Date: 2019-12-25 22:37:42 CET, cola version: 1.3.2
Document is loading...
All available functions which can be applied to this res_list object:
res_list
#> A 'ConsensusPartitionList' object with 24 methods.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows are extracted by 'SD, CV, MAD, ATC' methods.
#> Subgroups are detected by 'hclust, kmeans, skmeans, pam, mclust, NMF' method.
#> Number of partitions are tried for k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> Performed in total 30000 partitions by row resampling.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartitionList' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots" "collect_stats"
#> [5] "colnames" "functional_enrichment" "get_anno_col" "get_anno"
#> [9] "get_classes" "get_matrix" "get_membership" "get_stats"
#> [13] "is_best_k" "is_stable_k" "ncol" "nrow"
#> [17] "rownames" "show" "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
#> [21] "top_rows_heatmap" "top_rows_overlap"
#>
#> You can get result for a single method by, e.g. object["SD", "hclust"] or object["SD:hclust"]
#> or a subset of methods by object[c("SD", "CV")], c("hclust", "kmeans")]
The call of run_all_consensus_partition_methods() was:
#> run_all_consensus_partition_methods(data = mat, mc.cores = 4)
Dimension of the input matrix:
mat = get_matrix(res_list)
dim(mat)
#> [1] 17439 500
The density distribution for each sample is visualized as in one column in the following heatmap. The clustering is based on the distance which is the Kolmogorov-Smirnov statistic between two distributions.
library(ComplexHeatmap)
densityHeatmap(mat, ylab = "value", cluster_columns = TRUE, show_column_names = FALSE,
mc.cores = 4)
Folowing table shows the best k (number of partitions) for each combination
of top-value methods and partition methods. Clicking on the method name in
the table goes to the section for a single combination of methods.
The cola vignette explains the definition of the metrics used for determining the best number of partitions.
suggest_best_k(res_list)
| The best k | 1-PAC | Mean silhouette | Concordance | Optional k | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| SD:kmeans | 3 | 1.000 | 0.969 | 0.971 | ** | 2 |
| SD:mclust | 2 | 1.000 | 0.961 | 0.982 | ** | |
| CV:mclust | 2 | 1.000 | 0.967 | 0.987 | ** | |
| ATC:mclust | 2 | 1.000 | 0.987 | 0.995 | ** | |
| ATC:NMF | 2 | 1.000 | 0.974 | 0.990 | ** | |
| ATC:kmeans | 3 | 0.989 | 0.954 | 0.981 | ** | 2 |
| SD:NMF | 3 | 0.988 | 0.956 | 0.982 | ** | 2 |
| MAD:kmeans | 3 | 0.985 | 0.963 | 0.954 | ** | 2 |
| MAD:NMF | 3 | 0.981 | 0.943 | 0.978 | ** | 2 |
| ATC:skmeans | 3 | 0.980 | 0.942 | 0.978 | ** | 2 |
| CV:skmeans | 3 | 0.962 | 0.955 | 0.981 | ** | 2 |
| CV:kmeans | 3 | 0.960 | 0.935 | 0.968 | ** | |
| ATC:pam | 3 | 0.954 | 0.936 | 0.969 | ** | 2 |
| MAD:skmeans | 4 | 0.945 | 0.917 | 0.960 | * | 2,3 |
| MAD:pam | 3 | 0.940 | 0.941 | 0.974 | * | |
| SD:skmeans | 4 | 0.936 | 0.907 | 0.956 | * | 2,3 |
| SD:pam | 3 | 0.931 | 0.926 | 0.968 | * | |
| MAD:mclust | 3 | 0.922 | 0.905 | 0.961 | * | 2 |
| CV:NMF | 4 | 0.919 | 0.900 | 0.954 | * | 2,3 |
| CV:pam | 3 | 0.905 | 0.909 | 0.960 | * | |
| ATC:hclust | 3 | 0.669 | 0.820 | 0.910 | ||
| CV:hclust | 2 | 0.612 | 0.846 | 0.925 | ||
| MAD:hclust | 3 | 0.494 | 0.736 | 0.860 | ||
| SD:hclust | 3 | 0.371 | 0.691 | 0.821 |
**: 1-PAC > 0.95, *: 1-PAC > 0.9
Cumulative distribution function curves of consensus matrix for all methods.
collect_plots(res_list, fun = plot_ecdf)
Consensus heatmaps for all methods. (What is a consensus heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = consensus_heatmap, mc.cores = 4)
Membership heatmaps for all methods. (What is a membership heatmap?)
collect_plots(res_list, k = 2, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = membership_heatmap, mc.cores = 4)
Signature heatmaps for all methods. (What is a signature heatmap?)
Note in following heatmaps, rows are scaled.
collect_plots(res_list, k = 2, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 3, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 4, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 5, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
collect_plots(res_list, k = 6, fun = get_signatures, mc.cores = 4)
The statistics used for measuring the stability of consensus partitioning. (How are they defined?)
get_stats(res_list, k = 2)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 2 1.000 0.973 0.989 0.493 0.508 0.508
#> CV:NMF 2 1.000 0.979 0.992 0.497 0.503 0.503
#> MAD:NMF 2 1.000 0.979 0.991 0.492 0.509 0.509
#> ATC:NMF 2 1.000 0.974 0.990 0.484 0.515 0.515
#> SD:skmeans 2 1.000 0.986 0.995 0.499 0.501 0.501
#> CV:skmeans 2 1.000 0.972 0.989 0.501 0.500 0.500
#> MAD:skmeans 2 1.000 0.987 0.995 0.499 0.501 0.501
#> ATC:skmeans 2 1.000 0.982 0.993 0.500 0.500 0.500
#> SD:mclust 2 1.000 0.961 0.982 0.499 0.500 0.500
#> CV:mclust 2 1.000 0.967 0.987 0.497 0.503 0.503
#> MAD:mclust 2 0.998 0.948 0.973 0.496 0.499 0.499
#> ATC:mclust 2 1.000 0.987 0.995 0.497 0.504 0.504
#> SD:kmeans 2 1.000 0.986 0.994 0.497 0.504 0.504
#> CV:kmeans 2 0.646 0.845 0.922 0.457 0.557 0.557
#> MAD:kmeans 2 1.000 0.988 0.994 0.496 0.504 0.504
#> ATC:kmeans 2 1.000 0.982 0.992 0.497 0.504 0.504
#> SD:pam 2 0.853 0.923 0.965 0.497 0.505 0.505
#> CV:pam 2 0.771 0.872 0.946 0.500 0.499 0.499
#> MAD:pam 2 0.890 0.933 0.970 0.497 0.503 0.503
#> ATC:pam 2 0.992 0.978 0.990 0.495 0.506 0.506
#> SD:hclust 2 0.347 0.767 0.870 0.364 0.632 0.632
#> CV:hclust 2 0.612 0.846 0.925 0.365 0.647 0.647
#> MAD:hclust 2 0.351 0.515 0.755 0.392 0.791 0.791
#> ATC:hclust 2 0.451 0.763 0.862 0.444 0.501 0.501
get_stats(res_list, k = 3)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 3 0.988 0.956 0.982 0.329 0.795 0.613
#> CV:NMF 3 0.965 0.949 0.979 0.317 0.807 0.628
#> MAD:NMF 3 0.981 0.943 0.978 0.334 0.792 0.608
#> ATC:NMF 3 0.881 0.894 0.956 0.371 0.774 0.581
#> SD:skmeans 3 0.980 0.952 0.980 0.305 0.819 0.650
#> CV:skmeans 3 0.962 0.955 0.981 0.301 0.806 0.628
#> MAD:skmeans 3 0.993 0.960 0.984 0.304 0.824 0.657
#> ATC:skmeans 3 0.980 0.942 0.978 0.287 0.827 0.663
#> SD:mclust 3 0.886 0.894 0.955 0.305 0.788 0.599
#> CV:mclust 3 0.855 0.883 0.951 0.307 0.780 0.590
#> MAD:mclust 3 0.922 0.905 0.961 0.312 0.778 0.584
#> ATC:mclust 3 0.827 0.870 0.920 0.276 0.847 0.699
#> SD:kmeans 3 1.000 0.969 0.971 0.291 0.829 0.668
#> CV:kmeans 3 0.960 0.935 0.968 0.401 0.739 0.555
#> MAD:kmeans 3 0.985 0.963 0.954 0.289 0.825 0.662
#> ATC:kmeans 3 0.989 0.954 0.981 0.292 0.819 0.653
#> SD:pam 3 0.931 0.926 0.968 0.300 0.825 0.661
#> CV:pam 3 0.905 0.909 0.960 0.258 0.832 0.676
#> MAD:pam 3 0.940 0.941 0.974 0.307 0.819 0.649
#> ATC:pam 3 0.954 0.936 0.969 0.310 0.780 0.592
#> SD:hclust 3 0.371 0.691 0.821 0.601 0.644 0.483
#> CV:hclust 3 0.588 0.756 0.884 0.153 0.956 0.933
#> MAD:hclust 3 0.494 0.736 0.860 0.566 0.578 0.472
#> ATC:hclust 3 0.669 0.820 0.910 0.432 0.818 0.650
get_stats(res_list, k = 4)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 4 0.828 0.868 0.924 0.0988 0.907 0.743
#> CV:NMF 4 0.919 0.900 0.954 0.0894 0.895 0.712
#> MAD:NMF 4 0.799 0.820 0.898 0.1004 0.902 0.732
#> ATC:NMF 4 0.873 0.871 0.935 0.0982 0.889 0.691
#> SD:skmeans 4 0.936 0.907 0.956 0.1461 0.856 0.613
#> CV:skmeans 4 0.870 0.927 0.951 0.1071 0.895 0.713
#> MAD:skmeans 4 0.945 0.917 0.960 0.1468 0.870 0.644
#> ATC:skmeans 4 0.786 0.720 0.877 0.1064 0.964 0.900
#> SD:mclust 4 0.647 0.547 0.758 0.1179 0.826 0.551
#> CV:mclust 4 0.675 0.699 0.831 0.1152 0.917 0.770
#> MAD:mclust 4 0.651 0.534 0.769 0.1184 0.819 0.539
#> ATC:mclust 4 0.687 0.658 0.773 0.1230 0.950 0.866
#> SD:kmeans 4 0.711 0.646 0.804 0.1355 0.908 0.748
#> CV:kmeans 4 0.813 0.773 0.865 0.1104 0.912 0.759
#> MAD:kmeans 4 0.745 0.767 0.856 0.1468 0.872 0.653
#> ATC:kmeans 4 0.771 0.805 0.882 0.1451 0.863 0.636
#> SD:pam 4 0.803 0.831 0.919 0.1482 0.867 0.642
#> CV:pam 4 0.749 0.819 0.835 0.1608 0.854 0.621
#> MAD:pam 4 0.830 0.744 0.878 0.1461 0.875 0.657
#> ATC:pam 4 0.897 0.875 0.946 0.1347 0.846 0.599
#> SD:hclust 4 0.587 0.703 0.794 0.1710 0.928 0.817
#> CV:hclust 4 0.471 0.674 0.828 0.2169 0.884 0.811
#> MAD:hclust 4 0.576 0.678 0.813 0.1197 0.950 0.871
#> ATC:hclust 4 0.650 0.628 0.807 0.0978 0.996 0.989
get_stats(res_list, k = 5)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 5 0.801 0.800 0.890 0.0746 0.889 0.642
#> CV:NMF 5 0.785 0.736 0.872 0.0543 0.965 0.881
#> MAD:NMF 5 0.781 0.780 0.879 0.0724 0.878 0.615
#> ATC:NMF 5 0.774 0.745 0.852 0.0578 0.912 0.700
#> SD:skmeans 5 0.829 0.793 0.879 0.0494 0.952 0.814
#> CV:skmeans 5 0.817 0.839 0.904 0.0667 0.938 0.782
#> MAD:skmeans 5 0.835 0.819 0.889 0.0495 0.948 0.803
#> ATC:skmeans 5 0.786 0.709 0.833 0.0567 0.910 0.738
#> SD:mclust 5 0.675 0.646 0.795 0.0542 0.834 0.486
#> CV:mclust 5 0.705 0.714 0.826 0.0658 0.907 0.691
#> MAD:mclust 5 0.671 0.721 0.797 0.0445 0.840 0.513
#> ATC:mclust 5 0.629 0.641 0.749 0.0559 0.860 0.593
#> SD:kmeans 5 0.684 0.467 0.667 0.0728 0.866 0.571
#> CV:kmeans 5 0.851 0.851 0.898 0.0716 0.926 0.754
#> MAD:kmeans 5 0.686 0.602 0.746 0.0669 0.972 0.892
#> ATC:kmeans 5 0.717 0.584 0.715 0.0708 0.918 0.700
#> SD:pam 5 0.721 0.708 0.828 0.0612 0.934 0.755
#> CV:pam 5 0.727 0.803 0.855 0.0742 0.922 0.713
#> MAD:pam 5 0.728 0.684 0.757 0.0566 0.927 0.732
#> ATC:pam 5 0.799 0.810 0.903 0.0653 0.916 0.699
#> SD:hclust 5 0.663 0.681 0.808 0.0642 0.960 0.880
#> CV:hclust 5 0.467 0.624 0.793 0.0919 0.982 0.964
#> MAD:hclust 5 0.650 0.625 0.772 0.0680 0.932 0.805
#> ATC:hclust 5 0.617 0.539 0.739 0.0593 0.943 0.839
get_stats(res_list, k = 6)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> SD:NMF 6 0.773 0.690 0.831 0.0445 0.907 0.640
#> CV:NMF 6 0.751 0.694 0.833 0.0431 0.941 0.790
#> MAD:NMF 6 0.750 0.693 0.817 0.0472 0.894 0.597
#> ATC:NMF 6 0.755 0.705 0.839 0.0387 0.946 0.778
#> SD:skmeans 6 0.784 0.636 0.769 0.0432 0.935 0.725
#> CV:skmeans 6 0.816 0.793 0.864 0.0541 0.924 0.691
#> MAD:skmeans 6 0.787 0.651 0.803 0.0455 0.967 0.854
#> ATC:skmeans 6 0.864 0.771 0.895 0.0358 0.952 0.824
#> SD:mclust 6 0.695 0.697 0.792 0.0235 0.941 0.766
#> CV:mclust 6 0.718 0.645 0.779 0.0402 0.938 0.743
#> MAD:mclust 6 0.699 0.544 0.747 0.0369 0.937 0.763
#> ATC:mclust 6 0.638 0.527 0.673 0.0281 0.911 0.659
#> SD:kmeans 6 0.706 0.579 0.738 0.0475 0.867 0.498
#> CV:kmeans 6 0.783 0.701 0.823 0.0455 0.970 0.880
#> MAD:kmeans 6 0.709 0.519 0.717 0.0455 0.911 0.654
#> ATC:kmeans 6 0.738 0.621 0.759 0.0425 0.891 0.551
#> SD:pam 6 0.749 0.680 0.810 0.0474 0.933 0.706
#> CV:pam 6 0.778 0.687 0.846 0.0384 0.956 0.804
#> MAD:pam 6 0.764 0.514 0.748 0.0504 0.886 0.558
#> ATC:pam 6 0.756 0.699 0.844 0.0489 0.938 0.726
#> SD:hclust 6 0.675 0.637 0.796 0.0486 0.934 0.785
#> CV:hclust 6 0.492 0.497 0.757 0.1164 0.912 0.822
#> MAD:hclust 6 0.644 0.608 0.739 0.0569 0.917 0.728
#> ATC:hclust 6 0.628 0.488 0.710 0.0449 0.894 0.664
Following heatmap plots the partition for each combination of methods and the lightness correspond to the silhouette scores for samples in each method. On top the consensus subgroup is inferred from all methods by taking the mean silhouette scores as weight.
collect_stats(res_list, k = 2)
collect_stats(res_list, k = 3)
collect_stats(res_list, k = 4)
collect_stats(res_list, k = 5)
collect_stats(res_list, k = 6)
Collect partitions from all methods:
collect_classes(res_list, k = 2)
collect_classes(res_list, k = 3)
collect_classes(res_list, k = 4)
collect_classes(res_list, k = 5)
collect_classes(res_list, k = 6)
Overlap of top rows from different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 3000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 4000, method = "euler")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 5000, method = "euler")
Also visualize the correspondance of rankings between different top-row methods:
top_rows_overlap(res_list, top_n = 1000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 2000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 3000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 4000, method = "correspondance")
top_rows_overlap(res_list, top_n = 5000, method = "correspondance")
Heatmaps of the top rows:
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 1000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 2000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 3000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 4000)
top_rows_heatmap(res_list, top_n = 5000)
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.347 0.767 0.870 0.3643 0.632 0.632
#> 3 3 0.371 0.691 0.821 0.6011 0.644 0.483
#> 4 4 0.587 0.703 0.794 0.1710 0.928 0.817
#> 5 5 0.663 0.681 0.808 0.0642 0.960 0.880
#> 6 6 0.675 0.637 0.796 0.0486 0.934 0.785
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 2 0.9933 0.1443 0.452 0.548
#> SRR1404105 2 0.7528 0.7692 0.216 0.784
#> SRR2164936 2 0.0672 0.8522 0.008 0.992
#> SRR1472057 1 0.6247 0.8082 0.844 0.156
#> SRR614491 2 0.4298 0.8431 0.088 0.912
#> SRR1069376 2 0.7376 0.7758 0.208 0.792
#> SRR811964 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0376 0.8516 0.004 0.996
#> SRR1345715 2 0.7056 0.7871 0.192 0.808
#> SRR1328073 2 0.7299 0.7828 0.204 0.796
#> SRR1394209 2 0.5178 0.8336 0.116 0.884
#> SRR1474018 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.9000 0.6611 0.684 0.316
#> SRR1500555 2 0.2603 0.8525 0.044 0.956
#> SRR1354363 2 0.8144 0.7278 0.252 0.748
#> SRR1391619 1 0.4690 0.8088 0.900 0.100
#> SRR1307997 2 0.1414 0.8531 0.020 0.980
#> SRR663124 2 0.4431 0.8394 0.092 0.908
#> SRR1334670 2 0.7299 0.7781 0.204 0.796
#> SRR612515 2 0.4431 0.8394 0.092 0.908
#> SRR1092727 2 0.1184 0.8537 0.016 0.984
#> SRR1364013 2 0.1633 0.8538 0.024 0.976
#> SRR1468553 1 0.1414 0.7955 0.980 0.020
#> SRR1403980 1 0.2043 0.7995 0.968 0.032
#> SRR1420169 1 0.7745 0.7747 0.772 0.228
#> SRR1442800 2 0.7815 0.7517 0.232 0.768
#> SRR1359214 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.9044 0.6537 0.680 0.320
#> SRR1500030 1 0.8499 0.7098 0.724 0.276
#> SRR1093053 1 0.8081 0.7547 0.752 0.248
#> SRR1399843 1 0.9000 0.6756 0.684 0.316
#> SRR1380231 1 0.8813 0.6975 0.700 0.300
#> SRR809470 1 0.6973 0.7998 0.812 0.188
#> SRR614239 2 0.4431 0.8394 0.092 0.908
#> SRR613939 2 0.1843 0.8545 0.028 0.972
#> SRR612971 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0672 0.8518 0.008 0.992
#> SRR811357 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1471672 2 0.7056 0.7871 0.192 0.808
#> SRR613006 2 0.0938 0.8532 0.012 0.988
#> SRR1469570 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.8499 0.7098 0.724 0.276
#> SRR1079023 2 0.7219 0.7808 0.200 0.800
#> SRR813608 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1096736 2 0.9944 0.1244 0.456 0.544
#> SRR1478700 1 0.9358 0.5847 0.648 0.352
#> SRR1081543 1 0.4690 0.7983 0.900 0.100
#> SRR1384754 2 0.9944 0.1244 0.456 0.544
#> SRR612287 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1380317 2 0.5178 0.8336 0.116 0.884
#> SRR1315247 2 0.5737 0.8204 0.136 0.864
#> SRR1105344 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.2603 0.8525 0.044 0.956
#> SRR1480240 2 0.7745 0.7566 0.228 0.772
#> SRR1084816 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.3274 0.8499 0.060 0.940
#> SRR1419476 1 0.2236 0.8013 0.964 0.036
#> SRR1456075 1 0.8909 0.6744 0.692 0.308
#> SRR1389474 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1367005 2 0.7815 0.7522 0.232 0.768
#> SRR1334419 2 0.7056 0.7871 0.192 0.808
#> SRR1417154 1 0.1633 0.7971 0.976 0.024
#> SRR1095985 2 0.8016 0.7351 0.244 0.756
#> SRR1325771 2 0.7219 0.7808 0.200 0.800
#> SRR1360420 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.1414 0.8544 0.020 0.980
#> SRR1332993 2 0.7376 0.7758 0.208 0.792
#> SRR1311833 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.9358 0.5847 0.648 0.352
#> SRR1076916 1 0.2603 0.8016 0.956 0.044
#> SRR1356266 2 0.7219 0.7822 0.200 0.800
#> SRR1341983 2 0.0672 0.8514 0.008 0.992
#> SRR1456114 2 0.9833 0.3122 0.424 0.576
#> SRR1072948 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.6247 0.8082 0.844 0.156
#> SRR1480176 2 0.9044 0.6113 0.320 0.680
#> SRR613843 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1469192 2 0.9209 0.5750 0.336 0.664
#> SRR1404555 1 0.0938 0.7921 0.988 0.012
#> SRR659839 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1362848 2 0.9944 0.1244 0.456 0.544
#> SRR1407492 2 0.4431 0.8394 0.092 0.908
#> SRR1455082 2 0.1633 0.8507 0.024 0.976
#> SRR658362 2 0.0938 0.8534 0.012 0.988
#> SRR810921 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.3274 0.8071 0.940 0.060
#> SRR818232 2 0.7376 0.7745 0.208 0.792
#> SRR1454868 2 0.7602 0.7615 0.220 0.780
#> SRR1474816 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1342002 2 0.8144 0.7266 0.252 0.748
#> SRR1088437 2 0.0376 0.8516 0.004 0.996
#> SRR1466400 2 0.0938 0.8537 0.012 0.988
#> SRR658921 2 0.1843 0.8535 0.028 0.972
#> SRR1499873 2 0.0376 0.8496 0.004 0.996
#> SRR1101373 2 0.7056 0.7871 0.192 0.808
#> SRR1090145 2 0.6801 0.7951 0.180 0.820
#> SRR1379324 2 0.9710 0.3970 0.400 0.600
#> SRR1345307 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.2236 0.8013 0.964 0.036
#> SRR1454891 2 0.1414 0.8519 0.020 0.980
#> SRR663185 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR811819 2 0.7815 0.7540 0.232 0.768
#> SRR1318920 2 0.7883 0.7482 0.236 0.764
#> SRR656758 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1474351 2 0.7219 0.7808 0.200 0.800
#> SRR660450 2 0.1414 0.8544 0.020 0.980
#> SRR1472687 2 0.0672 0.8514 0.008 0.992
#> SRR1334291 2 0.0672 0.8518 0.008 0.992
#> SRR1415153 2 0.0672 0.8518 0.008 0.992
#> SRR1323271 2 0.1184 0.8535 0.016 0.984
#> SRR1368939 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.9323 0.6097 0.652 0.348
#> SRR614695 2 0.1843 0.8535 0.028 0.972
#> SRR1092372 2 0.7883 0.7482 0.236 0.764
#> SRR1474577 2 0.7056 0.7871 0.192 0.808
#> SRR1406582 2 0.7056 0.7871 0.192 0.808
#> SRR612779 2 0.0938 0.8513 0.012 0.988
#> SRR1089006 2 0.7056 0.7871 0.192 0.808
#> SRR1354071 2 0.8016 0.7386 0.244 0.756
#> SRR1105463 1 0.9460 0.5578 0.636 0.364
#> SRR811005 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1385319 2 0.7376 0.7752 0.208 0.792
#> SRR1325871 1 0.4690 0.8088 0.900 0.100
#> SRR1355415 1 0.7528 0.7849 0.784 0.216
#> SRR1090861 2 0.7219 0.7808 0.200 0.800
#> SRR1320712 2 0.7056 0.7795 0.192 0.808
#> SRR1470075 2 0.8016 0.7385 0.244 0.756
#> SRR1091254 2 0.7376 0.7753 0.208 0.792
#> SRR1101397 1 0.8608 0.7147 0.716 0.284
#> SRR1321165 2 0.7883 0.7482 0.236 0.764
#> SRR1092112 1 0.4815 0.8121 0.896 0.104
#> SRR1417588 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.6712 0.7976 0.176 0.824
#> SRR1432106 2 0.0376 0.8516 0.004 0.996
#> SRR655756 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1458314 2 0.9970 0.1291 0.468 0.532
#> SRR1318582 2 0.0672 0.8518 0.008 0.992
#> SRR1080484 2 0.0376 0.8515 0.004 0.996
#> SRR1072749 1 0.9580 0.5079 0.620 0.380
#> SRR1078586 2 0.7219 0.7808 0.200 0.800
#> SRR1400333 2 0.5294 0.8293 0.120 0.880
#> SRR1078834 2 0.3733 0.8391 0.072 0.928
#> SRR1417611 2 0.2423 0.8531 0.040 0.960
#> SRR1396840 2 0.8713 0.6610 0.292 0.708
#> SRR1465440 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.4298 0.8415 0.088 0.912
#> SRR1324269 2 0.9833 0.3156 0.424 0.576
#> SRR1401491 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1319443 2 0.8267 0.7182 0.260 0.740
#> SRR1324349 2 0.1633 0.8541 0.024 0.976
#> SRR1345523 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1500846 2 0.8144 0.7278 0.252 0.748
#> SRR661505 1 0.5842 0.8112 0.860 0.140
#> SRR1419062 1 0.8081 0.7600 0.752 0.248
#> SRR1480131 1 0.9983 0.1495 0.524 0.476
#> SRR1421284 2 0.3274 0.8499 0.060 0.940
#> SRR1329624 2 0.7299 0.7777 0.204 0.796
#> SRR1315739 1 0.0376 0.7880 0.996 0.004
#> SRR1099189 2 0.1843 0.8496 0.028 0.972
#> SRR1083286 2 0.7745 0.7566 0.228 0.772
#> SRR1091890 1 0.9998 0.1302 0.508 0.492
#> SRR1347436 2 0.4431 0.8418 0.092 0.908
#> SRR1327473 2 0.6712 0.7993 0.176 0.824
#> SRR1338195 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1457792 2 0.7219 0.7822 0.200 0.800
#> SRR658271 2 0.0376 0.8501 0.004 0.996
#> SRR1339597 1 0.9393 0.5745 0.644 0.356
#> SRR1454842 1 0.2236 0.8004 0.964 0.036
#> SRR1322643 2 0.7056 0.7871 0.192 0.808
#> SRR614887 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR1354620 1 0.7219 0.7931 0.800 0.200
#> SRR615056 2 0.1414 0.8533 0.020 0.980
#> SRR1105320 2 0.7056 0.7921 0.192 0.808
#> SRR1391529 2 0.7299 0.7781 0.204 0.796
#> SRR663052 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1478834 2 0.7453 0.7723 0.212 0.788
#> SRR812366 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.1184 0.7935 0.984 0.016
#> SRR615383 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1389157 2 0.4161 0.8450 0.084 0.916
#> SRR613568 2 0.1414 0.8544 0.020 0.980
#> SRR614095 2 0.1184 0.8524 0.016 0.984
#> SRR1103092 2 0.8144 0.7272 0.252 0.748
#> SRR1337155 2 0.9393 0.4253 0.356 0.644
#> SRR1475345 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1446180 2 0.5842 0.8187 0.140 0.860
#> SRR1406372 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.8499 0.7098 0.724 0.276
#> SRR1353136 2 0.7602 0.7615 0.220 0.780
#> SRR1093906 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1351104 2 0.8443 0.6977 0.272 0.728
#> SRR1363926 2 0.4161 0.8446 0.084 0.916
#> SRR1399861 2 0.7376 0.7623 0.208 0.792
#> SRR1338789 2 0.8713 0.6606 0.292 0.708
#> SRR1421420 1 0.7299 0.7909 0.796 0.204
#> SRR1420832 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1476231 2 0.7219 0.7808 0.200 0.800
#> SRR1352870 2 0.6801 0.7910 0.180 0.820
#> SRR1315041 2 0.2236 0.8537 0.036 0.964
#> SRR661877 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.8608 0.7147 0.716 0.284
#> SRR1416617 1 0.1414 0.7955 0.980 0.020
#> SRR1102443 2 0.7056 0.7871 0.192 0.808
#> SRR655672 2 0.4431 0.8394 0.092 0.908
#> SRR1420006 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0672 0.8518 0.008 0.992
#> SRR613819 2 0.2423 0.8534 0.040 0.960
#> SRR1469432 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.1414 0.8518 0.020 0.980
#> SRR1470727 2 0.9460 0.5064 0.364 0.636
#> SRR1339153 1 0.4431 0.8085 0.908 0.092
#> SRR1472749 1 0.3733 0.8095 0.928 0.072
#> SRR1414379 2 0.3879 0.8465 0.076 0.924
#> SRR1431326 2 0.7139 0.7839 0.196 0.804
#> SRR1487278 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1098312 2 0.9970 0.0639 0.468 0.532
#> SRR810273 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0938 0.8529 0.012 0.988
#> SRR614467 2 0.2043 0.8546 0.032 0.968
#> SRR811471 2 0.7602 0.7650 0.220 0.780
#> SRR1478341 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR1088606 2 0.8016 0.7351 0.244 0.756
#> SRR1479699 1 0.9988 0.1780 0.520 0.480
#> SRR1403589 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0938 0.8527 0.012 0.988
#> SRR1359803 2 0.8327 0.7123 0.264 0.736
#> SRR1338988 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1378992 2 0.7056 0.7871 0.192 0.808
#> SRR659427 2 0.9710 0.3449 0.400 0.600
#> SRR1096638 2 0.7528 0.7692 0.216 0.784
#> SRR1466619 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.4298 0.8431 0.088 0.912
#> SRR1439994 1 0.7602 0.7819 0.780 0.220
#> SRR1454931 2 0.8661 0.6723 0.288 0.712
#> SRR1332928 1 0.8207 0.7468 0.744 0.256
#> SRR658621 2 0.1633 0.8536 0.024 0.976
#> SRR1095840 2 0.7299 0.7782 0.204 0.796
#> SRR1458243 1 0.9580 0.5126 0.620 0.380
#> SRR1374270 2 0.3879 0.8458 0.076 0.924
#> SRR1470947 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.1843 0.8535 0.028 0.972
#> SRR662787 2 0.0376 0.8516 0.004 0.996
#> SRR1408727 2 0.5178 0.8335 0.116 0.884
#> SRR1456274 2 0.9944 0.1338 0.456 0.544
#> SRR817744 2 0.7219 0.7808 0.200 0.800
#> SRR1478744 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.8813 0.6975 0.700 0.300
#> SRR1374198 2 0.7883 0.7482 0.236 0.764
#> SRR1445856 1 0.9393 0.5745 0.644 0.356
#> SRR820049 1 0.6712 0.7923 0.824 0.176
#> SRR1375290 2 0.8661 0.6201 0.288 0.712
#> SRR818999 1 0.9358 0.5862 0.648 0.352
#> SRR1390242 2 0.7219 0.7808 0.200 0.800
#> SRR1401164 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1454629 2 0.9661 0.4228 0.392 0.608
#> SRR1332187 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR603365 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.1633 0.8546 0.024 0.976
#> SRR1436207 2 0.0938 0.8513 0.012 0.988
#> SRR1488017 2 0.7219 0.7808 0.200 0.800
#> SRR612947 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1480384 2 0.9286 0.5556 0.344 0.656
#> SRR1364761 2 0.0672 0.8496 0.008 0.992
#> SRR1308086 2 1.0000 -0.0757 0.496 0.504
#> SRR1441868 2 0.7056 0.7871 0.192 0.808
#> SRR1485380 1 0.5737 0.8113 0.864 0.136
#> SRR1073705 2 0.7056 0.7871 0.192 0.808
#> SRR615032 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0672 0.8518 0.008 0.992
#> SRR1100346 2 0.3879 0.8472 0.076 0.924
#> SRR1332816 2 0.7056 0.7871 0.192 0.808
#> SRR612299 2 0.2043 0.8545 0.032 0.968
#> SRR1407386 2 0.7219 0.7822 0.200 0.800
#> SRR1418064 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1309403 2 0.7299 0.7829 0.204 0.796
#> SRR1498395 2 0.0672 0.8518 0.008 0.992
#> SRR1079998 1 0.7674 0.7774 0.776 0.224
#> SRR1498885 2 0.2043 0.8541 0.032 0.968
#> SRR1337215 2 0.1633 0.8548 0.024 0.976
#> SRR1414749 1 0.1414 0.7955 0.980 0.020
#> SRR1365963 1 0.7950 0.7626 0.760 0.240
#> SRR1368030 2 0.2778 0.8515 0.048 0.952
#> SRR1419760 2 0.4562 0.8404 0.096 0.904
#> SRR1381841 2 0.9460 0.5030 0.364 0.636
#> SRR821388 2 0.9933 0.1414 0.452 0.548
#> SRR657623 2 0.1843 0.8539 0.028 0.972
#> SRR1094241 1 0.3879 0.8075 0.924 0.076
#> SRR819583 1 0.6048 0.8099 0.852 0.148
#> SRR1096149 2 0.9286 0.5503 0.344 0.656
#> SRR1342829 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR1353028 2 0.7883 0.7457 0.236 0.764
#> SRR811333 1 0.7883 0.7687 0.764 0.236
#> SRR1311666 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.1843 0.8545 0.028 0.972
#> SRR1446436 2 0.0672 0.8518 0.008 0.992
#> SRR815092 2 0.7219 0.7808 0.200 0.800
#> SRR1500149 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1100564 2 0.7745 0.7555 0.228 0.772
#> SRR1403072 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR811653 2 0.7376 0.7623 0.208 0.792
#> SRR1311348 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0376 0.8516 0.004 0.996
#> SRR1435442 2 0.0938 0.8537 0.012 0.988
#> SRR1421444 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1319520 2 0.7056 0.7871 0.192 0.808
#> SRR1444763 2 0.8267 0.7156 0.260 0.740
#> SRR1415026 2 0.0376 0.8516 0.004 0.996
#> SRR1416596 2 0.1184 0.8540 0.016 0.984
#> SRR1485499 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.2043 0.8541 0.032 0.968
#> SRR1310094 2 0.2778 0.8518 0.048 0.952
#> SRR663537 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1486780 2 0.8327 0.7100 0.264 0.736
#> SRR1453950 2 0.7883 0.7477 0.236 0.764
#> SRR1087875 2 0.7056 0.7871 0.192 0.808
#> SRR613318 2 0.5519 0.8228 0.128 0.872
#> SRR1332694 2 0.7376 0.7747 0.208 0.792
#> SRR1468469 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0376 0.8496 0.004 0.996
#> SRR1120318 2 0.7883 0.7478 0.236 0.764
#> SRR1311622 1 0.8909 0.6744 0.692 0.308
#> SRR1500931 1 0.5946 0.8105 0.856 0.144
#> SRR1387494 1 0.9988 0.1763 0.520 0.480
#> SRR1379175 2 0.6712 0.8011 0.176 0.824
#> SRR1401909 1 0.7528 0.7849 0.784 0.216
#> SRR1440541 2 0.0672 0.8527 0.008 0.992
#> SRR1068832 1 0.6343 0.8075 0.840 0.160
#> SRR1376640 2 0.1843 0.8546 0.028 0.972
#> SRR1085712 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1082283 2 0.9522 0.4765 0.372 0.628
#> SRR1084276 2 0.9970 0.1280 0.468 0.532
#> SRR1353262 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1437035 2 0.8016 0.7386 0.244 0.756
#> SRR1396877 2 0.9983 0.0877 0.476 0.524
#> SRR1443026 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1417936 2 0.7219 0.7808 0.200 0.800
#> SRR1436822 2 0.0376 0.8514 0.004 0.996
#> SRR1101128 1 0.3584 0.8086 0.932 0.068
#> SRR1363886 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.2236 0.8540 0.036 0.964
#> SRR1093218 1 0.4690 0.8118 0.900 0.100
#> SRR1077090 1 0.7139 0.7947 0.804 0.196
#> SRR1327430 2 0.4161 0.8446 0.084 0.916
#> SRR1088958 2 0.7056 0.7871 0.192 0.808
#> SRR1486931 2 0.0938 0.8529 0.012 0.988
#> SRR1086820 2 0.8081 0.7317 0.248 0.752
#> SRR1383000 2 0.7883 0.7477 0.236 0.764
#> SRR1355705 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.1633 0.8545 0.024 0.976
#> SRR660534 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.2236 0.8537 0.036 0.964
#> SRR1456401 2 0.3733 0.8466 0.072 0.928
#> SRR1086393 2 0.7674 0.7619 0.224 0.776
#> SRR1351521 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.2948 0.8511 0.052 0.948
#> SRR1309382 2 0.7376 0.7752 0.208 0.792
#> SRR1089375 1 0.9896 0.3622 0.560 0.440
#> SRR1499482 2 0.0938 0.8513 0.012 0.988
#> SRR614719 2 0.2423 0.8528 0.040 0.960
#> SRR1081473 1 0.8327 0.7440 0.736 0.264
#> SRR1087415 2 0.8081 0.7317 0.248 0.752
#> SRR1088217 1 0.6712 0.8035 0.824 0.176
#> SRR808496 2 0.3879 0.8465 0.076 0.924
#> SRR1336463 2 0.1184 0.8542 0.016 0.984
#> SRR612359 2 0.2948 0.8511 0.052 0.948
#> SRR1444412 2 0.9922 0.2170 0.448 0.552
#> SRR1074116 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR808914 2 0.7376 0.7745 0.208 0.792
#> SRR1349099 2 0.7883 0.7475 0.236 0.764
#> SRR1337886 2 0.0938 0.8527 0.012 0.988
#> SRR813632 1 0.9209 0.6230 0.664 0.336
#> SRR1101591 1 0.7139 0.7948 0.804 0.196
#> SRR1089713 1 0.9000 0.6708 0.684 0.316
#> SRR1453127 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.5946 0.8110 0.856 0.144
#> SRR1313831 2 0.7376 0.7745 0.208 0.792
#> SRR1315434 1 0.0376 0.7880 0.996 0.004
#> SRR814747 2 0.1843 0.8539 0.028 0.972
#> SRR1358539 2 0.7376 0.7750 0.208 0.792
#> SRR1367807 2 0.7056 0.7871 0.192 0.808
#> SRR1365791 2 0.9209 0.5684 0.336 0.664
#> SRR1081519 1 0.6973 0.7996 0.812 0.188
#> SRR614707 2 0.3274 0.8494 0.060 0.940
#> SRR1094027 2 0.7219 0.7808 0.200 0.800
#> SRR1489092 2 0.8081 0.7290 0.248 0.752
#> SRR1079502 1 0.8955 0.6780 0.688 0.312
#> SRR1457814 2 0.7376 0.7623 0.208 0.792
#> SRR1455127 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0376 0.8514 0.004 0.996
#> SRR1327855 1 0.6048 0.8099 0.852 0.148
#> SRR1417873 2 0.2423 0.8531 0.040 0.960
#> SRR1394125 1 0.5737 0.8117 0.864 0.136
#> SRR1488388 2 0.7219 0.7822 0.200 0.800
#> SRR1401122 2 0.2778 0.8515 0.048 0.952
#> SRR612383 2 0.4298 0.8415 0.088 0.912
#> SRR1477711 2 0.7219 0.7808 0.200 0.800
#> SRR1350813 2 0.1414 0.8518 0.020 0.980
#> SRR612851 2 0.1414 0.8535 0.020 0.980
#> SRR1086349 2 0.7139 0.7839 0.196 0.804
#> SRR812837 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1340010 2 0.9933 0.1443 0.452 0.548
#> SRR1475885 2 0.7883 0.7478 0.236 0.764
#> SRR1376334 2 0.7299 0.7781 0.204 0.796
#> SRR1399821 2 0.7883 0.7475 0.236 0.764
#> SRR1347042 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.4431 0.8394 0.092 0.908
#> SRR612604 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0376 0.8496 0.004 0.996
#> SRR1311877 2 0.7139 0.7839 0.196 0.804
#> SRR1465608 1 0.8081 0.7560 0.752 0.248
#> SRR1101808 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.1184 0.7935 0.984 0.016
#> SRR1331153 2 0.1414 0.8544 0.020 0.980
#> SRR1078439 1 0.8081 0.7547 0.752 0.248
#> SRR2165527 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1351147 2 0.6801 0.7951 0.180 0.820
#> SRR1313536 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.6712 0.7993 0.176 0.824
#> SRR1403110 2 0.7299 0.7781 0.204 0.796
#> SRR1400355 2 0.0672 0.8518 0.008 0.992
#> SRR1401317 1 0.6048 0.8099 0.852 0.148
#> SRR1456862 2 0.9944 0.1842 0.456 0.544
#> SRR1074622 2 0.7528 0.7692 0.216 0.784
#> SRR1465847 1 0.7674 0.7773 0.776 0.224
#> SRR1443376 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.0672 0.7899 0.992 0.008
#> SRR1075579 2 0.7219 0.7808 0.200 0.800
#> SRR1090881 2 0.8661 0.6201 0.288 0.712
#> SRR612251 2 0.1184 0.8524 0.016 0.984
#> SRR1418581 2 0.7056 0.7871 0.192 0.808
#> SRR658045 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.3584 0.8482 0.068 0.932
#> SRR613078 2 0.0938 0.8537 0.012 0.988
#> SRR1472998 1 0.7674 0.7773 0.776 0.224
#> SRR1433452 2 0.0938 0.8529 0.012 0.988
#> SRR1101957 2 0.7139 0.7839 0.196 0.804
#> SRR1487993 1 0.8499 0.7098 0.724 0.276
#> SRR1465983 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1380375 2 0.7453 0.7726 0.212 0.788
#> SRR1367566 1 0.1843 0.7978 0.972 0.028
#> SRR1316151 2 0.0672 0.8523 0.008 0.992
#> SRR1417547 2 0.2778 0.8515 0.048 0.952
#> SRR659389 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.1414 0.8544 0.020 0.980
#> SRR1398207 1 0.9129 0.6388 0.672 0.328
#> SRR1358755 1 0.7376 0.7891 0.792 0.208
#> SRR1078903 2 0.1184 0.8537 0.016 0.984
#> SRR1323252 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0376 0.8501 0.004 0.996
#> SRR1369172 2 0.9393 0.5261 0.356 0.644
#> SRR615982 2 0.0938 0.8513 0.012 0.988
#> SRR1480431 2 0.1843 0.8496 0.028 0.972
#> SRR1429825 2 0.0938 0.8534 0.012 0.988
#> SRR1102393 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.8813 0.6979 0.700 0.300
#> SRR808351 2 0.7674 0.7610 0.224 0.776
#> SRR1317513 2 0.7376 0.7747 0.208 0.792
#> SRR1480501 1 0.7376 0.7885 0.792 0.208
#> SRR1081910 1 0.8386 0.7363 0.732 0.268
#> SRR1086611 2 0.6343 0.7985 0.160 0.840
#> SRR1392571 2 0.1633 0.8538 0.024 0.976
#> SRR1311441 2 0.7139 0.7839 0.196 0.804
#> SRR808152 2 0.7528 0.7692 0.216 0.784
#> SRR657313 1 0.3879 0.8075 0.924 0.076
#> SRR1433131 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0672 0.8518 0.008 0.992
#> SRR1389108 2 0.7056 0.7871 0.192 0.808
#> SRR1376228 1 0.1414 0.7955 0.980 0.020
#> SRR1399757 2 0.7139 0.7842 0.196 0.804
#> SRR1358060 1 0.1414 0.7955 0.980 0.020
#> SRR1464517 1 0.8909 0.6745 0.692 0.308
#> SRR613557 2 0.4298 0.8431 0.088 0.912
#> SRR809831 2 0.9833 0.3156 0.424 0.576
#> SRR1429387 1 0.0000 0.7857 1.000 0.000
#> SRR816565 2 0.7219 0.7808 0.200 0.800
#> SRR1071644 2 0.7219 0.7808 0.200 0.800
#> SRR1406936 1 0.8813 0.6975 0.700 0.300
#> SRR1072031 2 0.0000 0.8500 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.4431 0.8394 0.092 0.908
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 1 0.7453 0.45517 0.700 0.152 0.148
#> SRR1404105 1 0.5268 0.75791 0.776 0.212 0.012
#> SRR2164936 2 0.0424 0.89428 0.008 0.992 0.000
#> SRR1472057 3 0.6286 0.47793 0.464 0.000 0.536
#> SRR614491 2 0.5659 0.67976 0.248 0.740 0.012
#> SRR1069376 1 0.5156 0.75818 0.776 0.216 0.008
#> SRR811964 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0747 0.89451 0.016 0.984 0.000
#> SRR1345715 1 0.4842 0.75501 0.776 0.224 0.000
#> SRR1328073 1 0.6684 0.69099 0.676 0.292 0.032
#> SRR1394209 2 0.6294 0.60898 0.288 0.692 0.020
#> SRR1474018 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.6155 0.10929 0.664 0.008 0.328
#> SRR1500555 2 0.2878 0.86683 0.096 0.904 0.000
#> SRR1354363 1 0.4351 0.74355 0.828 0.168 0.004
#> SRR1391619 3 0.4555 0.77021 0.200 0.000 0.800
#> SRR1307997 2 0.2261 0.88062 0.068 0.932 0.000
#> SRR663124 2 0.5884 0.65361 0.272 0.716 0.012
#> SRR1334670 1 0.4702 0.75728 0.788 0.212 0.000
#> SRR612515 2 0.5884 0.65361 0.272 0.716 0.012
#> SRR1092727 2 0.1643 0.88981 0.044 0.956 0.000
#> SRR1364013 2 0.1964 0.88722 0.056 0.944 0.000
#> SRR1468553 3 0.3038 0.81110 0.104 0.000 0.896
#> SRR1403980 3 0.3267 0.80901 0.116 0.000 0.884
#> SRR1420169 1 0.6168 -0.18660 0.588 0.000 0.412
#> SRR1442800 1 0.7464 0.42768 0.560 0.400 0.040
#> SRR1359214 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.6129 0.12002 0.668 0.008 0.324
#> SRR1500030 3 0.6309 0.42752 0.496 0.000 0.504
#> SRR1093053 3 0.7724 0.47315 0.396 0.052 0.552
#> SRR1399843 1 0.7348 0.00529 0.608 0.044 0.348
#> SRR1380231 1 0.6934 0.03860 0.624 0.028 0.348
#> SRR809470 3 0.6617 0.46241 0.436 0.008 0.556
#> SRR614239 2 0.5884 0.65361 0.272 0.716 0.012
#> SRR613939 2 0.1860 0.88771 0.052 0.948 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.1031 0.89286 0.024 0.976 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.4842 0.75501 0.776 0.224 0.000
#> SRR613006 2 0.1289 0.89217 0.032 0.968 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.6309 0.42752 0.496 0.000 0.504
#> SRR1079023 1 0.4750 0.75682 0.784 0.216 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.7039 0.46552 0.728 0.128 0.144
#> SRR1478700 1 0.5588 0.21560 0.720 0.004 0.276
#> SRR1081543 3 0.3993 0.76731 0.064 0.052 0.884
#> SRR1384754 1 0.7039 0.46552 0.728 0.128 0.144
#> SRR612287 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.6294 0.60898 0.288 0.692 0.020
#> SRR1315247 2 0.6490 0.59968 0.256 0.708 0.036
#> SRR1105344 2 0.0592 0.89229 0.012 0.988 0.000
#> SRR658549 2 0.2878 0.86683 0.096 0.904 0.000
#> SRR1480240 1 0.5318 0.75700 0.780 0.204 0.016
#> SRR1084816 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.4887 0.72636 0.228 0.772 0.000
#> SRR1419476 3 0.2959 0.81191 0.100 0.000 0.900
#> SRR1456075 1 0.5560 0.14601 0.700 0.000 0.300
#> SRR1389474 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.4861 0.75393 0.800 0.192 0.008
#> SRR1334419 1 0.4842 0.75501 0.776 0.224 0.000
#> SRR1417154 3 0.3267 0.81015 0.116 0.000 0.884
#> SRR1095985 1 0.7597 0.46466 0.568 0.384 0.048
#> SRR1325771 1 0.4750 0.75682 0.784 0.216 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.79722 0.000 0.000 1.000
#> SRR660272 2 0.2356 0.87532 0.072 0.928 0.000
#> SRR1332993 1 0.5156 0.75818 0.776 0.216 0.008
#> SRR1311833 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 1 0.5588 0.21560 0.720 0.004 0.276
#> SRR1076916 3 0.2878 0.80076 0.096 0.000 0.904
#> SRR1356266 1 0.4750 0.75759 0.784 0.216 0.000
#> SRR1341983 2 0.1289 0.89352 0.032 0.968 0.000
#> SRR1456114 1 0.5731 0.62133 0.804 0.088 0.108
#> SRR1072948 3 0.1031 0.80291 0.024 0.000 0.976
#> SRR1472370 3 0.6286 0.47793 0.464 0.000 0.536
#> SRR1480176 1 0.6544 0.71476 0.752 0.164 0.084
#> SRR613843 2 0.0592 0.89253 0.012 0.988 0.000
#> SRR1469192 1 0.6587 0.70479 0.752 0.156 0.092
#> SRR1404555 3 0.1163 0.80326 0.028 0.000 0.972
#> SRR659839 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362848 1 0.7039 0.46552 0.728 0.128 0.144
#> SRR1407492 2 0.5884 0.65361 0.272 0.716 0.012
#> SRR1455082 2 0.1964 0.88698 0.056 0.944 0.000
#> SRR658362 2 0.1289 0.89356 0.032 0.968 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.5178 0.71846 0.256 0.000 0.744
#> SRR818232 1 0.4702 0.75791 0.788 0.212 0.000
#> SRR1454868 2 0.8304 0.08549 0.416 0.504 0.080
#> SRR1474816 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.6154 0.75147 0.752 0.204 0.044
#> SRR1088437 2 0.1031 0.89286 0.024 0.976 0.000
#> SRR1466400 2 0.3116 0.83772 0.108 0.892 0.000
#> SRR658921 2 0.4002 0.77797 0.160 0.840 0.000
#> SRR1499873 2 0.0424 0.89373 0.008 0.992 0.000
#> SRR1101373 1 0.4842 0.75501 0.776 0.224 0.000
#> SRR1090145 1 0.5178 0.73473 0.744 0.256 0.000
#> SRR1379324 1 0.5811 0.64945 0.800 0.108 0.092
#> SRR1345307 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.2711 0.81204 0.088 0.000 0.912
#> SRR1086280 3 0.2959 0.81191 0.100 0.000 0.900
#> SRR1454891 2 0.2261 0.88159 0.068 0.932 0.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR811819 1 0.5585 0.75538 0.772 0.204 0.024
#> SRR1318920 1 0.5254 0.69759 0.736 0.264 0.000
#> SRR656758 2 0.0424 0.89454 0.008 0.992 0.000
#> SRR1474351 1 0.4750 0.75682 0.784 0.216 0.000
#> SRR660450 2 0.2356 0.87532 0.072 0.928 0.000
#> SRR1472687 2 0.1289 0.89352 0.032 0.968 0.000
#> SRR1334291 2 0.0747 0.89338 0.016 0.984 0.000
#> SRR1415153 2 0.0424 0.89398 0.008 0.992 0.000
#> SRR1323271 2 0.1964 0.88352 0.056 0.944 0.000
#> SRR1368939 2 0.0747 0.89140 0.016 0.984 0.000
#> SRR1443161 1 0.8054 0.12525 0.580 0.080 0.340
#> SRR614695 2 0.3038 0.85063 0.104 0.896 0.000
#> SRR1092372 1 0.5254 0.69759 0.736 0.264 0.000
#> SRR1474577 1 0.4842 0.75501 0.776 0.224 0.000
#> SRR1406582 1 0.4842 0.75501 0.776 0.224 0.000
#> SRR612779 2 0.1964 0.88626 0.056 0.944 0.000
#> SRR1089006 1 0.4842 0.75501 0.776 0.224 0.000
#> SRR1354071 1 0.6295 0.73983 0.728 0.236 0.036
#> SRR1105463 1 0.7786 0.25267 0.600 0.068 0.332
#> SRR811005 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.4702 0.75792 0.788 0.212 0.000
#> SRR1325871 3 0.4555 0.77021 0.200 0.000 0.800
#> SRR1355415 1 0.6235 -0.26831 0.564 0.000 0.436
#> SRR1090861 1 0.4750 0.75682 0.784 0.216 0.000
#> SRR1320712 2 0.7931 0.21520 0.412 0.528 0.060
#> SRR1470075 1 0.4861 0.74915 0.808 0.180 0.012
#> SRR1091254 1 0.4931 0.75801 0.784 0.212 0.004
#> SRR1101397 1 0.5810 0.04492 0.664 0.000 0.336
#> SRR1321165 1 0.5254 0.69759 0.736 0.264 0.000
#> SRR1092112 3 0.5591 0.67041 0.304 0.000 0.696
#> SRR1417588 3 0.0000 0.79722 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074790 1 0.5431 0.70686 0.716 0.284 0.000
#> SRR1432106 2 0.0892 0.89378 0.020 0.980 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.6025 0.57863 0.784 0.076 0.140
#> SRR1318582 2 0.0424 0.89398 0.008 0.992 0.000
#> SRR1080484 2 0.0592 0.89532 0.012 0.988 0.000
#> SRR1072749 1 0.5580 0.27670 0.736 0.008 0.256
#> SRR1078586 1 0.4750 0.75682 0.784 0.216 0.000
#> SRR1400333 2 0.5816 0.75018 0.156 0.788 0.056
#> SRR1078834 2 0.4805 0.77850 0.176 0.812 0.012
#> SRR1417611 2 0.3267 0.84348 0.116 0.884 0.000
#> SRR1396840 1 0.6723 0.68462 0.704 0.248 0.048
#> SRR1465440 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0592 0.89229 0.012 0.988 0.000
#> SRR614984 2 0.5659 0.68842 0.248 0.740 0.012
#> SRR1324269 1 0.7702 0.62152 0.680 0.140 0.180
#> SRR1401491 2 0.0592 0.89229 0.012 0.988 0.000
#> SRR1319443 1 0.5402 0.74615 0.792 0.180 0.028
#> SRR1324349 2 0.2356 0.87881 0.072 0.928 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.4351 0.74355 0.828 0.168 0.004
#> SRR661505 3 0.6193 0.70212 0.292 0.016 0.692
#> SRR1419062 1 0.7069 -0.32921 0.508 0.020 0.472
#> SRR1480131 1 0.8137 0.50018 0.628 0.120 0.252
#> SRR1421284 2 0.4974 0.71403 0.236 0.764 0.000
#> SRR1329624 1 0.4702 0.75714 0.788 0.212 0.000
#> SRR1315739 3 0.1753 0.80780 0.048 0.000 0.952
#> SRR1099189 2 0.2878 0.86821 0.096 0.904 0.000
#> SRR1083286 1 0.5318 0.75700 0.780 0.204 0.016
#> SRR1091890 1 0.7966 0.33403 0.652 0.128 0.220
#> SRR1347436 2 0.4821 0.81461 0.120 0.840 0.040
#> SRR1327473 1 0.5754 0.69232 0.700 0.296 0.004
#> SRR1338195 3 0.0000 0.79722 0.000 0.000 1.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.4750 0.75759 0.784 0.216 0.000
#> SRR658271 2 0.0237 0.89292 0.004 0.996 0.000
#> SRR1339597 1 0.5480 0.25129 0.732 0.004 0.264
#> SRR1454842 3 0.3030 0.80556 0.092 0.004 0.904
#> SRR1322643 1 0.4842 0.75501 0.776 0.224 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.79722 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354620 1 0.6274 -0.29975 0.544 0.000 0.456
#> SRR615056 2 0.3267 0.84384 0.116 0.884 0.000
#> SRR1105320 1 0.6294 0.69796 0.692 0.288 0.020
#> SRR1391529 1 0.4750 0.75771 0.784 0.216 0.000
#> SRR663052 2 0.0747 0.89457 0.016 0.984 0.000
#> SRR1478834 1 0.4883 0.75784 0.788 0.208 0.004
#> SRR812366 2 0.1031 0.88927 0.024 0.976 0.000
#> SRR1435330 3 0.2261 0.81126 0.068 0.000 0.932
#> SRR615383 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 2 0.5578 0.69228 0.240 0.748 0.012
#> SRR613568 2 0.2356 0.87532 0.072 0.928 0.000
#> SRR614095 2 0.3038 0.85458 0.104 0.896 0.000
#> SRR1103092 1 0.6154 0.75111 0.752 0.204 0.044
#> SRR1337155 2 0.9301 0.16835 0.244 0.524 0.232
#> SRR1475345 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 2 0.6526 0.59037 0.260 0.704 0.036
#> SRR1406372 2 0.0592 0.89229 0.012 0.988 0.000
#> SRR1339880 3 0.6309 0.42752 0.496 0.000 0.504
#> SRR1353136 2 0.8304 0.08549 0.416 0.504 0.080
#> SRR1093906 3 0.0000 0.79722 0.000 0.000 1.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.5526 0.74054 0.792 0.172 0.036
#> SRR1363926 2 0.5560 0.60829 0.300 0.700 0.000
#> SRR1399861 2 0.8085 0.18363 0.412 0.520 0.068
#> SRR1338789 1 0.4861 0.71605 0.808 0.180 0.012
#> SRR1421420 3 0.6345 0.58282 0.400 0.004 0.596
#> SRR1420832 2 0.0237 0.89431 0.004 0.996 0.000
#> SRR1476231 1 0.4750 0.75682 0.784 0.216 0.000
#> SRR1352870 2 0.7481 0.50642 0.296 0.640 0.064
#> SRR1315041 2 0.3038 0.85322 0.104 0.896 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443268 1 0.5810 0.04492 0.664 0.000 0.336
#> SRR1416617 3 0.3038 0.81110 0.104 0.000 0.896
#> SRR1102443 1 0.4842 0.75501 0.776 0.224 0.000
#> SRR655672 2 0.5884 0.65361 0.272 0.716 0.012
#> SRR1420006 3 0.0000 0.79722 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458267 2 0.0747 0.89338 0.016 0.984 0.000
#> SRR613819 2 0.4178 0.78679 0.172 0.828 0.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.1964 0.88694 0.056 0.944 0.000
#> SRR1470727 1 0.6438 0.68302 0.764 0.136 0.100
#> SRR1339153 3 0.4452 0.77479 0.192 0.000 0.808
#> SRR1472749 3 0.4178 0.78146 0.172 0.000 0.828
#> SRR1414379 2 0.5404 0.68451 0.256 0.740 0.004
#> SRR1431326 1 0.4796 0.75634 0.780 0.220 0.000
#> SRR1487278 2 0.2959 0.84349 0.100 0.900 0.000
#> SRR1098312 1 0.7508 0.44050 0.696 0.148 0.156
#> SRR810273 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.1031 0.89290 0.024 0.976 0.000
#> SRR614467 2 0.2625 0.87077 0.084 0.916 0.000
#> SRR811471 1 0.4912 0.75452 0.796 0.196 0.008
#> SRR1478341 3 0.0237 0.79787 0.004 0.000 0.996
#> SRR1088606 1 0.7551 0.49133 0.580 0.372 0.048
#> SRR1479699 1 0.7657 0.37269 0.676 0.116 0.208
#> SRR1403589 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.1753 0.88970 0.048 0.952 0.000
#> SRR1359803 1 0.5348 0.74405 0.796 0.176 0.028
#> SRR1338988 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.1031 0.88927 0.024 0.976 0.000
#> SRR1378992 1 0.4842 0.75501 0.776 0.224 0.000
#> SRR659427 1 0.8771 0.38019 0.556 0.304 0.140
#> SRR1096638 1 0.5220 0.75732 0.780 0.208 0.012
#> SRR1466619 2 0.1031 0.88927 0.024 0.976 0.000
#> SRR659307 2 0.5659 0.67976 0.248 0.740 0.012
#> SRR1439994 1 0.6154 -0.17844 0.592 0.000 0.408
#> SRR1454931 1 0.5947 0.73427 0.776 0.172 0.052
#> SRR1332928 1 0.6189 -0.02340 0.632 0.004 0.364
#> SRR658621 2 0.3340 0.84009 0.120 0.880 0.000
#> SRR1095840 1 0.4702 0.75723 0.788 0.212 0.000
#> SRR1458243 1 0.4931 0.29665 0.768 0.000 0.232
#> SRR1374270 2 0.5591 0.59975 0.304 0.696 0.000
#> SRR1470947 2 0.0237 0.89431 0.004 0.996 0.000
#> SRR1365598 2 0.4002 0.77797 0.160 0.840 0.000
#> SRR662787 2 0.0892 0.89378 0.020 0.980 0.000
#> SRR1408727 2 0.6081 0.50233 0.344 0.652 0.004
#> SRR1456274 1 0.7670 0.49709 0.684 0.152 0.164
#> SRR817744 1 0.4750 0.75682 0.784 0.216 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102680 1 0.6934 0.03860 0.624 0.028 0.348
#> SRR1374198 1 0.5254 0.69759 0.736 0.264 0.000
#> SRR1445856 1 0.5480 0.25129 0.732 0.004 0.264
#> SRR820049 3 0.7184 0.66702 0.240 0.072 0.688
#> SRR1375290 2 0.8675 0.15740 0.388 0.504 0.108
#> SRR818999 1 0.7768 0.22315 0.592 0.064 0.344
#> SRR1390242 1 0.4750 0.75682 0.784 0.216 0.000
#> SRR1401164 2 0.0747 0.89140 0.016 0.984 0.000
#> SRR1454629 1 0.6243 0.66507 0.776 0.124 0.100
#> SRR1332187 3 0.0000 0.79722 0.000 0.000 1.000
#> SRR603365 3 0.1529 0.80678 0.040 0.000 0.960
#> SRR657833 2 0.2537 0.87346 0.080 0.920 0.000
#> SRR1436207 2 0.1411 0.89115 0.036 0.964 0.000
#> SRR1488017 1 0.4750 0.75682 0.784 0.216 0.000
#> SRR612947 2 0.0237 0.89276 0.004 0.996 0.000
#> SRR1480384 1 0.6605 0.69915 0.752 0.152 0.096
#> SRR1364761 2 0.0747 0.89148 0.016 0.984 0.000
#> SRR1308086 1 0.7431 0.40008 0.696 0.116 0.188
#> SRR1441868 1 0.4842 0.75501 0.776 0.224 0.000
#> SRR1485380 3 0.5948 0.63559 0.360 0.000 0.640
#> SRR1073705 1 0.4842 0.75501 0.776 0.224 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0237 0.89431 0.004 0.996 0.000
#> SRR1442983 2 0.0424 0.89398 0.008 0.992 0.000
#> SRR1100346 2 0.4755 0.77429 0.184 0.808 0.008
#> SRR1332816 1 0.4842 0.75501 0.776 0.224 0.000
#> SRR612299 2 0.3816 0.80696 0.148 0.852 0.000
#> SRR1407386 1 0.4750 0.75759 0.784 0.216 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.6126 0.72071 0.712 0.268 0.020
#> SRR1498395 2 0.0424 0.89398 0.008 0.992 0.000
#> SRR1079998 1 0.6180 -0.19369 0.584 0.000 0.416
#> SRR1498885 2 0.2537 0.87110 0.080 0.920 0.000
#> SRR1337215 2 0.2448 0.87253 0.076 0.924 0.000
#> SRR1414749 3 0.2796 0.81227 0.092 0.000 0.908
#> SRR1365963 1 0.6026 -0.07931 0.624 0.000 0.376
#> SRR1368030 2 0.4796 0.73697 0.220 0.780 0.000
#> SRR1419760 2 0.4960 0.80948 0.128 0.832 0.040
#> SRR1381841 1 0.6892 0.68575 0.736 0.152 0.112
#> SRR821388 1 0.7396 0.45930 0.704 0.152 0.144
#> SRR657623 2 0.3340 0.84064 0.120 0.880 0.000
#> SRR1094241 3 0.4121 0.78481 0.168 0.000 0.832
#> SRR819583 3 0.6260 0.51274 0.448 0.000 0.552
#> SRR1096149 1 0.4712 0.68236 0.848 0.108 0.044
#> SRR1342829 3 0.0000 0.79722 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353028 1 0.4755 0.75023 0.808 0.184 0.008
#> SRR811333 1 0.6468 -0.27295 0.552 0.004 0.444
#> SRR1311666 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.1860 0.88771 0.052 0.948 0.000
#> SRR1446436 2 0.0747 0.89338 0.016 0.984 0.000
#> SRR815092 1 0.4750 0.75682 0.784 0.216 0.000
#> SRR1500149 2 0.0592 0.89229 0.012 0.988 0.000
#> SRR1100564 1 0.4912 0.75508 0.796 0.196 0.008
#> SRR1403072 3 0.0000 0.79722 0.000 0.000 1.000
#> SRR811653 2 0.8085 0.18363 0.412 0.520 0.068
#> SRR1311348 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0892 0.89378 0.020 0.980 0.000
#> SRR1435442 2 0.3116 0.83772 0.108 0.892 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.79722 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.4842 0.75501 0.776 0.224 0.000
#> SRR1444763 1 0.5763 0.71023 0.740 0.244 0.016
#> SRR1415026 2 0.0592 0.89452 0.012 0.988 0.000
#> SRR1416596 2 0.1643 0.88899 0.044 0.956 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR663465 2 0.2537 0.87110 0.080 0.920 0.000
#> SRR1310094 2 0.3340 0.84005 0.120 0.880 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.5635 0.74480 0.784 0.180 0.036
#> SRR1453950 1 0.5708 0.75437 0.768 0.204 0.028
#> SRR1087875 1 0.4842 0.75501 0.776 0.224 0.000
#> SRR613318 2 0.6978 0.49191 0.336 0.632 0.032
#> SRR1332694 1 0.4931 0.75782 0.784 0.212 0.004
#> SRR1468469 3 0.2711 0.81204 0.088 0.000 0.912
#> SRR818670 2 0.0592 0.89257 0.012 0.988 0.000
#> SRR1120318 1 0.5585 0.75622 0.772 0.204 0.024
#> SRR1311622 1 0.5560 0.14601 0.700 0.000 0.300
#> SRR1500931 3 0.6244 0.52344 0.440 0.000 0.560
#> SRR1387494 1 0.7525 0.36878 0.684 0.108 0.208
#> SRR1379175 2 0.7582 0.31618 0.380 0.572 0.048
#> SRR1401909 1 0.6235 -0.26831 0.564 0.000 0.436
#> SRR1440541 2 0.1031 0.89363 0.024 0.976 0.000
#> SRR1068832 3 0.6305 0.44418 0.484 0.000 0.516
#> SRR1376640 2 0.2261 0.88326 0.068 0.932 0.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.7283 0.66188 0.708 0.176 0.116
#> SRR1084276 1 0.8081 0.57247 0.644 0.136 0.220
#> SRR1353262 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.6295 0.73983 0.728 0.236 0.036
#> SRR1396877 1 0.7368 0.55176 0.696 0.104 0.200
#> SRR1443026 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.4750 0.75682 0.784 0.216 0.000
#> SRR1436822 2 0.1163 0.89089 0.028 0.972 0.000
#> SRR1101128 3 0.4555 0.76525 0.200 0.000 0.800
#> SRR1363886 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.3412 0.83676 0.124 0.876 0.000
#> SRR1093218 3 0.5178 0.73889 0.256 0.000 0.744
#> SRR1077090 1 0.6235 -0.25415 0.564 0.000 0.436
#> SRR1327430 2 0.5560 0.60829 0.300 0.700 0.000
#> SRR1088958 1 0.4842 0.75501 0.776 0.224 0.000
#> SRR1486931 2 0.1411 0.89134 0.036 0.964 0.000
#> SRR1086820 1 0.5860 0.73593 0.748 0.228 0.024
#> SRR1383000 1 0.5708 0.75437 0.768 0.204 0.028
#> SRR1355705 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR614335 2 0.2356 0.87641 0.072 0.928 0.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.3038 0.85322 0.104 0.896 0.000
#> SRR1456401 2 0.5465 0.63200 0.288 0.712 0.000
#> SRR1086393 1 0.5122 0.75680 0.788 0.200 0.012
#> SRR1351521 3 0.0000 0.79722 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093100 2 0.4842 0.73184 0.224 0.776 0.000
#> SRR1309382 1 0.4654 0.75728 0.792 0.208 0.000
#> SRR1089375 1 0.7533 0.35364 0.668 0.088 0.244
#> SRR1499482 2 0.1753 0.88951 0.048 0.952 0.000
#> SRR614719 2 0.3412 0.84255 0.124 0.876 0.000
#> SRR1081473 1 0.6985 -0.08671 0.592 0.024 0.384
#> SRR1087415 1 0.5860 0.73593 0.748 0.228 0.024
#> SRR1088217 3 0.6267 0.43540 0.452 0.000 0.548
#> SRR808496 2 0.5201 0.71307 0.236 0.760 0.004
#> SRR1336463 2 0.1964 0.88354 0.056 0.944 0.000
#> SRR612359 2 0.3752 0.82430 0.144 0.856 0.000
#> SRR1444412 1 0.7888 0.60418 0.664 0.140 0.196
#> SRR1074116 3 0.0000 0.79722 0.000 0.000 1.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.79722 0.000 0.000 1.000
#> SRR656095 2 0.0237 0.89276 0.004 0.996 0.000
#> SRR808914 1 0.4654 0.75699 0.792 0.208 0.000
#> SRR1349099 1 0.6828 0.63680 0.656 0.312 0.032
#> SRR1337886 2 0.1753 0.88970 0.048 0.952 0.000
#> SRR813632 1 0.6369 0.16140 0.668 0.016 0.316
#> SRR1101591 3 0.6309 0.42001 0.496 0.000 0.504
#> SRR1089713 1 0.7379 0.09678 0.616 0.048 0.336
#> SRR1453127 3 0.0892 0.80281 0.020 0.000 0.980
#> SRR1498354 3 0.6204 0.52292 0.424 0.000 0.576
#> SRR1313831 1 0.4702 0.75791 0.788 0.212 0.000
#> SRR1315434 3 0.3192 0.81001 0.112 0.000 0.888
#> SRR814747 2 0.4121 0.79447 0.168 0.832 0.000
#> SRR1358539 1 0.4931 0.75804 0.784 0.212 0.004
#> SRR1367807 1 0.4842 0.75501 0.776 0.224 0.000
#> SRR1365791 1 0.9594 0.39390 0.436 0.360 0.204
#> SRR1081519 3 0.6633 0.44160 0.444 0.008 0.548
#> SRR614707 2 0.4172 0.80366 0.156 0.840 0.004
#> SRR1094027 1 0.4750 0.75682 0.784 0.216 0.000
#> SRR1489092 1 0.7671 0.47337 0.568 0.380 0.052
#> SRR1079502 1 0.7061 0.08536 0.632 0.036 0.332
#> SRR1457814 2 0.8085 0.18363 0.412 0.520 0.068
#> SRR1455127 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR615081 2 0.1163 0.89089 0.028 0.972 0.000
#> SRR1327855 3 0.6260 0.51274 0.448 0.000 0.552
#> SRR1417873 2 0.3267 0.84348 0.116 0.884 0.000
#> SRR1394125 3 0.5591 0.70076 0.304 0.000 0.696
#> SRR1488388 1 0.4750 0.75759 0.784 0.216 0.000
#> SRR1401122 2 0.4796 0.73789 0.220 0.780 0.000
#> SRR612383 2 0.5659 0.68842 0.248 0.740 0.012
#> SRR1477711 1 0.4750 0.75682 0.784 0.216 0.000
#> SRR1350813 2 0.1964 0.88694 0.056 0.944 0.000
#> SRR612851 2 0.2537 0.87471 0.080 0.920 0.000
#> SRR1086349 1 0.4796 0.75634 0.780 0.220 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340010 1 0.7453 0.45517 0.700 0.152 0.148
#> SRR1475885 1 0.6906 0.61014 0.644 0.324 0.032
#> SRR1376334 1 0.4750 0.75771 0.784 0.216 0.000
#> SRR1399821 1 0.6828 0.63680 0.656 0.312 0.032
#> SRR1347042 3 0.0892 0.80281 0.020 0.000 0.980
#> SRR612323 2 0.5884 0.65361 0.272 0.716 0.012
#> SRR612604 2 0.1031 0.88933 0.024 0.976 0.000
#> SRR1389546 2 0.0592 0.89257 0.012 0.988 0.000
#> SRR1311877 1 0.4796 0.75634 0.780 0.220 0.000
#> SRR1465608 1 0.5988 -0.05634 0.632 0.000 0.368
#> SRR1101808 2 0.0237 0.89276 0.004 0.996 0.000
#> SRR1414079 3 0.2261 0.81126 0.068 0.000 0.932
#> SRR1331153 2 0.2356 0.87532 0.072 0.928 0.000
#> SRR1078439 3 0.7724 0.47315 0.396 0.052 0.552
#> SRR2165527 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.5216 0.73033 0.740 0.260 0.000
#> SRR1313536 2 0.0747 0.89162 0.016 0.984 0.000
#> SRR1070308 1 0.5754 0.69232 0.700 0.296 0.004
#> SRR1403110 1 0.4750 0.75771 0.784 0.216 0.000
#> SRR1400355 2 0.0424 0.89398 0.008 0.992 0.000
#> SRR1401317 3 0.6260 0.51274 0.448 0.000 0.552
#> SRR1456862 1 0.5897 0.58863 0.792 0.076 0.132
#> SRR1074622 1 0.5268 0.75791 0.776 0.212 0.012
#> SRR1465847 1 0.6267 -0.30140 0.548 0.000 0.452
#> SRR1443376 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0747 0.80131 0.016 0.000 0.984
#> SRR1075579 1 0.4750 0.75682 0.784 0.216 0.000
#> SRR1090881 2 0.8675 0.15740 0.388 0.504 0.108
#> SRR612251 2 0.3038 0.85458 0.104 0.896 0.000
#> SRR1418581 1 0.4842 0.75501 0.776 0.224 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 2 0.4978 0.73892 0.216 0.780 0.004
#> SRR613078 2 0.2878 0.84735 0.096 0.904 0.000
#> SRR1472998 1 0.6267 -0.30140 0.548 0.000 0.452
#> SRR1433452 2 0.1031 0.89290 0.024 0.976 0.000
#> SRR1101957 1 0.4796 0.75634 0.780 0.220 0.000
#> SRR1487993 3 0.6309 0.42752 0.496 0.000 0.504
#> SRR1465983 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.4883 0.75790 0.788 0.208 0.004
#> SRR1367566 3 0.3267 0.80984 0.116 0.000 0.884
#> SRR1316151 2 0.3482 0.81788 0.128 0.872 0.000
#> SRR1417547 2 0.4796 0.73789 0.220 0.780 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.2356 0.87532 0.072 0.928 0.000
#> SRR1398207 1 0.7969 0.07033 0.540 0.064 0.396
#> SRR1358755 1 0.6260 -0.28408 0.552 0.000 0.448
#> SRR1078903 2 0.1643 0.88989 0.044 0.956 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0592 0.89387 0.012 0.988 0.000
#> SRR1369172 1 0.5138 0.68494 0.828 0.120 0.052
#> SRR615982 2 0.1964 0.88626 0.056 0.944 0.000
#> SRR1480431 2 0.2878 0.86821 0.096 0.904 0.000
#> SRR1429825 2 0.1163 0.89112 0.028 0.972 0.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.6867 0.05823 0.636 0.028 0.336
#> SRR808351 1 0.5318 0.75713 0.780 0.204 0.016
#> SRR1317513 1 0.4931 0.75782 0.784 0.212 0.004
#> SRR1480501 1 0.6500 -0.33323 0.532 0.004 0.464
#> SRR1081910 1 0.6859 -0.18204 0.564 0.016 0.420
#> SRR1086611 2 0.6767 0.65222 0.216 0.720 0.064
#> SRR1392571 2 0.2356 0.87878 0.072 0.928 0.000
#> SRR1311441 1 0.4796 0.75634 0.780 0.220 0.000
#> SRR808152 1 0.5268 0.75791 0.776 0.212 0.012
#> SRR657313 3 0.4291 0.78191 0.180 0.000 0.820
#> SRR1433131 2 0.0592 0.89253 0.012 0.988 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0747 0.89346 0.016 0.984 0.000
#> SRR1389108 1 0.4842 0.75501 0.776 0.224 0.000
#> SRR1376228 3 0.2796 0.81227 0.092 0.000 0.908
#> SRR1399757 1 0.4796 0.75588 0.780 0.220 0.000
#> SRR1358060 3 0.2796 0.81227 0.092 0.000 0.908
#> SRR1464517 1 0.5873 0.11729 0.684 0.004 0.312
#> SRR613557 2 0.5659 0.67976 0.248 0.740 0.012
#> SRR809831 1 0.7702 0.62152 0.680 0.140 0.180
#> SRR1429387 3 0.0000 0.79722 0.000 0.000 1.000
#> SRR816565 1 0.4750 0.75682 0.784 0.216 0.000
#> SRR1071644 1 0.4750 0.75682 0.784 0.216 0.000
#> SRR1406936 1 0.7170 0.01862 0.612 0.036 0.352
#> SRR1072031 2 0.0000 0.89374 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.5884 0.65361 0.272 0.716 0.012
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 4 0.6716 0.41521 0.224 0.080 0.036 0.660
#> SRR1404105 1 0.2585 0.83484 0.916 0.032 0.004 0.048
#> SRR2164936 2 0.0524 0.88029 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1472057 4 0.6837 0.28407 0.100 0.000 0.428 0.472
#> SRR614491 2 0.5631 0.72337 0.072 0.696 0.000 0.232
#> SRR1069376 1 0.2019 0.84539 0.940 0.032 0.004 0.024
#> SRR811964 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0592 0.88004 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1345715 1 0.1305 0.84407 0.960 0.036 0.000 0.004
#> SRR1328073 1 0.4811 0.70870 0.800 0.100 0.008 0.092
#> SRR1394209 2 0.6448 0.66670 0.108 0.640 0.004 0.248
#> SRR1474018 2 0.0188 0.87965 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1099809 4 0.7756 0.56136 0.320 0.000 0.252 0.428
#> SRR1500555 2 0.3308 0.85534 0.036 0.872 0.000 0.092
#> SRR1354363 1 0.1890 0.82277 0.936 0.008 0.000 0.056
#> SRR1391619 3 0.4391 0.62158 0.008 0.000 0.740 0.252
#> SRR1307997 2 0.3156 0.86307 0.048 0.884 0.000 0.068
#> SRR663124 2 0.6158 0.69137 0.076 0.664 0.008 0.252
#> SRR1334670 1 0.2032 0.84097 0.936 0.028 0.000 0.036
#> SRR612515 2 0.6158 0.69137 0.076 0.664 0.008 0.252
#> SRR1092727 2 0.2002 0.87537 0.020 0.936 0.000 0.044
#> SRR1364013 2 0.2761 0.86970 0.048 0.904 0.000 0.048
#> SRR1468553 3 0.3108 0.74323 0.016 0.000 0.872 0.112
#> SRR1403980 3 0.3485 0.73355 0.028 0.000 0.856 0.116
#> SRR1420169 4 0.7385 0.54146 0.196 0.000 0.296 0.508
#> SRR1442800 1 0.7534 0.40442 0.564 0.144 0.024 0.268
#> SRR1359214 2 0.0188 0.87965 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1499849 4 0.7748 0.56067 0.324 0.000 0.248 0.428
#> SRR1500030 4 0.6837 0.06469 0.104 0.000 0.392 0.504
#> SRR1093053 3 0.8056 0.00628 0.116 0.048 0.476 0.360
#> SRR1399843 4 0.7885 0.51753 0.212 0.024 0.232 0.532
#> SRR1380231 4 0.7756 0.58051 0.248 0.008 0.244 0.500
#> SRR809470 3 0.7379 -0.24259 0.168 0.000 0.468 0.364
#> SRR614239 2 0.6158 0.69137 0.076 0.664 0.008 0.252
#> SRR613939 2 0.2830 0.87018 0.040 0.900 0.000 0.060
#> SRR612971 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.1406 0.87834 0.016 0.960 0.000 0.024
#> SRR811357 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.1452 0.84389 0.956 0.036 0.000 0.008
#> SRR613006 2 0.2385 0.86553 0.052 0.920 0.000 0.028
#> SRR1469570 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362906 4 0.6837 0.06469 0.104 0.000 0.392 0.504
#> SRR1079023 1 0.1109 0.84431 0.968 0.028 0.000 0.004
#> SRR813608 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 4 0.6346 0.43229 0.232 0.064 0.028 0.676
#> SRR1478700 4 0.7558 0.54226 0.380 0.000 0.192 0.428
#> SRR1081543 3 0.4106 0.67203 0.024 0.052 0.852 0.072
#> SRR1384754 4 0.6346 0.43229 0.232 0.064 0.028 0.676
#> SRR612287 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.6448 0.66670 0.108 0.640 0.004 0.248
#> SRR1315247 2 0.8217 0.19404 0.332 0.460 0.032 0.176
#> SRR1105344 2 0.2021 0.86490 0.040 0.936 0.000 0.024
#> SRR658549 2 0.3308 0.85534 0.036 0.872 0.000 0.092
#> SRR1480240 1 0.2319 0.84118 0.932 0.024 0.016 0.028
#> SRR1084816 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.5517 0.75183 0.092 0.724 0.000 0.184
#> SRR1419476 3 0.3108 0.73561 0.016 0.000 0.872 0.112
#> SRR1456075 4 0.6991 0.59117 0.232 0.000 0.188 0.580
#> SRR1389474 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.1488 0.83530 0.956 0.012 0.000 0.032
#> SRR1334419 1 0.1452 0.84389 0.956 0.036 0.000 0.008
#> SRR1417154 3 0.3335 0.73553 0.020 0.000 0.860 0.120
#> SRR1095985 1 0.7565 0.40503 0.568 0.128 0.032 0.272
#> SRR1325771 1 0.1109 0.84431 0.968 0.028 0.000 0.004
#> SRR1360420 3 0.0000 0.75012 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.3674 0.82886 0.116 0.848 0.000 0.036
#> SRR1332993 1 0.2019 0.84490 0.940 0.032 0.004 0.024
#> SRR1311833 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808044 4 0.7558 0.54226 0.380 0.000 0.192 0.428
#> SRR1076916 3 0.3128 0.72162 0.040 0.000 0.884 0.076
#> SRR1356266 1 0.1833 0.84618 0.944 0.032 0.000 0.024
#> SRR1341983 2 0.2399 0.87237 0.048 0.920 0.000 0.032
#> SRR1456114 1 0.6066 0.43739 0.672 0.008 0.072 0.248
#> SRR1072948 3 0.1109 0.75734 0.004 0.000 0.968 0.028
#> SRR1472370 4 0.6837 0.28407 0.100 0.000 0.428 0.472
#> SRR1480176 1 0.4538 0.69577 0.808 0.004 0.064 0.124
#> SRR613843 2 0.0927 0.87678 0.016 0.976 0.000 0.008
#> SRR1469192 1 0.4844 0.66550 0.784 0.004 0.064 0.148
#> SRR1404555 3 0.1557 0.74974 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR659839 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362848 4 0.6346 0.43229 0.232 0.064 0.028 0.676
#> SRR1407492 2 0.6158 0.69137 0.076 0.664 0.008 0.252
#> SRR1455082 2 0.2670 0.87024 0.040 0.908 0.000 0.052
#> SRR658362 2 0.1488 0.87942 0.012 0.956 0.000 0.032
#> SRR810921 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.5565 0.43647 0.056 0.000 0.684 0.260
#> SRR818232 1 0.2197 0.83911 0.928 0.024 0.000 0.048
#> SRR1454868 2 0.8228 0.30482 0.148 0.440 0.040 0.372
#> SRR1474816 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.3094 0.81772 0.900 0.020 0.032 0.048
#> SRR1088437 2 0.1109 0.87892 0.004 0.968 0.000 0.028
#> SRR1466400 2 0.6127 0.59721 0.228 0.664 0.000 0.108
#> SRR658921 2 0.6238 0.53914 0.276 0.632 0.000 0.092
#> SRR1499873 2 0.0524 0.88018 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1101373 1 0.1452 0.84389 0.956 0.036 0.000 0.008
#> SRR1090145 1 0.2751 0.82342 0.904 0.056 0.000 0.040
#> SRR1379324 1 0.5696 0.49791 0.680 0.004 0.052 0.264
#> SRR1345307 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.2610 0.75172 0.012 0.000 0.900 0.088
#> SRR1086280 3 0.3108 0.73561 0.016 0.000 0.872 0.112
#> SRR1454891 2 0.2813 0.86518 0.024 0.896 0.000 0.080
#> SRR663185 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811819 1 0.3316 0.82118 0.888 0.028 0.020 0.064
#> SRR1318920 1 0.4158 0.66668 0.768 0.008 0.000 0.224
#> SRR656758 2 0.0376 0.88012 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1474351 1 0.1109 0.84431 0.968 0.028 0.000 0.004
#> SRR660450 2 0.3674 0.82886 0.116 0.848 0.000 0.036
#> SRR1472687 2 0.2399 0.87237 0.048 0.920 0.000 0.032
#> SRR1334291 2 0.0779 0.87926 0.004 0.980 0.000 0.016
#> SRR1415153 2 0.0524 0.87955 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1323271 2 0.2214 0.87251 0.028 0.928 0.000 0.044
#> SRR1368939 2 0.2197 0.86252 0.048 0.928 0.000 0.024
#> SRR1443161 4 0.8270 0.45842 0.188 0.056 0.224 0.532
#> SRR614695 2 0.5798 0.67309 0.184 0.704 0.000 0.112
#> SRR1092372 1 0.4228 0.66016 0.760 0.008 0.000 0.232
#> SRR1474577 1 0.1452 0.84389 0.956 0.036 0.000 0.008
#> SRR1406582 1 0.1452 0.84389 0.956 0.036 0.000 0.008
#> SRR612779 2 0.2565 0.87076 0.032 0.912 0.000 0.056
#> SRR1089006 1 0.1452 0.84389 0.956 0.036 0.000 0.008
#> SRR1354071 1 0.4080 0.78491 0.848 0.048 0.016 0.088
#> SRR1105463 4 0.7960 0.50506 0.372 0.004 0.248 0.376
#> SRR811005 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.2197 0.83944 0.928 0.024 0.000 0.048
#> SRR1325871 3 0.4391 0.62158 0.008 0.000 0.740 0.252
#> SRR1355415 4 0.7476 0.44358 0.184 0.000 0.356 0.460
#> SRR1090861 1 0.1109 0.84431 0.968 0.028 0.000 0.004
#> SRR1320712 2 0.7889 0.35842 0.144 0.460 0.024 0.372
#> SRR1470075 1 0.1822 0.82575 0.944 0.008 0.004 0.044
#> SRR1091254 1 0.1920 0.84709 0.944 0.028 0.004 0.024
#> SRR1101397 4 0.7627 0.57642 0.292 0.000 0.240 0.468
#> SRR1321165 1 0.4228 0.66016 0.760 0.008 0.000 0.232
#> SRR1092112 3 0.6307 0.26208 0.092 0.000 0.620 0.288
#> SRR1417588 3 0.0000 0.75012 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074790 1 0.2843 0.79036 0.892 0.088 0.000 0.020
#> SRR1432106 2 0.1004 0.87947 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR655756 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.6444 0.29867 0.628 0.004 0.096 0.272
#> SRR1318582 2 0.0524 0.87955 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1080484 2 0.0657 0.88081 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1072749 1 0.7581 -0.50076 0.424 0.000 0.196 0.380
#> SRR1078586 1 0.1510 0.84632 0.956 0.028 0.000 0.016
#> SRR1400333 2 0.6551 0.70592 0.140 0.700 0.040 0.120
#> SRR1078834 2 0.6028 0.67490 0.184 0.696 0.004 0.116
#> SRR1417611 2 0.3697 0.84181 0.048 0.852 0.000 0.100
#> SRR1396840 1 0.5393 0.58874 0.692 0.008 0.028 0.272
#> SRR1465440 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.2021 0.86490 0.040 0.936 0.000 0.024
#> SRR614984 2 0.5911 0.71620 0.068 0.688 0.008 0.236
#> SRR1324269 1 0.6488 0.37467 0.648 0.004 0.128 0.220
#> SRR1401491 2 0.2021 0.86490 0.040 0.936 0.000 0.024
#> SRR1319443 1 0.3551 0.80191 0.868 0.016 0.020 0.096
#> SRR1324349 2 0.2644 0.87052 0.032 0.908 0.000 0.060
#> SRR1345523 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.1890 0.82277 0.936 0.008 0.000 0.056
#> SRR661505 3 0.6302 0.37945 0.064 0.008 0.620 0.308
#> SRR1419062 3 0.7931 -0.38632 0.208 0.008 0.392 0.392
#> SRR1480131 1 0.7469 -0.10695 0.512 0.004 0.180 0.304
#> SRR1421284 2 0.5633 0.74271 0.100 0.716 0.000 0.184
#> SRR1329624 1 0.1151 0.84520 0.968 0.024 0.000 0.008
#> SRR1315739 3 0.1854 0.75712 0.012 0.000 0.940 0.048
#> SRR1099189 2 0.3320 0.85704 0.056 0.876 0.000 0.068
#> SRR1083286 1 0.2513 0.84026 0.924 0.024 0.016 0.036
#> SRR1091890 4 0.7413 0.40796 0.196 0.068 0.104 0.632
#> SRR1347436 2 0.5063 0.80916 0.060 0.792 0.024 0.124
#> SRR1327473 1 0.3716 0.76379 0.852 0.096 0.000 0.052
#> SRR1338195 3 0.0000 0.75012 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.1724 0.84499 0.948 0.032 0.000 0.020
#> SRR658271 2 0.0188 0.87863 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1339597 4 0.7530 0.53482 0.376 0.000 0.188 0.436
#> SRR1454842 3 0.3508 0.71831 0.012 0.004 0.848 0.136
#> SRR1322643 1 0.1305 0.84407 0.960 0.036 0.000 0.004
#> SRR614887 3 0.0000 0.75012 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354620 4 0.7210 0.43535 0.148 0.000 0.360 0.492
#> SRR615056 2 0.3354 0.84920 0.044 0.872 0.000 0.084
#> SRR1105320 1 0.4413 0.73319 0.820 0.096 0.004 0.080
#> SRR1391529 1 0.2214 0.84008 0.928 0.028 0.000 0.044
#> SRR663052 2 0.0779 0.88058 0.004 0.980 0.000 0.016
#> SRR1478834 1 0.2383 0.83954 0.924 0.024 0.004 0.048
#> SRR812366 2 0.2871 0.84659 0.072 0.896 0.000 0.032
#> SRR1435330 3 0.2412 0.75396 0.008 0.000 0.908 0.084
#> SRR615383 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 2 0.5655 0.73501 0.084 0.704 0.000 0.212
#> SRR613568 2 0.3674 0.82886 0.116 0.848 0.000 0.036
#> SRR614095 2 0.3320 0.85300 0.056 0.876 0.000 0.068
#> SRR1103092 1 0.3379 0.82040 0.888 0.024 0.036 0.052
#> SRR1337155 2 0.9479 -0.00706 0.192 0.424 0.184 0.200
#> SRR1475345 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 2 0.8245 0.18445 0.332 0.456 0.032 0.180
#> SRR1406372 2 0.2021 0.86490 0.040 0.936 0.000 0.024
#> SRR1339880 4 0.6837 0.06469 0.104 0.000 0.392 0.504
#> SRR1353136 2 0.8228 0.30482 0.148 0.440 0.040 0.372
#> SRR1093906 3 0.0000 0.75012 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.3253 0.79703 0.876 0.016 0.008 0.100
#> SRR1363926 2 0.6327 0.66572 0.124 0.648 0.000 0.228
#> SRR1399861 2 0.7861 0.35818 0.140 0.460 0.024 0.376
#> SRR1338789 1 0.4372 0.63923 0.728 0.004 0.000 0.268
#> SRR1421420 3 0.7129 -0.07280 0.140 0.000 0.504 0.356
#> SRR1420832 2 0.0188 0.87951 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1476231 1 0.0921 0.84434 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1352870 2 0.7244 0.57861 0.104 0.588 0.028 0.280
#> SRR1315041 2 0.3399 0.84935 0.040 0.868 0.000 0.092
#> SRR661877 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443268 4 0.7627 0.57642 0.292 0.000 0.240 0.468
#> SRR1416617 3 0.3108 0.74323 0.016 0.000 0.872 0.112
#> SRR1102443 1 0.1452 0.84389 0.956 0.036 0.000 0.008
#> SRR655672 2 0.6158 0.69137 0.076 0.664 0.008 0.252
#> SRR1420006 3 0.0000 0.75012 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0779 0.87926 0.004 0.980 0.000 0.016
#> SRR613819 2 0.4805 0.79710 0.084 0.784 0.000 0.132
#> SRR1469432 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.2660 0.86963 0.036 0.908 0.000 0.056
#> SRR1470727 1 0.5271 0.60285 0.748 0.004 0.068 0.180
#> SRR1339153 3 0.4391 0.62917 0.008 0.000 0.740 0.252
#> SRR1472749 3 0.4907 0.61952 0.060 0.000 0.764 0.176
#> SRR1414379 2 0.5997 0.72393 0.100 0.692 0.004 0.204
#> SRR1431326 1 0.1209 0.84496 0.964 0.032 0.000 0.004
#> SRR1487278 2 0.6157 0.59115 0.232 0.660 0.000 0.108
#> SRR1098312 4 0.6878 0.42036 0.224 0.080 0.044 0.652
#> SRR810273 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.1174 0.87904 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR614467 2 0.2610 0.86381 0.012 0.900 0.000 0.088
#> SRR811471 1 0.2731 0.83880 0.912 0.032 0.008 0.048
#> SRR1478341 3 0.0188 0.75123 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1088606 1 0.7409 0.43333 0.588 0.120 0.032 0.260
#> SRR1479699 4 0.6987 0.44011 0.208 0.064 0.072 0.656
#> SRR1403589 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.2759 0.86932 0.052 0.904 0.000 0.044
#> SRR1359803 1 0.3614 0.79841 0.864 0.016 0.020 0.100
#> SRR1338988 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.2871 0.84659 0.072 0.896 0.000 0.032
#> SRR1378992 1 0.1452 0.84389 0.956 0.036 0.000 0.008
#> SRR659427 4 0.8718 0.25802 0.176 0.248 0.084 0.492
#> SRR1096638 1 0.2830 0.82802 0.904 0.032 0.004 0.060
#> SRR1466619 2 0.2413 0.85515 0.064 0.916 0.000 0.020
#> SRR659307 2 0.5631 0.72337 0.072 0.696 0.000 0.232
#> SRR1439994 4 0.7565 0.53069 0.216 0.000 0.312 0.472
#> SRR1454931 1 0.4185 0.76521 0.832 0.012 0.036 0.120
#> SRR1332928 4 0.7458 0.58233 0.240 0.000 0.252 0.508
#> SRR658621 2 0.3652 0.84272 0.052 0.856 0.000 0.092
#> SRR1095840 1 0.1624 0.84702 0.952 0.028 0.000 0.020
#> SRR1458243 1 0.7370 -0.47949 0.428 0.000 0.160 0.412
#> SRR1374270 2 0.6366 0.65774 0.120 0.640 0.000 0.240
#> SRR1470947 2 0.0188 0.87951 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1365598 2 0.6238 0.53914 0.276 0.632 0.000 0.092
#> SRR662787 2 0.1004 0.87947 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR1408727 2 0.6751 0.59042 0.136 0.592 0.000 0.272
#> SRR1456274 4 0.7148 0.44165 0.284 0.072 0.044 0.600
#> SRR817744 1 0.0921 0.84434 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 4 0.7756 0.58051 0.248 0.008 0.244 0.500
#> SRR1374198 1 0.4228 0.66016 0.760 0.008 0.000 0.232
#> SRR1445856 4 0.7530 0.53482 0.376 0.000 0.188 0.436
#> SRR820049 3 0.6931 0.39858 0.044 0.056 0.608 0.292
#> SRR1375290 2 0.8203 0.25908 0.116 0.456 0.056 0.372
#> SRR818999 4 0.8002 0.51115 0.360 0.004 0.264 0.372
#> SRR1390242 1 0.1256 0.84474 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1401164 2 0.2111 0.86454 0.044 0.932 0.000 0.024
#> SRR1454629 1 0.5840 0.47995 0.672 0.004 0.060 0.264
#> SRR1332187 3 0.0817 0.75104 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR603365 3 0.1940 0.75111 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR657833 2 0.3071 0.86117 0.068 0.888 0.000 0.044
#> SRR1436207 2 0.1975 0.87534 0.016 0.936 0.000 0.048
#> SRR1488017 1 0.1109 0.84431 0.968 0.028 0.000 0.004
#> SRR612947 2 0.0188 0.87950 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1480384 1 0.4939 0.65116 0.776 0.004 0.064 0.156
#> SRR1364761 2 0.0779 0.87992 0.004 0.980 0.000 0.016
#> SRR1308086 4 0.6749 0.42196 0.204 0.056 0.068 0.672
#> SRR1441868 1 0.1305 0.84407 0.960 0.036 0.000 0.004
#> SRR1485380 3 0.6147 0.14247 0.056 0.000 0.564 0.380
#> SRR1073705 1 0.1452 0.84389 0.956 0.036 0.000 0.008
#> SRR615032 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0188 0.87951 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1442983 2 0.0524 0.87955 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1100346 2 0.4937 0.78880 0.064 0.764 0.000 0.172
#> SRR1332816 1 0.1452 0.84389 0.956 0.036 0.000 0.008
#> SRR612299 2 0.6521 0.55597 0.256 0.620 0.000 0.124
#> SRR1407386 1 0.1724 0.84602 0.948 0.032 0.000 0.020
#> SRR1418064 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.4488 0.74994 0.820 0.076 0.008 0.096
#> SRR1498395 2 0.0524 0.87955 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1079998 4 0.7531 0.53305 0.208 0.000 0.316 0.476
#> SRR1498885 2 0.2742 0.86461 0.024 0.900 0.000 0.076
#> SRR1337215 2 0.3793 0.82580 0.112 0.844 0.000 0.044
#> SRR1414749 3 0.2867 0.74789 0.012 0.000 0.884 0.104
#> SRR1365963 4 0.7463 0.56486 0.224 0.000 0.272 0.504
#> SRR1368030 2 0.5395 0.75880 0.084 0.732 0.000 0.184
#> SRR1419760 2 0.5219 0.80348 0.060 0.780 0.024 0.136
#> SRR1381841 1 0.5816 0.56275 0.700 0.008 0.068 0.224
#> SRR821388 4 0.6777 0.41413 0.224 0.084 0.036 0.656
#> SRR657623 2 0.3732 0.84130 0.056 0.852 0.000 0.092
#> SRR1094241 3 0.4194 0.65230 0.008 0.000 0.764 0.228
#> SRR819583 4 0.6707 0.23110 0.088 0.000 0.444 0.468
#> SRR1096149 1 0.4335 0.69005 0.792 0.016 0.008 0.184
#> SRR1342829 3 0.0000 0.75012 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.2408 0.82880 0.920 0.016 0.004 0.060
#> SRR811333 4 0.7575 0.48681 0.200 0.000 0.356 0.444
#> SRR1311666 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.2830 0.87018 0.040 0.900 0.000 0.060
#> SRR1446436 2 0.0779 0.87926 0.004 0.980 0.000 0.016
#> SRR815092 1 0.1256 0.84474 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1500149 2 0.2385 0.85865 0.052 0.920 0.000 0.028
#> SRR1100564 1 0.2328 0.83225 0.924 0.016 0.004 0.056
#> SRR1403072 3 0.0000 0.75012 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR811653 2 0.7861 0.35818 0.140 0.460 0.024 0.376
#> SRR1311348 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.1004 0.87947 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR1435442 2 0.6209 0.58860 0.232 0.656 0.000 0.112
#> SRR1421444 3 0.0188 0.75068 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1344010 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.1305 0.84407 0.960 0.036 0.000 0.004
#> SRR1444763 1 0.4123 0.68946 0.772 0.008 0.000 0.220
#> SRR1415026 2 0.0469 0.88016 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1416596 2 0.1624 0.87799 0.020 0.952 0.000 0.028
#> SRR1485499 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.2742 0.86461 0.024 0.900 0.000 0.076
#> SRR1310094 2 0.3778 0.83924 0.052 0.848 0.000 0.100
#> SRR663537 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.3126 0.80395 0.884 0.016 0.008 0.092
#> SRR1453950 1 0.3607 0.80844 0.868 0.032 0.012 0.088
#> SRR1087875 1 0.1452 0.84389 0.956 0.036 0.000 0.008
#> SRR613318 2 0.7165 0.57663 0.116 0.576 0.016 0.292
#> SRR1332694 1 0.1339 0.84534 0.964 0.024 0.004 0.008
#> SRR1468469 3 0.2610 0.75172 0.012 0.000 0.900 0.088
#> SRR818670 2 0.0657 0.88023 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1120318 1 0.2864 0.83391 0.908 0.024 0.016 0.052
#> SRR1311622 4 0.6991 0.59117 0.232 0.000 0.188 0.580
#> SRR1500931 4 0.6709 0.21208 0.088 0.000 0.452 0.460
#> SRR1387494 4 0.6878 0.44490 0.204 0.056 0.076 0.664
#> SRR1379175 2 0.7738 0.45825 0.140 0.512 0.024 0.324
#> SRR1401909 4 0.7476 0.44358 0.184 0.000 0.356 0.460
#> SRR1440541 2 0.1256 0.87697 0.028 0.964 0.000 0.008
#> SRR1068832 4 0.6862 0.31564 0.104 0.000 0.408 0.488
#> SRR1376640 2 0.2908 0.86693 0.040 0.896 0.000 0.064
#> SRR1085712 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.5901 0.48534 0.652 0.000 0.068 0.280
#> SRR1084276 1 0.7046 0.17008 0.584 0.004 0.160 0.252
#> SRR1353262 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.4080 0.78491 0.848 0.048 0.016 0.088
#> SRR1396877 1 0.7006 0.14914 0.580 0.004 0.144 0.272
#> SRR1443026 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.1510 0.84632 0.956 0.028 0.000 0.016
#> SRR1436822 2 0.2596 0.85175 0.068 0.908 0.000 0.024
#> SRR1101128 3 0.5022 0.54615 0.044 0.000 0.736 0.220
#> SRR1363886 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.6209 0.61310 0.232 0.656 0.000 0.112
#> SRR1093218 3 0.5877 0.45288 0.068 0.000 0.656 0.276
#> SRR1077090 4 0.7442 0.49648 0.184 0.000 0.340 0.476
#> SRR1327430 2 0.6327 0.66572 0.124 0.648 0.000 0.228
#> SRR1088958 1 0.1452 0.84389 0.956 0.036 0.000 0.008
#> SRR1486931 2 0.2214 0.87562 0.028 0.928 0.000 0.044
#> SRR1086820 1 0.4767 0.73501 0.768 0.028 0.008 0.196
#> SRR1383000 1 0.3607 0.80844 0.868 0.032 0.012 0.088
#> SRR1355705 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614335 2 0.2596 0.86740 0.024 0.908 0.000 0.068
#> SRR660534 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.3399 0.84935 0.040 0.868 0.000 0.092
#> SRR1456401 2 0.6216 0.67914 0.120 0.660 0.000 0.220
#> SRR1086393 1 0.2261 0.84173 0.932 0.024 0.008 0.036
#> SRR1351521 3 0.0000 0.75012 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.5495 0.75408 0.096 0.728 0.000 0.176
#> SRR1309382 1 0.2111 0.84080 0.932 0.024 0.000 0.044
#> SRR1089375 4 0.8395 0.49372 0.388 0.044 0.160 0.408
#> SRR1499482 2 0.2408 0.87448 0.036 0.920 0.000 0.044
#> SRR614719 2 0.3876 0.83452 0.040 0.836 0.000 0.124
#> SRR1081473 4 0.7836 0.56008 0.232 0.008 0.280 0.480
#> SRR1087415 1 0.4767 0.73501 0.768 0.028 0.008 0.196
#> SRR1088217 3 0.7414 -0.27531 0.172 0.000 0.460 0.368
#> SRR808496 2 0.5772 0.74636 0.100 0.716 0.004 0.180
#> SRR1336463 2 0.2759 0.87127 0.044 0.904 0.000 0.052
#> SRR612359 2 0.4206 0.82255 0.048 0.816 0.000 0.136
#> SRR1444412 1 0.6727 0.28725 0.624 0.004 0.144 0.228
#> SRR1074116 3 0.0336 0.75129 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR821846 3 0.0000 0.75012 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0188 0.87950 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR808914 1 0.1284 0.84591 0.964 0.024 0.000 0.012
#> SRR1349099 1 0.5859 0.59661 0.684 0.044 0.016 0.256
#> SRR1337886 2 0.2759 0.86932 0.052 0.904 0.000 0.044
#> SRR813632 4 0.7922 0.54853 0.352 0.004 0.240 0.404
#> SRR1101591 3 0.7343 -0.37603 0.156 0.000 0.424 0.420
#> SRR1089713 4 0.8001 0.58277 0.268 0.016 0.232 0.484
#> SRR1453127 3 0.1109 0.75622 0.004 0.000 0.968 0.028
#> SRR1498354 3 0.6974 -0.18072 0.116 0.000 0.488 0.396
#> SRR1313831 1 0.2021 0.83926 0.936 0.024 0.000 0.040
#> SRR1315434 3 0.3108 0.73811 0.016 0.000 0.872 0.112
#> SRR814747 2 0.4646 0.80573 0.084 0.796 0.000 0.120
#> SRR1358539 1 0.1593 0.84584 0.956 0.024 0.004 0.016
#> SRR1367807 1 0.1452 0.84389 0.956 0.036 0.000 0.008
#> SRR1365791 1 0.9109 0.15039 0.460 0.120 0.180 0.240
#> SRR1081519 3 0.7386 -0.26268 0.168 0.000 0.464 0.368
#> SRR614707 2 0.6014 0.66728 0.188 0.696 0.004 0.112
#> SRR1094027 1 0.1510 0.84632 0.956 0.028 0.000 0.016
#> SRR1489092 1 0.7542 0.40682 0.568 0.124 0.032 0.276
#> SRR1079502 4 0.7841 0.58540 0.260 0.012 0.228 0.500
#> SRR1457814 2 0.7861 0.35818 0.140 0.460 0.024 0.376
#> SRR1455127 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615081 2 0.2596 0.85175 0.068 0.908 0.000 0.024
#> SRR1327855 4 0.6707 0.23110 0.088 0.000 0.444 0.468
#> SRR1417873 2 0.3697 0.84181 0.048 0.852 0.000 0.100
#> SRR1394125 3 0.6259 0.41078 0.116 0.000 0.652 0.232
#> SRR1488388 1 0.1724 0.84499 0.948 0.032 0.000 0.020
#> SRR1401122 2 0.5436 0.75762 0.092 0.732 0.000 0.176
#> SRR612383 2 0.5911 0.71620 0.068 0.688 0.008 0.236
#> SRR1477711 1 0.0921 0.84434 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.2660 0.86963 0.036 0.908 0.000 0.056
#> SRR612851 2 0.3037 0.86373 0.036 0.888 0.000 0.076
#> SRR1086349 1 0.1022 0.84468 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 4 0.6716 0.41521 0.224 0.080 0.036 0.660
#> SRR1475885 1 0.6155 0.57272 0.668 0.060 0.016 0.256
#> SRR1376334 1 0.2124 0.83975 0.932 0.028 0.000 0.040
#> SRR1399821 1 0.5859 0.59661 0.684 0.044 0.016 0.256
#> SRR1347042 3 0.1109 0.75622 0.004 0.000 0.968 0.028
#> SRR612323 2 0.6158 0.69137 0.076 0.664 0.008 0.252
#> SRR612604 2 0.3486 0.81919 0.092 0.864 0.000 0.044
#> SRR1389546 2 0.0657 0.88023 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1311877 1 0.1356 0.84528 0.960 0.032 0.000 0.008
#> SRR1465608 4 0.7472 0.56944 0.232 0.000 0.264 0.504
#> SRR1101808 2 0.0188 0.87950 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1414079 3 0.2412 0.75396 0.008 0.000 0.908 0.084
#> SRR1331153 2 0.3674 0.82886 0.116 0.848 0.000 0.036
#> SRR1078439 3 0.8056 0.00628 0.116 0.048 0.476 0.360
#> SRR2165527 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.2376 0.81464 0.916 0.068 0.000 0.016
#> SRR1313536 2 0.2021 0.86443 0.040 0.936 0.000 0.024
#> SRR1070308 1 0.3716 0.76379 0.852 0.096 0.000 0.052
#> SRR1403110 1 0.2214 0.84008 0.928 0.028 0.000 0.044
#> SRR1400355 2 0.0524 0.87955 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1401317 4 0.6707 0.23110 0.088 0.000 0.444 0.468
#> SRR1456862 1 0.6299 0.33426 0.636 0.004 0.084 0.276
#> SRR1074622 1 0.2585 0.83571 0.916 0.032 0.004 0.048
#> SRR1465847 4 0.7489 0.47434 0.184 0.000 0.364 0.452
#> SRR1443376 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.1302 0.75149 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1075579 1 0.1256 0.84474 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1090881 2 0.8203 0.25908 0.116 0.456 0.056 0.372
#> SRR612251 2 0.3320 0.85300 0.056 0.876 0.000 0.068
#> SRR1418581 1 0.1305 0.84407 0.960 0.036 0.000 0.004
#> SRR658045 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613214 2 0.5240 0.76490 0.072 0.740 0.000 0.188
#> SRR613078 2 0.5875 0.63720 0.204 0.692 0.000 0.104
#> SRR1472998 4 0.7489 0.47434 0.184 0.000 0.364 0.452
#> SRR1433452 2 0.1174 0.87904 0.012 0.968 0.000 0.020
#> SRR1101957 1 0.1356 0.84528 0.960 0.032 0.000 0.008
#> SRR1487993 4 0.6837 0.06469 0.104 0.000 0.392 0.504
#> SRR1465983 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.1362 0.84484 0.964 0.020 0.004 0.012
#> SRR1367566 3 0.3335 0.73876 0.020 0.000 0.860 0.120
#> SRR1316151 2 0.4798 0.73347 0.180 0.768 0.000 0.052
#> SRR1417547 2 0.5436 0.75762 0.092 0.732 0.000 0.176
#> SRR659389 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.3581 0.83083 0.116 0.852 0.000 0.032
#> SRR1398207 4 0.8056 0.50948 0.312 0.004 0.312 0.372
#> SRR1358755 4 0.7408 0.45035 0.172 0.000 0.364 0.464
#> SRR1078903 2 0.2089 0.87480 0.020 0.932 0.000 0.048
#> SRR1323252 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0672 0.87998 0.008 0.984 0.000 0.008
#> SRR1369172 1 0.4682 0.65140 0.760 0.004 0.024 0.212
#> SRR615982 2 0.2565 0.87076 0.032 0.912 0.000 0.056
#> SRR1480431 2 0.3320 0.85704 0.056 0.876 0.000 0.068
#> SRR1429825 2 0.2313 0.86286 0.044 0.924 0.000 0.032
#> SRR1102393 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 4 0.7750 0.59417 0.260 0.008 0.232 0.500
#> SRR808351 1 0.3007 0.82469 0.900 0.028 0.012 0.060
#> SRR1317513 1 0.1339 0.84534 0.964 0.024 0.004 0.008
#> SRR1480501 4 0.7456 0.47769 0.180 0.000 0.360 0.460
#> SRR1081910 4 0.7686 0.51945 0.228 0.000 0.336 0.436
#> SRR1086611 2 0.7599 0.55751 0.172 0.604 0.044 0.180
#> SRR1392571 2 0.3144 0.86298 0.044 0.884 0.000 0.072
#> SRR1311441 1 0.1209 0.84496 0.964 0.032 0.000 0.004
#> SRR808152 1 0.2585 0.83484 0.916 0.032 0.004 0.048
#> SRR657313 3 0.4188 0.64228 0.004 0.000 0.752 0.244
#> SRR1433131 2 0.0927 0.87678 0.016 0.976 0.000 0.008
#> SRR1321011 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0779 0.87935 0.004 0.980 0.000 0.016
#> SRR1389108 1 0.1452 0.84389 0.956 0.036 0.000 0.008
#> SRR1376228 3 0.2867 0.74789 0.012 0.000 0.884 0.104
#> SRR1399757 1 0.1022 0.84442 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.2867 0.74789 0.012 0.000 0.884 0.104
#> SRR1464517 4 0.7028 0.58105 0.228 0.000 0.196 0.576
#> SRR613557 2 0.5631 0.72337 0.072 0.696 0.000 0.232
#> SRR809831 1 0.6488 0.37467 0.648 0.004 0.128 0.220
#> SRR1429387 3 0.0000 0.75012 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.1256 0.84528 0.964 0.028 0.000 0.008
#> SRR1071644 1 0.0921 0.84434 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1406936 4 0.7868 0.57974 0.240 0.012 0.252 0.496
#> SRR1072031 2 0.0000 0.87930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.6158 0.69137 0.076 0.664 0.008 0.252
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 4 0.6945 0.3815 0.124 0.028 0.020 0.556 0.272
#> SRR1404105 1 0.1469 0.8425 0.948 0.000 0.000 0.016 0.036
#> SRR2164936 2 0.0609 0.8413 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1472057 5 0.4387 0.6459 0.004 0.000 0.208 0.044 0.744
#> SRR614491 2 0.5315 0.5014 0.032 0.612 0.000 0.336 0.020
#> SRR1069376 1 0.0898 0.8507 0.972 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR811964 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0510 0.8408 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1345715 1 0.0693 0.8489 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1328073 1 0.3902 0.7165 0.812 0.056 0.000 0.124 0.008
#> SRR1394209 2 0.5826 0.3927 0.060 0.564 0.000 0.356 0.020
#> SRR1474018 2 0.0162 0.8404 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1099809 5 0.5187 0.6993 0.180 0.000 0.072 0.028 0.720
#> SRR1500555 2 0.3475 0.7706 0.012 0.804 0.000 0.180 0.004
#> SRR1354363 1 0.2077 0.8300 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR1391619 3 0.4800 0.6708 0.000 0.000 0.716 0.196 0.088
#> SRR1307997 2 0.3510 0.7951 0.032 0.832 0.000 0.128 0.008
#> SRR663124 2 0.5119 0.4268 0.028 0.576 0.000 0.388 0.008
#> SRR1334670 1 0.1648 0.8420 0.940 0.000 0.000 0.020 0.040
#> SRR612515 2 0.5119 0.4268 0.028 0.576 0.000 0.388 0.008
#> SRR1092727 2 0.2179 0.8242 0.004 0.896 0.000 0.100 0.000
#> SRR1364013 2 0.2932 0.8130 0.032 0.864 0.000 0.104 0.000
#> SRR1468553 3 0.3090 0.7754 0.000 0.000 0.856 0.040 0.104
#> SRR1403980 3 0.3533 0.7676 0.012 0.000 0.840 0.040 0.108
#> SRR1420169 5 0.4241 0.7208 0.044 0.000 0.104 0.044 0.808
#> SRR1442800 4 0.7495 0.0963 0.336 0.076 0.000 0.440 0.148
#> SRR1359214 2 0.0162 0.8404 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1499849 5 0.5163 0.6954 0.184 0.000 0.068 0.028 0.720
#> SRR1500030 3 0.7340 0.2048 0.024 0.000 0.352 0.340 0.284
#> SRR1093053 3 0.8114 0.0989 0.044 0.040 0.396 0.176 0.344
#> SRR1399843 5 0.6752 0.4861 0.080 0.000 0.092 0.252 0.576
#> SRR1380231 5 0.6467 0.6631 0.128 0.000 0.104 0.124 0.644
#> SRR809470 5 0.5839 0.5676 0.060 0.000 0.296 0.032 0.612
#> SRR614239 2 0.5119 0.4268 0.028 0.576 0.000 0.388 0.008
#> SRR613939 2 0.2968 0.8168 0.012 0.864 0.000 0.112 0.012
#> SRR612971 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.1571 0.8350 0.004 0.936 0.000 0.060 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0579 0.8486 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR613006 2 0.2476 0.8194 0.020 0.904 0.000 0.064 0.012
#> SRR1469570 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.7340 0.2048 0.024 0.000 0.352 0.340 0.284
#> SRR1079023 1 0.0000 0.8485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 4 0.6103 0.3429 0.112 0.004 0.008 0.580 0.296
#> SRR1478700 5 0.5398 0.6282 0.240 0.000 0.056 0.028 0.676
#> SRR1081543 3 0.4287 0.7184 0.024 0.040 0.824 0.080 0.032
#> SRR1384754 4 0.6103 0.3429 0.112 0.004 0.008 0.580 0.296
#> SRR612287 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.5826 0.3927 0.060 0.564 0.000 0.356 0.020
#> SRR1315247 2 0.8095 -0.0679 0.124 0.408 0.016 0.340 0.112
#> SRR1105344 2 0.2243 0.8156 0.016 0.916 0.000 0.056 0.012
#> SRR658549 2 0.3475 0.7706 0.012 0.804 0.000 0.180 0.004
#> SRR1480240 1 0.1478 0.8442 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1084816 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.5092 0.5803 0.048 0.656 0.000 0.288 0.008
#> SRR1419476 3 0.3368 0.7379 0.000 0.000 0.820 0.024 0.156
#> SRR1456075 5 0.5612 0.6260 0.072 0.000 0.056 0.172 0.700
#> SRR1389474 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.1704 0.8383 0.928 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR1334419 1 0.0579 0.8486 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1417154 3 0.3192 0.7718 0.000 0.000 0.848 0.040 0.112
#> SRR1095985 4 0.7480 0.1107 0.320 0.064 0.000 0.444 0.172
#> SRR1325771 1 0.0162 0.8489 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1360420 3 0.0290 0.7832 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR660272 2 0.3919 0.7642 0.076 0.816 0.000 0.100 0.008
#> SRR1332993 1 0.0898 0.8501 0.972 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR1311833 2 0.0162 0.8403 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR808044 5 0.5398 0.6282 0.240 0.000 0.056 0.028 0.676
#> SRR1076916 3 0.3680 0.7424 0.012 0.000 0.832 0.048 0.108
#> SRR1356266 1 0.1408 0.8484 0.948 0.000 0.000 0.008 0.044
#> SRR1341983 2 0.2604 0.8289 0.020 0.896 0.000 0.072 0.012
#> SRR1456114 1 0.4789 0.3491 0.580 0.000 0.004 0.016 0.400
#> SRR1072948 3 0.1041 0.7900 0.000 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR1472370 5 0.4387 0.6459 0.004 0.000 0.208 0.044 0.744
#> SRR1480176 1 0.4025 0.6730 0.748 0.000 0.012 0.008 0.232
#> SRR613843 2 0.1153 0.8367 0.004 0.964 0.000 0.024 0.008
#> SRR1469192 1 0.4211 0.6774 0.752 0.000 0.016 0.016 0.216
#> SRR1404555 3 0.2300 0.7745 0.000 0.000 0.908 0.052 0.040
#> SRR659839 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0404 0.8411 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1362848 4 0.6103 0.3429 0.112 0.004 0.008 0.580 0.296
#> SRR1407492 2 0.5119 0.4268 0.028 0.576 0.000 0.388 0.008
#> SRR1455082 2 0.2964 0.8080 0.024 0.856 0.000 0.120 0.000
#> SRR658362 2 0.1704 0.8343 0.004 0.928 0.000 0.068 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.4758 0.0901 0.004 0.000 0.552 0.012 0.432
#> SRR818232 1 0.2054 0.8369 0.920 0.000 0.000 0.028 0.052
#> SRR1454868 4 0.7212 0.2728 0.080 0.360 0.020 0.484 0.056
#> SRR1474816 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.2068 0.8222 0.904 0.000 0.004 0.000 0.092
#> SRR1088437 2 0.1041 0.8394 0.004 0.964 0.000 0.032 0.000
#> SRR1466400 2 0.6138 0.4484 0.080 0.624 0.000 0.248 0.048
#> SRR658921 2 0.6605 0.3863 0.112 0.588 0.000 0.244 0.056
#> SRR1499873 2 0.0671 0.8411 0.004 0.980 0.000 0.016 0.000
#> SRR1101373 1 0.0579 0.8486 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1090145 1 0.2072 0.8350 0.928 0.020 0.000 0.036 0.016
#> SRR1379324 1 0.5442 0.3548 0.560 0.000 0.004 0.056 0.380
#> SRR1345307 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.2540 0.7849 0.000 0.000 0.888 0.024 0.088
#> SRR1086280 3 0.3368 0.7379 0.000 0.000 0.820 0.024 0.156
#> SRR1454891 2 0.2953 0.8004 0.012 0.844 0.000 0.144 0.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811819 1 0.2416 0.8129 0.888 0.000 0.000 0.012 0.100
#> SRR1318920 1 0.6385 0.3585 0.504 0.000 0.000 0.296 0.200
#> SRR656758 2 0.0404 0.8411 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.8485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.3919 0.7642 0.076 0.816 0.000 0.100 0.008
#> SRR1472687 2 0.2604 0.8289 0.020 0.896 0.000 0.072 0.012
#> SRR1334291 2 0.1197 0.8376 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1415153 2 0.0794 0.8397 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1323271 2 0.1956 0.8283 0.008 0.916 0.000 0.076 0.000
#> SRR1368939 2 0.2291 0.8144 0.008 0.908 0.000 0.072 0.012
#> SRR1443161 5 0.7739 0.2744 0.076 0.032 0.096 0.312 0.484
#> SRR614695 2 0.5589 0.5407 0.048 0.648 0.000 0.268 0.036
#> SRR1092372 1 0.6422 0.3416 0.492 0.000 0.000 0.308 0.200
#> SRR1474577 1 0.0579 0.8486 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1406582 1 0.0579 0.8486 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR612779 2 0.2722 0.8152 0.020 0.872 0.000 0.108 0.000
#> SRR1089006 1 0.0579 0.8486 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1354071 1 0.3696 0.7870 0.840 0.028 0.000 0.040 0.092
#> SRR1105463 5 0.5581 0.6186 0.256 0.000 0.080 0.016 0.648
#> SRR811005 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.1965 0.8384 0.924 0.000 0.000 0.024 0.052
#> SRR1325871 3 0.4800 0.6708 0.000 0.000 0.716 0.196 0.088
#> SRR1355415 5 0.5029 0.6943 0.056 0.000 0.172 0.036 0.736
#> SRR1090861 1 0.0162 0.8489 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1320712 4 0.6136 0.2559 0.076 0.364 0.000 0.536 0.024
#> SRR1470075 1 0.2017 0.8309 0.912 0.000 0.000 0.008 0.080
#> SRR1091254 1 0.0912 0.8511 0.972 0.000 0.000 0.012 0.016
#> SRR1101397 5 0.4512 0.7120 0.140 0.000 0.064 0.020 0.776
#> SRR1321165 1 0.6422 0.3416 0.492 0.000 0.000 0.308 0.200
#> SRR1092112 5 0.5232 0.1617 0.008 0.000 0.472 0.028 0.492
#> SRR1417588 3 0.0290 0.7832 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1074790 1 0.2158 0.8038 0.920 0.052 0.000 0.020 0.008
#> SRR1432106 2 0.0955 0.8402 0.004 0.968 0.000 0.028 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.4981 0.2031 0.528 0.000 0.008 0.016 0.448
#> SRR1318582 2 0.0794 0.8397 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1080484 2 0.0880 0.8410 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1072749 5 0.6381 0.5213 0.328 0.000 0.076 0.044 0.552
#> SRR1078586 1 0.0404 0.8504 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1400333 2 0.6189 0.5641 0.072 0.648 0.008 0.220 0.052
#> SRR1078834 2 0.6151 0.5516 0.076 0.652 0.000 0.196 0.076
#> SRR1417611 2 0.3304 0.7645 0.016 0.816 0.000 0.168 0.000
#> SRR1396840 1 0.6839 0.2018 0.424 0.000 0.004 0.304 0.268
#> SRR1465440 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.2243 0.8156 0.016 0.916 0.000 0.056 0.012
#> SRR614984 2 0.5052 0.4782 0.028 0.600 0.000 0.364 0.008
#> SRR1324269 1 0.5262 0.3148 0.568 0.000 0.036 0.008 0.388
#> SRR1401491 2 0.2243 0.8156 0.016 0.916 0.000 0.056 0.012
#> SRR1319443 1 0.3622 0.7778 0.816 0.000 0.000 0.048 0.136
#> SRR1324349 2 0.2669 0.8179 0.020 0.876 0.000 0.104 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.2077 0.8300 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR661505 3 0.6376 0.2278 0.012 0.004 0.512 0.108 0.364
#> SRR1419062 5 0.7456 0.4061 0.112 0.000 0.316 0.104 0.468
#> SRR1480131 5 0.5953 0.1955 0.420 0.000 0.040 0.036 0.504
#> SRR1421284 2 0.5217 0.5665 0.056 0.648 0.000 0.288 0.008
#> SRR1329624 1 0.0566 0.8503 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1315739 3 0.1638 0.7889 0.000 0.000 0.932 0.004 0.064
#> SRR1099189 2 0.3527 0.7829 0.028 0.820 0.000 0.148 0.004
#> SRR1083286 1 0.1704 0.8421 0.928 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR1091890 4 0.7657 0.3140 0.096 0.028 0.084 0.512 0.280
#> SRR1347436 2 0.4976 0.7069 0.036 0.736 0.008 0.192 0.028
#> SRR1327473 1 0.3090 0.7792 0.876 0.052 0.000 0.056 0.016
#> SRR1338195 3 0.0290 0.7832 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR809698 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.1469 0.8471 0.948 0.000 0.000 0.016 0.036
#> SRR658271 2 0.0290 0.8404 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1339597 5 0.4941 0.6306 0.224 0.000 0.040 0.024 0.712
#> SRR1454842 3 0.4309 0.7102 0.000 0.000 0.768 0.084 0.148
#> SRR1322643 1 0.0693 0.8489 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR614887 3 0.0290 0.7832 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1354620 5 0.4371 0.6933 0.028 0.000 0.164 0.032 0.776
#> SRR615056 2 0.3420 0.7845 0.036 0.836 0.000 0.124 0.004
#> SRR1105320 1 0.3646 0.7421 0.836 0.052 0.000 0.100 0.012
#> SRR1391529 1 0.1818 0.8400 0.932 0.000 0.000 0.024 0.044
#> SRR663052 2 0.0963 0.8407 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1478834 1 0.2012 0.8375 0.920 0.000 0.000 0.020 0.060
#> SRR812366 2 0.3106 0.7919 0.028 0.872 0.000 0.080 0.020
#> SRR1435330 3 0.2426 0.7877 0.000 0.000 0.900 0.036 0.064
#> SRR615383 2 0.0162 0.8403 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1389157 2 0.5425 0.5384 0.040 0.628 0.000 0.308 0.024
#> SRR613568 2 0.3919 0.7642 0.076 0.816 0.000 0.100 0.008
#> SRR614095 2 0.3350 0.7922 0.040 0.844 0.000 0.112 0.004
#> SRR1103092 1 0.2295 0.8261 0.900 0.000 0.008 0.004 0.088
#> SRR1337155 2 0.9135 -0.2216 0.088 0.388 0.112 0.168 0.244
#> SRR1475345 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 2 0.8126 -0.0794 0.124 0.404 0.016 0.340 0.116
#> SRR1406372 2 0.2243 0.8156 0.016 0.916 0.000 0.056 0.012
#> SRR1339880 3 0.7340 0.2048 0.024 0.000 0.352 0.340 0.284
#> SRR1353136 4 0.7212 0.2728 0.080 0.360 0.020 0.484 0.056
#> SRR1093906 3 0.0290 0.7832 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR614035 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.2798 0.7918 0.852 0.000 0.000 0.008 0.140
#> SRR1363926 2 0.5800 0.4194 0.068 0.576 0.000 0.340 0.016
#> SRR1399861 4 0.6376 0.2439 0.072 0.368 0.000 0.520 0.040
#> SRR1338789 1 0.6087 0.4215 0.552 0.000 0.000 0.160 0.288
#> SRR1421420 5 0.6791 0.1255 0.052 0.000 0.416 0.088 0.444
#> SRR1420832 2 0.0162 0.8401 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1476231 1 0.0162 0.8485 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1352870 2 0.6745 0.2571 0.044 0.520 0.008 0.348 0.080
#> SRR1315041 2 0.3098 0.7801 0.016 0.836 0.000 0.148 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443268 5 0.4512 0.7120 0.140 0.000 0.064 0.020 0.776
#> SRR1416617 3 0.3090 0.7754 0.000 0.000 0.856 0.040 0.104
#> SRR1102443 1 0.0579 0.8486 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR655672 2 0.5119 0.4268 0.028 0.576 0.000 0.388 0.008
#> SRR1420006 3 0.0404 0.7818 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1458267 2 0.1197 0.8376 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR613819 2 0.4555 0.6831 0.052 0.732 0.000 0.212 0.004
#> SRR1469432 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.2773 0.8118 0.020 0.868 0.000 0.112 0.000
#> SRR1470727 1 0.4467 0.6231 0.716 0.000 0.016 0.016 0.252
#> SRR1339153 3 0.5043 0.6619 0.000 0.000 0.704 0.160 0.136
#> SRR1472749 3 0.5004 0.6438 0.000 0.000 0.692 0.092 0.216
#> SRR1414379 2 0.5449 0.5111 0.056 0.616 0.000 0.316 0.012
#> SRR1431326 1 0.0451 0.8491 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1487278 2 0.6289 0.4365 0.084 0.616 0.000 0.244 0.056
#> SRR1098312 4 0.7081 0.3667 0.120 0.028 0.028 0.548 0.276
#> SRR810273 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.1430 0.8368 0.004 0.944 0.000 0.052 0.000
#> SRR614467 2 0.2660 0.8015 0.008 0.864 0.000 0.128 0.000
#> SRR811471 1 0.2325 0.8368 0.904 0.000 0.000 0.028 0.068
#> SRR1478341 3 0.0404 0.7843 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1088606 4 0.7572 0.0580 0.336 0.064 0.000 0.416 0.184
#> SRR1479699 4 0.7143 0.2913 0.100 0.024 0.036 0.508 0.332
#> SRR1403589 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.2947 0.8225 0.020 0.876 0.000 0.088 0.016
#> SRR1359803 1 0.3639 0.7743 0.812 0.000 0.000 0.044 0.144
#> SRR1338988 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.3106 0.7919 0.028 0.872 0.000 0.080 0.020
#> SRR1378992 1 0.0579 0.8486 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR659427 4 0.8202 0.3814 0.080 0.180 0.028 0.452 0.260
#> SRR1096638 1 0.1725 0.8367 0.936 0.000 0.000 0.020 0.044
#> SRR1466619 2 0.2760 0.8035 0.028 0.892 0.000 0.064 0.016
#> SRR659307 2 0.5315 0.5014 0.032 0.612 0.000 0.336 0.020
#> SRR1439994 5 0.3981 0.7135 0.044 0.000 0.108 0.028 0.820
#> SRR1454931 1 0.4215 0.7381 0.772 0.000 0.004 0.052 0.172
#> SRR1332928 5 0.4648 0.7194 0.080 0.000 0.072 0.060 0.788
#> SRR658621 2 0.3646 0.7708 0.036 0.816 0.000 0.144 0.004
#> SRR1095840 1 0.0510 0.8515 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1458243 5 0.5395 0.5832 0.272 0.000 0.044 0.028 0.656
#> SRR1374270 2 0.5899 0.3991 0.068 0.568 0.000 0.344 0.020
#> SRR1470947 2 0.0162 0.8401 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1365598 2 0.6605 0.3863 0.112 0.588 0.000 0.244 0.056
#> SRR662787 2 0.0955 0.8402 0.004 0.968 0.000 0.028 0.000
#> SRR1408727 2 0.6284 0.2500 0.080 0.516 0.000 0.376 0.028
#> SRR1456274 4 0.7339 0.2635 0.192 0.024 0.016 0.484 0.284
#> SRR817744 1 0.0162 0.8485 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1478744 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 5 0.6467 0.6631 0.128 0.000 0.104 0.124 0.644
#> SRR1374198 1 0.6422 0.3416 0.492 0.000 0.000 0.308 0.200
#> SRR1445856 5 0.4941 0.6306 0.224 0.000 0.040 0.024 0.712
#> SRR820049 3 0.7227 0.4326 0.016 0.036 0.544 0.204 0.200
#> SRR1375290 2 0.7864 -0.2222 0.044 0.392 0.028 0.376 0.160
#> SRR818999 5 0.5465 0.6314 0.244 0.000 0.084 0.012 0.660
#> SRR1390242 1 0.0451 0.8495 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1401164 2 0.2291 0.8168 0.008 0.908 0.000 0.072 0.012
#> SRR1454629 1 0.5709 0.3681 0.564 0.000 0.008 0.072 0.356
#> SRR1332187 3 0.1741 0.7837 0.000 0.000 0.936 0.024 0.040
#> SRR603365 3 0.3151 0.7382 0.000 0.000 0.836 0.020 0.144
#> SRR657833 2 0.3191 0.8092 0.052 0.860 0.000 0.084 0.004
#> SRR1436207 2 0.2249 0.8243 0.008 0.896 0.000 0.096 0.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.8485 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0290 0.8410 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1480384 1 0.4271 0.6654 0.744 0.000 0.016 0.016 0.224
#> SRR1364761 2 0.0955 0.8409 0.004 0.968 0.000 0.028 0.000
#> SRR1308086 4 0.6172 0.2982 0.080 0.000 0.032 0.576 0.312
#> SRR1441868 1 0.0693 0.8489 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1485380 5 0.5028 0.3164 0.000 0.000 0.400 0.036 0.564
#> SRR1073705 1 0.0579 0.8486 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR615032 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0162 0.8401 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1442983 2 0.0609 0.8403 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1100346 2 0.4805 0.6392 0.032 0.688 0.000 0.268 0.012
#> SRR1332816 1 0.0579 0.8486 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR612299 2 0.6536 0.3816 0.100 0.572 0.000 0.280 0.048
#> SRR1407386 1 0.1331 0.8484 0.952 0.000 0.000 0.008 0.040
#> SRR1418064 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.3991 0.7588 0.828 0.040 0.000 0.076 0.056
#> SRR1498395 2 0.0963 0.8391 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1079998 5 0.4121 0.7197 0.052 0.000 0.108 0.028 0.812
#> SRR1498885 2 0.2462 0.8105 0.008 0.880 0.000 0.112 0.000
#> SRR1337215 2 0.3967 0.7628 0.060 0.808 0.000 0.124 0.008
#> SRR1414749 3 0.2927 0.7789 0.000 0.000 0.868 0.040 0.092
#> SRR1365963 5 0.3755 0.7182 0.048 0.000 0.080 0.032 0.840
#> SRR1368030 2 0.4961 0.6050 0.044 0.672 0.000 0.276 0.008
#> SRR1419760 2 0.5073 0.6944 0.036 0.724 0.008 0.204 0.028
#> SRR1381841 1 0.5593 0.4418 0.588 0.000 0.008 0.068 0.336
#> SRR821388 4 0.6841 0.3831 0.124 0.028 0.016 0.564 0.268
#> SRR657623 2 0.3646 0.7717 0.036 0.816 0.000 0.144 0.004
#> SRR1094241 3 0.4930 0.6712 0.000 0.000 0.716 0.140 0.144
#> SRR819583 5 0.4496 0.6267 0.004 0.000 0.232 0.040 0.724
#> SRR1096149 1 0.3835 0.6683 0.744 0.000 0.000 0.012 0.244
#> SRR1342829 3 0.0290 0.7832 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1353028 1 0.2628 0.8208 0.884 0.000 0.000 0.028 0.088
#> SRR811333 5 0.5288 0.7111 0.088 0.000 0.176 0.024 0.712
#> SRR1311666 2 0.0162 0.8400 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1486698 2 0.2968 0.8168 0.012 0.864 0.000 0.112 0.012
#> SRR1446436 2 0.1197 0.8376 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR815092 1 0.0451 0.8495 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1500149 2 0.2513 0.8103 0.016 0.904 0.000 0.060 0.020
#> SRR1100564 1 0.2293 0.8280 0.900 0.000 0.000 0.016 0.084
#> SRR1403072 3 0.0566 0.7814 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR811653 4 0.6376 0.2439 0.072 0.368 0.000 0.520 0.040
#> SRR1311348 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.1041 0.8398 0.004 0.964 0.000 0.032 0.000
#> SRR1435442 2 0.6251 0.4357 0.084 0.616 0.000 0.248 0.052
#> SRR1421444 3 0.0566 0.7841 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1344010 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0693 0.8489 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1444763 1 0.6076 0.4796 0.572 0.000 0.000 0.232 0.196
#> SRR1415026 2 0.0404 0.8410 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1416596 2 0.1697 0.8340 0.008 0.932 0.000 0.060 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.2462 0.8105 0.008 0.880 0.000 0.112 0.000
#> SRR1310094 2 0.3456 0.7503 0.016 0.800 0.000 0.184 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.2707 0.7991 0.860 0.000 0.000 0.008 0.132
#> SRR1453950 1 0.2390 0.8158 0.896 0.000 0.000 0.020 0.084
#> SRR1087875 1 0.0579 0.8486 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR613318 2 0.5748 0.1754 0.056 0.488 0.000 0.444 0.012
#> SRR1332694 1 0.0609 0.8502 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1468469 3 0.2448 0.7851 0.000 0.000 0.892 0.020 0.088
#> SRR818670 2 0.0865 0.8410 0.004 0.972 0.000 0.024 0.000
#> SRR1120318 1 0.1864 0.8392 0.924 0.000 0.004 0.004 0.068
#> SRR1311622 5 0.5612 0.6260 0.072 0.000 0.056 0.172 0.700
#> SRR1500931 5 0.4552 0.6191 0.004 0.000 0.240 0.040 0.716
#> SRR1387494 4 0.6766 0.2463 0.080 0.016 0.032 0.512 0.360
#> SRR1379175 4 0.6744 0.0136 0.080 0.436 0.004 0.436 0.044
#> SRR1401909 5 0.5029 0.6943 0.056 0.000 0.172 0.036 0.736
#> SRR1440541 2 0.1538 0.8260 0.036 0.948 0.000 0.008 0.008
#> SRR1068832 5 0.4410 0.6592 0.008 0.000 0.196 0.044 0.752
#> SRR1376640 2 0.3080 0.8061 0.020 0.852 0.000 0.124 0.004
#> SRR1085712 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.6765 0.2226 0.476 0.000 0.020 0.156 0.348
#> SRR1084276 1 0.5725 0.0394 0.492 0.000 0.048 0.016 0.444
#> SRR1353262 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.3696 0.7870 0.840 0.028 0.000 0.040 0.092
#> SRR1396877 1 0.5641 0.0297 0.488 0.000 0.048 0.012 0.452
#> SRR1443026 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0404 0.8504 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1436822 2 0.2824 0.7989 0.028 0.888 0.000 0.068 0.016
#> SRR1101128 3 0.4721 0.3748 0.004 0.000 0.628 0.020 0.348
#> SRR1363886 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.6155 0.4561 0.084 0.600 0.000 0.280 0.036
#> SRR1093218 3 0.5988 0.3347 0.016 0.000 0.564 0.084 0.336
#> SRR1077090 5 0.3394 0.6960 0.012 0.000 0.116 0.028 0.844
#> SRR1327430 2 0.5800 0.4194 0.068 0.576 0.000 0.340 0.016
#> SRR1088958 1 0.0579 0.8486 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1486931 2 0.2802 0.8195 0.016 0.876 0.000 0.100 0.008
#> SRR1086820 1 0.5646 0.5702 0.632 0.000 0.000 0.156 0.212
#> SRR1383000 1 0.2390 0.8158 0.896 0.000 0.000 0.020 0.084
#> SRR1355705 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614335 2 0.2411 0.8145 0.008 0.884 0.000 0.108 0.000
#> SRR660534 2 0.0404 0.8411 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.3098 0.7801 0.016 0.836 0.000 0.148 0.000
#> SRR1456401 2 0.5759 0.4455 0.068 0.588 0.000 0.328 0.016
#> SRR1086393 1 0.1670 0.8471 0.936 0.000 0.000 0.012 0.052
#> SRR1351521 3 0.0404 0.7818 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1093100 2 0.5155 0.5867 0.056 0.660 0.000 0.276 0.008
#> SRR1309382 1 0.1872 0.8400 0.928 0.000 0.000 0.020 0.052
#> SRR1089375 5 0.7787 0.3935 0.328 0.016 0.084 0.120 0.452
#> SRR1499482 2 0.2824 0.8217 0.024 0.880 0.000 0.088 0.008
#> SRR614719 2 0.3690 0.7286 0.012 0.764 0.000 0.224 0.000
#> SRR1081473 5 0.6585 0.6597 0.104 0.000 0.136 0.128 0.632
#> SRR1087415 1 0.5646 0.5702 0.632 0.000 0.000 0.156 0.212
#> SRR1088217 5 0.5735 0.5873 0.052 0.000 0.284 0.036 0.628
#> SRR808496 2 0.5341 0.5539 0.056 0.640 0.000 0.292 0.012
#> SRR1336463 2 0.2773 0.8190 0.020 0.868 0.000 0.112 0.000
#> SRR612359 2 0.3934 0.7024 0.016 0.740 0.000 0.244 0.000
#> SRR1444412 1 0.5508 0.1751 0.532 0.000 0.036 0.016 0.416
#> SRR1074116 3 0.0693 0.7852 0.000 0.000 0.980 0.008 0.012
#> SRR821846 3 0.0290 0.7832 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR656095 2 0.0290 0.8410 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR808914 1 0.0898 0.8502 0.972 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR1349099 1 0.6767 0.2007 0.428 0.008 0.000 0.368 0.196
#> SRR1337886 2 0.2947 0.8225 0.020 0.876 0.000 0.088 0.016
#> SRR813632 5 0.5497 0.6584 0.228 0.000 0.068 0.028 0.676
#> SRR1101591 5 0.5636 0.6298 0.048 0.000 0.252 0.044 0.656
#> SRR1089713 5 0.6913 0.6383 0.164 0.008 0.088 0.128 0.612
#> SRR1453127 3 0.1331 0.7895 0.000 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1498354 5 0.4792 0.5534 0.012 0.000 0.312 0.020 0.656
#> SRR1313831 1 0.1818 0.8397 0.932 0.000 0.000 0.024 0.044
#> SRR1315434 3 0.3002 0.7718 0.000 0.000 0.856 0.028 0.116
#> SRR814747 2 0.4256 0.7199 0.048 0.764 0.000 0.184 0.004
#> SRR1358539 1 0.0771 0.8509 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1367807 1 0.0579 0.8486 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1365791 4 0.8942 0.0883 0.240 0.056 0.148 0.404 0.152
#> SRR1081519 5 0.5774 0.5752 0.052 0.000 0.292 0.036 0.620
#> SRR614707 2 0.6074 0.5413 0.088 0.648 0.000 0.212 0.052
#> SRR1094027 1 0.0404 0.8504 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1489092 4 0.7503 0.1074 0.320 0.064 0.000 0.440 0.176
#> SRR1079502 5 0.6623 0.6467 0.144 0.004 0.088 0.128 0.636
#> SRR1457814 4 0.6376 0.2439 0.072 0.368 0.000 0.520 0.040
#> SRR1455127 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615081 2 0.2824 0.7989 0.028 0.888 0.000 0.068 0.016
#> SRR1327855 5 0.4496 0.6267 0.004 0.000 0.232 0.040 0.724
#> SRR1417873 2 0.3304 0.7645 0.016 0.816 0.000 0.168 0.000
#> SRR1394125 3 0.6017 0.4724 0.060 0.000 0.616 0.048 0.276
#> SRR1488388 1 0.1469 0.8471 0.948 0.000 0.000 0.016 0.036
#> SRR1401122 2 0.5070 0.5982 0.052 0.668 0.000 0.272 0.008
#> SRR612383 2 0.5052 0.4782 0.028 0.600 0.000 0.364 0.008
#> SRR1477711 1 0.0162 0.8485 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1350813 2 0.2773 0.8118 0.020 0.868 0.000 0.112 0.000
#> SRR612851 2 0.3106 0.8006 0.024 0.844 0.000 0.132 0.000
#> SRR1086349 1 0.0324 0.8488 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR812837 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 4 0.6945 0.3815 0.124 0.028 0.020 0.556 0.272
#> SRR1475885 1 0.7096 0.1370 0.408 0.028 0.000 0.384 0.180
#> SRR1376334 1 0.1741 0.8405 0.936 0.000 0.000 0.024 0.040
#> SRR1399821 1 0.6767 0.2007 0.428 0.008 0.000 0.368 0.196
#> SRR1347042 3 0.1331 0.7895 0.000 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR612323 2 0.5119 0.4268 0.028 0.576 0.000 0.388 0.008
#> SRR612604 2 0.3459 0.7516 0.016 0.832 0.000 0.136 0.016
#> SRR1389546 2 0.0771 0.8411 0.004 0.976 0.000 0.020 0.000
#> SRR1311877 1 0.0324 0.8494 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1465608 5 0.3894 0.7209 0.056 0.000 0.080 0.032 0.832
#> SRR1101808 2 0.0290 0.8410 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1414079 3 0.2426 0.7877 0.000 0.000 0.900 0.036 0.064
#> SRR1331153 2 0.3919 0.7642 0.076 0.816 0.000 0.100 0.008
#> SRR1078439 3 0.8114 0.0989 0.044 0.040 0.396 0.176 0.344
#> SRR2165527 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.1772 0.8263 0.940 0.032 0.000 0.020 0.008
#> SRR1313536 2 0.2208 0.8152 0.012 0.916 0.000 0.060 0.012
#> SRR1070308 1 0.3090 0.7792 0.876 0.052 0.000 0.056 0.016
#> SRR1403110 1 0.1818 0.8400 0.932 0.000 0.000 0.024 0.044
#> SRR1400355 2 0.0794 0.8397 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1401317 5 0.4496 0.6267 0.004 0.000 0.232 0.040 0.724
#> SRR1456862 1 0.5330 0.2343 0.532 0.000 0.008 0.036 0.424
#> SRR1074622 1 0.1469 0.8424 0.948 0.000 0.000 0.016 0.036
#> SRR1465847 5 0.5094 0.7082 0.068 0.000 0.176 0.028 0.728
#> SRR1443376 2 0.0162 0.8400 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1471312 3 0.2153 0.7780 0.000 0.000 0.916 0.040 0.044
#> SRR1075579 1 0.0451 0.8495 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1090881 2 0.7864 -0.2222 0.044 0.392 0.028 0.376 0.160
#> SRR612251 2 0.3350 0.7922 0.040 0.844 0.000 0.112 0.004
#> SRR1418581 1 0.0693 0.8489 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR658045 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613214 2 0.4957 0.5889 0.032 0.660 0.000 0.296 0.012
#> SRR613078 2 0.5814 0.5078 0.068 0.656 0.000 0.232 0.044
#> SRR1472998 5 0.5094 0.7082 0.068 0.000 0.176 0.028 0.728
#> SRR1433452 2 0.1430 0.8368 0.004 0.944 0.000 0.052 0.000
#> SRR1101957 1 0.0324 0.8494 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1487993 3 0.7340 0.2048 0.024 0.000 0.352 0.340 0.284
#> SRR1465983 2 0.0162 0.8402 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1380375 1 0.0794 0.8508 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1367566 3 0.3374 0.7723 0.004 0.000 0.844 0.044 0.108
#> SRR1316151 2 0.5231 0.6400 0.080 0.732 0.000 0.148 0.040
#> SRR1417547 2 0.5070 0.5982 0.052 0.668 0.000 0.272 0.008
#> SRR659389 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.3796 0.7673 0.076 0.820 0.000 0.100 0.004
#> SRR1398207 5 0.6143 0.6653 0.196 0.000 0.136 0.032 0.636
#> SRR1358755 5 0.4816 0.7067 0.060 0.000 0.168 0.024 0.748
#> SRR1078903 2 0.2286 0.8206 0.004 0.888 0.000 0.108 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.1041 0.8409 0.004 0.964 0.000 0.032 0.000
#> SRR1369172 1 0.5026 0.5743 0.656 0.000 0.000 0.064 0.280
#> SRR615982 2 0.2722 0.8152 0.020 0.872 0.000 0.108 0.000
#> SRR1480431 2 0.3527 0.7829 0.028 0.820 0.000 0.148 0.004
#> SRR1429825 2 0.2444 0.8133 0.012 0.904 0.000 0.068 0.016
#> SRR1102393 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 5 0.5747 0.6805 0.112 0.000 0.068 0.116 0.704
#> SRR808351 1 0.1914 0.8335 0.924 0.000 0.000 0.016 0.060
#> SRR1317513 1 0.0609 0.8502 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1480501 5 0.5170 0.7013 0.056 0.000 0.164 0.048 0.732
#> SRR1081910 5 0.5608 0.7140 0.120 0.000 0.160 0.028 0.692
#> SRR1086611 2 0.7110 0.3372 0.068 0.548 0.008 0.268 0.108
#> SRR1392571 2 0.3474 0.7949 0.028 0.832 0.000 0.132 0.008
#> SRR1311441 1 0.0451 0.8491 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR808152 1 0.1469 0.8425 0.948 0.000 0.000 0.016 0.036
#> SRR657313 3 0.5008 0.6584 0.000 0.000 0.708 0.140 0.152
#> SRR1433131 2 0.1153 0.8367 0.004 0.964 0.000 0.024 0.008
#> SRR1321011 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.1043 0.8384 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1389108 1 0.0579 0.8486 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1376228 3 0.2927 0.7789 0.000 0.000 0.868 0.040 0.092
#> SRR1399757 1 0.0404 0.8489 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1358060 3 0.2927 0.7789 0.000 0.000 0.868 0.040 0.092
#> SRR1464517 5 0.6042 0.5657 0.076 0.000 0.060 0.212 0.652
#> SRR613557 2 0.5315 0.5014 0.032 0.612 0.000 0.336 0.020
#> SRR809831 1 0.5262 0.3148 0.568 0.000 0.036 0.008 0.388
#> SRR1429387 3 0.0290 0.7832 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR816565 1 0.0162 0.8494 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071644 1 0.0290 0.8492 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1406936 5 0.6662 0.6619 0.128 0.004 0.108 0.124 0.636
#> SRR1072031 2 0.0000 0.8399 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.5119 0.4268 0.028 0.576 0.000 0.388 0.008
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 4 0.5740 0.17757 0.064 0.012 0.012 0.688 0.124 0.100
#> SRR1404105 1 0.1577 0.85088 0.940 0.000 0.000 0.008 0.036 0.016
#> SRR2164936 2 0.1462 0.80191 0.000 0.936 0.000 0.056 0.000 0.008
#> SRR1472057 5 0.3549 0.67216 0.000 0.000 0.084 0.032 0.828 0.056
#> SRR614491 4 0.4581 0.25718 0.004 0.448 0.000 0.524 0.004 0.020
#> SRR1069376 1 0.1053 0.86110 0.964 0.000 0.000 0.004 0.020 0.012
#> SRR811964 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0937 0.79857 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0458 0.85864 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1328073 1 0.3618 0.71451 0.812 0.032 0.000 0.124 0.000 0.032
#> SRR1394209 4 0.5120 0.33570 0.032 0.412 0.000 0.532 0.012 0.012
#> SRR1474018 2 0.0458 0.80140 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1099809 5 0.4221 0.65159 0.168 0.000 0.012 0.020 0.764 0.036
#> SRR1500555 2 0.4264 0.47382 0.000 0.636 0.000 0.332 0.000 0.032
#> SRR1354363 1 0.2263 0.83009 0.896 0.000 0.000 0.000 0.056 0.048
#> SRR1391619 3 0.4679 0.70568 0.000 0.000 0.696 0.224 0.056 0.024
#> SRR1307997 2 0.4520 0.59267 0.012 0.688 0.000 0.248 0.000 0.052
#> SRR663124 4 0.4237 0.39398 0.000 0.396 0.000 0.584 0.000 0.020
#> SRR1334670 1 0.1649 0.84602 0.932 0.000 0.000 0.000 0.032 0.036
#> SRR612515 4 0.4237 0.39398 0.000 0.396 0.000 0.584 0.000 0.020
#> SRR1092727 2 0.3053 0.72460 0.004 0.812 0.000 0.172 0.000 0.012
#> SRR1364013 2 0.3753 0.67726 0.004 0.748 0.000 0.220 0.000 0.028
#> SRR1468553 3 0.3270 0.81359 0.000 0.000 0.836 0.084 0.072 0.008
#> SRR1403980 3 0.3622 0.80744 0.008 0.000 0.820 0.092 0.072 0.008
#> SRR1420169 5 0.3527 0.70018 0.028 0.000 0.016 0.052 0.844 0.060
#> SRR1442800 6 0.4927 0.62219 0.128 0.012 0.000 0.104 0.028 0.728
#> SRR1359214 2 0.0458 0.80140 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1499849 5 0.4255 0.64816 0.172 0.000 0.012 0.020 0.760 0.036
#> SRR1500030 4 0.6765 -0.35285 0.000 0.000 0.340 0.436 0.140 0.084
#> SRR1093053 3 0.7989 0.17787 0.028 0.036 0.348 0.252 0.292 0.044
#> SRR1399843 5 0.5903 0.52122 0.044 0.000 0.028 0.296 0.584 0.048
#> SRR1380231 5 0.5608 0.63468 0.080 0.000 0.024 0.172 0.676 0.048
#> SRR809470 5 0.5296 0.58333 0.044 0.000 0.224 0.012 0.668 0.052
#> SRR614239 4 0.4237 0.39398 0.000 0.396 0.000 0.584 0.000 0.020
#> SRR613939 2 0.4198 0.63012 0.000 0.708 0.000 0.232 0.000 0.060
#> SRR612971 2 0.0260 0.79951 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.2165 0.77471 0.000 0.884 0.000 0.108 0.000 0.008
#> SRR811357 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0547 0.85829 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR613006 2 0.3138 0.75053 0.000 0.832 0.000 0.060 0.000 0.108
#> SRR1469570 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0363 0.80173 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1362906 4 0.6765 -0.35285 0.000 0.000 0.340 0.436 0.140 0.084
#> SRR1079023 1 0.0260 0.85742 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR813608 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 4 0.5227 0.13475 0.060 0.000 0.000 0.692 0.148 0.100
#> SRR1478700 5 0.4985 0.55450 0.212 0.000 0.004 0.016 0.680 0.088
#> SRR1081543 3 0.3570 0.77132 0.012 0.012 0.824 0.112 0.000 0.040
#> SRR1384754 4 0.5227 0.13475 0.060 0.000 0.000 0.692 0.148 0.100
#> SRR612287 2 0.0458 0.80102 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1380317 4 0.5120 0.33570 0.032 0.412 0.000 0.532 0.012 0.012
#> SRR1315247 6 0.5656 0.17611 0.004 0.296 0.016 0.088 0.008 0.588
#> SRR1105344 2 0.2579 0.76324 0.000 0.872 0.000 0.040 0.000 0.088
#> SRR658549 2 0.4264 0.47382 0.000 0.636 0.000 0.332 0.000 0.032
#> SRR1480240 1 0.1745 0.84940 0.924 0.000 0.000 0.000 0.056 0.020
#> SRR1084816 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.4600 -0.04861 0.028 0.500 0.000 0.468 0.000 0.004
#> SRR1419476 3 0.3962 0.76051 0.000 0.000 0.780 0.032 0.152 0.036
#> SRR1456075 5 0.5418 0.58075 0.040 0.000 0.008 0.276 0.624 0.052
#> SRR1389474 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.1921 0.84201 0.916 0.000 0.000 0.000 0.032 0.052
#> SRR1334419 1 0.0547 0.85829 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1417154 3 0.3370 0.80952 0.000 0.000 0.828 0.092 0.072 0.008
#> SRR1095985 6 0.4853 0.61395 0.116 0.004 0.000 0.108 0.040 0.732
#> SRR1325771 1 0.0363 0.85801 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1360420 3 0.0405 0.82515 0.000 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR660272 2 0.4830 0.63990 0.024 0.712 0.000 0.124 0.000 0.140
#> SRR1332993 1 0.1053 0.86025 0.964 0.000 0.000 0.004 0.020 0.012
#> SRR1311833 2 0.0146 0.80108 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR808044 5 0.4985 0.55450 0.212 0.000 0.004 0.016 0.680 0.088
#> SRR1076916 3 0.3910 0.78258 0.008 0.000 0.812 0.036 0.052 0.092
#> SRR1356266 1 0.1418 0.85546 0.944 0.000 0.000 0.000 0.024 0.032
#> SRR1341983 2 0.3563 0.73475 0.000 0.796 0.000 0.132 0.000 0.072
#> SRR1456114 1 0.5377 0.29241 0.548 0.000 0.000 0.004 0.336 0.112
#> SRR1072948 3 0.1092 0.83079 0.000 0.000 0.960 0.020 0.020 0.000
#> SRR1472370 5 0.3549 0.67216 0.000 0.000 0.084 0.032 0.828 0.056
#> SRR1480176 1 0.3648 0.65358 0.740 0.000 0.000 0.004 0.240 0.016
#> SRR613843 2 0.1921 0.79127 0.000 0.916 0.000 0.032 0.000 0.052
#> SRR1469192 1 0.3936 0.65881 0.736 0.000 0.000 0.012 0.228 0.024
#> SRR1404555 3 0.2144 0.81347 0.000 0.000 0.908 0.040 0.004 0.048
#> SRR659839 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0717 0.80192 0.000 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR1362848 4 0.5227 0.13475 0.060 0.000 0.000 0.692 0.148 0.100
#> SRR1407492 4 0.4237 0.39398 0.000 0.396 0.000 0.584 0.000 0.020
#> SRR1455082 2 0.3993 0.59920 0.004 0.700 0.000 0.272 0.000 0.024
#> SRR658362 2 0.2165 0.78277 0.000 0.884 0.000 0.108 0.000 0.008
#> SRR810921 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0713 0.80163 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.4653 0.00215 0.000 0.000 0.484 0.012 0.484 0.020
#> SRR818232 1 0.2190 0.83107 0.900 0.000 0.000 0.000 0.040 0.060
#> SRR1454868 4 0.5295 0.53763 0.032 0.216 0.008 0.684 0.036 0.024
#> SRR1474816 2 0.0146 0.80097 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1342002 1 0.2214 0.82688 0.892 0.000 0.000 0.004 0.092 0.012
#> SRR1088437 2 0.1411 0.79247 0.004 0.936 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1466400 2 0.5077 0.25877 0.004 0.524 0.000 0.068 0.000 0.404
#> SRR658921 2 0.5157 0.18135 0.004 0.484 0.000 0.072 0.000 0.440
#> SRR1499873 2 0.1285 0.79745 0.004 0.944 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0547 0.85829 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1090145 1 0.2429 0.82018 0.888 0.008 0.000 0.008 0.008 0.088
#> SRR1379324 1 0.5715 0.21081 0.516 0.000 0.000 0.004 0.316 0.164
#> SRR1345307 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.2908 0.82093 0.000 0.000 0.864 0.048 0.076 0.012
#> SRR1086280 3 0.3962 0.76051 0.000 0.000 0.780 0.032 0.152 0.036
#> SRR1454891 2 0.3788 0.59201 0.004 0.704 0.000 0.280 0.000 0.012
#> SRR663185 2 0.0713 0.80163 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR811819 1 0.2313 0.81337 0.884 0.000 0.000 0.004 0.100 0.012
#> SRR1318920 6 0.4766 0.60445 0.316 0.000 0.000 0.000 0.072 0.612
#> SRR656758 2 0.1124 0.80353 0.000 0.956 0.000 0.036 0.000 0.008
#> SRR1474351 1 0.0260 0.85742 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR660450 2 0.4830 0.63990 0.024 0.712 0.000 0.124 0.000 0.140
#> SRR1472687 2 0.3522 0.73774 0.000 0.800 0.000 0.128 0.000 0.072
#> SRR1334291 2 0.1757 0.79079 0.000 0.916 0.000 0.076 0.000 0.008
#> SRR1415153 2 0.1398 0.79626 0.000 0.940 0.000 0.052 0.000 0.008
#> SRR1323271 2 0.2178 0.76449 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.2999 0.74706 0.000 0.840 0.000 0.048 0.000 0.112
#> SRR1443161 5 0.6750 0.38333 0.036 0.028 0.036 0.392 0.460 0.048
#> SRR614695 2 0.5288 0.34250 0.000 0.552 0.000 0.100 0.004 0.344
#> SRR1092372 6 0.4704 0.61746 0.300 0.000 0.000 0.000 0.072 0.628
#> SRR1474577 1 0.0547 0.85829 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1406582 1 0.0547 0.85829 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR612779 2 0.3632 0.67255 0.012 0.756 0.000 0.220 0.000 0.012
#> SRR1089006 1 0.0547 0.85829 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1354071 1 0.4173 0.74143 0.800 0.012 0.000 0.044 0.068 0.076
#> SRR1105463 5 0.4428 0.55941 0.228 0.000 0.016 0.000 0.708 0.048
#> SRR811005 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.2129 0.83392 0.904 0.000 0.000 0.000 0.040 0.056
#> SRR1325871 3 0.4679 0.70568 0.000 0.000 0.696 0.224 0.056 0.024
#> SRR1355415 5 0.4611 0.65296 0.024 0.000 0.056 0.020 0.752 0.148
#> SRR1090861 1 0.0363 0.85801 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1320712 4 0.4736 0.53043 0.040 0.216 0.000 0.704 0.004 0.036
#> SRR1470075 1 0.2190 0.83304 0.900 0.000 0.000 0.000 0.040 0.060
#> SRR1091254 1 0.1168 0.85922 0.956 0.000 0.000 0.000 0.016 0.028
#> SRR1101397 5 0.3774 0.66477 0.124 0.000 0.004 0.016 0.804 0.052
#> SRR1321165 6 0.4687 0.62008 0.296 0.000 0.000 0.000 0.072 0.632
#> SRR1092112 5 0.5323 0.19319 0.004 0.000 0.404 0.024 0.524 0.044
#> SRR1417588 3 0.0291 0.82493 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1074790 1 0.2328 0.80976 0.904 0.032 0.000 0.020 0.000 0.044
#> SRR1432106 2 0.1349 0.79435 0.004 0.940 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0146 0.80043 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.5449 0.14941 0.500 0.000 0.000 0.004 0.388 0.108
#> SRR1318582 2 0.1398 0.79626 0.000 0.940 0.000 0.052 0.000 0.008
#> SRR1080484 2 0.1327 0.79802 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1072749 5 0.5491 0.46277 0.308 0.000 0.016 0.036 0.600 0.040
#> SRR1078586 1 0.0622 0.86036 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1400333 2 0.6546 0.29278 0.020 0.544 0.000 0.204 0.036 0.196
#> SRR1078834 2 0.6390 0.27676 0.012 0.528 0.000 0.176 0.028 0.256
#> SRR1417611 2 0.3323 0.62779 0.008 0.752 0.000 0.240 0.000 0.000
#> SRR1396840 6 0.5208 0.56539 0.236 0.000 0.000 0.000 0.156 0.608
#> SRR1465440 2 0.0260 0.79951 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.2384 0.76569 0.000 0.884 0.000 0.032 0.000 0.084
#> SRR614984 4 0.4282 0.33434 0.000 0.420 0.000 0.560 0.000 0.020
#> SRR1324269 1 0.4541 0.26340 0.556 0.000 0.004 0.004 0.416 0.020
#> SRR1401491 2 0.2579 0.76324 0.000 0.872 0.000 0.040 0.000 0.088
#> SRR1319443 1 0.3834 0.72042 0.776 0.000 0.000 0.000 0.108 0.116
#> SRR1324349 2 0.3564 0.70166 0.008 0.772 0.000 0.200 0.000 0.020
#> SRR1345523 2 0.0146 0.79998 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.2263 0.83009 0.896 0.000 0.000 0.000 0.056 0.048
#> SRR661505 3 0.6512 0.27484 0.000 0.000 0.452 0.144 0.348 0.056
#> SRR1419062 5 0.7287 0.36218 0.072 0.000 0.256 0.152 0.480 0.040
#> SRR1480131 5 0.5018 0.27338 0.396 0.000 0.000 0.004 0.536 0.064
#> SRR1421284 2 0.4602 -0.07922 0.028 0.492 0.000 0.476 0.000 0.004
#> SRR1329624 1 0.0622 0.86021 0.980 0.000 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1315739 3 0.1972 0.82789 0.000 0.000 0.916 0.024 0.056 0.004
#> SRR1099189 2 0.3808 0.59002 0.004 0.700 0.000 0.284 0.000 0.012
#> SRR1083286 1 0.1890 0.84591 0.916 0.000 0.000 0.000 0.060 0.024
#> SRR1091890 4 0.6318 0.12481 0.044 0.008 0.076 0.652 0.132 0.088
#> SRR1347436 2 0.5322 0.43237 0.008 0.612 0.000 0.296 0.020 0.064
#> SRR1327473 1 0.3098 0.77397 0.860 0.032 0.000 0.052 0.000 0.056
#> SRR1338195 3 0.0146 0.82488 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0291 0.80095 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1457792 1 0.1320 0.85335 0.948 0.000 0.000 0.000 0.016 0.036
#> SRR658271 2 0.0363 0.80113 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1339597 5 0.4662 0.55539 0.192 0.000 0.000 0.008 0.700 0.100
#> SRR1454842 3 0.4588 0.73875 0.000 0.000 0.740 0.108 0.124 0.028
#> SRR1322643 1 0.0458 0.85864 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR614887 3 0.0146 0.82488 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1354620 5 0.3396 0.67930 0.012 0.000 0.056 0.020 0.848 0.064
#> SRR615056 2 0.3629 0.60181 0.016 0.724 0.000 0.260 0.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.3510 0.73874 0.828 0.032 0.000 0.096 0.000 0.044
#> SRR1391529 1 0.1995 0.83644 0.912 0.000 0.000 0.000 0.036 0.052
#> SRR663052 2 0.1643 0.79525 0.000 0.924 0.000 0.068 0.000 0.008
#> SRR1478834 1 0.2001 0.84054 0.912 0.000 0.000 0.000 0.048 0.040
#> SRR812366 2 0.3615 0.71182 0.004 0.796 0.000 0.060 0.000 0.140
#> SRR1435330 3 0.2456 0.82511 0.000 0.000 0.888 0.076 0.028 0.008
#> SRR615383 2 0.0405 0.80185 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1389157 4 0.4714 0.18967 0.008 0.460 0.000 0.508 0.008 0.016
#> SRR613568 2 0.4830 0.63990 0.024 0.712 0.000 0.124 0.000 0.140
#> SRR614095 2 0.3813 0.62797 0.020 0.736 0.000 0.236 0.000 0.008
#> SRR1103092 1 0.2214 0.83094 0.888 0.000 0.000 0.000 0.096 0.016
#> SRR1337155 6 0.8823 -0.08253 0.012 0.272 0.084 0.196 0.156 0.280
#> SRR1475345 2 0.0260 0.79951 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0146 0.80043 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1446180 6 0.5731 0.18342 0.004 0.292 0.016 0.088 0.012 0.588
#> SRR1406372 2 0.2509 0.76356 0.000 0.876 0.000 0.036 0.000 0.088
#> SRR1339880 4 0.6765 -0.35285 0.000 0.000 0.340 0.436 0.140 0.084
#> SRR1353136 4 0.5295 0.53763 0.032 0.216 0.008 0.684 0.036 0.024
#> SRR1093906 3 0.0291 0.82493 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR614035 2 0.0146 0.79998 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.3141 0.78021 0.836 0.000 0.000 0.004 0.112 0.048
#> SRR1363926 4 0.4853 0.32509 0.032 0.420 0.000 0.536 0.004 0.008
#> SRR1399861 4 0.4576 0.54131 0.032 0.212 0.000 0.720 0.020 0.016
#> SRR1338789 6 0.5945 0.29804 0.396 0.000 0.000 0.004 0.184 0.416
#> SRR1421420 5 0.6818 0.13555 0.032 0.000 0.344 0.140 0.452 0.032
#> SRR1420832 2 0.0790 0.80115 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0146 0.85747 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1352870 4 0.6016 0.41453 0.016 0.364 0.004 0.524 0.044 0.048
#> SRR1315041 2 0.3161 0.66338 0.008 0.776 0.000 0.216 0.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0458 0.80137 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1443268 5 0.3774 0.66477 0.124 0.000 0.004 0.016 0.804 0.052
#> SRR1416617 3 0.3270 0.81359 0.000 0.000 0.836 0.084 0.072 0.008
#> SRR1102443 1 0.0547 0.85829 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR655672 4 0.4237 0.39398 0.000 0.396 0.000 0.584 0.000 0.020
#> SRR1420006 3 0.0405 0.82457 0.000 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1458267 2 0.1757 0.79079 0.000 0.916 0.000 0.076 0.000 0.008
#> SRR613819 2 0.4263 0.32236 0.024 0.600 0.000 0.376 0.000 0.000
#> SRR1469432 2 0.0363 0.80024 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0458 0.80137 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.3726 0.66862 0.004 0.752 0.000 0.216 0.000 0.028
#> SRR1470727 1 0.4152 0.60444 0.700 0.000 0.000 0.012 0.264 0.024
#> SRR1339153 3 0.5058 0.70034 0.000 0.000 0.684 0.192 0.092 0.032
#> SRR1472749 3 0.5345 0.68922 0.000 0.000 0.680 0.124 0.140 0.056
#> SRR1414379 4 0.4825 0.18385 0.028 0.460 0.000 0.500 0.004 0.008
#> SRR1431326 1 0.0260 0.85883 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1487278 2 0.5083 0.24899 0.004 0.520 0.000 0.068 0.000 0.408
#> SRR1098312 4 0.5948 0.14413 0.072 0.008 0.020 0.672 0.132 0.096
#> SRR810273 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.2404 0.76968 0.000 0.872 0.000 0.112 0.000 0.016
#> SRR614467 2 0.2902 0.70640 0.004 0.800 0.000 0.196 0.000 0.000
#> SRR811471 1 0.2384 0.82813 0.888 0.000 0.000 0.000 0.048 0.064
#> SRR1478341 3 0.0291 0.82607 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1088606 6 0.4724 0.62325 0.124 0.004 0.000 0.084 0.044 0.744
#> SRR1479699 4 0.5989 0.08759 0.048 0.004 0.024 0.652 0.164 0.108
#> SRR1403589 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.3825 0.70935 0.000 0.768 0.000 0.160 0.000 0.072
#> SRR1359803 1 0.3878 0.71501 0.772 0.000 0.000 0.000 0.116 0.112
#> SRR1338988 2 0.0363 0.80083 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.3615 0.71182 0.004 0.796 0.000 0.060 0.000 0.140
#> SRR1378992 1 0.0547 0.85829 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR659427 4 0.6700 0.31728 0.044 0.128 0.004 0.564 0.224 0.036
#> SRR1096638 1 0.1820 0.84457 0.928 0.000 0.000 0.012 0.044 0.016
#> SRR1466619 2 0.3525 0.72870 0.004 0.808 0.000 0.068 0.000 0.120
#> SRR659307 4 0.4581 0.25718 0.004 0.448 0.000 0.524 0.004 0.020
#> SRR1439994 5 0.3341 0.68974 0.028 0.000 0.028 0.016 0.852 0.076
#> SRR1454931 1 0.4313 0.66407 0.728 0.000 0.000 0.000 0.148 0.124
#> SRR1332928 5 0.4159 0.68210 0.064 0.000 0.004 0.096 0.792 0.044
#> SRR658621 2 0.3738 0.56627 0.016 0.704 0.000 0.280 0.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.0820 0.86188 0.972 0.000 0.000 0.000 0.016 0.012
#> SRR1458243 5 0.5285 0.47740 0.244 0.000 0.004 0.008 0.628 0.116
#> SRR1374270 4 0.4841 0.34547 0.032 0.412 0.000 0.544 0.004 0.008
#> SRR1470947 2 0.0790 0.80115 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.5157 0.18135 0.004 0.484 0.000 0.072 0.000 0.440
#> SRR662787 2 0.1471 0.79402 0.004 0.932 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1408727 4 0.5065 0.44983 0.036 0.356 0.000 0.584 0.012 0.012
#> SRR1456274 4 0.6590 0.00476 0.152 0.008 0.008 0.592 0.136 0.104
#> SRR817744 1 0.0146 0.85747 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1478744 2 0.0632 0.80094 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0146 0.79998 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1102680 5 0.5608 0.63468 0.080 0.000 0.024 0.172 0.676 0.048
#> SRR1374198 6 0.4687 0.62008 0.296 0.000 0.000 0.000 0.072 0.632
#> SRR1445856 5 0.4662 0.55539 0.192 0.000 0.000 0.008 0.700 0.100
#> SRR820049 3 0.6874 0.48917 0.004 0.028 0.512 0.264 0.152 0.040
#> SRR1375290 4 0.6843 0.49756 0.012 0.288 0.012 0.512 0.116 0.060
#> SRR818999 5 0.4315 0.57279 0.220 0.000 0.016 0.000 0.720 0.044
#> SRR1390242 1 0.0405 0.85835 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1401164 2 0.3138 0.74714 0.000 0.832 0.000 0.060 0.000 0.108
#> SRR1454629 1 0.5911 0.07116 0.464 0.000 0.000 0.000 0.296 0.240
#> SRR1332187 3 0.1592 0.82304 0.000 0.000 0.940 0.032 0.008 0.020
#> SRR603365 3 0.3737 0.76380 0.000 0.000 0.800 0.028 0.136 0.036
#> SRR657833 2 0.4239 0.69467 0.008 0.748 0.000 0.156 0.000 0.088
#> SRR1436207 2 0.3154 0.71622 0.004 0.800 0.000 0.184 0.000 0.012
#> SRR1488017 1 0.0260 0.85742 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR612947 2 0.0458 0.80337 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.3987 0.64684 0.728 0.000 0.000 0.012 0.236 0.024
#> SRR1364761 2 0.1845 0.79092 0.004 0.916 0.000 0.072 0.000 0.008
#> SRR1308086 4 0.5509 0.11229 0.036 0.000 0.024 0.684 0.160 0.096
#> SRR1441868 1 0.0458 0.85864 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1485380 5 0.5090 0.41546 0.000 0.000 0.292 0.024 0.624 0.060
#> SRR1073705 1 0.0547 0.85829 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR615032 2 0.0260 0.79951 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0790 0.80115 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.1196 0.79840 0.000 0.952 0.000 0.040 0.000 0.008
#> SRR1100346 2 0.4589 0.13069 0.008 0.540 0.000 0.432 0.004 0.016
#> SRR1332816 1 0.0547 0.85829 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR612299 2 0.5414 0.17366 0.004 0.476 0.000 0.100 0.000 0.420
#> SRR1407386 1 0.1334 0.85583 0.948 0.000 0.000 0.000 0.020 0.032
#> SRR1418064 2 0.0146 0.80097 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1309403 1 0.4321 0.70973 0.792 0.024 0.000 0.088 0.032 0.064
#> SRR1498395 2 0.1584 0.79453 0.000 0.928 0.000 0.064 0.000 0.008
#> SRR1079998 5 0.3218 0.70257 0.040 0.000 0.024 0.020 0.864 0.052
#> SRR1498885 2 0.2703 0.72819 0.004 0.824 0.000 0.172 0.000 0.000
#> SRR1337215 2 0.4816 0.63874 0.024 0.712 0.000 0.112 0.000 0.152
#> SRR1414749 3 0.3109 0.81735 0.000 0.000 0.848 0.076 0.068 0.008
#> SRR1365963 5 0.3294 0.69018 0.036 0.000 0.008 0.044 0.856 0.056
#> SRR1368030 2 0.4527 0.02685 0.024 0.516 0.000 0.456 0.000 0.004
#> SRR1419760 2 0.5529 0.34548 0.012 0.576 0.000 0.328 0.020 0.064
#> SRR1381841 1 0.5751 0.17412 0.504 0.000 0.000 0.000 0.288 0.208
#> SRR821388 4 0.5705 0.17522 0.072 0.012 0.008 0.688 0.124 0.096
#> SRR657623 2 0.3758 0.56404 0.016 0.700 0.000 0.284 0.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.5058 0.70867 0.000 0.000 0.688 0.180 0.100 0.032
#> SRR819583 5 0.3776 0.66003 0.000 0.000 0.104 0.028 0.808 0.060
#> SRR1096149 1 0.4257 0.62811 0.724 0.000 0.000 0.008 0.212 0.056
#> SRR1342829 3 0.0405 0.82515 0.000 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1353028 1 0.2794 0.80486 0.860 0.000 0.000 0.000 0.060 0.080
#> SRR811333 5 0.4321 0.70085 0.080 0.000 0.096 0.020 0.784 0.020
#> SRR1311666 2 0.0260 0.80217 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.4198 0.63012 0.000 0.708 0.000 0.232 0.000 0.060
#> SRR1446436 2 0.1757 0.79079 0.000 0.916 0.000 0.076 0.000 0.008
#> SRR815092 1 0.0405 0.85835 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1500149 2 0.2954 0.74909 0.000 0.844 0.000 0.048 0.000 0.108
#> SRR1100564 1 0.2512 0.82756 0.880 0.000 0.000 0.000 0.060 0.060
#> SRR1403072 3 0.0909 0.82319 0.000 0.000 0.968 0.012 0.000 0.020
#> SRR811653 4 0.4576 0.54131 0.032 0.212 0.000 0.720 0.020 0.016
#> SRR1311348 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.1471 0.79228 0.004 0.932 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.5088 0.24462 0.004 0.516 0.000 0.068 0.000 0.412
#> SRR1421444 3 0.0520 0.82571 0.000 0.000 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR1344010 2 0.0260 0.79951 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0458 0.85864 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1444763 6 0.5296 0.25292 0.448 0.000 0.000 0.000 0.100 0.452
#> SRR1415026 2 0.0865 0.79980 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.2500 0.77043 0.004 0.868 0.000 0.116 0.000 0.012
#> SRR1485499 2 0.0363 0.80049 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0260 0.79951 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.2703 0.72819 0.004 0.824 0.000 0.172 0.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.3468 0.59381 0.008 0.728 0.000 0.264 0.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.3049 0.78883 0.844 0.000 0.000 0.004 0.104 0.048
#> SRR1453950 1 0.2415 0.81924 0.888 0.000 0.000 0.012 0.084 0.016
#> SRR1087875 1 0.0547 0.85829 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR613318 4 0.4707 0.50267 0.016 0.312 0.000 0.640 0.008 0.024
#> SRR1332694 1 0.0820 0.86025 0.972 0.000 0.000 0.000 0.016 0.012
#> SRR1468469 3 0.2808 0.82113 0.000 0.000 0.868 0.048 0.076 0.008
#> SRR818670 2 0.1674 0.79332 0.004 0.924 0.000 0.068 0.000 0.004
#> SRR1120318 1 0.1802 0.84701 0.916 0.000 0.000 0.000 0.072 0.012
#> SRR1311622 5 0.5418 0.58075 0.040 0.000 0.008 0.276 0.624 0.052
#> SRR1500931 5 0.3866 0.65505 0.000 0.000 0.112 0.028 0.800 0.060
#> SRR1387494 4 0.5927 0.05954 0.032 0.004 0.020 0.640 0.184 0.120
#> SRR1379175 4 0.5369 0.52672 0.036 0.288 0.000 0.624 0.028 0.024
#> SRR1401909 5 0.4611 0.65296 0.024 0.000 0.056 0.020 0.752 0.148
#> SRR1440541 2 0.1700 0.77879 0.028 0.936 0.000 0.012 0.000 0.024
#> SRR1068832 5 0.3544 0.67173 0.000 0.000 0.068 0.028 0.828 0.076
#> SRR1376640 2 0.4023 0.61003 0.004 0.704 0.000 0.264 0.000 0.028
#> SRR1085712 2 0.0146 0.79998 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.6420 -0.25055 0.384 0.000 0.004 0.008 0.284 0.320
#> SRR1084276 5 0.4664 0.02043 0.476 0.000 0.004 0.000 0.488 0.032
#> SRR1353262 2 0.0993 0.80160 0.000 0.964 0.000 0.024 0.000 0.012
#> SRR1437035 1 0.4173 0.74143 0.800 0.012 0.000 0.044 0.068 0.076
#> SRR1396877 5 0.4829 0.02888 0.472 0.000 0.008 0.004 0.488 0.028
#> SRR1443026 2 0.0820 0.80172 0.000 0.972 0.000 0.016 0.000 0.012
#> SRR1417936 1 0.0622 0.86036 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1436822 2 0.3207 0.73537 0.004 0.828 0.000 0.044 0.000 0.124
#> SRR1101128 3 0.4695 0.29941 0.000 0.000 0.556 0.008 0.404 0.032
#> SRR1363886 2 0.0363 0.80083 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0146 0.79998 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.5374 0.24145 0.000 0.504 0.000 0.116 0.000 0.380
#> SRR1093218 3 0.6062 0.32590 0.004 0.000 0.500 0.116 0.352 0.028
#> SRR1077090 5 0.2680 0.68685 0.004 0.000 0.028 0.016 0.884 0.068
#> SRR1327430 4 0.4853 0.32509 0.032 0.420 0.000 0.536 0.004 0.008
#> SRR1088958 1 0.0547 0.85829 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1486931 2 0.3408 0.73151 0.000 0.800 0.000 0.152 0.000 0.048
#> SRR1086820 1 0.5378 0.13202 0.544 0.000 0.000 0.000 0.132 0.324
#> SRR1383000 1 0.2415 0.81924 0.888 0.000 0.000 0.012 0.084 0.016
#> SRR1355705 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614335 2 0.2595 0.73728 0.004 0.836 0.000 0.160 0.000 0.000
#> SRR660534 2 0.0717 0.80192 0.000 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR817094 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.3161 0.66338 0.008 0.776 0.000 0.216 0.000 0.000
#> SRR1456401 4 0.4771 0.28701 0.032 0.436 0.000 0.524 0.004 0.004
#> SRR1086393 1 0.1794 0.85513 0.924 0.000 0.000 0.000 0.036 0.040
#> SRR1351521 3 0.0405 0.82457 0.000 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1093100 2 0.4598 -0.02703 0.028 0.504 0.000 0.464 0.000 0.004
#> SRR1309382 1 0.1934 0.84195 0.916 0.000 0.000 0.000 0.040 0.044
#> SRR1089375 5 0.7159 0.37245 0.280 0.008 0.012 0.164 0.468 0.068
#> SRR1499482 2 0.3957 0.68062 0.012 0.752 0.000 0.200 0.000 0.036
#> SRR614719 2 0.4026 0.36914 0.000 0.612 0.000 0.376 0.000 0.012
#> SRR1081473 5 0.6132 0.62689 0.064 0.000 0.068 0.180 0.640 0.048
#> SRR1087415 1 0.5378 0.13202 0.544 0.000 0.000 0.000 0.132 0.324
#> SRR1088217 5 0.4865 0.60808 0.036 0.000 0.208 0.004 0.700 0.052
#> SRR808496 2 0.4765 -0.09949 0.024 0.488 0.000 0.476 0.004 0.008
#> SRR1336463 2 0.3718 0.72165 0.004 0.780 0.000 0.164 0.000 0.052
#> SRR612359 2 0.4168 0.28827 0.000 0.584 0.000 0.400 0.000 0.016
#> SRR1444412 1 0.4651 0.10289 0.516 0.000 0.004 0.000 0.448 0.032
#> SRR1074116 3 0.0964 0.82675 0.000 0.000 0.968 0.012 0.016 0.004
#> SRR821846 3 0.0146 0.82488 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0458 0.80337 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0820 0.85997 0.972 0.000 0.000 0.000 0.016 0.012
#> SRR1349099 6 0.5080 0.64893 0.216 0.000 0.000 0.048 0.060 0.676
#> SRR1337886 2 0.3825 0.70935 0.000 0.768 0.000 0.160 0.000 0.072
#> SRR813632 5 0.4583 0.60498 0.216 0.000 0.012 0.020 0.716 0.036
#> SRR1101591 5 0.4839 0.64631 0.040 0.000 0.168 0.032 0.732 0.028
#> SRR1089713 5 0.5721 0.61883 0.116 0.000 0.012 0.176 0.652 0.044
#> SRR1453127 3 0.1313 0.82956 0.000 0.000 0.952 0.016 0.028 0.004
#> SRR1498354 5 0.4391 0.59089 0.004 0.000 0.208 0.020 0.728 0.040
#> SRR1313831 1 0.1995 0.83580 0.912 0.000 0.000 0.000 0.036 0.052
#> SRR1315434 3 0.3284 0.80706 0.000 0.000 0.832 0.056 0.104 0.008
#> SRR814747 2 0.4064 0.44076 0.020 0.644 0.000 0.336 0.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0909 0.86092 0.968 0.000 0.000 0.000 0.020 0.012
#> SRR1367807 1 0.0547 0.85829 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1365791 6 0.6487 0.50854 0.088 0.004 0.140 0.100 0.040 0.628
#> SRR1081519 5 0.5176 0.59299 0.036 0.000 0.216 0.012 0.680 0.056
#> SRR614707 2 0.6331 0.26797 0.024 0.516 0.000 0.140 0.016 0.304
#> SRR1094027 1 0.0622 0.86036 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1489092 6 0.4873 0.61399 0.116 0.004 0.000 0.104 0.044 0.732
#> SRR1079502 5 0.5484 0.62899 0.096 0.000 0.012 0.180 0.672 0.040
#> SRR1457814 4 0.4576 0.54131 0.032 0.212 0.000 0.720 0.020 0.016
#> SRR1455127 2 0.0363 0.80024 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR615081 2 0.3207 0.73537 0.004 0.828 0.000 0.044 0.000 0.124
#> SRR1327855 5 0.3776 0.66003 0.000 0.000 0.104 0.028 0.808 0.060
#> SRR1417873 2 0.3323 0.62779 0.008 0.752 0.000 0.240 0.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.6204 0.52713 0.036 0.000 0.572 0.124 0.252 0.016
#> SRR1488388 1 0.1320 0.85335 0.948 0.000 0.000 0.000 0.016 0.036
#> SRR1401122 2 0.4527 0.01849 0.024 0.516 0.000 0.456 0.000 0.004
#> SRR612383 4 0.4282 0.33434 0.000 0.420 0.000 0.560 0.000 0.020
#> SRR1477711 1 0.0146 0.85747 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1350813 2 0.3726 0.66862 0.004 0.752 0.000 0.216 0.000 0.028
#> SRR612851 2 0.3924 0.62529 0.012 0.720 0.000 0.252 0.000 0.016
#> SRR1086349 1 0.0000 0.85798 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0260 0.79951 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1340010 4 0.5740 0.17757 0.064 0.012 0.012 0.688 0.124 0.100
#> SRR1475885 6 0.5086 0.65012 0.188 0.004 0.000 0.056 0.056 0.696
#> SRR1376334 1 0.1921 0.83737 0.916 0.000 0.000 0.000 0.032 0.052
#> SRR1399821 6 0.5080 0.64893 0.216 0.000 0.000 0.048 0.060 0.676
#> SRR1347042 3 0.1313 0.82956 0.000 0.000 0.952 0.016 0.028 0.004
#> SRR612323 4 0.4237 0.39398 0.000 0.396 0.000 0.584 0.000 0.020
#> SRR612604 2 0.3892 0.66043 0.000 0.752 0.000 0.060 0.000 0.188
#> SRR1389546 2 0.1615 0.79458 0.004 0.928 0.000 0.064 0.000 0.004
#> SRR1311877 1 0.0551 0.86006 0.984 0.000 0.000 0.004 0.004 0.008
#> SRR1465608 5 0.3424 0.68951 0.040 0.000 0.008 0.044 0.848 0.060
#> SRR1101808 2 0.0458 0.80337 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.2456 0.82511 0.000 0.000 0.888 0.076 0.028 0.008
#> SRR1331153 2 0.4830 0.63990 0.024 0.712 0.000 0.124 0.000 0.140
#> SRR1078439 3 0.7989 0.17787 0.028 0.036 0.348 0.252 0.292 0.044
#> SRR2165527 2 0.0547 0.80149 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.2195 0.82298 0.904 0.012 0.000 0.016 0.000 0.068
#> SRR1313536 2 0.2560 0.76680 0.000 0.872 0.000 0.036 0.000 0.092
#> SRR1070308 1 0.3098 0.77397 0.860 0.032 0.000 0.052 0.000 0.056
#> SRR1403110 1 0.1995 0.83644 0.912 0.000 0.000 0.000 0.036 0.052
#> SRR1400355 2 0.1584 0.79335 0.000 0.928 0.000 0.064 0.000 0.008
#> SRR1401317 5 0.3776 0.66003 0.000 0.000 0.104 0.028 0.808 0.060
#> SRR1456862 1 0.5681 0.13643 0.492 0.000 0.000 0.004 0.360 0.144
#> SRR1074622 1 0.1382 0.85365 0.948 0.000 0.000 0.008 0.036 0.008
#> SRR1465847 5 0.4130 0.70333 0.060 0.000 0.096 0.024 0.800 0.020
#> SRR1443376 2 0.0146 0.80092 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.1938 0.81691 0.000 0.000 0.920 0.036 0.004 0.040
#> SRR1075579 1 0.0405 0.85835 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1090881 4 0.6843 0.49756 0.012 0.288 0.012 0.512 0.116 0.060
#> SRR612251 2 0.3813 0.62797 0.020 0.736 0.000 0.236 0.000 0.008
#> SRR1418581 1 0.0458 0.85864 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR658045 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613214 2 0.4536 -0.07710 0.004 0.496 0.000 0.476 0.000 0.024
#> SRR613078 2 0.5018 0.32101 0.004 0.556 0.000 0.068 0.000 0.372
#> SRR1472998 5 0.4130 0.70333 0.060 0.000 0.096 0.024 0.800 0.020
#> SRR1433452 2 0.2263 0.77688 0.000 0.884 0.000 0.100 0.000 0.016
#> SRR1101957 1 0.0551 0.86006 0.984 0.000 0.000 0.004 0.004 0.008
#> SRR1487993 4 0.6765 -0.35285 0.000 0.000 0.340 0.436 0.140 0.084
#> SRR1465983 2 0.0632 0.80338 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0891 0.86039 0.968 0.000 0.000 0.000 0.024 0.008
#> SRR1367566 3 0.3511 0.81046 0.004 0.000 0.824 0.092 0.072 0.008
#> SRR1316151 2 0.5121 0.50525 0.032 0.652 0.000 0.068 0.000 0.248
#> SRR1417547 2 0.4527 0.01849 0.024 0.516 0.000 0.456 0.000 0.004
#> SRR659389 2 0.0146 0.80043 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.4756 0.64903 0.024 0.720 0.000 0.124 0.000 0.132
#> SRR1398207 5 0.5049 0.62253 0.176 0.000 0.064 0.004 0.704 0.052
#> SRR1358755 5 0.3875 0.68925 0.048 0.000 0.056 0.016 0.824 0.056
#> SRR1078903 2 0.3087 0.71960 0.004 0.808 0.000 0.176 0.000 0.012
#> SRR1323252 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.2019 0.78837 0.000 0.900 0.000 0.088 0.000 0.012
#> SRR1369172 1 0.5399 0.40783 0.600 0.000 0.000 0.004 0.220 0.176
#> SRR615982 2 0.3659 0.66863 0.012 0.752 0.000 0.224 0.000 0.012
#> SRR1480431 2 0.3808 0.59002 0.004 0.700 0.000 0.284 0.000 0.012
#> SRR1429825 2 0.2908 0.75781 0.000 0.848 0.000 0.048 0.000 0.104
#> SRR1102393 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 5 0.5105 0.65412 0.080 0.000 0.008 0.152 0.712 0.048
#> SRR808351 1 0.2015 0.83953 0.916 0.000 0.000 0.012 0.056 0.016
#> SRR1317513 1 0.0820 0.86025 0.972 0.000 0.000 0.000 0.016 0.012
#> SRR1480501 5 0.4258 0.70028 0.036 0.000 0.060 0.076 0.800 0.028
#> SRR1081910 5 0.4726 0.69143 0.112 0.000 0.092 0.020 0.752 0.024
#> SRR1086611 2 0.7167 -0.07805 0.012 0.416 0.000 0.264 0.060 0.248
#> SRR1392571 2 0.4484 0.59086 0.012 0.688 0.000 0.252 0.000 0.048
#> SRR1311441 1 0.0260 0.85883 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR808152 1 0.1577 0.85088 0.940 0.000 0.000 0.008 0.036 0.016
#> SRR657313 3 0.5143 0.69795 0.000 0.000 0.680 0.180 0.108 0.032
#> SRR1433131 2 0.1995 0.79029 0.000 0.912 0.000 0.036 0.000 0.052
#> SRR1321011 2 0.0260 0.79951 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0260 0.79951 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.2020 0.78139 0.000 0.896 0.000 0.096 0.000 0.008
#> SRR1389108 1 0.0547 0.85829 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1376228 3 0.3109 0.81735 0.000 0.000 0.848 0.076 0.068 0.008
#> SRR1399757 1 0.0363 0.85873 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1358060 3 0.3109 0.81735 0.000 0.000 0.848 0.076 0.068 0.008
#> SRR1464517 5 0.5787 0.52262 0.036 0.000 0.012 0.324 0.564 0.064
#> SRR613557 4 0.4581 0.25718 0.004 0.448 0.000 0.524 0.004 0.020
#> SRR809831 1 0.4541 0.26340 0.556 0.000 0.004 0.004 0.416 0.020
#> SRR1429387 3 0.0291 0.82493 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR816565 1 0.0405 0.85861 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1071644 1 0.0260 0.85840 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1406936 5 0.5587 0.63864 0.088 0.000 0.028 0.172 0.676 0.036
#> SRR1072031 2 0.0000 0.80007 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 4 0.4237 0.39398 0.000 0.396 0.000 0.584 0.000 0.020
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.986 0.994 0.4968 0.504 0.504
#> 3 3 1.000 0.969 0.971 0.2906 0.829 0.668
#> 4 4 0.711 0.646 0.804 0.1355 0.908 0.748
#> 5 5 0.684 0.467 0.667 0.0728 0.866 0.571
#> 6 6 0.706 0.579 0.738 0.0475 0.867 0.498
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1394209 2 0.9954 0.147 0.460 0.540
#> SRR1474018 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1391619 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1403980 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1442800 1 0.1184 0.979 0.984 0.016
#> SRR1359214 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1093053 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1399843 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1380231 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1096736 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1478700 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1384754 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1380317 2 0.6801 0.780 0.180 0.820
#> SRR1315247 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1456075 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1417154 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1325771 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1360420 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1072948 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1362848 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1407492 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1454868 1 0.5294 0.862 0.880 0.120
#> SRR1474816 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR614695 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1325871 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1092112 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.0376 0.989 0.004 0.996
#> SRR1078834 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1419062 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1315739 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1091890 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1327473 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1338195 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR614887 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1354620 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1389157 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR613568 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1446180 1 0.1633 0.971 0.976 0.024
#> SRR1406372 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1353136 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1093906 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1399861 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1338789 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1421420 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1352870 2 0.8081 0.671 0.248 0.752
#> SRR1315041 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1420006 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1472749 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1478341 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1479699 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR659427 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1096638 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1439994 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1374270 2 0.6973 0.768 0.188 0.812
#> SRR1470947 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1456274 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR820049 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1375290 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR818999 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1332187 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR603365 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1485380 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1309403 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1414749 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1419760 1 0.8144 0.663 0.748 0.252
#> SRR1381841 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR821388 1 0.0376 0.991 0.996 0.004
#> SRR657623 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR819583 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1403072 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR811653 1 0.7219 0.749 0.800 0.200
#> SRR1311348 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR613318 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1468469 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1500931 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1379175 1 0.3733 0.920 0.928 0.072
#> SRR1401909 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1101128 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1093218 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1077090 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1101591 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1453127 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1315434 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1365791 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1081519 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR614707 2 0.0938 0.981 0.012 0.988
#> SRR1094027 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1079502 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1457814 2 0.8267 0.650 0.260 0.740
#> SRR1455127 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1475885 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1376334 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1347042 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.7219 0.750 0.200 0.800
#> SRR1403110 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1090881 1 0.8763 0.580 0.704 0.296
#> SRR612251 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1487993 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1367566 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1480501 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1086611 1 0.9460 0.428 0.636 0.364
#> SRR1392571 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR657313 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1376228 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1358060 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1464517 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR613557 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR809831 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1404105 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR614491 2 0.0592 0.984 0.000 0.988 0.012
#> SRR1069376 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0237 0.985 0.000 0.996 0.004
#> SRR1361415 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1345715 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 2 0.5497 0.605 0.292 0.708 0.000
#> SRR1394209 2 0.1905 0.975 0.016 0.956 0.028
#> SRR1474018 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1099809 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1354363 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1307997 2 0.0424 0.984 0.000 0.992 0.008
#> SRR663124 2 0.0592 0.984 0.000 0.988 0.012
#> SRR1334670 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0592 0.984 0.000 0.988 0.012
#> SRR1092727 2 0.0424 0.984 0.000 0.992 0.008
#> SRR1364013 2 0.0592 0.984 0.000 0.988 0.012
#> SRR1468553 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1403980 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1420169 3 0.3038 0.922 0.104 0.000 0.896
#> SRR1442800 2 0.5159 0.815 0.140 0.820 0.040
#> SRR1359214 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1499849 1 0.0592 0.980 0.988 0.000 0.012
#> SRR1500030 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1093053 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1399843 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1380231 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR809470 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR614239 2 0.0592 0.984 0.000 0.988 0.012
#> SRR613939 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR612971 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR1490204 2 0.0424 0.984 0.000 0.992 0.008
#> SRR811357 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1469570 2 0.0424 0.985 0.000 0.992 0.008
#> SRR1457354 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR1362906 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1079023 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0424 0.985 0.000 0.992 0.008
#> SRR1096736 1 0.0237 0.987 0.996 0.000 0.004
#> SRR1478700 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081543 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1384754 3 0.2878 0.930 0.096 0.000 0.904
#> SRR612287 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1380317 2 0.2050 0.964 0.028 0.952 0.020
#> SRR1315247 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1105344 2 0.1411 0.980 0.000 0.964 0.036
#> SRR658549 2 0.0592 0.983 0.000 0.988 0.012
#> SRR1480240 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0424 0.985 0.000 0.992 0.008
#> SRR612551 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR1358520 2 0.1163 0.984 0.000 0.972 0.028
#> SRR1419476 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1456075 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1389474 2 0.0424 0.985 0.000 0.992 0.008
#> SRR1367005 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1095985 3 0.3879 0.869 0.152 0.000 0.848
#> SRR1325771 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR660272 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1332993 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076916 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1356266 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0892 0.983 0.000 0.980 0.020
#> SRR1456114 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1472370 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1480176 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0892 0.980 0.000 0.980 0.020
#> SRR1469192 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR659839 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362848 3 0.1647 0.959 0.036 0.004 0.960
#> SRR1407492 2 0.0592 0.984 0.000 0.988 0.012
#> SRR1455082 2 0.0747 0.982 0.000 0.984 0.016
#> SRR658362 2 0.0592 0.985 0.000 0.988 0.012
#> SRR810921 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1456375 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR818232 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.1411 0.962 0.036 0.000 0.964
#> SRR1474816 2 0.0424 0.985 0.000 0.992 0.008
#> SRR1342002 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1466400 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR658921 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1499873 2 0.0424 0.985 0.000 0.992 0.008
#> SRR1101373 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1086280 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1454891 2 0.0592 0.984 0.000 0.988 0.012
#> SRR663185 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR811819 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1472687 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR1334291 2 0.0424 0.984 0.000 0.992 0.008
#> SRR1415153 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1368939 2 0.0892 0.980 0.000 0.980 0.020
#> SRR1443161 3 0.1529 0.965 0.040 0.000 0.960
#> SRR614695 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1092372 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.0237 0.987 0.996 0.000 0.004
#> SRR811005 2 0.0424 0.985 0.000 0.992 0.008
#> SRR1385319 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1355415 3 0.6260 0.289 0.448 0.000 0.552
#> SRR1090861 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.1163 0.984 0.000 0.972 0.028
#> SRR1470075 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0892 0.971 0.980 0.000 0.020
#> SRR1321165 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1417588 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1074790 2 0.3043 0.904 0.084 0.908 0.008
#> SRR1432106 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR655756 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1072749 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.1289 0.978 0.000 0.968 0.032
#> SRR1078834 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1417611 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1396840 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR1400530 2 0.1031 0.984 0.000 0.976 0.024
#> SRR614984 2 0.0592 0.984 0.000 0.988 0.012
#> SRR1324269 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.1411 0.980 0.000 0.964 0.036
#> SRR1319443 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.1163 0.983 0.000 0.972 0.028
#> SRR1345523 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR1500846 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1419062 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1480131 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.1163 0.984 0.000 0.972 0.028
#> SRR1329624 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1099189 2 0.0592 0.984 0.000 0.988 0.012
#> SRR1083286 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1347436 2 0.0747 0.983 0.000 0.984 0.016
#> SRR1327473 1 0.0237 0.987 0.996 0.000 0.004
#> SRR1338195 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR809698 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1322643 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1354620 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR615056 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1105320 1 0.0747 0.975 0.984 0.000 0.016
#> SRR1391529 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1478834 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.1411 0.980 0.000 0.964 0.036
#> SRR1435330 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR615383 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 2 0.0892 0.983 0.000 0.980 0.020
#> SRR613568 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR614095 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1103092 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 3 0.1031 0.951 0.024 0.000 0.976
#> SRR1475345 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR809089 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 3 0.3573 0.834 0.004 0.120 0.876
#> SRR1406372 2 0.1411 0.980 0.000 0.964 0.036
#> SRR1339880 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1353136 3 0.1643 0.969 0.044 0.000 0.956
#> SRR1093906 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR614035 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR1351104 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1399861 2 0.1163 0.984 0.000 0.972 0.028
#> SRR1338789 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1420832 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1476231 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.1315 0.932 0.008 0.020 0.972
#> SRR1315041 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR661877 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1443268 1 0.0892 0.971 0.980 0.000 0.020
#> SRR1416617 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1102443 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0592 0.984 0.000 0.988 0.012
#> SRR1420006 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1458267 2 0.0424 0.984 0.000 0.992 0.008
#> SRR613819 2 0.1163 0.984 0.000 0.972 0.028
#> SRR1469432 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR660907 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1465092 2 0.0424 0.984 0.000 0.992 0.008
#> SRR1470727 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.1529 0.965 0.040 0.000 0.960
#> SRR1472749 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1414379 2 0.1163 0.984 0.000 0.972 0.028
#> SRR1431326 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1098312 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR810273 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR614467 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR811471 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1088606 3 0.2625 0.922 0.084 0.000 0.916
#> SRR1479699 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1403589 2 0.0424 0.985 0.000 0.992 0.008
#> SRR812625 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1359803 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR1471222 2 0.1411 0.980 0.000 0.964 0.036
#> SRR1378992 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR659427 3 0.6437 0.717 0.048 0.220 0.732
#> SRR1096638 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.1529 0.979 0.000 0.960 0.040
#> SRR659307 3 0.1411 0.925 0.000 0.036 0.964
#> SRR1439994 1 0.5706 0.482 0.680 0.000 0.320
#> SRR1454931 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 3 0.5138 0.727 0.252 0.000 0.748
#> SRR658621 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1095840 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374270 2 0.1163 0.984 0.000 0.972 0.028
#> SRR1470947 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1365598 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR662787 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1408727 2 0.1163 0.984 0.000 0.972 0.028
#> SRR1456274 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1387379 2 0.0592 0.985 0.000 0.988 0.012
#> SRR1102680 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1374198 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0747 0.975 0.984 0.000 0.016
#> SRR820049 3 0.1529 0.965 0.040 0.000 0.960
#> SRR1375290 3 0.1529 0.965 0.040 0.000 0.960
#> SRR818999 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.1031 0.979 0.000 0.976 0.024
#> SRR1454629 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332187 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR603365 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR657833 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1436207 2 0.0237 0.984 0.000 0.996 0.004
#> SRR1488017 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1441868 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1073705 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR1452356 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1442983 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.0747 0.983 0.000 0.984 0.016
#> SRR1332816 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR612299 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1407386 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.5058 0.743 0.244 0.000 0.756
#> SRR1498885 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1337215 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1414749 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1365963 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1368030 2 0.1163 0.984 0.000 0.972 0.028
#> SRR1419760 2 0.1482 0.971 0.020 0.968 0.012
#> SRR1381841 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR821388 3 0.7366 0.301 0.036 0.400 0.564
#> SRR657623 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1094241 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR819583 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1096149 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1353028 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1311666 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1446436 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR815092 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1100564 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR811653 3 0.5060 0.791 0.028 0.156 0.816
#> SRR1311348 2 0.0424 0.985 0.000 0.992 0.008
#> SRR1489438 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1435442 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1421444 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1344010 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR1319520 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1416596 2 0.1529 0.980 0.000 0.960 0.040
#> SRR1485499 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1316078 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR663465 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1310094 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR663537 2 0.0424 0.985 0.000 0.992 0.008
#> SRR1486780 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR613318 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1332694 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR818670 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1500931 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1387494 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1379175 2 0.2050 0.964 0.028 0.952 0.020
#> SRR1401909 3 0.5254 0.711 0.264 0.000 0.736
#> SRR1440541 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR1068832 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1376640 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1085712 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR1082283 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.1411 0.980 0.000 0.964 0.036
#> SRR1437035 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0592 0.985 0.000 0.988 0.012
#> SRR1417936 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.1753 0.978 0.000 0.952 0.048
#> SRR1101128 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1363886 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR612983 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR1394366 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1093218 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1077090 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1327430 2 0.1163 0.984 0.000 0.972 0.028
#> SRR1088958 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0424 0.984 0.000 0.992 0.008
#> SRR1086820 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR614335 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR660534 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR1334265 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1456401 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1086393 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1093100 2 0.1163 0.984 0.000 0.972 0.028
#> SRR1309382 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0424 0.984 0.000 0.992 0.008
#> SRR614719 2 0.0592 0.984 0.000 0.988 0.012
#> SRR1081473 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1087415 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 3 0.4235 0.840 0.176 0.000 0.824
#> SRR808496 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1336463 2 0.1411 0.982 0.000 0.964 0.036
#> SRR612359 2 0.0747 0.983 0.000 0.984 0.016
#> SRR1444412 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR821846 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR656095 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0747 0.982 0.000 0.984 0.016
#> SRR813632 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1089713 1 0.6235 0.142 0.564 0.000 0.436
#> SRR1453127 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1498354 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1313831 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR814747 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1358539 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1081519 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR614707 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1094027 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1079502 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1457814 3 0.5202 0.707 0.008 0.220 0.772
#> SRR1455127 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR615081 2 0.1289 0.978 0.000 0.968 0.032
#> SRR1327855 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1417873 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1394125 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1488388 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR612383 2 0.0592 0.984 0.000 0.988 0.012
#> SRR1477711 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0424 0.984 0.000 0.992 0.008
#> SRR612851 2 0.0424 0.984 0.000 0.992 0.008
#> SRR1086349 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR1340010 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1475885 1 0.1163 0.960 0.972 0.000 0.028
#> SRR1376334 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR612323 2 0.0592 0.984 0.000 0.988 0.012
#> SRR612604 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1389546 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0237 0.987 0.996 0.000 0.004
#> SRR1101808 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1331153 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1078439 3 0.1529 0.965 0.040 0.000 0.960
#> SRR2165527 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR1351147 1 0.0237 0.987 0.996 0.000 0.004
#> SRR1313536 2 0.0892 0.982 0.000 0.980 0.020
#> SRR1070308 2 0.3755 0.861 0.120 0.872 0.008
#> SRR1403110 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1456862 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1443376 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1075579 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.4349 0.835 0.020 0.128 0.852
#> SRR612251 2 0.1163 0.984 0.000 0.972 0.028
#> SRR1418581 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 2 0.0747 0.983 0.000 0.984 0.016
#> SRR613078 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1472998 3 0.3412 0.901 0.124 0.000 0.876
#> SRR1433452 2 0.0424 0.984 0.000 0.992 0.008
#> SRR1101957 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1465983 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1316151 2 0.1529 0.978 0.000 0.960 0.040
#> SRR1417547 2 0.0892 0.984 0.000 0.980 0.020
#> SRR659389 2 0.0424 0.985 0.000 0.992 0.008
#> SRR1490270 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1398207 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358755 3 0.2356 0.952 0.072 0.000 0.928
#> SRR1078903 2 0.0424 0.984 0.000 0.992 0.008
#> SRR1323252 2 0.0424 0.985 0.000 0.992 0.008
#> SRR1451796 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0592 0.984 0.000 0.988 0.012
#> SRR1480431 2 0.0747 0.985 0.000 0.984 0.016
#> SRR1429825 2 0.1529 0.978 0.000 0.960 0.040
#> SRR1102393 2 0.0424 0.985 0.000 0.992 0.008
#> SRR1071313 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1081910 1 0.5785 0.465 0.668 0.000 0.332
#> SRR1086611 2 0.1399 0.977 0.004 0.968 0.028
#> SRR1392571 2 0.0592 0.984 0.000 0.988 0.012
#> SRR1311441 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1433131 2 0.1163 0.978 0.000 0.972 0.028
#> SRR1321011 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR1500598 2 0.0747 0.984 0.000 0.984 0.016
#> SRR1379343 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1399757 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1464517 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR613557 2 0.3941 0.828 0.000 0.844 0.156
#> SRR809831 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429387 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR816565 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.991 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.1753 0.972 0.048 0.000 0.952
#> SRR1072031 2 0.0424 0.985 0.000 0.992 0.008
#> SRR1374671 2 0.0592 0.984 0.000 0.988 0.012
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 3 0.2011 0.88734 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1404105 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0188 0.66278 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1472057 3 0.3688 0.85576 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR614491 4 0.6831 0.52150 0.000 0.420 0.100 0.480
#> SRR1069376 1 0.0336 0.92835 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR811964 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.3266 0.64993 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1345715 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1328073 4 0.7414 0.45122 0.188 0.320 0.000 0.492
#> SRR1394209 4 0.4814 0.48844 0.008 0.316 0.000 0.676
#> SRR1474018 2 0.3266 0.64993 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1099809 1 0.3801 0.82076 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1500555 4 0.4977 0.47443 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1354363 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1391619 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.4948 -0.34331 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR663124 2 0.4994 -0.40219 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1334670 1 0.0336 0.92802 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR612515 4 0.6745 0.51875 0.000 0.428 0.092 0.480
#> SRR1092727 2 0.4877 -0.28596 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR1364013 2 0.4961 -0.34418 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1468553 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420169 3 0.4831 0.82761 0.040 0.000 0.752 0.208
#> SRR1442800 4 0.5906 0.47425 0.064 0.292 0.000 0.644
#> SRR1359214 2 0.3266 0.64993 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1499849 1 0.3801 0.82076 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1500030 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093053 3 0.4008 0.71997 0.000 0.000 0.756 0.244
#> SRR1399843 3 0.3569 0.86536 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR1380231 3 0.3486 0.86752 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR809470 3 0.3801 0.84856 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR614239 2 0.4994 -0.40219 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR613939 4 0.4996 0.43977 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR612971 2 0.2921 0.65889 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1490204 2 0.4877 -0.28596 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR811357 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR613006 2 0.4916 -0.25177 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1469570 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.2921 0.65889 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1362906 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.3942 0.81768 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1478700 1 0.3975 0.82997 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1081543 3 0.1118 0.89463 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1384754 3 0.7493 0.34544 0.320 0.000 0.480 0.200
#> SRR612287 2 0.3074 0.65591 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1380317 4 0.4605 0.47996 0.000 0.336 0.000 0.664
#> SRR1315247 4 0.4955 0.47189 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1105344 2 0.3726 0.61152 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR658549 2 0.4985 -0.39358 0.000 0.532 0.000 0.468
#> SRR1480240 1 0.0592 0.92704 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1084816 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.2814 0.66150 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1358520 4 0.4830 0.42269 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1419476 3 0.0469 0.89870 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1456075 3 0.3610 0.86173 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1389474 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1334419 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1417154 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095985 3 0.6584 0.66066 0.096 0.000 0.568 0.336
#> SRR1325771 1 0.0188 0.92819 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1360420 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.4477 0.15322 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1332993 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808044 1 0.4008 0.82658 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR1076916 3 0.3356 0.87187 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1356266 1 0.0592 0.92908 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1341983 2 0.4697 0.08379 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR1456114 1 0.2011 0.91935 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1072948 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.3649 0.85800 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1480176 1 0.0188 0.92819 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR613843 2 0.2081 0.59636 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1469192 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.1022 0.64100 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1362848 4 0.5648 0.27158 0.008 0.020 0.356 0.616
#> SRR1407492 4 0.6700 0.51625 0.000 0.432 0.088 0.480
#> SRR1455082 2 0.4992 -0.40527 0.000 0.524 0.000 0.476
#> SRR658362 4 0.4925 0.39311 0.000 0.428 0.000 0.572
#> SRR810921 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.3266 0.64993 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1456375 3 0.2345 0.88664 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR818232 1 0.1637 0.91618 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1454868 4 0.4989 -0.00892 0.000 0.000 0.472 0.528
#> SRR1474816 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.3266 0.64993 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1466400 4 0.4989 0.45247 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR658921 2 0.4730 0.12122 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1499873 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1090145 1 0.1716 0.91542 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1379324 1 0.2216 0.91641 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1345307 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0188 0.89866 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1454891 2 0.4994 -0.40219 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR663185 2 0.3569 0.62848 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR811819 1 0.0336 0.92802 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1318920 1 0.2760 0.90857 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR656758 2 0.0336 0.65754 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1474351 1 0.0188 0.92819 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR660450 2 0.4916 -0.21631 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1472687 2 0.2973 0.65800 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1334291 2 0.4877 -0.28596 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR1415153 2 0.0592 0.65313 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1323271 2 0.3266 0.64993 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1368939 2 0.2081 0.59636 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1443161 4 0.4679 0.01928 0.000 0.000 0.352 0.648
#> SRR614695 4 0.4992 0.45057 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1092372 1 0.3024 0.90126 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1474577 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1406582 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR612779 2 0.3123 0.46569 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1089006 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1354071 1 0.3688 0.82876 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1105463 1 0.4018 0.81516 0.772 0.000 0.004 0.224
#> SRR811005 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.1792 0.91511 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1325871 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355415 3 0.7641 0.32159 0.324 0.000 0.452 0.224
#> SRR1090861 1 0.0188 0.92819 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1320712 4 0.4790 0.44122 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR1470075 1 0.1940 0.92034 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1091254 1 0.0336 0.92802 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1101397 1 0.4360 0.81637 0.744 0.000 0.008 0.248
#> SRR1321165 1 0.3726 0.86691 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1092112 3 0.3610 0.85951 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1417588 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.2081 0.59660 0.084 0.916 0.000 0.000
#> SRR1432106 2 0.3266 0.64993 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR655756 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.3266 0.88079 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1318582 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.3356 0.64538 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1072749 1 0.0921 0.92635 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1078586 1 0.0336 0.92802 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1400333 4 0.4776 0.53260 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1078834 4 0.4916 0.50408 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR1417611 2 0.3311 0.64788 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1396840 1 0.4431 0.79258 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1465440 2 0.2921 0.65889 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1400530 2 0.3024 0.65699 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR614984 4 0.6655 0.51248 0.000 0.440 0.084 0.476
#> SRR1324269 1 0.0469 0.92842 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1401491 2 0.3726 0.61152 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1319443 1 0.1211 0.92373 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1324349 2 0.4134 0.58253 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1345523 2 0.2647 0.66399 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1500846 1 0.1940 0.92034 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR661505 3 0.3356 0.87121 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1419062 3 0.3400 0.87052 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1480131 1 0.3266 0.86214 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1421284 4 0.4830 0.42269 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1329624 1 0.0336 0.92802 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1315739 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.4916 -0.29243 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1083286 1 0.1022 0.92533 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1091890 3 0.0469 0.89413 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1347436 2 0.4994 -0.40634 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1327473 1 0.1022 0.91917 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1338195 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR658271 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.3649 0.85858 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1454842 3 0.1637 0.87895 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1322643 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR614887 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354620 3 0.4018 0.84482 0.004 0.000 0.772 0.224
#> SRR615056 2 0.3311 0.64788 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1105320 1 0.3545 0.84480 0.828 0.000 0.008 0.164
#> SRR1391529 1 0.0592 0.92704 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR663052 2 0.4907 0.19817 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR1478834 1 0.0592 0.92704 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR812366 2 0.3486 0.61996 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1435330 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 4 0.6980 0.52902 0.000 0.400 0.116 0.484
#> SRR613568 2 0.4746 -0.05549 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR614095 2 0.3266 0.64993 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1103092 1 0.0817 0.92693 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1337155 4 0.4134 0.12983 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR1475345 2 0.2921 0.65889 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR809089 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 4 0.5380 0.42915 0.000 0.136 0.120 0.744
#> SRR1406372 2 0.3726 0.61152 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1339880 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353136 3 0.4500 0.58127 0.000 0.000 0.684 0.316
#> SRR1093906 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.2589 0.66451 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1351104 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1363926 2 0.4072 0.58559 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1399861 4 0.6141 0.49539 0.000 0.300 0.076 0.624
#> SRR1338789 1 0.3123 0.89554 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1421420 3 0.1022 0.89742 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1420832 2 0.3266 0.64993 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1476231 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 4 0.7039 0.39908 0.000 0.144 0.316 0.540
#> SRR1315041 2 0.3688 0.63009 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR661877 2 0.3266 0.64993 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1443268 1 0.4452 0.80700 0.732 0.000 0.008 0.260
#> SRR1416617 3 0.1022 0.89742 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1102443 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR655672 2 0.4994 -0.40219 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1420006 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.4888 -0.29536 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR613819 4 0.4830 0.42269 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1469432 2 0.3074 0.65591 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR660907 2 0.3074 0.65591 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1465092 2 0.4888 -0.29536 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1470727 1 0.0921 0.92712 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1339153 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414379 4 0.4804 0.43547 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR1431326 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1487278 2 0.4304 0.27092 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1098312 3 0.1867 0.89007 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR810273 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.4989 -0.38442 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR614467 4 0.5000 0.09712 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR811471 1 0.1557 0.92563 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1478341 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088606 4 0.6214 -0.39386 0.056 0.000 0.408 0.536
#> SRR1479699 3 0.2149 0.88322 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1403589 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812625 4 0.4992 0.42673 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1359803 1 0.1557 0.92007 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1338988 2 0.2921 0.65889 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1471222 4 0.4898 0.41360 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR1378992 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR659427 4 0.5179 0.45256 0.016 0.064 0.144 0.776
#> SRR1096638 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1466619 4 0.4746 0.40121 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR659307 4 0.6745 0.24526 0.000 0.092 0.428 0.480
#> SRR1439994 1 0.6352 0.67326 0.632 0.000 0.108 0.260
#> SRR1454931 1 0.2814 0.89049 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1332928 1 0.7840 0.03939 0.392 0.000 0.340 0.268
#> SRR658621 2 0.3356 0.64538 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1095840 1 0.0336 0.92802 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1458243 1 0.4072 0.82119 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1374270 4 0.4776 0.44652 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1470947 2 0.3074 0.65591 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1365598 4 0.4977 0.45333 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR662787 2 0.3266 0.64993 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1408727 4 0.4804 0.43547 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR1456274 1 0.4699 0.75883 0.676 0.000 0.004 0.320
#> SRR817744 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.3074 0.65591 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1387379 2 0.2149 0.66682 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1102680 3 0.3486 0.86870 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR1374198 1 0.2704 0.90983 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1445856 1 0.4567 0.80354 0.716 0.000 0.008 0.276
#> SRR820049 3 0.3123 0.80216 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1375290 3 0.5000 0.08814 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR818999 1 0.3801 0.82076 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1390242 1 0.0336 0.92802 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1401164 2 0.2647 0.56309 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1454629 1 0.4164 0.79091 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR1332187 3 0.0188 0.89866 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR603365 3 0.0707 0.89898 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR657833 2 0.4994 -0.39382 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1436207 2 0.4679 -0.14514 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1488017 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0707 0.65032 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1308086 3 0.1716 0.89250 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1441868 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1485380 3 0.2345 0.88664 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1073705 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR615032 2 0.2921 0.65889 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1452356 2 0.3356 0.64538 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1442983 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.5000 -0.43706 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR1332816 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR612299 4 0.4994 0.44428 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1407386 1 0.0336 0.92802 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1418064 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.3172 0.84928 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1498395 2 0.0817 0.64756 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1079998 3 0.6320 0.72506 0.140 0.000 0.656 0.204
#> SRR1498885 2 0.3311 0.64788 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1337215 4 0.4992 0.44970 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1414749 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365963 3 0.3870 0.85390 0.004 0.000 0.788 0.208
#> SRR1368030 4 0.4877 0.38769 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1419760 4 0.5590 0.49688 0.020 0.456 0.000 0.524
#> SRR1381841 1 0.3569 0.84915 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR821388 4 0.7261 0.48621 0.000 0.196 0.268 0.536
#> SRR657623 2 0.3356 0.64538 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1094241 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819583 3 0.3266 0.87381 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1096149 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1342829 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0336 0.92802 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR811333 3 0.3444 0.86900 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1311666 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.4994 -0.39382 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1446436 2 0.4989 -0.38485 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR815092 1 0.0336 0.92802 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1500149 2 0.3726 0.41626 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1100564 1 0.0592 0.92704 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1403072 3 0.0336 0.89861 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR811653 4 0.5860 0.27016 0.000 0.040 0.380 0.580
#> SRR1311348 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.3266 0.64993 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1435442 2 0.4830 -0.09024 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR1421444 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.2921 0.65889 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1319520 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1444763 1 0.3024 0.90126 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1415026 2 0.3074 0.65591 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1416596 2 0.4730 0.46133 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1485499 2 0.3074 0.65591 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1316078 2 0.2921 0.65889 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR663465 2 0.3311 0.64788 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1310094 2 0.3356 0.64693 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR663537 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1453950 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR613318 4 0.6570 0.51806 0.000 0.320 0.100 0.580
#> SRR1332694 1 0.0336 0.92802 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1468469 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0592 0.92704 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1311622 3 0.3172 0.87690 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR1500931 3 0.3074 0.87849 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1387494 3 0.1637 0.89330 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1379175 4 0.4522 0.48706 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR1401909 3 0.6685 0.68183 0.160 0.000 0.616 0.224
#> SRR1440541 2 0.2814 0.66254 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1068832 3 0.3870 0.85425 0.004 0.000 0.788 0.208
#> SRR1376640 4 0.4996 0.44179 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR1085712 2 0.2921 0.65889 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1082283 1 0.4431 0.79258 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1084276 1 0.3400 0.85360 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1353262 2 0.3444 0.62071 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1437035 1 0.2345 0.89829 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1396877 1 0.3486 0.84317 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1443026 2 0.1302 0.66635 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1417936 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.4994 0.14985 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1101128 3 0.2345 0.88664 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1363886 2 0.3074 0.65591 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR612983 2 0.2921 0.65889 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1394366 4 0.4994 0.44428 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1093218 3 0.2704 0.88622 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1077090 3 0.3688 0.85576 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1327430 4 0.4830 0.42269 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1088958 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1486931 2 0.4877 -0.28596 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR1086820 1 0.1867 0.92424 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1383000 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.2589 0.66451 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR614335 2 0.3569 0.62848 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR660534 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.2760 0.66236 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1334265 2 0.3444 0.64327 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1456401 2 0.3837 0.61558 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1086393 1 0.1792 0.92211 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1351521 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093100 4 0.4804 0.43590 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR1309382 1 0.0592 0.92704 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1089375 1 0.3486 0.84292 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1499482 2 0.4877 -0.28596 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR614719 2 0.4994 -0.40219 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1081473 3 0.3074 0.87861 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1087415 1 0.1940 0.92371 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1088217 3 0.6140 0.73896 0.096 0.000 0.652 0.252
#> SRR808496 4 0.4804 0.43547 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR1336463 4 0.4948 0.32104 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR612359 2 0.4994 -0.40634 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1444412 1 0.2647 0.89028 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1074116 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0592 0.92704 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1349099 1 0.4500 0.78233 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1337886 2 0.4804 -0.21992 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR813632 1 0.0336 0.92802 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1101591 3 0.3074 0.87860 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1089713 1 0.7211 0.46418 0.544 0.000 0.192 0.264
#> SRR1453127 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498354 3 0.3726 0.85310 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1313831 1 0.0592 0.92704 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1315434 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.3311 0.64788 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1358539 1 0.0336 0.92802 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1367807 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1365791 3 0.2530 0.88630 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1081519 3 0.3688 0.85573 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR614707 4 0.4916 0.48943 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR1094027 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.4164 0.82422 0.000 0.000 0.736 0.264
#> SRR1079502 3 0.3726 0.85647 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR1457814 4 0.5890 0.46185 0.000 0.072 0.268 0.660
#> SRR1455127 2 0.3266 0.64993 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR615081 2 0.4746 0.30676 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1327855 3 0.2345 0.88664 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1417873 2 0.4933 0.16637 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR1394125 3 0.1389 0.89696 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1488388 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1401122 2 0.3528 0.63203 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR612383 2 0.4994 -0.40219 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1477711 1 0.0336 0.92802 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1350813 2 0.4907 -0.30600 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR612851 2 0.4985 -0.39613 0.000 0.532 0.000 0.468
#> SRR1086349 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.2921 0.65889 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1340010 3 0.2760 0.85614 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1475885 4 0.5432 -0.07632 0.316 0.032 0.000 0.652
#> SRR1376334 1 0.0592 0.92704 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1399821 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1347042 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612323 4 0.6700 0.51638 0.000 0.432 0.088 0.480
#> SRR612604 2 0.4008 0.36879 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1389546 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.4103 0.81722 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR1101808 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.3764 0.40627 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1078439 3 0.3486 0.86715 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR2165527 2 0.3266 0.64993 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1351147 1 0.1716 0.91542 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1313536 2 0.1637 0.61883 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1070308 2 0.4985 0.41479 0.152 0.768 0.000 0.080
#> SRR1403110 1 0.0592 0.92704 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1400355 2 0.0817 0.64756 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1401317 3 0.3074 0.87853 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1456862 1 0.3649 0.85974 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1074622 1 0.1022 0.92698 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1465847 3 0.3400 0.86919 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1443376 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0336 0.92802 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1090881 4 0.7225 0.41286 0.000 0.160 0.328 0.512
#> SRR612251 4 0.4843 0.41417 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1418581 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR658045 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613214 2 0.4996 -0.40813 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR613078 4 0.4999 0.42196 0.000 0.492 0.000 0.508
#> SRR1472998 3 0.5221 0.81022 0.060 0.000 0.732 0.208
#> SRR1433452 2 0.4193 0.17861 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1101957 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0336 0.92802 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1367566 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316151 4 0.4624 0.49476 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR1417547 2 0.3356 0.64538 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR659389 2 0.0188 0.66278 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1490270 2 0.4730 -0.03977 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1398207 1 0.3801 0.82076 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1358755 3 0.5022 0.81887 0.044 0.000 0.736 0.220
#> SRR1078903 2 0.4877 -0.28596 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR1323252 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.2281 0.91550 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR615982 2 0.4992 -0.40045 0.000 0.524 0.000 0.476
#> SRR1480431 2 0.4898 0.08807 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR1429825 4 0.4585 0.45768 0.000 0.332 0.000 0.668
#> SRR1102393 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.4103 0.81878 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR808351 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0336 0.92802 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1480501 3 0.3172 0.87632 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR1081910 1 0.7200 0.44760 0.552 0.000 0.228 0.220
#> SRR1086611 4 0.4543 0.52892 0.000 0.324 0.000 0.676
#> SRR1392571 2 0.4992 -0.40045 0.000 0.524 0.000 0.476
#> SRR1311441 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR808152 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.1211 0.89768 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1433131 2 0.3873 0.38943 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1321011 2 0.2921 0.65889 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1500598 2 0.3024 0.65698 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1379343 2 0.1302 0.63071 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1389108 1 0.1474 0.92387 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1376228 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0188 0.92819 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1358060 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.3172 0.87690 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR613557 4 0.7404 0.52060 0.000 0.348 0.176 0.476
#> SRR809831 1 0.2216 0.90428 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1429387 3 0.0000 0.89864 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.92816 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.3356 0.87270 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1072031 2 0.0000 0.66250 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.4994 -0.40219 0.000 0.520 0.000 0.480
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 3 0.5904 0.71673 0.216 0.000 0.624 0.008 0.152
#> SRR1404105 1 0.4304 -0.06704 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR2164936 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1472057 3 0.6259 0.70991 0.336 0.000 0.556 0.048 0.060
#> SRR614491 4 0.6453 0.65226 0.000 0.096 0.080 0.628 0.196
#> SRR1069376 1 0.4297 -0.02813 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR811964 2 0.2773 0.67671 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1361415 2 0.3513 0.67875 0.000 0.800 0.000 0.020 0.180
#> SRR1345715 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1328073 4 0.6867 0.57178 0.048 0.108 0.000 0.484 0.360
#> SRR1394209 5 0.7310 -0.57582 0.032 0.220 0.000 0.344 0.404
#> SRR1474018 2 0.3438 0.68310 0.000 0.808 0.000 0.020 0.172
#> SRR1099809 1 0.3574 0.30725 0.804 0.000 0.000 0.028 0.168
#> SRR1500555 4 0.4457 0.67940 0.000 0.092 0.000 0.756 0.152
#> SRR1354363 1 0.4118 0.33443 0.660 0.000 0.000 0.004 0.336
#> SRR1391619 3 0.0290 0.81446 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1307997 4 0.5354 0.64909 0.000 0.192 0.000 0.668 0.140
#> SRR663124 4 0.5610 0.65892 0.000 0.176 0.000 0.640 0.184
#> SRR1334670 5 0.4294 0.21604 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR612515 4 0.6453 0.65226 0.000 0.096 0.080 0.628 0.196
#> SRR1092727 4 0.5265 0.58934 0.000 0.284 0.000 0.636 0.080
#> SRR1364013 4 0.5949 0.60567 0.000 0.240 0.000 0.588 0.172
#> SRR1468553 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.0324 0.81626 0.004 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR1420169 3 0.6750 0.65776 0.368 0.000 0.492 0.056 0.084
#> SRR1442800 4 0.4256 0.60234 0.052 0.040 0.000 0.808 0.100
#> SRR1359214 2 0.3343 0.68495 0.000 0.812 0.000 0.016 0.172
#> SRR1499849 1 0.3355 0.30232 0.804 0.000 0.000 0.012 0.184
#> SRR1500030 3 0.0290 0.81446 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1093053 3 0.7500 0.37126 0.084 0.000 0.492 0.252 0.172
#> SRR1399843 3 0.6546 0.70631 0.324 0.000 0.544 0.056 0.076
#> SRR1380231 3 0.6602 0.69698 0.320 0.000 0.540 0.048 0.092
#> SRR809470 3 0.6263 0.68848 0.336 0.000 0.556 0.056 0.052
#> SRR614239 4 0.5668 0.65807 0.000 0.172 0.000 0.632 0.196
#> SRR613939 4 0.2362 0.64269 0.000 0.076 0.000 0.900 0.024
#> SRR612971 2 0.1205 0.71213 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1490204 4 0.4941 0.52775 0.000 0.328 0.000 0.628 0.044
#> SRR811357 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1471672 1 0.3983 0.33355 0.660 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR613006 4 0.3210 0.53756 0.000 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR1469570 2 0.2732 0.67910 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1457354 2 0.2930 0.69197 0.000 0.832 0.000 0.004 0.164
#> SRR1362906 3 0.0609 0.81263 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1079023 5 0.4304 0.17134 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR813608 2 0.2732 0.67910 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1096736 1 0.6038 0.12783 0.460 0.016 0.000 0.072 0.452
#> SRR1478700 1 0.1697 0.36366 0.932 0.000 0.000 0.008 0.060
#> SRR1081543 3 0.3099 0.75650 0.008 0.000 0.848 0.012 0.132
#> SRR1384754 1 0.6301 -0.01730 0.600 0.000 0.208 0.020 0.172
#> SRR612287 2 0.2930 0.69197 0.000 0.832 0.000 0.004 0.164
#> SRR1380317 4 0.6887 0.50555 0.012 0.212 0.000 0.444 0.332
#> SRR1315247 4 0.2325 0.64112 0.000 0.068 0.000 0.904 0.028
#> SRR1105344 2 0.5028 0.47224 0.000 0.668 0.000 0.260 0.072
#> SRR658549 4 0.5446 0.66407 0.000 0.164 0.000 0.660 0.176
#> SRR1480240 5 0.4300 0.20859 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1084816 2 0.2732 0.67910 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR612551 2 0.0703 0.71007 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1358520 2 0.6816 -0.25742 0.000 0.360 0.000 0.324 0.316
#> SRR1419476 3 0.1485 0.81327 0.020 0.000 0.948 0.032 0.000
#> SRR1456075 3 0.6621 0.67986 0.360 0.000 0.508 0.048 0.084
#> SRR1389474 2 0.2732 0.67910 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1367005 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1334419 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1417154 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.8294 -0.31953 0.384 0.000 0.208 0.244 0.164
#> SRR1325771 5 0.4304 0.17134 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1360420 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660272 4 0.3816 0.36939 0.000 0.304 0.000 0.696 0.000
#> SRR1332993 1 0.4304 -0.06704 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR1311833 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR808044 1 0.1444 0.36652 0.948 0.000 0.000 0.012 0.040
#> SRR1076916 3 0.4964 0.76364 0.244 0.000 0.692 0.056 0.008
#> SRR1356266 5 0.4452 0.10757 0.496 0.000 0.000 0.004 0.500
#> SRR1341983 4 0.5168 0.22099 0.000 0.452 0.000 0.508 0.040
#> SRR1456114 1 0.4009 0.34128 0.684 0.000 0.000 0.004 0.312
#> SRR1072948 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.5571 0.72599 0.332 0.000 0.600 0.048 0.020
#> SRR1480176 5 0.4294 0.21604 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR613843 2 0.4291 0.21251 0.000 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1469192 1 0.4304 -0.06704 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR1404555 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659839 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR659533 2 0.3333 0.63497 0.000 0.788 0.000 0.208 0.004
#> SRR1362848 5 0.8584 -0.50926 0.064 0.084 0.132 0.316 0.404
#> SRR1407492 4 0.6416 0.65515 0.000 0.112 0.064 0.628 0.196
#> SRR1455082 4 0.5125 0.66653 0.000 0.156 0.000 0.696 0.148
#> SRR658362 4 0.6742 0.41861 0.000 0.316 0.000 0.408 0.276
#> SRR810921 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR662823 2 0.3438 0.68310 0.000 0.808 0.000 0.020 0.172
#> SRR1456375 3 0.2438 0.80690 0.060 0.000 0.900 0.040 0.000
#> SRR818232 5 0.4430 0.13369 0.456 0.000 0.000 0.004 0.540
#> SRR1454868 4 0.7114 0.35846 0.024 0.000 0.272 0.460 0.244
#> SRR1474816 2 0.2732 0.67910 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1342002 1 0.4306 -0.09592 0.508 0.000 0.000 0.000 0.492
#> SRR1088437 2 0.3438 0.68310 0.000 0.808 0.000 0.020 0.172
#> SRR1466400 4 0.2450 0.64232 0.000 0.076 0.000 0.896 0.028
#> SRR658921 4 0.5069 0.30022 0.000 0.328 0.000 0.620 0.052
#> SRR1499873 2 0.2773 0.67686 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1101373 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1090145 5 0.4522 0.09623 0.440 0.000 0.000 0.008 0.552
#> SRR1379324 1 0.4193 0.34126 0.684 0.000 0.000 0.012 0.304
#> SRR1345307 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0162 0.81578 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1454891 4 0.5732 0.64845 0.000 0.192 0.000 0.624 0.184
#> SRR663185 2 0.3639 0.67341 0.000 0.792 0.000 0.024 0.184
#> SRR811819 5 0.4294 0.21604 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1318920 1 0.4746 0.29147 0.600 0.000 0.000 0.024 0.376
#> SRR656758 2 0.3424 0.57951 0.000 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR1474351 5 0.4304 0.17134 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR660450 4 0.3849 0.48657 0.000 0.232 0.000 0.752 0.016
#> SRR1472687 2 0.2439 0.70404 0.000 0.876 0.000 0.004 0.120
#> SRR1334291 4 0.5210 0.60704 0.000 0.264 0.000 0.652 0.084
#> SRR1415153 2 0.2966 0.65810 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR1323271 2 0.3550 0.67644 0.000 0.796 0.000 0.020 0.184
#> SRR1368939 2 0.4294 0.24281 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000
#> SRR1443161 4 0.8331 0.14942 0.184 0.000 0.188 0.376 0.252
#> SRR614695 4 0.2450 0.64232 0.000 0.076 0.000 0.896 0.028
#> SRR1092372 1 0.4709 0.29661 0.612 0.000 0.000 0.024 0.364
#> SRR1474577 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1406582 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR612779 2 0.4622 0.09022 0.000 0.548 0.000 0.440 0.012
#> SRR1089006 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1354071 1 0.3957 0.28371 0.712 0.000 0.000 0.008 0.280
#> SRR1105463 1 0.4455 0.30648 0.772 0.000 0.020 0.048 0.160
#> SRR811005 2 0.2732 0.67910 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1385319 5 0.4542 0.12515 0.456 0.000 0.000 0.008 0.536
#> SRR1325871 3 0.1557 0.78816 0.000 0.000 0.940 0.008 0.052
#> SRR1355415 1 0.6836 -0.30247 0.500 0.000 0.348 0.056 0.096
#> SRR1090861 5 0.4304 0.17134 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1320712 5 0.6687 -0.58707 0.000 0.248 0.000 0.332 0.420
#> SRR1470075 1 0.4029 0.34081 0.680 0.000 0.000 0.004 0.316
#> SRR1091254 5 0.4297 0.20628 0.472 0.000 0.000 0.000 0.528
#> SRR1101397 1 0.2304 0.34424 0.908 0.000 0.000 0.044 0.048
#> SRR1321165 1 0.3909 0.34781 0.760 0.000 0.000 0.024 0.216
#> SRR1092112 3 0.5097 0.73517 0.320 0.000 0.624 0.056 0.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.4122 0.64222 0.008 0.796 0.000 0.132 0.064
#> SRR1432106 2 0.3438 0.68310 0.000 0.808 0.000 0.020 0.172
#> SRR655756 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1458314 1 0.2488 0.36861 0.872 0.000 0.000 0.004 0.124
#> SRR1318582 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1080484 2 0.3550 0.67644 0.000 0.796 0.000 0.020 0.184
#> SRR1072749 1 0.4150 0.09969 0.612 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR1078586 5 0.4294 0.21604 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1400333 4 0.3803 0.67036 0.000 0.056 0.000 0.804 0.140
#> SRR1078834 4 0.2491 0.64722 0.000 0.068 0.000 0.896 0.036
#> SRR1417611 2 0.3550 0.67644 0.000 0.796 0.000 0.020 0.184
#> SRR1396840 1 0.3051 0.33851 0.864 0.000 0.000 0.060 0.076
#> SRR1465440 2 0.1205 0.71213 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1400530 2 0.3216 0.69448 0.000 0.848 0.000 0.044 0.108
#> SRR614984 4 0.6286 0.66027 0.000 0.108 0.060 0.640 0.192
#> SRR1324269 1 0.4287 -0.04349 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR1401491 2 0.4980 0.48393 0.000 0.676 0.000 0.252 0.072
#> SRR1319443 5 0.4446 0.16955 0.476 0.000 0.000 0.004 0.520
#> SRR1324349 2 0.4960 0.59653 0.000 0.708 0.000 0.112 0.180
#> SRR1345523 2 0.1121 0.70780 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1500846 1 0.4029 0.34081 0.680 0.000 0.000 0.004 0.316
#> SRR661505 3 0.5231 0.73758 0.316 0.000 0.624 0.056 0.004
#> SRR1419062 3 0.5728 0.73364 0.312 0.000 0.608 0.048 0.032
#> SRR1480131 1 0.3550 0.29142 0.760 0.000 0.000 0.004 0.236
#> SRR1421284 5 0.6824 -0.56330 0.000 0.332 0.000 0.324 0.344
#> SRR1329624 5 0.4294 0.21604 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1315739 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 4 0.6231 0.57766 0.000 0.252 0.000 0.544 0.204
#> SRR1083286 5 0.4305 0.18022 0.488 0.000 0.000 0.000 0.512
#> SRR1091890 3 0.1792 0.78757 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1347436 4 0.5510 0.66210 0.000 0.164 0.000 0.652 0.184
#> SRR1327473 5 0.4494 -0.08737 0.380 0.000 0.000 0.012 0.608
#> SRR1338195 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1457792 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR658271 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1339597 1 0.1364 0.36946 0.952 0.000 0.000 0.012 0.036
#> SRR1454842 3 0.3120 0.75013 0.004 0.000 0.864 0.084 0.048
#> SRR1322643 1 0.3983 0.33355 0.660 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR614887 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354620 3 0.6331 0.68281 0.340 0.000 0.548 0.052 0.060
#> SRR615056 2 0.3550 0.67644 0.000 0.796 0.000 0.020 0.184
#> SRR1105320 5 0.5736 -0.18181 0.448 0.000 0.000 0.084 0.468
#> SRR1391529 5 0.4300 0.20859 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR663052 2 0.6627 -0.12266 0.000 0.448 0.000 0.308 0.244
#> SRR1478834 5 0.4300 0.20859 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR812366 2 0.5107 0.46388 0.000 0.640 0.000 0.296 0.064
#> SRR1435330 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615383 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1389157 4 0.6383 0.64483 0.000 0.076 0.092 0.632 0.200
#> SRR613568 4 0.3586 0.45205 0.000 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR614095 2 0.3476 0.68091 0.000 0.804 0.000 0.020 0.176
#> SRR1103092 1 0.4300 -0.08928 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1337155 4 0.6266 0.20027 0.320 0.000 0.052 0.568 0.060
#> SRR1475345 2 0.1704 0.71038 0.000 0.928 0.000 0.004 0.068
#> SRR809089 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1446180 4 0.4072 0.52944 0.136 0.004 0.004 0.800 0.056
#> SRR1406372 2 0.5040 0.50192 0.000 0.680 0.000 0.236 0.084
#> SRR1339880 3 0.1121 0.80730 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1353136 3 0.7266 0.07417 0.028 0.000 0.428 0.296 0.248
#> SRR1093906 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.1205 0.70888 0.000 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR1351104 1 0.3966 0.33562 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1363926 2 0.4851 0.58246 0.000 0.712 0.000 0.092 0.196
#> SRR1399861 4 0.7516 0.45743 0.000 0.176 0.060 0.388 0.376
#> SRR1338789 1 0.3355 0.36003 0.804 0.000 0.000 0.012 0.184
#> SRR1421420 3 0.1934 0.80990 0.020 0.000 0.932 0.008 0.040
#> SRR1420832 2 0.3438 0.68310 0.000 0.808 0.000 0.020 0.172
#> SRR1476231 1 0.4307 -0.11128 0.504 0.000 0.000 0.000 0.496
#> SRR1352870 4 0.6290 0.63209 0.012 0.028 0.124 0.644 0.192
#> SRR1315041 2 0.4101 0.65610 0.000 0.768 0.000 0.048 0.184
#> SRR661877 2 0.3343 0.68495 0.000 0.812 0.000 0.016 0.172
#> SRR1443268 1 0.2661 0.33840 0.896 0.000 0.008 0.052 0.044
#> SRR1416617 3 0.1686 0.81315 0.020 0.000 0.944 0.008 0.028
#> SRR1102443 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR655672 4 0.5638 0.65842 0.000 0.172 0.000 0.636 0.192
#> SRR1420006 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458267 4 0.5304 0.60031 0.000 0.272 0.000 0.640 0.088
#> SRR613819 2 0.6812 -0.25154 0.000 0.364 0.000 0.324 0.312
#> SRR1469432 2 0.2930 0.69197 0.000 0.832 0.000 0.004 0.164
#> SRR660907 2 0.2930 0.69197 0.000 0.832 0.000 0.004 0.164
#> SRR1465092 4 0.5373 0.59519 0.000 0.276 0.000 0.632 0.092
#> SRR1470727 1 0.4210 0.04710 0.588 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR1339153 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414379 4 0.6783 0.37521 0.000 0.296 0.000 0.388 0.316
#> SRR1431326 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1487278 4 0.4812 0.19151 0.000 0.372 0.000 0.600 0.028
#> SRR1098312 3 0.5676 0.72026 0.104 0.000 0.700 0.048 0.148
#> SRR810273 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1376000 4 0.3395 0.57729 0.000 0.236 0.000 0.764 0.000
#> SRR614467 2 0.6805 -0.22705 0.000 0.372 0.000 0.308 0.320
#> SRR811471 1 0.4074 0.30386 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1478341 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088606 4 0.7623 -0.08682 0.376 0.000 0.096 0.396 0.132
#> SRR1479699 3 0.6326 0.68585 0.120 0.000 0.652 0.080 0.148
#> SRR1403589 2 0.2732 0.67910 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR812625 4 0.2864 0.63989 0.000 0.112 0.000 0.864 0.024
#> SRR1359803 5 0.4559 0.15168 0.480 0.000 0.000 0.008 0.512
#> SRR1338988 2 0.1792 0.70818 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1471222 4 0.5240 0.48469 0.000 0.252 0.000 0.656 0.092
#> SRR1378992 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR659427 5 0.7963 -0.51662 0.096 0.112 0.020 0.360 0.412
#> SRR1096638 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1466619 4 0.5596 0.39612 0.000 0.304 0.000 0.596 0.100
#> SRR659307 4 0.6764 0.58201 0.004 0.036 0.184 0.580 0.196
#> SRR1439994 1 0.3681 0.31254 0.848 0.000 0.056 0.052 0.044
#> SRR1454931 1 0.4306 0.25646 0.660 0.000 0.000 0.012 0.328
#> SRR1332928 1 0.5464 0.17876 0.720 0.000 0.140 0.052 0.088
#> SRR658621 2 0.3550 0.67644 0.000 0.796 0.000 0.020 0.184
#> SRR1095840 5 0.4291 0.21793 0.464 0.000 0.000 0.000 0.536
#> SRR1458243 1 0.1251 0.35900 0.956 0.000 0.000 0.036 0.008
#> SRR1374270 5 0.6934 -0.59682 0.004 0.228 0.004 0.368 0.396
#> SRR1470947 2 0.3163 0.68929 0.000 0.824 0.000 0.012 0.164
#> SRR1365598 4 0.3075 0.63427 0.000 0.092 0.000 0.860 0.048
#> SRR662787 2 0.3513 0.67875 0.000 0.800 0.000 0.020 0.180
#> SRR1408727 4 0.6767 0.40516 0.000 0.272 0.000 0.380 0.348
#> SRR1456274 1 0.4199 0.26655 0.764 0.000 0.000 0.056 0.180
#> SRR817744 5 0.4304 0.17134 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1478744 2 0.2930 0.69197 0.000 0.832 0.000 0.004 0.164
#> SRR1387379 2 0.1671 0.70144 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1102680 3 0.6484 0.71246 0.312 0.000 0.556 0.048 0.084
#> SRR1374198 1 0.4686 0.28514 0.596 0.000 0.000 0.020 0.384
#> SRR1445856 1 0.2434 0.34975 0.908 0.000 0.008 0.048 0.036
#> SRR820049 3 0.5454 0.53817 0.016 0.000 0.676 0.220 0.088
#> SRR1375290 4 0.7296 0.22739 0.032 0.000 0.332 0.416 0.220
#> SRR818999 1 0.3812 0.30726 0.796 0.000 0.004 0.032 0.168
#> SRR1390242 5 0.4294 0.21604 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1401164 4 0.4448 -0.13168 0.000 0.480 0.000 0.516 0.004
#> SRR1454629 1 0.4197 0.29103 0.728 0.000 0.000 0.028 0.244
#> SRR1332187 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR603365 3 0.1648 0.81368 0.020 0.000 0.940 0.040 0.000
#> SRR657833 4 0.2648 0.62722 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1436207 4 0.5143 0.46370 0.000 0.368 0.000 0.584 0.048
#> SRR1488017 1 0.4307 -0.11128 0.504 0.000 0.000 0.000 0.496
#> SRR612947 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1480384 1 0.4304 -0.06704 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR1364761 2 0.3177 0.64252 0.000 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR1308086 3 0.2952 0.78656 0.020 0.000 0.868 0.008 0.104
#> SRR1441868 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1485380 3 0.2632 0.80602 0.072 0.000 0.888 0.040 0.000
#> SRR1073705 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR615032 2 0.1205 0.71213 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1452356 2 0.3550 0.67644 0.000 0.796 0.000 0.020 0.184
#> SRR1442983 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1100346 4 0.5283 0.67243 0.000 0.136 0.000 0.676 0.188
#> SRR1332816 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR612299 4 0.2450 0.64232 0.000 0.076 0.000 0.896 0.028
#> SRR1407386 5 0.4294 0.21604 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1418064 2 0.2891 0.66589 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1309403 5 0.5691 -0.15725 0.400 0.000 0.000 0.084 0.516
#> SRR1498395 2 0.3424 0.59654 0.000 0.760 0.000 0.240 0.000
#> SRR1079998 3 0.6006 0.58165 0.432 0.000 0.488 0.052 0.028
#> SRR1498885 2 0.3550 0.67644 0.000 0.796 0.000 0.020 0.184
#> SRR1337215 4 0.3090 0.63325 0.000 0.088 0.000 0.860 0.052
#> SRR1414749 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365963 3 0.6107 0.70919 0.344 0.000 0.560 0.052 0.044
#> SRR1368030 2 0.6810 -0.27761 0.000 0.356 0.000 0.344 0.300
#> SRR1419760 4 0.5853 0.66451 0.012 0.144 0.000 0.640 0.204
#> SRR1381841 1 0.4040 0.29241 0.724 0.000 0.000 0.016 0.260
#> SRR821388 4 0.7557 0.55068 0.024 0.048 0.148 0.508 0.272
#> SRR657623 2 0.3550 0.67644 0.000 0.796 0.000 0.020 0.184
#> SRR1094241 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819583 3 0.5071 0.74243 0.308 0.000 0.640 0.048 0.004
#> SRR1096149 1 0.3983 0.33355 0.660 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR1342829 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 5 0.4306 0.13588 0.492 0.000 0.000 0.000 0.508
#> SRR811333 3 0.5965 0.71165 0.320 0.000 0.588 0.044 0.048
#> SRR1311666 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1486698 4 0.2377 0.64277 0.000 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR1446436 4 0.3536 0.65080 0.000 0.156 0.000 0.812 0.032
#> SRR815092 5 0.4291 0.21793 0.464 0.000 0.000 0.000 0.536
#> SRR1500149 4 0.4273 -0.00191 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1100564 5 0.4297 0.21307 0.472 0.000 0.000 0.000 0.528
#> SRR1403072 3 0.0324 0.81579 0.004 0.000 0.992 0.004 0.000
#> SRR811653 5 0.7902 -0.53462 0.016 0.056 0.180 0.368 0.380
#> SRR1311348 2 0.2732 0.67910 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1489438 2 0.3438 0.68310 0.000 0.808 0.000 0.020 0.172
#> SRR1435442 4 0.4169 0.47573 0.000 0.240 0.000 0.732 0.028
#> SRR1421444 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.1205 0.71213 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1319520 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1444763 1 0.4435 0.32262 0.648 0.000 0.000 0.016 0.336
#> SRR1415026 2 0.1768 0.70944 0.000 0.924 0.000 0.004 0.072
#> SRR1416596 2 0.6024 0.35722 0.000 0.556 0.000 0.296 0.148
#> SRR1485499 2 0.2930 0.69197 0.000 0.832 0.000 0.004 0.164
#> SRR1316078 2 0.1638 0.71069 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR663465 2 0.3550 0.67644 0.000 0.796 0.000 0.020 0.184
#> SRR1310094 2 0.3639 0.67363 0.000 0.792 0.000 0.024 0.184
#> SRR663537 2 0.2732 0.67910 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1486780 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1453950 1 0.4304 -0.06704 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR1087875 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR613318 4 0.7557 0.53158 0.000 0.140 0.092 0.456 0.312
#> SRR1332694 5 0.4294 0.21604 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1468469 3 0.0671 0.81564 0.004 0.000 0.980 0.016 0.000
#> SRR818670 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1120318 5 0.4300 0.20859 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1311622 3 0.6326 0.72584 0.288 0.000 0.584 0.044 0.084
#> SRR1500931 3 0.4920 0.74335 0.308 0.000 0.644 0.048 0.000
#> SRR1387494 3 0.3536 0.78751 0.052 0.000 0.840 0.008 0.100
#> SRR1379175 5 0.7065 -0.59705 0.020 0.204 0.000 0.380 0.396
#> SRR1401909 1 0.6771 -0.49973 0.436 0.000 0.428 0.060 0.076
#> SRR1440541 2 0.2017 0.71054 0.000 0.912 0.000 0.008 0.080
#> SRR1068832 3 0.5574 0.72024 0.340 0.000 0.592 0.052 0.016
#> SRR1376640 4 0.2304 0.65539 0.000 0.100 0.000 0.892 0.008
#> SRR1085712 2 0.1041 0.71223 0.000 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR1082283 1 0.1981 0.35126 0.920 0.000 0.000 0.016 0.064
#> SRR1084276 1 0.3530 0.30100 0.784 0.000 0.000 0.012 0.204
#> SRR1353262 2 0.5691 0.44754 0.000 0.592 0.000 0.296 0.112
#> SRR1437035 1 0.4299 0.26234 0.608 0.000 0.000 0.004 0.388
#> SRR1396877 1 0.3274 0.29304 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1443026 2 0.2612 0.69418 0.000 0.868 0.000 0.124 0.008
#> SRR1417936 1 0.4307 -0.11128 0.504 0.000 0.000 0.000 0.496
#> SRR1436822 4 0.6132 0.02170 0.000 0.428 0.000 0.444 0.128
#> SRR1101128 3 0.2504 0.80653 0.064 0.000 0.896 0.040 0.000
#> SRR1363886 2 0.2930 0.69197 0.000 0.832 0.000 0.004 0.164
#> SRR612983 2 0.1282 0.71192 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1394366 4 0.2450 0.64232 0.000 0.076 0.000 0.896 0.028
#> SRR1093218 3 0.4729 0.78944 0.140 0.000 0.768 0.044 0.048
#> SRR1077090 3 0.5294 0.72689 0.332 0.000 0.608 0.056 0.004
#> SRR1327430 2 0.6823 -0.27465 0.000 0.348 0.000 0.324 0.328
#> SRR1088958 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1486931 4 0.5210 0.60704 0.000 0.264 0.000 0.652 0.084
#> SRR1086820 1 0.4356 0.32570 0.648 0.000 0.000 0.012 0.340
#> SRR1383000 1 0.4297 -0.02670 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR1355705 2 0.1043 0.70838 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR614335 2 0.3795 0.66361 0.000 0.780 0.000 0.028 0.192
#> SRR660534 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR817094 2 0.1043 0.70872 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1334265 2 0.3724 0.67036 0.000 0.788 0.000 0.028 0.184
#> SRR1456401 2 0.4360 0.63419 0.000 0.752 0.000 0.064 0.184
#> SRR1086393 1 0.4030 0.31864 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR1351521 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093100 5 0.6767 -0.58251 0.000 0.276 0.000 0.336 0.388
#> SRR1309382 5 0.4300 0.20859 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1089375 1 0.4067 0.28205 0.692 0.000 0.000 0.008 0.300
#> SRR1499482 4 0.5275 0.59629 0.000 0.276 0.000 0.640 0.084
#> SRR614719 4 0.5544 0.66001 0.000 0.168 0.000 0.648 0.184
#> SRR1081473 3 0.6541 0.71532 0.296 0.000 0.560 0.044 0.100
#> SRR1087415 1 0.4387 0.32444 0.640 0.000 0.000 0.012 0.348
#> SRR1088217 3 0.6989 0.53072 0.404 0.000 0.436 0.056 0.104
#> SRR808496 4 0.6694 0.44779 0.000 0.244 0.000 0.408 0.348
#> SRR1336463 4 0.5568 0.36983 0.000 0.384 0.000 0.540 0.076
#> SRR612359 4 0.5537 0.66433 0.000 0.160 0.000 0.648 0.192
#> SRR1444412 1 0.3636 0.27079 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR1074116 3 0.0162 0.81580 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656095 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR808914 5 0.4294 0.21710 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1349099 1 0.3326 0.31131 0.824 0.000 0.000 0.024 0.152
#> SRR1337886 4 0.3816 0.51625 0.000 0.304 0.000 0.696 0.000
#> SRR813632 5 0.4297 0.21485 0.472 0.000 0.000 0.000 0.528
#> SRR1101591 3 0.4863 0.74818 0.296 0.000 0.656 0.048 0.000
#> SRR1089713 1 0.6183 0.23866 0.616 0.000 0.080 0.048 0.256
#> SRR1453127 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 3 0.5379 0.72123 0.340 0.000 0.600 0.052 0.008
#> SRR1313831 5 0.4294 0.21710 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1315434 3 0.0290 0.81446 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR814747 2 0.3550 0.67644 0.000 0.796 0.000 0.020 0.184
#> SRR1358539 5 0.4291 0.21793 0.464 0.000 0.000 0.000 0.536
#> SRR1367807 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1365791 3 0.4134 0.79365 0.116 0.000 0.808 0.024 0.052
#> SRR1081519 3 0.5156 0.73317 0.328 0.000 0.620 0.048 0.004
#> SRR614707 4 0.2344 0.64131 0.000 0.064 0.000 0.904 0.032
#> SRR1094027 1 0.4307 -0.11128 0.504 0.000 0.000 0.000 0.496
#> SRR1489092 3 0.7411 0.62254 0.336 0.000 0.444 0.064 0.156
#> SRR1079502 3 0.6639 0.69661 0.332 0.000 0.528 0.048 0.092
#> SRR1457814 4 0.7913 0.46010 0.008 0.120 0.112 0.384 0.376
#> SRR1455127 2 0.3438 0.68310 0.000 0.808 0.000 0.020 0.172
#> SRR615081 4 0.5635 0.06161 0.000 0.428 0.000 0.496 0.076
#> SRR1327855 3 0.2569 0.80620 0.068 0.000 0.892 0.040 0.000
#> SRR1417873 2 0.6035 0.31263 0.000 0.580 0.000 0.204 0.216
#> SRR1394125 3 0.2844 0.81024 0.088 0.000 0.880 0.012 0.020
#> SRR1488388 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1401122 2 0.3639 0.67341 0.000 0.792 0.000 0.024 0.184
#> SRR612383 4 0.5640 0.65883 0.000 0.176 0.000 0.636 0.188
#> SRR1477711 5 0.4294 0.21604 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1350813 4 0.5498 0.57227 0.000 0.292 0.000 0.612 0.096
#> SRR612851 4 0.5413 0.65843 0.000 0.172 0.000 0.664 0.164
#> SRR1086349 1 0.4306 -0.09809 0.508 0.000 0.000 0.000 0.492
#> SRR812837 2 0.1205 0.71213 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1340010 3 0.7145 0.39907 0.056 0.000 0.520 0.168 0.256
#> SRR1475885 1 0.5777 -0.15827 0.468 0.000 0.000 0.444 0.088
#> SRR1376334 5 0.4294 0.21710 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1399821 1 0.4218 0.33511 0.660 0.000 0.000 0.008 0.332
#> SRR1347042 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612323 4 0.6447 0.65294 0.000 0.100 0.076 0.628 0.196
#> SRR612604 4 0.4833 0.08284 0.000 0.412 0.000 0.564 0.024
#> SRR1389546 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1311877 1 0.4304 -0.06704 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR1465608 1 0.1597 0.35063 0.940 0.000 0.000 0.012 0.048
#> SRR1101808 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331153 4 0.4256 0.03842 0.000 0.436 0.000 0.564 0.000
#> SRR1078439 3 0.7118 0.64504 0.188 0.000 0.544 0.204 0.064
#> SRR2165527 2 0.3343 0.68495 0.000 0.812 0.000 0.016 0.172
#> SRR1351147 5 0.4833 0.04410 0.412 0.000 0.000 0.024 0.564
#> SRR1313536 2 0.3999 0.49662 0.000 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR1070308 2 0.6883 0.34220 0.064 0.576 0.000 0.156 0.204
#> SRR1403110 5 0.4294 0.21710 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1400355 2 0.3143 0.64626 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1401317 3 0.5015 0.74676 0.296 0.000 0.652 0.048 0.004
#> SRR1456862 1 0.2069 0.37094 0.912 0.000 0.000 0.012 0.076
#> SRR1074622 1 0.4242 0.12703 0.572 0.000 0.000 0.000 0.428
#> SRR1465847 3 0.4973 0.73868 0.320 0.000 0.632 0.048 0.000
#> SRR1443376 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075579 5 0.4297 0.20628 0.472 0.000 0.000 0.000 0.528
#> SRR1090881 4 0.6444 0.62709 0.008 0.036 0.132 0.628 0.196
#> SRR612251 2 0.6818 -0.27800 0.000 0.352 0.000 0.336 0.312
#> SRR1418581 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR658045 2 0.2773 0.67671 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR613214 4 0.5567 0.66361 0.000 0.160 0.000 0.644 0.196
#> SRR613078 4 0.3449 0.58063 0.000 0.164 0.000 0.812 0.024
#> SRR1472998 3 0.6306 0.62092 0.412 0.000 0.488 0.048 0.052
#> SRR1433452 2 0.4306 -0.05224 0.000 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR1101957 1 0.4304 -0.06704 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR1487993 3 0.0703 0.81204 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1465983 2 0.2813 0.67423 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1380375 5 0.4294 0.21604 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1367566 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316151 4 0.4609 0.58013 0.000 0.152 0.000 0.744 0.104
#> SRR1417547 2 0.3550 0.67644 0.000 0.796 0.000 0.020 0.184
#> SRR659389 2 0.2732 0.67910 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1490270 4 0.3636 0.44044 0.000 0.272 0.000 0.728 0.000
#> SRR1398207 1 0.3966 0.30769 0.788 0.000 0.004 0.040 0.168
#> SRR1358755 3 0.6674 0.62320 0.364 0.000 0.500 0.048 0.088
#> SRR1078903 4 0.5316 0.58967 0.000 0.284 0.000 0.632 0.084
#> SRR1323252 2 0.2732 0.67910 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1451796 2 0.2929 0.66698 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1369172 1 0.3934 0.34534 0.716 0.000 0.000 0.008 0.276
#> SRR615982 4 0.5610 0.65854 0.000 0.176 0.000 0.640 0.184
#> SRR1480431 2 0.6138 0.20698 0.000 0.552 0.000 0.272 0.176
#> SRR1429825 4 0.4850 0.52709 0.000 0.224 0.000 0.700 0.076
#> SRR1102393 2 0.2732 0.67910 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1071313 1 0.3237 0.32727 0.848 0.000 0.000 0.048 0.104
#> SRR808351 1 0.4304 -0.06704 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR1317513 5 0.4294 0.21604 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1480501 3 0.6052 0.73368 0.296 0.000 0.600 0.048 0.056
#> SRR1081910 1 0.5932 0.25201 0.664 0.000 0.152 0.032 0.152
#> SRR1086611 4 0.3053 0.64671 0.008 0.044 0.000 0.872 0.076
#> SRR1392571 4 0.5544 0.66001 0.000 0.168 0.000 0.648 0.184
#> SRR1311441 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR808152 1 0.4304 -0.06704 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR657313 3 0.1547 0.81106 0.016 0.000 0.948 0.032 0.004
#> SRR1433131 4 0.4455 0.10502 0.000 0.404 0.000 0.588 0.008
#> SRR1321011 2 0.0807 0.71180 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012
#> SRR1500598 2 0.2930 0.69197 0.000 0.832 0.000 0.004 0.164
#> SRR1379343 2 0.3586 0.56250 0.000 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR1389108 1 0.3999 0.33148 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1376228 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399757 5 0.4302 0.18378 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520
#> SRR1358060 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.6326 0.72533 0.288 0.000 0.584 0.044 0.084
#> SRR613557 4 0.6524 0.64868 0.000 0.088 0.096 0.624 0.192
#> SRR809831 1 0.3913 0.22958 0.676 0.000 0.000 0.000 0.324
#> SRR1429387 3 0.0000 0.81572 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.4307 -0.11128 0.504 0.000 0.000 0.000 0.496
#> SRR1071644 1 0.4307 -0.11128 0.504 0.000 0.000 0.000 0.496
#> SRR1406936 3 0.6703 0.70315 0.312 0.000 0.536 0.048 0.104
#> SRR1072031 2 0.2732 0.67910 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1374671 4 0.5640 0.65684 0.000 0.176 0.000 0.636 0.188
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 5 0.6962 0.1104 0.000 0.000 0.364 0.132 0.392 0.112
#> SRR1404105 1 0.1059 0.8079 0.964 0.000 0.000 0.004 0.016 0.016
#> SRR2164936 2 0.5151 0.6187 0.000 0.684 0.000 0.156 0.032 0.128
#> SRR1472057 5 0.4313 0.4714 0.000 0.000 0.284 0.000 0.668 0.048
#> SRR614491 4 0.1625 0.5941 0.000 0.000 0.060 0.928 0.000 0.012
#> SRR1069376 1 0.1908 0.8039 0.924 0.000 0.000 0.012 0.044 0.020
#> SRR811964 2 0.5045 0.6267 0.000 0.696 0.000 0.148 0.032 0.124
#> SRR1361415 2 0.3697 0.6084 0.000 0.816 0.000 0.040 0.044 0.100
#> SRR1345715 1 0.4129 0.7630 0.772 0.000 0.000 0.016 0.120 0.092
#> SRR1328073 4 0.5727 0.4887 0.056 0.020 0.000 0.672 0.144 0.108
#> SRR1394209 4 0.6167 0.4916 0.000 0.156 0.000 0.592 0.080 0.172
#> SRR1474018 2 0.3697 0.6084 0.000 0.816 0.000 0.040 0.044 0.100
#> SRR1099809 5 0.4057 0.3984 0.388 0.000 0.000 0.000 0.600 0.012
#> SRR1500555 4 0.2531 0.4983 0.000 0.008 0.000 0.860 0.004 0.128
#> SRR1354363 1 0.4520 0.7449 0.740 0.000 0.000 0.020 0.120 0.120
#> SRR1391619 3 0.0976 0.8603 0.000 0.000 0.968 0.016 0.008 0.008
#> SRR1307997 4 0.3564 0.4516 0.000 0.040 0.000 0.816 0.024 0.120
#> SRR663124 4 0.0790 0.5975 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1334670 1 0.1010 0.7997 0.960 0.000 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR612515 4 0.1707 0.5958 0.000 0.004 0.056 0.928 0.000 0.012
#> SRR1092727 4 0.5218 0.2712 0.000 0.156 0.000 0.680 0.036 0.128
#> SRR1364013 4 0.2288 0.5767 0.000 0.072 0.000 0.896 0.004 0.028
#> SRR1468553 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.0632 0.8685 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1420169 5 0.4329 0.5076 0.004 0.000 0.240 0.000 0.700 0.056
#> SRR1442800 6 0.5329 0.5348 0.016 0.004 0.000 0.208 0.124 0.648
#> SRR1359214 2 0.3697 0.6084 0.000 0.816 0.000 0.040 0.044 0.100
#> SRR1499849 5 0.4006 0.4024 0.392 0.000 0.004 0.000 0.600 0.004
#> SRR1500030 3 0.0603 0.8666 0.000 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1093053 4 0.6496 0.3444 0.000 0.000 0.236 0.528 0.164 0.072
#> SRR1399843 5 0.5974 0.4405 0.000 0.000 0.252 0.072 0.584 0.092
#> SRR1380231 5 0.4680 0.4683 0.004 0.000 0.292 0.004 0.648 0.052
#> SRR809470 5 0.4365 0.4697 0.008 0.000 0.332 0.000 0.636 0.024
#> SRR614239 4 0.1138 0.5992 0.000 0.024 0.004 0.960 0.000 0.012
#> SRR613939 6 0.4591 0.5941 0.000 0.016 0.000 0.372 0.020 0.592
#> SRR612971 2 0.0458 0.6464 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1490204 4 0.5659 0.1562 0.000 0.208 0.000 0.620 0.036 0.136
#> SRR811357 2 0.5117 0.6222 0.000 0.688 0.000 0.152 0.032 0.128
#> SRR1471672 1 0.4351 0.7536 0.756 0.000 0.000 0.020 0.120 0.104
#> SRR613006 6 0.4889 0.6453 0.000 0.084 0.000 0.312 0.000 0.604
#> SRR1469570 2 0.5010 0.6281 0.000 0.700 0.000 0.144 0.032 0.124
#> SRR1457354 2 0.3048 0.6195 0.000 0.848 0.000 0.008 0.044 0.100
#> SRR1362906 3 0.1367 0.8434 0.000 0.000 0.944 0.000 0.044 0.012
#> SRR1079023 1 0.0363 0.8060 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR813608 2 0.5010 0.6281 0.000 0.700 0.000 0.144 0.032 0.124
#> SRR1096736 5 0.7985 0.0610 0.108 0.044 0.000 0.272 0.360 0.216
#> SRR1478700 5 0.5601 0.3246 0.272 0.000 0.000 0.016 0.580 0.132
#> SRR1081543 3 0.4585 0.6589 0.000 0.000 0.752 0.116 0.076 0.056
#> SRR1384754 5 0.6835 0.5034 0.112 0.000 0.068 0.068 0.584 0.168
#> SRR612287 2 0.3048 0.6195 0.000 0.848 0.000 0.008 0.044 0.100
#> SRR1380317 4 0.4837 0.5643 0.000 0.120 0.000 0.728 0.048 0.104
#> SRR1315247 6 0.4527 0.5928 0.000 0.008 0.000 0.360 0.028 0.604
#> SRR1105344 6 0.3986 0.2777 0.000 0.464 0.000 0.004 0.000 0.532
#> SRR658549 4 0.1341 0.5894 0.000 0.024 0.000 0.948 0.000 0.028
#> SRR1480240 1 0.1686 0.7848 0.924 0.000 0.000 0.000 0.064 0.012
#> SRR1084816 2 0.5045 0.6267 0.000 0.696 0.000 0.148 0.032 0.124
#> SRR612551 2 0.3935 0.6457 0.000 0.792 0.000 0.124 0.028 0.056
#> SRR1358520 4 0.6238 0.3300 0.000 0.380 0.000 0.456 0.044 0.120
#> SRR1419476 3 0.1204 0.8441 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1456075 5 0.5378 0.4801 0.000 0.000 0.236 0.012 0.616 0.136
#> SRR1389474 2 0.5045 0.6267 0.000 0.696 0.000 0.148 0.032 0.124
#> SRR1367005 1 0.4129 0.7630 0.772 0.000 0.000 0.016 0.120 0.092
#> SRR1334419 1 0.4129 0.7630 0.772 0.000 0.000 0.016 0.120 0.092
#> SRR1417154 3 0.0146 0.8755 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1095985 5 0.4794 0.5267 0.040 0.000 0.028 0.004 0.680 0.248
#> SRR1325771 1 0.0363 0.8060 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1360420 3 0.0260 0.8744 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR660272 6 0.5372 0.6538 0.000 0.160 0.000 0.236 0.004 0.600
#> SRR1332993 1 0.1148 0.8077 0.960 0.000 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR1311833 2 0.5151 0.6187 0.000 0.684 0.000 0.156 0.032 0.128
#> SRR808044 5 0.5697 0.2851 0.288 0.000 0.000 0.016 0.560 0.136
#> SRR1076916 3 0.4500 0.1414 0.000 0.000 0.572 0.000 0.392 0.036
#> SRR1356266 1 0.2179 0.8045 0.900 0.000 0.000 0.000 0.064 0.036
#> SRR1341983 2 0.6247 -0.4843 0.000 0.348 0.000 0.312 0.004 0.336
#> SRR1456114 1 0.4853 0.7214 0.704 0.000 0.000 0.020 0.156 0.120
#> SRR1072948 3 0.0260 0.8744 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1472370 5 0.4524 0.4405 0.000 0.000 0.336 0.000 0.616 0.048
#> SRR1480176 1 0.1531 0.7902 0.928 0.000 0.000 0.000 0.068 0.004
#> SRR613843 6 0.5974 0.4413 0.000 0.296 0.000 0.160 0.020 0.524
#> SRR1469192 1 0.1148 0.8077 0.960 0.000 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR1404555 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659839 2 0.5117 0.6222 0.000 0.688 0.000 0.152 0.032 0.128
#> SRR659533 2 0.5783 0.4924 0.000 0.584 0.000 0.256 0.032 0.128
#> SRR1362848 4 0.7164 0.4541 0.000 0.080 0.040 0.524 0.172 0.184
#> SRR1407492 4 0.1555 0.6004 0.000 0.008 0.040 0.940 0.000 0.012
#> SRR1455082 4 0.2790 0.5214 0.000 0.020 0.000 0.856 0.008 0.116
#> SRR658362 4 0.4024 0.5446 0.000 0.184 0.000 0.744 0.000 0.072
#> SRR810921 2 0.5117 0.6222 0.000 0.688 0.000 0.152 0.032 0.128
#> SRR662823 2 0.3697 0.6084 0.000 0.816 0.000 0.040 0.044 0.100
#> SRR1456375 3 0.2135 0.7674 0.000 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR818232 1 0.2457 0.7637 0.880 0.000 0.000 0.000 0.084 0.036
#> SRR1454868 4 0.4752 0.5337 0.000 0.000 0.116 0.740 0.076 0.068
#> SRR1474816 2 0.5078 0.6268 0.000 0.696 0.000 0.144 0.036 0.124
#> SRR1342002 1 0.0458 0.8062 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1088437 2 0.3557 0.6117 0.000 0.824 0.000 0.032 0.044 0.100
#> SRR1466400 6 0.4618 0.5991 0.000 0.012 0.000 0.360 0.028 0.600
#> SRR658921 6 0.5562 0.6624 0.000 0.188 0.000 0.176 0.020 0.616
#> SRR1499873 2 0.5045 0.6267 0.000 0.696 0.000 0.148 0.032 0.124
#> SRR1101373 1 0.4081 0.7648 0.776 0.000 0.000 0.016 0.120 0.088
#> SRR1090145 1 0.3454 0.7127 0.812 0.000 0.000 0.004 0.124 0.060
#> SRR1379324 1 0.5110 0.6926 0.668 0.000 0.000 0.016 0.180 0.136
#> SRR1345307 2 0.5117 0.6222 0.000 0.688 0.000 0.152 0.032 0.128
#> SRR1396166 3 0.0146 0.8755 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1086280 3 0.0458 0.8707 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1454891 4 0.1196 0.5926 0.000 0.040 0.000 0.952 0.000 0.008
#> SRR663185 2 0.3889 0.6013 0.000 0.804 0.000 0.052 0.044 0.100
#> SRR811819 1 0.0865 0.8005 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1318920 1 0.5581 0.6712 0.604 0.000 0.000 0.016 0.208 0.172
#> SRR656758 2 0.5845 0.4819 0.000 0.588 0.000 0.224 0.032 0.156
#> SRR1474351 1 0.0458 0.8054 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR660450 6 0.5207 0.6581 0.000 0.104 0.000 0.280 0.008 0.608
#> SRR1472687 2 0.2173 0.6301 0.000 0.904 0.000 0.004 0.028 0.064
#> SRR1334291 4 0.5153 0.2770 0.000 0.132 0.000 0.688 0.036 0.144
#> SRR1415153 2 0.5638 0.5350 0.000 0.620 0.000 0.216 0.036 0.128
#> SRR1323271 2 0.3827 0.6036 0.000 0.808 0.000 0.048 0.044 0.100
#> SRR1368939 6 0.5209 0.4170 0.000 0.344 0.000 0.092 0.004 0.560
#> SRR1443161 4 0.5995 0.3579 0.000 0.000 0.072 0.568 0.276 0.084
#> SRR614695 6 0.4570 0.5985 0.000 0.016 0.000 0.364 0.020 0.600
#> SRR1092372 1 0.5728 0.6274 0.572 0.000 0.000 0.016 0.252 0.160
#> SRR1474577 1 0.4129 0.7630 0.772 0.000 0.000 0.016 0.120 0.092
#> SRR1406582 1 0.4081 0.7648 0.776 0.000 0.000 0.016 0.120 0.088
#> SRR612779 2 0.6258 0.1928 0.000 0.416 0.000 0.412 0.036 0.136
#> SRR1089006 1 0.4129 0.7630 0.772 0.000 0.000 0.016 0.120 0.092
#> SRR1354071 5 0.4962 0.4808 0.320 0.000 0.000 0.004 0.600 0.076
#> SRR1105463 5 0.4368 0.4711 0.328 0.000 0.012 0.000 0.640 0.020
#> SRR811005 2 0.5010 0.6281 0.000 0.700 0.000 0.144 0.032 0.124
#> SRR1385319 1 0.2822 0.7462 0.852 0.000 0.000 0.000 0.108 0.040
#> SRR1325871 3 0.1781 0.8225 0.000 0.000 0.924 0.060 0.008 0.008
#> SRR1355415 5 0.5452 0.5706 0.148 0.000 0.192 0.000 0.636 0.024
#> SRR1090861 1 0.0363 0.8060 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1320712 4 0.6360 0.4983 0.000 0.140 0.004 0.584 0.092 0.180
#> SRR1470075 1 0.4853 0.7214 0.704 0.000 0.000 0.020 0.156 0.120
#> SRR1091254 1 0.1010 0.7997 0.960 0.000 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1101397 5 0.4824 0.4842 0.208 0.000 0.000 0.012 0.684 0.096
#> SRR1321165 5 0.5981 -0.1780 0.396 0.000 0.000 0.012 0.436 0.156
#> SRR1092112 5 0.3823 0.3204 0.000 0.000 0.436 0.000 0.564 0.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.6543 0.5560 0.080 0.616 0.000 0.132 0.048 0.124
#> SRR1432106 2 0.3697 0.6084 0.000 0.816 0.000 0.040 0.044 0.100
#> SRR655756 2 0.5151 0.6187 0.000 0.684 0.000 0.156 0.032 0.128
#> SRR1458314 1 0.5802 0.2915 0.472 0.000 0.000 0.020 0.400 0.108
#> SRR1318582 2 0.5184 0.6195 0.000 0.684 0.000 0.152 0.036 0.128
#> SRR1080484 2 0.3889 0.6013 0.000 0.804 0.000 0.052 0.044 0.100
#> SRR1072749 1 0.3401 0.6297 0.776 0.000 0.000 0.004 0.204 0.016
#> SRR1078586 1 0.1010 0.7999 0.960 0.000 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1400333 4 0.3668 0.3024 0.000 0.008 0.000 0.728 0.008 0.256
#> SRR1078834 6 0.4604 0.4980 0.000 0.008 0.000 0.432 0.024 0.536
#> SRR1417611 2 0.3889 0.6013 0.000 0.804 0.000 0.052 0.044 0.100
#> SRR1396840 5 0.4664 0.4945 0.184 0.000 0.000 0.004 0.696 0.116
#> SRR1465440 2 0.0458 0.6464 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.2542 0.6213 0.000 0.876 0.000 0.000 0.044 0.080
#> SRR614984 4 0.1536 0.5940 0.000 0.012 0.024 0.944 0.000 0.020
#> SRR1324269 1 0.2706 0.7032 0.832 0.000 0.000 0.000 0.160 0.008
#> SRR1401491 6 0.3995 0.2624 0.000 0.480 0.000 0.004 0.000 0.516
#> SRR1319443 1 0.2309 0.7689 0.888 0.000 0.000 0.000 0.084 0.028
#> SRR1324349 2 0.4827 0.4800 0.000 0.708 0.000 0.060 0.044 0.188
#> SRR1345523 2 0.3966 0.6456 0.000 0.792 0.000 0.120 0.032 0.056
#> SRR1500846 1 0.4853 0.7214 0.704 0.000 0.000 0.020 0.156 0.120
#> SRR661505 5 0.4905 0.3739 0.000 0.000 0.384 0.032 0.564 0.020
#> SRR1419062 5 0.4776 0.3990 0.000 0.000 0.356 0.004 0.588 0.052
#> SRR1480131 5 0.4264 0.1714 0.484 0.000 0.000 0.000 0.500 0.016
#> SRR1421284 4 0.6440 0.3515 0.000 0.348 0.000 0.456 0.048 0.148
#> SRR1329624 1 0.1124 0.7989 0.956 0.000 0.000 0.000 0.036 0.008
#> SRR1315739 3 0.0146 0.8755 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1099189 4 0.2249 0.5853 0.000 0.064 0.000 0.900 0.004 0.032
#> SRR1083286 1 0.2581 0.7432 0.856 0.000 0.000 0.000 0.128 0.016
#> SRR1091890 3 0.3255 0.7631 0.000 0.000 0.848 0.044 0.076 0.032
#> SRR1347436 4 0.2036 0.5766 0.000 0.028 0.000 0.916 0.008 0.048
#> SRR1327473 1 0.5493 0.4556 0.684 0.004 0.000 0.084 0.124 0.104
#> SRR1338195 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.5117 0.6222 0.000 0.688 0.000 0.152 0.032 0.128
#> SRR1457792 1 0.4081 0.7648 0.776 0.000 0.000 0.016 0.120 0.088
#> SRR658271 2 0.5151 0.6187 0.000 0.684 0.000 0.156 0.032 0.128
#> SRR1339597 5 0.5801 0.0684 0.360 0.000 0.000 0.016 0.500 0.124
#> SRR1454842 3 0.3908 0.6714 0.000 0.000 0.776 0.164 0.020 0.040
#> SRR1322643 1 0.4306 0.7558 0.760 0.000 0.000 0.020 0.120 0.100
#> SRR614887 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354620 5 0.4436 0.4937 0.028 0.000 0.308 0.000 0.652 0.012
#> SRR615056 2 0.3889 0.6013 0.000 0.804 0.000 0.052 0.044 0.100
#> SRR1105320 1 0.7158 -0.2142 0.380 0.000 0.000 0.196 0.324 0.100
#> SRR1391529 1 0.1686 0.7848 0.924 0.000 0.000 0.000 0.064 0.012
#> SRR663052 4 0.5047 0.3834 0.000 0.348 0.000 0.564 0.000 0.088
#> SRR1478834 1 0.1967 0.7767 0.904 0.000 0.000 0.000 0.084 0.012
#> SRR812366 6 0.4308 0.2777 0.000 0.452 0.000 0.008 0.008 0.532
#> SRR1435330 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615383 2 0.5151 0.6187 0.000 0.684 0.000 0.156 0.032 0.128
#> SRR1389157 4 0.1950 0.5862 0.000 0.000 0.064 0.912 0.000 0.024
#> SRR613568 6 0.5254 0.6526 0.000 0.120 0.000 0.280 0.004 0.596
#> SRR614095 2 0.3889 0.6019 0.000 0.804 0.000 0.052 0.044 0.100
#> SRR1103092 1 0.3037 0.6885 0.808 0.000 0.000 0.000 0.176 0.016
#> SRR1337155 5 0.5628 0.2684 0.000 0.000 0.016 0.124 0.564 0.296
#> SRR1475345 2 0.0622 0.6420 0.000 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR809089 2 0.5117 0.6222 0.000 0.688 0.000 0.152 0.032 0.128
#> SRR1446180 6 0.5364 0.5042 0.000 0.000 0.000 0.276 0.152 0.572
#> SRR1406372 2 0.4227 -0.2150 0.000 0.496 0.000 0.004 0.008 0.492
#> SRR1339880 3 0.2308 0.8040 0.000 0.000 0.892 0.000 0.068 0.040
#> SRR1353136 4 0.5925 0.4662 0.000 0.000 0.180 0.620 0.120 0.080
#> SRR1093906 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.3976 0.6451 0.000 0.788 0.000 0.128 0.028 0.056
#> SRR1351104 1 0.4431 0.7494 0.748 0.000 0.000 0.020 0.128 0.104
#> SRR1363926 2 0.4668 0.5396 0.000 0.744 0.000 0.108 0.048 0.100
#> SRR1399861 4 0.5766 0.5381 0.000 0.120 0.020 0.664 0.048 0.148
#> SRR1338789 1 0.5795 0.4840 0.536 0.000 0.000 0.016 0.308 0.140
#> SRR1421420 3 0.3645 0.7029 0.000 0.000 0.784 0.000 0.152 0.064
#> SRR1420832 2 0.3697 0.6084 0.000 0.816 0.000 0.040 0.044 0.100
#> SRR1476231 1 0.0000 0.8072 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 4 0.2401 0.5774 0.000 0.000 0.072 0.892 0.008 0.028
#> SRR1315041 2 0.4588 0.5390 0.000 0.744 0.000 0.072 0.044 0.140
#> SRR661877 2 0.3628 0.6102 0.000 0.820 0.000 0.036 0.044 0.100
#> SRR1443268 5 0.4380 0.5097 0.200 0.000 0.000 0.012 0.724 0.064
#> SRR1416617 3 0.3315 0.7198 0.000 0.000 0.804 0.000 0.156 0.040
#> SRR1102443 1 0.4081 0.7648 0.776 0.000 0.000 0.016 0.120 0.088
#> SRR655672 4 0.1151 0.5978 0.000 0.032 0.000 0.956 0.000 0.012
#> SRR1420006 3 0.0363 0.8728 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1458267 4 0.5007 0.3025 0.000 0.128 0.000 0.704 0.036 0.132
#> SRR613819 4 0.6156 0.3202 0.000 0.392 0.000 0.456 0.044 0.108
#> SRR1469432 2 0.3048 0.6195 0.000 0.848 0.000 0.008 0.044 0.100
#> SRR660907 2 0.3048 0.6195 0.000 0.848 0.000 0.008 0.044 0.100
#> SRR1465092 4 0.5118 0.2891 0.000 0.132 0.000 0.692 0.036 0.140
#> SRR1470727 1 0.3037 0.7077 0.820 0.000 0.000 0.004 0.160 0.016
#> SRR1339153 3 0.0405 0.8708 0.000 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1472749 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414379 4 0.6167 0.3556 0.000 0.336 0.000 0.500 0.044 0.120
#> SRR1431326 1 0.4081 0.7648 0.776 0.000 0.000 0.016 0.120 0.088
#> SRR1487278 6 0.5567 0.6518 0.000 0.212 0.000 0.156 0.020 0.612
#> SRR1098312 3 0.7116 0.1393 0.000 0.000 0.432 0.200 0.260 0.108
#> SRR810273 2 0.5117 0.6222 0.000 0.688 0.000 0.152 0.032 0.128
#> SRR1376000 4 0.5975 -0.4163 0.000 0.104 0.000 0.440 0.032 0.424
#> SRR614467 4 0.5985 0.3788 0.000 0.340 0.000 0.516 0.040 0.104
#> SRR811471 1 0.4081 0.7702 0.776 0.000 0.000 0.016 0.120 0.088
#> SRR1478341 3 0.0146 0.8755 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1088606 5 0.4622 0.1212 0.008 0.000 0.004 0.016 0.488 0.484
#> SRR1479699 3 0.7223 0.0796 0.000 0.000 0.400 0.220 0.272 0.108
#> SRR1403589 2 0.5010 0.6281 0.000 0.700 0.000 0.144 0.032 0.124
#> SRR812625 6 0.4948 0.5980 0.000 0.076 0.000 0.360 0.000 0.564
#> SRR1359803 1 0.2457 0.7645 0.880 0.000 0.000 0.000 0.084 0.036
#> SRR1338988 2 0.1485 0.6369 0.000 0.944 0.000 0.004 0.024 0.028
#> SRR1471222 6 0.5854 0.5101 0.000 0.184 0.000 0.264 0.012 0.540
#> SRR1378992 1 0.4129 0.7630 0.772 0.000 0.000 0.016 0.120 0.092
#> SRR659427 4 0.6410 0.4970 0.000 0.080 0.012 0.592 0.156 0.160
#> SRR1096638 1 0.4032 0.7663 0.780 0.000 0.000 0.016 0.120 0.084
#> SRR1466619 6 0.5397 0.4953 0.000 0.216 0.000 0.200 0.000 0.584
#> SRR659307 4 0.2356 0.5758 0.000 0.000 0.096 0.884 0.004 0.016
#> SRR1439994 5 0.4633 0.5273 0.188 0.000 0.012 0.012 0.724 0.064
#> SRR1454931 1 0.4666 0.1715 0.564 0.000 0.000 0.000 0.388 0.048
#> SRR1332928 5 0.5164 0.5649 0.100 0.000 0.040 0.012 0.712 0.136
#> SRR658621 2 0.3889 0.6013 0.000 0.804 0.000 0.052 0.044 0.100
#> SRR1095840 1 0.1124 0.7989 0.956 0.000 0.000 0.000 0.036 0.008
#> SRR1458243 5 0.5167 0.4254 0.236 0.000 0.000 0.016 0.644 0.104
#> SRR1374270 4 0.6213 0.5002 0.000 0.152 0.008 0.608 0.076 0.156
#> SRR1470947 2 0.3147 0.6184 0.000 0.844 0.000 0.012 0.044 0.100
#> SRR1365598 6 0.4838 0.6071 0.000 0.036 0.000 0.336 0.020 0.608
#> SRR662787 2 0.3827 0.6036 0.000 0.808 0.000 0.048 0.044 0.100
#> SRR1408727 4 0.5474 0.5039 0.000 0.200 0.000 0.640 0.032 0.128
#> SRR1456274 5 0.6363 0.4813 0.112 0.000 0.000 0.136 0.576 0.176
#> SRR817744 1 0.0363 0.8060 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1478744 2 0.3048 0.6195 0.000 0.848 0.000 0.008 0.044 0.100
#> SRR1387379 2 0.3906 0.6458 0.000 0.796 0.000 0.120 0.032 0.052
#> SRR1102680 5 0.4886 0.4294 0.000 0.000 0.300 0.004 0.620 0.076
#> SRR1374198 1 0.5557 0.6763 0.608 0.000 0.000 0.016 0.204 0.172
#> SRR1445856 5 0.4426 0.4805 0.216 0.000 0.004 0.004 0.712 0.064
#> SRR820049 4 0.5004 0.0639 0.000 0.000 0.456 0.492 0.028 0.024
#> SRR1375290 4 0.5234 0.4967 0.000 0.000 0.164 0.688 0.084 0.064
#> SRR818999 5 0.4290 0.4268 0.364 0.000 0.004 0.000 0.612 0.020
#> SRR1390242 1 0.1124 0.7989 0.956 0.000 0.000 0.000 0.036 0.008
#> SRR1401164 6 0.5440 0.6244 0.000 0.248 0.000 0.136 0.012 0.604
#> SRR1454629 5 0.4753 0.4406 0.348 0.000 0.000 0.004 0.596 0.052
#> SRR1332187 3 0.0458 0.8710 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR603365 3 0.1644 0.8278 0.000 0.000 0.920 0.000 0.076 0.004
#> SRR657833 6 0.4709 0.5601 0.000 0.040 0.000 0.400 0.004 0.556
#> SRR1436207 4 0.5719 0.1600 0.000 0.224 0.000 0.608 0.036 0.132
#> SRR1488017 1 0.0146 0.8068 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR612947 2 0.5117 0.6222 0.000 0.688 0.000 0.152 0.032 0.128
#> SRR1480384 1 0.1390 0.8073 0.948 0.000 0.000 0.004 0.032 0.016
#> SRR1364761 2 0.5539 0.5780 0.000 0.636 0.000 0.200 0.036 0.128
#> SRR1308086 3 0.5388 0.5574 0.000 0.000 0.672 0.056 0.164 0.108
#> SRR1441868 1 0.4129 0.7630 0.772 0.000 0.000 0.016 0.120 0.092
#> SRR1485380 3 0.2491 0.7252 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1073705 1 0.4081 0.7648 0.776 0.000 0.000 0.016 0.120 0.088
#> SRR615032 2 0.0458 0.6464 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.3889 0.6013 0.000 0.804 0.000 0.052 0.044 0.100
#> SRR1442983 2 0.5117 0.6222 0.000 0.688 0.000 0.152 0.032 0.128
#> SRR1100346 4 0.1701 0.5619 0.000 0.008 0.000 0.920 0.000 0.072
#> SRR1332816 1 0.4081 0.7648 0.776 0.000 0.000 0.016 0.120 0.088
#> SRR612299 6 0.4581 0.5951 0.000 0.016 0.000 0.368 0.020 0.596
#> SRR1407386 1 0.1124 0.7989 0.956 0.000 0.000 0.000 0.036 0.008
#> SRR1418064 2 0.5282 0.6054 0.000 0.672 0.000 0.164 0.036 0.128
#> SRR1309403 1 0.7088 -0.1168 0.420 0.000 0.000 0.192 0.288 0.100
#> SRR1498395 2 0.5790 0.4954 0.000 0.592 0.000 0.244 0.036 0.128
#> SRR1079998 5 0.5098 0.5052 0.076 0.000 0.304 0.000 0.608 0.012
#> SRR1498885 2 0.3889 0.6013 0.000 0.804 0.000 0.052 0.044 0.100
#> SRR1337215 6 0.4736 0.6160 0.000 0.024 0.000 0.344 0.024 0.608
#> SRR1414749 3 0.0146 0.8755 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1365963 5 0.4587 0.4672 0.000 0.000 0.316 0.004 0.632 0.048
#> SRR1368030 4 0.6106 0.3285 0.000 0.376 0.000 0.476 0.044 0.104
#> SRR1419760 4 0.2263 0.5914 0.008 0.012 0.000 0.912 0.032 0.036
#> SRR1381841 5 0.4985 0.1409 0.468 0.000 0.000 0.004 0.472 0.056
#> SRR821388 4 0.5623 0.4875 0.000 0.000 0.088 0.660 0.144 0.108
#> SRR657623 2 0.3889 0.6013 0.000 0.804 0.000 0.052 0.044 0.100
#> SRR1094241 3 0.0508 0.8737 0.000 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR819583 5 0.4444 0.2955 0.000 0.000 0.436 0.000 0.536 0.028
#> SRR1096149 1 0.4351 0.7536 0.756 0.000 0.000 0.020 0.120 0.104
#> SRR1342829 3 0.0260 0.8744 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1353028 1 0.0603 0.8075 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR811333 5 0.4665 0.4311 0.024 0.000 0.372 0.000 0.588 0.016
#> SRR1311666 2 0.5184 0.6195 0.000 0.684 0.000 0.152 0.036 0.128
#> SRR1486698 6 0.4617 0.5154 0.000 0.020 0.000 0.428 0.012 0.540
#> SRR1446436 4 0.5160 -0.1595 0.000 0.036 0.000 0.576 0.036 0.352
#> SRR815092 1 0.1124 0.7989 0.956 0.000 0.000 0.000 0.036 0.008
#> SRR1500149 6 0.5196 0.6017 0.000 0.252 0.000 0.144 0.000 0.604
#> SRR1100564 1 0.1719 0.7859 0.924 0.000 0.000 0.000 0.060 0.016
#> SRR1403072 3 0.0547 0.8684 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR811653 4 0.6161 0.5304 0.000 0.052 0.060 0.648 0.088 0.152
#> SRR1311348 2 0.5010 0.6281 0.000 0.700 0.000 0.144 0.032 0.124
#> SRR1489438 2 0.3697 0.6084 0.000 0.816 0.000 0.040 0.044 0.100
#> SRR1435442 6 0.5479 0.6691 0.000 0.124 0.000 0.244 0.020 0.612
#> SRR1421444 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0458 0.6464 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.4081 0.7648 0.776 0.000 0.000 0.016 0.120 0.088
#> SRR1444763 1 0.5439 0.6599 0.624 0.000 0.000 0.016 0.204 0.156
#> SRR1415026 2 0.1148 0.6407 0.000 0.960 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR1416596 2 0.5529 -0.1041 0.000 0.468 0.000 0.044 0.044 0.444
#> SRR1485499 2 0.3048 0.6195 0.000 0.848 0.000 0.008 0.044 0.100
#> SRR1316078 2 0.0520 0.6424 0.000 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR663465 2 0.3889 0.6013 0.000 0.804 0.000 0.052 0.044 0.100
#> SRR1310094 2 0.3889 0.6013 0.000 0.804 0.000 0.052 0.044 0.100
#> SRR663537 2 0.5010 0.6281 0.000 0.700 0.000 0.144 0.032 0.124
#> SRR1486780 1 0.4081 0.7648 0.776 0.000 0.000 0.016 0.120 0.088
#> SRR1453950 1 0.1148 0.8077 0.960 0.000 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR1087875 1 0.4081 0.7648 0.776 0.000 0.000 0.016 0.120 0.088
#> SRR613318 4 0.4854 0.5650 0.000 0.080 0.064 0.756 0.020 0.080
#> SRR1332694 1 0.1196 0.7976 0.952 0.000 0.000 0.000 0.040 0.008
#> SRR1468469 3 0.0458 0.8711 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR818670 2 0.5151 0.6187 0.000 0.684 0.000 0.156 0.032 0.128
#> SRR1120318 1 0.1967 0.7760 0.904 0.000 0.000 0.000 0.084 0.012
#> SRR1311622 5 0.5324 0.3465 0.000 0.000 0.340 0.000 0.540 0.120
#> SRR1500931 3 0.3868 -0.1678 0.000 0.000 0.508 0.000 0.492 0.000
#> SRR1387494 3 0.5665 0.4850 0.000 0.000 0.628 0.052 0.212 0.108
#> SRR1379175 4 0.5992 0.5195 0.000 0.136 0.000 0.620 0.092 0.152
#> SRR1401909 5 0.5353 0.5413 0.092 0.000 0.252 0.000 0.628 0.028
#> SRR1440541 2 0.2303 0.6501 0.000 0.904 0.000 0.024 0.020 0.052
#> SRR1068832 5 0.4224 0.4467 0.000 0.000 0.340 0.000 0.632 0.028
#> SRR1376640 4 0.4313 -0.4366 0.000 0.012 0.000 0.504 0.004 0.480
#> SRR1085712 2 0.1552 0.6478 0.000 0.940 0.000 0.036 0.004 0.020
#> SRR1082283 5 0.5335 0.3926 0.208 0.000 0.000 0.016 0.636 0.140
#> SRR1084276 5 0.4205 0.3349 0.420 0.000 0.000 0.000 0.564 0.016
#> SRR1353262 6 0.4118 0.3249 0.000 0.396 0.000 0.008 0.004 0.592
#> SRR1437035 1 0.5352 -0.1684 0.468 0.000 0.000 0.004 0.436 0.092
#> SRR1396877 5 0.4242 0.2849 0.448 0.000 0.000 0.000 0.536 0.016
#> SRR1443026 2 0.4672 0.6280 0.000 0.732 0.000 0.092 0.032 0.144
#> SRR1417936 1 0.0000 0.8072 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 6 0.5233 0.4558 0.000 0.332 0.000 0.112 0.000 0.556
#> SRR1101128 3 0.2378 0.7399 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1363886 2 0.3048 0.6195 0.000 0.848 0.000 0.008 0.044 0.100
#> SRR612983 2 0.0692 0.6467 0.000 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1394366 6 0.4570 0.5985 0.000 0.016 0.000 0.364 0.020 0.600
#> SRR1093218 3 0.5179 0.1146 0.000 0.000 0.516 0.000 0.392 0.092
#> SRR1077090 5 0.4322 0.4113 0.000 0.000 0.372 0.000 0.600 0.028
#> SRR1327430 4 0.5990 0.4095 0.000 0.308 0.000 0.540 0.044 0.108
#> SRR1088958 1 0.4081 0.7648 0.776 0.000 0.000 0.016 0.120 0.088
#> SRR1486931 4 0.5082 0.2813 0.000 0.132 0.000 0.696 0.036 0.136
#> SRR1086820 1 0.4783 0.7379 0.708 0.000 0.000 0.016 0.144 0.132
#> SRR1383000 1 0.1889 0.8047 0.920 0.000 0.000 0.004 0.056 0.020
#> SRR1355705 2 0.4049 0.6445 0.000 0.784 0.000 0.128 0.032 0.056
#> SRR614335 2 0.4065 0.5900 0.000 0.792 0.000 0.064 0.044 0.100
#> SRR660534 2 0.5117 0.6222 0.000 0.688 0.000 0.152 0.032 0.128
#> SRR817094 2 0.3880 0.6461 0.000 0.800 0.000 0.112 0.032 0.056
#> SRR1334265 2 0.4008 0.5940 0.000 0.796 0.000 0.060 0.044 0.100
#> SRR1456401 2 0.4290 0.5752 0.000 0.776 0.000 0.076 0.048 0.100
#> SRR1086393 1 0.4444 0.7549 0.736 0.000 0.000 0.016 0.164 0.084
#> SRR1351521 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093100 4 0.6257 0.4822 0.000 0.188 0.000 0.576 0.076 0.160
#> SRR1309382 1 0.2163 0.7702 0.892 0.000 0.000 0.000 0.092 0.016
#> SRR1089375 5 0.5215 0.4593 0.332 0.000 0.000 0.004 0.568 0.096
#> SRR1499482 4 0.5221 0.2737 0.000 0.152 0.000 0.680 0.036 0.132
#> SRR614719 4 0.1257 0.5927 0.000 0.028 0.000 0.952 0.000 0.020
#> SRR1081473 5 0.5497 0.3637 0.000 0.000 0.324 0.012 0.556 0.108
#> SRR1087415 1 0.4889 0.7270 0.696 0.000 0.000 0.016 0.152 0.136
#> SRR1088217 5 0.5517 0.5420 0.084 0.000 0.240 0.000 0.628 0.048
#> SRR808496 4 0.5068 0.5173 0.000 0.160 0.000 0.692 0.032 0.116
#> SRR1336463 2 0.6397 -0.4843 0.000 0.360 0.000 0.288 0.012 0.340
#> SRR612359 4 0.1480 0.5853 0.000 0.020 0.000 0.940 0.000 0.040
#> SRR1444412 1 0.4169 -0.0394 0.532 0.000 0.000 0.000 0.456 0.012
#> SRR1074116 3 0.0363 0.8728 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656095 2 0.5117 0.6222 0.000 0.688 0.000 0.152 0.032 0.128
#> SRR808914 1 0.1563 0.7892 0.932 0.000 0.000 0.000 0.056 0.012
#> SRR1349099 5 0.4955 0.5412 0.088 0.000 0.000 0.020 0.676 0.216
#> SRR1337886 6 0.6008 0.4139 0.000 0.160 0.000 0.412 0.012 0.416
#> SRR813632 1 0.1531 0.7898 0.928 0.000 0.000 0.000 0.068 0.004
#> SRR1101591 5 0.3862 0.2260 0.000 0.000 0.476 0.000 0.524 0.000
#> SRR1089713 5 0.4662 0.5733 0.228 0.000 0.008 0.004 0.692 0.068
#> SRR1453127 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 5 0.4037 0.4132 0.000 0.000 0.380 0.000 0.608 0.012
#> SRR1313831 1 0.1563 0.7892 0.932 0.000 0.000 0.000 0.056 0.012
#> SRR1315434 3 0.0260 0.8725 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR814747 2 0.3889 0.6013 0.000 0.804 0.000 0.052 0.044 0.100
#> SRR1358539 1 0.1010 0.7997 0.960 0.000 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1367807 1 0.4081 0.7648 0.776 0.000 0.000 0.016 0.120 0.088
#> SRR1365791 3 0.4781 0.4440 0.000 0.000 0.644 0.004 0.276 0.076
#> SRR1081519 5 0.3965 0.4011 0.000 0.000 0.388 0.000 0.604 0.008
#> SRR614707 6 0.4515 0.5916 0.000 0.008 0.000 0.356 0.028 0.608
#> SRR1094027 1 0.0146 0.8068 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1489092 5 0.4891 0.5384 0.012 0.000 0.180 0.004 0.696 0.108
#> SRR1079502 5 0.4979 0.4746 0.004 0.000 0.252 0.004 0.648 0.092
#> SRR1457814 4 0.6115 0.5365 0.000 0.088 0.044 0.652 0.068 0.148
#> SRR1455127 2 0.3697 0.6084 0.000 0.816 0.000 0.040 0.044 0.100
#> SRR615081 6 0.5464 0.6278 0.000 0.248 0.000 0.120 0.020 0.612
#> SRR1327855 3 0.2491 0.7262 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1417873 2 0.5558 0.3367 0.000 0.632 0.000 0.220 0.044 0.104
#> SRR1394125 3 0.4268 0.5168 0.000 0.000 0.684 0.004 0.272 0.040
#> SRR1488388 1 0.4081 0.7648 0.776 0.000 0.000 0.016 0.120 0.088
#> SRR1401122 2 0.3889 0.6013 0.000 0.804 0.000 0.052 0.044 0.100
#> SRR612383 4 0.1218 0.5982 0.000 0.028 0.004 0.956 0.000 0.012
#> SRR1477711 1 0.1010 0.7997 0.960 0.000 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1350813 4 0.5042 0.3085 0.000 0.124 0.000 0.700 0.036 0.140
#> SRR612851 4 0.2113 0.5591 0.000 0.028 0.000 0.908 0.004 0.060
#> SRR1086349 1 0.0260 0.8076 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR812837 2 0.0547 0.6468 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1340010 4 0.7020 0.2538 0.000 0.000 0.236 0.460 0.196 0.108
#> SRR1475885 6 0.4476 0.3213 0.000 0.000 0.000 0.064 0.272 0.664
#> SRR1376334 1 0.1563 0.7892 0.932 0.000 0.000 0.000 0.056 0.012
#> SRR1399821 1 0.4593 0.7390 0.728 0.000 0.000 0.016 0.120 0.136
#> SRR1347042 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612323 4 0.1644 0.5969 0.000 0.004 0.052 0.932 0.000 0.012
#> SRR612604 6 0.5473 0.6372 0.000 0.236 0.000 0.128 0.020 0.616
#> SRR1389546 2 0.5117 0.6222 0.000 0.688 0.000 0.152 0.032 0.128
#> SRR1311877 1 0.0622 0.8080 0.980 0.000 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1465608 5 0.4970 0.4762 0.204 0.000 0.000 0.016 0.676 0.104
#> SRR1101808 2 0.5117 0.6222 0.000 0.688 0.000 0.152 0.032 0.128
#> SRR1414079 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331153 6 0.5383 0.6120 0.000 0.244 0.000 0.156 0.004 0.596
#> SRR1078439 5 0.6484 0.3246 0.000 0.000 0.272 0.208 0.480 0.040
#> SRR2165527 2 0.3628 0.6102 0.000 0.820 0.000 0.036 0.044 0.100
#> SRR1351147 1 0.3994 0.6665 0.768 0.000 0.000 0.004 0.136 0.092
#> SRR1313536 6 0.5032 0.1598 0.000 0.468 0.000 0.060 0.004 0.468
#> SRR1070308 2 0.8280 0.1686 0.108 0.368 0.000 0.272 0.116 0.136
#> SRR1403110 1 0.1625 0.7870 0.928 0.000 0.000 0.000 0.060 0.012
#> SRR1400355 2 0.5487 0.5807 0.000 0.644 0.000 0.192 0.036 0.128
#> SRR1401317 5 0.4184 0.1847 0.000 0.000 0.488 0.000 0.500 0.012
#> SRR1456862 5 0.5934 -0.1081 0.396 0.000 0.000 0.016 0.452 0.136
#> SRR1074622 1 0.2501 0.7970 0.888 0.000 0.000 0.012 0.072 0.028
#> SRR1465847 5 0.3817 0.3271 0.000 0.000 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR1443376 2 0.5117 0.6222 0.000 0.688 0.000 0.152 0.032 0.128
#> SRR1471312 3 0.0363 0.8728 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1075579 1 0.0935 0.8011 0.964 0.000 0.000 0.000 0.032 0.004
#> SRR1090881 4 0.2894 0.5687 0.000 0.000 0.088 0.864 0.020 0.028
#> SRR612251 4 0.6039 0.3541 0.000 0.356 0.000 0.500 0.044 0.100
#> SRR1418581 1 0.4081 0.7648 0.776 0.000 0.000 0.016 0.120 0.088
#> SRR658045 2 0.5117 0.6222 0.000 0.688 0.000 0.152 0.032 0.128
#> SRR613214 4 0.1826 0.5804 0.000 0.020 0.004 0.924 0.000 0.052
#> SRR613078 6 0.5043 0.6412 0.000 0.056 0.000 0.312 0.020 0.612
#> SRR1472998 5 0.4470 0.5303 0.052 0.000 0.256 0.000 0.684 0.008
#> SRR1433452 2 0.6485 0.1520 0.000 0.408 0.000 0.376 0.036 0.180
#> SRR1101957 1 0.1059 0.8079 0.964 0.000 0.000 0.004 0.016 0.016
#> SRR1487993 3 0.1633 0.8372 0.000 0.000 0.932 0.000 0.044 0.024
#> SRR1465983 2 0.5117 0.6222 0.000 0.688 0.000 0.152 0.032 0.128
#> SRR1380375 1 0.1124 0.7989 0.956 0.000 0.000 0.000 0.036 0.008
#> SRR1367566 3 0.0146 0.8747 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1316151 6 0.4925 0.5027 0.000 0.040 0.000 0.344 0.020 0.596
#> SRR1417547 2 0.3889 0.6013 0.000 0.804 0.000 0.052 0.044 0.100
#> SRR659389 2 0.5045 0.6267 0.000 0.696 0.000 0.148 0.032 0.124
#> SRR1490270 6 0.5307 0.6508 0.000 0.128 0.000 0.276 0.004 0.592
#> SRR1398207 5 0.4227 0.4517 0.344 0.000 0.004 0.000 0.632 0.020
#> SRR1358755 5 0.4998 0.5387 0.088 0.000 0.252 0.000 0.648 0.012
#> SRR1078903 4 0.5221 0.2777 0.000 0.152 0.000 0.680 0.036 0.132
#> SRR1323252 2 0.5010 0.6281 0.000 0.700 0.000 0.144 0.032 0.124
#> SRR1451796 2 0.5374 0.5984 0.000 0.660 0.000 0.176 0.036 0.128
#> SRR1369172 1 0.5496 0.6325 0.608 0.000 0.000 0.016 0.236 0.140
#> SRR615982 4 0.1080 0.5936 0.000 0.032 0.000 0.960 0.004 0.004
#> SRR1480431 2 0.6009 0.3055 0.000 0.540 0.000 0.308 0.048 0.104
#> SRR1429825 6 0.5614 0.4671 0.000 0.160 0.000 0.292 0.004 0.544
#> SRR1102393 2 0.5045 0.6267 0.000 0.696 0.000 0.148 0.032 0.124
#> SRR1071313 5 0.5027 0.5390 0.160 0.000 0.000 0.016 0.680 0.144
#> SRR808351 1 0.1059 0.8079 0.964 0.000 0.000 0.004 0.016 0.016
#> SRR1317513 1 0.1124 0.7989 0.956 0.000 0.000 0.000 0.036 0.008
#> SRR1480501 5 0.4938 0.3778 0.000 0.000 0.340 0.000 0.580 0.080
#> SRR1081910 5 0.5321 0.5083 0.308 0.000 0.080 0.000 0.592 0.020
#> SRR1086611 6 0.4520 0.4520 0.000 0.000 0.000 0.448 0.032 0.520
#> SRR1392571 4 0.1401 0.5916 0.000 0.028 0.000 0.948 0.004 0.020
#> SRR1311441 1 0.4129 0.7630 0.772 0.000 0.000 0.016 0.120 0.092
#> SRR808152 1 0.1148 0.8077 0.960 0.000 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR657313 3 0.2765 0.8011 0.000 0.000 0.872 0.056 0.064 0.008
#> SRR1433131 6 0.5457 0.6432 0.000 0.216 0.000 0.160 0.012 0.612
#> SRR1321011 2 0.3588 0.6473 0.000 0.824 0.000 0.092 0.032 0.052
#> SRR1500598 2 0.2937 0.6204 0.000 0.852 0.000 0.004 0.044 0.100
#> SRR1379343 2 0.6072 0.4156 0.000 0.540 0.000 0.280 0.036 0.144
#> SRR1389108 1 0.4081 0.7648 0.776 0.000 0.000 0.016 0.120 0.088
#> SRR1376228 3 0.0146 0.8755 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1399757 1 0.0713 0.8027 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1358060 3 0.0146 0.8755 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1464517 5 0.5557 0.3436 0.000 0.000 0.340 0.008 0.532 0.120
#> SRR613557 4 0.1867 0.5881 0.000 0.000 0.064 0.916 0.000 0.020
#> SRR809831 1 0.4147 0.0291 0.552 0.000 0.000 0.000 0.436 0.012
#> SRR1429387 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.8072 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.8072 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 5 0.5413 0.4185 0.004 0.000 0.288 0.008 0.592 0.108
#> SRR1072031 2 0.5010 0.6281 0.000 0.700 0.000 0.144 0.032 0.124
#> SRR1374671 4 0.0790 0.5975 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.986 0.995 0.4992 0.501 0.501
#> 3 3 0.980 0.952 0.980 0.3049 0.819 0.650
#> 4 4 0.936 0.907 0.956 0.1461 0.856 0.613
#> 5 5 0.829 0.793 0.879 0.0494 0.952 0.814
#> 6 6 0.784 0.636 0.769 0.0432 0.935 0.725
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
#> attr(,"optional")
#> [1] 2 3
There is also optional best \(k\) = 2 3 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.9170 0.498 0.668 0.332
#> SRR1394209 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1391619 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1403980 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1442800 2 0.9866 0.244 0.432 0.568
#> SRR1359214 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1093053 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1399843 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1380231 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1096736 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1478700 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1384754 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1380317 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1315247 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1456075 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1417154 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1325771 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1360420 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1072948 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1362848 1 0.0938 0.984 0.988 0.012
#> SRR1407492 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1454868 1 0.9795 0.283 0.584 0.416
#> SRR1474816 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR614695 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1325871 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1092112 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1078834 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1419062 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1315739 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1091890 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1327473 1 0.0672 0.988 0.992 0.008
#> SRR1338195 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR614887 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1354620 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1389157 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR613568 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1446180 2 0.9775 0.302 0.412 0.588
#> SRR1406372 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1353136 1 0.0376 0.992 0.996 0.004
#> SRR1093906 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1399861 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1338789 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1421420 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1352870 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1315041 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1420006 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1472749 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1478341 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1479699 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR659427 1 0.0672 0.988 0.992 0.008
#> SRR1096638 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1439994 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1374270 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1456274 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR820049 1 0.6887 0.772 0.816 0.184
#> SRR1375290 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR818999 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1332187 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR603365 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1485380 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1309403 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1414749 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1419760 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1381841 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR821388 2 0.7815 0.698 0.232 0.768
#> SRR657623 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR819583 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1403072 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR811653 2 0.9944 0.163 0.456 0.544
#> SRR1311348 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR613318 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1468469 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1500931 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1379175 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1401909 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1101128 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1093218 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1077090 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1101591 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1453127 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1315434 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1365791 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1081519 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR614707 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1079502 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1457814 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1455127 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1475885 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1376334 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1347042 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.7139 0.754 0.196 0.804
#> SRR1403110 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1090881 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR612251 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1487993 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1367566 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1480501 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1086611 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1392571 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR657313 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1376228 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1358060 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1464517 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR613557 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR809831 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.0000 0.996 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.993 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR614491 3 0.6307 0.0594 0.000 0.488 0.512
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.4807 0.8382 0.848 0.060 0.092
#> SRR1394209 2 0.0237 0.9858 0.000 0.996 0.004
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.3551 0.8469 0.868 0.000 0.132
#> SRR1500555 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR612515 3 0.6280 0.1600 0.000 0.460 0.540
#> SRR1092727 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468553 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420169 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442800 3 0.5070 0.7034 0.004 0.224 0.772
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.4062 0.8076 0.836 0.000 0.164
#> SRR1500030 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093053 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399843 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380231 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR809470 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.4291 0.7862 0.820 0.000 0.180
#> SRR1478700 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081543 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384754 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.6299 0.0746 0.000 0.524 0.476
#> SRR1315247 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456075 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095985 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1325771 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076916 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472370 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362848 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407492 2 0.4121 0.7913 0.000 0.832 0.168
#> SRR1455082 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443161 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR614695 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.1964 0.9264 0.944 0.000 0.056
#> SRR1105463 1 0.4062 0.8076 0.836 0.000 0.164
#> SRR811005 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355415 3 0.6154 0.2920 0.408 0.000 0.592
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.1163 0.9622 0.000 0.972 0.028
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.4974 0.7038 0.764 0.000 0.236
#> SRR1321165 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074790 2 0.4291 0.7736 0.180 0.820 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.2165 0.9234 0.000 0.936 0.064
#> SRR1078834 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.0237 0.9712 0.996 0.000 0.004
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327473 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338195 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354620 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.5363 0.6300 0.724 0.000 0.276
#> SRR1391529 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 3 0.2066 0.9060 0.000 0.060 0.940
#> SRR613568 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353136 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399861 3 0.5650 0.5514 0.000 0.312 0.688
#> SRR1338789 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315041 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443268 1 0.5058 0.6907 0.756 0.000 0.244
#> SRR1416617 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420006 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098312 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088606 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1479699 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR659427 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR659307 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1439994 3 0.6252 0.1783 0.444 0.000 0.556
#> SRR1454931 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374270 2 0.5254 0.6312 0.000 0.736 0.264
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456274 1 0.6140 0.3454 0.596 0.000 0.404
#> SRR817744 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.4452 0.7697 0.808 0.000 0.192
#> SRR820049 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375290 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR818999 1 0.1031 0.9548 0.976 0.000 0.024
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332187 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.2261 0.9135 0.932 0.000 0.068
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.4555 0.7337 0.200 0.000 0.800
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414749 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365963 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419760 2 0.0747 0.9739 0.000 0.984 0.016
#> SRR1381841 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR821388 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR657623 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR811653 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR613318 3 0.5327 0.6282 0.000 0.272 0.728
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500931 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387494 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379175 2 0.6079 0.3633 0.000 0.612 0.388
#> SRR1401909 3 0.4842 0.6962 0.224 0.000 0.776
#> SRR1440541 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.3116 0.8740 0.892 0.000 0.108
#> SRR1084276 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101128 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093218 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077090 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093100 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0592 0.9649 0.988 0.000 0.012
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081473 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 3 0.3686 0.8171 0.140 0.000 0.860
#> SRR808496 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.3686 0.8401 0.860 0.000 0.140
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089713 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498354 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081519 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR614707 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079502 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457814 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327855 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475885 1 0.6045 0.4059 0.620 0.000 0.380
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR612323 2 0.6168 0.2846 0.000 0.588 0.412
#> SRR612604 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.6154 0.3318 0.592 0.000 0.408
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078439 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.4504 0.7494 0.196 0.804 0.000
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR612251 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472998 3 0.0237 0.9637 0.004 0.000 0.996
#> SRR1433452 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398207 1 0.2878 0.8870 0.904 0.000 0.096
#> SRR1358755 3 0.1163 0.9415 0.028 0.000 0.972
#> SRR1078903 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.5138 0.6772 0.748 0.000 0.252
#> SRR808351 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081910 3 0.6126 0.3084 0.400 0.000 0.600
#> SRR1086611 3 0.4605 0.7390 0.000 0.204 0.796
#> SRR1392571 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR613557 3 0.1031 0.9436 0.000 0.024 0.976
#> SRR809831 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9743 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.0000 0.9673 0.000 0.000 1.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.9896 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1472057 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614491 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811964 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1361415 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 4 0.6533 0.6941 0.168 0.040 0.096 0.696
#> SRR1394209 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099809 3 0.4999 0.0974 0.492 0.000 0.508 0.000
#> SRR1500555 4 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1307997 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR663124 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1092727 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1364013 4 0.4776 0.4551 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1468553 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420169 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442800 4 0.3688 0.7201 0.000 0.000 0.208 0.792
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499849 3 0.4941 0.2799 0.436 0.000 0.564 0.000
#> SRR1500030 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093053 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399843 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380231 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809470 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614239 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR613939 4 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR811357 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1471672 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613006 4 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1469570 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1457354 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813608 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1096736 2 0.7768 0.1167 0.360 0.400 0.240 0.000
#> SRR1478700 1 0.1302 0.9389 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1081543 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384754 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.0524 0.9398 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1315247 4 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1105344 2 0.1211 0.9188 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR658549 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR612551 2 0.4477 0.5131 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1358520 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456075 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389474 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1367005 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095985 3 0.0592 0.9269 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1325771 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660272 4 0.0336 0.9436 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 4 0.1302 0.9585 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR808044 1 0.3172 0.7941 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1076916 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.4989 0.0450 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1456114 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613843 4 0.0336 0.9436 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1469192 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659839 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR659533 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1362848 2 0.4898 0.3091 0.000 0.584 0.416 0.000
#> SRR1407492 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1455082 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR658362 2 0.1716 0.8953 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR810921 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR662823 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.0336 0.9324 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1474816 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466400 4 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658921 4 0.3837 0.6952 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1499873 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1101373 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1396166 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454891 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR663185 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656758 4 0.1302 0.9585 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660450 4 0.0336 0.9436 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334291 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1415153 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1323271 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368939 4 0.0336 0.9436 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1443161 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614695 4 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612779 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.4134 0.6274 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1105463 3 0.4972 0.2200 0.456 0.000 0.544 0.000
#> SRR811005 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355415 3 0.4790 0.4244 0.380 0.000 0.620 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 3 0.4817 0.4064 0.388 0.000 0.612 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074790 4 0.5678 0.7066 0.172 0.112 0.000 0.716
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655756 4 0.1302 0.9585 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1458314 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318582 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1080484 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 4 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078834 4 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.2281 0.8803 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.1118 0.9219 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR614984 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1324269 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.1211 0.9188 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0188 0.9439 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1345523 2 0.4977 0.0885 0.000 0.540 0.000 0.460
#> SRR1500846 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099189 4 0.4477 0.5889 0.000 0.312 0.000 0.688
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347436 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1327473 1 0.0188 0.9791 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1338195 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809698 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658271 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1339597 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354620 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.4877 0.2741 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0469 0.9397 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.3219 0.8133 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1435330 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615383 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1389157 4 0.1305 0.9334 0.000 0.004 0.036 0.960
#> SRR613568 4 0.0336 0.9436 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR614095 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 3 0.0592 0.9269 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809089 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1446180 3 0.2647 0.8402 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1406372 2 0.1211 0.9188 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1339880 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353136 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.4948 0.1620 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399861 2 0.0524 0.9398 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1338789 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.4661 0.4523 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1315041 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443268 3 0.4804 0.4155 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR1416617 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655672 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1420006 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458267 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR613819 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1470727 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 4 0.0336 0.9436 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1098312 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR810273 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1376000 4 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088606 3 0.1211 0.9091 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1479699 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403589 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR812625 4 0.4679 0.4305 0.000 0.352 0.000 0.648
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.3400 0.7935 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1378992 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659427 2 0.4072 0.6416 0.000 0.748 0.252 0.000
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.1211 0.9188 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR659307 3 0.3444 0.7535 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1439994 3 0.4746 0.4511 0.368 0.000 0.632 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.2345 0.8754 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1374270 2 0.0592 0.9341 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365598 4 0.3764 0.7083 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR662787 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408727 2 0.0188 0.9438 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1456274 3 0.4250 0.6195 0.276 0.000 0.724 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387379 4 0.4898 0.3473 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR1102680 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 3 0.4877 0.3566 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR820049 3 0.0188 0.9352 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1375290 3 0.0336 0.9324 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR818999 1 0.4406 0.5417 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 4 0.0336 0.9436 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1454629 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332187 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR657833 4 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436207 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1308086 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442983 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1100346 4 0.0336 0.9466 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1332816 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612299 4 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1309403 1 0.2589 0.8530 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1498395 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1079998 3 0.3610 0.7388 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337215 4 0.3123 0.8000 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR1414749 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365963 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419760 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1381841 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821388 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR657623 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311666 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1486698 4 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446436 4 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 4 0.0336 0.9436 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR811653 3 0.4049 0.6974 0.000 0.212 0.780 0.008
#> SRR1311348 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435442 4 0.0336 0.9436 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1421444 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.1211 0.9188 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663537 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613318 2 0.1151 0.9253 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818670 4 0.1302 0.9585 0.000 0.044 0.000 0.956
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500931 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387494 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379175 2 0.0469 0.9379 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1401909 3 0.3610 0.7388 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1440541 2 0.0592 0.9348 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1068832 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376640 4 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0188 0.9437 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1082283 1 0.4843 0.2927 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.2973 0.8365 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1437035 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0188 0.9791 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1443026 4 0.4331 0.6516 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.1211 0.9188 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1101128 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394366 4 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093218 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077090 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.4907 0.2293 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR614335 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660534 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR817094 2 0.4855 0.2872 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1334265 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.3801 0.7013 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1499482 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR614719 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1081473 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 3 0.1302 0.9023 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336463 2 0.0707 0.9335 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR612359 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1444412 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656095 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR808914 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 3 0.5000 0.0777 0.496 0.000 0.504 0.000
#> SRR1337886 4 0.1118 0.9574 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR813632 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089713 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498354 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081519 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614707 4 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079502 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457814 2 0.1635 0.9061 0.000 0.948 0.044 0.008
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615081 2 0.4072 0.6888 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1327855 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612383 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR612851 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475885 3 0.6532 0.2200 0.420 0.000 0.504 0.076
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612323 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR612604 4 0.0336 0.9436 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1389546 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 3 0.4776 0.4336 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1101808 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1414079 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331153 4 0.0336 0.9436 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1078439 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313536 4 0.0921 0.9358 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1070308 4 0.5689 0.6951 0.184 0.104 0.000 0.712
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1401317 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443376 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1471312 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.3726 0.7140 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR612251 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658045 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR613214 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR613078 4 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472998 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433452 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465983 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.2589 0.8658 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1417547 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659389 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1490270 4 0.0336 0.9436 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1398207 3 0.4948 0.2703 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR1358755 3 0.0188 0.9349 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1078903 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1323252 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1451796 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615982 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1480431 2 0.0336 0.9409 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1429825 2 0.1211 0.9188 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1102393 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1071313 3 0.4605 0.5148 0.336 0.000 0.664 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081910 3 0.3356 0.7675 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR1086611 4 0.0000 0.9424 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1392571 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1311441 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433131 4 0.0336 0.9436 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1321011 2 0.0336 0.9410 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9462 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379343 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613557 4 0.1356 0.9371 0.000 0.008 0.032 0.960
#> SRR809831 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9828 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.0000 0.9379 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072031 4 0.1389 0.9580 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1374671 4 0.1211 0.9587 0.000 0.040 0.000 0.960
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9375 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.2068 0.8630 0.000 0.000 0.904 0.092 0.004
#> SRR614491 2 0.5500 0.5611 0.000 0.640 0.084 0.268 0.008
#> SRR1069376 1 0.0566 0.9370 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR811964 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1345715 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1328073 2 0.4327 0.6276 0.104 0.780 0.112 0.004 0.000
#> SRR1394209 5 0.0451 0.9042 0.004 0.008 0.000 0.000 0.988
#> SRR1474018 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1099809 3 0.6093 0.4158 0.348 0.000 0.536 0.108 0.008
#> SRR1500555 2 0.4383 0.4446 0.000 0.572 0.000 0.424 0.004
#> SRR1354363 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1391619 3 0.3333 0.7360 0.000 0.000 0.788 0.208 0.004
#> SRR1307997 2 0.1043 0.8267 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR663124 2 0.3861 0.6573 0.000 0.728 0.000 0.264 0.008
#> SRR1334670 1 0.0671 0.9350 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR612515 2 0.5449 0.5664 0.000 0.644 0.080 0.268 0.008
#> SRR1092727 2 0.0703 0.8341 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1364013 2 0.2674 0.7074 0.000 0.856 0.000 0.004 0.140
#> SRR1468553 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420169 3 0.2068 0.8630 0.000 0.000 0.904 0.092 0.004
#> SRR1442800 4 0.6141 0.6058 0.024 0.224 0.132 0.620 0.000
#> SRR1359214 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1499849 3 0.5895 0.5408 0.292 0.000 0.592 0.108 0.008
#> SRR1500030 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093053 3 0.2516 0.8017 0.000 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1399843 3 0.1768 0.8751 0.000 0.000 0.924 0.072 0.004
#> SRR1380231 3 0.1892 0.8675 0.000 0.000 0.916 0.080 0.004
#> SRR809470 3 0.2411 0.8544 0.000 0.000 0.884 0.108 0.008
#> SRR614239 2 0.5171 0.5910 0.000 0.664 0.060 0.268 0.008
#> SRR613939 4 0.4201 0.6729 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR612971 5 0.1908 0.8548 0.000 0.092 0.000 0.000 0.908
#> SRR1490204 2 0.0510 0.8372 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR613006 4 0.4287 0.6166 0.000 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1362906 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0162 0.9373 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR813608 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 5 0.6338 0.4496 0.188 0.000 0.148 0.040 0.624
#> SRR1478700 1 0.3765 0.8384 0.820 0.000 0.048 0.124 0.008
#> SRR1081543 3 0.0162 0.8804 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1384754 3 0.0451 0.8813 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR612287 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1380317 5 0.3910 0.6544 0.000 0.008 0.004 0.248 0.740
#> SRR1315247 4 0.4171 0.6725 0.000 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR1105344 4 0.5077 0.2685 0.000 0.036 0.000 0.536 0.428
#> SRR658549 2 0.3885 0.6543 0.000 0.724 0.000 0.268 0.008
#> SRR1480240 1 0.0671 0.9350 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1084816 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.3143 0.6122 0.000 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1358520 5 0.0510 0.9103 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1419476 3 0.0865 0.8798 0.000 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1456075 3 0.2068 0.8630 0.000 0.000 0.904 0.092 0.004
#> SRR1389474 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1334419 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1417154 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095985 3 0.3728 0.7502 0.000 0.000 0.748 0.244 0.008
#> SRR1325771 1 0.0162 0.9373 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1360420 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660272 4 0.4278 0.6306 0.000 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9375 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808044 1 0.4868 0.7383 0.740 0.000 0.124 0.128 0.008
#> SRR1076916 3 0.1704 0.8708 0.000 0.000 0.928 0.068 0.004
#> SRR1356266 1 0.1357 0.9361 0.948 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR1341983 2 0.6003 0.1658 0.000 0.584 0.000 0.224 0.192
#> SRR1456114 1 0.1502 0.9284 0.940 0.000 0.000 0.056 0.004
#> SRR1072948 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.2068 0.8630 0.000 0.000 0.904 0.092 0.004
#> SRR1480176 1 0.0451 0.9366 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR613843 2 0.3612 0.3468 0.000 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.9375 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362848 5 0.4235 0.4692 0.000 0.000 0.336 0.008 0.656
#> SRR1407492 2 0.5449 0.5662 0.000 0.644 0.080 0.268 0.008
#> SRR1455082 2 0.1043 0.8293 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR658362 5 0.4369 0.6206 0.000 0.208 0.000 0.052 0.740
#> SRR810921 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662823 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1456375 3 0.1831 0.8683 0.000 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR818232 1 0.1124 0.9288 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1454868 3 0.3861 0.6748 0.000 0.000 0.728 0.264 0.008
#> SRR1474816 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9375 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1466400 4 0.4210 0.6722 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR658921 4 0.5754 0.6688 0.000 0.292 0.000 0.588 0.120
#> SRR1499873 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1090145 1 0.1704 0.9104 0.928 0.000 0.000 0.068 0.004
#> SRR1379324 1 0.1502 0.9284 0.940 0.000 0.000 0.056 0.004
#> SRR1345307 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0162 0.8818 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1454891 2 0.3551 0.6971 0.000 0.772 0.000 0.220 0.008
#> SRR663185 5 0.0510 0.9103 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR811819 1 0.0451 0.9366 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1318920 1 0.2389 0.9042 0.880 0.000 0.000 0.116 0.004
#> SRR656758 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0162 0.9373 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR660450 4 0.4256 0.6510 0.000 0.436 0.000 0.564 0.000
#> SRR1472687 5 0.1792 0.8627 0.000 0.084 0.000 0.000 0.916
#> SRR1334291 2 0.0703 0.8341 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1415153 2 0.0162 0.8406 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1323271 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1368939 4 0.4287 0.6166 0.000 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR1443161 3 0.2848 0.8076 0.000 0.000 0.840 0.156 0.004
#> SRR614695 4 0.4192 0.6720 0.000 0.404 0.000 0.596 0.000
#> SRR1092372 1 0.2660 0.8981 0.864 0.000 0.000 0.128 0.008
#> SRR1474577 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1406582 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR612779 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1354071 1 0.6097 -0.0150 0.476 0.000 0.420 0.096 0.008
#> SRR1105463 3 0.6058 0.4460 0.336 0.000 0.548 0.108 0.008
#> SRR811005 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.1357 0.9241 0.948 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR1325871 3 0.3607 0.6997 0.000 0.000 0.752 0.244 0.004
#> SRR1355415 3 0.5801 0.5773 0.272 0.000 0.612 0.108 0.008
#> SRR1090861 1 0.0162 0.9373 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1320712 5 0.1186 0.8886 0.000 0.008 0.008 0.020 0.964
#> SRR1470075 1 0.1502 0.9284 0.940 0.000 0.000 0.056 0.004
#> SRR1091254 1 0.0451 0.9366 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1101397 3 0.6041 0.5395 0.272 0.000 0.588 0.132 0.008
#> SRR1321165 1 0.3246 0.8554 0.808 0.000 0.000 0.184 0.008
#> SRR1092112 3 0.2068 0.8630 0.000 0.000 0.904 0.092 0.004
#> SRR1417588 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.1608 0.7731 0.072 0.928 0.000 0.000 0.000
#> SRR1432106 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR655756 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.2389 0.8941 0.880 0.000 0.000 0.116 0.004
#> SRR1318582 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1072749 1 0.0290 0.9376 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1078586 1 0.0451 0.9366 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1400333 4 0.2605 0.5477 0.000 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR1078834 4 0.3796 0.6326 0.000 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1417611 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1396840 1 0.4935 0.7573 0.720 0.000 0.068 0.200 0.012
#> SRR1465440 5 0.1851 0.8589 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1400530 5 0.4441 0.5828 0.000 0.044 0.000 0.236 0.720
#> SRR614984 2 0.4983 0.6057 0.000 0.676 0.048 0.268 0.008
#> SRR1324269 1 0.0865 0.9337 0.972 0.000 0.000 0.024 0.004
#> SRR1401491 4 0.5256 0.2885 0.000 0.048 0.000 0.532 0.420
#> SRR1319443 1 0.0771 0.9343 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1324349 5 0.0771 0.9103 0.000 0.020 0.000 0.004 0.976
#> SRR1345523 2 0.2561 0.6995 0.000 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1500846 1 0.1502 0.9284 0.940 0.000 0.000 0.056 0.004
#> SRR661505 3 0.2674 0.8519 0.000 0.000 0.856 0.140 0.004
#> SRR1419062 3 0.1768 0.8696 0.000 0.000 0.924 0.072 0.004
#> SRR1480131 1 0.2179 0.8900 0.896 0.000 0.000 0.100 0.004
#> SRR1421284 5 0.0510 0.9103 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1329624 1 0.0451 0.9366 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1315739 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.4968 0.6132 0.000 0.712 0.000 0.136 0.152
#> SRR1083286 1 0.0771 0.9348 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1091890 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.2286 0.7820 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1327473 1 0.1965 0.8612 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1338195 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR658271 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.2660 0.8814 0.864 0.000 0.000 0.128 0.008
#> SRR1454842 3 0.2966 0.7638 0.000 0.000 0.816 0.184 0.000
#> SRR1322643 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR614887 3 0.1608 0.8496 0.000 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1354620 3 0.2411 0.8544 0.000 0.000 0.884 0.108 0.008
#> SRR615056 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1105320 1 0.4814 0.2428 0.568 0.000 0.412 0.016 0.004
#> SRR1391529 1 0.0671 0.9350 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR663052 5 0.4203 0.6561 0.000 0.188 0.000 0.052 0.760
#> SRR1478834 1 0.0671 0.9350 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR812366 4 0.5408 0.3298 0.000 0.060 0.000 0.532 0.408
#> SRR1435330 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 2 0.5550 0.5557 0.000 0.636 0.088 0.268 0.008
#> SRR613568 4 0.4278 0.6306 0.000 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR614095 5 0.1410 0.8819 0.000 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1103092 1 0.1041 0.9319 0.964 0.000 0.000 0.032 0.004
#> SRR1337155 3 0.4009 0.7110 0.000 0.000 0.684 0.312 0.004
#> SRR1475345 5 0.1197 0.8915 0.000 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR809089 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 4 0.3821 0.4235 0.000 0.020 0.216 0.764 0.000
#> SRR1406372 4 0.4957 0.2311 0.000 0.028 0.000 0.528 0.444
#> SRR1339880 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353136 3 0.3579 0.7037 0.000 0.000 0.756 0.240 0.004
#> SRR1093906 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.2732 0.6776 0.000 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1351104 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1363926 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1399861 5 0.4506 0.6209 0.000 0.004 0.036 0.244 0.716
#> SRR1338789 1 0.2488 0.8924 0.872 0.000 0.000 0.124 0.004
#> SRR1421420 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420832 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9375 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.4993 0.6019 0.000 0.056 0.672 0.268 0.004
#> SRR1315041 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR661877 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1443268 3 0.6022 0.5462 0.268 0.000 0.592 0.132 0.008
#> SRR1416617 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR655672 2 0.3885 0.6543 0.000 0.724 0.000 0.268 0.008
#> SRR1420006 3 0.0162 0.8818 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1458267 2 0.1043 0.8267 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR613819 5 0.0510 0.9103 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1469432 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR660907 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1465092 2 0.0290 0.8397 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1470727 1 0.0703 0.9343 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1339153 3 0.2516 0.8017 0.000 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414379 5 0.0510 0.9103 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1431326 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1487278 4 0.4210 0.6722 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR1098312 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.1043 0.8043 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR614467 5 0.0404 0.9074 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR811471 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1478341 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088606 4 0.3932 0.2341 0.000 0.000 0.328 0.672 0.000
#> SRR1479699 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812625 4 0.6285 0.6094 0.000 0.220 0.000 0.536 0.244
#> SRR1359803 1 0.1124 0.9288 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1338988 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1471222 4 0.4902 0.1835 0.000 0.024 0.000 0.508 0.468
#> SRR1378992 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR659427 5 0.4300 0.6668 0.000 0.000 0.132 0.096 0.772
#> SRR1096638 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1466619 4 0.4287 0.1946 0.000 0.000 0.000 0.540 0.460
#> SRR659307 3 0.6589 0.3184 0.000 0.212 0.516 0.264 0.008
#> SRR1439994 3 0.5939 0.5741 0.252 0.000 0.608 0.132 0.008
#> SRR1454931 1 0.2629 0.8679 0.860 0.000 0.000 0.136 0.004
#> SRR1332928 3 0.2865 0.8406 0.004 0.000 0.856 0.132 0.008
#> SRR658621 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1095840 1 0.0671 0.9350 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1458243 1 0.4677 0.7612 0.756 0.000 0.104 0.132 0.008
#> SRR1374270 5 0.0579 0.9017 0.000 0.008 0.008 0.000 0.984
#> SRR1470947 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1365598 4 0.5776 0.6683 0.000 0.288 0.000 0.588 0.124
#> SRR662787 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1408727 5 0.0404 0.9074 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1456274 3 0.5965 0.5307 0.272 0.000 0.596 0.124 0.008
#> SRR817744 1 0.0162 0.9373 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1478744 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1387379 2 0.1908 0.7615 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1102680 3 0.1638 0.8716 0.000 0.000 0.932 0.064 0.004
#> SRR1374198 1 0.2249 0.9157 0.896 0.000 0.000 0.096 0.008
#> SRR1445856 3 0.6104 0.5439 0.256 0.000 0.588 0.148 0.008
#> SRR820049 3 0.3715 0.6834 0.000 0.000 0.736 0.260 0.004
#> SRR1375290 3 0.3741 0.6792 0.000 0.000 0.732 0.264 0.004
#> SRR818999 1 0.6123 0.1880 0.524 0.000 0.360 0.108 0.008
#> SRR1390242 1 0.0671 0.9350 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1401164 4 0.4249 0.6545 0.000 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR1454629 1 0.3013 0.8439 0.832 0.000 0.000 0.160 0.008
#> SRR1332187 3 0.0162 0.8818 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR603365 3 0.0955 0.8803 0.000 0.000 0.968 0.028 0.004
#> SRR657833 2 0.4138 -0.1620 0.000 0.616 0.000 0.384 0.000
#> SRR1436207 2 0.0609 0.8357 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1488017 1 0.0162 0.9373 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR612947 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9375 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0290 0.8397 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1308086 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1485380 3 0.1831 0.8683 0.000 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1073705 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR615032 5 0.1908 0.8548 0.000 0.092 0.000 0.000 0.908
#> SRR1452356 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1442983 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.4067 0.6279 0.000 0.692 0.000 0.300 0.008
#> SRR1332816 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR612299 4 0.4201 0.6729 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1407386 1 0.0451 0.9366 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1418064 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.3124 0.8053 0.844 0.000 0.136 0.016 0.004
#> SRR1498395 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.4765 0.7320 0.168 0.000 0.736 0.092 0.004
#> SRR1498885 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1337215 4 0.4707 0.6766 0.000 0.392 0.000 0.588 0.020
#> SRR1414749 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365963 3 0.2068 0.8630 0.000 0.000 0.904 0.092 0.004
#> SRR1368030 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1419760 2 0.4121 0.6514 0.004 0.720 0.000 0.264 0.012
#> SRR1381841 1 0.2719 0.8607 0.852 0.000 0.000 0.144 0.004
#> SRR821388 3 0.3013 0.7692 0.000 0.000 0.832 0.160 0.008
#> SRR657623 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1094241 3 0.1544 0.8519 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR819583 3 0.1831 0.8683 0.000 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1096149 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1342829 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0162 0.9376 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR811333 3 0.2011 0.8653 0.000 0.000 0.908 0.088 0.004
#> SRR1311666 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.3452 0.4321 0.000 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR1446436 2 0.1197 0.8205 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR815092 1 0.0671 0.9350 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1500149 4 0.4291 0.6119 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1100564 1 0.0671 0.9350 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1403072 3 0.0290 0.8818 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR811653 3 0.6608 0.2301 0.000 0.000 0.456 0.244 0.300
#> SRR1311348 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1435442 4 0.4210 0.6722 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344010 5 0.1851 0.8589 0.000 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1319520 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1444763 1 0.2124 0.9132 0.900 0.000 0.000 0.096 0.004
#> SRR1415026 5 0.1270 0.8899 0.000 0.052 0.000 0.000 0.948
#> SRR1416596 5 0.3895 0.4536 0.000 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR1485499 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1316078 5 0.1197 0.8915 0.000 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR663465 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1310094 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR663537 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9375 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR613318 5 0.5557 0.4948 0.000 0.000 0.116 0.260 0.624
#> SRR1332694 1 0.0671 0.9350 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1468469 3 0.0451 0.8813 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR818670 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0671 0.9350 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1311622 3 0.0671 0.8807 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1500931 3 0.1831 0.8683 0.000 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1387494 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379175 5 0.0404 0.9074 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1401909 3 0.5152 0.7071 0.176 0.000 0.708 0.108 0.008
#> SRR1440541 5 0.3366 0.6592 0.000 0.232 0.000 0.000 0.768
#> SRR1068832 3 0.2068 0.8630 0.000 0.000 0.904 0.092 0.004
#> SRR1376640 2 0.4249 0.0507 0.000 0.568 0.000 0.432 0.000
#> SRR1085712 5 0.3636 0.5930 0.000 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1082283 1 0.6616 0.2466 0.488 0.000 0.320 0.184 0.008
#> SRR1084276 1 0.2411 0.8802 0.884 0.000 0.000 0.108 0.008
#> SRR1353262 4 0.5535 0.3670 0.000 0.072 0.000 0.536 0.392
#> SRR1437035 1 0.1205 0.9277 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1396877 1 0.3588 0.8386 0.836 0.000 0.052 0.104 0.008
#> SRR1443026 2 0.5045 0.0271 0.000 0.636 0.000 0.308 0.056
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9375 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 5 0.4302 -0.0308 0.000 0.000 0.000 0.480 0.520
#> SRR1101128 3 0.1768 0.8696 0.000 0.000 0.924 0.072 0.004
#> SRR1363886 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR612983 5 0.2020 0.8467 0.000 0.100 0.000 0.000 0.900
#> SRR1394366 4 0.4201 0.6729 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1093218 3 0.0451 0.8813 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1077090 3 0.2068 0.8630 0.000 0.000 0.904 0.092 0.004
#> SRR1327430 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1088958 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1486931 2 0.0703 0.8341 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1086820 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9375 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.2690 0.6831 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR614335 5 0.0510 0.9103 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR660534 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.2230 0.7323 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1334265 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1456401 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1086393 1 0.1502 0.9284 0.940 0.000 0.000 0.056 0.004
#> SRR1351521 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093100 5 0.0404 0.9074 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1309382 1 0.0671 0.9350 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1089375 1 0.5928 0.1381 0.520 0.000 0.388 0.084 0.008
#> SRR1499482 2 0.0510 0.8372 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR614719 2 0.3582 0.6946 0.000 0.768 0.000 0.224 0.008
#> SRR1081473 3 0.0671 0.8807 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1087415 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1088217 3 0.4252 0.7938 0.064 0.000 0.784 0.144 0.008
#> SRR808496 5 0.0510 0.9103 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1336463 5 0.5329 -0.0162 0.000 0.052 0.000 0.432 0.516
#> SRR612359 2 0.4039 0.6508 0.000 0.720 0.004 0.268 0.008
#> SRR1444412 1 0.2124 0.8931 0.900 0.000 0.000 0.096 0.004
#> SRR1074116 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0671 0.9350 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1349099 3 0.6931 0.2760 0.292 0.000 0.428 0.272 0.008
#> SRR1337886 2 0.3074 0.5435 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR813632 1 0.0324 0.9371 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1101591 3 0.1831 0.8683 0.000 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1089713 3 0.3646 0.8238 0.044 0.000 0.828 0.120 0.008
#> SRR1453127 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 3 0.2233 0.8582 0.000 0.000 0.892 0.104 0.004
#> SRR1313831 1 0.0671 0.9350 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1315434 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814747 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1358539 1 0.0671 0.9350 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1367807 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1365791 3 0.1410 0.8648 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1081519 3 0.2124 0.8615 0.000 0.000 0.900 0.096 0.004
#> SRR614707 4 0.4201 0.6729 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1094027 1 0.0162 0.9373 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1489092 3 0.2971 0.8294 0.000 0.000 0.836 0.156 0.008
#> SRR1079502 3 0.1831 0.8683 0.000 0.000 0.920 0.076 0.004
#> SRR1457814 5 0.5379 0.5255 0.000 0.000 0.108 0.244 0.648
#> SRR1455127 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR615081 4 0.5851 0.5495 0.000 0.140 0.000 0.588 0.272
#> SRR1327855 3 0.1768 0.8696 0.000 0.000 0.924 0.072 0.004
#> SRR1417873 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1394125 3 0.0162 0.8818 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1488388 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1401122 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR612383 2 0.4622 0.6272 0.000 0.696 0.028 0.268 0.008
#> SRR1477711 1 0.0451 0.9366 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1350813 2 0.0404 0.8385 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR612851 2 0.1408 0.8209 0.000 0.948 0.000 0.044 0.008
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9375 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 5 0.1792 0.8627 0.000 0.084 0.000 0.000 0.916
#> SRR1340010 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475885 4 0.4675 0.4257 0.100 0.000 0.164 0.736 0.000
#> SRR1376334 1 0.0671 0.9350 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1399821 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1347042 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612323 2 0.5449 0.5664 0.000 0.644 0.080 0.268 0.008
#> SRR612604 4 0.4210 0.6722 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9375 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 3 0.6041 0.5394 0.272 0.000 0.588 0.132 0.008
#> SRR1101808 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331153 4 0.4291 0.6119 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1078439 3 0.1608 0.8531 0.000 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR2165527 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1351147 1 0.2763 0.8356 0.848 0.000 0.000 0.148 0.004
#> SRR1313536 4 0.4297 0.5978 0.000 0.472 0.000 0.528 0.000
#> SRR1070308 2 0.3043 0.7210 0.080 0.864 0.056 0.000 0.000
#> SRR1403110 1 0.0671 0.9350 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1400355 2 0.0162 0.8406 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1401317 3 0.1768 0.8696 0.000 0.000 0.924 0.072 0.004
#> SRR1456862 1 0.2660 0.8814 0.864 0.000 0.000 0.128 0.008
#> SRR1074622 1 0.0451 0.9374 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1465847 3 0.2068 0.8630 0.000 0.000 0.904 0.092 0.004
#> SRR1443376 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0162 0.8818 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1075579 1 0.0324 0.9371 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1090881 3 0.5500 0.5590 0.000 0.084 0.640 0.268 0.008
#> SRR612251 5 0.0510 0.9103 0.000 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1418581 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR658045 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613214 2 0.5110 0.5959 0.000 0.668 0.056 0.268 0.008
#> SRR613078 4 0.4210 0.6722 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR1472998 3 0.2068 0.8630 0.000 0.000 0.904 0.092 0.004
#> SRR1433452 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9375 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0671 0.9350 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1367566 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316151 4 0.4350 0.3016 0.000 0.004 0.000 0.588 0.408
#> SRR1417547 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR659389 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 4 0.4291 0.6119 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1398207 3 0.6006 0.4792 0.320 0.000 0.564 0.108 0.008
#> SRR1358755 3 0.3423 0.8326 0.040 0.000 0.844 0.108 0.008
#> SRR1078903 2 0.1043 0.8267 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.1638 0.9257 0.932 0.000 0.000 0.064 0.004
#> SRR615982 2 0.3093 0.7384 0.000 0.824 0.000 0.168 0.008
#> SRR1480431 5 0.4283 0.1475 0.000 0.456 0.000 0.000 0.544
#> SRR1429825 4 0.4437 0.1843 0.000 0.004 0.000 0.532 0.464
#> SRR1102393 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 3 0.5960 0.5561 0.256 0.000 0.604 0.132 0.008
#> SRR808351 1 0.0000 0.9375 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0671 0.9350 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1480501 3 0.1768 0.8696 0.000 0.000 0.924 0.072 0.004
#> SRR1081910 3 0.5220 0.6818 0.184 0.000 0.700 0.108 0.008
#> SRR1086611 4 0.2605 0.5477 0.000 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR1392571 2 0.3783 0.6684 0.000 0.740 0.000 0.252 0.008
#> SRR1311441 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR808152 1 0.0000 0.9375 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.2561 0.7987 0.000 0.000 0.856 0.144 0.000
#> SRR1433131 4 0.4249 0.6545 0.000 0.432 0.000 0.568 0.000
#> SRR1321011 2 0.3612 0.4971 0.000 0.732 0.000 0.000 0.268
#> SRR1500598 5 0.0609 0.9123 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1379343 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.1205 0.9325 0.956 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1376228 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0324 0.9371 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1358060 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.0671 0.8807 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR613557 2 0.5550 0.5557 0.000 0.636 0.088 0.268 0.008
#> SRR809831 1 0.2548 0.8931 0.896 0.000 0.028 0.072 0.004
#> SRR1429387 3 0.0000 0.8818 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.9375 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9375 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.1571 0.8726 0.000 0.000 0.936 0.060 0.004
#> SRR1072031 2 0.0000 0.8415 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.3861 0.6573 0.000 0.728 0.000 0.264 0.008
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 3 0.1074 0.84463 0.000 0.000 0.960 0.000 0.028 0.012
#> SRR1404105 1 0.2597 0.76647 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR2164936 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1472057 3 0.3381 0.80813 0.000 0.000 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR614491 4 0.2340 0.46374 0.000 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1069376 1 0.1719 0.75236 0.924 0.000 0.000 0.000 0.060 0.016
#> SRR811964 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1328073 4 0.6885 -0.25459 0.116 0.012 0.048 0.408 0.404 0.012
#> SRR1394209 2 0.0603 0.89828 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004 0.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099809 5 0.6566 -0.34140 0.172 0.000 0.340 0.000 0.440 0.048
#> SRR1500555 4 0.2491 0.35457 0.000 0.000 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1354363 1 0.2048 0.71605 0.880 0.000 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1391619 3 0.3883 0.48885 0.000 0.000 0.656 0.332 0.012 0.000
#> SRR1307997 4 0.4246 -0.46504 0.000 0.016 0.000 0.532 0.452 0.000
