0.36570 0.568 0.000 0.432
#> SRR1326205 3 0.6950 0.21348 0.408 0.020 0.572
#> SRR1421327 1 0.0475 0.88958 0.992 0.004 0.004
#> SRR1083311 3 0.4489 0.66931 0.036 0.108 0.856
#> SRR1499303 1 0.6678 0.20096 0.512 0.008 0.480
#> SRR1079522 1 0.5988 0.54652 0.632 0.000 0.368
#> SRR1452935 3 0.4742 0.67758 0.048 0.104 0.848
#> SRR1379495 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1470459 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR661361 3 0.4316 0.68213 0.088 0.044 0.868
#> SRR615778 1 0.4235 0.82922 0.824 0.000 0.176
#> SRR1447564 1 0.0829 0.89172 0.984 0.004 0.012
#> SRR1455195 1 0.0475 0.88975 0.992 0.004 0.004
#> SRR655182 3 0.6297 0.62756 0.060 0.184 0.756
#> SRR1335140 3 0.7145 0.58686 0.072 0.236 0.692
#> SRR1433555 3 0.3921 0.67299 0.036 0.080 0.884
#> SRR1308650 2 0.5810 0.52968 0.000 0.664 0.336
#> SRR1388354 1 0.0829 0.89075 0.984 0.004 0.012
#> SRR1317446 2 0.6126 0.41720 0.000 0.600 0.400
#> SRR1413602 3 0.4390 0.64088 0.012 0.148 0.840
#> SRR1479955 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR809853 1 0.5327 0.72263 0.728 0.000 0.272
#> SRR661313 3 0.4845 0.68017 0.052 0.104 0.844
#> SRR1499935 1 0.6318 0.56481 0.636 0.008 0.356
#> SRR1447303 3 0.4007 0.67418 0.036 0.084 0.880
#> SRR1429408 3 0.7491 0.45788 0.324 0.056 0.620
#> SRR1433950 1 0.1964 0.89067 0.944 0.000 0.056
#> SRR1362081 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1409854 1 0.4235 0.82751 0.824 0.000 0.176
#> SRR1435229 3 0.5325 0.55164 0.004 0.248 0.748
#> SRR1085996 1 0.2448 0.88474 0.924 0.000 0.076
#> SRR1414229 2 0.5327 0.61453 0.000 0.728 0.272
#> SRR1400974 3 0.4228 0.63877 0.008 0.148 0.844
#> SRR1399971 1 0.4399 0.82042 0.812 0.000 0.188
#> SRR613927 1 0.3715 0.86159 0.868 0.004 0.128
#> SRR1457854 1 0.1529 0.89233 0.960 0.000 0.040
#> SRR1473714 1 0.5621 0.67517 0.692 0.000 0.308
#> SRR813776 1 0.2261 0.88850 0.932 0.000 0.068
#> SRR808196 1 0.5070 0.77090 0.772 0.004 0.224
#> SRR1101085 1 0.4887 0.77059 0.772 0.000 0.228
#> SRR614395 1 0.1267 0.89307 0.972 0.004 0.024
#> SRR1478251 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1370551 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1362310 1 0.0747 0.89220 0.984 0.000 0.016
#> SRR665310 1 0.6291 0.25575 0.532 0.000 0.468
#> SRR1420109 3 0.5028 0.66784 0.040 0.132 0.828
#> SRR1330920 1 0.4654 0.79905 0.792 0.000 0.208
#> SRR1419539 3 0.6970 0.55737 0.048 0.276 0.676
#> SRR1359447 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1347259 1 0.6026 0.53475 0.624 0.000 0.376
#> SRR613915 1 0.2096 0.88998 0.944 0.004 0.052
#> SRR1384395 2 0.1643 0.83317 0.000 0.956 0.044
#> SRR821715 1 0.3784 0.85814 0.864 0.004 0.132
#> SRR1478228 1 0.1411 0.89241 0.964 0.000 0.036
#> SRR1445637 1 0.2796 0.88077 0.908 0.000 0.092
#> SRR608150 1 0.5929 0.63447 0.676 0.004 0.320
#> SRR1096383 1 0.0237 0.89015 0.996 0.000 0.004
#> SRR1341480 1 0.3551 0.85527 0.868 0.000 0.132
#> SRR1341344 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1326270 3 0.6187 0.62316 0.248 0.028 0.724
#> SRR1498838 3 0.3896 0.67887 0.052 0.060 0.888
#> SRR1416313 3 0.5174 0.67375 0.048 0.128 0.824
#> SRR808566 1 0.5285 0.75074 0.752 0.004 0.244
#> SRR1430270 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1367825 3 0.4293 0.62747 0.004 0.164 0.832
#> SRR613533 3 0.5305 0.61522 0.020 0.192 0.788
#> SRR661267 1 0.0237 0.89015 0.996 0.000 0.004
#> SRR810665 2 0.0747 0.84010 0.000 0.984 0.016
#> SRR1407250 1 0.6008 0.61502 0.664 0.004 0.332
#> SRR1420067 1 0.1964 0.89051 0.944 0.000 0.056
#> SRR1473632 3 0.6033 0.42826 0.004 0.336 0.660
#> SRR812536 1 0.4346 0.80879 0.816 0.000 0.184
#> SRR1370850 2 0.4399 0.74921 0.000 0.812 0.188
#> SRR1486195 2 0.0592 0.84062 0.000 0.988 0.012
#> SRR1407671 3 0.7403 0.61998 0.216 0.096 0.688
#> SRR1446375 3 0.5360 0.58293 0.012 0.220 0.768
#> SRR1465230 1 0.1163 0.89287 0.972 0.000 0.028
#> SRR614119 1 0.2959 0.87613 0.900 0.000 0.100
#> SRR1356101 2 0.0592 0.84063 0.000 0.988 0.012
#> SRR1404209 1 0.0983 0.89277 0.980 0.004 0.016
#> SRR1392676 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR665538 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR660510 3 0.4479 0.67476 0.044 0.096 0.860
#> SRR1445655 1 0.1129 0.89188 0.976 0.004 0.020
#> SRR658953 1 0.4233 0.82313 0.836 0.004 0.160
#> SRR2166459 1 0.4047 0.83332 0.848 0.004 0.148
#> SRR1070713 3 0.7438 0.22078 0.036 0.428 0.536
#> SRR1485312 3 0.4723 0.66253 0.160 0.016 0.824
#> SRR1317631 1 0.3038 0.86842 0.896 0.000 0.104
#> SRR1488610 1 0.3038 0.87682 0.896 0.000 0.104
#> SRR1330588 3 0.4519 0.67701 0.116 0.032 0.852
#> SRR1316367 3 0.6599 0.64190 0.084 0.168 0.748
#> SRR1433926 1 0.4399 0.82042 0.812 0.000 0.188
#> SRR1091302 1 0.3500 0.86318 0.880 0.004 0.116
#> SRR818263 1 0.3112 0.87900 0.900 0.004 0.096
#> SRR1404909 1 0.6062 0.51653 0.616 0.000 0.384
#> SRR663076 1 0.0424 0.89011 0.992 0.000 0.008
#> SRR1323577 2 0.3619 0.79104 0.000 0.864 0.136
#> SRR1442422 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1465893 1 0.1753 0.89188 0.952 0.000 0.048
#> SRR654862 1 0.4235 0.82854 0.824 0.000 0.176
#> SRR1407112 1 0.2625 0.87976 0.916 0.000 0.084
#> SRR1332969 3 0.6422 0.49534 0.324 0.016 0.660
#> SRR1353199 3 0.5331 0.67040 0.076 0.100 0.824
#> SRR1378885 1 0.3192 0.87136 0.888 0.000 0.112
#> SRR665357 2 0.4931 0.69306 0.000 0.768 0.232
#> SRR662186 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1501020 3 0.5803 0.61281 0.248 0.016 0.736
#> SRR1347819 3 0.4679 0.65296 0.020 0.148 0.832
#> SRR1480813 2 0.0424 0.84085 0.000 0.992 0.008
#> SRR1472576 3 0.7567 0.32401 0.048 0.376 0.576
#> SRR1431781 1 0.5754 0.67769 0.700 0.004 0.296
#> SRR1452270 3 0.6633 0.09328 0.444 0.008 0.548
#> SRR1500472 3 0.6200 0.44781 0.012 0.312 0.676
#> SRR1417632 3 0.6274 0.03510 0.000 0.456 0.544
#> SRR1350153 2 0.0892 0.83966 0.000 0.980 0.020
#> SRR1458113 3 0.5220 0.61106 0.012 0.208 0.780
#> SRR1326579 1 0.3619 0.85793 0.864 0.000 0.136
#> SRR1349363 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1096712 3 0.5109 0.60433 0.008 0.212 0.780
#> SRR1090407 3 0.6603 0.44043 0.332 0.020 0.648
#> SRR1083752 3 0.7379 0.35577 0.040 0.376 0.584
#> SRR1377599 1 0.7141 0.49461 0.600 0.032 0.368
#> SRR1488449 3 0.6633 0.09328 0.444 0.008 0.548
#> SRR1318354 2 0.6126 0.41105 0.000 0.600 0.400
#> SRR1359062 2 0.5431 0.63217 0.000 0.716 0.284
#> SRR1398924 3 0.6026 0.31959 0.000 0.376 0.624
#> SRR663783 3 0.6140 0.20570 0.000 0.404 0.596
#> SRR1319204 3 0.6008 0.43044 0.004 0.332 0.664
#> SRR1369070 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR615659 1 0.1031 0.89310 0.976 0.000 0.024
#> SRR1337449 2 0.2066 0.82943 0.000 0.940 0.060
#> SRR1316982 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1498595 3 0.6309 -0.10860 0.000 0.496 0.504
#> SRR1377423 3 0.5403 0.65384 0.060 0.124 0.816
#> SRR1312310 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1485613 1 0.1964 0.89023 0.944 0.000 0.056
#> SRR1338426 3 0.5610 0.63142 0.028 0.196 0.776
#> SRR1353309 3 0.5318 0.63980 0.204 0.016 0.780
#> SRR658941 3 0.6970 0.55737 0.048 0.276 0.676
#> SRR1101643 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1401468 1 0.2796 0.88090 0.908 0.000 0.092
#> SRR1368874 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1324085 1 0.5404 0.73480 0.740 0.004 0.256
#> SRR1363858 1 0.5621 0.67517 0.692 0.000 0.308
#> SRR819820 3 0.4469 0.68434 0.076 0.060 0.864
#> SRR1337342 1 0.2796 0.88052 0.908 0.000 0.092
#> SRR655206 3 0.6027 0.65379 0.060 0.164 0.776
#> SRR1387013 3 0.6669 0.06952 0.008 0.468 0.524
#> SRR1317410 1 0.1411 0.89241 0.964 0.000 0.036
#> SRR608198 1 0.5845 0.65476 0.688 0.004 0.308
#> SRR1440161 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1343741 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1381288 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1415379 1 0.0661 0.89083 0.988 0.004 0.008
#> SRR1099622 2 0.5733 0.56569 0.000 0.676 0.324
#> SRR663197 3 0.4915 0.63175 0.012 0.184 0.804
#> SRR1394836 3 0.6875 0.60142 0.244 0.056 0.700
#> SRR661699 1 0.5810 0.61407 0.664 0.000 0.336
#> SRR813680 1 0.1163 0.89379 0.972 0.000 0.028
#> SRR1410678 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1378109 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1499174 1 0.6490 0.53192 0.628 0.012 0.360
#> SRR1311486 2 0.2066 0.82943 0.000 0.940 0.060
#> SRR1382851 3 0.7022 0.57690 0.260 0.056 0.684
#> SRR1433410 1 0.3551 0.86140 0.868 0.000 0.132
#> SRR661167 3 0.5812 0.57474 0.264 0.012 0.724
#> SRR1432518 3 0.4092 0.67269 0.036 0.088 0.876
#> SRR660462 3 0.6208 0.63110 0.068 0.164 0.768
#> SRR1374608 1 0.2496 0.88409 0.928 0.004 0.068
#> SRR657949 1 0.2096 0.88902 0.944 0.004 0.052
#> SRR1308882 1 0.1129 0.89188 0.976 0.004 0.020
#> SRR655768 1 0.4235 0.82683 0.824 0.000 0.176
#> SRR1485870 1 0.6282 0.51359 0.612 0.004 0.384
#> SRR1444138 3 0.5480 0.53045 0.004 0.264 0.732
#> SRR1417342 1 0.0661 0.89083 0.988 0.004 0.008
#> SRR1470193 3 0.6962 0.20124 0.412 0.020 0.568
#> SRR1091380 3 0.4469 0.68434 0.076 0.060 0.864
#> SRR1099096 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1313583 1 0.0747 0.89223 0.984 0.000 0.016
#> SRR1467102 2 0.5465 0.62554 0.000 0.712 0.288
#> SRR1485416 1 0.3340 0.86218 0.880 0.000 0.120
#> SRR818821 3 0.5305 0.61522 0.020 0.192 0.788
#> SRR809963 1 0.1267 0.89307 0.972 0.004 0.024
#> SRR1072247 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1353710 1 0.4346 0.80873 0.816 0.000 0.184
#> SRR1445259 3 0.6075 0.43841 0.008 0.316 0.676
#> SRR1408393 1 0.2860 0.87781 0.912 0.004 0.084
#> SRR1361522 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1368597 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1309680 2 0.4605 0.73329 0.000 0.796 0.204
#> SRR1310542 3 0.5810 0.43790 0.000 0.336 0.664
#> SRR1333485 1 0.1647 0.89288 0.960 0.004 0.036
#> SRR1406437 3 0.6126 0.56996 0.268 0.020 0.712
#> SRR1354931 3 0.5852 0.65219 0.044 0.180 0.776
#> SRR1391856 3 0.6659 -0.00353 0.460 0.008 0.532
#> SRR1446738 3 0.8454 0.48424 0.112 0.316 0.572
#> SRR1309032 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1388145 3 0.6309 -0.06766 0.000 0.496 0.504
#> SRR1432611 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR815869 2 0.5431 0.63217 0.000 0.716 0.284
#> SRR613150 3 0.4423 0.68342 0.088 0.048 0.864
#> SRR1375329 3 0.5263 0.68311 0.084 0.088 0.828
#> SRR1387921 1 0.0424 0.89011 0.992 0.000 0.008
#> SRR1466792 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1360478 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1360695 1 0.1529 0.89233 0.960 0.000 0.040
#> SRR812943 3 0.6012 0.59241 0.032 0.220 0.748
#> SRR1400910 3 0.5905 0.36701 0.000 0.352 0.648
#> SRR1444203 1 0.1267 0.89344 0.972 0.004 0.024
#> SRR816177 3 0.6672 0.02139 0.008 0.472 0.520
#> SRR658754 3 0.5859 0.42001 0.000 0.344 0.656
#> SRR1429603 1 0.6126 0.48021 0.600 0.000 0.400
#> SRR1397366 3 0.5881 0.60652 0.256 0.016 0.728
#> SRR1446028 1 0.2625 0.88374 0.916 0.000 0.084
#> SRR1083918 3 0.6308 -0.05456 0.000 0.492 0.508
#> SRR1337606 3 0.6641 0.02992 0.448 0.008 0.544
#> SRR659109 3 0.5109 0.60433 0.008 0.212 0.780
#> SRR1337192 1 0.0475 0.88999 0.992 0.004 0.004
#> SRR656946 3 0.5493 0.57230 0.012 0.232 0.756
#> SRR1476102 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1476447 1 0.0661 0.89140 0.988 0.004 0.008
#> SRR1342067 1 0.1129 0.89188 0.976 0.004 0.020
#> SRR1385389 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1075971 1 0.1860 0.89091 0.948 0.000 0.052
#> SRR614419 1 0.1647 0.88527 0.960 0.004 0.036
#> SRR1322936 3 0.6800 0.49376 0.308 0.032 0.660
#> SRR1349121 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1430549 1 0.1411 0.89241 0.964 0.000 0.036
#> SRR612935 3 0.6299 -0.06095 0.000 0.476 0.524
#> SRR661481 2 0.0424 0.84085 0.000 0.992 0.008
#> SRR1354117 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1393596 3 0.6386 0.19898 0.412 0.004 0.584
#> SRR1452164 1 0.0747 0.89219 0.984 0.000 0.016
#> SRR1070503 1 0.4121 0.83279 0.832 0.000 0.168
#> SRR1499894 3 0.5728 0.55035 0.008 0.272 0.720
#> SRR1082883 1 0.5873 0.64446 0.684 0.004 0.312
#> SRR1468271 1 0.2959 0.87567 0.900 0.000 0.100
#> SRR1332443 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR810295 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR662103 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1328620 2 0.6295 0.19649 0.000 0.528 0.472
#> SRR1396294 3 0.7464 0.25164 0.400 0.040 0.560
#> SRR1419917 1 0.2537 0.88442 0.920 0.000 0.080
#> SRR662114 3 0.4217 0.67909 0.100 0.032 0.868
#> SRR1489199 1 0.2878 0.87911 0.904 0.000 0.096
#> SRR813584 3 0.6672 0.02139 0.008 0.472 0.520
#> SRR1069638 2 0.6298 0.37246 0.004 0.608 0.388
#> SRR614864 3 0.6495 0.02060 0.460 0.004 0.536
#> SRR1433392 1 0.3112 0.87871 0.900 0.004 0.096
#> SRR1377777 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR2167710 1 0.4233 0.82454 0.836 0.004 0.160
#> SRR1401252 1 0.1129 0.89188 0.976 0.004 0.020
#> SRR1309963 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1338031 1 0.2448 0.88465 0.924 0.000 0.076
#> SRR1418628 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1486889 1 0.4409 0.82033 0.824 0.004 0.172
#> SRR1380393 1 0.0592 0.89096 0.988 0.000 0.012
#> SRR1319731 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1356468 1 0.5956 0.62930 0.672 0.004 0.324
#> SRR1337010 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1486520 1 0.0661 0.88968 0.988 0.004 0.008
#> SRR1486538 1 0.5098 0.75444 0.752 0.000 0.248
#> SRR1340486 1 0.0000 0.88889 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.6286 0.23207 0.000 0.536 0.464
#> SRR1465459 1 0.4452 0.81319 0.808 0.000 0.192
#> SRR1080270 3 0.5810 0.43790 0.000 0.336 0.664
#> SRR1312501 3 0.4342 0.67557 0.120 0.024 0.856
#> SRR1093148 3 0.5585 0.64936 0.204 0.024 0.772
#> SRR1467080 2 0.6062 0.45358 0.000 0.616 0.384
#> SRR1410866 2 0.0424 0.84085 0.000 0.992 0.008
#> SRR816475 1 0.5158 0.76421 0.764 0.004 0.232
#> SRR1379198 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR613342 3 0.5864 0.50739 0.008 0.288 0.704
#> SRR1452246 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1338836 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1369129 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1396616 3 0.5536 0.67055 0.052 0.144 0.804
#> SRR813824 3 0.4316 0.68213 0.088 0.044 0.868
#> SRR1082376 1 0.2448 0.88474 0.924 0.000 0.076
#> SRR1500891 1 0.7159 0.25250 0.528 0.024 0.448
#> SRR807543 1 0.3941 0.84174 0.844 0.000 0.156
#> SRR1091572 3 0.7453 0.52777 0.292 0.064 0.644
#> SRR1346689 3 0.6950 0.21348 0.408 0.020 0.572
#> SRR1332424 1 0.3267 0.87005 0.884 0.000 0.116
#> SRR663729 1 0.0475 0.88967 0.992 0.004 0.004
#> SRR1097013 1 0.2796 0.87981 0.908 0.000 0.092
#> SRR613675 3 0.6800 0.49376 0.308 0.032 0.660
#> SRR1485357 1 0.5690 0.68904 0.708 0.004 0.288
#> SRR655816 1 0.4346 0.80879 0.816 0.000 0.184
#> SRR1500113 1 0.2959 0.87620 0.900 0.000 0.100
#> SRR1437622 3 0.7613 0.47592 0.064 0.316 0.620
#> SRR1355172 1 0.0237 0.89015 0.996 0.000 0.004
#> SRR655531 1 0.1647 0.88527 0.960 0.004 0.036
#> SRR1338147 3 0.4768 0.67935 0.052 0.100 0.848
#> SRR1413329 3 0.7069 0.27461 0.408 0.024 0.568
#> SRR1485931 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1420873 1 0.0475 0.88902 0.992 0.004 0.004
#> SRR1333308 1 0.6126 0.58235 0.644 0.004 0.352
#> SRR1452033 1 0.2165 0.88991 0.936 0.000 0.064
#> SRR1467316 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR809018 3 0.4228 0.63877 0.008 0.148 0.844
#> SRR1375351 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR663440 1 0.4399 0.81134 0.812 0.000 0.188
#> SRR1471755 2 0.6386 0.35649 0.004 0.584 0.412
#> SRR808019 1 0.0237 0.89015 0.996 0.000 0.004
#> SRR1479133 3 0.6016 0.58809 0.256 0.020 0.724
#> SRR615069 3 0.5864 0.50739 0.008 0.288 0.704
#> SRR1456185 2 0.3816 0.78179 0.000 0.852 0.148
#> SRR1350069 1 0.6398 0.43758 0.580 0.004 0.416
#> SRR816316 1 0.1289 0.89320 0.968 0.000 0.032
#> SRR664795 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1490721 1 0.4178 0.82779 0.828 0.000 0.172
#> SRR810643 1 0.1860 0.89079 0.948 0.000 0.052
#> SRR1430333 1 0.5325 0.74823 0.748 0.004 0.248
#> SRR1085285 3 0.3832 0.67957 0.076 0.036 0.888
#> SRR1099072 3 0.5881 0.60652 0.256 0.016 0.728
#> SRR1317985 1 0.0747 0.89219 0.984 0.000 0.016
#> SRR1487340 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1420276 2 0.2711 0.81564 0.000 0.912 0.088
#> SRR1351347 3 0.5536 0.64354 0.200 0.024 0.776
#> SRR1405525 1 0.4555 0.81152 0.800 0.000 0.200
#> SRR1370329 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.88889 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.1163 0.83766 0.000 0.972 0.028
#> SRR819610 3 0.7150 0.39775 0.036 0.348 0.616
#> SRR2157314 1 0.4047 0.83332 0.848 0.004 0.148
#> SRR1409465 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR809987 1 0.6148 0.57474 0.640 0.004 0.356
#> SRR613639 1 0.5591 0.66540 0.696 0.000 0.304
#> SRR1402285 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1077038 1 0.0829 0.89119 0.984 0.004 0.012
#> SRR1405660 3 0.4007 0.67296 0.036 0.084 0.880
#> SRR1095455 3 0.6200 0.44781 0.012 0.312 0.676
#> SRR1394734 3 0.6308 -0.05456 0.000 0.492 0.508
#> SRR1317771 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1365894 3 0.6641 0.02992 0.448 0.008 0.544
#> SRR1073581 1 0.0829 0.89182 0.984 0.004 0.012
#> SRR659804 1 0.2066 0.88978 0.940 0.000 0.060
#> SRR1345914 2 0.4399 0.74921 0.000 0.812 0.188
#> SRR1432186 2 0.2878 0.81313 0.000 0.904 0.096
#> SRR1473529 2 0.6274 0.26100 0.000 0.544 0.456
#> SRR660764 2 0.6079 0.44461 0.000 0.612 0.388
#> SRR820448 1 0.1289 0.89320 0.968 0.000 0.032
#> SRR1328845 3 0.7464 0.25164 0.400 0.040 0.560
#> SRR1336415 1 0.2625 0.87976 0.916 0.000 0.084
#> SRR1379065 1 0.0475 0.88958 0.992 0.004 0.004
#> SRR1459190 3 0.5237 0.68054 0.120 0.056 0.824
#> SRR1346773 1 0.2878 0.87775 0.904 0.000 0.096
#> SRR1499521 1 0.0000 0.88889 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0747 0.84004 0.000 0.984 0.016
#> SRR1347459 3 0.5859 0.42001 0.000 0.344 0.656
#> SRR1081209 2 0.0592 0.84068 0.000 0.988 0.012
#> SRR1400202 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1333395 1 0.5905 0.57817 0.648 0.000 0.352
#> SRR1309248 3 0.6235 0.10704 0.000 0.436 0.564
#> SRR809161 1 0.5785 0.59223 0.668 0.000 0.332
#> SRR1316320 3 0.7501 0.61878 0.212 0.104 0.684
#> SRR1432629 2 0.5621 0.59529 0.000 0.692 0.308
#> SRR1498931 1 0.0747 0.89164 0.984 0.000 0.016
#> SRR1416578 1 0.0661 0.89083 0.988 0.004 0.008
#> SRR1405547 3 0.4164 0.64316 0.008 0.144 0.848
#> SRR1470534 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1380764 1 0.1643 0.89220 0.956 0.000 0.044
#> SRR1309160 3 0.4035 0.67473 0.040 0.080 0.880
#> SRR663489 3 0.4805 0.62327 0.012 0.176 0.812
#> SRR1500450 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1078489 3 0.7509 0.51101 0.300 0.064 0.636
#> SRR1332648 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR660614 2 0.4887 0.69769 0.000 0.772 0.228
#> SRR1470420 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1475566 1 0.0000 0.88889 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0983 0.89229 0.980 0.004 0.016
#> SRR1481419 2 0.2537 0.82081 0.000 0.920 0.080
#> SRR1464766 1 0.1529 0.89277 0.960 0.000 0.040
#> SRR615946 3 0.5733 0.45706 0.000 0.324 0.676
#> SRR1446481 2 0.2066 0.82943 0.000 0.940 0.060
#> SRR1467656 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1402962 1 0.1289 0.89272 0.968 0.000 0.032
#> SRR660224 3 0.6286 -0.03340 0.000 0.464 0.536
#> SRR665586 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1347166 1 0.4235 0.82922 0.824 0.000 0.176
#> SRR1485722 1 0.6008 0.61502 0.664 0.004 0.332
#> SRR1415316 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR613390 1 0.2537 0.88328 0.920 0.000 0.080
#> SRR661108 3 0.3797 0.67842 0.052 0.056 0.892
#> SRR2170173 1 0.4172 0.82716 0.840 0.004 0.156
#> SRR817329 1 0.1647 0.89353 0.960 0.004 0.036
#> SRR1401990 1 0.5070 0.77090 0.772 0.004 0.224
#> SRR1467745 2 0.6079 0.39768 0.000 0.612 0.388
#> SRR1471795 2 0.3482 0.79541 0.000 0.872 0.128
#> SRR1415637 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR813137 1 0.1525 0.89302 0.964 0.004 0.032
#> SRR1314873 1 0.0829 0.89187 0.984 0.004 0.012
#> SRR1401211 1 0.0000 0.88889 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.4842 0.66650 0.000 0.776 0.224
#> SRR818797 1 0.3816 0.84933 0.852 0.000 0.148
#> SRR2164608 1 0.4172 0.82716 0.840 0.004 0.156
#> SRR1455586 2 0.2165 0.82689 0.000 0.936 0.064
#> SRR819459 3 0.5678 0.47058 0.000 0.316 0.684
#> SRR1488939 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1433232 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1385501 1 0.3879 0.84668 0.848 0.000 0.152
#> SRR1361652 2 0.6280 0.24596 0.000 0.540 0.460
#> SRR1437119 1 0.1411 0.89241 0.964 0.000 0.036
#> SRR1478547 3 0.4164 0.64056 0.008 0.144 0.848
#> SRR1430910 3 0.6244 0.10819 0.000 0.440 0.560
#> SRR1310584 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1500216 1 0.5621 0.67517 0.692 0.000 0.308
#> SRR1486762 2 0.4002 0.75046 0.000 0.840 0.160
#> SRR1480854 1 0.0475 0.88958 0.992 0.004 0.004
#> SRR1489394 1 0.1129 0.89188 0.976 0.004 0.020
#> SRR1418085 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1340221 1 0.1267 0.89344 0.972 0.004 0.024
#> SRR1473058 3 0.6875 0.60142 0.244 0.056 0.700
#> SRR1405165 3 0.4189 0.68269 0.068 0.056 0.876
#> SRR1433004 1 0.2796 0.87899 0.908 0.000 0.092
#> SRR1471477 1 0.2878 0.87758 0.904 0.000 0.096
#> SRR1098567 2 0.5397 0.63868 0.000 0.720 0.280
#> SRR1098712 3 0.6970 0.55737 0.048 0.276 0.676
#> SRR1455038 1 0.2537 0.88328 0.920 0.000 0.080
#> SRR1375248 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1403005 3 0.5812 0.57474 0.264 0.012 0.724
#> SRR1348378 2 0.5968 0.47113 0.000 0.636 0.364
#> SRR1413541 1 0.1964 0.89067 0.944 0.000 0.056
#> SRR1392943 1 0.0475 0.88975 0.992 0.004 0.004
#> SRR1475192 2 0.4555 0.69652 0.000 0.800 0.200
#> SRR1432085 2 0.5327 0.64965 0.000 0.728 0.272
#> SRR1452468 1 0.4121 0.83628 0.832 0.000 0.168
#> SRR1347060 3 0.5810 0.43790 0.000 0.336 0.664
#> SRR1414139 2 0.6286 0.23801 0.000 0.536 0.464
#> SRR1447962 2 0.5760 0.56225 0.000 0.672 0.328
#> SRR1444324 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1415004 1 0.1529 0.89287 0.960 0.000 0.040
#> SRR1413436 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1311266 1 0.2878 0.87911 0.904 0.000 0.096
#> SRR1343302 1 0.2537 0.88139 0.920 0.000 0.080
#> SRR1373746 1 0.1411 0.89241 0.964 0.000 0.036
#> SRR1429678 1 0.0475 0.88839 0.992 0.004 0.004
#> SRR1469413 2 0.5760 0.56225 0.000 0.672 0.328
#> SRR1405331 3 0.4505 0.68303 0.092 0.048 0.860
#> SRR1345609 1 0.0237 0.88837 0.996 0.004 0.000
#> SRR1380208 3 0.6890 0.45224 0.340 0.028 0.632
#> SRR1322840 1 0.1129 0.89188 0.976 0.004 0.020
#> SRR1399797 3 0.4915 0.63175 0.012 0.184 0.804
#> SRR1416654 3 0.4007 0.67418 0.036 0.084 0.880
#> SRR1315081 2 0.3116 0.80568 0.000 0.892 0.108
#> SRR1369196 3 0.6079 0.33110 0.000 0.388 0.612
#> SRR1400847 1 0.0661 0.88968 0.988 0.004 0.008
#> SRR1365291 1 0.4702 0.79607 0.788 0.000 0.212
#> SRR1367920 1 0.7141 0.49461 0.600 0.032 0.368
#> SRR1366648 3 0.4293 0.62747 0.004 0.164 0.832
#> SRR1441679 2 0.0237 0.84123 0.000 0.996 0.004
#> SRR1082173 3 0.4137 0.67936 0.096 0.032 0.872
#> SRR1363968 1 0.0424 0.89131 0.992 0.000 0.008
#> SRR814387 1 0.0000 0.88889 1.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0237 0.89015 0.996 0.000 0.004
#> SRR1386689 1 0.2625 0.87976 0.916 0.000 0.084
#> SRR1395575 3 0.4802 0.66497 0.156 0.020 0.824
#> SRR1453811 3 0.7059 0.12264 0.460 0.020 0.520
#> SRR1441159 1 0.3192 0.87207 0.888 0.000 0.112
#> SRR1403154 1 0.1031 0.89279 0.976 0.000 0.024
#> SRR1468722 3 0.5860 0.62407 0.228 0.024 0.748
#> SRR1310275 3 0.4446 0.67866 0.112 0.032 0.856
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 1 0.0376 0.8369 0.992 0.000 0.004 NA
#> SRR1331708 3 0.7395 0.5419 0.144 0.008 0.516 NA
#> SRR1464258 1 0.4786 0.7958 0.788 0.000 0.108 NA
#> SRR1454201 3 0.6879 0.6502 0.148 0.028 0.660 NA
#> SRR661589 3 0.5979 0.6185 0.172 0.000 0.692 NA
#> SRR1456229 1 0.4036 0.8175 0.836 0.000 0.088 NA
#> SRR1315165 1 0.7692 0.3875 0.456 0.000 0.272 NA
#> SRR1488960 1 0.1059 0.8398 0.972 0.000 0.016 NA
#> SRR1417809 1 0.1837 0.8407 0.944 0.000 0.028 NA
#> SRR1094457 1 0.0336 0.8348 0.992 0.000 0.000 NA
#> SRR1095575 3 0.4981 0.6960 0.056 0.016 0.788 NA
#> SRR1315931 1 0.0336 0.8349 0.992 0.000 0.000 NA
#> SRR1430066 3 0.3013 0.6847 0.000 0.032 0.888 NA
#> SRR1431037 3 0.3377 0.6967 0.016 0.032 0.884 NA
#> SRR1395554 3 0.5657 0.6113 0.000 0.120 0.720 NA
#> SRR818002 2 0.4756 0.7448 0.000 0.784 0.144 NA
#> SRR1344143 3 0.7534 0.2915 0.000 0.268 0.492 NA
#> SRR1486845 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1362866 1 0.5664 0.7509 0.720 0.000 0.156 NA
#> SRR1490740 1 0.0927 0.8402 0.976 0.000 0.016 NA
#> SRR1446627 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1456138 2 0.0592 0.8414 0.000 0.984 0.016 NA
#> SRR1416248 1 0.0188 0.8357 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1383907 1 0.7034 0.5914 0.576 0.000 0.204 NA
#> SRR1311018 1 0.3013 0.8328 0.888 0.000 0.032 NA
#> SRR1375699 2 0.4872 0.7373 0.000 0.776 0.148 NA
#> SRR1429846 1 0.4920 0.7846 0.776 0.000 0.136 NA
#> SRR613550 1 0.7156 0.4319 0.520 0.000 0.328 NA
#> SRR1348402 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1345146 3 0.4745 0.6988 0.028 0.028 0.800 NA
#> SRR1324025 3 0.3744 0.6981 0.028 0.028 0.868 NA
#> SRR1318879 3 0.5031 0.6952 0.056 0.016 0.784 NA
#> SRR820755 1 0.3828 0.8250 0.848 0.000 0.068 NA
#> SRR1485830 1 0.7863 0.2396 0.396 0.000 0.304 NA
#> SRR599313 1 0.7786 0.3348 0.424 0.000 0.268 NA
#> SRR612263 1 0.1624 0.8411 0.952 0.000 0.028 NA
#> SRR1415398 1 0.7480 0.2084 0.444 0.000 0.376 NA
#> SRR1326205 3 0.7816 0.3549 0.248 0.004 0.460 NA
#> SRR1421327 1 0.0779 0.8354 0.980 0.000 0.004 NA
#> SRR1083311 3 0.3285 0.6930 0.016 0.020 0.884 NA
#> SRR1499303 3 0.7821 0.0303 0.344 0.000 0.396 NA
#> SRR1079522 1 0.7773 0.3114 0.432 0.000 0.288 NA
#> SRR1452935 3 0.3662 0.6991 0.012 0.024 0.860 NA
#> SRR1379495 1 0.0336 0.8349 0.992 0.000 0.000 NA
#> SRR1470459 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR661361 3 0.3128 0.6926 0.040 0.000 0.884 NA
#> SRR615778 1 0.5815 0.7426 0.708 0.000 0.152 NA
#> SRR1447564 1 0.1182 0.8405 0.968 0.000 0.016 NA
#> SRR1455195 1 0.0657 0.8373 0.984 0.000 0.004 NA
#> SRR655182 3 0.6471 0.6558 0.032 0.076 0.680 NA
#> SRR1335140 3 0.6807 0.6330 0.020 0.092 0.624 NA
#> SRR1433555 3 0.2553 0.6931 0.016 0.008 0.916 NA
#> SRR1308650 2 0.7212 0.3704 0.000 0.516 0.324 NA
#> SRR1388354 1 0.1059 0.8390 0.972 0.000 0.016 NA
#> SRR1317446 3 0.7367 -0.0244 0.000 0.404 0.436 NA
#> SRR1413602 3 0.3051 0.6830 0.000 0.028 0.884 NA
#> SRR1479955 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR809853 1 0.6758 0.6200 0.604 0.000 0.240 NA
#> SRR661313 3 0.3377 0.6969 0.016 0.032 0.884 NA
#> SRR1499935 1 0.7793 0.3095 0.424 0.000 0.300 NA
#> SRR1447303 3 0.2076 0.6946 0.008 0.004 0.932 NA
#> SRR1429408 3 0.7532 0.5368 0.148 0.012 0.512 NA
#> SRR1433950 1 0.3009 0.8360 0.892 0.000 0.056 NA
#> SRR1362081 2 0.0188 0.8425 0.000 0.996 0.000 NA
#> SRR1409854 1 0.5624 0.7462 0.720 0.000 0.172 NA
#> SRR1435229 3 0.6245 0.6076 0.000 0.108 0.648 NA
#> SRR1085996 1 0.3970 0.8194 0.840 0.000 0.084 NA
#> SRR1414229 2 0.7138 0.4984 0.000 0.552 0.180 NA
#> SRR1400974 3 0.3149 0.6797 0.000 0.032 0.880 NA
#> SRR1399971 1 0.6162 0.7160 0.676 0.000 0.156 NA
#> SRR613927 1 0.4669 0.7964 0.796 0.000 0.104 NA
#> SRR1457854 1 0.2313 0.8390 0.924 0.000 0.044 NA
#> SRR1473714 1 0.7786 0.3348 0.424 0.000 0.268 NA
#> SRR813776 1 0.3828 0.8250 0.848 0.000 0.068 NA
#> SRR808196 1 0.6722 0.6211 0.616 0.000 0.184 NA
#> SRR1101085 1 0.7036 0.5911 0.576 0.000 0.208 NA
#> SRR614395 1 0.1004 0.8391 0.972 0.000 0.024 NA
#> SRR1478251 1 0.0336 0.8348 0.992 0.000 0.000 NA
#> SRR1370551 2 0.0188 0.8425 0.000 0.996 0.000 NA
#> SRR1362310 1 0.1411 0.8408 0.960 0.000 0.020 NA
#> SRR665310 1 0.7425 0.0876 0.420 0.000 0.412 NA
#> SRR1420109 3 0.5153 0.6944 0.016 0.048 0.768 NA
#> SRR1330920 1 0.5911 0.7183 0.692 0.000 0.196 NA
#> SRR1419539 3 0.7332 0.5823 0.028 0.148 0.608 NA
#> SRR1359447 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1347259 1 0.7867 0.2277 0.392 0.000 0.292 NA
#> SRR613915 1 0.2500 0.8303 0.916 0.000 0.040 NA
#> SRR1384395 2 0.2844 0.8173 0.000 0.900 0.052 NA
#> SRR821715 1 0.4844 0.7905 0.784 0.000 0.108 NA
#> SRR1478228 1 0.2644 0.8370 0.908 0.000 0.032 NA
#> SRR1445637 1 0.3885 0.8220 0.844 0.000 0.092 NA
#> SRR608150 1 0.7508 0.4442 0.496 0.000 0.272 NA
#> SRR1096383 1 0.0188 0.8362 0.996 0.000 0.004 NA
#> SRR1341480 1 0.5568 0.7505 0.728 0.000 0.120 NA
#> SRR1341344 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1326270 3 0.5842 0.6307 0.168 0.000 0.704 NA
#> SRR1498838 3 0.2335 0.6946 0.020 0.000 0.920 NA
#> SRR1416313 3 0.3973 0.6967 0.020 0.044 0.856 NA
#> SRR808566 1 0.7093 0.5747 0.568 0.000 0.220 NA
#> SRR1430270 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1367825 3 0.3144 0.6759 0.000 0.044 0.884 NA
#> SRR613533 3 0.4500 0.6678 0.004 0.068 0.812 NA
#> SRR661267 1 0.0188 0.8362 0.996 0.000 0.004 NA
#> SRR810665 2 0.1004 0.8393 0.000 0.972 0.024 NA
#> SRR1407250 1 0.7189 0.4889 0.532 0.000 0.300 NA
#> SRR1420067 1 0.2546 0.8383 0.912 0.000 0.060 NA
#> SRR1473632 3 0.7149 0.5080 0.000 0.184 0.552 NA
#> SRR812536 1 0.5339 0.7073 0.744 0.000 0.100 NA
#> SRR1370850 2 0.6016 0.6399 0.000 0.680 0.208 NA
#> SRR1486195 2 0.0804 0.8419 0.000 0.980 0.008 NA
#> SRR1407671 3 0.7275 0.6188 0.092 0.032 0.576 NA
#> SRR1446375 3 0.5881 0.6311 0.000 0.084 0.676 NA
#> SRR1465230 1 0.2882 0.8322 0.892 0.000 0.024 NA
#> SRR614119 1 0.4780 0.7970 0.788 0.000 0.096 NA
#> SRR1356101 2 0.0937 0.8411 0.000 0.976 0.012 NA
#> SRR1404209 1 0.1182 0.8406 0.968 0.000 0.016 NA
#> SRR1392676 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR665538 1 0.0469 0.8331 0.988 0.000 0.000 NA
#> SRR660510 3 0.3103 0.6947 0.016 0.016 0.892 NA
#> SRR1445655 1 0.2142 0.8340 0.928 0.000 0.016 NA
#> SRR658953 1 0.5076 0.7226 0.756 0.000 0.072 NA
#> SRR2166459 1 0.4758 0.7316 0.780 0.000 0.064 NA
#> SRR1070713 3 0.7919 0.3078 0.012 0.296 0.476 NA
#> SRR1485312 3 0.4906 0.6740 0.084 0.000 0.776 NA
#> SRR1317631 1 0.4030 0.8039 0.836 0.000 0.092 NA
#> SRR1488610 1 0.4669 0.8054 0.796 0.000 0.104 NA
#> SRR1330588 3 0.3959 0.6862 0.068 0.000 0.840 NA
#> SRR1316367 3 0.6677 0.6640 0.052 0.064 0.672 NA
#> SRR1433926 1 0.6162 0.7160 0.676 0.000 0.156 NA
#> SRR1091302 1 0.5325 0.7521 0.744 0.000 0.096 NA
#> SRR818263 1 0.4106 0.8189 0.832 0.000 0.084 NA
#> SRR1404909 1 0.7862 0.2371 0.396 0.000 0.308 NA
#> SRR663076 1 0.0672 0.8373 0.984 0.000 0.008 NA
#> SRR1323577 2 0.5174 0.7320 0.000 0.756 0.152 NA
#> SRR1442422 1 0.0336 0.8348 0.992 0.000 0.000 NA
#> SRR1465893 1 0.2751 0.8370 0.904 0.000 0.040 NA
#> SRR654862 1 0.5484 0.7546 0.732 0.000 0.164 NA
#> SRR1407112 1 0.4568 0.7881 0.800 0.000 0.076 NA
#> SRR1332969 3 0.6344 0.5380 0.224 0.000 0.648 NA
#> SRR1353199 3 0.5032 0.6763 0.016 0.020 0.744 NA
#> SRR1378885 1 0.4130 0.8145 0.828 0.000 0.108 NA
#> SRR665357 2 0.6110 0.5773 0.000 0.660 0.240 NA
#> SRR662186 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1501020 3 0.5902 0.6278 0.160 0.000 0.700 NA
#> SRR1347819 3 0.3556 0.6881 0.004 0.036 0.864 NA
#> SRR1480813 2 0.0376 0.8433 0.000 0.992 0.004 NA
#> SRR1472576 3 0.7941 0.4988 0.036 0.168 0.540 NA
#> SRR1431781 1 0.7539 0.4592 0.492 0.000 0.252 NA
#> SRR1452270 3 0.7410 0.2323 0.328 0.000 0.488 NA
#> SRR1500472 3 0.6392 0.5717 0.004 0.108 0.648 NA
#> SRR1417632 3 0.7372 0.3787 0.000 0.236 0.524 NA
#> SRR1350153 2 0.1151 0.8387 0.000 0.968 0.024 NA
#> SRR1458113 3 0.4816 0.6626 0.004 0.080 0.792 NA
#> SRR1326579 1 0.5280 0.7759 0.752 0.000 0.128 NA
#> SRR1349363 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1096712 3 0.4356 0.6646 0.000 0.064 0.812 NA
#> SRR1090407 3 0.6761 0.4981 0.224 0.000 0.608 NA
#> SRR1083752 3 0.7540 0.4381 0.004 0.232 0.520 NA
#> SRR1377599 1 0.8143 0.2062 0.388 0.008 0.312 NA
#> SRR1488449 3 0.7410 0.2323 0.328 0.000 0.488 NA
#> SRR1318354 3 0.7488 0.0144 0.000 0.384 0.436 NA
#> SRR1359062 2 0.6616 0.4526 0.000 0.584 0.308 NA
#> SRR1398924 3 0.6731 0.5089 0.000 0.148 0.604 NA
#> SRR663783 3 0.6957 0.4500 0.000 0.172 0.580 NA
#> SRR1319204 3 0.5985 0.5788 0.000 0.140 0.692 NA
#> SRR1369070 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR615659 1 0.1510 0.8416 0.956 0.000 0.028 NA
#> SRR1337449 2 0.2908 0.8148 0.000 0.896 0.064 NA
#> SRR1316982 2 0.0469 0.8404 0.000 0.988 0.000 NA
#> SRR1498595 3 0.7518 0.3048 0.000 0.260 0.496 NA
#> SRR1377423 3 0.5378 0.6532 0.004 0.036 0.696 NA
#> SRR1312310 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1485613 1 0.3697 0.8234 0.852 0.000 0.048 NA
#> SRR1338426 3 0.4411 0.6819 0.012 0.052 0.824 NA
#> SRR1353309 3 0.5470 0.6547 0.100 0.000 0.732 NA
#> SRR658941 3 0.7332 0.5823 0.028 0.148 0.608 NA
#> SRR1101643 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1401468 1 0.4673 0.8035 0.792 0.000 0.076 NA
#> SRR1368874 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1324085 1 0.7324 0.5242 0.532 0.000 0.228 NA
#> SRR1363858 1 0.7786 0.3348 0.424 0.000 0.268 NA
#> SRR819820 3 0.3015 0.6980 0.024 0.000 0.884 NA
#> SRR1337342 1 0.4235 0.8151 0.824 0.000 0.092 NA
#> SRR655206 3 0.5838 0.6831 0.024 0.056 0.720 NA
#> SRR1387013 3 0.7566 0.2192 0.000 0.320 0.468 NA
#> SRR1317410 1 0.2644 0.8370 0.908 0.000 0.032 NA
#> SRR608198 1 0.7430 0.4743 0.512 0.000 0.260 NA
#> SRR1440161 2 0.0188 0.8425 0.000 0.996 0.000 NA
#> SRR1343741 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1381288 2 0.0188 0.8434 0.000 0.996 0.004 NA
#> SRR1415379 1 0.0804 0.8377 0.980 0.000 0.008 NA
#> SRR1099622 2 0.6887 0.3586 0.000 0.528 0.356 NA
#> SRR663197 3 0.4353 0.6746 0.004 0.060 0.820 NA
#> SRR1394836 3 0.6975 0.5922 0.100 0.012 0.572 NA
#> SRR661699 1 0.7200 0.4868 0.552 0.000 0.228 NA
#> SRR813680 1 0.2131 0.8400 0.932 0.000 0.032 NA
#> SRR1410678 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1378109 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1499174 1 0.7483 0.4190 0.496 0.000 0.288 NA
#> SRR1311486 2 0.3071 0.8115 0.000 0.888 0.068 NA
#> SRR1382851 3 0.6957 0.5860 0.096 0.012 0.568 NA
#> SRR1433410 1 0.5228 0.7787 0.756 0.000 0.124 NA
#> SRR661167 3 0.6854 0.5808 0.172 0.000 0.596 NA
#> SRR1432518 3 0.2474 0.6933 0.016 0.008 0.920 NA
#> SRR660462 3 0.5775 0.6282 0.004 0.048 0.660 NA
#> SRR1374608 1 0.3247 0.8228 0.880 0.000 0.060 NA
#> SRR657949 1 0.2494 0.8286 0.916 0.000 0.036 NA
#> SRR1308882 1 0.1798 0.8351 0.944 0.000 0.016 NA
#> SRR655768 1 0.5834 0.7345 0.704 0.000 0.172 NA
#> SRR1485870 1 0.7905 0.1681 0.368 0.000 0.312 NA
#> SRR1444138 3 0.6400 0.5929 0.000 0.116 0.632 NA
#> SRR1417342 1 0.0927 0.8386 0.976 0.000 0.008 NA
#> SRR1470193 3 0.7816 0.3540 0.248 0.004 0.460 NA
#> SRR1091380 3 0.3015 0.6980 0.024 0.000 0.884 NA
#> SRR1099096 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1313583 1 0.1677 0.8410 0.948 0.000 0.012 NA
#> SRR1467102 2 0.6653 0.4285 0.000 0.568 0.328 NA
#> SRR1485416 1 0.5116 0.7759 0.764 0.000 0.108 NA
#> SRR818821 3 0.4500 0.6678 0.004 0.068 0.812 NA
#> SRR809963 1 0.1004 0.8391 0.972 0.000 0.024 NA
#> SRR1072247 1 0.0336 0.8349 0.992 0.000 0.000 NA
#> SRR1353710 1 0.5842 0.7059 0.704 0.000 0.168 NA
#> SRR1445259 3 0.6216 0.5674 0.000 0.108 0.652 NA
#> SRR1408393 1 0.3398 0.8067 0.872 0.000 0.060 NA
#> SRR1361522 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1368597 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1309680 2 0.6102 0.6346 0.000 0.672 0.212 NA
#> SRR1310542 3 0.6245 0.5546 0.000 0.164 0.668 NA
#> SRR1333485 1 0.2546 0.8337 0.912 0.000 0.028 NA
#> SRR1406437 3 0.6613 0.6036 0.116 0.000 0.596 NA
#> SRR1354931 3 0.5406 0.6686 0.004 0.076 0.740 NA
#> SRR1391856 3 0.7566 0.3479 0.192 0.000 0.416 NA
#> SRR1446738 3 0.8444 0.4867 0.048 0.196 0.484 NA
#> SRR1309032 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1388145 3 0.7264 0.2436 0.000 0.320 0.512 NA
#> SRR1432611 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR815869 2 0.6616 0.4526 0.000 0.584 0.308 NA
#> SRR613150 3 0.3725 0.6970 0.028 0.004 0.848 NA
#> SRR1375329 3 0.4726 0.7005 0.036 0.028 0.808 NA
#> SRR1387921 1 0.0672 0.8373 0.984 0.000 0.008 NA
#> SRR1466792 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1360478 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1360695 1 0.2021 0.8402 0.936 0.000 0.040 NA
#> SRR812943 3 0.6311 0.6330 0.008 0.088 0.656 NA
#> SRR1400910 3 0.6566 0.5310 0.000 0.140 0.624 NA
#> SRR1444203 1 0.1724 0.8413 0.948 0.000 0.020 NA
#> SRR816177 3 0.7465 0.3117 0.004 0.288 0.520 NA
#> SRR658754 3 0.6285 0.5482 0.000 0.168 0.664 NA
#> SRR1429603 1 0.7913 0.1467 0.360 0.000 0.316 NA
#> SRR1397366 3 0.5891 0.6249 0.168 0.000 0.700 NA
#> SRR1446028 1 0.4344 0.8125 0.816 0.000 0.076 NA
#> SRR1083918 3 0.7344 0.2713 0.000 0.300 0.512 NA
#> SRR1337606 3 0.7476 0.3612 0.176 0.000 0.416 NA
#> SRR659109 3 0.4356 0.6646 0.000 0.064 0.812 NA
#> SRR1337192 1 0.0524 0.8366 0.988 0.000 0.004 NA
#> SRR656946 3 0.6027 0.6224 0.000 0.092 0.664 NA
#> SRR1476102 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1476447 1 0.0779 0.8385 0.980 0.000 0.004 NA
#> SRR1342067 1 0.1975 0.8341 0.936 0.000 0.016 NA
#> SRR1385389 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1075971 1 0.3090 0.8335 0.888 0.000 0.056 NA
#> SRR614419 1 0.1854 0.8220 0.940 0.000 0.012 NA
#> SRR1322936 3 0.6980 0.5769 0.132 0.000 0.536 NA
#> SRR1349121 1 0.0336 0.8349 0.992 0.000 0.000 NA
#> SRR1430549 1 0.3013 0.8328 0.888 0.000 0.032 NA
#> SRR612935 3 0.7456 0.3255 0.000 0.236 0.508 NA
#> SRR661481 2 0.0524 0.8426 0.000 0.988 0.004 NA
#> SRR1354117 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1393596 3 0.7542 0.3861 0.212 0.000 0.476 NA
#> SRR1452164 1 0.1042 0.8404 0.972 0.000 0.020 NA
#> SRR1070503 1 0.5383 0.7601 0.740 0.000 0.160 NA
#> SRR1499894 3 0.5321 0.6299 0.000 0.112 0.748 NA
#> SRR1082883 1 0.7539 0.4428 0.492 0.000 0.252 NA
#> SRR1468271 1 0.4780 0.7962 0.788 0.000 0.096 NA
#> SRR1332443 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR810295 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR662103 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1328620 3 0.7345 0.1982 0.000 0.336 0.492 NA
#> SRR1396294 3 0.7417 0.4347 0.208 0.000 0.508 NA
#> SRR1419917 1 0.4039 0.8195 0.836 0.000 0.084 NA
#> SRR662114 3 0.3301 0.6899 0.048 0.000 0.876 NA
#> SRR1489199 1 0.4605 0.8068 0.800 0.000 0.092 NA
#> SRR813584 3 0.7465 0.3117 0.004 0.288 0.520 NA
#> SRR1069638 2 0.7771 0.1864 0.000 0.424 0.320 NA
#> SRR614864 3 0.7225 0.1413 0.352 0.000 0.496 NA
#> SRR1433392 1 0.4104 0.8185 0.832 0.000 0.088 NA
#> SRR1377777 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR2167710 1 0.5011 0.7218 0.764 0.000 0.076 NA
#> SRR1401252 1 0.2142 0.8340 0.928 0.000 0.016 NA
#> SRR1309963 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1338031 1 0.3761 0.8229 0.852 0.000 0.080 NA
#> SRR1418628 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1486889 1 0.5560 0.7315 0.728 0.000 0.156 NA
#> SRR1380393 1 0.0937 0.8388 0.976 0.000 0.012 NA
#> SRR1319731 1 0.0336 0.8349 0.992 0.000 0.000 NA
#> SRR1356468 1 0.7735 0.3523 0.444 0.000 0.276 NA
#> SRR1337010 2 0.1576 0.8243 0.000 0.948 0.004 NA
#> SRR1486520 1 0.1109 0.8388 0.968 0.000 0.004 NA
#> SRR1486538 1 0.6621 0.6328 0.628 0.000 0.188 NA
#> SRR1340486 1 0.0921 0.8395 0.972 0.000 0.000 NA
#> SRR1377696 3 0.7636 0.2395 0.000 0.284 0.468 NA
#> SRR1465459 1 0.5569 0.7440 0.724 0.000 0.172 NA
#> SRR1080270 3 0.6245 0.5546 0.000 0.164 0.668 NA
#> SRR1312501 3 0.4010 0.6865 0.064 0.000 0.836 NA
#> SRR1093148 3 0.5705 0.6620 0.108 0.000 0.712 NA
#> SRR1467080 2 0.7371 0.0716 0.000 0.424 0.416 NA
#> SRR1410866 2 0.0376 0.8433 0.000 0.992 0.004 NA
#> SRR816475 1 0.7064 0.5852 0.572 0.000 0.208 NA
#> SRR1379198 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR613342 3 0.5869 0.6148 0.008 0.112 0.720 NA
#> SRR1452246 2 0.2053 0.8139 0.000 0.924 0.004 NA
#> SRR1338836 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1369129 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1396616 3 0.4957 0.6828 0.004 0.060 0.772 NA
#> SRR813824 3 0.2983 0.6934 0.040 0.000 0.892 NA
#> SRR1082376 1 0.3970 0.8194 0.840 0.000 0.084 NA
#> SRR1500891 1 0.7752 0.0989 0.404 0.000 0.360 NA
#> SRR807543 1 0.5188 0.7716 0.756 0.000 0.148 NA
#> SRR1091572 3 0.7371 0.5749 0.116 0.016 0.524 NA
#> SRR1346689 3 0.7816 0.3549 0.248 0.004 0.460 NA
#> SRR1332424 1 0.5012 0.7884 0.772 0.000 0.112 NA
#> SRR663729 1 0.0469 0.8347 0.988 0.000 0.000 NA
#> SRR1097013 1 0.4163 0.8149 0.828 0.000 0.096 NA
#> SRR613675 3 0.6980 0.5769 0.132 0.000 0.536 NA
#> SRR1485357 1 0.7547 0.4498 0.488 0.000 0.236 NA
#> SRR655816 1 0.5339 0.7073 0.744 0.000 0.100 NA
#> SRR1500113 1 0.4784 0.7957 0.788 0.000 0.100 NA
#> SRR1437622 3 0.7664 0.5789 0.040 0.140 0.580 NA
#> SRR1355172 1 0.0376 0.8373 0.992 0.000 0.004 NA
#> SRR655531 1 0.1854 0.8220 0.940 0.000 0.012 NA
#> SRR1338147 3 0.3562 0.6966 0.020 0.032 0.876 NA
#> SRR1413329 3 0.7315 0.3648 0.300 0.000 0.516 NA
#> SRR1485931 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1420873 1 0.0817 0.8387 0.976 0.000 0.000 NA
#> SRR1333308 1 0.7846 0.2677 0.404 0.000 0.296 NA
#> SRR1452033 1 0.3679 0.8275 0.856 0.000 0.060 NA
#> SRR1467316 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR809018 3 0.3082 0.6799 0.000 0.032 0.884 NA
#> SRR1375351 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR663440 1 0.5551 0.7132 0.728 0.000 0.112 NA
#> SRR1471755 2 0.7577 0.1700 0.000 0.428 0.376 NA
#> SRR808019 1 0.0188 0.8362 0.996 0.000 0.004 NA
#> SRR1479133 3 0.6162 0.6104 0.168 0.000 0.676 NA
#> SRR615069 3 0.5869 0.6148 0.008 0.112 0.720 NA
#> SRR1456185 2 0.4919 0.7334 0.000 0.772 0.152 NA
#> SRR1350069 1 0.7899 0.1200 0.364 0.000 0.340 NA
#> SRR816316 1 0.1929 0.8415 0.940 0.000 0.036 NA
#> SRR664795 1 0.0469 0.8331 0.988 0.000 0.000 NA
#> SRR1490721 1 0.6240 0.6951 0.668 0.000 0.156 NA
#> SRR810643 1 0.2759 0.8365 0.904 0.000 0.044 NA
#> SRR1430333 1 0.6608 0.6274 0.628 0.000 0.168 NA
#> SRR1085285 3 0.3435 0.6931 0.036 0.000 0.864 NA
#> SRR1099072 3 0.5891 0.6249 0.168 0.000 0.700 NA
#> SRR1317985 1 0.1042 0.8404 0.972 0.000 0.020 NA
#> SRR1487340 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1420276 2 0.4231 0.7775 0.000 0.824 0.096 NA
#> SRR1351347 3 0.5517 0.6626 0.092 0.000 0.724 NA
#> SRR1405525 1 0.5972 0.7295 0.692 0.000 0.176 NA
#> SRR1370329 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1465001 1 0.0000 0.8348 1.000 0.000 0.000 NA
#> SRR1476525 2 0.1584 0.8342 0.000 0.952 0.036 NA
#> SRR819610 3 0.7366 0.5411 0.016 0.156 0.576 NA
#> SRR2157314 1 0.4804 0.7315 0.776 0.000 0.064 NA
#> SRR1409465 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR809987 1 0.7845 0.2700 0.404 0.000 0.292 NA
#> SRR613639 1 0.6773 0.5595 0.584 0.000 0.284 NA
#> SRR1402285 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1077038 1 0.1059 0.8395 0.972 0.000 0.012 NA
#> SRR1405660 3 0.2631 0.6933 0.016 0.008 0.912 NA
#> SRR1095455 3 0.6392 0.5717 0.004 0.108 0.648 NA
#> SRR1394734 3 0.7344 0.2713 0.000 0.300 0.512 NA
#> SRR1317771 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1365894 3 0.7476 0.3612 0.176 0.000 0.416 NA
#> SRR1073581 1 0.1174 0.8406 0.968 0.000 0.012 NA
#> SRR659804 1 0.3935 0.8200 0.840 0.000 0.060 NA
#> SRR1345914 2 0.6016 0.6399 0.000 0.680 0.208 NA
#> SRR1432186 2 0.4094 0.7757 0.000 0.828 0.116 NA
#> SRR1473529 3 0.7626 0.2042 0.000 0.304 0.464 NA
#> SRR660764 3 0.7500 -0.0618 0.000 0.404 0.416 NA
#> SRR820448 1 0.1929 0.8415 0.940 0.000 0.036 NA
#> SRR1328845 3 0.7417 0.4347 0.208 0.000 0.508 NA
#> SRR1336415 1 0.4568 0.7881 0.800 0.000 0.076 NA
#> SRR1379065 1 0.0657 0.8356 0.984 0.000 0.004 NA
#> SRR1459190 3 0.4363 0.6949 0.052 0.004 0.816 NA
#> SRR1346773 1 0.4724 0.7975 0.792 0.000 0.096 NA
#> SRR1499521 1 0.0188 0.8357 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1440898 2 0.1059 0.8402 0.000 0.972 0.016 NA
#> SRR1347459 3 0.6285 0.5482 0.000 0.168 0.664 NA
#> SRR1081209 2 0.0895 0.8405 0.000 0.976 0.020 NA
#> SRR1400202 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1333395 1 0.7692 0.3558 0.456 0.000 0.276 NA
#> SRR1309248 3 0.7276 0.4072 0.000 0.224 0.540 NA
#> SRR809161 1 0.6885 0.4927 0.596 0.000 0.208 NA
#> SRR1316320 3 0.7057 0.6173 0.076 0.028 0.576 NA
#> SRR1432629 2 0.6966 0.4098 0.000 0.540 0.328 NA
#> SRR1498931 1 0.1297 0.8401 0.964 0.000 0.016 NA
#> SRR1416578 1 0.0804 0.8377 0.980 0.000 0.008 NA
#> SRR1405547 3 0.3107 0.6832 0.000 0.036 0.884 NA
#> SRR1470534 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1380764 1 0.2494 0.8384 0.916 0.000 0.036 NA
#> SRR1309160 3 0.2553 0.6934 0.016 0.008 0.916 NA
#> SRR663489 3 0.3793 0.6712 0.000 0.044 0.844 NA
#> SRR1500450 1 0.0336 0.8352 0.992 0.000 0.000 NA
#> SRR1078489 3 0.7394 0.5699 0.116 0.016 0.516 NA
#> SRR1332648 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR660614 2 0.6134 0.5779 0.000 0.660 0.236 NA
#> SRR1470420 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1475566 1 0.0188 0.8357 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1477949 1 0.1610 0.8415 0.952 0.000 0.016 NA
#> SRR1481419 2 0.3674 0.7904 0.000 0.852 0.104 NA
#> SRR1464766 1 0.3176 0.8327 0.880 0.000 0.036 NA
#> SRR615946 3 0.6542 0.5417 0.000 0.168 0.636 NA
#> SRR1446481 2 0.3071 0.8115 0.000 0.888 0.068 NA
#> SRR1467656 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1402962 1 0.2036 0.8407 0.936 0.000 0.032 NA
#> SRR660224 3 0.7494 0.3293 0.000 0.236 0.500 NA
#> SRR665586 1 0.0336 0.8334 0.992 0.000 0.000 NA
#> SRR1347166 1 0.5815 0.7426 0.708 0.000 0.152 NA
#> SRR1485722 1 0.7189 0.4889 0.532 0.000 0.300 NA
#> SRR1415316 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR613390 1 0.3970 0.8189 0.840 0.000 0.084 NA
#> SRR661108 3 0.2489 0.6937 0.020 0.000 0.912 NA
#> SRR2170173 1 0.4944 0.7247 0.768 0.000 0.072 NA
#> SRR817329 1 0.1724 0.8410 0.948 0.000 0.032 NA
#> SRR1401990 1 0.6722 0.6211 0.616 0.000 0.184 NA
#> SRR1467745 2 0.7582 0.2465 0.000 0.456 0.336 NA
#> SRR1471795 2 0.4756 0.7448 0.000 0.784 0.144 NA
#> SRR1415637 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR813137 1 0.1510 0.8400 0.956 0.000 0.028 NA
#> SRR1314873 1 0.0657 0.8378 0.984 0.000 0.012 NA
#> SRR1401211 1 0.0188 0.8357 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1419692 2 0.6323 0.5904 0.000 0.640 0.112 NA
#> SRR818797 1 0.4920 0.7846 0.776 0.000 0.136 NA
#> SRR2164608 1 0.4944 0.7247 0.768 0.000 0.072 NA
#> SRR1455586 2 0.3453 0.8019 0.000 0.868 0.080 NA
#> SRR819459 3 0.5944 0.5820 0.000 0.140 0.696 NA
#> SRR1488939 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1433232 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1385501 1 0.5266 0.7731 0.752 0.000 0.140 NA
#> SRR1361652 3 0.7621 0.2215 0.000 0.296 0.468 NA
#> SRR1437119 1 0.3013 0.8328 0.888 0.000 0.032 NA
#> SRR1478547 3 0.3013 0.6807 0.000 0.032 0.888 NA
#> SRR1430910 3 0.7247 0.4211 0.000 0.240 0.544 NA
#> SRR1310584 1 0.0336 0.8349 0.992 0.000 0.000 NA
#> SRR1500216 1 0.7786 0.3348 0.424 0.000 0.268 NA
#> SRR1486762 2 0.5790 0.6641 0.000 0.684 0.080 NA
#> SRR1480854 1 0.0779 0.8354 0.980 0.000 0.004 NA
#> SRR1489394 1 0.2060 0.8345 0.932 0.000 0.016 NA
#> SRR1418085 1 0.0336 0.8348 0.992 0.000 0.000 NA
#> SRR1340221 1 0.1724 0.8413 0.948 0.000 0.020 NA
#> SRR1473058 3 0.6975 0.5922 0.100 0.012 0.572 NA
#> SRR1405165 3 0.3328 0.6958 0.024 0.004 0.872 NA
#> SRR1433004 1 0.4364 0.8090 0.816 0.000 0.092 NA
#> SRR1471477 1 0.4718 0.7987 0.792 0.000 0.092 NA
#> SRR1098567 2 0.6585 0.4585 0.000 0.584 0.312 NA
#> SRR1098712 3 0.7332 0.5823 0.028 0.148 0.608 NA
#> SRR1455038 1 0.4036 0.8175 0.836 0.000 0.088 NA
#> SRR1375248 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1403005 3 0.6854 0.5808 0.172 0.000 0.596 NA
#> SRR1348378 2 0.7384 0.2742 0.000 0.476 0.352 NA
#> SRR1413541 1 0.3247 0.8330 0.880 0.000 0.060 NA
#> SRR1392943 1 0.0524 0.8361 0.988 0.000 0.004 NA
#> SRR1475192 2 0.6111 0.6140 0.000 0.652 0.092 NA
#> SRR1432085 2 0.6585 0.4678 0.000 0.584 0.312 NA
#> SRR1452468 1 0.5657 0.7504 0.720 0.000 0.160 NA
#> SRR1347060 3 0.6245 0.5546 0.000 0.164 0.668 NA
#> SRR1414139 3 0.7352 0.2099 0.000 0.328 0.496 NA
#> SRR1447962 2 0.7148 0.2817 0.000 0.496 0.364 NA
#> SRR1444324 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1415004 1 0.2830 0.8370 0.900 0.000 0.040 NA
#> SRR1413436 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1311266 1 0.4605 0.8068 0.800 0.000 0.092 NA
#> SRR1343302 1 0.4444 0.7917 0.808 0.000 0.072 NA
#> SRR1373746 1 0.3013 0.8328 0.888 0.000 0.032 NA
#> SRR1429678 1 0.0524 0.8350 0.988 0.000 0.004 NA
#> SRR1469413 2 0.7148 0.2817 0.000 0.496 0.364 NA
#> SRR1405331 3 0.3697 0.6962 0.048 0.000 0.852 NA
#> SRR1345609 1 0.0188 0.8338 0.996 0.000 0.000 NA
#> SRR1380208 3 0.7319 0.5032 0.216 0.004 0.556 NA
#> SRR1322840 1 0.2142 0.8340 0.928 0.000 0.016 NA
#> SRR1399797 3 0.4353 0.6746 0.004 0.060 0.820 NA
#> SRR1416654 3 0.2076 0.6946 0.008 0.004 0.932 NA
#> SRR1315081 2 0.4710 0.7531 0.000 0.792 0.120 NA
#> SRR1369196 3 0.6578 0.4736 0.000 0.244 0.620 NA
#> SRR1400847 1 0.1109 0.8388 0.968 0.000 0.004 NA
#> SRR1365291 1 0.5710 0.7280 0.708 0.000 0.192 NA
#> SRR1367920 1 0.8143 0.2062 0.388 0.008 0.312 NA
#> SRR1366648 3 0.3144 0.6759 0.000 0.044 0.884 NA
#> SRR1441679 2 0.0000 0.8439 0.000 1.000 0.000 NA
#> SRR1082173 3 0.3570 0.6904 0.048 0.000 0.860 NA
#> SRR1363968 1 0.0672 0.8390 0.984 0.000 0.008 NA
#> SRR814387 1 0.0000 0.8348 1.000 0.000 0.000 NA
#> SRR657599 1 0.0188 0.8362 0.996 0.000 0.004 NA
#> SRR1386689 1 0.4568 0.7881 0.800 0.000 0.076 NA
#> SRR1395575 3 0.4906 0.6758 0.084 0.000 0.776 NA
#> SRR1453811 3 0.6894 0.1592 0.376 0.000 0.512 NA
#> SRR1441159 1 0.4727 0.7994 0.792 0.000 0.108 NA
#> SRR1403154 1 0.1888 0.8403 0.940 0.000 0.016 NA
#> SRR1468722 3 0.5816 0.6364 0.144 0.000 0.708 NA
#> SRR1310275 3 0.3732 0.6886 0.056 0.000 0.852 NA
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 1 0.0771 0.80346 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1331708 4 0.6902 0.23858 0.068 0.004 0.396 0.464 0.068
#> SRR1464258 1 0.4583 0.68054 0.740 0.000 0.064 0.192 0.004
#> SRR1454201 3 0.6910 0.32183 0.124 0.008 0.604 0.188 0.076
#> SRR661589 3 0.6007 0.24593 0.132 0.000 0.640 0.204 0.024
#> SRR1456229 1 0.4078 0.71983 0.776 0.000 0.040 0.180 0.004
#> SRR1315165 4 0.6351 0.60011 0.344 0.000 0.152 0.500 0.004
#> SRR1488960 1 0.1356 0.80667 0.956 0.000 0.012 0.028 0.004
#> SRR1417809 1 0.1697 0.80055 0.932 0.000 0.008 0.060 0.000
#> SRR1094457 1 0.0290 0.80081 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1095575 3 0.5128 0.55220 0.024 0.008 0.736 0.172 0.060
#> SRR1315931 1 0.0451 0.80177 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1430066 3 0.2819 0.60999 0.000 0.008 0.884 0.032 0.076
#> SRR1431037 3 0.3804 0.60810 0.004 0.012 0.832 0.100 0.052
#> SRR1395554 3 0.5359 0.50093 0.000 0.060 0.700 0.036 0.204
#> SRR818002 2 0.5377 0.44991 0.000 0.716 0.124 0.028 0.132
#> SRR1344143 3 0.6837 0.15943 0.000 0.148 0.444 0.024 0.384
#> SRR1486845 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362866 1 0.5527 0.53594 0.656 0.000 0.104 0.232 0.008
#> SRR1490740 1 0.1386 0.80669 0.952 0.000 0.016 0.032 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0579 0.74616 0.000 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1416248 1 0.0566 0.80218 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1383907 1 0.5998 -0.22673 0.464 0.000 0.112 0.424 0.000
#> SRR1311018 1 0.3308 0.76239 0.832 0.000 0.020 0.144 0.004
#> SRR1375699 2 0.5598 0.37547 0.000 0.688 0.120 0.024 0.168
#> SRR1429846 1 0.4973 0.65387 0.724 0.000 0.080 0.184 0.012
#> SRR613550 1 0.7269 -0.12855 0.472 0.000 0.264 0.224 0.040
#> SRR1348402 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 3 0.4757 0.58590 0.008 0.016 0.764 0.152 0.060
#> SRR1324025 3 0.4086 0.59780 0.008 0.008 0.812 0.116 0.056
#> SRR1318879 3 0.5189 0.54912 0.024 0.008 0.732 0.172 0.064
#> SRR820755 1 0.3935 0.75320 0.808 0.000 0.036 0.140 0.016
#> SRR1485830 4 0.6310 0.69736 0.272 0.000 0.164 0.556 0.008
#> SRR599313 4 0.6461 0.64025 0.300 0.000 0.156 0.532 0.012
#> SRR612263 1 0.2032 0.80296 0.924 0.000 0.020 0.052 0.004
#> SRR1415398 1 0.7691 -0.30383 0.416 0.000 0.316 0.196 0.072
#> SRR1326205 4 0.7410 0.50463 0.172 0.000 0.336 0.436 0.056
#> SRR1421327 1 0.0510 0.79838 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1083311 3 0.2751 0.61259 0.004 0.000 0.888 0.052 0.056
#> SRR1499303 4 0.6817 0.65373 0.248 0.000 0.280 0.464 0.008
#> SRR1079522 4 0.6687 0.64596 0.316 0.000 0.156 0.508 0.020
#> SRR1452935 3 0.3752 0.61645 0.000 0.008 0.828 0.092 0.072
#> SRR1379495 1 0.0324 0.80039 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1470459 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.3631 0.55954 0.012 0.000 0.820 0.144 0.024
#> SRR615778 1 0.5654 0.47027 0.620 0.000 0.080 0.288 0.012
#> SRR1447564 1 0.1442 0.80693 0.952 0.000 0.012 0.032 0.004
#> SRR1455195 1 0.0771 0.80456 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR655182 3 0.6494 0.52006 0.028 0.012 0.620 0.136 0.204
#> SRR1335140 3 0.6847 0.43877 0.004 0.020 0.528 0.188 0.260
#> SRR1433555 3 0.2171 0.61092 0.000 0.000 0.912 0.064 0.024
#> SRR1308650 2 0.7827 -0.45301 0.000 0.364 0.284 0.064 0.288
#> SRR1388354 1 0.1525 0.80607 0.948 0.000 0.012 0.036 0.004
#> SRR1317446 3 0.6887 -0.07442 0.000 0.308 0.404 0.004 0.284
#> SRR1413602 3 0.2819 0.60737 0.000 0.008 0.884 0.032 0.076
#> SRR1479955 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.6403 0.19884 0.540 0.000 0.172 0.280 0.008
#> SRR661313 3 0.3804 0.60609 0.004 0.012 0.832 0.100 0.052
#> SRR1499935 4 0.6484 0.66601 0.312 0.000 0.184 0.500 0.004
#> SRR1447303 3 0.2139 0.61464 0.000 0.000 0.916 0.052 0.032
#> SRR1429408 4 0.6411 0.22390 0.056 0.008 0.396 0.504 0.036
#> SRR1433950 1 0.3195 0.77978 0.856 0.000 0.040 0.100 0.004
#> SRR1362081 2 0.0162 0.74988 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1409854 1 0.5605 0.54282 0.656 0.000 0.104 0.228 0.012
#> SRR1435229 3 0.6189 0.45240 0.000 0.024 0.580 0.100 0.296
#> SRR1085996 1 0.4003 0.72447 0.780 0.000 0.036 0.180 0.004
#> SRR1414229 5 0.7550 0.70866 0.000 0.300 0.128 0.104 0.468
#> SRR1400974 3 0.2734 0.60276 0.000 0.008 0.888 0.028 0.076
#> SRR1399971 1 0.5802 0.38030 0.588 0.000 0.092 0.312 0.008
#> SRR613927 1 0.4723 0.69694 0.776 0.000 0.072 0.112 0.040
#> SRR1457854 1 0.2520 0.79410 0.888 0.000 0.012 0.096 0.004
#> SRR1473714 4 0.6461 0.64025 0.300 0.000 0.156 0.532 0.012
#> SRR813776 1 0.3935 0.75320 0.808 0.000 0.036 0.140 0.016
#> SRR808196 1 0.5678 -0.05122 0.524 0.000 0.084 0.392 0.000
#> SRR1101085 1 0.5966 -0.23996 0.460 0.000 0.108 0.432 0.000
#> SRR614395 1 0.1211 0.80618 0.960 0.000 0.016 0.024 0.000
#> SRR1478251 1 0.0162 0.79968 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1370551 2 0.0162 0.74988 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1362310 1 0.1934 0.80395 0.928 0.000 0.016 0.052 0.004
#> SRR665310 1 0.7689 -0.35327 0.396 0.000 0.344 0.188 0.072
#> SRR1420109 3 0.4975 0.59578 0.000 0.012 0.736 0.124 0.128
#> SRR1330920 1 0.5900 0.47336 0.628 0.000 0.132 0.228 0.012
#> SRR1419539 3 0.7006 0.36842 0.000 0.060 0.556 0.176 0.208
#> SRR1359447 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347259 4 0.6280 0.69587 0.272 0.000 0.160 0.560 0.008
#> SRR613915 1 0.2564 0.78178 0.904 0.000 0.020 0.052 0.024
#> SRR1384395 2 0.2798 0.67456 0.000 0.888 0.044 0.008 0.060
#> SRR821715 1 0.4890 0.68650 0.764 0.000 0.072 0.120 0.044
#> SRR1478228 1 0.2932 0.78134 0.864 0.000 0.020 0.112 0.004
#> SRR1445637 1 0.3946 0.74636 0.804 0.000 0.048 0.140 0.008
#> SRR608150 4 0.6740 0.47073 0.384 0.000 0.188 0.420 0.008
#> SRR1096383 1 0.0609 0.80316 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1341480 1 0.4924 0.49530 0.668 0.000 0.060 0.272 0.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.5933 0.27782 0.136 0.000 0.644 0.200 0.020
#> SRR1498838 3 0.2550 0.59573 0.004 0.000 0.892 0.084 0.020
#> SRR1416313 3 0.4305 0.60789 0.004 0.024 0.808 0.092 0.072
#> SRR808566 1 0.6156 -0.27530 0.456 0.000 0.132 0.412 0.000
#> SRR1430270 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.2569 0.60241 0.000 0.016 0.896 0.012 0.076
#> SRR613533 3 0.4552 0.59359 0.000 0.032 0.780 0.056 0.132
#> SRR661267 1 0.0609 0.80316 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR810665 2 0.1074 0.73781 0.000 0.968 0.016 0.004 0.012
#> SRR1407250 1 0.6793 -0.21519 0.448 0.000 0.212 0.332 0.008
#> SRR1420067 1 0.2754 0.79229 0.884 0.000 0.032 0.080 0.004
#> SRR1473632 3 0.7136 0.27511 0.000 0.068 0.488 0.116 0.328
#> SRR812536 1 0.5398 0.56734 0.724 0.000 0.048 0.140 0.088
#> SRR1370850 2 0.5761 0.26061 0.000 0.620 0.184 0.000 0.196
#> SRR1486195 2 0.0740 0.74480 0.000 0.980 0.008 0.004 0.008
#> SRR1407671 3 0.6654 0.20002 0.024 0.004 0.484 0.380 0.108
#> SRR1446375 3 0.6052 0.50359 0.000 0.028 0.620 0.100 0.252
#> SRR1465230 1 0.2777 0.76584 0.864 0.000 0.016 0.120 0.000
#> SRR614119 1 0.4649 0.66773 0.732 0.000 0.064 0.200 0.004
#> SRR1356101 2 0.0854 0.74309 0.000 0.976 0.012 0.008 0.004
#> SRR1404209 1 0.1251 0.80720 0.956 0.000 0.008 0.036 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0324 0.79795 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR660510 3 0.2885 0.61386 0.004 0.000 0.880 0.064 0.052
#> SRR1445655 1 0.1892 0.78306 0.916 0.000 0.004 0.080 0.000
#> SRR658953 1 0.5025 0.60504 0.744 0.000 0.032 0.148 0.076
#> SRR2166459 1 0.4689 0.62375 0.772 0.000 0.028 0.124 0.076
#> SRR1070713 3 0.8085 -0.08280 0.000 0.176 0.416 0.144 0.264
#> SRR1485312 3 0.5059 0.45880 0.060 0.000 0.720 0.196 0.024
#> SRR1317631 1 0.3732 0.69212 0.792 0.000 0.032 0.176 0.000
#> SRR1488610 1 0.4522 0.69271 0.744 0.000 0.060 0.192 0.004
#> SRR1330588 3 0.4255 0.51318 0.032 0.000 0.772 0.180 0.016
#> SRR1316367 3 0.6931 0.48881 0.048 0.008 0.580 0.152 0.212
#> SRR1433926 1 0.5802 0.38030 0.588 0.000 0.092 0.312 0.008
#> SRR1091302 1 0.4907 0.43978 0.656 0.000 0.052 0.292 0.000
#> SRR818263 1 0.3794 0.73876 0.800 0.000 0.048 0.152 0.000
#> SRR1404909 4 0.6291 0.69224 0.280 0.000 0.172 0.544 0.004
#> SRR663076 1 0.1202 0.80481 0.960 0.000 0.004 0.032 0.004
#> SRR1323577 2 0.5584 0.42493 0.000 0.696 0.132 0.028 0.144
#> SRR1442422 1 0.0162 0.79968 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1465893 1 0.3059 0.78037 0.860 0.000 0.028 0.108 0.004
#> SRR654862 1 0.5569 0.55700 0.664 0.000 0.108 0.216 0.012
#> SRR1407112 1 0.4441 0.58297 0.720 0.000 0.044 0.236 0.000
#> SRR1332969 3 0.6233 0.06331 0.180 0.000 0.592 0.216 0.012
#> SRR1353199 3 0.5353 0.53171 0.004 0.000 0.684 0.156 0.156
#> SRR1378885 1 0.4252 0.72717 0.784 0.000 0.064 0.144 0.008
#> SRR665357 2 0.5871 0.18151 0.000 0.604 0.212 0.000 0.184
#> SRR662186 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.6007 0.26058 0.136 0.000 0.648 0.188 0.028
#> SRR1347819 3 0.3552 0.60583 0.000 0.016 0.844 0.044 0.096
#> SRR1480813 2 0.0451 0.74856 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1472576 3 0.7616 0.23251 0.020 0.076 0.452 0.096 0.356
#> SRR1431781 4 0.6114 0.50845 0.376 0.000 0.132 0.492 0.000
#> SRR1452270 3 0.7730 -0.28385 0.304 0.000 0.420 0.200 0.076
#> SRR1500472 3 0.5885 0.47025 0.000 0.040 0.624 0.060 0.276
#> SRR1417632 3 0.6763 0.23793 0.000 0.112 0.464 0.036 0.388
#> SRR1350153 2 0.1026 0.73627 0.000 0.968 0.024 0.004 0.004
#> SRR1458113 3 0.4890 0.56806 0.000 0.036 0.748 0.052 0.164
#> SRR1326579 1 0.5138 0.59486 0.684 0.000 0.084 0.228 0.004
#> SRR1349363 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.4044 0.57887 0.000 0.028 0.804 0.028 0.140
#> SRR1090407 3 0.7066 -0.04273 0.196 0.000 0.548 0.196 0.060
#> SRR1083752 3 0.7869 0.13083 0.000 0.160 0.468 0.148 0.224
#> SRR1377599 4 0.7069 0.70270 0.260 0.000 0.180 0.516 0.044
#> SRR1488449 3 0.7730 -0.28385 0.304 0.000 0.420 0.200 0.076
#> SRR1318354 3 0.7079 -0.04393 0.000 0.288 0.400 0.012 0.300
#> SRR1359062 2 0.6303 0.04206 0.000 0.524 0.280 0.000 0.196
#> SRR1398924 3 0.5933 0.35754 0.000 0.048 0.544 0.032 0.376
#> SRR663783 3 0.6422 0.34552 0.000 0.084 0.560 0.044 0.312
#> SRR1319204 3 0.5683 0.48706 0.000 0.072 0.660 0.032 0.236
#> SRR1369070 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.1893 0.80330 0.928 0.000 0.024 0.048 0.000
#> SRR1337449 2 0.3418 0.64826 0.000 0.856 0.056 0.016 0.072
#> SRR1316982 2 0.0451 0.74622 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1498595 3 0.6656 0.16999 0.000 0.132 0.452 0.020 0.396
#> SRR1377423 3 0.5653 0.48744 0.000 0.000 0.632 0.160 0.208
#> SRR1312310 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.3691 0.74239 0.804 0.000 0.028 0.164 0.004
#> SRR1338426 3 0.3685 0.60717 0.000 0.016 0.832 0.040 0.112
#> SRR1353309 3 0.4957 0.35798 0.032 0.000 0.660 0.296 0.012
#> SRR658941 3 0.7006 0.36842 0.000 0.060 0.556 0.176 0.208
#> SRR1101643 1 0.0290 0.80092 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1401468 1 0.4288 0.68330 0.740 0.000 0.032 0.224 0.004
#> SRR1368874 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.6300 0.41287 0.416 0.000 0.132 0.448 0.004
#> SRR1363858 4 0.6461 0.64025 0.300 0.000 0.156 0.532 0.012
#> SRR819820 3 0.3011 0.58923 0.000 0.000 0.844 0.140 0.016
#> SRR1337342 1 0.4039 0.72946 0.784 0.000 0.044 0.168 0.004
#> SRR655206 3 0.5571 0.55810 0.000 0.028 0.688 0.188 0.096
#> SRR1387013 3 0.8028 -0.16572 0.000 0.200 0.400 0.112 0.288
#> SRR1317410 1 0.2932 0.78134 0.864 0.000 0.020 0.112 0.004
#> SRR608198 4 0.6705 0.42464 0.400 0.000 0.180 0.412 0.008
#> SRR1440161 2 0.0162 0.74988 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0162 0.75072 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1415379 1 0.0703 0.80298 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1099622 2 0.7001 -0.19974 0.000 0.420 0.324 0.012 0.244
#> SRR663197 3 0.4491 0.58479 0.000 0.024 0.776 0.052 0.148
#> SRR1394836 3 0.5839 0.05345 0.012 0.008 0.472 0.464 0.044
#> SRR661699 1 0.7202 0.03243 0.512 0.000 0.116 0.288 0.084
#> SRR813680 1 0.2351 0.79625 0.896 0.000 0.016 0.088 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.7485 -0.32601 0.416 0.000 0.212 0.324 0.048
#> SRR1311486 2 0.3849 0.62439 0.000 0.832 0.060 0.024 0.084
#> SRR1382851 4 0.5836 -0.01179 0.012 0.008 0.452 0.484 0.044
#> SRR1433410 1 0.4933 0.60987 0.688 0.000 0.060 0.248 0.004
#> SRR661167 3 0.7588 0.19395 0.152 0.000 0.504 0.224 0.120
#> SRR1432518 3 0.2104 0.61134 0.000 0.000 0.916 0.060 0.024
#> SRR660462 3 0.5875 0.43576 0.000 0.004 0.616 0.156 0.224
#> SRR1374608 1 0.3061 0.74253 0.844 0.000 0.020 0.136 0.000
#> SRR657949 1 0.2581 0.78088 0.904 0.000 0.020 0.048 0.028
#> SRR1308882 1 0.1638 0.78706 0.932 0.000 0.004 0.064 0.000
#> SRR655768 1 0.5585 0.50871 0.644 0.000 0.120 0.232 0.004
#> SRR1485870 4 0.6182 0.70694 0.240 0.000 0.168 0.584 0.008
#> SRR1444138 3 0.6264 0.43052 0.000 0.024 0.568 0.104 0.304
#> SRR1417342 1 0.0880 0.80328 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1470193 4 0.7410 0.50556 0.172 0.000 0.336 0.436 0.056
#> SRR1091380 3 0.3011 0.58923 0.000 0.000 0.844 0.140 0.016
#> SRR1099096 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.2463 0.79601 0.888 0.000 0.008 0.100 0.004
#> SRR1467102 2 0.6671 -0.01868 0.000 0.492 0.292 0.008 0.208
#> SRR1485416 1 0.4771 0.58952 0.712 0.000 0.060 0.224 0.004
#> SRR818821 3 0.4552 0.59359 0.000 0.032 0.780 0.056 0.132
#> SRR809963 1 0.1211 0.80618 0.960 0.000 0.016 0.024 0.000
#> SRR1072247 1 0.0324 0.80039 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1353710 1 0.5416 0.36482 0.632 0.000 0.080 0.284 0.004
#> SRR1445259 3 0.5826 0.46679 0.000 0.040 0.628 0.056 0.276
#> SRR1408393 1 0.3348 0.73626 0.860 0.000 0.020 0.080 0.040
#> SRR1361522 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0290 0.80092 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1309680 2 0.6127 0.22097 0.000 0.608 0.180 0.012 0.200
#> SRR1310542 3 0.5825 0.42276 0.000 0.076 0.632 0.028 0.264
#> SRR1333485 1 0.2286 0.77666 0.888 0.000 0.004 0.108 0.000
#> SRR1406437 3 0.5959 -0.00479 0.044 0.000 0.492 0.432 0.032
#> SRR1354931 3 0.5742 0.54768 0.000 0.028 0.680 0.148 0.144
#> SRR1391856 4 0.5458 0.46614 0.064 0.000 0.292 0.632 0.012
#> SRR1446738 3 0.8292 0.10902 0.012 0.096 0.400 0.244 0.248
#> SRR1309032 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 3 0.7232 0.00314 0.000 0.204 0.456 0.036 0.304
#> SRR1432611 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 2 0.6303 0.04206 0.000 0.524 0.280 0.000 0.196
#> SRR613150 3 0.4181 0.57123 0.016 0.000 0.796 0.136 0.052
#> SRR1375329 3 0.4777 0.58950 0.016 0.016 0.772 0.140 0.056
#> SRR1387921 1 0.1116 0.80451 0.964 0.000 0.004 0.028 0.004
#> SRR1466792 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.2289 0.79951 0.904 0.000 0.012 0.080 0.004
#> SRR812943 3 0.6273 0.48686 0.000 0.020 0.592 0.140 0.248
#> SRR1400910 3 0.5870 0.39279 0.000 0.048 0.568 0.032 0.352
#> SRR1444203 1 0.1628 0.80226 0.936 0.000 0.008 0.056 0.000
#> SRR816177 3 0.7190 0.06726 0.000 0.164 0.460 0.044 0.332
#> SRR658754 3 0.6032 0.41383 0.000 0.084 0.624 0.036 0.256
#> SRR1429603 4 0.6271 0.70370 0.240 0.000 0.180 0.572 0.008
#> SRR1397366 3 0.5822 0.25988 0.128 0.000 0.648 0.208 0.016
#> SRR1446028 1 0.3994 0.71175 0.772 0.000 0.040 0.188 0.000
#> SRR1083918 3 0.7150 0.02846 0.000 0.176 0.452 0.036 0.336
#> SRR1337606 4 0.4749 0.46706 0.040 0.000 0.252 0.700 0.008
#> SRR659109 3 0.4044 0.57887 0.000 0.028 0.804 0.028 0.140
#> SRR1337192 1 0.0566 0.80351 0.984 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR656946 3 0.6084 0.48864 0.000 0.024 0.612 0.108 0.256
#> SRR1476102 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0771 0.80572 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1342067 1 0.1831 0.78537 0.920 0.000 0.004 0.076 0.000
#> SRR1385389 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.3219 0.77015 0.840 0.000 0.020 0.136 0.004
#> SRR614419 1 0.1799 0.78046 0.940 0.000 0.012 0.028 0.020
#> SRR1322936 4 0.6446 0.10315 0.040 0.000 0.416 0.472 0.072
#> SRR1349121 1 0.0451 0.80182 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1430549 1 0.3308 0.76239 0.832 0.000 0.020 0.144 0.004
#> SRR612935 3 0.7118 0.20558 0.000 0.144 0.472 0.048 0.336
#> SRR661481 2 0.0579 0.74646 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1354117 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.6113 0.46516 0.108 0.000 0.356 0.528 0.008
#> SRR1452164 1 0.1549 0.80633 0.944 0.000 0.016 0.040 0.000
#> SRR1070503 1 0.5389 0.59244 0.684 0.000 0.100 0.204 0.012
#> SRR1499894 3 0.5274 0.52131 0.000 0.056 0.712 0.040 0.192
#> SRR1082883 4 0.6447 0.51740 0.364 0.000 0.160 0.472 0.004
#> SRR1468271 1 0.4681 0.66108 0.728 0.000 0.064 0.204 0.004
#> SRR1332443 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.6809 0.09844 0.000 0.240 0.464 0.008 0.288
#> SRR1396294 4 0.6559 0.38340 0.128 0.000 0.420 0.436 0.016
#> SRR1419917 1 0.3921 0.73262 0.784 0.000 0.044 0.172 0.000
#> SRR662114 3 0.3573 0.54311 0.016 0.000 0.816 0.156 0.012
#> SRR1489199 1 0.4524 0.68512 0.736 0.000 0.052 0.208 0.004
#> SRR813584 3 0.7190 0.06726 0.000 0.164 0.460 0.044 0.332
#> SRR1069638 5 0.7930 0.55870 0.000 0.200 0.252 0.112 0.436
#> SRR614864 3 0.6964 -0.46520 0.272 0.000 0.412 0.308 0.008
#> SRR1433392 1 0.3835 0.73624 0.796 0.000 0.048 0.156 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.4943 0.60440 0.752 0.000 0.032 0.140 0.076
#> SRR1401252 1 0.1831 0.78261 0.920 0.000 0.004 0.076 0.000
#> SRR1309963 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.3771 0.74245 0.804 0.000 0.036 0.156 0.004
#> SRR1418628 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.5147 0.45410 0.664 0.000 0.068 0.264 0.004
#> SRR1380393 1 0.1285 0.80531 0.956 0.000 0.004 0.036 0.004
#> SRR1319731 1 0.0324 0.80039 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1356468 4 0.6354 0.64508 0.316 0.000 0.148 0.528 0.008
#> SRR1337010 2 0.2522 0.62800 0.000 0.880 0.000 0.012 0.108
#> SRR1486520 1 0.1365 0.80613 0.952 0.000 0.004 0.040 0.004
#> SRR1486538 1 0.6426 -0.03085 0.516 0.000 0.096 0.360 0.028
#> SRR1340486 1 0.0963 0.80500 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1377696 3 0.6850 0.11296 0.000 0.148 0.416 0.024 0.412
#> SRR1465459 1 0.5510 0.54502 0.664 0.000 0.112 0.216 0.008
#> SRR1080270 3 0.5825 0.42276 0.000 0.076 0.632 0.028 0.264
#> SRR1312501 3 0.4100 0.52263 0.028 0.000 0.784 0.172 0.016
#> SRR1093148 3 0.5428 0.36541 0.060 0.000 0.668 0.248 0.024
#> SRR1467080 3 0.6918 -0.12313 0.000 0.332 0.380 0.004 0.284
#> SRR1410866 2 0.0451 0.74856 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR816475 1 0.6064 -0.25137 0.460 0.000 0.120 0.420 0.000
#> SRR1379198 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613342 3 0.5364 0.51361 0.004 0.048 0.696 0.032 0.220
#> SRR1452246 2 0.3594 0.51002 0.000 0.804 0.004 0.020 0.172
#> SRR1338836 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.5397 0.57417 0.000 0.028 0.712 0.152 0.108
#> SRR813824 3 0.3543 0.56456 0.012 0.000 0.828 0.136 0.024
#> SRR1082376 1 0.4003 0.72447 0.780 0.000 0.036 0.180 0.004
#> SRR1500891 4 0.7763 0.61998 0.300 0.000 0.264 0.376 0.060
#> SRR807543 1 0.5241 0.61530 0.696 0.000 0.088 0.204 0.012
#> SRR1091572 4 0.6312 0.02858 0.020 0.000 0.408 0.480 0.092
#> SRR1346689 4 0.7410 0.50463 0.172 0.000 0.336 0.436 0.056
#> SRR1332424 1 0.4729 0.64172 0.708 0.000 0.052 0.236 0.004
#> SRR663729 1 0.0290 0.79877 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1097013 1 0.4186 0.71438 0.768 0.000 0.044 0.184 0.004
#> SRR613675 4 0.6446 0.10315 0.040 0.000 0.416 0.472 0.072
#> SRR1485357 4 0.6140 0.51316 0.388 0.000 0.116 0.492 0.004
#> SRR655816 1 0.5398 0.56734 0.724 0.000 0.048 0.140 0.088
#> SRR1500113 1 0.4681 0.66126 0.728 0.000 0.064 0.204 0.004
#> SRR1437622 3 0.7681 0.36298 0.024 0.064 0.504 0.136 0.272
#> SRR1355172 1 0.0703 0.80409 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR655531 1 0.1799 0.78046 0.940 0.000 0.012 0.028 0.020
#> SRR1338147 3 0.3907 0.60404 0.004 0.012 0.824 0.108 0.052
#> SRR1413329 3 0.7159 -0.32341 0.244 0.000 0.464 0.264 0.028
#> SRR1485931 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0963 0.80606 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1333308 4 0.6262 0.69285 0.280 0.000 0.168 0.548 0.004
#> SRR1452033 1 0.3730 0.75046 0.808 0.000 0.036 0.152 0.004
#> SRR1467316 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.2673 0.60306 0.000 0.008 0.892 0.028 0.072
#> SRR1375351 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 1 0.5588 0.56226 0.704 0.000 0.052 0.164 0.080
#> SRR1471755 3 0.8098 -0.47771 0.000 0.284 0.324 0.092 0.300
#> SRR808019 1 0.0609 0.80316 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1479133 3 0.6496 0.19920 0.144 0.000 0.620 0.180 0.056
#> SRR615069 3 0.5364 0.51361 0.004 0.048 0.696 0.032 0.220
#> SRR1456185 2 0.5641 0.36620 0.000 0.684 0.124 0.024 0.168
#> SRR1350069 4 0.6686 0.69197 0.236 0.000 0.236 0.516 0.012
#> SRR816316 1 0.2300 0.79855 0.904 0.000 0.024 0.072 0.000
#> SRR664795 1 0.0324 0.79795 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1490721 1 0.5590 0.27057 0.592 0.000 0.080 0.324 0.004
#> SRR810643 1 0.3110 0.77717 0.856 0.000 0.028 0.112 0.004
#> SRR1430333 1 0.6600 0.36076 0.596 0.000 0.100 0.236 0.068
#> SRR1085285 3 0.3754 0.56581 0.016 0.000 0.824 0.124 0.036
#> SRR1099072 3 0.5822 0.25988 0.128 0.000 0.648 0.208 0.016
#> SRR1317985 1 0.1549 0.80633 0.944 0.000 0.016 0.040 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.4294 0.56021 0.000 0.788 0.092 0.008 0.112
#> SRR1351347 3 0.5190 0.39040 0.028 0.000 0.656 0.288 0.028
#> SRR1405525 1 0.5916 0.50510 0.632 0.000 0.124 0.228 0.016
#> SRR1370329 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0162 0.79967 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1476525 2 0.1471 0.72768 0.000 0.952 0.024 0.004 0.020
#> SRR819610 3 0.7345 0.34224 0.008 0.076 0.504 0.108 0.304
#> SRR2157314 1 0.4778 0.62174 0.764 0.000 0.028 0.132 0.076
#> SRR1409465 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.6358 0.69658 0.276 0.000 0.168 0.548 0.008
#> SRR613639 1 0.6972 0.15984 0.540 0.000 0.224 0.192 0.044
#> SRR1402285 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.1408 0.80664 0.948 0.000 0.008 0.044 0.000
#> SRR1405660 3 0.2104 0.61129 0.000 0.000 0.916 0.060 0.024
#> SRR1095455 3 0.5905 0.46729 0.000 0.040 0.620 0.060 0.280
#> SRR1394734 3 0.7150 0.02846 0.000 0.176 0.452 0.036 0.336
#> SRR1317771 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 4 0.4749 0.46706 0.040 0.000 0.252 0.700 0.008
#> SRR1073581 1 0.1430 0.80688 0.944 0.000 0.004 0.052 0.000
#> SRR659804 1 0.4041 0.72300 0.780 0.000 0.040 0.176 0.004
#> SRR1345914 2 0.5761 0.26061 0.000 0.620 0.184 0.000 0.196
#> SRR1432186 2 0.4444 0.56215 0.000 0.788 0.104 0.020 0.088
#> SRR1473529 3 0.6830 0.09152 0.000 0.188 0.420 0.012 0.380
#> SRR660764 3 0.7198 -0.11864 0.000 0.316 0.372 0.016 0.296
#> SRR820448 1 0.2300 0.79855 0.904 0.000 0.024 0.072 0.000
#> SRR1328845 4 0.6529 0.37441 0.124 0.000 0.424 0.436 0.016
#> SRR1336415 1 0.4441 0.58297 0.720 0.000 0.044 0.236 0.000
#> SRR1379065 1 0.0404 0.79900 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1459190 3 0.4162 0.55447 0.024 0.000 0.796 0.144 0.036
#> SRR1346773 1 0.4649 0.66549 0.732 0.000 0.064 0.200 0.004
#> SRR1499521 1 0.0671 0.80289 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1440898 2 0.1095 0.73914 0.000 0.968 0.012 0.008 0.012
#> SRR1347459 3 0.6032 0.41383 0.000 0.084 0.624 0.036 0.256
#> SRR1081209 2 0.0968 0.74053 0.000 0.972 0.012 0.004 0.012
#> SRR1400202 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.6678 0.59622 0.348 0.000 0.144 0.488 0.020
#> SRR1309248 3 0.6754 0.26800 0.000 0.108 0.488 0.040 0.364
#> SRR809161 1 0.7148 0.21942 0.568 0.000 0.140 0.180 0.112
#> SRR1316320 3 0.6795 0.24624 0.012 0.012 0.480 0.364 0.132
#> SRR1432629 2 0.7142 -0.19357 0.000 0.448 0.292 0.024 0.236
#> SRR1498931 1 0.1662 0.80542 0.936 0.000 0.004 0.056 0.004
#> SRR1416578 1 0.0703 0.80298 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1405547 3 0.2930 0.60853 0.000 0.012 0.880 0.032 0.076
#> SRR1470534 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.2866 0.78469 0.872 0.000 0.024 0.100 0.004
#> SRR1309160 3 0.2300 0.60922 0.000 0.000 0.904 0.072 0.024
#> SRR663489 3 0.3241 0.59387 0.000 0.012 0.856 0.028 0.104
#> SRR1500450 1 0.0404 0.80184 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1078489 4 0.6265 0.03953 0.020 0.000 0.404 0.488 0.088
#> SRR1332648 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660614 2 0.5902 0.17306 0.000 0.600 0.208 0.000 0.192
#> SRR1470420 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0451 0.80141 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1477949 1 0.1901 0.80497 0.928 0.000 0.012 0.056 0.004
#> SRR1481419 2 0.4023 0.60061 0.000 0.816 0.092 0.016 0.076
#> SRR1464766 1 0.3219 0.77085 0.840 0.000 0.020 0.136 0.004
#> SRR615946 3 0.6676 0.35546 0.000 0.076 0.580 0.088 0.256
#> SRR1446481 2 0.3849 0.62439 0.000 0.832 0.060 0.024 0.084
#> SRR1467656 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.2166 0.80021 0.912 0.000 0.012 0.072 0.004
#> SRR660224 3 0.7247 0.16142 0.000 0.148 0.436 0.052 0.364
#> SRR665586 1 0.0162 0.79847 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1347166 1 0.5654 0.47027 0.620 0.000 0.080 0.288 0.012
#> SRR1485722 1 0.6793 -0.21519 0.448 0.000 0.212 0.332 0.008
#> SRR1415316 1 0.0290 0.80092 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR613390 1 0.4003 0.72349 0.780 0.000 0.036 0.180 0.004
#> SRR661108 3 0.2720 0.59111 0.004 0.000 0.880 0.096 0.020
#> SRR2170173 1 0.4901 0.61029 0.756 0.000 0.032 0.136 0.076
#> SRR817329 1 0.2100 0.80381 0.924 0.000 0.016 0.048 0.012
#> SRR1401990 1 0.5678 -0.05122 0.524 0.000 0.084 0.392 0.000
#> SRR1467745 5 0.8052 0.45745 0.000 0.284 0.284 0.088 0.344
#> SRR1471795 2 0.5377 0.44991 0.000 0.716 0.124 0.028 0.132
#> SRR1415637 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 1 0.2027 0.80316 0.928 0.000 0.024 0.040 0.008
#> SRR1314873 1 0.0798 0.80518 0.976 0.000 0.008 0.016 0.000
#> SRR1401211 1 0.0671 0.80289 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1419692 5 0.6869 0.68005 0.000 0.324 0.044 0.124 0.508
#> SRR818797 1 0.4973 0.65387 0.724 0.000 0.080 0.184 0.012
#> SRR2164608 1 0.4901 0.61029 0.756 0.000 0.032 0.136 0.076
#> SRR1455586 2 0.3401 0.63745 0.000 0.852 0.072 0.008 0.068
#> SRR819459 3 0.5550 0.45957 0.000 0.068 0.668 0.028 0.236
#> SRR1488939 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 1 0.5165 0.61539 0.696 0.000 0.088 0.208 0.008
#> SRR1361652 3 0.6793 0.12239 0.000 0.164 0.424 0.016 0.396
#> SRR1437119 1 0.3308 0.76239 0.832 0.000 0.020 0.144 0.004
#> SRR1478547 3 0.2757 0.60409 0.000 0.008 0.888 0.032 0.072
#> SRR1430910 3 0.7101 0.29003 0.000 0.124 0.504 0.064 0.308
#> SRR1310584 1 0.0451 0.80176 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1500216 4 0.6461 0.64025 0.300 0.000 0.156 0.532 0.012
#> SRR1486762 5 0.6811 0.58416 0.000 0.408 0.048 0.096 0.448
#> SRR1480854 1 0.0510 0.79838 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1489394 1 0.1892 0.78528 0.916 0.000 0.004 0.080 0.000
#> SRR1418085 1 0.0162 0.79968 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1340221 1 0.1628 0.80226 0.936 0.000 0.008 0.056 0.000
#> SRR1473058 3 0.5839 0.05345 0.012 0.008 0.472 0.464 0.044
#> SRR1405165 3 0.3396 0.58360 0.008 0.000 0.844 0.112 0.036
#> SRR1433004 1 0.4251 0.69822 0.756 0.000 0.040 0.200 0.004
#> SRR1471477 1 0.4588 0.66903 0.732 0.000 0.056 0.208 0.004
#> SRR1098567 2 0.6399 0.05106 0.000 0.528 0.280 0.004 0.188
#> SRR1098712 3 0.7006 0.36842 0.000 0.060 0.556 0.176 0.208
#> SRR1455038 1 0.4078 0.71983 0.776 0.000 0.040 0.180 0.004
#> SRR1375248 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.7588 0.19395 0.152 0.000 0.504 0.224 0.120
#> SRR1348378 2 0.7756 -0.44748 0.000 0.344 0.328 0.056 0.272
#> SRR1413541 1 0.3350 0.77188 0.844 0.000 0.040 0.112 0.004
#> SRR1392943 1 0.0510 0.80238 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1475192 5 0.6787 0.67827 0.000 0.344 0.040 0.116 0.500
#> SRR1432085 2 0.6615 0.01725 0.000 0.508 0.276 0.008 0.208
#> SRR1452468 1 0.5571 0.49865 0.632 0.000 0.088 0.272 0.008
#> SRR1347060 3 0.5825 0.42276 0.000 0.076 0.632 0.028 0.264
#> SRR1414139 3 0.6958 0.10672 0.000 0.232 0.464 0.016 0.288
#> SRR1447962 2 0.6834 -0.12522 0.000 0.416 0.328 0.004 0.252
#> SRR1444324 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.2951 0.77785 0.860 0.000 0.028 0.112 0.000
#> SRR1413436 1 0.0290 0.80092 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1311266 1 0.4524 0.68512 0.736 0.000 0.052 0.208 0.004
#> SRR1343302 1 0.4313 0.59798 0.732 0.000 0.040 0.228 0.000
#> SRR1373746 1 0.3308 0.76239 0.832 0.000 0.020 0.144 0.004
#> SRR1429678 1 0.0324 0.80071 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1469413 2 0.6834 -0.12522 0.000 0.416 0.328 0.004 0.252
#> SRR1405331 3 0.4178 0.56011 0.016 0.000 0.788 0.156 0.040
#> SRR1345609 1 0.0000 0.79818 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 3 0.6881 -0.20269 0.148 0.000 0.492 0.328 0.032
#> SRR1322840 1 0.1892 0.78306 0.916 0.000 0.004 0.080 0.000
#> SRR1399797 3 0.4491 0.58479 0.000 0.024 0.776 0.052 0.148
#> SRR1416654 3 0.2139 0.61464 0.000 0.000 0.916 0.052 0.032
#> SRR1315081 2 0.4687 0.51324 0.000 0.756 0.116 0.008 0.120
#> SRR1369196 3 0.6485 0.34225 0.000 0.140 0.584 0.032 0.244
#> SRR1400847 1 0.1365 0.80613 0.952 0.000 0.004 0.040 0.004
#> SRR1365291 1 0.5834 0.49192 0.640 0.000 0.136 0.212 0.012
#> SRR1367920 4 0.7069 0.70270 0.260 0.000 0.180 0.516 0.044
#> SRR1366648 3 0.2569 0.60241 0.000 0.016 0.896 0.012 0.076
#> SRR1441679 2 0.0000 0.75191 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.3768 0.54704 0.016 0.000 0.808 0.156 0.020
#> SRR1363968 1 0.0955 0.80530 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR814387 1 0.0162 0.79967 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR657599 1 0.0404 0.80218 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1386689 1 0.4441 0.58297 0.720 0.000 0.044 0.236 0.000
#> SRR1395575 3 0.5059 0.46444 0.060 0.000 0.720 0.196 0.024
#> SRR1453811 3 0.6824 -0.35641 0.340 0.000 0.452 0.196 0.012
#> SRR1441159 1 0.4555 0.67416 0.732 0.000 0.052 0.212 0.004
#> SRR1403154 1 0.1809 0.80020 0.928 0.000 0.012 0.060 0.000
#> SRR1468722 3 0.6198 0.29249 0.120 0.000 0.652 0.172 0.056
#> SRR1310275 3 0.4015 0.52804 0.024 0.000 0.788 0.172 0.016
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 1 0.1124 0.774355 0.956 0.000 0.000 0.036 0.008 0.000
#> SRR1331708 4 0.6651 0.087121 0.036 0.000 0.360 0.476 0.072 0.056
#> SRR1464258 1 0.5033 0.582648 0.644 0.000 0.064 0.268 0.024 0.000
#> SRR1454201 3 0.6569 0.413967 0.104 0.000 0.600 0.156 0.112 0.028
#> SRR661589 3 0.5129 0.435770 0.100 0.000 0.700 0.164 0.024 0.012
#> SRR1456229 1 0.4796 0.597940 0.652 0.000 0.048 0.280 0.020 0.000
#> SRR1315165 4 0.5106 0.673437 0.236 0.000 0.116 0.640 0.008 0.000
#> SRR1488960 1 0.1719 0.777971 0.928 0.000 0.008 0.056 0.008 0.000
#> SRR1417809 1 0.2101 0.767658 0.892 0.000 0.004 0.100 0.004 0.000
#> SRR1094457 1 0.0622 0.766789 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008 0.000
#> SRR1095575 3 0.4303 0.531435 0.008 0.000 0.760 0.136 0.088 0.008
#> SRR1315931 1 0.0891 0.772665 0.968 0.000 0.000 0.024 0.008 0.000
#> SRR1430066 3 0.3101 0.491057 0.000 0.004 0.848 0.008 0.104 0.036
#> SRR1431037 3 0.3181 0.538558 0.000 0.000 0.852 0.044 0.028 0.076
#> SRR1395554 3 0.5928 0.218096 0.000 0.016 0.588 0.012 0.216 0.168
#> SRR818002 2 0.5458 0.545651 0.000 0.672 0.068 0.000 0.148 0.112
#> SRR1344143 5 0.4938 0.578754 0.000 0.072 0.232 0.012 0.676 0.008
#> SRR1486845 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1362866 1 0.5717 0.365424 0.540 0.000 0.096 0.336 0.028 0.000
#> SRR1490740 1 0.1888 0.777520 0.916 0.000 0.012 0.068 0.004 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0458 0.820802 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1416248 1 0.0935 0.774175 0.964 0.000 0.000 0.032 0.004 0.000
#> SRR1383907 4 0.5105 0.438773 0.352 0.000 0.080 0.564 0.004 0.000
#> SRR1311018 1 0.3942 0.697631 0.752 0.000 0.024 0.204 0.020 0.000
#> SRR1375699 2 0.5847 0.464531 0.000 0.632 0.076 0.000 0.148 0.144
#> SRR1429846 1 0.5392 0.543345 0.620 0.000 0.084 0.264 0.032 0.000
#> SRR613550 1 0.7210 -0.241952 0.380 0.000 0.284 0.256 0.076 0.004
#> SRR1348402 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1345146 3 0.4257 0.521302 0.000 0.004 0.760 0.128 0.100 0.008
#> SRR1324025 3 0.3440 0.547000 0.004 0.000 0.840 0.060 0.024 0.072
#> SRR1318879 3 0.4389 0.529730 0.008 0.000 0.752 0.140 0.092 0.008
#> SRR820755 1 0.4601 0.678817 0.712 0.000 0.032 0.208 0.048 0.000
#> SRR1485830 4 0.4704 0.690801 0.156 0.000 0.132 0.704 0.008 0.000
#> SRR599313 4 0.5549 0.668321 0.160 0.000 0.132 0.660 0.044 0.004
#> SRR612263 1 0.2455 0.773688 0.888 0.000 0.016 0.080 0.016 0.000
#> SRR1415398 3 0.7288 -0.324411 0.340 0.000 0.356 0.204 0.096 0.004
#> SRR1326205 4 0.7073 0.407635 0.108 0.000 0.320 0.464 0.076 0.032
#> SRR1421327 1 0.0972 0.764393 0.964 0.000 0.000 0.028 0.008 0.000
#> SRR1083311 3 0.2443 0.511491 0.000 0.000 0.880 0.020 0.096 0.004
#> SRR1499303 4 0.6228 0.617673 0.172 0.000 0.240 0.552 0.024 0.012
#> SRR1079522 4 0.5498 0.688637 0.224 0.000 0.108 0.632 0.036 0.000
#> SRR1452935 3 0.3821 0.522226 0.000 0.000 0.804 0.060 0.108 0.028
#> SRR1379495 1 0.0972 0.773058 0.964 0.000 0.000 0.028 0.008 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.3196 0.549295 0.004 0.000 0.848 0.096 0.016 0.036
#> SRR615778 1 0.5519 0.286035 0.512 0.000 0.072 0.392 0.024 0.000
#> SRR1447564 1 0.1781 0.778149 0.924 0.000 0.008 0.060 0.008 0.000
#> SRR1455195 1 0.1333 0.777074 0.944 0.000 0.000 0.048 0.008 0.000
#> SRR655182 3 0.6949 0.208148 0.020 0.004 0.536 0.080 0.220 0.140
#> SRR1335140 5 0.6059 0.241106 0.000 0.000 0.360 0.176 0.452 0.012
#> SRR1433555 3 0.1528 0.528781 0.000 0.000 0.936 0.016 0.048 0.000
#> SRR1308650 6 0.7503 0.214526 0.000 0.260 0.220 0.000 0.160 0.360
#> SRR1388354 1 0.1882 0.777584 0.920 0.000 0.012 0.060 0.008 0.000
#> SRR1317446 5 0.6022 0.468281 0.000 0.232 0.244 0.000 0.512 0.012
#> SRR1413602 3 0.2794 0.476757 0.000 0.000 0.840 0.012 0.144 0.004
#> SRR1479955 2 0.0146 0.823672 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR809853 1 0.6441 -0.064566 0.424 0.000 0.172 0.368 0.036 0.000
#> SRR661313 3 0.3533 0.544666 0.004 0.000 0.836 0.048 0.036 0.076
#> SRR1499935 4 0.5522 0.702692 0.220 0.000 0.148 0.616 0.012 0.004
#> SRR1447303 3 0.2015 0.528749 0.000 0.000 0.916 0.016 0.056 0.012
#> SRR1429408 4 0.6376 0.067270 0.032 0.000 0.376 0.480 0.032 0.080
#> SRR1433950 1 0.3926 0.718934 0.768 0.000 0.040 0.176 0.016 0.000
#> SRR1362081 2 0.0146 0.823408 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409854 1 0.5936 0.415082 0.556 0.000 0.116 0.288 0.040 0.000
#> SRR1435229 3 0.6706 0.003134 0.000 0.008 0.488 0.048 0.268 0.188
#> SRR1085996 1 0.4737 0.604512 0.656 0.000 0.044 0.280 0.020 0.000
#> SRR1414229 6 0.3522 0.482584 0.000 0.024 0.072 0.000 0.076 0.828
#> SRR1400974 3 0.3013 0.464273 0.000 0.004 0.828 0.012 0.152 0.004
#> SRR1399971 1 0.6075 0.153741 0.476 0.000 0.104 0.384 0.032 0.004
#> SRR613927 1 0.4928 0.642654 0.712 0.000 0.088 0.156 0.044 0.000
#> SRR1457854 1 0.3082 0.750606 0.828 0.000 0.020 0.144 0.008 0.000
#> SRR1473714 4 0.5549 0.668321 0.160 0.000 0.132 0.660 0.044 0.004
#> SRR813776 1 0.4601 0.678817 0.712 0.000 0.032 0.208 0.048 0.000
#> SRR808196 4 0.4925 0.317653 0.424 0.000 0.064 0.512 0.000 0.000
#> SRR1101085 4 0.5141 0.459310 0.344 0.000 0.076 0.572 0.008 0.000
#> SRR614395 1 0.1624 0.778351 0.936 0.000 0.008 0.044 0.012 0.000
#> SRR1478251 1 0.0520 0.765070 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1370551 2 0.0146 0.823408 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1362310 1 0.2568 0.768619 0.876 0.000 0.012 0.096 0.016 0.000
#> SRR665310 3 0.7189 -0.274101 0.340 0.000 0.388 0.164 0.104 0.004
#> SRR1420109 3 0.4993 0.476471 0.000 0.004 0.728 0.080 0.116 0.072
#> SRR1330920 1 0.6199 0.330427 0.528 0.000 0.136 0.296 0.036 0.004
#> SRR1419539 3 0.6651 0.229695 0.000 0.008 0.516 0.096 0.100 0.280
#> SRR1359447 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347259 4 0.5296 0.689585 0.192 0.000 0.108 0.668 0.028 0.004
#> SRR613915 1 0.2988 0.751329 0.860 0.000 0.016 0.080 0.044 0.000
#> SRR1384395 2 0.3072 0.745730 0.000 0.856 0.024 0.000 0.084 0.036
#> SRR821715 1 0.5265 0.611129 0.680 0.000 0.088 0.176 0.056 0.000
#> SRR1478228 1 0.3586 0.731187 0.796 0.000 0.024 0.160 0.020 0.000
#> SRR1445637 1 0.4720 0.649854 0.692 0.000 0.052 0.228 0.028 0.000
#> SRR608150 4 0.5934 0.579866 0.284 0.000 0.160 0.536 0.020 0.000
#> SRR1096383 1 0.1124 0.774733 0.956 0.000 0.000 0.036 0.008 0.000
#> SRR1341480 1 0.4891 0.327459 0.576 0.000 0.060 0.360 0.004 0.000
#> SRR1341344 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1326270 3 0.5045 0.454141 0.104 0.000 0.700 0.168 0.016 0.012
#> SRR1498838 3 0.1642 0.540075 0.000 0.000 0.936 0.032 0.028 0.004
#> SRR1416313 3 0.3695 0.528210 0.000 0.000 0.820 0.044 0.052 0.084
#> SRR808566 4 0.5298 0.464848 0.348 0.000 0.100 0.548 0.004 0.000
#> SRR1430270 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1367825 3 0.3232 0.464633 0.000 0.004 0.824 0.004 0.140 0.028
#> SRR613533 3 0.4744 0.359439 0.000 0.012 0.700 0.032 0.228 0.028
#> SRR661267 1 0.1124 0.774733 0.956 0.000 0.000 0.036 0.008 0.000
#> SRR810665 2 0.1332 0.808563 0.000 0.952 0.008 0.000 0.028 0.012
#> SRR1407250 4 0.6683 0.356273 0.344 0.000 0.236 0.388 0.028 0.004
#> SRR1420067 1 0.3310 0.750496 0.824 0.000 0.028 0.132 0.016 0.000
#> SRR1473632 3 0.7028 -0.186636 0.000 0.008 0.388 0.048 0.244 0.312
#> SRR812536 1 0.6007 0.484949 0.640 0.000 0.064 0.156 0.124 0.016
#> SRR1370850 2 0.5739 0.382460 0.000 0.580 0.084 0.000 0.288 0.048
#> SRR1486195 2 0.0665 0.820087 0.000 0.980 0.004 0.000 0.008 0.008
#> SRR1407671 3 0.6866 0.273406 0.012 0.004 0.432 0.368 0.128 0.056
#> SRR1446375 3 0.6496 0.117265 0.000 0.012 0.536 0.052 0.264 0.136
#> SRR1465230 1 0.2968 0.720770 0.816 0.000 0.016 0.168 0.000 0.000
#> SRR614119 1 0.5158 0.534077 0.616 0.000 0.064 0.296 0.024 0.000
#> SRR1356101 2 0.0964 0.814329 0.000 0.968 0.012 0.000 0.004 0.016
#> SRR1404209 1 0.1728 0.779577 0.924 0.000 0.004 0.064 0.008 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0993 0.767489 0.964 0.000 0.000 0.012 0.024 0.000
#> SRR660510 3 0.2320 0.521290 0.000 0.000 0.892 0.024 0.080 0.004
#> SRR1445655 1 0.2118 0.746421 0.888 0.000 0.000 0.104 0.008 0.000
#> SRR658953 1 0.5716 0.530018 0.660 0.000 0.044 0.164 0.116 0.016
#> SRR2166459 1 0.5342 0.569691 0.700 0.000 0.040 0.132 0.112 0.016
#> SRR1070713 3 0.7845 -0.320148 0.000 0.092 0.356 0.064 0.140 0.348
#> SRR1485312 3 0.4205 0.527488 0.048 0.000 0.780 0.136 0.024 0.012
#> SRR1317631 1 0.3673 0.620126 0.736 0.000 0.016 0.244 0.004 0.000
#> SRR1488610 1 0.5032 0.559937 0.620 0.000 0.052 0.304 0.024 0.000
#> SRR1330588 3 0.3778 0.544994 0.020 0.000 0.808 0.128 0.012 0.032
#> SRR1316367 3 0.7553 0.208967 0.040 0.004 0.492 0.112 0.200 0.152
#> SRR1433926 1 0.6075 0.153741 0.476 0.000 0.104 0.384 0.032 0.004
#> SRR1091302 1 0.4593 0.278292 0.576 0.000 0.044 0.380 0.000 0.000
#> SRR818263 1 0.4378 0.670221 0.724 0.000 0.048 0.208 0.020 0.000
#> SRR1404909 4 0.5323 0.700206 0.204 0.000 0.124 0.648 0.024 0.000
#> SRR663076 1 0.1493 0.776054 0.936 0.000 0.004 0.056 0.004 0.000
#> SRR1323577 2 0.5583 0.538690 0.000 0.660 0.076 0.000 0.156 0.108
#> SRR1442422 1 0.0520 0.765070 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1465893 1 0.3578 0.732653 0.796 0.000 0.028 0.160 0.016 0.000
#> SRR654862 1 0.5883 0.409771 0.552 0.000 0.112 0.300 0.036 0.000
#> SRR1407112 1 0.4186 0.477265 0.656 0.000 0.032 0.312 0.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.5790 0.300363 0.140 0.000 0.628 0.192 0.028 0.012
#> SRR1353199 3 0.5010 0.369201 0.004 0.000 0.684 0.100 0.196 0.016
#> SRR1378885 1 0.4956 0.622894 0.668 0.000 0.064 0.240 0.028 0.000
#> SRR665357 2 0.5266 0.170614 0.000 0.544 0.112 0.000 0.344 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.5224 0.433288 0.108 0.000 0.700 0.148 0.032 0.012
#> SRR1347819 3 0.3767 0.491834 0.000 0.000 0.800 0.012 0.104 0.084
#> SRR1480813 2 0.0405 0.822649 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1472576 5 0.7165 0.388840 0.012 0.016 0.312 0.076 0.468 0.116
#> SRR1431781 4 0.4728 0.631055 0.256 0.000 0.092 0.652 0.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.7147 -0.104014 0.256 0.000 0.464 0.164 0.108 0.008
#> SRR1500472 3 0.5220 -0.289205 0.000 0.012 0.480 0.036 0.460 0.012
#> SRR1417632 5 0.4800 0.556284 0.000 0.032 0.248 0.020 0.684 0.016
#> SRR1350153 2 0.1148 0.811762 0.000 0.960 0.016 0.000 0.020 0.004
#> SRR1458113 3 0.5302 0.382799 0.000 0.012 0.680 0.020 0.160 0.128
#> SRR1326579 1 0.5371 0.435214 0.564 0.000 0.068 0.344 0.024 0.000
#> SRR1349363 2 0.0146 0.823672 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1096712 3 0.4532 0.399864 0.000 0.000 0.720 0.008 0.164 0.108
#> SRR1090407 3 0.6302 0.209040 0.164 0.000 0.596 0.156 0.076 0.008
#> SRR1083752 3 0.8277 -0.250346 0.000 0.104 0.360 0.092 0.180 0.264
#> SRR1377599 4 0.5776 0.686660 0.152 0.000 0.120 0.660 0.052 0.016
#> SRR1488449 3 0.7147 -0.104014 0.256 0.000 0.464 0.164 0.108 0.008
#> SRR1318354 5 0.5530 0.512227 0.000 0.216 0.224 0.000 0.560 0.000
#> SRR1359062 2 0.6271 -0.090792 0.000 0.468 0.188 0.000 0.320 0.024
#> SRR1398924 5 0.5758 0.471750 0.000 0.012 0.348 0.008 0.528 0.104
#> SRR663783 5 0.5143 0.529582 0.000 0.032 0.368 0.028 0.568 0.004
#> SRR1319204 3 0.5957 -0.155013 0.000 0.032 0.496 0.004 0.376 0.092
#> SRR1369070 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.2555 0.769691 0.876 0.000 0.020 0.096 0.008 0.000
#> SRR1337449 2 0.3562 0.728173 0.000 0.828 0.032 0.000 0.076 0.064
#> SRR1316982 2 0.0603 0.818512 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1498595 5 0.5068 0.567461 0.000 0.056 0.236 0.008 0.672 0.028
#> SRR1377423 3 0.5330 0.263507 0.000 0.000 0.620 0.112 0.252 0.016
#> SRR1312310 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.4281 0.656509 0.708 0.000 0.028 0.244 0.020 0.000
#> SRR1338426 3 0.4371 0.451883 0.000 0.008 0.744 0.032 0.188 0.028
#> SRR1353309 3 0.4309 0.497146 0.004 0.000 0.712 0.236 0.040 0.008
#> SRR658941 3 0.6651 0.229695 0.000 0.008 0.516 0.096 0.100 0.280
#> SRR1101643 1 0.0508 0.768730 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004 0.000
#> SRR1401468 1 0.4761 0.561064 0.632 0.000 0.032 0.312 0.024 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.5642 0.532145 0.332 0.000 0.104 0.544 0.020 0.000
#> SRR1363858 4 0.5549 0.668321 0.160 0.000 0.132 0.660 0.044 0.004
#> SRR819820 3 0.1926 0.549150 0.000 0.000 0.912 0.068 0.020 0.000
#> SRR1337342 1 0.4442 0.645134 0.696 0.000 0.036 0.248 0.020 0.000
#> SRR655206 3 0.5963 0.355439 0.000 0.012 0.612 0.160 0.184 0.032
#> SRR1387013 6 0.7626 0.083702 0.000 0.112 0.340 0.028 0.152 0.368
#> SRR1317410 1 0.3586 0.731187 0.796 0.000 0.024 0.160 0.020 0.000
#> SRR608198 4 0.5891 0.558649 0.296 0.000 0.148 0.536 0.020 0.000
#> SRR1440161 2 0.0146 0.823408 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1343741 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0146 0.823968 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1415379 1 0.1049 0.768350 0.960 0.000 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1099622 2 0.7481 -0.427979 0.000 0.332 0.212 0.000 0.308 0.148
#> SRR663197 3 0.4689 0.427969 0.000 0.012 0.736 0.012 0.128 0.112
#> SRR1394836 3 0.6178 0.204049 0.008 0.000 0.464 0.400 0.044 0.084
#> SRR661699 1 0.7164 -0.118408 0.436 0.000 0.092 0.320 0.136 0.016
#> SRR813680 1 0.2825 0.755948 0.844 0.000 0.012 0.136 0.008 0.000
#> SRR1410678 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1378109 1 0.0405 0.763414 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1499174 4 0.7424 0.408781 0.332 0.000 0.232 0.356 0.040 0.040
#> SRR1311486 2 0.3880 0.708163 0.000 0.804 0.032 0.000 0.088 0.076
#> SRR1382851 3 0.6154 0.136985 0.008 0.000 0.440 0.428 0.044 0.080
#> SRR1433410 1 0.5172 0.451778 0.572 0.000 0.056 0.352 0.020 0.000
#> SRR661167 3 0.6912 0.298569 0.128 0.000 0.552 0.152 0.148 0.020
#> SRR1432518 3 0.1672 0.528535 0.000 0.000 0.932 0.016 0.048 0.004
#> SRR660462 3 0.5591 0.129164 0.000 0.000 0.556 0.112 0.316 0.016
#> SRR1374608 1 0.3187 0.686475 0.796 0.000 0.012 0.188 0.004 0.000
#> SRR657949 1 0.3000 0.750688 0.860 0.000 0.016 0.076 0.048 0.000
#> SRR1308882 1 0.1757 0.747690 0.916 0.000 0.000 0.076 0.008 0.000
#> SRR655768 1 0.5910 0.366500 0.544 0.000 0.132 0.296 0.028 0.000
#> SRR1485870 4 0.4673 0.672078 0.132 0.000 0.132 0.720 0.016 0.000
#> SRR1444138 3 0.6747 -0.046447 0.000 0.008 0.472 0.044 0.272 0.204
#> SRR1417342 1 0.1219 0.773291 0.948 0.000 0.000 0.048 0.004 0.000
#> SRR1470193 4 0.7073 0.407489 0.108 0.000 0.320 0.464 0.076 0.032
#> SRR1091380 3 0.1926 0.549150 0.000 0.000 0.912 0.068 0.020 0.000
#> SRR1099096 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1313583 1 0.3457 0.743637 0.800 0.000 0.016 0.164 0.020 0.000
#> SRR1467102 2 0.6669 -0.207887 0.000 0.428 0.184 0.000 0.336 0.052
#> SRR1485416 1 0.4864 0.459269 0.624 0.000 0.056 0.308 0.012 0.000
#> SRR818821 3 0.4744 0.359439 0.000 0.012 0.700 0.032 0.228 0.028
#> SRR809963 1 0.1624 0.778351 0.936 0.000 0.008 0.044 0.012 0.000
#> SRR1072247 1 0.0806 0.771279 0.972 0.000 0.000 0.020 0.008 0.000
#> SRR1353710 1 0.5160 0.199177 0.560 0.000 0.052 0.368 0.020 0.000
#> SRR1445259 3 0.5161 -0.297126 0.000 0.012 0.484 0.032 0.460 0.012
#> SRR1408393 1 0.4078 0.700162 0.800 0.000 0.032 0.088 0.072 0.008
#> SRR1361522 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1368597 1 0.0508 0.768730 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004 0.000
#> SRR1309680 2 0.6137 0.337553 0.000 0.560 0.088 0.000 0.268 0.084
#> SRR1310542 3 0.6314 0.050274 0.000 0.032 0.528 0.004 0.240 0.196
#> SRR1333485 1 0.2445 0.739694 0.868 0.000 0.008 0.120 0.004 0.000
#> SRR1406437 3 0.5818 0.178227 0.028 0.000 0.492 0.408 0.056 0.016