#> SRR663124 4 0.0000 0.44157 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334670 1 0.3351 0.75824 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR612515 4 0.2340 0.46374 0.000 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR1092727 4 0.4258 -0.50473 0.000 0.016 0.000 0.516 0.468 0.000
#> SRR1364013 5 0.5147 0.56209 0.000 0.084 0.000 0.436 0.480 0.000
#> SRR1468553 3 0.0146 0.85295 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1403980 3 0.0291 0.85330 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1420169 3 0.3516 0.80363 0.000 0.000 0.788 0.000 0.164 0.048
#> SRR1442800 6 0.3473 0.74396 0.016 0.000 0.092 0.004 0.056 0.832
#> SRR1359214 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499849 5 0.6517 -0.35550 0.160 0.000 0.352 0.000 0.440 0.048
#> SRR1500030 3 0.0458 0.84962 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1093053 3 0.3314 0.65308 0.000 0.000 0.764 0.224 0.012 0.000
#> SRR1399843 3 0.2364 0.84375 0.000 0.000 0.892 0.004 0.072 0.032
#> SRR1380231 3 0.2692 0.82322 0.000 0.000 0.840 0.000 0.148 0.012
#> SRR809470 3 0.3744 0.78368 0.000 0.000 0.764 0.000 0.184 0.052
#> SRR614239 4 0.0865 0.45683 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR613939 6 0.3134 0.81541 0.000 0.000 0.000 0.036 0.144 0.820
#> SRR612971 2 0.3364 0.69561 0.000 0.780 0.000 0.024 0.196 0.000
#> SRR1490204 4 0.4406 -0.53960 0.000 0.024 0.000 0.500 0.476 0.000
#> SRR811357 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1471672 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR613006 6 0.3253 0.80811 0.000 0.000 0.000 0.020 0.192 0.788
#> SRR1469570 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0458 0.84962 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1079023 1 0.3288 0.76019 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR813608 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1096736 2 0.6991 0.15965 0.372 0.420 0.056 0.000 0.028 0.124
#> SRR1478700 1 0.4992 0.58782 0.684 0.000 0.016 0.000 0.140 0.160
#> SRR1081543 3 0.1588 0.80823 0.000 0.000 0.924 0.072 0.004 0.000
#> SRR1384754 3 0.3470 0.77512 0.100 0.000 0.828 0.000 0.048 0.024
#> SRR612287 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380317 4 0.3864 -0.25793 0.000 0.480 0.000 0.520 0.000 0.000
#> SRR1315247 6 0.3134 0.81541 0.000 0.000 0.000 0.036 0.144 0.820
#> SRR1105344 6 0.3694 0.76851 0.000 0.140 0.000 0.000 0.076 0.784
#> SRR658549 4 0.0000 0.44157 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480240 1 0.3409 0.75588 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR1084816 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR612551 5 0.5105 0.56666 0.000 0.080 0.000 0.432 0.488 0.000
#> SRR1358520 2 0.0260 0.90744 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.0806 0.85299 0.000 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR1456075 3 0.3522 0.80832 0.000 0.000 0.784 0.000 0.172 0.044
#> SRR1389474 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1367005 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1334419 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1417154 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095985 3 0.5300 0.63564 0.000 0.000 0.600 0.000 0.188 0.212
#> SRR1325771 1 0.3288 0.76019 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660272 6 0.3483 0.78582 0.000 0.000 0.000 0.016 0.236 0.748
#> SRR1332993 1 0.2378 0.76564 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152 0.000
#> SRR1311833 5 0.4584 0.64874 0.000 0.028 0.000 0.444 0.524 0.004
#> SRR808044 1 0.6211 0.48415 0.592 0.000 0.092 0.000 0.156 0.160
#> SRR1076916 3 0.2402 0.83118 0.000 0.000 0.868 0.000 0.120 0.012
#> SRR1356266 1 0.4349 0.75689 0.708 0.000 0.000 0.000 0.208 0.084
#> SRR1341983 6 0.7150 0.33963 0.000 0.128 0.000 0.260 0.176 0.436
#> SRR1456114 1 0.2402 0.70715 0.856 0.000 0.000 0.000 0.004 0.140
#> SRR1072948 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.3344 0.80809 0.000 0.000 0.804 0.000 0.152 0.044
#> SRR1480176 1 0.3351 0.75824 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR613843 6 0.5940 0.27800 0.000 0.000 0.000 0.248 0.296 0.456
#> SRR1469192 1 0.2562 0.76633 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1404555 3 0.0146 0.85234 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR659839 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR659533 5 0.4393 0.64082 0.000 0.024 0.000 0.452 0.524 0.000
#> SRR1362848 2 0.5049 0.44022 0.000 0.600 0.340 0.020 0.028 0.012
#> SRR1407492 4 0.1863 0.46623 0.000 0.000 0.104 0.896 0.000 0.000
#> SRR1455082 4 0.4797 -0.49481 0.000 0.020 0.000 0.508 0.452 0.020
#> SRR658362 2 0.3371 0.62205 0.000 0.708 0.000 0.292 0.000 0.000
#> SRR810921 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.2949 0.81891 0.000 0.000 0.832 0.000 0.140 0.028
#> SRR818232 1 0.4152 0.74201 0.664 0.000 0.000 0.000 0.304 0.032
#> SRR1454868 4 0.4141 -0.04264 0.000 0.000 0.432 0.556 0.012 0.000
#> SRR1474816 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1342002 1 0.3101 0.76386 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244 0.000
#> SRR1088437 2 0.0146 0.90968 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1466400 6 0.2981 0.81691 0.000 0.000 0.000 0.020 0.160 0.820
#> SRR658921 6 0.3333 0.81596 0.000 0.032 0.000 0.012 0.136 0.820
#> SRR1499873 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1101373 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1090145 1 0.4361 0.73506 0.648 0.000 0.000 0.000 0.308 0.044
#> SRR1379324 1 0.2744 0.70237 0.840 0.000 0.000 0.000 0.016 0.144
#> SRR1345307 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0146 0.85308 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1454891 4 0.2996 0.13188 0.000 0.000 0.000 0.772 0.228 0.000
#> SRR663185 2 0.0146 0.90991 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR811819 1 0.3351 0.75824 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1318920 1 0.3352 0.69159 0.792 0.000 0.000 0.000 0.032 0.176
#> SRR656758 5 0.4617 0.64202 0.000 0.024 0.000 0.444 0.524 0.008
#> SRR1474351 1 0.3309 0.75972 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR660450 6 0.3457 0.78890 0.000 0.000 0.000 0.016 0.232 0.752
#> SRR1472687 2 0.2575 0.80066 0.000 0.872 0.000 0.024 0.100 0.004
#> SRR1334291 4 0.4260 -0.51211 0.000 0.016 0.000 0.512 0.472 0.000
#> SRR1415153 5 0.4393 0.64082 0.000 0.024 0.000 0.452 0.524 0.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368939 6 0.3432 0.79621 0.000 0.000 0.000 0.020 0.216 0.764
#> SRR1443161 3 0.4430 0.64281 0.000 0.000 0.708 0.232 0.032 0.028
#> SRR614695 6 0.3163 0.81419 0.000 0.000 0.000 0.040 0.140 0.820
#> SRR1092372 1 0.3776 0.68505 0.760 0.000 0.000 0.000 0.052 0.188
#> SRR1474577 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1406582 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR612779 5 0.4456 0.64810 0.000 0.028 0.000 0.448 0.524 0.000
#> SRR1089006 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1354071 5 0.6447 -0.31047 0.208 0.000 0.300 0.000 0.460 0.032
#> SRR1105463 5 0.6609 -0.33942 0.172 0.000 0.336 0.000 0.440 0.052
#> SRR811005 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1385319 1 0.4236 0.74040 0.656 0.000 0.000 0.000 0.308 0.036
#> SRR1325871 3 0.4172 0.24583 0.000 0.000 0.528 0.460 0.012 0.000
#> SRR1355415 3 0.6080 0.59428 0.148 0.000 0.576 0.000 0.224 0.052
#> SRR1090861 1 0.3288 0.76019 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1320712 2 0.2213 0.83013 0.000 0.888 0.000 0.100 0.008 0.004
#> SRR1470075 1 0.2402 0.70715 0.856 0.000 0.000 0.000 0.004 0.140
#> SRR1091254 1 0.3351 0.75824 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1101397 1 0.7369 -0.09036 0.368 0.000 0.308 0.000 0.164 0.160
#> SRR1321165 1 0.4828 0.62141 0.664 0.000 0.000 0.000 0.136 0.200
#> SRR1092112 3 0.3432 0.80497 0.000 0.000 0.800 0.000 0.148 0.052
#> SRR1417588 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 5 0.5978 0.45127 0.072 0.032 0.000 0.404 0.480 0.012
#> SRR1432106 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655756 5 0.4456 0.64810 0.000 0.028 0.000 0.448 0.524 0.000
#> SRR1458314 1 0.4120 0.63998 0.744 0.000 0.000 0.000 0.096 0.160
#> SRR1318582 5 0.4456 0.64810 0.000 0.028 0.000 0.448 0.524 0.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072749 1 0.3487 0.75348 0.756 0.000 0.000 0.000 0.224 0.020
#> SRR1078586 1 0.3351 0.75824 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1400333 6 0.2805 0.71384 0.000 0.000 0.004 0.184 0.000 0.812
#> SRR1078834 6 0.3213 0.75940 0.000 0.000 0.000 0.132 0.048 0.820
#> SRR1417611 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.6354 0.48612 0.536 0.000 0.052 0.000 0.196 0.216
#> SRR1465440 2 0.3364 0.69561 0.000 0.780 0.000 0.024 0.196 0.000
#> SRR1400530 2 0.3602 0.68992 0.000 0.784 0.000 0.000 0.056 0.160
#> SRR614984 4 0.0937 0.45795 0.000 0.000 0.040 0.960 0.000 0.000
#> SRR1324269 1 0.3938 0.74105 0.660 0.000 0.000 0.000 0.324 0.016
#> SRR1401491 6 0.3822 0.77729 0.000 0.128 0.000 0.000 0.096 0.776
#> SRR1319443 1 0.3428 0.75529 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304 0.000
#> SRR1324349 2 0.0146 0.91014 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1345523 5 0.4936 0.59894 0.000 0.064 0.000 0.436 0.500 0.000
#> SRR1500846 1 0.2402 0.70715 0.856 0.000 0.000 0.000 0.004 0.140
#> SRR661505 3 0.3910 0.80948 0.000 0.000 0.788 0.044 0.140 0.028
#> SRR1419062 3 0.2553 0.82474 0.000 0.000 0.848 0.000 0.144 0.008
#> SRR1480131 1 0.4695 0.63977 0.508 0.000 0.000 0.000 0.448 0.044
#> SRR1421284 2 0.0363 0.90450 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1329624 1 0.3351 0.75824 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 4 0.4172 -0.02118 0.000 0.040 0.000 0.680 0.280 0.000
#> SRR1083286 1 0.3446 0.75471 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1091890 3 0.0405 0.85114 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1347436 4 0.3847 -0.19349 0.000 0.008 0.000 0.644 0.348 0.000
#> SRR1327473 1 0.4570 0.73275 0.672 0.048 0.000 0.000 0.268 0.012
#> SRR1338195 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809698 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1457792 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR658271 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1339597 1 0.4636 0.59919 0.692 0.000 0.000 0.000 0.148 0.160
#> SRR1454842 3 0.3710 0.55825 0.000 0.000 0.696 0.292 0.012 0.000
#> SRR1322643 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR614887 3 0.2219 0.76044 0.000 0.000 0.864 0.136 0.000 0.000
#> SRR1354620 3 0.3776 0.78100 0.000 0.000 0.760 0.000 0.188 0.052
#> SRR615056 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105320 5 0.6403 -0.39341 0.292 0.000 0.348 0.000 0.348 0.012
#> SRR1391529 1 0.3390 0.75657 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296 0.000
#> SRR663052 2 0.3464 0.59461 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000 0.000
#> SRR1478834 1 0.3428 0.75551 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304 0.000
#> SRR812366 6 0.3852 0.74364 0.000 0.176 0.000 0.000 0.064 0.760
#> SRR1435330 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615383 5 0.4617 0.64202 0.000 0.024 0.000 0.444 0.524 0.008
#> SRR1389157 4 0.2527 0.45688 0.000 0.000 0.168 0.832 0.000 0.000
#> SRR613568 6 0.3457 0.78890 0.000 0.000 0.000 0.016 0.232 0.752
#> SRR614095 2 0.1858 0.83755 0.000 0.912 0.000 0.012 0.076 0.000
#> SRR1103092 1 0.3986 0.74551 0.664 0.000 0.000 0.000 0.316 0.020
#> SRR1337155 3 0.6123 0.52369 0.000 0.000 0.524 0.032 0.156 0.288
#> SRR1475345 2 0.1141 0.86929 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR809089 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1446180 6 0.2742 0.71643 0.000 0.000 0.076 0.044 0.008 0.872
#> SRR1406372 6 0.4007 0.69937 0.000 0.220 0.000 0.000 0.052 0.728
#> SRR1339880 3 0.0603 0.84891 0.000 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1353136 3 0.4212 0.31831 0.000 0.000 0.560 0.424 0.016 0.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614035 5 0.4981 0.59115 0.000 0.068 0.000 0.436 0.496 0.000
#> SRR1351104 1 0.2048 0.71641 0.880 0.000 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1363926 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399861 4 0.4454 -0.25418 0.000 0.476 0.008 0.504 0.008 0.004
#> SRR1338789 1 0.3772 0.66615 0.772 0.000 0.000 0.000 0.068 0.160
#> SRR1421420 3 0.0547 0.84995 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.3175 0.76264 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1352870 4 0.3838 -0.06308 0.000 0.000 0.448 0.552 0.000 0.000
#> SRR1315041 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443268 1 0.7428 -0.13522 0.344 0.000 0.320 0.000 0.172 0.164
#> SRR1416617 3 0.0146 0.85295 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1102443 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR655672 4 0.0000 0.44157 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420006 3 0.0146 0.85308 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1458267 4 0.4229 -0.42816 0.000 0.016 0.000 0.548 0.436 0.000
#> SRR613819 2 0.0260 0.90744 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 4 0.4407 -0.56048 0.000 0.024 0.000 0.492 0.484 0.000
#> SRR1470727 1 0.3450 0.76118 0.780 0.000 0.000 0.000 0.188 0.032
#> SRR1339153 3 0.3244 0.59862 0.000 0.000 0.732 0.268 0.000 0.000
#> SRR1472749 3 0.0146 0.85214 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1414379 2 0.0363 0.90450 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1431326 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1487278 6 0.2932 0.81654 0.000 0.000 0.000 0.016 0.164 0.820
#> SRR1098312 3 0.1074 0.84463 0.000 0.000 0.960 0.000 0.028 0.012
#> SRR810273 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1376000 5 0.5113 0.48953 0.000 0.000 0.000 0.448 0.472 0.080
#> SRR614467 2 0.0458 0.90117 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR811471 1 0.2402 0.71592 0.868 0.000 0.000 0.000 0.012 0.120
#> SRR1478341 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088606 6 0.3974 0.60624 0.012 0.000 0.128 0.000 0.080 0.780
#> SRR1479699 3 0.1074 0.84463 0.000 0.000 0.960 0.000 0.028 0.012
#> SRR1403589 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR812625 6 0.4073 0.80064 0.000 0.084 0.000 0.016 0.124 0.776
#> SRR1359803 1 0.4282 0.74032 0.656 0.000 0.000 0.000 0.304 0.040
#> SRR1338988 2 0.0146 0.90967 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1471222 6 0.3337 0.64374 0.000 0.260 0.000 0.004 0.000 0.736
#> SRR1378992 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR659427 2 0.4839 0.64057 0.000 0.720 0.120 0.136 0.016 0.008
#> SRR1096638 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1466619 6 0.2912 0.69231 0.000 0.216 0.000 0.000 0.000 0.784
#> SRR659307 4 0.3782 0.04082 0.000 0.000 0.412 0.588 0.000 0.000
#> SRR1439994 1 0.7431 -0.16059 0.336 0.000 0.328 0.000 0.168 0.168
#> SRR1454931 1 0.5050 0.64553 0.508 0.000 0.000 0.000 0.416 0.076
#> SRR1332928 3 0.7211 0.40015 0.256 0.000 0.428 0.000 0.180 0.136
#> SRR658621 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.3351 0.75824 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1458243 1 0.6048 0.50486 0.604 0.000 0.072 0.000 0.164 0.160
#> SRR1374270 2 0.0547 0.89804 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365598 6 0.3414 0.81505 0.000 0.036 0.000 0.016 0.128 0.820
#> SRR662787 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1408727 2 0.0547 0.89859 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1456274 3 0.7180 0.24317 0.332 0.000 0.380 0.000 0.172 0.116
#> SRR817744 1 0.3288 0.76019 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387379 5 0.4791 0.62293 0.000 0.052 0.000 0.436 0.512 0.000
#> SRR1102680 3 0.2581 0.83141 0.000 0.000 0.856 0.000 0.128 0.016
#> SRR1374198 1 0.3445 0.70231 0.796 0.000 0.000 0.000 0.048 0.156
#> SRR1445856 3 0.7445 0.15504 0.324 0.000 0.336 0.000 0.172 0.168
#> SRR820049 3 0.3838 0.28879 0.000 0.000 0.552 0.448 0.000 0.000
#> SRR1375290 4 0.3862 -0.13374 0.000 0.000 0.476 0.524 0.000 0.000
#> SRR818999 5 0.6578 -0.34874 0.164 0.000 0.344 0.000 0.440 0.052
#> SRR1390242 1 0.3351 0.75824 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1401164 6 0.3200 0.80712 0.000 0.000 0.000 0.016 0.196 0.788
#> SRR1454629 1 0.5280 0.60482 0.468 0.000 0.004 0.000 0.444 0.084
#> SRR1332187 3 0.0146 0.85308 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR603365 3 0.0806 0.85304 0.000 0.000 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR657833 6 0.5448 0.45036 0.000 0.000 0.000 0.132 0.352 0.516
#> SRR1436207 4 0.4405 -0.53007 0.000 0.024 0.000 0.504 0.472 0.000
#> SRR1488017 1 0.3266 0.76081 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272 0.000
#> SRR612947 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1480384 1 0.2562 0.76633 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1364761 5 0.4393 0.64082 0.000 0.024 0.000 0.452 0.524 0.000
#> SRR1308086 3 0.0858 0.84704 0.000 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1441868 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1485380 3 0.2911 0.81947 0.000 0.000 0.832 0.000 0.144 0.024
#> SRR1073705 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR615032 2 0.3364 0.69561 0.000 0.780 0.000 0.024 0.196 0.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442983 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1100346 4 0.1075 0.44381 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1332816 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR612299 6 0.3134 0.81541 0.000 0.000 0.000 0.036 0.144 0.820
#> SRR1407386 1 0.3351 0.75824 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1418064 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1309403 1 0.5144 0.69443 0.604 0.000 0.080 0.000 0.304 0.012
#> SRR1498395 5 0.4393 0.64082 0.000 0.024 0.000 0.452 0.524 0.000
#> SRR1079998 3 0.5511 0.69125 0.120 0.000 0.656 0.000 0.172 0.052
#> SRR1498885 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337215 6 0.2982 0.81736 0.000 0.004 0.000 0.012 0.164 0.820
#> SRR1414749 3 0.0146 0.85295 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1365963 3 0.3542 0.80448 0.000 0.000 0.788 0.000 0.160 0.052
#> SRR1368030 2 0.0146 0.90991 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1419760 4 0.0547 0.42660 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1381841 1 0.5112 0.61287 0.476 0.000 0.000 0.000 0.444 0.080
#> SRR821388 3 0.4713 0.32324 0.000 0.000 0.560 0.400 0.028 0.012
#> SRR657623 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.1327 0.82332 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000 0.000
#> SRR819583 3 0.2950 0.81802 0.000 0.000 0.828 0.000 0.148 0.024
#> SRR1096149 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1342829 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.3078 0.76865 0.796 0.000 0.000 0.000 0.192 0.012
#> SRR811333 3 0.3312 0.80108 0.000 0.000 0.792 0.000 0.180 0.028
#> SRR1311666 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1486698 6 0.5825 0.35273 0.000 0.000 0.000 0.288 0.224 0.488
#> SRR1446436 4 0.4258 -0.48359 0.000 0.000 0.000 0.516 0.468 0.016
#> SRR815092 1 0.3371 0.75767 0.708 0.000 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1500149 6 0.3431 0.79163 0.000 0.000 0.000 0.016 0.228 0.756
#> SRR1100564 1 0.3428 0.75529 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304 0.000
#> SRR1403072 3 0.0146 0.85308 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR811653 4 0.5669 -0.00146 0.000 0.088 0.392 0.500 0.016 0.004
#> SRR1311348 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435442 6 0.2932 0.81654 0.000 0.000 0.000 0.016 0.164 0.820
#> SRR1421444 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.3301 0.70547 0.000 0.788 0.000 0.024 0.188 0.000
#> SRR1319520 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1444763 1 0.3037 0.68515 0.808 0.000 0.000 0.000 0.016 0.176
#> SRR1415026 2 0.1257 0.87829 0.000 0.952 0.000 0.020 0.028 0.000
#> SRR1416596 2 0.3371 0.52241 0.000 0.708 0.000 0.000 0.000 0.292
#> SRR1485499 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.1141 0.86929 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663537 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1486780 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1453950 1 0.2527 0.76622 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1087875 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR613318 4 0.5835 0.18541 0.000 0.204 0.280 0.512 0.004 0.000
#> SRR1332694 1 0.3371 0.75720 0.708 0.000 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1468469 3 0.0291 0.85358 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR818670 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1120318 1 0.3409 0.75588 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300 0.000
#> SRR1311622 3 0.1462 0.85031 0.000 0.000 0.936 0.000 0.056 0.008
#> SRR1500931 3 0.2950 0.81802 0.000 0.000 0.828 0.000 0.148 0.024
#> SRR1387494 3 0.0858 0.84704 0.000 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1379175 2 0.0603 0.89828 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004 0.000
#> SRR1401909 3 0.5768 0.66024 0.136 0.000 0.624 0.000 0.188 0.052
#> SRR1440541 2 0.5305 0.10650 0.000 0.492 0.000 0.104 0.404 0.000
#> SRR1068832 3 0.3445 0.80386 0.000 0.000 0.796 0.000 0.156 0.048
#> SRR1376640 6 0.4720 0.59011 0.000 0.000 0.000 0.304 0.072 0.624
#> SRR1085712 2 0.5185 0.29479 0.000 0.564 0.000 0.108 0.328 0.000
#> SRR1082283 1 0.7422 0.11183 0.396 0.000 0.236 0.000 0.172 0.196
#> SRR1084276 1 0.4746 0.63799 0.508 0.000 0.000 0.000 0.444 0.048
#> SRR1353262 6 0.3730 0.75032 0.000 0.168 0.000 0.000 0.060 0.772
#> SRR1437035 1 0.3979 0.72406 0.628 0.000 0.000 0.000 0.360 0.012
#> SRR1396877 5 0.5840 -0.60047 0.432 0.000 0.088 0.000 0.448 0.032
#> SRR1443026 5 0.6240 0.37341 0.000 0.040 0.000 0.272 0.524 0.164
#> SRR1417936 1 0.3175 0.76264 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1436822 6 0.3695 0.42929 0.000 0.376 0.000 0.000 0.000 0.624
#> SRR1101128 3 0.2872 0.82025 0.000 0.000 0.836 0.000 0.140 0.024
#> SRR1363886 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.3835 0.66311 0.000 0.756 0.000 0.056 0.188 0.000
#> SRR1394366 6 0.3134 0.81541 0.000 0.000 0.000 0.036 0.144 0.820
#> SRR1093218 3 0.1398 0.85087 0.000 0.000 0.940 0.000 0.052 0.008
#> SRR1077090 3 0.3432 0.80497 0.000 0.000 0.800 0.000 0.148 0.052
#> SRR1327430 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088958 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1486931 4 0.4258 -0.50265 0.000 0.016 0.000 0.516 0.468 0.000
#> SRR1086820 1 0.2494 0.71491 0.864 0.000 0.000 0.000 0.016 0.120
#> SRR1383000 1 0.2219 0.76425 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1355705 5 0.4981 0.59115 0.000 0.068 0.000 0.436 0.496 0.000
#> SRR614335 2 0.0260 0.90744 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR660534 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR817094 5 0.4787 0.62300 0.000 0.052 0.000 0.432 0.516 0.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.2362 0.70902 0.860 0.000 0.000 0.000 0.004 0.136
#> SRR1351521 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.0717 0.89649 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008 0.000
#> SRR1309382 1 0.3446 0.75471 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1089375 5 0.6289 -0.32357 0.232 0.000 0.304 0.000 0.448 0.016
#> SRR1499482 4 0.4263 -0.53158 0.000 0.016 0.000 0.504 0.480 0.000
#> SRR614719 4 0.0713 0.41846 0.000 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1081473 3 0.2404 0.83885 0.000 0.000 0.872 0.000 0.112 0.016
#> SRR1087415 1 0.2494 0.71491 0.864 0.000 0.000 0.000 0.016 0.120
#> SRR1088217 3 0.5696 0.67631 0.072 0.000 0.628 0.000 0.216 0.084
#> SRR808496 2 0.0363 0.90450 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1336463 6 0.4881 0.50713 0.000 0.336 0.000 0.000 0.076 0.588
#> SRR612359 4 0.0260 0.44613 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1444412 1 0.4578 0.64864 0.520 0.000 0.000 0.000 0.444 0.036
#> SRR1074116 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656095 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR808914 1 0.3390 0.75657 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296 0.000
#> SRR1349099 1 0.7640 -0.07920 0.316 0.000 0.268 0.000 0.192 0.224
#> SRR1337886 6 0.6496 0.07853 0.000 0.020 0.000 0.292 0.292 0.396
#> SRR813632 1 0.3351 0.75824 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1101591 3 0.2949 0.81891 0.000 0.000 0.832 0.000 0.140 0.028
#> SRR1089713 5 0.6034 -0.43651 0.092 0.000 0.412 0.000 0.452 0.044
#> SRR1453127 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 3 0.3578 0.79603 0.000 0.000 0.784 0.000 0.164 0.052
#> SRR1313831 1 0.3390 0.75657 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296 0.000
#> SRR1315434 3 0.0363 0.85045 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.3351 0.75824 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1367807 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1365791 3 0.0865 0.84343 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1081519 3 0.3351 0.80508 0.000 0.000 0.800 0.000 0.160 0.040
#> SRR614707 6 0.3101 0.81613 0.000 0.000 0.000 0.032 0.148 0.820
#> SRR1094027 1 0.3244 0.76137 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR1489092 3 0.4264 0.76233 0.000 0.000 0.720 0.000 0.196 0.084
#> SRR1079502 3 0.2859 0.82149 0.000 0.000 0.828 0.000 0.156 0.016
#> SRR1457814 4 0.6002 0.04588 0.000 0.324 0.156 0.504 0.012 0.004
#> SRR1455127 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615081 6 0.3334 0.80957 0.000 0.052 0.000 0.004 0.124 0.820
#> SRR1327855 3 0.2513 0.82571 0.000 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1417873 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.0405 0.85331 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1488388 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1401122 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612383 4 0.0260 0.44581 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1477711 1 0.3351 0.75824 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1350813 4 0.4405 -0.53007 0.000 0.024 0.000 0.504 0.472 0.000
#> SRR612851 4 0.3634 -0.20077 0.000 0.000 0.000 0.644 0.356 0.000
#> SRR1086349 1 0.3175 0.76264 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR812837 2 0.3364 0.69561 0.000 0.780 0.000 0.024 0.196 0.000
#> SRR1340010 3 0.1074 0.84463 0.000 0.000 0.960 0.000 0.028 0.012
#> SRR1475885 6 0.0547 0.69467 0.020 0.000 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR1376334 1 0.3390 0.75657 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296 0.000
#> SRR1399821 1 0.2191 0.71547 0.876 0.000 0.000 0.000 0.004 0.120
#> SRR1347042 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612323 4 0.2340 0.46374 0.000 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR612604 6 0.2932 0.81654 0.000 0.000 0.000 0.016 0.164 0.820
#> SRR1389546 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1311877 1 0.3101 0.76386 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244 0.000
#> SRR1465608 1 0.7372 -0.09942 0.364 0.000 0.312 0.000 0.164 0.160
#> SRR1101808 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331153 6 0.4615 0.56284 0.000 0.008 0.000 0.028 0.396 0.568
#> SRR1078439 3 0.1524 0.82896 0.000 0.000 0.932 0.060 0.000 0.008
#> SRR2165527 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.4601 0.72259 0.628 0.000 0.000 0.000 0.312 0.060
#> SRR1313536 6 0.3941 0.77610 0.000 0.008 0.000 0.028 0.232 0.732
#> SRR1070308 5 0.6499 0.32051 0.120 0.024 0.008 0.404 0.432 0.012
#> SRR1403110 1 0.3390 0.75657 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296 0.000
#> SRR1400355 5 0.4393 0.64082 0.000 0.024 0.000 0.452 0.524 0.000
#> SRR1401317 3 0.2911 0.81947 0.000 0.000 0.832 0.000 0.144 0.024
#> SRR1456862 1 0.4336 0.62699 0.724 0.000 0.000 0.000 0.116 0.160
#> SRR1074622 1 0.1461 0.74928 0.940 0.000 0.000 0.000 0.044 0.016
#> SRR1465847 3 0.3332 0.80902 0.000 0.000 0.808 0.000 0.144 0.048
#> SRR1443376 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1471312 3 0.0146 0.85308 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1075579 1 0.3351 0.75824 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1090881 4 0.3810 -0.00642 0.000 0.000 0.428 0.572 0.000 0.000
#> SRR612251 2 0.0260 0.90744 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1418581 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR658045 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR613214 4 0.1814 0.46610 0.000 0.000 0.100 0.900 0.000 0.000
#> SRR613078 6 0.2981 0.81691 0.000 0.000 0.000 0.020 0.160 0.820
#> SRR1472998 3 0.3470 0.80268 0.000 0.000 0.796 0.000 0.152 0.052
#> SRR1433452 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1101957 1 0.2562 0.76633 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1487993 3 0.0458 0.84962 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1465983 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1380375 1 0.3351 0.75824 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1367566 3 0.0146 0.85295 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1316151 6 0.2631 0.71984 0.000 0.180 0.000 0.000 0.000 0.820
#> SRR1417547 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659389 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1490270 6 0.3558 0.77534 0.000 0.000 0.000 0.016 0.248 0.736
#> SRR1398207 5 0.6505 -0.36875 0.148 0.000 0.360 0.000 0.440 0.052
#> SRR1358755 3 0.5475 0.68584 0.092 0.000 0.648 0.000 0.208 0.052
#> SRR1078903 4 0.4218 -0.41023 0.000 0.016 0.000 0.556 0.428 0.000
#> SRR1323252 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1451796 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1369172 1 0.2981 0.69342 0.820 0.000 0.000 0.000 0.020 0.160
#> SRR615982 4 0.3371 -0.02654 0.000 0.000 0.000 0.708 0.292 0.000
#> SRR1480431 2 0.5019 0.27640 0.000 0.604 0.000 0.292 0.104 0.000
#> SRR1429825 6 0.2969 0.68426 0.000 0.224 0.000 0.000 0.000 0.776
#> SRR1102393 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1071313 3 0.7352 0.21541 0.332 0.000 0.348 0.000 0.180 0.140
#> SRR808351 1 0.2597 0.76651 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1317513 1 0.3351 0.75824 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288 0.000
#> SRR1480501 3 0.2553 0.82595 0.000 0.000 0.848 0.000 0.144 0.008
#> SRR1081910 3 0.5247 0.50814 0.024 0.000 0.524 0.000 0.404 0.048
#> SRR1086611 6 0.2738 0.71854 0.000 0.000 0.004 0.176 0.000 0.820
#> SRR1392571 4 0.2969 0.14228 0.000 0.000 0.000 0.776 0.224 0.000
#> SRR1311441 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR808152 1 0.2527 0.76622 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR657313 3 0.3175 0.61812 0.000 0.000 0.744 0.256 0.000 0.000
#> SRR1433131 6 0.3200 0.80712 0.000 0.000 0.000 0.016 0.196 0.788
#> SRR1321011 5 0.5252 0.53710 0.000 0.096 0.000 0.424 0.480 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.91202 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379343 5 0.4393 0.64082 0.000 0.024 0.000 0.452 0.524 0.000
#> SRR1389108 1 0.2003 0.71751 0.884 0.000 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1376228 3 0.0146 0.85295 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1399757 1 0.3309 0.75966 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.1333 0.85001 0.000 0.000 0.944 0.000 0.048 0.008
#> SRR613557 4 0.2340 0.46374 0.000 0.000 0.148 0.852 0.000 0.000
#> SRR809831 1 0.4680 0.64800 0.524 0.000 0.008 0.000 0.440 0.028
#> SRR1429387 3 0.0000 0.85262 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.3221 0.76184 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1071644 1 0.3175 0.76264 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1406936 3 0.2790 0.82968 0.000 0.000 0.840 0.000 0.140 0.020
#> SRR1072031 5 0.4517 0.65424 0.000 0.032 0.000 0.444 0.524 0.000
#> SRR1374671 4 0.0000 0.44157 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.853 0.923 0.965 0.4972 0.505 0.505
#> 3 3 0.931 0.926 0.968 0.2996 0.825 0.661
#> 4 4 0.803 0.831 0.919 0.1482 0.867 0.642
#> 5 5 0.721 0.708 0.828 0.0612 0.934 0.755
#> 6 6 0.749 0.680 0.810 0.0474 0.933 0.706
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.0376 0.940 0.996 0.004
#> SRR1404105 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.8661 0.649 0.712 0.288
#> SRR1394209 2 0.1633 0.966 0.024 0.976
#> SRR1474018 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1391619 1 0.8443 0.670 0.728 0.272
#> SRR1307997 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1403980 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1442800 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.6148 0.815 0.848 0.152
#> SRR1093053 1 0.8443 0.670 0.728 0.272
#> SRR1399843 1 0.8267 0.687 0.740 0.260
#> SRR1380231 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1471672 1 0.8661 0.606 0.712 0.288
#> SRR613006 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1096736 2 0.8386 0.605 0.268 0.732
#> SRR1478700 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.8386 0.676 0.732 0.268
#> SRR1384754 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1380317 1 0.8713 0.639 0.708 0.292
#> SRR1315247 2 0.6247 0.800 0.156 0.844
#> SRR1105344 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1456075 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1417154 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1325771 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1360420 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1072948 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.7528 0.744 0.784 0.216
#> SRR659839 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1362848 2 0.6148 0.808 0.152 0.848
#> SRR1407492 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1454868 1 0.8499 0.664 0.724 0.276
#> SRR1474816 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1466400 2 0.2778 0.940 0.048 0.952
#> SRR658921 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1101373 1 0.9954 0.167 0.540 0.460
#> SRR1090145 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.8443 0.670 0.728 0.272
#> SRR614695 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1325871 1 0.8386 0.676 0.732 0.268
#> SRR1355415 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1092112 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.2603 0.944 0.044 0.956
#> SRR1432106 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1400333 1 1.0000 0.138 0.504 0.496
#> SRR1078834 1 0.9922 0.293 0.552 0.448
#> SRR1417611 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.8386 0.676 0.732 0.268
#> SRR1419062 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1315739 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1091890 1 0.8386 0.676 0.732 0.268
#> SRR1347436 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1327473 1 0.6343 0.796 0.840 0.160
#> SRR1338195 1 0.6531 0.799 0.832 0.168
#> SRR809698 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.8386 0.676 0.732 0.268
#> SRR1322643 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR614887 1 0.8386 0.676 0.732 0.268
#> SRR1354620 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.0938 0.934 0.988 0.012
#> SRR615383 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1389157 1 0.9922 0.293 0.552 0.448
#> SRR613568 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.8386 0.676 0.732 0.268
#> SRR1475345 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1446180 1 0.8608 0.652 0.716 0.284
#> SRR1406372 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.1414 0.929 0.980 0.020
#> SRR1353136 1 0.8555 0.658 0.720 0.280
#> SRR1093906 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1399861 2 0.5946 0.818 0.144 0.856
#> SRR1338789 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1421420 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1352870 1 0.9833 0.361 0.576 0.424
#> SRR1315041 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.2778 0.906 0.952 0.048
#> SRR655672 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1420006 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.8443 0.670 0.728 0.272
#> SRR1472749 1 0.7453 0.749 0.788 0.212
#> SRR1414379 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.1414 0.929 0.980 0.020
#> SRR810273 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1478341 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1479699 1 0.3879 0.886 0.924 0.076
#> SRR1403589 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1378992 1 0.6247 0.801 0.844 0.156
#> SRR659427 2 0.7219 0.732 0.200 0.800
#> SRR1096638 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR659307 1 0.9922 0.293 0.552 0.448
#> SRR1439994 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1374270 2 0.6048 0.815 0.148 0.852
#> SRR1470947 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1456274 1 0.2236 0.917 0.964 0.036
#> SRR817744 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR820049 1 0.8555 0.658 0.720 0.280
#> SRR1375290 1 0.8386 0.676 0.732 0.268
#> SRR818999 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1332187 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR603365 1 0.8081 0.703 0.752 0.248
#> SRR657833 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.8386 0.676 0.732 0.268
#> SRR1441868 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1485380 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.9909 0.220 0.556 0.444
#> SRR615032 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1332816 1 0.9580 0.405 0.620 0.380
#> SRR612299 2 0.5059 0.862 0.112 0.888
#> SRR1407386 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1309403 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1414749 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1419760 1 0.7453 0.750 0.788 0.212
#> SRR1381841 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR821388 2 0.8386 0.598 0.268 0.732
#> SRR657623 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.8386 0.676 0.732 0.268
#> SRR819583 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1403072 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR811653 1 0.9686 0.431 0.604 0.396
#> SRR1311348 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.1414 0.970 0.020 0.980
#> SRR1421444 1 0.0376 0.940 0.996 0.004
#> SRR1344010 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR613318 2 0.0938 0.978 0.012 0.988
#> SRR1332694 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1468469 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.0938 0.934 0.988 0.012
#> SRR1500931 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.8327 0.682 0.736 0.264
#> SRR1379175 1 0.9833 0.361 0.576 0.424
#> SRR1401909 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1101128 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.2948 0.936 0.052 0.948
#> SRR1093218 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1077090 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.0938 0.934 0.988 0.012
#> SRR1486931 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.5629 0.835 0.132 0.868
#> SRR1309382 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.1843 0.923 0.972 0.028
#> SRR656095 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1101591 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1453127 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1315434 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1365791 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1081519 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR614707 1 0.9209 0.561 0.664 0.336
#> SRR1094027 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1079502 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1457814 1 0.9393 0.521 0.644 0.356
#> SRR1455127 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.5842 0.828 0.860 0.140
#> SRR1475885 1 0.9087 0.583 0.676 0.324
#> SRR1376334 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1347042 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.2236 0.953 0.036 0.964
#> SRR612604 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.1414 0.929 0.980 0.020
#> SRR1331153 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.8443 0.670 0.728 0.272
#> SRR2165527 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.9000 0.521 0.316 0.684
#> SRR1403110 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1090881 1 0.8555 0.658 0.720 0.280
#> SRR612251 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1487993 1 0.8081 0.703 0.752 0.248
#> SRR1465983 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1367566 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1480501 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1086611 1 0.9608 0.460 0.616 0.384
#> SRR1392571 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR657313 1 0.8386 0.676 0.732 0.268
#> SRR1433131 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1376228 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.4690 0.860 0.900 0.100
#> SRR1358060 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1464517 1 0.6623 0.794 0.828 0.172
#> SRR613557 2 0.1843 0.962 0.028 0.972
#> SRR809831 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.0000 0.942 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 3 0.2537 0.8813 0.080 0.000 0.920
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.3412 0.8460 0.124 0.000 0.876
#> SRR614491 2 0.6180 0.2515 0.000 0.584 0.416
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.3356 0.8915 0.908 0.036 0.056
#> SRR1394209 2 0.4974 0.6896 0.236 0.764 0.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR612515 3 0.6295 0.1467 0.000 0.472 0.528
#> SRR1092727 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468553 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420169 3 0.3619 0.8349 0.136 0.000 0.864
#> SRR1442800 1 0.6537 0.6731 0.740 0.196 0.064
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.2796 0.8810 0.908 0.000 0.092
#> SRR1500030 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093053 3 0.0592 0.9285 0.000 0.012 0.988
#> SRR1399843 3 0.3340 0.8496 0.120 0.000 0.880
#> SRR1380231 3 0.0237 0.9343 0.004 0.000 0.996
#> SRR809470 1 0.3267 0.8611 0.884 0.000 0.116
#> SRR614239 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.4790 0.8217 0.848 0.096 0.056
#> SRR1478700 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081543 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384754 3 0.4931 0.7263 0.232 0.000 0.768
#> SRR612287 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.3112 0.9042 0.028 0.916 0.056
#> SRR1315247 2 0.3356 0.8957 0.036 0.908 0.056
#> SRR1105344 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456075 3 0.4750 0.7460 0.216 0.000 0.784
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095985 3 0.5859 0.5062 0.344 0.000 0.656
#> SRR1325771 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076916 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472370 3 0.3340 0.8497 0.120 0.000 0.880
#> SRR1480176 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362848 3 0.9125 0.2351 0.144 0.392 0.464
#> SRR1407492 3 0.5706 0.5445 0.000 0.320 0.680
#> SRR1455082 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.0592 0.9285 0.000 0.012 0.988
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466400 2 0.0747 0.9671 0.016 0.984 0.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0424 0.9747 0.008 0.992 0.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443161 3 0.5493 0.7215 0.232 0.012 0.756
#> SRR614695 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 3 0.4750 0.7399 0.216 0.000 0.784
#> SRR1105463 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355415 1 0.2711 0.8845 0.912 0.000 0.088
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.4165 0.8607 0.076 0.876 0.048
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.0237 0.9344 0.004 0.000 0.996
#> SRR1417588 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074790 2 0.1753 0.9339 0.048 0.952 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.4605 0.7323 0.000 0.796 0.204
#> SRR1078834 1 0.7580 0.4441 0.604 0.340 0.056
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.0237 0.9343 0.004 0.000 0.996
#> SRR1419062 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480131 1 0.0424 0.9589 0.992 0.000 0.008
#> SRR1421284 2 0.2625 0.8931 0.084 0.916 0.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347436 2 0.1031 0.9594 0.000 0.976 0.024
#> SRR1327473 1 0.1964 0.9183 0.944 0.000 0.056
#> SRR1338195 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354620 3 0.3941 0.8165 0.156 0.000 0.844
#> SRR615056 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.3941 0.8123 0.844 0.000 0.156
#> SRR1391529 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 3 0.4605 0.7384 0.000 0.204 0.796
#> SRR613568 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 3 0.3771 0.8549 0.112 0.012 0.876
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 1 0.9767 -0.0544 0.404 0.232 0.364
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353136 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399861 2 0.2448 0.9024 0.076 0.924 0.000
#> SRR1338789 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.4235 0.7757 0.000 0.176 0.824
#> SRR1315041 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416617 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420006 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098312 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088606 1 0.2066 0.9151 0.940 0.000 0.060
#> SRR1479699 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR659427 2 0.8113 0.5197 0.212 0.644 0.144
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR659307 3 0.0237 0.9338 0.000 0.004 0.996
#> SRR1439994 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 3 0.4887 0.7306 0.228 0.000 0.772
#> SRR658621 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374270 2 0.0592 0.9707 0.012 0.988 0.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408727 2 0.2261 0.9115 0.068 0.932 0.000
#> SRR1456274 1 0.1964 0.9183 0.944 0.000 0.056
#> SRR817744 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR820049 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375290 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR818999 1 0.0237 0.9619 0.996 0.000 0.004
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454629 1 0.2356 0.9012 0.928 0.000 0.072
#> SRR1332187 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.0424 0.9321 0.008 0.000 0.992
#> SRR1441868 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332816 1 0.0237 0.9611 0.996 0.004 0.000
#> SRR612299 2 0.1860 0.9307 0.000 0.948 0.052
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.4660 0.8364 0.856 0.072 0.072
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.5465 0.6449 0.288 0.000 0.712
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337215 2 0.1031 0.9593 0.024 0.976 0.000
#> SRR1414749 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365963 3 0.5926 0.5122 0.356 0.000 0.644
#> SRR1368030 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419760 1 0.6673 0.6420 0.720 0.224 0.056
#> SRR1381841 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR821388 3 0.5291 0.6397 0.000 0.268 0.732
#> SRR657623 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR811333 1 0.4291 0.7817 0.820 0.000 0.180
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR811653 3 0.6518 0.7460 0.080 0.168 0.752
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR613318 2 0.6140 0.2941 0.000 0.596 0.404
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.0892 0.9251 0.020 0.000 0.980
#> SRR1500931 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387494 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379175 2 0.9677 0.0278 0.236 0.452 0.312
#> SRR1401909 1 0.6299 0.0332 0.524 0.000 0.476
#> SRR1440541 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.3551 0.8388 0.132 0.000 0.868
#> SRR1376640 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.0237 0.9619 0.996 0.000 0.004
#> SRR1084276 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.1860 0.9220 0.948 0.000 0.052
#> SRR1396877 1 0.1753 0.9256 0.952 0.000 0.048
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101128 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.0892 0.9632 0.020 0.980 0.000
#> SRR1093218 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077090 3 0.3816 0.8252 0.148 0.000 0.852
#> SRR1327430 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093100 2 0.3941 0.8060 0.156 0.844 0.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.3412 0.8468 0.876 0.000 0.124
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081473 3 0.0237 0.9344 0.004 0.000 0.996
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0747 0.9527 0.984 0.000 0.016
#> SRR808496 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR612359 2 0.2066 0.9226 0.000 0.940 0.060
#> SRR1444412 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.1964 0.9183 0.944 0.000 0.056
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.0592 0.9293 0.012 0.000 0.988
#> SRR1089713 3 0.5560 0.6009 0.300 0.000 0.700
#> SRR1453127 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498354 3 0.0747 0.9277 0.016 0.000 0.984
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081519 3 0.0592 0.9300 0.012 0.000 0.988
#> SRR614707 1 0.5016 0.6670 0.760 0.240 0.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.5098 0.7007 0.248 0.000 0.752
#> SRR1079502 3 0.3340 0.8497 0.120 0.000 0.880
#> SRR1457814 3 0.5529 0.5921 0.000 0.296 0.704
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327855 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475885 1 0.2550 0.9109 0.932 0.012 0.056
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR612323 2 0.6252 0.1623 0.000 0.556 0.444
#> SRR612604 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078439 3 0.0592 0.9285 0.000 0.012 0.988
#> SRR2165527 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.1860 0.9221 0.948 0.000 0.052
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.5307 0.7863 0.124 0.820 0.056
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.3686 0.8329 0.140 0.000 0.860
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.0892 0.9229 0.000 0.020 0.980
#> SRR612251 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472998 1 0.1529 0.9322 0.960 0.000 0.040
#> SRR1433452 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316151 2 0.0592 0.9712 0.012 0.988 0.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.6299 0.0623 0.524 0.000 0.476
#> SRR1078903 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.6286 0.0711 0.536 0.000 0.464
#> SRR808351 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081910 1 0.2878 0.8831 0.904 0.000 0.096
#> SRR1086611 1 0.6673 0.6421 0.720 0.224 0.056
#> SRR1392571 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR613557 3 0.4555 0.7440 0.000 0.200 0.800
#> SRR809831 1 0.0237 0.9619 0.996 0.000 0.004
#> SRR1429387 3 0.0000 0.9362 0.000 0.000 1.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9649 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.3816 0.8250 0.148 0.000 0.852
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.9820 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 3 0.0817 0.9142 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.3219 0.8319 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1472057 3 0.3356 0.7961 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR614491 4 0.3400 0.7414 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1361415 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 4 0.5138 0.3431 0.392 0.008 0.000 0.600
#> SRR1394209 4 0.5536 0.4871 0.024 0.384 0.000 0.592
#> SRR1474018 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500555 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1307997 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR663124 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 4 0.3266 0.7502 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1092727 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1364013 4 0.4967 0.3652 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR1468553 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420169 3 0.3486 0.7849 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1442800 4 0.3764 0.6420 0.216 0.000 0.000 0.784
#> SRR1359214 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.1118 0.9417 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1500030 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093053 4 0.4994 0.0489 0.000 0.000 0.480 0.520
#> SRR1399843 3 0.3942 0.6833 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR1380231 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0817 0.9545 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR614239 4 0.1792 0.8073 0.000 0.068 0.000 0.932
#> SRR613939 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1490204 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.4761 0.5598 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1471672 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613006 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1457354 2 0.1211 0.8540 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1362906 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1096736 1 0.6889 0.4106 0.592 0.232 0.000 0.176
#> SRR1478700 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081543 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384754 3 0.3907 0.7406 0.232 0.000 0.768 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380317 4 0.3400 0.7414 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1315247 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658549 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR612551 2 0.3024 0.8368 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1358520 2 0.0592 0.8478 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1419476 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456075 3 0.3837 0.7493 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR1389474 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1367005 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095985 3 0.4855 0.4115 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1325771 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660272 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 4 0.4500 0.4052 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR808044 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076916 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.3311 0.7994 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.3873 0.7832 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1469192 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659839 2 0.3528 0.8198 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR659533 2 0.3444 0.8255 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1362848 2 0.7970 -0.2037 0.020 0.432 0.164 0.384
#> SRR1407492 4 0.0469 0.8286 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1455082 4 0.0336 0.8297 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR658362 2 0.1302 0.8289 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR810921 2 0.3444 0.8253 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR662823 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 4 0.3444 0.6891 0.000 0.000 0.184 0.816
#> SRR1474816 2 0.4972 0.3552 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466400 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658921 2 0.4967 0.3654 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR1499873 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1101373 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.4382 0.6927 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1396166 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454891 4 0.4776 0.4969 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR663185 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.4985 0.3131 0.000 0.532 0.000 0.468
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660450 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334291 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415153 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.4855 0.4958 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1443161 4 0.4379 0.7322 0.036 0.172 0.000 0.792
#> SRR614695 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612779 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 3 0.4222 0.6782 0.272 0.000 0.728 0.000
#> SRR1105463 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811005 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.1022 0.9456 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.0921 0.8417 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.4205 0.8127 0.056 0.820 0.000 0.124
#> SRR1432106 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.3444 0.8255 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1458314 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318582 4 0.4500 0.4052 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR1080484 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078834 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1400530 2 0.3356 0.8290 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR614984 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.1302 0.8316 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1345523 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1500846 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.3356 0.7669 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1419062 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0188 0.9723 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099189 4 0.4967 0.3652 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347436 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327473 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338195 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.3610 0.8134 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1339597 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.4072 0.6571 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1322643 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354620 3 0.3569 0.7771 0.196 0.000 0.804 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.4567 0.6373 0.740 0.000 0.016 0.244
#> SRR1391529 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0188 0.8542 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1435330 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.3444 0.8253 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1389157 4 0.0592 0.8274 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR613568 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 4 0.3718 0.7011 0.012 0.000 0.168 0.820
#> SRR1475345 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1446180 4 0.0188 0.8304 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1406372 2 0.0592 0.8549 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1339880 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353136 3 0.4072 0.6569 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1093906 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.4898 0.4566 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR1399861 4 0.4804 0.5083 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR1338789 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 4 0.1118 0.8175 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1315041 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416617 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655672 4 0.4193 0.6720 0.000 0.268 0.000 0.732
#> SRR1420006 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458267 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.2408 0.7710 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1469432 2 0.3219 0.8319 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR660907 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.3837 0.5780 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1431326 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 4 0.3837 0.5948 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1098312 3 0.3311 0.7717 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR810273 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1376000 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.2281 0.7805 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR811471 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.1716 0.9131 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1479699 3 0.3266 0.7762 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1403589 2 0.3444 0.8250 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR812625 4 0.4331 0.5182 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.3074 0.8352 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1471222 4 0.3444 0.6832 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR1378992 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659427 2 0.6949 -0.1497 0.112 0.480 0.000 0.408
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0707 0.8460 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR659307 4 0.3400 0.6935 0.000 0.000 0.180 0.820
#> SRR1439994 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 3 0.3837 0.7493 0.224 0.000 0.776 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374270 4 0.4406 0.6509 0.000 0.300 0.000 0.700
#> SRR1470947 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365598 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408727 4 0.3400 0.7414 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1456274 1 0.4817 0.3372 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR817744 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1102680 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820049 3 0.3975 0.6767 0.000 0.000 0.760 0.240
#> SRR1375290 4 0.3400 0.6935 0.000 0.000 0.180 0.820
#> SRR818999 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1454629 1 0.2530 0.8690 0.896 0.000 0.004 0.100
#> SRR1332187 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR657833 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436207 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 4 0.3486 0.6646 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1308086 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.3311 0.8305 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1452356 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442983 4 0.4500 0.4052 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR1100346 4 0.0592 0.8274 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1332816 1 0.0188 0.9719 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR612299 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 4 0.4500 0.4052 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR1309403 1 0.4606 0.6181 0.724 0.000 0.012 0.264
#> SRR1498395 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079998 3 0.3942 0.7351 0.236 0.000 0.764 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337215 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414749 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365963 3 0.4564 0.5791 0.328 0.000 0.672 0.000
#> SRR1368030 2 0.3907 0.5729 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1419760 4 0.2814 0.7438 0.132 0.000 0.000 0.868
#> SRR1381841 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821388 4 0.3356 0.7444 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR657623 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811333 1 0.3486 0.7583 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1311666 2 0.4907 0.4524 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR1486698 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446436 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 4 0.4977 -0.0880 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR811653 4 0.7887 0.1314 0.012 0.180 0.388 0.420
#> SRR1311348 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1489438 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435442 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663537 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613318 4 0.3486 0.7385 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.4134 0.7535 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.1211 0.9041 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1500931 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387494 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379175 4 0.3400 0.7414 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1401909 1 0.4996 -0.0484 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1440541 2 0.3444 0.8255 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1068832 3 0.3400 0.7924 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR1376640 4 0.3123 0.7584 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR1085712 2 0.0592 0.8549 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1082283 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1437035 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101128 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394366 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093218 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077090 3 0.3486 0.7849 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1327430 4 0.4830 0.5058 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1088958 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.2149 0.8478 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR614335 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660534 2 0.3444 0.8255 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR817094 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1334265 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456401 4 0.3172 0.6938 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR1086393 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.1474 0.8222 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.1792 0.9066 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1499482 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614719 4 0.4989 0.3050 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1081473 3 0.0817 0.9151 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808496 4 0.3400 0.7414 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1336463 4 0.4916 0.0662 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR612359 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.3486 0.8228 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR808914 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.4907 0.4310 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR813632 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089713 3 0.4855 0.4086 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498354 3 0.0921 0.9126 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081519 3 0.0592 0.9202 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR614707 4 0.3311 0.7075 0.172 0.000 0.000 0.828
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.4331 0.6540 0.288 0.000 0.712 0.000
#> SRR1079502 3 0.3356 0.7961 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR1457814 4 0.7026 0.4891 0.000 0.180 0.248 0.572
#> SRR1455127 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615081 2 0.1022 0.8422 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1327855 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0707 0.8471 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1394125 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612383 4 0.0592 0.8274 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612851 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475885 1 0.4356 0.5747 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612323 4 0.3356 0.7444 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR612604 2 0.4961 0.3764 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1389546 2 0.3486 0.8228 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.3486 0.8228 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1414079 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331153 4 0.2345 0.7558 0.000 0.100 0.000 0.900
#> SRR1078439 4 0.4855 0.2967 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR2165527 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.0817 0.9537 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1313536 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1070308 4 0.5167 0.3554 0.016 0.340 0.000 0.644
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.3486 0.7851 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1443376 4 0.4817 0.2021 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1471312 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 4 0.3356 0.6986 0.000 0.000 0.176 0.824
#> SRR612251 2 0.2149 0.7882 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR613214 4 0.3649 0.7283 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR613078 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433452 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.3444 0.8250 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316151 4 0.3400 0.7414 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1417547 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659389 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1490270 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.4697 0.4027 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR1078903 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1451796 4 0.4643 0.3356 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615982 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429825 4 0.3801 0.7231 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1102393 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1071313 1 0.4907 0.1983 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.1940 0.8996 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1086611 4 0.2921 0.7367 0.140 0.000 0.000 0.860
#> SRR1392571 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.2408 0.8452 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1433131 4 0.4907 0.0793 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1321011 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1500598 2 0.0000 0.8556 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379343 4 0.0000 0.8316 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613557 4 0.0592 0.8261 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR809831 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.9298 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9759 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.3356 0.7963 0.176 0.000 0.824 0.000
#> SRR1072031 2 0.3400 0.8276 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1374671 4 0.4967 0.0173 0.000 0.452 0.000 0.548
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 3 0.3787 0.7648 0.008 0.000 0.820 0.052 0.120
#> SRR1404105 1 0.3143 0.6740 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR2164936 2 0.5046 0.7595 0.000 0.704 0.000 0.140 0.156
#> SRR1472057 3 0.3039 0.7532 0.192 0.000 0.808 0.000 0.000
#> SRR614491 4 0.3210 0.6642 0.000 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR1069376 1 0.4060 0.3312 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR811964 2 0.5752 0.7247 0.000 0.612 0.000 0.148 0.240
#> SRR1361415 2 0.1965 0.7842 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1345715 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1328073 4 0.5505 0.5464 0.168 0.036 0.000 0.704 0.092
#> SRR1394209 4 0.6698 0.3293 0.000 0.316 0.000 0.424 0.260
#> SRR1474018 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500555 4 0.0000 0.7683 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354363 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1391619 3 0.0162 0.9281 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1307997 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR663124 4 0.1403 0.7688 0.000 0.024 0.000 0.952 0.024
#> SRR1334670 1 0.0162 0.7649 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR612515 4 0.2516 0.7027 0.000 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR1092727 4 0.2329 0.7523 0.000 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1364013 4 0.4886 0.4023 0.000 0.372 0.000 0.596 0.032
#> SRR1468553 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420169 3 0.3577 0.7720 0.160 0.000 0.808 0.000 0.032
#> SRR1442800 4 0.5616 0.2771 0.412 0.000 0.000 0.512 0.076
#> SRR1359214 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.0290 0.7600 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1500030 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093053 4 0.4283 0.0887 0.000 0.000 0.456 0.544 0.000
#> SRR1399843 3 0.3774 0.5938 0.000 0.000 0.704 0.296 0.000
#> SRR1380231 3 0.0880 0.9087 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614239 4 0.1270 0.7535 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR613939 4 0.1544 0.7676 0.000 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR612971 2 0.5233 0.7527 0.000 0.684 0.000 0.148 0.168
#> SRR1490204 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR811357 2 0.6540 0.5269 0.000 0.476 0.000 0.288 0.236
#> SRR1471672 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR613006 4 0.2408 0.7637 0.000 0.016 0.000 0.892 0.092
#> SRR1469570 2 0.5752 0.7247 0.000 0.612 0.000 0.148 0.240
#> SRR1457354 2 0.1043 0.7758 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.3143 0.6740 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR813608 2 0.5752 0.7247 0.000 0.612 0.000 0.148 0.240
#> SRR1096736 5 0.4535 0.6002 0.008 0.160 0.000 0.072 0.760
#> SRR1478700 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1081543 3 0.0703 0.9170 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1384754 5 0.4573 0.5979 0.008 0.000 0.164 0.072 0.756
#> SRR612287 2 0.0162 0.7673 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1380317 4 0.3876 0.5834 0.000 0.316 0.000 0.684 0.000
#> SRR1315247 4 0.0290 0.7695 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1105344 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658549 4 0.0000 0.7683 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.5752 0.7247 0.000 0.612 0.000 0.148 0.240
#> SRR612551 2 0.4946 0.7633 0.000 0.712 0.000 0.120 0.168
#> SRR1358520 2 0.1792 0.7259 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456075 3 0.5115 0.0633 0.036 0.000 0.484 0.000 0.480
#> SRR1389474 2 0.5752 0.7247 0.000 0.612 0.000 0.148 0.240
#> SRR1367005 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1334419 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1417154 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.4401 0.3602 0.656 0.000 0.328 0.016 0.000
#> SRR1325771 1 0.4101 0.2863 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1360420 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660272 4 0.1792 0.7656 0.000 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1332993 1 0.3480 0.6080 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1311833 4 0.5867 0.3258 0.000 0.268 0.000 0.588 0.144
#> SRR808044 5 0.3949 0.8334 0.300 0.000 0.000 0.004 0.696
#> SRR1076916 3 0.3003 0.7676 0.188 0.000 0.812 0.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.2605 0.7141 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1341983 2 0.1965 0.7842 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1456114 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1072948 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.2516 0.8153 0.140 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.2852 0.6994 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR613843 2 0.6124 0.6740 0.000 0.564 0.000 0.200 0.236
#> SRR1469192 1 0.3143 0.6740 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1404555 3 0.0609 0.9191 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR659839 2 0.5821 0.7185 0.000 0.604 0.000 0.156 0.240
#> SRR659533 2 0.5233 0.7527 0.000 0.684 0.000 0.148 0.168
#> SRR1362848 4 0.7859 0.3245 0.000 0.336 0.092 0.388 0.184
#> SRR1407492 4 0.0579 0.7680 0.000 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1455082 4 0.1410 0.7612 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR658362 2 0.2927 0.7550 0.000 0.872 0.000 0.060 0.068
#> SRR810921 2 0.5787 0.7217 0.000 0.608 0.000 0.152 0.240
#> SRR662823 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 4 0.2773 0.6713 0.000 0.000 0.164 0.836 0.000
#> SRR1474816 2 0.6587 0.3002 0.000 0.404 0.000 0.388 0.208
#> SRR1342002 1 0.3143 0.6740 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1088437 2 0.1965 0.7842 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1466400 4 0.0162 0.7690 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR658921 2 0.5541 0.3338 0.000 0.552 0.000 0.372 0.076
#> SRR1499873 2 0.5233 0.7527 0.000 0.684 0.000 0.148 0.168
#> SRR1101373 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1090145 1 0.0162 0.7627 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1379324 1 0.2230 0.6780 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1345307 2 0.6350 0.6169 0.000 0.524 0.000 0.236 0.240
#> SRR1396166 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454891 4 0.4108 0.5371 0.000 0.308 0.000 0.684 0.008
#> SRR663185 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.4313 0.0573 0.636 0.000 0.000 0.008 0.356
#> SRR656758 4 0.6650 -0.2082 0.000 0.360 0.000 0.412 0.228
#> SRR1474351 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660450 4 0.1671 0.7664 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1472687 2 0.1965 0.7842 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1334291 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1415153 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1323271 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.6605 0.4749 0.000 0.452 0.000 0.312 0.236
#> SRR1443161 4 0.6580 0.2680 0.008 0.172 0.000 0.484 0.336
#> SRR614695 4 0.0000 0.7683 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092372 1 0.2605 0.6309 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1474577 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1406582 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR612779 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1089006 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1354071 3 0.4150 0.3841 0.388 0.000 0.612 0.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.0290 0.7602 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR811005 2 0.5752 0.7247 0.000 0.612 0.000 0.148 0.240
#> SRR1385319 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0162 0.9281 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1355415 1 0.0290 0.7600 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.2732 0.7097 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1320712 2 0.1908 0.7193 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1470075 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1091254 1 0.3143 0.6740 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1101397 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1321165 1 0.1410 0.7347 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1092112 3 0.4299 0.4532 0.388 0.000 0.608 0.004 0.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.5946 0.7263 0.008 0.612 0.000 0.140 0.240
#> SRR1432106 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.5233 0.7527 0.000 0.684 0.000 0.148 0.168
#> SRR1458314 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1318582 4 0.5331 0.4052 0.000 0.268 0.000 0.640 0.092
#> SRR1080484 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072749 1 0.3143 0.6740 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1078586 1 0.0880 0.7618 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1400333 4 0.0000 0.7683 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078834 4 0.0404 0.7698 0.000 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1417611 2 0.1608 0.7347 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1396840 1 0.1626 0.7350 0.940 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1465440 2 0.5233 0.7527 0.000 0.684 0.000 0.148 0.168
#> SRR1400530 2 0.5399 0.7409 0.000 0.664 0.000 0.148 0.188
#> SRR614984 4 0.0000 0.7683 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324269 1 0.3039 0.6845 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1401491 2 0.1965 0.7842 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1319443 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.4781 0.7260 0.000 0.728 0.000 0.160 0.112
#> SRR1345523 2 0.5233 0.7527 0.000 0.684 0.000 0.148 0.168
#> SRR1500846 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR661505 3 0.3003 0.7465 0.000 0.000 0.812 0.188 0.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.1608 0.7347 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1329624 1 0.0290 0.7639 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1315739 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.4304 -0.2303 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0162 0.9281 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1347436 4 0.0000 0.7683 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327473 1 0.7049 0.3062 0.556 0.068 0.000 0.164 0.212
#> SRR1338195 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.5233 0.7527 0.000 0.684 0.000 0.148 0.168
#> SRR1457792 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR658271 2 0.5831 0.7165 0.000 0.604 0.000 0.160 0.236
#> SRR1339597 1 0.3707 0.5583 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284
#> SRR1454842 3 0.3395 0.6751 0.000 0.000 0.764 0.236 0.000
#> SRR1322643 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR614887 3 0.0162 0.9281 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1354620 3 0.4045 0.4742 0.356 0.000 0.644 0.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.5240 0.4271 0.672 0.000 0.112 0.216 0.000
#> SRR1391529 1 0.3074 0.6809 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR663052 2 0.0404 0.7695 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1478834 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.5162 0.7440 0.000 0.692 0.000 0.148 0.160
#> SRR1435330 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615383 2 0.5787 0.7217 0.000 0.608 0.000 0.152 0.240
#> SRR1389157 4 0.0290 0.7673 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR613568 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR614095 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 4 0.4343 0.6659 0.136 0.000 0.096 0.768 0.000
#> SRR1475345 2 0.1965 0.7842 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR809089 2 0.5233 0.7527 0.000 0.684 0.000 0.148 0.168
#> SRR1446180 4 0.2389 0.7185 0.116 0.000 0.004 0.880 0.000
#> SRR1406372 2 0.2462 0.7867 0.000 0.880 0.000 0.008 0.112
#> SRR1339880 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353136 3 0.3837 0.5710 0.000 0.000 0.692 0.308 0.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.2605 0.7805 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1351104 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1363926 2 0.4817 0.4084 0.000 0.572 0.000 0.404 0.024
#> SRR1399861 4 0.4287 0.3611 0.000 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR1338789 5 0.3508 0.9109 0.252 0.000 0.000 0.000 0.748
#> SRR1421420 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.3177 0.6694 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1352870 4 0.0703 0.7642 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1315041 2 0.1608 0.7347 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR661877 2 0.0290 0.7684 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1443268 1 0.3534 0.3957 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256
#> SRR1416617 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102443 5 0.4168 0.8620 0.200 0.000 0.000 0.044 0.756
#> SRR655672 4 0.4150 0.4918 0.000 0.388 0.000 0.612 0.000
#> SRR1420006 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458267 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR613819 2 0.3039 0.5869 0.000 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1469432 2 0.3736 0.7698 0.000 0.808 0.000 0.140 0.052
#> SRR660907 2 0.1965 0.7842 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1465092 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1470727 1 0.3210 0.6653 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR1339153 3 0.0609 0.9191 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1472749 3 0.0162 0.9281 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1414379 2 0.3305 0.5254 0.000 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR1431326 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1487278 4 0.4732 0.5413 0.000 0.208 0.000 0.716 0.076
#> SRR1098312 3 0.2966 0.7517 0.000 0.000 0.816 0.184 0.000
#> SRR810273 2 0.5752 0.7247 0.000 0.612 0.000 0.148 0.240
#> SRR1376000 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR614467 2 0.2891 0.6140 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR811471 1 0.0290 0.7639 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1478341 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.2228 0.7144 0.912 0.000 0.000 0.048 0.040
#> SRR1479699 3 0.3039 0.7431 0.000 0.000 0.808 0.192 0.000
#> SRR1403589 2 0.5787 0.7216 0.000 0.608 0.000 0.152 0.240
#> SRR812625 4 0.4481 0.3016 0.000 0.416 0.000 0.576 0.008
#> SRR1359803 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.4401 0.7712 0.000 0.764 0.000 0.132 0.104
#> SRR1471222 4 0.4348 0.5113 0.000 0.316 0.000 0.668 0.016
#> SRR1378992 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR659427 4 0.6363 0.3190 0.000 0.392 0.000 0.444 0.164
#> SRR1096638 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1466619 2 0.1965 0.7162 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR659307 4 0.3395 0.6044 0.000 0.000 0.236 0.764 0.000
#> SRR1439994 5 0.4235 0.5463 0.424 0.000 0.000 0.000 0.576
#> SRR1454931 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 5 0.3768 0.5682 0.008 0.000 0.228 0.004 0.760
#> SRR658621 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.1851 0.7036 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1374270 4 0.4287 0.3708 0.000 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR1470947 2 0.1965 0.7842 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1365598 4 0.1608 0.7673 0.000 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR662787 2 0.1965 0.7842 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1408727 4 0.3876 0.5834 0.000 0.316 0.000 0.684 0.000
#> SRR1456274 4 0.6497 -0.2069 0.392 0.000 0.000 0.420 0.188
#> SRR817744 1 0.3143 0.6740 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1478744 2 0.1965 0.7842 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1387379 2 0.5233 0.7527 0.000 0.684 0.000 0.148 0.168
#> SRR1102680 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.3305 0.4787 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1445856 1 0.1197 0.7390 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR820049 3 0.3366 0.6847 0.000 0.000 0.768 0.232 0.000
#> SRR1375290 4 0.2605 0.6821 0.000 0.000 0.148 0.852 0.000
#> SRR818999 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.5233 0.7527 0.000 0.684 0.000 0.148 0.168
#> SRR1454629 1 0.0609 0.7539 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1332187 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR657833 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1436207 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1488017 1 0.3895 0.4504 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR612947 2 0.5752 0.7247 0.000 0.612 0.000 0.148 0.240
#> SRR1480384 1 0.3684 0.5467 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1364761 4 0.4266 0.6642 0.000 0.120 0.000 0.776 0.104
#> SRR1308086 3 0.0798 0.9163 0.000 0.000 0.976 0.008 0.016
#> SRR1441868 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1485380 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073705 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR615032 2 0.5155 0.7562 0.000 0.692 0.000 0.140 0.168
#> SRR1452356 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442983 4 0.5795 0.3389 0.000 0.268 0.000 0.596 0.136
#> SRR1100346 4 0.0290 0.7673 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1332816 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR612299 4 0.1671 0.7664 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1407386 1 0.3003 0.6890 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1418064 4 0.5515 0.3820 0.000 0.268 0.000 0.624 0.108
#> SRR1309403 4 0.5533 0.0392 0.436 0.000 0.016 0.512 0.036
#> SRR1498395 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1079998 1 0.4283 -0.0487 0.544 0.000 0.456 0.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337215 4 0.0162 0.7687 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1414749 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.6691 0.1224 0.400 0.000 0.360 0.000 0.240
#> SRR1368030 2 0.3586 0.4448 0.000 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR1419760 4 0.0703 0.7642 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1381841 1 0.0290 0.7602 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR821388 4 0.2773 0.6898 0.000 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR657623 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096149 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1342829 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.3003 0.6892 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR811333 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.6629 0.4329 0.000 0.436 0.000 0.332 0.232
#> SRR1486698 4 0.1608 0.7550 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1446436 4 0.1671 0.7664 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR815092 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 4 0.5913 0.0514 0.000 0.364 0.000 0.524 0.112
#> SRR1100564 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811653 4 0.7316 0.3444 0.000 0.316 0.232 0.420 0.032
#> SRR1311348 2 0.5752 0.7247 0.000 0.612 0.000 0.148 0.240
#> SRR1489438 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435442 4 0.1671 0.7664 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1421444 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.2471 0.7821 0.000 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1319520 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1444763 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1415026 2 0.1965 0.7842 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1416596 2 0.1608 0.7347 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1485499 2 0.1965 0.7842 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1316078 2 0.1965 0.7842 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR663465 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.1608 0.7347 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR663537 2 0.5752 0.7247 0.000 0.612 0.000 0.148 0.240
#> SRR1486780 5 0.4287 0.4160 0.460 0.000 0.000 0.000 0.540
#> SRR1453950 1 0.4060 0.3294 0.640 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1087875 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR613318 4 0.3876 0.5834 0.000 0.316 0.000 0.684 0.000
#> SRR1332694 1 0.3074 0.6809 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1468469 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818670 2 0.6350 0.6262 0.000 0.524 0.000 0.236 0.240
#> SRR1120318 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500931 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387494 3 0.0162 0.9281 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1379175 4 0.3752 0.6053 0.000 0.292 0.000 0.708 0.000
#> SRR1401909 1 0.3534 0.4725 0.744 0.000 0.256 0.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.5268 0.7492 0.000 0.680 0.000 0.148 0.172
#> SRR1068832 3 0.3039 0.7532 0.192 0.000 0.808 0.000 0.000
#> SRR1376640 4 0.2329 0.7136 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1085712 2 0.3013 0.7801 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160
#> SRR1082283 1 0.1626 0.7588 0.940 0.000 0.000 0.016 0.044
#> SRR1084276 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.4845 0.7376 0.000 0.724 0.000 0.148 0.128
#> SRR1437035 1 0.3074 0.6809 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1396877 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.5752 0.7247 0.000 0.612 0.000 0.148 0.240
#> SRR1417936 1 0.3895 0.4508 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1436822 2 0.1608 0.7347 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1101128 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0703 0.7727 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR612983 2 0.2179 0.7841 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1394366 4 0.1608 0.7667 0.000 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1093218 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077090 3 0.4938 0.5278 0.312 0.000 0.640 0.000 0.048
#> SRR1327430 4 0.4256 0.4141 0.000 0.436 0.000 0.564 0.000
#> SRR1088958 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1486931 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1086820 1 0.0290 0.7639 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1383000 1 0.3210 0.6655 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR1355705 2 0.4098 0.7777 0.000 0.780 0.000 0.064 0.156
#> SRR614335 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660534 2 0.5752 0.7247 0.000 0.612 0.000 0.148 0.240
#> SRR817094 2 0.5233 0.7527 0.000 0.684 0.000 0.148 0.168
#> SRR1334265 2 0.1608 0.7347 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1456401 4 0.3882 0.6026 0.000 0.224 0.000 0.756 0.020
#> SRR1086393 1 0.4138 0.2643 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR1351521 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.2020 0.7117 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.4869 0.5904 0.712 0.000 0.096 0.000 0.192
#> SRR1499482 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR614719 4 0.5103 0.2807 0.000 0.452 0.000 0.512 0.036
#> SRR1081473 3 0.0290 0.9253 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.2605 0.6358 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1088217 1 0.0404 0.7576 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR808496 4 0.3876 0.5834 0.000 0.316 0.000 0.684 0.000
#> SRR1336463 4 0.5884 0.0864 0.000 0.352 0.000 0.536 0.112
#> SRR612359 4 0.0000 0.7683 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656095 2 0.5787 0.7217 0.000 0.608 0.000 0.152 0.240
#> SRR808914 1 0.3074 0.6809 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1349099 1 0.4294 -0.2191 0.532 0.000 0.000 0.000 0.468
#> SRR1337886 2 0.5167 0.4120 0.000 0.552 0.000 0.404 0.044
#> SRR813632 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.0609 0.9174 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.4135 0.3358 0.656 0.000 0.340 0.004 0.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.4306 -0.1608 0.508 0.000 0.492 0.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.1121 0.7591 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1315434 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.1908 0.7435 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1367807 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1365791 3 0.1117 0.9116 0.016 0.000 0.964 0.020 0.000
#> SRR1081519 3 0.4307 0.1853 0.496 0.000 0.504 0.000 0.000
#> SRR614707 4 0.2654 0.7464 0.084 0.000 0.000 0.884 0.032
#> SRR1094027 1 0.3109 0.6776 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1489092 1 0.5385 0.0393 0.528 0.000 0.428 0.016 0.028
#> SRR1079502 3 0.2891 0.7725 0.176 0.000 0.824 0.000 0.000
#> SRR1457814 4 0.6351 0.4362 0.000 0.316 0.184 0.500 0.000
#> SRR1455127 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615081 2 0.2473 0.7402 0.000 0.896 0.000 0.032 0.072
#> SRR1327855 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.1792 0.7267 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1394125 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.3242 0.6587 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR1401122 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612383 4 0.0579 0.7680 0.000 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1477711 1 0.3074 0.6809 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1350813 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR612851 4 0.1732 0.7665 0.000 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1086349 1 0.4088 0.3012 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368
#> SRR812837 2 0.2605 0.7805 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1340010 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475885 5 0.5779 0.6717 0.212 0.000 0.000 0.172 0.616
#> SRR1376334 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1347042 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612323 4 0.2605 0.6967 0.000 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR612604 2 0.6566 0.3479 0.000 0.416 0.000 0.380 0.204
#> SRR1389546 2 0.5787 0.7217 0.000 0.608 0.000 0.152 0.240
#> SRR1311877 5 0.4161 0.6382 0.392 0.000 0.000 0.000 0.608
#> SRR1465608 5 0.3852 0.8976 0.220 0.000 0.000 0.020 0.760
#> SRR1101808 2 0.5664 0.7326 0.000 0.628 0.000 0.152 0.220
#> SRR1414079 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331153 4 0.4203 0.6512 0.000 0.128 0.000 0.780 0.092
#> SRR1078439 4 0.3999 0.3825 0.000 0.000 0.344 0.656 0.000
#> SRR2165527 2 0.1851 0.7836 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1351147 1 0.1270 0.7404 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1313536 2 0.5224 0.7464 0.000 0.684 0.000 0.176 0.140
#> SRR1070308 4 0.7100 0.3670 0.092 0.236 0.000 0.552 0.120
#> SRR1403110 1 0.3039 0.6848 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1400355 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1401317 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456862 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1074622 5 0.4015 0.7479 0.348 0.000 0.000 0.000 0.652
#> SRR1465847 1 0.4305 -0.1582 0.512 0.000 0.488 0.000 0.000
#> SRR1443376 4 0.6245 0.1221 0.000 0.316 0.000 0.516 0.168
#> SRR1471312 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.2561 0.7185 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1090881 4 0.2561 0.6867 0.000 0.000 0.144 0.856 0.000
#> SRR612251 2 0.2424 0.6762 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1418581 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR658045 2 0.5752 0.7247 0.000 0.612 0.000 0.148 0.240
#> SRR613214 4 0.3424 0.6452 0.000 0.240 0.000 0.760 0.000
#> SRR613078 4 0.1671 0.7664 0.000 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1472998 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433452 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1101957 5 0.3661 0.8754 0.276 0.000 0.000 0.000 0.724
#> SRR1487993 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.5435 0.7453 0.000 0.660 0.000 0.152 0.188
#> SRR1380375 1 0.3074 0.6809 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1367566 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316151 4 0.3796 0.5959 0.000 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659389 2 0.5233 0.7527 0.000 0.684 0.000 0.148 0.168
#> SRR1490270 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1398207 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.3452 0.4993 0.756 0.000 0.244 0.000 0.000
#> SRR1078903 4 0.2020 0.7622 0.000 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1323252 2 0.5268 0.7516 0.000 0.680 0.000 0.148 0.172
#> SRR1451796 4 0.4836 0.2782 0.000 0.356 0.000 0.612 0.032
#> SRR1369172 1 0.1851 0.7239 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR615982 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1480431 2 0.0000 0.7660 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429825 4 0.3684 0.6226 0.000 0.280 0.000 0.720 0.000
#> SRR1102393 2 0.5752 0.7247 0.000 0.612 0.000 0.148 0.240
#> SRR1071313 5 0.6180 0.6460 0.252 0.000 0.056 0.072 0.620
#> SRR808351 1 0.3143 0.6740 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1317513 1 0.3003 0.6877 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1480501 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.7649 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086611 4 0.0703 0.7642 0.024 0.000 0.000 0.976 0.000
#> SRR1392571 4 0.0290 0.7686 0.000 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1311441 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR808152 1 0.3966 0.4057 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR657313 3 0.2424 0.8127 0.000 0.000 0.868 0.132 0.000
#> SRR1433131 4 0.5498 0.2131 0.000 0.340 0.000 0.580 0.080
#> SRR1321011 2 0.5233 0.7527 0.000 0.684 0.000 0.148 0.168
#> SRR1500598 2 0.1965 0.7842 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1379343 4 0.1908 0.7646 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1389108 5 0.3424 0.9258 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1376228 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.3895 0.4504 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1358060 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.0162 0.9279 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR613557 4 0.0290 0.7675 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR809831 1 0.2929 0.6941 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1429387 3 0.0000 0.9299 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.3074 0.6809 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1071644 1 0.3143 0.6740 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1406936 3 0.3449 0.7657 0.164 0.000 0.812 0.000 0.024
#> SRR1072031 2 0.5752 0.7247 0.000 0.612 0.000 0.148 0.240
#> SRR1374671 4 0.5568 0.2035 0.000 0.308 0.000 0.596 0.096
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 3 0.4808 0.6297 0.000 0.000 0.576 0.360 0.064 0.000
#> SRR1404105 1 0.3221 0.7182 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR2164936 2 0.2179 0.6348 0.000 0.900 0.000 0.036 0.000 0.064
#> SRR1472057 3 0.3769 0.8199 0.016 0.000 0.768 0.192 0.024 0.000
#> SRR614491 6 0.3817 0.3965 0.000 0.000 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1069376 1 0.3717 0.5595 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384 0.000
#> SRR811964 2 0.2969 0.6934 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1361415 2 0.2631 0.5441 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000 0.000
#> SRR1345715 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1328073 6 0.6126 0.4097 0.144 0.024 0.000 0.400 0.000 0.432
#> SRR1394209 4 0.2163 0.6002 0.000 0.000 0.000 0.892 0.016 0.092
#> SRR1474018 4 0.3810 0.5498 0.000 0.428 0.000 0.572 0.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500555 6 0.2969 0.6993 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1354363 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0363 0.8838 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1307997 6 0.1765 0.7519 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR663124 6 0.3210 0.6934 0.000 0.152 0.000 0.036 0.000 0.812
#> SRR1334670 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 6 0.2969 0.6993 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1092727 6 0.1501 0.7464 0.000 0.076 0.000 0.000 0.000 0.924
#> SRR1364013 6 0.5211 0.2986 0.000 0.388 0.000 0.096 0.000 0.516
#> SRR1468553 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420169 3 0.3755 0.8199 0.012 0.000 0.768 0.192 0.028 0.000
#> SRR1442800 6 0.5355 0.5240 0.292 0.060 0.000 0.040 0.000 0.608
#> SRR1359214 4 0.3789 0.5654 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500030 3 0.1714 0.8703 0.000 0.000 0.908 0.092 0.000 0.000
#> SRR1093053 4 0.6125 -0.2064 0.000 0.000 0.312 0.352 0.000 0.336
#> SRR1399843 3 0.4985 0.5416 0.000 0.000 0.548 0.376 0.000 0.076
#> SRR1380231 3 0.2542 0.8632 0.044 0.000 0.876 0.080 0.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614239 6 0.2969 0.6993 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR613939 6 0.0146 0.7582 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR612971 2 0.0000 0.6999 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 6 0.1863 0.7474 0.000 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR811357 2 0.3482 0.6138 0.000 0.684 0.000 0.000 0.000 0.316
#> SRR1471672 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613006 6 0.2179 0.7520 0.000 0.064 0.000 0.036 0.000 0.900
#> SRR1469570 2 0.2969 0.6934 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1457354 4 0.5374 0.4750 0.000 0.252 0.000 0.580 0.000 0.168
#> SRR1362906 3 0.2048 0.8609 0.000 0.000 0.880 0.120 0.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.3221 0.7182 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR813608 2 0.2969 0.6934 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1096736 5 0.3547 0.6002 0.000 0.000 0.000 0.332 0.668 0.000
#> SRR1478700 5 0.0146 0.9093 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1081543 3 0.3470 0.8208 0.000 0.000 0.772 0.200 0.000 0.028
#> SRR1384754 5 0.2979 0.7762 0.004 0.000 0.004 0.188 0.804 0.000
#> SRR612287 4 0.3833 0.5247 0.000 0.444 0.000 0.556 0.000 0.000
#> SRR1380317 4 0.2883 0.5185 0.000 0.000 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1315247 6 0.2178 0.7386 0.000 0.000 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1105344 4 0.3828 0.5305 0.000 0.440 0.000 0.560 0.000 0.000
#> SRR658549 6 0.2703 0.7228 0.000 0.004 0.000 0.172 0.000 0.824
#> SRR1480240 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.2969 0.6934 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR612551 2 0.0000 0.6999 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 4 0.2730 0.6637 0.000 0.192 0.000 0.808 0.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456075 3 0.5854 0.1533 0.000 0.000 0.416 0.192 0.392 0.000
#> SRR1389474 2 0.2969 0.6934 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1367005 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334419 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.5374 0.1634 0.564 0.000 0.312 0.120 0.000 0.004
#> SRR1325771 1 0.3737 0.5435 0.608 0.000 0.000 0.000 0.392 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660272 6 0.1814 0.7490 0.000 0.100 0.000 0.000 0.000 0.900
#> SRR1332993 1 0.3428 0.6767 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304 0.000
#> SRR1311833 6 0.2941 0.6263 0.000 0.220 0.000 0.000 0.000 0.780
#> SRR808044 5 0.2006 0.8098 0.104 0.000 0.000 0.000 0.892 0.004
#> SRR1076916 3 0.5079 0.6754 0.224 0.000 0.628 0.148 0.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.2823 0.7532 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204 0.000
#> SRR1341983 2 0.3384 0.5597 0.000 0.812 0.000 0.120 0.000 0.068
#> SRR1456114 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.3329 0.8350 0.020 0.000 0.792 0.184 0.004 0.000
#> SRR1480176 1 0.2912 0.7446 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000
#> SRR613843 2 0.3175 0.6718 0.000 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256
#> SRR1469192 1 0.3221 0.7182 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1404555 3 0.1644 0.8782 0.000 0.000 0.932 0.040 0.000 0.028
#> SRR659839 2 0.2996 0.6916 0.000 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228
#> SRR659533 2 0.2003 0.6801 0.000 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1362848 4 0.0436 0.6000 0.000 0.000 0.004 0.988 0.004 0.004
#> SRR1407492 6 0.3109 0.7002 0.000 0.004 0.000 0.224 0.000 0.772
#> SRR1455082 6 0.3345 0.6248 0.000 0.204 0.000 0.020 0.000 0.776
#> SRR658362 2 0.3674 0.3448 0.000 0.716 0.000 0.268 0.000 0.016
#> SRR810921 2 0.2996 0.6916 0.000 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228
#> SRR662823 4 0.3810 0.5516 0.000 0.428 0.000 0.572 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 6 0.3974 0.6863 0.000 0.000 0.048 0.224 0.000 0.728
#> SRR1474816 2 0.3847 0.3236 0.000 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456
#> SRR1342002 1 0.3221 0.7182 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1088437 2 0.2631 0.5441 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000 0.000
#> SRR1466400 6 0.2631 0.7210 0.000 0.000 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR658921 4 0.6049 0.1561 0.000 0.268 0.000 0.408 0.000 0.324
#> SRR1499873 2 0.0000 0.6999 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.2260 0.7426 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1345307 2 0.3309 0.6521 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1396166 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454891 6 0.5047 0.5928 0.000 0.136 0.000 0.236 0.000 0.628
#> SRR663185 4 0.3810 0.5516 0.000 0.428 0.000 0.572 0.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.3684 0.3940 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372 0.000
#> SRR656758 2 0.3797 0.3725 0.000 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR1474351 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660450 6 0.1663 0.7527 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1472687 2 0.2738 0.5463 0.000 0.820 0.000 0.176 0.000 0.004
#> SRR1334291 6 0.1863 0.7474 0.000 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1415153 6 0.1863 0.7474 0.000 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1323271 4 0.3782 0.5689 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.3578 0.5744 0.000 0.660 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR1443161 4 0.3626 0.4629 0.000 0.000 0.000 0.788 0.068 0.144
#> SRR614695 6 0.2969 0.6993 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1092372 1 0.2378 0.7321 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152 0.000
#> SRR1474577 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406582 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612779 6 0.1863 0.7474 0.000 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1089006 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354071 3 0.4847 0.4897 0.340 0.000 0.588 0.072 0.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811005 2 0.2969 0.6934 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1385319 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0363 0.8838 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1355415 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.2996 0.7444 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1320712 4 0.1007 0.6222 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1470075 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.3221 0.7182 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1101397 5 0.0363 0.9053 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988 0.000
#> SRR1321165 1 0.1863 0.7670 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1092112 3 0.4743 0.4278 0.400 0.000 0.548 0.052 0.000 0.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.2597 0.7013 0.000 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1432106 4 0.3810 0.5516 0.000 0.428 0.000 0.572 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.1075 0.7073 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1458314 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1318582 6 0.2300 0.7088 0.000 0.144 0.000 0.000 0.000 0.856
#> SRR1080484 4 0.3789 0.5654 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1072749 1 0.4089 0.6987 0.696 0.000 0.000 0.040 0.264 0.000
#> SRR1078586 1 0.1141 0.7951 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1400333 6 0.2969 0.6993 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1078834 6 0.2912 0.7042 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1417611 4 0.2730 0.6637 0.000 0.192 0.000 0.808 0.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.1462 0.7732 0.936 0.000 0.000 0.008 0.056 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.6999 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.4106 0.6784 0.000 0.736 0.000 0.076 0.000 0.188
#> SRR614984 6 0.2969 0.6993 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1324269 1 0.2969 0.7401 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1401491 2 0.2631 0.5441 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.5661 0.2976 0.000 0.560 0.000 0.284 0.012 0.144
#> SRR1345523 2 0.0000 0.6999 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR661505 3 0.3508 0.8028 0.000 0.000 0.800 0.068 0.000 0.132
#> SRR1419062 3 0.2122 0.8711 0.024 0.000 0.900 0.076 0.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421284 4 0.2730 0.6637 0.000 0.192 0.000 0.808 0.000 0.000
#> SRR1329624 1 0.0458 0.7957 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 4 0.3518 0.4680 0.000 0.012 0.000 0.732 0.000 0.256
#> SRR1083286 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0622 0.8848 0.000 0.000 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR1347436 6 0.3422 0.7318 0.000 0.036 0.000 0.176 0.000 0.788
#> SRR1327473 1 0.6114 0.3344 0.452 0.076 0.000 0.416 0.052 0.004
#> SRR1338195 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.6999 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 5 0.1204 0.8668 0.056 0.000 0.000 0.000 0.944 0.000
#> SRR658271 2 0.3368 0.6853 0.000 0.756 0.000 0.012 0.000 0.232
#> SRR1339597 1 0.3659 0.6133 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364 0.000
#> SRR1454842 3 0.2883 0.7238 0.000 0.000 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1322643 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0363 0.8838 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1354620 3 0.3979 0.4947 0.360 0.000 0.628 0.012 0.000 0.000
#> SRR615056 4 0.3789 0.5654 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.6211 0.4210 0.524 0.048 0.016 0.336 0.000 0.076
#> SRR1391529 1 0.2969 0.7401 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR663052 2 0.4866 -0.1646 0.000 0.568 0.000 0.364 0.000 0.068
#> SRR1478834 1 0.0146 0.7968 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR812366 2 0.5605 0.4719 0.000 0.544 0.000 0.244 0.000 0.212
#> SRR1435330 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615383 2 0.2996 0.6916 0.000 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228
#> SRR1389157 6 0.2969 0.6993 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR613568 6 0.1863 0.7474 0.000 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR614095 4 0.3789 0.5654 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 6 0.4376 0.5998 0.212 0.000 0.084 0.000 0.000 0.704
#> SRR1475345 2 0.2631 0.5441 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.6999 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 6 0.3101 0.6929 0.000 0.000 0.000 0.244 0.000 0.756
#> SRR1406372 2 0.3698 0.6756 0.000 0.788 0.000 0.096 0.000 0.116
#> SRR1339880 3 0.2048 0.8609 0.000 0.000 0.880 0.120 0.000 0.000
#> SRR1353136 3 0.4864 0.5451 0.000 0.000 0.552 0.384 0.000 0.064
#> SRR1093906 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.2237 0.6314 0.000 0.896 0.000 0.036 0.000 0.068
#> SRR1351104 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363926 4 0.4973 0.5119 0.000 0.264 0.000 0.624 0.000 0.112
#> SRR1399861 4 0.2597 0.5563 0.000 0.000 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1338789 5 0.0146 0.9089 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1421420 3 0.1610 0.8751 0.000 0.000 0.916 0.084 0.000 0.000
#> SRR1420832 4 0.3804 0.5564 0.000 0.424 0.000 0.576 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.3244 0.7149 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR1352870 6 0.3109 0.6989 0.000 0.000 0.004 0.224 0.000 0.772
#> SRR1315041 4 0.2730 0.6637 0.000 0.192 0.000 0.808 0.000 0.000
#> SRR661877 2 0.3868 -0.4091 0.000 0.504 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR1443268 5 0.4184 0.1551 0.484 0.000 0.000 0.012 0.504 0.000
#> SRR1416617 3 0.0260 0.8861 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1102443 5 0.3612 0.7068 0.052 0.000 0.000 0.168 0.780 0.000
#> SRR655672 4 0.3756 0.3584 0.000 0.004 0.000 0.644 0.000 0.352
#> SRR1420006 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458267 6 0.1765 0.7519 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR613819 4 0.3213 0.6625 0.000 0.160 0.000 0.808 0.000 0.032
#> SRR1469432 2 0.4841 -0.2008 0.000 0.508 0.000 0.436 0.000 0.056
#> SRR660907 2 0.2631 0.5441 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000 0.000
#> SRR1465092 6 0.1765 0.7519 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1470727 1 0.3330 0.7026 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR1339153 3 0.1075 0.8703 0.000 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1472749 3 0.1225 0.8825 0.000 0.000 0.952 0.036 0.000 0.012
#> SRR1414379 4 0.2838 0.6641 0.000 0.188 0.000 0.808 0.000 0.004
#> SRR1431326 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1487278 6 0.2178 0.7153 0.000 0.132 0.000 0.000 0.000 0.868
#> SRR1098312 3 0.3312 0.8348 0.000 0.000 0.792 0.180 0.000 0.028
#> SRR810273 2 0.2969 0.6934 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1376000 6 0.1765 0.7519 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR614467 4 0.3122 0.6635 0.000 0.176 0.000 0.804 0.000 0.020
#> SRR811471 1 0.0937 0.7918 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.3897 0.6612 0.772 0.000 0.000 0.168 0.012 0.048
#> SRR1479699 3 0.3387 0.8368 0.000 0.000 0.796 0.164 0.000 0.040
#> SRR1403589 2 0.2969 0.6934 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR812625 4 0.5549 0.5224 0.000 0.164 0.000 0.532 0.000 0.304
#> SRR1359803 1 0.0260 0.7962 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1338988 2 0.2597 0.5494 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000 0.000
#> SRR1471222 4 0.4482 0.5136 0.000 0.048 0.000 0.628 0.000 0.324
#> SRR1378992 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659427 4 0.1219 0.5996 0.000 0.000 0.000 0.948 0.004 0.048
#> SRR1096638 5 0.0260 0.9068 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1466619 4 0.4134 0.6319 0.000 0.240 0.000 0.708 0.000 0.052
#> SRR659307 6 0.3511 0.6192 0.000 0.000 0.216 0.024 0.000 0.760
#> SRR1439994 5 0.3202 0.7019 0.176 0.000 0.000 0.024 0.800 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 5 0.2772 0.7834 0.000 0.000 0.004 0.180 0.816 0.000
#> SRR658621 4 0.3789 0.5654 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.1765 0.7537 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1374270 4 0.3377 0.6198 0.000 0.056 0.000 0.808 0.000 0.136
#> SRR1470947 2 0.2631 0.5441 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000 0.000
#> SRR1365598 6 0.2282 0.7598 0.000 0.088 0.000 0.024 0.000 0.888
#> SRR662787 2 0.2631 0.5441 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000 0.000
#> SRR1408727 4 0.2996 0.4955 0.000 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1456274 1 0.7335 0.3265 0.424 0.000 0.000 0.188 0.196 0.192
#> SRR817744 1 0.3221 0.7182 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1478744 2 0.2631 0.5441 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.6999 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.2730 0.8390 0.000 0.000 0.808 0.192 0.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.2823 0.6681 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204 0.000
#> SRR1445856 1 0.1625 0.7695 0.928 0.000 0.000 0.012 0.060 0.000
#> SRR820049 3 0.4944 0.5618 0.000 0.000 0.644 0.132 0.000 0.224
#> SRR1375290 6 0.2969 0.6993 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR818999 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.1075 0.6759 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1454629 1 0.0363 0.7915 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1332187 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR603365 3 0.0713 0.8845 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR657833 6 0.1765 0.7519 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1436207 6 0.1765 0.7519 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1488017 1 0.3672 0.5845 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368 0.000
#> SRR612947 2 0.2597 0.7013 0.000 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1480384 1 0.3515 0.6510 0.676 0.000 0.000 0.000 0.324 0.000
#> SRR1364761 6 0.2527 0.6932 0.000 0.168 0.000 0.000 0.000 0.832
#> SRR1308086 3 0.3381 0.8209 0.000 0.000 0.772 0.212 0.008 0.008
#> SRR1441868 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0547 0.8852 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1073705 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.6999 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452356 4 0.3789 0.5654 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1442983 6 0.2823 0.6468 0.000 0.204 0.000 0.000 0.000 0.796
#> SRR1100346 6 0.2969 0.6993 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1332816 5 0.0547 0.8982 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR612299 6 0.0363 0.7597 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1407386 1 0.3175 0.7248 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256 0.000
#> SRR1418064 6 0.2491 0.6908 0.000 0.164 0.000 0.000 0.000 0.836
#> SRR1309403 4 0.7551 -0.1568 0.324 0.008 0.032 0.356 0.040 0.240
#> SRR1498395 6 0.1863 0.7474 0.000 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1079998 1 0.4509 -0.1185 0.532 0.000 0.436 0.032 0.000 0.000
#> SRR1498885 4 0.3789 0.5654 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1337215 6 0.4406 0.7144 0.000 0.080 0.000 0.224 0.000 0.696
#> SRR1414749 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365963 5 0.6725 -0.0228 0.320 0.000 0.320 0.032 0.328 0.000
#> SRR1368030 4 0.3134 0.5798 0.000 0.024 0.000 0.808 0.000 0.168
#> SRR1419760 6 0.4255 0.7125 0.000 0.068 0.000 0.224 0.000 0.708
#> SRR1381841 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821388 6 0.3923 0.5478 0.000 0.004 0.000 0.416 0.000 0.580
#> SRR657623 4 0.3789 0.5654 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0260 0.8856 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR819583 3 0.1444 0.8766 0.000 0.000 0.928 0.072 0.000 0.000
#> SRR1096149 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.3198 0.7215 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR811333 1 0.0972 0.7825 0.964 0.000 0.028 0.008 0.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.3659 0.5339 0.000 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1486698 6 0.2969 0.6091 0.000 0.224 0.000 0.000 0.000 0.776
#> SRR1446436 6 0.1610 0.7549 0.000 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR815092 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 6 0.3695 0.1895 0.000 0.376 0.000 0.000 0.000 0.624
#> SRR1100564 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811653 4 0.1814 0.5695 0.000 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1311348 2 0.2969 0.6934 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1489438 4 0.3817 0.5455 0.000 0.432 0.000 0.568 0.000 0.000
#> SRR1435442 6 0.1663 0.7527 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1421444 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.2048 0.6044 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000 0.000
#> SRR1319520 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444763 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.2631 0.5441 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000 0.000
#> SRR1416596 4 0.2730 0.6637 0.000 0.192 0.000 0.808 0.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.2730 0.5284 0.000 0.808 0.000 0.192 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.2631 0.5441 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000 0.000
#> SRR663465 4 0.3659 0.5991 0.000 0.364 0.000 0.636 0.000 0.000
#> SRR1310094 4 0.2730 0.6637 0.000 0.192 0.000 0.808 0.000 0.000
#> SRR663537 2 0.2969 0.6934 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1486780 5 0.3843 -0.1827 0.452 0.000 0.000 0.000 0.548 0.000
#> SRR1453950 1 0.3717 0.5581 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384 0.000
#> SRR1087875 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613318 4 0.2431 0.5559 0.000 0.008 0.000 0.860 0.000 0.132
#> SRR1332694 1 0.2969 0.7401 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1468469 3 0.0363 0.8851 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR818670 2 0.3266 0.6571 0.000 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR1120318 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.3078 0.8342 0.000 0.000 0.796 0.192 0.012 0.000
#> SRR1500931 3 0.1564 0.8784 0.024 0.000 0.936 0.040 0.000 0.000
#> SRR1387494 3 0.2783 0.8512 0.000 0.000 0.836 0.148 0.000 0.016
#> SRR1379175 4 0.3390 0.3261 0.000 0.000 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1401909 1 0.3259 0.5726 0.772 0.000 0.216 0.012 0.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.4278 0.6712 0.000 0.712 0.000 0.076 0.000 0.212
#> SRR1068832 3 0.3806 0.7885 0.152 0.000 0.772 0.076 0.000 0.000
#> SRR1376640 6 0.2969 0.6993 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1085712 2 0.0146 0.6979 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.2361 0.7863 0.884 0.000 0.000 0.000 0.088 0.028
#> SRR1084276 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.5933 0.1684 0.000 0.432 0.000 0.348 0.000 0.220
#> SRR1437035 1 0.4307 0.7042 0.704 0.000 0.000 0.072 0.224 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.3314 0.6887 0.000 0.764 0.000 0.012 0.000 0.224
#> SRR1417936 1 0.3659 0.5913 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364 0.000
#> SRR1436822 4 0.2730 0.6637 0.000 0.192 0.000 0.808 0.000 0.000
#> SRR1101128 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363886 4 0.3868 0.4061 0.000 0.496 0.000 0.504 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.2378 0.5750 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000 0.000
#> SRR1394366 6 0.1387 0.7581 0.000 0.068 0.000 0.000 0.000 0.932
#> SRR1093218 3 0.2664 0.8426 0.000 0.000 0.816 0.184 0.000 0.000
#> SRR1077090 3 0.5229 0.6229 0.252 0.000 0.644 0.044 0.060 0.000
#> SRR1327430 4 0.3509 0.4833 0.000 0.016 0.000 0.744 0.000 0.240
#> SRR1088958 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486931 6 0.1765 0.7519 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1086820 1 0.0937 0.7918 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1383000 1 0.3266 0.7122 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272 0.000
#> SRR1355705 2 0.0632 0.6859 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR614335 4 0.3804 0.5567 0.000 0.424 0.000 0.576 0.000 0.000
#> SRR660534 2 0.2969 0.6934 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR817094 2 0.0000 0.6999 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 4 0.2730 0.6637 0.000 0.192 0.000 0.808 0.000 0.000
#> SRR1456401 4 0.5970 -0.1233 0.000 0.228 0.000 0.416 0.000 0.356
#> SRR1086393 1 0.3833 0.4551 0.556 0.000 0.000 0.000 0.444 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093100 4 0.2730 0.6637 0.000 0.192 0.000 0.808 0.000 0.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.5964 0.5920 0.600 0.000 0.096 0.080 0.224 0.000
#> SRR1499482 6 0.1765 0.7519 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR614719 6 0.4592 0.1235 0.000 0.468 0.000 0.036 0.000 0.496
#> SRR1081473 3 0.2912 0.8294 0.000 0.000 0.784 0.216 0.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.2135 0.7518 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808496 4 0.2730 0.5445 0.000 0.000 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1336463 2 0.4704 0.4609 0.000 0.684 0.000 0.156 0.000 0.160
#> SRR612359 6 0.2969 0.6993 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1444412 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656095 2 0.2996 0.6916 0.000 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228
#> SRR808914 1 0.2969 0.7401 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1349099 1 0.5528 0.3929 0.508 0.000 0.000 0.144 0.348 0.000
#> SRR1337886 2 0.4594 -0.0713 0.000 0.484 0.000 0.036 0.000 0.480
#> SRR813632 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.2257 0.8689 0.040 0.000 0.904 0.048 0.008 0.000
#> SRR1089713 1 0.4847 0.1584 0.588 0.000 0.340 0.072 0.000 0.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 3 0.4185 0.2263 0.492 0.000 0.496 0.012 0.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.1204 0.7945 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814747 4 0.3774 0.5717 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.2300 0.7772 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1367807 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.3683 0.8451 0.040 0.000 0.808 0.124 0.000 0.028
#> SRR1081519 3 0.4407 0.2449 0.484 0.000 0.492 0.024 0.000 0.000
#> SRR614707 6 0.2680 0.7372 0.032 0.000 0.000 0.108 0.000 0.860
#> SRR1094027 1 0.3023 0.7366 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232 0.000
#> SRR1489092 3 0.6929 0.3285 0.344 0.000 0.412 0.188 0.040 0.016
#> SRR1079502 3 0.3459 0.8230 0.016 0.000 0.768 0.212 0.004 0.000
#> SRR1457814 4 0.1267 0.6043 0.000 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1455127 4 0.4551 0.5746 0.000 0.344 0.000 0.608 0.000 0.048
#> SRR615081 4 0.5392 0.4298 0.000 0.192 0.000 0.584 0.000 0.224
#> SRR1327855 3 0.0363 0.8851 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1417873 4 0.3037 0.6651 0.000 0.176 0.000 0.808 0.000 0.016
#> SRR1394125 3 0.0937 0.8831 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.3288 0.7074 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1401122 4 0.3789 0.5654 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR612383 6 0.3109 0.7002 0.000 0.004 0.000 0.224 0.000 0.772
#> SRR1477711 1 0.2969 0.7401 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1350813 6 0.1765 0.7519 0.000 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR612851 6 0.0146 0.7587 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1086349 1 0.3737 0.5435 0.608 0.000 0.000 0.000 0.392 0.000
#> SRR812837 2 0.1863 0.6165 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.2823 0.8336 0.000 0.000 0.796 0.204 0.000 0.000
#> SRR1475885 5 0.5116 0.6994 0.048 0.000 0.000 0.136 0.700 0.116
#> SRR1376334 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612323 6 0.2969 0.6993 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR612604 2 0.4032 0.4338 0.000 0.572 0.000 0.008 0.000 0.420
#> SRR1389546 2 0.2969 0.6937 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1311877 5 0.2883 0.6466 0.212 0.000 0.000 0.000 0.788 0.000
#> SRR1465608 5 0.0547 0.8983 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1101808 2 0.1267 0.7098 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1414079 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331153 6 0.2300 0.7088 0.000 0.144 0.000 0.000 0.000 0.856
#> SRR1078439 6 0.5253 0.5345 0.000 0.000 0.168 0.228 0.000 0.604
#> SRR2165527 2 0.2697 0.5311 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.0458 0.7940 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1313536 2 0.1327 0.6912 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1070308 6 0.6130 0.2392 0.024 0.284 0.000 0.180 0.000 0.512
#> SRR1403110 1 0.2941 0.7426 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1400355 6 0.1863 0.7474 0.000 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1401317 3 0.1444 0.8766 0.000 0.000 0.928 0.072 0.000 0.000
#> SRR1456862 5 0.0547 0.8971 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1074622 5 0.2664 0.6961 0.184 0.000 0.000 0.000 0.816 0.000
#> SRR1465847 1 0.3860 -0.1667 0.528 0.000 0.472 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443376 6 0.3464 0.4608 0.000 0.312 0.000 0.000 0.000 0.688
#> SRR1471312 3 0.1714 0.8703 0.000 0.000 0.908 0.092 0.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.2941 0.7488 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1090881 6 0.2969 0.6993 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR612251 4 0.2793 0.6601 0.000 0.200 0.000 0.800 0.000 0.000
#> SRR1418581 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.2969 0.6934 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR613214 6 0.3869 0.2024 0.000 0.000 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR613078 6 0.0547 0.7604 0.000 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980
#> SRR1472998 1 0.0146 0.7953 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1433452 6 0.1863 0.7474 0.000 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1101957 5 0.1075 0.8727 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000
#> SRR1487993 3 0.2219 0.8573 0.000 0.000 0.864 0.136 0.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.1267 0.7095 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1380375 1 0.2969 0.7401 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316151 4 0.2854 0.5288 0.000 0.000 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1417547 4 0.3727 0.5852 0.000 0.388 0.000 0.612 0.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.6999 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 6 0.1863 0.7474 0.000 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1398207 1 0.0000 0.7964 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.3288 0.4998 0.724 0.000 0.276 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078903 6 0.1075 0.7588 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1323252 2 0.1007 0.7075 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1451796 6 0.3659 0.5432 0.000 0.364 0.000 0.000 0.000 0.636
#> SRR1369172 1 0.2491 0.7437 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR615982 6 0.0972 0.7618 0.000 0.028 0.000 0.008 0.000 0.964
#> SRR1480431 4 0.3789 0.5654 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1429825 6 0.4147 0.4241 0.000 0.012 0.000 0.436 0.000 0.552
#> SRR1102393 2 0.2969 0.6934 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1071313 5 0.3746 0.7420 0.048 0.000 0.000 0.192 0.760 0.000
#> SRR808351 1 0.3221 0.7182 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1317513 1 0.2969 0.7401 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1480501 3 0.3333 0.8276 0.000 0.000 0.784 0.192 0.024 0.000
#> SRR1081910 1 0.0260 0.7939 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1086611 6 0.2969 0.6993 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1392571 6 0.3566 0.7059 0.000 0.024 0.000 0.224 0.000 0.752
#> SRR1311441 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808152 1 0.3672 0.5845 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368 0.000
#> SRR657313 3 0.3453 0.8362 0.000 0.000 0.792 0.164 0.000 0.044
#> SRR1433131 6 0.3409 0.3884 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1321011 2 0.0000 0.6999 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.2631 0.5441 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000 0.000
#> SRR1379343 6 0.1863 0.7474 0.000 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1389108 5 0.0000 0.9116 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.3672 0.5845 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.2730 0.8390 0.000 0.000 0.808 0.192 0.000 0.000
#> SRR613557 6 0.2969 0.6993 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR809831 1 0.2883 0.7468 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.8862 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.2996 0.7385 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1071644 1 0.3221 0.7182 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1406936 3 0.4179 0.8004 0.016 0.000 0.744 0.192 0.048 0.000
#> SRR1072031 2 0.2969 0.6934 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1374671 2 0.5885 0.1699 0.000 0.476 0.000 0.248 0.000 0.276
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.961 0.982 0.4991 0.500 0.500
#> 3 3 0.886 0.894 0.955 0.3047 0.788 0.599
#> 4 4 0.647 0.547 0.758 0.1179 0.826 0.551
#> 5 5 0.675 0.646 0.795 0.0542 0.834 0.486
#> 6 6 0.695 0.697 0.792 0.0235 0.941 0.766
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1328073 2 0.3431 0.9245 0.064 0.936
#> SRR1394209 2 0.0672 0.9839 0.008 0.992
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1391619 1 0.2603 0.9520 0.956 0.044
#> SRR1307997 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1403980 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1420169 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1442800 2 0.4022 0.9058 0.080 0.920
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1093053 1 0.9993 0.1151 0.516 0.484
#> SRR1399843 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1380231 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR809470 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1096736 1 0.2423 0.9554 0.960 0.040
#> SRR1478700 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.4431 0.9045 0.908 0.092
#> SRR1384754 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR612287 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1380317 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1315247 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1456075 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1417154 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1095985 1 0.1633 0.9662 0.976 0.024
#> SRR1325771 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1360420 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR660272 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1072948 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1472370 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR659839 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1362848 2 0.6438 0.7928 0.164 0.836
#> SRR1407492 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.1633 0.9662 0.976 0.024
#> SRR818232 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1454868 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1086280 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1454891 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.5629 0.8582 0.868 0.132
#> SRR614695 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.1184 0.9686 0.984 0.016
#> SRR1105463 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1325871 1 0.4022 0.9172 0.920 0.080
#> SRR1355415 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1092112 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1074790 2 0.4690 0.8814 0.100 0.900
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1078834 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1419062 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1480131 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1315739 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1099189 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1091890 2 0.9775 0.2629 0.412 0.588
#> SRR1347436 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1327473 1 0.7674 0.7300 0.776 0.224
#> SRR1338195 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR809698 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.3879 0.9213 0.924 0.076
#> SRR1322643 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR614887 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1354620 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 0.7674 0.7308 0.776 0.224
#> SRR1391529 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR615383 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1389157 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR613568 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.9170 0.5359 0.668 0.332
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1446180 2 0.0376 0.9878 0.004 0.996
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.2236 0.9587 0.964 0.036
#> SRR1353136 1 0.9996 0.1005 0.512 0.488
#> SRR1093906 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR614035 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1399861 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1338789 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1421420 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1352870 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1315041 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1102443 1 0.1633 0.9662 0.976 0.024
#> SRR655672 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1420006 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.2236 0.9587 0.964 0.036
#> SRR1472749 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1414379 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.2778 0.9484 0.952 0.048
#> SRR810273 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1478341 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1088606 1 0.1633 0.9662 0.976 0.024
#> SRR1479699 1 0.9286 0.5097 0.656 0.344
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR659427 1 0.9909 0.2469 0.556 0.444
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1439994 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1374270 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1456274 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR817744 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR820049 1 1.0000 0.0552 0.500 0.500
#> SRR1375290 2 0.9933 0.1248 0.452 0.548
#> SRR818999 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.1633 0.9662 0.976 0.024
#> SRR1332187 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR603365 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR657833 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.3274 0.9372 0.940 0.060
#> SRR1441868 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1485380 1 0.1633 0.9662 0.976 0.024
#> SRR1073705 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1309403 2 0.9993 0.0160 0.484 0.516
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1414749 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1365963 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1419760 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1381841 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR821388 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR657623 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.2236 0.9587 0.964 0.036
#> SRR819583 1 0.1633 0.9662 0.976 0.024
#> SRR1096149 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1403072 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR811653 2 0.3879 0.9101 0.076 0.924
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR613318 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1468469 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR818670 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1500931 1 0.1633 0.9662 0.976 0.024
#> SRR1387494 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1379175 2 0.1633 0.9678 0.024 0.976
#> SRR1401909 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.1184 0.9686 0.984 0.016
#> SRR1396877 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1101128 1 0.1633 0.9662 0.976 0.024
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1093218 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1077090 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1093100 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.1633 0.9662 0.976 0.024
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR821846 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR656095 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1101591 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.1633 0.9662 0.976 0.024
#> SRR1453127 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1498354 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1315434 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR814747 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1365791 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1081519 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR614707 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.1184 0.9686 0.984 0.016
#> SRR1079502 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1457814 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1417873 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.9393 0.4823 0.644 0.356
#> SRR1475885 1 0.9944 0.2033 0.544 0.456
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1347042 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR612323 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1331153 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.8327 0.6657 0.736 0.264
#> SRR2165527 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1351147 1 0.1633 0.9662 0.976 0.024
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.2778 0.9423 0.048 0.952
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1456862 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1090881 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR612251 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1487993 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1367566 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1316151 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1480501 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1081910 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1086611 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1392571 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR657313 1 0.4022 0.9172 0.920 0.080
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1376228 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1399757 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1358060 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1464517 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR613557 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR809831 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR816565 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9730 1.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.1843 0.9647 0.972 0.028
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.9916 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.1860 0.9152 0.052 0.000 0.948
#> SRR614491 2 0.6045 0.3773 0.000 0.620 0.380
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 3 0.0592 0.9348 0.000 0.012 0.988
#> SRR1394209 3 0.0424 0.9349 0.000 0.008 0.992
#> SRR1474018 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1099809 1 0.6286 0.1428 0.536 0.000 0.464
#> SRR1500555 2 0.2537 0.8973 0.000 0.920 0.080
#> SRR1354363 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1307997 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR663124 2 0.0237 0.9686 0.000 0.996 0.004
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR612515 2 0.6026 0.3885 0.000 0.624 0.376
#> SRR1092727 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1468553 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1403980 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1420169 3 0.3116 0.8642 0.108 0.000 0.892
#> SRR1442800 3 0.1129 0.9299 0.004 0.020 0.976
#> SRR1359214 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1499849 1 0.6308 0.0381 0.508 0.000 0.492
#> SRR1500030 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1093053 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1399843 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1380231 3 0.0424 0.9389 0.008 0.000 0.992
#> SRR809470 3 0.6026 0.3975 0.376 0.000 0.624
#> SRR614239 2 0.0237 0.9686 0.000 0.996 0.004
#> SRR613939 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR612971 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.3412 0.8139 0.876 0.000 0.124
#> SRR613006 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1362906 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1478700 3 0.5254 0.6442 0.264 0.000 0.736
#> SRR1081543 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1384754 3 0.0892 0.9340 0.020 0.000 0.980
#> SRR612287 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1380317 3 0.0892 0.9277 0.000 0.020 0.980
#> SRR1315247 2 0.6008 0.3949 0.000 0.628 0.372
#> SRR1105344 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR658549 2 0.0424 0.9660 0.000 0.992 0.008
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1358520 2 0.1163 0.9524 0.000 0.972 0.028
#> SRR1419476 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1456075 3 0.1529 0.9236 0.040 0.000 0.960
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1095985 3 0.1529 0.9235 0.040 0.000 0.960
#> SRR1325771 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR660272 2 0.4346 0.7709 0.000 0.816 0.184
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 3 0.5098 0.6739 0.248 0.000 0.752
#> SRR1076916 3 0.0424 0.9389 0.008 0.000 0.992
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1456114 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1472370 3 0.1860 0.9152 0.052 0.000 0.948
#> SRR1480176 3 0.5529 0.5891 0.296 0.000 0.704
#> SRR613843 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR659839 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362848 3 0.0000 0.9376 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407492 2 0.4002 0.8031 0.000 0.840 0.160
#> SRR1455082 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1456375 3 0.0424 0.9389 0.008 0.000 0.992
#> SRR818232 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.0747 0.9322 0.000 0.016 0.984
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.4062 0.7635 0.836 0.000 0.164
#> SRR1088437 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1466400 2 0.4291 0.7729 0.000 0.820 0.180
#> SRR658921 2 0.1031 0.9555 0.000 0.976 0.024
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 3 0.4750 0.7286 0.216 0.000 0.784
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1086280 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1454891 2 0.0237 0.9686 0.000 0.996 0.004
#> SRR663185 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR811819 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0424 0.9654 0.000 0.992 0.008
#> SRR1472687 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1334291 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443161 3 0.0000 0.9376 0.000 0.000 1.000
#> SRR614695 2 0.2261 0.9095 0.000 0.932 0.068
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 3 0.2537 0.8916 0.080 0.000 0.920
#> SRR1105463 1 0.6062 0.3799 0.616 0.000 0.384
#> SRR811005 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1355415 1 0.6307 0.0546 0.512 0.000 0.488
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.5926 0.4702 0.000 0.644 0.356
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.6062 0.3799 0.616 0.000 0.384
#> SRR1321165 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.1163 0.9301 0.028 0.000 0.972
#> SRR1417588 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1074790 3 0.6262 0.5940 0.020 0.284 0.696
#> SRR1432106 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR655756 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1072749 1 0.5216 0.6270 0.740 0.000 0.260
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 3 0.4750 0.7250 0.000 0.216 0.784
#> SRR1078834 3 0.6008 0.4309 0.000 0.372 0.628
#> SRR1417611 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1396840 1 0.0424 0.9261 0.992 0.000 0.008
#> SRR1465440 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1400530 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR614984 2 0.4654 0.7328 0.000 0.792 0.208
#> SRR1324269 1 0.6260 0.1970 0.552 0.000 0.448
#> SRR1401491 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.1860 0.9309 0.000 0.948 0.052
#> SRR1345523 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1500846 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1419062 3 0.0424 0.9389 0.008 0.000 0.992
#> SRR1480131 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.4235 0.7872 0.000 0.824 0.176
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1099189 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0237 0.9376 0.000 0.004 0.996
#> SRR1347436 2 0.0237 0.9685 0.000 0.996 0.004
#> SRR1327473 3 0.1525 0.9274 0.032 0.004 0.964
#> SRR1338195 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR809698 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1322643 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1354620 3 0.5291 0.6425 0.268 0.000 0.732
#> SRR615056 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1105320 3 0.0475 0.9386 0.004 0.004 0.992
#> SRR1391529 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1435330 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR615383 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 2 0.6309 -0.0158 0.000 0.504 0.496
#> SRR613568 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR614095 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1103092 1 0.6095 0.3611 0.608 0.000 0.392
#> SRR1337155 3 0.0475 0.9386 0.004 0.004 0.992
#> SRR1475345 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR809089 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 3 0.1031 0.9275 0.000 0.024 0.976
#> SRR1406372 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1339880 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1353136 3 0.0000 0.9376 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093906 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR614035 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1399861 3 0.6140 0.3313 0.000 0.404 0.596
#> SRR1338789 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1420832 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.2356 0.8857 0.000 0.072 0.928
#> SRR1315041 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR661877 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1443268 1 0.6045 0.3898 0.620 0.000 0.380
#> SRR1416617 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1102443 3 0.1753 0.9182 0.048 0.000 0.952
#> SRR655672 2 0.0237 0.9686 0.000 0.996 0.004
#> SRR1420006 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR613819 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1469432 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR660907 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1465092 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1472749 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1414379 2 0.0424 0.9683 0.000 0.992 0.008
#> SRR1431326 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.3116 0.8658 0.000 0.892 0.108
#> SRR1098312 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR810273 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR614467 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR811471 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1088606 3 0.1129 0.9336 0.020 0.004 0.976
#> SRR1479699 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1471222 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1378992 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR659427 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR659307 3 0.4399 0.7593 0.000 0.188 0.812
#> SRR1439994 1 0.6062 0.3799 0.616 0.000 0.384
#> SRR1454931 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 3 0.1529 0.9236 0.040 0.000 0.960
#> SRR658621 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.5835 0.4800 0.660 0.000 0.340
#> SRR1374270 3 0.4002 0.7881 0.000 0.160 0.840
#> SRR1470947 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1365598 2 0.4235 0.7842 0.000 0.824 0.176
#> SRR662787 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1408727 2 0.0424 0.9683 0.000 0.992 0.008
#> SRR1456274 3 0.0424 0.9389 0.008 0.000 0.992
#> SRR817744 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1387379 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1102680 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.6008 0.4089 0.628 0.000 0.372
#> SRR820049 3 0.0237 0.9376 0.000 0.004 0.996
#> SRR1375290 3 0.0237 0.9376 0.000 0.004 0.996
#> SRR818999 1 0.6286 0.1435 0.536 0.000 0.464
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454629 3 0.1643 0.9211 0.044 0.000 0.956
#> SRR1332187 3 0.0424 0.9389 0.008 0.000 0.992
#> SRR603365 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR657833 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1441868 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1073705 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1452356 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332816 1 0.5560 0.5579 0.700 0.000 0.300
#> SRR612299 2 0.2066 0.9175 0.000 0.940 0.060
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 3 0.0661 0.9370 0.004 0.008 0.988
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 1 0.6307 0.0542 0.512 0.000 0.488
#> SRR1498885 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1337215 3 0.5560 0.5889 0.000 0.300 0.700
#> SRR1414749 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1365963 3 0.6045 0.3846 0.380 0.000 0.620
#> SRR1368030 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1419760 3 0.1163 0.9246 0.000 0.028 0.972
#> SRR1381841 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR821388 3 0.0424 0.9364 0.000 0.008 0.992
#> SRR657623 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1094241 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR819583 3 0.0424 0.9389 0.008 0.000 0.992
#> SRR1096149 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.1529 0.9235 0.040 0.000 0.960
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR811653 3 0.0592 0.9323 0.000 0.012 0.988
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1435442 2 0.3941 0.8062 0.000 0.844 0.156
#> SRR1421444 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1344010 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1319520 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1416596 2 0.0592 0.9654 0.000 0.988 0.012
#> SRR1485499 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1316078 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR663465 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1310094 2 0.0424 0.9683 0.000 0.992 0.008
#> SRR663537 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR613318 2 0.5859 0.4790 0.000 0.656 0.344
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR818670 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0237 0.9296 0.996 0.000 0.004
#> SRR1311622 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1500931 3 0.0424 0.9389 0.008 0.000 0.992
#> SRR1387494 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1379175 3 0.0424 0.9349 0.000 0.008 0.992
#> SRR1401909 1 0.6299 0.1000 0.524 0.000 0.476
#> SRR1440541 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.2066 0.9089 0.060 0.000 0.940
#> SRR1376640 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085712 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1082283 3 0.1753 0.9182 0.048 0.000 0.952
#> SRR1084276 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1437035 3 0.4121 0.7954 0.168 0.000 0.832
#> SRR1396877 3 0.5560 0.5775 0.300 0.000 0.700
#> SRR1443026 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0747 0.9622 0.000 0.984 0.016
#> SRR1101128 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1363886 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR612983 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1394366 2 0.3412 0.8467 0.000 0.876 0.124
#> SRR1093218 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1077090 3 0.3941 0.8099 0.156 0.000 0.844
#> SRR1327430 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1088958 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR614335 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR660534 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1334265 2 0.0424 0.9683 0.000 0.992 0.008
#> SRR1456401 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1086393 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1093100 2 0.5859 0.4785 0.000 0.656 0.344
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 3 0.1643 0.9211 0.044 0.000 0.956
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR614719 2 0.0237 0.9686 0.000 0.996 0.004
#> SRR1081473 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 3 0.6260 0.1825 0.448 0.000 0.552
#> SRR808496 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1336463 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR612359 2 0.1753 0.9306 0.000 0.952 0.048
#> SRR1444412 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR821846 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR656095 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 3 0.1643 0.9210 0.044 0.000 0.956
#> SRR1337886 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR813632 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.1643 0.9210 0.044 0.000 0.956
#> SRR1089713 3 0.1643 0.9211 0.044 0.000 0.956
#> SRR1453127 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1498354 3 0.1753 0.9182 0.048 0.000 0.952
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR814747 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.0424 0.9389 0.008 0.000 0.992
#> SRR1081519 3 0.1643 0.9210 0.044 0.000 0.956
#> SRR614707 3 0.4235 0.7742 0.000 0.176 0.824
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.1643 0.9211 0.044 0.000 0.956
#> SRR1079502 3 0.0424 0.9389 0.008 0.000 0.992
#> SRR1457814 3 0.2165 0.8883 0.000 0.064 0.936
#> SRR1455127 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR615081 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1327855 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1417873 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1394125 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR612383 2 0.3941 0.8082 0.000 0.844 0.156
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1340010 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1475885 3 0.1129 0.9336 0.020 0.004 0.976
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR612323 2 0.5138 0.6589 0.000 0.748 0.252
#> SRR612604 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 3 0.4178 0.7885 0.172 0.000 0.828
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1331153 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078439 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR2165527 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1351147 3 0.4235 0.7847 0.176 0.000 0.824
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.6286 0.1423 0.000 0.536 0.464
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1456862 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.1753 0.9182 0.048 0.000 0.952
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.4062 0.7869 0.000 0.164 0.836
#> SRR612251 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 2 0.1031 0.9563 0.000 0.976 0.024
#> SRR613078 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472998 3 0.1753 0.9182 0.048 0.000 0.952
#> SRR1433452 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1316151 3 0.4452 0.7509 0.000 0.192 0.808
#> SRR1417547 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR659389 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398207 1 0.6154 0.3164 0.592 0.000 0.408
#> SRR1358755 3 0.4654 0.7407 0.208 0.000 0.792
#> SRR1078903 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1429825 2 0.2878 0.8840 0.000 0.904 0.096
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 3 0.1643 0.9210 0.044 0.000 0.956
#> SRR808351 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1081910 3 0.1529 0.9235 0.040 0.000 0.960
#> SRR1086611 3 0.4121 0.7836 0.000 0.168 0.832
#> SRR1392571 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1500598 2 0.0237 0.9704 0.000 0.996 0.004
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1399757 1 0.5706 0.5212 0.680 0.000 0.320
#> SRR1358060 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1464517 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR613557 3 0.6280 0.1719 0.000 0.460 0.540
#> SRR809831 1 0.5291 0.6140 0.732 0.000 0.268
#> SRR1429387 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR816565 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9328 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.0237 0.9400 0.004 0.000 0.996
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.9705 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 3 0.2760 7.96e-01 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1404105 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.4477 2.19e-01 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1472057 1 0.5935 2.21e-01 0.496 0.000 0.468 0.036
#> SRR614491 4 0.4941 2.99e-01 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1069376 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.3610 4.25e-01 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1361415 4 0.3975 4.87e-01 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR1345715 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 3 0.7563 7.05e-02 0.000 0.196 0.440 0.364
#> SRR1394209 4 0.5846 -1.27e-01 0.000 0.032 0.452 0.516
#> SRR1474018 4 0.4454 3.91e-01 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR1099809 1 0.5308 6.25e-01 0.684 0.000 0.280 0.036
#> SRR1500555 4 0.5119 2.82e-01 0.000 0.440 0.004 0.556
#> SRR1354363 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0592 8.52e-01 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1307997 2 0.5161 3.57e-01 0.000 0.676 0.024 0.300
#> SRR663124 4 0.4941 2.99e-01 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1334670 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 4 0.4941 2.99e-01 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1092727 2 0.4790 6.54e-02 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1364013 4 0.4898 2.78e-01 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR1468553 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1403980 3 0.0000 8.54e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.5865 3.76e-01 0.552 0.000 0.412 0.036
#> SRR1442800 2 0.7105 1.99e-01 0.000 0.560 0.184 0.256
#> SRR1359214 4 0.4500 3.80e-01 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR1499849 1 0.5334 6.20e-01 0.680 0.000 0.284 0.036
#> SRR1500030 3 0.1302 8.43e-01 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1093053 3 0.3342 7.87e-01 0.000 0.032 0.868 0.100
#> SRR1399843 3 0.1211 8.43e-01 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1380231 3 0.1452 8.39e-01 0.008 0.000 0.956 0.036
#> SRR809470 1 0.5632 5.30e-01 0.624 0.000 0.340 0.036
#> SRR614239 4 0.4941 2.99e-01 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR613939 2 0.3893 4.52e-01 0.000 0.796 0.008 0.196
#> SRR612971 2 0.4643 2.31e-01 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1490204 2 0.4877 1.64e-01 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR811357 2 0.3444 4.38e-01 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1471672 1 0.1792 8.27e-01 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR613006 2 0.3528 4.55e-01 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1469570 2 0.3649 4.24e-01 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1457354 2 0.5217 1.98e-01 0.000 0.608 0.012 0.380
#> SRR1362906 3 0.1302 8.43e-01 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1079023 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.3649 4.25e-01 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1096736 3 0.3610 7.68e-01 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1478700 1 0.6374 4.84e-01 0.592 0.000 0.324 0.084
#> SRR1081543 3 0.2281 8.13e-01 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1384754 3 0.5553 6.54e-01 0.176 0.000 0.724 0.100
#> SRR612287 4 0.4804 3.17e-01 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR1380317 4 0.5883 1.08e-01 0.000 0.040 0.388 0.572
#> SRR1315247 2 0.5056 4.22e-01 0.000 0.732 0.044 0.224
#> SRR1105344 2 0.3801 4.48e-01 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR658549 4 0.4941 2.99e-01 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1480240 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.3688 4.16e-01 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR612551 2 0.4382 3.00e-01 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1358520 4 0.2266 4.65e-01 0.000 0.084 0.004 0.912
#> SRR1419476 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1456075 1 0.6655 1.79e-01 0.476 0.000 0.440 0.084
#> SRR1389474 2 0.3444 4.38e-01 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1367005 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1095985 3 0.6289 6.83e-01 0.100 0.148 0.716 0.036
#> SRR1325771 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR660272 2 0.6037 3.08e-01 0.000 0.628 0.068 0.304
#> SRR1332993 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.1211 4.86e-01 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR808044 1 0.6176 4.32e-01 0.572 0.000 0.368 0.060
#> SRR1076916 3 0.0336 8.53e-01 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 4 0.4985 2.04e-01 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1456114 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.1302 8.43e-01 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1472370 3 0.5928 -8.24e-02 0.456 0.000 0.508 0.036
#> SRR1480176 1 0.5793 4.84e-01 0.600 0.000 0.360 0.040
#> SRR613843 2 0.0817 4.88e-01 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1469192 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR659839 2 0.2281 4.95e-01 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR659533 2 0.4855 2.42e-02 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1362848 4 0.4855 1.78e-02 0.000 0.000 0.400 0.600
#> SRR1407492 4 0.4941 2.99e-01 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1455082 2 0.4830 2.31e-01 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR658362 4 0.4898 3.17e-01 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR810921 2 0.3764 3.96e-01 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR662823 4 0.4406 4.41e-01 0.000 0.300 0.000 0.700
#> SRR1456375 3 0.5282 4.84e-01 0.276 0.000 0.688 0.036
#> SRR818232 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.5607 2.04e-01 0.000 0.020 0.492 0.488
#> SRR1474816 2 0.1022 4.82e-01 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1342002 1 0.5022 6.84e-01 0.736 0.000 0.220 0.044
#> SRR1088437 4 0.4072 4.65e-01 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1466400 2 0.4671 4.38e-01 0.000 0.752 0.028 0.220
#> SRR658921 2 0.4775 4.36e-01 0.000 0.740 0.028 0.232
#> SRR1499873 2 0.4134 3.23e-01 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1101373 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.4818 6.76e-01 0.748 0.000 0.216 0.036
#> SRR1379324 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0921 4.85e-01 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1396166 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1086280 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1454891 4 0.4941 2.99e-01 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR663185 4 0.3764 4.97e-01 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR811819 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.3444 4.44e-01 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1474351 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.5496 3.41e-01 0.000 0.652 0.036 0.312
#> SRR1472687 2 0.4624 1.98e-01 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR1334291 2 0.3649 4.51e-01 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1415153 2 0.4331 2.68e-01 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1323271 4 0.5143 1.25e-01 0.000 0.456 0.004 0.540
#> SRR1368939 2 0.0707 4.85e-01 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1443161 3 0.3024 7.81e-01 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR614695 2 0.4671 4.38e-01 0.000 0.752 0.028 0.220
#> SRR1092372 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.3528 4.54e-01 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1089006 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 3 0.5894 4.51e-02 0.428 0.000 0.536 0.036
#> SRR1105463 1 0.5200 6.46e-01 0.700 0.000 0.264 0.036
#> SRR811005 2 0.4008 4.16e-01 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1385319 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1355415 1 0.5407 6.02e-01 0.668 0.000 0.296 0.036
#> SRR1090861 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 4 0.3156 4.49e-01 0.000 0.048 0.068 0.884
#> SRR1470075 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.5968 6.11e-01 0.664 0.000 0.252 0.084
#> SRR1321165 1 0.1722 8.45e-01 0.944 0.000 0.048 0.008
#> SRR1092112 3 0.5308 4.67e-01 0.280 0.000 0.684 0.036
#> SRR1417588 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1074790 2 0.7641 7.70e-02 0.000 0.452 0.224 0.324
#> SRR1432106 4 0.4222 4.60e-01 0.000 0.272 0.000 0.728
#> SRR655756 2 0.4072 3.38e-01 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1458314 1 0.0188 8.70e-01 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1318582 2 0.3873 3.83e-01 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1080484 4 0.3873 4.86e-01 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR1072749 1 0.5820 6.31e-01 0.680 0.000 0.240 0.080
#> SRR1078586 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.6544 2.69e-01 0.000 0.604 0.112 0.284
#> SRR1078834 2 0.5947 3.13e-01 0.000 0.628 0.060 0.312
#> SRR1417611 4 0.3942 3.37e-01 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR1396840 1 0.5021 6.72e-01 0.724 0.000 0.240 0.036
#> SRR1465440 2 0.4761 1.77e-01 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1400530 2 0.5036 3.87e-01 0.000 0.696 0.024 0.280
#> SRR614984 4 0.4941 2.99e-01 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1324269 1 0.5308 6.25e-01 0.684 0.000 0.280 0.036
#> SRR1401491 2 0.3873 4.39e-01 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1319443 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.7221 2.64e-02 0.000 0.432 0.140 0.428
#> SRR1345523 2 0.4222 3.57e-01 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR1500846 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.1209 8.43e-01 0.000 0.032 0.964 0.004
#> SRR1419062 3 0.0000 8.54e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.2060 8.40e-01 0.932 0.000 0.052 0.016
#> SRR1421284 4 0.2411 4.58e-01 0.000 0.040 0.040 0.920
#> SRR1329624 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1099189 4 0.4843 3.38e-01 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1083286 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.5865 4.28e-01 0.000 0.048 0.612 0.340
#> SRR1347436 2 0.5492 3.45e-01 0.000 0.640 0.032 0.328
#> SRR1327473 3 0.7214 5.52e-01 0.004 0.188 0.568 0.240
#> SRR1338195 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR809698 2 0.4164 3.27e-01 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1457792 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.1389 4.86e-01 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1339597 1 0.0672 8.66e-01 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1454842 3 0.1209 8.43e-01 0.000 0.032 0.964 0.004
#> SRR1322643 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1354620 1 0.5698 4.99e-01 0.608 0.000 0.356 0.036
#> SRR615056 4 0.4164 4.69e-01 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1105320 3 0.7234 4.91e-01 0.000 0.252 0.544 0.204
#> SRR1391529 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663052 4 0.4830 3.43e-01 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1478834 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.1792 4.63e-01 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1435330 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR615383 2 0.1022 4.86e-01 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1389157 4 0.5435 3.02e-01 0.000 0.420 0.016 0.564
#> SRR613568 2 0.5228 3.50e-01 0.000 0.664 0.024 0.312
#> SRR614095 4 0.4967 2.15e-01 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR1103092 1 0.5143 6.55e-01 0.708 0.000 0.256 0.036
#> SRR1337155 3 0.4836 5.60e-01 0.000 0.320 0.672 0.008
#> SRR1475345 4 0.4992 1.70e-01 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR809089 2 0.4072 3.38e-01 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1446180 2 0.6885 2.19e-01 0.000 0.596 0.196 0.208
#> SRR1406372 2 0.4401 4.00e-01 0.000 0.724 0.004 0.272
#> SRR1339880 3 0.1302 8.43e-01 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1353136 3 0.4406 5.61e-01 0.000 0.000 0.700 0.300
#> SRR1093906 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR614035 2 0.4713 1.83e-01 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1351104 1 0.0188 8.70e-01 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1363926 4 0.5004 1.13e-01 0.000 0.392 0.004 0.604
#> SRR1399861 4 0.3587 4.32e-01 0.000 0.040 0.104 0.856
#> SRR1338789 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.1211 8.43e-01 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1420832 4 0.4277 4.57e-01 0.000 0.280 0.000 0.720
#> SRR1476231 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 4 0.6027 3.15e-01 0.000 0.252 0.088 0.660
#> SRR1315041 4 0.5668 5.15e-05 0.000 0.444 0.024 0.532
#> SRR661877 4 0.4585 4.01e-01 0.000 0.332 0.000 0.668
#> SRR1443268 1 0.5845 6.20e-01 0.672 0.000 0.252 0.076
#> SRR1416617 3 0.0000 8.54e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102443 3 0.6574 1.89e-01 0.384 0.000 0.532 0.084
#> SRR655672 4 0.4941 2.99e-01 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1420006 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1458267 2 0.4992 -7.30e-02 0.000 0.524 0.000 0.476
#> SRR613819 4 0.2053 4.73e-01 0.000 0.072 0.004 0.924
#> SRR1469432 2 0.5000 -1.31e-01 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR660907 2 0.5000 -1.05e-01 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR1465092 2 0.5329 2.85e-01 0.000 0.568 0.012 0.420
#> SRR1470727 1 0.3325 7.94e-01 0.864 0.000 0.112 0.024
#> SRR1339153 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1472749 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1414379 4 0.3525 4.48e-01 0.000 0.100 0.040 0.860
#> SRR1431326 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.4671 4.38e-01 0.000 0.752 0.028 0.220
#> SRR1098312 3 0.2670 8.17e-01 0.000 0.040 0.908 0.052
#> SRR810273 2 0.2011 4.82e-01 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1376000 2 0.3569 4.53e-01 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR614467 4 0.3486 4.99e-01 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR811471 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1088606 3 0.6738 5.41e-01 0.040 0.312 0.604 0.044
#> SRR1479699 3 0.2926 8.11e-01 0.000 0.048 0.896 0.056
#> SRR1403589 2 0.0592 4.82e-01 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR812625 2 0.4888 2.25e-01 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1359803 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.4804 1.25e-01 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1471222 2 0.4996 -8.51e-02 0.000 0.516 0.000 0.484
#> SRR1378992 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659427 3 0.4804 4.71e-01 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1096638 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.4103 4.19e-01 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR659307 4 0.6253 3.18e-01 0.000 0.372 0.064 0.564
#> SRR1439994 1 0.5787 6.31e-01 0.680 0.000 0.244 0.076
#> SRR1454931 1 0.1975 8.42e-01 0.936 0.000 0.048 0.016
#> SRR1332928 1 0.6655 1.79e-01 0.476 0.000 0.440 0.084
#> SRR658621 4 0.3837 4.89e-01 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1095840 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.5520 6.47e-01 0.696 0.000 0.244 0.060
#> SRR1374270 4 0.4088 4.06e-01 0.000 0.040 0.140 0.820
#> SRR1470947 4 0.4761 3.45e-01 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR1365598 2 0.5599 3.37e-01 0.000 0.644 0.040 0.316
#> SRR662787 4 0.3266 4.30e-01 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1408727 4 0.2797 4.67e-01 0.000 0.068 0.032 0.900
#> SRR1456274 3 0.3266 8.13e-01 0.000 0.040 0.876 0.084
#> SRR817744 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 4 0.4977 1.83e-01 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1387379 2 0.4193 3.49e-01 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1102680 3 0.1022 8.43e-01 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.5228 6.41e-01 0.696 0.000 0.268 0.036
#> SRR820049 3 0.4100 7.49e-01 0.000 0.036 0.816 0.148
#> SRR1375290 3 0.3873 7.68e-01 0.000 0.060 0.844 0.096
#> SRR818999 1 0.5282 6.30e-01 0.688 0.000 0.276 0.036
#> SRR1390242 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.2081 4.94e-01 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1454629 3 0.7834 5.27e-01 0.172 0.232 0.560 0.036
#> SRR1332187 3 0.0000 8.54e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR603365 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR657833 2 0.3688 4.50e-01 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1436207 4 0.4994 1.98e-01 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1488017 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.3123 4.63e-01 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1480384 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.4356 2.58e-01 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1308086 3 0.1211 8.43e-01 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1441868 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1073705 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.4697 2.09e-01 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR1452356 4 0.4164 4.69e-01 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1442983 2 0.2647 4.86e-01 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1100346 4 0.4941 2.99e-01 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1332816 1 0.2589 7.87e-01 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR612299 2 0.4671 4.38e-01 0.000 0.752 0.028 0.220
#> SRR1407386 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.1557 4.92e-01 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1309403 3 0.7533 3.62e-01 0.004 0.344 0.480 0.172
#> SRR1498395 2 0.3444 4.55e-01 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1079998 1 0.6222 5.30e-01 0.616 0.000 0.304 0.080
#> SRR1498885 4 0.4164 4.69e-01 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1337215 2 0.6746 2.42e-01 0.000 0.580 0.124 0.296
#> SRR1414749 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1365963 1 0.6292 4.84e-01 0.592 0.000 0.332 0.076
#> SRR1368030 4 0.4353 4.97e-01 0.000 0.232 0.012 0.756
#> SRR1419760 3 0.7589 1.35e-01 0.000 0.400 0.404 0.196
#> SRR1381841 1 0.3674 7.86e-01 0.848 0.000 0.116 0.036
#> SRR821388 4 0.5599 2.92e-01 0.000 0.048 0.288 0.664
#> SRR657623 4 0.3873 4.91e-01 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR1094241 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR819583 3 0.0336 8.53e-01 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1096149 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1353028 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.5742 2.40e-01 0.368 0.000 0.596 0.036
#> SRR1311666 2 0.3400 4.36e-01 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1486698 2 0.4889 2.67e-01 0.000 0.636 0.004 0.360
#> SRR1446436 2 0.3610 4.52e-01 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR815092 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.3649 4.51e-01 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1100564 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR811653 4 0.4916 -2.70e-02 0.000 0.000 0.424 0.576
#> SRR1311348 2 0.3610 4.28e-01 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1489438 4 0.4522 3.83e-01 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR1435442 2 0.4775 4.30e-01 0.000 0.740 0.028 0.232
#> SRR1421444 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1344010 2 0.4730 1.93e-01 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1319520 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 4 0.4989 1.79e-01 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1416596 4 0.6801 -4.40e-02 0.000 0.448 0.096 0.456
#> SRR1485499 4 0.4624 3.76e-01 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR1316078 2 0.4916 3.84e-02 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR663465 4 0.4134 4.84e-01 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR1310094 4 0.4889 1.56e-01 0.000 0.360 0.004 0.636
#> SRR663537 2 0.3726 4.12e-01 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1486780 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613318 4 0.5879 4.50e-01 0.000 0.248 0.080 0.672
#> SRR1332694 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.1302 8.43e-01 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR818670 2 0.4304 2.91e-01 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1120318 1 0.0469 8.67e-01 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1311622 3 0.2408 8.23e-01 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1500931 3 0.4197 6.87e-01 0.156 0.000 0.808 0.036
#> SRR1387494 3 0.2197 8.28e-01 0.000 0.024 0.928 0.048
#> SRR1379175 3 0.7551 3.57e-01 0.000 0.240 0.488 0.272
#> SRR1401909 1 0.5383 6.08e-01 0.672 0.000 0.292 0.036
#> SRR1440541 2 0.4877 3.40e-01 0.000 0.664 0.008 0.328
#> SRR1068832 3 0.5928 -7.65e-02 0.456 0.000 0.508 0.036
#> SRR1376640 2 0.4989 -5.89e-02 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1085712 2 0.4250 3.53e-01 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1082283 1 0.5938 1.97e-01 0.488 0.000 0.476 0.036
#> SRR1084276 1 0.1940 8.31e-01 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1353262 2 0.4103 4.19e-01 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1437035 1 0.6520 3.45e-01 0.536 0.000 0.384 0.080
#> SRR1396877 1 0.5756 4.66e-01 0.592 0.000 0.372 0.036
#> SRR1443026 2 0.3688 4.48e-01 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1417936 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.5746 2.98e-01 0.000 0.612 0.040 0.348
#> SRR1101128 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1363886 4 0.4843 3.02e-01 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR612983 2 0.4746 1.59e-01 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1394366 2 0.4671 4.38e-01 0.000 0.752 0.028 0.220
#> SRR1093218 3 0.3697 8.07e-01 0.048 0.000 0.852 0.100
#> SRR1077090 1 0.5856 3.88e-01 0.556 0.000 0.408 0.036
#> SRR1327430 4 0.2053 4.72e-01 0.000 0.072 0.004 0.924
#> SRR1088958 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.3649 4.51e-01 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1086820 1 0.0376 8.69e-01 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1383000 1 0.5448 6.82e-01 0.724 0.000 0.196 0.080
#> SRR1355705 2 0.4500 2.80e-01 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR614335 4 0.3764 4.97e-01 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR660534 2 0.4164 3.15e-01 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR817094 2 0.3907 3.97e-01 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1334265 4 0.6094 3.25e-02 0.000 0.416 0.048 0.536
#> SRR1456401 4 0.4920 1.54e-01 0.000 0.368 0.004 0.628
#> SRR1086393 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1093100 4 0.2411 4.58e-01 0.000 0.040 0.040 0.920
#> SRR1309382 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 3 0.6396 2.03e-01 0.380 0.000 0.548 0.072
#> SRR1499482 2 0.4877 1.58e-01 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR614719 4 0.4941 2.99e-01 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1081473 3 0.2149 8.24e-01 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1087415 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.5359 6.14e-01 0.676 0.000 0.288 0.036
#> SRR808496 4 0.5058 4.11e-01 0.000 0.104 0.128 0.768
#> SRR1336463 2 0.4663 4.05e-01 0.000 0.716 0.012 0.272
#> SRR612359 4 0.4843 3.09e-01 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1444412 1 0.0336 8.69e-01 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1074116 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR821846 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR656095 2 0.3444 4.33e-01 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR808914 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.5933 2.28e-01 0.500 0.000 0.464 0.036
#> SRR1337886 2 0.4925 3.60e-02 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR813632 1 0.2973 7.80e-01 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1101591 1 0.5935 2.23e-01 0.496 0.000 0.468 0.036
#> SRR1089713 3 0.5558 3.74e-01 0.324 0.000 0.640 0.036
#> SRR1453127 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1498354 1 0.5901 3.20e-01 0.532 0.000 0.432 0.036
#> SRR1313831 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.1302 8.43e-01 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR814747 4 0.4535 4.27e-01 0.000 0.292 0.004 0.704
#> SRR1358539 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.0921 8.45e-01 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1081519 3 0.5935 -1.45e-01 0.468 0.000 0.496 0.036
#> SRR614707 2 0.6316 2.89e-01 0.000 0.612 0.088 0.300
#> SRR1094027 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.5816 1.66e-01 0.392 0.000 0.572 0.036
#> SRR1079502 3 0.1940 8.35e-01 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1457814 4 0.4018 3.47e-01 0.000 0.004 0.224 0.772
#> SRR1455127 4 0.4605 4.15e-01 0.000 0.336 0.000 0.664
#> SRR615081 2 0.4744 4.33e-01 0.000 0.736 0.024 0.240
#> SRR1327855 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1417873 4 0.4018 3.73e-01 0.000 0.224 0.004 0.772
#> SRR1394125 3 0.0000 8.54e-01 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 4 0.2408 4.73e-01 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR612383 4 0.4941 2.99e-01 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1477711 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.4948 1.07e-01 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR612851 4 0.4981 2.39e-01 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR1086349 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.4776 1.60e-01 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1340010 3 0.4560 5.60e-01 0.000 0.004 0.700 0.296
#> SRR1475885 3 0.7220 2.13e-01 0.000 0.420 0.440 0.140
#> SRR1376334 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0469 8.66e-01 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1347042 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR612323 4 0.4941 2.99e-01 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR612604 2 0.4212 4.46e-01 0.000 0.772 0.012 0.216
#> SRR1389546 2 0.4331 2.68e-01 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1311877 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.6412 4.45e-01 0.572 0.000 0.348 0.080
#> SRR1101808 2 0.4193 3.91e-01 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1414079 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1331153 2 0.5184 3.55e-01 0.000 0.672 0.024 0.304
#> SRR1078439 3 0.1022 8.43e-01 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR2165527 4 0.4277 4.59e-01 0.000 0.280 0.000 0.720
#> SRR1351147 3 0.8882 3.25e-01 0.240 0.300 0.404 0.056
#> SRR1313536 2 0.1716 4.95e-01 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1070308 2 0.7626 8.03e-02 0.000 0.464 0.232 0.304
#> SRR1403110 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.4522 3.04e-01 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1401317 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1456862 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.5921 2.81e-01 0.516 0.000 0.448 0.036
#> SRR1443376 2 0.3444 4.38e-01 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1471312 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1075579 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 4 0.6054 3.13e-01 0.000 0.256 0.088 0.656
#> SRR612251 4 0.4905 3.68e-01 0.000 0.364 0.004 0.632
#> SRR1418581 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.3356 4.42e-01 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR613214 4 0.4888 3.24e-01 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR613078 2 0.4538 4.42e-01 0.000 0.760 0.024 0.216
#> SRR1472998 1 0.5901 3.21e-01 0.532 0.000 0.432 0.036
#> SRR1433452 2 0.3649 4.51e-01 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1101957 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.1302 8.43e-01 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1465983 2 0.3688 4.07e-01 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1380375 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1316151 2 0.7369 5.53e-02 0.000 0.432 0.160 0.408
#> SRR1417547 4 0.2408 4.73e-01 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR659389 2 0.4331 2.96e-01 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1490270 2 0.4599 4.18e-01 0.000 0.736 0.016 0.248
#> SRR1398207 1 0.5256 6.36e-01 0.692 0.000 0.272 0.036
#> SRR1358755 1 0.5781 4.49e-01 0.584 0.000 0.380 0.036
#> SRR1078903 4 0.4961 2.81e-01 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR1323252 2 0.3726 4.17e-01 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1451796 2 0.3569 4.49e-01 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1369172 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615982 4 0.4933 2.99e-01 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1480431 4 0.4933 2.67e-01 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1429825 2 0.6263 2.47e-01 0.000 0.576 0.068 0.356
#> SRR1102393 2 0.3444 4.38e-01 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1071313 1 0.6609 1.62e-01 0.472 0.000 0.448 0.080
#> SRR808351 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.1211 8.43e-01 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1081910 3 0.5901 3.18e-03 0.432 0.000 0.532 0.036
#> SRR1086611 2 0.6473 2.78e-01 0.000 0.612 0.108 0.280
#> SRR1392571 4 0.4933 2.94e-01 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1311441 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1433131 2 0.3764 4.50e-01 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1321011 2 0.4679 2.17e-01 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1500598 4 0.4331 4.51e-01 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1379343 2 0.3444 4.41e-01 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1389108 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1399757 1 0.1211 8.49e-01 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1358060 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1464517 3 0.2149 8.24e-01 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR613557 4 0.5229 3.02e-01 0.000 0.428 0.008 0.564
#> SRR809831 1 0.5200 6.46e-01 0.700 0.000 0.264 0.036
#> SRR1429387 3 0.0188 8.55e-01 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR816565 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 8.72e-01 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.2530 8.21e-01 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1072031 2 0.3649 4.24e-01 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1374671 4 0.4941 2.99e-01 0.000 0.436 0.000 0.564
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 3 0.2411 0.85815 0.000 0.000 0.884 0.008 0.108
#> SRR1404105 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR2164936 2 0.0162 0.71456 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1472057 5 0.4595 0.73500 0.088 0.000 0.172 0.000 0.740
#> SRR614491 2 0.4130 0.61766 0.000 0.696 0.000 0.292 0.012
#> SRR1069376 1 0.0880 0.86138 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR811964 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 4 0.5065 -0.19161 0.000 0.420 0.000 0.544 0.036
#> SRR1345715 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1328073 4 0.5908 0.45518 0.000 0.004 0.276 0.592 0.128
#> SRR1394209 4 0.5422 0.45157 0.000 0.000 0.296 0.616 0.088
#> SRR1474018 4 0.4982 -0.16846 0.000 0.412 0.000 0.556 0.032
#> SRR1099809 5 0.4957 0.24744 0.444 0.000 0.028 0.000 0.528
#> SRR1500555 2 0.4404 0.60371 0.000 0.684 0.000 0.292 0.024
#> SRR1354363 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1391619 3 0.1410 0.89185 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1307997 4 0.5583 0.52745 0.000 0.244 0.040 0.664 0.052
#> SRR663124 2 0.4130 0.61766 0.000 0.696 0.000 0.292 0.012
#> SRR1334670 1 0.1478 0.85720 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR612515 2 0.4130 0.61766 0.000 0.696 0.000 0.292 0.012
#> SRR1092727 2 0.1965 0.70662 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1364013 2 0.4283 0.57386 0.000 0.644 0.000 0.348 0.008
#> SRR1468553 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.0162 0.91571 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1420169 5 0.4535 0.74474 0.140 0.000 0.108 0.000 0.752
#> SRR1442800 4 0.6193 0.59461 0.000 0.064 0.136 0.660 0.140
#> SRR1359214 4 0.3897 0.40038 0.000 0.204 0.000 0.768 0.028
#> SRR1499849 5 0.5016 0.51503 0.348 0.000 0.044 0.000 0.608
#> SRR1500030 3 0.2020 0.86535 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1093053 3 0.1644 0.89561 0.000 0.004 0.940 0.008 0.048
#> SRR1399843 3 0.2127 0.86152 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1380231 5 0.4126 0.53628 0.000 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR809470 5 0.5488 0.54882 0.300 0.000 0.092 0.000 0.608
#> SRR614239 2 0.4130 0.61766 0.000 0.696 0.000 0.292 0.012
#> SRR613939 2 0.5424 0.55869 0.000 0.652 0.012 0.264 0.072
#> SRR612971 2 0.2519 0.66236 0.000 0.884 0.000 0.100 0.016
#> SRR1490204 2 0.3752 0.62317 0.000 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.2136 0.85052 0.904 0.000 0.008 0.000 0.088
#> SRR613006 2 0.3561 0.63268 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 4 0.5745 0.15011 0.000 0.336 0.028 0.588 0.048
#> SRR1362906 3 0.2020 0.86535 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1079023 1 0.0162 0.86185 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR813608 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 5 0.4756 0.53887 0.000 0.000 0.288 0.044 0.668
#> SRR1478700 5 0.5284 0.69492 0.216 0.000 0.116 0.000 0.668
#> SRR1081543 3 0.1671 0.88103 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1384754 5 0.3835 0.62753 0.008 0.000 0.260 0.000 0.732
#> SRR612287 2 0.4950 0.43327 0.000 0.612 0.000 0.348 0.040
#> SRR1380317 4 0.5570 0.45200 0.000 0.000 0.288 0.608 0.104
#> SRR1315247 4 0.6476 -0.00782 0.000 0.428 0.020 0.444 0.108
#> SRR1105344 2 0.4520 0.61583 0.000 0.684 0.000 0.284 0.032
#> SRR658549 2 0.3816 0.61123 0.000 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR1480240 1 0.1544 0.85612 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1084816 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.1106 0.70632 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR1358520 4 0.2989 0.62071 0.000 0.052 0.040 0.884 0.024
#> SRR1419476 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456075 5 0.4541 0.73270 0.084 0.000 0.172 0.000 0.744
#> SRR1389474 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1334419 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1417154 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095985 5 0.4589 0.61878 0.020 0.000 0.316 0.004 0.660
#> SRR1325771 1 0.1544 0.85612 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1360420 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660272 4 0.6231 0.60985 0.000 0.076 0.092 0.652 0.180
#> SRR1332993 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1311833 2 0.0162 0.71447 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR808044 5 0.5222 0.72199 0.196 0.000 0.124 0.000 0.680
#> SRR1076916 3 0.3796 0.49860 0.000 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR1356266 1 0.1478 0.85720 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1341983 2 0.3796 0.62169 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1456114 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1072948 3 0.2074 0.86389 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1472370 5 0.4593 0.72959 0.080 0.000 0.184 0.000 0.736
#> SRR1480176 5 0.5045 0.58053 0.308 0.000 0.056 0.000 0.636
#> SRR613843 2 0.0451 0.71386 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1469192 1 0.2020 0.84696 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1404555 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0671 0.71563 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR659533 2 0.2852 0.67972 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1362848 4 0.5856 0.25384 0.000 0.000 0.396 0.504 0.100
#> SRR1407492 2 0.4130 0.61766 0.000 0.696 0.000 0.292 0.012
#> SRR1455082 2 0.4127 0.59890 0.000 0.680 0.000 0.312 0.008
#> SRR658362 2 0.4227 0.61579 0.000 0.692 0.000 0.292 0.016
#> SRR810921 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.5002 0.42417 0.000 0.596 0.000 0.364 0.040
#> SRR1456375 5 0.4415 0.47086 0.008 0.000 0.388 0.000 0.604
#> SRR818232 1 0.2648 0.79929 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1454868 3 0.5947 0.05943 0.000 0.004 0.512 0.388 0.096
#> SRR1474816 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.4201 0.44143 0.664 0.000 0.008 0.000 0.328
#> SRR1088437 4 0.4989 -0.17999 0.000 0.416 0.000 0.552 0.032
#> SRR1466400 4 0.6476 -0.00756 0.000 0.428 0.020 0.444 0.108
#> SRR658921 2 0.6509 0.07799 0.000 0.448 0.020 0.420 0.112
#> SRR1499873 2 0.0162 0.71456 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1101373 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1090145 5 0.5428 0.16297 0.444 0.000 0.048 0.004 0.504
#> SRR1379324 1 0.1410 0.85820 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1345307 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.4130 0.61766 0.000 0.696 0.000 0.292 0.012
#> SRR663185 4 0.4841 -0.17789 0.000 0.416 0.000 0.560 0.024
#> SRR811819 1 0.1732 0.85751 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1318920 1 0.2605 0.80310 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR656758 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0162 0.86185 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR660450 4 0.6017 0.54983 0.000 0.184 0.044 0.660 0.112
#> SRR1472687 2 0.1331 0.70474 0.000 0.952 0.000 0.040 0.008
#> SRR1334291 2 0.4594 0.59430 0.000 0.680 0.000 0.284 0.036
#> SRR1415153 2 0.0162 0.71456 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1323271 4 0.3106 0.52591 0.000 0.132 0.000 0.844 0.024
#> SRR1368939 2 0.1082 0.71416 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR1443161 3 0.3058 0.83368 0.000 0.000 0.860 0.044 0.096
#> SRR614695 2 0.6429 0.14383 0.000 0.468 0.020 0.408 0.104
#> SRR1092372 1 0.2813 0.79280 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1474577 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1406582 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR612779 2 0.3969 0.61124 0.000 0.692 0.000 0.304 0.004
#> SRR1089006 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1354071 5 0.4827 0.73933 0.116 0.000 0.160 0.000 0.724
#> SRR1105463 1 0.4446 0.34415 0.592 0.000 0.008 0.000 0.400
#> SRR811005 2 0.0703 0.71677 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1385319 1 0.2732 0.79128 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1325871 3 0.1478 0.88928 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1355415 5 0.4820 0.51682 0.332 0.000 0.036 0.000 0.632
#> SRR1090861 1 0.1410 0.85828 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1320712 4 0.4385 0.64839 0.000 0.032 0.112 0.796 0.060
#> SRR1470075 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1091254 1 0.1544 0.85948 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1101397 5 0.5381 0.10019 0.428 0.000 0.056 0.000 0.516
#> SRR1321165 1 0.3480 0.67363 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1092112 5 0.5067 0.68642 0.064 0.000 0.288 0.000 0.648
#> SRR1417588 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 4 0.5998 0.57469 0.000 0.028 0.192 0.648 0.132
#> SRR1432106 4 0.5143 -0.21082 0.000 0.428 0.000 0.532 0.040
#> SRR655756 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1318582 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 4 0.4909 -0.16675 0.000 0.412 0.000 0.560 0.028
#> SRR1072749 5 0.5111 -0.05036 0.464 0.000 0.036 0.000 0.500
#> SRR1078586 1 0.0404 0.86265 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1400333 4 0.6272 0.61510 0.000 0.100 0.180 0.648 0.072
#> SRR1078834 4 0.6164 0.55399 0.000 0.184 0.056 0.652 0.108
#> SRR1417611 4 0.1914 0.58155 0.000 0.060 0.000 0.924 0.016
#> SRR1396840 1 0.4276 0.41602 0.616 0.000 0.004 0.000 0.380
#> SRR1465440 2 0.2677 0.65370 0.000 0.872 0.000 0.112 0.016
#> SRR1400530 4 0.6109 0.59992 0.000 0.164 0.032 0.644 0.160
#> SRR614984 2 0.4130 0.61766 0.000 0.696 0.000 0.292 0.012
#> SRR1324269 1 0.5059 0.11832 0.548 0.000 0.036 0.000 0.416
#> SRR1401491 2 0.3551 0.66142 0.000 0.772 0.000 0.220 0.008
#> SRR1319443 1 0.2561 0.81067 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1324349 4 0.5805 0.63492 0.000 0.052 0.120 0.692 0.136
#> SRR1345523 2 0.1106 0.70723 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR1500846 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR661505 3 0.0162 0.91443 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1419062 3 0.0404 0.91273 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1480131 1 0.3774 0.61034 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296
#> SRR1421284 4 0.2900 0.63428 0.000 0.000 0.108 0.864 0.028
#> SRR1329624 1 0.1410 0.85828 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1315739 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.4173 0.61490 0.000 0.688 0.000 0.300 0.012
#> SRR1083286 1 0.2648 0.79929 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1091890 3 0.1117 0.89749 0.000 0.020 0.964 0.016 0.000
#> SRR1347436 4 0.5521 0.52278 0.000 0.244 0.044 0.668 0.044
#> SRR1327473 4 0.6425 0.36866 0.000 0.004 0.268 0.528 0.200
#> SRR1338195 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0510 0.86103 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR658271 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.2561 0.83326 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1454842 3 0.0671 0.91216 0.000 0.004 0.980 0.000 0.016
#> SRR1322643 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR614887 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354620 5 0.5195 0.68058 0.216 0.000 0.108 0.000 0.676
#> SRR615056 2 0.5068 0.40775 0.000 0.572 0.000 0.388 0.040
#> SRR1105320 4 0.6122 0.42518 0.000 0.004 0.284 0.564 0.148
#> SRR1391529 1 0.1478 0.85720 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR663052 2 0.4400 0.60191 0.000 0.672 0.000 0.308 0.020
#> SRR1478834 1 0.1478 0.85720 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR812366 2 0.1121 0.70096 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1435330 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0162 0.71447 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1389157 2 0.3857 0.60335 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000
#> SRR613568 4 0.5911 0.53018 0.000 0.204 0.032 0.656 0.108
#> SRR614095 2 0.4067 0.62463 0.000 0.692 0.000 0.300 0.008
#> SRR1103092 1 0.4597 0.25957 0.564 0.000 0.012 0.000 0.424
#> SRR1337155 4 0.6866 0.26812 0.000 0.096 0.408 0.444 0.052
#> SRR1475345 2 0.3488 0.60515 0.000 0.808 0.000 0.168 0.024
#> SRR809089 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 4 0.6295 0.60704 0.000 0.108 0.128 0.660 0.104
#> SRR1406372 2 0.6027 0.22650 0.000 0.484 0.016 0.428 0.072
#> SRR1339880 3 0.2124 0.86525 0.000 0.000 0.900 0.004 0.096
#> SRR1353136 3 0.2824 0.84696 0.000 0.000 0.872 0.032 0.096
#> SRR1093906 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.2036 0.69783 0.000 0.920 0.000 0.056 0.024
#> SRR1351104 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1363926 4 0.3013 0.61114 0.000 0.060 0.016 0.880 0.044
#> SRR1399861 4 0.5066 0.62470 0.000 0.024 0.152 0.736 0.088
#> SRR1338789 1 0.2179 0.85792 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1421420 3 0.2074 0.86389 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1420832 2 0.5026 0.41962 0.000 0.588 0.000 0.372 0.040
#> SRR1476231 1 0.0404 0.86080 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1352870 2 0.5998 0.06561 0.000 0.464 0.112 0.424 0.000
#> SRR1315041 4 0.3213 0.62296 0.000 0.060 0.040 0.872 0.028
#> SRR661877 2 0.4905 0.43931 0.000 0.624 0.000 0.336 0.040
#> SRR1443268 5 0.5227 0.00286 0.448 0.000 0.044 0.000 0.508
#> SRR1416617 3 0.0290 0.91520 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1102443 5 0.4419 0.69776 0.044 0.000 0.212 0.004 0.740
#> SRR655672 2 0.4130 0.61766 0.000 0.696 0.000 0.292 0.012
#> SRR1420006 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.3816 0.61123 0.000 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR613819 4 0.2482 0.58219 0.000 0.084 0.000 0.892 0.024
#> SRR1469432 2 0.4511 0.45016 0.000 0.628 0.000 0.356 0.016
#> SRR660907 2 0.4157 0.49494 0.000 0.716 0.000 0.264 0.020
#> SRR1465092 4 0.5622 0.47702 0.000 0.276 0.032 0.640 0.052
#> SRR1470727 1 0.3430 0.76843 0.776 0.000 0.004 0.000 0.220
#> SRR1339153 3 0.0510 0.91309 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1472749 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414379 4 0.3673 0.63057 0.000 0.060 0.040 0.848 0.052
#> SRR1431326 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1487278 2 0.6476 0.05569 0.000 0.444 0.020 0.428 0.108
#> SRR1098312 3 0.1831 0.88244 0.000 0.004 0.920 0.000 0.076
#> SRR810273 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.4712 0.59683 0.000 0.684 0.000 0.268 0.048
#> SRR614467 4 0.4702 -0.20559 0.000 0.432 0.000 0.552 0.016
#> SRR811471 1 0.1478 0.85720 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1478341 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088606 5 0.4538 0.57335 0.008 0.004 0.336 0.004 0.648
#> SRR1479699 3 0.3651 0.73848 0.000 0.004 0.808 0.160 0.028
#> SRR1403589 2 0.0162 0.71481 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR812625 2 0.4225 0.56024 0.000 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1359803 1 0.2732 0.79124 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1338988 2 0.3123 0.60896 0.000 0.828 0.000 0.160 0.012
#> SRR1471222 2 0.3730 0.63477 0.000 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR1378992 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR659427 4 0.5794 0.27654 0.000 0.000 0.384 0.520 0.096
#> SRR1096638 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1466619 2 0.4494 0.52727 0.000 0.608 0.000 0.380 0.012
#> SRR659307 2 0.4325 0.60684 0.000 0.684 0.004 0.300 0.012
#> SRR1439994 1 0.5295 0.09792 0.488 0.000 0.048 0.000 0.464
#> SRR1454931 1 0.3612 0.64679 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR1332928 5 0.4444 0.72765 0.072 0.000 0.180 0.000 0.748
#> SRR658621 4 0.4917 -0.17770 0.000 0.416 0.000 0.556 0.028
#> SRR1095840 1 0.1478 0.85720 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1458243 1 0.4779 0.31563 0.588 0.000 0.024 0.000 0.388
#> SRR1374270 4 0.4289 0.59814 0.000 0.000 0.176 0.760 0.064
#> SRR1470947 2 0.4734 0.45465 0.000 0.652 0.000 0.312 0.036
#> SRR1365598 4 0.6105 0.55805 0.000 0.176 0.048 0.656 0.120
#> SRR662787 4 0.2300 0.57199 0.000 0.072 0.000 0.904 0.024
#> SRR1408727 4 0.4096 0.63426 0.000 0.060 0.036 0.820 0.084
#> SRR1456274 5 0.5314 0.50842 0.000 0.004 0.296 0.068 0.632
#> SRR817744 1 0.0404 0.86080 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1478744 2 0.4562 0.46976 0.000 0.676 0.000 0.292 0.032
#> SRR1387379 2 0.0609 0.70982 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1102680 3 0.1041 0.89486 0.000 0.004 0.964 0.000 0.032
#> SRR1374198 1 0.2127 0.83582 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1445856 1 0.4436 0.34595 0.596 0.000 0.008 0.000 0.396
#> SRR820049 3 0.1393 0.90383 0.000 0.012 0.956 0.008 0.024
#> SRR1375290 3 0.1484 0.87278 0.000 0.048 0.944 0.008 0.000
#> SRR818999 5 0.4637 0.16384 0.452 0.000 0.012 0.000 0.536
#> SRR1390242 1 0.1544 0.85612 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1401164 2 0.2470 0.70098 0.000 0.884 0.000 0.104 0.012
#> SRR1454629 5 0.4212 0.66740 0.024 0.000 0.236 0.004 0.736
#> SRR1332187 3 0.0162 0.91566 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR603365 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR657833 2 0.5881 0.35428 0.000 0.560 0.020 0.356 0.064
#> SRR1436207 2 0.3816 0.61123 0.000 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR1488017 1 0.0162 0.86185 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR612947 2 0.0162 0.71481 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1480384 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1364761 2 0.0162 0.71456 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1308086 3 0.2124 0.86525 0.000 0.000 0.900 0.004 0.096
#> SRR1441868 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1485380 3 0.3766 0.55189 0.004 0.000 0.728 0.000 0.268
#> SRR1073705 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR615032 2 0.2624 0.64985 0.000 0.872 0.000 0.116 0.012
#> SRR1452356 4 0.4942 -0.21060 0.000 0.432 0.000 0.540 0.028
#> SRR1442983 2 0.0671 0.71563 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1100346 2 0.3816 0.61123 0.000 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR1332816 1 0.3234 0.74058 0.852 0.000 0.084 0.000 0.064
#> SRR612299 2 0.6475 0.07197 0.000 0.448 0.020 0.424 0.108
#> SRR1407386 1 0.1478 0.85720 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1418064 2 0.2891 0.67352 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1309403 4 0.6330 0.39696 0.000 0.004 0.276 0.540 0.180
#> SRR1498395 2 0.3278 0.68876 0.000 0.824 0.000 0.156 0.020
#> SRR1079998 5 0.5376 0.15018 0.424 0.000 0.056 0.000 0.520
#> SRR1498885 2 0.5026 0.41962 0.000 0.588 0.000 0.372 0.040
#> SRR1337215 4 0.6429 0.56048 0.000 0.032 0.176 0.604 0.188
#> SRR1414749 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365963 5 0.5605 0.23656 0.404 0.000 0.076 0.000 0.520
#> SRR1368030 4 0.5088 -0.20014 0.000 0.436 0.000 0.528 0.036
#> SRR1419760 4 0.5869 0.46895 0.000 0.004 0.268 0.600 0.128
#> SRR1381841 1 0.4264 0.41508 0.620 0.000 0.004 0.000 0.376
#> SRR821388 4 0.5630 0.45672 0.000 0.004 0.288 0.612 0.096
#> SRR657623 4 0.4917 -0.17770 0.000 0.416 0.000 0.556 0.028
#> SRR1094241 3 0.0609 0.91160 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR819583 3 0.3662 0.58664 0.004 0.000 0.744 0.000 0.252
#> SRR1096149 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1342829 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.1544 0.86227 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR811333 5 0.5035 0.71673 0.076 0.000 0.252 0.000 0.672
#> SRR1311666 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.4937 0.58584 0.000 0.672 0.000 0.264 0.064
#> SRR1446436 2 0.4668 0.59761 0.000 0.684 0.000 0.272 0.044
#> SRR815092 1 0.1478 0.85720 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1500149 2 0.5045 0.52122 0.000 0.636 0.000 0.308 0.056
#> SRR1100564 1 0.1671 0.85356 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1403072 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811653 3 0.5639 0.23730 0.000 0.000 0.568 0.340 0.092
#> SRR1311348 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 4 0.4980 -0.08220 0.000 0.380 0.000 0.584 0.036
#> SRR1435442 4 0.6459 0.10031 0.000 0.400 0.020 0.472 0.108
#> SRR1421444 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.2722 0.65599 0.000 0.872 0.000 0.108 0.020
#> SRR1319520 1 0.1792 0.85152 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1444763 1 0.2127 0.86231 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1415026 2 0.3876 0.59648 0.000 0.776 0.000 0.192 0.032
#> SRR1416596 4 0.4805 0.64692 0.000 0.052 0.052 0.768 0.128
#> SRR1485499 2 0.4908 0.43390 0.000 0.608 0.000 0.356 0.036
#> SRR1316078 2 0.3224 0.60901 0.000 0.824 0.000 0.160 0.016
#> SRR663465 2 0.5103 0.39292 0.000 0.556 0.000 0.404 0.040
#> SRR1310094 4 0.2970 0.61324 0.000 0.060 0.028 0.884 0.028
#> SRR663537 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1453950 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1087875 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR613318 2 0.6398 0.28849 0.000 0.496 0.024 0.384 0.096
#> SRR1332694 1 0.1410 0.85828 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1468469 3 0.3395 0.72206 0.000 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR818670 2 0.0290 0.71546 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1120318 1 0.3662 0.68256 0.744 0.000 0.004 0.000 0.252
#> SRR1311622 5 0.4304 0.03465 0.000 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR1500931 5 0.4380 0.54919 0.008 0.000 0.376 0.000 0.616
#> SRR1387494 3 0.0162 0.91443 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1379175 4 0.5778 0.45430 0.000 0.000 0.272 0.596 0.132
#> SRR1401909 5 0.4807 0.20009 0.448 0.000 0.020 0.000 0.532
#> SRR1440541 2 0.6170 0.33604 0.000 0.516 0.008 0.364 0.112
#> SRR1068832 5 0.5192 0.71801 0.092 0.000 0.244 0.000 0.664
#> SRR1376640 2 0.4088 0.60472 0.000 0.688 0.000 0.304 0.008
#> SRR1085712 2 0.2270 0.67942 0.000 0.904 0.000 0.076 0.020
#> SRR1082283 5 0.4998 0.73709 0.104 0.000 0.196 0.000 0.700
#> SRR1084276 1 0.3838 0.63153 0.716 0.000 0.004 0.000 0.280
#> SRR1353262 2 0.4969 0.58675 0.000 0.652 0.000 0.292 0.056
#> SRR1437035 5 0.5067 0.71247 0.204 0.000 0.092 0.004 0.700
#> SRR1396877 5 0.4840 0.59006 0.268 0.000 0.056 0.000 0.676
#> SRR1443026 2 0.2685 0.70403 0.000 0.880 0.000 0.092 0.028
#> SRR1417936 1 0.0162 0.86185 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1436822 4 0.6039 0.63790 0.000 0.108 0.080 0.680 0.132
#> SRR1101128 3 0.2074 0.83107 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1363886 2 0.4731 0.44904 0.000 0.640 0.000 0.328 0.032
#> SRR612983 2 0.1522 0.69908 0.000 0.944 0.000 0.044 0.012
#> SRR1394366 2 0.6469 0.11781 0.000 0.460 0.020 0.412 0.108
#> SRR1093218 5 0.3796 0.56667 0.000 0.000 0.300 0.000 0.700
#> SRR1077090 5 0.4591 0.74601 0.120 0.000 0.132 0.000 0.748
#> SRR1327430 4 0.2514 0.60595 0.000 0.060 0.000 0.896 0.044
#> SRR1088958 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1486931 2 0.4127 0.59595 0.000 0.680 0.000 0.312 0.008
#> SRR1086820 1 0.2020 0.85068 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1383000 1 0.4251 0.48854 0.624 0.000 0.004 0.000 0.372
#> SRR1355705 2 0.1485 0.70342 0.000 0.948 0.000 0.032 0.020
#> SRR614335 4 0.4674 -0.17944 0.000 0.416 0.000 0.568 0.016
#> SRR660534 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0609 0.70982 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1334265 4 0.4582 0.64456 0.000 0.060 0.064 0.792 0.084
#> SRR1456401 4 0.2834 0.60659 0.000 0.060 0.012 0.888 0.040
#> SRR1086393 1 0.2329 0.86034 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1351521 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093100 4 0.2773 0.63257 0.000 0.000 0.112 0.868 0.020
#> SRR1309382 1 0.1671 0.85347 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1089375 5 0.4180 0.69143 0.036 0.000 0.220 0.000 0.744
#> SRR1499482 2 0.4009 0.60151 0.000 0.684 0.000 0.312 0.004
#> SRR614719 2 0.4130 0.61766 0.000 0.696 0.000 0.292 0.012
#> SRR1081473 3 0.3424 0.71564 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1087415 1 0.1478 0.85720 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1088217 5 0.4757 0.39271 0.380 0.000 0.024 0.000 0.596
#> SRR808496 4 0.5151 0.64627 0.000 0.060 0.060 0.744 0.136
#> SRR1336463 4 0.5618 0.35125 0.000 0.320 0.016 0.604 0.060
#> SRR612359 2 0.4084 0.58175 0.000 0.668 0.000 0.328 0.004
#> SRR1444412 1 0.2930 0.79493 0.832 0.000 0.004 0.000 0.164
#> SRR1074116 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.1671 0.85352 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1349099 5 0.3912 0.74126 0.088 0.000 0.108 0.000 0.804
#> SRR1337886 2 0.1671 0.71246 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR813632 1 0.3300 0.72819 0.792 0.000 0.004 0.000 0.204
#> SRR1101591 5 0.4509 0.74197 0.096 0.000 0.152 0.000 0.752
#> SRR1089713 5 0.4637 0.67219 0.036 0.000 0.292 0.000 0.672
#> SRR1453127 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 5 0.5195 0.73314 0.108 0.000 0.216 0.000 0.676
#> SRR1313831 1 0.1478 0.85720 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1315434 3 0.2020 0.86535 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR814747 4 0.4989 -0.16145 0.000 0.416 0.000 0.552 0.032
#> SRR1358539 1 0.1671 0.85590 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1367807 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1365791 3 0.1043 0.88974 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1081519 5 0.5177 0.73053 0.104 0.000 0.220 0.000 0.676
#> SRR614707 4 0.6387 0.60845 0.000 0.108 0.124 0.652 0.116
#> SRR1094027 1 0.0510 0.86289 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1489092 5 0.4364 0.70182 0.048 0.000 0.216 0.000 0.736
#> SRR1079502 5 0.3816 0.55924 0.000 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR1457814 4 0.5644 0.43274 0.000 0.000 0.316 0.584 0.100
#> SRR1455127 2 0.4977 0.42964 0.000 0.604 0.000 0.356 0.040
#> SRR615081 4 0.6511 -0.04441 0.000 0.432 0.020 0.436 0.112
#> SRR1327855 3 0.0162 0.91571 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1417873 4 0.2438 0.59502 0.000 0.060 0.000 0.900 0.040
#> SRR1394125 3 0.0162 0.91557 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1488388 1 0.0290 0.86134 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1401122 4 0.2597 0.55614 0.000 0.092 0.000 0.884 0.024
#> SRR612383 2 0.4130 0.61766 0.000 0.696 0.000 0.292 0.012
#> SRR1477711 1 0.1197 0.85985 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1350813 2 0.4029 0.59861 0.000 0.680 0.000 0.316 0.004
#> SRR612851 2 0.3837 0.60814 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1086349 1 0.1732 0.85381 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR812837 2 0.3098 0.61922 0.000 0.836 0.000 0.148 0.016
#> SRR1340010 3 0.4852 0.66221 0.000 0.004 0.728 0.172 0.096
#> SRR1475885 4 0.7083 0.16170 0.004 0.008 0.280 0.420 0.288
#> SRR1376334 1 0.1544 0.85612 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1399821 1 0.2424 0.85984 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1347042 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612323 2 0.4130 0.61766 0.000 0.696 0.000 0.292 0.012
#> SRR612604 2 0.6322 0.36812 0.000 0.540 0.020 0.332 0.108
#> SRR1389546 2 0.0162 0.71456 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1311877 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1465608 5 0.4010 0.71346 0.136 0.000 0.072 0.000 0.792
#> SRR1101808 2 0.0955 0.71704 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1414079 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331153 4 0.6078 0.55574 0.000 0.188 0.036 0.648 0.128
#> SRR1078439 3 0.0324 0.91501 0.000 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR2165527 2 0.5026 0.41962 0.000 0.588 0.000 0.372 0.040
#> SRR1351147 5 0.5005 0.71048 0.076 0.000 0.208 0.008 0.708
#> SRR1313536 2 0.0162 0.71551 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1070308 4 0.6087 0.60891 0.000 0.048 0.164 0.660 0.128
#> SRR1403110 1 0.1478 0.85720 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1400355 2 0.0404 0.71676 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1401317 3 0.0880 0.90057 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1456862 1 0.2605 0.85740 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1074622 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1465847 5 0.4901 0.74493 0.104 0.000 0.184 0.000 0.712
#> SRR1443376 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.1478 0.85720 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1090881 4 0.5752 0.53333 0.000 0.240 0.148 0.612 0.000
#> SRR612251 2 0.4924 0.43704 0.000 0.552 0.000 0.420 0.028
#> SRR1418581 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR658045 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613214 2 0.4465 0.60177 0.000 0.672 0.000 0.304 0.024
#> SRR613078 2 0.6322 0.36812 0.000 0.540 0.020 0.332 0.108
#> SRR1472998 5 0.4617 0.74564 0.108 0.000 0.148 0.000 0.744
#> SRR1433452 2 0.4309 0.59200 0.000 0.676 0.000 0.308 0.016
#> SRR1101957 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1487993 3 0.2020 0.86535 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1465983 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0404 0.86236 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1367566 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316151 4 0.5363 0.57484 0.000 0.004 0.120 0.676 0.200
#> SRR1417547 4 0.2653 0.55308 0.000 0.096 0.000 0.880 0.024
#> SRR659389 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 4 0.6317 0.42477 0.000 0.288 0.028 0.576 0.108
#> SRR1398207 1 0.4565 0.31046 0.580 0.000 0.012 0.000 0.408
#> SRR1358755 5 0.5305 0.71473 0.196 0.000 0.132 0.000 0.672
#> SRR1078903 2 0.3612 0.63207 0.000 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0162 0.71563 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1369172 1 0.1851 0.86211 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR615982 2 0.3949 0.61340 0.000 0.696 0.000 0.300 0.004
#> SRR1480431 2 0.3838 0.64167 0.000 0.716 0.000 0.280 0.004
#> SRR1429825 4 0.5908 0.64186 0.000 0.064 0.120 0.688 0.128
#> SRR1102393 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 5 0.4263 0.72652 0.060 0.000 0.180 0.000 0.760
#> SRR808351 1 0.0880 0.86153 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1317513 1 0.1410 0.85828 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1480501 3 0.3999 0.51694 0.000 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1081910 5 0.5004 0.71225 0.072 0.000 0.256 0.000 0.672
#> SRR1086611 4 0.6938 0.59028 0.000 0.160 0.148 0.592 0.100
#> SRR1392571 2 0.4009 0.60151 0.000 0.684 0.000 0.312 0.004
#> SRR1311441 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR808152 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR657313 3 0.0510 0.91282 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1433131 2 0.5673 0.48781 0.000 0.600 0.012 0.316 0.072
#> SRR1321011 2 0.2573 0.65945 0.000 0.880 0.000 0.104 0.016
#> SRR1500598 2 0.4812 0.43334 0.000 0.600 0.000 0.372 0.028
#> SRR1379343 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.1965 0.84820 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1376228 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.2377 0.83087 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1358060 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.3003 0.78738 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR613557 2 0.4130 0.61766 0.000 0.696 0.000 0.292 0.012
#> SRR809831 1 0.4455 0.33274 0.588 0.000 0.008 0.000 0.404
#> SRR1429387 3 0.0000 0.91681 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0162 0.86185 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071644 1 0.0162 0.86185 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1406936 5 0.3857 0.54513 0.000 0.000 0.312 0.000 0.688
#> SRR1072031 2 0.0000 0.71468 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.4130 0.61766 0.000 0.696 0.000 0.292 0.012
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 3 0.6583 0.4179 0.000 0.000 0.484 0.204 0.260 0.052
#> SRR1404105 1 0.3659 0.7656 0.636 0.000 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR2164936 2 0.0000 0.7511 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472057 5 0.2100 0.8451 0.032 0.000 0.036 0.000 0.916 0.016
#> SRR614491 2 0.3243 0.7212 0.000 0.780 0.000 0.208 0.004 0.008
#> SRR1069376 1 0.2854 0.8021 0.792 0.000 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR811964 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1361415 2 0.5391 0.5282 0.000 0.560 0.000 0.344 0.020 0.076
#> SRR1345715 1 0.3706 0.7604 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1328073 4 0.5668 0.5638 0.000 0.016 0.136 0.640 0.188 0.020
#> SRR1394209 4 0.5555 0.5685 0.000 0.012 0.136 0.648 0.184 0.020
#> SRR1474018 2 0.5446 0.4691 0.000 0.520 0.000 0.384 0.016 0.080
#> SRR1099809 5 0.3855 0.6559 0.272 0.000 0.024 0.000 0.704 0.000
#> SRR1500555 2 0.3432 0.7067 0.000 0.764 0.000 0.216 0.000 0.020
#> SRR1354363 1 0.3659 0.7656 0.636 0.000 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1391619 3 0.1806 0.8461 0.000 0.000 0.908 0.000 0.088 0.004
#> SRR1307997 4 0.6680 -0.3298 0.000 0.256 0.020 0.496 0.028 0.200
#> SRR663124 2 0.3243 0.7212 0.000 0.780 0.000 0.208 0.004 0.008
#> SRR1334670 1 0.0363 0.8010 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR612515 2 0.3243 0.7212 0.000 0.780 0.000 0.208 0.004 0.008
#> SRR1092727 2 0.2178 0.7533 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.3650 0.6979 0.000 0.716 0.000 0.272 0.008 0.004
#> SRR1468553 3 0.0405 0.8583 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1403980 3 0.2680 0.8213 0.000 0.000 0.860 0.000 0.108 0.032
#> SRR1420169 5 0.2231 0.8449 0.048 0.000 0.028 0.000 0.908 0.016
#> SRR1442800 6 0.7435 0.3219 0.000 0.056 0.056 0.228 0.192 0.468
#> SRR1359214 2 0.4833 0.4189 0.000 0.488 0.000 0.464 0.004 0.044
#> SRR1499849 5 0.3640 0.7550 0.204 0.000 0.028 0.000 0.764 0.004
#> SRR1500030 3 0.2823 0.7761 0.000 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1093053 3 0.3732 0.7886 0.000 0.000 0.808 0.068 0.104 0.020
#> SRR1399843 3 0.4249 0.6939 0.000 0.000 0.688 0.000 0.260 0.052
#> SRR1380231 5 0.3408 0.7566 0.000 0.000 0.152 0.000 0.800 0.048
#> SRR809470 5 0.3201 0.7963 0.148 0.000 0.024 0.000 0.820 0.008
#> SRR614239 2 0.3243 0.7212 0.000 0.780 0.000 0.208 0.004 0.008
#> SRR613939 2 0.4087 0.6788 0.000 0.768 0.000 0.156 0.020 0.056
#> SRR612971 2 0.1890 0.7423 0.000 0.924 0.000 0.044 0.008 0.024
#> SRR1490204 2 0.2772 0.7369 0.000 0.816 0.000 0.180 0.004 0.000
#> SRR811357 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1471672 1 0.5227 0.7165 0.620 0.000 0.004 0.000 0.144 0.232
#> SRR613006 2 0.2520 0.7346 0.000 0.844 0.000 0.152 0.004 0.000
#> SRR1469570 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1457354 2 0.4208 0.4810 0.000 0.536 0.000 0.452 0.008 0.004
#> SRR1362906 3 0.3572 0.7639 0.000 0.000 0.764 0.000 0.204 0.032
#> SRR1079023 1 0.2092 0.8089 0.876 0.000 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR813608 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1096736 4 0.6590 0.1818 0.012 0.000 0.136 0.448 0.364 0.040
#> SRR1478700 5 0.3897 0.7393 0.188 0.000 0.028 0.000 0.764 0.020
#> SRR1081543 3 0.3421 0.7999 0.000 0.000 0.804 0.016 0.160 0.020
#> SRR1384754 5 0.2146 0.7844 0.000 0.000 0.116 0.000 0.880 0.004
#> SRR612287 2 0.5424 0.5198 0.000 0.588 0.000 0.304 0.024 0.084
#> SRR1380317 4 0.5285 0.5888 0.000 0.016 0.124 0.688 0.152 0.020
#> SRR1315247 6 0.6386 0.8278 0.000 0.300 0.000 0.208 0.028 0.464
#> SRR1105344 2 0.3158 0.7484 0.000 0.812 0.000 0.164 0.004 0.020
#> SRR658549 2 0.3243 0.7212 0.000 0.780 0.000 0.208 0.004 0.008
#> SRR1480240 1 0.0000 0.7969 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR612551 2 0.1719 0.7498 0.000 0.928 0.000 0.056 0.008 0.008
#> SRR1358520 4 0.2968 0.6165 0.000 0.056 0.032 0.868 0.044 0.000
#> SRR1419476 3 0.0260 0.8570 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1456075 5 0.2071 0.8438 0.028 0.000 0.044 0.000 0.916 0.012
#> SRR1389474 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1367005 1 0.3706 0.7604 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1334419 1 0.3706 0.7604 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1417154 3 0.0547 0.8562 0.000 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1095985 5 0.2595 0.8140 0.016 0.000 0.084 0.000 0.880 0.020
#> SRR1325771 1 0.2060 0.8096 0.900 0.000 0.000 0.000 0.016 0.084
#> SRR1360420 3 0.0000 0.8567 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660272 6 0.7299 0.7777 0.000 0.216 0.028 0.252 0.060 0.444
#> SRR1332993 1 0.3659 0.7656 0.636 0.000 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1311833 2 0.0000 0.7511 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808044 5 0.2812 0.8301 0.104 0.000 0.028 0.000 0.860 0.008
#> SRR1076916 5 0.4170 0.4339 0.000 0.000 0.308 0.000 0.660 0.032
#> SRR1356266 1 0.0000 0.7969 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.2805 0.7441 0.000 0.812 0.000 0.184 0.004 0.000
#> SRR1456114 1 0.3607 0.7704 0.652 0.000 0.000 0.000 0.000 0.348
#> SRR1072948 3 0.3543 0.7647 0.000 0.000 0.768 0.000 0.200 0.032
#> SRR1472370 5 0.2095 0.8447 0.028 0.000 0.040 0.000 0.916 0.016
#> SRR1480176 5 0.3950 0.6619 0.276 0.000 0.028 0.000 0.696 0.000
#> SRR613843 2 0.0865 0.7535 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.4076 0.7607 0.620 0.000 0.000 0.000 0.016 0.364
#> SRR1404555 3 0.0547 0.8552 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR659839 2 0.0547 0.7554 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.2135 0.7523 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1362848 4 0.5794 0.5577 0.000 0.012 0.156 0.624 0.184 0.024
#> SRR1407492 2 0.3243 0.7212 0.000 0.780 0.000 0.208 0.004 0.008
#> SRR1455082 2 0.3450 0.7111 0.000 0.772 0.000 0.208 0.008 0.012
#> SRR658362 2 0.3450 0.7182 0.000 0.772 0.000 0.208 0.012 0.008
#> SRR810921 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR662823 2 0.5393 0.5222 0.000 0.580 0.000 0.316 0.020 0.084
#> SRR1456375 5 0.2357 0.8130 0.012 0.000 0.116 0.000 0.872 0.000
#> SRR818232 1 0.0260 0.7970 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1454868 4 0.5549 0.5396 0.000 0.000 0.204 0.616 0.160 0.020
#> SRR1474816 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1342002 1 0.4136 0.5990 0.692 0.000 0.004 0.000 0.272 0.032
#> SRR1088437 2 0.5455 0.5125 0.000 0.548 0.000 0.352 0.020 0.080
#> SRR1466400 6 0.6377 0.8209 0.000 0.312 0.000 0.200 0.028 0.460
#> SRR658921 6 0.6599 0.8288 0.000 0.288 0.000 0.200 0.048 0.464
#> SRR1499873 2 0.0692 0.7572 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004 0.000
#> SRR1101373 1 0.3706 0.7604 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1090145 1 0.3789 0.3495 0.584 0.000 0.000 0.000 0.416 0.000
#> SRR1379324 1 0.0363 0.8004 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1345307 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1396166 3 0.0363 0.8569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1086280 3 0.0363 0.8569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1454891 2 0.3243 0.7212 0.000 0.780 0.000 0.208 0.004 0.008
#> SRR663185 2 0.4836 0.5250 0.000 0.536 0.000 0.416 0.008 0.040
#> SRR811819 1 0.1092 0.8037 0.960 0.000 0.000 0.000 0.020 0.020
#> SRR1318920 1 0.0806 0.7980 0.972 0.000 0.000 0.000 0.020 0.008
#> SRR656758 2 0.0713 0.7529 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.1663 0.8092 0.912 0.000 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR660450 6 0.7161 0.7996 0.000 0.224 0.024 0.248 0.052 0.452
#> SRR1472687 2 0.1615 0.7575 0.000 0.928 0.000 0.064 0.004 0.004
#> SRR1334291 2 0.3724 0.7019 0.000 0.780 0.000 0.176 0.020 0.024
#> SRR1415153 2 0.0458 0.7513 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1323271 4 0.4758 -0.3843 0.000 0.460 0.000 0.500 0.008 0.032
#> SRR1368939 2 0.0914 0.7540 0.000 0.968 0.000 0.016 0.016 0.000
#> SRR1443161 4 0.6781 0.1805 0.000 0.000 0.296 0.424 0.228 0.052
#> SRR614695 6 0.6414 0.7968 0.000 0.332 0.000 0.200 0.028 0.440
#> SRR1092372 1 0.0820 0.7995 0.972 0.000 0.000 0.000 0.012 0.016
#> SRR1474577 1 0.3706 0.7604 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1406582 1 0.3706 0.7604 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR612779 2 0.2946 0.7369 0.000 0.808 0.000 0.184 0.004 0.004
#> SRR1089006 1 0.3706 0.7604 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1354071 5 0.2859 0.8431 0.060 0.000 0.048 0.000 0.872 0.020
#> SRR1105463 1 0.4189 0.2344 0.552 0.000 0.004 0.000 0.436 0.008
#> SRR811005 2 0.1333 0.7608 0.000 0.944 0.000 0.048 0.008 0.000
#> SRR1385319 1 0.0508 0.7953 0.984 0.000 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1325871 3 0.2113 0.8427 0.000 0.000 0.896 0.008 0.092 0.004
#> SRR1355415 5 0.3292 0.7534 0.200 0.000 0.008 0.000 0.784 0.008
#> SRR1090861 1 0.1267 0.8076 0.940 0.000 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1320712 4 0.2777 0.6202 0.000 0.044 0.032 0.880 0.044 0.000
#> SRR1470075 1 0.3659 0.7656 0.636 0.000 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1091254 1 0.0146 0.7983 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1101397 1 0.5999 0.3396 0.472 0.000 0.024 0.000 0.376 0.128
#> SRR1321165 1 0.1757 0.7746 0.916 0.000 0.000 0.000 0.076 0.008
#> SRR1092112 5 0.2277 0.8426 0.032 0.000 0.076 0.000 0.892 0.000
#> SRR1417588 3 0.0146 0.8562 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1074790 4 0.5235 0.5799 0.012 0.040 0.052 0.700 0.188 0.008
#> SRR1432106 2 0.5491 0.4859 0.000 0.532 0.000 0.368 0.020 0.080
#> SRR655756 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1458314 1 0.3634 0.7679 0.644 0.000 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR1318582 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1080484 2 0.5329 0.4782 0.000 0.524 0.000 0.388 0.012 0.076
#> SRR1072749 1 0.6220 0.3910 0.472 0.000 0.028 0.000 0.340 0.160
#> SRR1078586 1 0.1610 0.8092 0.916 0.000 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1400333 4 0.5693 0.2693 0.000 0.204 0.072 0.656 0.036 0.032
#> SRR1078834 6 0.6879 0.8079 0.000 0.236 0.024 0.248 0.028 0.464
#> SRR1417611 4 0.2577 0.5604 0.000 0.072 0.012 0.884 0.000 0.032
#> SRR1396840 1 0.3674 0.6020 0.716 0.000 0.000 0.000 0.268 0.016
#> SRR1465440 2 0.2721 0.7351 0.000 0.868 0.000 0.088 0.004 0.040
#> SRR1400530 6 0.6892 0.6891 0.000 0.268 0.008 0.284 0.036 0.404
#> SRR614984 2 0.3243 0.7212 0.000 0.780 0.000 0.208 0.004 0.008
#> SRR1324269 1 0.4593 0.0976 0.512 0.000 0.028 0.000 0.456 0.004
#> SRR1401491 2 0.2113 0.7632 0.000 0.896 0.000 0.092 0.004 0.008
#> SRR1319443 1 0.0508 0.7951 0.984 0.000 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1324349 4 0.4217 0.6083 0.000 0.048 0.036 0.776 0.136 0.004
#> SRR1345523 2 0.1728 0.7509 0.000 0.924 0.000 0.064 0.008 0.004
#> SRR1500846 1 0.3659 0.7656 0.636 0.000 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR661505 3 0.1341 0.8574 0.000 0.000 0.948 0.000 0.028 0.024
#> SRR1419062 3 0.4007 0.7203 0.000 0.000 0.728 0.000 0.220 0.052
#> SRR1480131 1 0.2070 0.7542 0.892 0.000 0.000 0.000 0.100 0.008
#> SRR1421284 4 0.2345 0.6195 0.000 0.028 0.040 0.904 0.028 0.000
#> SRR1329624 1 0.0260 0.7998 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1315739 3 0.0000 0.8567 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.3200 0.7304 0.000 0.788 0.000 0.196 0.016 0.000
#> SRR1083286 1 0.0260 0.7970 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1091890 3 0.3065 0.7797 0.000 0.012 0.864 0.080 0.024 0.020
#> SRR1347436 4 0.4564 0.1356 0.000 0.264 0.024 0.684 0.008 0.020
#> SRR1327473 4 0.6046 0.4840 0.020 0.000 0.120 0.572 0.268 0.020
#> SRR1338195 3 0.0146 0.8562 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR809698 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1457792 1 0.2793 0.8035 0.800 0.000 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR658271 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1339597 1 0.2988 0.7437 0.828 0.000 0.000 0.000 0.144 0.028
#> SRR1454842 3 0.1141 0.8541 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1322643 1 0.3706 0.7604 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR614887 3 0.0146 0.8562 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1354620 5 0.2629 0.8317 0.092 0.000 0.040 0.000 0.868 0.000
#> SRR615056 2 0.5363 0.5357 0.000 0.580 0.000 0.320 0.020 0.080
#> SRR1105320 4 0.5911 0.5135 0.000 0.000 0.148 0.580 0.236 0.036
#> SRR1391529 1 0.0260 0.7998 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR663052 2 0.3669 0.7203 0.000 0.760 0.000 0.208 0.028 0.004
#> SRR1478834 1 0.0000 0.7969 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.1010 0.7497 0.000 0.960 0.000 0.036 0.004 0.000
#> SRR1435330 3 0.0146 0.8562 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR615383 2 0.0000 0.7511 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 2 0.3243 0.7212 0.000 0.780 0.000 0.208 0.004 0.008
#> SRR613568 6 0.7007 0.8099 0.000 0.240 0.016 0.256 0.044 0.444
#> SRR614095 2 0.2964 0.7403 0.000 0.792 0.000 0.204 0.004 0.000
#> SRR1103092 1 0.3890 0.3498 0.596 0.000 0.004 0.000 0.400 0.000
#> SRR1337155 6 0.7880 0.1098 0.000 0.044 0.192 0.152 0.180 0.432
#> SRR1475345 2 0.2702 0.7362 0.000 0.868 0.000 0.092 0.004 0.036
#> SRR809089 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1446180 6 0.7260 0.7498 0.000 0.200 0.036 0.228 0.060 0.476
#> SRR1406372 2 0.3767 0.6858 0.000 0.708 0.000 0.276 0.004 0.012
#> SRR1339880 3 0.3630 0.7579 0.000 0.000 0.756 0.000 0.212 0.032
#> SRR1353136 3 0.6315 0.2398 0.000 0.000 0.456 0.304 0.220 0.020
#> SRR1093906 3 0.0146 0.8562 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR614035 2 0.2215 0.7534 0.000 0.900 0.000 0.076 0.012 0.012
#> SRR1351104 1 0.3659 0.7656 0.636 0.000 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1363926 4 0.1411 0.5711 0.000 0.060 0.000 0.936 0.004 0.000
#> SRR1399861 4 0.2969 0.6239 0.000 0.020 0.064 0.872 0.036 0.008
#> SRR1338789 1 0.0713 0.8029 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1421420 3 0.3658 0.7520 0.000 0.000 0.752 0.000 0.216 0.032
#> SRR1420832 2 0.5432 0.5212 0.000 0.568 0.000 0.328 0.020 0.084
#> SRR1476231 1 0.2793 0.8019 0.800 0.000 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1352870 2 0.5015 0.5568 0.000 0.664 0.040 0.244 0.000 0.052
#> SRR1315041 4 0.1957 0.5972 0.000 0.048 0.024 0.920 0.008 0.000
#> SRR661877 2 0.5393 0.5305 0.000 0.596 0.000 0.296 0.024 0.084
#> SRR1443268 1 0.5907 0.3390 0.484 0.000 0.024 0.000 0.376 0.116
#> SRR1416617 3 0.3352 0.7729 0.000 0.000 0.792 0.000 0.176 0.032
#> SRR1102443 5 0.4820 0.7734 0.080 0.000 0.056 0.080 0.760 0.024
#> SRR655672 2 0.3243 0.7212 0.000 0.780 0.000 0.208 0.004 0.008
#> SRR1420006 3 0.0000 0.8567 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.2838 0.7322 0.000 0.808 0.000 0.188 0.004 0.000
#> SRR613819 4 0.1858 0.5350 0.000 0.092 0.000 0.904 0.004 0.000
#> SRR1469432 2 0.5287 0.5514 0.000 0.608 0.000 0.292 0.024 0.076
#> SRR660907 2 0.4361 0.5775 0.000 0.696 0.000 0.252 0.012 0.040
#> SRR1465092 2 0.4332 0.5567 0.000 0.672 0.000 0.276 0.000 0.052
#> SRR1470727 1 0.5440 0.6787 0.556 0.000 0.000 0.000 0.156 0.288
#> SRR1339153 3 0.1010 0.8539 0.000 0.000 0.960 0.000 0.036 0.004
#> SRR1472749 3 0.0000 0.8567 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414379 4 0.1889 0.5904 0.000 0.056 0.020 0.920 0.004 0.000
#> SRR1431326 1 0.3659 0.7670 0.636 0.000 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1487278 6 0.6368 0.8240 0.000 0.308 0.000 0.200 0.028 0.464
#> SRR1098312 3 0.4984 0.6868 0.000 0.000 0.676 0.044 0.228 0.052
#> SRR810273 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1376000 2 0.3873 0.6948 0.000 0.780 0.000 0.160 0.020 0.040
#> SRR614467 2 0.4551 0.5247 0.000 0.536 0.000 0.436 0.012 0.016
#> SRR811471 1 0.0000 0.7969 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0363 0.8569 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1088606 5 0.3815 0.7707 0.012 0.000 0.096 0.004 0.804 0.084
#> SRR1479699 3 0.5500 0.4173 0.000 0.000 0.592 0.280 0.108 0.020
#> SRR1403589 2 0.0291 0.7509 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR812625 2 0.3429 0.7105 0.000 0.740 0.000 0.252 0.004 0.004
#> SRR1359803 1 0.0260 0.7970 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1338988 2 0.2094 0.7351 0.000 0.908 0.000 0.064 0.004 0.024
#> SRR1471222 2 0.2805 0.7491 0.000 0.812 0.000 0.184 0.004 0.000
#> SRR1378992 1 0.3706 0.7604 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR659427 4 0.6208 0.5315 0.000 0.012 0.156 0.584 0.208 0.040
#> SRR1096638 1 0.3659 0.7656 0.636 0.000 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1466619 2 0.3534 0.6949 0.000 0.716 0.000 0.276 0.000 0.008
#> SRR659307 2 0.3243 0.7212 0.000 0.780 0.000 0.208 0.004 0.008
#> SRR1439994 1 0.5889 0.2996 0.480 0.000 0.028 0.000 0.388 0.104
#> SRR1454931 1 0.2165 0.7515 0.884 0.000 0.000 0.000 0.108 0.008
#> SRR1332928 5 0.2151 0.8425 0.024 0.000 0.048 0.000 0.912 0.016
#> SRR658621 2 0.5464 0.4828 0.000 0.528 0.000 0.376 0.020 0.076
#> SRR1095840 1 0.0000 0.7969 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.4778 0.5379 0.652 0.000 0.028 0.000 0.284 0.036
#> SRR1374270 4 0.3570 0.6214 0.000 0.016 0.084 0.836 0.044 0.020
#> SRR1470947 2 0.5192 0.5454 0.000 0.616 0.000 0.292 0.024 0.068
#> SRR1365598 6 0.6977 0.8062 0.000 0.224 0.012 0.244 0.056 0.464
#> SRR662787 4 0.3520 0.3747 0.000 0.188 0.000 0.776 0.000 0.036
#> SRR1408727 4 0.2002 0.5932 0.000 0.056 0.020 0.916 0.008 0.000
#> SRR1456274 5 0.6039 0.4389 0.004 0.000 0.124 0.228 0.592 0.052
#> SRR817744 1 0.2730 0.8032 0.808 0.000 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1478744 2 0.4792 0.5683 0.000 0.648 0.000 0.284 0.016 0.052
#> SRR1387379 2 0.1296 0.7557 0.000 0.948 0.000 0.044 0.004 0.004
#> SRR1102680 3 0.4959 0.6866 0.000 0.000 0.680 0.044 0.224 0.052
#> SRR1374198 1 0.0520 0.7997 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1445856 1 0.4074 0.5003 0.656 0.000 0.004 0.000 0.324 0.016
#> SRR820049 3 0.1297 0.8518 0.000 0.000 0.948 0.012 0.040 0.000
#> SRR1375290 3 0.3059 0.7855 0.000 0.000 0.856 0.084 0.040 0.020
#> SRR818999 5 0.3925 0.5237 0.332 0.000 0.004 0.000 0.656 0.008
#> SRR1390242 1 0.0000 0.7969 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.1719 0.7579 0.000 0.928 0.000 0.056 0.008 0.008
#> SRR1454629 5 0.2932 0.8157 0.028 0.000 0.080 0.004 0.868 0.020
#> SRR1332187 3 0.0713 0.8552 0.000 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR603365 3 0.0000 0.8567 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657833 2 0.4934 0.5327 0.000 0.692 0.000 0.176 0.020 0.112
#> SRR1436207 2 0.2838 0.7322 0.000 0.808 0.000 0.188 0.004 0.000
#> SRR1488017 1 0.2048 0.8090 0.880 0.000 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR612947 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1480384 1 0.3659 0.7656 0.636 0.000 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1364761 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1308086 3 0.4399 0.7278 0.000 0.000 0.712 0.024 0.228 0.036
#> SRR1441868 1 0.3706 0.7604 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1485380 3 0.4488 0.3276 0.000 0.000 0.548 0.000 0.420 0.032
#> SRR1073705 1 0.3706 0.7604 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR615032 2 0.2240 0.7343 0.000 0.904 0.000 0.056 0.008 0.032
#> SRR1452356 2 0.5424 0.5270 0.000 0.560 0.000 0.340 0.020 0.080
#> SRR1442983 2 0.0146 0.7518 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.3023 0.7217 0.000 0.784 0.000 0.212 0.004 0.000
#> SRR1332816 1 0.5291 0.6557 0.616 0.000 0.004 0.000 0.216 0.164
#> SRR612299 6 0.6368 0.8240 0.000 0.308 0.000 0.200 0.028 0.464
#> SRR1407386 1 0.0146 0.7985 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418064 2 0.1411 0.7554 0.000 0.936 0.000 0.060 0.000 0.004
#> SRR1309403 4 0.6184 0.4592 0.008 0.000 0.120 0.560 0.268 0.044
#> SRR1498395 2 0.2531 0.7480 0.000 0.856 0.000 0.132 0.000 0.012
#> SRR1079998 5 0.5252 0.1056 0.408 0.000 0.024 0.000 0.520 0.048
#> SRR1498885 2 0.5393 0.5342 0.000 0.580 0.000 0.316 0.020 0.084
#> SRR1337215 4 0.7536 -0.3974 0.000 0.180 0.052 0.412 0.056 0.300
#> SRR1414749 3 0.1498 0.8531 0.000 0.000 0.940 0.000 0.032 0.028
#> SRR1365963 5 0.4753 0.4306 0.328 0.000 0.028 0.000 0.620 0.024
#> SRR1368030 2 0.4096 0.4714 0.000 0.508 0.000 0.484 0.008 0.000
#> SRR1419760 4 0.5721 0.5558 0.000 0.016 0.136 0.632 0.196 0.020
#> SRR1381841 1 0.3672 0.5361 0.688 0.000 0.000 0.000 0.304 0.008
#> SRR821388 4 0.5168 0.5863 0.000 0.016 0.096 0.688 0.184 0.016
#> SRR657623 2 0.5421 0.5161 0.000 0.548 0.000 0.356 0.020 0.076
#> SRR1094241 3 0.0935 0.8536 0.000 0.000 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR819583 3 0.4534 0.1564 0.000 0.000 0.492 0.000 0.476 0.032
#> SRR1096149 1 0.3659 0.7656 0.636 0.000 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1342829 3 0.0000 0.8567 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0713 0.8047 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR811333 5 0.2237 0.8447 0.036 0.000 0.068 0.000 0.896 0.000
#> SRR1311666 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1486698 2 0.3522 0.7108 0.000 0.784 0.000 0.172 0.000 0.044
#> SRR1446436 2 0.3733 0.7061 0.000 0.784 0.000 0.168 0.020 0.028
#> SRR815092 1 0.0000 0.7969 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.4036 0.6770 0.000 0.768 0.000 0.164 0.020 0.048
#> SRR1100564 1 0.0000 0.7969 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.8567 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811653 4 0.5557 0.5569 0.000 0.004 0.176 0.632 0.168 0.020
#> SRR1311348 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1489438 2 0.5052 0.4586 0.000 0.512 0.000 0.420 0.004 0.064
#> SRR1435442 6 0.6386 0.8278 0.000 0.300 0.000 0.208 0.028 0.464
#> SRR1421444 3 0.0146 0.8562 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1344010 2 0.2772 0.7326 0.000 0.864 0.000 0.092 0.004 0.040
#> SRR1319520 1 0.3647 0.7692 0.640 0.000 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1444763 1 0.1349 0.8051 0.940 0.000 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1415026 2 0.3504 0.7280 0.000 0.820 0.000 0.112 0.016 0.052
#> SRR1416596 4 0.4300 0.4794 0.000 0.036 0.024 0.780 0.028 0.132
#> SRR1485499 2 0.5394 0.5362 0.000 0.588 0.000 0.308 0.024 0.080
#> SRR1316078 2 0.2600 0.7355 0.000 0.876 0.000 0.084 0.004 0.036
#> SRR663465 2 0.5363 0.5357 0.000 0.580 0.000 0.320 0.020 0.080
#> SRR1310094 4 0.2801 0.6067 0.000 0.056 0.028 0.884 0.020 0.012
#> SRR663537 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1486780 1 0.3659 0.7656 0.636 0.000 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1453950 1 0.3659 0.7656 0.636 0.000 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1087875 1 0.3706 0.7604 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR613318 2 0.4866 0.5648 0.000 0.588 0.012 0.364 0.028 0.008
#> SRR1332694 1 0.0000 0.7969 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.4419 0.4827 0.000 0.000 0.584 0.000 0.384 0.032
#> SRR818670 2 0.1082 0.7619 0.000 0.956 0.000 0.040 0.004 0.000
#> SRR1120318 1 0.2340 0.7307 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1311622 5 0.3283 0.7034 0.000 0.000 0.160 0.000 0.804 0.036
#> SRR1500931 5 0.2378 0.7870 0.000 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1387494 3 0.2542 0.8420 0.000 0.000 0.884 0.016 0.080 0.020
#> SRR1379175 4 0.5787 0.5522 0.000 0.016 0.132 0.620 0.212 0.020
#> SRR1401909 5 0.4027 0.5771 0.308 0.000 0.012 0.000 0.672 0.008
#> SRR1440541 2 0.4502 0.5656 0.000 0.600 0.000 0.364 0.032 0.004
#> SRR1068832 5 0.2448 0.8462 0.052 0.000 0.064 0.000 0.884 0.000
#> SRR1376640 2 0.3081 0.7148 0.000 0.776 0.000 0.220 0.004 0.000
#> SRR1085712 2 0.2510 0.7411 0.000 0.884 0.000 0.080 0.008 0.028
#> SRR1082283 5 0.1908 0.8462 0.056 0.000 0.028 0.000 0.916 0.000
#> SRR1084276 1 0.2048 0.7389 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1353262 2 0.3833 0.7217 0.000 0.772 0.000 0.180 0.020 0.028
#> SRR1437035 5 0.3706 0.8022 0.148 0.000 0.032 0.000 0.796 0.024
#> SRR1396877 5 0.2266 0.8191 0.108 0.000 0.012 0.000 0.880 0.000
#> SRR1443026 2 0.2798 0.7503 0.000 0.860 0.000 0.108 0.020 0.012
#> SRR1417936 1 0.2527 0.8060 0.832 0.000 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1436822 4 0.4773 0.3762 0.000 0.168 0.028 0.736 0.036 0.032
#> SRR1101128 3 0.4040 0.6457 0.000 0.000 0.688 0.000 0.280 0.032
#> SRR1363886 2 0.5288 0.5278 0.000 0.600 0.000 0.304 0.024 0.072
#> SRR612983 2 0.1957 0.7499 0.000 0.912 0.000 0.072 0.008 0.008
#> SRR1394366 6 0.6377 0.8209 0.000 0.312 0.000 0.200 0.028 0.460
#> SRR1093218 5 0.2704 0.7493 0.000 0.000 0.140 0.000 0.844 0.016
#> SRR1077090 5 0.2173 0.8446 0.064 0.000 0.028 0.000 0.904 0.004
#> SRR1327430 4 0.1411 0.5711 0.000 0.060 0.000 0.936 0.004 0.000
#> SRR1088958 1 0.3706 0.7604 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1486931 2 0.3243 0.7146 0.000 0.780 0.000 0.208 0.004 0.008
#> SRR1086820 1 0.1267 0.7854 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1383000 1 0.5697 0.6239 0.516 0.000 0.000 0.000 0.200 0.284
#> SRR1355705 2 0.1523 0.7528 0.000 0.940 0.000 0.044 0.008 0.008
#> SRR614335 2 0.4726 0.5258 0.000 0.536 0.000 0.424 0.008 0.032
#> SRR660534 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR817094 2 0.0777 0.7506 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004 0.000
#> SRR1334265 4 0.2401 0.6085 0.000 0.048 0.024 0.900 0.028 0.000
#> SRR1456401 4 0.1829 0.5683 0.000 0.064 0.000 0.920 0.004 0.012
#> SRR1086393 1 0.2520 0.8054 0.844 0.000 0.000 0.000 0.004 0.152
#> SRR1351521 3 0.0146 0.8562 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1093100 4 0.2395 0.6177 0.000 0.016 0.072 0.896 0.012 0.004
#> SRR1309382 1 0.0000 0.7969 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 5 0.2340 0.8356 0.024 0.000 0.060 0.000 0.900 0.016
#> SRR1499482 2 0.2871 0.7306 0.000 0.804 0.000 0.192 0.004 0.000
#> SRR614719 2 0.3243 0.7212 0.000 0.780 0.000 0.208 0.004 0.008
#> SRR1081473 3 0.4845 0.6246 0.000 0.000 0.636 0.016 0.296 0.052
#> SRR1087415 1 0.0000 0.7969 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 5 0.3539 0.7470 0.208 0.000 0.016 0.000 0.768 0.008
#> SRR808496 4 0.2950 0.6025 0.000 0.064 0.032 0.868 0.036 0.000
#> SRR1336463 2 0.4253 0.5214 0.000 0.608 0.000 0.372 0.012 0.008
#> SRR612359 2 0.3357 0.7079 0.000 0.764 0.000 0.224 0.004 0.008
#> SRR1444412 1 0.1219 0.7947 0.948 0.000 0.000 0.000 0.048 0.004
#> SRR1074116 3 0.0000 0.8567 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0146 0.8562 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR656095 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR808914 1 0.0260 0.7970 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1349099 5 0.2001 0.8421 0.044 0.000 0.020 0.000 0.920 0.016
#> SRR1337886 2 0.2003 0.7621 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR813632 1 0.3084 0.7573 0.832 0.000 0.004 0.000 0.132 0.032
#> SRR1101591 5 0.2007 0.8452 0.032 0.000 0.036 0.000 0.920 0.012
#> SRR1089713 5 0.2649 0.8364 0.028 0.000 0.076 0.000 0.880 0.016
#> SRR1453127 3 0.0146 0.8562 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1498354 5 0.2328 0.8458 0.052 0.000 0.056 0.000 0.892 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.7969 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.3543 0.7647 0.000 0.000 0.768 0.000 0.200 0.032
#> SRR814747 2 0.4559 0.4833 0.000 0.528 0.000 0.444 0.012 0.016
#> SRR1358539 1 0.0363 0.7962 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1367807 1 0.3706 0.7604 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1365791 3 0.2197 0.8375 0.000 0.000 0.900 0.000 0.056 0.044
#> SRR1081519 5 0.2325 0.8459 0.048 0.000 0.060 0.000 0.892 0.000
#> SRR614707 6 0.7173 0.7622 0.000 0.204 0.032 0.228 0.056 0.480
#> SRR1094027 1 0.2573 0.8093 0.864 0.000 0.000 0.000 0.024 0.112
#> SRR1489092 5 0.2318 0.8404 0.028 0.000 0.048 0.000 0.904 0.020
#> SRR1079502 5 0.3235 0.7407 0.000 0.000 0.128 0.000 0.820 0.052
#> SRR1457814 4 0.4738 0.6075 0.000 0.016 0.112 0.736 0.124 0.012
#> SRR1455127 2 0.5438 0.5261 0.000 0.584 0.000 0.308 0.024 0.084
#> SRR615081 6 0.6625 0.8283 0.000 0.284 0.000 0.208 0.048 0.460
#> SRR1327855 3 0.3062 0.7951 0.000 0.000 0.824 0.000 0.144 0.032
#> SRR1417873 4 0.1707 0.5742 0.000 0.056 0.000 0.928 0.004 0.012
#> SRR1394125 3 0.2776 0.8274 0.000 0.000 0.860 0.000 0.088 0.052
#> SRR1488388 1 0.2454 0.8069 0.840 0.000 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1401122 4 0.2821 0.5124 0.000 0.096 0.000 0.860 0.004 0.040
#> SRR612383 2 0.3243 0.7212 0.000 0.780 0.000 0.208 0.004 0.008
#> SRR1477711 1 0.1910 0.8119 0.892 0.000 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1350813 2 0.3243 0.7146 0.000 0.780 0.000 0.208 0.004 0.008
#> SRR612851 2 0.2871 0.7292 0.000 0.804 0.000 0.192 0.004 0.000
#> SRR1086349 1 0.3634 0.7687 0.644 0.000 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR812837 2 0.2711 0.7372 0.000 0.872 0.000 0.084 0.008 0.036
#> SRR1340010 4 0.6311 0.4380 0.000 0.000 0.216 0.532 0.208 0.044
#> SRR1475885 5 0.6821 0.3133 0.012 0.000 0.096 0.100 0.484 0.308
#> SRR1376334 1 0.0405 0.8001 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1399821 1 0.2965 0.7788 0.848 0.000 0.000 0.000 0.072 0.080
#> SRR1347042 3 0.0000 0.8567 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612323 2 0.3243 0.7212 0.000 0.780 0.000 0.208 0.004 0.008
#> SRR612604 6 0.6371 0.7878 0.000 0.340 0.000 0.188 0.028 0.444
#> SRR1389546 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1311877 1 0.3706 0.7604 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1465608 5 0.2693 0.8394 0.052 0.000 0.028 0.000 0.884 0.036
#> SRR1101808 2 0.1219 0.7630 0.000 0.948 0.000 0.048 0.004 0.000
#> SRR1414079 3 0.0146 0.8562 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1331153 6 0.7234 0.7868 0.000 0.224 0.024 0.256 0.056 0.440
#> SRR1078439 3 0.2394 0.8328 0.000 0.000 0.900 0.032 0.048 0.020
#> SRR2165527 2 0.5419 0.5169 0.000 0.572 0.000 0.324 0.020 0.084
#> SRR1351147 5 0.3981 0.8033 0.060 0.000 0.056 0.032 0.820 0.032
#> SRR1313536 2 0.0603 0.7554 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004 0.000
#> SRR1070308 4 0.4772 0.5881 0.000 0.048 0.056 0.716 0.180 0.000
#> SRR1403110 1 0.0363 0.8009 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1400355 2 0.1285 0.7644 0.000 0.944 0.000 0.052 0.004 0.000
#> SRR1401317 3 0.3481 0.7593 0.000 0.000 0.776 0.000 0.192 0.032
#> SRR1456862 1 0.1814 0.8019 0.900 0.000 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1074622 1 0.3659 0.7656 0.636 0.000 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1465847 5 0.2201 0.8479 0.048 0.000 0.052 0.000 0.900 0.000
#> SRR1443376 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1471312 3 0.0146 0.8569 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1075579 1 0.0713 0.8041 0.972 0.000 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1090881 4 0.5353 0.1125 0.000 0.280 0.080 0.612 0.000 0.028
#> SRR612251 2 0.3965 0.5974 0.000 0.604 0.000 0.388 0.008 0.000
#> SRR1418581 1 0.3706 0.7604 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR658045 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR613214 2 0.3861 0.7064 0.000 0.744 0.000 0.220 0.028 0.008
#> SRR613078 6 0.6404 0.7271 0.000 0.372 0.000 0.188 0.028 0.412
#> SRR1472998 5 0.2052 0.8453 0.056 0.000 0.028 0.000 0.912 0.004
#> SRR1433452 2 0.3201 0.7132 0.000 0.780 0.000 0.208 0.000 0.012
#> SRR1101957 1 0.3706 0.7604 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1487993 3 0.3572 0.7639 0.000 0.000 0.764 0.000 0.204 0.032
#> SRR1465983 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1380375 1 0.1610 0.8095 0.916 0.000 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1367566 3 0.0260 0.8581 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1316151 4 0.6217 0.0527 0.000 0.024 0.036 0.540 0.084 0.316
#> SRR1417547 4 0.3628 0.3903 0.000 0.168 0.000 0.784 0.004 0.044
#> SRR659389 2 0.0291 0.7522 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1490270 6 0.6584 0.8167 0.000 0.276 0.000 0.244 0.036 0.444
#> SRR1398207 1 0.4222 0.1039 0.516 0.000 0.004 0.000 0.472 0.008
#> SRR1358755 5 0.2558 0.8299 0.104 0.000 0.028 0.000 0.868 0.000
#> SRR1078903 2 0.2772 0.7357 0.000 0.816 0.000 0.180 0.004 0.000
#> SRR1323252 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.7511 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0692 0.8023 0.976 0.000 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR615982 2 0.2902 0.7287 0.000 0.800 0.000 0.196 0.004 0.000
#> SRR1480431 2 0.3081 0.7330 0.000 0.776 0.000 0.220 0.004 0.000
#> SRR1429825 4 0.4529 0.4731 0.000 0.140 0.028 0.760 0.056 0.016
#> SRR1102393 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1071313 5 0.2606 0.8447 0.044 0.000 0.048 0.000 0.888 0.020
#> SRR808351 1 0.3175 0.7917 0.744 0.000 0.000 0.000 0.000 0.256
#> SRR1317513 1 0.0363 0.8009 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1480501 3 0.4437 0.4830 0.000 0.000 0.576 0.000 0.392 0.032
#> SRR1081910 5 0.2237 0.8447 0.036 0.000 0.068 0.000 0.896 0.000
#> SRR1086611 6 0.7136 0.7676 0.000 0.216 0.044 0.228 0.036 0.476
#> SRR1392571 2 0.3134 0.7209 0.000 0.784 0.000 0.208 0.004 0.004
#> SRR1311441 1 0.3684 0.7637 0.628 0.000 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR808152 1 0.3659 0.7656 0.636 0.000 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR657313 3 0.0865 0.8543 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1433131 2 0.5004 0.5292 0.000 0.688 0.000 0.188 0.028 0.096
#> SRR1321011 2 0.2164 0.7402 0.000 0.908 0.000 0.056 0.008 0.028
#> SRR1500598 2 0.4634 0.5626 0.000 0.604 0.000 0.352 0.008 0.036
#> SRR1379343 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1389108 1 0.3706 0.7604 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1376228 3 0.0909 0.8569 0.000 0.000 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR1399757 1 0.2384 0.7977 0.888 0.000 0.000 0.000 0.064 0.048
#> SRR1358060 3 0.0000 0.8567 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.4326 0.6479 0.000 0.000 0.656 0.000 0.300 0.044
#> SRR613557 2 0.3243 0.7212 0.000 0.780 0.000 0.208 0.004 0.008
#> SRR809831 1 0.3996 0.3797 0.604 0.000 0.004 0.000 0.388 0.004
#> SRR1429387 3 0.0146 0.8562 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR816565 1 0.2006 0.8095 0.892 0.000 0.000 0.000 0.004 0.104
#> SRR1071644 1 0.2048 0.8091 0.880 0.000 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1406936 5 0.3432 0.7135 0.000 0.000 0.148 0.000 0.800 0.052
#> SRR1072031 2 0.0146 0.7505 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1374671 2 0.3011 0.7306 0.000 0.800 0.000 0.192 0.004 0.004
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["SD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["SD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'SD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.973 0.989 0.4929 0.508 0.508
#> 3 3 0.988 0.956 0.982 0.3293 0.795 0.613
#> 4 4 0.828 0.868 0.924 0.0988 0.907 0.743
#> 5 5 0.801 0.800 0.890 0.0746 0.889 0.642
#> 6 6 0.773 0.690 0.831 0.0445 0.907 0.640
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1394209 2 0.6887 0.771 0.184 0.816
#> SRR1474018 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.9710 0.323 0.400 0.600
#> SRR1354363 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1391619 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1403980 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1442800 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1093053 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1399843 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1380231 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1096736 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1478700 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1384754 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1380317 1 0.9896 0.229 0.560 0.440
#> SRR1315247 1 0.7219 0.753 0.800 0.200
#> SRR1105344 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1456075 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1417154 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1325771 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1360420 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1072948 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1362848 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1407492 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1454868 1 0.6712 0.788 0.824 0.176
#> SRR1474816 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1466400 2 0.7883 0.687 0.236 0.764
#> SRR658921 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1101373 1 0.1843 0.961 0.972 0.028
#> SRR1090145 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR614695 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1325871 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1320712 1 0.4431 0.893 0.908 0.092
#> SRR1470075 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1092112 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.7219 0.747 0.200 0.800
#> SRR1432106 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1400333 1 0.9850 0.265 0.572 0.428
#> SRR1078834 1 0.9580 0.399 0.620 0.380
#> SRR1417611 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1419062 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1315739 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1091890 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1327473 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1338195 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR614887 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1354620 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1389157 2 0.9087 0.515 0.324 0.676
#> SRR613568 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1446180 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1406372 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1353136 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1093906 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1399861 2 0.0672 0.983 0.008 0.992
#> SRR1338789 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1421420 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1352870 1 0.7219 0.753 0.800 0.200
#> SRR1315041 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1420006 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1472749 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1478341 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1479699 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR659427 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1096638 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.4815 0.878 0.104 0.896
#> SRR1439994 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1374270 1 0.8909 0.564 0.692 0.308
#> SRR1470947 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.2236 0.955 0.036 0.964
#> SRR662787 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1456274 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR820049 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1375290 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR818999 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1332187 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR603365 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1485380 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.0672 0.980 0.992 0.008
#> SRR615032 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1309403 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1414749 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1419760 1 0.6973 0.771 0.812 0.188
#> SRR1381841 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR821388 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR657623 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR819583 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1403072 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR811653 1 0.3584 0.919 0.932 0.068
#> SRR1311348 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR613318 1 0.7528 0.729 0.784 0.216
#> SRR1332694 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1468469 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1500931 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1379175 1 0.0376 0.984 0.996 0.004
#> SRR1401909 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1101128 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1093218 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1077090 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1101591 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1453127 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1315434 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1365791 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1081519 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR614707 1 0.6887 0.776 0.816 0.184
#> SRR1094027 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1079502 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1457814 1 0.7950 0.690 0.760 0.240
#> SRR1455127 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1475885 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1376334 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1347042 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.9954 0.149 0.460 0.540
#> SRR1403110 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1090881 1 0.7219 0.753 0.800 0.200
#> SRR612251 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1487993 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1367566 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1480501 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1086611 1 0.7299 0.747 0.796 0.204
#> SRR1392571 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR657313 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1376228 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1358060 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1464517 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR613557 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR809831 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.0000 0.987 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.991 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR614491 3 0.2165 0.9081 0.000 0.064 0.936
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.4930 0.8173 0.836 0.044 0.120
#> SRR1394209 2 0.0747 0.9717 0.016 0.984 0.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.0237 0.9798 0.996 0.000 0.004
#> SRR1500555 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR612515 3 0.1289 0.9391 0.000 0.032 0.968
#> SRR1092727 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468553 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420169 3 0.5098 0.6716 0.248 0.000 0.752
#> SRR1442800 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.0237 0.9798 0.996 0.000 0.004
#> SRR1500030 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093053 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399843 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380231 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR809470 3 0.2066 0.9150 0.060 0.000 0.940
#> SRR614239 2 0.6235 0.2173 0.000 0.564 0.436
#> SRR613939 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478700 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081543 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384754 1 0.0424 0.9761 0.992 0.000 0.008
#> SRR612287 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315247 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR658549 2 0.3686 0.8307 0.000 0.860 0.140
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456075 1 0.5291 0.6331 0.732 0.000 0.268
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095985 3 0.2261 0.9067 0.068 0.000 0.932
#> SRR1325771 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR660272 2 0.0747 0.9717 0.016 0.984 0.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076916 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472370 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362848 3 0.4555 0.7445 0.000 0.200 0.800
#> SRR1407492 3 0.4605 0.7386 0.000 0.204 0.796
#> SRR1455082 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466400 2 0.6026 0.3880 0.000 0.624 0.376
#> SRR658921 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443161 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR614695 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0237 0.9798 0.996 0.000 0.004
#> SRR1105463 1 0.0424 0.9762 0.992 0.000 0.008
#> SRR811005 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355415 3 0.6126 0.3431 0.400 0.000 0.600
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 3 0.6168 0.3014 0.000 0.412 0.588
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074790 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.3116 0.8715 0.000 0.892 0.108
#> SRR1078834 2 0.1289 0.9564 0.000 0.968 0.032
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.0237 0.9798 0.996 0.000 0.004
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR614984 3 0.4931 0.6993 0.000 0.232 0.768
#> SRR1324269 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327473 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338195 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354620 3 0.4702 0.7284 0.212 0.000 0.788
#> SRR615056 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.4654 0.7353 0.792 0.000 0.208
#> SRR1391529 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR613568 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353136 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399861 2 0.4002 0.8043 0.000 0.840 0.160
#> SRR1338789 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315041 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416617 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420006 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098312 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088606 3 0.0747 0.9554 0.016 0.000 0.984
#> SRR1479699 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR659427 3 0.0237 0.9649 0.000 0.004 0.996
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR659307 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1439994 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374270 2 0.6204 0.2524 0.000 0.576 0.424
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456274 1 0.0237 0.9797 0.996 0.000 0.004
#> SRR817744 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0237 0.9798 0.996 0.000 0.004
#> SRR820049 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375290 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR818999 1 0.0237 0.9798 0.996 0.000 0.004
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332187 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.0892 0.9645 0.980 0.000 0.020
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 1 0.6095 0.3447 0.608 0.000 0.392
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337215 2 0.5760 0.5107 0.328 0.672 0.000
#> SRR1414749 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365963 1 0.4974 0.6850 0.764 0.000 0.236
#> SRR1368030 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419760 2 0.0424 0.9797 0.008 0.992 0.000
#> SRR1381841 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR821388 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR657623 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR811653 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR613318 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500931 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387494 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379175 2 0.3415 0.8885 0.080 0.900 0.020
#> SRR1401909 3 0.4974 0.6912 0.236 0.000 0.764
#> SRR1440541 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.0237 0.9798 0.996 0.000 0.004
#> SRR1084276 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101128 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093218 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077090 3 0.0892 0.9519 0.020 0.000 0.980
#> SRR1327430 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093100 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081473 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 3 0.5098 0.6716 0.248 0.000 0.752
#> SRR808496 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR612359 2 0.2625 0.9004 0.000 0.916 0.084
#> SRR1444412 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089713 1 0.6308 0.0355 0.508 0.000 0.492
#> SRR1453127 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498354 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081519 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR614707 1 0.6057 0.4756 0.656 0.340 0.004
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.0592 0.9588 0.012 0.000 0.988
#> SRR1079502 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457814 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327855 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR612383 3 0.6291 0.1234 0.000 0.468 0.532
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475885 1 0.3340 0.8542 0.880 0.000 0.120
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR612323 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078439 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.7815 0.5268 0.260 0.644 0.096
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR612251 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 2 0.0237 0.9836 0.000 0.996 0.004
#> SRR613078 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472998 3 0.6168 0.3095 0.412 0.000 0.588
#> SRR1433452 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398207 1 0.0237 0.9798 0.996 0.000 0.004
#> SRR1358755 3 0.2711 0.8859 0.088 0.000 0.912
#> SRR1078903 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081910 1 0.5291 0.6364 0.732 0.000 0.268
#> SRR1086611 3 0.4702 0.7277 0.000 0.212 0.788
#> SRR1392571 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR613557 3 0.0237 0.9648 0.000 0.004 0.996
#> SRR809831 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9830 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.0000 0.9683 0.000 0.000 1.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.9874 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 3 0.3196 0.835 0.008 0.000 0.856 0.136
#> SRR1404105 1 0.0188 0.930 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2164936 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1472057 3 0.0469 0.927 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR614491 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069376 1 0.0188 0.931 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR811964 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1361415 2 0.2589 0.882 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1345715 1 0.1474 0.908 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1328073 1 0.4692 0.652 0.756 0.000 0.212 0.032
#> SRR1394209 1 0.7855 0.263 0.540 0.268 0.032 0.160
#> SRR1474018 2 0.2714 0.883 0.004 0.884 0.000 0.112
#> SRR1099809 1 0.1792 0.907 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1500555 3 0.4839 0.722 0.000 0.052 0.764 0.184
#> SRR1354363 1 0.0592 0.927 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1391619 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR663124 2 0.0469 0.942 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1334670 1 0.1022 0.925 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR612515 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092727 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1364013 2 0.0592 0.942 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1468553 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.0469 0.926 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1420169 3 0.4206 0.769 0.136 0.000 0.816 0.048
#> SRR1442800 4 0.3711 0.730 0.024 0.000 0.140 0.836
#> SRR1359214 2 0.2760 0.874 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1499849 1 0.1913 0.904 0.940 0.000 0.040 0.020
#> SRR1500030 3 0.0817 0.920 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1093053 3 0.0817 0.924 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1399843 3 0.2469 0.868 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1380231 3 0.2704 0.846 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR809470 4 0.5240 0.693 0.072 0.000 0.188 0.740
#> SRR614239 3 0.1302 0.899 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR613939 4 0.4193 0.687 0.000 0.268 0.000 0.732
#> SRR612971 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR811357 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1471672 1 0.1302 0.912 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR613006 2 0.0336 0.946 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1469570 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1457354 2 0.0188 0.946 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1362906 3 0.1302 0.910 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1079023 1 0.0469 0.931 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR813608 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1096736 1 0.4036 0.773 0.816 0.004 0.020 0.160
#> SRR1478700 1 0.1474 0.908 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1081543 3 0.0188 0.927 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1384754 1 0.5265 0.688 0.748 0.000 0.092 0.160
#> SRR612287 2 0.0592 0.942 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1380317 2 0.5324 0.756 0.008 0.760 0.084 0.148
#> SRR1315247 4 0.3355 0.709 0.000 0.004 0.160 0.836
#> SRR1105344 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658549 2 0.4632 0.506 0.000 0.688 0.308 0.004
#> SRR1480240 1 0.1474 0.914 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1084816 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612551 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.4578 0.792 0.052 0.788 0.000 0.160
#> SRR1419476 3 0.1557 0.906 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1456075 3 0.6906 0.440 0.264 0.000 0.580 0.156
#> SRR1389474 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1367005 1 0.0592 0.927 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1334419 1 0.2868 0.826 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1417154 3 0.0336 0.927 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1095985 4 0.4039 0.767 0.080 0.000 0.084 0.836
#> SRR1325771 1 0.0592 0.930 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1360420 3 0.0469 0.926 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR660272 4 0.5212 0.412 0.008 0.420 0.000 0.572
#> SRR1332993 1 0.0000 0.930 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR808044 1 0.0817 0.926 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1076916 4 0.4103 0.598 0.000 0.000 0.256 0.744
#> SRR1356266 1 0.1022 0.925 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1341983 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.0469 0.931 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1072948 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.0469 0.927 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1480176 1 0.0469 0.931 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR613843 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1469192 1 0.0336 0.929 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1404555 3 0.0336 0.928 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR659839 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR659533 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1362848 3 0.4598 0.776 0.044 0.004 0.792 0.160
#> SRR1407492 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455082 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658362 2 0.0188 0.946 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR810921 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR662823 2 0.2469 0.888 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1456375 3 0.0707 0.924 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR818232 1 0.4843 0.247 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1454868 3 0.0469 0.925 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1474816 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1342002 1 0.0188 0.930 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1088437 2 0.1970 0.915 0.008 0.932 0.000 0.060
#> SRR1466400 4 0.3266 0.770 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR658921 4 0.3123 0.772 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR1499873 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1101373 1 0.0336 0.929 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1090145 4 0.4981 0.272 0.464 0.000 0.000 0.536
#> SRR1379324 1 0.1022 0.925 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1345307 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1396166 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.1022 0.919 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1454891 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR663185 2 0.2944 0.871 0.004 0.868 0.000 0.128
#> SRR811819 1 0.0817 0.928 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1318920 4 0.3486 0.747 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR656758 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1474351 1 0.0469 0.931 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR660450 4 0.4916 0.408 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR1472687 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1415153 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1323271 2 0.3498 0.839 0.008 0.832 0.000 0.160
#> SRR1368939 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1443161 3 0.3710 0.796 0.000 0.004 0.804 0.192
#> SRR614695 4 0.3873 0.737 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR1092372 4 0.3356 0.755 0.176 0.000 0.000 0.824
#> SRR1474577 1 0.1716 0.899 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1406582 1 0.0707 0.925 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR612779 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1089006 1 0.1118 0.918 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1354071 1 0.1302 0.922 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1105463 4 0.3726 0.733 0.212 0.000 0.000 0.788
#> SRR811005 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1385319 4 0.4713 0.533 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1325871 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355415 4 0.3577 0.767 0.156 0.000 0.012 0.832
#> SRR1090861 1 0.0707 0.929 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1320712 3 0.4513 0.780 0.040 0.004 0.796 0.160
#> SRR1470075 1 0.1389 0.911 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1091254 1 0.1022 0.925 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1101397 1 0.3024 0.813 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1321165 4 0.3400 0.756 0.180 0.000 0.000 0.820
#> SRR1092112 3 0.4164 0.674 0.000 0.000 0.736 0.264
#> SRR1417588 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074790 1 0.0188 0.930 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1432106 2 0.3142 0.864 0.008 0.860 0.000 0.132
#> SRR655756 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1458314 1 0.1022 0.921 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1318582 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1080484 2 0.3249 0.858 0.008 0.852 0.000 0.140
#> SRR1072749 1 0.1118 0.916 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1078586 1 0.0469 0.931 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1400333 4 0.5070 0.517 0.000 0.372 0.008 0.620
#> SRR1078834 4 0.3528 0.764 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1417611 2 0.4244 0.811 0.036 0.804 0.000 0.160
#> SRR1396840 4 0.3074 0.766 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1465440 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614984 3 0.1557 0.888 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1324269 1 0.0469 0.931 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1401491 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1319443 4 0.4830 0.464 0.392 0.000 0.000 0.608
#> SRR1324349 2 0.4685 0.786 0.060 0.784 0.000 0.156
#> SRR1345523 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.0188 0.931 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR661505 3 0.2011 0.890 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1419062 3 0.2647 0.853 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1480131 1 0.4008 0.649 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR1421284 2 0.4680 0.793 0.048 0.788 0.004 0.160
#> SRR1329624 1 0.0817 0.928 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1315739 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.1792 0.902 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1091890 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1327473 1 0.1474 0.903 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1338195 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1457792 1 0.0188 0.931 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR658271 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1339597 1 0.0817 0.929 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1454842 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322643 1 0.1118 0.918 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR614887 3 0.0188 0.928 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1354620 4 0.5944 0.699 0.140 0.000 0.164 0.696
#> SRR615056 2 0.2408 0.891 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1105320 1 0.4059 0.696 0.788 0.000 0.200 0.012
#> SRR1391529 1 0.1557 0.911 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR663052 2 0.0524 0.944 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1478834 1 0.1389 0.917 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR812366 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1389157 3 0.0592 0.921 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR613568 2 0.4776 0.279 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR614095 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.1637 0.910 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1337155 4 0.3306 0.713 0.004 0.000 0.156 0.840
#> SRR1475345 2 0.0336 0.945 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR809089 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1446180 4 0.3208 0.717 0.004 0.000 0.148 0.848
#> SRR1406372 2 0.0188 0.946 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1339880 3 0.2469 0.867 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1353136 3 0.2999 0.841 0.000 0.004 0.864 0.132
#> SRR1093906 3 0.0336 0.927 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR614035 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.1211 0.916 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1363926 2 0.2408 0.891 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1399861 3 0.3823 0.806 0.008 0.008 0.824 0.160
#> SRR1338789 1 0.3356 0.786 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR1421420 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.2589 0.882 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1476231 1 0.0188 0.931 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1352870 3 0.1510 0.914 0.000 0.016 0.956 0.028
#> SRR1315041 2 0.3625 0.835 0.012 0.828 0.000 0.160
#> SRR661877 2 0.0921 0.936 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1443268 1 0.1474 0.908 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1416617 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.0817 0.923 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR655672 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420006 3 0.0592 0.925 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1458267 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR613819 2 0.3380 0.858 0.008 0.852 0.004 0.136
#> SRR1469432 2 0.1557 0.921 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR660907 2 0.0336 0.945 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1465092 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1470727 1 0.0188 0.930 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1339153 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472749 3 0.0188 0.928 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1414379 2 0.3498 0.839 0.008 0.832 0.000 0.160
#> SRR1431326 1 0.0188 0.930 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1487278 4 0.3688 0.756 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1098312 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1376000 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614467 2 0.3278 0.868 0.000 0.864 0.020 0.116
#> SRR811471 1 0.1022 0.925 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1478341 3 0.0592 0.925 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1088606 4 0.3205 0.746 0.024 0.000 0.104 0.872
#> SRR1479699 3 0.0188 0.928 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1403589 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR812625 2 0.1211 0.928 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1359803 1 0.4843 0.251 0.604 0.000 0.000 0.396
#> SRR1338988 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0188 0.947 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1378992 1 0.2973 0.817 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR659427 3 0.3988 0.803 0.020 0.004 0.820 0.156
#> SRR1096638 1 0.0336 0.929 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1466619 2 0.1716 0.915 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR659307 3 0.0592 0.921 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1439994 1 0.1118 0.919 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1454931 4 0.3610 0.743 0.200 0.000 0.000 0.800
#> SRR1332928 1 0.3219 0.795 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR658621 2 0.3032 0.870 0.008 0.868 0.000 0.124
#> SRR1095840 1 0.1022 0.925 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1458243 1 0.0336 0.931 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1374270 3 0.7202 0.394 0.008 0.256 0.576 0.160
#> SRR1470947 2 0.1022 0.934 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1365598 4 0.2944 0.778 0.004 0.128 0.000 0.868
#> SRR662787 2 0.3088 0.867 0.008 0.864 0.000 0.128
#> SRR1408727 2 0.4590 0.811 0.012 0.804 0.040 0.144
#> SRR1456274 1 0.1256 0.917 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR817744 1 0.0336 0.931 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1478744 2 0.0592 0.942 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1387379 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.0707 0.924 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1374198 4 0.4713 0.533 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1445856 4 0.3400 0.756 0.180 0.000 0.000 0.820
#> SRR820049 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375290 3 0.0707 0.924 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR818999 1 0.4907 0.197 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1390242 1 0.1022 0.925 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1401164 2 0.1792 0.897 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1454629 4 0.3610 0.743 0.200 0.000 0.000 0.800
#> SRR1332187 3 0.2921 0.824 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR603365 3 0.2530 0.865 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR657833 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1436207 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1488017 1 0.0469 0.931 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR612947 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1480384 1 0.0188 0.930 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1364761 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1308086 3 0.3208 0.828 0.004 0.000 0.848 0.148
#> SRR1441868 1 0.0336 0.929 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1485380 3 0.0817 0.923 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1073705 1 0.2345 0.865 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR615032 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.2831 0.876 0.004 0.876 0.000 0.120
#> SRR1442983 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1100346 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1332816 1 0.0336 0.929 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR612299 4 0.3356 0.768 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR1407386 1 0.1022 0.925 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1418064 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1309403 1 0.2521 0.881 0.912 0.000 0.064 0.024
#> SRR1498395 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1079998 3 0.4978 0.386 0.384 0.000 0.612 0.004
#> SRR1498885 2 0.2973 0.861 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1337215 4 0.4387 0.764 0.024 0.200 0.000 0.776
#> SRR1414749 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365963 3 0.5728 0.383 0.364 0.000 0.600 0.036
#> SRR1368030 2 0.2973 0.862 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1419760 2 0.0376 0.946 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1381841 4 0.3400 0.756 0.180 0.000 0.000 0.820
#> SRR821388 3 0.2654 0.861 0.004 0.000 0.888 0.108
#> SRR657623 2 0.3105 0.861 0.004 0.856 0.000 0.140
#> SRR1094241 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819583 3 0.1302 0.913 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1096149 1 0.1557 0.904 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1342829 3 0.0469 0.926 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1353028 1 0.0817 0.928 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR811333 3 0.0592 0.925 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1311666 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1486698 2 0.4888 0.201 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1446436 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR815092 1 0.1389 0.917 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1500149 2 0.0336 0.946 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1100564 1 0.1637 0.909 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1403072 3 0.1211 0.915 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR811653 3 0.3538 0.813 0.004 0.004 0.832 0.160
#> SRR1311348 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1489438 2 0.3157 0.858 0.004 0.852 0.000 0.144
#> SRR1435442 4 0.3402 0.773 0.004 0.164 0.000 0.832
#> SRR1421444 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0188 0.930 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444763 4 0.4776 0.467 0.376 0.000 0.000 0.624
#> SRR1415026 2 0.0336 0.945 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1416596 2 0.2760 0.876 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1485499 2 0.0592 0.942 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1316078 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.2760 0.874 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1310094 2 0.3853 0.827 0.020 0.820 0.000 0.160
#> SRR663537 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1486780 1 0.0188 0.930 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1453950 1 0.0188 0.930 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1087875 1 0.1118 0.918 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR613318 3 0.1474 0.905 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1332694 1 0.1118 0.924 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1468469 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1120318 1 0.1637 0.908 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1311622 3 0.2814 0.847 0.000 0.000 0.868 0.132
#> SRR1500931 3 0.2704 0.850 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1387494 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379175 2 0.8084 0.483 0.112 0.592 0.140 0.156
#> SRR1401909 4 0.3803 0.773 0.132 0.000 0.032 0.836
#> SRR1440541 2 0.0188 0.946 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1068832 3 0.2149 0.884 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1376640 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1085712 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 4 0.3688 0.738 0.208 0.000 0.000 0.792
#> SRR1084276 1 0.1716 0.906 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1353262 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.0469 0.931 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1396877 1 0.1118 0.924 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1443026 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1417936 1 0.0188 0.931 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1436822 2 0.3123 0.801 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1101128 3 0.1022 0.919 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1363886 2 0.0469 0.944 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR612983 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394366 4 0.3569 0.761 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1093218 3 0.1118 0.914 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1077090 3 0.3486 0.790 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR1327430 2 0.3272 0.865 0.008 0.860 0.004 0.128
#> SRR1088958 1 0.0469 0.928 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1486931 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1086820 1 0.1302 0.919 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1383000 1 0.0336 0.929 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1355705 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614335 2 0.2589 0.882 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR660534 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR817094 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.4322 0.810 0.044 0.804 0.000 0.152
#> SRR1456401 2 0.2149 0.901 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1086393 1 0.0469 0.931 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1351521 3 0.0336 0.927 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1093100 2 0.5207 0.776 0.040 0.772 0.028 0.160
#> SRR1309382 1 0.1716 0.906 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1089375 1 0.0469 0.931 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1499482 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614719 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1081473 3 0.0336 0.926 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1087415 1 0.2216 0.882 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1088217 4 0.3577 0.767 0.156 0.000 0.012 0.832
#> SRR808496 2 0.1637 0.919 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1336463 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612359 2 0.1211 0.923 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1444412 1 0.1211 0.922 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1074116 3 0.0707 0.924 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR821846 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR808914 1 0.1557 0.911 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1349099 4 0.2973 0.750 0.144 0.000 0.000 0.856
#> SRR1337886 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR813632 1 0.0469 0.931 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1101591 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089713 4 0.6881 0.620 0.236 0.000 0.172 0.592
#> SRR1453127 3 0.0188 0.928 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1498354 3 0.4343 0.654 0.004 0.000 0.732 0.264
#> SRR1313831 1 0.1389 0.917 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1315434 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.2647 0.880 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1358539 1 0.1022 0.925 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1367807 1 0.2469 0.856 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1365791 4 0.4164 0.601 0.000 0.000 0.264 0.736
#> SRR1081519 3 0.4741 0.515 0.004 0.000 0.668 0.328
#> SRR614707 4 0.3919 0.789 0.056 0.104 0.000 0.840
#> SRR1094027 1 0.0188 0.931 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1489092 4 0.4647 0.584 0.008 0.000 0.288 0.704
#> SRR1079502 3 0.0469 0.925 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1457814 3 0.3157 0.831 0.000 0.004 0.852 0.144
#> SRR1455127 2 0.2149 0.901 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR615081 4 0.3801 0.743 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1327855 3 0.0707 0.924 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1417873 2 0.3498 0.839 0.008 0.832 0.000 0.160
#> SRR1394125 3 0.0469 0.926 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1488388 1 0.0188 0.931 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1401122 2 0.3695 0.836 0.016 0.828 0.000 0.156
#> SRR612383 3 0.1474 0.892 0.000 0.052 0.948 0.000
#> SRR1477711 1 0.0707 0.929 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1350813 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612851 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1086349 1 0.0188 0.931 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR812837 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.2401 0.874 0.004 0.000 0.904 0.092
#> SRR1475885 4 0.2704 0.770 0.124 0.000 0.000 0.876
#> SRR1376334 1 0.1389 0.917 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1399821 1 0.1637 0.915 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1347042 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612323 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612604 4 0.4431 0.638 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR1389546 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1311877 1 0.0336 0.929 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1465608 1 0.3172 0.800 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1101808 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1414079 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.0469 0.943 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1078439 3 0.3074 0.827 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR2165527 2 0.2530 0.885 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1351147 4 0.4134 0.683 0.260 0.000 0.000 0.740
#> SRR1313536 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1070308 1 0.5460 0.639 0.748 0.124 0.124 0.004
#> SRR1403110 1 0.1118 0.924 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1400355 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1401317 3 0.0707 0.924 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1456862 1 0.3569 0.777 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1074622 1 0.0188 0.930 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1465847 3 0.0779 0.925 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR1443376 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1471312 3 0.0188 0.928 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1075579 1 0.0921 0.927 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1090881 3 0.1174 0.917 0.000 0.020 0.968 0.012
#> SRR612251 2 0.1716 0.917 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1418581 1 0.0469 0.928 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR658045 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR613214 2 0.1302 0.920 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR613078 4 0.3610 0.756 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1472998 3 0.4277 0.580 0.280 0.000 0.720 0.000
#> SRR1433452 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1101957 1 0.0336 0.929 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1487993 3 0.1637 0.900 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1465983 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1380375 1 0.0707 0.929 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1367566 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316151 4 0.3172 0.749 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR1417547 2 0.3377 0.854 0.012 0.848 0.000 0.140
#> SRR659389 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0336 0.946 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1398207 4 0.4746 0.505 0.368 0.000 0.000 0.632
#> SRR1358755 3 0.4388 0.769 0.132 0.000 0.808 0.060
#> SRR1078903 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1323252 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1451796 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1369172 1 0.0921 0.927 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR615982 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.1940 0.903 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1102393 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1071313 1 0.3172 0.798 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR808351 1 0.0188 0.930 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1317513 1 0.0817 0.928 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1480501 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.7093 0.328 0.568 0.000 0.212 0.220
#> SRR1086611 4 0.4060 0.772 0.004 0.112 0.048 0.836
#> SRR1392571 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1311441 1 0.1118 0.918 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR808152 1 0.0336 0.929 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR657313 3 0.0469 0.927 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1433131 4 0.4967 0.328 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR1321011 2 0.0000 0.947 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0469 0.944 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1379343 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1389108 1 0.2469 0.856 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1376228 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0592 0.930 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1358060 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.1302 0.911 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR613557 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809831 1 0.0921 0.927 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1429387 3 0.0000 0.928 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0188 0.931 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071644 1 0.0469 0.931 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1406936 3 0.1940 0.888 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1072031 2 0.0188 0.948 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1374671 2 0.0707 0.936 0.000 0.980 0.020 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 5 0.3752 0.50832 0.000 0.000 0.292 0.000 0.708
#> SRR1404105 1 0.1121 0.88793 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR2164936 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0955 0.91209 0.000 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR614491 3 0.1469 0.90303 0.000 0.016 0.948 0.000 0.036
#> SRR1069376 1 0.0963 0.88785 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR811964 2 0.0162 0.92344 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1361415 5 0.3966 0.58921 0.000 0.336 0.000 0.000 0.664
#> SRR1345715 5 0.4300 -0.00934 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1328073 1 0.4804 0.73521 0.764 0.020 0.136 0.004 0.076
#> SRR1394209 5 0.3377 0.69521 0.036 0.040 0.060 0.000 0.864
#> SRR1474018 2 0.4278 0.04949 0.000 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR1099809 1 0.3161 0.82413 0.860 0.000 0.044 0.004 0.092
#> SRR1500555 3 0.5422 0.57982 0.000 0.132 0.656 0.212 0.000
#> SRR1354363 1 0.3366 0.71090 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232
#> SRR1391619 3 0.1671 0.89121 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1307997 2 0.1644 0.89090 0.008 0.940 0.000 0.004 0.048
#> SRR663124 2 0.0324 0.92226 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1334670 1 0.0000 0.89078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 3 0.1043 0.90688 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1092727 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.2020 0.85760 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1468553 3 0.0290 0.91056 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1403980 3 0.1892 0.88113 0.000 0.000 0.916 0.004 0.080
#> SRR1420169 3 0.4472 0.79754 0.024 0.000 0.788 0.108 0.080
#> SRR1442800 4 0.0324 0.89508 0.004 0.000 0.004 0.992 0.000
#> SRR1359214 5 0.3816 0.64501 0.000 0.304 0.000 0.000 0.696
#> SRR1499849 1 0.3496 0.81383 0.844 0.000 0.056 0.008 0.092
#> SRR1500030 3 0.1792 0.88650 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1093053 3 0.2797 0.87795 0.000 0.000 0.880 0.060 0.060
#> SRR1399843 5 0.4287 0.07147 0.000 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1380231 3 0.3342 0.83026 0.048 0.000 0.848 0.004 0.100
#> SRR809470 1 0.7738 0.05272 0.388 0.000 0.296 0.256 0.060
#> SRR614239 3 0.2554 0.85569 0.000 0.072 0.892 0.000 0.036
#> SRR613939 4 0.0404 0.89529 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR612971 2 0.0703 0.91468 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1490204 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0609 0.91855 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1471672 1 0.4273 0.25855 0.552 0.000 0.000 0.000 0.448
#> SRR613006 2 0.0162 0.92347 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.2280 0.83526 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1362906 3 0.2813 0.81094 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1079023 1 0.0451 0.89121 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR813608 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 5 0.2900 0.66421 0.108 0.000 0.028 0.000 0.864
#> SRR1478700 5 0.4538 0.07472 0.452 0.000 0.000 0.008 0.540
#> SRR1081543 3 0.1671 0.89121 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1384754 5 0.3102 0.67186 0.056 0.000 0.084 0.000 0.860
#> SRR612287 2 0.1792 0.87177 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1380317 5 0.3535 0.71045 0.000 0.088 0.080 0.000 0.832
#> SRR1315247 4 0.0162 0.89546 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1105344 4 0.5049 0.03168 0.000 0.480 0.000 0.488 0.032
#> SRR658549 2 0.3563 0.65342 0.000 0.780 0.208 0.000 0.012
#> SRR1480240 1 0.0703 0.88723 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1084816 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0404 0.92005 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1358520 5 0.2690 0.72599 0.000 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1419476 3 0.1831 0.88364 0.000 0.000 0.920 0.004 0.076
#> SRR1456075 5 0.3209 0.63531 0.008 0.000 0.180 0.000 0.812
#> SRR1389474 2 0.0290 0.92283 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1367005 1 0.2329 0.83522 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1334419 5 0.3730 0.50997 0.288 0.000 0.000 0.000 0.712
#> SRR1417154 3 0.0510 0.90838 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1095985 4 0.0162 0.89546 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1325771 1 0.0162 0.89085 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1360420 3 0.0290 0.91062 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR660272 2 0.1116 0.91017 0.004 0.964 0.000 0.004 0.028
#> SRR1332993 1 0.0963 0.88785 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1311833 2 0.0963 0.90923 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR808044 1 0.6200 0.42720 0.548 0.000 0.000 0.196 0.256
#> SRR1076916 4 0.0290 0.89382 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1356266 1 0.0703 0.88992 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1341983 2 0.1121 0.90352 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1456114 1 0.1732 0.86835 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1072948 3 0.0963 0.90785 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1472370 3 0.0566 0.91043 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR1480176 1 0.1041 0.88516 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR613843 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.1197 0.88677 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1404555 3 0.4491 0.51891 0.000 0.000 0.652 0.328 0.020
#> SRR659839 2 0.0404 0.92170 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR659533 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362848 5 0.2605 0.66317 0.000 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR1407492 3 0.1310 0.90322 0.000 0.024 0.956 0.000 0.020
#> SRR1455082 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658362 2 0.0963 0.90821 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR810921 2 0.0609 0.91852 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR662823 5 0.4307 0.13566 0.000 0.500 0.000 0.000 0.500
#> SRR1456375 3 0.0510 0.91082 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR818232 1 0.1012 0.88677 0.968 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR1454868 3 0.1270 0.90289 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1474816 2 0.0404 0.92170 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1342002 1 0.0880 0.88925 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1088437 2 0.4291 -0.02113 0.000 0.536 0.000 0.000 0.464
#> SRR1466400 4 0.0290 0.89591 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR658921 4 0.0290 0.89591 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.1671 0.87175 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1090145 1 0.1357 0.87939 0.948 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR1379324 1 0.1648 0.88350 0.940 0.000 0.000 0.020 0.040
#> SRR1345307 2 0.0794 0.91415 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1396166 3 0.0963 0.90785 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1086280 3 0.1357 0.89732 0.000 0.000 0.948 0.004 0.048
#> SRR1454891 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663185 5 0.3586 0.69415 0.000 0.264 0.000 0.000 0.736
#> SRR811819 1 0.0671 0.88903 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1318920 4 0.0404 0.89437 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0671 0.88871 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR660450 2 0.3122 0.80322 0.004 0.852 0.000 0.120 0.024
#> SRR1472687 2 0.1608 0.88295 0.000 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1334291 2 0.2196 0.86722 0.024 0.916 0.000 0.004 0.056
#> SRR1415153 2 0.0963 0.90935 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1323271 5 0.3395 0.71648 0.000 0.236 0.000 0.000 0.764
#> SRR1368939 2 0.0162 0.92347 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1443161 5 0.3370 0.65309 0.000 0.000 0.148 0.028 0.824
#> SRR614695 4 0.0404 0.89529 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1092372 4 0.0290 0.89546 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1474577 5 0.4060 0.36387 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640
#> SRR1406582 1 0.3480 0.69139 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR612779 2 0.0510 0.92029 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1089006 1 0.4088 0.47516 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368
#> SRR1354071 1 0.3400 0.81453 0.840 0.000 0.040 0.004 0.116
#> SRR1105463 1 0.3979 0.79928 0.824 0.000 0.048 0.032 0.096
#> SRR811005 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.1877 0.86574 0.924 0.000 0.000 0.064 0.012
#> SRR1325871 3 0.1544 0.89555 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1355415 4 0.6078 0.62500 0.064 0.000 0.188 0.660 0.088
#> SRR1090861 1 0.0000 0.89078 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 5 0.2953 0.67019 0.000 0.012 0.144 0.000 0.844
#> SRR1470075 1 0.4138 0.43199 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR1091254 1 0.0794 0.88934 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1101397 5 0.3741 0.53860 0.264 0.000 0.004 0.000 0.732
#> SRR1321165 4 0.0290 0.89546 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1092112 3 0.4260 0.66797 0.004 0.000 0.720 0.256 0.020
#> SRR1417588 3 0.0703 0.90990 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1074790 1 0.1502 0.87930 0.940 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR1432106 5 0.3661 0.68284 0.000 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR655756 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.4526 0.57384 0.672 0.000 0.000 0.028 0.300
#> SRR1318582 2 0.0404 0.92170 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1080484 5 0.3336 0.71932 0.000 0.228 0.000 0.000 0.772
#> SRR1072749 1 0.1197 0.88677 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1078586 1 0.0671 0.88871 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1400333 4 0.2471 0.78582 0.000 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR1078834 4 0.4627 0.61202 0.008 0.256 0.000 0.704 0.032
#> SRR1417611 5 0.3109 0.72606 0.000 0.200 0.000 0.000 0.800
#> SRR1396840 4 0.0290 0.89546 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1465440 2 0.0794 0.91269 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1400530 2 0.1197 0.90069 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR614984 3 0.2616 0.83848 0.000 0.100 0.880 0.000 0.020
#> SRR1324269 1 0.0955 0.88595 0.968 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR1401491 2 0.4378 0.63445 0.000 0.716 0.000 0.248 0.036
#> SRR1319443 1 0.1197 0.87954 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1324349 5 0.3777 0.72068 0.020 0.192 0.000 0.004 0.784
#> SRR1345523 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.1732 0.86824 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR661505 3 0.1956 0.88260 0.000 0.000 0.916 0.008 0.076
#> SRR1419062 3 0.2692 0.86029 0.016 0.000 0.884 0.008 0.092
#> SRR1480131 1 0.2642 0.84438 0.888 0.000 0.024 0.004 0.084
#> SRR1421284 5 0.3184 0.71772 0.000 0.100 0.048 0.000 0.852
#> SRR1329624 1 0.0162 0.89068 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1315739 3 0.0404 0.90897 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1099189 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.1043 0.88249 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1091890 3 0.0703 0.90990 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1347436 2 0.1205 0.90411 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1327473 1 0.0963 0.88982 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1338195 3 0.0963 0.90785 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR809698 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0963 0.88785 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR658271 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.1740 0.87822 0.932 0.000 0.000 0.012 0.056
#> SRR1454842 3 0.0963 0.90785 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1322643 1 0.3983 0.53346 0.660 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR614887 3 0.0510 0.91082 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1354620 1 0.5900 0.35217 0.560 0.000 0.340 0.008 0.092
#> SRR615056 2 0.4114 0.32993 0.000 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1105320 1 0.5574 0.59974 0.652 0.000 0.212 0.004 0.132
#> SRR1391529 1 0.0609 0.88811 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR663052 2 0.1270 0.90203 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1478834 1 0.0609 0.88811 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR812366 2 0.1041 0.90962 0.000 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR1435330 3 0.0510 0.90968 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR615383 2 0.0794 0.91415 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1389157 3 0.1557 0.88311 0.000 0.052 0.940 0.000 0.008
#> SRR613568 2 0.0693 0.91866 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR614095 2 0.1270 0.89800 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1103092 1 0.2769 0.83594 0.876 0.000 0.032 0.000 0.092
#> SRR1337155 4 0.0486 0.89423 0.004 0.000 0.004 0.988 0.004
#> SRR1475345 2 0.1478 0.88894 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR809089 2 0.0162 0.92344 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1446180 4 0.0162 0.89546 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1406372 2 0.1544 0.88582 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1339880 5 0.4294 0.04598 0.000 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1353136 3 0.4227 0.32711 0.000 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR1093906 3 0.0404 0.90897 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR614035 2 0.0162 0.92272 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1351104 1 0.4307 0.09500 0.504 0.000 0.000 0.000 0.496
#> SRR1363926 2 0.4268 0.09065 0.000 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1399861 5 0.3132 0.65591 0.000 0.008 0.172 0.000 0.820
#> SRR1338789 4 0.3912 0.65578 0.228 0.000 0.000 0.752 0.020
#> SRR1421420 3 0.1270 0.90454 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1420832 5 0.4074 0.53610 0.000 0.364 0.000 0.000 0.636
#> SRR1476231 1 0.0671 0.89089 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1352870 3 0.1568 0.89623 0.000 0.020 0.944 0.000 0.036
#> SRR1315041 5 0.3274 0.72214 0.000 0.220 0.000 0.000 0.780
#> SRR661877 2 0.2516 0.81207 0.000 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1443268 1 0.4297 0.17703 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR1416617 3 0.0510 0.90905 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1102443 1 0.2127 0.84914 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR655672 2 0.0162 0.92320 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1420006 3 0.0510 0.90838 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1458267 2 0.1043 0.90653 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR613819 5 0.3395 0.71600 0.000 0.236 0.000 0.000 0.764
#> SRR1469432 2 0.2773 0.77980 0.000 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR660907 2 0.1671 0.87940 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1465092 2 0.1124 0.90709 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1470727 1 0.1043 0.88745 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1339153 3 0.1197 0.90429 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1472749 3 0.0963 0.90785 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1414379 5 0.2852 0.72595 0.000 0.172 0.000 0.000 0.828
#> SRR1431326 1 0.1732 0.86856 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1487278 4 0.0510 0.89408 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1098312 3 0.0865 0.90969 0.000 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR810273 2 0.0404 0.92170 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1376000 2 0.0963 0.90923 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR614467 2 0.4560 -0.06343 0.000 0.508 0.008 0.000 0.484
#> SRR811471 1 0.0609 0.89038 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1478341 3 0.0703 0.90696 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1088606 4 0.0162 0.89546 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1479699 3 0.0794 0.90953 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1403589 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.4747 0.65239 0.000 0.720 0.000 0.196 0.084
#> SRR1359803 1 0.1502 0.87769 0.940 0.000 0.000 0.056 0.004
#> SRR1338988 2 0.1197 0.90069 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1471222 2 0.1522 0.89912 0.000 0.944 0.000 0.012 0.044
#> SRR1378992 5 0.3707 0.51700 0.284 0.000 0.000 0.000 0.716
#> SRR659427 5 0.2732 0.65836 0.000 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR1096638 1 0.1478 0.87833 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1466619 4 0.2813 0.82277 0.000 0.040 0.000 0.876 0.084
#> SRR659307 3 0.1502 0.87953 0.000 0.056 0.940 0.000 0.004
#> SRR1439994 1 0.4866 0.48295 0.620 0.000 0.000 0.036 0.344
#> SRR1454931 1 0.4581 0.72728 0.764 0.000 0.012 0.148 0.076
#> SRR1332928 5 0.3112 0.66680 0.100 0.000 0.044 0.000 0.856
#> SRR658621 5 0.3774 0.65597 0.000 0.296 0.000 0.000 0.704
#> SRR1095840 1 0.0510 0.88889 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1458243 1 0.2464 0.85105 0.888 0.000 0.000 0.016 0.096
#> SRR1374270 5 0.3182 0.68454 0.000 0.032 0.124 0.000 0.844
#> SRR1470947 2 0.1965 0.86043 0.000 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1365598 4 0.0324 0.89633 0.004 0.004 0.000 0.992 0.000
#> SRR662787 5 0.4060 0.54233 0.000 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1408727 5 0.3608 0.71782 0.000 0.112 0.064 0.000 0.824
#> SRR1456274 1 0.4134 0.73008 0.760 0.000 0.044 0.000 0.196
#> SRR817744 1 0.0451 0.89121 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1478744 2 0.1851 0.86797 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1387379 2 0.0162 0.92272 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1102680 3 0.1608 0.88859 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1374198 4 0.2891 0.74071 0.176 0.000 0.000 0.824 0.000
#> SRR1445856 4 0.0609 0.89059 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR820049 3 0.0794 0.90935 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1375290 3 0.0703 0.90696 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR818999 1 0.3547 0.80582 0.836 0.000 0.060 0.004 0.100
#> SRR1390242 1 0.0671 0.88871 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1401164 4 0.2074 0.82513 0.000 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR1454629 1 0.4320 0.78363 0.804 0.000 0.032 0.076 0.088
#> SRR1332187 3 0.2286 0.85632 0.000 0.000 0.888 0.108 0.004
#> SRR603365 3 0.1626 0.90280 0.000 0.000 0.940 0.044 0.016
#> SRR657833 2 0.0290 0.92290 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1436207 2 0.0404 0.92170 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1488017 1 0.0510 0.89065 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR612947 2 0.0404 0.92170 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1480384 1 0.1043 0.88745 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1364761 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308086 5 0.3561 0.56138 0.000 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR1441868 1 0.2929 0.77910 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1485380 3 0.1697 0.89104 0.000 0.000 0.932 0.008 0.060
#> SRR1073705 5 0.3932 0.43667 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR615032 2 0.0703 0.91485 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1452356 5 0.3661 0.68171 0.000 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1442983 2 0.0609 0.91852 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1100346 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332816 1 0.1478 0.87815 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR612299 4 0.0703 0.89006 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1407386 1 0.0290 0.89104 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1418064 2 0.1197 0.90069 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1309403 1 0.2844 0.84468 0.876 0.000 0.028 0.004 0.092
#> SRR1498395 2 0.1282 0.90104 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1079998 3 0.4939 0.34647 0.380 0.000 0.592 0.008 0.020
#> SRR1498885 5 0.3730 0.66484 0.000 0.288 0.000 0.000 0.712
#> SRR1337215 4 0.0451 0.89628 0.004 0.008 0.000 0.988 0.000
#> SRR1414749 3 0.0880 0.90536 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1365963 3 0.5706 0.55869 0.204 0.000 0.640 0.004 0.152
#> SRR1368030 5 0.3424 0.71314 0.000 0.240 0.000 0.000 0.760
#> SRR1419760 2 0.5696 0.45455 0.268 0.644 0.024 0.004 0.060
#> SRR1381841 1 0.4425 0.68998 0.744 0.000 0.004 0.204 0.048
#> SRR821388 3 0.2377 0.85347 0.000 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR657623 5 0.3480 0.71032 0.000 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR1094241 3 0.1043 0.90688 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR819583 3 0.2077 0.87749 0.000 0.000 0.908 0.008 0.084
#> SRR1096149 5 0.4262 0.12658 0.440 0.000 0.000 0.000 0.560
#> SRR1342829 3 0.0162 0.91019 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1353028 1 0.0794 0.88934 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR811333 3 0.4587 0.66101 0.204 0.000 0.728 0.000 0.068
#> SRR1311666 2 0.1043 0.90653 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1486698 2 0.4300 0.05100 0.000 0.524 0.000 0.476 0.000
#> SRR1446436 2 0.1121 0.90375 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR815092 1 0.0510 0.88889 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1500149 2 0.0162 0.92347 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1100564 1 0.0404 0.89038 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1403072 3 0.1357 0.89758 0.000 0.000 0.948 0.004 0.048
#> SRR811653 5 0.3039 0.64201 0.000 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1311348 2 0.0290 0.92283 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1489438 5 0.3612 0.69235 0.000 0.268 0.000 0.000 0.732
#> SRR1435442 4 0.0510 0.89362 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1421444 3 0.0794 0.90935 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1344010 2 0.1043 0.90583 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1319520 1 0.1341 0.88137 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1444763 4 0.0290 0.89546 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1415026 2 0.1197 0.90069 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1416596 5 0.5202 0.35139 0.000 0.056 0.000 0.348 0.596
#> SRR1485499 2 0.2561 0.80681 0.000 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1316078 2 0.1197 0.90069 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR663465 5 0.4273 0.31282 0.000 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR1310094 5 0.3109 0.72652 0.000 0.200 0.000 0.000 0.800
#> SRR663537 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.1341 0.88216 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1453950 1 0.1043 0.88745 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1087875 1 0.4283 0.23375 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456
#> SRR613318 3 0.2329 0.85850 0.000 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1332694 1 0.0162 0.89068 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1468469 3 0.0880 0.90868 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR818670 2 0.0510 0.92029 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1120318 1 0.1864 0.86813 0.924 0.000 0.004 0.004 0.068
#> SRR1311622 5 0.3366 0.59740 0.000 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR1500931 3 0.2017 0.87987 0.000 0.000 0.912 0.008 0.080
#> SRR1387494 3 0.1043 0.90728 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1379175 5 0.3523 0.70880 0.008 0.072 0.076 0.000 0.844
#> SRR1401909 4 0.0833 0.89037 0.004 0.000 0.004 0.976 0.016
#> SRR1440541 2 0.0324 0.92259 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1068832 3 0.2077 0.87749 0.000 0.000 0.908 0.008 0.084
#> SRR1376640 2 0.0162 0.92347 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1085712 2 0.0703 0.91468 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1082283 4 0.1671 0.84738 0.076 0.000 0.000 0.924 0.000
#> SRR1084276 1 0.2270 0.85726 0.908 0.000 0.016 0.004 0.072
#> SRR1353262 2 0.3690 0.71974 0.000 0.780 0.000 0.200 0.020
#> SRR1437035 1 0.0898 0.89200 0.972 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR1396877 1 0.3357 0.82041 0.852 0.000 0.048 0.008 0.092
#> SRR1443026 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0671 0.89089 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1436822 4 0.3657 0.73620 0.000 0.116 0.000 0.820 0.064
#> SRR1101128 3 0.1892 0.88150 0.000 0.000 0.916 0.004 0.080
#> SRR1363886 2 0.2648 0.79644 0.000 0.848 0.000 0.000 0.152
#> SRR612983 2 0.1043 0.90583 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1394366 4 0.1043 0.88101 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1093218 3 0.1792 0.88919 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1077090 3 0.4481 0.58544 0.004 0.000 0.668 0.312 0.016
#> SRR1327430 5 0.3274 0.72250 0.000 0.220 0.000 0.000 0.780
#> SRR1088958 1 0.3274 0.73006 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1486931 2 0.1121 0.90375 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1086820 1 0.1082 0.88935 0.964 0.000 0.000 0.008 0.028
#> SRR1383000 1 0.1197 0.88493 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1355705 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614335 5 0.4262 0.33063 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR660534 2 0.0404 0.92170 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR817094 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 5 0.3461 0.71865 0.004 0.224 0.000 0.000 0.772
#> SRR1456401 2 0.4114 0.32299 0.000 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1086393 1 0.0963 0.88785 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1351521 3 0.0290 0.91084 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1093100 5 0.3354 0.71299 0.000 0.088 0.068 0.000 0.844
#> SRR1309382 1 0.0510 0.88889 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1089375 1 0.2172 0.86407 0.916 0.000 0.020 0.004 0.060
#> SRR1499482 2 0.0703 0.91645 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR614719 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081473 3 0.1121 0.90727 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1087415 1 0.3163 0.78874 0.824 0.000 0.000 0.164 0.012
#> SRR1088217 4 0.2067 0.86341 0.004 0.000 0.028 0.924 0.044
#> SRR808496 2 0.3480 0.64345 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1336463 2 0.1544 0.88621 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR612359 2 0.0880 0.90596 0.000 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1444412 1 0.1430 0.87631 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR1074116 3 0.0955 0.90541 0.000 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR821846 3 0.0963 0.90785 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR656095 2 0.0794 0.91431 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR808914 1 0.1041 0.88472 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1349099 4 0.1956 0.85126 0.008 0.000 0.000 0.916 0.076
#> SRR1337886 2 0.0510 0.91844 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR813632 1 0.1124 0.88417 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1101591 3 0.0290 0.91084 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1089713 1 0.5426 0.64968 0.684 0.000 0.168 0.008 0.140
#> SRR1453127 3 0.0404 0.91108 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1498354 3 0.3285 0.83712 0.044 0.000 0.856 0.008 0.092
#> SRR1313831 1 0.0404 0.88962 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1315434 3 0.1121 0.90558 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR814747 5 0.3752 0.66195 0.000 0.292 0.000 0.000 0.708
#> SRR1358539 1 0.0404 0.88962 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1367807 5 0.4015 0.39277 0.348 0.000 0.000 0.000 0.652
#> SRR1365791 4 0.3177 0.71771 0.000 0.000 0.208 0.792 0.000
#> SRR1081519 3 0.2237 0.87498 0.004 0.000 0.904 0.008 0.084
#> SRR614707 4 0.0162 0.89546 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1094027 1 0.0671 0.89089 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1489092 4 0.3461 0.74992 0.004 0.000 0.168 0.812 0.016
#> SRR1079502 3 0.0703 0.91167 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1457814 5 0.3395 0.60132 0.000 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR1455127 2 0.3586 0.61046 0.000 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR615081 4 0.0404 0.89529 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1327855 3 0.0992 0.90597 0.000 0.000 0.968 0.008 0.024
#> SRR1417873 5 0.3242 0.72345 0.000 0.216 0.000 0.000 0.784
#> SRR1394125 3 0.1892 0.88208 0.004 0.000 0.916 0.000 0.080
#> SRR1488388 1 0.0794 0.88934 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1401122 5 0.3210 0.72444 0.000 0.212 0.000 0.000 0.788
#> SRR612383 3 0.3496 0.69427 0.000 0.200 0.788 0.000 0.012
#> SRR1477711 1 0.0324 0.89057 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1350813 2 0.0162 0.92344 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612851 2 0.0162 0.92344 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1086349 1 0.0880 0.88925 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR812837 2 0.0963 0.90831 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1340010 3 0.1965 0.88106 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1475885 4 0.0290 0.89546 0.008 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1376334 1 0.0510 0.88889 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1399821 4 0.5699 0.50620 0.156 0.000 0.000 0.624 0.220
#> SRR1347042 3 0.0510 0.91076 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR612323 3 0.1282 0.90503 0.000 0.004 0.952 0.000 0.044
#> SRR612604 4 0.1410 0.86548 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1389546 2 0.0510 0.92029 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1311877 1 0.1043 0.88745 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1465608 5 0.3246 0.62543 0.184 0.000 0.008 0.000 0.808
#> SRR1101808 2 0.0290 0.92314 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1414079 3 0.0510 0.91082 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1331153 2 0.0290 0.92290 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1078439 3 0.3480 0.70964 0.000 0.000 0.752 0.248 0.000
#> SRR2165527 2 0.4030 0.39806 0.000 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1351147 1 0.3201 0.81971 0.844 0.000 0.016 0.008 0.132
#> SRR1313536 2 0.0451 0.92163 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1070308 1 0.4853 0.73783 0.776 0.088 0.040 0.004 0.092
#> SRR1403110 1 0.0510 0.88889 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1400355 2 0.0404 0.92170 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1401317 3 0.1671 0.88661 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1456862 4 0.0609 0.89066 0.020 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1074622 1 0.1121 0.88561 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1465847 3 0.1282 0.89982 0.004 0.000 0.952 0.000 0.044
#> SRR1443376 2 0.0162 0.92344 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1471312 3 0.0880 0.90868 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1075579 1 0.0404 0.89096 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1090881 3 0.1845 0.89241 0.000 0.016 0.928 0.000 0.056
#> SRR612251 2 0.3949 0.46082 0.000 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR1418581 1 0.1732 0.86941 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR658045 2 0.0290 0.92283 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR613214 2 0.4277 0.66425 0.000 0.768 0.156 0.000 0.076
#> SRR613078 4 0.1197 0.87459 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1472998 3 0.3715 0.64195 0.260 0.000 0.736 0.000 0.004
#> SRR1433452 2 0.0404 0.92170 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1101957 1 0.1121 0.88627 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1487993 3 0.3336 0.73180 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1465983 2 0.0290 0.92290 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1380375 1 0.0671 0.88871 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1367566 3 0.0404 0.91097 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1316151 4 0.2843 0.78458 0.000 0.008 0.000 0.848 0.144
#> SRR1417547 5 0.3177 0.72512 0.000 0.208 0.000 0.000 0.792
#> SRR659389 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0324 0.92308 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1398207 1 0.3216 0.82179 0.856 0.000 0.044 0.004 0.096
#> SRR1358755 3 0.6036 0.05682 0.436 0.000 0.460 0.004 0.100
#> SRR1078903 2 0.0880 0.91174 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1323252 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.1270 0.88274 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR615982 2 0.0290 0.92290 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1480431 2 0.0794 0.91269 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1429825 4 0.3682 0.74959 0.000 0.072 0.000 0.820 0.108
#> SRR1102393 2 0.0162 0.92344 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071313 5 0.3109 0.62076 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR808351 1 0.0880 0.88925 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1317513 1 0.0290 0.89017 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1480501 3 0.1270 0.90582 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1081910 1 0.5091 0.60924 0.676 0.000 0.236 0.000 0.088
#> SRR1086611 4 0.0324 0.89633 0.004 0.004 0.000 0.992 0.000
#> SRR1392571 2 0.0404 0.92170 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1311441 1 0.2966 0.77364 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR808152 1 0.1197 0.88524 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR657313 3 0.1205 0.90771 0.000 0.000 0.956 0.004 0.040
#> SRR1433131 4 0.4074 0.43741 0.000 0.364 0.000 0.636 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.3210 0.70603 0.000 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1379343 2 0.0404 0.92170 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1389108 5 0.3966 0.41955 0.336 0.000 0.000 0.000 0.664
#> SRR1376228 3 0.0404 0.90897 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1399757 1 0.0324 0.89104 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1358060 3 0.0794 0.90587 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1464517 3 0.3983 0.53757 0.000 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR613557 3 0.1106 0.90754 0.000 0.012 0.964 0.000 0.024
#> SRR809831 1 0.2429 0.85410 0.900 0.000 0.020 0.004 0.076
#> SRR1429387 3 0.0510 0.91076 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR816565 1 0.0566 0.89138 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1071644 1 0.0510 0.89065 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1406936 3 0.2127 0.87327 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1072031 2 0.0000 0.92355 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.0162 0.92320 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 3 0.5115 0.12935 0.000 0.000 0.464 0.456 0.080 0.000
#> SRR1404105 1 0.0508 0.84082 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR2164936 2 0.1556 0.82460 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1472057 5 0.3518 0.76561 0.000 0.000 0.256 0.012 0.732 0.000
#> SRR614491 3 0.0692 0.82680 0.000 0.020 0.976 0.000 0.004 0.000
#> SRR1069376 1 0.0865 0.83660 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR811964 2 0.0508 0.85082 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1361415 4 0.1957 0.73770 0.000 0.112 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.3094 0.78193 0.824 0.000 0.000 0.036 0.140 0.000
#> SRR1328073 1 0.7190 0.16020 0.428 0.316 0.172 0.024 0.060 0.000
#> SRR1394209 4 0.1458 0.71751 0.000 0.016 0.020 0.948 0.016 0.000
#> SRR1474018 4 0.2668 0.69335 0.000 0.168 0.000 0.828 0.004 0.000
#> SRR1099809 1 0.1806 0.81620 0.908 0.000 0.004 0.000 0.088 0.000
#> SRR1500555 3 0.6074 0.25326 0.000 0.372 0.496 0.028 0.012 0.092
#> SRR1354363 1 0.3172 0.77674 0.816 0.000 0.000 0.036 0.148 0.000
#> SRR1391619 3 0.0622 0.82994 0.000 0.000 0.980 0.008 0.012 0.000
#> SRR1307997 2 0.1464 0.83002 0.004 0.944 0.000 0.036 0.016 0.000
#> SRR663124 2 0.3996 -0.09906 0.000 0.512 0.484 0.000 0.004 0.000
#> SRR1334670 1 0.1075 0.83492 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR612515 3 0.1155 0.81523 0.000 0.036 0.956 0.004 0.004 0.000
#> SRR1092727 2 0.0260 0.85264 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.2058 0.83093 0.000 0.908 0.000 0.036 0.056 0.000
#> SRR1468553 3 0.0713 0.82346 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1403980 3 0.2941 0.57841 0.000 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1420169 5 0.3784 0.76717 0.000 0.000 0.236 0.024 0.736 0.004
#> SRR1442800 6 0.0951 0.88105 0.000 0.000 0.004 0.008 0.020 0.968
#> SRR1359214 4 0.1471 0.74708 0.000 0.064 0.000 0.932 0.004 0.000
#> SRR1499849 1 0.3508 0.58902 0.704 0.000 0.004 0.000 0.292 0.000
#> SRR1500030 3 0.0508 0.83011 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR1093053 3 0.4615 0.58628 0.000 0.000 0.728 0.068 0.032 0.172
#> SRR1399843 4 0.4026 0.21738 0.000 0.000 0.376 0.612 0.012 0.000
#> SRR1380231 5 0.3453 0.74875 0.064 0.000 0.132 0.000 0.804 0.000
#> SRR809470 1 0.7283 -0.10809 0.372 0.000 0.268 0.000 0.104 0.256
#> SRR614239 3 0.1674 0.78522 0.000 0.068 0.924 0.004 0.004 0.000
#> SRR613939 6 0.0405 0.88547 0.000 0.008 0.000 0.000 0.004 0.988
#> SRR612971 2 0.3782 0.30297 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0725 0.85093 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012 0.000
#> SRR811357 2 0.0914 0.84015 0.000 0.968 0.000 0.016 0.016 0.000
#> SRR1471672 1 0.3139 0.77701 0.816 0.000 0.000 0.032 0.152 0.000
#> SRR613006 2 0.2867 0.78219 0.000 0.848 0.000 0.040 0.000 0.112
#> SRR1469570 2 0.0777 0.85194 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004 0.000
#> SRR1457354 4 0.3950 0.19831 0.000 0.432 0.000 0.564 0.004 0.000
#> SRR1362906 3 0.3202 0.65181 0.000 0.000 0.800 0.176 0.024 0.000
#> SRR1079023 1 0.1007 0.83599 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR813608 2 0.0865 0.84761 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1096736 4 0.5706 0.34854 0.208 0.000 0.024 0.600 0.168 0.000
#> SRR1478700 1 0.5385 0.57676 0.624 0.000 0.000 0.204 0.160 0.012
#> SRR1081543 3 0.0405 0.83095 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR1384754 4 0.6211 0.22177 0.036 0.000 0.288 0.516 0.160 0.000
#> SRR612287 4 0.3860 0.07509 0.000 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000
#> SRR1380317 4 0.1590 0.74147 0.000 0.048 0.008 0.936 0.008 0.000
#> SRR1315247 6 0.0146 0.88624 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1105344 4 0.5878 0.25631 0.000 0.204 0.000 0.440 0.000 0.356
#> SRR658549 3 0.4481 0.31411 0.000 0.400 0.572 0.020 0.008 0.000
#> SRR1480240 1 0.1501 0.82477 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1084816 2 0.0806 0.85320 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008 0.000
#> SRR612551 2 0.1910 0.80313 0.000 0.892 0.000 0.108 0.000 0.000
#> SRR1358520 4 0.0790 0.73825 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1419476 5 0.3857 0.43381 0.000 0.000 0.468 0.000 0.532 0.000
#> SRR1456075 4 0.6378 0.16982 0.040 0.000 0.300 0.488 0.172 0.000
#> SRR1389474 2 0.0405 0.85189 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1367005 1 0.2121 0.81610 0.892 0.000 0.000 0.012 0.096 0.000
#> SRR1334419 1 0.4979 0.58846 0.640 0.000 0.000 0.224 0.136 0.000
#> SRR1417154 3 0.1141 0.81128 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1095985 6 0.0260 0.88573 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1325771 1 0.0865 0.83746 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1360420 3 0.0547 0.82694 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR660272 2 0.0837 0.84667 0.004 0.972 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR1332993 1 0.0692 0.83867 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1311833 2 0.1168 0.83232 0.000 0.956 0.000 0.028 0.016 0.000
#> SRR808044 1 0.5493 0.60090 0.632 0.000 0.000 0.024 0.160 0.184
#> SRR1076916 6 0.0000 0.88625 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356266 1 0.0260 0.84048 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1341983 2 0.3656 0.60537 0.000 0.728 0.000 0.256 0.004 0.012
#> SRR1456114 1 0.2218 0.81380 0.884 0.000 0.000 0.012 0.104 0.000
#> SRR1072948 3 0.0458 0.82855 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1472370 5 0.3360 0.76447 0.000 0.000 0.264 0.004 0.732 0.000
#> SRR1480176 1 0.1075 0.83492 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR613843 2 0.0632 0.85160 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.0291 0.84051 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1404555 3 0.3126 0.57697 0.000 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR659839 2 0.0363 0.84943 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR659533 2 0.0260 0.85264 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1362848 4 0.4059 0.54747 0.000 0.000 0.148 0.752 0.100 0.000
#> SRR1407492 3 0.0603 0.82841 0.000 0.016 0.980 0.000 0.004 0.000
#> SRR1455082 2 0.0717 0.85348 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008 0.000
#> SRR658362 2 0.3843 0.18514 0.000 0.548 0.000 0.452 0.000 0.000
#> SRR810921 2 0.0603 0.84658 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR662823 4 0.1814 0.74150 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.1141 0.81205 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR818232 1 0.1814 0.81186 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1454868 3 0.0520 0.83050 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008 0.000
#> SRR1474816 2 0.1802 0.83122 0.000 0.916 0.000 0.072 0.012 0.000
#> SRR1342002 1 0.0363 0.83969 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1088437 4 0.3789 0.24107 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1466400 6 0.0291 0.88648 0.000 0.004 0.000 0.000 0.004 0.992
#> SRR658921 6 0.0000 0.88625 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0632 0.85112 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.2118 0.81451 0.888 0.000 0.000 0.008 0.104 0.000
#> SRR1090145 1 0.3482 0.57820 0.684 0.000 0.000 0.000 0.316 0.000
#> SRR1379324 1 0.2600 0.80324 0.860 0.000 0.000 0.008 0.124 0.008
#> SRR1345307 2 0.0458 0.84808 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1396166 3 0.0458 0.82827 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1086280 3 0.1910 0.75910 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1454891 2 0.0405 0.85257 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR663185 4 0.1327 0.74700 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000 0.000
#> SRR811819 1 0.1204 0.83255 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1318920 6 0.0146 0.88567 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR656758 2 0.0632 0.85142 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0865 0.83746 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR660450 2 0.3481 0.63885 0.000 0.776 0.000 0.032 0.000 0.192
#> SRR1472687 2 0.3756 0.33196 0.000 0.600 0.000 0.400 0.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.1418 0.82601 0.000 0.944 0.000 0.032 0.024 0.000
#> SRR1415153 2 0.1245 0.82944 0.000 0.952 0.000 0.032 0.016 0.000
#> SRR1323271 4 0.0865 0.74008 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.1267 0.83577 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1443161 4 0.4980 0.51788 0.000 0.000 0.116 0.712 0.128 0.044
#> SRR614695 6 0.0363 0.88519 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1092372 6 0.0000 0.88625 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474577 1 0.3806 0.74352 0.776 0.000 0.000 0.088 0.136 0.000
#> SRR1406582 1 0.2450 0.80547 0.868 0.000 0.000 0.016 0.116 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.85180 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.2709 0.79521 0.848 0.000 0.000 0.020 0.132 0.000
#> SRR1354071 5 0.2968 0.65159 0.168 0.000 0.016 0.000 0.816 0.000
#> SRR1105463 5 0.3243 0.62045 0.208 0.000 0.008 0.000 0.780 0.004
#> SRR811005 2 0.0717 0.85329 0.000 0.976 0.000 0.016 0.008 0.000
#> SRR1385319 1 0.2384 0.81009 0.888 0.000 0.000 0.000 0.064 0.048
#> SRR1325871 3 0.0508 0.83025 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR1355415 5 0.4132 0.71701 0.020 0.000 0.108 0.000 0.776 0.096
#> SRR1090861 1 0.0713 0.83880 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1320712 4 0.4075 0.52684 0.000 0.000 0.184 0.740 0.076 0.000
#> SRR1470075 1 0.4614 0.63532 0.684 0.000 0.000 0.208 0.108 0.000
#> SRR1091254 1 0.0458 0.84006 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1101397 4 0.5659 -0.16108 0.420 0.000 0.000 0.428 0.152 0.000
#> SRR1321165 6 0.0146 0.88624 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1092112 3 0.4407 0.08707 0.000 0.000 0.496 0.000 0.024 0.480
#> SRR1417588 3 0.0000 0.83154 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 1 0.3983 0.64910 0.736 0.208 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1432106 4 0.1204 0.74685 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0260 0.85264 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.5672 0.52315 0.588 0.000 0.000 0.224 0.172 0.016
#> SRR1318582 2 0.0603 0.84656 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR1080484 4 0.1204 0.74582 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR1072749 1 0.0405 0.84054 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1078586 1 0.1075 0.83545 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1400333 6 0.2048 0.77724 0.000 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1078834 2 0.4389 0.23090 0.000 0.596 0.000 0.032 0.000 0.372
#> SRR1417611 4 0.0790 0.73825 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1396840 6 0.0000 0.88625 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465440 2 0.3823 0.23549 0.000 0.564 0.000 0.436 0.000 0.000
#> SRR1400530 4 0.4097 0.00100 0.000 0.488 0.000 0.504 0.008 0.000
#> SRR614984 3 0.3961 0.49553 0.000 0.276 0.700 0.016 0.008 0.000
#> SRR1324269 1 0.1267 0.83150 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1401491 2 0.5420 0.00618 0.000 0.456 0.000 0.428 0.000 0.116
#> SRR1319443 1 0.2135 0.79369 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1324349 4 0.5864 0.53682 0.084 0.048 0.000 0.668 0.156 0.044
#> SRR1345523 2 0.1765 0.81287 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.2389 0.80449 0.864 0.000 0.000 0.008 0.128 0.000
#> SRR661505 5 0.3351 0.74755 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712 0.000
#> SRR1419062 5 0.2793 0.77050 0.000 0.000 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1480131 1 0.3756 0.39759 0.600 0.000 0.000 0.000 0.400 0.000
#> SRR1421284 4 0.0935 0.73672 0.000 0.032 0.000 0.964 0.004 0.000
#> SRR1329624 1 0.0865 0.83746 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1315739 3 0.1141 0.81054 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1099189 2 0.1444 0.83045 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.1957 0.80399 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1091890 3 0.0547 0.82998 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1347436 2 0.1245 0.83012 0.000 0.952 0.000 0.032 0.016 0.000
#> SRR1327473 1 0.3103 0.77817 0.836 0.000 0.000 0.064 0.100 0.000
#> SRR1338195 3 0.0000 0.83154 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0777 0.85194 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004 0.000
#> SRR1457792 1 0.1285 0.83243 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052 0.000
#> SRR658271 2 0.0632 0.85194 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.2752 0.80887 0.864 0.000 0.000 0.012 0.104 0.020
#> SRR1454842 3 0.0363 0.83054 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1322643 1 0.2999 0.78974 0.836 0.000 0.000 0.040 0.124 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.83154 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354620 5 0.3616 0.70387 0.132 0.000 0.076 0.000 0.792 0.000
#> SRR615056 4 0.2300 0.71767 0.000 0.144 0.000 0.856 0.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.6324 0.29482 0.532 0.036 0.184 0.004 0.244 0.000
#> SRR1391529 1 0.2527 0.75973 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR663052 2 0.4671 0.47423 0.000 0.640 0.060 0.296 0.004 0.000
#> SRR1478834 1 0.1957 0.80387 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR812366 2 0.4218 0.22863 0.000 0.556 0.000 0.428 0.000 0.016
#> SRR1435330 3 0.0000 0.83154 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0146 0.85265 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1389157 3 0.1320 0.81305 0.000 0.036 0.948 0.016 0.000 0.000
#> SRR613568 2 0.2513 0.81393 0.008 0.896 0.000 0.020 0.016 0.060
#> SRR614095 2 0.3823 0.23549 0.000 0.564 0.000 0.436 0.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.1444 0.82652 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1337155 6 0.2664 0.74673 0.000 0.000 0.000 0.000 0.184 0.816
#> SRR1475345 2 0.3867 0.05767 0.000 0.512 0.000 0.488 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0260 0.85264 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1446180 6 0.0146 0.88624 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1406372 4 0.4264 -0.00867 0.000 0.488 0.000 0.496 0.000 0.016
#> SRR1339880 3 0.3860 0.62980 0.000 0.000 0.764 0.164 0.072 0.000
#> SRR1353136 3 0.3975 0.32414 0.000 0.000 0.600 0.392 0.008 0.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.83154 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.1556 0.82336 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.4657 0.64898 0.688 0.000 0.000 0.176 0.136 0.000
#> SRR1363926 4 0.2006 0.73893 0.000 0.104 0.000 0.892 0.004 0.000
#> SRR1399861 4 0.2212 0.65521 0.000 0.000 0.112 0.880 0.008 0.000
#> SRR1338789 6 0.6341 0.35918 0.200 0.000 0.000 0.040 0.244 0.516
#> SRR1421420 3 0.2747 0.75175 0.000 0.000 0.860 0.044 0.096 0.000
#> SRR1420832 4 0.1444 0.74653 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0547 0.83905 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1352870 3 0.3825 0.55263 0.000 0.220 0.744 0.032 0.004 0.000
#> SRR1315041 4 0.0865 0.74008 0.000 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR661877 4 0.3797 0.24974 0.000 0.420 0.000 0.580 0.000 0.000
#> SRR1443268 1 0.5549 0.30674 0.484 0.000 0.000 0.376 0.140 0.000
#> SRR1416617 3 0.0790 0.82372 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1102443 1 0.2572 0.79735 0.852 0.000 0.000 0.012 0.136 0.000
#> SRR655672 2 0.1341 0.84531 0.000 0.948 0.028 0.024 0.000 0.000
#> SRR1420006 3 0.1141 0.81007 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1458267 2 0.1245 0.82944 0.000 0.952 0.000 0.032 0.016 0.000
#> SRR613819 4 0.1204 0.74582 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR1469432 4 0.3668 0.46003 0.000 0.328 0.000 0.668 0.004 0.000
#> SRR660907 4 0.3867 0.01780 0.000 0.488 0.000 0.512 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.1257 0.83083 0.000 0.952 0.000 0.028 0.020 0.000
#> SRR1470727 1 0.1124 0.83883 0.956 0.000 0.000 0.008 0.036 0.000
#> SRR1339153 3 0.0363 0.83054 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1472749 3 0.0458 0.83062 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1414379 4 0.1007 0.74267 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1431326 1 0.1812 0.82365 0.912 0.000 0.000 0.008 0.080 0.000
#> SRR1487278 6 0.0405 0.88608 0.000 0.008 0.000 0.000 0.004 0.988
#> SRR1098312 3 0.1245 0.81834 0.000 0.016 0.952 0.000 0.032 0.000
#> SRR810273 2 0.0146 0.85265 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0520 0.84829 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR614467 4 0.2243 0.73773 0.000 0.112 0.004 0.880 0.004 0.000
#> SRR811471 1 0.0632 0.83879 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.83154 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088606 6 0.0146 0.88624 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1479699 3 0.1196 0.82061 0.000 0.008 0.952 0.000 0.040 0.000
#> SRR1403589 2 0.1958 0.81011 0.000 0.896 0.000 0.100 0.004 0.000
#> SRR812625 6 0.2813 0.80006 0.000 0.092 0.000 0.008 0.036 0.864
#> SRR1359803 1 0.1563 0.83097 0.932 0.000 0.000 0.000 0.056 0.012
#> SRR1338988 2 0.3867 0.05882 0.000 0.512 0.000 0.488 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.4526 0.10136 0.000 0.512 0.000 0.456 0.000 0.032
#> SRR1378992 1 0.5492 0.31595 0.492 0.000 0.000 0.376 0.132 0.000
#> SRR659427 4 0.2414 0.68836 0.000 0.012 0.036 0.896 0.056 0.000
#> SRR1096638 1 0.1866 0.82209 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084 0.000
#> SRR1466619 6 0.2772 0.71388 0.000 0.004 0.000 0.180 0.000 0.816
#> SRR659307 3 0.1858 0.77727 0.000 0.076 0.912 0.012 0.000 0.000
#> SRR1439994 5 0.5802 -0.11606 0.400 0.000 0.000 0.108 0.472 0.020
#> SRR1454931 1 0.5035 0.45116 0.600 0.000 0.000 0.000 0.296 0.104
#> SRR1332928 4 0.4120 0.46249 0.024 0.000 0.008 0.692 0.276 0.000
#> SRR658621 4 0.1267 0.74648 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.1007 0.83599 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1458243 1 0.2909 0.78603 0.828 0.000 0.000 0.012 0.156 0.004
#> SRR1374270 4 0.2068 0.67778 0.000 0.008 0.080 0.904 0.008 0.000
#> SRR1470947 4 0.3862 0.06259 0.000 0.476 0.000 0.524 0.000 0.000
#> SRR1365598 6 0.0000 0.88625 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR662787 4 0.1814 0.74243 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000 0.000
#> SRR1408727 4 0.1268 0.74045 0.000 0.036 0.008 0.952 0.004 0.000
#> SRR1456274 1 0.4331 0.72963 0.744 0.000 0.036 0.028 0.188 0.004
#> SRR817744 1 0.1007 0.83618 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1478744 4 0.3868 0.00198 0.000 0.492 0.000 0.508 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.1863 0.80700 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000 0.000
#> SRR1102680 5 0.3797 0.53472 0.000 0.000 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR1374198 6 0.2738 0.69172 0.176 0.000 0.000 0.000 0.004 0.820
#> SRR1445856 6 0.2706 0.80156 0.036 0.000 0.000 0.000 0.104 0.860
#> SRR820049 3 0.0865 0.82552 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1375290 3 0.0891 0.82618 0.000 0.008 0.968 0.024 0.000 0.000
#> SRR818999 1 0.4045 0.29304 0.564 0.000 0.008 0.000 0.428 0.000
#> SRR1390242 1 0.0937 0.83688 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1401164 6 0.0713 0.87767 0.000 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR1454629 5 0.3338 0.64055 0.172 0.000 0.008 0.000 0.800 0.020
#> SRR1332187 3 0.2006 0.76297 0.000 0.000 0.892 0.000 0.004 0.104
#> SRR603365 5 0.4175 0.41112 0.000 0.000 0.464 0.000 0.524 0.012
#> SRR657833 2 0.0865 0.85069 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.0547 0.85209 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1488017 1 0.0790 0.83813 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR612947 2 0.0291 0.85210 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1480384 1 0.0603 0.84091 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR1364761 2 0.1075 0.84292 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.4531 0.57103 0.004 0.000 0.712 0.112 0.172 0.000
#> SRR1441868 1 0.2404 0.80738 0.872 0.000 0.000 0.016 0.112 0.000
#> SRR1485380 5 0.3330 0.75149 0.000 0.000 0.284 0.000 0.716 0.000
#> SRR1073705 1 0.2949 0.78654 0.832 0.000 0.000 0.028 0.140 0.000
#> SRR615032 2 0.3797 0.28165 0.000 0.580 0.000 0.420 0.000 0.000
#> SRR1452356 4 0.1387 0.74728 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0260 0.85055 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1100346 2 0.1745 0.83046 0.000 0.920 0.012 0.068 0.000 0.000
#> SRR1332816 1 0.2446 0.80320 0.864 0.000 0.000 0.012 0.124 0.000
#> SRR612299 6 0.1152 0.86594 0.000 0.044 0.000 0.000 0.004 0.952
#> SRR1407386 1 0.1007 0.83599 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1418064 2 0.0858 0.84415 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028 0.000
#> SRR1309403 1 0.4891 0.53602 0.648 0.004 0.044 0.020 0.284 0.000
#> SRR1498395 2 0.1245 0.82944 0.000 0.952 0.000 0.032 0.016 0.000
#> SRR1079998 5 0.3816 0.77022 0.032 0.000 0.240 0.000 0.728 0.000
#> SRR1498885 4 0.1267 0.74668 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000 0.000
#> SRR1337215 6 0.0508 0.88439 0.000 0.012 0.000 0.000 0.004 0.984
#> SRR1414749 3 0.3446 0.37292 0.000 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1365963 1 0.7623 -0.16340 0.316 0.000 0.232 0.272 0.180 0.000
#> SRR1368030 4 0.1204 0.74665 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR1419760 2 0.5106 0.58705 0.160 0.716 0.024 0.032 0.068 0.000
#> SRR1381841 1 0.4301 0.36470 0.584 0.000 0.000 0.000 0.024 0.392
#> SRR821388 3 0.2805 0.69932 0.000 0.000 0.828 0.012 0.160 0.000
#> SRR657623 4 0.1204 0.74582 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0858 0.82729 0.000 0.000 0.968 0.004 0.028 0.000
#> SRR819583 5 0.3198 0.76664 0.000 0.000 0.260 0.000 0.740 0.000
#> SRR1096149 1 0.5487 0.42160 0.532 0.000 0.000 0.320 0.148 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.83154 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0458 0.84018 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR811333 3 0.2006 0.72747 0.104 0.000 0.892 0.000 0.004 0.000
#> SRR1311666 2 0.0603 0.84658 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR1486698 2 0.3840 0.49084 0.000 0.696 0.000 0.008 0.008 0.288
#> SRR1446436 2 0.1245 0.82944 0.000 0.952 0.000 0.032 0.016 0.000
#> SRR815092 1 0.1141 0.83381 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1500149 2 0.1245 0.84775 0.000 0.952 0.000 0.016 0.000 0.032
#> SRR1100564 1 0.1007 0.83599 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1403072 3 0.3390 0.41624 0.000 0.000 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR811653 4 0.3711 0.46352 0.000 0.000 0.260 0.720 0.020 0.000
#> SRR1311348 2 0.0725 0.85267 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012 0.000
#> SRR1489438 4 0.1411 0.74724 0.000 0.060 0.000 0.936 0.004 0.000
#> SRR1435442 6 0.1668 0.85027 0.000 0.060 0.000 0.004 0.008 0.928
#> SRR1421444 3 0.0000 0.83154 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.3789 0.29229 0.000 0.584 0.000 0.416 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.1700 0.82444 0.916 0.000 0.000 0.004 0.080 0.000
#> SRR1444763 6 0.0260 0.88508 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1415026 2 0.3851 0.15813 0.000 0.540 0.000 0.460 0.000 0.000
#> SRR1416596 4 0.2282 0.70648 0.000 0.024 0.000 0.888 0.000 0.088
#> SRR1485499 4 0.3838 0.15553 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.3868 0.02945 0.000 0.504 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR663465 4 0.1663 0.74444 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000 0.000
#> SRR1310094 4 0.0937 0.74149 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0865 0.84761 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.1753 0.82312 0.912 0.000 0.000 0.004 0.084 0.000
#> SRR1453950 1 0.0291 0.84008 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1087875 1 0.2790 0.79378 0.844 0.000 0.000 0.024 0.132 0.000
#> SRR613318 3 0.0820 0.82754 0.000 0.000 0.972 0.016 0.012 0.000
#> SRR1332694 1 0.0937 0.83688 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1468469 3 0.1714 0.77994 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR818670 2 0.0458 0.84808 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1120318 1 0.1863 0.80931 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1311622 4 0.5548 -0.02579 0.000 0.000 0.400 0.464 0.136 0.000
#> SRR1500931 5 0.3215 0.77216 0.000 0.000 0.240 0.000 0.756 0.004
#> SRR1387494 3 0.0937 0.82332 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1379175 4 0.1148 0.72614 0.000 0.016 0.020 0.960 0.004 0.000
#> SRR1401909 5 0.3266 0.46213 0.000 0.000 0.000 0.000 0.728 0.272
#> SRR1440541 2 0.4565 0.20927 0.000 0.532 0.000 0.432 0.036 0.000
#> SRR1068832 5 0.3126 0.77055 0.000 0.000 0.248 0.000 0.752 0.000
#> SRR1376640 2 0.1492 0.84458 0.000 0.940 0.000 0.024 0.000 0.036
#> SRR1085712 2 0.3221 0.60895 0.000 0.736 0.000 0.264 0.000 0.000
#> SRR1082283 6 0.2537 0.79110 0.096 0.000 0.000 0.000 0.032 0.872
#> SRR1084276 1 0.3737 0.41532 0.608 0.000 0.000 0.000 0.392 0.000
#> SRR1353262 4 0.6093 0.21296 0.000 0.316 0.000 0.388 0.000 0.296
#> SRR1437035 5 0.3445 0.54982 0.260 0.000 0.000 0.008 0.732 0.000
#> SRR1396877 1 0.2048 0.79824 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1443026 2 0.2597 0.73421 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0260 0.84030 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1436822 4 0.4487 0.45804 0.000 0.316 0.000 0.644 0.020 0.020
#> SRR1101128 5 0.3371 0.74397 0.000 0.000 0.292 0.000 0.708 0.000
#> SRR1363886 4 0.3838 0.15787 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.3531 0.49037 0.000 0.672 0.000 0.328 0.000 0.000
#> SRR1394366 6 0.1257 0.87238 0.000 0.028 0.000 0.020 0.000 0.952
#> SRR1093218 3 0.4603 0.23077 0.000 0.000 0.544 0.416 0.040 0.000
#> SRR1077090 5 0.4131 0.72382 0.000 0.000 0.272 0.000 0.688 0.040
#> SRR1327430 4 0.1152 0.74289 0.000 0.044 0.000 0.952 0.004 0.000
#> SRR1088958 1 0.2704 0.79297 0.844 0.000 0.000 0.016 0.140 0.000
#> SRR1486931 2 0.1245 0.82944 0.000 0.952 0.000 0.032 0.016 0.000
#> SRR1086820 1 0.2350 0.81718 0.888 0.000 0.000 0.000 0.076 0.036
#> SRR1383000 1 0.1333 0.83281 0.944 0.000 0.000 0.008 0.048 0.000
#> SRR1355705 2 0.1663 0.81897 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR614335 4 0.1663 0.74451 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000 0.000
#> SRR660534 2 0.0363 0.85307 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.1957 0.80026 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000 0.000
#> SRR1334265 4 0.1007 0.74358 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1456401 4 0.2964 0.65461 0.000 0.204 0.000 0.792 0.004 0.000
#> SRR1086393 1 0.1007 0.83502 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.83154 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093100 4 0.1755 0.72394 0.000 0.032 0.008 0.932 0.028 0.000
#> SRR1309382 1 0.1204 0.83255 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1089375 5 0.3197 0.64170 0.176 0.000 0.008 0.012 0.804 0.000
#> SRR1499482 2 0.0603 0.84656 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR614719 2 0.1257 0.84558 0.000 0.952 0.028 0.020 0.000 0.000
#> SRR1081473 5 0.4687 0.64496 0.000 0.000 0.336 0.060 0.604 0.000
#> SRR1087415 1 0.3254 0.77102 0.820 0.000 0.000 0.000 0.056 0.124
#> SRR1088217 6 0.3329 0.67685 0.004 0.000 0.004 0.000 0.236 0.756
#> SRR808496 4 0.2854 0.65270 0.000 0.208 0.000 0.792 0.000 0.000
#> SRR1336463 2 0.3961 0.21557 0.000 0.556 0.000 0.440 0.004 0.000
#> SRR612359 2 0.0993 0.84529 0.000 0.964 0.024 0.012 0.000 0.000
#> SRR1444412 1 0.3843 0.27143 0.548 0.000 0.000 0.000 0.452 0.000
#> SRR1074116 3 0.2378 0.70778 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.83154 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0260 0.85048 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR808914 1 0.1610 0.82092 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1349099 6 0.0405 0.88473 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1337886 2 0.1410 0.84522 0.000 0.944 0.000 0.044 0.004 0.008
#> SRR813632 1 0.0937 0.83745 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1101591 3 0.1863 0.76552 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1089713 5 0.3176 0.66592 0.156 0.000 0.032 0.000 0.812 0.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.83154 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 5 0.3445 0.76464 0.008 0.000 0.260 0.000 0.732 0.000
#> SRR1313831 1 0.1327 0.82973 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1315434 3 0.0260 0.83029 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR814747 4 0.1327 0.74722 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.1141 0.83381 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1367807 1 0.2868 0.79134 0.840 0.000 0.000 0.028 0.132 0.000
#> SRR1365791 6 0.2933 0.67877 0.000 0.000 0.200 0.000 0.004 0.796
#> SRR1081519 5 0.4089 0.40915 0.008 0.000 0.468 0.000 0.524 0.000
#> SRR614707 6 0.0146 0.88624 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1094027 1 0.0458 0.84003 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1489092 6 0.3566 0.75822 0.000 0.000 0.080 0.084 0.016 0.820
#> SRR1079502 5 0.4868 0.72051 0.004 0.000 0.220 0.112 0.664 0.000
#> SRR1457814 4 0.2980 0.58322 0.000 0.000 0.192 0.800 0.008 0.000
#> SRR1455127 4 0.3446 0.50362 0.000 0.308 0.000 0.692 0.000 0.000
#> SRR615081 6 0.0146 0.88624 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1327855 5 0.3330 0.75149 0.000 0.000 0.284 0.000 0.716 0.000
#> SRR1417873 4 0.1049 0.73514 0.000 0.032 0.000 0.960 0.008 0.000
#> SRR1394125 3 0.3371 0.43788 0.000 0.000 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR1488388 1 0.1411 0.83031 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060 0.000
#> SRR1401122 4 0.1007 0.74321 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR612383 3 0.3584 0.46730 0.000 0.308 0.688 0.000 0.004 0.000
#> SRR1477711 1 0.1204 0.83309 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1350813 2 0.0603 0.84656 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR612851 2 0.0260 0.85228 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.0458 0.84000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR812837 2 0.3695 0.39023 0.000 0.624 0.000 0.376 0.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.1245 0.81841 0.000 0.000 0.952 0.032 0.016 0.000
#> SRR1475885 6 0.0146 0.88567 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1376334 1 0.1556 0.82286 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1399821 1 0.5890 0.26719 0.488 0.000 0.000 0.016 0.136 0.360
#> SRR1347042 3 0.0000 0.83154 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612323 3 0.1080 0.81828 0.000 0.032 0.960 0.004 0.004 0.000
#> SRR612604 6 0.1075 0.86358 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1389546 2 0.0458 0.85259 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0363 0.84033 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1465608 4 0.5961 -0.06242 0.380 0.000 0.004 0.448 0.164 0.004
#> SRR1101808 2 0.0260 0.85048 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.83154 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.2222 0.82730 0.024 0.916 0.000 0.028 0.024 0.008
#> SRR1078439 6 0.4791 0.05273 0.000 0.000 0.436 0.000 0.052 0.512
#> SRR2165527 4 0.2730 0.67179 0.000 0.192 0.000 0.808 0.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.4260 0.65668 0.720 0.024 0.000 0.028 0.228 0.000
#> SRR1313536 2 0.3979 0.58987 0.000 0.708 0.000 0.256 0.000 0.036
#> SRR1070308 1 0.6727 0.27448 0.504 0.272 0.096 0.004 0.124 0.000
#> SRR1403110 1 0.1765 0.81450 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1400355 2 0.0692 0.84614 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1401317 5 0.3266 0.76031 0.000 0.000 0.272 0.000 0.728 0.000
#> SRR1456862 6 0.3030 0.77082 0.056 0.000 0.000 0.004 0.092 0.848
#> SRR1074622 1 0.1349 0.83149 0.940 0.000 0.000 0.004 0.056 0.000
#> SRR1465847 3 0.1176 0.81909 0.020 0.000 0.956 0.000 0.024 0.000
#> SRR1443376 2 0.0820 0.85301 0.000 0.972 0.000 0.016 0.012 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.83154 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0865 0.83746 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1090881 3 0.4253 0.45952 0.000 0.296 0.668 0.032 0.004 0.000
#> SRR612251 4 0.3371 0.53310 0.000 0.292 0.000 0.708 0.000 0.000
#> SRR1418581 1 0.1802 0.82516 0.916 0.000 0.000 0.012 0.072 0.000
#> SRR658045 2 0.0405 0.85257 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR613214 3 0.3858 0.53386 0.000 0.248 0.724 0.004 0.024 0.000
#> SRR613078 6 0.3192 0.65762 0.000 0.216 0.000 0.004 0.004 0.776
#> SRR1472998 1 0.4253 0.16153 0.524 0.000 0.460 0.000 0.016 0.000
#> SRR1433452 2 0.0806 0.85387 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008 0.000
#> SRR1101957 1 0.0603 0.83933 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR1487993 3 0.3054 0.69679 0.000 0.000 0.828 0.136 0.036 0.000
#> SRR1465983 2 0.0405 0.85257 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1380375 1 0.1075 0.83492 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1367566 3 0.1141 0.81339 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1316151 6 0.0363 0.88369 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1417547 4 0.1204 0.74582 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0713 0.85028 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.1124 0.84514 0.000 0.956 0.000 0.008 0.000 0.036
#> SRR1398207 1 0.3774 0.52201 0.664 0.000 0.008 0.000 0.328 0.000
#> SRR1358755 5 0.3869 0.74350 0.100 0.000 0.128 0.000 0.772 0.000
#> SRR1078903 2 0.0508 0.84788 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004 0.000
#> SRR1323252 2 0.0935 0.85029 0.000 0.964 0.000 0.032 0.004 0.000
#> SRR1451796 2 0.0713 0.85037 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.1674 0.82829 0.924 0.000 0.000 0.004 0.068 0.004
#> SRR615982 2 0.0363 0.85282 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.3482 0.51417 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000 0.000
#> SRR1429825 4 0.2985 0.72740 0.000 0.116 0.000 0.844 0.004 0.036
#> SRR1102393 2 0.0777 0.85252 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004 0.000
#> SRR1071313 4 0.4582 0.45416 0.184 0.000 0.004 0.704 0.108 0.000
#> SRR808351 1 0.0713 0.83806 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1317513 1 0.1007 0.83599 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1480501 5 0.4992 0.69427 0.000 0.000 0.260 0.116 0.624 0.000
#> SRR1081910 1 0.3766 0.63290 0.748 0.000 0.212 0.000 0.040 0.000
#> SRR1086611 6 0.0909 0.87971 0.000 0.020 0.000 0.012 0.000 0.968
#> SRR1392571 2 0.0858 0.83885 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004 0.000
#> SRR1311441 1 0.2301 0.81355 0.884 0.000 0.000 0.020 0.096 0.000
#> SRR808152 1 0.0858 0.83750 0.968 0.000 0.000 0.004 0.028 0.000
#> SRR657313 3 0.3929 0.43592 0.000 0.000 0.700 0.028 0.272 0.000
#> SRR1433131 6 0.4284 0.09371 0.000 0.440 0.000 0.012 0.004 0.544
#> SRR1321011 2 0.2631 0.72923 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000 0.000
#> SRR1500598 4 0.3727 0.32536 0.000 0.388 0.000 0.612 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0725 0.84444 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012 0.000
#> SRR1389108 1 0.2983 0.78695 0.832 0.000 0.000 0.032 0.136 0.000
#> SRR1376228 3 0.2340 0.71052 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1399757 1 0.0937 0.83707 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1358060 3 0.1267 0.80498 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1464517 4 0.5535 -0.11678 0.000 0.000 0.432 0.436 0.132 0.000
#> SRR613557 3 0.2773 0.67566 0.000 0.152 0.836 0.008 0.004 0.000
#> SRR809831 1 0.1765 0.81432 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.83154 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0363 0.83984 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1071644 1 0.0260 0.83991 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1406936 4 0.6044 -0.26174 0.004 0.000 0.216 0.432 0.348 0.000
#> SRR1072031 2 0.1007 0.84476 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.2724 0.79111 0.000 0.864 0.084 0.052 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.612 0.846 0.925 0.3649 0.647 0.647
#> 3 3 0.588 0.756 0.884 0.1528 0.956 0.933
#> 4 4 0.471 0.674 0.828 0.2169 0.884 0.811
#> 5 5 0.467 0.624 0.793 0.0919 0.982 0.964
#> 6 6 0.492 0.497 0.757 0.1164 0.912 0.822
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 2 0.9909 0.1560 0.444 0.556
#> SRR1404105 2 0.4161 0.8749 0.084 0.916
#> SRR2164936 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1472057 1 0.3879 0.8889 0.924 0.076
#> SRR614491 2 0.8909 0.5514 0.308 0.692
#> SRR1069376 2 0.0672 0.9271 0.008 0.992
#> SRR811964 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1345715 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1328073 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1394209 2 0.6438 0.7908 0.164 0.836
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.8144 0.7555 0.748 0.252
#> SRR1500555 2 0.6343 0.7941 0.160 0.840
#> SRR1354363 2 0.9866 0.1642 0.432 0.568
#> SRR1391619 1 0.3733 0.8896 0.928 0.072
#> SRR1307997 2 0.0672 0.9270 0.008 0.992
#> SRR663124 2 0.6438 0.7862 0.164 0.836
#> SRR1334670 2 0.0938 0.9253 0.012 0.988
#> SRR612515 2 0.6438 0.7862 0.164 0.836
#> SRR1092727 2 0.4562 0.8607 0.096 0.904
#> SRR1364013 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.2043 0.8814 0.968 0.032
#> SRR1403980 1 0.4161 0.8788 0.916 0.084
#> SRR1420169 1 0.5946 0.8628 0.856 0.144
#> SRR1442800 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1499849 2 0.9922 0.1137 0.448 0.552
#> SRR1500030 1 0.0376 0.8701 0.996 0.004
#> SRR1093053 2 0.9909 0.1331 0.444 0.556
#> SRR1399843 2 0.9044 0.5199 0.320 0.680
#> SRR1380231 1 0.7376 0.8138 0.792 0.208
#> SRR809470 1 0.6887 0.8326 0.816 0.184
#> SRR614239 2 0.6438 0.7862 0.164 0.836
#> SRR613939 2 0.0672 0.9270 0.008 0.992
#> SRR612971 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1471672 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.0376 0.8701 0.996 0.004
#> SRR1079023 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR813608 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1096736 2 0.8327 0.6335 0.264 0.736
#> SRR1478700 2 0.4562 0.8644 0.096 0.904
#> SRR1081543 1 0.6531 0.8382 0.832 0.168
#> SRR1384754 2 0.9815 0.2438 0.420 0.580
#> SRR612287 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1380317 2 0.6801 0.7694 0.180 0.820
#> SRR1315247 2 0.0376 0.9284 0.004 0.996
#> SRR1105344 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.4690 0.8568 0.100 0.900
#> SRR1480240 2 0.2778 0.9035 0.048 0.952
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.2236 0.9112 0.036 0.964
#> SRR1419476 1 0.4690 0.8843 0.900 0.100
#> SRR1456075 1 0.3733 0.8880 0.928 0.072
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1367005 2 0.2778 0.9015 0.048 0.952
#> SRR1334419 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1417154 1 0.4815 0.8757 0.896 0.104
#> SRR1095985 2 0.9896 0.1289 0.440 0.560
#> SRR1325771 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1360420 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1332993 2 0.6623 0.7755 0.172 0.828
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR808044 2 0.4562 0.8644 0.096 0.904
#> SRR1076916 1 0.9044 0.6517 0.680 0.320
#> SRR1356266 2 0.0938 0.9253 0.012 0.988
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.9933 0.3037 0.548 0.452
#> SRR1072948 1 0.0376 0.8701 0.996 0.004
#> SRR1472370 1 0.3879 0.8889 0.924 0.076
#> SRR1480176 2 0.4431 0.8667 0.092 0.908
#> SRR613843 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1469192 2 0.9248 0.4567 0.340 0.660
#> SRR1404555 1 0.3879 0.8835 0.924 0.076
#> SRR659839 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.8909 0.5514 0.308 0.692
#> SRR1362848 2 0.9552 0.3777 0.376 0.624
#> SRR1407492 2 0.6247 0.7948 0.156 0.844
#> SRR1455082 2 0.0672 0.9267 0.008 0.992
#> SRR658362 2 0.0672 0.9269 0.008 0.992
#> SRR810921 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1456375 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000
#> SRR818232 2 0.1414 0.9213 0.020 0.980
#> SRR1454868 2 0.9129 0.5049 0.328 0.672
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1342002 2 0.3879 0.8813 0.076 0.924
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1101373 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1090145 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1379324 2 0.0376 0.9281 0.004 0.996
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.1184 0.8760 0.984 0.016
#> SRR1086280 1 0.4431 0.8801 0.908 0.092
#> SRR1454891 2 0.4298 0.8682 0.088 0.912
#> SRR663185 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR811819 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1318920 2 0.0376 0.9281 0.004 0.996
#> SRR656758 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1474351 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1443161 2 0.9795 0.2354 0.416 0.584
#> SRR614695 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1092372 2 0.0376 0.9281 0.004 0.996
#> SRR1474577 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1406582 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR612779 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1089006 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1354071 2 0.4562 0.8581 0.096 0.904
#> SRR1105463 2 0.9000 0.5148 0.316 0.684
#> SRR811005 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1385319 2 0.5059 0.8449 0.112 0.888
#> SRR1325871 1 0.3274 0.8884 0.940 0.060
#> SRR1355415 1 0.4161 0.8875 0.916 0.084
#> SRR1090861 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1320712 2 0.8813 0.5636 0.300 0.700
#> SRR1470075 2 0.1633 0.9188 0.024 0.976
#> SRR1091254 2 0.0938 0.9254 0.012 0.988
#> SRR1101397 1 0.7950 0.7702 0.760 0.240
#> SRR1321165 2 0.0672 0.9269 0.008 0.992
#> SRR1092112 1 0.5519 0.8699 0.872 0.128
#> SRR1417588 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.9866 0.3662 0.568 0.432
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0938 0.9252 0.012 0.988
#> SRR1072749 1 0.3274 0.8878 0.940 0.060
#> SRR1078586 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1400333 2 0.1843 0.9171 0.028 0.972
#> SRR1078834 2 0.2236 0.9110 0.036 0.964
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1396840 2 0.0672 0.9269 0.008 0.992
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.6712 0.7719 0.176 0.824
#> SRR1324269 2 0.9909 0.1270 0.444 0.556
#> SRR1401491 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1319443 2 0.2778 0.9030 0.048 0.952
#> SRR1324349 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1500846 2 0.9866 0.1642 0.432 0.568
#> SRR661505 1 0.3879 0.8889 0.924 0.076
#> SRR1419062 1 0.7376 0.8138 0.792 0.208
#> SRR1480131 2 0.6438 0.7851 0.164 0.836
#> SRR1421284 2 0.1414 0.9209 0.020 0.980
#> SRR1329624 2 0.0938 0.9253 0.012 0.988
#> SRR1315739 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0938 0.9248 0.012 0.988
#> SRR1083286 2 0.2778 0.9035 0.048 0.952
#> SRR1091890 1 0.9775 0.3890 0.588 0.412
#> SRR1347436 2 0.0376 0.9281 0.004 0.996
#> SRR1327473 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1338195 1 0.0376 0.8701 0.996 0.004
#> SRR809698 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1457792 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.9775 0.4276 0.588 0.412
#> SRR1454842 1 0.9661 0.4810 0.608 0.392
#> SRR1322643 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR614887 1 0.2236 0.8830 0.964 0.036
#> SRR1354620 1 0.4298 0.8866 0.912 0.088
#> SRR615056 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1105320 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1391529 2 0.8443 0.6077 0.272 0.728
#> SRR663052 2 0.4562 0.8607 0.096 0.904
#> SRR1478834 2 0.5408 0.8319 0.124 0.876
#> SRR812366 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.1633 0.8792 0.976 0.024
#> SRR615383 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1389157 2 0.5946 0.8095 0.144 0.856
#> SRR613568 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.4939 0.8520 0.108 0.892
#> SRR1103092 2 0.2603 0.9056 0.044 0.956
#> SRR1337155 2 0.6531 0.7803 0.168 0.832
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1446180 2 0.0938 0.9252 0.012 0.988
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.1633 0.8792 0.976 0.024
#> SRR1353136 1 0.8386 0.7172 0.732 0.268
#> SRR1093906 1 0.0376 0.8701 0.996 0.004
#> SRR614035 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1351104 2 0.4022 0.8773 0.080 0.920
#> SRR1363926 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1399861 2 0.8207 0.6466 0.256 0.744
#> SRR1338789 2 0.1414 0.9211 0.020 0.980
#> SRR1421420 1 0.6247 0.8551 0.844 0.156
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1476231 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1352870 2 0.7376 0.7368 0.208 0.792
#> SRR1315041 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1443268 1 0.7950 0.7702 0.760 0.240
#> SRR1416617 1 0.4939 0.8740 0.892 0.108
#> SRR1102443 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR655672 2 0.6438 0.7862 0.164 0.836
#> SRR1420006 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.3733 0.8838 0.072 0.928
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1470727 1 0.9922 0.3131 0.552 0.448
#> SRR1339153 1 0.3879 0.8895 0.924 0.076
#> SRR1472749 1 0.6343 0.8478 0.840 0.160
#> SRR1414379 2 0.2236 0.9112 0.036 0.964
#> SRR1431326 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1487278 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1098312 2 0.9977 0.0286 0.472 0.528
#> SRR810273 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR811471 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1478341 1 0.0376 0.8701 0.996 0.004
#> SRR1088606 2 0.0672 0.9271 0.008 0.992
#> SRR1479699 2 0.9909 0.1509 0.444 0.556
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1359803 2 0.1633 0.9190 0.024 0.976
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1378992 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR659427 2 0.9087 0.5065 0.324 0.676
#> SRR1096638 2 0.1414 0.9214 0.020 0.980
#> SRR1466619 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.6712 0.7719 0.176 0.824
#> SRR1439994 1 0.4690 0.8827 0.900 0.100
#> SRR1454931 2 0.2948 0.8999 0.052 0.948
#> SRR1332928 1 0.6531 0.8468 0.832 0.168
#> SRR658621 2 0.3733 0.8838 0.072 0.928
#> SRR1095840 2 0.0672 0.9266 0.008 0.992
#> SRR1458243 1 0.7950 0.7702 0.760 0.240
#> SRR1374270 2 0.8443 0.6212 0.272 0.728
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1408727 2 0.1843 0.9158 0.028 0.972
#> SRR1456274 2 0.5059 0.8495 0.112 0.888
#> SRR817744 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.7299 0.8182 0.796 0.204
#> SRR1374198 2 0.0376 0.9281 0.004 0.996
#> SRR1445856 1 0.9775 0.4276 0.588 0.412
#> SRR820049 1 0.9393 0.5609 0.644 0.356
#> SRR1375290 2 0.8386 0.6317 0.268 0.732
#> SRR818999 1 0.8555 0.7149 0.720 0.280
#> SRR1390242 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1454629 2 0.3114 0.8979 0.056 0.944
#> SRR1332187 1 0.4022 0.8816 0.920 0.080
#> SRR603365 1 0.3879 0.8889 0.924 0.076
#> SRR657833 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.1843 0.9177 0.028 0.972
#> SRR1488017 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR612947 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1480384 2 0.9393 0.4149 0.356 0.644
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.1633 0.8792 0.976 0.024
#> SRR1441868 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1485380 1 0.3879 0.8889 0.924 0.076
#> SRR1073705 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.4690 0.8568 0.100 0.900
#> SRR1332816 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR612299 2 0.0672 0.9270 0.008 0.992
#> SRR1407386 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1309403 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.3879 0.8889 0.924 0.076
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1414749 1 0.1414 0.8769 0.980 0.020
#> SRR1365963 1 0.7056 0.8252 0.808 0.192
#> SRR1368030 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1419760 2 0.0672 0.9270 0.008 0.992
#> SRR1381841 2 0.3733 0.8835 0.072 0.928
#> SRR821388 2 0.9393 0.4328 0.356 0.644
#> SRR657623 2 0.2423 0.9080 0.040 0.960
#> SRR1094241 1 0.3879 0.8895 0.924 0.076
#> SRR819583 1 0.4161 0.8886 0.916 0.084
#> SRR1096149 1 0.9580 0.5158 0.620 0.380
#> SRR1342829 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000
#> SRR1353028 2 0.1184 0.9236 0.016 0.984
#> SRR811333 1 0.6887 0.8326 0.816 0.184
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR815092 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1100564 2 0.1184 0.9236 0.016 0.984
#> SRR1403072 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000
#> SRR811653 2 0.8207 0.6466 0.256 0.744
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.0672 0.8723 0.992 0.008
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1319520 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1444763 2 0.0672 0.9269 0.008 0.992
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1310094 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1486780 2 0.0672 0.9269 0.008 0.992
#> SRR1453950 2 0.2236 0.9113 0.036 0.964
#> SRR1087875 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR613318 2 0.9358 0.4471 0.352 0.648
#> SRR1332694 2 0.0938 0.9253 0.012 0.988
#> SRR1468469 1 0.0672 0.8723 0.992 0.008
#> SRR818670 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1120318 2 0.0672 0.9266 0.008 0.992
#> SRR1311622 1 0.3431 0.8875 0.936 0.064
#> SRR1500931 1 0.3114 0.8872 0.944 0.056
#> SRR1387494 1 0.8081 0.7542 0.752 0.248
#> SRR1379175 2 0.3274 0.8950 0.060 0.940
#> SRR1401909 1 0.3879 0.8889 0.924 0.076
#> SRR1440541 2 0.0376 0.9283 0.004 0.996
#> SRR1068832 1 0.3879 0.8889 0.924 0.076
#> SRR1376640 2 0.0672 0.9267 0.008 0.992
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1082283 2 0.4690 0.8613 0.100 0.900
#> SRR1084276 2 0.8763 0.5580 0.296 0.704
#> SRR1353262 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1437035 2 0.4562 0.8581 0.096 0.904
#> SRR1396877 2 0.9909 0.1270 0.444 0.556
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1417936 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1436822 2 0.0672 0.9269 0.008 0.992
#> SRR1101128 1 0.3879 0.8889 0.924 0.076
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1394366 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1093218 1 0.0672 0.8723 0.992 0.008
#> SRR1077090 1 0.3879 0.8889 0.924 0.076
#> SRR1327430 2 0.2043 0.9134 0.032 0.968
#> SRR1088958 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1086820 2 0.0376 0.9281 0.004 0.996
#> SRR1383000 2 0.9393 0.4149 0.356 0.644
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR660534 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1086393 2 0.9608 0.3290 0.384 0.616
#> SRR1351521 1 0.0376 0.8701 0.996 0.004
#> SRR1093100 2 0.1633 0.9185 0.024 0.976
#> SRR1309382 2 0.4298 0.8690 0.088 0.912
#> SRR1089375 2 0.7528 0.7137 0.216 0.784
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.6712 0.7719 0.176 0.824
#> SRR1081473 1 0.7219 0.8200 0.800 0.200
#> SRR1087415 2 0.0376 0.9281 0.004 0.996
#> SRR1088217 1 0.6438 0.8481 0.836 0.164
#> SRR808496 2 0.3274 0.8938 0.060 0.940
#> SRR1336463 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.4298 0.8682 0.088 0.912
#> SRR1444412 2 0.8763 0.5580 0.296 0.704
#> SRR1074116 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.0376 0.8701 0.996 0.004
#> SRR656095 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR808914 2 0.1414 0.9213 0.020 0.980
#> SRR1349099 2 0.0376 0.9281 0.004 0.996
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR813632 2 0.8813 0.5600 0.300 0.700
#> SRR1101591 1 0.1414 0.8774 0.980 0.020
#> SRR1089713 2 0.9358 0.4278 0.352 0.648
#> SRR1453127 1 0.0672 0.8721 0.992 0.008
#> SRR1498354 1 0.4431 0.8854 0.908 0.092
#> SRR1313831 2 0.0938 0.9253 0.012 0.988
#> SRR1315434 1 0.0376 0.8701 0.996 0.004
#> SRR814747 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1358539 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1367807 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1365791 1 0.8327 0.7429 0.736 0.264
#> SRR1081519 1 0.6712 0.8386 0.824 0.176
#> SRR614707 2 0.0672 0.9270 0.008 0.992
#> SRR1094027 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1489092 2 0.9686 0.2938 0.396 0.604
#> SRR1079502 1 0.7219 0.8200 0.800 0.200
#> SRR1457814 2 0.8207 0.6466 0.256 0.744
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.3879 0.8889 0.924 0.076
#> SRR1417873 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.6438 0.8440 0.836 0.164
#> SRR1488388 2 0.1184 0.9227 0.016 0.984
#> SRR1401122 2 0.1184 0.9231 0.016 0.984
#> SRR612383 2 0.6712 0.7719 0.176 0.824
#> SRR1477711 2 0.0938 0.9253 0.012 0.988
#> SRR1350813 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR612851 2 0.4022 0.8795 0.080 0.920
#> SRR1086349 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR812837 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1340010 2 0.9909 0.1560 0.444 0.556
#> SRR1475885 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1376334 2 0.0938 0.9253 0.012 0.988
#> SRR1399821 2 0.0376 0.9281 0.004 0.996
#> SRR1347042 1 0.0000 0.8673 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.6438 0.7862 0.164 0.836
#> SRR612604 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1311877 2 0.0938 0.9254 0.012 0.988
#> SRR1465608 1 0.8267 0.7414 0.740 0.260
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.1633 0.8792 0.976 0.024
#> SRR1331153 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1078439 2 0.9909 0.1331 0.444 0.556
#> SRR2165527 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1351147 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1403110 2 0.1843 0.9167 0.028 0.972
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.3879 0.8889 0.924 0.076
#> SRR1456862 2 0.6343 0.7933 0.160 0.840
#> SRR1074622 2 0.7453 0.7180 0.212 0.788
#> SRR1465847 1 0.6343 0.8504 0.840 0.160
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.6148 0.8510 0.848 0.152
#> SRR1075579 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1090881 2 0.4022 0.8785 0.080 0.920
#> SRR612251 2 0.8909 0.5514 0.308 0.692
#> SRR1418581 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.6712 0.7719 0.176 0.824
#> SRR613078 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.7528 0.8005 0.784 0.216
#> SRR1433452 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1101957 2 0.0938 0.9254 0.012 0.988
#> SRR1487993 1 0.1843 0.8805 0.972 0.028
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1380375 2 0.0938 0.9253 0.012 0.988
#> SRR1367566 1 0.4298 0.8805 0.912 0.088
#> SRR1316151 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.0938 0.9252 0.012 0.988
#> SRR659389 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.8081 0.7623 0.752 0.248
#> SRR1358755 1 0.6148 0.8562 0.848 0.152
#> SRR1078903 2 0.4298 0.8682 0.088 0.912
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1369172 2 0.0376 0.9281 0.004 0.996
#> SRR615982 2 0.0938 0.9252 0.012 0.988
#> SRR1480431 2 0.0938 0.9248 0.012 0.988
#> SRR1429825 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1071313 2 0.7674 0.7033 0.224 0.776
#> SRR808351 2 0.9286 0.4480 0.344 0.656
#> SRR1317513 2 0.0938 0.9253 0.012 0.988
#> SRR1480501 1 0.3431 0.8883 0.936 0.064
#> SRR1081910 1 0.6887 0.8326 0.816 0.184
#> SRR1086611 2 0.1184 0.9236 0.016 0.984
#> SRR1392571 2 0.0672 0.9270 0.008 0.992
#> SRR1311441 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR808152 2 0.1414 0.9214 0.020 0.980
#> SRR657313 1 0.3879 0.8896 0.924 0.076
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1389108 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1376228 1 0.0672 0.8718 0.992 0.008
#> SRR1399757 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1358060 1 0.1414 0.8769 0.980 0.020
#> SRR1464517 1 0.3879 0.8867 0.924 0.076
#> SRR613557 2 0.6801 0.7667 0.180 0.820
#> SRR809831 2 0.9850 0.1934 0.428 0.572
#> SRR1429387 1 0.0376 0.8701 0.996 0.004
#> SRR816565 2 0.0376 0.9282 0.004 0.996
#> SRR1071644 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1406936 1 0.6247 0.8551 0.844 0.156
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9291 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.6247 0.7948 0.156 0.844
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 2 0.8737 0.1944 0.124 0.536 0.340
#> SRR1404105 2 0.3192 0.8588 0.112 0.888 0.000
#> SRR2164936 2 0.0237 0.9188 0.004 0.996 0.000
#> SRR1472057 1 0.1989 0.5237 0.948 0.004 0.048
#> SRR614491 2 0.7902 0.5281 0.132 0.660 0.208
#> SRR1069376 2 0.1411 0.9118 0.036 0.964 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345715 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR1328073 2 0.0424 0.9181 0.008 0.992 0.000
#> SRR1394209 2 0.5174 0.7871 0.128 0.824 0.048
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.6062 0.5480 0.776 0.160 0.064
#> SRR1500555 2 0.5237 0.7853 0.120 0.824 0.056
#> SRR1354363 1 0.6500 0.1975 0.532 0.464 0.004
#> SRR1391619 3 0.6354 0.6606 0.196 0.056 0.748
#> SRR1307997 2 0.0592 0.9174 0.012 0.988 0.000
#> SRR663124 2 0.5677 0.7612 0.124 0.804 0.072
#> SRR1334670 2 0.1643 0.9073 0.044 0.956 0.000
#> SRR612515 2 0.5677 0.7612 0.124 0.804 0.072
#> SRR1092727 2 0.3967 0.8475 0.072 0.884 0.044
#> SRR1364013 2 0.0237 0.9186 0.004 0.996 0.000
#> SRR1468553 3 0.4744 0.7013 0.136 0.028 0.836
#> SRR1403980 3 0.8126 0.4316 0.356 0.080 0.564
#> SRR1420169 1 0.4087 0.5704 0.880 0.068 0.052
#> SRR1442800 2 0.0237 0.9187 0.004 0.996 0.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.7487 0.2001 0.500 0.464 0.036
#> SRR1500030 3 0.0892 0.6550 0.020 0.000 0.980
#> SRR1093053 2 0.9006 0.1269 0.304 0.536 0.160
#> SRR1399843 2 0.7769 0.5037 0.232 0.660 0.108
#> SRR1380231 1 0.8657 0.3592 0.592 0.164 0.244
#> SRR809470 1 0.6037 0.5622 0.788 0.100 0.112
#> SRR614239 2 0.5677 0.7612 0.124 0.804 0.072
#> SRR613939 2 0.0661 0.9181 0.008 0.988 0.004
#> SRR612971 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0892 0.6550 0.020 0.000 0.980
#> SRR1079023 2 0.1031 0.9148 0.024 0.976 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 2 0.7007 0.6429 0.100 0.724 0.176
#> SRR1478700 2 0.3851 0.8345 0.136 0.860 0.004
#> SRR1081543 3 0.5911 0.4879 0.060 0.156 0.784
#> SRR1384754 2 0.8395 0.2863 0.104 0.568 0.328
#> SRR612287 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.5473 0.7662 0.140 0.808 0.052
#> SRR1315247 2 0.0592 0.9180 0.012 0.988 0.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR658549 2 0.4058 0.8436 0.076 0.880 0.044
#> SRR1480240 2 0.2711 0.8789 0.088 0.912 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.1905 0.9033 0.028 0.956 0.016
#> SRR1419476 1 0.7806 0.1428 0.584 0.064 0.352
#> SRR1456075 1 0.7979 -0.0362 0.500 0.060 0.440
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 2 0.2959 0.8656 0.100 0.900 0.000
#> SRR1334419 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR1417154 3 0.8333 0.4093 0.328 0.100 0.572
#> SRR1095985 2 0.7901 -0.0962 0.440 0.504 0.056
#> SRR1325771 2 0.0892 0.9152 0.020 0.980 0.000
#> SRR1360420 3 0.4931 0.6777 0.232 0.000 0.768
#> SRR660272 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332993 2 0.5178 0.6626 0.256 0.744 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 2 0.3851 0.8345 0.136 0.860 0.004
#> SRR1076916 3 0.9825 -0.0407 0.268 0.308 0.424
#> SRR1356266 2 0.1529 0.9095 0.040 0.960 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.6318 0.3790 0.636 0.356 0.008
#> SRR1072948 3 0.5098 0.6716 0.248 0.000 0.752
#> SRR1472370 1 0.1753 0.5212 0.952 0.000 0.048
#> SRR1480176 2 0.3816 0.8206 0.148 0.852 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469192 2 0.6432 0.2066 0.428 0.568 0.004
#> SRR1404555 3 0.3780 0.6303 0.044 0.064 0.892
#> SRR659839 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.7902 0.5281 0.132 0.660 0.208
#> SRR1362848 2 0.8139 0.4154 0.108 0.616 0.276
#> SRR1407492 2 0.5497 0.7705 0.124 0.812 0.064
#> SRR1455082 2 0.0475 0.9178 0.004 0.992 0.004
#> SRR658362 2 0.0424 0.9181 0.008 0.992 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0237 0.9188 0.004 0.996 0.000
#> SRR1456375 3 0.5363 0.6533 0.276 0.000 0.724
#> SRR818232 2 0.2711 0.8751 0.088 0.912 0.000
#> SRR1454868 2 0.8042 0.4850 0.216 0.648 0.136
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342002 2 0.3192 0.8584 0.112 0.888 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101373 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR1090145 2 0.0237 0.9187 0.004 0.996 0.000
#> SRR1379324 2 0.1163 0.9139 0.028 0.972 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.4164 0.7025 0.144 0.008 0.848
#> SRR1086280 3 0.8447 0.2932 0.392 0.092 0.516
#> SRR1454891 2 0.3669 0.8583 0.064 0.896 0.040
#> SRR663185 2 0.0237 0.9188 0.004 0.996 0.000
#> SRR811819 2 0.1031 0.9148 0.024 0.976 0.000
#> SRR1318920 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 2 0.0892 0.9152 0.020 0.980 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0237 0.9186 0.004 0.996 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443161 2 0.8749 0.2106 0.300 0.560 0.140
#> SRR614695 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092372 2 0.1529 0.9073 0.040 0.960 0.000
#> SRR1474577 2 0.1289 0.9125 0.032 0.968 0.000
#> SRR1406582 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR612779 2 0.0424 0.9180 0.008 0.992 0.000
#> SRR1089006 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR1354071 2 0.3038 0.8529 0.104 0.896 0.000
#> SRR1105463 2 0.6753 0.2990 0.388 0.596 0.016
#> SRR811005 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 2 0.4605 0.7432 0.204 0.796 0.000
#> SRR1325871 3 0.6007 0.6751 0.184 0.048 0.768
#> SRR1355415 1 0.2173 0.5311 0.944 0.008 0.048
#> SRR1090861 2 0.0892 0.9152 0.020 0.980 0.000
#> SRR1320712 2 0.7548 0.5693 0.112 0.684 0.204
#> SRR1470075 2 0.1860 0.9040 0.052 0.948 0.000
#> SRR1091254 2 0.1529 0.9099 0.040 0.960 0.000
#> SRR1101397 1 0.4195 0.5715 0.852 0.136 0.012
#> SRR1321165 2 0.1753 0.9029 0.048 0.952 0.000
#> SRR1092112 1 0.7213 0.3592 0.668 0.060 0.272
#> SRR1417588 3 0.4887 0.6798 0.228 0.000 0.772
#> SRR1074790 2 0.0424 0.9181 0.008 0.992 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.6180 0.4030 0.660 0.332 0.008
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0829 0.9159 0.012 0.984 0.004
#> SRR1072749 1 0.6750 0.1674 0.640 0.024 0.336
#> SRR1078586 2 0.1031 0.9148 0.024 0.976 0.000
#> SRR1400333 2 0.1711 0.9062 0.032 0.960 0.008
#> SRR1078834 2 0.1711 0.9039 0.032 0.960 0.008
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396840 2 0.1753 0.9029 0.048 0.952 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR614984 2 0.5931 0.7467 0.124 0.792 0.084
#> SRR1324269 1 0.7489 0.1862 0.496 0.468 0.036
#> SRR1401491 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319443 2 0.3482 0.8387 0.128 0.872 0.000
#> SRR1324349 2 0.0237 0.9186 0.004 0.996 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.6500 0.1975 0.532 0.464 0.004
#> SRR661505 1 0.1753 0.5212 0.952 0.000 0.048
#> SRR1419062 1 0.8657 0.3592 0.592 0.164 0.244
#> SRR1480131 2 0.5178 0.6612 0.256 0.744 0.000
#> SRR1421284 2 0.1129 0.9127 0.020 0.976 0.004
#> SRR1329624 2 0.1411 0.9110 0.036 0.964 0.000
#> SRR1315739 3 0.4842 0.6819 0.224 0.000 0.776
#> SRR1099189 2 0.0661 0.9165 0.004 0.988 0.008
#> SRR1083286 2 0.2711 0.8789 0.088 0.912 0.000
#> SRR1091890 3 0.9357 -0.0389 0.168 0.392 0.440
#> SRR1347436 2 0.0424 0.9184 0.008 0.992 0.000
#> SRR1327473 2 0.0424 0.9181 0.008 0.992 0.000
#> SRR1338195 3 0.3340 0.6970 0.120 0.000 0.880
#> SRR809698 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.6018 0.4236 0.684 0.308 0.008
#> SRR1454842 3 0.9620 -0.0206 0.204 0.380 0.416
#> SRR1322643 2 0.1289 0.9125 0.032 0.968 0.000
#> SRR614887 3 0.5298 0.7003 0.164 0.032 0.804
#> SRR1354620 1 0.1878 0.5293 0.952 0.004 0.044
#> SRR615056 2 0.0237 0.9188 0.004 0.996 0.000
#> SRR1105320 2 0.0424 0.9181 0.008 0.992 0.000
#> SRR1391529 2 0.5948 0.4294 0.360 0.640 0.000
#> SRR663052 2 0.3967 0.8475 0.072 0.884 0.044
#> SRR1478834 2 0.4702 0.7288 0.212 0.788 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.4418 0.7028 0.132 0.020 0.848
#> SRR615383 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 2 0.5237 0.7850 0.120 0.824 0.056
#> SRR613568 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR614095 2 0.4290 0.8373 0.064 0.872 0.064
#> SRR1103092 2 0.3038 0.8628 0.104 0.896 0.000
#> SRR1337155 2 0.4802 0.7751 0.156 0.824 0.020
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 2 0.0892 0.9162 0.020 0.980 0.000
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.1919 0.6583 0.024 0.020 0.956
#> SRR1353136 3 0.9438 0.1393 0.252 0.244 0.504
#> SRR1093906 3 0.4796 0.6837 0.220 0.000 0.780
#> SRR614035 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351104 2 0.3412 0.8448 0.124 0.876 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399861 2 0.7147 0.6380 0.124 0.720 0.156
#> SRR1338789 2 0.1643 0.9075 0.044 0.956 0.000
#> SRR1421420 1 0.8891 0.1356 0.524 0.136 0.340
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476231 2 0.0892 0.9152 0.020 0.980 0.000
#> SRR1352870 2 0.6455 0.7101 0.128 0.764 0.108
#> SRR1315041 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0237 0.9188 0.004 0.996 0.000
#> SRR1443268 1 0.4195 0.5715 0.852 0.136 0.012
#> SRR1416617 3 0.8375 0.4032 0.324 0.104 0.572
#> SRR1102443 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR655672 2 0.5677 0.7612 0.124 0.804 0.072
#> SRR1420006 3 0.4931 0.6777 0.232 0.000 0.768
#> SRR1458267 2 0.0237 0.9186 0.004 0.996 0.000
#> SRR613819 2 0.3263 0.8731 0.048 0.912 0.040
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0424 0.9180 0.008 0.992 0.000
#> SRR1470727 1 0.7245 0.3723 0.596 0.368 0.036
#> SRR1339153 3 0.6542 0.6507 0.204 0.060 0.736
#> SRR1472749 3 0.7273 0.4296 0.132 0.156 0.712
#> SRR1414379 2 0.1905 0.9033 0.028 0.956 0.016
#> SRR1431326 2 0.1289 0.9125 0.032 0.968 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098312 2 0.9015 0.0844 0.144 0.508 0.348
#> SRR810273 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR614467 2 0.0237 0.9188 0.004 0.996 0.000
#> SRR811471 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR1478341 3 0.4796 0.6855 0.220 0.000 0.780
#> SRR1088606 2 0.1643 0.9055 0.044 0.956 0.000
#> SRR1479699 2 0.8771 0.1803 0.132 0.544 0.324
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0237 0.9186 0.004 0.996 0.000
#> SRR1359803 2 0.2959 0.8633 0.100 0.900 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378992 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR659427 2 0.7599 0.4834 0.260 0.656 0.084
#> SRR1096638 2 0.1753 0.9061 0.048 0.952 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR659307 2 0.5863 0.7518 0.120 0.796 0.084
#> SRR1439994 1 0.2773 0.5456 0.928 0.024 0.048
#> SRR1454931 2 0.3752 0.8218 0.144 0.856 0.000
#> SRR1332928 1 0.4628 0.5720 0.856 0.088 0.056
#> SRR658621 2 0.3263 0.8731 0.048 0.912 0.040
#> SRR1095840 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR1458243 1 0.4195 0.5715 0.852 0.136 0.012
#> SRR1374270 2 0.7424 0.6071 0.128 0.700 0.172
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR662787 2 0.0237 0.9188 0.004 0.996 0.000
#> SRR1408727 2 0.1711 0.9060 0.032 0.960 0.008
#> SRR1456274 2 0.3987 0.8432 0.108 0.872 0.020
#> SRR817744 2 0.0892 0.9152 0.020 0.980 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102680 1 0.8576 0.3726 0.600 0.160 0.240
#> SRR1374198 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR1445856 1 0.6018 0.4236 0.684 0.308 0.008
#> SRR820049 3 0.9544 0.0268 0.208 0.328 0.464
#> SRR1375290 2 0.7348 0.6072 0.176 0.704 0.120
#> SRR818999 1 0.6348 0.5269 0.752 0.188 0.060
#> SRR1390242 2 0.0892 0.9152 0.020 0.980 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454629 2 0.2959 0.8681 0.100 0.900 0.000
#> SRR1332187 3 0.5519 0.6446 0.120 0.068 0.812
#> SRR603365 1 0.1753 0.5212 0.952 0.000 0.048
#> SRR657833 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.1525 0.9091 0.032 0.964 0.004
#> SRR1488017 2 0.1031 0.9148 0.024 0.976 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 2 0.6460 0.1608 0.440 0.556 0.004
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.1919 0.6583 0.024 0.020 0.956
#> SRR1441868 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR1485380 1 0.1753 0.5212 0.952 0.000 0.048
#> SRR1073705 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0424 0.9184 0.008 0.992 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.4179 0.8402 0.072 0.876 0.052
#> SRR1332816 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR612299 2 0.0661 0.9181 0.008 0.988 0.004
#> SRR1407386 2 0.1031 0.9147 0.024 0.976 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 2 0.0424 0.9181 0.008 0.992 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 1 0.1753 0.5212 0.952 0.000 0.048
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337215 2 0.0237 0.9186 0.004 0.996 0.000
#> SRR1414749 3 0.6667 0.5319 0.368 0.016 0.616
#> SRR1365963 1 0.6299 0.5483 0.772 0.096 0.132
#> SRR1368030 2 0.0424 0.9184 0.008 0.992 0.000
#> SRR1419760 2 0.0592 0.9174 0.012 0.988 0.000
#> SRR1381841 2 0.3551 0.8356 0.132 0.868 0.000
#> SRR821388 2 0.8076 0.4559 0.116 0.632 0.252
#> SRR657623 2 0.1919 0.9019 0.024 0.956 0.020
#> SRR1094241 3 0.6722 0.6406 0.220 0.060 0.720
#> SRR819583 1 0.4489 0.5097 0.856 0.036 0.108
#> SRR1096149 1 0.6282 0.4061 0.664 0.324 0.012
#> SRR1342829 3 0.4974 0.6766 0.236 0.000 0.764
#> SRR1353028 2 0.1529 0.9101 0.040 0.960 0.000
#> SRR811333 1 0.6037 0.5622 0.788 0.100 0.112
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR815092 2 0.0892 0.9152 0.020 0.980 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100564 2 0.1411 0.9113 0.036 0.964 0.000
#> SRR1403072 3 0.5254 0.6664 0.264 0.000 0.736
#> SRR811653 2 0.7147 0.6380 0.124 0.720 0.156
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.4172 0.7009 0.156 0.004 0.840
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319520 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR1444763 2 0.1529 0.9080 0.040 0.960 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0237 0.9188 0.004 0.996 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 2 0.1411 0.9112 0.036 0.964 0.000
#> SRR1453950 2 0.2711 0.8776 0.088 0.912 0.000
#> SRR1087875 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR613318 2 0.8229 0.4304 0.124 0.620 0.256
#> SRR1332694 2 0.1643 0.9073 0.044 0.956 0.000
#> SRR1468469 3 0.3816 0.6982 0.148 0.000 0.852
#> SRR818670 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR1311622 1 0.7835 -0.0882 0.492 0.052 0.456
#> SRR1500931 1 0.2625 0.4903 0.916 0.000 0.084
#> SRR1387494 3 0.8528 0.2071 0.156 0.240 0.604
#> SRR1379175 2 0.3039 0.8812 0.044 0.920 0.036
#> SRR1401909 1 0.1753 0.5212 0.952 0.000 0.048
#> SRR1440541 2 0.0237 0.9190 0.004 0.996 0.000
#> SRR1068832 1 0.1753 0.5212 0.952 0.000 0.048
#> SRR1376640 2 0.0475 0.9178 0.004 0.992 0.004
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082283 2 0.4172 0.8127 0.156 0.840 0.004
#> SRR1084276 2 0.6451 0.3378 0.384 0.608 0.008
#> SRR1353262 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437035 2 0.3038 0.8529 0.104 0.896 0.000
#> SRR1396877 1 0.7489 0.1862 0.496 0.468 0.036
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417936 2 0.1031 0.9148 0.024 0.976 0.000
#> SRR1436822 2 0.0424 0.9181 0.008 0.992 0.000
#> SRR1101128 1 0.2066 0.5133 0.940 0.000 0.060
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0237 0.9188 0.004 0.996 0.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093218 3 0.3941 0.6982 0.156 0.000 0.844
#> SRR1077090 1 0.1753 0.5212 0.952 0.000 0.048
#> SRR1327430 2 0.1877 0.9041 0.032 0.956 0.012
#> SRR1088958 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086820 2 0.1031 0.9147 0.024 0.976 0.000
#> SRR1383000 2 0.6460 0.1608 0.440 0.556 0.004
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR614335 2 0.0237 0.9188 0.004 0.996 0.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0237 0.9186 0.004 0.996 0.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086393 2 0.6509 0.0347 0.472 0.524 0.004
#> SRR1351521 3 0.4346 0.6953 0.184 0.000 0.816
#> SRR1093100 2 0.1315 0.9107 0.020 0.972 0.008
#> SRR1309382 2 0.4291 0.7767 0.180 0.820 0.000
#> SRR1089375 2 0.5849 0.6726 0.216 0.756 0.028
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR614719 2 0.5863 0.7516 0.120 0.796 0.084
#> SRR1081473 1 0.9111 0.2512 0.532 0.176 0.292
#> SRR1087415 2 0.1031 0.9147 0.024 0.976 0.000
#> SRR1088217 1 0.4749 0.5775 0.852 0.076 0.072
#> SRR808496 2 0.2446 0.8888 0.052 0.936 0.012
#> SRR1336463 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR612359 2 0.3669 0.8583 0.064 0.896 0.040
#> SRR1444412 2 0.6451 0.3378 0.384 0.608 0.008
#> SRR1074116 3 0.5058 0.6745 0.244 0.000 0.756
#> SRR821846 3 0.4346 0.6953 0.184 0.000 0.816
#> SRR656095 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR808914 2 0.2711 0.8751 0.088 0.912 0.000
#> SRR1349099 2 0.1163 0.9141 0.028 0.972 0.000
#> SRR1337886 2 0.0237 0.9186 0.004 0.996 0.000
#> SRR813632 2 0.6659 0.5102 0.304 0.668 0.028
#> SRR1101591 1 0.5968 0.0210 0.636 0.000 0.364
#> SRR1089713 2 0.7775 0.3559 0.304 0.620 0.076
#> SRR1453127 3 0.4931 0.6903 0.212 0.004 0.784
#> SRR1498354 1 0.2063 0.5336 0.948 0.008 0.044
#> SRR1313831 2 0.1411 0.9114 0.036 0.964 0.000
#> SRR1315434 3 0.3482 0.6968 0.128 0.000 0.872
#> SRR814747 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358539 2 0.1031 0.9148 0.024 0.976 0.000
#> SRR1367807 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR1365791 3 0.9536 0.0946 0.252 0.260 0.488
#> SRR1081519 1 0.6529 0.5355 0.756 0.092 0.152
#> SRR614707 2 0.0661 0.9181 0.008 0.988 0.004
#> SRR1094027 2 0.1163 0.9141 0.028 0.972 0.000
#> SRR1489092 2 0.7885 0.2627 0.336 0.592 0.072
#> SRR1079502 1 0.9111 0.2512 0.532 0.176 0.292
#> SRR1457814 2 0.7147 0.6380 0.124 0.720 0.156
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327855 1 0.1753 0.5212 0.952 0.000 0.048
#> SRR1417873 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.9264 0.0822 0.412 0.156 0.432
#> SRR1488388 2 0.1753 0.9056 0.048 0.952 0.000
#> SRR1401122 2 0.0983 0.9142 0.016 0.980 0.004
#> SRR612383 2 0.5931 0.7467 0.124 0.792 0.084
#> SRR1477711 2 0.1411 0.9114 0.036 0.964 0.000
#> SRR1350813 2 0.0424 0.9180 0.008 0.992 0.000
#> SRR612851 2 0.3481 0.8679 0.052 0.904 0.044
#> SRR1086349 2 0.1031 0.9148 0.024 0.976 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340010 2 0.8737 0.1944 0.124 0.536 0.340
#> SRR1475885 2 0.0747 0.9176 0.016 0.984 0.000
#> SRR1376334 2 0.1643 0.9073 0.044 0.956 0.000
#> SRR1399821 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR1347042 3 0.4842 0.6819 0.224 0.000 0.776
#> SRR612323 2 0.5677 0.7612 0.124 0.804 0.072
#> SRR612604 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 2 0.1529 0.9097 0.040 0.960 0.000
#> SRR1465608 1 0.6027 0.5454 0.776 0.164 0.060
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.4418 0.7028 0.132 0.020 0.848
#> SRR1331153 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078439 2 0.9006 0.1269 0.304 0.536 0.160
#> SRR2165527 2 0.0237 0.9188 0.004 0.996 0.000
#> SRR1351147 2 0.0237 0.9187 0.004 0.996 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.0424 0.9181 0.008 0.992 0.000
#> SRR1403110 2 0.2066 0.8980 0.060 0.940 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 1 0.1753 0.5212 0.952 0.000 0.048
#> SRR1456862 2 0.5115 0.7038 0.228 0.768 0.004
#> SRR1074622 2 0.5529 0.5847 0.296 0.704 0.000
#> SRR1465847 1 0.5625 0.5564 0.808 0.076 0.116
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.5667 0.5157 0.060 0.140 0.800
#> SRR1075579 2 0.0892 0.9152 0.020 0.980 0.000
#> SRR1090881 2 0.3530 0.8662 0.068 0.900 0.032
#> SRR612251 2 0.7902 0.5281 0.132 0.660 0.208
#> SRR1418581 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 2 0.5931 0.7467 0.124 0.792 0.084
#> SRR613078 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472998 1 0.6309 0.5629 0.772 0.128 0.100
#> SRR1433452 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101957 2 0.1529 0.9097 0.040 0.960 0.000
#> SRR1487993 3 0.2056 0.6577 0.024 0.024 0.952
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 2 0.1643 0.9073 0.044 0.956 0.000
#> SRR1367566 3 0.6652 0.6333 0.172 0.084 0.744
#> SRR1316151 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417547 2 0.0661 0.9173 0.008 0.988 0.004
#> SRR659389 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398207 1 0.6119 0.5532 0.772 0.164 0.064
#> SRR1358755 1 0.3875 0.5759 0.888 0.068 0.044
#> SRR1078903 2 0.3669 0.8583 0.064 0.896 0.040
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 2 0.1031 0.9147 0.024 0.976 0.000
#> SRR615982 2 0.0892 0.9146 0.020 0.980 0.000
#> SRR1480431 2 0.0661 0.9165 0.004 0.988 0.008
#> SRR1429825 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 2 0.6318 0.6937 0.172 0.760 0.068
#> SRR808351 2 0.6442 0.1941 0.432 0.564 0.004
#> SRR1317513 2 0.1529 0.9095 0.040 0.960 0.000
#> SRR1480501 1 0.2682 0.5022 0.920 0.004 0.076
#> SRR1081910 1 0.6037 0.5622 0.788 0.100 0.112
#> SRR1086611 2 0.0892 0.9149 0.020 0.980 0.000
#> SRR1392571 2 0.0592 0.9174 0.012 0.988 0.000
#> SRR1311441 2 0.1289 0.9125 0.032 0.968 0.000
#> SRR808152 2 0.1753 0.9061 0.048 0.952 0.000
#> SRR657313 3 0.6806 0.6421 0.228 0.060 0.712
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 2 0.1163 0.9136 0.028 0.972 0.000
#> SRR1376228 3 0.6339 0.5524 0.360 0.008 0.632
#> SRR1399757 2 0.0892 0.9152 0.020 0.980 0.000
#> SRR1358060 3 0.6667 0.5319 0.368 0.016 0.616
#> SRR1464517 3 0.6295 0.5648 0.164 0.072 0.764
#> SRR613557 2 0.6023 0.7414 0.120 0.788 0.092
#> SRR809831 2 0.7396 -0.1220 0.480 0.488 0.032
#> SRR1429387 3 0.4796 0.6837 0.220 0.000 0.780
#> SRR816565 2 0.1031 0.9148 0.024 0.976 0.000
#> SRR1071644 2 0.0892 0.9152 0.020 0.980 0.000
#> SRR1406936 1 0.8891 0.1356 0.524 0.136 0.340
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9192 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.5497 0.7705 0.124 0.812 0.064
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 4 0.5213 0.49398 0.000 0.224 0.052 0.724
#> SRR1404105 2 0.4724 0.73320 0.096 0.792 0.000 0.112
#> SRR2164936 2 0.0592 0.85632 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1472057 1 0.2021 0.57635 0.936 0.000 0.040 0.024
#> SRR614491 4 0.4875 0.61045 0.004 0.296 0.008 0.692
#> SRR1069376 2 0.3286 0.82080 0.044 0.876 0.000 0.080
#> SRR811964 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0188 0.86089 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1345715 2 0.2996 0.82763 0.044 0.892 0.000 0.064
#> SRR1328073 2 0.2214 0.84988 0.028 0.928 0.000 0.044
#> SRR1394209 2 0.5742 0.13912 0.052 0.648 0.000 0.300
#> SRR1474018 2 0.0188 0.86085 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1099809 1 0.6866 0.59403 0.688 0.108 0.068 0.136
#> SRR1500555 2 0.5942 -0.26187 0.040 0.548 0.000 0.412
#> SRR1354363 1 0.7201 0.08584 0.496 0.356 0.000 0.148
#> SRR1391619 3 0.4924 0.76901 0.016 0.016 0.748 0.220
#> SRR1307997 2 0.1118 0.84674 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR663124 4 0.5147 0.59818 0.004 0.460 0.000 0.536
#> SRR1334670 2 0.3542 0.81183 0.060 0.864 0.000 0.076
#> SRR612515 4 0.5147 0.59818 0.004 0.460 0.000 0.536
#> SRR1092727 2 0.4800 0.16224 0.004 0.656 0.000 0.340
#> SRR1364013 2 0.0592 0.85721 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1468553 3 0.4328 0.79326 0.000 0.008 0.748 0.244
#> SRR1403980 3 0.7726 0.50659 0.184 0.012 0.504 0.300
#> SRR1420169 1 0.4071 0.61174 0.852 0.028 0.036 0.084
#> SRR1442800 2 0.1936 0.85343 0.028 0.940 0.000 0.032
#> SRR1359214 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.7959 0.07535 0.464 0.356 0.024 0.156
#> SRR1500030 3 0.4804 0.74030 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1093053 4 0.8641 0.49660 0.172 0.304 0.064 0.460
#> SRR1399843 4 0.7725 0.56886 0.112 0.420 0.028 0.440
#> SRR1380231 1 0.8692 0.42116 0.508 0.100 0.156 0.236
#> SRR809470 1 0.6675 0.59194 0.696 0.052 0.108 0.144
#> SRR614239 4 0.5147 0.59818 0.004 0.460 0.000 0.536
#> SRR613939 2 0.2542 0.80861 0.012 0.904 0.000 0.084
#> SRR612971 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0469 0.85820 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR811357 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 2 0.2996 0.82763 0.044 0.892 0.000 0.064
#> SRR613006 2 0.0336 0.86122 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.4843 0.73542 0.000 0.000 0.604 0.396
#> SRR1079023 2 0.3004 0.82840 0.048 0.892 0.000 0.060
#> SRR813608 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 4 0.5882 0.57302 0.016 0.436 0.012 0.536
#> SRR1478700 2 0.4956 0.70665 0.108 0.776 0.000 0.116
#> SRR1081543 4 0.6365 -0.56807 0.004 0.052 0.440 0.504
#> SRR1384754 4 0.5235 0.51563 0.000 0.236 0.048 0.716
#> SRR612287 2 0.0469 0.85849 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1380317 2 0.5973 -0.05218 0.056 0.612 0.000 0.332
#> SRR1315247 2 0.1624 0.85332 0.020 0.952 0.000 0.028
#> SRR1105344 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658549 2 0.4872 0.08974 0.004 0.640 0.000 0.356
#> SRR1480240 2 0.4359 0.76214 0.100 0.816 0.000 0.084
#> SRR1084816 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.3208 0.71024 0.004 0.848 0.000 0.148
#> SRR1419476 1 0.8147 0.20537 0.484 0.024 0.264 0.228
#> SRR1456075 1 0.7997 0.05118 0.404 0.012 0.200 0.384
#> SRR1389474 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 2 0.4356 0.75221 0.124 0.812 0.000 0.064
#> SRR1334419 2 0.2996 0.82763 0.044 0.892 0.000 0.064
#> SRR1417154 3 0.8005 0.48079 0.184 0.016 0.420 0.380
#> SRR1095985 2 0.8015 -0.32073 0.412 0.420 0.032 0.136
#> SRR1325771 2 0.2919 0.82990 0.044 0.896 0.000 0.060
#> SRR1360420 3 0.1109 0.78830 0.028 0.000 0.968 0.004
#> SRR660272 2 0.0336 0.85968 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1332993 2 0.6220 0.44604 0.248 0.648 0.000 0.104
#> SRR1311833 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808044 2 0.4956 0.70665 0.108 0.776 0.000 0.116
#> SRR1076916 4 0.9823 0.06684 0.216 0.196 0.244 0.344
#> SRR1356266 2 0.3383 0.81824 0.052 0.872 0.000 0.076
#> SRR1341983 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.6673 0.29820 0.608 0.252 0.000 0.140
#> SRR1072948 3 0.1576 0.78198 0.048 0.000 0.948 0.004
#> SRR1472370 1 0.1913 0.57794 0.940 0.000 0.040 0.020
#> SRR1480176 2 0.5257 0.66963 0.144 0.752 0.000 0.104
#> SRR613843 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469192 2 0.7210 -0.09296 0.404 0.456 0.000 0.140
#> SRR1404555 3 0.5383 0.69652 0.000 0.012 0.536 0.452
#> SRR659839 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659533 4 0.4875 0.61045 0.004 0.296 0.008 0.692
#> SRR1362848 4 0.5240 0.58578 0.004 0.284 0.024 0.688
#> SRR1407492 4 0.5163 0.55075 0.004 0.480 0.000 0.516
#> SRR1455082 2 0.0921 0.85052 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR658362 2 0.1940 0.81140 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR810921 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.1022 0.84778 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1456375 3 0.2281 0.75849 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR818232 2 0.4285 0.76377 0.104 0.820 0.000 0.076
#> SRR1454868 4 0.7247 0.61074 0.072 0.368 0.032 0.528
#> SRR1474816 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 2 0.4786 0.72842 0.108 0.788 0.000 0.104
#> SRR1088437 2 0.0188 0.86074 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1466400 2 0.0336 0.86122 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 2 0.2996 0.82763 0.044 0.892 0.000 0.064
#> SRR1090145 2 0.1936 0.84949 0.028 0.940 0.000 0.032
#> SRR1379324 2 0.3088 0.82609 0.052 0.888 0.000 0.060
#> SRR1345307 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.4319 0.79808 0.012 0.000 0.760 0.228
#> SRR1086280 4 0.8310 -0.51367 0.260 0.016 0.360 0.364
#> SRR1454891 2 0.4677 0.26458 0.004 0.680 0.000 0.316
#> SRR663185 2 0.1211 0.84193 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR811819 2 0.3004 0.82840 0.048 0.892 0.000 0.060
#> SRR1318920 2 0.3004 0.82880 0.048 0.892 0.000 0.060
#> SRR656758 2 0.0188 0.86100 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1474351 2 0.2919 0.82990 0.044 0.896 0.000 0.060
#> SRR660450 2 0.0336 0.85968 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1472687 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0817 0.85305 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1415153 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.0188 0.86156 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1443161 4 0.8573 0.49522 0.192 0.320 0.048 0.440
#> SRR614695 2 0.0672 0.86161 0.008 0.984 0.000 0.008
#> SRR1092372 2 0.3168 0.82472 0.056 0.884 0.000 0.060
#> SRR1474577 2 0.3081 0.82554 0.048 0.888 0.000 0.064
#> SRR1406582 2 0.2996 0.82763 0.044 0.892 0.000 0.064
#> SRR612779 2 0.0817 0.85310 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1089006 2 0.2996 0.82763 0.044 0.892 0.000 0.064
#> SRR1354071 2 0.4318 0.74593 0.116 0.816 0.000 0.068
#> SRR1105463 2 0.7080 0.03730 0.388 0.504 0.008 0.100
#> SRR811005 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 2 0.5809 0.54926 0.216 0.692 0.000 0.092
#> SRR1325871 3 0.4458 0.78112 0.012 0.008 0.772 0.208
#> SRR1355415 1 0.1863 0.58544 0.944 0.004 0.040 0.012
#> SRR1090861 2 0.2919 0.82990 0.044 0.896 0.000 0.060
#> SRR1320712 4 0.5182 0.63624 0.004 0.356 0.008 0.632
#> SRR1470075 2 0.3547 0.80954 0.072 0.864 0.000 0.064
#> SRR1091254 2 0.3301 0.82012 0.048 0.876 0.000 0.076
#> SRR1101397 1 0.4312 0.61667 0.812 0.056 0.000 0.132
#> SRR1321165 2 0.3323 0.81899 0.064 0.876 0.000 0.060
#> SRR1092112 1 0.6934 0.37142 0.596 0.024 0.300 0.080
#> SRR1417588 3 0.0817 0.78748 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1074790 2 0.2214 0.84988 0.028 0.928 0.000 0.044
#> SRR1432106 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0469 0.85902 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1458314 1 0.6552 0.35422 0.628 0.228 0.000 0.144
#> SRR1318582 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.1940 0.81109 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1072749 1 0.7040 0.21616 0.516 0.012 0.384 0.088
#> SRR1078586 2 0.3004 0.82840 0.048 0.892 0.000 0.060
#> SRR1400333 2 0.2676 0.79646 0.012 0.896 0.000 0.092
#> SRR1078834 2 0.2654 0.77279 0.004 0.888 0.000 0.108
#> SRR1417611 2 0.0188 0.86071 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1396840 2 0.3323 0.81899 0.064 0.876 0.000 0.060
#> SRR1465440 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614984 4 0.5119 0.63033 0.004 0.440 0.000 0.556
#> SRR1324269 1 0.7966 0.06836 0.460 0.360 0.024 0.156
#> SRR1401491 2 0.0188 0.86156 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1319443 2 0.4791 0.71363 0.136 0.784 0.000 0.080
#> SRR1324349 2 0.0336 0.85980 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1345523 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.7201 0.08584 0.496 0.356 0.000 0.148
#> SRR661505 1 0.1913 0.57794 0.940 0.000 0.040 0.020
#> SRR1419062 1 0.8692 0.42116 0.508 0.100 0.156 0.236
#> SRR1480131 2 0.6194 0.43670 0.260 0.644 0.000 0.096
#> SRR1421284 2 0.2593 0.77224 0.004 0.892 0.000 0.104
#> SRR1329624 2 0.3312 0.82061 0.052 0.876 0.000 0.072
#> SRR1315739 3 0.1004 0.78901 0.024 0.000 0.972 0.004
#> SRR1099189 2 0.1474 0.83221 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1083286 2 0.4359 0.76214 0.100 0.816 0.000 0.084
#> SRR1091890 4 0.6929 0.17069 0.032 0.152 0.156 0.660
#> SRR1347436 2 0.1302 0.84171 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1327473 2 0.2214 0.84988 0.028 0.928 0.000 0.044
#> SRR1338195 3 0.3791 0.80225 0.004 0.000 0.796 0.200
#> SRR809698 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 2 0.2996 0.82763 0.044 0.892 0.000 0.064
#> SRR658271 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.6407 0.40642 0.648 0.204 0.000 0.148
#> SRR1454842 3 0.8870 -0.24360 0.060 0.260 0.428 0.252
#> SRR1322643 2 0.3164 0.82313 0.052 0.884 0.000 0.064
#> SRR614887 3 0.4408 0.80004 0.004 0.008 0.756 0.232
#> SRR1354620 1 0.2224 0.58617 0.928 0.000 0.040 0.032
#> SRR615056 2 0.1118 0.84583 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1105320 2 0.2214 0.84988 0.028 0.928 0.000 0.044
#> SRR1391529 2 0.6831 0.14822 0.352 0.536 0.000 0.112
#> SRR663052 2 0.4837 0.12522 0.004 0.648 0.000 0.348
#> SRR1478834 2 0.5848 0.52915 0.228 0.684 0.000 0.088
#> SRR812366 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.4053 0.79629 0.000 0.004 0.768 0.228
#> SRR615383 2 0.0188 0.86084 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1389157 4 0.5168 0.50399 0.004 0.496 0.000 0.500
#> SRR613568 2 0.0336 0.85968 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR614095 2 0.4800 0.13440 0.004 0.656 0.000 0.340
#> SRR1103092 2 0.4581 0.74027 0.120 0.800 0.000 0.080
#> SRR1337155 2 0.5323 0.63294 0.172 0.748 0.004 0.076
#> SRR1475345 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0336 0.86000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1446180 2 0.2644 0.84048 0.032 0.908 0.000 0.060
#> SRR1406372 2 0.0188 0.86156 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.5088 0.72108 0.000 0.004 0.572 0.424
#> SRR1353136 4 0.7618 -0.35534 0.052 0.068 0.404 0.476
#> SRR1093906 3 0.1297 0.79315 0.020 0.000 0.964 0.016
#> SRR614035 2 0.0336 0.86000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1351104 2 0.4636 0.72765 0.140 0.792 0.000 0.068
#> SRR1363926 2 0.0188 0.86071 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1399861 4 0.5125 0.64936 0.000 0.388 0.008 0.604
#> SRR1338789 2 0.3547 0.81329 0.064 0.864 0.000 0.072
#> SRR1421420 1 0.8669 0.15763 0.412 0.048 0.204 0.336
#> SRR1420832 2 0.0188 0.86085 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1476231 2 0.2840 0.83066 0.044 0.900 0.000 0.056
#> SRR1352870 2 0.5914 -0.44793 0.016 0.504 0.012 0.468
#> SRR1315041 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661877 2 0.1118 0.84492 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1443268 1 0.4312 0.61667 0.812 0.056 0.000 0.132
#> SRR1416617 3 0.8101 0.46892 0.184 0.020 0.400 0.396
#> SRR1102443 2 0.2996 0.82763 0.044 0.892 0.000 0.064
#> SRR655672 4 0.5147 0.59818 0.004 0.460 0.000 0.536
#> SRR1420006 3 0.0921 0.78667 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1458267 2 0.0817 0.85305 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR613819 2 0.4343 0.43153 0.004 0.732 0.000 0.264
#> SRR1469432 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0921 0.85074 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1470727 1 0.7337 0.28323 0.580 0.264 0.020 0.136
#> SRR1339153 3 0.5202 0.76099 0.024 0.016 0.732 0.228
#> SRR1472749 4 0.7591 -0.48985 0.072 0.052 0.360 0.516
#> SRR1414379 2 0.3208 0.71024 0.004 0.848 0.000 0.148
#> SRR1431326 2 0.3081 0.82554 0.048 0.888 0.000 0.064
#> SRR1487278 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098312 4 0.6424 0.50103 0.028 0.252 0.060 0.660
#> SRR810273 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0188 0.86105 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614467 2 0.1716 0.82326 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR811471 2 0.2996 0.82763 0.044 0.892 0.000 0.064
#> SRR1478341 3 0.1284 0.79638 0.012 0.000 0.964 0.024
#> SRR1088606 2 0.3398 0.81977 0.060 0.872 0.000 0.068
#> SRR1479699 4 0.6977 0.51334 0.036 0.320 0.060 0.584
#> SRR1403589 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0188 0.86094 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1359803 2 0.4301 0.75397 0.120 0.816 0.000 0.064
#> SRR1338988 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0188 0.86071 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1378992 2 0.2996 0.82763 0.044 0.892 0.000 0.064
#> SRR659427 2 0.7762 -0.56590 0.148 0.448 0.016 0.388
#> SRR1096638 2 0.3587 0.80938 0.052 0.860 0.000 0.088
#> SRR1466619 2 0.0188 0.86071 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR659307 4 0.5308 0.61293 0.004 0.452 0.004 0.540
#> SRR1439994 1 0.1721 0.59198 0.952 0.008 0.028 0.012
#> SRR1454931 2 0.5032 0.68333 0.156 0.764 0.000 0.080
#> SRR1332928 1 0.5258 0.61051 0.772 0.036 0.036 0.156
#> SRR658621 2 0.4343 0.43153 0.004 0.732 0.000 0.264
#> SRR1095840 2 0.3081 0.82627 0.048 0.888 0.000 0.064
#> SRR1458243 1 0.4312 0.61667 0.812 0.056 0.000 0.132
#> SRR1374270 4 0.5481 0.64113 0.004 0.348 0.020 0.628
#> SRR1470947 2 0.0188 0.86085 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1365598 2 0.0188 0.86156 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR662787 2 0.1022 0.84711 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1408727 2 0.2530 0.77809 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1456274 2 0.5406 0.61263 0.076 0.740 0.004 0.180
#> SRR817744 2 0.2840 0.83066 0.044 0.900 0.000 0.056
#> SRR1478744 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 1 0.8669 0.43278 0.516 0.104 0.156 0.224
#> SRR1374198 2 0.3004 0.82880 0.048 0.892 0.000 0.060
#> SRR1445856 1 0.6407 0.40642 0.648 0.204 0.000 0.148
#> SRR820049 3 0.8396 0.02449 0.044 0.160 0.400 0.396
#> SRR1375290 4 0.6875 0.61744 0.048 0.408 0.028 0.516
#> SRR818999 1 0.6912 0.55926 0.680 0.132 0.056 0.132
#> SRR1390242 2 0.2840 0.83066 0.044 0.900 0.000 0.056
#> SRR1401164 2 0.0188 0.86156 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1454629 2 0.4359 0.76220 0.100 0.816 0.000 0.084
#> SRR1332187 3 0.5202 0.73600 0.004 0.016 0.668 0.312
#> SRR603365 1 0.1913 0.57794 0.940 0.000 0.040 0.020
#> SRR657833 2 0.0336 0.86003 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1436207 2 0.2300 0.82767 0.016 0.920 0.000 0.064
#> SRR1488017 2 0.3004 0.82840 0.048 0.892 0.000 0.060
#> SRR612947 2 0.0188 0.86084 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1480384 2 0.7218 -0.12356 0.416 0.444 0.000 0.140
#> SRR1364761 2 0.0188 0.86100 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1308086 3 0.5088 0.72108 0.000 0.004 0.572 0.424
#> SRR1441868 2 0.2996 0.82763 0.044 0.892 0.000 0.064
#> SRR1485380 1 0.1913 0.57794 0.940 0.000 0.040 0.020
#> SRR1073705 2 0.2996 0.82763 0.044 0.892 0.000 0.064
#> SRR615032 2 0.0336 0.86000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1452356 2 0.1716 0.82464 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1442983 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.4872 0.08473 0.004 0.640 0.000 0.356
#> SRR1332816 2 0.2996 0.82763 0.044 0.892 0.000 0.064
#> SRR612299 2 0.2412 0.80701 0.008 0.908 0.000 0.084
#> SRR1407386 2 0.3004 0.82845 0.048 0.892 0.000 0.060
#> SRR1418064 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309403 2 0.2214 0.84988 0.028 0.928 0.000 0.044
#> SRR1498395 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079998 1 0.1913 0.57794 0.940 0.000 0.040 0.020
#> SRR1498885 2 0.0188 0.86085 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1337215 2 0.0657 0.86007 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1414749 3 0.6115 0.62149 0.172 0.000 0.680 0.148
#> SRR1365963 1 0.6266 0.58211 0.700 0.032 0.072 0.196
#> SRR1368030 2 0.1557 0.82996 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1419760 2 0.1302 0.84574 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1381841 2 0.4955 0.69923 0.144 0.772 0.000 0.084
#> SRR821388 4 0.5157 0.60298 0.004 0.304 0.016 0.676
#> SRR657623 2 0.2814 0.73535 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1094241 3 0.5563 0.75294 0.040 0.016 0.716 0.228
#> SRR819583 1 0.4425 0.56055 0.824 0.008 0.092 0.076
#> SRR1096149 1 0.6646 0.34740 0.620 0.224 0.000 0.156
#> SRR1342829 3 0.1022 0.78610 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1353028 2 0.3320 0.81992 0.056 0.876 0.000 0.068
#> SRR811333 1 0.6675 0.59194 0.696 0.052 0.108 0.144
#> SRR1311666 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0336 0.86122 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.0188 0.86100 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR815092 2 0.2840 0.83066 0.044 0.900 0.000 0.056
#> SRR1500149 2 0.0188 0.86074 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1100564 2 0.3245 0.82216 0.056 0.880 0.000 0.064
#> SRR1403072 3 0.1867 0.77174 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR811653 4 0.5125 0.64936 0.000 0.388 0.008 0.604
#> SRR1311348 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0336 0.86122 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.2999 0.80584 0.004 0.000 0.864 0.132
#> SRR1344010 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 2 0.2996 0.82763 0.044 0.892 0.000 0.064
#> SRR1444763 2 0.3247 0.82106 0.060 0.880 0.000 0.060
#> SRR1415026 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0188 0.86071 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1485499 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.1474 0.83270 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1310094 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 2 0.3164 0.82347 0.052 0.884 0.000 0.064
#> SRR1453950 2 0.4300 0.76730 0.092 0.820 0.000 0.088
#> SRR1087875 2 0.2996 0.82763 0.044 0.892 0.000 0.064
#> SRR613318 4 0.4748 0.57587 0.000 0.268 0.016 0.716
#> SRR1332694 2 0.3464 0.81524 0.056 0.868 0.000 0.076
#> SRR1468469 3 0.3937 0.80137 0.012 0.000 0.800 0.188
#> SRR818670 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1120318 2 0.3081 0.82627 0.048 0.888 0.000 0.064
#> SRR1311622 1 0.7912 0.00758 0.396 0.008 0.204 0.392
#> SRR1500931 1 0.2843 0.55376 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1387494 4 0.7850 -0.26892 0.076 0.092 0.264 0.568
#> SRR1379175 2 0.3893 0.64145 0.008 0.796 0.000 0.196
#> SRR1401909 1 0.1913 0.57794 0.940 0.000 0.040 0.020
#> SRR1440541 2 0.0376 0.86202 0.004 0.992 0.000 0.004
#> SRR1068832 1 0.1913 0.57794 0.940 0.000 0.040 0.020
#> SRR1376640 2 0.0707 0.85437 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1085712 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 2 0.5174 0.67846 0.124 0.760 0.000 0.116
#> SRR1084276 2 0.7071 0.05237 0.380 0.504 0.004 0.112
#> SRR1353262 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437035 2 0.4318 0.74593 0.116 0.816 0.000 0.068
#> SRR1396877 1 0.7966 0.06836 0.460 0.360 0.024 0.156
#> SRR1443026 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417936 2 0.3004 0.82840 0.048 0.892 0.000 0.060
#> SRR1436822 2 0.1557 0.83102 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1101128 1 0.2142 0.57572 0.928 0.000 0.056 0.016
#> SRR1363886 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.1118 0.84583 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1394366 2 0.0336 0.85968 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1093218 3 0.3625 0.80277 0.012 0.000 0.828 0.160
#> SRR1077090 1 0.1913 0.57794 0.940 0.000 0.040 0.020
#> SRR1327430 2 0.2704 0.76184 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1088958 2 0.2996 0.82763 0.044 0.892 0.000 0.064
#> SRR1486931 2 0.0336 0.85968 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1086820 2 0.2919 0.82939 0.044 0.896 0.000 0.060
#> SRR1383000 2 0.7218 -0.12356 0.416 0.444 0.000 0.140
#> SRR1355705 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614335 2 0.1716 0.82326 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR660534 2 0.0469 0.85901 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR817094 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0336 0.85980 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1456401 2 0.0188 0.86071 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1086393 1 0.7252 -0.05354 0.436 0.420 0.000 0.144
#> SRR1351521 3 0.2480 0.80338 0.008 0.000 0.904 0.088
#> SRR1093100 2 0.2714 0.76224 0.004 0.884 0.000 0.112
#> SRR1309382 2 0.5594 0.59930 0.192 0.716 0.000 0.092
#> SRR1089375 2 0.6377 0.42314 0.212 0.660 0.004 0.124
#> SRR1499482 2 0.0336 0.85968 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR614719 4 0.5151 0.58953 0.004 0.464 0.000 0.532
#> SRR1081473 1 0.8754 0.28957 0.436 0.072 0.164 0.328
#> SRR1087415 2 0.2919 0.82939 0.044 0.896 0.000 0.060
#> SRR1088217 1 0.5469 0.60824 0.772 0.032 0.072 0.124
#> SRR808496 2 0.4019 0.59785 0.012 0.792 0.000 0.196
#> SRR1336463 2 0.0188 0.86071 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612359 2 0.4655 0.28067 0.004 0.684 0.000 0.312
#> SRR1444412 2 0.7071 0.05237 0.380 0.504 0.004 0.112
#> SRR1074116 3 0.1302 0.78234 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR821846 3 0.2334 0.80327 0.004 0.000 0.908 0.088
#> SRR656095 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808914 2 0.4285 0.76377 0.104 0.820 0.000 0.076
#> SRR1349099 2 0.2830 0.83699 0.040 0.900 0.000 0.060
#> SRR1337886 2 0.0188 0.86094 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR813632 2 0.7381 0.20585 0.280 0.568 0.020 0.132
#> SRR1101591 1 0.6702 0.08208 0.476 0.000 0.436 0.088
#> SRR1089713 2 0.8020 -0.09675 0.268 0.520 0.032 0.180
#> SRR1453127 3 0.1913 0.79882 0.020 0.000 0.940 0.040
#> SRR1498354 1 0.2310 0.59196 0.928 0.004 0.040 0.028
#> SRR1313831 2 0.3301 0.82086 0.048 0.876 0.000 0.076
#> SRR1315434 3 0.3852 0.80199 0.008 0.000 0.800 0.192
#> SRR814747 2 0.0592 0.85589 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1358539 2 0.3004 0.82840 0.048 0.892 0.000 0.060
#> SRR1367807 2 0.2996 0.82763 0.044 0.892 0.000 0.064
#> SRR1365791 4 0.9424 -0.10699 0.184 0.148 0.252 0.416
#> SRR1081519 1 0.6996 0.56092 0.664 0.044 0.160 0.132
#> SRR614707 2 0.2412 0.80701 0.008 0.908 0.000 0.084
#> SRR1094027 2 0.3081 0.82674 0.048 0.888 0.000 0.064
#> SRR1489092 2 0.8007 -0.18981 0.312 0.500 0.032 0.156
#> SRR1079502 1 0.8754 0.28957 0.436 0.072 0.164 0.328
#> SRR1457814 4 0.5125 0.64936 0.000 0.388 0.008 0.604
#> SRR1455127 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327855 1 0.1913 0.57794 0.940 0.000 0.040 0.020
#> SRR1417873 2 0.0188 0.86071 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1394125 4 0.9054 -0.34454 0.292 0.068 0.248 0.392
#> SRR1488388 2 0.3474 0.81558 0.064 0.868 0.000 0.068
#> SRR1401122 2 0.2345 0.78114 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR612383 4 0.5119 0.63033 0.004 0.440 0.000 0.556
#> SRR1477711 2 0.3301 0.82086 0.048 0.876 0.000 0.076
#> SRR1350813 2 0.0921 0.85074 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR612851 2 0.4632 0.29643 0.004 0.688 0.000 0.308
#> SRR1086349 2 0.3004 0.82840 0.048 0.892 0.000 0.060
#> SRR812837 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 4 0.5213 0.49398 0.000 0.224 0.052 0.724
#> SRR1475885 2 0.2483 0.84432 0.032 0.916 0.000 0.052
#> SRR1376334 2 0.3542 0.81183 0.060 0.864 0.000 0.076
#> SRR1399821 2 0.3004 0.82880 0.048 0.892 0.000 0.060
#> SRR1347042 3 0.1151 0.79024 0.024 0.000 0.968 0.008
#> SRR612323 4 0.5147 0.59818 0.004 0.460 0.000 0.536
#> SRR612604 2 0.0336 0.86122 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 2 0.3370 0.81741 0.048 0.872 0.000 0.080
#> SRR1465608 1 0.5942 0.59764 0.716 0.072 0.020 0.192
#> SRR1101808 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.4053 0.79629 0.000 0.004 0.768 0.228
#> SRR1331153 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078439 4 0.8641 0.49660 0.172 0.304 0.064 0.460
#> SRR2165527 2 0.1118 0.84492 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1351147 2 0.1936 0.84949 0.028 0.940 0.000 0.032
#> SRR1313536 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.2214 0.84988 0.028 0.928 0.000 0.044
#> SRR1403110 2 0.3834 0.79778 0.076 0.848 0.000 0.076
#> SRR1400355 2 0.0188 0.86100 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1401317 1 0.1913 0.57794 0.940 0.000 0.040 0.020
#> SRR1456862 2 0.5727 0.52681 0.236 0.688 0.000 0.076
#> SRR1074622 2 0.6641 0.32656 0.276 0.600 0.000 0.124
#> SRR1465847 1 0.6315 0.58601 0.716 0.036 0.112 0.136
#> SRR1443376 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 4 0.6240 -0.59368 0.004 0.044 0.452 0.500
#> SRR1075579 2 0.2840 0.83066 0.044 0.900 0.000 0.056
#> SRR1090881 2 0.4755 0.45111 0.012 0.724 0.004 0.260
#> SRR612251 4 0.4875 0.61045 0.004 0.296 0.008 0.692
#> SRR1418581 2 0.2996 0.82763 0.044 0.892 0.000 0.064
#> SRR658045 2 0.0336 0.86000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR613214 4 0.5119 0.63033 0.004 0.440 0.000 0.556
#> SRR613078 2 0.0336 0.86122 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1472998 1 0.6588 0.59777 0.708 0.072 0.084 0.136
#> SRR1433452 2 0.0188 0.86105 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1101957 2 0.3370 0.81741 0.048 0.872 0.000 0.080
#> SRR1487993 3 0.5220 0.71859 0.000 0.008 0.568 0.424
#> SRR1465983 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 2 0.3464 0.81524 0.056 0.868 0.000 0.076
#> SRR1367566 3 0.5549 0.74794 0.016 0.016 0.660 0.308
#> SRR1316151 2 0.0188 0.86071 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1417547 2 0.2216 0.79134 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR659389 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0188 0.86100 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1398207 1 0.6374 0.60058 0.720 0.100 0.052 0.128
#> SRR1358755 1 0.2730 0.61746 0.916 0.036 0.020 0.028
#> SRR1078903 2 0.4632 0.29506 0.004 0.688 0.000 0.308
#> SRR1323252 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 2 0.3004 0.82767 0.048 0.892 0.000 0.060
#> SRR615982 2 0.1792 0.82512 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1480431 2 0.1474 0.83221 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1429825 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 2 0.7090 0.20532 0.144 0.600 0.012 0.244
#> SRR808351 2 0.7143 -0.08609 0.408 0.460 0.000 0.132
#> SRR1317513 2 0.3383 0.81824 0.052 0.872 0.000 0.076
#> SRR1480501 1 0.2915 0.56113 0.892 0.000 0.080 0.028
#> SRR1081910 1 0.6675 0.59194 0.696 0.052 0.108 0.144
#> SRR1086611 2 0.2048 0.82941 0.008 0.928 0.000 0.064
#> SRR1392571 2 0.1302 0.84574 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1311441 2 0.3081 0.82554 0.048 0.888 0.000 0.064
#> SRR808152 2 0.3587 0.80938 0.052 0.860 0.000 0.088
#> SRR657313 3 0.5563 0.75491 0.040 0.016 0.716 0.228
#> SRR1433131 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0188 0.86100 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1389108 2 0.2996 0.82763 0.044 0.892 0.000 0.064
#> SRR1376228 3 0.5902 0.65056 0.160 0.000 0.700 0.140
#> SRR1399757 2 0.2840 0.83066 0.044 0.900 0.000 0.056
#> SRR1358060 3 0.6159 0.62178 0.172 0.000 0.676 0.152
#> SRR1464517 4 0.7319 -0.62568 0.108 0.012 0.416 0.464
#> SRR613557 4 0.5284 0.63688 0.004 0.436 0.004 0.556
#> SRR809831 1 0.7845 0.02604 0.444 0.380 0.016 0.160
#> SRR1429387 3 0.1411 0.79418 0.020 0.000 0.960 0.020
#> SRR816565 2 0.3004 0.82840 0.048 0.892 0.000 0.060
#> SRR1071644 2 0.2840 0.83066 0.044 0.900 0.000 0.056
#> SRR1406936 1 0.8669 0.15763 0.412 0.048 0.204 0.336
#> SRR1072031 2 0.0000 0.86142 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 4 0.5163 0.55075 0.004 0.480 0.000 0.516
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 4 0.6202 0.39662 0.000 0.140 0.004 0.532 0.324
#> SRR1404105 2 0.4873 0.68322 0.048 0.716 0.000 0.220 0.016
#> SRR2164936 2 0.0609 0.81856 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1472057 1 0.1393 0.52824 0.956 0.000 0.012 0.008 0.024
#> SRR614491 4 0.4357 0.50606 0.000 0.128 0.000 0.768 0.104
#> SRR1069376 2 0.3317 0.76645 0.004 0.804 0.000 0.188 0.004
#> SRR811964 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0162 0.82505 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1345715 2 0.2929 0.77362 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1328073 2 0.2439 0.80196 0.004 0.876 0.000 0.120 0.000
#> SRR1394209 2 0.5832 -0.13703 0.052 0.576 0.000 0.344 0.028
#> SRR1474018 2 0.0290 0.82373 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1099809 1 0.6326 0.52859 0.668 0.076 0.060 0.176 0.020
#> SRR1500555 4 0.5412 0.47206 0.024 0.444 0.000 0.512 0.020
#> SRR1354363 1 0.7531 0.22355 0.420 0.292 0.000 0.240 0.048
#> SRR1391619 3 0.5114 0.52658 0.008 0.000 0.716 0.124 0.152
#> SRR1307997 2 0.1270 0.80022 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR663124 4 0.4152 0.72897 0.000 0.296 0.000 0.692 0.012
#> SRR1334670 2 0.3670 0.75804 0.012 0.792 0.000 0.188 0.008
#> SRR612515 4 0.4152 0.72897 0.000 0.296 0.000 0.692 0.012
#> SRR1092727 2 0.4410 -0.23189 0.000 0.556 0.000 0.440 0.004
#> SRR1364013 2 0.0703 0.81782 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1468553 5 0.5286 -0.05241 0.000 0.008 0.444 0.032 0.516
#> SRR1403980 3 0.8434 -0.21744 0.188 0.004 0.352 0.160 0.296
#> SRR1420169 1 0.3645 0.55665 0.852 0.020 0.008 0.076 0.044
#> SRR1442800 2 0.2392 0.80552 0.004 0.888 0.000 0.104 0.004
#> SRR1359214 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.7877 0.20488 0.404 0.300 0.020 0.240 0.036
#> SRR1500030 5 0.2389 0.42666 0.000 0.000 0.116 0.004 0.880
#> SRR1093053 4 0.8429 0.51076 0.172 0.208 0.044 0.472 0.104
#> SRR1399843 4 0.7708 0.62518 0.112 0.308 0.020 0.480 0.080
#> SRR1380231 1 0.8381 0.28221 0.512 0.084 0.096 0.176 0.132
#> SRR809470 1 0.6104 0.52434 0.672 0.016 0.100 0.180 0.032
#> SRR614239 4 0.4152 0.72897 0.000 0.296 0.000 0.692 0.012
#> SRR613939 2 0.2230 0.76391 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0609 0.81858 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 2 0.2929 0.77362 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR613006 2 0.0404 0.82571 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362906 5 0.2304 0.43862 0.000 0.000 0.100 0.008 0.892
#> SRR1079023 2 0.2929 0.77432 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 4 0.6377 0.54062 0.000 0.336 0.000 0.484 0.180
#> SRR1478700 2 0.5273 0.65888 0.068 0.700 0.000 0.208 0.024
#> SRR1081543 5 0.5096 0.47269 0.004 0.020 0.056 0.200 0.720
#> SRR1384754 4 0.6244 0.45161 0.000 0.160 0.000 0.504 0.336
#> SRR612287 2 0.0510 0.82154 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1380317 2 0.6126 -0.32578 0.056 0.528 0.000 0.380 0.036
#> SRR1315247 2 0.1831 0.81272 0.004 0.920 0.000 0.076 0.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658549 2 0.4443 -0.34886 0.000 0.524 0.000 0.472 0.004
#> SRR1480240 2 0.4378 0.71023 0.040 0.740 0.000 0.216 0.004
#> SRR1084816 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.3489 0.57359 0.004 0.784 0.000 0.208 0.004
#> SRR1419476 1 0.7995 0.06921 0.496 0.012 0.192 0.152 0.148
#> SRR1456075 5 0.7273 0.20569 0.392 0.004 0.044 0.144 0.416
#> SRR1389474 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 2 0.4462 0.70584 0.064 0.740 0.000 0.196 0.000
#> SRR1334419 2 0.2929 0.77362 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1417154 5 0.8516 0.29729 0.188 0.008 0.252 0.172 0.380
#> SRR1095985 2 0.7855 -0.26962 0.376 0.376 0.016 0.180 0.052
#> SRR1325771 2 0.2891 0.77580 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1360420 3 0.0404 0.65521 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR660272 2 0.0290 0.82396 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1332993 2 0.6445 0.44512 0.188 0.580 0.000 0.212 0.020
#> SRR1311833 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808044 2 0.5273 0.65888 0.068 0.700 0.000 0.208 0.024
#> SRR1076916 5 0.9289 0.14896 0.200 0.144 0.068 0.244 0.344
#> SRR1356266 2 0.3525 0.76403 0.008 0.800 0.000 0.184 0.008
#> SRR1341983 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.7109 0.39896 0.528 0.188 0.000 0.232 0.052
#> SRR1072948 3 0.0880 0.64778 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.1299 0.53065 0.960 0.000 0.012 0.008 0.020
#> SRR1480176 2 0.5358 0.63184 0.088 0.680 0.000 0.220 0.012
#> SRR613843 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469192 2 0.7341 -0.12667 0.336 0.384 0.000 0.252 0.028
#> SRR1404555 5 0.3962 0.45983 0.000 0.000 0.088 0.112 0.800
#> SRR659839 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659533 4 0.4357 0.50606 0.000 0.128 0.000 0.768 0.104
#> SRR1362848 4 0.6279 0.55482 0.000 0.192 0.000 0.528 0.280
#> SRR1407492 4 0.4218 0.70743 0.000 0.332 0.000 0.660 0.008
#> SRR1455082 2 0.1043 0.80789 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR658362 2 0.2074 0.75043 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.1043 0.80695 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1456375 3 0.1942 0.61675 0.068 0.000 0.920 0.000 0.012
#> SRR818232 2 0.4513 0.71630 0.052 0.748 0.000 0.192 0.008
#> SRR1454868 4 0.7209 0.67275 0.072 0.264 0.016 0.552 0.096
#> SRR1474816 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 2 0.4841 0.68282 0.052 0.716 0.000 0.220 0.012
#> SRR1088437 2 0.0290 0.82382 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1466400 2 0.0290 0.82601 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR658921 2 0.0162 0.82605 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 2 0.2929 0.77362 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1090145 2 0.2338 0.80062 0.004 0.884 0.000 0.112 0.000
#> SRR1379324 2 0.3123 0.76952 0.004 0.812 0.000 0.184 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 5 0.5010 -0.19349 0.012 0.000 0.488 0.012 0.488
#> SRR1086280 5 0.8734 0.27235 0.268 0.008 0.236 0.184 0.304
#> SRR1454891 2 0.4331 -0.05945 0.000 0.596 0.000 0.400 0.004
#> SRR663185 2 0.1197 0.80101 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR811819 2 0.2929 0.77432 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1318920 2 0.3171 0.77168 0.008 0.816 0.000 0.176 0.000
#> SRR656758 2 0.0404 0.82561 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1474351 2 0.2891 0.77580 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR660450 2 0.0290 0.82396 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.1043 0.80820 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.0162 0.82604 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1443161 4 0.8266 0.53016 0.176 0.224 0.032 0.472 0.096
#> SRR614695 2 0.0703 0.82547 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1092372 2 0.3399 0.77041 0.020 0.812 0.000 0.168 0.000
#> SRR1474577 2 0.2966 0.77155 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR1406582 2 0.2929 0.77362 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR612779 2 0.0880 0.81249 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1089006 2 0.2929 0.77362 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1354071 2 0.4661 0.71206 0.076 0.756 0.000 0.156 0.012
#> SRR1105463 2 0.7248 0.03929 0.316 0.428 0.004 0.232 0.020
#> SRR811005 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 2 0.6092 0.52336 0.148 0.616 0.000 0.220 0.016
#> SRR1325871 3 0.4808 0.53887 0.000 0.000 0.724 0.108 0.168
#> SRR1355415 1 0.1710 0.53837 0.944 0.000 0.012 0.024 0.020
#> SRR1090861 2 0.2891 0.77580 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1320712 4 0.5824 0.65487 0.000 0.224 0.000 0.608 0.168
#> SRR1470075 2 0.3586 0.75686 0.020 0.792 0.000 0.188 0.000
#> SRR1091254 2 0.3231 0.76289 0.004 0.800 0.000 0.196 0.000
#> SRR1101397 1 0.4968 0.54657 0.732 0.016 0.004 0.188 0.060
#> SRR1321165 2 0.3565 0.76216 0.024 0.800 0.000 0.176 0.000
#> SRR1092112 1 0.6323 0.31220 0.576 0.000 0.292 0.100 0.032
#> SRR1417588 3 0.0404 0.65361 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1074790 2 0.2439 0.80196 0.004 0.876 0.000 0.120 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0703 0.81776 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1458314 1 0.6963 0.42914 0.548 0.164 0.000 0.236 0.052
#> SRR1318582 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.2179 0.73995 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1072749 1 0.6496 0.18041 0.508 0.000 0.368 0.088 0.036
#> SRR1078586 2 0.2929 0.77432 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1400333 2 0.2907 0.72895 0.012 0.864 0.000 0.116 0.008
#> SRR1078834 2 0.2787 0.70529 0.004 0.856 0.000 0.136 0.004
#> SRR1417611 2 0.0290 0.82338 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1396840 2 0.3565 0.76216 0.024 0.800 0.000 0.176 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614984 4 0.4138 0.72526 0.000 0.276 0.000 0.708 0.016
#> SRR1324269 1 0.7884 0.19895 0.400 0.304 0.020 0.240 0.036
#> SRR1401491 2 0.0162 0.82604 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1319443 2 0.5005 0.66791 0.076 0.708 0.000 0.208 0.008
#> SRR1324349 2 0.0290 0.82400 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.7531 0.22355 0.420 0.292 0.000 0.240 0.048
#> SRR661505 1 0.1299 0.53065 0.960 0.000 0.012 0.008 0.020
#> SRR1419062 1 0.8381 0.28221 0.512 0.084 0.096 0.176 0.132
#> SRR1480131 2 0.6464 0.42484 0.200 0.568 0.000 0.216 0.016
#> SRR1421284 2 0.2806 0.67796 0.004 0.844 0.000 0.152 0.000
#> SRR1329624 2 0.3402 0.76649 0.004 0.804 0.000 0.184 0.008
#> SRR1315739 3 0.0510 0.65430 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1099189 2 0.1851 0.76469 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1083286 2 0.4378 0.71023 0.040 0.740 0.000 0.216 0.004
#> SRR1091890 4 0.8053 0.04429 0.028 0.136 0.072 0.384 0.380
#> SRR1347436 2 0.1638 0.78882 0.000 0.932 0.000 0.064 0.004
#> SRR1327473 2 0.2439 0.80196 0.004 0.876 0.000 0.120 0.000
#> SRR1338195 3 0.4517 0.29160 0.000 0.000 0.556 0.008 0.436
#> SRR809698 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 2 0.2929 0.77362 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.6850 0.44551 0.568 0.148 0.000 0.228 0.056
#> SRR1454842 3 0.8713 -0.13529 0.056 0.184 0.412 0.260 0.088
#> SRR1322643 2 0.3003 0.76926 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR614887 3 0.5547 0.36464 0.000 0.000 0.564 0.080 0.356
#> SRR1354620 1 0.1507 0.53964 0.952 0.000 0.012 0.024 0.012
#> SRR615056 2 0.1341 0.79708 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1105320 2 0.2439 0.80196 0.004 0.876 0.000 0.120 0.000
#> SRR1391529 2 0.6984 0.17157 0.280 0.460 0.000 0.244 0.016
#> SRR663052 2 0.4437 -0.32228 0.000 0.532 0.000 0.464 0.004
#> SRR1478834 2 0.6169 0.50591 0.160 0.608 0.000 0.216 0.016
#> SRR812366 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435330 5 0.4973 -0.13641 0.000 0.004 0.480 0.020 0.496
#> SRR615383 2 0.0162 0.82499 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1389157 4 0.4283 0.69129 0.000 0.348 0.000 0.644 0.008
#> SRR613568 2 0.0290 0.82396 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR614095 2 0.4752 -0.18094 0.000 0.568 0.000 0.412 0.020
#> SRR1103092 2 0.4589 0.69039 0.064 0.724 0.000 0.212 0.000
#> SRR1337155 2 0.5541 0.61872 0.144 0.692 0.004 0.148 0.012
#> SRR1475345 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0290 0.82420 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1446180 2 0.2989 0.79195 0.008 0.852 0.000 0.132 0.008
#> SRR1406372 2 0.0162 0.82604 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1339880 5 0.1830 0.45541 0.000 0.000 0.068 0.008 0.924
#> SRR1353136 4 0.8050 -0.32662 0.052 0.032 0.364 0.388 0.164
#> SRR1093906 3 0.1197 0.65317 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR614035 2 0.0404 0.82314 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1351104 2 0.4767 0.68371 0.088 0.720 0.000 0.192 0.000
#> SRR1363926 2 0.0290 0.82338 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1399861 4 0.5359 0.70478 0.000 0.256 0.000 0.644 0.100
#> SRR1338789 2 0.3670 0.75874 0.012 0.792 0.000 0.188 0.008
#> SRR1421420 1 0.8605 -0.09516 0.416 0.024 0.140 0.204 0.216
#> SRR1420832 2 0.0290 0.82373 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1476231 2 0.2852 0.77672 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1352870 4 0.5788 0.62608 0.012 0.376 0.008 0.556 0.048
#> SRR1315041 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661877 2 0.1121 0.80401 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1443268 1 0.4968 0.54657 0.732 0.016 0.004 0.188 0.060
#> SRR1416617 5 0.8601 0.31488 0.188 0.012 0.236 0.180 0.384
#> SRR1102443 2 0.2929 0.77362 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR655672 4 0.4152 0.72897 0.000 0.296 0.000 0.692 0.012
#> SRR1420006 3 0.0290 0.65332 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1458267 2 0.0880 0.81306 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR613819 2 0.4251 0.27001 0.000 0.672 0.000 0.316 0.012
#> SRR1469432 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.1121 0.80491 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1470727 1 0.7539 0.38400 0.508 0.196 0.024 0.236 0.036
#> SRR1339153 3 0.5374 0.51729 0.020 0.000 0.708 0.128 0.144
#> SRR1472749 5 0.6192 0.48774 0.076 0.020 0.040 0.200 0.664
#> SRR1414379 2 0.3522 0.56475 0.004 0.780 0.000 0.212 0.004
#> SRR1431326 2 0.2966 0.77155 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR1487278 2 0.0162 0.82605 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1098312 4 0.7199 0.41152 0.024 0.196 0.004 0.440 0.336
#> SRR810273 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0290 0.82418 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR614467 2 0.2179 0.75345 0.000 0.896 0.000 0.100 0.004
#> SRR811471 2 0.2929 0.77362 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1478341 3 0.2674 0.61872 0.000 0.000 0.856 0.004 0.140
#> SRR1088606 2 0.3527 0.76819 0.024 0.804 0.000 0.172 0.000
#> SRR1479699 4 0.7535 0.45405 0.032 0.264 0.004 0.396 0.304
#> SRR1403589 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0290 0.82417 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1359803 2 0.4583 0.70483 0.064 0.740 0.000 0.192 0.004
#> SRR1338988 2 0.0162 0.82467 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1471222 2 0.0290 0.82412 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1378992 2 0.2929 0.77362 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR659427 4 0.7650 0.57834 0.144 0.352 0.008 0.428 0.068
#> SRR1096638 2 0.3578 0.75220 0.008 0.784 0.000 0.204 0.004
#> SRR1466619 2 0.0162 0.82484 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR659307 4 0.4206 0.72783 0.000 0.288 0.000 0.696 0.016
#> SRR1439994 1 0.2246 0.54835 0.924 0.004 0.016 0.028 0.028
#> SRR1454931 2 0.5246 0.64101 0.092 0.688 0.000 0.212 0.008
#> SRR1332928 1 0.4536 0.54343 0.792 0.028 0.004 0.108 0.068
#> SRR658621 2 0.4251 0.27001 0.000 0.672 0.000 0.316 0.012
#> SRR1095840 2 0.3003 0.76980 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1458243 1 0.4968 0.54657 0.732 0.016 0.004 0.188 0.060
#> SRR1374270 4 0.4752 0.62457 0.000 0.184 0.000 0.724 0.092
#> SRR1470947 2 0.0290 0.82373 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1365598 2 0.0290 0.82605 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR662787 2 0.1043 0.80610 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1408727 2 0.2773 0.67790 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1456274 2 0.5312 0.59085 0.040 0.680 0.000 0.244 0.036
#> SRR817744 2 0.2852 0.77672 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1478744 2 0.0162 0.82467 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 1 0.8305 0.30351 0.524 0.084 0.100 0.164 0.128
#> SRR1374198 2 0.3171 0.77168 0.008 0.816 0.000 0.176 0.000
#> SRR1445856 1 0.6850 0.44551 0.568 0.148 0.000 0.228 0.056
#> SRR820049 3 0.8190 -0.01248 0.040 0.108 0.388 0.376 0.088
#> SRR1375290 4 0.6618 0.67603 0.040 0.292 0.020 0.580 0.068
#> SRR818999 1 0.6547 0.51523 0.644 0.088 0.056 0.192 0.020
#> SRR1390242 2 0.2852 0.77672 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1401164 2 0.0162 0.82604 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1454629 2 0.4646 0.71747 0.060 0.748 0.000 0.180 0.012
#> SRR1332187 5 0.6032 0.24668 0.008 0.000 0.316 0.112 0.564
#> SRR603365 1 0.1299 0.53065 0.960 0.000 0.012 0.008 0.020
#> SRR657833 2 0.0404 0.82273 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1436207 2 0.2608 0.78265 0.020 0.888 0.000 0.088 0.004
#> SRR1488017 2 0.2929 0.77432 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR612947 2 0.0162 0.82499 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1480384 2 0.7346 -0.16195 0.344 0.376 0.000 0.252 0.028
#> SRR1364761 2 0.0290 0.82415 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1308086 5 0.1830 0.45541 0.000 0.000 0.068 0.008 0.924
#> SRR1441868 2 0.2929 0.77362 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1485380 1 0.1299 0.53065 0.960 0.000 0.012 0.008 0.020
#> SRR1073705 2 0.2929 0.77362 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR615032 2 0.0404 0.82314 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1452356 2 0.1952 0.76907 0.000 0.912 0.000 0.084 0.004
#> SRR1442983 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.4440 -0.33886 0.000 0.528 0.000 0.468 0.004
#> SRR1332816 2 0.2929 0.77362 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR612299 2 0.2280 0.75401 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1407386 2 0.2929 0.77431 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309403 2 0.2439 0.80196 0.004 0.876 0.000 0.120 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079998 1 0.1106 0.53395 0.964 0.000 0.012 0.000 0.024
#> SRR1498885 2 0.0290 0.82373 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1337215 2 0.0609 0.82525 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1414749 3 0.7088 0.17785 0.176 0.000 0.552 0.068 0.204
#> SRR1365963 1 0.6304 0.49272 0.632 0.012 0.020 0.200 0.136
#> SRR1368030 2 0.1671 0.77925 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1419760 2 0.1478 0.79589 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1381841 2 0.5196 0.65443 0.080 0.696 0.000 0.212 0.012
#> SRR821388 4 0.6259 0.59694 0.000 0.212 0.000 0.540 0.248
#> SRR657623 2 0.2848 0.67412 0.000 0.840 0.000 0.156 0.004
#> SRR1094241 3 0.5656 0.50501 0.036 0.000 0.696 0.128 0.140
#> SRR819583 1 0.4212 0.49764 0.816 0.000 0.060 0.072 0.052
#> SRR1096149 1 0.7094 0.43051 0.552 0.160 0.004 0.228 0.056
#> SRR1342829 3 0.0162 0.65165 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1353028 2 0.3231 0.76305 0.004 0.800 0.000 0.196 0.000
#> SRR811333 1 0.6104 0.52434 0.672 0.016 0.100 0.180 0.032
#> SRR1311666 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0404 0.82657 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1446436 2 0.0290 0.82422 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR815092 2 0.2852 0.77672 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1500149 2 0.0290 0.82622 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1100564 2 0.3196 0.76541 0.004 0.804 0.000 0.192 0.000
#> SRR1403072 3 0.1331 0.63429 0.040 0.000 0.952 0.000 0.008
#> SRR811653 4 0.5359 0.70478 0.000 0.256 0.000 0.644 0.100
#> SRR1311348 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0290 0.82601 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1421444 3 0.4356 0.43186 0.000 0.000 0.648 0.012 0.340
#> SRR1344010 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 2 0.2929 0.77362 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1444763 2 0.3355 0.76420 0.012 0.804 0.000 0.184 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0290 0.82338 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1485499 2 0.0162 0.82467 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.1544 0.78536 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 2 0.3123 0.76985 0.004 0.812 0.000 0.184 0.000
#> SRR1453950 2 0.4436 0.71419 0.040 0.744 0.000 0.208 0.008
#> SRR1087875 2 0.2929 0.77362 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR613318 4 0.4953 0.47134 0.000 0.124 0.000 0.712 0.164
#> SRR1332694 2 0.3634 0.76120 0.012 0.796 0.000 0.184 0.008
#> SRR1468469 3 0.4650 0.20788 0.012 0.000 0.520 0.000 0.468
#> SRR818670 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1120318 2 0.3003 0.76980 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1311622 5 0.7214 0.24169 0.384 0.004 0.044 0.136 0.432
#> SRR1500931 1 0.2390 0.50326 0.908 0.000 0.060 0.008 0.024
#> SRR1387494 5 0.7042 0.43273 0.072 0.056 0.032 0.268 0.572
#> SRR1379175 2 0.4236 0.48867 0.008 0.728 0.000 0.248 0.016
#> SRR1401909 1 0.1299 0.53065 0.960 0.000 0.012 0.008 0.020
#> SRR1440541 2 0.0566 0.82623 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1068832 1 0.1299 0.53065 0.960 0.000 0.012 0.008 0.020
#> SRR1376640 2 0.0794 0.81463 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 2 0.5462 0.63957 0.084 0.688 0.000 0.204 0.024
#> SRR1084276 2 0.7183 0.06580 0.308 0.432 0.004 0.240 0.016
#> SRR1353262 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437035 2 0.4661 0.71206 0.076 0.756 0.000 0.156 0.012
#> SRR1396877 1 0.7884 0.19895 0.400 0.304 0.020 0.240 0.036
#> SRR1443026 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417936 2 0.2929 0.77432 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1436822 2 0.1608 0.78359 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1101128 1 0.1799 0.53050 0.940 0.000 0.028 0.012 0.020
#> SRR1363886 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.1341 0.79708 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1394366 2 0.0404 0.82549 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1093218 3 0.4481 0.29787 0.008 0.000 0.576 0.000 0.416
#> SRR1077090 1 0.1300 0.53379 0.956 0.000 0.016 0.000 0.028
#> SRR1327430 2 0.2929 0.65178 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1088958 2 0.2929 0.77362 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1486931 2 0.0404 0.82245 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1086820 2 0.2929 0.77351 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1383000 2 0.7346 -0.16195 0.344 0.376 0.000 0.252 0.028
#> SRR1355705 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614335 2 0.2179 0.75345 0.000 0.896 0.000 0.100 0.004
#> SRR660534 2 0.0794 0.81683 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0290 0.82400 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1456401 2 0.0290 0.82338 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1086393 1 0.7528 0.12361 0.376 0.348 0.000 0.232 0.044
#> SRR1351521 3 0.3715 0.53088 0.000 0.000 0.736 0.004 0.260
#> SRR1093100 2 0.3010 0.64460 0.004 0.824 0.000 0.172 0.000
#> SRR1309382 2 0.5809 0.56710 0.128 0.640 0.000 0.220 0.012
#> SRR1089375 2 0.6600 0.45752 0.176 0.612 0.004 0.164 0.044
#> SRR1499482 2 0.0404 0.82245 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR614719 4 0.4183 0.71202 0.000 0.324 0.000 0.668 0.008
#> SRR1081473 1 0.8553 0.06397 0.432 0.036 0.108 0.240 0.184
#> SRR1087415 2 0.2929 0.77351 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1088217 1 0.4654 0.54547 0.760 0.004 0.060 0.164 0.012
#> SRR808496 2 0.4244 0.44176 0.012 0.728 0.000 0.248 0.012
#> SRR1336463 2 0.0290 0.82338 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR612359 2 0.4288 0.01881 0.000 0.612 0.000 0.384 0.004
#> SRR1444412 2 0.7183 0.06580 0.308 0.432 0.004 0.240 0.016
#> SRR1074116 3 0.0671 0.64745 0.016 0.000 0.980 0.000 0.004
#> SRR821846 3 0.3741 0.52652 0.000 0.000 0.732 0.004 0.264
#> SRR656095 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808914 2 0.4513 0.71630 0.052 0.748 0.000 0.192 0.008
#> SRR1349099 2 0.3239 0.78162 0.012 0.828 0.000 0.156 0.004
#> SRR1337886 2 0.0290 0.82417 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR813632 2 0.7218 0.23078 0.236 0.496 0.016 0.236 0.016
#> SRR1101591 1 0.6289 0.06979 0.480 0.000 0.420 0.064 0.036
#> SRR1089713 2 0.7816 0.00280 0.248 0.472 0.012 0.200 0.068
#> SRR1453127 3 0.1671 0.64795 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1498354 1 0.1682 0.54430 0.944 0.000 0.012 0.032 0.012
#> SRR1313831 2 0.3402 0.76651 0.004 0.804 0.000 0.184 0.008
#> SRR1315434 3 0.4300 0.21106 0.000 0.000 0.524 0.000 0.476
#> SRR814747 2 0.0703 0.81618 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1358539 2 0.2929 0.77432 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1367807 2 0.2929 0.77362 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1365791 5 0.8977 0.31963 0.172 0.120 0.068 0.232 0.408
#> SRR1081519 1 0.6332 0.48877 0.636 0.008 0.156 0.172 0.028
#> SRR614707 2 0.2280 0.75401 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1094027 2 0.2966 0.77259 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR1489092 2 0.8011 -0.11052 0.276 0.444 0.020 0.196 0.064
#> SRR1079502 1 0.8553 0.06397 0.432 0.036 0.108 0.240 0.184
#> SRR1457814 4 0.5359 0.70478 0.000 0.256 0.000 0.644 0.100
#> SRR1455127 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1327855 1 0.1299 0.53065 0.960 0.000 0.012 0.008 0.020
#> SRR1417873 2 0.0290 0.82338 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1394125 5 0.9206 0.30769 0.300 0.060 0.136 0.192 0.312
#> SRR1488388 2 0.3550 0.76251 0.020 0.796 0.000 0.184 0.000
#> SRR1401122 2 0.2471 0.70678 0.000 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR612383 4 0.4138 0.72526 0.000 0.276 0.000 0.708 0.016
#> SRR1477711 2 0.3402 0.76651 0.004 0.804 0.000 0.184 0.008
#> SRR1350813 2 0.1043 0.80767 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR612851 2 0.4744 -0.13833 0.000 0.572 0.000 0.408 0.020
#> SRR1086349 2 0.2929 0.77432 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 4 0.6202 0.39662 0.000 0.140 0.004 0.532 0.324
#> SRR1475885 2 0.2911 0.79222 0.008 0.852 0.000 0.136 0.004
#> SRR1376334 2 0.3670 0.75804 0.012 0.792 0.000 0.188 0.008
#> SRR1399821 2 0.3171 0.77168 0.008 0.816 0.000 0.176 0.000
#> SRR1347042 3 0.0794 0.65485 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR612323 4 0.4152 0.72897 0.000 0.296 0.000 0.692 0.012
#> SRR612604 2 0.0404 0.82571 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 2 0.3266 0.76014 0.004 0.796 0.000 0.200 0.000
#> SRR1465608 1 0.6114 0.51870 0.632 0.024 0.016 0.256 0.072
#> SRR1101808 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414079 5 0.4973 -0.13641 0.000 0.004 0.480 0.020 0.496
#> SRR1331153 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078439 4 0.8429 0.51076 0.172 0.208 0.044 0.472 0.104
#> SRR2165527 2 0.1121 0.80401 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1351147 2 0.2338 0.80062 0.004 0.884 0.000 0.112 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.2439 0.80196 0.004 0.876 0.000 0.120 0.000
#> SRR1403110 2 0.3988 0.74530 0.024 0.776 0.000 0.192 0.008
#> SRR1400355 2 0.0290 0.82422 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1401317 1 0.1299 0.53065 0.960 0.000 0.012 0.008 0.020
#> SRR1456862 2 0.6025 0.50377 0.180 0.612 0.000 0.200 0.008
#> SRR1074622 2 0.6730 0.34049 0.208 0.532 0.000 0.240 0.020
#> SRR1465847 1 0.5756 0.51744 0.692 0.004 0.100 0.168 0.036
#> SRR1443376 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 5 0.4873 0.47506 0.004 0.012 0.056 0.196 0.732
#> SRR1075579 2 0.2852 0.77672 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1090881 2 0.4819 0.12587 0.004 0.620 0.000 0.352 0.024
#> SRR612251 4 0.4357 0.50606 0.000 0.128 0.000 0.768 0.104
#> SRR1418581 2 0.2929 0.77362 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR658045 2 0.0404 0.82314 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR613214 4 0.4138 0.72526 0.000 0.276 0.000 0.708 0.016
#> SRR613078 2 0.0290 0.82601 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1472998 1 0.6279 0.53136 0.664 0.028 0.080 0.192 0.036
#> SRR1433452 2 0.0290 0.82418 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1101957 2 0.3266 0.76014 0.004 0.796 0.000 0.200 0.000
#> SRR1487993 5 0.1990 0.45708 0.000 0.004 0.068 0.008 0.920
#> SRR1465983 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 2 0.3634 0.76120 0.012 0.796 0.000 0.184 0.008
#> SRR1367566 5 0.6669 0.08415 0.016 0.008 0.404 0.112 0.460
#> SRR1316151 2 0.0162 0.82484 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1417547 2 0.2377 0.71813 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0290 0.82422 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1398207 1 0.5820 0.54059 0.684 0.048 0.052 0.204 0.012
#> SRR1358755 1 0.2862 0.56734 0.888 0.012 0.012 0.076 0.012
#> SRR1078903 2 0.4299 -0.00106 0.000 0.608 0.000 0.388 0.004
#> SRR1323252 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 2 0.2966 0.77139 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR615982 2 0.2124 0.76247 0.000 0.900 0.000 0.096 0.004
#> SRR1480431 2 0.1851 0.76469 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 2 0.6985 0.22323 0.108 0.540 0.000 0.276 0.076
#> SRR808351 2 0.7255 -0.10826 0.340 0.392 0.000 0.244 0.024
#> SRR1317513 2 0.3525 0.76403 0.008 0.800 0.000 0.184 0.008
#> SRR1480501 1 0.2522 0.51171 0.904 0.000 0.056 0.012 0.028
#> SRR1081910 1 0.6104 0.52434 0.672 0.016 0.100 0.180 0.032
#> SRR1086611 2 0.2112 0.78374 0.004 0.908 0.000 0.084 0.004
#> SRR1392571 2 0.1478 0.79589 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1311441 2 0.2966 0.77155 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR808152 2 0.3578 0.75220 0.008 0.784 0.000 0.204 0.004
#> SRR657313 3 0.5656 0.50363 0.036 0.000 0.696 0.128 0.140
#> SRR1433131 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0290 0.82422 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1389108 2 0.2929 0.77362 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1376228 3 0.6911 0.23075 0.156 0.000 0.576 0.068 0.200
#> SRR1399757 2 0.2852 0.77672 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1358060 3 0.7113 0.17317 0.176 0.000 0.548 0.068 0.208
#> SRR1464517 5 0.5496 0.49178 0.112 0.004 0.048 0.108 0.728
#> SRR613557 4 0.4206 0.72248 0.000 0.272 0.000 0.708 0.020
#> SRR809831 1 0.7782 0.16958 0.380 0.320 0.012 0.252 0.036
#> SRR1429387 3 0.1270 0.65260 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR816565 2 0.2929 0.77432 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1071644 2 0.2852 0.77672 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1406936 1 0.8605 -0.09516 0.416 0.024 0.140 0.204 0.216
#> SRR1072031 2 0.0000 0.82564 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 4 0.4218 0.70743 0.000 0.332 0.000 0.660 0.008
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 4 0.5804 0.2411 0.060 0.060 0.000 0.596 0.008 0.276
#> SRR1404105 2 0.4314 0.1354 0.484 0.500 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR2164936 2 0.0858 0.7488 0.004 0.968 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1472057 5 0.0935 0.7166 0.032 0.000 0.000 0.000 0.964 0.004
#> SRR614491 4 0.1950 0.4685 0.000 0.064 0.000 0.912 0.000 0.024
#> SRR1069376 2 0.3797 0.3750 0.420 0.580 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0291 0.7579 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1345715 2 0.3765 0.4060 0.404 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 2 0.3534 0.5888 0.244 0.740 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1394209 2 0.6023 -0.1761 0.084 0.528 0.004 0.348 0.016 0.020
#> SRR1474018 2 0.0260 0.7561 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.6241 -0.3646 0.472 0.032 0.048 0.024 0.412 0.012
#> SRR1500555 4 0.5449 0.4408 0.128 0.368 0.000 0.504 0.000 0.000
#> SRR1354363 1 0.3609 0.4113 0.824 0.092 0.000 0.008 0.064 0.012
#> SRR1391619 3 0.5099 0.5173 0.016 0.000 0.688 0.200 0.016 0.080
#> SRR1307997 2 0.1349 0.7345 0.004 0.940 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR663124 4 0.3217 0.6793 0.008 0.224 0.000 0.768 0.000 0.000
#> SRR1334670 2 0.3804 0.3635 0.424 0.576 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 4 0.3217 0.6793 0.008 0.224 0.000 0.768 0.000 0.000
#> SRR1092727 2 0.4128 -0.3339 0.004 0.504 0.000 0.488 0.004 0.000
#> SRR1364013 2 0.0777 0.7526 0.004 0.972 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1468553 6 0.5037 0.0399 0.008 0.000 0.416 0.032 0.012 0.532
#> SRR1403980 3 0.8308 -0.2165 0.080 0.000 0.340 0.136 0.156 0.288
#> SRR1420169 5 0.4214 0.5792 0.320 0.000 0.004 0.012 0.656 0.008
#> SRR1442800 2 0.3708 0.6016 0.220 0.752 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR1359214 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.5713 0.4462 0.672 0.148 0.016 0.020 0.128 0.016
#> SRR1500030 6 0.1471 0.4706 0.000 0.000 0.064 0.004 0.000 0.932
#> SRR1093053 4 0.8247 0.4302 0.176 0.160 0.032 0.460 0.116 0.056
#> SRR1399843 4 0.7633 0.5521 0.156 0.248 0.016 0.472 0.068 0.040
#> SRR1380231 5 0.8802 0.3266 0.236 0.064 0.084 0.112 0.396 0.108
#> SRR809470 1 0.6519 -0.4663 0.448 0.008 0.088 0.028 0.404 0.024
#> SRR614239 4 0.3217 0.6793 0.008 0.224 0.000 0.768 0.000 0.000
#> SRR613939 2 0.2573 0.7015 0.024 0.864 0.000 0.112 0.000 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0547 0.7527 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 2 0.3765 0.4060 0.404 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0405 0.7561 0.008 0.988 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362906 6 0.1333 0.4793 0.000 0.000 0.048 0.008 0.000 0.944
#> SRR1079023 2 0.3737 0.4251 0.392 0.608 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 4 0.7104 0.4472 0.160 0.212 0.000 0.492 0.008 0.128
#> SRR1478700 1 0.4348 -0.0238 0.520 0.464 0.000 0.004 0.008 0.004
#> SRR1081543 6 0.4610 0.4979 0.020 0.012 0.020 0.200 0.016 0.732
#> SRR1384754 4 0.6154 0.3340 0.068 0.088 0.000 0.556 0.004 0.284
#> SRR612287 2 0.0458 0.7545 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.6211 -0.3432 0.088 0.476 0.004 0.392 0.020 0.020
#> SRR1315247 2 0.2884 0.6608 0.164 0.824 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1105344 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658549 4 0.4114 0.4468 0.004 0.460 0.000 0.532 0.004 0.000
#> SRR1480240 2 0.3867 0.1919 0.488 0.512 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0146 0.7579 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.3570 0.5092 0.016 0.752 0.000 0.228 0.000 0.004
#> SRR1419476 5 0.8186 0.2832 0.168 0.000 0.160 0.104 0.428 0.140
#> SRR1456075 6 0.7473 0.0738 0.248 0.000 0.016 0.084 0.264 0.388
#> SRR1389474 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 2 0.3997 0.1640 0.488 0.508 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1334419 2 0.3765 0.4060 0.404 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 6 0.8313 0.3019 0.080 0.000 0.236 0.144 0.168 0.372
#> SRR1095985 1 0.7292 0.3497 0.428 0.288 0.008 0.060 0.204 0.012
#> SRR1325771 2 0.3727 0.4303 0.388 0.612 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0622 0.6541 0.000 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR660272 2 0.0260 0.7572 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1332993 1 0.4344 0.3585 0.612 0.356 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808044 1 0.4348 -0.0238 0.520 0.464 0.000 0.004 0.008 0.004
#> SRR1076916 6 0.9038 0.2043 0.200 0.096 0.036 0.172 0.148 0.348
#> SRR1356266 2 0.3782 0.3890 0.412 0.588 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.4329 0.2216 0.752 0.052 0.000 0.008 0.172 0.016
#> SRR1072948 3 0.1152 0.6479 0.000 0.000 0.952 0.004 0.044 0.000
#> SRR1472370 5 0.0790 0.7165 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1480176 1 0.4594 -0.0128 0.504 0.468 0.000 0.004 0.020 0.004
#> SRR613843 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.4404 0.5251 0.732 0.192 0.000 0.012 0.060 0.004
#> SRR1404555 6 0.3165 0.4928 0.008 0.000 0.040 0.116 0.000 0.836
#> SRR659839 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659533 4 0.1950 0.4685 0.000 0.064 0.000 0.912 0.000 0.024
#> SRR1362848 4 0.6232 0.4290 0.068 0.116 0.000 0.588 0.008 0.220
#> SRR1407492 4 0.3583 0.6671 0.008 0.260 0.000 0.728 0.004 0.000
#> SRR1455082 2 0.1152 0.7454 0.004 0.952 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR658362 2 0.2431 0.6618 0.008 0.860 0.000 0.132 0.000 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.1349 0.7327 0.004 0.940 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.2257 0.6208 0.004 0.000 0.900 0.012 0.076 0.008
#> SRR818232 2 0.3860 0.2242 0.472 0.528 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 4 0.6658 0.6095 0.112 0.212 0.008 0.584 0.040 0.044
#> SRR1474816 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 2 0.4466 0.1297 0.476 0.500 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1088437 2 0.0260 0.7574 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1466400 2 0.0291 0.7572 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR658921 2 0.0363 0.7565 0.012 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0146 0.7579 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 2 0.3765 0.4060 0.404 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 2 0.3314 0.5822 0.256 0.740 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1379324 2 0.3737 0.4227 0.392 0.608 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 6 0.4797 -0.0992 0.000 0.000 0.460 0.016 0.024 0.500
#> SRR1086280 6 0.8712 0.2682 0.112 0.000 0.208 0.156 0.236 0.288
#> SRR1454891 2 0.3979 -0.2023 0.004 0.540 0.000 0.456 0.000 0.000
#> SRR663185 2 0.1471 0.7279 0.004 0.932 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR811819 2 0.3737 0.4251 0.392 0.608 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 2 0.3795 0.4557 0.364 0.632 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0405 0.7574 0.004 0.988 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1474351 2 0.3727 0.4303 0.388 0.612 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0260 0.7572 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1472687 2 0.0146 0.7579 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.1152 0.7405 0.004 0.952 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.0146 0.7577 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443161 4 0.8183 0.4468 0.196 0.176 0.024 0.444 0.112 0.048
#> SRR614695 2 0.0717 0.7553 0.008 0.976 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1092372 2 0.4022 0.4444 0.360 0.628 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1474577 2 0.3774 0.3984 0.408 0.592 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 2 0.3765 0.4060 0.404 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0935 0.7477 0.004 0.964 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1089006 2 0.3765 0.4060 0.404 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 2 0.4191 0.3683 0.388 0.596 0.000 0.012 0.004 0.000
#> SRR1105463 1 0.4478 0.5251 0.708 0.200 0.004 0.000 0.088 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.3695 0.2916 0.624 0.376 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.4827 0.5300 0.004 0.000 0.696 0.184 0.008 0.108
#> SRR1355415 5 0.1471 0.7160 0.064 0.000 0.000 0.000 0.932 0.004
#> SRR1090861 2 0.3727 0.4303 0.388 0.612 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 4 0.5224 0.5596 0.028 0.140 0.000 0.692 0.008 0.132
#> SRR1470075 2 0.3944 0.3468 0.428 0.568 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1091254 2 0.3797 0.3771 0.420 0.580 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.4426 -0.3105 0.616 0.000 0.004 0.008 0.356 0.016
#> SRR1321165 2 0.4181 0.4245 0.368 0.616 0.000 0.008 0.004 0.004
#> SRR1092112 5 0.7009 0.3769 0.268 0.000 0.284 0.024 0.400 0.024
#> SRR1417588 3 0.0767 0.6522 0.000 0.000 0.976 0.004 0.008 0.012
#> SRR1074790 2 0.3534 0.5888 0.244 0.740 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0713 0.7491 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.3965 0.1678 0.772 0.028 0.000 0.008 0.176 0.016
#> SRR1318582 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.2278 0.6732 0.004 0.868 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1072749 5 0.7127 0.2995 0.240 0.000 0.336 0.028 0.368 0.028
#> SRR1078586 2 0.3737 0.4251 0.392 0.608 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.2848 0.6648 0.024 0.848 0.000 0.124 0.004 0.000
#> SRR1078834 2 0.2830 0.6548 0.020 0.836 0.000 0.144 0.000 0.000
#> SRR1417611 2 0.0363 0.7548 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1396840 2 0.4181 0.4245 0.368 0.616 0.000 0.008 0.004 0.004
#> SRR1465440 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614984 4 0.2994 0.6730 0.004 0.208 0.000 0.788 0.000 0.000
#> SRR1324269 1 0.5675 0.4498 0.676 0.148 0.016 0.020 0.124 0.016
#> SRR1401491 2 0.0146 0.7577 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.3866 -0.0838 0.516 0.484 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0260 0.7573 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.3609 0.4113 0.824 0.092 0.000 0.008 0.064 0.012
#> SRR661505 5 0.0713 0.7157 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1419062 5 0.8802 0.3266 0.236 0.064 0.084 0.112 0.396 0.108
#> SRR1480131 1 0.4153 0.3950 0.636 0.340 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1421284 2 0.2848 0.6035 0.008 0.816 0.000 0.176 0.000 0.000
#> SRR1329624 2 0.3774 0.3971 0.408 0.592 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0622 0.6527 0.000 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1099189 2 0.1863 0.6907 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000 0.000
#> SRR1083286 2 0.3867 0.1919 0.488 0.512 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 4 0.8185 -0.1033 0.112 0.088 0.068 0.360 0.024 0.348
#> SRR1347436 2 0.1643 0.7231 0.008 0.924 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1327473 2 0.3534 0.5888 0.244 0.740 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1338195 3 0.4089 0.2022 0.000 0.000 0.524 0.008 0.000 0.468
#> SRR809698 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 2 0.3774 0.3991 0.408 0.592 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.3764 0.1077 0.772 0.012 0.000 0.008 0.192 0.016
#> SRR1454842 3 0.8165 -0.0601 0.068 0.144 0.400 0.300 0.036 0.052
#> SRR1322643 2 0.3782 0.3910 0.412 0.588 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.5493 0.3180 0.000 0.000 0.520 0.120 0.004 0.356
#> SRR1354620 5 0.1753 0.7146 0.084 0.000 0.004 0.000 0.912 0.000
#> SRR615056 2 0.1588 0.7207 0.004 0.924 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1105320 2 0.3534 0.5888 0.244 0.740 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.3713 0.5248 0.744 0.224 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR663052 4 0.4120 0.4280 0.004 0.468 0.000 0.524 0.004 0.000
#> SRR1478834 1 0.3830 0.3012 0.620 0.376 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435330 6 0.4772 -0.0409 0.004 0.000 0.452 0.020 0.012 0.512
#> SRR615383 2 0.0146 0.7574 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1389157 4 0.3693 0.6536 0.008 0.280 0.000 0.708 0.004 0.000
#> SRR613568 2 0.0260 0.7572 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR614095 2 0.3991 -0.2535 0.000 0.524 0.000 0.472 0.000 0.004
#> SRR1103092 2 0.4128 0.1360 0.492 0.500 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1337155 2 0.5530 0.3362 0.268 0.596 0.000 0.012 0.120 0.004
#> SRR1475345 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0260 0.7574 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1446180 2 0.3650 0.5618 0.272 0.716 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1406372 2 0.0146 0.7577 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339880 6 0.0820 0.4916 0.000 0.000 0.016 0.012 0.000 0.972
#> SRR1353136 4 0.7343 -0.2591 0.064 0.016 0.328 0.456 0.036 0.100
#> SRR1093906 3 0.1219 0.6494 0.000 0.000 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR614035 2 0.0363 0.7561 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1351104 2 0.4184 0.1363 0.488 0.500 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1363926 2 0.0260 0.7562 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1399861 4 0.4559 0.6431 0.008 0.184 0.000 0.720 0.004 0.084
#> SRR1338789 2 0.3965 0.4303 0.376 0.616 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1421420 5 0.8743 0.1265 0.164 0.008 0.116 0.168 0.356 0.188
#> SRR1420832 2 0.0260 0.7561 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1476231 2 0.3706 0.4404 0.380 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 4 0.5093 0.5857 0.052 0.320 0.000 0.608 0.008 0.012
#> SRR1315041 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661877 2 0.1411 0.7296 0.004 0.936 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1443268 1 0.4426 -0.3105 0.616 0.000 0.004 0.008 0.356 0.016
#> SRR1416617 6 0.8363 0.3147 0.084 0.000 0.220 0.156 0.168 0.372
#> SRR1102443 2 0.3765 0.4060 0.404 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655672 4 0.3217 0.6793 0.008 0.224 0.000 0.768 0.000 0.000
#> SRR1420006 3 0.0767 0.6516 0.000 0.000 0.976 0.004 0.012 0.008
#> SRR1458267 2 0.1010 0.7458 0.004 0.960 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR613819 2 0.3659 0.1787 0.000 0.636 0.000 0.364 0.000 0.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.1152 0.7413 0.004 0.952 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1470727 1 0.5157 0.2631 0.692 0.072 0.012 0.016 0.200 0.008
#> SRR1339153 3 0.5284 0.5092 0.016 0.000 0.676 0.204 0.024 0.080
#> SRR1472749 6 0.5570 0.5039 0.056 0.004 0.008 0.192 0.072 0.668
#> SRR1414379 2 0.3596 0.5000 0.016 0.748 0.000 0.232 0.000 0.004
#> SRR1431326 2 0.3774 0.3984 0.408 0.592 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0146 0.7577 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098312 4 0.7243 0.2455 0.112 0.132 0.000 0.448 0.016 0.292
#> SRR810273 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0363 0.7558 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR614467 2 0.2234 0.6721 0.004 0.872 0.000 0.124 0.000 0.000
#> SRR811471 2 0.3774 0.3991 0.408 0.592 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.2695 0.6075 0.000 0.000 0.844 0.008 0.004 0.144
#> SRR1088606 2 0.4245 0.4708 0.328 0.644 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1479699 4 0.7736 0.2947 0.120 0.200 0.000 0.388 0.024 0.268
#> SRR1403589 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0260 0.7571 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1359803 2 0.3862 0.2021 0.476 0.524 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0146 0.7571 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0260 0.7575 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1378992 2 0.3765 0.4060 0.404 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659427 4 0.7743 0.5070 0.160 0.300 0.004 0.404 0.096 0.036
#> SRR1096638 2 0.3944 0.3496 0.428 0.568 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0146 0.7575 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR659307 4 0.3221 0.6775 0.004 0.220 0.000 0.772 0.000 0.004
#> SRR1439994 5 0.2278 0.6990 0.128 0.000 0.000 0.000 0.868 0.004
#> SRR1454931 1 0.3851 0.0103 0.540 0.460 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 5 0.5153 0.4969 0.408 0.000 0.004 0.024 0.532 0.032
#> SRR658621 2 0.3659 0.1787 0.000 0.636 0.000 0.364 0.000 0.000
#> SRR1095840 2 0.3765 0.4073 0.404 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.4426 -0.3105 0.616 0.000 0.004 0.008 0.356 0.016
#> SRR1374270 4 0.3262 0.5608 0.008 0.112 0.000 0.836 0.004 0.040
#> SRR1470947 2 0.0260 0.7561 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.0458 0.7550 0.016 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662787 2 0.1141 0.7342 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1408727 2 0.2946 0.6090 0.012 0.812 0.000 0.176 0.000 0.000
#> SRR1456274 2 0.5893 0.1751 0.352 0.512 0.000 0.112 0.004 0.020
#> SRR817744 2 0.3706 0.4404 0.380 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0146 0.7571 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 5 0.8805 0.3298 0.248 0.064 0.084 0.112 0.388 0.104
#> SRR1374198 2 0.3795 0.4557 0.364 0.632 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.3764 0.1077 0.772 0.012 0.000 0.008 0.192 0.016
#> SRR820049 4 0.7379 -0.1067 0.052 0.072 0.368 0.432 0.036 0.040
#> SRR1375290 4 0.6074 0.6205 0.092 0.220 0.012 0.624 0.032 0.020
#> SRR818999 1 0.6103 -0.3023 0.496 0.032 0.044 0.020 0.396 0.012
#> SRR1390242 2 0.3695 0.4456 0.376 0.624 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0146 0.7577 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454629 2 0.4284 0.3196 0.412 0.572 0.000 0.004 0.008 0.004
#> SRR1332187 6 0.5730 0.3123 0.024 0.000 0.260 0.120 0.004 0.592
#> SRR603365 5 0.0713 0.7157 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR657833 2 0.0458 0.7539 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.2767 0.6980 0.056 0.868 0.000 0.072 0.004 0.000
#> SRR1488017 2 0.3737 0.4251 0.392 0.608 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0146 0.7574 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.4535 0.5205 0.724 0.188 0.000 0.012 0.072 0.004
#> SRR1364761 2 0.0260 0.7570 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1308086 6 0.0820 0.4916 0.000 0.000 0.016 0.012 0.000 0.972
#> SRR1441868 2 0.3765 0.4060 0.404 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 5 0.0713 0.7157 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1073705 2 0.3765 0.4060 0.404 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0363 0.7561 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.2006 0.6930 0.004 0.892 0.000 0.104 0.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 4 0.4117 0.4345 0.004 0.464 0.000 0.528 0.004 0.000
#> SRR1332816 2 0.3765 0.4060 0.404 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612299 2 0.2581 0.6945 0.020 0.860 0.000 0.120 0.000 0.000
#> SRR1407386 2 0.3737 0.4242 0.392 0.608 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309403 2 0.3534 0.5888 0.244 0.740 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079998 5 0.1531 0.7151 0.068 0.000 0.000 0.000 0.928 0.004
#> SRR1498885 2 0.0260 0.7561 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1337215 2 0.0717 0.7555 0.008 0.976 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1414749 3 0.7062 0.1744 0.068 0.000 0.532 0.044 0.148 0.208
#> SRR1365963 1 0.6027 -0.4000 0.556 0.000 0.008 0.040 0.300 0.096
#> SRR1368030 2 0.1858 0.7051 0.004 0.904 0.000 0.092 0.000 0.000
#> SRR1419760 2 0.1643 0.7284 0.008 0.924 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1381841 1 0.4122 -0.0436 0.520 0.472 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR821388 4 0.6265 0.4806 0.068 0.136 0.000 0.592 0.008 0.196
#> SRR657623 2 0.2631 0.6008 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.5508 0.4986 0.016 0.000 0.664 0.204 0.040 0.076
#> SRR819583 5 0.3978 0.6673 0.104 0.000 0.044 0.020 0.808 0.024
#> SRR1096149 1 0.5331 0.1742 0.648 0.092 0.004 0.008 0.236 0.012
#> SRR1342829 3 0.0603 0.6504 0.000 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1353028 2 0.3797 0.3774 0.420 0.580 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811333 1 0.6519 -0.4663 0.448 0.008 0.088 0.028 0.404 0.024
#> SRR1311666 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0405 0.7574 0.004 0.988 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.0260 0.7562 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR815092 2 0.3695 0.4456 0.376 0.624 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0291 0.7579 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1100564 2 0.3782 0.3925 0.412 0.588 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.1524 0.6396 0.000 0.000 0.932 0.008 0.060 0.000
#> SRR811653 4 0.4559 0.6431 0.008 0.184 0.000 0.720 0.004 0.084
#> SRR1311348 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0291 0.7572 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.4004 0.3684 0.000 0.000 0.620 0.012 0.000 0.368
#> SRR1344010 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 2 0.3765 0.4060 0.404 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 2 0.3727 0.4232 0.388 0.612 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0146 0.7579 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0260 0.7562 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.0146 0.7571 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.1753 0.7107 0.004 0.912 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 2 0.3782 0.3906 0.412 0.588 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 2 0.4089 0.2250 0.468 0.524 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1087875 2 0.3765 0.4060 0.404 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613318 4 0.2997 0.4256 0.000 0.060 0.000 0.844 0.000 0.096
#> SRR1332694 2 0.3797 0.3727 0.420 0.580 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.4315 0.1113 0.000 0.000 0.496 0.004 0.012 0.488
#> SRR818670 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1120318 2 0.3765 0.4073 0.404 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 6 0.7431 0.1008 0.236 0.000 0.016 0.084 0.260 0.404
#> SRR1500931 5 0.1461 0.6940 0.016 0.000 0.044 0.000 0.940 0.000
#> SRR1387494 6 0.6752 0.4559 0.088 0.028 0.008 0.264 0.064 0.548
#> SRR1379175 2 0.4140 0.3803 0.024 0.688 0.000 0.280 0.008 0.000
#> SRR1401909 5 0.0713 0.7157 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1440541 2 0.0508 0.7551 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004 0.000
#> SRR1068832 5 0.0713 0.7157 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1376640 2 0.0790 0.7495 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.4612 0.0255 0.516 0.456 0.000 0.004 0.016 0.008
#> SRR1084276 1 0.3945 0.5311 0.748 0.200 0.004 0.000 0.048 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437035 2 0.4191 0.3683 0.388 0.596 0.000 0.012 0.004 0.000
#> SRR1396877 1 0.5675 0.4498 0.676 0.148 0.016 0.020 0.124 0.016
#> SRR1443026 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417936 2 0.3737 0.4251 0.392 0.608 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.1918 0.7127 0.008 0.904 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1101128 5 0.1390 0.7147 0.032 0.000 0.016 0.000 0.948 0.004
#> SRR1363886 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.1588 0.7207 0.004 0.924 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.0405 0.7575 0.004 0.988 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1093218 3 0.4285 0.2160 0.000 0.000 0.552 0.008 0.008 0.432
#> SRR1077090 5 0.1806 0.7120 0.088 0.000 0.000 0.000 0.908 0.004
#> SRR1327430 2 0.3110 0.5704 0.012 0.792 0.000 0.196 0.000 0.000
#> SRR1088958 2 0.3765 0.4060 0.404 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0363 0.7557 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1086820 2 0.3841 0.4367 0.380 0.616 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.4535 0.5205 0.724 0.188 0.000 0.012 0.072 0.004
#> SRR1355705 2 0.0146 0.7579 0.004 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614335 2 0.2234 0.6721 0.004 0.872 0.000 0.124 0.000 0.000
#> SRR660534 2 0.0865 0.7452 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0260 0.7573 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.0260 0.7562 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.3845 0.4815 0.788 0.144 0.000 0.004 0.056 0.008
#> SRR1351521 3 0.3468 0.4887 0.000 0.000 0.712 0.004 0.000 0.284
#> SRR1093100 2 0.3110 0.5713 0.012 0.792 0.000 0.196 0.000 0.000
#> SRR1309382 1 0.3765 0.2075 0.596 0.404 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 2 0.6207 -0.0735 0.392 0.476 0.000 0.028 0.080 0.024
#> SRR1499482 2 0.0363 0.7557 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR614719 4 0.3314 0.6671 0.004 0.256 0.000 0.740 0.000 0.000
#> SRR1081473 5 0.8872 0.2071 0.204 0.024 0.096 0.156 0.360 0.160
#> SRR1087415 2 0.3841 0.4367 0.380 0.616 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1088217 5 0.5584 0.4798 0.420 0.000 0.048 0.024 0.496 0.012
#> SRR808496 2 0.4359 0.3759 0.032 0.688 0.000 0.268 0.008 0.004
#> SRR1336463 2 0.0260 0.7562 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR612359 2 0.3961 -0.1364 0.004 0.556 0.000 0.440 0.000 0.000
#> SRR1444412 1 0.3945 0.5311 0.748 0.200 0.004 0.000 0.048 0.000
#> SRR1074116 3 0.0865 0.6501 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR821846 3 0.3489 0.4837 0.000 0.000 0.708 0.004 0.000 0.288
#> SRR656095 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808914 2 0.3860 0.2242 0.472 0.528 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 2 0.4154 0.4868 0.324 0.652 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1337886 2 0.0260 0.7571 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR813632 1 0.6051 0.4196 0.524 0.340 0.008 0.016 0.104 0.008
#> SRR1101591 3 0.6989 -0.2548 0.192 0.000 0.388 0.028 0.364 0.028
#> SRR1089713 1 0.7726 0.2801 0.376 0.360 0.008 0.088 0.124 0.044
#> SRR1453127 3 0.1700 0.6420 0.000 0.000 0.916 0.000 0.004 0.080
#> SRR1498354 5 0.1949 0.7127 0.088 0.000 0.004 0.000 0.904 0.004
#> SRR1313831 2 0.3782 0.3902 0.412 0.588 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 6 0.3869 -0.1619 0.000 0.000 0.500 0.000 0.000 0.500
#> SRR814747 2 0.0713 0.7476 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1358539 2 0.3737 0.4251 0.392 0.608 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 2 0.3765 0.4060 0.404 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 6 0.8734 0.3089 0.164 0.084 0.036 0.168 0.140 0.408
#> SRR1081519 1 0.6640 -0.5102 0.408 0.000 0.144 0.028 0.400 0.020
#> SRR614707 2 0.2581 0.6945 0.020 0.860 0.000 0.120 0.000 0.000
#> SRR1094027 2 0.3747 0.4190 0.396 0.604 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.7650 0.2988 0.392 0.336 0.008 0.080 0.152 0.032
#> SRR1079502 5 0.8872 0.2071 0.204 0.024 0.096 0.156 0.360 0.160
#> SRR1457814 4 0.4559 0.6431 0.008 0.184 0.000 0.720 0.004 0.084
#> SRR1455127 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1327855 5 0.0713 0.7157 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1417873 2 0.0363 0.7548 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1394125 6 0.9290 0.1516 0.152 0.044 0.120 0.148 0.244 0.292
#> SRR1488388 2 0.3817 0.3511 0.432 0.568 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.2595 0.6335 0.004 0.836 0.000 0.160 0.000 0.000
#> SRR612383 4 0.2994 0.6730 0.004 0.208 0.000 0.788 0.000 0.000
#> SRR1477711 2 0.3782 0.3902 0.412 0.588 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.1082 0.7439 0.004 0.956 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR612851 2 0.4117 -0.2367 0.004 0.528 0.000 0.464 0.000 0.004
#> SRR1086349 2 0.3737 0.4251 0.392 0.608 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 4 0.5804 0.2411 0.060 0.060 0.000 0.596 0.008 0.276
#> SRR1475885 2 0.3997 0.5330 0.288 0.688 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1376334 2 0.3804 0.3635 0.424 0.576 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 2 0.3795 0.4557 0.364 0.632 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.1049 0.6525 0.000 0.000 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR612323 4 0.3217 0.6793 0.008 0.224 0.000 0.768 0.000 0.000
#> SRR612604 2 0.0405 0.7561 0.008 0.988 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 2 0.3804 0.3683 0.424 0.576 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.5058 -0.2427 0.660 0.004 0.008 0.036 0.264 0.028
#> SRR1101808 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414079 6 0.4772 -0.0409 0.004 0.000 0.452 0.020 0.012 0.512
#> SRR1331153 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078439 4 0.8247 0.4302 0.176 0.160 0.032 0.460 0.116 0.056
#> SRR2165527 2 0.1411 0.7296 0.004 0.936 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1351147 2 0.3314 0.5822 0.256 0.740 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.3534 0.5888 0.244 0.740 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1403110 2 0.3828 0.3262 0.440 0.560 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0260 0.7562 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1401317 5 0.0713 0.7157 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1456862 1 0.4687 0.1938 0.536 0.424 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1074622 1 0.4663 0.4376 0.624 0.324 0.000 0.008 0.044 0.000
#> SRR1465847 1 0.6364 -0.5024 0.440 0.000 0.088 0.028 0.416 0.028
#> SRR1443376 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 6 0.4406 0.5001 0.020 0.004 0.020 0.200 0.016 0.740
#> SRR1075579 2 0.3706 0.4404 0.380 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 2 0.4797 -0.0354 0.032 0.568 0.000 0.388 0.004 0.008
#> SRR612251 4 0.1950 0.4685 0.000 0.064 0.000 0.912 0.000 0.024
#> SRR1418581 2 0.3765 0.4060 0.404 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0363 0.7561 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR613214 4 0.2994 0.6730 0.004 0.208 0.000 0.788 0.000 0.000
#> SRR613078 2 0.0291 0.7572 0.004 0.992 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1472998 1 0.6195 -0.4132 0.496 0.004 0.068 0.028 0.380 0.024
#> SRR1433452 2 0.0363 0.7558 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1101957 2 0.3804 0.3683 0.424 0.576 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 6 0.1148 0.4924 0.004 0.000 0.016 0.020 0.000 0.960
#> SRR1465983 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 2 0.3797 0.3727 0.420 0.580 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 6 0.6280 0.1423 0.016 0.000 0.388 0.104 0.028 0.464
#> SRR1316151 2 0.0405 0.7580 0.008 0.988 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1417547 2 0.2520 0.6454 0.004 0.844 0.000 0.152 0.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0260 0.7562 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1398207 1 0.5781 -0.3629 0.500 0.020 0.040 0.020 0.412 0.008
#> SRR1358755 5 0.3020 0.6587 0.176 0.000 0.004 0.004 0.812 0.004
#> SRR1078903 2 0.3966 -0.1534 0.004 0.552 0.000 0.444 0.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 2 0.3727 0.4294 0.388 0.612 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.2146 0.6783 0.004 0.880 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.1863 0.6907 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 2 0.7513 -0.2579 0.356 0.388 0.004 0.148 0.060 0.044
#> SRR808351 1 0.4674 0.5258 0.708 0.200 0.000 0.012 0.076 0.004
#> SRR1317513 2 0.3789 0.3818 0.416 0.584 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 5 0.2009 0.7045 0.040 0.000 0.040 0.000 0.916 0.004
#> SRR1081910 1 0.6519 -0.4663 0.448 0.008 0.088 0.028 0.404 0.024
#> SRR1086611 2 0.2176 0.7179 0.024 0.896 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1392571 2 0.1643 0.7284 0.008 0.924 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1311441 2 0.3774 0.3984 0.408 0.592 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808152 2 0.3944 0.3496 0.428 0.568 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.5566 0.4978 0.024 0.000 0.664 0.204 0.040 0.068
#> SRR1433131 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0260 0.7562 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1389108 2 0.3765 0.4060 0.404 0.596 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.6763 0.2284 0.064 0.000 0.564 0.036 0.136 0.200
#> SRR1399757 2 0.3706 0.4404 0.380 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.7083 0.1694 0.068 0.000 0.528 0.044 0.148 0.212
#> SRR1464517 6 0.5105 0.5131 0.076 0.000 0.012 0.112 0.072 0.728
#> SRR613557 4 0.3104 0.6698 0.004 0.204 0.000 0.788 0.000 0.004
#> SRR809831 1 0.5571 0.4713 0.680 0.160 0.012 0.020 0.112 0.016
#> SRR1429387 3 0.1285 0.6486 0.000 0.000 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR816565 2 0.3737 0.4251 0.392 0.608 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 2 0.3706 0.4404 0.380 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 5 0.8743 0.1265 0.164 0.008 0.116 0.168 0.356 0.188
#> SRR1072031 2 0.0000 0.7580 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 4 0.3583 0.6671 0.008 0.260 0.000 0.728 0.004 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.646 0.845 0.922 0.4572 0.557 0.557
#> 3 3 0.960 0.935 0.968 0.4007 0.739 0.555
#> 4 4 0.813 0.773 0.865 0.1104 0.912 0.759
#> 5 5 0.851 0.851 0.898 0.0716 0.926 0.754
#> 6 6 0.783 0.701 0.823 0.0455 0.970 0.880
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1404105 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR2164936 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR614491 1 0.4690 0.853 0.900 0.100
#> SRR1069376 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR811964 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1345715 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1328073 2 0.4562 0.838 0.096 0.904
#> SRR1394209 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.6712 0.786 0.176 0.824
#> SRR1354363 1 0.8081 0.604 0.752 0.248
#> SRR1391619 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1334670 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR612515 2 0.9815 0.321 0.420 0.580
#> SRR1092727 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1403980 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1442800 2 0.4161 0.845 0.084 0.916
#> SRR1359214 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1093053 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1399843 1 0.4939 0.844 0.892 0.108
#> SRR1380231 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1471672 2 0.8555 0.699 0.280 0.720
#> SRR613006 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1079023 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR813608 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1096736 2 0.9170 0.634 0.332 0.668
#> SRR1478700 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1384754 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1380317 2 0.0376 0.886 0.004 0.996
#> SRR1315247 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1480240 2 0.8955 0.666 0.312 0.688
#> SRR1084816 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1456075 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1367005 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1334419 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1417154 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1325771 2 0.4690 0.836 0.100 0.900
#> SRR1360420 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1332993 2 0.8955 0.666 0.312 0.688
#> SRR1311833 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1356266 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1341983 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.9491 0.285 0.632 0.368
#> SRR1072948 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.2603 0.918 0.956 0.044
#> SRR613843 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.7219 0.698 0.200 0.800
#> SRR1362848 1 0.7453 0.680 0.788 0.212
#> SRR1407492 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR818232 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1454868 1 0.9170 0.483 0.668 0.332
#> SRR1474816 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1342002 2 0.9954 0.344 0.460 0.540
#> SRR1088437 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1101373 2 0.4815 0.834 0.104 0.896
#> SRR1090145 2 0.3879 0.850 0.076 0.924
#> SRR1379324 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1345307 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR811819 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1318920 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR656758 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1474351 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR660450 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR614695 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1092372 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1474577 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1406582 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR612779 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1089006 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1354071 1 0.9754 0.142 0.592 0.408
#> SRR1105463 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1385319 2 0.8955 0.666 0.312 0.688
#> SRR1325871 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1090861 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1320712 2 0.3114 0.860 0.056 0.944
#> SRR1470075 2 0.8955 0.666 0.312 0.688
#> SRR1091254 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1101397 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1321165 2 0.9170 0.635 0.332 0.668
#> SRR1092112 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1078586 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1400333 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1078834 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1319443 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1324349 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1419062 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1329624 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1315739 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.4815 0.850 0.896 0.104
#> SRR1091890 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1327473 2 0.4298 0.843 0.088 0.912
#> SRR1338195 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1457792 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR658271 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.4298 0.869 0.912 0.088
#> SRR1322643 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR614887 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1354620 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1105320 2 0.8207 0.721 0.256 0.744
#> SRR1391529 2 0.9815 0.456 0.420 0.580
#> SRR663052 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.3584 0.892 0.932 0.068
#> SRR812366 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1389157 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR613568 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.0376 0.957 0.996 0.004
#> SRR1337155 1 0.4690 0.854 0.900 0.100
#> SRR1475345 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1446180 2 0.4431 0.841 0.092 0.908
#> SRR1406372 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1353136 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1093906 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1351104 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1363926 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1399861 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1338789 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1421420 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1476231 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1352870 2 0.6247 0.791 0.156 0.844
#> SRR1315041 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1102443 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR655672 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1420006 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1472749 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1431326 2 0.6048 0.805 0.148 0.852
#> SRR1487278 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.1414 0.942 0.980 0.020
#> SRR810273 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR811471 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1478341 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1088606 2 0.9170 0.634 0.332 0.668
#> SRR1479699 2 0.9795 0.468 0.416 0.584
#> SRR1403589 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1359803 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1338988 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1378992 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR659427 1 0.9460 0.398 0.636 0.364
#> SRR1096638 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1466619 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR659307 1 0.8144 0.661 0.748 0.252
#> SRR1439994 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1454931 2 0.9000 0.660 0.316 0.684
#> SRR1332928 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1095840 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1458243 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1374270 1 0.8327 0.612 0.736 0.264
#> SRR1470947 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1456274 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR817744 2 0.7815 0.741 0.232 0.768
#> SRR1478744 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1374198 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1445856 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR820049 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1375290 1 0.4161 0.874 0.916 0.084
#> SRR818999 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1390242 2 0.8713 0.687 0.292 0.708
#> SRR1401164 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1454629 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1332187 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR603365 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1488017 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR612947 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1441868 2 0.7950 0.735 0.240 0.760
#> SRR1485380 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1073705 2 0.5946 0.808 0.144 0.856
#> SRR615032 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1332816 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1407386 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1418064 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1309403 2 0.6623 0.788 0.172 0.828
#> SRR1498395 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1414749 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1419760 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1381841 2 0.9044 0.654 0.320 0.680
#> SRR821388 2 0.8443 0.707 0.272 0.728
#> SRR657623 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR819583 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1353028 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR811333 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR815092 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1500149 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1100564 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1403072 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR811653 1 0.8813 0.558 0.700 0.300
#> SRR1311348 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1319520 2 0.5178 0.826 0.116 0.884
#> SRR1444763 2 0.9044 0.654 0.320 0.680
#> SRR1415026 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1486780 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1453950 2 0.9977 0.307 0.472 0.528
#> SRR1087875 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR613318 1 0.9896 0.204 0.560 0.440
#> SRR1332694 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1468469 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1120318 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1311622 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1500931 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1379175 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1401909 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1437035 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1396877 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1417936 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1436822 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1101128 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1093218 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1077090 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1088958 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1486931 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1086820 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1383000 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1309382 1 0.9393 0.325 0.644 0.356
#> SRR1089375 1 0.5294 0.829 0.880 0.120
#> SRR1499482 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1087415 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1088217 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR808914 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1349099 2 0.9000 0.660 0.316 0.684
#> SRR1337886 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.1414 0.942 0.980 0.020
#> SRR1101591 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1453127 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1313831 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1315434 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1358539 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1367807 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1365791 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1081519 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR614707 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1094027 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1489092 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1079502 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1457814 1 0.9608 0.369 0.616 0.384
#> SRR1455127 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1488388 2 0.9000 0.660 0.316 0.684
#> SRR1401122 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.8016 0.619 0.244 0.756
#> SRR1477711 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1350813 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1086349 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR812837 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1475885 2 0.4431 0.841 0.092 0.908
#> SRR1376334 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1399821 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1347042 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1311877 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1465608 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.4022 0.879 0.920 0.080
#> SRR2165527 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1351147 2 0.4298 0.843 0.088 0.912
#> SRR1313536 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.1184 0.880 0.016 0.984
#> SRR1403110 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1400355 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1456862 2 0.9170 0.635 0.332 0.668
#> SRR1074622 1 0.8713 0.512 0.708 0.292
#> SRR1465847 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1075579 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1090881 2 0.4815 0.832 0.104 0.896
#> SRR612251 2 0.9209 0.528 0.336 0.664
#> SRR1418581 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR658045 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1101957 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1487993 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1380375 2 0.9000 0.660 0.316 0.684
#> SRR1367566 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1369172 2 0.8955 0.666 0.312 0.688
#> SRR615982 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.9795 0.110 0.584 0.416
#> SRR808351 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1317513 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1480501 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1086611 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1392571 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1311441 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR808152 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR657313 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1389108 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1376228 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1399757 2 0.3879 0.850 0.076 0.924
#> SRR1358060 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1464517 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR613557 2 0.9866 0.166 0.432 0.568
#> SRR809831 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR816565 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1071644 2 0.8909 0.671 0.308 0.692
#> SRR1406936 1 0.0000 0.961 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.888 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 3 0.0829 0.9243 0.012 0.004 0.984
#> SRR1404105 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR2164936 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1472057 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR614491 3 0.2339 0.8926 0.012 0.048 0.940
#> SRR1069376 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR811964 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1361415 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1345715 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1328073 1 0.5968 0.4355 0.636 0.364 0.000
#> SRR1394209 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1474018 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1099809 3 0.5926 0.4852 0.356 0.000 0.644
#> SRR1500555 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1354363 1 0.0661 0.9767 0.988 0.008 0.004
#> SRR1391619 3 0.0237 0.9304 0.004 0.000 0.996
#> SRR1307997 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR663124 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1334670 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR612515 2 0.6600 0.3151 0.012 0.604 0.384
#> SRR1092727 2 0.0424 0.9778 0.008 0.992 0.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468553 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420169 3 0.1643 0.9017 0.044 0.000 0.956
#> SRR1442800 2 0.4399 0.7586 0.188 0.812 0.000
#> SRR1359214 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1499849 3 0.4887 0.7108 0.228 0.000 0.772
#> SRR1500030 3 0.0237 0.9304 0.004 0.000 0.996
#> SRR1093053 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399843 3 0.5171 0.7442 0.012 0.204 0.784
#> SRR1380231 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR809470 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR614239 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR613939 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR612971 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1490204 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR811357 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1471672 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR613006 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1469570 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1457354 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079023 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR813608 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1096736 1 0.0237 0.9656 0.996 0.004 0.000
#> SRR1478700 1 0.0747 0.9662 0.984 0.000 0.016
#> SRR1081543 3 0.0829 0.9243 0.012 0.004 0.984
#> SRR1384754 3 0.0592 0.9264 0.012 0.000 0.988
#> SRR612287 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1380317 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1315247 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1105344 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR658549 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1480240 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1084816 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR612551 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1358520 2 0.0424 0.9778 0.008 0.992 0.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456075 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1389474 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1367005 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1334419 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095985 1 0.6274 0.1350 0.544 0.000 0.456
#> SRR1325771 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR660272 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1332993 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1311833 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR808044 1 0.0747 0.9662 0.984 0.000 0.016
#> SRR1076916 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356266 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1341983 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1456114 1 0.0661 0.9767 0.988 0.008 0.004
#> SRR1072948 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472370 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480176 1 0.0661 0.9767 0.988 0.008 0.004
#> SRR613843 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1469192 1 0.0747 0.9662 0.984 0.000 0.016
#> SRR1404555 3 0.0237 0.9304 0.004 0.000 0.996
#> SRR659839 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR659533 2 0.2446 0.9256 0.012 0.936 0.052
#> SRR1362848 3 0.4128 0.8106 0.012 0.132 0.856
#> SRR1407492 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000 0.000
#> SRR658362 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR810921 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR662823 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR818232 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1454868 3 0.6632 0.3935 0.012 0.392 0.596
#> SRR1474816 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1342002 1 0.0661 0.9767 0.988 0.008 0.004
#> SRR1088437 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1466400 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR658921 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1499873 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1101373 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1090145 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1379324 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1345307 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454891 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR663185 2 0.0424 0.9778 0.008 0.992 0.000
#> SRR811819 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1318920 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR656758 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1474351 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR660450 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1472687 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1334291 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1415153 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1323271 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1368939 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1443161 3 0.4629 0.7662 0.188 0.004 0.808
#> SRR614695 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1092372 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1474577 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1406582 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR612779 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1089006 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1354071 1 0.0661 0.9767 0.988 0.008 0.004
#> SRR1105463 1 0.2066 0.9245 0.940 0.000 0.060
#> SRR811005 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1385319 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1325871 3 0.0237 0.9304 0.004 0.000 0.996
#> SRR1355415 3 0.5254 0.6570 0.264 0.000 0.736
#> SRR1090861 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1320712 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1470075 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1091254 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1101397 3 0.4555 0.7478 0.200 0.000 0.800
#> SRR1321165 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1092112 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074790 2 0.2537 0.9034 0.080 0.920 0.000
#> SRR1432106 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.0747 0.9662 0.984 0.000 0.016
#> SRR1318582 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1080484 2 0.0424 0.9778 0.008 0.992 0.000
#> SRR1072749 3 0.1163 0.9138 0.028 0.000 0.972
#> SRR1078586 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1400333 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078834 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1417611 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1396840 1 0.0747 0.9662 0.984 0.000 0.016
#> SRR1465440 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1400530 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR614984 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1324269 1 0.0747 0.9662 0.984 0.000 0.016
#> SRR1401491 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1319443 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1324349 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1345523 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1500846 1 0.0747 0.9662 0.984 0.000 0.016
#> SRR661505 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480131 1 0.0592 0.9699 0.988 0.000 0.012
#> SRR1421284 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1329624 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099189 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1083286 1 0.0661 0.9767 0.988 0.008 0.004
#> SRR1091890 3 0.0829 0.9243 0.012 0.004 0.984
#> SRR1347436 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1327473 1 0.0747 0.9754 0.984 0.016 0.000
#> SRR1338195 3 0.0237 0.9304 0.004 0.000 0.996
#> SRR809698 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1457792 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR658271 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1339597 1 0.0747 0.9662 0.984 0.000 0.016
#> SRR1454842 3 0.4733 0.7558 0.004 0.196 0.800
#> SRR1322643 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR614887 3 0.0237 0.9304 0.004 0.000 0.996
#> SRR1354620 3 0.2448 0.8757 0.076 0.000 0.924
#> SRR615056 2 0.0424 0.9778 0.008 0.992 0.000
#> SRR1105320 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1391529 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR663052 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1478834 1 0.0661 0.9767 0.988 0.008 0.004
#> SRR812366 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1435330 3 0.0237 0.9304 0.004 0.000 0.996
#> SRR615383 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1389157 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR613568 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR614095 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1103092 1 0.0592 0.9699 0.988 0.000 0.012
#> SRR1337155 3 0.5884 0.7696 0.064 0.148 0.788
#> SRR1475345 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR809089 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1446180 2 0.1411 0.9531 0.036 0.964 0.000
#> SRR1406372 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1339880 3 0.0237 0.9304 0.004 0.000 0.996
#> SRR1353136 3 0.0829 0.9243 0.012 0.004 0.984
#> SRR1093906 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR614035 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1351104 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1363926 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1399861 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1338789 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1421420 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420832 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1476231 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1352870 2 0.1751 0.9511 0.012 0.960 0.028
#> SRR1315041 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443268 3 0.4842 0.7169 0.224 0.000 0.776
#> SRR1416617 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102443 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR655672 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1420006 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458267 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR613819 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1469432 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR660907 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1465092 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1470727 3 0.6154 0.3508 0.408 0.000 0.592
#> SRR1339153 3 0.0237 0.9304 0.004 0.000 0.996
#> SRR1472749 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414379 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1431326 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1487278 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1098312 3 0.0829 0.9243 0.012 0.004 0.984
#> SRR810273 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1376000 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR614467 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR811471 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088606 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1479699 2 0.8913 0.4028 0.208 0.572 0.220
#> SRR1403589 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR812625 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1359803 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1338988 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1471222 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1378992 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR659427 3 0.6713 0.3295 0.012 0.416 0.572
#> SRR1096638 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1466619 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR659307 3 0.6255 0.5550 0.012 0.320 0.668
#> SRR1439994 3 0.4555 0.7478 0.200 0.000 0.800
#> SRR1454931 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1332928 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR658621 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1095840 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1458243 3 0.5216 0.6647 0.260 0.000 0.740
#> SRR1374270 3 0.6282 0.5470 0.012 0.324 0.664
#> SRR1470947 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1365598 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR662787 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1408727 2 0.0424 0.9778 0.008 0.992 0.000
#> SRR1456274 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR817744 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1478744 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1387379 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1102680 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374198 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1445856 1 0.3340 0.8547 0.880 0.000 0.120
#> SRR820049 3 0.0237 0.9304 0.004 0.000 0.996
#> SRR1375290 3 0.4963 0.7519 0.008 0.200 0.792
#> SRR818999 1 0.3192 0.8631 0.888 0.000 0.112
#> SRR1390242 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1401164 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1454629 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1332187 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR657833 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1436207 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1488017 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR612947 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1480384 1 0.0747 0.9662 0.984 0.000 0.016
#> SRR1364761 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1308086 3 0.0237 0.9304 0.004 0.000 0.996
#> SRR1441868 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073705 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR615032 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1452356 2 0.0424 0.9778 0.008 0.992 0.000
#> SRR1442983 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1100346 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1332816 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR612299 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1407386 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1418064 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1309403 1 0.1643 0.9433 0.956 0.044 0.000
#> SRR1498395 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1079998 3 0.0892 0.9192 0.020 0.000 0.980
#> SRR1498885 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1337215 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1414749 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365963 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368030 2 0.0424 0.9778 0.008 0.992 0.000
#> SRR1419760 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1381841 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR821388 2 0.5986 0.5651 0.012 0.704 0.284
#> SRR657623 2 0.0424 0.9778 0.008 0.992 0.000
#> SRR1094241 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096149 1 0.0747 0.9662 0.984 0.000 0.016
#> SRR1342829 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353028 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR811333 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311666 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1486698 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1446436 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR815092 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1500149 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1100564 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR811653 3 0.6404 0.5055 0.012 0.344 0.644
#> SRR1311348 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1489438 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1435442 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1421444 3 0.0237 0.9304 0.004 0.000 0.996
#> SRR1344010 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1319520 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1444763 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1415026 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1416596 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1485499 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1316078 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR663465 2 0.0424 0.9778 0.008 0.992 0.000
#> SRR1310094 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR663537 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1486780 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1453950 1 0.0661 0.9767 0.988 0.008 0.004
#> SRR1087875 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR613318 3 0.6735 0.3019 0.012 0.424 0.564
#> SRR1332694 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR818670 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1120318 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1311622 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500931 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387494 3 0.0237 0.9304 0.004 0.000 0.996
#> SRR1379175 2 0.0424 0.9778 0.008 0.992 0.000
#> SRR1401909 3 0.2625 0.8687 0.084 0.000 0.916
#> SRR1440541 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1068832 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376640 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1085712 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1082283 1 0.0747 0.9662 0.984 0.000 0.016
#> SRR1084276 1 0.0747 0.9662 0.984 0.000 0.016
#> SRR1353262 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1437035 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1396877 3 0.5397 0.6302 0.280 0.000 0.720
#> SRR1443026 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1417936 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1436822 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1101128 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363886 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR612983 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1394366 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1093218 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077090 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327430 2 0.0424 0.9778 0.008 0.992 0.000
#> SRR1088958 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1486931 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1086820 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1383000 1 0.0747 0.9662 0.984 0.000 0.016
#> SRR1355705 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR614335 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR660534 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR817094 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1334265 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1456401 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1086393 1 0.0747 0.9662 0.984 0.000 0.016
#> SRR1351521 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093100 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1309382 1 0.0661 0.9767 0.988 0.008 0.004
#> SRR1089375 1 0.0661 0.9767 0.988 0.008 0.004
#> SRR1499482 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR614719 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1081473 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087415 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1088217 3 0.5291 0.6504 0.268 0.000 0.732
#> SRR808496 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1336463 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR612359 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1444412 1 0.0747 0.9662 0.984 0.000 0.016
#> SRR1074116 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR821846 3 0.0237 0.9304 0.004 0.000 0.996
#> SRR656095 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR808914 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1349099 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1337886 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR813632 1 0.0747 0.9662 0.984 0.000 0.016
#> SRR1101591 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089713 1 0.5926 0.4233 0.644 0.000 0.356
#> SRR1453127 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498354 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313831 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR814747 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1358539 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1367807 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1365791 3 0.0237 0.9304 0.004 0.000 0.996
#> SRR1081519 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR614707 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1094027 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1489092 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079502 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457814 3 0.6566 0.4327 0.012 0.376 0.612
#> SRR1455127 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR615081 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1327855 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417873 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1394125 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488388 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1401122 2 0.0424 0.9778 0.008 0.992 0.000
#> SRR612383 2 0.1999 0.9428 0.012 0.952 0.036
#> SRR1477711 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1350813 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR612851 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR1086349 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR812837 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1340010 3 0.0829 0.9243 0.012 0.004 0.984
#> SRR1475885 2 0.6204 0.2506 0.424 0.576 0.000
#> SRR1376334 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1399821 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR612323 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR612604 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1389546 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1311877 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1465608 1 0.6309 -0.0698 0.500 0.000 0.500
#> SRR1101808 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1414079 3 0.0237 0.9304 0.004 0.000 0.996
#> SRR1331153 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1078439 3 0.4834 0.7490 0.004 0.204 0.792
#> SRR2165527 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1351147 1 0.0747 0.9754 0.984 0.016 0.000
#> SRR1313536 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1070308 2 0.2066 0.9264 0.060 0.940 0.000
#> SRR1403110 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1400355 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456862 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1074622 1 0.0661 0.9767 0.988 0.008 0.004
#> SRR1465847 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443376 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075579 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1090881 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR612251 2 0.5578 0.6521 0.012 0.748 0.240
#> SRR1418581 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR658045 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR613214 2 0.0592 0.9752 0.012 0.988 0.000
#> SRR613078 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1472998 3 0.4504 0.7527 0.196 0.000 0.804
#> SRR1433452 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1101957 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1487993 3 0.0237 0.9304 0.004 0.000 0.996
#> SRR1465983 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1380375 1 0.0661 0.9767 0.988 0.008 0.004
#> SRR1367566 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316151 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1490270 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1398207 3 0.6267 0.2152 0.452 0.000 0.548
#> SRR1358755 3 0.4555 0.7478 0.200 0.000 0.800
#> SRR1078903 2 0.0424 0.9778 0.008 0.992 0.000
#> SRR1323252 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1451796 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1369172 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR615982 2 0.0424 0.9778 0.008 0.992 0.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1102393 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1071313 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR808351 1 0.0747 0.9662 0.984 0.000 0.016
#> SRR1317513 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1480501 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081910 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086611 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1392571 2 0.0000 0.9823 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR808152 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR657313 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433131 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1321011 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1500598 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1379343 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1389108 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399757 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR613557 2 0.6647 0.2791 0.012 0.592 0.396
#> SRR809831 1 0.4796 0.7178 0.780 0.000 0.220
#> SRR1429387 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR816565 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1071644 1 0.0592 0.9794 0.988 0.012 0.000
#> SRR1406936 3 0.0000 0.9317 0.000 0.000 1.000
#> SRR1072031 2 0.0237 0.9843 0.004 0.996 0.000
#> SRR1374671 2 0.0424 0.9778 0.008 0.992 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 4 0.4972 0.2711 0.000 0.000 0.456 0.544
#> SRR1404105 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.4661 0.7562 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR614491 4 0.4730 0.3991 0.000 0.000 0.364 0.636
#> SRR1069376 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR811964 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1345715 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1328073 1 0.6091 0.3530 0.596 0.060 0.000 0.344
#> SRR1394209 4 0.4985 0.4715 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1474018 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1099809 3 0.7640 0.5584 0.212 0.000 0.432 0.356
#> SRR1500555 4 0.4925 0.5366 0.000 0.428 0.000 0.572
#> SRR1354363 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1391619 3 0.3610 0.6168 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1307997 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR663124 4 0.4817 0.5968 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1334670 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR612515 4 0.6442 0.5805 0.000 0.124 0.244 0.632
#> SRR1092727 2 0.4967 -0.2480 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR1364013 2 0.3801 0.5785 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1468553 3 0.2281 0.7071 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1403980 3 0.0188 0.7470 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1420169 3 0.5420 0.7446 0.024 0.000 0.624 0.352
#> SRR1442800 2 0.4245 0.5799 0.196 0.784 0.000 0.020
#> SRR1359214 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1499849 3 0.6750 0.6803 0.104 0.000 0.540 0.356
#> SRR1500030 3 0.2469 0.6990 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1093053 3 0.4967 0.6985 0.000 0.000 0.548 0.452
#> SRR1399843 4 0.3090 0.4206 0.000 0.056 0.056 0.888
#> SRR1380231 3 0.4889 0.7512 0.004 0.000 0.636 0.360
#> SRR809470 3 0.4697 0.7536 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR614239 4 0.4817 0.5968 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR613939 2 0.0336 0.9239 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR612971 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR613006 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1362906 3 0.2345 0.7045 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1079023 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR813608 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.4961 0.2396 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1478700 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1081543 4 0.4972 0.2711 0.000 0.000 0.456 0.544
#> SRR1384754 4 0.4985 0.2437 0.000 0.000 0.468 0.532
#> SRR612287 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1380317 4 0.4817 0.5933 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1315247 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1105344 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658549 4 0.4992 0.4612 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1480240 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1358520 2 0.4916 -0.1290 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1419476 3 0.4624 0.7579 0.000 0.000 0.660 0.340
#> SRR1456075 3 0.4697 0.7546 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1334419 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1417154 3 0.2281 0.7071 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1095985 1 0.7692 -0.0390 0.412 0.000 0.220 0.368
#> SRR1325771 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1360420 3 0.1637 0.7580 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR660272 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1332993 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808044 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1076916 3 0.4222 0.7550 0.000 0.000 0.728 0.272
#> SRR1356266 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1341983 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1456114 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1072948 3 0.2868 0.7645 0.000 0.000 0.864 0.136
#> SRR1472370 3 0.4661 0.7562 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1480176 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR613843 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1404555 3 0.2469 0.6990 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR659839 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659533 4 0.6432 0.5877 0.000 0.128 0.236 0.636
#> SRR1362848 4 0.4730 0.3991 0.000 0.000 0.364 0.636
#> SRR1407492 4 0.4776 0.6087 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1455082 2 0.4040 0.5187 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR658362 2 0.4830 0.0139 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR810921 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1456375 3 0.3444 0.7661 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR818232 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1454868 4 0.6422 0.5768 0.000 0.120 0.248 0.632
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466400 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658921 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090145 1 0.0469 0.9413 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1379324 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.2281 0.7071 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1086280 3 0.0000 0.7483 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.4933 -0.1730 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR663185 2 0.3801 0.5856 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR811819 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1318920 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR656758 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR660450 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1472687 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1334291 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1368939 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1443161 4 0.1398 0.2480 0.004 0.000 0.040 0.956
#> SRR614695 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1092372 1 0.0336 0.9430 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1474577 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1406582 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612779 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1354071 1 0.2973 0.8301 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1105463 1 0.7091 0.2581 0.508 0.000 0.136 0.356
#> SRR811005 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1325871 3 0.3123 0.6628 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1355415 3 0.6797 0.6765 0.108 0.000 0.536 0.356
#> SRR1090861 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1320712 4 0.5951 0.6499 0.000 0.300 0.064 0.636
#> SRR1470075 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1091254 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1101397 3 0.6725 0.6854 0.104 0.000 0.548 0.348
#> SRR1321165 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1092112 3 0.4661 0.7562 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1417588 3 0.0188 0.7470 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1074790 2 0.3249 0.7034 0.140 0.852 0.000 0.008
#> SRR1432106 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR655756 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.4134 0.6862 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.3837 0.5764 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1072749 3 0.5403 0.7457 0.024 0.000 0.628 0.348
#> SRR1078586 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1400333 4 0.4992 0.4533 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1078834 2 0.1022 0.8989 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1417611 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1396840 1 0.2011 0.8884 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1465440 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1400530 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614984 4 0.5143 0.6212 0.000 0.360 0.012 0.628
#> SRR1324269 1 0.1022 0.9290 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1401491 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1319443 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1324349 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.3486 0.7763 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR661505 3 0.4679 0.7555 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1419062 3 0.4679 0.7555 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1480131 1 0.2868 0.8361 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1421284 2 0.4941 -0.1776 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR1329624 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1315739 3 0.0188 0.7492 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1099189 2 0.4933 -0.1612 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR1083286 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1091890 4 0.4985 0.2519 0.000 0.000 0.468 0.532
#> SRR1347436 2 0.2868 0.7511 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1327473 1 0.0707 0.9374 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1338195 3 0.2408 0.7013 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR809698 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR658271 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.4134 0.6862 0.740 0.000 0.000 0.260
#> SRR1454842 3 0.6471 0.1118 0.000 0.072 0.512 0.416
#> SRR1322643 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR614887 3 0.2469 0.6990 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1354620 3 0.5778 0.7316 0.040 0.000 0.604 0.356
#> SRR615056 2 0.3311 0.6874 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1105320 1 0.0707 0.9374 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1391529 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR663052 4 0.4992 0.4545 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1478834 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR812366 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1435330 3 0.2469 0.6990 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR615383 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 4 0.4790 0.6050 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR613568 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614095 4 0.4989 0.4628 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1103092 1 0.0817 0.9344 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1337155 4 0.4068 0.0192 0.016 0.008 0.160 0.816
#> SRR1475345 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR809089 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 2 0.3763 0.7095 0.024 0.832 0.000 0.144
#> SRR1406372 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1339880 3 0.2469 0.6990 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1353136 4 0.4746 0.3938 0.000 0.000 0.368 0.632
#> SRR1093906 3 0.0336 0.7483 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR614035 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1351104 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1363926 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1399861 4 0.4746 0.6128 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR1338789 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1421420 3 0.0469 0.7510 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1420832 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1476231 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1352870 4 0.6350 0.6622 0.000 0.252 0.112 0.636
#> SRR1315041 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR661877 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1443268 3 0.6991 0.6623 0.128 0.000 0.524 0.348
#> SRR1416617 3 0.2281 0.7071 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1102443 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR655672 4 0.4761 0.6119 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR1420006 3 0.0188 0.7492 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1458267 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR613819 4 0.4992 0.4545 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1469432 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR660907 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1465092 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1470727 1 0.7728 -0.0644 0.416 0.000 0.232 0.352
#> SRR1339153 3 0.3907 0.7063 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1472749 3 0.2345 0.7045 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1414379 2 0.4933 -0.1612 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR1431326 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1487278 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1098312 4 0.4866 0.3515 0.000 0.000 0.404 0.596
#> SRR810273 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614467 4 0.4996 0.4342 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR811471 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1478341 3 0.0336 0.7483 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1088606 1 0.2149 0.8860 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1479699 4 0.6795 0.4904 0.052 0.052 0.256 0.640
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1359803 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1338988 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1471222 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1378992 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR659427 4 0.3708 0.5311 0.000 0.148 0.020 0.832
#> SRR1096638 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1466619 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR659307 4 0.6400 0.5724 0.000 0.116 0.252 0.632
#> SRR1439994 3 0.6677 0.6885 0.100 0.000 0.552 0.348
#> SRR1454931 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1332928 3 0.4697 0.7546 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR658621 4 0.4996 0.4342 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR1095840 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1458243 3 0.7259 0.6306 0.156 0.000 0.492 0.352
#> SRR1374270 4 0.6350 0.5717 0.000 0.112 0.252 0.636
#> SRR1470947 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1365598 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR662787 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1408727 2 0.4925 -0.1575 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR1456274 1 0.0469 0.9382 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR817744 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1478744 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.4679 0.7555 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1374198 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1445856 1 0.7191 0.2246 0.500 0.000 0.148 0.352
#> SRR820049 3 0.4961 0.6987 0.000 0.000 0.552 0.448
#> SRR1375290 4 0.1661 0.3022 0.000 0.004 0.052 0.944
#> SRR818999 1 0.7020 0.3097 0.532 0.000 0.136 0.332
#> SRR1390242 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1401164 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1454629 1 0.2345 0.8739 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1332187 3 0.2281 0.7071 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR603365 3 0.4661 0.7562 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR657833 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1436207 2 0.0592 0.9133 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1488017 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR612947 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.1792 0.8969 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.2469 0.6990 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1441868 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1485380 3 0.4661 0.7562 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1073705 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR615032 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1452356 2 0.4855 -0.0230 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 4 0.4994 0.4522 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1332816 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612299 2 0.1211 0.8888 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1407386 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1418064 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1309403 1 0.1022 0.9292 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1498395 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1079998 3 0.5093 0.7518 0.012 0.000 0.640 0.348
#> SRR1498885 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1337215 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1414749 3 0.3528 0.7661 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1365963 3 0.4837 0.7552 0.004 0.000 0.648 0.348
#> SRR1368030 2 0.4933 -0.1612 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR1419760 2 0.4933 -0.1610 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR1381841 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR821388 4 0.6113 0.5292 0.000 0.080 0.284 0.636
#> SRR657623 2 0.3837 0.5769 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1094241 3 0.4605 0.7593 0.000 0.000 0.664 0.336
#> SRR819583 3 0.4661 0.7562 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1096149 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1342829 3 0.1637 0.7580 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1353028 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR811333 3 0.2589 0.7354 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1446436 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR815092 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1500149 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1100564 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1403072 3 0.3726 0.7654 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR811653 4 0.6350 0.5717 0.000 0.112 0.252 0.636
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1435442 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1421444 3 0.2345 0.7045 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1344010 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1319520 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444763 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1415026 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1416596 2 0.0336 0.9258 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1485499 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1316078 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR663465 2 0.2011 0.8362 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1310094 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR663537 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1453950 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1087875 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR613318 4 0.4889 0.4057 0.000 0.004 0.360 0.636
#> SRR1332694 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1468469 3 0.0000 0.7483 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1311622 3 0.2345 0.7045 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1500931 3 0.4661 0.7562 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1387494 3 0.2868 0.6776 0.000 0.000 0.864 0.136
#> SRR1379175 4 0.4985 0.4694 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1401909 3 0.5898 0.7301 0.048 0.000 0.604 0.348
#> SRR1440541 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1068832 3 0.4661 0.7562 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1376640 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1085712 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1082283 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1084276 1 0.6702 0.3502 0.544 0.000 0.100 0.356
#> SRR1353262 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1437035 1 0.0592 0.9397 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1396877 1 0.7612 0.0812 0.476 0.000 0.264 0.260
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0188 0.9430 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1436822 2 0.0336 0.9258 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1101128 3 0.4661 0.7562 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1363886 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612983 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1394366 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1093218 3 0.0188 0.7492 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1077090 3 0.4661 0.7562 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1327430 4 0.4994 0.4444 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1088958 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486931 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1086820 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1383000 1 0.0707 0.9349 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1355705 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614335 4 0.4992 0.4545 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR660534 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1456401 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1086393 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1351521 3 0.2281 0.7071 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1093100 2 0.4955 -0.2091 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1309382 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1089375 1 0.0707 0.9381 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614719 4 0.4994 0.4522 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1081473 3 0.4697 0.7546 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1087415 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1088217 3 0.6930 0.6646 0.120 0.000 0.524 0.356
#> SRR808496 4 0.4996 0.4342 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR1336463 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612359 4 0.4992 0.4539 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1444412 1 0.6653 0.3588 0.548 0.000 0.096 0.356
#> SRR1074116 3 0.3726 0.7654 0.000 0.000 0.788 0.212
#> SRR821846 3 0.2345 0.7045 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR656095 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1349099 1 0.0592 0.9376 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813632 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1101591 3 0.4304 0.7626 0.000 0.000 0.716 0.284
#> SRR1089713 1 0.7148 0.2342 0.496 0.000 0.140 0.364
#> SRR1453127 3 0.1940 0.7178 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1498354 3 0.4661 0.7562 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1313831 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1315434 3 0.2081 0.7137 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR814747 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1358539 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1367807 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1365791 3 0.2704 0.6881 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1081519 3 0.4661 0.7562 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR614707 2 0.1211 0.8888 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1094027 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1489092 3 0.6578 0.6945 0.108 0.000 0.592 0.300
#> SRR1079502 3 0.4697 0.7546 0.000 0.000 0.644 0.356
#> SRR1457814 4 0.6245 0.5513 0.000 0.096 0.268 0.636
#> SRR1455127 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR615081 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1327855 3 0.4661 0.7562 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1417873 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1394125 3 0.2530 0.7320 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1488388 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1401122 2 0.3801 0.5856 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR612383 4 0.6583 0.6203 0.000 0.176 0.192 0.632
#> SRR1477711 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1350813 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612851 4 0.4961 0.5113 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9430 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1340010 4 0.4967 0.2794 0.000 0.000 0.452 0.548
#> SRR1475885 2 0.5383 0.1069 0.452 0.536 0.000 0.012
#> SRR1376334 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1399821 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1347042 3 0.0336 0.7483 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR612323 4 0.5143 0.6211 0.000 0.360 0.012 0.628
#> SRR612604 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1465608 1 0.5495 0.5013 0.624 0.000 0.028 0.348
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.2408 0.7013 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1331153 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1078439 4 0.1743 0.2339 0.000 0.004 0.056 0.940
#> SRR2165527 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1351147 1 0.0779 0.9372 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.3428 0.6918 0.144 0.844 0.000 0.012
#> SRR1403110 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.4661 0.7562 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1456862 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1074622 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1465847 3 0.4661 0.7562 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.2469 0.6990 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1075579 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1090881 4 0.4804 0.5980 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR612251 4 0.6531 0.6115 0.000 0.160 0.204 0.636
#> SRR1418581 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR658045 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613214 4 0.5127 0.6234 0.000 0.356 0.012 0.632
#> SRR613078 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1472998 3 0.6725 0.6854 0.104 0.000 0.548 0.348
#> SRR1433452 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1101957 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1487993 3 0.2469 0.6990 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1367566 3 0.2281 0.7071 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1316151 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1417547 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR659389 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1490270 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1398207 4 0.7896 -0.4673 0.292 0.000 0.352 0.356
#> SRR1358755 3 0.6750 0.6803 0.104 0.000 0.540 0.356
#> SRR1078903 2 0.2216 0.8141 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR615982 2 0.4933 -0.1706 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR1480431 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1429825 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.0336 0.9401 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR808351 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1317513 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1480501 3 0.4661 0.7562 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1081910 3 0.4175 0.7598 0.012 0.000 0.776 0.212
#> SRR1086611 2 0.4304 0.4191 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1392571 2 0.4008 0.5289 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1311441 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR808152 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR657313 3 0.4941 0.7040 0.000 0.000 0.564 0.436
#> SRR1433131 2 0.0188 0.9264 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1321011 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1500598 2 0.0188 0.9268 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0188 0.9429 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1376228 3 0.0188 0.7492 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1399757 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1358060 3 0.0188 0.7470 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1464517 3 0.2921 0.7131 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR613557 4 0.6442 0.5805 0.000 0.124 0.244 0.632
#> SRR809831 1 0.5159 0.7076 0.756 0.000 0.156 0.088
#> SRR1429387 3 0.0469 0.7443 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR816565 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1071644 1 0.0336 0.9428 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1406936 3 0.2530 0.7399 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9276 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 4 0.4996 0.4419 0.000 0.484 0.000 0.516
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 3 0.4342 0.66969 0.000 0.000 0.728 0.232 0.040
#> SRR1404105 1 0.0000 0.94865 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.1386 0.90914 0.000 0.952 0.000 0.016 0.032
#> SRR1472057 5 0.3210 0.86421 0.000 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR614491 4 0.1671 0.80976 0.000 0.000 0.076 0.924 0.000
#> SRR1069376 1 0.0404 0.94896 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR811964 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1345715 1 0.1278 0.94598 0.960 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR1328073 1 0.5864 0.53569 0.640 0.028 0.000 0.244 0.088
#> SRR1394209 4 0.2654 0.84370 0.000 0.084 0.000 0.884 0.032
#> SRR1474018 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1099809 5 0.4176 0.82189 0.108 0.000 0.096 0.004 0.792
#> SRR1500555 4 0.3079 0.84319 0.000 0.092 0.012 0.868 0.028
#> SRR1354363 1 0.1377 0.94514 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR1391619 3 0.3143 0.74817 0.000 0.000 0.796 0.204 0.000
#> SRR1307997 2 0.1571 0.90042 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR663124 4 0.2104 0.85469 0.000 0.060 0.024 0.916 0.000
#> SRR1334670 1 0.0290 0.94753 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR612515 4 0.1943 0.83412 0.000 0.020 0.056 0.924 0.000
#> SRR1092727 4 0.3093 0.80603 0.000 0.168 0.000 0.824 0.008
#> SRR1364013 2 0.4465 0.47948 0.000 0.672 0.000 0.304 0.024
#> SRR1468553 3 0.0865 0.90315 0.000 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1403980 3 0.1121 0.89904 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1420169 5 0.3280 0.87092 0.004 0.000 0.184 0.004 0.808
#> SRR1442800 2 0.5377 0.64071 0.160 0.712 0.000 0.028 0.100
#> SRR1359214 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1499849 5 0.3937 0.85750 0.060 0.000 0.132 0.004 0.804
#> SRR1500030 3 0.0703 0.90361 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1093053 5 0.4010 0.85213 0.000 0.000 0.160 0.056 0.784
#> SRR1399843 4 0.2417 0.83042 0.000 0.016 0.032 0.912 0.040
#> SRR1380231 5 0.3631 0.85296 0.012 0.000 0.144 0.024 0.820
#> SRR809470 5 0.3521 0.86813 0.012 0.000 0.172 0.008 0.808
#> SRR614239 4 0.2104 0.85469 0.000 0.060 0.024 0.916 0.000
#> SRR613939 2 0.1877 0.89505 0.000 0.924 0.000 0.012 0.064
#> SRR612971 2 0.1628 0.90406 0.000 0.936 0.000 0.008 0.056
#> SRR1490204 2 0.0609 0.91468 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR811357 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR613006 2 0.1638 0.89858 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1469570 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.1670 0.90393 0.000 0.936 0.000 0.012 0.052
#> SRR1362906 3 0.0693 0.90447 0.000 0.000 0.980 0.012 0.008
#> SRR1079023 1 0.0404 0.94792 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 4 0.5921 0.12294 0.420 0.000 0.016 0.500 0.064
#> SRR1478700 1 0.1653 0.94223 0.944 0.000 0.004 0.024 0.028
#> SRR1081543 3 0.3805 0.73353 0.000 0.000 0.784 0.184 0.032
#> SRR1384754 3 0.4284 0.68552 0.000 0.000 0.736 0.224 0.040
#> SRR612287 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1380317 4 0.2095 0.85431 0.000 0.060 0.008 0.920 0.012
#> SRR1315247 2 0.1638 0.89858 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1105344 2 0.2046 0.89586 0.000 0.916 0.000 0.016 0.068
#> SRR658549 4 0.2017 0.85374 0.000 0.080 0.008 0.912 0.000
#> SRR1480240 1 0.0404 0.94638 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.2144 0.89407 0.000 0.912 0.000 0.020 0.068
#> SRR1358520 4 0.4955 0.67722 0.000 0.248 0.000 0.680 0.072
#> SRR1419476 5 0.3707 0.79190 0.000 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR1456075 5 0.3419 0.86431 0.000 0.000 0.180 0.016 0.804
#> SRR1389474 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR1334419 1 0.1278 0.94598 0.960 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR1417154 3 0.1399 0.89813 0.000 0.000 0.952 0.020 0.028
#> SRR1095985 5 0.3514 0.80103 0.088 0.000 0.048 0.016 0.848
#> SRR1325771 1 0.0162 0.94873 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1360420 3 0.1043 0.89216 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR660272 2 0.1571 0.90042 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1332993 1 0.0404 0.94896 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1311833 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808044 1 0.1653 0.94223 0.944 0.000 0.004 0.024 0.028
#> SRR1076916 5 0.4090 0.74898 0.000 0.000 0.268 0.016 0.716
#> SRR1356266 1 0.0290 0.94753 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1341983 2 0.2144 0.89407 0.000 0.912 0.000 0.020 0.068
#> SRR1456114 1 0.1564 0.94356 0.948 0.000 0.004 0.024 0.024
#> SRR1072948 3 0.1270 0.88342 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1472370 5 0.3210 0.86421 0.000 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1480176 1 0.0510 0.94699 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR613843 2 0.0162 0.91673 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1469192 1 0.0290 0.94760 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1404555 3 0.0865 0.90315 0.000 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR659839 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659533 4 0.1914 0.82984 0.000 0.016 0.060 0.924 0.000
#> SRR1362848 4 0.2554 0.79460 0.000 0.000 0.072 0.892 0.036
#> SRR1407492 4 0.2104 0.85469 0.000 0.060 0.024 0.916 0.000
#> SRR1455082 2 0.5139 0.42418 0.000 0.624 0.000 0.316 0.060
#> SRR658362 4 0.4898 0.68126 0.000 0.248 0.000 0.684 0.068
#> SRR810921 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1456375 3 0.1341 0.87976 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR818232 1 0.0404 0.94638 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1454868 4 0.1943 0.83412 0.000 0.020 0.056 0.924 0.000
#> SRR1474816 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0162 0.94873 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1088437 2 0.1800 0.90287 0.000 0.932 0.000 0.020 0.048
#> SRR1466400 2 0.1638 0.89858 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR658921 2 0.1638 0.89858 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1499873 2 0.0162 0.91698 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1101373 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR1090145 1 0.2452 0.88209 0.896 0.004 0.000 0.016 0.084
#> SRR1379324 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR1345307 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0807 0.90426 0.000 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR1086280 3 0.0880 0.89991 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1454891 4 0.3508 0.72839 0.000 0.252 0.000 0.748 0.000
#> SRR663185 2 0.5459 0.28442 0.000 0.568 0.000 0.360 0.072
#> SRR811819 1 0.0290 0.94853 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1318920 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR656758 2 0.0324 0.91635 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1474351 1 0.0162 0.94873 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR660450 2 0.1571 0.90042 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1472687 2 0.2144 0.89407 0.000 0.912 0.000 0.020 0.068
#> SRR1334291 2 0.1571 0.90042 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1415153 2 0.0162 0.91686 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1323271 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1368939 2 0.0324 0.91635 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1443161 4 0.4815 0.11725 0.000 0.000 0.020 0.524 0.456
#> SRR614695 2 0.1638 0.89858 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1092372 1 0.1377 0.94632 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR1474577 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR1406582 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR612779 2 0.0404 0.91600 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1089006 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR1354071 1 0.4902 0.03915 0.508 0.000 0.000 0.024 0.468
#> SRR1105463 5 0.3778 0.73500 0.188 0.000 0.012 0.012 0.788
#> SRR811005 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0566 0.94503 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1325871 3 0.1965 0.85879 0.000 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1355415 5 0.3794 0.86540 0.048 0.000 0.152 0.000 0.800
#> SRR1090861 1 0.0162 0.94873 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1320712 4 0.2171 0.84094 0.000 0.028 0.032 0.924 0.016
#> SRR1470075 1 0.1278 0.94598 0.960 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR1091254 1 0.0162 0.94873 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1101397 5 0.3769 0.86960 0.028 0.000 0.172 0.004 0.796
#> SRR1321165 1 0.1442 0.94642 0.952 0.000 0.004 0.032 0.012
#> SRR1092112 5 0.3143 0.86617 0.000 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1417588 3 0.0794 0.89952 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1074790 2 0.4520 0.69408 0.156 0.768 0.000 0.016 0.060
#> SRR1432106 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR655756 2 0.0324 0.91684 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1458314 5 0.4945 0.16844 0.440 0.000 0.004 0.020 0.536
#> SRR1318582 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.5518 0.20242 0.000 0.544 0.000 0.384 0.072
#> SRR1072749 5 0.3492 0.87106 0.016 0.000 0.188 0.000 0.796
#> SRR1078586 1 0.0404 0.94792 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1400333 4 0.4098 0.78114 0.000 0.156 0.000 0.780 0.064
#> SRR1078834 2 0.1981 0.89341 0.000 0.920 0.000 0.016 0.064
#> SRR1417611 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1396840 1 0.3609 0.81372 0.816 0.000 0.004 0.032 0.148
#> SRR1465440 2 0.1877 0.89941 0.000 0.924 0.000 0.012 0.064
#> SRR1400530 2 0.0324 0.91741 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR614984 4 0.1981 0.85110 0.000 0.048 0.028 0.924 0.000
#> SRR1324269 1 0.1670 0.91473 0.936 0.000 0.000 0.012 0.052
#> SRR1401491 2 0.0324 0.91741 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1319443 1 0.0404 0.94638 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1324349 2 0.1502 0.90221 0.000 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1345523 2 0.1557 0.90556 0.000 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR1500846 1 0.4915 0.25346 0.556 0.000 0.004 0.020 0.420
#> SRR661505 5 0.3366 0.86425 0.000 0.000 0.212 0.004 0.784
#> SRR1419062 5 0.3183 0.85766 0.000 0.000 0.156 0.016 0.828
#> SRR1480131 1 0.4193 0.52924 0.684 0.000 0.000 0.012 0.304
#> SRR1421284 4 0.4847 0.69461 0.000 0.240 0.000 0.692 0.068
#> SRR1329624 1 0.0162 0.94822 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1315739 3 0.0794 0.89952 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1099189 4 0.4666 0.70432 0.000 0.240 0.000 0.704 0.056
#> SRR1083286 1 0.0566 0.94503 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1091890 3 0.4054 0.70671 0.000 0.000 0.760 0.204 0.036
#> SRR1347436 2 0.4707 0.60854 0.000 0.708 0.000 0.228 0.064
#> SRR1327473 1 0.2700 0.87475 0.884 0.004 0.000 0.024 0.088
#> SRR1338195 3 0.0703 0.90361 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.1278 0.94598 0.960 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR658271 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 5 0.4846 0.40880 0.360 0.000 0.004 0.024 0.612
#> SRR1454842 4 0.4505 0.29002 0.000 0.012 0.384 0.604 0.000
#> SRR1322643 1 0.1278 0.94598 0.960 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR614887 3 0.0880 0.90070 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1354620 5 0.3612 0.87156 0.028 0.000 0.172 0.000 0.800
#> SRR615056 4 0.5322 0.54774 0.000 0.320 0.000 0.608 0.072
#> SRR1105320 1 0.3233 0.84460 0.852 0.008 0.000 0.028 0.112
#> SRR1391529 1 0.0807 0.94219 0.976 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR663052 4 0.2270 0.84854 0.000 0.076 0.000 0.904 0.020
#> SRR1478834 1 0.0807 0.94219 0.976 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR812366 2 0.0703 0.91450 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1435330 3 0.0865 0.90315 0.000 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR615383 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 4 0.2036 0.85422 0.000 0.056 0.024 0.920 0.000
#> SRR613568 2 0.1571 0.90042 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR614095 4 0.2616 0.84384 0.000 0.076 0.000 0.888 0.036
#> SRR1103092 1 0.1018 0.94095 0.968 0.000 0.000 0.016 0.016
#> SRR1337155 5 0.2708 0.75111 0.020 0.016 0.000 0.072 0.892
#> SRR1475345 2 0.1914 0.89938 0.000 0.924 0.000 0.016 0.060
#> SRR809089 2 0.0798 0.91443 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1446180 2 0.4169 0.68849 0.000 0.732 0.000 0.028 0.240
#> SRR1406372 2 0.0162 0.91673 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1339880 3 0.0992 0.90236 0.000 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR1353136 4 0.1831 0.80993 0.000 0.000 0.076 0.920 0.004
#> SRR1093906 3 0.0794 0.89952 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR614035 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1351104 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR1363926 2 0.1845 0.90372 0.000 0.928 0.000 0.016 0.056
#> SRR1399861 4 0.2196 0.85469 0.000 0.056 0.024 0.916 0.004
#> SRR1338789 1 0.1560 0.94616 0.948 0.000 0.004 0.028 0.020
#> SRR1421420 3 0.1124 0.89587 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1420832 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1476231 1 0.0000 0.94865 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 4 0.1915 0.84829 0.000 0.040 0.032 0.928 0.000
#> SRR1315041 2 0.2362 0.89329 0.000 0.900 0.000 0.024 0.076
#> SRR661877 2 0.2300 0.89004 0.000 0.904 0.000 0.024 0.072
#> SRR1443268 5 0.3847 0.86449 0.040 0.000 0.156 0.004 0.800
#> SRR1416617 3 0.1741 0.88975 0.000 0.000 0.936 0.024 0.040
#> SRR1102443 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR655672 4 0.1965 0.85261 0.000 0.052 0.024 0.924 0.000
#> SRR1420006 3 0.0794 0.89952 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1458267 2 0.1571 0.90042 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR613819 4 0.2983 0.83608 0.000 0.076 0.000 0.868 0.056
#> SRR1469432 2 0.1809 0.90105 0.000 0.928 0.000 0.012 0.060
#> SRR660907 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1465092 2 0.1571 0.90042 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1470727 5 0.3928 0.77212 0.152 0.000 0.040 0.008 0.800
#> SRR1339153 3 0.4025 0.74578 0.000 0.000 0.792 0.076 0.132
#> SRR1472749 3 0.0865 0.90315 0.000 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1414379 4 0.4847 0.69461 0.000 0.240 0.000 0.692 0.068
#> SRR1431326 1 0.1278 0.94598 0.960 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR1487278 2 0.1638 0.89858 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1098312 4 0.3432 0.74394 0.000 0.000 0.132 0.828 0.040
#> SRR810273 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.1571 0.90042 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR614467 4 0.3043 0.83445 0.000 0.080 0.000 0.864 0.056
#> SRR811471 1 0.0000 0.94865 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0794 0.89952 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1088606 1 0.4488 0.74821 0.736 0.000 0.004 0.048 0.212
#> SRR1479699 4 0.3202 0.78575 0.000 0.004 0.056 0.860 0.080
#> SRR1403589 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.1571 0.90042 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1359803 1 0.0290 0.94753 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1338988 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1471222 2 0.2046 0.90779 0.000 0.916 0.000 0.016 0.068
#> SRR1378992 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR659427 4 0.2512 0.84279 0.004 0.032 0.008 0.908 0.048
#> SRR1096638 1 0.1179 0.94688 0.964 0.000 0.004 0.016 0.016
#> SRR1466619 2 0.1571 0.90042 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR659307 4 0.1943 0.83412 0.000 0.020 0.056 0.924 0.000
#> SRR1439994 5 0.3769 0.86960 0.028 0.000 0.172 0.004 0.796
#> SRR1454931 1 0.0566 0.94503 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1332928 5 0.2806 0.86313 0.000 0.000 0.152 0.004 0.844
#> SRR658621 4 0.3239 0.82822 0.000 0.080 0.000 0.852 0.068
#> SRR1095840 1 0.0290 0.94853 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1458243 5 0.3823 0.85658 0.048 0.000 0.140 0.004 0.808
#> SRR1374270 4 0.2005 0.83071 0.000 0.016 0.056 0.924 0.004
#> SRR1470947 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1365598 2 0.1638 0.89858 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR662787 2 0.2300 0.89004 0.000 0.904 0.000 0.024 0.072
#> SRR1408727 4 0.3916 0.71489 0.000 0.256 0.000 0.732 0.012
#> SRR1456274 1 0.3400 0.86853 0.840 0.000 0.004 0.040 0.116
#> SRR817744 1 0.0000 0.94865 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1387379 2 0.0162 0.91698 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1102680 5 0.3081 0.85844 0.000 0.000 0.156 0.012 0.832
#> SRR1374198 1 0.1278 0.94598 0.960 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR1445856 5 0.3569 0.75827 0.152 0.000 0.028 0.004 0.816
#> SRR820049 5 0.4666 0.82003 0.000 0.000 0.180 0.088 0.732
#> SRR1375290 4 0.2152 0.81706 0.000 0.004 0.032 0.920 0.044
#> SRR818999 5 0.4164 0.66764 0.252 0.000 0.012 0.008 0.728
#> SRR1390242 1 0.0290 0.94753 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1401164 2 0.1282 0.90722 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1454629 1 0.3777 0.76882 0.784 0.004 0.000 0.020 0.192
#> SRR1332187 3 0.0703 0.90361 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR603365 5 0.3366 0.86425 0.000 0.000 0.212 0.004 0.784
#> SRR657833 2 0.1638 0.89858 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1436207 2 0.2863 0.85809 0.000 0.876 0.000 0.064 0.060
#> SRR1488017 1 0.0162 0.94873 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.3928 0.53880 0.700 0.000 0.000 0.004 0.296
#> SRR1364761 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.0992 0.90236 0.000 0.000 0.968 0.024 0.008
#> SRR1441868 1 0.1278 0.94598 0.960 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR1485380 5 0.3210 0.86421 0.000 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1073705 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR615032 2 0.1740 0.90256 0.000 0.932 0.000 0.012 0.056
#> SRR1452356 4 0.4707 0.72566 0.000 0.212 0.000 0.716 0.072
#> SRR1442983 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 4 0.2020 0.84691 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1332816 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR612299 2 0.3055 0.84600 0.000 0.864 0.000 0.072 0.064
#> SRR1407386 1 0.0000 0.94865 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0324 0.91635 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1309403 1 0.3507 0.83315 0.840 0.012 0.000 0.036 0.112
#> SRR1498395 2 0.0324 0.91635 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1079998 5 0.3456 0.86789 0.004 0.000 0.204 0.004 0.788
#> SRR1498885 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1337215 2 0.1638 0.89858 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1414749 3 0.1410 0.87604 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1365963 5 0.3266 0.86757 0.000 0.000 0.200 0.004 0.796
#> SRR1368030 4 0.4823 0.70629 0.000 0.228 0.000 0.700 0.072
#> SRR1419760 4 0.5156 0.58323 0.000 0.320 0.000 0.620 0.060
#> SRR1381841 1 0.0671 0.94571 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR821388 4 0.2504 0.79688 0.000 0.000 0.064 0.896 0.040
#> SRR657623 2 0.5603 -0.07849 0.000 0.476 0.000 0.452 0.072
#> SRR1094241 5 0.3861 0.81428 0.000 0.000 0.264 0.008 0.728
#> SRR819583 5 0.3177 0.86588 0.000 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1096149 1 0.1653 0.94223 0.944 0.000 0.004 0.024 0.028
#> SRR1342829 3 0.1043 0.89216 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1353028 1 0.0162 0.94873 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR811333 3 0.5062 0.29003 0.016 0.000 0.608 0.020 0.356
#> SRR1311666 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.1638 0.89858 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1446436 2 0.1571 0.90042 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR815092 1 0.0290 0.94753 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1500149 2 0.1502 0.90217 0.000 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1100564 1 0.0404 0.94792 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1403072 3 0.1410 0.87604 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR811653 4 0.2103 0.83420 0.000 0.020 0.056 0.920 0.004
#> SRR1311348 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1435442 2 0.1638 0.89858 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1421444 3 0.0703 0.90361 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1344010 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1319520 1 0.1278 0.94598 0.960 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR1444763 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR1415026 2 0.2144 0.89407 0.000 0.912 0.000 0.020 0.068
#> SRR1416596 2 0.1697 0.91188 0.000 0.932 0.000 0.008 0.060
#> SRR1485499 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1316078 2 0.2046 0.89586 0.000 0.916 0.000 0.016 0.068
#> SRR663465 2 0.5480 0.25459 0.000 0.560 0.000 0.368 0.072
#> SRR1310094 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR663537 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR1453950 1 0.0162 0.94873 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1087875 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR613318 4 0.1864 0.81598 0.000 0.004 0.068 0.924 0.004
#> SRR1332694 1 0.0404 0.94638 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1468469 3 0.0794 0.89952 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR818670 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0510 0.94699 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1311622 3 0.2079 0.87811 0.000 0.000 0.916 0.020 0.064
#> SRR1500931 5 0.3210 0.86421 0.000 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1387494 3 0.2654 0.85424 0.000 0.000 0.884 0.084 0.032
#> SRR1379175 4 0.2708 0.84365 0.000 0.072 0.000 0.884 0.044
#> SRR1401909 5 0.3670 0.87181 0.020 0.000 0.180 0.004 0.796
#> SRR1440541 2 0.0162 0.91711 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1068832 5 0.3177 0.86588 0.000 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1376640 2 0.1638 0.89858 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1085712 2 0.1845 0.90102 0.000 0.928 0.000 0.016 0.056
#> SRR1082283 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR1084276 5 0.3388 0.72231 0.200 0.000 0.000 0.008 0.792
#> SRR1353262 2 0.0671 0.91456 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1437035 1 0.2597 0.87560 0.884 0.000 0.000 0.024 0.092
#> SRR1396877 5 0.5374 0.59622 0.292 0.000 0.052 0.016 0.640
#> SRR1443026 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0162 0.94873 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1436822 2 0.3193 0.88102 0.000 0.840 0.000 0.028 0.132
#> SRR1101128 5 0.3210 0.86421 0.000 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1363886 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR612983 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1394366 2 0.1638 0.89858 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1093218 3 0.0794 0.89952 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1077090 5 0.3333 0.86558 0.000 0.000 0.208 0.004 0.788
#> SRR1327430 4 0.2769 0.84144 0.000 0.092 0.000 0.876 0.032
#> SRR1088958 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR1486931 2 0.1502 0.90216 0.000 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1086820 1 0.1278 0.94598 0.960 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR1383000 1 0.1124 0.93493 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1355705 2 0.2144 0.89407 0.000 0.912 0.000 0.020 0.068
#> SRR614335 4 0.3180 0.83018 0.000 0.076 0.000 0.856 0.068
#> SRR660534 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0609 0.91521 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1334265 2 0.1251 0.91606 0.000 0.956 0.000 0.008 0.036
#> SRR1456401 2 0.1364 0.91090 0.000 0.952 0.000 0.012 0.036
#> SRR1086393 1 0.1278 0.94598 0.960 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR1351521 3 0.0703 0.90361 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1093100 4 0.4639 0.70780 0.000 0.236 0.000 0.708 0.056
#> SRR1309382 1 0.0566 0.94503 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1089375 1 0.3012 0.84195 0.852 0.000 0.000 0.024 0.124
#> SRR1499482 2 0.1041 0.91065 0.000 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR614719 4 0.1792 0.85184 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1081473 5 0.3163 0.86006 0.000 0.000 0.164 0.012 0.824
#> SRR1087415 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR1088217 5 0.4059 0.85571 0.060 0.000 0.132 0.008 0.800
#> SRR808496 4 0.2653 0.84052 0.000 0.096 0.000 0.880 0.024
#> SRR1336463 2 0.1282 0.90666 0.000 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR612359 4 0.2011 0.85097 0.000 0.088 0.004 0.908 0.000
#> SRR1444412 5 0.3421 0.71771 0.204 0.000 0.000 0.008 0.788
#> SRR1074116 3 0.1410 0.87604 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR821846 3 0.0703 0.90361 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0404 0.94638 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1349099 1 0.3400 0.86853 0.840 0.000 0.004 0.040 0.116
#> SRR1337886 2 0.0771 0.91358 0.000 0.976 0.000 0.004 0.020
#> SRR813632 1 0.0807 0.94219 0.976 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR1101591 5 0.4114 0.64517 0.000 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1089713 5 0.4015 0.77637 0.124 0.000 0.040 0.024 0.812
#> SRR1453127 3 0.0404 0.90328 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1498354 5 0.3109 0.86720 0.000 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1313831 1 0.0290 0.94753 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1315434 3 0.0404 0.90328 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR814747 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1358539 1 0.0000 0.94865 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR1365791 3 0.2843 0.84729 0.000 0.000 0.876 0.076 0.048
#> SRR1081519 5 0.3143 0.86617 0.000 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR614707 2 0.2863 0.85868 0.000 0.876 0.000 0.060 0.064
#> SRR1094027 1 0.0162 0.94873 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1489092 5 0.3898 0.84409 0.016 0.000 0.160 0.024 0.800
#> SRR1079502 5 0.3183 0.85766 0.000 0.000 0.156 0.016 0.828
#> SRR1457814 4 0.2103 0.83420 0.000 0.020 0.056 0.920 0.004
#> SRR1455127 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR615081 2 0.1638 0.89858 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1327855 5 0.3210 0.86421 0.000 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1417873 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1394125 3 0.5240 0.28158 0.012 0.000 0.588 0.032 0.368
#> SRR1488388 1 0.1278 0.94598 0.960 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR1401122 2 0.5518 0.20242 0.000 0.544 0.000 0.384 0.072
#> SRR612383 4 0.1965 0.83747 0.000 0.024 0.052 0.924 0.000
#> SRR1477711 1 0.0290 0.94753 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1350813 2 0.1121 0.90815 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR612851 4 0.2079 0.85528 0.000 0.064 0.020 0.916 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.94865 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.2144 0.89407 0.000 0.912 0.000 0.020 0.068
#> SRR1340010 3 0.4342 0.66969 0.000 0.000 0.728 0.232 0.040
#> SRR1475885 2 0.7072 0.12814 0.368 0.464 0.004 0.044 0.120
#> SRR1376334 1 0.0290 0.94753 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1399821 1 0.1278 0.94598 0.960 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR1347042 3 0.0794 0.89952 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR612323 4 0.1965 0.85261 0.000 0.052 0.024 0.924 0.000
#> SRR612604 2 0.1638 0.89858 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1389546 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0162 0.94873 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1465608 5 0.4001 0.67638 0.208 0.000 0.004 0.024 0.764
#> SRR1101808 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0865 0.90315 0.000 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR1331153 2 0.1357 0.90519 0.000 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR1078439 4 0.4442 0.48427 0.000 0.004 0.016 0.676 0.304
#> SRR2165527 2 0.2300 0.89004 0.000 0.904 0.000 0.024 0.072
#> SRR1351147 1 0.4460 0.76380 0.792 0.084 0.000 0.028 0.096
#> SRR1313536 2 0.0324 0.91741 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1070308 2 0.5056 0.65898 0.160 0.732 0.000 0.020 0.088
#> SRR1403110 1 0.0404 0.94638 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1400355 2 0.0324 0.91635 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1401317 5 0.3210 0.86421 0.000 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1456862 1 0.1471 0.94444 0.952 0.000 0.004 0.024 0.020
#> SRR1074622 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR1465847 5 0.3143 0.86617 0.000 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1443376 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.1399 0.89590 0.000 0.000 0.952 0.028 0.020
#> SRR1075579 1 0.0000 0.94865 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 4 0.2012 0.85478 0.000 0.060 0.020 0.920 0.000
#> SRR612251 4 0.2125 0.83765 0.000 0.024 0.052 0.920 0.004
#> SRR1418581 1 0.1278 0.94598 0.960 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR658045 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613214 4 0.1981 0.85110 0.000 0.048 0.028 0.924 0.000
#> SRR613078 2 0.1638 0.89858 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1472998 5 0.3773 0.86988 0.032 0.000 0.164 0.004 0.800
#> SRR1433452 2 0.1357 0.90519 0.000 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR1101957 1 0.0671 0.94852 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1487993 3 0.0703 0.90361 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0290 0.94753 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1367566 3 0.1310 0.89670 0.000 0.000 0.956 0.024 0.020
#> SRR1316151 2 0.1638 0.89858 0.000 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1417547 2 0.2554 0.88238 0.000 0.892 0.000 0.036 0.072
#> SRR659389 2 0.1670 0.90436 0.000 0.936 0.000 0.012 0.052
#> SRR1490270 2 0.1571 0.90042 0.000 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1398207 5 0.4135 0.81689 0.108 0.000 0.084 0.008 0.800
#> SRR1358755 5 0.3764 0.86697 0.044 0.000 0.156 0.000 0.800
#> SRR1078903 2 0.4494 0.26042 0.000 0.608 0.000 0.380 0.012
#> SRR1323252 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR615982 4 0.3671 0.74976 0.000 0.236 0.000 0.756 0.008
#> SRR1480431 2 0.2300 0.89283 0.000 0.904 0.000 0.024 0.072
#> SRR1429825 2 0.1894 0.90100 0.000 0.920 0.000 0.008 0.072
#> SRR1102393 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.2437 0.90851 0.904 0.000 0.004 0.032 0.060
#> SRR808351 1 0.0290 0.94760 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1317513 1 0.0290 0.94753 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1480501 5 0.3210 0.86421 0.000 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1081910 5 0.4771 0.74446 0.020 0.000 0.272 0.020 0.688
#> SRR1086611 2 0.5268 0.38396 0.000 0.612 0.000 0.320 0.068
#> SRR1392571 2 0.5122 0.41566 0.000 0.628 0.000 0.312 0.060
#> SRR1311441 1 0.1278 0.94598 0.960 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR808152 1 0.0566 0.94884 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR657313 5 0.5673 0.69999 0.000 0.000 0.184 0.184 0.632
#> SRR1433131 2 0.1124 0.90929 0.000 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1321011 2 0.1408 0.90767 0.000 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1500598 2 0.2236 0.89211 0.000 0.908 0.000 0.024 0.068
#> SRR1379343 2 0.0451 0.91580 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1389108 1 0.1377 0.94561 0.956 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR1376228 3 0.0794 0.89952 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1399757 1 0.0000 0.94865 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.0794 0.89952 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1464517 3 0.3214 0.81155 0.000 0.000 0.844 0.036 0.120
#> SRR613557 4 0.1943 0.83412 0.000 0.020 0.056 0.924 0.000
#> SRR809831 1 0.5731 0.47375 0.636 0.000 0.092 0.016 0.256
#> SRR1429387 3 0.0794 0.89952 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR816565 1 0.0162 0.94873 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.94865 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.4894 -0.00438 0.000 0.000 0.520 0.024 0.456
#> SRR1072031 2 0.0000 0.91715 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 4 0.2127 0.84564 0.000 0.108 0.000 0.892 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 3 0.6560 0.46004 0.000 0.000 0.452 0.208 0.040 0.300
#> SRR1404105 1 0.0000 0.89527 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.2178 0.70912 0.000 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1472057 5 0.3572 0.79506 0.000 0.000 0.100 0.008 0.812 0.080
#> SRR614491 4 0.0820 0.80878 0.000 0.000 0.016 0.972 0.000 0.012
#> SRR1069376 1 0.0405 0.89534 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR811964 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1361415 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1345715 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR1328073 6 0.6425 0.17499 0.380 0.000 0.000 0.140 0.048 0.432
#> SRR1394209 4 0.3631 0.74440 0.000 0.160 0.000 0.792 0.012 0.036
#> SRR1474018 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1099809 5 0.2681 0.79472 0.072 0.000 0.028 0.000 0.880 0.020
#> SRR1500555 4 0.3502 0.71955 0.000 0.024 0.000 0.800 0.016 0.160
#> SRR1354363 1 0.2997 0.85309 0.844 0.000 0.000 0.000 0.060 0.096
#> SRR1391619 3 0.3043 0.74855 0.000 0.000 0.792 0.200 0.000 0.008
#> SRR1307997 2 0.3854 0.59474 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR663124 4 0.0881 0.81509 0.000 0.008 0.008 0.972 0.000 0.012
#> SRR1334670 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR612515 4 0.0881 0.81509 0.000 0.008 0.008 0.972 0.000 0.012
#> SRR1092727 4 0.3284 0.69239 0.000 0.032 0.000 0.800 0.000 0.168
#> SRR1364013 2 0.5866 0.25316 0.000 0.512 0.000 0.252 0.004 0.232
#> SRR1468553 3 0.1477 0.87823 0.000 0.000 0.940 0.008 0.004 0.048
#> SRR1403980 3 0.1225 0.88117 0.000 0.000 0.952 0.000 0.012 0.036
#> SRR1420169 5 0.2872 0.80918 0.000 0.000 0.076 0.008 0.864 0.052
#> SRR1442800 6 0.5607 0.21590 0.064 0.256 0.000 0.004 0.056 0.620
#> SRR1359214 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1499849 5 0.2507 0.80864 0.036 0.000 0.056 0.000 0.892 0.016
#> SRR1500030 3 0.1707 0.87570 0.000 0.000 0.928 0.012 0.004 0.056
#> SRR1093053 5 0.3165 0.79687 0.000 0.000 0.072 0.076 0.844 0.008
#> SRR1399843 4 0.1577 0.80785 0.000 0.008 0.000 0.940 0.016 0.036
#> SRR1380231 5 0.4383 0.68056 0.008 0.000 0.036 0.004 0.692 0.260
#> SRR809470 5 0.2611 0.81025 0.012 0.000 0.080 0.000 0.880 0.028
#> SRR614239 4 0.0862 0.81523 0.000 0.008 0.004 0.972 0.000 0.016
#> SRR613939 2 0.4521 0.56761 0.000 0.524 0.000 0.004 0.024 0.448
#> SRR612971 2 0.0865 0.67396 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1490204 2 0.3578 0.71135 0.000 0.660 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR811357 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1471672 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR613006 2 0.4300 0.60334 0.000 0.548 0.000 0.000 0.020 0.432
#> SRR1469570 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1457354 2 0.1444 0.68883 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1362906 3 0.1082 0.88134 0.000 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1079023 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR813608 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1096736 6 0.7049 0.03614 0.260 0.000 0.004 0.276 0.060 0.400
#> SRR1478700 1 0.3566 0.81506 0.800 0.000 0.000 0.000 0.104 0.096
#> SRR1081543 3 0.5663 0.64892 0.000 0.000 0.612 0.156 0.028 0.204
#> SRR1384754 3 0.6552 0.46514 0.000 0.000 0.452 0.204 0.040 0.304
#> SRR612287 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1380317 4 0.2007 0.80809 0.000 0.044 0.000 0.916 0.004 0.036
#> SRR1315247 2 0.4399 0.55241 0.000 0.516 0.000 0.000 0.024 0.460
#> SRR1105344 2 0.0717 0.65259 0.000 0.976 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR658549 4 0.1168 0.81464 0.000 0.016 0.000 0.956 0.000 0.028
#> SRR1480240 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1084816 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR612551 2 0.0000 0.65506 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 4 0.4516 0.48520 0.000 0.420 0.000 0.552 0.008 0.020
#> SRR1419476 5 0.4746 0.67326 0.000 0.000 0.240 0.008 0.672 0.080
#> SRR1456075 5 0.4419 0.73154 0.000 0.000 0.072 0.004 0.704 0.220
#> SRR1389474 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1367005 1 0.1951 0.88350 0.908 0.000 0.000 0.000 0.016 0.076
#> SRR1334419 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR1417154 3 0.2398 0.85437 0.000 0.000 0.888 0.004 0.028 0.080
#> SRR1095985 5 0.3806 0.73384 0.032 0.000 0.012 0.004 0.780 0.172
#> SRR1325771 1 0.0000 0.89527 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.1462 0.86631 0.000 0.000 0.936 0.000 0.008 0.056
#> SRR660272 2 0.4067 0.60715 0.000 0.548 0.000 0.000 0.008 0.444
#> SRR1332993 1 0.0405 0.89534 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1311833 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR808044 1 0.3473 0.82298 0.808 0.000 0.000 0.000 0.096 0.096
#> SRR1076916 5 0.5607 0.50362 0.000 0.000 0.148 0.004 0.532 0.316
#> SRR1356266 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1341983 2 0.0405 0.65511 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1456114 1 0.3063 0.85022 0.840 0.000 0.000 0.000 0.068 0.092
#> SRR1072948 3 0.1563 0.86431 0.000 0.000 0.932 0.000 0.012 0.056
#> SRR1472370 5 0.3572 0.79506 0.000 0.000 0.100 0.008 0.812 0.080
#> SRR1480176 1 0.1003 0.88712 0.964 0.000 0.000 0.000 0.016 0.020
#> SRR613843 2 0.3555 0.73625 0.000 0.712 0.000 0.000 0.008 0.280
#> SRR1469192 1 0.2412 0.82957 0.880 0.000 0.000 0.000 0.092 0.028
#> SRR1404555 3 0.2006 0.86646 0.000 0.000 0.904 0.016 0.000 0.080
#> SRR659839 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR659533 4 0.0881 0.81509 0.000 0.008 0.008 0.972 0.000 0.012
#> SRR1362848 4 0.5286 0.50545 0.000 0.000 0.056 0.616 0.040 0.288
#> SRR1407492 4 0.0665 0.81443 0.000 0.008 0.008 0.980 0.000 0.004
#> SRR1455082 2 0.6394 0.02163 0.000 0.352 0.000 0.284 0.012 0.352
#> SRR658362 4 0.4172 0.54509 0.000 0.376 0.000 0.608 0.008 0.008
#> SRR810921 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR662823 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1456375 3 0.1462 0.86631 0.000 0.000 0.936 0.000 0.008 0.056
#> SRR818232 1 0.0547 0.89123 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1454868 4 0.0665 0.81443 0.000 0.008 0.008 0.980 0.000 0.004
#> SRR1474816 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1342002 1 0.0000 0.89527 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.1327 0.68622 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1466400 2 0.4310 0.59311 0.000 0.540 0.000 0.000 0.020 0.440
#> SRR658921 2 0.4372 0.59613 0.000 0.544 0.000 0.000 0.024 0.432
#> SRR1499873 2 0.3244 0.74011 0.000 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR1101373 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR1090145 1 0.4264 0.45445 0.676 0.000 0.000 0.004 0.036 0.284
#> SRR1379324 1 0.2039 0.88266 0.904 0.000 0.000 0.000 0.020 0.076
#> SRR1345307 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1396166 3 0.0858 0.88221 0.000 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1086280 3 0.1124 0.88104 0.000 0.000 0.956 0.000 0.008 0.036
#> SRR1454891 4 0.3667 0.68000 0.000 0.132 0.000 0.788 0.000 0.080
#> SRR663185 2 0.3672 0.21666 0.000 0.712 0.000 0.276 0.008 0.004
#> SRR811819 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1318920 1 0.2006 0.88279 0.904 0.000 0.000 0.000 0.016 0.080
#> SRR656758 2 0.3409 0.73085 0.000 0.700 0.000 0.000 0.000 0.300
#> SRR1474351 1 0.0000 0.89527 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.4067 0.60715 0.000 0.548 0.000 0.000 0.008 0.444
#> SRR1472687 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1334291 2 0.3851 0.60004 0.000 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR1415153 2 0.3309 0.73871 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1323271 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1368939 2 0.3575 0.73461 0.000 0.708 0.000 0.000 0.008 0.284
#> SRR1443161 5 0.4650 0.08323 0.000 0.000 0.000 0.472 0.488 0.040
#> SRR614695 2 0.4314 0.58764 0.000 0.536 0.000 0.000 0.020 0.444
#> SRR1092372 1 0.2230 0.88172 0.892 0.000 0.000 0.000 0.024 0.084
#> SRR1474577 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR1406582 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR612779 2 0.3563 0.71306 0.000 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1089006 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR1354071 5 0.5767 0.45134 0.208 0.000 0.000 0.004 0.532 0.256
#> SRR1105463 5 0.2162 0.78396 0.088 0.000 0.004 0.000 0.896 0.012
#> SRR811005 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1385319 1 0.1341 0.88235 0.948 0.000 0.000 0.000 0.024 0.028
#> SRR1325871 3 0.2362 0.80906 0.000 0.000 0.860 0.136 0.000 0.004
#> SRR1355415 5 0.2386 0.81352 0.028 0.000 0.064 0.000 0.896 0.012
#> SRR1090861 1 0.0000 0.89527 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 4 0.3680 0.64404 0.000 0.000 0.004 0.744 0.020 0.232
#> SRR1470075 1 0.1951 0.88350 0.908 0.000 0.000 0.000 0.016 0.076
#> SRR1091254 1 0.0000 0.89527 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 5 0.2851 0.81229 0.016 0.000 0.080 0.000 0.868 0.036
#> SRR1321165 1 0.2658 0.87519 0.864 0.000 0.000 0.000 0.036 0.100
#> SRR1092112 5 0.2214 0.80944 0.000 0.000 0.096 0.000 0.888 0.016
#> SRR1417588 3 0.1265 0.87124 0.000 0.000 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1074790 6 0.5778 -0.25306 0.112 0.436 0.000 0.000 0.016 0.436
#> SRR1432106 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR655756 2 0.3266 0.73822 0.000 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR1458314 5 0.5003 0.43097 0.288 0.000 0.000 0.000 0.608 0.104
#> SRR1318582 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1080484 2 0.3693 0.20954 0.000 0.708 0.000 0.280 0.008 0.004
#> SRR1072749 5 0.2367 0.81143 0.008 0.000 0.088 0.000 0.888 0.016
#> SRR1078586 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1400333 4 0.5011 0.36057 0.000 0.040 0.000 0.564 0.020 0.376
#> SRR1078834 2 0.4803 0.51925 0.000 0.496 0.000 0.020 0.020 0.464
#> SRR1417611 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1396840 1 0.4518 0.70024 0.696 0.000 0.000 0.000 0.200 0.104
#> SRR1465440 2 0.0713 0.67054 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1400530 2 0.3265 0.73994 0.000 0.748 0.000 0.000 0.004 0.248
#> SRR614984 4 0.0881 0.81509 0.000 0.008 0.008 0.972 0.000 0.012
#> SRR1324269 1 0.2790 0.79143 0.844 0.000 0.000 0.000 0.132 0.024
#> SRR1401491 2 0.3394 0.73921 0.000 0.752 0.000 0.000 0.012 0.236
#> SRR1319443 1 0.0547 0.89123 0.980 0.000 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1324349 2 0.3862 0.63894 0.000 0.608 0.000 0.000 0.004 0.388
#> SRR1345523 2 0.1267 0.68506 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1500846 5 0.5309 0.05540 0.408 0.000 0.000 0.000 0.488 0.104
#> SRR661505 5 0.3623 0.79591 0.000 0.000 0.096 0.012 0.812 0.080
#> SRR1419062 5 0.4051 0.70568 0.000 0.000 0.044 0.004 0.728 0.224
#> SRR1480131 1 0.4343 0.34702 0.592 0.000 0.000 0.000 0.380 0.028
#> SRR1421284 4 0.4126 0.56463 0.000 0.360 0.000 0.624 0.008 0.008
#> SRR1329624 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1315739 3 0.1265 0.87124 0.000 0.000 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1099189 4 0.4147 0.60658 0.000 0.316 0.000 0.660 0.008 0.016
#> SRR1083286 1 0.1257 0.88239 0.952 0.000 0.000 0.000 0.028 0.020
#> SRR1091890 3 0.6196 0.57991 0.000 0.000 0.540 0.156 0.044 0.260
#> SRR1347436 6 0.5693 -0.31941 0.000 0.388 0.000 0.140 0.004 0.468
#> SRR1327473 1 0.4853 0.20631 0.556 0.000 0.000 0.008 0.044 0.392
#> SRR1338195 3 0.0508 0.88144 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR809698 2 0.3244 0.74014 0.000 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR1457792 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR658271 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1339597 5 0.4662 0.53607 0.236 0.000 0.000 0.000 0.668 0.096
#> SRR1454842 4 0.4676 0.41626 0.000 0.008 0.284 0.660 0.008 0.040
#> SRR1322643 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR614887 3 0.0547 0.87921 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1354620 5 0.2786 0.81319 0.012 0.000 0.080 0.008 0.876 0.024
#> SRR615056 2 0.4411 -0.42854 0.000 0.504 0.000 0.476 0.008 0.012
#> SRR1105320 1 0.4972 0.03718 0.504 0.000 0.000 0.008 0.048 0.440
#> SRR1391529 1 0.1682 0.86786 0.928 0.000 0.000 0.000 0.052 0.020
#> SRR663052 4 0.1820 0.80647 0.000 0.056 0.000 0.924 0.008 0.012
#> SRR1478834 1 0.2199 0.83897 0.892 0.000 0.000 0.000 0.088 0.020
#> SRR812366 2 0.2778 0.72244 0.000 0.824 0.000 0.000 0.008 0.168
#> SRR1435330 3 0.1370 0.87959 0.000 0.000 0.948 0.012 0.004 0.036
#> SRR615383 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1389157 4 0.0665 0.81443 0.000 0.008 0.008 0.980 0.000 0.004
#> SRR613568 2 0.3971 0.60855 0.000 0.548 0.000 0.000 0.004 0.448
#> SRR614095 4 0.2367 0.79287 0.000 0.088 0.000 0.888 0.008 0.016
#> SRR1103092 1 0.2333 0.83456 0.884 0.000 0.000 0.000 0.092 0.024
#> SRR1337155 5 0.2544 0.75928 0.004 0.000 0.000 0.012 0.864 0.120
#> SRR1475345 2 0.0146 0.65761 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR809089 2 0.2969 0.73369 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1446180 6 0.5581 -0.03815 0.000 0.324 0.000 0.020 0.100 0.556
#> SRR1406372 2 0.3445 0.73978 0.000 0.732 0.000 0.000 0.008 0.260
#> SRR1339880 3 0.2203 0.86555 0.000 0.000 0.896 0.016 0.004 0.084
#> SRR1353136 4 0.2318 0.76551 0.000 0.000 0.064 0.892 0.000 0.044
#> SRR1093906 3 0.1265 0.87124 0.000 0.000 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR614035 2 0.0291 0.65115 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1351104 1 0.1951 0.88350 0.908 0.000 0.000 0.000 0.016 0.076
#> SRR1363926 2 0.1757 0.68834 0.000 0.916 0.000 0.000 0.008 0.076
#> SRR1399861 4 0.0779 0.81454 0.000 0.008 0.008 0.976 0.000 0.008
#> SRR1338789 1 0.2214 0.87887 0.888 0.000 0.000 0.000 0.016 0.096
#> SRR1421420 3 0.1398 0.88176 0.000 0.000 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR1420832 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.89527 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 4 0.0779 0.81429 0.000 0.008 0.008 0.976 0.000 0.008
#> SRR1315041 2 0.0622 0.65123 0.000 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR661877 2 0.0405 0.64857 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1443268 5 0.2681 0.81076 0.020 0.000 0.072 0.000 0.880 0.028
#> SRR1416617 3 0.4159 0.71505 0.000 0.000 0.704 0.004 0.040 0.252
#> SRR1102443 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR655672 4 0.0881 0.81509 0.000 0.008 0.008 0.972 0.000 0.012
#> SRR1420006 3 0.1265 0.87124 0.000 0.000 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1458267 2 0.3833 0.61729 0.000 0.556 0.000 0.000 0.000 0.444
#> SRR613819 4 0.3219 0.75178 0.000 0.168 0.000 0.808 0.008 0.016
#> SRR1469432 2 0.0865 0.67415 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR660907 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1465092 2 0.3843 0.60813 0.000 0.548 0.000 0.000 0.000 0.452
#> SRR1470727 5 0.2691 0.78122 0.088 0.000 0.008 0.000 0.872 0.032
#> SRR1339153 3 0.4208 0.74507 0.000 0.000 0.772 0.112 0.092 0.024
#> SRR1472749 3 0.2110 0.86654 0.000 0.000 0.900 0.012 0.004 0.084
#> SRR1414379 4 0.4238 0.58265 0.000 0.340 0.000 0.636 0.008 0.016
#> SRR1431326 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR1487278 2 0.4289 0.61230 0.000 0.556 0.000 0.000 0.020 0.424
#> SRR1098312 4 0.6231 0.33202 0.000 0.000 0.132 0.500 0.044 0.324
#> SRR810273 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1376000 2 0.3847 0.60498 0.000 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456
#> SRR614467 4 0.3359 0.73567 0.000 0.196 0.000 0.784 0.008 0.012
#> SRR811471 1 0.0000 0.89527 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.1265 0.87124 0.000 0.000 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1088606 6 0.5813 0.15199 0.308 0.000 0.000 0.004 0.184 0.504
#> SRR1479699 6 0.5633 -0.32247 0.000 0.000 0.048 0.452 0.048 0.452
#> SRR1403589 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR812625 2 0.4300 0.59870 0.000 0.548 0.000 0.000 0.020 0.432
#> SRR1359803 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1338988 2 0.0000 0.65506 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.2613 0.69251 0.000 0.848 0.000 0.000 0.012 0.140
#> SRR1378992 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR659427 4 0.2245 0.80578 0.000 0.036 0.000 0.908 0.016 0.040
#> SRR1096638 1 0.1779 0.88718 0.920 0.000 0.000 0.000 0.016 0.064
#> SRR1466619 2 0.4348 0.60668 0.000 0.560 0.000 0.000 0.024 0.416
#> SRR659307 4 0.0779 0.81522 0.000 0.008 0.008 0.976 0.000 0.008
#> SRR1439994 5 0.3548 0.81106 0.016 0.000 0.080 0.008 0.832 0.064
#> SRR1454931 1 0.1341 0.88161 0.948 0.000 0.000 0.000 0.024 0.028
#> SRR1332928 5 0.2673 0.80632 0.000 0.000 0.044 0.012 0.880 0.064
#> SRR658621 4 0.3730 0.70207 0.000 0.236 0.000 0.740 0.008 0.016
#> SRR1095840 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1458243 5 0.2655 0.80900 0.020 0.000 0.060 0.000 0.884 0.036
#> SRR1374270 4 0.0767 0.81255 0.000 0.004 0.008 0.976 0.000 0.012
#> SRR1470947 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1365598 2 0.4389 0.57213 0.000 0.528 0.000 0.000 0.024 0.448
#> SRR662787 2 0.0405 0.64857 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1408727 4 0.4574 0.65169 0.000 0.168 0.000 0.720 0.012 0.100
#> SRR1456274 6 0.5215 -0.15610 0.456 0.000 0.000 0.012 0.060 0.472
#> SRR817744 1 0.0000 0.89527 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1387379 2 0.3101 0.73867 0.000 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR1102680 5 0.4024 0.70774 0.000 0.000 0.044 0.004 0.732 0.220
#> SRR1374198 1 0.1895 0.88548 0.912 0.000 0.000 0.000 0.016 0.072
#> SRR1445856 5 0.2331 0.77718 0.080 0.000 0.000 0.000 0.888 0.032
#> SRR820049 5 0.4776 0.75769 0.000 0.000 0.084 0.104 0.740 0.072
#> SRR1375290 4 0.1514 0.80668 0.000 0.004 0.004 0.944 0.012 0.036
#> SRR818999 5 0.2973 0.74919 0.136 0.000 0.004 0.000 0.836 0.024
#> SRR1390242 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1401164 2 0.4199 0.66044 0.000 0.600 0.000 0.000 0.020 0.380
#> SRR1454629 1 0.5842 0.20727 0.512 0.000 0.000 0.004 0.208 0.276
#> SRR1332187 3 0.0653 0.88166 0.000 0.000 0.980 0.012 0.004 0.004
#> SRR603365 5 0.3722 0.79082 0.000 0.000 0.100 0.008 0.800 0.092
#> SRR657833 2 0.4310 0.59287 0.000 0.540 0.000 0.000 0.020 0.440
#> SRR1436207 6 0.5489 -0.43325 0.000 0.440 0.000 0.108 0.004 0.448
#> SRR1488017 1 0.0000 0.89527 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1480384 1 0.4218 0.37880 0.616 0.000 0.000 0.000 0.360 0.024
#> SRR1364761 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1308086 3 0.2110 0.86654 0.000 0.000 0.900 0.012 0.004 0.084
#> SRR1441868 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR1485380 5 0.3722 0.79082 0.000 0.000 0.100 0.008 0.800 0.092
#> SRR1073705 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR615032 2 0.1007 0.67884 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1452356 4 0.4385 0.46559 0.000 0.440 0.000 0.540 0.008 0.012
#> SRR1442983 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1100346 4 0.1951 0.79962 0.000 0.020 0.000 0.916 0.004 0.060
#> SRR1332816 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR612299 2 0.5236 0.48781 0.000 0.480 0.000 0.044 0.024 0.452
#> SRR1407386 1 0.0146 0.89477 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418064 2 0.3309 0.73871 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1309403 1 0.5065 0.00188 0.492 0.000 0.000 0.012 0.048 0.448
#> SRR1498395 2 0.3428 0.72897 0.000 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1079998 5 0.3456 0.80221 0.004 0.000 0.092 0.008 0.828 0.068
#> SRR1498885 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1337215 2 0.4393 0.56586 0.000 0.524 0.000 0.000 0.024 0.452
#> SRR1414749 3 0.1745 0.85933 0.000 0.000 0.924 0.000 0.020 0.056
#> SRR1365963 5 0.2630 0.81080 0.004 0.000 0.092 0.000 0.872 0.032
#> SRR1368030 4 0.4144 0.51394 0.000 0.408 0.000 0.580 0.008 0.004
#> SRR1419760 4 0.5562 0.19587 0.000 0.124 0.000 0.496 0.004 0.376
#> SRR1381841 1 0.1421 0.88027 0.944 0.000 0.000 0.000 0.028 0.028
#> SRR821388 4 0.5241 0.49112 0.000 0.000 0.048 0.608 0.040 0.304
#> SRR657623 2 0.4090 -0.15929 0.000 0.604 0.000 0.384 0.008 0.004
#> SRR1094241 5 0.5200 0.69833 0.000 0.000 0.200 0.040 0.672 0.088
#> SRR819583 5 0.3525 0.79662 0.000 0.000 0.096 0.008 0.816 0.080
#> SRR1096149 1 0.3520 0.81840 0.804 0.000 0.000 0.000 0.100 0.096
#> SRR1342829 3 0.1462 0.86631 0.000 0.000 0.936 0.000 0.008 0.056
#> SRR1353028 1 0.0000 0.89527 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811333 5 0.6327 0.13730 0.016 0.000 0.364 0.000 0.400 0.220
#> SRR1311666 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1486698 2 0.4310 0.59287 0.000 0.540 0.000 0.000 0.020 0.440
#> SRR1446436 2 0.3847 0.60524 0.000 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456
#> SRR815092 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1500149 2 0.4218 0.61421 0.000 0.556 0.000 0.000 0.016 0.428
#> SRR1100564 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1403072 3 0.1745 0.85922 0.000 0.000 0.924 0.000 0.020 0.056
#> SRR811653 4 0.0779 0.81454 0.000 0.008 0.008 0.976 0.000 0.008
#> SRR1311348 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1489438 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1435442 2 0.4310 0.59311 0.000 0.540 0.000 0.000 0.020 0.440
#> SRR1421444 3 0.0405 0.88145 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.65506 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR1444763 1 0.2474 0.87487 0.880 0.000 0.000 0.000 0.040 0.080
#> SRR1415026 2 0.0000 0.65506 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.3555 0.71536 0.000 0.712 0.000 0.000 0.008 0.280
#> SRR1485499 2 0.0000 0.65506 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.65506 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.3583 0.24146 0.000 0.728 0.000 0.260 0.008 0.004
#> SRR1310094 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR663537 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1486780 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR1453950 1 0.0000 0.89527 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR613318 4 0.0870 0.81234 0.000 0.004 0.012 0.972 0.000 0.012
#> SRR1332694 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1468469 3 0.0717 0.88171 0.000 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR818670 2 0.3309 0.73879 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1120318 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1311622 3 0.3130 0.82319 0.000 0.000 0.828 0.000 0.048 0.124
#> SRR1500931 5 0.3722 0.79082 0.000 0.000 0.100 0.008 0.800 0.092
#> SRR1387494 3 0.5782 0.61633 0.000 0.000 0.572 0.092 0.044 0.292
#> SRR1379175 4 0.3394 0.69920 0.000 0.012 0.000 0.788 0.012 0.188
#> SRR1401909 5 0.3219 0.80827 0.008 0.000 0.088 0.008 0.848 0.048
#> SRR1440541 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1068832 5 0.3572 0.79506 0.000 0.000 0.100 0.008 0.812 0.080
#> SRR1376640 2 0.4377 0.59016 0.000 0.540 0.000 0.000 0.024 0.436
#> SRR1085712 2 0.0713 0.67005 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1082283 1 0.2660 0.86862 0.868 0.000 0.000 0.000 0.048 0.084
#> SRR1084276 5 0.2214 0.77868 0.096 0.000 0.000 0.000 0.888 0.016
#> SRR1353262 2 0.3608 0.73629 0.000 0.716 0.000 0.000 0.012 0.272
#> SRR1437035 1 0.4763 0.25916 0.576 0.000 0.000 0.004 0.048 0.372
#> SRR1396877 5 0.5458 0.53669 0.236 0.000 0.004 0.000 0.588 0.172
#> SRR1443026 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1417936 1 0.0000 0.89527 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.3333 0.51198 0.000 0.784 0.000 0.000 0.024 0.192
#> SRR1101128 5 0.3722 0.79082 0.000 0.000 0.100 0.008 0.800 0.092
#> SRR1363886 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR612983 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1394366 2 0.4318 0.58124 0.000 0.532 0.000 0.000 0.020 0.448
#> SRR1093218 3 0.0717 0.88206 0.000 0.000 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1077090 5 0.3525 0.80063 0.000 0.000 0.096 0.008 0.816 0.080
#> SRR1327430 4 0.3444 0.76552 0.000 0.140 0.000 0.812 0.012 0.036
#> SRR1088958 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR1486931 2 0.3817 0.63226 0.000 0.568 0.000 0.000 0.000 0.432
#> SRR1086820 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR1383000 1 0.2651 0.80866 0.860 0.000 0.000 0.000 0.112 0.028
#> SRR1355705 2 0.0260 0.65888 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR614335 4 0.3651 0.71088 0.000 0.224 0.000 0.752 0.008 0.016
#> SRR660534 2 0.3468 0.73572 0.000 0.712 0.000 0.004 0.000 0.284
#> SRR817094 2 0.2562 0.72261 0.000 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR1334265 2 0.3428 0.68890 0.000 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1456401 2 0.2146 0.70215 0.000 0.880 0.000 0.000 0.004 0.116
#> SRR1086393 1 0.3055 0.85049 0.840 0.000 0.000 0.000 0.064 0.096
#> SRR1351521 3 0.0405 0.88145 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1093100 4 0.4061 0.60979 0.000 0.316 0.000 0.664 0.008 0.012
#> SRR1309382 1 0.1341 0.88147 0.948 0.000 0.000 0.000 0.028 0.024
#> SRR1089375 1 0.6163 -0.00549 0.416 0.000 0.000 0.004 0.304 0.276
#> SRR1499482 2 0.3684 0.68722 0.000 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR614719 4 0.0914 0.81567 0.000 0.016 0.000 0.968 0.000 0.016
#> SRR1081473 5 0.3695 0.74319 0.000 0.000 0.044 0.004 0.776 0.176
#> SRR1087415 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR1088217 5 0.2414 0.80912 0.036 0.000 0.056 0.000 0.896 0.012
#> SRR808496 4 0.3281 0.76840 0.000 0.124 0.000 0.828 0.012 0.036
#> SRR1336463 2 0.3945 0.66731 0.000 0.612 0.000 0.000 0.008 0.380
#> SRR612359 4 0.1536 0.80794 0.000 0.016 0.000 0.940 0.004 0.040
#> SRR1444412 5 0.2301 0.77925 0.096 0.000 0.000 0.000 0.884 0.020
#> SRR1074116 3 0.2182 0.84485 0.000 0.000 0.900 0.004 0.020 0.076
#> SRR821846 3 0.0508 0.88144 0.000 0.000 0.984 0.012 0.004 0.000
#> SRR656095 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR808914 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1349099 6 0.5159 -0.14082 0.444 0.000 0.000 0.004 0.072 0.480
#> SRR1337886 2 0.4037 0.66672 0.000 0.608 0.000 0.000 0.012 0.380
#> SRR813632 1 0.2009 0.85018 0.908 0.000 0.000 0.000 0.068 0.024
#> SRR1101591 5 0.4850 0.29692 0.000 0.000 0.448 0.000 0.496 0.056
#> SRR1089713 5 0.4320 0.66531 0.040 0.000 0.004 0.004 0.696 0.256
#> SRR1453127 3 0.0291 0.88047 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1498354 5 0.1858 0.80945 0.000 0.000 0.092 0.000 0.904 0.004
#> SRR1313831 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1315434 3 0.0146 0.88066 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR814747 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1358539 1 0.0146 0.89477 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1367807 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR1365791 3 0.6257 0.53141 0.000 0.000 0.504 0.088 0.076 0.332
#> SRR1081519 5 0.1970 0.80893 0.000 0.000 0.092 0.000 0.900 0.008
#> SRR614707 2 0.5128 0.48023 0.000 0.476 0.000 0.036 0.024 0.464
#> SRR1094027 1 0.0000 0.89527 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 5 0.5137 0.58030 0.012 0.000 0.060 0.004 0.592 0.332
#> SRR1079502 5 0.3728 0.74084 0.000 0.000 0.044 0.004 0.772 0.180
#> SRR1457814 4 0.0779 0.81481 0.000 0.008 0.008 0.976 0.000 0.008
#> SRR1455127 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR615081 2 0.4300 0.60419 0.000 0.548 0.000 0.000 0.020 0.432
#> SRR1327855 5 0.3722 0.79082 0.000 0.000 0.100 0.008 0.800 0.092
#> SRR1417873 2 0.0260 0.65220 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1394125 5 0.6764 0.02192 0.008 0.000 0.312 0.020 0.336 0.324
#> SRR1488388 1 0.1895 0.88509 0.912 0.000 0.000 0.000 0.016 0.072
#> SRR1401122 2 0.3693 0.20954 0.000 0.708 0.000 0.280 0.008 0.004
#> SRR612383 4 0.0881 0.81509 0.000 0.008 0.008 0.972 0.000 0.012
#> SRR1477711 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1350813 2 0.3747 0.66695 0.000 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR612851 4 0.0964 0.81574 0.000 0.012 0.004 0.968 0.000 0.016
#> SRR1086349 1 0.0000 0.89527 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.65506 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.6533 0.46709 0.000 0.000 0.460 0.204 0.040 0.296
#> SRR1475885 6 0.5662 0.43742 0.172 0.100 0.000 0.004 0.068 0.656
#> SRR1376334 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1399821 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR1347042 3 0.1265 0.87124 0.000 0.000 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR612323 4 0.0881 0.81509 0.000 0.008 0.008 0.972 0.000 0.012
#> SRR612604 2 0.4289 0.61230 0.000 0.556 0.000 0.000 0.020 0.424
#> SRR1389546 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1311877 1 0.0000 0.89527 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 5 0.3611 0.70916 0.108 0.000 0.000 0.000 0.796 0.096
#> SRR1101808 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1414079 3 0.1296 0.88024 0.000 0.000 0.952 0.012 0.004 0.032
#> SRR1331153 2 0.3819 0.68382 0.000 0.624 0.000 0.000 0.004 0.372
#> SRR1078439 4 0.3709 0.63179 0.000 0.000 0.000 0.756 0.204 0.040
#> SRR2165527 2 0.0405 0.64857 0.000 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1351147 6 0.5197 0.25581 0.400 0.012 0.000 0.004 0.052 0.532
#> SRR1313536 2 0.3373 0.74023 0.000 0.744 0.000 0.000 0.008 0.248
#> SRR1070308 6 0.5842 0.27844 0.112 0.244 0.000 0.004 0.040 0.600
#> SRR1403110 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1400355 2 0.3371 0.73431 0.000 0.708 0.000 0.000 0.000 0.292
#> SRR1401317 5 0.3722 0.79082 0.000 0.000 0.100 0.008 0.800 0.092
#> SRR1456862 1 0.2629 0.86791 0.868 0.000 0.000 0.000 0.040 0.092
#> SRR1074622 1 0.1895 0.88509 0.912 0.000 0.000 0.000 0.016 0.072
#> SRR1465847 5 0.1970 0.80893 0.000 0.000 0.092 0.000 0.900 0.008
#> SRR1443376 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1471312 3 0.3056 0.82911 0.000 0.000 0.832 0.016 0.012 0.140
#> SRR1075579 1 0.0000 0.89527 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 4 0.1511 0.80773 0.000 0.012 0.000 0.940 0.004 0.044
#> SRR612251 4 0.0976 0.81502 0.000 0.008 0.008 0.968 0.000 0.016
#> SRR1418581 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR658045 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR613214 4 0.0881 0.81509 0.000 0.008 0.008 0.972 0.000 0.012
#> SRR613078 2 0.4310 0.59311 0.000 0.540 0.000 0.000 0.020 0.440
#> SRR1472998 5 0.2308 0.81180 0.016 0.000 0.076 0.000 0.896 0.012
#> SRR1433452 2 0.3717 0.67749 0.000 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR1101957 1 0.0405 0.89534 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1487993 3 0.1946 0.87079 0.000 0.000 0.912 0.012 0.004 0.072
#> SRR1465983 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1380375 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1367566 3 0.1483 0.87943 0.000 0.000 0.944 0.008 0.012 0.036
#> SRR1316151 2 0.4377 0.57806 0.000 0.540 0.000 0.000 0.024 0.436
#> SRR1417547 2 0.0862 0.63352 0.000 0.972 0.000 0.016 0.008 0.004
#> SRR659389 2 0.0865 0.67420 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1490270 2 0.3966 0.61372 0.000 0.552 0.000 0.000 0.004 0.444
#> SRR1398207 5 0.2677 0.80036 0.056 0.000 0.036 0.000 0.884 0.024
#> SRR1358755 5 0.2030 0.81232 0.028 0.000 0.064 0.000 0.908 0.000
#> SRR1078903 4 0.6118 -0.21557 0.000 0.304 0.000 0.360 0.000 0.336
#> SRR1323252 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1451796 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1369172 1 0.1951 0.88350 0.908 0.000 0.000 0.000 0.016 0.076
#> SRR615982 4 0.4066 0.61085 0.000 0.064 0.000 0.732 0.000 0.204
#> SRR1480431 2 0.0551 0.64895 0.000 0.984 0.000 0.004 0.008 0.004
#> SRR1429825 2 0.4310 0.59620 0.000 0.580 0.000 0.000 0.024 0.396
#> SRR1102393 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1071313 1 0.5398 0.38179 0.540 0.000 0.000 0.004 0.112 0.344
#> SRR808351 1 0.2199 0.83575 0.892 0.000 0.000 0.000 0.088 0.020
#> SRR1317513 1 0.0458 0.89234 0.984 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1480501 5 0.3572 0.79506 0.000 0.000 0.100 0.008 0.812 0.080
#> SRR1081910 5 0.5227 0.68865 0.028 0.000 0.112 0.000 0.664 0.196
#> SRR1086611 6 0.6331 -0.08220 0.000 0.320 0.000 0.216 0.020 0.444
#> SRR1392571 6 0.5999 -0.09803 0.000 0.312 0.000 0.256 0.000 0.432
#> SRR1311441 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR808152 1 0.0146 0.89552 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR657313 5 0.5333 0.68457 0.000 0.000 0.084 0.200 0.664 0.052
#> SRR1433131 2 0.3867 0.70959 0.000 0.660 0.000 0.000 0.012 0.328
#> SRR1321011 2 0.1327 0.68602 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1500598 2 0.0000 0.65506 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.3499 0.72072 0.000 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1389108 1 0.1838 0.88624 0.916 0.000 0.000 0.000 0.016 0.068
#> SRR1376228 3 0.1265 0.87124 0.000 0.000 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1399757 1 0.0146 0.89477 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1358060 3 0.1265 0.87124 0.000 0.000 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1464517 3 0.5309 0.61211 0.000 0.000 0.596 0.012 0.100 0.292
#> SRR613557 4 0.0881 0.81509 0.000 0.008 0.008 0.972 0.000 0.012
#> SRR809831 1 0.5358 0.37640 0.588 0.000 0.048 0.000 0.320 0.044
#> SRR1429387 3 0.1265 0.87124 0.000 0.000 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR816565 1 0.0000 0.89527 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.89527 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 5 0.6188 0.17620 0.000 0.000 0.288 0.004 0.404 0.304
#> SRR1072031 2 0.3288 0.73990 0.000 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276
#> SRR1374671 4 0.1908 0.79504 0.000 0.028 0.000 0.916 0.000 0.056
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.972 0.989 0.5006 0.500 0.500
#> 3 3 0.962 0.955 0.981 0.3008 0.806 0.628
#> 4 4 0.870 0.927 0.951 0.1071 0.895 0.713
#> 5 5 0.817 0.839 0.904 0.0667 0.938 0.782
#> 6 6 0.816 0.793 0.864 0.0541 0.924 0.691
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.9710 0.3361 0.400 0.600
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1328073 2 0.7219 0.7527 0.200 0.800
#> SRR1394209 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1391619 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1403980 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1442800 2 0.5946 0.8295 0.144 0.856
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1093053 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1399843 1 0.7139 0.7549 0.804 0.196
#> SRR1380231 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1096736 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1478700 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1384754 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1380317 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1315247 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1456075 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1417154 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1325771 2 0.9775 0.3140 0.412 0.588
#> SRR1360420 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1072948 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1362848 1 0.0376 0.9878 0.996 0.004
#> SRR1407492 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1454868 1 0.9998 0.0253 0.508 0.492
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1101373 1 0.4939 0.8747 0.892 0.108
#> SRR1090145 2 0.6531 0.7980 0.168 0.832
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR614695 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1325871 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1092112 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1078834 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1419062 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1315739 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1091890 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1327473 2 0.6887 0.7759 0.184 0.816
#> SRR1338195 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.6048 0.8236 0.852 0.148
#> SRR1322643 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR614887 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1354620 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 0.7056 0.7582 0.808 0.192
#> SRR1391529 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1389157 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR613568 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.0376 0.9878 0.996 0.004
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1446180 2 0.3274 0.9262 0.060 0.940
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1353136 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1093906 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1399861 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1338789 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1421420 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1352870 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1315041 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1420006 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1472749 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1478341 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1479699 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR659427 1 0.7219 0.7488 0.800 0.200
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1439994 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1374270 1 0.7453 0.7301 0.788 0.212
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1456274 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR820049 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1375290 1 0.1184 0.9761 0.984 0.016
#> SRR818999 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.0376 0.9878 0.996 0.004
#> SRR1332187 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR603365 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1485380 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.1184 0.9761 0.984 0.016
#> SRR615032 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1332816 2 0.6438 0.8005 0.164 0.836
#> SRR612299 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1309403 2 0.9954 0.1649 0.460 0.540
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1414749 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1419760 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1381841 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR821388 2 0.9608 0.3797 0.384 0.616
#> SRR657623 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR819583 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1403072 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR811653 1 0.9710 0.3317 0.600 0.400
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1319520 1 0.3733 0.9171 0.928 0.072
#> SRR1444763 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR613318 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1468469 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1500931 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1379175 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1401909 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1101128 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1093218 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1077090 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1101591 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1453127 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1315434 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1365791 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1081519 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR614707 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1079502 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1457814 2 0.9393 0.4496 0.356 0.644
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1475885 2 0.7056 0.7645 0.192 0.808
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1347042 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.4161 0.9034 0.916 0.084
#> SRR2165527 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1351147 2 0.7139 0.7586 0.196 0.804
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1090881 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR612251 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1487993 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1367566 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1480501 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1086611 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1392571 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR657313 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1376228 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1399757 2 0.7219 0.7527 0.200 0.800
#> SRR1358060 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1464517 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR613557 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR809831 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.0000 0.9915 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.9851 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR614491 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.8105 0.411 0.580 0.336 0.084
#> SRR1394209 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099809 3 0.2537 0.898 0.080 0.000 0.920
#> SRR1500555 3 0.0237 0.965 0.000 0.004 0.996
#> SRR1354363 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR612515 3 0.4399 0.771 0.000 0.188 0.812
#> SRR1092727 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468553 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420169 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442800 2 0.4291 0.774 0.180 0.820 0.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499849 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500030 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093053 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399843 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380231 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR809470 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 3 0.4452 0.767 0.192 0.000 0.808
#> SRR1478700 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081543 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384754 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.6274 0.149 0.000 0.544 0.456
#> SRR1315247 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456075 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095985 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1325771 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 1 0.3686 0.830 0.860 0.000 0.140
#> SRR1076916 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472370 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362848 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407492 2 0.3412 0.850 0.000 0.876 0.124
#> SRR1455082 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.3340 0.848 0.000 0.120 0.880
#> SRR1474816 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443161 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR614695 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.4974 0.701 0.764 0.000 0.236
#> SRR1105463 3 0.4504 0.761 0.196 0.000 0.804
#> SRR811005 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355415 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.5058 0.683 0.000 0.756 0.244
#> SRR1470075 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 3 0.2625 0.894 0.084 0.000 0.916
#> SRR1321165 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074790 2 0.4121 0.791 0.168 0.832 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072749 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078834 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR614984 2 0.5882 0.462 0.000 0.652 0.348
#> SRR1324269 3 0.6225 0.266 0.432 0.000 0.568
#> SRR1401491 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480131 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1421284 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327473 1 0.0237 0.980 0.996 0.004 0.000
#> SRR1338195 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354620 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.3941 0.819 0.844 0.000 0.156
#> SRR1391529 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 2 0.4452 0.757 0.000 0.808 0.192
#> SRR613568 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.0237 0.981 0.996 0.000 0.004
#> SRR1337155 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 2 0.4452 0.761 0.000 0.808 0.192
#> SRR1406372 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353136 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399861 2 0.5785 0.499 0.000 0.668 0.332
#> SRR1338789 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315041 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443268 3 0.3816 0.824 0.148 0.000 0.852
#> SRR1416617 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR655672 2 0.2165 0.920 0.000 0.936 0.064
#> SRR1420006 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470727 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1339153 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098312 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088606 1 0.4121 0.804 0.832 0.000 0.168
#> SRR1479699 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR659427 3 0.4555 0.755 0.000 0.200 0.800
#> SRR1096638 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR659307 3 0.1860 0.919 0.000 0.052 0.948
#> SRR1439994 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 3 0.3340 0.856 0.120 0.000 0.880
#> SRR1374270 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456274 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 3 0.3340 0.857 0.120 0.000 0.880
#> SRR820049 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375290 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR818999 3 0.3686 0.834 0.140 0.000 0.860
#> SRR1390242 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332187 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.4982 0.818 0.828 0.036 0.136
#> SRR1498395 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414749 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365963 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419760 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1381841 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR821388 3 0.0237 0.965 0.000 0.004 0.996
#> SRR657623 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR811653 3 0.4235 0.785 0.000 0.176 0.824
#> SRR1311348 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR613318 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500931 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387494 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379175 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401909 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.1411 0.952 0.964 0.000 0.036
#> SRR1084276 1 0.3941 0.813 0.844 0.000 0.156
#> SRR1353262 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101128 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093218 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077090 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093100 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.5529 0.579 0.704 0.000 0.296
#> SRR1499482 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081473 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444412 1 0.3340 0.859 0.880 0.000 0.120
#> SRR1074116 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.2796 0.895 0.908 0.000 0.092
#> SRR1337886 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089713 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498354 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081519 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR614707 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079502 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457814 3 0.4399 0.771 0.000 0.188 0.812
#> SRR1455127 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327855 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR612383 3 0.4346 0.776 0.000 0.184 0.816
#> SRR1477711 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475885 2 0.5706 0.529 0.320 0.680 0.000
#> SRR1376334 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR612323 2 0.5650 0.542 0.000 0.688 0.312
#> SRR612604 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 3 0.1411 0.939 0.036 0.000 0.964
#> SRR1101808 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078439 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.3686 0.829 0.140 0.860 0.000
#> SRR1403110 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.6235 0.239 0.000 0.436 0.564
#> SRR612251 3 0.4605 0.750 0.000 0.204 0.796
#> SRR1418581 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 2 0.5882 0.462 0.000 0.652 0.348
#> SRR613078 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472998 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398207 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358755 3 0.0237 0.966 0.004 0.000 0.996
#> SRR1078903 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 3 0.6267 0.157 0.452 0.000 0.548
#> SRR808351 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081910 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086611 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392571 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR613557 3 0.4235 0.785 0.000 0.176 0.824
#> SRR809831 3 0.5706 0.516 0.320 0.000 0.680
#> SRR1429387 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.984 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.0000 0.969 0.000 0.000 1.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.984 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614491 4 0.0000 0.8165 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 2 0.7734 0.3703 0.220 0.592 0.056 0.132
#> SRR1394209 4 0.3074 0.9038 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099809 3 0.0469 0.9136 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1500555 3 0.4989 0.0554 0.000 0.000 0.528 0.472
#> SRR1354363 1 0.0336 0.9742 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1391619 3 0.3528 0.8782 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1307997 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663124 4 0.2921 0.9073 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 4 0.0000 0.8165 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092727 4 0.4250 0.7764 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR1364013 2 0.3444 0.7218 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1468553 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1403980 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1420169 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442800 2 0.3208 0.7727 0.148 0.848 0.004 0.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499849 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500030 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1093053 3 0.0707 0.9118 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1399843 3 0.2216 0.8643 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1380231 3 0.0188 0.9190 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR809470 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614239 4 0.2921 0.9073 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR613939 2 0.0188 0.9762 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612971 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 3 0.3984 0.8358 0.132 0.000 0.828 0.040
#> SRR1478700 1 0.1637 0.9279 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1081543 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1384754 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR612287 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380317 4 0.2921 0.9073 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1315247 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658549 4 0.2921 0.9073 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 4 0.3649 0.8723 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1419476 3 0.0188 0.9190 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1456075 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1095985 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325771 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR660272 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808044 1 0.2469 0.8662 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1076916 3 0.0188 0.9190 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.0336 0.9742 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1072948 3 0.0921 0.9198 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1472370 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.0336 0.9742 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1404555 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR659839 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659533 4 0.0000 0.8165 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362848 4 0.1637 0.7738 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR1407492 4 0.2868 0.9060 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR1455082 2 0.3444 0.7219 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR658362 4 0.3610 0.8760 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR810921 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0469 0.9195 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR818232 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 4 0.0000 0.8165 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0188 0.9757 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1086280 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1454891 4 0.3486 0.8844 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR663185 4 0.4855 0.5583 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR811819 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443161 3 0.1302 0.8996 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR614695 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 3 0.2469 0.8284 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1105463 3 0.1557 0.8829 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.3444 0.8841 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1355415 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 4 0.0000 0.8165 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 3 0.1022 0.9019 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1321165 1 0.0469 0.9710 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1092112 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417588 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1074790 2 0.2921 0.7879 0.140 0.860 0.000 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0336 0.9722 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1458314 1 0.2921 0.8454 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 4 0.4855 0.5583 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR1072749 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.1474 0.9221 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1078834 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.2921 0.8454 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614984 4 0.2921 0.9073 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1324269 3 0.2281 0.8616 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.2921 0.8454 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR661505 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.2973 0.8410 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1421284 4 0.3528 0.8818 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1099189 4 0.3610 0.8760 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1347436 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327473 1 0.4103 0.6019 0.744 0.256 0.000 0.000
#> SRR1338195 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR809698 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.2921 0.8454 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1454842 3 0.3610 0.8719 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1322643 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.3172 0.8990 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR1354620 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615056 4 0.3311 0.8941 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR1105320 1 0.8372 0.1846 0.460 0.348 0.060 0.132
#> SRR1391529 1 0.0188 0.9769 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR663052 4 0.2921 0.9073 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR615383 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 4 0.2868 0.9060 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR613568 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614095 4 0.2921 0.9073 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1103092 1 0.2973 0.8410 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1337155 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 2 0.3356 0.7444 0.000 0.824 0.176 0.000
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1353136 3 0.4804 0.6163 0.000 0.000 0.616 0.384
#> SRR1093906 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR614035 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399861 4 0.2921 0.9073 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1338789 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 4 0.0000 0.8165 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315041 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443268 3 0.1302 0.8929 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1416617 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1102443 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655672 4 0.2760 0.9022 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR1420006 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613819 4 0.2921 0.9073 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470727 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.2149 0.9165 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1472749 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1414379 4 0.3610 0.8760 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1431326 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098312 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR810273 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614467 4 0.2973 0.9065 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR811471 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1088606 3 0.2589 0.8195 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1479699 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659427 4 0.5677 0.7963 0.000 0.140 0.140 0.720
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659307 4 0.0000 0.8165 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1439994 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658621 4 0.2973 0.9065 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 3 0.1302 0.8929 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1374270 4 0.1792 0.7552 0.000 0.000 0.068 0.932
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408727 4 0.3688 0.8685 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1456274 1 0.0469 0.9689 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.0188 0.9190 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 3 0.1022 0.9018 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR820049 3 0.1302 0.9032 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1375290 3 0.1557 0.8997 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR818999 3 0.0921 0.9046 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454629 1 0.2921 0.8454 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1332187 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR603365 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0336 0.9742 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1441868 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452356 4 0.3266 0.8963 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 4 0.2921 0.9073 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1332816 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0469 0.9681 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309403 2 0.8167 0.2338 0.284 0.524 0.060 0.132
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414749 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1365963 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368030 4 0.3486 0.8845 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1419760 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381841 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821388 4 0.1211 0.7908 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR657623 4 0.3610 0.8760 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1094241 3 0.0469 0.9176 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR819583 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0336 0.9742 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1342829 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0336 0.9193 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR811653 4 0.0000 0.8165 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663465 4 0.3764 0.8601 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1310094 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613318 4 0.0000 0.8165 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR818670 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1500931 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387494 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1379175 4 0.4877 0.6850 0.000 0.328 0.008 0.664