#> SRR1354931 3 0.5277 0.432032 0.000 0.000 0.664 0.064 0.060 0.212
#> SRR1391856 4 0.5316 0.340749 0.024 0.000 0.280 0.628 0.056 0.012
#> SRR1446738 3 0.7925 -0.091839 0.008 0.020 0.348 0.180 0.128 0.316
#> SRR1309032 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 5 0.7254 0.285739 0.000 0.104 0.332 0.000 0.348 0.216
#> SRR1432611 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 2 0.6271 -0.090792 0.000 0.468 0.188 0.000 0.320 0.024
#> SRR613150 3 0.3576 0.548029 0.008 0.000 0.824 0.084 0.076 0.008
#> SRR1375329 3 0.4180 0.525773 0.004 0.004 0.776 0.116 0.092 0.008
#> SRR1387921 1 0.1429 0.775875 0.940 0.000 0.004 0.052 0.004 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.2547 0.767044 0.868 0.000 0.016 0.112 0.004 0.000
#> SRR812943 3 0.6836 0.097449 0.000 0.008 0.508 0.084 0.244 0.156
#> SRR1400910 5 0.5834 0.453879 0.000 0.012 0.380 0.012 0.500 0.096
#> SRR1444203 1 0.2146 0.766219 0.880 0.000 0.000 0.116 0.004 0.000
#> SRR816177 3 0.7332 -0.470485 0.000 0.072 0.348 0.012 0.340 0.228
#> SRR658754 3 0.6503 0.012517 0.000 0.036 0.512 0.008 0.252 0.192
#> SRR1429603 4 0.5345 0.682583 0.172 0.000 0.128 0.668 0.028 0.004
#> SRR1397366 3 0.5051 0.449240 0.092 0.000 0.704 0.168 0.028 0.008
#> SRR1446028 1 0.4383 0.637058 0.696 0.000 0.036 0.252 0.016 0.000
#> SRR1083918 5 0.7113 0.281533 0.000 0.080 0.328 0.000 0.360 0.232
#> SRR1337606 4 0.4287 0.393000 0.008 0.000 0.216 0.728 0.040 0.008
#> SRR659109 3 0.4532 0.399864 0.000 0.000 0.720 0.008 0.164 0.108
#> SRR1337192 1 0.0862 0.772286 0.972 0.000 0.004 0.016 0.008 0.000
#> SRR656946 3 0.6609 0.084799 0.000 0.012 0.524 0.052 0.256 0.156
#> SRR1476102 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1476447 1 0.1340 0.778782 0.948 0.000 0.004 0.040 0.008 0.000
#> SRR1342067 1 0.2020 0.747645 0.896 0.000 0.000 0.096 0.008 0.000
#> SRR1385389 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1075971 1 0.3944 0.694341 0.744 0.000 0.024 0.216 0.016 0.000
#> SRR614419 1 0.2213 0.749593 0.908 0.000 0.012 0.032 0.048 0.000
#> SRR1322936 3 0.6299 0.093747 0.028 0.000 0.432 0.420 0.016 0.104
#> SRR1349121 1 0.0891 0.772526 0.968 0.000 0.000 0.024 0.008 0.000
#> SRR1430549 1 0.3942 0.697631 0.752 0.000 0.024 0.204 0.020 0.000
#> SRR612935 5 0.5402 0.582265 0.000 0.080 0.248 0.032 0.636 0.004
#> SRR661481 2 0.0508 0.821617 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1354117 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.5556 0.375711 0.072 0.000 0.324 0.568 0.036 0.000
#> SRR1452164 1 0.2013 0.776146 0.908 0.000 0.008 0.076 0.008 0.000
#> SRR1070503 1 0.5766 0.456479 0.572 0.000 0.104 0.288 0.036 0.000
#> SRR1499894 3 0.5862 0.254344 0.000 0.020 0.608 0.012 0.192 0.168
#> SRR1082883 4 0.5654 0.626915 0.252 0.000 0.140 0.588 0.020 0.000
#> SRR1468271 1 0.5174 0.525955 0.612 0.000 0.064 0.300 0.024 0.000
#> SRR1332443 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1328620 5 0.6463 0.527547 0.000 0.172 0.292 0.000 0.488 0.048
#> SRR1396294 4 0.5673 0.197769 0.052 0.000 0.396 0.512 0.028 0.012
#> SRR1419917 1 0.4575 0.620638 0.668 0.000 0.040 0.276 0.016 0.000
#> SRR662114 3 0.3311 0.547016 0.004 0.000 0.836 0.112 0.016 0.032
#> SRR1489199 1 0.4917 0.563870 0.628 0.000 0.044 0.304 0.024 0.000
#> SRR813584 3 0.7332 -0.470485 0.000 0.072 0.348 0.012 0.340 0.228
#> SRR1069638 6 0.4958 0.379647 0.000 0.012 0.212 0.008 0.084 0.684
#> SRR614864 3 0.6477 -0.310337 0.212 0.000 0.456 0.304 0.024 0.004
#> SRR1433392 1 0.4406 0.666892 0.720 0.000 0.048 0.212 0.020 0.000
#> SRR1377777 2 0.0146 0.823672 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR2167710 1 0.5653 0.532812 0.668 0.000 0.044 0.156 0.116 0.016
#> SRR1401252 1 0.2070 0.745875 0.892 0.000 0.000 0.100 0.008 0.000
#> SRR1309963 1 0.0405 0.763414 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1338031 1 0.4592 0.635855 0.684 0.000 0.044 0.252 0.020 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.4999 0.312732 0.592 0.000 0.040 0.344 0.024 0.000
#> SRR1380393 1 0.1615 0.776615 0.928 0.000 0.004 0.064 0.004 0.000
#> SRR1319731 1 0.0972 0.773058 0.964 0.000 0.000 0.028 0.008 0.000
#> SRR1356468 4 0.4705 0.706754 0.192 0.000 0.104 0.696 0.008 0.000
#> SRR1337010 2 0.3050 0.630308 0.000 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236
#> SRR1486520 1 0.1820 0.777282 0.924 0.000 0.008 0.056 0.012 0.000
#> SRR1486538 4 0.5946 0.313333 0.408 0.000 0.068 0.468 0.056 0.000
#> SRR1340486 1 0.1643 0.773855 0.924 0.000 0.000 0.068 0.008 0.000
#> SRR1377696 5 0.4498 0.550969 0.000 0.068 0.176 0.008 0.736 0.012
#> SRR1465459 1 0.5716 0.424602 0.572 0.000 0.124 0.284 0.016 0.004
#> SRR1080270 3 0.6314 0.050274 0.000 0.032 0.528 0.004 0.240 0.196
#> SRR1312501 3 0.3097 0.546327 0.012 0.000 0.848 0.112 0.008 0.020
#> SRR1093148 3 0.5077 0.497425 0.052 0.000 0.696 0.200 0.040 0.012
#> SRR1467080 5 0.6069 0.434748 0.000 0.256 0.232 0.000 0.500 0.012
#> SRR1410866 2 0.0405 0.822649 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR816475 4 0.5179 0.455244 0.348 0.000 0.088 0.560 0.004 0.000
#> SRR1379198 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR613342 3 0.5990 0.058263 0.000 0.020 0.540 0.012 0.316 0.112
#> SRR1452246 2 0.3647 0.448718 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1338836 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1396616 3 0.5020 0.478480 0.000 0.000 0.704 0.080 0.052 0.164
#> SRR813824 3 0.3097 0.549852 0.004 0.000 0.856 0.088 0.016 0.036
#> SRR1082376 1 0.4737 0.604512 0.656 0.000 0.044 0.280 0.020 0.000
#> SRR1500891 4 0.7231 0.603276 0.200 0.000 0.212 0.464 0.116 0.008
#> SRR807543 1 0.5647 0.483425 0.584 0.000 0.092 0.288 0.036 0.000
#> SRR1091572 4 0.6210 -0.149590 0.008 0.000 0.396 0.436 0.016 0.144
#> SRR1346689 4 0.7073 0.407635 0.108 0.000 0.320 0.464 0.076 0.032
#> SRR1332424 1 0.5170 0.474524 0.580 0.000 0.052 0.344 0.024 0.000
#> SRR663729 1 0.1088 0.769834 0.960 0.000 0.000 0.024 0.016 0.000
#> SRR1097013 1 0.4872 0.588532 0.644 0.000 0.052 0.284 0.020 0.000
#> SRR613675 3 0.6299 0.093747 0.028 0.000 0.432 0.420 0.016 0.104
#> SRR1485357 4 0.5046 0.639850 0.276 0.000 0.100 0.620 0.004 0.000
#> SRR655816 1 0.6007 0.484949 0.640 0.000 0.064 0.156 0.124 0.016
#> SRR1500113 1 0.5190 0.523932 0.608 0.000 0.064 0.304 0.024 0.000
#> SRR1437622 3 0.7393 -0.298333 0.016 0.012 0.384 0.112 0.380 0.096
#> SRR1355172 1 0.1265 0.776374 0.948 0.000 0.000 0.044 0.008 0.000
#> SRR655531 1 0.2213 0.749593 0.908 0.000 0.012 0.032 0.048 0.000
#> SRR1338147 3 0.3292 0.541515 0.000 0.000 0.844 0.056 0.024 0.076
#> SRR1413329 3 0.7102 -0.138968 0.172 0.000 0.444 0.296 0.076 0.012
#> SRR1485931 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.1769 0.777856 0.924 0.000 0.004 0.060 0.012 0.000
#> SRR1333308 4 0.5223 0.703847 0.196 0.000 0.136 0.652 0.016 0.000
#> SRR1452033 1 0.4438 0.663356 0.712 0.000 0.040 0.224 0.024 0.000
#> SRR1467316 2 0.0146 0.823672 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR809018 3 0.2975 0.466909 0.000 0.004 0.832 0.012 0.148 0.004
#> SRR1375351 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 1 0.5998 0.481419 0.624 0.000 0.064 0.184 0.120 0.008
#> SRR1471755 6 0.7493 0.245684 0.000 0.176 0.268 0.008 0.144 0.404
#> SRR808019 1 0.1010 0.773839 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004 0.000
#> SRR1479133 3 0.5535 0.393506 0.124 0.000 0.680 0.128 0.060 0.008
#> SRR615069 3 0.5990 0.058263 0.000 0.020 0.540 0.012 0.316 0.112
#> SRR1456185 2 0.5894 0.455649 0.000 0.628 0.080 0.000 0.148 0.144
#> SRR1350069 4 0.5495 0.644193 0.140 0.000 0.212 0.628 0.016 0.004
#> SRR816316 1 0.2971 0.762928 0.848 0.000 0.024 0.116 0.012 0.000
#> SRR664795 1 0.0993 0.767489 0.964 0.000 0.000 0.012 0.024 0.000
#> SRR1490721 1 0.5244 0.001023 0.496 0.000 0.072 0.424 0.008 0.000
#> SRR810643 1 0.3691 0.724685 0.784 0.000 0.024 0.172 0.020 0.000
#> SRR1430333 1 0.6637 0.234152 0.512 0.000 0.088 0.288 0.104 0.008
#> SRR1085285 3 0.2635 0.544526 0.016 0.000 0.892 0.048 0.036 0.008
#> SRR1099072 3 0.5051 0.449240 0.092 0.000 0.704 0.168 0.028 0.008
#> SRR1317985 1 0.2013 0.776146 0.908 0.000 0.008 0.076 0.008 0.000
#> SRR1487340 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1420276 2 0.4272 0.648826 0.000 0.752 0.040 0.000 0.172 0.036
#> SRR1351347 3 0.4900 0.493853 0.004 0.000 0.684 0.232 0.044 0.036
#> SRR1405525 1 0.6157 0.291540 0.504 0.000 0.120 0.332 0.044 0.000
#> SRR1370329 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1465001 1 0.0520 0.767192 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR1476525 2 0.1528 0.803478 0.000 0.944 0.016 0.000 0.028 0.012
#> SRR819610 5 0.6867 0.363876 0.000 0.016 0.384 0.080 0.420 0.100
#> SRR2157314 1 0.5455 0.560822 0.688 0.000 0.040 0.140 0.116 0.016
#> SRR1409465 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.4810 0.690614 0.160 0.000 0.140 0.692 0.008 0.000
#> SRR613639 1 0.6862 -0.021882 0.444 0.000 0.248 0.252 0.052 0.004
#> SRR1402285 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1077038 1 0.1769 0.777754 0.924 0.000 0.004 0.060 0.012 0.000
#> SRR1405660 3 0.1657 0.527336 0.000 0.000 0.928 0.016 0.056 0.000
#> SRR1095455 3 0.5221 -0.298949 0.000 0.012 0.476 0.036 0.464 0.012
#> SRR1394734 5 0.7113 0.281533 0.000 0.080 0.328 0.000 0.360 0.232
#> SRR1317771 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1365894 4 0.4287 0.393000 0.008 0.000 0.216 0.728 0.040 0.008
#> SRR1073581 1 0.1970 0.776677 0.900 0.000 0.000 0.092 0.008 0.000
#> SRR659804 1 0.4629 0.626942 0.680 0.000 0.040 0.256 0.024 0.000
#> SRR1345914 2 0.5739 0.382460 0.000 0.580 0.084 0.000 0.288 0.048
#> SRR1432186 2 0.4717 0.638825 0.000 0.744 0.068 0.000 0.108 0.080
#> SRR1473529 5 0.4490 0.574847 0.000 0.104 0.196 0.000 0.700 0.000
#> SRR660764 5 0.5511 0.466482 0.000 0.236 0.180 0.004 0.580 0.000
#> SRR820448 1 0.2971 0.762928 0.848 0.000 0.024 0.116 0.012 0.000
#> SRR1328845 4 0.5637 0.160697 0.048 0.000 0.408 0.504 0.028 0.012
#> SRR1336415 1 0.4186 0.477265 0.656 0.000 0.032 0.312 0.000 0.000
#> SRR1379065 1 0.0717 0.762182 0.976 0.000 0.000 0.016 0.008 0.000
#> SRR1459190 3 0.3584 0.548185 0.012 0.000 0.820 0.104 0.060 0.004
#> SRR1346773 1 0.5174 0.529893 0.612 0.000 0.064 0.300 0.024 0.000
#> SRR1499521 1 0.1124 0.774287 0.956 0.000 0.000 0.036 0.008 0.000
#> SRR1440898 2 0.1353 0.808484 0.000 0.952 0.012 0.000 0.012 0.024
#> SRR1347459 3 0.6503 0.012517 0.000 0.036 0.512 0.008 0.252 0.192
#> SRR1081209 2 0.1218 0.810899 0.000 0.956 0.004 0.000 0.028 0.012
#> SRR1400202 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1333395 4 0.5528 0.662797 0.252 0.000 0.096 0.616 0.036 0.000
#> SRR1309248 5 0.5193 0.534643 0.000 0.032 0.296 0.020 0.628 0.024
#> SRR809161 1 0.7344 0.109269 0.488 0.000 0.160 0.184 0.148 0.020
#> SRR1316320 3 0.6993 0.267931 0.004 0.004 0.436 0.340 0.100 0.116
#> SRR1432629 2 0.7502 -0.312525 0.000 0.364 0.200 0.000 0.264 0.172
#> SRR1498931 1 0.2162 0.775091 0.896 0.000 0.012 0.088 0.004 0.000
#> SRR1416578 1 0.1124 0.769918 0.956 0.000 0.000 0.036 0.008 0.000
#> SRR1405547 3 0.3147 0.486658 0.000 0.004 0.844 0.008 0.108 0.036
#> SRR1470534 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1380764 1 0.3476 0.738606 0.808 0.000 0.024 0.148 0.020 0.000
#> SRR1309160 3 0.1549 0.531576 0.000 0.000 0.936 0.020 0.044 0.000
#> SRR663489 3 0.3154 0.432656 0.000 0.004 0.800 0.012 0.184 0.000
#> SRR1500450 1 0.0777 0.773080 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004 0.000
#> SRR1078489 4 0.6182 -0.138781 0.008 0.000 0.392 0.444 0.016 0.140
#> SRR1332648 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR660614 2 0.5250 0.161589 0.000 0.540 0.108 0.000 0.352 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0858 0.773809 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004 0.000
#> SRR1477949 1 0.2362 0.774340 0.892 0.000 0.012 0.080 0.016 0.000
#> SRR1481419 2 0.4327 0.675904 0.000 0.776 0.060 0.000 0.088 0.076
#> SRR1464766 1 0.4067 0.701425 0.748 0.000 0.024 0.200 0.028 0.000
#> SRR615946 3 0.5833 0.110328 0.000 0.008 0.512 0.004 0.140 0.336
#> SRR1446481 2 0.3880 0.708163 0.000 0.804 0.032 0.000 0.088 0.076
#> SRR1467656 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.3141 0.749788 0.828 0.000 0.012 0.140 0.020 0.000
#> SRR660224 5 0.5279 0.558297 0.000 0.080 0.220 0.028 0.664 0.008
#> SRR665586 1 0.0363 0.763407 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1347166 1 0.5519 0.286035 0.512 0.000 0.072 0.392 0.024 0.000
#> SRR1485722 4 0.6683 0.356273 0.344 0.000 0.236 0.388 0.028 0.004
#> SRR1415316 1 0.0508 0.768730 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004 0.000
#> SRR613390 1 0.4717 0.608169 0.660 0.000 0.044 0.276 0.020 0.000
#> SRR661108 3 0.1708 0.542087 0.000 0.000 0.932 0.040 0.024 0.004
#> SRR2170173 1 0.5620 0.539887 0.672 0.000 0.044 0.152 0.116 0.016
#> SRR817329 1 0.2691 0.772117 0.872 0.000 0.008 0.088 0.032 0.000
#> SRR1401990 4 0.4925 0.317653 0.424 0.000 0.064 0.512 0.000 0.000
#> SRR1467745 6 0.7068 0.311669 0.000 0.172 0.220 0.000 0.140 0.468
#> SRR1471795 2 0.5458 0.545651 0.000 0.672 0.068 0.000 0.148 0.112
#> SRR1415637 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 1 0.2542 0.774079 0.884 0.000 0.020 0.080 0.016 0.000
#> SRR1314873 1 0.1155 0.776204 0.956 0.000 0.004 0.036 0.004 0.000
#> SRR1401211 1 0.1049 0.773740 0.960 0.000 0.000 0.032 0.008 0.000
#> SRR1419692 6 0.0984 0.461508 0.000 0.012 0.008 0.012 0.000 0.968
#> SRR818797 1 0.5392 0.543345 0.620 0.000 0.084 0.264 0.032 0.000
#> SRR2164608 1 0.5620 0.539887 0.672 0.000 0.044 0.152 0.116 0.016
#> SRR1455586 2 0.3693 0.712065 0.000 0.816 0.048 0.000 0.100 0.036
#> SRR819459 3 0.6092 0.118226 0.000 0.028 0.560 0.004 0.232 0.176
#> SRR1488939 2 0.0146 0.823672 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 1 0.5655 0.467116 0.576 0.000 0.096 0.296 0.032 0.000
#> SRR1361652 5 0.4294 0.571308 0.000 0.080 0.188 0.000 0.728 0.004
#> SRR1437119 1 0.3942 0.697631 0.752 0.000 0.024 0.204 0.020 0.000
#> SRR1478547 3 0.2936 0.470837 0.000 0.004 0.836 0.012 0.144 0.004
#> SRR1430910 5 0.7115 0.445308 0.000 0.092 0.344 0.036 0.444 0.084
#> SRR1310584 1 0.1151 0.775210 0.956 0.000 0.000 0.032 0.012 0.000
#> SRR1500216 4 0.5549 0.668321 0.160 0.000 0.132 0.660 0.044 0.004
#> SRR1486762 6 0.3354 0.467098 0.000 0.100 0.012 0.004 0.048 0.836
#> SRR1480854 1 0.0972 0.764393 0.964 0.000 0.000 0.028 0.008 0.000
#> SRR1489394 1 0.2118 0.748462 0.888 0.000 0.000 0.104 0.008 0.000
#> SRR1418085 1 0.0622 0.765605 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008 0.000
#> SRR1340221 1 0.2100 0.767082 0.884 0.000 0.000 0.112 0.004 0.000
#> SRR1473058 3 0.6178 0.204049 0.008 0.000 0.464 0.400 0.044 0.084
#> SRR1405165 3 0.2585 0.545032 0.000 0.000 0.880 0.068 0.048 0.004
#> SRR1433004 1 0.4843 0.567302 0.632 0.000 0.044 0.304 0.020 0.000
#> SRR1471477 1 0.5086 0.536471 0.616 0.000 0.056 0.304 0.024 0.000
#> SRR1098567 2 0.6490 -0.112782 0.000 0.456 0.184 0.000 0.320 0.040
#> SRR1098712 3 0.6651 0.229695 0.000 0.008 0.516 0.096 0.100 0.280
#> SRR1455038 1 0.4796 0.597940 0.652 0.000 0.048 0.280 0.020 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.6912 0.298569 0.128 0.000 0.552 0.152 0.148 0.020
#> SRR1348378 6 0.7674 0.134417 0.000 0.272 0.208 0.000 0.220 0.300
#> SRR1413541 1 0.4086 0.705805 0.752 0.000 0.044 0.188 0.016 0.000
#> SRR1392943 1 0.0858 0.771861 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004 0.000
#> SRR1475192 6 0.1413 0.476512 0.000 0.036 0.004 0.004 0.008 0.948
#> SRR1432085 2 0.6628 -0.133465 0.000 0.444 0.168 0.000 0.332 0.056
#> SRR1452468 1 0.5794 0.335167 0.528 0.000 0.088 0.348 0.036 0.000
#> SRR1347060 3 0.6314 0.050274 0.000 0.032 0.528 0.004 0.240 0.196
#> SRR1414139 5 0.6070 0.520797 0.000 0.168 0.316 0.008 0.500 0.008
#> SRR1447962 5 0.6547 0.275715 0.000 0.344 0.200 0.000 0.420 0.036
#> SRR1444324 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.3736 0.726541 0.788 0.000 0.032 0.160 0.020 0.000
#> SRR1413436 1 0.0508 0.768730 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004 0.000
#> SRR1311266 1 0.4917 0.563870 0.628 0.000 0.044 0.304 0.024 0.000
#> SRR1343302 1 0.4098 0.506181 0.676 0.000 0.032 0.292 0.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.3942 0.697631 0.752 0.000 0.024 0.204 0.020 0.000
#> SRR1429678 1 0.0665 0.767491 0.980 0.000 0.004 0.008 0.008 0.000
#> SRR1469413 5 0.6547 0.275715 0.000 0.344 0.200 0.000 0.420 0.036
#> SRR1405331 3 0.3944 0.548340 0.012 0.000 0.808 0.104 0.028 0.048
#> SRR1345609 1 0.0260 0.763295 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1380208 3 0.6642 0.000366 0.100 0.000 0.464 0.356 0.068 0.012
#> SRR1322840 1 0.2118 0.746421 0.888 0.000 0.000 0.104 0.008 0.000
#> SRR1399797 3 0.4689 0.427969 0.000 0.012 0.736 0.012 0.128 0.112
#> SRR1416654 3 0.2015 0.528749 0.000 0.000 0.916 0.016 0.056 0.012
#> SRR1315081 2 0.4689 0.597485 0.000 0.712 0.060 0.000 0.196 0.032
#> SRR1369196 3 0.6920 -0.184329 0.000 0.088 0.480 0.004 0.256 0.172
#> SRR1400847 1 0.1820 0.777282 0.924 0.000 0.008 0.056 0.012 0.000
#> SRR1365291 1 0.6065 0.319337 0.528 0.000 0.144 0.296 0.032 0.000
#> SRR1367920 4 0.5776 0.686660 0.152 0.000 0.120 0.660 0.052 0.016
#> SRR1366648 3 0.3232 0.464633 0.000 0.004 0.824 0.004 0.140 0.028
#> SRR1441679 2 0.0000 0.824653 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.3383 0.547485 0.004 0.000 0.832 0.112 0.016 0.036
#> SRR1363968 1 0.1606 0.776857 0.932 0.000 0.004 0.056 0.008 0.000
#> SRR814387 1 0.0520 0.767192 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR657599 1 0.1003 0.774220 0.964 0.000 0.000 0.020 0.016 0.000
#> SRR1386689 1 0.4186 0.477265 0.656 0.000 0.032 0.312 0.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.4205 0.529160 0.048 0.000 0.780 0.136 0.024 0.012
#> SRR1453811 3 0.6315 -0.220648 0.292 0.000 0.492 0.192 0.012 0.012
#> SRR1441159 1 0.4989 0.542061 0.616 0.000 0.052 0.312 0.020 0.000
#> SRR1403154 1 0.2361 0.762920 0.880 0.000 0.012 0.104 0.004 0.000
#> SRR1468722 3 0.5367 0.459415 0.092 0.000 0.696 0.140 0.064 0.008
#> SRR1310275 3 0.3552 0.545534 0.008 0.000 0.820 0.124 0.016 0.032
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.975 0.990 0.4735 0.526 0.526
#> 3 3 0.983 0.940 0.969 0.3404 0.708 0.506
#> 4 4 0.690 0.592 0.788 0.1506 0.853 0.626
#> 5 5 0.677 0.563 0.745 0.0738 0.826 0.470
#> 6 6 0.711 0.560 0.724 0.0417 0.924 0.680
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1331708 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1464258 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR661589 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1315165 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1094457 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1315931 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1430066 2 0.6048 0.8277 0.148 0.852
#> SRR1431037 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1395554 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1344143 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1486845 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1383907 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1429846 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR613550 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1324025 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1318879 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR820755 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1485830 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR599313 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1415398 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1326205 1 0.4022 0.9088 0.920 0.080
#> SRR1421327 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1083311 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1499303 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1079522 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1452935 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR661361 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR655182 2 0.9209 0.5038 0.336 0.664
#> SRR1335140 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1433555 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1308650 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1317446 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1413602 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR661313 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1499935 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1447303 1 0.5519 0.8499 0.872 0.128
#> SRR1429408 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1433950 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1409854 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1435229 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1414229 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1400974 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR613927 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR813776 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR808196 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1101085 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR614395 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1478251 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR665310 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1420109 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1330920 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1419539 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1359447 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1347259 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR613915 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1384395 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR821715 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1341480 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1326270 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1498838 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1416313 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR808566 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1430270 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1367825 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR613533 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR661267 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1407250 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1420067 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1473632 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR812536 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1407671 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1446375 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1465230 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR614119 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR660510 2 0.2603 0.9435 0.044 0.956
#> SRR1445655 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR658953 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1485312 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1317631 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1330588 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.7950 0.6839 0.760 0.240
#> SRR1433926 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1091302 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR818263 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1404909 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1442422 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1407112 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1332969 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1353199 2 0.9993 0.0768 0.484 0.516
#> SRR1378885 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR665357 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1501020 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1347819 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1472576 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1431781 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1452270 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1500472 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1417632 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1458113 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1326579 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1096712 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1090407 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1377599 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1488449 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1318354 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1359062 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1398924 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR663783 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1319204 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1498595 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1377423 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1338426 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1353309 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR658941 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1324085 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1363858 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR819820 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1337342 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR655206 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1387013 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1415379 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR663197 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1394836 2 0.0938 0.9733 0.012 0.988
#> SRR661699 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR813680 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1378109 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1382851 2 0.7602 0.7230 0.220 0.780
#> SRR1433410 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR661167 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1432518 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR660462 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1374608 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR657949 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1308882 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1485870 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1444138 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1470193 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1091380 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1467102 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1485416 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR818821 2 0.0376 0.9803 0.004 0.996
#> SRR809963 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1353710 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1445259 2 0.4298 0.8980 0.088 0.912
#> SRR1408393 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1310542 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1333485 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1406437 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1354931 2 0.4431 0.8941 0.092 0.908
#> SRR1391856 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1446738 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR815869 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR613150 1 0.9286 0.4689 0.656 0.344
#> SRR1375329 2 0.4815 0.8808 0.104 0.896
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR812943 2 0.7745 0.7108 0.228 0.772
#> SRR1400910 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1444203 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR658754 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1429603 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1397366 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1337606 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR659109 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR656946 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1342067 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1385389 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR612935 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1393596 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1070503 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1499894 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1082883 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1328620 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1396294 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1419917 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR662114 1 0.9833 0.2519 0.576 0.424
#> SRR1489199 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR813584 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1069638 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR614864 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR2167710 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1401252 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1309963 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1486889 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1486538 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1340486 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1465459 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1080270 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1312501 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1093148 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1467080 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR816475 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1379198 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR613342 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1369129 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1396616 2 0.6623 0.7961 0.172 0.828
#> SRR813824 2 0.9795 0.3017 0.416 0.584
#> SRR1082376 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1500891 1 0.2603 0.9486 0.956 0.044
#> SRR807543 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.4431 0.8946 0.908 0.092
#> SRR1346689 2 0.9248 0.4953 0.340 0.660
#> SRR1332424 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR663729 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR613675 1 0.4431 0.8946 0.908 0.092
#> SRR1485357 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR655816 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.3431 0.9238 0.064 0.936
#> SRR1355172 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1338147 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1413329 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1333308 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR809018 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR663440 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR808019 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1479133 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR615069 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1456185 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1350069 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR664795 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1490721 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1085285 2 0.6247 0.8172 0.156 0.844
#> SRR1099072 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1351347 1 0.2603 0.9487 0.956 0.044
#> SRR1405525 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR809987 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR613639 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1402285 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1405660 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1095455 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1394734 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1365894 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1073581 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1473529 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR660764 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1328845 1 0.0938 0.9812 0.988 0.012
#> SRR1336415 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1379065 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1459190 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1346773 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1347459 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1333395 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1309248 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR809161 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1316320 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1432629 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1416578 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1405547 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1470534 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1309160 2 0.6048 0.8276 0.148 0.852
#> SRR663489 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1078489 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1332648 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR660614 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR615946 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR661108 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR817329 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1401990 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1467745 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR813137 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR818797 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR2164608 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1455586 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR819459 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1385501 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1361652 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1478547 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1430910 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1486762 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1480854 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1489394 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1418085 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1340221 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1473058 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1405165 1 0.9460 0.4190 0.636 0.364
#> SRR1433004 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1098712 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1455038 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1403005 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1475192 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1452468 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1347060 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1414139 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1343302 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1405331 1 0.8386 0.6332 0.732 0.268
#> SRR1345609 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1380208 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1322840 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1399797 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1416654 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1315081 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1369196 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1365291 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1367920 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1366648 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9838 0.000 1.000
#> SRR1082173 1 0.0672 0.9852 0.992 0.008
#> SRR1363968 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1386689 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1395575 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1453811 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1403154 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1468722 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
#> SRR1310275 1 0.0000 0.9929 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331708 3 0.0892 0.966 0.020 0.000 0.980
#> SRR1464258 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454201 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR661589 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1456229 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315165 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1094457 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1095575 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1315931 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1431037 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1395554 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR818002 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.3941 0.815 0.000 0.844 0.156
#> SRR1486845 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1362866 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1490740 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1311018 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429846 1 0.5948 0.426 0.640 0.000 0.360
#> SRR613550 3 0.6267 0.203 0.452 0.000 0.548
#> SRR1348402 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1324025 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1318879 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR820755 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485830 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR599313 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.6095 0.383 0.392 0.000 0.608
#> SRR1326205 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421327 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1083311 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1499303 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079522 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1452935 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1379495 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR661361 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR615778 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR655182 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1335140 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433555 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1308650 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.5058 0.688 0.000 0.244 0.756
#> SRR1413602 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1479955 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR809853 3 0.5760 0.539 0.328 0.000 0.672
#> SRR661313 3 0.1129 0.966 0.020 0.004 0.976
#> SRR1499935 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447303 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1429408 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433950 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409854 1 0.5650 0.535 0.688 0.000 0.312
#> SRR1435229 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1085996 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 3 0.2625 0.908 0.000 0.084 0.916
#> SRR1400974 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1399971 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR613927 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR813776 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR808196 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1101085 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR614395 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478251 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1370551 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1420109 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1330920 1 0.5178 0.649 0.744 0.000 0.256
#> SRR1419539 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1359447 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347259 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR613915 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384395 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR821715 1 0.5905 0.445 0.648 0.000 0.352
#> SRR1478228 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR608150 3 0.1860 0.942 0.052 0.000 0.948
#> SRR1096383 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341480 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1341344 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1326270 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1498838 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1416313 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR808566 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR1430270 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1367825 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR613533 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR661267 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407250 3 0.1289 0.960 0.032 0.000 0.968
#> SRR1420067 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR812536 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1370850 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407671 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1446375 3 0.1170 0.965 0.016 0.008 0.976
#> SRR1465230 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR614119 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1445655 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR658953 1 0.6126 0.318 0.600 0.000 0.400
#> SRR2166459 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1485312 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1317631 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1488610 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1316367 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1433926 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR818263 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404909 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR663076 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442422 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1465893 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407112 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1332969 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1353199 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1378885 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR665357 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1347819 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1480813 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472576 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1431781 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1452270 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1500472 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1417632 3 0.0237 0.960 0.000 0.004 0.996
#> SRR1350153 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1326579 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1090407 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1083752 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1377599 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488449 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1318354 2 0.3619 0.836 0.000 0.864 0.136
#> SRR1359062 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398924 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR663783 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1319204 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1369070 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498595 2 0.5254 0.653 0.000 0.736 0.264
#> SRR1377423 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1312310 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1353309 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR658941 3 0.1182 0.965 0.012 0.012 0.976
#> SRR1101643 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324085 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1363858 3 0.1643 0.949 0.044 0.000 0.956
#> SRR819820 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1337342 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR655206 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1387013 3 0.2448 0.916 0.000 0.076 0.924
#> SRR1317410 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415379 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1099622 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR663197 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1394836 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR661699 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR813680 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1499174 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1311486 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1382851 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433410 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR661167 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1432518 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR660462 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1374608 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR657949 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308882 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR655768 3 0.1643 0.950 0.044 0.000 0.956
#> SRR1485870 3 0.5291 0.617 0.268 0.000 0.732
#> SRR1444138 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1417342 1 0.0237 0.967 0.996 0.000 0.004
#> SRR1470193 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091380 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1099096 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1467102 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485416 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR818821 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR809963 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1353710 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1445259 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1408393 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.2165 0.928 0.000 0.064 0.936
#> SRR1333485 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1406437 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1354931 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1391856 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446738 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1309032 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR815869 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR613150 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1375329 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1387921 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR812943 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1400910 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1444203 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR816177 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR658754 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1429603 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1397366 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1446028 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.4750 0.732 0.000 0.784 0.216
#> SRR1337606 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR659109 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1337192 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR656946 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1476102 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1476447 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1385389 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1075971 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322936 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1349121 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR612935 2 0.5988 0.407 0.000 0.632 0.368
#> SRR661481 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1393596 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 1 0.0237 0.965 0.996 0.000 0.004
#> SRR1499894 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1082883 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1468271 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR810295 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1396294 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419917 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1489199 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR813584 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1069638 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR614864 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1433392 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR2167710 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1401252 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1309963 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1338031 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.0237 0.967 0.996 0.000 0.004
#> SRR1380393 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1337010 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1340486 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1377696 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465459 3 0.2796 0.895 0.092 0.000 0.908
#> SRR1080270 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1312501 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1093148 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1467080 2 0.4291 0.778 0.000 0.820 0.180
#> SRR1410866 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR816475 1 0.6291 0.179 0.532 0.000 0.468
#> SRR1379198 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR613342 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1452246 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369129 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1396616 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR813824 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1082376 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500891 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR807543 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091572 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1346689 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR663729 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1097013 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR613675 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1485357 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR655816 1 0.5948 0.426 0.640 0.000 0.360
#> SRR1500113 1 0.4605 0.730 0.796 0.000 0.204
#> SRR1437622 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355172 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1413329 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1485931 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1452033 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR809018 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1375351 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR663440 1 0.6062 0.363 0.616 0.000 0.384
#> SRR1471755 2 0.5291 0.646 0.000 0.732 0.268
#> SRR808019 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479133 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR615069 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1456185 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350069 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR664795 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490721 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR810643 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.5948 0.426 0.640 0.000 0.360
#> SRR1085285 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1099072 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1317985 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1405525 1 0.3752 0.812 0.856 0.000 0.144
#> SRR1370329 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR819610 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR2157314 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR809987 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR613639 3 0.6026 0.424 0.376 0.000 0.624
#> SRR1402285 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1077038 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405660 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1095455 3 0.1129 0.966 0.020 0.004 0.976
#> SRR1394734 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1317771 1 0.0237 0.967 0.996 0.000 0.004
#> SRR1365894 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073581 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR660764 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328845 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR1336415 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1379065 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1459190 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1346773 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1081209 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1309248 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR809161 3 0.6154 0.339 0.408 0.000 0.592
#> SRR1316320 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1432629 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1405547 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1470534 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1380764 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR663489 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1500450 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1332648 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR660614 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR615946 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1446481 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR660224 2 0.1163 0.954 0.000 0.972 0.028
#> SRR665586 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485722 3 0.1163 0.964 0.028 0.000 0.972
#> SRR1415316 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR2170173 1 0.5859 0.464 0.656 0.000 0.344
#> SRR817329 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401990 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1467745 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR813137 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 3 0.0747 0.961 0.000 0.016 0.984
#> SRR818797 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164608 1 0.6180 0.271 0.584 0.000 0.416
#> SRR1455586 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR819459 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1488939 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.5254 0.661 0.264 0.000 0.736
#> SRR1361652 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.1129 0.966 0.020 0.004 0.976
#> SRR1430910 2 0.4346 0.773 0.000 0.816 0.184
#> SRR1310584 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486762 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480854 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1489394 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1418085 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1340221 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1473058 3 0.0892 0.961 0.000 0.020 0.980
#> SRR1405165 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1433004 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098712 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1455038 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1348378 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1475192 2 0.4702 0.730 0.000 0.788 0.212
#> SRR1432085 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452468 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347060 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1414139 3 0.3619 0.846 0.000 0.136 0.864
#> SRR1447962 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1373746 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1345609 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1380208 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1322840 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1399797 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1416654 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1315081 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1400847 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 1 0.5810 0.482 0.664 0.000 0.336
#> SRR1367920 3 0.0000 0.958 0.000 0.000 1.000
#> SRR1366648 3 0.1031 0.961 0.000 0.024 0.976
#> SRR1441679 2 0.0000 0.978 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1363968 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1386689 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1395575 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1453811 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1441159 1 0.0000 0.968 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 1 0.1031 0.960 0.976 0.000 0.024
#> SRR1468722 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
#> SRR1310275 3 0.1031 0.966 0.024 0.000 0.976
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 1 0.0000 0.7835 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331708 4 0.2921 0.4466 0.000 0.000 0.140 0.860
#> SRR1464258 1 0.4877 0.4039 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1454201 4 0.4072 0.2263 0.000 0.000 0.252 0.748
#> SRR661589 4 0.4040 0.2359 0.000 0.000 0.248 0.752
#> SRR1456229 1 0.2149 0.7496 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1315165 4 0.4406 0.4785 0.000 0.000 0.300 0.700
#> SRR1488960 1 0.0188 0.7832 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1417809 1 0.7180 0.4397 0.504 0.000 0.348 0.148
#> SRR1094457 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1095575 4 0.3873 0.2793 0.000 0.000 0.228 0.772
#> SRR1315931 1 0.0000 0.7835 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1431037 3 0.4761 0.8631 0.000 0.000 0.628 0.372
#> SRR1395554 3 0.4679 0.8578 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR818002 2 0.0469 0.9300 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1344143 2 0.5543 0.3347 0.000 0.556 0.424 0.020
#> SRR1486845 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1362866 4 0.0921 0.4000 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1490740 1 0.0469 0.7821 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0188 0.7834 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1383907 4 0.6508 0.3592 0.088 0.000 0.344 0.568
#> SRR1311018 1 0.0592 0.7820 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1375699 2 0.0469 0.9300 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1429846 4 0.7391 0.1188 0.396 0.000 0.164 0.440
#> SRR613550 4 0.7170 0.3957 0.268 0.000 0.184 0.548
#> SRR1348402 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1345146 4 0.3907 0.2724 0.000 0.000 0.232 0.768
#> SRR1324025 3 0.4907 0.8008 0.000 0.000 0.580 0.420
#> SRR1318879 4 0.4193 0.1829 0.000 0.000 0.268 0.732
#> SRR820755 1 0.1389 0.7704 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1485830 4 0.6106 0.3957 0.060 0.000 0.348 0.592
#> SRR599313 1 0.5016 0.4126 0.600 0.000 0.004 0.396
#> SRR612263 1 0.0592 0.7810 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1415398 4 0.7036 0.3999 0.208 0.000 0.216 0.576
#> SRR1326205 4 0.4961 -0.0354 0.000 0.000 0.448 0.552
#> SRR1421327 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1083311 3 0.4790 0.8623 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1499303 4 0.4605 0.4764 0.000 0.000 0.336 0.664
#> SRR1079522 4 0.0921 0.3942 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1452935 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1379495 1 0.0188 0.7834 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661361 4 0.5000 -0.6096 0.000 0.000 0.496 0.504
#> SRR615778 1 0.4925 0.3720 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1447564 1 0.0336 0.7828 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1455195 1 0.0000 0.7835 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655182 3 0.4746 0.8601 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR1335140 4 0.4877 -0.4967 0.000 0.000 0.408 0.592
#> SRR1433555 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1308650 2 0.4866 0.4135 0.000 0.596 0.404 0.000
#> SRR1388354 1 0.0336 0.7828 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1317446 3 0.5220 0.8486 0.000 0.016 0.632 0.352
#> SRR1413602 3 0.4776 0.8626 0.000 0.000 0.624 0.376
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809853 4 0.7251 0.0540 0.416 0.000 0.144 0.440
#> SRR661313 3 0.4790 0.8623 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1499935 4 0.4585 0.4767 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1447303 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1429408 4 0.3610 0.4642 0.000 0.000 0.200 0.800
#> SRR1433950 1 0.1302 0.7715 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 4 0.7485 0.1620 0.380 0.000 0.180 0.440
#> SRR1435229 3 0.4730 0.8606 0.000 0.000 0.636 0.364
#> SRR1085996 1 0.0592 0.7810 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1414229 3 0.6302 0.7522 0.000 0.068 0.564 0.368
#> SRR1400974 3 0.4790 0.8623 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1399971 1 0.4790 0.4400 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR613927 1 0.4925 0.3676 0.572 0.000 0.000 0.428
#> SRR1457854 1 0.0336 0.7828 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1473714 4 0.2586 0.4214 0.040 0.000 0.048 0.912
#> SRR813776 1 0.4888 0.3967 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR808196 1 0.7706 0.3103 0.424 0.000 0.348 0.228
#> SRR1101085 4 0.6106 0.3957 0.060 0.000 0.348 0.592
#> SRR614395 1 0.4072 0.6087 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1478251 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.7835 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 4 0.4538 0.3126 0.024 0.000 0.216 0.760
#> SRR1420109 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1330920 1 0.5273 0.2990 0.536 0.000 0.008 0.456
#> SRR1419539 3 0.4830 0.8143 0.000 0.000 0.608 0.392
#> SRR1359447 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347259 4 0.6295 0.3837 0.072 0.000 0.348 0.580
#> SRR613915 1 0.1557 0.7669 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1384395 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821715 4 0.7488 0.1545 0.384 0.000 0.180 0.436
#> SRR1478228 1 0.0336 0.7828 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1445637 1 0.4605 0.5078 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR608150 4 0.5036 0.3121 0.280 0.000 0.024 0.696
#> SRR1096383 1 0.0000 0.7835 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341480 4 0.6234 0.3880 0.068 0.000 0.348 0.584
#> SRR1341344 1 0.0817 0.7779 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1326270 4 0.3907 0.2724 0.000 0.000 0.232 0.768
#> SRR1498838 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1416313 3 0.4790 0.8623 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR808566 4 0.4331 0.4792 0.000 0.000 0.288 0.712
#> SRR1430270 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1367825 3 0.4730 0.8609 0.000 0.000 0.636 0.364
#> SRR613533 3 0.4713 0.8605 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR661267 1 0.0469 0.7820 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR810665 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 4 0.7527 0.3425 0.300 0.000 0.216 0.484
#> SRR1420067 1 0.0336 0.7828 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1473632 3 0.4843 0.8074 0.000 0.000 0.604 0.396
#> SRR812536 4 0.3764 0.2928 0.000 0.000 0.216 0.784
#> SRR1370850 2 0.0592 0.9279 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 4 0.4955 -0.5298 0.000 0.000 0.444 0.556
#> SRR1446375 3 0.4713 0.8605 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1465230 1 0.4973 0.5634 0.644 0.000 0.348 0.008
#> SRR614119 1 0.4855 0.4165 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR1356101 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.2081 0.7520 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR660510 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1445655 1 0.7561 0.3044 0.452 0.000 0.348 0.200
#> SRR658953 4 0.5055 0.3788 0.256 0.000 0.032 0.712
#> SRR2166459 1 0.0817 0.7790 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1070713 4 0.4955 -0.5298 0.000 0.000 0.444 0.556
#> SRR1485312 4 0.3873 0.2779 0.000 0.000 0.228 0.772
#> SRR1317631 4 0.6819 0.3319 0.112 0.000 0.348 0.540
#> SRR1488610 1 0.4843 0.4164 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1330588 4 0.4790 -0.2389 0.000 0.000 0.380 0.620
#> SRR1316367 4 0.4933 -0.5378 0.000 0.000 0.432 0.568
#> SRR1433926 1 0.4877 0.4039 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1091302 3 0.7921 -0.3956 0.328 0.000 0.348 0.324
#> SRR818263 1 0.2011 0.7546 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1404909 4 0.5970 0.4012 0.052 0.000 0.348 0.600
#> SRR663076 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1323577 2 0.0188 0.9334 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1442422 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1465893 1 0.0188 0.7834 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR654862 1 0.4877 0.4039 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1407112 1 0.5495 0.5451 0.624 0.000 0.348 0.028
#> SRR1332969 4 0.3726 0.2985 0.000 0.000 0.212 0.788
#> SRR1353199 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1378885 1 0.4817 0.4360 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR665357 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 4 0.3764 0.2928 0.000 0.000 0.216 0.784
#> SRR1347819 3 0.4776 0.8626 0.000 0.000 0.624 0.376
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.4948 -0.5227 0.000 0.000 0.440 0.560
#> SRR1431781 4 0.6171 0.3899 0.064 0.000 0.348 0.588
#> SRR1452270 4 0.3837 0.2826 0.000 0.000 0.224 0.776
#> SRR1500472 3 0.4746 0.8628 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR1417632 3 0.4961 0.3184 0.000 0.000 0.552 0.448
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.4679 0.8578 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1326579 1 0.4843 0.4164 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1349363 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.4697 0.8593 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1090407 4 0.3945 0.2969 0.004 0.000 0.216 0.780
#> SRR1083752 4 0.4948 -0.5227 0.000 0.000 0.440 0.560
#> SRR1377599 4 0.4103 0.4739 0.000 0.000 0.256 0.744
#> SRR1488449 4 0.3764 0.2928 0.000 0.000 0.216 0.784
#> SRR1318354 2 0.7734 -0.2213 0.000 0.420 0.344 0.236
#> SRR1359062 2 0.1118 0.9130 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1398924 3 0.4679 0.8578 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR663783 3 0.4746 0.8605 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR1319204 3 0.4679 0.8578 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0592 0.7810 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498595 3 0.7722 0.1212 0.000 0.336 0.428 0.236
#> SRR1377423 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.4746 0.4583 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1338426 3 0.4679 0.8578 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1353309 4 0.3907 0.2724 0.000 0.000 0.232 0.768
#> SRR658941 3 0.4898 0.8031 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR1101643 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1401468 1 0.4843 0.4164 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.6171 0.3911 0.064 0.000 0.348 0.588
#> SRR1363858 4 0.2984 0.4495 0.084 0.000 0.028 0.888
#> SRR819820 4 0.3907 0.2701 0.000 0.000 0.232 0.768
#> SRR1337342 1 0.4855 0.4134 0.600 0.000 0.000 0.400
#> SRR655206 4 0.4981 -0.5679 0.000 0.000 0.464 0.536
#> SRR1387013 3 0.7154 0.3936 0.000 0.132 0.436 0.432
#> SRR1317410 1 0.0000 0.7835 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.4888 0.3943 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1099622 2 0.2530 0.8415 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR663197 3 0.4776 0.8626 0.000 0.000 0.624 0.376
#> SRR1394836 4 0.4933 -0.5321 0.000 0.000 0.432 0.568
#> SRR661699 4 0.3649 0.3035 0.000 0.000 0.204 0.796
#> SRR813680 1 0.2216 0.7471 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1410678 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1378109 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1499174 4 0.3873 0.2793 0.000 0.000 0.228 0.772
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 3 0.4989 0.2606 0.000 0.000 0.528 0.472
#> SRR1433410 1 0.4843 0.4164 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR661167 3 0.4941 0.7673 0.000 0.000 0.564 0.436
#> SRR1432518 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR660462 3 0.4776 0.8626 0.000 0.000 0.624 0.376
#> SRR1374608 1 0.5495 0.5553 0.624 0.000 0.348 0.028
#> SRR657949 1 0.1211 0.7738 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1308882 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR655768 4 0.7628 0.2368 0.348 0.000 0.212 0.440
#> SRR1485870 4 0.5040 0.4548 0.008 0.000 0.364 0.628
#> SRR1444138 3 0.4713 0.8605 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1417342 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1470193 4 0.3569 0.4652 0.000 0.000 0.196 0.804
#> SRR1091380 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1099096 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1313583 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1467102 2 0.0469 0.9300 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1485416 4 0.5937 0.4039 0.052 0.000 0.340 0.608
#> SRR818821 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR809963 1 0.0469 0.7820 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1072247 1 0.0921 0.7763 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1353710 3 0.7919 -0.4353 0.316 0.000 0.348 0.336
#> SRR1445259 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1408393 1 0.2921 0.7145 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1361522 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1368597 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1309680 2 0.0592 0.9279 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1310542 3 0.4679 0.8578 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1333485 1 0.5306 0.5511 0.632 0.000 0.348 0.020
#> SRR1406437 4 0.1474 0.3594 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1354931 3 0.4776 0.8616 0.000 0.000 0.624 0.376
#> SRR1391856 4 0.0592 0.3971 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1446738 4 0.4948 -0.5227 0.000 0.000 0.440 0.560
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.5643 0.2993 0.000 0.548 0.428 0.024
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815869 2 0.0469 0.9300 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR613150 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1375329 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1387921 1 0.0188 0.7834 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0336 0.7828 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR812943 3 0.4843 0.8339 0.000 0.000 0.604 0.396
#> SRR1400910 3 0.4746 0.8427 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR1444203 1 0.7687 0.3169 0.428 0.000 0.348 0.224
#> SRR816177 4 0.4948 -0.5227 0.000 0.000 0.440 0.560
#> SRR658754 3 0.4679 0.8578 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1429603 4 0.5970 0.4012 0.052 0.000 0.348 0.600
#> SRR1397366 4 0.3873 0.2779 0.000 0.000 0.228 0.772
#> SRR1446028 1 0.4804 0.4356 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1083918 2 0.6315 0.2073 0.000 0.508 0.432 0.060
#> SRR1337606 4 0.3356 0.4578 0.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR659109 3 0.4790 0.8623 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1337192 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR656946 4 0.4972 -0.5527 0.000 0.000 0.456 0.544
#> SRR1476102 1 0.0817 0.7779 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1476447 1 0.0188 0.7834 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1342067 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1385389 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1075971 1 0.0469 0.7821 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR614419 1 0.0592 0.7810 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1322936 4 0.2281 0.3015 0.000 0.000 0.096 0.904
#> SRR1349121 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1430549 1 0.0336 0.7828 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR612935 3 0.7344 0.5815 0.000 0.188 0.512 0.300
#> SRR661481 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.4819 0.4751 0.004 0.000 0.344 0.652
#> SRR1452164 1 0.0188 0.7832 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1070503 1 0.5360 0.3261 0.552 0.000 0.012 0.436
#> SRR1499894 3 0.4679 0.8578 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1082883 4 0.6547 0.3589 0.092 0.000 0.340 0.568
#> SRR1468271 1 0.4843 0.4164 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1332443 1 0.1022 0.7746 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0524 0.7831 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1328620 3 0.4679 0.8578 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1396294 4 0.4356 0.4785 0.000 0.000 0.292 0.708
#> SRR1419917 1 0.1867 0.7588 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR662114 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1489199 1 0.4941 0.3521 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR813584 4 0.6323 -0.4906 0.000 0.060 0.440 0.500
#> SRR1069638 3 0.4830 0.8138 0.000 0.000 0.608 0.392
#> SRR614864 4 0.4086 0.3005 0.008 0.000 0.216 0.776
#> SRR1433392 1 0.2704 0.7254 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 4 0.3610 0.3085 0.000 0.000 0.200 0.800
#> SRR1401252 1 0.5306 0.5511 0.632 0.000 0.348 0.020
#> SRR1309963 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1338031 1 0.0817 0.7790 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.6952 0.3626 0.516 0.000 0.120 0.364
#> SRR1380393 1 0.0188 0.7834 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1319731 1 0.0188 0.7834 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1356468 4 0.7432 0.2160 0.180 0.000 0.348 0.472
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1486538 1 0.6106 0.5040 0.592 0.000 0.348 0.060
#> SRR1340486 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1377696 2 0.0817 0.9230 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1465459 4 0.6946 0.4009 0.200 0.000 0.212 0.588
#> SRR1080270 3 0.4679 0.8578 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1312501 4 0.4222 0.1715 0.000 0.000 0.272 0.728
#> SRR1093148 4 0.3801 0.2822 0.000 0.000 0.220 0.780
#> SRR1467080 2 0.7728 -0.2133 0.000 0.424 0.340 0.236
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.5478 0.4318 0.028 0.000 0.344 0.628
#> SRR1379198 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR613342 3 0.4679 0.8578 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1396616 3 0.4776 0.8616 0.000 0.000 0.624 0.376
#> SRR813824 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1082376 1 0.0817 0.7790 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1500891 3 0.4972 -0.0988 0.000 0.000 0.544 0.456
#> SRR807543 1 0.4933 0.3607 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1091572 4 0.4697 -0.4163 0.000 0.000 0.356 0.644
#> SRR1346689 3 0.4972 0.2853 0.000 0.000 0.544 0.456
#> SRR1332424 1 0.4843 0.4164 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR663729 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1097013 1 0.4790 0.4474 0.620 0.000 0.000 0.380
#> SRR613675 4 0.4522 -0.3372 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR1485357 4 0.6106 0.3957 0.060 0.000 0.348 0.592
#> SRR655816 4 0.7072 0.3970 0.268 0.000 0.172 0.560
#> SRR1500113 1 0.5193 0.3746 0.580 0.000 0.008 0.412
#> SRR1437622 4 0.4877 -0.4854 0.000 0.000 0.408 0.592
#> SRR1355172 1 0.1118 0.7753 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR655531 1 0.0469 0.7820 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1338147 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1413329 4 0.2918 0.3716 0.008 0.000 0.116 0.876
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.7835 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 4 0.6234 0.3880 0.068 0.000 0.348 0.584
#> SRR1452033 1 0.4776 0.4471 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.4776 0.8626 0.000 0.000 0.624 0.376
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663440 4 0.7105 0.3965 0.268 0.000 0.176 0.556
#> SRR1471755 2 0.6487 0.2242 0.000 0.500 0.428 0.072
#> SRR808019 1 0.0000 0.7835 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479133 4 0.3873 0.2753 0.000 0.000 0.228 0.772
#> SRR615069 3 0.4679 0.8578 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1456185 2 0.0592 0.9279 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1350069 4 0.4331 0.4772 0.000 0.000 0.288 0.712
#> SRR816316 1 0.0817 0.7790 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR664795 1 0.0469 0.7820 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1490721 4 0.6265 0.3837 0.072 0.000 0.340 0.588
#> SRR810643 1 0.0336 0.7828 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1430333 4 0.5130 0.2158 0.332 0.000 0.016 0.652
#> SRR1085285 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1099072 4 0.3726 0.2985 0.000 0.000 0.212 0.788
#> SRR1317985 1 0.0336 0.7828 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1487340 1 0.0188 0.7834 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1420276 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1405525 1 0.5212 0.3676 0.572 0.000 0.008 0.420
#> SRR1370329 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1465001 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819610 4 0.4948 -0.5308 0.000 0.000 0.440 0.560
#> SRR2157314 1 0.0592 0.7810 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.6106 0.3957 0.060 0.000 0.348 0.592
#> SRR613639 4 0.7468 0.2993 0.320 0.000 0.196 0.484
#> SRR1402285 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1077038 1 0.0188 0.7834 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1405660 3 0.4776 0.8626 0.000 0.000 0.624 0.376
#> SRR1095455 3 0.4713 0.8605 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1394734 4 0.5257 -0.5360 0.000 0.008 0.444 0.548
#> SRR1317771 1 0.0707 0.7794 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1365894 4 0.4697 0.4727 0.000 0.000 0.356 0.644
#> SRR1073581 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR659804 1 0.4697 0.4730 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR1345914 2 0.0592 0.9279 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1432186 2 0.0469 0.9300 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1473529 2 0.0592 0.9279 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR660764 2 0.0469 0.9300 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR820448 1 0.0817 0.7790 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1328845 4 0.3942 0.4040 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1336415 1 0.5403 0.5479 0.628 0.000 0.348 0.024
#> SRR1379065 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1459190 4 0.3975 0.2487 0.000 0.000 0.240 0.760
#> SRR1346773 1 0.4746 0.4576 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1499521 1 0.0188 0.7834 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.4679 0.8578 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1333395 4 0.6627 0.3422 0.096 0.000 0.348 0.556
#> SRR1309248 4 0.4941 -0.5163 0.000 0.000 0.436 0.564
#> SRR809161 4 0.7036 0.3999 0.208 0.000 0.216 0.576
#> SRR1316320 4 0.4933 -0.5102 0.000 0.000 0.432 0.568
#> SRR1432629 2 0.0469 0.9300 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1498931 1 0.0188 0.7832 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1416578 1 0.4973 0.5634 0.644 0.000 0.348 0.008
#> SRR1405547 3 0.4790 0.8623 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1470534 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1380764 1 0.0336 0.7828 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1309160 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR663489 3 0.4790 0.8623 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1500450 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1078489 4 0.1211 0.3847 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1332648 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR660614 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1477949 1 0.4500 0.5304 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.4776 0.4471 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR615946 3 0.4679 0.8578 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.0817 0.7790 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR660224 2 0.5821 0.2584 0.000 0.536 0.432 0.032
#> SRR665586 1 0.0469 0.7820 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1347166 1 0.4916 0.3798 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1485722 4 0.7247 0.4128 0.240 0.000 0.216 0.544
#> SRR1415316 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR613390 1 0.0817 0.7790 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR661108 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR2170173 4 0.7375 0.2402 0.348 0.000 0.172 0.480
#> SRR817329 1 0.0817 0.7790 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1401990 4 0.6819 0.3319 0.112 0.000 0.348 0.540
#> SRR1467745 2 0.5611 0.3660 0.000 0.564 0.412 0.024
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813137 1 0.0817 0.7790 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1314873 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1401211 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1419692 3 0.4925 0.2851 0.000 0.000 0.572 0.428
#> SRR818797 1 0.4941 0.3521 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR2164608 4 0.7128 0.4082 0.260 0.000 0.184 0.556
#> SRR1455586 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819459 3 0.4679 0.8578 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1488939 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 4 0.7613 0.2278 0.352 0.000 0.208 0.440
#> SRR1361652 2 0.6292 0.2221 0.000 0.524 0.416 0.060
#> SRR1437119 1 0.0336 0.7828 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1478547 3 0.4790 0.8623 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1430910 3 0.7252 0.5940 0.000 0.180 0.528 0.292
#> SRR1310584 1 0.0188 0.7834 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1500216 1 0.2053 0.7568 0.924 0.000 0.004 0.072
#> SRR1486762 2 0.1118 0.9130 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1480854 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1489394 1 0.5306 0.5511 0.632 0.000 0.348 0.020
#> SRR1418085 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1340221 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1473058 4 0.4941 -0.5163 0.000 0.000 0.436 0.564
#> SRR1405165 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1433004 1 0.4817 0.4356 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1471477 1 0.4877 0.3958 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1098567 2 0.0188 0.9334 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1098712 4 0.4948 -0.5227 0.000 0.000 0.440 0.560
#> SRR1455038 1 0.0817 0.7790 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1375248 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 4 0.3764 0.2928 0.000 0.000 0.216 0.784
#> SRR1348378 2 0.4103 0.6690 0.000 0.744 0.256 0.000
#> SRR1413541 1 0.2345 0.7420 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1392943 1 0.4643 0.5744 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR1475192 3 0.7467 0.5381 0.000 0.216 0.500 0.284
#> SRR1432085 2 0.0592 0.9279 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1452468 1 0.4961 0.3341 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1347060 3 0.4679 0.8578 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1414139 3 0.4990 0.8559 0.000 0.008 0.640 0.352
#> SRR1447962 2 0.0592 0.9279 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.4730 0.4603 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1413436 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1311266 1 0.3172 0.6930 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1343302 1 0.5306 0.5511 0.632 0.000 0.348 0.020
#> SRR1373746 1 0.0336 0.7828 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1429678 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1469413 2 0.2081 0.8697 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR1405331 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1345609 1 0.0817 0.7779 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1380208 4 0.1716 0.3541 0.000 0.000 0.064 0.936
#> SRR1322840 1 0.4661 0.5713 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1399797 3 0.4730 0.8605 0.000 0.000 0.636 0.364
#> SRR1416654 3 0.4804 0.8606 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1315081 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.4679 0.8578 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1400847 1 0.0188 0.7834 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1365291 4 0.7310 0.0839 0.408 0.000 0.152 0.440
#> SRR1367920 4 0.4585 0.4767 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1366648 3 0.4713 0.8602 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9349 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.4855 0.8378 0.000 0.000 0.600 0.400
#> SRR1363968 1 0.0000 0.7835 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0336 0.7830 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR657599 1 0.0817 0.7790 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1386689 3 0.7917 -0.3824 0.312 0.000 0.348 0.340
#> SRR1395575 4 0.4304 0.1319 0.000 0.000 0.284 0.716
#> SRR1453811 4 0.4049 0.3059 0.008 0.000 0.212 0.780
#> SRR1441159 1 0.3569 0.6569 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1403154 1 0.4837 0.5673 0.648 0.000 0.348 0.004
#> SRR1468722 4 0.3873 0.2753 0.000 0.000 0.228 0.772
#> SRR1310275 4 0.3873 0.2793 0.000 0.000 0.228 0.772
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 1 0.1341 0.7489 0.944 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1331708 5 0.6532 0.0547 0.000 0.000 0.204 0.348 0.448
#> SRR1464258 1 0.5874 0.5967 0.604 0.000 0.188 0.208 0.000
#> SRR1454201 3 0.2358 0.4937 0.000 0.000 0.888 0.008 0.104
#> SRR661589 3 0.2712 0.4949 0.000 0.000 0.880 0.032 0.088
#> SRR1456229 1 0.4636 0.7089 0.744 0.000 0.132 0.124 0.000
#> SRR1315165 4 0.6092 0.2167 0.000 0.000 0.132 0.504 0.364
#> SRR1488960 1 0.0798 0.7689 0.976 0.000 0.008 0.016 0.000
#> SRR1417809 4 0.4575 0.5856 0.236 0.000 0.052 0.712 0.000
#> SRR1094457 4 0.4101 0.5758 0.372 0.000 0.000 0.628 0.000
#> SRR1095575 3 0.3346 0.4933 0.000 0.000 0.844 0.092 0.064
#> SRR1315931 1 0.1121 0.7552 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1430066 3 0.3684 0.4309 0.000 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1431037 3 0.4210 0.2195 0.000 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1395554 5 0.4278 0.1697 0.000 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR818002 2 0.2690 0.8557 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1344143 5 0.2424 0.5464 0.000 0.132 0.000 0.000 0.868
#> SRR1486845 4 0.4114 0.5713 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1362866 3 0.6987 0.0172 0.020 0.000 0.436 0.192 0.352
#> SRR1490740 1 0.0671 0.7745 0.980 0.000 0.016 0.004 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.1544 0.7435 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1383907 4 0.3018 0.5859 0.004 0.000 0.068 0.872 0.056
#> SRR1311018 1 0.3012 0.7518 0.860 0.000 0.036 0.104 0.000
#> SRR1375699 2 0.2648 0.8597 0.000 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1429846 3 0.6504 -0.1805 0.356 0.000 0.448 0.196 0.000
#> SRR613550 3 0.5008 0.3977 0.140 0.000 0.708 0.152 0.000
#> SRR1348402 1 0.1965 0.7234 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1345146 3 0.3242 0.4781 0.000 0.000 0.844 0.040 0.116
#> SRR1324025 3 0.3424 0.4480 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1318879 3 0.3171 0.4694 0.000 0.000 0.816 0.008 0.176
#> SRR820755 1 0.3994 0.7270 0.772 0.000 0.188 0.040 0.000
#> SRR1485830 4 0.2955 0.5890 0.004 0.000 0.060 0.876 0.060
#> SRR599313 1 0.5629 0.5363 0.588 0.000 0.100 0.312 0.000
#> SRR612263 1 0.1430 0.7749 0.944 0.000 0.052 0.004 0.000
#> SRR1415398 3 0.3569 0.4609 0.068 0.000 0.828 0.104 0.000
#> SRR1326205 5 0.5490 0.4536 0.000 0.000 0.148 0.200 0.652
#> SRR1421327 4 0.4030 0.5923 0.352 0.000 0.000 0.648 0.000
#> SRR1083311 3 0.4074 0.3254 0.000 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1499303 4 0.6208 0.1941 0.000 0.000 0.144 0.480 0.376
#> SRR1079522 5 0.6785 0.0567 0.000 0.000 0.304 0.308 0.388
#> SRR1452935 3 0.4114 0.3018 0.000 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1379495 1 0.1544 0.7409 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.3143 0.4625 0.000 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR615778 1 0.6572 0.4174 0.452 0.000 0.328 0.220 0.000
#> SRR1447564 1 0.0703 0.7752 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.1121 0.7552 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR655182 5 0.3424 0.4984 0.000 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR1335140 5 0.4322 0.5426 0.000 0.000 0.144 0.088 0.768
#> SRR1433555 3 0.3876 0.3968 0.000 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1308650 5 0.4302 -0.1388 0.000 0.480 0.000 0.000 0.520
#> SRR1388354 1 0.1106 0.7760 0.964 0.000 0.024 0.012 0.000
#> SRR1317446 5 0.4161 0.2125 0.000 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1413602 3 0.4138 0.2857 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809853 3 0.6180 -0.2027 0.404 0.000 0.460 0.136 0.000
#> SRR661313 3 0.4138 0.2857 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1499935 4 0.6054 0.2097 0.000 0.000 0.124 0.496 0.380
#> SRR1447303 3 0.3730 0.4261 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1429408 4 0.6438 0.0901 0.000 0.000 0.176 0.424 0.400
#> SRR1433950 1 0.4317 0.7208 0.772 0.000 0.116 0.112 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 3 0.6232 -0.1515 0.372 0.000 0.480 0.148 0.000
#> SRR1435229 5 0.3366 0.5049 0.000 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR1085996 1 0.1430 0.7751 0.944 0.000 0.052 0.004 0.000
#> SRR1414229 5 0.1478 0.5847 0.000 0.000 0.064 0.000 0.936
#> SRR1400974 3 0.4074 0.3254 0.000 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1399971 1 0.5329 0.6220 0.656 0.000 0.108 0.236 0.000
#> SRR613927 1 0.5744 0.5640 0.572 0.000 0.320 0.108 0.000
#> SRR1457854 1 0.1012 0.7757 0.968 0.000 0.020 0.012 0.000
#> SRR1473714 5 0.7329 0.0326 0.024 0.000 0.284 0.320 0.372
#> SRR813776 1 0.5811 0.5627 0.568 0.000 0.316 0.116 0.000
#> SRR808196 4 0.2569 0.6302 0.076 0.000 0.016 0.896 0.012
#> SRR1101085 4 0.3021 0.5875 0.004 0.000 0.064 0.872 0.060
#> SRR614395 1 0.5201 0.6770 0.684 0.000 0.188 0.128 0.000
#> SRR1478251 4 0.4114 0.5713 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0671 0.7739 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR665310 3 0.3336 0.4679 0.060 0.000 0.844 0.096 0.000
#> SRR1420109 3 0.4101 0.3088 0.000 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1330920 3 0.6477 -0.1711 0.352 0.000 0.456 0.192 0.000
#> SRR1419539 5 0.2230 0.5600 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1359447 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347259 4 0.2819 0.5915 0.004 0.000 0.052 0.884 0.060
#> SRR613915 1 0.3910 0.7259 0.772 0.000 0.196 0.032 0.000
#> SRR1384395 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821715 3 0.4967 0.3924 0.192 0.000 0.704 0.104 0.000
#> SRR1478228 1 0.0324 0.7719 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1445637 1 0.4971 0.6885 0.712 0.000 0.144 0.144 0.000
#> SRR608150 5 0.7509 -0.0741 0.052 0.000 0.196 0.368 0.384
#> SRR1096383 1 0.0290 0.7681 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1341480 4 0.3085 0.5856 0.004 0.000 0.068 0.868 0.060
#> SRR1341344 1 0.2179 0.7104 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1326270 3 0.2889 0.4960 0.000 0.000 0.872 0.044 0.084
#> SRR1498838 3 0.3837 0.4062 0.000 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR1416313 3 0.4138 0.2857 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR808566 4 0.6356 0.1683 0.000 0.000 0.168 0.468 0.364
#> SRR1430270 4 0.4126 0.5656 0.380 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1367825 3 0.4294 0.0593 0.000 0.000 0.532 0.000 0.468
#> SRR613533 3 0.4306 -0.0299 0.000 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR661267 1 0.1403 0.7718 0.952 0.000 0.024 0.024 0.000
#> SRR810665 2 0.1410 0.9194 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1407250 3 0.6554 -0.2383 0.392 0.000 0.408 0.200 0.000
#> SRR1420067 1 0.1012 0.7757 0.968 0.000 0.020 0.012 0.000
#> SRR1473632 5 0.2424 0.5724 0.000 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR812536 3 0.2068 0.4858 0.004 0.000 0.904 0.092 0.000
#> SRR1370850 2 0.3003 0.8246 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 5 0.2408 0.5905 0.000 0.000 0.092 0.016 0.892
#> SRR1446375 5 0.4307 0.0565 0.000 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1465230 4 0.3999 0.5957 0.344 0.000 0.000 0.656 0.000
#> SRR614119 1 0.5696 0.6198 0.628 0.000 0.172 0.200 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.4591 0.7114 0.748 0.000 0.132 0.120 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.1965 0.7234 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR660510 3 0.3707 0.4292 0.000 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1445655 4 0.3174 0.6425 0.132 0.000 0.004 0.844 0.020
#> SRR658953 3 0.5887 0.3558 0.164 0.000 0.668 0.136 0.032
#> SRR2166459 1 0.3053 0.7484 0.828 0.000 0.164 0.008 0.000
#> SRR1070713 5 0.1018 0.5949 0.000 0.000 0.016 0.016 0.968
#> SRR1485312 3 0.2389 0.4866 0.000 0.000 0.880 0.116 0.004
#> SRR1317631 4 0.3009 0.6157 0.028 0.000 0.080 0.876 0.016
#> SRR1488610 1 0.5799 0.5946 0.612 0.000 0.168 0.220 0.000
#> SRR1330588 3 0.3280 0.4695 0.000 0.000 0.812 0.012 0.176
#> SRR1316367 5 0.2920 0.5739 0.000 0.000 0.132 0.016 0.852
#> SRR1433926 1 0.5930 0.5885 0.596 0.000 0.196 0.208 0.000
#> SRR1091302 4 0.1673 0.6266 0.032 0.000 0.008 0.944 0.016
#> SRR818263 1 0.4723 0.7036 0.736 0.000 0.132 0.132 0.000
#> SRR1404909 4 0.3021 0.5875 0.004 0.000 0.064 0.872 0.060
#> SRR663076 1 0.1608 0.7379 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1323577 2 0.1908 0.9029 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1442422 4 0.4060 0.5869 0.360 0.000 0.000 0.640 0.000
#> SRR1465893 1 0.1282 0.7669 0.952 0.000 0.004 0.044 0.000
#> SRR654862 1 0.5819 0.6056 0.612 0.000 0.188 0.200 0.000
#> SRR1407112 4 0.2813 0.6413 0.168 0.000 0.000 0.832 0.000
#> SRR1332969 3 0.2389 0.4851 0.004 0.000 0.880 0.116 0.000
#> SRR1353199 3 0.3707 0.4292 0.000 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1378885 1 0.5334 0.6647 0.672 0.000 0.180 0.148 0.000
#> SRR665357 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.2338 0.4858 0.004 0.000 0.884 0.112 0.000
#> SRR1347819 3 0.4171 0.2655 0.000 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 5 0.1018 0.5949 0.000 0.000 0.016 0.016 0.968
#> SRR1431781 4 0.2955 0.5890 0.004 0.000 0.060 0.876 0.060
#> SRR1452270 3 0.1831 0.4911 0.000 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1500472 3 0.4306 -0.0259 0.000 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR1417632 5 0.3119 0.5822 0.000 0.000 0.072 0.068 0.860
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 5 0.4273 0.1768 0.000 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR1326579 1 0.5841 0.5918 0.608 0.000 0.180 0.212 0.000
#> SRR1349363 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.4302 0.0121 0.000 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1090407 3 0.2624 0.4827 0.012 0.000 0.872 0.116 0.000