#> SRR1401909 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.1109 0.9547 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1084276 3 0.3400 0.7405 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 3 0.0592 0.9199 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101128 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093218 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1077090 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327430 4 0.3172 0.8997 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR1088958 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0336 0.9742 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614335 4 0.2921 0.9073 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR660534 2 0.0188 0.9762 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR817094 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1093100 4 0.3610 0.8760 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 3 0.0188 0.9184 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614719 4 0.2921 0.9073 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1081473 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808496 4 0.3172 0.9002 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR1336463 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612359 4 0.2921 0.9073 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1444412 3 0.4967 0.1181 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR1074116 3 0.0336 0.9193 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR821846 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR656095 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.3383 0.8501 0.872 0.000 0.052 0.076
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089713 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453127 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1498354 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR814747 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1081519 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614707 2 0.0336 0.9722 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.2149 0.9159 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1079502 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457814 4 0.0000 0.8165 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327855 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 4 0.4585 0.6954 0.000 0.332 0.000 0.668
#> SRR612383 4 0.0000 0.8165 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612851 4 0.2921 0.9073 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1475885 2 0.3610 0.6972 0.200 0.800 0.000 0.000
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR612323 4 0.2868 0.9060 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR612604 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 3 0.0817 0.9070 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1331153 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078439 3 0.1302 0.8996 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR2165527 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351147 2 0.4972 0.1681 0.456 0.544 0.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.2704 0.8113 0.124 0.876 0.000 0.000
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0336 0.9742 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 4 0.2921 0.9073 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR612251 4 0.0000 0.8165 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613214 4 0.0707 0.8323 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR613078 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472998 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1316151 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417547 2 0.2973 0.7904 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR659389 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398207 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358755 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.1389 0.9271 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615982 4 0.3801 0.8529 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1480431 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 3 0.0469 0.9139 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR808351 1 0.1637 0.9278 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0000 0.9186 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081910 3 0.1940 0.9172 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1086611 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392571 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.1716 0.9016 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1399757 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1464517 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR613557 4 0.0000 0.8165 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR809831 3 0.1388 0.9092 0.028 0.000 0.960 0.012
#> SRR1429387 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR816565 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9797 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.2921 0.9088 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9803 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 4 0.2921 0.9073 0.000 0.140 0.000 0.860
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 3 0.0000 0.8671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.2464 0.8931 0.000 0.888 0.000 0.096 0.016
#> SRR1472057 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR614491 4 0.2329 0.8081 0.000 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR1069376 1 0.0290 0.9336 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR811964 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1345715 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1328073 2 0.7624 -0.0899 0.272 0.376 0.312 0.004 0.036
#> SRR1394209 4 0.2685 0.7784 0.000 0.092 0.000 0.880 0.028
#> SRR1474018 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1099809 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1500555 3 0.6631 0.1137 0.000 0.000 0.420 0.224 0.356
#> SRR1354363 1 0.2020 0.9123 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1391619 3 0.1671 0.8198 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1307997 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR663124 4 0.2464 0.8204 0.000 0.016 0.096 0.888 0.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 4 0.2329 0.8081 0.000 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR1092727 4 0.3143 0.7308 0.000 0.204 0.000 0.796 0.000
#> SRR1364013 2 0.4197 0.7136 0.000 0.728 0.000 0.244 0.028
#> SRR1468553 3 0.0000 0.8671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.1732 0.8492 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1420169 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1442800 2 0.3957 0.7613 0.104 0.824 0.052 0.004 0.016
#> SRR1359214 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1499849 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1500030 3 0.0000 0.8671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093053 5 0.4242 0.2844 0.000 0.000 0.428 0.000 0.572
#> SRR1399843 3 0.6102 0.4983 0.000 0.000 0.568 0.232 0.200
#> SRR1380231 5 0.3790 0.7085 0.000 0.000 0.272 0.004 0.724
#> SRR809470 5 0.2605 0.8620 0.000 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR614239 4 0.2519 0.8192 0.000 0.016 0.100 0.884 0.000
#> SRR613939 2 0.1430 0.8965 0.000 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR612971 2 0.2012 0.9090 0.000 0.920 0.000 0.060 0.020
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR613006 2 0.0324 0.9301 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.1579 0.9179 0.000 0.944 0.000 0.032 0.024
#> SRR1362906 3 0.0162 0.8676 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 3 0.2452 0.7809 0.016 0.000 0.896 0.004 0.084
#> SRR1478700 5 0.3242 0.6262 0.216 0.000 0.000 0.000 0.784
#> SRR1081543 3 0.0404 0.8596 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1384754 3 0.0000 0.8671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612287 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1380317 4 0.1952 0.8220 0.000 0.004 0.084 0.912 0.000
#> SRR1315247 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1105344 2 0.3002 0.8765 0.000 0.856 0.000 0.116 0.028
#> SRR658549 4 0.2450 0.8229 0.000 0.028 0.076 0.896 0.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.3002 0.8765 0.000 0.856 0.000 0.116 0.028
#> SRR1358520 4 0.3829 0.7002 0.000 0.196 0.000 0.776 0.028
#> SRR1419476 3 0.4161 0.3656 0.000 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR1456075 5 0.3752 0.6484 0.000 0.000 0.292 0.000 0.708
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1334419 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1417154 3 0.1341 0.8592 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1095985 5 0.2127 0.8835 0.000 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR1325771 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.1792 0.8463 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR660272 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1332993 1 0.0290 0.9336 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808044 5 0.3932 0.3955 0.328 0.000 0.000 0.000 0.672
#> SRR1076916 3 0.2561 0.7970 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1356266 1 0.0162 0.9340 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1341983 2 0.3002 0.8765 0.000 0.856 0.000 0.116 0.028
#> SRR1456114 1 0.2329 0.8950 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1072948 3 0.3561 0.6390 0.000 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1472370 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1480176 1 0.1197 0.9045 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0162 0.9322 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1469192 1 0.4015 0.4330 0.652 0.000 0.000 0.000 0.348
#> SRR1404555 3 0.0000 0.8671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659533 4 0.2329 0.8081 0.000 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR1362848 3 0.2230 0.7339 0.000 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1407492 4 0.2625 0.8161 0.000 0.016 0.108 0.876 0.000
#> SRR1455082 2 0.3366 0.7553 0.000 0.784 0.000 0.212 0.004
#> SRR658362 4 0.3760 0.7082 0.000 0.188 0.000 0.784 0.028
#> SRR810921 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1456375 3 0.3949 0.5086 0.000 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR818232 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 4 0.3366 0.6998 0.000 0.000 0.232 0.768 0.000
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.2951 0.8789 0.000 0.860 0.000 0.112 0.028
#> SRR1466400 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR658921 2 0.0451 0.9315 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1090145 1 0.2393 0.8483 0.900 0.080 0.000 0.004 0.016
#> SRR1379324 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0404 0.8674 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1086280 3 0.1732 0.8492 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1454891 4 0.1124 0.8203 0.000 0.036 0.004 0.960 0.000
#> SRR663185 4 0.4787 0.3672 0.000 0.364 0.000 0.608 0.028
#> SRR811819 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR656758 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1472687 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1334291 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1368939 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1443161 5 0.2377 0.8789 0.000 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR614695 2 0.0324 0.9301 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1092372 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1474577 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1406582 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR612779 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1354071 5 0.2632 0.8322 0.072 0.000 0.032 0.004 0.892
#> SRR1105463 5 0.2654 0.8691 0.032 0.000 0.084 0.000 0.884
#> SRR811005 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0794 0.8547 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1355415 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 4 0.4171 0.4573 0.000 0.000 0.396 0.604 0.000
#> SRR1470075 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1321165 1 0.1908 0.9154 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1092112 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1417588 3 0.1341 0.8592 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1074790 2 0.3197 0.7551 0.152 0.832 0.000 0.004 0.012
#> SRR1432106 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR655756 2 0.2230 0.8410 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1458314 5 0.2280 0.7317 0.120 0.000 0.000 0.000 0.880
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 4 0.4787 0.3672 0.000 0.364 0.000 0.608 0.028
#> SRR1072749 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.2233 0.8451 0.000 0.892 0.000 0.104 0.004
#> SRR1078834 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1417611 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1396840 5 0.2230 0.7356 0.116 0.000 0.000 0.000 0.884
#> SRR1465440 2 0.2511 0.8963 0.000 0.892 0.000 0.080 0.028
#> SRR1400530 2 0.0290 0.9316 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR614984 4 0.2625 0.8161 0.000 0.016 0.108 0.876 0.000
#> SRR1324269 5 0.3844 0.7656 0.164 0.000 0.044 0.000 0.792
#> SRR1401491 2 0.0290 0.9316 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.1106 0.9244 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR1345523 2 0.2616 0.8899 0.000 0.880 0.000 0.100 0.020
#> SRR1500846 5 0.2329 0.7272 0.124 0.000 0.000 0.000 0.876
#> SRR661505 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1419062 5 0.2561 0.8652 0.000 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR1480131 5 0.2561 0.7770 0.144 0.000 0.000 0.000 0.856
#> SRR1421284 4 0.3193 0.7525 0.000 0.132 0.000 0.840 0.028
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.1732 0.8492 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1099189 4 0.3675 0.7103 0.000 0.188 0.000 0.788 0.024
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0000 0.8671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1327473 1 0.2567 0.8398 0.892 0.088 0.004 0.004 0.012
#> SRR1338195 3 0.0000 0.8671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR658271 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 5 0.1965 0.7555 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1454842 3 0.3003 0.6936 0.000 0.000 0.812 0.188 0.000
#> SRR1322643 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR614887 3 0.0162 0.8647 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1354620 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR615056 4 0.1082 0.8104 0.000 0.008 0.000 0.964 0.028
#> SRR1105320 1 0.6954 0.1627 0.472 0.184 0.324 0.004 0.016
#> SRR1391529 1 0.1908 0.8610 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR663052 4 0.0162 0.8167 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1478834 1 0.2127 0.8431 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR812366 2 0.0566 0.9299 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1435330 3 0.0000 0.8671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 4 0.2625 0.8161 0.000 0.016 0.108 0.876 0.000
#> SRR613568 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR614095 4 0.0162 0.8167 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1103092 1 0.4300 0.0147 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1337155 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1475345 2 0.2900 0.8812 0.000 0.864 0.000 0.108 0.028
#> SRR809089 2 0.1270 0.9180 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1446180 5 0.4219 0.3003 0.000 0.416 0.000 0.000 0.584
#> SRR1406372 2 0.0566 0.9307 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1339880 3 0.0000 0.8671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353136 3 0.1671 0.8157 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1093906 3 0.1478 0.8565 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR614035 2 0.3283 0.8571 0.000 0.832 0.000 0.140 0.028
#> SRR1351104 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1363926 2 0.2325 0.9018 0.000 0.904 0.000 0.068 0.028
#> SRR1399861 4 0.2068 0.8210 0.000 0.004 0.092 0.904 0.000
#> SRR1338789 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1421420 3 0.1732 0.8492 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1420832 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 4 0.3508 0.6718 0.000 0.000 0.252 0.748 0.000
#> SRR1315041 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR661877 2 0.3612 0.8236 0.000 0.800 0.000 0.172 0.028
#> SRR1443268 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1416617 3 0.1410 0.8579 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1102443 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR655672 4 0.2625 0.8161 0.000 0.016 0.108 0.876 0.000
#> SRR1420006 3 0.1732 0.8492 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613819 4 0.0771 0.8129 0.000 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR1469432 2 0.2388 0.9000 0.000 0.900 0.000 0.072 0.028
#> SRR660907 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1465092 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470727 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1339153 3 0.2516 0.7743 0.000 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1472749 3 0.0162 0.8676 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1414379 4 0.3370 0.7408 0.000 0.148 0.000 0.824 0.028
#> SRR1431326 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1487278 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1098312 3 0.0566 0.8606 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR810273 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR614467 4 0.0324 0.8161 0.000 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR811471 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.1478 0.8565 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1088606 5 0.1347 0.8253 0.008 0.008 0.020 0.004 0.960
#> SRR1479699 3 0.0404 0.8612 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1471222 2 0.2036 0.9106 0.000 0.920 0.000 0.056 0.024
#> SRR1378992 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR659427 4 0.5585 0.1892 0.000 0.016 0.044 0.552 0.388
#> SRR1096638 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1466619 2 0.0693 0.9299 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR659307 4 0.2852 0.7689 0.000 0.000 0.172 0.828 0.000
#> SRR1439994 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1454931 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR658621 4 0.0955 0.8107 0.000 0.004 0.000 0.968 0.028
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1374270 3 0.4182 0.2520 0.000 0.000 0.600 0.400 0.000
#> SRR1470947 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1365598 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR662787 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1408727 4 0.3760 0.7082 0.000 0.188 0.000 0.784 0.028
#> SRR1456274 1 0.4776 0.7540 0.744 0.004 0.164 0.004 0.084
#> SRR817744 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1387379 2 0.0162 0.9322 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1102680 5 0.3305 0.7803 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1374198 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1445856 5 0.2127 0.8833 0.000 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR820049 3 0.4430 0.1409 0.000 0.000 0.540 0.004 0.456
#> SRR1375290 3 0.4920 0.4744 0.000 0.000 0.644 0.048 0.308
#> SRR818999 5 0.2708 0.8609 0.044 0.000 0.072 0.000 0.884
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1454629 5 0.2685 0.7953 0.092 0.028 0.000 0.000 0.880
#> SRR1332187 3 0.0290 0.8677 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR603365 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR657833 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1436207 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480384 5 0.4060 0.4819 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.0000 0.8671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1485380 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1073705 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR615032 2 0.1981 0.9088 0.000 0.920 0.000 0.064 0.016
#> SRR1452356 4 0.1195 0.8102 0.000 0.012 0.000 0.960 0.028
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 4 0.2632 0.8201 0.000 0.040 0.072 0.888 0.000
#> SRR1332816 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR612299 2 0.2930 0.7659 0.000 0.832 0.000 0.164 0.004
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309403 3 0.7271 0.0836 0.340 0.300 0.344 0.004 0.012
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079998 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1498885 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1337215 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1414749 3 0.2074 0.8297 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1365963 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1368030 4 0.2795 0.7740 0.000 0.100 0.000 0.872 0.028
#> SRR1419760 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1381841 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821388 3 0.2411 0.7382 0.000 0.000 0.884 0.108 0.008
#> SRR657623 4 0.3724 0.7126 0.000 0.184 0.000 0.788 0.028
#> SRR1094241 3 0.4219 0.2877 0.000 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR819583 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1096149 5 0.4171 0.2023 0.396 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR1342829 3 0.1851 0.8443 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.1851 0.8434 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1446436 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR815092 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.4074 0.4365 0.000 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR811653 4 0.2280 0.8104 0.000 0.000 0.120 0.880 0.000
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1435442 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1421444 3 0.0000 0.8671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1319520 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1444763 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1415026 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1416596 2 0.1403 0.9220 0.000 0.952 0.000 0.024 0.024
#> SRR1485499 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1316078 2 0.3002 0.8765 0.000 0.856 0.000 0.116 0.028
#> SRR663465 4 0.4197 0.6368 0.000 0.244 0.000 0.728 0.028
#> SRR1310094 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR663537 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR613318 4 0.2329 0.8081 0.000 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.1732 0.8492 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR818670 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.1544 0.8550 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1500931 5 0.2329 0.8814 0.000 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR1387494 3 0.0000 0.8671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379175 4 0.3732 0.7160 0.000 0.176 0.000 0.792 0.032
#> SRR1401909 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1440541 2 0.0404 0.9307 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1068832 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1376640 2 0.0162 0.9322 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1085712 2 0.2900 0.8812 0.000 0.864 0.000 0.108 0.028
#> SRR1082283 1 0.4127 0.8008 0.784 0.000 0.136 0.000 0.080
#> SRR1084276 5 0.2694 0.8368 0.076 0.000 0.040 0.000 0.884
#> SRR1353262 2 0.0566 0.9307 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1437035 1 0.3430 0.6903 0.776 0.000 0.000 0.004 0.220
#> SRR1396877 5 0.3730 0.6835 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.3134 0.8737 0.000 0.848 0.000 0.120 0.032
#> SRR1101128 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1363886 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR612983 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1394366 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1093218 3 0.1732 0.8492 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1077090 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1327430 4 0.2388 0.7911 0.000 0.072 0.000 0.900 0.028
#> SRR1088958 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1486931 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1086820 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1383000 5 0.4015 0.4918 0.348 0.000 0.000 0.000 0.652
#> SRR1355705 2 0.3002 0.8765 0.000 0.856 0.000 0.116 0.028
#> SRR614335 4 0.0865 0.8119 0.000 0.004 0.000 0.972 0.024
#> SRR660534 2 0.1197 0.9011 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR817094 2 0.0290 0.9316 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1334265 2 0.2570 0.8943 0.000 0.888 0.000 0.084 0.028
#> SRR1456401 2 0.2054 0.9089 0.000 0.920 0.000 0.052 0.028
#> SRR1086393 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1351521 3 0.0000 0.8671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093100 4 0.3724 0.7118 0.000 0.184 0.000 0.788 0.028
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 5 0.2775 0.8301 0.076 0.000 0.036 0.004 0.884
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614719 4 0.1774 0.8245 0.000 0.016 0.052 0.932 0.000
#> SRR1081473 5 0.2389 0.8855 0.000 0.000 0.116 0.004 0.880
#> SRR1087415 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1088217 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR808496 4 0.1485 0.8087 0.000 0.032 0.000 0.948 0.020
#> SRR1336463 2 0.0451 0.9316 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR612359 4 0.2770 0.8173 0.000 0.044 0.076 0.880 0.000
#> SRR1444412 5 0.2597 0.8244 0.092 0.000 0.024 0.000 0.884
#> SRR1074116 3 0.4074 0.4320 0.000 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR821846 3 0.0000 0.8671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.5576 0.5083 0.604 0.000 0.308 0.004 0.084
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813632 1 0.4302 -0.0138 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480
#> SRR1101591 5 0.2966 0.8265 0.000 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR1089713 5 0.2233 0.8804 0.000 0.000 0.104 0.004 0.892
#> SRR1453127 3 0.0404 0.8674 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1498354 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0162 0.8676 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR814747 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1365791 3 0.0162 0.8677 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1081519 5 0.2690 0.8548 0.000 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR614707 2 0.2583 0.8101 0.000 0.864 0.000 0.132 0.004
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.4210 0.2571 0.000 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1079502 5 0.2389 0.8855 0.000 0.000 0.116 0.004 0.880
#> SRR1457814 4 0.2329 0.8081 0.000 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR1455127 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR615081 2 0.0451 0.9315 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1327855 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1417873 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1394125 3 0.1892 0.8481 0.000 0.000 0.916 0.004 0.080
#> SRR1488388 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1401122 4 0.4638 0.4721 0.000 0.324 0.000 0.648 0.028
#> SRR612383 4 0.2329 0.8081 0.000 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612851 4 0.2519 0.8193 0.000 0.016 0.100 0.884 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1340010 3 0.0000 0.8671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475885 2 0.5174 0.5785 0.196 0.708 0.008 0.004 0.084
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1347042 3 0.1478 0.8565 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR612323 4 0.2625 0.8161 0.000 0.016 0.108 0.876 0.000
#> SRR612604 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 5 0.1732 0.8662 0.000 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.8671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1078439 5 0.4415 0.2251 0.000 0.000 0.444 0.004 0.552
#> SRR2165527 2 0.3612 0.8236 0.000 0.800 0.000 0.172 0.028
#> SRR1351147 1 0.3786 0.6715 0.776 0.204 0.000 0.004 0.016
#> SRR1313536 2 0.0290 0.9316 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1070308 2 0.3607 0.7935 0.068 0.848 0.068 0.004 0.012
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401317 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1456862 1 0.1965 0.9148 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1074622 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1465847 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.8671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 4 0.3264 0.7757 0.000 0.016 0.164 0.820 0.000
#> SRR612251 4 0.2329 0.8081 0.000 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR1418581 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR658045 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613214 4 0.2329 0.8081 0.000 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR613078 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1472998 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1433452 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0290 0.9336 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1487993 3 0.0000 0.8671 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0162 0.8677 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1316151 2 0.1216 0.9246 0.000 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1417547 2 0.4276 0.7038 0.000 0.716 0.000 0.256 0.028
#> SRR659389 2 0.2616 0.8899 0.000 0.880 0.000 0.100 0.020
#> SRR1490270 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1398207 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1358755 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1078903 2 0.2966 0.7409 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR615982 4 0.2605 0.7745 0.000 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR1480431 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1429825 2 0.2595 0.8964 0.000 0.888 0.000 0.080 0.032
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 5 0.3010 0.7396 0.000 0.000 0.172 0.004 0.824
#> SRR808351 1 0.4291 0.0554 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 5 0.2230 0.8867 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1081910 3 0.2516 0.7971 0.000 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1086611 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1392571 2 0.0162 0.9317 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1311441 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR808152 1 0.0290 0.9336 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR657313 3 0.5206 0.1890 0.000 0.000 0.528 0.044 0.428
#> SRR1433131 2 0.0451 0.9315 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1321011 2 0.1117 0.9245 0.000 0.964 0.000 0.016 0.020
#> SRR1500598 2 0.3051 0.8741 0.000 0.852 0.000 0.120 0.028
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.1608 0.9267 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1376228 3 0.1732 0.8492 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1399757 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.1608 0.8532 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1464517 3 0.0290 0.8677 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR613557 4 0.2329 0.8081 0.000 0.000 0.124 0.876 0.000
#> SRR809831 5 0.4766 0.6847 0.072 0.000 0.220 0.000 0.708
#> SRR1429387 3 0.1043 0.8630 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR816565 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9340 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.1732 0.8492 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9325 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 4 0.2280 0.7857 0.000 0.120 0.000 0.880 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 3 0.0547 0.88512 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2164936 2 0.3851 -0.29719 0.000 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR1472057 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR614491 4 0.0865 0.93963 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1069376 1 0.0984 0.87703 0.968 0.000 0.000 0.008 0.012 0.012
#> SRR811964 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1361415 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1345715 1 0.3798 0.85687 0.816 0.000 0.008 0.024 0.056 0.096
#> SRR1328073 2 0.7875 0.24305 0.092 0.456 0.232 0.020 0.036 0.164
#> SRR1394209 6 0.3975 0.60750 0.000 0.040 0.000 0.244 0.000 0.716
#> SRR1474018 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1099809 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1500555 4 0.5613 0.50950 0.000 0.004 0.136 0.592 0.256 0.012
#> SRR1354363 1 0.4636 0.81937 0.748 0.000 0.008 0.024 0.116 0.104
#> SRR1391619 3 0.2772 0.74523 0.000 0.000 0.816 0.180 0.000 0.004
#> SRR1307997 2 0.0260 0.88416 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR663124 4 0.0865 0.93963 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1334670 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR612515 4 0.0865 0.93963 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1092727 4 0.1610 0.85885 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000 0.000
#> SRR1364013 6 0.4186 0.79151 0.000 0.312 0.000 0.032 0.000 0.656
#> SRR1468553 3 0.0363 0.89333 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1403980 3 0.1007 0.89033 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1420169 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1442800 2 0.3715 0.70521 0.012 0.792 0.012 0.012 0.004 0.168
#> SRR1359214 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1499849 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1500030 3 0.0547 0.88512 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1093053 5 0.3986 0.35486 0.000 0.000 0.384 0.004 0.608 0.004
#> SRR1399843 3 0.5710 0.43854 0.000 0.000 0.536 0.184 0.276 0.004
#> SRR1380231 5 0.3329 0.72739 0.000 0.000 0.236 0.004 0.756 0.004
#> SRR809470 5 0.1765 0.87719 0.000 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR614239 4 0.0865 0.93963 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR613939 2 0.1408 0.86168 0.000 0.944 0.000 0.020 0.000 0.036
#> SRR612971 2 0.3823 -0.19297 0.000 0.564 0.000 0.000 0.000 0.436
#> SRR1490204 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR811357 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1471672 1 0.3891 0.85511 0.808 0.000 0.008 0.024 0.056 0.104
#> SRR613006 2 0.1225 0.86728 0.000 0.952 0.000 0.012 0.000 0.036
#> SRR1469570 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1457354 6 0.3860 0.49485 0.000 0.472 0.000 0.000 0.000 0.528
#> SRR1362906 3 0.0260 0.89248 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1079023 1 0.0260 0.87696 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR813608 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1096736 3 0.5044 0.62078 0.008 0.000 0.688 0.032 0.060 0.212
#> SRR1478700 5 0.4717 0.62420 0.124 0.000 0.008 0.024 0.740 0.104
#> SRR1081543 3 0.0713 0.87923 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1384754 3 0.0547 0.88512 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR612287 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1380317 4 0.2651 0.83496 0.000 0.000 0.028 0.860 0.000 0.112
#> SRR1315247 2 0.1010 0.87175 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1105344 6 0.3240 0.82520 0.000 0.244 0.000 0.004 0.000 0.752
#> SRR658549 4 0.0935 0.93753 0.000 0.004 0.032 0.964 0.000 0.000
#> SRR1480240 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1084816 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR612551 6 0.3309 0.83573 0.000 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR1358520 6 0.4095 0.64976 0.000 0.060 0.000 0.216 0.000 0.724
#> SRR1419476 3 0.3634 0.47081 0.000 0.000 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR1456075 5 0.3547 0.52240 0.000 0.000 0.332 0.000 0.668 0.000
#> SRR1389474 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1367005 1 0.3891 0.85511 0.808 0.000 0.008 0.024 0.056 0.104
#> SRR1334419 1 0.3798 0.85687 0.816 0.000 0.008 0.024 0.056 0.096
#> SRR1417154 3 0.0713 0.89325 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1095985 5 0.1719 0.89229 0.000 0.000 0.056 0.008 0.928 0.008
#> SRR1325771 1 0.0146 0.87749 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1360420 3 0.1007 0.89033 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR660272 2 0.0935 0.87352 0.000 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1332993 1 0.1086 0.87683 0.964 0.000 0.000 0.012 0.012 0.012
#> SRR1311833 2 0.0260 0.88510 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR808044 5 0.5583 0.38447 0.240 0.000 0.008 0.024 0.624 0.104
#> SRR1076916 3 0.1444 0.87587 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1356266 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1341983 6 0.3426 0.83645 0.000 0.276 0.000 0.004 0.000 0.720
#> SRR1456114 1 0.4757 0.81062 0.736 0.000 0.008 0.024 0.128 0.104
#> SRR1072948 3 0.2631 0.76576 0.000 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1472370 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1480176 1 0.1152 0.85333 0.952 0.000 0.044 0.000 0.000 0.004
#> SRR613843 2 0.1531 0.86950 0.000 0.928 0.000 0.004 0.000 0.068
#> SRR1469192 1 0.4126 0.38576 0.624 0.000 0.000 0.008 0.360 0.008
#> SRR1404555 3 0.0547 0.88512 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR659533 4 0.0865 0.93963 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1362848 3 0.1297 0.86509 0.000 0.000 0.948 0.040 0.000 0.012
#> SRR1407492 4 0.0865 0.93963 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1455082 2 0.3649 0.61600 0.000 0.764 0.000 0.040 0.000 0.196
#> SRR658362 6 0.4332 0.57499 0.000 0.052 0.000 0.276 0.000 0.672
#> SRR810921 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR662823 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1456375 3 0.3244 0.64329 0.000 0.000 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR818232 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1454868 4 0.1531 0.91247 0.000 0.000 0.068 0.928 0.000 0.004
#> SRR1474816 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1342002 1 0.0146 0.87749 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1088437 6 0.3607 0.76270 0.000 0.348 0.000 0.000 0.000 0.652
#> SRR1466400 2 0.1010 0.87175 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR658921 2 0.1471 0.86390 0.000 0.932 0.000 0.004 0.000 0.064
#> SRR1499873 2 0.0547 0.88368 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1101373 1 0.3845 0.85662 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR1090145 1 0.5974 0.28681 0.520 0.304 0.000 0.012 0.004 0.160
#> SRR1379324 1 0.3891 0.85511 0.808 0.000 0.008 0.024 0.056 0.104
#> SRR1345307 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1396166 3 0.0458 0.89367 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1086280 3 0.1007 0.89033 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1454891 4 0.2733 0.82997 0.000 0.080 0.000 0.864 0.000 0.056
#> SRR663185 6 0.4356 0.74389 0.000 0.136 0.000 0.140 0.000 0.724
#> SRR811819 1 0.0146 0.87749 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1318920 1 0.3891 0.85511 0.808 0.000 0.008 0.024 0.056 0.104
#> SRR656758 2 0.0260 0.88510 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1474351 1 0.0146 0.87749 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR660450 2 0.0935 0.87352 0.000 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1472687 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1334291 2 0.0260 0.88425 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1415153 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1323271 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1368939 2 0.0935 0.87642 0.000 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1443161 5 0.1531 0.89321 0.000 0.000 0.068 0.000 0.928 0.004
#> SRR614695 2 0.1010 0.87175 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1092372 1 0.3845 0.85566 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR1474577 1 0.3845 0.85662 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR1406582 1 0.3845 0.85662 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR612779 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1089006 1 0.3845 0.85662 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR1354071 5 0.3900 0.77052 0.092 0.000 0.000 0.008 0.784 0.116
#> SRR1105463 5 0.1498 0.88412 0.028 0.000 0.032 0.000 0.940 0.000
#> SRR811005 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1385319 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1325871 3 0.2482 0.78196 0.000 0.000 0.848 0.148 0.000 0.004
#> SRR1355415 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1090861 1 0.0146 0.87749 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1320712 4 0.3802 0.57223 0.000 0.000 0.312 0.676 0.000 0.012
#> SRR1470075 1 0.3845 0.85566 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR1091254 1 0.0146 0.87749 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1101397 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1321165 1 0.4340 0.82575 0.768 0.000 0.008 0.016 0.112 0.096
#> SRR1092112 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1417588 3 0.0713 0.89325 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1074790 2 0.3865 0.69831 0.060 0.788 0.000 0.008 0.004 0.140
#> SRR1432106 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR655756 2 0.1461 0.86056 0.000 0.940 0.000 0.044 0.000 0.016
#> SRR1458314 5 0.2574 0.77956 0.004 0.000 0.008 0.024 0.884 0.080
#> SRR1318582 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1080484 6 0.4318 0.74380 0.000 0.132 0.000 0.140 0.000 0.728
#> SRR1072749 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1078586 1 0.0260 0.87696 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1400333 2 0.2308 0.82215 0.000 0.892 0.000 0.068 0.000 0.040
#> SRR1078834 2 0.1010 0.87175 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1417611 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1396840 5 0.1408 0.83105 0.008 0.000 0.008 0.024 0.952 0.008
#> SRR1465440 6 0.3804 0.62456 0.000 0.424 0.000 0.000 0.000 0.576
#> SRR1400530 2 0.1285 0.87244 0.000 0.944 0.000 0.004 0.000 0.052
#> SRR614984 4 0.0865 0.93963 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1324269 5 0.3329 0.70761 0.236 0.000 0.004 0.000 0.756 0.004
#> SRR1401491 2 0.2146 0.82076 0.000 0.880 0.000 0.004 0.000 0.116
#> SRR1319443 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1324349 2 0.3081 0.59472 0.000 0.776 0.000 0.004 0.000 0.220
#> SRR1345523 2 0.3864 -0.35677 0.000 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480
#> SRR1500846 5 0.3178 0.75428 0.028 0.000 0.008 0.024 0.856 0.084
#> SRR661505 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1419062 5 0.2191 0.85702 0.000 0.000 0.120 0.000 0.876 0.004
#> SRR1480131 5 0.2491 0.78032 0.164 0.000 0.000 0.000 0.836 0.000
#> SRR1421284 6 0.4014 0.61473 0.000 0.044 0.000 0.240 0.000 0.716
#> SRR1329624 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1315739 3 0.1007 0.89033 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1099189 6 0.4553 0.49505 0.000 0.052 0.000 0.328 0.000 0.620
#> SRR1083286 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1091890 3 0.0547 0.88512 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.0260 0.88245 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1327473 1 0.5039 0.57327 0.688 0.168 0.004 0.008 0.004 0.128
#> SRR1338195 3 0.0547 0.88512 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0547 0.88368 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1457792 1 0.3798 0.85687 0.816 0.000 0.008 0.024 0.056 0.096
#> SRR658271 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1339597 5 0.1294 0.83376 0.004 0.000 0.008 0.024 0.956 0.008
#> SRR1454842 3 0.3584 0.55541 0.000 0.000 0.688 0.308 0.000 0.004
#> SRR1322643 1 0.3845 0.85566 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR614887 3 0.0937 0.87648 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1354620 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR615056 6 0.3652 0.56280 0.000 0.016 0.000 0.264 0.000 0.720
#> SRR1105320 2 0.7699 -0.01611 0.204 0.360 0.292 0.008 0.004 0.132
#> SRR1391529 1 0.2595 0.73890 0.836 0.000 0.000 0.000 0.160 0.004
#> SRR663052 4 0.1267 0.89106 0.000 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1478834 1 0.2362 0.76788 0.860 0.000 0.000 0.000 0.136 0.004
#> SRR812366 2 0.3265 0.59165 0.000 0.748 0.000 0.004 0.000 0.248
#> SRR1435330 3 0.0547 0.88512 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0260 0.88510 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1389157 4 0.0865 0.93963 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR613568 2 0.0935 0.87352 0.000 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR614095 4 0.1863 0.84992 0.000 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1103092 1 0.3854 0.03644 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR1337155 5 0.1411 0.89689 0.000 0.000 0.060 0.000 0.936 0.004
#> SRR1475345 6 0.3464 0.80395 0.000 0.312 0.000 0.000 0.000 0.688
#> SRR809089 2 0.1444 0.83903 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1446180 2 0.5023 0.42721 0.000 0.600 0.000 0.004 0.312 0.084
#> SRR1406372 2 0.1531 0.86098 0.000 0.928 0.000 0.004 0.000 0.068
#> SRR1339880 3 0.0547 0.88512 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1353136 3 0.2632 0.76329 0.000 0.000 0.832 0.164 0.000 0.004
#> SRR1093906 3 0.0937 0.89154 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR614035 6 0.3405 0.83937 0.000 0.272 0.000 0.004 0.000 0.724
#> SRR1351104 1 0.3891 0.85511 0.808 0.000 0.008 0.024 0.056 0.104
#> SRR1363926 6 0.3789 0.63424 0.000 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584
#> SRR1399861 4 0.0865 0.93963 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1338789 1 0.3891 0.85511 0.808 0.000 0.008 0.024 0.056 0.104
#> SRR1421420 3 0.1007 0.89033 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1420832 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1476231 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1352870 4 0.1806 0.89072 0.000 0.000 0.088 0.908 0.000 0.004
#> SRR1315041 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR661877 6 0.3541 0.83783 0.000 0.260 0.000 0.012 0.000 0.728
#> SRR1443268 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1416617 3 0.0790 0.89276 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1102443 1 0.3845 0.85662 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR655672 4 0.0865 0.93963 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1420006 3 0.1007 0.89033 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1458267 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR613819 6 0.3817 0.22482 0.000 0.000 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1469432 6 0.3747 0.67462 0.000 0.396 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR660907 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1465092 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1470727 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1339153 3 0.3368 0.78942 0.000 0.000 0.820 0.060 0.116 0.004
#> SRR1472749 3 0.0260 0.89248 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1414379 6 0.4050 0.62144 0.000 0.048 0.000 0.236 0.000 0.716
#> SRR1431326 1 0.3798 0.85687 0.816 0.000 0.008 0.024 0.056 0.096
#> SRR1487278 2 0.1010 0.87175 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1098312 3 0.1334 0.87458 0.000 0.000 0.948 0.020 0.000 0.032
#> SRR810273 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1376000 2 0.0713 0.87647 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR614467 4 0.3833 0.15635 0.000 0.000 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR811471 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1478341 3 0.0937 0.89154 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1088606 5 0.3880 0.76440 0.012 0.008 0.012 0.016 0.788 0.164
#> SRR1479699 3 0.2173 0.84966 0.000 0.000 0.904 0.028 0.004 0.064
#> SRR1403589 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR812625 2 0.1753 0.85190 0.000 0.912 0.000 0.004 0.000 0.084
#> SRR1359803 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1338988 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1471222 6 0.3833 0.51740 0.000 0.444 0.000 0.000 0.000 0.556
#> SRR1378992 1 0.3845 0.85662 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR659427 5 0.5999 0.55878 0.000 0.004 0.060 0.172 0.616 0.148
#> SRR1096638 1 0.3798 0.85767 0.816 0.000 0.008 0.024 0.056 0.096
#> SRR1466619 2 0.3109 0.65338 0.000 0.772 0.000 0.004 0.000 0.224
#> SRR659307 4 0.1075 0.93163 0.000 0.000 0.048 0.952 0.000 0.000
#> SRR1439994 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1454931 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1332928 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR658621 6 0.3706 0.35189 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR1095840 1 0.0146 0.87749 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1458243 5 0.1411 0.89695 0.000 0.000 0.060 0.000 0.936 0.004
#> SRR1374270 3 0.3699 0.49214 0.000 0.000 0.660 0.336 0.000 0.004
#> SRR1470947 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1365598 2 0.1010 0.87175 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR662787 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1408727 6 0.4176 0.65456 0.000 0.068 0.000 0.212 0.000 0.720
#> SRR1456274 1 0.7694 0.50462 0.468 0.024 0.172 0.036 0.060 0.240
#> SRR817744 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1478744 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1387379 2 0.0713 0.87919 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1102680 5 0.2854 0.76799 0.000 0.000 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1374198 1 0.3845 0.85566 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR1445856 5 0.1285 0.89404 0.000 0.000 0.052 0.000 0.944 0.004
#> SRR820049 3 0.4887 0.05422 0.000 0.000 0.476 0.048 0.472 0.004
#> SRR1375290 3 0.5386 0.54986 0.000 0.000 0.604 0.204 0.188 0.004
#> SRR818999 5 0.1480 0.87579 0.040 0.000 0.020 0.000 0.940 0.000
#> SRR1390242 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1401164 2 0.1010 0.87175 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1454629 5 0.2317 0.83100 0.088 0.008 0.000 0.008 0.892 0.004
#> SRR1332187 3 0.0363 0.89333 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR603365 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR657833 2 0.1010 0.87175 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1436207 2 0.0547 0.88367 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1488017 1 0.0146 0.87749 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR612947 2 0.0363 0.88538 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1480384 5 0.3136 0.70678 0.228 0.000 0.000 0.000 0.768 0.004
#> SRR1364761 2 0.0632 0.88157 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1308086 3 0.0547 0.88512 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.3845 0.85566 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR1485380 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1073705 1 0.3845 0.85662 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR615032 2 0.3672 0.11511 0.000 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368
#> SRR1452356 6 0.3586 0.55406 0.000 0.012 0.000 0.268 0.000 0.720
#> SRR1442983 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1100346 4 0.0972 0.93525 0.000 0.008 0.028 0.964 0.000 0.000
#> SRR1332816 1 0.3845 0.85662 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR612299 2 0.1995 0.83353 0.000 0.912 0.000 0.052 0.000 0.036
#> SRR1407386 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1418064 2 0.0363 0.88538 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1309403 2 0.7609 0.00905 0.184 0.380 0.296 0.008 0.004 0.128
#> SRR1498395 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1079998 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1498885 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1337215 2 0.1010 0.87175 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1414749 3 0.1204 0.88465 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1365963 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1368030 6 0.3884 0.61096 0.000 0.036 0.000 0.240 0.000 0.724
#> SRR1419760 2 0.0363 0.88476 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1381841 1 0.0622 0.87378 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR821388 3 0.1926 0.83082 0.000 0.000 0.912 0.068 0.000 0.020
#> SRR657623 6 0.4095 0.65824 0.000 0.064 0.000 0.208 0.000 0.728
#> SRR1094241 3 0.4566 0.24982 0.000 0.000 0.540 0.028 0.428 0.004
#> SRR819583 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1096149 5 0.5861 0.19354 0.304 0.000 0.008 0.024 0.560 0.104
#> SRR1342829 3 0.1075 0.88872 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1353028 1 0.0146 0.87749 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR811333 3 0.1007 0.89033 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1311666 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1486698 2 0.1010 0.87175 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1446436 2 0.0547 0.87919 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR815092 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1500149 2 0.0935 0.87352 0.000 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1100564 1 0.0260 0.87696 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1403072 3 0.3446 0.57295 0.000 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR811653 4 0.1010 0.93817 0.000 0.000 0.036 0.960 0.000 0.004
#> SRR1311348 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1489438 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1435442 2 0.1010 0.87175 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1421444 3 0.0547 0.88512 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1344010 6 0.3288 0.83879 0.000 0.276 0.000 0.000 0.000 0.724
#> SRR1319520 1 0.3798 0.85687 0.816 0.000 0.008 0.024 0.056 0.096
#> SRR1444763 1 0.4063 0.85004 0.796 0.000 0.008 0.024 0.068 0.104
#> SRR1415026 6 0.3309 0.83573 0.000 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR1416596 2 0.3986 -0.22538 0.000 0.532 0.000 0.004 0.000 0.464
#> SRR1485499 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1316078 6 0.3446 0.80820 0.000 0.308 0.000 0.000 0.000 0.692
#> SRR663465 6 0.4222 0.69133 0.000 0.088 0.000 0.184 0.000 0.728
#> SRR1310094 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR663537 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1486780 1 0.3845 0.85662 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR1453950 1 0.0146 0.87749 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1087875 1 0.3845 0.85662 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR613318 4 0.0865 0.93963 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1332694 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1468469 3 0.1007 0.89033 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR818670 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1120318 1 0.0260 0.87696 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1311622 3 0.0937 0.89157 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1500931 5 0.1556 0.88753 0.000 0.000 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1387494 3 0.0405 0.89001 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000
#> SRR1379175 6 0.5408 0.35146 0.000 0.108 0.000 0.364 0.004 0.524
#> SRR1401909 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1440541 2 0.1714 0.81762 0.000 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1068832 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1376640 2 0.2100 0.83006 0.000 0.884 0.000 0.004 0.000 0.112
#> SRR1085712 6 0.3647 0.74348 0.000 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640
#> SRR1082283 1 0.5505 0.78054 0.704 0.000 0.096 0.024 0.072 0.104
#> SRR1084276 5 0.1327 0.85793 0.064 0.000 0.000 0.000 0.936 0.000
#> SRR1353262 2 0.2520 0.77501 0.000 0.844 0.000 0.004 0.000 0.152
#> SRR1437035 1 0.5611 0.17306 0.528 0.000 0.000 0.008 0.336 0.128
#> SRR1396877 5 0.3265 0.71196 0.000 0.000 0.248 0.000 0.748 0.004
#> SRR1443026 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1417936 1 0.0146 0.87749 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1436822 6 0.3290 0.80999 0.000 0.252 0.000 0.004 0.000 0.744
#> SRR1101128 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1363886 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR612983 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1394366 2 0.1010 0.87175 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1093218 3 0.1007 0.89033 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1077090 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1327430 6 0.4497 0.47969 0.000 0.048 0.000 0.328 0.000 0.624
#> SRR1088958 1 0.3845 0.85662 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR1486931 2 0.0363 0.88476 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1086820 1 0.3845 0.85566 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR1383000 5 0.3273 0.70781 0.212 0.000 0.000 0.008 0.776 0.004
#> SRR1355705 6 0.3428 0.81351 0.000 0.304 0.000 0.000 0.000 0.696
#> SRR614335 6 0.3782 0.27753 0.000 0.000 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR660534 2 0.0891 0.87568 0.000 0.968 0.000 0.024 0.000 0.008
#> SRR817094 2 0.1957 0.79430 0.000 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1334265 6 0.3727 0.70164 0.000 0.388 0.000 0.000 0.000 0.612
#> SRR1456401 6 0.3847 0.54813 0.000 0.456 0.000 0.000 0.000 0.544
#> SRR1086393 1 0.4117 0.84806 0.792 0.000 0.008 0.024 0.072 0.104
#> SRR1351521 3 0.0291 0.89136 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1093100 6 0.4134 0.61991 0.000 0.052 0.000 0.240 0.000 0.708
#> SRR1309382 1 0.0508 0.87273 0.984 0.000 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1089375 5 0.4365 0.75199 0.100 0.000 0.008 0.008 0.756 0.128
#> SRR1499482 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR614719 4 0.1053 0.93068 0.000 0.004 0.020 0.964 0.000 0.012
#> SRR1081473 5 0.1531 0.89363 0.000 0.000 0.068 0.000 0.928 0.004
#> SRR1087415 1 0.3891 0.85511 0.808 0.000 0.008 0.024 0.056 0.104
#> SRR1088217 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR808496 6 0.4334 0.30607 0.000 0.024 0.000 0.408 0.000 0.568
#> SRR1336463 2 0.1753 0.85044 0.000 0.912 0.000 0.004 0.000 0.084
#> SRR612359 4 0.1003 0.92897 0.000 0.016 0.020 0.964 0.000 0.000
#> SRR1444412 5 0.1556 0.84586 0.080 0.000 0.000 0.000 0.920 0.000
#> SRR1074116 3 0.3531 0.52603 0.000 0.000 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR821846 3 0.0547 0.88512 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR808914 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1349099 1 0.7585 0.28983 0.372 0.000 0.288 0.036 0.060 0.244
#> SRR1337886 2 0.1327 0.84683 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR813632 1 0.3961 0.07753 0.556 0.000 0.000 0.000 0.440 0.004
#> SRR1101591 5 0.2340 0.83446 0.000 0.000 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR1089713 5 0.3140 0.85115 0.000 0.000 0.056 0.008 0.844 0.092
#> SRR1453127 3 0.0458 0.89367 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1498354 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1313831 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1315434 3 0.0458 0.89367 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR814747 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1358539 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1367807 1 0.3845 0.85662 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR1365791 3 0.0363 0.89333 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1081519 5 0.1957 0.86507 0.000 0.000 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR614707 2 0.1930 0.83589 0.000 0.916 0.000 0.048 0.000 0.036
#> SRR1094027 1 0.0146 0.87749 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1489092 3 0.4719 0.34521 0.000 0.000 0.592 0.008 0.360 0.040
#> SRR1079502 5 0.1471 0.89545 0.000 0.000 0.064 0.000 0.932 0.004
#> SRR1457814 4 0.0865 0.93963 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1455127 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR615081 2 0.1644 0.85644 0.000 0.920 0.000 0.004 0.000 0.076
#> SRR1327855 5 0.1327 0.89625 0.000 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1417873 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1394125 3 0.1124 0.89082 0.000 0.000 0.956 0.008 0.036 0.000
#> SRR1488388 1 0.3845 0.85566 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR1401122 6 0.4316 0.73759 0.000 0.128 0.000 0.144 0.000 0.728
#> SRR612383 4 0.0865 0.93963 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1477711 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1350813 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR612851 4 0.0865 0.93963 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR812837 6 0.3288 0.83879 0.000 0.276 0.000 0.000 0.000 0.724
#> SRR1340010 3 0.0547 0.88512 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1475885 2 0.7229 0.33005 0.144 0.504 0.016 0.032 0.048 0.256
#> SRR1376334 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1399821 1 0.3845 0.85566 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR1347042 3 0.0937 0.89154 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR612323 4 0.0865 0.93963 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR612604 2 0.1010 0.87175 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1389546 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1311877 1 0.0146 0.87749 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1465608 5 0.1036 0.87413 0.000 0.000 0.024 0.008 0.964 0.004
#> SRR1101808 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1414079 3 0.0547 0.88512 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.0935 0.87642 0.000 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1078439 5 0.4791 0.28185 0.000 0.000 0.384 0.048 0.564 0.004
#> SRR2165527 6 0.3541 0.83783 0.000 0.260 0.000 0.012 0.000 0.728
#> SRR1351147 2 0.6071 0.26353 0.344 0.480 0.000 0.012 0.004 0.160
#> SRR1313536 2 0.1806 0.85127 0.000 0.908 0.000 0.004 0.000 0.088
#> SRR1070308 2 0.4196 0.69598 0.040 0.780 0.024 0.008 0.004 0.144
#> SRR1403110 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1400355 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1401317 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1456862 1 0.4369 0.83609 0.772 0.000 0.008 0.024 0.092 0.104
#> SRR1074622 1 0.3845 0.85662 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR1465847 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1443376 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1471312 3 0.0291 0.89136 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1075579 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090881 4 0.1285 0.92724 0.000 0.000 0.052 0.944 0.000 0.004
#> SRR612251 4 0.0865 0.93963 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR1418581 1 0.3798 0.85687 0.816 0.000 0.008 0.024 0.056 0.096
#> SRR658045 2 0.0363 0.88538 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR613214 4 0.0865 0.93963 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR613078 2 0.1010 0.87175 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1472998 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1433452 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1101957 1 0.0881 0.87687 0.972 0.000 0.000 0.008 0.012 0.008
#> SRR1487993 3 0.0547 0.88512 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1380375 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1367566 3 0.0363 0.89333 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1316151 2 0.3930 0.00158 0.000 0.576 0.000 0.004 0.000 0.420
#> SRR1417547 6 0.3719 0.83317 0.000 0.248 0.000 0.024 0.000 0.728
#> SRR659389 6 0.3838 0.55544 0.000 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR1490270 2 0.0935 0.87352 0.000 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1398207 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1358755 5 0.1267 0.89789 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1078903 2 0.2980 0.69252 0.000 0.800 0.000 0.192 0.000 0.008
#> SRR1323252 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1451796 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1369172 1 0.3891 0.85511 0.808 0.000 0.008 0.024 0.056 0.104
#> SRR615982 4 0.1910 0.83202 0.000 0.108 0.000 0.892 0.000 0.000
#> SRR1480431 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1429825 6 0.3852 0.64153 0.000 0.384 0.000 0.004 0.000 0.612
#> SRR1102393 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1071313 5 0.4640 0.68015 0.000 0.000 0.124 0.020 0.728 0.128
#> SRR808351 1 0.3862 -0.02610 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476 0.000
#> SRR1317513 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1480501 5 0.1444 0.89230 0.000 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1081910 3 0.1267 0.88281 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1086611 2 0.1010 0.87175 0.000 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1392571 2 0.0146 0.88332 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1311441 1 0.3798 0.85687 0.816 0.000 0.008 0.024 0.056 0.096
#> SRR808152 1 0.0881 0.87687 0.972 0.000 0.000 0.008 0.012 0.008
#> SRR657313 3 0.5728 0.27584 0.000 0.000 0.488 0.152 0.356 0.004
#> SRR1433131 2 0.1349 0.86781 0.000 0.940 0.000 0.004 0.000 0.056
#> SRR1321011 2 0.3756 -0.02621 0.000 0.600 0.000 0.000 0.000 0.400
#> SRR1500598 6 0.3266 0.84103 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1379343 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1389108 1 0.3845 0.85662 0.812 0.000 0.008 0.024 0.056 0.100
#> SRR1376228 3 0.1007 0.89033 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1399757 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1358060 3 0.0937 0.89154 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1464517 3 0.0363 0.89343 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR613557 4 0.0865 0.93963 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000 0.000
#> SRR809831 5 0.4904 0.63324 0.148 0.000 0.196 0.000 0.656 0.000
#> SRR1429387 3 0.0547 0.89364 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR816565 1 0.0146 0.87749 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071644 1 0.0146 0.87697 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1406936 3 0.1007 0.89033 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1072031 2 0.0458 0.88560 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1374671 4 0.1204 0.88838 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.771 0.872 0.946 0.5003 0.499 0.499
#> 3 3 0.905 0.909 0.960 0.2582 0.832 0.676
#> 4 4 0.749 0.819 0.835 0.1608 0.854 0.621
#> 5 5 0.727 0.803 0.855 0.0742 0.922 0.713
#> 6 6 0.778 0.687 0.846 0.0384 0.956 0.804
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.3733 0.8811 0.928 0.072
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.9661 0.3841 0.392 0.608
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.1184 0.9232 0.984 0.016
#> SRR1328073 2 0.3431 0.8911 0.064 0.936
#> SRR1394209 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.4562 0.8561 0.096 0.904
#> SRR1354363 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1391619 1 0.6438 0.7821 0.836 0.164
#> SRR1307997 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.2778 0.9021 0.952 0.048
#> SRR612515 2 0.9209 0.5092 0.336 0.664
#> SRR1092727 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1403980 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1442800 2 0.8386 0.5946 0.268 0.732
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.1184 0.9227 0.984 0.016
#> SRR1093053 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1399843 1 0.9661 0.3314 0.608 0.392
#> SRR1380231 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1471672 2 0.4298 0.8637 0.088 0.912
#> SRR613006 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0376 0.9302 0.996 0.004
#> SRR813608 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1096736 2 0.9922 0.2290 0.448 0.552
#> SRR1478700 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.9608 0.3530 0.616 0.384
#> SRR1384754 1 0.4022 0.8713 0.920 0.080
#> SRR612287 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1380317 2 0.6887 0.7531 0.184 0.816
#> SRR1315247 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1456075 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.8813 0.6114 0.700 0.300
#> SRR1334419 1 0.2948 0.8989 0.948 0.052
#> SRR1417154 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1325771 1 0.9661 0.4256 0.608 0.392
#> SRR1360420 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1072948 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.2948 0.8967 0.948 0.052
#> SRR659839 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.9248 0.5014 0.340 0.660
#> SRR1362848 2 0.9248 0.5014 0.340 0.660
#> SRR1407492 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0376 0.9302 0.996 0.004
#> SRR1454868 2 0.9795 0.3241 0.416 0.584
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1101373 1 0.9460 0.4901 0.636 0.364
#> SRR1090145 1 0.9552 0.4618 0.624 0.376
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.2423 0.9077 0.960 0.040
#> SRR1318920 1 0.8909 0.5980 0.692 0.308
#> SRR656758 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.5408 0.8372 0.876 0.124
#> SRR660450 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.5059 0.8431 0.888 0.112
#> SRR614695 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.7376 0.7442 0.792 0.208
#> SRR1474577 1 0.6148 0.8092 0.848 0.152
#> SRR1406582 1 0.6531 0.7921 0.832 0.168
#> SRR612779 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.8909 0.5980 0.692 0.308
#> SRR1354071 1 0.0376 0.9302 0.996 0.004
#> SRR1105463 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1325871 1 0.0938 0.9250 0.988 0.012
#> SRR1355415 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.8909 0.5980 0.692 0.308
#> SRR1320712 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0376 0.9302 0.996 0.004
#> SRR1101397 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.8909 0.5980 0.692 0.308
#> SRR1092112 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1078834 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.7815 0.6842 0.232 0.768
#> SRR1324269 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.4562 0.8634 0.904 0.096
#> SRR1324349 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1419062 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1315739 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1091890 1 0.7745 0.6902 0.772 0.228
#> SRR1347436 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1327473 2 0.0672 0.9408 0.008 0.992
#> SRR1338195 1 0.3431 0.8871 0.936 0.064
#> SRR809698 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.8909 0.5980 0.692 0.308
#> SRR658271 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.8207 0.6424 0.744 0.256
#> SRR1322643 1 0.8207 0.6791 0.744 0.256
#> SRR614887 1 0.3584 0.8843 0.932 0.068
#> SRR1354620 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 1.0000 0.1205 0.504 0.496
#> SRR1391529 1 0.0376 0.9302 0.996 0.004
#> SRR663052 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.3274 0.8904 0.940 0.060
#> SRR615383 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1389157 2 0.8813 0.5746 0.300 0.700
#> SRR613568 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.1184 0.9226 0.984 0.016
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1446180 2 0.9933 0.0757 0.452 0.548
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.0672 0.9275 0.992 0.008
#> SRR1353136 2 0.9988 0.1215 0.480 0.520
#> SRR1093906 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1399861 2 0.5946 0.8012 0.144 0.856
#> SRR1338789 1 0.8909 0.5980 0.692 0.308
#> SRR1421420 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.1633 0.9181 0.976 0.024
#> SRR1352870 2 0.9993 0.1065 0.484 0.516
#> SRR1315041 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1102443 2 0.8955 0.5032 0.312 0.688
#> SRR655672 2 0.8081 0.6607 0.248 0.752
#> SRR1420006 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.0672 0.9277 0.992 0.008
#> SRR1472749 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.9775 0.3806 0.588 0.412
#> SRR1487278 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.4562 0.8589 0.904 0.096
#> SRR810273 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1478341 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.8909 0.5984 0.692 0.308
#> SRR1479699 1 0.9944 0.1462 0.544 0.456
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1378992 2 0.9881 0.1491 0.436 0.564
#> SRR659427 2 0.9754 0.3428 0.408 0.592
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.9209 0.5092 0.336 0.664
#> SRR1439994 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.5946 0.8177 0.856 0.144
#> SRR1458243 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1374270 2 0.9977 0.1514 0.472 0.528
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1456274 2 0.5408 0.8196 0.124 0.876
#> SRR817744 1 0.8909 0.5980 0.692 0.308
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.8861 0.6043 0.696 0.304
#> SRR1445856 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR820049 1 0.3584 0.8845 0.932 0.068
#> SRR1375290 1 0.4562 0.8586 0.904 0.096
#> SRR818999 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.7602 0.7291 0.780 0.220
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.8909 0.5980 0.692 0.308
#> SRR1332187 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR603365 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.8909 0.5980 0.692 0.308
#> SRR612947 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.8909 0.5980 0.692 0.308
#> SRR1485380 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1073705 2 0.9286 0.4285 0.344 0.656
#> SRR615032 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1332816 2 0.4431 0.8590 0.092 0.908
#> SRR612299 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.0376 0.9302 0.996 0.004
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1309403 2 0.9323 0.4167 0.348 0.652
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1414749 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1419760 2 0.0672 0.9409 0.008 0.992
#> SRR1381841 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR821388 2 0.8955 0.5536 0.312 0.688
#> SRR657623 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR819583 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.3584 0.8865 0.932 0.068
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1403072 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR811653 2 0.9661 0.3841 0.392 0.608
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1319520 1 0.9988 0.1743 0.520 0.480
#> SRR1444763 1 0.8909 0.5980 0.692 0.308
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.5408 0.8373 0.876 0.124
#> SRR613318 2 0.9248 0.5014 0.340 0.660
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1468469 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1500931 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.3274 0.8904 0.940 0.060
#> SRR1379175 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1401909 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.8955 0.5915 0.688 0.312
#> SRR1396877 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1101128 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1093218 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1077090 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.8909 0.5980 0.692 0.308
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.5737 0.8255 0.864 0.136
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.0938 0.9378 0.012 0.988
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.6531 0.7918 0.832 0.168
#> SRR1088217 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.0376 0.9302 0.996 0.004
#> SRR1349099 1 0.7139 0.7677 0.804 0.196
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1101591 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1453127 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0376 0.9302 0.996 0.004
#> SRR1315434 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.8443 0.6554 0.728 0.272
#> SRR1367807 2 0.9998 -0.0700 0.492 0.508
#> SRR1365791 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1081519 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR614707 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1079502 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1457814 2 0.9286 0.4932 0.344 0.656
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.8909 0.5604 0.308 0.692
#> SRR1477711 1 0.0376 0.9302 0.996 0.004
#> SRR1350813 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.8909 0.5980 0.692 0.308
#> SRR812837 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.6801 0.7610 0.820 0.180
#> SRR1475885 2 0.2423 0.9119 0.040 0.960
#> SRR1376334 1 0.8909 0.5980 0.692 0.308
#> SRR1399821 1 0.6247 0.8049 0.844 0.156
#> SRR1347042 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.2236 0.9164 0.036 0.964
#> SRR612604 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.8016 0.6966 0.756 0.244
#> SRR1465608 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.3431 0.8871 0.936 0.064
#> SRR1331153 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.4562 0.8588 0.904 0.096
#> SRR2165527 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1351147 2 0.8443 0.5868 0.272 0.728
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.0938 0.9374 0.012 0.988
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.5737 0.8258 0.864 0.136
#> SRR1090881 2 0.8081 0.6602 0.248 0.752
#> SRR612251 2 0.9323 0.4849 0.348 0.652
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.6887 0.7522 0.184 0.816
#> SRR613078 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1487993 1 0.0672 0.9275 0.992 0.008
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1367566 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1480501 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1086611 2 0.0938 0.9374 0.012 0.988
#> SRR1392571 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.8909 0.5980 0.692 0.308
#> SRR808152 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR657313 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.8555 0.6442 0.720 0.280
#> SRR1376228 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.9954 0.2417 0.540 0.460
#> SRR1358060 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1464517 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR613557 2 0.9000 0.5464 0.316 0.684
#> SRR809831 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.2948 0.8992 0.948 0.052
#> SRR1406936 1 0.0000 0.9321 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.9476 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 3 0.0747 0.9125 0.016 0.000 0.984
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.3412 0.8662 0.124 0.000 0.876
#> SRR614491 3 0.6026 0.4089 0.000 0.376 0.624
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.6154 0.3053 0.592 0.408 0.000
#> SRR1394209 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.1411 0.9302 0.036 0.964 0.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR612515 2 0.6026 0.3738 0.000 0.624 0.376
#> SRR1092727 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468553 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420169 3 0.3879 0.8454 0.152 0.000 0.848
#> SRR1442800 2 0.6309 -0.0157 0.500 0.500 0.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500030 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093053 3 0.6414 0.7239 0.248 0.036 0.716
#> SRR1399843 2 0.8328 0.1305 0.084 0.520 0.396
#> SRR1380231 3 0.2625 0.8889 0.084 0.000 0.916
#> SRR809470 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.2448 0.8775 0.924 0.076 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.6330 0.3252 0.600 0.396 0.004
#> SRR1478700 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081543 3 0.1647 0.9025 0.036 0.004 0.960
#> SRR1384754 1 0.5465 0.5675 0.712 0.000 0.288
#> SRR612287 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.0592 0.9537 0.012 0.988 0.000
#> SRR1315247 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456075 3 0.3879 0.8452 0.152 0.000 0.848
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095985 3 0.6095 0.4896 0.392 0.000 0.608
#> SRR1325771 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076916 3 0.5650 0.6222 0.312 0.000 0.688
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472370 3 0.3412 0.8662 0.124 0.000 0.876
#> SRR1480176 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.6442 0.2463 0.432 0.564 0.004
#> SRR1362848 2 0.8521 0.0381 0.440 0.468 0.092
#> SRR1407492 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 2 0.6126 0.3089 0.000 0.600 0.400
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0237 0.9653 0.996 0.004 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443161 3 0.8802 0.5830 0.216 0.200 0.584
#> SRR614695 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355415 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 3 0.4750 0.7843 0.216 0.000 0.784
#> SRR1321165 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.4750 0.7843 0.216 0.000 0.784
#> SRR1417588 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074790 2 0.0424 0.9573 0.008 0.992 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072749 1 0.1289 0.9388 0.968 0.000 0.032
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078834 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.3412 0.8662 0.124 0.000 0.876
#> SRR1419062 3 0.3192 0.8745 0.112 0.000 0.888
#> SRR1480131 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.3412 0.8318 0.124 0.876 0.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0237 0.9137 0.000 0.004 0.996
#> SRR1347436 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327473 2 0.6260 0.1998 0.448 0.552 0.000
#> SRR1338195 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.5167 0.7487 0.016 0.192 0.792
#> SRR1322643 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354620 3 0.4702 0.7890 0.212 0.000 0.788
#> SRR615056 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.5551 0.6658 0.768 0.212 0.020
#> SRR1391529 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR613568 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.0424 0.9611 0.992 0.008 0.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 2 0.6008 0.3981 0.372 0.628 0.000
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353136 3 0.2796 0.8514 0.000 0.092 0.908
#> SRR1093906 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399861 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338789 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0237 0.9150 0.004 0.000 0.996
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 2 0.2711 0.8722 0.088 0.912 0.000
#> SRR1315041 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416617 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102443 1 0.0747 0.9523 0.984 0.016 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420006 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.0592 0.9138 0.012 0.000 0.988
#> SRR1472749 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431326 1 0.0237 0.9653 0.996 0.004 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098312 1 0.3528 0.8640 0.892 0.016 0.092
#> SRR810273 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088606 1 0.0237 0.9652 0.996 0.004 0.000
#> SRR1479699 1 0.7095 0.5114 0.660 0.292 0.048
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.1529 0.9225 0.960 0.040 0.000
#> SRR659427 2 0.6267 0.1918 0.452 0.548 0.000
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR659307 3 0.6225 0.2559 0.000 0.432 0.568
#> SRR1439994 3 0.4750 0.7844 0.216 0.000 0.784
#> SRR1454931 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 3 0.3551 0.8607 0.132 0.000 0.868
#> SRR658621 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374270 1 0.6126 0.3142 0.600 0.400 0.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456274 1 0.2796 0.8593 0.908 0.092 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.1860 0.9016 0.052 0.000 0.948
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR820049 3 0.4092 0.8738 0.088 0.036 0.876
#> SRR1375290 3 0.6632 0.4782 0.392 0.012 0.596
#> SRR818999 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454629 1 0.4555 0.6991 0.800 0.200 0.000
#> SRR1332187 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR603365 3 0.3192 0.8733 0.112 0.000 0.888
#> SRR657833 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.1289 0.9083 0.032 0.000 0.968
#> SRR1073705 1 0.0592 0.9567 0.988 0.012 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332816 1 0.3941 0.7661 0.844 0.156 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.1031 0.9439 0.976 0.024 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.4504 0.8055 0.196 0.000 0.804
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414749 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365963 3 0.4702 0.7887 0.212 0.000 0.788
#> SRR1368030 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419760 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1381841 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR821388 2 0.6586 0.6534 0.216 0.728 0.056
#> SRR657623 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.1643 0.9046 0.044 0.000 0.956
#> SRR819583 3 0.3412 0.8662 0.124 0.000 0.876
#> SRR1096149 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR811333 1 0.1860 0.9182 0.948 0.000 0.052
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR811653 2 0.8028 0.2518 0.072 0.560 0.368
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0237 0.9653 0.996 0.004 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR613318 2 0.7729 0.1492 0.436 0.516 0.048
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500931 3 0.0424 0.9145 0.008 0.000 0.992
#> SRR1387494 3 0.5928 0.6374 0.296 0.008 0.696
#> SRR1379175 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401909 3 0.4750 0.7844 0.216 0.000 0.784
#> SRR1440541 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.3412 0.8662 0.124 0.000 0.876
#> SRR1376640 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101128 3 0.0892 0.9120 0.020 0.000 0.980
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093218 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077090 3 0.3412 0.8662 0.124 0.000 0.876
#> SRR1327430 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093100 2 0.2796 0.8691 0.092 0.908 0.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081473 3 0.2796 0.8844 0.092 0.000 0.908
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0237 0.9653 0.996 0.004 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.0892 0.9120 0.020 0.000 0.980
#> SRR1089713 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498354 3 0.3412 0.8677 0.124 0.000 0.876
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0424 0.9611 0.992 0.008 0.000
#> SRR1365791 1 0.4002 0.7964 0.840 0.000 0.160
#> SRR1081519 3 0.5882 0.5817 0.348 0.000 0.652
#> SRR614707 2 0.0237 0.9613 0.004 0.996 0.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.1753 0.9238 0.952 0.000 0.048
#> SRR1079502 3 0.4452 0.8098 0.192 0.000 0.808
#> SRR1457814 2 0.6713 0.2791 0.416 0.572 0.012
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327855 3 0.0592 0.9138 0.012 0.000 0.988
#> SRR1417873 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.1031 0.9112 0.024 0.000 0.976
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR612383 2 0.4178 0.7671 0.000 0.828 0.172
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475885 2 0.4842 0.6911 0.224 0.776 0.000
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR612323 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078439 3 0.8082 0.5904 0.296 0.096 0.608
#> SRR2165527 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.6291 0.1249 0.532 0.468 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.4654 0.7154 0.208 0.792 0.000
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.3192 0.8733 0.112 0.000 0.888
#> SRR1456862 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.5706 0.6334 0.320 0.000 0.680
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.1289 0.9081 0.032 0.000 0.968
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR612251 2 0.6244 0.2291 0.440 0.560 0.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472998 1 0.4002 0.7717 0.840 0.000 0.160
#> SRR1433452 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.0237 0.9658 0.996 0.000 0.004
#> SRR808351 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086611 2 0.1643 0.9209 0.044 0.956 0.000
#> SRR1392571 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.4452 0.8089 0.192 0.000 0.808
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399757 1 0.2261 0.8900 0.932 0.068 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464517 3 0.0592 0.9138 0.012 0.000 0.988
#> SRR613557 2 0.6235 0.2004 0.000 0.564 0.436
#> SRR809831 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.9155 0.000 0.000 1.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9692 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.3116 0.8724 0.108 0.000 0.892
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.9652 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 3 0.4070 0.81713 0.000 0.044 0.824 0.132
#> SRR1404105 1 0.0188 0.96611 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.3219 0.84706 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1472057 3 0.4462 0.88623 0.064 0.132 0.804 0.000
#> SRR614491 3 0.6921 0.15657 0.000 0.108 0.468 0.424
#> SRR1069376 1 0.0188 0.96611 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.3942 0.83125 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1361415 2 0.4304 0.77210 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1345715 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1328073 4 0.5646 0.50007 0.296 0.048 0.000 0.656
#> SRR1394209 4 0.4103 0.49902 0.000 0.256 0.000 0.744
#> SRR1474018 2 0.3074 0.84646 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1099809 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500555 4 0.3464 0.70433 0.032 0.108 0.000 0.860
#> SRR1354363 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.2021 0.90048 0.000 0.040 0.936 0.024
#> SRR1307997 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR663124 4 0.2149 0.73065 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1334670 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 4 0.2149 0.73065 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1092727 4 0.3311 0.76136 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR1364013 4 0.4103 0.47898 0.000 0.256 0.000 0.744
#> SRR1468553 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420169 3 0.4462 0.88623 0.064 0.132 0.804 0.000
#> SRR1442800 4 0.5624 0.67544 0.108 0.172 0.000 0.720
#> SRR1359214 2 0.3074 0.84646 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1499849 1 0.0336 0.96339 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1500030 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093053 3 0.8355 0.49231 0.060 0.132 0.468 0.340
#> SRR1399843 4 0.2149 0.73065 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1380231 3 0.4740 0.87857 0.080 0.132 0.788 0.000
#> SRR809470 1 0.1022 0.94921 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR614239 4 0.0921 0.75625 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR613939 4 0.3688 0.76883 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR612971 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1490204 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR811357 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1471672 1 0.3836 0.78531 0.816 0.016 0.000 0.168
#> SRR613006 4 0.2868 0.78789 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR1469570 2 0.3942 0.83125 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1457354 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1362906 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0469 0.96573 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1096736 2 0.5714 0.54182 0.128 0.716 0.000 0.156
#> SRR1478700 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1081543 3 0.4331 0.76594 0.028 0.004 0.800 0.168
#> SRR1384754 1 0.7828 0.47594 0.588 0.060 0.212 0.140
#> SRR612287 2 0.3074 0.84646 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1380317 4 0.2149 0.73065 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1315247 4 0.2921 0.78859 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1105344 2 0.3074 0.84646 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR658549 4 0.2149 0.73065 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1480240 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.3942 0.83125 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR612551 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1358520 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1419476 3 0.2814 0.89805 0.000 0.132 0.868 0.000
#> SRR1456075 3 0.4356 0.88671 0.048 0.148 0.804 0.000
#> SRR1389474 2 0.3942 0.83125 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1367005 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095985 3 0.6661 0.65433 0.264 0.132 0.604 0.000
#> SRR1325771 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660272 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1332993 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR808044 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1076916 3 0.6570 0.69343 0.232 0.116 0.644 0.008
#> SRR1356266 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.3074 0.84646 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1456114 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.4462 0.88623 0.064 0.132 0.804 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.3569 0.84416 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1469192 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659839 4 0.3610 0.72786 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR659533 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1362848 2 0.5432 0.59330 0.000 0.740 0.124 0.136
#> SRR1407492 4 0.2081 0.73212 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1455082 4 0.2281 0.72830 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR658362 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR810921 4 0.3074 0.77678 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR662823 2 0.3024 0.84528 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1456375 3 0.2149 0.90157 0.000 0.088 0.912 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 4 0.2081 0.73212 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1474816 4 0.2921 0.78438 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1342002 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.3975 0.83320 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1466400 4 0.3266 0.76497 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR658921 4 0.4925 0.12173 0.000 0.428 0.000 0.572
#> SRR1499873 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1101373 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.1209 0.94836 0.964 0.032 0.000 0.004
#> SRR1379324 1 0.0469 0.96573 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1345307 4 0.4843 0.24618 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1396166 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454891 4 0.4543 0.31333 0.000 0.324 0.000 0.676
#> SRR663185 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR811819 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR656758 4 0.3649 0.72211 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1474351 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR660450 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1472687 2 0.3172 0.84379 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1334291 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1415153 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1323271 2 0.3074 0.84646 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1368939 2 0.4981 0.36540 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR1443161 4 0.4327 0.62522 0.016 0.216 0.000 0.768
#> SRR614695 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1092372 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR612779 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1089006 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.1637 0.93031 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.1302 0.94201 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR811005 4 0.2921 0.78453 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1385319 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.2814 0.86284 0.868 0.132 0.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.4679 0.69924 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1470075 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1101397 3 0.5003 0.83009 0.148 0.084 0.768 0.000
#> SRR1321165 1 0.0592 0.95906 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.4992 0.86781 0.096 0.132 0.772 0.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.5894 0.46906 0.040 0.568 0.000 0.392
#> SRR1432106 2 0.3942 0.83125 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR655756 2 0.4222 0.79727 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR1458314 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1318582 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1080484 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1072749 1 0.1388 0.94308 0.960 0.012 0.028 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 4 0.2011 0.73425 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR1078834 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1417611 2 0.3074 0.84646 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1396840 1 0.1022 0.94921 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1400530 2 0.3942 0.83125 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR614984 4 0.2149 0.73065 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1324269 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1319443 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 4 0.1211 0.75457 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1345523 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1500846 1 0.0188 0.96615 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.4462 0.88623 0.064 0.132 0.804 0.000
#> SRR1419062 3 0.4805 0.87595 0.084 0.132 0.784 0.000
#> SRR1480131 1 0.0921 0.95183 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1329624 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.4382 0.75882 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1083286 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.2469 0.84127 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1347436 4 0.0000 0.76277 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327473 1 0.7450 0.21628 0.504 0.216 0.000 0.280
#> SRR1338195 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1457792 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR658271 4 0.3610 0.72753 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1339597 1 0.0188 0.96613 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.6474 0.35009 0.044 0.016 0.556 0.384
#> SRR1322643 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354620 3 0.4931 0.87062 0.092 0.132 0.776 0.000
#> SRR615056 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1105320 4 0.6531 0.43687 0.332 0.064 0.012 0.592
#> SRR1391529 1 0.1022 0.94921 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1478834 1 0.0188 0.96470 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1435330 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615383 4 0.4585 0.46519 0.000 0.332 0.000 0.668
#> SRR1389157 4 0.2081 0.73212 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR613568 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR614095 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1103092 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 4 0.5432 0.57271 0.136 0.124 0.000 0.740
#> SRR1475345 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR809089 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1446180 4 0.3335 0.70296 0.020 0.120 0.000 0.860
#> SRR1406372 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1339880 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353136 3 0.3972 0.74970 0.000 0.008 0.788 0.204
#> SRR1093906 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.3074 0.84646 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1351104 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1363926 4 0.4877 0.20848 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1399861 4 0.3172 0.66812 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR1338789 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.1302 0.90443 0.000 0.044 0.956 0.000
#> SRR1420832 2 0.3074 0.84646 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1476231 1 0.0336 0.96602 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1352870 4 0.2266 0.73279 0.004 0.084 0.000 0.912
#> SRR1315041 2 0.3123 0.84609 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR661877 2 0.3024 0.84528 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1443268 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416617 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.3280 0.85812 0.860 0.016 0.000 0.124
#> SRR655672 4 0.4981 -0.26542 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR1420006 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458267 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR613819 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1469432 2 0.3528 0.84509 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR660907 2 0.3444 0.84623 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1465092 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1470727 1 0.0921 0.95183 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.4455 0.87995 0.008 0.108 0.820 0.064
#> SRR1472749 3 0.2081 0.90215 0.000 0.084 0.916 0.000
#> SRR1414379 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1431326 1 0.2222 0.91487 0.924 0.016 0.000 0.060
#> SRR1487278 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1098312 4 0.5966 0.58290 0.092 0.040 0.124 0.744
#> SRR810273 2 0.4746 0.64036 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1376000 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR614467 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR811471 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.2739 0.90258 0.904 0.060 0.000 0.036
#> SRR1479699 4 0.5064 0.65590 0.048 0.092 0.056 0.804
#> SRR1403589 2 0.4304 0.78127 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR812625 4 0.3400 0.76636 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1359803 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.3074 0.84646 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1471222 2 0.4989 0.10743 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1378992 1 0.2060 0.92320 0.932 0.016 0.000 0.052
#> SRR659427 2 0.4877 0.60821 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR1096638 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.4564 0.59819 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR659307 4 0.2342 0.72121 0.000 0.008 0.080 0.912
#> SRR1439994 3 0.4931 0.87062 0.092 0.132 0.776 0.000
#> SRR1454931 1 0.0336 0.96311 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1332928 3 0.4462 0.88623 0.064 0.132 0.804 0.000
#> SRR658621 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1095840 1 0.0188 0.96613 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0188 0.96503 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1374270 4 0.5375 0.56967 0.140 0.116 0.000 0.744
#> SRR1470947 2 0.3074 0.84646 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1365598 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR662787 2 0.4543 0.78425 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR1408727 4 0.2081 0.73212 0.000 0.084 0.000 0.916
#> SRR1456274 4 0.5733 0.47091 0.312 0.048 0.000 0.640
#> SRR817744 1 0.0188 0.96611 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.3074 0.84646 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1387379 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1102680 3 0.4234 0.89019 0.052 0.132 0.816 0.000
#> SRR1374198 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.2345 0.88927 0.900 0.100 0.000 0.000
#> SRR820049 3 0.4749 0.87882 0.020 0.132 0.804 0.044
#> SRR1375290 4 0.5626 0.59546 0.108 0.040 0.084 0.768
#> SRR818999 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.3942 0.83125 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1454629 4 0.7098 0.46617 0.312 0.152 0.000 0.536
#> SRR1332187 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR603365 3 0.4462 0.88623 0.064 0.132 0.804 0.000
#> SRR657833 4 0.2868 0.78789 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR1436207 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1488017 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR612947 4 0.4406 0.54919 0.000 0.300 0.000 0.700
#> SRR1480384 1 0.0188 0.96613 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1364761 4 0.3266 0.76566 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1308086 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.3707 0.89548 0.028 0.132 0.840 0.000
#> SRR1073705 1 0.1706 0.93860 0.948 0.016 0.000 0.036
#> SRR615032 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1452356 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1442983 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1100346 4 0.2149 0.73065 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1332816 1 0.4253 0.72197 0.776 0.016 0.000 0.208
#> SRR612299 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1407386 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1309403 4 0.6145 0.09341 0.460 0.048 0.000 0.492
#> SRR1498395 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1079998 3 0.4869 0.87329 0.088 0.132 0.780 0.000
#> SRR1498885 2 0.3024 0.84528 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1337215 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1414749 3 0.2216 0.90123 0.000 0.092 0.908 0.000
#> SRR1365963 3 0.4956 0.86545 0.108 0.116 0.776 0.000
#> SRR1368030 2 0.4304 0.76780 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1419760 4 0.0000 0.76277 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1381841 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821388 4 0.3900 0.68839 0.000 0.084 0.072 0.844
#> SRR657623 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1094241 3 0.3984 0.89350 0.040 0.132 0.828 0.000
#> SRR819583 3 0.4462 0.88623 0.064 0.132 0.804 0.000
#> SRR1096149 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR811333 1 0.2149 0.89679 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1311666 4 0.3400 0.75021 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1486698 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1446436 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR815092 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 4 0.3400 0.75126 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR1100564 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.2149 0.90157 0.000 0.088 0.912 0.000
#> SRR811653 4 0.2149 0.73065 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1311348 4 0.3266 0.76275 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1489438 2 0.3486 0.84575 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1435442 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1421444 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.3688 0.84143 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1319520 1 0.1406 0.94908 0.960 0.016 0.000 0.024
#> SRR1444763 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.3444 0.84620 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1416596 4 0.4103 0.64300 0.000 0.256 0.000 0.744
#> SRR1485499 2 0.3074 0.84646 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1316078 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR663465 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1310094 2 0.3074 0.84646 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR663537 2 0.4331 0.77855 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1486780 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR613318 4 0.3796 0.69914 0.000 0.096 0.056 0.848
#> SRR1332694 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818670 4 0.3123 0.77252 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR1120318 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.2814 0.89805 0.000 0.132 0.868 0.000
#> SRR1500931 3 0.3142 0.89752 0.008 0.132 0.860 0.000
#> SRR1387494 3 0.5834 0.64182 0.024 0.040 0.700 0.236
#> SRR1379175 4 0.2011 0.73425 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR1401909 3 0.4931 0.87062 0.092 0.132 0.776 0.000
#> SRR1440541 4 0.4382 0.56094 0.000 0.296 0.000 0.704
#> SRR1068832 3 0.4462 0.88623 0.064 0.132 0.804 0.000
#> SRR1376640 4 0.4040 0.74633 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR1085712 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1082283 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.1474 0.93660 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.3801 0.83857 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1437035 1 0.1211 0.94389 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0921 0.95191 0.972 0.028 0.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.3942 0.83125 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1417936 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.4304 0.77210 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1101128 3 0.3390 0.89774 0.016 0.132 0.852 0.000
#> SRR1363886 2 0.3074 0.84646 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR612983 2 0.3074 0.84646 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1394366 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1093218 3 0.0188 0.90609 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1077090 3 0.4462 0.88623 0.064 0.132 0.804 0.000
#> SRR1327430 4 0.2530 0.71849 0.000 0.112 0.000 0.888
#> SRR1088958 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1486931 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1086820 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.3123 0.84685 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR614335 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR660534 4 0.4961 0.02417 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR817094 2 0.3837 0.83666 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1334265 2 0.4972 0.21485 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR1456401 4 0.3172 0.76934 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR1086393 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1309382 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.1211 0.94389 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1499482 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR614719 4 0.2469 0.72013 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR1081473 3 0.4462 0.88623 0.064 0.132 0.804 0.000
#> SRR1087415 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.1637 0.93031 0.940 0.060 0.000 0.000
#> SRR808496 4 0.4866 -0.00539 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR1336463 4 0.3688 0.72064 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR612359 4 0.0336 0.76091 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1444412 1 0.1474 0.93660 0.948 0.052 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.2149 0.90157 0.000 0.088 0.912 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656095 4 0.2868 0.78674 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR808914 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.2363 0.93097 0.920 0.056 0.000 0.024
#> SRR1337886 4 0.3569 0.76914 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR813632 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.3205 0.90262 0.024 0.104 0.872 0.000
#> SRR1089713 1 0.1867 0.92100 0.928 0.072 0.000 0.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498354 3 0.4879 0.87252 0.092 0.128 0.780 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.4304 0.77210 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1358539 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.1798 0.93500 0.944 0.016 0.000 0.040
#> SRR1365791 1 0.8265 0.29617 0.476 0.040 0.168 0.316
#> SRR1081519 3 0.6390 0.71981 0.224 0.132 0.644 0.000
#> SRR614707 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1094027 1 0.0469 0.96576 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.3271 0.85548 0.856 0.132 0.012 0.000
#> SRR1079502 3 0.4931 0.87062 0.092 0.132 0.776 0.000
#> SRR1457814 4 0.3610 0.61308 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1455127 2 0.3074 0.84646 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR615081 2 0.4933 0.46125 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR1327855 3 0.3142 0.89752 0.008 0.132 0.860 0.000
#> SRR1417873 2 0.4304 0.77210 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1394125 3 0.2002 0.90478 0.020 0.044 0.936 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR612383 4 0.2149 0.73065 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1477711 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR612851 4 0.2149 0.73065 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR1086349 1 0.0469 0.96576 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.3219 0.84700 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1340010 3 0.0921 0.90563 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1475885 4 0.5927 0.69592 0.076 0.264 0.000 0.660
#> SRR1376334 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612323 4 0.2149 0.73065 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR612604 2 0.4454 0.74940 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR1389546 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1311877 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.3224 0.85455 0.864 0.016 0.000 0.120
#> SRR1101808 2 0.4972 0.39579 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR1414079 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331153 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1078439 4 0.5013 0.63764 0.044 0.072 0.076 0.808
#> SRR2165527 2 0.3942 0.79925 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1351147 4 0.6479 0.57278 0.224 0.140 0.000 0.636
#> SRR1313536 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1070308 4 0.5272 0.69944 0.084 0.172 0.000 0.744
#> SRR1403110 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1401317 3 0.4462 0.88623 0.064 0.132 0.804 0.000
#> SRR1456862 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.5546 0.69045 0.268 0.052 0.680 0.000
#> SRR1443376 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1471312 3 0.2313 0.90220 0.032 0.044 0.924 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 4 0.1940 0.73661 0.000 0.076 0.000 0.924
#> SRR612251 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1418581 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR613214 4 0.2281 0.72773 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR613078 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1472998 1 0.4332 0.74751 0.800 0.040 0.160 0.000
#> SRR1433452 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1101957 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0188 0.90602 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1465983 2 0.3975 0.82846 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1380375 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316151 4 0.2011 0.73425 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR1417547 2 0.4277 0.76976 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR659389 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1490270 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1398207 1 0.1211 0.94389 0.960 0.040 0.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0469 0.96204 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR1078903 4 0.2868 0.78789 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR1323252 2 0.3942 0.83125 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1451796 2 0.4981 0.35777 0.000 0.536 0.000 0.464
#> SRR1369172 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR615982 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1480431 2 0.4304 0.77210 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1429825 4 0.3219 0.66577 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR1102393 2 0.3942 0.83125 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1071313 1 0.3505 0.85788 0.864 0.048 0.000 0.088
#> SRR808351 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.2814 0.89805 0.000 0.132 0.868 0.000
#> SRR1081910 1 0.1022 0.94921 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1086611 4 0.0000 0.76277 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1392571 4 0.0000 0.76277 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.4534 0.88442 0.068 0.132 0.800 0.000
#> SRR1433131 4 0.4661 0.41676 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR1321011 2 0.3907 0.83361 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1500598 2 0.3172 0.84695 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1379343 4 0.2814 0.78901 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1389108 1 0.0592 0.96531 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.4206 0.79777 0.816 0.048 0.000 0.136
#> SRR1358060 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.3390 0.89756 0.016 0.132 0.852 0.000
#> SRR613557 4 0.2149 0.73065 0.000 0.088 0.000 0.912
#> SRR809831 1 0.0707 0.95696 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.90598 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0336 0.96601 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.96594 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.2500 0.90156 0.040 0.044 0.916 0.000
#> SRR1072031 2 0.3942 0.83125 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1374671 4 0.0188 0.76443 0.000 0.004 0.000 0.996
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 3 0.4224 0.7875 0.024 0.004 0.812 0.100 0.060
#> SRR1404105 1 0.0880 0.9103 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR2164936 2 0.0510 0.8411 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1472057 3 0.3921 0.8384 0.128 0.000 0.800 0.000 0.072
#> SRR614491 3 0.7681 0.2519 0.000 0.252 0.436 0.244 0.068
#> SRR1069376 5 0.4088 0.6375 0.368 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR811964 2 0.2852 0.7854 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1361415 2 0.2074 0.7958 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1345715 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1328073 4 0.2248 0.7839 0.088 0.012 0.000 0.900 0.000
#> SRR1394209 4 0.5858 0.4306 0.000 0.308 0.000 0.568 0.124
#> SRR1474018 2 0.0162 0.8402 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1099809 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1500555 4 0.3012 0.7739 0.004 0.072 0.000 0.872 0.052
#> SRR1354363 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1391619 3 0.2291 0.8639 0.012 0.000 0.908 0.072 0.008
#> SRR1307997 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR663124 4 0.3507 0.7549 0.000 0.120 0.000 0.828 0.052
#> SRR1334670 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR612515 4 0.3507 0.7549 0.000 0.120 0.000 0.828 0.052
#> SRR1092727 4 0.3684 0.6794 0.000 0.280 0.000 0.720 0.000
#> SRR1364013 4 0.4522 0.6037 0.000 0.248 0.000 0.708 0.044
#> SRR1468553 3 0.0162 0.9002 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1403980 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420169 3 0.4010 0.8317 0.136 0.000 0.792 0.000 0.072
#> SRR1442800 4 0.2616 0.8206 0.020 0.100 0.000 0.880 0.000
#> SRR1359214 2 0.0162 0.8402 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1499849 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1500030 3 0.0510 0.8968 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1093053 3 0.8036 0.3901 0.264 0.000 0.412 0.208 0.116
#> SRR1399843 4 0.3507 0.7549 0.000 0.120 0.000 0.828 0.052
#> SRR1380231 1 0.5396 0.2969 0.588 0.000 0.340 0.000 0.072
#> SRR809470 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614239 4 0.2790 0.7840 0.000 0.068 0.000 0.880 0.052
#> SRR613939 4 0.2929 0.8146 0.000 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR612971 2 0.1671 0.8320 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1490204 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR811357 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1471672 5 0.3090 0.8969 0.088 0.000 0.000 0.052 0.860
#> SRR613006 4 0.2561 0.8150 0.000 0.144 0.000 0.856 0.000
#> SRR1469570 2 0.2852 0.7854 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1457354 2 0.2377 0.8125 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1362906 3 0.0510 0.8968 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1079023 1 0.1732 0.8697 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR813608 2 0.2377 0.8125 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1096736 5 0.2615 0.8555 0.080 0.008 0.000 0.020 0.892
#> SRR1478700 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1081543 3 0.4192 0.7419 0.000 0.004 0.784 0.144 0.068
#> SRR1384754 5 0.4952 0.6715 0.032 0.004 0.112 0.088 0.764
#> SRR612287 2 0.0162 0.8402 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1380317 4 0.3459 0.7572 0.000 0.116 0.000 0.832 0.052
#> SRR1315247 4 0.2280 0.8246 0.000 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1105344 2 0.0162 0.8402 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR658549 4 0.3507 0.7549 0.000 0.120 0.000 0.828 0.052
#> SRR1480240 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1084816 2 0.2852 0.7854 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR612551 2 0.1671 0.8320 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1358520 2 0.3112 0.7744 0.000 0.856 0.000 0.100 0.044
#> SRR1419476 3 0.2208 0.8876 0.020 0.000 0.908 0.000 0.072
#> SRR1456075 3 0.3760 0.8248 0.028 0.000 0.784 0.000 0.188
#> SRR1389474 2 0.2852 0.7854 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1367005 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1334419 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1417154 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.3055 0.7970 0.864 0.000 0.064 0.000 0.072
#> SRR1325771 5 0.2891 0.9263 0.176 0.000 0.000 0.000 0.824
#> SRR1360420 3 0.0162 0.9010 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR660272 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1332993 1 0.0963 0.9091 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1311833 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR808044 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1076916 1 0.4016 0.7484 0.796 0.000 0.112 0.000 0.092
#> SRR1356266 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1341983 2 0.0162 0.8402 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1456114 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1072948 3 0.0162 0.9010 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1472370 3 0.3921 0.8384 0.128 0.000 0.800 0.000 0.072
#> SRR1480176 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR613843 2 0.1608 0.8368 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1469192 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1404555 3 0.0703 0.8944 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR659839 4 0.2773 0.7883 0.000 0.164 0.000 0.836 0.000
#> SRR659533 2 0.2179 0.7924 0.000 0.896 0.000 0.100 0.004
#> SRR1362848 2 0.7896 0.1325 0.016 0.404 0.108 0.100 0.372
#> SRR1407492 4 0.2914 0.7725 0.000 0.076 0.000 0.872 0.052
#> SRR1455082 4 0.3732 0.7340 0.000 0.176 0.000 0.792 0.032
#> SRR658362 2 0.2020 0.7937 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR810921 4 0.2424 0.8108 0.000 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.8392 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.1410 0.8932 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR818232 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1454868 4 0.2974 0.7718 0.000 0.080 0.000 0.868 0.052
#> SRR1474816 4 0.2329 0.8145 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1342002 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1088437 2 0.2329 0.8162 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1466400 4 0.3452 0.7298 0.000 0.244 0.000 0.756 0.000
#> SRR658921 2 0.4302 0.0769 0.000 0.520 0.000 0.480 0.000
#> SRR1499873 2 0.1671 0.8320 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1101373 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1090145 1 0.1041 0.8905 0.964 0.004 0.000 0.032 0.000
#> SRR1379324 5 0.4161 0.5703 0.392 0.000 0.000 0.000 0.608
#> SRR1345307 4 0.4182 0.3565 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1396166 3 0.0404 0.8981 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1086280 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454891 4 0.5220 0.1866 0.000 0.440 0.000 0.516 0.044
#> SRR663185 2 0.2020 0.7937 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR811819 1 0.2230 0.8273 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR1318920 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR656758 4 0.3730 0.6493 0.000 0.288 0.000 0.712 0.000
#> SRR1474351 1 0.3636 0.5605 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR660450 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1472687 2 0.0404 0.8382 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1334291 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1415153 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1323271 2 0.0162 0.8402 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1368939 2 0.4150 0.4259 0.000 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR1443161 4 0.5442 0.6342 0.020 0.076 0.000 0.676 0.228
#> SRR614695 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1092372 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1474577 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1406582 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR612779 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1089006 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1354071 1 0.0609 0.9005 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1105463 1 0.0290 0.9073 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR811005 4 0.2179 0.8202 0.000 0.112 0.000 0.888 0.000
#> SRR1385319 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1325871 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.1608 0.8592 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1090861 5 0.4294 0.3573 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1320712 2 0.5639 0.5276 0.000 0.616 0.000 0.260 0.124
#> SRR1470075 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1091254 1 0.3274 0.6730 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1101397 5 0.4159 0.7702 0.156 0.000 0.068 0.000 0.776
#> SRR1321165 1 0.0290 0.9141 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1092112 1 0.3631 0.7609 0.824 0.000 0.104 0.000 0.072
#> SRR1417588 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.4787 0.1994 0.012 0.528 0.000 0.456 0.004
#> SRR1432106 2 0.2773 0.7915 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR655756 2 0.2230 0.8181 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1458314 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1318582 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1080484 2 0.2020 0.7937 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1072749 1 0.0404 0.9153 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1078586 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1400333 4 0.2853 0.7748 0.000 0.072 0.000 0.876 0.052
#> SRR1078834 4 0.2304 0.8246 0.000 0.100 0.000 0.892 0.008
#> SRR1417611 2 0.0404 0.8404 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.1671 0.8320 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1400530 2 0.2852 0.7854 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR614984 4 0.3459 0.7570 0.000 0.116 0.000 0.832 0.052
#> SRR1324269 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1401491 2 0.1671 0.8320 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1319443 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1324349 4 0.2221 0.8041 0.000 0.052 0.000 0.912 0.036
#> SRR1345523 2 0.1671 0.8320 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1500846 1 0.4291 -0.0987 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR661505 3 0.3921 0.8384 0.128 0.000 0.800 0.000 0.072
#> SRR1419062 3 0.5338 0.5540 0.324 0.000 0.604 0.000 0.072
#> SRR1480131 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.3037 0.7765 0.000 0.860 0.000 0.100 0.040
#> SRR1329624 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1315739 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.3317 0.7665 0.000 0.840 0.000 0.116 0.044
#> SRR1083286 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1091890 3 0.3269 0.8061 0.000 0.000 0.848 0.096 0.056
#> SRR1347436 4 0.1270 0.7989 0.000 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1327473 4 0.5821 0.1582 0.096 0.400 0.000 0.504 0.000
#> SRR1338195 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.1671 0.8320 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1457792 5 0.2561 0.9536 0.144 0.000 0.000 0.000 0.856
#> SRR658271 4 0.3661 0.6534 0.000 0.276 0.000 0.724 0.000
#> SRR1339597 1 0.0880 0.9120 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1454842 3 0.4860 0.2256 0.000 0.004 0.540 0.440 0.016
#> SRR1322643 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR614887 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354620 1 0.3631 0.7609 0.824 0.000 0.104 0.000 0.072
#> SRR615056 2 0.2020 0.7937 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1105320 4 0.4861 0.7485 0.144 0.100 0.012 0.744 0.000
#> SRR1391529 1 0.0162 0.9126 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR663052 2 0.2179 0.7923 0.000 0.896 0.000 0.100 0.004
#> SRR1478834 1 0.0510 0.9161 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR812366 2 0.2377 0.8125 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1435330 3 0.0162 0.9002 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR615383 4 0.4192 0.3460 0.000 0.404 0.000 0.596 0.000
#> SRR1389157 4 0.2914 0.7725 0.000 0.076 0.000 0.872 0.052
#> SRR613568 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR614095 2 0.2020 0.7937 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1103092 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1337155 1 0.5213 0.4111 0.616 0.000 0.000 0.320 0.064
#> SRR1475345 2 0.1908 0.8277 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR809089 2 0.1671 0.8320 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1446180 4 0.3247 0.7723 0.012 0.072 0.000 0.864 0.052
#> SRR1406372 2 0.2773 0.7917 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1339880 3 0.0510 0.8968 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1353136 3 0.5103 0.7194 0.000 0.036 0.736 0.160 0.068
#> SRR1093906 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0162 0.8402 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1351104 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1363926 2 0.4305 0.0172 0.000 0.512 0.000 0.488 0.000
#> SRR1399861 4 0.4490 0.6680 0.000 0.224 0.000 0.724 0.052
#> SRR1338789 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1421420 3 0.0898 0.8987 0.020 0.000 0.972 0.000 0.008
#> SRR1420832 2 0.0162 0.8402 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1476231 1 0.1671 0.8759 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1352870 4 0.2853 0.7748 0.000 0.072 0.000 0.876 0.052
#> SRR1315041 2 0.2020 0.8190 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.8392 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443268 1 0.1341 0.8973 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1416617 3 0.0510 0.8968 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1102443 5 0.2329 0.9406 0.124 0.000 0.000 0.000 0.876
#> SRR655672 2 0.4455 0.3059 0.000 0.588 0.000 0.404 0.008
#> SRR1420006 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458267 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR613819 2 0.3112 0.7744 0.000 0.856 0.000 0.100 0.044
#> SRR1469432 2 0.2074 0.8264 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR660907 2 0.0880 0.8406 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1465092 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1470727 1 0.0162 0.9126 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1339153 3 0.3696 0.8637 0.032 0.000 0.844 0.048 0.076
#> SRR1472749 3 0.1851 0.8923 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1414379 2 0.3112 0.7744 0.000 0.856 0.000 0.100 0.044
#> SRR1431326 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1487278 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1098312 4 0.5465 0.6803 0.100 0.000 0.104 0.728 0.068
#> SRR810273 2 0.4101 0.4764 0.000 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1376000 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR614467 2 0.3112 0.7744 0.000 0.856 0.000 0.100 0.044
#> SRR811471 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1478341 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.0703 0.8960 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1479699 4 0.4246 0.7600 0.048 0.052 0.016 0.828 0.056
#> SRR1403589 2 0.3210 0.7486 0.000 0.788 0.000 0.212 0.000
#> SRR812625 4 0.2516 0.8133 0.000 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR1359803 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1338988 2 0.0162 0.8402 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1471222 2 0.4060 0.3183 0.000 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR1378992 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR659427 2 0.4817 0.5284 0.000 0.656 0.000 0.300 0.044
#> SRR1096638 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1466619 2 0.3508 0.6252 0.000 0.748 0.000 0.252 0.000
#> SRR659307 4 0.4009 0.7534 0.000 0.048 0.072 0.828 0.052
#> SRR1439994 1 0.4179 0.7029 0.776 0.000 0.152 0.000 0.072
#> SRR1454931 1 0.0290 0.9142 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1332928 3 0.3980 0.8381 0.128 0.000 0.796 0.000 0.076
#> SRR658621 2 0.2020 0.7937 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1095840 1 0.1341 0.8925 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1458243 1 0.1410 0.8975 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1374270 4 0.6921 0.1720 0.012 0.208 0.000 0.400 0.380
#> SRR1470947 2 0.0162 0.8402 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1365598 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR662787 2 0.2471 0.8077 0.000 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR1408727 4 0.2903 0.7728 0.000 0.080 0.000 0.872 0.048
#> SRR1456274 4 0.2805 0.7837 0.068 0.032 0.000 0.888 0.012
#> SRR817744 1 0.1732 0.8724 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1478744 2 0.0162 0.8402 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1387379 2 0.1908 0.8279 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1102680 3 0.3780 0.8463 0.116 0.000 0.812 0.000 0.072
#> SRR1374198 5 0.2732 0.9414 0.160 0.000 0.000 0.000 0.840
#> SRR1445856 1 0.2020 0.8720 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR820049 3 0.4532 0.8310 0.040 0.000 0.792 0.088 0.080
#> SRR1375290 4 0.3308 0.7583 0.012 0.000 0.076 0.860 0.052
#> SRR818999 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1390242 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1401164 2 0.2648 0.7996 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1454629 1 0.2773 0.7458 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1332187 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR603365 3 0.3921 0.8384 0.128 0.000 0.800 0.000 0.072
#> SRR657833 4 0.2516 0.8166 0.000 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR1436207 4 0.2377 0.8203 0.000 0.128 0.000 0.872 0.000
#> SRR1488017 5 0.2773 0.9378 0.164 0.000 0.000 0.000 0.836
#> SRR612947 4 0.3661 0.6500 0.000 0.276 0.000 0.724 0.000
#> SRR1480384 1 0.1270 0.8967 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1364761 4 0.3586 0.7038 0.000 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR1308086 3 0.0510 0.8968 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1441868 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1485380 3 0.2989 0.8754 0.060 0.000 0.868 0.000 0.072
#> SRR1073705 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR615032 2 0.1671 0.8320 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1452356 2 0.2020 0.7937 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1442983 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1100346 4 0.3692 0.7487 0.000 0.136 0.000 0.812 0.052
#> SRR1332816 5 0.3102 0.8918 0.084 0.000 0.000 0.056 0.860
#> SRR612299 4 0.2074 0.8240 0.000 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR1407386 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1418064 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1309403 4 0.4675 0.7315 0.164 0.100 0.000 0.736 0.000
#> SRR1498395 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1079998 3 0.4823 0.7232 0.228 0.000 0.700 0.000 0.072
#> SRR1498885 2 0.0000 0.8392 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337215 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1414749 3 0.1608 0.8909 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1365963 1 0.4428 0.7084 0.760 0.000 0.144 0.000 0.096
#> SRR1368030 2 0.3164 0.7731 0.000 0.852 0.000 0.104 0.044
#> SRR1419760 4 0.1270 0.7989 0.000 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1381841 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR821388 4 0.3921 0.7576 0.000 0.076 0.024 0.828 0.072
#> SRR657623 2 0.2020 0.7937 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1094241 3 0.3631 0.8538 0.104 0.000 0.824 0.000 0.072
#> SRR819583 3 0.3921 0.8384 0.128 0.000 0.800 0.000 0.072
#> SRR1096149 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1342829 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.2852 0.7641 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR811333 1 0.2079 0.8764 0.916 0.000 0.064 0.000 0.020
#> SRR1311666 4 0.3508 0.6865 0.000 0.252 0.000 0.748 0.000
#> SRR1486698 4 0.2813 0.8127 0.000 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1446436 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR815092 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1500149 4 0.2690 0.7954 0.000 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR1100564 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1403072 3 0.1478 0.8923 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR811653 4 0.3828 0.7467 0.000 0.120 0.000 0.808 0.072
#> SRR1311348 4 0.2929 0.7734 0.000 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR1489438 2 0.1792 0.8302 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1435442 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.1341 0.8372 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1319520 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1444763 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1415026 2 0.0963 0.8402 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1416596 4 0.3966 0.5417 0.000 0.336 0.000 0.664 0.000
#> SRR1485499 2 0.0162 0.8402 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1316078 2 0.1671 0.8320 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR663465 2 0.2020 0.7937 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1310094 2 0.0609 0.8409 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR663537 2 0.3305 0.7355 0.000 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR1486780 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1453950 1 0.4045 0.3353 0.644 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR1087875 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR613318 4 0.5560 0.6737 0.000 0.180 0.052 0.700 0.068
#> SRR1332694 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1468469 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818670 4 0.2852 0.7803 0.000 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR1120318 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1311622 3 0.2448 0.8881 0.020 0.000 0.892 0.000 0.088
#> SRR1500931 3 0.2300 0.8871 0.024 0.000 0.904 0.000 0.072
#> SRR1387494 3 0.5145 0.5487 0.032 0.000 0.664 0.280 0.024
#> SRR1379175 4 0.2708 0.7780 0.000 0.072 0.000 0.884 0.044
#> SRR1401909 1 0.3631 0.7609 0.824 0.000 0.104 0.000 0.072
#> SRR1440541 4 0.3983 0.5381 0.000 0.340 0.000 0.660 0.000
#> SRR1068832 3 0.3921 0.8384 0.128 0.000 0.800 0.000 0.072
#> SRR1376640 4 0.4101 0.6600 0.000 0.372 0.000 0.628 0.000
#> SRR1085712 2 0.1671 0.8320 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1082283 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1084276 1 0.0609 0.9005 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1353262 2 0.2471 0.8109 0.000 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR1437035 1 0.0703 0.8989 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1396877 1 0.0290 0.9142 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1443026 2 0.2852 0.7854 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1417936 5 0.2690 0.9445 0.156 0.000 0.000 0.000 0.844
#> SRR1436822 2 0.2470 0.7920 0.000 0.884 0.000 0.104 0.012
#> SRR1101128 3 0.2782 0.8810 0.048 0.000 0.880 0.000 0.072
#> SRR1363886 2 0.0162 0.8402 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR612983 2 0.0162 0.8402 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1394366 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1093218 3 0.0290 0.9009 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1077090 3 0.3921 0.8384 0.128 0.000 0.800 0.000 0.072
#> SRR1327430 4 0.3958 0.7264 0.000 0.176 0.000 0.780 0.044
#> SRR1088958 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1486931 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1086820 1 0.0794 0.9138 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1383000 1 0.2773 0.7744 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR1355705 2 0.0290 0.8407 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR614335 2 0.2020 0.7937 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR660534 2 0.4256 0.2123 0.000 0.564 0.000 0.436 0.000
#> SRR817094 2 0.1608 0.8332 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1334265 2 0.4560 -0.1434 0.000 0.508 0.000 0.484 0.008
#> SRR1456401 4 0.3109 0.7524 0.000 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1086393 5 0.3274 0.8779 0.220 0.000 0.000 0.000 0.780
#> SRR1351521 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.3112 0.7744 0.000 0.856 0.000 0.100 0.044
#> SRR1309382 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1089375 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499482 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR614719 4 0.3804 0.7386 0.000 0.160 0.000 0.796 0.044
#> SRR1081473 3 0.3921 0.8384 0.128 0.000 0.800 0.000 0.072
#> SRR1087415 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1088217 1 0.0609 0.9005 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR808496 2 0.5167 0.2490 0.000 0.552 0.000 0.404 0.044
#> SRR1336463 4 0.3730 0.6565 0.000 0.288 0.000 0.712 0.000
#> SRR612359 4 0.2376 0.7918 0.000 0.044 0.000 0.904 0.052
#> SRR1444412 1 0.0510 0.9029 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1074116 3 0.1478 0.8923 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR821846 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656095 4 0.2127 0.8217 0.000 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR808914 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1349099 5 0.4385 0.8705 0.140 0.056 0.000 0.020 0.784
#> SRR1337886 4 0.2890 0.8159 0.000 0.160 0.000 0.836 0.004
#> SRR813632 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1101591 3 0.2853 0.8779 0.072 0.000 0.876 0.000 0.052
#> SRR1089713 1 0.0963 0.8894 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1453127 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.3631 0.7609 0.824 0.000 0.104 0.000 0.072
#> SRR1313831 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1315434 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814747 2 0.2074 0.7958 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1358539 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1367807 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1365791 1 0.4396 0.7156 0.772 0.000 0.152 0.008 0.068
#> SRR1081519 1 0.3416 0.7763 0.840 0.000 0.088 0.000 0.072
#> SRR614707 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1094027 1 0.1544 0.8821 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1489092 1 0.2540 0.8377 0.888 0.000 0.024 0.000 0.088
#> SRR1079502 3 0.5272 0.5864 0.308 0.000 0.620 0.000 0.072
#> SRR1457814 4 0.5235 0.5084 0.000 0.312 0.000 0.620 0.068
#> SRR1455127 2 0.0162 0.8402 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR615081 2 0.3876 0.5572 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000
#> SRR1327855 3 0.2300 0.8871 0.024 0.000 0.904 0.000 0.072
#> SRR1417873 2 0.2669 0.7888 0.000 0.876 0.000 0.104 0.020
#> SRR1394125 3 0.1628 0.8922 0.056 0.000 0.936 0.000 0.008
#> SRR1488388 1 0.3074 0.7133 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1401122 2 0.2020 0.7937 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR612383 4 0.3507 0.7549 0.000 0.120 0.000 0.828 0.052
#> SRR1477711 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1350813 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR612851 4 0.3507 0.7549 0.000 0.120 0.000 0.828 0.052
#> SRR1086349 1 0.3143 0.7012 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR812837 2 0.0510 0.8410 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1340010 3 0.0960 0.8973 0.008 0.004 0.972 0.000 0.016
#> SRR1475885 4 0.3961 0.8116 0.028 0.168 0.000 0.792 0.012
#> SRR1376334 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1399821 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1347042 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612323 4 0.3507 0.7549 0.000 0.120 0.000 0.828 0.052
#> SRR612604 2 0.3210 0.7424 0.000 0.788 0.000 0.212 0.000
#> SRR1389546 2 0.2648 0.7999 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1311877 5 0.2605 0.9507 0.148 0.000 0.000 0.000 0.852
#> SRR1465608 5 0.2020 0.9141 0.100 0.000 0.000 0.000 0.900
#> SRR1101808 2 0.4201 0.3654 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331153 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1078439 4 0.3665 0.7568 0.020 0.008 0.068 0.852 0.052
#> SRR2165527 2 0.1478 0.8137 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1351147 4 0.3697 0.7833 0.080 0.100 0.000 0.820 0.000
#> SRR1313536 2 0.2377 0.8125 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1070308 4 0.2179 0.8233 0.004 0.100 0.000 0.896 0.000
#> SRR1403110 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1400355 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1401317 3 0.3921 0.8384 0.128 0.000 0.800 0.000 0.072
#> SRR1456862 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1074622 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1465847 1 0.3146 0.8112 0.856 0.000 0.092 0.000 0.052
#> SRR1443376 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1471312 3 0.3812 0.7533 0.204 0.000 0.772 0.000 0.024
#> SRR1075579 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1090881 4 0.2790 0.7771 0.000 0.068 0.000 0.880 0.052
#> SRR612251 2 0.3390 0.7671 0.000 0.840 0.000 0.100 0.060
#> SRR1418581 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR658045 2 0.2329 0.8145 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR613214 4 0.3863 0.7402 0.000 0.152 0.000 0.796 0.052
#> SRR613078 4 0.2329 0.8212 0.000 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR1472998 1 0.0771 0.8995 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR1433452 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1101957 5 0.2773 0.9381 0.164 0.000 0.000 0.000 0.836
#> SRR1487993 3 0.0671 0.8976 0.004 0.000 0.980 0.000 0.016
#> SRR1465983 2 0.2516 0.8074 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1380375 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1367566 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316151 4 0.2708 0.7780 0.000 0.072 0.000 0.884 0.044
#> SRR1417547 2 0.2020 0.7937 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR659389 2 0.1671 0.8320 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1490270 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0703 0.9163 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1078903 4 0.2127 0.8238 0.000 0.108 0.000 0.892 0.000
#> SRR1323252 2 0.2648 0.7998 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1451796 2 0.4015 0.4842 0.000 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1369172 5 0.3949 0.7011 0.332 0.000 0.000 0.000 0.668
#> SRR615982 4 0.2230 0.8229 0.000 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1480431 2 0.2074 0.7958 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1429825 4 0.4114 0.6657 0.000 0.244 0.000 0.732 0.024
#> SRR1102393 2 0.2852 0.7854 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1071313 1 0.3242 0.6988 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR808351 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1317513 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1480501 3 0.2300 0.8872 0.024 0.000 0.904 0.000 0.072
#> SRR1081910 1 0.0000 0.9108 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086611 4 0.1270 0.7989 0.000 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1392571 4 0.1121 0.8009 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1311441 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR808152 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR657313 3 0.3921 0.8384 0.128 0.000 0.800 0.000 0.072
#> SRR1433131 4 0.4235 0.2759 0.000 0.424 0.000 0.576 0.000
#> SRR1321011 2 0.2377 0.8125 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1500598 2 0.0404 0.8409 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1379343 4 0.2020 0.8241 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000
#> SRR1389108 5 0.2516 0.9563 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1376228 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399757 4 0.5380 0.7020 0.152 0.100 0.000 0.716 0.032
#> SRR1358060 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.2793 0.8850 0.036 0.000 0.876 0.000 0.088
#> SRR613557 4 0.3507 0.7549 0.000 0.120 0.000 0.828 0.052
#> SRR809831 1 0.1043 0.9109 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1429387 3 0.0000 0.9010 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.1792 0.8653 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1071644 1 0.0609 0.9168 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1406936 3 0.2653 0.8724 0.096 0.000 0.880 0.000 0.024
#> SRR1072031 2 0.2852 0.7854 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1374671 4 0.1282 0.8026 0.000 0.004 0.000 0.952 0.044
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 6 0.2584 0.50541 0.004 0.000 0.144 0.000 0.004 0.848
#> SRR1404105 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR2164936 2 0.0547 0.80398 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0146 0.78266 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR614491 6 0.2915 0.51126 0.000 0.184 0.000 0.008 0.000 0.808
#> SRR1069376 1 0.3737 0.48367 0.608 0.000 0.000 0.000 0.392 0.000
#> SRR811964 2 0.3810 0.48216 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0260 0.91046 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1328073 4 0.5119 0.64367 0.036 0.060 0.008 0.748 0.044 0.104
#> SRR1394209 4 0.7213 0.29420 0.112 0.220 0.000 0.412 0.000 0.256
#> SRR1474018 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099809 5 0.0937 0.90353 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960 0.000
#> SRR1500555 4 0.3934 0.51380 0.000 0.008 0.000 0.616 0.000 0.376
#> SRR1354363 1 0.0790 0.90561 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1391619 3 0.4117 0.57528 0.000 0.000 0.672 0.032 0.000 0.296
#> SRR1307997 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663124 4 0.4602 0.48452 0.000 0.044 0.000 0.572 0.000 0.384
#> SRR1334670 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR612515 4 0.4610 0.47965 0.000 0.044 0.000 0.568 0.000 0.388
#> SRR1092727 4 0.4599 0.62954 0.000 0.164 0.000 0.696 0.000 0.140
#> SRR1364013 4 0.5016 0.44211 0.000 0.324 0.000 0.584 0.000 0.092
#> SRR1468553 3 0.3907 0.48371 0.004 0.000 0.588 0.000 0.000 0.408
#> SRR1403980 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR1420169 3 0.0363 0.77754 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1442800 4 0.0520 0.73925 0.000 0.000 0.008 0.984 0.008 0.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499849 5 0.1082 0.90345 0.040 0.000 0.004 0.000 0.956 0.000
#> SRR1500030 6 0.3841 0.12882 0.004 0.000 0.380 0.000 0.000 0.616
#> SRR1093053 6 0.6895 0.28414 0.000 0.000 0.284 0.072 0.208 0.436
#> SRR1399843 4 0.4602 0.48452 0.000 0.044 0.000 0.572 0.000 0.384
#> SRR1380231 5 0.3869 0.19905 0.000 0.000 0.500 0.000 0.500 0.000
#> SRR809470 5 0.0000 0.91131 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614239 4 0.4602 0.48452 0.000 0.044 0.000 0.572 0.000 0.384
#> SRR613939 4 0.1151 0.73982 0.000 0.032 0.000 0.956 0.000 0.012
#> SRR612971 2 0.0713 0.80321 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1490204 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811357 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0146 0.90694 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR613006 4 0.1814 0.71823 0.000 0.100 0.000 0.900 0.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.3810 0.48216 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.3695 0.54721 0.000 0.624 0.000 0.376 0.000 0.000
#> SRR1362906 6 0.3915 0.02930 0.004 0.000 0.412 0.000 0.000 0.584
#> SRR1079023 5 0.1007 0.90225 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956 0.000
#> SRR813608 2 0.3706 0.54290 0.000 0.620 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.2044 0.84931 0.908 0.000 0.008 0.004 0.004 0.076
#> SRR1478700 1 0.0146 0.91051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1081543 6 0.0291 0.56568 0.004 0.000 0.004 0.000 0.000 0.992
#> SRR1384754 6 0.4194 0.35140 0.308 0.000 0.008 0.000 0.020 0.664
#> SRR612287 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380317 4 0.4846 0.49226 0.000 0.068 0.000 0.576 0.000 0.356
#> SRR1315247 4 0.1745 0.72914 0.000 0.012 0.000 0.920 0.000 0.068
#> SRR1105344 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658549 4 0.4602 0.48452 0.000 0.044 0.000 0.572 0.000 0.384
#> SRR1480240 5 0.0865 0.90511 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1084816 2 0.3810 0.48216 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0713 0.80321 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.1714 0.75771 0.000 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1419476 3 0.0291 0.78363 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1456075 3 0.3937 0.01544 0.000 0.000 0.572 0.000 0.004 0.424
#> SRR1389474 2 0.3810 0.48216 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0146 0.91051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1334419 1 0.1007 0.90098 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1417154 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR1095985 5 0.3109 0.73588 0.000 0.000 0.224 0.000 0.772 0.004
#> SRR1325771 1 0.1610 0.87355 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1360420 3 0.2805 0.79476 0.004 0.000 0.812 0.000 0.000 0.184
#> SRR660272 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332993 5 0.0547 0.90696 0.020 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000
#> SRR1311833 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808044 1 0.0146 0.91051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1076916 6 0.5356 0.38480 0.000 0.000 0.168 0.000 0.248 0.584
#> SRR1356266 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.1007 0.90015 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1072948 3 0.2838 0.79405 0.004 0.000 0.808 0.000 0.000 0.188
#> SRR1472370 3 0.0146 0.78266 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1480176 5 0.1327 0.89409 0.064 0.000 0.000 0.000 0.936 0.000
#> SRR613843 2 0.2697 0.72644 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR1469192 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1404555 6 0.2520 0.48570 0.004 0.000 0.152 0.000 0.000 0.844
#> SRR659839 4 0.1007 0.72865 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.3684 0.24773 0.000 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1362848 6 0.4823 0.42279 0.256 0.068 0.008 0.000 0.004 0.664
#> SRR1407492 4 0.3717 0.51095 0.000 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1455082 4 0.4893 0.38352 0.000 0.400 0.000 0.536 0.000 0.064
#> SRR658362 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810921 4 0.0632 0.73683 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.1219 0.79101 0.004 0.000 0.948 0.000 0.000 0.048
#> SRR818232 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1454868 4 0.3852 0.50953 0.000 0.004 0.000 0.612 0.000 0.384
#> SRR1474816 4 0.0632 0.73616 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1342002 5 0.0865 0.90557 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1088437 2 0.1556 0.78054 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1466400 4 0.2454 0.66813 0.000 0.160 0.000 0.840 0.000 0.000
#> SRR658921 4 0.3782 -0.00927 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0713 0.80321 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0146 0.91051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1090145 5 0.1285 0.87098 0.000 0.000 0.004 0.052 0.944 0.000
#> SRR1379324 1 0.3244 0.64492 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR1345307 4 0.2562 0.61412 0.000 0.172 0.000 0.828 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.3997 0.27158 0.004 0.000 0.508 0.000 0.000 0.488
#> SRR1086280 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR1454891 4 0.6014 0.27904 0.000 0.368 0.000 0.392 0.000 0.240
#> SRR663185 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811819 5 0.2378 0.82406 0.152 0.000 0.000 0.000 0.848 0.000
#> SRR1318920 1 0.1075 0.89868 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR656758 4 0.2597 0.61958 0.000 0.176 0.000 0.824 0.000 0.000
#> SRR1474351 5 0.3578 0.53806 0.340 0.000 0.000 0.000 0.660 0.000
#> SRR660450 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334291 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415153 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1368939 4 0.3868 -0.31712 0.000 0.496 0.000 0.504 0.000 0.000
#> SRR1443161 4 0.6126 0.33859 0.080 0.000 0.052 0.480 0.004 0.384
#> SRR614695 4 0.0547 0.74052 0.000 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1092372 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1474577 1 0.0146 0.91051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1406582 1 0.0146 0.91051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR612779 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0146 0.91051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1354071 5 0.0260 0.90962 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1105463 5 0.0146 0.91055 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR811005 4 0.0260 0.74074 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR1385319 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1325871 3 0.2941 0.77806 0.000 0.000 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1355415 5 0.2631 0.78577 0.000 0.000 0.180 0.000 0.820 0.000
#> SRR1090861 1 0.3862 0.10267 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476 0.000
#> SRR1320712 6 0.6156 0.46034 0.068 0.252 0.000 0.116 0.000 0.564
#> SRR1470075 1 0.1007 0.90015 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1091254 5 0.2300 0.80943 0.144 0.000 0.000 0.000 0.856 0.000
#> SRR1101397 1 0.2191 0.81748 0.876 0.000 0.004 0.000 0.120 0.000
#> SRR1321165 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1092112 5 0.3198 0.69380 0.000 0.000 0.260 0.000 0.740 0.000
#> SRR1417588 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR1074790 4 0.3650 0.38231 0.012 0.280 0.000 0.708 0.000 0.000
#> SRR1432106 2 0.3706 0.54858 0.000 0.620 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.1204 0.79270 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.0790 0.90574 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1318582 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072749 5 0.0000 0.91131 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078586 5 0.1007 0.90225 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956 0.000
#> SRR1400333 4 0.3717 0.51095 0.000 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1078834 4 0.2378 0.68528 0.000 0.000 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1417611 2 0.0458 0.80273 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1396840 5 0.0000 0.91131 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0713 0.80321 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.3810 0.48216 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000 0.000
#> SRR614984 4 0.4543 0.48722 0.000 0.040 0.000 0.576 0.000 0.384
#> SRR1324269 5 0.0458 0.91075 0.016 0.000 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1401491 2 0.0713 0.80321 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1319443 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1324349 4 0.2801 0.70751 0.000 0.068 0.000 0.860 0.000 0.072
#> SRR1345523 2 0.0713 0.80321 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.3727 0.39796 0.612 0.000 0.000 0.000 0.388 0.000
#> SRR661505 3 0.0146 0.78266 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1419062 3 0.2823 0.51552 0.000 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1480131 5 0.0000 0.91131 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.1556 0.76544 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1329624 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1315739 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR1099189 2 0.2163 0.74898 0.000 0.892 0.000 0.016 0.000 0.092
#> SRR1083286 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1091890 6 0.0692 0.56349 0.004 0.000 0.020 0.000 0.000 0.976
#> SRR1347436 4 0.3101 0.62832 0.000 0.000 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1327473 4 0.5399 0.36776 0.016 0.292 0.008 0.620 0.052 0.012
#> SRR1338195 3 0.3930 0.45236 0.004 0.000 0.576 0.000 0.000 0.420
#> SRR809698 2 0.0713 0.80321 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.2854 0.75736 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR658271 4 0.2527 0.61763 0.000 0.168 0.000 0.832 0.000 0.000
#> SRR1339597 5 0.2562 0.80365 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828 0.000
#> SRR1454842 4 0.6023 0.06687 0.000 0.000 0.252 0.412 0.000 0.336
#> SRR1322643 1 0.1007 0.90015 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR614887 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR1354620 5 0.3244 0.68465 0.000 0.000 0.268 0.000 0.732 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105320 4 0.3366 0.64152 0.036 0.000 0.008 0.824 0.128 0.004
#> SRR1391529 5 0.0000 0.91131 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663052 2 0.2135 0.72951 0.000 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128
#> SRR1478834 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR812366 2 0.3695 0.54721 0.000 0.624 0.000 0.376 0.000 0.000
#> SRR1435330 6 0.3937 -0.01525 0.004 0.000 0.424 0.000 0.000 0.572
#> SRR615383 4 0.3371 0.37481 0.000 0.292 0.000 0.708 0.000 0.000
#> SRR1389157 4 0.3717 0.51095 0.000 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR613568 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1103092 5 0.1007 0.90225 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956 0.000
#> SRR1337155 5 0.6625 0.00247 0.000 0.000 0.040 0.224 0.436 0.300
#> SRR1475345 2 0.1501 0.78761 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0713 0.80321 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1446180 4 0.4406 0.55322 0.000 0.028 0.004 0.648 0.004 0.316
#> SRR1406372 2 0.3797 0.49390 0.000 0.580 0.000 0.420 0.000 0.000
#> SRR1339880 6 0.3841 0.12882 0.004 0.000 0.380 0.000 0.000 0.616
#> SRR1353136 6 0.1245 0.56983 0.000 0.016 0.000 0.032 0.000 0.952
#> SRR1093906 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR614035 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.0146 0.91051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1363926 4 0.3747 0.08454 0.000 0.396 0.000 0.604 0.000 0.000
#> SRR1399861 4 0.5598 0.42151 0.000 0.152 0.000 0.492 0.000 0.356
#> SRR1338789 1 0.0790 0.90465 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1421420 3 0.2482 0.79349 0.000 0.000 0.848 0.000 0.004 0.148
#> SRR1420832 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476231 5 0.1267 0.89651 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1352870 4 0.3717 0.51095 0.000 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR1315041 2 0.3756 0.50742 0.000 0.600 0.000 0.400 0.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443268 5 0.3151 0.70818 0.252 0.000 0.000 0.000 0.748 0.000
#> SRR1416617 6 0.3841 0.12882 0.004 0.000 0.380 0.000 0.000 0.616
#> SRR1102443 1 0.0146 0.91051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR655672 2 0.6070 -0.13940 0.000 0.404 0.000 0.304 0.000 0.292
#> SRR1420006 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR1458267 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613819 2 0.1714 0.75771 0.000 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1469432 2 0.3620 0.56778 0.000 0.648 0.000 0.352 0.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0547 0.80389 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1465092 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470727 5 0.0000 0.91131 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.3620 0.25298 0.000 0.000 0.648 0.000 0.000 0.352
#> SRR1472749 6 0.3819 0.33203 0.004 0.000 0.372 0.000 0.000 0.624
#> SRR1414379 2 0.1714 0.75771 0.000 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1431326 1 0.1863 0.86482 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1487278 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098312 6 0.1453 0.56841 0.000 0.000 0.008 0.040 0.008 0.944
#> SRR810273 4 0.3684 0.12219 0.000 0.372 0.000 0.628 0.000 0.000
#> SRR1376000 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614467 2 0.2664 0.68601 0.000 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184
#> SRR811471 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1478341 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR1088606 5 0.0260 0.90962 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1479699 6 0.4361 0.14146 0.004 0.008 0.008 0.320 0.008 0.652
#> SRR1403589 2 0.3823 0.46709 0.000 0.564 0.000 0.436 0.000 0.000
#> SRR812625 4 0.1257 0.73584 0.000 0.028 0.000 0.952 0.000 0.020
#> SRR1359803 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.3868 0.23275 0.000 0.508 0.000 0.492 0.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.0146 0.91051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR659427 2 0.5434 0.35216 0.000 0.576 0.000 0.192 0.000 0.232
#> SRR1096638 1 0.1663 0.87715 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1466619 2 0.3810 0.45329 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000 0.000
#> SRR659307 4 0.4602 0.48452 0.000 0.044 0.000 0.572 0.000 0.384
#> SRR1439994 5 0.3499 0.60802 0.000 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1454931 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1332928 3 0.1082 0.76196 0.000 0.000 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR658621 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095840 5 0.1141 0.89986 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1458243 5 0.2941 0.74703 0.220 0.000 0.000 0.000 0.780 0.000
#> SRR1374270 6 0.7598 -0.06666 0.244 0.164 0.000 0.292 0.000 0.300
#> SRR1470947 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365598 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662787 2 0.0260 0.80358 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1408727 4 0.4552 0.55530 0.000 0.064 0.000 0.648 0.000 0.288
#> SRR1456274 4 0.4846 0.50815 0.000 0.000 0.008 0.608 0.056 0.328
#> SRR817744 5 0.0713 0.90468 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.2491 0.74557 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.0146 0.78266 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1374198 1 0.1863 0.87480 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1445856 5 0.2980 0.78477 0.012 0.000 0.180 0.000 0.808 0.000
#> SRR820049 3 0.2697 0.54285 0.000 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1375290 4 0.3852 0.50741 0.000 0.000 0.004 0.612 0.000 0.384
#> SRR818999 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1390242 5 0.0790 0.90644 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1401164 2 0.3774 0.50955 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000 0.000
#> SRR1454629 5 0.3163 0.65316 0.000 0.000 0.004 0.232 0.764 0.000
#> SRR1332187 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR603365 3 0.0146 0.78266 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR657833 4 0.1075 0.73426 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1436207 4 0.2491 0.70842 0.000 0.020 0.000 0.868 0.000 0.112
#> SRR1488017 1 0.1444 0.88260 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR612947 4 0.1957 0.68732 0.000 0.112 0.000 0.888 0.000 0.000
#> SRR1480384 5 0.1075 0.90160 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000
#> SRR1364761 4 0.3151 0.58365 0.000 0.252 0.000 0.748 0.000 0.000
#> SRR1308086 6 0.3841 0.12882 0.004 0.000 0.380 0.000 0.000 0.616
#> SRR1441868 1 0.0790 0.90564 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1485380 3 0.0146 0.78266 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1073705 1 0.0146 0.91051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR615032 2 0.0713 0.80321 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442983 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 4 0.4764 0.47907 0.000 0.056 0.000 0.560 0.000 0.384
#> SRR1332816 1 0.0146 0.90694 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR612299 4 0.0260 0.74181 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1407386 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1418064 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309403 4 0.3445 0.52345 0.000 0.000 0.008 0.732 0.260 0.000
#> SRR1498395 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.1910 0.67178 0.000 0.000 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337215 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414749 3 0.0363 0.78507 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1365963 5 0.4765 0.63460 0.132 0.000 0.196 0.000 0.672 0.000
#> SRR1368030 2 0.1714 0.75771 0.000 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1419760 4 0.3592 0.54826 0.000 0.000 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1381841 5 0.0937 0.90353 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960 0.000
#> SRR821388 6 0.2454 0.49114 0.000 0.000 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR657623 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0260 0.78140 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR819583 3 0.0146 0.78266 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1096149 1 0.0146 0.91051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1342829 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR1353028 5 0.3151 0.70663 0.252 0.000 0.000 0.000 0.748 0.000
#> SRR811333 5 0.2553 0.80094 0.008 0.000 0.000 0.000 0.848 0.144
#> SRR1311666 4 0.2300 0.64572 0.000 0.144 0.000 0.856 0.000 0.000
#> SRR1486698 4 0.3672 0.45571 0.000 0.368 0.000 0.632 0.000 0.000
#> SRR1446436 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815092 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1500149 4 0.0713 0.73531 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1100564 5 0.1007 0.90225 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956 0.000
#> SRR1403072 3 0.1152 0.79012 0.004 0.000 0.952 0.000 0.000 0.044
#> SRR811653 6 0.4583 -0.09949 0.000 0.044 0.000 0.376 0.000 0.580
#> SRR1311348 4 0.1444 0.71351 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.2762 0.72251 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000 0.000
#> SRR1435442 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.3714 0.61524 0.004 0.000 0.656 0.000 0.000 0.340
#> SRR1344010 2 0.0713 0.80321 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.2260 0.82850 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1444763 1 0.0260 0.91020 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1415026 2 0.0458 0.80388 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1416596 4 0.3023 0.51520 0.000 0.232 0.000 0.768 0.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0713 0.80321 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.1765 0.77724 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR663537 2 0.3864 0.36751 0.000 0.520 0.000 0.480 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0458 0.90958 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1453950 5 0.3804 0.32300 0.424 0.000 0.000 0.000 0.576 0.000
#> SRR1087875 1 0.0146 0.91051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR613318 6 0.2629 0.55547 0.000 0.092 0.000 0.040 0.000 0.868
#> SRR1332694 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1468469 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR818670 4 0.1387 0.71531 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR1120318 5 0.1007 0.90225 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956 0.000
#> SRR1311622 3 0.3937 0.01544 0.000 0.000 0.572 0.000 0.004 0.424
#> SRR1500931 3 0.0146 0.78266 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1387494 6 0.2864 0.54450 0.000 0.000 0.100 0.028 0.012 0.860
#> SRR1379175 4 0.3558 0.64445 0.000 0.028 0.000 0.760 0.000 0.212
#> SRR1401909 5 0.3266 0.68027 0.000 0.000 0.272 0.000 0.728 0.000
#> SRR1440541 4 0.2969 0.54044 0.000 0.224 0.000 0.776 0.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.0146 0.78266 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1376640 2 0.3868 -0.19049 0.000 0.508 0.000 0.492 0.000 0.000
#> SRR1085712 2 0.0713 0.80321 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.1152 0.89803 0.952 0.000 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1084276 5 0.0000 0.91131 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.3717 0.53414 0.000 0.616 0.000 0.384 0.000 0.000
#> SRR1437035 5 0.0260 0.90962 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1396877 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1443026 2 0.3810 0.48216 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.1267 0.89045 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1436822 2 0.0790 0.79126 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1101128 3 0.0146 0.78266 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394366 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093218 3 0.2527 0.79510 0.000 0.000 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1077090 3 0.0146 0.78266 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1327430 4 0.5144 0.44747 0.000 0.340 0.000 0.560 0.000 0.100
#> SRR1088958 1 0.0146 0.91051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1486931 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086820 5 0.1141 0.90039 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948 0.000
#> SRR1383000 5 0.3050 0.72913 0.236 0.000 0.000 0.000 0.764 0.000
#> SRR1355705 2 0.0260 0.80365 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660534 4 0.3847 -0.11517 0.000 0.456 0.000 0.544 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0713 0.80321 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1334265 4 0.3245 0.55578 0.000 0.228 0.000 0.764 0.000 0.008
#> SRR1456401 4 0.1765 0.69711 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.2664 0.79618 0.816 0.000 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR1351521 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR1093100 2 0.1714 0.75771 0.000 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1309382 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1089375 5 0.1124 0.90206 0.036 0.000 0.008 0.000 0.956 0.000
#> SRR1499482 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614719 4 0.4985 0.47049 0.000 0.076 0.000 0.548 0.000 0.376
#> SRR1081473 3 0.0146 0.78266 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1087415 1 0.0937 0.90096 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1088217 5 0.0146 0.91055 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR808496 2 0.4756 0.48174 0.000 0.672 0.000 0.200 0.000 0.128
#> SRR1336463 4 0.2697 0.61396 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000 0.000
#> SRR612359 4 0.4482 0.49063 0.000 0.036 0.000 0.580 0.000 0.384
#> SRR1444412 5 0.0000 0.91131 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.1152 0.79012 0.004 0.000 0.952 0.000 0.000 0.044
#> SRR821846 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR656095 4 0.0260 0.74078 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000
#> SRR808914 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1349099 1 0.2368 0.87665 0.888 0.008 0.008 0.000 0.092 0.004
#> SRR1337886 4 0.0806 0.74051 0.000 0.020 0.000 0.972 0.000 0.008
#> SRR813632 5 0.0937 0.90353 0.040 0.000 0.000 0.000 0.960 0.000
#> SRR1101591 3 0.1285 0.79384 0.000 0.000 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR1089713 5 0.0937 0.89652 0.000 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1453127 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR1498354 5 0.3244 0.68465 0.000 0.000 0.268 0.000 0.732 0.000
#> SRR1313831 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1315434 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR814747 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358539 5 0.0260 0.91169 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1367807 1 0.0146 0.91051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1365791 6 0.1970 0.55059 0.000 0.000 0.008 0.000 0.092 0.900
#> SRR1081519 5 0.3101 0.71369 0.000 0.000 0.244 0.000 0.756 0.000
#> SRR614707 4 0.0146 0.74209 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1094027 5 0.1075 0.90132 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000
#> SRR1489092 5 0.5812 0.12539 0.000 0.000 0.192 0.000 0.460 0.348
#> SRR1079502 3 0.2664 0.54747 0.000 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR1457814 6 0.3395 0.52013 0.000 0.132 0.000 0.060 0.000 0.808
#> SRR1455127 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615081 2 0.3810 0.46001 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000 0.000
#> SRR1327855 3 0.0146 0.78266 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1417873 2 0.1387 0.77238 0.000 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1394125 3 0.2783 0.79144 0.000 0.000 0.836 0.000 0.016 0.148
#> SRR1488388 5 0.2762 0.71435 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612383 4 0.4602 0.48452 0.000 0.044 0.000 0.572 0.000 0.384
#> SRR1477711 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1350813 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612851 4 0.4602 0.48452 0.000 0.044 0.000 0.572 0.000 0.384
#> SRR1086349 5 0.1863 0.84214 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896 0.000
#> SRR812837 2 0.0632 0.80362 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1340010 6 0.3976 0.12889 0.004 0.000 0.380 0.000 0.004 0.612
#> SRR1475885 4 0.2077 0.72247 0.008 0.024 0.008 0.920 0.040 0.000
#> SRR1376334 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1399821 1 0.1007 0.90015 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1347042 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR612323 4 0.4602 0.48452 0.000 0.044 0.000 0.572 0.000 0.384
#> SRR612604 2 0.3847 0.39839 0.000 0.544 0.000 0.456 0.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.3765 0.51516 0.000 0.596 0.000 0.404 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0458 0.91000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1465608 1 0.0146 0.91051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1101808 4 0.3578 0.24463 0.000 0.340 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR1331153 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078439 4 0.3852 0.50741 0.000 0.000 0.004 0.612 0.000 0.384
#> SRR2165527 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351147 4 0.2854 0.58563 0.000 0.000 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1313536 2 0.3647 0.56623 0.000 0.640 0.000 0.360 0.000 0.000
#> SRR1070308 4 0.0146 0.74120 0.000 0.000 0.004 0.996 0.000 0.000
#> SRR1403110 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1400355 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0146 0.78266 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1456862 1 0.0146 0.91051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1074622 1 0.0146 0.91051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1465847 5 0.2003 0.83325 0.000 0.000 0.116 0.000 0.884 0.000
#> SRR1443376 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 6 0.3240 0.42212 0.000 0.000 0.244 0.000 0.004 0.752
#> SRR1075579 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1090881 4 0.3717 0.51095 0.000 0.000 0.000 0.616 0.000 0.384
#> SRR612251 2 0.3866 0.04374 0.000 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR1418581 1 0.1007 0.90015 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR658045 2 0.3659 0.56168 0.000 0.636 0.000 0.364 0.000 0.000
#> SRR613214 4 0.5001 0.46873 0.000 0.076 0.000 0.540 0.000 0.384
#> SRR613078 4 0.0891 0.73977 0.000 0.024 0.000 0.968 0.000 0.008
#> SRR1472998 5 0.0260 0.90921 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1433452 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.1863 0.85446 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1487993 6 0.3852 0.12907 0.004 0.000 0.384 0.000 0.000 0.612
#> SRR1465983 2 0.3515 0.60830 0.000 0.676 0.000 0.324 0.000 0.000
#> SRR1380375 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1367566 3 0.2902 0.79052 0.004 0.000 0.800 0.000 0.000 0.196
#> SRR1316151 4 0.2412 0.71051 0.000 0.028 0.000 0.880 0.000 0.092
#> SRR1417547 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0713 0.80321 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1490270 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398207 5 0.0146 0.91055 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1358755 5 0.1633 0.89601 0.044 0.000 0.024 0.000 0.932 0.000
#> SRR1078903 4 0.2431 0.69937 0.000 0.008 0.000 0.860 0.000 0.132
#> SRR1323252 2 0.3774 0.50975 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.3828 0.42011 0.000 0.560 0.000 0.440 0.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.3563 0.55768 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR615982 4 0.2613 0.69488 0.000 0.012 0.000 0.848 0.000 0.140
#> SRR1480431 2 0.0000 0.80269 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429825 4 0.4988 0.26652 0.000 0.448 0.000 0.484 0.000 0.068
#> SRR1102393 2 0.3810 0.48216 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000 0.000
#> SRR1071313 6 0.5560 0.27851 0.116 0.000 0.008 0.000 0.356 0.520
#> SRR808351 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1317513 5 0.0146 0.91226 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1480501 3 0.0146 0.78266 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1081910 5 0.0000 0.91131 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086611 4 0.3647 0.53268 0.000 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1392571 4 0.1714 0.71904 0.000 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1311441 1 0.0937 0.90131 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR808152 1 0.2340 0.81488 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR657313 3 0.2416 0.60874 0.000 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1433131 4 0.3482 0.30175 0.000 0.316 0.000 0.684 0.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.3634 0.57059 0.000 0.644 0.000 0.356 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0458 0.80401 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1379343 4 0.0000 0.74219 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0146 0.91051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1376228 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR1399757 4 0.3373 0.53411 0.008 0.000 0.000 0.744 0.248 0.000
#> SRR1358060 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR1464517 3 0.3937 0.01544 0.000 0.000 0.572 0.000 0.004 0.424
#> SRR613557 4 0.4602 0.48452 0.000 0.044 0.000 0.572 0.000 0.384
#> SRR809831 5 0.0777 0.90638 0.004 0.000 0.024 0.000 0.972 0.000
#> SRR1429387 3 0.2871 0.79316 0.004 0.000 0.804 0.000 0.000 0.192
#> SRR816565 5 0.1267 0.89642 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR1071644 5 0.0363 0.91146 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1406936 6 0.4192 0.11772 0.000 0.000 0.412 0.000 0.016 0.572
#> SRR1072031 2 0.3810 0.48216 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000 0.000
#> SRR1374671 4 0.4025 0.61886 0.000 0.048 0.000 0.720 0.000 0.232
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.967 0.987 0.4974 0.503 0.503
#> 3 3 0.855 0.883 0.951 0.3065 0.780 0.590
#> 4 4 0.675 0.699 0.831 0.1152 0.917 0.770
#> 5 5 0.705 0.714 0.826 0.0658 0.907 0.691
#> 6 6 0.718 0.645 0.779 0.0402 0.938 0.743
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.9909 0.1938 0.444 0.556
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.1414 0.9670 0.980 0.020
#> SRR1394209 1 1.0000 0.0218 0.504 0.496
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.3584 0.9187 0.068 0.932
#> SRR1354363 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1391619 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1403980 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1442800 2 0.8763 0.5796 0.296 0.704
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1093053 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1399843 1 0.7139 0.7533 0.804 0.196
#> SRR1380231 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1096736 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1478700 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1384754 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1380317 2 0.5178 0.8613 0.116 0.884
#> SRR1315247 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1456075 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1417154 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1325771 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1360420 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1072948 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1362848 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1407492 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1454868 2 0.8327 0.6368 0.264 0.736
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR614695 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1325871 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1320712 1 0.9710 0.3320 0.600 0.400
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1092112 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1074790 1 0.9522 0.4069 0.628 0.372
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1078834 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.2423 0.9485 0.040 0.960
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1419062 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1315739 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1091890 1 0.8713 0.5853 0.708 0.292
#> SRR1347436 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1327473 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1338195 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.6801 0.7766 0.820 0.180
#> SRR1322643 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR614887 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1354620 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1389157 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR613568 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1446180 1 0.0938 0.9747 0.988 0.012
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1353136 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1093906 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1399861 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1338789 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1421420 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1352870 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1315041 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1420006 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1472749 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1478341 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1479699 1 0.9170 0.5015 0.668 0.332
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR659427 1 0.7219 0.7473 0.800 0.200
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1439994 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1374270 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1456274 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR820049 1 0.0376 0.9823 0.996 0.004
#> SRR1375290 1 0.4022 0.9037 0.920 0.080
#> SRR818999 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1332187 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR603365 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1485380 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1309403 1 0.1184 0.9709 0.984 0.016
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1414749 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1419760 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1381841 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR821388 1 0.9710 0.3320 0.600 0.400
#> SRR657623 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR819583 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1403072 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR811653 1 0.7883 0.6915 0.764 0.236
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR613318 2 0.9963 0.1344 0.464 0.536
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1468469 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1500931 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1379175 2 0.9323 0.4611 0.348 0.652
#> SRR1401909 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.7219 0.7456 0.200 0.800
#> SRR1068832 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1101128 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1093218 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1077090 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1101591 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1453127 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1315434 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1365791 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1081519 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR614707 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1079502 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1457814 1 0.9922 0.1889 0.552 0.448
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1475885 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1347042 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.2603 0.9427 0.956 0.044
#> SRR2165527 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.9732 0.3239 0.404 0.596
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1090881 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR612251 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1487993 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1367566 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1480501 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1086611 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1392571 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR657313 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1376228 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1358060 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1464517 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR613557 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR809831 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.0000 0.9860 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.9880 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR614491 3 0.0747 0.9168 0.000 0.016 0.984
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 3 0.0747 0.9168 0.000 0.016 0.984
#> SRR1394209 3 0.3619 0.8134 0.000 0.136 0.864
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099809 3 0.5859 0.4669 0.344 0.000 0.656
#> SRR1500555 3 0.0747 0.9168 0.000 0.016 0.984
#> SRR1354363 1 0.0237 0.9672 0.996 0.000 0.004
#> SRR1391619 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR663124 2 0.6244 0.2287 0.000 0.560 0.440
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR612515 3 0.4750 0.7125 0.000 0.216 0.784
#> SRR1092727 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468553 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420169 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1442800 3 0.0892 0.9148 0.000 0.020 0.980
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499849 3 0.4654 0.7134 0.208 0.000 0.792
#> SRR1500030 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093053 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399843 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380231 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR809470 3 0.0892 0.9159 0.020 0.000 0.980
#> SRR614239 2 0.5785 0.5104 0.000 0.668 0.332
#> SRR613939 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0424 0.9640 0.992 0.000 0.008
#> SRR613006 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1478700 1 0.0424 0.9640 0.992 0.000 0.008
#> SRR1081543 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384754 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380317 3 0.4750 0.7125 0.000 0.216 0.784
#> SRR1315247 2 0.3038 0.8513 0.000 0.896 0.104
#> SRR1105344 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR658549 2 0.5988 0.4286 0.000 0.632 0.368
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358520 3 0.6079 0.3625 0.000 0.388 0.612
#> SRR1419476 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456075 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095985 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1325771 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR660272 2 0.0424 0.9473 0.000 0.992 0.008
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 1 0.6309 -0.0265 0.504 0.000 0.496
#> SRR1076916 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.1031 0.9505 0.976 0.000 0.024
#> SRR1072948 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472370 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1480176 3 0.2165 0.8815 0.064 0.000 0.936
#> SRR613843 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.4504 0.7639 0.804 0.000 0.196
#> SRR1404555 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 3 0.3116 0.8397 0.000 0.108 0.892
#> SRR1362848 3 0.0592 0.9186 0.000 0.012 0.988
#> SRR1407492 2 0.6267 0.1889 0.000 0.548 0.452
#> SRR1455082 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR658362 2 0.3551 0.8280 0.000 0.868 0.132
#> SRR810921 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.4178 0.7724 0.000 0.172 0.828
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.4452 0.7695 0.808 0.000 0.192
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454891 2 0.4002 0.7944 0.000 0.840 0.160
#> SRR663185 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443161 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR614695 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1105463 3 0.4842 0.6904 0.224 0.000 0.776
#> SRR811005 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355415 3 0.1860 0.8910 0.052 0.000 0.948
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 3 0.0747 0.9168 0.000 0.016 0.984
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 3 0.5948 0.4291 0.360 0.000 0.640
#> SRR1321165 1 0.4178 0.7953 0.828 0.000 0.172
#> SRR1092112 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1417588 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074790 3 0.0747 0.9168 0.000 0.016 0.984
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.4002 0.8100 0.840 0.000 0.160
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072749 3 0.5560 0.5578 0.300 0.000 0.700
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.5291 0.6363 0.000 0.732 0.268
#> SRR1078834 2 0.3038 0.8591 0.000 0.896 0.104
#> SRR1417611 2 0.0237 0.9503 0.000 0.996 0.004
#> SRR1396840 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR614984 3 0.6008 0.4045 0.000 0.372 0.628
#> SRR1324269 3 0.4887 0.6864 0.228 0.000 0.772
#> SRR1401491 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 3 0.4750 0.7125 0.000 0.216 0.784
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.5650 0.5619 0.688 0.000 0.312
#> SRR661505 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480131 1 0.5560 0.5546 0.700 0.000 0.300
#> SRR1421284 3 0.6192 0.2692 0.000 0.420 0.580
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099189 2 0.0237 0.9503 0.000 0.996 0.004
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0747 0.9168 0.000 0.016 0.984
#> SRR1347436 2 0.5431 0.6095 0.000 0.716 0.284
#> SRR1327473 3 0.0747 0.9168 0.000 0.016 0.984
#> SRR1338195 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.2537 0.8985 0.920 0.000 0.080
#> SRR1454842 3 0.0237 0.9210 0.000 0.004 0.996
#> SRR1322643 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354620 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR615056 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105320 3 0.0747 0.9168 0.000 0.016 0.984
#> SRR1391529 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.6225 0.2549 0.000 0.568 0.432
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 2 0.6307 0.0569 0.000 0.512 0.488
#> SRR613568 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR614095 2 0.0424 0.9472 0.000 0.992 0.008
#> SRR1103092 3 0.6244 0.2063 0.440 0.000 0.560
#> SRR1337155 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 3 0.0747 0.9168 0.000 0.016 0.984
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353136 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399861 3 0.4750 0.7125 0.000 0.216 0.784
#> SRR1338789 1 0.4504 0.7642 0.804 0.000 0.196
#> SRR1421420 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.4452 0.7462 0.000 0.192 0.808
#> SRR1315041 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443268 3 0.6079 0.3643 0.388 0.000 0.612
#> SRR1416617 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102443 1 0.5760 0.4742 0.672 0.000 0.328
#> SRR655672 2 0.6225 0.2539 0.000 0.568 0.432
#> SRR1420006 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR613819 2 0.1289 0.9277 0.000 0.968 0.032
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470727 3 0.5948 0.4296 0.360 0.000 0.640
#> SRR1339153 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414379 2 0.4291 0.7691 0.000 0.820 0.180
#> SRR1431326 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098312 3 0.0424 0.9201 0.000 0.008 0.992
#> SRR810273 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR614467 2 0.6168 0.3129 0.000 0.588 0.412
#> SRR811471 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088606 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1479699 3 0.0747 0.9168 0.000 0.016 0.984
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR659427 3 0.3619 0.8098 0.000 0.136 0.864
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR659307 3 0.4750 0.7125 0.000 0.216 0.784
#> SRR1439994 3 0.5678 0.5250 0.316 0.000 0.684
#> SRR1454931 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR658621 2 0.2066 0.9034 0.000 0.940 0.060
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 3 0.6095 0.3550 0.392 0.000 0.608
#> SRR1374270 3 0.0237 0.9214 0.000 0.004 0.996
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR662787 2 0.4974 0.6908 0.000 0.764 0.236
#> SRR1408727 2 0.2537 0.8844 0.000 0.920 0.080
#> SRR1456274 3 0.0747 0.9168 0.000 0.016 0.984
#> SRR817744 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 3 0.6008 0.3998 0.372 0.000 0.628
#> SRR820049 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375290 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR818999 3 0.1643 0.8981 0.044 0.000 0.956
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454629 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1332187 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.2878 0.8629 0.000 0.904 0.096
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.4654 0.7297 0.000 0.792 0.208
#> SRR1332816 1 0.4555 0.7586 0.800 0.000 0.200
#> SRR612299 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 3 0.0747 0.9168 0.000 0.016 0.984
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.0892 0.9159 0.020 0.000 0.980
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337215 2 0.6305 0.0785 0.000 0.516 0.484
#> SRR1414749 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365963 3 0.1289 0.9079 0.032 0.000 0.968
#> SRR1368030 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419760 3 0.6045 0.3851 0.000 0.380 0.620
#> SRR1381841 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR821388 3 0.0747 0.9168 0.000 0.016 0.984
#> SRR657623 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.0592 0.9193 0.012 0.000 0.988
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR811653 3 0.4346 0.7543 0.000 0.184 0.816
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR613318 3 0.0747 0.9168 0.000 0.016 0.984
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500931 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387494 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379175 3 0.3482 0.8209 0.000 0.128 0.872
#> SRR1401909 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1440541 2 0.4555 0.7215 0.000 0.800 0.200
#> SRR1068832 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1376640 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082283 3 0.2878 0.8506 0.096 0.000 0.904
#> SRR1084276 3 0.6154 0.3085 0.408 0.000 0.592
#> SRR1353262 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437035 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1396877 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.5291 0.6368 0.000 0.732 0.268
#> SRR1101128 3 0.0592 0.9193 0.012 0.000 0.988
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093218 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077090 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1327430 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.2066 0.9179 0.940 0.000 0.060
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR614335 2 0.6225 0.2545 0.000 0.568 0.432
#> SRR660534 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.6291 0.1314 0.000 0.532 0.468
#> SRR1456401 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.4555 0.7586 0.800 0.000 0.200
#> SRR1351521 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093100 3 0.6140 0.3172 0.000 0.404 0.596
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR614719 2 0.4452 0.7524 0.000 0.808 0.192
#> SRR1081473 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 3 0.2711 0.8587 0.088 0.000 0.912
#> SRR808496 2 0.6079 0.3792 0.000 0.612 0.388
#> SRR1336463 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR612359 2 0.5098 0.6681 0.000 0.752 0.248
#> SRR1444412 3 0.6215 0.2439 0.428 0.000 0.572
#> SRR1074116 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1089713 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1453127 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498354 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081519 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR614707 2 0.2165 0.8995 0.000 0.936 0.064
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.0237 0.9215 0.004 0.000 0.996
#> SRR1079502 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457814 3 0.0747 0.9168 0.000 0.016 0.984
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327855 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR612383 3 0.4654 0.7241 0.000 0.208 0.792
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR612851 2 0.5650 0.5512 0.000 0.688 0.312
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475885 3 0.0747 0.9168 0.000 0.016 0.984
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR612323 3 0.5905 0.4549 0.000 0.352 0.648
#> SRR612604 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 3 0.4062 0.7747 0.164 0.000 0.836
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078439 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351147 3 0.0747 0.9168 0.000 0.016 0.984
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070308 3 0.1163 0.9097 0.000 0.028 0.972
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456862 1 0.0237 0.9672 0.996 0.000 0.004
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.6244 0.2047 0.000 0.440 0.560
#> SRR612251 3 0.4750 0.7125 0.000 0.216 0.784
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 3 0.5327 0.6200 0.000 0.272 0.728
#> SRR613078 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472998 3 0.0892 0.9159 0.020 0.000 0.980
#> SRR1433452 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398207 3 0.0892 0.9163 0.020 0.000 0.980
#> SRR1358755 3 0.1031 0.9143 0.024 0.000 0.976
#> SRR1078903 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.2356 0.8952 0.000 0.928 0.072
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR808351 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081910 3 0.0747 0.9180 0.016 0.000 0.984
#> SRR1086611 3 0.6252 0.1907 0.000 0.444 0.556
#> SRR1392571 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.4555 0.7586 0.800 0.000 0.200
#> SRR657313 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR613557 3 0.4750 0.7125 0.000 0.216 0.784
#> SRR809831 3 0.4796 0.6984 0.220 0.000 0.780
#> SRR1429387 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9702 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.0000 0.9223 0.000 0.000 1.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.9534 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 3 0.3907 0.7463 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1404105 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR2164936 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.2469 0.7405 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR614491 3 0.4730 0.5970 0.000 0.000 0.636 0.364
#> SRR1069376 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR811964 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.4730 0.5005 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1345715 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1328073 3 0.2216 0.7225 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1394209 3 0.5573 0.5194 0.000 0.028 0.604 0.368
#> SRR1474018 2 0.4103 0.6487 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1099809 3 0.4966 0.6002 0.156 0.000 0.768 0.076
#> SRR1500555 4 0.4843 0.1985 0.000 0.000 0.396 0.604
#> SRR1354363 1 0.2759 0.8996 0.904 0.000 0.044 0.052
#> SRR1391619 3 0.4543 0.6625 0.000 0.000 0.676 0.324
#> SRR1307997 2 0.4040 0.5597 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR663124 4 0.6897 0.6200 0.000 0.160 0.256 0.584
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 4 0.5057 0.3260 0.000 0.012 0.340 0.648
#> SRR1092727 2 0.4916 0.1555 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1364013 4 0.4992 -0.0918 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1468553 3 0.4040 0.7455 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1403980 3 0.3123 0.7688 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1420169 3 0.2843 0.7311 0.020 0.000 0.892 0.088
#> SRR1442800 3 0.5827 0.1749 0.000 0.052 0.632 0.316
#> SRR1359214 2 0.4564 0.5598 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR1499849 3 0.4030 0.6748 0.092 0.000 0.836 0.072
#> SRR1500030 3 0.3942 0.7468 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR1093053 3 0.4406 0.6688 0.000 0.000 0.700 0.300
#> SRR1399843 3 0.4605 0.6308 0.000 0.000 0.664 0.336
#> SRR1380231 3 0.1118 0.7681 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR809470 3 0.2563 0.7322 0.020 0.000 0.908 0.072
#> SRR614239 4 0.6958 0.6395 0.000 0.184 0.232 0.584
#> SRR613939 2 0.0921 0.8055 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR612971 2 0.3569 0.6967 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1490204 2 0.1474 0.7944 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR811357 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.1284 0.9387 0.964 0.000 0.024 0.012
#> SRR613006 2 0.0592 0.8140 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1469570 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.3942 0.7468 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 3 0.0921 0.7670 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1478700 1 0.5250 0.7502 0.744 0.000 0.176 0.080
#> SRR1081543 3 0.3907 0.7463 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1384754 3 0.3801 0.7501 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR612287 2 0.3764 0.6805 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1380317 3 0.6672 0.1242 0.000 0.088 0.504 0.408
#> SRR1315247 2 0.7028 0.0269 0.000 0.548 0.148 0.304
#> SRR1105344 2 0.0469 0.8175 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR658549 4 0.6922 0.6275 0.000 0.168 0.248 0.584
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.3649 0.6901 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1358520 4 0.7421 0.3850 0.000 0.356 0.176 0.468
#> SRR1419476 3 0.2973 0.7714 0.000 0.000 0.856 0.144
#> SRR1456075 3 0.1867 0.7457 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1389474 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1334419 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1417154 3 0.3764 0.7593 0.000 0.000 0.784 0.216
#> SRR1095985 3 0.0817 0.7606 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1325771 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.4072 0.7448 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR660272 2 0.5222 0.4331 0.000 0.688 0.032 0.280
#> SRR1332993 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1311833 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808044 3 0.5486 0.5503 0.200 0.000 0.720 0.080
#> SRR1076916 3 0.0921 0.7692 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0188 0.8194 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1456114 1 0.3377 0.8349 0.848 0.000 0.140 0.012
#> SRR1072948 3 0.3907 0.7479 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1472370 3 0.2530 0.7424 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1480176 3 0.3320 0.7145 0.068 0.000 0.876 0.056
#> SRR613843 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.5694 0.6745 0.696 0.000 0.224 0.080
#> SRR1404555 3 0.3975 0.7458 0.000 0.000 0.760 0.240
#> SRR659839 2 0.0188 0.8194 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR659533 4 0.4936 0.3145 0.000 0.008 0.340 0.652
#> SRR1362848 3 0.3907 0.7463 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1407492 4 0.6685 0.5863 0.000 0.132 0.268 0.600
#> SRR1455082 2 0.4222 0.5159 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR658362 4 0.7106 0.5094 0.000 0.380 0.132 0.488
#> SRR810921 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.3837 0.6746 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1456375 3 0.2345 0.7721 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR818232 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.5060 0.4909 0.000 0.004 0.584 0.412
#> SRR1474816 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.5599 0.6147 0.664 0.000 0.288 0.048
#> SRR1088437 4 0.4999 -0.1398 0.000 0.492 0.000 0.508
#> SRR1466400 2 0.0188 0.8189 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658921 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1090145 3 0.1854 0.7576 0.012 0.000 0.940 0.048
#> SRR1379324 1 0.0188 0.9508 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.3942 0.7468 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR1086280 3 0.3219 0.7675 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1454891 4 0.7085 0.6133 0.000 0.300 0.156 0.544
#> SRR663185 4 0.4898 0.1523 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR811819 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.1022 0.8066 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1472687 2 0.3837 0.6738 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1334291 2 0.0921 0.8086 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1415153 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.3649 0.7055 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1368939 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443161 3 0.3688 0.7119 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR614695 2 0.0188 0.8192 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1406582 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR612779 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1354071 3 0.0817 0.7606 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1105463 3 0.4525 0.6462 0.116 0.000 0.804 0.080
#> SRR811005 2 0.0336 0.8183 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.4250 0.7103 0.000 0.000 0.724 0.276
#> SRR1355415 3 0.2805 0.7348 0.012 0.000 0.888 0.100
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 3 0.4643 0.6438 0.000 0.000 0.656 0.344
#> SRR1470075 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 3 0.5265 0.5850 0.160 0.000 0.748 0.092
#> SRR1321165 1 0.3444 0.7881 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR1092112 3 0.1940 0.7420 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1417588 3 0.4072 0.7448 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1074790 3 0.4767 0.4349 0.000 0.020 0.724 0.256
#> SRR1432106 2 0.4500 0.5774 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR655756 2 0.0469 0.8175 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1458314 1 0.6336 0.4893 0.608 0.000 0.304 0.088
#> SRR1318582 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 4 0.4941 0.0686 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1072749 3 0.4955 0.6064 0.144 0.000 0.772 0.084
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.7115 -0.2868 0.000 0.452 0.128 0.420
#> SRR1078834 2 0.5343 0.3601 0.000 0.656 0.028 0.316
#> SRR1417611 4 0.5512 -0.1068 0.000 0.488 0.016 0.496
#> SRR1396840 1 0.4387 0.7653 0.776 0.000 0.200 0.024
#> SRR1465440 2 0.0707 0.8141 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1400530 2 0.0188 0.8194 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614984 4 0.6730 0.5845 0.000 0.132 0.276 0.592
#> SRR1324269 3 0.4688 0.6347 0.128 0.000 0.792 0.080
#> SRR1401491 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 4 0.7914 0.5398 0.000 0.308 0.340 0.352
#> SRR1345523 2 0.3649 0.6901 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1500846 1 0.6586 0.3277 0.544 0.000 0.368 0.088
#> SRR661505 3 0.3649 0.7346 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1419062 3 0.1211 0.7665 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1480131 3 0.6337 0.2135 0.380 0.000 0.552 0.068
#> SRR1421284 4 0.7277 0.6348 0.000 0.228 0.232 0.540
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.4072 0.7448 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1099189 4 0.7098 0.4717 0.000 0.400 0.128 0.472
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.4072 0.7352 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1347436 2 0.6634 0.0685 0.000 0.564 0.100 0.336
#> SRR1327473 3 0.1118 0.7587 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1338195 3 0.3975 0.7465 0.000 0.000 0.760 0.240
#> SRR809698 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.6238 0.5129 0.620 0.000 0.296 0.084
#> SRR1454842 3 0.4605 0.6308 0.000 0.000 0.664 0.336
#> SRR1322643 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR614887 3 0.4331 0.7153 0.000 0.000 0.712 0.288
#> SRR1354620 3 0.2805 0.7348 0.012 0.000 0.888 0.100
#> SRR615056 4 0.4679 0.2670 0.000 0.352 0.000 0.648
#> SRR1105320 3 0.1557 0.7490 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1391529 1 0.0895 0.9409 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR663052 4 0.6426 0.5472 0.000 0.108 0.272 0.620
#> SRR1478834 1 0.0376 0.9493 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR812366 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.4040 0.7454 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR615383 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 4 0.6895 0.5959 0.000 0.148 0.276 0.576
#> SRR613568 2 0.1716 0.7866 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR614095 4 0.5212 0.6019 0.000 0.192 0.068 0.740
#> SRR1103092 3 0.5787 0.4916 0.244 0.000 0.680 0.076
#> SRR1337155 3 0.3400 0.7028 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1475345 2 0.3764 0.6805 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR809089 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1446180 3 0.4406 0.5102 0.000 0.000 0.700 0.300
#> SRR1406372 2 0.3311 0.6938 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1339880 3 0.3907 0.7479 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1353136 3 0.4477 0.6675 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR1093906 3 0.4072 0.7448 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR614035 2 0.3726 0.6841 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1351104 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1363926 2 0.4304 0.5158 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1399861 4 0.5941 0.5165 0.000 0.072 0.276 0.652
#> SRR1338789 1 0.3937 0.7715 0.800 0.000 0.188 0.012
#> SRR1421420 3 0.4008 0.7461 0.000 0.000 0.756 0.244
#> SRR1420832 2 0.3801 0.6769 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 4 0.5070 0.2544 0.000 0.008 0.372 0.620
#> SRR1315041 2 0.5453 0.3721 0.000 0.648 0.032 0.320
#> SRR661877 2 0.4661 0.5266 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1443268 3 0.5204 0.5857 0.160 0.000 0.752 0.088
#> SRR1416617 3 0.3975 0.7467 0.000 0.000 0.760 0.240
#> SRR1102443 3 0.6003 0.0659 0.456 0.000 0.504 0.040
#> SRR655672 4 0.6883 0.6156 0.000 0.156 0.260 0.584
#> SRR1420006 3 0.4072 0.7448 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1458267 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613819 4 0.4464 0.5472 0.000 0.208 0.024 0.768
#> SRR1469432 2 0.0336 0.8184 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR660907 2 0.3801 0.6769 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1465092 2 0.4431 0.4527 0.000 0.696 0.000 0.304
#> SRR1470727 3 0.5186 0.5825 0.164 0.000 0.752 0.084
#> SRR1339153 3 0.4605 0.6617 0.000 0.000 0.664 0.336
#> SRR1472749 3 0.4008 0.7462 0.000 0.000 0.756 0.244
#> SRR1414379 4 0.7296 0.5726 0.000 0.320 0.172 0.508
#> SRR1431326 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1487278 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098312 3 0.3907 0.7463 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR810273 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0188 0.8189 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614467 4 0.5944 0.6562 0.000 0.164 0.140 0.696
#> SRR811471 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.4072 0.7448 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1088606 3 0.0817 0.7625 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1479699 3 0.3610 0.7446 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1403589 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.4585 0.4312 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.3649 0.6912 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1471222 2 0.4040 0.5684 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1378992 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR659427 3 0.4454 0.6433 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR1096638 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1466619 2 0.1940 0.7770 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR659307 4 0.4990 0.2937 0.000 0.008 0.352 0.640
#> SRR1439994 3 0.5220 0.5900 0.156 0.000 0.752 0.092
#> SRR1454931 1 0.1661 0.9148 0.944 0.000 0.052 0.004
#> SRR1332928 3 0.2342 0.7368 0.008 0.000 0.912 0.080
#> SRR658621 4 0.4059 0.5405 0.000 0.200 0.012 0.788
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 3 0.5265 0.5850 0.160 0.000 0.748 0.092
#> SRR1374270 3 0.4103 0.7252 0.000 0.000 0.744 0.256
#> SRR1470947 2 0.3801 0.6776 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1365598 2 0.2149 0.7689 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR662787 4 0.6000 0.0112 0.000 0.452 0.040 0.508
#> SRR1408727 2 0.7748 -0.4051 0.000 0.424 0.244 0.332
#> SRR1456274 3 0.0592 0.7619 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR817744 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.3837 0.6738 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1387379 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.1557 0.7693 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 3 0.5265 0.5850 0.160 0.000 0.748 0.092
#> SRR820049 3 0.4679 0.6409 0.000 0.000 0.648 0.352
#> SRR1375290 3 0.4624 0.6258 0.000 0.000 0.660 0.340
#> SRR818999 3 0.2845 0.7266 0.028 0.000 0.896 0.076
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454629 3 0.3123 0.7246 0.000 0.000 0.844 0.156
#> SRR1332187 3 0.3764 0.7571 0.000 0.000 0.784 0.216
#> SRR603365 3 0.4134 0.7267 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR657833 2 0.0921 0.8047 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1436207 2 0.6586 -0.0687 0.000 0.500 0.080 0.420
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.3301 0.8783 0.876 0.000 0.048 0.076
#> SRR1364761 2 0.0188 0.8190 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1308086 3 0.3873 0.7491 0.000 0.000 0.772 0.228
#> SRR1441868 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1485380 3 0.2216 0.7604 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1073705 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR615032 2 0.2868 0.7459 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1452356 4 0.5522 0.6129 0.000 0.204 0.080 0.716
#> SRR1442983 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 4 0.6890 0.6312 0.000 0.268 0.152 0.580
#> SRR1332816 1 0.4546 0.6848 0.732 0.000 0.256 0.012
#> SRR612299 2 0.2589 0.7382 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309403 3 0.1940 0.7341 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1498395 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.2706 0.7307 0.020 0.000 0.900 0.080
#> SRR1498885 2 0.4477 0.5861 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1337215 2 0.7606 -0.3097 0.000 0.468 0.228 0.304
#> SRR1414749 3 0.3528 0.7642 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1365963 3 0.3301 0.7115 0.048 0.000 0.876 0.076
#> SRR1368030 4 0.4830 0.1846 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1419760 4 0.7924 0.5329 0.000 0.332 0.328 0.340
#> SRR1381841 1 0.2266 0.8917 0.912 0.000 0.084 0.004
#> SRR821388 3 0.4222 0.7172 0.000 0.000 0.728 0.272
#> SRR657623 4 0.4989 -0.0791 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1094241 3 0.4605 0.6633 0.000 0.000 0.664 0.336
#> SRR819583 3 0.2081 0.7578 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1096149 1 0.2402 0.9047 0.912 0.000 0.012 0.076
#> SRR1342829 3 0.4072 0.7448 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.0469 0.7657 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1311666 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0188 0.8189 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1446436 2 0.0188 0.8192 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR815092 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.3400 0.7658 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR811653 3 0.5038 0.6105 0.000 0.012 0.652 0.336
#> SRR1311348 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.4972 0.2855 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR1435442 2 0.0469 0.8152 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1421444 3 0.4072 0.7448 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1344010 2 0.3764 0.6805 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1319520 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1444763 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.3688 0.6872 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1416596 2 0.4304 0.5073 0.000 0.716 0.000 0.284
#> SRR1485499 2 0.3801 0.6769 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1316078 2 0.3569 0.6967 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR663465 4 0.4713 0.2885 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR1310094 2 0.6519 0.1605 0.000 0.584 0.096 0.320
#> SRR663537 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1453950 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1087875 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR613318 3 0.4855 0.5416 0.000 0.000 0.600 0.400
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.4040 0.7455 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR818670 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.2973 0.8317 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1311622 3 0.3907 0.7479 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1500931 3 0.2760 0.7659 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1387494 3 0.3907 0.7463 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1379175 3 0.5548 0.3577 0.000 0.032 0.628 0.340
#> SRR1401909 3 0.2805 0.7348 0.012 0.000 0.888 0.100
#> SRR1440541 2 0.6924 0.0579 0.000 0.536 0.124 0.340
#> SRR1068832 3 0.2408 0.7400 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1376640 2 0.2921 0.7167 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1085712 2 0.3764 0.6805 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1082283 3 0.3687 0.6987 0.080 0.000 0.856 0.064
#> SRR1084276 3 0.5486 0.5459 0.200 0.000 0.720 0.080
#> SRR1353262 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437035 3 0.0817 0.7606 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1396877 3 0.2053 0.7399 0.004 0.000 0.924 0.072
#> SRR1443026 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.6591 -0.1365 0.000 0.496 0.080 0.424
#> SRR1101128 3 0.2149 0.7546 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1363886 2 0.3801 0.6769 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR612983 2 0.3764 0.6810 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1394366 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093218 3 0.3400 0.7649 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1077090 3 0.2775 0.7316 0.020 0.000 0.896 0.084
#> SRR1327430 4 0.6605 0.1748 0.000 0.440 0.080 0.480
#> SRR1088958 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1486931 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.5410 0.7253 0.728 0.000 0.192 0.080
#> SRR1355705 2 0.3649 0.6901 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR614335 4 0.6695 0.6462 0.000 0.164 0.220 0.616
#> SRR660534 2 0.2814 0.6976 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR817094 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.7830 -0.4281 0.000 0.400 0.268 0.332
#> SRR1456401 2 0.3356 0.6901 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1086393 1 0.5661 0.6800 0.700 0.000 0.220 0.080
#> SRR1351521 3 0.4072 0.7448 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1093100 4 0.6473 0.6239 0.000 0.188 0.168 0.644
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 3 0.1151 0.7595 0.008 0.000 0.968 0.024
#> SRR1499482 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614719 4 0.6975 0.6491 0.000 0.200 0.216 0.584
#> SRR1081473 3 0.0592 0.7664 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 3 0.3286 0.7147 0.044 0.000 0.876 0.080
#> SRR808496 4 0.7084 0.6184 0.000 0.176 0.264 0.560
#> SRR1336463 2 0.2281 0.7678 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR612359 4 0.7037 0.6384 0.000 0.268 0.168 0.564
#> SRR1444412 3 0.5661 0.5189 0.220 0.000 0.700 0.080
#> SRR1074116 3 0.4040 0.7471 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR821846 3 0.4040 0.7455 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR656095 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 3 0.0469 0.7622 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1337886 2 0.4222 0.5438 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR813632 1 0.2670 0.9017 0.908 0.000 0.052 0.040
#> SRR1101591 3 0.2589 0.7669 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1089713 3 0.0817 0.7606 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1453127 3 0.4072 0.7448 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1498354 3 0.2345 0.7397 0.000 0.000 0.900 0.100
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.3942 0.7468 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR814747 2 0.4040 0.6341 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1365791 3 0.3024 0.7692 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1081519 3 0.1940 0.7444 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR614707 2 0.5344 0.3881 0.000 0.668 0.032 0.300
#> SRR1094027 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1489092 3 0.0336 0.7651 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1079502 3 0.0592 0.7618 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1457814 3 0.4761 0.5840 0.000 0.000 0.628 0.372
#> SRR1455127 2 0.3837 0.6738 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR615081 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327855 3 0.2921 0.7716 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR1417873 4 0.5168 -0.1328 0.000 0.492 0.004 0.504
#> SRR1394125 3 0.2149 0.7707 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1488388 1 0.0657 0.9496 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1401122 4 0.4998 -0.1263 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR612383 4 0.5291 0.3597 0.000 0.024 0.324 0.652
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.1211 0.8032 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR612851 4 0.6922 0.6274 0.000 0.168 0.248 0.584
#> SRR1086349 1 0.0188 0.9515 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR812837 2 0.3764 0.6805 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1340010 3 0.3907 0.7463 0.000 0.000 0.768 0.232
#> SRR1475885 3 0.2647 0.7103 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.1059 0.9435 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR1347042 3 0.4072 0.7448 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR612323 4 0.6708 0.5861 0.000 0.132 0.272 0.596
#> SRR612604 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0336 0.9512 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1465608 3 0.4104 0.6761 0.080 0.000 0.832 0.088
#> SRR1101808 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.4008 0.7458 0.000 0.000 0.756 0.244
#> SRR1331153 2 0.2408 0.7537 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1078439 3 0.4454 0.6545 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR2165527 2 0.4605 0.5457 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR1351147 3 0.2589 0.7023 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1313536 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070308 3 0.6942 0.0339 0.000 0.176 0.584 0.240
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.2081 0.7605 0.000 0.000 0.916 0.084
#> SRR1456862 1 0.1584 0.9290 0.952 0.000 0.036 0.012
#> SRR1074622 1 0.0592 0.9495 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1465847 3 0.1867 0.7413 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1443376 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.3942 0.7468 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 4 0.6851 0.5511 0.000 0.132 0.300 0.568
#> SRR612251 4 0.5957 0.1247 0.000 0.040 0.420 0.540
#> SRR1418581 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR658045 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613214 4 0.6592 0.5603 0.000 0.116 0.284 0.600
#> SRR613078 2 0.2704 0.7082 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1472998 3 0.2635 0.7314 0.020 0.000 0.904 0.076
#> SRR1433452 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1487993 3 0.3942 0.7468 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR1465983 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0188 0.9515 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1367566 3 0.4040 0.7454 0.000 0.000 0.752 0.248
#> SRR1316151 2 0.5250 0.3868 0.000 0.660 0.024 0.316
#> SRR1417547 2 0.4967 0.2942 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR659389 2 0.2704 0.7550 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1490270 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398207 3 0.2635 0.7314 0.020 0.000 0.904 0.076
#> SRR1358755 3 0.2924 0.7324 0.016 0.000 0.884 0.100
#> SRR1078903 2 0.4916 0.1575 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1323252 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR615982 2 0.4193 0.5290 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1480431 2 0.2281 0.7638 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1429825 2 0.6376 -0.0963 0.000 0.504 0.064 0.432
#> SRR1102393 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 3 0.0592 0.7613 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR808351 1 0.2871 0.8942 0.896 0.000 0.032 0.072
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.2469 0.7719 0.000 0.000 0.892 0.108
#> SRR1081910 3 0.1389 0.7547 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1086611 3 0.7888 -0.5714 0.000 0.288 0.368 0.344
#> SRR1392571 2 0.4250 0.5082 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1311441 1 0.0336 0.9512 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR808152 1 0.4464 0.7500 0.768 0.000 0.208 0.024
#> SRR657313 3 0.4661 0.6465 0.000 0.000 0.652 0.348
#> SRR1433131 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.2868 0.7448 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1500598 2 0.3764 0.6805 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1379343 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0469 0.9508 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1376228 3 0.4072 0.7448 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1399757 1 0.0524 0.9503 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1358060 3 0.4072 0.7448 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR1464517 3 0.3801 0.7508 0.000 0.000 0.780 0.220
#> SRR613557 4 0.4855 0.2817 0.000 0.004 0.352 0.644
#> SRR809831 3 0.4332 0.6568 0.112 0.000 0.816 0.072
#> SRR1429387 3 0.4072 0.7448 0.000 0.000 0.748 0.252
#> SRR816565 1 0.0188 0.9515 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9517 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.2647 0.7713 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR1072031 2 0.0000 0.8204 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.4643 0.3797 0.000 0.656 0.000 0.344
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 3 0.0162 0.8643 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1404105 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR2164936 2 0.0404 0.8270 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1472057 5 0.3143 0.7801 0.000 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR614491 3 0.3480 0.6557 0.000 0.000 0.752 0.248 0.000
#> SRR1069376 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR811964 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.4574 0.5124 0.000 0.576 0.000 0.412 0.012
#> SRR1345715 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR1328073 5 0.5903 0.5967 0.000 0.016 0.280 0.096 0.608
#> SRR1394209 3 0.5388 0.4146 0.000 0.004 0.580 0.360 0.056
#> SRR1474018 2 0.4193 0.6527 0.000 0.684 0.000 0.304 0.012
#> SRR1099809 5 0.2488 0.7900 0.004 0.000 0.124 0.000 0.872
#> SRR1500555 4 0.6050 0.3033 0.000 0.004 0.360 0.524 0.112
#> SRR1354363 1 0.4657 0.7522 0.668 0.000 0.000 0.036 0.296
#> SRR1391619 3 0.3569 0.7965 0.000 0.000 0.828 0.104 0.068
#> SRR1307997 2 0.3662 0.6441 0.000 0.744 0.000 0.252 0.004
#> SRR663124 4 0.3455 0.7241 0.000 0.008 0.208 0.784 0.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 4 0.3242 0.7138 0.000 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR1092727 4 0.4351 0.7092 0.000 0.132 0.100 0.768 0.000
#> SRR1364013 4 0.4560 -0.3307 0.000 0.484 0.000 0.508 0.008
#> SRR1468553 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.1197 0.8366 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1420169 5 0.2648 0.7996 0.000 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR1442800 5 0.8361 -0.1990 0.000 0.288 0.140 0.252 0.320
#> SRR1359214 2 0.4547 0.5295 0.000 0.588 0.000 0.400 0.012
#> SRR1499849 5 0.2561 0.7984 0.000 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR1500030 3 0.0703 0.8535 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1093053 3 0.4169 0.7647 0.000 0.000 0.784 0.116 0.100
#> SRR1399843 3 0.4334 0.7480 0.000 0.000 0.764 0.156 0.080
#> SRR1380231 5 0.4015 0.6438 0.000 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR809470 5 0.2561 0.7984 0.000 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR614239 4 0.3530 0.7263 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR613939 2 0.1792 0.7831 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR612971 2 0.0955 0.8213 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1490204 2 0.2516 0.7619 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.3565 0.8566 0.800 0.000 0.000 0.024 0.176
#> SRR613006 2 0.1792 0.7870 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0703 0.8535 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1079023 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 5 0.3966 0.6542 0.000 0.000 0.336 0.000 0.664
#> SRR1478700 5 0.4779 -0.1490 0.388 0.000 0.000 0.024 0.588
#> SRR1081543 3 0.0162 0.8637 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1384754 3 0.1671 0.8442 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR612287 2 0.3246 0.7396 0.000 0.808 0.000 0.184 0.008
#> SRR1380317 4 0.4576 0.1889 0.000 0.004 0.456 0.536 0.004
#> SRR1315247 2 0.5633 0.2878 0.000 0.588 0.056 0.340 0.016
#> SRR1105344 2 0.2127 0.7959 0.000 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR658549 4 0.3596 0.7288 0.000 0.016 0.200 0.784 0.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.3246 0.7396 0.000 0.808 0.000 0.184 0.008
#> SRR1358520 2 0.6607 0.0341 0.000 0.460 0.168 0.364 0.008
#> SRR1419476 3 0.3210 0.6773 0.000 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1456075 5 0.2648 0.7993 0.000 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR1389474 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.3309 0.8812 0.836 0.000 0.000 0.036 0.128
#> SRR1334419 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR1417154 3 0.0162 0.8635 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1095985 5 0.3661 0.7339 0.000 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR1325771 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660272 2 0.4797 0.5479 0.000 0.676 0.040 0.280 0.004
#> SRR1332993 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR1311833 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808044 5 0.1836 0.6978 0.032 0.000 0.036 0.000 0.932
#> SRR1076916 3 0.4307 -0.2730 0.000 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR1356266 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0880 0.8253 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1456114 1 0.4181 0.7814 0.712 0.000 0.000 0.020 0.268
#> SRR1072948 3 0.0794 0.8618 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1472370 5 0.3177 0.7774 0.000 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1480176 5 0.2970 0.7977 0.004 0.000 0.168 0.000 0.828
#> SRR613843 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469192 5 0.4907 -0.4200 0.484 0.000 0.000 0.024 0.492
#> SRR1404555 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0162 0.8280 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR659533 4 0.3274 0.7098 0.000 0.000 0.220 0.780 0.000
#> SRR1362848 3 0.1582 0.8563 0.000 0.000 0.944 0.028 0.028
#> SRR1407492 4 0.3455 0.7241 0.000 0.008 0.208 0.784 0.000
#> SRR1455082 2 0.3913 0.5520 0.000 0.676 0.000 0.324 0.000
#> SRR658362 4 0.5271 0.7024 0.000 0.152 0.168 0.680 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.3642 0.7140 0.000 0.760 0.000 0.232 0.008
#> SRR1456375 3 0.2424 0.7896 0.000 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR818232 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 4 0.4450 -0.0167 0.000 0.000 0.488 0.508 0.004
#> SRR1474816 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 5 0.4803 -0.3790 0.488 0.000 0.004 0.012 0.496
#> SRR1088437 2 0.4713 0.4564 0.000 0.544 0.000 0.440 0.016
#> SRR1466400 2 0.0703 0.8213 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR658921 2 0.0290 0.8268 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR1090145 5 0.5415 0.7047 0.060 0.000 0.260 0.020 0.660
#> SRR1379324 1 0.2424 0.8626 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1345307 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.1197 0.8366 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1454891 4 0.4522 0.7328 0.000 0.080 0.176 0.744 0.000
#> SRR663185 4 0.5624 0.4982 0.000 0.264 0.096 0.632 0.008
#> SRR811819 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0162 0.8947 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR656758 2 0.0162 0.8273 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.1732 0.7989 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1472687 2 0.4016 0.6846 0.000 0.716 0.000 0.272 0.012
#> SRR1334291 2 0.0609 0.8256 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.4152 0.6618 0.000 0.692 0.000 0.296 0.012
#> SRR1368939 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443161 3 0.5449 0.5201 0.000 0.000 0.636 0.108 0.256
#> SRR614695 2 0.0703 0.8242 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1092372 1 0.1270 0.8744 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1474577 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR1406582 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR612779 2 0.0162 0.8275 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1089006 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR1354071 5 0.3636 0.7378 0.000 0.000 0.272 0.000 0.728
#> SRR1105463 5 0.2605 0.7997 0.000 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR811005 2 0.0162 0.8280 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1385319 1 0.1608 0.8647 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1325871 3 0.2260 0.8369 0.000 0.000 0.908 0.028 0.064
#> SRR1355415 5 0.2648 0.7996 0.000 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR1090861 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 3 0.4522 0.6811 0.000 0.000 0.736 0.196 0.068
#> SRR1470075 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR1091254 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 5 0.2513 0.7811 0.000 0.000 0.116 0.008 0.876
#> SRR1321165 1 0.3039 0.7297 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1092112 5 0.2690 0.7995 0.000 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR1417588 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 5 0.7361 0.4031 0.000 0.100 0.156 0.212 0.532
#> SRR1432106 2 0.4557 0.5235 0.000 0.584 0.000 0.404 0.012
#> SRR655756 2 0.1121 0.8184 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1458314 5 0.4827 -0.3994 0.476 0.000 0.000 0.020 0.504
#> SRR1318582 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 4 0.5859 0.2399 0.000 0.356 0.076 0.556 0.012
#> SRR1072749 5 0.2179 0.7806 0.000 0.000 0.112 0.000 0.888
#> SRR1078586 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 4 0.5527 0.1535 0.000 0.428 0.056 0.512 0.004
#> SRR1078834 2 0.4906 0.3750 0.000 0.592 0.024 0.380 0.004
#> SRR1417611 2 0.4659 0.3435 0.000 0.496 0.000 0.492 0.012
#> SRR1396840 1 0.4300 0.1232 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1465440 2 0.0510 0.8255 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1400530 2 0.0880 0.8219 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR614984 4 0.3242 0.7138 0.000 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR1324269 5 0.2488 0.7900 0.004 0.000 0.124 0.000 0.872
#> SRR1401491 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0992 0.8875 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1324349 4 0.6831 0.1506 0.000 0.416 0.092 0.440 0.052
#> SRR1345523 2 0.3246 0.7396 0.000 0.808 0.000 0.184 0.008
#> SRR1500846 5 0.4949 -0.3179 0.444 0.000 0.004 0.020 0.532
#> SRR661505 3 0.5335 0.5186 0.000 0.000 0.644 0.096 0.260
#> SRR1419062 5 0.4138 0.5792 0.000 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR1480131 5 0.5508 0.6010 0.244 0.000 0.120 0.000 0.636
#> SRR1421284 4 0.5610 0.6878 0.000 0.120 0.236 0.640 0.004
#> SRR1329624 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 4 0.5162 0.7012 0.000 0.148 0.160 0.692 0.000
#> SRR1083286 1 0.0290 0.8943 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1091890 3 0.2852 0.7101 0.000 0.000 0.828 0.172 0.000
#> SRR1347436 2 0.5547 0.0327 0.000 0.484 0.056 0.456 0.004
#> SRR1327473 5 0.4452 0.7184 0.000 0.000 0.272 0.032 0.696
#> SRR1338195 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0162 0.8275 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1457792 1 0.2260 0.8935 0.908 0.000 0.000 0.028 0.064
#> SRR658271 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.5001 0.3969 0.496 0.000 0.016 0.008 0.480
#> SRR1454842 3 0.4002 0.7738 0.000 0.000 0.796 0.120 0.084
#> SRR1322643 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR614887 3 0.1877 0.8404 0.000 0.000 0.924 0.012 0.064
#> SRR1354620 5 0.2648 0.7996 0.000 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR615056 4 0.2249 0.6282 0.000 0.096 0.000 0.896 0.008
#> SRR1105320 5 0.4800 0.6967 0.000 0.000 0.272 0.052 0.676
#> SRR1391529 1 0.2471 0.8149 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR663052 4 0.3455 0.7241 0.000 0.008 0.208 0.784 0.000
#> SRR1478834 1 0.2074 0.8446 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR812366 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 4 0.3530 0.7263 0.000 0.012 0.204 0.784 0.000
#> SRR613568 2 0.2230 0.7765 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR614095 4 0.3456 0.7320 0.000 0.016 0.184 0.800 0.000
#> SRR1103092 5 0.3471 0.7393 0.092 0.000 0.072 0.000 0.836
#> SRR1337155 5 0.6152 0.4601 0.000 0.000 0.324 0.152 0.524
#> SRR1475345 2 0.3318 0.7368 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR809089 2 0.0162 0.8275 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1446180 5 0.6429 0.4314 0.000 0.004 0.216 0.248 0.532
#> SRR1406372 2 0.3318 0.7083 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1339880 3 0.0703 0.8535 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1353136 3 0.3719 0.7911 0.000 0.000 0.816 0.116 0.068
#> SRR1093906 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.3388 0.7320 0.000 0.792 0.000 0.200 0.008
#> SRR1351104 1 0.3309 0.8812 0.836 0.000 0.000 0.036 0.128
#> SRR1363926 2 0.4178 0.6019 0.000 0.696 0.004 0.292 0.008
#> SRR1399861 4 0.3452 0.6794 0.000 0.000 0.244 0.756 0.000
#> SRR1338789 1 0.4141 0.6317 0.736 0.000 0.028 0.000 0.236
#> SRR1421420 3 0.0290 0.8639 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1420832 2 0.3750 0.7111 0.000 0.756 0.000 0.232 0.012
#> SRR1476231 1 0.1774 0.8954 0.932 0.000 0.000 0.016 0.052
#> SRR1352870 4 0.3519 0.7090 0.000 0.000 0.216 0.776 0.008
#> SRR1315041 2 0.5132 0.4684 0.000 0.612 0.036 0.344 0.008
#> SRR661877 2 0.4565 0.5188 0.000 0.580 0.000 0.408 0.012
#> SRR1443268 5 0.2358 0.7712 0.000 0.000 0.104 0.008 0.888
#> SRR1416617 3 0.0162 0.8642 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1102443 1 0.5789 0.4691 0.588 0.000 0.104 0.004 0.304
#> SRR655672 4 0.3455 0.7241 0.000 0.008 0.208 0.784 0.000
#> SRR1420006 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0162 0.8275 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR613819 4 0.3995 0.7348 0.000 0.044 0.180 0.776 0.000
#> SRR1469432 2 0.0290 0.8270 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR660907 2 0.3282 0.7381 0.000 0.804 0.000 0.188 0.008
#> SRR1465092 2 0.4047 0.5441 0.000 0.676 0.000 0.320 0.004
#> SRR1470727 5 0.2127 0.7773 0.000 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR1339153 3 0.3970 0.7742 0.000 0.000 0.800 0.104 0.096
#> SRR1472749 3 0.0703 0.8607 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1414379 4 0.5531 0.6874 0.000 0.168 0.164 0.664 0.004
#> SRR1431326 1 0.1469 0.8966 0.948 0.000 0.000 0.016 0.036
#> SRR1487278 2 0.0162 0.8275 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1098312 3 0.1750 0.8526 0.000 0.000 0.936 0.028 0.036
#> SRR810273 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0703 0.8214 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR614467 4 0.3455 0.7241 0.000 0.008 0.208 0.784 0.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088606 5 0.3661 0.7339 0.000 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR1479699 3 0.5820 0.5636 0.000 0.000 0.612 0.196 0.192
#> SRR1403589 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.4895 0.3736 0.000 0.528 0.012 0.452 0.008
#> SRR1359803 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.2304 0.7903 0.000 0.892 0.000 0.100 0.008
#> SRR1471222 2 0.4397 0.2863 0.000 0.564 0.000 0.432 0.004
#> SRR1378992 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR659427 3 0.5516 0.5911 0.000 0.000 0.640 0.232 0.128
#> SRR1096638 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR1466619 2 0.2929 0.7217 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR659307 4 0.3366 0.7021 0.000 0.000 0.232 0.768 0.000
#> SRR1439994 5 0.2389 0.7850 0.000 0.000 0.116 0.004 0.880
#> SRR1454931 1 0.5639 0.1300 0.524 0.000 0.080 0.000 0.396
#> SRR1332928 5 0.2605 0.8000 0.000 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR658621 4 0.3586 0.7330 0.000 0.020 0.188 0.792 0.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 5 0.2077 0.7555 0.000 0.000 0.084 0.008 0.908
#> SRR1374270 3 0.4219 0.7616 0.000 0.000 0.780 0.116 0.104
#> SRR1470947 2 0.3355 0.7378 0.000 0.804 0.000 0.184 0.012
#> SRR1365598 2 0.2424 0.7685 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR662787 2 0.4802 0.3584 0.000 0.504 0.004 0.480 0.012
#> SRR1408727 4 0.5363 0.1251 0.000 0.372 0.052 0.572 0.004
#> SRR1456274 5 0.4275 0.7166 0.000 0.000 0.284 0.020 0.696
#> SRR817744 1 0.0162 0.8947 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1478744 2 0.3596 0.7242 0.000 0.776 0.000 0.212 0.012
#> SRR1387379 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 5 0.4219 0.5076 0.000 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR1374198 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 5 0.2329 0.7910 0.000 0.000 0.124 0.000 0.876
#> SRR820049 3 0.4057 0.7717 0.000 0.000 0.792 0.120 0.088
#> SRR1375290 3 0.4647 0.7193 0.000 0.000 0.736 0.172 0.092
#> SRR818999 5 0.2605 0.7997 0.000 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR1390242 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454629 5 0.5441 0.6292 0.000 0.000 0.280 0.096 0.624
#> SRR1332187 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR603365 3 0.4612 0.6960 0.000 0.000 0.736 0.084 0.180
#> SRR657833 2 0.1270 0.8066 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1436207 2 0.5152 0.2658 0.000 0.572 0.012 0.392 0.024
#> SRR1488017 1 0.1043 0.8811 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR612947 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.4651 0.6639 0.608 0.000 0.000 0.020 0.372
#> SRR1364761 2 0.0162 0.8275 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1308086 3 0.1608 0.8460 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1441868 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR1485380 5 0.3876 0.6845 0.000 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR1073705 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR615032 2 0.1557 0.8129 0.000 0.940 0.000 0.052 0.008
#> SRR1452356 4 0.3936 0.7304 0.000 0.052 0.144 0.800 0.004
#> SRR1442983 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 4 0.4035 0.7311 0.000 0.060 0.156 0.784 0.000
#> SRR1332816 1 0.5166 0.6781 0.660 0.000 0.032 0.024 0.284
#> SRR612299 2 0.2516 0.7393 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309403 5 0.5936 0.6502 0.000 0.040 0.264 0.068 0.628
#> SRR1498395 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079998 5 0.2516 0.7981 0.000 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1498885 2 0.4537 0.5383 0.000 0.592 0.000 0.396 0.012
#> SRR1337215 2 0.5785 0.2995 0.000 0.564 0.080 0.348 0.008
#> SRR1414749 3 0.0290 0.8636 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1365963 5 0.2424 0.7937 0.000 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1368030 4 0.2929 0.5621 0.000 0.152 0.000 0.840 0.008
#> SRR1419760 4 0.5940 0.1339 0.000 0.436 0.080 0.476 0.008
#> SRR1381841 1 0.4030 0.4622 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR821388 3 0.4100 0.6903 0.000 0.000 0.764 0.192 0.044
#> SRR657623 4 0.3455 0.4758 0.000 0.208 0.000 0.784 0.008
#> SRR1094241 3 0.3962 0.7758 0.000 0.000 0.800 0.112 0.088
#> SRR819583 5 0.3895 0.6850 0.000 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR1096149 1 0.4546 0.7470 0.668 0.000 0.000 0.028 0.304
#> SRR1342829 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811333 5 0.4030 0.6437 0.000 0.000 0.352 0.000 0.648
#> SRR1311666 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.1270 0.8065 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1446436 2 0.0794 0.8229 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0162 0.8275 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0703 0.8603 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR811653 3 0.3491 0.6954 0.000 0.000 0.768 0.228 0.004
#> SRR1311348 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.4674 0.4975 0.000 0.568 0.000 0.416 0.016
#> SRR1435442 2 0.0963 0.8154 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.3282 0.7381 0.000 0.804 0.000 0.188 0.008
#> SRR1319520 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR1444763 1 0.1478 0.8669 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1415026 2 0.3209 0.7412 0.000 0.812 0.000 0.180 0.008
#> SRR1416596 2 0.4289 0.6004 0.000 0.708 0.012 0.272 0.008
#> SRR1485499 2 0.3318 0.7401 0.000 0.808 0.000 0.180 0.012
#> SRR1316078 2 0.2753 0.7689 0.000 0.856 0.000 0.136 0.008
#> SRR663465 4 0.3439 0.5171 0.000 0.188 0.004 0.800 0.008
#> SRR1310094 2 0.5214 0.4565 0.000 0.604 0.040 0.348 0.008
#> SRR663537 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR1453950 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR1087875 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR613318 3 0.5107 0.4086 0.000 0.000 0.596 0.356 0.048
#> SRR1332694 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.3177 0.7036 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1311622 3 0.1121 0.8561 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1500931 5 0.4138 0.5827 0.000 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR1387494 3 0.0794 0.8595 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1379175 4 0.8415 0.3391 0.000 0.300 0.212 0.320 0.168
#> SRR1401909 5 0.2605 0.7997 0.000 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR1440541 2 0.5783 0.2445 0.000 0.540 0.000 0.360 0.100
#> SRR1068832 5 0.2852 0.7959 0.000 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR1376640 2 0.2929 0.7028 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1085712 2 0.3246 0.7404 0.000 0.808 0.000 0.184 0.008
#> SRR1082283 5 0.2719 0.7988 0.004 0.000 0.144 0.000 0.852
#> SRR1084276 5 0.2629 0.7971 0.004 0.000 0.136 0.000 0.860
#> SRR1353262 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437035 5 0.3636 0.7378 0.000 0.000 0.272 0.000 0.728
#> SRR1396877 5 0.2648 0.7997 0.000 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR1443026 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.1282 0.8964 0.952 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1436822 2 0.5314 0.2568 0.000 0.548 0.044 0.404 0.004
#> SRR1101128 5 0.3534 0.7473 0.000 0.000 0.256 0.000 0.744
#> SRR1363886 2 0.3779 0.7100 0.000 0.752 0.000 0.236 0.012
#> SRR612983 2 0.3318 0.7363 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1394366 2 0.0162 0.8275 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1093218 3 0.1410 0.8514 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1077090 5 0.2516 0.7981 0.000 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1327430 4 0.5124 0.2504 0.000 0.324 0.040 0.628 0.008
#> SRR1088958 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR1486931 2 0.0162 0.8275 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 5 0.4359 0.2467 0.272 0.000 0.004 0.020 0.704
#> SRR1355705 2 0.3246 0.7396 0.000 0.808 0.000 0.184 0.008
#> SRR614335 4 0.3455 0.7241 0.000 0.008 0.208 0.784 0.000
#> SRR660534 2 0.3561 0.5782 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.5769 0.2438 0.000 0.540 0.072 0.380 0.008
#> SRR1456401 2 0.3944 0.6309 0.000 0.720 0.004 0.272 0.004
#> SRR1086393 5 0.5071 -0.2618 0.424 0.000 0.000 0.036 0.540
#> SRR1351521 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093100 4 0.4430 0.6817 0.000 0.036 0.256 0.708 0.000
#> SRR1309382 1 0.0510 0.8906 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1089375 5 0.3586 0.7449 0.000 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1499482 2 0.0703 0.8241 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR614719 4 0.3805 0.7334 0.000 0.032 0.184 0.784 0.000
#> SRR1081473 5 0.4060 0.6261 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR1087415 1 0.2124 0.8944 0.916 0.000 0.000 0.028 0.056
#> SRR1088217 5 0.2605 0.7997 0.000 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR808496 4 0.4725 0.7311 0.000 0.076 0.188 0.732 0.004
#> SRR1336463 2 0.3333 0.6985 0.000 0.788 0.000 0.208 0.004
#> SRR612359 4 0.4078 0.7301 0.000 0.068 0.148 0.784 0.000
#> SRR1444412 5 0.2921 0.7906 0.020 0.000 0.124 0.000 0.856
#> SRR1074116 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 5 0.3661 0.7361 0.000 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR1337886 2 0.4327 0.5586 0.000 0.632 0.000 0.360 0.008
#> SRR813632 1 0.3003 0.7890 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188
#> SRR1101591 5 0.3707 0.6876 0.000 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR1089713 5 0.3661 0.7339 0.000 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR1453127 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 5 0.2732 0.7984 0.000 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR1313831 1 0.0324 0.8948 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1315434 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814747 2 0.4350 0.5206 0.000 0.588 0.000 0.408 0.004
#> SRR1358539 1 0.0162 0.8947 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1367807 1 0.3355 0.8800 0.832 0.000 0.000 0.036 0.132
#> SRR1365791 3 0.1908 0.8082 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1081519 5 0.2891 0.7953 0.000 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR614707 2 0.4972 0.4239 0.000 0.612 0.032 0.352 0.004
#> SRR1094027 1 0.1043 0.8970 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1489092 5 0.3730 0.7244 0.000 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR1079502 5 0.3752 0.7189 0.000 0.000 0.292 0.000 0.708
#> SRR1457814 3 0.3999 0.5056 0.000 0.000 0.656 0.344 0.000
#> SRR1455127 2 0.4016 0.6852 0.000 0.716 0.000 0.272 0.012
#> SRR615081 2 0.0510 0.8241 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1327855 3 0.3774 0.5119 0.000 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1417873 2 0.4748 0.3400 0.000 0.492 0.000 0.492 0.016
#> SRR1394125 3 0.3039 0.6661 0.000 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1488388 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR1401122 4 0.4659 -0.3414 0.000 0.488 0.000 0.500 0.012
#> SRR612383 4 0.3242 0.7138 0.000 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.1608 0.8067 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR612851 4 0.3760 0.7292 0.000 0.028 0.188 0.784 0.000
#> SRR1086349 1 0.2676 0.8904 0.884 0.000 0.000 0.036 0.080
#> SRR812837 2 0.3282 0.7381 0.000 0.804 0.000 0.188 0.008
#> SRR1340010 3 0.0290 0.8628 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1475885 5 0.5160 0.6926 0.000 0.008 0.256 0.064 0.672
#> SRR1376334 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.3146 0.8838 0.844 0.000 0.000 0.028 0.128
#> SRR1347042 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612323 4 0.3242 0.7138 0.000 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.1914 0.8952 0.924 0.000 0.000 0.016 0.060
#> SRR1465608 5 0.2233 0.7747 0.004 0.000 0.104 0.000 0.892
#> SRR1101808 2 0.0162 0.8275 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.2852 0.7298 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1078439 3 0.4891 0.7014 0.000 0.000 0.716 0.172 0.112
#> SRR2165527 2 0.4470 0.5723 0.000 0.616 0.000 0.372 0.012
#> SRR1351147 5 0.4780 0.7083 0.000 0.000 0.248 0.060 0.692
#> SRR1313536 2 0.0162 0.8273 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1070308 2 0.8296 -0.1951 0.000 0.356 0.144 0.216 0.284
#> SRR1403110 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.4306 -0.2174 0.000 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR1456862 1 0.3551 0.8196 0.772 0.000 0.000 0.008 0.220
#> SRR1074622 1 0.3655 0.8650 0.804 0.000 0.000 0.036 0.160
#> SRR1465847 5 0.2561 0.7984 0.000 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR1443376 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0703 0.8605 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1075579 1 0.1981 0.8951 0.924 0.000 0.000 0.028 0.048
#> SRR1090881 4 0.3786 0.7281 0.000 0.016 0.204 0.776 0.004
#> SRR612251 4 0.3857 0.5548 0.000 0.000 0.312 0.688 0.000
#> SRR1418581 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR658045 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613214 4 0.3242 0.7138 0.000 0.000 0.216 0.784 0.000
#> SRR613078 2 0.1851 0.7835 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1472998 5 0.2561 0.7984 0.000 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR1433452 2 0.0162 0.8275 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1101957 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR1487993 3 0.0609 0.8558 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1465983 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.5256 0.3924 0.000 0.592 0.048 0.356 0.004
#> SRR1417547 2 0.4533 0.4538 0.000 0.544 0.000 0.448 0.008
#> SRR659389 2 0.3053 0.7526 0.000 0.828 0.000 0.164 0.008
#> SRR1490270 2 0.0404 0.8268 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1398207 5 0.2605 0.7997 0.000 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR1358755 5 0.2605 0.7997 0.000 0.000 0.148 0.000 0.852
#> SRR1078903 4 0.3661 0.5377 0.000 0.276 0.000 0.724 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.2825 0.8860 0.860 0.000 0.000 0.016 0.124
#> SRR615982 2 0.4074 0.4721 0.000 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR1480431 2 0.3003 0.7304 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1429825 2 0.5258 0.2595 0.000 0.548 0.040 0.408 0.004
#> SRR1102393 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 5 0.3661 0.7361 0.000 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR808351 1 0.4540 0.7082 0.640 0.000 0.000 0.020 0.340
#> SRR1317513 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.3730 0.5091 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1081910 5 0.3074 0.7866 0.000 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1086611 4 0.6357 0.1794 0.000 0.420 0.088 0.468 0.024
#> SRR1392571 2 0.3966 0.5234 0.000 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1311441 1 0.3165 0.8840 0.848 0.000 0.000 0.036 0.116
#> SRR808152 1 0.4894 0.6496 0.612 0.000 0.000 0.036 0.352
#> SRR657313 3 0.4010 0.7744 0.000 0.000 0.796 0.116 0.088
#> SRR1433131 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0162 0.8277 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1500598 2 0.2358 0.7890 0.000 0.888 0.000 0.104 0.008
#> SRR1379343 2 0.0609 0.8251 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1389108 1 0.3262 0.8823 0.840 0.000 0.000 0.036 0.124
#> SRR1376228 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0162 0.8947 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.2074 0.8181 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR613557 4 0.3707 0.6460 0.000 0.000 0.284 0.716 0.000
#> SRR809831 5 0.2561 0.7984 0.000 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR1429387 3 0.0000 0.8642 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0703 0.8965 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1071644 1 0.0000 0.8944 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.3109 0.6879 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1072031 2 0.0000 0.8280 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 4 0.5331 0.5593 0.000 0.268 0.092 0.640 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 3 0.0865 0.86811 0.000 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR1404105 6 0.3782 0.81889 0.412 0.000 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR2164936 2 0.1387 0.78486 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1472057 5 0.3901 0.78370 0.000 0.000 0.136 0.000 0.768 0.096
#> SRR614491 3 0.4251 0.75947 0.000 0.000 0.760 0.144 0.020 0.076
#> SRR1069376 6 0.3782 0.81889 0.412 0.000 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR811964 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1361415 4 0.5574 -0.20363 0.000 0.440 0.000 0.460 0.020 0.080
#> SRR1345715 6 0.3747 0.82471 0.396 0.000 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR1328073 5 0.6975 0.01761 0.000 0.008 0.376 0.160 0.388 0.068
#> SRR1394209 3 0.5909 0.26499 0.000 0.004 0.516 0.344 0.020 0.116
#> SRR1474018 2 0.5050 0.43357 0.000 0.568 0.000 0.368 0.020 0.044
#> SRR1099809 5 0.0713 0.80909 0.000 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1500555 4 0.6703 0.35631 0.000 0.020 0.308 0.476 0.032 0.164
#> SRR1354363 6 0.5366 0.70289 0.292 0.000 0.000 0.000 0.144 0.564
#> SRR1391619 3 0.3261 0.81990 0.000 0.000 0.820 0.012 0.024 0.144
#> SRR1307997 2 0.4064 0.59763 0.000 0.720 0.000 0.236 0.004 0.040
#> SRR663124 4 0.4456 0.53634 0.000 0.000 0.276 0.672 0.008 0.044
#> SRR1334670 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 4 0.4456 0.53634 0.000 0.000 0.276 0.672 0.008 0.044
#> SRR1092727 4 0.4098 0.50158 0.000 0.220 0.036 0.732 0.000 0.012
#> SRR1364013 4 0.5266 0.12118 0.000 0.316 0.000 0.580 0.008 0.096
#> SRR1468553 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.0632 0.87492 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1420169 5 0.3352 0.80524 0.000 0.000 0.112 0.000 0.816 0.072
#> SRR1442800 2 0.8041 -0.06682 0.000 0.384 0.056 0.264 0.176 0.120
#> SRR1359214 2 0.4976 0.34160 0.000 0.520 0.000 0.428 0.020 0.032
#> SRR1499849 5 0.0713 0.80909 0.000 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1500030 3 0.0405 0.87864 0.000 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1093053 3 0.3988 0.79756 0.000 0.000 0.784 0.036 0.040 0.140
#> SRR1399843 3 0.4919 0.71349 0.000 0.000 0.708 0.152 0.032 0.108
#> SRR1380231 5 0.3710 0.67829 0.000 0.000 0.292 0.000 0.696 0.012
#> SRR809470 5 0.0713 0.80909 0.000 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR614239 4 0.4456 0.53634 0.000 0.000 0.276 0.672 0.008 0.044
#> SRR613939 2 0.2118 0.76018 0.000 0.888 0.000 0.104 0.000 0.008
#> SRR612971 2 0.0363 0.79547 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1490204 2 0.2834 0.74057 0.000 0.848 0.000 0.128 0.008 0.016
#> SRR811357 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1471672 6 0.4986 0.65087 0.444 0.000 0.000 0.000 0.068 0.488
#> SRR613006 2 0.2191 0.75004 0.000 0.876 0.000 0.120 0.000 0.004
#> SRR1469570 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1457354 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1362906 3 0.0603 0.87685 0.000 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1079023 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1096736 5 0.4498 0.21896 0.000 0.000 0.428 0.004 0.544 0.024
#> SRR1478700 6 0.5449 0.37674 0.120 0.000 0.000 0.000 0.424 0.456
#> SRR1081543 3 0.1007 0.86395 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1384754 3 0.1296 0.86781 0.000 0.000 0.948 0.004 0.004 0.044
#> SRR612287 2 0.5133 0.49287 0.000 0.620 0.000 0.280 0.012 0.088
#> SRR1380317 4 0.5635 0.36642 0.000 0.020 0.360 0.524 0.000 0.096
#> SRR1315247 2 0.5347 0.16297 0.000 0.500 0.004 0.412 0.004 0.080
#> SRR1105344 2 0.2376 0.77234 0.000 0.884 0.000 0.096 0.012 0.008
#> SRR658549 4 0.4456 0.53634 0.000 0.000 0.276 0.672 0.008 0.044
#> SRR1480240 1 0.0146 0.80232 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1084816 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR612551 2 0.5133 0.49287 0.000 0.620 0.000 0.280 0.012 0.088
#> SRR1358520 4 0.6906 0.51133 0.000 0.220 0.244 0.456 0.000 0.080
#> SRR1419476 3 0.2954 0.82538 0.000 0.000 0.844 0.000 0.048 0.108
#> SRR1456075 5 0.1701 0.81173 0.000 0.000 0.072 0.000 0.920 0.008
#> SRR1389474 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1367005 6 0.3774 0.81898 0.408 0.000 0.000 0.000 0.000 0.592
#> SRR1334419 6 0.3747 0.82471 0.396 0.000 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR1417154 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095985 5 0.3202 0.78746 0.000 0.000 0.176 0.000 0.800 0.024
#> SRR1325771 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660272 2 0.4467 0.55509 0.000 0.692 0.000 0.236 0.004 0.068
#> SRR1332993 6 0.4334 0.80741 0.408 0.000 0.000 0.000 0.024 0.568
#> SRR1311833 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR808044 5 0.3041 0.71374 0.064 0.000 0.012 0.000 0.856 0.068
#> SRR1076916 3 0.4131 0.25610 0.000 0.000 0.600 0.000 0.384 0.016
#> SRR1356266 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.2624 0.75192 0.000 0.856 0.000 0.124 0.000 0.020
#> SRR1456114 6 0.5802 0.59731 0.256 0.000 0.000 0.000 0.244 0.500
#> SRR1072948 3 0.0937 0.86906 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1472370 5 0.4095 0.77337 0.000 0.000 0.152 0.000 0.748 0.100
#> SRR1480176 5 0.0935 0.81167 0.000 0.000 0.032 0.000 0.964 0.004
#> SRR613843 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1469192 6 0.5662 0.48963 0.160 0.000 0.000 0.000 0.364 0.476
#> SRR1404555 3 0.0146 0.87896 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0436 0.79630 0.000 0.988 0.000 0.004 0.004 0.004
#> SRR659533 4 0.4516 0.53467 0.000 0.000 0.276 0.668 0.008 0.048
#> SRR1362848 3 0.2006 0.84128 0.000 0.000 0.904 0.080 0.016 0.000
#> SRR1407492 4 0.4456 0.53634 0.000 0.000 0.276 0.672 0.008 0.044
#> SRR1455082 2 0.4147 0.53862 0.000 0.668 0.000 0.304 0.004 0.024
#> SRR658362 4 0.4890 0.55892 0.000 0.052 0.260 0.664 0.004 0.020
#> SRR810921 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR662823 2 0.5408 0.46226 0.000 0.584 0.000 0.308 0.020 0.088
#> SRR1456375 3 0.3381 0.73161 0.000 0.000 0.800 0.000 0.156 0.044
#> SRR818232 1 0.0146 0.80232 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1454868 3 0.5145 0.06914 0.000 0.000 0.484 0.432 0.000 0.084
#> SRR1474816 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1342002 6 0.5827 0.53853 0.208 0.000 0.000 0.000 0.316 0.476
#> SRR1088437 4 0.5197 -0.03316 0.000 0.388 0.000 0.532 0.008 0.072
#> SRR1466400 2 0.1531 0.78191 0.000 0.928 0.000 0.068 0.000 0.004
#> SRR658921 2 0.0891 0.79347 0.000 0.968 0.000 0.024 0.000 0.008
#> SRR1499873 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1101373 6 0.3747 0.82471 0.396 0.000 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR1090145 5 0.4048 0.79500 0.036 0.000 0.140 0.012 0.788 0.024
#> SRR1379324 1 0.2282 0.71020 0.888 0.000 0.000 0.000 0.088 0.024
#> SRR1345307 2 0.0146 0.79619 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1396166 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454891 4 0.3633 0.55724 0.000 0.000 0.252 0.732 0.004 0.012
#> SRR663185 4 0.3620 0.35677 0.000 0.248 0.000 0.736 0.008 0.008
#> SRR811819 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0858 0.79465 0.000 0.968 0.000 0.028 0.000 0.004
#> SRR1474351 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.1972 0.77697 0.000 0.916 0.000 0.056 0.004 0.024
#> SRR1472687 2 0.5579 0.41854 0.000 0.536 0.000 0.352 0.020 0.092
#> SRR1334291 2 0.2373 0.76314 0.000 0.888 0.000 0.084 0.004 0.024
#> SRR1415153 2 0.0291 0.79633 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1323271 2 0.4607 0.52493 0.000 0.628 0.000 0.328 0.020 0.024
#> SRR1368939 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1443161 3 0.5824 0.55706 0.000 0.000 0.592 0.032 0.220 0.156
#> SRR614695 2 0.1219 0.78873 0.000 0.948 0.000 0.048 0.004 0.000
#> SRR1092372 1 0.1700 0.72846 0.916 0.000 0.000 0.000 0.080 0.004
#> SRR1474577 6 0.3747 0.82471 0.396 0.000 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR1406582 6 0.3747 0.82471 0.396 0.000 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR612779 2 0.0405 0.79602 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1089006 6 0.3747 0.82471 0.396 0.000 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR1354071 5 0.2595 0.79858 0.000 0.000 0.160 0.000 0.836 0.004
#> SRR1105463 5 0.1074 0.81049 0.000 0.000 0.028 0.000 0.960 0.012
#> SRR811005 2 0.0291 0.79660 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1385319 1 0.1806 0.72050 0.908 0.000 0.000 0.000 0.088 0.004
#> SRR1325871 3 0.2588 0.83706 0.000 0.000 0.860 0.004 0.012 0.124
#> SRR1355415 5 0.3072 0.80737 0.000 0.000 0.076 0.000 0.840 0.084
#> SRR1090861 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 3 0.3428 0.76164 0.000 0.000 0.808 0.152 0.024 0.016
#> SRR1470075 6 0.3774 0.81898 0.408 0.000 0.000 0.000 0.000 0.592
#> SRR1091254 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 5 0.1780 0.79208 0.000 0.000 0.028 0.000 0.924 0.048
#> SRR1321165 1 0.2854 0.55233 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1092112 5 0.0937 0.81387 0.000 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 5 0.6989 0.51633 0.000 0.060 0.124 0.176 0.564 0.076
#> SRR1432106 2 0.5272 0.23746 0.000 0.468 0.000 0.460 0.020 0.052
#> SRR655756 2 0.3492 0.71534 0.000 0.788 0.000 0.176 0.004 0.032
#> SRR1458314 5 0.5662 -0.36537 0.132 0.000 0.004 0.000 0.436 0.428
#> SRR1318582 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1080484 4 0.4105 0.37782 0.000 0.216 0.000 0.732 0.008 0.044
#> SRR1072749 5 0.1780 0.79208 0.000 0.000 0.028 0.000 0.924 0.048
#> SRR1078586 1 0.0405 0.79757 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1400333 2 0.5069 0.12869 0.000 0.484 0.000 0.440 0.000 0.076
#> SRR1078834 2 0.4774 0.39200 0.000 0.600 0.000 0.332 0.000 0.068
#> SRR1417611 4 0.5260 0.05653 0.000 0.356 0.000 0.552 0.008 0.084
#> SRR1396840 5 0.3652 0.42175 0.324 0.000 0.000 0.000 0.672 0.004
#> SRR1465440 2 0.1679 0.77930 0.000 0.936 0.000 0.036 0.012 0.016
#> SRR1400530 2 0.1237 0.79181 0.000 0.956 0.000 0.020 0.004 0.020
#> SRR614984 4 0.4456 0.53634 0.000 0.000 0.276 0.672 0.008 0.044
#> SRR1324269 5 0.0713 0.80909 0.000 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1401491 2 0.0146 0.79655 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.1644 0.73432 0.920 0.000 0.000 0.000 0.076 0.004
#> SRR1324349 4 0.8277 0.28877 0.000 0.284 0.092 0.328 0.208 0.088
#> SRR1345523 2 0.4973 0.52344 0.000 0.648 0.000 0.256 0.012 0.084
#> SRR1500846 5 0.5469 -0.23373 0.108 0.000 0.004 0.000 0.484 0.404
#> SRR661505 3 0.5088 0.59520 0.000 0.000 0.632 0.000 0.200 0.168
#> SRR1419062 5 0.4400 0.50772 0.000 0.000 0.376 0.000 0.592 0.032
#> SRR1480131 5 0.1565 0.79921 0.028 0.000 0.028 0.000 0.940 0.004
#> SRR1421284 4 0.5343 0.53957 0.000 0.068 0.280 0.616 0.000 0.036
#> SRR1329624 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 4 0.4367 0.58765 0.000 0.096 0.160 0.736 0.000 0.008
#> SRR1083286 1 0.2442 0.66062 0.852 0.000 0.000 0.000 0.144 0.004
#> SRR1091890 3 0.2219 0.78576 0.000 0.000 0.864 0.136 0.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.4977 0.29274 0.000 0.552 0.000 0.372 0.000 0.076
#> SRR1327473 5 0.4359 0.76460 0.000 0.000 0.160 0.036 0.752 0.052
#> SRR1338195 3 0.0146 0.87896 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.1320 0.78482 0.000 0.948 0.000 0.016 0.000 0.036
#> SRR1457792 1 0.3868 -0.65554 0.508 0.000 0.000 0.000 0.000 0.492
#> SRR658271 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1339597 5 0.4207 0.53437 0.144 0.000 0.004 0.000 0.748 0.104
#> SRR1454842 3 0.3971 0.79771 0.000 0.000 0.796 0.072 0.032 0.100
#> SRR1322643 6 0.3747 0.82471 0.396 0.000 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR614887 3 0.1714 0.84904 0.000 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1354620 5 0.2905 0.80646 0.000 0.000 0.064 0.000 0.852 0.084
#> SRR615056 4 0.1719 0.56444 0.000 0.008 0.000 0.928 0.008 0.056
#> SRR1105320 5 0.5578 0.67153 0.000 0.000 0.168 0.108 0.656 0.068
#> SRR1391529 1 0.3565 0.45841 0.716 0.000 0.004 0.000 0.276 0.004
#> SRR663052 4 0.4456 0.53634 0.000 0.000 0.276 0.672 0.008 0.044
#> SRR1478834 1 0.3426 0.46174 0.720 0.000 0.000 0.000 0.276 0.004
#> SRR812366 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1435330 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0146 0.79611 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1389157 4 0.4456 0.53634 0.000 0.000 0.276 0.672 0.008 0.044
#> SRR613568 2 0.2803 0.74670 0.000 0.864 0.000 0.084 0.004 0.048
#> SRR614095 4 0.4283 0.55356 0.000 0.000 0.244 0.704 0.008 0.044
#> SRR1103092 5 0.0820 0.80285 0.012 0.000 0.016 0.000 0.972 0.000
#> SRR1337155 5 0.7279 0.18747 0.000 0.000 0.304 0.140 0.388 0.168
#> SRR1475345 2 0.3984 0.61569 0.000 0.736 0.000 0.224 0.012 0.028
#> SRR809089 2 0.1657 0.78610 0.000 0.928 0.000 0.056 0.000 0.016
#> SRR1446180 5 0.7204 0.28298 0.000 0.000 0.132 0.256 0.428 0.184
#> SRR1406372 2 0.3165 0.72437 0.000 0.836 0.000 0.116 0.008 0.040
#> SRR1339880 3 0.0603 0.87685 0.000 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1353136 3 0.3975 0.80155 0.000 0.000 0.784 0.064 0.020 0.132
#> SRR1093906 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.5315 0.47622 0.000 0.584 0.000 0.316 0.016 0.084
#> SRR1351104 6 0.3899 0.81955 0.404 0.000 0.000 0.000 0.004 0.592
#> SRR1363926 2 0.4540 0.50211 0.000 0.632 0.000 0.324 0.008 0.036
#> SRR1399861 4 0.4409 0.52021 0.000 0.000 0.288 0.664 0.004 0.044
#> SRR1338789 1 0.4671 0.40015 0.676 0.000 0.072 0.000 0.244 0.008
#> SRR1421420 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.5373 0.47471 0.000 0.600 0.000 0.288 0.020 0.092
#> SRR1476231 1 0.3647 -0.22863 0.640 0.000 0.000 0.000 0.000 0.360
#> SRR1352870 4 0.5357 0.47839 0.000 0.000 0.280 0.592 0.008 0.120
#> SRR1315041 2 0.5434 0.40432 0.000 0.592 0.016 0.308 0.008 0.076
#> SRR661877 4 0.5567 -0.17287 0.000 0.424 0.000 0.476 0.020 0.080
#> SRR1443268 5 0.1780 0.79208 0.000 0.000 0.028 0.000 0.924 0.048
#> SRR1416617 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102443 5 0.5087 0.29593 0.332 0.000 0.016 0.000 0.592 0.060
#> SRR655672 4 0.4456 0.53634 0.000 0.000 0.276 0.672 0.008 0.044
#> SRR1420006 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.1075 0.78879 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR613819 4 0.4047 0.55713 0.000 0.000 0.244 0.716 0.004 0.036
#> SRR1469432 2 0.0551 0.79682 0.000 0.984 0.000 0.004 0.004 0.008
#> SRR660907 2 0.5089 0.49414 0.000 0.624 0.000 0.280 0.012 0.084
#> SRR1465092 2 0.4443 0.56862 0.000 0.696 0.000 0.232 0.004 0.068
#> SRR1470727 5 0.1261 0.80168 0.000 0.000 0.024 0.000 0.952 0.024
#> SRR1339153 3 0.3559 0.80861 0.000 0.000 0.800 0.012 0.036 0.152
#> SRR1472749 3 0.0146 0.87896 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1414379 4 0.5007 0.56105 0.000 0.136 0.100 0.712 0.000 0.052
#> SRR1431326 1 0.3706 -0.31909 0.620 0.000 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1487278 2 0.1092 0.79219 0.000 0.960 0.000 0.020 0.000 0.020
#> SRR1098312 3 0.1807 0.85395 0.000 0.000 0.920 0.060 0.020 0.000
#> SRR810273 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1376000 2 0.1858 0.77691 0.000 0.912 0.000 0.076 0.000 0.012
#> SRR614467 4 0.4394 0.53701 0.000 0.000 0.276 0.676 0.008 0.040
#> SRR811471 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0146 0.87888 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1088606 5 0.3276 0.79896 0.000 0.000 0.132 0.000 0.816 0.052
#> SRR1479699 3 0.5429 0.44282 0.000 0.000 0.616 0.272 0.044 0.068
#> SRR1403589 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR812625 4 0.4865 0.00885 0.000 0.372 0.000 0.572 0.008 0.048
#> SRR1359803 1 0.0405 0.79751 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1338988 2 0.4697 0.55141 0.000 0.668 0.000 0.260 0.012 0.060
#> SRR1471222 4 0.4446 0.02161 0.000 0.424 0.000 0.552 0.008 0.016
#> SRR1378992 6 0.3747 0.82471 0.396 0.000 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR659427 3 0.6577 0.43825 0.000 0.008 0.548 0.232 0.084 0.128
#> SRR1096638 6 0.3782 0.81889 0.412 0.000 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1466619 2 0.2790 0.74670 0.000 0.856 0.000 0.116 0.008 0.020
#> SRR659307 4 0.4476 0.53238 0.000 0.000 0.280 0.668 0.008 0.044
#> SRR1439994 5 0.1421 0.81017 0.000 0.000 0.028 0.000 0.944 0.028
#> SRR1454931 5 0.3697 0.54749 0.248 0.000 0.016 0.000 0.732 0.004
#> SRR1332928 5 0.2930 0.81217 0.000 0.000 0.124 0.000 0.840 0.036
#> SRR658621 4 0.4411 0.53747 0.000 0.000 0.276 0.672 0.004 0.048
#> SRR1095840 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 5 0.1765 0.78878 0.000 0.000 0.024 0.000 0.924 0.052
#> SRR1374270 3 0.4385 0.78240 0.000 0.000 0.760 0.084 0.032 0.124
#> SRR1470947 2 0.5208 0.48886 0.000 0.612 0.000 0.288 0.016 0.084
#> SRR1365598 2 0.3183 0.72389 0.000 0.828 0.000 0.128 0.004 0.040
#> SRR662787 4 0.6131 0.09510 0.000 0.364 0.044 0.500 0.008 0.084
#> SRR1408727 4 0.4361 0.38974 0.000 0.204 0.004 0.716 0.000 0.076
#> SRR1456274 5 0.3616 0.77363 0.000 0.000 0.184 0.012 0.780 0.024
#> SRR817744 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.5373 0.47844 0.000 0.600 0.000 0.288 0.020 0.092
#> SRR1387379 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1102680 5 0.4517 0.33687 0.000 0.000 0.444 0.000 0.524 0.032
#> SRR1374198 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 5 0.1341 0.81053 0.000 0.000 0.028 0.000 0.948 0.024
#> SRR820049 3 0.4007 0.79379 0.000 0.000 0.784 0.048 0.032 0.136
#> SRR1375290 3 0.5465 0.60435 0.000 0.000 0.648 0.196 0.040 0.116
#> SRR818999 5 0.0858 0.80982 0.000 0.000 0.028 0.000 0.968 0.004
#> SRR1390242 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0260 0.79600 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1454629 5 0.4574 0.75272 0.000 0.000 0.112 0.008 0.716 0.164
#> SRR1332187 3 0.0146 0.87888 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR603365 3 0.4723 0.69233 0.000 0.000 0.680 0.000 0.140 0.180
#> SRR657833 2 0.2070 0.76351 0.000 0.892 0.000 0.100 0.000 0.008
#> SRR1436207 2 0.5188 0.15388 0.000 0.496 0.000 0.424 0.004 0.076
#> SRR1488017 1 0.1471 0.74400 0.932 0.000 0.000 0.000 0.064 0.004
#> SRR612947 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1480384 6 0.6190 0.49972 0.280 0.000 0.004 0.000 0.316 0.400
#> SRR1364761 2 0.1082 0.79388 0.000 0.956 0.000 0.040 0.000 0.004
#> SRR1308086 3 0.1296 0.86781 0.000 0.000 0.948 0.004 0.004 0.044
#> SRR1441868 6 0.3756 0.82264 0.400 0.000 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR1485380 5 0.4681 0.70126 0.000 0.000 0.232 0.000 0.668 0.100
#> SRR1073705 6 0.3747 0.82471 0.396 0.000 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR615032 2 0.3322 0.71251 0.000 0.832 0.000 0.104 0.012 0.052
#> SRR1452356 4 0.1554 0.56583 0.000 0.004 0.004 0.940 0.008 0.044
#> SRR1442983 2 0.0146 0.79651 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1100346 4 0.4436 0.53921 0.000 0.000 0.272 0.676 0.008 0.044
#> SRR1332816 6 0.6480 0.53541 0.236 0.000 0.036 0.000 0.252 0.476
#> SRR612299 2 0.3136 0.68626 0.000 0.796 0.000 0.188 0.000 0.016
#> SRR1407386 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0405 0.79615 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1309403 5 0.6241 0.58162 0.000 0.016 0.224 0.112 0.592 0.056
#> SRR1498395 2 0.0146 0.79654 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1079998 5 0.1498 0.80969 0.000 0.000 0.028 0.000 0.940 0.032
#> SRR1498885 4 0.5634 -0.05477 0.000 0.380 0.000 0.508 0.020 0.092
#> SRR1337215 2 0.5272 0.36847 0.000 0.588 0.020 0.320 0.000 0.072
#> SRR1414749 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365963 5 0.0713 0.80909 0.000 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1368030 4 0.2272 0.55026 0.000 0.056 0.000 0.900 0.004 0.040
#> SRR1419760 2 0.5740 0.16578 0.000 0.504 0.036 0.384 0.000 0.076
#> SRR1381841 5 0.3930 0.17888 0.420 0.000 0.000 0.000 0.576 0.004
#> SRR821388 3 0.2830 0.77840 0.000 0.000 0.836 0.144 0.020 0.000
#> SRR657623 4 0.3068 0.49169 0.000 0.120 0.000 0.840 0.008 0.032
#> SRR1094241 3 0.3388 0.80905 0.000 0.000 0.804 0.004 0.036 0.156
#> SRR819583 5 0.4539 0.72076 0.000 0.000 0.216 0.000 0.688 0.096
#> SRR1096149 6 0.5682 0.65053 0.268 0.000 0.000 0.000 0.208 0.524
#> SRR1342829 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811333 5 0.3714 0.76038 0.000 0.000 0.196 0.000 0.760 0.044
#> SRR1311666 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1486698 2 0.1812 0.77392 0.000 0.912 0.000 0.080 0.000 0.008
#> SRR1446436 2 0.1429 0.78641 0.000 0.940 0.000 0.052 0.004 0.004
#> SRR815092 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0653 0.79562 0.000 0.980 0.000 0.004 0.004 0.012
#> SRR1100564 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.1780 0.85884 0.000 0.000 0.924 0.000 0.028 0.048
#> SRR811653 3 0.4120 0.68810 0.000 0.000 0.728 0.204 0.000 0.068
#> SRR1311348 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1489438 4 0.5017 -0.14838 0.000 0.432 0.000 0.508 0.008 0.052
#> SRR1435442 2 0.1970 0.77761 0.000 0.912 0.000 0.060 0.000 0.028
#> SRR1421444 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.5133 0.49287 0.000 0.620 0.000 0.280 0.012 0.088
#> SRR1319520 6 0.3765 0.82239 0.404 0.000 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR1444763 1 0.1806 0.71937 0.908 0.000 0.000 0.000 0.088 0.004
#> SRR1415026 2 0.5218 0.48893 0.000 0.616 0.000 0.280 0.016 0.088
#> SRR1416596 2 0.4626 0.55162 0.000 0.688 0.000 0.228 0.008 0.076
#> SRR1485499 2 0.4773 0.52854 0.000 0.652 0.000 0.280 0.016 0.052
#> SRR1316078 2 0.2443 0.74301 0.000 0.880 0.000 0.096 0.004 0.020
#> SRR663465 4 0.2666 0.52148 0.000 0.092 0.000 0.872 0.008 0.028
#> SRR1310094 2 0.5064 0.33458 0.000 0.540 0.000 0.392 0.008 0.060
#> SRR663537 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1486780 6 0.3782 0.81889 0.412 0.000 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1453950 6 0.3782 0.81889 0.412 0.000 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1087875 6 0.3747 0.82471 0.396 0.000 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR613318 3 0.4839 0.70278 0.000 0.000 0.704 0.164 0.020 0.112
#> SRR1332694 1 0.0146 0.80232 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1468469 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0291 0.79633 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1120318 1 0.3852 0.23181 0.612 0.000 0.000 0.000 0.384 0.004
#> SRR1311622 3 0.0767 0.87820 0.000 0.000 0.976 0.004 0.008 0.012
#> SRR1500931 5 0.4831 0.65652 0.000 0.000 0.268 0.000 0.636 0.096
#> SRR1387494 3 0.0692 0.87444 0.000 0.000 0.976 0.004 0.020 0.000
#> SRR1379175 4 0.8233 0.34754 0.000 0.172 0.272 0.344 0.056 0.156
#> SRR1401909 5 0.3611 0.79585 0.000 0.000 0.108 0.000 0.796 0.096
#> SRR1440541 2 0.6454 0.21912 0.000 0.504 0.000 0.280 0.056 0.160
#> SRR1068832 5 0.4085 0.77199 0.000 0.000 0.156 0.000 0.748 0.096
#> SRR1376640 2 0.3840 0.55791 0.000 0.696 0.000 0.284 0.000 0.020
#> SRR1085712 2 0.4668 0.53297 0.000 0.660 0.000 0.276 0.012 0.052
#> SRR1082283 5 0.0790 0.81088 0.000 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1084276 5 0.0972 0.80993 0.000 0.000 0.028 0.000 0.964 0.008
#> SRR1353262 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1437035 5 0.2833 0.80104 0.000 0.000 0.148 0.004 0.836 0.012
#> SRR1396877 5 0.0790 0.81112 0.000 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1443026 2 0.0146 0.79654 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1417936 1 0.2823 0.43673 0.796 0.000 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR1436822 2 0.5065 0.25551 0.000 0.532 0.000 0.396 0.004 0.068
#> SRR1101128 5 0.4461 0.73911 0.000 0.000 0.192 0.000 0.704 0.104
#> SRR1363886 2 0.5116 0.49631 0.000 0.612 0.000 0.304 0.020 0.064
#> SRR612983 2 0.5191 0.48944 0.000 0.616 0.000 0.284 0.016 0.084
#> SRR1394366 2 0.1152 0.78931 0.000 0.952 0.000 0.044 0.004 0.000
#> SRR1093218 3 0.1296 0.86781 0.000 0.000 0.948 0.004 0.004 0.044
#> SRR1077090 5 0.2331 0.80033 0.000 0.000 0.032 0.000 0.888 0.080
#> SRR1327430 4 0.4079 0.45135 0.000 0.136 0.000 0.752 0.000 0.112
#> SRR1088958 6 0.3747 0.82471 0.396 0.000 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR1486931 2 0.1080 0.79242 0.000 0.960 0.000 0.032 0.004 0.004
#> SRR1086820 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 5 0.5274 -0.22120 0.100 0.000 0.000 0.000 0.492 0.408
#> SRR1355705 2 0.5115 0.49291 0.000 0.624 0.000 0.276 0.012 0.088
#> SRR614335 4 0.4456 0.53634 0.000 0.000 0.276 0.672 0.008 0.044
#> SRR660534 2 0.3694 0.59098 0.000 0.740 0.000 0.232 0.000 0.028
#> SRR817094 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1334265 2 0.6266 0.25436 0.000 0.532 0.068 0.312 0.008 0.080
#> SRR1456401 2 0.3406 0.68590 0.000 0.792 0.000 0.180 0.008 0.020
#> SRR1086393 6 0.5588 0.55359 0.172 0.000 0.000 0.000 0.300 0.528
#> SRR1351521 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093100 4 0.4559 0.53703 0.000 0.020 0.284 0.668 0.004 0.024
#> SRR1309382 1 0.1753 0.72493 0.912 0.000 0.000 0.000 0.084 0.004
#> SRR1089375 5 0.2446 0.81008 0.000 0.000 0.124 0.000 0.864 0.012
#> SRR1499482 2 0.1219 0.78839 0.000 0.948 0.000 0.048 0.004 0.000
#> SRR614719 4 0.4130 0.54724 0.000 0.000 0.264 0.700 0.008 0.028
#> SRR1081473 5 0.3448 0.68918 0.000 0.000 0.280 0.000 0.716 0.004
#> SRR1087415 1 0.3446 0.04406 0.692 0.000 0.000 0.000 0.000 0.308
#> SRR1088217 5 0.1074 0.81049 0.000 0.000 0.028 0.000 0.960 0.012
#> SRR808496 4 0.5218 0.54048 0.000 0.036 0.264 0.636 0.000 0.064
#> SRR1336463 2 0.2420 0.74845 0.000 0.876 0.000 0.108 0.008 0.008
#> SRR612359 4 0.4511 0.53768 0.000 0.016 0.276 0.672 0.000 0.036
#> SRR1444412 5 0.1116 0.80963 0.004 0.000 0.028 0.000 0.960 0.008
#> SRR1074116 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0146 0.87896 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.79627 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 5 0.2706 0.80771 0.000 0.000 0.124 0.000 0.852 0.024
#> SRR1337886 4 0.5051 -0.14186 0.000 0.416 0.000 0.520 0.008 0.056
#> SRR813632 1 0.3993 0.13965 0.520 0.000 0.000 0.000 0.476 0.004
#> SRR1101591 5 0.2979 0.79736 0.000 0.000 0.116 0.000 0.840 0.044
#> SRR1089713 5 0.2595 0.79858 0.000 0.000 0.160 0.000 0.836 0.004
#> SRR1453127 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 5 0.3806 0.78991 0.000 0.000 0.136 0.000 0.776 0.088
#> SRR1313831 1 0.0146 0.80176 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1315434 3 0.0146 0.87896 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR814747 2 0.5035 0.23512 0.000 0.472 0.000 0.468 0.008 0.052
#> SRR1358539 1 0.0146 0.80098 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1367807 6 0.4606 0.78281 0.344 0.000 0.000 0.000 0.052 0.604
#> SRR1365791 3 0.1411 0.85486 0.000 0.000 0.936 0.000 0.060 0.004
#> SRR1081519 5 0.1700 0.81836 0.000 0.000 0.080 0.000 0.916 0.004
#> SRR614707 2 0.4687 0.43757 0.000 0.624 0.000 0.308 0.000 0.068
#> SRR1094027 1 0.2178 0.61541 0.868 0.000 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1489092 5 0.3163 0.79749 0.000 0.000 0.140 0.000 0.820 0.040
#> SRR1079502 5 0.2738 0.79122 0.000 0.000 0.176 0.000 0.820 0.004
#> SRR1457814 3 0.4605 0.67679 0.000 0.000 0.704 0.216 0.020 0.060
#> SRR1455127 2 0.5673 0.28733 0.000 0.476 0.000 0.412 0.020 0.092
#> SRR615081 2 0.0777 0.79235 0.000 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1327855 3 0.4475 0.60956 0.000 0.000 0.700 0.000 0.200 0.100
#> SRR1417873 4 0.5382 0.11798 0.000 0.316 0.000 0.568 0.008 0.108
#> SRR1394125 3 0.2595 0.75884 0.000 0.000 0.836 0.000 0.160 0.004
#> SRR1488388 6 0.3782 0.81889 0.412 0.000 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1401122 4 0.4631 0.24048 0.000 0.288 0.000 0.652 0.008 0.052
#> SRR612383 4 0.4630 0.52919 0.000 0.000 0.276 0.660 0.008 0.056
#> SRR1477711 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.1668 0.78098 0.000 0.928 0.000 0.060 0.004 0.008
#> SRR612851 4 0.4456 0.53634 0.000 0.000 0.276 0.672 0.008 0.044
#> SRR1086349 1 0.3862 -0.61809 0.524 0.000 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR812837 2 0.5115 0.49291 0.000 0.624 0.000 0.276 0.012 0.088
#> SRR1340010 3 0.1007 0.86395 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000 0.000
#> SRR1475885 5 0.5542 0.69405 0.000 0.000 0.144 0.096 0.668 0.092
#> SRR1376334 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 6 0.4463 0.80233 0.376 0.000 0.000 0.000 0.036 0.588
#> SRR1347042 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612323 4 0.4456 0.53634 0.000 0.000 0.276 0.672 0.008 0.044
#> SRR612604 2 0.0717 0.79217 0.000 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR1389546 2 0.0547 0.79485 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.3782 -0.43603 0.588 0.000 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR1465608 5 0.1780 0.79208 0.000 0.000 0.028 0.000 0.924 0.048
#> SRR1101808 2 0.0146 0.79626 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0146 0.87896 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.2789 0.74681 0.000 0.864 0.000 0.088 0.004 0.044
#> SRR1078439 3 0.5635 0.60704 0.000 0.000 0.640 0.184 0.052 0.124
#> SRR2165527 4 0.5503 -0.22683 0.000 0.452 0.000 0.452 0.016 0.080
#> SRR1351147 5 0.4699 0.75576 0.000 0.000 0.144 0.064 0.736 0.056
#> SRR1313536 2 0.0520 0.79459 0.000 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1070308 2 0.8184 -0.06966 0.000 0.396 0.124 0.232 0.168 0.080
#> SRR1403110 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0291 0.79656 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1401317 5 0.5290 0.31803 0.000 0.000 0.428 0.000 0.472 0.100
#> SRR1456862 1 0.5561 -0.49448 0.440 0.000 0.000 0.000 0.136 0.424
#> SRR1074622 6 0.4403 0.80428 0.408 0.000 0.000 0.000 0.028 0.564
#> SRR1465847 5 0.0790 0.81112 0.000 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1443376 2 0.0405 0.79634 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1471312 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.3446 0.05957 0.692 0.000 0.000 0.000 0.000 0.308
#> SRR1090881 4 0.5326 0.51057 0.000 0.016 0.276 0.608 0.000 0.100
#> SRR612251 4 0.4427 0.51368 0.000 0.000 0.292 0.660 0.004 0.044
#> SRR1418581 6 0.3747 0.82471 0.396 0.000 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR658045 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR613214 4 0.4456 0.53634 0.000 0.000 0.276 0.672 0.008 0.044
#> SRR613078 2 0.2790 0.72914 0.000 0.840 0.000 0.140 0.000 0.020
#> SRR1472998 5 0.0713 0.80909 0.000 0.000 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1433452 2 0.0603 0.79488 0.000 0.980 0.000 0.016 0.000 0.004
#> SRR1101957 6 0.3782 0.81889 0.412 0.000 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1487993 3 0.0146 0.87896 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0146 0.79611 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1380375 1 0.0291 0.80084 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1367566 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.5067 0.41170 0.000 0.604 0.004 0.312 0.004 0.076
#> SRR1417547 4 0.5024 -0.16404 0.000 0.440 0.000 0.500 0.008 0.052
#> SRR659389 2 0.5115 0.49831 0.000 0.624 0.000 0.276 0.012 0.088
#> SRR1490270 2 0.0767 0.79514 0.000 0.976 0.000 0.008 0.004 0.012
#> SRR1398207 5 0.1049 0.81222 0.000 0.000 0.032 0.000 0.960 0.008
#> SRR1358755 5 0.1434 0.81630 0.000 0.000 0.048 0.000 0.940 0.012
#> SRR1078903 4 0.4090 0.33233 0.000 0.328 0.016 0.652 0.000 0.004
#> SRR1323252 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1451796 2 0.0405 0.79684 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1369172 6 0.3843 0.75487 0.452 0.000 0.000 0.000 0.000 0.548
#> SRR615982 2 0.3961 0.33705 0.000 0.556 0.000 0.440 0.004 0.000
#> SRR1480431 2 0.3650 0.63817 0.000 0.716 0.000 0.272 0.004 0.008
#> SRR1429825 2 0.5125 0.28111 0.000 0.540 0.000 0.380 0.004 0.076
#> SRR1102393 2 0.0000 0.79627 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 5 0.2212 0.81422 0.000 0.000 0.112 0.000 0.880 0.008
#> SRR808351 6 0.6055 0.56907 0.260 0.000 0.004 0.000 0.276 0.460
#> SRR1317513 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.3871 0.71872 0.000 0.000 0.768 0.000 0.148 0.084
#> SRR1081910 5 0.1802 0.81989 0.000 0.000 0.072 0.000 0.916 0.012
#> SRR1086611 2 0.5574 0.17275 0.000 0.504 0.020 0.392 0.000 0.084
#> SRR1392571 2 0.3871 0.51252 0.000 0.676 0.000 0.308 0.000 0.016
#> SRR1311441 6 0.3782 0.81889 0.412 0.000 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR808152 6 0.5397 0.62595 0.200 0.000 0.000 0.000 0.216 0.584
#> SRR657313 3 0.3740 0.80491 0.000 0.000 0.800 0.032 0.032 0.136
#> SRR1433131 2 0.0146 0.79611 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1321011 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1500598 2 0.1887 0.77371 0.000 0.924 0.000 0.048 0.012 0.016
#> SRR1379343 2 0.1349 0.78645 0.000 0.940 0.000 0.056 0.004 0.000
#> SRR1389108 6 0.3747 0.82471 0.396 0.000 0.000 0.000 0.000 0.604
#> SRR1376228 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.0951 0.87373 0.000 0.000 0.968 0.004 0.020 0.008
#> SRR613557 4 0.4585 0.49986 0.000 0.000 0.304 0.644 0.008 0.044
#> SRR809831 5 0.1333 0.81437 0.000 0.000 0.048 0.000 0.944 0.008
#> SRR1429387 3 0.0000 0.87931 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.2048 0.63825 0.880 0.000 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1071644 1 0.0000 0.80430 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.1745 0.85556 0.000 0.000 0.924 0.000 0.056 0.020
#> SRR1072031 2 0.0260 0.79588 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1374671 4 0.3138 0.52686 0.000 0.144 0.016 0.828 0.004 0.008
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["CV", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["CV:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'CV' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.979 0.992 0.4973 0.503 0.503
#> 3 3 0.965 0.949 0.979 0.3168 0.807 0.628
#> 4 4 0.919 0.900 0.954 0.0894 0.895 0.712
#> 5 5 0.785 0.736 0.872 0.0543 0.965 0.881
#> 6 6 0.751 0.694 0.833 0.0431 0.941 0.790
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
#> attr(,"optional")
#> [1] 2 3
There is also optional best \(k\) = 2 3 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1394209 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1500555 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR1354363 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1391619 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1403980 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1442800 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1093053 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1399843 1 0.0376 0.990 0.996 0.004
#> SRR1380231 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1096736 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1478700 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1384754 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1380317 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1315247 2 0.7815 0.699 0.232 0.768
#> SRR1105344 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1456075 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1417154 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1325771 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1360420 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1072948 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1362848 2 0.8081 0.672 0.248 0.752
#> SRR1407492 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1454868 2 0.8555 0.615 0.280 0.720
#> SRR1474816 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR614695 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1325871 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.8081 0.673 0.248 0.752
#> SRR1470075 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1092112 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1074790 1 0.9866 0.232 0.568 0.432
#> SRR1432106 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.1414 0.970 0.020 0.980
#> SRR1078834 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1419062 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1315739 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1091890 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1327473 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1338195 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.2043 0.961 0.968 0.032
#> SRR1322643 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR614887 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1354620 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1389157 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR613568 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1446180 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1406372 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1353136 1 0.4815 0.879 0.896 0.104
#> SRR1093906 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1399861 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1338789 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1421420 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1352870 2 0.9427 0.443 0.360 0.640
#> SRR1315041 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1420006 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1472749 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1478341 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1479699 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR659427 1 0.7056 0.759 0.808 0.192
#> SRR1096638 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1439994 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1374270 1 0.9944 0.151 0.544 0.456
#> SRR1470947 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1456274 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR820049 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1375290 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR818999 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1332187 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR603365 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1485380 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1309403 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1414749 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1419760 2 0.1414 0.970 0.020 0.980
#> SRR1381841 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR821388 1 0.7299 0.740 0.796 0.204
#> SRR657623 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR819583 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1403072 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR811653 2 0.9754 0.318 0.408 0.592
#> SRR1311348 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR613318 2 0.1184 0.974 0.016 0.984
#> SRR1332694 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1468469 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1500931 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1379175 1 0.8443 0.623 0.728 0.272
#> SRR1401909 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0376 0.985 0.004 0.996
#> SRR1101128 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1093218 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1077090 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1101591 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1453127 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1315434 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1365791 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1081519 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR614707 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1079502 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1457814 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1455127 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1475885 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1376334 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1347042 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1070308 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1403110 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1090881 2 0.9795 0.295 0.416 0.584
#> SRR612251 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1487993 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1367566 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1480501 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1086611 2 0.7950 0.686 0.240 0.760
#> SRR1392571 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR657313 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1376228 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1358060 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1464517 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR613557 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR809831 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.0000 0.994 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.989 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR614491 3 0.0592 0.937 0.000 0.012 0.988
#> SRR1069376 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 3 0.6955 0.685 0.172 0.100 0.728
#> SRR1394209 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500555 3 0.0661 0.939 0.004 0.008 0.988
#> SRR1354363 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR612515 3 0.4346 0.778 0.000 0.184 0.816
#> SRR1092727 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468553 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420169 3 0.3619 0.825 0.136 0.000 0.864
#> SRR1442800 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.0747 0.966 0.984 0.000 0.016
#> SRR1500030 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093053 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399843 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380231 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR809470 3 0.0747 0.935 0.016 0.000 0.984
#> SRR614239 2 0.1529 0.953 0.000 0.960 0.040
#> SRR613939 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478700 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081543 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384754 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315247 3 0.6008 0.446 0.000 0.372 0.628
#> SRR1105344 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456075 3 0.0237 0.943 0.004 0.000 0.996
#> SRR1389474 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095985 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1325771 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076916 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472370 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.1031 0.971 0.000 0.976 0.024
#> SRR1362848 3 0.4399 0.763 0.000 0.188 0.812
#> SRR1407492 3 0.5497 0.612 0.000 0.292 0.708
#> SRR1455082 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.4842 0.724 0.000 0.224 0.776
#> SRR1474816 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443161 3 0.2878 0.867 0.096 0.000 0.904
#> SRR614695 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 3 0.0424 0.941 0.008 0.000 0.992
#> SRR1105463 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355415 1 0.5138 0.649 0.748 0.000 0.252
#> SRR1090861 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.0892 0.932 0.020 0.000 0.980
#> SRR1417588 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074790 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.5560 0.547 0.000 0.700 0.300
#> SRR1078834 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR614984 2 0.0237 0.991 0.000 0.996 0.004
#> SRR1324269 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327473 1 0.3038 0.876 0.896 0.000 0.104
#> SRR1338195 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354620 3 0.5968 0.454 0.364 0.000 0.636
#> SRR615056 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105320 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 3 0.4555 0.757 0.000 0.200 0.800
#> SRR613568 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 3 0.2448 0.886 0.076 0.000 0.924
#> SRR1406372 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353136 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399861 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338789 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315041 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416617 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420006 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098312 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088606 3 0.2711 0.875 0.088 0.000 0.912
#> SRR1479699 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR659427 3 0.4555 0.757 0.000 0.200 0.800
#> SRR1096638 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR659307 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1439994 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374270 3 0.6111 0.386 0.000 0.396 0.604
#> SRR1470947 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456274 3 0.6140 0.315 0.404 0.000 0.596
#> SRR817744 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR820049 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375290 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR818999 1 0.4702 0.718 0.788 0.000 0.212
#> SRR1390242 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332187 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.6225 0.193 0.000 0.568 0.432
#> SRR1488017 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.6045 0.415 0.380 0.000 0.620
#> SRR1498885 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414749 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365963 1 0.3619 0.831 0.864 0.000 0.136
#> SRR1368030 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419760 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1381841 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR821388 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR657623 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR811653 3 0.3116 0.856 0.000 0.108 0.892
#> SRR1311348 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR613318 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500931 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387494 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379175 3 0.5882 0.501 0.000 0.348 0.652
#> SRR1401909 3 0.6302 0.118 0.480 0.000 0.520
#> SRR1440541 2 0.3686 0.832 0.000 0.860 0.140
#> SRR1068832 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 3 0.3551 0.830 0.132 0.000 0.868
#> SRR1443026 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0237 0.991 0.000 0.996 0.004
#> SRR1101128 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093218 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077090 3 0.6286 0.174 0.464 0.000 0.536
#> SRR1327430 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093100 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 3 0.6095 0.368 0.392 0.000 0.608
#> SRR1499482 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081473 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.6235 0.187 0.564 0.000 0.436
#> SRR808496 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR612359 3 0.3340 0.844 0.000 0.120 0.880
#> SRR1444412 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.3038 0.876 0.896 0.000 0.104
#> SRR1337886 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089713 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498354 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081519 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR614707 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079502 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457814 3 0.3619 0.829 0.000 0.136 0.864
#> SRR1455127 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327855 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR612383 3 0.2537 0.881 0.000 0.080 0.920
#> SRR1477711 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475885 1 0.2356 0.911 0.928 0.000 0.072
#> SRR1376334 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR612323 2 0.0237 0.991 0.000 0.996 0.004
#> SRR612604 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078439 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.5591 0.567 0.696 0.000 0.304
#> SRR1313536 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070308 3 0.2550 0.896 0.056 0.012 0.932
#> SRR1403110 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.4346 0.778 0.000 0.184 0.816
#> SRR612251 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472998 3 0.4605 0.741 0.204 0.000 0.796
#> SRR1433452 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398207 1 0.5905 0.433 0.648 0.000 0.352
#> SRR1358755 3 0.5706 0.548 0.320 0.000 0.680
#> SRR1078903 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.5948 0.439 0.640 0.000 0.360
#> SRR808351 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081910 3 0.0592 0.938 0.012 0.000 0.988
#> SRR1086611 2 0.1643 0.949 0.000 0.956 0.044
#> SRR1392571 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR613557 3 0.3941 0.809 0.000 0.156 0.844
#> SRR809831 1 0.4504 0.754 0.804 0.000 0.196
#> SRR1429387 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.982 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.0000 0.946 0.000 0.000 1.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.995 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472057 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR614491 3 0.0804 0.86388 0.000 0.012 0.980 0.008
#> SRR1069376 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 3 0.4149 0.69988 0.168 0.000 0.804 0.028
#> SRR1394209 3 0.4866 0.38944 0.000 0.404 0.596 0.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099809 4 0.1940 0.87181 0.076 0.000 0.000 0.924
#> SRR1500555 4 0.3925 0.69572 0.000 0.176 0.016 0.808
#> SRR1354363 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.0188 0.98678 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR663124 3 0.3636 0.73287 0.000 0.172 0.820 0.008
#> SRR1334670 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 3 0.1722 0.84242 0.000 0.048 0.944 0.008
#> SRR1092727 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1364013 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1468553 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1403980 3 0.4477 0.47695 0.000 0.000 0.688 0.312
#> SRR1420169 4 0.1256 0.89437 0.028 0.000 0.008 0.964
#> SRR1442800 4 0.4697 0.50380 0.000 0.000 0.356 0.644
#> SRR1359214 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499849 4 0.1792 0.87697 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1500030 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093053 4 0.3610 0.73392 0.000 0.000 0.200 0.800
#> SRR1399843 3 0.5093 0.44934 0.000 0.012 0.640 0.348
#> SRR1380231 4 0.2011 0.87194 0.000 0.000 0.080 0.920
#> SRR809470 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR614239 3 0.3852 0.71143 0.000 0.192 0.800 0.008
#> SRR613939 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR612971 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1469570 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.4635 0.69069 0.756 0.000 0.216 0.028
#> SRR1478700 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081543 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384754 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380317 3 0.4941 0.30134 0.000 0.436 0.564 0.000
#> SRR1315247 4 0.3351 0.73724 0.000 0.148 0.008 0.844
#> SRR1105344 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658549 3 0.2799 0.79629 0.000 0.108 0.884 0.008
#> SRR1480240 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.0188 0.98590 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1419476 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1456075 3 0.0672 0.86675 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1389474 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0592 0.86662 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1095985 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1325771 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.1867 0.82652 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR660272 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1332993 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076916 3 0.4193 0.60542 0.000 0.000 0.732 0.268
#> SRR1356266 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0592 0.86714 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1472370 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1480176 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0188 0.98683 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1469192 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR659839 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659533 3 0.4621 0.59855 0.000 0.284 0.708 0.008
#> SRR1362848 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407492 3 0.2329 0.82612 0.000 0.072 0.916 0.012
#> SRR1455082 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR658362 2 0.0188 0.98683 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR810921 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.4356 0.55943 0.000 0.000 0.708 0.292
#> SRR818232 1 0.1302 0.93507 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1454868 3 0.3751 0.71040 0.000 0.196 0.800 0.004
#> SRR1474816 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466400 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR658921 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1499873 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 4 0.2011 0.86794 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1379324 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0707 0.97358 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1396166 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1086280 3 0.4941 0.12775 0.000 0.000 0.564 0.436
#> SRR1454891 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR663185 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1474351 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1472687 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0921 0.96653 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1415153 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1323271 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443161 4 0.4903 0.63897 0.028 0.000 0.248 0.724
#> SRR614695 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1092372 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1089006 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1105463 4 0.1118 0.89273 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR811005 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.4605 0.46518 0.664 0.000 0.000 0.336
#> SRR1325871 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355415 4 0.1118 0.89273 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1090861 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321165 4 0.3486 0.76847 0.188 0.000 0.000 0.812
#> SRR1092112 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1417588 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1074790 1 0.0921 0.95301 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1432106 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1458314 1 0.3444 0.76791 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1318582 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0188 0.98590 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.0469 0.98319 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1078834 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1417611 2 0.0188 0.98590 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1396840 4 0.1211 0.89080 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1465440 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614984 3 0.3852 0.71143 0.000 0.192 0.800 0.008
#> SRR1324269 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0921 0.95086 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1324349 2 0.0817 0.96579 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661505 4 0.1042 0.89509 0.008 0.000 0.020 0.972
#> SRR1419062 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1480131 4 0.1211 0.89080 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1421284 2 0.0188 0.98590 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0336 0.87070 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1099189 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.4431 0.53818 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1091890 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1347436 2 0.0921 0.96653 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1327473 1 0.3813 0.80196 0.828 0.000 0.148 0.024
#> SRR1338195 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1339597 1 0.0592 0.96190 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1454842 3 0.3606 0.76855 0.000 0.020 0.840 0.140
#> SRR1322643 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0336 0.87134 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1354620 4 0.1118 0.89273 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR615056 2 0.0188 0.98683 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1105320 3 0.4564 0.48666 0.000 0.000 0.672 0.328
#> SRR1391529 4 0.4164 0.66883 0.264 0.000 0.000 0.736
#> SRR663052 3 0.3088 0.77803 0.000 0.128 0.864 0.008
#> SRR1478834 4 0.4222 0.65403 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR812366 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR615383 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1389157 3 0.4387 0.65771 0.000 0.236 0.752 0.012
#> SRR613568 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR614095 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1103092 4 0.4564 0.53394 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1337155 4 0.1042 0.89509 0.008 0.000 0.020 0.972
#> SRR1475345 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1446180 4 0.1042 0.89552 0.008 0.000 0.020 0.972
#> SRR1406372 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353136 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093906 3 0.0336 0.87070 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR614035 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1351104 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399861 3 0.3539 0.73207 0.000 0.176 0.820 0.004
#> SRR1338789 1 0.0336 0.96865 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1421420 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1420832 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.4711 0.64707 0.000 0.236 0.740 0.024
#> SRR1315041 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443268 1 0.3172 0.80186 0.840 0.000 0.000 0.160
#> SRR1416617 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1102443 1 0.0592 0.96282 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR655672 2 0.2342 0.89950 0.000 0.912 0.080 0.008
#> SRR1420006 3 0.0592 0.86645 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1458267 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613819 2 0.0524 0.98362 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1469432 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0817 0.97011 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1470727 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.3266 0.73717 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1472749 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1414379 2 0.0188 0.98590 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0592 0.97694 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1098312 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614467 2 0.5016 0.28005 0.000 0.600 0.396 0.004
#> SRR811471 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1088606 4 0.1256 0.89437 0.028 0.000 0.008 0.964
#> SRR1479699 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1403589 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659427 4 0.7566 -0.00284 0.000 0.192 0.392 0.416
#> SRR1096638 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659307 3 0.2101 0.83479 0.000 0.060 0.928 0.012
#> SRR1439994 4 0.3074 0.80470 0.152 0.000 0.000 0.848
#> SRR1454931 4 0.2216 0.85984 0.092 0.000 0.000 0.908
#> SRR1332928 4 0.1209 0.89588 0.004 0.000 0.032 0.964
#> SRR658621 2 0.0188 0.98683 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1095840 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.3610 0.74426 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1374270 3 0.2149 0.81764 0.000 0.088 0.912 0.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.1022 0.96556 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR662787 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408727 2 0.1637 0.92872 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1456274 3 0.4981 0.09477 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 4 0.2081 0.86875 0.000 0.000 0.084 0.916
#> SRR1374198 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 4 0.1211 0.89080 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR820049 4 0.2408 0.85006 0.000 0.000 0.104 0.896
#> SRR1375290 4 0.2921 0.80869 0.000 0.000 0.140 0.860
#> SRR818999 4 0.1118 0.89273 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1390242 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0188 0.98683 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1454629 4 0.1118 0.89273 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1332187 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR603365 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR657833 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1436207 2 0.2081 0.90852 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1488017 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1480384 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1308086 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1073705 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1452356 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.0524 0.98309 0.000 0.988 0.004 0.008
#> SRR1332816 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1407386 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0188 0.98683 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1309403 3 0.4406 0.50370 0.000 0.000 0.700 0.300
#> SRR1498395 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079998 4 0.1118 0.89273 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1498885 2 0.0188 0.98590 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1337215 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1414749 4 0.4605 0.55718 0.000 0.000 0.336 0.664
#> SRR1365963 1 0.1042 0.95219 0.972 0.000 0.020 0.008
#> SRR1368030 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419760 2 0.0336 0.98537 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1381841 4 0.3528 0.76977 0.192 0.000 0.000 0.808
#> SRR821388 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR657623 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094241 4 0.4992 0.12061 0.000 0.000 0.476 0.524
#> SRR819583 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1096149 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0336 0.87070 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1353028 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.0336 0.87070 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1311666 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1446436 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR815092 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR811653 3 0.1902 0.83385 0.000 0.064 0.932 0.004
#> SRR1311348 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1421444 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1344010 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613318 3 0.0336 0.86918 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1332694 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0336 0.87070 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR818670 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.1792 0.90994 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1311622 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500931 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1387494 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379175 2 0.0937 0.96909 0.000 0.976 0.012 0.012
#> SRR1401909 4 0.1118 0.89273 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1440541 3 0.4356 0.56048 0.000 0.292 0.708 0.000
#> SRR1068832 4 0.1209 0.89588 0.004 0.000 0.032 0.964
#> SRR1376640 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1085712 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.0336 0.96900 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1084276 4 0.1211 0.89080 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1353262 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437035 4 0.2011 0.86914 0.080 0.000 0.000 0.920
#> SRR1396877 4 0.6534 0.60973 0.244 0.000 0.132 0.624
#> SRR1443026 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0707 0.97189 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1101128 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1363886 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0188 0.98683 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1394366 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1093218 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077090 4 0.1118 0.89273 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1327430 2 0.0188 0.98590 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1086820 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614335 2 0.0376 0.98544 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR660534 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR817094 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1093100 2 0.1792 0.91913 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 4 0.1305 0.89507 0.004 0.000 0.036 0.960
#> SRR1499482 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR614719 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1081473 4 0.4804 0.43660 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1087415 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 4 0.1118 0.89273 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR808496 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336463 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR612359 2 0.5244 0.28448 0.000 0.600 0.388 0.012
#> SRR1444412 4 0.1211 0.89080 0.040 0.000 0.000 0.960
#> SRR1074116 4 0.1637 0.88328 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR821846 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR656095 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.3266 0.79606 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813632 1 0.1118 0.94307 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1101591 3 0.4790 0.32066 0.000 0.000 0.620 0.380
#> SRR1089713 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1453127 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1498354 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1313831 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.0707 0.86403 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1081519 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR614707 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1094027 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 4 0.4817 0.43124 0.000 0.000 0.388 0.612
#> SRR1079502 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1457814 3 0.1151 0.85682 0.000 0.024 0.968 0.008
#> SRR1455127 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615081 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1327855 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1417873 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.4955 0.10590 0.000 0.000 0.556 0.444
#> SRR1488388 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612383 3 0.3937 0.71538 0.000 0.188 0.800 0.012
#> SRR1477711 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR612851 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1086349 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475885 1 0.5746 0.37774 0.612 0.000 0.040 0.348
#> SRR1376334 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR612323 3 0.3852 0.71143 0.000 0.192 0.800 0.008
#> SRR612604 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1389546 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0188 0.97172 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1331153 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078439 4 0.0921 0.89375 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR2165527 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351147 4 0.4214 0.74764 0.016 0.000 0.204 0.780
#> SRR1313536 2 0.0188 0.98683 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1070308 3 0.3739 0.79256 0.076 0.032 0.868 0.024
#> SRR1403110 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0188 0.98678 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1401317 4 0.1118 0.89524 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1456862 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 4 0.1398 0.89464 0.004 0.000 0.040 0.956
#> SRR1443376 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1075579 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.4284 0.67074 0.000 0.224 0.764 0.012
#> SRR612251 3 0.5281 0.19758 0.000 0.464 0.528 0.008
#> SRR1418581 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR613214 3 0.3852 0.71143 0.000 0.192 0.800 0.008
#> SRR613078 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1472998 4 0.1118 0.89273 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1433452 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1316151 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1398207 4 0.1118 0.89273 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1358755 4 0.1118 0.89273 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1078903 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1323252 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1480431 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.0188 0.98683 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1102393 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.4720 0.63375 0.720 0.000 0.264 0.016
#> SRR808351 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 4 0.1302 0.89253 0.000 0.000 0.044 0.956
#> SRR1081910 3 0.5407 0.62935 0.152 0.000 0.740 0.108
#> SRR1086611 2 0.1557 0.94693 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1392571 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1311441 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657313 4 0.4543 0.52302 0.000 0.000 0.324 0.676
#> SRR1433131 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0336 0.98558 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1389108 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0336 0.87070 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1399757 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.0336 0.87070 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1464517 3 0.0000 0.87201 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613557 3 0.1388 0.85516 0.000 0.028 0.960 0.012
#> SRR809831 1 0.3249 0.82332 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1429387 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR816565 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.97497 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.0188 0.87207 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1072031 2 0.0000 0.98779 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.5285 0.01715 0.000 0.524 0.468 0.008
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 3 0.1671 0.78184 0.000 0.000 0.924 0.076 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1472057 5 0.0510 0.79732 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR614491 3 0.1792 0.78192 0.000 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1361415 2 0.0510 0.88727 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1345715 1 0.0404 0.90034 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1328073 3 0.4443 0.50094 0.240 0.000 0.724 0.028 0.008
#> SRR1394209 2 0.6816 -0.23318 0.000 0.360 0.324 0.316 0.000
#> SRR1474018 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1099809 5 0.5357 0.40821 0.264 0.000 0.000 0.096 0.640
#> SRR1500555 4 0.5598 0.15692 0.000 0.080 0.000 0.544 0.376
#> SRR1354363 1 0.1908 0.85480 0.908 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1391619 3 0.2230 0.77497 0.000 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1307997 2 0.2020 0.85656 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR663124 3 0.4155 0.64255 0.000 0.144 0.780 0.076 0.000
#> SRR1334670 1 0.0162 0.90269 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR612515 3 0.3234 0.73724 0.000 0.064 0.852 0.084 0.000
#> SRR1092727 2 0.1478 0.87896 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1364013 2 0.1270 0.87953 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1468553 3 0.0162 0.79960 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1403980 3 0.5040 0.48695 0.000 0.000 0.680 0.084 0.236
#> SRR1420169 5 0.0703 0.79531 0.000 0.000 0.000 0.024 0.976
#> SRR1442800 4 0.6080 0.24720 0.000 0.000 0.344 0.520 0.136
#> SRR1359214 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1499849 5 0.3362 0.71950 0.080 0.000 0.000 0.076 0.844
#> SRR1500030 3 0.0703 0.79852 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1093053 5 0.3898 0.64021 0.000 0.000 0.116 0.080 0.804
#> SRR1399843 4 0.7390 0.01813 0.000 0.028 0.300 0.376 0.296
#> SRR1380231 5 0.4020 0.69509 0.000 0.000 0.096 0.108 0.796
#> SRR809470 5 0.6401 0.17793 0.020 0.000 0.104 0.384 0.492
#> SRR614239 3 0.4747 0.55601 0.000 0.196 0.720 0.084 0.000
#> SRR613939 2 0.4088 0.44871 0.000 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR612971 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1490204 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR811357 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1471672 1 0.1043 0.88772 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR613006 2 0.1478 0.87727 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1469570 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1457354 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1362906 3 0.3242 0.69185 0.000 0.000 0.784 0.216 0.000
#> SRR1079023 1 0.0162 0.90269 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR813608 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1096736 1 0.6608 0.12943 0.460 0.000 0.284 0.256 0.000
#> SRR1478700 1 0.2813 0.78588 0.832 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1081543 3 0.0162 0.79960 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1384754 3 0.3395 0.66712 0.000 0.000 0.764 0.236 0.000