#> SRR1083752 5 0.1469 0.5977 0.000 0.000 0.036 0.016 0.948
#> SRR1377599 4 0.6416 0.1418 0.000 0.000 0.176 0.452 0.372
#> SRR1488449 3 0.1851 0.4878 0.000 0.000 0.912 0.088 0.000
#> SRR1318354 5 0.6047 0.2494 0.000 0.136 0.332 0.000 0.532
#> SRR1359062 2 0.3949 0.6129 0.000 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR1398924 5 0.2020 0.5811 0.000 0.000 0.100 0.000 0.900
#> SRR663783 3 0.4210 0.2296 0.000 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1319204 5 0.4256 0.1972 0.000 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.1041 0.7754 0.964 0.000 0.032 0.004 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498595 5 0.2110 0.5694 0.000 0.072 0.000 0.016 0.912
#> SRR1377423 3 0.3857 0.4018 0.000 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.5335 0.6458 0.668 0.000 0.132 0.200 0.000
#> SRR1338426 5 0.4305 0.0747 0.000 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR1353309 3 0.2790 0.4993 0.000 0.000 0.880 0.052 0.068
#> SRR658941 5 0.2605 0.5656 0.000 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR1101643 1 0.1965 0.7234 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1401468 1 0.5666 0.5928 0.620 0.000 0.136 0.244 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.2819 0.5915 0.004 0.000 0.052 0.884 0.060
#> SRR1363858 5 0.6946 0.0045 0.008 0.000 0.244 0.360 0.388
#> SRR819820 3 0.2228 0.5001 0.000 0.000 0.912 0.040 0.048
#> SRR1337342 1 0.5805 0.6039 0.612 0.000 0.172 0.216 0.000
#> SRR655206 5 0.2470 0.5870 0.000 0.000 0.104 0.012 0.884
#> SRR1387013 5 0.1018 0.5949 0.000 0.000 0.016 0.016 0.968
#> SRR1317410 1 0.0324 0.7719 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR608198 1 0.5831 0.5563 0.592 0.000 0.140 0.268 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.4088 0.5794 0.368 0.000 0.000 0.632 0.000
#> SRR1099622 2 0.4060 0.5597 0.000 0.640 0.000 0.000 0.360
#> SRR663197 3 0.4138 0.2857 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1394836 5 0.3810 0.5543 0.000 0.000 0.168 0.040 0.792
#> SRR661699 3 0.2964 0.4652 0.000 0.000 0.856 0.120 0.024
#> SRR813680 1 0.4720 0.7047 0.736 0.000 0.140 0.124 0.000
#> SRR1410678 1 0.1965 0.7234 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1378109 4 0.4060 0.5869 0.360 0.000 0.000 0.640 0.000
#> SRR1499174 3 0.6246 0.2522 0.256 0.000 0.600 0.116 0.028
#> SRR1311486 2 0.1341 0.9213 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1382851 5 0.5180 0.4867 0.000 0.000 0.120 0.196 0.684
#> SRR1433410 1 0.5766 0.5987 0.616 0.000 0.164 0.220 0.000
#> SRR661167 3 0.3003 0.4730 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1432518 3 0.3796 0.4148 0.000 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR660462 3 0.4101 0.3156 0.000 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1374608 4 0.4616 0.6051 0.288 0.000 0.036 0.676 0.000
#> SRR657949 1 0.3527 0.7361 0.792 0.000 0.192 0.016 0.000
#> SRR1308882 4 0.4060 0.5869 0.360 0.000 0.000 0.640 0.000
#> SRR655768 3 0.6157 -0.1280 0.364 0.000 0.496 0.140 0.000
#> SRR1485870 4 0.5766 0.2857 0.004 0.000 0.088 0.560 0.348
#> SRR1444138 3 0.4307 -0.0511 0.000 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR1417342 1 0.1484 0.7592 0.944 0.000 0.008 0.048 0.000
#> SRR1470193 4 0.6596 0.0979 0.000 0.000 0.212 0.416 0.372
#> SRR1091380 3 0.4074 0.3255 0.000 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1099096 1 0.1965 0.7234 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1313583 4 0.4171 0.5544 0.396 0.000 0.000 0.604 0.000
#> SRR1467102 2 0.2280 0.8846 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1485416 4 0.3334 0.5764 0.004 0.000 0.080 0.852 0.064
#> SRR818821 3 0.3837 0.4062 0.000 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR809963 1 0.2795 0.7630 0.872 0.000 0.100 0.028 0.000
#> SRR1072247 1 0.2127 0.7136 0.892 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1353710 4 0.2467 0.6217 0.052 0.000 0.024 0.908 0.016
#> SRR1445259 3 0.3932 0.3816 0.000 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR1408393 1 0.5060 0.6724 0.684 0.000 0.224 0.092 0.000
#> SRR1361522 1 0.1965 0.7234 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1368597 1 0.1908 0.7258 0.908 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1309680 2 0.3074 0.8164 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1310542 5 0.4126 0.2386 0.000 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR1333485 4 0.3949 0.6018 0.332 0.000 0.000 0.668 0.000
#> SRR1406437 3 0.6188 -0.1292 0.000 0.000 0.448 0.136 0.416
#> SRR1354931 3 0.4060 0.3259 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1391856 5 0.6800 0.0463 0.000 0.000 0.292 0.344 0.364
#> SRR1446738 5 0.1469 0.5979 0.000 0.000 0.036 0.016 0.948
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 5 0.3487 0.4946 0.000 0.212 0.008 0.000 0.780
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 2 0.2074 0.8956 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR613150 3 0.3586 0.4399 0.000 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1375329 3 0.3730 0.4244 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1387921 1 0.1608 0.7379 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0162 0.7714 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR812943 5 0.3039 0.5387 0.000 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1400910 5 0.2516 0.5692 0.000 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1444203 4 0.2689 0.6316 0.084 0.000 0.016 0.888 0.012
#> SRR816177 5 0.1469 0.5977 0.000 0.000 0.036 0.016 0.948
#> SRR658754 5 0.4268 0.1819 0.000 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1429603 4 0.2955 0.5891 0.004 0.000 0.060 0.876 0.060
#> SRR1397366 3 0.2233 0.4901 0.000 0.000 0.892 0.104 0.004
#> SRR1446028 1 0.5507 0.6367 0.652 0.000 0.160 0.188 0.000
#> SRR1083918 5 0.2338 0.5581 0.000 0.112 0.004 0.000 0.884
#> SRR1337606 4 0.6458 0.0827 0.000 0.000 0.180 0.424 0.396
#> SRR659109 3 0.4138 0.2857 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1337192 1 0.1671 0.7392 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR656946 5 0.2361 0.5885 0.000 0.000 0.096 0.012 0.892
#> SRR1476102 1 0.2179 0.7104 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1476447 1 0.0955 0.7719 0.968 0.000 0.004 0.028 0.000
#> SRR1342067 4 0.4060 0.5869 0.360 0.000 0.000 0.640 0.000
#> SRR1385389 4 0.4114 0.5713 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1075971 1 0.0404 0.7733 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.2769 0.7626 0.876 0.000 0.092 0.032 0.000
#> SRR1322936 5 0.6330 0.2904 0.000 0.000 0.236 0.236 0.528
#> SRR1349121 1 0.1965 0.7234 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1430549 1 0.1403 0.7758 0.952 0.000 0.024 0.024 0.000
#> SRR612935 5 0.5518 0.2069 0.000 0.072 0.384 0.000 0.544
#> SRR661481 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.6114 0.2067 0.000 0.000 0.132 0.492 0.376
#> SRR1452164 1 0.0162 0.7714 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.6530 -0.2313 0.380 0.000 0.424 0.196 0.000
#> SRR1499894 5 0.4302 0.0970 0.000 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1082883 4 0.3714 0.5747 0.024 0.000 0.084 0.840 0.052
#> SRR1468271 1 0.6084 0.5541 0.572 0.000 0.220 0.208 0.000
#> SRR1332443 1 0.2891 0.6135 0.824 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.2020 0.7254 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1328620 5 0.4126 0.2413 0.000 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR1396294 4 0.6092 0.2167 0.000 0.000 0.132 0.504 0.364
#> SRR1419917 1 0.4630 0.7099 0.744 0.000 0.140 0.116 0.000
#> SRR662114 3 0.3684 0.4310 0.000 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1489199 1 0.6385 0.4809 0.504 0.000 0.296 0.200 0.000
#> SRR813584 5 0.1018 0.5949 0.000 0.000 0.016 0.016 0.968
#> SRR1069638 5 0.1671 0.5863 0.000 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR614864 3 0.3085 0.4783 0.032 0.000 0.852 0.116 0.000
#> SRR1433392 1 0.4766 0.7011 0.732 0.000 0.132 0.136 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 3 0.3134 0.4707 0.028 0.000 0.864 0.096 0.012
#> SRR1401252 4 0.3949 0.6018 0.332 0.000 0.000 0.668 0.000
#> SRR1309963 4 0.4114 0.5713 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1338031 1 0.2358 0.7661 0.888 0.000 0.104 0.008 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 4 0.6184 -0.1675 0.380 0.000 0.140 0.480 0.000
#> SRR1380393 1 0.1410 0.7451 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1319731 1 0.1544 0.7409 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1356468 4 0.2640 0.6160 0.052 0.000 0.032 0.900 0.016
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.1851 0.7285 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1486538 4 0.4818 0.6141 0.284 0.000 0.028 0.676 0.012
#> SRR1340486 4 0.4045 0.5878 0.356 0.000 0.000 0.644 0.000
#> SRR1377696 5 0.4219 -0.0663 0.000 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1465459 3 0.4025 0.4530 0.076 0.000 0.792 0.132 0.000
#> SRR1080270 5 0.4126 0.2386 0.000 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR1312501 3 0.3280 0.4689 0.000 0.000 0.812 0.012 0.176
#> SRR1093148 3 0.6100 -0.0480 0.000 0.000 0.484 0.128 0.388
#> SRR1467080 5 0.6282 0.2237 0.000 0.164 0.340 0.000 0.496
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.4013 0.5434 0.004 0.000 0.108 0.804 0.084
#> SRR1379198 4 0.4114 0.5713 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR613342 5 0.4273 0.1768 0.000 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.4114 0.5713 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1396616 3 0.3913 0.3791 0.000 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR813824 3 0.3730 0.4261 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1082376 1 0.2017 0.7713 0.912 0.000 0.080 0.008 0.000
#> SRR1500891 5 0.5619 0.4275 0.000 0.000 0.156 0.208 0.636
#> SRR807543 1 0.6491 0.4134 0.464 0.000 0.336 0.200 0.000
#> SRR1091572 5 0.5039 0.4979 0.000 0.000 0.116 0.184 0.700
#> SRR1346689 5 0.4734 0.5247 0.000 0.000 0.108 0.160 0.732
#> SRR1332424 1 0.5759 0.5958 0.616 0.000 0.160 0.224 0.000
#> SRR663729 4 0.4114 0.5713 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1097013 1 0.5478 0.6467 0.656 0.000 0.164 0.180 0.000
#> SRR613675 5 0.5039 0.4979 0.000 0.000 0.116 0.184 0.700
#> SRR1485357 4 0.3021 0.5875 0.004 0.000 0.064 0.872 0.060
#> SRR655816 3 0.4266 0.4333 0.120 0.000 0.776 0.104 0.000
#> SRR1500113 1 0.6132 0.5427 0.564 0.000 0.224 0.212 0.000
#> SRR1437622 5 0.5002 0.5084 0.000 0.000 0.160 0.132 0.708
#> SRR1355172 1 0.3099 0.7561 0.848 0.000 0.124 0.028 0.000
#> SRR655531 1 0.2843 0.7542 0.876 0.000 0.076 0.048 0.000
#> SRR1338147 3 0.3661 0.4337 0.000 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1413329 3 0.3870 0.4421 0.028 0.000 0.816 0.132 0.024
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.1638 0.7445 0.932 0.000 0.004 0.064 0.000
#> SRR1333308 4 0.2819 0.5915 0.004 0.000 0.052 0.884 0.060
#> SRR1452033 1 0.5547 0.6263 0.644 0.000 0.148 0.208 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.4101 0.3103 0.000 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.4634 0.4132 0.136 0.000 0.744 0.120 0.000
#> SRR1471755 5 0.2304 0.5614 0.000 0.100 0.000 0.008 0.892
#> SRR808019 1 0.0703 0.7629 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1479133 3 0.1522 0.5000 0.000 0.000 0.944 0.012 0.044
#> SRR615069 5 0.4262 0.1924 0.000 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1456185 2 0.2966 0.8289 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1350069 4 0.6060 0.2037 0.000 0.000 0.124 0.492 0.384
#> SRR816316 1 0.2873 0.7579 0.856 0.000 0.128 0.016 0.000
#> SRR664795 1 0.2719 0.7554 0.884 0.000 0.068 0.048 0.000
#> SRR1490721 4 0.3078 0.5869 0.008 0.000 0.064 0.872 0.056
#> SRR810643 1 0.1195 0.7767 0.960 0.000 0.028 0.012 0.000
#> SRR1430333 3 0.6308 -0.1672 0.352 0.000 0.484 0.164 0.000
#> SRR1085285 3 0.3707 0.4292 0.000 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1099072 3 0.2563 0.4832 0.008 0.000 0.872 0.120 0.000
#> SRR1317985 1 0.0404 0.7733 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.1851 0.7295 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1420276 2 0.0609 0.9362 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1351347 3 0.3752 0.4207 0.000 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1405525 1 0.6398 0.4748 0.500 0.000 0.300 0.200 0.000
#> SRR1370329 1 0.1965 0.7234 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1465001 1 0.1608 0.7379 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819610 5 0.2677 0.5830 0.000 0.000 0.112 0.016 0.872
#> SRR2157314 1 0.2305 0.7659 0.896 0.000 0.092 0.012 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.3277 0.5791 0.004 0.000 0.068 0.856 0.072
#> SRR613639 3 0.4929 0.4081 0.148 0.000 0.716 0.136 0.000
#> SRR1402285 4 0.4150 0.5553 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1077038 1 0.1281 0.7769 0.956 0.000 0.032 0.012 0.000
#> SRR1405660 3 0.4150 0.2783 0.000 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1095455 5 0.4307 0.0462 0.000 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1394734 5 0.1018 0.5949 0.000 0.000 0.016 0.016 0.968
#> SRR1317771 1 0.2179 0.7104 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1365894 4 0.6002 0.2002 0.000 0.000 0.116 0.492 0.392
#> SRR1073581 1 0.1197 0.7533 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR659804 1 0.5361 0.6471 0.668 0.000 0.144 0.188 0.000
#> SRR1345914 2 0.2966 0.8289 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1432186 2 0.2074 0.8953 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1473529 2 0.3109 0.8122 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR660764 2 0.2280 0.8846 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR820448 1 0.2136 0.7704 0.904 0.000 0.088 0.008 0.000
#> SRR1328845 5 0.6115 0.2676 0.000 0.000 0.168 0.280 0.552
#> SRR1336415 4 0.3336 0.6308 0.228 0.000 0.000 0.772 0.000
#> SRR1379065 4 0.4088 0.5794 0.368 0.000 0.000 0.632 0.000
#> SRR1459190 3 0.1270 0.4970 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1346773 1 0.5392 0.6434 0.664 0.000 0.144 0.192 0.000
#> SRR1499521 1 0.1478 0.7461 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 5 0.4101 0.2511 0.000 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.2020 0.7208 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1333395 4 0.3976 0.5841 0.016 0.000 0.124 0.812 0.048
#> SRR1309248 5 0.2491 0.5912 0.000 0.000 0.068 0.036 0.896
#> SRR809161 3 0.3517 0.4627 0.068 0.000 0.832 0.100 0.000
#> SRR1316320 5 0.3055 0.5835 0.000 0.000 0.072 0.064 0.864
#> SRR1432629 2 0.2605 0.8626 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1498931 1 0.0324 0.7719 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1416578 4 0.4015 0.5933 0.348 0.000 0.000 0.652 0.000
#> SRR1405547 3 0.3983 0.3621 0.000 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR1470534 4 0.4150 0.5553 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1380764 1 0.0912 0.7751 0.972 0.000 0.012 0.016 0.000
#> SRR1309160 3 0.3707 0.4292 0.000 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR663489 3 0.3895 0.3907 0.000 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1500450 1 0.1478 0.7440 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1078489 5 0.6496 0.2063 0.000 0.000 0.232 0.280 0.488
#> SRR1332648 4 0.4114 0.5713 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR660614 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.1671 0.7357 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1477949 1 0.4766 0.6999 0.732 0.000 0.132 0.136 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.5405 0.6385 0.660 0.000 0.136 0.204 0.000
#> SRR615946 5 0.4262 0.1865 0.000 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1446481 2 0.1544 0.9157 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.2727 0.7613 0.868 0.000 0.116 0.016 0.000
#> SRR660224 5 0.5754 0.3583 0.000 0.292 0.120 0.000 0.588
#> SRR665586 1 0.1893 0.7647 0.928 0.000 0.024 0.048 0.000
#> SRR1347166 1 0.6538 0.4207 0.452 0.000 0.340 0.208 0.000
#> SRR1485722 3 0.6554 -0.2383 0.392 0.000 0.408 0.200 0.000
#> SRR1415316 1 0.1965 0.7234 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR613390 1 0.2077 0.7706 0.908 0.000 0.084 0.008 0.000
#> SRR661108 3 0.3305 0.4572 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR2170173 3 0.4879 0.3935 0.176 0.000 0.716 0.108 0.000
#> SRR817329 1 0.2249 0.7681 0.896 0.000 0.096 0.008 0.000
#> SRR1401990 4 0.2483 0.6153 0.028 0.000 0.048 0.908 0.016
#> SRR1467745 5 0.3003 0.5071 0.000 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR1471795 2 0.1671 0.9117 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 1 0.3171 0.7438 0.816 0.000 0.176 0.008 0.000
#> SRR1314873 1 0.1638 0.7522 0.932 0.000 0.004 0.064 0.000
#> SRR1401211 1 0.1965 0.7234 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1419692 5 0.2329 0.5496 0.000 0.000 0.000 0.124 0.876
#> SRR818797 1 0.6490 0.3349 0.432 0.000 0.380 0.188 0.000
#> SRR2164608 3 0.4171 0.4366 0.112 0.000 0.784 0.104 0.000
#> SRR1455586 2 0.1544 0.9157 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR819459 5 0.4249 0.1952 0.000 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1488939 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.6092 -0.1231 0.364 0.000 0.504 0.132 0.000
#> SRR1361652 5 0.2824 0.5619 0.000 0.096 0.032 0.000 0.872
#> SRR1437119 1 0.1211 0.7755 0.960 0.000 0.016 0.024 0.000
#> SRR1478547 3 0.4074 0.3254 0.000 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1430910 5 0.4592 0.3023 0.000 0.024 0.332 0.000 0.644
#> SRR1310584 1 0.1544 0.7435 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1500216 1 0.3752 0.7411 0.812 0.000 0.064 0.124 0.000
#> SRR1486762 2 0.3983 0.6006 0.000 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1480854 4 0.4060 0.5869 0.360 0.000 0.000 0.640 0.000
#> SRR1489394 4 0.3895 0.6052 0.320 0.000 0.000 0.680 0.000
#> SRR1418085 4 0.4114 0.5713 0.376 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1340221 4 0.4101 0.5724 0.372 0.000 0.000 0.628 0.000
#> SRR1473058 5 0.4010 0.5570 0.000 0.000 0.088 0.116 0.796
#> SRR1405165 3 0.3586 0.4389 0.000 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1433004 1 0.5283 0.6648 0.676 0.000 0.188 0.136 0.000
#> SRR1471477 1 0.6337 0.4932 0.524 0.000 0.260 0.216 0.000
#> SRR1098567 2 0.1851 0.9052 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1098712 5 0.1774 0.5974 0.000 0.000 0.052 0.016 0.932
#> SRR1455038 1 0.3193 0.7539 0.840 0.000 0.132 0.028 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.1410 0.4935 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1348378 2 0.4262 0.3595 0.000 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR1413541 1 0.4630 0.7099 0.744 0.000 0.140 0.116 0.000
#> SRR1392943 4 0.4201 0.5299 0.408 0.000 0.000 0.592 0.000
#> SRR1475192 5 0.3779 0.5174 0.000 0.052 0.144 0.000 0.804
#> SRR1432085 2 0.2891 0.8365 0.000 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1452468 3 0.6584 -0.2575 0.380 0.000 0.412 0.208 0.000
#> SRR1347060 5 0.4273 0.1768 0.000 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR1414139 5 0.4161 0.2125 0.000 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1447962 2 0.2929 0.8324 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1444324 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.4960 0.6149 0.668 0.000 0.064 0.268 0.000
#> SRR1413436 1 0.1908 0.7258 0.908 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1311266 1 0.4926 0.6809 0.712 0.000 0.112 0.176 0.000
#> SRR1343302 4 0.3586 0.6226 0.264 0.000 0.000 0.736 0.000
#> SRR1373746 1 0.1211 0.7755 0.960 0.000 0.016 0.024 0.000
#> SRR1429678 1 0.1908 0.7258 0.908 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1469413 2 0.4045 0.5608 0.000 0.644 0.000 0.000 0.356
#> SRR1405331 3 0.3876 0.3968 0.000 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1345609 1 0.2179 0.7104 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1380208 5 0.6246 0.3310 0.000 0.000 0.272 0.192 0.536
#> SRR1322840 4 0.4060 0.5869 0.360 0.000 0.000 0.640 0.000
#> SRR1399797 5 0.4307 0.0405 0.000 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1416654 3 0.4074 0.3249 0.000 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1315081 2 0.1544 0.9157 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1369196 5 0.4126 0.2386 0.000 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR1400847 1 0.1410 0.7451 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1365291 3 0.6378 -0.1282 0.348 0.000 0.476 0.176 0.000
#> SRR1367920 4 0.6066 0.1996 0.000 0.000 0.124 0.488 0.388
#> SRR1366648 5 0.4302 0.0814 0.000 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9438 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.3612 0.4367 0.000 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1363968 1 0.0865 0.7666 0.972 0.000 0.004 0.024 0.000
#> SRR814387 1 0.1908 0.7258 0.908 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR657599 1 0.3565 0.7394 0.800 0.000 0.176 0.024 0.000
#> SRR1386689 4 0.1869 0.6254 0.036 0.000 0.012 0.936 0.016
#> SRR1395575 3 0.3224 0.4751 0.000 0.000 0.824 0.016 0.160
#> SRR1453811 3 0.3555 0.4647 0.052 0.000 0.824 0.124 0.000
#> SRR1441159 1 0.4325 0.6986 0.756 0.000 0.064 0.180 0.000
#> SRR1403154 4 0.4015 0.5933 0.348 0.000 0.000 0.652 0.000
#> SRR1468722 3 0.2450 0.4980 0.000 0.000 0.900 0.052 0.048
#> SRR1310275 3 0.2659 0.4979 0.000 0.000 0.888 0.052 0.060
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 1 0.2738 0.70971 0.820 0.000 0.000 0.176 0.000 0.004
#> SRR1331708 6 0.5614 0.11654 0.000 0.000 0.048 0.056 0.352 0.544
#> SRR1464258 1 0.3622 0.63461 0.744 0.000 0.004 0.016 0.000 0.236
#> SRR1454201 3 0.3076 0.60400 0.000 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR661589 3 0.2941 0.59012 0.000 0.000 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1456229 1 0.2805 0.70009 0.828 0.000 0.000 0.012 0.000 0.160
#> SRR1315165 6 0.6138 0.14463 0.000 0.000 0.036 0.124 0.364 0.476
#> SRR1488960 1 0.1820 0.75330 0.924 0.000 0.000 0.056 0.012 0.008
#> SRR1417809 4 0.5065 0.53426 0.200 0.000 0.000 0.668 0.016 0.116
#> SRR1094457 4 0.2260 0.76200 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1095575 3 0.3482 0.49228 0.000 0.000 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1315931 1 0.2730 0.69785 0.808 0.000 0.000 0.192 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.70713 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.1910 0.66721 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1395554 3 0.3109 0.51131 0.000 0.000 0.772 0.004 0.224 0.000
#> SRR818002 2 0.4341 0.47569 0.000 0.564 0.000 0.024 0.412 0.000
#> SRR1344143 5 0.4085 0.57796 0.000 0.012 0.048 0.024 0.792 0.124
#> SRR1486845 4 0.2340 0.75755 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000 0.000
#> SRR1362866 6 0.5503 0.29621 0.032 0.000 0.144 0.008 0.152 0.664
#> SRR1490740 1 0.0260 0.75834 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1446627 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.2668 0.71213 0.828 0.000 0.000 0.168 0.000 0.004
#> SRR1383907 4 0.4266 0.58578 0.004 0.000 0.000 0.620 0.020 0.356
#> SRR1311018 1 0.2538 0.71888 0.860 0.000 0.000 0.016 0.000 0.124
#> SRR1375699 2 0.4334 0.48074 0.000 0.568 0.000 0.024 0.408 0.000
#> SRR1429846 6 0.5609 0.39330 0.236 0.000 0.220 0.000 0.000 0.544
#> SRR613550 6 0.5634 0.29875 0.172 0.000 0.316 0.000 0.000 0.512
#> SRR1348402 1 0.3023 0.66836 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1345146 3 0.5081 0.40332 0.000 0.000 0.588 0.000 0.104 0.308
#> SRR1324025 3 0.0865 0.70214 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1318879 3 0.2871 0.62701 0.000 0.000 0.804 0.000 0.004 0.192
#> SRR820755 1 0.4867 0.27612 0.548 0.000 0.000 0.032 0.016 0.404
#> SRR1485830 4 0.4426 0.56366 0.008 0.000 0.000 0.596 0.020 0.376
#> SRR599313 1 0.4939 0.48899 0.612 0.000 0.000 0.052 0.016 0.320
#> SRR612263 1 0.0622 0.75884 0.980 0.000 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1415398 6 0.6579 0.18043 0.136 0.000 0.372 0.024 0.024 0.444
#> SRR1326205 5 0.6244 0.17465 0.000 0.000 0.112 0.048 0.440 0.400
#> SRR1421327 4 0.2178 0.76448 0.132 0.000 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR1083311 3 0.1267 0.69732 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1499303 6 0.6050 0.07551 0.000 0.000 0.036 0.112 0.368 0.484
#> SRR1079522 6 0.5565 0.14691 0.000 0.000 0.076 0.040 0.296 0.588
#> SRR1452935 3 0.2114 0.68329 0.000 0.000 0.904 0.008 0.076 0.012
#> SRR1379495 1 0.2793 0.69211 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.2454 0.64577 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR615778 6 0.4616 0.15151 0.368 0.000 0.032 0.008 0.000 0.592
#> SRR1447564 1 0.0881 0.75716 0.972 0.000 0.000 0.012 0.008 0.008
#> SRR1455195 1 0.2697 0.70035 0.812 0.000 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR655182 3 0.5718 -0.10833 0.000 0.000 0.464 0.008 0.400 0.128
#> SRR1335140 5 0.6082 0.28082 0.000 0.000 0.152 0.020 0.460 0.368
#> SRR1433555 3 0.1075 0.70121 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1308650 5 0.5334 0.04385 0.000 0.368 0.060 0.024 0.548 0.000
#> SRR1388354 1 0.0862 0.75770 0.972 0.000 0.000 0.008 0.004 0.016
#> SRR1317446 5 0.4401 0.20765 0.000 0.000 0.464 0.024 0.512 0.000
#> SRR1413602 3 0.1663 0.68266 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.5575 0.00287 0.460 0.000 0.140 0.000 0.000 0.400
#> SRR661313 3 0.1556 0.68780 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1499935 6 0.5994 0.10906 0.000 0.000 0.028 0.116 0.396 0.460
#> SRR1447303 3 0.0717 0.70768 0.000 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1429408 6 0.6099 0.08904 0.000 0.000 0.044 0.100 0.404 0.452
#> SRR1433950 1 0.2653 0.70808 0.844 0.000 0.000 0.012 0.000 0.144
#> SRR1362081 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 6 0.5600 0.32942 0.304 0.000 0.172 0.000 0.000 0.524
#> SRR1435229 3 0.5568 0.07952 0.000 0.000 0.544 0.008 0.320 0.128
#> SRR1085996 1 0.0508 0.75846 0.984 0.000 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR1414229 5 0.4035 0.45760 0.000 0.000 0.296 0.020 0.680 0.004
#> SRR1400974 3 0.1327 0.69572 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1399971 1 0.3682 0.65180 0.764 0.000 0.004 0.032 0.000 0.200
#> SRR613927 6 0.5816 0.00483 0.436 0.000 0.048 0.024 0.024 0.468
#> SRR1457854 1 0.0260 0.75834 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1473714 6 0.6781 0.17298 0.064 0.000 0.064 0.052 0.316 0.504
#> SRR813776 6 0.5705 0.01466 0.428 0.000 0.040 0.024 0.024 0.484
#> SRR808196 4 0.4245 0.63354 0.020 0.000 0.000 0.684 0.016 0.280
#> SRR1101085 4 0.4345 0.59004 0.008 0.000 0.000 0.624 0.020 0.348
#> SRR614395 1 0.4556 0.50141 0.640 0.000 0.000 0.040 0.008 0.312
#> SRR1478251 4 0.2260 0.76200 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0909 0.75719 0.968 0.000 0.000 0.012 0.000 0.020
#> SRR665310 3 0.5830 0.05817 0.044 0.000 0.464 0.028 0.024 0.440
#> SRR1420109 3 0.1858 0.68711 0.000 0.000 0.912 0.000 0.076 0.012
#> SRR1330920 6 0.5238 0.33405 0.292 0.000 0.128 0.000 0.000 0.580
#> SRR1419539 5 0.3782 0.38529 0.000 0.000 0.360 0.000 0.636 0.004
#> SRR1359447 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347259 4 0.4254 0.58977 0.004 0.000 0.000 0.624 0.020 0.352
#> SRR613915 1 0.5535 0.17807 0.520 0.000 0.020 0.040 0.020 0.400
#> SRR1384395 2 0.1682 0.83853 0.000 0.928 0.000 0.020 0.052 0.000
#> SRR821715 6 0.6757 0.29836 0.188 0.000 0.300 0.024 0.024 0.464
#> SRR1478228 1 0.0260 0.75834 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1445637 1 0.2703 0.69579 0.824 0.000 0.000 0.004 0.000 0.172
#> SRR608150 6 0.5750 0.15578 0.004 0.000 0.040 0.064 0.360 0.532
#> SRR1096383 1 0.1285 0.75486 0.944 0.000 0.000 0.052 0.000 0.004
#> SRR1341480 4 0.4358 0.58697 0.008 0.000 0.000 0.620 0.020 0.352
#> SRR1341344 1 0.3351 0.60535 0.712 0.000 0.000 0.288 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.3076 0.56856 0.000 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1498838 3 0.0260 0.70734 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1416313 3 0.1663 0.68266 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR808566 6 0.6268 0.15563 0.000 0.000 0.040 0.136 0.356 0.468
#> SRR1430270 4 0.2527 0.74096 0.168 0.000 0.000 0.832 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.2340 0.62813 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR613533 3 0.2573 0.63609 0.000 0.000 0.856 0.008 0.132 0.004
#> SRR661267 1 0.2513 0.73001 0.852 0.000 0.000 0.140 0.000 0.008
#> SRR810665 2 0.2950 0.77126 0.000 0.828 0.000 0.024 0.148 0.000
#> SRR1407250 1 0.6012 -0.03946 0.436 0.000 0.136 0.020 0.000 0.408
#> SRR1420067 1 0.0603 0.75818 0.980 0.000 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1473632 5 0.5253 0.53587 0.000 0.000 0.224 0.008 0.628 0.140
#> SRR812536 3 0.5114 0.19791 0.004 0.000 0.516 0.028 0.024 0.428
#> SRR1370850 2 0.4396 0.38307 0.000 0.520 0.000 0.024 0.456 0.000
#> SRR1486195 2 0.0508 0.86889 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1407671 5 0.4994 0.54604 0.000 0.000 0.184 0.008 0.668 0.140
#> SRR1446375 3 0.4100 0.52651 0.000 0.000 0.752 0.008 0.176 0.064
#> SRR1465230 4 0.2135 0.76476 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000 0.000
#> SRR614119 1 0.3348 0.65668 0.768 0.000 0.000 0.016 0.000 0.216
#> SRR1356101 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.2653 0.70986 0.844 0.000 0.000 0.012 0.000 0.144
#> SRR1392676 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.3271 0.66595 0.760 0.000 0.000 0.232 0.000 0.008
#> SRR660510 3 0.0000 0.70713 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.4077 0.69399 0.060 0.000 0.000 0.752 0.008 0.180
#> SRR658953 6 0.6344 0.36450 0.156 0.000 0.212 0.028 0.028 0.576
#> SRR2166459 1 0.4394 0.58213 0.724 0.000 0.000 0.044 0.024 0.208
#> SRR1070713 5 0.2030 0.58809 0.000 0.000 0.064 0.000 0.908 0.028
#> SRR1485312 3 0.3915 0.30740 0.004 0.000 0.584 0.000 0.000 0.412
#> SRR1317631 4 0.3957 0.62236 0.004 0.000 0.000 0.696 0.020 0.280
#> SRR1488610 1 0.3514 0.64290 0.752 0.000 0.000 0.020 0.000 0.228
#> SRR1330588 3 0.2454 0.64597 0.000 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1316367 5 0.5885 0.39342 0.000 0.000 0.284 0.008 0.516 0.192
#> SRR1433926 1 0.3570 0.64252 0.752 0.000 0.004 0.016 0.000 0.228
#> SRR1091302 4 0.4203 0.63250 0.016 0.000 0.000 0.680 0.016 0.288
#> SRR818263 1 0.2768 0.70304 0.832 0.000 0.000 0.012 0.000 0.156
#> SRR1404909 4 0.4266 0.58467 0.000 0.000 0.004 0.620 0.020 0.356
#> SRR663076 1 0.2762 0.69459 0.804 0.000 0.000 0.196 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.4206 0.55994 0.000 0.620 0.000 0.024 0.356 0.000
#> SRR1442422 4 0.2219 0.76319 0.136 0.000 0.000 0.864 0.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.1334 0.75721 0.948 0.000 0.000 0.020 0.000 0.032
#> SRR654862 1 0.3564 0.60778 0.724 0.000 0.000 0.012 0.000 0.264
#> SRR1407112 4 0.4135 0.70141 0.072 0.000 0.000 0.760 0.012 0.156
#> SRR1332969 3 0.3944 0.27497 0.004 0.000 0.568 0.000 0.000 0.428
#> SRR1353199 3 0.1010 0.70472 0.000 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1378885 1 0.3923 0.33726 0.580 0.000 0.000 0.004 0.000 0.416
#> SRR665357 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.3923 0.29885 0.004 0.000 0.580 0.000 0.000 0.416
#> SRR1347819 3 0.1714 0.67960 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 5 0.3375 0.57980 0.000 0.000 0.056 0.008 0.824 0.112
#> SRR1431781 4 0.4227 0.59372 0.000 0.000 0.004 0.632 0.020 0.344
#> SRR1452270 3 0.4850 0.20979 0.000 0.000 0.524 0.024 0.020 0.432
#> SRR1500472 3 0.3606 0.59625 0.000 0.000 0.800 0.008 0.140 0.052
#> SRR1417632 5 0.5345 0.48361 0.000 0.000 0.140 0.012 0.624 0.224
#> SRR1350153 2 0.0547 0.86679 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.3248 0.50921 0.000 0.000 0.768 0.004 0.224 0.004
#> SRR1326579 1 0.3596 0.63865 0.748 0.000 0.004 0.016 0.000 0.232
#> SRR1349363 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.1957 0.66367 0.000 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1090407 3 0.4177 0.17817 0.012 0.000 0.520 0.000 0.000 0.468
#> SRR1083752 5 0.3063 0.58568 0.000 0.000 0.092 0.000 0.840 0.068
#> SRR1377599 6 0.5880 0.12819 0.000 0.000 0.036 0.100 0.336 0.528
#> SRR1488449 3 0.4708 0.21730 0.000 0.000 0.528 0.020 0.016 0.436
#> SRR1318354 5 0.5936 0.32737 0.000 0.036 0.364 0.032 0.528 0.040
#> SRR1359062 5 0.6230 0.31712 0.000 0.240 0.232 0.024 0.504 0.000
#> SRR1398924 5 0.5364 0.53608 0.000 0.000 0.236 0.020 0.628 0.116
#> SRR663783 3 0.2556 0.65163 0.000 0.000 0.864 0.008 0.120 0.008
#> SRR1319204 3 0.5029 -0.14656 0.000 0.000 0.492 0.008 0.448 0.052
#> SRR1369070 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0146 0.75817 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498595 5 0.3822 0.57687 0.000 0.008 0.048 0.020 0.808 0.116
#> SRR1377423 3 0.0713 0.70603 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.3284 0.67084 0.784 0.000 0.000 0.020 0.000 0.196
#> SRR1338426 3 0.2742 0.63579 0.000 0.000 0.852 0.008 0.128 0.012
#> SRR1353309 3 0.3290 0.55002 0.004 0.000 0.744 0.000 0.000 0.252
#> SRR658941 3 0.5034 -0.13696 0.000 0.000 0.468 0.000 0.460 0.072
#> SRR1101643 1 0.3023 0.66836 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.3782 0.63530 0.740 0.000 0.000 0.036 0.000 0.224
#> SRR1368874 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.4332 0.59372 0.008 0.000 0.000 0.628 0.020 0.344
#> SRR1363858 6 0.5692 0.16025 0.008 0.000 0.032 0.064 0.344 0.552
#> SRR819820 3 0.3265 0.55517 0.004 0.000 0.748 0.000 0.000 0.248
#> SRR1337342 1 0.3582 0.61837 0.732 0.000 0.000 0.016 0.000 0.252
#> SRR655206 5 0.3529 0.56282 0.000 0.000 0.208 0.000 0.764 0.028
#> SRR1387013 5 0.2250 0.58657 0.000 0.000 0.064 0.000 0.896 0.040
#> SRR1317410 1 0.0891 0.75841 0.968 0.000 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR608198 1 0.4164 0.59652 0.708 0.000 0.004 0.032 0.004 0.252
#> SRR1440161 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.2260 0.76200 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1099622 5 0.4979 -0.13875 0.000 0.424 0.028 0.024 0.524 0.000
#> SRR663197 3 0.1663 0.68266 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1394836 5 0.5977 0.29238 0.000 0.000 0.256 0.004 0.484 0.256
#> SRR661699 6 0.5118 -0.06322 0.000 0.000 0.440 0.036 0.024 0.500
#> SRR813680 1 0.3171 0.67362 0.784 0.000 0.000 0.012 0.000 0.204
#> SRR1410678 1 0.3023 0.66836 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.2178 0.76448 0.132 0.000 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR1499174 3 0.6195 -0.02373 0.176 0.000 0.440 0.004 0.012 0.368
#> SRR1311486 2 0.2988 0.76881 0.000 0.824 0.000 0.024 0.152 0.000
#> SRR1382851 5 0.5987 0.11742 0.000 0.000 0.100 0.036 0.464 0.400
#> SRR1433410 1 0.3487 0.64657 0.756 0.000 0.000 0.020 0.000 0.224
#> SRR661167 3 0.1610 0.68935 0.000 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1432518 3 0.0935 0.70540 0.000 0.000 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR660462 3 0.1327 0.69658 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1374608 4 0.3033 0.73980 0.108 0.000 0.000 0.848 0.012 0.032
#> SRR657949 1 0.5605 0.22715 0.544 0.000 0.020 0.044 0.024 0.368
#> SRR1308882 4 0.2178 0.76448 0.132 0.000 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR655768 6 0.5612 0.32545 0.308 0.000 0.172 0.000 0.000 0.520
#> SRR1485870 6 0.5913 0.13792 0.000 0.000 0.012 0.152 0.356 0.480
#> SRR1444138 3 0.3682 0.58235 0.000 0.000 0.792 0.008 0.148 0.052
#> SRR1417342 1 0.1901 0.75482 0.912 0.000 0.000 0.076 0.004 0.008
#> SRR1470193 6 0.5900 0.14053 0.000 0.000 0.040 0.088 0.372 0.500
#> SRR1091380 3 0.1588 0.69103 0.000 0.000 0.924 0.000 0.072 0.004
#> SRR1099096 1 0.3023 0.66836 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1313583 4 0.2632 0.74703 0.164 0.000 0.000 0.832 0.000 0.004
#> SRR1467102 2 0.4273 0.52638 0.000 0.596 0.000 0.024 0.380 0.000
#> SRR1485416 4 0.4637 0.53500 0.004 0.000 0.004 0.572 0.028 0.392
#> SRR818821 3 0.0993 0.70783 0.000 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR809963 1 0.4940 0.59442 0.688 0.000 0.000 0.104 0.020 0.188
#> SRR1072247 1 0.3151 0.65053 0.748 0.000 0.000 0.252 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.4276 0.61958 0.016 0.000 0.000 0.664 0.016 0.304
#> SRR1445259 3 0.2697 0.68060 0.000 0.000 0.876 0.008 0.068 0.048
#> SRR1408393 1 0.5657 0.07085 0.484 0.000 0.032 0.028 0.024 0.432
#> SRR1361522 1 0.3023 0.66836 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.2996 0.67184 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.4405 0.35005 0.000 0.504 0.000 0.024 0.472 0.000
#> SRR1310542 5 0.4401 0.20765 0.000 0.000 0.464 0.024 0.512 0.000
#> SRR1333485 4 0.2278 0.76469 0.128 0.000 0.000 0.868 0.000 0.004
#> SRR1406437 3 0.6375 -0.11081 0.000 0.000 0.400 0.016 0.344 0.240
#> SRR1354931 3 0.2046 0.69405 0.000 0.000 0.908 0.000 0.060 0.032
#> SRR1391856 6 0.6245 0.20678 0.000 0.000 0.132 0.060 0.264 0.544
#> SRR1446738 5 0.2948 0.58699 0.000 0.000 0.092 0.000 0.848 0.060
#> SRR1309032 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 5 0.5376 0.48404 0.000 0.156 0.172 0.024 0.648 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 2 0.4973 0.51359 0.000 0.584 0.036 0.024 0.356 0.000
#> SRR613150 3 0.1141 0.69933 0.000 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1375329 3 0.2361 0.67955 0.000 0.000 0.896 0.008 0.032 0.064
#> SRR1387921 1 0.2730 0.69702 0.808 0.000 0.000 0.192 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0363 0.75797 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR812943 5 0.5798 0.28993 0.000 0.000 0.372 0.008 0.476 0.144
#> SRR1400910 5 0.5553 0.44304 0.000 0.000 0.296 0.008 0.560 0.136
#> SRR1444203 4 0.4158 0.63895 0.028 0.000 0.000 0.708 0.012 0.252
#> SRR816177 5 0.2629 0.59199 0.000 0.000 0.092 0.000 0.868 0.040
#> SRR658754 3 0.3737 0.13989 0.000 0.000 0.608 0.000 0.392 0.000
#> SRR1429603 4 0.4266 0.58467 0.000 0.000 0.004 0.620 0.020 0.356
#> SRR1397366 3 0.3899 0.32182 0.004 0.000 0.592 0.000 0.000 0.404
#> SRR1446028 1 0.3168 0.67561 0.792 0.000 0.000 0.016 0.000 0.192
#> SRR1083918 5 0.2094 0.58651 0.000 0.000 0.064 0.024 0.908 0.004
#> SRR1337606 6 0.5946 0.12002 0.000 0.000 0.048 0.080 0.384 0.488
#> SRR659109 3 0.1556 0.68780 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1337192 1 0.3230 0.69185 0.776 0.000 0.000 0.212 0.000 0.012
#> SRR656946 5 0.5239 0.51927 0.000 0.000 0.216 0.008 0.632 0.144
#> SRR1476102 1 0.3409 0.58723 0.700 0.000 0.000 0.300 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.1245 0.75643 0.952 0.000 0.000 0.016 0.000 0.032
#> SRR1342067 4 0.2178 0.76448 0.132 0.000 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.2416 0.75125 0.156 0.000 0.000 0.844 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0405 0.75837 0.988 0.000 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR614419 1 0.4678 0.62541 0.724 0.000 0.000 0.096 0.024 0.156
#> SRR1322936 6 0.6015 -0.09957 0.000 0.000 0.136 0.020 0.420 0.424
#> SRR1349121 1 0.3023 0.66836 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.1625 0.74857 0.928 0.000 0.000 0.012 0.000 0.060
#> SRR612935 5 0.5828 0.29854 0.000 0.020 0.388 0.032 0.512 0.048
#> SRR661481 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 6 0.6030 0.09230 0.000 0.000 0.032 0.112 0.404 0.452
#> SRR1452164 1 0.0363 0.75797 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1070503 6 0.5355 0.22398 0.356 0.000 0.104 0.004 0.000 0.536
#> SRR1499894 3 0.2260 0.63603 0.000 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1082883 4 0.5187 0.44161 0.012 0.000 0.004 0.500 0.048 0.436
#> SRR1468271 1 0.3673 0.62580 0.736 0.000 0.004 0.016 0.000 0.244
#> SRR1332443 1 0.3482 0.56154 0.684 0.000 0.000 0.316 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.3163 0.66719 0.764 0.000 0.000 0.232 0.000 0.004
#> SRR1328620 5 0.5219 0.26978 0.000 0.000 0.416 0.028 0.516 0.040
#> SRR1396294 6 0.6212 0.15351 0.000 0.000 0.036 0.136 0.356 0.472
#> SRR1419917 1 0.2572 0.71220 0.852 0.000 0.000 0.012 0.000 0.136
#> SRR662114 3 0.0632 0.70554 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1489199 1 0.4455 0.35728 0.584 0.000 0.020 0.008 0.000 0.388
#> SRR813584 5 0.1471 0.58914 0.000 0.000 0.064 0.000 0.932 0.004
#> SRR1069638 5 0.3044 0.59706 0.000 0.000 0.116 0.000 0.836 0.048
#> SRR614864 3 0.4224 0.23710 0.016 0.000 0.552 0.000 0.000 0.432
#> SRR1433392 1 0.2877 0.69580 0.820 0.000 0.000 0.012 0.000 0.168
#> SRR1377777 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 6 0.5287 -0.09009 0.008 0.000 0.436 0.028 0.028 0.500
#> SRR1401252 4 0.2278 0.76469 0.128 0.000 0.000 0.868 0.000 0.004
#> SRR1309963 4 0.2260 0.76200 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0777 0.75767 0.972 0.000 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1418628 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.6031 0.18187 0.456 0.000 0.000 0.228 0.004 0.312
#> SRR1380393 1 0.2697 0.69939 0.812 0.000 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.2730 0.69702 0.808 0.000 0.000 0.192 0.000 0.000
#> SRR1356468 4 0.4627 0.58968 0.028 0.000 0.000 0.620 0.016 0.336
#> SRR1337010 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.3141 0.69593 0.788 0.000 0.000 0.200 0.000 0.012
#> SRR1486538 4 0.3474 0.73302 0.112 0.000 0.000 0.820 0.012 0.056
#> SRR1340486 4 0.2178 0.76395 0.132 0.000 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR1377696 5 0.4783 0.46882 0.000 0.168 0.000 0.032 0.716 0.084
#> SRR1465459 6 0.5616 0.28216 0.164 0.000 0.328 0.000 0.000 0.508
#> SRR1080270 5 0.4336 0.18446 0.000 0.000 0.476 0.020 0.504 0.000
#> SRR1312501 3 0.2378 0.65193 0.000 0.000 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR1093148 3 0.6018 0.05022 0.000 0.000 0.456 0.008 0.348 0.188
#> SRR1467080 5 0.5364 0.25472 0.000 0.056 0.416 0.024 0.504 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.5863 0.32043 0.000 0.000 0.016 0.440 0.124 0.420
#> SRR1379198 4 0.2260 0.76200 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR613342 3 0.3262 0.54723 0.000 0.000 0.788 0.008 0.196 0.008
#> SRR1452246 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.2260 0.76200 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.1789 0.69940 0.000 0.000 0.924 0.000 0.044 0.032
#> SRR813824 3 0.0260 0.70693 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1082376 1 0.0935 0.75696 0.964 0.000 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1500891 5 0.6192 0.20500 0.000 0.000 0.120 0.040 0.452 0.388
#> SRR807543 6 0.4570 0.01810 0.436 0.000 0.036 0.000 0.000 0.528
#> SRR1091572 5 0.5980 0.16426 0.000 0.000 0.144 0.016 0.452 0.388
#> SRR1346689 5 0.6025 0.27618 0.000 0.000 0.144 0.020 0.472 0.364
#> SRR1332424 1 0.3858 0.62796 0.732 0.000 0.004 0.028 0.000 0.236
#> SRR663729 4 0.2378 0.75454 0.152 0.000 0.000 0.848 0.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.2980 0.68575 0.808 0.000 0.000 0.012 0.000 0.180
#> SRR613675 5 0.6030 0.16736 0.000 0.000 0.152 0.016 0.444 0.388
#> SRR1485357 4 0.4447 0.56623 0.004 0.000 0.004 0.600 0.020 0.372
#> SRR655816 6 0.6772 0.24282 0.164 0.000 0.340 0.028 0.024 0.444
#> SRR1500113 1 0.3673 0.62704 0.736 0.000 0.004 0.016 0.000 0.244
#> SRR1437622 5 0.6062 0.23250 0.000 0.000 0.148 0.024 0.496 0.332
#> SRR1355172 1 0.1806 0.74175 0.908 0.000 0.000 0.004 0.000 0.088
#> SRR655531 1 0.5573 0.58709 0.620 0.000 0.000 0.196 0.024 0.160
#> SRR1338147 3 0.0858 0.70497 0.000 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1413329 6 0.5010 0.15131 0.024 0.000 0.356 0.024 0.008 0.588
#> SRR1485931 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.2531 0.73667 0.860 0.000 0.000 0.128 0.004 0.008
#> SRR1333308 4 0.4358 0.58789 0.008 0.000 0.000 0.620 0.020 0.352
#> SRR1452033 1 0.3231 0.67049 0.784 0.000 0.000 0.016 0.000 0.200
#> SRR1467316 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.1327 0.69572 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 6 0.6759 0.27611 0.168 0.000 0.320 0.028 0.024 0.460
#> SRR1471755 5 0.1750 0.58531 0.000 0.008 0.056 0.004 0.928 0.004
#> SRR808019 1 0.2520 0.72277 0.844 0.000 0.000 0.152 0.000 0.004
#> SRR1479133 3 0.3547 0.45260 0.000 0.000 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR615069 3 0.4493 0.25938 0.000 0.000 0.644 0.008 0.312 0.036
#> SRR1456185 2 0.4393 0.39319 0.000 0.524 0.000 0.024 0.452 0.000
#> SRR1350069 6 0.6053 0.10127 0.000 0.000 0.036 0.108 0.400 0.456
#> SRR816316 1 0.1444 0.74720 0.928 0.000 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR664795 1 0.5639 0.56905 0.604 0.000 0.000 0.200 0.020 0.176
#> SRR1490721 4 0.4302 0.57478 0.004 0.000 0.000 0.608 0.020 0.368
#> SRR810643 1 0.1643 0.74698 0.924 0.000 0.000 0.008 0.000 0.068
#> SRR1430333 6 0.6480 0.41425 0.220 0.000 0.180 0.028 0.024 0.548
#> SRR1085285 3 0.0547 0.70609 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1099072 3 0.4083 0.19889 0.008 0.000 0.532 0.000 0.000 0.460
#> SRR1317985 1 0.0291 0.75829 0.992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1487340 1 0.2996 0.67184 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.2282 0.81447 0.000 0.888 0.000 0.024 0.088 0.000
#> SRR1351347 3 0.1644 0.70342 0.000 0.000 0.932 0.000 0.040 0.028
#> SRR1405525 1 0.4687 0.29039 0.536 0.000 0.036 0.004 0.000 0.424
#> SRR1370329 1 0.3023 0.66836 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.2762 0.69429 0.804 0.000 0.000 0.196 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819610 5 0.5019 0.43525 0.000 0.000 0.292 0.000 0.604 0.104
#> SRR2157314 1 0.4604 0.61061 0.724 0.000 0.000 0.076 0.024 0.176
#> SRR1409465 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.5101 0.48966 0.004 0.000 0.008 0.540 0.052 0.396
#> SRR613639 6 0.5908 0.28799 0.176 0.000 0.324 0.000 0.008 0.492
#> SRR1402285 4 0.2562 0.73744 0.172 0.000 0.000 0.828 0.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.1713 0.76010 0.928 0.000 0.000 0.028 0.000 0.044
#> SRR1405660 3 0.1765 0.67663 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1095455 3 0.3792 0.56865 0.000 0.000 0.780 0.008 0.160 0.052
#> SRR1394734 5 0.1471 0.58914 0.000 0.000 0.064 0.000 0.932 0.004
#> SRR1317771 1 0.3309 0.61624 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000 0.000
#> SRR1365894 6 0.5936 0.09689 0.000 0.000 0.024 0.116 0.404 0.456
#> SRR1073581 1 0.2668 0.71486 0.828 0.000 0.000 0.168 0.000 0.004
#> SRR659804 1 0.3071 0.68400 0.804 0.000 0.000 0.016 0.000 0.180
#> SRR1345914 2 0.4381 0.41994 0.000 0.536 0.000 0.024 0.440 0.000
#> SRR1432186 2 0.4252 0.53685 0.000 0.604 0.000 0.024 0.372 0.000
#> SRR1473529 2 0.5457 0.31025 0.000 0.484 0.000 0.032 0.432 0.052
#> SRR660764 2 0.4654 0.52275 0.000 0.592 0.016 0.024 0.368 0.000
#> SRR820448 1 0.1692 0.75121 0.932 0.000 0.000 0.012 0.008 0.048
#> SRR1328845 5 0.5870 -0.00177 0.000 0.000 0.060 0.056 0.452 0.432
#> SRR1336415 4 0.2487 0.75261 0.092 0.000 0.000 0.876 0.000 0.032
#> SRR1379065 4 0.2260 0.76200 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1459190 3 0.3953 0.44003 0.000 0.000 0.656 0.000 0.016 0.328
#> SRR1346773 1 0.3136 0.67857 0.796 0.000 0.000 0.016 0.000 0.188
#> SRR1499521 1 0.2848 0.71131 0.816 0.000 0.000 0.176 0.000 0.008
#> SRR1440898 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 5 0.4393 0.23066 0.000 0.000 0.452 0.024 0.524 0.000
#> SRR1081209 2 0.0260 0.87257 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.3050 0.66438 0.764 0.000 0.000 0.236 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.4570 0.55438 0.008 0.000 0.000 0.588 0.028 0.376
#> SRR1309248 5 0.4944 0.53699 0.000 0.000 0.148 0.008 0.676 0.168
#> SRR809161 6 0.6685 0.19796 0.144 0.000 0.364 0.028 0.024 0.440
#> SRR1316320 5 0.5463 0.48319 0.000 0.000 0.144 0.016 0.616 0.224
#> SRR1432629 2 0.4348 0.46973 0.000 0.560 0.000 0.024 0.416 0.000
#> SRR1498931 1 0.0260 0.75834 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1416578 4 0.2135 0.76476 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0865 0.70381 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1470534 4 0.2562 0.73744 0.172 0.000 0.000 0.828 0.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.1151 0.75568 0.956 0.000 0.000 0.012 0.000 0.032
#> SRR1309160 3 0.0458 0.70659 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR663489 3 0.0547 0.70683 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1500450 1 0.2838 0.70213 0.808 0.000 0.000 0.188 0.004 0.000
#> SRR1078489 6 0.5910 0.02944 0.000 0.000 0.064 0.056 0.420 0.460
#> SRR1332648 4 0.2340 0.75755 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000 0.000
#> SRR660614 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.2912 0.68076 0.784 0.000 0.000 0.216 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.2744 0.70741 0.840 0.000 0.000 0.016 0.000 0.144
#> SRR1481419 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.3231 0.67049 0.784 0.000 0.000 0.016 0.000 0.200
#> SRR615946 3 0.3747 0.12753 0.000 0.000 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1446481 2 0.3333 0.73580 0.000 0.784 0.000 0.024 0.192 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.1204 0.75098 0.944 0.000 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR660224 5 0.6643 0.43430 0.000 0.172 0.204 0.024 0.552 0.048
#> SRR665586 1 0.3658 0.69557 0.772 0.000 0.000 0.192 0.008 0.028
#> SRR1347166 6 0.4675 0.18438 0.360 0.000 0.044 0.000 0.004 0.592
#> SRR1485722 1 0.6063 -0.06095 0.428 0.000 0.144 0.020 0.000 0.408
#> SRR1415316 1 0.3023 0.66836 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0777 0.75782 0.972 0.000 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR661108 3 0.1387 0.69399 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR2170173 6 0.6828 0.28261 0.184 0.000 0.312 0.028 0.024 0.452
#> SRR817329 1 0.1890 0.75414 0.924 0.000 0.000 0.024 0.008 0.044
#> SRR1401990 4 0.4172 0.62142 0.012 0.000 0.000 0.672 0.016 0.300
#> SRR1467745 5 0.2359 0.58115 0.000 0.016 0.052 0.024 0.904 0.004
#> SRR1471795 2 0.3956 0.63402 0.000 0.684 0.000 0.024 0.292 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 1 0.4334 0.56793 0.720 0.000 0.000 0.040 0.020 0.220
#> SRR1314873 1 0.3093 0.72221 0.816 0.000 0.000 0.164 0.008 0.012
#> SRR1401211 1 0.3023 0.66836 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1419692 5 0.3456 0.51945 0.000 0.000 0.040 0.004 0.800 0.156
#> SRR818797 6 0.4886 0.12058 0.396 0.000 0.064 0.000 0.000 0.540
#> SRR2164608 6 0.6772 0.24282 0.164 0.000 0.340 0.028 0.024 0.444
#> SRR1455586 2 0.3593 0.70514 0.000 0.748 0.000 0.024 0.228 0.000
#> SRR819459 3 0.3847 -0.05639 0.000 0.000 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 6 0.5688 0.38706 0.264 0.000 0.212 0.000 0.000 0.524
#> SRR1361652 5 0.5275 0.51889 0.000 0.008 0.224 0.032 0.664 0.072
#> SRR1437119 1 0.1367 0.75396 0.944 0.000 0.000 0.012 0.000 0.044
#> SRR1478547 3 0.1267 0.69732 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1430910 5 0.5374 0.33941 0.000 0.000 0.372 0.032 0.544 0.052
#> SRR1310584 1 0.2814 0.71078 0.820 0.000 0.000 0.172 0.000 0.008
#> SRR1500216 1 0.3307 0.73317 0.828 0.000 0.000 0.040 0.012 0.120
#> SRR1486762 5 0.6096 0.22585 0.000 0.288 0.172 0.024 0.516 0.000
#> SRR1480854 4 0.2178 0.76448 0.132 0.000 0.000 0.868 0.000 0.000
#> SRR1489394 4 0.2212 0.76318 0.112 0.000 0.000 0.880 0.000 0.008
#> SRR1418085 4 0.2340 0.75755 0.148 0.000 0.000 0.852 0.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.2219 0.76319 0.136 0.000 0.000 0.864 0.000 0.000
#> SRR1473058 5 0.5881 0.31602 0.000 0.000 0.164 0.012 0.516 0.308
#> SRR1405165 3 0.1007 0.70119 0.000 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1433004 1 0.2912 0.66644 0.784 0.000 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR1471477 1 0.4134 0.48735 0.640 0.000 0.004 0.016 0.000 0.340
#> SRR1098567 2 0.4193 0.56468 0.000 0.624 0.000 0.024 0.352 0.000
#> SRR1098712 5 0.3206 0.58478 0.000 0.000 0.104 0.000 0.828 0.068
#> SRR1455038 1 0.2278 0.72440 0.868 0.000 0.000 0.004 0.000 0.128
#> SRR1375248 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.4676 0.26796 0.000 0.000 0.552 0.020 0.016 0.412
#> SRR1348378 5 0.5241 -0.05339 0.000 0.400 0.048 0.024 0.528 0.000
#> SRR1413541 1 0.2730 0.70379 0.836 0.000 0.000 0.012 0.000 0.152
#> SRR1392943 4 0.2631 0.73290 0.180 0.000 0.000 0.820 0.000 0.000
#> SRR1475192 5 0.4591 0.35888 0.000 0.012 0.376 0.024 0.588 0.000
#> SRR1432085 2 0.4366 0.44297 0.000 0.548 0.000 0.024 0.428 0.000
#> SRR1452468 6 0.4987 0.26206 0.328 0.000 0.088 0.000 0.000 0.584
#> SRR1347060 3 0.3717 0.15945 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR1414139 5 0.4401 0.20765 0.000 0.000 0.464 0.024 0.512 0.000
#> SRR1447962 2 0.4355 0.45703 0.000 0.556 0.000 0.024 0.420 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.3385 0.67087 0.788 0.000 0.000 0.032 0.000 0.180
#> SRR1413436 1 0.2996 0.67184 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.3003 0.69137 0.812 0.000 0.000 0.016 0.000 0.172
#> SRR1343302 4 0.2301 0.75920 0.096 0.000 0.000 0.884 0.000 0.020
#> SRR1373746 1 0.1434 0.75304 0.940 0.000 0.000 0.012 0.000 0.048
#> SRR1429678 1 0.2996 0.67184 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000 0.000
#> SRR1469413 5 0.5094 -0.10955 0.000 0.416 0.036 0.024 0.524 0.000
#> SRR1405331 3 0.2190 0.70151 0.000 0.000 0.900 0.000 0.060 0.040
#> SRR1345609 1 0.3409 0.58723 0.700 0.000 0.000 0.300 0.000 0.000
#> SRR1380208 5 0.6153 0.13919 0.000 0.000 0.148 0.024 0.416 0.412
#> SRR1322840 4 0.2135 0.76436 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.2416 0.61898 0.000 0.000 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1416654 3 0.1444 0.69241 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1315081 2 0.3645 0.69740 0.000 0.740 0.000 0.024 0.236 0.000
#> SRR1369196 5 0.4401 0.20765 0.000 0.000 0.464 0.024 0.512 0.000
#> SRR1400847 1 0.2631 0.70398 0.820 0.000 0.000 0.180 0.000 0.000
#> SRR1365291 6 0.5667 0.37847 0.228 0.000 0.240 0.000 0.000 0.532
#> SRR1367920 6 0.5963 0.10442 0.000 0.000 0.028 0.112 0.396 0.464
#> SRR1366648 3 0.3309 0.41862 0.000 0.000 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.87612 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.1625 0.70165 0.000 0.000 0.928 0.000 0.012 0.060
#> SRR1363968 1 0.1297 0.75880 0.948 0.000 0.000 0.040 0.000 0.012
#> SRR814387 1 0.2996 0.67184 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.4019 0.61241 0.740 0.000 0.000 0.028 0.016 0.216
#> SRR1386689 4 0.4123 0.63408 0.016 0.000 0.000 0.696 0.016 0.272
#> SRR1395575 3 0.2762 0.61331 0.000 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1453811 3 0.4337 0.12114 0.020 0.000 0.500 0.000 0.000 0.480
#> SRR1441159 1 0.2981 0.69579 0.820 0.000 0.000 0.020 0.000 0.160
#> SRR1403154 4 0.2135 0.76476 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.4581 0.34766 0.000 0.000 0.596 0.020 0.016 0.368
#> SRR1310275 3 0.3288 0.53455 0.000 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 5.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.981 0.992 0.495 0.505 0.505
#> 3 3 0.960 0.937 0.972 0.240 0.858 0.726
#> 4 4 0.958 0.931 0.972 0.180 0.868 0.667
#> 5 5 0.936 0.875 0.952 0.070 0.915 0.706
#> 6 6 0.899 0.837 0.921 0.034 0.944 0.766
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 5
#> attr(,"optional")
#> [1] 2 3 4
There is also optional best \(k\) = 2 3 4 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1331708 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1464258 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.9954 0.148 0.540 0.460
#> SRR661589 2 0.6438 0.802 0.164 0.836
#> SRR1456229 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1315165 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1094457 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR1315931 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1430066 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1431037 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1395554 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1344143 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1486845 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1383907 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1429846 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR613550 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1345146 2 0.9087 0.526 0.324 0.676
#> SRR1324025 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1318879 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR820755 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1485830 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR599313 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1415398 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1326205 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1421327 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1083311 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1499303 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1079522 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1452935 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR661361 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR615778 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR655182 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1335140 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1433555 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1308650 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1317446 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1413602 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR661313 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1499935 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1447303 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1429408 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR1433950 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1409854 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1435229 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1414229 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1400974 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR613927 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR813776 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR808196 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1101085 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR614395 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1478251 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR665310 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1420109 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1330920 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1419539 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1359447 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1347259 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR613915 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1384395 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR821715 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1341480 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1326270 2 0.9866 0.246 0.432 0.568
#> SRR1498838 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1416313 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR808566 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1430270 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1367825 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR613533 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR661267 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1407250 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1420067 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1473632 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR812536 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1407671 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1446375 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1465230 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR614119 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR660510 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1445655 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR658953 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1485312 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1317631 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1330588 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1316367 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1091302 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR818263 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1404909 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1442422 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1407112 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1332969 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1353199 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1378885 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR665357 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1501020 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1347819 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1472576 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1431781 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1452270 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1500472 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1417632 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1458113 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1326579 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1096712 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1090407 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1377599 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1488449 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1318354 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1359062 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1398924 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR663783 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1319204 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1498595 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1377423 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1338426 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1353309 1 0.8661 0.592 0.712 0.288
#> SRR658941 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1324085 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1363858 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR819820 1 0.4022 0.908 0.920 0.080
#> SRR1337342 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR655206 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1387013 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1415379 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR663197 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1394836 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR661699 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR813680 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1378109 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1382851 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1433410 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR661167 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1432518 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR660462 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1374608 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR657949 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1308882 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1485870 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1444138 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1470193 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1091380 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1467102 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1485416 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR818821 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR809963 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1353710 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1445259 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1408393 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1310542 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1333485 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1406437 1 0.8443 0.626 0.728 0.272
#> SRR1354931 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1391856 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1446738 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR815869 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR613150 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1375329 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1387921 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR812943 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1400910 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1444203 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR658754 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1429603 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1397366 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1337606 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR659109 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR656946 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1342067 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1385389 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.7815 0.696 0.768 0.232
#> SRR1349121 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR612935 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1393596 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1070503 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1499894 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1082883 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1328620 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1396294 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1419917 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR662114 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1489199 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR813584 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1069638 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR614864 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR2167710 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1401252 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1309963 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1486889 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1486538 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1340486 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1465459 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1080270 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1312501 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1093148 2 0.7139 0.756 0.196 0.804
#> SRR1467080 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR816475 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1379198 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR613342 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1369129 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1396616 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR813824 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1082376 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1500891 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR807543 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1091572 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1346689 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1332424 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR663729 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR613675 2 0.8661 0.597 0.288 0.712
#> SRR1485357 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR655816 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1355172 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1338147 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1413329 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1485931 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1333308 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR809018 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR663440 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR808019 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1479133 1 0.1843 0.965 0.972 0.028
#> SRR615069 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1456185 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1350069 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR664795 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1490721 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1085285 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1099072 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1351347 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR809987 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR613639 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1402285 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1405660 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1095455 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1394734 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.9491 0.426 0.368 0.632
#> SRR1073581 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1473529 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR660764 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1328845 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1336415 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1379065 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1459190 2 0.7950 0.686 0.240 0.760
#> SRR1346773 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1347459 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1333395 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1309248 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR809161 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1316320 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1432629 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1416578 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1405547 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1470534 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1309160 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR663489 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1078489 2 0.1184 0.975 0.016 0.984
#> SRR1332648 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR660614 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR615946 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR661108 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR2170173 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR817329 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1401990 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1467745 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR813137 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR818797 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR2164608 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1455586 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR819459 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1385501 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1361652 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1478547 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1430910 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1486762 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1480854 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1489394 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1418085 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1340221 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1473058 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1405165 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1098712 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1455038 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1403005 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1475192 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1452468 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1347060 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1414139 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1343302 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1405331 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1322840 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1399797 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1416654 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1315081 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1369196 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1365291 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1367920 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1366648 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1082173 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1363968 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1386689 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1395575 2 0.0938 0.979 0.012 0.988
#> SRR1453811 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1403154 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
#> SRR1468722 1 0.9866 0.232 0.568 0.432
#> SRR1310275 1 0.0000 0.993 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331708 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1464258 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454201 3 0.0592 0.931 0.012 0.000 0.988
#> SRR661589 3 0.0661 0.932 0.008 0.004 0.988
#> SRR1456229 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315165 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1488960 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1094457 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1095575 3 0.2959 0.857 0.100 0.000 0.900
#> SRR1315931 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1431037 3 0.5291 0.654 0.000 0.268 0.732
#> SRR1395554 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR818002 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486845 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1362866 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1311018 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429846 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR613550 1 0.5678 0.518 0.684 0.000 0.316
#> SRR1348402 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 3 0.1877 0.918 0.012 0.032 0.956
#> SRR1324025 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1318879 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR820755 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485830 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR599313 1 0.0237 0.978 0.996 0.000 0.004
#> SRR612263 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.1031 0.924 0.024 0.000 0.976
#> SRR1326205 2 0.0424 0.968 0.000 0.992 0.008
#> SRR1421327 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1083311 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1499303 1 0.1482 0.958 0.968 0.020 0.012
#> SRR1079522 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1452935 3 0.4452 0.761 0.000 0.192 0.808
#> SRR1379495 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR615778 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR655182 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433555 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1308650 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 2 0.5397 0.604 0.000 0.720 0.280
#> SRR1413602 3 0.1031 0.929 0.000 0.024 0.976
#> SRR1479955 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.1529 0.918 0.000 0.040 0.960
#> SRR1499935 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1447303 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1429408 1 0.6381 0.487 0.648 0.340 0.012
#> SRR1433950 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409854 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435229 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400974 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1399971 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR613927 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR813776 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR808196 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1101085 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR614395 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478251 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1370551 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.1031 0.924 0.024 0.000 0.976
#> SRR1420109 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1330920 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419539 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359447 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347259 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR613915 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384395 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR821715 3 0.6126 0.363 0.400 0.000 0.600
#> SRR1478228 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1096383 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341480 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1341344 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.0592 0.931 0.012 0.000 0.988
#> SRR1498838 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1416313 3 0.3816 0.818 0.000 0.148 0.852
#> SRR808566 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1430270 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1367825 3 0.2537 0.887 0.000 0.080 0.920
#> SRR613533 2 0.6045 0.366 0.000 0.620 0.380
#> SRR661267 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407250 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420067 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR812536 3 0.0592 0.931 0.012 0.000 0.988
#> SRR1370850 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446375 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465230 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR614119 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1445655 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR658953 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0592 0.931 0.012 0.000 0.988
#> SRR1317631 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1488610 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1316367 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR818263 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404909 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR663076 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442422 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1465893 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407112 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1332969 3 0.1643 0.908 0.044 0.000 0.956
#> SRR1353199 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1378885 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR665357 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0592 0.931 0.012 0.000 0.988
#> SRR1347819 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1480813 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472576 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431781 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1452270 3 0.0592 0.931 0.012 0.000 0.988
#> SRR1500472 2 0.3116 0.866 0.000 0.892 0.108
#> SRR1417632 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458113 2 0.0237 0.972 0.000 0.996 0.004
#> SRR1326579 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.5254 0.661 0.000 0.264 0.736
#> SRR1090407 3 0.0592 0.931 0.012 0.000 0.988
#> SRR1083752 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377599 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1488449 3 0.0592 0.931 0.012 0.000 0.988
#> SRR1318354 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359062 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398924 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR663783 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1319204 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498595 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377423 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1312310 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 2 0.5327 0.620 0.000 0.728 0.272
#> SRR1353309 3 0.0592 0.931 0.012 0.000 0.988
#> SRR658941 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324085 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1363858 1 0.0424 0.977 0.992 0.000 0.008
#> SRR819820 3 0.0592 0.931 0.012 0.000 0.988
#> SRR1337342 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR655206 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387013 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415379 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1099622 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR663197 3 0.2537 0.887 0.000 0.080 0.920
#> SRR1394836 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR661699 3 0.2356 0.875 0.072 0.000 0.928
#> SRR813680 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1499174 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.0424 0.968 0.000 0.992 0.008
#> SRR1433410 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR661167 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1432518 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR660462 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1374608 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR657949 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308882 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR655768 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1444138 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1091380 3 0.2261 0.897 0.000 0.068 0.932
#> SRR1099096 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1467102 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485416 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR818821 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR809963 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1445259 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1408393 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310542 2 0.4399 0.762 0.000 0.812 0.188
#> SRR1333485 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1406437 1 0.9061 0.286 0.548 0.264 0.188
#> SRR1354931 3 0.5431 0.626 0.000 0.284 0.716
#> SRR1391856 3 0.6111 0.347 0.396 0.000 0.604
#> SRR1446738 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR815869 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1375329 3 0.2537 0.883 0.000 0.080 0.920
#> SRR1387921 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR812943 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400910 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444203 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR816177 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR658754 2 0.4555 0.744 0.000 0.800 0.200
#> SRR1429603 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1397366 3 0.0592 0.931 0.012 0.000 0.988
#> SRR1446028 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337606 1 0.1015 0.970 0.980 0.008 0.012
#> SRR659109 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1337192 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR656946 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1385389 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1075971 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.6129 0.507 0.668 0.324 0.008
#> SRR1349121 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR612935 2 0.3038 0.871 0.000 0.896 0.104
#> SRR661481 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1393596 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1452164 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499894 2 0.5098 0.664 0.000 0.752 0.248
#> SRR1082883 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1468271 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396294 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1419917 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1489199 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR813584 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069638 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR614864 3 0.0592 0.931 0.012 0.000 0.988
#> SRR1433392 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.5465 0.580 0.712 0.000 0.288
#> SRR1401252 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1309963 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1338031 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1380393 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1337010 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1340486 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1377696 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465459 3 0.6154 0.341 0.408 0.000 0.592
#> SRR1080270 2 0.4399 0.762 0.000 0.812 0.188
#> SRR1312501 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1093148 2 0.9256 0.111 0.168 0.488 0.344
#> SRR1467080 2 0.4452 0.756 0.000 0.808 0.192
#> SRR1410866 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR816475 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1379198 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR613342 2 0.3038 0.871 0.000 0.896 0.104
#> SRR1452246 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369129 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1396616 3 0.5016 0.698 0.000 0.240 0.760
#> SRR813824 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1082376 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500891 2 0.0424 0.968 0.000 0.992 0.008
#> SRR807543 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091572 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1346689 2 0.0237 0.971 0.000 0.996 0.004
#> SRR1332424 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR663729 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1097013 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR613675 2 0.2860 0.867 0.084 0.912 0.004
#> SRR1485357 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR655816 1 0.6192 0.244 0.580 0.000 0.420
#> SRR1500113 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355172 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1413329 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485931 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1452033 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1375351 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR663440 1 0.5882 0.443 0.652 0.000 0.348
#> SRR1471755 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR808019 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479133 3 0.0592 0.931 0.012 0.000 0.988
#> SRR615069 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456185 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350069 1 0.1999 0.941 0.952 0.036 0.012
#> SRR816316 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR664795 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490721 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR810643 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085285 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1099072 3 0.4002 0.795 0.160 0.000 0.840
#> SRR1317985 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1405525 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR809987 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR613639 1 0.6126 0.305 0.600 0.000 0.400
#> SRR1402285 1 0.0424 0.977 0.992 0.000 0.008
#> SRR1077038 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405660 3 0.1411 0.921 0.000 0.036 0.964
#> SRR1095455 2 0.3192 0.862 0.000 0.888 0.112
#> SRR1394734 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.4128 0.780 0.132 0.856 0.012
#> SRR1073581 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR660764 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328845 2 0.0592 0.964 0.000 0.988 0.012
#> SRR1336415 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1379065 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1459190 3 0.0592 0.931 0.012 0.000 0.988
#> SRR1346773 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347459 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1309248 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR809161 3 0.0592 0.931 0.012 0.000 0.988
#> SRR1316320 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432629 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1405547 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1470534 1 0.0424 0.977 0.992 0.000 0.008
#> SRR1380764 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR663489 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1500450 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 2 0.1015 0.956 0.008 0.980 0.012
#> SRR1332648 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR660614 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR615946 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR2170173 1 0.4605 0.728 0.796 0.000 0.204
#> SRR817329 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401990 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1467745 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR813137 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR818797 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164608 1 0.6168 0.269 0.588 0.000 0.412
#> SRR1455586 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR819459 2 0.4399 0.762 0.000 0.812 0.188
#> SRR1488939 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385501 1 0.3340 0.849 0.880 0.000 0.120
#> SRR1361652 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1430910 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486762 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480854 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1489394 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1418085 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1340221 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1473058 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405165 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1433004 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098712 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455038 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.0592 0.931 0.012 0.000 0.988
#> SRR1348378 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.0237 0.978 0.996 0.000 0.004
#> SRR1475192 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452468 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347060 2 0.4452 0.756 0.000 0.808 0.192
#> SRR1414139 2 0.2625 0.893 0.000 0.916 0.084
#> SRR1447962 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1373746 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.1289 0.924 0.000 0.032 0.968
#> SRR1345609 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.0424 0.968 0.000 0.992 0.008
#> SRR1322840 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1399797 3 0.6095 0.391 0.000 0.392 0.608
#> SRR1416654 3 0.0592 0.935 0.000 0.012 0.988
#> SRR1315081 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369196 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 1 0.0747 0.966 0.984 0.000 0.016
#> SRR1367920 1 0.6082 0.577 0.692 0.296 0.012
#> SRR1366648 3 0.6126 0.369 0.000 0.400 0.600
#> SRR1441679 2 0.0000 0.975 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.5216 0.668 0.000 0.260 0.740
#> SRR1363968 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1386689 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1395575 3 0.0661 0.934 0.004 0.008 0.988
#> SRR1453811 3 0.5327 0.637 0.272 0.000 0.728
#> SRR1441159 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 1 0.0592 0.975 0.988 0.000 0.012
#> SRR1468722 3 0.0592 0.931 0.012 0.000 0.988
#> SRR1310275 3 0.0592 0.931 0.012 0.000 0.988
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331708 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464258 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454201 3 0.4843 0.3542 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR661589 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315165 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 4 0.0817 0.9277 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1094457 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095575 3 0.3356 0.7732 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR1315931 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.3569 0.7483 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR1395554 2 0.3219 0.7948 0.000 0.836 0.164 0.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486845 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362866 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429846 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613550 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 3 0.2882 0.8467 0.084 0.024 0.892 0.000
#> SRR1324025 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318879 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820755 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485830 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR599313 1 0.1211 0.9526 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR612263 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.3688 0.7381 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1326205 4 0.4961 0.1608 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR1421327 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079522 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452935 3 0.3172 0.7863 0.000 0.160 0.840 0.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655182 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1335140 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 2 0.4855 0.3319 0.000 0.600 0.400 0.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499935 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429408 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433950 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435229 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400974 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613927 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813776 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808196 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101085 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614395 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478251 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.3649 0.7427 0.204 0.000 0.796 0.000
#> SRR1420109 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330920 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419539 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359447 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347259 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613915 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1384395 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821715 1 0.1022 0.9611 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608150 4 0.2345 0.8418 0.100 0.000 0.000 0.900
#> SRR1096383 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341480 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.0188 0.9256 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0817 0.9120 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR808566 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1430270 4 0.2281 0.8467 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR1367825 3 0.0336 0.9232 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR613533 2 0.4992 0.0815 0.000 0.524 0.476 0.000