#> SRR612287 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1380317 2 0.6785 -0.15107 0.000 0.388 0.304 0.308 0.000
#> SRR1315247 4 0.5983 0.14949 0.000 0.116 0.000 0.504 0.380
#> SRR1105344 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR658549 3 0.3180 0.73554 0.000 0.068 0.856 0.076 0.000
#> SRR1480240 1 0.1012 0.88957 0.968 0.000 0.000 0.020 0.012
#> SRR1084816 2 0.0794 0.88825 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR612551 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1358520 2 0.3612 0.62449 0.000 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR1419476 5 0.1908 0.77395 0.000 0.000 0.000 0.092 0.908
#> SRR1456075 3 0.6018 0.42972 0.008 0.000 0.568 0.312 0.112
#> SRR1389474 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1367005 1 0.0794 0.89377 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1334419 1 0.1792 0.85670 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1417154 3 0.0798 0.79702 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1095985 5 0.3949 0.47271 0.000 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR1325771 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.1671 0.76934 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR660272 2 0.1121 0.88491 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR808044 1 0.0510 0.89905 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1076916 4 0.6563 0.20248 0.000 0.000 0.356 0.436 0.208
#> SRR1356266 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1456114 1 0.2230 0.83676 0.884 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1072948 3 0.2771 0.73730 0.000 0.000 0.860 0.012 0.128
#> SRR1472370 5 0.0510 0.79732 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1480176 1 0.0740 0.89702 0.980 0.000 0.004 0.008 0.008
#> SRR613843 2 0.0609 0.88914 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0703 0.79790 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR659839 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR659533 3 0.4670 0.56064 0.000 0.200 0.724 0.076 0.000
#> SRR1362848 3 0.3177 0.69233 0.000 0.000 0.792 0.208 0.000
#> SRR1407492 3 0.1914 0.78291 0.000 0.016 0.924 0.060 0.000
#> SRR1455082 2 0.0963 0.88748 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR658362 2 0.0794 0.88356 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR810921 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR662823 2 0.1732 0.85199 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1456375 3 0.3003 0.67450 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR818232 1 0.0290 0.90161 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1454868 3 0.4254 0.63569 0.000 0.148 0.772 0.080 0.000
#> SRR1474816 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0510 0.88983 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1466400 2 0.4227 0.30541 0.000 0.580 0.000 0.420 0.000
#> SRR658921 2 0.4171 0.34022 0.000 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.88938 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0162 0.90275 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1090145 5 0.3957 0.62498 0.008 0.000 0.000 0.280 0.712
#> SRR1379324 1 0.2773 0.78392 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1345307 2 0.1608 0.87190 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1396166 3 0.0290 0.79950 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1086280 3 0.4316 0.63515 0.000 0.000 0.772 0.108 0.120
#> SRR1454891 2 0.1121 0.88048 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR663185 2 0.1908 0.84236 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR811819 1 0.0324 0.90167 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1318920 1 0.3707 0.60168 0.716 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR656758 2 0.1197 0.88498 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1474351 1 0.0162 0.90269 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR660450 2 0.2813 0.79853 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1472687 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1334291 2 0.3586 0.65028 0.000 0.736 0.000 0.264 0.000
#> SRR1415153 2 0.1410 0.88104 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1323271 2 0.2516 0.79804 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1368939 2 0.1197 0.88387 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1443161 4 0.5201 -0.04218 0.000 0.000 0.044 0.532 0.424
#> SRR614695 2 0.5757 0.11114 0.000 0.496 0.088 0.416 0.000
#> SRR1092372 1 0.3876 0.56392 0.684 0.000 0.000 0.316 0.000
#> SRR1474577 1 0.0609 0.89685 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1406582 1 0.0162 0.90275 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR612779 2 0.1478 0.87727 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1089006 1 0.0162 0.90275 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1354071 5 0.0290 0.79920 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1105463 5 0.1197 0.79202 0.000 0.000 0.000 0.048 0.952
#> SRR811005 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1385319 1 0.4687 0.48363 0.636 0.000 0.000 0.336 0.028
#> SRR1325871 3 0.1965 0.78076 0.000 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1355415 5 0.1270 0.79366 0.000 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1090861 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 3 0.2605 0.74538 0.000 0.000 0.852 0.148 0.000
#> SRR1470075 1 0.2648 0.80155 0.848 0.000 0.000 0.152 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.4844 0.59195 0.668 0.000 0.000 0.280 0.052
#> SRR1321165 5 0.6605 0.02358 0.236 0.000 0.000 0.312 0.452
#> SRR1092112 5 0.2605 0.75159 0.000 0.000 0.000 0.148 0.852
#> SRR1417588 3 0.0000 0.79962 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 1 0.3634 0.74356 0.796 0.008 0.012 0.184 0.000
#> SRR1432106 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR655756 2 0.1478 0.87727 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1458314 1 0.6268 0.34260 0.536 0.000 0.000 0.204 0.260
#> SRR1318582 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1080484 2 0.2813 0.76676 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1072749 1 0.3327 0.80050 0.852 0.000 0.004 0.060 0.084
#> SRR1078586 1 0.0162 0.90269 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1400333 2 0.4420 0.24125 0.000 0.548 0.000 0.448 0.004
#> SRR1078834 2 0.4516 0.32763 0.000 0.576 0.004 0.416 0.004
#> SRR1417611 2 0.2813 0.76699 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1396840 5 0.5915 0.13079 0.108 0.000 0.000 0.384 0.508
#> SRR1465440 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1400530 2 0.0290 0.88865 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR614984 3 0.4170 0.64228 0.000 0.140 0.780 0.080 0.000
#> SRR1324269 1 0.0671 0.89659 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1401491 2 0.0404 0.88928 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1319443 1 0.1282 0.87847 0.952 0.000 0.000 0.044 0.004
#> SRR1324349 2 0.3705 0.76260 0.064 0.816 0.000 0.120 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.88938 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.2179 0.84065 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR661505 5 0.0510 0.79732 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1419062 5 0.2470 0.76709 0.000 0.000 0.012 0.104 0.884
#> SRR1480131 5 0.2233 0.76678 0.004 0.000 0.000 0.104 0.892
#> SRR1421284 2 0.3534 0.64540 0.000 0.744 0.000 0.256 0.000
#> SRR1329624 1 0.0162 0.90269 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1315739 3 0.1908 0.75164 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1099189 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1083286 1 0.2654 0.82729 0.888 0.000 0.000 0.048 0.064
#> SRR1091890 3 0.0162 0.79962 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1347436 2 0.3274 0.71349 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1327473 1 0.4666 0.56144 0.704 0.000 0.240 0.056 0.000
#> SRR1338195 3 0.0162 0.79960 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR809698 2 0.0609 0.88904 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0963 0.88798 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1339597 1 0.4264 0.65888 0.744 0.000 0.000 0.044 0.212
#> SRR1454842 3 0.4513 0.68284 0.000 0.004 0.764 0.128 0.104
#> SRR1322643 1 0.1671 0.86358 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR614887 3 0.1544 0.78518 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1354620 5 0.0290 0.79935 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR615056 2 0.1671 0.86555 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1105320 3 0.6427 0.31504 0.016 0.000 0.568 0.172 0.244
#> SRR1391529 5 0.3969 0.40699 0.304 0.000 0.000 0.004 0.692
#> SRR663052 3 0.4466 0.60438 0.000 0.176 0.748 0.076 0.000
#> SRR1478834 1 0.5616 0.12488 0.512 0.000 0.000 0.076 0.412
#> SRR812366 2 0.0404 0.88928 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1435330 3 0.0000 0.79962 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0880 0.88866 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1389157 3 0.4349 0.59466 0.000 0.176 0.756 0.068 0.000
#> SRR613568 2 0.1608 0.87546 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR614095 2 0.1270 0.87624 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1103092 1 0.5341 0.28606 0.564 0.000 0.000 0.060 0.376
#> SRR1337155 5 0.0794 0.79814 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972
#> SRR1475345 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR809089 2 0.1043 0.88381 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1446180 4 0.4450 -0.15200 0.000 0.004 0.000 0.508 0.488
#> SRR1406372 2 0.0963 0.88711 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1339880 3 0.1270 0.79292 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1353136 3 0.3336 0.71734 0.000 0.000 0.772 0.228 0.000
#> SRR1093906 3 0.0162 0.79936 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR614035 2 0.1121 0.88101 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1351104 1 0.3143 0.74710 0.796 0.000 0.000 0.204 0.000
#> SRR1363926 2 0.2179 0.82602 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1399861 3 0.5707 0.51480 0.000 0.160 0.624 0.216 0.000
#> SRR1338789 1 0.5651 0.48407 0.620 0.000 0.000 0.248 0.132
#> SRR1421420 3 0.1168 0.79588 0.000 0.000 0.960 0.032 0.008
#> SRR1420832 2 0.0510 0.88729 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.6274 0.36583 0.000 0.164 0.564 0.264 0.008
#> SRR1315041 2 0.2773 0.77201 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR661877 2 0.0963 0.87990 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1443268 1 0.5950 0.45889 0.592 0.000 0.000 0.188 0.220
#> SRR1416617 3 0.0798 0.79831 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1102443 1 0.0162 0.90275 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR655672 2 0.4930 0.52192 0.000 0.684 0.244 0.072 0.000
#> SRR1420006 3 0.0162 0.79936 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1458267 2 0.1478 0.87722 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR613819 2 0.1908 0.85575 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1469432 2 0.0162 0.88977 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR660907 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1465092 2 0.1544 0.87447 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1470727 1 0.0671 0.89882 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004
#> SRR1339153 3 0.5086 0.60319 0.000 0.000 0.700 0.144 0.156
#> SRR1472749 3 0.1410 0.78906 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1414379 2 0.3508 0.65161 0.000 0.748 0.000 0.252 0.000
#> SRR1431326 1 0.0290 0.90203 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1487278 4 0.4291 0.03088 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1098312 3 0.0510 0.79849 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR810273 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1376000 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR614467 2 0.5284 0.53696 0.000 0.668 0.116 0.216 0.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0162 0.79936 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1088606 4 0.4306 -0.19532 0.000 0.000 0.000 0.508 0.492
#> SRR1479699 3 0.0880 0.79447 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1403589 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR812625 2 0.4045 0.45117 0.000 0.644 0.000 0.356 0.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1471222 2 0.0510 0.88887 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1378992 1 0.1121 0.88444 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR659427 5 0.7924 -0.08489 0.000 0.192 0.100 0.304 0.404
#> SRR1096638 1 0.0162 0.90275 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1466619 2 0.3999 0.47883 0.000 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR659307 3 0.3888 0.65890 0.000 0.136 0.800 0.064 0.000
#> SRR1439994 5 0.2464 0.74437 0.016 0.000 0.000 0.096 0.888
#> SRR1454931 5 0.6265 0.29364 0.220 0.000 0.000 0.240 0.540
#> SRR1332928 5 0.3752 0.52431 0.000 0.000 0.000 0.292 0.708
#> SRR658621 2 0.1341 0.87551 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1095840 1 0.0162 0.90269 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1458243 1 0.5929 0.42654 0.584 0.000 0.000 0.156 0.260
#> SRR1374270 3 0.2951 0.77369 0.000 0.028 0.860 0.112 0.000
#> SRR1470947 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1365598 4 0.4906 -0.02058 0.000 0.480 0.000 0.496 0.024
#> SRR662787 2 0.2732 0.78765 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1408727 2 0.3663 0.70854 0.000 0.776 0.016 0.208 0.000
#> SRR1456274 4 0.6214 0.04274 0.144 0.000 0.380 0.476 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1387379 2 0.0162 0.88909 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1102680 5 0.3291 0.69834 0.000 0.000 0.120 0.040 0.840
#> SRR1374198 1 0.1608 0.86190 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1445856 5 0.3003 0.63231 0.000 0.000 0.000 0.188 0.812
#> SRR820049 5 0.2270 0.75716 0.000 0.000 0.020 0.076 0.904
#> SRR1375290 5 0.5316 0.37790 0.000 0.000 0.284 0.084 0.632
#> SRR818999 5 0.2462 0.76162 0.008 0.000 0.000 0.112 0.880
#> SRR1390242 1 0.0162 0.90269 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1401164 2 0.4074 0.43247 0.000 0.636 0.000 0.364 0.000
#> SRR1454629 5 0.0404 0.79911 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1332187 3 0.0794 0.79555 0.000 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR603365 5 0.0609 0.79622 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR657833 2 0.1043 0.88695 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1436207 2 0.2806 0.76493 0.000 0.844 0.000 0.004 0.152
#> SRR1488017 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0794 0.88886 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1480384 1 0.1043 0.88278 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1364761 2 0.0794 0.88956 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1308086 3 0.2020 0.77248 0.000 0.000 0.900 0.100 0.000
#> SRR1441868 1 0.0510 0.89911 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1485380 5 0.0404 0.79803 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1073705 1 0.0404 0.90034 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR615032 2 0.1121 0.88101 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1452356 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1442983 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1100346 2 0.4615 0.55504 0.000 0.700 0.252 0.048 0.000
#> SRR1332816 1 0.0162 0.90275 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR612299 2 0.4114 0.43144 0.000 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1309403 3 0.5767 0.39387 0.004 0.000 0.616 0.124 0.256
#> SRR1498395 2 0.0963 0.88686 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1079998 5 0.0510 0.79732 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1498885 2 0.2020 0.83590 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1337215 2 0.4219 0.30140 0.000 0.584 0.000 0.416 0.000
#> SRR1414749 5 0.4302 0.11083 0.000 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1365963 1 0.6152 0.43693 0.572 0.000 0.032 0.320 0.076
#> SRR1368030 2 0.1341 0.87072 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1419760 2 0.2116 0.86608 0.000 0.912 0.008 0.076 0.004
#> SRR1381841 4 0.6756 0.08739 0.364 0.000 0.000 0.372 0.264
#> SRR821388 3 0.0609 0.79825 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR657623 2 0.2020 0.83561 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1094241 5 0.5341 0.31588 0.000 0.000 0.300 0.080 0.620
#> SRR819583 5 0.0162 0.79931 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1096149 1 0.3480 0.69636 0.752 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1342829 3 0.0609 0.79806 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1353028 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.2166 0.76792 0.004 0.000 0.912 0.072 0.012
#> SRR1311666 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1486698 2 0.3143 0.73834 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1446436 2 0.3491 0.71805 0.000 0.768 0.004 0.228 0.000
#> SRR815092 1 0.0290 0.90147 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1500149 2 0.1908 0.85825 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1100564 1 0.0510 0.89814 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1403072 5 0.1732 0.78182 0.000 0.000 0.000 0.080 0.920
#> SRR811653 3 0.4714 0.58579 0.000 0.032 0.644 0.324 0.000
#> SRR1311348 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1489438 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1435442 2 0.4235 0.27726 0.000 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.79962 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1319520 1 0.0162 0.90275 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1444763 1 0.3857 0.56630 0.688 0.000 0.000 0.312 0.000
#> SRR1415026 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1416596 2 0.2230 0.82180 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1485499 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1316078 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR663465 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1310094 2 0.2329 0.81406 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR663537 2 0.0703 0.88872 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1486780 1 0.0162 0.90275 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0162 0.90275 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR613318 3 0.1792 0.78382 0.000 0.000 0.916 0.084 0.000
#> SRR1332694 1 0.0162 0.90269 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1468469 3 0.0609 0.79825 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR818670 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1120318 1 0.3667 0.76051 0.812 0.000 0.000 0.140 0.048
#> SRR1311622 3 0.4251 0.58887 0.000 0.000 0.672 0.316 0.012
#> SRR1500931 5 0.0510 0.79927 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1387494 3 0.0510 0.79849 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1379175 2 0.5571 0.39587 0.000 0.600 0.020 0.332 0.048
#> SRR1401909 5 0.0609 0.79622 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1440541 3 0.4065 0.45198 0.000 0.264 0.720 0.016 0.000
#> SRR1068832 5 0.0510 0.79732 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1376640 2 0.0290 0.88976 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1085712 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1082283 1 0.3586 0.63365 0.736 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1084276 5 0.0290 0.79938 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1353262 2 0.1341 0.88046 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1437035 5 0.2236 0.74522 0.068 0.000 0.000 0.024 0.908
#> SRR1396877 3 0.7732 -0.00715 0.164 0.000 0.424 0.092 0.320
#> SRR1443026 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.3419 0.70167 0.000 0.804 0.000 0.016 0.180
#> SRR1101128 5 0.0404 0.79880 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1363886 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR612983 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1394366 2 0.4397 0.26288 0.000 0.564 0.004 0.432 0.000
#> SRR1093218 3 0.2230 0.76115 0.000 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1077090 5 0.1043 0.78938 0.000 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1327430 2 0.2732 0.79253 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1088958 1 0.0162 0.90275 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1486931 2 0.1478 0.88021 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR614335 2 0.2929 0.77351 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR660534 2 0.1764 0.87397 0.000 0.928 0.008 0.064 0.000
#> SRR817094 2 0.0290 0.88962 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1334265 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1456401 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1086393 1 0.0162 0.90275 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1351521 3 0.0162 0.79936 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1093100 2 0.3961 0.63457 0.000 0.736 0.016 0.248 0.000
#> SRR1309382 1 0.0703 0.89407 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1089375 5 0.3730 0.72170 0.004 0.000 0.028 0.168 0.800
#> SRR1499482 2 0.1043 0.88690 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR614719 2 0.2208 0.85283 0.000 0.908 0.020 0.072 0.000
#> SRR1081473 5 0.3934 0.65189 0.000 0.000 0.124 0.076 0.800
#> SRR1087415 1 0.0162 0.90275 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1088217 5 0.2516 0.75043 0.000 0.000 0.000 0.140 0.860
#> SRR808496 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1336463 2 0.0963 0.88626 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR612359 3 0.5604 0.06628 0.000 0.456 0.472 0.072 0.000
#> SRR1444412 5 0.0162 0.79920 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1074116 5 0.0992 0.79495 0.000 0.000 0.024 0.008 0.968
#> SRR821846 3 0.0000 0.79962 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR808914 1 0.0566 0.89828 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004
#> SRR1349099 4 0.6059 0.32965 0.244 0.000 0.184 0.572 0.000
#> SRR1337886 2 0.1121 0.88530 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR813632 1 0.1750 0.86873 0.936 0.000 0.000 0.028 0.036
#> SRR1101591 5 0.4367 0.27119 0.000 0.000 0.416 0.004 0.580
#> SRR1089713 5 0.2462 0.76494 0.000 0.000 0.008 0.112 0.880
#> SRR1453127 3 0.0000 0.79962 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 5 0.1851 0.77524 0.000 0.000 0.000 0.088 0.912
#> SRR1313831 1 0.0162 0.90269 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1315434 3 0.0404 0.79920 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR814747 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1358539 1 0.0162 0.90269 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1367807 1 0.0162 0.90275 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1365791 3 0.4015 0.39377 0.000 0.000 0.652 0.348 0.000
#> SRR1081519 5 0.3752 0.71567 0.000 0.000 0.064 0.124 0.812
#> SRR614707 2 0.4430 0.20593 0.000 0.540 0.004 0.456 0.000
#> SRR1094027 1 0.0162 0.90269 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1489092 3 0.6618 -0.06039 0.000 0.000 0.452 0.304 0.244
#> SRR1079502 5 0.0771 0.79830 0.000 0.000 0.004 0.020 0.976
#> SRR1457814 3 0.3266 0.73437 0.000 0.004 0.796 0.200 0.000
#> SRR1455127 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR615081 2 0.3752 0.55388 0.000 0.708 0.000 0.292 0.000
#> SRR1327855 5 0.0510 0.79732 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1417873 2 0.2179 0.82603 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1394125 3 0.5589 0.40569 0.000 0.000 0.628 0.128 0.244
#> SRR1488388 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.2773 0.77144 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR612383 3 0.4810 0.53779 0.000 0.204 0.712 0.084 0.000
#> SRR1477711 1 0.0290 0.90147 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1350813 2 0.0609 0.88904 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR612851 2 0.2300 0.85894 0.000 0.904 0.024 0.072 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1340010 3 0.0880 0.79686 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1475885 4 0.5885 0.33817 0.092 0.000 0.100 0.696 0.112
#> SRR1376334 1 0.0162 0.90269 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1399821 1 0.1732 0.85783 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.79962 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612323 3 0.4268 0.63892 0.000 0.144 0.772 0.084 0.000
#> SRR612604 2 0.3932 0.54108 0.000 0.672 0.000 0.328 0.000
#> SRR1389546 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.4260 0.60448 0.680 0.000 0.004 0.308 0.008
#> SRR1101808 2 0.0703 0.88872 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.79962 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1078439 5 0.1792 0.76176 0.000 0.000 0.000 0.084 0.916
#> SRR2165527 2 0.0609 0.88607 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1351147 1 0.8481 -0.21318 0.340 0.000 0.236 0.204 0.220
#> SRR1313536 2 0.0290 0.88865 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1070308 3 0.6273 0.55183 0.100 0.028 0.696 0.096 0.080
#> SRR1403110 1 0.0290 0.90147 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1400355 2 0.1043 0.88680 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1401317 5 0.0404 0.79803 0.000 0.000 0.000 0.012 0.988
#> SRR1456862 1 0.4114 0.52038 0.624 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1074622 1 0.0162 0.90275 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1465847 5 0.4150 0.66289 0.004 0.000 0.140 0.068 0.788
#> SRR1443376 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.79962 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.5263 0.51561 0.000 0.176 0.680 0.144 0.000
#> SRR612251 2 0.5606 0.25215 0.000 0.568 0.344 0.088 0.000
#> SRR1418581 1 0.0162 0.90275 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR658045 2 0.1043 0.88691 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR613214 3 0.4808 0.59001 0.000 0.168 0.724 0.108 0.000
#> SRR613078 2 0.2813 0.79003 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000
#> SRR1472998 5 0.0609 0.79679 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1433452 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.3242 0.70569 0.000 0.000 0.784 0.216 0.000
#> SRR1465983 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1380375 1 0.0162 0.90269 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1367566 3 0.0290 0.79945 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1316151 4 0.4291 -0.02831 0.000 0.464 0.000 0.536 0.000
#> SRR1417547 2 0.2377 0.80979 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR659389 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1490270 2 0.1341 0.87998 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1398207 5 0.2439 0.75839 0.004 0.000 0.000 0.120 0.876
#> SRR1358755 5 0.0880 0.79569 0.000 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1078903 2 0.1894 0.87220 0.000 0.920 0.008 0.072 0.000
#> SRR1323252 2 0.0609 0.88904 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1451796 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1369172 1 0.0290 0.90203 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR615982 2 0.1410 0.87746 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1480431 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1429825 2 0.3532 0.76727 0.000 0.832 0.000 0.092 0.076
#> SRR1102393 2 0.0880 0.88743 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1071313 1 0.7688 0.06305 0.424 0.000 0.252 0.260 0.064
#> SRR808351 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0162 0.90269 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1480501 5 0.1205 0.79286 0.000 0.000 0.004 0.040 0.956
#> SRR1081910 3 0.5189 0.57201 0.108 0.000 0.724 0.148 0.020
#> SRR1086611 4 0.5122 0.37970 0.000 0.312 0.060 0.628 0.000
#> SRR1392571 2 0.1544 0.87738 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1311441 1 0.0162 0.90275 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657313 5 0.4914 0.47252 0.000 0.000 0.204 0.092 0.704
#> SRR1433131 2 0.0609 0.88914 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1321011 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1500598 2 0.0404 0.88816 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1379343 2 0.0963 0.88743 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1389108 1 0.0404 0.90034 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1376228 3 0.1638 0.77423 0.000 0.000 0.932 0.004 0.064
#> SRR1399757 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.0162 0.79936 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1464517 3 0.3796 0.61090 0.000 0.000 0.700 0.300 0.000
#> SRR613557 3 0.2172 0.77752 0.000 0.016 0.908 0.076 0.000
#> SRR809831 1 0.5996 0.49081 0.644 0.000 0.192 0.024 0.140
#> SRR1429387 3 0.0162 0.79936 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR816565 1 0.0162 0.90269 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.90332 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.1764 0.78506 0.000 0.000 0.928 0.064 0.008
#> SRR1072031 2 0.0794 0.88825 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1374671 3 0.5478 0.13271 0.000 0.420 0.516 0.064 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 3 0.3171 0.59056 0.000 0.000 0.784 0.204 0.000 0.012
#> SRR1404105 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0937 0.87343 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1472057 5 0.0865 0.79982 0.000 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR614491 3 0.3834 0.65453 0.000 0.004 0.780 0.076 0.000 0.140
#> SRR1069376 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0520 0.87298 0.000 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1361415 2 0.1267 0.86787 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0146 0.90002 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1328073 3 0.6206 0.37092 0.168 0.012 0.592 0.184 0.000 0.044
#> SRR1394209 4 0.5176 0.31485 0.000 0.288 0.108 0.600 0.000 0.004
#> SRR1474018 2 0.1007 0.87258 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.6568 0.00882 0.440 0.000 0.000 0.144 0.356 0.060
#> SRR1500555 6 0.5956 0.46434 0.000 0.052 0.004 0.160 0.168 0.616
#> SRR1354363 1 0.2263 0.82083 0.884 0.000 0.000 0.100 0.000 0.016
#> SRR1391619 3 0.4513 0.61750 0.000 0.000 0.704 0.172 0.000 0.124
#> SRR1307997 2 0.3764 0.75048 0.000 0.796 0.008 0.088 0.000 0.108
#> SRR663124 3 0.5407 0.55890 0.000 0.104 0.680 0.076 0.000 0.140
#> SRR1334670 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 3 0.4801 0.61684 0.000 0.048 0.728 0.084 0.000 0.140
#> SRR1092727 2 0.3196 0.76986 0.000 0.824 0.004 0.036 0.000 0.136
#> SRR1364013 2 0.2822 0.81510 0.000 0.852 0.000 0.040 0.000 0.108
#> SRR1468553 3 0.0820 0.72189 0.000 0.000 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR1403980 3 0.3757 0.62246 0.000 0.000 0.784 0.164 0.016 0.036
#> SRR1420169 5 0.0865 0.79982 0.000 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1442800 6 0.4008 0.44531 0.000 0.000 0.168 0.044 0.020 0.768
#> SRR1359214 2 0.1327 0.86655 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1499849 5 0.4236 0.73882 0.036 0.000 0.000 0.140 0.768 0.056
#> SRR1500030 3 0.1563 0.71595 0.000 0.000 0.932 0.056 0.000 0.012
#> SRR1093053 5 0.4232 0.63685 0.000 0.000 0.000 0.168 0.732 0.100
#> SRR1399843 4 0.5907 0.42360 0.000 0.012 0.064 0.620 0.228 0.076
#> SRR1380231 5 0.5443 0.65958 0.000 0.000 0.120 0.156 0.668 0.056
#> SRR809470 6 0.6408 0.35901 0.040 0.000 0.100 0.048 0.220 0.592
#> SRR614239 3 0.5938 0.48317 0.000 0.152 0.624 0.084 0.000 0.140
#> SRR613939 6 0.3719 0.52450 0.000 0.248 0.000 0.024 0.000 0.728
#> SRR612971 2 0.0937 0.87343 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0909 0.87217 0.000 0.968 0.000 0.012 0.000 0.020
#> SRR811357 2 0.0909 0.87154 0.000 0.968 0.000 0.020 0.000 0.012
#> SRR1471672 1 0.0713 0.88764 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.2784 0.79290 0.000 0.848 0.000 0.028 0.000 0.124
#> SRR1469570 2 0.0291 0.87430 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1457354 2 0.1075 0.87174 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.3955 0.19796 0.000 0.000 0.560 0.436 0.000 0.004
#> SRR1079023 1 0.0405 0.89794 0.988 0.000 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR813608 2 0.0405 0.87351 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1096736 4 0.6026 0.32892 0.168 0.000 0.296 0.516 0.000 0.020
#> SRR1478700 1 0.3804 0.46486 0.656 0.000 0.000 0.336 0.000 0.008
#> SRR1081543 3 0.0717 0.72277 0.000 0.000 0.976 0.016 0.000 0.008
#> SRR1384754 3 0.4152 0.15030 0.000 0.000 0.548 0.440 0.000 0.012
#> SRR612287 2 0.1007 0.87258 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1380317 4 0.5990 0.26472 0.000 0.312 0.120 0.532 0.000 0.036
#> SRR1315247 6 0.3649 0.52725 0.000 0.036 0.000 0.016 0.152 0.796
#> SRR1105344 2 0.1007 0.87258 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR658549 3 0.4913 0.60754 0.000 0.060 0.720 0.076 0.000 0.144
#> SRR1480240 1 0.1814 0.83789 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0508 0.87430 0.000 0.984 0.000 0.004 0.000 0.012
#> SRR612551 2 0.0937 0.87343 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1358520 4 0.3862 -0.09489 0.000 0.476 0.000 0.524 0.000 0.000
#> SRR1419476 5 0.3918 0.76362 0.000 0.000 0.048 0.108 0.800 0.044
#> SRR1456075 4 0.5970 0.44586 0.012 0.000 0.196 0.592 0.180 0.020
#> SRR1389474 2 0.0520 0.87298 0.000 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1367005 1 0.0363 0.89670 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.2378 0.76673 0.848 0.000 0.000 0.152 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.2019 0.70004 0.000 0.000 0.900 0.088 0.000 0.012
#> SRR1095985 6 0.4263 0.03047 0.000 0.000 0.000 0.016 0.480 0.504
#> SRR1325771 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.1542 0.72077 0.000 0.000 0.936 0.008 0.052 0.004
#> SRR660272 2 0.0993 0.86958 0.000 0.964 0.000 0.012 0.000 0.024
#> SRR1332993 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0717 0.87230 0.000 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR808044 1 0.0806 0.88824 0.972 0.000 0.000 0.020 0.000 0.008
#> SRR1076916 6 0.4966 0.41800 0.000 0.000 0.196 0.076 0.036 0.692
#> SRR1356266 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0937 0.87343 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.2572 0.78987 0.852 0.000 0.000 0.136 0.012 0.000
#> SRR1072948 3 0.4484 0.47613 0.000 0.000 0.672 0.056 0.268 0.004
#> SRR1472370 5 0.0865 0.79982 0.000 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1480176 1 0.2643 0.80105 0.856 0.000 0.008 0.128 0.000 0.008
#> SRR613843 2 0.0405 0.87551 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1469192 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0935 0.72615 0.000 0.000 0.964 0.004 0.000 0.032
#> SRR659839 2 0.0993 0.87022 0.000 0.964 0.000 0.012 0.000 0.024
#> SRR659533 3 0.5898 0.46867 0.000 0.168 0.616 0.060 0.000 0.156
#> SRR1362848 3 0.4116 0.20288 0.000 0.000 0.572 0.416 0.000 0.012
#> SRR1407492 3 0.3917 0.65444 0.000 0.012 0.780 0.064 0.000 0.144
#> SRR1455082 2 0.1625 0.85462 0.000 0.928 0.000 0.012 0.000 0.060
#> SRR658362 2 0.1411 0.86930 0.000 0.936 0.000 0.060 0.000 0.004
#> SRR810921 2 0.0820 0.87236 0.000 0.972 0.000 0.016 0.000 0.012
#> SRR662823 2 0.2664 0.77600 0.000 0.816 0.000 0.184 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.2553 0.67121 0.000 0.000 0.848 0.008 0.144 0.000
#> SRR818232 1 0.0713 0.88963 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.5381 0.57198 0.000 0.096 0.684 0.084 0.000 0.136
#> SRR1474816 2 0.1391 0.86216 0.000 0.944 0.000 0.040 0.000 0.016
#> SRR1342002 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0972 0.87711 0.000 0.964 0.000 0.028 0.000 0.008
#> SRR1466400 6 0.3547 0.53475 0.000 0.300 0.000 0.004 0.000 0.696
#> SRR658921 6 0.3371 0.54172 0.000 0.292 0.000 0.000 0.000 0.708
#> SRR1499873 2 0.0000 0.87530 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 5 0.5037 0.67307 0.008 0.000 0.000 0.224 0.652 0.116
#> SRR1379324 1 0.4444 0.15252 0.536 0.000 0.000 0.028 0.000 0.436
#> SRR1345307 2 0.2006 0.83723 0.000 0.904 0.000 0.080 0.000 0.016
#> SRR1396166 3 0.0993 0.72060 0.000 0.000 0.964 0.024 0.000 0.012
#> SRR1086280 3 0.3164 0.66949 0.000 0.000 0.844 0.104 0.020 0.032
#> SRR1454891 2 0.1838 0.84633 0.000 0.916 0.000 0.016 0.000 0.068
#> SRR663185 2 0.3266 0.66237 0.000 0.728 0.000 0.272 0.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0260 0.89911 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1318920 6 0.3672 0.34281 0.368 0.000 0.000 0.000 0.000 0.632
#> SRR656758 2 0.1500 0.85724 0.000 0.936 0.000 0.012 0.000 0.052
#> SRR1474351 1 0.0260 0.89911 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.2815 0.80205 0.000 0.848 0.000 0.032 0.000 0.120
#> SRR1472687 2 0.0790 0.87480 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.4799 0.48809 0.000 0.652 0.008 0.268 0.000 0.072
#> SRR1415153 2 0.3165 0.78525 0.000 0.836 0.008 0.040 0.000 0.116
#> SRR1323271 2 0.3409 0.61826 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.1082 0.86882 0.000 0.956 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR1443161 4 0.5569 0.31642 0.000 0.000 0.000 0.540 0.280 0.180
#> SRR614695 6 0.4186 0.52131 0.000 0.180 0.024 0.044 0.000 0.752
#> SRR1092372 6 0.4026 0.35667 0.348 0.000 0.000 0.016 0.000 0.636
#> SRR1474577 1 0.0260 0.89796 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.2147 0.83289 0.000 0.896 0.000 0.020 0.000 0.084
#> SRR1089006 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 5 0.1092 0.80960 0.000 0.000 0.000 0.020 0.960 0.020
#> SRR1105463 5 0.2728 0.78229 0.000 0.000 0.000 0.100 0.860 0.040
#> SRR811005 2 0.0405 0.87351 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1385319 1 0.4787 0.41157 0.608 0.000 0.000 0.032 0.020 0.340
#> SRR1325871 3 0.3822 0.65862 0.000 0.000 0.776 0.096 0.000 0.128
#> SRR1355415 5 0.1575 0.80440 0.000 0.000 0.000 0.032 0.936 0.032
#> SRR1090861 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 3 0.3690 0.48038 0.000 0.000 0.700 0.288 0.000 0.012
#> SRR1470075 1 0.3076 0.65608 0.760 0.000 0.000 0.240 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 4 0.5335 0.20213 0.412 0.000 0.000 0.492 0.092 0.004
#> SRR1321165 6 0.5398 0.43479 0.088 0.000 0.000 0.040 0.232 0.640
#> SRR1092112 5 0.4026 0.42687 0.000 0.000 0.000 0.012 0.612 0.376
#> SRR1417588 3 0.0260 0.72572 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1074790 1 0.5619 0.49999 0.632 0.016 0.020 0.228 0.000 0.104
#> SRR1432106 2 0.0937 0.87389 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.2573 0.80362 0.000 0.864 0.000 0.024 0.000 0.112
#> SRR1458314 4 0.6297 0.16665 0.272 0.000 0.000 0.360 0.360 0.008
#> SRR1318582 2 0.1334 0.86545 0.000 0.948 0.000 0.032 0.000 0.020
#> SRR1080484 2 0.3634 0.51342 0.000 0.644 0.000 0.356 0.000 0.000
#> SRR1072749 1 0.4422 0.53358 0.680 0.000 0.000 0.068 0.252 0.000
#> SRR1078586 1 0.0622 0.89445 0.980 0.000 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1400333 6 0.3239 0.55841 0.000 0.152 0.000 0.024 0.008 0.816
#> SRR1078834 6 0.5326 0.40201 0.000 0.332 0.012 0.088 0.000 0.568
#> SRR1417611 2 0.3620 0.52091 0.000 0.648 0.000 0.352 0.000 0.000
#> SRR1396840 6 0.5644 0.44760 0.064 0.000 0.000 0.100 0.196 0.640
#> SRR1465440 2 0.0865 0.87418 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0777 0.87571 0.000 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR614984 3 0.5290 0.56733 0.000 0.096 0.688 0.068 0.000 0.148
#> SRR1324269 1 0.2001 0.85029 0.912 0.000 0.000 0.068 0.008 0.012
#> SRR1401491 2 0.0935 0.87526 0.000 0.964 0.000 0.032 0.000 0.004
#> SRR1319443 1 0.1625 0.86175 0.928 0.000 0.000 0.060 0.012 0.000
#> SRR1324349 2 0.5022 0.60132 0.028 0.692 0.000 0.112 0.000 0.168
#> SRR1345523 2 0.0508 0.87565 0.000 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1500846 1 0.3450 0.74324 0.808 0.000 0.000 0.148 0.032 0.012
#> SRR661505 5 0.0713 0.80227 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1419062 5 0.4301 0.74278 0.000 0.000 0.028 0.144 0.760 0.068
#> SRR1480131 5 0.3782 0.75113 0.004 0.000 0.000 0.140 0.784 0.072
#> SRR1421284 2 0.3867 0.16791 0.000 0.512 0.000 0.488 0.000 0.000
#> SRR1329624 1 0.0146 0.90056 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0767 0.72503 0.000 0.000 0.976 0.004 0.012 0.008
#> SRR1099189 2 0.0790 0.87529 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.2838 0.79634 0.852 0.000 0.000 0.116 0.028 0.004
#> SRR1091890 3 0.0820 0.72306 0.000 0.000 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR1347436 2 0.4815 0.46415 0.000 0.644 0.000 0.284 0.012 0.060
#> SRR1327473 1 0.6575 0.04741 0.468 0.000 0.324 0.156 0.004 0.048
#> SRR1338195 3 0.0603 0.72500 0.000 0.000 0.980 0.016 0.000 0.004
#> SRR809698 2 0.0146 0.87461 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1457792 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0993 0.86986 0.000 0.964 0.000 0.012 0.000 0.024
#> SRR1339597 1 0.3582 0.67617 0.768 0.000 0.000 0.036 0.196 0.000
#> SRR1454842 3 0.5513 0.58246 0.000 0.004 0.664 0.128 0.044 0.160
#> SRR1322643 1 0.1663 0.84307 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.3168 0.67613 0.000 0.000 0.828 0.056 0.000 0.116
#> SRR1354620 5 0.0858 0.80868 0.000 0.000 0.000 0.028 0.968 0.004
#> SRR615056 2 0.2509 0.85020 0.000 0.876 0.000 0.088 0.000 0.036
#> SRR1105320 3 0.5731 0.49159 0.060 0.000 0.648 0.216 0.028 0.048
#> SRR1391529 5 0.3979 0.50355 0.264 0.000 0.000 0.020 0.708 0.008
#> SRR663052 3 0.5467 0.54162 0.000 0.152 0.672 0.076 0.000 0.100
#> SRR1478834 1 0.5035 0.62268 0.704 0.000 0.000 0.128 0.128 0.040
#> SRR812366 2 0.0937 0.87343 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.0291 0.72532 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR615383 2 0.0891 0.87128 0.000 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1389157 3 0.5333 0.56509 0.000 0.100 0.684 0.068 0.000 0.148
#> SRR613568 2 0.1779 0.84899 0.000 0.920 0.000 0.016 0.000 0.064
#> SRR614095 2 0.2875 0.82481 0.000 0.852 0.000 0.052 0.000 0.096
#> SRR1103092 1 0.5696 0.46784 0.612 0.000 0.000 0.132 0.220 0.036
#> SRR1337155 5 0.1349 0.80556 0.000 0.000 0.000 0.004 0.940 0.056
#> SRR1475345 2 0.0937 0.87343 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.1297 0.86553 0.000 0.948 0.000 0.012 0.000 0.040
#> SRR1446180 6 0.3825 0.46369 0.000 0.004 0.000 0.032 0.220 0.744
#> SRR1406372 2 0.2070 0.83634 0.000 0.892 0.000 0.008 0.000 0.100
#> SRR1339880 3 0.2446 0.67638 0.000 0.000 0.864 0.124 0.000 0.012
#> SRR1353136 3 0.4970 0.32680 0.000 0.000 0.540 0.396 0.004 0.060
#> SRR1093906 3 0.0653 0.72673 0.000 0.000 0.980 0.012 0.004 0.004
#> SRR614035 2 0.1720 0.86988 0.000 0.928 0.000 0.040 0.000 0.032
#> SRR1351104 1 0.3647 0.41309 0.640 0.000 0.000 0.360 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.3309 0.65319 0.000 0.720 0.000 0.280 0.000 0.000
#> SRR1399861 3 0.6933 0.10472 0.000 0.112 0.404 0.356 0.000 0.128
#> SRR1338789 6 0.6050 0.31903 0.304 0.000 0.000 0.084 0.068 0.544
#> SRR1421420 3 0.3858 0.62736 0.000 0.000 0.800 0.068 0.108 0.024
#> SRR1420832 2 0.1327 0.86640 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.6769 0.44667 0.000 0.068 0.516 0.156 0.012 0.248
#> SRR1315041 2 0.3592 0.53656 0.000 0.656 0.000 0.344 0.000 0.000
#> SRR661877 2 0.1814 0.84685 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000 0.000
#> SRR1443268 5 0.6203 -0.15600 0.276 0.000 0.000 0.336 0.384 0.004
#> SRR1416617 3 0.1713 0.71555 0.000 0.000 0.928 0.044 0.000 0.028
#> SRR1102443 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655672 2 0.6585 0.15049 0.000 0.480 0.304 0.068 0.000 0.148
#> SRR1420006 3 0.0551 0.72590 0.000 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1458267 2 0.4050 0.72397 0.000 0.776 0.012 0.108 0.000 0.104
#> SRR613819 2 0.3354 0.80567 0.000 0.812 0.000 0.128 0.000 0.060
#> SRR1469432 2 0.0603 0.87575 0.000 0.980 0.000 0.016 0.000 0.004
#> SRR660907 2 0.1007 0.87258 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.2480 0.81597 0.000 0.872 0.000 0.104 0.000 0.024
#> SRR1470727 1 0.1794 0.85783 0.924 0.000 0.000 0.040 0.036 0.000
#> SRR1339153 3 0.6206 0.47398 0.000 0.000 0.572 0.156 0.064 0.208
#> SRR1472749 3 0.2771 0.68696 0.000 0.000 0.852 0.032 0.000 0.116
#> SRR1414379 2 0.3868 0.15413 0.000 0.508 0.000 0.492 0.000 0.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 6 0.4843 0.54072 0.000 0.232 0.000 0.116 0.000 0.652
#> SRR1098312 3 0.1890 0.71177 0.000 0.000 0.916 0.060 0.000 0.024
#> SRR810273 2 0.0520 0.87298 0.000 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1376000 2 0.0622 0.87278 0.000 0.980 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR614467 2 0.4941 0.41935 0.000 0.572 0.004 0.360 0.000 0.064
#> SRR811471 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.1341 0.72168 0.000 0.000 0.948 0.028 0.000 0.024
#> SRR1088606 6 0.3963 0.48475 0.000 0.000 0.000 0.080 0.164 0.756
#> SRR1479699 3 0.1720 0.71954 0.000 0.000 0.928 0.040 0.000 0.032
#> SRR1403589 2 0.0520 0.87298 0.000 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR812625 6 0.3175 0.55795 0.000 0.256 0.000 0.000 0.000 0.744
#> SRR1359803 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.1007 0.87258 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.1082 0.87432 0.000 0.956 0.000 0.040 0.000 0.004
#> SRR1378992 1 0.1267 0.86377 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR659427 4 0.5245 0.34407 0.000 0.116 0.000 0.560 0.324 0.000
#> SRR1096638 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 6 0.3807 0.47067 0.000 0.368 0.000 0.004 0.000 0.628
#> SRR659307 3 0.5220 0.57353 0.000 0.096 0.696 0.068 0.000 0.140
#> SRR1439994 5 0.2624 0.72026 0.004 0.000 0.000 0.148 0.844 0.004
#> SRR1454931 1 0.6631 0.36879 0.544 0.000 0.000 0.136 0.148 0.172
#> SRR1332928 4 0.4072 0.08128 0.000 0.000 0.000 0.544 0.448 0.008
#> SRR658621 2 0.2046 0.86462 0.000 0.908 0.000 0.060 0.000 0.032
#> SRR1095840 1 0.0260 0.89911 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.6115 0.39191 0.588 0.000 0.000 0.160 0.188 0.064
#> SRR1374270 3 0.4012 0.60625 0.000 0.032 0.728 0.232 0.000 0.008
#> SRR1470947 2 0.1007 0.87258 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1365598 6 0.3240 0.57549 0.000 0.144 0.000 0.028 0.008 0.820
#> SRR662787 2 0.3464 0.59713 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000 0.000
#> SRR1408727 2 0.5115 0.07809 0.000 0.464 0.000 0.456 0.000 0.080
#> SRR1456274 6 0.6660 -0.06730 0.028 0.000 0.308 0.308 0.000 0.356
#> SRR817744 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.1007 0.87258 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0632 0.87573 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1102680 5 0.4975 0.62753 0.000 0.000 0.184 0.096 0.692 0.028
#> SRR1374198 1 0.2996 0.67021 0.772 0.000 0.000 0.000 0.000 0.228
#> SRR1445856 5 0.4131 0.52749 0.000 0.000 0.000 0.040 0.688 0.272
#> SRR820049 5 0.3213 0.72226 0.000 0.000 0.004 0.084 0.836 0.076
#> SRR1375290 3 0.7151 0.27228 0.000 0.004 0.432 0.116 0.296 0.152
#> SRR818999 5 0.4269 0.73962 0.012 0.000 0.004 0.144 0.760 0.080
#> SRR1390242 1 0.0260 0.89911 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1401164 6 0.3428 0.53275 0.000 0.304 0.000 0.000 0.000 0.696
#> SRR1454629 5 0.0260 0.80709 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR1332187 3 0.1418 0.72214 0.000 0.000 0.944 0.024 0.000 0.032
#> SRR603365 5 0.0865 0.79982 0.000 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR657833 2 0.1367 0.86220 0.000 0.944 0.000 0.012 0.000 0.044
#> SRR1436207 2 0.2706 0.74926 0.000 0.832 0.000 0.008 0.160 0.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0717 0.87282 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1480384 1 0.1007 0.87587 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1364761 2 0.0891 0.87329 0.000 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1308086 3 0.3287 0.57246 0.000 0.000 0.768 0.220 0.000 0.012
#> SRR1441868 1 0.0146 0.90002 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1485380 5 0.0632 0.80338 0.000 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.1720 0.86988 0.000 0.928 0.000 0.040 0.000 0.032
#> SRR1452356 2 0.1075 0.87164 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0520 0.87298 0.000 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1100346 3 0.6324 0.23448 0.000 0.324 0.496 0.056 0.000 0.124
#> SRR1332816 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612299 6 0.4011 0.47929 0.000 0.304 0.000 0.024 0.000 0.672
#> SRR1407386 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.1003 0.87091 0.000 0.964 0.000 0.020 0.000 0.016
#> SRR1309403 3 0.5874 0.48707 0.028 0.004 0.640 0.220 0.068 0.040
#> SRR1498395 2 0.1921 0.85063 0.000 0.916 0.000 0.052 0.000 0.032
#> SRR1079998 5 0.0865 0.79982 0.000 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1498885 2 0.3390 0.62405 0.000 0.704 0.000 0.296 0.000 0.000
#> SRR1337215 6 0.3684 0.50999 0.000 0.332 0.000 0.004 0.000 0.664
#> SRR1414749 5 0.4693 0.28715 0.000 0.000 0.424 0.016 0.540 0.020
#> SRR1365963 4 0.6231 0.39832 0.244 0.000 0.016 0.544 0.180 0.016
#> SRR1368030 2 0.2823 0.75539 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000 0.000
#> SRR1419760 2 0.4992 0.58748 0.000 0.684 0.016 0.160 0.000 0.140
#> SRR1381841 6 0.6213 0.23745 0.368 0.000 0.000 0.048 0.112 0.472
#> SRR821388 3 0.1563 0.71327 0.000 0.000 0.932 0.056 0.000 0.012
#> SRR657623 2 0.3244 0.66943 0.000 0.732 0.000 0.268 0.000 0.000
#> SRR1094241 5 0.5252 0.53998 0.000 0.000 0.148 0.132 0.680 0.040
#> SRR819583 5 0.0622 0.80882 0.000 0.000 0.000 0.008 0.980 0.012
#> SRR1096149 1 0.3823 0.21319 0.564 0.000 0.000 0.436 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.1841 0.71569 0.000 0.000 0.920 0.008 0.064 0.008
#> SRR1353028 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.3512 0.64995 0.000 0.000 0.808 0.140 0.012 0.040
#> SRR1311666 2 0.0717 0.87251 0.000 0.976 0.000 0.016 0.000 0.008
#> SRR1486698 2 0.3938 0.45521 0.000 0.660 0.000 0.016 0.000 0.324
#> SRR1446436 2 0.5058 0.57865 0.000 0.676 0.024 0.100 0.000 0.200
#> SRR815092 1 0.0260 0.89911 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.1074 0.87073 0.000 0.960 0.000 0.012 0.000 0.028
#> SRR1100564 1 0.0865 0.88481 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1403072 5 0.3039 0.79040 0.000 0.000 0.020 0.052 0.860 0.068
#> SRR811653 4 0.5830 0.13344 0.000 0.040 0.324 0.544 0.000 0.092
#> SRR1311348 2 0.0909 0.87196 0.000 0.968 0.000 0.020 0.000 0.012
#> SRR1489438 2 0.0937 0.87389 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1435442 6 0.4209 0.45463 0.000 0.396 0.000 0.012 0.004 0.588
#> SRR1421444 3 0.0000 0.72556 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0937 0.87343 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 6 0.4002 0.37756 0.320 0.000 0.000 0.020 0.000 0.660
#> SRR1415026 2 0.0632 0.87559 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.4386 0.46255 0.000 0.652 0.000 0.048 0.000 0.300
#> SRR1485499 2 0.0937 0.87343 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0937 0.87343 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.1075 0.87164 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.3515 0.57627 0.000 0.676 0.000 0.324 0.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0260 0.87402 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1486780 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613318 3 0.3297 0.67758 0.000 0.000 0.820 0.068 0.000 0.112
#> SRR1332694 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.1225 0.71732 0.000 0.000 0.952 0.036 0.000 0.012
#> SRR818670 2 0.1088 0.86935 0.000 0.960 0.000 0.024 0.000 0.016
#> SRR1120318 1 0.3670 0.74056 0.796 0.000 0.000 0.152 0.028 0.024
#> SRR1311622 4 0.4684 0.19067 0.000 0.000 0.380 0.580 0.024 0.016
#> SRR1500931 5 0.0806 0.80884 0.000 0.000 0.000 0.020 0.972 0.008
#> SRR1387494 3 0.1434 0.71507 0.000 0.000 0.940 0.048 0.000 0.012
#> SRR1379175 4 0.6355 0.25125 0.000 0.296 0.000 0.520 0.100 0.084
#> SRR1401909 5 0.0713 0.80227 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1440541 3 0.4821 0.38320 0.000 0.248 0.672 0.056 0.000 0.024
#> SRR1068832 5 0.0547 0.80415 0.000 0.000 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1376640 2 0.0508 0.87694 0.000 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1085712 2 0.0865 0.87418 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.3371 0.57542 0.708 0.000 0.000 0.000 0.000 0.292
#> SRR1084276 5 0.0508 0.80861 0.000 0.000 0.000 0.012 0.984 0.004
#> SRR1353262 2 0.1584 0.85774 0.000 0.928 0.000 0.008 0.000 0.064
#> SRR1437035 5 0.3161 0.78124 0.024 0.000 0.004 0.080 0.856 0.036
#> SRR1396877 3 0.7454 0.02131 0.348 0.000 0.388 0.148 0.084 0.032
#> SRR1443026 2 0.0725 0.87567 0.000 0.976 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1417936 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.4085 0.62728 0.000 0.716 0.000 0.052 0.232 0.000
#> SRR1101128 5 0.1297 0.80672 0.000 0.000 0.000 0.040 0.948 0.012
#> SRR1363886 2 0.1007 0.87258 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.1007 0.87258 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1394366 6 0.3457 0.55680 0.000 0.232 0.000 0.016 0.000 0.752
#> SRR1093218 3 0.3883 0.37963 0.000 0.000 0.656 0.332 0.000 0.012
#> SRR1077090 5 0.1204 0.79165 0.000 0.000 0.000 0.056 0.944 0.000
#> SRR1327430 2 0.4548 0.54550 0.000 0.632 0.000 0.312 0.000 0.056
#> SRR1088958 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.3140 0.79820 0.000 0.844 0.008 0.056 0.000 0.092
#> SRR1086820 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0790 0.87488 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR614335 2 0.4060 0.63157 0.000 0.684 0.000 0.284 0.000 0.032
#> SRR660534 2 0.2822 0.80033 0.000 0.856 0.004 0.032 0.000 0.108
#> SRR817094 2 0.0405 0.87536 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1334265 2 0.1267 0.86894 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.1204 0.86948 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.0146 0.90026 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0405 0.72563 0.000 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1093100 2 0.3869 0.11003 0.000 0.500 0.000 0.500 0.000 0.000
#> SRR1309382 1 0.1555 0.87154 0.940 0.000 0.000 0.040 0.008 0.012
#> SRR1089375 5 0.4914 0.70408 0.000 0.000 0.060 0.176 0.708 0.056
#> SRR1499482 2 0.2651 0.81901 0.000 0.872 0.004 0.036 0.000 0.088
#> SRR614719 2 0.4426 0.69770 0.000 0.752 0.032 0.072 0.000 0.144
#> SRR1081473 5 0.4520 0.64748 0.000 0.000 0.124 0.116 0.740 0.020
#> SRR1087415 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 5 0.3740 0.75021 0.000 0.000 0.000 0.096 0.784 0.120
#> SRR808496 2 0.1075 0.87164 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1336463 2 0.1865 0.87228 0.000 0.920 0.000 0.040 0.000 0.040
#> SRR612359 3 0.6687 0.17724 0.000 0.324 0.456 0.076 0.000 0.144
#> SRR1444412 5 0.0520 0.80833 0.000 0.000 0.000 0.008 0.984 0.008
#> SRR1074116 5 0.1257 0.80281 0.000 0.000 0.028 0.020 0.952 0.000
#> SRR821846 3 0.0520 0.72557 0.000 0.000 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR656095 2 0.0520 0.87298 0.000 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR808914 1 0.1327 0.86646 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1349099 6 0.5330 0.42274 0.028 0.000 0.136 0.148 0.008 0.680
#> SRR1337886 2 0.2266 0.82732 0.000 0.880 0.000 0.012 0.000 0.108
#> SRR813632 1 0.3000 0.80548 0.860 0.000 0.000 0.076 0.048 0.016
#> SRR1101591 5 0.4176 0.33893 0.000 0.000 0.404 0.016 0.580 0.000
#> SRR1089713 5 0.4060 0.74057 0.000 0.000 0.012 0.188 0.752 0.048
#> SRR1453127 3 0.0405 0.72483 0.000 0.000 0.988 0.008 0.000 0.004
#> SRR1498354 5 0.3254 0.76637 0.000 0.000 0.000 0.124 0.820 0.056
#> SRR1313831 1 0.0363 0.89780 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.1367 0.71525 0.000 0.000 0.944 0.044 0.000 0.012
#> SRR814747 2 0.1204 0.86932 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0260 0.89911 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.4176 0.25794 0.000 0.000 0.580 0.016 0.000 0.404
#> SRR1081519 5 0.6559 0.41889 0.000 0.000 0.284 0.140 0.500 0.076
#> SRR614707 6 0.3500 0.53774 0.000 0.204 0.000 0.028 0.000 0.768
#> SRR1094027 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 6 0.5766 0.20863 0.000 0.000 0.376 0.052 0.060 0.512
#> SRR1079502 5 0.2400 0.79087 0.000 0.000 0.016 0.064 0.896 0.024
#> SRR1457814 3 0.4979 0.46769 0.000 0.004 0.604 0.312 0.000 0.080
#> SRR1455127 2 0.0937 0.87343 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR615081 6 0.4131 0.45151 0.000 0.384 0.000 0.016 0.000 0.600
#> SRR1327855 5 0.0713 0.80227 0.000 0.000 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1417873 2 0.3023 0.71873 0.000 0.768 0.000 0.232 0.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.4229 0.59818 0.000 0.000 0.752 0.176 0.028 0.044
#> SRR1488388 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.3695 0.46924 0.000 0.624 0.000 0.376 0.000 0.000
#> SRR612383 3 0.5926 0.48075 0.000 0.152 0.624 0.080 0.000 0.144
#> SRR1477711 1 0.0508 0.89617 0.984 0.000 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1350813 2 0.0603 0.87363 0.000 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR612851 2 0.4195 0.70562 0.000 0.768 0.040 0.044 0.000 0.148
#> SRR1086349 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0937 0.87343 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.1686 0.70758 0.000 0.000 0.924 0.064 0.000 0.012
#> SRR1475885 6 0.4664 0.46459 0.016 0.000 0.084 0.140 0.016 0.744
#> SRR1376334 1 0.0458 0.89579 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.3592 0.44773 0.656 0.000 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1347042 3 0.0363 0.72519 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000 0.000
#> SRR612323 3 0.5495 0.55594 0.000 0.100 0.672 0.084 0.000 0.144
#> SRR612604 6 0.4109 0.38709 0.000 0.412 0.000 0.012 0.000 0.576
#> SRR1389546 2 0.0622 0.87278 0.000 0.980 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1311877 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 4 0.4900 0.24360 0.400 0.000 0.000 0.548 0.040 0.012
#> SRR1101808 2 0.0291 0.87430 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1414079 3 0.0291 0.72481 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1331153 2 0.0622 0.87265 0.000 0.980 0.000 0.008 0.000 0.012
#> SRR1078439 5 0.2308 0.77399 0.000 0.000 0.000 0.068 0.892 0.040
#> SRR2165527 2 0.1444 0.86291 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.7954 -0.07094 0.368 0.000 0.292 0.192 0.056 0.092
#> SRR1313536 2 0.0865 0.87418 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1070308 3 0.6280 0.38543 0.132 0.012 0.588 0.220 0.004 0.044
#> SRR1403110 1 0.0865 0.88464 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.2361 0.82728 0.000 0.884 0.000 0.028 0.000 0.088
#> SRR1401317 5 0.0632 0.80332 0.000 0.000 0.000 0.024 0.976 0.000
#> SRR1456862 6 0.5806 0.28444 0.296 0.000 0.000 0.172 0.008 0.524
#> SRR1074622 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 5 0.6661 0.43139 0.008 0.000 0.276 0.132 0.512 0.072
#> SRR1443376 2 0.0622 0.87278 0.000 0.980 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1471312 3 0.0458 0.72481 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.5870 0.53127 0.000 0.108 0.632 0.096 0.000 0.164
#> SRR612251 2 0.6453 0.41356 0.000 0.568 0.164 0.128 0.000 0.140
#> SRR1418581 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.1049 0.87109 0.000 0.960 0.000 0.008 0.000 0.032
#> SRR613214 3 0.5915 0.51923 0.000 0.104 0.620 0.088 0.000 0.188
#> SRR613078 2 0.3300 0.76279 0.000 0.816 0.000 0.024 0.012 0.148
#> SRR1472998 5 0.0865 0.79982 0.000 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1433452 2 0.0622 0.87278 0.000 0.980 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR1101957 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.3937 0.24732 0.000 0.000 0.572 0.424 0.000 0.004
#> SRR1465983 2 0.0520 0.87298 0.000 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1380375 1 0.0146 0.90056 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0914 0.72274 0.000 0.000 0.968 0.016 0.000 0.016
#> SRR1316151 6 0.4475 0.54334 0.000 0.220 0.000 0.088 0.000 0.692
#> SRR1417547 2 0.3446 0.60417 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0937 0.87343 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.1088 0.86824 0.000 0.960 0.000 0.016 0.000 0.024
#> SRR1398207 5 0.3872 0.74690 0.000 0.000 0.004 0.144 0.776 0.076
#> SRR1358755 5 0.2680 0.78254 0.000 0.000 0.000 0.108 0.860 0.032
#> SRR1078903 2 0.3860 0.73480 0.000 0.792 0.020 0.056 0.000 0.132
#> SRR1323252 2 0.0146 0.87461 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1451796 2 0.0520 0.87298 0.000 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1369172 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.3505 0.75397 0.000 0.808 0.008 0.048 0.000 0.136
#> SRR1480431 2 0.0937 0.87343 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.4159 0.69190 0.000 0.736 0.000 0.176 0.088 0.000
#> SRR1102393 2 0.0717 0.87349 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1071313 4 0.6852 0.32787 0.136 0.000 0.304 0.480 0.064 0.016
#> SRR808351 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0146 0.90056 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1480501 5 0.2786 0.76499 0.000 0.000 0.024 0.100 0.864 0.012
#> SRR1081910 3 0.5588 0.54459 0.068 0.000 0.684 0.160 0.024 0.064
#> SRR1086611 6 0.2182 0.54743 0.000 0.068 0.008 0.020 0.000 0.904
#> SRR1392571 2 0.2926 0.79162 0.000 0.844 0.004 0.028 0.000 0.124
#> SRR1311441 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657313 5 0.4617 0.61298 0.000 0.000 0.028 0.100 0.736 0.136
#> SRR1433131 2 0.0291 0.87493 0.000 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1321011 2 0.0713 0.87532 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.1007 0.87258 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.1461 0.86068 0.000 0.940 0.000 0.016 0.000 0.044
#> SRR1389108 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.1511 0.71732 0.000 0.000 0.940 0.004 0.044 0.012
#> SRR1399757 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.0405 0.72574 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR1464517 4 0.4389 0.06381 0.000 0.000 0.444 0.536 0.008 0.012
#> SRR613557 3 0.4162 0.64525 0.000 0.020 0.768 0.072 0.000 0.140
#> SRR809831 1 0.6124 0.31766 0.556 0.000 0.280 0.124 0.024 0.016
#> SRR1429387 3 0.0820 0.72505 0.000 0.000 0.972 0.016 0.000 0.012
#> SRR816565 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.90176 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.4584 0.54618 0.000 0.000 0.724 0.128 0.136 0.012
#> SRR1072031 2 0.0405 0.87351 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1374671 3 0.6365 0.32751 0.000 0.248 0.540 0.068 0.000 0.144
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.351 0.515 0.755 0.3915 0.791 0.791
#> 3 3 0.494 0.736 0.860 0.5656 0.578 0.472
#> 4 4 0.576 0.678 0.813 0.1197 0.950 0.871
#> 5 5 0.650 0.625 0.772 0.0680 0.932 0.805
#> 6 6 0.644 0.608 0.739 0.0569 0.917 0.728
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 2 0.6712 0.4334 0.176 0.824
#> SRR1404105 2 0.0938 0.4875 0.012 0.988
#> SRR2164936 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1472057 1 0.9993 0.9356 0.516 0.484
#> SRR614491 2 0.9286 0.6733 0.344 0.656
#> SRR1069376 2 0.0938 0.4870 0.012 0.988
#> SRR811964 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1361415 2 0.9815 0.6829 0.420 0.580
#> SRR1345715 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1328073 2 0.4022 0.5444 0.080 0.920
#> SRR1394209 2 0.8861 0.6509 0.304 0.696
#> SRR1474018 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1099809 2 0.7528 -0.0614 0.216 0.784
#> SRR1500555 2 0.9460 0.6800 0.364 0.636
#> SRR1354363 2 0.0672 0.4918 0.008 0.992
#> SRR1391619 2 0.9993 -0.8773 0.484 0.516
#> SRR1307997 2 0.9580 0.6856 0.380 0.620
#> SRR663124 2 0.9491 0.6716 0.368 0.632
#> SRR1334670 2 0.1633 0.4731 0.024 0.976
#> SRR612515 2 0.9491 0.6716 0.368 0.632
#> SRR1092727 2 0.9815 0.6829 0.420 0.580
#> SRR1364013 2 0.9661 0.6868 0.392 0.608
#> SRR1468553 1 0.9922 0.9636 0.552 0.448
#> SRR1403980 1 0.9944 0.9597 0.544 0.456
#> SRR1420169 2 0.9922 -0.8103 0.448 0.552
#> SRR1442800 2 0.6531 0.5473 0.168 0.832
#> SRR1359214 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1499849 2 0.7528 -0.0614 0.216 0.784
#> SRR1500030 2 0.7815 -0.1178 0.232 0.768
#> SRR1093053 2 0.8499 -0.0627 0.276 0.724
#> SRR1399843 2 0.8955 -0.3380 0.312 0.688
#> SRR1380231 2 0.8861 -0.4119 0.304 0.696
#> SRR809470 1 0.9993 0.9357 0.516 0.484
#> SRR614239 2 0.9491 0.6716 0.368 0.632
#> SRR613939 2 0.9833 0.6832 0.424 0.576
#> SRR612971 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1490204 2 0.9815 0.6829 0.420 0.580
#> SRR811357 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1471672 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR613006 2 0.9795 0.6836 0.416 0.584
#> SRR1469570 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1457354 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1362906 2 0.7815 -0.1178 0.232 0.768
#> SRR1079023 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR813608 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1096736 2 0.5408 0.2906 0.124 0.876
#> SRR1478700 2 0.7376 -0.0197 0.208 0.792
#> SRR1081543 2 0.9881 -0.7063 0.436 0.564
#> SRR1384754 2 0.5408 0.2906 0.124 0.876
#> SRR612287 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1380317 2 0.8861 0.6509 0.304 0.696
#> SRR1315247 2 0.9286 0.6817 0.344 0.656
#> SRR1105344 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR658549 2 0.9460 0.6800 0.364 0.636
#> SRR1480240 2 0.1184 0.4821 0.016 0.984
#> SRR1084816 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR612551 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1358520 2 0.9393 0.6828 0.356 0.644
#> SRR1419476 1 0.9922 0.9639 0.552 0.448
#> SRR1456075 2 0.8443 -0.2834 0.272 0.728
#> SRR1389474 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1367005 2 0.0938 0.4888 0.012 0.988
#> SRR1334419 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1417154 1 1.0000 0.9060 0.500 0.500
#> SRR1095985 2 0.6531 0.5473 0.168 0.832
#> SRR1325771 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1360420 1 0.9850 0.9603 0.572 0.428
#> SRR660272 2 0.9686 0.6864 0.396 0.604
#> SRR1332993 2 0.1184 0.4824 0.016 0.984
#> SRR1311833 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR808044 2 0.7376 -0.0197 0.208 0.792
#> SRR1076916 1 0.9909 0.9635 0.556 0.444
#> SRR1356266 2 0.0672 0.4919 0.008 0.992
#> SRR1341983 2 0.9850 0.6814 0.428 0.572
#> SRR1456114 2 0.4022 0.3808 0.080 0.920
#> SRR1072948 1 0.9850 0.9603 0.572 0.428
#> SRR1472370 1 0.9993 0.9356 0.516 0.484
#> SRR1480176 2 0.3114 0.4224 0.056 0.944
#> SRR613843 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1469192 2 0.2948 0.4285 0.052 0.948
#> SRR1404555 1 0.9944 0.9590 0.544 0.456
#> SRR659839 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR659533 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1362848 2 0.5408 0.2906 0.124 0.876
#> SRR1407492 2 0.9491 0.6716 0.368 0.632
#> SRR1455082 2 0.9635 0.6856 0.388 0.612
#> SRR658362 2 0.9833 0.6817 0.424 0.576
#> SRR810921 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR662823 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1456375 1 0.9933 0.9616 0.548 0.452
#> SRR818232 2 0.1414 0.4780 0.020 0.980
#> SRR1454868 2 0.8443 0.6210 0.272 0.728
#> SRR1474816 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1342002 2 0.3733 0.3916 0.072 0.928
#> SRR1088437 2 0.9833 0.6818 0.424 0.576
#> SRR1466400 2 0.9710 0.6858 0.400 0.600
#> SRR658921 2 0.9635 0.6861 0.388 0.612
#> SRR1499873 2 0.9866 0.6797 0.432 0.568
#> SRR1101373 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1090145 2 0.2043 0.4999 0.032 0.968
#> SRR1379324 2 0.6048 0.2506 0.148 0.852
#> SRR1345307 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1396166 1 0.9850 0.9603 0.572 0.428
#> SRR1086280 1 0.9922 0.9639 0.552 0.448
#> SRR1454891 2 0.9754 0.6849 0.408 0.592
#> SRR663185 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR811819 2 0.2043 0.4621 0.032 0.968
#> SRR1318920 2 0.3274 0.4815 0.060 0.940
#> SRR656758 2 0.9866 0.6802 0.432 0.568
#> SRR1474351 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR660450 2 0.9661 0.6866 0.392 0.608
#> SRR1472687 2 0.9850 0.6814 0.428 0.572
#> SRR1334291 2 0.9775 0.6846 0.412 0.588
#> SRR1415153 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1323271 2 0.9795 0.6840 0.416 0.584
#> SRR1368939 2 0.9833 0.6818 0.424 0.576
#> SRR1443161 2 0.8144 0.0182 0.252 0.748
#> SRR614695 2 0.9635 0.6862 0.388 0.612
#> SRR1092372 2 0.3733 0.4656 0.072 0.928
#> SRR1474577 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1406582 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR612779 2 0.9815 0.6835 0.420 0.580
#> SRR1089006 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1354071 2 0.3114 0.4739 0.056 0.944
#> SRR1105463 2 0.9170 -0.4964 0.332 0.668
#> SRR811005 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1385319 2 0.1633 0.4731 0.024 0.976
#> SRR1325871 2 0.9993 -0.8773 0.484 0.516
#> SRR1355415 1 0.9988 0.9410 0.520 0.480
#> SRR1090861 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1320712 2 0.9087 0.6616 0.324 0.676
#> SRR1470075 2 0.2236 0.4589 0.036 0.964
#> SRR1091254 2 0.1184 0.4838 0.016 0.984
#> SRR1101397 2 0.9209 -0.4988 0.336 0.664
#> SRR1321165 2 0.3733 0.4656 0.072 0.928
#> SRR1092112 1 0.9896 0.9635 0.560 0.440
#> SRR1417588 1 0.9850 0.9603 0.572 0.428
#> SRR1074790 2 0.2043 0.5261 0.032 0.968
#> SRR1432106 2 0.9833 0.6818 0.424 0.576
#> SRR655756 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1458314 2 0.4022 0.3808 0.080 0.920
#> SRR1318582 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1080484 2 0.9815 0.6830 0.420 0.580
#> SRR1072749 2 0.7453 -0.0489 0.212 0.788
#> SRR1078586 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1400333 2 0.9248 0.6763 0.340 0.660
#> SRR1078834 2 0.9686 0.6815 0.396 0.604
#> SRR1417611 2 0.9552 0.6857 0.376 0.624
#> SRR1396840 2 0.4431 0.4336 0.092 0.908
#> SRR1465440 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1400530 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR614984 2 0.9460 0.6709 0.364 0.636
#> SRR1324269 2 0.3879 0.3841 0.076 0.924
#> SRR1401491 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1319443 2 0.2423 0.4514 0.040 0.960
#> SRR1324349 2 0.9635 0.6863 0.388 0.612
#> SRR1345523 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1500846 2 0.0672 0.4918 0.008 0.992
#> SRR661505 2 0.9977 -0.7606 0.472 0.528
#> SRR1419062 2 0.9248 -0.5256 0.340 0.660
#> SRR1480131 2 0.8081 -0.1864 0.248 0.752
#> SRR1421284 2 0.9393 0.6829 0.356 0.644
#> SRR1329624 2 0.0672 0.4925 0.008 0.992
#> SRR1315739 1 0.9909 0.9649 0.556 0.444
#> SRR1099189 2 0.9732 0.6861 0.404 0.596
#> SRR1083286 2 0.1414 0.4781 0.020 0.980
#> SRR1091890 2 0.7219 0.3921 0.200 0.800
#> SRR1347436 2 0.9393 0.6832 0.356 0.644
#> SRR1327473 2 0.3733 0.5484 0.072 0.928
#> SRR1338195 1 0.9850 0.9603 0.572 0.428
#> SRR809698 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1457792 2 0.0376 0.4959 0.004 0.996
#> SRR658271 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1339597 2 0.7674 -0.0850 0.224 0.776
#> SRR1454842 1 0.9833 0.9587 0.576 0.424
#> SRR1322643 2 0.0938 0.4901 0.012 0.988
#> SRR614887 1 0.9850 0.9603 0.572 0.428
#> SRR1354620 2 0.9998 -0.8966 0.492 0.508
#> SRR615056 2 0.9795 0.6845 0.416 0.584
#> SRR1105320 2 0.3879 0.5513 0.076 0.924
#> SRR1391529 2 0.1414 0.4780 0.020 0.980
#> SRR663052 2 0.9795 0.6839 0.416 0.584
#> SRR1478834 2 0.3114 0.4228 0.056 0.944
#> SRR812366 2 0.9833 0.6818 0.424 0.576
#> SRR1435330 1 0.9896 0.9645 0.560 0.440
#> SRR615383 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1389157 2 0.9209 0.6429 0.336 0.664
#> SRR613568 2 0.9686 0.6864 0.396 0.604
#> SRR614095 2 0.9795 0.6846 0.416 0.584
#> SRR1103092 2 0.2236 0.4552 0.036 0.964
#> SRR1337155 2 0.8909 0.4675 0.308 0.692
#> SRR1475345 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR809089 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1446180 2 0.9286 0.6817 0.344 0.656
#> SRR1406372 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1339880 2 0.7815 -0.1178 0.232 0.768
#> SRR1353136 2 0.8443 0.6210 0.272 0.728
#> SRR1093906 1 0.9850 0.9603 0.572 0.428
#> SRR614035 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1351104 2 0.2948 0.4336 0.052 0.948
#> SRR1363926 2 0.9427 0.6812 0.360 0.640
#> SRR1399861 2 0.8555 0.6284 0.280 0.720
#> SRR1338789 2 0.3879 0.4340 0.076 0.924
#> SRR1421420 2 0.9491 -0.6005 0.368 0.632
#> SRR1420832 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1476231 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1352870 2 0.9248 0.6070 0.340 0.660
#> SRR1315041 2 0.9552 0.6857 0.376 0.624
#> SRR661877 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1443268 2 0.9209 -0.4988 0.336 0.664
#> SRR1416617 1 0.9909 0.9649 0.556 0.444
#> SRR1102443 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR655672 2 0.9491 0.6716 0.368 0.632
#> SRR1420006 1 0.9850 0.9603 0.572 0.428
#> SRR1458267 2 0.9775 0.6846 0.412 0.588
#> SRR613819 2 0.9427 0.6825 0.360 0.640
#> SRR1469432 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR660907 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1465092 2 0.9686 0.6860 0.396 0.604
#> SRR1470727 2 0.3584 0.3985 0.068 0.932
#> SRR1339153 2 0.9996 -0.8836 0.488 0.512
#> SRR1472749 2 0.9833 -0.7411 0.424 0.576
#> SRR1414379 2 0.9044 0.6754 0.320 0.680
#> SRR1431326 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1487278 2 0.9775 0.6844 0.412 0.588
#> SRR1098312 2 0.7139 0.4112 0.196 0.804
#> SRR810273 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1376000 2 0.9833 0.6826 0.424 0.576
#> SRR614467 2 0.9775 0.6853 0.412 0.588
#> SRR811471 2 0.1184 0.4832 0.016 0.984
#> SRR1478341 1 0.9850 0.9603 0.572 0.428
#> SRR1088606 2 0.6531 0.5473 0.168 0.832
#> SRR1479699 2 0.6438 0.3191 0.164 0.836
#> SRR1403589 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR812625 2 0.9815 0.6836 0.420 0.580
#> SRR1359803 2 0.2236 0.4578 0.036 0.964
#> SRR1338988 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1471222 2 0.9833 0.6818 0.424 0.576
#> SRR1378992 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR659427 2 0.8386 0.5263 0.268 0.732
#> SRR1096638 2 0.2423 0.4521 0.040 0.960
#> SRR1466619 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR659307 2 0.9170 0.6674 0.332 0.668
#> SRR1439994 1 1.0000 0.9071 0.500 0.500
#> SRR1454931 2 0.2778 0.4392 0.048 0.952
#> SRR1332928 2 0.8661 -0.3444 0.288 0.712
#> SRR658621 2 0.9710 0.6860 0.400 0.600
#> SRR1095840 2 0.0672 0.4917 0.008 0.992
#> SRR1458243 2 0.7602 -0.0715 0.220 0.780
#> SRR1374270 2 0.9323 0.6804 0.348 0.652
#> SRR1470947 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1365598 2 0.9635 0.6861 0.388 0.612
#> SRR662787 2 0.9833 0.6818 0.424 0.576
#> SRR1408727 2 0.9323 0.6603 0.348 0.652
#> SRR1456274 2 0.6343 0.3255 0.160 0.840
#> SRR817744 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1478744 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1387379 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1102680 2 0.8861 -0.4119 0.304 0.696
#> SRR1374198 2 0.3733 0.4656 0.072 0.928
#> SRR1445856 2 0.7674 -0.0850 0.224 0.776
#> SRR820049 2 0.9996 -0.5814 0.488 0.512
#> SRR1375290 2 0.9129 0.5488 0.328 0.672
#> SRR818999 2 0.9209 -0.5078 0.336 0.664
#> SRR1390242 2 0.0376 0.4971 0.004 0.996
#> SRR1401164 2 0.9833 0.6818 0.424 0.576
#> SRR1454629 2 0.4562 0.3763 0.096 0.904
#> SRR1332187 1 0.9850 0.9603 0.572 0.428
#> SRR603365 1 0.9850 0.9603 0.572 0.428
#> SRR657833 2 0.9795 0.6841 0.416 0.584
#> SRR1436207 2 0.9866 0.6797 0.432 0.568
#> SRR1488017 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR612947 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1480384 2 0.3584 0.3985 0.068 0.932
#> SRR1364761 2 0.9866 0.6797 0.432 0.568
#> SRR1308086 2 0.6438 0.1785 0.164 0.836
#> SRR1441868 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1485380 1 0.9988 0.9410 0.520 0.480
#> SRR1073705 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR615032 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1452356 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1442983 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1100346 2 0.9491 0.6807 0.368 0.632
#> SRR1332816 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR612299 2 0.9732 0.6857 0.404 0.596
#> SRR1407386 2 0.0376 0.4959 0.004 0.996
#> SRR1418064 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1309403 2 0.4298 0.5304 0.088 0.912
#> SRR1498395 2 0.9815 0.6829 0.420 0.580
#> SRR1079998 2 0.9754 -0.7041 0.408 0.592
#> SRR1498885 2 0.9754 0.6851 0.408 0.592
#> SRR1337215 2 0.9608 0.6867 0.384 0.616
#> SRR1414749 1 0.9909 0.9649 0.556 0.444
#> SRR1365963 2 0.9427 -0.5718 0.360 0.640
#> SRR1368030 2 0.9427 0.6821 0.360 0.640
#> SRR1419760 2 0.9358 0.6826 0.352 0.648
#> SRR1381841 2 0.6801 0.1386 0.180 0.820
#> SRR821388 2 0.6623 0.4409 0.172 0.828
#> SRR657623 2 0.9710 0.6860 0.400 0.600
#> SRR1094241 1 0.9993 0.9268 0.516 0.484
#> SRR819583 1 0.9988 0.9410 0.520 0.480
#> SRR1096149 2 0.3274 0.4185 0.060 0.940
#> SRR1342829 1 0.9850 0.9603 0.572 0.428
#> SRR1353028 2 0.1414 0.4782 0.020 0.980
#> SRR811333 2 0.9795 -0.7286 0.416 0.584
#> SRR1311666 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1486698 2 0.9815 0.6840 0.420 0.580
#> SRR1446436 2 0.9815 0.6829 0.420 0.580
#> SRR815092 2 0.0376 0.4971 0.004 0.996
#> SRR1500149 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1100564 2 0.0938 0.4867 0.012 0.988
#> SRR1403072 1 0.9850 0.9603 0.572 0.428
#> SRR811653 2 0.8555 0.6284 0.280 0.720
#> SRR1311348 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1489438 2 0.9833 0.6818 0.424 0.576
#> SRR1435442 2 0.9710 0.6858 0.400 0.600
#> SRR1421444 1 0.9850 0.9603 0.572 0.428
#> SRR1344010 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1319520 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1444763 2 0.3584 0.4708 0.068 0.932
#> SRR1415026 2 0.9815 0.6829 0.420 0.580
#> SRR1416596 2 0.9775 0.6846 0.412 0.588
#> SRR1485499 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1316078 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR663465 2 0.9754 0.6851 0.408 0.592
#> SRR1310094 2 0.9491 0.6853 0.368 0.632
#> SRR663537 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1486780 2 0.2423 0.4500 0.040 0.960
#> SRR1453950 2 0.2948 0.4285 0.052 0.948
#> SRR1087875 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR613318 2 0.9248 0.6665 0.340 0.660
#> SRR1332694 2 0.1843 0.4667 0.028 0.972
#> SRR1468469 1 0.9850 0.9603 0.572 0.428
#> SRR818670 2 0.9866 0.6797 0.432 0.568
#> SRR1120318 2 0.2043 0.4614 0.032 0.968
#> SRR1311622 2 0.8443 -0.2834 0.272 0.728
#> SRR1500931 1 0.9977 0.9482 0.528 0.472
#> SRR1387494 2 0.6887 0.1812 0.184 0.816
#> SRR1379175 2 0.8499 0.6271 0.276 0.724
#> SRR1401909 1 0.9988 0.9410 0.520 0.480
#> SRR1440541 2 0.9686 0.6865 0.396 0.604
#> SRR1068832 1 0.9993 0.9360 0.516 0.484
#> SRR1376640 2 0.9710 0.6855 0.400 0.600
#> SRR1085712 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1082283 2 0.5519 0.3052 0.128 0.872
#> SRR1084276 2 0.5294 0.2798 0.120 0.880
#> SRR1353262 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1437035 2 0.2778 0.4847 0.048 0.952
#> SRR1396877 2 0.5842 0.2278 0.140 0.860
#> SRR1443026 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1417936 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1436822 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1101128 1 0.9909 0.9638 0.556 0.444
#> SRR1363886 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR612983 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1394366 2 0.9710 0.6861 0.400 0.600
#> SRR1093218 2 0.9970 -0.8466 0.468 0.532
#> SRR1077090 2 1.0000 -0.9089 0.500 0.500
#> SRR1327430 2 0.9491 0.6826 0.368 0.632
#> SRR1088958 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1486931 2 0.9580 0.6864 0.380 0.620
#> SRR1086820 2 0.4022 0.4105 0.080 0.920
#> SRR1383000 2 0.2948 0.4285 0.052 0.948
#> SRR1355705 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR614335 2 0.9775 0.6845 0.412 0.588
#> SRR660534 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR817094 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1334265 2 0.9552 0.6857 0.376 0.624
#> SRR1456401 2 0.9427 0.6812 0.360 0.640
#> SRR1086393 2 0.1633 0.4728 0.024 0.976
#> SRR1351521 1 0.9850 0.9603 0.572 0.428
#> SRR1093100 2 0.9460 0.6827 0.364 0.636
#> SRR1309382 2 0.1633 0.4731 0.024 0.976
#> SRR1089375 2 0.8555 -0.2732 0.280 0.720
#> SRR1499482 2 0.9754 0.6854 0.408 0.592
#> SRR614719 2 0.9661 0.6847 0.392 0.608
#> SRR1081473 2 0.9393 -0.5678 0.356 0.644
#> SRR1087415 2 0.4022 0.4105 0.080 0.920
#> SRR1088217 1 0.9963 0.9553 0.536 0.464
#> SRR808496 2 0.9170 0.6766 0.332 0.668
#> SRR1336463 2 0.9635 0.6864 0.388 0.612
#> SRR612359 2 0.9248 0.6699 0.340 0.660
#> SRR1444412 2 0.4562 0.3391 0.096 0.904
#> SRR1074116 1 0.9850 0.9603 0.572 0.428
#> SRR821846 1 0.9850 0.9603 0.572 0.428
#> SRR656095 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR808914 2 0.0376 0.4959 0.004 0.996
#> SRR1349099 2 0.4690 0.4888 0.100 0.900
#> SRR1337886 2 0.9815 0.6836 0.420 0.580
#> SRR813632 2 0.7528 -0.0614 0.216 0.784
#> SRR1101591 2 0.9552 -0.6192 0.376 0.624
#> SRR1089713 2 0.8763 -0.3849 0.296 0.704
#> SRR1453127 1 0.9896 0.9644 0.560 0.440
#> SRR1498354 1 0.9993 0.9355 0.516 0.484
#> SRR1313831 2 0.1414 0.4780 0.020 0.980
#> SRR1315434 1 0.9993 0.9322 0.516 0.484
#> SRR814747 2 0.9635 0.6859 0.388 0.612
#> SRR1358539 2 0.0672 0.4920 0.008 0.992
#> SRR1367807 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1365791 2 0.6531 0.5473 0.168 0.832
#> SRR1081519 1 0.9970 0.9526 0.532 0.468
#> SRR614707 2 0.9580 0.6857 0.380 0.620
#> SRR1094027 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1489092 2 0.6531 0.5473 0.168 0.832
#> SRR1079502 2 0.8909 -0.4220 0.308 0.692
#> SRR1457814 2 0.8555 0.6284 0.280 0.720
#> SRR1455127 2 0.9833 0.6818 0.424 0.576
#> SRR615081 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1327855 1 0.9988 0.9410 0.520 0.480
#> SRR1417873 2 0.9552 0.6857 0.376 0.624
#> SRR1394125 2 0.9248 -0.5256 0.340 0.660
#> SRR1488388 2 0.0376 0.4959 0.004 0.996
#> SRR1401122 2 0.9460 0.6839 0.364 0.636
#> SRR612383 2 0.9427 0.6698 0.360 0.640
#> SRR1477711 2 0.0376 0.4959 0.004 0.996
#> SRR1350813 2 0.9686 0.6860 0.396 0.604
#> SRR612851 2 0.9815 0.6837 0.420 0.580
#> SRR1086349 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR812837 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1340010 2 0.6712 0.4334 0.176 0.824
#> SRR1475885 2 0.5737 0.5069 0.136 0.864
#> SRR1376334 2 0.1414 0.4780 0.020 0.980
#> SRR1399821 2 0.4690 0.4888 0.100 0.900
#> SRR1347042 1 0.9896 0.9644 0.560 0.440
#> SRR612323 2 0.9491 0.6716 0.368 0.632
#> SRR612604 2 0.9815 0.6827 0.420 0.580
#> SRR1389546 2 0.9866 0.6797 0.432 0.568
#> SRR1311877 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1465608 2 0.9427 -0.5718 0.360 0.640
#> SRR1101808 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1414079 1 0.9896 0.9645 0.560 0.440
#> SRR1331153 2 0.9686 0.6864 0.396 0.604
#> SRR1078439 2 0.8499 -0.0627 0.276 0.724
#> SRR2165527 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1351147 2 0.2043 0.5200 0.032 0.968
#> SRR1313536 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1070308 2 0.3733 0.5484 0.072 0.928
#> SRR1403110 2 0.1414 0.4780 0.020 0.980
#> SRR1400355 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1401317 1 0.9988 0.9410 0.520 0.480
#> SRR1456862 2 0.4562 0.3449 0.096 0.904
#> SRR1074622 2 0.1843 0.4660 0.028 0.972
#> SRR1465847 2 0.9970 -0.8449 0.468 0.532
#> SRR1443376 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1471312 1 0.9896 0.9640 0.560 0.440
#> SRR1075579 2 0.0376 0.4971 0.004 0.996
#> SRR1090881 2 0.9129 0.5488 0.328 0.672
#> SRR612251 2 0.9795 0.6846 0.416 0.584
#> SRR1418581 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR658045 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR613214 2 0.9248 0.6745 0.340 0.660
#> SRR613078 2 0.9710 0.6858 0.400 0.600
#> SRR1472998 2 0.9970 -0.8449 0.468 0.532
#> SRR1433452 2 0.9815 0.6830 0.420 0.580
#> SRR1101957 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1487993 2 0.7815 -0.1178 0.232 0.768
#> SRR1465983 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1380375 2 0.2043 0.4618 0.032 0.968
#> SRR1367566 1 0.9988 0.9379 0.520 0.480
#> SRR1316151 2 0.9087 0.6754 0.324 0.676
#> SRR1417547 2 0.9460 0.6839 0.364 0.636
#> SRR659389 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1490270 2 0.9661 0.6866 0.392 0.608
#> SRR1398207 2 0.9087 -0.4712 0.324 0.676
#> SRR1358755 1 0.9993 0.9355 0.516 0.484
#> SRR1078903 2 0.9815 0.6829 0.420 0.580
#> SRR1323252 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1451796 2 0.9833 0.6818 0.424 0.576
#> SRR1369172 2 0.4298 0.4003 0.088 0.912
#> SRR615982 2 0.9775 0.6851 0.412 0.588
#> SRR1480431 2 0.9732 0.6861 0.404 0.596
#> SRR1429825 2 0.9775 0.6846 0.412 0.588
#> SRR1102393 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1071313 2 0.8327 -0.2603 0.264 0.736
#> SRR808351 2 0.1414 0.4776 0.020 0.980
#> SRR1317513 2 0.1843 0.4667 0.028 0.972
#> SRR1480501 2 0.9170 -0.4969 0.332 0.668
#> SRR1081910 2 0.8016 -0.1799 0.244 0.756
#> SRR1086611 2 0.9323 0.6656 0.348 0.652
#> SRR1392571 2 0.9661 0.6863 0.392 0.608
#> SRR1311441 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR808152 2 0.1184 0.4824 0.016 0.984
#> SRR657313 2 0.9998 -0.8909 0.492 0.508
#> SRR1433131 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1321011 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1500598 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1379343 2 0.9866 0.6797 0.432 0.568
#> SRR1389108 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1376228 1 0.9909 0.9649 0.556 0.444
#> SRR1399757 2 0.0376 0.4959 0.004 0.996
#> SRR1358060 1 0.9909 0.9649 0.556 0.444
#> SRR1464517 2 0.6973 0.0657 0.188 0.812
#> SRR613557 2 0.9286 0.6733 0.344 0.656
#> SRR809831 2 0.3879 0.3841 0.076 0.924
#> SRR1429387 1 0.9850 0.9603 0.572 0.428
#> SRR816565 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1071644 2 0.0000 0.5003 0.000 1.000
#> SRR1406936 2 0.8955 -0.4358 0.312 0.688
#> SRR1072031 2 0.9850 0.6805 0.428 0.572
#> SRR1374671 2 0.9491 0.6716 0.368 0.632
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 1 0.7147 0.6443 0.720 0.124 0.156
#> SRR1404105 1 0.1337 0.8180 0.972 0.016 0.012
#> SRR2164936 2 0.0237 0.8761 0.004 0.996 0.000
#> SRR1472057 3 0.5882 0.5759 0.348 0.000 0.652
#> SRR614491 2 0.6762 0.6652 0.288 0.676 0.036
#> SRR1069376 1 0.1015 0.8164 0.980 0.012 0.008
#> SRR811964 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0747 0.8780 0.016 0.984 0.000
#> SRR1345715 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1328073 1 0.5159 0.7175 0.820 0.140 0.040
#> SRR1394209 2 0.7820 0.5443 0.324 0.604 0.072
#> SRR1474018 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.5058 0.6370 0.756 0.000 0.244
#> SRR1500555 2 0.5486 0.7869 0.196 0.780 0.024
#> SRR1354363 1 0.0829 0.8161 0.984 0.012 0.004
#> SRR1391619 3 0.3941 0.7643 0.156 0.000 0.844
#> SRR1307997 2 0.5167 0.7954 0.192 0.792 0.016
#> SRR663124 2 0.7220 0.6485 0.284 0.660 0.056
#> SRR1334670 1 0.1337 0.8166 0.972 0.012 0.016
#> SRR612515 2 0.7220 0.6485 0.284 0.660 0.056
#> SRR1092727 2 0.3539 0.8575 0.100 0.888 0.012
#> SRR1364013 2 0.2945 0.8646 0.088 0.908 0.004
#> SRR1468553 3 0.2165 0.7981 0.064 0.000 0.936
#> SRR1403980 3 0.2860 0.7975 0.084 0.004 0.912
#> SRR1420169 3 0.6305 0.2453 0.484 0.000 0.516
#> SRR1442800 1 0.7607 0.4595 0.644 0.280 0.076
#> SRR1359214 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.5058 0.6370 0.756 0.000 0.244
#> SRR1500030 1 0.5988 0.4295 0.632 0.000 0.368
#> SRR1093053 1 0.8633 -0.0104 0.464 0.100 0.436
#> SRR1399843 1 0.6848 0.2363 0.568 0.016 0.416
#> SRR1380231 1 0.7156 0.2937 0.572 0.028 0.400
#> SRR809470 3 0.5905 0.5653 0.352 0.000 0.648
#> SRR614239 2 0.7220 0.6485 0.284 0.660 0.056
#> SRR613939 2 0.3030 0.8638 0.092 0.904 0.004
#> SRR612971 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.1163 0.8779 0.028 0.972 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0892 0.8153 0.980 0.020 0.000
#> SRR613006 2 0.1163 0.8749 0.028 0.972 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362906 1 0.5988 0.4295 0.632 0.000 0.368
#> SRR1079023 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.5708 0.6838 0.768 0.028 0.204
#> SRR1478700 1 0.5070 0.6689 0.772 0.004 0.224
#> SRR1081543 3 0.6157 0.6933 0.128 0.092 0.780
#> SRR1384754 1 0.5708 0.6838 0.768 0.028 0.204
#> SRR612287 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.7820 0.5443 0.324 0.604 0.072
#> SRR1315247 2 0.5325 0.7184 0.248 0.748 0.004
#> SRR1105344 2 0.0237 0.8763 0.004 0.996 0.000
#> SRR658549 2 0.5486 0.7869 0.196 0.780 0.024
#> SRR1480240 1 0.1182 0.8173 0.976 0.012 0.012
#> SRR1084816 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.5363 0.7096 0.276 0.724 0.000
#> SRR1419476 3 0.3551 0.7874 0.132 0.000 0.868
#> SRR1456075 1 0.5810 0.4725 0.664 0.000 0.336
#> SRR1389474 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.1337 0.8176 0.972 0.016 0.012
#> SRR1334419 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1417154 3 0.3267 0.7905 0.116 0.000 0.884
#> SRR1095985 1 0.7607 0.4595 0.644 0.280 0.076
#> SRR1325771 1 0.0892 0.8149 0.980 0.020 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.7794 0.000 0.000 1.000
#> SRR660272 2 0.3816 0.8309 0.148 0.852 0.000
#> SRR1332993 1 0.1482 0.8170 0.968 0.012 0.020
#> SRR1311833 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 1 0.5070 0.6689 0.772 0.004 0.224
#> SRR1076916 3 0.3116 0.7872 0.108 0.000 0.892
#> SRR1356266 1 0.1129 0.8164 0.976 0.020 0.004
#> SRR1341983 2 0.1289 0.8779 0.032 0.968 0.000
#> SRR1456114 1 0.2261 0.7997 0.932 0.000 0.068
#> SRR1072948 3 0.0747 0.7862 0.016 0.000 0.984
#> SRR1472370 3 0.5882 0.5759 0.348 0.000 0.652
#> SRR1480176 1 0.3610 0.7927 0.888 0.016 0.096
#> SRR613843 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.3459 0.7926 0.892 0.012 0.096
#> SRR1404555 3 0.2200 0.7904 0.056 0.004 0.940
#> SRR659839 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362848 1 0.5708 0.6838 0.768 0.028 0.204
#> SRR1407492 2 0.7220 0.6485 0.284 0.660 0.056
#> SRR1455082 2 0.3983 0.8402 0.144 0.852 0.004
#> SRR658362 2 0.1643 0.8766 0.044 0.956 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0592 0.8774 0.012 0.988 0.000
#> SRR1456375 3 0.5138 0.6923 0.252 0.000 0.748
#> SRR818232 1 0.1337 0.8163 0.972 0.016 0.012
#> SRR1454868 2 0.8779 0.2274 0.416 0.472 0.112
#> SRR1474816 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.3539 0.7912 0.888 0.012 0.100
#> SRR1088437 2 0.0747 0.8780 0.016 0.984 0.000
#> SRR1466400 2 0.3941 0.8159 0.156 0.844 0.000
#> SRR658921 2 0.4178 0.8048 0.172 0.828 0.000
#> SRR1499873 2 0.0592 0.8764 0.012 0.988 0.000
#> SRR1101373 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1090145 1 0.2998 0.7916 0.916 0.068 0.016
#> SRR1379324 1 0.4539 0.7492 0.836 0.016 0.148
#> SRR1345307 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.2959 0.7946 0.100 0.000 0.900
#> SRR1086280 3 0.3551 0.7874 0.132 0.000 0.868
#> SRR1454891 2 0.4351 0.8216 0.168 0.828 0.004
#> SRR663185 2 0.0592 0.8774 0.012 0.988 0.000
#> SRR811819 1 0.2414 0.8157 0.940 0.020 0.040
#> SRR1318920 1 0.4015 0.7441 0.876 0.096 0.028
#> SRR656758 2 0.1129 0.8784 0.020 0.976 0.004
#> SRR1474351 1 0.0892 0.8149 0.980 0.020 0.000
#> SRR660450 2 0.3879 0.8292 0.152 0.848 0.000
#> SRR1472687 2 0.1289 0.8779 0.032 0.968 0.000
#> SRR1334291 2 0.1647 0.8764 0.036 0.960 0.004
#> SRR1415153 2 0.0237 0.8761 0.004 0.996 0.000
#> SRR1323271 2 0.1964 0.8729 0.056 0.944 0.000
#> SRR1368939 2 0.0592 0.8769 0.012 0.988 0.000
#> SRR1443161 1 0.8379 0.2947 0.552 0.096 0.352
#> SRR614695 2 0.4062 0.8096 0.164 0.836 0.000
#> SRR1092372 1 0.4558 0.7304 0.856 0.100 0.044
#> SRR1474577 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1406582 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR612779 2 0.3879 0.8339 0.152 0.848 0.000
#> SRR1089006 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1354071 1 0.3583 0.7973 0.900 0.056 0.044
#> SRR1105463 1 0.6282 0.3156 0.612 0.004 0.384
#> SRR811005 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.1491 0.8169 0.968 0.016 0.016
#> SRR1325871 3 0.3941 0.7643 0.156 0.000 0.844
#> SRR1355415 3 0.6192 0.4579 0.420 0.000 0.580
#> SRR1090861 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1320712 2 0.7681 0.3818 0.412 0.540 0.048
#> SRR1470075 1 0.0892 0.8130 0.980 0.000 0.020
#> SRR1091254 1 0.0848 0.8153 0.984 0.008 0.008
#> SRR1101397 1 0.6079 0.3231 0.612 0.000 0.388
#> SRR1321165 1 0.4558 0.7304 0.856 0.100 0.044
#> SRR1092112 3 0.3619 0.7828 0.136 0.000 0.864
#> SRR1417588 3 0.0000 0.7794 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074790 1 0.3116 0.7583 0.892 0.108 0.000
#> SRR1432106 2 0.0747 0.8780 0.016 0.984 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.2261 0.7997 0.932 0.000 0.068
#> SRR1318582 2 0.0237 0.8761 0.004 0.996 0.000
#> SRR1080484 2 0.1289 0.8768 0.032 0.968 0.000
#> SRR1072749 1 0.5058 0.6370 0.756 0.000 0.244
#> SRR1078586 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1400333 2 0.6606 0.7191 0.236 0.716 0.048
#> SRR1078834 2 0.5763 0.7329 0.244 0.740 0.016
#> SRR1417611 2 0.3340 0.8458 0.120 0.880 0.000
#> SRR1396840 1 0.5331 0.7249 0.824 0.100 0.076
#> SRR1465440 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0237 0.8763 0.004 0.996 0.000
#> SRR614984 2 0.7095 0.6463 0.292 0.660 0.048
#> SRR1324269 1 0.3454 0.7872 0.888 0.008 0.104
#> SRR1401491 2 0.0237 0.8763 0.004 0.996 0.000
#> SRR1319443 1 0.1711 0.8152 0.960 0.008 0.032
#> SRR1324349 2 0.2959 0.8596 0.100 0.900 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.0829 0.8161 0.984 0.012 0.004
#> SRR661505 3 0.6796 0.6623 0.236 0.056 0.708
#> SRR1419062 3 0.7278 0.1740 0.456 0.028 0.516
#> SRR1480131 1 0.5465 0.5747 0.712 0.000 0.288
#> SRR1421284 2 0.5397 0.7065 0.280 0.720 0.000
#> SRR1329624 1 0.0829 0.8148 0.984 0.012 0.004
#> SRR1315739 3 0.2066 0.7981 0.060 0.000 0.940
#> SRR1099189 2 0.3454 0.8576 0.104 0.888 0.008
#> SRR1083286 1 0.1337 0.8175 0.972 0.012 0.016
#> SRR1091890 1 0.7613 0.5924 0.680 0.116 0.204
#> SRR1347436 2 0.5119 0.8193 0.152 0.816 0.032
#> SRR1327473 1 0.4047 0.7184 0.848 0.148 0.004
#> SRR1338195 3 0.0000 0.7794 0.000 0.000 1.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0592 0.8145 0.988 0.012 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.5016 0.6456 0.760 0.000 0.240
#> SRR1454842 3 0.1129 0.7876 0.020 0.004 0.976
#> SRR1322643 1 0.0237 0.8139 0.996 0.004 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.7794 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354620 3 0.6126 0.4687 0.400 0.000 0.600
#> SRR615056 2 0.2625 0.8664 0.084 0.916 0.000
#> SRR1105320 1 0.4172 0.7092 0.840 0.156 0.004
#> SRR1391529 1 0.1337 0.8163 0.972 0.016 0.012
#> SRR663052 2 0.1031 0.8778 0.024 0.976 0.000
#> SRR1478834 1 0.2550 0.8106 0.932 0.012 0.056
#> SRR812366 2 0.0747 0.8767 0.016 0.984 0.000
#> SRR1435330 3 0.1753 0.7961 0.048 0.000 0.952
#> SRR615383 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 2 0.8028 0.5947 0.288 0.616 0.096
#> SRR613568 2 0.3816 0.8309 0.148 0.852 0.000
#> SRR614095 2 0.2537 0.8663 0.080 0.920 0.000
#> SRR1103092 1 0.2486 0.8066 0.932 0.008 0.060
#> SRR1337155 2 0.9882 0.0864 0.312 0.408 0.280
#> SRR1475345 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 2 0.5325 0.7184 0.248 0.748 0.004
#> SRR1406372 2 0.0237 0.8763 0.004 0.996 0.000
#> SRR1339880 1 0.5988 0.4295 0.632 0.000 0.368
#> SRR1353136 2 0.8779 0.2274 0.416 0.472 0.112
#> SRR1093906 3 0.0000 0.7794 0.000 0.000 1.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.1989 0.8099 0.948 0.004 0.048
#> SRR1363926 2 0.6333 0.6125 0.332 0.656 0.012
#> SRR1399861 2 0.8789 0.1797 0.428 0.460 0.112
#> SRR1338789 1 0.2636 0.8062 0.932 0.020 0.048
#> SRR1421420 1 0.6518 -0.0149 0.512 0.004 0.484
#> SRR1420832 2 0.0424 0.8768 0.008 0.992 0.000
#> SRR1476231 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1352870 2 0.8842 0.4645 0.308 0.548 0.144
#> SRR1315041 2 0.3267 0.8479 0.116 0.884 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443268 1 0.6079 0.3231 0.612 0.000 0.388
#> SRR1416617 3 0.2066 0.7981 0.060 0.000 0.940
#> SRR1102443 1 0.0892 0.8153 0.980 0.020 0.000
#> SRR655672 2 0.7220 0.6485 0.284 0.660 0.056
#> SRR1420006 3 0.0000 0.7794 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458267 2 0.1647 0.8764 0.036 0.960 0.004
#> SRR613819 2 0.5008 0.8005 0.180 0.804 0.016
#> SRR1469432 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.3826 0.8479 0.124 0.868 0.008
#> SRR1470727 1 0.3771 0.7830 0.876 0.012 0.112
#> SRR1339153 3 0.3816 0.7681 0.148 0.000 0.852
#> SRR1472749 3 0.5431 0.6393 0.284 0.000 0.716
#> SRR1414379 2 0.6284 0.6562 0.304 0.680 0.016
#> SRR1431326 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1487278 2 0.3752 0.8231 0.144 0.856 0.000
#> SRR1098312 1 0.7412 0.6201 0.700 0.124 0.176
#> SRR810273 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.1529 0.8767 0.040 0.960 0.000
#> SRR614467 2 0.2200 0.8720 0.056 0.940 0.004
#> SRR811471 1 0.1337 0.8176 0.972 0.012 0.016
#> SRR1478341 3 0.0000 0.7794 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088606 1 0.7607 0.4595 0.644 0.280 0.076
#> SRR1479699 1 0.7101 0.6093 0.692 0.068 0.240
#> SRR1403589 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.1529 0.8773 0.040 0.960 0.000
#> SRR1359803 1 0.1585 0.8158 0.964 0.008 0.028
#> SRR1338988 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0747 0.8767 0.016 0.984 0.000
#> SRR1378992 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR659427 1 0.8976 0.3298 0.552 0.276 0.172
#> SRR1096638 1 0.1647 0.8125 0.960 0.004 0.036
#> SRR1466619 2 0.0892 0.8772 0.020 0.980 0.000
#> SRR659307 2 0.7027 0.6436 0.296 0.660 0.044
#> SRR1439994 3 0.6168 0.4415 0.412 0.000 0.588
#> SRR1454931 1 0.2269 0.8151 0.944 0.016 0.040
#> SRR1332928 1 0.5905 0.4301 0.648 0.000 0.352
#> SRR658621 2 0.3267 0.8522 0.116 0.884 0.000
#> SRR1095840 1 0.0829 0.8164 0.984 0.012 0.004
#> SRR1458243 1 0.4931 0.6540 0.768 0.000 0.232
#> SRR1374270 2 0.6169 0.5747 0.360 0.636 0.004
#> SRR1470947 2 0.0424 0.8768 0.008 0.992 0.000
#> SRR1365598 2 0.4178 0.8048 0.172 0.828 0.000
#> SRR662787 2 0.0747 0.8780 0.016 0.984 0.000
#> SRR1408727 2 0.7685 0.4402 0.384 0.564 0.052
#> SRR1456274 1 0.7306 0.6156 0.684 0.080 0.236
#> SRR817744 1 0.0892 0.8149 0.980 0.020 0.000
#> SRR1478744 2 0.0424 0.8768 0.008 0.992 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102680 1 0.7156 0.2937 0.572 0.028 0.400
#> SRR1374198 1 0.4558 0.7304 0.856 0.100 0.044
#> SRR1445856 1 0.5016 0.6456 0.760 0.000 0.240
#> SRR820049 3 0.8201 0.5238 0.276 0.112 0.612
#> SRR1375290 2 0.9584 0.1423 0.372 0.428 0.200
#> SRR818999 1 0.6373 0.2582 0.588 0.004 0.408
#> SRR1390242 1 0.0983 0.8157 0.980 0.016 0.004
#> SRR1401164 2 0.0747 0.8767 0.016 0.984 0.000
#> SRR1454629 1 0.3637 0.7968 0.892 0.024 0.084
#> SRR1332187 3 0.0747 0.7841 0.016 0.000 0.984
#> SRR603365 3 0.0237 0.7810 0.004 0.000 0.996
#> SRR657833 2 0.2537 0.8687 0.080 0.920 0.000
#> SRR1436207 2 0.1964 0.8742 0.056 0.944 0.000
#> SRR1488017 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR612947 2 0.0592 0.8775 0.012 0.988 0.000
#> SRR1480384 1 0.3771 0.7830 0.876 0.012 0.112
#> SRR1364761 2 0.0892 0.8773 0.020 0.980 0.000
#> SRR1308086 1 0.5659 0.6423 0.740 0.012 0.248
#> SRR1441868 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1485380 3 0.4842 0.7274 0.224 0.000 0.776
#> SRR1073705 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0424 0.8768 0.008 0.992 0.000
#> SRR1442983 2 0.0237 0.8761 0.004 0.996 0.000
#> SRR1100346 2 0.5774 0.7530 0.232 0.748 0.020
#> SRR1332816 1 0.0892 0.8153 0.980 0.020 0.000
#> SRR612299 2 0.3941 0.8190 0.156 0.844 0.000
#> SRR1407386 1 0.0747 0.8149 0.984 0.016 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.4483 0.7377 0.848 0.128 0.024
#> SRR1498395 2 0.0983 0.8773 0.016 0.980 0.004
#> SRR1079998 1 0.6299 -0.0318 0.524 0.000 0.476
#> SRR1498885 2 0.1964 0.8725 0.056 0.944 0.000
#> SRR1337215 2 0.4399 0.8001 0.188 0.812 0.000
#> SRR1414749 3 0.2066 0.7981 0.060 0.000 0.940
#> SRR1365963 1 0.6154 0.2599 0.592 0.000 0.408
#> SRR1368030 2 0.5588 0.7066 0.276 0.720 0.004
#> SRR1419760 2 0.5874 0.7699 0.208 0.760 0.032
#> SRR1381841 1 0.5305 0.7031 0.788 0.020 0.192
#> SRR821388 1 0.7091 0.6479 0.724 0.124 0.152
#> SRR657623 2 0.3267 0.8522 0.116 0.884 0.000
#> SRR1094241 3 0.3412 0.7804 0.124 0.000 0.876
#> SRR819583 3 0.5678 0.6242 0.316 0.000 0.684
#> SRR1096149 1 0.2200 0.8078 0.940 0.004 0.056
#> SRR1342829 3 0.0000 0.7794 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353028 1 0.1620 0.8177 0.964 0.012 0.024
#> SRR811333 3 0.6267 0.3000 0.452 0.000 0.548
#> SRR1311666 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.2945 0.8647 0.088 0.908 0.004
#> SRR1446436 2 0.1289 0.8775 0.032 0.968 0.000
#> SRR815092 1 0.0983 0.8157 0.980 0.016 0.004
#> SRR1500149 2 0.1529 0.8738 0.040 0.960 0.000
#> SRR1100564 1 0.0661 0.8148 0.988 0.008 0.004
#> SRR1403072 3 0.0000 0.7794 0.000 0.000 1.000
#> SRR811653 2 0.8789 0.1797 0.428 0.460 0.112
#> SRR1311348 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0747 0.8780 0.016 0.984 0.000
#> SRR1435442 2 0.3941 0.8159 0.156 0.844 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.7794 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1444763 1 0.4092 0.7526 0.876 0.088 0.036
#> SRR1415026 2 0.0747 0.8780 0.016 0.984 0.000
#> SRR1416596 2 0.1964 0.8724 0.056 0.944 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR663465 2 0.1964 0.8725 0.056 0.944 0.000
#> SRR1310094 2 0.3482 0.8423 0.128 0.872 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.2492 0.8143 0.936 0.016 0.048
#> SRR1453950 1 0.3459 0.7926 0.892 0.012 0.096
#> SRR1087875 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR613318 2 0.7741 0.4601 0.376 0.568 0.056
#> SRR1332694 1 0.1482 0.8173 0.968 0.012 0.020
#> SRR1468469 3 0.2959 0.7946 0.100 0.000 0.900
#> SRR818670 2 0.0892 0.8773 0.020 0.980 0.000
#> SRR1120318 1 0.2651 0.8081 0.928 0.012 0.060
#> SRR1311622 1 0.5810 0.4725 0.664 0.000 0.336
#> SRR1500931 3 0.5431 0.6649 0.284 0.000 0.716
#> SRR1387494 1 0.6556 0.5898 0.692 0.032 0.276
#> SRR1379175 2 0.8671 0.2487 0.416 0.480 0.104
#> SRR1401909 3 0.6192 0.4579 0.420 0.000 0.580
#> SRR1440541 2 0.1289 0.8748 0.032 0.968 0.000
#> SRR1068832 3 0.5882 0.5773 0.348 0.000 0.652
#> SRR1376640 2 0.4602 0.8292 0.152 0.832 0.016
#> SRR1085712 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.4418 0.7614 0.848 0.020 0.132
#> SRR1084276 1 0.4473 0.7429 0.828 0.008 0.164
#> SRR1353262 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.3369 0.8013 0.908 0.052 0.040
#> SRR1396877 1 0.4465 0.7332 0.820 0.004 0.176
#> SRR1443026 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1436822 2 0.0424 0.8765 0.008 0.992 0.000
#> SRR1101128 3 0.3116 0.7934 0.108 0.000 0.892
#> SRR1363886 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.4178 0.8121 0.172 0.828 0.000
#> SRR1093218 3 0.6168 0.4049 0.412 0.000 0.588
#> SRR1077090 3 0.6168 0.4415 0.412 0.000 0.588
#> SRR1327430 2 0.6255 0.6335 0.320 0.668 0.012
#> SRR1088958 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1486931 2 0.2902 0.8677 0.064 0.920 0.016
#> SRR1086820 1 0.2947 0.8014 0.920 0.020 0.060
#> SRR1383000 1 0.3459 0.7926 0.892 0.012 0.096
#> SRR1355705 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR614335 2 0.1964 0.8726 0.056 0.944 0.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.3267 0.8479 0.116 0.884 0.000
#> SRR1456401 2 0.6333 0.6125 0.332 0.656 0.012
#> SRR1086393 1 0.1774 0.8182 0.960 0.016 0.024
#> SRR1351521 3 0.0000 0.7794 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093100 2 0.5588 0.7065 0.276 0.720 0.004
#> SRR1309382 1 0.1170 0.8160 0.976 0.008 0.016
#> SRR1089375 1 0.7513 0.4083 0.604 0.052 0.344
#> SRR1499482 2 0.3918 0.8388 0.140 0.856 0.004
#> SRR614719 2 0.5156 0.7760 0.216 0.776 0.008
#> SRR1081473 1 0.6500 0.0672 0.532 0.004 0.464
#> SRR1087415 1 0.2947 0.8014 0.920 0.020 0.060
#> SRR1088217 3 0.5810 0.5953 0.336 0.000 0.664
#> SRR808496 2 0.5938 0.7290 0.248 0.732 0.020
#> SRR1336463 2 0.2796 0.8632 0.092 0.908 0.000
#> SRR612359 2 0.6735 0.6966 0.260 0.696 0.044
#> SRR1444412 1 0.3375 0.7892 0.892 0.008 0.100
#> SRR1074116 3 0.0000 0.7794 0.000 0.000 1.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.7794 0.000 0.000 1.000
#> SRR656095 2 0.0592 0.8775 0.012 0.988 0.000
#> SRR808914 1 0.0747 0.8149 0.984 0.016 0.000
#> SRR1349099 1 0.5696 0.6794 0.796 0.148 0.056
#> SRR1337886 2 0.1529 0.8773 0.040 0.960 0.000
#> SRR813632 1 0.5058 0.6370 0.756 0.000 0.244
#> SRR1101591 1 0.6309 -0.0972 0.504 0.000 0.496
#> SRR1089713 1 0.7129 0.3172 0.580 0.028 0.392
#> SRR1453127 3 0.1643 0.7951 0.044 0.000 0.956
#> SRR1498354 3 0.5968 0.5468 0.364 0.000 0.636
#> SRR1313831 1 0.1337 0.8163 0.972 0.016 0.012
#> SRR1315434 3 0.4062 0.7663 0.164 0.000 0.836
#> SRR814747 2 0.3879 0.8303 0.152 0.848 0.000
#> SRR1358539 1 0.1491 0.8183 0.968 0.016 0.016
#> SRR1367807 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1365791 1 0.7683 0.4551 0.640 0.280 0.080
#> SRR1081519 3 0.5591 0.6371 0.304 0.000 0.696
#> SRR614707 2 0.5070 0.7603 0.224 0.772 0.004
#> SRR1094027 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1489092 1 0.7607 0.4595 0.644 0.280 0.076
#> SRR1079502 1 0.6661 0.2934 0.588 0.012 0.400
#> SRR1457814 2 0.8789 0.1797 0.428 0.460 0.112
#> SRR1455127 2 0.0237 0.8762 0.004 0.996 0.000
#> SRR615081 2 0.0424 0.8765 0.008 0.992 0.000
#> SRR1327855 3 0.5678 0.6242 0.316 0.000 0.684
#> SRR1417873 2 0.3340 0.8458 0.120 0.880 0.000
#> SRR1394125 3 0.7278 0.1740 0.456 0.028 0.516
#> SRR1488388 1 0.0592 0.8145 0.988 0.012 0.000
#> SRR1401122 2 0.5254 0.7246 0.264 0.736 0.000
#> SRR612383 2 0.7218 0.6354 0.296 0.652 0.052
#> SRR1477711 1 0.0747 0.8149 0.984 0.016 0.000
#> SRR1350813 2 0.3826 0.8479 0.124 0.868 0.008
#> SRR612851 2 0.4473 0.8233 0.164 0.828 0.008
#> SRR1086349 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340010 1 0.7147 0.6443 0.720 0.124 0.156
#> SRR1475885 1 0.6576 0.6016 0.740 0.192 0.068
#> SRR1376334 1 0.1337 0.8163 0.972 0.016 0.012
#> SRR1399821 1 0.5696 0.6794 0.796 0.148 0.056
#> SRR1347042 3 0.1643 0.7951 0.044 0.000 0.956
#> SRR612323 2 0.7220 0.6485 0.284 0.660 0.056
#> SRR612604 2 0.1753 0.8707 0.048 0.952 0.000
#> SRR1389546 2 0.0892 0.8773 0.020 0.980 0.000
#> SRR1311877 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1465608 1 0.6154 0.2599 0.592 0.000 0.408
#> SRR1101808 2 0.0592 0.8775 0.012 0.988 0.000
#> SRR1414079 3 0.1753 0.7961 0.048 0.000 0.952
#> SRR1331153 2 0.3816 0.8309 0.148 0.852 0.000
#> SRR1078439 1 0.8633 -0.0104 0.464 0.100 0.436
#> SRR2165527 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.3112 0.7695 0.900 0.096 0.004
#> SRR1313536 2 0.0424 0.8766 0.008 0.992 0.000
#> SRR1070308 1 0.4047 0.7184 0.848 0.148 0.004
#> SRR1403110 1 0.1337 0.8163 0.972 0.016 0.012
#> SRR1400355 2 0.0592 0.8777 0.012 0.988 0.000
#> SRR1401317 3 0.5678 0.6242 0.316 0.000 0.684
#> SRR1456862 1 0.2796 0.7891 0.908 0.000 0.092
#> SRR1074622 1 0.1877 0.8154 0.956 0.012 0.032
#> SRR1465847 3 0.6095 0.4773 0.392 0.000 0.608
#> SRR1443376 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.1411 0.7884 0.036 0.000 0.964
#> SRR1075579 1 0.0983 0.8157 0.980 0.016 0.004
#> SRR1090881 2 0.9584 0.1423 0.372 0.428 0.200
#> SRR612251 2 0.2537 0.8663 0.080 0.920 0.000
#> SRR1418581 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 2 0.6526 0.7013 0.260 0.704 0.036
#> SRR613078 2 0.3879 0.8191 0.152 0.848 0.000
#> SRR1472998 3 0.6095 0.4773 0.392 0.000 0.608
#> SRR1433452 2 0.1289 0.8779 0.032 0.968 0.000
#> SRR1101957 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1487993 1 0.5988 0.4295 0.632 0.000 0.368
#> SRR1465983 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.1620 0.8173 0.964 0.012 0.024
#> SRR1367566 3 0.3116 0.7938 0.108 0.000 0.892
#> SRR1316151 2 0.5138 0.7227 0.252 0.748 0.000
#> SRR1417547 2 0.5254 0.7246 0.264 0.736 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.3879 0.8292 0.152 0.848 0.000
#> SRR1398207 1 0.6451 0.1739 0.560 0.004 0.436
#> SRR1358755 3 0.6062 0.5061 0.384 0.000 0.616
#> SRR1078903 2 0.2845 0.8679 0.068 0.920 0.012
#> SRR1323252 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0892 0.8782 0.020 0.980 0.000
#> SRR1369172 1 0.3445 0.7952 0.896 0.016 0.088
#> SRR615982 2 0.4002 0.8282 0.160 0.840 0.000
#> SRR1480431 2 0.3454 0.8576 0.104 0.888 0.008
#> SRR1429825 2 0.1315 0.8765 0.020 0.972 0.008
#> SRR1102393 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.6008 0.4823 0.664 0.004 0.332
#> SRR808351 1 0.1620 0.8166 0.964 0.012 0.024
#> SRR1317513 1 0.1482 0.8173 0.968 0.012 0.020
#> SRR1480501 1 0.6587 0.2195 0.568 0.008 0.424
#> SRR1081910 1 0.5810 0.4767 0.664 0.000 0.336
#> SRR1086611 2 0.7509 0.6056 0.300 0.636 0.064
#> SRR1392571 2 0.4723 0.8203 0.160 0.824 0.016
#> SRR1311441 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR808152 1 0.1482 0.8170 0.968 0.012 0.020
#> SRR657313 3 0.3879 0.7683 0.152 0.000 0.848
#> SRR1433131 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.1163 0.8778 0.028 0.972 0.000
#> SRR1389108 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1376228 3 0.2066 0.7981 0.060 0.000 0.940
#> SRR1399757 1 0.0747 0.8149 0.984 0.016 0.000
#> SRR1358060 3 0.2066 0.7981 0.060 0.000 0.940
#> SRR1464517 1 0.5363 0.6031 0.724 0.000 0.276
#> SRR613557 2 0.6762 0.6652 0.288 0.676 0.036
#> SRR809831 1 0.3454 0.7872 0.888 0.008 0.104
#> SRR1429387 3 0.0000 0.7794 0.000 0.000 1.000
#> SRR816565 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1071644 1 0.0747 0.8157 0.984 0.016 0.000
#> SRR1406936 1 0.6688 0.2646 0.580 0.012 0.408
#> SRR1072031 2 0.0000 0.8754 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.7220 0.6485 0.284 0.660 0.056
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 4 0.7103 0.5853 0.248 0.108 0.028 0.616
#> SRR1404105 1 0.1675 0.8018 0.948 0.004 0.004 0.044
#> SRR2164936 2 0.0188 0.8713 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1472057 3 0.6867 0.3393 0.124 0.000 0.552 0.324
#> SRR614491 2 0.6079 0.6736 0.060 0.652 0.008 0.280
#> SRR1069376 1 0.1576 0.8021 0.948 0.004 0.000 0.048
#> SRR811964 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0707 0.8719 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1345715 1 0.0524 0.8008 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1328073 1 0.5278 0.5845 0.768 0.112 0.008 0.112
#> SRR1394209 2 0.7331 0.5640 0.096 0.584 0.036 0.284
#> SRR1474018 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.7264 -0.0644 0.512 0.000 0.168 0.320
#> SRR1500555 2 0.4938 0.7784 0.032 0.756 0.008 0.204
#> SRR1354363 1 0.1109 0.8034 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1391619 3 0.4671 0.5613 0.028 0.000 0.752 0.220
#> SRR1307997 2 0.5087 0.7819 0.060 0.760 0.004 0.176
#> SRR663124 2 0.6127 0.6575 0.060 0.644 0.008 0.288
#> SRR1334670 1 0.1930 0.8002 0.936 0.004 0.004 0.056
#> SRR612515 2 0.6127 0.6575 0.060 0.644 0.008 0.288
#> SRR1092727 2 0.3278 0.8449 0.020 0.864 0.000 0.116
#> SRR1364013 2 0.3013 0.8566 0.032 0.888 0.000 0.080
#> SRR1468553 3 0.2450 0.6917 0.016 0.000 0.912 0.072
#> SRR1403980 3 0.3027 0.6890 0.020 0.004 0.888 0.088
#> SRR1420169 3 0.7581 -0.0504 0.196 0.000 0.424 0.380
#> SRR1442800 1 0.8004 0.1198 0.464 0.164 0.024 0.348
#> SRR1359214 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.7264 -0.0644 0.512 0.000 0.168 0.320
#> SRR1500030 4 0.6586 0.5553 0.156 0.000 0.216 0.628
#> SRR1093053 4 0.9048 0.3756 0.156 0.100 0.348 0.396
#> SRR1399843 4 0.7453 0.5565 0.232 0.000 0.260 0.508
#> SRR1380231 4 0.7911 0.5280 0.228 0.012 0.276 0.484
#> SRR809470 3 0.6854 0.3437 0.120 0.000 0.548 0.332
#> SRR614239 2 0.6127 0.6575 0.060 0.644 0.008 0.288
#> SRR613939 2 0.2909 0.8551 0.020 0.888 0.000 0.092
#> SRR612971 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.1398 0.8707 0.004 0.956 0.000 0.040
#> SRR811357 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0804 0.8012 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR613006 2 0.1890 0.8635 0.008 0.936 0.000 0.056
#> SRR1469570 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0188 0.8710 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1362906 4 0.6586 0.5553 0.156 0.000 0.216 0.628
#> SRR1079023 1 0.0376 0.7999 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR813608 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 4 0.5596 0.6271 0.236 0.012 0.044 0.708
#> SRR1478700 1 0.7146 -0.0102 0.516 0.000 0.148 0.336
#> SRR1081543 3 0.5864 0.4798 0.068 0.080 0.760 0.092
#> SRR1384754 4 0.5596 0.6271 0.236 0.012 0.044 0.708
#> SRR612287 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.7331 0.5640 0.096 0.584 0.036 0.284
#> SRR1315247 2 0.6721 0.5535 0.172 0.632 0.004 0.192
#> SRR1105344 2 0.1004 0.8677 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR658549 2 0.4938 0.7784 0.032 0.756 0.008 0.204
#> SRR1480240 1 0.1743 0.8007 0.940 0.004 0.000 0.056
#> SRR1084816 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.5655 0.7192 0.084 0.704 0.000 0.212
#> SRR1419476 3 0.4199 0.6574 0.032 0.000 0.804 0.164
#> SRR1456075 4 0.7198 0.5924 0.256 0.000 0.196 0.548
#> SRR1389474 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.1209 0.8029 0.964 0.004 0.000 0.032
#> SRR1334419 1 0.0524 0.8008 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1417154 3 0.3598 0.6707 0.028 0.000 0.848 0.124
#> SRR1095985 1 0.8004 0.1198 0.464 0.164 0.024 0.348
#> SRR1325771 1 0.0657 0.7991 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1360420 3 0.0000 0.6845 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.4542 0.7869 0.108 0.804 0.000 0.088
#> SRR1332993 1 0.1762 0.8003 0.944 0.004 0.004 0.048
#> SRR1311833 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808044 1 0.7146 -0.0102 0.516 0.000 0.148 0.336
#> SRR1076916 3 0.3441 0.6579 0.024 0.000 0.856 0.120
#> SRR1356266 1 0.2076 0.8035 0.932 0.008 0.004 0.056
#> SRR1341983 2 0.1305 0.8720 0.004 0.960 0.000 0.036
#> SRR1456114 1 0.4322 0.6881 0.804 0.000 0.044 0.152
#> SRR1072948 3 0.1302 0.6918 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1472370 3 0.6867 0.3393 0.124 0.000 0.552 0.324
#> SRR1480176 1 0.4514 0.7091 0.812 0.004 0.072 0.112
#> SRR613843 2 0.0188 0.8711 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1469192 1 0.4494 0.7028 0.808 0.004 0.056 0.132
#> SRR1404555 3 0.2216 0.6609 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR659839 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362848 4 0.5596 0.6271 0.236 0.012 0.044 0.708
#> SRR1407492 2 0.6127 0.6575 0.060 0.644 0.008 0.288
#> SRR1455082 2 0.3907 0.8285 0.032 0.828 0.000 0.140
#> SRR658362 2 0.1557 0.8697 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR810921 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0469 0.8715 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1456375 3 0.6089 0.4868 0.080 0.000 0.640 0.280
#> SRR818232 1 0.1902 0.7993 0.932 0.004 0.000 0.064
#> SRR1454868 2 0.8016 0.2455 0.128 0.436 0.036 0.400
#> SRR1474816 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.4464 0.7014 0.812 0.004 0.060 0.124
#> SRR1088437 2 0.0657 0.8721 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1466400 2 0.5515 0.6938 0.116 0.732 0.000 0.152
#> SRR658921 2 0.5167 0.7177 0.132 0.760 0.000 0.108
#> SRR1499873 2 0.0524 0.8723 0.004 0.988 0.000 0.008
#> SRR1101373 1 0.0524 0.8008 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1090145 1 0.3089 0.7688 0.896 0.044 0.008 0.052
#> SRR1379324 1 0.6167 0.4835 0.652 0.000 0.100 0.248
#> SRR1345307 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.3598 0.6749 0.028 0.000 0.848 0.124
#> SRR1086280 3 0.4199 0.6574 0.032 0.000 0.804 0.164
#> SRR1454891 2 0.4149 0.8094 0.028 0.804 0.000 0.168
#> SRR663185 2 0.0469 0.8715 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR811819 1 0.2907 0.7853 0.900 0.004 0.032 0.064
#> SRR1318920 1 0.4535 0.5910 0.704 0.000 0.004 0.292
#> SRR656758 2 0.1042 0.8725 0.008 0.972 0.000 0.020
#> SRR1474351 1 0.0657 0.8006 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR660450 2 0.4605 0.7857 0.108 0.800 0.000 0.092
#> SRR1472687 2 0.1305 0.8720 0.004 0.960 0.000 0.036
#> SRR1334291 2 0.1807 0.8682 0.008 0.940 0.000 0.052
#> SRR1415153 2 0.0592 0.8716 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1323271 2 0.1722 0.8676 0.008 0.944 0.000 0.048
#> SRR1368939 2 0.0657 0.8705 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1443161 4 0.8715 0.5401 0.184 0.084 0.236 0.496
#> SRR614695 2 0.5594 0.6895 0.112 0.724 0.000 0.164
#> SRR1092372 1 0.4868 0.5635 0.684 0.000 0.012 0.304
#> SRR1474577 1 0.0524 0.8008 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1406582 1 0.0524 0.8008 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR612779 2 0.4070 0.8212 0.044 0.824 0.000 0.132
#> SRR1089006 1 0.0524 0.8008 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1354071 1 0.4450 0.7288 0.832 0.040 0.032 0.096
#> SRR1105463 1 0.7845 -0.3704 0.404 0.000 0.304 0.292
#> SRR811005 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.2164 0.7982 0.924 0.004 0.004 0.068
#> SRR1325871 3 0.4671 0.5613 0.028 0.000 0.752 0.220
#> SRR1355415 3 0.7388 0.2312 0.188 0.000 0.500 0.312
#> SRR1090861 1 0.0524 0.7998 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1320712 2 0.7501 0.4090 0.156 0.504 0.008 0.332
#> SRR1470075 1 0.1807 0.7962 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR1091254 1 0.1492 0.8031 0.956 0.004 0.004 0.036
#> SRR1101397 4 0.7857 0.4269 0.328 0.000 0.280 0.392
#> SRR1321165 1 0.4868 0.5635 0.684 0.000 0.012 0.304
#> SRR1092112 3 0.4335 0.6438 0.036 0.000 0.796 0.168
#> SRR1417588 3 0.0000 0.6845 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074790 1 0.3082 0.7130 0.884 0.084 0.000 0.032
#> SRR1432106 2 0.0657 0.8721 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR655756 2 0.0188 0.8713 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1458314 1 0.4322 0.6881 0.804 0.000 0.044 0.152
#> SRR1318582 2 0.0592 0.8716 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1080484 2 0.1109 0.8706 0.004 0.968 0.000 0.028
#> SRR1072749 1 0.7102 0.0457 0.548 0.000 0.164 0.288
#> SRR1078586 1 0.0524 0.8009 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1400333 2 0.6785 0.6699 0.136 0.668 0.028 0.168
#> SRR1078834 2 0.6084 0.6891 0.152 0.704 0.008 0.136
#> SRR1417611 2 0.3325 0.8376 0.024 0.864 0.000 0.112
#> SRR1396840 1 0.5538 0.5178 0.644 0.000 0.036 0.320
#> SRR1465440 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0895 0.8683 0.004 0.976 0.000 0.020
#> SRR614984 2 0.6150 0.6568 0.060 0.640 0.008 0.292
#> SRR1324269 1 0.4716 0.6940 0.796 0.004 0.068 0.132
#> SRR1401491 2 0.1004 0.8677 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR1319443 1 0.2891 0.7876 0.896 0.004 0.020 0.080
#> SRR1324349 2 0.3128 0.8530 0.040 0.884 0.000 0.076
#> SRR1345523 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.1109 0.8034 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR661505 3 0.6965 0.4272 0.072 0.052 0.644 0.232
#> SRR1419062 3 0.7978 -0.2620 0.200 0.012 0.428 0.360
#> SRR1480131 1 0.7322 0.1082 0.532 0.000 0.224 0.244
#> SRR1421284 2 0.5661 0.7171 0.080 0.700 0.000 0.220
#> SRR1329624 1 0.1004 0.8029 0.972 0.004 0.000 0.024
#> SRR1315739 3 0.2329 0.6926 0.012 0.000 0.916 0.072
#> SRR1099189 2 0.3047 0.8480 0.012 0.872 0.000 0.116
#> SRR1083286 1 0.1902 0.7998 0.932 0.004 0.000 0.064
#> SRR1091890 4 0.7999 0.5863 0.220 0.108 0.092 0.580
#> SRR1347436 2 0.5063 0.7984 0.048 0.776 0.016 0.160
#> SRR1327473 1 0.4046 0.6326 0.828 0.124 0.000 0.048
#> SRR1338195 3 0.0000 0.6845 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.1109 0.8042 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR658271 2 0.0188 0.8713 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1339597 1 0.7134 0.0834 0.532 0.000 0.156 0.312
#> SRR1454842 3 0.1576 0.6908 0.000 0.004 0.948 0.048
#> SRR1322643 1 0.0817 0.8024 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR614887 3 0.0188 0.6832 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1354620 3 0.7250 0.2163 0.160 0.000 0.504 0.336
#> SRR615056 2 0.2813 0.8550 0.024 0.896 0.000 0.080
#> SRR1105320 1 0.4356 0.6137 0.812 0.124 0.000 0.064
#> SRR1391529 1 0.1902 0.7993 0.932 0.004 0.000 0.064
#> SRR663052 2 0.0817 0.8718 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1478834 1 0.3648 0.7647 0.856 0.004 0.032 0.108
#> SRR812366 2 0.1305 0.8636 0.004 0.960 0.000 0.036
#> SRR1435330 3 0.1978 0.6928 0.004 0.000 0.928 0.068
#> SRR615383 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 2 0.7113 0.5860 0.060 0.592 0.048 0.300
#> SRR613568 2 0.4542 0.7869 0.108 0.804 0.000 0.088
#> SRR614095 2 0.2483 0.8595 0.032 0.916 0.000 0.052
#> SRR1103092 1 0.3025 0.7782 0.896 0.004 0.044 0.056
#> SRR1337155 2 0.9587 -0.1331 0.136 0.372 0.240 0.252
#> SRR1475345 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 2 0.6721 0.5535 0.172 0.632 0.004 0.192
#> SRR1406372 2 0.0895 0.8683 0.004 0.976 0.000 0.020
#> SRR1339880 4 0.6586 0.5553 0.156 0.000 0.216 0.628
#> SRR1353136 2 0.8016 0.2455 0.128 0.436 0.036 0.400
#> SRR1093906 3 0.0000 0.6845 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.3224 0.7497 0.864 0.000 0.016 0.120
#> SRR1363926 2 0.6403 0.6268 0.112 0.628 0.000 0.260
#> SRR1399861 2 0.8031 0.1922 0.148 0.420 0.028 0.404
#> SRR1338789 1 0.4214 0.6966 0.780 0.000 0.016 0.204
#> SRR1421420 4 0.7526 0.3535 0.188 0.000 0.372 0.440
#> SRR1420832 2 0.0336 0.8712 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1476231 1 0.0657 0.8016 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1352870 2 0.7856 0.4411 0.068 0.524 0.080 0.328
#> SRR1315041 2 0.3266 0.8398 0.024 0.868 0.000 0.108
#> SRR661877 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443268 4 0.7857 0.4269 0.328 0.000 0.280 0.392
#> SRR1416617 3 0.2329 0.6926 0.012 0.000 0.916 0.072
#> SRR1102443 1 0.0927 0.8010 0.976 0.008 0.000 0.016
#> SRR655672 2 0.6127 0.6575 0.060 0.644 0.008 0.288
#> SRR1420006 3 0.0336 0.6828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1458267 2 0.1807 0.8682 0.008 0.940 0.000 0.052
#> SRR613819 2 0.4885 0.7899 0.056 0.784 0.008 0.152
#> SRR1469432 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.3659 0.8347 0.024 0.840 0.000 0.136
#> SRR1470727 1 0.5010 0.6576 0.772 0.004 0.068 0.156
#> SRR1339153 3 0.4406 0.5909 0.028 0.000 0.780 0.192
#> SRR1472749 3 0.6300 0.3707 0.108 0.000 0.640 0.252
#> SRR1414379 2 0.6401 0.6676 0.084 0.652 0.012 0.252
#> SRR1431326 1 0.0524 0.8008 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1487278 2 0.5375 0.7037 0.116 0.744 0.000 0.140
#> SRR1098312 4 0.7475 0.5803 0.236 0.112 0.048 0.604
#> SRR810273 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.1975 0.8676 0.016 0.936 0.000 0.048
#> SRR614467 2 0.2053 0.8629 0.004 0.924 0.000 0.072
#> SRR811471 1 0.1847 0.8020 0.940 0.004 0.004 0.052
#> SRR1478341 3 0.0000 0.6845 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.8004 0.1198 0.464 0.164 0.024 0.348
#> SRR1479699 4 0.7709 0.6257 0.228 0.068 0.108 0.596
#> SRR1403589 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.1489 0.8717 0.004 0.952 0.000 0.044
#> SRR1359803 1 0.2821 0.7901 0.900 0.004 0.020 0.076
#> SRR1338988 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.1305 0.8636 0.004 0.960 0.000 0.036
#> SRR1378992 1 0.0524 0.8008 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR659427 4 0.8401 0.3635 0.176 0.252 0.060 0.512
#> SRR1096638 1 0.2741 0.7705 0.892 0.000 0.012 0.096
#> SRR1466619 2 0.1545 0.8647 0.008 0.952 0.000 0.040
#> SRR659307 2 0.6270 0.6519 0.060 0.636 0.012 0.292
#> SRR1439994 3 0.7286 0.1520 0.156 0.000 0.480 0.364
#> SRR1454931 1 0.3328 0.7791 0.872 0.004 0.024 0.100
#> SRR1332928 4 0.7408 0.5617 0.276 0.000 0.212 0.512
#> SRR658621 2 0.3367 0.8397 0.028 0.864 0.000 0.108
#> SRR1095840 1 0.1004 0.8039 0.972 0.004 0.000 0.024
#> SRR1458243 1 0.7158 -0.0129 0.512 0.000 0.148 0.340
#> SRR1374270 2 0.6595 0.5988 0.124 0.608 0.000 0.268
#> SRR1470947 2 0.0336 0.8712 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1365598 2 0.5167 0.7177 0.132 0.760 0.000 0.108
#> SRR662787 2 0.0657 0.8721 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1408727 2 0.7034 0.4674 0.116 0.532 0.004 0.348
#> SRR1456274 4 0.7754 0.6126 0.280 0.064 0.092 0.564
#> SRR817744 1 0.0524 0.7996 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1478744 2 0.0336 0.8712 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1387379 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 4 0.7911 0.5280 0.228 0.012 0.276 0.484
#> SRR1374198 1 0.4868 0.5635 0.684 0.000 0.012 0.304
#> SRR1445856 1 0.7134 0.0834 0.532 0.000 0.156 0.312
#> SRR820049 3 0.7898 0.1442 0.056 0.100 0.524 0.320
#> SRR1375290 2 0.8792 0.0664 0.100 0.400 0.120 0.380
#> SRR818999 1 0.7894 -0.4243 0.376 0.000 0.320 0.304
#> SRR1390242 1 0.0779 0.8023 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1401164 2 0.1305 0.8649 0.004 0.960 0.000 0.036
#> SRR1454629 1 0.5240 0.6647 0.748 0.008 0.052 0.192
#> SRR1332187 3 0.1022 0.6854 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR603365 3 0.0817 0.6891 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR657833 2 0.3215 0.8514 0.032 0.876 0.000 0.092
#> SRR1436207 2 0.2198 0.8645 0.008 0.920 0.000 0.072
#> SRR1488017 1 0.0376 0.7999 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR612947 2 0.0469 0.8717 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1480384 1 0.4963 0.6637 0.776 0.004 0.068 0.152
#> SRR1364761 2 0.1004 0.8718 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR1308086 4 0.5620 0.6210 0.208 0.000 0.084 0.708
#> SRR1441868 1 0.0524 0.8008 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1485380 3 0.5579 0.5493 0.060 0.000 0.688 0.252
#> SRR1073705 1 0.0524 0.8008 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR615032 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0336 0.8712 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1442983 2 0.0592 0.8716 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1100346 2 0.5358 0.7479 0.052 0.724 0.004 0.220
#> SRR1332816 1 0.0804 0.8012 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR612299 2 0.5515 0.7029 0.116 0.732 0.000 0.152
#> SRR1407386 1 0.1109 0.8040 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1418064 2 0.0188 0.8713 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1309403 1 0.4992 0.6270 0.788 0.104 0.008 0.100
#> SRR1498395 2 0.1256 0.8713 0.008 0.964 0.000 0.028
#> SRR1079998 4 0.7800 0.2697 0.248 0.000 0.376 0.376
#> SRR1498885 2 0.1890 0.8657 0.008 0.936 0.000 0.056
#> SRR1337215 2 0.5092 0.7480 0.140 0.764 0.000 0.096
#> SRR1414749 3 0.2329 0.6926 0.012 0.000 0.916 0.072
#> SRR1365963 4 0.7816 0.4076 0.284 0.000 0.300 0.416
#> SRR1368030 2 0.5593 0.7243 0.080 0.708 0.000 0.212
#> SRR1419760 2 0.5666 0.7569 0.060 0.728 0.016 0.196
#> SRR1381841 1 0.6673 0.3472 0.608 0.000 0.140 0.252
#> SRR821388 4 0.7012 0.5831 0.248 0.108 0.024 0.620
#> SRR657623 2 0.3367 0.8397 0.028 0.864 0.000 0.108
#> SRR1094241 3 0.3991 0.6236 0.020 0.000 0.808 0.172
#> SRR819583 3 0.6567 0.4079 0.104 0.000 0.588 0.308
#> SRR1096149 1 0.3708 0.7184 0.832 0.000 0.020 0.148
#> SRR1342829 3 0.0000 0.6845 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.2310 0.7965 0.920 0.004 0.008 0.068
#> SRR811333 3 0.7606 -0.0452 0.208 0.000 0.444 0.348
#> SRR1311666 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.2843 0.8563 0.020 0.892 0.000 0.088
#> SRR1446436 2 0.1576 0.8697 0.004 0.948 0.000 0.048
#> SRR815092 1 0.0779 0.8023 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1500149 2 0.2466 0.8512 0.028 0.916 0.000 0.056
#> SRR1100564 1 0.1743 0.8024 0.940 0.004 0.000 0.056
#> SRR1403072 3 0.0336 0.6828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR811653 2 0.8031 0.1922 0.148 0.420 0.028 0.404
#> SRR1311348 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0657 0.8721 0.004 0.984 0.000 0.012
#> SRR1435442 2 0.5515 0.6938 0.116 0.732 0.000 0.152
#> SRR1421444 3 0.0000 0.6845 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0524 0.8008 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1444763 1 0.4482 0.6415 0.728 0.000 0.008 0.264
#> SRR1415026 2 0.0707 0.8719 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1416596 2 0.2021 0.8643 0.012 0.932 0.000 0.056
#> SRR1485499 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.1890 0.8657 0.008 0.936 0.000 0.056
#> SRR1310094 2 0.3441 0.8350 0.024 0.856 0.000 0.120
#> SRR663537 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.3109 0.7647 0.880 0.004 0.016 0.100
#> SRR1453950 1 0.4442 0.7076 0.812 0.004 0.056 0.128
#> SRR1087875 1 0.0524 0.8008 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR613318 2 0.7377 0.4757 0.136 0.536 0.012 0.316
#> SRR1332694 1 0.1930 0.8011 0.936 0.004 0.004 0.056
#> SRR1468469 3 0.3598 0.6749 0.028 0.000 0.848 0.124
#> SRR818670 2 0.0895 0.8722 0.004 0.976 0.000 0.020
#> SRR1120318 1 0.2860 0.7792 0.904 0.004 0.044 0.048
#> SRR1311622 4 0.7198 0.5924 0.256 0.000 0.196 0.548
#> SRR1500931 3 0.6222 0.4615 0.080 0.000 0.616 0.304
#> SRR1387494 4 0.6959 0.6248 0.192 0.032 0.124 0.652
#> SRR1379175 2 0.7939 0.2670 0.128 0.444 0.032 0.396
#> SRR1401909 3 0.7388 0.2312 0.188 0.000 0.500 0.312
#> SRR1440541 2 0.1411 0.8690 0.020 0.960 0.000 0.020
#> SRR1068832 3 0.6867 0.3421 0.124 0.000 0.552 0.324
#> SRR1376640 2 0.4187 0.8183 0.024 0.816 0.008 0.152
#> SRR1085712 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.5968 0.5294 0.672 0.000 0.092 0.236
#> SRR1084276 1 0.5857 0.5772 0.712 0.004 0.112 0.172
#> SRR1353262 2 0.0188 0.8710 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1437035 1 0.4031 0.7469 0.856 0.036 0.032 0.076
#> SRR1396877 1 0.5783 0.5621 0.708 0.000 0.120 0.172
#> SRR1443026 2 0.0188 0.8710 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1417936 1 0.0524 0.8009 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1436822 2 0.1004 0.8672 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR1101128 3 0.3813 0.6657 0.024 0.000 0.828 0.148
#> SRR1363886 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.5568 0.7088 0.120 0.728 0.000 0.152
#> SRR1093218 3 0.7093 0.0396 0.128 0.000 0.476 0.396
#> SRR1077090 3 0.7286 0.1520 0.156 0.000 0.480 0.364
#> SRR1327430 2 0.6221 0.6489 0.100 0.644 0.000 0.256
#> SRR1088958 1 0.0524 0.8008 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1486931 2 0.2795 0.8574 0.012 0.896 0.004 0.088
#> SRR1086820 1 0.4323 0.7015 0.788 0.000 0.028 0.184
#> SRR1383000 1 0.4388 0.7115 0.816 0.004 0.056 0.124
#> SRR1355705 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614335 2 0.2048 0.8634 0.008 0.928 0.000 0.064
#> SRR660534 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.3266 0.8398 0.024 0.868 0.000 0.108
#> SRR1456401 2 0.6403 0.6268 0.112 0.628 0.000 0.260
#> SRR1086393 1 0.2328 0.7984 0.924 0.004 0.016 0.056
#> SRR1351521 3 0.0336 0.6828 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1093100 2 0.5661 0.7155 0.080 0.700 0.000 0.220
#> SRR1309382 1 0.2164 0.7977 0.924 0.004 0.004 0.068
#> SRR1089375 4 0.8264 0.5614 0.272 0.028 0.228 0.472
#> SRR1499482 2 0.4015 0.8253 0.052 0.832 0.000 0.116
#> SRR614719 2 0.4877 0.7704 0.044 0.752 0.000 0.204
#> SRR1081473 4 0.7576 0.4184 0.204 0.000 0.344 0.452
#> SRR1087415 1 0.4323 0.7015 0.788 0.000 0.028 0.184
#> SRR1088217 3 0.6739 0.3865 0.120 0.000 0.576 0.304
#> SRR808496 2 0.5934 0.7264 0.076 0.704 0.012 0.208
#> SRR1336463 2 0.3071 0.8556 0.044 0.888 0.000 0.068
#> SRR612359 2 0.5955 0.6941 0.052 0.672 0.012 0.264
#> SRR1444412 1 0.4592 0.7115 0.804 0.004 0.064 0.128
#> SRR1074116 3 0.0000 0.6845 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.6845 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0469 0.8717 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR808914 1 0.1209 0.8036 0.964 0.004 0.000 0.032
#> SRR1349099 1 0.6006 0.4672 0.624 0.036 0.012 0.328
#> SRR1337886 2 0.1398 0.8720 0.004 0.956 0.000 0.040
#> SRR813632 1 0.7250 -0.0584 0.516 0.000 0.168 0.316
#> SRR1101591 3 0.7793 -0.2863 0.248 0.000 0.396 0.356
#> SRR1089713 4 0.7937 0.5335 0.236 0.012 0.272 0.480
#> SRR1453127 3 0.1792 0.6911 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1498354 3 0.6980 0.3076 0.132 0.000 0.536 0.332
#> SRR1313831 1 0.1902 0.7993 0.932 0.004 0.000 0.064
#> SRR1315434 3 0.4686 0.6202 0.068 0.000 0.788 0.144
#> SRR814747 2 0.4094 0.8169 0.056 0.828 0.000 0.116
#> SRR1358539 1 0.1822 0.8037 0.944 0.004 0.008 0.044
#> SRR1367807 1 0.0524 0.8008 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1365791 1 0.8079 0.1172 0.464 0.164 0.028 0.344
#> SRR1081519 3 0.6477 0.4252 0.100 0.000 0.600 0.300
#> SRR614707 2 0.5619 0.7088 0.152 0.724 0.000 0.124
#> SRR1094027 1 0.0524 0.8009 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1489092 1 0.8004 0.1198 0.464 0.164 0.024 0.348
#> SRR1079502 4 0.7642 0.5246 0.220 0.004 0.280 0.496
#> SRR1457814 2 0.8031 0.1922 0.148 0.420 0.028 0.404
#> SRR1455127 2 0.0188 0.8713 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR615081 2 0.1004 0.8672 0.004 0.972 0.000 0.024
#> SRR1327855 3 0.6567 0.4079 0.104 0.000 0.588 0.308
#> SRR1417873 2 0.3325 0.8376 0.024 0.864 0.000 0.112
#> SRR1394125 3 0.7978 -0.2620 0.200 0.012 0.428 0.360
#> SRR1488388 1 0.1109 0.8042 0.968 0.004 0.000 0.028
#> SRR1401122 2 0.5522 0.7300 0.080 0.716 0.000 0.204
#> SRR612383 2 0.6194 0.6474 0.060 0.632 0.008 0.300
#> SRR1477711 1 0.0657 0.8017 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR1350813 2 0.3659 0.8347 0.024 0.840 0.000 0.136
#> SRR612851 2 0.4105 0.8125 0.032 0.812 0.000 0.156
#> SRR1086349 1 0.0524 0.7998 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR812837 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 4 0.7103 0.5853 0.248 0.108 0.028 0.616
#> SRR1475885 1 0.6981 0.3326 0.556 0.076 0.020 0.348
#> SRR1376334 1 0.1902 0.7993 0.932 0.004 0.000 0.064
#> SRR1399821 1 0.6006 0.4672 0.624 0.036 0.012 0.328
#> SRR1347042 3 0.1792 0.6911 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR612323 2 0.6127 0.6575 0.060 0.644 0.008 0.288
#> SRR612604 2 0.3080 0.8248 0.024 0.880 0.000 0.096
#> SRR1389546 2 0.0895 0.8722 0.004 0.976 0.000 0.020
#> SRR1311877 1 0.0779 0.8023 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1465608 4 0.7816 0.4076 0.284 0.000 0.300 0.416
#> SRR1101808 2 0.0469 0.8717 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1414079 3 0.1978 0.6928 0.004 0.000 0.928 0.068
#> SRR1331153 2 0.4542 0.7869 0.108 0.804 0.000 0.088
#> SRR1078439 4 0.9048 0.3756 0.156 0.100 0.348 0.396
#> SRR2165527 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.3071 0.7337 0.888 0.068 0.000 0.044
#> SRR1313536 2 0.0895 0.8694 0.004 0.976 0.000 0.020
#> SRR1070308 1 0.4046 0.6326 0.828 0.124 0.000 0.048
#> SRR1403110 1 0.1902 0.7993 0.932 0.004 0.000 0.064
#> SRR1400355 2 0.0921 0.8717 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1401317 3 0.6567 0.4079 0.104 0.000 0.588 0.308
#> SRR1456862 1 0.4907 0.6401 0.764 0.000 0.060 0.176
#> SRR1074622 1 0.2310 0.7909 0.920 0.004 0.008 0.068
#> SRR1465847 3 0.7228 0.1799 0.156 0.000 0.504 0.340
#> SRR1443376 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.1637 0.6729 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1075579 1 0.0779 0.8023 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1090881 2 0.8792 0.0664 0.100 0.400 0.120 0.380
#> SRR612251 2 0.2483 0.8595 0.032 0.916 0.000 0.052
#> SRR1418581 1 0.0524 0.8008 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR658045 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613214 2 0.5654 0.7071 0.040 0.680 0.008 0.272
#> SRR613078 2 0.5217 0.7195 0.108 0.756 0.000 0.136
#> SRR1472998 3 0.7228 0.1799 0.156 0.000 0.504 0.340
#> SRR1433452 2 0.1584 0.8705 0.012 0.952 0.000 0.036
#> SRR1101957 1 0.0779 0.8023 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1487993 4 0.6586 0.5553 0.156 0.000 0.216 0.628
#> SRR1465983 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.2234 0.7984 0.924 0.004 0.008 0.064
#> SRR1367566 3 0.3525 0.6745 0.040 0.000 0.860 0.100
#> SRR1316151 2 0.5740 0.6263 0.208 0.700 0.000 0.092
#> SRR1417547 2 0.5522 0.7300 0.080 0.716 0.000 0.204
#> SRR659389 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.4605 0.7857 0.108 0.800 0.000 0.092
#> SRR1398207 1 0.7866 -0.4304 0.376 0.000 0.348 0.276
#> SRR1358755 3 0.7122 0.2603 0.144 0.000 0.516 0.340
#> SRR1078903 2 0.2796 0.8570 0.016 0.892 0.000 0.092
#> SRR1323252 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.1022 0.8717 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1369172 1 0.4979 0.6724 0.760 0.000 0.064 0.176
#> SRR615982 2 0.4174 0.8167 0.044 0.816 0.000 0.140
#> SRR1480431 2 0.3047 0.8480 0.012 0.872 0.000 0.116
#> SRR1429825 2 0.1690 0.8689 0.008 0.952 0.008 0.032
#> SRR1102393 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 4 0.7490 0.5578 0.328 0.000 0.196 0.476
#> SRR808351 1 0.2310 0.7881 0.920 0.004 0.008 0.068
#> SRR1317513 1 0.1930 0.8011 0.936 0.004 0.004 0.056
#> SRR1480501 4 0.7623 0.4656 0.200 0.004 0.308 0.488
#> SRR1081910 1 0.7645 -0.1985 0.468 0.000 0.268 0.264
#> SRR1086611 2 0.7512 0.5664 0.152 0.600 0.036 0.212
#> SRR1392571 2 0.4696 0.8032 0.056 0.792 0.004 0.148
#> SRR1311441 1 0.0524 0.8008 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR808152 1 0.1847 0.7991 0.940 0.004 0.004 0.052
#> SRR657313 3 0.4446 0.5958 0.028 0.000 0.776 0.196
#> SRR1433131 2 0.0188 0.8711 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1321011 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.1677 0.8700 0.012 0.948 0.000 0.040
#> SRR1389108 1 0.0524 0.8008 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1376228 3 0.2329 0.6926 0.012 0.000 0.916 0.072
#> SRR1399757 1 0.0524 0.7993 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1358060 3 0.2329 0.6926 0.012 0.000 0.916 0.072
#> SRR1464517 4 0.6308 0.6336 0.208 0.000 0.136 0.656
#> SRR613557 2 0.6079 0.6736 0.060 0.652 0.008 0.280
#> SRR809831 1 0.4716 0.6940 0.796 0.004 0.068 0.132
#> SRR1429387 3 0.0000 0.6845 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0524 0.8009 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR1071644 1 0.0376 0.7999 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1406936 4 0.7626 0.5096 0.212 0.004 0.288 0.496
#> SRR1072031 2 0.0000 0.8711 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.6127 0.6575 0.060 0.644 0.008 0.288
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 4 0.7525 0.06155 0.096 0.072 0.016 0.428 0.388
#> SRR1404105 1 0.1502 0.84451 0.940 0.000 0.000 0.004 0.056
#> SRR2164936 2 0.0963 0.80830 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1472057 5 0.5191 0.27281 0.004 0.000 0.408 0.036 0.552
#> SRR614491 2 0.4698 0.26658 0.004 0.520 0.000 0.468 0.008
#> SRR1069376 1 0.1704 0.84410 0.928 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR811964 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0963 0.80724 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1345715 1 0.0566 0.84198 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1328073 1 0.5174 0.64512 0.744 0.076 0.000 0.128 0.052
#> SRR1394209 2 0.6159 0.10367 0.044 0.496 0.004 0.420 0.036
#> SRR1474018 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099809 5 0.6114 0.27349 0.376 0.000 0.072 0.024 0.528
#> SRR1500555 2 0.4416 0.53902 0.000 0.632 0.000 0.356 0.012
#> SRR1354363 1 0.1571 0.84249 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR1391619 3 0.4845 0.64727 0.000 0.000 0.724 0.148 0.128
#> SRR1307997 2 0.5042 0.53825 0.028 0.628 0.000 0.332 0.012
#> SRR663124 2 0.4954 0.25922 0.004 0.528 0.000 0.448 0.020
#> SRR1334670 1 0.2208 0.83921 0.908 0.000 0.000 0.020 0.072
#> SRR612515 2 0.4954 0.25922 0.004 0.528 0.000 0.448 0.020
#> SRR1092727 2 0.3402 0.74255 0.008 0.804 0.000 0.184 0.004
#> SRR1364013 2 0.3937 0.73862 0.012 0.784 0.000 0.184 0.020
#> SRR1468553 3 0.2362 0.81087 0.000 0.000 0.900 0.024 0.076
#> SRR1403980 3 0.3096 0.79893 0.008 0.004 0.872 0.032 0.084
#> SRR1420169 5 0.5741 0.44612 0.056 0.000 0.304 0.028 0.612
#> SRR1442800 4 0.7497 0.06722 0.276 0.040 0.000 0.404 0.280
#> SRR1359214 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499849 5 0.6114 0.27349 0.376 0.000 0.072 0.024 0.528
#> SRR1500030 5 0.6645 0.31153 0.012 0.000 0.160 0.360 0.468
#> SRR1093053 4 0.8429 -0.12087 0.024 0.068 0.308 0.316 0.284
#> SRR1399843 5 0.7868 0.47206 0.124 0.000 0.168 0.256 0.452
#> SRR1380231 5 0.7876 0.53506 0.132 0.008 0.160 0.200 0.500
#> SRR809470 5 0.5683 0.27733 0.028 0.000 0.420 0.032 0.520
#> SRR614239 2 0.4954 0.25922 0.004 0.528 0.000 0.448 0.020
#> SRR613939 2 0.3805 0.73388 0.000 0.784 0.000 0.184 0.032
#> SRR612971 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.1608 0.80347 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0833 0.84260 0.976 0.004 0.000 0.004 0.016
#> SRR613006 2 0.2813 0.78156 0.000 0.868 0.000 0.108 0.024
#> SRR1469570 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0566 0.80773 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004
#> SRR1362906 5 0.6645 0.31153 0.012 0.000 0.160 0.360 0.468
#> SRR1079023 1 0.0162 0.84213 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR813608 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 5 0.5842 0.14706 0.068 0.004 0.004 0.452 0.472
#> SRR1478700 5 0.6260 0.26153 0.368 0.000 0.068 0.036 0.528
#> SRR1081543 3 0.5697 0.57534 0.048 0.064 0.736 0.116 0.036
#> SRR1384754 5 0.5842 0.14706 0.068 0.004 0.004 0.452 0.472
#> SRR612287 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.6159 0.10367 0.044 0.496 0.004 0.420 0.036
#> SRR1315247 2 0.6991 0.14050 0.052 0.484 0.004 0.360 0.100
#> SRR1105344 2 0.2069 0.79230 0.000 0.912 0.000 0.076 0.012
#> SRR658549 2 0.4416 0.53902 0.000 0.632 0.000 0.356 0.012
#> SRR1480240 1 0.2006 0.84277 0.916 0.000 0.000 0.012 0.072
#> SRR1084816 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0162 0.80674 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1358520 2 0.5099 0.44506 0.040 0.608 0.000 0.348 0.004
#> SRR1419476 3 0.4133 0.69244 0.000 0.000 0.768 0.052 0.180
#> SRR1456075 5 0.6379 0.53320 0.084 0.000 0.088 0.192 0.636
#> SRR1389474 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.1430 0.84285 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR1334419 1 0.0566 0.84198 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1417154 3 0.3656 0.77525 0.008 0.000 0.832 0.056 0.104
#> SRR1095985 4 0.7497 0.06722 0.276 0.040 0.000 0.404 0.280
#> SRR1325771 1 0.0579 0.84191 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1360420 3 0.0324 0.81353 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR660272 2 0.5548 0.59705 0.052 0.676 0.000 0.228 0.044
#> SRR1332993 1 0.1768 0.84263 0.924 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1311833 2 0.0404 0.80768 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR808044 5 0.6260 0.26153 0.368 0.000 0.068 0.036 0.528
#> SRR1076916 3 0.3702 0.75573 0.008 0.000 0.832 0.080 0.080
#> SRR1356266 1 0.2589 0.84528 0.896 0.004 0.004 0.020 0.076
#> SRR1341983 2 0.2248 0.79767 0.000 0.900 0.000 0.088 0.012
#> SRR1456114 1 0.4313 0.64601 0.704 0.000 0.008 0.012 0.276
#> SRR1072948 3 0.1430 0.81741 0.000 0.000 0.944 0.004 0.052
#> SRR1472370 5 0.5191 0.27281 0.004 0.000 0.408 0.036 0.552
#> SRR1480176 1 0.4048 0.72769 0.764 0.000 0.016 0.012 0.208
#> SRR613843 2 0.1914 0.80202 0.000 0.924 0.000 0.060 0.016
#> SRR1469192 1 0.3828 0.72670 0.764 0.000 0.008 0.008 0.220
#> SRR1404555 3 0.2871 0.77188 0.000 0.000 0.872 0.088 0.040
#> SRR659839 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0290 0.80606 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1362848 5 0.5842 0.14706 0.068 0.004 0.004 0.452 0.472
#> SRR1407492 2 0.4954 0.25922 0.004 0.528 0.000 0.448 0.020
#> SRR1455082 2 0.4363 0.66081 0.008 0.708 0.000 0.268 0.016
#> SRR658362 2 0.1851 0.80227 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0609 0.80687 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1456375 3 0.4894 -0.00244 0.000 0.000 0.520 0.024 0.456
#> SRR818232 1 0.2344 0.83783 0.904 0.000 0.000 0.032 0.064
#> SRR1454868 4 0.6699 0.41851 0.060 0.324 0.004 0.540 0.072
#> SRR1474816 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.3912 0.72781 0.768 0.000 0.020 0.004 0.208
#> SRR1088437 2 0.0609 0.80704 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1466400 2 0.6065 0.41299 0.028 0.596 0.000 0.292 0.084
#> SRR658921 2 0.6022 0.46817 0.040 0.624 0.000 0.260 0.076
#> SRR1499873 2 0.0510 0.80830 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1101373 1 0.0451 0.84205 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1090145 1 0.2839 0.81815 0.892 0.024 0.000 0.036 0.048
#> SRR1379324 1 0.6230 0.34530 0.528 0.000 0.040 0.060 0.372
#> SRR1345307 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.3163 0.75992 0.000 0.000 0.824 0.012 0.164
#> SRR1086280 3 0.4133 0.69244 0.000 0.000 0.768 0.052 0.180
#> SRR1454891 2 0.4059 0.63559 0.004 0.700 0.000 0.292 0.004
#> SRR663185 2 0.0609 0.80687 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR811819 1 0.2748 0.82586 0.880 0.000 0.008 0.016 0.096
#> SRR1318920 1 0.6463 0.31911 0.488 0.000 0.000 0.212 0.300
#> SRR656758 2 0.1569 0.80727 0.008 0.944 0.000 0.044 0.004
#> SRR1474351 1 0.0451 0.84341 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR660450 2 0.5575 0.59267 0.052 0.672 0.000 0.232 0.044
#> SRR1472687 2 0.2305 0.79590 0.000 0.896 0.000 0.092 0.012
#> SRR1334291 2 0.1908 0.79831 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1415153 2 0.0963 0.80669 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1323271 2 0.2068 0.79318 0.004 0.904 0.000 0.092 0.000
#> SRR1368939 2 0.2079 0.79725 0.000 0.916 0.000 0.064 0.020
#> SRR1443161 5 0.8266 0.16889 0.044 0.056 0.164 0.352 0.384
#> SRR614695 2 0.6099 0.39037 0.028 0.580 0.000 0.312 0.080
#> SRR1092372 1 0.6562 0.27329 0.464 0.000 0.000 0.228 0.308
#> SRR1474577 1 0.0566 0.84198 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1406582 1 0.0451 0.84205 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR612779 2 0.4295 0.66504 0.024 0.724 0.000 0.248 0.004
#> SRR1089006 1 0.0566 0.84198 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1354071 1 0.4611 0.74860 0.792 0.020 0.012 0.076 0.100
#> SRR1105463 5 0.6865 0.47841 0.288 0.000 0.184 0.024 0.504
#> SRR811005 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.2450 0.83625 0.896 0.000 0.000 0.028 0.076
#> SRR1325871 3 0.4845 0.64727 0.000 0.000 0.724 0.148 0.128
#> SRR1355415 5 0.6143 0.30624 0.052 0.000 0.384 0.040 0.524
#> SRR1090861 1 0.0451 0.84220 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1320712 4 0.6539 0.24856 0.072 0.392 0.000 0.488 0.048
#> SRR1470075 1 0.2179 0.82891 0.896 0.000 0.000 0.004 0.100
#> SRR1091254 1 0.1728 0.84362 0.940 0.000 0.004 0.020 0.036
#> SRR1101397 5 0.6138 0.54182 0.176 0.000 0.144 0.036 0.644
#> SRR1321165 1 0.6579 0.26524 0.460 0.000 0.000 0.232 0.308
#> SRR1092112 3 0.4163 0.59641 0.000 0.000 0.740 0.032 0.228
#> SRR1417588 3 0.0324 0.81353 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1074790 1 0.2993 0.78030 0.884 0.044 0.000 0.048 0.024
#> SRR1432106 2 0.0609 0.80704 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR655756 2 0.0404 0.80748 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1458314 1 0.4313 0.64601 0.704 0.000 0.008 0.012 0.276
#> SRR1318582 2 0.0963 0.80669 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1080484 2 0.1043 0.80410 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1072749 5 0.6394 0.09031 0.440 0.000 0.084 0.028 0.448
#> SRR1078586 1 0.0566 0.84441 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1400333 2 0.6653 0.36944 0.072 0.568 0.012 0.300 0.048
#> SRR1078834 2 0.6706 0.36216 0.060 0.556 0.008 0.308 0.068
#> SRR1417611 2 0.3318 0.72785 0.012 0.808 0.000 0.180 0.000
#> SRR1396840 1 0.6967 0.16654 0.420 0.000 0.012 0.228 0.340
#> SRR1465440 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.2006 0.79386 0.000 0.916 0.000 0.072 0.012
#> SRR614984 2 0.4881 0.24935 0.004 0.520 0.000 0.460 0.016
#> SRR1324269 1 0.4301 0.70532 0.740 0.000 0.016 0.016 0.228
#> SRR1401491 2 0.2069 0.79230 0.000 0.912 0.000 0.076 0.012
#> SRR1319443 1 0.3387 0.81065 0.836 0.000 0.004 0.032 0.128
#> SRR1324349 2 0.3708 0.75094 0.020 0.808 0.000 0.160 0.012
#> SRR1345523 2 0.0162 0.80599 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1500846 1 0.1571 0.84249 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR661505 3 0.6858 0.35857 0.004 0.036 0.556 0.156 0.248
#> SRR1419062 5 0.8175 0.36084 0.128 0.008 0.344 0.144 0.376
#> SRR1480131 1 0.6846 -0.07701 0.428 0.000 0.128 0.032 0.412
#> SRR1421284 2 0.5070 0.43618 0.036 0.600 0.000 0.360 0.004
#> SRR1329624 1 0.1195 0.84508 0.960 0.000 0.000 0.012 0.028
#> SRR1315739 3 0.2300 0.81171 0.000 0.000 0.904 0.024 0.072
#> SRR1099189 2 0.3317 0.74381 0.004 0.804 0.000 0.188 0.004
#> SRR1083286 1 0.2172 0.84040 0.908 0.000 0.000 0.016 0.076
#> SRR1091890 4 0.8319 0.01226 0.084 0.072 0.084 0.408 0.352
#> SRR1347436 2 0.4991 0.60452 0.028 0.668 0.004 0.288 0.012
#> SRR1327473 1 0.4040 0.71305 0.820 0.080 0.000 0.076 0.024
#> SRR1338195 3 0.0451 0.81388 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR809698 2 0.0290 0.80736 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1457792 1 0.1430 0.84574 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR658271 2 0.0290 0.80700 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1339597 5 0.6230 0.15644 0.400 0.000 0.072 0.028 0.500
#> SRR1454842 3 0.2067 0.81296 0.000 0.000 0.920 0.032 0.048
#> SRR1322643 1 0.1124 0.84154 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR614887 3 0.0671 0.81287 0.000 0.000 0.980 0.016 0.004
#> SRR1354620 5 0.5628 0.36034 0.032 0.000 0.360 0.032 0.576
#> SRR615056 2 0.2921 0.76496 0.020 0.856 0.000 0.124 0.000
#> SRR1105320 1 0.4404 0.69469 0.796 0.080 0.000 0.096 0.028
#> SRR1391529 1 0.2260 0.83834 0.908 0.000 0.000 0.028 0.064
#> SRR663052 2 0.1121 0.80756 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1478834 1 0.3727 0.78875 0.812 0.000 0.016 0.020 0.152
#> SRR812366 2 0.2616 0.78189 0.000 0.880 0.000 0.100 0.020
#> SRR1435330 3 0.2124 0.81526 0.000 0.000 0.916 0.028 0.056
#> SRR615383 2 0.0404 0.80768 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1389157 2 0.6160 0.09006 0.008 0.476 0.040 0.444 0.032
#> SRR613568 2 0.5548 0.59705 0.052 0.676 0.000 0.228 0.044
#> SRR614095 2 0.3152 0.76575 0.024 0.840 0.000 0.136 0.000
#> SRR1103092 1 0.2959 0.81702 0.864 0.000 0.008 0.016 0.112
#> SRR1337155 4 0.8917 0.38311 0.060 0.272 0.196 0.376 0.096
#> SRR1475345 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0290 0.80684 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1446180 2 0.6991 0.14050 0.052 0.484 0.004 0.360 0.100
#> SRR1406372 2 0.1942 0.79489 0.000 0.920 0.000 0.068 0.012
#> SRR1339880 5 0.6645 0.31153 0.012 0.000 0.160 0.360 0.468
#> SRR1353136 4 0.6699 0.41851 0.060 0.324 0.004 0.540 0.072
#> SRR1093906 3 0.0324 0.81353 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR614035 2 0.0162 0.80674 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1351104 1 0.3086 0.77626 0.816 0.000 0.000 0.004 0.180
#> SRR1363926 2 0.5889 0.16966 0.056 0.512 0.000 0.412 0.020
#> SRR1399861 4 0.6485 0.45121 0.064 0.304 0.000 0.564 0.068
#> SRR1338789 1 0.5711 0.52208 0.600 0.000 0.004 0.100 0.296
#> SRR1421420 5 0.7321 0.43078 0.060 0.000 0.288 0.168 0.484
#> SRR1420832 2 0.0609 0.80688 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1476231 1 0.0404 0.84408 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1352870 4 0.7062 0.13553 0.016 0.424 0.064 0.436 0.060
#> SRR1315041 2 0.3203 0.73888 0.012 0.820 0.000 0.168 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443268 5 0.6138 0.54182 0.176 0.000 0.144 0.036 0.644
#> SRR1416617 3 0.2300 0.81171 0.000 0.000 0.904 0.024 0.072
#> SRR1102443 1 0.0932 0.84227 0.972 0.004 0.000 0.004 0.020
#> SRR655672 2 0.4954 0.25922 0.004 0.528 0.000 0.448 0.020
#> SRR1420006 3 0.0798 0.81050 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1458267 2 0.1908 0.79831 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR613819 2 0.4508 0.61856 0.032 0.708 0.000 0.256 0.004
#> SRR1469432 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.4030 0.69029 0.008 0.736 0.000 0.248 0.008
#> SRR1470727 1 0.4190 0.67609 0.724 0.000 0.012 0.008 0.256
#> SRR1339153 3 0.4548 0.67964 0.000 0.000 0.752 0.120 0.128
#> SRR1472749 3 0.6105 0.37656 0.012 0.000 0.588 0.128 0.272
#> SRR1414379 2 0.5347 0.32336 0.040 0.556 0.000 0.396 0.008
#> SRR1431326 1 0.0451 0.84245 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1487278 2 0.5959 0.44146 0.028 0.612 0.000 0.280 0.080
#> SRR1098312 4 0.7901 0.06223 0.096 0.076 0.036 0.428 0.364
#> SRR810273 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.2068 0.79822 0.004 0.904 0.000 0.092 0.000
#> SRR614467 2 0.2068 0.78902 0.000 0.904 0.000 0.092 0.004
#> SRR811471 1 0.1924 0.84278 0.924 0.000 0.004 0.008 0.064
#> SRR1478341 3 0.0324 0.81353 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1088606 4 0.7497 0.06722 0.276 0.040 0.000 0.404 0.280
#> SRR1479699 5 0.7666 0.11207 0.088 0.036 0.060 0.404 0.412
#> SRR1403589 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.2625 0.79085 0.000 0.876 0.000 0.108 0.016
#> SRR1359803 1 0.3340 0.81350 0.840 0.000 0.004 0.032 0.124
#> SRR1338988 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.2616 0.78189 0.000 0.880 0.000 0.100 0.020
#> SRR1378992 1 0.0566 0.84198 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR659427 4 0.7366 0.40251 0.032 0.172 0.020 0.512 0.264
#> SRR1096638 1 0.2583 0.81485 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132
#> SRR1466619 2 0.2573 0.78570 0.000 0.880 0.000 0.104 0.016
#> SRR659307 2 0.4944 0.22361 0.004 0.508 0.004 0.472 0.012
#> SRR1439994 5 0.5034 0.37722 0.020 0.000 0.348 0.016 0.616
#> SRR1454931 1 0.3887 0.79262 0.804 0.000 0.008 0.040 0.148
#> SRR1332928 5 0.6493 0.55365 0.128 0.000 0.096 0.136 0.640
#> SRR658621 2 0.3319 0.73630 0.020 0.820 0.000 0.160 0.000
#> SRR1095840 1 0.1018 0.84564 0.968 0.000 0.000 0.016 0.016
#> SRR1458243 5 0.6287 0.28996 0.352 0.000 0.068 0.040 0.540
#> SRR1374270 2 0.5932 0.09878 0.064 0.488 0.000 0.432 0.016
#> SRR1470947 2 0.0609 0.80688 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1365598 2 0.6022 0.46817 0.040 0.624 0.000 0.260 0.076
#> SRR662787 2 0.0609 0.80704 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1408727 4 0.6359 0.17636 0.060 0.416 0.000 0.480 0.044
#> SRR1456274 4 0.8178 -0.14726 0.176 0.044 0.044 0.376 0.360
#> SRR817744 1 0.0451 0.84219 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1478744 2 0.0609 0.80688 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 5 0.7876 0.53506 0.132 0.008 0.160 0.200 0.500
#> SRR1374198 1 0.6579 0.26524 0.460 0.000 0.000 0.232 0.308
#> SRR1445856 5 0.6230 0.15644 0.400 0.000 0.072 0.028 0.500
#> SRR820049 3 0.7400 0.24482 0.000 0.072 0.492 0.268 0.168
#> SRR1375290 4 0.8139 0.42922 0.028 0.320 0.092 0.432 0.128
#> SRR818999 5 0.6780 0.48928 0.260 0.000 0.188 0.024 0.528
#> SRR1390242 1 0.0807 0.84462 0.976 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR1401164 2 0.2448 0.78549 0.000 0.892 0.000 0.088 0.020
#> SRR1454629 1 0.5940 0.53875 0.616 0.000 0.024 0.088 0.272
#> SRR1332187 3 0.1582 0.81048 0.000 0.000 0.944 0.028 0.028
#> SRR603365 3 0.1251 0.81669 0.000 0.000 0.956 0.008 0.036
#> SRR657833 2 0.4161 0.72842 0.024 0.772 0.000 0.188 0.016
#> SRR1436207 2 0.2439 0.78829 0.004 0.876 0.000 0.120 0.000
#> SRR1488017 1 0.0162 0.84213 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR612947 2 0.0510 0.80701 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1480384 1 0.4164 0.68241 0.728 0.000 0.012 0.008 0.252
#> SRR1364761 2 0.1270 0.80728 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1308086 5 0.5835 0.19707 0.028 0.000 0.040 0.440 0.492
#> SRR1441868 1 0.0566 0.84198 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1485380 3 0.4846 0.24481 0.000 0.000 0.588 0.028 0.384
#> SRR1073705 1 0.0451 0.84205 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR615032 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0609 0.80688 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1442983 2 0.0963 0.80746 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1100346 2 0.4530 0.49000 0.008 0.612 0.000 0.376 0.004
#> SRR1332816 1 0.0833 0.84260 0.976 0.004 0.000 0.004 0.016
#> SRR612299 2 0.6083 0.40818 0.028 0.584 0.000 0.308 0.080
#> SRR1407386 1 0.1522 0.84634 0.944 0.000 0.000 0.012 0.044
#> SRR1418064 2 0.0290 0.80672 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1309403 1 0.5083 0.67224 0.764 0.068 0.008 0.112 0.048
#> SRR1498395 2 0.1478 0.80453 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1079998 5 0.5881 0.50921 0.096 0.000 0.244 0.024 0.636
#> SRR1498885 2 0.2068 0.79048 0.004 0.904 0.000 0.092 0.000
#> SRR1337215 2 0.5961 0.53006 0.072 0.644 0.000 0.236 0.048
#> SRR1414749 3 0.2300 0.81171 0.000 0.000 0.904 0.024 0.072
#> SRR1365963 5 0.5598 0.54176 0.120 0.000 0.168 0.024 0.688
#> SRR1368030 2 0.5171 0.45980 0.040 0.616 0.000 0.336 0.008
#> SRR1419760 2 0.5265 0.48436 0.028 0.604 0.004 0.352 0.012
#> SRR1381841 1 0.6651 0.18046 0.484 0.000 0.064 0.064 0.388
#> SRR821388 4 0.7440 0.06716 0.096 0.072 0.012 0.432 0.388
#> SRR657623 2 0.3319 0.73630 0.020 0.820 0.000 0.160 0.000
#> SRR1094241 3 0.4269 0.71687 0.000 0.000 0.776 0.116 0.108
#> SRR819583 5 0.5103 0.17453 0.000 0.000 0.452 0.036 0.512
#> SRR1096149 1 0.3789 0.71523 0.760 0.000 0.000 0.016 0.224
#> SRR1342829 3 0.0324 0.81353 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1353028 1 0.2520 0.83177 0.888 0.000 0.004 0.012 0.096
#> SRR811333 5 0.6613 0.44074 0.116 0.000 0.328 0.032 0.524
#> SRR1311666 2 0.0162 0.80567 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1486698 2 0.3769 0.73701 0.000 0.788 0.000 0.180 0.032
#> SRR1446436 2 0.1792 0.80113 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR815092 1 0.0807 0.84462 0.976 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR1500149 2 0.3477 0.75700 0.012 0.840 0.000 0.116 0.032
#> SRR1100564 1 0.2208 0.84178 0.908 0.000 0.000 0.020 0.072
#> SRR1403072 3 0.0798 0.81050 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR811653 4 0.6485 0.45121 0.064 0.304 0.000 0.564 0.068
#> SRR1311348 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0609 0.80704 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1435442 2 0.6065 0.41299 0.028 0.596 0.000 0.292 0.084
#> SRR1421444 3 0.0324 0.81353 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1344010 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0451 0.84245 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1444763 1 0.5784 0.55810 0.604 0.000 0.000 0.144 0.252
#> SRR1415026 2 0.0880 0.80642 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1416596 2 0.2286 0.79051 0.004 0.888 0.000 0.108 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.2068 0.79048 0.004 0.904 0.000 0.092 0.000
#> SRR1310094 2 0.3391 0.72208 0.012 0.800 0.000 0.188 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.2806 0.79687 0.844 0.000 0.000 0.004 0.152
#> SRR1453950 1 0.3796 0.73222 0.768 0.000 0.008 0.008 0.216
#> SRR1087875 1 0.0451 0.84205 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR613318 4 0.6249 0.14623 0.056 0.420 0.000 0.484 0.040
#> SRR1332694 1 0.2206 0.84092 0.912 0.000 0.004 0.016 0.068
#> SRR1468469 3 0.3163 0.75992 0.000 0.000 0.824 0.012 0.164
#> SRR818670 2 0.1043 0.80822 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1120318 1 0.2746 0.81870 0.872 0.000 0.008 0.008 0.112
#> SRR1311622 5 0.6379 0.53320 0.084 0.000 0.088 0.192 0.636
#> SRR1500931 3 0.5296 -0.12265 0.000 0.000 0.480 0.048 0.472
#> SRR1387494 5 0.6697 0.20496 0.020 0.024 0.076 0.380 0.500
#> SRR1379175 4 0.6631 0.40362 0.064 0.332 0.000 0.532 0.072
#> SRR1401909 5 0.6143 0.30624 0.052 0.000 0.384 0.040 0.524
#> SRR1440541 2 0.1913 0.79547 0.024 0.936 0.000 0.020 0.020
#> SRR1068832 5 0.5304 0.27503 0.008 0.000 0.408 0.036 0.548
#> SRR1376640 2 0.4121 0.66538 0.004 0.720 0.000 0.264 0.012
#> SRR1085712 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.6265 0.39603 0.548 0.000 0.040 0.068 0.344
#> SRR1084276 1 0.5412 0.53348 0.632 0.000 0.052 0.016 0.300
#> SRR1353262 2 0.0865 0.80712 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1437035 1 0.4218 0.77441 0.816 0.016 0.012 0.060 0.096
#> SRR1396877 1 0.5569 0.54721 0.636 0.000 0.056 0.024 0.284
#> SRR1443026 2 0.0865 0.80712 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004
#> SRR1417936 1 0.0404 0.84394 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1436822 2 0.2233 0.79159 0.000 0.904 0.000 0.080 0.016
#> SRR1101128 3 0.3724 0.66703 0.000 0.000 0.776 0.020 0.204
#> SRR1363886 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0510 0.80728 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1394366 2 0.5954 0.40381 0.024 0.572 0.000 0.336 0.068
#> SRR1093218 5 0.6508 0.20400 0.008 0.000 0.392 0.148 0.452
#> SRR1077090 5 0.5034 0.37722 0.020 0.000 0.348 0.016 0.616
#> SRR1327430 2 0.5755 0.23250 0.048 0.532 0.000 0.400 0.020
#> SRR1088958 1 0.0451 0.84205 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1486931 2 0.2953 0.77156 0.000 0.844 0.000 0.144 0.012
#> SRR1086820 1 0.5148 0.65983 0.684 0.000 0.008 0.072 0.236
#> SRR1383000 1 0.3764 0.73769 0.772 0.000 0.008 0.008 0.212
#> SRR1355705 2 0.0162 0.80674 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR614335 2 0.2068 0.78694 0.004 0.904 0.000 0.092 0.000
#> SRR660534 2 0.0290 0.80606 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.3203 0.73888 0.012 0.820 0.000 0.168 0.000
#> SRR1456401 2 0.5889 0.16966 0.056 0.512 0.000 0.412 0.020
#> SRR1086393 1 0.1894 0.84339 0.920 0.000 0.008 0.000 0.072
#> SRR1351521 3 0.0798 0.81050 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008
#> SRR1093100 2 0.5159 0.43774 0.036 0.604 0.000 0.352 0.008
#> SRR1309382 1 0.2448 0.83565 0.892 0.000 0.000 0.020 0.088
#> SRR1089375 5 0.8433 0.51303 0.188 0.024 0.140 0.196 0.452
#> SRR1499482 2 0.4141 0.67171 0.024 0.728 0.000 0.248 0.000
#> SRR614719 2 0.4333 0.54018 0.004 0.640 0.000 0.352 0.004
#> SRR1081473 5 0.7332 0.45799 0.064 0.000 0.256 0.180 0.500
#> SRR1087415 1 0.5148 0.65983 0.684 0.000 0.008 0.072 0.236
#> SRR1088217 5 0.5406 0.20284 0.016 0.000 0.448 0.028 0.508
#> SRR808496 2 0.5261 0.44537 0.036 0.600 0.000 0.352 0.012
#> SRR1336463 2 0.3667 0.76133 0.020 0.812 0.000 0.156 0.012
#> SRR612359 2 0.4905 0.33849 0.004 0.548 0.004 0.432 0.012
#> SRR1444412 1 0.4394 0.72889 0.756 0.000 0.032 0.016 0.196
#> SRR1074116 3 0.0566 0.81409 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012
#> SRR821846 3 0.0451 0.81388 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR656095 2 0.0609 0.80779 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR808914 1 0.1444 0.84480 0.948 0.000 0.000 0.012 0.040
#> SRR1349099 1 0.6836 0.18086 0.424 0.004 0.000 0.264 0.308
#> SRR1337886 2 0.2573 0.79206 0.000 0.880 0.000 0.104 0.016
#> SRR813632 5 0.6122 0.26621 0.380 0.000 0.072 0.024 0.524
#> SRR1101591 5 0.6478 0.49346 0.124 0.000 0.272 0.032 0.572
#> SRR1089713 5 0.7924 0.53521 0.136 0.008 0.156 0.208 0.492
#> SRR1453127 3 0.2036 0.81519 0.000 0.000 0.920 0.024 0.056
#> SRR1498354 5 0.5394 0.30571 0.016 0.000 0.392 0.032 0.560
#> SRR1313831 1 0.2260 0.83834 0.908 0.000 0.000 0.028 0.064
#> SRR1315434 3 0.3944 0.69246 0.004 0.000 0.764 0.020 0.212
#> SRR814747 2 0.4054 0.66750 0.028 0.748 0.000 0.224 0.000
#> SRR1358539 1 0.1970 0.84497 0.924 0.000 0.004 0.012 0.060
#> SRR1367807 1 0.0566 0.84198 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1365791 4 0.7628 0.06808 0.276 0.040 0.004 0.404 0.276
#> SRR1081519 5 0.5397 0.14965 0.012 0.000 0.468 0.032 0.488
#> SRR614707 2 0.6491 0.41223 0.072 0.580 0.000 0.280 0.068
#> SRR1094027 1 0.0566 0.84441 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1489092 4 0.7497 0.06722 0.276 0.040 0.000 0.404 0.280
#> SRR1079502 5 0.7492 0.52010 0.092 0.004 0.172 0.204 0.528
#> SRR1457814 4 0.6485 0.45121 0.064 0.304 0.000 0.564 0.068
#> SRR1455127 2 0.0162 0.80559 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR615081 2 0.2233 0.79159 0.000 0.904 0.000 0.080 0.016
#> SRR1327855 5 0.5103 0.17453 0.000 0.000 0.452 0.036 0.512
#> SRR1417873 2 0.3318 0.72785 0.012 0.808 0.000 0.180 0.000
#> SRR1394125 5 0.8175 0.36084 0.128 0.008 0.344 0.144 0.376
#> SRR1488388 1 0.1430 0.84574 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR1401122 2 0.4971 0.47638 0.036 0.628 0.000 0.332 0.004
#> SRR612383 2 0.4886 0.22453 0.004 0.512 0.000 0.468 0.016
#> SRR1477711 1 0.0798 0.84426 0.976 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1350813 2 0.4030 0.69029 0.008 0.736 0.000 0.248 0.008
#> SRR612851 2 0.4088 0.64560 0.004 0.712 0.000 0.276 0.008
#> SRR1086349 1 0.0290 0.84241 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR812837 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 4 0.7525 0.06155 0.096 0.072 0.016 0.428 0.388
#> SRR1475885 1 0.7291 0.01841 0.348 0.020 0.000 0.324 0.308
#> SRR1376334 1 0.2260 0.83834 0.908 0.000 0.000 0.028 0.064
#> SRR1399821 1 0.6836 0.18086 0.424 0.004 0.000 0.264 0.308
#> SRR1347042 3 0.2036 0.81519 0.000 0.000 0.920 0.024 0.056
#> SRR612323 2 0.4954 0.25922 0.004 0.528 0.000 0.448 0.020
#> SRR612604 2 0.3928 0.70716 0.008 0.800 0.000 0.152 0.040
#> SRR1389546 2 0.0963 0.80857 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1311877 1 0.0771 0.84408 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1465608 5 0.5598 0.54176 0.120 0.000 0.168 0.024 0.688
#> SRR1101808 2 0.0609 0.80779 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1414079 3 0.2124 0.81526 0.000 0.000 0.916 0.028 0.056
#> SRR1331153 2 0.5548 0.59705 0.052 0.676 0.000 0.228 0.044
#> SRR1078439 4 0.8429 -0.12087 0.024 0.068 0.308 0.316 0.284
#> SRR2165527 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.3071 0.79158 0.880 0.032 0.000 0.056 0.032
#> SRR1313536 2 0.1943 0.80003 0.000 0.924 0.000 0.056 0.020
#> SRR1070308 1 0.4040 0.71305 0.820 0.080 0.000 0.076 0.024
#> SRR1403110 1 0.2260 0.83834 0.908 0.000 0.000 0.028 0.064
#> SRR1400355 2 0.1197 0.80640 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1401317 5 0.5103 0.17453 0.000 0.000 0.452 0.036 0.512
#> SRR1456862 1 0.4774 0.57238 0.660 0.000 0.020 0.012 0.308
#> SRR1074622 1 0.2124 0.83509 0.900 0.000 0.000 0.004 0.096
#> SRR1465847 5 0.5978 0.36753 0.056 0.000 0.376 0.028 0.540
#> SRR1443376 2 0.0290 0.80640 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1471312 3 0.2260 0.79135 0.000 0.000 0.908 0.064 0.028
#> SRR1075579 1 0.0807 0.84462 0.976 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR1090881 4 0.8139 0.42922 0.028 0.320 0.092 0.432 0.128
#> SRR612251 2 0.3060 0.76580 0.024 0.848 0.000 0.128 0.000
#> SRR1418581 1 0.0566 0.84198 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR658045 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613214 2 0.4708 0.34804 0.000 0.548 0.000 0.436 0.016
#> SRR613078 2 0.5735 0.47667 0.024 0.632 0.000 0.272 0.072
#> SRR1472998 5 0.5978 0.36753 0.056 0.000 0.376 0.028 0.540
#> SRR1433452 2 0.1768 0.80322 0.004 0.924 0.000 0.072 0.000
#> SRR1101957 1 0.0771 0.84408 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1487993 5 0.6645 0.31153 0.012 0.000 0.160 0.360 0.468
#> SRR1465983 2 0.0162 0.80583 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1380375 1 0.2457 0.83733 0.900 0.000 0.008 0.016 0.076
#> SRR1367566 3 0.3242 0.78449 0.000 0.000 0.844 0.040 0.116
#> SRR1316151 2 0.6842 0.36220 0.152 0.592 0.000 0.180 0.076
#> SRR1417547 2 0.4971 0.47638 0.036 0.628 0.000 0.332 0.004
#> SRR659389 2 0.0404 0.80697 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1490270 2 0.5575 0.59267 0.052 0.672 0.000 0.232 0.044
#> SRR1398207 5 0.7114 0.46990 0.288 0.000 0.216 0.028 0.468
#> SRR1358755 5 0.5430 0.34068 0.020 0.000 0.372 0.032 0.576
#> SRR1078903 2 0.2956 0.77468 0.008 0.848 0.000 0.140 0.004
#> SRR1323252 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.1410 0.80774 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1369172 1 0.5402 0.60683 0.652 0.000 0.024 0.048 0.276
#> SRR615982 2 0.4243 0.65044 0.024 0.712 0.000 0.264 0.000
#> SRR1480431 2 0.3317 0.74381 0.004 0.804 0.000 0.188 0.004
#> SRR1429825 2 0.2540 0.79246 0.000 0.888 0.000 0.088 0.024
#> SRR1102393 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 5 0.7024 0.55270 0.200 0.000 0.088 0.140 0.572
#> SRR808351 1 0.2124 0.83272 0.900 0.000 0.000 0.004 0.096
#> SRR1317513 1 0.2206 0.84092 0.912 0.000 0.004 0.016 0.068
#> SRR1480501 5 0.7152 0.51130 0.068 0.004 0.200 0.168 0.560
#> SRR1081910 5 0.6995 0.31054 0.368 0.000 0.176 0.024 0.432
#> SRR1086611 2 0.7139 0.12561 0.060 0.484 0.020 0.368 0.068
#> SRR1392571 2 0.4796 0.59555 0.028 0.664 0.000 0.300 0.008
#> SRR1311441 1 0.0451 0.84245 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR808152 1 0.1768 0.84162 0.924 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR657313 3 0.4588 0.68050 0.000 0.000 0.748 0.116 0.136
#> SRR1433131 2 0.1914 0.80202 0.000 0.924 0.000 0.060 0.016
#> SRR1321011 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.2006 0.80234 0.012 0.916 0.000 0.072 0.000
#> SRR1389108 1 0.0451 0.84205 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1376228 3 0.2300 0.81171 0.000 0.000 0.904 0.024 0.072
#> SRR1399757 1 0.0693 0.84224 0.980 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1358060 3 0.2300 0.81171 0.000 0.000 0.904 0.024 0.072
#> SRR1464517 5 0.6239 0.33766 0.028 0.000 0.080 0.356 0.536
#> SRR613557 2 0.4698 0.26658 0.004 0.520 0.000 0.468 0.008
#> SRR809831 1 0.4301 0.70532 0.740 0.000 0.016 0.016 0.228
#> SRR1429387 3 0.0324 0.81353 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR816565 1 0.0290 0.84307 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1071644 1 0.0579 0.84301 0.984 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1406936 5 0.7344 0.50268 0.072 0.004 0.192 0.196 0.536
#> SRR1072031 2 0.0000 0.80554 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.4954 0.25922 0.004 0.528 0.000 0.448 0.020
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 4 0.7739 -0.16961 0.072 0.044 0.008 0.380 0.344 0.152
#> SRR1404105 1 0.1398 0.85433 0.940 0.000 0.000 0.000 0.052 0.008
#> SRR2164936 2 0.1719 0.78872 0.000 0.924 0.000 0.060 0.000 0.016
#> SRR1472057 5 0.5477 0.40772 0.008 0.000 0.304 0.024 0.596 0.068
#> SRR614491 4 0.4314 0.65531 0.004 0.244 0.000 0.704 0.004 0.044
#> SRR1069376 1 0.1686 0.85315 0.924 0.000 0.000 0.000 0.064 0.012
#> SRR811964 2 0.0146 0.79228 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.1075 0.78987 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0820 0.84932 0.972 0.000 0.000 0.000 0.012 0.016
#> SRR1328073 1 0.5231 0.63391 0.728 0.056 0.000 0.112 0.032 0.072
#> SRR1394209 4 0.5782 0.61945 0.036 0.292 0.000 0.596 0.036 0.040
#> SRR1474018 2 0.0363 0.79393 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1099809 5 0.5192 0.31188 0.348 0.000 0.032 0.008 0.584 0.028
#> SRR1500555 4 0.5047 0.49327 0.000 0.348 0.000 0.564 0.000 0.088
#> SRR1354363 1 0.1995 0.84821 0.912 0.000 0.000 0.000 0.052 0.036
#> SRR1391619 3 0.4689 0.67943 0.000 0.000 0.712 0.152 0.124 0.012
#> SRR1307997 4 0.5718 0.42212 0.028 0.368 0.000 0.524 0.004 0.076
#> SRR663124 4 0.4010 0.66688 0.004 0.264 0.000 0.708 0.004 0.020
#> SRR1334670 1 0.2563 0.84041 0.884 0.000 0.000 0.008 0.068 0.040
#> SRR612515 4 0.4010 0.66688 0.004 0.264 0.000 0.708 0.004 0.020
#> SRR1092727 2 0.4524 0.45247 0.008 0.648 0.000 0.304 0.000 0.040
#> SRR1364013 2 0.5245 0.33293 0.012 0.584 0.000 0.320 0.000 0.084
#> SRR1468553 3 0.2501 0.82055 0.000 0.000 0.872 0.016 0.108 0.004
#> SRR1403980 3 0.3097 0.80830 0.008 0.000 0.848 0.020 0.112 0.012
#> SRR1420169 5 0.5158 0.51888 0.040 0.000 0.212 0.012 0.684 0.052
#> SRR1442800 6 0.5399 0.46613 0.144 0.000 0.000 0.076 0.100 0.680
#> SRR1359214 2 0.0363 0.79393 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1499849 5 0.5192 0.31188 0.348 0.000 0.032 0.008 0.584 0.028
#> SRR1500030 5 0.7127 0.29375 0.000 0.000 0.148 0.280 0.432 0.140
#> SRR1093053 4 0.7706 -0.25610 0.024 0.020 0.284 0.336 0.296 0.040
#> SRR1399843 5 0.7185 0.48487 0.096 0.000 0.096 0.192 0.544 0.072
#> SRR1380231 5 0.7038 0.55738 0.116 0.004 0.080 0.116 0.588 0.096
#> SRR809470 5 0.5813 0.41258 0.024 0.000 0.308 0.036 0.580 0.052
#> SRR614239 4 0.4010 0.66688 0.004 0.264 0.000 0.708 0.004 0.020
#> SRR613939 2 0.5279 0.27927 0.000 0.556 0.000 0.324 0.000 0.120
#> SRR612971 2 0.0260 0.79273 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.2868 0.73974 0.000 0.840 0.000 0.132 0.000 0.028
#> SRR811357 2 0.0146 0.79232 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.1148 0.84974 0.960 0.000 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR613006 2 0.3930 0.68239 0.000 0.764 0.000 0.092 0.000 0.144
#> SRR1469570 2 0.0000 0.79155 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.1092 0.79221 0.000 0.960 0.000 0.020 0.000 0.020
#> SRR1362906 5 0.7127 0.29375 0.000 0.000 0.148 0.280 0.432 0.140
#> SRR1079023 1 0.0146 0.84938 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR813608 2 0.0146 0.79228 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1096736 5 0.6488 0.30126 0.040 0.000 0.000 0.360 0.428 0.172
#> SRR1478700 5 0.5552 0.34895 0.304 0.000 0.016 0.008 0.584 0.088
#> SRR1081543 3 0.5168 0.64257 0.036 0.016 0.736 0.136 0.024 0.052
#> SRR1384754 5 0.6488 0.30126 0.040 0.000 0.000 0.360 0.428 0.172
#> SRR612287 2 0.0260 0.79273 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1380317 4 0.5782 0.61945 0.036 0.292 0.000 0.596 0.036 0.040
#> SRR1315247 6 0.5656 0.14058 0.004 0.308 0.004 0.140 0.000 0.544
#> SRR1105344 2 0.3006 0.73933 0.000 0.844 0.000 0.064 0.000 0.092
#> SRR658549 4 0.5047 0.49327 0.000 0.348 0.000 0.564 0.000 0.088
#> SRR1480240 1 0.2173 0.85085 0.904 0.000 0.000 0.004 0.064 0.028
#> SRR1084816 2 0.0146 0.79228 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0260 0.79467 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1358520 4 0.5112 0.44158 0.032 0.412 0.000 0.532 0.008 0.016
#> SRR1419476 3 0.4650 0.67777 0.004 0.000 0.716 0.044 0.204 0.032
#> SRR1456075 5 0.5629 0.55163 0.068 0.000 0.016 0.116 0.684 0.116
#> SRR1389474 2 0.0146 0.79228 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.1829 0.84848 0.920 0.000 0.000 0.000 0.056 0.024
#> SRR1334419 1 0.0820 0.84932 0.972 0.000 0.000 0.000 0.012 0.016
#> SRR1417154 3 0.3559 0.78623 0.000 0.000 0.800 0.036 0.152 0.012
#> SRR1095985 6 0.5399 0.46613 0.144 0.000 0.000 0.076 0.100 0.680
#> SRR1325771 1 0.0717 0.84811 0.976 0.000 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1360420 3 0.0146 0.82740 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR660272 2 0.6476 0.16846 0.040 0.488 0.000 0.236 0.000 0.236
#> SRR1332993 1 0.1745 0.85146 0.920 0.000 0.000 0.000 0.068 0.012
#> SRR1311833 2 0.0777 0.79491 0.000 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR808044 5 0.5552 0.34895 0.304 0.000 0.016 0.008 0.584 0.088
#> SRR1076916 3 0.3710 0.76868 0.000 0.000 0.812 0.024 0.064 0.100
#> SRR1356266 1 0.2656 0.85205 0.884 0.004 0.000 0.008 0.060 0.044
#> SRR1341983 2 0.3893 0.68454 0.000 0.764 0.000 0.156 0.000 0.080
#> SRR1456114 1 0.4559 0.61081 0.664 0.000 0.000 0.004 0.272 0.060
#> SRR1072948 3 0.1524 0.83169 0.000 0.000 0.932 0.008 0.060 0.000
#> SRR1472370 5 0.5477 0.40772 0.008 0.000 0.304 0.024 0.596 0.068
#> SRR1480176 1 0.3717 0.74464 0.768 0.000 0.012 0.004 0.200 0.016
#> SRR613843 2 0.2826 0.75430 0.000 0.856 0.000 0.052 0.000 0.092
#> SRR1469192 1 0.3596 0.73874 0.760 0.000 0.008 0.000 0.216 0.016
#> SRR1404555 3 0.2918 0.78436 0.000 0.000 0.864 0.032 0.020 0.084
#> SRR659839 2 0.0146 0.79338 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0603 0.79531 0.000 0.980 0.000 0.016 0.000 0.004
#> SRR1362848 5 0.6488 0.30126 0.040 0.000 0.000 0.360 0.428 0.172
#> SRR1407492 4 0.4010 0.66688 0.004 0.264 0.000 0.708 0.004 0.020
#> SRR1455082 4 0.5378 0.17149 0.008 0.452 0.000 0.456 0.000 0.084
#> SRR658362 2 0.3027 0.72843 0.000 0.824 0.000 0.148 0.000 0.028
#> SRR810921 2 0.0146 0.79228 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0713 0.79106 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1456375 5 0.5296 0.18898 0.004 0.000 0.420 0.028 0.512 0.036
#> SRR818232 1 0.2806 0.83377 0.872 0.000 0.000 0.012 0.060 0.056
#> SRR1454868 4 0.5006 0.54724 0.052 0.092 0.004 0.756 0.056 0.040
#> SRR1474816 2 0.0508 0.79214 0.000 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1342002 1 0.3721 0.72810 0.752 0.000 0.012 0.000 0.220 0.016
#> SRR1088437 2 0.0935 0.79341 0.000 0.964 0.000 0.032 0.000 0.004
#> SRR1466400 2 0.5714 0.00514 0.004 0.428 0.000 0.140 0.000 0.428
#> SRR658921 2 0.5450 0.10137 0.000 0.452 0.000 0.120 0.000 0.428
#> SRR1499873 2 0.1204 0.78705 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0862 0.84953 0.972 0.000 0.000 0.004 0.008 0.016
#> SRR1090145 1 0.3031 0.81074 0.864 0.016 0.000 0.012 0.024 0.084
#> SRR1379324 1 0.5906 0.24494 0.472 0.000 0.008 0.004 0.376 0.140
#> SRR1345307 2 0.0000 0.79155 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.3482 0.77216 0.000 0.000 0.796 0.024 0.168 0.012
#> SRR1086280 3 0.4650 0.67777 0.004 0.000 0.716 0.044 0.204 0.032
#> SRR1454891 2 0.4723 -0.17719 0.004 0.484 0.000 0.476 0.000 0.036
#> SRR663185 2 0.0713 0.79106 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR811819 1 0.2449 0.83945 0.884 0.000 0.004 0.004 0.092 0.016
#> SRR1318920 6 0.6020 0.34930 0.336 0.000 0.000 0.012 0.176 0.476
#> SRR656758 2 0.2656 0.74895 0.008 0.860 0.000 0.120 0.000 0.012
#> SRR1474351 1 0.0291 0.85082 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR660450 2 0.6492 0.15579 0.040 0.484 0.000 0.240 0.000 0.236
#> SRR1472687 2 0.3928 0.67944 0.000 0.760 0.000 0.160 0.000 0.080
#> SRR1334291 2 0.3027 0.72817 0.000 0.824 0.000 0.148 0.000 0.028
#> SRR1415153 2 0.1950 0.77896 0.000 0.912 0.000 0.064 0.000 0.024
#> SRR1323271 2 0.2615 0.73513 0.004 0.852 0.000 0.136 0.000 0.008
#> SRR1368939 2 0.3435 0.70848 0.000 0.804 0.000 0.060 0.000 0.136
#> SRR1443161 5 0.7519 0.32956 0.036 0.016 0.116 0.332 0.432 0.068
#> SRR614695 6 0.5901 0.00906 0.004 0.384 0.000 0.176 0.000 0.436
#> SRR1092372 6 0.5943 0.38174 0.304 0.000 0.000 0.012 0.176 0.508
#> SRR1474577 1 0.0964 0.84913 0.968 0.000 0.000 0.004 0.012 0.016
#> SRR1406582 1 0.0862 0.84953 0.972 0.000 0.000 0.004 0.008 0.016
#> SRR612779 2 0.5152 0.00670 0.024 0.520 0.000 0.416 0.000 0.040
#> SRR1089006 1 0.0964 0.84913 0.968 0.000 0.000 0.004 0.012 0.016
#> SRR1354071 1 0.4516 0.74161 0.768 0.012 0.000 0.056 0.120 0.044
#> SRR1105463 5 0.6306 0.44876 0.260 0.000 0.108 0.008 0.560 0.064
#> SRR811005 2 0.0363 0.79461 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.2916 0.83230 0.864 0.000 0.000 0.012 0.072 0.052
#> SRR1325871 3 0.4689 0.67943 0.000 0.000 0.712 0.152 0.124 0.012
#> SRR1355415 5 0.6307 0.40592 0.024 0.000 0.280 0.028 0.548 0.120
#> SRR1090861 1 0.0622 0.84875 0.980 0.000 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1320712 4 0.5190 0.59710 0.048 0.164 0.000 0.712 0.028 0.048
#> SRR1470075 1 0.2609 0.83175 0.868 0.000 0.000 0.000 0.096 0.036
#> SRR1091254 1 0.1706 0.85219 0.936 0.000 0.004 0.004 0.032 0.024
#> SRR1101397 5 0.4378 0.55079 0.152 0.000 0.056 0.008 0.760 0.024
#> SRR1321165 6 0.5931 0.38542 0.300 0.000 0.000 0.012 0.176 0.512
#> SRR1092112 3 0.4685 0.55311 0.000 0.000 0.680 0.036 0.252 0.032
#> SRR1417588 3 0.0146 0.82740 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1074790 1 0.2998 0.77855 0.872 0.028 0.000 0.060 0.008 0.032
#> SRR1432106 2 0.0935 0.79220 0.000 0.964 0.000 0.032 0.000 0.004
#> SRR655756 2 0.0520 0.79557 0.000 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1458314 1 0.4559 0.61081 0.664 0.000 0.000 0.004 0.272 0.060
#> SRR1318582 2 0.1950 0.77896 0.000 0.912 0.000 0.064 0.000 0.024
#> SRR1080484 2 0.1267 0.77892 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1072749 5 0.5269 0.12747 0.416 0.000 0.044 0.004 0.516 0.020
#> SRR1078586 1 0.0405 0.85190 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1400333 2 0.7411 -0.24943 0.056 0.376 0.004 0.324 0.020 0.220
#> SRR1078834 2 0.7331 -0.23408 0.040 0.356 0.004 0.308 0.020 0.272
#> SRR1417611 2 0.3843 0.59048 0.008 0.740 0.000 0.232 0.004 0.016
#> SRR1396840 6 0.6063 0.34479 0.264 0.000 0.000 0.012 0.224 0.500
#> SRR1465440 2 0.0260 0.79273 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.2905 0.74523 0.000 0.852 0.000 0.064 0.000 0.084
#> SRR614984 4 0.4043 0.66532 0.004 0.256 0.000 0.712 0.004 0.024
#> SRR1324269 1 0.4220 0.70720 0.724 0.000 0.012 0.004 0.228 0.032
#> SRR1401491 2 0.3006 0.73933 0.000 0.844 0.000 0.064 0.000 0.092
#> SRR1319443 1 0.3808 0.79472 0.792 0.000 0.000 0.008 0.112 0.088
#> SRR1324349 2 0.4809 0.49965 0.016 0.668 0.000 0.260 0.004 0.052
#> SRR1345523 2 0.0458 0.79501 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.1995 0.84821 0.912 0.000 0.000 0.000 0.052 0.036
#> SRR661505 3 0.6489 0.34537 0.008 0.000 0.512 0.152 0.284 0.044
#> SRR1419062 5 0.7544 0.37829 0.112 0.004 0.280 0.076 0.464 0.064
#> SRR1480131 1 0.6837 -0.08085 0.408 0.000 0.076 0.024 0.408 0.084
#> SRR1421284 4 0.5029 0.46651 0.028 0.400 0.000 0.548 0.008 0.016
#> SRR1329624 1 0.1003 0.85354 0.964 0.000 0.000 0.000 0.020 0.016
#> SRR1315739 3 0.2405 0.82281 0.000 0.000 0.880 0.016 0.100 0.004
#> SRR1099189 2 0.4184 0.49007 0.004 0.672 0.000 0.296 0.000 0.028
#> SRR1083286 1 0.2307 0.84787 0.896 0.000 0.000 0.004 0.068 0.032
#> SRR1091890 4 0.8294 -0.20277 0.068 0.044 0.060 0.368 0.332 0.128
#> SRR1347436 2 0.5933 -0.16510 0.024 0.456 0.004 0.428 0.004 0.084
#> SRR1327473 1 0.3962 0.71204 0.812 0.060 0.000 0.076 0.008 0.044
#> SRR1338195 3 0.0291 0.82769 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR809698 2 0.0458 0.79562 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.1789 0.85296 0.924 0.000 0.000 0.000 0.044 0.032
#> SRR658271 2 0.0725 0.79474 0.000 0.976 0.000 0.012 0.000 0.012
#> SRR1339597 5 0.5684 0.26801 0.332 0.000 0.016 0.008 0.552 0.092
#> SRR1454842 3 0.2085 0.82673 0.000 0.000 0.912 0.024 0.056 0.008
#> SRR1322643 1 0.1461 0.84969 0.940 0.000 0.000 0.000 0.044 0.016
#> SRR614887 3 0.0508 0.82685 0.000 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1354620 5 0.5748 0.46179 0.032 0.000 0.264 0.020 0.612 0.072
#> SRR615056 2 0.3460 0.60988 0.020 0.760 0.000 0.220 0.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.4338 0.69235 0.788 0.060 0.000 0.088 0.012 0.052
#> SRR1391529 1 0.2744 0.83509 0.876 0.000 0.000 0.012 0.060 0.052
#> SRR663052 2 0.1584 0.78585 0.000 0.928 0.000 0.064 0.000 0.008
#> SRR1478834 1 0.3771 0.78716 0.788 0.000 0.004 0.008 0.156 0.044
#> SRR812366 2 0.3845 0.68565 0.000 0.772 0.000 0.088 0.000 0.140
#> SRR1435330 3 0.2367 0.82572 0.000 0.000 0.888 0.016 0.088 0.008
#> SRR615383 2 0.0777 0.79491 0.000 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR1389157 4 0.6069 0.64072 0.008 0.240 0.020 0.616 0.052 0.064
#> SRR613568 2 0.6476 0.16846 0.040 0.488 0.000 0.236 0.000 0.236
#> SRR614095 2 0.3735 0.61988 0.020 0.748 0.000 0.224 0.000 0.008
#> SRR1103092 1 0.2755 0.83002 0.864 0.000 0.008 0.004 0.108 0.016
#> SRR1337155 4 0.9001 0.19751 0.040 0.124 0.160 0.372 0.116 0.188
#> SRR1475345 2 0.0260 0.79273 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0405 0.79498 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1446180 6 0.5656 0.14058 0.004 0.308 0.004 0.140 0.000 0.544
#> SRR1406372 2 0.3055 0.73676 0.000 0.840 0.000 0.064 0.000 0.096
#> SRR1339880 5 0.7127 0.29375 0.000 0.000 0.148 0.280 0.432 0.140
#> SRR1353136 4 0.5006 0.54724 0.052 0.092 0.004 0.756 0.056 0.040
#> SRR1093906 3 0.0146 0.82740 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR614035 2 0.0146 0.79350 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.3104 0.78070 0.800 0.000 0.000 0.000 0.184 0.016
#> SRR1363926 4 0.4928 0.64124 0.052 0.280 0.000 0.648 0.008 0.012
#> SRR1399861 4 0.4220 0.52317 0.044 0.072 0.000 0.804 0.052 0.028
#> SRR1338789 1 0.6170 0.27724 0.488 0.000 0.000 0.016 0.272 0.224
#> SRR1421420 5 0.6473 0.44635 0.036 0.000 0.212 0.096 0.592 0.064
#> SRR1420832 2 0.0713 0.79177 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0260 0.85193 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1352870 4 0.6577 0.57857 0.012 0.204 0.036 0.604 0.084 0.060
#> SRR1315041 2 0.3763 0.61205 0.008 0.752 0.000 0.220 0.004 0.016
#> SRR661877 2 0.0146 0.79210 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1443268 5 0.4378 0.55079 0.152 0.000 0.056 0.008 0.760 0.024
#> SRR1416617 3 0.2454 0.82121 0.000 0.000 0.876 0.016 0.104 0.004
#> SRR1102443 1 0.1237 0.85022 0.956 0.000 0.000 0.004 0.020 0.020
#> SRR655672 4 0.4010 0.66688 0.004 0.264 0.000 0.708 0.004 0.020
#> SRR1420006 3 0.0964 0.82195 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004 0.012
#> SRR1458267 2 0.3027 0.72817 0.000 0.824 0.000 0.148 0.000 0.028
#> SRR613819 2 0.4871 0.07286 0.024 0.560 0.000 0.396 0.008 0.012
#> SRR1469432 2 0.0603 0.79168 0.000 0.980 0.000 0.016 0.000 0.004
#> SRR660907 2 0.0146 0.79210 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.5040 0.10139 0.008 0.528 0.000 0.408 0.000 0.056
#> SRR1470727 1 0.3919 0.67298 0.708 0.000 0.008 0.000 0.268 0.016
#> SRR1339153 3 0.4428 0.70788 0.000 0.000 0.740 0.120 0.128 0.012
#> SRR1472749 3 0.5989 0.42382 0.000 0.000 0.580 0.116 0.248 0.056
#> SRR1414379 4 0.5308 0.54546 0.032 0.352 0.000 0.576 0.016 0.024
#> SRR1431326 1 0.0717 0.84987 0.976 0.000 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1487278 2 0.5661 0.06132 0.004 0.444 0.000 0.132 0.000 0.420
#> SRR1098312 4 0.7894 -0.17027 0.072 0.048 0.016 0.384 0.336 0.144
#> SRR810273 2 0.0000 0.79155 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.3239 0.71268 0.004 0.808 0.000 0.164 0.000 0.024
#> SRR614467 2 0.2178 0.73694 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000 0.000
#> SRR811471 1 0.2237 0.84814 0.896 0.000 0.000 0.000 0.068 0.036
#> SRR1478341 3 0.0146 0.82740 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1088606 6 0.5399 0.46613 0.144 0.000 0.000 0.076 0.100 0.680
#> SRR1479699 5 0.7703 0.29332 0.072 0.012 0.036 0.352 0.380 0.148
#> SRR1403589 2 0.0260 0.79278 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.4269 0.63653 0.000 0.724 0.000 0.184 0.000 0.092
#> SRR1359803 1 0.3699 0.79782 0.796 0.000 0.000 0.004 0.112 0.088
#> SRR1338988 2 0.0146 0.79166 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.3845 0.68565 0.000 0.772 0.000 0.088 0.000 0.140
#> SRR1378992 1 0.0964 0.84913 0.968 0.000 0.000 0.004 0.012 0.016
#> SRR659427 4 0.6160 0.27864 0.028 0.044 0.016 0.612 0.248 0.052
#> SRR1096638 1 0.2581 0.82499 0.856 0.000 0.000 0.000 0.128 0.016
#> SRR1466619 2 0.3914 0.68630 0.000 0.768 0.000 0.104 0.000 0.128
#> SRR659307 4 0.4492 0.65311 0.004 0.236 0.000 0.700 0.008 0.052
#> SRR1439994 5 0.4326 0.48444 0.020 0.000 0.236 0.008 0.716 0.020
#> SRR1454931 1 0.4204 0.77194 0.764 0.000 0.004 0.008 0.132 0.092
#> SRR1332928 5 0.5315 0.56163 0.100 0.000 0.016 0.060 0.712 0.112
#> SRR658621 2 0.3850 0.52687 0.020 0.716 0.000 0.260 0.000 0.004
#> SRR1095840 1 0.0964 0.85377 0.968 0.000 0.000 0.004 0.016 0.012
#> SRR1458243 5 0.5506 0.35760 0.292 0.000 0.016 0.008 0.596 0.088
#> SRR1374270 4 0.5144 0.64222 0.052 0.256 0.000 0.656 0.012 0.024
#> SRR1470947 2 0.0713 0.79177 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.5450 0.10137 0.000 0.452 0.000 0.120 0.000 0.428
#> SRR662787 2 0.0713 0.79110 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1408727 4 0.5134 0.61708 0.052 0.192 0.000 0.700 0.032 0.024
#> SRR1456274 4 0.8209 -0.32689 0.172 0.012 0.028 0.324 0.312 0.152
#> SRR817744 1 0.0508 0.84917 0.984 0.000 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1478744 2 0.0790 0.79172 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0363 0.79471 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1102680 5 0.7038 0.55738 0.116 0.004 0.080 0.116 0.588 0.096
#> SRR1374198 6 0.5931 0.38542 0.300 0.000 0.000 0.012 0.176 0.512
#> SRR1445856 5 0.5684 0.26801 0.332 0.000 0.016 0.008 0.552 0.092
#> SRR820049 3 0.7095 0.29985 0.000 0.028 0.472 0.264 0.184 0.052
#> SRR1375290 4 0.7404 0.47882 0.024 0.132 0.064 0.560 0.152 0.068
#> SRR818999 5 0.6181 0.47528 0.236 0.000 0.112 0.008 0.584 0.060
#> SRR1390242 1 0.0622 0.85246 0.980 0.000 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1401164 2 0.4154 0.64747 0.000 0.740 0.000 0.096 0.000 0.164
#> SRR1454629 1 0.6198 0.39463 0.528 0.000 0.004 0.024 0.260 0.184
#> SRR1332187 3 0.1882 0.82220 0.000 0.000 0.928 0.024 0.028 0.020
#> SRR603365 3 0.1265 0.83026 0.000 0.000 0.948 0.008 0.044 0.000
#> SRR657833 2 0.5628 0.36757 0.020 0.580 0.000 0.276 0.000 0.124
#> SRR1436207 2 0.3852 0.63074 0.004 0.740 0.000 0.224 0.000 0.032
#> SRR1488017 1 0.0146 0.84938 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR612947 2 0.0713 0.79429 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.3897 0.67977 0.712 0.000 0.008 0.000 0.264 0.016
#> SRR1364761 2 0.2250 0.76968 0.000 0.888 0.000 0.092 0.000 0.020
#> SRR1308086 5 0.6425 0.32784 0.004 0.000 0.028 0.332 0.460 0.176
#> SRR1441868 1 0.0820 0.84932 0.972 0.000 0.000 0.000 0.012 0.016
#> SRR1485380 3 0.5438 0.02513 0.000 0.000 0.492 0.020 0.420 0.068
#> SRR1073705 1 0.0862 0.84953 0.972 0.000 0.000 0.004 0.008 0.016
#> SRR615032 2 0.0260 0.79273 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0713 0.79177 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.1297 0.79035 0.000 0.948 0.000 0.040 0.000 0.012
#> SRR1100346 4 0.4824 0.51704 0.008 0.356 0.000 0.588 0.000 0.048
#> SRR1332816 1 0.1148 0.84974 0.960 0.000 0.000 0.004 0.016 0.020
#> SRR612299 6 0.5947 -0.04260 0.004 0.404 0.000 0.184 0.000 0.408
#> SRR1407386 1 0.1575 0.85489 0.936 0.000 0.000 0.000 0.032 0.032
#> SRR1418064 2 0.0820 0.79290 0.000 0.972 0.000 0.016 0.000 0.012
#> SRR1309403 1 0.5081 0.66129 0.748 0.052 0.000 0.080 0.064 0.056
#> SRR1498395 2 0.2432 0.76394 0.000 0.876 0.000 0.100 0.000 0.024
#> SRR1079998 5 0.4438 0.56296 0.088 0.000 0.140 0.008 0.752 0.012
#> SRR1498885 2 0.2234 0.74085 0.004 0.872 0.000 0.124 0.000 0.000
#> SRR1337215 2 0.6703 0.07656 0.056 0.464 0.000 0.220 0.000 0.260
#> SRR1414749 3 0.2454 0.82121 0.000 0.000 0.876 0.016 0.104 0.004
#> SRR1365963 5 0.3786 0.57736 0.092 0.000 0.072 0.004 0.812 0.020
#> SRR1368030 4 0.5047 0.41849 0.032 0.424 0.000 0.524 0.008 0.012
#> SRR1419760 4 0.5646 0.49586 0.028 0.340 0.004 0.560 0.004 0.064
#> SRR1381841 1 0.6067 0.09414 0.440 0.000 0.016 0.004 0.404 0.136
#> SRR821388 4 0.7736 -0.16484 0.072 0.044 0.008 0.384 0.340 0.152
#> SRR657623 2 0.3850 0.52687 0.020 0.716 0.000 0.260 0.000 0.004
#> SRR1094241 3 0.4269 0.74591 0.000 0.000 0.760 0.116 0.108 0.016
#> SRR819583 5 0.5515 0.34187 0.004 0.000 0.348 0.024 0.556 0.068
#> SRR1096149 1 0.3680 0.71373 0.744 0.000 0.000 0.004 0.232 0.020
#> SRR1342829 3 0.0146 0.82740 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1353028 1 0.2510 0.83559 0.872 0.000 0.000 0.000 0.100 0.028
#> SRR811333 5 0.6073 0.50990 0.100 0.000 0.228 0.024 0.608 0.040
#> SRR1311666 2 0.0632 0.79529 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.5267 0.29250 0.000 0.560 0.000 0.320 0.000 0.120
#> SRR1446436 2 0.2949 0.73474 0.000 0.832 0.000 0.140 0.000 0.028
#> SRR815092 1 0.0622 0.85246 0.980 0.000 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1500149 2 0.4434 0.63705 0.008 0.728 0.000 0.096 0.000 0.168
#> SRR1100564 1 0.2249 0.85166 0.900 0.000 0.000 0.004 0.064 0.032
#> SRR1403072 3 0.1053 0.82138 0.000 0.000 0.964 0.020 0.004 0.012
#> SRR811653 4 0.4220 0.52317 0.044 0.072 0.000 0.804 0.052 0.028
#> SRR1311348 2 0.0146 0.79232 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0935 0.79220 0.000 0.964 0.000 0.032 0.000 0.004
#> SRR1435442 6 0.5714 -0.06283 0.004 0.428 0.000 0.140 0.000 0.428
#> SRR1421444 3 0.0146 0.82740 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1344010 2 0.0363 0.79384 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0717 0.84987 0.976 0.000 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR1444763 1 0.5906 0.27348 0.512 0.000 0.000 0.012 0.168 0.308
#> SRR1415026 2 0.1007 0.79018 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.3472 0.72403 0.004 0.812 0.000 0.136 0.004 0.044
#> SRR1485499 2 0.0260 0.79273 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0146 0.79166 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.2234 0.74085 0.004 0.872 0.000 0.124 0.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.3902 0.54697 0.008 0.720 0.000 0.256 0.004 0.012
#> SRR663537 2 0.0000 0.79155 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.2821 0.80428 0.832 0.000 0.000 0.000 0.152 0.016
#> SRR1453950 1 0.3596 0.74010 0.760 0.000 0.008 0.000 0.216 0.016
#> SRR1087875 1 0.0862 0.84953 0.972 0.000 0.000 0.004 0.008 0.016
#> SRR613318 4 0.4294 0.61857 0.040 0.168 0.000 0.760 0.016 0.016
#> SRR1332694 1 0.2164 0.84731 0.900 0.000 0.000 0.000 0.068 0.032
#> SRR1468469 3 0.3447 0.77415 0.000 0.000 0.800 0.024 0.164 0.012
#> SRR818670 2 0.1951 0.77809 0.000 0.908 0.000 0.076 0.000 0.016
#> SRR1120318 1 0.2520 0.83176 0.872 0.000 0.008 0.000 0.108 0.012
#> SRR1311622 5 0.5629 0.55163 0.068 0.000 0.016 0.116 0.684 0.116
#> SRR1500931 5 0.5630 0.28497 0.000 0.000 0.380 0.032 0.516 0.072
#> SRR1387494 5 0.6833 0.35118 0.008 0.004 0.056 0.316 0.468 0.148
#> SRR1379175 4 0.5018 0.55310 0.056 0.100 0.000 0.748 0.056 0.040
#> SRR1401909 5 0.6307 0.40592 0.024 0.000 0.280 0.028 0.548 0.120
#> SRR1440541 2 0.2415 0.76618 0.024 0.904 0.000 0.036 0.004 0.032
#> SRR1068832 5 0.5583 0.40611 0.012 0.000 0.308 0.024 0.588 0.068
#> SRR1376640 2 0.5341 -0.10638 0.004 0.480 0.000 0.440 0.008 0.068
#> SRR1085712 2 0.0260 0.79341 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.6275 0.21992 0.460 0.000 0.012 0.008 0.340 0.180
#> SRR1084276 1 0.5083 0.52882 0.612 0.000 0.020 0.008 0.320 0.040
#> SRR1353262 2 0.1644 0.78391 0.000 0.932 0.000 0.028 0.000 0.040
#> SRR1437035 1 0.4158 0.77256 0.796 0.012 0.000 0.044 0.104 0.044
#> SRR1396877 1 0.5491 0.53621 0.616 0.000 0.044 0.012 0.284 0.044
#> SRR1443026 2 0.1418 0.78756 0.000 0.944 0.000 0.024 0.000 0.032
#> SRR1417936 1 0.0260 0.85159 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1436822 2 0.3315 0.72622 0.000 0.820 0.000 0.076 0.000 0.104
#> SRR1101128 3 0.4293 0.63972 0.000 0.000 0.728 0.024 0.212 0.036
#> SRR1363886 2 0.0260 0.79273 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0520 0.79506 0.000 0.984 0.000 0.008 0.000 0.008
#> SRR1394366 6 0.6118 -0.10061 0.004 0.376 0.000 0.232 0.000 0.388
#> SRR1093218 5 0.6328 0.26001 0.004 0.000 0.324 0.084 0.512 0.076
#> SRR1077090 5 0.4326 0.48444 0.020 0.000 0.236 0.008 0.716 0.020
#> SRR1327430 4 0.4950 0.62819 0.040 0.304 0.000 0.632 0.012 0.012
#> SRR1088958 1 0.0862 0.84953 0.972 0.000 0.000 0.004 0.008 0.016
#> SRR1486931 2 0.4314 0.60026 0.000 0.712 0.000 0.220 0.004 0.064
#> SRR1086820 1 0.5507 0.53131 0.596 0.000 0.000 0.008 0.216 0.180
#> SRR1383000 1 0.3539 0.74996 0.768 0.000 0.008 0.000 0.208 0.016
#> SRR1355705 2 0.0260 0.79467 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR614335 2 0.2362 0.72607 0.004 0.860 0.000 0.136 0.000 0.000
#> SRR660534 2 0.0603 0.79531 0.000 0.980 0.000 0.016 0.000 0.004
#> SRR817094 2 0.0260 0.79273 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.3763 0.61205 0.008 0.752 0.000 0.220 0.004 0.016
#> SRR1456401 4 0.4928 0.64124 0.052 0.280 0.000 0.648 0.008 0.012
#> SRR1086393 1 0.1701 0.85479 0.920 0.000 0.000 0.000 0.072 0.008
#> SRR1351521 3 0.0964 0.82195 0.000 0.000 0.968 0.016 0.004 0.012
#> SRR1093100 4 0.4960 0.45288 0.028 0.408 0.000 0.544 0.008 0.012
#> SRR1309382 1 0.2796 0.83611 0.868 0.000 0.000 0.008 0.080 0.044
#> SRR1089375 5 0.7518 0.52541 0.160 0.008 0.064 0.128 0.532 0.108
#> SRR1499482 2 0.5043 0.02308 0.024 0.520 0.000 0.424 0.000 0.032
#> SRR614719 4 0.4759 0.43320 0.004 0.396 0.000 0.556 0.000 0.044
#> SRR1081473 5 0.6492 0.47834 0.040 0.000 0.176 0.100 0.608 0.076
#> SRR1087415 1 0.5507 0.53131 0.596 0.000 0.000 0.008 0.216 0.180
#> SRR1088217 5 0.5723 0.35500 0.016 0.000 0.348 0.032 0.552 0.052
#> SRR808496 4 0.5345 0.43242 0.028 0.408 0.000 0.524 0.012 0.028
#> SRR1336463 2 0.4606 0.62443 0.008 0.716 0.000 0.184 0.004 0.088
#> SRR612359 4 0.4691 0.62569 0.004 0.284 0.000 0.656 0.008 0.048
#> SRR1444412 1 0.4328 0.72829 0.732 0.000 0.012 0.008 0.208 0.040
#> SRR1074116 3 0.0405 0.82801 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR821846 3 0.0291 0.82769 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR656095 2 0.0777 0.79478 0.000 0.972 0.000 0.024 0.000 0.004
#> SRR808914 1 0.1408 0.85277 0.944 0.000 0.000 0.000 0.036 0.020
#> SRR1349099 6 0.6138 0.41251 0.288 0.000 0.000 0.028 0.168 0.516
#> SRR1337886 2 0.4222 0.64023 0.000 0.728 0.000 0.184 0.000 0.088
#> SRR813632 5 0.5204 0.30462 0.352 0.000 0.032 0.008 0.580 0.028
#> SRR1101591 5 0.5051 0.54495 0.104 0.000 0.180 0.012 0.692 0.012
#> SRR1089713 5 0.7105 0.55813 0.120 0.004 0.076 0.120 0.580 0.100
#> SRR1453127 3 0.2203 0.82656 0.000 0.000 0.896 0.016 0.084 0.004
#> SRR1498354 5 0.5482 0.43206 0.016 0.000 0.292 0.020 0.608 0.064
#> SRR1313831 1 0.2744 0.83509 0.876 0.000 0.000 0.012 0.060 0.052
#> SRR1315434 3 0.3834 0.69224 0.000 0.000 0.728 0.024 0.244 0.004
#> SRR814747 2 0.4591 0.22907 0.024 0.604 0.000 0.360 0.008 0.004
#> SRR1358539 1 0.1826 0.85428 0.924 0.000 0.004 0.000 0.052 0.020
#> SRR1367807 1 0.0964 0.84913 0.968 0.000 0.000 0.004 0.012 0.016
#> SRR1365791 6 0.5493 0.46392 0.144 0.000 0.004 0.076 0.096 0.680
#> SRR1081519 5 0.5669 0.33328 0.012 0.000 0.356 0.036 0.548 0.048
#> SRR614707 2 0.7024 -0.16708 0.052 0.372 0.000 0.268 0.004 0.304
#> SRR1094027 1 0.0405 0.85190 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1489092 6 0.5399 0.46613 0.144 0.000 0.000 0.076 0.100 0.680
#> SRR1079502 5 0.6557 0.54430 0.068 0.000 0.088 0.124 0.624 0.096
#> SRR1457814 4 0.4220 0.52317 0.044 0.072 0.000 0.804 0.052 0.028
#> SRR1455127 2 0.0692 0.79215 0.000 0.976 0.000 0.020 0.000 0.004
#> SRR615081 2 0.3315 0.72622 0.000 0.820 0.000 0.076 0.000 0.104
#> SRR1327855 5 0.5515 0.34187 0.004 0.000 0.348 0.024 0.556 0.068
#> SRR1417873 2 0.3843 0.59048 0.008 0.740 0.000 0.232 0.004 0.016
#> SRR1394125 5 0.7555 0.37198 0.112 0.004 0.284 0.076 0.460 0.064
#> SRR1488388 1 0.1789 0.85296 0.924 0.000 0.000 0.000 0.044 0.032
#> SRR1401122 4 0.5000 0.38352 0.028 0.440 0.000 0.512 0.008 0.012
#> SRR612383 4 0.3972 0.66599 0.004 0.244 0.000 0.724 0.004 0.024
#> SRR1477711 1 0.0914 0.85217 0.968 0.000 0.000 0.000 0.016 0.016
#> SRR1350813 2 0.5040 0.10139 0.008 0.528 0.000 0.408 0.000 0.056
#> SRR612851 2 0.4775 -0.13384 0.004 0.500 0.000 0.456 0.000 0.040
#> SRR1086349 1 0.0405 0.84952 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR812837 2 0.0146 0.79166 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1340010 4 0.7739 -0.16961 0.072 0.044 0.008 0.380 0.344 0.152
#> SRR1475885 6 0.5880 0.43667 0.204 0.000 0.000 0.048 0.144 0.604
#> SRR1376334 1 0.2744 0.83509 0.876 0.000 0.000 0.012 0.060 0.052
#> SRR1399821 6 0.6138 0.41251 0.288 0.000 0.000 0.028 0.168 0.516
#> SRR1347042 3 0.2203 0.82656 0.000 0.000 0.896 0.016 0.084 0.004
#> SRR612323 4 0.4010 0.66688 0.004 0.264 0.000 0.708 0.004 0.020
#> SRR612604 2 0.4613 0.52178 0.000 0.660 0.000 0.080 0.000 0.260
#> SRR1389546 2 0.1913 0.77701 0.000 0.908 0.000 0.080 0.000 0.012
#> SRR1311877 1 0.0622 0.85180 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1465608 5 0.3786 0.57736 0.092 0.000 0.072 0.004 0.812 0.020
#> SRR1101808 2 0.0858 0.79472 0.000 0.968 0.000 0.028 0.000 0.004
#> SRR1414079 3 0.2367 0.82572 0.000 0.000 0.888 0.016 0.088 0.008
#> SRR1331153 2 0.6476 0.16846 0.040 0.488 0.000 0.236 0.000 0.236
#> SRR1078439 4 0.7706 -0.25610 0.024 0.020 0.284 0.336 0.296 0.040
#> SRR2165527 2 0.0146 0.79210 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.3117 0.78946 0.868 0.020 0.000 0.052 0.016 0.044
#> SRR1313536 2 0.3125 0.74725 0.000 0.836 0.000 0.080 0.000 0.084
#> SRR1070308 1 0.3962 0.71204 0.812 0.060 0.000 0.076 0.008 0.044
#> SRR1403110 1 0.2744 0.83509 0.876 0.000 0.000 0.012 0.060 0.052
#> SRR1400355 2 0.2333 0.76904 0.000 0.884 0.000 0.092 0.000 0.024
#> SRR1401317 5 0.5515 0.34187 0.004 0.000 0.348 0.024 0.556 0.068
#> SRR1456862 1 0.4817 0.52193 0.616 0.000 0.000 0.008 0.320 0.056
#> SRR1074622 1 0.2112 0.84591 0.896 0.000 0.000 0.000 0.088 0.016
#> SRR1465847 5 0.5460 0.47040 0.044 0.000 0.268 0.020 0.632 0.036
#> SRR1443376 2 0.0508 0.79483 0.000 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1471312 3 0.2434 0.80313 0.000 0.000 0.896 0.032 0.016 0.056
#> SRR1075579 1 0.0622 0.85246 0.980 0.000 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1090881 4 0.7404 0.47882 0.024 0.132 0.064 0.560 0.152 0.068
#> SRR612251 2 0.3487 0.62207 0.020 0.756 0.000 0.224 0.000 0.000
#> SRR1418581 1 0.0820 0.84932 0.972 0.000 0.000 0.000 0.012 0.016
#> SRR658045 2 0.0000 0.79155 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613214 4 0.4370 0.63063 0.000 0.280 0.000 0.672 0.004 0.044
#> SRR613078 2 0.5492 0.15238 0.000 0.472 0.000 0.128 0.000 0.400
#> SRR1472998 5 0.5460 0.47040 0.044 0.000 0.268 0.020 0.632 0.036
#> SRR1433452 2 0.2973 0.73834 0.000 0.836 0.000 0.136 0.004 0.024
#> SRR1101957 1 0.0622 0.85180 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1487993 5 0.7127 0.29375 0.000 0.000 0.148 0.280 0.432 0.140
#> SRR1465983 2 0.0508 0.79512 0.000 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1380375 1 0.2420 0.84379 0.888 0.000 0.004 0.000 0.076 0.032
#> SRR1367566 3 0.3277 0.79168 0.000 0.000 0.812 0.024 0.156 0.008
#> SRR1316151 2 0.7022 0.16116 0.096 0.480 0.000 0.100 0.024 0.300
#> SRR1417547 4 0.5000 0.38352 0.028 0.440 0.000 0.512 0.008 0.012
#> SRR659389 2 0.0508 0.79534 0.000 0.984 0.000 0.012 0.000 0.004
#> SRR1490270 2 0.6492 0.15579 0.040 0.484 0.000 0.240 0.000 0.236
#> SRR1398207 5 0.6629 0.45922 0.264 0.000 0.136 0.016 0.528 0.056
#> SRR1358755 5 0.5422 0.45536 0.020 0.000 0.272 0.020 0.628 0.060
#> SRR1078903 2 0.4178 0.58528 0.008 0.708 0.000 0.248 0.000 0.036
#> SRR1323252 2 0.0000 0.79155 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.2237 0.78014 0.000 0.896 0.000 0.068 0.000 0.036
#> SRR1369172 1 0.5473 0.54512 0.600 0.000 0.008 0.004 0.260 0.128
#> SRR615982 2 0.5175 -0.08762 0.024 0.496 0.000 0.440 0.000 0.040
#> SRR1480431 2 0.4184 0.49007 0.004 0.672 0.000 0.296 0.000 0.028
#> SRR1429825 2 0.3655 0.71990 0.000 0.800 0.000 0.108 0.004 0.088
#> SRR1102393 2 0.0146 0.79228 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1071313 5 0.6095 0.53186 0.176 0.000 0.016 0.068 0.628 0.112
#> SRR808351 1 0.1918 0.84561 0.904 0.000 0.000 0.000 0.088 0.008
#> SRR1317513 1 0.2164 0.84731 0.900 0.000 0.000 0.000 0.068 0.032
#> SRR1480501 5 0.6148 0.54028 0.044 0.000 0.112 0.108 0.656 0.080
#> SRR1081910 5 0.6358 0.31855 0.352 0.000 0.112 0.016 0.488 0.032
#> SRR1086611 4 0.7589 0.33550 0.040 0.292 0.008 0.392 0.040 0.228
#> SRR1392571 4 0.5600 0.32852 0.028 0.408 0.000 0.500 0.004 0.060
#> SRR1311441 1 0.0717 0.84987 0.976 0.000 0.000 0.000 0.008 0.016
#> SRR808152 1 0.1686 0.85161 0.924 0.000 0.000 0.000 0.064 0.012
#> SRR657313 3 0.4460 0.70682 0.000 0.000 0.736 0.112 0.140 0.012
#> SRR1433131 2 0.2937 0.75043 0.000 0.848 0.000 0.056 0.000 0.096
#> SRR1321011 2 0.0260 0.79273 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0146 0.79166 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.3141 0.73242 0.012 0.828 0.000 0.140 0.000 0.020
#> SRR1389108 1 0.0862 0.84953 0.972 0.000 0.000 0.004 0.008 0.016
#> SRR1376228 3 0.2454 0.82121 0.000 0.000 0.876 0.016 0.104 0.004
#> SRR1399757 1 0.0806 0.84857 0.972 0.000 0.000 0.000 0.008 0.020
#> SRR1358060 3 0.2454 0.82121 0.000 0.000 0.876 0.016 0.104 0.004
#> SRR1464517 5 0.6405 0.41012 0.012 0.000 0.040 0.260 0.540 0.148
#> SRR613557 4 0.4314 0.65531 0.004 0.244 0.000 0.704 0.004 0.044
#> SRR809831 1 0.4220 0.70720 0.724 0.000 0.012 0.004 0.228 0.032
#> SRR1429387 3 0.0146 0.82740 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR816565 1 0.0146 0.85051 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1071644 1 0.0622 0.85019 0.980 0.000 0.000 0.000 0.008 0.012
#> SRR1406936 5 0.6379 0.53067 0.048 0.000 0.104 0.120 0.636 0.092
#> SRR1072031 2 0.0000 0.79155 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 4 0.4010 0.66688 0.004 0.264 0.000 0.708 0.004 0.020
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.988 0.994 0.4964 0.504 0.504
#> 3 3 0.985 0.963 0.954 0.2886 0.825 0.662
#> 4 4 0.745 0.767 0.856 0.1468 0.872 0.653
#> 5 5 0.686 0.602 0.746 0.0669 0.972 0.892
#> 6 6 0.709 0.519 0.717 0.0455 0.911 0.654
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1394209 1 0.8499 0.622 0.724 0.276
#> SRR1474018 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1391619 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1403980 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1442800 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1093053 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1399843 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1380231 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1096736 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1478700 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1384754 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1380317 2 0.7950 0.685 0.240 0.760
#> SRR1315247 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1456075 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1417154 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1325771 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1360420 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1072948 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1362848 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1407492 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1454868 1 0.6048 0.827 0.852 0.148
#> SRR1474816 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR614695 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1325871 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1092112 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.4431 0.896 0.092 0.908
#> SRR1078834 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1419062 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1315739 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1091890 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1327473 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1338195 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR614887 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1354620 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1389157 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR613568 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1446180 1 0.1414 0.975 0.980 0.020
#> SRR1406372 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1353136 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1093906 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1399861 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1338789 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1421420 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1352870 2 0.6247 0.816 0.156 0.844
#> SRR1315041 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1420006 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1472749 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1478341 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1479699 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR659427 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1096638 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1439994 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1374270 2 0.6531 0.799 0.168 0.832
#> SRR1470947 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1456274 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR820049 1 0.0938 0.983 0.988 0.012
#> SRR1375290 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR818999 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1332187 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR603365 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1485380 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1309403 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1414749 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1419760 1 0.5842 0.837 0.860 0.140
#> SRR1381841 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR821388 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR657623 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR819583 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1403072 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR811653 1 0.7056 0.764 0.808 0.192
#> SRR1311348 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR613318 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1468469 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1500931 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1379175 1 0.6801 0.783 0.820 0.180
#> SRR1401909 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1101128 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1093218 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1077090 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1101591 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1453127 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1315434 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1365791 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1081519 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR614707 2 0.8267 0.651 0.260 0.740
#> SRR1094027 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1079502 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1457814 2 0.8386 0.637 0.268 0.732
#> SRR1455127 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1475885 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1376334 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1347042 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.7139 0.758 0.196 0.804
#> SRR1403110 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1090881 1 0.7219 0.752 0.800 0.200
#> SRR612251 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1487993 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1367566 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1480501 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1086611 1 0.7528 0.727 0.784 0.216
#> SRR1392571 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR657313 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1376228 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1358060 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1464517 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR613557 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR809831 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.994 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR614491 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 2 0.6683 0.0402 0.496 0.496 0.008
#> SRR1394209 2 0.3337 0.9438 0.032 0.908 0.060
#> SRR1474018 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1099809 1 0.0237 0.9910 0.996 0.000 0.004
#> SRR1500555 2 0.1289 0.9594 0.000 0.968 0.032
#> SRR1354363 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1307997 2 0.0237 0.9676 0.000 0.996 0.004
#> SRR663124 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.0592 0.9686 0.000 0.988 0.012
#> SRR1468553 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1403980 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1420169 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1442800 2 0.6500 0.7490 0.140 0.760 0.100
#> SRR1359214 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1499849 1 0.0237 0.9910 0.996 0.000 0.004
#> SRR1500030 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1093053 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1399843 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1380231 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR809470 3 0.3192 0.9592 0.112 0.000 0.888
#> SRR614239 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR613939 2 0.1289 0.9594 0.000 0.968 0.032
#> SRR612971 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.1289 0.9594 0.000 0.968 0.032
#> SRR1469570 2 0.0237 0.9684 0.000 0.996 0.004
#> SRR1457354 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1362906 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0237 0.9684 0.000 0.996 0.004
#> SRR1096736 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1478700 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081543 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1384754 3 0.5327 0.7556 0.272 0.000 0.728
#> SRR612287 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1380317 2 0.2947 0.9520 0.020 0.920 0.060
#> SRR1315247 2 0.1411 0.9578 0.000 0.964 0.036
#> SRR1105344 2 0.2796 0.9551 0.000 0.908 0.092
#> SRR658549 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0237 0.9684 0.000 0.996 0.004
#> SRR612551 2 0.1964 0.9642 0.000 0.944 0.056
#> SRR1358520 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1419476 3 0.2796 0.9706 0.092 0.000 0.908
#> SRR1456075 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1095985 3 0.3192 0.9518 0.112 0.000 0.888
#> SRR1325771 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR660272 2 0.1289 0.9594 0.000 0.968 0.032
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076916 3 0.2796 0.9706 0.092 0.000 0.908
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0237 0.9686 0.000 0.996 0.004
#> SRR1456114 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1472370 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1480176 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.1289 0.9594 0.000 0.968 0.032
#> SRR1469192 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.2711 0.9672 0.088 0.000 0.912
#> SRR659839 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362848 3 0.1753 0.9231 0.048 0.000 0.952
#> SRR1407492 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455082 2 0.0237 0.9676 0.000 0.996 0.004
#> SRR658362 2 0.1860 0.9648 0.000 0.948 0.052
#> SRR810921 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1456375 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR818232 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1454868 3 0.3030 0.9698 0.092 0.004 0.904
#> SRR1474816 2 0.0237 0.9684 0.000 0.996 0.004
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1466400 2 0.1411 0.9578 0.000 0.964 0.036
#> SRR658921 2 0.1529 0.9588 0.000 0.960 0.040
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0424 0.9859 0.992 0.000 0.008
#> SRR1090145 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1086280 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1454891 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR663185 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR811819 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR656758 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.1289 0.9594 0.000 0.968 0.032
#> SRR1472687 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1334291 2 0.0237 0.9676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1368939 2 0.1289 0.9594 0.000 0.968 0.032
#> SRR1443161 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR614695 2 0.1411 0.9578 0.000 0.964 0.036
#> SRR1092372 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.1289 0.9615 0.968 0.000 0.032
#> SRR811005 2 0.0237 0.9684 0.000 0.996 0.004
#> SRR1385319 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1325871 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1355415 3 0.6305 0.2635 0.484 0.000 0.516
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0892 0.9750 0.980 0.000 0.020
#> SRR1321165 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1092112 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1417588 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1074790 2 0.2301 0.9264 0.060 0.936 0.004
#> SRR1432106 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR655756 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1072749 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.1411 0.9578 0.000 0.964 0.036
#> SRR1078834 2 0.1411 0.9578 0.000 0.964 0.036
#> SRR1417611 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1396840 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1465440 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1400530 2 0.2537 0.9594 0.000 0.920 0.080
#> SRR614984 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.2796 0.9551 0.000 0.908 0.092
#> SRR1319443 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1324349 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1345523 2 0.1964 0.9642 0.000 0.944 0.056
#> SRR1500846 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1419062 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1480131 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1099189 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1347436 2 0.0237 0.9676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1327473 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338195 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR809698 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1322643 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.2796 0.9706 0.092 0.000 0.908
#> SRR1354620 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR615056 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1105320 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1391529 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.2625 0.9578 0.000 0.916 0.084
#> SRR1435330 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR615383 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 2 0.2066 0.9348 0.000 0.940 0.060
#> SRR613568 2 0.1289 0.9594 0.000 0.968 0.032
#> SRR614095 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1103092 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 3 0.2066 0.9398 0.060 0.000 0.940
#> SRR1475345 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR809089 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 3 0.2772 0.8600 0.004 0.080 0.916
#> SRR1406372 2 0.2796 0.9551 0.000 0.908 0.092
#> SRR1339880 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1353136 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1093906 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR614035 2 0.1964 0.9642 0.000 0.944 0.056
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1399861 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1338789 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1421420 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1420832 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.2066 0.8741 0.000 0.060 0.940
#> SRR1315041 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR661877 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1443268 1 0.1031 0.9706 0.976 0.000 0.024
#> SRR1416617 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1102443 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420006 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR613819 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1469432 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR660907 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1465092 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.2796 0.9706 0.092 0.000 0.908
#> SRR1472749 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1414379 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1431326 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.1411 0.9578 0.000 0.964 0.036
#> SRR1098312 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR810273 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.1289 0.9594 0.000 0.968 0.032
#> SRR614467 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR811471 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1088606 3 0.2625 0.9358 0.084 0.000 0.916
#> SRR1479699 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1403589 2 0.0237 0.9684 0.000 0.996 0.004
#> SRR812625 2 0.1289 0.9594 0.000 0.968 0.032
#> SRR1359803 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1338988 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1471222 2 0.2261 0.9607 0.000 0.932 0.068
#> SRR1378992 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR659427 3 0.3030 0.9670 0.092 0.004 0.904
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.2796 0.9551 0.000 0.908 0.092
#> SRR659307 3 0.2878 0.8669 0.000 0.096 0.904
#> SRR1439994 1 0.3816 0.8021 0.852 0.000 0.148
#> SRR1454931 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1332928 3 0.6168 0.4696 0.412 0.000 0.588
#> SRR658621 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374270 2 0.2947 0.9533 0.020 0.920 0.060
#> SRR1470947 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1365598 2 0.1411 0.9578 0.000 0.964 0.036
#> SRR662787 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1408727 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1456274 1 0.2261 0.9171 0.932 0.000 0.068
#> SRR817744 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1387379 2 0.1411 0.9669 0.000 0.964 0.036
#> SRR1102680 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1374198 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1445856 1 0.0747 0.9793 0.984 0.000 0.016
#> SRR820049 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1375290 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR818999 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.1289 0.9594 0.000 0.968 0.032
#> SRR1454629 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1332187 3 0.2796 0.9706 0.092 0.000 0.908
#> SRR603365 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR657833 2 0.1289 0.9594 0.000 0.968 0.032
#> SRR1436207 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1441868 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1073705 1 0.1031 0.9661 0.976 0.000 0.024
#> SRR615032 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1452356 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.0892 0.9636 0.000 0.980 0.020
#> SRR1332816 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR612299 2 0.1411 0.9578 0.000 0.964 0.036
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.0424 0.9873 0.992 0.000 0.008
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.5431 0.7365 0.284 0.000 0.716
#> SRR1498885 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1337215 2 0.1411 0.9578 0.000 0.964 0.036
#> SRR1414749 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1365963 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1368030 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1419760 2 0.3941 0.8242 0.156 0.844 0.000
#> SRR1381841 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR821388 3 0.7603 0.6790 0.096 0.236 0.668
#> SRR657623 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1094241 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR819583 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1096149 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.1289 0.9594 0.000 0.968 0.032
#> SRR1446436 2 0.1289 0.9594 0.000 0.968 0.032
#> SRR815092 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.1289 0.9594 0.000 0.968 0.032
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.2796 0.9706 0.092 0.000 0.908
#> SRR811653 3 0.1860 0.9275 0.052 0.000 0.948
#> SRR1311348 2 0.0237 0.9684 0.000 0.996 0.004
#> SRR1489438 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1435442 2 0.1411 0.9578 0.000 0.964 0.036
#> SRR1421444 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1344010 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1319520 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1415026 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1416596 2 0.2796 0.9551 0.000 0.908 0.092
#> SRR1485499 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1316078 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR663465 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1310094 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR663537 2 0.0237 0.9684 0.000 0.996 0.004
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR613318 2 0.1753 0.9654 0.000 0.952 0.048
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR818670 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1500931 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1387494 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1379175 2 0.3481 0.9351 0.044 0.904 0.052
#> SRR1401909 3 0.5591 0.6973 0.304 0.000 0.696
#> SRR1440541 2 0.1964 0.9642 0.000 0.944 0.056
#> SRR1068832 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1376640 2 0.1289 0.9594 0.000 0.968 0.032
#> SRR1085712 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1082283 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1084276 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.2625 0.9578 0.000 0.916 0.084
#> SRR1437035 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0592 0.9685 0.000 0.988 0.012
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.2796 0.9551 0.000 0.908 0.092
#> SRR1101128 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1363886 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR612983 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1394366 2 0.1411 0.9578 0.000 0.964 0.036
#> SRR1093218 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1077090 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1327430 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1088958 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0237 0.9676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.1964 0.9642 0.000 0.944 0.056
#> SRR614335 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR660534 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.1964 0.9642 0.000 0.944 0.056
#> SRR1334265 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1456401 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1086393 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1093100 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081473 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1087415 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1088217 3 0.3619 0.9320 0.136 0.000 0.864
#> SRR808496 2 0.1964 0.9640 0.000 0.944 0.056
#> SRR1336463 2 0.2066 0.9639 0.000 0.940 0.060
#> SRR612359 2 0.0237 0.9676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1444412 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR821846 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR656095 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1089713 3 0.6045 0.5491 0.380 0.000 0.620
#> SRR1453127 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1498354 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR814747 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.2796 0.9706 0.092 0.000 0.908
#> SRR1081519 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR614707 2 0.1411 0.9578 0.000 0.964 0.036
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.3619 0.9318 0.136 0.000 0.864
#> SRR1079502 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1457814 3 0.5455 0.6734 0.020 0.204 0.776
#> SRR1455127 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR615081 2 0.2165 0.9599 0.000 0.936 0.064
#> SRR1327855 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1417873 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1394125 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR612383 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1340010 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1475885 1 0.1411 0.9547 0.964 0.000 0.036
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0237 0.9914 0.996 0.000 0.004
#> SRR1347042 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR612323 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR612604 2 0.1411 0.9578 0.000 0.964 0.036
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1331153 2 0.1289 0.9594 0.000 0.968 0.032
#> SRR1078439 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR2165527 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1351147 1 0.0892 0.9739 0.980 0.000 0.020
#> SRR1313536 2 0.0892 0.9636 0.000 0.980 0.020
#> SRR1070308 2 0.2301 0.9288 0.060 0.936 0.004
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1456862 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.2796 0.9706 0.092 0.000 0.908
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.3456 0.9071 0.036 0.060 0.904
#> SRR612251 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR613078 2 0.1411 0.9578 0.000 0.964 0.036
#> SRR1472998 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1433452 2 0.0237 0.9676 0.000 0.996 0.004
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1316151 2 0.2625 0.9568 0.000 0.916 0.084
#> SRR1417547 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR659389 2 0.0237 0.9684 0.000 0.996 0.004
#> SRR1490270 2 0.1289 0.9594 0.000 0.968 0.032
#> SRR1398207 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358755 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1078903 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0237 0.9684 0.000 0.996 0.004
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.1529 0.9665 0.000 0.960 0.040
#> SRR1429825 2 0.2711 0.9561 0.000 0.912 0.088
#> SRR1102393 2 0.0237 0.9684 0.000 0.996 0.004
#> SRR1071313 1 0.0592 0.9834 0.988 0.000 0.012
#> SRR808351 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1081910 1 0.4452 0.7269 0.808 0.000 0.192
#> SRR1086611 2 0.4887 0.7317 0.000 0.772 0.228
#> SRR1392571 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1433131 2 0.1289 0.9594 0.000 0.968 0.032
#> SRR1321011 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1500598 2 0.2066 0.9634 0.000 0.940 0.060
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1399757 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1464517 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR613557 2 0.2066 0.9274 0.000 0.940 0.060
#> SRR809831 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429387 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR816565 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9943 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.2878 0.9735 0.096 0.000 0.904
#> SRR1072031 2 0.0237 0.9684 0.000 0.996 0.004
#> SRR1374671 2 0.0000 0.9682 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 3 0.1635 0.9401 0.008 0.000 0.948 0.044
#> SRR1404105 1 0.0188 0.9455 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2164936 2 0.3311 0.7276 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1472057 3 0.2675 0.9229 0.008 0.000 0.892 0.100
#> SRR614491 4 0.5489 0.6956 0.000 0.240 0.060 0.700
#> SRR1069376 1 0.0336 0.9456 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR811964 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1361415 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1345715 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1328073 4 0.7133 0.4354 0.280 0.172 0.000 0.548
#> SRR1394209 4 0.5378 0.5190 0.012 0.448 0.000 0.540
#> SRR1474018 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1099809 1 0.3032 0.8998 0.868 0.000 0.008 0.124
#> SRR1500555 4 0.3688 0.7188 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1354363 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1391619 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1307997 4 0.4431 0.7001 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR663124 4 0.4477 0.6878 0.000 0.312 0.000 0.688
#> SRR1334670 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR612515 4 0.5532 0.6939 0.000 0.228 0.068 0.704
#> SRR1092727 4 0.4661 0.6679 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR1364013 4 0.4877 0.5373 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1468553 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1403980 3 0.1256 0.9407 0.008 0.000 0.964 0.028
#> SRR1420169 3 0.2867 0.9193 0.012 0.000 0.884 0.104
#> SRR1442800 4 0.2990 0.5887 0.036 0.056 0.008 0.900
#> SRR1359214 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1499849 1 0.3161 0.8972 0.864 0.000 0.012 0.124
#> SRR1500030 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1093053 3 0.3300 0.8344 0.008 0.000 0.848 0.144
#> SRR1399843 3 0.2342 0.9314 0.008 0.000 0.912 0.080
#> SRR1380231 3 0.2859 0.9163 0.008 0.000 0.880 0.112
#> SRR809470 3 0.3392 0.8936 0.020 0.000 0.856 0.124
#> SRR614239 4 0.4857 0.6999 0.000 0.284 0.016 0.700
#> SRR613939 4 0.3837 0.7094 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR612971 2 0.0000 0.7673 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 4 0.4661 0.6679 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR811357 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1471672 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR613006 4 0.4072 0.7086 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1469570 2 0.3219 0.7322 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1457354 2 0.0336 0.7661 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1362906 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9456 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.3266 0.7300 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1096736 1 0.3052 0.9034 0.860 0.004 0.000 0.136
#> SRR1478700 1 0.2944 0.9119 0.868 0.000 0.004 0.128
#> SRR1081543 3 0.1151 0.9402 0.008 0.000 0.968 0.024
#> SRR1384754 1 0.6800 0.0205 0.460 0.000 0.444 0.096
#> SRR612287 2 0.0336 0.7661 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1380317 4 0.5229 0.5562 0.000 0.428 0.008 0.564
#> SRR1315247 4 0.3933 0.7020 0.000 0.200 0.008 0.792
#> SRR1105344 2 0.2345 0.6875 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR658549 4 0.4477 0.6920 0.000 0.312 0.000 0.688
#> SRR1480240 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1084816 2 0.3266 0.7300 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR612551 2 0.0336 0.7684 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1358520 2 0.4972 -0.3710 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR1419476 3 0.0469 0.9403 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1456075 3 0.2611 0.9258 0.008 0.000 0.896 0.096
#> SRR1389474 2 0.3311 0.7276 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1367005 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1334419 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1417154 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1095985 3 0.4868 0.7781 0.024 0.000 0.720 0.256
#> SRR1325771 1 0.0188 0.9455 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1360420 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR660272 4 0.4072 0.7053 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1332993 1 0.0188 0.9455 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1311833 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR808044 1 0.2944 0.9101 0.868 0.000 0.004 0.128
#> SRR1076916 3 0.2011 0.9312 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1356266 1 0.1118 0.9463 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1341983 4 0.4948 0.5257 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1456114 1 0.1474 0.9414 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1072948 3 0.0524 0.9417 0.008 0.000 0.988 0.004
#> SRR1472370 3 0.2675 0.9229 0.008 0.000 0.892 0.100
#> SRR1480176 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR613843 2 0.4477 0.5499 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1469192 1 0.0188 0.9455 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1404555 3 0.0592 0.9362 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR659839 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR659533 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1362848 4 0.7489 0.3534 0.008 0.156 0.328 0.508
#> SRR1407492 4 0.5448 0.6971 0.000 0.244 0.056 0.700
#> SRR1455082 4 0.4454 0.6955 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR658362 2 0.4955 -0.3190 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR810921 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR662823 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1456375 3 0.2124 0.9324 0.008 0.000 0.924 0.068
#> SRR818232 1 0.1807 0.9362 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR1454868 4 0.5295 -0.0280 0.008 0.000 0.488 0.504
#> SRR1474816 2 0.3311 0.7279 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9456 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1466400 4 0.4086 0.7082 0.000 0.216 0.008 0.776
#> SRR658921 4 0.4673 0.6482 0.000 0.292 0.008 0.700
#> SRR1499873 2 0.3311 0.7276 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1101373 1 0.1635 0.9394 0.948 0.008 0.000 0.044
#> SRR1090145 1 0.2198 0.9319 0.920 0.000 0.008 0.072
#> SRR1379324 1 0.1637 0.9407 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1345307 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1396166 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1086280 3 0.0804 0.9421 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR1454891 4 0.4500 0.6835 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR663185 2 0.1211 0.7486 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR811819 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1318920 1 0.2859 0.9293 0.880 0.000 0.008 0.112
#> SRR656758 2 0.3801 0.6687 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1474351 1 0.0188 0.9458 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR660450 4 0.3837 0.7066 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1472687 2 0.0000 0.7673 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334291 4 0.4564 0.6856 0.000 0.328 0.000 0.672
#> SRR1415153 2 0.3486 0.7140 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1323271 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1368939 2 0.4477 0.5499 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1443161 4 0.5268 -0.0281 0.008 0.000 0.452 0.540
#> SRR614695 4 0.3933 0.7091 0.000 0.200 0.008 0.792
#> SRR1092372 1 0.2918 0.9281 0.876 0.000 0.008 0.116
#> SRR1474577 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1406582 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR612779 4 0.4977 0.4272 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1089006 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1354071 1 0.3032 0.9004 0.868 0.000 0.008 0.124
#> SRR1105463 1 0.4568 0.8356 0.800 0.000 0.076 0.124
#> SRR811005 2 0.3219 0.7322 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1385319 1 0.1890 0.9345 0.936 0.000 0.008 0.056
#> SRR1325871 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1355415 3 0.6924 0.3757 0.340 0.000 0.536 0.124
#> SRR1090861 1 0.0188 0.9455 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1320712 4 0.5165 0.4831 0.000 0.484 0.004 0.512
#> SRR1470075 1 0.1474 0.9414 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1091254 1 0.0817 0.9454 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1101397 1 0.3659 0.8937 0.840 0.000 0.024 0.136
#> SRR1321165 1 0.3450 0.9083 0.836 0.000 0.008 0.156
#> SRR1092112 3 0.2611 0.9231 0.008 0.000 0.896 0.096
#> SRR1417588 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1074790 2 0.4804 0.6769 0.072 0.780 0.000 0.148
#> SRR1432106 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR655756 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1458314 1 0.1792 0.9395 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1318582 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1080484 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1072749 1 0.0657 0.9460 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1078586 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1400333 4 0.3450 0.7010 0.000 0.156 0.008 0.836
#> SRR1078834 4 0.3768 0.7092 0.000 0.184 0.008 0.808
#> SRR1417611 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1396840 1 0.4095 0.8785 0.792 0.000 0.016 0.192
#> SRR1465440 2 0.0000 0.7673 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0707 0.7618 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR614984 4 0.5426 0.6983 0.000 0.232 0.060 0.708
#> SRR1324269 1 0.1305 0.9428 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR1401491 2 0.2281 0.6916 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1319443 1 0.1452 0.9414 0.956 0.000 0.008 0.036
#> SRR1324349 2 0.4761 -0.1228 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1345523 2 0.0592 0.7689 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1500846 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR661505 3 0.2198 0.9325 0.008 0.000 0.920 0.072
#> SRR1419062 3 0.2480 0.9271 0.008 0.000 0.904 0.088
#> SRR1480131 1 0.2654 0.9130 0.888 0.000 0.004 0.108
#> SRR1421284 2 0.4972 -0.3710 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR1329624 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1315739 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1099189 4 0.4907 0.4933 0.000 0.420 0.000 0.580
#> SRR1083286 1 0.1118 0.9436 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1091890 3 0.0927 0.9406 0.008 0.000 0.976 0.016
#> SRR1347436 4 0.4382 0.7009 0.000 0.296 0.000 0.704
#> SRR1327473 1 0.0707 0.9449 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1338195 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR809698 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1457792 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR658271 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1339597 1 0.2530 0.9214 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1454842 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1322643 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR614887 3 0.0336 0.9379 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1354620 3 0.3598 0.8957 0.028 0.000 0.848 0.124
#> SRR615056 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1105320 1 0.2773 0.9047 0.880 0.000 0.004 0.116
#> SRR1391529 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR663052 2 0.2760 0.6701 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1478834 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR812366 2 0.2704 0.6953 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1435330 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR615383 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1389157 4 0.5578 0.6488 0.000 0.128 0.144 0.728
#> SRR613568 4 0.4040 0.7089 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR614095 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1103092 1 0.0921 0.9444 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1337155 4 0.4500 0.2065 0.000 0.000 0.316 0.684
#> SRR1475345 2 0.0000 0.7673 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1446180 4 0.2345 0.5544 0.000 0.000 0.100 0.900
#> SRR1406372 2 0.2281 0.6916 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1339880 3 0.0804 0.9410 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR1353136 3 0.3810 0.7803 0.008 0.000 0.804 0.188
#> SRR1093906 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR614035 2 0.0592 0.7689 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1351104 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1363926 2 0.4564 0.0813 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR1399861 4 0.6278 0.5282 0.000 0.408 0.060 0.532
#> SRR1338789 1 0.2976 0.9271 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR1421420 3 0.0804 0.9420 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR1420832 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1476231 1 0.0188 0.9455 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1352870 4 0.4134 0.5378 0.000 0.000 0.260 0.740
#> SRR1315041 2 0.3764 0.4620 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR661877 2 0.0707 0.7624 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1443268 1 0.3812 0.8846 0.832 0.000 0.028 0.140
#> SRR1416617 3 0.1042 0.9419 0.008 0.000 0.972 0.020
#> SRR1102443 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR655672 4 0.4454 0.6904 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR1420006 3 0.0804 0.9417 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR1458267 4 0.4661 0.6679 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR613819 2 0.4972 -0.3710 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR1469432 2 0.0336 0.7661 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR660907 2 0.0336 0.7661 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1465092 4 0.4585 0.6819 0.000 0.332 0.000 0.668
#> SRR1470727 1 0.0779 0.9458 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1339153 3 0.0336 0.9379 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1472749 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1414379 4 0.4994 0.5075 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1431326 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1487278 4 0.4897 0.5749 0.000 0.332 0.008 0.660
#> SRR1098312 3 0.1356 0.9396 0.008 0.000 0.960 0.032
#> SRR810273 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1376000 4 0.4103 0.7087 0.000 0.256 0.000 0.744
#> SRR614467 2 0.4585 0.0905 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR811471 1 0.1557 0.9453 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1478341 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1088606 3 0.5288 0.4477 0.008 0.000 0.520 0.472
#> SRR1479699 3 0.1452 0.9401 0.008 0.000 0.956 0.036
#> SRR1403589 2 0.3219 0.7322 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR812625 4 0.3942 0.7147 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR1359803 1 0.1635 0.9401 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1338988 2 0.0000 0.7673 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471222 4 0.4761 0.6210 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR1378992 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR659427 4 0.7640 0.3775 0.020 0.168 0.264 0.548
#> SRR1096638 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1466619 4 0.4866 0.5659 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR659307 4 0.4713 0.3995 0.000 0.000 0.360 0.640
#> SRR1439994 1 0.4969 0.8187 0.772 0.000 0.088 0.140
#> SRR1454931 1 0.3032 0.9070 0.868 0.000 0.008 0.124
#> SRR1332928 1 0.7235 0.1911 0.480 0.000 0.372 0.148
#> SRR658621 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1095840 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1458243 1 0.3052 0.9050 0.860 0.000 0.004 0.136
#> SRR1374270 4 0.4977 0.5337 0.000 0.460 0.000 0.540
#> SRR1470947 2 0.0336 0.7661 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1365598 4 0.4086 0.7082 0.000 0.216 0.008 0.776
#> SRR662787 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1408727 4 0.4996 0.5013 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR1456274 1 0.4035 0.8773 0.804 0.000 0.020 0.176
#> SRR817744 1 0.0188 0.9455 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1478744 2 0.0336 0.7661 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1387379 2 0.2281 0.7551 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1102680 3 0.2546 0.9275 0.008 0.000 0.900 0.092
#> SRR1374198 1 0.2859 0.9293 0.880 0.000 0.008 0.112
#> SRR1445856 1 0.4004 0.8854 0.812 0.000 0.024 0.164
#> SRR820049 3 0.2799 0.8537 0.008 0.000 0.884 0.108
#> SRR1375290 3 0.4567 0.6227 0.008 0.000 0.716 0.276
#> SRR818999 1 0.3032 0.8998 0.868 0.000 0.008 0.124
#> SRR1390242 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1401164 2 0.4679 0.4633 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1454629 1 0.3577 0.8826 0.832 0.000 0.012 0.156
#> SRR1332187 3 0.0592 0.9395 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR603365 3 0.0672 0.9421 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR657833 4 0.4072 0.7086 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1436207 4 0.4961 0.4640 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR1488017 1 0.0188 0.9455 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612947 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9456 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.3528 0.7103 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1308086 3 0.1151 0.9409 0.008 0.000 0.968 0.024
#> SRR1441868 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1485380 3 0.2048 0.9335 0.008 0.000 0.928 0.064
#> SRR1073705 1 0.1635 0.9394 0.948 0.008 0.000 0.044
#> SRR615032 2 0.0000 0.7673 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1442983 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1100346 4 0.4072 0.7179 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1332816 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR612299 4 0.4086 0.7082 0.000 0.216 0.008 0.776
#> SRR1407386 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1418064 2 0.3528 0.7119 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1309403 1 0.2944 0.8912 0.868 0.000 0.004 0.128
#> SRR1498395 2 0.4164 0.6004 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1079998 3 0.5339 0.7786 0.156 0.000 0.744 0.100
#> SRR1498885 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1337215 4 0.4086 0.7082 0.000 0.216 0.008 0.776
#> SRR1414749 3 0.0336 0.9420 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1365963 3 0.2859 0.9180 0.008 0.000 0.880 0.112
#> SRR1368030 2 0.4961 -0.3529 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1419760 4 0.5279 0.6847 0.072 0.192 0.000 0.736
#> SRR1381841 1 0.3324 0.8965 0.852 0.000 0.012 0.136
#> SRR821388 4 0.6547 0.5027 0.008 0.084 0.296 0.612
#> SRR657623 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1094241 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR819583 3 0.2480 0.9271 0.008 0.000 0.904 0.088
#> SRR1096149 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1342829 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1353028 1 0.0707 0.9451 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR811333 3 0.3392 0.9013 0.020 0.000 0.856 0.124
#> SRR1311666 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1486698 4 0.4072 0.7086 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1446436 4 0.4072 0.7086 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR815092 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1500149 4 0.4998 0.1455 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR1100564 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1403072 3 0.0469 0.9400 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR811653 4 0.6545 0.1325 0.008 0.056 0.428 0.508
#> SRR1311348 2 0.3219 0.7322 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1489438 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1435442 4 0.4123 0.7065 0.000 0.220 0.008 0.772
#> SRR1421444 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1344010 2 0.0000 0.7673 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1444763 1 0.2737 0.9308 0.888 0.000 0.008 0.104
#> SRR1415026 2 0.0336 0.7661 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1416596 2 0.4989 -0.3268 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1485499 2 0.0336 0.7661 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1316078 2 0.0000 0.7673 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1310094 2 0.2760 0.6477 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR663537 2 0.3219 0.7322 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1486780 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1453950 1 0.0188 0.9455 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1087875 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR613318 4 0.6201 0.5833 0.000 0.376 0.060 0.564
#> SRR1332694 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1468469 3 0.0336 0.9420 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR818670 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1120318 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1311622 3 0.2048 0.9350 0.008 0.000 0.928 0.064
#> SRR1500931 3 0.2480 0.9267 0.008 0.000 0.904 0.088
#> SRR1387494 3 0.1151 0.9410 0.008 0.000 0.968 0.024
#> SRR1379175 4 0.4898 0.5540 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR1401909 3 0.5664 0.7431 0.156 0.000 0.720 0.124
#> SRR1440541 2 0.0336 0.7661 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1068832 3 0.2924 0.9186 0.016 0.000 0.884 0.100
#> SRR1376640 4 0.3764 0.7182 0.000 0.216 0.000 0.784
#> SRR1085712 2 0.0000 0.7673 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.3852 0.8893 0.808 0.000 0.012 0.180
#> SRR1084276 1 0.2859 0.9079 0.880 0.000 0.008 0.112
#> SRR1353262 2 0.2760 0.6909 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1437035 1 0.2149 0.9260 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1396877 1 0.2737 0.9122 0.888 0.000 0.008 0.104
#> SRR1443026 2 0.2530 0.7510 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1417936 1 0.0188 0.9455 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1436822 4 0.4967 0.4934 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR1101128 3 0.2048 0.9335 0.008 0.000 0.928 0.064
#> SRR1363886 2 0.0336 0.7661 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR612983 2 0.0000 0.7673 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394366 4 0.4086 0.7082 0.000 0.216 0.008 0.776
#> SRR1093218 3 0.2048 0.9350 0.008 0.000 0.928 0.064
#> SRR1077090 3 0.2611 0.9231 0.008 0.000 0.896 0.096
#> SRR1327430 2 0.4994 -0.4328 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1088958 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1486931 4 0.4564 0.6856 0.000 0.328 0.000 0.672
#> SRR1086820 1 0.1867 0.9439 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9456 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0469 0.7688 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR614335 2 0.1211 0.7486 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR660534 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR817094 2 0.0817 0.7683 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1334265 2 0.3172 0.5892 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1456401 2 0.4406 0.1921 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR1086393 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1351521 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1093100 2 0.5000 -0.4645 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR1309382 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1089375 1 0.2976 0.9025 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR1499482 4 0.4661 0.6679 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR614719 4 0.4454 0.6904 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR1081473 3 0.2048 0.9350 0.008 0.000 0.928 0.064
#> SRR1087415 1 0.2271 0.9417 0.916 0.000 0.008 0.076
#> SRR1088217 3 0.4057 0.8648 0.032 0.000 0.816 0.152
#> SRR808496 4 0.4985 0.5275 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1336463 4 0.4985 0.5364 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR612359 4 0.4304 0.7046 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR1444412 1 0.1489 0.9412 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1074116 3 0.0336 0.9420 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR821846 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR656095 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR808914 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1349099 1 0.3972 0.8798 0.788 0.000 0.008 0.204
#> SRR1337886 4 0.4817 0.6057 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR813632 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1101591 3 0.2342 0.9299 0.008 0.000 0.912 0.080
#> SRR1089713 1 0.7325 0.1550 0.472 0.000 0.368 0.160
#> SRR1453127 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1498354 3 0.3224 0.9052 0.016 0.000 0.864 0.120
#> SRR1313831 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1315434 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR814747 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1358539 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1367807 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1365791 3 0.2408 0.9210 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1081519 3 0.2675 0.9216 0.008 0.000 0.892 0.100
#> SRR614707 4 0.3450 0.6838 0.000 0.156 0.008 0.836
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9456 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.4152 0.8612 0.032 0.000 0.808 0.160
#> SRR1079502 3 0.2675 0.9245 0.008 0.000 0.892 0.100
#> SRR1457814 4 0.7241 0.4535 0.000 0.196 0.264 0.540
#> SRR1455127 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR615081 4 0.5296 0.3557 0.000 0.492 0.008 0.500
#> SRR1327855 3 0.1970 0.9344 0.008 0.000 0.932 0.060
#> SRR1417873 2 0.4817 -0.1796 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1394125 3 0.1635 0.9394 0.008 0.000 0.948 0.044
#> SRR1488388 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1401122 2 0.1211 0.7486 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR612383 4 0.4406 0.6950 0.000 0.300 0.000 0.700
#> SRR1477711 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1350813 4 0.4746 0.6264 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR612851 4 0.4454 0.6947 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR1086349 1 0.0188 0.9455 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR812837 2 0.0000 0.7673 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.2048 0.9222 0.008 0.000 0.928 0.064
#> SRR1475885 4 0.4567 0.2301 0.276 0.000 0.008 0.716
#> SRR1376334 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1399821 1 0.1635 0.9400 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1347042 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR612323 4 0.5532 0.6939 0.000 0.228 0.068 0.704
#> SRR612604 4 0.4985 0.1577 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1389546 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1311877 1 0.0188 0.9455 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1465608 1 0.3606 0.8945 0.840 0.000 0.020 0.140
#> SRR1101808 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1414079 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1331153 4 0.4697 0.5686 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR1078439 3 0.1545 0.9413 0.008 0.000 0.952 0.040
#> SRR2165527 2 0.0707 0.7624 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1351147 1 0.2198 0.9297 0.920 0.000 0.008 0.072
#> SRR1313536 2 0.3873 0.6757 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1070308 2 0.6280 0.3852 0.080 0.604 0.000 0.316
#> SRR1403110 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1400355 2 0.3801 0.6750 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1401317 3 0.2048 0.9339 0.008 0.000 0.928 0.064
#> SRR1456862 1 0.2976 0.9176 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR1074622 1 0.0469 0.9457 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1465847 3 0.2480 0.9269 0.008 0.000 0.904 0.088
#> SRR1443376 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1471312 3 0.0469 0.9389 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1075579 1 0.0921 0.9449 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1090881 4 0.4746 0.4728 0.008 0.000 0.304 0.688
#> SRR612251 2 0.4967 -0.3636 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR1418581 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR658045 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR613214 4 0.4382 0.6980 0.000 0.296 0.000 0.704
#> SRR613078 4 0.3837 0.7066 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1472998 3 0.2867 0.9193 0.012 0.000 0.884 0.104
#> SRR1433452 4 0.4564 0.6856 0.000 0.328 0.000 0.672
#> SRR1101957 1 0.0188 0.9455 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1487993 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1465983 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1380375 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1367566 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1316151 4 0.4722 0.6327 0.000 0.300 0.008 0.692
#> SRR1417547 2 0.0817 0.7611 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR659389 2 0.3266 0.7300 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1490270 4 0.4072 0.7086 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1398207 1 0.3392 0.8917 0.856 0.000 0.020 0.124
#> SRR1358755 3 0.3694 0.8928 0.032 0.000 0.844 0.124
#> SRR1078903 4 0.4661 0.6679 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR1323252 2 0.3219 0.7322 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1451796 2 0.3400 0.7221 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1369172 1 0.1637 0.9412 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR615982 4 0.4454 0.6887 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR1480431 2 0.4713 0.0634 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1429825 4 0.4776 0.5874 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1102393 2 0.3266 0.7300 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1071313 1 0.3300 0.9011 0.848 0.000 0.008 0.144
#> SRR808351 1 0.0000 0.9456 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0817 0.9445 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1480501 3 0.2342 0.9307 0.008 0.000 0.912 0.080
#> SRR1081910 1 0.5874 0.6938 0.700 0.000 0.176 0.124
#> SRR1086611 4 0.2596 0.6331 0.000 0.068 0.024 0.908
#> SRR1392571 4 0.4431 0.6914 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR1311441 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR808152 1 0.0188 0.9455 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR657313 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1433131 4 0.4830 0.4677 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1321011 2 0.0336 0.7684 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1500598 2 0.0336 0.7661 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1379343 2 0.4356 0.5405 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1389108 1 0.1302 0.9419 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1376228 3 0.0336 0.9420 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1399757 1 0.0336 0.9459 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1358060 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR1464517 3 0.2124 0.9358 0.008 0.000 0.924 0.068
#> SRR613557 4 0.5728 0.6728 0.000 0.188 0.104 0.708
#> SRR809831 1 0.1398 0.9419 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1429387 3 0.0672 0.9412 0.008 0.000 0.984 0.008
#> SRR816565 1 0.0000 0.9456 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0188 0.9455 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1406936 3 0.2546 0.9275 0.008 0.000 0.900 0.092
#> SRR1072031 2 0.3219 0.7322 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1374671 4 0.4477 0.6878 0.000 0.312 0.000 0.688
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 3 0.4445 0.6896 0.000 0.000 0.676 0.024 0.300
#> SRR1404105 1 0.0162 0.8402 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR2164936 2 0.3689 0.6234 0.000 0.740 0.000 0.256 0.004
#> SRR1472057 3 0.4135 0.7004 0.000 0.000 0.656 0.004 0.340
#> SRR614491 4 0.6316 0.4785 0.000 0.084 0.052 0.604 0.260
#> SRR1069376 1 0.0880 0.8394 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR811964 2 0.3715 0.6221 0.000 0.736 0.000 0.260 0.004
#> SRR1361415 2 0.2723 0.6511 0.000 0.864 0.000 0.012 0.124
#> SRR1345715 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR1328073 4 0.7707 0.1150 0.172 0.080 0.000 0.380 0.368
#> SRR1394209 5 0.7195 0.0357 0.032 0.196 0.000 0.336 0.436
#> SRR1474018 2 0.2563 0.6554 0.000 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR1099809 1 0.4353 0.6451 0.660 0.000 0.004 0.008 0.328
#> SRR1500555 4 0.4003 0.5483 0.000 0.036 0.004 0.780 0.180
#> SRR1354363 1 0.2249 0.8260 0.896 0.000 0.000 0.008 0.096
#> SRR1391619 3 0.0963 0.8188 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1307997 4 0.4789 0.5777 0.000 0.116 0.000 0.728 0.156
#> SRR663124 4 0.5752 0.5255 0.000 0.148 0.000 0.612 0.240
#> SRR1334670 1 0.1638 0.8340 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR612515 4 0.6327 0.4753 0.000 0.080 0.056 0.604 0.260
#> SRR1092727 4 0.5167 0.5274 0.000 0.240 0.000 0.668 0.092
#> SRR1364013 4 0.6084 0.4955 0.000 0.208 0.000 0.572 0.220
#> SRR1468553 3 0.0000 0.8264 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.1121 0.8271 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1420169 3 0.4288 0.6595 0.000 0.000 0.612 0.004 0.384
#> SRR1442800 4 0.3949 0.3232 0.000 0.004 0.000 0.696 0.300
#> SRR1359214 2 0.2563 0.6554 0.000 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR1499849 1 0.4457 0.6385 0.656 0.000 0.012 0.004 0.328
#> SRR1500030 3 0.1121 0.8172 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1093053 3 0.6009 0.3552 0.000 0.000 0.580 0.180 0.240
#> SRR1399843 3 0.3790 0.7581 0.000 0.000 0.724 0.004 0.272
#> SRR1380231 3 0.4327 0.6608 0.000 0.000 0.632 0.008 0.360
#> SRR809470 3 0.4757 0.6174 0.012 0.000 0.628 0.012 0.348
#> SRR614239 4 0.5904 0.5120 0.000 0.116 0.012 0.616 0.256
#> SRR613939 4 0.3058 0.5514 0.000 0.044 0.000 0.860 0.096
#> SRR612971 2 0.0290 0.6782 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1490204 4 0.4965 0.4248 0.000 0.304 0.000 0.644 0.052
#> SRR811357 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1471672 1 0.2136 0.8272 0.904 0.000 0.000 0.008 0.088
#> SRR613006 4 0.3595 0.5598 0.000 0.140 0.000 0.816 0.044
#> SRR1469570 2 0.3715 0.6221 0.000 0.736 0.000 0.260 0.004
#> SRR1457354 2 0.2408 0.6647 0.000 0.892 0.000 0.016 0.092
#> SRR1362906 3 0.1430 0.8162 0.000 0.000 0.944 0.004 0.052
#> SRR1079023 1 0.0609 0.8406 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR813608 2 0.3715 0.6221 0.000 0.736 0.000 0.260 0.004
#> SRR1096736 5 0.5743 -0.0222 0.412 0.032 0.000 0.032 0.524
#> SRR1478700 1 0.4511 0.6266 0.628 0.000 0.000 0.016 0.356
#> SRR1081543 3 0.3602 0.7159 0.000 0.000 0.796 0.024 0.180
#> SRR1384754 5 0.6600 -0.0689 0.404 0.000 0.180 0.004 0.412
#> SRR612287 2 0.2068 0.6655 0.000 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR1380317 4 0.6759 0.0956 0.000 0.220 0.004 0.416 0.360
#> SRR1315247 4 0.3236 0.4999 0.000 0.020 0.000 0.828 0.152
#> SRR1105344 2 0.5515 0.3818 0.000 0.628 0.000 0.260 0.112
#> SRR658549 4 0.5295 0.5486 0.000 0.112 0.000 0.664 0.224
#> SRR1480240 1 0.1956 0.8297 0.916 0.000 0.000 0.008 0.076
#> SRR1084816 2 0.3715 0.6221 0.000 0.736 0.000 0.260 0.004
#> SRR612551 2 0.2068 0.6708 0.000 0.904 0.000 0.092 0.004
#> SRR1358520 2 0.6678 -0.1858 0.000 0.432 0.000 0.312 0.256
#> SRR1419476 3 0.0703 0.8262 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1456075 3 0.4620 0.6567 0.012 0.000 0.612 0.004 0.372
#> SRR1389474 2 0.3715 0.6221 0.000 0.736 0.000 0.260 0.004
#> SRR1367005 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR1334419 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR1417154 3 0.0162 0.8267 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1095985 5 0.6519 -0.1412 0.008 0.000 0.304 0.176 0.512
#> SRR1325771 1 0.0703 0.8406 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1360420 3 0.0000 0.8264 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660272 4 0.3667 0.5563 0.000 0.140 0.000 0.812 0.048
#> SRR1332993 1 0.0404 0.8402 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1311833 2 0.3790 0.6098 0.000 0.724 0.000 0.272 0.004
#> SRR808044 1 0.4555 0.6406 0.636 0.000 0.000 0.020 0.344
#> SRR1076916 3 0.2674 0.8017 0.000 0.000 0.856 0.004 0.140
#> SRR1356266 1 0.2574 0.8418 0.876 0.000 0.000 0.012 0.112
#> SRR1341983 4 0.4848 0.2162 0.000 0.420 0.000 0.556 0.024
#> SRR1456114 1 0.2920 0.8132 0.852 0.000 0.000 0.016 0.132
#> SRR1072948 3 0.0162 0.8269 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1472370 3 0.3790 0.7357 0.000 0.000 0.724 0.004 0.272
#> SRR1480176 1 0.1410 0.8370 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR613843 4 0.4420 -0.1244 0.000 0.448 0.000 0.548 0.004
#> SRR1469192 1 0.0162 0.8402 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1404555 3 0.1331 0.8097 0.000 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR659839 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR659533 2 0.3766 0.6147 0.000 0.728 0.000 0.268 0.004
#> SRR1362848 5 0.8076 0.1564 0.032 0.144 0.084 0.260 0.480
#> SRR1407492 4 0.6217 0.4914 0.000 0.088 0.044 0.612 0.256
#> SRR1455082 4 0.4879 0.5718 0.000 0.108 0.000 0.716 0.176
#> SRR658362 4 0.6810 0.1666 0.000 0.348 0.000 0.352 0.300
#> SRR810921 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR662823 2 0.2563 0.6554 0.000 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR1456375 3 0.1965 0.8133 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR818232 1 0.3264 0.7859 0.820 0.000 0.000 0.016 0.164
#> SRR1454868 4 0.7034 -0.0593 0.000 0.008 0.292 0.368 0.332
#> SRR1474816 2 0.3741 0.6201 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1342002 1 0.0290 0.8409 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1088437 2 0.2563 0.6554 0.000 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR1466400 4 0.3531 0.5173 0.000 0.036 0.000 0.816 0.148
#> SRR658921 4 0.5198 0.4830 0.000 0.164 0.000 0.688 0.148
#> SRR1499873 2 0.3715 0.6221 0.000 0.736 0.000 0.260 0.004
#> SRR1101373 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR1090145 1 0.3779 0.7560 0.776 0.000 0.000 0.024 0.200
#> SRR1379324 1 0.3449 0.7990 0.812 0.000 0.000 0.024 0.164
#> SRR1345307 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1396166 3 0.0000 0.8264 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0162 0.8267 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1454891 4 0.5752 0.5255 0.000 0.148 0.000 0.612 0.240
#> SRR663185 2 0.2818 0.6465 0.000 0.856 0.000 0.012 0.132
#> SRR811819 1 0.1571 0.8349 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR1318920 1 0.4817 0.7269 0.656 0.000 0.000 0.044 0.300
#> SRR656758 2 0.4047 0.5414 0.000 0.676 0.000 0.320 0.004
#> SRR1474351 1 0.0703 0.8406 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR660450 4 0.3648 0.5490 0.000 0.092 0.000 0.824 0.084
#> SRR1472687 2 0.2189 0.6695 0.000 0.904 0.000 0.012 0.084
#> SRR1334291 4 0.4852 0.5777 0.000 0.184 0.000 0.716 0.100
#> SRR1415153 2 0.3928 0.5763 0.000 0.700 0.000 0.296 0.004
#> SRR1323271 2 0.2920 0.6445 0.000 0.852 0.000 0.016 0.132
#> SRR1368939 4 0.5234 -0.1346 0.000 0.460 0.000 0.496 0.044
#> SRR1443161 5 0.6835 0.1251 0.000 0.004 0.276 0.292 0.428
#> SRR614695 4 0.3214 0.5346 0.000 0.036 0.000 0.844 0.120
#> SRR1092372 1 0.4854 0.7206 0.648 0.000 0.000 0.044 0.308
#> SRR1474577 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR1406582 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR612779 4 0.4717 0.2022 0.000 0.396 0.000 0.584 0.020
#> SRR1089006 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR1354071 1 0.4403 0.5681 0.608 0.000 0.000 0.008 0.384
#> SRR1105463 1 0.6279 0.4278 0.520 0.000 0.116 0.012 0.352
#> SRR811005 2 0.3715 0.6221 0.000 0.736 0.000 0.260 0.004
#> SRR1385319 1 0.3675 0.7705 0.788 0.000 0.000 0.024 0.188
#> SRR1325871 3 0.2233 0.7731 0.000 0.000 0.892 0.004 0.104
#> SRR1355415 3 0.7149 0.1126 0.256 0.000 0.372 0.016 0.356
#> SRR1090861 1 0.0703 0.8406 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1320712 5 0.6937 -0.0110 0.000 0.268 0.008 0.300 0.424
#> SRR1470075 1 0.2660 0.8177 0.864 0.000 0.000 0.008 0.128
#> SRR1091254 1 0.1571 0.8349 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR1101397 1 0.4425 0.5823 0.600 0.000 0.008 0.000 0.392
#> SRR1321165 1 0.5220 0.5690 0.516 0.000 0.000 0.044 0.440
#> SRR1092112 3 0.3430 0.7575 0.000 0.000 0.776 0.004 0.220
#> SRR1417588 3 0.0000 0.8264 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.5814 0.5268 0.084 0.644 0.000 0.244 0.028
#> SRR1432106 2 0.2563 0.6554 0.000 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR655756 2 0.3766 0.6147 0.000 0.728 0.000 0.268 0.004
#> SRR1458314 1 0.3727 0.7700 0.768 0.000 0.000 0.016 0.216
#> SRR1318582 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1080484 2 0.2818 0.6465 0.000 0.856 0.000 0.012 0.132
#> SRR1072749 1 0.0880 0.8425 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1078586 1 0.1197 0.8379 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1400333 4 0.4141 0.4620 0.000 0.028 0.000 0.736 0.236
#> SRR1078834 4 0.3283 0.5239 0.000 0.028 0.000 0.832 0.140
#> SRR1417611 2 0.2818 0.6465 0.000 0.856 0.000 0.012 0.132
#> SRR1396840 1 0.5238 0.5134 0.480 0.000 0.000 0.044 0.476
#> SRR1465440 2 0.0290 0.6782 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1400530 2 0.3180 0.6462 0.000 0.856 0.000 0.068 0.076
#> SRR614984 4 0.6146 0.4960 0.000 0.084 0.044 0.620 0.252
#> SRR1324269 1 0.2011 0.8326 0.908 0.000 0.000 0.004 0.088
#> SRR1401491 2 0.5359 0.3936 0.000 0.644 0.000 0.256 0.100
#> SRR1319443 1 0.3055 0.8057 0.840 0.000 0.000 0.016 0.144
#> SRR1324349 2 0.5442 0.3422 0.000 0.644 0.000 0.240 0.116
#> SRR1345523 2 0.2286 0.6684 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1500846 1 0.2304 0.8255 0.892 0.000 0.000 0.008 0.100
#> SRR661505 3 0.2813 0.7904 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1419062 3 0.3452 0.7631 0.000 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1480131 1 0.4108 0.6768 0.684 0.000 0.000 0.008 0.308
#> SRR1421284 2 0.6771 -0.2318 0.000 0.396 0.000 0.312 0.292
#> SRR1329624 1 0.1357 0.8376 0.948 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR1315739 3 0.0000 0.8264 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 4 0.6255 0.4716 0.000 0.208 0.000 0.540 0.252
#> SRR1083286 1 0.2929 0.8078 0.840 0.000 0.000 0.008 0.152
#> SRR1091890 3 0.2890 0.7467 0.000 0.000 0.836 0.004 0.160
#> SRR1347436 4 0.5258 0.5397 0.000 0.104 0.000 0.664 0.232
#> SRR1327473 1 0.3250 0.7143 0.820 0.008 0.000 0.004 0.168
#> SRR1338195 3 0.0162 0.8254 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR809698 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1457792 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR658271 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1339597 1 0.4465 0.6848 0.672 0.000 0.000 0.024 0.304
#> SRR1454842 3 0.1043 0.8175 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1322643 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR614887 3 0.0290 0.8244 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1354620 3 0.4633 0.6251 0.016 0.000 0.632 0.004 0.348
#> SRR615056 2 0.2723 0.6511 0.000 0.864 0.000 0.012 0.124
#> SRR1105320 1 0.4812 0.5007 0.600 0.000 0.000 0.028 0.372
#> SRR1391529 1 0.1956 0.8297 0.916 0.000 0.000 0.008 0.076
#> SRR663052 2 0.5856 0.3144 0.000 0.604 0.000 0.172 0.224
#> SRR1478834 1 0.2017 0.8294 0.912 0.000 0.000 0.008 0.080
#> SRR812366 2 0.5594 0.3912 0.000 0.608 0.000 0.284 0.108
#> SRR1435330 3 0.0162 0.8254 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR615383 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1389157 4 0.6195 0.4444 0.000 0.044 0.088 0.616 0.252
#> SRR613568 4 0.3622 0.5579 0.000 0.136 0.000 0.816 0.048
#> SRR614095 2 0.2723 0.6511 0.000 0.864 0.000 0.012 0.124
#> SRR1103092 1 0.2358 0.8247 0.888 0.000 0.000 0.008 0.104
#> SRR1337155 4 0.6000 -0.0585 0.000 0.000 0.112 0.460 0.428
#> SRR1475345 2 0.0992 0.6772 0.000 0.968 0.000 0.008 0.024
#> SRR809089 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1446180 4 0.3967 0.3469 0.000 0.000 0.012 0.724 0.264
#> SRR1406372 2 0.5339 0.4371 0.000 0.660 0.000 0.224 0.116
#> SRR1339880 3 0.1952 0.8058 0.000 0.000 0.912 0.004 0.084
#> SRR1353136 3 0.6788 -0.0592 0.000 0.004 0.420 0.232 0.344
#> SRR1093906 3 0.0000 0.8264 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.2286 0.6684 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1351104 1 0.2136 0.8272 0.904 0.000 0.000 0.008 0.088
#> SRR1363926 2 0.5361 0.3731 0.000 0.668 0.000 0.188 0.144
#> SRR1399861 5 0.7388 -0.0130 0.000 0.228 0.036 0.332 0.404
#> SRR1338789 1 0.4506 0.7037 0.676 0.000 0.000 0.028 0.296
#> SRR1421420 3 0.2286 0.8094 0.000 0.000 0.888 0.004 0.108
#> SRR1420832 2 0.2563 0.6554 0.000 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR1476231 1 0.0000 0.8404 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 4 0.5877 0.3315 0.000 0.000 0.160 0.596 0.244
#> SRR1315041 2 0.4807 0.4999 0.000 0.728 0.000 0.140 0.132
#> SRR661877 2 0.2513 0.6569 0.000 0.876 0.000 0.008 0.116
#> SRR1443268 1 0.4902 0.5287 0.564 0.000 0.028 0.000 0.408
#> SRR1416617 3 0.1965 0.8163 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1102443 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR655672 4 0.5589 0.5247 0.000 0.128 0.000 0.628 0.244
#> SRR1420006 3 0.0162 0.8267 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1458267 4 0.5205 0.5523 0.000 0.224 0.000 0.672 0.104
#> SRR613819 2 0.6678 -0.1858 0.000 0.432 0.000 0.312 0.256
#> SRR1469432 2 0.2068 0.6655 0.000 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR660907 2 0.2068 0.6655 0.000 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR1465092 4 0.5076 0.5647 0.000 0.200 0.000 0.692 0.108
#> SRR1470727 1 0.1270 0.8402 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1339153 3 0.0404 0.8233 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1472749 3 0.0000 0.8264 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414379 4 0.6756 0.0985 0.000 0.368 0.000 0.368 0.264
#> SRR1431326 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR1487278 4 0.5211 0.4344 0.000 0.212 0.000 0.676 0.112
#> SRR1098312 3 0.3756 0.7250 0.000 0.000 0.744 0.008 0.248
#> SRR810273 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1376000 4 0.2471 0.5776 0.000 0.136 0.000 0.864 0.000
#> SRR614467 2 0.6673 -0.1526 0.000 0.440 0.000 0.284 0.276
#> SRR811471 1 0.2677 0.8350 0.872 0.000 0.000 0.016 0.112
#> SRR1478341 3 0.0000 0.8264 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088606 5 0.6327 0.1109 0.000 0.000 0.184 0.308 0.508
#> SRR1479699 3 0.4161 0.6960 0.000 0.000 0.704 0.016 0.280
#> SRR1403589 2 0.3715 0.6221 0.000 0.736 0.000 0.260 0.004
#> SRR812625 4 0.3169 0.5746 0.000 0.084 0.000 0.856 0.060
#> SRR1359803 1 0.3278 0.7985 0.824 0.000 0.000 0.020 0.156
#> SRR1338988 2 0.0898 0.6773 0.000 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR1471222 4 0.5570 0.3830 0.000 0.288 0.000 0.608 0.104
#> SRR1378992 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR659427 5 0.7446 0.1428 0.024 0.152 0.036 0.284 0.504
#> SRR1096638 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR1466619 4 0.5850 0.3034 0.000 0.316 0.000 0.564 0.120
#> SRR659307 4 0.6403 0.2082 0.000 0.000 0.232 0.512 0.256
#> SRR1439994 1 0.5345 0.4782 0.540 0.000 0.056 0.000 0.404
#> SRR1454931 1 0.4733 0.6199 0.624 0.000 0.000 0.028 0.348
#> SRR1332928 5 0.6517 -0.0728 0.360 0.000 0.172 0.004 0.464
#> SRR658621 2 0.2723 0.6511 0.000 0.864 0.000 0.012 0.124
#> SRR1095840 1 0.1638 0.8340 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1458243 1 0.4654 0.6363 0.628 0.000 0.000 0.024 0.348
#> SRR1374270 5 0.6762 -0.0682 0.000 0.268 0.000 0.356 0.376
#> SRR1470947 2 0.1908 0.6665 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1365598 4 0.3521 0.5201 0.000 0.040 0.000 0.820 0.140
#> SRR662787 2 0.2723 0.6511 0.000 0.864 0.000 0.012 0.124
#> SRR1408727 5 0.6822 -0.1361 0.000 0.316 0.000 0.340 0.344
#> SRR1456274 5 0.5414 -0.2324 0.412 0.000 0.000 0.060 0.528
#> SRR817744 1 0.0609 0.8406 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1478744 2 0.1908 0.6665 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1387379 2 0.2763 0.6583 0.000 0.848 0.000 0.148 0.004
#> SRR1102680 3 0.3928 0.7334 0.000 0.000 0.700 0.004 0.296
#> SRR1374198 1 0.4666 0.7454 0.676 0.000 0.000 0.040 0.284
#> SRR1445856 1 0.5676 0.5573 0.520 0.000 0.036 0.024 0.420
#> SRR820049 3 0.4541 0.5840 0.000 0.000 0.752 0.112 0.136
#> SRR1375290 3 0.6703 -0.0699 0.000 0.000 0.428 0.296 0.276
#> SRR818999 1 0.4608 0.6301 0.644 0.000 0.008 0.012 0.336
#> SRR1390242 1 0.1638 0.8340 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1401164 4 0.5213 0.0341 0.000 0.396 0.000 0.556 0.048
#> SRR1454629 1 0.5100 0.4560 0.516 0.000 0.000 0.036 0.448
#> SRR1332187 3 0.0404 0.8269 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR603365 3 0.0162 0.8267 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR657833 4 0.3037 0.5739 0.000 0.100 0.000 0.860 0.040
#> SRR1436207 4 0.4950 0.3371 0.000 0.348 0.000 0.612 0.040
#> SRR1488017 1 0.0162 0.8406 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR612947 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1480384 1 0.0290 0.8409 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1364761 2 0.3928 0.5847 0.000 0.700 0.000 0.296 0.004
#> SRR1308086 3 0.3421 0.7327 0.000 0.000 0.788 0.008 0.204
#> SRR1441868 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR1485380 3 0.1732 0.8173 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1073705 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR615032 2 0.0290 0.6782 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1452356 2 0.2723 0.6511 0.000 0.864 0.000 0.012 0.124
#> SRR1442983 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1100346 4 0.4734 0.5348 0.000 0.064 0.000 0.704 0.232
#> SRR1332816 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR612299 4 0.3413 0.5359 0.000 0.044 0.000 0.832 0.124
#> SRR1407386 1 0.1430 0.8368 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR1418064 2 0.3969 0.5710 0.000 0.692 0.000 0.304 0.004
#> SRR1309403 1 0.4950 0.5149 0.612 0.000 0.000 0.040 0.348
#> SRR1498395 2 0.4390 0.3425 0.000 0.568 0.000 0.428 0.004
#> SRR1079998 3 0.5740 0.5642 0.128 0.000 0.600 0.000 0.272
#> SRR1498885 2 0.2818 0.6465 0.000 0.856 0.000 0.012 0.132
#> SRR1337215 4 0.3803 0.5267 0.000 0.056 0.000 0.804 0.140
#> SRR1414749 3 0.0290 0.8271 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1365963 3 0.3932 0.7058 0.000 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR1368030 2 0.6575 -0.1340 0.000 0.464 0.000 0.300 0.236
#> SRR1419760 4 0.5711 0.3770 0.044 0.032 0.000 0.600 0.324
#> SRR1381841 1 0.4846 0.5712 0.588 0.000 0.000 0.028 0.384
#> SRR821388 4 0.7113 0.0945 0.000 0.036 0.160 0.420 0.384
#> SRR657623 2 0.2818 0.6465 0.000 0.856 0.000 0.012 0.132
#> SRR1094241 3 0.0290 0.8244 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR819583 3 0.3039 0.7794 0.000 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1096149 1 0.2136 0.8272 0.904 0.000 0.000 0.008 0.088
#> SRR1342829 3 0.0000 0.8264 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0955 0.8421 0.968 0.000 0.000 0.004 0.028
#> SRR811333 3 0.4608 0.6379 0.012 0.000 0.644 0.008 0.336
#> SRR1311666 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1486698 4 0.2351 0.5832 0.000 0.088 0.000 0.896 0.016
#> SRR1446436 4 0.2654 0.5888 0.000 0.084 0.000 0.884 0.032
#> SRR815092 1 0.1638 0.8340 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1500149 4 0.5068 0.1546 0.000 0.364 0.000 0.592 0.044
#> SRR1100564 1 0.2136 0.8287 0.904 0.000 0.000 0.008 0.088
#> SRR1403072 3 0.0290 0.8269 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR811653 5 0.7434 0.0867 0.000 0.044 0.220 0.308 0.428
#> SRR1311348 2 0.3715 0.6221 0.000 0.736 0.000 0.260 0.004
#> SRR1489438 2 0.2563 0.6554 0.000 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR1435442 4 0.4064 0.5304 0.000 0.092 0.000 0.792 0.116
#> SRR1421444 3 0.0162 0.8254 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1344010 2 0.0290 0.6782 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1319520 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR1444763 1 0.4430 0.7442 0.708 0.000 0.000 0.036 0.256
#> SRR1415026 2 0.0609 0.6766 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1416596 2 0.5849 0.0659 0.000 0.508 0.000 0.392 0.100
#> SRR1485499 2 0.2068 0.6655 0.000 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR1316078 2 0.0898 0.6773 0.000 0.972 0.000 0.008 0.020
#> SRR663465 2 0.2818 0.6465 0.000 0.856 0.000 0.012 0.132
#> SRR1310094 2 0.4025 0.5813 0.000 0.792 0.000 0.076 0.132
#> SRR663537 2 0.3715 0.6221 0.000 0.736 0.000 0.260 0.004
#> SRR1486780 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR1453950 1 0.0162 0.8402 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1087875 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR613318 4 0.7630 0.1306 0.000 0.208 0.060 0.400 0.332
#> SRR1332694 1 0.1571 0.8349 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR1468469 3 0.0510 0.8268 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR818670 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1120318 1 0.2017 0.8294 0.912 0.000 0.000 0.008 0.080
#> SRR1311622 3 0.3741 0.7529 0.000 0.000 0.732 0.004 0.264
#> SRR1500931 3 0.3109 0.7752 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1387494 3 0.2605 0.7864 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1379175 5 0.6619 -0.0260 0.000 0.220 0.000 0.360 0.420
#> SRR1401909 3 0.6517 0.3840 0.132 0.000 0.496 0.016 0.356
#> SRR1440541 2 0.0912 0.6794 0.000 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR1068832 3 0.3884 0.7219 0.004 0.000 0.708 0.000 0.288
#> SRR1376640 4 0.2645 0.5684 0.000 0.044 0.000 0.888 0.068
#> SRR1085712 2 0.0671 0.6781 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1082283 1 0.5109 0.5572 0.504 0.000 0.000 0.036 0.460
#> SRR1084276 1 0.4165 0.6617 0.672 0.000 0.000 0.008 0.320
#> SRR1353262 2 0.5835 0.3437 0.000 0.568 0.000 0.312 0.120
#> SRR1437035 1 0.4088 0.6652 0.688 0.000 0.000 0.008 0.304
#> SRR1396877 1 0.3934 0.7032 0.716 0.000 0.000 0.008 0.276
#> SRR1443026 2 0.3491 0.6349 0.000 0.768 0.000 0.228 0.004
#> SRR1417936 1 0.0000 0.8404 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 4 0.6156 0.1577 0.000 0.412 0.000 0.456 0.132
#> SRR1101128 3 0.1608 0.8191 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1363886 2 0.2068 0.6655 0.000 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR612983 2 0.0510 0.6785 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1394366 4 0.3262 0.5332 0.000 0.036 0.000 0.840 0.124
#> SRR1093218 3 0.3579 0.7671 0.000 0.000 0.756 0.004 0.240
#> SRR1077090 3 0.3612 0.7283 0.000 0.000 0.732 0.000 0.268
#> SRR1327430 2 0.6800 -0.2687 0.000 0.376 0.000 0.320 0.304
#> SRR1088958 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR1486931 4 0.4818 0.5789 0.000 0.180 0.000 0.720 0.100
#> SRR1086820 1 0.3370 0.8179 0.824 0.000 0.000 0.028 0.148
#> SRR1383000 1 0.0510 0.8411 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1355705 2 0.2233 0.6691 0.000 0.892 0.000 0.104 0.004
#> SRR614335 2 0.2818 0.6465 0.000 0.856 0.000 0.012 0.132
#> SRR660534 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR817094 2 0.2389 0.6670 0.000 0.880 0.000 0.116 0.004
#> SRR1334265 2 0.4247 0.5598 0.000 0.776 0.000 0.092 0.132
#> SRR1456401 2 0.5002 0.4519 0.000 0.708 0.000 0.160 0.132
#> SRR1086393 1 0.2249 0.8352 0.896 0.000 0.000 0.008 0.096
#> SRR1351521 3 0.0000 0.8264 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093100 5 0.6946 -0.0545 0.000 0.320 0.004 0.312 0.364
#> SRR1309382 1 0.2193 0.8269 0.900 0.000 0.000 0.008 0.092
#> SRR1089375 1 0.4225 0.5959 0.632 0.000 0.000 0.004 0.364
#> SRR1499482 4 0.5141 0.5321 0.000 0.236 0.000 0.672 0.092
#> SRR614719 4 0.5580 0.5296 0.000 0.132 0.000 0.632 0.236
#> SRR1081473 3 0.3838 0.7436 0.000 0.000 0.716 0.004 0.280
#> SRR1087415 1 0.3454 0.8143 0.816 0.000 0.000 0.028 0.156
#> SRR1088217 3 0.5496 0.5053 0.032 0.000 0.548 0.020 0.400
#> SRR808496 4 0.6772 0.1425 0.000 0.280 0.000 0.388 0.332
#> SRR1336463 4 0.5109 0.2914 0.000 0.460 0.000 0.504 0.036
#> SRR612359 4 0.5506 0.5284 0.000 0.108 0.004 0.648 0.240
#> SRR1444412 1 0.2971 0.8039 0.836 0.000 0.000 0.008 0.156
#> SRR1074116 3 0.0290 0.8269 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR821846 3 0.0162 0.8254 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR656095 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR808914 1 0.1956 0.8297 0.916 0.000 0.000 0.008 0.076
#> SRR1349099 5 0.5185 -0.3592 0.384 0.000 0.000 0.048 0.568
#> SRR1337886 4 0.4040 0.4568 0.000 0.276 0.000 0.712 0.012
#> SRR813632 1 0.1270 0.8384 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1101591 3 0.3109 0.7759 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1089713 5 0.6863 0.0307 0.304 0.000 0.188 0.020 0.488
#> SRR1453127 3 0.0000 0.8264 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 3 0.4218 0.6568 0.000 0.000 0.660 0.008 0.332
#> SRR1313831 1 0.1956 0.8297 0.916 0.000 0.000 0.008 0.076
#> SRR1315434 3 0.0794 0.8240 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR814747 2 0.2818 0.6465 0.000 0.856 0.000 0.012 0.132
#> SRR1358539 1 0.1638 0.8340 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1367807 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR1365791 3 0.4219 0.7216 0.000 0.000 0.716 0.024 0.260
#> SRR1081519 3 0.3980 0.7086 0.000 0.000 0.708 0.008 0.284
#> SRR614707 4 0.3183 0.4916 0.000 0.016 0.000 0.828 0.156
#> SRR1094027 1 0.0290 0.8408 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1489092 5 0.5631 -0.4125 0.024 0.000 0.440 0.032 0.504
#> SRR1079502 3 0.4225 0.6829 0.000 0.000 0.632 0.004 0.364
#> SRR1457814 5 0.7774 0.0704 0.000 0.152 0.104 0.324 0.420
#> SRR1455127 2 0.2563 0.6554 0.000 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR615081 4 0.6254 0.2247 0.000 0.340 0.000 0.500 0.160
#> SRR1327855 3 0.1544 0.8203 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1417873 2 0.5831 0.2238 0.000 0.604 0.000 0.236 0.160
#> SRR1394125 3 0.2813 0.8016 0.000 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1488388 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR1401122 2 0.2818 0.6465 0.000 0.856 0.000 0.012 0.132
#> SRR612383 4 0.5689 0.5234 0.000 0.136 0.000 0.616 0.248
#> SRR1477711 1 0.1571 0.8349 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR1350813 4 0.5137 0.5605 0.000 0.208 0.000 0.684 0.108
#> SRR612851 4 0.4832 0.5679 0.000 0.104 0.000 0.720 0.176
#> SRR1086349 1 0.0000 0.8404 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0290 0.6782 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1340010 3 0.6214 0.2110 0.000 0.008 0.492 0.112 0.388
#> SRR1475885 5 0.5847 0.0963 0.096 0.000 0.000 0.424 0.480
#> SRR1376334 1 0.1956 0.8297 0.916 0.000 0.000 0.008 0.076
#> SRR1399821 1 0.2669 0.8219 0.876 0.000 0.000 0.020 0.104
#> SRR1347042 3 0.0000 0.8264 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612323 4 0.6316 0.4785 0.000 0.084 0.052 0.604 0.260
#> SRR612604 4 0.5644 0.2182 0.000 0.328 0.000 0.576 0.096
#> SRR1389546 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1311877 1 0.0162 0.8402 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1465608 1 0.4490 0.5686 0.588 0.000 0.004 0.004 0.404
#> SRR1101808 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1414079 3 0.0162 0.8254 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1331153 4 0.4398 0.4204 0.000 0.240 0.000 0.720 0.040
#> SRR1078439 3 0.3291 0.7980 0.000 0.000 0.840 0.040 0.120
#> SRR2165527 2 0.2513 0.6569 0.000 0.876 0.000 0.008 0.116
#> SRR1351147 1 0.4254 0.7258 0.740 0.000 0.000 0.040 0.220
#> SRR1313536 2 0.5016 0.4453 0.000 0.608 0.000 0.348 0.044
#> SRR1070308 2 0.7936 0.1249 0.120 0.440 0.000 0.252 0.188
#> SRR1403110 1 0.1956 0.8297 0.916 0.000 0.000 0.008 0.076
#> SRR1400355 2 0.4084 0.5349 0.000 0.668 0.000 0.328 0.004
#> SRR1401317 3 0.2074 0.8150 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1456862 1 0.4655 0.6633 0.644 0.000 0.000 0.028 0.328
#> SRR1074622 1 0.0794 0.8399 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1465847 3 0.3305 0.7615 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1443376 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1471312 3 0.0290 0.8266 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1075579 1 0.1357 0.8376 0.948 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR1090881 4 0.6507 0.1501 0.000 0.000 0.244 0.488 0.268
#> SRR612251 2 0.6670 -0.1771 0.000 0.436 0.000 0.308 0.256
#> SRR1418581 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR658045 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR613214 4 0.5403 0.5262 0.000 0.108 0.000 0.644 0.248
#> SRR613078 4 0.3586 0.5454 0.000 0.076 0.000 0.828 0.096
#> SRR1472998 3 0.3895 0.7123 0.000 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1433452 4 0.4371 0.3224 0.000 0.344 0.000 0.644 0.012
#> SRR1101957 1 0.0162 0.8402 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1487993 3 0.1270 0.8156 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1465983 2 0.3741 0.6193 0.000 0.732 0.000 0.264 0.004
#> SRR1380375 1 0.1571 0.8349 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR1367566 3 0.0000 0.8264 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316151 4 0.5182 0.4031 0.000 0.112 0.000 0.680 0.208
#> SRR1417547 2 0.2818 0.6465 0.000 0.856 0.000 0.012 0.132
#> SRR659389 2 0.3662 0.6252 0.000 0.744 0.000 0.252 0.004
#> SRR1490270 4 0.3565 0.5597 0.000 0.144 0.000 0.816 0.040
#> SRR1398207 1 0.5133 0.5990 0.620 0.000 0.032 0.012 0.336
#> SRR1358755 3 0.5137 0.5985 0.044 0.000 0.612 0.004 0.340
#> SRR1078903 4 0.5240 0.5233 0.000 0.244 0.000 0.660 0.096
#> SRR1323252 2 0.3715 0.6221 0.000 0.736 0.000 0.260 0.004
#> SRR1451796 2 0.3790 0.6110 0.000 0.724 0.000 0.272 0.004
#> SRR1369172 1 0.3687 0.7916 0.792 0.000 0.000 0.028 0.180
#> SRR615982 4 0.5716 0.5284 0.000 0.144 0.000 0.616 0.240
#> SRR1480431 2 0.6096 0.2285 0.000 0.536 0.000 0.316 0.148
#> SRR1429825 4 0.5447 0.3187 0.000 0.248 0.000 0.640 0.112
#> SRR1102393 2 0.3715 0.6221 0.000 0.736 0.000 0.260 0.004
#> SRR1071313 1 0.4420 0.4986 0.548 0.000 0.000 0.004 0.448
#> SRR808351 1 0.0162 0.8402 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1317513 1 0.1571 0.8349 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR1480501 3 0.3715 0.7593 0.000 0.000 0.736 0.004 0.260
#> SRR1081910 1 0.6392 0.4346 0.524 0.000 0.136 0.012 0.328
#> SRR1086611 4 0.3585 0.4359 0.000 0.004 0.004 0.772 0.220
#> SRR1392571 4 0.5373 0.5359 0.000 0.112 0.000 0.652 0.236
#> SRR1311441 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR808152 1 0.0162 0.8402 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR657313 3 0.0404 0.8233 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1433131 4 0.4712 0.3540 0.000 0.268 0.000 0.684 0.048
#> SRR1321011 2 0.2124 0.6706 0.000 0.900 0.000 0.096 0.004
#> SRR1500598 2 0.2068 0.6655 0.000 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR1379343 2 0.4415 0.3105 0.000 0.552 0.000 0.444 0.004
#> SRR1389108 1 0.2077 0.8284 0.908 0.000 0.000 0.008 0.084
#> SRR1376228 3 0.0290 0.8271 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1399757 1 0.0963 0.8396 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1358060 3 0.0162 0.8269 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1464517 3 0.3741 0.7529 0.000 0.000 0.732 0.004 0.264
#> SRR613557 4 0.6342 0.4617 0.000 0.060 0.080 0.608 0.252
#> SRR809831 1 0.2971 0.8014 0.836 0.000 0.000 0.008 0.156
#> SRR1429387 3 0.0000 0.8264 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0162 0.8406 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071644 1 0.0000 0.8404 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.4084 0.7147 0.000 0.000 0.668 0.004 0.328
#> SRR1072031 2 0.3715 0.6221 0.000 0.736 0.000 0.260 0.004
#> SRR1374671 4 0.5740 0.5237 0.000 0.144 0.000 0.612 0.244
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 3 0.6484 0.30498 0.000 0.000 0.456 0.224 0.288 0.032
#> SRR1404105 1 0.1829 0.73070 0.920 0.000 0.000 0.004 0.064 0.012
#> SRR2164936 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1472057 5 0.4967 -0.10303 0.000 0.000 0.420 0.032 0.528 0.020
#> SRR614491 4 0.4719 0.61988 0.000 0.072 0.028 0.712 0.000 0.188
#> SRR1069376 1 0.2680 0.71639 0.856 0.000 0.000 0.004 0.124 0.016
#> SRR811964 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1361415 2 0.5519 0.54414 0.000 0.592 0.000 0.228 0.172 0.008
#> SRR1345715 1 0.4594 0.64952 0.696 0.000 0.000 0.020 0.232 0.052
#> SRR1328073 4 0.6588 0.48221 0.124 0.068 0.000 0.620 0.108 0.080
#> SRR1394209 4 0.3042 0.51104 0.000 0.032 0.000 0.836 0.128 0.004
#> SRR1474018 2 0.5519 0.54414 0.000 0.592 0.000 0.228 0.172 0.008
#> SRR1099809 1 0.4289 -0.02811 0.540 0.000 0.004 0.000 0.444 0.012
#> SRR1500555 4 0.4332 0.54569 0.000 0.052 0.000 0.672 0.000 0.276
#> SRR1354363 1 0.4876 0.63031 0.668 0.000 0.000 0.024 0.248 0.060
#> SRR1391619 3 0.0891 0.76838 0.000 0.000 0.968 0.024 0.008 0.000
#> SRR1307997 4 0.5561 0.39119 0.000 0.172 0.000 0.536 0.000 0.292
#> SRR663124 4 0.4461 0.61066 0.000 0.104 0.000 0.704 0.000 0.192
#> SRR1334670 1 0.0520 0.72702 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR612515 4 0.4749 0.61768 0.000 0.072 0.028 0.708 0.000 0.192
#> SRR1092727 2 0.6115 -0.22338 0.000 0.368 0.000 0.324 0.000 0.308
#> SRR1364013 4 0.4638 0.58830 0.000 0.152 0.000 0.692 0.000 0.156
#> SRR1468553 3 0.0146 0.77925 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1403980 3 0.2518 0.73699 0.000 0.000 0.880 0.012 0.092 0.016
#> SRR1420169 5 0.5046 -0.01019 0.000 0.000 0.384 0.032 0.556 0.028
#> SRR1442800 6 0.3768 0.56389 0.008 0.004 0.000 0.092 0.092 0.804
#> SRR1359214 2 0.5519 0.54414 0.000 0.592 0.000 0.228 0.172 0.008
#> SRR1499849 1 0.4076 0.02218 0.564 0.000 0.004 0.000 0.428 0.004
#> SRR1500030 3 0.1297 0.76039 0.000 0.000 0.948 0.012 0.040 0.000
#> SRR1093053 4 0.5641 0.25985 0.000 0.000 0.320 0.556 0.100 0.024
#> SRR1399843 3 0.5348 0.34082 0.000 0.000 0.512 0.076 0.400 0.012
#> SRR1380231 5 0.6074 -0.09952 0.040 0.000 0.432 0.032 0.456 0.040
#> SRR809470 5 0.5248 -0.00423 0.052 0.000 0.456 0.004 0.476 0.012
#> SRR614239 4 0.4615 0.61833 0.000 0.080 0.016 0.712 0.000 0.192
#> SRR613939 6 0.2357 0.64184 0.000 0.012 0.000 0.116 0.000 0.872
#> SRR612971 2 0.3215 0.58339 0.000 0.828 0.000 0.072 0.100 0.000
#> SRR1490204 2 0.5995 -0.06501 0.000 0.428 0.000 0.248 0.000 0.324
#> SRR811357 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1471672 1 0.4699 0.64088 0.684 0.000 0.000 0.020 0.240 0.056
#> SRR613006 6 0.3072 0.64999 0.000 0.076 0.000 0.084 0.000 0.840
#> SRR1469570 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1457354 2 0.5429 0.54969 0.000 0.608 0.000 0.212 0.172 0.008
#> SRR1362906 3 0.1745 0.74925 0.000 0.000 0.924 0.020 0.056 0.000
#> SRR1079023 1 0.0146 0.73028 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR813608 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1096736 5 0.6782 0.25758 0.160 0.000 0.000 0.288 0.468 0.084
#> SRR1478700 5 0.4976 0.22391 0.304 0.000 0.000 0.024 0.624 0.048
#> SRR1081543 3 0.4547 0.49323 0.000 0.000 0.656 0.276 0.068 0.000
#> SRR1384754 5 0.7050 0.43439 0.164 0.000 0.080 0.124 0.564 0.068
#> SRR612287 2 0.5429 0.54969 0.000 0.608 0.000 0.212 0.172 0.008
#> SRR1380317 4 0.3067 0.60190 0.000 0.024 0.004 0.860 0.028 0.084
#> SRR1315247 6 0.2308 0.63973 0.000 0.008 0.000 0.108 0.004 0.880
#> SRR1105344 6 0.5736 0.35564 0.000 0.352 0.000 0.128 0.012 0.508
#> SRR658549 4 0.4513 0.59795 0.000 0.096 0.000 0.692 0.000 0.212
#> SRR1480240 1 0.1049 0.71947 0.960 0.000 0.000 0.000 0.032 0.008
#> SRR1084816 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR612551 2 0.0692 0.59109 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1358520 4 0.5616 0.24923 0.000 0.224 0.000 0.588 0.176 0.012
#> SRR1419476 3 0.0692 0.77281 0.000 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1456075 5 0.5449 0.02031 0.000 0.000 0.360 0.060 0.548 0.032
#> SRR1389474 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1367005 1 0.4706 0.64641 0.688 0.000 0.000 0.020 0.232 0.060
#> SRR1334419 1 0.4594 0.64952 0.696 0.000 0.000 0.020 0.232 0.052
#> SRR1417154 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095985 5 0.6717 0.29453 0.040 0.000 0.128 0.024 0.468 0.340
#> SRR1325771 1 0.0146 0.73000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1360420 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660272 6 0.2965 0.65575 0.000 0.080 0.000 0.072 0.000 0.848
#> SRR1332993 1 0.2110 0.72725 0.900 0.000 0.000 0.004 0.084 0.012
#> SRR1311833 2 0.2814 0.56395 0.000 0.820 0.000 0.008 0.000 0.172
#> SRR808044 5 0.4788 0.24168 0.296 0.000 0.000 0.016 0.640 0.048
#> SRR1076916 3 0.3183 0.65434 0.000 0.000 0.788 0.004 0.200 0.008
#> SRR1356266 1 0.2637 0.72128 0.872 0.000 0.000 0.008 0.096 0.024
#> SRR1341983 6 0.6291 0.23088 0.000 0.404 0.000 0.100 0.060 0.436
#> SRR1456114 1 0.5037 0.60365 0.636 0.000 0.000 0.024 0.280 0.060
#> SRR1072948 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.4442 0.28148 0.000 0.000 0.536 0.004 0.440 0.020
#> SRR1480176 1 0.0632 0.72462 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR613843 6 0.4109 0.32774 0.000 0.412 0.000 0.012 0.000 0.576
#> SRR1469192 1 0.1829 0.73070 0.920 0.000 0.000 0.004 0.064 0.012
#> SRR1404555 3 0.0458 0.77252 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR659839 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR659533 2 0.3284 0.54495 0.000 0.800 0.000 0.032 0.000 0.168
#> SRR1362848 4 0.4345 0.49671 0.000 0.008 0.028 0.752 0.176 0.036
#> SRR1407492 4 0.4696 0.61972 0.000 0.076 0.024 0.712 0.000 0.188
#> SRR1455082 4 0.4634 0.53718 0.000 0.072 0.000 0.644 0.000 0.284
#> SRR658362 4 0.3196 0.57324 0.000 0.108 0.000 0.840 0.016 0.036
#> SRR810921 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR662823 2 0.5519 0.54414 0.000 0.592 0.000 0.228 0.172 0.008
#> SRR1456375 3 0.2402 0.70652 0.000 0.000 0.856 0.000 0.140 0.004
#> SRR818232 1 0.2451 0.68088 0.888 0.000 0.000 0.004 0.068 0.040
#> SRR1454868 4 0.4997 0.54993 0.000 0.000 0.136 0.716 0.068 0.080
#> SRR1474816 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1342002 1 0.1349 0.73270 0.940 0.000 0.000 0.000 0.056 0.004
#> SRR1088437 2 0.5519 0.54414 0.000 0.592 0.000 0.228 0.172 0.008
#> SRR1466400 6 0.2165 0.64154 0.000 0.008 0.000 0.108 0.000 0.884
#> SRR658921 6 0.3063 0.65966 0.000 0.068 0.000 0.092 0.000 0.840
#> SRR1499873 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1101373 1 0.4594 0.64952 0.696 0.000 0.000 0.020 0.232 0.052
#> SRR1090145 1 0.3469 0.62137 0.824 0.000 0.000 0.012 0.092 0.072
#> SRR1379324 1 0.5123 0.54990 0.580 0.000 0.000 0.016 0.344 0.060
#> SRR1345307 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1396166 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0146 0.77876 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1454891 4 0.4486 0.60910 0.000 0.112 0.000 0.704 0.000 0.184
#> SRR663185 2 0.5540 0.54182 0.000 0.588 0.000 0.232 0.172 0.008
#> SRR811819 1 0.0146 0.72886 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1318920 1 0.5685 0.48914 0.560 0.000 0.000 0.020 0.300 0.120
#> SRR656758 2 0.3201 0.51914 0.000 0.780 0.000 0.012 0.000 0.208
#> SRR1474351 1 0.0000 0.72931 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660450 6 0.2560 0.65153 0.000 0.036 0.000 0.092 0.000 0.872
#> SRR1472687 2 0.5099 0.55801 0.000 0.656 0.000 0.180 0.156 0.008
#> SRR1334291 4 0.6131 0.07173 0.000 0.328 0.000 0.336 0.000 0.336
#> SRR1415153 2 0.3481 0.51086 0.000 0.776 0.000 0.032 0.000 0.192
#> SRR1323271 2 0.5540 0.54182 0.000 0.588 0.000 0.232 0.172 0.008
#> SRR1368939 6 0.3795 0.39751 0.000 0.364 0.000 0.004 0.000 0.632
#> SRR1443161 4 0.5213 0.46126 0.000 0.000 0.132 0.660 0.188 0.020
#> SRR614695 6 0.2257 0.63662 0.000 0.008 0.000 0.116 0.000 0.876
#> SRR1092372 1 0.5724 0.45608 0.548 0.000 0.000 0.020 0.312 0.120
#> SRR1474577 1 0.4651 0.64681 0.692 0.000 0.000 0.020 0.232 0.056
#> SRR1406582 1 0.4594 0.64952 0.696 0.000 0.000 0.020 0.232 0.052
#> SRR612779 2 0.5381 0.18990 0.000 0.560 0.000 0.144 0.000 0.296
#> SRR1089006 1 0.4594 0.64952 0.696 0.000 0.000 0.020 0.232 0.052
#> SRR1354071 1 0.5399 -0.12860 0.504 0.000 0.000 0.044 0.416 0.036
#> SRR1105463 5 0.5387 0.23816 0.448 0.000 0.064 0.004 0.472 0.012
#> SRR811005 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1385319 1 0.2796 0.66683 0.868 0.000 0.000 0.008 0.080 0.044
#> SRR1325871 3 0.3104 0.61047 0.000 0.000 0.800 0.184 0.016 0.000
#> SRR1355415 5 0.6233 0.36131 0.204 0.000 0.304 0.008 0.476 0.008
#> SRR1090861 1 0.0146 0.73000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1320712 4 0.3025 0.53219 0.000 0.032 0.004 0.860 0.088 0.016
#> SRR1470075 1 0.5019 0.60796 0.640 0.000 0.000 0.024 0.276 0.060
#> SRR1091254 1 0.0520 0.72845 0.984 0.000 0.000 0.000 0.008 0.008
#> SRR1101397 5 0.4276 0.36846 0.256 0.000 0.000 0.020 0.700 0.024
#> SRR1321165 5 0.5865 -0.02994 0.400 0.000 0.000 0.020 0.464 0.116
#> SRR1092112 3 0.3852 0.38818 0.000 0.000 0.612 0.000 0.384 0.004
#> SRR1417588 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.4939 0.47723 0.104 0.724 0.000 0.016 0.020 0.136
#> SRR1432106 2 0.5519 0.54414 0.000 0.592 0.000 0.228 0.172 0.008
#> SRR655756 2 0.2877 0.56470 0.000 0.820 0.000 0.012 0.000 0.168
#> SRR1458314 1 0.5235 0.38812 0.496 0.000 0.000 0.016 0.432 0.056
#> SRR1318582 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1080484 2 0.5540 0.54182 0.000 0.588 0.000 0.232 0.172 0.008
#> SRR1072749 1 0.2714 0.70829 0.848 0.000 0.000 0.004 0.136 0.012
#> SRR1078586 1 0.0000 0.72931 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 6 0.3999 -0.14844 0.000 0.000 0.000 0.496 0.004 0.500
#> SRR1078834 6 0.3109 0.51759 0.000 0.004 0.000 0.224 0.000 0.772
#> SRR1417611 2 0.5540 0.54182 0.000 0.588 0.000 0.232 0.172 0.008
#> SRR1396840 5 0.5155 0.30864 0.308 0.000 0.000 0.008 0.596 0.088
#> SRR1465440 2 0.3315 0.58263 0.000 0.820 0.000 0.076 0.104 0.000
#> SRR1400530 2 0.5653 0.54117 0.000 0.616 0.000 0.184 0.172 0.028
#> SRR614984 4 0.4677 0.61628 0.000 0.076 0.020 0.708 0.000 0.196
#> SRR1324269 1 0.1958 0.67474 0.896 0.000 0.000 0.000 0.100 0.004
#> SRR1401491 6 0.5547 0.36029 0.000 0.376 0.000 0.100 0.012 0.512
#> SRR1319443 1 0.2058 0.69317 0.908 0.000 0.000 0.008 0.072 0.012
#> SRR1324349 2 0.6575 0.41829 0.000 0.488 0.000 0.280 0.172 0.060
#> SRR1345523 2 0.1367 0.59090 0.000 0.944 0.000 0.000 0.012 0.044
#> SRR1500846 1 0.4919 0.62512 0.660 0.000 0.000 0.024 0.256 0.060
#> SRR661505 3 0.3819 0.50781 0.000 0.000 0.672 0.000 0.316 0.012
#> SRR1419062 3 0.5225 0.35004 0.000 0.000 0.548 0.032 0.380 0.040
#> SRR1480131 1 0.4009 0.22125 0.632 0.000 0.000 0.004 0.356 0.008
#> SRR1421284 4 0.5490 0.27578 0.000 0.204 0.000 0.600 0.188 0.008
#> SRR1329624 1 0.0260 0.72904 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1315739 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 4 0.4243 0.61070 0.000 0.132 0.000 0.736 0.000 0.132
#> SRR1083286 1 0.2613 0.63805 0.848 0.000 0.000 0.000 0.140 0.012
#> SRR1091890 3 0.4293 0.62568 0.000 0.000 0.760 0.140 0.076 0.024
#> SRR1347436 4 0.4376 0.60651 0.000 0.084 0.000 0.704 0.000 0.212
#> SRR1327473 1 0.4886 0.50073 0.716 0.000 0.000 0.112 0.136 0.036
#> SRR1338195 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1457792 1 0.4651 0.64899 0.692 0.000 0.000 0.020 0.232 0.056
#> SRR658271 2 0.2743 0.57314 0.000 0.828 0.000 0.008 0.000 0.164
#> SRR1339597 5 0.4856 0.01426 0.368 0.000 0.000 0.008 0.576 0.048
#> SRR1454842 3 0.1461 0.75559 0.000 0.000 0.940 0.044 0.016 0.000
#> SRR1322643 1 0.4754 0.64036 0.680 0.000 0.000 0.020 0.240 0.060
#> SRR614887 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354620 5 0.5303 -0.01754 0.064 0.000 0.460 0.004 0.464 0.008
#> SRR615056 2 0.5519 0.54414 0.000 0.592 0.000 0.228 0.172 0.008
#> SRR1105320 1 0.6122 0.07244 0.556 0.000 0.000 0.172 0.232 0.040
#> SRR1391529 1 0.0891 0.72191 0.968 0.000 0.000 0.000 0.024 0.008
#> SRR663052 4 0.5260 -0.18941 0.000 0.440 0.000 0.464 0.096 0.000
#> SRR1478834 1 0.1124 0.71827 0.956 0.000 0.000 0.000 0.036 0.008
#> SRR812366 6 0.6344 0.27270 0.000 0.360 0.000 0.124 0.052 0.464
#> SRR1435330 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615383 2 0.2743 0.57314 0.000 0.828 0.000 0.008 0.000 0.164
#> SRR1389157 4 0.4862 0.60874 0.000 0.056 0.052 0.708 0.000 0.184
#> SRR613568 6 0.2962 0.65395 0.000 0.068 0.000 0.084 0.000 0.848
#> SRR614095 2 0.5540 0.54182 0.000 0.588 0.000 0.232 0.172 0.008
#> SRR1103092 1 0.1908 0.68415 0.900 0.000 0.000 0.000 0.096 0.004
#> SRR1337155 6 0.5535 0.15566 0.004 0.000 0.044 0.040 0.380 0.532
#> SRR1475345 2 0.4291 0.57284 0.000 0.748 0.000 0.116 0.128 0.008
#> SRR809089 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1446180 6 0.4126 0.54222 0.000 0.000 0.008 0.116 0.112 0.764
#> SRR1406372 6 0.6768 0.18773 0.000 0.368 0.000 0.136 0.084 0.412
#> SRR1339880 3 0.2476 0.72997 0.000 0.000 0.888 0.032 0.072 0.008
#> SRR1353136 4 0.4928 0.48729 0.000 0.000 0.204 0.680 0.100 0.016
#> SRR1093906 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.1821 0.59126 0.000 0.928 0.000 0.008 0.024 0.040
#> SRR1351104 1 0.4745 0.63428 0.676 0.000 0.000 0.020 0.248 0.056
#> SRR1363926 2 0.5793 0.47556 0.000 0.528 0.000 0.292 0.172 0.008
#> SRR1399861 4 0.2357 0.56627 0.000 0.028 0.008 0.904 0.052 0.008
#> SRR1338789 5 0.5326 -0.23781 0.428 0.000 0.000 0.016 0.492 0.064
#> SRR1421420 3 0.3557 0.68919 0.000 0.000 0.800 0.044 0.148 0.008
#> SRR1420832 2 0.5519 0.54414 0.000 0.592 0.000 0.228 0.172 0.008
#> SRR1476231 1 0.1082 0.73284 0.956 0.000 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1352870 4 0.5068 0.58104 0.000 0.020 0.096 0.692 0.008 0.184
#> SRR1315041 2 0.6276 0.46593 0.000 0.520 0.000 0.268 0.172 0.040
#> SRR661877 2 0.5497 0.54581 0.000 0.596 0.000 0.224 0.172 0.008
#> SRR1443268 5 0.3622 0.40460 0.236 0.000 0.000 0.016 0.744 0.004
#> SRR1416617 3 0.3559 0.69438 0.000 0.000 0.800 0.036 0.152 0.012
#> SRR1102443 1 0.4594 0.64952 0.696 0.000 0.000 0.020 0.232 0.052
#> SRR655672 4 0.4403 0.61292 0.000 0.096 0.000 0.708 0.000 0.196
#> SRR1420006 3 0.0146 0.77876 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1458267 4 0.6115 0.13218 0.000 0.324 0.000 0.368 0.000 0.308
#> SRR613819 4 0.5600 0.21472 0.000 0.244 0.000 0.576 0.172 0.008
#> SRR1469432 2 0.5429 0.54969 0.000 0.608 0.000 0.212 0.172 0.008
#> SRR660907 2 0.5429 0.54969 0.000 0.608 0.000 0.212 0.172 0.008
#> SRR1465092 4 0.6129 0.09501 0.000 0.328 0.000 0.348 0.000 0.324
#> SRR1470727 1 0.2833 0.70237 0.836 0.000 0.000 0.004 0.148 0.012
#> SRR1339153 3 0.0260 0.77704 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414379 4 0.5636 0.27193 0.000 0.208 0.000 0.596 0.180 0.016
#> SRR1431326 1 0.4706 0.64641 0.688 0.000 0.000 0.020 0.232 0.060
#> SRR1487278 6 0.2633 0.65484 0.000 0.104 0.000 0.032 0.000 0.864
#> SRR1098312 3 0.6107 0.43592 0.000 0.000 0.548 0.196 0.224 0.032
#> SRR810273 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1376000 6 0.4984 0.45001 0.000 0.244 0.000 0.124 0.000 0.632
#> SRR614467 4 0.5023 0.31170 0.000 0.220 0.000 0.636 0.144 0.000
#> SRR811471 1 0.4599 0.64987 0.680 0.000 0.000 0.012 0.252 0.056
#> SRR1478341 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088606 6 0.5275 0.12840 0.008 0.000 0.044 0.020 0.364 0.564
#> SRR1479699 3 0.6215 0.40770 0.000 0.000 0.528 0.216 0.224 0.032
#> SRR1403589 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR812625 6 0.3718 0.63585 0.000 0.068 0.000 0.128 0.008 0.796
#> SRR1359803 1 0.2262 0.68597 0.896 0.000 0.000 0.008 0.080 0.016
#> SRR1338988 2 0.4411 0.57115 0.000 0.736 0.000 0.124 0.132 0.008
#> SRR1471222 6 0.6149 0.47008 0.000 0.180 0.000 0.216 0.044 0.560
#> SRR1378992 1 0.4594 0.64952 0.696 0.000 0.000 0.020 0.232 0.052
#> SRR659427 4 0.3672 0.52624 0.000 0.016 0.008 0.796 0.160 0.020
#> SRR1096638 1 0.4594 0.64952 0.696 0.000 0.000 0.020 0.232 0.052
#> SRR1466619 6 0.5679 0.46849 0.000 0.208 0.000 0.216 0.008 0.568
#> SRR659307 4 0.4917 0.59892 0.000 0.040 0.084 0.708 0.000 0.168
#> SRR1439994 5 0.3731 0.40131 0.240 0.000 0.000 0.020 0.736 0.004
#> SRR1454931 1 0.4755 0.26372 0.632 0.000 0.000 0.008 0.304 0.056
#> SRR1332928 5 0.5261 0.51456 0.112 0.000 0.060 0.060 0.728 0.040
#> SRR658621 2 0.5519 0.54414 0.000 0.592 0.000 0.228 0.172 0.008
#> SRR1095840 1 0.0405 0.72709 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1458243 5 0.4489 0.30953 0.264 0.000 0.000 0.012 0.680 0.044
#> SRR1374270 4 0.3223 0.51185 0.000 0.052 0.000 0.836 0.104 0.008
#> SRR1470947 2 0.5452 0.54857 0.000 0.604 0.000 0.216 0.172 0.008
#> SRR1365598 6 0.2358 0.64407 0.000 0.016 0.000 0.108 0.000 0.876
#> SRR662787 2 0.5519 0.54414 0.000 0.592 0.000 0.228 0.172 0.008
#> SRR1408727 4 0.2687 0.53418 0.000 0.072 0.000 0.876 0.044 0.008
#> SRR1456274 5 0.5985 0.41152 0.140 0.000 0.000 0.200 0.600 0.060
#> SRR817744 1 0.0405 0.73126 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1478744 2 0.5429 0.54969 0.000 0.608 0.000 0.212 0.172 0.008
#> SRR1387379 2 0.1625 0.59007 0.000 0.928 0.000 0.000 0.012 0.060
#> SRR1102680 3 0.5509 0.28874 0.000 0.000 0.496 0.048 0.416 0.040
#> SRR1374198 1 0.5656 0.49209 0.568 0.000 0.000 0.020 0.292 0.120
#> SRR1445856 5 0.4054 0.34990 0.264 0.000 0.008 0.008 0.708 0.012
#> SRR820049 3 0.4472 -0.02961 0.000 0.000 0.496 0.476 0.000 0.028
#> SRR1375290 4 0.4975 0.53239 0.000 0.000 0.172 0.704 0.048 0.076
#> SRR818999 1 0.4289 -0.03102 0.540 0.000 0.000 0.004 0.444 0.012
#> SRR1390242 1 0.0622 0.72603 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1401164 6 0.3109 0.58950 0.000 0.224 0.000 0.004 0.000 0.772
#> SRR1454629 1 0.5316 -0.14943 0.480 0.000 0.000 0.020 0.444 0.056
#> SRR1332187 3 0.0291 0.77779 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR603365 3 0.0146 0.77876 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR657833 6 0.3196 0.63425 0.000 0.064 0.000 0.108 0.000 0.828
#> SRR1436207 2 0.5818 0.06421 0.000 0.492 0.000 0.228 0.000 0.280
#> SRR1488017 1 0.1010 0.73293 0.960 0.000 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR612947 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1480384 1 0.2110 0.73064 0.900 0.000 0.000 0.004 0.084 0.012
#> SRR1364761 2 0.2778 0.57268 0.000 0.824 0.000 0.008 0.000 0.168
#> SRR1308086 3 0.5326 0.55014 0.000 0.000 0.664 0.160 0.144 0.032
#> SRR1441868 1 0.4651 0.64899 0.692 0.000 0.000 0.020 0.232 0.056
#> SRR1485380 3 0.2191 0.72233 0.000 0.000 0.876 0.000 0.120 0.004
#> SRR1073705 1 0.4594 0.64952 0.696 0.000 0.000 0.020 0.232 0.052
#> SRR615032 2 0.3315 0.58263 0.000 0.820 0.000 0.076 0.104 0.000
#> SRR1452356 2 0.5519 0.54414 0.000 0.592 0.000 0.228 0.172 0.008
#> SRR1442983 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1100346 4 0.4253 0.59503 0.000 0.064 0.000 0.704 0.000 0.232
#> SRR1332816 1 0.4594 0.64952 0.696 0.000 0.000 0.020 0.232 0.052
#> SRR612299 6 0.2266 0.64365 0.000 0.012 0.000 0.108 0.000 0.880
#> SRR1407386 1 0.0260 0.72904 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1418064 2 0.3236 0.53739 0.000 0.796 0.000 0.024 0.000 0.180
#> SRR1309403 1 0.6047 0.12209 0.572 0.000 0.000 0.180 0.208 0.040
#> SRR1498395 2 0.3858 0.47267 0.000 0.740 0.000 0.044 0.000 0.216
#> SRR1079998 5 0.5298 0.04318 0.076 0.000 0.444 0.000 0.472 0.008
#> SRR1498885 2 0.5540 0.54182 0.000 0.588 0.000 0.232 0.172 0.008
#> SRR1337215 6 0.2257 0.64063 0.000 0.008 0.000 0.116 0.000 0.876
#> SRR1414749 3 0.0603 0.77650 0.000 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1365963 5 0.4453 -0.10921 0.000 0.000 0.452 0.020 0.524 0.004
#> SRR1368030 4 0.5921 0.16758 0.000 0.260 0.000 0.548 0.172 0.020
#> SRR1419760 4 0.4815 0.58995 0.032 0.020 0.000 0.728 0.044 0.176
#> SRR1381841 1 0.4892 0.08188 0.560 0.000 0.000 0.008 0.384 0.048
#> SRR821388 4 0.5863 0.53453 0.000 0.024 0.068 0.668 0.124 0.116
#> SRR657623 2 0.5540 0.54182 0.000 0.588 0.000 0.232 0.172 0.008
#> SRR1094241 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819583 3 0.4034 0.47047 0.000 0.000 0.648 0.004 0.336 0.012
#> SRR1096149 1 0.4767 0.63081 0.672 0.000 0.000 0.020 0.252 0.056
#> SRR1342829 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.1462 0.73711 0.936 0.000 0.000 0.000 0.056 0.008
#> SRR811333 5 0.6047 0.20129 0.172 0.000 0.368 0.000 0.448 0.012
#> SRR1311666 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1486698 6 0.4164 0.56078 0.000 0.124 0.000 0.132 0.000 0.744
#> SRR1446436 6 0.5568 0.31183 0.000 0.236 0.000 0.212 0.000 0.552
#> SRR815092 1 0.0717 0.72489 0.976 0.000 0.000 0.000 0.016 0.008
#> SRR1500149 6 0.3460 0.60255 0.000 0.220 0.000 0.020 0.000 0.760
#> SRR1100564 1 0.1196 0.71612 0.952 0.000 0.000 0.000 0.040 0.008
#> SRR1403072 3 0.0146 0.77876 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR811653 4 0.3299 0.56529 0.000 0.004 0.064 0.840 0.084 0.008
#> SRR1311348 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1489438 2 0.5519 0.54414 0.000 0.592 0.000 0.228 0.172 0.008
#> SRR1435442 6 0.2277 0.65805 0.000 0.032 0.000 0.076 0.000 0.892
#> SRR1421444 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.3405 0.58162 0.000 0.812 0.000 0.076 0.112 0.000
#> SRR1319520 1 0.4651 0.64899 0.692 0.000 0.000 0.020 0.232 0.056
#> SRR1444763 1 0.5560 0.49267 0.528 0.000 0.000 0.016 0.360 0.096
#> SRR1415026 2 0.4242 0.57273 0.000 0.736 0.000 0.128 0.136 0.000
#> SRR1416596 6 0.7488 0.14747 0.000 0.284 0.000 0.240 0.140 0.336
#> SRR1485499 2 0.5429 0.54969 0.000 0.608 0.000 0.212 0.172 0.008
#> SRR1316078 2 0.4209 0.57393 0.000 0.756 0.000 0.112 0.124 0.008
#> SRR663465 2 0.5540 0.54182 0.000 0.588 0.000 0.232 0.172 0.008
#> SRR1310094 2 0.5655 0.51729 0.000 0.564 0.000 0.256 0.172 0.008
#> SRR663537 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1486780 1 0.4594 0.64952 0.696 0.000 0.000 0.020 0.232 0.052
#> SRR1453950 1 0.1829 0.73070 0.920 0.000 0.000 0.004 0.064 0.012
#> SRR1087875 1 0.4594 0.64952 0.696 0.000 0.000 0.020 0.232 0.052
#> SRR613318 4 0.3277 0.59965 0.000 0.024 0.028 0.852 0.012 0.084
#> SRR1332694 1 0.0972 0.72136 0.964 0.000 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR1468469 3 0.0260 0.77795 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR818670 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1120318 1 0.1285 0.71098 0.944 0.000 0.000 0.000 0.052 0.004
#> SRR1311622 3 0.5398 0.36238 0.000 0.000 0.524 0.056 0.392 0.028
#> SRR1500931 3 0.3925 0.47776 0.000 0.000 0.656 0.004 0.332 0.008
#> SRR1387494 3 0.4562 0.63512 0.000 0.000 0.736 0.092 0.148 0.024
#> SRR1379175 4 0.2925 0.54887 0.000 0.024 0.000 0.856 0.104 0.016
#> SRR1401909 5 0.5819 0.18443 0.112 0.000 0.396 0.008 0.476 0.008
#> SRR1440541 2 0.4050 0.58049 0.000 0.776 0.000 0.104 0.108 0.012
#> SRR1068832 3 0.4584 0.22048 0.004 0.000 0.520 0.004 0.452 0.020
#> SRR1376640 6 0.4332 0.35619 0.000 0.040 0.000 0.316 0.000 0.644
#> SRR1085712 2 0.2918 0.58518 0.000 0.856 0.000 0.052 0.088 0.004
#> SRR1082283 5 0.5044 0.27418 0.280 0.000 0.000 0.012 0.628 0.080
#> SRR1084276 1 0.3993 0.11369 0.592 0.000 0.000 0.000 0.400 0.008
#> SRR1353262 6 0.5674 0.40261 0.000 0.296 0.000 0.140 0.012 0.552
#> SRR1437035 1 0.5380 0.12240 0.592 0.000 0.000 0.056 0.312 0.040
#> SRR1396877 1 0.3861 0.22322 0.640 0.000 0.000 0.000 0.352 0.008
#> SRR1443026 2 0.2706 0.57643 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1417936 1 0.1082 0.73284 0.956 0.000 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1436822 6 0.6324 0.40428 0.000 0.256 0.000 0.224 0.028 0.492
#> SRR1101128 3 0.2053 0.72967 0.000 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1363886 2 0.5429 0.54969 0.000 0.608 0.000 0.212 0.172 0.008
#> SRR612983 2 0.3196 0.58373 0.000 0.828 0.000 0.064 0.108 0.000
#> SRR1394366 6 0.2212 0.63997 0.000 0.008 0.000 0.112 0.000 0.880
#> SRR1093218 3 0.5341 0.37561 0.000 0.000 0.532 0.052 0.388 0.028
#> SRR1077090 3 0.3986 0.22546 0.000 0.000 0.532 0.000 0.464 0.004
#> SRR1327430 4 0.4043 0.42622 0.000 0.128 0.000 0.756 0.116 0.000
#> SRR1088958 1 0.4594 0.64952 0.696 0.000 0.000 0.020 0.232 0.052
#> SRR1486931 4 0.6125 0.08995 0.000 0.312 0.000 0.348 0.000 0.340
#> SRR1086820 1 0.4923 0.58703 0.608 0.000 0.000 0.012 0.324 0.056
#> SRR1383000 1 0.2408 0.72650 0.876 0.000 0.000 0.004 0.108 0.012
#> SRR1355705 2 0.1340 0.59067 0.000 0.948 0.000 0.008 0.004 0.040
#> SRR614335 2 0.5540 0.54182 0.000 0.588 0.000 0.232 0.172 0.008
#> SRR660534 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR817094 2 0.1141 0.59020 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1334265 2 0.5779 0.50391 0.000 0.552 0.000 0.264 0.172 0.012
#> SRR1456401 2 0.5752 0.48993 0.000 0.540 0.000 0.280 0.172 0.008
#> SRR1086393 1 0.4440 0.66401 0.716 0.000 0.000 0.016 0.212 0.056
#> SRR1351521 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093100 4 0.3464 0.48431 0.000 0.084 0.000 0.808 0.108 0.000
#> SRR1309382 1 0.1462 0.70924 0.936 0.000 0.000 0.000 0.056 0.008
#> SRR1089375 1 0.5466 -0.08966 0.524 0.000 0.000 0.052 0.388 0.036
#> SRR1499482 2 0.6127 -0.26364 0.000 0.348 0.000 0.336 0.000 0.316
#> SRR614719 4 0.4431 0.61062 0.000 0.096 0.000 0.704 0.000 0.200
#> SRR1081473 3 0.5805 0.29863 0.000 0.000 0.480 0.080 0.404 0.036
#> SRR1087415 1 0.5060 0.57843 0.600 0.000 0.000 0.016 0.324 0.060
#> SRR1088217 5 0.5622 0.04441 0.060 0.000 0.436 0.004 0.472 0.028
#> SRR808496 4 0.3310 0.53972 0.000 0.052 0.000 0.848 0.052 0.048
#> SRR1336463 6 0.6770 0.29899 0.000 0.340 0.000 0.168 0.068 0.424
#> SRR612359 4 0.4376 0.60651 0.000 0.084 0.000 0.704 0.000 0.212
#> SRR1444412 1 0.3271 0.49320 0.760 0.000 0.000 0.000 0.232 0.008
#> SRR1074116 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656095 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR808914 1 0.0692 0.72362 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.004
#> SRR1349099 5 0.5535 0.41510 0.204 0.000 0.000 0.032 0.632 0.132
#> SRR1337886 6 0.5268 0.30113 0.000 0.360 0.000 0.108 0.000 0.532
#> SRR813632 1 0.1082 0.71730 0.956 0.000 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1101591 3 0.3807 0.43518 0.000 0.000 0.628 0.000 0.368 0.004
#> SRR1089713 5 0.6435 0.37586 0.356 0.000 0.056 0.028 0.496 0.064
#> SRR1453127 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 3 0.4691 0.12544 0.020 0.000 0.504 0.004 0.464 0.008
#> SRR1313831 1 0.0806 0.72329 0.972 0.000 0.000 0.000 0.020 0.008
#> SRR1315434 3 0.0717 0.77244 0.000 0.000 0.976 0.008 0.016 0.000
#> SRR814747 2 0.5540 0.54182 0.000 0.588 0.000 0.232 0.172 0.008
#> SRR1358539 1 0.0291 0.72779 0.992 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1367807 1 0.4594 0.64952 0.696 0.000 0.000 0.020 0.232 0.052
#> SRR1365791 3 0.4813 0.56776 0.000 0.000 0.680 0.012 0.220 0.088
#> SRR1081519 3 0.4208 0.22005 0.000 0.000 0.536 0.004 0.452 0.008
#> SRR614707 6 0.2566 0.63598 0.000 0.008 0.000 0.112 0.012 0.868
#> SRR1094027 1 0.0865 0.73308 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1489092 5 0.6967 0.25404 0.084 0.000 0.276 0.020 0.496 0.124
#> SRR1079502 5 0.5937 -0.16890 0.008 0.000 0.428 0.064 0.460 0.040
#> SRR1457814 4 0.2639 0.57059 0.000 0.008 0.040 0.888 0.056 0.008
#> SRR1455127 2 0.5519 0.54414 0.000 0.592 0.000 0.228 0.172 0.008
#> SRR615081 6 0.4195 0.59289 0.000 0.200 0.000 0.076 0.000 0.724
#> SRR1327855 3 0.2100 0.72981 0.000 0.000 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1417873 2 0.5989 0.40738 0.000 0.484 0.000 0.332 0.172 0.012
#> SRR1394125 3 0.4681 0.58494 0.000 0.000 0.688 0.032 0.240 0.040
#> SRR1488388 1 0.4482 0.65360 0.700 0.000 0.000 0.012 0.232 0.056
#> SRR1401122 2 0.5540 0.54182 0.000 0.588 0.000 0.232 0.172 0.008
#> SRR612383 4 0.4447 0.61095 0.000 0.100 0.000 0.704 0.000 0.196
#> SRR1477711 1 0.0146 0.72886 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1350813 4 0.6123 0.10197 0.000 0.340 0.000 0.352 0.000 0.308
#> SRR612851 4 0.4863 0.51115 0.000 0.092 0.000 0.624 0.000 0.284
#> SRR1086349 1 0.1340 0.73258 0.948 0.000 0.000 0.004 0.040 0.008
#> SRR812837 2 0.3215 0.58339 0.000 0.828 0.000 0.072 0.100 0.000
#> SRR1340010 4 0.5837 0.32852 0.000 0.000 0.240 0.584 0.144 0.032
#> SRR1475885 6 0.4146 0.34826 0.004 0.000 0.000 0.028 0.288 0.680
#> SRR1376334 1 0.0806 0.72329 0.972 0.000 0.000 0.000 0.020 0.008
#> SRR1399821 1 0.4864 0.62429 0.660 0.000 0.000 0.020 0.260 0.060
#> SRR1347042 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612323 4 0.4749 0.61768 0.000 0.072 0.028 0.708 0.000 0.192
#> SRR612604 6 0.2814 0.62114 0.000 0.172 0.000 0.008 0.000 0.820
#> SRR1389546 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1311877 1 0.1340 0.73258 0.948 0.000 0.000 0.004 0.040 0.008
#> SRR1465608 5 0.4568 0.38470 0.232 0.000 0.000 0.032 0.700 0.036
#> SRR1101808 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1414079 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331153 6 0.3307 0.63860 0.000 0.148 0.000 0.044 0.000 0.808
#> SRR1078439 3 0.4762 0.59845 0.000 0.000 0.688 0.104 0.200 0.008
#> SRR2165527 2 0.5497 0.54581 0.000 0.596 0.000 0.224 0.172 0.008
#> SRR1351147 1 0.4335 0.53526 0.752 0.000 0.000 0.016 0.096 0.136
#> SRR1313536 2 0.4317 0.07326 0.000 0.520 0.000 0.008 0.008 0.464
#> SRR1070308 2 0.7568 0.19793 0.128 0.500 0.000 0.184 0.064 0.124
#> SRR1403110 1 0.0891 0.72191 0.968 0.000 0.000 0.000 0.024 0.008
#> SRR1400355 2 0.3352 0.53953 0.000 0.792 0.000 0.032 0.000 0.176
#> SRR1401317 3 0.3488 0.60916 0.000 0.000 0.744 0.004 0.244 0.008
#> SRR1456862 5 0.5167 -0.02069 0.360 0.000 0.000 0.016 0.564 0.060
#> SRR1074622 1 0.3158 0.70089 0.812 0.000 0.000 0.004 0.164 0.020
#> SRR1465847 3 0.3872 0.38198 0.000 0.000 0.604 0.000 0.392 0.004
#> SRR1443376 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1471312 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0260 0.72904 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1090881 4 0.5028 0.57363 0.000 0.000 0.100 0.692 0.032 0.176
#> SRR612251 4 0.5637 0.19684 0.000 0.252 0.000 0.568 0.172 0.008
#> SRR1418581 1 0.4594 0.64952 0.696 0.000 0.000 0.020 0.232 0.052
#> SRR658045 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR613214 4 0.4281 0.60470 0.000 0.072 0.000 0.708 0.000 0.220
#> SRR613078 6 0.2121 0.64781 0.000 0.012 0.000 0.096 0.000 0.892
#> SRR1472998 5 0.4789 -0.11968 0.008 0.000 0.460 0.020 0.504 0.008
#> SRR1433452 2 0.5418 0.09770 0.000 0.520 0.000 0.128 0.000 0.352
#> SRR1101957 1 0.1829 0.73070 0.920 0.000 0.000 0.004 0.064 0.012
#> SRR1487993 3 0.1682 0.75086 0.000 0.000 0.928 0.020 0.052 0.000
#> SRR1465983 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1380375 1 0.0146 0.72886 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1367566 3 0.0551 0.77705 0.000 0.000 0.984 0.008 0.004 0.004
#> SRR1316151 6 0.4325 0.50394 0.000 0.064 0.000 0.244 0.000 0.692
#> SRR1417547 2 0.5540 0.54182 0.000 0.588 0.000 0.232 0.172 0.008
#> SRR659389 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1490270 6 0.3175 0.64564 0.000 0.080 0.000 0.088 0.000 0.832
#> SRR1398207 1 0.4697 -0.09997 0.516 0.000 0.016 0.004 0.452 0.012
#> SRR1358755 5 0.5378 0.02075 0.084 0.000 0.448 0.000 0.460 0.008
#> SRR1078903 2 0.6110 -0.22398 0.000 0.372 0.000 0.328 0.000 0.300
#> SRR1323252 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1451796 2 0.2968 0.56101 0.000 0.816 0.000 0.016 0.000 0.168
#> SRR1369172 1 0.5220 0.49941 0.540 0.000 0.000 0.016 0.384 0.060
#> SRR615982 4 0.4461 0.61066 0.000 0.104 0.000 0.704 0.000 0.192
#> SRR1480431 2 0.6085 0.43199 0.000 0.528 0.000 0.280 0.164 0.028
#> SRR1429825 6 0.5304 0.48182 0.000 0.152 0.000 0.216 0.008 0.624
#> SRR1102393 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1071313 5 0.4789 0.44436 0.184 0.000 0.000 0.064 0.712 0.040
#> SRR808351 1 0.1707 0.73155 0.928 0.000 0.000 0.004 0.056 0.012
#> SRR1317513 1 0.0622 0.72603 0.980 0.000 0.000 0.000 0.012 0.008
#> SRR1480501 3 0.5499 0.31684 0.000 0.000 0.500 0.052 0.412 0.036
#> SRR1081910 1 0.5321 -0.17190 0.496 0.000 0.080 0.000 0.416 0.008
#> SRR1086611 6 0.3265 0.47390 0.000 0.004 0.000 0.248 0.000 0.748
#> SRR1392571 4 0.4396 0.60747 0.000 0.088 0.000 0.704 0.000 0.208
#> SRR1311441 1 0.4706 0.64641 0.688 0.000 0.000 0.020 0.232 0.060
#> SRR808152 1 0.1829 0.73070 0.920 0.000 0.000 0.004 0.064 0.012
#> SRR657313 3 0.0291 0.77856 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1433131 6 0.2930 0.64961 0.000 0.124 0.000 0.036 0.000 0.840
#> SRR1321011 2 0.0458 0.59116 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1500598 2 0.5429 0.54969 0.000 0.608 0.000 0.212 0.172 0.008
#> SRR1379343 2 0.4204 0.41589 0.000 0.696 0.000 0.052 0.000 0.252
#> SRR1389108 1 0.4594 0.64952 0.696 0.000 0.000 0.020 0.232 0.052
#> SRR1376228 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0146 0.73000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1358060 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.5585 0.36440 0.000 0.000 0.520 0.068 0.380 0.032
#> SRR613557 4 0.4882 0.61341 0.000 0.064 0.044 0.704 0.000 0.188
#> SRR809831 1 0.3052 0.51839 0.780 0.000 0.000 0.000 0.216 0.004
#> SRR1429387 3 0.0000 0.77945 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0865 0.73308 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1071644 1 0.1082 0.73375 0.956 0.000 0.000 0.000 0.040 0.004
#> SRR1406936 3 0.6173 0.18763 0.020 0.000 0.440 0.064 0.436 0.040
#> SRR1072031 2 0.2706 0.57737 0.000 0.832 0.000 0.008 0.000 0.160
#> SRR1374671 4 0.4418 0.61290 0.000 0.100 0.000 0.708 0.000 0.192
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 4.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.987 0.995 0.4992 0.501 0.501
#> 3 3 0.993 0.960 0.984 0.3040 0.824 0.657
#> 4 4 0.945 0.917 0.960 0.1468 0.870 0.644
#> 5 5 0.835 0.819 0.889 0.0495 0.948 0.803
#> 6 6 0.787 0.651 0.803 0.0455 0.967 0.854
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 4
#> attr(,"optional")
#> [1] 2 3
There is also optional best \(k\) = 2 3 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1069376 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR811964 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.917 0.5026 0.668 0.332
#> SRR1394209 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1474018 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1354363 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1391619 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR612515 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1092727 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1403980 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1442800 1 0.850 0.6188 0.724 0.276
#> SRR1359214 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1093053 1 0.163 0.9710 0.976 0.024
#> SRR1399843 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1380231 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR809470 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1471672 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR613006 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR813608 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1096736 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1478700 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1384754 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1380317 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1315247 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1105344 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1456075 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1417154 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1325771 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1360420 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1072948 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR613843 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR659839 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1362848 1 0.278 0.9460 0.952 0.048
#> SRR1407492 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1454868 1 0.921 0.4943 0.664 0.336
#> SRR1474816 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1466400 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR658921 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1101373 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR663185 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR656758 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR660450 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR614695 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR612779 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1325871 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1470075 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1092112 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1432106 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1078834 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1417611 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1419062 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1315739 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1091890 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1327473 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1338195 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR658271 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1322643 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR614887 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1354620 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR663052 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR812366 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1389157 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR613568 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1475345 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1446180 2 0.680 0.7806 0.180 0.820
#> SRR1406372 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1353136 1 0.584 0.8356 0.860 0.140
#> SRR1093906 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1399861 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1338789 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1421420 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1352870 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1315041 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR655672 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1420006 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1472749 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR810273 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1478341 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1479699 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1403589 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1378992 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR659427 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1096638 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1439994 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1374270 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1470947 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1456274 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR817744 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR820049 1 0.722 0.7495 0.800 0.200
#> SRR1375290 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR818999 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1332187 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR603365 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR612947 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1485380 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR615032 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1332816 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR612299 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1309403 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1498395 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1414749 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1419760 2 0.574 0.8422 0.136 0.864
#> SRR1381841 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR821388 2 0.730 0.7447 0.204 0.796
#> SRR657623 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR819583 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR811333 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1403072 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR811653 2 1.000 0.0433 0.488 0.512
#> SRR1311348 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1319520 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR613318 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1332694 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1468469 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1500931 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1379175 2 0.204 0.9627 0.032 0.968
#> SRR1401909 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1101128 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1093218 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1077090 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1309382 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1101591 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1453127 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1315434 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1365791 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1081519 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR614707 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1094027 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1079502 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1457814 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1455127 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR812837 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1475885 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1376334 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1347042 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR612604 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR2165527 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1351147 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.634 0.8092 0.160 0.840
#> SRR1403110 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1090881 2 0.456 0.8921 0.096 0.904
#> SRR612251 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR613078 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1487993 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1367566 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR615982 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1429825 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR808351 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1480501 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1086611 2 0.141 0.9749 0.020 0.980
#> SRR1392571 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR808152 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR657313 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1376228 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1358060 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1464517 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR613557 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR809831 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.000 0.9949 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.000 0.9943 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR614491 2 0.0747 0.9753 0.000 0.984 0.016
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.3030 0.8740 0.904 0.092 0.004
#> SRR1394209 2 0.2625 0.9034 0.000 0.916 0.084
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.2959 0.8833 0.900 0.000 0.100
#> SRR1500555 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR612515 2 0.4887 0.7040 0.000 0.772 0.228
#> SRR1092727 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468553 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420169 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442800 3 0.3129 0.8814 0.088 0.008 0.904
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.3267 0.8652 0.884 0.000 0.116
#> SRR1500030 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093053 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399843 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380231 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR809470 3 0.0424 0.9685 0.008 0.000 0.992
#> SRR614239 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.2625 0.9016 0.916 0.000 0.084
#> SRR1478700 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081543 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384754 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380317 3 0.6291 0.1117 0.000 0.468 0.532
#> SRR1315247 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456075 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095985 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1325771 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076916 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472370 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362848 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407492 2 0.0592 0.9792 0.000 0.988 0.012
#> SRR1455082 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443161 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR614695 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.4399 0.7742 0.812 0.000 0.188
#> SRR1105463 1 0.4504 0.7624 0.804 0.000 0.196
#> SRR811005 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355415 3 0.6140 0.3013 0.404 0.000 0.596