#> SRR661267 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420067 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.1792 0.8777 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446375 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465230 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614119 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658953 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2166459 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 3 0.0469 0.9208 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1317631 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316367 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818263 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404909 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407112 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332969 3 0.3528 0.7562 0.192 0.000 0.808 0.000
#> SRR1353199 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378885 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665357 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.1716 0.8813 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500472 2 0.1637 0.9137 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1417632 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 2 0.0336 0.9602 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1326579 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.3649 0.7372 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1090407 3 0.0817 0.9120 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1083752 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377599 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488449 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318354 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359062 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663783 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319204 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498595 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377423 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.4981 0.1354 0.000 0.464 0.536 0.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658941 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363858 4 0.4967 0.1984 0.452 0.000 0.000 0.548
#> SRR819820 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337342 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655206 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387013 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663197 3 0.0336 0.9232 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1394836 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661699 3 0.3942 0.6865 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR813680 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.4955 0.2162 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1433410 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR657949 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308882 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444138 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091380 3 0.0188 0.9256 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 4 0.0188 0.9483 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1467102 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809963 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445259 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408393 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310542 2 0.3528 0.7565 0.000 0.808 0.192 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406437 4 0.3726 0.6957 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1354931 3 0.3569 0.7484 0.000 0.196 0.804 0.000
#> SRR1391856 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446738 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815869 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375329 3 0.2345 0.8433 0.000 0.100 0.900 0.000
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812943 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400910 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444203 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658754 2 0.4713 0.4378 0.000 0.640 0.360 0.000
#> SRR1429603 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1397366 3 0.1792 0.8777 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337606 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656946 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1322936 4 0.3873 0.6744 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR1349121 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612935 2 0.1557 0.9176 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499894 2 0.4605 0.4943 0.000 0.664 0.336 0.000
#> SRR1082883 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396294 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419917 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489199 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813584 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1069638 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614864 3 0.3444 0.7651 0.184 0.000 0.816 0.000
#> SRR1433392 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 1 0.0895 0.9712 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR1401252 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 4 0.3569 0.7160 0.196 0.000 0.000 0.804
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377696 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465459 1 0.2081 0.8998 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1080270 2 0.3528 0.7565 0.000 0.808 0.192 0.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093148 2 0.7901 0.0895 0.008 0.452 0.320 0.220
#> SRR1467080 2 0.3649 0.7389 0.000 0.796 0.204 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613342 2 0.1792 0.9062 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396616 3 0.2760 0.8228 0.000 0.128 0.872 0.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500891 4 0.4843 0.3200 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR807543 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091572 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346689 2 0.2530 0.8590 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1332424 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663729 4 0.0336 0.9445 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1097013 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613675 2 0.4843 0.3564 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1485357 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655816 1 0.4522 0.4969 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0188 0.9634 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1355172 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413329 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663440 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808019 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479133 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615069 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456185 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350069 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR664795 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490721 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1085285 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.3649 0.7430 0.204 0.000 0.796 0.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613639 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402285 4 0.4477 0.5556 0.312 0.000 0.000 0.688
#> SRR1077038 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405660 3 0.0188 0.9256 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1095455 2 0.1716 0.9099 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1394734 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073581 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660764 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328845 4 0.0336 0.9444 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1336415 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1459190 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1346773 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309248 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809161 3 0.3975 0.6987 0.240 0.000 0.760 0.000
#> SRR1316320 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432629 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.4790 0.4066 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1380764 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 4 0.0336 0.9446 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1332648 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660614 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615946 2 0.2011 0.8933 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817329 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401990 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467745 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813137 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818797 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164608 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455586 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819459 2 0.3528 0.7565 0.000 0.808 0.192 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361652 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430910 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0707 0.9741 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1486762 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480854 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1473058 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405165 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455038 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 4 0.4981 0.1659 0.464 0.000 0.000 0.536
#> SRR1475192 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347060 2 0.3801 0.7143 0.000 0.780 0.220 0.000
#> SRR1414139 2 0.1474 0.9215 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.3837 0.7078 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1322840 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399797 3 0.4661 0.4711 0.000 0.348 0.652 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315081 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369196 2 0.2149 0.8847 0.000 0.912 0.088 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367920 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1366648 3 0.4730 0.4338 0.000 0.364 0.636 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9667 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.3801 0.7139 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1363968 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1386689 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453811 1 0.4585 0.4692 0.668 0.000 0.332 0.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.9947 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.9522 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.9278 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.0469 0.9209 0.012 0.000 0.988 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331708 4 0.0162 0.9577 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1464258 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454201 3 0.4949 0.4554 0.288 0.000 0.656 0.000 0.056
#> SRR661589 3 0.0162 0.8758 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1456229 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315165 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 4 0.2516 0.8186 0.000 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1094457 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095575 5 0.0865 0.8873 0.004 0.000 0.024 0.000 0.972
#> SRR1315931 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.4294 0.1886 0.000 0.468 0.532 0.000 0.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.0162 0.9500 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486845 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362866 1 0.0162 0.9675 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429846 5 0.0794 0.8892 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR613550 5 0.0162 0.9007 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1348402 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 5 0.6402 0.4103 0.216 0.000 0.276 0.000 0.508
#> SRR1324025 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318879 3 0.0404 0.8723 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR820755 5 0.1197 0.8744 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1485830 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR599313 1 0.0162 0.9674 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 5 0.0162 0.8992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1326205 2 0.4390 0.2732 0.000 0.568 0.000 0.428 0.004
#> SRR1421327 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079522 4 0.3999 0.4871 0.000 0.000 0.000 0.656 0.344
#> SRR1452935 3 0.0162 0.8757 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615778 1 0.3366 0.6691 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232
#> SRR1447564 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655182 2 0.0162 0.9500 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1335140 2 0.0162 0.9500 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1433555 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.3949 0.5109 0.000 0.332 0.668 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661313 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499935 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429408 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433950 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 5 0.3730 0.6196 0.288 0.000 0.000 0.000 0.712
#> SRR1435229 2 0.0162 0.9500 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1085996 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400974 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613927 5 0.0290 0.9009 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813776 5 0.0290 0.9009 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR808196 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101085 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614395 5 0.4161 0.3880 0.392 0.000 0.000 0.000 0.608
#> SRR1478251 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 5 0.0162 0.8992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1420109 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330920 5 0.3177 0.7315 0.208 0.000 0.000 0.000 0.792
#> SRR1419539 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359447 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347259 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613915 5 0.0290 0.9009 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1384395 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821715 5 0.0162 0.9007 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1478228 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.4268 0.1839 0.556 0.000 0.000 0.444 0.000
#> SRR1096383 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341480 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.0671 0.8617 0.016 0.000 0.980 0.000 0.004
#> SRR1498838 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808566 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430270 4 0.4101 0.4334 0.372 0.000 0.000 0.628 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0880 0.8518 0.000 0.032 0.968 0.000 0.000
#> SRR661267 1 0.0162 0.9677 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR810665 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420067 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 2 0.0162 0.9500 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR812536 5 0.0162 0.8992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.0162 0.9500 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1446375 2 0.0324 0.9473 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1465230 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614119 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0510 0.9564 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR660510 3 0.0162 0.8758 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1445655 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658953 5 0.0000 0.8987 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166459 5 0.0290 0.9009 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485312 5 0.2852 0.7492 0.000 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR1317631 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316367 2 0.0162 0.9500 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1433926 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091302 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818263 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404909 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407112 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332969 5 0.0162 0.8992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1353199 3 0.0162 0.8758 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1378885 1 0.4161 0.2957 0.608 0.000 0.000 0.000 0.392
#> SRR665357 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 5 0.0703 0.8879 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1347819 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452270 5 0.0162 0.8992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1500472 2 0.4359 0.2308 0.000 0.584 0.412 0.000 0.004
#> SRR1417632 2 0.0162 0.9500 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.4297 0.1752 0.000 0.472 0.528 0.000 0.000
#> SRR1326579 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 5 0.0162 0.8992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1083752 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377599 4 0.0162 0.9577 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1488449 5 0.0162 0.8992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1318354 2 0.4182 0.2732 0.000 0.600 0.400 0.000 0.000
#> SRR1359062 2 0.4171 0.2849 0.000 0.604 0.396 0.000 0.000
#> SRR1398924 2 0.0162 0.9500 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR663783 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319204 2 0.0162 0.9500 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498595 2 0.0162 0.9500 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1377423 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.1270 0.8336 0.000 0.052 0.948 0.000 0.000
#> SRR1353309 3 0.0162 0.8758 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658941 2 0.0404 0.9417 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363858 1 0.0703 0.9461 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR819820 3 0.3508 0.5563 0.000 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1337342 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655206 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387013 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663197 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394836 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661699 5 0.0162 0.8992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR813680 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.4150 0.3868 0.000 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR1433410 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661167 3 0.0162 0.8758 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1432518 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR657949 5 0.0290 0.9009 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1308882 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485870 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444138 2 0.4264 0.3346 0.000 0.620 0.376 0.000 0.004
#> SRR1417342 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091380 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 4 0.3395 0.6627 0.236 0.000 0.000 0.764 0.000
#> SRR1467102 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809963 5 0.0510 0.8968 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445259 3 0.0162 0.8757 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1408393 5 0.0162 0.9007 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1361522 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310542 3 0.4291 0.2010 0.000 0.464 0.536 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406437 4 0.4337 0.6552 0.000 0.196 0.000 0.748 0.056
#> SRR1354931 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391856 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446738 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 2 0.4182 0.2732 0.000 0.600 0.400 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0162 0.8758 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1375329 3 0.0162 0.8757 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812943 2 0.0162 0.9500 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1400910 2 0.0162 0.9500 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444203 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658754 3 0.3508 0.6395 0.000 0.252 0.748 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1397366 5 0.1121 0.8736 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1446028 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337606 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656946 2 0.0162 0.9500 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1476102 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614419 5 0.4300 0.1200 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1322936 4 0.5137 0.5738 0.096 0.228 0.000 0.676 0.000
#> SRR1349121 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612935 2 0.4367 0.2180 0.000 0.580 0.416 0.000 0.004
#> SRR661481 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 5 0.3730 0.6196 0.288 0.000 0.000 0.000 0.712
#> SRR1499894 3 0.4273 0.2451 0.000 0.448 0.552 0.000 0.000
#> SRR1082883 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0609 0.9525 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1328620 2 0.4182 0.2732 0.000 0.600 0.400 0.000 0.000
#> SRR1396294 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419917 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489199 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813584 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069638 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614864 5 0.3983 0.7467 0.164 0.000 0.052 0.000 0.784
#> SRR1433392 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 5 0.0000 0.8987 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401252 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 4 0.0162 0.9568 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.0162 0.9500 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1465459 5 0.0162 0.9007 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1080270 3 0.4287 0.2129 0.000 0.460 0.540 0.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093148 3 0.6686 0.5666 0.076 0.132 0.624 0.164 0.004
#> SRR1467080 3 0.4294 0.1886 0.000 0.468 0.532 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613342 3 0.4302 0.1473 0.000 0.480 0.520 0.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500891 2 0.4449 0.0923 0.000 0.512 0.000 0.484 0.004
#> SRR807543 5 0.3966 0.5293 0.336 0.000 0.000 0.000 0.664
#> SRR1091572 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1346689 2 0.0451 0.9436 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1332424 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663729 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613675 2 0.4506 0.5481 0.028 0.676 0.000 0.296 0.000
#> SRR1485357 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR655816 5 0.0162 0.8992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1500113 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355172 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655531 5 0.3796 0.5855 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1338147 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413329 5 0.0290 0.9009 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 5 0.0162 0.9007 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1471755 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808019 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479133 5 0.4297 0.2152 0.000 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR615069 2 0.1671 0.8741 0.000 0.924 0.076 0.000 0.000
#> SRR1456185 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350069 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR664795 5 0.0290 0.9009 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1490721 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 5 0.0290 0.9009 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1085285 3 0.0162 0.8758 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1099072 5 0.0162 0.8992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.0162 0.9675 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2157314 5 0.0404 0.8992 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613639 5 0.0290 0.9009 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1402285 4 0.3336 0.6715 0.228 0.000 0.000 0.772 0.000
#> SRR1077038 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 2 0.4449 -0.0353 0.000 0.512 0.484 0.000 0.004
#> SRR1394734 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.0794 0.9444 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1365894 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073581 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.0162 0.9500 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR660764 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820448 1 0.4192 0.2843 0.596 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR1328845 4 0.0703 0.9345 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1336415 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1459190 5 0.3305 0.6841 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1346773 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 2 0.4060 0.3824 0.000 0.640 0.360 0.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.2605 0.8088 0.000 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1309248 2 0.0162 0.9500 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR809161 5 0.0162 0.8992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1316320 2 0.0162 0.9500 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1432629 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.3480 0.6417 0.248 0.000 0.000 0.752 0.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0162 0.8758 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR663489 3 0.0162 0.8758 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1500450 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 4 0.0404 0.9482 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1332648 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660614 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615946 3 0.4294 0.1886 0.000 0.468 0.532 0.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665586 1 0.4235 0.2236 0.576 0.000 0.000 0.000 0.424
#> SRR1347166 1 0.4291 0.0863 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1485722 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0162 0.8758 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2170173 5 0.0162 0.9007 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR817329 1 0.4249 0.1977 0.568 0.000 0.000 0.000 0.432
#> SRR1401990 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467745 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 5 0.0290 0.9009 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1314873 1 0.3707 0.5740 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284
#> SRR1401211 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818797 5 0.0404 0.8990 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR2164608 5 0.0162 0.9007 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1455586 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819459 3 0.4294 0.1886 0.000 0.468 0.532 0.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 5 0.0290 0.9009 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1361652 2 0.0162 0.9500 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0162 0.9674 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1486762 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480854 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473058 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405165 3 0.0162 0.8758 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1433004 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1455038 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 5 0.0162 0.8992 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1348378 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 4 0.4242 0.2835 0.428 0.000 0.000 0.572 0.000
#> SRR1475192 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 1 0.4150 0.3308 0.612 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR1347060 3 0.3913 0.5270 0.000 0.324 0.676 0.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.4273 0.1134 0.000 0.552 0.448 0.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 2 0.2249 0.8482 0.000 0.896 0.000 0.096 0.008
#> SRR1322840 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315081 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369196 3 0.4291 0.2010 0.000 0.464 0.536 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 5 0.0290 0.9009 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1367920 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1366648 3 0.0290 0.8722 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9523 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.0000 0.8776 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363968 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1386689 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0162 0.8758 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1453811 5 0.3398 0.7236 0.216 0.000 0.004 0.000 0.780
#> SRR1441159 1 0.0000 0.9714 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.9608 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468722 5 0.3508 0.6432 0.000 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1310275 3 0.2006 0.8065 0.012 0.000 0.916 0.000 0.072
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1331708 5 0.1910 0.50190 0.000 0.000 0.000 0.108 0.892 0.000
#> SRR1464258 1 0.0146 0.96828 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1454201 5 0.5353 0.39328 0.084 0.000 0.256 0.000 0.628 0.032
#> SRR661589 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.0260 0.96629 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1315165 4 0.0260 0.93625 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1488960 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1417809 4 0.0717 0.92537 0.000 0.000 0.000 0.976 0.008 0.016
#> SRR1094457 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095575 5 0.4637 0.04653 0.016 0.000 0.016 0.000 0.528 0.440
#> SRR1315931 1 0.0000 0.96937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0520 0.92101 0.000 0.008 0.984 0.000 0.008 0.000
#> SRR1395554 2 0.3955 0.20518 0.000 0.560 0.436 0.000 0.004 0.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344143 5 0.3531 0.76372 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672 0.000
#> SRR1486845 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362866 1 0.2631 0.78288 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.96937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0291 0.96910 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1383907 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429846 6 0.0458 0.86202 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984
#> SRR613550 6 0.0000 0.86742 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348402 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1345146 5 0.4811 0.41329 0.008 0.004 0.080 0.000 0.680 0.228
#> SRR1324025 3 0.0458 0.92296 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1318879 5 0.4091 -0.00243 0.000 0.000 0.472 0.000 0.520 0.008
#> SRR820755 6 0.1327 0.82731 0.064 0.000 0.000 0.000 0.000 0.936
#> SRR1485830 4 0.1007 0.91881 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR599313 1 0.0146 0.96828 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR612263 1 0.0146 0.96828 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1415398 6 0.0000 0.86742 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326205 5 0.3641 0.75511 0.000 0.224 0.000 0.028 0.748 0.000
#> SRR1421327 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.1910 0.87788 0.000 0.000 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1079522 5 0.3883 0.47257 0.000 0.000 0.000 0.088 0.768 0.144
#> SRR1452935 3 0.3672 0.40298 0.000 0.000 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.96937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0458 0.92296 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR615778 1 0.3830 0.33914 0.620 0.000 0.000 0.004 0.000 0.376
#> SRR1447564 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.96937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655182 5 0.3531 0.76372 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672 0.000
#> SRR1335140 5 0.2793 0.74169 0.000 0.200 0.000 0.000 0.800 0.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.0291 0.96910 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1317446 3 0.3706 0.24224 0.000 0.380 0.620 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809853 1 0.0363 0.96364 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR661313 3 0.0146 0.92665 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1499935 4 0.1910 0.87788 0.000 0.000 0.000 0.892 0.108 0.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429408 4 0.3390 0.71542 0.000 0.000 0.000 0.704 0.296 0.000
#> SRR1433950 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 6 0.3244 0.62644 0.268 0.000 0.000 0.000 0.000 0.732
#> SRR1435229 5 0.3531 0.76372 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672 0.000
#> SRR1085996 1 0.0146 0.96828 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1414229 2 0.0146 0.89654 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1400974 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR613927 6 0.0000 0.86742 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457854 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1473714 1 0.2597 0.79547 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR813776 6 0.0146 0.86704 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR808196 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101085 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614395 6 0.3337 0.63462 0.260 0.000 0.000 0.004 0.000 0.736
#> SRR1478251 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0291 0.96910 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR665310 6 0.0260 0.86746 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1420109 3 0.0260 0.92600 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1330920 6 0.1267 0.83132 0.060 0.000 0.000 0.000 0.000 0.940
#> SRR1419539 2 0.0458 0.88663 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1359447 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347259 4 0.0790 0.92567 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR613915 6 0.0000 0.86742 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384395 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821715 6 0.0000 0.86742 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478228 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1445637 1 0.0260 0.96629 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR608150 1 0.5454 0.37016 0.548 0.000 0.000 0.152 0.300 0.000
#> SRR1096383 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1341480 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341344 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.1053 0.90473 0.020 0.000 0.964 0.000 0.012 0.004
#> SRR1498838 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0146 0.92665 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR808566 4 0.0146 0.93723 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1430270 4 0.1957 0.81356 0.112 0.000 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613533 3 0.2112 0.81721 0.000 0.088 0.896 0.000 0.016 0.000
#> SRR661267 1 0.1219 0.92823 0.948 0.000 0.000 0.004 0.000 0.048
#> SRR810665 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1420067 1 0.0000 0.96937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 5 0.3531 0.76372 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672 0.000
#> SRR812536 6 0.0260 0.86746 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1370850 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 5 0.3810 0.62379 0.000 0.428 0.000 0.000 0.572 0.000
#> SRR1446375 5 0.4026 0.70703 0.000 0.376 0.012 0.000 0.612 0.000
#> SRR1465230 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614119 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.0146 0.96828 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1392676 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.1644 0.89801 0.920 0.000 0.000 0.004 0.000 0.076
#> SRR660510 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658953 6 0.0260 0.86746 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR2166459 6 0.0260 0.86746 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1070713 2 0.0547 0.88275 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1485312 6 0.3854 0.07343 0.000 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536
#> SRR1317631 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488610 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1330588 3 0.0458 0.92296 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1316367 5 0.3499 0.76579 0.000 0.320 0.000 0.000 0.680 0.000
#> SRR1433926 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1091302 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818263 1 0.0146 0.96828 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1404909 4 0.1387 0.90498 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR663076 1 0.0291 0.96910 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR654862 1 0.0260 0.96629 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1407112 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332969 6 0.0632 0.85362 0.000 0.000 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1353199 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378885 1 0.3482 0.50674 0.684 0.000 0.000 0.000 0.000 0.316
#> SRR665357 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 6 0.2048 0.76839 0.000 0.000 0.120 0.000 0.000 0.880
#> SRR1347819 3 0.0146 0.92665 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431781 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452270 6 0.0260 0.86746 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1500472 5 0.4711 0.73229 0.000 0.328 0.064 0.000 0.608 0.000
#> SRR1417632 5 0.3266 0.76725 0.000 0.272 0.000 0.000 0.728 0.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 2 0.4057 0.27459 0.000 0.600 0.388 0.000 0.012 0.000
#> SRR1326579 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1349363 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.0405 0.92173 0.000 0.008 0.988 0.000 0.004 0.000
#> SRR1090407 6 0.0146 0.86647 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1083752 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1377599 5 0.3782 0.07864 0.000 0.000 0.000 0.412 0.588 0.000
#> SRR1488449 6 0.0260 0.86746 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1318354 2 0.4061 0.55380 0.000 0.748 0.164 0.000 0.088 0.000
#> SRR1359062 2 0.2219 0.73126 0.000 0.864 0.136 0.000 0.000 0.000
#> SRR1398924 5 0.3515 0.76501 0.000 0.324 0.000 0.000 0.676 0.000
#> SRR663783 3 0.0146 0.92592 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1319204 5 0.3862 0.51437 0.000 0.476 0.000 0.000 0.524 0.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0146 0.96828 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1337449 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498595 5 0.3607 0.74663 0.000 0.348 0.000 0.000 0.652 0.000
#> SRR1377423 3 0.0146 0.92592 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1338426 3 0.1807 0.84750 0.000 0.060 0.920 0.000 0.020 0.000
#> SRR1353309 3 0.0260 0.92426 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR658941 2 0.1814 0.79087 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1101643 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0260 0.93625 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1363858 1 0.2631 0.79025 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR819820 3 0.1910 0.82821 0.000 0.000 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1337342 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR655206 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387013 2 0.0458 0.88663 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1317410 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR608198 1 0.0291 0.96910 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663197 3 0.0146 0.92665 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1394836 2 0.3288 0.50736 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR661699 6 0.0260 0.86746 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR813680 1 0.0937 0.93790 0.960 0.000 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1410678 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.0603 0.96144 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1311486 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 2 0.6118 -0.19031 0.000 0.360 0.000 0.304 0.336 0.000
#> SRR1433410 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.0260 0.92388 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374608 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR657949 6 0.0260 0.86746 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1308882 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655768 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1485870 4 0.1556 0.89650 0.000 0.000 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1444138 5 0.5184 0.54563 0.000 0.432 0.088 0.000 0.480 0.000
#> SRR1417342 1 0.0692 0.95659 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004 0.000
#> SRR1470193 4 0.1075 0.91706 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1091380 3 0.0146 0.92592 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1099096 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1313583 4 0.1556 0.85589 0.080 0.000 0.000 0.920 0.000 0.000
#> SRR1467102 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818821 3 0.0363 0.92119 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR809963 6 0.0363 0.86499 0.012 0.000 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1072247 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445259 3 0.3867 0.06897 0.000 0.000 0.512 0.000 0.488 0.000
#> SRR1408393 6 0.0260 0.86746 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1361522 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310542 2 0.3828 0.20407 0.000 0.560 0.440 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406437 4 0.4726 0.68755 0.000 0.056 0.000 0.696 0.220 0.028
#> SRR1354931 3 0.0865 0.91185 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1391856 4 0.3351 0.72345 0.000 0.000 0.000 0.712 0.288 0.000
#> SRR1446738 2 0.1814 0.78804 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 2 0.3221 0.52160 0.000 0.736 0.264 0.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375329 5 0.3992 0.28758 0.000 0.012 0.364 0.000 0.624 0.000
#> SRR1387921 1 0.0291 0.96910 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR812943 5 0.3531 0.76372 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672 0.000
#> SRR1400910 5 0.3515 0.76501 0.000 0.324 0.000 0.000 0.676 0.000
#> SRR1444203 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816177 2 0.0458 0.88663 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR658754 3 0.3528 0.44350 0.000 0.296 0.700 0.000 0.004 0.000
#> SRR1429603 4 0.1204 0.91239 0.000 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1397366 6 0.2527 0.71798 0.000 0.000 0.168 0.000 0.000 0.832
#> SRR1446028 1 0.0291 0.96910 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337606 4 0.3634 0.64638 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356 0.000
#> SRR659109 3 0.0146 0.92665 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1337192 1 0.0291 0.96910 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR656946 5 0.3634 0.73863 0.000 0.356 0.000 0.000 0.644 0.000
#> SRR1476102 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0291 0.96910 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1342067 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR614419 6 0.3349 0.64194 0.244 0.000 0.000 0.000 0.008 0.748
#> SRR1322936 4 0.6067 0.29394 0.116 0.032 0.000 0.428 0.424 0.000
#> SRR1349121 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR612935 5 0.5418 0.60034 0.000 0.388 0.120 0.000 0.492 0.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.3330 0.72820 0.000 0.000 0.000 0.716 0.284 0.000
#> SRR1452164 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1070503 6 0.3126 0.64897 0.248 0.000 0.000 0.000 0.000 0.752
#> SRR1499894 2 0.3864 0.12255 0.000 0.520 0.480 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082883 4 0.0260 0.93625 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1468271 1 0.0291 0.96910 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1332443 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.1908 0.87450 0.900 0.000 0.000 0.004 0.000 0.096
#> SRR1328620 2 0.4085 0.49281 0.000 0.716 0.232 0.000 0.052 0.000
#> SRR1396294 4 0.0458 0.93355 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1419917 1 0.0146 0.96828 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR662114 3 0.0146 0.92665 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1489199 1 0.0260 0.96629 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR813584 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1069638 2 0.0363 0.88947 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR614864 6 0.4781 0.61353 0.140 0.000 0.188 0.000 0.000 0.672
#> SRR1433392 1 0.0260 0.96629 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1377777 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 6 0.1714 0.80512 0.000 0.000 0.000 0.000 0.092 0.908
#> SRR1401252 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0260 0.96629 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1418628 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 4 0.0291 0.93473 0.004 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004
#> SRR1380393 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1319731 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1356468 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1486538 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340486 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377696 5 0.3578 0.75431 0.000 0.340 0.000 0.000 0.660 0.000
#> SRR1465459 6 0.0000 0.86742 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080270 2 0.3961 0.19825 0.000 0.556 0.440 0.000 0.004 0.000
#> SRR1312501 3 0.0458 0.92296 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1093148 3 0.5952 0.41665 0.024 0.088 0.544 0.016 0.328 0.000
#> SRR1467080 2 0.3828 0.20304 0.000 0.560 0.440 0.000 0.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.0260 0.93655 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613342 2 0.4101 0.23892 0.000 0.580 0.408 0.000 0.012 0.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.0790 0.91445 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.0260 0.96629 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1500891 5 0.3816 0.75945 0.000 0.240 0.000 0.032 0.728 0.000
#> SRR807543 6 0.3198 0.63606 0.260 0.000 0.000 0.000 0.000 0.740
#> SRR1091572 2 0.3659 0.34694 0.000 0.636 0.000 0.000 0.364 0.000
#> SRR1346689 5 0.3534 0.76620 0.000 0.276 0.000 0.008 0.716 0.000
#> SRR1332424 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR663729 4 0.0146 0.93653 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.0291 0.96834 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR613675 5 0.6801 0.19845 0.052 0.276 0.000 0.248 0.424 0.000
#> SRR1485357 4 0.0260 0.93625 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR655816 6 0.0260 0.86746 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1500113 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1437622 2 0.1141 0.84521 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1355172 1 0.0000 0.96937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655531 6 0.2553 0.75195 0.144 0.000 0.000 0.000 0.008 0.848
#> SRR1338147 3 0.0458 0.92296 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1413329 6 0.0260 0.86746 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1485931 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0291 0.96910 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1333308 4 0.0547 0.93131 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1452033 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 6 0.0260 0.86746 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1471755 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808019 1 0.0000 0.96937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479133 3 0.3563 0.44041 0.000 0.000 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR615069 2 0.2121 0.77774 0.000 0.892 0.096 0.000 0.012 0.000
#> SRR1456185 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350069 4 0.3351 0.72343 0.000 0.000 0.000 0.712 0.288 0.000
#> SRR816316 1 0.1141 0.92712 0.948 0.000 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR664795 6 0.0405 0.86728 0.004 0.000 0.000 0.000 0.008 0.988
#> SRR1490721 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR810643 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1430333 6 0.0260 0.86746 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1085285 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099072 6 0.0000 0.86742 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.96937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0458 0.92296 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1405525 1 0.3756 0.37762 0.600 0.000 0.000 0.000 0.400 0.000
#> SRR1370329 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0291 0.96910 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819610 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2157314 6 0.0972 0.85332 0.028 0.000 0.000 0.000 0.008 0.964
#> SRR1409465 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.0260 0.93625 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR613639 6 0.0000 0.86742 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402285 4 0.0865 0.90720 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.0146 0.96828 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1405660 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 5 0.4646 0.73553 0.000 0.324 0.060 0.000 0.616 0.000
#> SRR1394734 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317771 1 0.1644 0.89776 0.920 0.000 0.000 0.004 0.000 0.076
#> SRR1365894 4 0.3634 0.64638 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356 0.000
#> SRR1073581 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473529 5 0.3647 0.73097 0.000 0.360 0.000 0.000 0.640 0.000
#> SRR660764 2 0.0260 0.89288 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR820448 6 0.3843 0.24782 0.452 0.000 0.000 0.000 0.000 0.548
#> SRR1328845 4 0.4332 0.66558 0.000 0.048 0.000 0.664 0.288 0.000
#> SRR1336415 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459190 6 0.3847 0.42191 0.000 0.000 0.348 0.000 0.008 0.644
#> SRR1346773 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1499521 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 2 0.2234 0.74504 0.000 0.872 0.124 0.000 0.004 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.1196 0.90990 0.000 0.000 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1309248 5 0.3309 0.76733 0.000 0.280 0.000 0.000 0.720 0.000
#> SRR809161 6 0.0260 0.86746 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1316320 5 0.2454 0.70697 0.000 0.160 0.000 0.000 0.840 0.000
#> SRR1432629 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1416578 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0937 0.90300 0.040 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.0291 0.96910 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1078489 4 0.4543 0.56607 0.000 0.032 0.004 0.584 0.380 0.000
#> SRR1332648 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660614 2 0.0260 0.89288 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0291 0.96910 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1477949 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR615946 2 0.4147 0.19404 0.000 0.552 0.436 0.000 0.012 0.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.96937 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665586 6 0.3828 0.28698 0.440 0.000 0.000 0.000 0.000 0.560
#> SRR1347166 6 0.3489 0.59402 0.288 0.000 0.000 0.004 0.000 0.708
#> SRR1485722 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1415316 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0363 0.96364 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR661108 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2170173 6 0.0260 0.86746 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR817329 6 0.3823 0.29623 0.436 0.000 0.000 0.000 0.000 0.564
#> SRR1401990 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467745 2 0.0458 0.88663 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 6 0.0146 0.86704 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1314873 1 0.3528 0.54479 0.700 0.000 0.000 0.004 0.000 0.296
#> SRR1401211 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.2793 0.65610 0.000 0.800 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR818797 6 0.0146 0.86704 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR2164608 6 0.0260 0.86746 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1455586 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819459 2 0.3817 0.21807 0.000 0.568 0.432 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 6 0.0146 0.86704 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1361652 5 0.3531 0.76372 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672 0.000
#> SRR1437119 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430910 2 0.3672 0.02244 0.000 0.632 0.000 0.000 0.368 0.000
#> SRR1310584 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1500216 1 0.0146 0.96828 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486762 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480854 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473058 2 0.3076 0.57392 0.000 0.760 0.000 0.000 0.240 0.000
#> SRR1405165 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.0363 0.96364 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1471477 1 0.0291 0.96910 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 2 0.1556 0.81376 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1455038 1 0.0260 0.96629 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1375248 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 6 0.0405 0.86606 0.000 0.000 0.004 0.000 0.008 0.988
#> SRR1348378 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1413541 1 0.0146 0.96828 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1392943 4 0.3547 0.48604 0.332 0.000 0.000 0.668 0.000 0.000
#> SRR1475192 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 1 0.3868 -0.08246 0.504 0.000 0.000 0.000 0.000 0.496
#> SRR1347060 3 0.3742 0.31920 0.000 0.348 0.648 0.000 0.004 0.000
#> SRR1414139 2 0.3428 0.45147 0.000 0.696 0.304 0.000 0.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0291 0.96910 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1413436 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1343302 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1429678 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.0458 0.92296 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1345609 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1380208 5 0.0865 0.56976 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1322840 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.0291 0.92484 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315081 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369196 2 0.3828 0.20407 0.000 0.560 0.440 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1365291 6 0.0146 0.86704 0.004 0.000 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1367920 4 0.3765 0.57349 0.000 0.000 0.000 0.596 0.404 0.000
#> SRR1366648 3 0.0547 0.91028 0.000 0.020 0.980 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.90023 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.0790 0.91456 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1363968 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR814387 1 0.0146 0.96926 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0603 0.95838 0.980 0.000 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1386689 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.92736 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453811 6 0.2941 0.67926 0.220 0.000 0.000 0.000 0.000 0.780
#> SRR1441159 1 0.0146 0.96954 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1403154 4 0.0000 0.93905 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.3993 0.09391 0.000 0.000 0.520 0.000 0.004 0.476
#> SRR1310275 3 0.3010 0.80552 0.004 0.000 0.836 0.000 0.132 0.028
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.633 0.807 0.918 0.4642 0.536 0.536
#> 3 3 0.970 0.936 0.974 0.3976 0.670 0.458
#> 4 4 0.703 0.745 0.831 0.1297 0.889 0.698
#> 5 5 0.775 0.797 0.886 0.0814 0.863 0.554
#> 6 6 0.754 0.583 0.762 0.0385 0.920 0.652
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1331708 1 0.7139 0.7244 0.804 0.196
#> SRR1464258 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.8555 0.6236 0.720 0.280
#> SRR661589 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1456229 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1315165 1 0.0376 0.8873 0.996 0.004
#> SRR1488960 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1094457 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1095575 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR1315931 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1430066 2 0.9393 0.4145 0.356 0.644
#> SRR1431037 2 0.7299 0.7266 0.204 0.796
#> SRR1395554 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1344143 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1486845 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1362866 1 0.0376 0.8873 0.996 0.004
#> SRR1490740 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1383907 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1429846 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR613550 1 0.9044 0.5650 0.680 0.320
#> SRR1348402 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1324025 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1318879 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR820755 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1485830 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR599313 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1415398 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR1326205 1 0.9754 0.3728 0.592 0.408
#> SRR1421327 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1083311 2 0.0376 0.9235 0.004 0.996
#> SRR1499303 1 0.8955 0.5777 0.688 0.312
#> SRR1079522 1 0.8813 0.5953 0.700 0.300
#> SRR1452935 2 0.9795 0.2313 0.416 0.584
#> SRR1379495 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR661361 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR615778 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR655182 2 0.9933 0.0966 0.452 0.548
#> SRR1335140 2 0.9866 0.1732 0.432 0.568
#> SRR1433555 2 0.7745 0.6916 0.228 0.772
#> SRR1308650 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1317446 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1413602 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR661313 2 0.7745 0.6916 0.228 0.772
#> SRR1499935 1 0.6247 0.7645 0.844 0.156
#> SRR1447303 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1429408 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR1433950 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1409854 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1435229 2 0.8081 0.6568 0.248 0.752
#> SRR1085996 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1414229 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1400974 2 0.4690 0.8430 0.100 0.900
#> SRR1399971 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR613927 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.8016 0.6698 0.756 0.244
#> SRR813776 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR808196 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1101085 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR614395 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1478251 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR665310 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR1420109 2 0.8144 0.6498 0.252 0.748
#> SRR1330920 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1419539 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1359447 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1347259 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR613915 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1384395 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR821715 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR608150 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1096383 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1341480 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1326270 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR1498838 2 0.9795 0.2313 0.416 0.584
#> SRR1416313 2 0.7602 0.7037 0.220 0.780
#> SRR808566 1 0.1843 0.8711 0.972 0.028
#> SRR1430270 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1367825 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR613533 2 0.6438 0.7756 0.164 0.836
#> SRR661267 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1407250 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1420067 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1473632 2 0.7299 0.7266 0.204 0.796
#> SRR812536 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR1370850 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1407671 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1446375 2 0.7299 0.7266 0.204 0.796
#> SRR1465230 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR614119 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR660510 1 0.9732 0.4108 0.596 0.404
#> SRR1445655 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR658953 1 0.2948 0.8536 0.948 0.052
#> SRR2166459 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1485312 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR1317631 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1330588 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1316367 1 0.8555 0.6236 0.720 0.280
#> SRR1433926 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1091302 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR818263 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1404909 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1442422 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1407112 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1332969 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR1353199 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1378885 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR665357 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1501020 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR1347819 2 0.7219 0.7318 0.200 0.800
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1472576 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1431781 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1452270 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1500472 2 0.8713 0.5685 0.292 0.708
#> SRR1417632 2 0.7815 0.6852 0.232 0.768
#> SRR1350153 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1458113 2 0.5946 0.7980 0.144 0.856
#> SRR1326579 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1096712 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1090407 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR1083752 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1377599 1 0.7528 0.7026 0.784 0.216
#> SRR1488449 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR1318354 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1359062 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1398924 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR663783 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1319204 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1498595 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1377423 2 0.7815 0.6851 0.232 0.768
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1338426 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1353309 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR658941 2 0.7815 0.6850 0.232 0.768
#> SRR1101643 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1324085 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1363858 1 0.0938 0.8820 0.988 0.012
#> SRR819820 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1337342 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR655206 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1387013 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1317410 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR608198 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1415379 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR663197 2 0.3733 0.8687 0.072 0.928
#> SRR1394836 2 0.9427 0.4030 0.360 0.640
#> SRR661699 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR813680 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1378109 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.7299 0.7160 0.796 0.204
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1382851 2 0.9996 -0.0589 0.488 0.512
#> SRR1433410 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR661167 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1432518 2 0.9795 0.2313 0.416 0.584
#> SRR660462 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1374608 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR657949 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1308882 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1485870 1 0.0376 0.8873 0.996 0.004
#> SRR1444138 2 0.7745 0.6916 0.228 0.772
#> SRR1417342 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1470193 1 0.7299 0.7162 0.796 0.204
#> SRR1091380 2 0.7745 0.6916 0.228 0.772
#> SRR1099096 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1467102 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1485416 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR818821 1 0.9909 0.2981 0.556 0.444
#> SRR809963 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1353710 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1445259 2 0.9881 0.1592 0.436 0.564
#> SRR1408393 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1310542 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1333485 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1406437 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1354931 1 0.9977 0.2078 0.528 0.472
#> SRR1391856 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR1446738 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1388145 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR815869 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR613150 1 0.9686 0.4307 0.604 0.396
#> SRR1375329 1 1.0000 0.0996 0.500 0.500
#> SRR1387921 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR812943 1 0.9795 0.3794 0.584 0.416
#> SRR1400910 2 0.7376 0.7212 0.208 0.792
#> SRR1444203 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR816177 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR658754 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1429603 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1397366 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR1446028 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1337606 1 0.8267 0.6498 0.740 0.260
#> SRR659109 2 0.7745 0.6916 0.228 0.772
#> SRR1337192 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR656946 2 0.7453 0.7154 0.212 0.788
#> SRR1476102 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1342067 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1385389 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.6887 0.7368 0.816 0.184
#> SRR1349121 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR612935 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1393596 1 0.0376 0.8873 0.996 0.004
#> SRR1452164 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1070503 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1499894 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1082883 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1328620 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1396294 1 0.0376 0.8873 0.996 0.004
#> SRR1419917 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR662114 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1489199 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR813584 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1069638 2 0.0938 0.9177 0.012 0.988
#> SRR614864 1 0.9580 0.4637 0.620 0.380
#> SRR1433392 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR2167710 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR1401252 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1309963 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1486889 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1486538 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1340486 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1465459 1 0.9358 0.5133 0.648 0.352
#> SRR1080270 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1312501 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1093148 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1467080 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR816475 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1379198 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR613342 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1369129 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1396616 1 0.9732 0.4107 0.596 0.404
#> SRR813824 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1082376 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1500891 1 0.9427 0.4977 0.640 0.360
#> SRR807543 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR1346689 2 0.9775 0.2449 0.412 0.588
#> SRR1332424 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR663729 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR613675 1 0.8555 0.6236 0.720 0.280
#> SRR1485357 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR655816 1 0.8499 0.6267 0.724 0.276
#> SRR1500113 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.9993 -0.0418 0.484 0.516
#> SRR1355172 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1338147 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1413329 1 0.0376 0.8873 0.996 0.004
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1333308 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR809018 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR663440 1 0.4939 0.8080 0.892 0.108
#> SRR1471755 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR808019 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1479133 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR615069 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1456185 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1350069 1 0.0376 0.8873 0.996 0.004
#> SRR816316 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR664795 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1490721 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1085285 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1099072 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR1317985 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1351347 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1405525 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR819610 2 0.7219 0.7318 0.200 0.800
#> SRR2157314 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR809987 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR613639 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1402285 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1405660 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1095455 2 0.7299 0.7266 0.204 0.796
#> SRR1394734 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1317771 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1365894 1 0.9358 0.5131 0.648 0.352
#> SRR1073581 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1473529 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR660764 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1328845 1 0.8763 0.6003 0.704 0.296
#> SRR1336415 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1379065 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1459190 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1346773 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1347459 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1333395 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1309248 2 0.7139 0.7370 0.196 0.804
#> SRR809161 1 0.9580 0.4632 0.620 0.380
#> SRR1316320 2 0.7674 0.6981 0.224 0.776
#> SRR1432629 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1416578 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1405547 2 0.7745 0.6916 0.228 0.772
#> SRR1470534 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1309160 1 0.9686 0.4307 0.604 0.396
#> SRR663489 2 0.4690 0.8438 0.100 0.900
#> SRR1500450 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1078489 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR1332648 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR660614 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR615946 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR665586 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR661108 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR2170173 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR817329 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1401990 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1467745 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR813137 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.0938 0.9177 0.012 0.988
#> SRR818797 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR2164608 1 0.7056 0.7291 0.808 0.192
#> SRR1455586 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR819459 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1385501 1 0.8267 0.6497 0.740 0.260
#> SRR1361652 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1478547 2 0.7745 0.6916 0.228 0.772
#> SRR1430910 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1486762 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1480854 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1489394 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1418085 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1340221 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1473058 2 0.7376 0.7211 0.208 0.792
#> SRR1405165 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1433004 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1098712 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1455038 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1403005 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR1348378 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1475192 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1452468 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1347060 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1414139 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1343302 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1405331 1 0.9833 0.3586 0.576 0.424
#> SRR1345609 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1380208 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1322840 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1399797 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1416654 2 0.7745 0.6916 0.228 0.772
#> SRR1315081 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1369196 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1365291 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1367920 1 0.2043 0.8682 0.968 0.032
#> SRR1366648 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9264 0.000 1.000
#> SRR1082173 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1363968 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1386689 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1395575 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1453811 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
#> SRR1441159 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1403154 1 0.0000 0.8898 1.000 0.000
#> SRR1468722 1 0.9661 0.4403 0.608 0.392
#> SRR1310275 1 0.9635 0.4487 0.612 0.388
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331708 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464258 3 0.6307 0.078590 0.488 0.000 0.512
#> SRR1454201 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR661589 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456229 1 0.1289 0.951146 0.968 0.000 0.032
#> SRR1315165 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488960 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094457 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095575 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315931 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.2537 0.915201 0.000 0.920 0.080
#> SRR1486845 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362866 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 1 0.6309 -0.026922 0.504 0.000 0.496
#> SRR1311018 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.2448 0.887972 0.076 0.000 0.924
#> SRR613550 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324025 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318879 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR820755 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485830 1 0.0892 0.963295 0.980 0.000 0.020
#> SRR599313 1 0.1289 0.951116 0.968 0.000 0.032
#> SRR612263 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326205 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421327 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499303 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079522 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452935 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR615778 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR655182 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1335140 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308650 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 2 0.2066 0.932582 0.000 0.940 0.060
#> SRR1413602 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR809853 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR661313 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499935 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429408 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433950 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409854 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435229 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 2 0.4654 0.763830 0.000 0.792 0.208
#> SRR1400974 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.2537 0.883868 0.080 0.000 0.920
#> SRR1457854 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR813776 3 0.2537 0.883868 0.080 0.000 0.920
#> SRR808196 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101085 1 0.3816 0.818386 0.852 0.000 0.148
#> SRR614395 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478251 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420109 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1330920 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419539 2 0.6140 0.346434 0.000 0.596 0.404
#> SRR1359447 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347259 1 0.1031 0.959481 0.976 0.000 0.024
#> SRR613915 3 0.6140 0.343794 0.404 0.000 0.596
#> SRR1384395 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR821715 3 0.2448 0.887972 0.076 0.000 0.924
#> SRR1478228 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR608150 1 0.6126 0.322392 0.600 0.000 0.400
#> SRR1096383 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341480 1 0.0237 0.978207 0.996 0.000 0.004
#> SRR1341344 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR808566 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1430270 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR661267 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407250 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420067 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR812536 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407671 3 0.3941 0.792635 0.000 0.156 0.844
#> SRR1446375 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465230 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR614119 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445655 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR658953 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR2166459 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.2537 0.915201 0.000 0.920 0.080
#> SRR1485312 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317631 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1330588 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316367 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433926 3 0.6026 0.417664 0.376 0.000 0.624
#> SRR1091302 1 0.0424 0.974667 0.992 0.000 0.008
#> SRR818263 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404909 3 0.6260 0.203615 0.448 0.000 0.552
#> SRR663076 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442422 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.2878 0.880720 0.904 0.000 0.096
#> SRR1407112 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353199 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1378885 3 0.6008 0.426362 0.372 0.000 0.628
#> SRR665357 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472576 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431781 3 0.2537 0.883868 0.080 0.000 0.920
#> SRR1452270 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500472 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417632 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326579 1 0.2066 0.920947 0.940 0.000 0.060
#> SRR1349363 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1083752 2 0.4452 0.779952 0.000 0.808 0.192
#> SRR1377599 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488449 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318354 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359062 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398924 3 0.5926 0.416664 0.000 0.356 0.644
#> SRR663783 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319204 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498595 2 0.2356 0.922407 0.000 0.928 0.072
#> SRR1377423 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR658941 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0237 0.978365 0.996 0.000 0.004
#> SRR1368874 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324085 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363858 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR819820 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337342 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR655206 3 0.0237 0.956305 0.000 0.004 0.996
#> SRR1387013 2 0.2066 0.932582 0.000 0.940 0.060
#> SRR1317410 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.2066 0.918673 0.940 0.000 0.060
#> SRR1440161 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415379 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR663197 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394836 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR661699 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR813680 1 0.0892 0.963201 0.980 0.000 0.020
#> SRR1410678 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499174 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1382851 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433410 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432518 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374608 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR657949 1 0.2959 0.873933 0.900 0.000 0.100
#> SRR1308882 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR655768 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485870 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444138 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417342 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091380 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467102 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485416 1 0.4796 0.714107 0.780 0.000 0.220
#> SRR818821 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR809963 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445259 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408393 3 0.5882 0.482892 0.348 0.000 0.652
#> SRR1361522 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310542 2 0.2066 0.932582 0.000 0.940 0.060
#> SRR1333485 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406437 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354931 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1391856 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446738 2 0.5216 0.670878 0.000 0.740 0.260
#> SRR1309032 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.1529 0.946995 0.000 0.960 0.040
#> SRR1432611 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR815869 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR613150 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375329 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387921 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR812943 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400910 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444203 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR816177 3 0.6140 0.304252 0.000 0.404 0.596
#> SRR658754 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429603 3 0.6252 0.227216 0.444 0.000 0.556
#> SRR1397366 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.2066 0.932582 0.000 0.940 0.060
#> SRR1337606 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR656946 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385389 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322936 3 0.4555 0.743889 0.200 0.000 0.800
#> SRR1349121 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR612935 2 0.5431 0.617741 0.000 0.716 0.284
#> SRR661481 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1393596 3 0.4346 0.763540 0.184 0.000 0.816
#> SRR1452164 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499894 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082883 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.1163 0.955122 0.972 0.000 0.028
#> SRR1332443 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 2 0.2537 0.915201 0.000 0.920 0.080
#> SRR1396294 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419917 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR662114 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489199 3 0.6026 0.409284 0.376 0.000 0.624
#> SRR813584 2 0.2537 0.915201 0.000 0.920 0.080
#> SRR1069638 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR614864 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433392 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR2167710 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401252 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309963 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340486 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465459 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080270 2 0.4555 0.774766 0.000 0.800 0.200
#> SRR1312501 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093148 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1467080 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR816475 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379198 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR613342 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369129 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082376 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500891 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR807543 3 0.2537 0.883868 0.080 0.000 0.920
#> SRR1091572 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1346689 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332424 1 0.0424 0.974743 0.992 0.000 0.008
#> SRR663729 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097013 3 0.3267 0.847437 0.116 0.000 0.884
#> SRR613675 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485357 1 0.3340 0.851283 0.880 0.000 0.120
#> SRR655816 3 0.2448 0.887972 0.076 0.000 0.924
#> SRR1500113 1 0.5859 0.461615 0.656 0.000 0.344
#> SRR1437622 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355172 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413329 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485931 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR663440 3 0.1031 0.938094 0.024 0.000 0.976
#> SRR1471755 2 0.2625 0.911341 0.000 0.916 0.084
#> SRR808019 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479133 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR615069 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456185 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1350069 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR816316 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR664795 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490721 1 0.0747 0.967158 0.984 0.000 0.016
#> SRR810643 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085285 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099072 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405525 3 0.6280 0.163553 0.460 0.000 0.540
#> SRR1370329 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR819610 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR809987 1 0.4750 0.714711 0.784 0.000 0.216
#> SRR613639 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402285 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095455 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394734 2 0.2537 0.915201 0.000 0.920 0.080
#> SRR1317771 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073581 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR660764 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR820448 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328845 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1336415 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379065 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459190 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1346773 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347459 2 0.5785 0.545301 0.000 0.668 0.332
#> SRR1081209 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 1 0.6307 0.000259 0.512 0.000 0.488
#> SRR1309248 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR809161 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316320 3 0.5016 0.667709 0.000 0.240 0.760
#> SRR1432629 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470534 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332648 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR660614 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR615946 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0747 0.962748 0.000 0.984 0.016
#> SRR665586 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 3 0.5138 0.664126 0.252 0.000 0.748
#> SRR1485722 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR2170173 3 0.1753 0.915488 0.048 0.000 0.952
#> SRR817329 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401990 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467745 2 0.1411 0.949699 0.000 0.964 0.036
#> SRR1471795 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR813137 1 0.1860 0.929402 0.948 0.000 0.052
#> SRR1314873 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 3 0.0237 0.956169 0.000 0.004 0.996
#> SRR818797 3 0.2537 0.883868 0.080 0.000 0.920
#> SRR2164608 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455586 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR819459 3 0.5178 0.639977 0.000 0.256 0.744
#> SRR1488939 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361652 2 0.0747 0.962706 0.000 0.984 0.016
#> SRR1437119 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1430910 2 0.2165 0.929641 0.000 0.936 0.064
#> SRR1310584 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486762 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480854 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489394 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418085 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340221 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473058 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405165 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433004 3 0.5327 0.638506 0.272 0.000 0.728
#> SRR1471477 3 0.2537 0.883868 0.080 0.000 0.920
#> SRR1098567 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098712 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455038 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348378 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475192 2 0.2066 0.932582 0.000 0.940 0.060
#> SRR1432085 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452468 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347060 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414139 2 0.2066 0.932582 0.000 0.940 0.060
#> SRR1447962 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405331 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380208 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322840 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315081 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369196 2 0.2066 0.932582 0.000 0.940 0.060
#> SRR1400847 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.0424 0.952612 0.008 0.000 0.992
#> SRR1367920 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.972399 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363968 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1386689 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453811 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 1 0.0000 0.981942 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310275 3 0.0000 0.959620 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331708 3 0.4948 0.6304 0.000 0.000 0.560 0.440
#> SRR1464258 1 0.7887 -0.1665 0.376 0.000 0.292 0.332
#> SRR1454201 3 0.3649 0.7830 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR661589 3 0.3486 0.7861 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR1456229 1 0.1635 0.8573 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR1315165 4 0.1792 0.6273 0.000 0.000 0.068 0.932
#> SRR1488960 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 4 0.3610 0.7295 0.200 0.000 0.000 0.800
#> SRR1094457 4 0.4713 0.6363 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1095575 3 0.4477 0.7466 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR1315931 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.2814 0.7900 0.000 0.000 0.868 0.132
#> SRR1431037 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344143 2 0.5364 0.6723 0.000 0.652 0.320 0.028
#> SRR1486845 1 0.4817 0.0892 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1362866 3 0.4713 0.7195 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 4 0.0000 0.6668 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311018 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR613550 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1348402 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 3 0.4713 0.7195 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1324025 3 0.3123 0.7896 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1318879 3 0.3907 0.7778 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR820755 1 0.4673 0.5451 0.700 0.000 0.008 0.292
#> SRR1485830 4 0.3356 0.7349 0.176 0.000 0.000 0.824
#> SRR599313 1 0.5353 0.2788 0.556 0.000 0.012 0.432
#> SRR612263 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1326205 4 0.3837 0.5618 0.000 0.000 0.224 0.776
#> SRR1421327 1 0.3688 0.6388 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1083311 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.1211 0.6298 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1079522 3 0.4713 0.7195 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1452935 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.3528 0.7855 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR615778 3 0.6426 0.6447 0.080 0.000 0.568 0.352
#> SRR1447564 1 0.2149 0.8281 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1455195 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655182 3 0.2973 0.7884 0.000 0.000 0.856 0.144
#> SRR1335140 3 0.1716 0.7716 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1433555 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.4585 0.6824 0.000 0.668 0.332 0.000
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 2 0.4925 0.5471 0.000 0.572 0.428 0.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809853 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR661313 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499935 4 0.2149 0.6407 0.000 0.000 0.088 0.912
#> SRR1447303 3 0.2760 0.7906 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1429408 4 0.4040 0.5242 0.000 0.000 0.248 0.752
#> SRR1433950 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1435229 3 0.0817 0.7817 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1085996 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414229 3 0.4996 -0.3525 0.000 0.484 0.516 0.000
#> SRR1400974 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.1792 0.8560 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR613927 3 0.4897 0.7305 0.008 0.000 0.660 0.332
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473714 3 0.3569 0.7851 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR813776 3 0.4761 0.7331 0.004 0.000 0.664 0.332
#> SRR808196 4 0.4564 0.6635 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1101085 4 0.3123 0.7351 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR614395 1 0.4746 0.5246 0.688 0.000 0.008 0.304
#> SRR1478251 4 0.4713 0.6363 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1370551 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1420109 3 0.1022 0.7837 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1330920 3 0.4713 0.7195 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1419539 2 0.4985 0.4486 0.000 0.532 0.468 0.000
#> SRR1359447 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347259 4 0.3356 0.7349 0.176 0.000 0.000 0.824
#> SRR613915 3 0.7333 0.3489 0.332 0.000 0.496 0.172
#> SRR1384395 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821715 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1478228 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.3257 0.7305 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR608150 1 0.6261 0.1613 0.504 0.000 0.056 0.440
#> SRR1096383 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341480 4 0.3444 0.7328 0.184 0.000 0.000 0.816
#> SRR1341344 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.3569 0.7848 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR1498838 3 0.1302 0.7867 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1416313 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808566 4 0.2921 0.4958 0.000 0.000 0.140 0.860
#> SRR1430270 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661267 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1420067 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 3 0.1022 0.7816 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR812536 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1370850 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407671 3 0.3812 0.6399 0.000 0.140 0.832 0.028
#> SRR1446375 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465230 4 0.4713 0.6363 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR614119 1 0.3725 0.6942 0.812 0.000 0.008 0.180
#> SRR1356101 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.1635 0.8575 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1392676 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.1940 0.7893 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1445655 4 0.3528 0.7314 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR658953 3 0.4713 0.7195 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR2166459 1 0.3300 0.7643 0.848 0.000 0.008 0.144
#> SRR1070713 2 0.5442 0.6580 0.000 0.636 0.336 0.028
#> SRR1485312 3 0.4522 0.7420 0.000 0.000 0.680 0.320
#> SRR1317631 4 0.3266 0.7357 0.168 0.000 0.000 0.832
#> SRR1488610 1 0.0336 0.8961 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1330588 3 0.3649 0.7830 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1316367 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433926 3 0.7923 0.2365 0.324 0.000 0.344 0.332
#> SRR1091302 4 0.4500 0.6713 0.316 0.000 0.000 0.684
#> SRR818263 1 0.3852 0.7006 0.800 0.000 0.008 0.192
#> SRR1404909 4 0.0188 0.6708 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR663076 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442422 4 0.4713 0.6363 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1465893 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR654862 1 0.5206 0.4920 0.668 0.000 0.024 0.308
#> SRR1407112 4 0.4713 0.6363 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1332969 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1353199 3 0.3356 0.7880 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1378885 3 0.6826 0.5705 0.228 0.000 0.600 0.172
#> SRR665357 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.4522 0.7420 0.000 0.000 0.680 0.320
#> SRR1347819 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 3 0.2943 0.7074 0.000 0.076 0.892 0.032
#> SRR1431781 4 0.0000 0.6668 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452270 3 0.4697 0.7221 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1500472 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417632 3 0.4898 0.0369 0.000 0.000 0.584 0.416
#> SRR1350153 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326579 1 0.3688 0.6871 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1349363 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1083752 2 0.5495 0.6428 0.000 0.624 0.348 0.028
#> SRR1377599 3 0.4989 0.5830 0.000 0.000 0.528 0.472
#> SRR1488449 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1318354 2 0.4643 0.6553 0.000 0.656 0.344 0.000
#> SRR1359062 2 0.4730 0.6476 0.000 0.636 0.364 0.000
#> SRR1398924 3 0.3172 0.6064 0.000 0.160 0.840 0.000
#> SRR663783 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319204 3 0.0336 0.7701 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498595 2 0.5384 0.6689 0.000 0.648 0.324 0.028
#> SRR1377423 3 0.1474 0.7853 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1312310 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353309 3 0.3528 0.7861 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR658941 3 0.0817 0.7817 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.4967 -0.2036 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR1368874 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.3311 0.7355 0.172 0.000 0.000 0.828
#> SRR1363858 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR819820 3 0.3486 0.7861 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR1337342 1 0.2814 0.7792 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR655206 3 0.2845 0.7101 0.000 0.076 0.896 0.028
#> SRR1387013 2 0.5423 0.6615 0.000 0.640 0.332 0.028
#> SRR1317410 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.3801 0.6731 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1440161 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 1 0.4961 -0.1644 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1099622 2 0.4585 0.6824 0.000 0.668 0.332 0.000
#> SRR663197 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394836 3 0.1557 0.7779 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR661699 3 0.4713 0.7195 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR813680 1 0.3278 0.7836 0.864 0.000 0.020 0.116
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.4713 0.6363 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1499174 3 0.4564 0.7380 0.000 0.000 0.672 0.328
#> SRR1311486 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 4 0.4830 0.4457 0.000 0.000 0.392 0.608
#> SRR1433410 1 0.2760 0.7835 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR661167 3 0.3400 0.7874 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1432518 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374608 1 0.4999 -0.1113 0.508 0.000 0.000 0.492
#> SRR657949 1 0.5022 0.6075 0.736 0.000 0.044 0.220
#> SRR1308882 1 0.1940 0.8279 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR655768 3 0.5511 0.7118 0.032 0.000 0.636 0.332
#> SRR1485870 4 0.1677 0.6452 0.012 0.000 0.040 0.948
#> SRR1444138 3 0.0817 0.7817 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1417342 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470193 4 0.4961 -0.4374 0.000 0.000 0.448 0.552
#> SRR1091380 3 0.0817 0.7817 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1099096 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 4 0.4855 0.5825 0.400 0.000 0.000 0.600
#> SRR1467102 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485416 4 0.0707 0.6848 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR818821 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809963 1 0.0336 0.8961 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.3356 0.7349 0.176 0.000 0.000 0.824
#> SRR1445259 3 0.0336 0.7777 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1408393 3 0.7164 0.5615 0.156 0.000 0.524 0.320
#> SRR1361522 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310542 2 0.4730 0.6476 0.000 0.636 0.364 0.000
#> SRR1333485 4 0.3764 0.7234 0.216 0.000 0.000 0.784
#> SRR1406437 3 0.4103 0.7709 0.000 0.000 0.744 0.256
#> SRR1354931 3 0.1211 0.7856 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1391856 3 0.4713 0.7195 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1446738 2 0.5659 0.6077 0.000 0.600 0.368 0.032
#> SRR1309032 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.4585 0.6824 0.000 0.668 0.332 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815869 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613150 3 0.1792 0.7895 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1375329 3 0.1557 0.7882 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812943 3 0.1211 0.7858 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1400910 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444203 4 0.3486 0.7322 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR816177 3 0.5587 0.0435 0.000 0.372 0.600 0.028
#> SRR658754 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0000 0.6668 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1397366 3 0.4522 0.7420 0.000 0.000 0.680 0.320
#> SRR1446028 1 0.2921 0.7713 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1083918 2 0.4585 0.6824 0.000 0.668 0.332 0.000
#> SRR1337606 3 0.4830 0.6559 0.000 0.000 0.608 0.392
#> SRR659109 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656946 3 0.1557 0.7779 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1476102 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 4 0.4713 0.6363 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1385389 1 0.3649 0.6318 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614419 1 0.2814 0.7793 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1322936 4 0.2530 0.6454 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1349121 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612935 2 0.4996 0.3036 0.000 0.516 0.484 0.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.0000 0.6668 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1499894 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082883 4 0.4977 0.2758 0.460 0.000 0.000 0.540
#> SRR1468271 1 0.3610 0.6978 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1332443 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 2 0.4933 0.5397 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1396294 4 0.2704 0.6042 0.000 0.000 0.124 0.876
#> SRR1419917 1 0.4295 0.6309 0.752 0.000 0.008 0.240
#> SRR662114 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489199 3 0.7830 0.3423 0.268 0.000 0.400 0.332
#> SRR813584 2 0.5423 0.6615 0.000 0.640 0.332 0.028
#> SRR1069638 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614864 3 0.4477 0.7458 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR1433392 1 0.1452 0.8705 0.956 0.000 0.008 0.036
#> SRR1377777 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 3 0.4713 0.7195 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1401252 4 0.4304 0.6926 0.284 0.000 0.000 0.716
#> SRR1309963 4 0.4804 0.6005 0.384 0.000 0.000 0.616
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.3837 0.6814 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 4 0.4776 0.6195 0.376 0.000 0.000 0.624
#> SRR1337010 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 4 0.3649 0.7272 0.204 0.000 0.000 0.796
#> SRR1340486 4 0.4713 0.6363 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1377696 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465459 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1080270 3 0.4999 -0.3722 0.000 0.492 0.508 0.000
#> SRR1312501 3 0.1867 0.7906 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1093148 3 0.2760 0.7918 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1467080 2 0.4585 0.6836 0.000 0.668 0.332 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.0000 0.6668 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379198 4 0.4713 0.6363 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR613342 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.4713 0.6363 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1396616 3 0.1022 0.7837 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR813824 3 0.1940 0.7902 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1082376 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500891 4 0.4164 0.1620 0.000 0.000 0.264 0.736
#> SRR807543 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1091572 4 0.4866 0.4292 0.000 0.000 0.404 0.596
#> SRR1346689 4 0.4356 0.4873 0.000 0.000 0.292 0.708
#> SRR1332424 1 0.3024 0.7606 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR663729 1 0.1211 0.8699 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1097013 3 0.6897 0.6031 0.124 0.000 0.544 0.332
#> SRR613675 4 0.4761 0.4605 0.000 0.000 0.372 0.628
#> SRR1485357 4 0.2530 0.7293 0.112 0.000 0.000 0.888
#> SRR655816 3 0.4713 0.7195 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1500113 1 0.6058 0.4016 0.624 0.000 0.068 0.308
#> SRR1437622 3 0.3837 0.7355 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR1355172 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.2814 0.7900 0.000 0.000 0.868 0.132
#> SRR1413329 3 0.4713 0.7195 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1485931 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 4 0.3528 0.7314 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR1452033 1 0.1792 0.8465 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1467316 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0188 0.7763 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1375351 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1471755 2 0.4585 0.6824 0.000 0.668 0.332 0.000
#> SRR808019 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479133 3 0.3688 0.7822 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR615069 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456185 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350069 4 0.3074 0.6117 0.000 0.000 0.152 0.848
#> SRR816316 1 0.3142 0.7770 0.860 0.000 0.008 0.132
#> SRR664795 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490721 4 0.3311 0.7344 0.172 0.000 0.000 0.828
#> SRR810643 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 3 0.6337 0.6479 0.072 0.000 0.568 0.360
#> SRR1085285 3 0.3444 0.7867 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1099072 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351347 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.7216 0.2316 0.548 0.000 0.208 0.244
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819610 3 0.1792 0.7816 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR2157314 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.2081 0.7255 0.084 0.000 0.000 0.916
#> SRR613639 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1402285 1 0.1211 0.8699 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1077038 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095455 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394734 2 0.5442 0.6580 0.000 0.636 0.336 0.028
#> SRR1317771 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 4 0.2281 0.6403 0.000 0.000 0.096 0.904
#> SRR1073581 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660764 2 0.2345 0.8300 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR820448 1 0.2081 0.8326 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1328845 4 0.3942 0.5429 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1336415 4 0.4713 0.6363 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1379065 1 0.3688 0.6235 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1459190 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1346773 1 0.2408 0.8122 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1499521 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.4916 -0.1702 0.000 0.424 0.576 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.0779 0.6594 0.004 0.000 0.016 0.980
#> SRR1309248 3 0.1109 0.7644 0.000 0.004 0.968 0.028
#> SRR809161 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1316320 3 0.5891 0.4592 0.000 0.168 0.700 0.132
#> SRR1432629 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.4713 0.6363 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1405547 3 0.0817 0.7817 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1470534 1 0.1211 0.8699 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1380764 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.3356 0.7880 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR663489 3 0.1022 0.7842 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1500450 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 3 0.1637 0.7882 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1332648 1 0.4605 0.2852 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR660614 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.2760 0.7835 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1481419 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615946 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660224 2 0.4088 0.7490 0.000 0.764 0.232 0.004
#> SRR665586 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347166 3 0.7684 0.4118 0.220 0.000 0.420 0.360
#> SRR1485722 3 0.4522 0.7420 0.000 0.000 0.680 0.320
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661108 3 0.3486 0.7861 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR2170173 3 0.4713 0.7195 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR817329 1 0.1042 0.8839 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR1401990 4 0.3907 0.7186 0.232 0.000 0.000 0.768
#> SRR1467745 2 0.4585 0.6824 0.000 0.668 0.332 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813137 1 0.2813 0.8009 0.896 0.000 0.024 0.080
#> SRR1314873 1 0.3266 0.7546 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1401211 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 4 0.4761 0.4728 0.000 0.000 0.372 0.628
#> SRR818797 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR2164608 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1455586 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819459 3 0.3123 0.6168 0.000 0.156 0.844 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1361652 2 0.3688 0.7665 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0188 0.7763 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1430910 2 0.4933 0.5397 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.1211 0.8785 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1486762 2 0.4713 0.6525 0.000 0.640 0.360 0.000
#> SRR1480854 4 0.4817 0.5938 0.388 0.000 0.000 0.612
#> SRR1489394 4 0.4713 0.6363 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1418085 4 0.4948 0.4885 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1340221 4 0.4713 0.6363 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1473058 3 0.4855 0.1917 0.000 0.000 0.600 0.400
#> SRR1405165 3 0.3219 0.7891 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1433004 3 0.7659 0.4375 0.224 0.000 0.444 0.332
#> SRR1471477 3 0.6808 0.6209 0.120 0.000 0.560 0.320
#> SRR1098567 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098712 3 0.2814 0.7181 0.000 0.000 0.868 0.132
#> SRR1455038 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.4522 0.7420 0.000 0.000 0.680 0.320
#> SRR1348378 2 0.4522 0.6914 0.000 0.680 0.320 0.000
#> SRR1413541 1 0.0921 0.8821 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1392943 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475192 2 0.4730 0.6476 0.000 0.636 0.364 0.000
#> SRR1432085 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452468 3 0.4713 0.7195 0.000 0.000 0.640 0.360
#> SRR1347060 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414139 2 0.4730 0.6476 0.000 0.636 0.364 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 4 0.4356 0.6392 0.292 0.000 0.000 0.708
#> SRR1413436 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343302 4 0.4713 0.6363 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1373746 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.4564 0.6853 0.000 0.672 0.328 0.000
#> SRR1405331 3 0.2814 0.7900 0.000 0.000 0.868 0.132
#> SRR1345609 1 0.0592 0.8896 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1380208 3 0.4679 0.7243 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1322840 4 0.4193 0.6984 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR1399797 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0707 0.7808 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1315081 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369196 2 0.4933 0.5397 0.000 0.568 0.432 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.4585 0.7355 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1367920 4 0.2216 0.6409 0.000 0.000 0.092 0.908
#> SRR1366648 3 0.0000 0.7749 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.8848 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.2868 0.7899 0.000 0.000 0.864 0.136
#> SRR1363968 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1386689 4 0.4585 0.6580 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR1395575 3 0.3610 0.7840 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1453811 3 0.4522 0.7420 0.000 0.000 0.680 0.320
#> SRR1441159 1 0.0000 0.9010 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 4 0.4713 0.6363 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1468722 3 0.4134 0.7668 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR1310275 3 0.3610 0.7843 0.000 0.000 0.800 0.200
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331708 4 0.5525 0.3703 0.004 0.000 0.392 0.544 0.060
#> SRR1464258 3 0.2377 0.7975 0.000 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1454201 3 0.2020 0.8187 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR661589 3 0.1608 0.8276 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1456229 1 0.4373 0.7205 0.764 0.000 0.176 0.052 0.008
#> SRR1315165 4 0.4133 0.7354 0.000 0.000 0.180 0.768 0.052
#> SRR1488960 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 4 0.2903 0.7786 0.080 0.000 0.048 0.872 0.000
#> SRR1094457 4 0.2424 0.8081 0.132 0.000 0.000 0.868 0.000
#> SRR1095575 3 0.1965 0.8192 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1315931 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.2377 0.7932 0.000 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1431037 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1395554 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR818002 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1344143 5 0.4166 0.4752 0.000 0.348 0.000 0.004 0.648
#> SRR1486845 1 0.4235 0.2082 0.576 0.000 0.000 0.424 0.000
#> SRR1362866 3 0.3209 0.7976 0.024 0.000 0.872 0.052 0.052
#> SRR1490740 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1383907 4 0.0162 0.8141 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1311018 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1375699 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1429846 3 0.1341 0.8258 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR613550 3 0.1965 0.8144 0.000 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 3 0.1270 0.8106 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1324025 3 0.2280 0.8006 0.000 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1318879 3 0.2020 0.8187 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR820755 3 0.3861 0.7552 0.068 0.000 0.804 0.128 0.000
#> SRR1485830 4 0.1357 0.8040 0.000 0.000 0.004 0.948 0.048
#> SRR599313 3 0.6397 0.4914 0.244 0.000 0.572 0.168 0.016
#> SRR612263 1 0.2221 0.8715 0.912 0.000 0.036 0.052 0.000
#> SRR1415398 3 0.1121 0.8343 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1326205 4 0.4879 0.7043 0.000 0.000 0.176 0.716 0.108
#> SRR1421327 1 0.4522 0.6651 0.708 0.000 0.044 0.248 0.000
#> SRR1083311 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1499303 4 0.3507 0.7641 0.000 0.000 0.120 0.828 0.052
#> SRR1079522 3 0.2914 0.7961 0.000 0.000 0.872 0.076 0.052
#> SRR1452935 5 0.0880 0.8442 0.000 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.1270 0.8332 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR615778 3 0.3601 0.7785 0.000 0.000 0.820 0.128 0.052
#> SRR1447564 1 0.1502 0.8762 0.940 0.000 0.004 0.056 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655182 3 0.3039 0.7685 0.000 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1335140 5 0.1608 0.8224 0.000 0.000 0.072 0.000 0.928
#> SRR1433555 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1308650 5 0.2124 0.8335 0.000 0.096 0.000 0.004 0.900
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 5 0.1478 0.8480 0.000 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR1413602 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1479955 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809853 3 0.1965 0.8192 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR661313 5 0.2813 0.7713 0.000 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1499935 4 0.4133 0.7354 0.000 0.000 0.180 0.768 0.052
#> SRR1447303 3 0.2230 0.8032 0.000 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1429408 4 0.4832 0.7072 0.000 0.000 0.176 0.720 0.104
#> SRR1433950 1 0.1270 0.8873 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 3 0.2280 0.8018 0.000 0.000 0.880 0.120 0.000
#> SRR1435229 5 0.2891 0.7376 0.000 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR1085996 1 0.0771 0.9019 0.976 0.000 0.020 0.004 0.000
#> SRR1414229 5 0.0290 0.8490 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1400974 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1399971 1 0.3766 0.6507 0.728 0.000 0.004 0.268 0.000
#> SRR613927 3 0.2377 0.7975 0.000 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1457854 1 0.0794 0.9009 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1473714 3 0.1628 0.8355 0.000 0.000 0.936 0.008 0.056
#> SRR813776 3 0.2377 0.7975 0.000 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR808196 4 0.2389 0.8151 0.116 0.000 0.004 0.880 0.000
#> SRR1101085 4 0.0162 0.8141 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR614395 3 0.3601 0.7652 0.052 0.000 0.820 0.128 0.000
#> SRR1478251 4 0.2516 0.8038 0.140 0.000 0.000 0.860 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0880 0.8988 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR665310 3 0.1121 0.8343 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1420109 5 0.2891 0.7376 0.000 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR1330920 3 0.2377 0.7975 0.000 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1419539 5 0.1965 0.8350 0.000 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR1359447 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347259 4 0.0162 0.8141 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR613915 3 0.4496 0.6960 0.156 0.000 0.752 0.092 0.000
#> SRR1384395 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821715 3 0.2304 0.8326 0.000 0.000 0.908 0.048 0.044
#> SRR1478228 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1445637 3 0.5069 0.5128 0.328 0.000 0.620 0.052 0.000
#> SRR608150 3 0.7643 0.0934 0.356 0.000 0.368 0.220 0.056
#> SRR1096383 1 0.1270 0.8873 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1341480 4 0.0162 0.8141 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.1608 0.8276 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1498838 3 0.4101 0.3371 0.000 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1416313 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR808566 4 0.4302 0.2920 0.000 0.000 0.480 0.520 0.000
#> SRR1430270 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367825 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR613533 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR661267 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810665 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1407250 3 0.1965 0.8192 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1420067 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1473632 5 0.2852 0.7412 0.000 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR812536 3 0.1671 0.8166 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1370850 2 0.0451 0.9782 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1486195 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1407671 5 0.1544 0.8231 0.000 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR1446375 5 0.0703 0.8440 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1465230 4 0.2424 0.8081 0.132 0.000 0.000 0.868 0.000
#> SRR614119 3 0.4666 0.6464 0.240 0.000 0.704 0.056 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404209 3 0.5036 0.5206 0.320 0.000 0.628 0.052 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660510 5 0.3707 0.6656 0.000 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR1445655 4 0.0162 0.8141 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR658953 3 0.3555 0.7805 0.000 0.000 0.824 0.124 0.052
#> SRR2166459 3 0.5091 0.5955 0.244 0.000 0.672 0.084 0.000
#> SRR1070713 5 0.1965 0.8350 0.000 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR1485312 3 0.1544 0.8291 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1317631 4 0.1357 0.8191 0.048 0.000 0.004 0.948 0.000
#> SRR1488610 1 0.1557 0.8789 0.940 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1330588 3 0.1197 0.8336 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1316367 5 0.2424 0.8007 0.000 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1433926 1 0.5334 0.1395 0.512 0.000 0.436 0.052 0.000
#> SRR1091302 4 0.1732 0.8145 0.080 0.000 0.000 0.920 0.000
#> SRR818263 3 0.6077 0.1874 0.396 0.000 0.480 0.124 0.000
#> SRR1404909 4 0.0162 0.8141 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR663076 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1442422 4 0.2424 0.8081 0.132 0.000 0.000 0.868 0.000
#> SRR1465893 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR654862 3 0.4357 0.7269 0.104 0.000 0.768 0.128 0.000
#> SRR1407112 4 0.2377 0.8091 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000
#> SRR1332969 3 0.1341 0.8327 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1353199 3 0.1671 0.8275 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1378885 3 0.4474 0.7578 0.124 0.000 0.788 0.052 0.036
#> SRR665357 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.1478 0.8306 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1347819 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1480813 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 5 0.3252 0.7725 0.000 0.008 0.156 0.008 0.828
#> SRR1431781 4 0.0162 0.8141 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.8303 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500472 5 0.0703 0.8440 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1417632 5 0.4946 0.4139 0.000 0.000 0.052 0.300 0.648
#> SRR1350153 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1458113 5 0.0404 0.8504 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1326579 1 0.5766 0.6652 0.696 0.000 0.124 0.128 0.052
#> SRR1349363 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096712 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1090407 3 0.1121 0.8343 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1083752 5 0.1965 0.8350 0.000 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR1377599 4 0.5334 0.3767 0.000 0.000 0.436 0.512 0.052
#> SRR1488449 3 0.1836 0.8361 0.000 0.000 0.932 0.032 0.036
#> SRR1318354 5 0.1892 0.8441 0.000 0.080 0.000 0.004 0.916
#> SRR1359062 5 0.2124 0.8335 0.000 0.096 0.000 0.004 0.900
#> SRR1398924 5 0.0000 0.8462 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR663783 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1319204 5 0.0000 0.8462 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.1484 0.8864 0.944 0.000 0.008 0.048 0.000
#> SRR1337449 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498595 5 0.4437 0.2187 0.000 0.464 0.000 0.004 0.532
#> SRR1377423 5 0.3876 0.5715 0.000 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0794 0.9009 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1338426 5 0.0000 0.8462 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353309 3 0.1197 0.8336 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR658941 5 0.4268 0.2478 0.000 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1101643 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 4 0.3928 0.5945 0.296 0.000 0.004 0.700 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0162 0.8141 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1363858 3 0.5046 0.7470 0.056 0.000 0.756 0.116 0.072
#> SRR819820 3 0.1197 0.8336 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1337342 1 0.5117 0.7291 0.748 0.000 0.072 0.128 0.052
#> SRR655206 5 0.2249 0.8368 0.000 0.096 0.008 0.000 0.896
#> SRR1387013 5 0.2124 0.8335 0.000 0.096 0.000 0.004 0.900
#> SRR1317410 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR608198 1 0.5757 0.6079 0.656 0.000 0.052 0.240 0.052
#> SRR1440161 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 1 0.4304 -0.0295 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1099622 5 0.2286 0.8285 0.000 0.108 0.000 0.004 0.888
#> SRR663197 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1394836 5 0.3177 0.7409 0.000 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR661699 3 0.1671 0.8166 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR813680 3 0.5820 0.4856 0.308 0.000 0.572 0.120 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.2424 0.8081 0.132 0.000 0.000 0.868 0.000
#> SRR1499174 3 0.2249 0.8210 0.000 0.000 0.896 0.008 0.096
#> SRR1311486 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1382851 4 0.5232 0.2275 0.000 0.000 0.044 0.500 0.456
#> SRR1433410 1 0.4737 0.7515 0.772 0.000 0.048 0.128 0.052
#> SRR661167 3 0.1608 0.8276 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1432518 5 0.1671 0.8495 0.000 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR660462 5 0.1341 0.8535 0.000 0.000 0.056 0.000 0.944
#> SRR1374608 1 0.5059 0.2597 0.548 0.000 0.036 0.416 0.000
#> SRR657949 3 0.4501 0.7143 0.116 0.000 0.756 0.128 0.000
#> SRR1308882 1 0.2280 0.8221 0.880 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR655768 3 0.1281 0.8346 0.012 0.000 0.956 0.000 0.032
#> SRR1485870 4 0.3307 0.7692 0.000 0.000 0.104 0.844 0.052
#> SRR1444138 5 0.2891 0.7376 0.000 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR1417342 1 0.1270 0.8797 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1470193 4 0.5288 0.3822 0.000 0.000 0.404 0.544 0.052
#> SRR1091380 5 0.2966 0.7309 0.000 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR1099096 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 4 0.3336 0.7380 0.228 0.000 0.000 0.772 0.000
#> SRR1467102 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1485416 4 0.1197 0.7974 0.000 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR818821 5 0.1851 0.8441 0.000 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR809963 1 0.2376 0.8662 0.904 0.000 0.044 0.052 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.0290 0.8131 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1445259 5 0.3913 0.5477 0.000 0.000 0.324 0.000 0.676
#> SRR1408393 3 0.3146 0.7825 0.028 0.000 0.844 0.128 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0794 0.8986 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0451 0.9782 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1310542 5 0.1965 0.8350 0.000 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR1333485 4 0.1571 0.8199 0.060 0.000 0.004 0.936 0.000
#> SRR1406437 3 0.0404 0.8331 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1354931 3 0.4242 0.1447 0.000 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR1391856 3 0.4317 0.7508 0.000 0.000 0.772 0.112 0.116
#> SRR1446738 5 0.1965 0.8350 0.000 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 5 0.2124 0.8335 0.000 0.096 0.000 0.004 0.900
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 2 0.4403 0.1108 0.000 0.560 0.000 0.004 0.436
#> SRR613150 5 0.3966 0.4845 0.000 0.000 0.336 0.000 0.664
#> SRR1375329 5 0.3305 0.6970 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812943 5 0.3661 0.6725 0.000 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR1400910 5 0.0000 0.8462 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444203 4 0.0451 0.8159 0.008 0.000 0.004 0.988 0.000
#> SRR816177 5 0.1965 0.8350 0.000 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR658754 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1429603 4 0.0162 0.8141 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1397366 3 0.1121 0.8343 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1446028 1 0.2536 0.8273 0.868 0.000 0.004 0.128 0.000
#> SRR1083918 5 0.4251 0.4730 0.000 0.372 0.000 0.004 0.624
#> SRR1337606 4 0.5606 0.5263 0.000 0.000 0.296 0.600 0.104
#> SRR659109 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1337192 1 0.0609 0.9045 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR656946 5 0.3480 0.6566 0.000 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR1476102 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1342067 4 0.2561 0.8012 0.144 0.000 0.000 0.856 0.000
#> SRR1385389 1 0.3366 0.6765 0.768 0.000 0.000 0.232 0.000
#> SRR1075971 1 0.0290 0.9086 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR614419 1 0.3532 0.7940 0.824 0.000 0.048 0.128 0.000
#> SRR1322936 4 0.5844 0.5727 0.000 0.000 0.208 0.608 0.184
#> SRR1349121 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR612935 5 0.2068 0.8383 0.000 0.092 0.000 0.004 0.904
#> SRR661481 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.3949 0.5324 0.000 0.000 0.332 0.668 0.000
#> SRR1452164 1 0.0963 0.8960 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1070503 3 0.2377 0.7975 0.000 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1499894 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1082883 4 0.5475 0.6450 0.184 0.000 0.060 0.704 0.052
#> SRR1468271 1 0.3644 0.7858 0.824 0.000 0.080 0.096 0.000
#> SRR1332443 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 5 0.1270 0.8510 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1396294 4 0.4133 0.7354 0.000 0.000 0.180 0.768 0.052
#> SRR1419917 1 0.6050 0.2446 0.512 0.000 0.360 0.128 0.000
#> SRR662114 5 0.1341 0.8499 0.000 0.000 0.056 0.000 0.944
#> SRR1489199 3 0.3003 0.8255 0.000 0.000 0.864 0.092 0.044
#> SRR813584 5 0.2179 0.8318 0.000 0.100 0.000 0.004 0.896
#> SRR1069638 5 0.0162 0.8463 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR614864 3 0.1121 0.8343 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1433392 3 0.5226 0.3860 0.376 0.000 0.572 0.052 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 3 0.2914 0.7961 0.000 0.000 0.872 0.076 0.052
#> SRR1401252 4 0.3622 0.8024 0.136 0.000 0.048 0.816 0.000
#> SRR1309963 4 0.3895 0.5824 0.320 0.000 0.000 0.680 0.000
#> SRR1338031 1 0.0992 0.8991 0.968 0.000 0.024 0.008 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.5055 0.6993 0.708 0.000 0.072 0.208 0.012
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 4 0.4585 0.7436 0.216 0.000 0.004 0.728 0.052
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1486538 4 0.1357 0.8191 0.048 0.000 0.004 0.948 0.000
#> SRR1340486 4 0.2424 0.8081 0.132 0.000 0.000 0.868 0.000
#> SRR1377696 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1465459 3 0.2153 0.8342 0.000 0.000 0.916 0.040 0.044
#> SRR1080270 5 0.1270 0.8510 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1312501 5 0.3210 0.6974 0.000 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1093148 5 0.4015 0.4402 0.000 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR1467080 5 0.2286 0.8271 0.000 0.108 0.000 0.004 0.888
#> SRR1410866 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.0162 0.8141 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1379198 4 0.3143 0.7492 0.204 0.000 0.000 0.796 0.000
#> SRR613342 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1452246 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.2424 0.8081 0.132 0.000 0.000 0.868 0.000
#> SRR1396616 5 0.3661 0.6738 0.000 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR813824 3 0.3707 0.5602 0.000 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1082376 1 0.1965 0.8767 0.924 0.000 0.024 0.052 0.000
#> SRR1500891 4 0.5062 0.6598 0.000 0.000 0.276 0.656 0.068
#> SRR807543 3 0.2376 0.8316 0.000 0.000 0.904 0.052 0.044
#> SRR1091572 5 0.5202 0.2661 0.000 0.000 0.056 0.348 0.596
#> SRR1346689 4 0.5365 0.6612 0.000 0.000 0.204 0.664 0.132
#> SRR1332424 1 0.4667 0.7556 0.776 0.000 0.044 0.128 0.052
#> SRR663729 1 0.2959 0.8215 0.864 0.000 0.036 0.100 0.000
#> SRR1097013 3 0.3460 0.7970 0.044 0.000 0.828 0.128 0.000
#> SRR613675 4 0.5807 0.2529 0.000 0.000 0.092 0.484 0.424
#> SRR1485357 4 0.0162 0.8141 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR655816 3 0.2377 0.7975 0.000 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1500113 1 0.5264 0.2776 0.556 0.000 0.392 0.000 0.052
#> SRR1437622 3 0.6371 0.2209 0.000 0.000 0.516 0.216 0.268
#> SRR1355172 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR655531 1 0.0290 0.9076 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1338147 3 0.2377 0.7932 0.000 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1413329 3 0.2914 0.7961 0.000 0.000 0.872 0.076 0.052
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 4 0.0162 0.8141 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1452033 1 0.2914 0.8460 0.872 0.000 0.052 0.076 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 5 0.2813 0.7770 0.000 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.2536 0.7984 0.000 0.000 0.868 0.128 0.004
#> SRR1471755 5 0.4307 0.1303 0.000 0.496 0.000 0.000 0.504
#> SRR808019 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479133 3 0.1197 0.8336 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR615069 5 0.0000 0.8462 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456185 2 0.0451 0.9782 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1350069 4 0.4162 0.7343 0.000 0.000 0.176 0.768 0.056
#> SRR816316 1 0.5513 0.5518 0.632 0.000 0.252 0.116 0.000
#> SRR664795 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490721 4 0.2609 0.7834 0.004 0.000 0.048 0.896 0.052
#> SRR810643 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1430333 3 0.3601 0.7785 0.000 0.000 0.820 0.128 0.052
#> SRR1085285 3 0.1608 0.8276 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1099072 3 0.1121 0.8343 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1351347 5 0.1410 0.8526 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940
#> SRR1405525 1 0.5234 0.4863 0.612 0.000 0.332 0.004 0.052
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR819610 3 0.3730 0.5485 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR2157314 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.0162 0.8141 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR613639 3 0.1121 0.8343 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1402285 1 0.2020 0.8398 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1077038 1 0.1270 0.8873 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1405660 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1095455 5 0.1671 0.8480 0.000 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR1394734 5 0.2124 0.8335 0.000 0.096 0.000 0.004 0.900
#> SRR1317771 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 4 0.3307 0.7692 0.000 0.000 0.104 0.844 0.052
#> SRR1073581 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR659804 1 0.0510 0.9060 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1345914 2 0.0451 0.9782 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1432186 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1473529 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR660764 5 0.4151 0.5358 0.000 0.344 0.000 0.004 0.652
#> SRR820448 1 0.3704 0.8025 0.820 0.000 0.092 0.088 0.000
#> SRR1328845 4 0.4162 0.7343 0.000 0.000 0.176 0.768 0.056
#> SRR1336415 4 0.2074 0.8150 0.104 0.000 0.000 0.896 0.000
#> SRR1379065 1 0.3452 0.6568 0.756 0.000 0.000 0.244 0.000
#> SRR1459190 3 0.1121 0.8343 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1346773 1 0.2338 0.8425 0.884 0.000 0.004 0.112 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 5 0.1270 0.8510 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1081209 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 4 0.5491 0.0548 0.004 0.000 0.452 0.492 0.052
#> SRR1309248 5 0.1121 0.8304 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR809161 3 0.1121 0.8343 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1316320 5 0.1121 0.8304 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1432629 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1498931 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1416578 4 0.2424 0.8081 0.132 0.000 0.000 0.868 0.000
#> SRR1405547 5 0.3949 0.5868 0.000 0.000 0.332 0.000 0.668
#> SRR1470534 1 0.2020 0.8398 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1380764 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1309160 3 0.1608 0.8276 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR663489 5 0.3242 0.7441 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1500450 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 5 0.3579 0.7032 0.000 0.000 0.240 0.004 0.756
#> SRR1332648 1 0.4101 0.3729 0.628 0.000 0.000 0.372 0.000
#> SRR660614 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.3460 0.7974 0.828 0.000 0.044 0.128 0.000
#> SRR1481419 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1464766 1 0.1270 0.8873 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR615946 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1446481 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.0451 0.9075 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR660224 5 0.3607 0.6951 0.000 0.244 0.000 0.004 0.752
#> SRR665586 1 0.0963 0.8940 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1347166 3 0.3601 0.7785 0.000 0.000 0.820 0.128 0.052
#> SRR1485722 3 0.2464 0.8164 0.016 0.000 0.888 0.000 0.096
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.1965 0.8767 0.924 0.000 0.024 0.052 0.000
#> SRR661108 3 0.1608 0.8276 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR2170173 3 0.1792 0.8150 0.000 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR817329 3 0.5142 0.4126 0.348 0.000 0.600 0.052 0.000
#> SRR1401990 4 0.1502 0.8202 0.056 0.000 0.004 0.940 0.000
#> SRR1467745 5 0.1965 0.8350 0.000 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR1471795 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 3 0.4712 0.6095 0.268 0.000 0.684 0.048 0.000
#> SRR1314873 1 0.4737 0.6959 0.708 0.000 0.068 0.224 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 4 0.3949 0.6042 0.000 0.000 0.004 0.696 0.300
#> SRR818797 3 0.3262 0.8125 0.000 0.000 0.840 0.124 0.036
#> SRR2164608 3 0.1671 0.8166 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1455586 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR819459 5 0.1270 0.8510 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1488939 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.2377 0.7975 0.000 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1361652 5 0.2179 0.8165 0.000 0.100 0.000 0.004 0.896
#> SRR1437119 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1478547 5 0.4278 0.1506 0.000 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR1430910 5 0.1430 0.8506 0.000 0.052 0.000 0.004 0.944
#> SRR1310584 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1500216 1 0.3180 0.8402 0.856 0.000 0.068 0.076 0.000
#> SRR1486762 5 0.2124 0.8335 0.000 0.096 0.000 0.004 0.900
#> SRR1480854 4 0.4030 0.5196 0.352 0.000 0.000 0.648 0.000
#> SRR1489394 4 0.2377 0.8091 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000
#> SRR1418085 4 0.4192 0.3951 0.404 0.000 0.000 0.596 0.000
#> SRR1340221 4 0.2377 0.8091 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000
#> SRR1473058 5 0.5291 -0.0700 0.000 0.000 0.048 0.456 0.496
#> SRR1405165 3 0.1851 0.8208 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1433004 3 0.4519 0.7615 0.036 0.000 0.784 0.128 0.052
#> SRR1471477 1 0.5348 0.0591 0.492 0.000 0.456 0.000 0.052
#> SRR1098567 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1098712 5 0.5691 0.3727 0.000 0.000 0.112 0.296 0.592
#> SRR1455038 1 0.1965 0.8767 0.924 0.000 0.024 0.052 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.1121 0.8343 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1348378 5 0.2488 0.8161 0.000 0.124 0.000 0.004 0.872
#> SRR1413541 1 0.2681 0.8597 0.892 0.000 0.004 0.052 0.052
#> SRR1392943 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1475192 5 0.1965 0.8350 0.000 0.096 0.000 0.000 0.904
#> SRR1432085 2 0.0451 0.9782 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1452468 3 0.3601 0.7785 0.000 0.000 0.820 0.128 0.052
#> SRR1347060 5 0.1469 0.8554 0.000 0.016 0.036 0.000 0.948
#> SRR1414139 5 0.2124 0.8335 0.000 0.096 0.000 0.004 0.900
#> SRR1447962 2 0.0451 0.9782 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1444324 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 4 0.2877 0.7586 0.144 0.000 0.004 0.848 0.004
#> SRR1413436 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.1270 0.8873 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1343302 4 0.2377 0.8091 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000
#> SRR1373746 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.4359 0.2033 0.000 0.584 0.000 0.004 0.412
#> SRR1405331 3 0.2127 0.8075 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1345609 1 0.0794 0.8944 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1380208 3 0.5375 0.4829 0.000 0.000 0.604 0.076 0.320
#> SRR1322840 4 0.1831 0.8204 0.076 0.000 0.004 0.920 0.000
#> SRR1399797 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1416654 5 0.2127 0.8298 0.000 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR1315081 2 0.0162 0.9845 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1369196 5 0.1270 0.8510 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1400847 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.3309 0.8104 0.000 0.000 0.836 0.128 0.036
#> SRR1367920 4 0.3821 0.7488 0.000 0.000 0.148 0.800 0.052
#> SRR1366648 5 0.1270 0.8542 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9853 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.2773 0.7884 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1363968 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.9095 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0162 0.9094 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1386689 4 0.2377 0.8091 0.128 0.000 0.000 0.872 0.000
#> SRR1395575 3 0.1608 0.8276 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1453811 3 0.1544 0.8291 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1441159 1 0.0510 0.9060 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1403154 4 0.2424 0.8081 0.132 0.000 0.000 0.868 0.000
#> SRR1468722 3 0.1478 0.8306 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1310275 3 0.3508 0.6251 0.000 0.000 0.748 0.000 0.252
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 1 0.1387 0.86296 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1331708 5 0.5780 0.05680 0.000 0.000 0.004 0.168 0.496 0.332
#> SRR1464258 5 0.2562 0.37384 0.000 0.000 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR1454201 5 0.3833 -0.30123 0.000 0.000 0.000 0.000 0.556 0.444
#> SRR661589 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1456229 1 0.5254 0.41792 0.564 0.000 0.000 0.000 0.316 0.120
#> SRR1315165 4 0.5130 0.52370 0.000 0.000 0.000 0.612 0.136 0.252
#> SRR1488960 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417809 4 0.5636 0.43915 0.176 0.000 0.000 0.516 0.308 0.000
#> SRR1094457 4 0.1387 0.78072 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR1095575 5 0.3833 -0.30123 0.000 0.000 0.000 0.000 0.556 0.444
#> SRR1315931 1 0.2300 0.79587 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1430066 6 0.4809 0.47605 0.000 0.000 0.072 0.000 0.328 0.600
#> SRR1431037 3 0.1204 0.76862 0.000 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1395554 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818002 2 0.4718 0.68202 0.000 0.616 0.000 0.068 0.000 0.316
#> SRR1344143 3 0.7404 0.44884 0.000 0.092 0.416 0.020 0.172 0.300
#> SRR1486845 4 0.3862 0.12444 0.476 0.000 0.000 0.524 0.000 0.000
#> SRR1362866 5 0.3448 -0.00789 0.004 0.000 0.000 0.000 0.716 0.280
#> SRR1490740 1 0.1863 0.84702 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.1088 0.91640 0.000 0.960 0.000 0.016 0.000 0.024
#> SRR1416248 1 0.0146 0.86834 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1383907 4 0.1814 0.76655 0.000 0.000 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1311018 1 0.1267 0.86402 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1375699 2 0.3700 0.83613 0.000 0.780 0.000 0.068 0.000 0.152
#> SRR1429846 5 0.3634 0.14109 0.000 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR613550 5 0.3867 -0.23714 0.000 0.000 0.000 0.000 0.512 0.488
#> SRR1348402 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345146 5 0.3833 -0.30123 0.000 0.000 0.000 0.000 0.556 0.444
#> SRR1324025 6 0.4738 0.48007 0.000 0.000 0.064 0.000 0.336 0.600
#> SRR1318879 5 0.3833 -0.30123 0.000 0.000 0.000 0.000 0.556 0.444
#> SRR820755 5 0.3245 0.38805 0.028 0.000 0.000 0.000 0.800 0.172
#> SRR1485830 4 0.3587 0.70571 0.000 0.000 0.000 0.772 0.188 0.040
#> SRR599313 5 0.3720 0.39002 0.236 0.000 0.000 0.028 0.736 0.000
#> SRR612263 1 0.3023 0.73980 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232 0.000
#> SRR1415398 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1326205 4 0.6728 0.35051 0.000 0.000 0.068 0.472 0.188 0.272
#> SRR1421327 1 0.6068 0.11008 0.388 0.000 0.000 0.344 0.268 0.000
#> SRR1083311 3 0.0146 0.79700 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1499303 4 0.5877 0.36419 0.000 0.000 0.000 0.456 0.332 0.212
#> SRR1079522 5 0.3221 0.02043 0.000 0.000 0.000 0.000 0.736 0.264
#> SRR1452935 3 0.0891 0.78514 0.000 0.000 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR1379495 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR615778 5 0.0000 0.37708 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.1610 0.82216 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655182 5 0.5102 -0.32578 0.000 0.000 0.080 0.000 0.492 0.428
#> SRR1335140 3 0.4893 0.61328 0.000 0.000 0.660 0.000 0.172 0.168
#> SRR1433555 3 0.0146 0.79700 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1308650 3 0.4718 0.63012 0.000 0.000 0.616 0.068 0.000 0.316
#> SRR1388354 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317446 3 0.0632 0.79222 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1413602 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809853 5 0.3797 -0.27945 0.000 0.000 0.000 0.000 0.580 0.420
#> SRR661313 3 0.4493 0.30124 0.000 0.000 0.612 0.000 0.044 0.344
#> SRR1499935 4 0.5130 0.52370 0.000 0.000 0.000 0.612 0.136 0.252
#> SRR1447303 6 0.4687 0.48087 0.000 0.000 0.060 0.000 0.336 0.604
#> SRR1429408 4 0.6397 0.40273 0.000 0.000 0.064 0.516 0.136 0.284
#> SRR1433950 1 0.2260 0.82107 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1362081 2 0.0146 0.92058 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1409854 5 0.3076 0.31435 0.000 0.000 0.000 0.000 0.760 0.240
#> SRR1435229 6 0.5816 0.22260 0.000 0.000 0.388 0.000 0.184 0.428
#> SRR1085996 1 0.1714 0.85293 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1414229 3 0.0363 0.79584 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1400974 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.5089 0.58961 0.620 0.000 0.000 0.136 0.244 0.000
#> SRR613927 5 0.3351 0.25600 0.000 0.000 0.000 0.000 0.712 0.288
#> SRR1457854 1 0.1444 0.86018 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1473714 6 0.3923 0.35668 0.000 0.000 0.004 0.000 0.416 0.580
#> SRR813776 5 0.2562 0.37384 0.000 0.000 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR808196 4 0.1524 0.78203 0.060 0.000 0.000 0.932 0.008 0.000
#> SRR1101085 4 0.1753 0.77015 0.000 0.000 0.000 0.912 0.084 0.004
#> SRR614395 5 0.3003 0.38317 0.016 0.000 0.000 0.000 0.812 0.172
#> SRR1478251 4 0.2048 0.75931 0.120 0.000 0.000 0.880 0.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.1556 0.85695 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR665310 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1420109 6 0.5799 0.21927 0.000 0.000 0.392 0.000 0.180 0.428
#> SRR1330920 5 0.2697 0.36416 0.000 0.000 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR1419539 3 0.4530 0.60492 0.000 0.000 0.600 0.044 0.000 0.356
#> SRR1359447 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347259 4 0.1387 0.77374 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR613915 5 0.4220 0.39419 0.096 0.000 0.000 0.000 0.732 0.172
#> SRR1384395 2 0.2389 0.89699 0.000 0.888 0.000 0.060 0.000 0.052
#> SRR821715 6 0.3857 0.32233 0.000 0.000 0.000 0.000 0.468 0.532
#> SRR1478228 1 0.1267 0.86402 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1445637 5 0.4332 0.29650 0.352 0.000 0.000 0.000 0.616 0.032
#> SRR608150 5 0.4716 0.33985 0.152 0.000 0.004 0.028 0.732 0.084
#> SRR1096383 1 0.3023 0.73980 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232 0.000
#> SRR1341480 4 0.2962 0.75382 0.000 0.000 0.000 0.848 0.084 0.068
#> SRR1341344 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1498838 6 0.5269 0.42580 0.000 0.000 0.156 0.000 0.248 0.596
#> SRR1416313 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808566 6 0.5586 0.06145 0.000 0.000 0.000 0.384 0.144 0.472
#> SRR1430270 1 0.0146 0.86781 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.1714 0.74094 0.000 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR613533 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661267 1 0.0260 0.86848 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR810665 2 0.2451 0.89537 0.000 0.884 0.000 0.060 0.000 0.056
#> SRR1407250 5 0.3810 -0.28812 0.000 0.000 0.000 0.000 0.572 0.428
#> SRR1420067 1 0.1444 0.86113 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1473632 6 0.5733 0.26567 0.000 0.000 0.328 0.000 0.184 0.488
#> SRR812536 5 0.3823 -0.10535 0.000 0.000 0.000 0.000 0.564 0.436
#> SRR1370850 2 0.4718 0.68202 0.000 0.616 0.000 0.068 0.000 0.316
#> SRR1486195 2 0.2451 0.89537 0.000 0.884 0.000 0.060 0.000 0.056
#> SRR1407671 3 0.5302 0.57910 0.000 0.000 0.616 0.004 0.172 0.208
#> SRR1446375 3 0.2562 0.68354 0.000 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1465230 4 0.1387 0.78072 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR614119 5 0.5180 0.34273 0.220 0.000 0.000 0.000 0.616 0.164
#> SRR1356101 2 0.1092 0.91623 0.000 0.960 0.000 0.020 0.000 0.020
#> SRR1404209 5 0.5575 0.33175 0.296 0.000 0.000 0.000 0.532 0.172
#> SRR1392676 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660510 3 0.4812 0.20551 0.000 0.000 0.588 0.000 0.068 0.344
#> SRR1445655 4 0.1387 0.77374 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR658953 5 0.1957 0.28898 0.000 0.000 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR2166459 5 0.5741 0.27975 0.372 0.000 0.000 0.000 0.456 0.172
#> SRR1070713 3 0.4278 0.63018 0.000 0.000 0.632 0.032 0.000 0.336
#> SRR1485312 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1317631 4 0.1657 0.77674 0.016 0.000 0.000 0.928 0.056 0.000
#> SRR1488610 1 0.3151 0.69118 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1330588 6 0.4482 0.46725 0.000 0.000 0.036 0.000 0.384 0.580
#> SRR1316367 3 0.5575 0.46694 0.000 0.000 0.528 0.000 0.304 0.168
#> SRR1433926 5 0.5633 0.05509 0.412 0.000 0.000 0.000 0.440 0.148
#> SRR1091302 4 0.1616 0.78078 0.048 0.000 0.000 0.932 0.020 0.000
#> SRR818263 5 0.5438 0.37642 0.260 0.000 0.000 0.000 0.568 0.172
#> SRR1404909 4 0.1588 0.77289 0.000 0.000 0.000 0.924 0.072 0.004
#> SRR663076 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.3475 0.85004 0.000 0.800 0.000 0.060 0.000 0.140
#> SRR1442422 4 0.1387 0.78072 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.1434 0.86465 0.940 0.000 0.000 0.012 0.048 0.000
#> SRR654862 5 0.3506 0.39931 0.052 0.000 0.000 0.000 0.792 0.156
#> SRR1407112 4 0.1471 0.78129 0.064 0.000 0.000 0.932 0.004 0.000
#> SRR1332969 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1353199 6 0.3852 0.49932 0.000 0.000 0.004 0.000 0.384 0.612
#> SRR1378885 5 0.4620 0.24724 0.068 0.000 0.000 0.000 0.640 0.292
#> SRR665357 2 0.0777 0.91796 0.000 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR662186 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1347819 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.1092 0.91623 0.000 0.960 0.000 0.020 0.000 0.020
#> SRR1472576 6 0.6063 -0.04655 0.000 0.000 0.200 0.048 0.172 0.580
#> SRR1431781 4 0.1387 0.77374 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1452270 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1500472 3 0.2454 0.69487 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1417632 3 0.6293 0.35352 0.000 0.000 0.392 0.008 0.288 0.312
#> SRR1350153 2 0.2390 0.89694 0.000 0.888 0.000 0.056 0.000 0.056
#> SRR1458113 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1326579 5 0.3578 0.08341 0.340 0.000 0.000 0.000 0.660 0.000
#> SRR1349363 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090407 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1083752 3 0.3634 0.65822 0.000 0.000 0.696 0.008 0.000 0.296
#> SRR1377599 5 0.5774 -0.01303 0.000 0.000 0.000 0.176 0.440 0.384
#> SRR1488449 6 0.3756 0.47473 0.000 0.000 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1318354 3 0.1801 0.77490 0.000 0.004 0.924 0.016 0.000 0.056
#> SRR1359062 3 0.2058 0.77028 0.000 0.000 0.908 0.036 0.000 0.056
#> SRR1398924 3 0.0146 0.79706 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR663783 3 0.0146 0.79700 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1319204 3 0.0146 0.79706 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.2941 0.73884 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1337449 2 0.1934 0.90622 0.000 0.916 0.000 0.040 0.000 0.044
#> SRR1316982 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498595 2 0.7096 -0.00796 0.000 0.324 0.292 0.068 0.000 0.316
#> SRR1377423 3 0.5027 0.38694 0.000 0.000 0.640 0.000 0.160 0.200
#> SRR1312310 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.1501 0.85829 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1338426 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353309 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR658941 6 0.3930 0.30271 0.000 0.000 0.092 0.000 0.144 0.764
#> SRR1101643 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 4 0.6860 0.36435 0.236 0.000 0.000 0.448 0.248 0.068
#> SRR1368874 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.1387 0.77374 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1363858 5 0.2915 0.27516 0.000 0.000 0.000 0.008 0.808 0.184
#> SRR819820 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1337342 5 0.3717 -0.07978 0.384 0.000 0.000 0.000 0.616 0.000
#> SRR655206 3 0.4225 0.45894 0.000 0.000 0.508 0.008 0.004 0.480
#> SRR1387013 3 0.4443 0.61334 0.000 0.000 0.596 0.036 0.000 0.368
#> SRR1317410 1 0.1267 0.86402 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR608198 5 0.4889 0.07475 0.312 0.000 0.000 0.084 0.604 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.3789 0.31406 0.416 0.000 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1099622 3 0.4718 0.63012 0.000 0.000 0.616 0.068 0.000 0.316
#> SRR663197 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394836 6 0.3692 0.21119 0.000 0.000 0.244 0.008 0.012 0.736
#> SRR661699 5 0.3823 -0.10535 0.000 0.000 0.000 0.000 0.564 0.436
#> SRR813680 5 0.5282 0.37756 0.228 0.000 0.000 0.000 0.600 0.172
#> SRR1410678 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 4 0.1387 0.78072 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR1499174 5 0.3804 -0.28330 0.000 0.000 0.000 0.000 0.576 0.424
#> SRR1311486 2 0.2571 0.89197 0.000 0.876 0.000 0.060 0.000 0.064
#> SRR1382851 6 0.7513 -0.25554 0.000 0.000 0.292 0.140 0.252 0.316
#> SRR1433410 5 0.3789 -0.14303 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584 0.000
#> SRR661167 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1432518 3 0.0146 0.79700 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR660462 3 0.0146 0.79700 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1374608 4 0.5771 0.26657 0.336 0.000 0.000 0.476 0.188 0.000
#> SRR657949 5 0.3927 0.39667 0.072 0.000 0.000 0.000 0.756 0.172
#> SRR1308882 1 0.3221 0.61188 0.736 0.000 0.000 0.264 0.000 0.000
#> SRR655768 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1485870 4 0.5078 0.58055 0.000 0.000 0.000 0.632 0.208 0.160
#> SRR1444138 6 0.5799 0.21927 0.000 0.000 0.392 0.000 0.180 0.428
#> SRR1417342 1 0.2562 0.71025 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1470193 5 0.5631 0.04438 0.000 0.000 0.000 0.168 0.508 0.324
#> SRR1091380 3 0.5223 -0.10643 0.000 0.000 0.472 0.000 0.092 0.436
#> SRR1099096 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 4 0.3769 0.49273 0.356 0.000 0.000 0.640 0.004 0.000
#> SRR1467102 2 0.2962 0.87948 0.000 0.848 0.000 0.068 0.000 0.084
#> SRR1485416 4 0.4638 0.58787 0.000 0.000 0.000 0.636 0.296 0.068
#> SRR818821 3 0.0291 0.79582 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR809963 1 0.3672 0.56712 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 4 0.1714 0.76938 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1445259 3 0.4671 0.45587 0.000 0.000 0.688 0.000 0.156 0.156
#> SRR1408393 5 0.2948 0.37110 0.008 0.000 0.000 0.000 0.804 0.188
#> SRR1361522 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.1265 0.85899 0.948 0.000 0.000 0.008 0.044 0.000
#> SRR1309680 2 0.4718 0.68202 0.000 0.616 0.000 0.068 0.000 0.316
#> SRR1310542 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.1644 0.77895 0.028 0.000 0.000 0.932 0.040 0.000
#> SRR1406437 6 0.2996 0.30652 0.000 0.000 0.000 0.000 0.228 0.772
#> SRR1354931 6 0.5273 0.40686 0.000 0.000 0.184 0.000 0.212 0.604
#> SRR1391856 5 0.5592 -0.05434 0.000 0.000 0.156 0.000 0.504 0.340
#> SRR1446738 3 0.3986 0.64076 0.000 0.000 0.664 0.020 0.000 0.316
#> SRR1309032 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 3 0.4718 0.63012 0.000 0.000 0.616 0.068 0.000 0.316
#> SRR1432611 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.5851 0.27885 0.000 0.328 0.544 0.060 0.000 0.068
#> SRR613150 3 0.2709 0.69070 0.000 0.000 0.848 0.000 0.132 0.020
#> SRR1375329 6 0.5887 0.26752 0.000 0.000 0.364 0.000 0.204 0.432
#> SRR1387921 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812943 6 0.5962 0.26807 0.000 0.000 0.364 0.000 0.224 0.412
#> SRR1400910 3 0.0146 0.79706 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1444203 4 0.1471 0.77483 0.004 0.000 0.000 0.932 0.064 0.000
#> SRR816177 3 0.4389 0.59570 0.000 0.000 0.596 0.032 0.000 0.372
#> SRR658754 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.1387 0.77374 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1397366 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1446028 1 0.3409 0.66637 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR1083918 3 0.7002 0.23144 0.000 0.252 0.372 0.064 0.000 0.312
#> SRR1337606 5 0.6629 0.04482 0.000 0.000 0.044 0.204 0.436 0.316
#> SRR659109 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.2854 0.76295 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR656946 6 0.4647 0.23936 0.000 0.000 0.104 0.008 0.184 0.704
#> SRR1476102 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.1267 0.86402 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1342067 4 0.1610 0.77450 0.084 0.000 0.000 0.916 0.000 0.000
#> SRR1385389 1 0.3607 0.43210 0.652 0.000 0.000 0.348 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.1327 0.86291 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR614419 1 0.3782 0.48847 0.588 0.000 0.000 0.000 0.412 0.000
#> SRR1322936 5 0.6437 -0.07084 0.000 0.000 0.144 0.244 0.536 0.076
#> SRR1349121 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.1267 0.86402 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR612935 3 0.1462 0.77773 0.000 0.008 0.936 0.000 0.000 0.056
#> SRR661481 2 0.1633 0.91053 0.000 0.932 0.000 0.024 0.000 0.044
#> SRR1354117 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.6109 0.16420 0.000 0.000 0.000 0.356 0.352 0.292
#> SRR1452164 1 0.2527 0.79060 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1070503 5 0.2912 0.34205 0.000 0.000 0.000 0.000 0.784 0.216
#> SRR1499894 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082883 5 0.5246 -0.10448 0.028 0.000 0.000 0.288 0.616 0.068
#> SRR1468271 1 0.3435 0.75248 0.820 0.000 0.000 0.024 0.128 0.028
#> SRR1332443 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328620 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396294 4 0.5231 0.52477 0.000 0.000 0.004 0.612 0.132 0.252
#> SRR1419917 5 0.4828 0.25489 0.320 0.000 0.000 0.000 0.604 0.076
#> SRR662114 3 0.0146 0.79706 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1489199 5 0.2762 0.35965 0.000 0.000 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR813584 3 0.5144 0.57596 0.000 0.008 0.540 0.068 0.000 0.384
#> SRR1069638 3 0.2536 0.75945 0.000 0.000 0.864 0.020 0.000 0.116
#> SRR614864 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1433392 5 0.5665 0.31189 0.328 0.000 0.000 0.000 0.500 0.172
#> SRR1377777 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 5 0.3266 0.01560 0.000 0.000 0.000 0.000 0.728 0.272
#> SRR1401252 4 0.3767 0.71365 0.088 0.000 0.000 0.780 0.132 0.000
#> SRR1309963 4 0.3050 0.66103 0.236 0.000 0.000 0.764 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.1714 0.85293 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 5 0.5868 -0.12205 0.348 0.000 0.000 0.204 0.448 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1356468 4 0.5604 0.53224 0.268 0.000 0.000 0.556 0.172 0.004
#> SRR1337010 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.1267 0.86402 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1486538 4 0.2494 0.75386 0.016 0.000 0.000 0.864 0.120 0.000
#> SRR1340486 4 0.1387 0.78072 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR1377696 2 0.4718 0.68202 0.000 0.616 0.000 0.068 0.000 0.316
#> SRR1465459 5 0.3765 0.02454 0.000 0.000 0.000 0.000 0.596 0.404
#> SRR1080270 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1312501 6 0.5873 0.27705 0.000 0.000 0.368 0.000 0.200 0.432
#> SRR1093148 6 0.6075 0.22282 0.000 0.000 0.332 0.000 0.276 0.392
#> SRR1467080 3 0.2272 0.76666 0.000 0.004 0.900 0.040 0.000 0.056
#> SRR1410866 2 0.0717 0.91863 0.000 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR816475 4 0.3587 0.72694 0.000 0.000 0.000 0.792 0.140 0.068
#> SRR1379198 4 0.2527 0.72426 0.168 0.000 0.000 0.832 0.000 0.000
#> SRR613342 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.1501 0.77869 0.076 0.000 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.4808 -0.14919 0.000 0.000 0.480 0.000 0.052 0.468
#> SRR813824 6 0.5103 0.44868 0.000 0.000 0.120 0.000 0.276 0.604
#> SRR1082376 1 0.3221 0.71020 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1500891 6 0.4836 0.09193 0.000 0.000 0.020 0.032 0.356 0.592
#> SRR807543 5 0.3620 0.14494 0.000 0.000 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1091572 3 0.7309 0.20120 0.000 0.000 0.404 0.200 0.260 0.136
#> SRR1346689 6 0.6451 0.07697 0.000 0.000 0.072 0.160 0.232 0.536
#> SRR1332424 5 0.3982 -0.26454 0.460 0.000 0.000 0.000 0.536 0.004
#> SRR663729 1 0.3879 0.52101 0.688 0.000 0.000 0.292 0.020 0.000
#> SRR1097013 5 0.3547 0.24449 0.004 0.000 0.000 0.000 0.696 0.300
#> SRR613675 5 0.6537 -0.22211 0.000 0.000 0.348 0.028 0.396 0.228
#> SRR1485357 4 0.2801 0.75815 0.000 0.000 0.000 0.860 0.072 0.068
#> SRR655816 5 0.3659 0.09214 0.000 0.000 0.000 0.000 0.636 0.364
#> SRR1500113 1 0.5969 -0.16129 0.432 0.000 0.000 0.000 0.332 0.236
#> SRR1437622 6 0.4317 0.25850 0.000 0.000 0.092 0.056 0.076 0.776
#> SRR1355172 1 0.1714 0.85293 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338147 6 0.4809 0.47605 0.000 0.000 0.072 0.000 0.328 0.600
#> SRR1413329 5 0.3221 0.02043 0.000 0.000 0.000 0.000 0.736 0.264
#> SRR1485931 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333308 4 0.1387 0.77374 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1452033 1 0.3879 0.66264 0.688 0.000 0.000 0.020 0.292 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.4504 0.06938 0.000 0.000 0.536 0.000 0.032 0.432
#> SRR1375351 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 5 0.3499 0.21511 0.000 0.000 0.000 0.000 0.680 0.320
#> SRR1471755 6 0.7096 -0.32984 0.000 0.308 0.296 0.068 0.000 0.328
#> SRR808019 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1479133 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR615069 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456185 2 0.3700 0.83613 0.000 0.780 0.000 0.068 0.000 0.152
#> SRR1350069 4 0.5130 0.52370 0.000 0.000 0.000 0.612 0.136 0.252
#> SRR816316 5 0.5592 0.09430 0.368 0.000 0.000 0.000 0.484 0.148
#> SRR664795 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490721 4 0.4962 0.47041 0.000 0.000 0.000 0.516 0.416 0.068
#> SRR810643 1 0.1267 0.86402 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1430333 5 0.1863 0.33015 0.000 0.000 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1085285 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1099072 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1317985 1 0.0632 0.86448 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.2571 0.89197 0.000 0.876 0.000 0.060 0.000 0.064
#> SRR1351347 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405525 5 0.6038 0.17369 0.316 0.000 0.000 0.000 0.416 0.268
#> SRR1370329 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.1633 0.91053 0.000 0.932 0.000 0.024 0.000 0.044
#> SRR819610 6 0.1858 0.30483 0.000 0.000 0.076 0.000 0.012 0.912
#> SRR2157314 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.3513 0.72560 0.000 0.000 0.000 0.796 0.144 0.060
#> SRR613639 6 0.3727 0.49629 0.000 0.000 0.000 0.000 0.388 0.612
#> SRR1402285 1 0.3371 0.54410 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.3221 0.71020 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095455 3 0.0146 0.79700 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1394734 3 0.4315 0.63579 0.000 0.000 0.636 0.036 0.000 0.328
#> SRR1317771 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365894 4 0.5227 0.55598 0.000 0.000 0.000 0.612 0.200 0.188
#> SRR1073581 1 0.1501 0.85960 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR659804 1 0.1327 0.86312 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1345914 2 0.4566 0.72087 0.000 0.652 0.000 0.068 0.000 0.280
#> SRR1432186 2 0.3953 0.80628 0.000 0.744 0.000 0.060 0.000 0.196
#> SRR1473529 2 0.2451 0.89537 0.000 0.884 0.000 0.060 0.000 0.056
#> SRR660764 3 0.4341 0.68595 0.000 0.108 0.772 0.060 0.000 0.060
#> SRR820448 1 0.4516 0.45870 0.564 0.000 0.000 0.000 0.400 0.036
#> SRR1328845 4 0.5231 0.52477 0.000 0.000 0.004 0.612 0.132 0.252
#> SRR1336415 4 0.1616 0.78078 0.048 0.000 0.000 0.932 0.020 0.000
#> SRR1379065 1 0.3672 0.39905 0.632 0.000 0.000 0.368 0.000 0.000
#> SRR1459190 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1346773 1 0.2135 0.82766 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1499521 1 0.0146 0.86841 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1440898 2 0.0717 0.91863 0.000 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR1347459 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.1863 0.90734 0.000 0.920 0.000 0.036 0.000 0.044
#> SRR1400202 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1333395 5 0.4325 -0.14147 0.004 0.000 0.000 0.412 0.568 0.016
#> SRR1309248 6 0.6160 -0.23992 0.000 0.000 0.340 0.008 0.224 0.428
#> SRR809161 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1316320 3 0.5142 0.58167 0.000 0.000 0.624 0.000 0.172 0.204
#> SRR1432629 2 0.4718 0.68202 0.000 0.616 0.000 0.068 0.000 0.316
#> SRR1498931 1 0.1141 0.86545 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1416578 4 0.1387 0.78072 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR1405547 6 0.4552 0.31888 0.000 0.000 0.364 0.000 0.044 0.592
#> SRR1470534 1 0.3371 0.54410 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.1267 0.86402 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1309160 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR663489 3 0.4199 0.11628 0.000 0.000 0.568 0.000 0.016 0.416
#> SRR1500450 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078489 6 0.5767 0.26716 0.000 0.000 0.324 0.000 0.192 0.484
#> SRR1332648 1 0.3854 0.07520 0.536 0.000 0.000 0.464 0.000 0.000
#> SRR660614 2 0.0405 0.92015 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1470420 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.3774 0.49501 0.592 0.000 0.000 0.000 0.408 0.000
#> SRR1481419 2 0.1633 0.91053 0.000 0.932 0.000 0.024 0.000 0.044
#> SRR1464766 1 0.2664 0.78633 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR615946 3 0.0146 0.79758 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.2629 0.89011 0.000 0.872 0.000 0.060 0.000 0.068
#> SRR1467656 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.1327 0.86344 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR660224 3 0.6637 0.42297 0.000 0.208 0.496 0.064 0.000 0.232
#> SRR665586 1 0.0790 0.85694 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1347166 5 0.0000 0.37708 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485722 5 0.3810 -0.28812 0.000 0.000 0.000 0.000 0.572 0.428
#> SRR1415316 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613390 1 0.3221 0.71020 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR661108 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR2170173 5 0.3810 -0.08436 0.000 0.000 0.000 0.000 0.572 0.428
#> SRR817329 5 0.5214 0.37963 0.216 0.000 0.000 0.000 0.612 0.172
#> SRR1401990 4 0.2688 0.77507 0.024 0.000 0.000 0.884 0.044 0.048
#> SRR1467745 3 0.4856 0.59724 0.000 0.000 0.572 0.068 0.000 0.360
#> SRR1471795 2 0.2744 0.88705 0.000 0.864 0.000 0.064 0.000 0.072
#> SRR1415637 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 5 0.5519 0.33264 0.280 0.000 0.000 0.000 0.548 0.172
#> SRR1314873 1 0.5962 0.17763 0.412 0.000 0.000 0.224 0.364 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 4 0.6922 0.30403 0.000 0.000 0.208 0.492 0.124 0.176
#> SRR818797 5 0.3428 0.23211 0.000 0.000 0.000 0.000 0.696 0.304
#> SRR2164608 5 0.3823 -0.10535 0.000 0.000 0.000 0.000 0.564 0.436
#> SRR1455586 2 0.2629 0.89011 0.000 0.872 0.000 0.060 0.000 0.068
#> SRR819459 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.1564 0.91150 0.000 0.936 0.000 0.024 0.000 0.040
#> SRR1433232 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 5 0.2697 0.36416 0.000 0.000 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR1361652 3 0.5259 0.64943 0.000 0.020 0.700 0.040 0.172 0.068
#> SRR1437119 1 0.1267 0.86402 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1478547 3 0.5903 -0.22126 0.000 0.000 0.428 0.000 0.208 0.364
#> SRR1430910 3 0.1219 0.78317 0.000 0.000 0.948 0.004 0.000 0.048
#> SRR1310584 1 0.1267 0.86402 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1500216 1 0.4228 0.51876 0.588 0.000 0.000 0.020 0.392 0.000
#> SRR1486762 3 0.3608 0.72425 0.000 0.000 0.788 0.064 0.000 0.148
#> SRR1480854 4 0.3457 0.64611 0.232 0.000 0.000 0.752 0.016 0.000
#> SRR1489394 4 0.1471 0.78129 0.064 0.000 0.000 0.932 0.004 0.000
#> SRR1418085 4 0.3428 0.55708 0.304 0.000 0.000 0.696 0.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.1471 0.78129 0.064 0.000 0.000 0.932 0.004 0.000
#> SRR1473058 6 0.6151 0.09315 0.000 0.000 0.220 0.092 0.104 0.584
#> SRR1405165 6 0.4218 0.49513 0.000 0.000 0.024 0.000 0.360 0.616
#> SRR1433004 5 0.0000 0.37708 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471477 6 0.5883 0.06670 0.204 0.000 0.000 0.000 0.360 0.436
#> SRR1098567 2 0.3045 0.87494 0.000 0.840 0.000 0.060 0.000 0.100
#> SRR1098712 6 0.5264 0.22022 0.000 0.000 0.112 0.064 0.132 0.692
#> SRR1455038 1 0.3221 0.71020 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1348378 3 0.3434 0.73582 0.000 0.004 0.808 0.048 0.000 0.140
#> SRR1413541 1 0.3823 0.47989 0.564 0.000 0.000 0.000 0.436 0.000
#> SRR1392943 1 0.1267 0.86402 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1475192 3 0.2985 0.75196 0.000 0.000 0.844 0.056 0.000 0.100
#> SRR1432085 2 0.3700 0.83613 0.000 0.780 0.000 0.068 0.000 0.152
#> SRR1452468 5 0.0458 0.37041 0.000 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1347060 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414139 3 0.2058 0.77028 0.000 0.000 0.908 0.036 0.000 0.056
#> SRR1447962 2 0.3736 0.83327 0.000 0.776 0.000 0.068 0.000 0.156
#> SRR1444324 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 4 0.5336 0.52211 0.228 0.000 0.000 0.592 0.180 0.000
#> SRR1413436 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.3050 0.73893 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR1343302 4 0.1471 0.78129 0.064 0.000 0.000 0.932 0.004 0.000
#> SRR1373746 1 0.1267 0.86402 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.6833 0.31481 0.000 0.428 0.188 0.068 0.000 0.316
#> SRR1405331 6 0.4842 0.47423 0.000 0.000 0.076 0.000 0.324 0.600
#> SRR1345609 1 0.1327 0.83617 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1380208 5 0.5178 0.01259 0.000 0.000 0.088 0.000 0.488 0.424
#> SRR1322840 4 0.2277 0.77608 0.076 0.000 0.000 0.892 0.032 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.3729 0.41944 0.000 0.000 0.692 0.000 0.012 0.296
#> SRR1315081 2 0.2629 0.89011 0.000 0.872 0.000 0.060 0.000 0.068
#> SRR1369196 3 0.1890 0.77766 0.000 0.000 0.916 0.024 0.000 0.060
#> SRR1400847 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 5 0.2562 0.37384 0.000 0.000 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR1367920 4 0.6045 0.30942 0.000 0.000 0.004 0.420 0.364 0.212
#> SRR1366648 3 0.0000 0.79781 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.92081 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 5 0.4978 -0.32537 0.000 0.000 0.068 0.000 0.500 0.432
#> SRR1363968 1 0.1267 0.86402 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.86830 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.1267 0.86402 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1386689 4 0.1471 0.78129 0.064 0.000 0.000 0.932 0.004 0.000
#> SRR1395575 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1453811 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1441159 1 0.1387 0.86155 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1403154 4 0.1387 0.78072 0.068 0.000 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR1468722 6 0.3717 0.50257 0.000 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1310275 3 0.6086 -0.33231 0.000 0.000 0.388 0.000 0.284 0.328
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.965 0.939 0.969 0.4733 0.519 0.519
#> 3 3 0.622 0.790 0.880 0.2408 0.898 0.807
#> 4 4 0.696 0.784 0.885 0.2100 0.827 0.609
#> 5 5 0.647 0.539 0.758 0.0792 0.856 0.556
#> 6 6 0.777 0.747 0.866 0.0432 0.883 0.572
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1331708 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1464258 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR661589 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1315165 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1488960 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1417809 2 0.4161 0.92865 0.084 0.916
#> SRR1094457 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1095575 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1315931 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1430066 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1431037 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1395554 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR818002 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1344143 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR1486845 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1362866 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1383907 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1311018 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1429846 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR613550 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1324025 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1318879 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR820755 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1485830 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR599313 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1415398 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1326205 2 0.2778 0.95176 0.048 0.952
#> SRR1421327 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1083311 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1499303 2 0.2948 0.95158 0.052 0.948
#> SRR1079522 2 0.3431 0.94562 0.064 0.936
#> SRR1452935 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR661361 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR655182 1 0.4431 0.88133 0.908 0.092
#> SRR1335140 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR1433555 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR1388354 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1317446 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1413602 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR809853 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR661313 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1499935 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1447303 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1429408 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1433950 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1409854 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1435229 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1414229 1 0.8327 0.62770 0.736 0.264
#> SRR1400974 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.0376 0.97464 0.996 0.004
#> SRR613927 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR813776 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR808196 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1101085 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR614395 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1478251 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1370551 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR665310 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1420109 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1330920 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1419539 2 0.8955 0.60257 0.312 0.688
#> SRR1359447 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1347259 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR613915 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1384395 1 0.9881 0.24177 0.564 0.436
#> SRR821715 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1478228 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR608150 2 0.8661 0.64814 0.288 0.712
#> SRR1096383 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1341480 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1341344 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1326270 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1498838 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1416313 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR808566 2 0.3431 0.94558 0.064 0.936
#> SRR1430270 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1367825 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR613533 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR661267 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1407250 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1420067 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1473632 2 0.8909 0.59553 0.308 0.692
#> SRR812536 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1370850 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1407671 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR1446375 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1465230 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR614119 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR660510 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1445655 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR658953 1 0.7453 0.71577 0.788 0.212
#> SRR2166459 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1070713 2 0.2778 0.95176 0.048 0.952
#> SRR1485312 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1317631 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1488610 1 0.1184 0.96325 0.984 0.016
#> SRR1330588 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1316367 1 0.9661 0.31827 0.608 0.392
#> SRR1433926 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1091302 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR818263 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1404909 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR663076 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1442422 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1465893 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR654862 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1407112 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1332969 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1353199 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1378885 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR665357 2 1.0000 -0.00367 0.496 0.504
#> SRR662186 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1501020 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1347819 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1480813 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1472576 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR1431781 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1452270 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1500472 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1417632 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR1350153 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1458113 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1326579 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1096712 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1090407 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1083752 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR1377599 2 0.5408 0.88763 0.124 0.876
#> SRR1488449 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1318354 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1359062 1 0.0672 0.97070 0.992 0.008
#> SRR1398924 1 0.9833 0.23249 0.576 0.424
#> SRR663783 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1319204 1 0.0938 0.96719 0.988 0.012
#> SRR1369070 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1498595 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR1377423 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1338426 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1353309 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR658941 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1101643 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1324085 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1363858 1 0.8443 0.60650 0.728 0.272
#> SRR819820 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1337342 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR655206 2 0.2778 0.95176 0.048 0.952
#> SRR1387013 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR1317410 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR608198 1 0.8713 0.56727 0.708 0.292
#> SRR1440161 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1415379 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1099622 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR663197 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1394836 2 0.3431 0.94558 0.064 0.936
#> SRR661699 1 0.0376 0.97464 0.996 0.004