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.4178 0.7973 0.828 0.000 0.172
#> SRR1321165 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074790 2 0.4504 0.7513 0.196 0.804 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.5988 0.4097 0.000 0.632 0.368
#> SRR1078834 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.1411 0.9469 0.964 0.000 0.036
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327473 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338195 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354620 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.0747 0.9642 0.984 0.000 0.016
#> SRR1391529 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 3 0.1529 0.9348 0.000 0.040 0.960
#> SRR613568 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353136 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399861 3 0.5706 0.5329 0.000 0.320 0.680
#> SRR1338789 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315041 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443268 1 0.5216 0.6622 0.740 0.000 0.260
#> SRR1416617 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420006 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098312 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088606 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1479699 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR659427 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR659307 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1439994 1 0.6302 0.0994 0.520 0.000 0.480
#> SRR1454931 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374270 2 0.4178 0.7869 0.000 0.828 0.172
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456274 1 0.6140 0.3390 0.596 0.000 0.404
#> SRR817744 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.5058 0.6892 0.756 0.000 0.244
#> SRR820049 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375290 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR818999 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332187 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.0237 0.9740 0.996 0.000 0.004
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.4504 0.7424 0.196 0.000 0.804
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414749 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365963 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419760 3 0.7147 0.6503 0.076 0.228 0.696
#> SRR1381841 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR821388 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR657623 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR811653 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR613318 2 0.5327 0.6249 0.000 0.728 0.272
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500931 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387494 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379175 2 0.5397 0.6112 0.000 0.720 0.280
#> SRR1401909 3 0.4504 0.7424 0.196 0.000 0.804
#> SRR1440541 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.1031 0.9574 0.976 0.000 0.024
#> SRR1084276 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101128 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093218 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077090 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093100 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0592 0.9676 0.988 0.000 0.012
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081473 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 3 0.0892 0.9573 0.020 0.000 0.980
#> SRR808496 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.3551 0.8478 0.868 0.000 0.132
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089713 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498354 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081519 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR614707 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079502 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457814 3 0.0592 0.9638 0.000 0.012 0.988
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327855 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475885 3 0.6309 -0.0196 0.496 0.000 0.504
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR612323 2 0.4178 0.7902 0.000 0.828 0.172
#> SRR612604 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.5760 0.5301 0.672 0.000 0.328
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078439 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.4555 0.7451 0.200 0.800 0.000
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR612251 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472998 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398207 1 0.2165 0.9203 0.936 0.000 0.064
#> SRR1358755 3 0.0237 0.9721 0.004 0.000 0.996
#> SRR1078903 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.2625 0.9011 0.916 0.000 0.084
#> SRR808351 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081910 1 0.5138 0.6676 0.748 0.000 0.252
#> SRR1086611 3 0.2537 0.8910 0.000 0.080 0.920
#> SRR1392571 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR613557 3 0.5327 0.6234 0.000 0.272 0.728
#> SRR809831 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9772 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.0000 0.9757 0.000 0.000 1.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.9906 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1472057 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR614491 4 0.1209 0.9562 0.000 0.032 0.004 0.964
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811964 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1361415 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 4 0.5969 0.4276 0.360 0.028 0.012 0.600
#> SRR1394209 2 0.0188 0.9543 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1474018 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1099809 1 0.4456 0.6069 0.716 0.004 0.280 0.000
#> SRR1500555 4 0.0188 0.9470 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1354363 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1307997 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR663124 4 0.1022 0.9579 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 4 0.1209 0.9562 0.000 0.032 0.004 0.964
#> SRR1092727 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1364013 4 0.4713 0.4726 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR1468553 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420169 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1442800 4 0.4817 0.7140 0.040 0.004 0.188 0.768
#> SRR1359214 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1499849 1 0.4720 0.5186 0.672 0.004 0.324 0.000
#> SRR1500030 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093053 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399843 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380231 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR809470 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR614239 4 0.1209 0.9562 0.000 0.032 0.004 0.964
#> SRR613939 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1490204 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR811357 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1471672 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613006 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1469570 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1457354 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1362906 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813608 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1096736 2 0.7242 0.1955 0.376 0.476 0.148 0.000
#> SRR1478700 1 0.1398 0.9344 0.956 0.004 0.040 0.000
#> SRR1081543 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384754 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1380317 2 0.0592 0.9456 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1315247 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1105344 2 0.1118 0.9403 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR658549 4 0.1022 0.9579 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR612551 2 0.4008 0.6640 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1358520 2 0.0188 0.9569 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1419476 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456075 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1389474 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1367005 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095985 3 0.0524 0.9529 0.000 0.004 0.988 0.008
#> SRR1325771 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660272 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR808044 1 0.2401 0.8815 0.904 0.004 0.092 0.000
#> SRR1076916 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 4 0.4730 0.4496 0.000 0.364 0.000 0.636
#> SRR1456114 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613843 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659839 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR659533 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1362848 2 0.4477 0.5508 0.000 0.688 0.312 0.000
#> SRR1407492 4 0.1209 0.9562 0.000 0.032 0.004 0.964
#> SRR1455082 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR658362 2 0.1022 0.9373 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR810921 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR662823 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1456375 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.0188 0.9562 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1474816 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1466400 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658921 4 0.3444 0.7567 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR1499873 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1101373 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1396166 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454891 4 0.1022 0.9579 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR663185 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR811819 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656758 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660450 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1334291 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1415153 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1323271 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1368939 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443161 3 0.0188 0.9562 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR614695 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612779 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.4800 0.4820 0.656 0.004 0.340 0.000
#> SRR1105463 1 0.5080 0.2701 0.576 0.004 0.420 0.000
#> SRR811005 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0188 0.9562 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1355415 3 0.4905 0.4270 0.364 0.004 0.632 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.0188 0.9543 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 3 0.5070 0.2875 0.416 0.004 0.580 0.000
#> SRR1321165 1 0.0188 0.9688 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074790 4 0.5486 0.6887 0.200 0.080 0.000 0.720
#> SRR1432106 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR655756 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1458314 1 0.0188 0.9688 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1318582 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1080484 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1072749 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 4 0.0779 0.9378 0.000 0.004 0.016 0.980
#> SRR1078834 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417611 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1396840 1 0.3105 0.8235 0.856 0.004 0.140 0.000
#> SRR1465440 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1400530 2 0.0921 0.9462 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR614984 4 0.1209 0.9562 0.000 0.032 0.004 0.964
#> SRR1324269 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.1118 0.9403 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0469 0.9566 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1345523 4 0.4996 0.0978 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR1500846 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1419062 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1480131 1 0.0188 0.9688 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0188 0.9569 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099189 4 0.3528 0.7868 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347436 4 0.1022 0.9579 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1327473 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338195 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809698 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658271 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1339597 1 0.0188 0.9688 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354620 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR615056 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1105320 1 0.2011 0.8949 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0188 0.9569 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.3400 0.8052 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1435330 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615383 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1389157 4 0.1209 0.9355 0.000 0.004 0.032 0.964
#> SRR613568 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1103092 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 3 0.0657 0.9500 0.000 0.004 0.984 0.012
#> SRR1475345 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR809089 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1446180 3 0.2334 0.8834 0.000 0.004 0.908 0.088
#> SRR1406372 2 0.1118 0.9403 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1339880 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353136 3 0.0188 0.9562 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.4967 0.1405 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1399861 2 0.0469 0.9489 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1338789 1 0.0188 0.9688 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.5137 0.1653 0.000 0.004 0.544 0.452
#> SRR1315041 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR661877 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1443268 3 0.4936 0.4073 0.372 0.004 0.624 0.000
#> SRR1416617 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655672 4 0.1022 0.9579 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1420006 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458267 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR613819 2 0.0188 0.9569 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1469432 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR660907 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1465092 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1470727 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.0188 0.9569 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1431326 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1098312 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR810273 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1376000 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0188 0.9569 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR811471 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088606 3 0.1109 0.9375 0.000 0.004 0.968 0.028
#> SRR1479699 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403589 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR812625 4 0.3074 0.8027 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1471222 2 0.3610 0.7736 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1378992 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659427 2 0.3942 0.6786 0.000 0.764 0.236 0.000
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.1118 0.9403 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR659307 3 0.4872 0.4404 0.000 0.004 0.640 0.356
#> SRR1439994 3 0.4632 0.5499 0.308 0.004 0.688 0.000
#> SRR1454931 1 0.0188 0.9688 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1332928 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR658621 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.2053 0.9025 0.924 0.004 0.072 0.000
#> SRR1374270 2 0.0188 0.9569 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1470947 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1365598 4 0.2814 0.8268 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR662787 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1408727 2 0.0188 0.9569 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1456274 3 0.4401 0.6206 0.272 0.004 0.724 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1387379 4 0.4661 0.4995 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR1102680 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 3 0.5070 0.2870 0.416 0.004 0.580 0.000
#> SRR820049 3 0.0188 0.9562 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1375290 3 0.0188 0.9562 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR818999 1 0.1576 0.9272 0.948 0.004 0.048 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.0188 0.9688 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1332187 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR657833 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1436207 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1308086 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1452356 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1442983 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1100346 4 0.0592 0.9532 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1332816 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612299 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1309403 1 0.0592 0.9575 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1498395 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1079998 3 0.3402 0.7850 0.164 0.004 0.832 0.000
#> SRR1498885 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1337215 4 0.4564 0.4870 0.000 0.328 0.000 0.672
#> SRR1414749 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365963 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1368030 2 0.0188 0.9569 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1419760 4 0.1297 0.9493 0.000 0.020 0.016 0.964
#> SRR1381841 1 0.0188 0.9688 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR821388 3 0.0188 0.9562 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR657623 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1094241 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819583 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1311666 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1486698 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1446436 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR811653 3 0.3649 0.7282 0.000 0.204 0.796 0.000
#> SRR1311348 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1489438 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1435442 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1319520 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1416596 2 0.1118 0.9403 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1485499 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1316078 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR663465 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1310094 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR663537 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613318 2 0.0336 0.9525 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818670 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500931 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1387494 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379175 2 0.0469 0.9490 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1401909 3 0.3494 0.7745 0.172 0.004 0.824 0.000
#> SRR1440541 2 0.0592 0.9534 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1068832 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1376640 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0469 0.9562 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1082283 1 0.3494 0.7815 0.824 0.004 0.172 0.000
#> SRR1084276 1 0.0188 0.9688 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.3024 0.8434 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1437035 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0188 0.9688 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1443026 4 0.3873 0.7308 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.1118 0.9403 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1101128 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1363886 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR612983 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1394366 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093218 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077090 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1327430 2 0.0188 0.9569 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1088958 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.4843 0.3222 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR614335 2 0.0188 0.9569 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR660534 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR817094 2 0.4888 0.2665 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1334265 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1456401 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1086393 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.0188 0.9569 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.3157 0.8189 0.852 0.004 0.144 0.000
#> SRR1499482 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR614719 4 0.1022 0.9579 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1081473 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 3 0.0376 0.9549 0.004 0.004 0.992 0.000
#> SRR808496 2 0.0188 0.9569 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1336463 2 0.0921 0.9463 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR612359 4 0.1209 0.9562 0.000 0.032 0.004 0.964
#> SRR1444412 1 0.0188 0.9688 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656095 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR808914 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.5097 0.2410 0.568 0.004 0.428 0.000
#> SRR1337886 4 0.0817 0.9582 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR813632 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1089713 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498354 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081519 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR614707 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1079502 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1457814 2 0.1118 0.9275 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1455127 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR615081 2 0.3873 0.7357 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1327855 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1417873 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1394125 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR612383 4 0.1022 0.9579 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR612851 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1340010 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475885 3 0.6044 0.3284 0.384 0.004 0.572 0.040
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612323 4 0.1209 0.9562 0.000 0.032 0.004 0.964
#> SRR612604 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1389546 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 3 0.4920 0.4177 0.368 0.004 0.628 0.000
#> SRR1101808 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1414079 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331153 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078439 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2165527 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1351147 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1313536 4 0.0469 0.9519 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1070308 4 0.5355 0.7105 0.180 0.084 0.000 0.736
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1401317 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1456862 1 0.0188 0.9688 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1443376 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1471312 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.3626 0.7579 0.000 0.004 0.812 0.184
#> SRR612251 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658045 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR613214 4 0.1209 0.9562 0.000 0.032 0.004 0.964
#> SRR613078 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472998 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1433452 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465983 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.2281 0.8988 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1417547 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR659389 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1490270 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.4855 0.4580 0.644 0.004 0.352 0.000
#> SRR1358755 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1078903 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1323252 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1451796 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615982 4 0.1022 0.9579 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1480431 2 0.2469 0.8635 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1429825 2 0.1118 0.9403 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1102393 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1071313 1 0.5016 0.3344 0.600 0.004 0.396 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1081910 1 0.4855 0.4496 0.644 0.004 0.352 0.000
#> SRR1086611 4 0.2593 0.8498 0.000 0.004 0.104 0.892
#> SRR1392571 4 0.1022 0.9579 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1311441 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433131 4 0.0000 0.9486 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.1557 0.9186 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1500598 2 0.0336 0.9585 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1379343 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613557 4 0.1284 0.9429 0.000 0.012 0.024 0.964
#> SRR809831 1 0.0188 0.9688 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.9584 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9712 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.0188 0.9575 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1072031 4 0.0921 0.9592 0.000 0.028 0.000 0.972
#> SRR1374671 4 0.1022 0.9579 0.000 0.032 0.000 0.968
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 3 0.0290 0.91436 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1404105 1 0.0162 0.92104 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.1341 0.90204 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR614491 2 0.4054 0.69787 0.000 0.748 0.028 0.224 0.000
#> SRR1069376 1 0.1043 0.91878 0.960 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1328073 2 0.4918 0.60472 0.148 0.748 0.080 0.024 0.000
#> SRR1394209 5 0.0162 0.93025 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1474018 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.5480 0.30199 0.560 0.000 0.368 0.072 0.000
#> SRR1500555 2 0.3966 0.59995 0.000 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1354363 1 0.1671 0.91189 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1391619 3 0.2732 0.81706 0.000 0.000 0.840 0.160 0.000
#> SRR1307997 2 0.1121 0.85067 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR663124 2 0.3274 0.73063 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1334670 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR612515 2 0.4054 0.69787 0.000 0.748 0.028 0.224 0.000
#> SRR1092727 2 0.0794 0.85700 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1364013 2 0.2074 0.77592 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1468553 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1403980 3 0.0290 0.91410 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1420169 3 0.1478 0.89841 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR1442800 4 0.5708 0.63247 0.036 0.164 0.112 0.688 0.000
#> SRR1359214 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.5603 -0.00232 0.476 0.000 0.452 0.072 0.000
#> SRR1500030 3 0.0290 0.91396 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1093053 3 0.2516 0.83474 0.000 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR1399843 3 0.0290 0.91450 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1380231 3 0.1341 0.90302 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR809470 3 0.1768 0.89245 0.004 0.000 0.924 0.072 0.000
#> SRR614239 2 0.3882 0.70707 0.000 0.756 0.020 0.224 0.000
#> SRR613939 4 0.4171 0.68728 0.000 0.396 0.000 0.604 0.000
#> SRR612971 5 0.1197 0.89583 0.000 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1490204 2 0.0609 0.85985 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR613006 4 0.4268 0.64370 0.000 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1362906 3 0.0290 0.91396 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1079023 1 0.0162 0.92051 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 5 0.6883 0.40448 0.204 0.000 0.132 0.080 0.584
#> SRR1478700 1 0.3309 0.86594 0.836 0.000 0.036 0.128 0.000
#> SRR1081543 3 0.0703 0.90835 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1384754 3 0.1830 0.87989 0.008 0.000 0.924 0.068 0.000
#> SRR612287 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380317 5 0.3696 0.70754 0.000 0.000 0.016 0.212 0.772
#> SRR1315247 4 0.4030 0.70811 0.000 0.352 0.000 0.648 0.000
#> SRR1105344 4 0.5059 0.30614 0.000 0.036 0.000 0.548 0.416
#> SRR658549 2 0.3274 0.73063 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1480240 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.3395 0.57252 0.000 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1358520 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419476 3 0.0609 0.91228 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1456075 3 0.1341 0.90468 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1334419 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1417154 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1095985 3 0.3752 0.67290 0.000 0.000 0.708 0.292 0.000
#> SRR1325771 1 0.0162 0.92051 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1360420 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR660272 4 0.4242 0.66545 0.000 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR1332993 1 0.0290 0.92121 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808044 1 0.4454 0.78631 0.760 0.000 0.112 0.128 0.000
#> SRR1076916 3 0.0703 0.91158 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1356266 1 0.1671 0.91665 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1341983 2 0.5102 0.46698 0.000 0.696 0.000 0.176 0.128
#> SRR1456114 1 0.1965 0.90622 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1072948 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1472370 3 0.1270 0.90271 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1480176 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR613843 2 0.3242 0.51982 0.000 0.784 0.000 0.216 0.000
#> SRR1469192 1 0.0162 0.92104 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1404555 3 0.1478 0.88665 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362848 5 0.3696 0.65686 0.000 0.000 0.212 0.016 0.772
#> SRR1407492 2 0.3882 0.70707 0.000 0.756 0.020 0.224 0.000
#> SRR1455082 2 0.1043 0.85382 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR658362 5 0.4350 0.51237 0.000 0.268 0.000 0.028 0.704
#> SRR810921 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662823 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456375 3 0.1197 0.90441 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR818232 1 0.1851 0.88624 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1454868 3 0.3336 0.75111 0.000 0.000 0.772 0.228 0.000
#> SRR1474816 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.92070 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1466400 4 0.4101 0.70826 0.000 0.372 0.000 0.628 0.000
#> SRR658921 4 0.5467 0.70690 0.000 0.276 0.000 0.624 0.100
#> SRR1499873 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1090145 1 0.2020 0.87690 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1379324 1 0.1965 0.90622 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1086280 3 0.0162 0.91452 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1454891 2 0.2852 0.77085 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR663185 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1318920 1 0.2773 0.87567 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0162 0.92051 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR660450 4 0.4201 0.68567 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1472687 5 0.1197 0.89583 0.000 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1334291 2 0.0880 0.85562 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323271 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368939 4 0.4278 0.62957 0.000 0.452 0.000 0.548 0.000
#> SRR1443161 3 0.2516 0.83474 0.000 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR614695 4 0.4045 0.70837 0.000 0.356 0.000 0.644 0.000
#> SRR1092372 1 0.3003 0.86255 0.812 0.000 0.000 0.188 0.000
#> SRR1474577 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1406582 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1354071 1 0.5546 0.07556 0.496 0.000 0.436 0.068 0.000
#> SRR1105463 3 0.5603 0.08602 0.452 0.000 0.476 0.072 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.1965 0.88205 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1325871 3 0.3109 0.77896 0.000 0.000 0.800 0.200 0.000
#> SRR1355415 3 0.5062 0.57997 0.276 0.000 0.656 0.068 0.000
#> SRR1090861 1 0.0162 0.92051 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1320712 5 0.0290 0.92785 0.000 0.000 0.000 0.008 0.992
#> SRR1470075 1 0.1965 0.90622 0.904 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1091254 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1101397 3 0.5814 0.44988 0.288 0.000 0.584 0.128 0.000
#> SRR1321165 1 0.3210 0.84571 0.788 0.000 0.000 0.212 0.000
#> SRR1092112 3 0.1410 0.89927 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1417588 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1074790 2 0.1892 0.78697 0.080 0.916 0.000 0.004 0.000
#> SRR1432106 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.2127 0.90168 0.892 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0162 0.92104 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1078586 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1400333 4 0.2763 0.60885 0.000 0.148 0.004 0.848 0.000
#> SRR1078834 4 0.3586 0.67354 0.000 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR1417611 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.4461 0.78913 0.728 0.000 0.052 0.220 0.000
#> SRR1465440 5 0.1197 0.89583 0.000 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1400530 5 0.3805 0.68993 0.000 0.032 0.000 0.184 0.784
#> SRR614984 2 0.3789 0.71122 0.000 0.760 0.016 0.224 0.000
#> SRR1324269 1 0.0609 0.91870 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1401491 4 0.5175 0.32577 0.000 0.044 0.000 0.548 0.408
#> SRR1319443 1 0.1197 0.91086 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1324349 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.2471 0.73197 0.000 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1500846 1 0.1671 0.91189 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR661505 3 0.1270 0.90491 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1419062 3 0.0963 0.90915 0.000 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1480131 1 0.1608 0.89920 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1421284 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1315739 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1099189 2 0.4094 0.73402 0.000 0.788 0.000 0.128 0.084
#> SRR1083286 1 0.1121 0.91292 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1091890 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1347436 2 0.2230 0.80742 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1327473 1 0.0671 0.91583 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1338195 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.2329 0.89392 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1454842 3 0.2471 0.83813 0.000 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR1322643 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR614887 3 0.2230 0.85196 0.000 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR1354620 3 0.1768 0.89236 0.004 0.000 0.924 0.072 0.000
#> SRR615056 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 0.3687 0.73950 0.792 0.000 0.180 0.028 0.000
#> SRR1391529 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR663052 5 0.3612 0.61079 0.000 0.228 0.000 0.008 0.764
#> SRR1478834 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR812366 4 0.5288 0.34456 0.000 0.052 0.000 0.544 0.404
#> SRR1435330 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 2 0.4284 0.68324 0.000 0.736 0.040 0.224 0.000
#> SRR613568 4 0.4242 0.66545 0.000 0.428 0.000 0.572 0.000
#> SRR614095 5 0.0963 0.90597 0.000 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1103092 1 0.0510 0.91891 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1337155 3 0.3895 0.64699 0.000 0.000 0.680 0.320 0.000
#> SRR1475345 5 0.0794 0.91162 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR809089 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 4 0.3909 0.49731 0.000 0.024 0.216 0.760 0.000
#> SRR1406372 4 0.5003 0.28792 0.000 0.032 0.000 0.544 0.424
#> SRR1339880 3 0.0290 0.91396 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1353136 3 0.3109 0.77921 0.000 0.000 0.800 0.200 0.000
#> SRR1093906 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR614035 2 0.2605 0.71406 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1351104 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1363926 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399861 5 0.3596 0.71928 0.000 0.000 0.016 0.200 0.784
#> SRR1338789 1 0.2424 0.89277 0.868 0.000 0.000 0.132 0.000
#> SRR1421420 3 0.0162 0.91450 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1420832 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.92070 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.4737 0.66527 0.000 0.068 0.708 0.224 0.000
#> SRR1315041 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR661877 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443268 3 0.5733 0.51495 0.256 0.000 0.608 0.136 0.000
#> SRR1416617 3 0.0000 0.91451 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR655672 2 0.3274 0.73063 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1420006 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1458267 2 0.1121 0.85067 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR613819 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1469432 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660907 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0609 0.85985 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1470727 1 0.0703 0.91971 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1339153 3 0.2471 0.83608 0.000 0.000 0.864 0.136 0.000
#> SRR1472749 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1414379 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1487278 4 0.4114 0.70731 0.000 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1098312 3 0.0404 0.91392 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0510 0.86084 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR614467 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.1732 0.91098 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1478341 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1088606 4 0.3895 0.32508 0.000 0.000 0.320 0.680 0.000
#> SRR1479699 3 0.0290 0.91446 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812625 4 0.6036 0.66794 0.000 0.308 0.000 0.548 0.144
#> SRR1359803 1 0.1410 0.90509 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1338988 5 0.0290 0.92738 0.000 0.008 0.000 0.000 0.992
#> SRR1471222 4 0.5044 0.20535 0.000 0.032 0.000 0.504 0.464
#> SRR1378992 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR659427 5 0.3798 0.72929 0.000 0.000 0.128 0.064 0.808
#> SRR1096638 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1466619 4 0.4273 0.23386 0.000 0.000 0.000 0.552 0.448
#> SRR659307 2 0.6621 0.17261 0.000 0.428 0.348 0.224 0.000
#> SRR1439994 3 0.5434 0.60687 0.208 0.000 0.656 0.136 0.000
#> SRR1454931 1 0.2516 0.85687 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR1332928 3 0.2909 0.84144 0.012 0.000 0.848 0.140 0.000
#> SRR658621 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1458243 1 0.3601 0.85260 0.820 0.000 0.052 0.128 0.000
#> SRR1374270 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470947 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365598 4 0.5385 0.70998 0.000 0.288 0.000 0.624 0.088
#> SRR662787 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1408727 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456274 3 0.5775 0.48985 0.264 0.000 0.600 0.136 0.000
#> SRR817744 1 0.0162 0.92051 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1478744 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.1410 0.81916 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1102680 3 0.0880 0.91019 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1374198 1 0.2773 0.87681 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1445856 3 0.5834 0.46187 0.276 0.000 0.588 0.136 0.000
#> SRR820049 3 0.3274 0.75742 0.000 0.000 0.780 0.220 0.000
#> SRR1375290 3 0.3305 0.75303 0.000 0.000 0.776 0.224 0.000
#> SRR818999 1 0.4138 0.75031 0.780 0.000 0.148 0.072 0.000
#> SRR1390242 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1401164 4 0.4262 0.64973 0.000 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR1454629 1 0.2763 0.84731 0.848 0.000 0.004 0.148 0.000
#> SRR1332187 3 0.0703 0.91142 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR603365 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR657833 4 0.4306 0.53894 0.000 0.492 0.000 0.508 0.000
#> SRR1436207 2 0.0794 0.85700 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.92070 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0162 0.92104 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.0290 0.91396 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1441868 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1485380 3 0.0880 0.90945 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1073705 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR615032 5 0.1197 0.89583 0.000 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1452356 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.3561 0.69847 0.000 0.740 0.000 0.260 0.000
#> SRR1332816 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR612299 4 0.4074 0.70787 0.000 0.364 0.000 0.636 0.000
#> SRR1407386 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.2653 0.84230 0.880 0.000 0.096 0.024 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.3825 0.78293 0.136 0.000 0.804 0.060 0.000
#> SRR1498885 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337215 4 0.5006 0.71369 0.000 0.328 0.000 0.624 0.048
#> SRR1414749 3 0.0000 0.91451 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365963 3 0.1544 0.89837 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1368030 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419760 2 0.3305 0.72691 0.000 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR1381841 1 0.2516 0.85687 0.860 0.000 0.000 0.140 0.000
#> SRR821388 3 0.2516 0.83272 0.000 0.000 0.860 0.140 0.000
#> SRR657623 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094241 3 0.1608 0.88267 0.000 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR819583 3 0.1121 0.90582 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1096149 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1342829 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1353028 1 0.0290 0.92124 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR811333 3 0.1608 0.89417 0.000 0.000 0.928 0.072 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.3143 0.57965 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1446436 2 0.0880 0.85562 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR815092 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1500149 4 0.4268 0.64370 0.000 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR1100564 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1403072 3 0.0404 0.91471 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR811653 3 0.6057 0.47841 0.000 0.000 0.576 0.200 0.224
#> SRR1311348 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1435442 4 0.4114 0.70731 0.000 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1421444 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1344010 5 0.1197 0.89583 0.000 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1319520 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1444763 1 0.2773 0.87067 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1415026 5 0.0609 0.91950 0.000 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1416596 5 0.3210 0.68174 0.000 0.000 0.000 0.212 0.788
#> SRR1485499 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316078 5 0.0794 0.91162 0.000 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR663465 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1310094 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1453950 1 0.0162 0.92104 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1087875 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR613318 5 0.3988 0.69964 0.000 0.000 0.036 0.196 0.768
#> SRR1332694 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.91451 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1311622 3 0.0404 0.91435 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1500931 3 0.1270 0.90271 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1387494 3 0.0290 0.91396 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1379175 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401909 3 0.4238 0.74219 0.164 0.000 0.768 0.068 0.000
#> SRR1440541 5 0.2813 0.74155 0.000 0.168 0.000 0.000 0.832
#> SRR1068832 3 0.1638 0.89718 0.004 0.000 0.932 0.064 0.000
#> SRR1376640 2 0.4150 0.27191 0.000 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR1085712 5 0.3210 0.67299 0.000 0.212 0.000 0.000 0.788
#> SRR1082283 1 0.4933 0.75000 0.704 0.000 0.096 0.200 0.000
#> SRR1084276 1 0.1768 0.89694 0.924 0.000 0.004 0.072 0.000
#> SRR1353262 4 0.5579 0.42052 0.000 0.080 0.000 0.552 0.368
#> SRR1437035 1 0.0955 0.91586 0.968 0.000 0.004 0.028 0.000
#> SRR1396877 1 0.1704 0.89873 0.928 0.000 0.004 0.068 0.000
#> SRR1443026 2 0.4928 0.17832 0.000 0.660 0.000 0.284 0.056
#> SRR1417936 1 0.0000 0.92070 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 5 0.4235 0.17671 0.000 0.000 0.000 0.424 0.576
#> SRR1101128 3 0.0880 0.90945 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1363886 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612983 5 0.2605 0.77072 0.000 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR1394366 4 0.4074 0.70787 0.000 0.364 0.000 0.636 0.000
#> SRR1093218 3 0.0510 0.91387 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1077090 3 0.1410 0.89927 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1327430 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1486931 2 0.0880 0.85562 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1086820 1 0.1732 0.91098 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1383000 1 0.0162 0.92104 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1355705 2 0.2690 0.70193 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR614335 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.2074 0.76480 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1334265 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456401 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.1671 0.91189 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1351521 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1093100 5 0.0162 0.93025 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1309382 1 0.0510 0.91963 0.984 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1089375 1 0.4645 0.58333 0.688 0.000 0.268 0.044 0.000
#> SRR1499482 2 0.0510 0.86116 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR614719 2 0.3039 0.75507 0.000 0.808 0.000 0.192 0.000
#> SRR1081473 3 0.0609 0.91367 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1087415 1 0.1732 0.91098 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1088217 3 0.3321 0.83212 0.032 0.000 0.832 0.136 0.000
#> SRR808496 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1336463 5 0.4940 0.18314 0.000 0.032 0.000 0.392 0.576
#> SRR612359 2 0.3305 0.72691 0.000 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR1444412 1 0.1270 0.90922 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1074116 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR821846 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1349099 1 0.6114 0.56648 0.564 0.000 0.192 0.244 0.000
#> SRR1337886 2 0.2179 0.73351 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR813632 1 0.0290 0.92022 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1101591 3 0.1197 0.90441 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1089713 3 0.3966 0.79895 0.072 0.000 0.796 0.132 0.000
#> SRR1453127 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1498354 3 0.1544 0.89595 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR1313831 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1315434 3 0.0290 0.91396 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR814747 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1367807 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1365791 3 0.1908 0.87464 0.000 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1081519 3 0.1544 0.89595 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR614707 4 0.4074 0.70787 0.000 0.364 0.000 0.636 0.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.92070 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.2605 0.84572 0.000 0.000 0.852 0.148 0.000
#> SRR1079502 3 0.1043 0.90793 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1457814 5 0.4096 0.69050 0.000 0.000 0.040 0.200 0.760
#> SRR1455127 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR615081 4 0.5595 0.58008 0.000 0.124 0.000 0.624 0.252
#> SRR1327855 3 0.0609 0.91209 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1417873 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1394125 3 0.0510 0.91379 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR1488388 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1401122 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.3461 0.72323 0.000 0.772 0.004 0.224 0.000
#> SRR1477711 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1350813 2 0.0794 0.85700 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR612851 2 0.1197 0.84919 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.92070 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 5 0.1197 0.89583 0.000 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1340010 3 0.0404 0.91392 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1475885 4 0.4417 0.51524 0.100 0.004 0.124 0.772 0.000
#> SRR1376334 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1399821 1 0.1732 0.91098 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1347042 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR612323 2 0.4054 0.69787 0.000 0.748 0.028 0.224 0.000
#> SRR612604 4 0.4114 0.70731 0.000 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.92070 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 3 0.5565 0.55929 0.240 0.000 0.632 0.128 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1331153 4 0.4262 0.64973 0.000 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR1078439 3 0.1544 0.88511 0.000 0.000 0.932 0.068 0.000
#> SRR2165527 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1351147 1 0.2605 0.83451 0.852 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1313536 4 0.4430 0.62048 0.000 0.456 0.000 0.540 0.004
#> SRR1070308 2 0.2828 0.74487 0.104 0.872 0.020 0.004 0.000
#> SRR1403110 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0703 0.91123 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1456862 1 0.2377 0.89234 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1074622 1 0.0963 0.91933 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1465847 3 0.1197 0.90441 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0290 0.91468 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1075579 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1090881 3 0.4284 0.70640 0.000 0.040 0.736 0.224 0.000
#> SRR612251 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613214 2 0.3690 0.71517 0.000 0.764 0.012 0.224 0.000
#> SRR613078 4 0.4114 0.70731 0.000 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1472998 3 0.1410 0.89927 0.000 0.000 0.940 0.060 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0162 0.92104 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1487993 3 0.0290 0.91396 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1367566 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1316151 4 0.4525 0.40334 0.000 0.016 0.000 0.624 0.360
#> SRR1417547 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 4 0.4268 0.64370 0.000 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR1398207 1 0.5587 0.10879 0.500 0.000 0.428 0.072 0.000
#> SRR1358755 3 0.2325 0.88067 0.028 0.000 0.904 0.068 0.000
#> SRR1078903 2 0.1043 0.85236 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.2074 0.90326 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR615982 2 0.2329 0.80570 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1480431 2 0.4302 0.12966 0.000 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR1429825 4 0.4278 0.22384 0.000 0.000 0.000 0.548 0.452
#> SRR1102393 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.6180 0.16225 0.460 0.000 0.404 0.136 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.92070 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0404 0.91966 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1480501 3 0.0609 0.91209 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1081910 1 0.5447 0.37000 0.572 0.000 0.356 0.072 0.000
#> SRR1086611 4 0.2920 0.60656 0.000 0.132 0.016 0.852 0.000
#> SRR1392571 2 0.3143 0.74445 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1311441 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR808152 1 0.0162 0.92104 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR657313 3 0.2377 0.84262 0.000 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1433131 4 0.4219 0.67829 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR1321011 2 0.3452 0.55451 0.000 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR1500598 5 0.0000 0.93299 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.1608 0.91256 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.91451 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0290 0.92016 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1358060 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1464517 3 0.0162 0.91450 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR613557 2 0.4284 0.68324 0.000 0.736 0.040 0.224 0.000
#> SRR809831 1 0.0794 0.91711 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1429387 3 0.0162 0.91447 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.92070 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.92070 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.0963 0.91047 0.000 0.000 0.964 0.036 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.86509 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.3274 0.73063 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 3 0.1204 0.83984 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1404105 1 0.2527 0.52608 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.3215 0.75807 0.000 0.000 0.756 0.000 0.240 0.004
#> SRR614491 2 0.6934 0.46747 0.000 0.480 0.092 0.004 0.256 0.168
#> SRR1069376 1 0.3672 0.22263 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1328073 2 0.4081 0.66933 0.160 0.768 0.048 0.000 0.024 0.000
#> SRR1394209 4 0.0146 0.90804 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1474018 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.5410 0.06836 0.576 0.000 0.176 0.000 0.248 0.000
#> SRR1500555 2 0.6061 0.41331 0.000 0.456 0.000 0.004 0.252 0.288
#> SRR1354363 1 0.3860 -0.00356 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472 0.000
#> SRR1391619 3 0.3782 0.67467 0.000 0.000 0.740 0.000 0.224 0.036
#> SRR1307997 2 0.1745 0.82757 0.000 0.924 0.000 0.000 0.020 0.056
#> SRR663124 2 0.5526 0.56998 0.000 0.572 0.000 0.004 0.256 0.168
#> SRR1334670 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 2 0.6970 0.46216 0.000 0.476 0.096 0.004 0.256 0.168
#> SRR1092727 2 0.1152 0.83795 0.000 0.952 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1364013 2 0.0713 0.83864 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1468553 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.1411 0.83772 0.000 0.000 0.936 0.000 0.060 0.004
#> SRR1420169 3 0.3426 0.72841 0.000 0.000 0.720 0.000 0.276 0.004
#> SRR1442800 6 0.3780 0.81670 0.016 0.072 0.048 0.000 0.036 0.828
#> SRR1359214 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.5568 0.03234 0.552 0.000 0.212 0.000 0.236 0.000
#> SRR1500030 3 0.0713 0.83952 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1093053 3 0.3388 0.72410 0.000 0.000 0.792 0.000 0.172 0.036
#> SRR1399843 3 0.1753 0.84007 0.000 0.000 0.912 0.000 0.084 0.004
#> SRR1380231 3 0.2833 0.80029 0.012 0.000 0.836 0.000 0.148 0.004
#> SRR809470 3 0.4732 0.64351 0.084 0.000 0.664 0.000 0.248 0.004
#> SRR614239 2 0.6392 0.52600 0.000 0.528 0.044 0.004 0.256 0.168
#> SRR613939 6 0.2260 0.85357 0.000 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR612971 4 0.2378 0.78964 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.1010 0.84142 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR811357 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.3851 0.03614 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460 0.000
#> SRR613006 6 0.2730 0.85057 0.000 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1469570 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0713 0.83952 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1079023 1 0.0260 0.60953 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 5 0.6596 0.37665 0.116 0.000 0.108 0.260 0.516 0.000
#> SRR1478700 5 0.3725 0.50741 0.316 0.000 0.008 0.000 0.676 0.000
#> SRR1081543 3 0.1663 0.80037 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1384754 3 0.3851 0.06973 0.000 0.000 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR612287 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1380317 4 0.5514 0.49314 0.000 0.000 0.016 0.596 0.260 0.128
#> SRR1315247 6 0.2320 0.85370 0.000 0.132 0.000 0.000 0.004 0.864
#> SRR1105344 6 0.3672 0.77283 0.000 0.056 0.000 0.168 0.000 0.776
#> SRR658549 2 0.5526 0.56998 0.000 0.572 0.000 0.004 0.256 0.168
#> SRR1480240 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.1444 0.80279 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1358520 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.1644 0.83322 0.000 0.000 0.920 0.000 0.076 0.004
#> SRR1456075 3 0.3189 0.76418 0.000 0.000 0.760 0.000 0.236 0.004
#> SRR1389474 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1334419 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1417154 3 0.0146 0.84450 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1095985 3 0.6909 0.34012 0.072 0.000 0.440 0.000 0.260 0.228
#> SRR1325771 1 0.0363 0.60916 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660272 6 0.2730 0.85070 0.000 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1332993 1 0.3023 0.45189 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808044 5 0.4400 0.57003 0.248 0.000 0.068 0.000 0.684 0.000
#> SRR1076916 3 0.1908 0.82579 0.000 0.000 0.900 0.000 0.096 0.004
#> SRR1356266 1 0.2730 0.45778 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192 0.000
#> SRR1341983 2 0.4793 0.36958 0.000 0.628 0.000 0.084 0.000 0.288
#> SRR1456114 5 0.3860 0.18673 0.472 0.000 0.000 0.000 0.528 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.3081 0.76267 0.000 0.000 0.776 0.000 0.220 0.004
#> SRR1480176 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.3428 0.43561 0.000 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1469192 1 0.2527 0.52608 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1404555 3 0.0363 0.84260 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR659839 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362848 4 0.4110 0.57655 0.000 0.000 0.268 0.692 0.040 0.000
#> SRR1407492 2 0.6498 0.51710 0.000 0.520 0.052 0.004 0.256 0.168
#> SRR1455082 2 0.2020 0.81143 0.000 0.896 0.000 0.000 0.008 0.096
#> SRR658362 4 0.5023 0.44703 0.000 0.296 0.000 0.628 0.044 0.032
#> SRR810921 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662823 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.2933 0.77142 0.000 0.000 0.796 0.000 0.200 0.004
#> SRR818232 1 0.1124 0.58917 0.956 0.000 0.000 0.000 0.036 0.008
#> SRR1454868 3 0.5555 0.49828 0.000 0.000 0.560 0.004 0.276 0.160
#> SRR1474816 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.1765 0.57850 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1088437 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1466400 6 0.2527 0.85811 0.000 0.168 0.000 0.000 0.000 0.832
#> SRR658921 6 0.2907 0.86003 0.000 0.152 0.000 0.020 0.000 0.828
#> SRR1499873 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1090145 1 0.1780 0.56624 0.924 0.000 0.000 0.000 0.048 0.028
#> SRR1379324 5 0.3838 0.25556 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.1082 0.84220 0.000 0.000 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR1454891 2 0.3909 0.73546 0.000 0.772 0.000 0.004 0.076 0.148
#> SRR663185 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.4629 -0.12648 0.524 0.000 0.000 0.000 0.436 0.040
#> SRR656758 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0260 0.60953 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR660450 6 0.2762 0.84887 0.000 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR1472687 4 0.2048 0.82202 0.000 0.120 0.000 0.880 0.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.1367 0.83527 0.000 0.944 0.000 0.000 0.012 0.044
#> SRR1415153 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323271 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1368939 6 0.3076 0.81282 0.000 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760
#> SRR1443161 3 0.3551 0.71245 0.000 0.000 0.772 0.000 0.192 0.036
#> SRR614695 6 0.2219 0.85379 0.000 0.136 0.000 0.000 0.000 0.864
#> SRR1092372 1 0.4649 -0.25551 0.492 0.000 0.000 0.000 0.468 0.040
#> SRR1474577 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1406582 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1354071 1 0.5482 0.08761 0.588 0.000 0.192 0.000 0.216 0.004
#> SRR1105463 1 0.5794 0.00506 0.528 0.000 0.220 0.000 0.248 0.004
#> SRR811005 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.1225 0.58696 0.952 0.000 0.000 0.000 0.036 0.012
#> SRR1325871 3 0.5165 0.54834 0.000 0.000 0.612 0.004 0.268 0.116
#> SRR1355415 3 0.5814 0.38374 0.224 0.000 0.524 0.000 0.248 0.004
#> SRR1090861 1 0.0363 0.60916 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1320712 4 0.0632 0.89615 0.000 0.000 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1470075 5 0.3857 0.20126 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532 0.000
#> SRR1091254 1 0.0363 0.60916 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1101397 5 0.4389 0.58687 0.100 0.000 0.188 0.000 0.712 0.000
#> SRR1321165 5 0.4824 0.36016 0.420 0.000 0.000 0.000 0.524 0.056
#> SRR1092112 3 0.3189 0.74306 0.000 0.000 0.760 0.000 0.236 0.004
#> SRR1417588 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.2302 0.75331 0.120 0.872 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1432106 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458314 5 0.3717 0.40872 0.384 0.000 0.000 0.000 0.616 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1072749 1 0.2793 0.51336 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 6 0.0508 0.76657 0.000 0.004 0.000 0.000 0.012 0.984
#> SRR1078834 6 0.1531 0.82188 0.000 0.068 0.000 0.000 0.004 0.928
#> SRR1417611 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1396840 5 0.5307 0.45730 0.332 0.000 0.028 0.000 0.580 0.060
#> SRR1465440 4 0.2340 0.79430 0.000 0.148 0.000 0.852 0.000 0.000
#> SRR1400530 4 0.2937 0.79110 0.000 0.056 0.000 0.848 0.000 0.096
#> SRR614984 2 0.6392 0.52600 0.000 0.528 0.044 0.004 0.256 0.168
#> SRR1324269 1 0.0713 0.59546 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1401491 6 0.3806 0.77874 0.000 0.068 0.000 0.164 0.000 0.768
#> SRR1319443 1 0.1007 0.58794 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1324349 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1345523 2 0.0790 0.83509 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.3854 0.02447 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR661505 3 0.2060 0.83534 0.000 0.000 0.900 0.000 0.084 0.016
#> SRR1419062 3 0.2100 0.82069 0.000 0.000 0.884 0.000 0.112 0.004
#> SRR1480131 1 0.2969 0.37852 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1421284 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.3977 0.74396 0.000 0.780 0.000 0.020 0.056 0.144
#> SRR1083286 1 0.1863 0.53347 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1091890 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.3482 0.76338 0.000 0.812 0.000 0.004 0.068 0.116
#> SRR1327473 1 0.2121 0.58028 0.892 0.000 0.000 0.012 0.096 0.000
#> SRR1338195 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 5 0.3647 0.45134 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640 0.000
#> SRR1454842 3 0.3319 0.73113 0.000 0.000 0.800 0.000 0.164 0.036
#> SRR1322643 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR614887 3 0.2988 0.74544 0.000 0.000 0.828 0.000 0.144 0.028
#> SRR1354620 3 0.4687 0.65230 0.084 0.000 0.672 0.000 0.240 0.004
#> SRR615056 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.4376 0.23142 0.704 0.000 0.212 0.000 0.084 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663052 4 0.4136 0.54494 0.000 0.272 0.000 0.692 0.032 0.004
#> SRR1478834 1 0.0146 0.60843 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR812366 6 0.3892 0.72741 0.000 0.048 0.000 0.212 0.000 0.740
#> SRR1435330 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 2 0.7277 0.40688 0.000 0.436 0.136 0.004 0.256 0.168
#> SRR613568 6 0.2762 0.84887 0.000 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR614095 4 0.1556 0.85704 0.000 0.080 0.000 0.920 0.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.1267 0.57325 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1337155 3 0.5986 0.23630 0.000 0.000 0.408 0.000 0.232 0.360
#> SRR1475345 4 0.1204 0.87399 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 6 0.2932 0.76509 0.000 0.012 0.040 0.000 0.088 0.860
#> SRR1406372 6 0.4038 0.68619 0.000 0.044 0.000 0.244 0.000 0.712
#> SRR1339880 3 0.0713 0.83952 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1353136 3 0.5127 0.55883 0.000 0.000 0.616 0.004 0.268 0.112
#> SRR1093906 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0937 0.82937 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.3854 0.02542 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR1363926 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1399861 4 0.6006 0.45850 0.000 0.000 0.048 0.568 0.260 0.124
#> SRR1338789 5 0.3930 0.33105 0.420 0.000 0.000 0.000 0.576 0.004
#> SRR1421420 3 0.1152 0.84331 0.000 0.000 0.952 0.000 0.044 0.004
#> SRR1420832 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.1387 0.59264 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1352870 3 0.5526 0.50172 0.000 0.000 0.572 0.004 0.256 0.168
#> SRR1315041 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR661877 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1443268 5 0.4095 0.57431 0.064 0.000 0.208 0.000 0.728 0.000
#> SRR1416617 3 0.0935 0.84332 0.000 0.000 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR1102443 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR655672 2 0.5526 0.56998 0.000 0.572 0.000 0.004 0.256 0.168
#> SRR1420006 3 0.0146 0.84473 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1458267 2 0.1926 0.82211 0.000 0.912 0.000 0.000 0.020 0.068
#> SRR613819 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1469432 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR660907 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0937 0.84099 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1470727 1 0.3151 0.46219 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1339153 3 0.3551 0.69703 0.000 0.000 0.772 0.000 0.192 0.036
#> SRR1472749 3 0.0146 0.84372 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1414379 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1431326 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1487278 6 0.2562 0.85754 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1098312 3 0.0865 0.83878 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.1444 0.82610 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR614467 4 0.0000 0.90955 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811471 1 0.3867 -0.06918 0.512 0.000 0.000 0.000 0.488 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088606 6 0.4314 0.61839 0.000 0.000 0.096 0.000 0.184 0.720
#> SRR1479699 3 0.0865 0.83878 0.000 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812625 6 0.3695 0.84347 0.000 0.164 0.000 0.060 0.000 0.776
#> SRR1359803 1 0.1349 0.57785 0.940 0.000 0.000 0.000 0.056 0.004
#> SRR1338988 4 0.1075 0.88075 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1471222 6 0.3482 0.58036 0.000 0.000 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR1378992 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR659427 4 0.3370 0.76319 0.000 0.000 0.092 0.828 0.072 0.008
#> SRR1096638 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1466619 6 0.2883 0.72516 0.000 0.000 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR659307 3 0.7136 0.32159 0.000 0.116 0.456 0.004 0.256 0.168
#> SRR1439994 5 0.4258 0.57415 0.068 0.000 0.204 0.000 0.724 0.004
#> SRR1454931 1 0.3348 0.37490 0.768 0.000 0.000 0.000 0.216 0.016
#> SRR1332928 5 0.3426 0.44334 0.000 0.000 0.276 0.000 0.720 0.004
#> SRR658621 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 5 0.3606 0.55393 0.256 0.000 0.016 0.000 0.728 0.000
#> SRR1374270 4 0.0000 0.90955 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470947 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1365598 6 0.3010 0.85997 0.000 0.148 0.000 0.020 0.004 0.828
#> SRR662787 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1408727 4 0.0000 0.90955 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456274 5 0.4184 0.47259 0.028 0.000 0.296 0.000 0.672 0.004
#> SRR817744 1 0.0260 0.60953 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1478744 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0260 0.84936 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.2053 0.82467 0.000 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1374198 1 0.4366 -0.08599 0.548 0.000 0.000 0.000 0.428 0.024
#> SRR1445856 5 0.4606 0.56958 0.092 0.000 0.212 0.000 0.692 0.004
#> SRR820049 3 0.5196 0.54509 0.000 0.000 0.616 0.004 0.252 0.128
#> SRR1375290 3 0.5470 0.50965 0.000 0.000 0.580 0.004 0.256 0.160
#> SRR818999 1 0.5557 0.03686 0.552 0.000 0.200 0.000 0.248 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 6 0.2730 0.85057 0.000 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808
#> SRR1454629 1 0.3794 0.31205 0.724 0.000 0.000 0.000 0.248 0.028
#> SRR1332187 3 0.0603 0.84525 0.000 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR603365 3 0.0291 0.84517 0.000 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR657833 6 0.3592 0.64650 0.000 0.344 0.000 0.000 0.000 0.656
#> SRR1436207 2 0.1152 0.83795 0.000 0.952 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1488017 1 0.1204 0.59739 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.2562 0.52528 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1364761 2 0.0146 0.85220 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1308086 3 0.0937 0.83767 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1441868 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1485380 3 0.2362 0.80951 0.000 0.000 0.860 0.000 0.136 0.004
#> SRR1073705 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR615032 4 0.2378 0.78964 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000 0.000
#> SRR1452356 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.5899 0.48658 0.000 0.504 0.000 0.004 0.256 0.236
#> SRR1332816 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR612299 6 0.2260 0.85501 0.000 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1407386 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.2618 0.49152 0.872 0.000 0.076 0.000 0.052 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.4663 0.65424 0.080 0.000 0.672 0.000 0.244 0.004
#> SRR1498885 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1337215 6 0.2668 0.85876 0.000 0.168 0.000 0.004 0.000 0.828
#> SRR1414749 3 0.0405 0.84477 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1365963 3 0.3383 0.73344 0.000 0.000 0.728 0.000 0.268 0.004
#> SRR1368030 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1419760 2 0.6598 0.50814 0.060 0.512 0.000 0.004 0.256 0.168
#> SRR1381841 1 0.3376 0.36877 0.764 0.000 0.000 0.000 0.220 0.016
#> SRR821388 3 0.4539 0.60783 0.000 0.000 0.668 0.004 0.268 0.060
#> SRR657623 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.1789 0.81672 0.000 0.000 0.924 0.000 0.044 0.032
#> SRR819583 3 0.2482 0.80301 0.000 0.000 0.848 0.000 0.148 0.004
#> SRR1096149 1 0.3854 0.02435 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.2003 0.57356 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR811333 3 0.4469 0.68426 0.076 0.000 0.700 0.000 0.220 0.004
#> SRR1311666 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.3797 0.21434 0.000 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR1446436 2 0.1528 0.83246 0.000 0.936 0.000 0.000 0.016 0.048
#> SRR815092 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 6 0.3050 0.81725 0.000 0.236 0.000 0.000 0.000 0.764
#> SRR1100564 1 0.0458 0.60291 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1403072 3 0.0858 0.84404 0.000 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR811653 3 0.6844 0.40196 0.000 0.000 0.476 0.124 0.276 0.124
#> SRR1311348 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1435442 6 0.2562 0.85754 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1421444 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344010 4 0.2340 0.79430 0.000 0.148 0.000 0.852 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1444763 5 0.4224 0.28796 0.432 0.000 0.000 0.000 0.552 0.016
#> SRR1415026 4 0.1714 0.84817 0.000 0.092 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1416596 4 0.2697 0.71139 0.000 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1485499 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1316078 4 0.1327 0.86862 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000 0.000
#> SRR663465 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1310094 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1453950 1 0.2562 0.52223 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR1087875 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR613318 4 0.6970 0.32470 0.000 0.000 0.156 0.472 0.248 0.124
#> SRR1332694 1 0.0146 0.60843 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1468469 3 0.1082 0.84172 0.000 0.000 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR818670 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.1700 0.83822 0.000 0.000 0.916 0.000 0.080 0.004
#> SRR1500931 3 0.2805 0.78276 0.000 0.000 0.812 0.000 0.184 0.004
#> SRR1387494 3 0.0632 0.84008 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1379175 4 0.0146 0.90804 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1401909 3 0.5245 0.55752 0.136 0.000 0.612 0.000 0.248 0.004
#> SRR1440541 4 0.3607 0.51116 0.000 0.348 0.000 0.652 0.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.3163 0.75022 0.000 0.000 0.764 0.000 0.232 0.004
#> SRR1376640 6 0.3872 0.27646 0.000 0.392 0.000 0.000 0.004 0.604
#> SRR1085712 4 0.3727 0.44113 0.000 0.388 0.000 0.612 0.000 0.000
#> SRR1082283 5 0.4722 0.56426 0.244 0.000 0.056 0.000 0.680 0.020
#> SRR1084276 1 0.3101 0.34827 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244 0.000
#> SRR1353262 6 0.3672 0.77353 0.000 0.056 0.000 0.168 0.000 0.776
#> SRR1437035 1 0.1556 0.55317 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1396877 1 0.3081 0.37500 0.776 0.000 0.004 0.000 0.220 0.000
#> SRR1443026 2 0.2558 0.68138 0.000 0.840 0.000 0.004 0.000 0.156
#> SRR1417936 1 0.1387 0.59264 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1436822 6 0.3857 0.20180 0.000 0.000 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1101128 3 0.2278 0.81360 0.000 0.000 0.868 0.000 0.128 0.004
#> SRR1363886 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR612983 4 0.3351 0.60304 0.000 0.288 0.000 0.712 0.000 0.000
#> SRR1394366 6 0.2219 0.85379 0.000 0.136 0.000 0.000 0.000 0.864
#> SRR1093218 3 0.2006 0.83264 0.000 0.000 0.892 0.000 0.104 0.004
#> SRR1077090 3 0.3240 0.73859 0.000 0.000 0.752 0.000 0.244 0.004
#> SRR1327430 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1088958 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1486931 2 0.1367 0.83527 0.000 0.944 0.000 0.000 0.012 0.044
#> SRR1086820 1 0.3868 -0.08207 0.508 0.000 0.000 0.000 0.492 0.000
#> SRR1383000 1 0.3288 0.39073 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1355705 2 0.0937 0.82937 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR614335 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0260 0.84899 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1334265 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1456401 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.3851 0.02618 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093100 4 0.0146 0.90783 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1309382 1 0.0458 0.60332 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1089375 1 0.5051 0.16354 0.652 0.000 0.188 0.000 0.156 0.004
#> SRR1499482 2 0.0713 0.84553 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR614719 2 0.5342 0.59857 0.000 0.604 0.000 0.004 0.236 0.156
#> SRR1081473 3 0.2006 0.83256 0.000 0.000 0.892 0.000 0.104 0.004
#> SRR1087415 1 0.3868 -0.08207 0.508 0.000 0.000 0.000 0.492 0.000
#> SRR1088217 3 0.5106 0.62460 0.092 0.000 0.644 0.000 0.248 0.016
#> SRR808496 4 0.0000 0.90955 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1336463 4 0.4755 -0.07318 0.000 0.048 0.000 0.492 0.000 0.460
#> SRR612359 2 0.5659 0.56626 0.000 0.568 0.004 0.004 0.256 0.168
#> SRR1444412 1 0.2597 0.43978 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1074116 3 0.0146 0.84450 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR821846 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 5 0.5415 0.56435 0.140 0.000 0.120 0.000 0.676 0.064
#> SRR1337886 2 0.2762 0.64915 0.000 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR813632 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.2964 0.77074 0.000 0.000 0.792 0.000 0.204 0.004
#> SRR1089713 1 0.6067 -0.06372 0.452 0.000 0.296 0.000 0.248 0.004
#> SRR1453127 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 3 0.3731 0.72291 0.020 0.000 0.736 0.000 0.240 0.004
#> SRR1313831 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0632 0.84039 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR814747 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1365791 3 0.2258 0.83175 0.000 0.000 0.896 0.000 0.060 0.044
#> SRR1081519 3 0.3136 0.74936 0.000 0.000 0.768 0.000 0.228 0.004
#> SRR614707 6 0.2389 0.85321 0.000 0.128 0.000 0.000 0.008 0.864
#> SRR1094027 1 0.1267 0.59595 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1489092 3 0.5746 0.58099 0.084 0.000 0.596 0.000 0.264 0.056
#> SRR1079502 3 0.2520 0.80560 0.000 0.000 0.844 0.000 0.152 0.004
#> SRR1457814 4 0.6655 0.37357 0.000 0.000 0.104 0.504 0.268 0.124
#> SRR1455127 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR615081 6 0.3225 0.83790 0.000 0.092 0.000 0.080 0.000 0.828
#> SRR1327855 3 0.2006 0.82275 0.000 0.000 0.892 0.000 0.104 0.004
#> SRR1417873 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.1471 0.83772 0.000 0.000 0.932 0.000 0.064 0.004
#> SRR1488388 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1401122 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR612383 2 0.5761 0.56297 0.000 0.564 0.008 0.004 0.256 0.168
#> SRR1477711 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.1082 0.83975 0.000 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR612851 2 0.2034 0.82198 0.000 0.912 0.000 0.004 0.024 0.060
#> SRR1086349 1 0.1501 0.58869 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR812837 4 0.2340 0.79430 0.000 0.148 0.000 0.852 0.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.1007 0.83676 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1475885 6 0.2527 0.73057 0.000 0.000 0.000 0.000 0.168 0.832
#> SRR1376334 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.3864 -0.03371 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612323 2 0.6934 0.46747 0.000 0.480 0.092 0.004 0.256 0.168
#> SRR612604 6 0.2562 0.85754 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1389546 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.1910 0.57135 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1465608 5 0.4358 0.58473 0.092 0.000 0.196 0.000 0.712 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331153 6 0.3647 0.65485 0.000 0.360 0.000 0.000 0.000 0.640
#> SRR1078439 3 0.1418 0.82759 0.000 0.000 0.944 0.000 0.024 0.032
#> SRR2165527 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.1984 0.55775 0.912 0.000 0.000 0.000 0.032 0.056
#> SRR1313536 6 0.3699 0.69189 0.000 0.336 0.000 0.004 0.000 0.660
#> SRR1070308 2 0.2755 0.74861 0.120 0.856 0.012 0.000 0.012 0.000
#> SRR1403110 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.2053 0.82121 0.000 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1456862 5 0.3659 0.44507 0.364 0.000 0.000 0.000 0.636 0.000
#> SRR1074622 1 0.3684 0.21293 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372 0.000
#> SRR1465847 3 0.2964 0.76848 0.000 0.000 0.792 0.000 0.204 0.004
#> SRR1443376 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0146 0.84473 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.5526 0.50172 0.000 0.000 0.572 0.004 0.256 0.168
#> SRR612251 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1418581 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613214 2 0.6446 0.52162 0.000 0.524 0.048 0.004 0.256 0.168
#> SRR613078 6 0.2562 0.85754 0.000 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1472998 3 0.3215 0.74203 0.000 0.000 0.756 0.000 0.240 0.004
#> SRR1433452 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.2527 0.52608 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000
#> SRR1487993 3 0.0713 0.83952 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316151 6 0.2562 0.75813 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR1417547 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 6 0.2854 0.84000 0.000 0.208 0.000 0.000 0.000 0.792
#> SRR1398207 1 0.5832 -0.03119 0.492 0.000 0.260 0.000 0.248 0.000
#> SRR1358755 3 0.4979 0.62311 0.116 0.000 0.648 0.000 0.232 0.004
#> SRR1078903 2 0.1867 0.82404 0.000 0.916 0.000 0.000 0.020 0.064
#> SRR1323252 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 5 0.3782 0.34992 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588 0.000
#> SRR615982 2 0.3672 0.74961 0.000 0.792 0.000 0.004 0.064 0.140
#> SRR1480431 2 0.3797 0.30391 0.000 0.580 0.000 0.420 0.000 0.000
#> SRR1429825 6 0.3050 0.69880 0.000 0.000 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR1102393 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 5 0.3697 0.51108 0.016 0.000 0.248 0.000 0.732 0.004
#> SRR808351 1 0.2491 0.52997 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.60968 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.2234 0.82193 0.000 0.000 0.872 0.000 0.124 0.004
#> SRR1081910 1 0.5771 -0.01698 0.508 0.000 0.244 0.000 0.248 0.000
#> SRR1086611 6 0.0146 0.77267 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1392571 2 0.4457 0.69595 0.000 0.720 0.000 0.004 0.108 0.168
#> SRR1311441 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR808152 1 0.2562 0.52223 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000
#> SRR657313 3 0.3210 0.73318 0.000 0.000 0.812 0.000 0.152 0.036
#> SRR1433131 6 0.2697 0.85228 0.000 0.188 0.000 0.000 0.000 0.812
#> SRR1321011 2 0.1267 0.81325 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1500598 4 0.0146 0.91262 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.3847 0.04821 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456 0.000
#> SRR1376228 3 0.0405 0.84477 0.000 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1399757 1 0.0260 0.60953 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.1588 0.83867 0.000 0.000 0.924 0.000 0.072 0.004
#> SRR613557 2 0.7073 0.44635 0.000 0.464 0.108 0.004 0.256 0.168
#> SRR809831 1 0.2178 0.49519 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132 0.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.84418 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.1267 0.59595 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1071644 1 0.1387 0.59264 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1406936 3 0.2320 0.82008 0.000 0.000 0.864 0.000 0.132 0.004
#> SRR1072031 2 0.0000 0.85318 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.5526 0.56998 0.000 0.572 0.000 0.004 0.256 0.168
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.890 0.933 0.970 0.4972 0.503 0.503
#> 3 3 0.940 0.941 0.974 0.3071 0.819 0.649
#> 4 4 0.830 0.744 0.878 0.1461 0.875 0.657
#> 5 5 0.728 0.684 0.757 0.0566 0.927 0.732
#> 6 6 0.764 0.514 0.748 0.0504 0.886 0.558
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.0376 0.955 0.996 0.004
#> SRR1404105 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.7528 0.743 0.784 0.216
#> SRR1394209 2 0.8499 0.597 0.276 0.724
#> SRR1474018 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1391619 1 0.9170 0.552 0.668 0.332
#> SRR1307997 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1403980 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1442800 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.6247 0.814 0.844 0.156
#> SRR1093053 1 0.9170 0.552 0.668 0.332
#> SRR1399843 1 0.7376 0.750 0.792 0.208
#> SRR1380231 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1096736 1 0.9933 0.238 0.548 0.452
#> SRR1478700 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.8499 0.653 0.724 0.276
#> SRR1384754 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1380317 1 0.9170 0.552 0.668 0.332
#> SRR1315247 2 0.1633 0.959 0.024 0.976
#> SRR1105344 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1456075 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1417154 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1325771 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1360420 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1072948 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.6531 0.800 0.832 0.168
#> SRR659839 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1362848 2 0.6148 0.807 0.152 0.848
#> SRR1407492 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1454868 1 0.9170 0.552 0.668 0.332
#> SRR1474816 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1466400 2 0.1414 0.963 0.020 0.980
#> SRR658921 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1101373 1 0.2236 0.929 0.964 0.036
#> SRR1090145 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.9170 0.552 0.668 0.332
#> SRR614695 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1325871 1 0.9129 0.560 0.672 0.328
#> SRR1355415 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1092112 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.4431 0.885 0.092 0.908
#> SRR1432106 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.8555 0.592 0.280 0.720
#> SRR1078834 2 0.8608 0.584 0.284 0.716
#> SRR1417611 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.8081 0.696 0.752 0.248
#> SRR1419062 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1315739 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1091890 1 0.8499 0.653 0.724 0.276
#> SRR1347436 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1327473 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1338195 1 0.5842 0.833 0.860 0.140
#> SRR809698 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.8499 0.653 0.724 0.276
#> SRR1322643 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR614887 1 0.8499 0.653 0.724 0.276
#> SRR1354620 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.2603 0.923 0.956 0.044
#> SRR615383 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1389157 2 0.8499 0.600 0.276 0.724
#> SRR613568 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.8386 0.666 0.732 0.268
#> SRR1475345 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1446180 1 0.9209 0.544 0.664 0.336
#> SRR1406372 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.1184 0.946 0.984 0.016
#> SRR1353136 1 0.9129 0.560 0.672 0.328
#> SRR1093906 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1399861 2 0.8955 0.518 0.312 0.688
#> SRR1338789 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1421420 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1352870 2 0.8555 0.592 0.280 0.720
#> SRR1315041 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1420006 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.9170 0.552 0.668 0.332
#> SRR1472749 1 0.3733 0.899 0.928 0.072
#> SRR1414379 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.3114 0.913 0.944 0.056
#> SRR810273 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1478341 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1479699 1 0.3274 0.910 0.940 0.060
#> SRR1403589 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR659427 2 0.9686 0.292 0.396 0.604
#> SRR1096638 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.8499 0.600 0.276 0.724
#> SRR1439994 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1374270 2 0.5059 0.860 0.112 0.888
#> SRR1470947 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1456274 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR820049 1 0.9170 0.552 0.668 0.332
#> SRR1375290 1 0.8499 0.653 0.724 0.276
#> SRR818999 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1332187 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR603365 1 0.7056 0.771 0.808 0.192
#> SRR657833 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.8267 0.678 0.740 0.260
#> SRR1441868 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1485380 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.3431 0.904 0.936 0.064
#> SRR615032 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1332816 1 0.2603 0.922 0.956 0.044
#> SRR612299 2 0.2236 0.947 0.036 0.964
#> SRR1407386 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1309403 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1414749 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1419760 1 0.5946 0.828 0.856 0.144
#> SRR1381841 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR821388 2 0.7299 0.729 0.204 0.796
#> SRR657623 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.8499 0.653 0.724 0.276
#> SRR819583 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1403072 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR811653 1 0.9248 0.536 0.660 0.340
#> SRR1311348 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0376 0.978 0.004 0.996
#> SRR1421444 1 0.0938 0.949 0.988 0.012
#> SRR1344010 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR613318 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1468469 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1500931 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.6531 0.802 0.832 0.168
#> SRR1379175 2 0.8555 0.592 0.280 0.720
#> SRR1401909 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1101128 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.1414 0.963 0.020 0.980
#> SRR1093218 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1077090 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.7299 0.728 0.204 0.796
#> SRR1309382 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.1843 0.936 0.972 0.028
#> SRR656095 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1101591 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1453127 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1315434 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1365791 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1081519 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR614707 1 0.9248 0.536 0.660 0.340
#> SRR1094027 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1079502 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1457814 1 0.9358 0.511 0.648 0.352
#> SRR1455127 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.7056 0.772 0.808 0.192
#> SRR1475885 1 0.8909 0.597 0.692 0.308
#> SRR1376334 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1347042 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.0672 0.975 0.008 0.992
#> SRR612604 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.3114 0.913 0.944 0.056
#> SRR1331153 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.9129 0.560 0.672 0.328
#> SRR2165527 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.7815 0.687 0.232 0.768
#> SRR1403110 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1090881 1 0.8909 0.598 0.692 0.308
#> SRR612251 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1487993 1 0.6438 0.805 0.836 0.164
#> SRR1465983 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1367566 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1480501 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1086611 1 0.9732 0.384 0.596 0.404
#> SRR1392571 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR657313 1 0.8499 0.653 0.724 0.276
#> SRR1433131 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1376228 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.1184 0.945 0.984 0.016
#> SRR1358060 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1464517 1 0.2423 0.927 0.960 0.040
#> SRR613557 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR809831 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.0000 0.957 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.982 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 3 0.2796 0.877 0.092 0.000 0.908
#> SRR1404105 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0747 0.936 0.016 0.000 0.984
#> SRR614491 2 0.3686 0.826 0.000 0.860 0.140
#> SRR1069376 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.0661 0.968 0.988 0.008 0.004
#> SRR1394209 2 0.3267 0.859 0.116 0.884 0.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR612515 2 0.6180 0.253 0.000 0.584 0.416
#> SRR1092727 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468553 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420169 3 0.0892 0.934 0.020 0.000 0.980
#> SRR1442800 1 0.6045 0.393 0.620 0.380 0.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.3267 0.861 0.884 0.000 0.116
#> SRR1500030 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093053 3 0.1031 0.928 0.000 0.024 0.976
#> SRR1399843 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380231 3 0.0747 0.936 0.016 0.000 0.984
#> SRR809470 1 0.3192 0.865 0.888 0.000 0.112
#> SRR614239 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.5536 0.767 0.804 0.052 0.144
#> SRR1478700 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081543 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384754 3 0.3551 0.842 0.132 0.000 0.868
#> SRR612287 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.4677 0.811 0.028 0.840 0.132
#> SRR1315247 2 0.1774 0.950 0.016 0.960 0.024
#> SRR1105344 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456075 3 0.3551 0.842 0.132 0.000 0.868
#> SRR1389474 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095985 3 0.5650 0.552 0.312 0.000 0.688
#> SRR1325771 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076916 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472370 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362848 3 0.4786 0.836 0.112 0.044 0.844
#> SRR1407492 3 0.6180 0.312 0.000 0.416 0.584
#> SRR1455082 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474816 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466400 2 0.0237 0.982 0.004 0.996 0.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443161 3 0.4196 0.849 0.112 0.024 0.864
#> SRR614695 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 3 0.1163 0.929 0.028 0.000 0.972
#> SRR1105463 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355415 1 0.3192 0.865 0.888 0.000 0.112
#> SRR1090861 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.3192 0.864 0.112 0.888 0.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074790 2 0.4062 0.800 0.164 0.836 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.6079 0.334 0.000 0.612 0.388
#> SRR1078834 1 0.6192 0.284 0.580 0.420 0.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR614984 2 0.4291 0.768 0.000 0.820 0.180
#> SRR1324269 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480131 1 0.4555 0.750 0.800 0.000 0.200
#> SRR1421284 2 0.3116 0.869 0.108 0.892 0.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327473 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338195 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354620 3 0.1289 0.927 0.032 0.000 0.968
#> SRR615056 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.6204 0.264 0.576 0.000 0.424
#> SRR1391529 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 3 0.6154 0.334 0.000 0.408 0.592
#> SRR613568 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 3 0.1129 0.934 0.020 0.004 0.976
#> SRR1475345 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 3 0.4865 0.814 0.032 0.136 0.832
#> SRR1406372 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353136 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399861 2 0.2711 0.892 0.088 0.912 0.000
#> SRR1338789 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.0892 0.931 0.000 0.020 0.980
#> SRR1315041 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416617 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420006 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.0237 0.942 0.000 0.004 0.996
#> SRR1472749 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098312 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088606 1 0.0424 0.972 0.992 0.000 0.008
#> SRR1479699 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR659427 3 0.6663 0.752 0.124 0.124 0.752
#> SRR1096638 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR659307 3 0.0237 0.942 0.000 0.004 0.996
#> SRR1439994 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 3 0.3551 0.842 0.132 0.000 0.868
#> SRR658621 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374270 2 0.1031 0.962 0.024 0.976 0.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408727 2 0.2537 0.901 0.080 0.920 0.000
#> SRR1456274 1 0.0747 0.964 0.984 0.000 0.016
#> SRR817744 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR820049 3 0.0237 0.942 0.000 0.004 0.996
#> SRR1375290 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR818999 1 0.0592 0.968 0.988 0.000 0.012
#> SRR1390242 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454629 1 0.3340 0.856 0.880 0.000 0.120
#> SRR1332187 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.2878 0.873 0.096 0.000 0.904
#> SRR1441868 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 3 0.5061 0.742 0.208 0.008 0.784
#> SRR1498395 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.5254 0.668 0.264 0.000 0.736
#> SRR1498885 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337215 2 0.1031 0.962 0.024 0.976 0.000
#> SRR1414749 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365963 3 0.4346 0.784 0.184 0.000 0.816
#> SRR1368030 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419760 1 0.6546 0.636 0.716 0.240 0.044
#> SRR1381841 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR821388 3 0.2625 0.878 0.000 0.084 0.916
#> SRR657623 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0424 0.972 0.992 0.000 0.008
#> SRR1311666 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR811653 3 0.3678 0.877 0.080 0.028 0.892
#> SRR1311348 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR613318 3 0.6291 0.150 0.000 0.468 0.532
#> SRR1332694 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.0592 0.938 0.012 0.000 0.988
#> SRR1500931 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387494 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379175 3 0.8592 0.371 0.108 0.360 0.532
#> SRR1401909 3 0.6280 0.152 0.460 0.000 0.540
#> SRR1440541 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.0892 0.934 0.020 0.000 0.980
#> SRR1376640 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101128 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.0892 0.966 0.020 0.980 0.000
#> SRR1093218 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077090 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093100 2 0.4750 0.725 0.216 0.784 0.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 3 0.3686 0.829 0.140 0.000 0.860
#> SRR1499482 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081473 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.2959 0.878 0.900 0.000 0.100
#> SRR808496 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR612359 3 0.6305 0.100 0.000 0.484 0.516
#> SRR1444412 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.0892 0.934 0.020 0.000 0.980
#> SRR1089713 3 0.1163 0.929 0.028 0.000 0.972
#> SRR1453127 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498354 3 0.1289 0.927 0.032 0.000 0.968
#> SRR1313831 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081519 3 0.0892 0.934 0.020 0.000 0.980
#> SRR614707 1 0.3619 0.819 0.864 0.136 0.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.4235 0.789 0.176 0.000 0.824
#> SRR1079502 3 0.0892 0.934 0.020 0.000 0.980
#> SRR1457814 3 0.4002 0.800 0.000 0.160 0.840
#> SRR1455127 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327855 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475885 1 0.0892 0.957 0.980 0.020 0.000
#> SRR1376334 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR612323 2 0.6180 0.254 0.000 0.584 0.416
#> SRR612604 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0237 0.975 0.996 0.000 0.004
#> SRR1101808 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078439 3 0.1031 0.928 0.000 0.024 0.976
#> SRR2165527 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.6809 0.686 0.156 0.740 0.104
#> SRR1403110 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.1163 0.929 0.028 0.000 0.972
#> SRR1443376 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.1031 0.928 0.000 0.024 0.976
#> SRR612251 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316151 2 0.0237 0.982 0.004 0.996 0.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398207 1 0.2537 0.900 0.920 0.000 0.080
#> SRR1358755 3 0.3752 0.824 0.144 0.000 0.856
#> SRR1078903 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 3 0.3752 0.830 0.144 0.000 0.856
#> SRR808351 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086611 1 0.7474 0.626 0.696 0.176 0.128
#> SRR1392571 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR613557 3 0.6111 0.366 0.000 0.396 0.604
#> SRR809831 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.944 0.000 0.000 1.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.979 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.0892 0.934 0.020 0.000 0.980
#> SRR1072031 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.985 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 3 0.0592 0.9485 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0188 0.5906 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1472057 3 0.0921 0.9418 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR614491 4 0.0000 0.4300 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 4 0.5263 0.1771 0.448 0.008 0.000 0.544
#> SRR1394209 4 0.2124 0.3360 0.008 0.068 0.000 0.924
#> SRR1474018 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1099809 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500555 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1354363 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1307997 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR663124 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 4 0.4222 0.6534 0.000 0.272 0.000 0.728
#> SRR1092727 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1364013 4 0.4134 -0.0834 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR1468553 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420169 3 0.0921 0.9418 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1442800 4 0.7861 0.4231 0.272 0.360 0.000 0.368
#> SRR1359214 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1499849 1 0.0592 0.9773 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1500030 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093053 3 0.4605 0.4773 0.000 0.000 0.664 0.336
#> SRR1399843 3 0.0707 0.9455 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1380231 3 0.0817 0.9445 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR809470 1 0.0592 0.9773 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR614239 4 0.4661 0.6998 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR613939 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR612971 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR811357 2 0.2973 0.3988 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1471672 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613006 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1469570 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.4643 0.6637 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1362906 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 4 0.7442 -0.0100 0.392 0.024 0.096 0.488
#> SRR1478700 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081543 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384754 3 0.1302 0.9293 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR612287 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1380317 4 0.0000 0.4300 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315247 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1105344 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR658549 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.1118 0.6019 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1358520 2 0.4817 0.6587 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1419476 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456075 3 0.1302 0.9293 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095985 3 0.4477 0.5757 0.312 0.000 0.688 0.000
#> SRR1325771 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660272 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.4972 -0.4503 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR808044 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076916 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1456114 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.0188 0.9565 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.2011 0.5043 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1469192 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659839 2 0.2149 0.4910 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR659533 2 0.1716 0.5264 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1362848 4 0.6208 -0.0288 0.008 0.040 0.396 0.556
#> SRR1407492 4 0.4936 0.7111 0.000 0.372 0.004 0.624
#> SRR1455082 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR658362 2 0.4855 0.6497 0.000 0.600 0.000 0.400
#> SRR810921 2 0.0707 0.5715 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR662823 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1456375 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.4624 0.4670 0.000 0.000 0.660 0.340
#> SRR1474816 2 0.3400 0.3103 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1466400 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR658921 2 0.4040 0.1442 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR1499873 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.2149 0.4877 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1396166 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454891 4 0.4679 0.5752 0.000 0.352 0.000 0.648
#> SRR663185 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR811819 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.4713 -0.2419 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660450 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1472687 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1334291 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1415153 4 0.4790 0.7087 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR1323271 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1368939 2 0.1792 0.5149 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1443161 4 0.4095 0.2968 0.016 0.000 0.192 0.792
#> SRR614695 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612779 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 3 0.1022 0.9387 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1105463 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.0592 0.9773 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.5229 0.6308 0.008 0.564 0.000 0.428
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.4225 0.4687 0.184 0.792 0.000 0.024
#> SRR1432106 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR655756 2 0.2921 0.4082 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1458314 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.4746 -0.2470 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1080484 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1072749 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 4 0.4761 0.7112 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR1078834 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1417611 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1396840 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.3356 0.6350 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR614984 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1324269 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.4888 0.6400 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR1345523 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.3610 0.7399 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1421284 2 0.4790 0.6642 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099189 4 0.3311 0.1336 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347436 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1327473 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338195 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.3219 0.3602 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1339597 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.1474 0.9153 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1322643 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354620 3 0.1118 0.9356 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR615056 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1105320 1 0.5300 0.5098 0.664 0.000 0.308 0.028
#> SRR1391529 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.4830 0.6585 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0921 0.5993 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1435330 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.2647 0.4422 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1389157 4 0.4761 0.7112 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR613568 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR614095 2 0.4790 0.6643 0.000 0.620 0.000 0.380
#> SRR1103092 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 4 0.5119 0.1596 0.004 0.000 0.440 0.556
#> SRR1475345 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR809089 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 4 0.6534 0.5510 0.000 0.132 0.244 0.624
#> SRR1406372 2 0.4761 0.6660 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1339880 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353136 3 0.3024 0.8056 0.000 0.000 0.852 0.148
#> SRR1093906 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.4761 0.6660 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.3688 0.3132 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1399861 4 0.2944 0.2289 0.004 0.128 0.000 0.868
#> SRR1338789 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 4 0.4776 0.3281 0.000 0.000 0.376 0.624
#> SRR1315041 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR661877 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1443268 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416617 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655672 4 0.4277 0.5920 0.000 0.280 0.000 0.720
#> SRR1420006 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458267 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR613819 4 0.4790 -0.3897 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR1469432 2 0.1211 0.6032 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR660907 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1465092 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1470727 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.0188 0.9560 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1472749 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414379 4 0.4866 -0.4170 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR1431326 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.5000 -0.5329 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR1098312 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR614467 2 0.4998 0.5728 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR811471 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.1209 0.9582 0.964 0.000 0.004 0.032
#> SRR1479699 3 0.1867 0.8966 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1403589 2 0.1474 0.5374 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR812625 4 0.5000 0.5563 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.3569 0.6389 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1471222 4 0.4916 0.6473 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR1378992 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659427 4 0.6598 0.0741 0.012 0.096 0.256 0.636
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.4989 0.5886 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR659307 4 0.4776 0.3281 0.000 0.000 0.376 0.624
#> SRR1439994 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 3 0.1302 0.9293 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR658621 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374270 4 0.3528 0.0765 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1470947 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1365598 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR662787 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1408727 4 0.0000 0.4300 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456274 1 0.3494 0.7725 0.824 0.000 0.004 0.172
#> SRR817744 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1387379 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR820049 3 0.2216 0.8748 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1375290 4 0.4981 0.0985 0.000 0.000 0.464 0.536
#> SRR818999 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454629 1 0.1733 0.9450 0.948 0.000 0.024 0.028
#> SRR1332187 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR657833 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1436207 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 4 0.5000 0.5507 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR1308086 3 0.0592 0.9485 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.2011 0.6140 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1452356 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1442983 2 0.4730 -0.2356 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1100346 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1332816 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612299 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.4746 -0.2470 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1309403 3 0.4472 0.6975 0.220 0.000 0.760 0.020
#> SRR1498395 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1079998 3 0.3266 0.7904 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1498885 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1337215 4 0.4746 0.7096 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR1414749 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365963 3 0.2647 0.8467 0.120 0.000 0.880 0.000
#> SRR1368030 4 0.4500 -0.2564 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR1419760 4 0.6566 0.5261 0.236 0.140 0.000 0.624
#> SRR1381841 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821388 4 0.4477 0.3812 0.000 0.000 0.312 0.688
#> SRR657623 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1094241 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.3726 0.2455 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1486698 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1446436 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR815092 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.4817 -0.2898 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR811653 4 0.4262 0.2496 0.008 0.000 0.236 0.756
#> SRR1311348 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1435442 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1421444 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1319520 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1416596 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1485499 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1316078 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR663465 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1310094 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR663537 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613318 4 0.0000 0.4300 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.2345 0.4746 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.0188 0.9563 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1500931 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387494 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379175 4 0.0000 0.4300 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401909 3 0.4977 0.1934 0.460 0.000 0.540 0.000
#> SRR1440541 2 0.1389 0.5422 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1068832 3 0.0921 0.9418 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1376640 4 0.1389 0.4737 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR1085712 2 0.4761 0.6660 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1082283 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0188 0.5906 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1437035 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.4830 0.6572 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR1101128 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR612983 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1394366 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1093218 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077090 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327430 4 0.3074 0.1833 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR1088958 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.3764 0.6412 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR614335 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR660534 2 0.1022 0.5598 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR817094 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1456401 2 0.4955 -0.4371 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1086393 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.4998 0.5618 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 3 0.3074 0.8088 0.152 0.000 0.848 0.000
#> SRR1499482 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR614719 4 0.3907 0.1127 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR1081473 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0592 0.9773 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR808496 4 0.0000 0.4300 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.4072 0.1295 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR612359 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1444412 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.2216 0.4840 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR808914 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.4222 0.0487 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR813632 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.0921 0.9418 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1089713 3 0.1022 0.9387 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498354 3 0.1118 0.9356 0.036 0.000 0.964 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081519 3 0.0921 0.9418 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR614707 4 0.5159 0.3810 0.364 0.012 0.000 0.624
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.2921 0.8231 0.140 0.000 0.860 0.000
#> SRR1079502 3 0.0817 0.9445 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1457814 4 0.3726 0.2766 0.000 0.000 0.212 0.788
#> SRR1455127 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR615081 2 0.5000 0.5722 0.000 0.504 0.000 0.496
#> SRR1327855 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.4843 0.6563 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1394125 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR612383 4 0.4761 0.7112 0.000 0.372 0.000 0.628
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR612851 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1340010 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475885 1 0.2704 0.8502 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612323 4 0.2281 0.5162 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR612604 2 0.3975 0.1680 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1389546 2 0.1867 0.5124 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0469 0.9809 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1101808 2 0.1940 0.5077 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1414079 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331153 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1078439 3 0.4643 0.4593 0.000 0.000 0.656 0.344
#> SRR2165527 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1351147 1 0.0336 0.9849 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1313536 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.7333 -0.4026 0.060 0.536 0.048 0.356
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 4 0.4981 0.6053 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR1401317 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.1022 0.9387 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1443376 2 0.4522 -0.1037 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1471312 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 4 0.4776 0.3281 0.000 0.000 0.376 0.624
#> SRR612251 2 0.4989 0.5885 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613214 4 0.1118 0.3873 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR613078 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1472998 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433452 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0469 0.5787 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316151 4 0.0000 0.4300 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR659389 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1398207 1 0.0469 0.9812 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1358755 3 0.3801 0.7134 0.220 0.000 0.780 0.000
#> SRR1078903 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1323252 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.4331 -0.0158 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615982 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1480431 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1429825 4 0.2814 0.2331 0.000 0.132 0.000 0.868
#> SRR1102393 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 3 0.1389 0.9255 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086611 4 0.5866 0.4494 0.324 0.052 0.000 0.624
#> SRR1392571 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1311441 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.4776 -0.2621 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1321011 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.4776 0.6663 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1379343 4 0.4776 0.7128 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613557 4 0.5420 0.7009 0.000 0.352 0.024 0.624
#> SRR809831 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.9585 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9927 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.0921 0.9418 0.028 0.000 0.972 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.5892 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.4406 -0.0654 0.000 0.700 0.000 0.300
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 3 0.2798 0.802977 0.140 0.000 0.852 0.008 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.2228 0.698951 0.000 0.912 0.000 0.040 0.048
#> SRR1472057 3 0.1544 0.875693 0.068 0.000 0.932 0.000 0.000
#> SRR614491 4 0.3966 0.310340 0.000 0.000 0.000 0.664 0.336
#> SRR1069376 1 0.0290 0.811364 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR811964 2 0.0000 0.732563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 5 0.4262 0.673859 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1345715 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1328073 4 0.5409 0.405400 0.316 0.080 0.000 0.604 0.000
#> SRR1394209 5 0.4526 0.503067 0.028 0.000 0.000 0.300 0.672
#> SRR1474018 5 0.3876 0.773273 0.000 0.316 0.000 0.000 0.684
#> SRR1099809 1 0.3656 0.771975 0.800 0.000 0.000 0.168 0.032
#> SRR1500555 4 0.3586 0.748665 0.000 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR1354363 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1391619 3 0.0162 0.911217 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1307997 4 0.4201 0.721165 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR663124 4 0.4045 0.743215 0.000 0.356 0.000 0.644 0.000
#> SRR1334670 1 0.3321 0.782626 0.832 0.000 0.000 0.136 0.032
#> SRR612515 4 0.4618 0.692209 0.000 0.208 0.000 0.724 0.068
#> SRR1092727 4 0.4306 0.557204 0.000 0.492 0.000 0.508 0.000
#> SRR1364013 4 0.6069 0.005865 0.000 0.136 0.000 0.524 0.340
#> SRR1468553 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420169 3 0.2171 0.869622 0.064 0.000 0.912 0.000 0.024
#> SRR1442800 4 0.6215 0.266001 0.252 0.164 0.000 0.576 0.008
#> SRR1359214 5 0.3876 0.773273 0.000 0.316 0.000 0.000 0.684
#> SRR1499849 1 0.4703 0.746215 0.768 0.000 0.060 0.140 0.032
#> SRR1500030 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093053 3 0.3857 0.559342 0.000 0.000 0.688 0.312 0.000
#> SRR1399843 3 0.2179 0.833673 0.000 0.000 0.888 0.112 0.000
#> SRR1380231 3 0.1341 0.883272 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR809470 1 0.4490 0.753106 0.768 0.000 0.032 0.168 0.032
#> SRR614239 4 0.4040 0.743578 0.000 0.260 0.000 0.724 0.016
#> SRR613939 4 0.3837 0.754200 0.000 0.308 0.000 0.692 0.000
#> SRR612971 2 0.1121 0.716669 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1490204 4 0.4182 0.726071 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR811357 2 0.2127 0.648675 0.000 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1471672 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR613006 4 0.4977 0.723426 0.000 0.356 0.000 0.604 0.040
#> SRR1469570 2 0.0000 0.732563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 5 0.4126 0.725693 0.000 0.380 0.000 0.000 0.620
#> SRR1362906 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.732563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 5 0.5632 0.052838 0.232 0.000 0.000 0.140 0.628
#> SRR1478700 1 0.5441 0.695025 0.624 0.000 0.000 0.096 0.280
#> SRR1081543 3 0.1197 0.887313 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR1384754 3 0.8034 0.239263 0.232 0.000 0.436 0.140 0.192
#> SRR612287 5 0.3932 0.769333 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1380317 5 0.4088 0.445547 0.000 0.000 0.000 0.368 0.632
#> SRR1315247 4 0.3586 0.743875 0.000 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR1105344 5 0.3895 0.772455 0.000 0.320 0.000 0.000 0.680
#> SRR658549 4 0.3837 0.756277 0.000 0.308 0.000 0.692 0.000
#> SRR1480240 1 0.3656 0.771975 0.800 0.000 0.000 0.168 0.032
#> SRR1084816 2 0.0000 0.732563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.1732 0.675181 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1358520 5 0.5027 0.762690 0.000 0.304 0.000 0.056 0.640
#> SRR1419476 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456075 3 0.6459 0.494367 0.244 0.000 0.604 0.084 0.068
#> SRR1389474 2 0.0000 0.732563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1334419 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1417154 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095985 3 0.7316 0.112375 0.336 0.000 0.408 0.224 0.032
#> SRR1325771 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660272 4 0.4074 0.741935 0.000 0.364 0.000 0.636 0.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.3966 0.000966 0.000 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR808044 1 0.4994 0.728870 0.696 0.000 0.000 0.096 0.208
#> SRR1076916 3 0.3409 0.788709 0.000 0.000 0.816 0.160 0.024
#> SRR1356266 1 0.1124 0.808944 0.960 0.000 0.000 0.036 0.004
#> SRR1341983 5 0.5157 0.642000 0.000 0.440 0.000 0.040 0.520
#> SRR1456114 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1072948 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.0162 0.911195 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0324 0.811764 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR613843 2 0.1851 0.701050 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.1851 0.866857 0.000 0.000 0.912 0.088 0.000
#> SRR659839 2 0.1792 0.677569 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR659533 2 0.2189 0.702876 0.000 0.904 0.000 0.084 0.012
#> SRR1362848 5 0.6033 0.513995 0.028 0.000 0.160 0.164 0.648
#> SRR1407492 4 0.3895 0.744774 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1455082 4 0.4691 0.739208 0.000 0.276 0.000 0.680 0.044
#> SRR658362 5 0.4824 0.724379 0.000 0.376 0.000 0.028 0.596
#> SRR810921 2 0.0703 0.725205 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR662823 5 0.3932 0.769333 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1456375 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818232 1 0.3656 0.771975 0.800 0.000 0.000 0.168 0.032
#> SRR1454868 3 0.3999 0.480772 0.000 0.000 0.656 0.344 0.000
#> SRR1474816 2 0.3074 0.538521 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 5 0.4262 0.673859 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1466400 4 0.3586 0.743875 0.000 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR658921 2 0.5797 0.358715 0.000 0.592 0.000 0.132 0.276
#> SRR1499873 2 0.1121 0.716669 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1101373 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1090145 1 0.3769 0.766235 0.788 0.000 0.000 0.180 0.032
#> SRR1379324 1 0.5150 0.778055 0.692 0.000 0.000 0.136 0.172
#> SRR1345307 2 0.1478 0.699286 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454891 4 0.5491 0.588002 0.000 0.272 0.000 0.624 0.104
#> SRR663185 5 0.3932 0.769333 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR811819 1 0.3321 0.782626 0.832 0.000 0.000 0.136 0.032
#> SRR1318920 1 0.6303 0.709810 0.524 0.000 0.000 0.196 0.280
#> SRR656758 2 0.3452 0.335715 0.000 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR1474351 1 0.3495 0.777782 0.816 0.000 0.000 0.152 0.032
#> SRR660450 4 0.4030 0.743564 0.000 0.352 0.000 0.648 0.000
#> SRR1472687 5 0.4878 0.656466 0.000 0.440 0.000 0.024 0.536
#> SRR1334291 4 0.4201 0.721165 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1415153 4 0.4210 0.715511 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR1323271 5 0.3876 0.773273 0.000 0.316 0.000 0.000 0.684
#> SRR1368939 2 0.1121 0.710782 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1443161 5 0.6929 0.160989 0.220 0.000 0.012 0.336 0.432
#> SRR614695 4 0.3586 0.748665 0.000 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR1092372 1 0.5664 0.758237 0.632 0.000 0.000 0.168 0.200
#> SRR1474577 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1406582 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR612779 4 0.4201 0.721165 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1089006 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1354071 3 0.3074 0.759942 0.196 0.000 0.804 0.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.3910 0.756811 0.772 0.000 0.000 0.196 0.032
#> SRR811005 2 0.0000 0.732563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.3656 0.771975 0.800 0.000 0.000 0.168 0.032
#> SRR1325871 3 0.0162 0.911217 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1355415 1 0.4490 0.753106 0.768 0.000 0.032 0.168 0.032
#> SRR1090861 1 0.0162 0.811787 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1320712 5 0.5460 0.736057 0.004 0.264 0.000 0.092 0.640
#> SRR1470075 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1091254 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1321165 1 0.5413 0.766328 0.664 0.000 0.000 0.168 0.168
#> SRR1092112 3 0.3656 0.774470 0.000 0.000 0.800 0.168 0.032
#> SRR1417588 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.2772 0.707704 0.044 0.896 0.000 0.028 0.032
#> SRR1432106 5 0.3932 0.769333 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR655756 2 0.2077 0.684095 0.000 0.908 0.000 0.084 0.008
#> SRR1458314 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1318582 2 0.4278 -0.352384 0.000 0.548 0.000 0.452 0.000
#> SRR1080484 5 0.3895 0.772380 0.000 0.320 0.000 0.000 0.680
#> SRR1072749 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.1764 0.804980 0.928 0.000 0.000 0.064 0.008
#> SRR1400333 4 0.3586 0.748665 0.000 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR1078834 4 0.3636 0.751928 0.000 0.272 0.000 0.728 0.000
#> SRR1417611 5 0.4891 0.765800 0.000 0.316 0.000 0.044 0.640
#> SRR1396840 1 0.4933 0.759941 0.704 0.000 0.000 0.200 0.096
#> SRR1465440 2 0.1410 0.708448 0.000 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1400530 2 0.3857 0.131768 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR614984 4 0.3661 0.751293 0.000 0.276 0.000 0.724 0.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 5 0.4262 0.673859 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1319443 1 0.3656 0.771975 0.800 0.000 0.000 0.168 0.032
#> SRR1324349 2 0.6722 -0.348810 0.000 0.416 0.000 0.268 0.316
#> SRR1345523 2 0.1121 0.716669 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1500846 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR661505 3 0.0404 0.907318 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.5160 0.726194 0.732 0.000 0.080 0.156 0.032
#> SRR1421284 5 0.4938 0.765181 0.000 0.312 0.000 0.048 0.640
#> SRR1329624 1 0.3321 0.782626 0.832 0.000 0.000 0.136 0.032
#> SRR1315739 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 5 0.5113 0.449669 0.000 0.044 0.000 0.380 0.576
#> SRR1083286 1 0.3656 0.771975 0.800 0.000 0.000 0.168 0.032
#> SRR1091890 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347436 4 0.3876 0.756886 0.000 0.316 0.000 0.684 0.000
#> SRR1327473 1 0.1121 0.797338 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1338195 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.1408 0.716451 0.000 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1457792 1 0.5357 0.701986 0.640 0.000 0.000 0.096 0.264
#> SRR658271 2 0.2470 0.648007 0.000 0.884 0.000 0.104 0.012
#> SRR1339597 1 0.2753 0.784567 0.856 0.000 0.000 0.008 0.136
#> SRR1454842 3 0.1341 0.876940 0.000 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1322643 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR614887 3 0.0162 0.911217 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1354620 3 0.4073 0.711978 0.216 0.000 0.752 0.032 0.000
#> SRR615056 5 0.3895 0.772467 0.000 0.320 0.000 0.000 0.680
#> SRR1105320 1 0.4444 0.353813 0.624 0.000 0.364 0.012 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663052 5 0.5202 0.728561 0.000 0.348 0.000 0.056 0.596
#> SRR1478834 1 0.3321 0.782626 0.832 0.000 0.000 0.136 0.032
#> SRR812366 2 0.3857 0.307225 0.000 0.688 0.000 0.000 0.312
#> SRR1435330 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615383 2 0.1410 0.702946 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1389157 4 0.3586 0.748665 0.000 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR613568 4 0.4201 0.721165 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR614095 5 0.3876 0.773273 0.000 0.316 0.000 0.000 0.684
#> SRR1103092 1 0.3656 0.771975 0.800 0.000 0.000 0.168 0.032
#> SRR1337155 4 0.3689 0.396361 0.004 0.000 0.256 0.740 0.000
#> SRR1475345 5 0.4268 0.668840 0.000 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR809089 2 0.1043 0.719421 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1446180 4 0.3289 0.561691 0.000 0.048 0.108 0.844 0.000
#> SRR1406372 5 0.4283 0.653709 0.000 0.456 0.000 0.000 0.544
#> SRR1339880 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353136 3 0.3143 0.725989 0.000 0.000 0.796 0.204 0.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.4787 -0.288591 0.000 0.608 0.000 0.028 0.364
#> SRR1351104 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1363926 2 0.6117 0.309657 0.000 0.540 0.000 0.156 0.304
#> SRR1399861 5 0.4843 0.507664 0.008 0.024 0.000 0.328 0.640
#> SRR1338789 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1421420 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420832 5 0.3876 0.773273 0.000 0.316 0.000 0.000 0.684
#> SRR1476231 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 4 0.3684 0.471432 0.000 0.000 0.280 0.720 0.000
#> SRR1315041 5 0.4891 0.765800 0.000 0.316 0.000 0.044 0.640
#> SRR661877 5 0.3999 0.760368 0.000 0.344 0.000 0.000 0.656
#> SRR1443268 1 0.5434 0.767969 0.648 0.000 0.000 0.232 0.120
#> SRR1416617 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.5600 0.687921 0.616 0.000 0.000 0.116 0.268
#> SRR655672 4 0.6697 0.158553 0.000 0.240 0.000 0.380 0.380
#> SRR1420006 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458267 4 0.4182 0.726071 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR613819 5 0.5597 0.646120 0.000 0.160 0.000 0.200 0.640
#> SRR1469432 2 0.3707 0.352711 0.000 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR660907 5 0.4210 0.704826 0.000 0.412 0.000 0.000 0.588
#> SRR1465092 4 0.4150 0.733642 0.000 0.388 0.000 0.612 0.000
#> SRR1470727 1 0.0162 0.811467 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1339153 3 0.1270 0.884456 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414379 5 0.5602 0.680817 0.000 0.196 0.000 0.164 0.640
#> SRR1431326 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1487278 4 0.4273 0.552562 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1098312 3 0.0162 0.911217 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.732563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 4 0.4182 0.726071 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR614467 5 0.5565 0.698485 0.000 0.216 0.000 0.144 0.640
#> SRR811471 1 0.3656 0.771975 0.800 0.000 0.000 0.168 0.032
#> SRR1478341 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.4674 0.737411 0.708 0.000 0.000 0.232 0.060
#> SRR1479699 3 0.1732 0.857307 0.000 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1403589 2 0.0963 0.718039 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR812625 2 0.6734 -0.134952 0.000 0.408 0.000 0.324 0.268
#> SRR1359803 1 0.3656 0.771975 0.800 0.000 0.000 0.168 0.032
#> SRR1338988 2 0.4114 -0.127426 0.000 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR1471222 2 0.6749 -0.064886 0.000 0.408 0.000 0.288 0.304
#> SRR1378992 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR659427 5 0.7144 0.465118 0.104 0.016 0.068 0.244 0.568
#> SRR1096638 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1466619 5 0.5008 0.750886 0.000 0.300 0.000 0.056 0.644
#> SRR659307 4 0.4074 0.385683 0.000 0.000 0.364 0.636 0.000
#> SRR1439994 1 0.4803 0.738837 0.720 0.000 0.000 0.096 0.184
#> SRR1454931 1 0.3656 0.771975 0.800 0.000 0.000 0.168 0.032
#> SRR1332928 3 0.8122 0.108401 0.232 0.000 0.380 0.112 0.276
#> SRR658621 5 0.3876 0.773273 0.000 0.316 0.000 0.000 0.684
#> SRR1095840 1 0.3656 0.771975 0.800 0.000 0.000 0.168 0.032
#> SRR1458243 1 0.4929 0.782886 0.716 0.000 0.000 0.136 0.148
#> SRR1374270 5 0.5597 0.645009 0.000 0.160 0.000 0.200 0.640
#> SRR1470947 5 0.4262 0.673859 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1365598 4 0.3814 0.742140 0.000 0.276 0.000 0.720 0.004
#> SRR662787 5 0.4262 0.673859 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1408727 5 0.4074 0.451081 0.000 0.000 0.000 0.364 0.636
#> SRR1456274 1 0.3849 0.638576 0.752 0.000 0.016 0.232 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 5 0.4262 0.673859 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1387379 2 0.1121 0.716669 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1102680 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.6062 0.732819 0.564 0.000 0.000 0.168 0.268
#> SRR1445856 1 0.5413 0.766328 0.664 0.000 0.000 0.168 0.168
#> SRR820049 3 0.1965 0.842312 0.000 0.000 0.904 0.096 0.000
#> SRR1375290 4 0.3983 0.399963 0.000 0.000 0.340 0.660 0.000
#> SRR818999 1 0.3812 0.770344 0.796 0.000 0.004 0.168 0.032
#> SRR1390242 1 0.3321 0.782626 0.832 0.000 0.000 0.136 0.032
#> SRR1401164 2 0.2376 0.697011 0.000 0.904 0.000 0.052 0.044
#> SRR1454629 1 0.4807 0.741273 0.760 0.000 0.064 0.144 0.032
#> SRR1332187 3 0.0162 0.911217 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR657833 4 0.4201 0.721165 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1436207 4 0.4182 0.726071 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0880 0.723309 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1480384 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 4 0.4262 0.668206 0.000 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR1308086 3 0.3577 0.767433 0.160 0.000 0.808 0.032 0.000
#> SRR1441868 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1485380 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR615032 2 0.2280 0.632383 0.000 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1452356 5 0.3876 0.773273 0.000 0.316 0.000 0.000 0.684
#> SRR1442983 2 0.4114 -0.102120 0.000 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR1100346 4 0.3661 0.751293 0.000 0.276 0.000 0.724 0.000
#> SRR1332816 1 0.5400 0.698054 0.632 0.000 0.000 0.096 0.272
#> SRR612299 4 0.3837 0.754200 0.000 0.308 0.000 0.692 0.000
#> SRR1407386 1 0.0162 0.811816 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1418064 2 0.4235 -0.269566 0.000 0.576 0.000 0.424 0.000
#> SRR1309403 3 0.5176 0.561113 0.312 0.012 0.636 0.040 0.000
#> SRR1498395 4 0.4201 0.721165 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1079998 3 0.6532 0.466614 0.260 0.000 0.572 0.136 0.032
#> SRR1498885 5 0.3876 0.773273 0.000 0.316 0.000 0.000 0.684
#> SRR1337215 4 0.4067 0.748038 0.000 0.300 0.000 0.692 0.008
#> SRR1414749 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.6539 -0.090783 0.452 0.000 0.424 0.092 0.032
#> SRR1368030 5 0.5382 0.583141 0.000 0.100 0.000 0.260 0.640
#> SRR1419760 4 0.4865 0.709174 0.064 0.252 0.000 0.684 0.000
#> SRR1381841 1 0.3841 0.761749 0.780 0.000 0.000 0.188 0.032
#> SRR821388 4 0.5974 0.354805 0.000 0.000 0.284 0.568 0.148
#> SRR657623 5 0.3876 0.773273 0.000 0.316 0.000 0.000 0.684
#> SRR1094241 3 0.0162 0.911217 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1342829 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0324 0.811661 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR811333 1 0.3656 0.771975 0.800 0.000 0.000 0.168 0.032
#> SRR1311666 2 0.2773 0.564217 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR1486698 4 0.4400 0.747432 0.000 0.308 0.000 0.672 0.020
#> SRR1446436 4 0.4045 0.745488 0.000 0.356 0.000 0.644 0.000
#> SRR815092 1 0.3321 0.782626 0.832 0.000 0.000 0.136 0.032
#> SRR1500149 2 0.4304 -0.360395 0.000 0.516 0.000 0.484 0.000
#> SRR1100564 1 0.3656 0.771975 0.800 0.000 0.000 0.168 0.032
#> SRR1403072 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811653 5 0.5491 0.484457 0.020 0.000 0.048 0.312 0.620
#> SRR1311348 2 0.0000 0.732563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 5 0.3913 0.770999 0.000 0.324 0.000 0.000 0.676
#> SRR1435442 4 0.4030 0.743564 0.000 0.352 0.000 0.648 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344010 5 0.4306 0.588580 0.000 0.492 0.000 0.000 0.508
#> SRR1319520 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1444763 1 0.5796 0.687368 0.588 0.000 0.000 0.128 0.284
#> SRR1415026 5 0.4262 0.673859 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1416596 5 0.4891 0.765800 0.000 0.316 0.000 0.044 0.640
#> SRR1485499 5 0.4150 0.726832 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612
#> SRR1316078 5 0.4262 0.673859 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR663465 5 0.4147 0.773287 0.000 0.316 0.000 0.008 0.676
#> SRR1310094 5 0.4891 0.765800 0.000 0.316 0.000 0.044 0.640
#> SRR663537 2 0.0000 0.732563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.3480 0.746184 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1453950 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR613318 5 0.4161 0.413347 0.000 0.000 0.000 0.392 0.608
#> SRR1332694 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818670 2 0.2074 0.647809 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1120318 1 0.3656 0.771975 0.800 0.000 0.000 0.168 0.032
#> SRR1311622 3 0.0404 0.907086 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1500931 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387494 3 0.0162 0.911217 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1379175 5 0.4533 0.233731 0.008 0.000 0.000 0.448 0.544
#> SRR1401909 1 0.7037 0.253422 0.464 0.000 0.336 0.168 0.032
#> SRR1440541 2 0.3752 0.614783 0.000 0.804 0.000 0.048 0.148
#> SRR1068832 3 0.1851 0.861367 0.088 0.000 0.912 0.000 0.000
#> SRR1376640 4 0.4240 0.481769 0.000 0.036 0.000 0.736 0.228
#> SRR1085712 2 0.4074 -0.249603 0.000 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1082283 1 0.2771 0.789492 0.860 0.000 0.000 0.128 0.012
#> SRR1084276 1 0.3321 0.782626 0.832 0.000 0.000 0.136 0.032
#> SRR1353262 2 0.3684 0.388689 0.000 0.720 0.000 0.000 0.280
#> SRR1437035 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.3321 0.782626 0.832 0.000 0.000 0.136 0.032
#> SRR1443026 2 0.0404 0.731844 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1417936 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 5 0.4984 0.764105 0.000 0.308 0.000 0.052 0.640
#> SRR1101128 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363886 5 0.3895 0.772467 0.000 0.320 0.000 0.000 0.680
#> SRR612983 5 0.4305 0.598567 0.000 0.488 0.000 0.000 0.512
#> SRR1394366 4 0.3730 0.747797 0.000 0.288 0.000 0.712 0.000
#> SRR1093218 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077090 3 0.1331 0.893008 0.000 0.000 0.952 0.008 0.040
#> SRR1327430 5 0.5128 0.495251 0.000 0.052 0.000 0.344 0.604
#> SRR1088958 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1486931 4 0.4201 0.721165 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1086820 1 0.3656 0.771975 0.800 0.000 0.000 0.168 0.032
#> SRR1383000 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.3480 0.241533 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR614335 5 0.3876 0.773273 0.000 0.316 0.000 0.000 0.684
#> SRR660534 2 0.0880 0.719550 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR817094 2 0.1121 0.716669 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1334265 5 0.4891 0.765800 0.000 0.316 0.000 0.044 0.640
#> SRR1456401 2 0.5967 -0.295515 0.000 0.456 0.000 0.436 0.108
#> SRR1086393 1 0.2127 0.794215 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1351521 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093100 5 0.5466 0.722433 0.000 0.244 0.000 0.116 0.640
#> SRR1309382 1 0.3616 0.773530 0.804 0.000 0.000 0.164 0.032
#> SRR1089375 3 0.3210 0.745411 0.212 0.000 0.788 0.000 0.000
#> SRR1499482 4 0.4182 0.726071 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR614719 4 0.6281 0.018787 0.000 0.160 0.000 0.488 0.352
#> SRR1081473 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.5115 0.772438 0.696 0.000 0.000 0.168 0.136
#> SRR1088217 1 0.3944 0.754306 0.768 0.000 0.000 0.200 0.032
#> SRR808496 5 0.4060 0.457056 0.000 0.000 0.000 0.360 0.640
#> SRR1336463 2 0.4770 0.252469 0.000 0.644 0.000 0.320 0.036
#> SRR612359 4 0.3661 0.751293 0.000 0.276 0.000 0.724 0.000
#> SRR1444412 1 0.3321 0.782626 0.832 0.000 0.000 0.136 0.032
#> SRR1074116 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656095 2 0.1908 0.664852 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.4404 0.746001 0.712 0.000 0.000 0.036 0.252
#> SRR1337886 2 0.5114 0.174387 0.000 0.608 0.000 0.340 0.052
#> SRR813632 1 0.3321 0.782626 0.832 0.000 0.000 0.136 0.032
#> SRR1101591 3 0.1732 0.867311 0.080 0.000 0.920 0.000 0.000
#> SRR1089713 3 0.6332 0.526418 0.224 0.000 0.608 0.136 0.032
#> SRR1453127 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 3 0.6640 0.469012 0.236 0.000 0.568 0.164 0.032
#> SRR1313831 1 0.2193 0.800425 0.900 0.000 0.000 0.092 0.008
#> SRR1315434 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814747 5 0.4029 0.773509 0.000 0.316 0.000 0.004 0.680
#> SRR1358539 1 0.0324 0.811812 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1367807 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1365791 3 0.1908 0.864606 0.000 0.000 0.908 0.092 0.000
#> SRR1081519 3 0.5528 0.680573 0.100 0.000 0.700 0.168 0.032
#> SRR614707 4 0.4887 0.602937 0.132 0.148 0.000 0.720 0.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.6897 0.313491 0.300 0.000 0.484 0.196 0.020
#> SRR1079502 3 0.1197 0.887992 0.048 0.000 0.952 0.000 0.000
#> SRR1457814 5 0.5027 0.496344 0.000 0.000 0.056 0.304 0.640
#> SRR1455127 5 0.3876 0.773273 0.000 0.316 0.000 0.000 0.684
#> SRR615081 5 0.5080 0.723196 0.000 0.316 0.000 0.056 0.628
#> SRR1327855 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417873 5 0.5107 0.758025 0.000 0.296 0.000 0.064 0.640
#> SRR1394125 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 5 0.3876 0.773273 0.000 0.316 0.000 0.000 0.684
#> SRR612383 4 0.3895 0.744774 0.000 0.320 0.000 0.680 0.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 4 0.4201 0.721165 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR612851 4 0.4074 0.740656 0.000 0.364 0.000 0.636 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.4201 -0.375685 0.000 0.592 0.000 0.000 0.408
#> SRR1340010 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475885 1 0.6549 0.587855 0.476 0.000 0.000 0.244 0.280
#> SRR1376334 1 0.3321 0.782626 0.832 0.000 0.000 0.136 0.032
#> SRR1399821 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1347042 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612323 4 0.4589 0.507979 0.000 0.064 0.000 0.724 0.212
#> SRR612604 2 0.2929 0.587025 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1389546 2 0.1608 0.687185 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1311877 1 0.3281 0.777693 0.848 0.000 0.000 0.092 0.060
#> SRR1465608 1 0.5637 0.680657 0.604 0.000 0.000 0.112 0.284
#> SRR1101808 2 0.2006 0.695006 0.000 0.916 0.000 0.072 0.012
#> SRR1414079 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331153 4 0.4201 0.721165 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1078439 3 0.3949 0.536010 0.000 0.000 0.668 0.332 0.000
#> SRR2165527 5 0.4171 0.720110 0.000 0.396 0.000 0.000 0.604
#> SRR1351147 1 0.3582 0.750341 0.768 0.000 0.000 0.224 0.008
#> SRR1313536 2 0.3365 0.674945 0.000 0.836 0.000 0.120 0.044
#> SRR1070308 2 0.6607 -0.302392 0.124 0.504 0.012 0.352 0.008
#> SRR1403110 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 4 0.4256 0.678059 0.000 0.436 0.000 0.564 0.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.5796 0.687368 0.588 0.000 0.000 0.128 0.284
#> SRR1074622 1 0.3110 0.785099 0.860 0.000 0.000 0.060 0.080
#> SRR1465847 3 0.5988 0.607571 0.176 0.000 0.656 0.136 0.032
#> SRR1443376 2 0.3480 0.339688 0.000 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.1484 0.806899 0.944 0.000 0.000 0.048 0.008
#> SRR1090881 4 0.3661 0.475066 0.000 0.000 0.276 0.724 0.000
#> SRR612251 5 0.5304 0.753544 0.000 0.292 0.000 0.080 0.628
#> SRR1418581 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR658045 2 0.0000 0.732563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613214 4 0.4767 -0.005582 0.000 0.020 0.000 0.560 0.420
#> SRR613078 4 0.3857 0.754157 0.000 0.312 0.000 0.688 0.000
#> SRR1472998 1 0.3656 0.771975 0.800 0.000 0.000 0.168 0.032
#> SRR1433452 4 0.4201 0.721165 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1101957 1 0.5164 0.715261 0.672 0.000 0.000 0.096 0.232
#> SRR1487993 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0955 0.729055 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1380375 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316151 5 0.4219 0.373828 0.000 0.000 0.000 0.416 0.584
#> SRR1417547 5 0.4029 0.773520 0.000 0.316 0.000 0.004 0.680
#> SRR659389 2 0.1408 0.716451 0.000 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1490270 4 0.4201 0.721165 0.000 0.408 0.000 0.592 0.000
#> SRR1398207 1 0.4237 0.761741 0.780 0.000 0.020 0.168 0.032
#> SRR1358755 3 0.4302 0.667314 0.248 0.000 0.720 0.032 0.000
#> SRR1078903 4 0.4262 0.659381 0.000 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR1323252 2 0.1121 0.716669 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1451796 2 0.4494 -0.049266 0.000 0.608 0.000 0.380 0.012
#> SRR1369172 1 0.3734 0.801525 0.812 0.000 0.000 0.060 0.128
#> SRR615982 4 0.4088 0.738847 0.000 0.368 0.000 0.632 0.000
#> SRR1480431 5 0.4147 0.772498 0.000 0.316 0.000 0.008 0.676
#> SRR1429825 5 0.5524 0.351337 0.000 0.068 0.000 0.416 0.516
#> SRR1102393 2 0.0000 0.732563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.7137 -0.041778 0.436 0.000 0.392 0.100 0.072
#> SRR808351 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.2773 0.795033 0.868 0.000 0.000 0.112 0.020
#> SRR1086611 4 0.4322 0.642247 0.088 0.144 0.000 0.768 0.000
#> SRR1392571 4 0.3796 0.751114 0.000 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1311441 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR808152 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0162 0.911217 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1433131 2 0.4549 -0.268726 0.000 0.528 0.000 0.464 0.008
#> SRR1321011 2 0.1121 0.716669 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1500598 5 0.4262 0.673859 0.000 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1379343 4 0.4182 0.726071 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1389108 1 0.5461 0.693025 0.620 0.000 0.000 0.096 0.284
#> SRR1376228 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0162 0.811586 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1358060 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613557 4 0.3885 0.749764 0.000 0.268 0.008 0.724 0.000
#> SRR809831 1 0.0324 0.811646 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1429387 3 0.0000 0.912729 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.811741 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.1965 0.858538 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.732563 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.4803 -0.190681 0.000 0.536 0.000 0.444 0.020
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 3 0.4222 0.662784 0.088 0.000 0.728 0.184 0.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.5127 0.323823 0.000 0.588 0.000 0.300 0.000 0.112
#> SRR1472057 3 0.1444 0.851806 0.072 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000
#> SRR614491 6 0.5266 0.234696 0.000 0.112 0.000 0.344 0.000 0.544
#> SRR1069376 1 0.0260 0.601316 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR811964 6 0.5955 0.182952 0.000 0.316 0.000 0.240 0.000 0.444
#> SRR1361415 2 0.0000 0.436879 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345715 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1328073 6 0.4952 0.346567 0.068 0.000 0.000 0.408 0.000 0.524
#> SRR1394209 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1474018 2 0.3482 -0.051227 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1500555 6 0.3833 0.366294 0.000 0.000 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1354363 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1391619 3 0.0146 0.896557 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1307997 6 0.0000 0.596377 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR663124 6 0.1531 0.591937 0.000 0.004 0.000 0.068 0.000 0.928
#> SRR1334670 1 0.3695 0.672672 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR612515 6 0.3955 0.366281 0.000 0.004 0.000 0.436 0.000 0.560
#> SRR1092727 6 0.3221 0.522546 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1364013 6 0.5871 0.198482 0.000 0.320 0.000 0.216 0.000 0.464
#> SRR1468553 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420169 3 0.2009 0.842773 0.068 0.000 0.908 0.000 0.024 0.000
#> SRR1442800 6 0.7208 0.062146 0.236 0.000 0.000 0.112 0.236 0.416
#> SRR1359214 2 0.3482 -0.051227 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.3830 0.671009 0.620 0.000 0.004 0.000 0.376 0.000
#> SRR1500030 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093053 3 0.5714 0.250980 0.000 0.000 0.484 0.340 0.000 0.176
#> SRR1399843 3 0.4548 0.560857 0.000 0.000 0.672 0.248 0.000 0.080
#> SRR1380231 3 0.1349 0.861136 0.056 0.000 0.940 0.000 0.004 0.000
#> SRR809470 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR614239 6 0.3823 0.371399 0.000 0.000 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR613939 6 0.2664 0.565091 0.000 0.000 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR612971 2 0.5344 0.316524 0.000 0.588 0.000 0.240 0.000 0.172
#> SRR1490204 6 0.0260 0.596807 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR811357 6 0.5801 0.247784 0.000 0.260 0.000 0.240 0.000 0.500
#> SRR1471672 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR613006 6 0.2605 0.578326 0.000 0.028 0.000 0.108 0.000 0.864
#> SRR1469570 6 0.5955 0.182952 0.000 0.316 0.000 0.240 0.000 0.444
#> SRR1457354 2 0.6047 -0.235171 0.000 0.412 0.000 0.316 0.000 0.272
#> SRR1362906 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813608 6 0.5955 0.182952 0.000 0.316 0.000 0.240 0.000 0.444
#> SRR1096736 5 0.6213 0.416580 0.172 0.032 0.000 0.284 0.512 0.000
#> SRR1478700 5 0.3737 0.799366 0.392 0.000 0.000 0.000 0.608 0.000
#> SRR1081543 3 0.1610 0.849982 0.000 0.000 0.916 0.084 0.000 0.000
#> SRR1384754 5 0.5329 0.705636 0.380 0.000 0.096 0.004 0.520 0.000
#> SRR612287 2 0.3244 0.051895 0.000 0.732 0.000 0.268 0.000 0.000
#> SRR1380317 4 0.5086 0.757247 0.000 0.384 0.000 0.532 0.000 0.084
#> SRR1315247 6 0.2838 0.562058 0.000 0.000 0.000 0.188 0.004 0.808
#> SRR1105344 2 0.2562 0.224177 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000 0.000
#> SRR658549 6 0.2697 0.562913 0.000 0.000 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1480240 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1084816 6 0.5955 0.182952 0.000 0.316 0.000 0.240 0.000 0.444
#> SRR612551 2 0.5092 0.356384 0.000 0.624 0.000 0.232 0.000 0.144
#> SRR1358520 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456075 3 0.5106 0.105554 0.396 0.000 0.520 0.000 0.084 0.000
#> SRR1389474 6 0.5955 0.182952 0.000 0.316 0.000 0.240 0.000 0.444
#> SRR1367005 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1334419 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095985 5 0.6761 -0.350011 0.332 0.000 0.288 0.036 0.344 0.000
#> SRR1325771 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660272 6 0.1765 0.590142 0.000 0.000 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR1332993 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 6 0.3076 0.480565 0.000 0.000 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR808044 1 0.3737 -0.428303 0.608 0.000 0.000 0.000 0.392 0.000
#> SRR1076916 3 0.3620 0.562176 0.000 0.000 0.648 0.000 0.352 0.000
#> SRR1356266 1 0.1910 0.642638 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1341983 2 0.1327 0.427937 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1456114 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.0146 0.896260 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0146 0.613229 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR613843 6 0.6093 0.202990 0.000 0.296 0.000 0.316 0.000 0.388
#> SRR1469192 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.2053 0.826639 0.000 0.000 0.888 0.108 0.004 0.000
#> SRR659839 6 0.5815 0.243543 0.000 0.264 0.000 0.240 0.000 0.496
#> SRR659533 6 0.6111 0.157261 0.000 0.324 0.000 0.304 0.000 0.372
#> SRR1362848 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1407492 6 0.3578 0.409939 0.000 0.000 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR1455082 6 0.5455 0.376065 0.000 0.264 0.000 0.172 0.000 0.564
#> SRR658362 2 0.1714 0.363412 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000 0.000
#> SRR810921 6 0.5939 0.193608 0.000 0.308 0.000 0.240 0.000 0.452
#> SRR662823 2 0.3390 -0.006443 0.000 0.704 0.000 0.296 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818232 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1454868 3 0.5926 0.181513 0.000 0.000 0.464 0.276 0.000 0.260
#> SRR1474816 6 0.5224 0.336368 0.000 0.228 0.000 0.164 0.000 0.608
#> SRR1342002 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0458 0.444051 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1466400 6 0.3109 0.544668 0.000 0.000 0.000 0.224 0.004 0.772
#> SRR658921 4 0.6110 0.082688 0.000 0.300 0.000 0.372 0.000 0.328
#> SRR1499873 2 0.5344 0.316524 0.000 0.588 0.000 0.240 0.000 0.172
#> SRR1101373 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1090145 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1379324 5 0.3864 -0.556534 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520 0.000
#> SRR1345307 6 0.5890 0.216868 0.000 0.288 0.000 0.240 0.000 0.472
#> SRR1396166 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454891 6 0.4982 0.334687 0.000 0.084 0.000 0.340 0.000 0.576
#> SRR663185 2 0.3390 -0.006443 0.000 0.704 0.000 0.296 0.000 0.000
#> SRR811819 1 0.3695 0.672672 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1318920 5 0.3684 -0.409284 0.372 0.000 0.000 0.000 0.628 0.000
#> SRR656758 6 0.5510 0.319033 0.000 0.192 0.000 0.248 0.000 0.560
#> SRR1474351 1 0.3695 0.672672 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR660450 6 0.1863 0.588640 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR1472687 2 0.0713 0.436687 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1334291 6 0.0000 0.596377 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1415153 6 0.0632 0.590764 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1323271 2 0.3782 -0.390623 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000 0.000
#> SRR1368939 6 0.5901 0.211931 0.000 0.292 0.000 0.240 0.000 0.468
#> SRR1443161 4 0.6922 0.487787 0.116 0.200 0.000 0.520 0.008 0.156
#> SRR614695 6 0.3833 0.366294 0.000 0.000 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1092372 5 0.3838 -0.520856 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552 0.000
#> SRR1474577 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1406582 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR612779 6 0.0146 0.596710 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1089006 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1354071 3 0.2933 0.714874 0.200 0.000 0.796 0.000 0.004 0.000
#> SRR1105463 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR811005 6 0.5955 0.182952 0.000 0.316 0.000 0.240 0.000 0.444
#> SRR1385319 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1325871 3 0.0146 0.896557 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1090861 1 0.0146 0.613380 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1320712 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1470075 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1321165 5 0.3864 -0.559897 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520 0.000
#> SRR1092112 3 0.3706 0.519960 0.000 0.000 0.620 0.000 0.380 0.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.5953 0.269940 0.016 0.540 0.000 0.232 0.000 0.212
#> SRR1432106 2 0.3390 -0.006443 0.000 0.704 0.000 0.296 0.000 0.000
#> SRR655756 6 0.5953 0.192749 0.000 0.308 0.000 0.244 0.000 0.448
#> SRR1458314 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1318582 6 0.1141 0.581477 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948
#> SRR1080484 2 0.3446 -0.031971 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000 0.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.2340 0.651621 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1400333 6 0.3833 0.366294 0.000 0.000 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1078834 6 0.3833 0.366294 0.000 0.000 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1417611 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.3833 0.626701 0.556 0.000 0.000 0.000 0.444 0.000
#> SRR1465440 2 0.5237 0.336206 0.000 0.608 0.000 0.220 0.000 0.172
#> SRR1400530 2 0.3528 0.363367 0.000 0.700 0.000 0.004 0.000 0.296
#> SRR614984 6 0.3823 0.371399 0.000 0.000 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1324269 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.436879 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1324349 2 0.6029 -0.105298 0.000 0.424 0.000 0.276 0.000 0.300
#> SRR1345523 2 0.5344 0.316524 0.000 0.588 0.000 0.240 0.000 0.172
#> SRR1500846 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR661505 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419062 3 0.0146 0.896549 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1480131 1 0.3830 0.671009 0.620 0.000 0.004 0.000 0.376 0.000
#> SRR1421284 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1329624 1 0.3695 0.672672 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 4 0.5185 0.662368 0.000 0.328 0.000 0.564 0.000 0.108
#> SRR1083286 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1091890 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347436 6 0.2527 0.571721 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1327473 1 0.3266 0.459020 0.728 0.000 0.000 0.272 0.000 0.000
#> SRR1338195 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.5492 0.284326 0.000 0.564 0.000 0.244 0.000 0.192
#> SRR1457792 1 0.3867 -0.636129 0.512 0.000 0.000 0.000 0.488 0.000
#> SRR658271 6 0.5862 0.231547 0.000 0.260 0.000 0.256 0.000 0.484
#> SRR1339597 1 0.2454 0.317923 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1454842 3 0.0146 0.896557 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1322643 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR614887 3 0.0146 0.896557 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1354620 3 0.3133 0.694756 0.212 0.000 0.780 0.000 0.008 0.000
#> SRR615056 2 0.3464 -0.041526 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.5844 0.244030 0.476 0.000 0.308 0.216 0.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.3448 0.129097 0.000 0.716 0.000 0.280 0.000 0.004
#> SRR1478834 1 0.3672 0.672780 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368 0.000
#> SRR812366 6 0.6093 -0.324965 0.000 0.336 0.000 0.284 0.000 0.380
#> SRR1435330 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615383 6 0.5939 0.193608 0.000 0.308 0.000 0.240 0.000 0.452
#> SRR1389157 6 0.3833 0.366294 0.000 0.000 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR613568 6 0.0000 0.596377 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.3464 -0.041851 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1337155 6 0.6795 0.356966 0.004 0.000 0.148 0.112 0.212 0.524
#> SRR1475345 2 0.0146 0.439241 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR809089 2 0.5371 0.311261 0.000 0.584 0.000 0.240 0.000 0.176
#> SRR1446180 6 0.3966 0.364489 0.000 0.000 0.000 0.444 0.004 0.552
#> SRR1406372 2 0.1625 0.443360 0.000 0.928 0.000 0.012 0.000 0.060
#> SRR1339880 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353136 3 0.5138 0.449211 0.000 0.000 0.600 0.276 0.000 0.124
#> SRR1093906 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.3917 0.426951 0.000 0.692 0.000 0.284 0.000 0.024
#> SRR1351104 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1363926 4 0.5219 0.666611 0.000 0.296 0.000 0.580 0.000 0.124
#> SRR1399861 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1338789 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1421420 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.3482 -0.051227 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 6 0.4417 0.360890 0.000 0.000 0.028 0.416 0.000 0.556
#> SRR1315041 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR661877 2 0.3266 0.042141 0.000 0.728 0.000 0.272 0.000 0.000
#> SRR1443268 5 0.2730 -0.026723 0.192 0.000 0.000 0.000 0.808 0.000
#> SRR1416617 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102443 5 0.5565 0.510996 0.208 0.000 0.000 0.240 0.552 0.000
#> SRR655672 6 0.5769 -0.028684 0.000 0.256 0.000 0.236 0.000 0.508
#> SRR1420006 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458267 6 0.0146 0.596622 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR613819 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1469432 2 0.5344 0.191636 0.000 0.532 0.000 0.120 0.000 0.348
#> SRR660907 2 0.2003 0.314979 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR1465092 6 0.2135 0.579383 0.000 0.000 0.000 0.128 0.000 0.872
#> SRR1470727 1 0.0458 0.589743 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1339153 3 0.1863 0.831378 0.000 0.000 0.896 0.104 0.000 0.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1414379 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1431326 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1487278 6 0.1863 0.588640 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR1098312 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810273 6 0.5955 0.182952 0.000 0.316 0.000 0.240 0.000 0.444
#> SRR1376000 6 0.0260 0.596807 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR614467 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR811471 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.5081 0.619272 0.588 0.000 0.000 0.104 0.308 0.000
#> SRR1479699 3 0.1411 0.856038 0.000 0.000 0.936 0.004 0.000 0.060
#> SRR1403589 6 0.5939 0.193608 0.000 0.308 0.000 0.240 0.000 0.452
#> SRR812625 6 0.5979 -0.179843 0.000 0.252 0.000 0.308 0.000 0.440
#> SRR1359803 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1338988 2 0.1610 0.451874 0.000 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1471222 6 0.6097 -0.358830 0.000 0.284 0.000 0.344 0.000 0.372
#> SRR1378992 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR659427 4 0.4482 0.792615 0.036 0.384 0.000 0.580 0.000 0.000
#> SRR1096638 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1466619 2 0.5880 -0.397535 0.000 0.424 0.000 0.376 0.000 0.200
#> SRR659307 6 0.4932 0.240976 0.000 0.000 0.372 0.072 0.000 0.556
#> SRR1439994 5 0.3864 0.673912 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520 0.000
#> SRR1454931 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1332928 5 0.4037 0.800760 0.380 0.000 0.012 0.000 0.608 0.000
#> SRR658621 2 0.3482 -0.051227 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1458243 1 0.3868 0.575862 0.508 0.000 0.000 0.000 0.492 0.000
#> SRR1374270 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.436879 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365598 6 0.3380 0.520253 0.000 0.004 0.000 0.244 0.004 0.748
#> SRR662787 2 0.0146 0.434030 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1408727 4 0.5071 0.766165 0.000 0.400 0.000 0.520 0.000 0.080
#> SRR1456274 1 0.4478 0.322464 0.724 0.000 0.008 0.100 0.000 0.168
#> SRR817744 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.436879 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.5344 0.316524 0.000 0.588 0.000 0.240 0.000 0.172
#> SRR1102680 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374198 5 0.3717 -0.427550 0.384 0.000 0.000 0.000 0.616 0.000
#> SRR1445856 5 0.3864 -0.559897 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520 0.000
#> SRR820049 3 0.1700 0.854764 0.000 0.000 0.928 0.024 0.000 0.048
#> SRR1375290 6 0.4894 0.346899 0.000 0.000 0.068 0.376 0.000 0.556
#> SRR818999 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1390242 1 0.3695 0.672672 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1401164 2 0.5081 0.326293 0.000 0.588 0.000 0.308 0.000 0.104
#> SRR1454629 1 0.3841 0.669690 0.616 0.000 0.004 0.000 0.380 0.000
#> SRR1332187 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657833 6 0.0146 0.596710 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1436207 6 0.0260 0.596807 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1488017 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.5497 0.284822 0.000 0.564 0.000 0.240 0.000 0.196
#> SRR1480384 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 6 0.0146 0.595681 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1308086 3 0.4729 0.599908 0.128 0.000 0.676 0.196 0.000 0.000
#> SRR1441868 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073705 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR615032 2 0.5062 0.361038 0.000 0.636 0.000 0.196 0.000 0.168
#> SRR1452356 2 0.3482 -0.051227 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000 0.000
#> SRR1442983 6 0.2778 0.520787 0.000 0.008 0.000 0.168 0.000 0.824
#> SRR1100346 6 0.3823 0.371399 0.000 0.000 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1332816 5 0.3756 0.791336 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600 0.000
#> SRR612299 6 0.2562 0.569756 0.000 0.000 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR1407386 1 0.0146 0.613309 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1418064 6 0.1714 0.565311 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR1309403 3 0.5719 0.499211 0.264 0.000 0.584 0.124 0.000 0.028
#> SRR1498395 6 0.0000 0.596377 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079998 3 0.5880 0.088138 0.200 0.000 0.424 0.000 0.376 0.000
#> SRR1498885 2 0.3482 -0.051227 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000 0.000
#> SRR1337215 6 0.3695 0.400940 0.000 0.000 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1414749 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.5625 -0.011154 0.532 0.000 0.276 0.000 0.192 0.000
#> SRR1368030 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1419760 6 0.3830 0.399427 0.004 0.000 0.000 0.376 0.000 0.620
#> SRR1381841 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR821388 6 0.6573 0.197898 0.000 0.056 0.156 0.340 0.000 0.448
#> SRR657623 2 0.3482 -0.051227 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0146 0.896557 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096149 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0260 0.614885 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR811333 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1311666 6 0.5543 0.302256 0.000 0.204 0.000 0.240 0.000 0.556
#> SRR1486698 6 0.4762 0.500810 0.000 0.148 0.000 0.176 0.000 0.676
#> SRR1446436 6 0.1910 0.588224 0.000 0.000 0.000 0.108 0.000 0.892
#> SRR815092 1 0.3695 0.672672 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1500149 6 0.3472 0.570270 0.000 0.092 0.000 0.100 0.000 0.808
#> SRR1100564 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811653 4 0.3717 0.814918 0.000 0.384 0.000 0.616 0.000 0.000
#> SRR1311348 6 0.5955 0.182952 0.000 0.316 0.000 0.240 0.000 0.444
#> SRR1489438 2 0.3428 -0.023700 0.000 0.696 0.000 0.304 0.000 0.000
#> SRR1435442 6 0.1863 0.588640 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000 0.896
#> SRR1421444 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.2165 0.462738 0.000 0.884 0.000 0.108 0.000 0.008
#> SRR1319520 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1444763 5 0.3695 0.807756 0.376 0.000 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1415026 2 0.0146 0.439101 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1416596 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.1501 0.365211 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0363 0.442654 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.3862 -0.588449 0.000 0.524 0.000 0.476 0.000 0.000
#> SRR1310094 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR663537 6 0.5955 0.182952 0.000 0.316 0.000 0.240 0.000 0.444
#> SRR1486780 1 0.3101 0.050675 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR613318 4 0.4052 0.778407 0.000 0.356 0.000 0.628 0.000 0.016
#> SRR1332694 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818670 6 0.5855 0.230520 0.000 0.276 0.000 0.240 0.000 0.484
#> SRR1120318 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1311622 3 0.0458 0.888794 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500931 3 0.0146 0.896549 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1387494 3 0.0146 0.896557 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1379175 4 0.5569 0.657164 0.000 0.320 0.000 0.520 0.000 0.160
#> SRR1401909 1 0.5682 0.507835 0.460 0.000 0.160 0.000 0.380 0.000
#> SRR1440541 2 0.3868 -0.025802 0.000 0.504 0.000 0.000 0.000 0.496
#> SRR1068832 3 0.1806 0.835198 0.088 0.000 0.908 0.000 0.004 0.000
#> SRR1376640 6 0.3843 0.357960 0.000 0.000 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR1085712 2 0.4330 0.423879 0.000 0.696 0.000 0.236 0.000 0.068
#> SRR1082283 1 0.4085 0.637348 0.748 0.000 0.000 0.096 0.156 0.000
#> SRR1084276 1 0.3695 0.672672 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1353262 6 0.5906 -0.202117 0.000 0.368 0.000 0.208 0.000 0.424
#> SRR1437035 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.3695 0.672672 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1443026 6 0.5978 0.183473 0.000 0.296 0.000 0.260 0.000 0.444
#> SRR1417936 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1101128 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.3428 -0.023812 0.000 0.696 0.000 0.304 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.1007 0.451940 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1394366 6 0.2558 0.574189 0.000 0.000 0.000 0.156 0.004 0.840
#> SRR1093218 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1077090 3 0.1204 0.869362 0.000 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1327430 4 0.4838 0.788117 0.000 0.396 0.000 0.544 0.000 0.060
#> SRR1088958 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1486931 6 0.0000 0.596377 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.4596 0.403244 0.000 0.672 0.000 0.240 0.000 0.088
#> SRR614335 2 0.3464 -0.042414 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000 0.000
#> SRR660534 6 0.5921 0.203190 0.000 0.300 0.000 0.240 0.000 0.460
#> SRR817094 2 0.5344 0.316524 0.000 0.588 0.000 0.240 0.000 0.172
#> SRR1334265 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1456401 4 0.5645 0.293617 0.000 0.152 0.000 0.456 0.000 0.392
#> SRR1086393 1 0.1957 0.426981 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1093100 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1309382 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1089375 3 0.2912 0.706735 0.216 0.000 0.784 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499482 6 0.0000 0.596377 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.5436 -0.114761 0.000 0.476 0.000 0.120 0.000 0.404
#> SRR1081473 3 0.0146 0.896355 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.3866 0.587978 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR1088217 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR808496 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1336463 6 0.5796 0.177787 0.000 0.388 0.000 0.180 0.000 0.432
#> SRR612359 6 0.3789 0.393172 0.000 0.000 0.000 0.416 0.000 0.584
#> SRR1444412 1 0.3695 0.672672 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656095 6 0.5770 0.255941 0.000 0.252 0.000 0.240 0.000 0.508
#> SRR808914 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.3309 -0.043078 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR1337886 6 0.5386 0.233444 0.000 0.368 0.000 0.120 0.000 0.512
#> SRR813632 1 0.3695 0.672672 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1101591 3 0.1663 0.838550 0.088 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089713 3 0.5939 0.042174 0.216 0.000 0.412 0.000 0.372 0.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 3 0.5981 -0.006502 0.228 0.000 0.396 0.000 0.376 0.000
#> SRR1313831 1 0.2597 0.655460 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814747 2 0.3756 -0.351699 0.000 0.600 0.000 0.400 0.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0363 0.616237 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1367807 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1365791 3 0.2165 0.825480 0.000 0.000 0.884 0.108 0.008 0.000
#> SRR1081519 3 0.5271 0.335150 0.104 0.000 0.516 0.000 0.380 0.000
#> SRR614707 6 0.4435 0.398790 0.024 0.000 0.000 0.392 0.004 0.580
#> SRR1094027 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.6874 0.125617 0.312 0.000 0.440 0.088 0.160 0.000
#> SRR1079502 3 0.1285 0.864911 0.052 0.000 0.944 0.004 0.000 0.000
#> SRR1457814 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1455127 2 0.5182 -0.267427 0.000 0.556 0.000 0.340 0.000 0.104
#> SRR615081 2 0.6058 -0.261665 0.000 0.404 0.000 0.324 0.000 0.272
#> SRR1327855 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417873 4 0.3782 0.834608 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.3482 -0.051227 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000 0.000
#> SRR612383 6 0.3482 0.436211 0.000 0.000 0.000 0.316 0.000 0.684
#> SRR1477711 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 6 0.0000 0.596377 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612851 6 0.1444 0.592495 0.000 0.000 0.000 0.072 0.000 0.928
#> SRR1086349 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.3076 0.464354 0.000 0.760 0.000 0.240 0.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.0547 0.887681 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1475885 5 0.5901 0.561564 0.372 0.000 0.000 0.116 0.488 0.024
#> SRR1376334 1 0.3695 0.672672 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1399821 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612323 6 0.4057 0.360613 0.000 0.008 0.000 0.436 0.000 0.556
#> SRR612604 6 0.5942 0.283515 0.000 0.232 0.000 0.324 0.000 0.444
#> SRR1389546 6 0.5867 0.225727 0.000 0.280 0.000 0.240 0.000 0.480
#> SRR1311877 1 0.3151 -0.011051 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1465608 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1101808 2 0.5921 0.112355 0.000 0.460 0.000 0.240 0.000 0.300
#> SRR1414079 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1331153 6 0.0000 0.596377 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078439 3 0.5850 0.144446 0.000 0.000 0.424 0.384 0.000 0.192
#> SRR2165527 2 0.1501 0.365900 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.5226 0.628074 0.620 0.000 0.000 0.104 0.264 0.012
#> SRR1313536 2 0.5648 -0.000464 0.000 0.472 0.000 0.156 0.000 0.372
#> SRR1070308 6 0.4252 0.463016 0.152 0.084 0.012 0.000 0.000 0.752
#> SRR1403110 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 6 0.0000 0.596377 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456862 5 0.3695 0.807756 0.376 0.000 0.000 0.000 0.624 0.000
#> SRR1074622 1 0.3446 -0.206130 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1465847 3 0.5763 0.168670 0.176 0.000 0.452 0.000 0.372 0.000
#> SRR1443376 6 0.4550 0.414926 0.000 0.084 0.000 0.240 0.000 0.676
#> SRR1471312 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.2092 0.646386 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1090881 6 0.4057 0.365212 0.000 0.000 0.008 0.436 0.000 0.556
#> SRR612251 4 0.3817 0.809842 0.000 0.432 0.000 0.568 0.000 0.000
#> SRR1418581 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR658045 6 0.5955 0.182952 0.000 0.316 0.000 0.240 0.000 0.444
#> SRR613214 4 0.5228 -0.037921 0.000 0.100 0.000 0.524 0.000 0.376
#> SRR613078 6 0.2527 0.570679 0.000 0.000 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1472998 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1433452 6 0.0000 0.596377 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101957 5 0.3823 0.746978 0.436 0.000 0.000 0.000 0.564 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465983 6 0.6010 0.106028 0.000 0.360 0.000 0.240 0.000 0.400
#> SRR1380375 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1316151 4 0.3446 0.730208 0.000 0.308 0.000 0.692 0.000 0.000
#> SRR1417547 2 0.3810 -0.442355 0.000 0.572 0.000 0.428 0.000 0.000
#> SRR659389 2 0.5336 0.316899 0.000 0.588 0.000 0.244 0.000 0.168
#> SRR1490270 6 0.0000 0.596377 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.3706 0.671897 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1358755 3 0.3141 0.708187 0.200 0.000 0.788 0.000 0.012 0.000
#> SRR1078903 6 0.2454 0.576409 0.000 0.000 0.000 0.160 0.000 0.840
#> SRR1323252 2 0.5992 0.004119 0.000 0.420 0.000 0.240 0.000 0.340
#> SRR1451796 6 0.1327 0.580348 0.000 0.064 0.000 0.000 0.000 0.936
#> SRR1369172 1 0.3428 0.564197 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304 0.000
#> SRR615982 6 0.2416 0.563197 0.000 0.000 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR1480431 2 0.3499 -0.051544 0.000 0.680 0.000 0.320 0.000 0.000
#> SRR1429825 4 0.6011 0.478284 0.000 0.272 0.000 0.432 0.000 0.296
#> SRR1102393 6 0.5955 0.182952 0.000 0.316 0.000 0.240 0.000 0.444
#> SRR1071313 1 0.4184 -0.493797 0.576 0.000 0.016 0.000 0.408 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0146 0.896045 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.2969 0.661635 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1086611 6 0.3833 0.366294 0.000 0.000 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1392571 6 0.3717 0.395887 0.000 0.000 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR1311441 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0260 0.895029 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1433131 6 0.3790 0.559825 0.000 0.104 0.000 0.116 0.000 0.780
#> SRR1321011 2 0.5344 0.316524 0.000 0.588 0.000 0.240 0.000 0.172
#> SRR1500598 2 0.0000 0.436879 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379343 6 0.0458 0.594652 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR1389108 5 0.3706 0.811238 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0146 0.606528 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613557 6 0.3823 0.371399 0.000 0.000 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR809831 1 0.0260 0.614916 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.897966 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.611411 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.1910 0.824702 0.108 0.000 0.892 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072031 6 0.5955 0.182952 0.000 0.316 0.000 0.240 0.000 0.444
#> SRR1374671 6 0.5966 0.300282 0.000 0.232 0.000 0.340 0.000 0.428
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.998 0.948 0.973 0.4962 0.499 0.499
#> 3 3 0.922 0.905 0.961 0.3120 0.778 0.584
#> 4 4 0.651 0.534 0.769 0.1184 0.819 0.539
#> 5 5 0.671 0.721 0.797 0.0445 0.840 0.513
#> 6 6 0.699 0.544 0.747 0.0369 0.937 0.763
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1404105 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0376 0.963 0.996 0.004
#> SRR614491 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1328073 2 0.0672 0.973 0.008 0.992
#> SRR1394209 2 0.0938 0.969 0.012 0.988
#> SRR1474018 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1391619 1 0.4562 0.922 0.904 0.096
#> SRR1307997 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1403980 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1420169 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1442800 2 0.0376 0.977 0.004 0.996
#> SRR1359214 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.4431 0.925 0.908 0.092
#> SRR1093053 2 0.9896 0.167 0.440 0.560
#> SRR1399843 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1380231 1 0.3114 0.943 0.944 0.056
#> SRR809470 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1079023 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1096736 1 0.4431 0.925 0.908 0.092
#> SRR1478700 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.6623 0.834 0.828 0.172
#> SRR1384754 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR612287 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1380317 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1315247 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1456075 1 0.2236 0.952 0.964 0.036
#> SRR1389474 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1417154 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1095985 1 0.3114 0.943 0.944 0.056
#> SRR1325771 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1360420 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR660272 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1356266 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1072948 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1472370 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1480176 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.4431 0.925 0.908 0.092
#> SRR659839 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1362848 2 0.6712 0.769 0.176 0.824
#> SRR1407492 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.1184 0.959 0.984 0.016
#> SRR818232 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1454868 2 0.2423 0.940 0.040 0.960
#> SRR1474816 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1086280 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1454891 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.9909 0.262 0.556 0.444
#> SRR614695 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.1184 0.959 0.984 0.016
#> SRR1105463 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1325871 1 0.6801 0.824 0.820 0.180
#> SRR1355415 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1092112 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1074790 2 0.0672 0.973 0.008 0.992
#> SRR1432106 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1078834 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.4431 0.925 0.908 0.092
#> SRR1419062 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1480131 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1315739 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1099189 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1091890 2 0.7376 0.719 0.208 0.792
#> SRR1347436 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1327473 1 0.7453 0.777 0.788 0.212
#> SRR1338195 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR809698 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.5294 0.897 0.880 0.120
#> SRR1322643 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR614887 1 0.4815 0.914 0.896 0.104
#> SRR1354620 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 0.8016 0.726 0.756 0.244
#> SRR1391529 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.4562 0.922 0.904 0.096
#> SRR615383 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1389157 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR613568 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1337155 2 0.9815 0.235 0.420 0.580
#> SRR1475345 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1446180 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1406372 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1353136 2 0.9850 0.208 0.428 0.572
#> SRR1093906 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR614035 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1399861 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1338789 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1421420 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1420832 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1352870 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1315041 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1102443 1 0.1184 0.959 0.984 0.016
#> SRR655672 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1420006 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1458267 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.4562 0.922 0.904 0.096
#> SRR1472749 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1414379 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.4562 0.922 0.904 0.096
#> SRR810273 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1478341 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1088606 1 0.4431 0.925 0.908 0.092
#> SRR1479699 2 0.9866 0.195 0.432 0.568
#> SRR1403589 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR659427 2 0.9323 0.438 0.348 0.652
#> SRR1096638 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1439994 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.2778 0.947 0.952 0.048
#> SRR658621 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1374270 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1456274 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR817744 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.4431 0.925 0.908 0.092
#> SRR1374198 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR820049 2 0.9896 0.167 0.440 0.560
#> SRR1375290 2 0.9170 0.476 0.332 0.668
#> SRR818999 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.4022 0.932 0.920 0.080
#> SRR1332187 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR603365 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR657833 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.4690 0.918 0.900 0.100
#> SRR1441868 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1485380 1 0.1414 0.958 0.980 0.020
#> SRR1073705 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1309403 2 0.9522 0.372 0.372 0.628
#> SRR1498395 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1414749 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1365963 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1419760 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1381841 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR821388 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR657623 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.4562 0.922 0.904 0.096
#> SRR819583 1 0.1414 0.958 0.980 0.020
#> SRR1096149 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1353028 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1403072 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR811653 2 0.6048 0.809 0.148 0.852
#> SRR1311348 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.4562 0.922 0.904 0.096
#> SRR1344010 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR613318 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1468469 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR818670 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1500931 1 0.1184 0.959 0.984 0.016
#> SRR1387494 1 0.4562 0.922 0.904 0.096
#> SRR1379175 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1401909 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.0672 0.962 0.992 0.008
#> SRR1376640 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.0938 0.961 0.988 0.012
#> SRR1396877 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1101128 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1363886 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1093218 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1077090 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1093100 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.1184 0.959 0.984 0.016
#> SRR1499482 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1087415 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR821846 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR656095 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1101591 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.1184 0.959 0.984 0.016
#> SRR1453127 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1498354 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1315434 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR814747 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1365791 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1081519 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR614707 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.1184 0.959 0.984 0.016
#> SRR1079502 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1457814 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1455127 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1417873 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1488388 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1340010 2 0.9732 0.284 0.404 0.596
#> SRR1475885 2 0.9286 0.445 0.344 0.656
#> SRR1376334 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1347042 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR612323 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.4690 0.918 0.900 0.100
#> SRR1331153 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.9393 0.504 0.644 0.356
#> SRR2165527 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1351147 1 0.1633 0.957 0.976 0.024
#> SRR1313536 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.0376 0.977 0.004 0.996
#> SRR1403110 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1456862 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1075579 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1090881 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR612251 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1487993 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1465983 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1367566 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1316151 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.0376 0.963 0.996 0.004
#> SRR808351 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1480501 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1081910 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1086611 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1392571 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR657313 1 0.4939 0.910 0.892 0.108
#> SRR1433131 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1376228 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1399757 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1358060 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1464517 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR613557 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR809831 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR816565 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.964 1.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.4298 0.928 0.912 0.088
#> SRR1072031 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.980 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1404105 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.1411 0.92330 0.036 0.000 0.964
#> SRR614491 2 0.3752 0.82567 0.000 0.856 0.144
#> SRR1069376 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1345715 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 3 0.0592 0.93335 0.000 0.012 0.988
#> SRR1394209 3 0.0000 0.93644 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474018 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1099809 1 0.6308 0.00687 0.508 0.000 0.492
#> SRR1500555 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1307997 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR663124 2 0.0424 0.97250 0.000 0.992 0.008
#> SRR1334670 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR612515 2 0.5363 0.61265 0.000 0.724 0.276
#> SRR1092727 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1468553 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1403980 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1420169 3 0.1643 0.91761 0.044 0.000 0.956
#> SRR1442800 3 0.0892 0.92783 0.000 0.020 0.980
#> SRR1359214 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1499849 1 0.6309 -0.00911 0.504 0.000 0.496
#> SRR1500030 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1093053 3 0.0237 0.93638 0.000 0.004 0.996
#> SRR1399843 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1380231 3 0.0592 0.93623 0.012 0.000 0.988
#> SRR809470 3 0.6225 0.25117 0.432 0.000 0.568
#> SRR614239 2 0.0592 0.96959 0.000 0.988 0.012
#> SRR613939 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR612971 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1490204 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.3412 0.82715 0.876 0.000 0.124
#> SRR613006 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1362906 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1079023 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1478700 3 0.2625 0.88275 0.084 0.000 0.916
#> SRR1081543 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1384754 3 0.0424 0.93769 0.008 0.000 0.992
#> SRR612287 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1380317 3 0.0424 0.93307 0.000 0.008 0.992
#> SRR1315247 2 0.5882 0.44613 0.000 0.652 0.348
#> SRR1105344 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR658549 2 0.0237 0.97531 0.000 0.996 0.004
#> SRR1480240 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1358520 2 0.0424 0.97501 0.000 0.992 0.008
#> SRR1419476 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1456075 3 0.1031 0.93085 0.024 0.000 0.976
#> SRR1389474 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1095985 3 0.0747 0.93456 0.016 0.000 0.984
#> SRR1325771 1 0.2448 0.87732 0.924 0.000 0.076
#> SRR1360420 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR660272 2 0.2537 0.90344 0.000 0.920 0.080
#> SRR1332993 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 3 0.2537 0.88653 0.080 0.000 0.920
#> SRR1076916 3 0.0424 0.93769 0.008 0.000 0.992
#> SRR1356266 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1456114 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1472370 3 0.1411 0.92330 0.036 0.000 0.964
#> SRR1480176 3 0.6204 0.27921 0.424 0.000 0.576
#> SRR613843 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR659839 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362848 3 0.0000 0.93644 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407492 2 0.1411 0.94869 0.000 0.964 0.036
#> SRR1455082 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR658362 2 0.0424 0.97521 0.000 0.992 0.008
#> SRR810921 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1456375 3 0.0424 0.93769 0.008 0.000 0.992
#> SRR818232 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.0237 0.93638 0.000 0.004 0.996
#> SRR1474816 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.3340 0.82769 0.880 0.000 0.120
#> SRR1088437 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1466400 2 0.5058 0.66685 0.000 0.756 0.244
#> SRR658921 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1499873 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 3 0.6095 0.36983 0.392 0.000 0.608
#> SRR1379324 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1086280 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1454891 2 0.0237 0.97531 0.000 0.996 0.004
#> SRR663185 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR811819 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472687 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1334291 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1368939 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443161 3 0.0000 0.93644 0.000 0.000 1.000
#> SRR614695 2 0.1163 0.95398 0.000 0.972 0.028
#> SRR1092372 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 3 0.1411 0.92330 0.036 0.000 0.964
#> SRR1105463 1 0.6244 0.19485 0.560 0.000 0.440
#> SRR811005 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1355415 3 0.6045 0.40055 0.380 0.000 0.620
#> SRR1090861 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.4452 0.77445 0.000 0.808 0.192
#> SRR1470075 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 3 0.6204 0.27022 0.424 0.000 0.576
#> SRR1321165 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.0592 0.93623 0.012 0.000 0.988
#> SRR1417588 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1074790 2 0.6500 0.13031 0.004 0.532 0.464
#> SRR1432106 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR655756 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1072749 1 0.4750 0.69739 0.784 0.000 0.216
#> SRR1078586 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 3 0.4887 0.70520 0.000 0.228 0.772
#> SRR1078834 3 0.5988 0.44207 0.000 0.368 0.632
#> SRR1417611 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1396840 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1400530 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR614984 2 0.3879 0.81514 0.000 0.848 0.152
#> SRR1324269 1 0.6252 0.18270 0.556 0.000 0.444
#> SRR1401491 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1319443 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0592 0.97196 0.000 0.988 0.012
#> SRR1345523 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1500846 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1419062 3 0.0424 0.93769 0.008 0.000 0.992
#> SRR1480131 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.1529 0.94688 0.000 0.960 0.040
#> SRR1329624 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1099189 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0237 0.93638 0.000 0.004 0.996
#> SRR1347436 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327473 3 0.0661 0.93547 0.004 0.008 0.988
#> SRR1338195 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR809698 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1322643 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1354620 3 0.3340 0.84488 0.120 0.000 0.880
#> SRR615056 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1105320 3 0.0661 0.93547 0.004 0.008 0.988
#> SRR1391529 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1478834 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1435330 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR615383 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 3 0.6309 0.04339 0.000 0.496 0.504
#> SRR613568 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR614095 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1103092 1 0.4399 0.73811 0.812 0.000 0.188
#> SRR1337155 3 0.0592 0.93335 0.000 0.012 0.988
#> SRR1475345 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR809089 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 3 0.1529 0.91143 0.000 0.040 0.960
#> SRR1406372 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1339880 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1353136 3 0.0000 0.93644 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093906 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR614035 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1351104 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1399861 3 0.6008 0.41679 0.000 0.372 0.628
#> SRR1338789 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1420832 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1476231 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.3267 0.83425 0.000 0.116 0.884
#> SRR1315041 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR661877 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1443268 1 0.6307 0.03050 0.512 0.000 0.488
#> SRR1416617 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1102443 3 0.1411 0.92330 0.036 0.000 0.964
#> SRR655672 2 0.0237 0.97531 0.000 0.996 0.004
#> SRR1420006 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1458267 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR613819 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1469432 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR660907 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1465092 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1472749 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1414379 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1431326 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.2625 0.89558 0.000 0.916 0.084
#> SRR1098312 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR810273 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR614467 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR811471 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1088606 3 0.0747 0.93456 0.016 0.000 0.984
#> SRR1479699 3 0.0237 0.93638 0.000 0.004 0.996
#> SRR1403589 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1359803 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1471222 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1378992 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR659427 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1096638 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR659307 3 0.5098 0.67589 0.000 0.248 0.752
#> SRR1439994 1 0.6274 0.14233 0.544 0.000 0.456
#> SRR1454931 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 3 0.0747 0.93456 0.016 0.000 0.984
#> SRR658621 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1095840 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.6045 0.36609 0.620 0.000 0.380
#> SRR1374270 3 0.4887 0.69906 0.000 0.228 0.772
#> SRR1470947 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1365598 2 0.3752 0.82760 0.000 0.856 0.144
#> SRR662787 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1408727 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1456274 3 0.0592 0.93623 0.012 0.000 0.988
#> SRR817744 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1387379 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1102680 3 0.0475 0.93736 0.004 0.004 0.992
#> SRR1374198 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.6244 0.19573 0.560 0.000 0.440
#> SRR820049 3 0.0237 0.93638 0.000 0.004 0.996
#> SRR1375290 3 0.0237 0.93638 0.000 0.004 0.996
#> SRR818999 1 0.6291 0.09952 0.532 0.000 0.468
#> SRR1390242 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454629 3 0.0747 0.93456 0.016 0.000 0.984
#> SRR1332187 3 0.0424 0.93769 0.008 0.000 0.992
#> SRR603365 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR657833 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1441868 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1073705 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1452356 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1442983 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332816 1 0.2261 0.88690 0.932 0.000 0.068
#> SRR612299 2 0.1031 0.95769 0.000 0.976 0.024
#> SRR1407386 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 3 0.0661 0.93547 0.004 0.008 0.988
#> SRR1498395 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.6307 0.05973 0.488 0.000 0.512
#> SRR1498885 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1337215 3 0.5810 0.51403 0.000 0.336 0.664
#> SRR1414749 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1365963 3 0.4974 0.68593 0.236 0.000 0.764
#> SRR1368030 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1419760 3 0.0592 0.93335 0.000 0.012 0.988
#> SRR1381841 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR821388 3 0.0237 0.93638 0.000 0.004 0.996
#> SRR657623 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1094241 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR819583 3 0.0592 0.93623 0.012 0.000 0.988
#> SRR1096149 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1353028 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.1411 0.92330 0.036 0.000 0.964
#> SRR1311666 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR811653 3 0.0000 0.93644 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311348 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1435442 2 0.3816 0.81699 0.000 0.852 0.148
#> SRR1421444 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1344010 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1319520 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1416596 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1485499 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1316078 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR663465 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1310094 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR663537 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR613318 2 0.4605 0.74546 0.000 0.796 0.204
#> SRR1332694 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR818670 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1500931 3 0.0592 0.93623 0.012 0.000 0.988
#> SRR1387494 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1379175 3 0.0592 0.93078 0.000 0.012 0.988
#> SRR1401909 3 0.6252 0.21751 0.444 0.000 0.556
#> SRR1440541 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.1411 0.92330 0.036 0.000 0.964
#> SRR1376640 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085712 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1082283 3 0.1411 0.92330 0.036 0.000 0.964
#> SRR1084276 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1437035 3 0.3340 0.84514 0.120 0.000 0.880
#> SRR1396877 3 0.5810 0.49961 0.336 0.000 0.664
#> SRR1443026 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1101128 3 0.0424 0.93769 0.008 0.000 0.992
#> SRR1363886 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR612983 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1394366 2 0.2878 0.88188 0.000 0.904 0.096
#> SRR1093218 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1077090 3 0.2066 0.90467 0.060 0.000 0.940
#> SRR1327430 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1088958 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR614335 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR660534 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1334265 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1456401 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1086393 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1093100 2 0.6126 0.32534 0.000 0.600 0.400
#> SRR1309382 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 3 0.1411 0.92330 0.036 0.000 0.964
#> SRR1499482 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR614719 2 0.0237 0.97531 0.000 0.996 0.004
#> SRR1081473 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1087415 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 3 0.6180 0.30388 0.416 0.000 0.584
#> SRR808496 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1336463 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR612359 2 0.0424 0.97261 0.000 0.992 0.008
#> SRR1444412 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR821846 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR656095 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 3 0.1289 0.92611 0.032 0.000 0.968
#> SRR1337886 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.1643 0.91760 0.044 0.000 0.956
#> SRR1089713 3 0.1411 0.92330 0.036 0.000 0.964
#> SRR1453127 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1498354 3 0.1753 0.91450 0.048 0.000 0.952
#> SRR1313831 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR814747 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1358539 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.0424 0.93769 0.008 0.000 0.992
#> SRR1081519 3 0.1163 0.92849 0.028 0.000 0.972
#> SRR614707 3 0.4062 0.78038 0.000 0.164 0.836
#> SRR1094027 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.1289 0.92583 0.032 0.000 0.968
#> SRR1079502 3 0.0424 0.93769 0.008 0.000 0.992
#> SRR1457814 3 0.1643 0.90266 0.000 0.044 0.956
#> SRR1455127 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR615081 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1327855 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1417873 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1394125 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1488388 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR612383 2 0.0747 0.96647 0.000 0.984 0.016
#> SRR1477711 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1340010 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1475885 3 0.0829 0.93562 0.012 0.004 0.984
#> SRR1376334 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR612323 2 0.4555 0.74555 0.000 0.800 0.200
#> SRR612604 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 3 0.2261 0.89775 0.068 0.000 0.932
#> SRR1101808 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1331153 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078439 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR2165527 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1351147 3 0.4555 0.74296 0.200 0.000 0.800
#> SRR1313536 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.6045 0.39408 0.000 0.620 0.380
#> SRR1403110 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1456862 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.1529 0.92047 0.040 0.000 0.960
#> SRR1443376 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1075579 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.2356 0.88028 0.000 0.072 0.928
#> SRR612251 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1418581 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 2 0.0592 0.96959 0.000 0.988 0.012
#> SRR613078 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472998 3 0.1411 0.92330 0.036 0.000 0.964
#> SRR1433452 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1465983 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1316151 3 0.5810 0.49667 0.000 0.336 0.664
#> SRR1417547 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR659389 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398207 1 0.6244 0.19495 0.560 0.000 0.440
#> SRR1358755 3 0.2537 0.88661 0.080 0.000 0.920
#> SRR1078903 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1429825 2 0.0747 0.96851 0.000 0.984 0.016
#> SRR1102393 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 3 0.0747 0.93456 0.016 0.000 0.984
#> SRR808351 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1081910 3 0.1163 0.92822 0.028 0.000 0.972
#> SRR1086611 3 0.2878 0.85669 0.000 0.096 0.904
#> SRR1392571 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1433131 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1500598 2 0.0237 0.97725 0.000 0.996 0.004
#> SRR1379343 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1399757 1 0.6045 0.36677 0.620 0.000 0.380
#> SRR1358060 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR1464517 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR613557 2 0.6295 0.07567 0.000 0.528 0.472
#> SRR809831 1 0.1031 0.92811 0.976 0.000 0.024
#> SRR1429387 3 0.0237 0.93864 0.004 0.000 0.996
#> SRR816565 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.94950 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.0424 0.93769 0.008 0.000 0.992
#> SRR1072031 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.97735 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 3 0.1557 0.846794 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1404105 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR2164936 2 0.4356 0.310337 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1472057 3 0.5992 -0.031314 0.444 0.000 0.516 0.040
#> SRR614491 4 0.5000 -0.001998 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1069376 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR811964 2 0.3764 0.412586 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1361415 4 0.3610 0.479185 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1345715 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1328073 3 0.7248 0.130973 0.000 0.148 0.472 0.380
#> SRR1394209 4 0.5781 -0.164523 0.000 0.028 0.480 0.492
#> SRR1474018 4 0.3801 0.448795 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1099809 1 0.5339 0.630568 0.688 0.000 0.272 0.040
#> SRR1500555 4 0.5000 -0.001998 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1354363 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1391619 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1307997 2 0.5432 0.316162 0.000 0.652 0.032 0.316
#> SRR663124 4 0.5000 -0.008744 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR1334670 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 4 0.5000 -0.001998 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1092727 2 0.4477 0.299073 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1364013 4 0.4985 0.037001 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1468553 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1403980 3 0.0000 0.865576 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.5915 0.397322 0.560 0.000 0.400 0.040
#> SRR1442800 2 0.7425 0.088914 0.000 0.508 0.280 0.212
#> SRR1359214 4 0.4454 0.352203 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR1499849 1 0.5366 0.626371 0.684 0.000 0.276 0.040
#> SRR1500030 3 0.0921 0.859172 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1093053 3 0.3372 0.775153 0.000 0.036 0.868 0.096
#> SRR1399843 3 0.0817 0.859139 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1380231 3 0.1545 0.847040 0.008 0.000 0.952 0.040
#> SRR809470 1 0.5417 0.613494 0.676 0.000 0.284 0.040
#> SRR614239 4 0.5000 -0.001998 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR613939 2 0.3688 0.419618 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR612971 2 0.4955 -0.004517 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1490204 2 0.4431 0.356735 0.000 0.696 0.000 0.304
#> SRR811357 2 0.3610 0.425368 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1471672 1 0.3982 0.705951 0.776 0.000 0.220 0.004
#> SRR613006 2 0.3764 0.420289 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1469570 2 0.3649 0.422660 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1457354 2 0.5372 0.004841 0.000 0.544 0.012 0.444
#> SRR1362906 3 0.0921 0.859172 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1079023 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR813608 2 0.3649 0.424100 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1096736 3 0.3172 0.798634 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR1478700 1 0.6176 0.431622 0.572 0.000 0.368 0.060
#> SRR1081543 3 0.1118 0.854509 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1384754 3 0.5810 0.524168 0.256 0.000 0.672 0.072
#> SRR612287 4 0.4250 0.440658 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR1380317 4 0.5935 -0.103857 0.000 0.036 0.468 0.496
#> SRR1315247 2 0.5446 0.350992 0.000 0.680 0.044 0.276
#> SRR1105344 2 0.3873 0.412249 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR658549 4 0.5000 -0.008744 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR1480240 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.3837 0.405241 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR612551 2 0.4356 0.333815 0.000 0.708 0.000 0.292
#> SRR1358520 4 0.2610 0.453091 0.000 0.088 0.012 0.900
#> SRR1419476 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1456075 1 0.6299 0.306193 0.520 0.000 0.420 0.060
#> SRR1389474 2 0.3528 0.430532 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1367005 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1334419 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1417154 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1095985 3 0.6056 0.712533 0.088 0.136 0.736 0.040
#> SRR1325771 1 0.0188 0.875301 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1360420 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR660272 2 0.5937 0.265070 0.000 0.608 0.052 0.340
#> SRR1332993 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1311833 2 0.1389 0.465117 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR808044 1 0.6135 0.421116 0.568 0.000 0.376 0.056
#> SRR1076916 3 0.0000 0.865576 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.4994 0.038013 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1456114 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1072948 3 0.0921 0.859172 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1472370 3 0.5971 0.036299 0.428 0.000 0.532 0.040
#> SRR1480176 1 0.5512 0.588042 0.660 0.000 0.300 0.040
#> SRR613843 2 0.1211 0.464912 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1469192 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1404555 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR659839 2 0.1637 0.469149 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR659533 2 0.4585 0.270285 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR1362848 4 0.4994 -0.166856 0.000 0.000 0.480 0.520
#> SRR1407492 4 0.5000 -0.001998 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1455082 2 0.4916 0.202409 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR658362 4 0.4994 0.026653 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR810921 2 0.3837 0.405241 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR662823 4 0.4164 0.446619 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1456375 3 0.5535 0.428388 0.304 0.000 0.656 0.040
#> SRR818232 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.4761 0.521384 0.000 0.004 0.664 0.332
#> SRR1474816 2 0.1022 0.462904 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1342002 1 0.4868 0.698044 0.748 0.000 0.212 0.040
#> SRR1088437 4 0.3610 0.476639 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1466400 2 0.5228 0.364973 0.000 0.696 0.036 0.268
#> SRR658921 2 0.4840 0.391543 0.000 0.732 0.028 0.240
#> SRR1499873 2 0.4103 0.365740 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1101373 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090145 1 0.4163 0.721481 0.792 0.000 0.188 0.020
#> SRR1379324 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.1211 0.464224 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1396166 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1086280 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1454891 4 0.5000 -0.001998 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR663185 4 0.3649 0.478917 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR811819 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.3688 0.431925 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1474351 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.5517 0.314320 0.000 0.648 0.036 0.316
#> SRR1472687 2 0.4406 0.311898 0.000 0.700 0.000 0.300
#> SRR1334291 2 0.3873 0.411377 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1415153 2 0.4164 0.353733 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1323271 4 0.5028 0.181252 0.000 0.400 0.004 0.596
#> SRR1368939 2 0.0188 0.455185 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1443161 3 0.2973 0.765141 0.000 0.000 0.856 0.144
#> SRR614695 2 0.4776 0.392884 0.000 0.732 0.024 0.244
#> SRR1092372 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1406582 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612779 2 0.3569 0.422504 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1089006 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1354071 3 0.5964 0.058687 0.424 0.000 0.536 0.040
#> SRR1105463 1 0.5256 0.646005 0.700 0.000 0.260 0.040
#> SRR811005 2 0.3837 0.422817 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1385319 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1355415 1 0.5339 0.631872 0.688 0.000 0.272 0.040
#> SRR1090861 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 4 0.2830 0.450897 0.000 0.060 0.040 0.900
#> SRR1470075 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1091254 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.5966 0.542607 0.624 0.000 0.316 0.060
#> SRR1321165 1 0.0707 0.868097 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1092112 3 0.5442 0.461003 0.288 0.000 0.672 0.040
#> SRR1417588 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1074790 2 0.7764 -0.016771 0.000 0.404 0.240 0.356
#> SRR1432106 4 0.3726 0.475499 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR655756 2 0.4103 0.365740 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1458314 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1318582 2 0.3907 0.395906 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1080484 4 0.3569 0.478659 0.000 0.196 0.000 0.804
#> SRR1072749 1 0.5417 0.656132 0.704 0.000 0.240 0.056
#> SRR1078586 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.6350 0.266818 0.000 0.612 0.092 0.296
#> SRR1078834 2 0.6033 0.284345 0.000 0.620 0.064 0.316
#> SRR1417611 4 0.4382 0.247939 0.000 0.296 0.000 0.704
#> SRR1396840 1 0.4037 0.770386 0.824 0.000 0.136 0.040
#> SRR1465440 2 0.4925 0.042661 0.000 0.572 0.000 0.428
#> SRR1400530 2 0.5571 0.206632 0.000 0.580 0.024 0.396
#> SRR614984 4 0.5000 -0.001998 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1324269 1 0.5312 0.635927 0.692 0.000 0.268 0.040
#> SRR1401491 2 0.3764 0.415836 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1319443 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 4 0.7387 0.048385 0.000 0.392 0.164 0.444
#> SRR1345523 2 0.4331 0.343430 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1500846 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR661505 3 0.0707 0.858240 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.865576 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0336 0.873872 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1421284 4 0.2589 0.446335 0.000 0.044 0.044 0.912
#> SRR1329624 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1099189 4 0.4992 0.035024 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR1083286 1 0.0188 0.875434 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1091890 3 0.5727 0.549328 0.000 0.076 0.688 0.236
#> SRR1347436 2 0.5460 0.319165 0.000 0.632 0.028 0.340
#> SRR1327473 3 0.7004 0.599758 0.012 0.152 0.616 0.220
#> SRR1338195 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR809698 2 0.4103 0.365740 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1457792 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR658271 2 0.1389 0.465117 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1339597 1 0.0657 0.870839 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1454842 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1322643 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR614887 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1354620 1 0.5658 0.544081 0.632 0.000 0.328 0.040
#> SRR615056 4 0.3801 0.473919 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1105320 3 0.7198 0.461908 0.000 0.280 0.540 0.180
#> SRR1391529 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663052 4 0.4998 0.015812 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR1478834 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.1867 0.450895 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1435330 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR615383 2 0.1302 0.464662 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1389157 4 0.5590 0.014463 0.000 0.456 0.020 0.524
#> SRR613568 2 0.5173 0.324249 0.000 0.660 0.020 0.320
#> SRR614095 4 0.5000 -0.015330 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR1103092 1 0.3706 0.788751 0.848 0.000 0.112 0.040
#> SRR1337155 3 0.4040 0.651949 0.000 0.248 0.752 0.000
#> SRR1475345 4 0.4941 0.222310 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR809089 2 0.3975 0.387174 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1446180 2 0.6708 0.234911 0.000 0.596 0.132 0.272
#> SRR1406372 2 0.4697 0.334710 0.000 0.696 0.008 0.296
#> SRR1339880 3 0.0817 0.859139 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1353136 3 0.3942 0.633646 0.000 0.000 0.764 0.236
#> SRR1093906 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR614035 2 0.4643 0.255254 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1351104 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1363926 4 0.5112 0.157623 0.000 0.384 0.008 0.608
#> SRR1399861 4 0.3907 0.409662 0.000 0.044 0.120 0.836
#> SRR1338789 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0817 0.859139 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1420832 4 0.3942 0.467111 0.000 0.236 0.000 0.764
#> SRR1476231 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1352870 4 0.6240 0.102597 0.000 0.320 0.076 0.604
#> SRR1315041 4 0.5364 0.140549 0.000 0.392 0.016 0.592
#> SRR661877 4 0.4406 0.406768 0.000 0.300 0.000 0.700
#> SRR1443268 1 0.5769 0.582829 0.652 0.000 0.292 0.056
#> SRR1416617 3 0.0000 0.865576 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102443 3 0.6240 0.254143 0.368 0.000 0.568 0.064
#> SRR655672 4 0.5000 -0.001998 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1420006 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1458267 2 0.4985 0.069801 0.000 0.532 0.000 0.468
#> SRR613819 4 0.2480 0.459563 0.000 0.088 0.008 0.904
#> SRR1469432 4 0.5163 0.197123 0.000 0.480 0.004 0.516
#> SRR660907 4 0.4925 0.243161 0.000 0.428 0.000 0.572
#> SRR1465092 2 0.5294 0.224241 0.000 0.508 0.008 0.484
#> SRR1470727 1 0.0672 0.870776 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1339153 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1472749 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1414379 4 0.2973 0.448985 0.000 0.096 0.020 0.884
#> SRR1431326 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1487278 2 0.5052 0.383390 0.000 0.720 0.036 0.244
#> SRR1098312 3 0.1520 0.849527 0.000 0.024 0.956 0.020
#> SRR810273 2 0.1474 0.465278 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1376000 2 0.3610 0.420400 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR614467 4 0.3649 0.471534 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR811471 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1088606 3 0.6457 0.555258 0.032 0.304 0.624 0.040
#> SRR1479699 3 0.1820 0.841588 0.000 0.036 0.944 0.020
#> SRR1403589 2 0.0000 0.453654 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.4877 0.235040 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR1359803 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.4994 -0.129465 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1471222 2 0.4697 0.262399 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR1378992 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR659427 3 0.4543 0.521971 0.000 0.000 0.676 0.324
#> SRR1096638 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1466619 2 0.4008 0.399103 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR659307 4 0.5928 0.023677 0.000 0.456 0.036 0.508
#> SRR1439994 1 0.5592 0.624926 0.680 0.000 0.264 0.056
#> SRR1454931 1 0.0707 0.868097 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1332928 3 0.6360 0.050958 0.420 0.000 0.516 0.064
#> SRR658621 4 0.3528 0.480190 0.000 0.192 0.000 0.808
#> SRR1095840 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.5448 0.649607 0.700 0.000 0.244 0.056
#> SRR1374270 4 0.4312 0.393719 0.000 0.056 0.132 0.812
#> SRR1470947 4 0.4522 0.380974 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR1365598 2 0.5619 0.310528 0.000 0.640 0.040 0.320
#> SRR662787 4 0.2868 0.427394 0.000 0.136 0.000 0.864
#> SRR1408727 4 0.2635 0.455294 0.000 0.076 0.020 0.904
#> SRR1456274 3 0.3024 0.831887 0.012 0.020 0.896 0.072
#> SRR817744 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1478744 4 0.4817 0.307180 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1387379 2 0.4134 0.367931 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1102680 3 0.0707 0.858248 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.5256 0.646005 0.700 0.000 0.260 0.040
#> SRR820049 3 0.3533 0.788254 0.000 0.056 0.864 0.080
#> SRR1375290 3 0.2816 0.809563 0.000 0.036 0.900 0.064
#> SRR818999 1 0.5284 0.641021 0.696 0.000 0.264 0.040
#> SRR1390242 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0469 0.457282 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1454629 3 0.8153 0.515072 0.152 0.268 0.528 0.052
#> SRR1332187 3 0.0000 0.865576 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR603365 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR657833 2 0.4008 0.403051 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1436207 2 0.4989 0.055112 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1488017 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612947 2 0.3444 0.437602 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1480384 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1364761 2 0.4250 0.334673 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1308086 3 0.1211 0.854599 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1441868 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1485380 3 0.0376 0.865351 0.004 0.000 0.992 0.004
#> SRR1073705 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR615032 2 0.4941 0.017040 0.000 0.564 0.000 0.436
#> SRR1452356 4 0.3873 0.471031 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR1442983 2 0.1940 0.468466 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1100346 4 0.4996 0.000508 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR1332816 1 0.2944 0.781093 0.868 0.000 0.128 0.004
#> SRR612299 2 0.5195 0.361285 0.000 0.692 0.032 0.276
#> SRR1407386 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.2011 0.455513 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1309403 3 0.7605 0.374964 0.008 0.324 0.496 0.172
#> SRR1498395 2 0.3444 0.425103 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1079998 1 0.5917 0.535928 0.624 0.000 0.320 0.056
#> SRR1498885 4 0.3907 0.468918 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR1337215 2 0.6603 0.210706 0.000 0.572 0.100 0.328
#> SRR1414749 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1365963 1 0.6179 0.389326 0.552 0.000 0.392 0.056
#> SRR1368030 4 0.4123 0.468635 0.000 0.220 0.008 0.772
#> SRR1419760 3 0.7261 0.284415 0.000 0.368 0.480 0.152
#> SRR1381841 1 0.2500 0.836640 0.916 0.000 0.044 0.040
#> SRR821388 4 0.5582 0.240426 0.000 0.032 0.348 0.620
#> SRR657623 4 0.3486 0.481795 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1094241 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR819583 3 0.0000 0.865576 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.1398 0.856402 0.956 0.000 0.040 0.004
#> SRR1342829 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1353028 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811333 1 0.5971 0.327270 0.532 0.000 0.428 0.040
#> SRR1311666 2 0.3726 0.416079 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1486698 2 0.4898 0.205472 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR1446436 2 0.3688 0.418282 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR815092 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.3873 0.411377 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1100564 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR811653 4 0.5000 -0.182217 0.000 0.000 0.496 0.504
#> SRR1311348 2 0.3528 0.430532 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1489438 4 0.3907 0.458840 0.000 0.232 0.000 0.768
#> SRR1435442 2 0.5430 0.335183 0.000 0.664 0.036 0.300
#> SRR1421444 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1344010 2 0.4961 -0.013854 0.000 0.552 0.000 0.448
#> SRR1319520 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444763 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 4 0.4925 0.233598 0.000 0.428 0.000 0.572
#> SRR1416596 4 0.6170 0.077809 0.000 0.420 0.052 0.528
#> SRR1485499 4 0.4164 0.450233 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR1316078 4 0.4996 0.160505 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR663465 4 0.3837 0.473452 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1310094 4 0.5112 0.155709 0.000 0.384 0.008 0.608
#> SRR663537 2 0.3764 0.412586 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1486780 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1453950 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1087875 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR613318 4 0.5018 0.250871 0.000 0.332 0.012 0.656
#> SRR1332694 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0921 0.859172 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR818670 2 0.4134 0.365729 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1120318 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.1716 0.849348 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1500931 3 0.4595 0.653061 0.184 0.000 0.776 0.040
#> SRR1387494 3 0.0895 0.858364 0.000 0.004 0.976 0.020
#> SRR1379175 3 0.7513 0.332850 0.000 0.284 0.492 0.224
#> SRR1401909 1 0.5339 0.631872 0.688 0.000 0.272 0.040
#> SRR1440541 2 0.5075 0.296891 0.000 0.644 0.012 0.344
#> SRR1068832 3 0.5982 0.015914 0.436 0.000 0.524 0.040
#> SRR1376640 2 0.4992 0.067618 0.000 0.524 0.000 0.476
#> SRR1085712 2 0.4661 0.234168 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1082283 1 0.5933 0.376580 0.552 0.000 0.408 0.040
#> SRR1084276 1 0.0336 0.873894 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1353262 2 0.4008 0.397268 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1437035 1 0.6229 0.315592 0.528 0.000 0.416 0.056
#> SRR1396877 1 0.5778 0.490562 0.604 0.000 0.356 0.040
#> SRR1443026 2 0.3219 0.434764 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1417936 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1436822 2 0.5712 0.223336 0.000 0.584 0.032 0.384
#> SRR1101128 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1363886 4 0.4454 0.408235 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR612983 2 0.4624 0.258966 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR1394366 2 0.5052 0.383390 0.000 0.720 0.036 0.244
#> SRR1093218 3 0.5096 0.687319 0.156 0.000 0.760 0.084
#> SRR1077090 1 0.5905 0.408344 0.564 0.000 0.396 0.040
#> SRR1327430 4 0.2473 0.457879 0.000 0.080 0.012 0.908
#> SRR1088958 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486931 2 0.3873 0.411377 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1086820 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.4949 0.719681 0.760 0.000 0.180 0.060
#> SRR1355705 2 0.4585 0.276331 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR614335 4 0.3649 0.478917 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR660534 2 0.3907 0.396798 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR817094 2 0.3873 0.401108 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1334265 4 0.5735 0.131622 0.000 0.392 0.032 0.576
#> SRR1456401 4 0.5070 0.171819 0.000 0.372 0.008 0.620
#> SRR1086393 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1093100 4 0.3071 0.439860 0.000 0.044 0.068 0.888
#> SRR1309382 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 3 0.5977 0.029728 0.432 0.000 0.528 0.040
#> SRR1499482 2 0.4888 0.212098 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR614719 4 0.5000 -0.001998 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1081473 3 0.1389 0.851039 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1087415 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.5366 0.626531 0.684 0.000 0.276 0.040
#> SRR808496 4 0.5672 0.340618 0.000 0.188 0.100 0.712
#> SRR1336463 2 0.4990 0.295472 0.000 0.640 0.008 0.352
#> SRR612359 4 0.4877 0.038900 0.000 0.408 0.000 0.592
#> SRR1444412 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR821846 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR656095 2 0.3688 0.419539 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR808914 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.5924 0.384284 0.556 0.000 0.404 0.040
#> SRR1337886 2 0.4624 0.273554 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR813632 1 0.2216 0.824069 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1101591 1 0.6031 0.344242 0.536 0.000 0.420 0.044
#> SRR1089713 3 0.5762 0.302317 0.352 0.000 0.608 0.040
#> SRR1453127 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1498354 1 0.5793 0.484225 0.600 0.000 0.360 0.040
#> SRR1313831 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0921 0.859172 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR814747 4 0.4295 0.452254 0.000 0.240 0.008 0.752
#> SRR1358539 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1365791 3 0.0921 0.853683 0.000 0.028 0.972 0.000
#> SRR1081519 1 0.5942 0.371307 0.548 0.000 0.412 0.040
#> SRR614707 2 0.6495 0.257627 0.000 0.608 0.108 0.284
#> SRR1094027 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1489092 3 0.5996 -0.036897 0.448 0.000 0.512 0.040
#> SRR1079502 3 0.1716 0.846572 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1457814 4 0.4018 0.340049 0.000 0.004 0.224 0.772
#> SRR1455127 4 0.4331 0.439847 0.000 0.288 0.000 0.712
#> SRR615081 2 0.4599 0.395219 0.000 0.736 0.016 0.248
#> SRR1327855 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1417873 4 0.4511 0.302918 0.000 0.268 0.008 0.724
#> SRR1394125 3 0.0000 0.865576 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1401122 4 0.2011 0.460782 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR612383 4 0.5000 -0.001998 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1477711 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.4972 0.111801 0.000 0.544 0.000 0.456
#> SRR612851 2 0.4994 0.043798 0.000 0.520 0.000 0.480
#> SRR1086349 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR812837 2 0.4933 -0.010505 0.000 0.568 0.000 0.432
#> SRR1340010 3 0.4134 0.606578 0.000 0.000 0.740 0.260
#> SRR1475885 3 0.7453 0.380777 0.012 0.352 0.504 0.132
#> SRR1376334 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0592 0.868468 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1347042 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR612323 4 0.5000 -0.001998 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR612604 2 0.4053 0.410053 0.000 0.768 0.004 0.228
#> SRR1389546 2 0.4164 0.353733 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1311877 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1465608 1 0.6110 0.440557 0.576 0.000 0.368 0.056
#> SRR1101808 2 0.4477 0.347279 0.000 0.688 0.000 0.312
#> SRR1414079 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1331153 2 0.5368 0.295919 0.000 0.636 0.024 0.340
#> SRR1078439 3 0.0592 0.860311 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR2165527 4 0.4072 0.456464 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1351147 3 0.8970 0.182949 0.300 0.300 0.348 0.052
#> SRR1313536 2 0.1637 0.465148 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1070308 2 0.7740 -0.010348 0.000 0.416 0.236 0.348
#> SRR1403110 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.4431 0.349605 0.000 0.696 0.000 0.304
#> SRR1401317 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1456862 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1465847 1 0.5924 0.388902 0.556 0.000 0.404 0.040
#> SRR1443376 2 0.3024 0.449530 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1471312 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1075579 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 4 0.6587 0.131646 0.000 0.292 0.112 0.596
#> SRR612251 4 0.4978 0.199749 0.000 0.384 0.004 0.612
#> SRR1418581 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR658045 2 0.3444 0.435044 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR613214 4 0.4996 0.020275 0.000 0.484 0.000 0.516
#> SRR613078 2 0.4053 0.410053 0.000 0.768 0.004 0.228
#> SRR1472998 1 0.5924 0.388902 0.556 0.000 0.404 0.040
#> SRR1433452 2 0.3873 0.411377 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1101957 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1487993 3 0.0921 0.859172 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1465983 2 0.3873 0.401500 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1380375 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1316151 2 0.7523 -0.016028 0.000 0.412 0.184 0.404
#> SRR1417547 4 0.2011 0.460782 0.000 0.080 0.000 0.920
#> SRR659389 2 0.4277 0.342379 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1490270 2 0.4936 0.334826 0.000 0.672 0.012 0.316
#> SRR1398207 1 0.5168 0.660637 0.712 0.000 0.248 0.040
#> SRR1358755 1 0.5860 0.442028 0.580 0.000 0.380 0.040
#> SRR1078903 2 0.4977 0.078510 0.000 0.540 0.000 0.460
#> SRR1323252 2 0.3837 0.407737 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1451796 2 0.3486 0.447261 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1369172 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.5000 -0.006807 0.000 0.500 0.000 0.500
#> SRR1480431 2 0.4999 0.010551 0.000 0.508 0.000 0.492
#> SRR1429825 2 0.5872 0.212179 0.000 0.576 0.040 0.384
#> SRR1102393 2 0.3444 0.435044 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1071313 1 0.6257 0.261418 0.508 0.000 0.436 0.056
#> SRR808351 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1317513 1 0.0000 0.876536 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0817 0.859139 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1081910 1 0.6010 0.188890 0.488 0.000 0.472 0.040
#> SRR1086611 2 0.6640 0.243658 0.000 0.604 0.128 0.268
#> SRR1392571 4 0.4998 -0.006162 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR1311441 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR808152 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR657313 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1433131 2 0.3726 0.417008 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1321011 2 0.4907 0.054821 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR1500598 4 0.4072 0.456577 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1379343 2 0.3311 0.443418 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1389108 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1376228 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1399757 1 0.2281 0.815986 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1358060 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1464517 3 0.1389 0.851039 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR613557 4 0.5000 -0.001998 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR809831 1 0.4636 0.723111 0.772 0.000 0.188 0.040
#> SRR1429387 3 0.0188 0.866327 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR816565 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071644 1 0.0188 0.876494 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1406936 3 0.2011 0.842980 0.000 0.000 0.920 0.080
#> SRR1072031 2 0.3801 0.411462 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1374671 4 0.5000 -0.008744 0.000 0.500 0.000 0.500
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 3 0.3053 0.7622 0.000 0.000 0.828 0.008 0.164
#> SRR1404105 1 0.1608 0.8415 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR2164936 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472057 5 0.4342 0.7939 0.040 0.000 0.232 0.000 0.728
#> SRR614491 2 0.2798 0.7865 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1069376 1 0.0794 0.8513 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR811964 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.5077 0.5530 0.000 0.568 0.000 0.392 0.040
#> SRR1345715 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1328073 4 0.6360 0.5031 0.000 0.016 0.284 0.560 0.140
#> SRR1394209 4 0.5920 0.4972 0.000 0.000 0.272 0.580 0.148
#> SRR1474018 2 0.5171 0.4356 0.000 0.504 0.000 0.456 0.040
#> SRR1099809 1 0.6101 -0.1880 0.444 0.000 0.124 0.000 0.432
#> SRR1500555 2 0.2674 0.7857 0.000 0.856 0.000 0.140 0.004
#> SRR1354363 1 0.1608 0.8415 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1391619 3 0.1410 0.8536 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1307997 4 0.6178 0.6030 0.000 0.304 0.040 0.584 0.072
#> SRR663124 2 0.2798 0.7865 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1334670 1 0.2723 0.8549 0.864 0.000 0.000 0.012 0.124
#> SRR612515 2 0.2798 0.7865 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1092727 2 0.1043 0.8073 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1364013 2 0.3163 0.7777 0.000 0.824 0.000 0.164 0.012
#> SRR1468553 3 0.0510 0.8739 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1403980 3 0.0290 0.8736 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1420169 5 0.5270 0.7942 0.120 0.000 0.208 0.000 0.672
#> SRR1442800 4 0.6158 0.6506 0.000 0.096 0.148 0.668 0.088
#> SRR1359214 4 0.4169 0.4186 0.000 0.240 0.000 0.732 0.028
#> SRR1499849 5 0.6089 0.5566 0.324 0.000 0.144 0.000 0.532
#> SRR1500030 3 0.2561 0.7881 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1093053 3 0.0955 0.8672 0.000 0.000 0.968 0.004 0.028
#> SRR1399843 3 0.2690 0.7777 0.000 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1380231 5 0.4161 0.6732 0.000 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR809470 1 0.5861 0.3002 0.500 0.000 0.100 0.000 0.400
#> SRR614239 2 0.2798 0.7865 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR613939 2 0.2798 0.7839 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR612971 2 0.3319 0.7205 0.000 0.820 0.000 0.160 0.020
#> SRR1490204 2 0.2471 0.7882 0.000 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.2470 0.8273 0.884 0.000 0.012 0.000 0.104
#> SRR613006 2 0.2377 0.7921 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 4 0.6344 0.3480 0.000 0.344 0.028 0.536 0.092
#> SRR1362906 3 0.2561 0.7881 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1079023 1 0.0162 0.8550 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR813608 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 5 0.4907 0.6622 0.000 0.000 0.292 0.052 0.656
#> SRR1478700 5 0.5335 0.7888 0.132 0.000 0.200 0.000 0.668
#> SRR1081543 3 0.1952 0.8357 0.000 0.000 0.912 0.004 0.084
#> SRR1384754 5 0.3636 0.7442 0.000 0.000 0.272 0.000 0.728
#> SRR612287 2 0.4972 0.5729 0.000 0.620 0.000 0.336 0.044
#> SRR1380317 4 0.6161 0.5187 0.000 0.012 0.276 0.580 0.132
#> SRR1315247 4 0.5779 0.0959 0.000 0.456 0.036 0.480 0.028
#> SRR1105344 2 0.2286 0.8008 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR658549 2 0.2798 0.7865 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1480240 1 0.2818 0.8533 0.856 0.000 0.000 0.012 0.132
#> SRR1084816 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0693 0.8028 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1358520 4 0.4890 0.7101 0.000 0.124 0.052 0.764 0.060
#> SRR1419476 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456075 5 0.4192 0.7884 0.032 0.000 0.232 0.000 0.736
#> SRR1389474 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1334419 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1417154 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095985 5 0.4066 0.7269 0.000 0.000 0.324 0.004 0.672
#> SRR1325771 1 0.2771 0.8563 0.860 0.000 0.000 0.012 0.128
#> SRR1360420 3 0.0162 0.8760 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR660272 4 0.5991 0.6676 0.000 0.084 0.096 0.684 0.136
#> SRR1332993 1 0.1608 0.8415 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1311833 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808044 5 0.5430 0.7766 0.148 0.000 0.192 0.000 0.660
#> SRR1076916 3 0.4192 -0.1511 0.000 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1356266 1 0.2771 0.8542 0.860 0.000 0.000 0.012 0.128
#> SRR1341983 2 0.2179 0.7981 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1456114 1 0.1608 0.8415 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1072948 3 0.2605 0.7855 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1472370 5 0.4313 0.7939 0.040 0.000 0.228 0.000 0.732
#> SRR1480176 5 0.6177 0.3708 0.400 0.000 0.136 0.000 0.464
#> SRR613843 2 0.0404 0.8055 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1469192 1 0.1768 0.8407 0.924 0.000 0.004 0.000 0.072
#> SRR1404555 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0510 0.8063 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR659533 2 0.0290 0.8057 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1362848 3 0.6185 0.1233 0.000 0.000 0.504 0.348 0.148
#> SRR1407492 2 0.2798 0.7865 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1455082 2 0.2605 0.7841 0.000 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR658362 2 0.2843 0.7861 0.000 0.848 0.000 0.144 0.008
#> SRR810921 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.4972 0.5729 0.000 0.620 0.000 0.336 0.044
#> SRR1456375 5 0.3837 0.7340 0.000 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR818232 1 0.2953 0.8496 0.844 0.000 0.000 0.012 0.144
#> SRR1454868 3 0.4102 0.7189 0.000 0.004 0.796 0.080 0.120
#> SRR1474816 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.3419 0.7287 0.804 0.000 0.016 0.000 0.180
#> SRR1088437 2 0.5086 0.5507 0.000 0.564 0.000 0.396 0.040
#> SRR1466400 2 0.5716 -0.0500 0.000 0.472 0.032 0.468 0.028
#> SRR658921 2 0.5716 -0.0185 0.000 0.476 0.032 0.464 0.028
#> SRR1499873 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1090145 1 0.5720 0.4854 0.544 0.000 0.060 0.012 0.384
#> SRR1379324 1 0.2723 0.8550 0.864 0.000 0.000 0.012 0.124
#> SRR1345307 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0290 0.8760 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1086280 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.2798 0.7865 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR663185 2 0.4902 0.5528 0.000 0.564 0.000 0.408 0.028
#> SRR811819 1 0.2864 0.8540 0.852 0.000 0.000 0.012 0.136
#> SRR1318920 1 0.2909 0.8511 0.848 0.000 0.000 0.012 0.140
#> SRR656758 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0771 0.8571 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR660450 4 0.5635 0.6728 0.000 0.196 0.036 0.684 0.084
#> SRR1472687 2 0.0955 0.8024 0.000 0.968 0.000 0.028 0.004
#> SRR1334291 2 0.2956 0.7821 0.000 0.848 0.004 0.140 0.008
#> SRR1415153 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323271 4 0.3445 0.6099 0.000 0.140 0.000 0.824 0.036
#> SRR1368939 2 0.0404 0.8054 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1443161 3 0.3477 0.7574 0.000 0.000 0.824 0.040 0.136
#> SRR614695 2 0.5715 -0.0141 0.000 0.480 0.032 0.460 0.028
#> SRR1092372 1 0.2909 0.8512 0.848 0.000 0.000 0.012 0.140
#> SRR1474577 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1406582 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR612779 2 0.2561 0.7868 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1089006 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1354071 5 0.5201 0.7917 0.128 0.000 0.188 0.000 0.684
#> SRR1105463 1 0.4425 0.6991 0.680 0.000 0.024 0.000 0.296
#> SRR811005 2 0.0671 0.8068 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1385319 1 0.2953 0.8496 0.844 0.000 0.000 0.012 0.144
#> SRR1325871 3 0.1041 0.8677 0.000 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR1355415 5 0.5861 0.6528 0.260 0.000 0.148 0.000 0.592
#> SRR1090861 1 0.2723 0.8555 0.864 0.000 0.000 0.012 0.124
#> SRR1320712 4 0.5960 0.6518 0.000 0.040 0.180 0.664 0.116
#> SRR1470075 1 0.1608 0.8415 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1091254 1 0.2674 0.8553 0.868 0.000 0.000 0.012 0.120
#> SRR1101397 1 0.6282 0.1818 0.496 0.000 0.164 0.000 0.340
#> SRR1321165 1 0.3242 0.8353 0.816 0.000 0.000 0.012 0.172
#> SRR1092112 5 0.4367 0.6478 0.004 0.000 0.416 0.000 0.580
#> SRR1417588 3 0.0290 0.8760 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1074790 4 0.6671 0.6438 0.000 0.064 0.188 0.604 0.144
#> SRR1432106 2 0.5077 0.5530 0.000 0.568 0.000 0.392 0.040
#> SRR655756 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.1608 0.8415 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1318582 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.5086 0.5507 0.000 0.564 0.000 0.396 0.040
#> SRR1072749 1 0.5400 0.5378 0.632 0.000 0.096 0.000 0.272
#> SRR1078586 1 0.0566 0.8564 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1400333 4 0.6688 0.6362 0.000 0.156 0.220 0.580 0.044
#> SRR1078834 4 0.5360 0.6351 0.000 0.232 0.052 0.684 0.032
#> SRR1417611 4 0.3218 0.6193 0.000 0.128 0.004 0.844 0.024
#> SRR1396840 1 0.4003 0.7287 0.704 0.000 0.008 0.000 0.288
#> SRR1465440 2 0.3194 0.7301 0.000 0.832 0.000 0.148 0.020
#> SRR1400530 4 0.6400 0.7002 0.000 0.212 0.036 0.608 0.144
#> SRR614984 2 0.2798 0.7865 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1324269 1 0.5270 0.5481 0.672 0.000 0.120 0.000 0.208
#> SRR1401491 2 0.1671 0.8047 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1319443 1 0.2953 0.8496 0.844 0.000 0.000 0.012 0.144
#> SRR1324349 4 0.6673 0.7127 0.000 0.128 0.112 0.624 0.136
#> SRR1345523 2 0.0912 0.8017 0.000 0.972 0.000 0.016 0.012
#> SRR1500846 1 0.1608 0.8415 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR661505 3 0.0162 0.8740 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1419062 3 0.0703 0.8647 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1480131 1 0.3391 0.8280 0.800 0.000 0.000 0.012 0.188
#> SRR1421284 4 0.4546 0.6409 0.000 0.012 0.176 0.756 0.056
#> SRR1329624 1 0.2612 0.8558 0.868 0.000 0.000 0.008 0.124
#> SRR1315739 3 0.0290 0.8760 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1099189 2 0.2798 0.7865 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1083286 1 0.2953 0.8496 0.844 0.000 0.000 0.012 0.144
#> SRR1091890 3 0.2452 0.8007 0.000 0.052 0.908 0.028 0.012
#> SRR1347436 4 0.5523 0.5154 0.000 0.352 0.036 0.588 0.024
#> SRR1327473 4 0.6724 0.1393 0.000 0.000 0.284 0.420 0.296
#> SRR1338195 3 0.0290 0.8760 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR809698 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0609 0.8531 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR658271 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.3300 0.8146 0.792 0.000 0.004 0.000 0.204
#> SRR1454842 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322643 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR614887 3 0.0162 0.8760 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1354620 5 0.5808 0.7447 0.160 0.000 0.232 0.000 0.608
#> SRR615056 2 0.4990 0.5684 0.000 0.600 0.000 0.360 0.040
#> SRR1105320 4 0.6630 0.3031 0.000 0.004 0.308 0.476 0.212
#> SRR1391529 1 0.2723 0.8549 0.864 0.000 0.000 0.012 0.124
#> SRR663052 2 0.2753 0.7909 0.000 0.856 0.000 0.136 0.008
#> SRR1478834 1 0.2723 0.8549 0.864 0.000 0.000 0.012 0.124
#> SRR812366 2 0.0703 0.8009 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1435330 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 2 0.2798 0.7865 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR613568 4 0.5329 0.6296 0.000 0.236 0.036 0.684 0.044
#> SRR614095 2 0.2329 0.7980 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1103092 1 0.4199 0.7173 0.692 0.000 0.008 0.004 0.296
#> SRR1337155 3 0.6857 -0.1105 0.000 0.124 0.492 0.344 0.040
#> SRR1475345 2 0.3757 0.6779 0.000 0.772 0.000 0.208 0.020
#> SRR809089 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 4 0.5799 0.6654 0.000 0.168 0.124 0.676 0.032
#> SRR1406372 2 0.6270 0.0837 0.000 0.508 0.024 0.384 0.084
#> SRR1339880 3 0.2561 0.7881 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1353136 3 0.3238 0.7709 0.000 0.000 0.836 0.028 0.136
#> SRR1093906 3 0.0290 0.8760 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR614035 2 0.1981 0.7876 0.000 0.920 0.000 0.064 0.016
#> SRR1351104 1 0.1608 0.8415 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1363926 4 0.5326 0.7189 0.000 0.124 0.032 0.724 0.120
#> SRR1399861 4 0.5657 0.6087 0.000 0.012 0.204 0.660 0.124
#> SRR1338789 1 0.2864 0.8546 0.852 0.000 0.000 0.012 0.136
#> SRR1421420 3 0.2561 0.7881 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1420832 2 0.4972 0.5729 0.000 0.620 0.000 0.336 0.044
#> SRR1476231 1 0.0703 0.8525 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1352870 2 0.6330 -0.1924 0.000 0.456 0.160 0.384 0.000
#> SRR1315041 4 0.5049 0.7152 0.000 0.124 0.044 0.752 0.080
#> SRR661877 2 0.4891 0.5749 0.000 0.640 0.000 0.316 0.044
#> SRR1443268 1 0.6241 0.2165 0.512 0.000 0.164 0.000 0.324
#> SRR1416617 3 0.0290 0.8760 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1102443 5 0.4644 0.7985 0.052 0.000 0.224 0.004 0.720
#> SRR655672 2 0.2798 0.7865 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1420006 3 0.0162 0.8760 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1458267 2 0.2471 0.7882 0.000 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR613819 4 0.3845 0.6721 0.000 0.124 0.004 0.812 0.060
#> SRR1469432 2 0.4957 0.5853 0.000 0.624 0.000 0.332 0.044
#> SRR660907 2 0.4485 0.5840 0.000 0.680 0.000 0.292 0.028
#> SRR1465092 4 0.5531 0.3755 0.000 0.416 0.028 0.532 0.024
#> SRR1470727 1 0.2563 0.8215 0.872 0.000 0.008 0.000 0.120
#> SRR1339153 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414379 4 0.5312 0.7197 0.000 0.124 0.044 0.732 0.100
#> SRR1431326 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1487278 2 0.5716 -0.0500 0.000 0.472 0.032 0.468 0.028
#> SRR1098312 3 0.1892 0.8354 0.000 0.004 0.916 0.000 0.080
#> SRR810273 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.2798 0.7839 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR614467 2 0.5386 0.5364 0.000 0.564 0.000 0.372 0.064
#> SRR811471 1 0.2771 0.8542 0.860 0.000 0.000 0.012 0.128
#> SRR1478341 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088606 5 0.4196 0.6895 0.000 0.000 0.356 0.004 0.640
#> SRR1479699 3 0.2929 0.7982 0.000 0.004 0.876 0.044 0.076
#> SRR1403589 2 0.0404 0.8065 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR812625 2 0.2690 0.7844 0.000 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1359803 1 0.2997 0.8479 0.840 0.000 0.000 0.012 0.148
#> SRR1338988 2 0.3456 0.7017 0.000 0.800 0.000 0.184 0.016
#> SRR1471222 2 0.2424 0.7942 0.000 0.868 0.000 0.132 0.000
#> SRR1378992 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR659427 3 0.6125 0.0934 0.000 0.000 0.500 0.364 0.136
#> SRR1096638 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1466619 2 0.3053 0.7803 0.000 0.828 0.000 0.164 0.008
#> SRR659307 2 0.2798 0.7865 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1439994 1 0.6000 0.3773 0.572 0.000 0.160 0.000 0.268
#> SRR1454931 1 0.3318 0.8303 0.808 0.000 0.000 0.012 0.180
#> SRR1332928 5 0.4086 0.7799 0.024 0.000 0.240 0.000 0.736
#> SRR658621 2 0.5086 0.5507 0.000 0.564 0.000 0.396 0.040
#> SRR1095840 1 0.2771 0.8542 0.860 0.000 0.000 0.012 0.128
#> SRR1458243 1 0.5137 0.5774 0.684 0.000 0.108 0.000 0.208
#> SRR1374270 4 0.5553 0.6172 0.000 0.012 0.180 0.676 0.132
#> SRR1470947 2 0.4748 0.5881 0.000 0.660 0.000 0.300 0.040
#> SRR1365598 4 0.5240 0.6190 0.000 0.244 0.036 0.684 0.036
#> SRR662787 4 0.3218 0.6193 0.000 0.128 0.004 0.844 0.024
#> SRR1408727 4 0.5807 0.7207 0.000 0.124 0.052 0.692 0.132
#> SRR1456274 5 0.4812 0.6758 0.000 0.004 0.312 0.032 0.652
#> SRR817744 1 0.0703 0.8525 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1478744 2 0.4616 0.5890 0.000 0.676 0.000 0.288 0.036
#> SRR1387379 2 0.0451 0.8039 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004
#> SRR1102680 3 0.1205 0.8566 0.000 0.004 0.956 0.000 0.040
#> SRR1374198 1 0.2771 0.8545 0.860 0.000 0.000 0.012 0.128
#> SRR1445856 1 0.4419 0.6795 0.668 0.000 0.020 0.000 0.312
#> SRR820049 3 0.1596 0.8439 0.000 0.028 0.948 0.012 0.012
#> SRR1375290 3 0.0613 0.8686 0.000 0.008 0.984 0.004 0.004
#> SRR818999 1 0.4620 0.5556 0.592 0.000 0.016 0.000 0.392
#> SRR1390242 1 0.2771 0.8542 0.860 0.000 0.000 0.012 0.128
#> SRR1401164 2 0.0510 0.8063 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1454629 5 0.4178 0.7544 0.008 0.000 0.292 0.004 0.696
#> SRR1332187 3 0.0162 0.8747 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR603365 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR657833 2 0.5309 0.3003 0.000 0.596 0.028 0.356 0.020
#> SRR1436207 2 0.2471 0.7882 0.000 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR1488017 1 0.0162 0.8550 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR612947 2 0.0290 0.8059 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1480384 1 0.1608 0.8415 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1364761 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.2719 0.7861 0.000 0.000 0.852 0.004 0.144
#> SRR1441868 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1485380 3 0.3366 0.5213 0.000 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1073705 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR615032 2 0.3194 0.7299 0.000 0.832 0.000 0.148 0.020
#> SRR1452356 2 0.5077 0.5530 0.000 0.568 0.000 0.392 0.040
#> SRR1442983 2 0.0404 0.8056 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1100346 2 0.2674 0.7872 0.000 0.856 0.000 0.140 0.004
#> SRR1332816 1 0.2300 0.8234 0.908 0.000 0.040 0.000 0.052
#> SRR612299 4 0.5716 0.0475 0.000 0.468 0.032 0.472 0.028
#> SRR1407386 1 0.2723 0.8549 0.864 0.000 0.000 0.012 0.124
#> SRR1418064 2 0.1270 0.8056 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1309403 4 0.6429 0.3507 0.000 0.000 0.296 0.496 0.208
#> SRR1498395 2 0.2017 0.8038 0.000 0.912 0.000 0.080 0.008
#> SRR1079998 1 0.6248 0.1767 0.520 0.000 0.172 0.000 0.308
#> SRR1498885 2 0.4935 0.5734 0.000 0.616 0.000 0.344 0.040
#> SRR1337215 4 0.6871 0.5866 0.000 0.064 0.224 0.572 0.140
#> SRR1414749 3 0.0290 0.8760 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1365963 1 0.6561 -0.1940 0.424 0.000 0.204 0.000 0.372
#> SRR1368030 2 0.5434 0.5520 0.000 0.588 0.000 0.336 0.076
#> SRR1419760 4 0.6366 0.4723 0.000 0.012 0.300 0.544 0.144
#> SRR1381841 1 0.3884 0.7370 0.708 0.000 0.000 0.004 0.288
#> SRR821388 4 0.6104 0.5222 0.000 0.012 0.280 0.584 0.124
#> SRR657623 2 0.5086 0.5507 0.000 0.564 0.000 0.396 0.040
#> SRR1094241 3 0.0162 0.8760 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR819583 3 0.3561 0.4509 0.000 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1096149 1 0.1671 0.8420 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1342829 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.2771 0.8557 0.860 0.000 0.000 0.012 0.128
#> SRR811333 5 0.4817 0.7811 0.044 0.000 0.300 0.000 0.656
#> SRR1311666 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.2753 0.7855 0.000 0.856 0.000 0.136 0.008
#> SRR1446436 2 0.2798 0.7839 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR815092 1 0.2771 0.8542 0.860 0.000 0.000 0.012 0.128
#> SRR1500149 2 0.3596 0.7047 0.000 0.776 0.000 0.212 0.012
#> SRR1100564 1 0.2818 0.8533 0.856 0.000 0.000 0.012 0.132
#> SRR1403072 3 0.0290 0.8760 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR811653 3 0.4386 0.6824 0.000 0.000 0.764 0.096 0.140
#> SRR1311348 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.4924 0.5300 0.000 0.552 0.000 0.420 0.028
#> SRR1435442 4 0.5651 0.3023 0.000 0.400 0.032 0.540 0.028
#> SRR1421444 3 0.0290 0.8760 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1344010 2 0.3476 0.7075 0.000 0.804 0.000 0.176 0.020
#> SRR1319520 1 0.1341 0.8461 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1444763 1 0.2771 0.8545 0.860 0.000 0.000 0.012 0.128
#> SRR1415026 2 0.3977 0.6809 0.000 0.764 0.000 0.204 0.032
#> SRR1416596 4 0.5926 0.7220 0.000 0.116 0.060 0.684 0.140
#> SRR1485499 2 0.4972 0.5733 0.000 0.620 0.000 0.336 0.044
#> SRR1316078 2 0.3690 0.6854 0.000 0.780 0.000 0.200 0.020
#> SRR663465 2 0.5026 0.5635 0.000 0.588 0.000 0.372 0.040
#> SRR1310094 4 0.4946 0.7050 0.000 0.124 0.048 0.760 0.068
#> SRR663537 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.1608 0.8415 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1453950 1 0.1608 0.8415 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1087875 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR613318 2 0.5659 0.6053 0.000 0.652 0.016 0.236 0.096
#> SRR1332694 1 0.2723 0.8549 0.864 0.000 0.000 0.012 0.124
#> SRR1468469 3 0.4262 0.0637 0.000 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR818670 2 0.0290 0.8059 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1120318 1 0.3496 0.8205 0.788 0.000 0.000 0.012 0.200
#> SRR1311622 5 0.3966 0.6513 0.000 0.000 0.336 0.000 0.664
#> SRR1500931 5 0.4242 0.6257 0.000 0.000 0.428 0.000 0.572
#> SRR1387494 3 0.0162 0.8740 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1379175 4 0.6196 0.5188 0.000 0.012 0.268 0.580 0.140
#> SRR1401909 5 0.6248 0.3493 0.384 0.000 0.148 0.000 0.468
#> SRR1440541 2 0.5394 0.6016 0.000 0.660 0.000 0.208 0.132
#> SRR1068832 5 0.5631 0.7617 0.108 0.000 0.292 0.000 0.600
#> SRR1376640 2 0.2516 0.7871 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1085712 2 0.2669 0.7609 0.000 0.876 0.000 0.104 0.020
#> SRR1082283 5 0.5373 0.7815 0.112 0.000 0.236 0.000 0.652
#> SRR1084276 1 0.3399 0.8359 0.812 0.000 0.004 0.012 0.172
#> SRR1353262 2 0.3456 0.7587 0.000 0.800 0.000 0.184 0.016
#> SRR1437035 5 0.5502 0.7444 0.192 0.000 0.156 0.000 0.652
#> SRR1396877 5 0.4639 0.2249 0.344 0.000 0.024 0.000 0.632
#> SRR1443026 2 0.1608 0.8069 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1417936 1 0.0290 0.8547 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1436822 4 0.6512 0.7223 0.000 0.184 0.060 0.620 0.136
#> SRR1101128 3 0.1121 0.8451 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1363886 2 0.4891 0.5751 0.000 0.640 0.000 0.316 0.044
#> SRR612983 2 0.1877 0.7846 0.000 0.924 0.000 0.064 0.012
#> SRR1394366 2 0.5715 -0.0141 0.000 0.480 0.032 0.460 0.028
#> SRR1093218 5 0.3636 0.7442 0.000 0.000 0.272 0.000 0.728
#> SRR1077090 5 0.5195 0.7994 0.108 0.000 0.216 0.000 0.676
#> SRR1327430 4 0.5208 0.7132 0.000 0.124 0.020 0.724 0.132
#> SRR1088958 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1486931 2 0.2719 0.7840 0.000 0.852 0.000 0.144 0.004
#> SRR1086820 1 0.2953 0.8522 0.844 0.000 0.000 0.012 0.144
#> SRR1383000 1 0.3487 0.7449 0.780 0.000 0.008 0.000 0.212
#> SRR1355705 2 0.1701 0.7907 0.000 0.936 0.000 0.048 0.016
#> SRR614335 2 0.4825 0.5583 0.000 0.568 0.000 0.408 0.024
#> SRR660534 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0290 0.8038 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1334265 4 0.5891 0.7218 0.000 0.124 0.060 0.688 0.128
#> SRR1456401 4 0.5281 0.7168 0.000 0.124 0.032 0.728 0.116
#> SRR1086393 1 0.2997 0.8578 0.840 0.000 0.000 0.012 0.148
#> SRR1351521 3 0.0290 0.8760 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1093100 4 0.4610 0.6367 0.000 0.012 0.176 0.752 0.060
#> SRR1309382 1 0.2818 0.8533 0.856 0.000 0.000 0.012 0.132
#> SRR1089375 5 0.4646 0.8027 0.060 0.000 0.228 0.000 0.712
#> SRR1499482 2 0.2516 0.7871 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR614719 2 0.2798 0.7865 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1081473 3 0.3109 0.7282 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1087415 1 0.2771 0.8542 0.860 0.000 0.000 0.012 0.128
#> SRR1088217 5 0.6268 0.3960 0.360 0.000 0.156 0.000 0.484
#> SRR808496 4 0.6239 0.7210 0.000 0.124 0.076 0.660 0.140
#> SRR1336463 4 0.6282 0.3977 0.000 0.388 0.032 0.508 0.072
#> SRR612359 2 0.2843 0.7846 0.000 0.848 0.000 0.144 0.008
#> SRR1444412 1 0.2953 0.8518 0.844 0.000 0.000 0.012 0.144
#> SRR1074116 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0290 0.8760 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR656095 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.2818 0.8533 0.856 0.000 0.000 0.012 0.132
#> SRR1349099 5 0.3648 0.7026 0.092 0.000 0.084 0.000 0.824
#> SRR1337886 2 0.0703 0.8079 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR813632 1 0.2605 0.8329 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1101591 5 0.4210 0.7931 0.036 0.000 0.224 0.000 0.740
#> SRR1089713 5 0.4716 0.7757 0.036 0.000 0.308 0.000 0.656
#> SRR1453127 3 0.0290 0.8760 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1498354 5 0.5637 0.7628 0.112 0.000 0.284 0.000 0.604
#> SRR1313831 1 0.2723 0.8549 0.864 0.000 0.000 0.012 0.124
#> SRR1315434 3 0.2561 0.7881 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR814747 2 0.5375 0.5401 0.000 0.568 0.000 0.368 0.064
#> SRR1358539 1 0.2818 0.8533 0.856 0.000 0.000 0.012 0.132
#> SRR1367807 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1365791 3 0.0794 0.8614 0.000 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1081519 5 0.5022 0.7556 0.048 0.000 0.332 0.000 0.620
#> SRR614707 4 0.5879 0.6718 0.000 0.148 0.116 0.684 0.052
#> SRR1094027 1 0.0609 0.8563 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1489092 5 0.4906 0.8054 0.076 0.000 0.232 0.000 0.692
#> SRR1079502 5 0.3816 0.7026 0.000 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR1457814 3 0.6284 0.0285 0.000 0.004 0.488 0.372 0.136
#> SRR1455127 2 0.4972 0.5729 0.000 0.620 0.000 0.336 0.044
#> SRR615081 2 0.5716 -0.0364 0.000 0.472 0.032 0.468 0.028
#> SRR1327855 3 0.0404 0.8753 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1417873 4 0.4263 0.6830 0.000 0.124 0.012 0.792 0.072
#> SRR1394125 3 0.0404 0.8718 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1488388 1 0.0000 0.8549 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 4 0.3197 0.6003 0.000 0.140 0.000 0.836 0.024
#> SRR612383 2 0.2798 0.7865 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1477711 1 0.2439 0.8569 0.876 0.000 0.000 0.004 0.120
#> SRR1350813 2 0.2648 0.7834 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR612851 2 0.2516 0.7871 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1086349 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR812837 2 0.3513 0.7038 0.000 0.800 0.000 0.180 0.020
#> SRR1340010 3 0.4630 0.6530 0.000 0.000 0.744 0.116 0.140
#> SRR1475885 4 0.6706 0.2679 0.000 0.004 0.316 0.456 0.224
#> SRR1376334 1 0.2771 0.8545 0.860 0.000 0.000 0.012 0.128
#> SRR1399821 1 0.3081 0.8570 0.832 0.000 0.000 0.012 0.156
#> SRR1347042 3 0.0290 0.8760 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR612323 2 0.2798 0.7865 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR612604 2 0.4960 0.6302 0.000 0.696 0.028 0.248 0.028
#> SRR1389546 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1465608 5 0.4967 0.7926 0.104 0.000 0.192 0.000 0.704
#> SRR1101808 2 0.0290 0.8059 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331153 4 0.5822 0.6863 0.000 0.172 0.036 0.676 0.116
#> SRR1078439 3 0.0162 0.8740 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR2165527 2 0.4987 0.5716 0.000 0.616 0.000 0.340 0.044
#> SRR1351147 5 0.5111 0.7971 0.064 0.000 0.248 0.008 0.680
#> SRR1313536 2 0.0162 0.8052 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1070308 4 0.6946 0.7024 0.000 0.128 0.132 0.596 0.144
#> SRR1403110 1 0.2723 0.8549 0.864 0.000 0.000 0.012 0.124
#> SRR1400355 2 0.0404 0.8064 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1401317 3 0.0609 0.8717 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1456862 1 0.2953 0.8559 0.844 0.000 0.000 0.012 0.144
#> SRR1074622 1 0.1608 0.8415 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1465847 5 0.4876 0.8042 0.080 0.000 0.220 0.000 0.700
#> SRR1443376 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.2612 0.8558 0.868 0.000 0.000 0.008 0.124
#> SRR1090881 4 0.6372 0.6243 0.000 0.228 0.224 0.544 0.004
#> SRR612251 2 0.4924 0.6510 0.000 0.668 0.000 0.272 0.060
#> SRR1418581 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR658045 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613214 2 0.2843 0.7861 0.000 0.848 0.000 0.144 0.008
#> SRR613078 2 0.4960 0.6302 0.000 0.696 0.028 0.248 0.028
#> SRR1472998 5 0.5053 0.8015 0.096 0.000 0.216 0.000 0.688
#> SRR1433452 2 0.2806 0.7793 0.000 0.844 0.000 0.152 0.004
#> SRR1101957 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1487993 3 0.2561 0.7881 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1465983 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.1430 0.8590 0.944 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR1367566 3 0.0510 0.8739 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1316151 4 0.5285 0.6407 0.000 0.016 0.132 0.712 0.140
#> SRR1417547 4 0.3326 0.5846 0.000 0.152 0.000 0.824 0.024
#> SRR659389 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 4 0.5225 0.5781 0.000 0.280 0.032 0.660 0.028
#> SRR1398207 1 0.4290 0.7021 0.680 0.000 0.016 0.000 0.304
#> SRR1358755 5 0.5866 0.7461 0.156 0.000 0.248 0.000 0.596
#> SRR1078903 2 0.2471 0.7892 0.000 0.864 0.000 0.136 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0162 0.8051 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1369172 1 0.2818 0.8554 0.856 0.000 0.000 0.012 0.132
#> SRR615982 2 0.2798 0.7865 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1480431 2 0.2377 0.7974 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1429825 4 0.6826 0.7181 0.000 0.164 0.100 0.604 0.132
#> SRR1102393 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 5 0.4313 0.7945 0.040 0.000 0.228 0.000 0.732
#> SRR808351 1 0.1197 0.8491 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1317513 1 0.2723 0.8549 0.864 0.000 0.000 0.012 0.124
#> SRR1480501 3 0.4171 0.2572 0.000 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR1081910 5 0.4661 0.7694 0.032 0.000 0.312 0.000 0.656
#> SRR1086611 4 0.6676 0.6378 0.000 0.188 0.212 0.568 0.032
#> SRR1392571 2 0.2886 0.7827 0.000 0.844 0.000 0.148 0.008
#> SRR1311441 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR808152 1 0.1608 0.8415 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR657313 3 0.0000 0.8755 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.4796 0.6410 0.000 0.704 0.024 0.248 0.024
#> SRR1321011 2 0.3194 0.7299 0.000 0.832 0.000 0.148 0.020
#> SRR1500598 2 0.4497 0.5893 0.000 0.632 0.000 0.352 0.016
#> SRR1379343 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.1671 0.8404 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1376228 3 0.0290 0.8760 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1399757 1 0.3124 0.8511 0.840 0.000 0.008 0.008 0.144
#> SRR1358060 3 0.0290 0.8760 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1464517 3 0.2852 0.7633 0.000 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR613557 2 0.2798 0.7865 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR809831 1 0.3949 0.7198 0.696 0.000 0.004 0.000 0.300
#> SRR1429387 3 0.0290 0.8760 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR816565 1 0.0404 0.8560 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1071644 1 0.0451 0.8553 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1406936 5 0.3837 0.6976 0.000 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR1072031 2 0.0000 0.8043 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.2798 0.7865 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 5 0.6212 -0.1814 0.000 0.000 0.404 0.096 0.444 0.056
#> SRR1404105 1 0.3862 0.7145 0.524 0.000 0.000 0.476 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.1204 0.7260 0.000 0.944 0.056 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472057 5 0.1151 0.6441 0.032 0.000 0.012 0.000 0.956 0.000
#> SRR614491 2 0.3210 0.6827 0.000 0.812 0.000 0.036 0.000 0.152
#> SRR1069376 1 0.3620 0.7466 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.5295 0.2387 0.000 0.500 0.000 0.104 0.000 0.396
#> SRR1345715 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR1328073 5 0.7049 -0.8087 0.000 0.004 0.060 0.348 0.360 0.228
#> SRR1394209 5 0.6946 -0.8176 0.000 0.000 0.064 0.356 0.360 0.220
#> SRR1474018 2 0.5316 0.1966 0.000 0.480 0.000 0.104 0.000 0.416
#> SRR1099809 5 0.2964 0.5473 0.204 0.000 0.004 0.000 0.792 0.000
#> SRR1500555 2 0.3349 0.6734 0.000 0.804 0.000 0.024 0.008 0.164
#> SRR1354363 1 0.3862 0.7145 0.524 0.000 0.000 0.476 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.2019 0.8129 0.000 0.000 0.900 0.012 0.088 0.000
#> SRR1307997 6 0.5438 0.3813 0.000 0.372 0.024 0.068 0.000 0.536
#> SRR663124 2 0.3210 0.6827 0.000 0.812 0.000 0.036 0.000 0.152
#> SRR1334670 1 0.0146 0.7650 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR612515 2 0.3210 0.6827 0.000 0.812 0.000 0.036 0.000 0.152
#> SRR1092727 2 0.1610 0.7260 0.000 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1364013 2 0.3190 0.6654 0.000 0.772 0.000 0.008 0.000 0.220
#> SRR1468553 3 0.1444 0.8185 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1403980 3 0.3835 0.6338 0.000 0.000 0.668 0.012 0.320 0.000
#> SRR1420169 5 0.1434 0.6437 0.048 0.000 0.012 0.000 0.940 0.000
#> SRR1442800 6 0.5862 0.0954 0.000 0.148 0.052 0.004 0.168 0.628
#> SRR1359214 6 0.5327 -0.1060 0.000 0.436 0.000 0.104 0.000 0.460
#> SRR1499849 5 0.2402 0.5983 0.140 0.000 0.004 0.000 0.856 0.000
#> SRR1500030 3 0.3979 0.5709 0.000 0.000 0.628 0.012 0.360 0.000
#> SRR1093053 3 0.4248 0.7012 0.000 0.000 0.752 0.020 0.168 0.060
#> SRR1399843 3 0.4690 0.3780 0.000 0.000 0.512 0.028 0.452 0.008
#> SRR1380231 5 0.1802 0.5982 0.000 0.000 0.072 0.012 0.916 0.000
#> SRR809470 5 0.3582 0.4981 0.252 0.000 0.000 0.016 0.732 0.000
#> SRR614239 2 0.3210 0.6827 0.000 0.812 0.000 0.036 0.000 0.152
#> SRR613939 2 0.3432 0.6492 0.000 0.764 0.000 0.000 0.020 0.216
#> SRR612971 2 0.1923 0.7190 0.000 0.916 0.004 0.064 0.000 0.016
#> SRR1490204 2 0.2003 0.7154 0.000 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116
#> SRR811357 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.5784 0.5530 0.504 0.000 0.000 0.260 0.236 0.000
#> SRR613006 2 0.2945 0.6999 0.000 0.824 0.020 0.000 0.000 0.156
#> SRR1469570 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 6 0.4325 -0.1313 0.000 0.456 0.000 0.020 0.000 0.524
#> SRR1362906 3 0.4144 0.5630 0.000 0.000 0.620 0.020 0.360 0.000
#> SRR1079023 1 0.2491 0.7719 0.836 0.000 0.000 0.164 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 5 0.6283 -0.4747 0.000 0.000 0.076 0.344 0.492 0.088
#> SRR1478700 5 0.1434 0.6437 0.048 0.000 0.012 0.000 0.940 0.000
#> SRR1081543 3 0.4025 0.6382 0.000 0.000 0.668 0.016 0.312 0.004
#> SRR1384754 5 0.1297 0.6152 0.000 0.000 0.040 0.012 0.948 0.000
#> SRR612287 2 0.5249 0.2599 0.000 0.528 0.000 0.104 0.000 0.368
#> SRR1380317 4 0.7024 0.8267 0.000 0.000 0.064 0.356 0.320 0.260
#> SRR1315247 6 0.4602 0.3607 0.000 0.364 0.008 0.004 0.024 0.600
#> SRR1105344 2 0.1753 0.7310 0.000 0.912 0.004 0.000 0.000 0.084
#> SRR658549 2 0.3210 0.6827 0.000 0.812 0.000 0.036 0.000 0.152
#> SRR1480240 1 0.0000 0.7635 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0260 0.7362 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1358520 6 0.6419 -0.0736 0.000 0.064 0.028 0.348 0.056 0.504
#> SRR1419476 3 0.1471 0.8183 0.000 0.000 0.932 0.004 0.064 0.000
#> SRR1456075 5 0.1065 0.6307 0.008 0.000 0.020 0.008 0.964 0.000
#> SRR1389474 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.1802 0.8169 0.000 0.000 0.916 0.012 0.072 0.000
#> SRR1095985 5 0.2032 0.5969 0.004 0.000 0.068 0.012 0.912 0.004
#> SRR1325771 1 0.2199 0.7713 0.892 0.000 0.000 0.088 0.020 0.000
#> SRR1360420 3 0.1267 0.8186 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR660272 6 0.5017 0.4147 0.000 0.300 0.036 0.008 0.024 0.632
#> SRR1332993 1 0.3862 0.7145 0.524 0.000 0.000 0.476 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR808044 5 0.1411 0.6392 0.060 0.000 0.004 0.000 0.936 0.000
#> SRR1076916 5 0.3230 0.4455 0.000 0.000 0.212 0.012 0.776 0.000
#> SRR1356266 1 0.0146 0.7646 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.1910 0.7203 0.000 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1456114 1 0.3854 0.7178 0.536 0.000 0.000 0.464 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.4144 0.5630 0.000 0.000 0.620 0.020 0.360 0.000
#> SRR1472370 5 0.1074 0.6432 0.028 0.000 0.012 0.000 0.960 0.000
#> SRR1480176 5 0.3819 0.3950 0.372 0.000 0.004 0.000 0.624 0.000
#> SRR613843 2 0.2258 0.7245 0.000 0.896 0.060 0.000 0.000 0.044
#> SRR1469192 1 0.3862 0.7145 0.524 0.000 0.000 0.476 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.1471 0.8180 0.000 0.000 0.932 0.004 0.064 0.000
#> SRR659839 2 0.1524 0.7264 0.000 0.932 0.060 0.000 0.000 0.008
#> SRR659533 2 0.1462 0.7320 0.000 0.936 0.008 0.000 0.000 0.056
#> SRR1362848 5 0.7157 -0.8134 0.000 0.000 0.100 0.352 0.356 0.192
#> SRR1407492 2 0.3210 0.6827 0.000 0.812 0.000 0.036 0.000 0.152
#> SRR1455082 2 0.2805 0.6736 0.000 0.812 0.000 0.004 0.000 0.184
#> SRR658362 2 0.3247 0.6820 0.000 0.808 0.000 0.036 0.000 0.156
#> SRR810921 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.5285 0.2558 0.000 0.524 0.000 0.108 0.000 0.368
#> SRR1456375 5 0.1349 0.6208 0.004 0.000 0.056 0.000 0.940 0.000
#> SRR818232 1 0.0603 0.7582 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004 0.000
#> SRR1454868 4 0.7518 0.7467 0.000 0.000 0.196 0.348 0.284 0.172
#> SRR1474816 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.4913 0.3702 0.564 0.000 0.000 0.072 0.364 0.000
#> SRR1088437 2 0.5300 0.2309 0.000 0.496 0.000 0.104 0.000 0.400
#> SRR1466400 6 0.4479 0.3541 0.000 0.368 0.008 0.000 0.024 0.600
#> SRR658921 6 0.4468 0.3571 0.000 0.364 0.008 0.000 0.024 0.604
#> SRR1499873 2 0.0000 0.7360 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.4408 0.1483 0.560 0.000 0.000 0.020 0.416 0.004
#> SRR1379324 1 0.0146 0.7646 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.1584 0.8179 0.000 0.000 0.928 0.008 0.064 0.000
#> SRR1086280 3 0.1686 0.8174 0.000 0.000 0.924 0.012 0.064 0.000
#> SRR1454891 2 0.3210 0.6827 0.000 0.812 0.000 0.036 0.000 0.152
#> SRR663185 2 0.5190 0.2005 0.000 0.464 0.000 0.088 0.000 0.448
#> SRR811819 1 0.0632 0.7618 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1318920 1 0.0806 0.7598 0.972 0.000 0.000 0.020 0.008 0.000
#> SRR656758 2 0.1970 0.7242 0.000 0.912 0.060 0.000 0.000 0.028
#> SRR1474351 1 0.1814 0.7742 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000 0.000
#> SRR660450 6 0.4653 0.4171 0.000 0.324 0.020 0.004 0.020 0.632
#> SRR1472687 2 0.0405 0.7363 0.000 0.988 0.000 0.004 0.000 0.008
#> SRR1334291 2 0.3342 0.6440 0.000 0.760 0.000 0.000 0.012 0.228
#> SRR1415153 2 0.1890 0.7248 0.000 0.916 0.060 0.000 0.000 0.024
#> SRR1323271 6 0.5808 0.2525 0.000 0.288 0.000 0.220 0.000 0.492
#> SRR1368939 2 0.1890 0.7283 0.000 0.916 0.060 0.000 0.000 0.024
#> SRR1443161 5 0.7204 -0.5264 0.000 0.000 0.212 0.292 0.392 0.104
#> SRR614695 6 0.4500 0.3392 0.000 0.376 0.008 0.000 0.024 0.592
#> SRR1092372 1 0.0692 0.7598 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004 0.000
#> SRR1474577 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.2260 0.7076 0.000 0.860 0.000 0.000 0.000 0.140
#> SRR1089006 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR1354071 5 0.1777 0.6447 0.044 0.000 0.024 0.004 0.928 0.000
#> SRR1105463 5 0.4168 0.2948 0.400 0.000 0.000 0.016 0.584 0.000
#> SRR811005 2 0.0260 0.7369 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1385319 1 0.0603 0.7582 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004 0.000
#> SRR1325871 3 0.2019 0.8132 0.000 0.000 0.900 0.012 0.088 0.000
#> SRR1355415 5 0.1556 0.6305 0.080 0.000 0.000 0.000 0.920 0.000
#> SRR1090861 1 0.1387 0.7733 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1320712 6 0.6645 -0.3461 0.000 0.024 0.036 0.348 0.124 0.468
#> SRR1470075 1 0.3857 0.7164 0.532 0.000 0.000 0.468 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0260 0.7659 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1101397 5 0.4570 0.3069 0.368 0.000 0.012 0.024 0.596 0.000
#> SRR1321165 1 0.1951 0.7299 0.908 0.000 0.000 0.016 0.076 0.000
#> SRR1092112 5 0.1007 0.6255 0.000 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000
#> SRR1417588 3 0.1411 0.8183 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060 0.000
#> SRR1074790 4 0.7917 0.7372 0.004 0.068 0.044 0.328 0.296 0.260
#> SRR1432106 2 0.5307 0.2488 0.000 0.512 0.000 0.108 0.000 0.380
#> SRR655756 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.3854 0.7173 0.536 0.000 0.000 0.464 0.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.5300 0.2309 0.000 0.496 0.000 0.104 0.000 0.400
#> SRR1072749 5 0.5737 0.0411 0.368 0.000 0.008 0.136 0.488 0.000
#> SRR1078586 1 0.1814 0.7737 0.900 0.000 0.000 0.100 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.7739 -0.4254 0.000 0.316 0.044 0.312 0.060 0.268
#> SRR1078834 6 0.4784 0.4219 0.000 0.320 0.028 0.004 0.020 0.628
#> SRR1417611 6 0.5665 0.1215 0.000 0.112 0.008 0.360 0.004 0.516
#> SRR1396840 1 0.3879 0.4919 0.688 0.000 0.000 0.020 0.292 0.000
#> SRR1465440 2 0.2376 0.7021 0.000 0.888 0.000 0.068 0.000 0.044
#> SRR1400530 6 0.4546 0.4095 0.000 0.312 0.020 0.024 0.000 0.644
#> SRR614984 2 0.3210 0.6827 0.000 0.812 0.000 0.036 0.000 0.152
#> SRR1324269 5 0.3997 0.0474 0.488 0.000 0.004 0.000 0.508 0.000
#> SRR1401491 2 0.0937 0.7376 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1319443 1 0.0603 0.7582 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004 0.000
#> SRR1324349 6 0.7092 -0.3046 0.000 0.064 0.032 0.332 0.124 0.448
#> SRR1345523 2 0.0405 0.7359 0.000 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1500846 1 0.3862 0.7145 0.524 0.000 0.000 0.476 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.2009 0.8113 0.000 0.000 0.904 0.008 0.084 0.004
#> SRR1419062 3 0.4315 0.5686 0.000 0.000 0.612 0.016 0.364 0.008
#> SRR1480131 1 0.1461 0.7438 0.940 0.000 0.000 0.016 0.044 0.000
#> SRR1421284 6 0.6276 -0.3692 0.000 0.008 0.028 0.348 0.132 0.484
#> SRR1329624 1 0.0547 0.7684 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.1411 0.8183 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060 0.000
#> SRR1099189 2 0.2950 0.6944 0.000 0.828 0.000 0.024 0.000 0.148
#> SRR1083286 1 0.0603 0.7582 0.980 0.000 0.000 0.016 0.004 0.000
#> SRR1091890 3 0.3762 0.6870 0.000 0.000 0.800 0.012 0.080 0.108
#> SRR1347436 2 0.6606 -0.3651 0.000 0.388 0.028 0.320 0.000 0.264
#> SRR1327473 5 0.6756 -0.6536 0.008 0.000 0.052 0.344 0.440 0.156
#> SRR1338195 3 0.1411 0.8183 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060 0.000
#> SRR809698 2 0.0260 0.7357 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.3531 0.7509 0.672 0.000 0.000 0.328 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.3351 0.6773 0.800 0.000 0.000 0.040 0.160 0.000
#> SRR1454842 3 0.1524 0.8181 0.000 0.000 0.932 0.008 0.060 0.000
#> SRR1322643 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.1411 0.8183 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060 0.000
#> SRR1354620 5 0.1267 0.6373 0.060 0.000 0.000 0.000 0.940 0.000
#> SRR615056 2 0.5285 0.2558 0.000 0.524 0.000 0.108 0.000 0.368
#> SRR1105320 5 0.6868 -0.6830 0.000 0.000 0.076 0.324 0.424 0.176
#> SRR1391529 1 0.0363 0.7670 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.3102 0.6871 0.000 0.816 0.000 0.028 0.000 0.156
#> SRR1478834 1 0.0000 0.7635 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.1411 0.7244 0.000 0.936 0.060 0.000 0.000 0.004
#> SRR1435330 3 0.1411 0.8183 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060 0.000
#> SRR615383 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 2 0.3247 0.6790 0.000 0.808 0.000 0.036 0.000 0.156
#> SRR613568 6 0.4649 0.4185 0.000 0.324 0.024 0.004 0.016 0.632
#> SRR614095 2 0.1556 0.7319 0.000 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1103092 1 0.3727 0.2979 0.612 0.000 0.000 0.000 0.388 0.000
#> SRR1337155 6 0.6763 -0.3725 0.000 0.016 0.296 0.016 0.268 0.404
#> SRR1475345 2 0.3396 0.6322 0.000 0.812 0.000 0.072 0.000 0.116
#> SRR809089 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 6 0.4887 0.4251 0.000 0.312 0.036 0.004 0.020 0.628
#> SRR1406372 2 0.2996 0.6308 0.000 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228
#> SRR1339880 3 0.4261 0.4878 0.000 0.000 0.572 0.020 0.408 0.000
#> SRR1353136 5 0.6902 -0.2527 0.000 0.000 0.376 0.136 0.388 0.100
#> SRR1093906 3 0.1411 0.8183 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060 0.000
#> SRR614035 2 0.1151 0.7302 0.000 0.956 0.000 0.012 0.000 0.032
#> SRR1351104 1 0.3862 0.7145 0.524 0.000 0.000 0.476 0.000 0.000
#> SRR1363926 6 0.4884 0.1173 0.000 0.064 0.004 0.340 0.000 0.592
#> SRR1399861 6 0.6909 -0.6202 0.000 0.000 0.068 0.364 0.196 0.372
#> SRR1338789 1 0.0692 0.7620 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1421420 3 0.4269 0.4807 0.000 0.000 0.568 0.020 0.412 0.000
#> SRR1420832 2 0.5285 0.2558 0.000 0.524 0.000 0.108 0.000 0.368
#> SRR1476231 1 0.3547 0.7497 0.668 0.000 0.000 0.332 0.000 0.000
#> SRR1352870 2 0.5494 0.2360 0.000 0.576 0.032 0.028 0.024 0.340
#> SRR1315041 6 0.5481 0.0888 0.000 0.068 0.024 0.336 0.004 0.568
#> SRR661877 2 0.5155 0.2992 0.000 0.556 0.000 0.100 0.000 0.344
#> SRR1443268 5 0.4118 0.2875 0.396 0.000 0.008 0.004 0.592 0.000
#> SRR1416617 3 0.4101 0.4841 0.000 0.000 0.580 0.012 0.408 0.000
#> SRR1102443 5 0.3828 0.5487 0.040 0.000 0.024 0.084 0.824 0.028
#> SRR655672 2 0.3210 0.6827 0.000 0.812 0.000 0.036 0.000 0.152
#> SRR1420006 3 0.1267 0.8186 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1458267 2 0.2219 0.7058 0.000 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR613819 6 0.4981 0.1266 0.000 0.072 0.004 0.340 0.000 0.584
#> SRR1469432 2 0.4923 0.2898 0.000 0.560 0.000 0.072 0.000 0.368
#> SRR660907 2 0.4904 0.3433 0.000 0.600 0.000 0.084 0.000 0.316
#> SRR1465092 2 0.3543 0.5865 0.000 0.740 0.004 0.004 0.004 0.248
#> SRR1470727 1 0.5360 0.6452 0.456 0.000 0.000 0.436 0.108 0.000
#> SRR1339153 3 0.1584 0.8180 0.000 0.000 0.928 0.008 0.064 0.000
#> SRR1472749 3 0.1411 0.8183 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060 0.000
#> SRR1414379 6 0.5372 0.0913 0.000 0.064 0.020 0.340 0.004 0.572
#> SRR1431326 1 0.3868 0.7091 0.508 0.000 0.000 0.492 0.000 0.000
#> SRR1487278 6 0.4490 0.3483 0.000 0.372 0.008 0.000 0.024 0.596
#> SRR1098312 3 0.5280 0.4296 0.000 0.000 0.532 0.024 0.392 0.052
#> SRR810273 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.3111 0.6875 0.000 0.820 0.008 0.000 0.016 0.156
#> SRR614467 6 0.4889 -0.1631 0.000 0.436 0.000 0.060 0.000 0.504
#> SRR811471 1 0.0000 0.7635 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.1411 0.8183 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060 0.000
#> SRR1088606 5 0.3038 0.5568 0.000 0.000 0.072 0.012 0.856 0.060
#> SRR1479699 3 0.5801 0.4591 0.000 0.000 0.592 0.040 0.248 0.120
#> SRR1403589 2 0.1411 0.7256 0.000 0.936 0.060 0.000 0.000 0.004
#> SRR812625 2 0.2378 0.7016 0.000 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1359803 1 0.0717 0.7566 0.976 0.000 0.000 0.016 0.008 0.000
#> SRR1338988 2 0.3101 0.7107 0.000 0.856 0.056 0.068 0.000 0.020
#> SRR1471222 2 0.3270 0.7128 0.000 0.820 0.060 0.000 0.000 0.120
#> SRR1378992 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR659427 4 0.7113 0.7723 0.000 0.000 0.100 0.360 0.360 0.180
#> SRR1096638 1 0.3866 0.7119 0.516 0.000 0.000 0.484 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.2491 0.7004 0.000 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR659307 2 0.3278 0.6800 0.000 0.808 0.000 0.040 0.000 0.152
#> SRR1439994 5 0.3878 0.4058 0.348 0.000 0.004 0.004 0.644 0.000
#> SRR1454931 1 0.2358 0.7082 0.876 0.000 0.000 0.016 0.108 0.000
#> SRR1332928 5 0.1036 0.6277 0.004 0.000 0.024 0.008 0.964 0.000
#> SRR658621 2 0.5309 0.2144 0.000 0.488 0.000 0.104 0.000 0.408
#> SRR1095840 1 0.0000 0.7635 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.3942 0.3540 0.624 0.000 0.004 0.004 0.368 0.000
#> SRR1374270 6 0.6453 -0.5085 0.000 0.000 0.040 0.348 0.168 0.444
#> SRR1470947 2 0.5155 0.2988 0.000 0.556 0.000 0.100 0.000 0.344
#> SRR1365598 6 0.4578 0.4099 0.000 0.328 0.012 0.004 0.024 0.632
#> SRR662787 6 0.5789 0.1758 0.000 0.168 0.004 0.336 0.000 0.492
#> SRR1408727 6 0.5477 0.0727 0.000 0.064 0.024 0.352 0.004 0.556
#> SRR1456274 5 0.5122 0.2141 0.000 0.000 0.076 0.176 0.692 0.056
#> SRR817744 1 0.3620 0.7460 0.648 0.000 0.000 0.352 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.4957 0.3243 0.000 0.584 0.000 0.084 0.000 0.332
#> SRR1387379 2 0.0146 0.7360 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1102680 3 0.5368 0.3638 0.000 0.000 0.500 0.024 0.420 0.056
#> SRR1374198 1 0.0692 0.7598 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004 0.000
#> SRR1445856 1 0.3993 0.0657 0.520 0.000 0.000 0.004 0.476 0.000
#> SRR820049 3 0.2605 0.7852 0.000 0.000 0.884 0.012 0.064 0.040
#> SRR1375290 3 0.3794 0.7275 0.000 0.000 0.804 0.020 0.100 0.076
#> SRR818999 5 0.3861 0.4151 0.352 0.000 0.000 0.008 0.640 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.7635 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.1719 0.7276 0.000 0.924 0.060 0.000 0.000 0.016
#> SRR1454629 5 0.2066 0.6232 0.024 0.000 0.040 0.012 0.920 0.004
#> SRR1332187 3 0.1913 0.8135 0.000 0.000 0.908 0.012 0.080 0.000
#> SRR603365 3 0.1411 0.8183 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060 0.000
#> SRR657833 2 0.4212 0.2058 0.000 0.560 0.000 0.000 0.016 0.424
#> SRR1436207 2 0.2178 0.7086 0.000 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR1488017 1 0.2454 0.7717 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0260 0.7357 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.3862 0.7145 0.524 0.000 0.000 0.476 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.1075 0.7288 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.4756 0.4239 0.000 0.000 0.532 0.028 0.428 0.012
#> SRR1441868 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR1485380 5 0.4184 -0.2557 0.000 0.000 0.484 0.012 0.504 0.000
#> SRR1073705 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.1926 0.7168 0.000 0.912 0.000 0.068 0.000 0.020
#> SRR1452356 2 0.5292 0.2539 0.000 0.520 0.000 0.108 0.000 0.372
#> SRR1442983 2 0.1524 0.7264 0.000 0.932 0.060 0.000 0.000 0.008
#> SRR1100346 2 0.3139 0.6846 0.000 0.816 0.000 0.032 0.000 0.152
#> SRR1332816 1 0.5640 0.5861 0.532 0.000 0.000 0.268 0.200 0.000
#> SRR612299 6 0.4479 0.3541 0.000 0.368 0.008 0.000 0.024 0.600
#> SRR1407386 1 0.0000 0.7635 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.2462 0.7178 0.000 0.876 0.028 0.000 0.000 0.096
#> SRR1309403 5 0.7049 -0.7290 0.008 0.000 0.060 0.324 0.404 0.204
#> SRR1498395 2 0.2375 0.7309 0.000 0.896 0.060 0.000 0.008 0.036
#> SRR1079998 5 0.3809 0.4441 0.304 0.000 0.008 0.004 0.684 0.000
#> SRR1498885 2 0.5285 0.2558 0.000 0.524 0.000 0.108 0.000 0.368
#> SRR1337215 6 0.7652 0.1567 0.000 0.244 0.040 0.128 0.140 0.448
#> SRR1414749 3 0.2730 0.7767 0.000 0.000 0.836 0.012 0.152 0.000
#> SRR1365963 5 0.3608 0.4914 0.248 0.000 0.012 0.004 0.736 0.000
#> SRR1368030 6 0.4258 -0.1962 0.000 0.468 0.000 0.016 0.000 0.516
#> SRR1419760 5 0.7205 -0.8103 0.000 0.004 0.076 0.336 0.352 0.232
#> SRR1381841 1 0.4110 0.3054 0.608 0.000 0.000 0.016 0.376 0.000
#> SRR821388 4 0.7098 0.8201 0.000 0.000 0.080 0.352 0.344 0.224
#> SRR657623 2 0.5295 0.2390 0.000 0.500 0.000 0.104 0.000 0.396
#> SRR1094241 3 0.1584 0.8180 0.000 0.000 0.928 0.008 0.064 0.000
#> SRR819583 5 0.3979 0.1563 0.000 0.000 0.360 0.012 0.628 0.000
#> SRR1096149 1 0.3862 0.7145 0.524 0.000 0.000 0.476 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.1267 0.8186 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1353028 1 0.1007 0.7719 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR811333 5 0.1088 0.6416 0.024 0.000 0.016 0.000 0.960 0.000
#> SRR1311666 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.2945 0.6845 0.000 0.824 0.000 0.000 0.020 0.156
#> SRR1446436 2 0.3320 0.6567 0.000 0.772 0.000 0.000 0.016 0.212
#> SRR815092 1 0.0000 0.7635 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.3606 0.5886 0.000 0.728 0.000 0.000 0.016 0.256
#> SRR1100564 1 0.0000 0.7635 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.1267 0.8186 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR811653 4 0.7306 0.8013 0.000 0.000 0.124 0.356 0.328 0.192
#> SRR1311348 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.5209 0.2233 0.000 0.492 0.000 0.092 0.000 0.416
#> SRR1435442 6 0.4567 0.3798 0.000 0.352 0.008 0.004 0.024 0.612
#> SRR1421444 3 0.1411 0.8183 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060 0.000
#> SRR1344010 2 0.2912 0.6728 0.000 0.852 0.000 0.072 0.000 0.076
#> SRR1319520 1 0.3810 0.7302 0.572 0.000 0.000 0.428 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0260 0.7640 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.2799 0.6823 0.000 0.860 0.000 0.076 0.000 0.064
#> SRR1416596 6 0.4417 0.0581 0.000 0.012 0.024 0.268 0.008 0.688
#> SRR1485499 2 0.5249 0.2599 0.000 0.528 0.000 0.104 0.000 0.368
#> SRR1316078 2 0.2506 0.6965 0.000 0.880 0.000 0.068 0.000 0.052
#> SRR663465 2 0.5285 0.2558 0.000 0.524 0.000 0.108 0.000 0.368
#> SRR1310094 6 0.5900 0.0524 0.000 0.068 0.028 0.336 0.020 0.548
#> SRR663537 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.3862 0.7145 0.524 0.000 0.000 0.476 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.3860 0.7156 0.528 0.000 0.000 0.472 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR613318 2 0.4731 0.4499 0.000 0.620 0.012 0.032 0.004 0.332
#> SRR1332694 1 0.0260 0.7658 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1468469 5 0.3969 0.2449 0.000 0.000 0.332 0.016 0.652 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.7360 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.1957 0.7024 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1311622 5 0.2581 0.5387 0.000 0.000 0.120 0.020 0.860 0.000
#> SRR1500931 5 0.1918 0.5928 0.000 0.000 0.088 0.008 0.904 0.000
#> SRR1387494 3 0.3037 0.7676 0.000 0.000 0.820 0.016 0.160 0.004
#> SRR1379175 5 0.6927 -0.8170 0.000 0.000 0.060 0.352 0.360 0.228
#> SRR1401909 5 0.2896 0.5761 0.160 0.000 0.000 0.016 0.824 0.000
#> SRR1440541 2 0.4168 0.3636 0.000 0.584 0.000 0.016 0.000 0.400
#> SRR1068832 5 0.1334 0.6444 0.032 0.000 0.020 0.000 0.948 0.000
#> SRR1376640 2 0.2669 0.6916 0.000 0.836 0.000 0.008 0.000 0.156
#> SRR1085712 2 0.2164 0.7089 0.000 0.900 0.000 0.068 0.000 0.032
#> SRR1082283 5 0.1411 0.6382 0.060 0.000 0.004 0.000 0.936 0.000
#> SRR1084276 1 0.0865 0.7553 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1353262 2 0.2958 0.6942 0.000 0.824 0.008 0.000 0.008 0.160
#> SRR1437035 5 0.2214 0.6292 0.092 0.000 0.012 0.004 0.892 0.000
#> SRR1396877 5 0.2762 0.5481 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804 0.000
#> SRR1443026 2 0.2389 0.7286 0.000 0.888 0.060 0.000 0.000 0.052
#> SRR1417936 1 0.3151 0.7629 0.748 0.000 0.000 0.252 0.000 0.000
#> SRR1436822 6 0.6619 0.2037 0.000 0.244 0.032 0.324 0.000 0.400
#> SRR1101128 3 0.3835 0.6326 0.000 0.000 0.668 0.012 0.320 0.000
#> SRR1363886 2 0.5166 0.2753 0.000 0.540 0.000 0.096 0.000 0.364
#> SRR612983 2 0.0622 0.7355 0.000 0.980 0.000 0.008 0.000 0.012
#> SRR1394366 6 0.4479 0.3541 0.000 0.368 0.008 0.000 0.024 0.600
#> SRR1093218 5 0.1297 0.6164 0.000 0.000 0.040 0.012 0.948 0.000
#> SRR1077090 5 0.1367 0.6436 0.044 0.000 0.012 0.000 0.944 0.000
#> SRR1327430 6 0.4897 0.1170 0.000 0.064 0.004 0.344 0.000 0.588
#> SRR1088958 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.2882 0.6712 0.000 0.812 0.000 0.000 0.008 0.180
#> SRR1086820 1 0.1075 0.7500 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1383000 1 0.5820 0.5680 0.416 0.000 0.000 0.400 0.184 0.000
#> SRR1355705 2 0.0622 0.7358 0.000 0.980 0.000 0.012 0.000 0.008
#> SRR614335 2 0.5114 0.2075 0.000 0.468 0.000 0.080 0.000 0.452
#> SRR660534 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0935 0.7332 0.000 0.964 0.032 0.000 0.000 0.004
#> SRR1334265 6 0.5961 0.0363 0.000 0.068 0.028 0.332 0.024 0.548
#> SRR1456401 6 0.4968 0.1266 0.000 0.072 0.004 0.336 0.000 0.588
#> SRR1086393 1 0.1713 0.7706 0.928 0.000 0.000 0.044 0.028 0.000
#> SRR1351521 3 0.1411 0.8183 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060 0.000
#> SRR1093100 6 0.6136 -0.3559 0.000 0.000 0.040 0.348 0.120 0.492
#> SRR1309382 1 0.0146 0.7625 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1089375 5 0.1605 0.6456 0.044 0.000 0.016 0.004 0.936 0.000
#> SRR1499482 2 0.2219 0.7075 0.000 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR614719 2 0.3210 0.6827 0.000 0.812 0.000 0.036 0.000 0.152
#> SRR1081473 3 0.4699 0.3282 0.000 0.000 0.496 0.028 0.468 0.008
#> SRR1087415 1 0.0000 0.7635 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 5 0.2783 0.5847 0.148 0.000 0.000 0.016 0.836 0.000
#> SRR808496 6 0.6091 0.0958 0.000 0.116 0.032 0.336 0.004 0.512
#> SRR1336463 2 0.5183 0.3222 0.000 0.608 0.004 0.116 0.000 0.272
#> SRR612359 2 0.3245 0.6704 0.000 0.800 0.000 0.028 0.000 0.172
#> SRR1444412 1 0.0000 0.7635 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.1267 0.8186 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR821846 3 0.1471 0.8178 0.000 0.000 0.932 0.004 0.064 0.000
#> SRR656095 2 0.1141 0.7276 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0146 0.7636 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1349099 5 0.2053 0.5904 0.108 0.000 0.000 0.004 0.888 0.000
#> SRR1337886 2 0.1267 0.7330 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR813632 1 0.3453 0.7182 0.804 0.000 0.000 0.064 0.132 0.000
#> SRR1101591 5 0.0993 0.6420 0.024 0.000 0.012 0.000 0.964 0.000
#> SRR1089713 5 0.1478 0.6335 0.020 0.000 0.032 0.004 0.944 0.000
#> SRR1453127 3 0.1411 0.8183 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060 0.000
#> SRR1498354 5 0.1196 0.6444 0.040 0.000 0.008 0.000 0.952 0.000
#> SRR1313831 1 0.0405 0.7613 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1315434 3 0.4144 0.5630 0.000 0.000 0.620 0.020 0.360 0.000
#> SRR814747 2 0.4534 0.1903 0.000 0.492 0.000 0.032 0.000 0.476
#> SRR1358539 1 0.0000 0.7635 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.4075 0.7125 0.000 0.000 0.744 0.016 0.204 0.036
#> SRR1081519 5 0.1074 0.6428 0.028 0.000 0.012 0.000 0.960 0.000
#> SRR614707 6 0.4870 0.4229 0.000 0.312 0.040 0.004 0.016 0.628
#> SRR1094027 1 0.2494 0.7732 0.864 0.000 0.000 0.120 0.016 0.000
#> SRR1489092 5 0.1334 0.6447 0.032 0.000 0.020 0.000 0.948 0.000
#> SRR1079502 5 0.1807 0.5948 0.000 0.000 0.060 0.020 0.920 0.000
#> SRR1457814 4 0.7222 0.7312 0.000 0.000 0.092 0.356 0.244 0.308
#> SRR1455127 2 0.5249 0.2621 0.000 0.528 0.000 0.104 0.000 0.368
#> SRR615081 6 0.4358 0.3291 0.000 0.380 0.008 0.000 0.016 0.596
#> SRR1327855 3 0.3710 0.6486 0.000 0.000 0.696 0.012 0.292 0.000
#> SRR1417873 6 0.4968 0.1266 0.000 0.072 0.004 0.336 0.000 0.588
#> SRR1394125 3 0.4195 0.6162 0.000 0.000 0.648 0.016 0.328 0.008
#> SRR1488388 1 0.3244 0.7609 0.732 0.000 0.000 0.268 0.000 0.000
#> SRR1401122 6 0.5059 0.1356 0.000 0.080 0.000 0.392 0.000 0.528
#> SRR612383 2 0.3210 0.6827 0.000 0.812 0.000 0.036 0.000 0.152
#> SRR1477711 1 0.2823 0.7693 0.796 0.000 0.000 0.204 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.2703 0.6829 0.000 0.824 0.000 0.004 0.000 0.172
#> SRR612851 2 0.2520 0.6948 0.000 0.844 0.000 0.004 0.000 0.152
#> SRR1086349 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.2009 0.7146 0.000 0.908 0.000 0.068 0.000 0.024
#> SRR1340010 5 0.7124 -0.7589 0.000 0.000 0.120 0.360 0.368 0.152
#> SRR1475885 6 0.5410 -0.4394 0.004 0.000 0.068 0.012 0.416 0.500
#> SRR1376334 1 0.0692 0.7601 0.976 0.000 0.000 0.020 0.004 0.000
#> SRR1399821 1 0.2145 0.7443 0.900 0.000 0.000 0.028 0.072 0.000
#> SRR1347042 3 0.1411 0.8183 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060 0.000
#> SRR612323 2 0.3210 0.6827 0.000 0.812 0.000 0.036 0.000 0.152
#> SRR612604 6 0.4481 0.2462 0.000 0.416 0.004 0.000 0.024 0.556
#> SRR1389546 2 0.1141 0.7275 0.000 0.948 0.052 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR1465608 5 0.1370 0.6441 0.036 0.000 0.012 0.004 0.948 0.000
#> SRR1101808 2 0.0260 0.7371 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1414079 3 0.1411 0.8183 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060 0.000
#> SRR1331153 6 0.4738 0.4229 0.000 0.320 0.024 0.008 0.016 0.632
#> SRR1078439 3 0.3051 0.7749 0.000 0.000 0.844 0.008 0.112 0.036
#> SRR2165527 2 0.5285 0.2558 0.000 0.524 0.000 0.108 0.000 0.368
#> SRR1351147 5 0.3516 0.5563 0.060 0.000 0.028 0.008 0.840 0.064
#> SRR1313536 2 0.1219 0.7300 0.000 0.948 0.048 0.000 0.000 0.004
#> SRR1070308 4 0.7803 0.7125 0.000 0.068 0.044 0.332 0.280 0.276
#> SRR1403110 1 0.0260 0.7662 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0146 0.7367 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1401317 3 0.3819 0.6267 0.000 0.000 0.672 0.012 0.316 0.000
#> SRR1456862 1 0.0622 0.7668 0.980 0.000 0.000 0.012 0.008 0.000
#> SRR1074622 1 0.3862 0.7145 0.524 0.000 0.000 0.476 0.000 0.000
#> SRR1465847 5 0.1151 0.6439 0.032 0.000 0.012 0.000 0.956 0.000
#> SRR1443376 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.1584 0.8177 0.000 0.000 0.928 0.008 0.064 0.000
#> SRR1075579 1 0.0865 0.7710 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1090881 2 0.8368 -0.3900 0.000 0.316 0.156 0.276 0.064 0.188
#> SRR612251 2 0.4335 0.2625 0.000 0.508 0.000 0.020 0.000 0.472
#> SRR1418581 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR613214 2 0.3247 0.6820 0.000 0.808 0.000 0.036 0.000 0.156
#> SRR613078 2 0.4524 0.0801 0.000 0.520 0.004 0.000 0.024 0.452
#> SRR1472998 5 0.1225 0.6444 0.036 0.000 0.012 0.000 0.952 0.000
#> SRR1433452 2 0.3073 0.6442 0.000 0.788 0.000 0.000 0.008 0.204
#> SRR1101957 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.4144 0.5630 0.000 0.000 0.620 0.020 0.360 0.000
#> SRR1465983 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.1556 0.7739 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.2257 0.8023 0.000 0.000 0.876 0.008 0.116 0.000
#> SRR1316151 6 0.5850 -0.1215 0.000 0.052 0.044 0.096 0.132 0.676
#> SRR1417547 6 0.5312 0.1668 0.000 0.112 0.000 0.364 0.000 0.524
#> SRR659389 2 0.0146 0.7359 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 6 0.4266 0.3842 0.000 0.348 0.008 0.000 0.016 0.628
#> SRR1398207 5 0.4234 0.1799 0.440 0.000 0.000 0.016 0.544 0.000
#> SRR1358755 5 0.1500 0.6429 0.052 0.000 0.012 0.000 0.936 0.000
#> SRR1078903 2 0.2320 0.7074 0.000 0.864 0.000 0.004 0.000 0.132
#> SRR1323252 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.1411 0.7249 0.000 0.936 0.060 0.000 0.000 0.004
#> SRR1369172 1 0.0603 0.7633 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR615982 2 0.2593 0.6967 0.000 0.844 0.000 0.008 0.000 0.148
#> SRR1480431 2 0.2006 0.7230 0.000 0.892 0.000 0.004 0.000 0.104
#> SRR1429825 6 0.6724 0.2034 0.000 0.264 0.036 0.328 0.000 0.372
#> SRR1102393 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 5 0.1262 0.6355 0.016 0.000 0.020 0.008 0.956 0.000
#> SRR808351 1 0.3756 0.7359 0.600 0.000 0.000 0.400 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0363 0.7667 0.988 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1480501 5 0.4282 -0.0938 0.000 0.000 0.420 0.020 0.560 0.000
#> SRR1081910 5 0.1088 0.6416 0.024 0.000 0.016 0.000 0.960 0.000
#> SRR1086611 6 0.5825 0.3559 0.000 0.312 0.048 0.004 0.072 0.564
#> SRR1392571 2 0.2841 0.6857 0.000 0.824 0.000 0.012 0.000 0.164
#> SRR1311441 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.3862 0.7145 0.524 0.000 0.000 0.476 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.1584 0.8180 0.000 0.000 0.928 0.008 0.064 0.000
#> SRR1433131 2 0.3606 0.6023 0.000 0.728 0.000 0.000 0.016 0.256
#> SRR1321011 2 0.1719 0.7203 0.000 0.924 0.000 0.060 0.000 0.016
#> SRR1500598 2 0.4994 0.2832 0.000 0.544 0.000 0.076 0.000 0.380
#> SRR1379343 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.3868 0.7076 0.504 0.000 0.000 0.496 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.2191 0.8004 0.000 0.000 0.876 0.004 0.120 0.000
#> SRR1399757 1 0.2512 0.7579 0.880 0.000 0.000 0.060 0.060 0.000
#> SRR1358060 3 0.1267 0.8186 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1464517 3 0.4593 0.3669 0.000 0.000 0.512 0.028 0.456 0.004
#> SRR613557 2 0.3278 0.6800 0.000 0.808 0.000 0.040 0.000 0.152
#> SRR809831 1 0.3101 0.5693 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244 0.000
#> SRR1429387 3 0.1411 0.8183 0.000 0.000 0.936 0.004 0.060 0.000
#> SRR816565 1 0.2473 0.7725 0.856 0.000 0.000 0.136 0.008 0.000
#> SRR1071644 1 0.2597 0.7709 0.824 0.000 0.000 0.176 0.000 0.000
#> SRR1406936 5 0.2519 0.5619 0.000 0.000 0.072 0.020 0.888 0.020
#> SRR1072031 2 0.1267 0.7243 0.000 0.940 0.060 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.3062 0.6914 0.000 0.824 0.000 0.032 0.000 0.144
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["MAD", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["MAD:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'MAD' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.979 0.991 0.4922 0.509 0.509
#> 3 3 0.981 0.943 0.978 0.3335 0.792 0.608
#> 4 4 0.799 0.820 0.898 0.1004 0.902 0.732
#> 5 5 0.781 0.780 0.879 0.0724 0.878 0.615
#> 6 6 0.750 0.693 0.817 0.0472 0.894 0.597
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1394209 1 0.8813 0.583 0.700 0.300
#> SRR1474018 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1391619 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1403980 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1442800 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1093053 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1399843 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1380231 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1096736 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1478700 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1384754 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1380317 1 0.8386 0.644 0.732 0.268
#> SRR1315247 1 0.7219 0.755 0.800 0.200
#> SRR1105344 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1456075 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1417154 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1325771 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1360420 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1072948 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1362848 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1407492 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1454868 1 0.4690 0.886 0.900 0.100
#> SRR1474816 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1466400 2 0.9732 0.314 0.404 0.596
#> SRR658921 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR614695 2 0.0376 0.988 0.004 0.996
#> SRR1092372 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1325871 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1320712 1 0.6973 0.772 0.812 0.188
#> SRR1470075 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1092112 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.7674 0.711 0.224 0.776
#> SRR1432106 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1400333 1 0.9358 0.468 0.648 0.352
#> SRR1078834 1 0.7528 0.731 0.784 0.216
#> SRR1417611 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1419062 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1315739 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1091890 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1327473 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1338195 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR614887 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1354620 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1389157 2 0.8443 0.623 0.272 0.728
#> SRR613568 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1446180 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1406372 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1353136 1 0.0376 0.986 0.996 0.004
#> SRR1093906 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1399861 2 0.4022 0.908 0.080 0.920
#> SRR1338789 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1421420 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1352870 1 0.6887 0.778 0.816 0.184
#> SRR1315041 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1420006 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1472749 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1478341 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1479699 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR659427 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1096638 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1439994 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1374270 1 0.8144 0.671 0.748 0.252
#> SRR1470947 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.7376 0.734 0.208 0.792
#> SRR662787 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1456274 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR820049 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1375290 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR818999 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1332187 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR603365 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1485380 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1309403 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.1414 0.973 0.020 0.980
#> SRR1414749 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1419760 1 0.0376 0.986 0.996 0.004
#> SRR1381841 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR821388 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR657623 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR819583 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1403072 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR811653 1 0.1843 0.963 0.972 0.028
#> SRR1311348 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR613318 1 0.8207 0.664 0.744 0.256
#> SRR1332694 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1468469 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1500931 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1379175 1 0.1184 0.975 0.984 0.016
#> SRR1401909 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1101128 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.0376 0.988 0.004 0.996
#> SRR1093218 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1077090 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1101591 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1453127 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1315434 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1365791 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1081519 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR614707 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1079502 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1457814 1 0.7376 0.743 0.792 0.208
#> SRR1455127 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1475885 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1376334 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1347042 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.9754 0.314 0.408 0.592
#> SRR1403110 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1090881 1 0.6887 0.778 0.816 0.184
#> SRR612251 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1487993 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1367566 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.0376 0.988 0.004 0.996
#> SRR1417547 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1480501 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1086611 1 0.4690 0.886 0.900 0.100
#> SRR1392571 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR657313 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1376228 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1358060 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1464517 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR613557 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR809831 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.0000 0.990 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.992 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR614491 3 0.5650 0.54502 0.000 0.312 0.688
#> SRR1069376 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.2165 0.91250 0.936 0.064 0.000
#> SRR1394209 2 0.5058 0.67206 0.244 0.756 0.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500555 3 0.0237 0.96555 0.000 0.004 0.996
#> SRR1354363 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR612515 3 0.2711 0.88422 0.000 0.088 0.912
#> SRR1092727 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468553 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420169 3 0.4605 0.73821 0.204 0.000 0.796
#> SRR1442800 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500030 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093053 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399843 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380231 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR809470 3 0.4931 0.69423 0.232 0.000 0.768
#> SRR614239 2 0.6280 0.14894 0.000 0.540 0.460
#> SRR613939 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478700 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081543 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384754 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.0237 0.97128 0.000 0.996 0.004
#> SRR1315247 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR658549 2 0.5138 0.65554 0.000 0.748 0.252
#> SRR1480240 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456075 1 0.2625 0.89762 0.916 0.000 0.084
#> SRR1389474 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095985 3 0.0424 0.96237 0.008 0.000 0.992
#> SRR1325771 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR660272 2 0.0747 0.95961 0.016 0.984 0.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076916 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472370 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362848 3 0.6260 0.18077 0.000 0.448 0.552
#> SRR1407492 3 0.5058 0.67083 0.000 0.244 0.756
#> SRR1455082 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474816 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466400 3 0.5678 0.53731 0.000 0.316 0.684
#> SRR658921 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443161 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR614695 2 0.2959 0.87119 0.000 0.900 0.100
#> SRR1092372 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.1289 0.95340 0.968 0.000 0.032
#> SRR811005 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355415 3 0.5178 0.65418 0.256 0.000 0.744
#> SRR1090861 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.6260 0.18903 0.000 0.552 0.448
#> SRR1470075 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074790 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.6309 0.00513 0.000 0.504 0.496
#> SRR1078834 3 0.6126 0.33542 0.000 0.400 0.600
#> SRR1417611 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.0237 0.98085 0.996 0.000 0.004
#> SRR1465440 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR614984 3 0.4504 0.74743 0.000 0.196 0.804
#> SRR1324269 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327473 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338195 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354620 3 0.2537 0.89360 0.080 0.000 0.920
#> SRR615056 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR613568 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406372 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353136 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399861 2 0.6225 0.23648 0.000 0.568 0.432
#> SRR1338789 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315041 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416617 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420006 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098312 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088606 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1479699 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR659427 3 0.0237 0.96556 0.000 0.004 0.996
#> SRR1096638 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR659307 3 0.0237 0.96555 0.000 0.004 0.996
#> SRR1439994 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374270 2 0.6225 0.23094 0.000 0.568 0.432
#> SRR1470947 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.0592 0.96376 0.000 0.988 0.012
#> SRR662787 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456274 1 0.0237 0.98077 0.996 0.000 0.004
#> SRR817744 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0237 0.98085 0.996 0.000 0.004
#> SRR820049 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375290 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR818999 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332187 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 1 0.6244 0.20634 0.560 0.000 0.440
#> SRR1498885 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337215 2 0.6140 0.32903 0.404 0.596 0.000
#> SRR1414749 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365963 1 0.5327 0.62031 0.728 0.000 0.272
#> SRR1368030 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419760 2 0.5500 0.79190 0.084 0.816 0.100
#> SRR1381841 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR821388 3 0.2261 0.90469 0.000 0.068 0.932
#> SRR657623 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.1289 0.94143 0.032 0.000 0.968
#> SRR1311666 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR811653 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311348 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR613318 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500931 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387494 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379175 2 0.6509 0.10891 0.472 0.524 0.004
#> SRR1401909 3 0.4291 0.77225 0.180 0.000 0.820
#> SRR1440541 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.0237 0.98085 0.996 0.000 0.004
#> SRR1084276 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101128 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.2796 0.88030 0.000 0.908 0.092
#> SRR1093218 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077090 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093100 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081473 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 3 0.1753 0.92629 0.048 0.000 0.952
#> SRR808496 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR612359 2 0.4842 0.70240 0.000 0.776 0.224
#> SRR1444412 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089713 1 0.6299 0.09096 0.524 0.000 0.476
#> SRR1453127 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498354 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081519 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR614707 1 0.9324 0.33736 0.516 0.272 0.212
#> SRR1094027 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.5968 0.42817 0.364 0.000 0.636
#> SRR1079502 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457814 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455127 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327855 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR612383 2 0.5733 0.51685 0.000 0.676 0.324
#> SRR1477711 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475885 1 0.5926 0.44080 0.644 0.000 0.356
#> SRR1376334 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR612323 3 0.0237 0.96555 0.000 0.004 0.996
#> SRR612604 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078439 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.6274 0.16576 0.456 0.544 0.000
#> SRR1403110 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR612251 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472998 3 0.5363 0.61827 0.276 0.000 0.724
#> SRR1433452 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358755 3 0.0424 0.96237 0.008 0.000 0.992
#> SRR1078903 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081910 1 0.4346 0.76663 0.816 0.000 0.184
#> SRR1086611 3 0.0237 0.96558 0.000 0.004 0.996
#> SRR1392571 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR613557 3 0.0237 0.96555 0.000 0.004 0.996
#> SRR809831 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.98442 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.0000 0.96879 0.000 0.000 1.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.97494 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 3 0.4387 0.73623 0.024 0.000 0.776 0.200
#> SRR1404105 1 0.0000 0.91820 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0524 0.88888 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR614491 3 0.0707 0.88146 0.000 0.020 0.980 0.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.91820 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.3266 0.83684 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1345715 1 0.1118 0.90465 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1328073 1 0.2660 0.85793 0.908 0.000 0.056 0.036
#> SRR1394209 1 0.7868 0.40303 0.596 0.084 0.116 0.204
#> SRR1474018 2 0.3172 0.84236 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1099809 1 0.2976 0.83322 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR1500555 3 0.4761 0.73895 0.000 0.048 0.768 0.184
#> SRR1354363 1 0.0592 0.91539 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1391619 3 0.0592 0.88458 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1307997 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR663124 2 0.1305 0.90475 0.000 0.960 0.036 0.004
#> SRR1334670 1 0.1118 0.91275 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR612515 3 0.0188 0.88719 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1092727 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1364013 2 0.0817 0.91952 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1468553 3 0.0000 0.88795 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.1867 0.87078 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR1420169 3 0.4175 0.68227 0.200 0.000 0.784 0.016
#> SRR1442800 4 0.4711 0.67140 0.052 0.008 0.144 0.796
#> SRR1359214 2 0.3266 0.83650 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1499849 1 0.2124 0.89158 0.932 0.000 0.028 0.040
#> SRR1500030 3 0.1474 0.87044 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1093053 3 0.0469 0.88943 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1399843 3 0.1716 0.86501 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1380231 3 0.5383 0.17169 0.012 0.000 0.536 0.452
#> SRR809470 4 0.5070 0.70807 0.192 0.000 0.060 0.748
#> SRR614239 3 0.1677 0.86639 0.000 0.040 0.948 0.012
#> SRR613939 2 0.4948 0.07483 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR612971 2 0.0336 0.92254 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1490204 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR811357 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1471672 1 0.1474 0.89335 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR613006 2 0.0707 0.91409 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1469570 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0707 0.91986 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1362906 3 0.1716 0.86442 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1079023 1 0.0592 0.91859 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR813608 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.5111 0.64231 0.740 0.000 0.056 0.204
#> SRR1478700 1 0.1637 0.88708 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1081543 3 0.0921 0.88110 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1384754 1 0.6407 0.49833 0.648 0.000 0.148 0.204
#> SRR612287 2 0.2149 0.88804 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1380317 2 0.7725 0.23690 0.004 0.456 0.336 0.204
#> SRR1315247 4 0.3978 0.61889 0.000 0.012 0.192 0.796
#> SRR1105344 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658549 2 0.4819 0.44200 0.000 0.652 0.344 0.004
#> SRR1480240 1 0.1940 0.88560 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1084816 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0336 0.92254 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1358520 2 0.5847 0.72042 0.060 0.716 0.020 0.204
#> SRR1419476 3 0.3610 0.75877 0.000 0.000 0.800 0.200
#> SRR1456075 3 0.7515 0.19722 0.364 0.000 0.448 0.188
#> SRR1389474 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0336 0.91774 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1334419 1 0.2530 0.83170 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1417154 3 0.1389 0.88145 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1095985 4 0.4669 0.70633 0.104 0.000 0.100 0.796
#> SRR1325771 1 0.0817 0.91723 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1360420 3 0.1211 0.88390 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR660272 4 0.5724 0.38772 0.028 0.424 0.000 0.548
#> SRR1332993 1 0.0188 0.91783 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1311833 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR808044 1 0.0469 0.91815 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1076916 4 0.4977 0.07596 0.000 0.000 0.460 0.540
#> SRR1356266 1 0.1474 0.90377 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1341983 2 0.0336 0.92254 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1456114 1 0.0592 0.91907 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1072948 3 0.0000 0.88795 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.0592 0.88879 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1480176 1 0.0817 0.91723 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR613843 2 0.0336 0.92092 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1469192 1 0.0817 0.91096 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1404555 3 0.1118 0.88609 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR659839 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR659533 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362848 3 0.5643 0.67667 0.068 0.008 0.720 0.204
#> SRR1407492 3 0.0188 0.88792 0.000 0.004 0.996 0.000
#> SRR1455082 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658362 2 0.0707 0.91986 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR810921 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR662823 2 0.3219 0.83892 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1456375 3 0.1716 0.87442 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR818232 1 0.4981 -0.05625 0.536 0.000 0.000 0.464
#> SRR1454868 3 0.0921 0.88134 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1474816 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1342002 1 0.0469 0.91586 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1088437 2 0.2921 0.85654 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1466400 4 0.4136 0.69045 0.000 0.196 0.016 0.788
#> SRR658921 4 0.4477 0.60317 0.000 0.312 0.000 0.688
#> SRR1499873 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0707 0.91330 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1090145 4 0.4996 0.22952 0.484 0.000 0.000 0.516