#> SRR813680 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1378109 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1499174 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1382851 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1433410 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR661167 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1432518 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR660462 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1374608 1 0.7674 0.69197 0.776 0.224
#> SRR657949 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1308882 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR655768 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1485870 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1444138 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1417342 2 0.6712 0.82414 0.176 0.824
#> SRR1470193 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1091380 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1313583 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1467102 2 0.0376 0.94998 0.004 0.996
#> SRR1485416 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR818821 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR809963 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1353710 2 0.4815 0.90907 0.104 0.896
#> SRR1445259 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1408393 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR1310542 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1333485 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1406437 1 0.0376 0.97464 0.996 0.004
#> SRR1354931 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1391856 1 0.7139 0.73770 0.804 0.196
#> SRR1446738 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1309032 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1388145 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR1432611 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR815869 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR613150 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1375329 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1387921 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR812943 1 0.9710 0.29433 0.600 0.400
#> SRR1400910 2 0.9775 0.36039 0.412 0.588
#> SRR1444203 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR816177 2 0.2778 0.95176 0.048 0.952
#> SRR658754 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1429603 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1397366 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR1337606 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR659109 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1337192 1 0.9552 0.36415 0.624 0.376
#> SRR656946 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1476102 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1342067 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1385389 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1075971 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR614419 1 0.1414 0.95951 0.980 0.020
#> SRR1322936 2 0.9170 0.56102 0.332 0.668
#> SRR1349121 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR612935 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1393596 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1452164 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1070503 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1499894 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1082883 2 0.7815 0.74302 0.232 0.768
#> SRR1468271 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.8763 0.55938 0.704 0.296
#> SRR810295 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1328620 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1396294 2 0.3733 0.93913 0.072 0.928
#> SRR1419917 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR662114 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1489199 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR813584 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR1069638 1 0.9170 0.47704 0.668 0.332
#> SRR614864 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR2167710 1 0.4298 0.88688 0.912 0.088
#> SRR1401252 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1309963 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1338031 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1486889 1 0.0376 0.97464 0.996 0.004
#> SRR1380393 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1356468 2 0.3879 0.93580 0.076 0.924
#> SRR1337010 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1486538 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1340486 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1377696 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR1465459 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1080270 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1312501 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1093148 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1467080 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR816475 2 0.3274 0.94855 0.060 0.940
#> SRR1379198 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR613342 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1369129 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1396616 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR813824 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1082376 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1500891 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR807543 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1091572 2 0.6148 0.85494 0.152 0.848
#> SRR1346689 2 0.1184 0.95159 0.016 0.984
#> SRR1332424 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR663729 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1097013 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR613675 2 0.9635 0.42910 0.388 0.612
#> SRR1485357 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR655816 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1500113 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1437622 2 0.2778 0.95176 0.048 0.952
#> SRR1355172 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1338147 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1413329 1 0.0376 0.97464 0.996 0.004
#> SRR1485931 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1333308 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1452033 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR809018 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR663440 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.1184 0.95159 0.016 0.984
#> SRR808019 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1479133 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR615069 1 0.2603 0.93532 0.956 0.044
#> SRR1456185 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1350069 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR816316 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR664795 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1490721 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR810643 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1085285 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1099072 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.9896 0.20702 0.440 0.560
#> SRR1351347 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1405525 1 0.3114 0.92221 0.944 0.056
#> SRR1370329 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR819610 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR2157314 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR809987 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR613639 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1402285 2 0.4022 0.93229 0.080 0.920
#> SRR1077038 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1405660 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1095455 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1394734 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR1317771 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1365894 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1073581 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1432186 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1473529 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR660764 1 0.0672 0.97070 0.992 0.008
#> SRR820448 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1328845 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1336415 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1379065 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1459190 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1346773 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1347459 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1333395 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1309248 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR809161 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1316320 2 0.0376 0.95103 0.004 0.996
#> SRR1432629 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1498931 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1416578 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1405547 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1470534 2 0.4562 0.91715 0.096 0.904
#> SRR1380764 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1309160 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR663489 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1500450 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1078489 2 0.6531 0.83506 0.168 0.832
#> SRR1332648 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR660614 2 0.4161 0.90238 0.084 0.916
#> SRR1470420 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1464766 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR615946 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1446481 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR660224 2 0.0672 0.95079 0.008 0.992
#> SRR665586 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR661108 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR2170173 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR817329 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1401990 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1467745 2 0.2778 0.95176 0.048 0.952
#> SRR1471795 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR813137 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1419692 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR818797 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR2164608 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1455586 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR819459 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1385501 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1361652 2 0.8608 0.61704 0.284 0.716
#> SRR1437119 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1478547 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1430910 1 0.8267 0.63582 0.740 0.260
#> SRR1310584 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1486762 1 0.8386 0.62050 0.732 0.268
#> SRR1480854 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1489394 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1418085 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1340221 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1473058 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1405165 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1433004 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1098712 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1455038 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1403005 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1413541 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1475192 1 0.9522 0.38321 0.628 0.372
#> SRR1432085 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1452468 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1347060 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1414139 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1447962 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1415004 1 0.9580 0.35268 0.620 0.380
#> SRR1413436 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1343302 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1373746 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1405331 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.8661 0.57647 0.712 0.288
#> SRR1380208 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1322840 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1399797 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1416654 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1315081 1 0.1843 0.95505 0.972 0.028
#> SRR1369196 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1400847 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1365291 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1367920 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1366648 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.95016 0.000 1.000
#> SRR1082173 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1363968 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1386689 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1395575 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1453811 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1403154 2 0.3114 0.95134 0.056 0.944
#> SRR1468722 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
#> SRR1310275 1 0.0000 0.97822 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1331708 1 0.4931 0.68969 0.768 0.232 0.000
#> SRR1464258 3 0.5178 0.79333 0.256 0.000 0.744
#> SRR1454201 3 0.0237 0.87424 0.004 0.000 0.996
#> SRR661589 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456229 3 0.4399 0.82909 0.188 0.000 0.812
#> SRR1315165 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1488960 3 0.0747 0.87343 0.016 0.000 0.984
#> SRR1417809 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1094457 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1095575 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1315931 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1430066 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR818002 2 0.1964 0.85415 0.056 0.944 0.000
#> SRR1344143 2 0.6111 0.25363 0.396 0.604 0.000
#> SRR1486845 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1362866 3 0.4733 0.81361 0.196 0.004 0.800
#> SRR1490740 3 0.5254 0.78795 0.264 0.000 0.736
#> SRR1446627 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416248 3 0.5431 0.77276 0.284 0.000 0.716
#> SRR1383907 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1311018 3 0.5397 0.77615 0.280 0.000 0.720
#> SRR1375699 2 0.1031 0.88292 0.024 0.976 0.000
#> SRR1429846 3 0.0237 0.87474 0.004 0.000 0.996
#> SRR613550 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348402 3 0.3116 0.85292 0.108 0.000 0.892
#> SRR1345146 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1324025 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318879 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR820755 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485830 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR599313 3 0.5465 0.77095 0.288 0.000 0.712
#> SRR612263 3 0.4346 0.83067 0.184 0.000 0.816
#> SRR1415398 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326205 1 0.5431 0.60786 0.716 0.284 0.000
#> SRR1421327 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499303 1 0.5431 0.60786 0.716 0.284 0.000
#> SRR1079522 1 0.5431 0.60786 0.716 0.284 0.000
#> SRR1452935 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379495 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1470459 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR615778 3 0.4887 0.80098 0.228 0.000 0.772
#> SRR1447564 3 0.2711 0.86020 0.088 0.000 0.912
#> SRR1455195 3 0.5327 0.78236 0.272 0.000 0.728
#> SRR655182 3 0.2229 0.85329 0.012 0.044 0.944
#> SRR1335140 1 0.6154 0.38016 0.592 0.408 0.000
#> SRR1433555 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308650 2 0.0424 0.89359 0.008 0.992 0.000
#> SRR1388354 3 0.4121 0.83425 0.168 0.000 0.832
#> SRR1317446 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413602 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1479955 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR809853 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR661313 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499935 1 0.2537 0.85563 0.920 0.080 0.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429408 1 0.2537 0.85557 0.920 0.080 0.000
#> SRR1433950 3 0.5431 0.77713 0.284 0.000 0.716
#> SRR1362081 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409854 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435229 3 0.1015 0.87006 0.012 0.008 0.980
#> SRR1085996 3 0.4750 0.81592 0.216 0.000 0.784
#> SRR1414229 3 0.5346 0.75263 0.040 0.152 0.808
#> SRR1400974 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399971 3 0.5158 0.79383 0.232 0.004 0.764
#> SRR613927 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457854 3 0.3941 0.84136 0.156 0.000 0.844
#> SRR1473714 3 0.4346 0.82392 0.184 0.000 0.816
#> SRR813776 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR808196 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1101085 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR614395 3 0.4702 0.81677 0.212 0.000 0.788
#> SRR1478251 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362310 3 0.5431 0.77276 0.284 0.000 0.716
#> SRR665310 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1420109 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1330920 3 0.3551 0.84430 0.132 0.000 0.868
#> SRR1419539 3 0.8985 0.28587 0.220 0.216 0.564
#> SRR1359447 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347259 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR613915 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384395 3 0.5902 0.49657 0.004 0.316 0.680
#> SRR821715 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478228 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1445637 3 0.2261 0.86254 0.068 0.000 0.932
#> SRR608150 1 0.4914 0.75607 0.844 0.068 0.088
#> SRR1096383 3 0.5327 0.78236 0.272 0.000 0.728
#> SRR1341480 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1341344 3 0.5431 0.77276 0.284 0.000 0.716
#> SRR1326270 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR808566 1 0.3091 0.84834 0.912 0.072 0.016
#> SRR1430270 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR661267 3 0.4605 0.82187 0.204 0.000 0.796
#> SRR810665 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407250 3 0.1964 0.86730 0.056 0.000 0.944
#> SRR1420067 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1473632 2 0.9306 0.19029 0.176 0.488 0.336
#> SRR812536 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1370850 2 0.1860 0.85973 0.052 0.948 0.000
#> SRR1486195 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407671 2 0.6309 -0.11886 0.500 0.500 0.000
#> SRR1446375 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1465230 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR614119 3 0.4002 0.84004 0.160 0.000 0.840
#> SRR1356101 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404209 3 0.4555 0.82385 0.200 0.000 0.800
#> SRR1392676 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR665538 3 0.2448 0.86253 0.076 0.000 0.924
#> SRR660510 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445655 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR658953 3 0.8445 -0.10221 0.424 0.088 0.488
#> SRR2166459 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1070713 2 0.6062 0.28913 0.384 0.616 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317631 1 0.2448 0.85819 0.924 0.076 0.000
#> SRR1488610 3 0.5560 0.76286 0.300 0.000 0.700
#> SRR1330588 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316367 3 0.8345 0.51649 0.288 0.116 0.596
#> SRR1433926 3 0.4399 0.81917 0.188 0.000 0.812
#> SRR1091302 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR818263 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1404909 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR663076 3 0.5397 0.77615 0.280 0.000 0.720
#> SRR1323577 2 0.0237 0.89575 0.004 0.996 0.000
#> SRR1442422 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1465893 3 0.5621 0.75425 0.308 0.000 0.692
#> SRR654862 3 0.4654 0.82006 0.208 0.000 0.792
#> SRR1407112 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1332969 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353199 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1378885 3 0.3116 0.85642 0.108 0.000 0.892
#> SRR665357 3 0.6824 0.25215 0.016 0.408 0.576
#> SRR662186 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480813 2 0.0592 0.89075 0.012 0.988 0.000
#> SRR1472576 1 0.6235 0.30700 0.564 0.436 0.000
#> SRR1431781 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1452270 3 0.0424 0.87358 0.008 0.000 0.992
#> SRR1500472 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1417632 1 0.6095 0.41672 0.608 0.392 0.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326579 3 0.5216 0.78871 0.260 0.000 0.740
#> SRR1349363 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1083752 1 0.6308 0.13517 0.508 0.492 0.000
#> SRR1377599 1 0.4531 0.76698 0.824 0.168 0.008
#> SRR1488449 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1318354 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1359062 3 0.0424 0.87230 0.000 0.008 0.992
#> SRR1398924 3 0.7004 0.27081 0.020 0.428 0.552
#> SRR663783 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1319204 3 0.3120 0.82125 0.012 0.080 0.908
#> SRR1369070 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR615659 3 0.4605 0.82161 0.204 0.000 0.796
#> SRR1337449 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.0237 0.89583 0.004 0.996 0.000
#> SRR1498595 1 0.6307 0.14569 0.512 0.488 0.000
#> SRR1377423 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1312310 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485613 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1338426 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1353309 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR658941 3 0.3267 0.85175 0.116 0.000 0.884
#> SRR1101643 3 0.5431 0.77276 0.284 0.000 0.716
#> SRR1401468 3 0.5465 0.77267 0.288 0.000 0.712
#> SRR1368874 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324085 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1363858 3 0.6796 0.61784 0.344 0.024 0.632
#> SRR819820 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337342 3 0.5327 0.78216 0.272 0.000 0.728
#> SRR655206 2 0.6280 0.03600 0.460 0.540 0.000
#> SRR1387013 2 0.5560 0.49919 0.300 0.700 0.000
#> SRR1317410 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR608198 3 0.6079 0.64052 0.388 0.000 0.612
#> SRR1440161 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415379 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1099622 2 0.0237 0.89583 0.004 0.996 0.000
#> SRR663197 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394836 1 0.6949 0.68787 0.732 0.156 0.112
#> SRR661699 3 0.6954 0.29954 0.352 0.028 0.620
#> SRR813680 3 0.3619 0.84825 0.136 0.000 0.864
#> SRR1410678 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1378109 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1499174 3 0.1964 0.86734 0.056 0.000 0.944
#> SRR1311486 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1382851 1 0.3482 0.81506 0.872 0.128 0.000
#> SRR1433410 3 0.5529 0.76643 0.296 0.000 0.704
#> SRR661167 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432518 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR660462 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1374608 1 0.6777 0.21094 0.616 0.020 0.364
#> SRR657949 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1308882 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR655768 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485870 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1444138 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417342 1 0.2496 0.85901 0.928 0.068 0.004
#> SRR1470193 1 0.4796 0.70879 0.780 0.220 0.000
#> SRR1091380 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099096 3 0.5397 0.77615 0.280 0.000 0.720
#> SRR1313583 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1467102 2 0.0237 0.89583 0.004 0.996 0.000
#> SRR1485416 1 0.2448 0.85819 0.924 0.076 0.000
#> SRR818821 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR809963 3 0.0592 0.87505 0.012 0.000 0.988
#> SRR1072247 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1353710 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1445259 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1408393 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1361522 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1368597 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1309680 2 0.4974 0.61883 0.236 0.764 0.000
#> SRR1310542 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1333485 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1406437 3 0.3272 0.85451 0.104 0.004 0.892
#> SRR1354931 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1391856 3 0.7178 0.30497 0.464 0.024 0.512
#> SRR1446738 1 0.5810 0.53826 0.664 0.336 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.4291 0.70822 0.180 0.820 0.000
#> SRR1432611 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR613150 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375329 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1387921 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1466792 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360695 3 0.4605 0.82161 0.204 0.000 0.796
#> SRR812943 3 0.7400 0.57720 0.072 0.264 0.664
#> SRR1400910 2 0.8149 0.17024 0.072 0.520 0.408
#> SRR1444203 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR816177 1 0.6168 0.37510 0.588 0.412 0.000
#> SRR658754 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429603 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1397366 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446028 3 0.5138 0.79216 0.252 0.000 0.748
#> SRR1083918 2 0.3551 0.77556 0.132 0.868 0.000
#> SRR1337606 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337192 1 0.6274 -0.29318 0.544 0.000 0.456
#> SRR656946 1 0.6215 0.33540 0.572 0.428 0.000
#> SRR1476102 3 0.5058 0.79227 0.244 0.000 0.756
#> SRR1476447 3 0.5529 0.76643 0.296 0.000 0.704
#> SRR1342067 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1385389 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1075971 3 0.5254 0.78795 0.264 0.000 0.736
#> SRR614419 3 0.4409 0.72739 0.172 0.004 0.824
#> SRR1322936 1 0.7394 0.44696 0.652 0.064 0.284
#> SRR1349121 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1430549 3 0.5465 0.77248 0.288 0.000 0.712
#> SRR612935 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR661481 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1393596 1 0.5327 0.62775 0.728 0.272 0.000
#> SRR1452164 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1070503 3 0.0592 0.87484 0.012 0.000 0.988
#> SRR1499894 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082883 1 0.3141 0.84234 0.912 0.068 0.020
#> SRR1468271 3 0.4887 0.80408 0.228 0.000 0.772
#> SRR1332443 3 0.7768 0.54545 0.344 0.064 0.592
#> SRR810295 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR662103 3 0.1031 0.87387 0.024 0.000 0.976
#> SRR1328620 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1396294 1 0.2998 0.84708 0.916 0.068 0.016
#> SRR1419917 3 0.1031 0.87405 0.024 0.000 0.976
#> SRR662114 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489199 3 0.0747 0.87377 0.016 0.000 0.984
#> SRR813584 2 0.6295 -0.01587 0.472 0.528 0.000
#> SRR1069638 3 0.7453 0.65169 0.228 0.092 0.680
#> SRR614864 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433392 3 0.4931 0.80722 0.232 0.000 0.768
#> SRR1377777 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR2167710 3 0.8507 -0.11470 0.424 0.092 0.484
#> SRR1401252 1 0.2356 0.86065 0.928 0.072 0.000
#> SRR1309963 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1338031 3 0.0747 0.87494 0.016 0.000 0.984
#> SRR1418628 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486889 3 0.6026 0.64750 0.376 0.000 0.624
#> SRR1380393 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1319731 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1356468 1 0.2165 0.85901 0.936 0.064 0.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486520 3 0.5397 0.77615 0.280 0.000 0.720
#> SRR1486538 1 0.4750 0.71059 0.784 0.216 0.000
#> SRR1340486 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1377696 2 0.4452 0.69211 0.192 0.808 0.000
#> SRR1465459 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312501 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093148 3 0.0747 0.87477 0.016 0.000 0.984
#> SRR1467080 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR816475 1 0.2356 0.86065 0.928 0.072 0.000
#> SRR1379198 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR613342 3 0.0237 0.87424 0.004 0.000 0.996
#> SRR1452246 2 0.1643 0.86605 0.044 0.956 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369129 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1396616 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR813824 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082376 3 0.5178 0.79325 0.256 0.000 0.744
#> SRR1500891 1 0.5968 0.47562 0.636 0.364 0.000
#> SRR807543 3 0.1529 0.87038 0.040 0.000 0.960
#> SRR1091572 1 0.6470 0.66227 0.760 0.092 0.148
#> SRR1346689 1 0.5905 0.49882 0.648 0.352 0.000
#> SRR1332424 3 0.5397 0.77625 0.280 0.000 0.720
#> SRR663729 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1097013 3 0.3192 0.85476 0.112 0.000 0.888
#> SRR613675 1 0.7847 0.26504 0.588 0.068 0.344
#> SRR1485357 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR655816 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1500113 3 0.4605 0.81356 0.204 0.000 0.796
#> SRR1437622 1 0.5431 0.60786 0.716 0.284 0.000
#> SRR1355172 3 0.3619 0.84821 0.136 0.000 0.864
#> SRR655531 3 0.0747 0.87343 0.016 0.000 0.984
#> SRR1338147 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413329 3 0.0747 0.87152 0.016 0.000 0.984
#> SRR1485931 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420873 3 0.5327 0.78147 0.272 0.000 0.728
#> SRR1333308 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1452033 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1467316 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR663440 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1471755 2 0.6291 -0.00193 0.468 0.532 0.000
#> SRR808019 3 0.5254 0.78795 0.264 0.000 0.736
#> SRR1479133 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR615069 3 0.3769 0.80068 0.016 0.104 0.880
#> SRR1456185 2 0.0237 0.89583 0.004 0.996 0.000
#> SRR1350069 1 0.2356 0.86065 0.928 0.072 0.000
#> SRR816316 3 0.3412 0.85204 0.124 0.000 0.876
#> SRR664795 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1490721 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR810643 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1430333 3 0.0747 0.87343 0.016 0.000 0.984
#> SRR1085285 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099072 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317985 3 0.5254 0.78795 0.264 0.000 0.736
#> SRR1487340 3 0.5178 0.79309 0.256 0.000 0.744
#> SRR1420276 3 0.5158 0.63722 0.004 0.232 0.764
#> SRR1351347 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1405525 3 0.2496 0.86340 0.068 0.004 0.928
#> SRR1370329 3 0.5327 0.78237 0.272 0.000 0.728
#> SRR1465001 3 0.5397 0.77615 0.280 0.000 0.720
#> SRR1476525 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR819610 1 0.5785 0.53799 0.668 0.332 0.000
#> SRR2157314 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1409465 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR809987 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR613639 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402285 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1077038 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1405660 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095455 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1394734 2 0.6215 0.14842 0.428 0.572 0.000
#> SRR1317771 3 0.4062 0.83154 0.164 0.000 0.836
#> SRR1365894 1 0.2356 0.86065 0.928 0.072 0.000
#> SRR1073581 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR659804 3 0.5363 0.78273 0.276 0.000 0.724
#> SRR1345914 2 0.2590 0.83928 0.072 0.924 0.004
#> SRR1432186 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.3116 0.80341 0.108 0.892 0.000
#> SRR660764 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR820448 3 0.1964 0.86898 0.056 0.000 0.944
#> SRR1328845 1 0.2878 0.84303 0.904 0.096 0.000
#> SRR1336415 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1379065 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1459190 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1346773 3 0.5431 0.77713 0.284 0.000 0.716
#> SRR1499521 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1440898 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.0424 0.87230 0.000 0.008 0.992
#> SRR1081209 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400202 3 0.5397 0.77615 0.280 0.000 0.720
#> SRR1333395 1 0.5431 0.60786 0.716 0.284 0.000
#> SRR1309248 1 0.6192 0.35017 0.580 0.420 0.000
#> SRR809161 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1316320 1 0.6154 0.37978 0.592 0.408 0.000
#> SRR1432629 2 0.1031 0.88235 0.024 0.976 0.000
#> SRR1498931 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1416578 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470534 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1380764 3 0.5397 0.77615 0.280 0.000 0.720
#> SRR1309160 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR663489 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1500450 3 0.1163 0.87341 0.028 0.000 0.972
#> SRR1078489 1 0.6295 0.64813 0.764 0.072 0.164
#> SRR1332648 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR660614 2 0.4682 0.62557 0.004 0.804 0.192
#> SRR1470420 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475566 3 0.5431 0.77276 0.284 0.000 0.716
#> SRR1477949 3 0.5098 0.79383 0.248 0.000 0.752
#> SRR1481419 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464766 3 0.4887 0.80175 0.228 0.000 0.772
#> SRR615946 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446481 2 0.0747 0.88846 0.016 0.984 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402962 3 0.2066 0.86602 0.060 0.000 0.940
#> SRR660224 2 0.6688 0.21409 0.408 0.580 0.012
#> SRR665586 3 0.0747 0.87343 0.016 0.000 0.984
#> SRR1347166 3 0.4605 0.81257 0.204 0.000 0.796
#> SRR1485722 3 0.2537 0.86100 0.080 0.000 0.920
#> SRR1415316 3 0.5465 0.77370 0.288 0.000 0.712
#> SRR613390 3 0.1860 0.86846 0.052 0.000 0.948
#> SRR661108 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR2170173 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR817329 3 0.0237 0.87474 0.004 0.000 0.996
#> SRR1401990 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1467745 1 0.6309 0.12456 0.504 0.496 0.000
#> SRR1471795 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR813137 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1314873 3 0.4555 0.81589 0.200 0.000 0.800
#> SRR1401211 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1419692 1 0.4452 0.76591 0.808 0.192 0.000
#> SRR818797 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR2164608 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1455586 2 0.0237 0.89583 0.004 0.996 0.000
#> SRR819459 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361652 2 0.8043 0.33919 0.084 0.592 0.324
#> SRR1437119 3 0.5431 0.77276 0.284 0.000 0.716
#> SRR1478547 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1430910 3 0.3918 0.78581 0.012 0.120 0.868
#> SRR1310584 3 0.5431 0.77276 0.284 0.000 0.716
#> SRR1500216 3 0.5431 0.77276 0.284 0.000 0.716
#> SRR1486762 3 0.4172 0.74823 0.004 0.156 0.840
#> SRR1480854 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1489394 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1418085 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1340221 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1473058 1 0.3482 0.81681 0.872 0.128 0.000
#> SRR1405165 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433004 3 0.0592 0.87449 0.012 0.000 0.988
#> SRR1471477 3 0.4931 0.79920 0.232 0.000 0.768
#> SRR1098567 2 0.2400 0.81944 0.004 0.932 0.064
#> SRR1098712 1 0.5216 0.68078 0.740 0.260 0.000
#> SRR1455038 3 0.4702 0.81798 0.212 0.000 0.788
#> SRR1375248 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348378 2 0.2590 0.80818 0.004 0.924 0.072
#> SRR1413541 3 0.3816 0.84833 0.148 0.000 0.852
#> SRR1392943 3 0.5529 0.76643 0.296 0.000 0.704
#> SRR1475192 3 0.5277 0.72563 0.024 0.180 0.796
#> SRR1432085 2 0.5656 0.47202 0.004 0.712 0.284
#> SRR1452468 3 0.1289 0.87289 0.032 0.000 0.968
#> SRR1347060 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414139 3 0.0592 0.87276 0.012 0.000 0.988
#> SRR1447962 2 0.0237 0.89583 0.004 0.996 0.000
#> SRR1444324 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.6672 -0.33045 0.520 0.008 0.472
#> SRR1413436 3 0.5397 0.77781 0.280 0.000 0.720
#> SRR1311266 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1343302 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1373746 3 0.5431 0.77276 0.284 0.000 0.716
#> SRR1429678 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1469413 2 0.0892 0.88570 0.020 0.980 0.000
#> SRR1405331 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345609 1 0.6537 0.60993 0.740 0.064 0.196
#> SRR1380208 1 0.5431 0.60786 0.716 0.284 0.000
#> SRR1322840 1 0.2356 0.86065 0.928 0.072 0.000
#> SRR1399797 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315081 3 0.3038 0.80688 0.000 0.104 0.896
#> SRR1369196 3 0.0424 0.87229 0.000 0.008 0.992
#> SRR1400847 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR1365291 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367920 1 0.2537 0.85552 0.920 0.080 0.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.89767 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363968 3 0.5363 0.77931 0.276 0.000 0.724
#> SRR814387 3 0.5397 0.77615 0.280 0.000 0.720
#> SRR657599 3 0.0424 0.87505 0.008 0.000 0.992
#> SRR1386689 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453811 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441159 3 0.5529 0.76643 0.296 0.000 0.704
#> SRR1403154 1 0.2261 0.86258 0.932 0.068 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310275 3 0.0000 0.87470 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 1 0.2704 0.89786 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1331708 4 0.0779 0.90234 0.016 0.004 0.000 0.980
#> SRR1464258 1 0.2704 0.89786 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1454201 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661589 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456229 3 0.4164 0.59724 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR1315165 4 0.1151 0.90393 0.024 0.008 0.000 0.968
#> SRR1488960 3 0.5427 0.17696 0.416 0.000 0.568 0.016
#> SRR1417809 4 0.0895 0.90447 0.020 0.004 0.000 0.976
#> SRR1094457 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1095575 3 0.4804 0.54571 0.276 0.000 0.708 0.016
#> SRR1315931 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1430066 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818002 2 0.0524 0.93019 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1344143 2 0.5018 0.46693 0.012 0.656 0.000 0.332
#> SRR1486845 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1362866 3 0.5440 0.28148 0.384 0.000 0.596 0.020
#> SRR1490740 1 0.3074 0.88006 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1383907 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1311018 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1375699 2 0.1042 0.92234 0.008 0.972 0.000 0.020
#> SRR1429846 3 0.3907 0.65452 0.232 0.000 0.768 0.000
#> SRR613550 3 0.0921 0.85030 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1348402 1 0.4621 0.72643 0.708 0.000 0.284 0.008
#> SRR1345146 3 0.4898 0.56105 0.264 0.004 0.716 0.016
#> SRR1324025 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318879 3 0.4399 0.63411 0.224 0.000 0.760 0.016
#> SRR820755 3 0.1940 0.82103 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1485830 4 0.0592 0.90617 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR599313 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR612263 1 0.2647 0.89996 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1415398 3 0.0188 0.85962 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1326205 4 0.0592 0.90364 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1421327 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1083311 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499303 4 0.0779 0.90234 0.016 0.004 0.000 0.980
#> SRR1079522 4 0.2658 0.85678 0.080 0.012 0.004 0.904
#> SRR1452935 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379495 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615778 1 0.5003 0.68270 0.676 0.000 0.308 0.016
#> SRR1447564 3 0.5586 0.02040 0.452 0.000 0.528 0.020
#> SRR1455195 1 0.4008 0.78657 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR655182 3 0.5243 0.54444 0.276 0.012 0.696 0.016
#> SRR1335140 4 0.2335 0.86339 0.020 0.060 0.000 0.920
#> SRR1433555 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308650 2 0.1182 0.92061 0.016 0.968 0.000 0.016
#> SRR1388354 1 0.4642 0.78115 0.740 0.000 0.240 0.020
#> SRR1317446 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1413602 3 0.0188 0.85912 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1479955 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809853 3 0.1867 0.81846 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR661313 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499935 4 0.0592 0.90612 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1447303 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429408 4 0.1042 0.90468 0.020 0.008 0.000 0.972
#> SRR1433950 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 3 0.0592 0.85637 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1435229 3 0.4707 0.61908 0.236 0.008 0.744 0.012
#> SRR1085996 3 0.4898 0.20063 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR1414229 3 0.6117 0.59898 0.072 0.224 0.688 0.016
#> SRR1400974 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.4636 0.84795 0.792 0.000 0.140 0.068
#> SRR613927 3 0.0376 0.85939 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1457854 1 0.4564 0.65202 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1473714 1 0.5607 0.16361 0.492 0.000 0.488 0.020
#> SRR813776 3 0.0817 0.85364 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR808196 4 0.0592 0.90560 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1101085 4 0.0336 0.90727 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR614395 1 0.4072 0.78016 0.748 0.000 0.252 0.000
#> SRR1478251 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1370551 2 0.0188 0.93203 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR665310 3 0.1488 0.84264 0.032 0.000 0.956 0.012
#> SRR1420109 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1330920 1 0.5151 0.28306 0.532 0.000 0.464 0.004
#> SRR1419539 3 0.9275 0.02885 0.116 0.328 0.384 0.172
#> SRR1359447 2 0.0188 0.93214 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1347259 4 0.0336 0.90732 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR613915 3 0.0779 0.85631 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR1384395 3 0.5448 0.58095 0.024 0.276 0.688 0.012
#> SRR821715 3 0.0336 0.85853 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1478228 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1445637 3 0.4898 0.20153 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR608150 4 0.4978 0.62996 0.256 0.008 0.016 0.720
#> SRR1096383 1 0.2647 0.89999 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1341480 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1341344 1 0.2714 0.90199 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1326270 3 0.0817 0.85164 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808566 4 0.4482 0.64700 0.264 0.008 0.000 0.728
#> SRR1430270 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1367825 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661267 3 0.4250 0.57882 0.276 0.000 0.724 0.000
#> SRR810665 2 0.0469 0.93008 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1407250 3 0.3837 0.65855 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR1420067 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1473632 2 0.8202 0.21937 0.016 0.424 0.320 0.240
#> SRR812536 3 0.2861 0.78754 0.096 0.000 0.888 0.016
#> SRR1370850 2 0.0672 0.92881 0.008 0.984 0.000 0.008
#> SRR1486195 2 0.0336 0.93098 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1407671 4 0.5558 0.21292 0.020 0.432 0.000 0.548
#> SRR1446375 3 0.0779 0.85486 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR1465230 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR614119 1 0.4522 0.67693 0.680 0.000 0.320 0.000
#> SRR1356101 2 0.0336 0.93098 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1404209 1 0.2704 0.89786 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.5288 0.20979 0.520 0.000 0.472 0.008
#> SRR660510 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1445655 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR658953 3 0.6282 0.45643 0.368 0.004 0.572 0.056
#> SRR2166459 3 0.2255 0.82302 0.068 0.000 0.920 0.012
#> SRR1070713 2 0.5130 0.50017 0.020 0.668 0.000 0.312
#> SRR1485312 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.0469 0.90766 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1488610 1 0.3160 0.89016 0.872 0.000 0.108 0.020
#> SRR1330588 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316367 3 0.7911 0.22924 0.304 0.040 0.524 0.132
#> SRR1433926 1 0.4564 0.65326 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1091302 4 0.0592 0.90560 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR818263 1 0.2704 0.89786 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1404909 4 0.0469 0.90684 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR663076 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1323577 2 0.0188 0.93203 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1442422 4 0.0469 0.90664 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1465893 1 0.3219 0.89228 0.868 0.000 0.112 0.020
#> SRR654862 1 0.4431 0.70045 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR1407112 4 0.0592 0.90560 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1332969 3 0.0592 0.85537 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1353199 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378885 3 0.1792 0.82793 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR665357 3 0.4067 0.76368 0.060 0.080 0.848 0.012
#> SRR662186 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347819 3 0.0188 0.85962 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1480813 2 0.1059 0.92215 0.012 0.972 0.000 0.016
#> SRR1472576 4 0.3278 0.80906 0.020 0.116 0.000 0.864
#> SRR1431781 4 0.0592 0.90560 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1452270 3 0.1970 0.82110 0.060 0.000 0.932 0.008
#> SRR1500472 3 0.0524 0.85745 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1417632 4 0.1042 0.89968 0.020 0.008 0.000 0.972
#> SRR1350153 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1326579 1 0.3105 0.89439 0.868 0.000 0.120 0.012
#> SRR1349363 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096712 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083752 4 0.5607 0.04028 0.020 0.484 0.000 0.496
#> SRR1377599 4 0.0927 0.90156 0.016 0.000 0.008 0.976
#> SRR1488449 3 0.0336 0.85864 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1318354 3 0.0188 0.85912 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1359062 3 0.0336 0.85853 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1398924 3 0.5718 0.46549 0.012 0.344 0.624 0.020
#> SRR663783 3 0.0188 0.85912 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1319204 3 0.1059 0.85103 0.012 0.000 0.972 0.016
#> SRR1369070 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.4564 0.64935 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.1059 0.92282 0.016 0.972 0.000 0.012
#> SRR1498595 4 0.3428 0.78537 0.012 0.144 0.000 0.844
#> SRR1377423 3 0.0188 0.85912 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1338426 3 0.0657 0.85664 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR1353309 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658941 3 0.5711 0.45817 0.304 0.028 0.656 0.012
#> SRR1101643 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1401468 1 0.2714 0.90166 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1368874 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.0592 0.90560 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1363858 1 0.6410 0.70672 0.672 0.008 0.136 0.184
#> SRR819820 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337342 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR655206 2 0.5774 -0.01454 0.020 0.492 0.004 0.484
#> SRR1387013 2 0.5594 0.07389 0.020 0.520 0.000 0.460
#> SRR1317410 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR608198 1 0.6116 0.67718 0.668 0.000 0.112 0.220
#> SRR1440161 2 0.0469 0.93008 0.012 0.988 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1099622 2 0.0937 0.92466 0.012 0.976 0.000 0.012
#> SRR663197 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394836 4 0.8088 0.48351 0.252 0.128 0.068 0.552
#> SRR661699 3 0.5746 0.51310 0.348 0.000 0.612 0.040
#> SRR813680 3 0.4164 0.60365 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR1410678 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1378109 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1499174 3 0.4916 0.16745 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 4 0.1109 0.90213 0.028 0.004 0.000 0.968
#> SRR1433410 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR661167 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432518 3 0.0188 0.85912 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR660462 3 0.1854 0.83074 0.048 0.000 0.940 0.012
#> SRR1374608 4 0.5600 0.10352 0.468 0.000 0.020 0.512
#> SRR657949 3 0.2450 0.81798 0.072 0.000 0.912 0.016
#> SRR1308882 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR655768 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485870 4 0.0469 0.90684 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1444138 3 0.0524 0.85825 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR1417342 4 0.0967 0.90487 0.016 0.004 0.004 0.976
#> SRR1470193 4 0.0927 0.90081 0.016 0.008 0.000 0.976
#> SRR1091380 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099096 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1313583 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1467102 2 0.0804 0.92704 0.012 0.980 0.000 0.008
#> SRR1485416 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR818821 3 0.0188 0.85912 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR809963 3 0.5292 0.05025 0.480 0.000 0.512 0.008
#> SRR1072247 1 0.3325 0.88955 0.864 0.000 0.112 0.024
#> SRR1353710 4 0.0707 0.90413 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1445259 3 0.0188 0.85912 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1408393 3 0.1488 0.84222 0.032 0.000 0.956 0.012
#> SRR1361522 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1368597 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1309680 2 0.2174 0.89097 0.020 0.928 0.000 0.052
#> SRR1310542 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1333485 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1406437 3 0.5386 0.32753 0.368 0.000 0.612 0.020
#> SRR1354931 3 0.1356 0.84630 0.032 0.000 0.960 0.008
#> SRR1391856 1 0.7495 0.32846 0.468 0.000 0.192 0.340
#> SRR1446738 4 0.5511 0.47052 0.032 0.332 0.000 0.636
#> SRR1309032 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.2413 0.87788 0.020 0.916 0.000 0.064
#> SRR1432611 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.1042 0.85049 0.020 0.000 0.972 0.008
#> SRR613150 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375329 3 0.0657 0.85655 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR1387921 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.4843 0.48912 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR812943 3 0.6165 0.48788 0.284 0.040 0.652 0.024
#> SRR1400910 3 0.5906 0.18648 0.012 0.456 0.516 0.016
#> SRR1444203 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR816177 4 0.5526 0.26891 0.020 0.416 0.000 0.564
#> SRR658754 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429603 4 0.0336 0.90732 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1397366 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.4502 0.79213 0.748 0.000 0.236 0.016
#> SRR1083918 2 0.2002 0.89614 0.020 0.936 0.000 0.044
#> SRR1337606 4 0.1004 0.90513 0.024 0.004 0.000 0.972
#> SRR659109 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337192 4 0.5970 0.50876 0.244 0.000 0.088 0.668
#> SRR656946 4 0.5543 0.24584 0.020 0.424 0.000 0.556
#> SRR1476102 1 0.2988 0.89709 0.876 0.000 0.112 0.012
#> SRR1476447 1 0.2714 0.90166 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1342067 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1385389 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1075971 1 0.4955 0.35362 0.556 0.000 0.444 0.000
#> SRR614419 1 0.7354 0.01583 0.452 0.000 0.388 0.160
#> SRR1322936 4 0.6217 0.57926 0.160 0.008 0.140 0.692
#> SRR1349121 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1430549 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR612935 3 0.1975 0.83007 0.048 0.000 0.936 0.016
#> SRR661481 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.0592 0.90349 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1452164 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1070503 3 0.3074 0.75444 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1499894 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082883 4 0.3257 0.79371 0.152 0.004 0.000 0.844
#> SRR1468271 1 0.3074 0.88175 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1332443 4 0.4231 0.74647 0.080 0.000 0.096 0.824
#> SRR810295 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.5366 0.34475 0.548 0.000 0.440 0.012
#> SRR1328620 3 0.0188 0.85912 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1396294 4 0.4074 0.74755 0.196 0.008 0.004 0.792
#> SRR1419917 3 0.4948 0.13105 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR662114 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489199 3 0.1867 0.82445 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR813584 2 0.5594 0.08154 0.020 0.520 0.000 0.460
#> SRR1069638 3 0.8226 0.36259 0.184 0.212 0.544 0.060
#> SRR614864 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.4661 0.62139 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2167710 3 0.6143 0.47115 0.368 0.004 0.580 0.048
#> SRR1401252 4 0.0592 0.90617 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1309963 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1338031 3 0.3074 0.74861 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.6316 0.48090 0.596 0.000 0.080 0.324
#> SRR1380393 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1319731 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1356468 4 0.0707 0.90585 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1337010 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1486538 4 0.0592 0.90349 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1340486 4 0.0469 0.90664 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1377696 2 0.4936 0.38261 0.004 0.624 0.000 0.372
#> SRR1465459 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080270 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1312501 3 0.0188 0.85959 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1093148 3 0.5047 0.45820 0.316 0.000 0.668 0.016
#> SRR1467080 3 0.1489 0.83395 0.044 0.000 0.952 0.004
#> SRR1410866 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.2530 0.84323 0.100 0.004 0.000 0.896
#> SRR1379198 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR613342 3 0.0188 0.85912 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1452246 2 0.1624 0.91059 0.020 0.952 0.000 0.028
#> SRR1338836 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1396616 3 0.1209 0.84704 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR813824 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082376 3 0.2149 0.81526 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1500891 4 0.1042 0.89924 0.020 0.008 0.000 0.972
#> SRR807543 3 0.1940 0.82183 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1091572 4 0.5009 0.75264 0.168 0.036 0.020 0.776
#> SRR1346689 4 0.0895 0.90102 0.020 0.004 0.000 0.976
#> SRR1332424 1 0.2714 0.90166 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR663729 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1097013 3 0.3975 0.63762 0.240 0.000 0.760 0.000
#> SRR613675 4 0.6597 0.52418 0.156 0.012 0.168 0.664
#> SRR1485357 4 0.0592 0.90560 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR655816 3 0.2924 0.78373 0.100 0.000 0.884 0.016
#> SRR1500113 1 0.4088 0.80243 0.764 0.000 0.232 0.004
#> SRR1437622 4 0.1042 0.89924 0.020 0.008 0.000 0.972
#> SRR1355172 3 0.3266 0.73611 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR655531 3 0.5564 0.31651 0.436 0.000 0.544 0.020
#> SRR1338147 3 0.0707 0.85425 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1413329 3 0.5386 0.40460 0.368 0.000 0.612 0.020
#> SRR1485931 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.2888 0.89802 0.872 0.000 0.124 0.004
#> SRR1333308 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1452033 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.0188 0.85962 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1471755 4 0.5746 0.31641 0.032 0.396 0.000 0.572
#> SRR808019 1 0.3444 0.85368 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR1479133 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615069 3 0.1871 0.84200 0.024 0.012 0.948 0.016
#> SRR1456185 2 0.0779 0.92715 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR1350069 4 0.0592 0.90612 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR816316 3 0.3123 0.74858 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR664795 3 0.3836 0.75723 0.168 0.000 0.816 0.016
#> SRR1490721 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR810643 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1430333 3 0.5355 0.36953 0.360 0.000 0.620 0.020
#> SRR1085285 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099072 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.3801 0.81533 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1487340 1 0.3219 0.87012 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1420276 3 0.3402 0.78812 0.032 0.076 0.880 0.012
#> SRR1351347 3 0.1256 0.84856 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1405525 3 0.5756 0.37153 0.348 0.004 0.616 0.032
#> SRR1370329 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1465001 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819610 4 0.5339 0.42372 0.020 0.356 0.000 0.624
#> SRR2157314 3 0.5339 0.52534 0.356 0.000 0.624 0.020
#> SRR1409465 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809987 4 0.0707 0.90591 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR613639 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402285 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1077038 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1405660 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095455 3 0.0188 0.85912 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1394734 2 0.5465 0.30239 0.020 0.588 0.000 0.392
#> SRR1317771 1 0.4999 0.61723 0.660 0.000 0.328 0.012
#> SRR1365894 4 0.1022 0.90254 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1073581 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR659804 1 0.2704 0.89786 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1345914 2 0.1958 0.90606 0.028 0.944 0.020 0.008
#> SRR1432186 2 0.0188 0.93214 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.0937 0.92518 0.012 0.976 0.000 0.012
#> SRR660764 3 0.2142 0.82336 0.056 0.000 0.928 0.016
#> SRR820448 3 0.4955 0.09089 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR1328845 4 0.0895 0.90458 0.020 0.004 0.000 0.976
#> SRR1336415 4 0.0592 0.90560 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1379065 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1459190 3 0.0657 0.85588 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR1346773 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1499521 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1440898 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081209 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1333395 4 0.0927 0.90081 0.016 0.008 0.000 0.976
#> SRR1309248 4 0.2489 0.85634 0.020 0.068 0.000 0.912
#> SRR809161 3 0.2329 0.81124 0.072 0.000 0.916 0.012
#> SRR1316320 4 0.1297 0.89548 0.020 0.016 0.000 0.964
#> SRR1432629 2 0.0672 0.92891 0.008 0.984 0.000 0.008
#> SRR1498931 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1416578 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1405547 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470534 4 0.0672 0.90527 0.008 0.000 0.008 0.984
#> SRR1380764 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1309160 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663489 3 0.2542 0.80032 0.084 0.000 0.904 0.012
#> SRR1500450 3 0.5493 0.00599 0.456 0.000 0.528 0.016
#> SRR1078489 4 0.6326 0.54664 0.280 0.036 0.036 0.648
#> SRR1332648 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR660614 2 0.4194 0.72503 0.028 0.800 0.172 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1477949 1 0.3324 0.88847 0.852 0.000 0.136 0.012
#> SRR1481419 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.4008 0.78859 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR615946 3 0.0336 0.85853 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1446481 2 0.1059 0.92338 0.016 0.972 0.000 0.012
#> SRR1467656 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 3 0.4072 0.61786 0.252 0.000 0.748 0.000
#> SRR660224 3 0.8053 0.24219 0.108 0.340 0.496 0.056
#> SRR665586 3 0.5173 0.50406 0.320 0.000 0.660 0.020
#> SRR1347166 3 0.5493 -0.01153 0.456 0.000 0.528 0.016
#> SRR1485722 3 0.3975 0.63266 0.240 0.000 0.760 0.000
#> SRR1415316 1 0.2714 0.90156 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR613390 3 0.3123 0.74830 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2170173 3 0.3037 0.78233 0.100 0.000 0.880 0.020
#> SRR817329 3 0.4967 0.05952 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR1401990 4 0.0592 0.90560 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1467745 4 0.5950 0.24744 0.040 0.416 0.000 0.544
#> SRR1471795 2 0.0188 0.93214 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813137 3 0.0779 0.85626 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR1314873 1 0.6334 0.07295 0.484 0.000 0.456 0.060
#> SRR1401211 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1419692 4 0.2224 0.88177 0.040 0.032 0.000 0.928
#> SRR818797 3 0.1474 0.83740 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR2164608 3 0.2924 0.78373 0.100 0.000 0.884 0.016
#> SRR1455586 2 0.0937 0.92466 0.012 0.976 0.000 0.012
#> SRR819459 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361652 2 0.6964 0.06317 0.052 0.496 0.424 0.028
#> SRR1437119 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1430910 3 0.1648 0.84406 0.012 0.016 0.956 0.016
#> SRR1310584 1 0.2988 0.89724 0.876 0.000 0.112 0.012
#> SRR1500216 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1486762 3 0.3779 0.74931 0.012 0.136 0.840 0.012
#> SRR1480854 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1489394 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1418085 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1340221 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1473058 4 0.2483 0.87027 0.032 0.052 0.000 0.916
#> SRR1405165 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433004 3 0.1557 0.83584 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1471477 1 0.2831 0.89892 0.876 0.000 0.120 0.004
#> SRR1098567 2 0.2400 0.88350 0.028 0.924 0.044 0.004
#> SRR1098712 4 0.5578 0.50444 0.040 0.312 0.000 0.648
#> SRR1455038 3 0.4500 0.49126 0.316 0.000 0.684 0.000
#> SRR1375248 2 0.0336 0.93098 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1348378 2 0.1762 0.91056 0.020 0.952 0.016 0.012
#> SRR1413541 1 0.3610 0.83810 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1392943 1 0.3616 0.88176 0.852 0.000 0.112 0.036
#> SRR1475192 3 0.5925 0.48810 0.028 0.324 0.632 0.016
#> SRR1432085 2 0.5080 0.65304 0.028 0.744 0.216 0.012
#> SRR1452468 3 0.5339 0.27225 0.384 0.000 0.600 0.016
#> SRR1347060 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414139 3 0.1677 0.83654 0.040 0.000 0.948 0.012
#> SRR1447962 2 0.0779 0.92715 0.016 0.980 0.000 0.004
#> SRR1444324 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 4 0.6751 0.09142 0.396 0.000 0.096 0.508
#> SRR1413436 1 0.2859 0.89952 0.880 0.000 0.112 0.008
#> SRR1311266 1 0.2814 0.89426 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1343302 4 0.0592 0.90560 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1373746 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1429678 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1469413 2 0.1182 0.92061 0.016 0.968 0.000 0.016
#> SRR1405331 3 0.1109 0.84943 0.028 0.000 0.968 0.004
#> SRR1345609 4 0.3813 0.77552 0.148 0.000 0.024 0.828
#> SRR1380208 4 0.3325 0.82610 0.112 0.024 0.000 0.864
#> SRR1322840 4 0.0188 0.90751 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1399797 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315081 3 0.1771 0.83796 0.036 0.004 0.948 0.012
#> SRR1369196 3 0.0336 0.85853 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1400847 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1365291 3 0.1389 0.83977 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1367920 4 0.0469 0.90439 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1366648 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.93296 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.0921 0.84952 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1363968 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR814387 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR657599 3 0.4933 0.14064 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR1386689 4 0.0592 0.90560 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1395575 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453811 3 0.1118 0.84634 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1441159 1 0.2530 0.90324 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1403154 4 0.0469 0.90664 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1468722 3 0.0000 0.86045 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310275 3 0.1118 0.84577 0.036 0.000 0.964 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331708 4 0.0671 0.35007 0.000 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR1464258 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454201 3 0.1670 0.81768 0.012 0.000 0.936 0.000 0.052
#> SRR661589 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1456229 1 0.4537 0.28564 0.592 0.000 0.396 0.000 0.012
#> SRR1315165 4 0.1278 0.34943 0.016 0.004 0.000 0.960 0.020
#> SRR1488960 1 0.3169 0.81710 0.868 0.000 0.084 0.024 0.024
#> SRR1417809 4 0.1571 0.30869 0.004 0.000 0.000 0.936 0.060
#> SRR1094457 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1095575 3 0.7786 0.34684 0.284 0.000 0.444 0.168 0.104
#> SRR1315931 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430066 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1431037 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1395554 3 0.0807 0.82616 0.012 0.000 0.976 0.000 0.012
#> SRR818002 2 0.4791 0.37561 0.000 0.524 0.012 0.460 0.004
#> SRR1344143 4 0.4985 -0.06716 0.000 0.392 0.012 0.580 0.016
#> SRR1486845 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1362866 1 0.5883 0.44267 0.596 0.000 0.096 0.296 0.012
#> SRR1490740 1 0.1430 0.85281 0.944 0.000 0.052 0.000 0.004
#> SRR1446627 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0290 0.84582 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1416248 1 0.0162 0.87151 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1383907 4 0.4278 -0.52339 0.000 0.000 0.000 0.548 0.452
#> SRR1311018 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1375699 2 0.4769 0.41089 0.000 0.544 0.012 0.440 0.004
#> SRR1429846 1 0.3109 0.70799 0.800 0.000 0.200 0.000 0.000
#> SRR613550 3 0.4666 0.57927 0.284 0.000 0.676 0.000 0.040
#> SRR1348402 1 0.0613 0.87029 0.984 0.000 0.008 0.004 0.004
#> SRR1345146 3 0.8452 0.18390 0.228 0.000 0.324 0.276 0.172
#> SRR1324025 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1318879 3 0.8396 0.24223 0.204 0.000 0.340 0.284 0.172
#> SRR820755 3 0.5933 0.13260 0.444 0.000 0.452 0.000 0.104
#> SRR1485830 4 0.4307 -0.60231 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR599313 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612263 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415398 3 0.3511 0.77160 0.012 0.000 0.800 0.004 0.184
#> SRR1326205 4 0.0880 0.33703 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1421327 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1083311 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1499303 4 0.0794 0.34020 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1079522 4 0.0693 0.35942 0.000 0.012 0.000 0.980 0.008
#> SRR1452935 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1379495 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR615778 1 0.0932 0.86755 0.972 0.000 0.020 0.004 0.004
#> SRR1447564 1 0.4684 0.74247 0.780 0.000 0.076 0.104 0.040
#> SRR1455195 1 0.1831 0.83852 0.920 0.000 0.076 0.000 0.004
#> SRR655182 3 0.8354 0.23516 0.204 0.008 0.376 0.292 0.120
#> SRR1335140 4 0.1668 0.36277 0.000 0.032 0.000 0.940 0.028
#> SRR1433555 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1308650 2 0.5008 0.33945 0.000 0.500 0.012 0.476 0.012
#> SRR1388354 1 0.0613 0.87016 0.984 0.000 0.008 0.004 0.004
#> SRR1317446 3 0.0727 0.82671 0.012 0.000 0.980 0.004 0.004
#> SRR1413602 3 0.0912 0.82630 0.012 0.000 0.972 0.000 0.016
#> SRR1479955 2 0.0290 0.84582 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR809853 3 0.4457 0.74523 0.124 0.000 0.760 0.000 0.116
#> SRR661313 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1499935 4 0.4126 -0.37958 0.000 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1447303 3 0.1012 0.82484 0.012 0.000 0.968 0.000 0.020
#> SRR1429408 4 0.1205 0.32797 0.000 0.004 0.000 0.956 0.040
#> SRR1433950 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 3 0.4425 0.63554 0.244 0.000 0.716 0.000 0.040
#> SRR1435229 3 0.6408 0.63021 0.056 0.016 0.652 0.192 0.084
#> SRR1085996 1 0.3885 0.59538 0.724 0.000 0.268 0.000 0.008
#> SRR1414229 4 0.7879 -0.17186 0.020 0.160 0.380 0.384 0.056
#> SRR1400974 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1399971 1 0.2054 0.82616 0.916 0.000 0.004 0.072 0.008
#> SRR613927 3 0.5237 0.68916 0.160 0.000 0.684 0.000 0.156
#> SRR1457854 1 0.2286 0.81432 0.888 0.000 0.108 0.000 0.004
#> SRR1473714 1 0.4480 0.73719 0.772 0.000 0.128 0.092 0.008
#> SRR813776 3 0.6107 0.31954 0.372 0.000 0.496 0.000 0.132
#> SRR808196 4 0.4307 -0.61107 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1101085 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR614395 1 0.1710 0.85652 0.944 0.000 0.020 0.024 0.012
#> SRR1478251 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1370551 2 0.0162 0.84647 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1362310 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665310 3 0.6177 0.62711 0.012 0.000 0.600 0.176 0.212
#> SRR1420109 3 0.0912 0.82626 0.016 0.000 0.972 0.000 0.012
#> SRR1330920 1 0.2077 0.83318 0.908 0.000 0.084 0.008 0.000
#> SRR1419539 4 0.6353 -0.10323 0.000 0.372 0.060 0.520 0.048
#> SRR1359447 2 0.0579 0.84449 0.000 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1347259 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR613915 3 0.7167 0.41768 0.300 0.000 0.488 0.048 0.164
#> SRR1384395 4 0.7704 -0.02088 0.000 0.192 0.340 0.396 0.072
#> SRR821715 3 0.3742 0.76929 0.012 0.000 0.792 0.012 0.184
#> SRR1478228 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.3612 0.60143 0.732 0.000 0.268 0.000 0.000
#> SRR608150 4 0.3940 0.30685 0.220 0.000 0.000 0.756 0.024
#> SRR1096383 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341480 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1341344 1 0.0451 0.86892 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1326270 3 0.2280 0.77867 0.120 0.000 0.880 0.000 0.000
#> SRR1498838 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1416313 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR808566 4 0.3145 0.34610 0.136 0.008 0.000 0.844 0.012
#> SRR1430270 4 0.4307 -0.61107 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1367825 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR613533 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR661267 1 0.4477 0.58844 0.708 0.000 0.252 0.000 0.040
#> SRR810665 2 0.0727 0.84240 0.000 0.980 0.012 0.004 0.004
#> SRR1407250 1 0.4249 0.19407 0.568 0.000 0.432 0.000 0.000
#> SRR1420067 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 4 0.7638 -0.05422 0.036 0.328 0.100 0.480 0.056
#> SRR812536 5 0.6980 -0.29343 0.020 0.000 0.324 0.200 0.456
#> SRR1370850 2 0.3719 0.69774 0.000 0.776 0.012 0.208 0.004
#> SRR1486195 2 0.0324 0.84649 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1407671 4 0.4772 0.12818 0.000 0.320 0.004 0.648 0.028
#> SRR1446375 3 0.5631 0.66316 0.016 0.000 0.672 0.188 0.124
#> SRR1465230 4 0.4307 -0.61107 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR614119 1 0.2127 0.81647 0.892 0.000 0.108 0.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0451 0.84529 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1404209 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR665538 1 0.1948 0.85658 0.932 0.000 0.036 0.008 0.024
#> SRR660510 3 0.0566 0.82637 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1445655 4 0.4307 -0.60222 0.000 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR658953 4 0.5257 0.23133 0.012 0.000 0.024 0.484 0.480
#> SRR2166459 3 0.7284 0.43800 0.032 0.000 0.444 0.256 0.268
#> SRR1070713 4 0.4735 -0.00691 0.000 0.372 0.012 0.608 0.008
#> SRR1485312 3 0.1197 0.81913 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1317631 4 0.3730 -0.15981 0.000 0.000 0.000 0.712 0.288
#> SRR1488610 1 0.0880 0.85720 0.968 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1330588 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1316367 4 0.8064 0.17841 0.236 0.052 0.224 0.456 0.032
#> SRR1433926 1 0.2074 0.81883 0.896 0.000 0.104 0.000 0.000
#> SRR1091302 4 0.4307 -0.61107 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR818263 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404909 4 0.4306 -0.59395 0.000 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR663076 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.1430 0.82064 0.000 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR1442422 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1465893 1 0.1197 0.84466 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR654862 1 0.2424 0.79274 0.868 0.000 0.132 0.000 0.000
#> SRR1407112 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1332969 3 0.1410 0.81464 0.060 0.000 0.940 0.000 0.000
#> SRR1353199 3 0.0404 0.82624 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1378885 3 0.5143 0.39911 0.368 0.000 0.584 0.000 0.048
#> SRR665357 4 0.7833 -0.07466 0.000 0.184 0.352 0.376 0.088
#> SRR662186 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1347819 3 0.2140 0.81595 0.012 0.000 0.924 0.024 0.040
#> SRR1480813 2 0.3583 0.71528 0.000 0.792 0.012 0.192 0.004
#> SRR1472576 4 0.2748 0.38182 0.000 0.096 0.008 0.880 0.016
#> SRR1431781 4 0.4278 -0.51909 0.000 0.000 0.000 0.548 0.452
#> SRR1452270 3 0.6360 0.58250 0.016 0.000 0.564 0.144 0.276
#> SRR1500472 3 0.3916 0.77565 0.012 0.000 0.820 0.072 0.096
#> SRR1417632 4 0.1026 0.34898 0.000 0.004 0.004 0.968 0.024
#> SRR1350153 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.0693 0.82555 0.012 0.000 0.980 0.000 0.008
#> SRR1326579 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.0794 0.83462 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1096712 3 0.0693 0.82640 0.012 0.000 0.980 0.000 0.008
#> SRR1090407 3 0.0693 0.82610 0.012 0.000 0.980 0.000 0.008
#> SRR1083752 4 0.4523 0.07982 0.000 0.344 0.012 0.640 0.004
#> SRR1377599 4 0.0510 0.34624 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1488449 3 0.5332 0.71131 0.012 0.000 0.700 0.124 0.164
#> SRR1318354 3 0.3325 0.78114 0.012 0.000 0.852 0.104 0.032
#> SRR1359062 3 0.4736 0.67645 0.012 0.000 0.720 0.224 0.044
#> SRR1398924 3 0.7520 0.21341 0.012 0.200 0.440 0.316 0.032
#> SRR663783 3 0.4718 0.75018 0.012 0.000 0.752 0.080 0.156
#> SRR1319204 3 0.6397 0.57201 0.012 0.028 0.608 0.256 0.096
#> SRR1369070 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615659 1 0.2011 0.83054 0.908 0.000 0.088 0.000 0.004
#> SRR1337449 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.4882 0.47875 0.000 0.588 0.012 0.388 0.012
#> SRR1498595 4 0.2582 0.37467 0.000 0.080 0.004 0.892 0.024
#> SRR1377423 3 0.3123 0.78301 0.012 0.000 0.828 0.000 0.160
#> SRR1312310 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338426 3 0.4191 0.73500 0.012 0.000 0.784 0.160 0.044
#> SRR1353309 3 0.0671 0.82663 0.016 0.000 0.980 0.000 0.004
#> SRR658941 4 0.8907 0.16071 0.228 0.128 0.168 0.416 0.060
#> SRR1101643 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0703 0.86286 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.4307 -0.61107 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1363858 1 0.3816 0.54203 0.696 0.000 0.000 0.304 0.000
#> SRR819820 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1337342 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655206 4 0.4339 0.19425 0.000 0.296 0.000 0.684 0.020
#> SRR1387013 4 0.4567 0.05392 0.000 0.356 0.012 0.628 0.004
#> SRR1317410 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR608198 1 0.1608 0.82619 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1440161 2 0.0579 0.84449 0.000 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1343741 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415379 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1099622 2 0.4970 0.41266 0.000 0.544 0.012 0.432 0.012
#> SRR663197 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1394836 4 0.5077 0.27892 0.052 0.240 0.000 0.692 0.016
#> SRR661699 5 0.6018 -0.21095 0.008 0.000 0.088 0.424 0.480
#> SRR813680 1 0.4348 0.47544 0.668 0.000 0.316 0.000 0.016
#> SRR1410678 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378109 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1499174 1 0.3586 0.61335 0.736 0.000 0.264 0.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 4 0.0880 0.33703 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1433410 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661167 3 0.1364 0.82285 0.012 0.000 0.952 0.000 0.036
#> SRR1432518 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR660462 3 0.6269 0.61089 0.012 0.000 0.588 0.196 0.204
#> SRR1374608 1 0.5330 0.25039 0.548 0.000 0.000 0.396 0.056
#> SRR657949 5 0.7394 -0.26923 0.040 0.000 0.288 0.236 0.436
#> SRR1308882 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR655768 3 0.3532 0.78653 0.076 0.000 0.832 0.000 0.092
#> SRR1485870 4 0.4307 -0.61107 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1444138 3 0.2277 0.81795 0.024 0.000 0.920 0.028 0.028
#> SRR1417342 4 0.3210 0.04212 0.000 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1470193 4 0.0992 0.34985 0.000 0.008 0.000 0.968 0.024
#> SRR1091380 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1099096 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313583 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1467102 2 0.4962 0.54266 0.000 0.632 0.024 0.332 0.012
#> SRR1485416 4 0.4262 -0.48602 0.000 0.000 0.000 0.560 0.440
#> SRR818821 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR809963 1 0.4780 0.73258 0.768 0.000 0.032 0.080 0.120
#> SRR1072247 1 0.1043 0.85021 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1353710 4 0.4533 -0.52367 0.008 0.000 0.000 0.544 0.448
#> SRR1445259 3 0.1809 0.81835 0.012 0.000 0.928 0.000 0.060
#> SRR1408393 3 0.7186 0.53658 0.048 0.000 0.508 0.204 0.240
#> SRR1361522 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.4981 0.40086 0.000 0.536 0.012 0.440 0.012
#> SRR1310542 3 0.2618 0.80449 0.012 0.000 0.900 0.052 0.036
#> SRR1333485 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1406437 4 0.7366 -0.04962 0.392 0.000 0.128 0.408 0.072
#> SRR1354931 3 0.6000 0.63875 0.140 0.000 0.636 0.204 0.020
#> SRR1391856 1 0.4977 0.12373 0.500 0.000 0.000 0.472 0.028
#> SRR1446738 4 0.4283 0.20577 0.000 0.292 0.012 0.692 0.004
#> SRR1309032 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.5007 0.34157 0.000 0.504 0.012 0.472 0.012
#> SRR1432611 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.5229 0.62486 0.012 0.000 0.668 0.260 0.060
#> SRR613150 3 0.0854 0.82632 0.012 0.000 0.976 0.004 0.008
#> SRR1375329 3 0.5234 0.68807 0.012 0.000 0.708 0.168 0.112
#> SRR1387921 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.2179 0.82128 0.896 0.000 0.100 0.000 0.004
#> SRR812943 4 0.8676 0.10329 0.212 0.048 0.240 0.412 0.088
#> SRR1400910 4 0.7823 -0.06455 0.032 0.324 0.144 0.452 0.048
#> SRR1444203 4 0.4307 -0.61107 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR816177 4 0.4066 0.14808 0.000 0.324 0.000 0.672 0.004
#> SRR658754 3 0.0693 0.82555 0.012 0.000 0.980 0.000 0.008
#> SRR1429603 4 0.4302 -0.56985 0.000 0.000 0.000 0.520 0.480
#> SRR1397366 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1446028 1 0.0968 0.86820 0.972 0.000 0.012 0.004 0.012
#> SRR1083918 2 0.4803 0.32102 0.000 0.496 0.012 0.488 0.004
#> SRR1337606 4 0.2228 0.26701 0.004 0.004 0.000 0.900 0.092
#> SRR659109 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1337192 1 0.6174 0.24454 0.556 0.000 0.000 0.236 0.208
#> SRR656946 4 0.4962 0.08912 0.000 0.332 0.012 0.632 0.024
#> SRR1476102 1 0.0451 0.86912 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1476447 1 0.0609 0.86357 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1342067 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1385389 4 0.4307 -0.61107 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1075971 1 0.3366 0.69186 0.784 0.000 0.212 0.000 0.004
#> SRR614419 4 0.6069 0.22809 0.056 0.000 0.028 0.460 0.456
#> SRR1322936 4 0.4795 0.32382 0.200 0.008 0.020 0.740 0.032
#> SRR1349121 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612935 3 0.6759 0.47023 0.012 0.000 0.488 0.296 0.204
#> SRR661481 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.1043 0.32986 0.000 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1452164 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070503 1 0.4632 0.11529 0.540 0.000 0.448 0.000 0.012
#> SRR1499894 3 0.1095 0.82568 0.012 0.000 0.968 0.012 0.008
#> SRR1082883 4 0.6387 0.01771 0.304 0.000 0.000 0.500 0.196
#> SRR1468271 1 0.0162 0.87232 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1332443 4 0.6519 -0.28667 0.192 0.000 0.000 0.404 0.404
#> SRR810295 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.2166 0.84289 0.912 0.000 0.012 0.004 0.072
#> SRR1328620 3 0.0693 0.82555 0.012 0.000 0.980 0.000 0.008
#> SRR1396294 4 0.3210 0.34338 0.152 0.008 0.000 0.832 0.008
#> SRR1419917 1 0.3702 0.77501 0.820 0.000 0.096 0.000 0.084
#> SRR662114 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1489199 3 0.4517 0.25081 0.436 0.000 0.556 0.000 0.008
#> SRR813584 4 0.4523 0.07982 0.000 0.344 0.012 0.640 0.004
#> SRR1069638 4 0.8762 0.15045 0.200 0.152 0.120 0.456 0.072
#> SRR614864 3 0.1478 0.81317 0.064 0.000 0.936 0.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.2074 0.81921 0.896 0.000 0.104 0.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.0290 0.84582 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR2167710 4 0.5083 0.23524 0.008 0.000 0.020 0.492 0.480
#> SRR1401252 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1309963 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1338031 3 0.6261 0.22946 0.396 0.000 0.456 0.000 0.148
#> SRR1418628 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.3951 0.68386 0.776 0.000 0.004 0.192 0.028
#> SRR1380393 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0162 0.87237 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1356468 4 0.4304 -0.58123 0.000 0.000 0.000 0.516 0.484
#> SRR1337010 2 0.0451 0.84568 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 4 0.2179 0.24913 0.000 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1340486 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1377696 4 0.4764 -0.20299 0.000 0.436 0.012 0.548 0.004
#> SRR1465459 3 0.1608 0.80917 0.072 0.000 0.928 0.000 0.000
#> SRR1080270 3 0.0968 0.82620 0.012 0.000 0.972 0.004 0.012
#> SRR1312501 3 0.0865 0.82535 0.024 0.000 0.972 0.000 0.004
#> SRR1093148 1 0.7585 0.07318 0.400 0.000 0.252 0.300 0.048
#> SRR1467080 3 0.4776 0.71150 0.012 0.000 0.744 0.168 0.076
#> SRR1410866 2 0.0451 0.84559 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR816475 4 0.3844 0.14126 0.028 0.004 0.000 0.788 0.180
#> SRR1379198 4 0.4307 -0.61107 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR613342 3 0.0693 0.82555 0.012 0.000 0.980 0.000 0.008
#> SRR1452246 2 0.5008 0.33517 0.000 0.500 0.012 0.476 0.012
#> SRR1338836 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.4307 -0.61107 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1396616 3 0.5040 0.71143 0.152 0.000 0.732 0.100 0.016
#> SRR813824 3 0.0566 0.82632 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1082376 3 0.5998 0.18450 0.424 0.000 0.464 0.000 0.112
#> SRR1500891 4 0.0992 0.34985 0.000 0.008 0.000 0.968 0.024
#> SRR807543 3 0.4793 0.24106 0.436 0.000 0.544 0.000 0.020
#> SRR1091572 4 0.4264 0.33909 0.188 0.016 0.012 0.772 0.012
#> SRR1346689 4 0.0703 0.34314 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1332424 1 0.0162 0.87151 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR663729 4 0.4307 -0.61107 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1097013 1 0.4574 0.23564 0.576 0.000 0.412 0.000 0.012
#> SRR613675 4 0.5332 0.31205 0.208 0.008 0.040 0.708 0.036
#> SRR1485357 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR655816 5 0.7042 -0.18055 0.024 0.000 0.248 0.248 0.480
#> SRR1500113 1 0.1671 0.83920 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1437622 4 0.0992 0.34985 0.000 0.008 0.000 0.968 0.024
#> SRR1355172 1 0.5052 0.18314 0.552 0.000 0.412 0.000 0.036
#> SRR655531 1 0.7757 0.27657 0.440 0.000 0.088 0.192 0.280
#> SRR1338147 3 0.1041 0.82358 0.032 0.000 0.964 0.000 0.004
#> SRR1413329 1 0.7666 0.27863 0.472 0.000 0.188 0.248 0.092
#> SRR1485931 2 0.0162 0.84738 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.0162 0.87152 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1333308 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1452033 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1467316 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0912 0.82547 0.012 0.000 0.972 0.000 0.016
#> SRR1375351 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.5629 0.72533 0.052 0.000 0.708 0.108 0.132
#> SRR1471755 4 0.4639 0.07495 0.000 0.344 0.012 0.636 0.008
#> SRR808019 1 0.0510 0.87006 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1479133 3 0.0566 0.82637 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR615069 3 0.7791 0.26334 0.012 0.116 0.424 0.356 0.092
#> SRR1456185 2 0.4697 0.51760 0.000 0.620 0.012 0.360 0.008
#> SRR1350069 4 0.3074 0.06781 0.000 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR816316 1 0.5761 0.02905 0.492 0.000 0.420 0.000 0.088
#> SRR664795 5 0.8222 -0.31182 0.212 0.000 0.276 0.136 0.376
#> SRR1490721 4 0.4305 -0.58825 0.000 0.000 0.000 0.512 0.488
#> SRR810643 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.7704 0.29201 0.476 0.000 0.180 0.240 0.104
#> SRR1085285 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1099072 3 0.0609 0.82626 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.1704 0.84330 0.928 0.000 0.068 0.000 0.004
#> SRR1487340 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420276 3 0.7772 0.10998 0.000 0.196 0.372 0.356 0.076
#> SRR1351347 3 0.4811 0.75153 0.080 0.000 0.768 0.116 0.036
#> SRR1405525 1 0.7918 0.16971 0.416 0.004 0.132 0.328 0.120
#> SRR1370329 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819610 4 0.4455 0.21892 0.000 0.284 0.008 0.692 0.016
#> SRR2157314 5 0.6949 -0.15179 0.032 0.000 0.156 0.332 0.480
#> SRR1409465 2 0.0162 0.84738 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR809987 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR613639 3 0.1282 0.82095 0.044 0.000 0.952 0.000 0.004
#> SRR1402285 4 0.4307 -0.61107 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1077038 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1405660 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1095455 3 0.1877 0.81450 0.012 0.000 0.924 0.000 0.064
#> SRR1394734 4 0.4552 0.05685 0.000 0.352 0.012 0.632 0.004
#> SRR1317771 1 0.1588 0.86158 0.948 0.000 0.016 0.008 0.028
#> SRR1365894 4 0.3932 -0.23645 0.000 0.000 0.000 0.672 0.328
#> SRR1073581 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345914 2 0.4850 0.58278 0.000 0.660 0.016 0.304 0.020
#> SRR1432186 2 0.0451 0.84546 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1473529 2 0.4802 0.34006 0.000 0.504 0.012 0.480 0.004
#> SRR660764 3 0.6900 0.40981 0.012 0.000 0.448 0.320 0.220
#> SRR820448 1 0.2462 0.80860 0.880 0.000 0.112 0.000 0.008
#> SRR1328845 4 0.1282 0.32745 0.000 0.004 0.000 0.952 0.044
#> SRR1336415 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1379065 4 0.4307 -0.61107 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1459190 3 0.4037 0.76602 0.012 0.000 0.784 0.028 0.176
#> SRR1346773 1 0.0162 0.87237 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1440898 2 0.0290 0.84646 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.0981 0.82596 0.012 0.000 0.972 0.008 0.008
#> SRR1081209 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.0162 0.87155 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1333395 4 0.1251 0.34762 0.000 0.008 0.000 0.956 0.036
#> SRR1309248 4 0.1582 0.36123 0.000 0.028 0.000 0.944 0.028
#> SRR809161 3 0.6447 0.53914 0.004 0.000 0.528 0.216 0.252
#> SRR1316320 4 0.1082 0.35155 0.000 0.008 0.000 0.964 0.028
#> SRR1432629 2 0.3511 0.72219 0.000 0.800 0.012 0.184 0.004
#> SRR1498931 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416578 4 0.4307 -0.61107 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1405547 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1470534 4 0.4307 -0.61107 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1380764 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309160 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR663489 3 0.5720 0.62461 0.000 0.000 0.624 0.168 0.208
#> SRR1500450 1 0.2149 0.84939 0.924 0.000 0.036 0.028 0.012
#> SRR1078489 4 0.4631 0.33798 0.200 0.028 0.012 0.748 0.012
#> SRR1332648 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR660614 2 0.5026 0.68633 0.000 0.760 0.088 0.096 0.056
#> SRR1470420 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0324 0.87186 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.1908 0.82771 0.908 0.000 0.092 0.000 0.000
#> SRR615946 3 0.3923 0.75896 0.016 0.000 0.812 0.132 0.040
#> SRR1446481 2 0.4457 0.56606 0.000 0.656 0.012 0.328 0.004
#> SRR1467656 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.4467 0.41654 0.640 0.000 0.344 0.000 0.016
#> SRR660224 4 0.5518 0.22181 0.000 0.040 0.012 0.500 0.448
#> SRR665586 1 0.8464 -0.03796 0.340 0.000 0.244 0.188 0.228
#> SRR1347166 1 0.4927 0.69582 0.756 0.000 0.060 0.140 0.044
#> SRR1485722 1 0.4192 0.27969 0.596 0.000 0.404 0.000 0.000
#> SRR1415316 1 0.0162 0.87155 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR613390 3 0.6180 0.21901 0.404 0.000 0.460 0.000 0.136
#> SRR661108 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR2170173 5 0.6844 -0.14200 0.020 0.000 0.176 0.324 0.480
#> SRR817329 1 0.2470 0.81374 0.884 0.000 0.104 0.000 0.012
#> SRR1401990 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1467745 4 0.4742 0.07015 0.000 0.344 0.012 0.632 0.012
#> SRR1471795 2 0.0486 0.84556 0.000 0.988 0.004 0.004 0.004
#> SRR1415637 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 3 0.6678 0.40336 0.316 0.000 0.492 0.012 0.180
#> SRR1314873 1 0.5734 0.52813 0.648 0.000 0.024 0.244 0.084
#> SRR1401211 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 4 0.0981 0.36283 0.000 0.008 0.012 0.972 0.008
#> SRR818797 3 0.4604 0.27101 0.428 0.000 0.560 0.000 0.012
#> SRR2164608 5 0.6946 -0.12858 0.020 0.000 0.212 0.288 0.480
#> SRR1455586 2 0.4916 0.53517 0.000 0.628 0.016 0.340 0.016
#> SRR819459 3 0.1095 0.82558 0.012 0.000 0.968 0.012 0.008
#> SRR1488939 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.2722 0.79971 0.020 0.000 0.872 0.000 0.108
#> SRR1361652 4 0.7532 -0.09830 0.008 0.344 0.108 0.456 0.084
#> SRR1437119 1 0.0162 0.87151 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1478547 3 0.0404 0.82624 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1430910 3 0.6705 0.48366 0.012 0.112 0.576 0.268 0.032
#> SRR1310584 1 0.0794 0.85862 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1500216 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486762 3 0.7620 0.20494 0.008 0.160 0.412 0.364 0.056
#> SRR1480854 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1489394 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1418085 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1340221 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1473058 4 0.1628 0.37448 0.000 0.056 0.008 0.936 0.000
#> SRR1405165 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1433004 3 0.6009 0.44456 0.320 0.000 0.544 0.000 0.136
#> SRR1471477 1 0.0162 0.87152 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1098567 2 0.4959 0.64134 0.000 0.704 0.028 0.236 0.032
#> SRR1098712 4 0.4582 0.20401 0.000 0.288 0.012 0.684 0.016
#> SRR1455038 1 0.4182 0.41998 0.644 0.000 0.352 0.000 0.004
#> SRR1375248 2 0.0290 0.84554 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1403005 3 0.1364 0.82367 0.012 0.000 0.952 0.000 0.036
#> SRR1348378 2 0.5311 0.44815 0.000 0.560 0.012 0.396 0.032
#> SRR1413541 1 0.1121 0.85768 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.0324 0.86994 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1475192 4 0.7723 -0.04183 0.000 0.296 0.212 0.420 0.072
#> SRR1432085 2 0.6628 0.29326 0.000 0.460 0.064 0.416 0.060
#> SRR1452468 1 0.2116 0.83935 0.912 0.000 0.076 0.008 0.004
#> SRR1347060 3 0.0693 0.82555 0.012 0.000 0.980 0.000 0.008
#> SRR1414139 3 0.5049 0.68167 0.012 0.000 0.712 0.200 0.076
#> SRR1447962 2 0.4786 0.52300 0.000 0.620 0.012 0.356 0.012
#> SRR1444324 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.5274 0.50370 0.676 0.000 0.000 0.192 0.132