#> SRR1379324 1 0.0921 0.91605 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1345307 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1396166 3 0.0336 0.88877 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1086280 3 0.2589 0.84258 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR1454891 2 0.0188 0.92304 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR663185 2 0.3569 0.81362 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR811819 1 0.0817 0.91723 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1318920 4 0.4679 0.54644 0.352 0.000 0.000 0.648
#> SRR656758 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1474351 1 0.0817 0.91723 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR660450 4 0.4830 0.47124 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR1472687 2 0.0469 0.92183 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1334291 2 0.0336 0.92092 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1415153 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1323271 2 0.3710 0.81351 0.004 0.804 0.000 0.192
#> SRR1368939 2 0.0336 0.92092 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1443161 3 0.3649 0.75533 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR614695 4 0.4431 0.61373 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR1092372 4 0.4543 0.58737 0.324 0.000 0.000 0.676
#> SRR1474577 1 0.1474 0.89284 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1406582 1 0.1022 0.90675 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR612779 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1089006 1 0.1211 0.90185 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1354071 1 0.1792 0.89485 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1105463 4 0.4086 0.69925 0.216 0.000 0.008 0.776
#> SRR811005 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 4 0.4843 0.46536 0.396 0.000 0.000 0.604
#> SRR1325871 3 0.0592 0.88475 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1355415 4 0.4624 0.71961 0.164 0.000 0.052 0.784
#> SRR1090861 1 0.0921 0.91605 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1320712 3 0.5503 0.68583 0.060 0.008 0.728 0.204
#> SRR1470075 1 0.0336 0.91774 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1091254 1 0.1389 0.90623 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1101397 1 0.3123 0.77920 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1321165 4 0.4222 0.65403 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1092112 3 0.4331 0.64345 0.000 0.000 0.712 0.288
#> SRR1417588 3 0.0592 0.88852 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1074790 1 0.0336 0.91697 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1432106 2 0.3626 0.82023 0.004 0.812 0.000 0.184
#> SRR655756 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.0592 0.91539 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1318582 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1080484 2 0.3668 0.81682 0.004 0.808 0.000 0.188
#> SRR1072749 1 0.1474 0.89132 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1078586 1 0.0817 0.91723 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1400333 4 0.6016 0.38705 0.000 0.412 0.044 0.544
#> SRR1078834 4 0.4332 0.69244 0.000 0.176 0.032 0.792
#> SRR1417611 2 0.4959 0.76179 0.052 0.752 0.000 0.196
#> SRR1396840 4 0.3801 0.69662 0.220 0.000 0.000 0.780
#> SRR1465440 2 0.0469 0.92183 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1400530 2 0.0188 0.92313 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614984 3 0.0592 0.88471 0.000 0.016 0.984 0.000
#> SRR1324269 1 0.0817 0.91723 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1401491 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319443 4 0.4888 0.42846 0.412 0.000 0.000 0.588
#> SRR1324349 2 0.6039 0.66503 0.128 0.684 0.000 0.188
#> SRR1345523 2 0.0188 0.92304 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1500846 1 0.0336 0.91697 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR661505 3 0.2868 0.82872 0.000 0.000 0.864 0.136
#> SRR1419062 3 0.5000 0.06738 0.000 0.000 0.504 0.496
#> SRR1480131 1 0.4761 0.30865 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1421284 2 0.6464 0.68474 0.060 0.688 0.048 0.204
#> SRR1329624 1 0.0921 0.91605 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1315739 3 0.0592 0.88852 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1099189 2 0.0469 0.92183 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1083286 1 0.2760 0.82763 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1091890 3 0.0188 0.88855 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1347436 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1327473 1 0.1867 0.87342 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1338195 3 0.0000 0.88795 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0336 0.91866 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR658271 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1339597 1 0.0817 0.91723 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1454842 3 0.0000 0.88795 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322643 1 0.0817 0.91172 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR614887 3 0.1302 0.88274 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1354620 4 0.5646 0.62201 0.088 0.000 0.204 0.708
#> SRR615056 2 0.3311 0.83317 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1105320 1 0.1356 0.91407 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR1391529 1 0.1867 0.88907 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR663052 2 0.1677 0.90914 0.000 0.948 0.012 0.040
#> SRR1478834 1 0.1716 0.89499 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR812366 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.0592 0.88923 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR615383 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1389157 3 0.1520 0.88017 0.000 0.024 0.956 0.020
#> SRR613568 2 0.4888 0.14755 0.000 0.588 0.000 0.412
#> SRR614095 2 0.0592 0.92095 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1103092 1 0.1867 0.89045 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1337155 4 0.3649 0.60647 0.000 0.000 0.204 0.796
#> SRR1475345 2 0.0707 0.92006 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR809089 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 4 0.3649 0.60647 0.000 0.000 0.204 0.796
#> SRR1406372 2 0.0336 0.92254 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1339880 3 0.2530 0.83290 0.000 0.000 0.888 0.112
#> SRR1353136 3 0.3400 0.77510 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1093906 3 0.1022 0.88594 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR614035 2 0.0592 0.92126 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1351104 1 0.1022 0.90720 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1363926 2 0.3219 0.83908 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR1399861 3 0.4153 0.74230 0.004 0.008 0.784 0.204
#> SRR1338789 1 0.2216 0.87352 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1421420 3 0.1022 0.87971 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1420832 2 0.3311 0.83309 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1476231 1 0.0000 0.91820 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.2976 0.83724 0.000 0.008 0.872 0.120
#> SRR1315041 2 0.4136 0.79935 0.016 0.788 0.000 0.196
#> SRR661877 2 0.2011 0.89253 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1443268 1 0.0469 0.91698 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1416617 3 0.0469 0.88888 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1102443 1 0.1211 0.90128 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR655672 2 0.0188 0.92304 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1420006 3 0.1716 0.87442 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1458267 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR613819 2 0.4709 0.77972 0.008 0.768 0.024 0.200
#> SRR1469432 2 0.2589 0.87109 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR660907 2 0.1118 0.91403 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1465092 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1470727 1 0.0000 0.91820 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.0188 0.88855 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1472749 3 0.0921 0.88692 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1414379 2 0.4662 0.77989 0.012 0.768 0.016 0.204
#> SRR1431326 1 0.0336 0.91774 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1487278 4 0.4647 0.63750 0.008 0.288 0.000 0.704
#> SRR1098312 3 0.0188 0.88855 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR810273 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1376000 2 0.0336 0.92092 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR614467 2 0.4990 0.76507 0.000 0.756 0.060 0.184
#> SRR811471 1 0.1118 0.91270 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1478341 3 0.1557 0.87808 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1088606 4 0.4332 0.65586 0.040 0.000 0.160 0.800
#> SRR1479699 3 0.1389 0.88244 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1403589 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR812625 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359803 1 0.4967 0.00228 0.548 0.000 0.000 0.452
#> SRR1338988 2 0.0592 0.92095 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1471222 2 0.0188 0.92313 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1378992 1 0.2868 0.80274 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR659427 3 0.4704 0.72403 0.028 0.004 0.764 0.204
#> SRR1096638 1 0.0707 0.91330 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1466619 2 0.0707 0.92118 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR659307 3 0.1182 0.88507 0.000 0.016 0.968 0.016
#> SRR1439994 1 0.0921 0.91461 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1454931 4 0.3907 0.68874 0.232 0.000 0.000 0.768
#> SRR1332928 1 0.3933 0.71060 0.792 0.000 0.008 0.200
#> SRR658621 2 0.3668 0.81682 0.004 0.808 0.000 0.188
#> SRR1095840 1 0.1302 0.90851 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1458243 1 0.0469 0.91869 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1374270 3 0.7288 0.46174 0.016 0.184 0.596 0.204
#> SRR1470947 2 0.2081 0.89055 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1365598 4 0.4284 0.69166 0.012 0.224 0.000 0.764
#> SRR662787 2 0.3808 0.82091 0.012 0.812 0.000 0.176
#> SRR1408727 2 0.6748 0.64180 0.024 0.660 0.116 0.200
#> SRR1456274 1 0.0804 0.91719 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR817744 1 0.0592 0.91859 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1478744 2 0.1637 0.90314 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1387379 2 0.0188 0.92304 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1102680 3 0.1940 0.86927 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1374198 4 0.4992 0.24989 0.476 0.000 0.000 0.524
#> SRR1445856 4 0.4720 0.58409 0.324 0.000 0.004 0.672
#> SRR820049 3 0.0336 0.88877 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1375290 3 0.1302 0.88261 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR818999 4 0.5127 0.52949 0.356 0.000 0.012 0.632
#> SRR1390242 1 0.1302 0.90875 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1401164 2 0.0921 0.90927 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1454629 4 0.4134 0.66804 0.260 0.000 0.000 0.740
#> SRR1332187 3 0.4406 0.59134 0.000 0.000 0.700 0.300
#> SRR603365 3 0.2216 0.85918 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR657833 2 0.0469 0.91899 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1436207 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1488017 1 0.0707 0.91797 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR612947 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1480384 1 0.0592 0.91446 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1364761 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.3937 0.75976 0.012 0.000 0.800 0.188
#> SRR1441868 1 0.0707 0.91330 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1485380 3 0.2216 0.85906 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1073705 1 0.1792 0.87864 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR615032 2 0.0592 0.92095 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1452356 2 0.3486 0.82012 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1442983 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1100346 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1332816 1 0.0707 0.91297 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR612299 4 0.4072 0.67406 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1407386 1 0.0921 0.91605 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1418064 2 0.0336 0.92092 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1309403 1 0.0921 0.91671 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1498395 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1079998 3 0.4830 0.34615 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1498885 2 0.3356 0.83011 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1337215 4 0.5549 0.64459 0.048 0.280 0.000 0.672
#> SRR1414749 3 0.0469 0.88888 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1365963 3 0.4955 0.42933 0.344 0.000 0.648 0.008
#> SRR1368030 2 0.3356 0.83028 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1419760 2 0.1526 0.90688 0.012 0.960 0.016 0.012
#> SRR1381841 4 0.3945 0.69912 0.216 0.000 0.004 0.780
#> SRR821388 3 0.3852 0.75843 0.008 0.000 0.800 0.192
#> SRR657623 2 0.3569 0.81336 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1094241 3 0.0469 0.88883 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR819583 3 0.2760 0.83343 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1096149 1 0.1557 0.89022 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1342829 3 0.1118 0.88499 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1353028 1 0.0817 0.91723 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR811333 3 0.4362 0.78209 0.088 0.000 0.816 0.096
#> SRR1311666 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1486698 2 0.4164 0.59161 0.000 0.736 0.000 0.264
#> SRR1446436 2 0.0707 0.91415 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR815092 1 0.1716 0.89499 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1500149 2 0.0336 0.92092 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1100564 1 0.1867 0.88902 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1403072 3 0.2704 0.83694 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR811653 3 0.3649 0.75383 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1311348 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.3539 0.82763 0.004 0.820 0.000 0.176
#> SRR1435442 4 0.4248 0.69277 0.012 0.220 0.000 0.768
#> SRR1421444 3 0.0000 0.88795 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0592 0.92095 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1319520 1 0.0188 0.91819 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444763 1 0.4431 0.52658 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1415026 2 0.0817 0.91868 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1416596 2 0.3172 0.84569 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1485499 2 0.1637 0.90305 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1316078 2 0.0592 0.92095 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR663465 2 0.3311 0.83321 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1310094 2 0.4669 0.77538 0.036 0.764 0.000 0.200
#> SRR663537 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0188 0.91783 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1453950 1 0.0000 0.91820 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0921 0.90957 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR613318 3 0.2704 0.82254 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR1332694 1 0.0921 0.91605 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1468469 3 0.0188 0.88855 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR818670 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.2469 0.85417 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1311622 3 0.3074 0.80131 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1500931 3 0.4981 0.18955 0.000 0.000 0.536 0.464
#> SRR1387494 3 0.0469 0.88910 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1379175 1 0.9548 -0.04476 0.356 0.308 0.136 0.200
#> SRR1401909 4 0.4780 0.70847 0.116 0.000 0.096 0.788
#> SRR1440541 2 0.0707 0.91986 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1068832 3 0.3649 0.75994 0.000 0.000 0.796 0.204
#> SRR1376640 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1085712 2 0.0469 0.92183 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1082283 4 0.4018 0.69509 0.224 0.000 0.004 0.772
#> SRR1084276 1 0.2589 0.84306 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1353262 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1437035 1 0.0592 0.91847 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1396877 1 0.1824 0.89828 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR1443026 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1417936 1 0.0469 0.91869 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1436822 2 0.2345 0.87449 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1101128 3 0.2408 0.85120 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1363886 2 0.1557 0.90505 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR612983 2 0.0592 0.92095 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1394366 4 0.4343 0.66283 0.000 0.264 0.004 0.732
#> SRR1093218 3 0.2760 0.81964 0.000 0.000 0.872 0.128
#> SRR1077090 3 0.3219 0.80646 0.000 0.000 0.836 0.164
#> SRR1327430 2 0.4795 0.78062 0.024 0.768 0.012 0.196
#> SRR1088958 1 0.0817 0.91172 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1486931 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1086820 1 0.1474 0.90377 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1383000 1 0.0707 0.91297 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1355705 2 0.0336 0.92254 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR614335 2 0.3751 0.81044 0.000 0.800 0.004 0.196
#> SRR660534 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR817094 2 0.0188 0.92304 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1334265 2 0.4956 0.76596 0.056 0.756 0.000 0.188
#> SRR1456401 2 0.2814 0.86135 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1086393 1 0.0817 0.91723 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1351521 3 0.1118 0.88499 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1093100 2 0.7791 0.52916 0.052 0.588 0.156 0.204
#> SRR1309382 1 0.2469 0.85232 0.892 0.000 0.000 0.108
#> SRR1089375 1 0.0707 0.91899 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1499482 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614719 2 0.0188 0.92304 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1081473 3 0.1211 0.87677 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1087415 1 0.2081 0.87982 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1088217 4 0.4614 0.72347 0.144 0.000 0.064 0.792
#> SRR808496 2 0.2345 0.88145 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1336463 2 0.0336 0.92254 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR612359 2 0.1557 0.88944 0.000 0.944 0.056 0.000
#> SRR1444412 1 0.0921 0.91605 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1074116 3 0.1637 0.87676 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR821846 3 0.0000 0.88795 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR808914 1 0.2081 0.87806 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1349099 4 0.4605 0.56027 0.336 0.000 0.000 0.664
#> SRR1337886 2 0.0188 0.92304 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR813632 1 0.0817 0.91723 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1101591 3 0.0817 0.88233 0.024 0.000 0.976 0.000
#> SRR1089713 4 0.5673 0.62847 0.288 0.000 0.052 0.660
#> SRR1453127 3 0.0592 0.88852 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1498354 4 0.5284 0.32916 0.016 0.000 0.368 0.616
#> SRR1313831 1 0.2011 0.88191 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1315434 3 0.0592 0.88468 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR814747 2 0.3123 0.84468 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1358539 1 0.1389 0.90623 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1367807 1 0.1940 0.87076 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1365791 4 0.3942 0.56372 0.000 0.000 0.236 0.764
#> SRR1081519 4 0.5097 0.17287 0.004 0.000 0.428 0.568
#> SRR614707 4 0.5040 0.72989 0.088 0.096 0.020 0.796
#> SRR1094027 1 0.0188 0.91851 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1489092 4 0.5657 0.59991 0.312 0.000 0.044 0.644
#> SRR1079502 3 0.1302 0.87437 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1457814 3 0.3751 0.75758 0.000 0.004 0.800 0.196
#> SRR1455127 2 0.3074 0.84804 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR615081 4 0.4746 0.51371 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR1327855 3 0.1716 0.87484 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1417873 2 0.4136 0.79932 0.016 0.788 0.000 0.196
#> SRR1394125 3 0.1792 0.87309 0.000 0.000 0.932 0.068
#> SRR1488388 1 0.0469 0.91869 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1401122 2 0.4245 0.79550 0.020 0.784 0.000 0.196
#> SRR612383 3 0.3688 0.65023 0.000 0.208 0.792 0.000
#> SRR1477711 1 0.0817 0.91723 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1350813 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612851 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1086349 1 0.0000 0.91820 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0707 0.92006 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1340010 3 0.4019 0.75092 0.012 0.000 0.792 0.196
#> SRR1475885 4 0.3893 0.70724 0.196 0.000 0.008 0.796
#> SRR1376334 1 0.1940 0.88565 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1399821 1 0.1022 0.91864 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1347042 3 0.0336 0.88877 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR612323 3 0.0336 0.88631 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR612604 4 0.4916 0.38927 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR1389546 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0707 0.91308 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1465608 1 0.3219 0.76799 0.836 0.000 0.000 0.164
#> SRR1101808 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1414079 3 0.0188 0.88855 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1331153 2 0.2345 0.83884 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1078439 3 0.3074 0.81540 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR2165527 2 0.3123 0.84468 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1351147 4 0.4164 0.66400 0.264 0.000 0.000 0.736
#> SRR1313536 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070308 1 0.5531 0.52087 0.716 0.228 0.044 0.012
#> SRR1403110 1 0.1557 0.90090 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1400355 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.1716 0.87480 0.000 0.000 0.936 0.064
#> SRR1456862 1 0.2011 0.89242 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1074622 1 0.0336 0.91697 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1465847 3 0.1661 0.87901 0.004 0.000 0.944 0.052
#> SRR1443376 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.1022 0.88650 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1075579 1 0.0921 0.91605 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1090881 3 0.1902 0.87381 0.000 0.004 0.932 0.064
#> SRR612251 2 0.2921 0.85634 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1418581 1 0.0707 0.91330 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR658045 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR613214 2 0.2888 0.82581 0.000 0.872 0.124 0.004
#> SRR613078 4 0.4134 0.66454 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR1472998 3 0.3801 0.65646 0.220 0.000 0.780 0.000
#> SRR1433452 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1101957 1 0.0592 0.91446 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1487993 3 0.1474 0.87059 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1465983 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1380375 1 0.0817 0.91723 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1367566 3 0.0000 0.88795 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316151 4 0.4454 0.54434 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR1417547 2 0.4245 0.79541 0.020 0.784 0.000 0.196
#> SRR659389 2 0.0188 0.92304 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1490270 2 0.1118 0.90248 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1398207 4 0.4621 0.64162 0.284 0.000 0.008 0.708
#> SRR1358755 3 0.4466 0.75402 0.036 0.000 0.784 0.180
#> SRR1078903 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1323252 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1369172 1 0.0921 0.91605 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR615982 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.0469 0.92183 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1429825 2 0.1211 0.91451 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1102393 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.3668 0.73182 0.808 0.000 0.004 0.188
#> SRR808351 1 0.0336 0.91697 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1317513 1 0.0921 0.91605 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1480501 3 0.1022 0.87970 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1081910 1 0.6465 0.00665 0.516 0.000 0.072 0.412
#> SRR1086611 4 0.4559 0.64578 0.004 0.040 0.164 0.792
#> SRR1392571 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0336 0.91774 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR808152 1 0.0592 0.91446 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR657313 3 0.0336 0.88877 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1433131 2 0.4948 0.05003 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR1321011 2 0.0336 0.92254 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1500598 2 0.1302 0.91065 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1379343 2 0.0188 0.92256 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1389108 1 0.2149 0.85904 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1376228 3 0.0469 0.88888 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1399757 1 0.0817 0.91723 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1358060 3 0.0707 0.88801 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1464517 3 0.1389 0.87271 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR613557 3 0.0336 0.88792 0.000 0.008 0.992 0.000
#> SRR809831 1 0.0921 0.91605 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1429387 3 0.0592 0.88852 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR816565 1 0.0469 0.91869 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1071644 1 0.0707 0.91797 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1406936 3 0.3172 0.79226 0.000 0.000 0.840 0.160
#> SRR1072031 2 0.0000 0.92314 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.1677 0.90040 0.000 0.948 0.040 0.012
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 5 0.3336 0.5102 0.000 0.000 0.228 0.000 0.772
#> SRR1404105 1 0.1341 0.8834 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR2164936 2 0.0703 0.8965 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1472057 3 0.1892 0.8910 0.004 0.000 0.916 0.000 0.080
#> SRR614491 3 0.2927 0.8555 0.000 0.060 0.872 0.000 0.068
#> SRR1069376 1 0.1341 0.8834 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR811964 2 0.0000 0.8979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 5 0.3949 0.5941 0.000 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR1345715 1 0.3949 0.6168 0.668 0.000 0.000 0.000 0.332
#> SRR1328073 1 0.3354 0.8304 0.844 0.068 0.000 0.000 0.088
#> SRR1394209 5 0.2333 0.6488 0.040 0.016 0.028 0.000 0.916
#> SRR1474018 5 0.4291 0.2802 0.000 0.464 0.000 0.000 0.536
#> SRR1099809 1 0.3192 0.8010 0.848 0.000 0.112 0.000 0.040
#> SRR1500555 3 0.4357 0.7304 0.000 0.128 0.768 0.104 0.000
#> SRR1354363 1 0.3305 0.7657 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1391619 3 0.2377 0.8680 0.000 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1307997 2 0.1331 0.8695 0.008 0.952 0.000 0.000 0.040
#> SRR663124 2 0.0671 0.8987 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1334670 1 0.0290 0.8858 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR612515 3 0.2136 0.8857 0.000 0.008 0.904 0.000 0.088
#> SRR1092727 2 0.0290 0.8986 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1364013 2 0.2329 0.8338 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1468553 3 0.0290 0.9009 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1403980 3 0.1628 0.8756 0.008 0.000 0.936 0.000 0.056
#> SRR1420169 3 0.4636 0.7816 0.064 0.000 0.764 0.020 0.152
#> SRR1442800 4 0.0162 0.8962 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1359214 5 0.3895 0.6130 0.000 0.320 0.000 0.000 0.680
#> SRR1499849 1 0.3527 0.7866 0.828 0.000 0.116 0.000 0.056
#> SRR1500030 3 0.3305 0.7852 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1093053 3 0.2286 0.8791 0.000 0.000 0.888 0.004 0.108
#> SRR1399843 3 0.4262 0.3924 0.000 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR1380231 3 0.3651 0.7742 0.108 0.000 0.828 0.004 0.060
#> SRR809470 1 0.6096 0.5149 0.604 0.000 0.148 0.236 0.012
#> SRR614239 3 0.3955 0.7832 0.000 0.116 0.800 0.000 0.084
#> SRR613939 4 0.0290 0.8936 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR612971 2 0.1544 0.8733 0.000 0.932 0.000 0.000 0.068
#> SRR1490204 2 0.0162 0.8985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR811357 2 0.0609 0.8902 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1471672 1 0.3983 0.6029 0.660 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR613006 2 0.1082 0.8930 0.000 0.964 0.000 0.028 0.008
#> SRR1469570 2 0.0510 0.8982 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1457354 2 0.3452 0.6589 0.000 0.756 0.000 0.000 0.244
#> SRR1362906 3 0.3661 0.7204 0.000 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1079023 1 0.0290 0.8873 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR813608 2 0.0510 0.8982 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1096736 5 0.2179 0.6140 0.100 0.000 0.004 0.000 0.896
#> SRR1478700 1 0.4273 0.3816 0.552 0.000 0.000 0.000 0.448
#> SRR1081543 3 0.2690 0.8487 0.000 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1384754 5 0.2754 0.6145 0.080 0.000 0.040 0.000 0.880
#> SRR612287 2 0.3534 0.6356 0.000 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR1380317 5 0.3019 0.6640 0.000 0.048 0.088 0.000 0.864
#> SRR1315247 4 0.0000 0.8973 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105344 4 0.5856 0.1415 0.000 0.396 0.000 0.504 0.100
#> SRR658549 2 0.3492 0.6547 0.000 0.796 0.188 0.000 0.016
#> SRR1480240 1 0.0794 0.8820 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1084816 2 0.0404 0.8987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR612551 2 0.0880 0.8938 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1358520 5 0.2339 0.6946 0.004 0.100 0.004 0.000 0.892
#> SRR1419476 3 0.1082 0.8897 0.000 0.000 0.964 0.008 0.028
#> SRR1456075 5 0.3574 0.5591 0.028 0.000 0.168 0.000 0.804
#> SRR1389474 2 0.0000 0.8979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.2732 0.8261 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1334419 5 0.4161 0.1497 0.392 0.000 0.000 0.000 0.608
#> SRR1417154 3 0.0671 0.8983 0.000 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1095985 4 0.0000 0.8973 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325771 1 0.0162 0.8863 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1360420 3 0.0290 0.9004 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR660272 2 0.0771 0.8896 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004
#> SRR1332993 1 0.1478 0.8811 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1311833 2 0.0609 0.8902 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR808044 1 0.6153 0.5232 0.560 0.000 0.000 0.208 0.232
#> SRR1076916 4 0.0000 0.8973 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0963 0.8865 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1341983 2 0.2074 0.8459 0.000 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1456114 1 0.2561 0.8385 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1072948 3 0.1851 0.8876 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1472370 3 0.0880 0.9022 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1480176 1 0.1043 0.8788 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR613843 2 0.0404 0.8987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1469192 1 0.1410 0.8823 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1404555 4 0.4726 0.2127 0.000 0.000 0.400 0.580 0.020
#> SRR659839 2 0.0404 0.8943 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR659533 2 0.0510 0.8982 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1362848 5 0.2295 0.6359 0.008 0.004 0.088 0.000 0.900
#> SRR1407492 3 0.2074 0.8808 0.000 0.044 0.920 0.000 0.036
#> SRR1455082 2 0.0609 0.8975 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR658362 2 0.2011 0.8575 0.000 0.908 0.004 0.000 0.088
#> SRR810921 2 0.0290 0.8958 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR662823 5 0.4256 0.3622 0.000 0.436 0.000 0.000 0.564
#> SRR1456375 3 0.0898 0.9022 0.000 0.000 0.972 0.008 0.020
#> SRR818232 1 0.1300 0.8766 0.956 0.000 0.000 0.028 0.016
#> SRR1454868 3 0.2230 0.8745 0.000 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1474816 2 0.0404 0.8942 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1342002 1 0.1043 0.8861 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1088437 5 0.4273 0.3285 0.000 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR1466400 4 0.0000 0.8973 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658921 4 0.0000 0.8973 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0404 0.8987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1101373 1 0.2179 0.8596 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1090145 1 0.1281 0.8770 0.956 0.000 0.000 0.012 0.032
#> SRR1379324 1 0.1809 0.8807 0.928 0.000 0.000 0.012 0.060
#> SRR1345307 2 0.0609 0.8902 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1396166 3 0.1671 0.8916 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1086280 3 0.0671 0.8953 0.000 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1454891 2 0.0451 0.8989 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR663185 5 0.3636 0.6702 0.000 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR811819 1 0.0794 0.8820 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1318920 4 0.0162 0.8957 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR656758 2 0.0404 0.8987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1474351 1 0.0609 0.8841 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR660450 2 0.3790 0.6096 0.004 0.744 0.000 0.248 0.004
#> SRR1472687 2 0.2605 0.8007 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1334291 2 0.2171 0.8280 0.024 0.912 0.000 0.000 0.064
#> SRR1415153 2 0.0794 0.8851 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1323271 5 0.3480 0.6913 0.000 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR1368939 2 0.0693 0.8988 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1443161 5 0.2561 0.6167 0.000 0.000 0.144 0.000 0.856
#> SRR614695 4 0.0000 0.8973 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092372 4 0.0000 0.8973 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.4291 0.3239 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1406582 1 0.3109 0.7903 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR612779 2 0.0609 0.8904 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1089006 1 0.3305 0.7658 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1354071 1 0.3301 0.8099 0.848 0.000 0.080 0.000 0.072
#> SRR1105463 1 0.4287 0.7624 0.800 0.000 0.116 0.028 0.056
#> SRR811005 2 0.0510 0.8982 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1385319 1 0.1894 0.8543 0.920 0.000 0.000 0.072 0.008
#> SRR1325871 3 0.2329 0.8703 0.000 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1355415 4 0.6438 0.4960 0.108 0.000 0.268 0.584 0.040
#> SRR1090861 1 0.0162 0.8863 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1320712 5 0.2295 0.6409 0.004 0.008 0.088 0.000 0.900
#> SRR1470075 1 0.3561 0.7236 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR1091254 1 0.1043 0.8861 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1101397 5 0.4045 0.2399 0.356 0.000 0.000 0.000 0.644
#> SRR1321165 4 0.0000 0.8973 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.2017 0.8660 0.000 0.000 0.912 0.080 0.008
#> SRR1417588 3 0.0609 0.9014 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1074790 1 0.1626 0.8735 0.940 0.016 0.000 0.000 0.044
#> SRR1432106 5 0.3752 0.6512 0.000 0.292 0.000 0.000 0.708
#> SRR655756 2 0.0510 0.8982 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1458314 1 0.3752 0.6794 0.708 0.000 0.000 0.000 0.292
#> SRR1318582 2 0.0290 0.8958 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1080484 5 0.3561 0.6830 0.000 0.260 0.000 0.000 0.740
#> SRR1072749 1 0.1544 0.8802 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1078586 1 0.0510 0.8845 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1400333 4 0.1671 0.8320 0.000 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1078834 4 0.4155 0.6537 0.004 0.228 0.000 0.744 0.024
#> SRR1417611 5 0.3274 0.7055 0.000 0.220 0.000 0.000 0.780
#> SRR1396840 4 0.0000 0.8973 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.1792 0.8618 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1400530 2 0.2230 0.8343 0.000 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR614984 3 0.3276 0.7974 0.000 0.132 0.836 0.000 0.032
#> SRR1324269 1 0.0609 0.8838 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1401491 2 0.5488 0.4618 0.000 0.608 0.000 0.300 0.092
#> SRR1319443 1 0.0992 0.8810 0.968 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR1324349 5 0.3596 0.7078 0.016 0.200 0.000 0.000 0.784
#> SRR1345523 2 0.0794 0.8953 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1500846 1 0.2424 0.8468 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR661505 3 0.0703 0.8940 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1419062 3 0.2234 0.8582 0.036 0.000 0.916 0.004 0.044
#> SRR1480131 1 0.2546 0.8495 0.904 0.000 0.036 0.012 0.048
#> SRR1421284 5 0.2077 0.6888 0.000 0.084 0.008 0.000 0.908
#> SRR1329624 1 0.0162 0.8870 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1315739 3 0.0290 0.9001 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1099189 2 0.0794 0.8956 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1083286 1 0.0703 0.8828 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1091890 3 0.0703 0.9017 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1347436 2 0.0794 0.8851 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1327473 1 0.0963 0.8865 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1338195 3 0.1478 0.8947 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR809698 2 0.0510 0.8982 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1457792 1 0.1478 0.8811 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR658271 2 0.0404 0.8987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1339597 1 0.2249 0.8670 0.896 0.000 0.000 0.008 0.096
#> SRR1454842 3 0.1851 0.8875 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1322643 1 0.3508 0.7330 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252
#> SRR614887 3 0.0703 0.9012 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1354620 1 0.5961 0.0175 0.464 0.000 0.460 0.028 0.048
#> SRR615056 5 0.4278 0.3130 0.000 0.452 0.000 0.000 0.548
#> SRR1105320 1 0.4338 0.7602 0.792 0.016 0.112 0.000 0.080
#> SRR1391529 1 0.0703 0.8828 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR663052 2 0.2329 0.8388 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1478834 1 0.0609 0.8838 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR812366 2 0.1908 0.8557 0.000 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1435330 3 0.0703 0.9021 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR615383 2 0.0404 0.8942 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1389157 3 0.0865 0.8950 0.000 0.024 0.972 0.000 0.004
#> SRR613568 2 0.1116 0.8886 0.004 0.964 0.000 0.028 0.004
#> SRR614095 2 0.2377 0.8225 0.000 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1103092 1 0.1907 0.8637 0.928 0.000 0.028 0.000 0.044
#> SRR1337155 4 0.0000 0.8973 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475345 2 0.2605 0.8007 0.000 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR809089 2 0.0000 0.8979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 4 0.0000 0.8973 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1406372 2 0.2930 0.7791 0.000 0.832 0.000 0.004 0.164
#> SRR1339880 5 0.4297 -0.1499 0.000 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1353136 5 0.4307 -0.2176 0.000 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1093906 3 0.0290 0.8986 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR614035 2 0.0794 0.8953 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1351104 1 0.3983 0.6036 0.660 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR1363926 5 0.4297 0.2516 0.000 0.472 0.000 0.000 0.528
#> SRR1399861 5 0.2690 0.6136 0.000 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR1338789 4 0.5180 0.4131 0.312 0.000 0.000 0.624 0.064
#> SRR1421420 3 0.2329 0.8701 0.000 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1420832 5 0.4060 0.5445 0.000 0.360 0.000 0.000 0.640
#> SRR1476231 1 0.0794 0.8871 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1352870 3 0.1372 0.8897 0.000 0.024 0.956 0.004 0.016
#> SRR1315041 5 0.3242 0.7086 0.000 0.216 0.000 0.000 0.784
#> SRR661877 2 0.3661 0.5964 0.000 0.724 0.000 0.000 0.276
#> SRR1443268 1 0.3636 0.7078 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR1416617 3 0.0404 0.8997 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1102443 1 0.2179 0.8595 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR655672 2 0.0798 0.8974 0.000 0.976 0.008 0.000 0.016
#> SRR1420006 3 0.0324 0.8992 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1458267 2 0.0963 0.8792 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR613819 5 0.3366 0.7093 0.000 0.212 0.004 0.000 0.784
#> SRR1469432 2 0.3999 0.4343 0.000 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR660907 2 0.3210 0.7129 0.000 0.788 0.000 0.000 0.212
#> SRR1465092 2 0.0794 0.8851 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1470727 1 0.1341 0.8834 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1339153 3 0.2280 0.8723 0.000 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1472749 3 0.1768 0.8935 0.000 0.000 0.924 0.004 0.072
#> SRR1414379 5 0.2439 0.7010 0.000 0.120 0.004 0.000 0.876
#> SRR1431326 1 0.2280 0.8549 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1487278 4 0.0162 0.8961 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1098312 3 0.0880 0.9005 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR810273 2 0.0162 0.8969 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1376000 2 0.0404 0.8942 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR614467 5 0.4268 0.5156 0.000 0.344 0.008 0.000 0.648
#> SRR811471 1 0.0794 0.8871 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1478341 3 0.0404 0.8978 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1088606 4 0.0000 0.8973 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1479699 3 0.0703 0.9020 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1403589 2 0.0404 0.8988 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR812625 2 0.5191 0.6030 0.000 0.684 0.000 0.192 0.124
#> SRR1359803 1 0.1408 0.8781 0.948 0.000 0.000 0.044 0.008
#> SRR1338988 2 0.2179 0.8381 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1471222 2 0.2707 0.8374 0.000 0.876 0.000 0.024 0.100
#> SRR1378992 5 0.4015 0.2791 0.348 0.000 0.000 0.000 0.652
#> SRR659427 5 0.2516 0.6184 0.000 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1096638 1 0.1908 0.8700 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1466619 4 0.3193 0.7561 0.000 0.028 0.000 0.840 0.132
#> SRR659307 3 0.0794 0.8924 0.000 0.028 0.972 0.000 0.000
#> SRR1439994 1 0.3990 0.6544 0.688 0.000 0.004 0.000 0.308
#> SRR1454931 1 0.4691 0.6769 0.740 0.000 0.028 0.200 0.032
#> SRR1332928 5 0.2358 0.6126 0.104 0.000 0.008 0.000 0.888
#> SRR658621 5 0.3774 0.6464 0.000 0.296 0.000 0.000 0.704
#> SRR1095840 1 0.0404 0.8852 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1458243 1 0.2471 0.8446 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1374270 5 0.2616 0.6477 0.000 0.020 0.100 0.000 0.880
#> SRR1470947 2 0.3074 0.7374 0.000 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1365598 4 0.0000 0.8973 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR662787 5 0.4161 0.4787 0.000 0.392 0.000 0.000 0.608
#> SRR1408727 5 0.3060 0.7002 0.000 0.128 0.024 0.000 0.848
#> SRR1456274 1 0.2732 0.8272 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR817744 1 0.0404 0.8874 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1478744 2 0.3039 0.7432 0.000 0.808 0.000 0.000 0.192
#> SRR1387379 2 0.0963 0.8919 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1102680 3 0.1124 0.8874 0.000 0.000 0.960 0.004 0.036
#> SRR1374198 4 0.2690 0.7469 0.156 0.000 0.000 0.844 0.000
#> SRR1445856 4 0.1197 0.8613 0.048 0.000 0.000 0.952 0.000
#> SRR820049 3 0.1270 0.8973 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1375290 3 0.0290 0.8986 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR818999 1 0.3964 0.7723 0.812 0.000 0.120 0.012 0.056
#> SRR1390242 1 0.0703 0.8833 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1401164 4 0.1597 0.8544 0.000 0.048 0.000 0.940 0.012
#> SRR1454629 1 0.4752 0.7329 0.772 0.000 0.060 0.124 0.044
#> SRR1332187 3 0.3980 0.6181 0.000 0.000 0.708 0.284 0.008
#> SRR603365 3 0.1195 0.9022 0.000 0.000 0.960 0.012 0.028
#> SRR657833 2 0.0290 0.8958 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1436207 2 0.0162 0.8969 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1488017 1 0.0609 0.8875 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR612947 2 0.0510 0.8923 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1480384 1 0.1410 0.8823 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1364761 2 0.0510 0.8982 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1308086 5 0.4015 0.2541 0.000 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR1441868 1 0.3039 0.7980 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1485380 3 0.0609 0.8953 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1073705 5 0.4262 -0.0194 0.440 0.000 0.000 0.000 0.560
#> SRR615032 2 0.1732 0.8648 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1452356 5 0.3796 0.6413 0.000 0.300 0.000 0.000 0.700
#> SRR1442983 2 0.0609 0.8902 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1100346 2 0.0510 0.8982 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1332816 1 0.1851 0.8718 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR612299 4 0.0000 0.8973 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407386 1 0.0290 0.8873 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1418064 2 0.1121 0.8729 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1309403 1 0.2162 0.8593 0.916 0.008 0.012 0.000 0.064
#> SRR1498395 2 0.0963 0.8792 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1079998 3 0.4256 0.2067 0.436 0.000 0.564 0.000 0.000
#> SRR1498885 5 0.3913 0.6023 0.000 0.324 0.000 0.000 0.676
#> SRR1337215 4 0.0162 0.8959 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1414749 3 0.0290 0.8988 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1365963 3 0.5673 0.5324 0.252 0.000 0.616 0.000 0.132
#> SRR1368030 5 0.3452 0.6943 0.000 0.244 0.000 0.000 0.756
#> SRR1419760 2 0.6896 0.1937 0.324 0.516 0.088 0.000 0.072
#> SRR1381841 1 0.4210 0.7242 0.772 0.000 0.016 0.184 0.028
#> SRR821388 3 0.3074 0.8162 0.000 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR657623 5 0.3636 0.6724 0.000 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1094241 3 0.2230 0.8745 0.000 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR819583 3 0.1041 0.8893 0.000 0.000 0.964 0.004 0.032
#> SRR1096149 1 0.4171 0.4923 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR1342829 3 0.0404 0.9009 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1353028 1 0.1043 0.8861 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR811333 1 0.5377 0.1187 0.496 0.000 0.456 0.004 0.044
#> SRR1311666 2 0.0794 0.8851 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1486698 2 0.4151 0.4504 0.000 0.652 0.000 0.344 0.004
#> SRR1446436 2 0.1043 0.8761 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR815092 1 0.0609 0.8838 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1500149 2 0.0579 0.8987 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008
#> SRR1100564 1 0.0404 0.8853 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1403072 3 0.0912 0.8940 0.000 0.000 0.972 0.016 0.012
#> SRR811653 5 0.2891 0.5947 0.000 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR1311348 2 0.0000 0.8979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 5 0.3684 0.6644 0.000 0.280 0.000 0.000 0.720
#> SRR1435442 4 0.0162 0.8962 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1421444 3 0.1197 0.8981 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1344010 2 0.1851 0.8588 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1319520 1 0.1732 0.8753 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1444763 4 0.0162 0.8957 0.004 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1415026 2 0.2179 0.8381 0.000 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1416596 5 0.5272 0.4141 0.000 0.072 0.000 0.308 0.620
#> SRR1485499 2 0.4088 0.3639 0.000 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR1316078 2 0.2329 0.8265 0.000 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR663465 5 0.4192 0.4469 0.000 0.404 0.000 0.000 0.596
#> SRR1310094 5 0.3242 0.7107 0.000 0.216 0.000 0.000 0.784
#> SRR663537 2 0.0510 0.8982 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1486780 1 0.1608 0.8785 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1453950 1 0.1270 0.8843 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1087875 1 0.4015 0.5881 0.652 0.000 0.000 0.000 0.348
#> SRR613318 3 0.3730 0.7012 0.000 0.000 0.712 0.000 0.288
#> SRR1332694 1 0.0290 0.8873 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1468469 3 0.1965 0.8848 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR818670 2 0.0162 0.8972 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1120318 1 0.1872 0.8647 0.928 0.000 0.020 0.000 0.052
#> SRR1311622 5 0.3508 0.4665 0.000 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1500931 3 0.1844 0.8744 0.012 0.000 0.936 0.012 0.040
#> SRR1387494 3 0.1410 0.8965 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1379175 5 0.2921 0.6821 0.020 0.068 0.028 0.000 0.884
#> SRR1401909 4 0.0451 0.8929 0.000 0.000 0.008 0.988 0.004
#> SRR1440541 2 0.0609 0.8993 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1068832 3 0.1329 0.8864 0.008 0.000 0.956 0.004 0.032
#> SRR1376640 2 0.0693 0.8984 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008
#> SRR1085712 2 0.1478 0.8760 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1082283 4 0.0000 0.8973 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0955 0.8811 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR1353262 2 0.4697 0.5339 0.000 0.660 0.000 0.304 0.036
#> SRR1437035 1 0.0963 0.8876 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1396877 1 0.3336 0.8026 0.844 0.000 0.096 0.000 0.060
#> SRR1443026 2 0.0794 0.8954 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1417936 1 0.0609 0.8875 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1436822 4 0.5632 0.4157 0.000 0.140 0.000 0.628 0.232
#> SRR1101128 3 0.0865 0.8926 0.000 0.000 0.972 0.004 0.024
#> SRR1363886 2 0.4114 0.3388 0.000 0.624 0.000 0.000 0.376
#> SRR612983 2 0.1851 0.8588 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1394366 4 0.0162 0.8963 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1093218 3 0.3336 0.7793 0.000 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1077090 3 0.3795 0.7649 0.000 0.000 0.780 0.192 0.028
#> SRR1327430 5 0.3300 0.7155 0.000 0.204 0.004 0.000 0.792
#> SRR1088958 1 0.3109 0.7906 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1486931 2 0.1043 0.8761 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1086820 1 0.1282 0.8858 0.952 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1383000 1 0.1544 0.8799 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1355705 2 0.0794 0.8953 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR614335 5 0.4150 0.4781 0.000 0.388 0.000 0.000 0.612
#> SRR660534 2 0.0290 0.8958 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR817094 2 0.0794 0.8953 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1334265 5 0.3398 0.7059 0.004 0.216 0.000 0.000 0.780
#> SRR1456401 2 0.4227 0.1872 0.000 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1086393 1 0.1410 0.8823 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1351521 3 0.0510 0.9015 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1093100 5 0.2446 0.6761 0.000 0.056 0.044 0.000 0.900
#> SRR1309382 1 0.0671 0.8841 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1089375 1 0.0955 0.8810 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR1499482 2 0.0703 0.8877 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR614719 2 0.0609 0.8975 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1081473 3 0.2020 0.8829 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1087415 1 0.2920 0.8235 0.852 0.000 0.000 0.132 0.016
#> SRR1088217 4 0.2037 0.8494 0.004 0.000 0.064 0.920 0.012
#> SRR808496 2 0.3932 0.4825 0.000 0.672 0.000 0.000 0.328
#> SRR1336463 2 0.2690 0.7923 0.000 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR612359 2 0.2563 0.7848 0.000 0.872 0.120 0.000 0.008
#> SRR1444412 1 0.0794 0.8821 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1074116 3 0.0404 0.8978 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR821846 3 0.1410 0.8956 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR656095 2 0.0609 0.8902 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR808914 1 0.0794 0.8820 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1349099 4 0.0510 0.8903 0.000 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1337886 2 0.1270 0.8836 0.000 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR813632 1 0.0794 0.8825 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1101591 3 0.0693 0.9018 0.008 0.000 0.980 0.000 0.012
#> SRR1089713 1 0.4785 0.7145 0.756 0.000 0.152 0.024 0.068
#> SRR1453127 3 0.0290 0.9009 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1498354 3 0.3585 0.7941 0.088 0.000 0.844 0.016 0.052
#> SRR1313831 1 0.0510 0.8845 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1315434 3 0.2329 0.8701 0.000 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR814747 5 0.3707 0.6601 0.000 0.284 0.000 0.000 0.716
#> SRR1358539 1 0.0510 0.8851 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1367807 1 0.4300 0.2882 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476
#> SRR1365791 4 0.0963 0.8757 0.000 0.000 0.036 0.964 0.000
#> SRR1081519 3 0.2151 0.8680 0.016 0.000 0.924 0.020 0.040
#> SRR614707 4 0.0000 0.8973 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094027 1 0.0703 0.8874 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1489092 4 0.1357 0.8713 0.004 0.000 0.000 0.948 0.048
#> SRR1079502 3 0.2286 0.8806 0.000 0.000 0.888 0.004 0.108
#> SRR1457814 5 0.3210 0.5507 0.000 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1455127 2 0.4262 0.1098 0.000 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR615081 4 0.0162 0.8959 0.000 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1327855 3 0.0290 0.8986 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1417873 5 0.3395 0.6995 0.000 0.236 0.000 0.000 0.764
#> SRR1394125 3 0.1787 0.8734 0.016 0.000 0.936 0.004 0.044
#> SRR1488388 1 0.1270 0.8843 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1401122 5 0.3210 0.7129 0.000 0.212 0.000 0.000 0.788
#> SRR612383 3 0.4383 0.2739 0.000 0.424 0.572 0.000 0.004
#> SRR1477711 1 0.0290 0.8859 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1350813 2 0.0162 0.8985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612851 2 0.0162 0.8985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1086349 1 0.1043 0.8861 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR812837 2 0.1851 0.8588 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1340010 3 0.3274 0.7910 0.000 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1475885 4 0.0000 0.8973 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376334 1 0.0609 0.8838 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1399821 4 0.5644 0.4994 0.228 0.000 0.000 0.628 0.144
#> SRR1347042 3 0.0609 0.9014 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR612323 3 0.1965 0.8842 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR612604 4 0.0510 0.8900 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR1389546 2 0.0510 0.8923 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1311877 1 0.1197 0.8850 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1465608 5 0.3521 0.4932 0.232 0.000 0.004 0.000 0.764
#> SRR1101808 2 0.0290 0.8983 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1414079 3 0.0609 0.9017 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1331153 2 0.0451 0.8978 0.004 0.988 0.000 0.000 0.008
#> SRR1078439 3 0.2522 0.8598 0.000 0.000 0.880 0.108 0.012
#> SRR2165527 2 0.4268 0.0896 0.000 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1351147 1 0.2414 0.8501 0.900 0.012 0.008 0.000 0.080
#> SRR1313536 2 0.0963 0.8919 0.000 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1070308 1 0.4778 0.7126 0.764 0.132 0.028 0.000 0.076
#> SRR1403110 1 0.0510 0.8845 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1400355 2 0.0404 0.8943 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1401317 3 0.0510 0.8964 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1456862 4 0.1041 0.8750 0.032 0.000 0.000 0.964 0.004
#> SRR1074622 1 0.1478 0.8811 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1465847 3 0.0510 0.8964 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1443376 2 0.0000 0.8979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.1697 0.8979 0.000 0.000 0.932 0.008 0.060
#> SRR1075579 1 0.0290 0.8873 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1090881 3 0.1211 0.8915 0.000 0.016 0.960 0.000 0.024
#> SRR612251 2 0.4305 -0.1120 0.000 0.512 0.000 0.000 0.488
#> SRR1418581 1 0.2179 0.8596 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR658045 2 0.0000 0.8979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613214 2 0.5233 0.5245 0.000 0.684 0.168 0.000 0.148
#> SRR613078 4 0.0290 0.8946 0.000 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1472998 3 0.3210 0.7141 0.212 0.000 0.788 0.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0162 0.8969 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1101957 1 0.1410 0.8823 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1487993 3 0.3508 0.7514 0.000 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1465983 2 0.0000 0.8979 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0510 0.8845 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1367566 3 0.0703 0.9014 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1316151 4 0.2068 0.8282 0.000 0.004 0.000 0.904 0.092
#> SRR1417547 5 0.3480 0.6927 0.000 0.248 0.000 0.000 0.752
#> SRR659389 2 0.0609 0.8975 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1490270 2 0.0671 0.8963 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004
#> SRR1398207 1 0.4017 0.7731 0.812 0.000 0.116 0.016 0.056
#> SRR1358755 3 0.4771 0.6201 0.224 0.000 0.712 0.004 0.060
#> SRR1078903 2 0.0510 0.8923 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1323252 2 0.0510 0.8982 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1451796 2 0.0404 0.8987 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1369172 1 0.1894 0.8773 0.920 0.000 0.000 0.008 0.072
#> SRR615982 2 0.0404 0.8974 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1480431 2 0.1671 0.8678 0.000 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1429825 4 0.5163 0.4187 0.000 0.068 0.000 0.636 0.296
#> SRR1102393 2 0.0162 0.8985 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071313 5 0.3210 0.5415 0.212 0.000 0.000 0.000 0.788
#> SRR808351 1 0.1043 0.8861 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1317513 1 0.0290 0.8858 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1480501 3 0.2471 0.8633 0.000 0.000 0.864 0.000 0.136
#> SRR1081910 1 0.4484 0.6983 0.752 0.000 0.192 0.012 0.044
#> SRR1086611 4 0.0000 0.8973 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1392571 2 0.0290 0.8958 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1311441 1 0.3143 0.7867 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR808152 1 0.1478 0.8811 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR657313 3 0.2074 0.8806 0.000 0.000 0.896 0.000 0.104
#> SRR1433131 4 0.3949 0.4726 0.000 0.332 0.000 0.668 0.000
#> SRR1321011 2 0.0794 0.8953 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1500598 2 0.4150 0.2996 0.000 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1379343 2 0.0162 0.8969 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1389108 5 0.4278 -0.0664 0.452 0.000 0.000 0.000 0.548
#> SRR1376228 3 0.0290 0.8988 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1399757 1 0.0404 0.8874 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1358060 3 0.0290 0.8988 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1464517 3 0.4171 0.5139 0.000 0.000 0.604 0.000 0.396
#> SRR613557 3 0.1668 0.8932 0.000 0.028 0.940 0.000 0.032
#> SRR809831 1 0.1124 0.8783 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1429387 3 0.0510 0.9015 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR816565 1 0.0510 0.8877 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1071644 1 0.0963 0.8865 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1406936 3 0.4045 0.5785 0.000 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR1072031 2 0.0510 0.8982 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1374671 2 0.0771 0.8980 0.000 0.976 0.004 0.000 0.020
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 3 0.5291 0.35187 0.000 0.000 0.552 0.328 0.120 0.000
#> SRR1404105 1 0.0260 0.81671 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR2164936 2 0.2003 0.83442 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000 0.000
#> SRR1472057 5 0.4119 0.56821 0.004 0.000 0.336 0.016 0.644 0.000
#> SRR614491 3 0.1003 0.75072 0.000 0.028 0.964 0.004 0.004 0.000
#> SRR1069376 1 0.0632 0.81557 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR811964 2 0.0547 0.88034 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1361415 4 0.2218 0.79871 0.000 0.104 0.000 0.884 0.012 0.000
#> SRR1345715 1 0.2877 0.76460 0.820 0.000 0.000 0.012 0.168 0.000
#> SRR1328073 2 0.6479 -0.10534 0.404 0.444 0.032 0.032 0.088 0.000
#> SRR1394209 4 0.2144 0.71397 0.004 0.000 0.048 0.908 0.040 0.000
#> SRR1474018 4 0.1910 0.79698 0.000 0.108 0.000 0.892 0.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.2593 0.75853 0.844 0.000 0.008 0.000 0.148 0.000
#> SRR1500555 2 0.5505 -0.07257 0.000 0.464 0.460 0.028 0.012 0.036
#> SRR1354363 1 0.2882 0.76014 0.812 0.000 0.000 0.008 0.180 0.000
#> SRR1391619 3 0.0692 0.75690 0.000 0.000 0.976 0.020 0.004 0.000
#> SRR1307997 2 0.1908 0.83754 0.000 0.924 0.012 0.044 0.020 0.000
#> SRR663124 2 0.4436 0.46227 0.000 0.636 0.324 0.036 0.004 0.000
#> SRR1334670 1 0.1910 0.78981 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR612515 3 0.1226 0.74450 0.000 0.040 0.952 0.004 0.004 0.000
#> SRR1092727 2 0.0865 0.88017 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.2583 0.85902 0.000 0.884 0.008 0.056 0.052 0.000
#> SRR1468553 3 0.1531 0.73721 0.000 0.000 0.928 0.004 0.068 0.000
#> SRR1403980 3 0.4659 -0.22715 0.000 0.004 0.504 0.032 0.460 0.000
#> SRR1420169 5 0.4891 0.55511 0.004 0.000 0.304 0.056 0.628 0.008
#> SRR1442800 6 0.0405 0.92103 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008 0.988
#> SRR1359214 4 0.1444 0.79566 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000 0.000
#> SRR1499849 1 0.3864 0.13974 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480 0.000
#> SRR1500030 3 0.1196 0.75141 0.000 0.000 0.952 0.040 0.008 0.000
#> SRR1093053 3 0.1230 0.75773 0.000 0.000 0.956 0.028 0.008 0.008
#> SRR1399843 3 0.3945 0.37100 0.000 0.000 0.612 0.380 0.008 0.000
#> SRR1380231 5 0.3693 0.64172 0.092 0.000 0.120 0.000 0.788 0.000
#> SRR809470 1 0.6811 0.03218 0.456 0.000 0.088 0.000 0.304 0.152
#> SRR614239 3 0.2062 0.70572 0.000 0.088 0.900 0.008 0.004 0.000
#> SRR613939 6 0.0000 0.92272 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612971 4 0.3838 0.35544 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0820 0.87261 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016 0.000
#> SRR811357 2 0.0725 0.86643 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012 0.000
#> SRR1471672 1 0.3046 0.75211 0.800 0.000 0.000 0.012 0.188 0.000
#> SRR613006 2 0.3892 0.72126 0.000 0.752 0.000 0.060 0.000 0.188
#> SRR1469570 2 0.1267 0.87300 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1457354 4 0.3445 0.71041 0.000 0.244 0.000 0.744 0.012 0.000
#> SRR1362906 3 0.3344 0.64940 0.000 0.000 0.804 0.152 0.044 0.000
#> SRR1079023 1 0.1556 0.80173 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR813608 2 0.1327 0.87196 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1096736 4 0.6681 0.03455 0.320 0.000 0.052 0.436 0.192 0.000
#> SRR1478700 1 0.4193 0.70981 0.744 0.000 0.008 0.052 0.192 0.004
#> SRR1081543 3 0.0935 0.75474 0.000 0.000 0.964 0.032 0.004 0.000
#> SRR1384754 4 0.7406 -0.05335 0.152 0.000 0.288 0.372 0.188 0.000
#> SRR612287 4 0.3198 0.69906 0.000 0.260 0.000 0.740 0.000 0.000
#> SRR1380317 4 0.2066 0.74450 0.000 0.024 0.072 0.904 0.000 0.000
#> SRR1315247 6 0.0000 0.92272 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1105344 4 0.5383 0.56683 0.000 0.164 0.000 0.576 0.000 0.260
#> SRR658549 2 0.4809 0.25736 0.000 0.568 0.384 0.040 0.004 0.004
#> SRR1480240 1 0.2597 0.74472 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1084816 2 0.0632 0.88061 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.2300 0.80439 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000 0.000
#> SRR1358520 4 0.1549 0.77701 0.000 0.044 0.000 0.936 0.020 0.000
#> SRR1419476 5 0.3847 0.35305 0.000 0.000 0.456 0.000 0.544 0.000
#> SRR1456075 3 0.7007 0.19111 0.084 0.000 0.412 0.308 0.196 0.000
#> SRR1389474 2 0.0993 0.87988 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012 0.000
#> SRR1367005 1 0.2278 0.78922 0.868 0.000 0.000 0.004 0.128 0.000
#> SRR1334419 1 0.3860 0.72381 0.764 0.000 0.000 0.072 0.164 0.000
#> SRR1417154 3 0.2320 0.68323 0.000 0.000 0.864 0.004 0.132 0.000
#> SRR1095985 6 0.0458 0.91731 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1325771 1 0.1141 0.81015 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1360420 3 0.1444 0.73611 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR660272 2 0.1793 0.86721 0.012 0.928 0.000 0.012 0.000 0.048
#> SRR1332993 1 0.0363 0.81703 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1311833 2 0.0622 0.86856 0.000 0.980 0.000 0.012 0.008 0.000
#> SRR808044 1 0.5014 0.64043 0.676 0.000 0.004 0.008 0.188 0.124
#> SRR1076916 6 0.0363 0.91788 0.000 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988
#> SRR1356266 1 0.0632 0.81575 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1341983 2 0.3547 0.51846 0.000 0.696 0.000 0.300 0.000 0.004
#> SRR1456114 1 0.2048 0.79352 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1072948 3 0.0820 0.75748 0.000 0.000 0.972 0.016 0.012 0.000
#> SRR1472370 5 0.3969 0.55854 0.004 0.000 0.344 0.008 0.644 0.000
#> SRR1480176 1 0.1806 0.79827 0.908 0.004 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR613843 2 0.1563 0.87383 0.000 0.932 0.000 0.056 0.000 0.012
#> SRR1469192 1 0.0363 0.81719 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1404555 3 0.3866 0.07342 0.000 0.000 0.516 0.000 0.000 0.484
#> SRR659839 2 0.0622 0.87542 0.000 0.980 0.000 0.008 0.012 0.000
#> SRR659533 2 0.1082 0.87990 0.000 0.956 0.000 0.040 0.004 0.000
#> SRR1362848 4 0.4247 0.55617 0.004 0.000 0.164 0.740 0.092 0.000
#> SRR1407492 3 0.1218 0.75234 0.000 0.028 0.956 0.012 0.004 0.000
#> SRR1455082 2 0.1628 0.88030 0.000 0.940 0.008 0.036 0.004 0.012
#> SRR658362 4 0.3756 0.48003 0.000 0.400 0.000 0.600 0.000 0.000
#> SRR810921 2 0.0725 0.87687 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012 0.000
#> SRR662823 4 0.1858 0.79834 0.000 0.092 0.000 0.904 0.004 0.000
#> SRR1456375 3 0.2706 0.66450 0.000 0.000 0.832 0.000 0.160 0.008
#> SRR818232 1 0.2915 0.73230 0.808 0.000 0.000 0.000 0.184 0.008
#> SRR1454868 3 0.1092 0.75972 0.000 0.000 0.960 0.020 0.020 0.000
#> SRR1474816 2 0.2331 0.84703 0.000 0.888 0.000 0.080 0.032 0.000
#> SRR1342002 1 0.0260 0.81707 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1088437 4 0.3766 0.70479 0.000 0.256 0.000 0.720 0.024 0.000
#> SRR1466400 6 0.0000 0.92272 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658921 6 0.0000 0.92272 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.1327 0.87110 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.2092 0.79216 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1090145 1 0.3828 0.30012 0.560 0.000 0.000 0.000 0.440 0.000
#> SRR1379324 1 0.2191 0.79290 0.876 0.000 0.000 0.000 0.120 0.004
#> SRR1345307 2 0.0508 0.87398 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1396166 3 0.0909 0.75607 0.000 0.000 0.968 0.012 0.020 0.000
#> SRR1086280 3 0.3468 0.44910 0.000 0.000 0.712 0.000 0.284 0.004
#> SRR1454891 2 0.1036 0.88138 0.000 0.964 0.008 0.024 0.004 0.000
#> SRR663185 4 0.1588 0.79608 0.000 0.072 0.000 0.924 0.004 0.000
#> SRR811819 1 0.2191 0.78257 0.876 0.004 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1318920 6 0.0260 0.92092 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR656758 2 0.1444 0.86714 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.1204 0.80882 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR660450 2 0.3441 0.71180 0.000 0.784 0.004 0.024 0.000 0.188
#> SRR1472687 4 0.4097 0.21610 0.000 0.488 0.000 0.504 0.008 0.000
#> SRR1334291 2 0.2009 0.82807 0.000 0.916 0.004 0.040 0.040 0.000
#> SRR1415153 2 0.1624 0.83916 0.000 0.936 0.004 0.040 0.020 0.000
#> SRR1323271 4 0.1500 0.78519 0.000 0.052 0.000 0.936 0.012 0.000
#> SRR1368939 2 0.2058 0.86654 0.000 0.908 0.000 0.036 0.000 0.056
#> SRR1443161 4 0.5463 0.18406 0.000 0.000 0.312 0.540 0.148 0.000
#> SRR614695 6 0.0000 0.92272 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092372 6 0.0260 0.92005 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000 0.992
#> SRR1474577 1 0.3284 0.75217 0.800 0.000 0.000 0.032 0.168 0.000
#> SRR1406582 1 0.2402 0.78337 0.856 0.000 0.000 0.004 0.140 0.000
#> SRR612779 2 0.0458 0.88050 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.2743 0.76905 0.828 0.000 0.000 0.008 0.164 0.000
#> SRR1354071 5 0.3073 0.59745 0.204 0.000 0.008 0.000 0.788 0.000
#> SRR1105463 5 0.3298 0.56608 0.236 0.000 0.008 0.000 0.756 0.000
#> SRR811005 2 0.0547 0.88049 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.3248 0.73559 0.804 0.000 0.000 0.000 0.164 0.032
#> SRR1325871 3 0.0622 0.75695 0.000 0.000 0.980 0.012 0.008 0.000
#> SRR1355415 5 0.4867 0.62750 0.032 0.000 0.156 0.000 0.712 0.100
#> SRR1090861 1 0.0632 0.81590 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1320712 4 0.4251 0.51883 0.000 0.000 0.208 0.716 0.076 0.000
#> SRR1470075 1 0.3834 0.72852 0.772 0.000 0.000 0.084 0.144 0.000
#> SRR1091254 1 0.0547 0.81645 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1101397 1 0.5370 0.50421 0.588 0.000 0.000 0.220 0.192 0.000
#> SRR1321165 6 0.0291 0.92129 0.004 0.000 0.000 0.000 0.004 0.992
#> SRR1092112 3 0.4301 0.50971 0.000 0.000 0.696 0.000 0.064 0.240
#> SRR1417588 3 0.0146 0.75711 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1074790 1 0.4756 0.45272 0.608 0.332 0.000 0.004 0.056 0.000
#> SRR1432106 4 0.1327 0.79528 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.1010 0.88070 0.000 0.960 0.000 0.036 0.004 0.000
#> SRR1458314 1 0.4554 0.67725 0.716 0.000 0.000 0.104 0.172 0.008
#> SRR1318582 2 0.0603 0.87256 0.000 0.980 0.000 0.004 0.016 0.000
#> SRR1080484 4 0.1531 0.79483 0.000 0.068 0.000 0.928 0.004 0.000
#> SRR1072749 1 0.0405 0.81789 0.988 0.000 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR1078586 1 0.1910 0.79003 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1400333 6 0.1152 0.88263 0.000 0.044 0.000 0.004 0.000 0.952
#> SRR1078834 2 0.4744 0.36722 0.000 0.608 0.008 0.036 0.004 0.344
#> SRR1417611 4 0.1765 0.77961 0.000 0.052 0.000 0.924 0.024 0.000
#> SRR1396840 6 0.0146 0.92176 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004 0.996
#> SRR1465440 4 0.3717 0.51243 0.000 0.384 0.000 0.616 0.000 0.000
#> SRR1400530 4 0.3784 0.63442 0.000 0.308 0.000 0.680 0.012 0.000
#> SRR614984 3 0.4655 0.30427 0.000 0.384 0.576 0.032 0.008 0.000
#> SRR1324269 1 0.2092 0.78095 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1401491 4 0.5011 0.62168 0.000 0.272 0.000 0.616 0.000 0.112
#> SRR1319443 1 0.3198 0.65146 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1324349 4 0.7353 0.34001 0.228 0.084 0.000 0.468 0.192 0.028
#> SRR1345523 2 0.2092 0.82639 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.2135 0.79118 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR661505 5 0.3860 0.27873 0.000 0.000 0.472 0.000 0.528 0.000
#> SRR1419062 5 0.2941 0.63955 0.000 0.000 0.220 0.000 0.780 0.000
#> SRR1480131 5 0.3843 0.06624 0.452 0.000 0.000 0.000 0.548 0.000
#> SRR1421284 4 0.1713 0.77463 0.000 0.044 0.000 0.928 0.028 0.000
#> SRR1329624 1 0.0937 0.81285 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1315739 3 0.1663 0.72449 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1099189 2 0.1753 0.86162 0.000 0.912 0.000 0.084 0.004 0.000
#> SRR1083286 1 0.2969 0.69539 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1091890 3 0.1599 0.74798 0.000 0.028 0.940 0.008 0.024 0.000
#> SRR1347436 2 0.1151 0.85358 0.000 0.956 0.000 0.032 0.012 0.000
#> SRR1327473 1 0.4533 0.63595 0.704 0.000 0.000 0.140 0.156 0.000
#> SRR1338195 3 0.0146 0.75729 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.1267 0.87278 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.1387 0.80870 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR658271 2 0.1387 0.87052 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.2930 0.78426 0.840 0.000 0.000 0.000 0.124 0.036
#> SRR1454842 3 0.0622 0.75695 0.000 0.000 0.980 0.012 0.008 0.000
#> SRR1322643 1 0.2821 0.77270 0.832 0.000 0.000 0.016 0.152 0.000
#> SRR614887 3 0.0653 0.75707 0.000 0.000 0.980 0.012 0.004 0.004
#> SRR1354620 5 0.3991 0.63342 0.156 0.000 0.088 0.000 0.756 0.000
#> SRR615056 4 0.1663 0.79819 0.000 0.088 0.000 0.912 0.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.5698 0.06595 0.460 0.056 0.024 0.012 0.448 0.000
#> SRR1391529 1 0.3221 0.64811 0.736 0.000 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR663052 2 0.4123 0.12862 0.000 0.568 0.012 0.420 0.000 0.000
#> SRR1478834 1 0.2912 0.70428 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000
#> SRR812366 4 0.4756 0.47555 0.000 0.380 0.000 0.564 0.000 0.056
#> SRR1435330 3 0.1285 0.74504 0.000 0.000 0.944 0.004 0.052 0.000
#> SRR615383 2 0.0865 0.88015 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1389157 3 0.2206 0.72123 0.000 0.064 0.904 0.024 0.008 0.000
#> SRR613568 2 0.3382 0.80787 0.004 0.832 0.000 0.044 0.012 0.108
#> SRR614095 4 0.3717 0.51465 0.000 0.384 0.000 0.616 0.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.2454 0.75664 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1337155 6 0.0790 0.90843 0.000 0.000 0.000 0.000 0.032 0.968
#> SRR1475345 4 0.3563 0.59982 0.000 0.336 0.000 0.664 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0713 0.88077 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1446180 6 0.0000 0.92272 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406372 4 0.3969 0.62585 0.000 0.312 0.000 0.668 0.000 0.020
#> SRR1339880 3 0.4154 0.59137 0.000 0.000 0.740 0.164 0.096 0.000
#> SRR1353136 3 0.3518 0.55022 0.000 0.000 0.732 0.256 0.012 0.000
#> SRR1093906 3 0.0972 0.75356 0.000 0.000 0.964 0.008 0.028 0.000
#> SRR614035 2 0.1957 0.83717 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.3453 0.74713 0.792 0.000 0.000 0.044 0.164 0.000
#> SRR1363926 4 0.1983 0.79621 0.000 0.072 0.000 0.908 0.020 0.000
#> SRR1399861 4 0.2821 0.63945 0.000 0.000 0.152 0.832 0.016 0.000
#> SRR1338789 6 0.5758 0.39878 0.280 0.000 0.000 0.016 0.148 0.556
#> SRR1421420 3 0.4140 0.59395 0.000 0.000 0.744 0.104 0.152 0.000
#> SRR1420832 4 0.1501 0.79649 0.000 0.076 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0260 0.81707 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1352870 3 0.4701 0.44357 0.000 0.256 0.680 0.036 0.024 0.004
#> SRR1315041 4 0.1616 0.77950 0.000 0.048 0.000 0.932 0.020 0.000
#> SRR661877 4 0.3221 0.69869 0.000 0.264 0.000 0.736 0.000 0.000
#> SRR1443268 1 0.4795 0.61975 0.672 0.000 0.000 0.152 0.176 0.000
#> SRR1416617 3 0.1610 0.72789 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1102443 1 0.2595 0.77446 0.836 0.000 0.000 0.004 0.160 0.000
#> SRR655672 2 0.2340 0.86258 0.000 0.896 0.044 0.056 0.004 0.000
#> SRR1420006 3 0.2053 0.70837 0.000 0.000 0.888 0.000 0.108 0.004
#> SRR1458267 2 0.1838 0.83307 0.000 0.928 0.012 0.040 0.020 0.000
#> SRR613819 4 0.1204 0.79129 0.000 0.056 0.000 0.944 0.000 0.000
#> SRR1469432 4 0.3071 0.76383 0.000 0.180 0.000 0.804 0.016 0.000
#> SRR660907 4 0.3351 0.66759 0.000 0.288 0.000 0.712 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.1088 0.85869 0.000 0.960 0.000 0.016 0.024 0.000
#> SRR1470727 1 0.0937 0.81389 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1339153 3 0.0767 0.75779 0.000 0.000 0.976 0.012 0.004 0.008
#> SRR1472749 3 0.0767 0.75805 0.000 0.000 0.976 0.004 0.012 0.008
#> SRR1414379 4 0.1219 0.78726 0.000 0.048 0.000 0.948 0.004 0.000
#> SRR1431326 1 0.2048 0.79433 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1487278 6 0.0146 0.92194 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1098312 3 0.2453 0.72727 0.000 0.044 0.896 0.016 0.044 0.000
#> SRR810273 2 0.0547 0.88071 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0405 0.87828 0.000 0.988 0.000 0.008 0.004 0.000
#> SRR614467 4 0.2106 0.78451 0.000 0.064 0.032 0.904 0.000 0.000
#> SRR811471 1 0.0632 0.81774 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1478341 3 0.0767 0.75601 0.000 0.000 0.976 0.012 0.008 0.004
#> SRR1088606 6 0.0000 0.92272 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1479699 3 0.2776 0.71920 0.000 0.040 0.884 0.028 0.044 0.004
#> SRR1403589 2 0.2744 0.80306 0.000 0.840 0.000 0.144 0.016 0.000
#> SRR812625 6 0.3902 0.65582 0.000 0.212 0.000 0.012 0.028 0.748
#> SRR1359803 1 0.2595 0.75403 0.836 0.000 0.000 0.000 0.160 0.004
#> SRR1338988 4 0.3578 0.59348 0.000 0.340 0.000 0.660 0.000 0.000
#> SRR1471222 4 0.4319 0.55530 0.000 0.348 0.000 0.620 0.000 0.032
#> SRR1378992 1 0.4602 0.64663 0.696 0.000 0.000 0.144 0.160 0.000
#> SRR659427 4 0.3142 0.68099 0.000 0.008 0.108 0.840 0.044 0.000
#> SRR1096638 1 0.1863 0.79882 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1466619 6 0.2969 0.67049 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR659307 3 0.2790 0.67071 0.000 0.116 0.856 0.020 0.008 0.000
#> SRR1439994 1 0.5413 0.54137 0.604 0.000 0.004 0.068 0.296 0.028
#> SRR1454931 5 0.4685 0.09456 0.436 0.000 0.000 0.000 0.520 0.044
#> SRR1332928 4 0.5267 0.46991 0.080 0.000 0.032 0.660 0.224 0.004
#> SRR658621 4 0.1644 0.79674 0.000 0.076 0.000 0.920 0.004 0.000
#> SRR1095840 1 0.2048 0.78359 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1458243 1 0.2778 0.76877 0.824 0.000 0.000 0.008 0.168 0.000
#> SRR1374270 4 0.2487 0.68432 0.000 0.000 0.092 0.876 0.032 0.000
#> SRR1470947 4 0.3288 0.68166 0.000 0.276 0.000 0.724 0.000 0.000
#> SRR1365598 6 0.0000 0.92272 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR662787 4 0.2100 0.79715 0.000 0.112 0.000 0.884 0.004 0.000
#> SRR1408727 4 0.1785 0.73949 0.000 0.008 0.048 0.928 0.016 0.000
#> SRR1456274 1 0.3859 0.72875 0.756 0.004 0.012 0.020 0.208 0.000
#> SRR817744 1 0.1267 0.80782 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1478744 4 0.3351 0.66730 0.000 0.288 0.000 0.712 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.2300 0.80520 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000 0.000
#> SRR1102680 5 0.3592 0.56951 0.000 0.000 0.344 0.000 0.656 0.000
#> SRR1374198 6 0.2135 0.78937 0.128 0.000 0.000 0.000 0.000 0.872
#> SRR1445856 6 0.2201 0.84901 0.048 0.000 0.000 0.000 0.052 0.900
#> SRR820049 3 0.0520 0.75717 0.000 0.000 0.984 0.008 0.008 0.000
#> SRR1375290 3 0.1409 0.74997 0.000 0.012 0.948 0.032 0.008 0.000
#> SRR818999 5 0.3819 0.31913 0.372 0.000 0.004 0.000 0.624 0.000
#> SRR1390242 1 0.1444 0.80396 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1401164 6 0.0363 0.91841 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1454629 5 0.3499 0.60322 0.196 0.000 0.008 0.004 0.780 0.012
#> SRR1332187 3 0.3528 0.49044 0.000 0.000 0.700 0.000 0.004 0.296
#> SRR603365 3 0.3615 0.45440 0.000 0.000 0.700 0.000 0.292 0.008
#> SRR657833 2 0.1700 0.86320 0.000 0.916 0.000 0.080 0.004 0.000
#> SRR1436207 2 0.1349 0.87570 0.000 0.940 0.000 0.056 0.004 0.000
#> SRR1488017 1 0.1075 0.81081 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR612947 2 0.0632 0.88093 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0713 0.81590 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1364761 2 0.1556 0.86279 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.4788 0.52572 0.008 0.000 0.688 0.112 0.192 0.000
#> SRR1441868 1 0.2320 0.78725 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132 0.000
#> SRR1485380 5 0.3782 0.43587 0.000 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR1073705 1 0.3053 0.76060 0.812 0.000 0.000 0.020 0.168 0.000
#> SRR615032 4 0.3789 0.43902 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000 0.000
#> SRR1452356 4 0.1349 0.79094 0.000 0.056 0.000 0.940 0.004 0.000
#> SRR1442983 2 0.0260 0.87864 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.2487 0.84370 0.000 0.876 0.032 0.092 0.000 0.000
#> SRR1332816 1 0.2362 0.78559 0.860 0.000 0.000 0.004 0.136 0.000
#> SRR612299 6 0.0000 0.92272 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.1556 0.80120 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR1418064 2 0.0935 0.86650 0.000 0.964 0.000 0.004 0.032 0.000
#> SRR1309403 5 0.4553 -0.07381 0.476 0.008 0.008 0.008 0.500 0.000
#> SRR1498395 2 0.1624 0.83916 0.000 0.936 0.004 0.040 0.020 0.000
#> SRR1079998 5 0.4446 0.54998 0.040 0.000 0.348 0.000 0.612 0.000
#> SRR1498885 4 0.1556 0.79763 0.000 0.080 0.000 0.920 0.000 0.000
#> SRR1337215 6 0.0146 0.92194 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1414749 3 0.3854 -0.12745 0.000 0.000 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR1365963 1 0.6648 0.00622 0.420 0.000 0.376 0.076 0.128 0.000
#> SRR1368030 4 0.1531 0.79592 0.000 0.068 0.000 0.928 0.004 0.000
#> SRR1419760 2 0.6584 0.42131 0.160 0.604 0.112 0.040 0.084 0.000
#> SRR1381841 1 0.5147 0.41904 0.576 0.000 0.000 0.000 0.108 0.316
#> SRR821388 3 0.3269 0.61727 0.000 0.000 0.792 0.024 0.184 0.000
#> SRR657623 4 0.1444 0.79566 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0984 0.75792 0.000 0.000 0.968 0.012 0.012 0.008
#> SRR819583 5 0.3482 0.59259 0.000 0.000 0.316 0.000 0.684 0.000
#> SRR1096149 1 0.4252 0.68438 0.724 0.000 0.000 0.088 0.188 0.000
#> SRR1342829 3 0.0790 0.75313 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1353028 1 0.0713 0.81490 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR811333 3 0.4800 -0.02813 0.468 0.000 0.492 0.016 0.024 0.000
#> SRR1311666 2 0.0260 0.87431 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1486698 2 0.3550 0.64966 0.000 0.752 0.008 0.004 0.004 0.232
#> SRR1446436 2 0.2103 0.82532 0.000 0.916 0.020 0.040 0.024 0.000
#> SRR815092 1 0.2219 0.77339 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1500149 2 0.1934 0.87095 0.000 0.916 0.000 0.044 0.000 0.040
#> SRR1100564 1 0.1957 0.78767 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1403072 3 0.3861 0.28805 0.000 0.000 0.640 0.000 0.352 0.008
#> SRR811653 4 0.4378 0.21128 0.000 0.000 0.368 0.600 0.032 0.000
#> SRR1311348 2 0.0993 0.87981 0.000 0.964 0.000 0.024 0.012 0.000
#> SRR1489438 4 0.1584 0.79293 0.000 0.064 0.000 0.928 0.008 0.000
#> SRR1435442 6 0.0363 0.91868 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1421444 3 0.0291 0.75709 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1344010 4 0.3851 0.31810 0.000 0.460 0.000 0.540 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.1863 0.79914 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR1444763 6 0.0603 0.91562 0.016 0.000 0.000 0.000 0.004 0.980
#> SRR1415026 4 0.3672 0.54400 0.000 0.368 0.000 0.632 0.000 0.000
#> SRR1416596 4 0.2058 0.77017 0.000 0.036 0.000 0.908 0.000 0.056
#> SRR1485499 4 0.2941 0.73469 0.000 0.220 0.000 0.780 0.000 0.000
#> SRR1316078 4 0.3547 0.60579 0.000 0.332 0.000 0.668 0.000 0.000
#> SRR663465 4 0.1444 0.79625 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000 0.000
#> SRR1310094 4 0.1349 0.79025 0.000 0.056 0.000 0.940 0.004 0.000
#> SRR663537 2 0.1387 0.86955 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.1910 0.79744 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.81699 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.2669 0.77369 0.836 0.000 0.000 0.008 0.156 0.000
#> SRR613318 3 0.1010 0.75363 0.000 0.000 0.960 0.036 0.004 0.000
#> SRR1332694 1 0.1714 0.79814 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1468469 3 0.3168 0.64215 0.000 0.000 0.804 0.024 0.172 0.000
#> SRR818670 2 0.0820 0.87601 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016 0.000
#> SRR1120318 1 0.3189 0.68084 0.760 0.004 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR1311622 3 0.5522 0.35519 0.000 0.000 0.544 0.288 0.168 0.000
#> SRR1500931 5 0.3221 0.62731 0.000 0.000 0.264 0.000 0.736 0.000
#> SRR1387494 3 0.1606 0.74416 0.000 0.008 0.932 0.004 0.056 0.000
#> SRR1379175 4 0.2190 0.73208 0.000 0.008 0.044 0.908 0.040 0.000
#> SRR1401909 5 0.3899 0.14543 0.004 0.000 0.000 0.000 0.592 0.404
#> SRR1440541 4 0.4432 0.52808 0.000 0.364 0.000 0.600 0.036 0.000
#> SRR1068832 5 0.3595 0.61576 0.008 0.000 0.288 0.000 0.704 0.000
#> SRR1376640 2 0.2134 0.86594 0.000 0.904 0.000 0.044 0.000 0.052
#> SRR1085712 2 0.3482 0.48820 0.000 0.684 0.000 0.316 0.000 0.000
#> SRR1082283 6 0.1003 0.90556 0.020 0.000 0.000 0.000 0.016 0.964
#> SRR1084276 1 0.3695 0.44586 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1353262 4 0.5689 0.55790 0.000 0.200 0.000 0.548 0.004 0.248
#> SRR1437035 5 0.4176 0.20505 0.404 0.000 0.000 0.016 0.580 0.000
#> SRR1396877 1 0.3383 0.63683 0.728 0.000 0.004 0.000 0.268 0.000
#> SRR1443026 2 0.3189 0.66682 0.000 0.760 0.000 0.236 0.000 0.004
#> SRR1417936 1 0.0547 0.81602 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1436822 4 0.3111 0.77413 0.000 0.156 0.000 0.820 0.016 0.008
#> SRR1101128 5 0.3782 0.43937 0.000 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR1363886 4 0.2912 0.73828 0.000 0.216 0.000 0.784 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.3774 0.18788 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000 0.000
#> SRR1394366 6 0.0146 0.92233 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1093218 3 0.4481 0.46012 0.000 0.000 0.656 0.284 0.060 0.000
#> SRR1077090 3 0.4534 -0.17897 0.000 0.000 0.492 0.000 0.476 0.032
#> SRR1327430 4 0.2000 0.77349 0.000 0.048 0.004 0.916 0.032 0.000
#> SRR1088958 1 0.2520 0.77770 0.844 0.000 0.000 0.004 0.152 0.000
#> SRR1486931 2 0.1737 0.83737 0.000 0.932 0.008 0.040 0.020 0.000
#> SRR1086820 1 0.2398 0.79439 0.876 0.000 0.000 0.000 0.104 0.020
#> SRR1383000 1 0.1327 0.80935 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1355705 2 0.2135 0.82242 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR614335 4 0.1700 0.79747 0.000 0.080 0.000 0.916 0.004 0.000
#> SRR660534 2 0.0865 0.88065 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.2527 0.77442 0.000 0.832 0.000 0.168 0.000 0.000
#> SRR1334265 4 0.2030 0.78484 0.000 0.064 0.000 0.908 0.028 0.000
#> SRR1456401 4 0.2653 0.78591 0.000 0.144 0.000 0.844 0.012 0.000
#> SRR1086393 1 0.0865 0.81410 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1351521 3 0.0603 0.75608 0.000 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1093100 4 0.2321 0.72306 0.000 0.008 0.040 0.900 0.052 0.000
#> SRR1309382 1 0.2135 0.77883 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1089375 5 0.3352 0.59417 0.208 0.000 0.008 0.008 0.776 0.000
#> SRR1499482 2 0.0520 0.87102 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR614719 2 0.2138 0.86876 0.000 0.908 0.036 0.052 0.004 0.000
#> SRR1081473 3 0.5128 -0.09416 0.000 0.000 0.504 0.084 0.412 0.000
#> SRR1087415 1 0.2956 0.77616 0.848 0.000 0.000 0.000 0.064 0.088
#> SRR1088217 6 0.3276 0.68552 0.004 0.000 0.004 0.000 0.228 0.764
#> SRR808496 4 0.2632 0.77437 0.000 0.164 0.000 0.832 0.004 0.000
#> SRR1336463 4 0.4290 0.53920 0.000 0.364 0.000 0.612 0.004 0.020
#> SRR612359 2 0.2001 0.85215 0.000 0.912 0.068 0.012 0.008 0.000
#> SRR1444412 1 0.3737 0.41273 0.608 0.000 0.000 0.000 0.392 0.000
#> SRR1074116 3 0.3101 0.54561 0.000 0.000 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR821846 3 0.0146 0.75729 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0520 0.87647 0.000 0.984 0.000 0.008 0.008 0.000
#> SRR808914 1 0.2823 0.71870 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204 0.000
#> SRR1349099 6 0.0984 0.91096 0.008 0.000 0.000 0.012 0.012 0.968
#> SRR1337886 2 0.1668 0.87473 0.000 0.928 0.000 0.060 0.004 0.008
#> SRR813632 1 0.1610 0.80241 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084 0.000
#> SRR1101591 3 0.3342 0.56801 0.012 0.000 0.760 0.000 0.228 0.000
#> SRR1089713 5 0.3333 0.61589 0.192 0.000 0.024 0.000 0.784 0.000
#> SRR1453127 3 0.0260 0.75725 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1498354 5 0.3841 0.63909 0.032 0.000 0.244 0.000 0.724 0.000
#> SRR1313831 1 0.2178 0.77607 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132 0.000
#> SRR1315434 3 0.1082 0.75225 0.000 0.000 0.956 0.040 0.004 0.000
#> SRR814747 4 0.1501 0.79716 0.000 0.076 0.000 0.924 0.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.1814 0.79334 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1367807 1 0.2768 0.77196 0.832 0.000 0.000 0.012 0.156 0.000
#> SRR1365791 6 0.0790 0.90315 0.000 0.000 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1081519 5 0.3789 0.58599 0.008 0.000 0.332 0.000 0.660 0.000
#> SRR614707 6 0.0000 0.92272 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094027 1 0.0458 0.81640 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1489092 6 0.3421 0.80929 0.008 0.000 0.016 0.084 0.052 0.840
#> SRR1079502 5 0.4934 0.57825 0.000 0.000 0.256 0.112 0.632 0.000
#> SRR1457814 4 0.3163 0.54876 0.000 0.000 0.232 0.764 0.004 0.000
#> SRR1455127 4 0.2482 0.78263 0.000 0.148 0.000 0.848 0.004 0.000
#> SRR615081 6 0.0806 0.90768 0.000 0.008 0.000 0.020 0.000 0.972
#> SRR1327855 5 0.3797 0.41914 0.000 0.000 0.420 0.000 0.580 0.000
#> SRR1417873 4 0.1845 0.77820 0.000 0.052 0.000 0.920 0.028 0.000
#> SRR1394125 5 0.4088 0.51947 0.000 0.000 0.368 0.016 0.616 0.000
#> SRR1488388 1 0.1444 0.80768 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1401122 4 0.1625 0.78952 0.000 0.060 0.000 0.928 0.012 0.000
#> SRR612383 3 0.4312 0.05989 0.000 0.476 0.508 0.012 0.004 0.000
#> SRR1477711 1 0.2135 0.77892 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1350813 2 0.0725 0.87807 0.000 0.976 0.000 0.012 0.012 0.000
#> SRR612851 2 0.0790 0.88102 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.0547 0.81612 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR812837 2 0.3864 -0.11835 0.000 0.520 0.000 0.480 0.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.2956 0.68221 0.000 0.000 0.840 0.120 0.040 0.000
#> SRR1475885 6 0.0000 0.92272 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376334 1 0.2597 0.74269 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR1399821 1 0.5554 0.52530 0.596 0.000 0.000 0.012 0.164 0.228
#> SRR1347042 3 0.0508 0.75686 0.000 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000
#> SRR612323 3 0.1003 0.75153 0.000 0.028 0.964 0.004 0.004 0.000
#> SRR612604 6 0.0363 0.91841 0.000 0.012 0.000 0.000 0.000 0.988
#> SRR1389546 2 0.0935 0.88083 0.000 0.964 0.000 0.032 0.004 0.000
#> SRR1311877 1 0.0458 0.81718 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1465608 1 0.6347 0.39156 0.512 0.000 0.040 0.256 0.192 0.000
#> SRR1101808 2 0.0777 0.88118 0.000 0.972 0.000 0.024 0.004 0.000
#> SRR1414079 3 0.0146 0.75711 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1331153 2 0.3717 0.80841 0.044 0.832 0.000 0.060 0.052 0.012
#> SRR1078439 3 0.3271 0.58626 0.000 0.000 0.760 0.000 0.008 0.232
#> SRR2165527 4 0.2378 0.78211 0.000 0.152 0.000 0.848 0.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.4399 0.45924 0.616 0.028 0.000 0.004 0.352 0.000
#> SRR1313536 2 0.4238 0.37298 0.000 0.628 0.000 0.344 0.000 0.028
#> SRR1070308 1 0.6534 0.05617 0.396 0.336 0.012 0.008 0.248 0.000
#> SRR1403110 1 0.2854 0.71405 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1400355 2 0.0820 0.86451 0.000 0.972 0.000 0.012 0.016 0.000
#> SRR1401317 5 0.3695 0.50885 0.000 0.000 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1456862 6 0.3878 0.70505 0.116 0.000 0.000 0.000 0.112 0.772
#> SRR1074622 1 0.1327 0.80940 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1465847 3 0.1865 0.72881 0.040 0.000 0.920 0.000 0.040 0.000
#> SRR1443376 2 0.1074 0.88020 0.000 0.960 0.000 0.028 0.012 0.000
#> SRR1471312 3 0.1307 0.75409 0.000 0.000 0.952 0.008 0.032 0.008
#> SRR1075579 1 0.1204 0.80887 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR1090881 3 0.4452 0.43303 0.000 0.288 0.664 0.040 0.008 0.000
#> SRR612251 4 0.2805 0.76322 0.000 0.184 0.000 0.812 0.004 0.000
#> SRR1418581 1 0.1663 0.80412 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR658045 2 0.1007 0.87800 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR613214 3 0.4692 0.39887 0.000 0.300 0.648 0.032 0.016 0.004
#> SRR613078 6 0.2527 0.74541 0.000 0.168 0.000 0.000 0.000 0.832
#> SRR1472998 3 0.3647 0.20812 0.360 0.000 0.640 0.000 0.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.1391 0.87844 0.000 0.944 0.000 0.040 0.016 0.000
#> SRR1101957 1 0.0260 0.81694 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1487993 3 0.2609 0.70437 0.000 0.000 0.868 0.096 0.036 0.000
#> SRR1465983 2 0.0632 0.88061 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.1957 0.78768 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1367566 3 0.2389 0.68913 0.000 0.000 0.864 0.008 0.128 0.000
#> SRR1316151 6 0.0291 0.92128 0.000 0.000 0.000 0.004 0.004 0.992
#> SRR1417547 4 0.1327 0.79395 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000 0.000
#> SRR659389 2 0.1644 0.86642 0.000 0.920 0.000 0.076 0.004 0.000
#> SRR1490270 2 0.1895 0.86012 0.000 0.912 0.000 0.016 0.000 0.072
#> SRR1398207 1 0.4097 0.08501 0.504 0.000 0.008 0.000 0.488 0.000
#> SRR1358755 5 0.4269 0.64643 0.092 0.000 0.184 0.000 0.724 0.000
#> SRR1078903 2 0.0748 0.87444 0.000 0.976 0.004 0.016 0.004 0.000
#> SRR1323252 2 0.1327 0.87116 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0937 0.87931 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.1753 0.80473 0.912 0.000 0.000 0.000 0.084 0.004
#> SRR615982 2 0.0935 0.88089 0.000 0.964 0.000 0.032 0.004 0.000
#> SRR1480431 2 0.3684 0.31966 0.000 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1429825 4 0.2404 0.79261 0.000 0.080 0.000 0.884 0.000 0.036
#> SRR1102393 2 0.0865 0.88019 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1071313 4 0.5531 0.34948 0.228 0.000 0.020 0.612 0.140 0.000
#> SRR808351 1 0.0937 0.81618 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1317513 1 0.1714 0.79668 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092 0.000
#> SRR1480501 5 0.5380 0.38856 0.000 0.000 0.384 0.116 0.500 0.000
#> SRR1081910 1 0.3140 0.76943 0.852 0.000 0.072 0.008 0.064 0.004
#> SRR1086611 6 0.0260 0.92156 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.992
#> SRR1392571 2 0.0951 0.87739 0.000 0.968 0.008 0.020 0.004 0.000
#> SRR1311441 1 0.2320 0.78724 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132 0.000
#> SRR808152 1 0.0458 0.81646 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR657313 3 0.2775 0.70307 0.000 0.000 0.856 0.040 0.104 0.000
#> SRR1433131 6 0.4229 0.47651 0.000 0.292 0.000 0.040 0.000 0.668
#> SRR1321011 2 0.2883 0.70829 0.000 0.788 0.000 0.212 0.000 0.000
#> SRR1500598 4 0.2823 0.74705 0.000 0.204 0.000 0.796 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0508 0.87684 0.000 0.984 0.000 0.012 0.004 0.000
#> SRR1389108 1 0.3003 0.75999 0.812 0.000 0.000 0.016 0.172 0.000
#> SRR1376228 3 0.3330 0.45232 0.000 0.000 0.716 0.000 0.284 0.000
#> SRR1399757 1 0.0937 0.81365 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000
#> SRR1358060 3 0.2100 0.70209 0.000 0.000 0.884 0.004 0.112 0.000
#> SRR1464517 3 0.5336 0.41209 0.000 0.000 0.588 0.244 0.168 0.000
#> SRR613557 3 0.3892 0.51005 0.000 0.236 0.732 0.024 0.008 0.000
#> SRR809831 1 0.2854 0.71281 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1429387 3 0.0146 0.75711 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR816565 1 0.0363 0.81726 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1071644 1 0.0458 0.81646 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1406936 5 0.6023 0.29180 0.000 0.000 0.244 0.364 0.392 0.000
#> SRR1072031 2 0.1327 0.87207 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.3602 0.76715 0.000 0.792 0.136 0.072 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "hclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:hclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'hclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.451 0.763 0.862 0.4444 0.501 0.501
#> 3 3 0.669 0.820 0.910 0.4315 0.818 0.650
#> 4 4 0.650 0.628 0.807 0.0978 0.996 0.989
#> 5 5 0.617 0.539 0.739 0.0593 0.943 0.839
#> 6 6 0.628 0.488 0.710 0.0449 0.894 0.664
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.9491 0.678 0.632 0.368
#> SRR1404105 1 0.9044 0.727 0.680 0.320
#> SRR2164936 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.2423 0.901 0.040 0.960
#> SRR1069376 1 0.9358 0.708 0.648 0.352
#> SRR811964 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0938 0.925 0.012 0.988
#> SRR1345715 1 0.9970 0.518 0.532 0.468
#> SRR1328073 2 0.9996 -0.405 0.488 0.512
#> SRR1394209 2 0.6148 0.740 0.152 0.848
#> SRR1474018 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.2948 0.753 0.948 0.052
#> SRR1500555 2 0.0938 0.925 0.012 0.988
#> SRR1354363 1 0.9000 0.729 0.684 0.316
#> SRR1391619 1 0.0376 0.741 0.996 0.004
#> SRR1307997 2 0.0376 0.930 0.004 0.996
#> SRR663124 2 0.0672 0.927 0.008 0.992
#> SRR1334670 1 0.9427 0.701 0.640 0.360
#> SRR612515 2 0.0938 0.925 0.012 0.988
#> SRR1092727 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.1184 0.922 0.016 0.984
#> SRR1468553 1 0.0672 0.743 0.992 0.008
#> SRR1403980 1 0.1414 0.747 0.980 0.020
#> SRR1420169 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1442800 2 0.2043 0.908 0.032 0.968
#> SRR1359214 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.2948 0.753 0.948 0.052
#> SRR1500030 1 0.0376 0.741 0.996 0.004
#> SRR1093053 1 0.7056 0.756 0.808 0.192
#> SRR1399843 1 0.8081 0.748 0.752 0.248
#> SRR1380231 1 0.4431 0.758 0.908 0.092
#> SRR809470 1 0.0938 0.744 0.988 0.012
#> SRR614239 2 0.0938 0.925 0.012 0.988
#> SRR613939 2 0.0938 0.925 0.012 0.988
#> SRR612971 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1471672 1 0.9977 0.510 0.528 0.472
#> SRR613006 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.9552 0.684 0.624 0.376
#> SRR813608 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1096736 1 0.9881 0.587 0.564 0.436
#> SRR1478700 1 0.6048 0.760 0.852 0.148
#> SRR1081543 1 0.9608 0.671 0.616 0.384
#> SRR1384754 1 0.9686 0.655 0.604 0.396
#> SRR612287 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1380317 2 0.6148 0.740 0.152 0.848
#> SRR1315247 2 0.5946 0.755 0.144 0.856
#> SRR1105344 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0938 0.925 0.012 0.988
#> SRR1480240 1 0.9087 0.725 0.676 0.324
#> SRR1084816 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.6148 0.740 0.152 0.848
#> SRR1419476 1 0.0376 0.741 0.996 0.004
#> SRR1456075 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.9661 0.662 0.608 0.392
#> SRR1334419 1 0.9983 0.501 0.524 0.476
#> SRR1417154 1 0.2236 0.751 0.964 0.036
#> SRR1095985 1 0.8081 0.746 0.752 0.248
#> SRR1325771 2 0.9988 -0.380 0.480 0.520
#> SRR1360420 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0376 0.930 0.004 0.996
#> SRR1332993 1 0.9358 0.708 0.648 0.352
#> SRR1311833 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.6801 0.759 0.820 0.180
#> SRR1076916 1 0.0672 0.743 0.992 0.008
#> SRR1356266 1 0.9460 0.698 0.636 0.364
#> SRR1341983 2 0.0672 0.927 0.008 0.992
#> SRR1456114 1 0.9323 0.711 0.652 0.348
#> SRR1072948 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.9608 0.674 0.616 0.384
#> SRR613843 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.9044 0.727 0.680 0.320
#> SRR1404555 1 0.7299 0.755 0.796 0.204
#> SRR659839 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1362848 1 0.9881 0.587 0.564 0.436
#> SRR1407492 2 0.0938 0.925 0.012 0.988
#> SRR1455082 2 0.0938 0.925 0.012 0.988
#> SRR658362 2 0.0376 0.930 0.004 0.996
#> SRR810921 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.9427 0.701 0.640 0.360
#> SRR1454868 1 0.9129 0.715 0.672 0.328
#> SRR1474816 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.9522 0.688 0.628 0.372
#> SRR1088437 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1466400 2 0.3274 0.877 0.060 0.940
#> SRR658921 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1101373 1 0.9998 0.460 0.508 0.492
#> SRR1090145 1 0.8861 0.733 0.696 0.304
#> SRR1379324 1 0.9170 0.720 0.668 0.332
#> SRR1345307 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.1843 0.912 0.028 0.972
#> SRR663185 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.9491 0.693 0.632 0.368
#> SRR1318920 1 0.9635 0.669 0.612 0.388
#> SRR656758 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.9608 0.674 0.616 0.384
#> SRR660450 2 0.0376 0.930 0.004 0.996
#> SRR1472687 2 0.0938 0.925 0.012 0.988
#> SRR1334291 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.7745 0.753 0.772 0.228
#> SRR614695 2 0.3431 0.872 0.064 0.936
#> SRR1092372 1 0.9552 0.685 0.624 0.376
#> SRR1474577 1 0.9977 0.510 0.528 0.472
#> SRR1406582 1 0.9988 0.491 0.520 0.480
#> SRR612779 2 0.2423 0.900 0.040 0.960
#> SRR1089006 1 0.9977 0.510 0.528 0.472
#> SRR1354071 1 0.5178 0.759 0.884 0.116
#> SRR1105463 1 0.2236 0.750 0.964 0.036
#> SRR811005 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.9427 0.701 0.640 0.360
#> SRR1325871 1 0.0376 0.741 0.996 0.004
#> SRR1355415 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.9580 0.679 0.620 0.380
#> SRR1320712 1 0.9996 0.470 0.512 0.488
#> SRR1470075 1 0.9427 0.701 0.640 0.360
#> SRR1091254 1 0.9580 0.679 0.620 0.380
#> SRR1101397 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.9460 0.697 0.636 0.364
#> SRR1092112 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.9996 -0.405 0.488 0.512
#> SRR1432106 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.8955 0.730 0.688 0.312
#> SRR1318582 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.2603 0.752 0.956 0.044
#> SRR1078586 1 0.9427 0.701 0.640 0.360
#> SRR1400333 2 0.8499 0.444 0.276 0.724
#> SRR1078834 2 0.4690 0.824 0.100 0.900
#> SRR1417611 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.9460 0.697 0.636 0.364
#> SRR1465440 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.7602 0.589 0.220 0.780
#> SRR1324269 1 0.6712 0.759 0.824 0.176
#> SRR1401491 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.9044 0.727 0.680 0.320
#> SRR1324349 2 0.1184 0.922 0.016 0.984
#> SRR1345523 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.8909 0.732 0.692 0.308
#> SRR661505 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1419062 1 0.4298 0.758 0.912 0.088
#> SRR1480131 1 0.9323 0.710 0.652 0.348
#> SRR1421284 2 0.6343 0.725 0.160 0.840
#> SRR1329624 1 0.9427 0.701 0.640 0.360
#> SRR1315739 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.2236 0.904 0.036 0.964
#> SRR1083286 1 0.8955 0.730 0.688 0.312
#> SRR1091890 1 0.8861 0.733 0.696 0.304
#> SRR1347436 2 0.0376 0.930 0.004 0.996
#> SRR1327473 2 0.9988 -0.379 0.480 0.520
#> SRR1338195 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.9977 0.510 0.528 0.472
#> SRR658271 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.9000 0.729 0.684 0.316
#> SRR1454842 1 0.0376 0.741 0.996 0.004
#> SRR1322643 1 0.9427 0.701 0.640 0.360
#> SRR614887 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1354620 1 0.0938 0.744 0.988 0.012
#> SRR615056 2 0.0376 0.930 0.004 0.996
#> SRR1105320 2 0.9988 -0.379 0.480 0.520
#> SRR1391529 1 0.9460 0.697 0.636 0.364
#> SRR663052 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.9460 0.697 0.636 0.364
#> SRR812366 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.0672 0.743 0.992 0.008
#> SRR615383 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1389157 2 0.9944 -0.289 0.456 0.544
#> SRR613568 2 0.0376 0.930 0.004 0.996
#> SRR614095 2 0.2603 0.896 0.044 0.956
#> SRR1103092 1 0.8909 0.732 0.692 0.308
#> SRR1337155 1 0.7299 0.756 0.796 0.204
#> SRR1475345 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1446180 2 0.6148 0.741 0.152 0.848
#> SRR1406372 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.0376 0.741 0.996 0.004
#> SRR1353136 1 0.9129 0.715 0.672 0.328
#> SRR1093906 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.9427 0.701 0.640 0.360
#> SRR1363926 2 0.0672 0.927 0.008 0.992
#> SRR1399861 1 0.9933 0.555 0.548 0.452
#> SRR1338789 1 0.9393 0.704 0.644 0.356
#> SRR1421420 1 0.1414 0.747 0.980 0.020
#> SRR1420832 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.9635 0.668 0.612 0.388
#> SRR1352870 2 0.6623 0.706 0.172 0.828
#> SRR1315041 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.0938 0.744 0.988 0.012
#> SRR1102443 1 0.9963 0.531 0.536 0.464
#> SRR655672 2 0.0938 0.925 0.012 0.988
#> SRR1420006 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.6048 0.746 0.148 0.852
#> SRR1469432 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.6247 0.760 0.844 0.156
#> SRR1339153 1 0.2043 0.749 0.968 0.032
#> SRR1472749 1 0.0376 0.741 0.996 0.004
#> SRR1414379 2 0.6148 0.740 0.152 0.848
#> SRR1431326 1 0.9993 0.481 0.516 0.484
#> SRR1487278 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.8861 0.733 0.696 0.304
#> SRR810273 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.9460 0.697 0.636 0.364
#> SRR1478341 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.9552 0.685 0.624 0.376
#> SRR1479699 1 0.8813 0.735 0.700 0.300
#> SRR1403589 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.3274 0.755 0.940 0.060
#> SRR1338988 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1378992 1 0.9983 0.501 0.524 0.476
#> SRR659427 1 0.7056 0.756 0.808 0.192
#> SRR1096638 1 0.9323 0.711 0.652 0.348
#> SRR1466619 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.2423 0.901 0.040 0.960
#> SRR1439994 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.9358 0.707 0.648 0.352
#> SRR1332928 1 0.8955 0.730 0.688 0.312
#> SRR658621 2 0.0376 0.930 0.004 0.996
#> SRR1095840 1 0.9087 0.725 0.676 0.324
#> SRR1458243 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1374270 1 0.9988 0.490 0.520 0.480
#> SRR1470947 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.6048 0.746 0.148 0.852
#> SRR1456274 1 0.9580 0.680 0.620 0.380
#> SRR817744 1 0.9491 0.693 0.632 0.368
#> SRR1478744 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.5059 0.759 0.888 0.112
#> SRR1374198 1 0.9491 0.693 0.632 0.368
#> SRR1445856 1 0.0672 0.743 0.992 0.008
#> SRR820049 1 0.0376 0.741 0.996 0.004
#> SRR1375290 1 0.4431 0.758 0.908 0.092
#> SRR818999 1 0.2423 0.751 0.960 0.040
#> SRR1390242 1 0.9522 0.689 0.628 0.372
#> SRR1401164 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.9323 0.710 0.652 0.348
#> SRR1332187 1 0.1414 0.747 0.980 0.020
#> SRR603365 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.0376 0.930 0.004 0.996
#> SRR1436207 2 0.0672 0.927 0.008 0.992
#> SRR1488017 1 0.9552 0.684 0.624 0.376
#> SRR612947 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.5842 0.760 0.860 0.140
#> SRR1364761 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.0672 0.743 0.992 0.008
#> SRR1441868 1 0.9993 0.481 0.516 0.484
#> SRR1485380 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.9998 0.460 0.508 0.492
#> SRR615032 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.2948 0.888 0.052 0.948
#> SRR1332816 1 0.9977 0.510 0.528 0.472
#> SRR612299 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.9491 0.693 0.632 0.368
#> SRR1418064 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1309403 2 0.9988 -0.379 0.480 0.520
#> SRR1498395 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.5059 0.808 0.112 0.888
#> SRR1414749 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.0672 0.743 0.992 0.008
#> SRR1368030 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1419760 2 0.9896 -0.226 0.440 0.560
#> SRR1381841 1 0.9129 0.722 0.672 0.328
#> SRR821388 1 0.9970 0.523 0.532 0.468
#> SRR657623 2 0.0672 0.927 0.008 0.992
#> SRR1094241 1 0.0376 0.741 0.996 0.004
#> SRR819583 1 0.1184 0.745 0.984 0.016
#> SRR1096149 1 0.6048 0.760 0.852 0.148
#> SRR1342829 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.9460 0.697 0.636 0.364
#> SRR811333 1 0.8016 0.750 0.756 0.244
#> SRR1311666 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0376 0.930 0.004 0.996
#> SRR1446436 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.9248 0.715 0.660 0.340
#> SRR1500149 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.9087 0.725 0.676 0.324
#> SRR1403072 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR811653 1 0.9933 0.555 0.548 0.452
#> SRR1311348 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1319520 1 0.9993 0.481 0.516 0.484
#> SRR1444763 1 0.9635 0.669 0.612 0.388
#> SRR1415026 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0938 0.925 0.012 0.988
#> SRR663537 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.9608 0.674 0.616 0.384
#> SRR1453950 1 0.9170 0.721 0.668 0.332
#> SRR1087875 1 0.9988 0.491 0.520 0.480
#> SRR613318 2 0.9996 -0.402 0.488 0.512
#> SRR1332694 1 0.9427 0.701 0.640 0.360
#> SRR1468469 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.9087 0.725 0.676 0.324
#> SRR1311622 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1500931 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.0672 0.743 0.992 0.008
#> SRR1379175 2 0.9248 0.224 0.340 0.660
#> SRR1401909 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.3431 0.873 0.064 0.936
#> SRR1085712 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.9209 0.718 0.664 0.336
#> SRR1084276 1 0.5059 0.759 0.888 0.112
#> SRR1353262 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.9460 0.698 0.636 0.364
#> SRR1396877 1 0.7453 0.755 0.788 0.212
#> SRR1443026 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.9552 0.684 0.624 0.376
#> SRR1436822 2 0.3879 0.857 0.076 0.924
#> SRR1101128 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.3274 0.877 0.060 0.940
#> SRR1093218 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1077090 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.5408 0.787 0.124 0.876
#> SRR1088958 1 0.9988 0.491 0.520 0.480
#> SRR1486931 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.9170 0.720 0.668 0.332
#> SRR1383000 1 0.8144 0.748 0.748 0.252
#> SRR1355705 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.1843 0.911 0.028 0.972
#> SRR1086393 1 0.9608 0.674 0.616 0.384
#> SRR1351521 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1093100 1 0.9944 0.548 0.544 0.456
#> SRR1309382 1 0.9170 0.720 0.668 0.332
#> SRR1089375 1 0.4431 0.758 0.908 0.092
#> SRR1499482 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.2043 0.908 0.032 0.968
#> SRR1081473 1 0.3114 0.754 0.944 0.056
#> SRR1087415 1 0.9170 0.720 0.668 0.332
#> SRR1088217 1 0.0938 0.744 0.988 0.012
#> SRR808496 2 0.2236 0.904 0.036 0.964
#> SRR1336463 2 0.1843 0.911 0.028 0.972
#> SRR612359 2 0.2236 0.905 0.036 0.964
#> SRR1444412 1 0.5059 0.759 0.888 0.112
#> SRR1074116 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.9944 0.548 0.544 0.456
#> SRR1349099 1 0.9635 0.669 0.612 0.388
#> SRR1337886 2 0.0672 0.927 0.008 0.992
#> SRR813632 1 0.3431 0.755 0.936 0.064
#> SRR1101591 1 0.1414 0.747 0.980 0.020
#> SRR1089713 1 0.7376 0.756 0.792 0.208
#> SRR1453127 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.2043 0.749 0.968 0.032
#> SRR1313831 1 0.9427 0.701 0.640 0.360
#> SRR1315434 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.9944 0.548 0.544 0.456
#> SRR1367807 1 0.9977 0.510 0.528 0.472
#> SRR1365791 1 0.6148 0.759 0.848 0.152
#> SRR1081519 1 0.0938 0.744 0.988 0.012
#> SRR614707 2 0.5178 0.801 0.116 0.884
#> SRR1094027 1 0.9427 0.701 0.640 0.360
#> SRR1489092 1 0.8016 0.747 0.756 0.244
#> SRR1079502 1 0.4431 0.758 0.908 0.092
#> SRR1457814 1 0.9933 0.555 0.548 0.452
#> SRR1455127 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.2948 0.754 0.948 0.052
#> SRR1488388 1 0.9358 0.708 0.648 0.352
#> SRR1401122 2 0.5294 0.793 0.120 0.880
#> SRR612383 2 0.0938 0.925 0.012 0.988
#> SRR1477711 1 0.9460 0.697 0.636 0.364
#> SRR1350813 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.2778 0.892 0.048 0.952
#> SRR1086349 1 0.9635 0.668 0.612 0.388
#> SRR812837 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.9491 0.678 0.632 0.368
#> SRR1475885 1 0.9661 0.664 0.608 0.392
#> SRR1376334 1 0.9427 0.701 0.640 0.360
#> SRR1399821 1 0.9635 0.669 0.612 0.388
#> SRR1347042 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.7815 0.559 0.232 0.768
#> SRR612604 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.9635 0.668 0.612 0.388
#> SRR1465608 1 0.7883 0.751 0.764 0.236
#> SRR1101808 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.0672 0.743 0.992 0.008
#> SRR1331153 2 0.0376 0.930 0.004 0.996
#> SRR1078439 1 0.7376 0.754 0.792 0.208
#> SRR2165527 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1351147 2 1.0000 -0.440 0.500 0.500
#> SRR1313536 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.9988 -0.379 0.480 0.520
#> SRR1403110 1 0.9460 0.697 0.636 0.364
#> SRR1400355 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.9460 0.697 0.636 0.364
#> SRR1074622 1 0.6973 0.758 0.812 0.188
#> SRR1465847 1 0.2423 0.751 0.960 0.040
#> SRR1443376 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.3114 0.754 0.944 0.056
#> SRR1075579 1 0.9522 0.689 0.628 0.372
#> SRR1090881 2 0.9998 -0.402 0.492 0.508
#> SRR612251 2 0.4431 0.836 0.092 0.908
#> SRR1418581 1 0.9988 0.491 0.520 0.480
#> SRR658045 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.2236 0.904 0.036 0.964
#> SRR613078 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.2603 0.752 0.956 0.044
#> SRR1433452 2 0.5408 0.787 0.124 0.876
#> SRR1101957 1 0.9635 0.668 0.612 0.388
#> SRR1487993 1 0.0376 0.741 0.996 0.004
#> SRR1465983 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.9427 0.701 0.640 0.360
#> SRR1367566 1 0.0672 0.743 0.992 0.008
#> SRR1316151 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.0938 0.925 0.012 0.988
#> SRR659389 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0376 0.930 0.004 0.996
#> SRR1398207 1 0.4939 0.759 0.892 0.108
#> SRR1358755 1 0.1414 0.746 0.980 0.020
#> SRR1078903 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.9170 0.720 0.668 0.332
#> SRR615982 2 0.2603 0.896 0.044 0.956
#> SRR1480431 2 0.2236 0.904 0.036 0.964
#> SRR1429825 2 0.7139 0.650 0.196 0.804
#> SRR1102393 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.9323 0.711 0.652 0.348
#> SRR808351 1 0.6623 0.759 0.828 0.172
#> SRR1317513 1 0.9427 0.701 0.640 0.360
#> SRR1480501 1 0.2236 0.750 0.964 0.036
#> SRR1081910 1 0.8016 0.750 0.756 0.244
#> SRR1086611 2 0.4690 0.824 0.100 0.900
#> SRR1392571 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.9993 0.481 0.516 0.484
#> SRR808152 1 0.9522 0.688 0.628 0.372
#> SRR657313 1 0.0376 0.741 0.996 0.004
#> SRR1433131 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.9988 0.491 0.520 0.480
#> SRR1376228 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1399757 2 0.9988 -0.380 0.480 0.520
#> SRR1358060 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR1464517 1 0.3114 0.754 0.944 0.056
#> SRR613557 2 0.2423 0.901 0.040 0.960
#> SRR809831 1 0.6623 0.759 0.828 0.172
#> SRR1429387 1 0.0000 0.739 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.9635 0.668 0.612 0.388
#> SRR1071644 1 0.9580 0.679 0.620 0.380
#> SRR1406936 1 0.4431 0.758 0.908 0.092
#> SRR1072031 2 0.0000 0.932 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0938 0.925 0.012 0.988
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 1 0.4742 0.8101 0.848 0.048 0.104
#> SRR1404105 1 0.2625 0.8366 0.916 0.000 0.084
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0237 0.8581 0.004 0.000 0.996
#> SRR614491 2 0.3816 0.8417 0.148 0.852 0.000
#> SRR1069376 1 0.1529 0.8576 0.960 0.000 0.040
#> SRR811964 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.1289 0.9319 0.032 0.968 0.000
#> SRR1345715 1 0.3030 0.8276 0.904 0.092 0.004
#> SRR1328073 1 0.3816 0.7771 0.852 0.148 0.000
#> SRR1394209 2 0.5706 0.5852 0.320 0.680 0.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099809 3 0.6026 0.4882 0.376 0.000 0.624
#> SRR1500555 2 0.2959 0.8863 0.100 0.900 0.000
#> SRR1354363 1 0.3551 0.8008 0.868 0.000 0.132
#> SRR1391619 3 0.1860 0.8546 0.052 0.000 0.948
#> SRR1307997 2 0.0592 0.9411 0.012 0.988 0.000
#> SRR663124 2 0.2261 0.9102 0.068 0.932 0.000
#> SRR1334670 1 0.0892 0.8595 0.980 0.000 0.020
#> SRR612515 2 0.2959 0.8863 0.100 0.900 0.000
#> SRR1092727 2 0.1031 0.9369 0.024 0.976 0.000
#> SRR1364013 2 0.1753 0.9236 0.048 0.952 0.000
#> SRR1468553 3 0.2356 0.8489 0.072 0.000 0.928
#> SRR1403980 3 0.4062 0.7941 0.164 0.000 0.836
#> SRR1420169 3 0.1031 0.8591 0.024 0.000 0.976
#> SRR1442800 2 0.3941 0.8322 0.156 0.844 0.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499849 3 0.6026 0.4882 0.376 0.000 0.624
#> SRR1500030 3 0.3116 0.8326 0.108 0.000 0.892
#> SRR1093053 1 0.6490 0.4009 0.628 0.012 0.360
#> SRR1399843 1 0.5365 0.6412 0.744 0.004 0.252
#> SRR1380231 3 0.6291 0.2403 0.468 0.000 0.532
#> SRR809470 3 0.5760 0.5812 0.328 0.000 0.672
#> SRR614239 2 0.2959 0.8863 0.100 0.900 0.000
#> SRR613939 2 0.0892 0.9384 0.020 0.980 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.2796 0.8272 0.908 0.092 0.000
#> SRR613006 2 0.0892 0.9382 0.020 0.980 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0237 0.9434 0.004 0.996 0.000
#> SRR1362906 3 0.1964 0.8541 0.056 0.000 0.944
#> SRR1079023 1 0.1015 0.8621 0.980 0.008 0.012
#> SRR813608 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.2301 0.8454 0.936 0.060 0.004
#> SRR1478700 1 0.6295 0.0307 0.528 0.000 0.472
#> SRR1081543 1 0.3263 0.8545 0.912 0.040 0.048
#> SRR1384754 1 0.2806 0.8552 0.928 0.032 0.040
#> SRR612287 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.5706 0.5852 0.320 0.680 0.000
#> SRR1315247 2 0.5760 0.5676 0.328 0.672 0.000
#> SRR1105344 2 0.0237 0.9434 0.004 0.996 0.000
#> SRR658549 2 0.2448 0.9046 0.076 0.924 0.000
#> SRR1480240 1 0.1964 0.8499 0.944 0.000 0.056
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.5591 0.6156 0.304 0.696 0.000
#> SRR1419476 3 0.3686 0.8063 0.140 0.000 0.860
#> SRR1456075 3 0.2261 0.8512 0.068 0.000 0.932
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.1905 0.8613 0.956 0.028 0.016
#> SRR1334419 1 0.2878 0.8243 0.904 0.096 0.000
#> SRR1417154 1 0.6307 -0.0486 0.512 0.000 0.488
#> SRR1095985 1 0.5506 0.6825 0.764 0.016 0.220
#> SRR1325771 1 0.4555 0.7189 0.800 0.200 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.8559 0.000 0.000 1.000
#> SRR660272 2 0.0892 0.9387 0.020 0.980 0.000
#> SRR1332993 1 0.1529 0.8576 0.960 0.000 0.040
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 1 0.5988 0.3961 0.632 0.000 0.368
#> SRR1076916 3 0.5431 0.6481 0.284 0.000 0.716
#> SRR1356266 1 0.1129 0.8628 0.976 0.004 0.020
#> SRR1341983 2 0.1031 0.9360 0.024 0.976 0.000
#> SRR1456114 1 0.2599 0.8581 0.932 0.016 0.052
#> SRR1072948 3 0.0000 0.8559 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472370 3 0.0237 0.8581 0.004 0.000 0.996
#> SRR1480176 1 0.1337 0.8623 0.972 0.016 0.012
#> SRR613843 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.2625 0.8366 0.916 0.000 0.084
#> SRR1404555 1 0.5591 0.5390 0.696 0.000 0.304
#> SRR659839 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362848 1 0.2301 0.8454 0.936 0.060 0.004
#> SRR1407492 2 0.2878 0.8907 0.096 0.904 0.000
#> SRR1455082 2 0.2261 0.9101 0.068 0.932 0.000
#> SRR658362 2 0.0237 0.9434 0.004 0.996 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.8559 0.000 0.000 1.000
#> SRR818232 1 0.0892 0.8595 0.980 0.000 0.020
#> SRR1454868 1 0.5235 0.7630 0.812 0.036 0.152
#> SRR1474816 2 0.0237 0.9434 0.004 0.996 0.000
#> SRR1342002 1 0.0983 0.8621 0.980 0.004 0.016
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466400 2 0.4452 0.7877 0.192 0.808 0.000
#> SRR658921 2 0.0592 0.9412 0.012 0.988 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.3192 0.8124 0.888 0.112 0.000
#> SRR1090145 1 0.2448 0.8396 0.924 0.000 0.076
#> SRR1379324 1 0.1860 0.8540 0.948 0.000 0.052
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0237 0.8576 0.004 0.000 0.996
#> SRR1086280 3 0.0747 0.8586 0.016 0.000 0.984
#> SRR1454891 2 0.3879 0.8387 0.152 0.848 0.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0592 0.8602 0.988 0.000 0.012
#> SRR1318920 1 0.0424 0.8598 0.992 0.008 0.000
#> SRR656758 2 0.0424 0.9423 0.008 0.992 0.000
#> SRR1474351 1 0.1337 0.8623 0.972 0.016 0.012
#> SRR660450 2 0.0892 0.9387 0.020 0.980 0.000
#> SRR1472687 2 0.1163 0.9339 0.028 0.972 0.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0237 0.9434 0.004 0.996 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443161 1 0.5560 0.5509 0.700 0.000 0.300
#> SRR614695 2 0.4504 0.7823 0.196 0.804 0.000
#> SRR1092372 1 0.1015 0.8632 0.980 0.008 0.012
#> SRR1474577 1 0.2796 0.8272 0.908 0.092 0.000
#> SRR1406582 1 0.2959 0.8214 0.900 0.100 0.000
#> SRR612779 2 0.2537 0.9008 0.080 0.920 0.000
#> SRR1089006 1 0.2796 0.8272 0.908 0.092 0.000
#> SRR1354071 1 0.6302 -0.0596 0.520 0.000 0.480
#> SRR1105463 3 0.5621 0.6158 0.308 0.000 0.692
#> SRR811005 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0892 0.8595 0.980 0.000 0.020
#> SRR1325871 3 0.1860 0.8546 0.052 0.000 0.948
#> SRR1355415 3 0.0424 0.8585 0.008 0.000 0.992
#> SRR1090861 1 0.0848 0.8611 0.984 0.008 0.008
#> SRR1320712 1 0.3192 0.8124 0.888 0.112 0.000
#> SRR1470075 1 0.0892 0.8603 0.980 0.000 0.020
#> SRR1091254 1 0.0475 0.8593 0.992 0.004 0.004
#> SRR1101397 3 0.0592 0.8589 0.012 0.000 0.988
#> SRR1321165 1 0.0747 0.8596 0.984 0.000 0.016
#> SRR1092112 3 0.0237 0.8576 0.004 0.000 0.996
#> SRR1417588 3 0.0237 0.8580 0.004 0.000 0.996
#> SRR1074790 1 0.3816 0.7771 0.852 0.148 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.3482 0.8040 0.872 0.000 0.128
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0424 0.9424 0.008 0.992 0.000
#> SRR1072749 3 0.4062 0.7936 0.164 0.000 0.836
#> SRR1078586 1 0.1267 0.8616 0.972 0.004 0.024
#> SRR1400333 1 0.6476 0.1565 0.548 0.448 0.004
#> SRR1078834 2 0.5216 0.6888 0.260 0.740 0.000
#> SRR1417611 2 0.0237 0.9434 0.004 0.996 0.000
#> SRR1396840 1 0.0747 0.8596 0.984 0.000 0.016
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0237 0.9434 0.004 0.996 0.000
#> SRR614984 2 0.6045 0.4355 0.380 0.620 0.000
#> SRR1324269 1 0.5785 0.4758 0.668 0.000 0.332
#> SRR1401491 2 0.0237 0.9434 0.004 0.996 0.000
#> SRR1319443 1 0.2066 0.8475 0.940 0.000 0.060
#> SRR1324349 2 0.1411 0.9298 0.036 0.964 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.3686 0.7930 0.860 0.000 0.140
#> SRR661505 3 0.1289 0.8585 0.032 0.000 0.968
#> SRR1419062 3 0.6215 0.3629 0.428 0.000 0.572
#> SRR1480131 1 0.1289 0.8586 0.968 0.000 0.032
#> SRR1421284 2 0.5760 0.5680 0.328 0.672 0.000
#> SRR1329624 1 0.1267 0.8622 0.972 0.004 0.024
#> SRR1315739 3 0.0237 0.8580 0.004 0.000 0.996
#> SRR1099189 2 0.3116 0.8802 0.108 0.892 0.000
#> SRR1083286 1 0.2356 0.8421 0.928 0.000 0.072
#> SRR1091890 1 0.3644 0.8041 0.872 0.004 0.124
#> SRR1347436 2 0.1163 0.9354 0.028 0.972 0.000
#> SRR1327473 1 0.4291 0.7425 0.820 0.180 0.000
#> SRR1338195 3 0.0237 0.8580 0.004 0.000 0.996
#> SRR809698 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.2796 0.8276 0.908 0.092 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.2878 0.8283 0.904 0.000 0.096
#> SRR1454842 3 0.1860 0.8546 0.052 0.000 0.948
#> SRR1322643 1 0.0892 0.8603 0.980 0.000 0.020
#> SRR614887 3 0.0424 0.8590 0.008 0.000 0.992
#> SRR1354620 3 0.1643 0.8564 0.044 0.000 0.956
#> SRR615056 2 0.0592 0.9411 0.012 0.988 0.000
#> SRR1105320 1 0.4291 0.7425 0.820 0.180 0.000
#> SRR1391529 1 0.0747 0.8596 0.984 0.000 0.016
#> SRR663052 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478834 1 0.0747 0.8596 0.984 0.000 0.016
#> SRR812366 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.2959 0.8381 0.100 0.000 0.900
#> SRR615383 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 1 0.5681 0.6618 0.748 0.236 0.016
#> SRR613568 2 0.0892 0.9387 0.020 0.980 0.000
#> SRR614095 2 0.2537 0.8998 0.080 0.920 0.000
#> SRR1103092 1 0.3116 0.8203 0.892 0.000 0.108
#> SRR1337155 1 0.6180 0.4837 0.660 0.008 0.332
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 2 0.5835 0.5405 0.340 0.660 0.000
#> SRR1406372 2 0.0237 0.9434 0.004 0.996 0.000
#> SRR1339880 3 0.3116 0.8326 0.108 0.000 0.892
#> SRR1353136 1 0.5235 0.7630 0.812 0.036 0.152
#> SRR1093906 3 0.0237 0.8580 0.004 0.000 0.996
#> SRR614035 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.0892 0.8603 0.980 0.000 0.020
#> SRR1363926 2 0.0892 0.9390 0.020 0.980 0.000
#> SRR1399861 1 0.2448 0.8377 0.924 0.076 0.000
#> SRR1338789 1 0.1031 0.8601 0.976 0.000 0.024
#> SRR1421420 3 0.2448 0.8474 0.076 0.000 0.924
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.1170 0.8612 0.976 0.016 0.008
#> SRR1352870 2 0.6008 0.4782 0.372 0.628 0.000
#> SRR1315041 2 0.0237 0.9434 0.004 0.996 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443268 3 0.0592 0.8589 0.012 0.000 0.988
#> SRR1416617 3 0.3686 0.8120 0.140 0.000 0.860
#> SRR1102443 1 0.3030 0.8303 0.904 0.092 0.004
#> SRR655672 2 0.2878 0.8907 0.096 0.904 0.000
#> SRR1420006 3 0.0000 0.8559 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR613819 2 0.5650 0.5992 0.312 0.688 0.000
#> SRR1469432 2 0.0237 0.9434 0.004 0.996 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0592 0.9416 0.012 0.988 0.000
#> SRR1470727 1 0.6045 0.3446 0.620 0.000 0.380
#> SRR1339153 3 0.2711 0.8425 0.088 0.000 0.912
#> SRR1472749 3 0.3116 0.8326 0.108 0.000 0.892
#> SRR1414379 2 0.5650 0.6005 0.312 0.688 0.000
#> SRR1431326 1 0.3038 0.8185 0.896 0.104 0.000
#> SRR1487278 2 0.2066 0.9165 0.060 0.940 0.000
#> SRR1098312 1 0.3644 0.8041 0.872 0.004 0.124
#> SRR810273 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0424 0.9423 0.008 0.992 0.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR811471 1 0.1163 0.8608 0.972 0.000 0.028
#> SRR1478341 3 0.0237 0.8580 0.004 0.000 0.996
#> SRR1088606 1 0.1015 0.8632 0.980 0.008 0.012
#> SRR1479699 1 0.2711 0.8329 0.912 0.000 0.088
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359803 3 0.6308 0.1594 0.492 0.000 0.508
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.2878 0.8243 0.904 0.096 0.000
#> SRR659427 1 0.6448 0.4239 0.636 0.012 0.352
#> SRR1096638 1 0.1643 0.8566 0.956 0.000 0.044
#> SRR1466619 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR659307 2 0.3816 0.8417 0.148 0.852 0.000
#> SRR1439994 3 0.0424 0.8586 0.008 0.000 0.992
#> SRR1454931 1 0.1163 0.8585 0.972 0.000 0.028
#> SRR1332928 1 0.3482 0.8040 0.872 0.000 0.128
#> SRR658621 2 0.0592 0.9411 0.012 0.988 0.000
#> SRR1095840 1 0.1964 0.8499 0.944 0.000 0.056
#> SRR1458243 3 0.0592 0.8589 0.012 0.000 0.988
#> SRR1374270 1 0.3715 0.7990 0.868 0.128 0.004
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.0592 0.9412 0.012 0.988 0.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408727 2 0.5650 0.5992 0.312 0.688 0.000
#> SRR1456274 1 0.2050 0.8627 0.952 0.028 0.020
#> SRR817744 1 0.0592 0.8602 0.988 0.000 0.012
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.6291 0.2356 0.468 0.000 0.532
#> SRR1374198 1 0.0592 0.8598 0.988 0.000 0.012
#> SRR1445856 3 0.3816 0.8023 0.148 0.000 0.852
#> SRR820049 3 0.1411 0.8580 0.036 0.000 0.964
#> SRR1375290 3 0.4346 0.7665 0.184 0.000 0.816
#> SRR818999 3 0.5785 0.5720 0.332 0.000 0.668
#> SRR1390242 1 0.1170 0.8623 0.976 0.008 0.016
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454629 1 0.1289 0.8586 0.968 0.000 0.032
#> SRR1332187 3 0.5988 0.5028 0.368 0.000 0.632
#> SRR603365 3 0.0000 0.8559 0.000 0.000 1.000
#> SRR657833 2 0.1163 0.9354 0.028 0.972 0.000
#> SRR1436207 2 0.2625 0.8993 0.084 0.916 0.000
#> SRR1488017 1 0.1015 0.8621 0.980 0.008 0.012
#> SRR612947 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.6140 0.2682 0.596 0.000 0.404
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.3192 0.8301 0.112 0.000 0.888
#> SRR1441868 1 0.3038 0.8185 0.896 0.104 0.000
#> SRR1485380 3 0.0237 0.8581 0.004 0.000 0.996
#> SRR1073705 1 0.3192 0.8124 0.888 0.112 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.4452 0.7941 0.192 0.808 0.000
#> SRR1332816 1 0.2796 0.8272 0.908 0.092 0.000
#> SRR612299 2 0.1031 0.9364 0.024 0.976 0.000
#> SRR1407386 1 0.0592 0.8602 0.988 0.000 0.012
#> SRR1418064 2 0.0237 0.9434 0.004 0.996 0.000
#> SRR1309403 1 0.4291 0.7425 0.820 0.180 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.0237 0.8581 0.004 0.000 0.996
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337215 2 0.5291 0.6799 0.268 0.732 0.000
#> SRR1414749 3 0.0424 0.8587 0.008 0.000 0.992
#> SRR1365963 3 0.3816 0.8023 0.148 0.000 0.852
#> SRR1368030 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419760 1 0.5493 0.6662 0.756 0.232 0.012
#> SRR1381841 1 0.1860 0.8518 0.948 0.000 0.052
#> SRR821388 1 0.2796 0.8301 0.908 0.092 0.000
#> SRR657623 2 0.1411 0.9298 0.036 0.964 0.000
#> SRR1094241 3 0.0747 0.8594 0.016 0.000 0.984
#> SRR819583 3 0.1860 0.8546 0.052 0.000 0.948
#> SRR1096149 1 0.6295 0.0307 0.528 0.000 0.472
#> SRR1342829 3 0.0000 0.8559 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353028 1 0.1163 0.8608 0.972 0.000 0.028
#> SRR811333 1 0.4750 0.6958 0.784 0.000 0.216
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0747 0.9400 0.016 0.984 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR815092 1 0.1529 0.8557 0.960 0.000 0.040
#> SRR1500149 2 0.0424 0.9423 0.008 0.992 0.000
#> SRR1100564 1 0.1964 0.8499 0.944 0.000 0.056
#> SRR1403072 3 0.0000 0.8559 0.000 0.000 1.000
#> SRR811653 1 0.2448 0.8377 0.924 0.076 0.000
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.2066 0.9165 0.060 0.940 0.000
#> SRR1421444 3 0.0237 0.8580 0.004 0.000 0.996
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.3038 0.8185 0.896 0.104 0.000
#> SRR1444763 1 0.0424 0.8598 0.992 0.008 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0237 0.9434 0.004 0.996 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0237 0.9433 0.004 0.996 0.000
#> SRR1310094 2 0.1289 0.9324 0.032 0.968 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.1337 0.8631 0.972 0.016 0.012
#> SRR1453950 1 0.2356 0.8443 0.928 0.000 0.072
#> SRR1087875 1 0.2959 0.8214 0.900 0.100 0.000
#> SRR613318 1 0.4233 0.7639 0.836 0.160 0.004
#> SRR1332694 1 0.1267 0.8622 0.972 0.004 0.024
#> SRR1468469 3 0.0000 0.8559 0.000 0.000 1.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.1964 0.8499 0.944 0.000 0.056
#> SRR1311622 3 0.2261 0.8512 0.068 0.000 0.932
#> SRR1500931 3 0.0237 0.8581 0.004 0.000 0.996
#> SRR1387494 3 0.3192 0.8301 0.112 0.000 0.888
#> SRR1379175 1 0.6298 0.3454 0.608 0.388 0.004
#> SRR1401909 3 0.0424 0.8585 0.008 0.000 0.992
#> SRR1440541 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.0237 0.8581 0.004 0.000 0.996
#> SRR1376640 2 0.4346 0.8029 0.184 0.816 0.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.1753 0.8556 0.952 0.000 0.048
#> SRR1084276 3 0.6204 0.3642 0.424 0.000 0.576
#> SRR1353262 2 0.0237 0.9434 0.004 0.996 0.000
#> SRR1437035 1 0.1129 0.8628 0.976 0.004 0.020
#> SRR1396877 1 0.5760 0.4811 0.672 0.000 0.328
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.1015 0.8621 0.980 0.008 0.012
#> SRR1436822 2 0.4555 0.7782 0.200 0.800 0.000
#> SRR1101128 3 0.0237 0.8581 0.004 0.000 0.996
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.4452 0.7877 0.192 0.808 0.000
#> SRR1093218 3 0.0592 0.8587 0.012 0.000 0.988
#> SRR1077090 3 0.0424 0.8586 0.008 0.000 0.992
#> SRR1327430 2 0.5497 0.6326 0.292 0.708 0.000
#> SRR1088958 1 0.2959 0.8214 0.900 0.100 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.1860 0.8540 0.948 0.000 0.052
#> SRR1383000 1 0.5058 0.6547 0.756 0.000 0.244
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0237 0.9434 0.004 0.996 0.000
#> SRR1456401 2 0.1964 0.9185 0.056 0.944 0.000
#> SRR1086393 1 0.1781 0.8639 0.960 0.020 0.020
#> SRR1351521 3 0.0000 0.8559 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093100 1 0.2537 0.8361 0.920 0.080 0.000
#> SRR1309382 1 0.1753 0.8535 0.952 0.000 0.048
#> SRR1089375 3 0.6291 0.2403 0.468 0.000 0.532
#> SRR1499482 2 0.1031 0.9369 0.024 0.976 0.000
#> SRR614719 2 0.3619 0.8541 0.136 0.864 0.000
#> SRR1081473 3 0.4346 0.7747 0.184 0.000 0.816
#> SRR1087415 1 0.1860 0.8540 0.948 0.000 0.052
#> SRR1088217 3 0.5760 0.5812 0.328 0.000 0.672
#> SRR808496 2 0.3116 0.8802 0.108 0.892 0.000
#> SRR1336463 2 0.1964 0.9185 0.056 0.944 0.000
#> SRR612359 2 0.3816 0.8430 0.148 0.852 0.000
#> SRR1444412 3 0.6204 0.3642 0.424 0.000 0.576
#> SRR1074116 3 0.0000 0.8559 0.000 0.000 1.000
#> SRR821846 3 0.0237 0.8580 0.004 0.000 0.996
#> SRR656095 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR808914 1 0.2448 0.8381 0.924 0.076 0.000
#> SRR1349099 1 0.0424 0.8598 0.992 0.008 0.000
#> SRR1337886 2 0.1031 0.9361 0.024 0.976 0.000
#> SRR813632 3 0.6154 0.4198 0.408 0.000 0.592
#> SRR1101591 3 0.2448 0.8468 0.076 0.000 0.924
#> SRR1089713 1 0.5810 0.4620 0.664 0.000 0.336
#> SRR1453127 3 0.0237 0.8580 0.004 0.000 0.996
#> SRR1498354 3 0.5497 0.6395 0.292 0.000 0.708
#> SRR1313831 1 0.0892 0.8595 0.980 0.000 0.020
#> SRR1315434 3 0.0592 0.8587 0.012 0.000 0.988
#> SRR814747 2 0.0237 0.9433 0.004 0.996 0.000
#> SRR1358539 1 0.2448 0.8381 0.924 0.076 0.000
#> SRR1367807 1 0.2796 0.8272 0.908 0.092 0.000
#> SRR1365791 1 0.6483 0.2881 0.600 0.008 0.392
#> SRR1081519 3 0.5760 0.5812 0.328 0.000 0.672
#> SRR614707 2 0.5363 0.6655 0.276 0.724 0.000
#> SRR1094027 1 0.1267 0.8616 0.972 0.004 0.024
#> SRR1489092 1 0.5618 0.6216 0.732 0.008 0.260
#> SRR1079502 3 0.6260 0.3025 0.448 0.000 0.552
#> SRR1457814 1 0.2448 0.8377 0.924 0.076 0.000
#> SRR1455127 2 0.0237 0.9434 0.004 0.996 0.000
#> SRR615081 2 0.0892 0.9382 0.020 0.980 0.000
#> SRR1327855 3 0.0237 0.8581 0.004 0.000 0.996
#> SRR1417873 2 0.0237 0.9434 0.004 0.996 0.000
#> SRR1394125 3 0.5591 0.6318 0.304 0.000 0.696
#> SRR1488388 1 0.1529 0.8576 0.960 0.000 0.040
#> SRR1401122 2 0.4555 0.7667 0.200 0.800 0.000
#> SRR612383 2 0.2959 0.8863 0.100 0.900 0.000
#> SRR1477711 1 0.0747 0.8602 0.984 0.000 0.016
#> SRR1350813 2 0.0592 0.9416 0.012 0.988 0.000
#> SRR612851 2 0.3752 0.8469 0.144 0.856 0.000
#> SRR1086349 1 0.0829 0.8603 0.984 0.012 0.004
#> SRR812837 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340010 1 0.4742 0.8101 0.848 0.048 0.104
#> SRR1475885 1 0.0592 0.8605 0.988 0.012 0.000
#> SRR1376334 1 0.0892 0.8595 0.980 0.000 0.020
#> SRR1399821 1 0.0424 0.8598 0.992 0.008 0.000
#> SRR1347042 3 0.0237 0.8580 0.004 0.000 0.996
#> SRR612323 2 0.6168 0.3471 0.412 0.588 0.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0829 0.8603 0.984 0.012 0.004
#> SRR1465608 1 0.5216 0.6317 0.740 0.000 0.260
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.2959 0.8381 0.100 0.000 0.900
#> SRR1331153 2 0.0892 0.9387 0.020 0.980 0.000
#> SRR1078439 1 0.6473 0.4665 0.652 0.016 0.332
#> SRR2165527 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.3551 0.7932 0.868 0.132 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070308 1 0.4291 0.7425 0.820 0.180 0.000
#> SRR1403110 1 0.0747 0.8596 0.984 0.000 0.016
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0237 0.8581 0.004 0.000 0.996
#> SRR1456862 1 0.0747 0.8596 0.984 0.000 0.016
#> SRR1074622 1 0.5650 0.5246 0.688 0.000 0.312
#> SRR1465847 3 0.5431 0.6489 0.284 0.000 0.716
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.6307 0.1760 0.488 0.000 0.512
#> SRR1075579 1 0.1170 0.8623 0.976 0.008 0.016
#> SRR1090881 1 0.5331 0.7301 0.792 0.184 0.024
#> SRR612251 2 0.4974 0.7309 0.236 0.764 0.000
#> SRR1418581 1 0.2959 0.8214 0.900 0.100 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 2 0.3482 0.8606 0.128 0.872 0.000
#> SRR613078 2 0.0592 0.9415 0.012 0.988 0.000
#> SRR1472998 3 0.5591 0.6205 0.304 0.000 0.696
#> SRR1433452 2 0.5497 0.6326 0.292 0.708 0.000
#> SRR1101957 1 0.0829 0.8603 0.984 0.012 0.004
#> SRR1487993 3 0.3116 0.8326 0.108 0.000 0.892
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.1267 0.8622 0.972 0.004 0.024
#> SRR1367566 3 0.2537 0.8463 0.080 0.000 0.920
#> SRR1316151 2 0.0592 0.9412 0.012 0.988 0.000
#> SRR1417547 2 0.1643 0.9261 0.044 0.956 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0592 0.9411 0.012 0.988 0.000
#> SRR1398207 3 0.6286 0.2332 0.464 0.000 0.536
#> SRR1358755 3 0.2796 0.8384 0.092 0.000 0.908
#> SRR1078903 2 0.0592 0.9414 0.012 0.988 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.1860 0.8540 0.948 0.000 0.052
#> SRR615982 2 0.2711 0.8949 0.088 0.912 0.000
#> SRR1480431 2 0.3116 0.8802 0.108 0.892 0.000
#> SRR1429825 2 0.5905 0.5106 0.352 0.648 0.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.1643 0.8566 0.956 0.000 0.044
#> SRR808351 1 0.5882 0.4404 0.652 0.000 0.348
#> SRR1317513 1 0.1267 0.8622 0.972 0.004 0.024
#> SRR1480501 3 0.4887 0.7242 0.228 0.000 0.772
#> SRR1081910 1 0.4750 0.6961 0.784 0.000 0.216
#> SRR1086611 2 0.5216 0.6888 0.260 0.740 0.000
#> SRR1392571 2 0.1289 0.9335 0.032 0.968 0.000
#> SRR1311441 1 0.3038 0.8185 0.896 0.104 0.000
#> SRR808152 1 0.0983 0.8621 0.980 0.004 0.016
#> SRR657313 3 0.1529 0.8571 0.040 0.000 0.960
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.2959 0.8214 0.900 0.100 0.000
#> SRR1376228 3 0.0237 0.8580 0.004 0.000 0.996
#> SRR1399757 1 0.4555 0.7189 0.800 0.200 0.000
#> SRR1358060 3 0.0424 0.8587 0.008 0.000 0.992
#> SRR1464517 3 0.5327 0.6718 0.272 0.000 0.728
#> SRR613557 2 0.3816 0.8417 0.148 0.852 0.000
#> SRR809831 1 0.5810 0.4654 0.664 0.000 0.336
#> SRR1429387 3 0.0237 0.8580 0.004 0.000 0.996
#> SRR816565 1 0.1170 0.8612 0.976 0.016 0.008
#> SRR1071644 1 0.0848 0.8611 0.984 0.008 0.008
#> SRR1406936 3 0.6260 0.3025 0.448 0.000 0.552
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9439 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.2878 0.8907 0.096 0.904 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 1 0.5619 0.68785 0.676 0.000 0.056 0.268
#> SRR1404105 1 0.3307 0.78571 0.868 0.000 0.028 0.104
#> SRR2164936 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.1637 0.80132 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR614491 2 0.5136 0.29626 0.048 0.728 0.000 0.224
#> SRR1069376 1 0.1767 0.79355 0.944 0.000 0.012 0.044
#> SRR811964 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.3149 0.72346 0.032 0.880 0.000 0.088
#> SRR1345715 1 0.4053 0.71011 0.768 0.000 0.004 0.228
#> SRR1328073 1 0.4993 0.64295 0.712 0.028 0.000 0.260
#> SRR1394209 2 0.7536 -0.60880 0.228 0.488 0.000 0.284
#> SRR1474018 2 0.2647 0.71872 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1099809 3 0.7494 0.50056 0.264 0.000 0.500 0.236
#> SRR1500555 2 0.4307 0.49695 0.024 0.784 0.000 0.192
#> SRR1354363 1 0.4638 0.74524 0.776 0.000 0.044 0.180
#> SRR1391619 3 0.4868 0.77874 0.024 0.000 0.720 0.256
#> SRR1307997 2 0.1284 0.77822 0.012 0.964 0.000 0.024
#> SRR663124 2 0.3625 0.60252 0.012 0.828 0.000 0.160
#> SRR1334670 1 0.2530 0.78010 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR612515 2 0.4307 0.49695 0.024 0.784 0.000 0.192
#> SRR1092727 2 0.2611 0.74114 0.008 0.896 0.000 0.096
#> SRR1364013 2 0.2943 0.71284 0.032 0.892 0.000 0.076
#> SRR1468553 3 0.4312 0.80795 0.056 0.000 0.812 0.132
#> SRR1403980 3 0.5551 0.77003 0.112 0.000 0.728 0.160
#> SRR1420169 3 0.2867 0.81746 0.012 0.000 0.884 0.104
#> SRR1442800 2 0.6277 -0.29392 0.068 0.572 0.000 0.360
#> SRR1359214 2 0.0336 0.78208 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1499849 3 0.7494 0.50056 0.264 0.000 0.500 0.236
#> SRR1500030 3 0.5839 0.75247 0.060 0.000 0.648 0.292
#> SRR1093053 1 0.7436 0.35625 0.512 0.000 0.236 0.252
#> SRR1399843 1 0.6634 0.59084 0.624 0.000 0.164 0.212
#> SRR1380231 3 0.7706 0.26292 0.364 0.000 0.412 0.224
#> SRR809470 3 0.7196 0.58760 0.212 0.000 0.552 0.236
#> SRR614239 2 0.4307 0.49695 0.024 0.784 0.000 0.192
#> SRR613939 2 0.3142 0.70897 0.008 0.860 0.000 0.132
#> SRR612971 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.1022 0.77728 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR811357 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.3837 0.70727 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR613006 2 0.3649 0.61236 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1469570 2 0.0336 0.78211 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1457354 2 0.2921 0.69146 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1362906 3 0.4690 0.77984 0.016 0.000 0.724 0.260
#> SRR1079023 1 0.1305 0.78544 0.960 0.000 0.004 0.036
#> SRR813608 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.4122 0.71486 0.760 0.000 0.004 0.236
#> SRR1478700 1 0.7763 -0.00396 0.432 0.000 0.304 0.264
#> SRR1081543 1 0.4238 0.76229 0.796 0.000 0.028 0.176
#> SRR1384754 1 0.4692 0.73294 0.756 0.000 0.032 0.212
#> SRR612287 2 0.0188 0.78142 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1380317 2 0.7536 -0.60880 0.228 0.488 0.000 0.284
#> SRR1315247 2 0.7587 -0.96672 0.196 0.412 0.000 0.392
#> SRR1105344 2 0.1867 0.75566 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR658549 2 0.3836 0.57865 0.016 0.816 0.000 0.168
#> SRR1480240 1 0.3501 0.77098 0.848 0.000 0.020 0.132
#> SRR1084816 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.7457 -0.58108 0.220 0.504 0.000 0.276
#> SRR1419476 3 0.4735 0.77989 0.068 0.000 0.784 0.148
#> SRR1456075 3 0.4868 0.78288 0.024 0.000 0.720 0.256
#> SRR1389474 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.2704 0.79044 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1334419 1 0.3907 0.69658 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR1417154 3 0.7747 0.14729 0.384 0.000 0.384 0.232
#> SRR1095985 1 0.6492 0.58848 0.636 0.000 0.144 0.220
#> SRR1325771 1 0.5935 0.55948 0.664 0.080 0.000 0.256
#> SRR1360420 3 0.0817 0.80381 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR660272 2 0.1913 0.76947 0.020 0.940 0.000 0.040
#> SRR1332993 1 0.1767 0.79355 0.944 0.000 0.012 0.044
#> SRR1311833 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808044 1 0.7234 0.34860 0.544 0.000 0.252 0.204
#> SRR1076916 3 0.6785 0.65242 0.184 0.000 0.608 0.208
#> SRR1356266 1 0.1902 0.79394 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1341983 2 0.1406 0.76920 0.024 0.960 0.000 0.016
#> SRR1456114 1 0.3597 0.79029 0.836 0.000 0.016 0.148
#> SRR1072948 3 0.1118 0.80200 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1472370 3 0.1637 0.80132 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1480176 1 0.1824 0.78464 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR613843 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.3307 0.78571 0.868 0.000 0.028 0.104
#> SRR1404555 1 0.7045 0.41274 0.544 0.000 0.148 0.308
#> SRR659839 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0188 0.78145 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1362848 1 0.4122 0.71486 0.760 0.000 0.004 0.236
#> SRR1407492 2 0.4464 0.48317 0.024 0.768 0.000 0.208
#> SRR1455082 2 0.3591 0.59695 0.008 0.824 0.000 0.168
#> SRR658362 2 0.1489 0.76495 0.004 0.952 0.000 0.044
#> SRR810921 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0469 0.78046 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1456375 3 0.1302 0.80581 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR818232 1 0.2530 0.78010 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1454868 1 0.6407 0.68415 0.680 0.016 0.108 0.196
#> SRR1474816 2 0.3074 0.68205 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1342002 1 0.1722 0.78979 0.944 0.000 0.008 0.048
#> SRR1088437 2 0.0336 0.78178 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1466400 2 0.6688 -0.49000 0.096 0.536 0.000 0.368
#> SRR658921 2 0.3356 0.65186 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1499873 2 0.1022 0.78121 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1101373 1 0.4328 0.68127 0.748 0.008 0.000 0.244
#> SRR1090145 1 0.4323 0.74359 0.788 0.000 0.028 0.184
#> SRR1379324 1 0.3447 0.77753 0.852 0.000 0.020 0.128
#> SRR1345307 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.2714 0.81095 0.004 0.000 0.884 0.112
#> SRR1086280 3 0.3271 0.81199 0.012 0.000 0.856 0.132
#> SRR1454891 2 0.5354 0.24647 0.056 0.712 0.000 0.232
#> SRR663185 2 0.1302 0.76761 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR811819 1 0.1489 0.79111 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1318920 1 0.3024 0.78272 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR656758 2 0.1635 0.77503 0.008 0.948 0.000 0.044
#> SRR1474351 1 0.1824 0.78464 0.936 0.000 0.004 0.060
#> SRR660450 2 0.1913 0.76947 0.020 0.940 0.000 0.040
#> SRR1472687 2 0.1510 0.76174 0.028 0.956 0.000 0.016
#> SRR1334291 2 0.1022 0.77728 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1415153 2 0.0921 0.77842 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1323271 2 0.3024 0.68338 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1368939 2 0.0188 0.78142 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1443161 1 0.6957 0.49602 0.576 0.000 0.164 0.260
#> SRR614695 2 0.6708 -0.51754 0.096 0.528 0.000 0.376
#> SRR1092372 1 0.2921 0.78204 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1474577 1 0.3801 0.70570 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR1406582 1 0.3975 0.69575 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR612779 2 0.4711 0.55516 0.064 0.784 0.000 0.152
#> SRR1089006 1 0.3837 0.70727 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1354071 1 0.7706 -0.12228 0.412 0.000 0.364 0.224
#> SRR1105463 3 0.7091 0.60439 0.208 0.000 0.568 0.224
#> SRR811005 2 0.0188 0.78140 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1385319 1 0.2530 0.78010 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1325871 3 0.4868 0.77874 0.024 0.000 0.720 0.256
#> SRR1355415 3 0.1978 0.80274 0.004 0.000 0.928 0.068
#> SRR1090861 1 0.1489 0.78313 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1320712 1 0.4522 0.67395 0.728 0.004 0.004 0.264
#> SRR1470075 1 0.2589 0.78070 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1091254 1 0.2011 0.79207 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1101397 3 0.2611 0.81114 0.008 0.000 0.896 0.096
#> SRR1321165 1 0.2704 0.78415 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1092112 3 0.2714 0.81095 0.004 0.000 0.884 0.112
#> SRR1417588 3 0.0592 0.80713 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1074790 1 0.4993 0.64295 0.712 0.028 0.000 0.260
#> SRR1432106 2 0.0188 0.78142 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR655756 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.4849 0.73504 0.772 0.000 0.064 0.164
#> SRR1318582 2 0.0469 0.78163 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1080484 2 0.2124 0.76208 0.008 0.924 0.000 0.068
#> SRR1072749 3 0.6435 0.73838 0.136 0.000 0.640 0.224
#> SRR1078586 1 0.1545 0.79166 0.952 0.000 0.008 0.040
#> SRR1400333 1 0.7842 -0.38191 0.436 0.228 0.004 0.332
#> SRR1078834 2 0.7261 -0.74308 0.152 0.480 0.000 0.368
#> SRR1417611 2 0.3024 0.68338 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1396840 1 0.2704 0.78415 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1465440 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.2281 0.73835 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR614984 2 0.7539 -0.65905 0.256 0.492 0.000 0.252
#> SRR1324269 1 0.7001 0.43821 0.580 0.000 0.224 0.196
#> SRR1401491 2 0.1867 0.75566 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1319443 1 0.3711 0.76730 0.836 0.000 0.024 0.140
#> SRR1324349 2 0.2722 0.72513 0.032 0.904 0.000 0.064
#> SRR1345523 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.4638 0.73849 0.776 0.000 0.044 0.180
#> SRR661505 3 0.3895 0.79967 0.012 0.000 0.804 0.184
#> SRR1419062 3 0.7706 0.35981 0.328 0.000 0.436 0.236
#> SRR1480131 1 0.2921 0.77342 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1421284 2 0.7578 -0.62340 0.236 0.480 0.000 0.284
#> SRR1329624 1 0.1452 0.79099 0.956 0.000 0.008 0.036
#> SRR1315739 3 0.1940 0.80665 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1099189 2 0.5386 0.34564 0.056 0.708 0.000 0.236
#> SRR1083286 1 0.3999 0.76443 0.824 0.000 0.036 0.140
#> SRR1091890 1 0.5361 0.72015 0.724 0.000 0.068 0.208
#> SRR1347436 2 0.3015 0.72905 0.024 0.884 0.000 0.092
#> SRR1327473 1 0.5546 0.59074 0.680 0.052 0.000 0.268
#> SRR1338195 3 0.1474 0.80855 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR809698 2 0.0188 0.78140 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1457792 1 0.3801 0.70649 0.780 0.000 0.000 0.220
#> SRR658271 2 0.0469 0.78231 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1339597 1 0.4285 0.75851 0.804 0.000 0.040 0.156
#> SRR1454842 3 0.4868 0.77874 0.024 0.000 0.720 0.256
#> SRR1322643 1 0.2589 0.78070 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR614887 3 0.1557 0.80939 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1354620 3 0.3176 0.80375 0.036 0.000 0.880 0.084
#> SRR615056 2 0.2255 0.75903 0.012 0.920 0.000 0.068
#> SRR1105320 1 0.5546 0.59074 0.680 0.052 0.000 0.268
#> SRR1391529 1 0.2530 0.77966 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR663052 2 0.1211 0.77001 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1478834 1 0.2530 0.77966 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR812366 2 0.0188 0.78142 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1435330 3 0.4565 0.80528 0.064 0.000 0.796 0.140
#> SRR615383 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 1 0.6627 0.45913 0.616 0.112 0.004 0.268
#> SRR613568 2 0.1913 0.76947 0.020 0.940 0.000 0.040
#> SRR614095 2 0.4356 0.60612 0.064 0.812 0.000 0.124
#> SRR1103092 1 0.4532 0.74499 0.792 0.000 0.052 0.156
#> SRR1337155 1 0.6897 0.44837 0.584 0.000 0.256 0.160
#> SRR1475345 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 4 0.7610 0.00000 0.200 0.400 0.000 0.400
#> SRR1406372 2 0.1940 0.75343 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1339880 3 0.5839 0.75247 0.060 0.000 0.648 0.292
#> SRR1353136 1 0.6407 0.68415 0.680 0.016 0.108 0.196
#> SRR1093906 3 0.0592 0.80713 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR614035 2 0.0469 0.78187 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1351104 1 0.2647 0.77936 0.880 0.000 0.000 0.120
#> SRR1363926 2 0.3681 0.64190 0.008 0.816 0.000 0.176
#> SRR1399861 1 0.4283 0.69985 0.740 0.000 0.004 0.256
#> SRR1338789 1 0.2714 0.78119 0.884 0.000 0.004 0.112
#> SRR1421420 3 0.4181 0.80965 0.052 0.000 0.820 0.128
#> SRR1420832 2 0.0592 0.78082 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1476231 1 0.1661 0.78418 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR1352870 2 0.7805 -0.77519 0.280 0.420 0.000 0.300
#> SRR1315041 2 0.3024 0.68338 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR661877 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443268 3 0.2611 0.81114 0.008 0.000 0.896 0.096
#> SRR1416617 3 0.5234 0.78340 0.096 0.000 0.752 0.152
#> SRR1102443 1 0.4582 0.70460 0.748 0.008 0.008 0.236
#> SRR655672 2 0.4464 0.48317 0.024 0.768 0.000 0.208
#> SRR1420006 3 0.1302 0.80229 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1458267 2 0.1022 0.77728 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR613819 2 0.7474 -0.58782 0.220 0.500 0.000 0.280
#> SRR1469432 2 0.3024 0.68468 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR660907 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.2480 0.75040 0.008 0.904 0.000 0.088
#> SRR1470727 1 0.7357 0.30339 0.524 0.000 0.260 0.216
#> SRR1339153 3 0.5466 0.76963 0.040 0.000 0.668 0.292
#> SRR1472749 3 0.5839 0.75247 0.060 0.000 0.648 0.292
#> SRR1414379 2 0.7503 -0.59708 0.228 0.496 0.000 0.276
#> SRR1431326 1 0.3975 0.69148 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1487278 2 0.5036 0.36585 0.024 0.696 0.000 0.280
#> SRR1098312 1 0.5361 0.72015 0.724 0.000 0.068 0.208
#> SRR810273 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.2197 0.75823 0.004 0.916 0.000 0.080
#> SRR614467 2 0.1302 0.76761 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR811471 1 0.1635 0.79328 0.948 0.000 0.008 0.044
#> SRR1478341 3 0.1211 0.80772 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1088606 1 0.2921 0.78204 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1479699 1 0.4919 0.74351 0.752 0.000 0.048 0.200
#> SRR1403589 2 0.0921 0.78090 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR812625 2 0.0817 0.78032 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1359803 3 0.7842 0.24528 0.360 0.000 0.376 0.264
#> SRR1338988 2 0.0188 0.78142 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1471222 2 0.0707 0.78180 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1378992 1 0.3907 0.70200 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR659427 1 0.7387 0.38140 0.520 0.000 0.224 0.256
#> SRR1096638 1 0.2124 0.79385 0.924 0.000 0.008 0.068
#> SRR1466619 2 0.2814 0.70393 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR659307 2 0.5136 0.29626 0.048 0.728 0.000 0.224
#> SRR1439994 3 0.2197 0.80952 0.004 0.000 0.916 0.080
#> SRR1454931 1 0.2976 0.77785 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR1332928 1 0.4849 0.73504 0.772 0.000 0.064 0.164
#> SRR658621 2 0.2255 0.75903 0.012 0.920 0.000 0.068
#> SRR1095840 1 0.3447 0.77239 0.852 0.000 0.020 0.128
#> SRR1458243 3 0.2611 0.81114 0.008 0.000 0.896 0.096
#> SRR1374270 1 0.5061 0.65501 0.704 0.020 0.004 0.272
#> SRR1470947 2 0.0592 0.78082 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1365598 2 0.3356 0.65186 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR662787 2 0.1302 0.76761 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1408727 2 0.7474 -0.58782 0.220 0.500 0.000 0.280
#> SRR1456274 1 0.2860 0.79192 0.888 0.008 0.004 0.100
#> SRR817744 1 0.1743 0.79075 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1478744 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0336 0.78178 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1102680 3 0.7654 0.26785 0.368 0.000 0.420 0.212
#> SRR1374198 1 0.2704 0.78623 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1445856 3 0.5434 0.76462 0.128 0.000 0.740 0.132
#> SRR820049 3 0.4175 0.79672 0.016 0.000 0.784 0.200
#> SRR1375290 3 0.6386 0.72194 0.140 0.000 0.648 0.212
#> SRR818999 3 0.7274 0.56964 0.220 0.000 0.540 0.240
#> SRR1390242 1 0.1474 0.79156 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1401164 2 0.0707 0.78248 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1454629 1 0.2921 0.77342 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1332187 3 0.7413 0.52133 0.252 0.000 0.516 0.232
#> SRR603365 3 0.1118 0.80200 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR657833 2 0.3015 0.72905 0.024 0.884 0.000 0.092
#> SRR1436207 2 0.4644 0.46497 0.024 0.748 0.000 0.228
#> SRR1488017 1 0.1398 0.78528 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR612947 2 0.0469 0.78187 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1480384 1 0.7468 0.24405 0.504 0.000 0.268 0.228
#> SRR1364761 2 0.1022 0.77728 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1308086 3 0.5906 0.75008 0.064 0.000 0.644 0.292
#> SRR1441868 1 0.3975 0.69148 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1485380 3 0.1637 0.80132 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1073705 1 0.4328 0.68127 0.748 0.008 0.000 0.244
#> SRR615032 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0592 0.78082 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1442983 2 0.0336 0.78155 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1100346 2 0.6245 -0.09133 0.108 0.648 0.000 0.244
#> SRR1332816 1 0.3837 0.70727 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR612299 2 0.3837 0.57885 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1407386 1 0.1576 0.79082 0.948 0.000 0.004 0.048
#> SRR1418064 2 0.3074 0.68205 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1309403 1 0.5546 0.59074 0.680 0.052 0.000 0.268
#> SRR1498395 2 0.0469 0.78163 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1079998 3 0.1637 0.80132 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1498885 2 0.0188 0.78142 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1337215 2 0.7338 -0.77113 0.160 0.464 0.000 0.376
#> SRR1414749 3 0.2466 0.80791 0.004 0.000 0.900 0.096
#> SRR1365963 3 0.5434 0.76462 0.128 0.000 0.740 0.132
#> SRR1368030 2 0.2814 0.70393 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1419760 1 0.6601 0.47015 0.624 0.116 0.004 0.256
#> SRR1381841 1 0.3443 0.77388 0.848 0.000 0.016 0.136
#> SRR821388 1 0.4682 0.69526 0.744 0.016 0.004 0.236
#> SRR657623 2 0.2892 0.73151 0.036 0.896 0.000 0.068
#> SRR1094241 3 0.2976 0.81531 0.008 0.000 0.872 0.120
#> SRR819583 3 0.3216 0.80669 0.044 0.000 0.880 0.076
#> SRR1096149 1 0.7763 -0.00396 0.432 0.000 0.304 0.264
#> SRR1342829 3 0.1118 0.80200 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR1353028 1 0.1722 0.79343 0.944 0.000 0.008 0.048
#> SRR811333 1 0.6025 0.63293 0.688 0.000 0.140 0.172
#> SRR1311666 2 0.0336 0.78148 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1486698 2 0.1867 0.74507 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1446436 2 0.1022 0.77728 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR815092 1 0.3142 0.77712 0.860 0.000 0.008 0.132
#> SRR1500149 2 0.1635 0.77503 0.008 0.948 0.000 0.044
#> SRR1100564 1 0.3554 0.76870 0.844 0.000 0.020 0.136
#> SRR1403072 3 0.1637 0.80076 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR811653 1 0.4283 0.69985 0.740 0.000 0.004 0.256
#> SRR1311348 2 0.0336 0.78211 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1489438 2 0.0188 0.78142 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1435442 2 0.5036 0.36585 0.024 0.696 0.000 0.280
#> SRR1421444 3 0.0921 0.80880 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1344010 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.3975 0.69148 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1444763 1 0.2868 0.78470 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1415026 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.3074 0.67763 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR1485499 2 0.2647 0.71872 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1316078 2 0.2149 0.74605 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR663465 2 0.1978 0.76429 0.004 0.928 0.000 0.068
#> SRR1310094 2 0.3913 0.64367 0.028 0.824 0.000 0.148
#> SRR663537 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.2345 0.79610 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1453950 1 0.2813 0.79143 0.896 0.000 0.024 0.080
#> SRR1087875 1 0.3975 0.69575 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR613318 1 0.5594 0.60283 0.672 0.040 0.004 0.284
#> SRR1332694 1 0.1452 0.79099 0.956 0.000 0.008 0.036
#> SRR1468469 3 0.1867 0.80161 0.000 0.000 0.928 0.072
#> SRR818670 2 0.1022 0.78121 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1120318 1 0.3501 0.77098 0.848 0.000 0.020 0.132
#> SRR1311622 3 0.4868 0.78288 0.024 0.000 0.720 0.256
#> SRR1500931 3 0.2149 0.79924 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1387494 3 0.5906 0.75008 0.064 0.000 0.644 0.292
#> SRR1379175 1 0.7625 -0.20195 0.504 0.236 0.004 0.256
#> SRR1401909 3 0.1978 0.80274 0.004 0.000 0.928 0.068
#> SRR1440541 2 0.1389 0.77094 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1068832 3 0.1637 0.80132 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1376640 2 0.6476 -0.13430 0.112 0.616 0.000 0.272
#> SRR1085712 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.3160 0.78582 0.872 0.000 0.020 0.108
#> SRR1084276 3 0.7146 0.40092 0.336 0.000 0.516 0.148
#> SRR1353262 2 0.2921 0.69146 0.000 0.860 0.000 0.140
#> SRR1437035 1 0.1902 0.79394 0.932 0.000 0.004 0.064
#> SRR1396877 1 0.7098 0.40485 0.564 0.000 0.244 0.192
#> SRR1443026 2 0.0336 0.78181 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1417936 1 0.1398 0.78554 0.956 0.000 0.004 0.040
#> SRR1436822 2 0.6739 -0.36022 0.120 0.576 0.000 0.304
#> SRR1101128 3 0.1637 0.80132 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1363886 2 0.0188 0.78142 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612983 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.6688 -0.49000 0.096 0.536 0.000 0.368
#> SRR1093218 3 0.3494 0.79443 0.004 0.000 0.824 0.172
#> SRR1077090 3 0.1940 0.80838 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1327430 2 0.7474 -0.67149 0.212 0.496 0.000 0.292
#> SRR1088958 1 0.3975 0.69575 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1486931 2 0.1022 0.77728 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1086820 1 0.3392 0.77912 0.856 0.000 0.020 0.124
#> SRR1383000 1 0.5944 0.63275 0.696 0.000 0.164 0.140
#> SRR1355705 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614335 2 0.1302 0.76761 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR660534 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.3024 0.68338 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1456401 2 0.4552 0.56793 0.044 0.784 0.000 0.172
#> SRR1086393 1 0.2401 0.79224 0.904 0.000 0.004 0.092
#> SRR1351521 3 0.1637 0.80858 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1093100 1 0.4368 0.70144 0.748 0.004 0.004 0.244
#> SRR1309382 1 0.3390 0.77178 0.852 0.000 0.016 0.132
#> SRR1089375 3 0.7723 0.26251 0.364 0.000 0.408 0.228
#> SRR1499482 2 0.2611 0.74114 0.008 0.896 0.000 0.096
#> SRR614719 2 0.5041 0.32997 0.040 0.728 0.000 0.232
#> SRR1081473 3 0.6703 0.71320 0.156 0.000 0.612 0.232
#> SRR1087415 1 0.3392 0.77912 0.856 0.000 0.020 0.124
#> SRR1088217 3 0.7196 0.58760 0.212 0.000 0.552 0.236
#> SRR808496 2 0.5386 0.34564 0.056 0.708 0.000 0.236
#> SRR1336463 2 0.4552 0.56793 0.044 0.784 0.000 0.172
#> SRR612359 2 0.5279 0.27180 0.052 0.716 0.000 0.232
#> SRR1444412 3 0.7146 0.40092 0.336 0.000 0.516 0.148
#> SRR1074116 3 0.1118 0.80200 0.000 0.000 0.964 0.036
#> SRR821846 3 0.1474 0.80855 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR656095 2 0.0188 0.78140 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR808914 1 0.3681 0.74284 0.816 0.008 0.000 0.176
#> SRR1349099 1 0.2921 0.78418 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1337886 2 0.1629 0.76742 0.024 0.952 0.000 0.024
#> SRR813632 3 0.7659 0.42942 0.296 0.000 0.460 0.244
#> SRR1101591 3 0.4789 0.80441 0.056 0.000 0.772 0.172
#> SRR1089713 1 0.7114 0.38806 0.560 0.000 0.252 0.188
#> SRR1453127 3 0.1211 0.80772 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1498354 3 0.6941 0.62691 0.192 0.000 0.588 0.220
#> SRR1313831 1 0.2530 0.78010 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1315434 3 0.3494 0.79443 0.004 0.000 0.824 0.172
#> SRR814747 2 0.1978 0.76297 0.004 0.928 0.000 0.068
#> SRR1358539 1 0.3681 0.74284 0.816 0.008 0.000 0.176
#> SRR1367807 1 0.3837 0.70727 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1365791 1 0.7632 0.15866 0.468 0.000 0.288 0.244
#> SRR1081519 3 0.7196 0.58760 0.212 0.000 0.552 0.236
#> SRR614707 2 0.7374 -0.79644 0.164 0.456 0.000 0.380
#> SRR1094027 1 0.1545 0.79166 0.952 0.000 0.008 0.040
#> SRR1489092 1 0.6836 0.49966 0.580 0.000 0.140 0.280
#> SRR1079502 3 0.7681 0.32408 0.344 0.000 0.432 0.224
#> SRR1457814 1 0.4283 0.69985 0.740 0.000 0.004 0.256
#> SRR1455127 2 0.3024 0.68468 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR615081 2 0.3726 0.60008 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1327855 3 0.1637 0.80132 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1417873 2 0.3024 0.68338 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1394125 3 0.7196 0.60611 0.236 0.000 0.552 0.212
#> SRR1488388 1 0.1767 0.79355 0.944 0.000 0.012 0.044
#> SRR1401122 2 0.5792 0.16852 0.168 0.708 0.000 0.124
#> SRR612383 2 0.4307 0.49695 0.024 0.784 0.000 0.192
#> SRR1477711 1 0.1489 0.79178 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1350813 2 0.2480 0.75040 0.008 0.904 0.000 0.088
#> SRR612851 2 0.5664 0.22496 0.076 0.696 0.000 0.228
#> SRR1086349 1 0.1637 0.77882 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR812837 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 1 0.5619 0.68785 0.676 0.000 0.056 0.268
#> SRR1475885 1 0.3157 0.78108 0.852 0.004 0.000 0.144
#> SRR1376334 1 0.2530 0.78010 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1399821 1 0.2921 0.78418 0.860 0.000 0.000 0.140
#> SRR1347042 3 0.1211 0.80772 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR612323 2 0.7685 -0.67309 0.288 0.456 0.000 0.256
#> SRR612604 2 0.0188 0.78142 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1389546 2 0.1022 0.77728 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1311877 1 0.1637 0.77882 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1465608 1 0.6514 0.57529 0.636 0.000 0.152 0.212
#> SRR1101808 2 0.0469 0.78187 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1414079 3 0.4565 0.80528 0.064 0.000 0.796 0.140
#> SRR1331153 2 0.1913 0.76947 0.020 0.940 0.000 0.040
#> SRR1078439 1 0.7301 0.42169 0.536 0.000 0.228 0.236
#> SRR2165527 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.4599 0.67056 0.736 0.016 0.000 0.248
#> SRR1313536 2 0.0592 0.78084 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1070308 1 0.5546 0.59074 0.680 0.052 0.000 0.268
#> SRR1403110 1 0.2530 0.77966 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1400355 2 0.1022 0.77728 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1401317 3 0.1637 0.80132 0.000 0.000 0.940 0.060
#> SRR1456862 1 0.2530 0.78641 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1074622 1 0.6790 0.49768 0.608 0.000 0.196 0.196
#> SRR1465847 3 0.6754 0.64170 0.204 0.000 0.612 0.184
#> SRR1443376 2 0.0336 0.78155 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1471312 3 0.7841 0.25697 0.356 0.000 0.380 0.264
#> SRR1075579 1 0.1474 0.79156 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1090881 1 0.6147 0.58623 0.648 0.064 0.008 0.280
#> SRR612251 2 0.6605 -0.25280 0.136 0.616 0.000 0.248
#> SRR1418581 1 0.3942 0.69332 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR658045 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613214 2 0.4793 0.41301 0.040 0.756 0.000 0.204
#> SRR613078 2 0.2611 0.74249 0.008 0.896 0.000 0.096
#> SRR1472998 3 0.6903 0.61702 0.224 0.000 0.592 0.184
#> SRR1433452 2 0.7458 -0.66381 0.212 0.500 0.000 0.288
#> SRR1101957 1 0.1637 0.77882 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1487993 3 0.5839 0.75247 0.060 0.000 0.648 0.292
#> SRR1465983 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.1356 0.79128 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR1367566 3 0.4440 0.80659 0.060 0.000 0.804 0.136
#> SRR1316151 2 0.3356 0.65186 0.000 0.824 0.000 0.176
#> SRR1417547 2 0.3198 0.71664 0.040 0.880 0.000 0.080
#> SRR659389 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.1854 0.77140 0.012 0.940 0.000 0.048
#> SRR1398207 3 0.7591 0.29609 0.352 0.000 0.444 0.204
#> SRR1358755 3 0.3834 0.79473 0.076 0.000 0.848 0.076
#> SRR1078903 2 0.2466 0.74744 0.004 0.900 0.000 0.096
#> SRR1323252 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.1022 0.77728 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1369172 1 0.3447 0.77753 0.852 0.000 0.020 0.128
#> SRR615982 2 0.4893 0.51630 0.064 0.768 0.000 0.168
#> SRR1480431 2 0.5386 0.34564 0.056 0.708 0.000 0.236
#> SRR1429825 2 0.7704 -0.71575 0.264 0.452 0.000 0.284
#> SRR1102393 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.2124 0.79385 0.924 0.000 0.008 0.068
#> SRR808351 1 0.7088 0.41339 0.568 0.000 0.228 0.204
#> SRR1317513 1 0.1356 0.79128 0.960 0.000 0.008 0.032
#> SRR1480501 3 0.5938 0.70660 0.168 0.000 0.696 0.136
#> SRR1081910 1 0.6025 0.63121 0.688 0.000 0.140 0.172
#> SRR1086611 2 0.7261 -0.74308 0.152 0.480 0.000 0.368
#> SRR1392571 2 0.2988 0.71877 0.012 0.876 0.000 0.112
#> SRR1311441 1 0.3975 0.69148 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR808152 1 0.1807 0.79213 0.940 0.000 0.008 0.052
#> SRR657313 3 0.4535 0.78391 0.016 0.000 0.744 0.240
#> SRR1433131 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0188 0.78142 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1379343 2 0.0336 0.78155 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1389108 1 0.3975 0.68992 0.760 0.000 0.000 0.240
#> SRR1376228 3 0.2149 0.80713 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1399757 1 0.5935 0.55948 0.664 0.080 0.000 0.256
#> SRR1358060 3 0.2466 0.80791 0.004 0.000 0.900 0.096
#> SRR1464517 3 0.7328 0.61362 0.200 0.000 0.524 0.276
#> SRR613557 2 0.5136 0.29626 0.048 0.728 0.000 0.224
#> SRR809831 1 0.7028 0.42708 0.576 0.000 0.228 0.196
#> SRR1429387 3 0.0592 0.80713 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR816565 1 0.1661 0.78418 0.944 0.000 0.004 0.052
#> SRR1071644 1 0.1489 0.78522 0.952 0.000 0.004 0.044
#> SRR1406936 3 0.7681 0.32408 0.344 0.000 0.432 0.224
#> SRR1072031 2 0.0000 0.78120 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.4464 0.48317 0.024 0.768 0.000 0.208
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 1 0.6352 0.55413 0.620 0.000 0.040 0.200 0.140
#> SRR1404105 1 0.3471 0.65203 0.820 0.000 0.012 0.012 0.156
#> SRR2164936 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1472057 3 0.1800 0.67017 0.000 0.000 0.932 0.020 0.048
#> SRR614491 2 0.4425 0.33827 0.024 0.680 0.000 0.296 0.000
#> SRR1069376 1 0.2236 0.68543 0.908 0.000 0.000 0.024 0.068
#> SRR811964 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1361415 2 0.3165 0.71463 0.036 0.848 0.000 0.116 0.000
#> SRR1345715 1 0.4709 0.63762 0.716 0.000 0.004 0.224 0.056
#> SRR1328073 1 0.5055 0.59359 0.680 0.024 0.000 0.264 0.032
#> SRR1394209 2 0.6832 -0.44839 0.212 0.420 0.000 0.360 0.008
#> SRR1474018 2 0.4029 0.40201 0.000 0.680 0.000 0.316 0.004
#> SRR1099809 5 0.6426 0.43631 0.156 0.000 0.368 0.004 0.472
#> SRR1500555 2 0.4017 0.49183 0.012 0.736 0.000 0.248 0.004
#> SRR1354363 1 0.4607 0.56568 0.692 0.000 0.012 0.020 0.276
#> SRR1391619 3 0.5765 0.30568 0.000 0.000 0.488 0.088 0.424
#> SRR1307997 2 0.1942 0.75860 0.012 0.920 0.000 0.068 0.000
#> SRR663124 2 0.3652 0.58496 0.012 0.784 0.000 0.200 0.004
#> SRR1334670 1 0.3942 0.58650 0.728 0.000 0.000 0.012 0.260
#> SRR612515 2 0.4017 0.49183 0.012 0.736 0.000 0.248 0.004
#> SRR1092727 2 0.2707 0.72452 0.008 0.860 0.000 0.132 0.000
#> SRR1364013 2 0.2850 0.71503 0.036 0.872 0.000 0.092 0.000
#> SRR1468553 3 0.5320 0.52159 0.028 0.000 0.652 0.036 0.284
#> SRR1403980 3 0.6092 0.33324 0.060 0.000 0.576 0.040 0.324
#> SRR1420169 3 0.3484 0.67766 0.004 0.000 0.824 0.028 0.144
#> SRR1442800 4 0.5008 0.69372 0.040 0.324 0.000 0.632 0.004
#> SRR1359214 2 0.0963 0.77369 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1499849 5 0.6426 0.43631 0.156 0.000 0.368 0.004 0.472
#> SRR1500030 5 0.6256 -0.15836 0.012 0.000 0.404 0.104 0.480
#> SRR1093053 1 0.7464 0.07327 0.440 0.000 0.088 0.124 0.348
#> SRR1399843 1 0.6869 0.32957 0.536 0.000 0.080 0.084 0.300
#> SRR1380231 5 0.6750 0.53185 0.232 0.000 0.280 0.008 0.480
#> SRR809470 5 0.6359 0.24423 0.096 0.000 0.416 0.020 0.468
#> SRR614239 2 0.4017 0.49183 0.012 0.736 0.000 0.248 0.004
#> SRR613939 2 0.3548 0.66429 0.012 0.796 0.000 0.188 0.004
#> SRR612971 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1490204 2 0.1544 0.76077 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR811357 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1471672 1 0.4490 0.63726 0.724 0.000 0.000 0.224 0.052
#> SRR613006 2 0.4397 0.05615 0.000 0.564 0.000 0.432 0.004
#> SRR1469570 2 0.0510 0.77465 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1457354 2 0.4196 0.30173 0.000 0.640 0.000 0.356 0.004
#> SRR1362906 3 0.5966 0.36616 0.004 0.000 0.520 0.100 0.376
#> SRR1079023 1 0.1485 0.68627 0.948 0.000 0.000 0.032 0.020
#> SRR813608 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1096736 1 0.4795 0.61950 0.704 0.000 0.000 0.224 0.072
#> SRR1478700 5 0.7315 0.39816 0.336 0.000 0.184 0.044 0.436
#> SRR1081543 1 0.5104 0.64775 0.728 0.000 0.016 0.144 0.112
#> SRR1384754 1 0.5209 0.61958 0.704 0.000 0.008 0.172 0.116
#> SRR612287 2 0.0794 0.77292 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1380317 2 0.6832 -0.44839 0.212 0.420 0.000 0.360 0.008
#> SRR1315247 4 0.6067 0.73589 0.124 0.192 0.000 0.648 0.036
#> SRR1105344 2 0.2648 0.68676 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR658549 2 0.3659 0.55826 0.012 0.768 0.000 0.220 0.000
#> SRR1480240 1 0.4037 0.55549 0.704 0.000 0.004 0.004 0.288
#> SRR1084816 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR612551 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1358520 2 0.6792 -0.43168 0.204 0.432 0.000 0.356 0.008
#> SRR1419476 3 0.4393 0.53166 0.016 0.000 0.736 0.020 0.228
#> SRR1456075 3 0.6099 0.35222 0.012 0.000 0.516 0.092 0.380
#> SRR1389474 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1367005 1 0.3861 0.68840 0.804 0.000 0.000 0.068 0.128
#> SRR1334419 1 0.4342 0.62760 0.728 0.000 0.000 0.232 0.040
#> SRR1417154 5 0.6946 0.45797 0.220 0.000 0.276 0.020 0.484
#> SRR1095985 1 0.7229 -0.02513 0.412 0.000 0.080 0.100 0.408
#> SRR1325771 1 0.5879 0.51197 0.632 0.076 0.000 0.260 0.032
#> SRR1360420 3 0.0865 0.68127 0.000 0.000 0.972 0.024 0.004
#> SRR660272 2 0.2573 0.74137 0.016 0.880 0.000 0.104 0.000
#> SRR1332993 1 0.2236 0.68543 0.908 0.000 0.000 0.024 0.068
#> SRR1311833 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR808044 1 0.6640 -0.18511 0.420 0.000 0.152 0.012 0.416
#> SRR1076916 3 0.6154 0.00842 0.068 0.000 0.520 0.028 0.384
#> SRR1356266 1 0.2305 0.68131 0.896 0.000 0.000 0.012 0.092
#> SRR1341983 2 0.1579 0.76695 0.024 0.944 0.000 0.032 0.000
#> SRR1456114 1 0.3970 0.64127 0.744 0.000 0.000 0.020 0.236
#> SRR1072948 3 0.1041 0.67715 0.000 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR1472370 3 0.1800 0.67017 0.000 0.000 0.932 0.020 0.048
#> SRR1480176 1 0.2370 0.68675 0.904 0.000 0.000 0.056 0.040
#> SRR613843 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1469192 1 0.3471 0.65203 0.820 0.000 0.012 0.012 0.156
#> SRR1404555 5 0.7164 0.16579 0.344 0.000 0.036 0.176 0.444
#> SRR659839 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR659533 2 0.0290 0.77248 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1362848 1 0.4795 0.61950 0.704 0.000 0.000 0.224 0.072
#> SRR1407492 2 0.4234 0.47588 0.020 0.724 0.000 0.252 0.004
#> SRR1455082 2 0.3487 0.57957 0.008 0.780 0.000 0.212 0.000
#> SRR658362 2 0.1410 0.75597 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR810921 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR662823 2 0.0510 0.77164 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1456375 3 0.1981 0.68515 0.000 0.000 0.924 0.028 0.048
#> SRR818232 1 0.3942 0.58650 0.728 0.000 0.000 0.012 0.260
#> SRR1454868 1 0.6639 0.52402 0.612 0.008 0.040 0.152 0.188
#> SRR1474816 2 0.4264 0.24903 0.000 0.620 0.000 0.376 0.004
#> SRR1342002 1 0.2278 0.69063 0.908 0.000 0.000 0.032 0.060
#> SRR1088437 2 0.0510 0.77414 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1466400 4 0.5258 0.75234 0.064 0.296 0.000 0.636 0.004
#> SRR658921 2 0.4310 0.19599 0.000 0.604 0.000 0.392 0.004
#> SRR1499873 2 0.1410 0.77159 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1101373 1 0.4506 0.62074 0.716 0.004 0.000 0.244 0.036
#> SRR1090145 1 0.4829 0.43619 0.604 0.000 0.008 0.016 0.372
#> SRR1379324 1 0.4109 0.56823 0.700 0.000 0.000 0.012 0.288
#> SRR1345307 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1396166 3 0.3495 0.66499 0.000 0.000 0.812 0.028 0.160
#> SRR1086280 3 0.4072 0.63838 0.008 0.000 0.772 0.028 0.192
#> SRR1454891 2 0.4603 0.30754 0.032 0.668 0.000 0.300 0.000
#> SRR663185 2 0.1341 0.75843 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR811819 1 0.2208 0.68823 0.908 0.000 0.000 0.020 0.072
#> SRR1318920 1 0.5341 0.56423 0.664 0.000 0.000 0.124 0.212
#> SRR656758 2 0.2411 0.74511 0.008 0.884 0.000 0.108 0.000
#> SRR1474351 1 0.2370 0.68675 0.904 0.000 0.000 0.056 0.040
#> SRR660450 2 0.2573 0.74137 0.016 0.880 0.000 0.104 0.000
#> SRR1472687 2 0.1668 0.76138 0.032 0.940 0.000 0.028 0.000
#> SRR1334291 2 0.1544 0.76077 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1415153 2 0.1410 0.76431 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1323271 2 0.4225 0.27999 0.000 0.632 0.000 0.364 0.004
#> SRR1368939 2 0.0703 0.77462 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1443161 1 0.6808 0.17342 0.492 0.000 0.072 0.072 0.364
#> SRR614695 4 0.5335 0.75720 0.064 0.288 0.000 0.640 0.008
#> SRR1092372 1 0.5365 0.54837 0.656 0.000 0.000 0.116 0.228
#> SRR1474577 1 0.4490 0.63716 0.724 0.000 0.000 0.224 0.052
#> SRR1406582 1 0.4370 0.62766 0.724 0.000 0.000 0.236 0.040
#> SRR612779 2 0.4643 0.55698 0.068 0.736 0.000 0.192 0.004
#> SRR1089006 1 0.4490 0.63726 0.724 0.000 0.000 0.224 0.052
#> SRR1354071 5 0.6953 0.52669 0.284 0.000 0.256 0.012 0.448
#> SRR1105463 3 0.6409 -0.30062 0.132 0.000 0.440 0.008 0.420
#> SRR811005 2 0.0404 0.77354 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1385319 1 0.3942 0.58650 0.728 0.000 0.000 0.012 0.260
#> SRR1325871 3 0.5765 0.30568 0.000 0.000 0.488 0.088 0.424
#> SRR1355415 3 0.2171 0.66605 0.000 0.000 0.912 0.024 0.064
#> SRR1090861 1 0.1626 0.68699 0.940 0.000 0.000 0.044 0.016
#> SRR1320712 1 0.4622 0.60512 0.684 0.000 0.000 0.276 0.040
#> SRR1470075 1 0.3579 0.60739 0.756 0.000 0.000 0.004 0.240
#> SRR1091254 1 0.3193 0.67884 0.840 0.000 0.000 0.028 0.132
#> SRR1101397 3 0.3577 0.66496 0.000 0.000 0.808 0.032 0.160
#> SRR1321165 1 0.4589 0.60401 0.724 0.000 0.000 0.064 0.212
#> SRR1092112 3 0.3495 0.66499 0.000 0.000 0.812 0.028 0.160
#> SRR1417588 3 0.1809 0.68839 0.000 0.000 0.928 0.012 0.060
#> SRR1074790 1 0.5055 0.59359 0.680 0.024 0.000 0.264 0.032
#> SRR1432106 2 0.0510 0.77367 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR655756 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1458314 1 0.5024 0.48813 0.628 0.000 0.040 0.004 0.328
#> SRR1318582 2 0.0703 0.77368 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1080484 2 0.2193 0.74907 0.008 0.900 0.000 0.092 0.000
#> SRR1072749 3 0.6780 0.17021 0.092 0.000 0.488 0.052 0.368
#> SRR1078586 1 0.1638 0.68301 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1400333 4 0.6892 0.21473 0.384 0.128 0.000 0.452 0.036
#> SRR1078834 4 0.6027 0.78702 0.124 0.264 0.000 0.600 0.012
#> SRR1417611 2 0.4196 0.30296 0.000 0.640 0.000 0.356 0.004
#> SRR1396840 1 0.4588 0.60308 0.720 0.000 0.000 0.060 0.220
#> SRR1465440 2 0.0162 0.77308 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1400530 2 0.3003 0.64585 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR614984 2 0.6796 -0.39262 0.220 0.456 0.000 0.316 0.008
#> SRR1324269 1 0.6320 -0.03342 0.480 0.000 0.124 0.008 0.388
#> SRR1401491 2 0.2648 0.68676 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1319443 1 0.4317 0.52849 0.668 0.000 0.004 0.008 0.320
#> SRR1324349 2 0.2676 0.72472 0.036 0.884 0.000 0.080 0.000
#> SRR1345523 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1500846 1 0.4651 0.55758 0.684 0.000 0.012 0.020 0.284
#> SRR661505 3 0.5213 0.49054 0.000 0.000 0.616 0.064 0.320
#> SRR1419062 5 0.6664 0.51597 0.200 0.000 0.304 0.008 0.488
#> SRR1480131 1 0.4305 0.55267 0.688 0.000 0.004 0.012 0.296
#> SRR1421284 2 0.6865 -0.46219 0.220 0.412 0.000 0.360 0.008
#> SRR1329624 1 0.1557 0.68513 0.940 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1315739 3 0.2795 0.67835 0.000 0.000 0.872 0.028 0.100
#> SRR1099189 2 0.4928 0.36903 0.056 0.660 0.000 0.284 0.000
#> SRR1083286 1 0.4453 0.52013 0.660 0.000 0.008 0.008 0.324
#> SRR1091890 1 0.6356 0.39349 0.548 0.000 0.044 0.072 0.336
#> SRR1347436 2 0.3106 0.71241 0.024 0.844 0.000 0.132 0.000
#> SRR1327473 1 0.5466 0.54248 0.644 0.040 0.000 0.284 0.032
#> SRR1338195 3 0.2964 0.67755 0.000 0.000 0.856 0.024 0.120
#> SRR809698 2 0.0404 0.77354 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1457792 1 0.4424 0.63674 0.728 0.000 0.000 0.224 0.048
#> SRR658271 2 0.2280 0.71947 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1339597 1 0.4571 0.53860 0.664 0.000 0.020 0.004 0.312
#> SRR1454842 3 0.5765 0.30568 0.000 0.000 0.488 0.088 0.424
#> SRR1322643 1 0.3579 0.60739 0.756 0.000 0.000 0.004 0.240
#> SRR614887 3 0.3106 0.67413 0.000 0.000 0.844 0.024 0.132
#> SRR1354620 3 0.3424 0.63114 0.028 0.000 0.852 0.024 0.096
#> SRR615056 2 0.2305 0.74683 0.012 0.896 0.000 0.092 0.000
#> SRR1105320 1 0.5466 0.54248 0.644 0.040 0.000 0.284 0.032
#> SRR1391529 1 0.3715 0.58756 0.736 0.000 0.000 0.004 0.260
#> SRR663052 2 0.1270 0.76065 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1478834 1 0.3715 0.58756 0.736 0.000 0.000 0.004 0.260
#> SRR812366 2 0.0290 0.77284 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1435330 3 0.5259 0.55013 0.036 0.000 0.688 0.040 0.236
#> SRR615383 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1389157 1 0.6920 0.43428 0.536 0.092 0.004 0.304 0.064
#> SRR613568 2 0.2573 0.74137 0.016 0.880 0.000 0.104 0.000
#> SRR614095 2 0.4354 0.60662 0.068 0.768 0.000 0.160 0.004
#> SRR1103092 1 0.4921 0.48450 0.640 0.000 0.036 0.004 0.320
#> SRR1337155 1 0.7096 0.06519 0.496 0.000 0.164 0.044 0.296
#> SRR1475345 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR809089 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1446180 4 0.6117 0.72934 0.128 0.184 0.000 0.648 0.040
#> SRR1406372 2 0.2648 0.68694 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1339880 5 0.6256 -0.15836 0.012 0.000 0.404 0.104 0.480
#> SRR1353136 1 0.6639 0.52402 0.612 0.008 0.040 0.152 0.188
#> SRR1093906 3 0.1809 0.68839 0.000 0.000 0.928 0.012 0.060
#> SRR614035 2 0.0609 0.77419 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1351104 1 0.3635 0.60189 0.748 0.000 0.000 0.004 0.248
#> SRR1363926 2 0.4604 0.12697 0.008 0.584 0.000 0.404 0.004
#> SRR1399861 1 0.4830 0.60917 0.684 0.000 0.000 0.256 0.060
#> SRR1338789 1 0.3480 0.60551 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1421420 3 0.5113 0.56003 0.028 0.000 0.688 0.036 0.248
#> SRR1420832 2 0.0771 0.77413 0.004 0.976 0.000 0.020 0.000
#> SRR1476231 1 0.1965 0.68728 0.924 0.000 0.000 0.052 0.024
#> SRR1352870 4 0.6826 0.71186 0.256 0.228 0.000 0.500 0.016
#> SRR1315041 2 0.4196 0.30296 0.000 0.640 0.000 0.356 0.004
#> SRR661877 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1443268 3 0.3577 0.66496 0.000 0.000 0.808 0.032 0.160
#> SRR1416617 3 0.5846 0.39934 0.048 0.000 0.592 0.036 0.324
#> SRR1102443 1 0.4827 0.62338 0.704 0.004 0.000 0.232 0.060
#> SRR655672 2 0.4234 0.47588 0.020 0.724 0.000 0.252 0.004
#> SRR1420006 3 0.1582 0.67692 0.000 0.000 0.944 0.028 0.028
#> SRR1458267 2 0.1544 0.76077 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR613819 2 0.6806 -0.42767 0.208 0.432 0.000 0.352 0.008
#> SRR1469432 2 0.4251 0.25859 0.000 0.624 0.000 0.372 0.004
#> SRR660907 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1465092 2 0.2612 0.73626 0.008 0.868 0.000 0.124 0.000
#> SRR1470727 1 0.6587 -0.21032 0.428 0.000 0.144 0.012 0.416
#> SRR1339153 5 0.6533 -0.25443 0.012 0.000 0.424 0.136 0.428
#> SRR1472749 5 0.6256 -0.15836 0.012 0.000 0.404 0.104 0.480
#> SRR1414379 2 0.6824 -0.43667 0.212 0.428 0.000 0.352 0.008
#> SRR1431326 1 0.4468 0.62576 0.716 0.000 0.000 0.240 0.044
#> SRR1487278 4 0.4870 0.36458 0.016 0.448 0.000 0.532 0.004
#> SRR1098312 1 0.6356 0.39349 0.548 0.000 0.044 0.072 0.336
#> SRR810273 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1376000 2 0.2439 0.73897 0.004 0.876 0.000 0.120 0.000
#> SRR614467 2 0.1341 0.75843 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR811471 1 0.2305 0.68177 0.896 0.000 0.000 0.012 0.092
#> SRR1478341 3 0.2482 0.68457 0.000 0.000 0.892 0.024 0.084
#> SRR1088606 1 0.5365 0.54837 0.656 0.000 0.000 0.116 0.228
#> SRR1479699 1 0.5567 0.42555 0.560 0.000 0.016 0.044 0.380
#> SRR1403589 2 0.2605 0.69025 0.000 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR812625 2 0.1121 0.77049 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1359803 5 0.6374 0.50365 0.180 0.000 0.224 0.016 0.580
#> SRR1338988 2 0.0510 0.77367 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1471222 2 0.1121 0.77296 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1378992 1 0.4384 0.63270 0.728 0.000 0.000 0.228 0.044
#> SRR659427 1 0.7387 0.09526 0.444 0.000 0.080 0.124 0.352
#> SRR1096638 1 0.2653 0.68263 0.880 0.000 0.000 0.024 0.096
#> SRR1466619 2 0.4118 0.36040 0.000 0.660 0.000 0.336 0.004
#> SRR659307 2 0.4425 0.33827 0.024 0.680 0.000 0.296 0.000
#> SRR1439994 3 0.3134 0.67656 0.000 0.000 0.848 0.032 0.120
#> SRR1454931 1 0.3884 0.56908 0.708 0.000 0.000 0.004 0.288
#> SRR1332928 1 0.5024 0.48813 0.628 0.000 0.040 0.004 0.328
#> SRR658621 2 0.2305 0.74683 0.012 0.896 0.000 0.092 0.000
#> SRR1095840 1 0.4059 0.55392 0.700 0.000 0.004 0.004 0.292
#> SRR1458243 3 0.3577 0.66496 0.000 0.000 0.808 0.032 0.160
#> SRR1374270 1 0.5348 0.58298 0.656 0.012 0.004 0.276 0.052
#> SRR1470947 2 0.0771 0.77413 0.004 0.976 0.000 0.020 0.000
#> SRR1365598 2 0.4310 0.19599 0.000 0.604 0.000 0.392 0.004
#> SRR662787 2 0.1341 0.75843 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1408727 2 0.6806 -0.42767 0.208 0.432 0.000 0.352 0.008
#> SRR1456274 1 0.3563 0.69147 0.840 0.008 0.000 0.060 0.092
#> SRR817744 1 0.2193 0.68996 0.912 0.000 0.000 0.028 0.060
#> SRR1478744 2 0.0000 0.77256 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0404 0.77459 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1102680 5 0.6871 0.53116 0.232 0.000 0.288 0.012 0.468
#> SRR1374198 1 0.4736 0.60393 0.712 0.000 0.000 0.072 0.216
#> SRR1445856 3 0.5750 0.42196 0.072 0.000 0.640 0.028 0.260
#> SRR820049 3 0.5341 0.44067 0.000 0.000 0.580 0.064 0.356
#> SRR1375290 3 0.7183 0.10069 0.112 0.000 0.472 0.072 0.344
#> SRR818999 5 0.6326 0.35511 0.136 0.000 0.408 0.004 0.452
#> SRR1390242 1 0.1956 0.68372 0.916 0.000 0.000 0.008 0.076
#> SRR1401164 2 0.1341 0.77331 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR1454629 1 0.4305 0.55267 0.688 0.000 0.004 0.012 0.296
#> SRR1332187 5 0.6419 0.32238 0.108 0.000 0.372 0.020 0.500
#> SRR603365 3 0.1041 0.67715 0.000 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR657833 2 0.3106 0.71241 0.024 0.844 0.000 0.132 0.000
#> SRR1436207 2 0.4314 0.46677 0.016 0.700 0.000 0.280 0.004
#> SRR1488017 1 0.1568 0.68674 0.944 0.000 0.000 0.036 0.020
#> SRR612947 2 0.0510 0.77323 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1480384 5 0.6585 0.23397 0.408 0.000 0.144 0.012 0.436
#> SRR1364761 2 0.1544 0.76077 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1308086 5 0.6252 -0.15164 0.012 0.000 0.400 0.104 0.484
#> SRR1441868 1 0.4468 0.62576 0.716 0.000 0.000 0.240 0.044
#> SRR1485380 3 0.1800 0.67017 0.000 0.000 0.932 0.020 0.048
#> SRR1073705 1 0.4506 0.62074 0.716 0.004 0.000 0.244 0.036
#> SRR615032 2 0.0290 0.77352 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1452356 2 0.0771 0.77413 0.004 0.976 0.000 0.020 0.000
#> SRR1442983 2 0.0404 0.77387 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1100346 2 0.5683 -0.05539 0.080 0.564 0.000 0.352 0.004
#> SRR1332816 1 0.4490 0.63726 0.724 0.000 0.000 0.224 0.052
#> SRR612299 2 0.4434 -0.05506 0.000 0.536 0.000 0.460 0.004
#> SRR1407386 1 0.2144 0.68918 0.912 0.000 0.000 0.020 0.068
#> SRR1418064 2 0.4264 0.24903 0.000 0.620 0.000 0.376 0.004
#> SRR1309403 1 0.5466 0.54248 0.644 0.040 0.000 0.284 0.032
#> SRR1498395 2 0.0703 0.77368 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1079998 3 0.1800 0.67017 0.000 0.000 0.932 0.020 0.048
#> SRR1498885 2 0.0510 0.77367 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1337215 4 0.5976 0.78602 0.136 0.252 0.000 0.604 0.008
#> SRR1414749 3 0.3724 0.64499 0.000 0.000 0.788 0.028 0.184
#> SRR1365963 3 0.5750 0.42196 0.072 0.000 0.640 0.028 0.260
#> SRR1368030 2 0.4118 0.36040 0.000 0.660 0.000 0.336 0.004
#> SRR1419760 1 0.6611 0.46548 0.560 0.072 0.000 0.296 0.072
#> SRR1381841 1 0.4401 0.56094 0.684 0.000 0.004 0.016 0.296
#> SRR821388 1 0.5139 0.60855 0.688 0.012 0.000 0.236 0.064
#> SRR657623 2 0.2932 0.72263 0.032 0.864 0.000 0.104 0.000
#> SRR1094241 3 0.3616 0.67184 0.000 0.000 0.804 0.032 0.164
#> SRR819583 3 0.3458 0.63429 0.024 0.000 0.840 0.016 0.120
#> SRR1096149 5 0.7315 0.39816 0.336 0.000 0.184 0.044 0.436
#> SRR1342829 3 0.1041 0.67715 0.000 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR1353028 1 0.2248 0.68246 0.900 0.000 0.000 0.012 0.088
#> SRR811333 1 0.6200 0.27752 0.540 0.000 0.092 0.020 0.348
#> SRR1311666 2 0.0609 0.77275 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1486698 2 0.1908 0.73516 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1446436 2 0.1544 0.76077 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR815092 1 0.3992 0.57789 0.720 0.000 0.000 0.012 0.268
#> SRR1500149 2 0.2411 0.74511 0.008 0.884 0.000 0.108 0.000
#> SRR1100564 1 0.4102 0.54494 0.692 0.000 0.004 0.004 0.300
#> SRR1403072 3 0.1915 0.66738 0.000 0.000 0.928 0.032 0.040
#> SRR811653 1 0.4830 0.60917 0.684 0.000 0.000 0.256 0.060
#> SRR1311348 2 0.0510 0.77465 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1489438 2 0.0510 0.77367 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1435442 4 0.4870 0.36458 0.016 0.448 0.000 0.532 0.004
#> SRR1421444 3 0.2233 0.68843 0.000 0.000 0.904 0.016 0.080
#> SRR1344010 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1319520 1 0.4468 0.62576 0.716 0.000 0.000 0.240 0.044
#> SRR1444763 1 0.5270 0.57291 0.672 0.000 0.000 0.120 0.208
#> SRR1415026 2 0.0404 0.77409 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1416596 2 0.4238 0.26710 0.000 0.628 0.000 0.368 0.004
#> SRR1485499 2 0.4029 0.40201 0.000 0.680 0.000 0.316 0.004
#> SRR1316078 2 0.3074 0.63963 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR663465 2 0.2136 0.75076 0.008 0.904 0.000 0.088 0.000
#> SRR1310094 2 0.4819 0.23944 0.024 0.620 0.000 0.352 0.004
#> SRR663537 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1486780 1 0.3267 0.68857 0.844 0.000 0.000 0.044 0.112
#> SRR1453950 1 0.3067 0.66948 0.856 0.000 0.012 0.012 0.120
#> SRR1087875 1 0.4370 0.62766 0.724 0.000 0.000 0.236 0.040
#> SRR613318 1 0.5619 0.54236 0.628 0.028 0.004 0.300 0.040
#> SRR1332694 1 0.1557 0.68513 0.940 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1468469 3 0.2260 0.67486 0.000 0.000 0.908 0.028 0.064
#> SRR818670 2 0.1478 0.77096 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1120318 1 0.4037 0.55549 0.704 0.000 0.004 0.004 0.288
#> SRR1311622 3 0.6099 0.35222 0.012 0.000 0.516 0.092 0.380
#> SRR1500931 3 0.2423 0.65539 0.000 0.000 0.896 0.024 0.080
#> SRR1387494 5 0.6252 -0.15164 0.012 0.000 0.400 0.104 0.484
#> SRR1379175 1 0.7180 -0.06636 0.456 0.160 0.000 0.340 0.044
#> SRR1401909 3 0.2171 0.66605 0.000 0.000 0.912 0.024 0.064
#> SRR1440541 2 0.2648 0.68950 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1068832 3 0.1800 0.67017 0.000 0.000 0.932 0.020 0.048
#> SRR1376640 2 0.5946 -0.05191 0.108 0.552 0.000 0.336 0.004
#> SRR1085712 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1082283 1 0.4080 0.60615 0.728 0.000 0.000 0.020 0.252
#> SRR1084276 3 0.6855 -0.39441 0.236 0.000 0.444 0.008 0.312
#> SRR1353262 2 0.4196 0.30173 0.000 0.640 0.000 0.356 0.004
#> SRR1437035 1 0.2305 0.68131 0.896 0.000 0.000 0.012 0.092
#> SRR1396877 1 0.6754 -0.19105 0.420 0.000 0.172 0.012 0.396
#> SRR1443026 2 0.2127 0.72491 0.000 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1417936 1 0.1648 0.68658 0.940 0.000 0.000 0.040 0.020
#> SRR1436822 4 0.5966 0.63259 0.100 0.376 0.000 0.520 0.004
#> SRR1101128 3 0.1800 0.67017 0.000 0.000 0.932 0.020 0.048
#> SRR1363886 2 0.0703 0.77368 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR612983 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1394366 4 0.5258 0.75234 0.064 0.296 0.000 0.636 0.004
#> SRR1093218 3 0.4850 0.57258 0.000 0.000 0.696 0.072 0.232
#> SRR1077090 3 0.2769 0.67847 0.000 0.000 0.876 0.032 0.092
#> SRR1327430 4 0.6761 0.72904 0.200 0.304 0.000 0.484 0.012
#> SRR1088958 1 0.4370 0.62766 0.724 0.000 0.000 0.236 0.040
#> SRR1486931 2 0.1544 0.76077 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1086820 1 0.4152 0.56458 0.692 0.000 0.000 0.012 0.296
#> SRR1383000 1 0.5632 0.40500 0.620 0.000 0.088 0.008 0.284
#> SRR1355705 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR614335 2 0.1341 0.75843 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000
#> SRR660534 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR817094 2 0.0404 0.77409 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1334265 2 0.4182 0.31186 0.000 0.644 0.000 0.352 0.004
#> SRR1456401 2 0.5192 0.14699 0.044 0.596 0.000 0.356 0.004
#> SRR1086393 1 0.3043 0.69405 0.864 0.000 0.000 0.056 0.080
#> SRR1351521 3 0.3085 0.68738 0.000 0.000 0.852 0.032 0.116
#> SRR1093100 1 0.4908 0.61467 0.692 0.004 0.000 0.244 0.060
#> SRR1309382 1 0.4156 0.55351 0.700 0.000 0.008 0.004 0.288
#> SRR1089375 5 0.6736 0.53202 0.232 0.000 0.276 0.008 0.484
#> SRR1499482 2 0.2707 0.72452 0.008 0.860 0.000 0.132 0.000
#> SRR614719 2 0.4360 0.35599 0.020 0.680 0.000 0.300 0.000
#> SRR1081473 3 0.7052 0.02013 0.112 0.000 0.440 0.056 0.392
#> SRR1087415 1 0.4152 0.56458 0.692 0.000 0.000 0.012 0.296
#> SRR1088217 5 0.6359 0.24423 0.096 0.000 0.416 0.020 0.468
#> SRR808496 2 0.4928 0.36903 0.056 0.660 0.000 0.284 0.000
#> SRR1336463 2 0.5192 0.14699 0.044 0.596 0.000 0.356 0.004
#> SRR612359 2 0.4546 0.31679 0.028 0.668 0.000 0.304 0.000
#> SRR1444412 3 0.6855 -0.39441 0.236 0.000 0.444 0.008 0.312
#> SRR1074116 3 0.1041 0.67715 0.000 0.000 0.964 0.032 0.004
#> SRR821846 3 0.2964 0.67755 0.000 0.000 0.856 0.024 0.120
#> SRR656095 2 0.0290 0.77240 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR808914 1 0.4153 0.66511 0.784 0.008 0.000 0.160 0.048
#> SRR1349099 1 0.5299 0.56598 0.668 0.000 0.000 0.120 0.212
#> SRR1337886 2 0.1893 0.76227 0.024 0.928 0.000 0.048 0.000
#> SRR813632 5 0.6467 0.49270 0.176 0.000 0.324 0.004 0.496
#> SRR1101591 3 0.5537 0.56599 0.044 0.000 0.672 0.048 0.236
#> SRR1089713 5 0.6734 0.20101 0.404 0.000 0.168 0.012 0.416
#> SRR1453127 3 0.2482 0.68457 0.000 0.000 0.892 0.024 0.084
#> SRR1498354 3 0.6307 -0.24583 0.120 0.000 0.464 0.008 0.408
#> SRR1313831 1 0.3942 0.58650 0.728 0.000 0.000 0.012 0.260
#> SRR1315434 3 0.4850 0.57258 0.000 0.000 0.696 0.072 0.232
#> SRR814747 2 0.3662 0.54155 0.004 0.744 0.000 0.252 0.000
#> SRR1358539 1 0.4153 0.66511 0.784 0.008 0.000 0.160 0.048
#> SRR1367807 1 0.4490 0.63726 0.724 0.000 0.000 0.224 0.052
#> SRR1365791 5 0.7147 0.46950 0.280 0.000 0.180 0.044 0.496
#> SRR1081519 5 0.6362 0.23766 0.096 0.000 0.420 0.020 0.464
#> SRR614707 4 0.6115 0.78548 0.140 0.252 0.000 0.596 0.012
#> SRR1094027 1 0.1638 0.68301 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1489092 5 0.7114 0.10309 0.372 0.000 0.040 0.152 0.436
#> SRR1079502 5 0.6700 0.52670 0.216 0.000 0.288 0.008 0.488
#> SRR1457814 1 0.4830 0.60917 0.684 0.000 0.000 0.256 0.060
#> SRR1455127 2 0.4251 0.25859 0.000 0.624 0.000 0.372 0.004
#> SRR615081 2 0.4420 -0.00349 0.000 0.548 0.000 0.448 0.004
#> SRR1327855 3 0.1800 0.67017 0.000 0.000 0.932 0.020 0.048
#> SRR1417873 2 0.4196 0.30296 0.000 0.640 0.000 0.356 0.004
#> SRR1394125 5 0.7109 0.26928 0.140 0.000 0.404 0.044 0.412
#> SRR1488388 1 0.2110 0.68500 0.912 0.000 0.000 0.016 0.072
#> SRR1401122 2 0.5599 0.25926 0.172 0.656 0.000 0.168 0.004
#> SRR612383 2 0.4017 0.49183 0.012 0.736 0.000 0.248 0.004
#> SRR1477711 1 0.2069 0.68756 0.912 0.000 0.000 0.012 0.076
#> SRR1350813 2 0.2612 0.73626 0.008 0.868 0.000 0.124 0.000
#> SRR612851 2 0.5219 0.26872 0.060 0.636 0.000 0.300 0.004
#> SRR1086349 1 0.1877 0.68547 0.924 0.000 0.000 0.064 0.012
#> SRR812837 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1340010 1 0.6352 0.55413 0.620 0.000 0.040 0.200 0.140
#> SRR1475885 1 0.5493 0.55720 0.660 0.004 0.000 0.124 0.212
#> SRR1376334 1 0.3942 0.58650 0.728 0.000 0.000 0.012 0.260
#> SRR1399821 1 0.5299 0.56598 0.668 0.000 0.000 0.120 0.212
#> SRR1347042 3 0.2482 0.68457 0.000 0.000 0.892 0.024 0.084
#> SRR612323 2 0.7001 -0.43174 0.248 0.424 0.000 0.316 0.012
#> SRR612604 2 0.1121 0.77103 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1389546 2 0.1544 0.76077 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1311877 1 0.1877 0.68547 0.924 0.000 0.000 0.064 0.012
#> SRR1465608 1 0.6472 0.24520 0.504 0.000 0.068 0.048 0.380
#> SRR1101808 2 0.0510 0.77323 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1414079 3 0.5259 0.55013 0.036 0.000 0.688 0.040 0.236
#> SRR1331153 2 0.2625 0.73868 0.016 0.876 0.000 0.108 0.000
#> SRR1078439 1 0.7277 0.10494 0.452 0.000 0.096 0.092 0.360
#> SRR2165527 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1351147 1 0.4702 0.61788 0.700 0.008 0.000 0.256 0.036
#> SRR1313536 2 0.1270 0.76901 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1070308 1 0.5466 0.54248 0.644 0.040 0.000 0.284 0.032
#> SRR1403110 1 0.3635 0.59347 0.748 0.000 0.000 0.004 0.248
#> SRR1400355 2 0.1544 0.76077 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1401317 3 0.1800 0.67017 0.000 0.000 0.932 0.020 0.048
#> SRR1456862 1 0.4170 0.62764 0.760 0.000 0.000 0.048 0.192
#> SRR1074622 1 0.5998 0.14402 0.520 0.000 0.104 0.004 0.372
#> SRR1465847 3 0.5960 -0.12586 0.116 0.000 0.516 0.000 0.368
#> SRR1443376 2 0.0404 0.77387 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1471312 5 0.6345 0.50258 0.176 0.000 0.224 0.016 0.584
#> SRR1075579 1 0.1956 0.68372 0.916 0.000 0.000 0.008 0.076
#> SRR1090881 1 0.6665 0.54063 0.568 0.060 0.004 0.288 0.080
#> SRR612251 2 0.6162 -0.08256 0.124 0.548 0.000 0.320 0.008
#> SRR1418581 1 0.4370 0.62611 0.724 0.000 0.000 0.236 0.040
#> SRR658045 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR613214 2 0.4295 0.46536 0.024 0.724 0.000 0.248 0.004
#> SRR613078 2 0.3282 0.67622 0.008 0.804 0.000 0.188 0.000
#> SRR1472998 3 0.6100 -0.21381 0.128 0.000 0.484 0.000 0.388
#> SRR1433452 4 0.6772 0.72636 0.200 0.308 0.000 0.480 0.012
#> SRR1101957 1 0.1877 0.68547 0.924 0.000 0.000 0.064 0.012
#> SRR1487993 5 0.6256 -0.15836 0.012 0.000 0.404 0.104 0.480
#> SRR1465983 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1380375 1 0.1357 0.68468 0.948 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR1367566 3 0.5416 0.51159 0.032 0.000 0.644 0.036 0.288
#> SRR1316151 2 0.4310 0.19599 0.000 0.604 0.000 0.392 0.004
#> SRR1417547 2 0.3214 0.70534 0.036 0.844 0.000 0.120 0.000
#> SRR659389 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1490270 2 0.2416 0.74551 0.012 0.888 0.000 0.100 0.000
#> SRR1398207 5 0.6877 0.49584 0.232 0.000 0.332 0.008 0.428
#> SRR1358755 3 0.4070 0.58258 0.048 0.000 0.808 0.020 0.124
#> SRR1078903 2 0.2612 0.73558 0.008 0.868 0.000 0.124 0.000
#> SRR1323252 2 0.0162 0.77308 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1451796 2 0.1544 0.76077 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1369172 1 0.4109 0.56823 0.700 0.000 0.000 0.012 0.288
#> SRR615982 2 0.4772 0.52341 0.068 0.720 0.000 0.208 0.004
#> SRR1480431 2 0.4928 0.36903 0.056 0.660 0.000 0.284 0.000
#> SRR1429825 4 0.7032 0.63516 0.252 0.328 0.000 0.408 0.012
#> SRR1102393 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1071313 1 0.2653 0.68263 0.880 0.000 0.000 0.024 0.096
#> SRR808351 1 0.6411 -0.01558 0.480 0.000 0.124 0.012 0.384
#> SRR1317513 1 0.1357 0.68468 0.948 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR1480501 3 0.5760 0.17037 0.108 0.000 0.620 0.008 0.264
#> SRR1081910 1 0.6221 0.26632 0.532 0.000 0.092 0.020 0.356
#> SRR1086611 4 0.6027 0.78702 0.124 0.264 0.000 0.600 0.012
#> SRR1392571 2 0.2997 0.70396 0.012 0.840 0.000 0.148 0.000
#> SRR1311441 1 0.4468 0.62576 0.716 0.000 0.000 0.240 0.044
#> SRR808152 1 0.2104 0.68739 0.916 0.000 0.000 0.024 0.060
#> SRR657313 3 0.5708 0.37198 0.000 0.000 0.528 0.088 0.384
#> SRR1433131 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1321011 2 0.0162 0.77308 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1500598 2 0.0609 0.77399 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1379343 2 0.0404 0.77387 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1389108 1 0.4325 0.62380 0.724 0.000 0.000 0.240 0.036
#> SRR1376228 3 0.3238 0.66979 0.000 0.000 0.836 0.028 0.136
#> SRR1399757 1 0.5879 0.51197 0.632 0.076 0.000 0.260 0.032
#> SRR1358060 3 0.3724 0.64499 0.000 0.000 0.788 0.028 0.184
#> SRR1464517 5 0.7394 0.15361 0.140 0.000 0.336 0.072 0.452
#> SRR613557 2 0.4425 0.33827 0.024 0.680 0.000 0.296 0.000
#> SRR809831 1 0.6325 -0.05152 0.476 0.000 0.124 0.008 0.392
#> SRR1429387 3 0.1809 0.68839 0.000 0.000 0.928 0.012 0.060
#> SRR816565 1 0.1965 0.68728 0.924 0.000 0.000 0.052 0.024
#> SRR1071644 1 0.1648 0.68765 0.940 0.000 0.000 0.040 0.020
#> SRR1406936 5 0.6700 0.52670 0.216 0.000 0.288 0.008 0.488
#> SRR1072031 2 0.0162 0.77221 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1374671 2 0.4234 0.47588 0.020 0.724 0.000 0.252 0.004
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 1 0.4318 0.529032 0.772 0.000 0.012 0.124 0.076 0.016
#> SRR1404105 1 0.5205 0.347793 0.580 0.000 0.004 0.072 0.336 0.008
#> SRR2164936 2 0.0146 0.768739 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1472057 3 0.0937 0.651261 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR614491 2 0.5161 0.429018 0.136 0.668 0.000 0.004 0.012 0.180
#> SRR1069376 1 0.4359 0.495879 0.664 0.000 0.000 0.032 0.296 0.008
#> SRR811964 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.3236 0.675539 0.036 0.820 0.000 0.000 0.004 0.140
#> SRR1345715 1 0.1708 0.629513 0.932 0.000 0.000 0.004 0.040 0.024
#> SRR1328073 1 0.1909 0.607317 0.920 0.024 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR1394209 2 0.6601 -0.209317 0.328 0.368 0.000 0.008 0.012 0.284
#> SRR1474018 2 0.3866 -0.449133 0.000 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR1099809 5 0.6851 -0.149843 0.040 0.000 0.272 0.280 0.404 0.004
#> SRR1500555 2 0.4510 0.528176 0.080 0.724 0.000 0.004 0.008 0.184
#> SRR1354363 1 0.6109 0.048547 0.448 0.000 0.000 0.188 0.352 0.012
#> SRR1391619 4 0.3265 0.570856 0.000 0.000 0.248 0.748 0.004 0.000
#> SRR1307997 2 0.2845 0.683873 0.008 0.836 0.000 0.000 0.008 0.148
#> SRR663124 2 0.4026 0.596963 0.056 0.768 0.000 0.004 0.008 0.164
#> SRR1334670 5 0.3652 0.390863 0.324 0.000 0.000 0.004 0.672 0.000
#> SRR612515 2 0.4540 0.526372 0.080 0.720 0.000 0.004 0.008 0.188
#> SRR1092727 2 0.3109 0.690697 0.016 0.812 0.000 0.000 0.004 0.168
#> SRR1364013 2 0.3014 0.718433 0.052 0.860 0.000 0.004 0.008 0.076
#> SRR1468553 3 0.5168 0.067437 0.008 0.000 0.488 0.440 0.064 0.000
#> SRR1403980 4 0.6232 0.050039 0.024 0.000 0.416 0.416 0.140 0.004
#> SRR1420169 3 0.3602 0.621814 0.000 0.000 0.784 0.160 0.056 0.000
#> SRR1442800 6 0.5187 0.640152 0.140 0.148 0.000 0.004 0.024 0.684
#> SRR1359214 2 0.1327 0.759442 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1499849 5 0.6851 -0.149843 0.040 0.000 0.272 0.280 0.404 0.004
#> SRR1500030 4 0.2595 0.607743 0.000 0.000 0.160 0.836 0.000 0.004
#> SRR1093053 1 0.6392 0.049941 0.416 0.000 0.020 0.392 0.164 0.008
#> SRR1399843 1 0.6463 0.062274 0.452 0.000 0.028 0.240 0.280 0.000
#> SRR1380231 5 0.6915 0.090003 0.068 0.000 0.200 0.272 0.456 0.004
#> SRR809470 5 0.6051 -0.267022 0.000 0.000 0.344 0.260 0.396 0.000
#> SRR614239 2 0.4540 0.526372 0.080 0.720 0.000 0.004 0.008 0.188
#> SRR613939 2 0.3743 0.547940 0.024 0.724 0.000 0.000 0.000 0.252
#> SRR612971 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.2048 0.719362 0.000 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR811357 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.1492 0.629854 0.940 0.000 0.000 0.000 0.036 0.024
#> SRR613006 6 0.4264 0.666429 0.012 0.376 0.000 0.000 0.008 0.604
#> SRR1469570 2 0.1444 0.755503 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1457354 6 0.3838 0.612328 0.000 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR1362906 4 0.3390 0.504903 0.000 0.000 0.296 0.704 0.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.3330 0.529172 0.716 0.000 0.000 0.000 0.284 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.2485 0.605739 0.892 0.000 0.000 0.040 0.056 0.012
#> SRR1478700 4 0.7009 -0.024776 0.192 0.000 0.068 0.472 0.256 0.012
#> SRR1081543 1 0.4459 0.570632 0.740 0.000 0.000 0.084 0.156 0.020
#> SRR1384754 1 0.3441 0.587438 0.832 0.000 0.004 0.092 0.060 0.012
#> SRR612287 2 0.1204 0.758924 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1380317 2 0.6601 -0.209317 0.328 0.368 0.000 0.008 0.012 0.284
#> SRR1315247 6 0.5198 0.458183 0.184 0.048 0.000 0.012 0.060 0.696
#> SRR1105344 2 0.3050 0.524087 0.000 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236
#> SRR658549 2 0.4126 0.577509 0.056 0.756 0.000 0.004 0.008 0.176
#> SRR1480240 5 0.3508 0.435190 0.292 0.000 0.000 0.004 0.704 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.6603 -0.211875 0.316 0.372 0.000 0.008 0.012 0.292
#> SRR1419476 3 0.4166 0.537686 0.000 0.000 0.728 0.076 0.196 0.000
#> SRR1456075 4 0.3935 0.515464 0.004 0.000 0.292 0.688 0.016 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.3742 0.384925 0.648 0.000 0.000 0.004 0.348 0.000
#> SRR1334419 1 0.0951 0.627113 0.968 0.000 0.000 0.004 0.008 0.020
#> SRR1417154 5 0.5735 0.064452 0.012 0.000 0.232 0.188 0.568 0.000
#> SRR1095985 5 0.7936 0.247989 0.176 0.000 0.072 0.164 0.452 0.136
#> SRR1325771 1 0.3230 0.560860 0.844 0.056 0.000 0.000 0.016 0.084
#> SRR1360420 3 0.0865 0.649460 0.000 0.000 0.964 0.036 0.000 0.000
#> SRR660272 2 0.3404 0.650880 0.012 0.792 0.000 0.004 0.008 0.184
#> SRR1332993 1 0.4359 0.495879 0.664 0.000 0.000 0.032 0.296 0.008
#> SRR1311833 2 0.0146 0.769581 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR808044 4 0.7168 -0.317699 0.240 0.000 0.060 0.348 0.344 0.008
#> SRR1076916 3 0.5916 0.112390 0.000 0.000 0.460 0.236 0.304 0.000
#> SRR1356266 1 0.4356 0.409501 0.608 0.000 0.000 0.032 0.360 0.000
#> SRR1341983 2 0.1636 0.765408 0.024 0.936 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1456114 1 0.5069 -0.029199 0.484 0.000 0.000 0.076 0.440 0.000
#> SRR1072948 3 0.0547 0.647772 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.0937 0.651261 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1480176 1 0.3023 0.568331 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232 0.000
#> SRR613843 2 0.0146 0.768521 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1469192 1 0.5205 0.347793 0.580 0.000 0.004 0.072 0.336 0.008
#> SRR1404555 4 0.7131 0.181134 0.124 0.000 0.000 0.444 0.188 0.244
#> SRR659839 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0260 0.768977 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1362848 1 0.2485 0.605739 0.892 0.000 0.000 0.040 0.056 0.012
#> SRR1407492 2 0.4731 0.504598 0.084 0.696 0.000 0.004 0.008 0.208
#> SRR1455082 2 0.4026 0.594160 0.056 0.768 0.000 0.004 0.008 0.164
#> SRR658362 2 0.1524 0.749561 0.008 0.932 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR810921 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0603 0.767674 0.004 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1456375 3 0.1714 0.650856 0.000 0.000 0.908 0.092 0.000 0.000
#> SRR818232 5 0.3652 0.390863 0.324 0.000 0.000 0.004 0.672 0.000
#> SRR1454868 1 0.5571 0.442076 0.644 0.000 0.008 0.184 0.140 0.024
#> SRR1474816 6 0.3804 0.642644 0.000 0.424 0.000 0.000 0.000 0.576
#> SRR1342002 1 0.3595 0.526433 0.704 0.000 0.000 0.008 0.288 0.000
#> SRR1088437 2 0.0632 0.771272 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1466400 6 0.5302 0.621320 0.176 0.128 0.000 0.004 0.024 0.668
#> SRR658921 6 0.3915 0.653281 0.000 0.412 0.000 0.000 0.004 0.584
#> SRR1499873 2 0.1644 0.760724 0.004 0.920 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1101373 1 0.0935 0.624186 0.964 0.004 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1090145 5 0.2703 0.483999 0.172 0.000 0.000 0.004 0.824 0.000
#> SRR1379324 5 0.4214 0.364529 0.320 0.000 0.000 0.024 0.652 0.004
#> SRR1345307 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.3364 0.593281 0.000 0.000 0.780 0.196 0.024 0.000
#> SRR1086280 3 0.3794 0.552239 0.000 0.000 0.744 0.216 0.040 0.000
#> SRR1454891 2 0.5341 0.400517 0.144 0.644 0.000 0.004 0.012 0.196
#> SRR663185 2 0.1411 0.751941 0.004 0.936 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR811819 1 0.3782 0.451087 0.636 0.000 0.000 0.000 0.360 0.004
#> SRR1318920 1 0.7451 -0.033710 0.340 0.000 0.000 0.140 0.304 0.216
#> SRR656758 2 0.3213 0.636531 0.004 0.784 0.000 0.000 0.008 0.204
#> SRR1474351 1 0.3023 0.568331 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232 0.000
#> SRR660450 2 0.3404 0.650880 0.012 0.792 0.000 0.004 0.008 0.184
#> SRR1472687 2 0.1793 0.760025 0.032 0.928 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1334291 2 0.2048 0.719362 0.000 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1415153 2 0.1910 0.728117 0.000 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1323271 6 0.3833 0.620414 0.000 0.444 0.000 0.000 0.000 0.556
#> SRR1368939 2 0.1267 0.758788 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1443161 1 0.6681 -0.106889 0.356 0.000 0.016 0.332 0.288 0.008
#> SRR614695 6 0.5367 0.616011 0.180 0.124 0.000 0.004 0.028 0.664
#> SRR1092372 5 0.7473 0.040368 0.316 0.000 0.000 0.148 0.328 0.208
#> SRR1474577 1 0.1341 0.629672 0.948 0.000 0.000 0.000 0.028 0.024
#> SRR1406582 1 0.0891 0.627057 0.968 0.000 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR612779 2 0.4858 0.478640 0.092 0.676 0.000 0.000 0.012 0.220
#> SRR1089006 1 0.1492 0.629854 0.940 0.000 0.000 0.000 0.036 0.024
#> SRR1354071 5 0.6751 0.190423 0.076 0.000 0.180 0.232 0.508 0.004
#> SRR1105463 3 0.6788 -0.025143 0.032 0.000 0.360 0.256 0.348 0.004
#> SRR811005 2 0.0260 0.770159 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1385319 5 0.3652 0.390863 0.324 0.000 0.000 0.004 0.672 0.000
#> SRR1325871 4 0.3265 0.570856 0.000 0.000 0.248 0.748 0.004 0.000
#> SRR1355415 3 0.1398 0.648109 0.000 0.000 0.940 0.008 0.052 0.000
#> SRR1090861 1 0.3198 0.548783 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1320712 1 0.2084 0.606185 0.916 0.000 0.000 0.016 0.024 0.044
#> SRR1470075 5 0.3795 0.317114 0.364 0.000 0.000 0.000 0.632 0.004
#> SRR1091254 1 0.4521 0.288825 0.568 0.000 0.000 0.028 0.400 0.004
#> SRR1101397 3 0.3930 0.557282 0.000 0.000 0.728 0.236 0.032 0.004
#> SRR1321165 5 0.6695 0.151401 0.332 0.000 0.000 0.100 0.456 0.112
#> SRR1092112 3 0.3364 0.593281 0.000 0.000 0.780 0.196 0.024 0.000
#> SRR1417588 3 0.2562 0.623755 0.000 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR1074790 1 0.1909 0.607317 0.920 0.024 0.000 0.000 0.004 0.052
#> SRR1432106 2 0.1007 0.762858 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR655756 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458314 5 0.5895 0.407722 0.296 0.000 0.016 0.128 0.552 0.008
#> SRR1318582 2 0.1267 0.758188 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1080484 2 0.2500 0.722665 0.012 0.868 0.000 0.004 0.000 0.116
#> SRR1072749 4 0.6271 0.288192 0.032 0.000 0.348 0.464 0.156 0.000
#> SRR1078586 1 0.3807 0.438415 0.628 0.000 0.000 0.004 0.368 0.000
#> SRR1400333 1 0.6306 0.142091 0.484 0.060 0.000 0.016 0.064 0.376
#> SRR1078834 6 0.5821 0.570227 0.232 0.112 0.000 0.008 0.036 0.612
#> SRR1417611 6 0.3843 0.607547 0.000 0.452 0.000 0.000 0.000 0.548
#> SRR1396840 5 0.6695 0.153531 0.332 0.000 0.000 0.100 0.456 0.112
#> SRR1465440 2 0.0458 0.769659 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1400530 2 0.3351 0.396070 0.000 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288
#> SRR614984 2 0.6286 -0.063201 0.372 0.444 0.000 0.008 0.016 0.160
#> SRR1324269 5 0.6896 0.392911 0.252 0.000 0.064 0.220 0.460 0.004
#> SRR1401491 2 0.3050 0.524087 0.000 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236
#> SRR1319443 5 0.3518 0.458016 0.256 0.000 0.000 0.012 0.732 0.000
#> SRR1324349 2 0.2705 0.725388 0.052 0.872 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1345523 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.6141 0.033889 0.444 0.000 0.000 0.196 0.348 0.012
#> SRR661505 4 0.4157 0.168025 0.000 0.000 0.444 0.544 0.012 0.000
#> SRR1419062 5 0.6895 0.023290 0.052 0.000 0.244 0.268 0.432 0.004
#> SRR1480131 5 0.3330 0.437094 0.284 0.000 0.000 0.000 0.716 0.000
#> SRR1421284 2 0.6605 -0.221962 0.336 0.360 0.000 0.008 0.012 0.284
#> SRR1329624 1 0.3861 0.458376 0.640 0.000 0.000 0.008 0.352 0.000
#> SRR1315739 3 0.2969 0.570654 0.000 0.000 0.776 0.224 0.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.5250 0.339676 0.132 0.608 0.000 0.000 0.004 0.256
#> SRR1083286 5 0.3766 0.462827 0.256 0.000 0.000 0.024 0.720 0.000
#> SRR1091890 5 0.5661 0.393621 0.260 0.000 0.016 0.108 0.604 0.012
#> SRR1347436 2 0.3562 0.661949 0.028 0.784 0.000 0.000 0.008 0.180
#> SRR1327473 1 0.2599 0.585241 0.884 0.028 0.000 0.004 0.008 0.076
#> SRR1338195 3 0.3351 0.532402 0.000 0.000 0.712 0.288 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0363 0.770601 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1457792 1 0.1642 0.630556 0.936 0.000 0.000 0.004 0.032 0.028
#> SRR658271 2 0.3023 0.526728 0.000 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232
#> SRR1339597 5 0.5419 0.374249 0.328 0.000 0.008 0.108 0.556 0.000
#> SRR1454842 4 0.3265 0.570856 0.000 0.000 0.248 0.748 0.004 0.000
#> SRR1322643 5 0.3795 0.317114 0.364 0.000 0.000 0.000 0.632 0.004
#> SRR614887 3 0.3409 0.518489 0.000 0.000 0.700 0.300 0.000 0.000
#> SRR1354620 3 0.2565 0.619396 0.008 0.000 0.872 0.016 0.104 0.000
#> SRR615056 2 0.2592 0.719370 0.016 0.864 0.000 0.004 0.000 0.116
#> SRR1105320 1 0.2599 0.585241 0.884 0.028 0.000 0.004 0.008 0.076
#> SRR1391529 5 0.3684 0.378984 0.332 0.000 0.000 0.004 0.664 0.000
#> SRR663052 2 0.1349 0.754138 0.004 0.940 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1478834 5 0.3684 0.378984 0.332 0.000 0.000 0.004 0.664 0.000
#> SRR812366 2 0.0790 0.766742 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1435330 3 0.5474 0.253495 0.012 0.000 0.532 0.372 0.080 0.004
#> SRR615383 2 0.0146 0.769581 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1389157 1 0.6382 0.430711 0.628 0.080 0.000 0.040 0.140 0.112
#> SRR613568 2 0.3404 0.650880 0.012 0.792 0.000 0.004 0.008 0.184
#> SRR614095 2 0.4680 0.516996 0.088 0.700 0.000 0.000 0.012 0.200
#> SRR1103092 5 0.4753 0.474623 0.240 0.000 0.036 0.032 0.688 0.004
#> SRR1337155 1 0.7556 -0.237330 0.340 0.000 0.116 0.224 0.312 0.008
#> SRR1475345 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 6 0.5158 0.440209 0.188 0.040 0.000 0.012 0.064 0.696
#> SRR1406372 2 0.3126 0.496621 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1339880 4 0.2595 0.607743 0.000 0.000 0.160 0.836 0.000 0.004
#> SRR1353136 1 0.5571 0.442076 0.644 0.000 0.008 0.184 0.140 0.024
#> SRR1093906 3 0.2562 0.623755 0.000 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0692 0.770937 0.004 0.976 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1351104 5 0.3769 0.334681 0.356 0.000 0.000 0.000 0.640 0.004
#> SRR1363926 6 0.4219 0.665948 0.020 0.388 0.000 0.000 0.000 0.592
#> SRR1399861 1 0.2632 0.597237 0.888 0.000 0.000 0.032 0.048 0.032
#> SRR1338789 5 0.3930 0.314617 0.364 0.000 0.000 0.004 0.628 0.004
#> SRR1421420 3 0.5194 0.203911 0.012 0.000 0.536 0.388 0.064 0.000
#> SRR1420832 2 0.0972 0.770487 0.008 0.964 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1476231 1 0.3151 0.553990 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1352870 6 0.5937 0.387112 0.356 0.108 0.000 0.004 0.024 0.508
#> SRR1315041 6 0.3843 0.607547 0.000 0.452 0.000 0.000 0.000 0.548
#> SRR661877 2 0.0146 0.768739 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1443268 3 0.3930 0.557282 0.000 0.000 0.728 0.236 0.032 0.004
#> SRR1416617 3 0.5836 -0.040921 0.016 0.000 0.440 0.424 0.120 0.000
#> SRR1102443 1 0.2713 0.617323 0.884 0.004 0.000 0.024 0.064 0.024
#> SRR655672 2 0.4731 0.504598 0.084 0.696 0.000 0.004 0.008 0.208
#> SRR1420006 3 0.1075 0.651143 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.2048 0.719362 0.000 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR613819 2 0.6588 -0.197045 0.320 0.380 0.000 0.008 0.012 0.280
#> SRR1469432 6 0.3810 0.638141 0.000 0.428 0.000 0.000 0.000 0.572
#> SRR660907 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.2896 0.706112 0.016 0.824 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1470727 5 0.7221 0.324619 0.244 0.000 0.084 0.268 0.400 0.004
#> SRR1339153 4 0.4015 0.573917 0.000 0.000 0.208 0.744 0.036 0.012
#> SRR1472749 4 0.2595 0.607743 0.000 0.000 0.160 0.836 0.000 0.004
#> SRR1414379 2 0.6592 -0.202038 0.324 0.376 0.000 0.008 0.012 0.280
#> SRR1431326 1 0.1218 0.625678 0.956 0.000 0.000 0.004 0.012 0.028
#> SRR1487278 6 0.4403 0.668337 0.032 0.268 0.000 0.000 0.016 0.684
#> SRR1098312 5 0.5661 0.393621 0.260 0.000 0.016 0.108 0.604 0.012
#> SRR810273 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.2882 0.691958 0.008 0.812 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR614467 2 0.1411 0.751941 0.004 0.936 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR811471 1 0.4419 0.434192 0.620 0.000 0.000 0.024 0.348 0.008
#> SRR1478341 3 0.2854 0.602306 0.000 0.000 0.792 0.208 0.000 0.000
#> SRR1088606 5 0.7473 0.040368 0.316 0.000 0.000 0.148 0.328 0.208
#> SRR1479699 5 0.3925 0.460746 0.220 0.000 0.008 0.024 0.744 0.004
#> SRR1403589 2 0.3266 0.420148 0.000 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR812625 2 0.1075 0.765485 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1359803 5 0.5790 0.018137 0.008 0.000 0.148 0.300 0.540 0.004
#> SRR1338988 2 0.1141 0.759997 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1471222 2 0.1610 0.752547 0.000 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1378992 1 0.1003 0.629077 0.964 0.000 0.000 0.000 0.016 0.020
#> SRR659427 1 0.6341 0.060457 0.420 0.000 0.016 0.388 0.168 0.008
#> SRR1096638 1 0.4555 0.492456 0.660 0.000 0.000 0.048 0.284 0.008
#> SRR1466619 6 0.3862 0.541011 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR659307 2 0.5161 0.429018 0.136 0.668 0.000 0.004 0.012 0.180
#> SRR1439994 3 0.3492 0.603002 0.000 0.000 0.788 0.176 0.032 0.004
#> SRR1454931 5 0.3853 0.417987 0.304 0.000 0.000 0.016 0.680 0.000
#> SRR1332928 5 0.5895 0.407722 0.296 0.000 0.016 0.128 0.552 0.008
#> SRR658621 2 0.2592 0.719370 0.016 0.864 0.000 0.004 0.000 0.116
#> SRR1095840 5 0.3489 0.435969 0.288 0.000 0.000 0.004 0.708 0.000
#> SRR1458243 3 0.3930 0.557282 0.000 0.000 0.728 0.236 0.032 0.004
#> SRR1374270 1 0.3165 0.581837 0.860 0.004 0.000 0.028 0.052 0.056
#> SRR1470947 2 0.0972 0.770487 0.008 0.964 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1365598 6 0.3915 0.653281 0.000 0.412 0.000 0.000 0.004 0.584
#> SRR662787 2 0.1411 0.751941 0.004 0.936 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1408727 2 0.6588 -0.197045 0.320 0.380 0.000 0.008 0.012 0.280
#> SRR1456274 1 0.4915 0.509130 0.664 0.008 0.000 0.052 0.260 0.016
#> SRR817744 1 0.3714 0.479903 0.656 0.000 0.000 0.000 0.340 0.004
#> SRR1478744 2 0.0146 0.768993 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1387379 2 0.0632 0.771461 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1102680 5 0.7108 0.064615 0.080 0.000 0.208 0.288 0.420 0.004
#> SRR1374198 1 0.7163 -0.073410 0.364 0.000 0.000 0.112 0.352 0.172
#> SRR1445856 3 0.6008 0.280717 0.020 0.000 0.556 0.272 0.144 0.008
#> SRR820049 4 0.4047 0.332016 0.000 0.000 0.384 0.604 0.012 0.000
#> SRR1375290 4 0.6049 0.432449 0.092 0.000 0.308 0.540 0.060 0.000
#> SRR818999 5 0.6746 -0.189722 0.028 0.000 0.320 0.272 0.376 0.004
#> SRR1390242 1 0.3841 0.413360 0.616 0.000 0.000 0.004 0.380 0.000
#> SRR1401164 2 0.1501 0.762726 0.000 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1454629 5 0.3330 0.437094 0.284 0.000 0.000 0.000 0.716 0.000
#> SRR1332187 5 0.6031 -0.239697 0.000 0.000 0.296 0.280 0.424 0.000
#> SRR603365 3 0.0547 0.647772 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR657833 2 0.3562 0.661949 0.028 0.784 0.000 0.000 0.008 0.180
#> SRR1436207 2 0.4831 0.430189 0.096 0.636 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR1488017 1 0.3309 0.533202 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR612947 2 0.0603 0.770487 0.004 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1480384 5 0.7233 0.273969 0.232 0.000 0.084 0.292 0.388 0.004
#> SRR1364761 2 0.2048 0.719362 0.000 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1308086 4 0.2558 0.606294 0.000 0.000 0.156 0.840 0.000 0.004
#> SRR1441868 1 0.1218 0.625678 0.956 0.000 0.000 0.004 0.012 0.028
#> SRR1485380 3 0.0937 0.651261 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1073705 1 0.0935 0.624186 0.964 0.004 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR615032 2 0.0547 0.770246 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1452356 2 0.0972 0.770487 0.008 0.964 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1442983 2 0.0632 0.769488 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1100346 2 0.6274 0.085121 0.192 0.512 0.000 0.004 0.024 0.268
#> SRR1332816 1 0.1492 0.629854 0.940 0.000 0.000 0.000 0.036 0.024
#> SRR612299 6 0.4345 0.670265 0.016 0.344 0.000 0.000 0.012 0.628
#> SRR1407386 1 0.3769 0.460684 0.640 0.000 0.000 0.000 0.356 0.004
#> SRR1418064 6 0.3804 0.642644 0.000 0.424 0.000 0.000 0.000 0.576
#> SRR1309403 1 0.2599 0.585241 0.884 0.028 0.000 0.004 0.008 0.076
#> SRR1498395 2 0.1267 0.758188 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1079998 3 0.0937 0.651261 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1498885 2 0.1007 0.762858 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1337215 6 0.5700 0.562364 0.236 0.108 0.000 0.004 0.036 0.616
#> SRR1414749 3 0.3620 0.421188 0.000 0.000 0.648 0.352 0.000 0.000
#> SRR1365963 3 0.6008 0.280717 0.020 0.000 0.556 0.272 0.144 0.008
#> SRR1368030 6 0.3862 0.541011 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1419760 1 0.5543 0.485180 0.672 0.020 0.000 0.028 0.120 0.160
#> SRR1381841 5 0.4274 0.419935 0.288 0.000 0.000 0.024 0.676 0.012
#> SRR821388 1 0.2766 0.601417 0.888 0.012 0.000 0.032 0.044 0.024
#> SRR657623 2 0.3182 0.690977 0.036 0.832 0.000 0.008 0.000 0.124
#> SRR1094241 3 0.3630 0.591166 0.000 0.000 0.756 0.212 0.032 0.000
#> SRR819583 3 0.2986 0.617608 0.012 0.000 0.852 0.032 0.104 0.000
#> SRR1096149 4 0.7009 -0.024776 0.192 0.000 0.068 0.472 0.256 0.012
#> SRR1342829 3 0.0547 0.647772 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.4406 0.440911 0.624 0.000 0.000 0.024 0.344 0.008
#> SRR811333 5 0.6258 0.454421 0.248 0.000 0.056 0.132 0.560 0.004
#> SRR1311666 2 0.1267 0.760126 0.000 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1486698 2 0.2094 0.729729 0.020 0.900 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1446436 2 0.2048 0.719362 0.000 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR815092 5 0.3584 0.413803 0.308 0.000 0.000 0.004 0.688 0.000
#> SRR1500149 2 0.3213 0.636531 0.004 0.784 0.000 0.000 0.008 0.204
#> SRR1100564 5 0.3405 0.447731 0.272 0.000 0.000 0.004 0.724 0.000
#> SRR1403072 3 0.0717 0.644813 0.000 0.000 0.976 0.016 0.008 0.000
#> SRR811653 1 0.2632 0.597237 0.888 0.000 0.000 0.032 0.048 0.032
#> SRR1311348 2 0.1444 0.755503 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1489438 2 0.1007 0.762858 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1435442 6 0.4403 0.668337 0.032 0.268 0.000 0.000 0.016 0.684
#> SRR1421444 3 0.2793 0.611991 0.000 0.000 0.800 0.200 0.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.1218 0.625678 0.956 0.000 0.000 0.004 0.012 0.028
#> SRR1444763 1 0.7387 -0.002309 0.360 0.000 0.000 0.128 0.292 0.220
#> SRR1415026 2 0.0790 0.768086 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1416596 6 0.3833 0.621071 0.000 0.444 0.000 0.000 0.000 0.556
#> SRR1485499 2 0.3866 -0.449133 0.000 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484
#> SRR1316078 2 0.3464 0.317701 0.000 0.688 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR663465 2 0.2312 0.727001 0.012 0.876 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1310094 6 0.4529 0.590259 0.024 0.460 0.000 0.004 0.000 0.512
#> SRR663537 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.3737 0.371098 0.608 0.000 0.000 0.000 0.392 0.000
#> SRR1453950 1 0.5061 0.419928 0.612 0.000 0.004 0.068 0.308 0.008
#> SRR1087875 1 0.0891 0.627057 0.968 0.000 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR613318 1 0.3551 0.562317 0.840 0.020 0.000 0.020 0.044 0.076
#> SRR1332694 1 0.3861 0.458376 0.640 0.000 0.000 0.008 0.352 0.000
#> SRR1468469 3 0.1926 0.651662 0.000 0.000 0.912 0.068 0.020 0.000
#> SRR818670 2 0.1858 0.753061 0.004 0.904 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR1120318 5 0.3508 0.435190 0.292 0.000 0.000 0.004 0.704 0.000
#> SRR1311622 4 0.3935 0.515464 0.004 0.000 0.292 0.688 0.016 0.000
#> SRR1500931 3 0.1779 0.636865 0.000 0.000 0.920 0.016 0.064 0.000
#> SRR1387494 4 0.2558 0.606294 0.000 0.000 0.156 0.840 0.000 0.004
#> SRR1379175 1 0.6628 0.301183 0.536 0.096 0.000 0.012 0.096 0.260
#> SRR1401909 3 0.1398 0.648109 0.000 0.000 0.940 0.008 0.052 0.000
#> SRR1440541 2 0.3126 0.490272 0.000 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1068832 3 0.0937 0.651261 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1376640 2 0.6122 0.004588 0.196 0.488 0.000 0.000 0.016 0.300
#> SRR1085712 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 5 0.4744 0.210310 0.376 0.000 0.000 0.028 0.580 0.016
#> SRR1084276 3 0.7047 -0.009469 0.100 0.000 0.392 0.140 0.364 0.004
#> SRR1353262 6 0.3838 0.612328 0.000 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR1437035 1 0.4356 0.409501 0.608 0.000 0.000 0.032 0.360 0.000
#> SRR1396877 5 0.6606 0.450012 0.148 0.000 0.120 0.168 0.560 0.004
#> SRR1443026 2 0.2941 0.543359 0.000 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1417936 1 0.3288 0.536152 0.724 0.000 0.000 0.000 0.276 0.000
#> SRR1436822 6 0.6066 0.601953 0.212 0.224 0.000 0.008 0.012 0.544
#> SRR1101128 3 0.0937 0.651261 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1363886 2 0.1141 0.760953 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR612983 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394366 6 0.5302 0.621320 0.176 0.128 0.000 0.004 0.024 0.668
#> SRR1093218 3 0.3857 0.100630 0.000 0.000 0.532 0.468 0.000 0.000
#> SRR1077090 3 0.2913 0.622882 0.000 0.000 0.848 0.116 0.032 0.004
#> SRR1327430 6 0.5779 0.554612 0.304 0.180 0.000 0.000 0.004 0.512
#> SRR1088958 1 0.0891 0.627057 0.968 0.000 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR1486931 2 0.2048 0.719362 0.000 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1086820 5 0.4214 0.364143 0.320 0.000 0.000 0.024 0.652 0.004
#> SRR1383000 1 0.6882 -0.022303 0.460 0.000 0.056 0.196 0.280 0.008
#> SRR1355705 2 0.0146 0.768739 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR614335 2 0.1411 0.751941 0.004 0.936 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR660534 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0790 0.768086 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1334265 6 0.3843 0.602102 0.000 0.452 0.000 0.000 0.000 0.548
#> SRR1456401 6 0.4979 0.570149 0.056 0.448 0.000 0.000 0.004 0.492
#> SRR1086393 1 0.4427 0.526414 0.684 0.000 0.000 0.040 0.264 0.012
#> SRR1351521 3 0.3023 0.599005 0.000 0.000 0.768 0.232 0.000 0.000
#> SRR1093100 1 0.2544 0.602995 0.896 0.004 0.000 0.028 0.048 0.024
#> SRR1309382 5 0.3586 0.441832 0.280 0.000 0.004 0.004 0.712 0.000
#> SRR1089375 5 0.6908 0.087673 0.068 0.000 0.196 0.276 0.456 0.004
#> SRR1499482 2 0.3144 0.686491 0.016 0.808 0.000 0.000 0.004 0.172
#> SRR614719 2 0.5175 0.423506 0.124 0.652 0.000 0.004 0.008 0.212
#> SRR1081473 4 0.6396 0.353210 0.044 0.000 0.304 0.488 0.164 0.000
#> SRR1087415 5 0.4214 0.364143 0.320 0.000 0.000 0.024 0.652 0.004
#> SRR1088217 5 0.6037 -0.266757 0.000 0.000 0.352 0.252 0.396 0.000
#> SRR808496 2 0.5250 0.339676 0.132 0.608 0.000 0.000 0.004 0.256
#> SRR1336463 6 0.4979 0.570149 0.056 0.448 0.000 0.000 0.004 0.492
#> SRR612359 2 0.5292 0.399094 0.140 0.640 0.000 0.004 0.008 0.208
#> SRR1444412 3 0.7047 -0.009469 0.100 0.000 0.392 0.140 0.364 0.004
#> SRR1074116 3 0.0547 0.647772 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.3351 0.532402 0.000 0.000 0.712 0.288 0.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0260 0.770140 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR808914 1 0.3084 0.614741 0.832 0.004 0.000 0.000 0.132 0.032
#> SRR1349099 1 0.7420 -0.020790 0.348 0.000 0.000 0.136 0.304 0.212
#> SRR1337886 2 0.2069 0.757076 0.020 0.908 0.000 0.000 0.004 0.068
#> SRR813632 5 0.6801 -0.076209 0.044 0.000 0.228 0.292 0.432 0.004
#> SRR1101591 3 0.5646 0.215861 0.028 0.000 0.532 0.356 0.084 0.000
#> SRR1089713 5 0.6698 0.435526 0.148 0.000 0.116 0.188 0.544 0.004
#> SRR1453127 3 0.2854 0.602306 0.000 0.000 0.792 0.208 0.000 0.000
#> SRR1498354 3 0.6762 0.012677 0.032 0.000 0.384 0.248 0.332 0.004
#> SRR1313831 5 0.3652 0.390863 0.324 0.000 0.000 0.004 0.672 0.000
#> SRR1315434 3 0.3857 0.100630 0.000 0.000 0.532 0.468 0.000 0.000
#> SRR814747 2 0.3937 -0.209625 0.004 0.572 0.000 0.000 0.000 0.424
#> SRR1358539 1 0.3084 0.614741 0.832 0.004 0.000 0.000 0.132 0.032
#> SRR1367807 1 0.1492 0.629854 0.940 0.000 0.000 0.000 0.036 0.024
#> SRR1365791 5 0.6441 0.241619 0.076 0.000 0.132 0.200 0.580 0.012
#> SRR1081519 5 0.6044 -0.269742 0.000 0.000 0.348 0.256 0.396 0.000
#> SRR614707 6 0.5825 0.557225 0.240 0.108 0.000 0.008 0.036 0.608
#> SRR1094027 1 0.3807 0.438415 0.628 0.000 0.000 0.004 0.368 0.000
#> SRR1489092 5 0.7566 0.057863 0.156 0.000 0.012 0.332 0.356 0.144
#> SRR1079502 5 0.6983 0.031631 0.068 0.000 0.204 0.292 0.432 0.004
#> SRR1457814 1 0.2632 0.597237 0.888 0.000 0.000 0.032 0.048 0.032
#> SRR1455127 6 0.3810 0.638141 0.000 0.428 0.000 0.000 0.000 0.572
#> SRR615081 6 0.4291 0.670461 0.016 0.356 0.000 0.000 0.008 0.620
#> SRR1327855 3 0.0937 0.651261 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1417873 6 0.3843 0.607547 0.000 0.452 0.000 0.000 0.000 0.548
#> SRR1394125 4 0.6750 0.257945 0.036 0.000 0.264 0.428 0.268 0.004
#> SRR1488388 1 0.4428 0.479632 0.648 0.000 0.000 0.032 0.312 0.008
#> SRR1401122 2 0.5664 0.224876 0.192 0.612 0.000 0.008 0.012 0.176
#> SRR612383 2 0.4540 0.526372 0.080 0.720 0.000 0.004 0.008 0.188
#> SRR1477711 1 0.3819 0.436350 0.624 0.000 0.000 0.000 0.372 0.004
#> SRR1350813 2 0.2896 0.706112 0.016 0.824 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR612851 2 0.5699 0.283658 0.164 0.580 0.000 0.000 0.016 0.240
#> SRR1086349 1 0.2941 0.572533 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 1 0.4318 0.529032 0.772 0.000 0.012 0.124 0.076 0.016
#> SRR1475885 1 0.7589 -0.037312 0.332 0.004 0.000 0.140 0.300 0.224
#> SRR1376334 5 0.3652 0.390863 0.324 0.000 0.000 0.004 0.672 0.000
#> SRR1399821 1 0.7420 -0.020790 0.348 0.000 0.000 0.136 0.304 0.212
#> SRR1347042 3 0.2854 0.602306 0.000 0.000 0.792 0.208 0.000 0.000
#> SRR612323 2 0.6238 -0.111700 0.412 0.416 0.000 0.008 0.016 0.148
#> SRR612604 2 0.1863 0.732393 0.000 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1389546 2 0.2048 0.719362 0.000 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1311877 1 0.2941 0.572533 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1465608 5 0.6461 0.188499 0.324 0.000 0.016 0.288 0.372 0.000
#> SRR1101808 2 0.0603 0.770487 0.004 0.980 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1414079 3 0.5474 0.253495 0.012 0.000 0.532 0.372 0.080 0.004
#> SRR1331153 2 0.3437 0.644520 0.012 0.788 0.000 0.004 0.008 0.188
#> SRR1078439 1 0.6825 0.000492 0.428 0.000 0.040 0.312 0.212 0.008
#> SRR2165527 2 0.0146 0.768739 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1351147 1 0.2002 0.618803 0.916 0.008 0.000 0.000 0.020 0.056
#> SRR1313536 2 0.1910 0.731444 0.000 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1070308 1 0.2599 0.585241 0.884 0.028 0.000 0.004 0.008 0.076
#> SRR1403110 5 0.3728 0.366640 0.344 0.000 0.000 0.004 0.652 0.000
#> SRR1400355 2 0.2048 0.719362 0.000 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1401317 3 0.0937 0.651261 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1456862 5 0.5665 0.140246 0.376 0.000 0.000 0.048 0.520 0.056
#> SRR1074622 5 0.7039 0.272674 0.324 0.000 0.064 0.216 0.392 0.004
#> SRR1465847 3 0.6687 0.057998 0.040 0.000 0.416 0.240 0.304 0.000
#> SRR1443376 2 0.0632 0.769488 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1471312 5 0.5803 0.007915 0.008 0.000 0.148 0.304 0.536 0.004
#> SRR1075579 1 0.3841 0.413360 0.616 0.000 0.000 0.004 0.380 0.000
#> SRR1090881 1 0.6034 0.475015 0.656 0.048 0.000 0.048 0.148 0.100
#> SRR612251 2 0.6214 0.159087 0.216 0.528 0.000 0.012 0.012 0.232
#> SRR1418581 1 0.1036 0.626245 0.964 0.000 0.000 0.004 0.008 0.024
#> SRR658045 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613214 2 0.4653 0.512870 0.120 0.712 0.000 0.004 0.004 0.160
#> SRR613078 2 0.3940 0.509866 0.016 0.704 0.000 0.000 0.008 0.272
#> SRR1472998 3 0.6787 0.004749 0.044 0.000 0.388 0.252 0.316 0.000
#> SRR1433452 6 0.5802 0.559759 0.304 0.184 0.000 0.000 0.004 0.508
#> SRR1101957 1 0.2941 0.572533 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR1487993 4 0.2595 0.607743 0.000 0.000 0.160 0.836 0.000 0.004
#> SRR1465983 2 0.0146 0.768521 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1380375 1 0.3861 0.455579 0.640 0.000 0.000 0.008 0.352 0.000
#> SRR1367566 3 0.5251 0.074523 0.008 0.000 0.488 0.432 0.072 0.000
#> SRR1316151 6 0.3915 0.653281 0.000 0.412 0.000 0.000 0.004 0.584
#> SRR1417547 2 0.3414 0.672187 0.040 0.812 0.000 0.008 0.000 0.140
#> SRR659389 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.3166 0.655919 0.008 0.800 0.000 0.000 0.008 0.184
#> SRR1398207 5 0.7064 0.078465 0.076 0.000 0.256 0.228 0.436 0.004
#> SRR1358755 3 0.3616 0.581557 0.020 0.000 0.808 0.028 0.140 0.004
#> SRR1078903 2 0.3037 0.693581 0.016 0.808 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1323252 2 0.0458 0.769659 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1451796 2 0.2048 0.719362 0.000 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1369172 5 0.4214 0.364529 0.320 0.000 0.000 0.024 0.652 0.004
#> SRR615982 2 0.4993 0.448871 0.100 0.660 0.000 0.000 0.012 0.228
#> SRR1480431 2 0.5250 0.339676 0.132 0.608 0.000 0.000 0.004 0.256
#> SRR1429825 6 0.6450 0.418598 0.348 0.220 0.000 0.000 0.024 0.408
#> SRR1102393 2 0.0146 0.769581 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1071313 1 0.4555 0.492456 0.660 0.000 0.000 0.048 0.284 0.008
#> SRR808351 5 0.7158 0.316019 0.292 0.000 0.072 0.244 0.388 0.004
#> SRR1317513 1 0.3861 0.455579 0.640 0.000 0.000 0.008 0.352 0.000
#> SRR1480501 3 0.6173 0.263074 0.048 0.000 0.556 0.160 0.236 0.000
#> SRR1081910 5 0.6321 0.453747 0.248 0.000 0.056 0.140 0.552 0.004
#> SRR1086611 6 0.5821 0.570227 0.232 0.112 0.000 0.008 0.036 0.612
#> SRR1392571 2 0.3529 0.666287 0.036 0.788 0.000 0.000 0.004 0.172
#> SRR1311441 1 0.1218 0.625678 0.956 0.000 0.000 0.004 0.012 0.028
#> SRR808152 1 0.3789 0.478157 0.660 0.000 0.000 0.008 0.332 0.000
#> SRR657313 4 0.3528 0.514265 0.000 0.000 0.296 0.700 0.004 0.000
#> SRR1433131 2 0.0146 0.768521 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1321011 2 0.0458 0.769659 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1500598 2 0.1204 0.759118 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1379343 2 0.0632 0.769488 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1389108 1 0.0632 0.624906 0.976 0.000 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1376228 3 0.3309 0.519738 0.000 0.000 0.720 0.280 0.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.3230 0.560860 0.844 0.056 0.000 0.000 0.016 0.084
#> SRR1358060 3 0.3620 0.421188 0.000 0.000 0.648 0.352 0.000 0.000
#> SRR1464517 4 0.5653 0.518660 0.084 0.000 0.144 0.676 0.084 0.012
#> SRR613557 2 0.5161 0.429018 0.136 0.668 0.000 0.004 0.012 0.180
#> SRR809831 5 0.6913 0.391875 0.252 0.000 0.064 0.224 0.456 0.004
#> SRR1429387 3 0.2562 0.623755 0.000 0.000 0.828 0.172 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.3151 0.553990 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252 0.000
#> SRR1071644 1 0.3266 0.539243 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272 0.000
#> SRR1406936 5 0.6983 0.031631 0.068 0.000 0.204 0.292 0.432 0.004
#> SRR1072031 2 0.0000 0.768726 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.4731 0.504598 0.084 0.696 0.000 0.004 0.008 0.208
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "kmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:kmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'kmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.982 0.992 0.4972 0.504 0.504
#> 3 3 0.989 0.954 0.981 0.2918 0.819 0.653
#> 4 4 0.771 0.805 0.882 0.1451 0.863 0.636
#> 5 5 0.717 0.584 0.715 0.0708 0.918 0.700
#> 6 6 0.738 0.621 0.759 0.0425 0.891 0.551
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.2603 0.9491 0.956 0.044
#> SRR1394209 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1391619 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1403980 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1442800 1 0.7883 0.7033 0.764 0.236
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1093053 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1399843 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1380231 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1096736 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1478700 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1384754 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1380317 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1315247 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1456075 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1417154 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1325771 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1360420 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1072948 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1362848 1 0.0376 0.9853 0.996 0.004
#> SRR1407492 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1454868 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1466400 1 0.7602 0.7292 0.780 0.220
#> SRR658921 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1101373 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR614695 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.5178 0.8713 0.884 0.116
#> SRR612779 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1325871 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.1633 0.9678 0.976 0.024
#> SRR1320712 2 0.0672 0.9889 0.008 0.992
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1092112 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1400333 1 0.0376 0.9853 0.996 0.004
#> SRR1078834 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1419062 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1315739 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1091890 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1327473 1 0.2236 0.9568 0.964 0.036
#> SRR1338195 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR614887 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1354620 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1389157 1 0.8861 0.5776 0.696 0.304
#> SRR613568 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1446180 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1353136 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1093906 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1399861 1 0.5946 0.8370 0.856 0.144
#> SRR1338789 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1421420 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1352870 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1315041 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.2603 0.9491 0.956 0.044
#> SRR655672 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1420006 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1472749 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.2423 0.9530 0.960 0.040
#> SRR1487278 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1478341 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1479699 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1378992 1 0.2603 0.9491 0.956 0.044
#> SRR659427 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.9963 0.1291 0.464 0.536
#> SRR1439994 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1374270 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1456274 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR820049 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1375290 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR818999 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1332187 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR603365 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.1843 0.9642 0.972 0.028
#> SRR1485380 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1073705 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1309403 2 0.0376 0.9930 0.004 0.996
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1414749 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1419760 1 0.4815 0.8853 0.896 0.104
#> SRR1381841 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR821388 2 0.7139 0.7497 0.196 0.804
#> SRR657623 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR819583 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1403072 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR811653 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1319520 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.7299 0.7538 0.796 0.204
#> SRR613318 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1468469 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1500931 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1379175 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1401909 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1101128 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1093218 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1077090 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.2043 0.9605 0.968 0.032
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1093100 1 0.6438 0.8107 0.836 0.164
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1101591 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1453127 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1315434 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.1184 0.9749 0.984 0.016
#> SRR1367807 1 0.2603 0.9491 0.956 0.044
#> SRR1365791 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1081519 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR614707 1 0.5519 0.8570 0.872 0.128
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1079502 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1457814 1 0.0376 0.9853 0.996 0.004
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.0376 0.9853 0.996 0.004
#> SRR812837 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1475885 1 0.8443 0.6407 0.728 0.272
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1347042 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.2043 0.9605 0.968 0.032
#> SRR1465608 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1351147 1 0.9996 0.0711 0.512 0.488
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1090881 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR612251 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1487993 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1367566 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1480501 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1086611 1 0.0376 0.9853 0.996 0.004
#> SRR1392571 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.5842 0.8421 0.860 0.140
#> SRR808152 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR657313 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.7299 0.7538 0.796 0.204
#> SRR1376228 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1399757 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1358060 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1464517 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR613557 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR809831 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.0000 0.9886 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.9970 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 1 0.2959 0.873 0.900 0.000 0.100
#> SRR1404105 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1472057 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR614491 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1069376 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR1394209 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR1474018 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099809 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1500555 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1354363 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1307997 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR663124 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1334670 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1092727 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1364013 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1468553 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1403980 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1420169 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1442800 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499849 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1500030 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1093053 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1399843 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380231 1 0.2165 0.911 0.936 0.000 0.064
#> SRR809470 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR614239 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR613939 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1079023 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478700 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384754 1 0.1289 0.942 0.968 0.000 0.032
#> SRR612287 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380317 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR1315247 2 0.6260 0.185 0.448 0.552 0.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR658549 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1480240 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1419476 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1456075 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1389474 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1095985 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325771 1 0.6140 0.327 0.596 0.404 0.000
#> SRR1360420 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR660272 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1076916 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1356266 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1472370 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1480176 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.6008 0.413 0.628 0.000 0.372
#> SRR659839 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1362848 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR1407492 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1455082 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR658362 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR810921 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1456375 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR818232 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474816 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466400 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.6168 0.306 0.588 0.412 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1086280 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1454891 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR663185 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR811819 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443161 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR614695 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1092372 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105463 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR811005 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1355415 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1090861 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR1470075 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1321165 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1417588 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1074790 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1458314 1 0.0747 0.957 0.984 0.000 0.016
#> SRR1318582 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1072749 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1078586 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078834 1 0.2682 0.884 0.920 0.076 0.004
#> SRR1417611 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR614984 2 0.1267 0.962 0.024 0.972 0.004
#> SRR1324269 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345523 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1500846 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1419062 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1480131 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.1129 0.967 0.020 0.976 0.004
#> SRR1329624 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1099189 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1083286 1 0.4887 0.696 0.772 0.000 0.228
#> SRR1091890 1 0.3267 0.855 0.884 0.000 0.116
#> SRR1347436 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1327473 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338195 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR809698 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1457792 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1322643 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1354620 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR615056 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1478834 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR615383 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR613568 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1446180 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406372 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1353136 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093906 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR614035 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1351104 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399861 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR1338789 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1420832 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315041 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1443268 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1416617 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1102443 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR655672 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1420006 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1458267 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1470727 1 0.0424 0.963 0.992 0.000 0.008
#> SRR1339153 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1472749 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1414379 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1431326 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098312 1 0.3116 0.864 0.892 0.000 0.108
#> SRR810273 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR614467 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR811471 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1088606 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1479699 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR659427 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR1096638 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR659307 2 0.6359 0.318 0.404 0.592 0.004
#> SRR1439994 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1454931 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0747 0.957 0.984 0.000 0.016
#> SRR658621 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1095840 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1374270 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR662787 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1408727 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1456274 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.2537 0.903 0.080 0.000 0.920
#> SRR1374198 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR820049 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1375290 1 0.6260 0.196 0.552 0.000 0.448
#> SRR818999 3 0.5859 0.484 0.344 0.000 0.656
#> SRR1390242 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332187 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR603365 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR657833 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1488017 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0747 0.957 0.984 0.000 0.016
#> SRR1364761 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1441868 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1073705 1 0.5560 0.574 0.700 0.300 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1442983 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.2200 0.927 0.056 0.940 0.004
#> SRR1332816 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.0237 0.966 0.996 0.004 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1498885 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337215 1 0.0237 0.966 0.996 0.004 0.000
#> SRR1414749 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1365963 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1368030 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419760 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381841 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR821388 1 0.1878 0.921 0.952 0.044 0.004
#> SRR657623 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1094241 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR819583 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1096149 1 0.4504 0.746 0.804 0.000 0.196
#> SRR1342829 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1353028 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR811333 1 0.1411 0.939 0.964 0.000 0.036
#> SRR1311666 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1446436 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR811653 1 0.4555 0.749 0.800 0.000 0.200
#> SRR1311348 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1344010 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0237 0.966 0.996 0.004 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR613318 1 0.6169 0.430 0.636 0.360 0.004
#> SRR1332694 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR818670 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1500931 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1387494 3 0.4750 0.718 0.216 0.000 0.784
#> SRR1379175 1 0.0237 0.966 0.996 0.004 0.000
#> SRR1401909 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1440541 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1376640 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084276 3 0.5905 0.465 0.352 0.000 0.648
#> SRR1353262 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.4291 0.774 0.180 0.820 0.000
#> SRR1101128 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1363886 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1394366 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093218 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1077090 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1327430 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.4702 0.722 0.788 0.000 0.212
#> SRR1355705 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR614335 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR660534 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1093100 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR1309382 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR614719 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1081473 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1087415 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR808496 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1336463 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR612359 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1444412 3 0.6111 0.354 0.396 0.000 0.604
#> SRR1074116 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR821846 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR656095 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR808914 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR813632 1 0.6154 0.300 0.592 0.000 0.408
#> SRR1101591 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1089713 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453127 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1498354 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1313831 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR814747 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 1 0.5497 0.589 0.708 0.000 0.292
#> SRR1081519 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR614707 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079502 1 0.1964 0.919 0.944 0.000 0.056
#> SRR1457814 1 0.0237 0.966 0.996 0.000 0.004
#> SRR1455127 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327855 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1417873 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394125 1 0.5650 0.549 0.688 0.000 0.312
#> SRR1488388 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR612383 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1477711 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR612851 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1086349 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340010 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475885 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376334 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR612323 2 0.6169 0.434 0.360 0.636 0.004
#> SRR612604 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1414079 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1331153 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078439 1 0.5216 0.648 0.740 0.000 0.260
#> SRR2165527 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1351147 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403110 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1456862 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1443376 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1075579 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR612251 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1418581 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR613078 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472998 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1433452 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1465983 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1316151 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1490270 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398207 3 0.5810 0.502 0.336 0.000 0.664
#> SRR1358755 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1078903 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1480431 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1429825 2 0.5070 0.707 0.224 0.772 0.004
#> SRR1102393 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1081910 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086611 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392571 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
#> SRR1311441 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1433131 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1399757 2 0.5733 0.514 0.324 0.676 0.000
#> SRR1358060 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR1464517 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR613557 2 0.3644 0.845 0.124 0.872 0.004
#> SRR809831 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429387 3 0.0237 0.982 0.004 0.000 0.996
#> SRR816565 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.0000 0.970 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.987 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.0237 0.986 0.000 0.996 0.004
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 1 0.6205 0.69519 0.668 0.000 0.136 0.196
#> SRR1404105 1 0.0817 0.91178 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR2164936 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1472057 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614491 4 0.3726 0.73711 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1069376 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR811964 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.2589 0.82534 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1345715 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1328073 1 0.4382 0.65430 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1394209 4 0.2868 0.68666 0.136 0.000 0.000 0.864
#> SRR1474018 2 0.2760 0.81035 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1099809 3 0.1938 0.92493 0.012 0.000 0.936 0.052
#> SRR1500555 4 0.3801 0.73611 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1354363 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1391619 3 0.1389 0.93799 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1307997 4 0.4804 0.57888 0.000 0.384 0.000 0.616
#> SRR663124 2 0.4713 0.15143 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1334670 1 0.1302 0.90933 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR612515 4 0.3726 0.73711 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR1092727 2 0.4072 0.50869 0.000 0.748 0.000 0.252
#> SRR1364013 4 0.4250 0.69500 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR1468553 3 0.0921 0.94499 0.000 0.000 0.972 0.028
#> SRR1403980 3 0.2402 0.91177 0.012 0.000 0.912 0.076
#> SRR1420169 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442800 4 0.4955 0.11603 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR1359214 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1499849 3 0.1661 0.93035 0.004 0.000 0.944 0.052
#> SRR1500030 3 0.1389 0.93799 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1093053 3 0.3047 0.88644 0.012 0.000 0.872 0.116
#> SRR1399843 1 0.2973 0.89155 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1380231 1 0.3047 0.88172 0.872 0.000 0.012 0.116
#> SRR809470 3 0.0707 0.94675 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR614239 4 0.3801 0.73611 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR613939 4 0.4790 0.58248 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR612971 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.3764 0.68803 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR811357 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR613006 4 0.5000 0.30932 0.000 0.496 0.000 0.504
#> SRR1469570 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1457354 2 0.3400 0.74512 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1362906 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1079023 1 0.1118 0.91102 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR813608 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.3266 0.82975 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1478700 1 0.2281 0.89696 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1081543 1 0.4624 0.70042 0.660 0.000 0.000 0.340
#> SRR1384754 1 0.5160 0.77639 0.760 0.000 0.136 0.104
#> SRR612287 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380317 4 0.2530 0.69246 0.112 0.000 0.000 0.888
#> SRR1315247 4 0.2949 0.70620 0.088 0.024 0.000 0.888
#> SRR1105344 2 0.3400 0.74512 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR658549 4 0.4477 0.65572 0.000 0.312 0.000 0.688
#> SRR1480240 1 0.1940 0.90211 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1084816 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 4 0.3266 0.74549 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1419476 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456075 3 0.1211 0.93961 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1389474 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1334419 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1417154 3 0.0817 0.94570 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1095985 1 0.2831 0.88320 0.876 0.000 0.004 0.120
#> SRR1325771 4 0.4872 0.42871 0.356 0.004 0.000 0.640
#> SRR1360420 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR660272 4 0.4933 0.49044 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1332993 1 0.0921 0.91157 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1311833 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR808044 1 0.2281 0.89696 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1076916 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.1302 0.90933 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1341983 4 0.4998 0.39991 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR1456114 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1072948 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1472370 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.1389 0.91121 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR613843 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.2149 0.89947 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1404555 1 0.7448 0.17895 0.452 0.000 0.372 0.176
#> SRR659839 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1362848 1 0.4916 0.43355 0.576 0.000 0.000 0.424
#> SRR1407492 4 0.3266 0.74549 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1455082 4 0.4250 0.69500 0.000 0.276 0.000 0.724
#> SRR658362 2 0.4661 0.18390 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR810921 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1456375 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR818232 1 0.1637 0.90635 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1454868 4 0.4697 0.07398 0.356 0.000 0.000 0.644
#> SRR1474816 2 0.3400 0.74512 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1342002 1 0.1474 0.90990 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1088437 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1466400 4 0.2469 0.69154 0.108 0.000 0.000 0.892
#> SRR658921 2 0.3873 0.66434 0.000 0.772 0.000 0.228
#> SRR1499873 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 4 0.4955 0.19737 0.444 0.000 0.000 0.556
#> SRR1090145 1 0.1637 0.90635 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1379324 1 0.1022 0.91217 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1345307 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1086280 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454891 4 0.3801 0.73611 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR663185 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR811819 1 0.1211 0.91021 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1318920 1 0.1474 0.90773 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR656758 2 0.1118 0.88963 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1474351 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR660450 4 0.4941 0.48146 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR1472687 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334291 4 0.4866 0.54648 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR1415153 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1323271 2 0.3688 0.70196 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1368939 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1443161 1 0.4746 0.61461 0.632 0.000 0.000 0.368
#> SRR614695 4 0.2773 0.74291 0.004 0.116 0.000 0.880
#> SRR1092372 1 0.1637 0.90635 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1474577 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1406582 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR612779 2 0.2469 0.82416 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1089006 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1354071 1 0.2345 0.89334 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1105463 3 0.0188 0.94917 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR811005 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.1637 0.90635 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1325871 3 0.1389 0.93799 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1355415 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1320712 4 0.2868 0.68666 0.136 0.000 0.000 0.864
#> SRR1470075 1 0.1022 0.91177 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1091254 1 0.1302 0.90933 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1101397 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.1557 0.90595 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1092112 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417588 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1074790 4 0.4841 0.72185 0.080 0.140 0.000 0.780
#> SRR1432106 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1458314 1 0.2081 0.90034 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1318582 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1080484 2 0.0469 0.90720 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1072749 3 0.2329 0.91373 0.012 0.000 0.916 0.072
#> SRR1078586 1 0.0921 0.91166 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1400333 4 0.2149 0.69311 0.088 0.000 0.000 0.912
#> SRR1078834 4 0.2271 0.70162 0.076 0.008 0.000 0.916
#> SRR1417611 2 0.2760 0.81035 0.000 0.872 0.000 0.128
#> SRR1396840 1 0.2466 0.89388 0.900 0.000 0.004 0.096
#> SRR1465440 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.3400 0.74512 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR614984 4 0.3688 0.73780 0.000 0.208 0.000 0.792
#> SRR1324269 1 0.2266 0.89276 0.912 0.000 0.004 0.084
#> SRR1401491 2 0.3688 0.70196 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1319443 1 0.1557 0.90595 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1324349 4 0.4790 0.58509 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR1345523 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1500846 1 0.2149 0.89997 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR661505 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419062 3 0.3706 0.86003 0.040 0.000 0.848 0.112
#> SRR1480131 1 0.2149 0.89852 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1421284 4 0.3354 0.73146 0.044 0.084 0.000 0.872
#> SRR1329624 1 0.0469 0.91204 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1315739 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1099189 4 0.4072 0.71571 0.000 0.252 0.000 0.748
#> SRR1083286 1 0.3372 0.87771 0.868 0.000 0.036 0.096
#> SRR1091890 1 0.6897 0.61663 0.588 0.000 0.168 0.244
#> SRR1347436 4 0.3266 0.74549 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1327473 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1338195 3 0.0592 0.94826 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR809698 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1457792 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR658271 2 0.1792 0.86463 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1339597 1 0.2149 0.89947 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1454842 3 0.1389 0.93799 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1322643 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR614887 3 0.0592 0.94826 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1354620 3 0.1557 0.92458 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR615056 2 0.0817 0.89808 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1105320 1 0.1557 0.91281 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1391529 1 0.1022 0.91018 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR663052 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1478834 1 0.1867 0.90326 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR812366 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1435330 3 0.1474 0.93691 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR615383 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1389157 4 0.1716 0.69686 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR613568 4 0.4941 0.48146 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR614095 4 0.4855 0.55249 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR1103092 1 0.2216 0.89671 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1337155 1 0.3494 0.85651 0.824 0.000 0.004 0.172
#> SRR1475345 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0188 0.90963 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1446180 1 0.4500 0.64732 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1406372 2 0.1557 0.87280 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1339880 3 0.1389 0.93799 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1353136 1 0.4898 0.53196 0.584 0.000 0.000 0.416
#> SRR1093906 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR614035 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1351104 1 0.1118 0.91107 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1363926 4 0.4730 0.60421 0.000 0.364 0.000 0.636
#> SRR1399861 4 0.2408 0.69309 0.104 0.000 0.000 0.896
#> SRR1338789 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1421420 3 0.0707 0.94625 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1420832 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1352870 4 0.1867 0.69568 0.072 0.000 0.000 0.928
#> SRR1315041 2 0.3649 0.70888 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR661877 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1443268 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416617 3 0.2255 0.91643 0.012 0.000 0.920 0.068
#> SRR1102443 1 0.4500 0.62138 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR655672 4 0.3801 0.73611 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1420006 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1458267 4 0.4866 0.54648 0.000 0.404 0.000 0.596
#> SRR613819 4 0.3219 0.74506 0.000 0.164 0.000 0.836
#> SRR1469432 2 0.3400 0.74512 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR660907 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 4 0.4843 0.58855 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1470727 1 0.2149 0.89517 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1339153 3 0.1389 0.93799 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1472749 3 0.1389 0.93799 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1414379 4 0.3266 0.74549 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1431326 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1487278 2 0.4746 0.28544 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1098312 1 0.5977 0.65991 0.680 0.000 0.216 0.104
#> SRR810273 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 4 0.4961 0.45222 0.000 0.448 0.000 0.552
#> SRR614467 4 0.4477 0.65572 0.000 0.312 0.000 0.688
#> SRR811471 1 0.0707 0.91327 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1478341 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1088606 1 0.2011 0.90515 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1479699 1 0.2081 0.90955 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1403589 2 0.1557 0.87280 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR812625 2 0.0592 0.90454 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1359803 1 0.2281 0.89542 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1338988 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1471222 2 0.2011 0.85553 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1378992 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR659427 1 0.4948 0.47592 0.560 0.000 0.000 0.440
#> SRR1096638 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1466619 2 0.3942 0.64748 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR659307 4 0.3047 0.71206 0.012 0.116 0.000 0.872
#> SRR1439994 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.2011 0.90101 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1332928 1 0.2345 0.89585 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR658621 2 0.2345 0.83359 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1095840 1 0.1302 0.90933 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1458243 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374270 4 0.2814 0.66338 0.132 0.000 0.000 0.868
#> SRR1470947 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365598 4 0.4830 0.56230 0.000 0.392 0.000 0.608
#> SRR662787 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1408727 4 0.2921 0.74632 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1456274 1 0.2281 0.88418 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR817744 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1478744 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.4599 0.81026 0.088 0.000 0.800 0.112
#> SRR1374198 1 0.1474 0.90773 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1445856 3 0.0188 0.94917 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR820049 3 0.1302 0.93787 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1375290 3 0.7917 0.00188 0.312 0.000 0.344 0.344
#> SRR818999 3 0.6801 0.00110 0.448 0.000 0.456 0.096
#> SRR1390242 1 0.1302 0.90933 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1401164 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1454629 1 0.1637 0.90523 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1332187 3 0.1022 0.94293 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR603365 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR657833 4 0.4817 0.57290 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1436207 4 0.4776 0.61457 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1488017 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR612947 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.2281 0.89621 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1364761 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.1389 0.93799 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1441868 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1485380 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073705 4 0.4925 0.24727 0.428 0.000 0.000 0.572
#> SRR615032 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1442983 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1100346 4 0.3105 0.74656 0.004 0.140 0.000 0.856
#> SRR1332816 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR612299 4 0.3074 0.74562 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR1407386 1 0.0707 0.91194 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1418064 2 0.4948 -0.05795 0.000 0.560 0.000 0.440
#> SRR1309403 4 0.3942 0.57246 0.236 0.000 0.000 0.764
#> SRR1498395 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1079998 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337215 4 0.2408 0.69086 0.104 0.000 0.000 0.896
#> SRR1414749 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365963 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.3688 0.70239 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1419760 4 0.2408 0.69199 0.104 0.000 0.000 0.896
#> SRR1381841 1 0.2011 0.90101 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR821388 4 0.3858 0.69140 0.100 0.056 0.000 0.844
#> SRR657623 2 0.2345 0.83359 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1094241 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819583 3 0.0188 0.94917 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1096149 1 0.2611 0.89481 0.896 0.000 0.008 0.096
#> SRR1342829 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1353028 1 0.0817 0.91310 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR811333 1 0.4662 0.82039 0.796 0.000 0.092 0.112
#> SRR1311666 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1486698 2 0.4382 0.37404 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1446436 4 0.4967 0.44281 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR815092 1 0.1389 0.90908 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1500149 4 0.4888 0.52855 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR1100564 1 0.2149 0.89781 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1403072 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR811653 4 0.7103 -0.20359 0.404 0.000 0.128 0.468
#> SRR1311348 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1489438 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435442 4 0.4661 0.61627 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR1421444 3 0.0336 0.94935 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1344010 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.2530 0.86013 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1444763 1 0.1557 0.90839 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1415026 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416596 4 0.4933 0.49054 0.000 0.432 0.000 0.568
#> SRR1485499 2 0.1557 0.87280 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1316078 2 0.1302 0.88277 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR663465 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310094 4 0.4992 0.37330 0.000 0.476 0.000 0.524
#> SRR663537 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1453950 1 0.1557 0.90452 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1087875 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR613318 4 0.2483 0.71268 0.052 0.032 0.000 0.916
#> SRR1332694 1 0.1022 0.91090 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1468469 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.3123 0.76330 0.000 0.844 0.000 0.156
#> SRR1120318 1 0.1940 0.90211 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1311622 3 0.1389 0.93616 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1500931 3 0.0188 0.94917 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1387494 3 0.5464 0.65626 0.212 0.000 0.716 0.072
#> SRR1379175 4 0.2197 0.69701 0.080 0.004 0.000 0.916
#> SRR1401909 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.3400 0.74512 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR1068832 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376640 4 0.3311 0.74406 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR1085712 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.1716 0.90538 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1084276 3 0.6659 0.19364 0.400 0.000 0.512 0.088
#> SRR1353262 2 0.2973 0.79074 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1437035 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1396877 1 0.2593 0.88958 0.892 0.000 0.004 0.104
#> SRR1443026 2 0.1557 0.87280 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1417936 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1436822 4 0.3278 0.74246 0.020 0.116 0.000 0.864
#> SRR1101128 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1394366 4 0.2888 0.74321 0.004 0.124 0.000 0.872
#> SRR1093218 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1077090 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327430 4 0.3123 0.74646 0.000 0.156 0.000 0.844
#> SRR1088958 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1486931 4 0.4843 0.56025 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR1086820 1 0.1302 0.90906 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1383000 1 0.2611 0.89371 0.896 0.000 0.008 0.096
#> SRR1355705 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR614335 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR660534 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1334265 4 0.4994 0.36176 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1456401 4 0.4888 0.53174 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR1086393 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1351521 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1093100 4 0.3123 0.65924 0.156 0.000 0.000 0.844
#> SRR1309382 1 0.1940 0.90223 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1089375 1 0.2530 0.88799 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1499482 4 0.4967 0.49042 0.000 0.452 0.000 0.548
#> SRR614719 4 0.3801 0.73611 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1081473 3 0.2329 0.91373 0.012 0.000 0.916 0.072
#> SRR1087415 1 0.1211 0.90990 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1088217 3 0.0469 0.94631 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR808496 4 0.3801 0.73611 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1336463 4 0.4941 0.48146 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR612359 4 0.3801 0.73611 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1444412 3 0.6708 0.02127 0.448 0.000 0.464 0.088
#> SRR1074116 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR821846 3 0.0592 0.94826 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR656095 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR808914 1 0.1474 0.90773 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1349099 1 0.1557 0.90716 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1337886 2 0.3024 0.78481 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR813632 1 0.6457 0.46972 0.604 0.000 0.296 0.100
#> SRR1101591 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.2714 0.88688 0.884 0.000 0.004 0.112
#> SRR1453127 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1498354 3 0.0188 0.94917 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1313831 1 0.1474 0.90773 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1315434 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR814747 2 0.3688 0.70239 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1358539 1 0.1389 0.90864 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1367807 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1365791 1 0.6907 0.34965 0.532 0.000 0.348 0.120
#> SRR1081519 3 0.0188 0.94917 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR614707 4 0.4304 0.45492 0.284 0.000 0.000 0.716
#> SRR1094027 1 0.1389 0.91042 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR1489092 1 0.3539 0.85353 0.820 0.000 0.004 0.176
#> SRR1079502 1 0.3335 0.87545 0.860 0.000 0.020 0.120
#> SRR1457814 4 0.1940 0.69338 0.076 0.000 0.000 0.924
#> SRR1455127 2 0.3400 0.74512 0.000 0.820 0.000 0.180
#> SRR615081 4 0.4713 0.60747 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR1327855 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.4955 -0.07616 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1394125 1 0.6919 0.33842 0.528 0.000 0.352 0.120
#> SRR1488388 1 0.0921 0.91157 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1401122 4 0.4164 0.69760 0.000 0.264 0.000 0.736
#> SRR612383 4 0.4040 0.71870 0.000 0.248 0.000 0.752
#> SRR1477711 1 0.0707 0.91194 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1350813 2 0.4898 -0.11284 0.000 0.584 0.000 0.416
#> SRR612851 4 0.3266 0.74549 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1086349 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR812837 2 0.0188 0.90963 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1340010 1 0.4661 0.64235 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1475885 1 0.3764 0.76730 0.784 0.000 0.000 0.216
#> SRR1376334 1 0.1474 0.90773 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1399821 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1347042 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR612323 4 0.3037 0.73845 0.020 0.100 0.000 0.880
#> SRR612604 2 0.2281 0.84121 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1389546 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1465608 1 0.2408 0.89535 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1101808 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1414079 3 0.1389 0.93799 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1331153 4 0.4855 0.55353 0.000 0.400 0.000 0.600
#> SRR1078439 1 0.7806 0.23207 0.392 0.000 0.252 0.356
#> SRR2165527 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1351147 1 0.3311 0.81377 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1313536 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1070308 4 0.3486 0.74047 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1403110 1 0.1118 0.90960 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1400355 2 0.3311 0.75669 0.000 0.828 0.000 0.172
#> SRR1401317 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0921 0.91187 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1074622 1 0.2216 0.89794 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR1465847 3 0.0000 0.94980 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1471312 3 0.1022 0.94293 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1075579 1 0.0592 0.91201 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1090881 1 0.4994 0.34270 0.520 0.000 0.000 0.480
#> SRR612251 4 0.3801 0.73611 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1418581 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR658045 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613214 4 0.3801 0.73611 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR613078 4 0.4746 0.60059 0.000 0.368 0.000 0.632
#> SRR1472998 3 0.2402 0.91177 0.012 0.000 0.912 0.076
#> SRR1433452 4 0.4916 0.50756 0.000 0.424 0.000 0.576
#> SRR1101957 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1487993 3 0.1389 0.93799 0.000 0.000 0.952 0.048
#> SRR1465983 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0921 0.91166 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1367566 3 0.2402 0.91177 0.012 0.000 0.912 0.076
#> SRR1316151 4 0.3444 0.74238 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR1417547 4 0.4941 0.48600 0.000 0.436 0.000 0.564
#> SRR659389 2 0.0336 0.90786 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1490270 4 0.4955 0.46288 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1398207 3 0.6831 0.10137 0.420 0.000 0.480 0.100
#> SRR1358755 3 0.0469 0.94725 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1078903 4 0.4981 0.46850 0.000 0.464 0.000 0.536
#> SRR1323252 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1369172 1 0.0707 0.91251 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR615982 4 0.3266 0.74549 0.000 0.168 0.000 0.832
#> SRR1480431 2 0.4543 0.29495 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR1429825 4 0.3048 0.74174 0.016 0.108 0.000 0.876
#> SRR1102393 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1071313 1 0.1637 0.90998 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR808351 1 0.2345 0.89585 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1317513 1 0.0707 0.91185 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1480501 3 0.1474 0.93245 0.000 0.000 0.948 0.052
#> SRR1081910 1 0.1940 0.90216 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1086611 4 0.2081 0.69364 0.084 0.000 0.000 0.916
#> SRR1392571 4 0.3801 0.73611 0.000 0.220 0.000 0.780
#> SRR1311441 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR808152 1 0.1022 0.91177 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR657313 3 0.0707 0.94734 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1433131 2 0.1557 0.87280 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1321011 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1500598 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1379343 2 0.0000 0.91124 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1376228 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1399757 4 0.6164 0.60410 0.264 0.092 0.000 0.644
#> SRR1358060 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1464517 3 0.2329 0.91662 0.012 0.000 0.916 0.072
#> SRR613557 4 0.3649 0.73711 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR809831 1 0.2408 0.89134 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR1429387 3 0.0188 0.94940 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR816565 1 0.1118 0.91169 0.964 0.000 0.000 0.036
#> SRR1071644 1 0.1211 0.91056 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1406936 1 0.2714 0.88604 0.884 0.000 0.004 0.112
#> SRR1072031 2 0.0188 0.91043 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1374671 4 0.4898 0.55724 0.000 0.416 0.000 0.584
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 1 0.6963 2.49e-01 0.536 0.000 0.040 0.208 0.216
#> SRR1404105 1 0.3534 3.87e-01 0.744 0.000 0.000 0.000 0.256
#> SRR2164936 2 0.0404 8.19e-01 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1472057 3 0.0324 9.14e-01 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR614491 4 0.1502 6.83e-01 0.000 0.056 0.000 0.940 0.004
#> SRR1069376 5 0.4192 6.67e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR811964 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.5785 4.65e-01 0.000 0.568 0.000 0.112 0.320
#> SRR1345715 5 0.4192 6.67e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR1328073 5 0.5505 2.01e-01 0.092 0.000 0.000 0.304 0.604
#> SRR1394209 4 0.1908 6.57e-01 0.000 0.000 0.000 0.908 0.092
#> SRR1474018 2 0.5715 4.61e-01 0.000 0.564 0.000 0.100 0.336
#> SRR1099809 3 0.3762 7.78e-01 0.244 0.000 0.748 0.004 0.004
#> SRR1500555 4 0.1478 6.82e-01 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1354363 5 0.4341 6.61e-01 0.404 0.000 0.000 0.004 0.592
#> SRR1391619 3 0.3880 8.61e-01 0.116 0.000 0.820 0.016 0.048
#> SRR1307997 4 0.6291 5.47e-01 0.000 0.164 0.000 0.492 0.344
#> SRR663124 4 0.5295 1.27e-01 0.000 0.464 0.000 0.488 0.048
#> SRR1334670 1 0.4101 6.96e-02 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR612515 4 0.1502 6.83e-01 0.000 0.056 0.000 0.940 0.004
#> SRR1092727 2 0.5237 3.54e-01 0.000 0.628 0.000 0.300 0.072
#> SRR1364013 4 0.4123 6.64e-01 0.000 0.104 0.000 0.788 0.108
#> SRR1468553 3 0.3188 8.78e-01 0.100 0.000 0.860 0.012 0.028
#> SRR1403980 3 0.5072 6.50e-01 0.340 0.000 0.620 0.012 0.028
#> SRR1420169 3 0.0451 9.14e-01 0.000 0.000 0.988 0.008 0.004
#> SRR1442800 1 0.6465 9.77e-02 0.440 0.000 0.000 0.184 0.376
#> SRR1359214 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499849 3 0.3266 8.14e-01 0.200 0.000 0.796 0.004 0.000
#> SRR1500030 3 0.3779 8.62e-01 0.116 0.000 0.824 0.012 0.048
#> SRR1093053 1 0.7740 -2.53e-01 0.324 0.000 0.308 0.316 0.052
#> SRR1399843 1 0.2423 4.87e-01 0.896 0.000 0.000 0.024 0.080
#> SRR1380231 1 0.0671 5.17e-01 0.980 0.000 0.016 0.004 0.000
#> SRR809470 3 0.2763 8.62e-01 0.148 0.000 0.848 0.000 0.004
#> SRR614239 4 0.1478 6.82e-01 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR613939 4 0.6318 5.43e-01 0.000 0.168 0.000 0.488 0.344
#> SRR612971 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.6526 2.22e-01 0.000 0.452 0.000 0.204 0.344
#> SRR811357 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 5 0.4192 6.67e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR613006 4 0.6702 4.07e-01 0.000 0.248 0.000 0.408 0.344
#> SRR1469570 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.6068 4.01e-01 0.000 0.532 0.000 0.140 0.328
#> SRR1362906 3 0.1673 9.08e-01 0.016 0.000 0.944 0.008 0.032
#> SRR1079023 5 0.4227 6.44e-01 0.420 0.000 0.000 0.000 0.580
#> SRR813608 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 5 0.5975 2.32e-01 0.224 0.000 0.000 0.188 0.588
#> SRR1478700 1 0.4086 3.21e-01 0.704 0.000 0.000 0.012 0.284
#> SRR1081543 1 0.5018 3.09e-01 0.664 0.000 0.000 0.268 0.068
#> SRR1384754 1 0.5731 3.20e-01 0.636 0.000 0.092 0.016 0.256
#> SRR612287 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380317 4 0.0880 6.90e-01 0.000 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1315247 4 0.5178 6.58e-01 0.064 0.004 0.000 0.652 0.280
#> SRR1105344 2 0.6134 3.76e-01 0.000 0.516 0.000 0.144 0.340
#> SRR658549 4 0.3386 6.42e-01 0.000 0.128 0.000 0.832 0.040
#> SRR1480240 1 0.2561 4.93e-01 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR1084816 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 4 0.3399 6.92e-01 0.000 0.020 0.000 0.812 0.168
#> SRR1419476 3 0.0162 9.14e-01 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1456075 3 0.4070 8.54e-01 0.124 0.000 0.808 0.020 0.048
#> SRR1389474 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 5 0.4192 6.69e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR1334419 5 0.4182 6.69e-01 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR1417154 3 0.2248 8.94e-01 0.088 0.000 0.900 0.000 0.012
#> SRR1095985 1 0.0566 5.16e-01 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1325771 5 0.4423 -1.88e-01 0.036 0.004 0.000 0.232 0.728
#> SRR1360420 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660272 4 0.6506 4.98e-01 0.000 0.200 0.000 0.456 0.344
#> SRR1332993 5 0.4242 6.25e-01 0.428 0.000 0.000 0.000 0.572
#> SRR1311833 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808044 1 0.4040 3.27e-01 0.712 0.000 0.000 0.012 0.276
#> SRR1076916 3 0.1195 9.11e-01 0.028 0.000 0.960 0.000 0.012
#> SRR1356266 1 0.4088 8.55e-02 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368
#> SRR1341983 4 0.6629 4.86e-01 0.000 0.232 0.000 0.436 0.332
#> SRR1456114 5 0.4219 6.51e-01 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584
#> SRR1072948 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480176 5 0.4306 4.34e-01 0.492 0.000 0.000 0.000 0.508
#> SRR613843 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.3635 3.56e-01 0.748 0.000 0.000 0.004 0.248
#> SRR1404555 1 0.4864 3.97e-01 0.768 0.000 0.116 0.060 0.056
#> SRR659839 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0510 8.16e-01 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1362848 4 0.5441 2.91e-01 0.080 0.000 0.000 0.596 0.324
#> SRR1407492 4 0.0609 6.95e-01 0.000 0.020 0.000 0.980 0.000
#> SRR1455082 4 0.4569 6.62e-01 0.000 0.104 0.000 0.748 0.148
#> SRR658362 2 0.4767 1.35e-01 0.000 0.560 0.000 0.420 0.020
#> SRR810921 2 0.0290 8.21e-01 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR662823 2 0.0404 8.19e-01 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818232 1 0.4015 1.60e-01 0.652 0.000 0.000 0.000 0.348
#> SRR1454868 4 0.5522 2.91e-01 0.308 0.000 0.000 0.600 0.092
#> SRR1474816 2 0.6080 3.94e-01 0.000 0.528 0.000 0.140 0.332
#> SRR1342002 1 0.4192 1.62e-02 0.596 0.000 0.000 0.000 0.404
#> SRR1088437 2 0.1894 7.94e-01 0.000 0.920 0.000 0.008 0.072
#> SRR1466400 4 0.5882 6.30e-01 0.148 0.000 0.000 0.588 0.264
#> SRR658921 2 0.6498 2.33e-01 0.000 0.452 0.000 0.196 0.352
#> SRR1499873 2 0.2852 7.33e-01 0.000 0.828 0.000 0.000 0.172
#> SRR1101373 5 0.4768 2.29e-01 0.180 0.000 0.000 0.096 0.724
#> SRR1090145 1 0.3966 1.65e-01 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1379324 1 0.3636 3.59e-01 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR1345307 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0404 9.14e-01 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1086280 3 0.0404 9.14e-01 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1454891 4 0.1571 6.83e-01 0.000 0.060 0.000 0.936 0.004
#> SRR663185 2 0.1818 8.00e-01 0.000 0.932 0.000 0.024 0.044
#> SRR811819 1 0.4235 -1.21e-01 0.576 0.000 0.000 0.000 0.424
#> SRR1318920 1 0.4210 -3.85e-02 0.588 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR656758 2 0.3995 7.05e-01 0.000 0.788 0.000 0.060 0.152
#> SRR1474351 5 0.4249 6.22e-01 0.432 0.000 0.000 0.000 0.568
#> SRR660450 4 0.6506 4.98e-01 0.000 0.200 0.000 0.456 0.344
#> SRR1472687 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334291 4 0.6370 5.33e-01 0.000 0.176 0.000 0.480 0.344
#> SRR1415153 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.6441 2.67e-01 0.000 0.468 0.000 0.188 0.344
#> SRR1368939 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443161 4 0.6372 9.47e-02 0.324 0.000 0.000 0.492 0.184
#> SRR614695 4 0.3190 6.95e-01 0.008 0.012 0.000 0.840 0.140
#> SRR1092372 1 0.3966 1.93e-01 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR1474577 5 0.4182 6.69e-01 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR1406582 5 0.4182 6.69e-01 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR612779 2 0.5870 4.58e-01 0.000 0.584 0.000 0.140 0.276
#> SRR1089006 5 0.4192 6.67e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR1354071 1 0.1638 5.27e-01 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1105463 3 0.1410 8.96e-01 0.060 0.000 0.940 0.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0290 8.21e-01 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1385319 1 0.4015 1.60e-01 0.652 0.000 0.000 0.000 0.348
#> SRR1325871 3 0.3929 8.59e-01 0.120 0.000 0.816 0.016 0.048
#> SRR1355415 3 0.0162 9.14e-01 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1090861 5 0.4192 6.69e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR1320712 4 0.3074 5.61e-01 0.000 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR1470075 5 0.4235 6.35e-01 0.424 0.000 0.000 0.000 0.576
#> SRR1091254 1 0.4101 6.96e-02 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1101397 3 0.1280 9.10e-01 0.008 0.000 0.960 0.008 0.024
#> SRR1321165 1 0.3039 4.60e-01 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1092112 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417588 3 0.0290 9.14e-01 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1074790 5 0.4793 -5.72e-01 0.000 0.020 0.000 0.436 0.544
#> SRR1432106 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0404 8.19e-01 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1458314 1 0.4127 2.53e-01 0.680 0.000 0.000 0.008 0.312
#> SRR1318582 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.2873 7.60e-01 0.000 0.860 0.000 0.020 0.120
#> SRR1072749 3 0.5376 6.64e-01 0.316 0.000 0.624 0.020 0.040
#> SRR1078586 1 0.3424 4.10e-01 0.760 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR1400333 4 0.2669 6.97e-01 0.020 0.000 0.000 0.876 0.104
#> SRR1078834 4 0.0798 6.93e-01 0.008 0.000 0.000 0.976 0.016
#> SRR1417611 2 0.5715 4.61e-01 0.000 0.564 0.000 0.100 0.336
#> SRR1396840 1 0.1851 5.25e-01 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1465440 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.6112 3.78e-01 0.000 0.516 0.000 0.140 0.344
#> SRR614984 4 0.1557 6.83e-01 0.000 0.052 0.000 0.940 0.008
#> SRR1324269 1 0.2189 4.98e-01 0.904 0.000 0.000 0.012 0.084
#> SRR1401491 2 0.6344 3.08e-01 0.000 0.484 0.000 0.172 0.344
#> SRR1319443 1 0.2929 4.59e-01 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180
#> SRR1324349 4 0.6254 5.50e-01 0.000 0.160 0.000 0.500 0.340
#> SRR1345523 2 0.0404 8.19e-01 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1500846 1 0.4127 2.66e-01 0.680 0.000 0.000 0.008 0.312
#> SRR661505 3 0.0324 9.14e-01 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1419062 1 0.4499 -1.93e-01 0.584 0.000 0.408 0.004 0.004
#> SRR1480131 1 0.1732 5.24e-01 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1421284 4 0.1408 6.86e-01 0.000 0.008 0.000 0.948 0.044
#> SRR1329624 1 0.4287 -2.68e-01 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR1315739 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 4 0.2448 6.72e-01 0.000 0.088 0.000 0.892 0.020
#> SRR1083286 1 0.1638 5.27e-01 0.932 0.000 0.004 0.000 0.064
#> SRR1091890 1 0.6435 3.32e-01 0.644 0.000 0.140 0.128 0.088
#> SRR1347436 4 0.3106 6.97e-01 0.000 0.020 0.000 0.840 0.140
#> SRR1327473 5 0.4517 6.55e-01 0.388 0.000 0.000 0.012 0.600
#> SRR1338195 3 0.2819 8.89e-01 0.080 0.000 0.884 0.012 0.024
#> SRR809698 2 0.0404 8.19e-01 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1457792 5 0.4192 6.69e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR658271 2 0.5087 5.58e-01 0.000 0.644 0.000 0.064 0.292
#> SRR1339597 1 0.3934 3.27e-01 0.716 0.000 0.000 0.008 0.276
#> SRR1454842 3 0.3929 8.59e-01 0.120 0.000 0.816 0.016 0.048
#> SRR1322643 5 0.4192 6.69e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR614887 3 0.2270 8.97e-01 0.072 0.000 0.908 0.004 0.016
#> SRR1354620 3 0.3048 8.06e-01 0.176 0.000 0.820 0.004 0.000
#> SRR615056 2 0.3454 7.25e-01 0.000 0.816 0.000 0.028 0.156
#> SRR1105320 5 0.4443 4.99e-01 0.472 0.000 0.000 0.004 0.524
#> SRR1391529 1 0.3966 1.75e-01 0.664 0.000 0.000 0.000 0.336
#> SRR663052 2 0.0510 8.16e-01 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1478834 1 0.2690 4.87e-01 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR812366 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.4173 8.03e-01 0.204 0.000 0.760 0.008 0.028
#> SRR615383 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 4 0.0671 6.93e-01 0.004 0.000 0.000 0.980 0.016
#> SRR613568 4 0.6545 4.85e-01 0.000 0.208 0.000 0.448 0.344
#> SRR614095 4 0.6344 5.39e-01 0.000 0.172 0.000 0.484 0.344
#> SRR1103092 1 0.1544 5.26e-01 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1337155 1 0.0992 5.10e-01 0.968 0.000 0.000 0.008 0.024
#> SRR1475345 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0404 8.19e-01 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1446180 1 0.4333 4.37e-01 0.740 0.000 0.000 0.048 0.212
#> SRR1406372 2 0.5129 5.34e-01 0.000 0.616 0.000 0.056 0.328
#> SRR1339880 3 0.3827 8.60e-01 0.120 0.000 0.820 0.012 0.048
#> SRR1353136 4 0.6300 1.07e-01 0.336 0.000 0.000 0.496 0.168
#> SRR1093906 3 0.0162 9.14e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614035 2 0.1670 8.02e-01 0.000 0.936 0.000 0.012 0.052
#> SRR1351104 5 0.4350 6.54e-01 0.408 0.000 0.000 0.004 0.588
#> SRR1363926 4 0.6335 5.40e-01 0.000 0.168 0.000 0.480 0.352
#> SRR1399861 4 0.2249 6.49e-01 0.008 0.000 0.000 0.896 0.096
#> SRR1338789 5 0.4249 6.19e-01 0.432 0.000 0.000 0.000 0.568
#> SRR1421420 3 0.2233 8.96e-01 0.080 0.000 0.904 0.000 0.016
#> SRR1420832 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476231 5 0.4192 6.67e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR1352870 4 0.2561 6.97e-01 0.020 0.000 0.000 0.884 0.096
#> SRR1315041 2 0.6394 2.88e-01 0.000 0.476 0.000 0.180 0.344
#> SRR661877 2 0.0404 8.19e-01 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1443268 3 0.0290 9.15e-01 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1416617 3 0.5212 6.52e-01 0.332 0.000 0.620 0.016 0.032
#> SRR1102443 5 0.5699 2.16e-01 0.108 0.000 0.000 0.308 0.584
#> SRR655672 4 0.2079 6.85e-01 0.000 0.064 0.000 0.916 0.020
#> SRR1420006 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458267 4 0.6291 5.47e-01 0.000 0.164 0.000 0.492 0.344
#> SRR613819 4 0.4400 6.62e-01 0.000 0.020 0.000 0.672 0.308
#> SRR1469432 2 0.6068 4.01e-01 0.000 0.532 0.000 0.140 0.328
#> SRR660907 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 4 0.6273 5.67e-01 0.000 0.184 0.000 0.524 0.292
#> SRR1470727 1 0.2193 4.92e-01 0.900 0.000 0.000 0.008 0.092
#> SRR1339153 3 0.5550 7.41e-01 0.228 0.000 0.676 0.048 0.048
#> SRR1472749 3 0.3779 8.62e-01 0.116 0.000 0.824 0.012 0.048
#> SRR1414379 4 0.1300 6.98e-01 0.000 0.016 0.000 0.956 0.028
#> SRR1431326 5 0.4192 6.69e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR1487278 5 0.6953 -5.45e-01 0.004 0.332 0.000 0.312 0.352
#> SRR1098312 1 0.5190 3.80e-01 0.716 0.000 0.168 0.016 0.100
#> SRR810273 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 4 0.6506 4.98e-01 0.000 0.200 0.000 0.456 0.344
#> SRR614467 4 0.3106 6.28e-01 0.000 0.140 0.000 0.840 0.020
#> SRR811471 1 0.3730 3.26e-01 0.712 0.000 0.000 0.000 0.288
#> SRR1478341 3 0.0404 9.14e-01 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1088606 1 0.2848 4.95e-01 0.840 0.000 0.000 0.004 0.156
#> SRR1479699 1 0.4242 -1.22e-01 0.572 0.000 0.000 0.000 0.428
#> SRR1403589 2 0.4674 6.17e-01 0.000 0.708 0.000 0.060 0.232
#> SRR812625 2 0.3238 7.42e-01 0.000 0.836 0.000 0.028 0.136
#> SRR1359803 1 0.1792 5.23e-01 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1338988 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.5731 4.62e-01 0.000 0.568 0.000 0.104 0.328
#> SRR1378992 5 0.4182 6.69e-01 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR659427 4 0.6170 1.44e-01 0.320 0.000 0.000 0.524 0.156
#> SRR1096638 5 0.4192 6.67e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR1466619 2 0.6506 2.33e-01 0.000 0.456 0.000 0.200 0.344
#> SRR659307 4 0.1934 6.76e-01 0.008 0.040 0.000 0.932 0.020
#> SRR1439994 3 0.1299 9.10e-01 0.008 0.000 0.960 0.012 0.020
#> SRR1454931 1 0.2732 4.91e-01 0.840 0.000 0.000 0.000 0.160
#> SRR1332928 1 0.3728 3.41e-01 0.748 0.000 0.000 0.008 0.244
#> SRR658621 2 0.5093 6.10e-01 0.000 0.696 0.000 0.124 0.180
#> SRR1095840 1 0.4030 1.25e-01 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352
#> SRR1458243 3 0.1186 9.11e-01 0.008 0.000 0.964 0.008 0.020
#> SRR1374270 4 0.3112 6.22e-01 0.044 0.000 0.000 0.856 0.100
#> SRR1470947 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365598 4 0.6534 5.46e-01 0.008 0.160 0.000 0.480 0.352
#> SRR662787 2 0.0404 8.19e-01 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1408727 4 0.0693 6.94e-01 0.000 0.008 0.000 0.980 0.012
#> SRR1456274 5 0.5459 5.11e-01 0.316 0.000 0.000 0.084 0.600
#> SRR817744 5 0.4201 6.65e-01 0.408 0.000 0.000 0.000 0.592
#> SRR1478744 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 1 0.5536 -1.75e-01 0.572 0.000 0.368 0.016 0.044
#> SRR1374198 1 0.4114 8.92e-02 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR1445856 3 0.2241 8.89e-01 0.076 0.000 0.908 0.008 0.008
#> SRR820049 3 0.3857 8.61e-01 0.120 0.000 0.820 0.016 0.044
#> SRR1375290 4 0.7104 4.28e-02 0.376 0.000 0.120 0.448 0.056
#> SRR818999 1 0.3675 4.02e-01 0.772 0.000 0.216 0.004 0.008
#> SRR1390242 1 0.4150 8.26e-03 0.612 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR1401164 2 0.3895 6.06e-01 0.000 0.680 0.000 0.000 0.320
#> SRR1454629 1 0.2773 4.88e-01 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164
#> SRR1332187 3 0.2723 8.82e-01 0.124 0.000 0.864 0.000 0.012
#> SRR603365 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR657833 4 0.6291 5.47e-01 0.000 0.164 0.000 0.492 0.344
#> SRR1436207 4 0.5702 6.15e-01 0.000 0.180 0.000 0.628 0.192
#> SRR1488017 5 0.4201 6.65e-01 0.408 0.000 0.000 0.000 0.592
#> SRR612947 2 0.1478 7.99e-01 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1480384 1 0.3642 3.61e-01 0.760 0.000 0.000 0.008 0.232
#> SRR1364761 2 0.0290 8.23e-01 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1308086 3 0.4812 7.94e-01 0.192 0.000 0.736 0.020 0.052
#> SRR1441868 5 0.4192 6.69e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR1485380 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073705 5 0.4797 2.21e-01 0.172 0.000 0.000 0.104 0.724
#> SRR615032 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0404 8.19e-01 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 4 0.0671 6.94e-01 0.000 0.016 0.000 0.980 0.004
#> SRR1332816 5 0.4192 6.67e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR612299 4 0.5536 6.25e-01 0.008 0.060 0.000 0.580 0.352
#> SRR1407386 1 0.4287 -2.53e-01 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR1418064 5 0.6822 -5.65e-01 0.000 0.316 0.000 0.340 0.344
#> SRR1309403 4 0.6510 3.34e-01 0.224 0.000 0.000 0.480 0.296
#> SRR1498395 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337215 4 0.5029 6.59e-01 0.060 0.000 0.000 0.648 0.292
#> SRR1414749 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365963 3 0.0854 9.13e-01 0.012 0.000 0.976 0.004 0.008
#> SRR1368030 2 0.6386 2.96e-01 0.000 0.480 0.000 0.180 0.340
#> SRR1419760 4 0.1300 6.90e-01 0.016 0.000 0.000 0.956 0.028
#> SRR1381841 1 0.2471 5.04e-01 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR821388 4 0.2678 6.38e-01 0.016 0.004 0.000 0.880 0.100
#> SRR657623 2 0.5218 5.92e-01 0.000 0.684 0.000 0.136 0.180
#> SRR1094241 3 0.0162 9.14e-01 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR819583 3 0.1041 9.07e-01 0.032 0.000 0.964 0.004 0.000
#> SRR1096149 1 0.4441 3.22e-01 0.696 0.000 0.012 0.012 0.280
#> SRR1342829 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.3561 3.79e-01 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR811333 1 0.2234 4.88e-01 0.916 0.000 0.036 0.004 0.044
#> SRR1311666 2 0.2362 7.76e-01 0.000 0.900 0.000 0.024 0.076
#> SRR1486698 2 0.5867 3.32e-01 0.000 0.588 0.000 0.268 0.144
#> SRR1446436 4 0.6599 4.64e-01 0.000 0.220 0.000 0.436 0.344
#> SRR815092 1 0.4015 1.35e-01 0.652 0.000 0.000 0.000 0.348
#> SRR1500149 4 0.6264 5.48e-01 0.000 0.160 0.000 0.496 0.344
#> SRR1100564 1 0.1608 5.25e-01 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1403072 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811653 4 0.6345 1.75e-01 0.304 0.000 0.008 0.536 0.152
#> SRR1311348 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435442 4 0.6478 5.54e-01 0.008 0.152 0.000 0.488 0.352
#> SRR1421444 3 0.2005 9.03e-01 0.056 0.000 0.924 0.004 0.016
#> SRR1344010 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 5 0.4425 6.57e-01 0.392 0.000 0.000 0.008 0.600
#> SRR1444763 1 0.4249 -1.18e-01 0.568 0.000 0.000 0.000 0.432
#> SRR1415026 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416596 4 0.6506 4.98e-01 0.000 0.200 0.000 0.456 0.344
#> SRR1485499 2 0.3164 7.42e-01 0.000 0.852 0.000 0.044 0.104
#> SRR1316078 2 0.2632 7.67e-01 0.000 0.888 0.000 0.040 0.072
#> SRR663465 2 0.0703 8.17e-01 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1310094 4 0.6725 3.89e-01 0.000 0.256 0.000 0.400 0.344
#> SRR663537 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 5 0.4192 6.69e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR1453950 1 0.2891 4.75e-01 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1087875 5 0.4425 6.62e-01 0.392 0.000 0.000 0.008 0.600
#> SRR613318 4 0.0609 6.91e-01 0.000 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1332694 1 0.3424 4.10e-01 0.760 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR1468469 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818670 2 0.6206 3.73e-01 0.000 0.532 0.000 0.172 0.296
#> SRR1120318 1 0.2605 4.90e-01 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR1311622 3 0.4605 8.17e-01 0.176 0.000 0.756 0.020 0.048
#> SRR1500931 3 0.0510 9.11e-01 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1387494 3 0.5791 5.08e-01 0.388 0.000 0.540 0.020 0.052
#> SRR1379175 4 0.3224 6.93e-01 0.016 0.000 0.000 0.824 0.160
#> SRR1401909 3 0.0162 9.14e-01 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.6112 3.78e-01 0.000 0.516 0.000 0.140 0.344
#> SRR1068832 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376640 4 0.4520 6.63e-01 0.000 0.032 0.000 0.684 0.284
#> SRR1085712 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.2813 4.84e-01 0.832 0.000 0.000 0.000 0.168
#> SRR1084276 1 0.4325 3.51e-01 0.684 0.000 0.300 0.004 0.012
#> SRR1353262 2 0.5606 4.96e-01 0.000 0.600 0.000 0.104 0.296
#> SRR1437035 5 0.4235 6.38e-01 0.424 0.000 0.000 0.000 0.576
#> SRR1396877 1 0.1121 5.26e-01 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1443026 2 0.2770 7.60e-01 0.000 0.880 0.000 0.044 0.076
#> SRR1417936 5 0.4201 6.64e-01 0.408 0.000 0.000 0.000 0.592
#> SRR1436822 4 0.4433 6.68e-01 0.008 0.016 0.000 0.696 0.280
#> SRR1101128 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0404 8.19e-01 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1394366 4 0.5034 6.47e-01 0.020 0.016 0.000 0.616 0.348
#> SRR1093218 3 0.0771 9.14e-01 0.000 0.000 0.976 0.004 0.020
#> SRR1077090 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327430 4 0.4570 6.50e-01 0.000 0.020 0.000 0.632 0.348
#> SRR1088958 5 0.4182 6.69e-01 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR1486931 4 0.6291 5.47e-01 0.000 0.164 0.000 0.492 0.344
#> SRR1086820 1 0.3274 4.26e-01 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR1383000 1 0.3764 3.74e-01 0.772 0.000 0.008 0.008 0.212
#> SRR1355705 2 0.0404 8.19e-01 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR614335 2 0.1818 8.00e-01 0.000 0.932 0.000 0.024 0.044
#> SRR660534 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 4 0.6781 3.31e-01 0.000 0.280 0.000 0.376 0.344
#> SRR1456401 4 0.6370 5.33e-01 0.000 0.176 0.000 0.480 0.344
#> SRR1086393 5 0.4182 6.69e-01 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR1351521 3 0.0404 9.14e-01 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1093100 4 0.3535 5.74e-01 0.028 0.000 0.000 0.808 0.164
#> SRR1309382 1 0.2471 4.98e-01 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136
#> SRR1089375 1 0.0880 5.23e-01 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1499482 4 0.6545 5.17e-01 0.000 0.216 0.000 0.460 0.324
#> SRR614719 4 0.1478 6.82e-01 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1081473 3 0.5585 6.32e-01 0.336 0.000 0.596 0.020 0.048
#> SRR1087415 1 0.4088 8.64e-02 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368
#> SRR1088217 3 0.1965 8.67e-01 0.096 0.000 0.904 0.000 0.000
#> SRR808496 4 0.1877 6.84e-01 0.000 0.064 0.000 0.924 0.012
#> SRR1336463 4 0.6506 4.98e-01 0.000 0.200 0.000 0.456 0.344
#> SRR612359 4 0.1478 6.82e-01 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1444412 1 0.4146 3.77e-01 0.716 0.000 0.268 0.004 0.012
#> SRR1074116 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.2819 8.89e-01 0.080 0.000 0.884 0.012 0.024
#> SRR656095 2 0.0404 8.19e-01 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR808914 1 0.4074 8.87e-02 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1349099 1 0.4150 5.47e-02 0.612 0.000 0.000 0.000 0.388
#> SRR1337886 2 0.6186 3.67e-01 0.000 0.512 0.000 0.152 0.336
#> SRR813632 1 0.3387 4.46e-01 0.836 0.000 0.128 0.004 0.032
#> SRR1101591 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.1282 5.26e-01 0.952 0.000 0.000 0.004 0.044
#> SRR1453127 3 0.0404 9.14e-01 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1498354 3 0.0794 9.08e-01 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.4074 8.87e-02 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1315434 3 0.0671 9.14e-01 0.000 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR814747 2 0.6386 2.96e-01 0.000 0.480 0.000 0.180 0.340
#> SRR1358539 1 0.4161 -9.32e-05 0.608 0.000 0.000 0.000 0.392
#> SRR1367807 5 0.4182 6.69e-01 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR1365791 1 0.3649 4.12e-01 0.808 0.000 0.152 0.000 0.040
#> SRR1081519 3 0.0794 9.08e-01 0.028 0.000 0.972 0.000 0.000
#> SRR614707 5 0.6778 3.38e-02 0.312 0.000 0.000 0.296 0.392
#> SRR1094027 1 0.4114 1.13e-01 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR1489092 1 0.1830 4.94e-01 0.932 0.000 0.000 0.040 0.028
#> SRR1079502 1 0.1329 5.06e-01 0.956 0.000 0.008 0.004 0.032
#> SRR1457814 4 0.2685 6.37e-01 0.028 0.000 0.000 0.880 0.092
#> SRR1455127 2 0.6091 3.90e-01 0.000 0.524 0.000 0.140 0.336
#> SRR615081 4 0.6507 5.50e-01 0.008 0.156 0.000 0.484 0.352
#> SRR1327855 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.6805 -1.00e-01 0.000 0.360 0.000 0.296 0.344
#> SRR1394125 1 0.3656 4.08e-01 0.800 0.000 0.168 0.000 0.032
#> SRR1488388 5 0.4235 6.41e-01 0.424 0.000 0.000 0.000 0.576
#> SRR1401122 4 0.5289 6.27e-01 0.000 0.064 0.000 0.596 0.340
#> SRR612383 4 0.1792 6.70e-01 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1477711 1 0.4262 -1.80e-01 0.560 0.000 0.000 0.000 0.440
#> SRR1350813 2 0.6285 -9.68e-02 0.000 0.456 0.000 0.392 0.152
#> SRR612851 4 0.1012 6.97e-01 0.000 0.020 0.000 0.968 0.012
#> SRR1086349 5 0.4192 6.69e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR812837 2 0.0404 8.19e-01 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1340010 4 0.6510 -5.03e-02 0.380 0.000 0.000 0.428 0.192
#> SRR1475885 5 0.5042 6.17e-02 0.460 0.000 0.000 0.032 0.508
#> SRR1376334 1 0.4074 8.87e-02 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1399821 5 0.4192 6.69e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR1347042 3 0.0404 9.14e-01 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR612323 4 0.0671 6.93e-01 0.000 0.004 0.000 0.980 0.016
#> SRR612604 2 0.5613 4.78e-01 0.000 0.576 0.000 0.092 0.332
#> SRR1389546 2 0.0162 8.24e-01 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1311877 5 0.4182 6.69e-01 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR1465608 1 0.3942 3.46e-01 0.728 0.000 0.000 0.012 0.260
#> SRR1101808 2 0.1942 7.95e-01 0.000 0.920 0.000 0.012 0.068
#> SRR1414079 3 0.3733 8.45e-01 0.156 0.000 0.808 0.008 0.028
#> SRR1331153 4 0.6370 5.33e-01 0.000 0.176 0.000 0.480 0.344
#> SRR1078439 1 0.5685 1.17e-01 0.528 0.000 0.016 0.408 0.048
#> SRR2165527 2 0.0404 8.19e-01 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1351147 1 0.4620 2.15e-02 0.592 0.000 0.000 0.016 0.392
#> SRR1313536 2 0.3774 6.31e-01 0.000 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1070308 4 0.5052 6.38e-01 0.000 0.048 0.000 0.612 0.340
#> SRR1403110 1 0.3999 1.51e-01 0.656 0.000 0.000 0.000 0.344
#> SRR1400355 2 0.6112 3.78e-01 0.000 0.516 0.000 0.140 0.344
#> SRR1401317 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.4126 5.77e-02 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1074622 1 0.3671 3.62e-01 0.756 0.000 0.000 0.008 0.236
#> SRR1465847 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.3530 8.25e-01 0.204 0.000 0.784 0.000 0.012
#> SRR1075579 1 0.4287 -2.61e-01 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR1090881 4 0.5774 3.06e-01 0.232 0.000 0.000 0.612 0.156
#> SRR612251 4 0.1478 6.82e-01 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR1418581 5 0.4192 6.69e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR658045 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613214 4 0.1478 6.82e-01 0.000 0.064 0.000 0.936 0.000
#> SRR613078 4 0.6318 5.43e-01 0.000 0.168 0.000 0.488 0.344
#> SRR1472998 3 0.5392 6.06e-01 0.364 0.000 0.584 0.016 0.036
#> SRR1433452 4 0.6418 5.22e-01 0.000 0.184 0.000 0.472 0.344
#> SRR1101957 5 0.4192 6.67e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR1487993 3 0.3779 8.62e-01 0.116 0.000 0.824 0.012 0.048
#> SRR1465983 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.3395 4.15e-01 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236
#> SRR1367566 3 0.5117 6.54e-01 0.332 0.000 0.624 0.012 0.032
#> SRR1316151 4 0.5486 6.17e-01 0.000 0.076 0.000 0.572 0.352
#> SRR1417547 4 0.6555 4.81e-01 0.000 0.220 0.000 0.460 0.320
#> SRR659389 2 0.0404 8.19e-01 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1490270 4 0.6599 4.64e-01 0.000 0.220 0.000 0.436 0.344
#> SRR1398207 1 0.3790 3.81e-01 0.744 0.000 0.248 0.004 0.004
#> SRR1358755 3 0.1768 8.91e-01 0.072 0.000 0.924 0.004 0.000
#> SRR1078903 4 0.6553 5.13e-01 0.000 0.216 0.000 0.456 0.328
#> SRR1323252 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0880 8.13e-01 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1369172 1 0.3932 2.26e-01 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR615982 4 0.1399 6.98e-01 0.000 0.020 0.000 0.952 0.028
#> SRR1480431 2 0.5810 2.95e-01 0.000 0.580 0.000 0.296 0.124
#> SRR1429825 4 0.3530 6.86e-01 0.000 0.012 0.000 0.784 0.204
#> SRR1102393 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.4101 1.30e-01 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR808351 1 0.3741 3.27e-01 0.732 0.000 0.000 0.004 0.264
#> SRR1317513 1 0.4306 -3.82e-01 0.508 0.000 0.000 0.000 0.492
#> SRR1480501 3 0.2672 8.70e-01 0.116 0.000 0.872 0.008 0.004
#> SRR1081910 1 0.1965 5.19e-01 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1086611 4 0.1211 6.91e-01 0.024 0.000 0.000 0.960 0.016
#> SRR1392571 4 0.1877 6.84e-01 0.000 0.064 0.000 0.924 0.012
#> SRR1311441 5 0.4192 6.69e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR808152 5 0.4262 6.03e-01 0.440 0.000 0.000 0.000 0.560
#> SRR657313 3 0.2710 8.95e-01 0.056 0.000 0.896 0.016 0.032
#> SRR1433131 2 0.4756 5.88e-01 0.000 0.668 0.000 0.044 0.288
#> SRR1321011 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 5 0.4425 6.62e-01 0.392 0.000 0.000 0.008 0.600
#> SRR1376228 3 0.0000 9.14e-01 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399757 5 0.5117 -4.07e-01 0.032 0.012 0.000 0.332 0.624
#> SRR1358060 3 0.0566 9.14e-01 0.004 0.000 0.984 0.000 0.012
#> SRR1464517 3 0.5537 6.60e-01 0.308 0.000 0.620 0.020 0.052
#> SRR613557 4 0.1484 6.83e-01 0.000 0.048 0.000 0.944 0.008
#> SRR809831 1 0.1197 5.26e-01 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1429387 3 0.0404 9.14e-01 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR816565 5 0.4219 6.51e-01 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584
#> SRR1071644 5 0.4192 6.69e-01 0.404 0.000 0.000 0.000 0.596
#> SRR1406936 1 0.1364 5.07e-01 0.952 0.000 0.000 0.012 0.036
#> SRR1072031 2 0.0000 8.24e-01 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 4 0.5900 5.89e-01 0.000 0.188 0.000 0.600 0.212
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 5 0.7366 0.18941 0.072 0.000 0.020 0.200 0.396 0.312
#> SRR1404105 1 0.3866 -0.11344 0.516 0.000 0.000 0.000 0.484 0.000
#> SRR2164936 2 0.0146 0.91708 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0508 0.83568 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR614491 4 0.0632 0.78935 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1069376 1 0.1700 0.66577 0.916 0.000 0.000 0.004 0.080 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 6 0.4506 0.60751 0.000 0.344 0.000 0.036 0.004 0.616
#> SRR1345715 1 0.0146 0.69022 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.3772 0.47812 0.772 0.000 0.000 0.160 0.068 0.000
#> SRR1394209 4 0.2706 0.76010 0.044 0.000 0.000 0.880 0.060 0.016
#> SRR1474018 6 0.4289 0.58435 0.000 0.360 0.000 0.028 0.000 0.612
#> SRR1099809 3 0.5163 0.62523 0.000 0.000 0.608 0.004 0.276 0.112
#> SRR1500555 4 0.0632 0.78935 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1354363 1 0.0146 0.69041 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1391619 3 0.5378 0.67017 0.000 0.000 0.576 0.008 0.112 0.304
#> SRR1307997 6 0.5272 0.67074 0.000 0.072 0.000 0.300 0.024 0.604
#> SRR663124 4 0.4130 0.45788 0.000 0.300 0.000 0.672 0.004 0.024
#> SRR1334670 1 0.3756 0.28012 0.600 0.000 0.000 0.000 0.400 0.000
#> SRR612515 4 0.0632 0.78935 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1092727 2 0.5046 0.23686 0.000 0.560 0.000 0.364 0.004 0.072
#> SRR1364013 4 0.2631 0.72956 0.000 0.044 0.000 0.876 0.004 0.076
#> SRR1468553 3 0.4657 0.74263 0.000 0.000 0.684 0.004 0.092 0.220
#> SRR1403980 3 0.6104 0.49155 0.000 0.000 0.460 0.008 0.308 0.224
#> SRR1420169 3 0.0964 0.83527 0.000 0.000 0.968 0.004 0.012 0.016
#> SRR1442800 5 0.6655 0.06175 0.284 0.000 0.000 0.080 0.488 0.148
#> SRR1359214 2 0.1141 0.88330 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1499849 3 0.4431 0.68261 0.000 0.000 0.688 0.004 0.248 0.060
#> SRR1500030 3 0.5378 0.67017 0.000 0.000 0.576 0.008 0.112 0.304
#> SRR1093053 6 0.6991 -0.34488 0.000 0.000 0.056 0.304 0.316 0.324
#> SRR1399843 5 0.5191 0.48052 0.116 0.000 0.000 0.008 0.624 0.252
#> SRR1380231 5 0.3785 0.60435 0.176 0.000 0.020 0.004 0.780 0.020
#> SRR809470 3 0.4474 0.72501 0.000 0.000 0.704 0.008 0.220 0.068
#> SRR614239 4 0.0632 0.78935 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR613939 6 0.5469 0.66057 0.000 0.068 0.000 0.312 0.036 0.584
#> SRR612971 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 6 0.5244 0.70171 0.000 0.248 0.000 0.124 0.008 0.620
#> SRR811357 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0146 0.69022 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR613006 6 0.6255 0.68674 0.000 0.120 0.000 0.256 0.072 0.552
#> SRR1469570 2 0.0260 0.91598 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1457354 6 0.4433 0.61228 0.000 0.344 0.000 0.040 0.000 0.616
#> SRR1362906 3 0.3163 0.81180 0.000 0.000 0.824 0.008 0.024 0.144
#> SRR1079023 1 0.2340 0.63192 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.5022 0.43446 0.720 0.000 0.000 0.096 0.100 0.084
#> SRR1478700 1 0.6407 -0.23696 0.360 0.000 0.000 0.012 0.324 0.304
#> SRR1081543 5 0.6280 0.17989 0.016 0.000 0.000 0.240 0.456 0.288
#> SRR1384754 5 0.7037 0.28494 0.252 0.000 0.040 0.012 0.380 0.316
#> SRR612287 2 0.0260 0.91656 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1380317 4 0.1167 0.78344 0.012 0.000 0.000 0.960 0.020 0.008
#> SRR1315247 6 0.5701 0.37252 0.000 0.000 0.000 0.376 0.164 0.460
#> SRR1105344 6 0.4392 0.62363 0.000 0.332 0.000 0.040 0.000 0.628
#> SRR658549 4 0.1826 0.76943 0.000 0.052 0.000 0.924 0.004 0.020
#> SRR1480240 5 0.3351 0.53309 0.288 0.000 0.000 0.000 0.712 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0146 0.91708 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1358520 4 0.2734 0.65677 0.000 0.008 0.000 0.840 0.004 0.148
#> SRR1419476 3 0.0881 0.83495 0.000 0.000 0.972 0.008 0.012 0.008
#> SRR1456075 3 0.5502 0.64380 0.000 0.000 0.544 0.008 0.116 0.332
#> SRR1389474 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.69014 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0146 0.69022 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.4675 0.75759 0.000 0.000 0.696 0.008 0.096 0.200
#> SRR1095985 5 0.2425 0.58945 0.088 0.000 0.000 0.004 0.884 0.024
#> SRR1325771 1 0.4364 0.09221 0.556 0.000 0.000 0.012 0.008 0.424
#> SRR1360420 3 0.0146 0.83604 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR660272 6 0.5339 0.68838 0.000 0.092 0.000 0.280 0.020 0.608
#> SRR1332993 1 0.2595 0.60979 0.836 0.000 0.000 0.004 0.160 0.000
#> SRR1311833 2 0.0260 0.91598 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR808044 1 0.6313 -0.24052 0.372 0.000 0.000 0.008 0.332 0.288
#> SRR1076916 3 0.3503 0.81321 0.000 0.000 0.816 0.008 0.068 0.108
#> SRR1356266 1 0.3843 0.12926 0.548 0.000 0.000 0.000 0.452 0.000
#> SRR1341983 6 0.5230 0.65254 0.000 0.100 0.000 0.324 0.004 0.572
#> SRR1456114 1 0.1814 0.65455 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100 0.000
#> SRR1072948 3 0.0146 0.83604 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1472370 3 0.0260 0.83534 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1480176 1 0.3050 0.55621 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469192 5 0.4671 0.33372 0.424 0.000 0.000 0.000 0.532 0.044
#> SRR1404555 5 0.5224 0.40319 0.024 0.000 0.036 0.020 0.632 0.288
#> SRR659839 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.1471 0.86793 0.000 0.932 0.000 0.064 0.004 0.000
#> SRR1362848 4 0.6179 0.52098 0.184 0.000 0.000 0.592 0.088 0.136
#> SRR1407492 4 0.0717 0.78728 0.000 0.016 0.000 0.976 0.000 0.008
#> SRR1455082 4 0.2984 0.69692 0.000 0.044 0.000 0.848 0.004 0.104
#> SRR658362 4 0.4393 0.05333 0.000 0.480 0.000 0.500 0.004 0.016
#> SRR810921 2 0.0146 0.91708 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0146 0.91708 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0520 0.83620 0.000 0.000 0.984 0.008 0.000 0.008
#> SRR818232 5 0.3979 0.10482 0.456 0.000 0.000 0.000 0.540 0.004
#> SRR1454868 4 0.5184 0.55582 0.008 0.000 0.000 0.636 0.132 0.224
#> SRR1474816 6 0.4658 0.61779 0.000 0.340 0.000 0.040 0.008 0.612
#> SRR1342002 1 0.3738 0.34142 0.680 0.000 0.000 0.004 0.312 0.004
#> SRR1088437 2 0.2163 0.83137 0.000 0.892 0.000 0.008 0.004 0.096
#> SRR1466400 6 0.6252 0.15081 0.004 0.000 0.000 0.328 0.328 0.340
#> SRR658921 6 0.6249 0.66965 0.000 0.256 0.000 0.092 0.096 0.556
#> SRR1499873 2 0.3448 0.51844 0.000 0.716 0.000 0.000 0.004 0.280
#> SRR1101373 1 0.2768 0.53072 0.832 0.000 0.000 0.012 0.000 0.156
#> SRR1090145 5 0.3995 0.04851 0.480 0.000 0.000 0.000 0.516 0.004
#> SRR1379324 1 0.3860 -0.05831 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.1152 0.83762 0.000 0.000 0.952 0.004 0.000 0.044
#> SRR1086280 3 0.1841 0.83654 0.000 0.000 0.920 0.008 0.008 0.064
#> SRR1454891 4 0.0632 0.78935 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR663185 2 0.3155 0.76739 0.000 0.828 0.000 0.132 0.004 0.036
#> SRR811819 1 0.3547 0.40589 0.668 0.000 0.000 0.000 0.332 0.000
#> SRR1318920 1 0.3514 0.51109 0.752 0.000 0.000 0.000 0.228 0.020
#> SRR656758 2 0.4341 0.53547 0.000 0.712 0.000 0.068 0.004 0.216
#> SRR1474351 1 0.1327 0.67740 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR660450 6 0.5455 0.68931 0.000 0.096 0.000 0.280 0.024 0.600
#> SRR1472687 2 0.0260 0.91672 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1334291 6 0.5414 0.68767 0.000 0.092 0.000 0.280 0.024 0.604
#> SRR1415153 2 0.0146 0.91736 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1323271 6 0.4563 0.64399 0.000 0.316 0.000 0.056 0.000 0.628
#> SRR1368939 2 0.0146 0.91736 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1443161 4 0.6437 0.23988 0.020 0.000 0.000 0.424 0.288 0.268
#> SRR614695 4 0.4780 0.51034 0.000 0.004 0.000 0.684 0.128 0.184
#> SRR1092372 5 0.4264 0.01321 0.484 0.000 0.000 0.000 0.500 0.016
#> SRR1474577 1 0.0146 0.69022 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0146 0.69022 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR612779 6 0.5026 0.59467 0.000 0.356 0.000 0.072 0.004 0.568
#> SRR1089006 1 0.0146 0.69022 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1354071 5 0.3534 0.58278 0.244 0.000 0.000 0.000 0.740 0.016
#> SRR1105463 3 0.2492 0.79356 0.000 0.000 0.876 0.004 0.100 0.020
#> SRR811005 2 0.0146 0.91708 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1385319 5 0.3991 0.05149 0.472 0.000 0.000 0.000 0.524 0.004
#> SRR1325871 3 0.5405 0.66297 0.000 0.000 0.568 0.008 0.112 0.312
#> SRR1355415 3 0.0870 0.83318 0.000 0.000 0.972 0.004 0.012 0.012
#> SRR1090861 1 0.0632 0.68820 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1320712 4 0.4844 0.56250 0.272 0.000 0.000 0.652 0.060 0.016
#> SRR1470075 1 0.2378 0.61672 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152 0.000
#> SRR1091254 1 0.3907 0.25603 0.588 0.000 0.000 0.000 0.408 0.004
#> SRR1101397 3 0.2402 0.82600 0.000 0.000 0.888 0.008 0.020 0.084
#> SRR1321165 5 0.3922 0.46985 0.320 0.000 0.000 0.000 0.664 0.016
#> SRR1092112 3 0.0622 0.83603 0.000 0.000 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR1417588 3 0.0935 0.83764 0.000 0.000 0.964 0.004 0.000 0.032
#> SRR1074790 6 0.5348 0.40889 0.332 0.004 0.000 0.096 0.004 0.564
#> SRR1432106 2 0.0146 0.91754 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR655756 2 0.0260 0.91444 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.5079 -0.11557 0.536 0.000 0.000 0.000 0.380 0.084
#> SRR1318582 2 0.0146 0.91736 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1080484 2 0.4203 0.59932 0.000 0.720 0.000 0.056 0.004 0.220
#> SRR1072749 3 0.6242 0.41744 0.000 0.000 0.416 0.008 0.312 0.264
#> SRR1078586 5 0.3864 0.20061 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520 0.000
#> SRR1400333 4 0.4526 0.60429 0.012 0.000 0.000 0.728 0.108 0.152
#> SRR1078834 4 0.2579 0.75541 0.004 0.000 0.000 0.876 0.088 0.032
#> SRR1417611 6 0.4264 0.59552 0.000 0.352 0.000 0.028 0.000 0.620
#> SRR1396840 5 0.3404 0.58677 0.224 0.000 0.000 0.000 0.760 0.016
#> SRR1465440 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 6 0.4631 0.62604 0.000 0.332 0.000 0.040 0.008 0.620
#> SRR614984 4 0.0632 0.78935 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1324269 5 0.4475 0.56556 0.220 0.000 0.000 0.000 0.692 0.088
#> SRR1401491 6 0.4943 0.66162 0.000 0.300 0.000 0.072 0.008 0.620
#> SRR1319443 5 0.3684 0.45495 0.332 0.000 0.000 0.000 0.664 0.004
#> SRR1324349 6 0.4751 0.66837 0.000 0.072 0.000 0.312 0.000 0.616
#> SRR1345523 2 0.0146 0.91708 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.5289 -0.07437 0.540 0.000 0.000 0.004 0.360 0.096
#> SRR661505 3 0.0508 0.83594 0.000 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1419062 5 0.4201 0.47347 0.000 0.000 0.196 0.004 0.732 0.068
#> SRR1480131 5 0.3076 0.57919 0.240 0.000 0.000 0.000 0.760 0.000
#> SRR1421284 4 0.0810 0.78737 0.008 0.004 0.000 0.976 0.004 0.008
#> SRR1329624 1 0.3126 0.52994 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1315739 3 0.0146 0.83604 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1099189 4 0.1390 0.78034 0.000 0.032 0.000 0.948 0.004 0.016
#> SRR1083286 5 0.3073 0.59849 0.204 0.000 0.008 0.000 0.788 0.000
#> SRR1091890 5 0.7130 0.20170 0.020 0.000 0.116 0.100 0.460 0.304
#> SRR1347436 4 0.1887 0.75814 0.000 0.016 0.000 0.924 0.012 0.048
#> SRR1327473 1 0.1082 0.67112 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040 0.000
#> SRR1338195 3 0.4419 0.75552 0.000 0.000 0.704 0.004 0.072 0.220
#> SRR809698 2 0.0146 0.91708 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.69014 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658271 6 0.4334 0.50744 0.000 0.408 0.000 0.024 0.000 0.568
#> SRR1339597 1 0.4853 -0.23471 0.488 0.000 0.000 0.000 0.456 0.056
#> SRR1454842 3 0.5378 0.67017 0.000 0.000 0.576 0.008 0.112 0.304
#> SRR1322643 1 0.0000 0.69014 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.4337 0.77074 0.000 0.000 0.724 0.008 0.068 0.200
#> SRR1354620 3 0.3827 0.62133 0.000 0.000 0.720 0.004 0.256 0.020
#> SRR615056 2 0.4034 0.48561 0.000 0.692 0.000 0.024 0.004 0.280
#> SRR1105320 1 0.2773 0.62086 0.828 0.000 0.000 0.004 0.164 0.004
#> SRR1391529 5 0.3961 0.20297 0.440 0.000 0.000 0.000 0.556 0.004
#> SRR663052 2 0.1615 0.86579 0.000 0.928 0.000 0.064 0.004 0.004
#> SRR1478834 5 0.3351 0.53309 0.288 0.000 0.000 0.000 0.712 0.000
#> SRR812366 2 0.0260 0.91598 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1435330 3 0.5580 0.67213 0.000 0.000 0.580 0.008 0.172 0.240
#> SRR615383 2 0.0260 0.91598 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1389157 4 0.2011 0.76984 0.004 0.000 0.000 0.912 0.064 0.020
#> SRR613568 6 0.5438 0.69039 0.000 0.096 0.000 0.276 0.024 0.604
#> SRR614095 6 0.4852 0.66171 0.000 0.068 0.000 0.316 0.004 0.612
#> SRR1103092 5 0.3050 0.58304 0.236 0.000 0.000 0.000 0.764 0.000
#> SRR1337155 5 0.2331 0.58713 0.080 0.000 0.000 0.000 0.888 0.032
#> SRR1475345 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0146 0.91708 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1446180 5 0.3389 0.50323 0.108 0.000 0.000 0.008 0.824 0.060
#> SRR1406372 6 0.3975 0.52853 0.000 0.392 0.000 0.008 0.000 0.600
#> SRR1339880 3 0.5449 0.66245 0.000 0.000 0.568 0.008 0.120 0.304
#> SRR1353136 4 0.6416 0.20424 0.016 0.000 0.000 0.404 0.304 0.276
#> SRR1093906 3 0.0508 0.83696 0.000 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR614035 2 0.1536 0.88149 0.000 0.940 0.000 0.016 0.004 0.040