#> SRR1413436 1 0.0324 0.86994 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1311266 1 0.1608 0.84177 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1343302 4 0.4307 -0.61107 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1373746 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.4958 0.42531 0.000 0.552 0.012 0.424 0.012
#> SRR1405331 3 0.2100 0.81888 0.048 0.000 0.924 0.016 0.012
#> SRR1345609 4 0.5369 -0.39585 0.060 0.000 0.000 0.552 0.388
#> SRR1380208 4 0.1153 0.36592 0.004 0.024 0.000 0.964 0.008
#> SRR1322840 5 0.4307 0.59646 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1399797 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1416654 3 0.0693 0.82610 0.012 0.000 0.980 0.000 0.008
#> SRR1315081 3 0.7529 0.37042 0.008 0.136 0.484 0.300 0.072
#> SRR1369196 3 0.4407 0.72637 0.012 0.000 0.768 0.168 0.052
#> SRR1400847 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365291 3 0.4861 0.26526 0.428 0.000 0.548 0.000 0.024
#> SRR1367920 4 0.3949 -0.24038 0.000 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1366648 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1441679 2 0.0000 0.84804 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.1205 0.82197 0.040 0.000 0.956 0.000 0.004
#> SRR1363968 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814387 1 0.0000 0.87264 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657599 1 0.1851 0.83232 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1386689 4 0.4307 -0.61107 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1395575 3 0.0566 0.82610 0.012 0.000 0.984 0.000 0.004
#> SRR1453811 3 0.2852 0.73265 0.172 0.000 0.828 0.000 0.000
#> SRR1441159 1 0.0162 0.87237 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1403154 4 0.4307 -0.61107 0.000 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1468722 3 0.0912 0.82566 0.012 0.000 0.972 0.000 0.016
#> SRR1310275 3 0.2852 0.73306 0.172 0.000 0.828 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 1 0.0146 0.881388 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1331708 4 0.4407 0.030471 0.000 0.000 0.000 0.496 0.480 0.024
#> SRR1464258 1 0.0520 0.882039 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1454201 3 0.1500 0.824052 0.000 0.000 0.936 0.000 0.012 0.052
#> SRR661589 3 0.0146 0.850634 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1456229 1 0.4209 0.752311 0.776 0.000 0.112 0.000 0.032 0.080
#> SRR1315165 4 0.4412 0.042481 0.008 0.000 0.000 0.500 0.480 0.012
#> SRR1488960 1 0.2724 0.845757 0.876 0.000 0.016 0.000 0.032 0.076
#> SRR1417809 4 0.4228 0.609413 0.012 0.000 0.000 0.704 0.252 0.032
#> SRR1094457 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095575 3 0.5402 0.437862 0.124 0.000 0.664 0.000 0.044 0.168
#> SRR1315931 1 0.0291 0.881775 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1430066 3 0.0000 0.851070 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1431037 3 0.0363 0.850569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1395554 3 0.0458 0.849199 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR818002 5 0.2442 0.733510 0.000 0.144 0.000 0.000 0.852 0.004
#> SRR1344143 5 0.2265 0.749156 0.000 0.056 0.000 0.028 0.904 0.012
#> SRR1486845 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362866 1 0.3645 0.779933 0.824 0.000 0.048 0.000 0.080 0.048
#> SRR1490740 1 0.1515 0.871328 0.944 0.000 0.008 0.000 0.028 0.020
#> SRR1446627 2 0.0146 0.951970 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1456138 2 0.1531 0.887157 0.000 0.928 0.000 0.000 0.068 0.004
#> SRR1416248 1 0.0363 0.880686 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1383907 4 0.1501 0.867494 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1311018 1 0.0405 0.881599 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1375699 5 0.3245 0.682174 0.000 0.228 0.000 0.000 0.764 0.008
#> SRR1429846 1 0.2375 0.847094 0.896 0.000 0.060 0.000 0.008 0.036
#> SRR613550 1 0.5344 0.238039 0.528 0.000 0.376 0.000 0.008 0.088
#> SRR1348402 1 0.0964 0.880110 0.968 0.000 0.000 0.004 0.016 0.012
#> SRR1345146 5 0.6860 0.000363 0.084 0.000 0.368 0.000 0.396 0.152
#> SRR1324025 3 0.0508 0.850833 0.000 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1318879 3 0.6588 -0.062988 0.040 0.000 0.456 0.000 0.236 0.268
#> SRR820755 1 0.5408 0.588194 0.652 0.000 0.136 0.000 0.032 0.180
#> SRR1485830 4 0.0713 0.898726 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR599313 1 0.0260 0.881158 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR612263 1 0.0520 0.881520 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1415398 6 0.4064 0.544185 0.000 0.000 0.360 0.000 0.016 0.624
#> SRR1326205 5 0.3905 0.504211 0.000 0.000 0.000 0.316 0.668 0.016
#> SRR1421327 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083311 3 0.0508 0.850779 0.000 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1499303 5 0.4550 0.257771 0.000 0.000 0.000 0.420 0.544 0.036
#> SRR1079522 5 0.4141 0.663056 0.004 0.000 0.000 0.188 0.740 0.068
#> SRR1452935 3 0.0260 0.850857 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1379495 1 0.0000 0.881657 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.952576 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0291 0.850024 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR615778 1 0.0964 0.879875 0.968 0.000 0.012 0.000 0.016 0.004
#> SRR1447564 1 0.1861 0.871937 0.928 0.000 0.016 0.000 0.036 0.020
#> SRR1455195 1 0.1962 0.864779 0.924 0.000 0.020 0.000 0.028 0.028
#> SRR655182 3 0.5388 -0.098174 0.056 0.000 0.460 0.000 0.460 0.024
#> SRR1335140 5 0.2858 0.722125 0.000 0.000 0.000 0.124 0.844 0.032
#> SRR1433555 3 0.0405 0.849117 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1308650 5 0.2980 0.706518 0.000 0.192 0.000 0.000 0.800 0.008
#> SRR1388354 1 0.1003 0.880116 0.964 0.000 0.004 0.000 0.028 0.004
#> SRR1317446 3 0.0520 0.850039 0.000 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1413602 3 0.0363 0.850569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1479955 2 0.2191 0.817982 0.000 0.876 0.000 0.000 0.120 0.004
#> SRR809853 3 0.6613 -0.154031 0.328 0.000 0.400 0.000 0.032 0.240
#> SRR661313 3 0.0363 0.850569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1499935 4 0.2631 0.772079 0.000 0.000 0.000 0.820 0.180 0.000
#> SRR1447303 3 0.1003 0.842467 0.000 0.000 0.964 0.000 0.016 0.020
#> SRR1429408 5 0.3982 0.146930 0.000 0.000 0.000 0.460 0.536 0.004
#> SRR1433950 1 0.0146 0.881563 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1362081 2 0.0291 0.949527 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1409854 3 0.5977 -0.044558 0.420 0.000 0.440 0.000 0.028 0.112
#> SRR1435229 3 0.4559 0.289114 0.012 0.000 0.600 0.000 0.364 0.024
#> SRR1085996 1 0.4017 0.769203 0.792 0.000 0.104 0.000 0.032 0.072
#> SRR1414229 5 0.5159 0.548129 0.000 0.028 0.192 0.000 0.672 0.108
#> SRR1400974 3 0.0000 0.851070 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399971 1 0.3317 0.706916 0.808 0.000 0.004 0.032 0.156 0.000
#> SRR613927 6 0.5967 0.542308 0.228 0.000 0.204 0.000 0.020 0.548
#> SRR1457854 1 0.3199 0.826427 0.852 0.000 0.052 0.000 0.028 0.068
#> SRR1473714 1 0.5595 0.197171 0.500 0.000 0.072 0.004 0.404 0.020
#> SRR813776 1 0.6179 0.172360 0.480 0.000 0.168 0.000 0.024 0.328
#> SRR808196 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101085 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614395 1 0.1837 0.868652 0.932 0.000 0.012 0.004 0.032 0.020
#> SRR1478251 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0291 0.949527 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1362310 1 0.0363 0.880686 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR665310 6 0.3511 0.714176 0.000 0.000 0.216 0.000 0.024 0.760
#> SRR1420109 3 0.0717 0.845341 0.000 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1330920 1 0.1777 0.868269 0.932 0.000 0.032 0.000 0.012 0.024
#> SRR1419539 5 0.3500 0.744405 0.000 0.056 0.044 0.032 0.848 0.020
#> SRR1359447 2 0.0291 0.949527 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1347259 4 0.0146 0.910309 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR613915 6 0.5088 0.643929 0.184 0.000 0.140 0.000 0.012 0.664
#> SRR1384395 5 0.5286 0.652991 0.000 0.112 0.100 0.000 0.696 0.092
#> SRR821715 6 0.4454 0.612693 0.020 0.000 0.308 0.000 0.020 0.652
#> SRR1478228 1 0.0291 0.881579 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1445637 1 0.3849 0.779229 0.804 0.000 0.104 0.000 0.032 0.060
#> SRR608150 5 0.6112 0.236369 0.100 0.000 0.000 0.368 0.484 0.048
#> SRR1096383 1 0.0405 0.881957 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1341480 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341344 1 0.0692 0.880134 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1326270 3 0.2422 0.766425 0.072 0.000 0.892 0.000 0.012 0.024
#> SRR1498838 3 0.0146 0.851127 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1416313 3 0.0363 0.850569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR808566 5 0.5046 0.416490 0.044 0.000 0.000 0.340 0.592 0.024
#> SRR1430270 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0363 0.850569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR613533 3 0.0260 0.850857 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR661267 1 0.3468 0.807418 0.832 0.000 0.072 0.000 0.024 0.072
#> SRR810665 2 0.3769 0.362089 0.000 0.640 0.000 0.000 0.356 0.004
#> SRR1407250 1 0.4085 0.734625 0.772 0.000 0.152 0.000 0.028 0.048
#> SRR1420067 1 0.0000 0.881657 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1473632 5 0.4038 0.707613 0.000 0.052 0.072 0.004 0.804 0.068
#> SRR812536 6 0.2201 0.730560 0.000 0.000 0.048 0.000 0.052 0.900
#> SRR1370850 5 0.3360 0.643706 0.000 0.264 0.000 0.000 0.732 0.004
#> SRR1486195 2 0.0508 0.945366 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1407671 5 0.2384 0.749640 0.000 0.044 0.000 0.040 0.900 0.016
#> SRR1446375 3 0.2937 0.733794 0.000 0.000 0.848 0.000 0.096 0.056
#> SRR1465230 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614119 1 0.2453 0.850750 0.896 0.000 0.044 0.000 0.016 0.044
#> SRR1356101 2 0.0508 0.945366 0.000 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1404209 1 0.0603 0.880512 0.980 0.000 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1392676 2 0.0146 0.951970 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR665538 1 0.2532 0.846166 0.884 0.000 0.012 0.000 0.024 0.080
#> SRR660510 3 0.0363 0.849886 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1445655 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658953 6 0.2462 0.652901 0.004 0.000 0.004 0.000 0.132 0.860
#> SRR2166459 6 0.3266 0.755252 0.008 0.000 0.132 0.000 0.036 0.824
#> SRR1070713 5 0.2190 0.750929 0.000 0.060 0.000 0.040 0.900 0.000
#> SRR1485312 3 0.0717 0.847173 0.008 0.000 0.976 0.000 0.000 0.016
#> SRR1317631 4 0.2378 0.796658 0.000 0.000 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR1488610 1 0.0603 0.881587 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1330588 3 0.0363 0.850569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1316367 5 0.5950 0.460668 0.088 0.004 0.248 0.012 0.608 0.040
#> SRR1433926 1 0.2875 0.833481 0.872 0.000 0.064 0.000 0.028 0.036
#> SRR1091302 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818263 1 0.0520 0.881130 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1404909 4 0.0260 0.909098 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR663076 1 0.0458 0.880841 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1323577 5 0.3998 0.156619 0.000 0.492 0.000 0.000 0.504 0.004
#> SRR1442422 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0622 0.879406 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012 0.000
#> SRR654862 1 0.3168 0.819311 0.852 0.000 0.076 0.000 0.024 0.048
#> SRR1407112 4 0.0146 0.910654 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1332969 3 0.1765 0.796638 0.052 0.000 0.924 0.000 0.000 0.024
#> SRR1353199 3 0.0260 0.850843 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1378885 1 0.5681 0.525439 0.616 0.000 0.196 0.000 0.032 0.156
#> SRR665357 5 0.5407 0.613804 0.000 0.092 0.144 0.000 0.680 0.084
#> SRR662186 2 0.0000 0.952576 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0725 0.845069 0.000 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR1347819 3 0.2282 0.791328 0.000 0.000 0.888 0.000 0.024 0.088
#> SRR1480813 5 0.3528 0.604194 0.000 0.296 0.000 0.000 0.700 0.004
#> SRR1472576 5 0.2252 0.741058 0.000 0.012 0.000 0.072 0.900 0.016
#> SRR1431781 4 0.1714 0.851783 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1452270 6 0.4135 0.617480 0.000 0.000 0.300 0.000 0.032 0.668
#> SRR1500472 3 0.2094 0.793219 0.000 0.000 0.900 0.000 0.020 0.080
#> SRR1417632 5 0.2538 0.724782 0.000 0.000 0.000 0.124 0.860 0.016
#> SRR1350153 2 0.0000 0.952576 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.0363 0.850569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1326579 1 0.0653 0.882088 0.980 0.000 0.004 0.000 0.012 0.004
#> SRR1349363 2 0.2595 0.754251 0.000 0.836 0.000 0.000 0.160 0.004
#> SRR1096712 3 0.0508 0.850646 0.000 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1090407 3 0.0820 0.844801 0.000 0.000 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR1083752 5 0.2190 0.750929 0.000 0.060 0.000 0.040 0.900 0.000
#> SRR1377599 4 0.4445 0.327251 0.000 0.000 0.000 0.572 0.396 0.032
#> SRR1488449 6 0.4241 0.528780 0.000 0.000 0.368 0.000 0.024 0.608
#> SRR1318354 3 0.2046 0.806873 0.000 0.000 0.908 0.000 0.032 0.060
#> SRR1359062 3 0.4791 0.428647 0.000 0.000 0.652 0.000 0.244 0.104
#> SRR1398924 5 0.5041 0.255201 0.000 0.028 0.420 0.000 0.524 0.028
#> SRR663783 3 0.3509 0.588187 0.000 0.000 0.744 0.000 0.016 0.240
#> SRR1319204 3 0.4551 0.311973 0.000 0.000 0.608 0.000 0.344 0.048
#> SRR1369070 2 0.0146 0.951970 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR615659 1 0.2480 0.852817 0.896 0.000 0.028 0.000 0.028 0.048
#> SRR1337449 2 0.0146 0.951571 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1316982 5 0.3629 0.642239 0.000 0.260 0.000 0.000 0.724 0.016
#> SRR1498595 5 0.2356 0.735792 0.000 0.004 0.000 0.096 0.884 0.016
#> SRR1377423 3 0.3189 0.612911 0.000 0.000 0.760 0.000 0.004 0.236
#> SRR1312310 2 0.0000 0.952576 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0146 0.881388 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1338426 3 0.1984 0.806612 0.000 0.000 0.912 0.000 0.032 0.056
#> SRR1353309 3 0.0806 0.843671 0.000 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR658941 5 0.4869 0.645312 0.060 0.012 0.092 0.000 0.748 0.088
#> SRR1101643 1 0.0458 0.880841 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1401468 1 0.0260 0.881158 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.952576 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 4 0.1075 0.885874 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1363858 1 0.4158 0.236842 0.572 0.000 0.004 0.008 0.416 0.000
#> SRR819820 3 0.0622 0.846428 0.000 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1337342 1 0.0405 0.881797 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR655206 5 0.2519 0.751828 0.000 0.056 0.000 0.048 0.888 0.008
#> SRR1387013 5 0.2179 0.750818 0.000 0.064 0.000 0.036 0.900 0.000
#> SRR1317410 1 0.0291 0.881579 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR608198 1 0.1167 0.874371 0.960 0.000 0.008 0.020 0.012 0.000
#> SRR1440161 2 0.0405 0.948395 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1343741 2 0.0000 0.952576 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0146 0.951970 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1415379 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099622 5 0.3259 0.685928 0.000 0.216 0.000 0.000 0.772 0.012
#> SRR663197 3 0.0363 0.850569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1394836 5 0.2701 0.745298 0.020 0.028 0.000 0.056 0.888 0.008
#> SRR661699 6 0.2062 0.692500 0.008 0.000 0.004 0.000 0.088 0.900
#> SRR813680 1 0.3017 0.826356 0.860 0.000 0.064 0.000 0.016 0.060
#> SRR1410678 1 0.0363 0.881055 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1378109 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499174 1 0.3564 0.779449 0.816 0.000 0.120 0.000 0.024 0.040
#> SRR1311486 2 0.0291 0.949821 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1382851 5 0.3081 0.661970 0.000 0.000 0.000 0.220 0.776 0.004
#> SRR1433410 1 0.0363 0.880686 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR661167 3 0.2214 0.789540 0.000 0.000 0.888 0.000 0.016 0.096
#> SRR1432518 3 0.0508 0.849875 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR660462 6 0.4264 0.553224 0.000 0.000 0.352 0.000 0.028 0.620
#> SRR1374608 1 0.4893 0.265725 0.552 0.000 0.000 0.396 0.040 0.012
#> SRR657949 6 0.2351 0.740267 0.012 0.000 0.052 0.000 0.036 0.900
#> SRR1308882 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655768 3 0.5205 0.376641 0.144 0.000 0.648 0.000 0.012 0.196
#> SRR1485870 4 0.1075 0.886474 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1444138 3 0.2146 0.810748 0.004 0.000 0.908 0.000 0.044 0.044
#> SRR1417342 4 0.3217 0.691057 0.008 0.000 0.000 0.768 0.224 0.000
#> SRR1470193 5 0.4361 0.502286 0.000 0.000 0.000 0.308 0.648 0.044
#> SRR1091380 3 0.0405 0.849117 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1099096 1 0.0363 0.880686 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1313583 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467102 5 0.3695 0.628520 0.000 0.272 0.000 0.000 0.712 0.016
#> SRR1485416 4 0.0865 0.893837 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR818821 3 0.0405 0.851065 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR809963 1 0.4267 0.678975 0.728 0.000 0.012 0.000 0.052 0.208
#> SRR1072247 1 0.0508 0.880431 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1353710 4 0.0865 0.895013 0.000 0.000 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1445259 3 0.1391 0.833405 0.000 0.000 0.944 0.000 0.016 0.040
#> SRR1408393 6 0.3391 0.753434 0.016 0.000 0.148 0.000 0.024 0.812
#> SRR1361522 1 0.0363 0.881570 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1368597 1 0.0363 0.881055 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1309680 5 0.2871 0.709397 0.000 0.192 0.000 0.000 0.804 0.004
#> SRR1310542 3 0.2197 0.796412 0.000 0.000 0.900 0.000 0.056 0.044
#> SRR1333485 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406437 5 0.6068 0.143378 0.388 0.000 0.024 0.012 0.480 0.096
#> SRR1354931 3 0.6814 -0.040500 0.132 0.000 0.404 0.000 0.372 0.092
#> SRR1391856 5 0.6487 0.134054 0.384 0.000 0.000 0.180 0.400 0.036
#> SRR1446738 5 0.2421 0.750710 0.004 0.052 0.000 0.044 0.896 0.004
#> SRR1309032 2 0.0000 0.952576 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 5 0.2933 0.705215 0.000 0.200 0.000 0.000 0.796 0.004
#> SRR1432611 2 0.0000 0.952576 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.5301 0.259458 0.000 0.000 0.568 0.000 0.300 0.132
#> SRR613150 3 0.0520 0.850236 0.000 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1375329 3 0.3777 0.653321 0.004 0.000 0.788 0.000 0.124 0.084
#> SRR1387921 1 0.0260 0.881729 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.952576 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.952576 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 1 0.3084 0.830138 0.860 0.000 0.056 0.000 0.028 0.056
#> SRR812943 5 0.5783 0.480686 0.064 0.012 0.252 0.000 0.616 0.056
#> SRR1400910 5 0.4671 0.661340 0.000 0.068 0.148 0.000 0.736 0.048
#> SRR1444203 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816177 5 0.2190 0.750929 0.000 0.060 0.000 0.040 0.900 0.000
#> SRR658754 3 0.0632 0.848133 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1429603 4 0.0458 0.904792 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1397366 3 0.0820 0.843139 0.000 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016
#> SRR1446028 1 0.1325 0.877215 0.956 0.000 0.012 0.004 0.012 0.016
#> SRR1083918 5 0.2442 0.734470 0.000 0.144 0.000 0.000 0.852 0.004
#> SRR1337606 5 0.4098 -0.022886 0.000 0.000 0.000 0.496 0.496 0.008
#> SRR659109 3 0.0363 0.850569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1337192 1 0.4338 0.070590 0.496 0.000 0.000 0.484 0.020 0.000
#> SRR656946 5 0.2747 0.751101 0.000 0.056 0.000 0.040 0.880 0.024
#> SRR1476102 1 0.0717 0.879938 0.976 0.000 0.000 0.008 0.016 0.000
#> SRR1476447 1 0.0508 0.880431 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1342067 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385389 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075971 1 0.3827 0.788166 0.808 0.000 0.088 0.000 0.032 0.072
#> SRR614419 6 0.3238 0.663876 0.036 0.000 0.012 0.000 0.120 0.832
#> SRR1322936 5 0.3622 0.713554 0.028 0.000 0.008 0.056 0.832 0.076
#> SRR1349121 1 0.0000 0.881657 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0622 0.882311 0.980 0.000 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR612935 6 0.4893 0.541776 0.000 0.000 0.340 0.000 0.076 0.584
#> SRR661481 2 0.0146 0.951571 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1354117 2 0.0000 0.952576 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.4322 0.371843 0.000 0.000 0.000 0.600 0.372 0.028
#> SRR1452164 1 0.0405 0.881532 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1070503 1 0.3932 0.764748 0.792 0.000 0.120 0.000 0.024 0.064
#> SRR1499894 3 0.0820 0.847343 0.000 0.000 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR1082883 4 0.4474 0.640771 0.108 0.000 0.000 0.704 0.188 0.000
#> SRR1468271 1 0.0767 0.881420 0.976 0.000 0.012 0.000 0.004 0.008
#> SRR1332443 4 0.3993 0.247354 0.400 0.000 0.000 0.592 0.008 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.952576 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 1 0.1982 0.861026 0.912 0.000 0.000 0.004 0.016 0.068
#> SRR1328620 3 0.0777 0.845385 0.000 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1396294 5 0.4650 0.520073 0.040 0.000 0.000 0.292 0.652 0.016
#> SRR1419917 1 0.3147 0.800372 0.828 0.000 0.016 0.000 0.016 0.140
#> SRR662114 3 0.0363 0.850569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1489199 1 0.5269 0.563356 0.648 0.000 0.232 0.000 0.032 0.088
#> SRR813584 5 0.2190 0.750929 0.000 0.060 0.000 0.040 0.900 0.000
#> SRR1069638 5 0.4512 0.669442 0.028 0.024 0.088 0.000 0.776 0.084
#> SRR614864 3 0.2575 0.750768 0.076 0.000 0.884 0.000 0.020 0.020
#> SRR1433392 1 0.2471 0.850975 0.896 0.000 0.040 0.000 0.020 0.044
#> SRR1377777 2 0.0858 0.930211 0.000 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR2167710 6 0.2531 0.659888 0.004 0.000 0.008 0.000 0.128 0.860
#> SRR1401252 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309963 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.5921 0.242939 0.496 0.000 0.112 0.000 0.028 0.364
#> SRR1418628 2 0.0000 0.952576 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.3632 0.731958 0.800 0.000 0.008 0.148 0.040 0.004
#> SRR1380393 1 0.0146 0.881388 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1319731 1 0.0291 0.881775 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1356468 4 0.0458 0.904294 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1337010 2 0.0458 0.942018 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1486520 1 0.0363 0.880686 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1486538 4 0.3468 0.629229 0.000 0.000 0.000 0.728 0.264 0.008
#> SRR1340486 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377696 5 0.2317 0.747599 0.000 0.064 0.000 0.020 0.900 0.016
#> SRR1465459 3 0.3958 0.532611 0.196 0.000 0.756 0.000 0.020 0.028
#> SRR1080270 3 0.1141 0.830552 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1312501 3 0.0622 0.850144 0.000 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1093148 5 0.7188 0.021398 0.248 0.000 0.260 0.000 0.396 0.096
#> SRR1467080 3 0.4203 0.595384 0.000 0.000 0.740 0.000 0.124 0.136
#> SRR1410866 2 0.0858 0.931291 0.000 0.968 0.000 0.000 0.028 0.004
#> SRR816475 4 0.3615 0.602790 0.008 0.000 0.000 0.700 0.292 0.000
#> SRR1379198 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613342 3 0.0363 0.850569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1452246 5 0.3043 0.705421 0.000 0.200 0.000 0.000 0.792 0.008
#> SRR1338836 2 0.0146 0.951970 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1369129 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.4075 0.674226 0.028 0.000 0.784 0.000 0.116 0.072
#> SRR813824 3 0.0717 0.845341 0.000 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1082376 1 0.5537 0.555288 0.628 0.000 0.124 0.000 0.032 0.216
#> SRR1500891 5 0.3683 0.681364 0.000 0.000 0.000 0.192 0.764 0.044
#> SRR807543 1 0.4995 0.632762 0.688 0.000 0.196 0.000 0.032 0.084
#> SRR1091572 5 0.3396 0.721231 0.032 0.000 0.000 0.064 0.840 0.064
#> SRR1346689 5 0.2704 0.717324 0.000 0.000 0.000 0.140 0.844 0.016
#> SRR1332424 1 0.0551 0.882131 0.984 0.000 0.004 0.004 0.008 0.000
#> SRR663729 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.4252 0.749188 0.772 0.000 0.116 0.000 0.032 0.080
#> SRR613675 5 0.3350 0.714848 0.028 0.000 0.008 0.036 0.848 0.080
#> SRR1485357 4 0.0363 0.907299 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR655816 6 0.2119 0.724737 0.000 0.000 0.036 0.000 0.060 0.904
#> SRR1500113 1 0.1679 0.870090 0.936 0.000 0.036 0.000 0.012 0.016
#> SRR1437622 5 0.2473 0.718975 0.000 0.000 0.000 0.136 0.856 0.008
#> SRR1355172 1 0.4209 0.752802 0.776 0.000 0.112 0.000 0.032 0.080
#> SRR655531 6 0.4968 0.452232 0.308 0.000 0.012 0.000 0.064 0.616
#> SRR1338147 3 0.1003 0.841970 0.000 0.000 0.964 0.000 0.016 0.020
#> SRR1413329 1 0.6197 0.222224 0.524 0.000 0.028 0.012 0.120 0.316
#> SRR1485931 2 0.0291 0.950022 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1420873 1 0.0692 0.880134 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1333308 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.0405 0.881688 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1467316 2 0.0291 0.950022 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR809018 3 0.0458 0.849389 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1375351 2 0.0000 0.952576 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 6 0.5614 0.555356 0.116 0.000 0.312 0.000 0.016 0.556
#> SRR1471755 5 0.2445 0.751117 0.000 0.060 0.000 0.040 0.892 0.008
#> SRR808019 1 0.2020 0.863078 0.920 0.000 0.020 0.000 0.020 0.040
#> SRR1479133 3 0.0622 0.847902 0.000 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR615069 5 0.5035 0.527953 0.008 0.012 0.232 0.000 0.668 0.080
#> SRR1456185 5 0.3512 0.635261 0.000 0.272 0.000 0.000 0.720 0.008
#> SRR1350069 4 0.3592 0.491268 0.000 0.000 0.000 0.656 0.344 0.000
#> SRR816316 1 0.5019 0.661394 0.696 0.000 0.108 0.000 0.032 0.164
#> SRR664795 6 0.3048 0.728338 0.072 0.000 0.044 0.000 0.024 0.860
#> SRR1490721 4 0.0260 0.908648 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR810643 1 0.0260 0.881745 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1430333 1 0.5669 0.048113 0.476 0.000 0.024 0.000 0.084 0.416
#> SRR1085285 3 0.0260 0.850857 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1099072 3 0.0858 0.844519 0.004 0.000 0.968 0.000 0.000 0.028
#> SRR1317985 1 0.2038 0.862831 0.920 0.000 0.020 0.000 0.028 0.032
#> SRR1487340 1 0.0405 0.882260 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008 0.000
#> SRR1420276 5 0.5243 0.626899 0.000 0.088 0.136 0.000 0.696 0.080
#> SRR1351347 3 0.5700 0.467345 0.112 0.000 0.656 0.000 0.120 0.112
#> SRR1405525 1 0.5829 0.313204 0.552 0.000 0.064 0.000 0.320 0.064
#> SRR1370329 1 0.0260 0.881679 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1465001 1 0.0363 0.880686 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.952576 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819610 5 0.2706 0.750243 0.008 0.048 0.000 0.040 0.888 0.016
#> SRR2157314 6 0.2069 0.713557 0.004 0.000 0.020 0.000 0.068 0.908
#> SRR1409465 2 0.0291 0.950022 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR809987 4 0.0363 0.907288 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR613639 3 0.4355 0.517759 0.176 0.000 0.736 0.000 0.012 0.076
#> SRR1402285 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.0146 0.881388 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1405660 3 0.0363 0.850569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1095455 3 0.1074 0.840227 0.000 0.000 0.960 0.000 0.012 0.028
#> SRR1394734 5 0.2179 0.750744 0.000 0.064 0.000 0.036 0.900 0.000
#> SRR1317771 1 0.1989 0.862595 0.916 0.000 0.000 0.004 0.028 0.052
#> SRR1365894 4 0.3330 0.592536 0.000 0.000 0.000 0.716 0.284 0.000
#> SRR1073581 1 0.0260 0.881564 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR659804 1 0.0508 0.882179 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1345914 5 0.3711 0.647057 0.000 0.260 0.000 0.000 0.720 0.020
#> SRR1432186 2 0.3668 0.445061 0.000 0.668 0.000 0.000 0.328 0.004
#> SRR1473529 5 0.2768 0.730819 0.000 0.156 0.000 0.000 0.832 0.012
#> SRR660764 5 0.5587 0.304211 0.000 0.000 0.272 0.000 0.540 0.188
#> SRR820448 1 0.2415 0.856200 0.900 0.000 0.036 0.000 0.024 0.040
#> SRR1328845 5 0.3684 0.493176 0.000 0.000 0.000 0.332 0.664 0.004
#> SRR1336415 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379065 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459190 6 0.4101 0.452632 0.000 0.000 0.408 0.000 0.012 0.580
#> SRR1346773 1 0.0767 0.882104 0.976 0.000 0.004 0.000 0.008 0.012
#> SRR1499521 1 0.0146 0.881388 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1440898 2 0.0603 0.940899 0.000 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1347459 3 0.1265 0.834036 0.000 0.000 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR1081209 2 0.0146 0.951571 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1400202 1 0.0458 0.881052 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1333395 5 0.4913 0.396713 0.000 0.000 0.000 0.364 0.564 0.072
#> SRR1309248 5 0.2112 0.734785 0.000 0.000 0.000 0.088 0.896 0.016
#> SRR809161 6 0.3245 0.739467 0.000 0.000 0.172 0.000 0.028 0.800
#> SRR1316320 5 0.2358 0.730130 0.000 0.000 0.000 0.108 0.876 0.016
#> SRR1432629 5 0.3489 0.609269 0.000 0.288 0.000 0.000 0.708 0.004
#> SRR1498931 1 0.0291 0.881579 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1416578 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0363 0.850569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1470534 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.0363 0.880686 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1309160 3 0.0146 0.850634 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR663489 6 0.4513 0.344799 0.000 0.000 0.440 0.000 0.032 0.528
#> SRR1500450 1 0.1893 0.869951 0.928 0.000 0.008 0.004 0.024 0.036
#> SRR1078489 5 0.3613 0.712880 0.052 0.000 0.000 0.056 0.828 0.064
#> SRR1332648 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660614 2 0.5293 -0.021888 0.000 0.492 0.028 0.000 0.436 0.044
#> SRR1470420 2 0.0000 0.952576 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0363 0.880686 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1477949 1 0.0862 0.880882 0.972 0.000 0.008 0.000 0.016 0.004
#> SRR1481419 2 0.0000 0.952576 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.2466 0.848444 0.896 0.000 0.052 0.000 0.024 0.028
#> SRR615946 3 0.4328 0.520242 0.000 0.000 0.708 0.000 0.212 0.080
#> SRR1446481 5 0.3847 0.510083 0.000 0.348 0.000 0.000 0.644 0.008
#> SRR1467656 2 0.0000 0.952576 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 1 0.3869 0.781117 0.804 0.000 0.096 0.000 0.032 0.068
#> SRR660224 5 0.3659 0.630305 0.000 0.004 0.004 0.004 0.720 0.268
#> SRR665586 6 0.4523 0.663291 0.180 0.000 0.052 0.000 0.036 0.732
#> SRR1347166 1 0.3327 0.798069 0.844 0.000 0.016 0.004 0.060 0.076
#> SRR1485722 1 0.3714 0.769153 0.804 0.000 0.128 0.000 0.024 0.044
#> SRR1415316 1 0.0547 0.881093 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR613390 1 0.5643 0.466517 0.584 0.000 0.108 0.000 0.028 0.280
#> SRR661108 3 0.0000 0.851070 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2170173 6 0.2094 0.717725 0.004 0.000 0.024 0.000 0.064 0.908
#> SRR817329 1 0.2171 0.861788 0.912 0.000 0.032 0.000 0.016 0.040
#> SRR1401990 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467745 5 0.2445 0.751117 0.000 0.060 0.000 0.040 0.892 0.008
#> SRR1471795 2 0.3163 0.667439 0.000 0.764 0.000 0.000 0.232 0.004
#> SRR1415637 2 0.0146 0.951970 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR813137 6 0.5749 0.585638 0.224 0.000 0.152 0.000 0.028 0.596
#> SRR1314873 1 0.4650 0.674016 0.732 0.000 0.012 0.016 0.068 0.172
#> SRR1401211 1 0.0000 0.881657 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419692 5 0.3150 0.722485 0.000 0.000 0.000 0.104 0.832 0.064
#> SRR818797 1 0.5201 0.566414 0.652 0.000 0.236 0.000 0.032 0.080
#> SRR2164608 6 0.2058 0.725387 0.000 0.000 0.036 0.000 0.056 0.908
#> SRR1455586 5 0.3738 0.615547 0.000 0.280 0.000 0.000 0.704 0.016
#> SRR819459 3 0.0508 0.850646 0.000 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1488939 2 0.0291 0.950022 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1433232 2 0.0291 0.950022 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1385501 3 0.4173 0.565533 0.032 0.000 0.732 0.000 0.020 0.216
#> SRR1361652 5 0.5069 0.675968 0.000 0.096 0.088 0.000 0.716 0.100
#> SRR1437119 1 0.0260 0.881158 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1478547 3 0.0520 0.848547 0.000 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1430910 5 0.4878 0.101636 0.000 0.008 0.468 0.000 0.484 0.040
#> SRR1310584 1 0.0508 0.880431 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1500216 1 0.0260 0.881158 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1486762 5 0.5344 0.530679 0.000 0.044 0.220 0.000 0.652 0.084
#> SRR1480854 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489394 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418085 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340221 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473058 5 0.2293 0.742028 0.004 0.016 0.000 0.080 0.896 0.004
#> SRR1405165 3 0.0363 0.850569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1433004 1 0.5899 0.402465 0.552 0.000 0.136 0.000 0.028 0.284
#> SRR1471477 1 0.0870 0.880490 0.972 0.000 0.012 0.000 0.012 0.004
#> SRR1098567 5 0.4586 0.549109 0.000 0.312 0.012 0.000 0.640 0.036
#> SRR1098712 5 0.3185 0.747614 0.004 0.056 0.000 0.040 0.860 0.040
#> SRR1455038 1 0.4061 0.764315 0.788 0.000 0.108 0.000 0.032 0.072
#> SRR1375248 2 0.0291 0.949527 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1403005 3 0.1701 0.817042 0.000 0.000 0.920 0.000 0.008 0.072
#> SRR1348378 5 0.3514 0.690929 0.000 0.208 0.004 0.000 0.768 0.020
#> SRR1413541 1 0.0717 0.881184 0.976 0.000 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1392943 1 0.0692 0.880624 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1475192 5 0.4339 0.696647 0.000 0.068 0.080 0.000 0.776 0.076
#> SRR1432085 5 0.4399 0.692839 0.000 0.172 0.036 0.000 0.744 0.048
#> SRR1452468 1 0.1546 0.876041 0.944 0.000 0.020 0.000 0.020 0.016
#> SRR1347060 3 0.0363 0.850569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1414139 3 0.4348 0.569897 0.000 0.000 0.724 0.000 0.124 0.152
#> SRR1447962 5 0.3652 0.633899 0.000 0.264 0.000 0.000 0.720 0.016
#> SRR1444324 2 0.0146 0.951047 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1415004 1 0.4527 0.479627 0.660 0.000 0.000 0.272 0.068 0.000
#> SRR1413436 1 0.0692 0.881071 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1311266 1 0.1635 0.871121 0.940 0.000 0.020 0.000 0.020 0.020
#> SRR1343302 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0260 0.881158 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1429678 1 0.0458 0.880841 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1469413 5 0.3514 0.672843 0.000 0.228 0.000 0.000 0.752 0.020
#> SRR1405331 3 0.1938 0.821972 0.008 0.000 0.920 0.000 0.052 0.020
#> SRR1345609 4 0.3826 0.723879 0.124 0.000 0.004 0.784 0.088 0.000
#> SRR1380208 5 0.2979 0.726905 0.004 0.000 0.000 0.088 0.852 0.056
#> SRR1322840 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399797 3 0.0363 0.850569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1416654 3 0.0717 0.845341 0.000 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1315081 5 0.5021 0.408190 0.000 0.004 0.300 0.000 0.608 0.088
#> SRR1369196 3 0.4813 0.338366 0.000 0.000 0.608 0.000 0.316 0.076
#> SRR1400847 1 0.0260 0.881158 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1365291 1 0.4839 0.607725 0.684 0.000 0.220 0.000 0.020 0.076
#> SRR1367920 4 0.2300 0.803084 0.000 0.000 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1366648 3 0.0363 0.850569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.952576 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.0508 0.850833 0.000 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1363968 1 0.0260 0.881158 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR814387 1 0.0458 0.880841 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR657599 1 0.1616 0.872413 0.940 0.000 0.020 0.000 0.012 0.028
#> SRR1386689 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0363 0.850569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1453811 3 0.4724 0.277273 0.320 0.000 0.628 0.000 0.024 0.028
#> SRR1441159 1 0.0520 0.881949 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1403154 4 0.0000 0.912058 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.1267 0.828040 0.000 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1310275 3 0.4052 0.433896 0.260 0.000 0.708 0.000 0.012 0.020
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17559 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.933 0.923 0.963 0.3187 0.687 0.687
#> 3 3 0.692 0.822 0.920 0.9071 0.634 0.489
#> 4 4 0.575 0.664 0.798 0.1842 0.831 0.592
#> 5 5 0.576 0.567 0.737 0.0862 0.827 0.472
#> 6 6 0.582 0.497 0.697 0.0424 0.895 0.571
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR1474533 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1331708 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1464258 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1454201 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR661589 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1456229 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1315165 1 0.0938 0.9666 0.988 0.012
#> SRR1488960 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1417809 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1094457 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1095575 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1315931 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1430066 1 0.1843 0.9549 0.972 0.028
#> SRR1431037 1 0.2043 0.9523 0.968 0.032
#> SRR1395554 1 0.0938 0.9650 0.988 0.012
#> SRR818002 2 0.4562 0.8690 0.096 0.904
#> SRR1344143 1 0.5294 0.8620 0.880 0.120
#> SRR1486845 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1362866 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1490740 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1446627 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1416248 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR1383907 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR1375699 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR1429846 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR613550 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1348402 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1345146 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1324025 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1318879 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR820755 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1485830 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR599313 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR612263 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1415398 1 0.1633 0.9576 0.976 0.024
#> SRR1326205 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1421327 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR1083311 1 0.9922 0.1079 0.552 0.448
#> SRR1499303 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1079522 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1452935 1 0.2236 0.9490 0.964 0.036
#> SRR1379495 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1470459 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR661361 1 0.0938 0.9651 0.988 0.012
#> SRR615778 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1447564 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1455195 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR655182 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1335140 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1433555 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR1308650 2 0.2423 0.9098 0.040 0.960
#> SRR1388354 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1317446 2 0.8813 0.6360 0.300 0.700
#> SRR1413602 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR1479955 2 0.0672 0.9195 0.008 0.992
#> SRR809853 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR661313 1 0.2236 0.9490 0.964 0.036
#> SRR1499935 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR1447303 1 0.3584 0.9215 0.932 0.068
#> SRR1429408 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR1433950 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1362081 2 0.1184 0.9178 0.016 0.984
#> SRR1409854 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1435229 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1085996 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1414229 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR1400974 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR1399971 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR613927 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1457854 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1473714 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR813776 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR808196 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1101085 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR614395 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1478251 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1370551 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1362310 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR665310 1 0.2236 0.9490 0.964 0.036
#> SRR1420109 1 0.0376 0.9690 0.996 0.004
#> SRR1330920 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1419539 1 0.1414 0.9630 0.980 0.020
#> SRR1359447 2 0.1843 0.9140 0.028 0.972
#> SRR1347259 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR613915 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1384395 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR821715 1 0.1633 0.9576 0.976 0.024
#> SRR1478228 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1445637 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR608150 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1096383 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1341480 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1341344 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR1326270 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1498838 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR1416313 1 0.2778 0.9394 0.952 0.048
#> SRR808566 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1430270 1 0.1414 0.9630 0.980 0.020
#> SRR1367825 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR613533 1 0.4161 0.9058 0.916 0.084
#> SRR661267 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR810665 2 0.1843 0.9140 0.028 0.972
#> SRR1407250 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR1420067 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1473632 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR812536 1 0.3431 0.9253 0.936 0.064
#> SRR1370850 1 0.1633 0.9575 0.976 0.024
#> SRR1486195 2 0.1843 0.9140 0.028 0.972
#> SRR1407671 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1446375 1 0.0376 0.9689 0.996 0.004
#> SRR1465230 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR614119 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1404209 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1392676 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR665538 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR660510 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR1445655 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR658953 1 0.0376 0.9689 0.996 0.004
#> SRR2166459 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1070713 1 0.9522 0.3611 0.628 0.372
#> SRR1485312 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1317631 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1488610 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1330588 1 0.0672 0.9671 0.992 0.008
#> SRR1316367 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1433926 1 0.0672 0.9681 0.992 0.008
#> SRR1091302 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR818263 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1404909 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR663076 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1323577 2 0.1633 0.9123 0.024 0.976
#> SRR1442422 1 0.1414 0.9630 0.980 0.020
#> SRR1465893 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR654862 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1407112 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR1332969 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1353199 1 0.3431 0.9253 0.936 0.064
#> SRR1378885 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR665357 2 0.2043 0.9131 0.032 0.968
#> SRR662186 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1501020 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1347819 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR1480813 2 0.3114 0.8942 0.056 0.944
#> SRR1472576 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1431781 1 0.1414 0.9630 0.980 0.020
#> SRR1452270 1 0.2236 0.9490 0.964 0.036
#> SRR1500472 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR1417632 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1350153 2 0.0672 0.9196 0.008 0.992
#> SRR1458113 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR1326579 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1349363 2 0.0672 0.9195 0.008 0.992
#> SRR1096712 1 0.3879 0.9138 0.924 0.076
#> SRR1090407 1 0.0376 0.9689 0.996 0.004
#> SRR1083752 1 0.9775 0.2329 0.588 0.412
#> SRR1377599 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1488449 1 0.2236 0.9490 0.964 0.036
#> SRR1318354 2 0.3431 0.9024 0.064 0.936
#> SRR1359062 2 0.3431 0.9023 0.064 0.936
#> SRR1398924 1 0.4298 0.9015 0.912 0.088
#> SRR663783 1 0.4690 0.8885 0.900 0.100
#> SRR1319204 1 0.9129 0.4859 0.672 0.328
#> SRR1369070 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR615659 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1337449 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1498595 1 0.1633 0.9608 0.976 0.024
#> SRR1377423 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR1312310 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1485613 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR1338426 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR1353309 1 0.3114 0.9327 0.944 0.056
#> SRR658941 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1101643 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR1401468 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1368874 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1324085 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR1363858 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR819820 1 0.0376 0.9689 0.996 0.004
#> SRR1337342 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR655206 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1387013 2 0.8763 0.6437 0.296 0.704
#> SRR1317410 1 0.0672 0.9681 0.992 0.008
#> SRR608198 1 0.0672 0.9681 0.992 0.008
#> SRR1440161 2 0.1633 0.9154 0.024 0.976
#> SRR1343741 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1381288 2 0.0376 0.9200 0.004 0.996
#> SRR1415379 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1099622 2 0.1843 0.9143 0.028 0.972
#> SRR663197 1 0.4298 0.9018 0.912 0.088
#> SRR1394836 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR661699 1 0.0376 0.9689 0.996 0.004
#> SRR813680 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1410678 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1378109 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1499174 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1311486 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1382851 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR1433410 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR661167 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR1432518 1 0.3584 0.9215 0.932 0.068
#> SRR660462 1 0.8813 0.5539 0.700 0.300
#> SRR1374608 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR657949 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1308882 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR655768 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1485870 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1444138 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR1417342 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1470193 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1091380 1 0.0376 0.9689 0.996 0.004
#> SRR1099096 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1313583 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1467102 2 0.4161 0.8910 0.084 0.916
#> SRR1485416 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR818821 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR809963 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1072247 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1353710 1 0.0938 0.9666 0.988 0.012
#> SRR1445259 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR1408393 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1361522 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1368597 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1309680 2 0.9795 0.3819 0.416 0.584
#> SRR1310542 2 0.5519 0.8561 0.128 0.872
#> SRR1333485 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1406437 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1354931 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1391856 1 0.0938 0.9666 0.988 0.012
#> SRR1446738 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR1309032 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1388145 2 0.7528 0.7585 0.216 0.784
#> SRR1432611 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR815869 2 0.3879 0.8960 0.076 0.924
#> SRR613150 1 0.2423 0.9458 0.960 0.040
#> SRR1375329 1 0.1414 0.9603 0.980 0.020
#> SRR1387921 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1466792 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1360695 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR812943 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1400910 1 0.3114 0.9331 0.944 0.056
#> SRR1444203 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR816177 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR658754 2 0.8661 0.6558 0.288 0.712
#> SRR1429603 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1397366 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1446028 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1083918 2 0.9944 0.2658 0.456 0.544
#> SRR1337606 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR659109 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR1337192 1 0.0672 0.9681 0.992 0.008
#> SRR656946 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1476102 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1476447 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR1342067 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1385389 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1075971 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR614419 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1322936 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1349121 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1430549 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR612935 2 0.5629 0.8523 0.132 0.868
#> SRR661481 2 0.0376 0.9196 0.004 0.996
#> SRR1354117 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1393596 1 0.0672 0.9682 0.992 0.008
#> SRR1452164 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1070503 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1499894 1 0.2778 0.9394 0.952 0.048
#> SRR1082883 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1468271 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1332443 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR810295 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR662103 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1328620 1 0.7453 0.7285 0.788 0.212
#> SRR1396294 1 0.0938 0.9666 0.988 0.012
#> SRR1419917 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR662114 1 0.2423 0.9458 0.960 0.040
#> SRR1489199 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR813584 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1069638 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR614864 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1433392 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR2167710 1 0.0376 0.9689 0.996 0.004
#> SRR1401252 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1309963 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1338031 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1418628 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1486889 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1380393 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1319731 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1356468 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1337010 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1486520 1 0.0672 0.9681 0.992 0.008
#> SRR1486538 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1340486 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1377696 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR1465459 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1080270 2 0.8861 0.6290 0.304 0.696
#> SRR1312501 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1093148 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1467080 2 0.4161 0.8911 0.084 0.916
#> SRR1410866 2 0.0672 0.9186 0.008 0.992
#> SRR816475 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1379198 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR613342 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR1452246 2 0.1184 0.9157 0.016 0.984
#> SRR1338836 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1369129 1 0.1633 0.9610 0.976 0.024
#> SRR1396616 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR813824 1 0.3431 0.9253 0.936 0.064
#> SRR1082376 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1500891 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR807543 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1091572 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR1346689 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1332424 1 0.1633 0.9610 0.976 0.024
#> SRR663729 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1097013 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR613675 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR1485357 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR655816 1 0.0938 0.9650 0.988 0.012
#> SRR1500113 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1437622 1 0.0376 0.9695 0.996 0.004
#> SRR1355172 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR655531 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1338147 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1413329 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1485931 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1420873 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1333308 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1452033 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR1467316 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR809018 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR1375351 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR663440 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1471755 2 0.8955 0.6160 0.312 0.688
#> SRR808019 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1479133 1 0.2778 0.9394 0.952 0.048
#> SRR615069 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR1456185 2 0.9460 0.5129 0.364 0.636
#> SRR1350069 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR816316 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR664795 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1490721 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR810643 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1430333 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1085285 1 0.0938 0.9650 0.988 0.012
#> SRR1099072 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1317985 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1487340 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1420276 2 0.2043 0.9131 0.032 0.968
#> SRR1351347 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR1405525 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1370329 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1465001 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1476525 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR819610 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR2157314 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1409465 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR809987 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR613639 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1402285 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1077038 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR1405660 1 0.3584 0.9215 0.932 0.068
#> SRR1095455 1 0.4298 0.9015 0.912 0.088
#> SRR1394734 1 0.5629 0.8514 0.868 0.132
#> SRR1317771 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1365894 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR1073581 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR659804 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1345914 1 0.9998 -0.0812 0.508 0.492
#> SRR1432186 2 0.0938 0.9187 0.012 0.988
#> SRR1473529 2 0.5737 0.8487 0.136 0.864
#> SRR660764 2 0.5408 0.8597 0.124 0.876
#> SRR820448 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1328845 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1336415 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1379065 1 0.0672 0.9681 0.992 0.008
#> SRR1459190 1 0.2043 0.9520 0.968 0.032
#> SRR1346773 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1499521 1 0.1184 0.9648 0.984 0.016
#> SRR1440898 2 0.0376 0.9196 0.004 0.996
#> SRR1347459 2 0.9248 0.5605 0.340 0.660
#> SRR1081209 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1400202 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1333395 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1309248 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR809161 1 0.3431 0.9253 0.936 0.064
#> SRR1316320 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1432629 2 0.0672 0.9195 0.008 0.992
#> SRR1498931 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1416578 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1405547 1 0.2778 0.9394 0.952 0.048
#> SRR1470534 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1380764 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1309160 1 0.2778 0.9394 0.952 0.048
#> SRR663489 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR1500450 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1078489 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR1332648 1 0.1184 0.9649 0.984 0.016
#> SRR660614 2 0.2043 0.9131 0.032 0.968
#> SRR1470420 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1481419 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1464766 1 0.0672 0.9681 0.992 0.008
#> SRR615946 1 0.0938 0.9667 0.988 0.012
#> SRR1446481 2 0.3584 0.8859 0.068 0.932
#> SRR1467656 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1402962 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR660224 2 0.9977 0.2051 0.472 0.528
#> SRR665586 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1347166 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1485722 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR1415316 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR613390 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR661108 1 0.3114 0.9325 0.944 0.056
#> SRR2170173 1 0.1633 0.9577 0.976 0.024
#> SRR817329 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1401990 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1467745 1 0.9922 0.1003 0.552 0.448
#> SRR1471795 2 0.1633 0.9151 0.024 0.976
#> SRR1415637 2 0.0376 0.9200 0.004 0.996
#> SRR813137 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1314873 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1401211 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1419692 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR818797 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR2164608 1 0.0938 0.9650 0.988 0.012
#> SRR1455586 2 0.3584 0.9004 0.068 0.932
#> SRR819459 2 0.9491 0.5004 0.368 0.632
#> SRR1488939 2 0.0376 0.9196 0.004 0.996
#> SRR1433232 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1385501 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1361652 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR1437119 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1478547 1 0.4022 0.9098 0.920 0.080
#> SRR1430910 1 0.4815 0.8841 0.896 0.104
#> SRR1310584 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1500216 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR1486762 2 0.2778 0.9091 0.048 0.952
#> SRR1480854 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1489394 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1418085 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1340221 1 0.0672 0.9682 0.992 0.008
#> SRR1473058 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR1405165 1 0.2603 0.9426 0.956 0.044
#> SRR1433004 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1471477 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1098567 2 0.2043 0.9131 0.032 0.968
#> SRR1098712 1 0.2043 0.9563 0.968 0.032
#> SRR1455038 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1375248 2 0.1843 0.9140 0.028 0.972
#> SRR1403005 1 0.3274 0.9289 0.940 0.060
#> SRR1348378 2 0.4431 0.8850 0.092 0.908
#> SRR1413541 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1392943 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1475192 2 1.0000 0.1158 0.496 0.504
#> SRR1432085 2 0.3733 0.8952 0.072 0.928
#> SRR1452468 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1347060 1 0.9909 0.1224 0.556 0.444
#> SRR1414139 2 0.8813 0.6360 0.300 0.700
#> SRR1447962 2 0.4161 0.8911 0.084 0.916
#> SRR1444324 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1415004 1 0.0938 0.9666 0.988 0.012
#> SRR1413436 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1311266 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR1343302 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1373746 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1429678 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1469413 2 0.4815 0.8764 0.104 0.896
#> SRR1405331 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1345609 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1380208 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1322840 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1399797 1 1.0000 -0.0941 0.504 0.496
#> SRR1416654 1 0.3114 0.9325 0.944 0.056
#> SRR1315081 2 0.4161 0.8911 0.084 0.916
#> SRR1369196 1 0.6247 0.8092 0.844 0.156
#> SRR1400847 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR1365291 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1367920 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1366648 2 0.9954 0.2460 0.460 0.540
#> SRR1441679 2 0.0000 0.9204 0.000 1.000
#> SRR1082173 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1363968 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR814387 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR657599 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1386689 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1395575 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1453811 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
#> SRR1441159 1 0.0376 0.9694 0.996 0.004
#> SRR1403154 1 0.1843 0.9588 0.972 0.028
#> SRR1468722 1 0.2603 0.9426 0.956 0.044
#> SRR1310275 1 0.0000 0.9704 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR1474533 1 0.6291 0.27340 0.532 0.000 0.468
#> SRR1331708 1 0.2625 0.81375 0.916 0.000 0.084
#> SRR1464258 3 0.6274 0.00128 0.456 0.000 0.544
#> SRR1454201 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR661589 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456229 3 0.0237 0.95031 0.004 0.000 0.996
#> SRR1315165 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488960 1 0.6309 0.22328 0.500 0.000 0.500
#> SRR1417809 1 0.5859 0.59130 0.656 0.000 0.344
#> SRR1094457 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095575 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315931 1 0.5678 0.62383 0.684 0.000 0.316
#> SRR1430066 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431037 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1395554 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR818002 1 0.4974 0.56535 0.764 0.236 0.000
#> SRR1344143 1 0.3213 0.80859 0.900 0.008 0.092
#> SRR1486845 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362866 1 0.6154 0.47805 0.592 0.000 0.408
#> SRR1490740 3 0.6045 0.24664 0.380 0.000 0.620
#> SRR1446627 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416248 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383907 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311018 1 0.0237 0.83704 0.996 0.000 0.004
#> SRR1375699 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429846 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR613550 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348402 1 0.6295 0.31438 0.528 0.000 0.472
#> SRR1345146 3 0.0892 0.93704 0.020 0.000 0.980
#> SRR1324025 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318879 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR820755 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485830 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR599313 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR612263 3 0.3941 0.76657 0.156 0.000 0.844
#> SRR1415398 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326205 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421327 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083311 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499303 1 0.4002 0.77761 0.840 0.000 0.160
#> SRR1079522 1 0.6062 0.52388 0.616 0.000 0.384
#> SRR1452935 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379495 1 0.4121 0.77257 0.832 0.000 0.168
#> SRR1470459 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR661361 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR615778 1 0.6154 0.47818 0.592 0.000 0.408
#> SRR1447564 1 0.6204 0.44214 0.576 0.000 0.424
#> SRR1455195 3 0.6045 0.24400 0.380 0.000 0.620
#> SRR655182 3 0.5591 0.46838 0.304 0.000 0.696
#> SRR1335140 1 0.5882 0.58514 0.652 0.000 0.348
#> SRR1433555 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308650 2 0.3816 0.82136 0.148 0.852 0.000
#> SRR1388354 1 0.6126 0.49417 0.600 0.000 0.400
#> SRR1317446 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413602 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1479955 2 0.0237 0.93990 0.000 0.996 0.004
#> SRR809853 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR661313 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499935 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1447303 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429408 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433950 1 0.6062 0.52545 0.616 0.000 0.384
#> SRR1362081 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1409854 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435229 3 0.0592 0.94410 0.012 0.000 0.988
#> SRR1085996 3 0.0424 0.94734 0.008 0.000 0.992
#> SRR1414229 1 0.6357 0.53297 0.684 0.020 0.296
#> SRR1400974 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399971 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR613927 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457854 3 0.5431 0.51800 0.284 0.000 0.716
#> SRR1473714 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR813776 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR808196 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101085 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR614395 3 0.5016 0.61293 0.240 0.000 0.760
#> SRR1478251 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1370551 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.0424 0.83660 0.992 0.000 0.008
#> SRR665310 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420109 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1330920 3 0.5058 0.60562 0.244 0.000 0.756
#> SRR1419539 1 0.5763 0.58288 0.716 0.008 0.276
#> SRR1359447 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347259 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR613915 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384395 2 0.0237 0.94014 0.000 0.996 0.004
#> SRR821715 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478228 1 0.5291 0.69096 0.732 0.000 0.268
#> SRR1445637 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR608150 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096383 3 0.0592 0.94406 0.012 0.000 0.988
#> SRR1341480 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341344 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1326270 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498838 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416313 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR808566 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1430270 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367825 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR613533 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR661267 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR810665 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407250 3 0.2796 0.85458 0.092 0.000 0.908
#> SRR1420067 1 0.6140 0.48556 0.596 0.000 0.404
#> SRR1473632 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR812536 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1370850 1 0.6629 0.55721 0.624 0.016 0.360
#> SRR1486195 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407671 1 0.6126 0.49348 0.600 0.000 0.400
#> SRR1446375 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465230 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR614119 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356101 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404209 3 0.0424 0.94734 0.008 0.000 0.992
#> SRR1392676 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR665538 3 0.2959 0.84756 0.100 0.000 0.900
#> SRR660510 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1445655 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR658953 3 0.2625 0.86679 0.084 0.000 0.916
#> SRR2166459 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1070713 1 0.4654 0.61280 0.792 0.208 0.000
#> SRR1485312 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317631 1 0.4931 0.72779 0.768 0.000 0.232
#> SRR1488610 1 0.4178 0.77273 0.828 0.000 0.172
#> SRR1330588 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316367 1 0.4750 0.74186 0.784 0.000 0.216
#> SRR1433926 1 0.0592 0.83505 0.988 0.000 0.012
#> SRR1091302 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR818263 3 0.3551 0.80443 0.132 0.000 0.868
#> SRR1404909 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR663076 1 0.3192 0.80294 0.888 0.000 0.112
#> SRR1323577 2 0.4654 0.75332 0.208 0.792 0.000
#> SRR1442422 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465893 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR654862 3 0.0237 0.95029 0.004 0.000 0.996
#> SRR1407112 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332969 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353199 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1378885 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR665357 2 0.0237 0.93999 0.000 0.996 0.004
#> SRR662186 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347819 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480813 2 0.3752 0.82586 0.144 0.856 0.000
#> SRR1472576 1 0.4504 0.75707 0.804 0.000 0.196
#> SRR1431781 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452270 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500472 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417632 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350153 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1326579 1 0.5988 0.55328 0.632 0.000 0.368
#> SRR1349363 2 0.0592 0.93431 0.000 0.988 0.012
#> SRR1096712 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1090407 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1083752 1 0.3038 0.74953 0.896 0.104 0.000
#> SRR1377599 1 0.3116 0.80394 0.892 0.000 0.108
#> SRR1488449 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1318354 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1359062 3 0.1964 0.89936 0.000 0.056 0.944
#> SRR1398924 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR663783 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1319204 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1369070 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR615659 3 0.1753 0.90899 0.048 0.000 0.952
#> SRR1337449 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316982 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498595 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377423 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1312310 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.0747 0.83360 0.984 0.000 0.016
#> SRR1338426 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353309 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR658941 1 0.4346 0.69895 0.816 0.000 0.184
#> SRR1101643 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401468 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368874 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324085 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363858 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR819820 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337342 1 0.6204 0.44261 0.576 0.000 0.424
#> SRR655206 1 0.6204 0.44233 0.576 0.000 0.424
#> SRR1387013 1 0.4555 0.62570 0.800 0.200 0.000
#> SRR1317410 1 0.0237 0.83704 0.996 0.000 0.004
#> SRR608198 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440161 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415379 1 0.0747 0.83528 0.984 0.000 0.016
#> SRR1099622 2 0.3116 0.85947 0.108 0.892 0.000
#> SRR663197 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394836 1 0.3551 0.79371 0.868 0.000 0.132
#> SRR661699 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR813680 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1410678 1 0.5650 0.63752 0.688 0.000 0.312
#> SRR1378109 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499174 3 0.4062 0.77310 0.164 0.000 0.836
#> SRR1311486 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1382851 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433410 1 0.0892 0.83451 0.980 0.000 0.020
#> SRR661167 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432518 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR660462 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374608 1 0.6062 0.52492 0.616 0.000 0.384
#> SRR657949 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1308882 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR655768 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1485870 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444138 3 0.1031 0.93146 0.024 0.000 0.976
#> SRR1417342 1 0.4750 0.74313 0.784 0.000 0.216
#> SRR1470193 1 0.5178 0.70391 0.744 0.000 0.256
#> SRR1091380 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099096 1 0.2625 0.81408 0.916 0.000 0.084
#> SRR1313583 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467102 2 0.3340 0.83797 0.000 0.880 0.120
#> SRR1485416 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR818821 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR809963 3 0.0592 0.94406 0.012 0.000 0.988
#> SRR1072247 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353710 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445259 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408393 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361522 1 0.6026 0.53889 0.624 0.000 0.376
#> SRR1368597 1 0.6095 0.50966 0.608 0.000 0.392
#> SRR1309680 2 0.6648 0.38766 0.016 0.620 0.364
#> SRR1310542 3 0.0747 0.94021 0.000 0.016 0.984
#> SRR1333485 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406437 1 0.6154 0.47787 0.592 0.000 0.408
#> SRR1354931 3 0.6095 0.30900 0.392 0.000 0.608
#> SRR1391856 1 0.3412 0.79339 0.876 0.000 0.124
#> SRR1446738 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309032 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1388145 2 0.5591 0.54588 0.000 0.696 0.304
#> SRR1432611 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR815869 3 0.0592 0.94330 0.000 0.012 0.988
#> SRR613150 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375329 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387921 1 0.5785 0.60939 0.668 0.000 0.332
#> SRR1466792 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1360695 3 0.0424 0.94734 0.008 0.000 0.992
#> SRR812943 1 0.6286 0.33754 0.536 0.000 0.464
#> SRR1400910 3 0.8649 0.40124 0.232 0.172 0.596
#> SRR1444203 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR816177 1 0.2625 0.81369 0.916 0.000 0.084
#> SRR658754 3 0.0892 0.93652 0.000 0.020 0.980
#> SRR1429603 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1397366 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446028 1 0.5905 0.57968 0.648 0.000 0.352
#> SRR1083918 1 0.5760 0.37419 0.672 0.328 0.000
#> SRR1337606 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR659109 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337192 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR656946 1 0.0747 0.83522 0.984 0.000 0.016
#> SRR1476102 1 0.4842 0.73505 0.776 0.000 0.224
#> SRR1476447 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342067 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385389 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075971 3 0.1411 0.92131 0.036 0.000 0.964
#> SRR614419 1 0.6225 0.42356 0.568 0.000 0.432
#> SRR1322936 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349121 1 0.5431 0.66433 0.716 0.000 0.284
#> SRR1430549 1 0.1163 0.83234 0.972 0.000 0.028
#> SRR612935 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR661481 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1393596 1 0.0747 0.83526 0.984 0.000 0.016
#> SRR1452164 1 0.6299 0.30218 0.524 0.000 0.476
#> SRR1070503 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499894 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082883 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468271 1 0.6244 0.40558 0.560 0.000 0.440
#> SRR1332443 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR810295 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR662103 3 0.5926 0.32074 0.356 0.000 0.644
#> SRR1328620 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396294 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419917 3 0.4974 0.62436 0.236 0.000 0.764
#> SRR662114 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1489199 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR813584 1 0.0237 0.83500 0.996 0.004 0.000
#> SRR1069638 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR614864 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433392 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1377777 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR2167710 3 0.0592 0.94409 0.012 0.000 0.988
#> SRR1401252 1 0.3038 0.80512 0.896 0.000 0.104
#> SRR1309963 1 0.0237 0.83720 0.996 0.000 0.004
#> SRR1338031 3 0.0237 0.95031 0.004 0.000 0.996
#> SRR1418628 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486889 1 0.5363 0.68213 0.724 0.000 0.276
#> SRR1380393 1 0.5431 0.67190 0.716 0.000 0.284
#> SRR1319731 1 0.5016 0.71938 0.760 0.000 0.240
#> SRR1356468 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337010 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486538 1 0.3816 0.78413 0.852 0.000 0.148
#> SRR1340486 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1377696 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465459 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1080270 3 0.0592 0.94344 0.000 0.012 0.988
#> SRR1312501 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093148 3 0.4452 0.70727 0.192 0.000 0.808
#> SRR1467080 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1410866 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR816475 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379198 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR613342 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1452246 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369129 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396616 3 0.3192 0.83089 0.112 0.000 0.888
#> SRR813824 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1082376 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500891 1 0.3482 0.79406 0.872 0.000 0.128
#> SRR807543 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091572 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1346689 1 0.0237 0.83720 0.996 0.000 0.004
#> SRR1332424 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR663729 1 0.0892 0.83437 0.980 0.000 0.020
#> SRR1097013 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR613675 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485357 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR655816 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500113 1 0.4931 0.72806 0.768 0.000 0.232
#> SRR1437622 1 0.2165 0.82083 0.936 0.000 0.064
#> SRR1355172 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR655531 3 0.6079 0.21567 0.388 0.000 0.612
#> SRR1338147 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1413329 3 0.0424 0.94734 0.008 0.000 0.992
#> SRR1485931 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.5650 0.63804 0.688 0.000 0.312
#> SRR1333308 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452033 1 0.0892 0.83447 0.980 0.000 0.020
#> SRR1467316 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR809018 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375351 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR663440 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1471755 1 0.4887 0.57883 0.772 0.228 0.000
#> SRR808019 3 0.0237 0.95029 0.004 0.000 0.996
#> SRR1479133 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR615069 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456185 2 0.5363 0.66051 0.276 0.724 0.000
#> SRR1350069 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR816316 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR664795 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1490721 1 0.0424 0.83660 0.992 0.000 0.008
#> SRR810643 1 0.6111 0.50293 0.604 0.000 0.396
#> SRR1430333 3 0.0892 0.93702 0.020 0.000 0.980
#> SRR1085285 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099072 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1317985 3 0.6095 0.19885 0.392 0.000 0.608
#> SRR1487340 1 0.6308 0.25053 0.508 0.000 0.492
#> SRR1420276 2 0.3116 0.85877 0.000 0.892 0.108
#> SRR1351347 3 0.1529 0.91465 0.040 0.000 0.960
#> SRR1405525 1 0.6215 0.43317 0.572 0.000 0.428
#> SRR1370329 1 0.6168 0.46944 0.588 0.000 0.412
#> SRR1465001 1 0.4062 0.77704 0.836 0.000 0.164
#> SRR1476525 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR819610 1 0.5363 0.68202 0.724 0.000 0.276
#> SRR2157314 3 0.0592 0.94409 0.012 0.000 0.988
#> SRR1409465 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR809987 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR613639 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1402285 1 0.1163 0.83232 0.972 0.000 0.028
#> SRR1077038 1 0.0892 0.83193 0.980 0.000 0.020
#> SRR1405660 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095455 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394734 1 0.1163 0.81859 0.972 0.028 0.000
#> SRR1317771 1 0.6252 0.39278 0.556 0.000 0.444
#> SRR1365894 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073581 1 0.6062 0.52397 0.616 0.000 0.384
#> SRR659804 1 0.5678 0.63244 0.684 0.000 0.316
#> SRR1345914 3 0.6204 0.26066 0.000 0.424 0.576
#> SRR1432186 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1473529 2 0.5325 0.65375 0.004 0.748 0.248
#> SRR660764 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR820448 3 0.0237 0.95031 0.004 0.000 0.996
#> SRR1328845 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336415 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379065 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1459190 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1346773 1 0.5058 0.71669 0.756 0.000 0.244
#> SRR1499521 1 0.0237 0.83704 0.996 0.000 0.004
#> SRR1440898 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.0237 0.94998 0.000 0.004 0.996
#> SRR1081209 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.4121 0.77508 0.832 0.000 0.168
#> SRR1333395 1 0.6079 0.51652 0.612 0.000 0.388
#> SRR1309248 1 0.1753 0.82645 0.952 0.000 0.048
#> SRR809161 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316320 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432629 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498931 1 0.5397 0.67750 0.720 0.000 0.280
#> SRR1416578 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405547 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470534 1 0.1753 0.82640 0.952 0.000 0.048
#> SRR1380764 1 0.1411 0.83043 0.964 0.000 0.036
#> SRR1309160 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR663489 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500450 3 0.6295 -0.12779 0.472 0.000 0.528
#> SRR1078489 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332648 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR660614 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470420 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1477949 1 0.6215 0.43296 0.572 0.000 0.428
#> SRR1481419 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.4062 0.72233 0.836 0.000 0.164
#> SRR615946 3 0.3267 0.82468 0.116 0.000 0.884
#> SRR1446481 2 0.6045 0.48148 0.380 0.620 0.000
#> SRR1467656 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1402962 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR660224 3 0.0592 0.94443 0.000 0.012 0.988
#> SRR665586 3 0.1289 0.92553 0.032 0.000 0.968
#> SRR1347166 1 0.6225 0.42343 0.568 0.000 0.432
#> SRR1485722 3 0.3816 0.78275 0.148 0.000 0.852
#> SRR1415316 1 0.5968 0.55942 0.636 0.000 0.364
#> SRR613390 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR661108 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR2170173 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR817329 3 0.0424 0.94734 0.008 0.000 0.992
#> SRR1401990 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1467745 1 0.1529 0.80948 0.960 0.040 0.000
#> SRR1471795 2 0.0424 0.93733 0.008 0.992 0.000
#> SRR1415637 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR813137 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1314873 1 0.6168 0.46922 0.588 0.000 0.412
#> SRR1401211 1 0.5760 0.61315 0.672 0.000 0.328
#> SRR1419692 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR818797 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR2164608 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455586 2 0.2711 0.87074 0.000 0.912 0.088
#> SRR819459 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488939 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433232 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385501 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1361652 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1437119 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478547 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1430910 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310584 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500216 1 0.0237 0.83724 0.996 0.000 0.004
#> SRR1486762 2 0.5529 0.60037 0.000 0.704 0.296
#> SRR1480854 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489394 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418085 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340221 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1473058 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1405165 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433004 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1471477 1 0.5560 0.65314 0.700 0.000 0.300
#> SRR1098567 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098712 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455038 3 0.0237 0.95031 0.004 0.000 0.996
#> SRR1375248 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403005 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1348378 2 0.4062 0.78472 0.000 0.836 0.164
#> SRR1413541 1 0.6295 0.31411 0.528 0.000 0.472
#> SRR1392943 1 0.4452 0.76055 0.808 0.000 0.192
#> SRR1475192 2 0.9601 0.25771 0.392 0.408 0.200
#> SRR1432085 2 0.3551 0.82432 0.000 0.868 0.132
#> SRR1452468 3 0.6168 0.12294 0.412 0.000 0.588
#> SRR1347060 3 0.0237 0.94998 0.000 0.004 0.996
#> SRR1414139 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1447962 2 0.4235 0.76893 0.000 0.824 0.176
#> SRR1444324 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1413436 1 0.6140 0.48589 0.596 0.000 0.404
#> SRR1311266 1 0.4842 0.73096 0.776 0.000 0.224
#> SRR1343302 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1373746 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429678 1 0.4974 0.72434 0.764 0.000 0.236
#> SRR1469413 2 0.5254 0.62704 0.000 0.736 0.264
#> SRR1405331 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345609 1 0.4452 0.76060 0.808 0.000 0.192
#> SRR1380208 1 0.5968 0.55933 0.636 0.000 0.364
#> SRR1322840 1 0.1964 0.82366 0.944 0.000 0.056
#> SRR1399797 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416654 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315081 3 0.1289 0.92553 0.000 0.032 0.968
#> SRR1369196 3 0.0237 0.94998 0.000 0.004 0.996
#> SRR1400847 1 0.0237 0.83704 0.996 0.000 0.004
#> SRR1365291 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1367920 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1366648 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441679 2 0.0000 0.94253 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363968 1 0.0237 0.83704 0.996 0.000 0.004
#> SRR814387 1 0.5678 0.63197 0.684 0.000 0.316
#> SRR657599 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1386689 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1395575 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453811 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441159 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403154 1 0.0000 0.83754 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468722 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310275 3 0.0000 0.95303 0.000 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR1474533 1 0.5055 0.39812 0.624 0.000 0.368 0.008
#> SRR1331708 4 0.4250 0.61119 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1464258 1 0.6068 0.07638 0.508 0.000 0.448 0.044
#> SRR1454201 3 0.3837 0.80726 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR661589 3 0.0592 0.83872 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1456229 3 0.3913 0.83323 0.028 0.000 0.824 0.148
#> SRR1315165 1 0.1474 0.74632 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1488960 4 0.2281 0.59785 0.000 0.000 0.096 0.904
#> SRR1417809 4 0.3726 0.63798 0.212 0.000 0.000 0.788
#> SRR1094457 1 0.4817 0.21347 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1095575 3 0.4134 0.78648 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR1315931 1 0.4542 0.57206 0.752 0.000 0.228 0.020
#> SRR1430066 3 0.1716 0.81892 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1431037 3 0.2101 0.81033 0.012 0.000 0.928 0.060
#> SRR1395554 3 0.1557 0.81727 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR818002 2 0.7651 0.11660 0.320 0.452 0.000 0.228
#> SRR1344143 4 0.4692 0.54894 0.032 0.212 0.000 0.756
#> SRR1486845 1 0.4103 0.53537 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR1362866 4 0.5496 0.44687 0.064 0.000 0.232 0.704
#> SRR1490740 3 0.5744 0.76770 0.108 0.000 0.708 0.184
#> SRR1446627 2 0.0188 0.89649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1456138 2 0.0707 0.88713 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1416248 1 0.0817 0.75463 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1383907 4 0.4866 0.46553 0.404 0.000 0.000 0.596
#> SRR1311018 1 0.1182 0.75086 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR1375699 1 0.0817 0.75375 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1429846 3 0.1398 0.83589 0.004 0.000 0.956 0.040
#> SRR613550 3 0.3610 0.82257 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1348402 4 0.4011 0.47185 0.008 0.000 0.208 0.784
#> SRR1345146 4 0.4761 -0.02379 0.000 0.000 0.372 0.628
#> SRR1324025 3 0.1824 0.81397 0.004 0.000 0.936 0.060
#> SRR1318879 3 0.4985 0.48309 0.000 0.000 0.532 0.468
#> SRR820755 3 0.3610 0.82210 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1485830 1 0.1474 0.74698 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR599313 1 0.1722 0.74020 0.944 0.000 0.048 0.008
#> SRR612263 3 0.4988 0.75145 0.020 0.000 0.692 0.288
#> SRR1415398 3 0.2589 0.84449 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1326205 4 0.4730 0.52509 0.364 0.000 0.000 0.636
#> SRR1421327 4 0.4933 0.40101 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1083311 3 0.2149 0.82567 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1499303 4 0.3942 0.63136 0.236 0.000 0.000 0.764
#> SRR1079522 4 0.2413 0.63237 0.064 0.000 0.020 0.916
#> SRR1452935 3 0.3172 0.83429 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR1379495 1 0.2542 0.71900 0.904 0.000 0.084 0.012
#> SRR1470459 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.1824 0.81666 0.004 0.000 0.936 0.060
#> SRR615778 4 0.5042 0.60353 0.136 0.000 0.096 0.768
#> SRR1447564 4 0.2271 0.60727 0.008 0.000 0.076 0.916
#> SRR1455195 3 0.4898 0.80968 0.072 0.000 0.772 0.156
#> SRR655182 3 0.4916 0.56506 0.000 0.000 0.576 0.424
#> SRR1335140 4 0.4035 0.57614 0.020 0.176 0.000 0.804
#> SRR1433555 3 0.1867 0.84578 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1308650 2 0.5703 0.68834 0.220 0.716 0.024 0.040
#> SRR1388354 4 0.2048 0.61137 0.008 0.000 0.064 0.928
#> SRR1317446 3 0.1716 0.82142 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1413602 3 0.1792 0.84493 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1479955 2 0.1716 0.85255 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR809853 3 0.3831 0.81783 0.004 0.000 0.792 0.204
#> SRR661313 3 0.1474 0.81940 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1499935 1 0.3873 0.58437 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1447303 3 0.2081 0.84555 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1429408 1 0.2704 0.70183 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1433950 1 0.6951 0.28936 0.544 0.000 0.132 0.324
#> SRR1362081 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1409854 3 0.3123 0.83569 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1435229 3 0.4323 0.82335 0.028 0.000 0.788 0.184
#> SRR1085996 3 0.3498 0.83396 0.008 0.000 0.832 0.160
#> SRR1414229 1 0.6457 0.31538 0.548 0.004 0.384 0.064
#> SRR1400974 3 0.1716 0.82142 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1399971 1 0.0657 0.75227 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR613927 3 0.3688 0.81843 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1457854 3 0.4675 0.79132 0.020 0.000 0.736 0.244
#> SRR1473714 1 0.3764 0.64218 0.816 0.000 0.172 0.012
#> SRR813776 3 0.3764 0.81366 0.000 0.000 0.784 0.216
#> SRR808196 1 0.4746 0.27677 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1101085 1 0.3074 0.68059 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR614395 3 0.6079 0.43134 0.048 0.000 0.544 0.408
#> SRR1478251 1 0.2647 0.70618 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1370551 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.1022 0.75428 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR665310 3 0.4564 0.71822 0.000 0.000 0.672 0.328
#> SRR1420109 3 0.2412 0.84474 0.008 0.000 0.908 0.084
#> SRR1330920 3 0.4903 0.76915 0.028 0.000 0.724 0.248
#> SRR1419539 1 0.6480 0.33857 0.564 0.008 0.368 0.060
#> SRR1359447 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347259 4 0.4761 0.51488 0.372 0.000 0.000 0.628
#> SRR613915 3 0.4304 0.76455 0.000 0.000 0.716 0.284
#> SRR1384395 3 0.8263 -0.12918 0.116 0.372 0.452 0.060
#> SRR821715 3 0.3266 0.83372 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1478228 1 0.2142 0.73602 0.928 0.000 0.056 0.016
#> SRR1445637 3 0.3539 0.82997 0.004 0.000 0.820 0.176
#> SRR608150 1 0.1022 0.75145 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1096383 3 0.4182 0.71780 0.180 0.000 0.796 0.024
#> SRR1341480 4 0.4996 0.25585 0.484 0.000 0.000 0.516
#> SRR1341344 1 0.1389 0.74715 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1326270 3 0.1890 0.81480 0.008 0.000 0.936 0.056
#> SRR1498838 3 0.1867 0.82285 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1416313 3 0.1557 0.81924 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR808566 1 0.2868 0.69843 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1430270 1 0.4985 -0.09973 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1367825 3 0.1716 0.81601 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR613533 3 0.1978 0.84443 0.004 0.000 0.928 0.068
#> SRR661267 3 0.2704 0.84375 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR810665 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 3 0.4153 0.76374 0.132 0.000 0.820 0.048
#> SRR1420067 1 0.5867 0.48964 0.688 0.000 0.216 0.096
#> SRR1473632 1 0.4266 0.65432 0.828 0.004 0.068 0.100
#> SRR812536 3 0.4996 0.42358 0.000 0.000 0.516 0.484
#> SRR1370850 4 0.4290 0.54653 0.016 0.212 0.000 0.772
#> SRR1486195 2 0.0804 0.88821 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR1407671 4 0.3441 0.58779 0.004 0.152 0.004 0.840
#> SRR1446375 3 0.4679 0.69133 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1465230 1 0.3907 0.57480 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR614119 3 0.2662 0.84459 0.016 0.000 0.900 0.084
#> SRR1356101 2 0.4181 0.77521 0.000 0.820 0.128 0.052
#> SRR1404209 3 0.3498 0.83441 0.008 0.000 0.832 0.160
#> SRR1392676 2 0.0188 0.89649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR665538 4 0.5386 0.14383 0.024 0.000 0.344 0.632
#> SRR660510 3 0.1022 0.84087 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1445655 4 0.4713 0.53589 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR658953 4 0.2149 0.60050 0.000 0.000 0.088 0.912
#> SRR2166459 3 0.4907 0.58510 0.000 0.000 0.580 0.420
#> SRR1070713 1 0.7017 0.43546 0.608 0.212 0.008 0.172
#> SRR1485312 3 0.1792 0.82003 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1317631 4 0.4072 0.62598 0.252 0.000 0.000 0.748
#> SRR1488610 1 0.3300 0.70238 0.848 0.000 0.008 0.144
#> SRR1330588 3 0.1716 0.81601 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1316367 1 0.6723 0.40298 0.616 0.000 0.196 0.188
#> SRR1433926 1 0.4553 0.61083 0.780 0.000 0.180 0.040
#> SRR1091302 1 0.2011 0.73224 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR818263 3 0.4888 0.67406 0.224 0.000 0.740 0.036
#> SRR1404909 4 0.4776 0.50730 0.376 0.000 0.000 0.624
#> SRR663076 1 0.2814 0.70618 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1323577 2 0.5035 0.68966 0.196 0.748 0.000 0.056
#> SRR1442422 1 0.4999 -0.19987 0.508 0.000 0.000 0.492
#> SRR1465893 1 0.0469 0.75446 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR654862 3 0.3818 0.83459 0.048 0.000 0.844 0.108
#> SRR1407112 1 0.1211 0.74954 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1332969 3 0.1637 0.82326 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1353199 3 0.3356 0.83195 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1378885 3 0.1576 0.84276 0.004 0.000 0.948 0.048
#> SRR665357 2 0.2704 0.79444 0.000 0.876 0.124 0.000
#> SRR662186 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.1474 0.82656 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1347819 3 0.1743 0.81591 0.004 0.000 0.940 0.056
#> SRR1480813 2 0.3569 0.74561 0.196 0.804 0.000 0.000
#> SRR1472576 4 0.3764 0.63725 0.216 0.000 0.000 0.784
#> SRR1431781 1 0.4804 0.22087 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1452270 3 0.4431 0.68863 0.000 0.000 0.696 0.304
#> SRR1500472 3 0.4477 0.73873 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR1417632 4 0.4981 0.31880 0.464 0.000 0.000 0.536
#> SRR1350153 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.1557 0.81924 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1326579 1 0.5152 0.45202 0.664 0.000 0.020 0.316
#> SRR1349363 2 0.4955 0.20878 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1096712 3 0.1716 0.81892 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1090407 3 0.1940 0.84570 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1083752 1 0.7322 0.30669 0.532 0.224 0.000 0.244
#> SRR1377599 4 0.4585 0.56676 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR1488449 3 0.4382 0.74991 0.000 0.000 0.704 0.296
#> SRR1318354 3 0.3606 0.83752 0.000 0.020 0.840 0.140
#> SRR1359062 3 0.2695 0.80193 0.008 0.024 0.912 0.056
#> SRR1398924 3 0.4585 0.71103 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR663783 3 0.3172 0.83549 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR1319204 3 0.4706 0.80154 0.000 0.028 0.748 0.224
#> SRR1369070 2 0.0188 0.89649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR615659 3 0.4123 0.80841 0.008 0.000 0.772 0.220
#> SRR1337449 2 0.0188 0.89597 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1316982 2 0.5883 0.72850 0.048 0.740 0.160 0.052
#> SRR1498595 4 0.4399 0.63285 0.224 0.016 0.000 0.760
#> SRR1377423 3 0.3649 0.81940 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1312310 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.3047 0.69272 0.872 0.000 0.116 0.012
#> SRR1338426 3 0.3172 0.83738 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR1353309 3 0.1118 0.84258 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR658941 1 0.5986 0.43668 0.620 0.000 0.320 0.060
#> SRR1101643 1 0.1022 0.75397 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1401468 1 0.1890 0.73563 0.936 0.000 0.056 0.008
#> SRR1368874 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324085 1 0.1792 0.73884 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1363858 1 0.1209 0.74707 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR819820 3 0.3219 0.83415 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1337342 3 0.7172 0.26947 0.376 0.000 0.484 0.140
#> SRR655206 4 0.4130 0.63588 0.108 0.000 0.064 0.828
#> SRR1387013 1 0.5557 0.45953 0.652 0.308 0.000 0.040
#> SRR1317410 1 0.1174 0.74981 0.968 0.000 0.020 0.012
#> SRR608198 1 0.0921 0.75304 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1440161 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0188 0.89649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1415379 4 0.4431 0.59185 0.304 0.000 0.000 0.696
#> SRR1099622 2 0.7812 0.59366 0.184 0.592 0.168 0.056
#> SRR663197 3 0.1557 0.82234 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1394836 4 0.7307 0.05363 0.376 0.000 0.156 0.468
#> SRR661699 4 0.2408 0.59592 0.000 0.000 0.104 0.896
#> SRR813680 3 0.2593 0.84631 0.004 0.000 0.892 0.104
#> SRR1410678 1 0.3873 0.59811 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1378109 4 0.4961 0.37055 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR1499174 3 0.6320 0.67931 0.204 0.000 0.656 0.140
#> SRR1311486 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1382851 1 0.4804 0.21890 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1433410 1 0.0895 0.75483 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR661167 3 0.2345 0.84510 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1432518 3 0.3219 0.83451 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR660462 3 0.4134 0.78386 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR1374608 4 0.4040 0.62745 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR657949 4 0.5000 -0.41404 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1308882 4 0.4624 0.55706 0.340 0.000 0.000 0.660
#> SRR655768 3 0.3764 0.81182 0.000 0.000 0.784 0.216
#> SRR1485870 1 0.4941 0.01783 0.564 0.000 0.000 0.436
#> SRR1444138 3 0.4586 0.81974 0.068 0.000 0.796 0.136
#> SRR1417342 4 0.3726 0.63866 0.212 0.000 0.000 0.788
#> SRR1470193 4 0.4040 0.62764 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR1091380 3 0.1743 0.84364 0.004 0.000 0.940 0.056
#> SRR1099096 1 0.0592 0.75458 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1313583 1 0.4304 0.48411 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1467102 2 0.7159 0.44721 0.020 0.540 0.352 0.088
#> SRR1485416 4 0.4564 0.56945 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR818821 3 0.3649 0.81989 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR809963 4 0.4522 0.19231 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR1072247 1 0.0188 0.75355 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1353710 1 0.4222 0.49884 0.728 0.000 0.000 0.272
#> SRR1445259 3 0.3356 0.82887 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1408393 3 0.4746 0.66785 0.000 0.000 0.632 0.368
#> SRR1361522 1 0.6350 0.45913 0.636 0.000 0.112 0.252
#> SRR1368597 1 0.5453 0.23155 0.592 0.000 0.020 0.388
#> SRR1309680 4 0.4267 0.53488 0.004 0.216 0.008 0.772
#> SRR1310542 3 0.2300 0.81622 0.000 0.016 0.920 0.064
#> SRR1333485 4 0.4543 0.57366 0.324 0.000 0.000 0.676
#> SRR1406437 4 0.5366 0.59903 0.276 0.000 0.040 0.684
#> SRR1354931 3 0.6305 0.07913 0.424 0.000 0.516 0.060
#> SRR1391856 1 0.6118 0.54080 0.672 0.000 0.208 0.120
#> SRR1446738 1 0.3400 0.66951 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1309032 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 4 0.4955 0.34068 0.000 0.344 0.008 0.648
#> SRR1432611 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.2915 0.81931 0.000 0.028 0.892 0.080
#> SRR613150 3 0.2345 0.82316 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1375329 3 0.4222 0.77568 0.000 0.000 0.728 0.272
#> SRR1387921 1 0.3942 0.62250 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1466792 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 3 0.3972 0.81752 0.008 0.000 0.788 0.204
#> SRR812943 4 0.4103 0.36020 0.000 0.000 0.256 0.744
#> SRR1400910 4 0.7387 -0.12085 0.004 0.144 0.384 0.468
#> SRR1444203 4 0.4877 0.45314 0.408 0.000 0.000 0.592
#> SRR816177 4 0.4713 0.53496 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR658754 3 0.2553 0.80424 0.016 0.008 0.916 0.060
#> SRR1429603 4 0.4843 0.48086 0.396 0.000 0.000 0.604
#> SRR1397366 3 0.1940 0.84582 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1446028 4 0.3688 0.63369 0.208 0.000 0.000 0.792
#> SRR1083918 1 0.6637 0.39727 0.572 0.324 0.000 0.104
#> SRR1337606 1 0.0817 0.75344 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR659109 3 0.1902 0.81473 0.004 0.000 0.932 0.064
#> SRR1337192 1 0.1211 0.75037 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR656946 1 0.4967 0.00233 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR1476102 4 0.4477 0.58855 0.312 0.000 0.000 0.688
#> SRR1476447 1 0.1022 0.75397 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1342067 4 0.4955 0.37182 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR1385389 1 0.4331 0.47103 0.712 0.000 0.000 0.288
#> SRR1075971 3 0.4290 0.82636 0.036 0.000 0.800 0.164
#> SRR614419 4 0.1978 0.60887 0.004 0.000 0.068 0.928
#> SRR1322936 1 0.0592 0.75438 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1349121 1 0.4086 0.58824 0.776 0.000 0.216 0.008
#> SRR1430549 1 0.1833 0.74341 0.944 0.000 0.024 0.032
#> SRR612935 3 0.4679 0.69102 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR661481 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.0376 0.89428 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1393596 4 0.4222 0.61382 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1452164 3 0.6953 0.29750 0.112 0.000 0.476 0.412
#> SRR1070503 3 0.0779 0.83791 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR1499894 3 0.2216 0.82457 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1082883 1 0.0707 0.75374 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1468271 1 0.6587 0.32468 0.576 0.000 0.324 0.100
#> SRR1332443 1 0.3486 0.64200 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR810295 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662103 4 0.3356 0.51633 0.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR1328620 3 0.3219 0.83480 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1396294 1 0.0921 0.75446 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1419917 3 0.4992 0.46190 0.000 0.000 0.524 0.476
#> SRR662114 3 0.1716 0.84598 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1489199 3 0.3224 0.84124 0.016 0.000 0.864 0.120
#> SRR813584 4 0.5487 0.45518 0.400 0.020 0.000 0.580
#> SRR1069638 1 0.5464 0.53662 0.708 0.000 0.228 0.064
#> SRR614864 3 0.1209 0.84061 0.004 0.000 0.964 0.032
#> SRR1433392 3 0.2924 0.84321 0.016 0.000 0.884 0.100
#> SRR1377777 2 0.0188 0.89649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2167710 4 0.2281 0.59763 0.000 0.000 0.096 0.904
#> SRR1401252 4 0.4072 0.62445 0.252 0.000 0.000 0.748
#> SRR1309963 4 0.4761 0.51871 0.372 0.000 0.000 0.628
#> SRR1338031 3 0.3975 0.79748 0.000 0.000 0.760 0.240
#> SRR1418628 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 4 0.4898 0.42781 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1380393 1 0.1545 0.74581 0.952 0.000 0.040 0.008
#> SRR1319731 1 0.1970 0.73719 0.932 0.000 0.060 0.008
#> SRR1356468 1 0.2647 0.70944 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1337010 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.0336 0.75248 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1486538 4 0.3688 0.63865 0.208 0.000 0.000 0.792
#> SRR1340486 1 0.1302 0.74831 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1377696 4 0.6534 0.53552 0.220 0.148 0.000 0.632
#> SRR1465459 3 0.2345 0.84510 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1080270 3 0.2553 0.80424 0.016 0.008 0.916 0.060
#> SRR1312501 3 0.1398 0.84303 0.004 0.000 0.956 0.040
#> SRR1093148 3 0.5247 0.72861 0.100 0.000 0.752 0.148
#> SRR1467080 3 0.2714 0.82144 0.000 0.004 0.884 0.112
#> SRR1410866 2 0.0336 0.89383 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR816475 1 0.3764 0.60897 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1379198 1 0.4134 0.53189 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR613342 3 0.2469 0.84423 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1452246 2 0.2868 0.80773 0.136 0.864 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0188 0.89649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1369129 4 0.4999 0.23117 0.492 0.000 0.000 0.508
#> SRR1396616 3 0.4685 0.69133 0.156 0.000 0.784 0.060
#> SRR813824 3 0.0336 0.83665 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1082376 3 0.3157 0.83754 0.004 0.000 0.852 0.144
#> SRR1500891 4 0.3837 0.63540 0.224 0.000 0.000 0.776
#> SRR807543 3 0.2271 0.84455 0.008 0.000 0.916 0.076
#> SRR1091572 1 0.0524 0.75208 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1346689 4 0.4564 0.56901 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1332424 1 0.1388 0.74801 0.960 0.000 0.028 0.012
#> SRR663729 4 0.4477 0.58416 0.312 0.000 0.000 0.688
#> SRR1097013 3 0.3708 0.83534 0.020 0.000 0.832 0.148
#> SRR613675 1 0.0188 0.75329 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1485357 1 0.2345 0.72019 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR655816 4 0.4817 -0.04810 0.000 0.000 0.388 0.612
#> SRR1500113 1 0.4285 0.65527 0.820 0.000 0.104 0.076
#> SRR1437622 4 0.4356 0.60287 0.292 0.000 0.000 0.708
#> SRR1355172 3 0.2125 0.84560 0.004 0.000 0.920 0.076
#> SRR655531 4 0.2466 0.59956 0.004 0.000 0.096 0.900
#> SRR1338147 3 0.2443 0.80460 0.024 0.000 0.916 0.060
#> SRR1413329 4 0.4477 0.21663 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR1485931 2 0.0188 0.89649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1420873 1 0.4819 0.35600 0.652 0.000 0.004 0.344
#> SRR1333308 1 0.4761 0.26570 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1452033 1 0.3479 0.66670 0.840 0.000 0.148 0.012
#> SRR1467316 2 0.0188 0.89649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR809018 3 0.1867 0.82285 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1375351 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.4304 0.75968 0.000 0.000 0.716 0.284
#> SRR1471755 1 0.2334 0.71694 0.908 0.088 0.000 0.004
#> SRR808019 3 0.3164 0.82542 0.064 0.000 0.884 0.052
#> SRR1479133 3 0.2868 0.84150 0.000 0.000 0.864 0.136
#> SRR615069 3 0.3355 0.83749 0.000 0.004 0.836 0.160
#> SRR1456185 2 0.4364 0.69742 0.220 0.764 0.000 0.016
#> SRR1350069 1 0.1211 0.74954 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR816316 3 0.3219 0.83328 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR664795 4 0.5000 -0.40713 0.000 0.000 0.500 0.500
#> SRR1490721 4 0.4843 0.47504 0.396 0.000 0.000 0.604
#> SRR810643 1 0.6422 0.38503 0.616 0.000 0.280 0.104
#> SRR1430333 4 0.3751 0.48584 0.004 0.000 0.196 0.800
#> SRR1085285 3 0.2647 0.84445 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1099072 3 0.3024 0.83963 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1317985 3 0.4949 0.80762 0.060 0.000 0.760 0.180
#> SRR1487340 3 0.5848 0.58844 0.040 0.000 0.584 0.376
#> SRR1420276 3 0.5573 0.45635 0.000 0.272 0.676 0.052
#> SRR1351347 3 0.3820 0.75929 0.088 0.000 0.848 0.064
#> SRR1405525 4 0.3208 0.55867 0.004 0.000 0.148 0.848
#> SRR1370329 1 0.7192 0.10691 0.472 0.000 0.140 0.388
#> SRR1465001 1 0.0817 0.75548 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1476525 2 0.0188 0.89649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR819610 4 0.4250 0.61309 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR2157314 4 0.2408 0.59337 0.000 0.000 0.104 0.896
#> SRR1409465 2 0.0188 0.89649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR809987 1 0.1211 0.74954 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR613639 3 0.3123 0.83770 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1402285 4 0.4697 0.53699 0.356 0.000 0.000 0.644
#> SRR1077038 1 0.3271 0.67876 0.856 0.000 0.132 0.012
#> SRR1405660 3 0.1637 0.82326 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1095455 3 0.3726 0.81445 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1394734 4 0.6698 0.41861 0.372 0.096 0.000 0.532
#> SRR1317771 4 0.4070 0.63704 0.132 0.000 0.044 0.824
#> SRR1365894 1 0.1389 0.74730 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1073581 1 0.5697 0.45671 0.664 0.000 0.280 0.056
#> SRR659804 1 0.6187 0.44304 0.672 0.000 0.144 0.184
#> SRR1345914 4 0.4538 0.52425 0.000 0.216 0.024 0.760
#> SRR1432186 2 0.0336 0.89474 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1473529 4 0.4499 0.51785 0.004 0.228 0.012 0.756
#> SRR660764 3 0.4655 0.73366 0.000 0.004 0.684 0.312
#> SRR820448 3 0.4356 0.75886 0.000 0.000 0.708 0.292
#> SRR1328845 1 0.2530 0.71088 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1336415 1 0.3400 0.64707 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1379065 4 0.4898 0.43739 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1459190 3 0.4250 0.77175 0.000 0.000 0.724 0.276
#> SRR1346773 1 0.5058 0.58638 0.768 0.000 0.128 0.104
#> SRR1499521 1 0.1890 0.73549 0.936 0.000 0.056 0.008
#> SRR1440898 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.1743 0.81578 0.000 0.004 0.940 0.056
#> SRR1081209 2 0.0188 0.89649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1400202 1 0.3726 0.62538 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1333395 4 0.2704 0.64264 0.124 0.000 0.000 0.876
#> SRR1309248 4 0.4040 0.62668 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR809161 3 0.4564 0.71800 0.000 0.000 0.672 0.328
#> SRR1316320 4 0.5003 0.58192 0.308 0.016 0.000 0.676
#> SRR1432629 2 0.3569 0.70965 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1498931 1 0.2593 0.71987 0.904 0.000 0.080 0.016
#> SRR1416578 4 0.4898 0.43773 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1405547 3 0.1716 0.81892 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1470534 4 0.4605 0.56141 0.336 0.000 0.000 0.664
#> SRR1380764 1 0.0707 0.75482 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1309160 3 0.2469 0.84541 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR663489 3 0.3873 0.74826 0.000 0.000 0.772 0.228
#> SRR1500450 4 0.2799 0.59624 0.008 0.000 0.108 0.884
#> SRR1078489 1 0.0927 0.75034 0.976 0.000 0.016 0.008
#> SRR1332648 4 0.4955 0.37272 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR660614 2 0.3402 0.75591 0.000 0.832 0.164 0.004
#> SRR1470420 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.0817 0.75463 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1477949 4 0.3828 0.62113 0.084 0.000 0.068 0.848
#> SRR1481419 2 0.0188 0.89649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1464766 1 0.4212 0.60088 0.772 0.000 0.216 0.012
#> SRR615946 3 0.4673 0.70214 0.140 0.004 0.796 0.060
#> SRR1446481 2 0.5336 0.12733 0.492 0.500 0.004 0.004
#> SRR1467656 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1402962 3 0.3400 0.82898 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR660224 4 0.3550 0.59793 0.000 0.096 0.044 0.860
#> SRR665586 4 0.3975 0.38973 0.000 0.000 0.240 0.760
#> SRR1347166 4 0.3301 0.62882 0.076 0.000 0.048 0.876
#> SRR1485722 3 0.4379 0.69183 0.172 0.000 0.792 0.036
#> SRR1415316 4 0.2918 0.64028 0.116 0.000 0.008 0.876
#> SRR613390 3 0.3688 0.81622 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR661108 3 0.1716 0.82142 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR2170173 4 0.3688 0.45313 0.000 0.000 0.208 0.792
#> SRR817329 3 0.4585 0.71563 0.000 0.000 0.668 0.332
#> SRR1401990 1 0.4776 0.24358 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1467745 1 0.2751 0.70647 0.904 0.000 0.040 0.056
#> SRR1471795 2 0.3401 0.75710 0.008 0.840 0.000 0.152
#> SRR1415637 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813137 3 0.4164 0.78398 0.000 0.000 0.736 0.264
#> SRR1314873 4 0.2480 0.63805 0.088 0.000 0.008 0.904
#> SRR1401211 1 0.3707 0.67238 0.840 0.000 0.132 0.028
#> SRR1419692 1 0.0336 0.75325 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR818797 3 0.1389 0.84400 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR2164608 4 0.4624 0.11768 0.000 0.000 0.340 0.660
#> SRR1455586 3 0.6381 0.24823 0.008 0.340 0.592 0.060
#> SRR819459 3 0.2198 0.81733 0.000 0.008 0.920 0.072
#> SRR1488939 2 0.4511 0.57555 0.008 0.724 0.000 0.268
#> SRR1433232 2 0.0188 0.89649 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1385501 3 0.3528 0.82447 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1361652 4 0.3764 0.43284 0.000 0.000 0.216 0.784
#> SRR1437119 1 0.0779 0.75431 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1478547 3 0.1637 0.82041 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1430910 3 0.3219 0.83249 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1310584 1 0.0188 0.75355 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1500216 1 0.1938 0.73745 0.936 0.000 0.052 0.012
#> SRR1486762 3 0.6322 0.54473 0.052 0.188 0.704 0.056
#> SRR1480854 1 0.4761 0.26576 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1489394 4 0.4817 0.48997 0.388 0.000 0.000 0.612
#> SRR1418085 1 0.3942 0.56794 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1340221 4 0.4992 0.28272 0.476 0.000 0.000 0.524
#> SRR1473058 1 0.1557 0.74468 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1405165 3 0.1867 0.82285 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1433004 3 0.3649 0.81830 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1471477 1 0.3885 0.70839 0.844 0.000 0.064 0.092
#> SRR1098567 2 0.2216 0.83265 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1098712 1 0.0336 0.75248 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1455038 3 0.3708 0.83514 0.020 0.000 0.832 0.148
#> SRR1375248 2 0.3453 0.81487 0.000 0.868 0.080 0.052
#> SRR1403005 3 0.3311 0.83223 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR1348378 2 0.3831 0.71598 0.000 0.792 0.204 0.004
#> SRR1413541 3 0.5168 0.41518 0.004 0.000 0.504 0.492
#> SRR1392943 4 0.4941 0.39387 0.436 0.000 0.000 0.564
#> SRR1475192 1 0.6404 0.31048 0.548 0.004 0.388 0.060
#> SRR1432085 2 0.7332 0.25494 0.044 0.472 0.428 0.056
#> SRR1452468 4 0.4933 -0.23270 0.000 0.000 0.432 0.568
#> SRR1347060 3 0.1824 0.81397 0.004 0.000 0.936 0.060
#> SRR1414139 3 0.3539 0.80430 0.000 0.004 0.820 0.176
#> SRR1447962 2 0.6437 0.63477 0.000 0.648 0.168 0.184
#> SRR1444324 2 0.0188 0.89597 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1415004 1 0.0592 0.75421 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1413436 4 0.4149 0.64178 0.168 0.000 0.028 0.804
#> SRR1311266 1 0.5349 0.43072 0.640 0.000 0.336 0.024
#> SRR1343302 1 0.3569 0.62669 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1373746 1 0.0804 0.75180 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1429678 1 0.1118 0.75528 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1469413 2 0.7363 0.39141 0.000 0.492 0.332 0.176
#> SRR1405331 3 0.2032 0.82771 0.036 0.000 0.936 0.028
#> SRR1345609 4 0.3975 0.63052 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1380208 4 0.3266 0.64330 0.168 0.000 0.000 0.832
#> SRR1322840 4 0.4331 0.60410 0.288 0.000 0.000 0.712
#> SRR1399797 3 0.1637 0.82041 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1416654 3 0.1661 0.81810 0.004 0.000 0.944 0.052
#> SRR1315081 3 0.3071 0.79828 0.000 0.044 0.888 0.068
#> SRR1369196 3 0.2924 0.79504 0.036 0.004 0.900 0.060
#> SRR1400847 1 0.1042 0.75003 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR1365291 3 0.2704 0.84344 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1367920 4 0.4999 0.23009 0.492 0.000 0.000 0.508
#> SRR1366648 3 0.1792 0.82168 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1441679 2 0.0000 0.89727 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 3 0.0804 0.83476 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR1363968 1 0.1151 0.74905 0.968 0.000 0.024 0.008
#> SRR814387 1 0.3649 0.62571 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR657599 3 0.4382 0.75198 0.000 0.000 0.704 0.296
#> SRR1386689 1 0.2868 0.69136 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1395575 3 0.1792 0.82003 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1453811 3 0.0657 0.83292 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR1441159 1 0.1284 0.74903 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR1403154 1 0.3486 0.63722 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1468722 3 0.1637 0.83676 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1310275 3 0.2443 0.80431 0.024 0.000 0.916 0.060
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR1474533 3 0.5447 0.196969 0.356 0.000 0.572 0.072 0.000
#> SRR1331708 4 0.4517 0.668218 0.112 0.008 0.028 0.796 0.056
#> SRR1464258 1 0.5673 -0.116854 0.500 0.000 0.080 0.000 0.420
#> SRR1454201 5 0.2171 0.716839 0.024 0.000 0.064 0.000 0.912
#> SRR661589 3 0.4066 0.535114 0.004 0.000 0.672 0.000 0.324
#> SRR1456229 5 0.4149 0.699382 0.128 0.000 0.088 0.000 0.784
#> SRR1315165 1 0.6244 -0.068520 0.444 0.000 0.144 0.412 0.000
#> SRR1488960 4 0.4760 0.308992 0.000 0.000 0.020 0.564 0.416
#> SRR1417809 4 0.1989 0.700177 0.020 0.000 0.032 0.932 0.016
#> SRR1094457 4 0.4861 0.263842 0.428 0.000 0.024 0.548 0.000
#> SRR1095575 5 0.2464 0.715889 0.012 0.000 0.092 0.004 0.892
#> SRR1315931 1 0.4990 0.187537 0.600 0.000 0.040 0.000 0.360
#> SRR1430066 3 0.2488 0.722413 0.000 0.000 0.872 0.004 0.124
#> SRR1431037 3 0.3531 0.710382 0.036 0.000 0.816 0.000 0.148
#> SRR1395554 3 0.3841 0.691211 0.032 0.000 0.780 0.000 0.188
#> SRR818002 2 0.6705 0.492764 0.252 0.584 0.032 0.120 0.012
#> SRR1344143 2 0.7534 0.178747 0.024 0.444 0.036 0.356 0.140
#> SRR1486845 1 0.4818 -0.000254 0.520 0.000 0.020 0.460 0.000
#> SRR1362866 5 0.3048 0.660086 0.036 0.000 0.024 0.060 0.880
#> SRR1490740 5 0.3535 0.679506 0.164 0.000 0.028 0.000 0.808
#> SRR1446627 2 0.0162 0.893492 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.3678 0.821951 0.012 0.856 0.036 0.064 0.032
#> SRR1416248 1 0.2060 0.676562 0.924 0.000 0.008 0.016 0.052
#> SRR1383907 4 0.4402 0.633212 0.204 0.000 0.056 0.740 0.000
#> SRR1311018 1 0.4549 0.050588 0.528 0.000 0.008 0.000 0.464
#> SRR1375699 1 0.2102 0.661676 0.916 0.000 0.012 0.068 0.004
#> SRR1429846 3 0.2956 0.711892 0.012 0.000 0.872 0.020 0.096
#> SRR613550 3 0.5431 0.070381 0.000 0.000 0.516 0.060 0.424
#> SRR1348402 4 0.4968 0.135733 0.000 0.000 0.028 0.516 0.456
#> SRR1345146 5 0.3452 0.601727 0.000 0.000 0.032 0.148 0.820
#> SRR1324025 3 0.3366 0.712405 0.032 0.000 0.828 0.000 0.140
#> SRR1318879 4 0.6706 0.060108 0.000 0.000 0.256 0.416 0.328
#> SRR820755 5 0.4326 0.593510 0.000 0.000 0.264 0.028 0.708
#> SRR1485830 1 0.3163 0.603902 0.824 0.000 0.012 0.164 0.000
#> SRR599313 1 0.2843 0.670532 0.876 0.000 0.076 0.000 0.048
#> SRR612263 5 0.2610 0.719444 0.028 0.000 0.076 0.004 0.892
#> SRR1415398 5 0.4747 0.025522 0.000 0.000 0.488 0.016 0.496
#> SRR1326205 4 0.4858 0.627985 0.184 0.000 0.032 0.740 0.044
#> SRR1421327 4 0.4394 0.620958 0.220 0.000 0.048 0.732 0.000
#> SRR1083311 3 0.3239 0.712927 0.000 0.004 0.828 0.012 0.156
#> SRR1499303 4 0.2086 0.696243 0.028 0.000 0.016 0.928 0.028
#> SRR1079522 4 0.4203 0.635333 0.008 0.012 0.032 0.792 0.156
#> SRR1452935 5 0.3241 0.704728 0.024 0.000 0.144 0.000 0.832
#> SRR1379495 1 0.4497 0.274132 0.632 0.000 0.016 0.000 0.352
#> SRR1470459 2 0.0609 0.891609 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.4252 0.604616 0.020 0.000 0.700 0.000 0.280
#> SRR615778 4 0.6288 0.542502 0.112 0.000 0.048 0.628 0.212
#> SRR1447564 5 0.4440 0.524331 0.020 0.000 0.028 0.200 0.752
#> SRR1455195 5 0.4571 0.675411 0.188 0.000 0.076 0.000 0.736
#> SRR655182 5 0.2270 0.686263 0.052 0.000 0.020 0.012 0.916
#> SRR1335140 4 0.4226 0.652447 0.000 0.096 0.028 0.808 0.068
#> SRR1433555 5 0.4264 0.414672 0.000 0.000 0.376 0.004 0.620
#> SRR1308650 2 0.4931 0.747752 0.104 0.752 0.120 0.024 0.000
#> SRR1388354 5 0.4584 0.512486 0.020 0.000 0.032 0.208 0.740
#> SRR1317446 3 0.3074 0.694735 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1413602 3 0.3804 0.705069 0.000 0.000 0.796 0.044 0.160
#> SRR1479955 2 0.4017 0.793653 0.000 0.824 0.032 0.084 0.060
#> SRR809853 5 0.2300 0.713829 0.052 0.000 0.040 0.000 0.908
#> SRR661313 3 0.4639 0.428978 0.020 0.000 0.612 0.000 0.368
#> SRR1499935 1 0.4885 0.197493 0.572 0.000 0.028 0.400 0.000
#> SRR1447303 5 0.3779 0.645573 0.012 0.000 0.236 0.000 0.752
#> SRR1429408 4 0.6308 0.231339 0.388 0.000 0.156 0.456 0.000
#> SRR1433950 5 0.3659 0.595432 0.220 0.000 0.012 0.000 0.768
#> SRR1362081 2 0.0404 0.894109 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1409854 5 0.3573 0.699805 0.036 0.000 0.152 0.000 0.812
#> SRR1435229 5 0.2953 0.672765 0.144 0.000 0.012 0.000 0.844
#> SRR1085996 5 0.3702 0.709289 0.096 0.000 0.084 0.000 0.820
#> SRR1414229 1 0.4748 0.528991 0.728 0.000 0.100 0.000 0.172
#> SRR1400974 3 0.3010 0.707039 0.000 0.000 0.824 0.004 0.172
#> SRR1399971 1 0.3048 0.616948 0.820 0.000 0.004 0.000 0.176
#> SRR613927 5 0.3999 0.626739 0.000 0.000 0.240 0.020 0.740
#> SRR1457854 5 0.2707 0.701361 0.100 0.000 0.024 0.000 0.876
#> SRR1473714 1 0.4075 0.584834 0.780 0.000 0.060 0.000 0.160
#> SRR813776 5 0.4800 0.559501 0.000 0.000 0.272 0.052 0.676
#> SRR808196 4 0.4747 0.079071 0.488 0.000 0.016 0.496 0.000
#> SRR1101085 1 0.3618 0.578754 0.788 0.000 0.012 0.196 0.004
#> SRR614395 4 0.6803 0.306371 0.016 0.000 0.196 0.492 0.296
#> SRR1478251 1 0.4193 0.429522 0.684 0.000 0.012 0.304 0.000
#> SRR1370551 2 0.0404 0.894109 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.2707 0.673305 0.888 0.000 0.008 0.024 0.080
#> SRR665310 5 0.5446 0.530571 0.000 0.000 0.176 0.164 0.660
#> SRR1420109 5 0.4487 0.691812 0.104 0.000 0.140 0.000 0.756
#> SRR1330920 5 0.5182 0.662171 0.032 0.000 0.184 0.064 0.720
#> SRR1419539 3 0.3608 0.593322 0.064 0.000 0.824 0.112 0.000
#> SRR1359447 2 0.0510 0.893289 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1347259 4 0.3182 0.683642 0.124 0.000 0.032 0.844 0.000
#> SRR613915 5 0.6817 -0.030180 0.000 0.000 0.344 0.308 0.348
#> SRR1384395 3 0.4234 0.654461 0.088 0.088 0.804 0.000 0.020
#> SRR821715 5 0.4138 0.587703 0.000 0.000 0.276 0.016 0.708
#> SRR1478228 5 0.4648 0.170312 0.464 0.000 0.012 0.000 0.524
#> SRR1445637 5 0.3759 0.706790 0.056 0.000 0.136 0.000 0.808
#> SRR608150 1 0.4021 0.569080 0.764 0.000 0.036 0.200 0.000
#> SRR1096383 3 0.6750 0.217457 0.280 0.000 0.480 0.008 0.232
#> SRR1341480 4 0.4592 0.476575 0.332 0.000 0.024 0.644 0.000
#> SRR1341344 1 0.3812 0.569579 0.772 0.000 0.024 0.204 0.000
#> SRR1326270 3 0.5139 0.493192 0.060 0.000 0.624 0.000 0.316
#> SRR1498838 3 0.3366 0.682260 0.000 0.000 0.784 0.004 0.212
#> SRR1416313 3 0.3527 0.694998 0.016 0.000 0.792 0.000 0.192
#> SRR808566 4 0.6375 0.380482 0.316 0.000 0.188 0.496 0.000
#> SRR1430270 1 0.5047 0.262530 0.588 0.000 0.016 0.380 0.016
#> SRR1367825 3 0.2351 0.721323 0.016 0.000 0.896 0.000 0.088
#> SRR613533 5 0.4496 0.658531 0.056 0.000 0.216 0.000 0.728
#> SRR661267 3 0.4971 -0.005165 0.000 0.000 0.512 0.028 0.460
#> SRR810665 2 0.0290 0.894615 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1407250 5 0.5651 0.599179 0.248 0.000 0.132 0.000 0.620
#> SRR1420067 1 0.5166 -0.007601 0.528 0.000 0.032 0.004 0.436
#> SRR1473632 5 0.5768 0.187102 0.412 0.012 0.036 0.012 0.528
#> SRR812536 4 0.5559 0.318674 0.000 0.000 0.344 0.572 0.084
#> SRR1370850 4 0.2729 0.696880 0.008 0.020 0.056 0.900 0.016
#> SRR1486195 2 0.4402 0.451259 0.000 0.636 0.352 0.012 0.000
#> SRR1407671 4 0.4220 0.648256 0.000 0.056 0.032 0.808 0.104
#> SRR1446375 5 0.1405 0.683266 0.008 0.000 0.016 0.020 0.956
#> SRR1465230 1 0.4574 0.176959 0.576 0.000 0.012 0.412 0.000
#> SRR614119 5 0.5450 0.614019 0.124 0.000 0.228 0.000 0.648
#> SRR1356101 3 0.4434 0.085883 0.004 0.460 0.536 0.000 0.000
#> SRR1404209 5 0.4482 0.688597 0.088 0.000 0.160 0.000 0.752
#> SRR1392676 2 0.0162 0.893492 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR665538 4 0.4096 0.653295 0.000 0.000 0.144 0.784 0.072
#> SRR660510 3 0.3519 0.679593 0.000 0.000 0.776 0.008 0.216
#> SRR1445655 4 0.3410 0.690465 0.092 0.000 0.068 0.840 0.000
#> SRR658953 4 0.3555 0.646920 0.000 0.000 0.052 0.824 0.124
#> SRR2166459 5 0.4457 0.603749 0.000 0.000 0.092 0.152 0.756
#> SRR1070713 3 0.6377 -0.062711 0.124 0.016 0.532 0.328 0.000
#> SRR1485312 3 0.2036 0.713670 0.000 0.000 0.920 0.024 0.056
#> SRR1317631 4 0.2409 0.700050 0.032 0.000 0.068 0.900 0.000
#> SRR1488610 1 0.5101 0.397479 0.628 0.000 0.032 0.012 0.328
#> SRR1330588 3 0.3602 0.699517 0.024 0.000 0.796 0.000 0.180
#> SRR1316367 5 0.4104 0.587298 0.220 0.000 0.032 0.000 0.748
#> SRR1433926 1 0.4650 -0.046944 0.520 0.000 0.012 0.000 0.468
#> SRR1091302 1 0.5803 -0.007647 0.488 0.000 0.092 0.420 0.000
#> SRR818263 5 0.6241 0.484021 0.324 0.000 0.164 0.000 0.512
#> SRR1404909 4 0.3851 0.663417 0.164 0.004 0.036 0.796 0.000
#> SRR663076 1 0.3218 0.642466 0.856 0.000 0.016 0.108 0.020
#> SRR1323577 2 0.5540 0.685320 0.048 0.712 0.144 0.096 0.000
#> SRR1442422 4 0.4413 0.610927 0.232 0.000 0.044 0.724 0.000
#> SRR1465893 1 0.1461 0.676183 0.952 0.000 0.004 0.016 0.028
#> SRR654862 5 0.5290 0.652426 0.184 0.000 0.140 0.000 0.676
#> SRR1407112 1 0.4021 0.560583 0.764 0.000 0.036 0.200 0.000
#> SRR1332969 3 0.3001 0.718417 0.004 0.000 0.844 0.008 0.144
#> SRR1353199 5 0.4218 0.498578 0.000 0.000 0.332 0.008 0.660
#> SRR1378885 5 0.5119 0.433481 0.048 0.000 0.360 0.000 0.592
#> SRR665357 2 0.2344 0.825205 0.000 0.904 0.032 0.000 0.064
#> SRR662186 2 0.0290 0.894615 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1501020 3 0.3209 0.702533 0.000 0.000 0.812 0.008 0.180
#> SRR1347819 3 0.4276 0.630725 0.028 0.000 0.716 0.000 0.256
#> SRR1480813 2 0.4128 0.700714 0.220 0.752 0.020 0.008 0.000
#> SRR1472576 4 0.4725 0.644174 0.056 0.008 0.036 0.784 0.116
#> SRR1431781 4 0.5223 0.597586 0.220 0.000 0.108 0.672 0.000
#> SRR1452270 3 0.4594 0.465755 0.000 0.000 0.680 0.284 0.036
#> SRR1500472 5 0.1901 0.695642 0.004 0.000 0.040 0.024 0.932
#> SRR1417632 1 0.7314 0.048547 0.440 0.012 0.036 0.372 0.140
#> SRR1350153 2 0.0510 0.893518 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1458113 3 0.4323 0.495035 0.012 0.000 0.656 0.000 0.332
#> SRR1326579 5 0.5262 -0.071059 0.460 0.000 0.020 0.016 0.504
#> SRR1349363 2 0.5943 0.677069 0.012 0.692 0.036 0.116 0.144
#> SRR1096712 3 0.1818 0.710811 0.000 0.000 0.932 0.024 0.044
#> SRR1090407 3 0.4549 0.105518 0.000 0.000 0.528 0.008 0.464
#> SRR1083752 4 0.8054 0.341679 0.196 0.248 0.132 0.424 0.000
#> SRR1377599 4 0.5586 0.592150 0.208 0.008 0.032 0.692 0.060
#> SRR1488449 3 0.6680 0.259506 0.000 0.000 0.428 0.320 0.252
#> SRR1318354 5 0.3401 0.704735 0.000 0.064 0.096 0.000 0.840
#> SRR1359062 3 0.4208 0.643413 0.020 0.004 0.728 0.000 0.248
#> SRR1398924 5 0.2841 0.695465 0.016 0.020 0.056 0.012 0.896
#> SRR663783 5 0.3456 0.675230 0.000 0.000 0.184 0.016 0.800
#> SRR1319204 5 0.3567 0.671974 0.000 0.092 0.068 0.004 0.836
#> SRR1369070 2 0.0162 0.893492 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR615659 5 0.3401 0.710910 0.096 0.000 0.064 0.000 0.840
#> SRR1337449 2 0.1168 0.884685 0.008 0.960 0.032 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.4963 0.268405 0.040 0.352 0.608 0.000 0.000
#> SRR1498595 4 0.4625 0.655702 0.036 0.032 0.036 0.804 0.092
#> SRR1377423 5 0.3779 0.657993 0.000 0.000 0.200 0.024 0.776
#> SRR1312310 2 0.0404 0.894109 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.4087 0.548813 0.756 0.000 0.036 0.000 0.208
#> SRR1338426 3 0.4313 0.658211 0.000 0.000 0.732 0.040 0.228
#> SRR1353309 3 0.4192 0.316484 0.000 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR658941 3 0.4217 0.479086 0.280 0.000 0.704 0.012 0.004
#> SRR1101643 1 0.2289 0.673858 0.904 0.000 0.004 0.012 0.080
#> SRR1401468 1 0.1991 0.668813 0.916 0.000 0.076 0.004 0.004
#> SRR1368874 2 0.0290 0.894615 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1324085 1 0.5701 0.274021 0.568 0.000 0.100 0.332 0.000
#> SRR1363858 1 0.2456 0.671612 0.904 0.000 0.064 0.024 0.008
#> SRR819820 5 0.3596 0.654610 0.000 0.000 0.212 0.012 0.776
#> SRR1337342 1 0.7679 0.371911 0.504 0.000 0.176 0.176 0.144
#> SRR655206 4 0.3579 0.632819 0.000 0.000 0.240 0.756 0.004
#> SRR1387013 2 0.7831 -0.101927 0.364 0.372 0.096 0.168 0.000
#> SRR1317410 1 0.3662 0.512774 0.744 0.000 0.004 0.000 0.252
#> SRR608198 1 0.1788 0.667580 0.932 0.000 0.004 0.056 0.008
#> SRR1440161 2 0.0404 0.894109 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1343741 2 0.0162 0.894546 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1381288 2 0.0162 0.893492 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1415379 4 0.2069 0.695685 0.076 0.000 0.000 0.912 0.012
#> SRR1099622 3 0.4433 0.585489 0.044 0.084 0.800 0.072 0.000
#> SRR663197 3 0.3430 0.675638 0.004 0.000 0.776 0.000 0.220
#> SRR1394836 3 0.4080 0.432901 0.020 0.000 0.728 0.252 0.000
#> SRR661699 4 0.4298 0.635497 0.000 0.000 0.184 0.756 0.060
#> SRR813680 5 0.5026 0.431315 0.040 0.000 0.372 0.000 0.588
#> SRR1410678 1 0.3944 0.579136 0.764 0.000 0.004 0.212 0.020
#> SRR1378109 4 0.4119 0.631443 0.212 0.000 0.036 0.752 0.000
#> SRR1499174 5 0.4350 0.606536 0.268 0.000 0.028 0.000 0.704
#> SRR1311486 2 0.0833 0.893137 0.004 0.976 0.016 0.004 0.000
#> SRR1382851 4 0.5844 0.536477 0.244 0.000 0.156 0.600 0.000
#> SRR1433410 1 0.3113 0.670587 0.864 0.000 0.020 0.016 0.100
#> SRR661167 5 0.3969 0.557982 0.000 0.000 0.304 0.004 0.692
#> SRR1432518 5 0.3821 0.648461 0.000 0.000 0.216 0.020 0.764
#> SRR660462 5 0.5658 0.356691 0.000 0.000 0.332 0.096 0.572
#> SRR1374608 4 0.3489 0.681615 0.036 0.000 0.144 0.820 0.000
#> SRR657949 4 0.6200 0.292751 0.000 0.000 0.180 0.540 0.280
#> SRR1308882 4 0.2911 0.678426 0.136 0.000 0.008 0.852 0.004
#> SRR655768 5 0.2423 0.717784 0.024 0.000 0.080 0.000 0.896
#> SRR1485870 4 0.5144 0.507241 0.304 0.000 0.064 0.632 0.000
#> SRR1444138 5 0.3999 0.633258 0.240 0.000 0.020 0.000 0.740
#> SRR1417342 4 0.2833 0.680773 0.024 0.000 0.020 0.888 0.068
#> SRR1470193 4 0.2491 0.699304 0.036 0.000 0.068 0.896 0.000
#> SRR1091380 5 0.4136 0.678440 0.048 0.000 0.188 0.000 0.764
#> SRR1099096 1 0.2196 0.678664 0.916 0.000 0.004 0.024 0.056
#> SRR1313583 1 0.4333 0.565238 0.752 0.000 0.020 0.208 0.020
#> SRR1467102 3 0.3674 0.639565 0.024 0.064 0.844 0.068 0.000
#> SRR1485416 4 0.2813 0.696592 0.084 0.000 0.040 0.876 0.000
#> SRR818821 5 0.4029 0.637518 0.000 0.000 0.232 0.024 0.744
#> SRR809963 4 0.4751 0.617519 0.000 0.000 0.152 0.732 0.116
#> SRR1072247 1 0.1644 0.667063 0.940 0.000 0.008 0.048 0.004
#> SRR1353710 4 0.5375 0.474235 0.320 0.000 0.076 0.604 0.000
#> SRR1445259 5 0.2300 0.717587 0.024 0.000 0.072 0.000 0.904
#> SRR1408393 5 0.6147 0.363018 0.000 0.000 0.188 0.256 0.556
#> SRR1361522 5 0.5327 0.251677 0.404 0.000 0.012 0.032 0.552
#> SRR1368597 1 0.6016 0.294289 0.540 0.000 0.020 0.368 0.072
#> SRR1309680 4 0.5566 0.451767 0.000 0.276 0.044 0.644 0.036
#> SRR1310542 3 0.1865 0.708659 0.000 0.024 0.936 0.008 0.032
#> SRR1333485 4 0.1892 0.696709 0.080 0.000 0.004 0.916 0.000
#> SRR1406437 4 0.4114 0.616066 0.016 0.000 0.272 0.712 0.000
#> SRR1354931 3 0.4528 0.598636 0.212 0.000 0.728 0.000 0.060
#> SRR1391856 3 0.4270 0.472434 0.048 0.000 0.748 0.204 0.000
#> SRR1446738 3 0.6323 -0.092480 0.192 0.000 0.516 0.292 0.000
#> SRR1309032 2 0.0404 0.894109 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1388145 4 0.4741 0.644352 0.000 0.096 0.160 0.740 0.004
#> SRR1432611 2 0.0404 0.894109 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.4086 0.646522 0.000 0.024 0.736 0.000 0.240
#> SRR613150 3 0.2438 0.699136 0.000 0.000 0.900 0.060 0.040
#> SRR1375329 5 0.2005 0.707808 0.004 0.000 0.056 0.016 0.924
#> SRR1387921 1 0.5254 0.136665 0.516 0.000 0.016 0.020 0.448
#> SRR1466792 2 0.0404 0.894109 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1360478 2 0.0290 0.894615 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1360695 5 0.3535 0.714161 0.080 0.000 0.088 0.000 0.832
#> SRR812943 5 0.3807 0.620357 0.040 0.008 0.028 0.080 0.844
#> SRR1400910 5 0.6488 0.384576 0.008 0.280 0.096 0.032 0.584
#> SRR1444203 4 0.3815 0.622659 0.220 0.000 0.012 0.764 0.004
#> SRR816177 4 0.4237 0.669510 0.076 0.000 0.152 0.772 0.000
#> SRR658754 3 0.3282 0.712103 0.044 0.012 0.860 0.000 0.084
#> SRR1429603 4 0.4179 0.665277 0.152 0.000 0.072 0.776 0.000
#> SRR1397366 5 0.4446 0.100762 0.004 0.000 0.476 0.000 0.520
#> SRR1446028 1 0.7223 0.216481 0.372 0.000 0.020 0.256 0.352
#> SRR1083918 4 0.8561 0.152605 0.224 0.212 0.280 0.284 0.000
#> SRR1337606 1 0.5382 0.481982 0.660 0.000 0.128 0.212 0.000
#> SRR659109 3 0.3236 0.713272 0.020 0.000 0.828 0.000 0.152
#> SRR1337192 1 0.2753 0.625701 0.856 0.000 0.008 0.136 0.000
#> SRR656946 1 0.6243 0.511412 0.628 0.000 0.032 0.172 0.168
#> SRR1476102 4 0.4121 0.637582 0.208 0.000 0.024 0.760 0.008
#> SRR1476447 1 0.2339 0.676366 0.912 0.000 0.008 0.028 0.052
#> SRR1342067 4 0.4521 0.503505 0.316 0.000 0.012 0.664 0.008
#> SRR1385389 4 0.4978 0.135583 0.476 0.000 0.028 0.496 0.000
#> SRR1075971 5 0.4025 0.698132 0.132 0.000 0.076 0.000 0.792
#> SRR614419 4 0.3732 0.629774 0.000 0.000 0.032 0.792 0.176
#> SRR1322936 1 0.2270 0.657629 0.904 0.000 0.020 0.076 0.000
#> SRR1349121 1 0.4397 0.640518 0.784 0.000 0.088 0.012 0.116
#> SRR1430549 5 0.4527 0.301426 0.392 0.000 0.012 0.000 0.596
#> SRR612935 5 0.3225 0.665724 0.000 0.028 0.048 0.052 0.872
#> SRR661481 2 0.0451 0.894665 0.004 0.988 0.008 0.000 0.000
#> SRR1354117 2 0.1043 0.880596 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1393596 4 0.1915 0.701821 0.040 0.000 0.032 0.928 0.000
#> SRR1452164 5 0.4819 0.656590 0.100 0.000 0.044 0.084 0.772
#> SRR1070503 5 0.5351 0.093607 0.052 0.000 0.464 0.000 0.484
#> SRR1499894 3 0.2763 0.716099 0.000 0.000 0.848 0.004 0.148
#> SRR1082883 1 0.4558 0.561811 0.740 0.000 0.080 0.180 0.000
#> SRR1468271 1 0.5125 0.546047 0.712 0.000 0.068 0.020 0.200
#> SRR1332443 1 0.3700 0.539973 0.752 0.000 0.008 0.240 0.000
#> SRR810295 2 0.0290 0.894615 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR662103 4 0.4746 0.084555 0.000 0.000 0.016 0.504 0.480
#> SRR1328620 5 0.2605 0.699233 0.000 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR1396294 4 0.6767 0.243894 0.272 0.000 0.348 0.380 0.000
#> SRR1419917 5 0.2067 0.674749 0.028 0.000 0.012 0.032 0.928
#> SRR662114 3 0.4276 0.391246 0.000 0.000 0.616 0.004 0.380
#> SRR1489199 5 0.4751 0.682058 0.116 0.000 0.152 0.000 0.732
#> SRR813584 4 0.4469 0.661754 0.148 0.000 0.096 0.756 0.000
#> SRR1069638 1 0.2932 0.657563 0.864 0.000 0.032 0.000 0.104
#> SRR614864 5 0.4638 0.518685 0.028 0.000 0.324 0.000 0.648
#> SRR1433392 5 0.5253 0.645048 0.124 0.000 0.200 0.000 0.676
#> SRR1377777 2 0.1403 0.875825 0.000 0.952 0.024 0.024 0.000
#> SRR2167710 4 0.4065 0.612077 0.000 0.000 0.048 0.772 0.180
#> SRR1401252 4 0.1651 0.701456 0.036 0.000 0.012 0.944 0.008
#> SRR1309963 4 0.3064 0.690365 0.108 0.000 0.036 0.856 0.000
#> SRR1338031 5 0.2171 0.716798 0.024 0.000 0.064 0.000 0.912
#> SRR1418628 2 0.0290 0.894615 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1486889 4 0.3888 0.679120 0.076 0.000 0.120 0.804 0.000
#> SRR1380393 1 0.4392 0.277005 0.612 0.000 0.008 0.000 0.380
#> SRR1319731 1 0.4497 0.125204 0.568 0.000 0.008 0.000 0.424
#> SRR1356468 1 0.3461 0.549837 0.772 0.000 0.004 0.224 0.000
#> SRR1337010 2 0.0510 0.892996 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1486520 1 0.1710 0.676292 0.944 0.000 0.024 0.020 0.012
#> SRR1486538 4 0.3989 0.656630 0.040 0.000 0.032 0.820 0.108
#> SRR1340486 1 0.4254 0.536204 0.740 0.000 0.040 0.220 0.000
#> SRR1377696 4 0.8824 0.033727 0.140 0.324 0.036 0.340 0.160
#> SRR1465459 5 0.4161 0.594246 0.016 0.000 0.280 0.000 0.704
#> SRR1080270 3 0.3340 0.711644 0.044 0.008 0.852 0.000 0.096
#> SRR1312501 5 0.5159 0.345934 0.044 0.000 0.400 0.000 0.556
#> SRR1093148 3 0.3193 0.641372 0.032 0.000 0.852 0.112 0.004
#> SRR1467080 3 0.3616 0.712995 0.000 0.004 0.828 0.052 0.116
#> SRR1410866 2 0.1211 0.884611 0.024 0.960 0.016 0.000 0.000
#> SRR816475 4 0.6084 0.521041 0.220 0.000 0.208 0.572 0.000
#> SRR1379198 1 0.4402 0.339052 0.636 0.000 0.012 0.352 0.000
#> SRR613342 5 0.3878 0.643298 0.016 0.000 0.236 0.000 0.748
#> SRR1452246 2 0.3819 0.701070 0.228 0.756 0.016 0.000 0.000
#> SRR1338836 2 0.0162 0.893492 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1369129 4 0.4415 0.367285 0.388 0.000 0.008 0.604 0.000
#> SRR1396616 3 0.3569 0.684338 0.104 0.000 0.828 0.000 0.068
#> SRR813824 5 0.4435 0.502383 0.016 0.000 0.336 0.000 0.648
#> SRR1082376 5 0.4226 0.696938 0.084 0.000 0.140 0.000 0.776
#> SRR1500891 4 0.4519 0.647087 0.044 0.008 0.036 0.796 0.116
#> SRR807543 5 0.4905 0.644451 0.080 0.000 0.224 0.000 0.696
#> SRR1091572 1 0.1280 0.676120 0.960 0.000 0.024 0.008 0.008
#> SRR1346689 4 0.5119 0.647514 0.136 0.008 0.032 0.752 0.072
#> SRR1332424 1 0.3278 0.635040 0.824 0.000 0.020 0.000 0.156
#> SRR663729 4 0.2206 0.699899 0.068 0.000 0.016 0.912 0.004
#> SRR1097013 5 0.4361 0.697305 0.124 0.000 0.108 0.000 0.768
#> SRR613675 1 0.1597 0.675017 0.948 0.000 0.020 0.024 0.008
#> SRR1485357 1 0.4339 0.438371 0.684 0.000 0.020 0.296 0.000
#> SRR655816 4 0.5110 0.545538 0.000 0.000 0.224 0.680 0.096
#> SRR1500113 5 0.4387 0.436619 0.348 0.000 0.012 0.000 0.640
#> SRR1437622 4 0.2378 0.701070 0.048 0.000 0.048 0.904 0.000
#> SRR1355172 3 0.4830 -0.030887 0.020 0.000 0.492 0.000 0.488
#> SRR655531 4 0.3749 0.656150 0.000 0.000 0.080 0.816 0.104
#> SRR1338147 3 0.3794 0.705094 0.048 0.000 0.800 0.000 0.152
#> SRR1413329 4 0.4444 0.632199 0.000 0.000 0.180 0.748 0.072
#> SRR1485931 2 0.0404 0.890853 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1420873 1 0.5735 0.192542 0.556 0.000 0.040 0.376 0.028
#> SRR1333308 4 0.5028 0.218283 0.444 0.000 0.032 0.524 0.000
#> SRR1452033 1 0.4645 0.439689 0.688 0.000 0.044 0.000 0.268
#> SRR1467316 2 0.2234 0.864057 0.008 0.924 0.036 0.024 0.008
#> SRR809018 3 0.3011 0.716446 0.000 0.000 0.844 0.016 0.140
#> SRR1375351 2 0.0290 0.894615 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR663440 3 0.6349 0.270959 0.000 0.000 0.472 0.360 0.168
#> SRR1471755 1 0.4178 0.586596 0.788 0.156 0.016 0.040 0.000
#> SRR808019 3 0.5309 0.292535 0.060 0.000 0.576 0.000 0.364
#> SRR1479133 5 0.4387 0.463786 0.000 0.000 0.348 0.012 0.640
#> SRR615069 3 0.4672 0.675258 0.000 0.076 0.784 0.048 0.092
#> SRR1456185 2 0.4116 0.757285 0.164 0.792 0.012 0.024 0.008
#> SRR1350069 1 0.5404 0.420590 0.636 0.000 0.100 0.264 0.000
#> SRR816316 5 0.3814 0.708399 0.068 0.000 0.124 0.000 0.808
#> SRR664795 4 0.5646 0.464865 0.000 0.000 0.212 0.632 0.156
#> SRR1490721 4 0.4168 0.652155 0.184 0.000 0.052 0.764 0.000
#> SRR810643 5 0.4229 0.573837 0.276 0.000 0.020 0.000 0.704
#> SRR1430333 4 0.4133 0.642268 0.000 0.000 0.180 0.768 0.052
#> SRR1085285 3 0.4275 0.593802 0.000 0.000 0.696 0.020 0.284
#> SRR1099072 5 0.4390 0.265869 0.000 0.000 0.428 0.004 0.568
#> SRR1317985 5 0.3794 0.690395 0.152 0.000 0.048 0.000 0.800
#> SRR1487340 5 0.3256 0.718808 0.064 0.000 0.060 0.012 0.864
#> SRR1420276 3 0.2555 0.695327 0.004 0.072 0.900 0.008 0.016
#> SRR1351347 3 0.6394 -0.113750 0.168 0.000 0.428 0.000 0.404
#> SRR1405525 5 0.3547 0.609780 0.016 0.008 0.032 0.092 0.852
#> SRR1370329 5 0.3639 0.649907 0.164 0.000 0.008 0.020 0.808
#> SRR1465001 1 0.2570 0.666612 0.880 0.000 0.004 0.008 0.108
#> SRR1476525 2 0.0162 0.893492 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR819610 4 0.3354 0.695416 0.068 0.000 0.088 0.844 0.000
#> SRR2157314 4 0.5295 0.118758 0.000 0.000 0.048 0.488 0.464
#> SRR1409465 2 0.0162 0.893492 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR809987 1 0.3203 0.597475 0.820 0.000 0.012 0.168 0.000
#> SRR613639 5 0.4147 0.535939 0.000 0.000 0.316 0.008 0.676
#> SRR1402285 4 0.3044 0.673921 0.148 0.000 0.008 0.840 0.004
#> SRR1077038 1 0.3641 0.645348 0.820 0.000 0.060 0.000 0.120
#> SRR1405660 3 0.3210 0.685073 0.000 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1095455 5 0.1992 0.713319 0.032 0.000 0.044 0.000 0.924
#> SRR1394734 4 0.4531 0.663918 0.144 0.004 0.092 0.760 0.000
#> SRR1317771 4 0.2828 0.686904 0.004 0.000 0.104 0.872 0.020
#> SRR1365894 1 0.4958 0.497054 0.692 0.000 0.084 0.224 0.000
#> SRR1073581 1 0.6392 0.258563 0.512 0.000 0.220 0.268 0.000
#> SRR659804 5 0.3961 0.563135 0.248 0.000 0.016 0.000 0.736
#> SRR1345914 4 0.5855 0.600310 0.000 0.104 0.124 0.696 0.076
#> SRR1432186 2 0.0290 0.892365 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1473529 2 0.7096 0.471923 0.008 0.528 0.032 0.180 0.252
#> SRR660764 5 0.4660 0.649250 0.000 0.028 0.132 0.068 0.772
#> SRR820448 5 0.3247 0.703270 0.008 0.000 0.136 0.016 0.840
#> SRR1328845 1 0.5290 0.363207 0.624 0.000 0.076 0.300 0.000
#> SRR1336415 1 0.4402 0.334587 0.636 0.000 0.012 0.352 0.000
#> SRR1379065 4 0.4241 0.570950 0.264 0.000 0.012 0.716 0.008
#> SRR1459190 5 0.4421 0.635846 0.000 0.000 0.184 0.068 0.748
#> SRR1346773 5 0.4108 0.496940 0.308 0.000 0.008 0.000 0.684
#> SRR1499521 1 0.2095 0.672062 0.920 0.000 0.060 0.008 0.012
#> SRR1440898 2 0.0324 0.894681 0.004 0.992 0.004 0.000 0.000
#> SRR1347459 3 0.4252 0.605505 0.020 0.000 0.700 0.000 0.280
#> SRR1081209 2 0.0162 0.893492 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1400202 1 0.4209 0.652523 0.800 0.000 0.016 0.116 0.068
#> SRR1333395 4 0.1701 0.687177 0.000 0.000 0.016 0.936 0.048
#> SRR1309248 4 0.4985 0.647699 0.072 0.012 0.036 0.772 0.108
#> SRR809161 5 0.5478 0.530106 0.000 0.000 0.180 0.164 0.656
#> SRR1316320 4 0.5442 0.647403 0.084 0.108 0.028 0.748 0.032
#> SRR1432629 2 0.3183 0.759609 0.000 0.828 0.016 0.156 0.000
#> SRR1498931 5 0.4533 0.218434 0.448 0.000 0.008 0.000 0.544
#> SRR1416578 4 0.4790 0.526568 0.292 0.000 0.020 0.672 0.016
#> SRR1405547 3 0.1943 0.714800 0.000 0.000 0.924 0.020 0.056
#> SRR1470534 4 0.2464 0.695156 0.092 0.000 0.012 0.892 0.004
#> SRR1380764 1 0.2221 0.678760 0.912 0.000 0.000 0.036 0.052
#> SRR1309160 3 0.4491 0.505974 0.000 0.000 0.652 0.020 0.328
#> SRR663489 3 0.4901 0.517027 0.000 0.000 0.672 0.268 0.060
#> SRR1500450 4 0.3921 0.629887 0.000 0.000 0.044 0.784 0.172
#> SRR1078489 1 0.3670 0.646359 0.832 0.000 0.100 0.060 0.008
#> SRR1332648 4 0.4065 0.573049 0.264 0.000 0.016 0.720 0.000
#> SRR660614 2 0.4339 0.603676 0.000 0.684 0.020 0.000 0.296
#> SRR1470420 2 0.0404 0.894109 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.2914 0.667284 0.872 0.000 0.012 0.016 0.100
#> SRR1477949 5 0.4265 0.516593 0.020 0.000 0.012 0.224 0.744
#> SRR1481419 2 0.0000 0.894100 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.4806 0.437392 0.688 0.000 0.060 0.000 0.252
#> SRR615946 3 0.4805 0.646175 0.128 0.000 0.728 0.000 0.144
#> SRR1446481 2 0.4996 0.321727 0.432 0.544 0.016 0.004 0.004
#> SRR1467656 2 0.0290 0.894615 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1402962 5 0.3011 0.701902 0.016 0.000 0.140 0.000 0.844
#> SRR660224 4 0.4604 0.620057 0.000 0.016 0.068 0.764 0.152
#> SRR665586 5 0.3942 0.527159 0.000 0.000 0.020 0.232 0.748
#> SRR1347166 4 0.3297 0.671798 0.000 0.000 0.068 0.848 0.084
#> SRR1485722 5 0.6002 0.528733 0.308 0.000 0.140 0.000 0.552
#> SRR1415316 5 0.5856 0.410875 0.112 0.000 0.024 0.212 0.652
#> SRR613390 5 0.2707 0.715780 0.024 0.000 0.100 0.000 0.876
#> SRR661108 3 0.3086 0.703181 0.000 0.000 0.816 0.004 0.180
#> SRR2170173 4 0.5112 0.520892 0.000 0.000 0.080 0.664 0.256
#> SRR817329 5 0.3734 0.688707 0.000 0.000 0.128 0.060 0.812
#> SRR1401990 4 0.4928 0.546387 0.284 0.000 0.056 0.660 0.000
#> SRR1467745 1 0.3697 0.639386 0.832 0.008 0.088 0.072 0.000
#> SRR1471795 2 0.3356 0.814714 0.016 0.860 0.016 0.096 0.012
#> SRR1415637 2 0.0000 0.894100 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 5 0.4133 0.656241 0.000 0.000 0.180 0.052 0.768
#> SRR1314873 4 0.3174 0.654561 0.004 0.000 0.020 0.844 0.132
#> SRR1401211 1 0.3269 0.669207 0.852 0.000 0.020 0.016 0.112
#> SRR1419692 1 0.1329 0.671326 0.956 0.000 0.008 0.032 0.004
#> SRR818797 3 0.4640 0.280575 0.016 0.000 0.584 0.000 0.400
#> SRR2164608 4 0.5324 0.517966 0.000 0.000 0.128 0.668 0.204
#> SRR1455586 3 0.3146 0.662865 0.028 0.056 0.880 0.032 0.004
#> SRR819459 3 0.2587 0.713892 0.008 0.016 0.908 0.020 0.048
#> SRR1488939 2 0.4721 0.771885 0.012 0.792 0.036 0.092 0.068
#> SRR1433232 2 0.0162 0.893492 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1385501 5 0.2522 0.713117 0.012 0.000 0.108 0.000 0.880
#> SRR1361652 5 0.4111 0.564288 0.004 0.020 0.028 0.148 0.800
#> SRR1437119 1 0.3751 0.593546 0.772 0.000 0.012 0.004 0.212
#> SRR1478547 3 0.3177 0.686994 0.000 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1430910 5 0.2554 0.717983 0.020 0.008 0.076 0.000 0.896
#> SRR1310584 1 0.1560 0.676902 0.948 0.000 0.004 0.020 0.028
#> SRR1500216 1 0.3427 0.664761 0.844 0.000 0.096 0.004 0.056
#> SRR1486762 3 0.7117 0.380061 0.164 0.056 0.524 0.000 0.256
#> SRR1480854 4 0.5435 0.238519 0.428 0.000 0.060 0.512 0.000
#> SRR1489394 4 0.4710 0.580706 0.248 0.000 0.024 0.708 0.020
#> SRR1418085 1 0.4793 0.086910 0.544 0.000 0.020 0.436 0.000
#> SRR1340221 4 0.4764 0.242039 0.436 0.000 0.012 0.548 0.004
#> SRR1473058 1 0.6589 0.065149 0.448 0.000 0.224 0.328 0.000
#> SRR1405165 3 0.2654 0.718928 0.000 0.000 0.884 0.032 0.084
#> SRR1433004 5 0.2588 0.717051 0.048 0.000 0.060 0.000 0.892
#> SRR1471477 1 0.4863 0.539669 0.716 0.000 0.064 0.212 0.008
#> SRR1098567 2 0.4542 0.123545 0.000 0.536 0.456 0.000 0.008
#> SRR1098712 1 0.4016 0.620713 0.796 0.000 0.112 0.092 0.000
#> SRR1455038 5 0.4069 0.703637 0.112 0.000 0.096 0.000 0.792
#> SRR1375248 3 0.4287 0.089432 0.000 0.460 0.540 0.000 0.000
#> SRR1403005 5 0.3878 0.635690 0.000 0.000 0.236 0.016 0.748
#> SRR1348378 2 0.4608 0.594018 0.008 0.688 0.284 0.004 0.016
#> SRR1413541 5 0.2228 0.687387 0.068 0.000 0.012 0.008 0.912
#> SRR1392943 4 0.4737 0.394393 0.380 0.000 0.016 0.600 0.004
#> SRR1475192 3 0.4301 0.549329 0.244 0.008 0.728 0.000 0.020
#> SRR1432085 3 0.4564 0.646461 0.040 0.152 0.772 0.000 0.036
#> SRR1452468 5 0.3574 0.675006 0.004 0.000 0.072 0.088 0.836
#> SRR1347060 3 0.3650 0.700640 0.028 0.000 0.796 0.000 0.176
#> SRR1414139 3 0.4478 0.684788 0.000 0.004 0.764 0.088 0.144
#> SRR1447962 3 0.4013 0.602441 0.004 0.084 0.804 0.108 0.000
#> SRR1444324 2 0.1270 0.875137 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1415004 1 0.1469 0.673318 0.948 0.000 0.000 0.036 0.016
#> SRR1413436 4 0.3165 0.700334 0.032 0.000 0.044 0.876 0.048
#> SRR1311266 1 0.5693 -0.216729 0.468 0.000 0.080 0.000 0.452
#> SRR1343302 4 0.5407 0.121436 0.472 0.000 0.056 0.472 0.000
#> SRR1373746 1 0.3790 0.493483 0.724 0.000 0.004 0.000 0.272
#> SRR1429678 1 0.2989 0.679206 0.872 0.000 0.004 0.044 0.080
#> SRR1469413 3 0.3467 0.607484 0.004 0.036 0.832 0.128 0.000
#> SRR1405331 5 0.5251 0.652552 0.184 0.000 0.136 0.000 0.680
#> SRR1345609 4 0.3319 0.686393 0.064 0.000 0.020 0.864 0.052
#> SRR1380208 4 0.1498 0.698612 0.008 0.000 0.024 0.952 0.016
#> SRR1322840 4 0.1597 0.701029 0.048 0.000 0.012 0.940 0.000
#> SRR1399797 3 0.3715 0.633099 0.004 0.000 0.736 0.000 0.260
#> SRR1416654 5 0.4878 0.208119 0.024 0.000 0.440 0.000 0.536
#> SRR1315081 3 0.3350 0.718590 0.000 0.040 0.844 0.004 0.112
#> SRR1369196 3 0.2284 0.697991 0.056 0.004 0.912 0.000 0.028
#> SRR1400847 1 0.3231 0.585839 0.800 0.000 0.004 0.000 0.196
#> SRR1365291 5 0.4748 0.109506 0.000 0.000 0.492 0.016 0.492
#> SRR1367920 4 0.4457 0.416359 0.368 0.000 0.012 0.620 0.000
#> SRR1366648 3 0.2771 0.719852 0.000 0.000 0.860 0.012 0.128
#> SRR1441679 2 0.0000 0.894100 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082173 5 0.5199 0.541241 0.072 0.000 0.292 0.000 0.636
#> SRR1363968 1 0.2331 0.669804 0.900 0.000 0.020 0.000 0.080
#> SRR814387 1 0.3947 0.652455 0.816 0.000 0.012 0.108 0.064
#> SRR657599 5 0.6612 0.220611 0.000 0.000 0.276 0.264 0.460
#> SRR1386689 1 0.4668 0.321230 0.624 0.000 0.024 0.352 0.000
#> SRR1395575 3 0.2513 0.722170 0.000 0.000 0.876 0.008 0.116
#> SRR1453811 5 0.5353 0.046700 0.052 0.000 0.472 0.000 0.476
#> SRR1441159 1 0.4537 0.238042 0.592 0.000 0.012 0.000 0.396
#> SRR1403154 1 0.4505 0.256292 0.604 0.000 0.012 0.384 0.000
#> SRR1468722 3 0.3359 0.712814 0.000 0.000 0.840 0.052 0.108
#> SRR1310275 3 0.5458 -0.026721 0.060 0.000 0.476 0.000 0.464
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR1474533 3 0.6246 0.34763 0.244 0.000 0.572 0.088 0.004 0.092
#> SRR1331708 4 0.5751 0.24014 0.032 0.004 0.048 0.492 0.008 0.416
#> SRR1464258 5 0.5234 0.35421 0.336 0.000 0.040 0.016 0.592 0.016
#> SRR1454201 5 0.2918 0.68956 0.048 0.000 0.020 0.000 0.868 0.064
#> SRR661589 3 0.3833 0.48800 0.000 0.000 0.648 0.000 0.344 0.008
#> SRR1456229 5 0.2941 0.68039 0.092 0.000 0.024 0.008 0.864 0.012
#> SRR1315165 4 0.5713 0.55136 0.104 0.000 0.100 0.652 0.000 0.144
#> SRR1488960 6 0.5022 0.43638 0.064 0.000 0.028 0.004 0.228 0.676
#> SRR1417809 6 0.3549 0.50322 0.056 0.000 0.032 0.084 0.000 0.828
#> SRR1094457 6 0.6084 -0.08917 0.276 0.000 0.000 0.344 0.000 0.380
#> SRR1095575 5 0.5056 0.61554 0.008 0.004 0.060 0.168 0.716 0.044
#> SRR1315931 1 0.4969 0.06988 0.496 0.000 0.016 0.012 0.460 0.016
#> SRR1430066 3 0.2595 0.69864 0.000 0.000 0.836 0.000 0.160 0.004
#> SRR1431037 3 0.2805 0.69505 0.012 0.000 0.828 0.000 0.160 0.000
#> SRR1395554 3 0.3809 0.57071 0.000 0.000 0.684 0.008 0.304 0.004
#> SRR818002 1 0.5293 0.27772 0.568 0.320 0.000 0.004 0.000 0.108
#> SRR1344143 4 0.6517 0.39989 0.004 0.204 0.048 0.588 0.028 0.128
#> SRR1486845 4 0.5486 0.53181 0.124 0.000 0.040 0.648 0.000 0.188
#> SRR1362866 5 0.3993 0.63937 0.028 0.000 0.052 0.056 0.820 0.044
#> SRR1490740 5 0.2905 0.65344 0.144 0.000 0.012 0.000 0.836 0.008
#> SRR1446627 2 0.0603 0.88703 0.000 0.980 0.016 0.004 0.000 0.000
#> SRR1456138 2 0.3882 0.81142 0.004 0.824 0.052 0.048 0.008 0.064
#> SRR1416248 1 0.1390 0.64360 0.948 0.000 0.004 0.000 0.016 0.032
#> SRR1383907 6 0.5169 -0.10891 0.044 0.000 0.020 0.460 0.000 0.476
#> SRR1311018 1 0.3342 0.59378 0.760 0.000 0.000 0.000 0.228 0.012
#> SRR1375699 1 0.2255 0.61350 0.892 0.004 0.000 0.016 0.000 0.088
#> SRR1429846 3 0.3923 0.65838 0.000 0.000 0.764 0.036 0.184 0.016
#> SRR613550 5 0.5793 0.16335 0.000 0.000 0.388 0.012 0.472 0.128
#> SRR1348402 6 0.5188 0.45780 0.060 0.000 0.052 0.000 0.224 0.664
#> SRR1345146 5 0.4939 0.56915 0.008 0.000 0.044 0.032 0.684 0.232
#> SRR1324025 3 0.3479 0.66837 0.008 0.000 0.768 0.012 0.212 0.000
#> SRR1318879 4 0.6322 0.31907 0.004 0.000 0.068 0.576 0.160 0.192
#> SRR820755 5 0.4452 0.58923 0.000 0.000 0.184 0.004 0.716 0.096
#> SRR1485830 4 0.3733 0.55633 0.172 0.000 0.012 0.784 0.004 0.028
#> SRR599313 4 0.5636 0.43414 0.068 0.000 0.144 0.676 0.100 0.012
#> SRR612263 5 0.1817 0.69896 0.016 0.000 0.020 0.012 0.936 0.016
#> SRR1415398 5 0.5061 0.08658 0.000 0.000 0.428 0.000 0.496 0.076
#> SRR1326205 6 0.6380 0.08674 0.188 0.000 0.032 0.312 0.000 0.468
#> SRR1421327 4 0.3979 0.54678 0.004 0.000 0.032 0.720 0.000 0.244
#> SRR1083311 3 0.4206 0.65190 0.000 0.004 0.724 0.000 0.212 0.060
#> SRR1499303 4 0.5102 0.37300 0.004 0.004 0.048 0.576 0.008 0.360
#> SRR1079522 4 0.5269 0.48001 0.004 0.004 0.048 0.660 0.044 0.240
#> SRR1452935 5 0.2169 0.68990 0.012 0.000 0.080 0.000 0.900 0.008
#> SRR1379495 1 0.4537 0.35646 0.612 0.000 0.012 0.008 0.356 0.012
#> SRR1470459 2 0.0790 0.88323 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000 0.000
#> SRR661361 3 0.4070 0.30587 0.000 0.000 0.568 0.004 0.424 0.004
#> SRR615778 4 0.6960 0.14736 0.028 0.000 0.032 0.440 0.184 0.316
#> SRR1447564 5 0.6168 0.36234 0.124 0.000 0.028 0.012 0.540 0.296
#> SRR1455195 5 0.3194 0.67597 0.132 0.000 0.032 0.000 0.828 0.008
#> SRR655182 5 0.3724 0.65879 0.096 0.000 0.012 0.000 0.804 0.088
#> SRR1335140 4 0.5712 0.47723 0.004 0.052 0.048 0.632 0.016 0.248
#> SRR1433555 5 0.4166 0.58240 0.000 0.000 0.216 0.008 0.728 0.048
#> SRR1308650 2 0.5558 0.64702 0.160 0.656 0.140 0.004 0.000 0.040
#> SRR1388354 6 0.6380 -0.00220 0.360 0.000 0.020 0.000 0.216 0.404
#> SRR1317446 3 0.3200 0.68021 0.000 0.000 0.788 0.000 0.196 0.016
#> SRR1413602 3 0.4156 0.66503 0.000 0.000 0.732 0.000 0.188 0.080
#> SRR1479955 2 0.3738 0.82569 0.016 0.840 0.048 0.024 0.012 0.060
#> SRR809853 5 0.2082 0.69159 0.024 0.000 0.016 0.020 0.924 0.016
#> SRR661313 3 0.3890 0.38577 0.004 0.000 0.596 0.000 0.400 0.000
#> SRR1499935 4 0.2274 0.61062 0.012 0.000 0.008 0.892 0.000 0.088
#> SRR1447303 5 0.2841 0.65187 0.000 0.000 0.164 0.000 0.824 0.012
#> SRR1429408 4 0.7258 0.24474 0.176 0.000 0.140 0.412 0.000 0.272
#> SRR1433950 5 0.4132 0.55184 0.220 0.000 0.008 0.000 0.728 0.044
#> SRR1362081 2 0.0508 0.88951 0.000 0.984 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR1409854 5 0.1674 0.68721 0.004 0.000 0.068 0.004 0.924 0.000
#> SRR1435229 5 0.2840 0.67315 0.092 0.000 0.004 0.016 0.868 0.020
#> SRR1085996 5 0.2319 0.68898 0.060 0.000 0.020 0.008 0.904 0.008
#> SRR1414229 1 0.7090 0.24778 0.424 0.000 0.080 0.136 0.344 0.016
#> SRR1400974 3 0.2994 0.67411 0.000 0.000 0.788 0.000 0.208 0.004
#> SRR1399971 1 0.1908 0.65181 0.900 0.000 0.004 0.000 0.096 0.000
#> SRR613927 5 0.4256 0.62327 0.000 0.000 0.140 0.004 0.744 0.112
#> SRR1457854 5 0.3389 0.64985 0.164 0.000 0.004 0.000 0.800 0.032
#> SRR1473714 1 0.7084 0.22275 0.420 0.000 0.084 0.128 0.352 0.016
#> SRR813776 5 0.5223 0.48665 0.000 0.000 0.208 0.000 0.612 0.180
#> SRR808196 1 0.5087 0.20033 0.560 0.000 0.000 0.092 0.000 0.348
#> SRR1101085 1 0.5645 0.19639 0.544 0.000 0.008 0.324 0.004 0.120
#> SRR614395 6 0.6439 0.18269 0.008 0.000 0.140 0.036 0.340 0.476
#> SRR1478251 4 0.5969 0.21560 0.380 0.000 0.012 0.452 0.000 0.156
#> SRR1370551 2 0.0865 0.88163 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362310 1 0.1461 0.63682 0.940 0.000 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR665310 5 0.5451 0.37501 0.000 0.000 0.116 0.004 0.528 0.352
#> SRR1420109 5 0.4164 0.66234 0.056 0.000 0.100 0.036 0.796 0.012
#> SRR1330920 5 0.4170 0.66739 0.008 0.000 0.104 0.024 0.788 0.076
#> SRR1419539 3 0.3350 0.63102 0.012 0.004 0.840 0.068 0.000 0.076
#> SRR1359447 2 0.0436 0.89059 0.000 0.988 0.000 0.004 0.004 0.004
#> SRR1347259 4 0.3342 0.56296 0.000 0.000 0.012 0.760 0.000 0.228
#> SRR613915 5 0.6892 0.12411 0.000 0.000 0.272 0.052 0.384 0.292
#> SRR1384395 3 0.4739 0.62868 0.036 0.076 0.768 0.080 0.040 0.000
#> SRR821715 5 0.4707 0.54814 0.000 0.000 0.204 0.000 0.676 0.120
#> SRR1478228 1 0.3852 0.59777 0.740 0.000 0.004 0.000 0.224 0.032
#> SRR1445637 5 0.2839 0.69277 0.048 0.000 0.076 0.004 0.868 0.004
#> SRR608150 1 0.5659 0.16999 0.496 0.000 0.032 0.400 0.000 0.072
#> SRR1096383 3 0.7177 0.05756 0.300 0.000 0.360 0.000 0.256 0.084
#> SRR1341480 6 0.6133 0.07832 0.304 0.000 0.004 0.264 0.000 0.428
#> SRR1341344 4 0.2596 0.58773 0.032 0.000 0.056 0.892 0.012 0.008
#> SRR1326270 3 0.4308 0.54013 0.028 0.000 0.664 0.008 0.300 0.000
#> SRR1498838 3 0.3566 0.65450 0.000 0.000 0.744 0.000 0.236 0.020
#> SRR1416313 3 0.3109 0.66387 0.000 0.000 0.772 0.000 0.224 0.004
#> SRR808566 6 0.7356 0.24408 0.220 0.000 0.188 0.176 0.000 0.416
#> SRR1430270 1 0.4392 0.41973 0.680 0.000 0.000 0.064 0.000 0.256
#> SRR1367825 3 0.2402 0.70673 0.000 0.000 0.868 0.012 0.120 0.000
#> SRR613533 5 0.3333 0.66707 0.016 0.000 0.124 0.016 0.832 0.012
#> SRR661267 3 0.6461 0.03319 0.024 0.000 0.392 0.000 0.364 0.220
#> SRR810665 2 0.0146 0.89000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1407250 5 0.5356 0.61490 0.116 0.000 0.100 0.060 0.708 0.016
#> SRR1420067 1 0.5965 0.01964 0.452 0.000 0.032 0.004 0.424 0.088
#> SRR1473632 5 0.6482 0.21191 0.300 0.000 0.052 0.080 0.536 0.032
#> SRR812536 6 0.4652 0.35136 0.000 0.000 0.312 0.000 0.064 0.624
#> SRR1370850 6 0.4342 0.50752 0.136 0.028 0.052 0.012 0.000 0.772
#> SRR1486195 3 0.4868 0.18325 0.000 0.416 0.524 0.000 0.000 0.060
#> SRR1407671 6 0.4730 0.42774 0.000 0.096 0.048 0.080 0.016 0.760
#> SRR1446375 5 0.3092 0.67718 0.028 0.000 0.028 0.004 0.860 0.080
#> SRR1465230 4 0.6200 0.20978 0.380 0.000 0.008 0.384 0.000 0.228
#> SRR614119 5 0.6146 0.49979 0.252 0.000 0.204 0.000 0.520 0.024
#> SRR1356101 3 0.4322 0.34183 0.000 0.372 0.600 0.000 0.000 0.028
#> SRR1404209 5 0.3777 0.67934 0.056 0.000 0.088 0.028 0.820 0.008
#> SRR1392676 2 0.0405 0.88893 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000 0.000
#> SRR665538 6 0.4006 0.53266 0.028 0.000 0.104 0.012 0.052 0.804
#> SRR660510 3 0.4446 0.46195 0.000 0.000 0.612 0.000 0.348 0.040
#> SRR1445655 4 0.4107 0.51019 0.004 0.000 0.028 0.688 0.000 0.280
#> SRR658953 6 0.4497 0.47340 0.004 0.000 0.040 0.104 0.088 0.764
#> SRR2166459 5 0.5271 0.35455 0.012 0.000 0.072 0.000 0.536 0.380
#> SRR1070713 4 0.6588 0.21473 0.016 0.020 0.340 0.444 0.000 0.180
#> SRR1485312 3 0.2763 0.70763 0.000 0.000 0.876 0.028 0.072 0.024
#> SRR1317631 6 0.3961 0.45479 0.036 0.000 0.028 0.160 0.000 0.776
#> SRR1488610 5 0.6594 0.26262 0.088 0.000 0.044 0.356 0.480 0.032
#> SRR1330588 3 0.4927 0.29734 0.000 0.000 0.540 0.056 0.400 0.004
#> SRR1316367 5 0.4620 0.12973 0.428 0.000 0.000 0.000 0.532 0.040
#> SRR1433926 1 0.4233 0.47416 0.668 0.000 0.008 0.004 0.304 0.016
#> SRR1091302 4 0.4955 0.58212 0.080 0.000 0.080 0.724 0.000 0.116
#> SRR818263 5 0.5391 0.60013 0.184 0.000 0.120 0.024 0.664 0.008
#> SRR1404909 4 0.3424 0.58006 0.004 0.000 0.032 0.796 0.000 0.168
#> SRR663076 1 0.2178 0.59776 0.868 0.000 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1323577 2 0.5350 0.66848 0.080 0.688 0.124 0.000 0.000 0.108
#> SRR1442422 4 0.5017 0.21607 0.052 0.000 0.008 0.508 0.000 0.432
#> SRR1465893 1 0.1495 0.64650 0.948 0.000 0.004 0.008 0.020 0.020
#> SRR654862 5 0.4825 0.64746 0.084 0.000 0.108 0.048 0.748 0.012
#> SRR1407112 1 0.5804 0.28628 0.556 0.000 0.052 0.316 0.000 0.076
#> SRR1332969 3 0.3078 0.68527 0.000 0.000 0.796 0.000 0.192 0.012
#> SRR1353199 5 0.5732 0.03627 0.004 0.000 0.404 0.000 0.448 0.144
#> SRR1378885 5 0.4443 0.55051 0.020 0.000 0.256 0.020 0.696 0.008
#> SRR665357 2 0.2617 0.81873 0.000 0.876 0.040 0.000 0.080 0.004
#> SRR662186 2 0.1738 0.87106 0.000 0.928 0.016 0.052 0.000 0.004
#> SRR1501020 3 0.3481 0.67859 0.000 0.000 0.776 0.000 0.192 0.032
#> SRR1347819 3 0.4470 0.30329 0.012 0.000 0.568 0.008 0.408 0.004
#> SRR1480813 2 0.3888 0.65444 0.252 0.716 0.032 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472576 6 0.4848 0.32081 0.356 0.004 0.016 0.012 0.012 0.600
#> SRR1431781 4 0.4926 0.51988 0.020 0.000 0.068 0.660 0.000 0.252
#> SRR1452270 3 0.4660 0.23374 0.000 0.000 0.540 0.000 0.044 0.416
#> SRR1500472 5 0.3233 0.68035 0.020 0.004 0.036 0.000 0.848 0.092
#> SRR1417632 4 0.6710 0.48129 0.052 0.024 0.056 0.604 0.060 0.204
#> SRR1350153 2 0.0363 0.88936 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458113 5 0.4802 0.32415 0.000 0.000 0.368 0.028 0.584 0.020
#> SRR1326579 1 0.4449 0.58880 0.696 0.000 0.000 0.000 0.216 0.088
#> SRR1349363 2 0.5851 0.72072 0.036 0.708 0.052 0.056 0.040 0.108
#> SRR1096712 3 0.3130 0.69771 0.000 0.000 0.852 0.060 0.072 0.016
#> SRR1090407 3 0.4757 0.04412 0.000 0.000 0.484 0.000 0.468 0.048
#> SRR1083752 4 0.3165 0.59874 0.008 0.040 0.052 0.864 0.000 0.036
#> SRR1377599 4 0.4352 0.56082 0.008 0.000 0.048 0.752 0.020 0.172
#> SRR1488449 6 0.5881 0.05186 0.000 0.000 0.296 0.000 0.232 0.472
#> SRR1318354 5 0.2898 0.68150 0.004 0.084 0.028 0.000 0.868 0.016
#> SRR1359062 3 0.4294 0.54736 0.004 0.008 0.668 0.008 0.304 0.008
#> SRR1398924 5 0.3900 0.65321 0.008 0.024 0.052 0.052 0.832 0.032
#> SRR663783 5 0.3346 0.66993 0.004 0.000 0.092 0.004 0.832 0.068
#> SRR1319204 5 0.5288 0.54627 0.004 0.168 0.056 0.036 0.708 0.028
#> SRR1369070 2 0.0603 0.88703 0.000 0.980 0.016 0.004 0.000 0.000
#> SRR615659 5 0.3058 0.68868 0.108 0.000 0.020 0.000 0.848 0.024
#> SRR1337449 2 0.3055 0.81949 0.064 0.840 0.096 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316982 3 0.5310 0.44791 0.016 0.252 0.640 0.084 0.004 0.004
#> SRR1498595 6 0.6320 -0.03625 0.012 0.040 0.060 0.376 0.016 0.496
#> SRR1377423 5 0.4137 0.63494 0.004 0.000 0.108 0.000 0.756 0.132
#> SRR1312310 2 0.0363 0.88936 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485613 1 0.4449 0.57688 0.712 0.000 0.032 0.012 0.232 0.012
#> SRR1338426 5 0.6448 0.10230 0.000 0.000 0.368 0.060 0.448 0.124
#> SRR1353309 5 0.5170 0.43162 0.000 0.000 0.304 0.052 0.612 0.032
#> SRR658941 3 0.3978 0.58909 0.116 0.000 0.780 0.096 0.004 0.004
#> SRR1101643 4 0.6978 -0.11047 0.216 0.000 0.032 0.408 0.324 0.020
#> SRR1401468 1 0.5354 0.59034 0.708 0.000 0.088 0.124 0.064 0.016
#> SRR1368874 2 0.0146 0.89016 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1324085 4 0.3805 0.59605 0.040 0.000 0.084 0.812 0.000 0.064
#> SRR1363858 4 0.6572 0.27477 0.180 0.000 0.132 0.580 0.092 0.016
#> SRR819820 5 0.3426 0.67422 0.008 0.000 0.104 0.004 0.828 0.056
#> SRR1337342 5 0.7126 0.31213 0.048 0.000 0.200 0.288 0.440 0.024
#> SRR655206 6 0.4834 0.44893 0.008 0.000 0.256 0.080 0.000 0.656
#> SRR1387013 2 0.7720 -0.09252 0.324 0.340 0.032 0.220 0.000 0.084
#> SRR1317410 1 0.3728 0.60858 0.768 0.000 0.008 0.008 0.200 0.016
#> SRR608198 1 0.4436 0.62110 0.760 0.000 0.008 0.140 0.068 0.024
#> SRR1440161 2 0.0508 0.88951 0.000 0.984 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR1343741 2 0.0551 0.88902 0.000 0.984 0.008 0.004 0.000 0.004
#> SRR1381288 2 0.0291 0.88949 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000 0.000
#> SRR1415379 6 0.4884 -0.06652 0.032 0.000 0.008 0.452 0.004 0.504
#> SRR1099622 3 0.4158 0.61207 0.008 0.092 0.792 0.028 0.000 0.080
#> SRR663197 3 0.3967 0.47325 0.000 0.000 0.632 0.000 0.356 0.012
#> SRR1394836 3 0.4478 0.50768 0.008 0.000 0.728 0.116 0.000 0.148
#> SRR661699 6 0.5086 0.38104 0.000 0.000 0.064 0.228 0.040 0.668
#> SRR813680 5 0.4944 0.38303 0.028 0.000 0.368 0.000 0.576 0.028
#> SRR1410678 1 0.3633 0.47314 0.732 0.000 0.012 0.000 0.004 0.252
#> SRR1378109 6 0.5331 -0.06557 0.080 0.000 0.008 0.428 0.000 0.484
#> SRR1499174 5 0.3597 0.60369 0.196 0.000 0.012 0.004 0.776 0.012
#> SRR1311486 2 0.3652 0.80768 0.084 0.816 0.020 0.000 0.000 0.080
#> SRR1382851 4 0.4327 0.58294 0.016 0.000 0.092 0.752 0.000 0.140
#> SRR1433410 1 0.6586 0.16984 0.416 0.000 0.040 0.120 0.408 0.016
#> SRR661167 5 0.3727 0.62212 0.000 0.000 0.188 0.004 0.768 0.040
#> SRR1432518 5 0.3186 0.67326 0.000 0.000 0.100 0.004 0.836 0.060
#> SRR660462 5 0.6047 -0.03449 0.000 0.000 0.352 0.000 0.392 0.256
#> SRR1374608 6 0.5004 0.33871 0.004 0.000 0.096 0.276 0.000 0.624
#> SRR657949 6 0.5573 0.37882 0.000 0.000 0.128 0.020 0.256 0.596
#> SRR1308882 4 0.4602 0.15644 0.028 0.000 0.004 0.492 0.000 0.476
#> SRR655768 5 0.4219 0.67373 0.092 0.000 0.040 0.000 0.780 0.088
#> SRR1485870 4 0.2894 0.60850 0.004 0.000 0.036 0.852 0.000 0.108
#> SRR1444138 5 0.4072 0.47360 0.292 0.000 0.004 0.004 0.684 0.016
#> SRR1417342 6 0.4115 0.47776 0.124 0.000 0.016 0.068 0.008 0.784
#> SRR1470193 6 0.4224 0.03593 0.000 0.000 0.016 0.432 0.000 0.552
#> SRR1091380 5 0.2828 0.68575 0.024 0.000 0.100 0.008 0.864 0.004
#> SRR1099096 1 0.4051 0.63504 0.764 0.000 0.016 0.024 0.184 0.012
#> SRR1313583 1 0.2892 0.57975 0.840 0.000 0.000 0.020 0.004 0.136
#> SRR1467102 3 0.3420 0.65027 0.004 0.064 0.844 0.032 0.000 0.056
#> SRR1485416 6 0.4884 0.46318 0.204 0.000 0.028 0.076 0.000 0.692
#> SRR818821 5 0.3975 0.64969 0.000 0.000 0.112 0.004 0.772 0.112
#> SRR809963 6 0.4520 0.50123 0.000 0.000 0.124 0.020 0.116 0.740
#> SRR1072247 1 0.3410 0.62241 0.836 0.000 0.024 0.108 0.012 0.020
#> SRR1353710 4 0.3016 0.60942 0.008 0.000 0.048 0.852 0.000 0.092
#> SRR1445259 5 0.1528 0.69437 0.012 0.000 0.016 0.000 0.944 0.028
#> SRR1408393 6 0.5532 -0.04863 0.000 0.000 0.136 0.000 0.384 0.480
#> SRR1361522 5 0.4305 0.59103 0.196 0.000 0.004 0.020 0.740 0.040
#> SRR1368597 4 0.7953 0.14809 0.108 0.000 0.044 0.364 0.284 0.200
#> SRR1309680 6 0.4586 0.42953 0.012 0.228 0.048 0.000 0.008 0.704
#> SRR1310542 3 0.2862 0.70779 0.000 0.052 0.872 0.000 0.056 0.020
#> SRR1333485 6 0.4459 -0.07800 0.020 0.000 0.004 0.460 0.000 0.516
#> SRR1406437 6 0.5266 0.32988 0.064 0.000 0.360 0.012 0.004 0.560
#> SRR1354931 3 0.5665 0.55620 0.084 0.000 0.676 0.140 0.088 0.012
#> SRR1391856 4 0.4436 0.53964 0.004 0.000 0.192 0.732 0.016 0.056
#> SRR1446738 3 0.7140 -0.01473 0.256 0.004 0.428 0.084 0.000 0.228
#> SRR1309032 2 0.0458 0.88856 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000 0.000
#> SRR1388145 6 0.5011 0.44683 0.008 0.080 0.264 0.000 0.004 0.644
#> SRR1432611 2 0.0363 0.88936 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR815869 3 0.4203 0.62270 0.000 0.028 0.700 0.000 0.260 0.012
#> SRR613150 3 0.3530 0.65009 0.000 0.000 0.792 0.000 0.056 0.152
#> SRR1375329 5 0.4794 0.61694 0.004 0.004 0.052 0.120 0.748 0.072
#> SRR1387921 1 0.3878 0.61333 0.772 0.000 0.000 0.000 0.112 0.116
#> SRR1466792 2 0.0508 0.88951 0.000 0.984 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR1360478 2 0.0000 0.88999 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360695 5 0.4546 0.66368 0.144 0.000 0.036 0.000 0.744 0.076
#> SRR812943 5 0.4504 0.62036 0.036 0.000 0.060 0.036 0.784 0.084
#> SRR1400910 4 0.6665 0.32914 0.004 0.112 0.060 0.584 0.204 0.036
#> SRR1444203 6 0.4861 0.28302 0.392 0.000 0.004 0.052 0.000 0.552
#> SRR816177 6 0.6030 0.44467 0.112 0.000 0.208 0.080 0.000 0.600
#> SRR658754 3 0.3821 0.67999 0.012 0.008 0.812 0.056 0.108 0.004
#> SRR1429603 4 0.3284 0.57877 0.000 0.000 0.020 0.784 0.000 0.196
#> SRR1397366 5 0.4238 0.40746 0.000 0.000 0.344 0.000 0.628 0.028
#> SRR1446028 1 0.5106 0.32081 0.592 0.000 0.020 0.004 0.044 0.340
#> SRR1083918 3 0.8510 -0.08279 0.128 0.296 0.300 0.108 0.000 0.168
#> SRR1337606 4 0.2207 0.58111 0.008 0.000 0.076 0.900 0.016 0.000
#> SRR659109 3 0.3284 0.69179 0.000 0.000 0.800 0.032 0.168 0.000
#> SRR1337192 4 0.4543 0.38823 0.252 0.000 0.052 0.684 0.000 0.012
#> SRR656946 1 0.6249 0.44531 0.612 0.000 0.020 0.152 0.056 0.160
#> SRR1476102 6 0.4631 0.42047 0.132 0.000 0.004 0.160 0.000 0.704
#> SRR1476447 1 0.3471 0.64850 0.828 0.000 0.008 0.040 0.112 0.012
#> SRR1342067 4 0.3828 0.53406 0.016 0.000 0.008 0.724 0.000 0.252
#> SRR1385389 4 0.6121 0.30989 0.208 0.000 0.012 0.472 0.000 0.308
#> SRR1075971 5 0.2547 0.68034 0.112 0.000 0.016 0.000 0.868 0.004
#> SRR614419 6 0.3172 0.51365 0.000 0.000 0.040 0.016 0.100 0.844
#> SRR1322936 1 0.4016 0.60590 0.788 0.000 0.024 0.144 0.012 0.032
#> SRR1349121 1 0.6883 0.25638 0.464 0.000 0.100 0.080 0.336 0.020
#> SRR1430549 5 0.4338 -0.07735 0.484 0.000 0.000 0.000 0.496 0.020
#> SRR612935 5 0.4334 0.62771 0.008 0.028 0.048 0.000 0.764 0.152
#> SRR661481 2 0.2306 0.84683 0.092 0.888 0.004 0.000 0.000 0.016
#> SRR1354117 2 0.1349 0.87004 0.000 0.940 0.056 0.000 0.000 0.004
#> SRR1393596 4 0.4189 0.37308 0.000 0.000 0.020 0.604 0.000 0.376
#> SRR1452164 5 0.6015 0.25986 0.336 0.000 0.024 0.000 0.500 0.140
#> SRR1070503 5 0.5474 0.47446 0.020 0.000 0.276 0.084 0.612 0.008
#> SRR1499894 3 0.3955 0.68757 0.000 0.004 0.772 0.000 0.132 0.092
#> SRR1082883 4 0.3207 0.57464 0.048 0.000 0.088 0.848 0.004 0.012
#> SRR1468271 1 0.3955 0.55802 0.772 0.000 0.036 0.000 0.024 0.168
#> SRR1332443 1 0.5171 0.41047 0.640 0.000 0.008 0.216 0.000 0.136
#> SRR810295 2 0.0260 0.88988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR662103 6 0.4938 0.27043 0.016 0.000 0.024 0.012 0.352 0.596
#> SRR1328620 5 0.3099 0.67865 0.008 0.000 0.084 0.000 0.848 0.060
#> SRR1396294 3 0.7048 -0.17222 0.116 0.000 0.424 0.308 0.000 0.152
#> SRR1419917 5 0.3043 0.68247 0.056 0.000 0.020 0.000 0.860 0.064
#> SRR662114 5 0.4933 0.39474 0.000 0.000 0.324 0.024 0.612 0.040
#> SRR1489199 5 0.3621 0.67452 0.052 0.000 0.092 0.012 0.828 0.016
#> SRR813584 6 0.5674 0.30106 0.368 0.004 0.072 0.028 0.000 0.528
#> SRR1069638 1 0.7259 0.40538 0.436 0.000 0.072 0.244 0.232 0.016
#> SRR614864 5 0.3329 0.60259 0.000 0.000 0.220 0.004 0.768 0.008
#> SRR1433392 5 0.4395 0.64523 0.052 0.000 0.152 0.028 0.760 0.008
#> SRR1377777 2 0.2364 0.85243 0.000 0.904 0.036 0.044 0.004 0.012
#> SRR2167710 6 0.3885 0.50914 0.008 0.000 0.064 0.012 0.116 0.800
#> SRR1401252 4 0.4338 0.46919 0.004 0.000 0.036 0.660 0.000 0.300
#> SRR1309963 6 0.4830 0.43163 0.124 0.000 0.024 0.140 0.000 0.712
#> SRR1338031 5 0.2262 0.69315 0.036 0.000 0.020 0.000 0.908 0.036
#> SRR1418628 2 0.0260 0.88988 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486889 4 0.3790 0.59347 0.000 0.000 0.072 0.772 0.000 0.156
#> SRR1380393 1 0.4851 0.32805 0.580 0.000 0.016 0.012 0.376 0.016
#> SRR1319731 1 0.3481 0.59066 0.756 0.000 0.004 0.000 0.228 0.012
#> SRR1356468 4 0.6166 0.14486 0.396 0.000 0.012 0.444 0.012 0.136
#> SRR1337010 2 0.0508 0.88951 0.000 0.984 0.012 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486520 1 0.6076 0.47028 0.588 0.000 0.068 0.264 0.064 0.016
#> SRR1486538 6 0.4966 0.36930 0.040 0.000 0.028 0.204 0.024 0.704
#> SRR1340486 4 0.5987 0.22147 0.368 0.000 0.060 0.500 0.000 0.072
#> SRR1377696 4 0.8036 0.27698 0.028 0.240 0.056 0.440 0.060 0.176
#> SRR1465459 5 0.3194 0.64396 0.004 0.000 0.172 0.004 0.808 0.012
#> SRR1080270 3 0.3369 0.69742 0.016 0.012 0.836 0.024 0.112 0.000
#> SRR1312501 5 0.6596 0.36948 0.008 0.000 0.208 0.240 0.504 0.040
#> SRR1093148 3 0.4089 0.61816 0.012 0.000 0.776 0.024 0.028 0.160
#> SRR1467080 3 0.4488 0.64536 0.000 0.048 0.752 0.000 0.060 0.140
#> SRR1410866 2 0.0622 0.88952 0.008 0.980 0.012 0.000 0.000 0.000
#> SRR816475 6 0.7075 0.03671 0.072 0.000 0.248 0.320 0.000 0.360
#> SRR1379198 1 0.5276 0.32995 0.604 0.000 0.000 0.208 0.000 0.188
#> SRR613342 5 0.2959 0.66879 0.000 0.000 0.124 0.008 0.844 0.024
#> SRR1452246 2 0.4232 0.65862 0.228 0.724 0.008 0.032 0.000 0.008
#> SRR1338836 2 0.0603 0.88703 0.000 0.980 0.016 0.004 0.000 0.000
#> SRR1369129 6 0.5983 -0.06792 0.232 0.000 0.000 0.356 0.000 0.412
#> SRR1396616 3 0.5279 0.55686 0.040 0.000 0.676 0.204 0.072 0.008
#> SRR813824 5 0.3368 0.58886 0.000 0.000 0.232 0.000 0.756 0.012
#> SRR1082376 5 0.2648 0.68835 0.040 0.000 0.064 0.008 0.884 0.004
#> SRR1500891 6 0.5949 0.16335 0.028 0.000 0.056 0.312 0.036 0.568
#> SRR807543 5 0.4307 0.63838 0.028 0.000 0.156 0.044 0.764 0.008
#> SRR1091572 1 0.6113 0.39094 0.532 0.000 0.048 0.340 0.060 0.020
#> SRR1346689 6 0.6574 0.19369 0.176 0.000 0.040 0.256 0.012 0.516
#> SRR1332424 1 0.6348 0.21162 0.440 0.000 0.036 0.096 0.412 0.016
#> SRR663729 6 0.4696 0.46369 0.148 0.000 0.024 0.104 0.000 0.724
#> SRR1097013 5 0.3093 0.68083 0.092 0.000 0.044 0.004 0.852 0.008
#> SRR613675 1 0.4244 0.61040 0.776 0.000 0.024 0.140 0.048 0.012
#> SRR1485357 1 0.5613 0.25248 0.568 0.000 0.016 0.292 0.000 0.124
#> SRR655816 6 0.4628 0.48293 0.000 0.000 0.208 0.016 0.072 0.704
#> SRR1500113 1 0.3956 0.56939 0.712 0.000 0.000 0.000 0.252 0.036
#> SRR1437622 6 0.4121 0.28477 0.012 0.000 0.012 0.308 0.000 0.668
#> SRR1355172 5 0.5731 0.08599 0.052 0.000 0.444 0.000 0.452 0.052
#> SRR655531 6 0.4028 0.53239 0.032 0.000 0.084 0.008 0.072 0.804
#> SRR1338147 3 0.3025 0.69249 0.024 0.000 0.820 0.000 0.156 0.000
#> SRR1413329 6 0.4224 0.50454 0.000 0.000 0.172 0.020 0.056 0.752
#> SRR1485931 2 0.4276 0.71242 0.004 0.748 0.044 0.188 0.004 0.012
#> SRR1420873 1 0.5269 0.15180 0.544 0.000 0.052 0.008 0.012 0.384
#> SRR1333308 4 0.3470 0.60675 0.028 0.000 0.028 0.820 0.000 0.124
#> SRR1452033 1 0.5903 0.17320 0.484 0.000 0.044 0.044 0.412 0.016
#> SRR1467316 2 0.2905 0.84313 0.000 0.880 0.036 0.048 0.012 0.024
#> SRR809018 3 0.3416 0.69789 0.000 0.000 0.804 0.000 0.140 0.056
#> SRR1375351 2 0.0000 0.88999 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663440 6 0.5537 0.08639 0.000 0.000 0.368 0.000 0.140 0.492
#> SRR1471755 1 0.5306 0.39185 0.616 0.292 0.020 0.064 0.000 0.008
#> SRR808019 3 0.5091 -0.07186 0.028 0.000 0.488 0.008 0.460 0.016
#> SRR1479133 5 0.4402 0.50507 0.000 0.000 0.268 0.000 0.672 0.060
#> SRR615069 4 0.6885 0.40245 0.004 0.048 0.140 0.592 0.100 0.116
#> SRR1456185 2 0.4237 0.62999 0.272 0.692 0.004 0.008 0.000 0.024
#> SRR1350069 4 0.6618 0.07695 0.396 0.000 0.084 0.408 0.000 0.112
#> SRR816316 5 0.1780 0.69269 0.028 0.000 0.048 0.000 0.924 0.000
#> SRR664795 6 0.4632 0.48918 0.008 0.000 0.152 0.000 0.128 0.712
#> SRR1490721 6 0.5546 0.10479 0.080 0.000 0.024 0.360 0.000 0.536
#> SRR810643 1 0.4390 0.57699 0.700 0.000 0.004 0.000 0.232 0.064
#> SRR1430333 6 0.4733 0.49236 0.000 0.000 0.136 0.092 0.040 0.732
#> SRR1085285 3 0.5065 0.54138 0.000 0.000 0.616 0.000 0.260 0.124
#> SRR1099072 5 0.4963 0.46666 0.000 0.000 0.296 0.032 0.632 0.040
#> SRR1317985 5 0.4338 0.47146 0.300 0.000 0.004 0.000 0.660 0.036
#> SRR1487340 5 0.4859 0.63352 0.136 0.000 0.032 0.000 0.716 0.116
#> SRR1420276 3 0.3168 0.69271 0.000 0.092 0.852 0.004 0.028 0.024
#> SRR1351347 5 0.6989 0.37942 0.080 0.000 0.232 0.168 0.504 0.016
#> SRR1405525 5 0.5407 0.57393 0.028 0.000 0.060 0.084 0.712 0.116
#> SRR1370329 1 0.5359 0.11213 0.460 0.000 0.000 0.000 0.432 0.108
#> SRR1465001 1 0.1995 0.65059 0.912 0.000 0.000 0.000 0.052 0.036
#> SRR1476525 2 0.0146 0.89035 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR819610 6 0.5189 0.45764 0.264 0.004 0.080 0.016 0.000 0.636
#> SRR2157314 6 0.4969 0.45533 0.036 0.000 0.060 0.000 0.228 0.676
#> SRR1409465 2 0.0993 0.88257 0.000 0.964 0.024 0.012 0.000 0.000
#> SRR809987 1 0.3942 0.55346 0.784 0.000 0.012 0.120 0.000 0.084
#> SRR613639 5 0.5230 0.42826 0.004 0.000 0.292 0.000 0.592 0.112
#> SRR1402285 6 0.4593 0.41858 0.180 0.000 0.004 0.112 0.000 0.704
#> SRR1077038 5 0.7894 -0.11636 0.248 0.000 0.148 0.288 0.300 0.016
#> SRR1405660 3 0.3470 0.63986 0.000 0.000 0.740 0.000 0.248 0.012
#> SRR1095455 5 0.1766 0.69137 0.016 0.012 0.008 0.004 0.940 0.020
#> SRR1394734 6 0.6984 0.38877 0.216 0.040 0.104 0.096 0.000 0.544
#> SRR1317771 6 0.4667 0.24754 0.000 0.000 0.032 0.328 0.016 0.624
#> SRR1365894 4 0.2427 0.59722 0.020 0.000 0.056 0.900 0.004 0.020
#> SRR1073581 4 0.5784 0.45140 0.072 0.000 0.224 0.636 0.020 0.048
#> SRR659804 5 0.4952 0.12008 0.408 0.000 0.000 0.000 0.524 0.068
#> SRR1345914 6 0.4943 0.50418 0.044 0.072 0.152 0.000 0.008 0.724
#> SRR1432186 2 0.1926 0.84878 0.000 0.912 0.020 0.000 0.000 0.068
#> SRR1473529 2 0.7643 0.30917 0.004 0.472 0.060 0.248 0.092 0.124
#> SRR660764 5 0.4837 0.61089 0.004 0.020 0.084 0.004 0.720 0.168
#> SRR820448 5 0.3611 0.66808 0.012 0.000 0.072 0.000 0.812 0.104
#> SRR1328845 1 0.6274 0.24210 0.544 0.000 0.060 0.256 0.000 0.140
#> SRR1336415 1 0.5342 0.36343 0.620 0.000 0.008 0.212 0.000 0.160
#> SRR1379065 4 0.4359 0.45983 0.028 0.000 0.008 0.652 0.000 0.312
#> SRR1459190 5 0.4768 0.55218 0.000 0.000 0.080 0.008 0.668 0.244
#> SRR1346773 5 0.4252 0.28545 0.372 0.000 0.000 0.000 0.604 0.024
#> SRR1499521 1 0.4254 0.61582 0.792 0.000 0.076 0.088 0.020 0.024
#> SRR1440898 2 0.1082 0.88146 0.040 0.956 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347459 5 0.4631 0.25293 0.008 0.000 0.396 0.008 0.572 0.016
#> SRR1081209 2 0.3366 0.79331 0.000 0.824 0.036 0.128 0.004 0.008
#> SRR1400202 1 0.3164 0.60420 0.824 0.000 0.000 0.004 0.032 0.140
#> SRR1333395 4 0.5214 0.23796 0.004 0.000 0.044 0.500 0.016 0.436
#> SRR1309248 4 0.5332 0.42843 0.004 0.004 0.052 0.604 0.024 0.312
#> SRR809161 5 0.5568 0.27029 0.000 0.000 0.140 0.000 0.468 0.392
#> SRR1316320 4 0.4913 0.54732 0.004 0.040 0.044 0.716 0.008 0.188
#> SRR1432629 2 0.3909 0.70696 0.012 0.756 0.024 0.004 0.000 0.204
#> SRR1498931 1 0.3348 0.60282 0.768 0.000 0.000 0.000 0.216 0.016
#> SRR1416578 6 0.5931 0.18947 0.368 0.000 0.012 0.152 0.000 0.468
#> SRR1405547 3 0.2545 0.70873 0.000 0.000 0.888 0.020 0.068 0.024
#> SRR1470534 6 0.4162 0.43687 0.100 0.000 0.004 0.144 0.000 0.752
#> SRR1380764 1 0.2476 0.65485 0.892 0.000 0.004 0.004 0.060 0.040
#> SRR1309160 3 0.4903 0.37995 0.000 0.000 0.568 0.000 0.360 0.072
#> SRR663489 3 0.4945 0.38082 0.000 0.000 0.584 0.004 0.068 0.344
#> SRR1500450 6 0.4339 0.50576 0.032 0.000 0.040 0.012 0.148 0.768
#> SRR1078489 4 0.4238 0.52716 0.036 0.000 0.112 0.788 0.052 0.012
#> SRR1332648 6 0.5671 0.19806 0.188 0.000 0.004 0.260 0.000 0.548
#> SRR660614 2 0.6216 0.53938 0.004 0.584 0.048 0.080 0.264 0.020
#> SRR1470420 2 0.0790 0.88323 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475566 1 0.2070 0.64145 0.908 0.000 0.000 0.000 0.044 0.048
#> SRR1477949 6 0.6325 0.12621 0.336 0.000 0.028 0.000 0.180 0.456
#> SRR1481419 2 0.0146 0.89000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464766 1 0.4948 0.46216 0.632 0.000 0.024 0.020 0.308 0.016
#> SRR615946 3 0.4968 0.59824 0.064 0.000 0.700 0.024 0.200 0.012
#> SRR1446481 1 0.4912 0.18031 0.572 0.380 0.032 0.008 0.004 0.004
#> SRR1467656 2 0.0508 0.88980 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000 0.000
#> SRR1402962 5 0.2981 0.69121 0.024 0.000 0.072 0.004 0.868 0.032
#> SRR660224 6 0.3690 0.52424 0.008 0.016 0.080 0.004 0.064 0.828
#> SRR665586 5 0.5042 0.45005 0.000 0.000 0.040 0.032 0.612 0.316
#> SRR1347166 6 0.5521 0.33188 0.004 0.000 0.060 0.260 0.052 0.624
#> SRR1485722 5 0.5673 0.58409 0.152 0.000 0.104 0.056 0.672 0.016
#> SRR1415316 5 0.5643 0.54849 0.024 0.000 0.028 0.116 0.664 0.168
#> SRR613390 5 0.1706 0.69466 0.024 0.000 0.032 0.004 0.936 0.004
#> SRR661108 3 0.3200 0.67933 0.000 0.000 0.788 0.000 0.196 0.016
#> SRR2170173 6 0.4432 0.47013 0.000 0.000 0.080 0.008 0.192 0.720
#> SRR817329 5 0.3744 0.67063 0.000 0.000 0.056 0.032 0.812 0.100
#> SRR1401990 6 0.5988 0.22267 0.232 0.000 0.012 0.236 0.000 0.520
#> SRR1467745 1 0.4598 0.56485 0.736 0.000 0.116 0.124 0.000 0.024
#> SRR1471795 2 0.3814 0.79345 0.100 0.800 0.004 0.008 0.000 0.088
#> SRR1415637 2 0.0000 0.88999 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813137 5 0.5062 0.54719 0.012 0.000 0.100 0.000 0.648 0.240
#> SRR1314873 6 0.4582 0.42908 0.004 0.000 0.028 0.160 0.068 0.740
#> SRR1401211 1 0.3911 0.62395 0.804 0.000 0.040 0.000 0.068 0.088
#> SRR1419692 1 0.3940 0.58529 0.772 0.000 0.020 0.180 0.012 0.016
#> SRR818797 5 0.4262 0.06409 0.000 0.000 0.476 0.000 0.508 0.016
#> SRR2164608 6 0.4429 0.48475 0.000 0.000 0.140 0.000 0.144 0.716
#> SRR1455586 3 0.3294 0.66237 0.012 0.060 0.856 0.024 0.000 0.048
#> SRR819459 3 0.3445 0.68275 0.000 0.048 0.836 0.000 0.036 0.080
#> SRR1488939 2 0.4620 0.79528 0.076 0.780 0.044 0.016 0.008 0.076
#> SRR1433232 2 0.0972 0.88143 0.000 0.964 0.028 0.008 0.000 0.000
#> SRR1385501 5 0.1528 0.69217 0.000 0.000 0.048 0.000 0.936 0.016
#> SRR1361652 5 0.6133 0.49008 0.004 0.016 0.060 0.104 0.628 0.188
#> SRR1437119 1 0.1794 0.64492 0.924 0.000 0.000 0.000 0.036 0.040
#> SRR1478547 3 0.3298 0.64890 0.000 0.000 0.756 0.000 0.236 0.008
#> SRR1430910 5 0.1948 0.69262 0.004 0.020 0.016 0.008 0.932 0.020
#> SRR1310584 1 0.1265 0.63619 0.948 0.000 0.000 0.000 0.008 0.044
#> SRR1500216 4 0.4713 0.49659 0.040 0.000 0.124 0.752 0.072 0.012
#> SRR1486762 5 0.7208 0.05678 0.080 0.088 0.368 0.020 0.428 0.016
#> SRR1480854 4 0.2741 0.60989 0.008 0.000 0.032 0.868 0.000 0.092
#> SRR1489394 6 0.6183 0.15299 0.244 0.000 0.016 0.252 0.000 0.488
#> SRR1418085 1 0.6149 -0.21806 0.380 0.000 0.004 0.372 0.000 0.244
#> SRR1340221 1 0.4828 0.19538 0.568 0.000 0.000 0.064 0.000 0.368
#> SRR1473058 4 0.5966 0.49376 0.084 0.000 0.160 0.620 0.000 0.136
#> SRR1405165 3 0.2936 0.71018 0.000 0.000 0.852 0.016 0.112 0.020
#> SRR1433004 5 0.1410 0.69208 0.044 0.000 0.004 0.000 0.944 0.008
#> SRR1471477 1 0.4370 0.40962 0.672 0.000 0.036 0.008 0.000 0.284
#> SRR1098567 3 0.4559 0.20138 0.000 0.444 0.528 0.000 0.016 0.012
#> SRR1098712 1 0.4174 0.58646 0.784 0.000 0.100 0.072 0.000 0.044
#> SRR1455038 5 0.3051 0.68194 0.056 0.000 0.032 0.024 0.872 0.016
#> SRR1375248 3 0.3737 0.34186 0.000 0.392 0.608 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403005 5 0.3368 0.66093 0.000 0.000 0.116 0.004 0.820 0.060
#> SRR1348378 2 0.4865 0.61166 0.004 0.672 0.240 0.076 0.004 0.004
#> SRR1413541 5 0.3121 0.67968 0.064 0.000 0.024 0.008 0.864 0.040
#> SRR1392943 4 0.4764 0.47386 0.040 0.000 0.008 0.640 0.008 0.304
#> SRR1475192 3 0.4842 0.60121 0.092 0.012 0.756 0.100 0.028 0.012
#> SRR1432085 3 0.4089 0.64721 0.024 0.160 0.776 0.012 0.028 0.000
#> SRR1452468 5 0.6258 0.43937 0.004 0.000 0.064 0.248 0.564 0.120
#> SRR1347060 3 0.3073 0.67196 0.000 0.000 0.788 0.008 0.204 0.000
#> SRR1414139 3 0.4671 0.54023 0.000 0.008 0.676 0.000 0.072 0.244
#> SRR1447962 3 0.4234 0.57440 0.000 0.100 0.744 0.000 0.004 0.152
#> SRR1444324 2 0.1478 0.87987 0.000 0.944 0.032 0.020 0.000 0.004
#> SRR1415004 1 0.1598 0.63949 0.940 0.000 0.008 0.008 0.004 0.040
#> SRR1413436 4 0.4844 0.52158 0.000 0.000 0.048 0.664 0.028 0.260
#> SRR1311266 5 0.5646 0.51278 0.216 0.000 0.076 0.044 0.648 0.016
#> SRR1343302 1 0.6518 -0.20412 0.368 0.000 0.020 0.336 0.000 0.276
#> SRR1373746 1 0.4074 0.55782 0.716 0.000 0.008 0.008 0.252 0.016
#> SRR1429678 1 0.4399 0.61540 0.728 0.000 0.008 0.024 0.212 0.028
#> SRR1469413 3 0.3710 0.60796 0.000 0.064 0.788 0.000 0.004 0.144
#> SRR1405331 5 0.5005 0.63285 0.092 0.000 0.092 0.060 0.740 0.016
#> SRR1345609 6 0.4510 0.36185 0.048 0.000 0.020 0.228 0.000 0.704
#> SRR1380208 6 0.4704 0.20544 0.004 0.000 0.036 0.332 0.008 0.620
#> SRR1322840 6 0.4274 0.00940 0.004 0.000 0.012 0.432 0.000 0.552
#> SRR1399797 3 0.4109 0.33319 0.000 0.000 0.576 0.000 0.412 0.012
#> SRR1416654 5 0.3907 0.27387 0.004 0.000 0.408 0.000 0.588 0.000
#> SRR1315081 3 0.3617 0.70437 0.000 0.080 0.816 0.000 0.088 0.016
#> SRR1369196 3 0.2948 0.67370 0.012 0.000 0.860 0.084 0.044 0.000
#> SRR1400847 1 0.3795 0.61956 0.768 0.000 0.012 0.008 0.196 0.016
#> SRR1365291 5 0.5759 0.43882 0.000 0.000 0.276 0.096 0.584 0.044
#> SRR1367920 4 0.3726 0.56588 0.028 0.000 0.004 0.752 0.000 0.216
#> SRR1366648 3 0.3130 0.70174 0.000 0.004 0.824 0.000 0.144 0.028
#> SRR1441679 2 0.0951 0.88455 0.000 0.968 0.020 0.008 0.000 0.004
#> SRR1082173 5 0.4100 0.64409 0.052 0.000 0.180 0.004 0.756 0.008
#> SRR1363968 1 0.5026 0.61690 0.720 0.000 0.040 0.064 0.160 0.016
#> SRR814387 1 0.2896 0.58533 0.824 0.000 0.000 0.000 0.016 0.160
#> SRR657599 6 0.6117 0.24610 0.028 0.000 0.176 0.000 0.268 0.528
#> SRR1386689 1 0.5395 0.36410 0.612 0.000 0.008 0.216 0.000 0.164
#> SRR1395575 3 0.2613 0.70441 0.000 0.000 0.848 0.000 0.140 0.012
#> SRR1453811 5 0.4353 0.32327 0.020 0.000 0.388 0.004 0.588 0.000
#> SRR1441159 5 0.4967 -0.00943 0.456 0.000 0.016 0.012 0.500 0.016
#> SRR1403154 1 0.6108 -0.10556 0.436 0.000 0.012 0.368 0.000 0.184
#> SRR1468722 3 0.3854 0.68775 0.000 0.000 0.772 0.000 0.136 0.092
#> SRR1310275 5 0.5913 0.47330 0.052 0.000 0.260 0.076 0.600 0.012
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
sessionInfo()
#> R version 3.6.0 (2019-04-26)
#> Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
#> Running under: CentOS Linux 7 (Core)
#>
#> Matrix products: default
#> BLAS: /usr/lib64/libblas.so.3.4.2
#> LAPACK: /usr/lib64/liblapack.so.3.4.2
#>
#> locale:
#> [1] LC_CTYPE=en_GB.UTF-8 LC_NUMERIC=C LC_TIME=en_GB.UTF-8
#> [4] LC_COLLATE=en_GB.UTF-8 LC_MONETARY=en_GB.UTF-8 LC_MESSAGES=en_GB.UTF-8
#> [7] LC_PAPER=en_GB.UTF-8 LC_NAME=C LC_ADDRESS=C
#> [10] LC_TELEPHONE=C LC_MEASUREMENT=en_GB.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
#>
#> attached base packages:
#> [1] grid stats graphics grDevices utils datasets methods base
#>
#> other attached packages:
#> [1] genefilter_1.66.0 ComplexHeatmap_2.3.1 markdown_1.1 knitr_1.26
#> [5] GetoptLong_0.1.7 cola_1.3.2
#>
#> loaded via a namespace (and not attached):
#> [1] circlize_0.4.8 shape_1.4.4 xfun_0.11 slam_0.1-46
#> [5] lattice_0.20-38 splines_3.6.0 colorspace_1.4-1 vctrs_0.2.0
#> [9] stats4_3.6.0 blob_1.2.0 XML_3.98-1.20 survival_2.44-1.1
#> [13] rlang_0.4.2 pillar_1.4.2 DBI_1.0.0 BiocGenerics_0.30.0
#> [17] bit64_0.9-7 RColorBrewer_1.1-2 matrixStats_0.55.0 stringr_1.4.0
#> [21] GlobalOptions_0.1.1 evaluate_0.14 memoise_1.1.0 Biobase_2.44.0
#> [25] IRanges_2.18.3 parallel_3.6.0 AnnotationDbi_1.46.1 highr_0.8
#> [29] Rcpp_1.0.3 xtable_1.8-4 backports_1.1.5 S4Vectors_0.22.1
#> [33] annotate_1.62.0 skmeans_0.2-11 bit_1.1-14 microbenchmark_1.4-7
#> [37] brew_1.0-6 impute_1.58.0 rjson_0.2.20 png_0.1-7
#> [41] digest_0.6.23 stringi_1.4.3 polyclip_1.10-0 clue_0.3-57
#> [45] tools_3.6.0 bitops_1.0-6 magrittr_1.5 eulerr_6.0.0
#> [49] RCurl_1.95-4.12 RSQLite_2.1.4 tibble_2.1.3 cluster_2.1.0
#> [53] crayon_1.3.4 pkgconfig_2.0.3 zeallot_0.1.0 Matrix_1.2-17
#> [57] xml2_1.2.2 httr_1.4.1 R6_2.4.1 mclust_5.4.5
#> [61] compiler_3.6.0