#> SRR1351104 1 0.1765 0.65682 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096 0.000
#> SRR1363926 6 0.4997 0.68574 0.000 0.084 0.000 0.280 0.008 0.628
#> SRR1399861 4 0.3076 0.74571 0.016 0.000 0.000 0.856 0.064 0.064
#> SRR1338789 1 0.2219 0.63068 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1421420 3 0.4372 0.76956 0.000 0.000 0.728 0.008 0.080 0.184
#> SRR1420832 2 0.0260 0.91656 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1476231 1 0.0405 0.69018 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1352870 4 0.4250 0.58220 0.004 0.000 0.000 0.736 0.084 0.176
#> SRR1315041 6 0.4601 0.64745 0.000 0.312 0.000 0.060 0.000 0.628
#> SRR661877 2 0.0146 0.91708 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1443268 3 0.1196 0.83881 0.000 0.000 0.952 0.000 0.008 0.040
#> SRR1416617 3 0.6223 0.48126 0.000 0.000 0.428 0.008 0.268 0.296
#> SRR1102443 1 0.3542 0.49711 0.788 0.000 0.000 0.160 0.052 0.000
#> SRR655672 4 0.1138 0.78365 0.000 0.024 0.000 0.960 0.004 0.012
#> SRR1420006 3 0.0622 0.83603 0.000 0.000 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR1458267 6 0.5473 0.65541 0.000 0.076 0.000 0.324 0.028 0.572
#> SRR613819 6 0.4220 0.39147 0.000 0.008 0.000 0.468 0.004 0.520
#> SRR1469432 6 0.4568 0.61363 0.000 0.344 0.000 0.040 0.004 0.612
#> SRR660907 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 6 0.5075 0.46135 0.000 0.064 0.000 0.452 0.004 0.480
#> SRR1470727 5 0.4880 0.51956 0.288 0.000 0.000 0.000 0.620 0.092
#> SRR1339153 3 0.6807 0.51520 0.000 0.000 0.436 0.068 0.184 0.312
#> SRR1472749 3 0.5378 0.67017 0.000 0.000 0.576 0.008 0.112 0.304
#> SRR1414379 4 0.1364 0.77079 0.000 0.004 0.000 0.944 0.004 0.048
#> SRR1431326 1 0.0000 0.69014 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 6 0.6473 0.67988 0.000 0.172 0.000 0.176 0.096 0.556
#> SRR1098312 5 0.6969 0.23868 0.068 0.000 0.144 0.016 0.460 0.312
#> SRR810273 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 6 0.5508 0.69045 0.000 0.096 0.000 0.276 0.028 0.600
#> SRR614467 4 0.1738 0.77067 0.000 0.052 0.000 0.928 0.004 0.016
#> SRR811471 1 0.3833 0.06233 0.556 0.000 0.000 0.000 0.444 0.000
#> SRR1478341 3 0.1152 0.83732 0.000 0.000 0.952 0.004 0.000 0.044
#> SRR1088606 5 0.3263 0.50107 0.176 0.000 0.000 0.004 0.800 0.020
#> SRR1479699 1 0.4747 0.28222 0.568 0.000 0.000 0.000 0.376 0.056
#> SRR1403589 6 0.4097 0.30024 0.000 0.492 0.000 0.008 0.000 0.500
#> SRR812625 2 0.4230 0.58851 0.000 0.728 0.000 0.068 0.004 0.200
#> SRR1359803 5 0.3126 0.57341 0.248 0.000 0.000 0.000 0.752 0.000
#> SRR1338988 2 0.0260 0.91598 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1471222 6 0.5244 0.60139 0.000 0.360 0.000 0.060 0.020 0.560
#> SRR1378992 1 0.0146 0.69022 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR659427 4 0.5387 0.50608 0.008 0.000 0.000 0.600 0.136 0.256
#> SRR1096638 1 0.0146 0.69022 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1466619 6 0.4819 0.67447 0.000 0.284 0.000 0.088 0.000 0.628
#> SRR659307 4 0.1168 0.78358 0.000 0.016 0.000 0.956 0.000 0.028
#> SRR1439994 3 0.2285 0.82182 0.000 0.000 0.900 0.008 0.028 0.064
#> SRR1454931 5 0.3383 0.54393 0.268 0.000 0.000 0.000 0.728 0.004
#> SRR1332928 5 0.5357 0.28398 0.428 0.000 0.000 0.000 0.464 0.108
#> SRR658621 2 0.5434 0.13350 0.000 0.552 0.000 0.124 0.004 0.320
#> SRR1095840 1 0.3867 0.02932 0.512 0.000 0.000 0.000 0.488 0.000
#> SRR1458243 3 0.1923 0.83300 0.000 0.000 0.916 0.004 0.016 0.064
#> SRR1374270 4 0.3441 0.73582 0.020 0.000 0.000 0.832 0.076 0.072
#> SRR1470947 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365598 6 0.6005 0.63095 0.000 0.060 0.000 0.284 0.096 0.560
#> SRR662787 2 0.0665 0.90932 0.000 0.980 0.000 0.008 0.004 0.008
#> SRR1408727 4 0.0837 0.78389 0.004 0.000 0.000 0.972 0.004 0.020
#> SRR1456274 1 0.2571 0.58741 0.876 0.000 0.000 0.060 0.064 0.000
#> SRR817744 1 0.0713 0.68713 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 5 0.4910 0.38857 0.000 0.000 0.136 0.004 0.668 0.192
#> SRR1374198 1 0.4205 0.21317 0.564 0.000 0.000 0.000 0.420 0.016
#> SRR1445856 3 0.2812 0.79811 0.004 0.000 0.868 0.004 0.084 0.040
#> SRR820049 3 0.5207 0.69095 0.000 0.000 0.608 0.008 0.104 0.280
#> SRR1375290 4 0.6481 0.12470 0.000 0.000 0.016 0.356 0.316 0.312
#> SRR818999 5 0.4640 0.58412 0.124 0.000 0.100 0.004 0.744 0.028
#> SRR1390242 1 0.3446 0.43599 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308 0.000
#> SRR1401164 6 0.3995 0.33645 0.000 0.480 0.000 0.000 0.004 0.516
#> SRR1454629 5 0.3426 0.53814 0.276 0.000 0.000 0.000 0.720 0.004
#> SRR1332187 3 0.5172 0.72941 0.000 0.000 0.644 0.008 0.148 0.200
#> SRR603365 3 0.0146 0.83604 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR657833 6 0.5373 0.66699 0.000 0.072 0.000 0.308 0.028 0.592
#> SRR1436207 4 0.4581 0.25845 0.000 0.068 0.000 0.672 0.004 0.256
#> SRR1488017 1 0.0713 0.68759 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR612947 2 0.1471 0.86541 0.000 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1480384 5 0.5540 0.33082 0.412 0.000 0.000 0.008 0.476 0.104
#> SRR1364761 2 0.0692 0.90544 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1308086 3 0.5870 0.58441 0.000 0.000 0.496 0.008 0.168 0.328
#> SRR1441868 1 0.0000 0.69014 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.83574 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.2841 0.52125 0.824 0.000 0.000 0.012 0.000 0.164
#> SRR615032 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0767 0.90809 0.000 0.976 0.000 0.012 0.004 0.008
#> SRR1442983 2 0.0260 0.91598 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1100346 4 0.0976 0.78539 0.000 0.008 0.000 0.968 0.008 0.016
#> SRR1332816 1 0.0146 0.69022 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR612299 6 0.5356 0.54590 0.000 0.008 0.000 0.332 0.100 0.560
#> SRR1407386 1 0.2969 0.56864 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1418064 6 0.5361 0.70707 0.000 0.192 0.000 0.180 0.008 0.620
#> SRR1309403 1 0.7308 0.14680 0.428 0.000 0.000 0.180 0.212 0.180
#> SRR1498395 2 0.0146 0.91736 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1079998 3 0.0260 0.83534 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1498885 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337215 6 0.5860 0.37658 0.004 0.000 0.000 0.364 0.172 0.460
#> SRR1414749 3 0.0767 0.83536 0.000 0.000 0.976 0.004 0.012 0.008
#> SRR1365963 3 0.2380 0.83305 0.000 0.000 0.892 0.004 0.036 0.068
#> SRR1368030 6 0.4822 0.65030 0.000 0.308 0.000 0.068 0.004 0.620
#> SRR1419760 4 0.2507 0.76252 0.020 0.000 0.000 0.892 0.060 0.028
#> SRR1381841 5 0.3337 0.55350 0.260 0.000 0.000 0.000 0.736 0.004
#> SRR821388 4 0.3634 0.73588 0.048 0.004 0.000 0.832 0.060 0.056
#> SRR657623 2 0.5415 0.17853 0.000 0.564 0.000 0.128 0.004 0.304
#> SRR1094241 3 0.0891 0.83802 0.000 0.000 0.968 0.008 0.000 0.024
#> SRR819583 3 0.1889 0.81743 0.000 0.000 0.920 0.004 0.056 0.020
#> SRR1096149 1 0.6401 -0.23374 0.368 0.000 0.000 0.012 0.316 0.304
#> SRR1342829 3 0.0146 0.83604 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1353028 5 0.3867 0.15331 0.488 0.000 0.000 0.000 0.512 0.000
#> SRR811333 5 0.4193 0.59226 0.136 0.000 0.012 0.004 0.768 0.080
#> SRR1311666 2 0.3240 0.56587 0.000 0.752 0.000 0.004 0.000 0.244
#> SRR1486698 2 0.5639 0.16699 0.000 0.544 0.000 0.284 0.004 0.168
#> SRR1446436 6 0.5500 0.69380 0.000 0.104 0.000 0.272 0.024 0.600
#> SRR815092 1 0.3864 0.05897 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480 0.000
#> SRR1500149 6 0.5997 0.65702 0.000 0.076 0.000 0.300 0.072 0.552
#> SRR1100564 5 0.3126 0.57485 0.248 0.000 0.000 0.000 0.752 0.000
#> SRR1403072 3 0.0622 0.83603 0.000 0.000 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR811653 4 0.5404 0.50096 0.004 0.000 0.004 0.588 0.120 0.284
#> SRR1311348 2 0.0260 0.91598 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1489438 2 0.0146 0.91754 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1435442 6 0.5979 0.62155 0.000 0.052 0.000 0.284 0.104 0.560
#> SRR1421444 3 0.4261 0.76459 0.000 0.000 0.720 0.004 0.064 0.212
#> SRR1344010 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0146 0.68852 0.996 0.000 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444763 1 0.2980 0.56755 0.808 0.000 0.000 0.000 0.180 0.012
#> SRR1415026 2 0.0146 0.91754 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1416596 6 0.5108 0.69137 0.000 0.096 0.000 0.276 0.008 0.620
#> SRR1485499 2 0.3244 0.53205 0.000 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR1316078 2 0.3198 0.55169 0.000 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260
#> SRR663465 2 0.1958 0.83779 0.000 0.896 0.000 0.000 0.004 0.100
#> SRR1310094 6 0.5194 0.70236 0.000 0.140 0.000 0.232 0.004 0.624
#> SRR663537 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0260 0.69029 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1453950 5 0.4314 0.30568 0.444 0.000 0.000 0.000 0.536 0.020
#> SRR1087875 1 0.0146 0.69022 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR613318 4 0.1657 0.77707 0.012 0.000 0.000 0.936 0.040 0.012
#> SRR1332694 5 0.3847 0.26186 0.456 0.000 0.000 0.000 0.544 0.000
#> SRR1468469 3 0.0622 0.83603 0.000 0.000 0.980 0.008 0.000 0.012
#> SRR818670 6 0.5150 0.65198 0.000 0.312 0.000 0.096 0.004 0.588
#> SRR1120318 5 0.3489 0.53122 0.288 0.000 0.000 0.000 0.708 0.004
#> SRR1311622 3 0.5948 0.56686 0.000 0.000 0.480 0.008 0.180 0.332
#> SRR1500931 3 0.1370 0.82462 0.000 0.000 0.948 0.004 0.036 0.012
#> SRR1387494 6 0.6631 -0.52552 0.012 0.000 0.324 0.008 0.324 0.332
#> SRR1379175 4 0.4680 0.32097 0.004 0.004 0.000 0.648 0.052 0.292
#> SRR1401909 3 0.0767 0.83379 0.000 0.000 0.976 0.004 0.008 0.012
#> SRR1440541 6 0.4631 0.62604 0.000 0.332 0.000 0.040 0.008 0.620
#> SRR1068832 3 0.0260 0.83534 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1376640 6 0.4676 0.45070 0.000 0.008 0.000 0.436 0.028 0.528
#> SRR1085712 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 5 0.3852 0.37769 0.384 0.000 0.000 0.000 0.612 0.004
#> SRR1084276 5 0.5067 0.54964 0.124 0.000 0.168 0.000 0.684 0.024
#> SRR1353262 6 0.4362 0.54586 0.000 0.388 0.000 0.028 0.000 0.584
#> SRR1437035 1 0.2933 0.59668 0.796 0.000 0.000 0.004 0.200 0.000
#> SRR1396877 5 0.3171 0.59946 0.204 0.000 0.000 0.000 0.784 0.012
#> SRR1443026 2 0.2969 0.62893 0.000 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR1417936 1 0.0692 0.68903 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020 0.000
#> SRR1436822 6 0.4667 0.45484 0.000 0.008 0.000 0.428 0.028 0.536
#> SRR1101128 3 0.0291 0.83548 0.000 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1363886 2 0.0363 0.91441 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR612983 2 0.0146 0.91708 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1394366 6 0.5329 0.53571 0.000 0.004 0.000 0.332 0.108 0.556
#> SRR1093218 3 0.2214 0.83006 0.000 0.000 0.888 0.000 0.016 0.096
#> SRR1077090 3 0.0260 0.83534 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1327430 6 0.4157 0.57530 0.004 0.008 0.000 0.360 0.004 0.624
#> SRR1088958 1 0.0146 0.69022 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1486931 6 0.5334 0.66836 0.000 0.076 0.000 0.304 0.024 0.596
#> SRR1086820 5 0.3817 0.28049 0.432 0.000 0.000 0.000 0.568 0.000
#> SRR1383000 5 0.5983 0.35591 0.376 0.000 0.004 0.008 0.460 0.152
#> SRR1355705 2 0.0146 0.91708 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR614335 2 0.3114 0.77286 0.000 0.832 0.000 0.128 0.004 0.036
#> SRR660534 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0363 0.91441 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1334265 6 0.5255 0.70604 0.000 0.176 0.000 0.196 0.004 0.624
#> SRR1456401 6 0.5084 0.68912 0.000 0.092 0.000 0.280 0.008 0.620
#> SRR1086393 1 0.0146 0.69022 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.1841 0.83640 0.000 0.000 0.920 0.008 0.008 0.064
#> SRR1093100 4 0.3544 0.73303 0.028 0.000 0.000 0.828 0.068 0.076
#> SRR1309382 5 0.3330 0.53807 0.284 0.000 0.000 0.000 0.716 0.000
#> SRR1089375 5 0.3543 0.60093 0.200 0.000 0.000 0.000 0.768 0.032
#> SRR1499482 6 0.5487 0.53261 0.000 0.080 0.000 0.416 0.016 0.488
#> SRR614719 4 0.0632 0.78935 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1081473 3 0.6319 0.37147 0.000 0.000 0.372 0.008 0.300 0.320
#> SRR1087415 1 0.3737 0.26846 0.608 0.000 0.000 0.000 0.392 0.000
#> SRR1088217 3 0.2963 0.74443 0.000 0.000 0.828 0.004 0.152 0.016
#> SRR808496 4 0.1036 0.78527 0.000 0.024 0.000 0.964 0.004 0.008
#> SRR1336463 6 0.5004 0.69134 0.000 0.096 0.000 0.276 0.004 0.624
#> SRR612359 4 0.0632 0.78935 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR1444412 5 0.5226 0.55939 0.140 0.000 0.152 0.000 0.676 0.032
#> SRR1074116 3 0.0146 0.83604 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR821846 3 0.4419 0.75552 0.000 0.000 0.704 0.004 0.072 0.220
#> SRR656095 2 0.0146 0.91708 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.3923 0.23857 0.580 0.000 0.000 0.000 0.416 0.004
#> SRR1349099 1 0.3952 0.42254 0.672 0.000 0.000 0.000 0.308 0.020
#> SRR1337886 6 0.4688 0.62844 0.000 0.328 0.000 0.052 0.004 0.616
#> SRR813632 5 0.5114 0.58504 0.180 0.000 0.044 0.004 0.696 0.076
#> SRR1101591 3 0.0000 0.83574 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089713 5 0.2964 0.59847 0.204 0.000 0.000 0.000 0.792 0.004
#> SRR1453127 3 0.1411 0.83593 0.000 0.000 0.936 0.004 0.000 0.060
#> SRR1498354 3 0.1889 0.81675 0.000 0.000 0.920 0.004 0.056 0.020
#> SRR1313831 1 0.3881 0.27737 0.600 0.000 0.000 0.000 0.396 0.004
#> SRR1315434 3 0.1701 0.83521 0.000 0.000 0.920 0.000 0.008 0.072
#> SRR814747 6 0.4772 0.65072 0.000 0.308 0.000 0.064 0.004 0.624
#> SRR1358539 1 0.3215 0.51296 0.756 0.000 0.000 0.000 0.240 0.004
#> SRR1367807 1 0.0146 0.69022 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1365791 5 0.3995 0.51794 0.028 0.000 0.048 0.004 0.792 0.128
#> SRR1081519 3 0.2505 0.82129 0.000 0.000 0.888 0.008 0.064 0.040
#> SRR614707 1 0.6615 0.17633 0.452 0.000 0.000 0.112 0.348 0.088
#> SRR1094027 1 0.3789 0.09293 0.584 0.000 0.000 0.000 0.416 0.000
#> SRR1489092 5 0.1890 0.56916 0.044 0.000 0.000 0.008 0.924 0.024
#> SRR1079502 5 0.3902 0.58564 0.108 0.000 0.012 0.004 0.796 0.080
#> SRR1457814 4 0.3017 0.74747 0.016 0.000 0.000 0.860 0.060 0.064
#> SRR1455127 6 0.4420 0.61537 0.000 0.340 0.000 0.040 0.000 0.620
#> SRR615081 6 0.6005 0.63095 0.000 0.060 0.000 0.284 0.096 0.560
#> SRR1327855 3 0.0000 0.83574 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417873 6 0.5069 0.70423 0.000 0.228 0.000 0.144 0.000 0.628
#> SRR1394125 5 0.3871 0.55284 0.036 0.000 0.088 0.004 0.812 0.060
#> SRR1488388 1 0.2320 0.63369 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132 0.000
#> SRR1401122 6 0.4255 0.57165 0.000 0.016 0.000 0.380 0.004 0.600
#> SRR612383 4 0.0790 0.78657 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1477711 1 0.3371 0.47389 0.708 0.000 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR1350813 4 0.5871 -0.08556 0.000 0.408 0.000 0.420 0.004 0.168
#> SRR612851 4 0.1053 0.78255 0.000 0.012 0.000 0.964 0.004 0.020
#> SRR1086349 1 0.0405 0.69018 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR812837 2 0.0146 0.91708 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1340010 4 0.6805 0.27872 0.056 0.000 0.000 0.436 0.260 0.248
#> SRR1475885 1 0.5157 0.32019 0.568 0.000 0.000 0.004 0.340 0.088
#> SRR1376334 1 0.3961 0.17433 0.556 0.000 0.000 0.000 0.440 0.004
#> SRR1399821 1 0.0260 0.69013 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1347042 3 0.0935 0.83764 0.000 0.000 0.964 0.004 0.000 0.032
#> SRR612323 4 0.0551 0.78648 0.004 0.004 0.000 0.984 0.000 0.008
#> SRR612604 6 0.5643 0.57931 0.000 0.356 0.000 0.036 0.072 0.536
#> SRR1389546 2 0.0508 0.91128 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1311877 1 0.0508 0.68966 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012 0.000
#> SRR1465608 5 0.6303 0.28247 0.348 0.000 0.000 0.012 0.400 0.240
#> SRR1101808 2 0.2069 0.85134 0.000 0.908 0.000 0.020 0.004 0.068
#> SRR1414079 3 0.5217 0.71033 0.000 0.000 0.628 0.008 0.128 0.236
#> SRR1331153 6 0.5430 0.68634 0.000 0.092 0.000 0.284 0.024 0.600
#> SRR1078439 5 0.6195 0.00076 0.000 0.000 0.004 0.304 0.400 0.292
#> SRR2165527 2 0.0146 0.91708 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.4543 0.34496 0.584 0.000 0.000 0.004 0.380 0.032
#> SRR1313536 6 0.4264 0.32137 0.000 0.484 0.000 0.000 0.016 0.500
#> SRR1070308 6 0.4255 0.57162 0.000 0.016 0.000 0.380 0.004 0.600
#> SRR1403110 5 0.3975 0.15337 0.452 0.000 0.000 0.000 0.544 0.004
#> SRR1400355 6 0.4541 0.62150 0.000 0.336 0.000 0.040 0.004 0.620
#> SRR1401317 3 0.0146 0.83563 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1456862 1 0.3684 0.30302 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372 0.000
#> SRR1074622 5 0.5577 0.31433 0.416 0.000 0.000 0.008 0.468 0.108
#> SRR1465847 3 0.1442 0.83883 0.000 0.000 0.944 0.004 0.012 0.040
#> SRR1443376 2 0.0260 0.91598 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1471312 3 0.5611 0.66948 0.000 0.000 0.580 0.008 0.200 0.212
#> SRR1075579 1 0.2416 0.62857 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156 0.000
#> SRR1090881 4 0.5265 0.61723 0.048 0.000 0.000 0.684 0.144 0.124
#> SRR612251 4 0.0777 0.78833 0.000 0.024 0.000 0.972 0.004 0.000
#> SRR1418581 1 0.0146 0.69022 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613214 4 0.0632 0.78935 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR613078 6 0.5960 0.63941 0.000 0.064 0.000 0.304 0.080 0.552
#> SRR1472998 5 0.6369 -0.30053 0.000 0.000 0.348 0.012 0.372 0.268
#> SRR1433452 6 0.5084 0.68912 0.000 0.092 0.000 0.280 0.008 0.620
#> SRR1101957 1 0.0405 0.69018 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008 0.000
#> SRR1487993 3 0.5378 0.67017 0.000 0.000 0.576 0.008 0.112 0.304
#> SRR1465983 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 5 0.3817 0.31815 0.432 0.000 0.000 0.000 0.568 0.000
#> SRR1367566 3 0.6164 0.50551 0.000 0.000 0.452 0.008 0.276 0.264
#> SRR1316151 6 0.4968 0.59155 0.000 0.016 0.000 0.328 0.052 0.604
#> SRR1417547 6 0.5146 0.67534 0.000 0.100 0.000 0.300 0.004 0.596
#> SRR659389 2 0.0146 0.91708 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1490270 6 0.5193 0.69775 0.000 0.112 0.000 0.260 0.008 0.620
#> SRR1398207 5 0.4279 0.58261 0.108 0.000 0.104 0.004 0.768 0.016
#> SRR1358755 3 0.2255 0.80156 0.000 0.000 0.892 0.004 0.088 0.016
#> SRR1078903 6 0.5288 0.55417 0.000 0.088 0.000 0.404 0.004 0.504
#> SRR1323252 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.2730 0.67870 0.000 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1369172 1 0.3862 -0.05130 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476 0.000
#> SRR615982 4 0.1370 0.77473 0.000 0.012 0.000 0.948 0.004 0.036
#> SRR1480431 2 0.5552 0.14448 0.000 0.524 0.000 0.340 0.004 0.132
#> SRR1429825 4 0.4554 0.09094 0.004 0.000 0.000 0.600 0.036 0.360
#> SRR1102393 2 0.0260 0.91598 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1071313 1 0.4427 0.00100 0.548 0.000 0.000 0.004 0.428 0.020
#> SRR808351 5 0.5486 0.25690 0.448 0.000 0.000 0.008 0.448 0.096
#> SRR1317513 1 0.2969 0.56369 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224 0.000
#> SRR1480501 3 0.3521 0.75443 0.000 0.000 0.796 0.004 0.156 0.044
#> SRR1081910 5 0.3405 0.55414 0.272 0.000 0.000 0.000 0.724 0.004
#> SRR1086611 4 0.3058 0.74689 0.012 0.000 0.000 0.848 0.104 0.036
#> SRR1392571 4 0.1053 0.78490 0.000 0.020 0.000 0.964 0.004 0.012
#> SRR1311441 1 0.0000 0.69014 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.2941 0.55761 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220 0.000
#> SRR657313 3 0.3680 0.79708 0.000 0.000 0.784 0.000 0.072 0.144
#> SRR1433131 6 0.4366 0.43762 0.000 0.440 0.000 0.004 0.016 0.540
#> SRR1321011 2 0.0260 0.91598 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1500598 2 0.1327 0.87111 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1379343 2 0.0000 0.91849 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0146 0.69022 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0146 0.83604 0.000 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1399757 6 0.4989 0.40876 0.344 0.000 0.000 0.056 0.012 0.588
#> SRR1358060 3 0.2207 0.83465 0.000 0.000 0.900 0.008 0.016 0.076
#> SRR1464517 3 0.6281 0.42169 0.000 0.000 0.388 0.008 0.268 0.336
#> SRR613557 4 0.0632 0.78935 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR809831 5 0.3201 0.59828 0.208 0.000 0.000 0.000 0.780 0.012
#> SRR1429387 3 0.0935 0.83764 0.000 0.000 0.964 0.004 0.000 0.032
#> SRR816565 1 0.2320 0.64115 0.864 0.000 0.000 0.004 0.132 0.000
#> SRR1071644 1 0.0291 0.69060 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004 0.000
#> SRR1406936 5 0.3844 0.57957 0.108 0.000 0.004 0.004 0.792 0.092
#> SRR1072031 2 0.0260 0.91598 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1374671 4 0.3965 0.54861 0.000 0.072 0.000 0.764 0.004 0.160
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "skmeans"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:skmeans"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'skmeans' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.982 0.993 0.5003 0.500 0.500
#> 3 3 0.980 0.942 0.978 0.2867 0.827 0.663
#> 4 4 0.786 0.720 0.877 0.1064 0.964 0.900
#> 5 5 0.786 0.709 0.833 0.0567 0.910 0.738
#> 6 6 0.864 0.771 0.895 0.0358 0.952 0.824
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.5059 0.872 0.888 0.112
#> SRR1394209 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1391619 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1403980 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1442800 2 0.8555 0.614 0.280 0.720
#> SRR1359214 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1093053 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1399843 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1380231 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1096736 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1478700 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1384754 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1380317 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1315247 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1456075 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1417154 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1325771 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1360420 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1072948 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1362848 1 0.0938 0.983 0.988 0.012
#> SRR1407492 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1454868 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1474816 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1466400 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1101373 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR614695 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.6148 0.819 0.848 0.152
#> SRR612779 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1325871 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1092112 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.7883 0.696 0.236 0.764
#> SRR1078834 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1419062 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1315739 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1091890 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1327473 1 0.2603 0.950 0.956 0.044
#> SRR1338195 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR614887 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1354620 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1389157 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR613568 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1446180 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1406372 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1353136 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1093906 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1399861 2 0.0672 0.982 0.008 0.992
#> SRR1338789 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1421420 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1352870 2 0.7139 0.758 0.196 0.804
#> SRR1315041 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1102443 2 0.9522 0.414 0.372 0.628
#> SRR655672 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1420006 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1472749 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.1184 0.979 0.984 0.016
#> SRR1487278 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1478341 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1479699 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1378992 1 0.0672 0.987 0.992 0.008
#> SRR659427 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1096638 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.2236 0.955 0.036 0.964
#> SRR1439994 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1374270 1 0.0672 0.987 0.992 0.008
#> SRR1470947 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1456274 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR820049 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1375290 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR818999 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1332187 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR603365 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1485380 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1073705 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1309403 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1414749 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1419760 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1381841 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR821388 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR657623 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR819583 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1403072 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR811653 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1311348 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1319520 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.9552 0.395 0.624 0.376
#> SRR613318 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1468469 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1500931 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1379175 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1401909 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1101128 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1093218 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1077090 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1093100 2 0.9170 0.507 0.332 0.668
#> SRR1309382 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1101591 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1453127 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1315434 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0938 0.983 0.988 0.012
#> SRR1365791 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1081519 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR614707 2 0.6048 0.825 0.148 0.852
#> SRR1094027 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1079502 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1457814 2 0.9850 0.260 0.428 0.572
#> SRR1455127 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1475885 2 0.4161 0.903 0.084 0.916
#> SRR1376334 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1347042 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.0672 0.987 0.992 0.008
#> SRR1465608 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1351147 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1403110 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1090881 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR612251 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1487993 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1367566 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1480501 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1086611 2 0.8267 0.654 0.260 0.740
#> SRR1392571 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.6623 0.791 0.828 0.172
#> SRR808152 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR657313 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.9881 0.223 0.564 0.436
#> SRR1376228 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1399757 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1358060 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1464517 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR613557 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR809831 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.0000 0.995 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.990 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR614491 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394209 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099809 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500555 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468553 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420169 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442800 1 0.2878 0.85295 0.904 0.096 0.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499849 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500030 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093053 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399843 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1380231 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR809470 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.6307 0.05586 0.512 0.000 0.488
#> SRR1478700 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081543 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384754 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315247 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480240 1 0.0237 0.94363 0.996 0.000 0.004
#> SRR1084816 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456075 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095985 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1325771 2 0.6309 -0.00832 0.500 0.500 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1076916 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472370 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.6307 0.13382 0.512 0.000 0.488
#> SRR1404555 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362848 3 0.1289 0.94769 0.032 0.000 0.968
#> SRR1407492 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474816 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0237 0.94360 0.996 0.000 0.004
#> SRR1088437 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466400 2 0.1643 0.94486 0.044 0.956 0.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101373 2 0.6309 0.00720 0.496 0.504 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443161 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR614695 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1105463 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355415 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074790 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.6295 0.18842 0.528 0.000 0.472
#> SRR1318582 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072749 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078586 1 0.0237 0.94363 0.996 0.000 0.004
#> SRR1400333 3 0.3551 0.81469 0.000 0.132 0.868
#> SRR1078834 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.5678 0.57474 0.684 0.000 0.316
#> SRR1465440 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324269 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500846 3 0.6302 -0.02713 0.480 0.000 0.520
#> SRR661505 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480131 1 0.6140 0.38402 0.596 0.000 0.404
#> SRR1421284 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.5905 0.50250 0.648 0.000 0.352
#> SRR1091890 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327473 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338195 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 3 0.6062 0.30953 0.384 0.000 0.616
#> SRR1454842 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354620 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478834 1 0.4504 0.75719 0.804 0.000 0.196
#> SRR812366 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 2 0.1529 0.94686 0.000 0.960 0.040
#> SRR613568 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.6168 0.36385 0.588 0.000 0.412
#> SRR1337155 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1406372 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353136 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399861 3 0.6126 0.32596 0.000 0.400 0.600
#> SRR1338789 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.2711 0.87366 0.000 0.088 0.912
#> SRR1315041 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443268 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416617 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420006 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470727 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1339153 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098312 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088606 1 0.6008 0.45869 0.628 0.000 0.372
#> SRR1479699 3 0.5465 0.57524 0.288 0.000 0.712
#> SRR1403589 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359803 1 0.4555 0.75219 0.800 0.000 0.200
#> SRR1338988 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR659427 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096638 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR659307 3 0.2261 0.89888 0.000 0.068 0.932
#> SRR1439994 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454931 1 0.3816 0.81262 0.852 0.000 0.148
#> SRR1332928 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374270 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456274 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR820049 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375290 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR818999 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454629 1 0.5968 0.47707 0.636 0.000 0.364
#> SRR1332187 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073705 2 0.6309 0.00735 0.496 0.504 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.6192 0.26968 0.580 0.420 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337215 2 0.1411 0.95307 0.036 0.964 0.000
#> SRR1414749 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365963 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419760 2 0.3340 0.85738 0.120 0.880 0.000
#> SRR1381841 1 0.4555 0.75219 0.800 0.000 0.200
#> SRR821388 2 0.5016 0.67997 0.000 0.760 0.240
#> SRR657623 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096149 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100564 1 0.4555 0.75219 0.800 0.000 0.200
#> SRR1403072 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR811653 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311348 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.4796 0.72569 0.780 0.000 0.220
#> SRR1087875 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR613318 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332694 1 0.0237 0.94363 0.996 0.000 0.004
#> SRR1468469 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.4062 0.79500 0.836 0.000 0.164
#> SRR1311622 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500931 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387494 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379175 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401909 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082283 3 0.6307 0.02141 0.488 0.000 0.512
#> SRR1084276 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101128 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093218 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077090 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093100 3 0.5497 0.57821 0.000 0.292 0.708
#> SRR1309382 1 0.0892 0.93132 0.980 0.000 0.020
#> SRR1089375 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081473 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444412 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR813632 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101591 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089713 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498354 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081519 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR614707 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079502 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457814 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455127 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327855 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394125 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475885 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376334 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR612323 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078439 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403110 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 3 0.1529 0.93851 0.040 0.000 0.960
#> SRR1465847 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR612251 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472998 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0237 0.94363 0.996 0.000 0.004
#> SRR1367566 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398207 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358755 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.6267 0.25154 0.548 0.000 0.452
#> SRR808351 3 0.1753 0.92976 0.048 0.000 0.952
#> SRR1317513 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081910 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086611 3 0.2711 0.87059 0.000 0.088 0.912
#> SRR1392571 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399757 2 0.5760 0.50152 0.328 0.672 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR613557 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR809831 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.94635 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.0000 0.97922 0.000 0.000 1.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.98938 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1069376 1 0.0336 0.8744 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR811964 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0336 0.7417 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1345715 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1328073 1 0.4049 0.8041 0.780 0.008 0.000 0.212
#> SRR1394209 4 0.4193 0.4214 0.000 0.268 0.000 0.732
#> SRR1474018 2 0.3942 0.6130 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1099809 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1354363 1 0.3610 0.8164 0.800 0.000 0.000 0.200
#> SRR1391619 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR663124 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1334670 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1092727 2 0.2704 0.6312 0.000 0.876 0.000 0.124
#> SRR1364013 2 0.3726 0.5161 0.000 0.788 0.000 0.212
#> SRR1468553 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420169 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442800 1 0.5959 0.2034 0.568 0.044 0.000 0.388
#> SRR1359214 2 0.0336 0.7417 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1499849 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500030 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093053 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399843 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380231 3 0.0188 0.9557 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR809470 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR613939 2 0.3486 0.6516 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR612971 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.4222 0.5869 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR811357 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR613006 2 0.3975 0.6123 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1469570 2 0.0592 0.7395 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1457354 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1362906 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0188 0.8747 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR813608 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.7493 0.3353 0.488 0.000 0.304 0.208
#> SRR1478700 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081543 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384754 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380317 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1315247 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1105344 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR658549 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1480240 1 0.0188 0.8733 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456075 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1334419 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1417154 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095985 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325771 2 0.7620 -0.0271 0.324 0.456 0.000 0.220
#> SRR1360420 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.4643 0.5217 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1332993 1 0.0336 0.8744 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1311833 2 0.0336 0.7417 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR808044 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1076916 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.1022 0.8703 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1072948 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469192 3 0.4999 -0.0442 0.492 0.000 0.508 0.000
#> SRR1404555 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.2345 0.6576 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1362848 4 0.4817 0.2398 0.000 0.000 0.388 0.612
#> SRR1407492 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1455082 2 0.3610 0.5336 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR658362 2 0.3837 0.4980 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR810921 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474816 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1342002 1 0.0524 0.8741 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1088437 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466400 2 0.5959 0.4038 0.044 0.568 0.000 0.388
#> SRR658921 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1499873 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.7630 0.0913 0.428 0.364 0.000 0.208
#> SRR1090145 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR663185 2 0.3837 0.4980 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR811819 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0707 0.8730 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR656758 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1472687 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1415153 2 0.2216 0.7084 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1323271 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1368939 2 0.2530 0.6984 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1443161 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614695 4 0.4776 0.0123 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1092372 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1406582 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR612779 2 0.0188 0.7425 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1089006 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1354071 3 0.0469 0.9476 0.012 0.000 0.988 0.000
#> SRR1105463 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355415 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.3486 0.8206 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1320712 4 0.3610 0.4789 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1470075 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.2589 0.6386 0.000 0.884 0.000 0.116
#> SRR1432106 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458314 3 0.5296 -0.0737 0.492 0.000 0.500 0.008
#> SRR1318582 2 0.0336 0.7417 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1080484 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072749 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0188 0.8733 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1400333 4 0.6584 0.3593 0.012 0.060 0.364 0.564
#> SRR1078834 4 0.4790 -0.0122 0.000 0.380 0.000 0.620
#> SRR1417611 2 0.4277 0.5798 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1396840 1 0.4331 0.4974 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR614984 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1324269 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1319443 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 3 0.5277 0.0523 0.460 0.000 0.532 0.008
#> SRR661505 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.4040 0.5680 0.752 0.000 0.248 0.000
#> SRR1421284 2 0.4746 0.2313 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1329624 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.4585 0.3050 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR1083286 1 0.3837 0.6075 0.776 0.000 0.224 0.000
#> SRR1091890 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327473 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1338195 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR658271 2 0.4222 0.5866 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR1339597 3 0.4855 0.2760 0.400 0.000 0.600 0.000
#> SRR1454842 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1322643 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR614887 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354620 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.3266 0.8273 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1391529 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.3837 0.4980 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1478834 1 0.0921 0.8580 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR812366 2 0.0336 0.7417 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1435330 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0188 0.7425 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1389157 4 0.3726 0.3685 0.000 0.212 0.000 0.788
#> SRR613568 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR614095 2 0.0469 0.7407 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1103092 1 0.4250 0.5201 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR1337155 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 3 0.6794 0.0579 0.104 0.000 0.524 0.372
#> SRR1406372 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1339880 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353136 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.1211 0.8689 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1363926 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1399861 4 0.6677 0.3887 0.000 0.100 0.348 0.552
#> SRR1338789 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.3649 0.8144 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1352870 4 0.4994 0.0697 0.000 0.000 0.480 0.520
#> SRR1315041 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR661877 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443268 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416617 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.3870 0.8099 0.788 0.004 0.000 0.208
#> SRR655672 2 0.4830 0.1795 0.000 0.608 0.000 0.392
#> SRR1420006 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.2345 0.7045 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR613819 2 0.4134 0.5947 0.000 0.740 0.000 0.260
#> SRR1469432 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR660907 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470727 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.3528 0.5446 0.000 0.808 0.000 0.192
#> SRR1431326 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1487278 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1098312 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.4500 0.5480 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR614467 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR811471 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.7442 0.1069 0.496 0.000 0.200 0.304
#> SRR1479699 3 0.4781 0.4425 0.336 0.000 0.660 0.004
#> SRR1403589 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR812625 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359803 1 0.1022 0.8547 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1338988 2 0.0336 0.7417 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1471222 2 0.2530 0.6984 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1378992 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR659427 3 0.0592 0.9433 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1096638 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1466619 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR659307 4 0.7681 0.3381 0.000 0.380 0.216 0.404
#> SRR1439994 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0921 0.8580 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1332928 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374270 3 0.3400 0.7245 0.000 0.000 0.820 0.180
#> SRR1470947 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR662787 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408727 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1456274 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR817744 1 0.3266 0.8284 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1478744 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR820049 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375290 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818999 3 0.0188 0.9557 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.1474 0.7273 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1454629 1 0.3610 0.6453 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1332187 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.2011 0.7141 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1436207 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488017 1 0.0336 0.8744 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR612947 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480384 3 0.0188 0.9553 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1485380 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.7630 0.0913 0.428 0.364 0.000 0.208
#> SRR615032 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0336 0.7417 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1100346 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1332816 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR612299 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1407386 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1309403 2 0.5735 0.4232 0.032 0.576 0.000 0.392
#> SRR1498395 2 0.0336 0.7417 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1079998 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337215 2 0.5125 0.4663 0.008 0.604 0.000 0.388
#> SRR1414749 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365963 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0469 0.7407 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1419760 4 0.3552 0.4683 0.024 0.128 0.000 0.848
#> SRR1381841 1 0.0921 0.8580 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR821388 4 0.4888 0.2487 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR657623 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096149 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.2216 0.7086 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1486698 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR815092 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.2814 0.6851 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1100564 1 0.0921 0.8580 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR811653 3 0.4866 0.2371 0.000 0.000 0.596 0.404
#> SRR1311348 2 0.1637 0.7227 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1489438 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1421444 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1444763 1 0.2149 0.8559 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1415026 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1485499 2 0.3942 0.6130 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1316078 2 0.3975 0.6102 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR663465 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.4103 0.5987 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR663537 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.1211 0.8693 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1453950 1 0.1389 0.8408 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1087875 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR613318 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1332694 1 0.0188 0.8733 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0188 0.7425 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1120318 1 0.0921 0.8580 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1311622 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500931 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387494 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379175 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1401909 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.4250 0.5833 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1068832 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1085712 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.5000 -0.0392 0.504 0.000 0.496 0.000
#> SRR1084276 3 0.0188 0.9557 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1353262 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1437035 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396877 3 0.1557 0.8967 0.056 0.000 0.944 0.000
#> SRR1443026 2 0.4250 0.5833 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1417936 1 0.0469 0.8741 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1436822 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1101128 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0188 0.7425 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR612983 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394366 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1093218 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077090 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1088958 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1486931 2 0.2530 0.6983 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1086820 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614335 2 0.3837 0.4980 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR660534 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0336 0.7417 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1334265 2 0.3942 0.6130 0.000 0.764 0.000 0.236
#> SRR1456401 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1086393 1 0.2149 0.8561 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1351521 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093100 4 0.6992 0.5151 0.000 0.176 0.248 0.576
#> SRR1309382 1 0.0469 0.8689 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1089375 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614719 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1081473 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.3837 0.4980 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1336463 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR612359 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1444412 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0592 0.8737 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1337886 2 0.0469 0.7407 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR813632 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089713 3 0.1474 0.9018 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498354 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.3444 0.6463 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1358539 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1365791 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081519 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614707 1 0.4985 0.2528 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1094027 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079502 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457814 3 0.5039 0.2254 0.000 0.004 0.592 0.404
#> SRR1455127 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR615081 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1327855 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1394125 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0336 0.8744 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1401122 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612383 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1477711 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612851 2 0.4761 0.2227 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1086349 1 0.3649 0.8144 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR812837 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1475885 4 0.4907 -0.2257 0.420 0.000 0.000 0.580
#> SRR1376334 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1347042 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR612604 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1389546 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.3649 0.8144 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1465608 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1078439 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.4072 0.7062 0.748 0.000 0.000 0.252
#> SRR1313536 2 0.2530 0.6984 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1070308 2 0.0188 0.7425 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1403110 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.4250 0.5833 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1401317 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 3 0.4072 0.5814 0.252 0.000 0.748 0.000
#> SRR1465847 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0817 0.7368 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1471312 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.1211 0.9169 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR612251 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1418581 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR658045 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613214 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR613078 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1472998 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1101957 1 0.3649 0.8144 0.796 0.000 0.000 0.204
#> SRR1487993 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0188 0.8733 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1367566 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1417547 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1398207 3 0.0188 0.9557 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1358755 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.2281 0.7065 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1369172 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.4776 0.2141 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1480431 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1102393 2 0.0188 0.7425 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1071313 1 0.5155 0.1787 0.528 0.000 0.468 0.004
#> SRR808351 3 0.4134 0.5671 0.260 0.000 0.740 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081910 3 0.3610 0.6920 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1086611 4 0.5193 0.5114 0.096 0.064 0.044 0.796
#> SRR1392571 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1311441 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR808152 1 0.0000 0.8749 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.4817 0.4789 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1321011 2 0.0188 0.7425 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1500598 2 0.3688 0.6346 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1379343 2 0.0000 0.7430 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.3688 0.8128 0.792 0.000 0.000 0.208
#> SRR1376228 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399757 2 0.4955 0.3851 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1358060 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613557 2 0.4866 0.1529 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR809831 3 0.2814 0.7959 0.132 0.000 0.868 0.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0336 0.8744 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1071644 1 0.0817 0.8726 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1406936 3 0.0000 0.9596 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0188 0.7425 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1374671 2 0.4564 0.3131 0.000 0.672 0.000 0.328
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.1121 0.8092 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR2164936 2 0.0703 0.7316 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1472057 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614491 4 0.5118 0.7048 0.000 0.412 0.000 0.548 0.040
#> SRR1069376 5 0.4304 0.2315 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR811964 2 0.0404 0.7405 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1361415 2 0.0880 0.7471 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000
#> SRR1345715 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1328073 5 0.1792 0.8400 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR1394209 5 0.4876 0.3233 0.000 0.028 0.000 0.396 0.576
#> SRR1474018 2 0.3636 0.6528 0.000 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR1099809 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500555 4 0.5118 0.7048 0.000 0.412 0.000 0.548 0.040
#> SRR1354363 5 0.2074 0.8432 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896
#> SRR1391619 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.4126 0.5782 0.000 0.620 0.000 0.380 0.000
#> SRR663124 4 0.5118 0.7048 0.000 0.412 0.000 0.548 0.040
#> SRR1334670 1 0.0162 0.8191 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR612515 4 0.5118 0.7048 0.000 0.412 0.000 0.548 0.040
#> SRR1092727 2 0.3177 0.4137 0.000 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR1364013 2 0.3696 0.3715 0.000 0.772 0.000 0.212 0.016
#> SRR1468553 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420169 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442800 1 0.6188 0.3431 0.548 0.044 0.000 0.352 0.056
#> SRR1359214 2 0.0963 0.7465 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1499849 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500030 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093053 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399843 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380231 3 0.4015 0.4709 0.348 0.000 0.652 0.000 0.000
#> SRR809470 3 0.0609 0.9325 0.020 0.000 0.980 0.000 0.000
#> SRR614239 4 0.5118 0.7048 0.000 0.412 0.000 0.548 0.040
#> SRR613939 2 0.2773 0.7090 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR612971 2 0.0404 0.7405 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1490204 2 0.3636 0.6533 0.000 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.7449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR613006 2 0.3612 0.6554 0.000 0.732 0.000 0.268 0.000
#> SRR1469570 2 0.1908 0.7342 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1457354 2 0.4210 0.5514 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.2424 0.7317 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132
#> SRR813608 2 0.0404 0.7470 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1096736 5 0.2270 0.8292 0.076 0.000 0.020 0.000 0.904
#> SRR1478700 3 0.3816 0.5788 0.000 0.000 0.696 0.000 0.304
#> SRR1081543 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1384754 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0290 0.7465 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1380317 4 0.5111 0.7034 0.000 0.408 0.000 0.552 0.040
#> SRR1315247 2 0.6137 0.3786 0.032 0.460 0.000 0.452 0.056
#> SRR1105344 2 0.4088 0.5866 0.000 0.632 0.000 0.368 0.000
#> SRR658549 4 0.5125 0.6998 0.000 0.416 0.000 0.544 0.040
#> SRR1480240 1 0.0162 0.8191 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1084816 2 0.0162 0.7438 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR612551 2 0.0510 0.7379 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1358520 2 0.0510 0.7379 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456075 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0404 0.7470 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1367005 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1334419 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1417154 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095985 3 0.1908 0.8700 0.092 0.000 0.908 0.000 0.000
#> SRR1325771 5 0.7002 0.1000 0.016 0.252 0.000 0.276 0.456
#> SRR1360420 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660272 2 0.4015 0.6022 0.000 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1332993 1 0.4302 -0.1236 0.520 0.000 0.000 0.000 0.480
#> SRR1311833 2 0.1270 0.7436 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR808044 3 0.3876 0.5575 0.000 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1076916 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0290 0.8187 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1341983 2 0.0290 0.7423 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1456114 5 0.3816 0.6337 0.304 0.000 0.000 0.000 0.696
#> SRR1072948 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.1270 0.8049 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR613843 2 0.0404 0.7405 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1469192 3 0.5785 0.0993 0.404 0.000 0.504 0.000 0.092
#> SRR1404555 3 0.0162 0.9444 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0404 0.7405 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR659533 2 0.3132 0.4853 0.000 0.820 0.000 0.172 0.008
#> SRR1362848 5 0.3159 0.7022 0.000 0.000 0.056 0.088 0.856
#> SRR1407492 4 0.5118 0.7048 0.000 0.412 0.000 0.548 0.040
#> SRR1455082 2 0.3663 0.3824 0.000 0.776 0.000 0.208 0.016
#> SRR658362 2 0.3759 0.3491 0.000 0.764 0.000 0.220 0.016
#> SRR810921 2 0.0510 0.7379 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR662823 2 0.0703 0.7316 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.8184 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474816 2 0.4210 0.5514 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1342002 1 0.3928 0.4531 0.700 0.000 0.004 0.000 0.296
#> SRR1088437 2 0.0404 0.7405 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1466400 4 0.7341 -0.0161 0.356 0.156 0.000 0.432 0.056
#> SRR658921 2 0.5381 0.4602 0.000 0.516 0.000 0.428 0.056
#> SRR1499873 2 0.0000 0.7449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 5 0.2233 0.7592 0.016 0.080 0.000 0.000 0.904
#> SRR1090145 1 0.0000 0.8184 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.2891 0.6625 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1345307 2 0.0162 0.7440 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454891 4 0.5118 0.7048 0.000 0.412 0.000 0.548 0.040
#> SRR663185 2 0.3759 0.3491 0.000 0.764 0.000 0.220 0.016
#> SRR811819 1 0.0963 0.8124 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1318920 1 0.3508 0.5538 0.748 0.000 0.000 0.000 0.252
#> SRR656758 2 0.0404 0.7405 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1474351 1 0.1341 0.8025 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR660450 2 0.4210 0.5514 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1472687 2 0.0290 0.7423 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1334291 2 0.4210 0.5514 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1415153 2 0.2329 0.7232 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1323271 2 0.4201 0.5549 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000
#> SRR1368939 2 0.2329 0.7239 0.000 0.876 0.000 0.124 0.000
#> SRR1443161 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614695 4 0.3427 0.3408 0.004 0.096 0.000 0.844 0.056
#> SRR1092372 1 0.0000 0.8184 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1406582 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR612779 2 0.0510 0.7472 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1089006 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1354071 1 0.4294 0.0959 0.532 0.000 0.468 0.000 0.000
#> SRR1105463 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0404 0.7405 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.8184 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1355415 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090861 5 0.4182 0.4248 0.400 0.000 0.000 0.000 0.600
#> SRR1320712 5 0.1671 0.7583 0.000 0.000 0.000 0.076 0.924
#> SRR1470075 1 0.4219 0.1453 0.584 0.000 0.000 0.000 0.416
#> SRR1091254 1 0.0162 0.8191 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1101397 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.8184 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.2628 0.6930 0.000 0.884 0.000 0.028 0.088
#> SRR1432106 2 0.0162 0.7458 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR655756 2 0.0703 0.7316 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1458314 3 0.5044 0.0841 0.032 0.000 0.504 0.000 0.464
#> SRR1318582 2 0.1478 0.7412 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1080484 2 0.0510 0.7379 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1072749 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.1121 0.8092 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1400333 4 0.5791 0.2210 0.116 0.028 0.072 0.728 0.056
#> SRR1078834 4 0.4086 0.3269 0.004 0.152 0.000 0.788 0.056
#> SRR1417611 2 0.3837 0.6303 0.000 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1396840 1 0.1671 0.7592 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0404 0.7470 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1400530 2 0.4210 0.5514 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR614984 4 0.5118 0.7048 0.000 0.412 0.000 0.548 0.040
#> SRR1324269 3 0.1043 0.9146 0.040 0.000 0.960 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.4101 0.5839 0.000 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.8184 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0162 0.7458 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1345523 2 0.0510 0.7379 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1500846 5 0.4948 0.1432 0.028 0.000 0.436 0.000 0.536
#> SRR661505 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.1270 0.7838 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.5125 -0.4336 0.000 0.544 0.000 0.416 0.040
#> SRR1329624 1 0.1121 0.8092 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1315739 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.4990 -0.3295 0.000 0.580 0.000 0.384 0.036
#> SRR1083286 1 0.1341 0.7818 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.0703 0.7316 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1327473 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1338195 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0510 0.7379 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1457792 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR658271 2 0.3774 0.6383 0.000 0.704 0.000 0.296 0.000
#> SRR1339597 3 0.5289 0.4449 0.072 0.000 0.616 0.000 0.312
#> SRR1454842 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1322643 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR614887 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354620 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0162 0.7438 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1105320 1 0.3480 0.5846 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1391529 1 0.0162 0.8191 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR663052 2 0.3970 0.3182 0.000 0.752 0.000 0.224 0.024
#> SRR1478834 1 0.0451 0.8180 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR812366 2 0.0794 0.7469 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1435330 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0510 0.7472 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1389157 4 0.1444 0.3834 0.000 0.012 0.000 0.948 0.040
#> SRR613568 2 0.4210 0.5514 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR614095 2 0.1121 0.7458 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1103092 1 0.1410 0.7780 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1337155 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475345 2 0.0290 0.7423 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR809089 2 0.0703 0.7316 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1446180 1 0.7516 0.2433 0.416 0.000 0.192 0.336 0.056
#> SRR1406372 2 0.4060 0.5928 0.000 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR1339880 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353136 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0510 0.7379 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1351104 5 0.3707 0.6641 0.284 0.000 0.000 0.000 0.716
#> SRR1363926 2 0.4359 0.5472 0.000 0.584 0.000 0.412 0.004
#> SRR1399861 4 0.6289 0.2640 0.000 0.024 0.336 0.544 0.096
#> SRR1338789 1 0.4283 -0.0166 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456
#> SRR1421420 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0404 0.7405 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1476231 5 0.3336 0.7346 0.228 0.000 0.000 0.000 0.772
#> SRR1352870 4 0.5908 0.1301 0.004 0.024 0.328 0.588 0.056
#> SRR1315041 2 0.4114 0.5814 0.000 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR661877 2 0.0703 0.7316 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1443268 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416617 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102443 5 0.1792 0.8400 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR655672 4 0.5153 0.6682 0.000 0.436 0.000 0.524 0.040
#> SRR1420006 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.2648 0.7125 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR613819 2 0.3816 0.6331 0.000 0.696 0.000 0.304 0.000
#> SRR1469432 2 0.4210 0.5514 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR660907 2 0.0404 0.7405 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1465092 2 0.0404 0.7405 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1470727 3 0.1121 0.9109 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.1608 0.6748 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1431326 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1487278 2 0.5546 0.4193 0.004 0.488 0.000 0.452 0.056
#> SRR1098312 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.7449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.3796 0.6361 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR614467 4 0.5118 0.7048 0.000 0.412 0.000 0.548 0.040
#> SRR811471 1 0.0963 0.8123 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1478341 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.3260 0.7194 0.856 0.000 0.004 0.084 0.056
#> SRR1479699 1 0.6236 0.2057 0.456 0.000 0.400 0.000 0.144
#> SRR1403589 2 0.4060 0.5928 0.000 0.640 0.000 0.360 0.000
#> SRR812625 2 0.0404 0.7405 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1359803 1 0.0290 0.8168 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0794 0.7469 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1471222 2 0.2648 0.7131 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1378992 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR659427 3 0.0671 0.9317 0.000 0.000 0.980 0.004 0.016
#> SRR1096638 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1466619 2 0.4150 0.5720 0.000 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR659307 4 0.6537 0.6330 0.000 0.312 0.100 0.548 0.040
#> SRR1439994 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0290 0.8168 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1332928 3 0.3424 0.6835 0.000 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR658621 2 0.0510 0.7379 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1095840 1 0.0162 0.8191 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1458243 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374270 3 0.3957 0.5964 0.000 0.000 0.712 0.280 0.008
#> SRR1470947 2 0.0404 0.7405 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1365598 2 0.5546 0.4193 0.004 0.488 0.000 0.452 0.056
#> SRR662787 2 0.0703 0.7316 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1408727 4 0.5143 0.6846 0.000 0.428 0.000 0.532 0.040
#> SRR1456274 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR817744 5 0.4242 0.3593 0.428 0.000 0.000 0.000 0.572
#> SRR1478744 2 0.0404 0.7405 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1387379 2 0.0162 0.7458 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1102680 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0162 0.8183 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1445856 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR820049 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1375290 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818999 3 0.4210 0.3070 0.412 0.000 0.588 0.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0162 0.8191 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1401164 2 0.1792 0.7375 0.000 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1454629 1 0.1774 0.7760 0.932 0.000 0.052 0.016 0.000
#> SRR1332187 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR657833 2 0.2020 0.7313 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1436207 2 0.0162 0.7438 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1488017 1 0.3366 0.5858 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232
#> SRR612947 2 0.0290 0.7423 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1480384 3 0.4528 0.6954 0.104 0.000 0.752 0.000 0.144
#> SRR1364761 2 0.0609 0.7473 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1308086 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1441868 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1485380 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073705 5 0.2233 0.7592 0.016 0.080 0.000 0.000 0.904
#> SRR615032 2 0.0404 0.7470 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1452356 2 0.0609 0.7349 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1442983 2 0.1671 0.7382 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1100346 4 0.5048 0.6945 0.000 0.380 0.000 0.580 0.040
#> SRR1332816 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR612299 2 0.5546 0.4193 0.004 0.488 0.000 0.452 0.056
#> SRR1407386 1 0.1121 0.8092 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1418064 2 0.4359 0.5472 0.000 0.584 0.000 0.412 0.004
#> SRR1309403 2 0.6728 0.1614 0.320 0.412 0.000 0.268 0.000
#> SRR1498395 2 0.1608 0.7392 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1079998 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0162 0.7438 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1337215 2 0.6201 0.3720 0.036 0.456 0.000 0.452 0.056
#> SRR1414749 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365963 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0963 0.7465 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR1419760 4 0.1493 0.3547 0.000 0.024 0.000 0.948 0.028
#> SRR1381841 1 0.0290 0.8168 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR821388 4 0.5627 0.6857 0.000 0.368 0.000 0.548 0.084
#> SRR657623 2 0.0510 0.7379 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1094241 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096149 3 0.3983 0.5111 0.000 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR1342829 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0963 0.8123 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR811333 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.3143 0.6891 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1486698 2 0.0703 0.7316 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1446436 2 0.4210 0.5514 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR815092 1 0.0162 0.8191 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1500149 2 0.2377 0.7194 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR1100564 1 0.0451 0.8180 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1403072 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811653 3 0.5148 0.1911 0.000 0.000 0.528 0.432 0.040
#> SRR1311348 2 0.2891 0.7024 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1489438 2 0.0162 0.7458 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1435442 2 0.5546 0.4193 0.004 0.488 0.000 0.452 0.056
#> SRR1421444 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0404 0.7405 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1319520 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1444763 5 0.4294 0.2828 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1415026 2 0.0162 0.7458 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1416596 2 0.4359 0.5472 0.000 0.584 0.000 0.412 0.004
#> SRR1485499 2 0.3636 0.6528 0.000 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR1316078 2 0.3636 0.6528 0.000 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR663465 2 0.0162 0.7438 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1310094 2 0.3661 0.6504 0.000 0.724 0.000 0.276 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.7449 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 5 0.3109 0.7680 0.200 0.000 0.000 0.000 0.800
#> SRR1453950 1 0.1484 0.8088 0.944 0.000 0.008 0.000 0.048
#> SRR1087875 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR613318 4 0.5103 0.7030 0.000 0.404 0.000 0.556 0.040
#> SRR1332694 1 0.1121 0.8092 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1468469 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0510 0.7472 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1120318 1 0.0451 0.8180 0.988 0.000 0.008 0.000 0.004
#> SRR1311622 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500931 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387494 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379175 4 0.4829 -0.4277 0.000 0.484 0.000 0.496 0.020
#> SRR1401909 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.3730 0.6433 0.000 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR1068832 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.4210 0.5514 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1085712 2 0.0404 0.7405 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1082283 1 0.4171 0.3482 0.604 0.000 0.396 0.000 0.000
#> SRR1084276 3 0.4074 0.4338 0.364 0.000 0.636 0.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.4210 0.5514 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1437035 1 0.2852 0.6940 0.828 0.000 0.000 0.000 0.172
#> SRR1396877 1 0.4101 0.3933 0.628 0.000 0.372 0.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.3796 0.6356 0.000 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1417936 1 0.4101 0.2540 0.628 0.000 0.000 0.000 0.372
#> SRR1436822 2 0.4359 0.5472 0.000 0.584 0.000 0.412 0.004
#> SRR1101128 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0404 0.7470 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR612983 2 0.0510 0.7379 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1394366 2 0.5546 0.4193 0.004 0.488 0.000 0.452 0.056
#> SRR1093218 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077090 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.4210 0.5514 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1088958 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1486931 2 0.2929 0.7017 0.000 0.820 0.000 0.180 0.000
#> SRR1086820 1 0.0290 0.8174 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1383000 3 0.0771 0.9293 0.004 0.000 0.976 0.000 0.020
#> SRR1355705 2 0.0510 0.7379 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR614335 2 0.3759 0.3491 0.000 0.764 0.000 0.220 0.016
#> SRR660534 2 0.0162 0.7438 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR817094 2 0.0794 0.7469 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1334265 2 0.3636 0.6528 0.000 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR1456401 2 0.4210 0.5514 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1086393 5 0.2929 0.7873 0.180 0.000 0.000 0.000 0.820
#> SRR1351521 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093100 4 0.4962 -0.0476 0.000 0.008 0.016 0.544 0.432
#> SRR1309382 1 0.0324 0.8190 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004
#> SRR1089375 3 0.3876 0.5316 0.316 0.000 0.684 0.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0290 0.7423 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR614719 4 0.5118 0.7048 0.000 0.412 0.000 0.548 0.040
#> SRR1081473 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.2179 0.7377 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112
#> SRR1088217 3 0.1792 0.8768 0.084 0.000 0.916 0.000 0.000
#> SRR808496 2 0.3759 0.3491 0.000 0.764 0.000 0.220 0.016
#> SRR1336463 2 0.4182 0.5617 0.000 0.600 0.000 0.400 0.000
#> SRR612359 4 0.5118 0.7048 0.000 0.412 0.000 0.548 0.040
#> SRR1444412 3 0.4060 0.4420 0.360 0.000 0.640 0.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0510 0.7379 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR808914 1 0.0162 0.8191 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1349099 1 0.3366 0.5855 0.768 0.000 0.000 0.000 0.232
#> SRR1337886 2 0.0794 0.7469 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR813632 3 0.3424 0.6693 0.240 0.000 0.760 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.3999 0.4285 0.656 0.000 0.344 0.000 0.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0162 0.8191 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1315434 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814747 2 0.3177 0.6871 0.000 0.792 0.000 0.208 0.000
#> SRR1358539 1 0.0290 0.8188 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1367807 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1365791 3 0.0963 0.9204 0.036 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1081519 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614707 4 0.6570 -0.2466 0.388 0.000 0.000 0.408 0.204
#> SRR1094027 1 0.1965 0.7684 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1489092 3 0.1121 0.9138 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1079502 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457814 4 0.5125 0.1154 0.000 0.000 0.416 0.544 0.040
#> SRR1455127 2 0.4101 0.5847 0.000 0.628 0.000 0.372 0.000
#> SRR615081 2 0.5546 0.4193 0.004 0.488 0.000 0.452 0.056
#> SRR1327855 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.4114 0.5814 0.000 0.624 0.000 0.376 0.000
#> SRR1394125 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1488388 5 0.4273 0.3183 0.448 0.000 0.000 0.000 0.552
#> SRR1401122 2 0.0404 0.7475 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR612383 4 0.5118 0.7048 0.000 0.412 0.000 0.548 0.040
#> SRR1477711 1 0.1121 0.8092 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1350813 2 0.0703 0.7316 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR612851 2 0.5175 -0.5588 0.000 0.496 0.000 0.464 0.040
#> SRR1086349 5 0.3395 0.7242 0.236 0.000 0.000 0.000 0.764
#> SRR812837 2 0.0510 0.7379 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1340010 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475885 5 0.6581 0.2408 0.224 0.000 0.000 0.324 0.452
#> SRR1376334 1 0.0162 0.8191 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1399821 5 0.2471 0.8213 0.136 0.000 0.000 0.000 0.864
#> SRR1347042 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612323 4 0.5118 0.7048 0.000 0.412 0.000 0.548 0.040
#> SRR612604 2 0.4359 0.5472 0.000 0.584 0.000 0.412 0.004
#> SRR1389546 2 0.0404 0.7470 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1311877 5 0.3366 0.7288 0.232 0.000 0.000 0.000 0.768
#> SRR1465608 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0609 0.7349 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.4359 0.5472 0.000 0.584 0.000 0.412 0.004
#> SRR1078439 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR2165527 2 0.0703 0.7316 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1351147 1 0.4863 0.5809 0.708 0.000 0.000 0.088 0.204
#> SRR1313536 2 0.2516 0.7179 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1070308 2 0.0404 0.7470 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1403110 1 0.0162 0.8191 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1400355 2 0.3730 0.6433 0.000 0.712 0.000 0.288 0.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.3612 0.5033 0.732 0.000 0.000 0.000 0.268
#> SRR1074622 3 0.4840 0.6549 0.124 0.000 0.724 0.000 0.152
#> SRR1465847 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.1908 0.7338 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.1121 0.8092 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1090881 3 0.1830 0.8804 0.000 0.000 0.924 0.068 0.008
#> SRR612251 4 0.5118 0.7048 0.000 0.412 0.000 0.548 0.040
#> SRR1418581 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR658045 2 0.0404 0.7405 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR613214 4 0.5118 0.7048 0.000 0.412 0.000 0.548 0.040
#> SRR613078 2 0.5337 0.4486 0.000 0.508 0.000 0.440 0.052
#> SRR1472998 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.4210 0.5514 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1101957 5 0.3305 0.7387 0.224 0.000 0.000 0.000 0.776
#> SRR1487993 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0404 0.7405 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1380375 1 0.1121 0.8092 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1367566 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.4855 0.5085 0.000 0.552 0.000 0.424 0.024
#> SRR1417547 2 0.0162 0.7438 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR659389 2 0.0703 0.7316 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1490270 2 0.4210 0.5514 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000
#> SRR1398207 1 0.4300 0.0543 0.524 0.000 0.476 0.000 0.000
#> SRR1358755 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0162 0.7438 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1323252 2 0.0404 0.7470 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1451796 2 0.3074 0.6931 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1369172 1 0.2280 0.7286 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR615982 4 0.4979 0.5922 0.000 0.480 0.000 0.492 0.028
#> SRR1480431 2 0.1121 0.7106 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1429825 2 0.4359 0.5472 0.000 0.584 0.000 0.412 0.004
#> SRR1102393 2 0.0510 0.7472 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1071313 3 0.5454 0.1926 0.064 0.000 0.532 0.000 0.404
#> SRR808351 3 0.4844 0.6479 0.108 0.000 0.720 0.000 0.172
#> SRR1317513 1 0.1197 0.8071 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1480501 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.2424 0.7044 0.868 0.000 0.132 0.000 0.000
#> SRR1086611 4 0.2778 0.3241 0.016 0.000 0.032 0.892 0.060
#> SRR1392571 4 0.5125 0.6998 0.000 0.416 0.000 0.544 0.040
#> SRR1311441 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR808152 1 0.2020 0.7650 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR657313 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.3966 0.6106 0.000 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1321011 2 0.0703 0.7471 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1500598 2 0.3336 0.6767 0.000 0.772 0.000 0.228 0.000
#> SRR1379343 2 0.0290 0.7423 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1389108 5 0.1965 0.8473 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR1376228 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399757 2 0.4537 0.5555 0.000 0.592 0.000 0.396 0.012
#> SRR1358060 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613557 4 0.5118 0.7048 0.000 0.412 0.000 0.548 0.040
#> SRR809831 1 0.3177 0.6137 0.792 0.000 0.208 0.000 0.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.3816 0.4389 0.696 0.000 0.000 0.000 0.304
#> SRR1071644 5 0.3983 0.5848 0.340 0.000 0.000 0.000 0.660
#> SRR1406936 3 0.0000 0.9473 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0609 0.7473 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1374671 2 0.4898 -0.2903 0.000 0.592 0.000 0.376 0.032
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 3 0.1864 0.90872 0.000 0.000 0.924 0.032 0.004 0.040
#> SRR1404105 1 0.0547 0.86354 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR2164936 2 0.1663 0.85490 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR614491 4 0.0790 0.82213 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1069376 1 0.3862 0.02566 0.524 0.000 0.000 0.000 0.476 0.000
#> SRR811964 2 0.1387 0.86639 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.86852 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345715 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1328073 5 0.0603 0.83310 0.004 0.000 0.000 0.016 0.980 0.000
#> SRR1394209 5 0.4987 0.24803 0.000 0.044 0.000 0.420 0.524 0.012
#> SRR1474018 2 0.1007 0.84890 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1099809 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1500555 4 0.0790 0.82213 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1354363 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1391619 3 0.1864 0.90872 0.000 0.000 0.924 0.032 0.004 0.040
#> SRR1307997 2 0.3271 0.65623 0.000 0.760 0.000 0.008 0.000 0.232
#> SRR663124 4 0.0790 0.82213 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1334670 1 0.0260 0.86616 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR612515 4 0.0790 0.82213 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1092727 2 0.3789 0.26842 0.000 0.584 0.000 0.416 0.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.3851 0.13163 0.000 0.540 0.000 0.460 0.000 0.000
#> SRR1468553 3 0.0862 0.92435 0.000 0.000 0.972 0.008 0.004 0.016
#> SRR1403980 3 0.0260 0.92597 0.008 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000
#> SRR1420169 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1442800 6 0.1531 0.79114 0.068 0.004 0.000 0.000 0.000 0.928
#> SRR1359214 2 0.0000 0.86852 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499849 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1500030 3 0.1864 0.90872 0.000 0.000 0.924 0.032 0.004 0.040
#> SRR1093053 3 0.1719 0.91249 0.000 0.000 0.932 0.032 0.004 0.032
#> SRR1399843 3 0.0937 0.92156 0.000 0.000 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1380231 3 0.3795 0.43222 0.364 0.000 0.632 0.000 0.000 0.004
#> SRR809470 3 0.0508 0.92446 0.012 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004
#> SRR614239 4 0.0790 0.82213 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR613939 2 0.2134 0.86235 0.000 0.904 0.000 0.044 0.000 0.052
#> SRR612971 2 0.1327 0.86791 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.1461 0.85725 0.000 0.940 0.000 0.016 0.000 0.044
#> SRR811357 2 0.1141 0.87120 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1471672 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR613006 2 0.2046 0.86174 0.000 0.908 0.000 0.032 0.000 0.060
#> SRR1469570 2 0.0146 0.86740 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1457354 2 0.3774 0.31242 0.000 0.592 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR1362906 3 0.1864 0.90872 0.000 0.000 0.924 0.032 0.004 0.040
#> SRR1079023 1 0.1204 0.84324 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000
#> SRR813608 2 0.1007 0.87260 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1096736 5 0.0909 0.82144 0.000 0.000 0.000 0.020 0.968 0.012
#> SRR1478700 3 0.5057 0.45124 0.000 0.000 0.592 0.028 0.340 0.040
#> SRR1081543 3 0.1624 0.91208 0.000 0.000 0.936 0.020 0.004 0.040
#> SRR1384754 3 0.1864 0.90872 0.000 0.000 0.924 0.032 0.004 0.040
#> SRR612287 2 0.0000 0.86852 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380317 4 0.1610 0.77394 0.000 0.084 0.000 0.916 0.000 0.000
#> SRR1315247 6 0.1152 0.82388 0.004 0.044 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1105344 2 0.1910 0.80047 0.000 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR658549 4 0.0790 0.82213 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1480240 1 0.0146 0.86440 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.1267 0.86920 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.1444 0.86458 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.86852 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1456075 3 0.1642 0.91435 0.000 0.000 0.936 0.028 0.004 0.032
#> SRR1389474 2 0.1007 0.87260 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1367005 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1334419 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1417154 3 0.0858 0.92363 0.000 0.000 0.968 0.000 0.004 0.028
#> SRR1095985 3 0.1682 0.89416 0.020 0.000 0.928 0.000 0.000 0.052
#> SRR1325771 5 0.4564 0.04364 0.008 0.472 0.000 0.000 0.500 0.020
#> SRR1360420 3 0.0000 0.92658 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660272 2 0.1124 0.85698 0.000 0.956 0.000 0.008 0.000 0.036
#> SRR1332993 1 0.3620 0.42063 0.648 0.000 0.000 0.000 0.352 0.000
#> SRR1311833 2 0.0865 0.87336 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR808044 3 0.4938 0.44052 0.000 0.000 0.592 0.020 0.348 0.040
#> SRR1076916 3 0.0632 0.92527 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1356266 1 0.0790 0.85711 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1341983 2 0.1327 0.86791 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1456114 5 0.2969 0.66213 0.224 0.000 0.000 0.000 0.776 0.000
#> SRR1072948 3 0.0717 0.92519 0.000 0.000 0.976 0.008 0.000 0.016
#> SRR1472370 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1480176 1 0.0363 0.86586 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR613843 2 0.1444 0.86458 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.4284 0.31609 0.588 0.000 0.392 0.000 0.016 0.004
#> SRR1404555 3 0.2149 0.89422 0.000 0.000 0.900 0.016 0.004 0.080
#> SRR659839 2 0.1327 0.86791 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.3838 0.17381 0.000 0.552 0.000 0.448 0.000 0.000
#> SRR1362848 5 0.3348 0.72740 0.000 0.000 0.028 0.100 0.836 0.036
#> SRR1407492 4 0.0790 0.82213 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1455082 2 0.3857 0.10385 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000 0.000
#> SRR658362 4 0.3823 0.25741 0.000 0.436 0.000 0.564 0.000 0.000
#> SRR810921 2 0.1444 0.86458 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.1663 0.85490 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR818232 1 0.0260 0.86616 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1454868 3 0.1624 0.91208 0.000 0.000 0.936 0.020 0.004 0.040
#> SRR1474816 2 0.3774 0.31242 0.000 0.592 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR1342002 1 0.2003 0.79176 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1088437 2 0.1141 0.87142 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1466400 6 0.1245 0.81519 0.032 0.016 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR658921 6 0.2762 0.66804 0.000 0.196 0.000 0.000 0.000 0.804
#> SRR1499873 2 0.0937 0.87350 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1101373 5 0.0363 0.82798 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR1090145 1 0.0405 0.86571 0.988 0.000 0.000 0.000 0.008 0.004
#> SRR1379324 1 0.3405 0.57211 0.724 0.000 0.000 0.000 0.272 0.004
#> SRR1345307 2 0.1267 0.86920 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0603 0.92567 0.000 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1086280 3 0.0458 0.92593 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1454891 4 0.0790 0.82213 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR663185 4 0.3867 0.06853 0.000 0.488 0.000 0.512 0.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0363 0.86586 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1318920 1 0.4635 0.38372 0.608 0.000 0.000 0.000 0.336 0.056
#> SRR656758 2 0.1444 0.86458 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0547 0.86354 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR660450 2 0.4147 0.27097 0.000 0.552 0.000 0.012 0.000 0.436
#> SRR1472687 2 0.1141 0.87142 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.4010 0.31619 0.000 0.584 0.000 0.008 0.000 0.408
#> SRR1415153 2 0.1333 0.87343 0.000 0.944 0.000 0.048 0.000 0.008
#> SRR1323271 2 0.3706 0.38019 0.000 0.620 0.000 0.000 0.000 0.380
#> SRR1368939 2 0.1333 0.87343 0.000 0.944 0.000 0.048 0.000 0.008
#> SRR1443161 3 0.1864 0.90872 0.000 0.000 0.924 0.032 0.004 0.040
#> SRR614695 6 0.1391 0.80770 0.000 0.016 0.000 0.040 0.000 0.944
#> SRR1092372 1 0.1462 0.83974 0.936 0.000 0.000 0.000 0.008 0.056
#> SRR1474577 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1406582 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR612779 2 0.0713 0.87343 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1089006 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1354071 1 0.3890 0.30563 0.596 0.000 0.400 0.000 0.000 0.004
#> SRR1105463 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR811005 2 0.1327 0.86791 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0260 0.86616 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1325871 3 0.1864 0.90872 0.000 0.000 0.924 0.032 0.004 0.040
#> SRR1355415 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1090861 5 0.3789 0.25621 0.416 0.000 0.000 0.000 0.584 0.000
#> SRR1320712 5 0.0870 0.82305 0.000 0.012 0.000 0.012 0.972 0.004
#> SRR1470075 1 0.3860 0.07110 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472 0.000
#> SRR1091254 1 0.0260 0.86616 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1101397 3 0.0508 0.92598 0.000 0.000 0.984 0.012 0.000 0.004
#> SRR1321165 1 0.1398 0.84156 0.940 0.000 0.000 0.000 0.008 0.052
#> SRR1092112 3 0.0458 0.92593 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1417588 3 0.0862 0.92435 0.000 0.000 0.972 0.008 0.004 0.016
#> SRR1074790 2 0.1007 0.84953 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.86852 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.1765 0.84865 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR1458314 5 0.4465 -0.00468 0.020 0.000 0.472 0.000 0.504 0.004
#> SRR1318582 2 0.1152 0.87332 0.000 0.952 0.000 0.044 0.000 0.004
#> SRR1080484 2 0.0713 0.87193 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1072749 3 0.0767 0.92430 0.008 0.000 0.976 0.012 0.000 0.004
#> SRR1078586 1 0.0146 0.86588 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1400333 6 0.0146 0.79960 0.000 0.000 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1078834 6 0.1500 0.79925 0.000 0.012 0.000 0.052 0.000 0.936
#> SRR1417611 2 0.1007 0.84890 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1396840 1 0.1594 0.83564 0.932 0.000 0.016 0.000 0.000 0.052
#> SRR1465440 2 0.1007 0.87260 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.3774 0.31242 0.000 0.592 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR614984 4 0.0790 0.82213 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1324269 3 0.1700 0.87606 0.080 0.000 0.916 0.000 0.000 0.004
#> SRR1401491 2 0.1444 0.83010 0.000 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1319443 1 0.0260 0.86616 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.86852 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345523 2 0.1444 0.86458 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1500846 5 0.4204 0.09469 0.008 0.000 0.448 0.000 0.540 0.004
#> SRR661505 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1419062 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1480131 1 0.0260 0.86302 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421284 4 0.2823 0.69683 0.000 0.204 0.000 0.796 0.000 0.000
#> SRR1329624 1 0.0547 0.86354 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.92658 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 4 0.2762 0.66846 0.000 0.196 0.000 0.804 0.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.0260 0.86302 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 3 0.1624 0.91208 0.000 0.000 0.936 0.020 0.004 0.040
#> SRR1347436 2 0.1663 0.85490 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1327473 5 0.0865 0.82430 0.036 0.000 0.000 0.000 0.964 0.000
#> SRR1338195 3 0.1624 0.91208 0.000 0.000 0.936 0.020 0.004 0.040
#> SRR809698 2 0.1444 0.86458 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1457792 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR658271 2 0.1007 0.84890 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1339597 3 0.4897 0.38279 0.064 0.000 0.588 0.000 0.344 0.004
#> SRR1454842 3 0.1864 0.90872 0.000 0.000 0.924 0.032 0.004 0.040
#> SRR1322643 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR614887 3 0.0964 0.92350 0.000 0.000 0.968 0.012 0.004 0.016
#> SRR1354620 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR615056 2 0.0000 0.86852 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.2854 0.67740 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.86533 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663052 4 0.3823 0.25261 0.000 0.436 0.000 0.564 0.000 0.000
#> SRR1478834 1 0.0146 0.86440 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0713 0.87343 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.1218 0.92013 0.000 0.000 0.956 0.012 0.004 0.028
#> SRR615383 2 0.0790 0.87348 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1389157 4 0.1387 0.73584 0.000 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR613568 2 0.3782 0.30305 0.000 0.588 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR614095 2 0.0260 0.86679 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1103092 1 0.0260 0.86302 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1475345 2 0.1075 0.87233 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.1663 0.85490 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1446180 6 0.1867 0.78160 0.064 0.000 0.020 0.000 0.000 0.916
#> SRR1406372 2 0.1075 0.84609 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1339880 3 0.1864 0.90872 0.000 0.000 0.924 0.032 0.004 0.040
#> SRR1353136 3 0.1708 0.91115 0.000 0.000 0.932 0.024 0.004 0.040
#> SRR1093906 3 0.0603 0.92567 0.000 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR614035 2 0.1444 0.86458 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1351104 5 0.2969 0.66194 0.224 0.000 0.000 0.000 0.776 0.000
#> SRR1363926 2 0.3810 0.25585 0.000 0.572 0.000 0.000 0.000 0.428
#> SRR1399861 4 0.1655 0.71588 0.000 0.008 0.052 0.932 0.000 0.008
#> SRR1338789 5 0.3966 0.19168 0.444 0.000 0.000 0.000 0.552 0.004
#> SRR1421420 3 0.0363 0.92634 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1420832 2 0.0363 0.87091 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1476231 5 0.2941 0.65608 0.220 0.000 0.000 0.000 0.780 0.000
#> SRR1352870 6 0.0551 0.80235 0.000 0.008 0.004 0.004 0.000 0.984
#> SRR1315041 2 0.2416 0.75094 0.000 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR661877 2 0.1663 0.85490 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1443268 3 0.0260 0.92679 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1416617 3 0.0603 0.92567 0.000 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1102443 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR655672 4 0.1007 0.81528 0.000 0.044 0.000 0.956 0.000 0.000
#> SRR1420006 3 0.0146 0.92642 0.004 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.1616 0.87313 0.000 0.932 0.000 0.048 0.000 0.020
#> SRR613819 2 0.1204 0.84123 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1469432 2 0.3774 0.31242 0.000 0.592 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR660907 2 0.1327 0.86791 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.1387 0.86639 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1470727 3 0.1644 0.87888 0.076 0.000 0.920 0.000 0.000 0.004
#> SRR1339153 3 0.1401 0.91738 0.000 0.000 0.948 0.020 0.004 0.028
#> SRR1472749 3 0.1864 0.90872 0.000 0.000 0.924 0.032 0.004 0.040
#> SRR1414379 2 0.1471 0.84341 0.000 0.932 0.000 0.064 0.000 0.004
#> SRR1431326 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1487278 6 0.1141 0.82278 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1098312 3 0.1864 0.90872 0.000 0.000 0.924 0.032 0.004 0.040
#> SRR810273 2 0.1267 0.86920 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.1649 0.86668 0.000 0.932 0.000 0.032 0.000 0.036
#> SRR614467 4 0.0790 0.82213 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR811471 1 0.0547 0.86354 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1478341 3 0.0862 0.92435 0.000 0.000 0.972 0.008 0.004 0.016
#> SRR1088606 6 0.3564 0.53166 0.264 0.000 0.012 0.000 0.000 0.724
#> SRR1479699 3 0.6929 0.12076 0.296 0.000 0.444 0.012 0.200 0.048
#> SRR1403589 2 0.1075 0.84609 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR812625 2 0.1327 0.86791 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1359803 1 0.0146 0.86440 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.86852 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.1333 0.87343 0.000 0.944 0.000 0.048 0.000 0.008
#> SRR1378992 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR659427 3 0.3570 0.71790 0.000 0.000 0.752 0.228 0.004 0.016
#> SRR1096638 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1466619 2 0.3499 0.50542 0.000 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR659307 4 0.0363 0.80470 0.000 0.012 0.000 0.988 0.000 0.000
#> SRR1439994 3 0.0767 0.92430 0.008 0.000 0.976 0.012 0.000 0.004
#> SRR1454931 1 0.0146 0.86440 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 3 0.3772 0.57771 0.008 0.000 0.692 0.000 0.296 0.004
#> SRR658621 2 0.0547 0.87111 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.0260 0.86616 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1458243 3 0.0622 0.92643 0.000 0.000 0.980 0.012 0.000 0.008
#> SRR1374270 3 0.4452 0.53282 0.000 0.000 0.644 0.312 0.004 0.040
#> SRR1470947 2 0.1141 0.87142 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR1365598 6 0.1141 0.82278 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR662787 2 0.1714 0.85187 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000 0.000
#> SRR1408727 4 0.2597 0.71502 0.000 0.176 0.000 0.824 0.000 0.000
#> SRR1456274 5 0.0291 0.83925 0.004 0.000 0.000 0.000 0.992 0.004
#> SRR817744 5 0.3843 0.15458 0.452 0.000 0.000 0.000 0.548 0.000
#> SRR1478744 2 0.1327 0.86791 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.1007 0.87260 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1374198 1 0.1657 0.83633 0.928 0.000 0.000 0.000 0.016 0.056
#> SRR1445856 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR820049 3 0.0767 0.92538 0.000 0.000 0.976 0.008 0.004 0.012
#> SRR1375290 3 0.1716 0.91210 0.000 0.000 0.932 0.028 0.004 0.036
#> SRR818999 1 0.3961 0.18395 0.556 0.000 0.440 0.000 0.000 0.004
#> SRR1390242 1 0.0260 0.86616 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1401164 2 0.1124 0.87482 0.000 0.956 0.000 0.036 0.000 0.008
#> SRR1454629 1 0.0260 0.86302 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332187 3 0.0632 0.92527 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR603365 3 0.0000 0.92658 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657833 2 0.1285 0.87234 0.000 0.944 0.000 0.052 0.000 0.004
#> SRR1436207 2 0.1501 0.86359 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000 0.000
#> SRR1488017 1 0.1957 0.79667 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR612947 2 0.1327 0.86791 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1480384 3 0.4729 0.62916 0.208 0.000 0.700 0.012 0.076 0.004
#> SRR1364761 2 0.1007 0.87260 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.1864 0.90872 0.000 0.000 0.924 0.032 0.004 0.040
#> SRR1441868 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1485380 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1073705 5 0.0363 0.82798 0.000 0.012 0.000 0.000 0.988 0.000
#> SRR615032 2 0.1007 0.87260 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.1387 0.86615 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0858 0.87362 0.000 0.968 0.000 0.028 0.000 0.004
#> SRR1100346 4 0.1418 0.80321 0.000 0.032 0.000 0.944 0.000 0.024
#> SRR1332816 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR612299 6 0.1141 0.82278 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1407386 1 0.0363 0.86586 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1418064 2 0.3810 0.25585 0.000 0.572 0.000 0.000 0.000 0.428
#> SRR1309403 2 0.6015 -0.20174 0.372 0.388 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR1498395 2 0.1010 0.87381 0.000 0.960 0.000 0.036 0.000 0.004
#> SRR1079998 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1498885 2 0.0865 0.87350 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1337215 6 0.1007 0.82378 0.000 0.044 0.000 0.000 0.000 0.956
#> SRR1414749 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1365963 3 0.0520 0.92609 0.008 0.000 0.984 0.000 0.000 0.008
#> SRR1368030 2 0.0146 0.86772 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1419760 6 0.5046 0.46828 0.016 0.060 0.000 0.320 0.000 0.604
#> SRR1381841 1 0.0146 0.86440 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR821388 4 0.0000 0.79126 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR657623 2 0.0713 0.87193 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0363 0.92634 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR819583 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1096149 3 0.4687 0.43838 0.000 0.000 0.604 0.020 0.352 0.024
#> SRR1342829 3 0.0000 0.92658 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0363 0.86586 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR811333 3 0.0622 0.92699 0.008 0.000 0.980 0.000 0.000 0.012
#> SRR1311666 2 0.0717 0.86639 0.000 0.976 0.000 0.008 0.000 0.016
#> SRR1486698 2 0.1663 0.85490 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.4461 0.34071 0.000 0.564 0.000 0.032 0.000 0.404
#> SRR815092 1 0.0260 0.86616 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1500149 2 0.2179 0.85551 0.000 0.900 0.000 0.036 0.000 0.064
#> SRR1100564 1 0.0146 0.86440 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.92658 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811653 4 0.3596 0.53272 0.000 0.000 0.172 0.784 0.004 0.040
#> SRR1311348 2 0.0458 0.86274 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1489438 2 0.0000 0.86852 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435442 6 0.1141 0.82278 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1421444 3 0.1313 0.91872 0.000 0.000 0.952 0.016 0.004 0.028
#> SRR1344010 2 0.1327 0.86791 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1319520 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1444763 5 0.3221 0.71123 0.188 0.000 0.000 0.000 0.792 0.020
#> SRR1415026 2 0.0000 0.86852 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416596 2 0.3817 0.24558 0.000 0.568 0.000 0.000 0.000 0.432
#> SRR1485499 2 0.1007 0.84890 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1316078 2 0.0937 0.85114 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR663465 2 0.0000 0.86852 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.1007 0.84890 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR663537 2 0.1267 0.86920 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR1486780 5 0.2527 0.72966 0.168 0.000 0.000 0.000 0.832 0.000
#> SRR1453950 1 0.0964 0.85607 0.968 0.000 0.016 0.000 0.012 0.004
#> SRR1087875 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR613318 4 0.0458 0.80903 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000 0.000
#> SRR1332694 1 0.0146 0.86588 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1468469 3 0.0363 0.92634 0.000 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR818670 2 0.0458 0.87231 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0146 0.86440 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 3 0.1788 0.91084 0.000 0.000 0.928 0.028 0.004 0.040
#> SRR1500931 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1387494 3 0.1864 0.90872 0.000 0.000 0.924 0.032 0.004 0.040
#> SRR1379175 6 0.3409 0.57237 0.000 0.300 0.000 0.000 0.000 0.700
#> SRR1401909 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1440541 2 0.1007 0.84890 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1068832 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1376640 2 0.3817 0.26214 0.000 0.568 0.000 0.000 0.000 0.432
#> SRR1085712 2 0.1327 0.86791 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.4285 0.24275 0.552 0.000 0.432 0.000 0.008 0.008
#> SRR1084276 3 0.3937 0.28022 0.424 0.000 0.572 0.000 0.000 0.004
#> SRR1353262 2 0.3747 0.34248 0.000 0.604 0.000 0.000 0.000 0.396
#> SRR1437035 1 0.2178 0.77865 0.868 0.000 0.000 0.000 0.132 0.000
#> SRR1396877 1 0.3109 0.61727 0.772 0.000 0.224 0.000 0.000 0.004
#> SRR1443026 2 0.1007 0.84890 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1417936 1 0.3050 0.63854 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR1436822 2 0.3851 0.15916 0.000 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR1101128 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1363886 2 0.0000 0.86852 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.1444 0.86458 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1394366 6 0.1075 0.82356 0.000 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952
#> SRR1093218 3 0.0458 0.92649 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000 0.000
#> SRR1077090 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1327430 2 0.3789 0.29044 0.000 0.584 0.000 0.000 0.000 0.416
#> SRR1088958 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1486931 2 0.2001 0.86716 0.000 0.912 0.000 0.048 0.000 0.040
#> SRR1086820 1 0.1524 0.83696 0.932 0.000 0.000 0.000 0.060 0.008
#> SRR1383000 3 0.1655 0.90587 0.032 0.000 0.940 0.012 0.012 0.004
#> SRR1355705 2 0.1444 0.86458 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR614335 4 0.3867 0.06862 0.000 0.488 0.000 0.512 0.000 0.000
#> SRR660534 2 0.1267 0.86920 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.86852 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.1007 0.84890 0.000 0.956 0.000 0.000 0.000 0.044
#> SRR1456401 2 0.3774 0.31242 0.000 0.592 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR1086393 5 0.1863 0.78536 0.104 0.000 0.000 0.000 0.896 0.000
#> SRR1351521 3 0.0603 0.92567 0.000 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1093100 4 0.2039 0.70649 0.000 0.004 0.000 0.908 0.072 0.016
#> SRR1309382 1 0.0146 0.86440 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 3 0.3961 0.22510 0.440 0.000 0.556 0.000 0.000 0.004
#> SRR1499482 2 0.1327 0.86791 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR614719 4 0.0790 0.82213 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1081473 3 0.0603 0.92622 0.000 0.000 0.980 0.016 0.000 0.004
#> SRR1087415 1 0.2902 0.68925 0.800 0.000 0.000 0.000 0.196 0.004
#> SRR1088217 3 0.0692 0.92145 0.020 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004
#> SRR808496 4 0.3860 0.12999 0.000 0.472 0.000 0.528 0.000 0.000
#> SRR1336463 2 0.3695 0.38963 0.000 0.624 0.000 0.000 0.000 0.376
#> SRR612359 4 0.0790 0.82213 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1444412 3 0.3937 0.27771 0.424 0.000 0.572 0.000 0.000 0.004
#> SRR1074116 3 0.0000 0.92658 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.1401 0.91736 0.000 0.000 0.948 0.020 0.004 0.028
#> SRR656095 2 0.1444 0.86458 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0260 0.86616 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1349099 1 0.4427 0.49394 0.660 0.000 0.000 0.000 0.284 0.056
#> SRR1337886 2 0.0146 0.86963 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR813632 3 0.3742 0.47104 0.348 0.000 0.648 0.000 0.000 0.004
#> SRR1101591 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1089713 1 0.3652 0.47794 0.672 0.000 0.324 0.000 0.000 0.004
#> SRR1453127 3 0.0862 0.92435 0.000 0.000 0.972 0.008 0.004 0.016
#> SRR1498354 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1313831 1 0.0260 0.86616 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1315434 3 0.1390 0.91922 0.000 0.000 0.948 0.032 0.004 0.016
#> SRR814747 2 0.0790 0.85602 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1358539 1 0.0260 0.86616 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1367807 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1365791 3 0.1349 0.91311 0.004 0.000 0.940 0.000 0.000 0.056
#> SRR1081519 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR614707 6 0.1297 0.80231 0.040 0.000 0.000 0.000 0.012 0.948
#> SRR1094027 1 0.0790 0.85804 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR1489092 3 0.1682 0.89416 0.020 0.000 0.928 0.000 0.000 0.052
#> SRR1079502 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1457814 4 0.1327 0.70758 0.000 0.000 0.064 0.936 0.000 0.000
#> SRR1455127 2 0.2340 0.75997 0.000 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148
#> SRR615081 6 0.1141 0.82278 0.000 0.052 0.000 0.000 0.000 0.948
#> SRR1327855 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1417873 2 0.2416 0.75094 0.000 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1394125 3 0.0520 0.92684 0.008 0.000 0.984 0.000 0.000 0.008
#> SRR1488388 5 0.3737 0.33931 0.392 0.000 0.000 0.000 0.608 0.000
#> SRR1401122 2 0.0146 0.86772 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR612383 4 0.0790 0.82213 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1477711 1 0.0363 0.86586 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1350813 2 0.1663 0.85490 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR612851 4 0.2454 0.70673 0.000 0.160 0.000 0.840 0.000 0.000
#> SRR1086349 5 0.2912 0.66161 0.216 0.000 0.000 0.000 0.784 0.000
#> SRR812837 2 0.1444 0.86458 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.1864 0.90872 0.000 0.000 0.924 0.032 0.004 0.040
#> SRR1475885 6 0.1575 0.79637 0.032 0.000 0.000 0.000 0.032 0.936
#> SRR1376334 1 0.0260 0.86616 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1399821 5 0.0405 0.83739 0.008 0.000 0.000 0.000 0.988 0.004
#> SRR1347042 3 0.0862 0.92435 0.000 0.000 0.972 0.008 0.004 0.016
#> SRR612323 4 0.0790 0.82213 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR612604 6 0.4157 0.05942 0.000 0.444 0.000 0.012 0.000 0.544
#> SRR1389546 2 0.1075 0.87191 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1311877 5 0.2912 0.66001 0.216 0.000 0.000 0.000 0.784 0.000
#> SRR1465608 3 0.0767 0.92430 0.008 0.000 0.976 0.012 0.000 0.004
#> SRR1101808 2 0.1444 0.86458 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.1390 0.91721 0.000 0.000 0.948 0.016 0.004 0.032
#> SRR1331153 2 0.3847 0.20238 0.000 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456
#> SRR1078439 3 0.0767 0.92538 0.000 0.000 0.976 0.008 0.004 0.012
#> SRR2165527 2 0.1663 0.85490 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1351147 6 0.3927 0.34547 0.344 0.000 0.000 0.000 0.012 0.644
#> SRR1313536 2 0.1333 0.87343 0.000 0.944 0.000 0.048 0.000 0.008
#> SRR1070308 2 0.0000 0.86852 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403110 1 0.0260 0.86616 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1400355 2 0.0937 0.85087 0.000 0.960 0.000 0.000 0.000 0.040
#> SRR1401317 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1456862 1 0.3830 0.34723 0.620 0.000 0.000 0.000 0.376 0.004
#> SRR1074622 3 0.4857 0.59345 0.228 0.000 0.680 0.012 0.076 0.004
#> SRR1465847 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1443376 2 0.0935 0.87380 0.000 0.964 0.000 0.032 0.000 0.004
#> SRR1471312 3 0.0632 0.92527 0.000 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1075579 1 0.0458 0.86490 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000
#> SRR1090881 3 0.2507 0.87932 0.000 0.000 0.884 0.072 0.004 0.040
#> SRR612251 4 0.0790 0.82213 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR1418581 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR658045 2 0.1387 0.86639 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR613214 4 0.0790 0.82213 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000 0.000
#> SRR613078 6 0.3012 0.67185 0.000 0.196 0.000 0.008 0.000 0.796
#> SRR1472998 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1433452 2 0.3789 0.29044 0.000 0.584 0.000 0.000 0.000 0.416
#> SRR1101957 5 0.2697 0.69688 0.188 0.000 0.000 0.000 0.812 0.000
#> SRR1487993 3 0.1864 0.90872 0.000 0.000 0.924 0.032 0.004 0.040
#> SRR1465983 2 0.1387 0.86639 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0291 0.86481 0.992 0.000 0.004 0.000 0.004 0.000
#> SRR1367566 3 0.0603 0.92567 0.000 0.000 0.980 0.004 0.000 0.016
#> SRR1316151 6 0.3592 0.45553 0.000 0.344 0.000 0.000 0.000 0.656
#> SRR1417547 2 0.0000 0.86852 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659389 2 0.1765 0.84865 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.3774 0.31242 0.000 0.592 0.000 0.000 0.000 0.408
#> SRR1398207 1 0.3950 0.20775 0.564 0.000 0.432 0.000 0.000 0.004
#> SRR1358755 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1078903 2 0.1327 0.86791 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.1007 0.87260 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0603 0.86493 0.000 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1369172 1 0.2912 0.66263 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216 0.000
#> SRR615982 4 0.2996 0.63054 0.000 0.228 0.000 0.772 0.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.2219 0.80935 0.000 0.864 0.000 0.136 0.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.3851 0.16047 0.000 0.540 0.000 0.000 0.000 0.460
#> SRR1102393 2 0.0000 0.86852 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 3 0.4760 0.17217 0.040 0.000 0.520 0.000 0.436 0.004
#> SRR808351 3 0.4825 0.61842 0.208 0.000 0.692 0.012 0.084 0.004
#> SRR1317513 1 0.0363 0.86586 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1480501 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1081910 1 0.1219 0.83215 0.948 0.000 0.048 0.000 0.000 0.004
#> SRR1086611 6 0.1644 0.77285 0.004 0.000 0.000 0.076 0.000 0.920
#> SRR1392571 4 0.1267 0.80332 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000 0.000
#> SRR1311441 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR808152 1 0.0790 0.85804 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032 0.000
#> SRR657313 3 0.0260 0.92707 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.1528 0.85717 0.000 0.936 0.000 0.016 0.000 0.048
#> SRR1321011 2 0.0000 0.86852 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0632 0.85948 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1379343 2 0.1327 0.86791 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1389108 5 0.0146 0.84061 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.92658 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399757 2 0.4493 0.43181 0.000 0.636 0.000 0.000 0.052 0.312
#> SRR1358060 3 0.0458 0.92593 0.000 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1464517 3 0.1864 0.90872 0.000 0.000 0.924 0.032 0.004 0.040
#> SRR613557 4 0.0632 0.81607 0.000 0.024 0.000 0.976 0.000 0.000
#> SRR809831 1 0.2146 0.76148 0.880 0.000 0.116 0.000 0.000 0.004
#> SRR1429387 3 0.0862 0.92435 0.000 0.000 0.972 0.008 0.004 0.016
#> SRR816565 1 0.2442 0.76028 0.852 0.000 0.000 0.004 0.144 0.000
#> SRR1071644 5 0.3351 0.58082 0.288 0.000 0.000 0.000 0.712 0.000
#> SRR1406936 3 0.0405 0.92540 0.008 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004
#> SRR1072031 2 0.0000 0.86852 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 4 0.3175 0.59565 0.000 0.256 0.000 0.744 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "pam"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:pam"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'pam' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 3.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 0.992 0.978 0.990 0.4950 0.506 0.506
#> 3 3 0.954 0.936 0.969 0.3099 0.780 0.592
#> 4 4 0.897 0.875 0.946 0.1347 0.846 0.599
#> 5 5 0.799 0.810 0.903 0.0653 0.916 0.699
#> 6 6 0.756 0.699 0.844 0.0489 0.938 0.726
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 3
#> attr(,"optional")
#> [1] 2
There is also optional best \(k\) = 2 that is worth to check.
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.5519 0.859 0.872 0.128
#> SRR1394209 1 0.6712 0.800 0.824 0.176
#> SRR1474018 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1391619 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1403980 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1442800 1 0.6048 0.836 0.852 0.148
#> SRR1359214 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1093053 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1399843 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1380231 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1096736 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1478700 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1384754 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1380317 1 0.6623 0.806 0.828 0.172
#> SRR1315247 2 0.1843 0.967 0.028 0.972
#> SRR1105344 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1456075 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1417154 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1325771 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1360420 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1072948 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1362848 1 0.6623 0.806 0.828 0.172
#> SRR1407492 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1454868 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1474816 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1466400 1 0.6801 0.795 0.820 0.180
#> SRR658921 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1101373 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR614695 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.6247 0.826 0.844 0.156
#> SRR612779 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1325871 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1320712 1 0.9323 0.495 0.652 0.348
#> SRR1470075 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1092112 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1400333 1 0.4939 0.881 0.892 0.108
#> SRR1078834 2 0.9580 0.370 0.380 0.620
#> SRR1417611 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1419062 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1315739 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1091890 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1327473 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1338195 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR614887 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1354620 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1389157 1 0.6623 0.806 0.828 0.172
#> SRR613568 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1446180 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1406372 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1353136 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1093906 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1399861 1 0.6623 0.806 0.828 0.172
#> SRR1338789 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1421420 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1352870 1 0.1633 0.964 0.976 0.024
#> SRR1315041 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.6623 0.806 0.828 0.172
#> SRR655672 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1420006 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1472749 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1478341 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1479699 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1378992 1 0.5294 0.868 0.880 0.120
#> SRR659427 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1096638 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.8443 0.618 0.272 0.728
#> SRR1439994 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1374270 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1456274 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR820049 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1375290 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR818999 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1332187 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR603365 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1485380 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1073705 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1309403 1 0.6623 0.806 0.828 0.172
#> SRR1498395 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.6531 0.793 0.168 0.832
#> SRR1414749 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1419760 1 0.6623 0.806 0.828 0.172
#> SRR1381841 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR821388 2 0.1633 0.971 0.024 0.976
#> SRR657623 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR819583 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1403072 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR811653 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1311348 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1319520 1 0.6973 0.784 0.812 0.188
#> SRR1444763 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.6623 0.806 0.828 0.172
#> SRR613318 2 0.6973 0.764 0.188 0.812
#> SRR1332694 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1468469 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1500931 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1379175 2 0.0672 0.987 0.008 0.992
#> SRR1401909 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0938 0.983 0.012 0.988
#> SRR1101128 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1093218 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1077090 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1093100 1 0.6623 0.806 0.828 0.172
#> SRR1309382 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1101591 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1453127 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1315434 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.1843 0.961 0.972 0.028
#> SRR1365791 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1081519 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR614707 1 0.6247 0.826 0.844 0.156
#> SRR1094027 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1079502 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1457814 1 0.1184 0.972 0.984 0.016
#> SRR1455127 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1475885 1 0.6438 0.816 0.836 0.164
#> SRR1376334 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1347042 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.1843 0.967 0.028 0.972
#> SRR612604 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1351147 1 0.8327 0.662 0.736 0.264
#> SRR1313536 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1403110 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1090881 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR612251 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1487993 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1367566 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1480501 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1086611 1 0.5737 0.850 0.864 0.136
#> SRR1392571 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.0672 0.978 0.992 0.008
#> SRR808152 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR657313 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.6623 0.806 0.828 0.172
#> SRR1376228 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1399757 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1358060 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1464517 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR613557 2 0.0376 0.991 0.004 0.996
#> SRR809831 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.0000 0.985 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.995 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 3 0.5138 0.6907 0.252 0.000 0.748
#> SRR1404105 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR614491 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1069376 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR811964 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 1 0.6280 0.1942 0.540 0.460 0.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394209 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099809 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1500555 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1354363 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1391619 3 0.3116 0.8728 0.108 0.000 0.892
#> SRR1307997 2 0.4796 0.7108 0.220 0.780 0.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334670 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR612515 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1364013 1 0.1031 0.9371 0.976 0.024 0.000
#> SRR1468553 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420169 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442800 1 0.6154 0.2862 0.592 0.000 0.408
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499849 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500030 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093053 1 0.4796 0.7242 0.780 0.000 0.220
#> SRR1399843 3 0.4452 0.7861 0.192 0.000 0.808
#> SRR1380231 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR809470 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR614239 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR613939 1 0.1031 0.9371 0.976 0.024 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079023 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR813608 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478700 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1081543 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1384754 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR612287 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380317 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315247 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR658549 1 0.6215 0.2939 0.572 0.428 0.000
#> SRR1480240 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358520 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456075 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 3 0.1964 0.9529 0.056 0.000 0.944
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095985 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1325771 1 0.3412 0.8324 0.876 0.124 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332993 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1076916 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1356266 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456114 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1072948 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472370 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480176 3 0.1031 0.9791 0.024 0.000 0.976
#> SRR613843 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469192 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1404555 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362848 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1407492 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1455082 1 0.1031 0.9371 0.976 0.024 0.000
#> SRR658362 2 0.5948 0.4332 0.360 0.640 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR818232 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1454868 1 0.0892 0.9324 0.980 0.000 0.020
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342002 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1088437 2 0.6308 -0.0322 0.492 0.508 0.000
#> SRR1466400 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1379324 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454891 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR663185 1 0.5591 0.5828 0.696 0.304 0.000
#> SRR811819 3 0.1031 0.9791 0.024 0.000 0.976
#> SRR1318920 3 0.1031 0.9791 0.024 0.000 0.976
#> SRR656758 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 3 0.1031 0.9791 0.024 0.000 0.976
#> SRR660450 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 1 0.6225 0.2815 0.568 0.432 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443161 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR614695 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1092372 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1105463 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1325871 1 0.6309 0.0500 0.504 0.000 0.496
#> SRR1355415 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1090861 3 0.1529 0.9671 0.040 0.000 0.960
#> SRR1320712 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470075 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1091254 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1101397 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1321165 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1092112 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074790 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 1 0.1529 0.9264 0.960 0.040 0.000
#> SRR1072749 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1078586 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1400333 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078834 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396840 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR614984 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1324269 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1401491 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319443 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1324349 1 0.1031 0.9371 0.976 0.024 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500846 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR661505 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480131 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421284 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1329624 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1315739 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099189 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1083286 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1091890 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347436 1 0.4399 0.7617 0.812 0.188 0.000
#> SRR1327473 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338195 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 3 0.2878 0.9107 0.096 0.000 0.904
#> SRR658271 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1454842 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322643 3 0.1031 0.9791 0.024 0.000 0.976
#> SRR614887 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354620 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR615056 1 0.4796 0.7227 0.780 0.220 0.000
#> SRR1105320 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391529 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR663052 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478834 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR812366 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR613568 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR614095 1 0.1031 0.9371 0.976 0.024 0.000
#> SRR1103092 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1337155 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 3 0.5431 0.6330 0.284 0.000 0.716
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353136 1 0.0892 0.9324 0.980 0.000 0.020
#> SRR1093906 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR614035 2 0.5216 0.6274 0.260 0.740 0.000
#> SRR1351104 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1363926 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1399861 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338789 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1421420 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.4452 0.7378 0.808 0.000 0.192
#> SRR1352870 1 0.0983 0.9387 0.980 0.016 0.004
#> SRR1315041 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443268 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1416617 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR655672 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1420006 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR613819 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465092 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1470727 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1339153 3 0.5497 0.5775 0.292 0.000 0.708
#> SRR1472749 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414379 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1098312 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR810273 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR614467 1 0.1031 0.9371 0.976 0.024 0.000
#> SRR811471 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1478341 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088606 3 0.1031 0.9791 0.024 0.000 0.976
#> SRR1479699 3 0.1031 0.9791 0.024 0.000 0.976
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359803 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR659427 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096638 1 0.4887 0.6814 0.772 0.000 0.228
#> SRR1466619 2 0.0237 0.9697 0.004 0.996 0.000
#> SRR659307 1 0.1015 0.9378 0.980 0.012 0.008
#> SRR1439994 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1454931 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1332928 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR658621 1 0.1031 0.9371 0.976 0.024 0.000
#> SRR1095840 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1458243 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1374270 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408727 1 0.0237 0.9394 0.996 0.004 0.000
#> SRR1456274 1 0.0237 0.9368 0.996 0.000 0.004
#> SRR817744 3 0.2878 0.9096 0.096 0.000 0.904
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374198 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1445856 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR820049 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375290 3 0.5363 0.6117 0.276 0.000 0.724
#> SRR818999 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1390242 3 0.1031 0.9791 0.024 0.000 0.976
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454629 3 0.1031 0.9791 0.024 0.000 0.976
#> SRR1332187 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR657833 2 0.4504 0.7464 0.196 0.804 0.000
#> SRR1436207 2 0.6079 0.3626 0.388 0.612 0.000
#> SRR1488017 3 0.4178 0.8142 0.172 0.000 0.828
#> SRR612947 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1441868 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.4346 0.7547 0.184 0.816 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR612299 1 0.6026 0.4033 0.624 0.376 0.000
#> SRR1407386 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1309403 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337215 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414749 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365963 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1368030 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419760 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381841 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR821388 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR657623 1 0.1031 0.9371 0.976 0.024 0.000
#> SRR1094241 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096149 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1342829 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353028 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR811333 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0237 0.9698 0.004 0.996 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR815092 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100564 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1403072 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR811653 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 3 0.1860 0.9564 0.052 0.000 0.948
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416596 1 0.5733 0.5291 0.676 0.324 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.4062 0.7919 0.164 0.836 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 3 0.1031 0.9791 0.024 0.000 0.976
#> SRR1453950 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR613318 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1332694 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1468469 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1311622 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1500931 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387494 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1379175 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1401909 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376640 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082283 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1084276 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1353262 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437035 3 0.2625 0.9241 0.084 0.000 0.916
#> SRR1396877 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417936 3 0.1031 0.9791 0.024 0.000 0.976
#> SRR1436822 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101128 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394366 1 0.1031 0.9373 0.976 0.024 0.000
#> SRR1093218 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077090 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327430 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086820 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1383000 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR614335 1 0.1411 0.9294 0.964 0.036 0.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334265 1 0.1031 0.9371 0.976 0.024 0.000
#> SRR1456401 2 0.3816 0.8133 0.148 0.852 0.000
#> SRR1086393 3 0.1031 0.9791 0.024 0.000 0.976
#> SRR1351521 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093100 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309382 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1089375 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR614719 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1081473 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087415 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1088217 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR808496 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1336463 2 0.3192 0.8579 0.112 0.888 0.000
#> SRR612359 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1444412 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1074116 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR808914 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1349099 3 0.1031 0.9791 0.024 0.000 0.976
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR813632 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1101591 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089713 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1453127 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498354 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313831 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1315434 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR814747 1 0.5760 0.5363 0.672 0.328 0.000
#> SRR1358539 3 0.4654 0.7590 0.208 0.000 0.792
#> SRR1367807 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081519 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR614707 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094027 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1489092 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079502 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457814 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR615081 2 0.6267 0.1670 0.452 0.548 0.000
#> SRR1327855 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417873 1 0.3038 0.8691 0.896 0.104 0.000
#> SRR1394125 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488388 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1401122 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR612383 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1477711 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1350813 2 0.1529 0.9358 0.040 0.960 0.000
#> SRR612851 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1086349 1 0.3412 0.8201 0.876 0.000 0.124
#> SRR812837 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340010 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1475885 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376334 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1399821 3 0.4842 0.7339 0.224 0.000 0.776
#> SRR1347042 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR612323 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 3 0.3267 0.8868 0.116 0.000 0.884
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078439 1 0.6267 0.2061 0.548 0.000 0.452
#> SRR2165527 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070308 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1403110 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456862 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1074622 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1465847 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075579 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1090881 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR612251 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1418581 1 0.2959 0.8466 0.900 0.000 0.100
#> SRR658045 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR613078 2 0.6140 0.3186 0.404 0.596 0.000
#> SRR1472998 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1433452 2 0.1031 0.9513 0.024 0.976 0.000
#> SRR1101957 1 0.0237 0.9369 0.996 0.000 0.004
#> SRR1487993 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1367566 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316151 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1417547 1 0.1031 0.9371 0.976 0.024 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1398207 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358755 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR615982 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1480431 1 0.3619 0.8323 0.864 0.136 0.000
#> SRR1429825 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR808351 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1317513 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1480501 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081910 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1086611 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392571 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR1311441 1 0.0237 0.9369 0.996 0.000 0.004
#> SRR808152 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR657313 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9392 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399757 1 0.3879 0.8030 0.848 0.152 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464517 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR613557 1 0.0892 0.9392 0.980 0.020 0.000
#> SRR809831 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1429387 3 0.0000 0.9787 0.000 0.000 1.000
#> SRR816565 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1071644 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1406936 3 0.0892 0.9811 0.020 0.000 0.980
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9733 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.4796 0.7101 0.220 0.780 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 1 0.0707 0.9283 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614491 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 4 0.4948 0.2546 0.000 0.440 0.000 0.560
#> SRR1345715 1 0.2149 0.8777 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1328073 4 0.1389 0.8876 0.048 0.000 0.000 0.952
#> SRR1394209 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099809 1 0.3074 0.7844 0.848 0.000 0.152 0.000
#> SRR1500555 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0188 0.8812 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1307997 2 0.3801 0.7110 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR663124 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612515 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1364013 4 0.0188 0.9242 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1468553 3 0.2081 0.8754 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1403980 3 0.2149 0.8743 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1420169 3 0.0188 0.8807 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1442800 4 0.0188 0.9238 0.004 0.000 0.000 0.996
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499849 3 0.4761 0.5125 0.372 0.000 0.628 0.000
#> SRR1500030 3 0.2081 0.8754 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1093053 4 0.5477 0.6412 0.180 0.000 0.092 0.728
#> SRR1399843 1 0.2814 0.8187 0.868 0.000 0.000 0.132
#> SRR1380231 3 0.4996 0.2467 0.484 0.000 0.516 0.000
#> SRR809470 3 0.2704 0.8534 0.124 0.000 0.876 0.000
#> SRR614239 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613939 4 0.0188 0.9242 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR612971 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.2149 0.8777 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR613006 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.2589 0.8548 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1478700 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.4830 0.3379 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1384754 1 0.0188 0.9382 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612287 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380317 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315247 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658549 4 0.4888 0.3361 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456075 1 0.4972 0.0522 0.544 0.000 0.456 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0592 0.9319 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1334419 1 0.2149 0.8777 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1417154 3 0.3024 0.8328 0.148 0.000 0.852 0.000
#> SRR1095985 3 0.4998 0.2343 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR1325771 1 0.4981 0.1647 0.536 0.000 0.000 0.464
#> SRR1360420 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1076916 3 0.2149 0.8743 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0188 0.9387 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR613843 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.4981 -0.0796 0.536 0.000 0.464 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362848 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1407492 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455082 4 0.0188 0.9242 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR658362 2 0.4713 0.4342 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR810921 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 4 0.4998 0.0947 0.000 0.488 0.000 0.512
#> SRR1466400 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 4 0.4888 0.2633 0.412 0.000 0.000 0.588
#> SRR1090145 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.2081 0.8754 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1454891 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR663185 4 0.4304 0.6093 0.000 0.284 0.000 0.716
#> SRR811819 1 0.0188 0.9387 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1318920 1 0.0188 0.9387 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR656758 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0188 0.9387 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR660450 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323271 4 0.4888 0.3337 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443161 4 0.2530 0.8219 0.112 0.000 0.000 0.888
#> SRR614695 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.2149 0.8777 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1406582 1 0.2149 0.8777 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR612779 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.2149 0.8777 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1354071 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1105463 3 0.4431 0.6367 0.304 0.000 0.696 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.2011 0.8761 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1355415 3 0.0188 0.8807 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1090861 1 0.0469 0.9344 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1320712 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 3 0.3311 0.7550 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074790 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 4 0.0707 0.9124 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1072749 1 0.2408 0.8445 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078834 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614984 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 4 0.0188 0.9242 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661505 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419062 3 0.4972 0.3263 0.456 0.000 0.544 0.000
#> SRR1480131 3 0.5000 0.2086 0.496 0.000 0.504 0.000
#> SRR1421284 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099189 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1091890 1 0.7726 -0.1965 0.404 0.000 0.368 0.228
#> SRR1347436 4 0.3486 0.7458 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1327473 4 0.4981 0.0913 0.464 0.000 0.000 0.536
#> SRR1338195 3 0.2081 0.8754 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0336 0.9367 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR658271 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1454842 3 0.2081 0.8754 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1322643 1 0.0188 0.9387 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR614887 3 0.2149 0.8743 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1354620 3 0.4356 0.6032 0.292 0.000 0.708 0.000
#> SRR615056 4 0.3610 0.7354 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1105320 4 0.1118 0.8988 0.036 0.000 0.000 0.964
#> SRR1391529 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.2149 0.8743 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613568 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614095 4 0.0188 0.9242 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1103092 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 4 0.4222 0.6220 0.272 0.000 0.000 0.728
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.3311 0.8099 0.172 0.000 0.828 0.000
#> SRR1353136 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.4277 0.5886 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399861 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338789 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.2081 0.8754 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0921 0.9238 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1352870 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315041 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443268 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416617 3 0.3123 0.8259 0.156 0.000 0.844 0.000
#> SRR1102443 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR655672 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420006 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613819 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339153 3 0.2149 0.8743 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1472749 3 0.2081 0.8754 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1414379 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.2149 0.8777 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1487278 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1098312 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614467 4 0.0188 0.9242 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR811471 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.0188 0.9387 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1479699 1 0.0188 0.9387 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.2149 0.8777 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR659427 4 0.1716 0.8711 0.064 0.000 0.000 0.936
#> SRR1096638 1 0.0188 0.9387 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1466619 2 0.0188 0.9727 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR659307 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1439994 3 0.4761 0.3903 0.372 0.000 0.628 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0707 0.9257 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR658621 4 0.0188 0.9242 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 3 0.4804 0.3608 0.384 0.000 0.616 0.000
#> SRR1374270 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408727 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456274 1 0.2081 0.8810 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR817744 1 0.0817 0.9266 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.4998 0.2343 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.3444 0.7614 0.816 0.000 0.184 0.000
#> SRR820049 3 0.2081 0.8754 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1375290 4 0.4204 0.7095 0.192 0.000 0.020 0.788
#> SRR818999 1 0.2216 0.8574 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1390242 1 0.0188 0.9387 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454629 1 0.0188 0.9387 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1332187 3 0.2149 0.8743 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.3569 0.7464 0.000 0.804 0.000 0.196
#> SRR1436207 2 0.4817 0.3641 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1488017 1 0.0336 0.9367 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR612947 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308086 1 0.4843 0.2425 0.604 0.000 0.396 0.000
#> SRR1441868 1 0.2149 0.8777 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1485380 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073705 4 0.3024 0.7784 0.148 0.000 0.000 0.852
#> SRR615032 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.3649 0.7251 0.000 0.796 0.000 0.204
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332816 1 0.2149 0.8777 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR612299 4 0.4776 0.3936 0.000 0.376 0.000 0.624
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1309403 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337215 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414749 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.4406 0.5162 0.700 0.000 0.300 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419760 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1381841 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821388 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR657623 4 0.0188 0.9242 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1094241 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819583 3 0.0188 0.8808 0.004 0.000 0.996 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342829 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0188 0.9728 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR811653 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.2081 0.8754 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.3486 0.7701 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1444763 1 0.0592 0.9320 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416596 4 0.4543 0.5180 0.000 0.324 0.000 0.676
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.3219 0.7924 0.000 0.836 0.000 0.164
#> SRR663537 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0188 0.9387 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.2149 0.8777 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR613318 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.3123 0.7817 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1500931 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.2469 0.8364 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1379175 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401909 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376640 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.2081 0.8660 0.916 0.000 0.084 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.0188 0.9387 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1396877 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0188 0.9387 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1436822 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1101128 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394366 4 0.0188 0.9242 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1093218 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1077090 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327430 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.2149 0.8777 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614335 4 0.0592 0.9159 0.000 0.016 0.000 0.984
#> SRR660534 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 4 0.0188 0.9242 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1456401 2 0.3024 0.8144 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1086393 1 0.0188 0.9387 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1351521 3 0.1211 0.8797 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1093100 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614719 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081473 3 0.4866 0.4452 0.404 0.000 0.596 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 3 0.2216 0.8726 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR808496 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.2530 0.8596 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR612359 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.3569 0.7142 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821846 3 0.2081 0.8754 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0188 0.9387 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101591 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1498354 3 0.0336 0.8806 0.008 0.000 0.992 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR814747 4 0.4454 0.5660 0.000 0.308 0.000 0.692
#> SRR1358539 1 0.2011 0.8843 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1367807 1 0.2149 0.8777 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1365791 1 0.4817 0.2158 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR1081519 3 0.2216 0.8726 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR614707 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.4454 0.4572 0.692 0.000 0.308 0.000
#> SRR1079502 3 0.4998 0.2343 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR1457814 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615081 2 0.4967 0.1699 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR1327855 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417873 4 0.2216 0.8523 0.000 0.092 0.000 0.908
#> SRR1394125 3 0.4998 0.2343 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612383 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.1211 0.9386 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR612851 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.2149 0.8777 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR812837 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 4 0.2530 0.8219 0.112 0.000 0.000 0.888
#> SRR1475885 1 0.2345 0.8673 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.2149 0.8777 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1347042 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612323 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.2149 0.8777 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1465608 1 0.0336 0.9360 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.2149 0.8743 0.088 0.000 0.912 0.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078439 4 0.5057 0.4770 0.340 0.000 0.012 0.648
#> SRR2165527 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.2589 0.8518 0.884 0.000 0.000 0.116
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070308 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.2081 0.8754 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.2408 0.8661 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR612251 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.2149 0.8777 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR658045 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613214 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR613078 2 0.4866 0.3202 0.000 0.596 0.000 0.404
#> SRR1472998 1 0.1302 0.9061 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1433452 2 0.0817 0.9541 0.000 0.976 0.000 0.024
#> SRR1101957 1 0.2149 0.8777 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR1487993 3 0.2081 0.8754 0.084 0.000 0.916 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367566 3 0.3266 0.8146 0.168 0.000 0.832 0.000
#> SRR1316151 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417547 4 0.0188 0.9242 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR659389 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1398207 3 0.4955 0.3502 0.444 0.000 0.556 0.000
#> SRR1358755 3 0.1867 0.8601 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615982 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480431 4 0.2589 0.8269 0.000 0.116 0.000 0.884
#> SRR1429825 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.4454 0.5758 0.308 0.000 0.692 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086611 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1392571 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.2149 0.8777 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR808152 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.2216 0.8726 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.3024 0.8171 0.852 0.000 0.000 0.148
#> SRR1376228 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399757 4 0.4318 0.7781 0.068 0.116 0.000 0.816
#> SRR1358060 3 0.2011 0.8761 0.080 0.000 0.920 0.000
#> SRR1464517 1 0.1716 0.8878 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR613557 4 0.0000 0.9265 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR809831 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.8810 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.0000 0.9400 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9764 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.3801 0.7102 0.000 0.780 0.000 0.220
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1404105 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614491 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 4 0.4262 0.2234 0.000 0.440 0.000 0.560 0.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 4 0.3895 0.6259 0.320 0.000 0.000 0.680 0.000
#> SRR1394209 4 0.2020 0.8327 0.100 0.000 0.000 0.900 0.000
#> SRR1474018 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1099809 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500555 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0162 0.8886 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1307997 2 0.3274 0.7319 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR663124 2 0.0703 0.9367 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1334670 1 0.3274 0.7725 0.780 0.000 0.000 0.000 0.220
#> SRR612515 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1364013 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468553 3 0.3177 0.7483 0.000 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1403980 5 0.2280 0.7783 0.000 0.000 0.120 0.000 0.880
#> SRR1420169 5 0.6438 0.1425 0.176 0.000 0.400 0.000 0.424
#> SRR1442800 4 0.4242 0.3124 0.000 0.000 0.000 0.572 0.428
#> SRR1359214 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1499849 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500030 3 0.3003 0.7746 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1093053 4 0.4933 0.5789 0.096 0.000 0.000 0.704 0.200
#> SRR1399843 1 0.4496 0.7429 0.728 0.000 0.000 0.056 0.216
#> SRR1380231 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR809470 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614239 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613939 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.1121 0.9259 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR813608 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1478700 1 0.3074 0.7843 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR1081543 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1384754 1 0.0404 0.8227 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR612287 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1380317 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1315247 4 0.2813 0.7683 0.000 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1105344 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR658549 4 0.3816 0.5320 0.000 0.304 0.000 0.696 0.000
#> SRR1480240 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.3274 0.6618 0.000 0.000 0.780 0.000 0.220
#> SRR1456075 3 0.6374 0.3596 0.280 0.000 0.512 0.000 0.208
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.3966 0.5390 0.000 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR1095985 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1325771 1 0.6155 0.3458 0.548 0.000 0.000 0.276 0.176
#> SRR1360420 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660272 2 0.2020 0.8823 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1332993 1 0.3109 0.7827 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808044 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1076916 5 0.2891 0.7193 0.000 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR1356266 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1341983 2 0.3074 0.8182 0.000 0.804 0.000 0.196 0.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.4029 0.6662 0.680 0.000 0.000 0.004 0.316
#> SRR613843 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1404555 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1362848 4 0.3143 0.7555 0.204 0.000 0.000 0.796 0.000
#> SRR1407492 4 0.1965 0.8254 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1455082 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR658362 2 0.4287 0.2713 0.000 0.540 0.000 0.460 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818232 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454868 4 0.2074 0.8247 0.000 0.000 0.000 0.896 0.104
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.3895 0.6786 0.680 0.000 0.000 0.000 0.320
#> SRR1088437 4 0.4305 0.0443 0.000 0.488 0.000 0.512 0.000
#> SRR1466400 4 0.2891 0.7598 0.000 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR658921 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1101373 1 0.4114 0.2045 0.624 0.000 0.000 0.376 0.000
#> SRR1090145 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379324 5 0.2891 0.7265 0.176 0.000 0.000 0.000 0.824
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.3003 0.7746 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1454891 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR663185 4 0.3274 0.6830 0.000 0.220 0.000 0.780 0.000
#> SRR811819 5 0.4307 -0.3440 0.500 0.000 0.000 0.000 0.500
#> SRR1318920 1 0.2891 0.7155 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR656758 2 0.0609 0.9414 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000
#> SRR1474351 1 0.2891 0.7155 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR660450 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472687 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1334291 2 0.1544 0.9083 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323271 4 0.4210 0.3110 0.000 0.412 0.000 0.588 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443161 4 0.3074 0.7647 0.196 0.000 0.000 0.804 0.000
#> SRR614695 4 0.1965 0.8254 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1092372 1 0.3837 0.6743 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308
#> SRR1474577 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 5 0.3586 0.4873 0.264 0.000 0.000 0.000 0.736
#> SRR1105463 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 5 0.0162 0.8568 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1325871 3 0.2605 0.8024 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1355415 5 0.4030 0.4217 0.000 0.000 0.352 0.000 0.648
#> SRR1090861 1 0.2891 0.7155 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1320712 4 0.3143 0.7555 0.204 0.000 0.000 0.796 0.000
#> SRR1470075 1 0.1197 0.8204 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1091254 1 0.4210 0.5524 0.588 0.000 0.000 0.000 0.412
#> SRR1101397 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.4138 0.6029 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR1092112 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 4 0.1197 0.8588 0.048 0.000 0.000 0.952 0.000
#> SRR1432106 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 4 0.1608 0.8395 0.000 0.072 0.000 0.928 0.000
#> SRR1072749 5 0.3305 0.6637 0.224 0.000 0.000 0.000 0.776
#> SRR1078586 1 0.4138 0.6029 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR1400333 4 0.1965 0.8291 0.000 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1078834 4 0.1965 0.8291 0.000 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396840 5 0.2891 0.7265 0.176 0.000 0.000 0.000 0.824
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614984 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324269 5 0.2891 0.7265 0.176 0.000 0.000 0.000 0.824
#> SRR1401491 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1319443 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1324349 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.3074 0.7845 0.804 0.000 0.000 0.000 0.196
#> SRR661505 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419062 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480131 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1421284 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1329624 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1315739 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083286 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1091890 5 0.3639 0.7463 0.000 0.000 0.100 0.076 0.824
#> SRR1347436 4 0.3003 0.7505 0.000 0.188 0.000 0.812 0.000
#> SRR1327473 1 0.3949 0.3489 0.668 0.000 0.000 0.332 0.000
#> SRR1338195 3 0.3003 0.7746 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR809698 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1454842 3 0.3003 0.7746 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1322643 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.3305 0.7236 0.000 0.000 0.776 0.000 0.224
#> SRR1354620 5 0.3003 0.6770 0.000 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR615056 4 0.3109 0.7285 0.000 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1105320 4 0.5546 0.6376 0.176 0.000 0.000 0.648 0.176
#> SRR1391529 1 0.3452 0.7565 0.756 0.000 0.000 0.000 0.244
#> SRR663052 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1478834 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435330 5 0.2891 0.7193 0.000 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR615383 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613568 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614095 4 0.1544 0.8417 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1103092 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1337155 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475345 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 5 0.2516 0.7425 0.000 0.000 0.000 0.140 0.860
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.3003 0.7746 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1353136 4 0.3888 0.7413 0.076 0.000 0.000 0.804 0.120
#> SRR1093906 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.3684 0.6464 0.000 0.720 0.000 0.280 0.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 4 0.1965 0.8254 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1399861 4 0.2020 0.8327 0.100 0.000 0.000 0.900 0.000
#> SRR1338789 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.3003 0.7746 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1420832 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 4 0.1965 0.8291 0.000 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1315041 2 0.1478 0.9192 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR661877 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1443268 3 0.3774 0.5201 0.000 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1416617 5 0.2891 0.7193 0.000 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR1102443 4 0.3816 0.6516 0.304 0.000 0.000 0.696 0.000
#> SRR655672 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420006 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.1544 0.9083 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR613819 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 4 0.1965 0.8254 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1470727 1 0.3837 0.6613 0.692 0.000 0.000 0.000 0.308
#> SRR1339153 3 0.3242 0.7363 0.000 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1472749 3 0.3003 0.7746 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1414379 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098312 5 0.2891 0.7265 0.176 0.000 0.000 0.000 0.824
#> SRR810273 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.1732 0.8996 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR614467 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR811471 1 0.4138 0.6029 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR1478341 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088606 5 0.4276 0.1202 0.380 0.000 0.000 0.004 0.616
#> SRR1479699 5 0.3366 0.6577 0.232 0.000 0.000 0.000 0.768
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1359803 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659427 4 0.2304 0.8164 0.100 0.000 0.000 0.892 0.008
#> SRR1096638 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.2020 0.8970 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR659307 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439994 3 0.3966 0.4469 0.336 0.000 0.664 0.000 0.000
#> SRR1454931 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332928 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR658621 4 0.1043 0.8588 0.000 0.040 0.000 0.960 0.000
#> SRR1095840 1 0.4138 0.6029 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR1458243 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374270 4 0.1704 0.8475 0.004 0.000 0.000 0.928 0.068
#> SRR1470947 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1365598 2 0.1544 0.9083 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR662787 2 0.1671 0.9125 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR1408727 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456274 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817744 1 0.2891 0.7155 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1478744 2 0.1908 0.9025 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 5 0.4971 0.6674 0.176 0.000 0.116 0.000 0.708
#> SRR820049 3 0.3966 0.5387 0.000 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR1375290 5 0.3074 0.6937 0.000 0.000 0.000 0.196 0.804
#> SRR818999 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1390242 1 0.2891 0.7155 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1401164 2 0.1478 0.9193 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR1454629 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332187 5 0.2891 0.7193 0.000 0.000 0.176 0.000 0.824
#> SRR603365 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR657833 2 0.3109 0.7620 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1436207 2 0.4150 0.3672 0.000 0.612 0.000 0.388 0.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.3209 0.7751 0.008 0.000 0.812 0.000 0.180
#> SRR1441868 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073705 4 0.4150 0.5111 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.3143 0.7758 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612299 4 0.4114 0.4290 0.000 0.376 0.000 0.624 0.000
#> SRR1407386 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1309403 4 0.2891 0.7598 0.000 0.000 0.000 0.824 0.176
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1337215 4 0.1965 0.8291 0.000 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1414749 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365963 5 0.3048 0.7262 0.176 0.000 0.004 0.000 0.820
#> SRR1368030 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1419760 4 0.1965 0.8291 0.000 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1381841 5 0.1965 0.7840 0.096 0.000 0.000 0.000 0.904
#> SRR821388 4 0.2020 0.8327 0.100 0.000 0.000 0.900 0.000
#> SRR657623 4 0.1544 0.8417 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1094241 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819583 5 0.3003 0.6770 0.000 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1096149 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1342829 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR811333 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.2074 0.8787 0.000 0.896 0.000 0.104 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR815092 1 0.4045 0.6414 0.644 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR1500149 2 0.2127 0.8801 0.000 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1100564 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811653 4 0.2020 0.8327 0.100 0.000 0.000 0.900 0.000
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435442 2 0.1732 0.8995 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1421444 3 0.3003 0.7746 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1416596 4 0.4161 0.4466 0.000 0.392 0.000 0.608 0.000
#> SRR1485499 2 0.1608 0.9148 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1316078 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR663465 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1310094 2 0.3395 0.7636 0.000 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.4138 0.6029 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR1087875 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613318 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332694 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1468469 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1120318 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311622 1 0.4163 0.7386 0.740 0.000 0.032 0.000 0.228
#> SRR1500931 5 0.4060 0.4052 0.000 0.000 0.360 0.000 0.640
#> SRR1387494 5 0.3109 0.6914 0.000 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1379175 4 0.1965 0.8291 0.000 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1401909 5 0.4268 0.1996 0.000 0.000 0.444 0.000 0.556
#> SRR1440541 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376640 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1085712 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1082283 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1084276 5 0.2891 0.7265 0.176 0.000 0.000 0.000 0.824
#> SRR1353262 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.0963 0.8216 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1396877 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101128 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR612983 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1394366 4 0.2390 0.8333 0.000 0.020 0.000 0.896 0.084
#> SRR1093218 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1077090 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327430 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.1544 0.9083 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1086820 1 0.3210 0.7760 0.788 0.000 0.000 0.000 0.212
#> SRR1383000 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1355705 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR614335 4 0.0510 0.8699 0.000 0.016 0.000 0.984 0.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 4 0.0880 0.8628 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1456401 2 0.1965 0.8840 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.1544 0.8573 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1093100 4 0.2020 0.8327 0.100 0.000 0.000 0.900 0.000
#> SRR1309382 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089375 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1499482 2 0.1671 0.9026 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR614719 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081473 1 0.3242 0.7728 0.784 0.000 0.000 0.000 0.216
#> SRR1087415 1 0.4045 0.5725 0.644 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR1088217 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR808496 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1336463 2 0.1478 0.9098 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR612359 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1444412 5 0.0162 0.8573 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1074116 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.3003 0.7746 0.000 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR656095 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808914 1 0.4138 0.6029 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR1349099 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR813632 5 0.0794 0.8471 0.028 0.000 0.000 0.000 0.972
#> SRR1101591 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089713 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 5 0.3109 0.6612 0.000 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1313831 1 0.3480 0.6559 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248
#> SRR1315434 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR814747 4 0.3796 0.5762 0.000 0.300 0.000 0.700 0.000
#> SRR1358539 1 0.2891 0.7155 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1367807 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081519 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR614707 4 0.3464 0.8065 0.068 0.000 0.000 0.836 0.096
#> SRR1094027 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1489092 5 0.2471 0.7347 0.136 0.000 0.000 0.000 0.864
#> SRR1079502 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457814 4 0.0510 0.8706 0.016 0.000 0.000 0.984 0.000
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR615081 4 0.4273 0.0700 0.000 0.448 0.000 0.552 0.000
#> SRR1327855 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417873 4 0.3177 0.7400 0.000 0.208 0.000 0.792 0.000
#> SRR1394125 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1488388 1 0.3109 0.7827 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1401122 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612383 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1477711 1 0.4138 0.6029 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR1350813 2 0.2280 0.8629 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR612851 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1340010 4 0.3684 0.6805 0.280 0.000 0.000 0.720 0.000
#> SRR1475885 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376334 5 0.3274 0.5905 0.220 0.000 0.000 0.000 0.780
#> SRR1399821 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612323 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.2891 0.7155 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1465608 1 0.2020 0.8128 0.900 0.000 0.000 0.000 0.100
#> SRR1101808 2 0.2020 0.8979 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1414079 3 0.3177 0.7485 0.000 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1331153 2 0.1544 0.9083 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1078439 5 0.4297 0.0347 0.000 0.000 0.000 0.472 0.528
#> SRR2165527 2 0.1965 0.8999 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR1351147 1 0.4349 0.6866 0.756 0.000 0.000 0.068 0.176
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070308 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403110 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0162 0.8228 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1074622 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1465847 5 0.3143 0.6837 0.000 0.000 0.204 0.000 0.796
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 4 0.2813 0.7677 0.000 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR612251 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613214 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613078 2 0.4192 0.3200 0.000 0.596 0.000 0.404 0.000
#> SRR1472998 5 0.2891 0.7265 0.176 0.000 0.000 0.000 0.824
#> SRR1433452 2 0.1732 0.9001 0.000 0.920 0.000 0.080 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.2966 0.7775 0.000 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.4138 0.6029 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR1367566 5 0.2852 0.7242 0.000 0.000 0.172 0.000 0.828
#> SRR1316151 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417547 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.0290 0.9441 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1398207 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1358755 5 0.3003 0.6770 0.000 0.000 0.188 0.000 0.812
#> SRR1078903 2 0.2020 0.8823 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 5 0.2891 0.7265 0.176 0.000 0.000 0.000 0.824
#> SRR615982 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480431 4 0.2074 0.8064 0.000 0.104 0.000 0.896 0.000
#> SRR1429825 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.3143 0.7809 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204
#> SRR808351 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1317513 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1480501 1 0.4786 0.6859 0.720 0.000 0.188 0.000 0.092
#> SRR1081910 5 0.2852 0.7311 0.172 0.000 0.000 0.000 0.828
#> SRR1086611 4 0.1965 0.8291 0.000 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1392571 4 0.1965 0.8254 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.2561 0.8025 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144
#> SRR657313 5 0.2966 0.7138 0.000 0.000 0.184 0.000 0.816
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399757 4 0.6296 0.5833 0.216 0.016 0.000 0.592 0.176
#> SRR1358060 3 0.2605 0.8025 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148
#> SRR1464517 1 0.3305 0.7659 0.776 0.000 0.000 0.000 0.224
#> SRR613557 4 0.0000 0.8745 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809831 5 0.0162 0.8572 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996
#> SRR1429387 3 0.0000 0.8904 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.3177 0.7789 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208
#> SRR1071644 1 0.0000 0.8227 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 5 0.0000 0.8586 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9475 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.3305 0.7255 0.000 0.776 0.000 0.224 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 1 0.3126 0.7690 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1404105 1 0.3126 0.7690 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR2164936 2 0.3854 0.0349 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1472057 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614491 4 0.3499 0.5357 0.000 0.000 0.000 0.680 0.000 0.320
#> SRR1069376 1 0.0363 0.8230 0.988 0.000 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR811964 2 0.0458 0.8456 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1361415 6 0.1501 0.7694 0.000 0.076 0.000 0.000 0.000 0.924
#> SRR1345715 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1328073 4 0.4227 0.5415 0.256 0.000 0.000 0.692 0.000 0.052
#> SRR1394209 4 0.5642 0.4214 0.160 0.000 0.000 0.488 0.000 0.352
#> SRR1474018 6 0.1714 0.7688 0.000 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1099809 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500555 4 0.0000 0.6858 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354363 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1391619 3 0.0405 0.8792 0.000 0.000 0.988 0.000 0.004 0.008
#> SRR1307997 2 0.3244 0.6161 0.000 0.732 0.000 0.268 0.000 0.000
#> SRR663124 2 0.1225 0.8376 0.000 0.952 0.000 0.036 0.000 0.012
#> SRR1334670 1 0.2730 0.7979 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192 0.000
#> SRR612515 4 0.0000 0.6858 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1364013 6 0.1957 0.6630 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000 0.888
#> SRR1468553 3 0.2941 0.7370 0.000 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1403980 5 0.0790 0.8844 0.000 0.000 0.032 0.000 0.968 0.000
#> SRR1420169 5 0.4690 0.3105 0.048 0.000 0.400 0.000 0.552 0.000
#> SRR1442800 4 0.2562 0.5815 0.000 0.000 0.000 0.828 0.172 0.000
#> SRR1359214 6 0.2491 0.7573 0.000 0.164 0.000 0.000 0.000 0.836
#> SRR1499849 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500030 3 0.2980 0.7682 0.000 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1093053 4 0.4411 0.5058 0.080 0.000 0.000 0.712 0.204 0.004
#> SRR1399843 1 0.4158 0.7527 0.704 0.000 0.000 0.052 0.244 0.000
#> SRR1380231 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR809470 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614239 4 0.3288 0.5629 0.000 0.000 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR613939 4 0.1501 0.6738 0.000 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR612971 2 0.3843 0.0736 0.000 0.548 0.000 0.000 0.000 0.452
#> SRR1490204 2 0.0547 0.8441 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR613006 2 0.2910 0.7612 0.000 0.852 0.000 0.068 0.000 0.080
#> SRR1469570 2 0.0260 0.8490 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1457354 2 0.1141 0.8283 0.000 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1362906 3 0.0260 0.8798 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1079023 1 0.2631 0.8022 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1478700 1 0.3301 0.8029 0.788 0.000 0.000 0.000 0.188 0.024
#> SRR1081543 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1384754 1 0.1983 0.8239 0.908 0.000 0.000 0.000 0.020 0.072
#> SRR612287 6 0.3221 0.6961 0.000 0.264 0.000 0.000 0.000 0.736
#> SRR1380317 4 0.3175 0.5754 0.000 0.000 0.000 0.744 0.000 0.256
#> SRR1315247 4 0.1007 0.6706 0.000 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1105344 6 0.1714 0.7688 0.000 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR658549 4 0.5722 -0.2419 0.000 0.164 0.000 0.432 0.000 0.404
#> SRR1480240 5 0.1387 0.8586 0.068 0.000 0.000 0.000 0.932 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.3854 0.0349 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1358520 4 0.3833 0.4146 0.000 0.000 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1419476 3 0.3607 0.4100 0.000 0.000 0.652 0.000 0.348 0.000
#> SRR1456075 3 0.5974 0.3381 0.280 0.000 0.500 0.000 0.212 0.008
#> SRR1389474 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1334419 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1417154 3 0.3563 0.5561 0.000 0.000 0.664 0.000 0.336 0.000
#> SRR1095985 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1325771 4 0.5070 0.0146 0.464 0.000 0.000 0.476 0.048 0.012
#> SRR1360420 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR660272 2 0.3460 0.6629 0.000 0.760 0.000 0.220 0.000 0.020
#> SRR1332993 1 0.2340 0.8160 0.852 0.000 0.000 0.000 0.148 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808044 1 0.3126 0.7690 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1076916 5 0.1333 0.8710 0.000 0.000 0.048 0.000 0.944 0.008
#> SRR1356266 1 0.2631 0.8022 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1341983 6 0.2910 0.7272 0.000 0.080 0.000 0.068 0.000 0.852
#> SRR1456114 1 0.0260 0.8231 0.992 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1072948 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.3336 0.8051 0.812 0.000 0.000 0.056 0.132 0.000
#> SRR613843 2 0.0458 0.8456 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1469192 1 0.3126 0.7690 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1404555 5 0.0790 0.8845 0.000 0.000 0.000 0.032 0.968 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0547 0.8440 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1362848 4 0.5826 0.3829 0.188 0.000 0.000 0.436 0.000 0.376
#> SRR1407492 4 0.3660 0.5742 0.000 0.160 0.000 0.780 0.000 0.060
#> SRR1455082 4 0.3867 -0.0493 0.000 0.000 0.000 0.512 0.000 0.488
#> SRR658362 6 0.2994 0.5623 0.000 0.004 0.000 0.208 0.000 0.788
#> SRR810921 2 0.0458 0.8456 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR662823 6 0.2941 0.7349 0.000 0.220 0.000 0.000 0.000 0.780
#> SRR1456375 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818232 5 0.1387 0.8586 0.068 0.000 0.000 0.000 0.932 0.000
#> SRR1454868 4 0.0820 0.6822 0.012 0.000 0.000 0.972 0.016 0.000
#> SRR1474816 2 0.0260 0.8490 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1342002 1 0.2491 0.8118 0.836 0.000 0.000 0.000 0.164 0.000
#> SRR1088437 6 0.1501 0.7694 0.000 0.076 0.000 0.000 0.000 0.924
#> SRR1466400 4 0.1075 0.6687 0.000 0.000 0.000 0.952 0.048 0.000
#> SRR658921 2 0.1921 0.8150 0.000 0.916 0.000 0.032 0.000 0.052
#> SRR1499873 6 0.1501 0.7694 0.000 0.076 0.000 0.000 0.000 0.924
#> SRR1101373 1 0.5817 0.0217 0.496 0.000 0.000 0.244 0.000 0.260
#> SRR1090145 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379324 5 0.1075 0.8753 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000
#> SRR1345307 2 0.0458 0.8456 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1396166 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.2793 0.7619 0.000 0.000 0.800 0.000 0.200 0.000
#> SRR1454891 4 0.3672 0.4979 0.000 0.000 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR663185 6 0.2608 0.7278 0.000 0.048 0.000 0.080 0.000 0.872
#> SRR811819 1 0.4242 0.3374 0.536 0.000 0.000 0.016 0.448 0.000
#> SRR1318920 1 0.4313 0.4602 0.668 0.000 0.000 0.284 0.048 0.000
#> SRR656758 2 0.2191 0.7625 0.000 0.876 0.000 0.004 0.000 0.120
#> SRR1474351 1 0.1780 0.8084 0.924 0.000 0.000 0.028 0.048 0.000
#> SRR660450 2 0.1663 0.8054 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000 0.000
#> SRR1472687 6 0.1501 0.7694 0.000 0.076 0.000 0.000 0.000 0.924
#> SRR1334291 2 0.2378 0.7516 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323271 6 0.4075 0.5577 0.000 0.076 0.000 0.184 0.000 0.740
#> SRR1368939 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1443161 4 0.4260 0.1898 0.472 0.000 0.000 0.512 0.000 0.016
#> SRR614695 4 0.0000 0.6858 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092372 1 0.2135 0.8209 0.872 0.000 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR1474577 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1406582 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR612779 2 0.1074 0.8368 0.000 0.960 0.000 0.028 0.000 0.012
#> SRR1089006 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1354071 5 0.3482 0.4603 0.316 0.000 0.000 0.000 0.684 0.000
#> SRR1105463 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 5 0.1444 0.8563 0.072 0.000 0.000 0.000 0.928 0.000
#> SRR1325871 3 0.2513 0.8054 0.000 0.000 0.852 0.000 0.140 0.008
#> SRR1355415 5 0.3620 0.4550 0.000 0.000 0.352 0.000 0.648 0.000
#> SRR1090861 1 0.2712 0.7671 0.864 0.000 0.000 0.088 0.048 0.000
#> SRR1320712 4 0.5800 0.3662 0.180 0.000 0.000 0.424 0.000 0.396
#> SRR1470075 1 0.2237 0.8350 0.896 0.000 0.000 0.000 0.068 0.036
#> SRR1091254 1 0.3198 0.7481 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1101397 3 0.0260 0.8798 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1321165 1 0.2996 0.7778 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1092112 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 4 0.4552 0.4732 0.040 0.000 0.000 0.572 0.000 0.388
#> SRR1432106 6 0.3288 0.6841 0.000 0.276 0.000 0.000 0.000 0.724
#> SRR655756 2 0.1765 0.7839 0.000 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1458314 1 0.3245 0.7794 0.764 0.000 0.000 0.000 0.228 0.008
#> SRR1318582 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 6 0.1719 0.7137 0.000 0.016 0.000 0.060 0.000 0.924
#> SRR1072749 5 0.2969 0.6374 0.224 0.000 0.000 0.000 0.776 0.000
#> SRR1078586 1 0.2996 0.7778 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1400333 4 0.0000 0.6858 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1078834 4 0.0000 0.6858 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417611 2 0.3634 0.4261 0.000 0.644 0.000 0.000 0.000 0.356
#> SRR1396840 5 0.1075 0.8753 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0260 0.8490 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR614984 4 0.0000 0.6858 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324269 5 0.1075 0.8753 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000
#> SRR1401491 6 0.1714 0.7688 0.000 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1319443 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1324349 4 0.3860 0.3542 0.000 0.000 0.000 0.528 0.000 0.472
#> SRR1345523 2 0.3854 0.0349 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1500846 1 0.2473 0.8186 0.856 0.000 0.000 0.000 0.136 0.008
#> SRR661505 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1419062 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480131 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1421284 4 0.3797 0.4419 0.000 0.000 0.000 0.580 0.000 0.420
#> SRR1329624 1 0.2631 0.8022 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 4 0.3833 0.4145 0.000 0.000 0.000 0.556 0.000 0.444
#> SRR1083286 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1091890 5 0.1075 0.8718 0.000 0.000 0.000 0.048 0.952 0.000
#> SRR1347436 4 0.1995 0.6608 0.000 0.052 0.000 0.912 0.000 0.036
#> SRR1327473 1 0.4014 0.5388 0.716 0.000 0.000 0.240 0.000 0.044
#> SRR1338195 3 0.2980 0.7682 0.000 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR809698 2 0.0458 0.8456 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1457792 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR658271 2 0.0547 0.8456 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1339597 1 0.3050 0.7763 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR1454842 3 0.2980 0.7682 0.000 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1322643 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR614887 3 0.3050 0.7131 0.000 0.000 0.764 0.000 0.236 0.000
#> SRR1354620 5 0.2793 0.7009 0.000 0.000 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR615056 6 0.2030 0.7549 0.000 0.064 0.000 0.028 0.000 0.908
#> SRR1105320 4 0.5394 0.5041 0.224 0.000 0.000 0.600 0.172 0.004
#> SRR1391529 1 0.2823 0.7913 0.796 0.000 0.000 0.000 0.204 0.000
#> SRR663052 6 0.3288 0.6881 0.000 0.276 0.000 0.000 0.000 0.724
#> SRR1478834 5 0.0790 0.8842 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435330 5 0.1075 0.8740 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 4 0.0000 0.6858 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613568 2 0.0713 0.8403 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR614095 6 0.4089 -0.2667 0.000 0.008 0.000 0.468 0.000 0.524
#> SRR1103092 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337155 5 0.3175 0.6488 0.000 0.000 0.000 0.256 0.744 0.000
#> SRR1475345 6 0.3706 0.4844 0.000 0.380 0.000 0.000 0.000 0.620
#> SRR809089 2 0.2378 0.7209 0.000 0.848 0.000 0.000 0.000 0.152
#> SRR1446180 5 0.3966 0.2969 0.004 0.000 0.000 0.444 0.552 0.000
#> SRR1406372 2 0.0260 0.8490 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1339880 3 0.2980 0.7682 0.000 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1353136 4 0.5754 0.3049 0.240 0.000 0.000 0.512 0.248 0.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR614035 6 0.1501 0.7694 0.000 0.076 0.000 0.000 0.000 0.924
#> SRR1351104 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1363926 4 0.5365 0.3869 0.000 0.256 0.000 0.580 0.000 0.164
#> SRR1399861 4 0.5190 0.5140 0.132 0.000 0.000 0.596 0.000 0.272
#> SRR1338789 1 0.0000 0.8231 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.2980 0.7682 0.000 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1420832 6 0.1501 0.7694 0.000 0.076 0.000 0.000 0.000 0.924
#> SRR1476231 1 0.0000 0.8231 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 4 0.0000 0.6858 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315041 6 0.4169 0.1948 0.000 0.456 0.000 0.012 0.000 0.532
#> SRR661877 6 0.3288 0.6881 0.000 0.276 0.000 0.000 0.000 0.724
#> SRR1443268 3 0.4039 0.1897 0.000 0.000 0.568 0.000 0.424 0.008
#> SRR1416617 5 0.1075 0.8740 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1102443 4 0.4990 0.1830 0.452 0.000 0.000 0.480 0.000 0.068
#> SRR655672 4 0.3727 0.4754 0.000 0.000 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1420006 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.2378 0.7516 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000 0.000
#> SRR613819 4 0.3843 0.4045 0.000 0.000 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR1469432 2 0.0260 0.8490 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR660907 2 0.3659 0.3211 0.000 0.636 0.000 0.000 0.000 0.364
#> SRR1465092 4 0.1610 0.6708 0.000 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1470727 1 0.3547 0.6651 0.668 0.000 0.000 0.000 0.332 0.000
#> SRR1339153 3 0.6025 0.3983 0.000 0.000 0.472 0.320 0.200 0.008
#> SRR1472749 3 0.2980 0.7682 0.000 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR1414379 4 0.3843 0.4045 0.000 0.000 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR1431326 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1487278 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1098312 5 0.1075 0.8753 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000
#> SRR810273 2 0.0146 0.8496 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1376000 2 0.2416 0.7475 0.000 0.844 0.000 0.156 0.000 0.000
#> SRR614467 6 0.2631 0.5935 0.000 0.000 0.000 0.180 0.000 0.820
#> SRR811471 1 0.2996 0.7778 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1088606 4 0.6116 -0.1602 0.340 0.000 0.000 0.360 0.300 0.000
#> SRR1479699 5 0.2487 0.8348 0.092 0.000 0.000 0.032 0.876 0.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0865 0.8373 0.000 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1359803 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.3578 0.3875 0.000 0.660 0.000 0.000 0.000 0.340
#> SRR1471222 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR659427 4 0.4161 0.3632 0.372 0.000 0.000 0.612 0.008 0.008
#> SRR1096638 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1466619 6 0.4180 0.4762 0.000 0.348 0.000 0.024 0.000 0.628
#> SRR659307 4 0.0000 0.6858 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1439994 3 0.3804 0.4149 0.336 0.000 0.656 0.000 0.000 0.008
#> SRR1454931 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.3323 0.7721 0.752 0.000 0.000 0.000 0.240 0.008
#> SRR658621 6 0.1806 0.6858 0.000 0.004 0.000 0.088 0.000 0.908
#> SRR1095840 1 0.2996 0.7778 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1458243 3 0.0260 0.8798 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1374270 4 0.0865 0.6808 0.036 0.000 0.000 0.964 0.000 0.000
#> SRR1470947 6 0.2260 0.7641 0.000 0.140 0.000 0.000 0.000 0.860
#> SRR1365598 2 0.4093 0.2266 0.000 0.516 0.000 0.476 0.000 0.008
#> SRR662787 2 0.2597 0.6852 0.000 0.824 0.000 0.000 0.000 0.176
#> SRR1408727 4 0.3563 0.5206 0.000 0.000 0.000 0.664 0.000 0.336
#> SRR1456274 1 0.3309 0.5292 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000 0.000
#> SRR817744 1 0.1075 0.8131 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1478744 6 0.3782 0.4068 0.000 0.412 0.000 0.000 0.000 0.588
#> SRR1387379 2 0.0458 0.8456 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1102680 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.8231 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 5 0.3478 0.7776 0.060 0.000 0.116 0.000 0.816 0.008
#> SRR820049 3 0.3592 0.5390 0.000 0.000 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR1375290 5 0.3717 0.4491 0.000 0.000 0.000 0.384 0.616 0.000
#> SRR818999 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.1075 0.8131 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1401164 6 0.3695 0.5017 0.000 0.376 0.000 0.000 0.000 0.624
#> SRR1454629 5 0.1257 0.8789 0.028 0.000 0.000 0.020 0.952 0.000
#> SRR1332187 5 0.1075 0.8740 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657833 2 0.4650 0.5383 0.000 0.676 0.000 0.220 0.000 0.104
#> SRR1436207 2 0.5019 0.4218 0.000 0.604 0.000 0.292 0.000 0.104
#> SRR1488017 1 0.0000 0.8231 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0458 0.8456 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1480384 1 0.3050 0.7763 0.764 0.000 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.3231 0.7695 0.012 0.000 0.800 0.000 0.180 0.008
#> SRR1441868 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1485380 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.5998 -0.2850 0.404 0.000 0.000 0.360 0.000 0.236
#> SRR615032 2 0.1204 0.8260 0.000 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1452356 6 0.1501 0.7694 0.000 0.076 0.000 0.000 0.000 0.924
#> SRR1442983 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 4 0.0146 0.6857 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1332816 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR612299 4 0.2260 0.5869 0.000 0.140 0.000 0.860 0.000 0.000
#> SRR1407386 1 0.2631 0.8022 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1418064 2 0.0858 0.8403 0.000 0.968 0.000 0.028 0.000 0.004
#> SRR1309403 4 0.1930 0.6550 0.036 0.000 0.000 0.916 0.048 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498885 6 0.3428 0.6479 0.000 0.304 0.000 0.000 0.000 0.696
#> SRR1337215 4 0.0000 0.6858 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414749 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365963 5 0.1477 0.8727 0.048 0.000 0.004 0.000 0.940 0.008
#> SRR1368030 6 0.1714 0.7688 0.000 0.092 0.000 0.000 0.000 0.908
#> SRR1419760 4 0.0000 0.6858 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1381841 5 0.2907 0.7721 0.152 0.000 0.000 0.020 0.828 0.000
#> SRR821388 4 0.2538 0.6361 0.124 0.000 0.000 0.860 0.000 0.016
#> SRR657623 6 0.1866 0.6908 0.000 0.008 0.000 0.084 0.000 0.908
#> SRR1094241 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR819583 5 0.2793 0.7009 0.000 0.000 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1096149 1 0.3323 0.7721 0.752 0.000 0.000 0.000 0.240 0.008
#> SRR1342829 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.2697 0.7999 0.812 0.000 0.000 0.000 0.188 0.000
#> SRR811333 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.5564 0.3190 0.000 0.516 0.000 0.328 0.000 0.156
#> SRR1446436 2 0.0713 0.8403 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR815092 1 0.2854 0.7907 0.792 0.000 0.000 0.000 0.208 0.000
#> SRR1500149 4 0.4808 -0.1404 0.000 0.468 0.000 0.480 0.000 0.052
#> SRR1100564 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811653 4 0.5572 0.4772 0.188 0.000 0.000 0.544 0.000 0.268
#> SRR1311348 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.3266 0.5287 0.000 0.728 0.000 0.000 0.000 0.272
#> SRR1435442 2 0.3864 0.2302 0.000 0.520 0.000 0.480 0.000 0.000
#> SRR1421444 3 0.2902 0.7652 0.000 0.000 0.800 0.000 0.196 0.004
#> SRR1344010 2 0.3854 0.0349 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1319520 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1444763 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1415026 2 0.3860 0.0157 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR1416596 2 0.5836 -0.1278 0.000 0.420 0.000 0.392 0.000 0.188
#> SRR1485499 6 0.3727 0.4486 0.000 0.388 0.000 0.000 0.000 0.612
#> SRR1316078 6 0.3309 0.6788 0.000 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR663465 6 0.1663 0.7693 0.000 0.088 0.000 0.000 0.000 0.912
#> SRR1310094 6 0.5042 0.4354 0.000 0.308 0.000 0.100 0.000 0.592
#> SRR663537 2 0.0458 0.8456 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1486780 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1453950 1 0.3390 0.7387 0.704 0.000 0.000 0.000 0.296 0.000
#> SRR1087875 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR613318 4 0.0146 0.6860 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1332694 1 0.2631 0.8022 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR818670 2 0.2416 0.7319 0.000 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1120318 5 0.0790 0.8843 0.032 0.000 0.000 0.000 0.968 0.000
#> SRR1311622 1 0.4133 0.7381 0.708 0.000 0.032 0.000 0.252 0.008
#> SRR1500931 5 0.3659 0.4299 0.000 0.000 0.364 0.000 0.636 0.000
#> SRR1387494 5 0.3043 0.6958 0.000 0.000 0.200 0.000 0.792 0.008
#> SRR1379175 4 0.1267 0.6773 0.000 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1401909 5 0.3823 0.2520 0.000 0.000 0.436 0.000 0.564 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376640 4 0.0790 0.6814 0.000 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1085712 6 0.3634 0.5447 0.000 0.356 0.000 0.000 0.000 0.644
#> SRR1082283 1 0.3312 0.7952 0.792 0.000 0.000 0.028 0.180 0.000
#> SRR1084276 5 0.1075 0.8753 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000
#> SRR1353262 2 0.0790 0.8401 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1437035 1 0.1261 0.8273 0.952 0.000 0.000 0.024 0.024 0.000
#> SRR1396877 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0260 0.8490 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1417936 1 0.0000 0.8231 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 4 0.3727 0.4754 0.000 0.000 0.000 0.612 0.000 0.388
#> SRR1101128 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1363886 6 0.3428 0.6419 0.000 0.304 0.000 0.000 0.000 0.696
#> SRR612983 6 0.2912 0.7360 0.000 0.216 0.000 0.000 0.000 0.784
#> SRR1394366 4 0.0146 0.6851 0.000 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1093218 3 0.0260 0.8798 0.000 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1077090 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1327430 4 0.3659 0.4994 0.000 0.000 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR1088958 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1486931 2 0.2378 0.7516 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.3126 0.7690 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1383000 1 0.3126 0.7690 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1355705 6 0.1910 0.7697 0.000 0.108 0.000 0.000 0.000 0.892
#> SRR614335 6 0.1700 0.6939 0.000 0.004 0.000 0.080 0.000 0.916
#> SRR660534 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0790 0.8400 0.000 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR1334265 6 0.4097 -0.3066 0.000 0.008 0.000 0.492 0.000 0.500
#> SRR1456401 2 0.2250 0.7881 0.000 0.888 0.000 0.092 0.000 0.020
#> SRR1086393 1 0.0000 0.8231 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351521 3 0.1387 0.8530 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1093100 4 0.5295 0.4172 0.104 0.000 0.000 0.500 0.000 0.396
#> SRR1309382 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089375 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.2416 0.7475 0.000 0.844 0.000 0.156 0.000 0.000
#> SRR614719 4 0.3620 0.5113 0.000 0.000 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1081473 1 0.3349 0.7691 0.748 0.000 0.000 0.000 0.244 0.008
#> SRR1087415 1 0.3672 0.5997 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368 0.000
#> SRR1088217 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR808496 4 0.3804 0.4266 0.000 0.000 0.000 0.576 0.000 0.424
#> SRR1336463 2 0.2088 0.7995 0.000 0.904 0.000 0.068 0.000 0.028
#> SRR612359 4 0.0000 0.6858 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444412 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.2980 0.7682 0.000 0.000 0.800 0.000 0.192 0.008
#> SRR656095 2 0.0458 0.8456 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR808914 1 0.3109 0.7794 0.772 0.000 0.000 0.004 0.224 0.000
#> SRR1349099 1 0.0865 0.8219 0.964 0.000 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1337886 2 0.3672 0.3610 0.000 0.632 0.000 0.000 0.000 0.368
#> SRR813632 5 0.0260 0.8961 0.008 0.000 0.000 0.000 0.992 0.000
#> SRR1101591 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089713 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1453127 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1498354 5 0.2883 0.6852 0.000 0.000 0.212 0.000 0.788 0.000
#> SRR1313831 1 0.3198 0.6353 0.740 0.000 0.000 0.000 0.260 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR814747 6 0.2009 0.7583 0.000 0.068 0.000 0.024 0.000 0.908
#> SRR1358539 1 0.1075 0.8131 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1367807 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1365791 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081519 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614707 4 0.2212 0.6455 0.112 0.000 0.000 0.880 0.000 0.008
#> SRR1094027 1 0.2631 0.8022 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1489092 5 0.5358 0.4106 0.128 0.000 0.000 0.328 0.544 0.000
#> SRR1079502 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457814 4 0.4697 0.5117 0.064 0.000 0.000 0.612 0.000 0.324
#> SRR1455127 2 0.1910 0.7898 0.000 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR615081 4 0.6096 0.1017 0.000 0.288 0.000 0.380 0.000 0.332
#> SRR1327855 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1417873 4 0.5508 0.2103 0.000 0.128 0.000 0.440 0.000 0.432
#> SRR1394125 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.2300 0.8172 0.856 0.000 0.000 0.000 0.144 0.000
#> SRR1401122 6 0.3868 -0.3190 0.000 0.000 0.000 0.492 0.000 0.508
#> SRR612383 4 0.3390 0.5611 0.000 0.000 0.000 0.704 0.000 0.296
#> SRR1477711 1 0.2996 0.7778 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1350813 2 0.5716 0.0140 0.000 0.444 0.000 0.164 0.000 0.392
#> SRR612851 4 0.0146 0.6856 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1086349 1 0.0000 0.8231 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR812837 6 0.3266 0.6887 0.000 0.272 0.000 0.000 0.000 0.728
#> SRR1340010 1 0.4756 -0.1107 0.488 0.000 0.000 0.464 0.000 0.048
#> SRR1475885 1 0.4812 0.3604 0.588 0.000 0.000 0.344 0.000 0.068
#> SRR1376334 5 0.3221 0.5880 0.264 0.000 0.000 0.000 0.736 0.000
#> SRR1399821 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1347042 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612323 4 0.0000 0.6858 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.2384 0.8075 0.888 0.000 0.000 0.000 0.048 0.064
#> SRR1465608 1 0.1838 0.8342 0.916 0.000 0.000 0.000 0.068 0.016
#> SRR1101808 6 0.1610 0.7698 0.000 0.084 0.000 0.000 0.000 0.916
#> SRR1414079 3 0.2941 0.7362 0.000 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000
#> SRR1331153 2 0.2378 0.7516 0.000 0.848 0.000 0.152 0.000 0.000
#> SRR1078439 4 0.3747 0.2008 0.000 0.000 0.000 0.604 0.396 0.000
#> SRR2165527 6 0.3309 0.6830 0.000 0.280 0.000 0.000 0.000 0.720
#> SRR1351147 4 0.4753 -0.0760 0.456 0.000 0.000 0.496 0.048 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1070308 4 0.3647 0.4997 0.000 0.000 0.000 0.640 0.000 0.360
#> SRR1403110 5 0.1387 0.8586 0.068 0.000 0.000 0.000 0.932 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0405 0.8251 0.988 0.000 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1074622 1 0.3126 0.7690 0.752 0.000 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1465847 5 0.1501 0.8523 0.000 0.000 0.076 0.000 0.924 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.8231 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 4 0.2378 0.5988 0.000 0.000 0.000 0.848 0.152 0.000
#> SRR612251 4 0.3774 0.4544 0.000 0.000 0.000 0.592 0.000 0.408
#> SRR1418581 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR658045 2 0.0458 0.8456 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR613214 4 0.3126 0.5828 0.000 0.000 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR613078 4 0.4357 0.2782 0.000 0.340 0.000 0.624 0.000 0.036
#> SRR1472998 5 0.1075 0.8753 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000
#> SRR1433452 2 0.2454 0.7436 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.1075 0.8201 0.952 0.000 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1487993 3 0.2948 0.7717 0.000 0.000 0.804 0.000 0.188 0.008
#> SRR1465983 2 0.3371 0.4834 0.000 0.708 0.000 0.000 0.000 0.292
#> SRR1380375 1 0.2996 0.7778 0.772 0.000 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1367566 5 0.1075 0.8740 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952 0.000
#> SRR1316151 4 0.1141 0.6778 0.000 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1417547 6 0.1765 0.6769 0.000 0.000 0.000 0.096 0.000 0.904
#> SRR659389 2 0.3854 0.0349 0.000 0.536 0.000 0.000 0.000 0.464
#> SRR1490270 2 0.1863 0.8170 0.000 0.920 0.000 0.044 0.000 0.036
#> SRR1398207 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358755 5 0.2793 0.7009 0.000 0.000 0.200 0.000 0.800 0.000
#> SRR1078903 2 0.2553 0.7536 0.000 0.848 0.000 0.144 0.000 0.008
#> SRR1323252 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 5 0.1075 0.8753 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000
#> SRR615982 4 0.3672 0.4985 0.000 0.000 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1480431 6 0.2311 0.6907 0.000 0.016 0.000 0.104 0.000 0.880
#> SRR1429825 4 0.1610 0.6708 0.000 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1102393 2 0.0260 0.8490 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1071313 1 0.2988 0.8117 0.824 0.000 0.000 0.024 0.152 0.000
#> SRR808351 1 0.2631 0.8022 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1317513 1 0.2631 0.8022 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1480501 1 0.4601 0.6954 0.688 0.000 0.200 0.000 0.112 0.000
#> SRR1081910 5 0.1075 0.8753 0.048 0.000 0.000 0.000 0.952 0.000
#> SRR1086611 4 0.0000 0.6858 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1392571 4 0.0000 0.6858 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR808152 1 0.2768 0.8211 0.832 0.000 0.000 0.000 0.156 0.012
#> SRR657313 5 0.1267 0.8700 0.000 0.000 0.060 0.000 0.940 0.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.3797 0.1695 0.000 0.580 0.000 0.000 0.000 0.420
#> SRR1379343 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.1387 0.8174 0.932 0.000 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1376228 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1399757 4 0.7928 0.3654 0.204 0.184 0.000 0.424 0.048 0.140
#> SRR1358060 3 0.2340 0.8017 0.000 0.000 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR1464517 1 0.3398 0.7620 0.740 0.000 0.000 0.000 0.252 0.008
#> SRR613557 4 0.0000 0.6858 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809831 5 0.0146 0.8973 0.004 0.000 0.000 0.000 0.996 0.000
#> SRR1429387 3 0.0000 0.8820 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.2631 0.8022 0.820 0.000 0.000 0.000 0.180 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.8231 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 5 0.0000 0.8984 0.000 0.000 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.8505 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.5093 0.4532 0.000 0.632 0.000 0.192 0.000 0.176
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "mclust"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:mclust"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'mclust' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.987 0.995 0.4966 0.504 0.504
#> 3 3 0.827 0.870 0.920 0.2762 0.847 0.699
#> 4 4 0.687 0.658 0.773 0.1230 0.950 0.866
#> 5 5 0.629 0.641 0.749 0.0559 0.860 0.593
#> 6 6 0.638 0.527 0.673 0.0281 0.911 0.659
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1394209 1 0.4022 0.9117 0.920 0.080
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1500555 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1391619 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1092727 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1403980 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1442800 2 0.9552 0.4031 0.376 0.624
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1093053 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1399843 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1380231 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1096736 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1478700 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1384754 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1380317 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1315247 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1456075 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1417154 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1325771 1 0.0376 0.9926 0.996 0.004
#> SRR1360420 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1072948 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1362848 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1407492 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1454868 1 0.4022 0.9117 0.920 0.080
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1466400 2 0.6343 0.8093 0.160 0.840
#> SRR658921 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR614695 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1325871 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1320712 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1092112 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1074790 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1400333 2 0.7299 0.7446 0.204 0.796
#> SRR1078834 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1324269 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1419062 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1421284 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1315739 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1091890 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1327473 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1338195 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR614887 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1354620 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1389157 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR613568 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1446180 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1353136 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1093906 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1399861 1 0.5059 0.8731 0.888 0.112
#> SRR1338789 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1421420 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1352870 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1315041 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1420006 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1472749 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1478341 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1479699 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR659427 1 0.4815 0.8830 0.896 0.104
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR659307 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1439994 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1374270 1 0.9881 0.2224 0.564 0.436
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1456274 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR820049 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1375290 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR818999 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1332187 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR603365 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1485380 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1309403 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1337215 2 0.0938 0.9813 0.012 0.988
#> SRR1414749 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1419760 2 0.6438 0.8033 0.164 0.836
#> SRR1381841 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR821388 2 0.7139 0.7572 0.196 0.804
#> SRR657623 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR819583 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1403072 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR811653 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR613318 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1468469 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1500931 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1379175 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1401909 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1101128 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1093218 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1077090 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1093100 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1444412 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1101591 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1453127 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1315434 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1365791 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1081519 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR614707 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1079502 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1457814 2 0.0672 0.9852 0.008 0.992
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1475885 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1347042 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1351147 2 0.9993 0.0686 0.484 0.516
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1090881 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR612251 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR613078 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1487993 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1367566 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1429825 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1480501 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1086611 2 0.0938 0.9813 0.012 0.988
#> SRR1392571 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR657313 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1376228 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.5408 0.8577 0.876 0.124
#> SRR1358060 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1464517 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR613557 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR809831 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.0000 0.9965 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.9928 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 1 0.6095 0.4292 0.608 0.000 0.392
#> SRR1404105 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.1964 0.9608 0.000 0.944 0.056
#> SRR1472057 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR614491 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1069376 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.1529 0.9629 0.000 0.960 0.040
#> SRR1361415 2 0.0747 0.9679 0.000 0.984 0.016
#> SRR1345715 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.3879 0.7923 0.848 0.000 0.152
#> SRR1394209 1 0.8594 0.4551 0.588 0.268 0.144
#> SRR1474018 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR1099809 3 0.4750 0.8062 0.216 0.000 0.784
#> SRR1500555 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1354363 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.2261 0.9234 0.068 0.000 0.932
#> SRR1307997 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR663124 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1334670 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR612515 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1092727 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1364013 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1468553 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1403980 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1420169 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1442800 2 0.7220 0.5330 0.284 0.660 0.056
#> SRR1359214 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR1499849 3 0.3482 0.8897 0.128 0.000 0.872
#> SRR1500030 3 0.3192 0.9005 0.112 0.000 0.888
#> SRR1093053 3 0.2356 0.9220 0.072 0.000 0.928
#> SRR1399843 1 0.5058 0.6953 0.756 0.000 0.244
#> SRR1380231 3 0.5988 0.5241 0.368 0.000 0.632
#> SRR809470 3 0.5327 0.7243 0.272 0.000 0.728
#> SRR614239 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR613939 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR612971 2 0.1411 0.9629 0.000 0.964 0.036
#> SRR1490204 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR811357 2 0.1411 0.9629 0.000 0.964 0.036
#> SRR1471672 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1469570 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR1457354 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1362906 3 0.3340 0.8947 0.120 0.000 0.880
#> SRR1079023 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.1411 0.9629 0.000 0.964 0.036
#> SRR1096736 1 0.4654 0.7396 0.792 0.000 0.208
#> SRR1478700 1 0.5497 0.6327 0.708 0.000 0.292
#> SRR1081543 3 0.5058 0.7678 0.244 0.000 0.756
#> SRR1384754 1 0.4887 0.7154 0.772 0.000 0.228
#> SRR612287 2 0.1529 0.9629 0.000 0.960 0.040
#> SRR1380317 2 0.4164 0.8281 0.144 0.848 0.008
#> SRR1315247 2 0.1015 0.9631 0.012 0.980 0.008
#> SRR1105344 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR658549 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1480240 1 0.0892 0.8647 0.980 0.000 0.020
#> SRR1084816 2 0.1411 0.9629 0.000 0.964 0.036
#> SRR612551 2 0.1643 0.9626 0.000 0.956 0.044
#> SRR1358520 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1419476 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1456075 1 0.6095 0.4290 0.608 0.000 0.392
#> SRR1389474 2 0.1411 0.9629 0.000 0.964 0.036
#> SRR1367005 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.5098 0.7619 0.248 0.000 0.752
#> SRR1095985 3 0.5138 0.7540 0.252 0.000 0.748
#> SRR1325771 1 0.6420 0.5299 0.688 0.288 0.024
#> SRR1360420 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR660272 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1332993 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR808044 1 0.4605 0.7433 0.796 0.000 0.204
#> SRR1076916 3 0.4291 0.8458 0.180 0.000 0.820
#> SRR1356266 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1456114 1 0.0237 0.8686 0.996 0.000 0.004
#> SRR1072948 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1472370 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1480176 1 0.4178 0.7760 0.828 0.000 0.172
#> SRR613843 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR1469192 1 0.4452 0.7556 0.808 0.000 0.192
#> SRR1404555 3 0.4504 0.8286 0.196 0.000 0.804
#> SRR659839 2 0.1529 0.9629 0.000 0.960 0.040
#> SRR659533 2 0.1163 0.9675 0.000 0.972 0.028
#> SRR1362848 1 0.6698 0.6164 0.684 0.036 0.280
#> SRR1407492 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1455082 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR658362 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR810921 2 0.1753 0.9621 0.000 0.952 0.048
#> SRR662823 2 0.1964 0.9608 0.000 0.944 0.056
#> SRR1456375 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR818232 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.8196 0.5544 0.124 0.252 0.624
#> SRR1474816 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1342002 1 0.4002 0.7846 0.840 0.000 0.160
#> SRR1088437 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1466400 2 0.3009 0.9126 0.052 0.920 0.028
#> SRR658921 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1499873 2 0.0237 0.9689 0.000 0.996 0.004
#> SRR1101373 1 0.0237 0.8665 0.996 0.004 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.1411 0.9629 0.000 0.964 0.036
#> SRR1396166 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1086280 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1454891 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR663185 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR811819 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.9686 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1472687 2 0.1289 0.9669 0.000 0.968 0.032
#> SRR1334291 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1415153 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR1323271 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR1368939 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR1443161 1 0.6192 0.3575 0.580 0.000 0.420
#> SRR614695 2 0.0661 0.9669 0.004 0.988 0.008
#> SRR1092372 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR1089006 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.4452 0.7562 0.808 0.000 0.192
#> SRR1105463 3 0.3879 0.8679 0.152 0.000 0.848
#> SRR811005 2 0.1753 0.9634 0.000 0.952 0.048
#> SRR1385319 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.2356 0.9220 0.072 0.000 0.928
#> SRR1355415 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1090861 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 1 0.3038 0.8250 0.896 0.000 0.104
#> SRR1470075 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 3 0.5948 0.4867 0.360 0.000 0.640
#> SRR1321165 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1417588 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1074790 1 0.5585 0.6426 0.772 0.204 0.024
#> SRR1432106 2 0.1860 0.9618 0.000 0.948 0.052
#> SRR655756 2 0.1964 0.9608 0.000 0.944 0.056
#> SRR1458314 1 0.4346 0.7636 0.816 0.000 0.184
#> SRR1318582 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR1080484 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1072749 3 0.6126 0.3478 0.400 0.000 0.600
#> SRR1078586 1 0.1031 0.8635 0.976 0.000 0.024
#> SRR1400333 2 0.6075 0.5176 0.316 0.676 0.008
#> SRR1078834 2 0.1315 0.9578 0.020 0.972 0.008
#> SRR1417611 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR1396840 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.1411 0.9629 0.000 0.964 0.036
#> SRR1400530 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR614984 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1324269 1 0.5216 0.6752 0.740 0.000 0.260
#> SRR1401491 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR1319443 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.1129 0.9663 0.004 0.976 0.020
#> SRR1345523 2 0.1860 0.9614 0.000 0.948 0.052
#> SRR1500846 1 0.5216 0.6814 0.740 0.000 0.260
#> SRR661505 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1419062 3 0.3879 0.8661 0.152 0.000 0.848
#> SRR1480131 1 0.0424 0.8678 0.992 0.000 0.008
#> SRR1421284 2 0.4485 0.8317 0.136 0.844 0.020
#> SRR1329624 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1099189 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1083286 1 0.1031 0.8638 0.976 0.000 0.024
#> SRR1091890 3 0.5016 0.7740 0.240 0.000 0.760
#> SRR1347436 2 0.0237 0.9687 0.000 0.996 0.004
#> SRR1327473 1 0.0747 0.8657 0.984 0.000 0.016
#> SRR1338195 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR809698 2 0.1964 0.9608 0.000 0.944 0.056
#> SRR1457792 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0747 0.9682 0.000 0.984 0.016
#> SRR1339597 1 0.4452 0.7559 0.808 0.000 0.192
#> SRR1454842 3 0.2261 0.9234 0.068 0.000 0.932
#> SRR1322643 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1354620 3 0.2356 0.9219 0.072 0.000 0.928
#> SRR615056 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1105320 1 0.1753 0.8542 0.952 0.000 0.048
#> SRR1391529 1 0.0424 0.8677 0.992 0.000 0.008
#> SRR663052 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1478834 1 0.1163 0.8620 0.972 0.000 0.028
#> SRR812366 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR1435330 3 0.3116 0.9027 0.108 0.000 0.892
#> SRR615383 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR1389157 2 0.1585 0.9538 0.028 0.964 0.008
#> SRR613568 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR614095 2 0.0424 0.9687 0.000 0.992 0.008
#> SRR1103092 1 0.1964 0.8507 0.944 0.000 0.056
#> SRR1337155 3 0.4555 0.8226 0.200 0.000 0.800
#> SRR1475345 2 0.1643 0.9627 0.000 0.956 0.044
#> SRR809089 2 0.1860 0.9618 0.000 0.948 0.052
#> SRR1446180 2 0.9579 -0.0742 0.368 0.432 0.200
#> SRR1406372 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR1339880 3 0.3816 0.8730 0.148 0.000 0.852
#> SRR1353136 3 0.5760 0.5668 0.328 0.000 0.672
#> SRR1093906 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR614035 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1351104 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0848 0.9653 0.008 0.984 0.008
#> SRR1399861 1 0.9755 0.1557 0.396 0.376 0.228
#> SRR1338789 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1420832 2 0.1860 0.9622 0.000 0.948 0.052
#> SRR1476231 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 2 0.1751 0.9496 0.028 0.960 0.012
#> SRR1315041 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR661877 2 0.1964 0.9608 0.000 0.944 0.056
#> SRR1443268 3 0.5497 0.6553 0.292 0.000 0.708
#> SRR1416617 3 0.2261 0.9234 0.068 0.000 0.932
#> SRR1102443 1 0.3686 0.8012 0.860 0.000 0.140
#> SRR655672 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1420006 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1458267 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR613819 2 0.0424 0.9685 0.000 0.992 0.008
#> SRR1469432 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR660907 2 0.1411 0.9629 0.000 0.964 0.036
#> SRR1465092 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1470727 1 0.4931 0.7108 0.768 0.000 0.232
#> SRR1339153 3 0.2261 0.9234 0.068 0.000 0.932
#> SRR1472749 3 0.2448 0.9201 0.076 0.000 0.924
#> SRR1414379 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1431326 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1098312 1 0.4842 0.7199 0.776 0.000 0.224
#> SRR810273 2 0.1411 0.9629 0.000 0.964 0.036
#> SRR1376000 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR614467 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR811471 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1088606 1 0.8892 0.0867 0.444 0.436 0.120
#> SRR1479699 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403589 2 0.0747 0.9680 0.000 0.984 0.016
#> SRR812625 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1359803 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.1411 0.9629 0.000 0.964 0.036
#> SRR1471222 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR1378992 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR659427 3 0.7065 0.6203 0.276 0.052 0.672
#> SRR1096638 1 0.3412 0.8115 0.876 0.000 0.124
#> SRR1466619 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR659307 2 0.1129 0.9663 0.004 0.976 0.020
#> SRR1439994 3 0.5968 0.4627 0.364 0.000 0.636
#> SRR1454931 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.4750 0.7320 0.784 0.000 0.216
#> SRR658621 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1095840 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.6309 0.0591 0.504 0.000 0.496
#> SRR1374270 2 0.6835 0.5404 0.284 0.676 0.040
#> SRR1470947 2 0.1964 0.9608 0.000 0.944 0.056
#> SRR1365598 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR662787 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1408727 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1456274 1 0.3482 0.8092 0.872 0.000 0.128
#> SRR817744 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.1753 0.9621 0.000 0.952 0.048
#> SRR1387379 2 0.1643 0.9626 0.000 0.956 0.044
#> SRR1102680 3 0.2537 0.9185 0.080 0.000 0.920
#> SRR1374198 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.5497 0.6315 0.708 0.000 0.292
#> SRR820049 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1375290 3 0.2796 0.9123 0.092 0.000 0.908
#> SRR818999 3 0.6267 0.2433 0.452 0.000 0.548
#> SRR1390242 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR1454629 1 0.2165 0.8468 0.936 0.000 0.064
#> SRR1332187 3 0.4346 0.8381 0.184 0.000 0.816
#> SRR603365 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR657833 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1436207 2 0.0424 0.9687 0.000 0.992 0.008
#> SRR1488017 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.1031 0.9683 0.000 0.976 0.024
#> SRR1480384 1 0.6026 0.4723 0.624 0.000 0.376
#> SRR1364761 2 0.1411 0.9629 0.000 0.964 0.036
#> SRR1308086 3 0.3192 0.9005 0.112 0.000 0.888
#> SRR1441868 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1073705 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.1411 0.9629 0.000 0.964 0.036
#> SRR1452356 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1442983 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR1100346 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1332816 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0661 0.9669 0.004 0.988 0.008
#> SRR1407386 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0661 0.9669 0.004 0.988 0.008
#> SRR1309403 2 0.3375 0.8791 0.100 0.892 0.008
#> SRR1498395 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR1079998 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1498885 2 0.1753 0.9625 0.000 0.952 0.048
#> SRR1337215 2 0.6416 0.3711 0.376 0.616 0.008
#> SRR1414749 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1365963 1 0.5882 0.5304 0.652 0.000 0.348
#> SRR1368030 2 0.0424 0.9687 0.000 0.992 0.008
#> SRR1419760 2 0.6260 0.1595 0.448 0.552 0.000
#> SRR1381841 1 0.1163 0.8623 0.972 0.000 0.028
#> SRR821388 2 0.4636 0.8383 0.036 0.848 0.116
#> SRR657623 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1094241 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR819583 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1096149 1 0.5591 0.6135 0.696 0.000 0.304
#> SRR1342829 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1353028 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR811333 1 0.5968 0.4595 0.636 0.000 0.364
#> SRR1311666 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR1486698 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1446436 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR815092 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1100564 1 0.1643 0.8560 0.956 0.000 0.044
#> SRR1403072 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR811653 3 0.3116 0.9024 0.108 0.000 0.892
#> SRR1311348 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR1489438 2 0.1529 0.9629 0.000 0.960 0.040
#> SRR1435442 2 0.0661 0.9669 0.004 0.988 0.008
#> SRR1421444 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1344010 2 0.1860 0.9614 0.000 0.948 0.052
#> SRR1319520 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.1529 0.9629 0.000 0.960 0.040
#> SRR1416596 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1485499 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR1316078 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR663465 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1310094 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR663537 2 0.1411 0.9629 0.000 0.964 0.036
#> SRR1486780 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.4062 0.7815 0.836 0.000 0.164
#> SRR1087875 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR613318 2 0.1636 0.9608 0.016 0.964 0.020
#> SRR1332694 1 0.1031 0.8637 0.976 0.000 0.024
#> SRR1468469 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR818670 2 0.0000 0.9686 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.1860 0.8524 0.948 0.000 0.052
#> SRR1311622 1 0.6045 0.4592 0.620 0.000 0.380
#> SRR1500931 3 0.2261 0.9234 0.068 0.000 0.932
#> SRR1387494 3 0.3116 0.9031 0.108 0.000 0.892
#> SRR1379175 2 0.1315 0.9580 0.020 0.972 0.008
#> SRR1401909 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1440541 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1068832 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1376640 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1085712 2 0.1860 0.9614 0.000 0.948 0.052
#> SRR1082283 1 0.2959 0.8270 0.900 0.000 0.100
#> SRR1084276 1 0.5327 0.6647 0.728 0.000 0.272
#> SRR1353262 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1437035 1 0.2711 0.8342 0.912 0.000 0.088
#> SRR1396877 1 0.4346 0.7641 0.816 0.000 0.184
#> SRR1443026 2 0.1289 0.9651 0.000 0.968 0.032
#> SRR1417936 1 0.0237 0.8686 0.996 0.000 0.004
#> SRR1436822 2 0.0661 0.9669 0.004 0.988 0.008
#> SRR1101128 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1363886 2 0.1529 0.9629 0.000 0.960 0.040
#> SRR612983 2 0.1964 0.9608 0.000 0.944 0.056
#> SRR1394366 2 0.0661 0.9669 0.004 0.988 0.008
#> SRR1093218 3 0.2261 0.9234 0.068 0.000 0.932
#> SRR1077090 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1327430 2 0.1015 0.9647 0.012 0.980 0.008
#> SRR1088958 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1086820 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.4796 0.7263 0.780 0.000 0.220
#> SRR1355705 2 0.1860 0.9622 0.000 0.948 0.052
#> SRR614335 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR660534 2 0.1411 0.9629 0.000 0.964 0.036
#> SRR817094 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR1334265 2 0.0424 0.9685 0.000 0.992 0.008
#> SRR1456401 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR1086393 1 0.3816 0.7951 0.852 0.000 0.148
#> SRR1351521 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1093100 1 0.8138 0.5566 0.636 0.132 0.232
#> SRR1309382 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.4702 0.7344 0.788 0.000 0.212
#> SRR1499482 2 0.0237 0.9687 0.000 0.996 0.004
#> SRR614719 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1081473 3 0.2356 0.9220 0.072 0.000 0.928
#> SRR1087415 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 3 0.4605 0.8140 0.204 0.000 0.796
#> SRR808496 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1336463 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR612359 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1444412 1 0.5497 0.6366 0.708 0.000 0.292
#> SRR1074116 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR821846 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR656095 2 0.1964 0.9608 0.000 0.944 0.056
#> SRR808914 1 0.1529 0.8575 0.960 0.000 0.040
#> SRR1349099 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0237 0.9687 0.000 0.996 0.004
#> SRR813632 1 0.4842 0.7199 0.776 0.000 0.224
#> SRR1101591 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1089713 1 0.4702 0.7382 0.788 0.000 0.212
#> SRR1453127 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1498354 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1313831 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR814747 2 0.0237 0.9687 0.000 0.996 0.004
#> SRR1358539 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.5431 0.7070 0.284 0.000 0.716
#> SRR1081519 3 0.4796 0.7970 0.220 0.000 0.780
#> SRR614707 1 0.2569 0.8447 0.936 0.032 0.032
#> SRR1094027 1 0.1411 0.8593 0.964 0.000 0.036
#> SRR1489092 3 0.4504 0.8286 0.196 0.000 0.804
#> SRR1079502 3 0.4291 0.8452 0.180 0.000 0.820
#> SRR1457814 2 0.5897 0.7657 0.076 0.792 0.132
#> SRR1455127 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR615081 2 0.0661 0.9669 0.004 0.988 0.008
#> SRR1327855 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1417873 2 0.0424 0.9685 0.000 0.992 0.008
#> SRR1394125 3 0.4399 0.8365 0.188 0.000 0.812
#> SRR1488388 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR612383 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1477711 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR612851 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1086349 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.1860 0.9614 0.000 0.948 0.052
#> SRR1340010 1 0.6126 0.4123 0.600 0.000 0.400
#> SRR1475885 1 0.0747 0.8656 0.984 0.000 0.016
#> SRR1376334 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR612323 2 0.1129 0.9663 0.004 0.976 0.020
#> SRR612604 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1389546 2 0.1411 0.9629 0.000 0.964 0.036
#> SRR1311877 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.5178 0.6829 0.744 0.000 0.256
#> SRR1101808 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1414079 3 0.2261 0.9234 0.068 0.000 0.932
#> SRR1331153 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1078439 3 0.2625 0.9166 0.084 0.000 0.916
#> SRR2165527 2 0.1964 0.9608 0.000 0.944 0.056
#> SRR1351147 1 0.7169 0.2780 0.568 0.404 0.028
#> SRR1313536 2 0.0424 0.9686 0.000 0.992 0.008
#> SRR1070308 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1403110 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR1401317 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1456862 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.4750 0.7304 0.784 0.000 0.216
#> SRR1465847 3 0.2878 0.9094 0.096 0.000 0.904
#> SRR1443376 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR1471312 3 0.4654 0.8127 0.208 0.000 0.792
#> SRR1075579 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 1 0.9234 0.1738 0.476 0.160 0.364
#> SRR612251 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1418581 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.1529 0.9629 0.000 0.960 0.040
#> SRR613214 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR613078 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1472998 1 0.5988 0.4861 0.632 0.000 0.368
#> SRR1433452 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1101957 1 0.0424 0.8677 0.992 0.000 0.008
#> SRR1487993 3 0.3116 0.9031 0.108 0.000 0.892
#> SRR1465983 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR1380375 1 0.3116 0.8219 0.892 0.000 0.108
#> SRR1367566 3 0.2261 0.9234 0.068 0.000 0.932
#> SRR1316151 2 0.0661 0.9669 0.004 0.988 0.008
#> SRR1417547 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR659389 2 0.1964 0.9608 0.000 0.944 0.056
#> SRR1490270 2 0.0424 0.9679 0.000 0.992 0.008
#> SRR1398207 1 0.5905 0.4863 0.648 0.000 0.352
#> SRR1358755 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1078903 2 0.0237 0.9687 0.000 0.996 0.004
#> SRR1323252 2 0.1411 0.9629 0.000 0.964 0.036
#> SRR1451796 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR1369172 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1480431 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1429825 2 0.0237 0.9683 0.000 0.996 0.004
#> SRR1102393 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR1071313 1 0.4346 0.7638 0.816 0.000 0.184
#> SRR808351 1 0.4750 0.7304 0.784 0.000 0.216
#> SRR1317513 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1081910 1 0.4178 0.7752 0.828 0.000 0.172
#> SRR1086611 2 0.2096 0.9323 0.052 0.944 0.004
#> SRR1392571 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR1311441 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1433131 2 0.0892 0.9677 0.000 0.980 0.020
#> SRR1321011 2 0.1411 0.9629 0.000 0.964 0.036
#> SRR1500598 2 0.1529 0.9626 0.000 0.960 0.040
#> SRR1379343 2 0.1411 0.9629 0.000 0.964 0.036
#> SRR1389108 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1399757 1 0.6661 0.3554 0.588 0.400 0.012
#> SRR1358060 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR1464517 1 0.6309 0.0645 0.504 0.000 0.496
#> SRR613557 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
#> SRR809831 1 0.4399 0.7604 0.812 0.000 0.188
#> SRR1429387 3 0.2165 0.9243 0.064 0.000 0.936
#> SRR816565 1 0.4121 0.7784 0.832 0.000 0.168
#> SRR1071644 1 0.0000 0.8694 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.6062 0.4246 0.384 0.000 0.616
#> SRR1072031 2 0.1411 0.9629 0.000 0.964 0.036
#> SRR1374671 2 0.0892 0.9673 0.000 0.980 0.020
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 1 0.7862 -0.21626 0.364 0.000 0.364 0.272
#> SRR1404105 1 0.2281 0.75894 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR2164936 2 0.4746 0.71047 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1472057 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.0336 0.78833 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1069376 1 0.0000 0.74042 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1361415 2 0.1118 0.78542 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1345715 1 0.0592 0.73160 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1328073 1 0.1767 0.75361 0.944 0.000 0.012 0.044
#> SRR1394209 1 0.4923 0.67595 0.716 0.008 0.012 0.264
#> SRR1474018 2 0.2149 0.76729 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1099809 3 0.5344 0.50044 0.032 0.000 0.668 0.300
#> SRR1500555 2 0.0188 0.78888 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1354363 1 0.0779 0.73694 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1391619 3 0.2843 0.74271 0.020 0.000 0.892 0.088
#> SRR1307997 2 0.2149 0.76618 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR663124 2 0.3764 0.75818 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1334670 1 0.2216 0.75861 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR612515 2 0.0336 0.78833 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1092727 2 0.4008 0.75075 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR1364013 2 0.0336 0.78852 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1468553 3 0.0188 0.77965 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1403980 3 0.0524 0.77886 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1420169 3 0.0188 0.77981 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1442800 4 0.6779 0.53686 0.116 0.324 0.000 0.560
#> SRR1359214 2 0.4643 0.72139 0.000 0.656 0.000 0.344
#> SRR1499849 3 0.4136 0.66568 0.016 0.000 0.788 0.196
#> SRR1500030 3 0.6402 0.43893 0.108 0.000 0.624 0.268
#> SRR1093053 3 0.4590 0.65950 0.060 0.000 0.792 0.148
#> SRR1399843 4 0.6928 -0.00162 0.372 0.000 0.116 0.512
#> SRR1380231 3 0.6867 -0.01338 0.104 0.000 0.484 0.412
#> SRR809470 3 0.5649 0.40320 0.036 0.000 0.620 0.344
#> SRR614239 2 0.0188 0.78888 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR613939 2 0.0921 0.78609 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR612971 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1490204 2 0.0707 0.79043 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR811357 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1471672 1 0.0592 0.73160 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR613006 2 0.0188 0.78950 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1469570 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1457354 2 0.2216 0.76439 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1362906 3 0.5810 0.52551 0.072 0.000 0.672 0.256
#> SRR1079023 1 0.2530 0.75866 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR813608 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1096736 1 0.1975 0.72956 0.936 0.000 0.016 0.048
#> SRR1478700 1 0.2796 0.73530 0.892 0.000 0.016 0.092
#> SRR1081543 4 0.6621 0.21629 0.084 0.000 0.408 0.508
#> SRR1384754 1 0.4012 0.70832 0.800 0.000 0.016 0.184
#> SRR612287 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1380317 2 0.5187 0.47140 0.040 0.728 0.004 0.228
#> SRR1315247 2 0.3335 0.70987 0.016 0.856 0.000 0.128
#> SRR1105344 2 0.2216 0.76744 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR658549 2 0.0188 0.78888 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1480240 1 0.5399 0.39348 0.520 0.000 0.012 0.468
#> SRR1084816 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR612551 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1358520 2 0.2081 0.76675 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1419476 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456075 3 0.7793 -0.05962 0.300 0.000 0.424 0.276
#> SRR1389474 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1367005 1 0.0336 0.73631 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1334419 1 0.0592 0.73160 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1417154 3 0.5231 0.51473 0.028 0.000 0.676 0.296
#> SRR1095985 4 0.6591 0.17728 0.080 0.000 0.424 0.496
#> SRR1325771 1 0.6543 0.53320 0.660 0.148 0.008 0.184
#> SRR1360420 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.2216 0.76439 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1332993 1 0.2281 0.75962 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1311833 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR808044 1 0.1888 0.73176 0.940 0.000 0.016 0.044
#> SRR1076916 3 0.5062 0.54143 0.024 0.000 0.692 0.284
#> SRR1356266 1 0.2760 0.75653 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1341983 2 0.0000 0.78930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.2530 0.75984 0.896 0.000 0.004 0.100
#> SRR1072948 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.5597 0.39915 0.516 0.000 0.020 0.464
#> SRR613843 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1469192 1 0.4776 0.67457 0.712 0.000 0.016 0.272
#> SRR1404555 3 0.6337 0.22674 0.068 0.000 0.552 0.380
#> SRR659839 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR659533 2 0.4222 0.74297 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR1362848 1 0.5279 0.64359 0.716 0.000 0.052 0.232
#> SRR1407492 2 0.0188 0.78888 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1455082 2 0.0188 0.78888 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR658362 2 0.1389 0.78852 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR810921 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR662823 2 0.4761 0.70776 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1456375 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.4977 0.42554 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1454868 4 0.7820 0.58507 0.068 0.292 0.088 0.552
#> SRR1474816 2 0.2216 0.76439 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1342002 1 0.4387 0.70353 0.752 0.000 0.012 0.236
#> SRR1088437 2 0.0336 0.78940 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1466400 4 0.6599 0.42668 0.080 0.432 0.000 0.488
#> SRR658921 2 0.2216 0.76439 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1499873 2 0.1867 0.78683 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1101373 1 0.1484 0.71405 0.960 0.020 0.004 0.016
#> SRR1090145 1 0.3444 0.74241 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1379324 1 0.0000 0.74042 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1396166 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.2805 0.74552 0.012 0.000 0.888 0.100
#> SRR1454891 2 0.0469 0.78799 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR663185 2 0.3074 0.77345 0.000 0.848 0.000 0.152
#> SRR811819 1 0.4356 0.67207 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR1318920 1 0.1389 0.74946 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR656758 2 0.3688 0.76042 0.000 0.792 0.000 0.208
#> SRR1474351 1 0.2868 0.75482 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR660450 2 0.2216 0.76439 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1472687 2 0.4543 0.72611 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR1334291 2 0.2149 0.76689 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1415153 2 0.4679 0.71713 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1323271 2 0.2081 0.76578 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1368939 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1443161 1 0.6351 0.51492 0.588 0.000 0.080 0.332
#> SRR614695 2 0.2334 0.76374 0.004 0.908 0.000 0.088
#> SRR1092372 1 0.4500 0.63080 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1474577 1 0.0592 0.73160 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1406582 1 0.0592 0.73160 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR612779 2 0.2469 0.78215 0.000 0.892 0.000 0.108
#> SRR1089006 1 0.0592 0.73160 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1354071 4 0.5696 -0.36108 0.484 0.000 0.024 0.492
#> SRR1105463 3 0.2814 0.72861 0.000 0.000 0.868 0.132
#> SRR811005 2 0.4624 0.72037 0.000 0.660 0.000 0.340
#> SRR1385319 1 0.4977 0.42554 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1325871 3 0.3392 0.71971 0.020 0.000 0.856 0.124
#> SRR1355415 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.1302 0.75314 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1320712 1 0.1174 0.74132 0.968 0.000 0.012 0.020
#> SRR1470075 1 0.0188 0.73842 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1091254 1 0.3942 0.71566 0.764 0.000 0.000 0.236
#> SRR1101397 3 0.7609 0.07594 0.252 0.000 0.476 0.272
#> SRR1321165 1 0.5132 0.44277 0.548 0.000 0.004 0.448
#> SRR1092112 3 0.0336 0.77947 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1417588 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074790 1 0.6396 0.18673 0.648 0.252 0.008 0.092
#> SRR1432106 2 0.4761 0.70776 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR655756 2 0.4761 0.70776 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1458314 1 0.4059 0.72809 0.788 0.000 0.012 0.200
#> SRR1318582 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1080484 2 0.0188 0.78888 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1072749 3 0.6790 0.36967 0.192 0.000 0.608 0.200
#> SRR1078586 1 0.4372 0.68812 0.728 0.000 0.004 0.268
#> SRR1400333 4 0.6860 0.55242 0.084 0.340 0.012 0.564
#> SRR1078834 2 0.3598 0.70305 0.028 0.848 0.000 0.124
#> SRR1417611 2 0.2149 0.76729 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1396840 1 0.5636 0.45195 0.552 0.000 0.024 0.424
#> SRR1465440 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1400530 2 0.2149 0.76618 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR614984 2 0.0188 0.78888 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1324269 4 0.7863 0.18865 0.344 0.000 0.276 0.380
#> SRR1401491 2 0.1022 0.78563 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1319443 1 0.4888 0.51702 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1324349 2 0.2149 0.76458 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1345523 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1500846 1 0.4136 0.72684 0.788 0.000 0.016 0.196
#> SRR661505 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419062 3 0.3052 0.72775 0.004 0.000 0.860 0.136
#> SRR1480131 1 0.6080 0.30289 0.488 0.000 0.044 0.468
#> SRR1421284 2 0.3935 0.69094 0.060 0.840 0.000 0.100
#> SRR1329624 1 0.1302 0.75292 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1315739 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0188 0.78888 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1083286 1 0.4382 0.66893 0.704 0.000 0.000 0.296
#> SRR1091890 4 0.6532 0.18424 0.076 0.000 0.420 0.504
#> SRR1347436 2 0.1637 0.77563 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1327473 1 0.2976 0.75774 0.872 0.000 0.008 0.120
#> SRR1338195 3 0.1174 0.77301 0.012 0.000 0.968 0.020
#> SRR809698 2 0.4761 0.70776 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1457792 1 0.0592 0.73160 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR658271 2 0.3172 0.77299 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1339597 1 0.4883 0.66348 0.696 0.000 0.016 0.288
#> SRR1454842 3 0.3384 0.72290 0.024 0.000 0.860 0.116
#> SRR1322643 1 0.0592 0.73160 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR614887 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1354620 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0336 0.78940 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1105320 1 0.5172 0.52872 0.588 0.000 0.008 0.404
#> SRR1391529 1 0.4837 0.61148 0.648 0.000 0.004 0.348
#> SRR663052 2 0.4543 0.72643 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR1478834 1 0.5080 0.50793 0.576 0.000 0.004 0.420
#> SRR812366 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1435330 3 0.2335 0.75658 0.020 0.000 0.920 0.060
#> SRR615383 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1389157 2 0.4810 0.55665 0.036 0.764 0.004 0.196
#> SRR613568 2 0.2216 0.76439 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR614095 2 0.2011 0.76780 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1103092 1 0.5119 0.47208 0.556 0.000 0.004 0.440
#> SRR1337155 3 0.6347 0.21540 0.068 0.000 0.548 0.384
#> SRR1475345 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR809089 2 0.4761 0.70776 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1446180 4 0.8748 0.56605 0.124 0.188 0.168 0.520
#> SRR1406372 2 0.1940 0.77475 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1339880 3 0.6912 0.41253 0.192 0.000 0.592 0.216
#> SRR1353136 4 0.7024 0.30896 0.128 0.000 0.360 0.512
#> SRR1093906 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.2973 0.77523 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1351104 1 0.0336 0.73631 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1363926 2 0.2676 0.75416 0.012 0.896 0.000 0.092
#> SRR1399861 4 0.8004 0.49494 0.164 0.348 0.024 0.464
#> SRR1338789 1 0.2345 0.75893 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1421420 3 0.0336 0.77934 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1420832 2 0.4679 0.71640 0.000 0.648 0.000 0.352
#> SRR1476231 1 0.0000 0.74042 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 2 0.6334 0.20551 0.060 0.624 0.012 0.304
#> SRR1315041 2 0.2149 0.76618 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR661877 2 0.4761 0.70776 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1443268 3 0.6293 0.44682 0.096 0.000 0.628 0.276
#> SRR1416617 3 0.4678 0.61398 0.024 0.000 0.744 0.232
#> SRR1102443 1 0.2867 0.75842 0.884 0.000 0.012 0.104
#> SRR655672 2 0.0188 0.78888 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1420006 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0188 0.78950 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR613819 2 0.2081 0.76578 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1469432 2 0.2149 0.76618 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR660907 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1465092 2 0.0921 0.78507 0.000 0.972 0.000 0.028
#> SRR1470727 1 0.5130 0.62827 0.652 0.000 0.016 0.332
#> SRR1339153 3 0.2706 0.74682 0.020 0.000 0.900 0.080
#> SRR1472749 3 0.4927 0.57085 0.024 0.000 0.712 0.264
#> SRR1414379 2 0.2149 0.76458 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1431326 1 0.0469 0.73396 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1487278 2 0.2216 0.76439 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1098312 1 0.7580 0.13033 0.476 0.000 0.228 0.296
#> SRR810273 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1376000 2 0.0188 0.78950 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR614467 2 0.0707 0.78966 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR811471 1 0.2704 0.75723 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1478341 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1088606 4 0.8885 0.52981 0.136 0.148 0.216 0.500
#> SRR1479699 1 0.4584 0.66227 0.696 0.000 0.004 0.300
#> SRR1403589 2 0.1716 0.77910 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR812625 2 0.3764 0.75890 0.000 0.784 0.000 0.216
#> SRR1359803 1 0.5143 0.42576 0.540 0.000 0.004 0.456
#> SRR1338988 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1471222 2 0.2281 0.78370 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1378992 1 0.0592 0.73160 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR659427 3 0.9729 -0.25809 0.192 0.224 0.372 0.212
#> SRR1096638 1 0.3032 0.75471 0.868 0.000 0.008 0.124
#> SRR1466619 2 0.2216 0.76744 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR659307 2 0.2871 0.74124 0.032 0.896 0.000 0.072
#> SRR1439994 3 0.6284 0.48040 0.172 0.000 0.664 0.164
#> SRR1454931 1 0.5497 0.38945 0.524 0.000 0.016 0.460
#> SRR1332928 1 0.4857 0.66500 0.700 0.000 0.016 0.284
#> SRR658621 2 0.1118 0.78334 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1095840 1 0.3444 0.74166 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR1458243 3 0.7735 -0.00276 0.280 0.000 0.444 0.276
#> SRR1374270 4 0.7154 0.56547 0.084 0.316 0.028 0.572
#> SRR1470947 2 0.4761 0.70776 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1365598 2 0.2216 0.76439 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR662787 2 0.4543 0.72624 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR1408727 2 0.2149 0.76458 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1456274 1 0.3324 0.75337 0.852 0.000 0.012 0.136
#> SRR817744 1 0.0469 0.74495 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1478744 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1387379 2 0.4761 0.70776 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1102680 3 0.4285 0.67819 0.040 0.000 0.804 0.156
#> SRR1374198 1 0.0000 0.74042 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.7271 0.32462 0.532 0.000 0.192 0.276
#> SRR820049 3 0.0524 0.77886 0.004 0.000 0.988 0.008
#> SRR1375290 3 0.5007 0.61989 0.068 0.000 0.760 0.172
#> SRR818999 3 0.5231 0.37916 0.012 0.000 0.604 0.384
#> SRR1390242 1 0.1867 0.75907 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1401164 2 0.3610 0.76285 0.000 0.800 0.000 0.200
#> SRR1454629 1 0.5602 0.36963 0.508 0.000 0.020 0.472
#> SRR1332187 3 0.4284 0.66067 0.020 0.000 0.780 0.200
#> SRR603365 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.1474 0.78008 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1436207 2 0.0188 0.78888 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1488017 1 0.2216 0.75855 0.908 0.000 0.000 0.092
#> SRR612947 2 0.4250 0.74189 0.000 0.724 0.000 0.276
#> SRR1480384 1 0.5393 0.65598 0.688 0.000 0.044 0.268
#> SRR1364761 2 0.4661 0.71718 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1308086 3 0.7065 0.37120 0.216 0.000 0.572 0.212
#> SRR1441868 1 0.0592 0.73160 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1485380 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.1114 0.72663 0.972 0.008 0.004 0.016
#> SRR615032 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1452356 2 0.3266 0.76996 0.000 0.832 0.000 0.168
#> SRR1442983 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1100346 2 0.2081 0.76675 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1332816 1 0.0592 0.73160 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR612299 2 0.2216 0.76439 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1407386 1 0.2281 0.75880 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1418064 2 0.2216 0.76439 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1309403 4 0.6421 0.53195 0.076 0.368 0.000 0.556
#> SRR1498395 2 0.4761 0.70932 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1079998 3 0.0188 0.77861 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1498885 2 0.4761 0.70776 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1337215 4 0.6453 0.53658 0.080 0.360 0.000 0.560
#> SRR1414749 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365963 3 0.7859 -0.15618 0.352 0.000 0.376 0.272
#> SRR1368030 2 0.1557 0.77974 0.000 0.944 0.000 0.056
#> SRR1419760 4 0.6832 0.55000 0.080 0.348 0.012 0.560
#> SRR1381841 1 0.6396 0.23902 0.468 0.000 0.064 0.468
#> SRR821388 2 0.6906 0.03081 0.096 0.580 0.012 0.312
#> SRR657623 2 0.0188 0.78888 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1094241 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.2730 0.73467 0.896 0.000 0.016 0.088
#> SRR1342829 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.2868 0.75458 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR811333 4 0.6929 0.14511 0.108 0.000 0.440 0.452
#> SRR1311666 2 0.4697 0.71598 0.000 0.644 0.000 0.356
#> SRR1486698 2 0.2011 0.78523 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR1446436 2 0.0188 0.78950 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR815092 1 0.2760 0.75708 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1500149 2 0.1302 0.78312 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1100564 1 0.4535 0.67092 0.704 0.000 0.004 0.292
#> SRR1403072 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR811653 3 0.6664 0.36151 0.128 0.000 0.600 0.272
#> SRR1311348 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1489438 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1435442 2 0.2924 0.74304 0.016 0.884 0.000 0.100
#> SRR1421444 3 0.0895 0.77552 0.004 0.000 0.976 0.020
#> SRR1344010 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1319520 1 0.0592 0.73160 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1444763 1 0.1716 0.75649 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1415026 2 0.4761 0.70776 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1416596 2 0.2216 0.76439 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1485499 2 0.2281 0.77738 0.000 0.904 0.000 0.096
#> SRR1316078 2 0.4454 0.73365 0.000 0.692 0.000 0.308
#> SRR663465 2 0.3907 0.75353 0.000 0.768 0.000 0.232
#> SRR1310094 2 0.2149 0.76618 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR663537 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1486780 1 0.0336 0.73631 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1453950 1 0.4690 0.68498 0.724 0.000 0.016 0.260
#> SRR1087875 1 0.0592 0.73160 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR613318 2 0.3205 0.72621 0.024 0.872 0.000 0.104
#> SRR1332694 1 0.3982 0.71532 0.776 0.000 0.004 0.220
#> SRR1468469 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0188 0.78950 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1120318 1 0.5503 0.38650 0.516 0.000 0.016 0.468
#> SRR1311622 1 0.7748 0.00736 0.440 0.000 0.284 0.276
#> SRR1500931 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387494 3 0.6664 0.36151 0.128 0.000 0.600 0.272
#> SRR1379175 2 0.2973 0.73863 0.020 0.884 0.000 0.096
#> SRR1401909 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.1867 0.77297 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1068832 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.2216 0.76439 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1085712 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1082283 1 0.4482 0.69048 0.728 0.000 0.008 0.264
#> SRR1084276 1 0.7878 -0.11570 0.376 0.000 0.340 0.284
#> SRR1353262 2 0.2149 0.76618 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1437035 1 0.4594 0.67677 0.712 0.000 0.008 0.280
#> SRR1396877 1 0.5290 0.53351 0.584 0.000 0.012 0.404
#> SRR1443026 2 0.4564 0.73872 0.000 0.672 0.000 0.328
#> SRR1417936 1 0.2773 0.75826 0.880 0.000 0.004 0.116
#> SRR1436822 2 0.2216 0.76439 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1101128 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR612983 2 0.4761 0.70776 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1394366 2 0.2924 0.74304 0.016 0.884 0.000 0.100
#> SRR1093218 3 0.3428 0.70947 0.012 0.000 0.844 0.144
#> SRR1077090 3 0.0469 0.77818 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1327430 2 0.2909 0.74241 0.020 0.888 0.000 0.092
#> SRR1088958 1 0.0592 0.73160 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1486931 2 0.0188 0.78950 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1086820 1 0.0817 0.74913 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1383000 1 0.4776 0.67028 0.712 0.000 0.016 0.272
#> SRR1355705 2 0.4730 0.71155 0.000 0.636 0.000 0.364
#> SRR614335 2 0.2814 0.77730 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR660534 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR817094 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1334265 2 0.2149 0.76729 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1456401 2 0.2149 0.76618 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1086393 1 0.4485 0.69333 0.740 0.000 0.012 0.248
#> SRR1351521 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1093100 1 0.5490 0.64179 0.688 0.004 0.040 0.268
#> SRR1309382 1 0.4888 0.52290 0.588 0.000 0.000 0.412
#> SRR1089375 1 0.5459 0.49227 0.552 0.000 0.016 0.432
#> SRR1499482 2 0.0000 0.78930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614719 2 0.0188 0.78888 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1081473 3 0.3862 0.69283 0.024 0.000 0.824 0.152
#> SRR1087415 1 0.0336 0.73631 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1088217 3 0.2921 0.72279 0.000 0.000 0.860 0.140
#> SRR808496 2 0.1118 0.78341 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1336463 2 0.2149 0.76618 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR612359 2 0.0188 0.78888 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1444412 1 0.7795 -0.03269 0.404 0.000 0.344 0.252
#> SRR1074116 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR821846 3 0.1510 0.76884 0.016 0.000 0.956 0.028
#> SRR656095 2 0.4746 0.70932 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR808914 1 0.5288 0.40001 0.520 0.000 0.008 0.472
#> SRR1349099 1 0.0469 0.74094 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1337886 2 0.1389 0.78917 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR813632 1 0.5026 0.64637 0.672 0.000 0.016 0.312
#> SRR1101591 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089713 4 0.7575 0.35831 0.264 0.000 0.252 0.484
#> SRR1453127 3 0.0188 0.77992 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1498354 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.4356 0.67172 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR1315434 3 0.0188 0.77965 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR814747 2 0.2149 0.76729 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1358539 1 0.4283 0.69958 0.740 0.000 0.004 0.256
#> SRR1367807 1 0.0592 0.73160 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1365791 4 0.6586 0.18893 0.080 0.000 0.420 0.500
#> SRR1081519 3 0.3895 0.68191 0.012 0.000 0.804 0.184
#> SRR614707 4 0.6607 -0.01752 0.392 0.064 0.008 0.536
#> SRR1094027 1 0.3208 0.75108 0.848 0.000 0.004 0.148
#> SRR1489092 4 0.6430 0.14862 0.068 0.000 0.428 0.504
#> SRR1079502 3 0.6386 0.22680 0.072 0.000 0.552 0.376
#> SRR1457814 2 0.6575 0.14717 0.068 0.612 0.016 0.304
#> SRR1455127 2 0.1867 0.77581 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR615081 2 0.2216 0.76439 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1327855 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.2081 0.76578 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1394125 3 0.6438 0.03523 0.068 0.000 0.496 0.436
#> SRR1488388 1 0.0000 0.74042 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.2149 0.76458 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR612383 2 0.0336 0.78833 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1477711 1 0.3266 0.74803 0.832 0.000 0.000 0.168
#> SRR1350813 2 0.0592 0.78961 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR612851 2 0.1389 0.78005 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1086349 1 0.1557 0.75518 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR812837 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1340010 1 0.6765 0.44761 0.576 0.000 0.124 0.300
#> SRR1475885 1 0.6025 0.34653 0.540 0.028 0.008 0.424
#> SRR1376334 1 0.4500 0.64982 0.684 0.000 0.000 0.316
#> SRR1399821 1 0.0592 0.73160 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1347042 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR612323 2 0.1940 0.77048 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR612604 2 0.1302 0.78308 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1389546 2 0.4500 0.72762 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR1311877 1 0.2773 0.75824 0.880 0.000 0.004 0.116
#> SRR1465608 1 0.4857 0.66500 0.700 0.000 0.016 0.284
#> SRR1101808 2 0.1211 0.78928 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1414079 3 0.3205 0.72970 0.024 0.000 0.872 0.104
#> SRR1331153 2 0.2216 0.76439 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1078439 3 0.5397 0.57645 0.064 0.000 0.716 0.220
#> SRR2165527 2 0.4761 0.70776 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1351147 4 0.7218 0.53104 0.140 0.296 0.008 0.556
#> SRR1313536 2 0.3975 0.75221 0.000 0.760 0.000 0.240
#> SRR1070308 2 0.2149 0.76618 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1403110 1 0.4643 0.61616 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR1400355 2 0.2530 0.78203 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1401317 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0469 0.74510 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1074622 1 0.4690 0.68231 0.724 0.000 0.016 0.260
#> SRR1465847 3 0.4212 0.65293 0.012 0.000 0.772 0.216
#> SRR1443376 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1471312 3 0.4898 0.57603 0.024 0.000 0.716 0.260
#> SRR1075579 1 0.0000 0.74042 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 4 0.8460 0.57127 0.120 0.248 0.104 0.528
#> SRR612251 2 0.1118 0.78337 0.000 0.964 0.000 0.036
#> SRR1418581 1 0.0592 0.73160 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR658045 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR613214 2 0.0188 0.78888 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR613078 2 0.2149 0.76683 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1472998 3 0.7869 -0.15844 0.312 0.000 0.392 0.296
#> SRR1433452 2 0.2216 0.76439 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1101957 1 0.2197 0.75944 0.916 0.000 0.004 0.080
#> SRR1487993 3 0.6238 0.45058 0.092 0.000 0.632 0.276
#> SRR1465983 2 0.4761 0.70932 0.000 0.628 0.000 0.372
#> SRR1380375 1 0.4560 0.66788 0.700 0.000 0.004 0.296
#> SRR1367566 3 0.4807 0.59246 0.024 0.000 0.728 0.248
#> SRR1316151 2 0.2216 0.76439 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1417547 2 0.1867 0.77182 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR659389 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1490270 2 0.2149 0.76618 0.000 0.912 0.000 0.088
#> SRR1398207 3 0.6334 0.02545 0.060 0.000 0.484 0.456
#> SRR1358755 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.78930 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1451796 2 0.4543 0.72648 0.000 0.676 0.000 0.324
#> SRR1369172 1 0.2011 0.75795 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR615982 2 0.1474 0.77887 0.000 0.948 0.000 0.052
#> SRR1480431 2 0.2814 0.77728 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR1429825 2 0.2081 0.76578 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1102393 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1071313 1 0.4831 0.66823 0.704 0.000 0.016 0.280
#> SRR808351 1 0.4776 0.67028 0.712 0.000 0.016 0.272
#> SRR1317513 1 0.3123 0.74961 0.844 0.000 0.000 0.156
#> SRR1480501 3 0.0188 0.77981 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1081910 1 0.5229 0.49951 0.564 0.000 0.008 0.428
#> SRR1086611 2 0.6898 -0.32539 0.072 0.484 0.012 0.432
#> SRR1392571 2 0.0188 0.78888 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1311441 1 0.0592 0.73160 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR808152 1 0.0000 0.74042 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.0469 0.79019 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1321011 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1500598 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1379343 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1389108 1 0.0592 0.73160 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1376228 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1399757 2 0.7877 -0.30951 0.240 0.472 0.008 0.280
#> SRR1358060 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.7830 -0.12022 0.324 0.000 0.404 0.272
#> SRR613557 2 0.0336 0.78833 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR809831 1 0.5564 0.46214 0.544 0.000 0.020 0.436
#> SRR1429387 3 0.0000 0.78016 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.3895 0.73594 0.804 0.000 0.012 0.184
#> SRR1071644 1 0.0000 0.74042 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 4 0.7073 0.21540 0.124 0.000 0.412 0.464
#> SRR1072031 2 0.4776 0.70804 0.000 0.624 0.000 0.376
#> SRR1374671 2 0.1940 0.78590 0.000 0.924 0.000 0.076
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 1 0.8155 -0.2934 0.416 0.000 0.180 0.240 0.164
#> SRR1404105 1 0.2074 0.7200 0.896 0.000 0.000 0.104 0.000
#> SRR2164936 5 0.4088 0.9071 0.000 0.368 0.000 0.000 0.632
#> SRR1472057 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614491 2 0.4934 0.6553 0.000 0.708 0.000 0.188 0.104
#> SRR1069376 1 0.0000 0.7440 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR811964 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1361415 2 0.2929 0.6398 0.000 0.820 0.000 0.000 0.180
#> SRR1345715 1 0.1915 0.7210 0.928 0.000 0.000 0.040 0.032
#> SRR1328073 1 0.1544 0.7309 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1394209 1 0.4886 0.5254 0.740 0.108 0.004 0.144 0.004
#> SRR1474018 2 0.0880 0.7184 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1099809 3 0.5858 0.6267 0.008 0.000 0.632 0.204 0.156
#> SRR1500555 2 0.4934 0.6553 0.000 0.708 0.000 0.188 0.104
#> SRR1354363 1 0.1012 0.7401 0.968 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR1391619 3 0.3120 0.8079 0.028 0.000 0.876 0.064 0.032
#> SRR1307997 2 0.0404 0.7154 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR663124 2 0.5819 0.5143 0.000 0.612 0.000 0.188 0.200
#> SRR1334670 1 0.3752 0.4922 0.708 0.000 0.000 0.292 0.000
#> SRR612515 2 0.4934 0.6553 0.000 0.708 0.000 0.188 0.104
#> SRR1092727 2 0.5580 0.4548 0.000 0.632 0.000 0.132 0.236
#> SRR1364013 2 0.4430 0.6722 0.000 0.752 0.000 0.172 0.076
#> SRR1468553 3 0.0162 0.8404 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1403980 3 0.1270 0.8305 0.000 0.000 0.948 0.052 0.000
#> SRR1420169 3 0.0404 0.8397 0.000 0.000 0.988 0.012 0.000
#> SRR1442800 4 0.6627 0.4478 0.216 0.300 0.000 0.480 0.004
#> SRR1359214 5 0.4242 0.7637 0.000 0.428 0.000 0.000 0.572
#> SRR1499849 3 0.4527 0.7023 0.000 0.000 0.732 0.204 0.064
#> SRR1500030 3 0.7769 0.4459 0.132 0.000 0.464 0.140 0.264
#> SRR1093053 3 0.4617 0.7332 0.060 0.000 0.776 0.132 0.032
#> SRR1399843 4 0.5886 0.6409 0.272 0.000 0.144 0.584 0.000
#> SRR1380231 4 0.6274 0.5917 0.208 0.000 0.256 0.536 0.000
#> SRR809470 3 0.4536 0.5406 0.016 0.000 0.656 0.324 0.004
#> SRR614239 2 0.4934 0.6553 0.000 0.708 0.000 0.188 0.104
#> SRR613939 2 0.1792 0.7056 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR612971 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1490204 2 0.2966 0.6028 0.000 0.816 0.000 0.000 0.184
#> SRR811357 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1471672 1 0.1915 0.7210 0.928 0.000 0.000 0.040 0.032
#> SRR613006 2 0.1792 0.7051 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1469570 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1457354 2 0.0404 0.7126 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1362906 3 0.6848 0.5744 0.048 0.000 0.548 0.140 0.264
#> SRR1079023 1 0.2891 0.6508 0.824 0.000 0.000 0.176 0.000
#> SRR813608 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1096736 1 0.1211 0.7451 0.960 0.000 0.000 0.024 0.016
#> SRR1478700 1 0.3115 0.6866 0.852 0.000 0.000 0.112 0.036
#> SRR1081543 4 0.6455 0.5585 0.312 0.000 0.204 0.484 0.000
#> SRR1384754 1 0.3888 0.6263 0.800 0.000 0.000 0.136 0.064
#> SRR612287 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1380317 2 0.5709 0.3760 0.184 0.652 0.000 0.156 0.008
#> SRR1315247 2 0.3241 0.6119 0.104 0.856 0.000 0.028 0.012
#> SRR1105344 2 0.0162 0.7152 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR658549 2 0.5159 0.6365 0.000 0.688 0.000 0.188 0.124
#> SRR1480240 4 0.3662 0.6804 0.252 0.000 0.000 0.744 0.004
#> SRR1084816 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR612551 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1358520 2 0.3283 0.6993 0.000 0.832 0.000 0.140 0.028
#> SRR1419476 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456075 3 0.7942 0.3952 0.144 0.000 0.440 0.152 0.264
#> SRR1389474 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1367005 1 0.0000 0.7440 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.1915 0.7210 0.928 0.000 0.000 0.040 0.032
#> SRR1417154 3 0.3789 0.6893 0.016 0.000 0.760 0.224 0.000
#> SRR1095985 4 0.6080 0.6077 0.200 0.000 0.228 0.572 0.000
#> SRR1325771 1 0.6232 0.1640 0.488 0.380 0.000 0.128 0.004
#> SRR1360420 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0290 0.7142 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1332993 1 0.1544 0.7341 0.932 0.000 0.000 0.068 0.000
#> SRR1311833 5 0.3983 0.9646 0.000 0.340 0.000 0.000 0.660
#> SRR808044 1 0.1608 0.7297 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000
#> SRR1076916 3 0.3732 0.7133 0.008 0.000 0.776 0.208 0.008
#> SRR1356266 1 0.3586 0.5417 0.736 0.000 0.000 0.264 0.000
#> SRR1341983 2 0.3825 0.6733 0.000 0.804 0.000 0.060 0.136
#> SRR1456114 1 0.1478 0.7350 0.936 0.000 0.000 0.064 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472370 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480176 4 0.5156 0.6772 0.276 0.000 0.064 0.656 0.004
#> SRR613843 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1469192 1 0.3890 0.5443 0.736 0.000 0.000 0.252 0.012
#> SRR1404555 4 0.6635 0.4491 0.224 0.000 0.360 0.416 0.000
#> SRR659839 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR659533 2 0.5775 0.4132 0.000 0.608 0.000 0.148 0.244
#> SRR1362848 1 0.6003 0.4399 0.696 0.048 0.048 0.172 0.036
#> SRR1407492 2 0.4886 0.6581 0.000 0.712 0.000 0.188 0.100
#> SRR1455082 2 0.4855 0.6443 0.000 0.720 0.000 0.168 0.112
#> SRR658362 2 0.5672 0.5606 0.000 0.632 0.000 0.188 0.180
#> SRR810921 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR662823 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1456375 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818232 4 0.3561 0.6776 0.260 0.000 0.000 0.740 0.000
#> SRR1454868 4 0.7524 0.5315 0.296 0.176 0.044 0.472 0.012
#> SRR1474816 2 0.0510 0.7111 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1342002 1 0.2732 0.6657 0.840 0.000 0.000 0.160 0.000
#> SRR1088437 2 0.3837 0.3949 0.000 0.692 0.000 0.000 0.308
#> SRR1466400 2 0.6958 -0.2970 0.236 0.436 0.000 0.316 0.012
#> SRR658921 2 0.0510 0.7111 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1499873 2 0.3752 0.4079 0.000 0.708 0.000 0.000 0.292
#> SRR1101373 1 0.1822 0.7261 0.936 0.004 0.000 0.036 0.024
#> SRR1090145 1 0.4307 -0.1888 0.500 0.000 0.000 0.500 0.000
#> SRR1379324 1 0.0794 0.7444 0.972 0.000 0.000 0.028 0.000
#> SRR1345307 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1396166 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0880 0.8367 0.000 0.000 0.968 0.032 0.000
#> SRR1454891 2 0.4886 0.6581 0.000 0.712 0.000 0.188 0.100
#> SRR663185 2 0.5687 0.4922 0.000 0.628 0.000 0.164 0.208
#> SRR811819 4 0.4088 0.5511 0.368 0.000 0.000 0.632 0.000
#> SRR1318920 1 0.4045 0.2575 0.644 0.000 0.000 0.356 0.000
#> SRR656758 2 0.3796 0.3770 0.000 0.700 0.000 0.000 0.300
#> SRR1474351 1 0.2966 0.6501 0.816 0.000 0.000 0.184 0.000
#> SRR660450 2 0.0510 0.7111 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1472687 2 0.4249 -0.2115 0.000 0.568 0.000 0.000 0.432
#> SRR1334291 2 0.0794 0.7167 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1415153 2 0.4307 -0.5272 0.000 0.504 0.000 0.000 0.496
#> SRR1323271 2 0.0290 0.7131 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1368939 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1443161 1 0.7604 -0.3651 0.432 0.000 0.140 0.336 0.092
#> SRR614695 2 0.0613 0.7114 0.008 0.984 0.000 0.004 0.004
#> SRR1092372 4 0.4101 0.5394 0.372 0.000 0.000 0.628 0.000
#> SRR1474577 1 0.1915 0.7210 0.928 0.000 0.000 0.040 0.032
#> SRR1406582 1 0.1915 0.7210 0.928 0.000 0.000 0.040 0.032
#> SRR612779 2 0.3730 0.4138 0.000 0.712 0.000 0.000 0.288
#> SRR1089006 1 0.1915 0.7210 0.928 0.000 0.000 0.040 0.032
#> SRR1354071 4 0.3999 0.6897 0.240 0.000 0.020 0.740 0.000
#> SRR1105463 3 0.1478 0.8276 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR811005 2 0.4287 -0.3332 0.000 0.540 0.000 0.000 0.460
#> SRR1385319 4 0.3561 0.6776 0.260 0.000 0.000 0.740 0.000
#> SRR1325871 3 0.3960 0.7725 0.044 0.000 0.824 0.100 0.032
#> SRR1355415 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0609 0.7450 0.980 0.000 0.000 0.020 0.000
#> SRR1320712 1 0.1117 0.7459 0.964 0.000 0.000 0.020 0.016
#> SRR1470075 1 0.0324 0.7448 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1091254 4 0.4210 0.4748 0.412 0.000 0.000 0.588 0.000
#> SRR1101397 3 0.7005 0.5555 0.052 0.000 0.532 0.152 0.264
#> SRR1321165 4 0.3636 0.6729 0.272 0.000 0.000 0.728 0.000
#> SRR1092112 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074790 1 0.5098 0.3558 0.660 0.276 0.000 0.060 0.004
#> SRR1432106 5 0.3949 0.9756 0.000 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR655756 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1458314 1 0.3194 0.6723 0.832 0.000 0.000 0.148 0.020
#> SRR1318582 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1080484 2 0.4421 0.6188 0.000 0.748 0.000 0.068 0.184
#> SRR1072749 3 0.6941 0.5513 0.052 0.000 0.540 0.144 0.264
#> SRR1078586 1 0.4278 0.0101 0.548 0.000 0.000 0.452 0.000
#> SRR1400333 4 0.6608 0.5144 0.276 0.228 0.000 0.492 0.004
#> SRR1078834 2 0.4342 0.5068 0.188 0.760 0.000 0.044 0.008
#> SRR1417611 2 0.0290 0.7179 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1396840 4 0.3636 0.6729 0.272 0.000 0.000 0.728 0.000
#> SRR1465440 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1400530 2 0.0404 0.7126 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR614984 2 0.4886 0.6581 0.000 0.712 0.000 0.188 0.100
#> SRR1324269 4 0.6653 0.5973 0.292 0.000 0.188 0.508 0.012
#> SRR1401491 2 0.1792 0.7062 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1319443 4 0.3636 0.6729 0.272 0.000 0.000 0.728 0.000
#> SRR1324349 2 0.0771 0.7185 0.004 0.976 0.000 0.000 0.020
#> SRR1345523 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1500846 1 0.3323 0.6814 0.844 0.000 0.000 0.100 0.056
#> SRR661505 3 0.0162 0.8403 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1419062 3 0.2233 0.8089 0.004 0.000 0.892 0.104 0.000
#> SRR1480131 4 0.3762 0.6832 0.244 0.000 0.004 0.748 0.004
#> SRR1421284 2 0.5069 0.5851 0.104 0.720 0.004 0.168 0.004
#> SRR1329624 1 0.1851 0.7227 0.912 0.000 0.000 0.088 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.4934 0.6545 0.000 0.708 0.000 0.188 0.104
#> SRR1083286 4 0.4437 0.6401 0.316 0.000 0.020 0.664 0.000
#> SRR1091890 4 0.6486 0.5535 0.308 0.000 0.212 0.480 0.000
#> SRR1347436 2 0.4199 0.6838 0.000 0.772 0.000 0.160 0.068
#> SRR1327473 1 0.1270 0.7387 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1338195 3 0.1216 0.8365 0.000 0.000 0.960 0.020 0.020
#> SRR809698 5 0.3966 0.9703 0.000 0.336 0.000 0.000 0.664
#> SRR1457792 1 0.1741 0.7262 0.936 0.000 0.000 0.040 0.024
#> SRR658271 2 0.3003 0.5868 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1339597 1 0.4126 0.2694 0.620 0.000 0.000 0.380 0.000
#> SRR1454842 3 0.3954 0.7784 0.044 0.000 0.828 0.088 0.040
#> SRR1322643 1 0.0703 0.7420 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR614887 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354620 3 0.0162 0.8403 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR615056 2 0.3586 0.5097 0.000 0.736 0.000 0.000 0.264
#> SRR1105320 4 0.4930 0.5310 0.424 0.000 0.028 0.548 0.000
#> SRR1391529 4 0.3949 0.6405 0.300 0.000 0.000 0.696 0.004
#> SRR663052 2 0.6016 0.1715 0.000 0.548 0.000 0.140 0.312
#> SRR1478834 4 0.3635 0.6816 0.248 0.000 0.000 0.748 0.004
#> SRR812366 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1435330 3 0.1478 0.8279 0.000 0.000 0.936 0.064 0.000
#> SRR615383 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1389157 2 0.4446 0.4957 0.192 0.752 0.000 0.048 0.008
#> SRR613568 2 0.0510 0.7111 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR614095 2 0.0794 0.7187 0.000 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1103092 4 0.3635 0.6816 0.248 0.000 0.000 0.748 0.004
#> SRR1337155 4 0.6575 0.5385 0.236 0.000 0.300 0.464 0.000
#> SRR1475345 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR809089 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1446180 4 0.7041 0.6115 0.224 0.156 0.056 0.560 0.004
#> SRR1406372 2 0.1732 0.7042 0.000 0.920 0.000 0.000 0.080
#> SRR1339880 3 0.7942 0.4073 0.144 0.000 0.440 0.152 0.264
#> SRR1353136 4 0.7284 0.5157 0.340 0.000 0.188 0.432 0.040
#> SRR1093906 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.4101 0.1360 0.000 0.628 0.000 0.000 0.372
#> SRR1351104 1 0.0290 0.7439 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1363926 2 0.0798 0.7082 0.008 0.976 0.000 0.000 0.016
#> SRR1399861 4 0.8426 0.3912 0.336 0.216 0.024 0.344 0.080
#> SRR1338789 1 0.2690 0.6727 0.844 0.000 0.000 0.156 0.000
#> SRR1421420 3 0.1043 0.8341 0.000 0.000 0.960 0.040 0.000
#> SRR1420832 5 0.4249 0.7479 0.000 0.432 0.000 0.000 0.568
#> SRR1476231 1 0.0290 0.7454 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1352870 2 0.5739 0.3276 0.244 0.624 0.000 0.128 0.004
#> SRR1315041 2 0.0000 0.7160 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR661877 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1443268 3 0.6371 0.5981 0.016 0.000 0.568 0.152 0.264
#> SRR1416617 3 0.2377 0.7910 0.000 0.000 0.872 0.128 0.000
#> SRR1102443 1 0.3053 0.6990 0.872 0.044 0.008 0.076 0.000
#> SRR655672 2 0.4734 0.6634 0.000 0.724 0.000 0.188 0.088
#> SRR1420006 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.1792 0.7051 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR613819 2 0.1205 0.7031 0.040 0.956 0.000 0.000 0.004
#> SRR1469432 2 0.0609 0.7154 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR660907 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1465092 2 0.4216 0.6798 0.000 0.780 0.000 0.120 0.100
#> SRR1470727 4 0.5605 0.3600 0.468 0.000 0.052 0.472 0.008
#> SRR1339153 3 0.2735 0.8016 0.036 0.000 0.880 0.084 0.000
#> SRR1472749 3 0.5057 0.7260 0.036 0.000 0.748 0.128 0.088
#> SRR1414379 2 0.3099 0.6970 0.028 0.848 0.000 0.124 0.000
#> SRR1431326 1 0.1648 0.7271 0.940 0.000 0.000 0.040 0.020
#> SRR1487278 2 0.0510 0.7111 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1098312 1 0.7686 -0.4478 0.384 0.000 0.176 0.364 0.076
#> SRR810273 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1376000 2 0.1792 0.7051 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR614467 2 0.5541 0.5829 0.000 0.648 0.000 0.188 0.164
#> SRR811471 1 0.3966 0.4053 0.664 0.000 0.000 0.336 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088606 4 0.6961 0.6160 0.216 0.152 0.056 0.572 0.004
#> SRR1479699 4 0.4171 0.5547 0.396 0.000 0.000 0.604 0.000
#> SRR1403589 2 0.1197 0.7140 0.000 0.952 0.000 0.000 0.048
#> SRR812625 2 0.4150 0.0415 0.000 0.612 0.000 0.000 0.388
#> SRR1359803 4 0.3586 0.6765 0.264 0.000 0.000 0.736 0.000
#> SRR1338988 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1471222 2 0.3003 0.6001 0.000 0.812 0.000 0.000 0.188
#> SRR1378992 1 0.1915 0.7210 0.928 0.000 0.000 0.040 0.032
#> SRR659427 4 0.9127 0.4436 0.320 0.132 0.112 0.340 0.096
#> SRR1096638 1 0.1197 0.7405 0.952 0.000 0.000 0.048 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.7160 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR659307 2 0.4994 0.6486 0.000 0.696 0.000 0.208 0.096
#> SRR1439994 3 0.6249 0.6121 0.016 0.000 0.584 0.140 0.260
#> SRR1454931 4 0.3561 0.6776 0.260 0.000 0.000 0.740 0.000
#> SRR1332928 1 0.4552 0.4766 0.696 0.000 0.000 0.264 0.040
#> SRR658621 2 0.4350 0.6499 0.000 0.764 0.000 0.084 0.152
#> SRR1095840 4 0.4291 0.3078 0.464 0.000 0.000 0.536 0.000
#> SRR1458243 3 0.7221 0.5322 0.068 0.000 0.516 0.152 0.264
#> SRR1374270 4 0.7602 0.4764 0.324 0.208 0.040 0.420 0.008
#> SRR1470947 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1365598 2 0.0510 0.7111 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR662787 2 0.4291 -0.3603 0.000 0.536 0.000 0.000 0.464
#> SRR1408727 2 0.3606 0.6785 0.024 0.808 0.000 0.164 0.004
#> SRR1456274 1 0.1732 0.7256 0.920 0.000 0.000 0.080 0.000
#> SRR817744 1 0.0703 0.7438 0.976 0.000 0.000 0.024 0.000
#> SRR1478744 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1387379 5 0.3966 0.9695 0.000 0.336 0.000 0.000 0.664
#> SRR1102680 3 0.6114 0.1318 0.192 0.000 0.564 0.244 0.000
#> SRR1374198 1 0.3336 0.5647 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1445856 3 0.8015 0.2976 0.164 0.000 0.448 0.172 0.216
#> SRR820049 3 0.1121 0.8327 0.000 0.000 0.956 0.044 0.000
#> SRR1375290 3 0.7279 -0.1294 0.252 0.000 0.460 0.252 0.036
#> SRR818999 3 0.6477 -0.2972 0.184 0.000 0.424 0.392 0.000
#> SRR1390242 1 0.3857 0.3947 0.688 0.000 0.000 0.312 0.000
#> SRR1401164 2 0.4015 0.2135 0.000 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1454629 4 0.3635 0.6841 0.248 0.000 0.000 0.748 0.004
#> SRR1332187 3 0.2233 0.8075 0.004 0.000 0.892 0.104 0.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR657833 2 0.1341 0.7141 0.000 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1436207 2 0.4891 0.6605 0.000 0.716 0.000 0.172 0.112
#> SRR1488017 1 0.2329 0.7016 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR612947 2 0.4227 -0.1329 0.000 0.580 0.000 0.000 0.420
#> SRR1480384 1 0.6518 0.3620 0.632 0.000 0.084 0.164 0.120
#> SRR1364761 5 0.4171 0.8483 0.000 0.396 0.000 0.000 0.604
#> SRR1308086 3 0.7942 0.4087 0.144 0.000 0.440 0.152 0.264
#> SRR1441868 1 0.1741 0.7262 0.936 0.000 0.000 0.040 0.024
#> SRR1485380 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.1741 0.7262 0.936 0.000 0.000 0.040 0.024
#> SRR615032 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1452356 2 0.4074 0.1759 0.000 0.636 0.000 0.000 0.364
#> SRR1442983 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1100346 2 0.3391 0.6758 0.000 0.800 0.000 0.188 0.012
#> SRR1332816 1 0.1915 0.7210 0.928 0.000 0.000 0.040 0.032
#> SRR612299 2 0.0798 0.7082 0.008 0.976 0.000 0.000 0.016
#> SRR1407386 1 0.2690 0.6624 0.844 0.000 0.000 0.156 0.000
#> SRR1418064 2 0.0510 0.7111 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1309403 4 0.7017 0.3458 0.236 0.376 0.000 0.376 0.012
#> SRR1498395 5 0.3983 0.9640 0.000 0.340 0.000 0.000 0.660
#> SRR1079998 3 0.2624 0.7968 0.000 0.000 0.872 0.012 0.116
#> SRR1498885 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1337215 4 0.7018 0.3837 0.240 0.348 0.000 0.400 0.012
#> SRR1414749 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365963 3 0.7302 0.5122 0.076 0.000 0.512 0.152 0.260
#> SRR1368030 2 0.2561 0.6732 0.000 0.856 0.000 0.000 0.144
#> SRR1419760 4 0.6760 0.4649 0.304 0.244 0.000 0.448 0.004
#> SRR1381841 4 0.3534 0.6795 0.256 0.000 0.000 0.744 0.000
#> SRR821388 2 0.7601 0.3364 0.148 0.500 0.028 0.280 0.044
#> SRR657623 2 0.4428 0.6529 0.000 0.760 0.000 0.096 0.144
#> SRR1094241 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.3276 0.6723 0.836 0.000 0.000 0.132 0.032
#> SRR1342829 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.3395 0.5936 0.764 0.000 0.000 0.236 0.000
#> SRR811333 4 0.6063 0.6305 0.256 0.000 0.176 0.568 0.000
#> SRR1311666 2 0.4294 -0.4383 0.000 0.532 0.000 0.000 0.468
#> SRR1486698 2 0.5382 0.5127 0.000 0.660 0.000 0.128 0.212
#> SRR1446436 2 0.1851 0.7062 0.000 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR815092 1 0.4161 0.2583 0.608 0.000 0.000 0.392 0.000
#> SRR1500149 2 0.1478 0.7132 0.000 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR1100564 4 0.4252 0.6765 0.280 0.000 0.020 0.700 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811653 1 0.8750 -0.3676 0.336 0.016 0.224 0.272 0.152
#> SRR1311348 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1489438 5 0.3949 0.9756 0.000 0.332 0.000 0.000 0.668
#> SRR1435442 2 0.1087 0.7025 0.008 0.968 0.000 0.008 0.016
#> SRR1421444 3 0.0609 0.8380 0.000 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1344010 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1319520 1 0.1741 0.7262 0.936 0.000 0.000 0.040 0.024
#> SRR1444763 1 0.3684 0.5090 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR1415026 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1416596 2 0.0404 0.7126 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1485499 2 0.3305 0.5757 0.000 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1316078 5 0.4273 0.7016 0.000 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR663465 2 0.4161 0.0255 0.000 0.608 0.000 0.000 0.392
#> SRR1310094 2 0.0162 0.7152 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR663537 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1486780 1 0.0162 0.7440 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1453950 1 0.3835 0.5423 0.732 0.000 0.000 0.260 0.008
#> SRR1087875 1 0.1915 0.7210 0.928 0.000 0.000 0.040 0.032
#> SRR613318 2 0.4130 0.6483 0.024 0.768 0.000 0.196 0.012
#> SRR1332694 1 0.3636 0.5323 0.728 0.000 0.000 0.272 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR818670 2 0.3336 0.5545 0.000 0.772 0.000 0.000 0.228
#> SRR1120318 4 0.3607 0.6822 0.244 0.000 0.000 0.752 0.004
#> SRR1311622 3 0.8136 0.3283 0.176 0.000 0.408 0.152 0.264
#> SRR1500931 3 0.0162 0.8404 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1387494 3 0.8185 0.2969 0.172 0.000 0.400 0.164 0.264
#> SRR1379175 2 0.4149 0.5113 0.188 0.768 0.000 0.040 0.004
#> SRR1401909 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0880 0.7175 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR1068832 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.0404 0.7126 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1085712 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1082283 4 0.5386 0.6047 0.372 0.000 0.064 0.564 0.000
#> SRR1084276 4 0.6536 0.3517 0.196 0.000 0.392 0.412 0.000
#> SRR1353262 2 0.0703 0.7145 0.000 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1437035 1 0.4383 0.0254 0.572 0.000 0.000 0.424 0.004
#> SRR1396877 4 0.4142 0.6878 0.252 0.000 0.016 0.728 0.004
#> SRR1443026 2 0.4273 -0.4340 0.000 0.552 0.000 0.000 0.448
#> SRR1417936 1 0.1671 0.7320 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1436822 2 0.0932 0.7071 0.020 0.972 0.000 0.004 0.004
#> SRR1101128 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363886 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR612983 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1394366 2 0.0912 0.7060 0.012 0.972 0.000 0.000 0.016
#> SRR1093218 3 0.5105 0.6877 0.000 0.000 0.660 0.076 0.264
#> SRR1077090 3 0.3343 0.7654 0.000 0.000 0.812 0.016 0.172
#> SRR1327430 2 0.0671 0.7104 0.016 0.980 0.000 0.000 0.004
#> SRR1088958 1 0.1915 0.7210 0.928 0.000 0.000 0.040 0.032
#> SRR1486931 2 0.1792 0.7051 0.000 0.916 0.000 0.000 0.084
#> SRR1086820 1 0.2280 0.7075 0.880 0.000 0.000 0.120 0.000
#> SRR1383000 1 0.4404 0.5822 0.760 0.000 0.000 0.152 0.088
#> SRR1355705 5 0.4227 0.7825 0.000 0.420 0.000 0.000 0.580
#> SRR614335 2 0.5625 0.5077 0.000 0.636 0.000 0.160 0.204
#> SRR660534 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR817094 5 0.3966 0.9697 0.000 0.336 0.000 0.000 0.664
#> SRR1334265 2 0.0000 0.7160 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.0404 0.7166 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1086393 1 0.3480 0.5248 0.752 0.000 0.000 0.248 0.000
#> SRR1351521 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1093100 1 0.6212 0.4225 0.684 0.048 0.048 0.172 0.048
#> SRR1309382 4 0.3612 0.6751 0.268 0.000 0.000 0.732 0.000
#> SRR1089375 4 0.4589 0.6881 0.248 0.000 0.048 0.704 0.000
#> SRR1499482 2 0.3445 0.6705 0.000 0.824 0.000 0.036 0.140
#> SRR614719 2 0.4934 0.6553 0.000 0.708 0.000 0.188 0.104
#> SRR1081473 3 0.3624 0.7810 0.020 0.000 0.836 0.112 0.032
#> SRR1087415 1 0.0451 0.7451 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1088217 3 0.1571 0.8277 0.000 0.000 0.936 0.060 0.004
#> SRR808496 2 0.4734 0.6633 0.000 0.724 0.000 0.188 0.088
#> SRR1336463 2 0.0162 0.7152 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612359 2 0.4886 0.6581 0.000 0.712 0.000 0.188 0.100
#> SRR1444412 4 0.6667 0.4760 0.236 0.000 0.348 0.416 0.000
#> SRR1074116 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.1582 0.8334 0.000 0.000 0.944 0.028 0.028
#> SRR656095 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR808914 4 0.3635 0.6842 0.248 0.000 0.000 0.748 0.004
#> SRR1349099 1 0.3684 0.4208 0.720 0.000 0.000 0.280 0.000
#> SRR1337886 2 0.3913 0.3225 0.000 0.676 0.000 0.000 0.324
#> SRR813632 4 0.7332 0.4529 0.360 0.000 0.244 0.368 0.028
#> SRR1101591 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089713 4 0.4295 0.6909 0.236 0.000 0.028 0.732 0.004
#> SRR1453127 3 0.0162 0.8404 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1498354 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313831 4 0.4150 0.5092 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1315434 3 0.0510 0.8387 0.000 0.000 0.984 0.016 0.000
#> SRR814747 2 0.0609 0.7177 0.000 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1358539 4 0.4227 0.4343 0.420 0.000 0.000 0.580 0.000
#> SRR1367807 1 0.1915 0.7210 0.928 0.000 0.000 0.040 0.032
#> SRR1365791 4 0.6071 0.6042 0.192 0.000 0.236 0.572 0.000
#> SRR1081519 3 0.2230 0.8017 0.000 0.000 0.884 0.116 0.000
#> SRR614707 4 0.6311 0.5448 0.320 0.176 0.000 0.504 0.000
#> SRR1094027 1 0.2329 0.7078 0.876 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1489092 4 0.6349 0.5837 0.232 0.000 0.244 0.524 0.000
#> SRR1079502 4 0.6612 0.4344 0.216 0.000 0.372 0.412 0.000
#> SRR1457814 2 0.8441 -0.5052 0.304 0.320 0.036 0.288 0.052
#> SRR1455127 2 0.0880 0.7175 0.000 0.968 0.000 0.000 0.032
#> SRR615081 2 0.0671 0.7099 0.004 0.980 0.000 0.000 0.016
#> SRR1327855 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.7160 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1394125 4 0.6323 0.4327 0.164 0.000 0.360 0.476 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.7440 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.2673 0.7146 0.016 0.892 0.000 0.076 0.016
#> SRR612383 2 0.4934 0.6553 0.000 0.708 0.000 0.188 0.104
#> SRR1477711 1 0.3612 0.5307 0.732 0.000 0.000 0.268 0.000
#> SRR1350813 2 0.5301 0.5667 0.000 0.676 0.000 0.148 0.176
#> SRR612851 2 0.4593 0.6667 0.000 0.736 0.000 0.184 0.080
#> SRR1086349 1 0.1121 0.7456 0.956 0.000 0.000 0.044 0.000
#> SRR812837 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1340010 1 0.7833 -0.4420 0.376 0.000 0.176 0.356 0.092
#> SRR1475885 1 0.6266 -0.3247 0.472 0.152 0.000 0.376 0.000
#> SRR1376334 4 0.4150 0.5046 0.388 0.000 0.000 0.612 0.000
#> SRR1399821 1 0.0703 0.7420 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1347042 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612323 2 0.4221 0.6699 0.004 0.764 0.000 0.188 0.044
#> SRR612604 2 0.1121 0.7175 0.000 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1389546 2 0.4268 -0.2578 0.000 0.556 0.000 0.000 0.444
#> SRR1311877 1 0.1671 0.7310 0.924 0.000 0.000 0.076 0.000
#> SRR1465608 1 0.6374 -0.0098 0.564 0.000 0.044 0.312 0.080
#> SRR1101808 2 0.4101 0.3054 0.000 0.664 0.000 0.004 0.332
#> SRR1414079 3 0.2437 0.8215 0.004 0.000 0.904 0.060 0.032
#> SRR1331153 2 0.0510 0.7111 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1078439 3 0.6436 -0.0529 0.232 0.000 0.504 0.264 0.000
#> SRR2165527 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1351147 4 0.6597 0.5098 0.268 0.232 0.000 0.496 0.004
#> SRR1313536 2 0.3305 0.5350 0.000 0.776 0.000 0.000 0.224
#> SRR1070308 2 0.0324 0.7142 0.004 0.992 0.000 0.000 0.004
#> SRR1403110 4 0.3796 0.6442 0.300 0.000 0.000 0.700 0.000
#> SRR1400355 2 0.3480 0.4950 0.000 0.752 0.000 0.000 0.248
#> SRR1401317 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.1410 0.7400 0.940 0.000 0.000 0.060 0.000
#> SRR1074622 1 0.4179 0.6021 0.776 0.000 0.000 0.152 0.072
#> SRR1465847 3 0.2674 0.7812 0.000 0.000 0.856 0.140 0.004
#> SRR1443376 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1471312 3 0.2929 0.7686 0.008 0.000 0.840 0.152 0.000
#> SRR1075579 1 0.0290 0.7443 0.992 0.000 0.000 0.008 0.000
#> SRR1090881 4 0.7333 0.5528 0.308 0.148 0.056 0.484 0.004
#> SRR612251 2 0.4786 0.6617 0.000 0.720 0.000 0.188 0.092
#> SRR1418581 1 0.1741 0.7262 0.936 0.000 0.000 0.040 0.024
#> SRR658045 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR613214 2 0.4886 0.6572 0.000 0.712 0.000 0.188 0.100
#> SRR613078 2 0.0510 0.7146 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1472998 3 0.8217 0.1112 0.200 0.000 0.408 0.224 0.168
#> SRR1433452 2 0.0510 0.7143 0.000 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1101957 1 0.0963 0.7447 0.964 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1487993 3 0.7508 0.4962 0.096 0.000 0.492 0.148 0.264
#> SRR1465983 5 0.3983 0.9642 0.000 0.340 0.000 0.000 0.660
#> SRR1380375 4 0.4367 0.4591 0.416 0.000 0.000 0.580 0.004
#> SRR1367566 3 0.2929 0.7682 0.008 0.000 0.840 0.152 0.000
#> SRR1316151 2 0.0740 0.7092 0.008 0.980 0.000 0.004 0.008
#> SRR1417547 2 0.3420 0.7054 0.000 0.840 0.000 0.076 0.084
#> SRR659389 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1490270 2 0.0404 0.7126 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1398207 4 0.6685 0.4640 0.204 0.000 0.356 0.436 0.004
#> SRR1358755 3 0.0162 0.8403 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000
#> SRR1078903 2 0.3134 0.6885 0.000 0.848 0.000 0.032 0.120
#> SRR1323252 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1451796 2 0.3816 0.3296 0.000 0.696 0.000 0.000 0.304
#> SRR1369172 1 0.2377 0.7038 0.872 0.000 0.000 0.128 0.000
#> SRR615982 2 0.4417 0.6732 0.000 0.760 0.000 0.148 0.092
#> SRR1480431 2 0.5460 0.5263 0.000 0.656 0.000 0.148 0.196
#> SRR1429825 2 0.3317 0.5475 0.188 0.804 0.000 0.004 0.004
#> SRR1102393 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1071313 1 0.4101 0.1953 0.628 0.000 0.000 0.372 0.000
#> SRR808351 1 0.4297 0.5900 0.764 0.000 0.000 0.164 0.072
#> SRR1317513 1 0.3336 0.5929 0.772 0.000 0.000 0.228 0.000
#> SRR1480501 3 0.1732 0.8151 0.000 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR1081910 4 0.4276 0.6880 0.256 0.000 0.028 0.716 0.000
#> SRR1086611 2 0.6884 -0.4703 0.260 0.376 0.000 0.360 0.004
#> SRR1392571 2 0.4886 0.6581 0.000 0.712 0.000 0.188 0.100
#> SRR1311441 1 0.1661 0.7284 0.940 0.000 0.000 0.036 0.024
#> SRR808152 1 0.0162 0.7446 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR657313 3 0.0290 0.8402 0.000 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR1433131 2 0.2020 0.6997 0.000 0.900 0.000 0.000 0.100
#> SRR1321011 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1500598 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1379343 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1389108 1 0.1915 0.7210 0.928 0.000 0.000 0.040 0.032
#> SRR1376228 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399757 2 0.5483 0.3296 0.256 0.648 0.000 0.088 0.008
#> SRR1358060 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.8276 0.2499 0.196 0.000 0.380 0.160 0.264
#> SRR613557 2 0.4967 0.6538 0.000 0.704 0.000 0.192 0.104
#> SRR809831 4 0.4649 0.6899 0.244 0.000 0.044 0.708 0.004
#> SRR1429387 3 0.0000 0.8404 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.2179 0.7111 0.888 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1071644 1 0.1270 0.7343 0.948 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1406936 4 0.6523 0.5693 0.268 0.000 0.248 0.484 0.000
#> SRR1072031 5 0.3932 0.9810 0.000 0.328 0.000 0.000 0.672
#> SRR1374671 2 0.5354 0.5441 0.000 0.668 0.000 0.140 0.192
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 5 0.4991 0.0471 0.396 0.000 0.036 0.020 0.548 0.000
#> SRR1404105 1 0.4300 -0.4654 0.528 0.000 0.000 0.456 0.012 0.004
#> SRR2164936 2 0.3717 -0.5193 0.000 0.616 0.000 0.000 0.000 0.384
#> SRR1472057 3 0.0146 0.8052 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR614491 2 0.5880 0.4508 0.000 0.584 0.000 0.036 0.236 0.144
#> SRR1069376 4 0.4226 0.6502 0.404 0.000 0.000 0.580 0.012 0.004
#> SRR811964 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1361415 2 0.2243 0.4737 0.000 0.880 0.000 0.004 0.004 0.112
#> SRR1345715 4 0.0891 0.5967 0.024 0.000 0.000 0.968 0.008 0.000
#> SRR1328073 4 0.4587 0.5647 0.356 0.000 0.000 0.596 0.048 0.000
#> SRR1394209 4 0.6648 0.3470 0.380 0.136 0.000 0.432 0.024 0.028
#> SRR1474018 2 0.0000 0.5871 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1099809 5 0.5976 0.4903 0.192 0.000 0.316 0.000 0.484 0.008
#> SRR1500555 2 0.5817 0.4541 0.000 0.588 0.000 0.032 0.236 0.144
#> SRR1354363 4 0.3758 0.6805 0.284 0.000 0.000 0.700 0.016 0.000
#> SRR1391619 3 0.3665 0.6055 0.020 0.000 0.728 0.000 0.252 0.000
#> SRR1307997 2 0.0603 0.5893 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR663124 2 0.4163 0.5066 0.000 0.716 0.000 0.004 0.232 0.048
#> SRR1334670 1 0.3679 0.1923 0.724 0.000 0.000 0.260 0.012 0.004
#> SRR612515 2 0.5880 0.4508 0.000 0.584 0.000 0.036 0.236 0.144
#> SRR1092727 2 0.3776 0.4883 0.000 0.760 0.000 0.000 0.188 0.052
#> SRR1364013 2 0.3543 0.5158 0.000 0.756 0.000 0.004 0.224 0.016
#> SRR1468553 3 0.2260 0.7576 0.000 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1403980 3 0.2778 0.7221 0.008 0.000 0.824 0.000 0.168 0.000
#> SRR1420169 3 0.1141 0.8033 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1442800 1 0.6387 0.3864 0.516 0.036 0.000 0.020 0.108 0.320
#> SRR1359214 2 0.3810 -0.6968 0.000 0.572 0.000 0.000 0.000 0.428
#> SRR1499849 3 0.6109 -0.1967 0.324 0.000 0.428 0.000 0.244 0.004
#> SRR1500030 5 0.3645 0.6525 0.024 0.000 0.236 0.000 0.740 0.000
#> SRR1093053 3 0.4892 0.3739 0.100 0.000 0.628 0.000 0.272 0.000
#> SRR1399843 1 0.2765 0.6828 0.848 0.000 0.004 0.000 0.132 0.016
#> SRR1380231 1 0.3372 0.6480 0.804 0.000 0.016 0.000 0.164 0.016
#> SRR809470 3 0.6134 -0.0781 0.332 0.000 0.468 0.000 0.184 0.016
#> SRR614239 2 0.5507 0.4660 0.000 0.608 0.000 0.016 0.232 0.144
#> SRR613939 2 0.0000 0.5871 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612971 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1490204 2 0.0363 0.5798 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR811357 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1471672 4 0.0891 0.5967 0.024 0.000 0.000 0.968 0.008 0.000
#> SRR613006 2 0.0405 0.5889 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1469570 6 0.3866 0.9520 0.000 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1457354 2 0.1588 0.5723 0.000 0.924 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1362906 5 0.3645 0.6525 0.024 0.000 0.236 0.000 0.740 0.000
#> SRR1079023 1 0.4315 -0.5325 0.496 0.000 0.000 0.488 0.012 0.004
#> SRR813608 6 0.3864 0.9558 0.000 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520
#> SRR1096736 4 0.3770 0.6617 0.244 0.000 0.000 0.728 0.028 0.000
#> SRR1478700 5 0.6077 -0.1975 0.220 0.000 0.004 0.368 0.408 0.000
#> SRR1081543 1 0.3062 0.6795 0.824 0.000 0.008 0.008 0.156 0.004
#> SRR1384754 5 0.6133 -0.0849 0.356 0.000 0.012 0.192 0.440 0.000
#> SRR612287 6 0.3860 0.9485 0.000 0.472 0.000 0.000 0.000 0.528
#> SRR1380317 2 0.6800 0.2477 0.320 0.480 0.000 0.060 0.020 0.120
#> SRR1315247 2 0.7040 0.0802 0.140 0.420 0.000 0.020 0.064 0.356
#> SRR1105344 2 0.0405 0.5891 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR658549 2 0.5230 0.4777 0.000 0.628 0.000 0.008 0.232 0.132
#> SRR1480240 1 0.2538 0.6865 0.860 0.000 0.000 0.000 0.124 0.016
#> SRR1084816 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR612551 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1358520 2 0.2841 0.5554 0.000 0.824 0.000 0.000 0.164 0.012
#> SRR1419476 3 0.0458 0.8059 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1456075 5 0.3645 0.6525 0.024 0.000 0.236 0.000 0.740 0.000
#> SRR1389474 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1367005 4 0.4181 0.6617 0.384 0.000 0.000 0.600 0.012 0.004
#> SRR1334419 4 0.0891 0.5967 0.024 0.000 0.000 0.968 0.008 0.000
#> SRR1417154 3 0.5310 0.4164 0.180 0.000 0.644 0.000 0.160 0.016
#> SRR1095985 1 0.5139 0.4921 0.664 0.000 0.184 0.000 0.136 0.016
#> SRR1325771 2 0.6122 -0.3874 0.196 0.400 0.000 0.396 0.004 0.004
#> SRR1360420 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0935 0.5878 0.000 0.964 0.000 0.000 0.004 0.032
#> SRR1332993 4 0.4303 0.5881 0.460 0.000 0.000 0.524 0.012 0.004
#> SRR1311833 6 0.3869 0.9189 0.000 0.500 0.000 0.000 0.000 0.500
#> SRR808044 4 0.5320 0.5140 0.288 0.000 0.000 0.572 0.140 0.000
#> SRR1076916 3 0.4987 0.4865 0.104 0.000 0.664 0.000 0.220 0.012
#> SRR1356266 1 0.3481 0.2901 0.756 0.000 0.000 0.228 0.012 0.004
#> SRR1341983 2 0.2122 0.5382 0.000 0.900 0.000 0.000 0.024 0.076
#> SRR1456114 4 0.4293 0.6037 0.448 0.000 0.000 0.536 0.012 0.004
#> SRR1072948 3 0.0291 0.8032 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000
#> SRR1472370 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.2723 0.6935 0.856 0.000 0.000 0.020 0.120 0.004
#> SRR613843 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1469192 1 0.5185 0.1184 0.564 0.000 0.000 0.328 0.108 0.000
#> SRR1404555 1 0.5898 0.1954 0.512 0.000 0.324 0.000 0.148 0.016
#> SRR659839 6 0.3862 0.9540 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR659533 2 0.3516 0.5139 0.000 0.760 0.000 0.004 0.220 0.016
#> SRR1362848 4 0.6953 0.1483 0.368 0.036 0.000 0.376 0.204 0.016
#> SRR1407492 2 0.5507 0.4660 0.000 0.608 0.000 0.016 0.232 0.144
#> SRR1455082 2 0.3454 0.5160 0.000 0.760 0.000 0.004 0.224 0.012
#> SRR658362 2 0.5441 0.4697 0.000 0.616 0.000 0.016 0.232 0.136
#> SRR810921 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR662823 6 0.3864 0.9519 0.000 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520
#> SRR1456375 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR818232 1 0.2146 0.6917 0.880 0.000 0.000 0.000 0.116 0.004
#> SRR1454868 1 0.6339 0.5273 0.624 0.008 0.080 0.020 0.180 0.088
#> SRR1474816 2 0.3426 0.4270 0.000 0.720 0.000 0.000 0.004 0.276
#> SRR1342002 1 0.4116 -0.3439 0.572 0.000 0.000 0.416 0.012 0.000
#> SRR1088437 2 0.3192 0.2527 0.000 0.776 0.000 0.004 0.004 0.216
#> SRR1466400 1 0.7266 0.2240 0.396 0.100 0.000 0.020 0.124 0.360
#> SRR658921 2 0.3601 0.3994 0.000 0.684 0.000 0.000 0.004 0.312
#> SRR1499873 2 0.2416 0.3947 0.000 0.844 0.000 0.000 0.000 0.156
#> SRR1101373 4 0.2113 0.6526 0.092 0.004 0.000 0.896 0.008 0.000
#> SRR1090145 1 0.2162 0.5494 0.896 0.000 0.000 0.088 0.012 0.004
#> SRR1379324 4 0.4303 0.5885 0.460 0.000 0.000 0.524 0.012 0.004
#> SRR1345307 6 0.3866 0.9520 0.000 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1396166 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.2362 0.7554 0.004 0.000 0.860 0.000 0.136 0.000
#> SRR1454891 2 0.5880 0.4508 0.000 0.584 0.000 0.036 0.236 0.144
#> SRR663185 2 0.3852 0.5142 0.000 0.740 0.000 0.004 0.224 0.032
#> SRR811819 1 0.1296 0.6020 0.952 0.000 0.000 0.032 0.012 0.004
#> SRR1318920 1 0.3018 0.4504 0.816 0.000 0.000 0.168 0.012 0.004
#> SRR656758 2 0.2092 0.4586 0.000 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR1474351 1 0.3426 0.3294 0.764 0.000 0.000 0.220 0.012 0.004
#> SRR660450 2 0.1219 0.5827 0.000 0.948 0.000 0.000 0.004 0.048
#> SRR1472687 2 0.3807 -0.4628 0.000 0.628 0.000 0.004 0.000 0.368
#> SRR1334291 2 0.3215 0.4537 0.000 0.756 0.000 0.000 0.004 0.240
#> SRR1415153 2 0.3076 0.1329 0.000 0.760 0.000 0.000 0.000 0.240
#> SRR1323271 2 0.0632 0.5897 0.000 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR1368939 6 0.3867 0.9463 0.000 0.488 0.000 0.000 0.000 0.512
#> SRR1443161 1 0.5549 0.4487 0.564 0.000 0.008 0.088 0.328 0.012
#> SRR614695 2 0.4424 0.3797 0.020 0.624 0.000 0.012 0.000 0.344
#> SRR1092372 1 0.1829 0.5718 0.920 0.000 0.000 0.064 0.012 0.004
#> SRR1474577 4 0.0891 0.5967 0.024 0.000 0.000 0.968 0.008 0.000
#> SRR1406582 4 0.0891 0.5967 0.024 0.000 0.000 0.968 0.008 0.000
#> SRR612779 2 0.1910 0.4803 0.000 0.892 0.000 0.000 0.000 0.108
#> SRR1089006 4 0.0891 0.5967 0.024 0.000 0.000 0.968 0.008 0.000
#> SRR1354071 1 0.2623 0.6841 0.852 0.000 0.000 0.000 0.132 0.016
#> SRR1105463 3 0.1958 0.7820 0.004 0.000 0.896 0.000 0.100 0.000
#> SRR811005 2 0.3950 -0.7064 0.000 0.564 0.000 0.004 0.000 0.432
#> SRR1385319 1 0.2357 0.6906 0.872 0.000 0.000 0.000 0.116 0.012
#> SRR1325871 3 0.3711 0.5945 0.020 0.000 0.720 0.000 0.260 0.000
#> SRR1355415 3 0.0000 0.8046 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1090861 4 0.4262 0.6215 0.424 0.000 0.000 0.560 0.012 0.004
#> SRR1320712 4 0.3971 0.6505 0.268 0.004 0.000 0.704 0.024 0.000
#> SRR1470075 4 0.4234 0.6456 0.408 0.000 0.000 0.576 0.012 0.004
#> SRR1091254 1 0.2162 0.5524 0.896 0.000 0.000 0.088 0.012 0.004
#> SRR1101397 5 0.3645 0.6525 0.024 0.000 0.236 0.000 0.740 0.000
#> SRR1321165 1 0.1957 0.6928 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1092112 3 0.0146 0.8054 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1417588 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1074790 4 0.5797 0.3805 0.168 0.340 0.000 0.488 0.004 0.000
#> SRR1432106 6 0.3862 0.9487 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR655756 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1458314 4 0.5686 0.3780 0.364 0.000 0.000 0.472 0.164 0.000
#> SRR1318582 6 0.3864 0.9558 0.000 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520
#> SRR1080484 2 0.3785 0.3974 0.000 0.780 0.000 0.004 0.064 0.152
#> SRR1072749 5 0.4662 0.6434 0.096 0.000 0.236 0.000 0.668 0.000
#> SRR1078586 1 0.2237 0.6664 0.896 0.000 0.000 0.036 0.068 0.000
#> SRR1400333 1 0.4154 0.6705 0.792 0.024 0.000 0.020 0.120 0.044
#> SRR1078834 2 0.5919 0.3226 0.260 0.580 0.000 0.020 0.012 0.128
#> SRR1417611 2 0.0000 0.5871 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.2219 0.6854 0.864 0.000 0.000 0.000 0.136 0.000
#> SRR1465440 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1400530 2 0.1082 0.5852 0.000 0.956 0.000 0.000 0.004 0.040
#> SRR614984 2 0.5880 0.4508 0.000 0.584 0.000 0.036 0.236 0.144
#> SRR1324269 1 0.4629 0.5588 0.684 0.000 0.028 0.016 0.260 0.012
#> SRR1401491 2 0.0146 0.5870 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1319443 1 0.1957 0.6928 0.888 0.000 0.000 0.000 0.112 0.000
#> SRR1324349 2 0.0603 0.5932 0.000 0.980 0.000 0.000 0.004 0.016
#> SRR1345523 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1500846 4 0.5992 0.2841 0.268 0.000 0.000 0.440 0.292 0.000
#> SRR661505 3 0.1075 0.8040 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1419062 3 0.5201 0.2824 0.200 0.000 0.616 0.000 0.184 0.000
#> SRR1480131 1 0.2723 0.6833 0.852 0.000 0.004 0.000 0.128 0.016
#> SRR1421284 2 0.7064 0.4011 0.024 0.524 0.000 0.116 0.212 0.124
#> SRR1329624 4 0.4308 0.5751 0.468 0.000 0.000 0.516 0.012 0.004
#> SRR1315739 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.5441 0.4691 0.000 0.616 0.000 0.016 0.232 0.136
#> SRR1083286 1 0.2989 0.6650 0.824 0.000 0.008 0.004 0.160 0.004
#> SRR1091890 1 0.3176 0.6718 0.812 0.000 0.032 0.000 0.156 0.000
#> SRR1347436 2 0.4268 0.5241 0.000 0.732 0.000 0.012 0.200 0.056
#> SRR1327473 4 0.3986 0.5624 0.464 0.000 0.000 0.532 0.004 0.000
#> SRR1338195 3 0.2738 0.7282 0.004 0.000 0.820 0.000 0.176 0.000
#> SRR809698 2 0.3868 -0.8907 0.000 0.508 0.000 0.000 0.000 0.492
#> SRR1457792 4 0.2948 0.6789 0.188 0.000 0.000 0.804 0.008 0.000
#> SRR658271 2 0.1327 0.5197 0.000 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1339597 1 0.4768 0.5408 0.704 0.000 0.000 0.176 0.104 0.016
#> SRR1454842 3 0.3756 0.5818 0.020 0.000 0.712 0.000 0.268 0.000
#> SRR1322643 4 0.3323 0.6757 0.240 0.000 0.000 0.752 0.008 0.000
#> SRR614887 3 0.1141 0.8022 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1354620 3 0.1141 0.8020 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR615056 2 0.2845 0.3575 0.000 0.820 0.000 0.004 0.004 0.172
#> SRR1105320 1 0.1863 0.6479 0.920 0.000 0.000 0.044 0.036 0.000
#> SRR1391529 1 0.2611 0.6893 0.876 0.000 0.000 0.016 0.092 0.016
#> SRR663052 2 0.3539 0.5034 0.000 0.756 0.000 0.000 0.220 0.024
#> SRR1478834 1 0.2494 0.6878 0.864 0.000 0.000 0.000 0.120 0.016
#> SRR812366 6 0.3866 0.9520 0.000 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1435330 3 0.3428 0.7165 0.024 0.000 0.808 0.000 0.152 0.016
#> SRR615383 6 0.3867 0.9463 0.000 0.488 0.000 0.000 0.000 0.512
#> SRR1389157 2 0.6409 0.3010 0.268 0.536 0.000 0.020 0.028 0.148
#> SRR613568 2 0.1411 0.5780 0.000 0.936 0.000 0.000 0.004 0.060
#> SRR614095 2 0.0291 0.5899 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR1103092 1 0.2538 0.6865 0.860 0.000 0.000 0.000 0.124 0.016
#> SRR1337155 1 0.5512 0.4228 0.616 0.000 0.184 0.000 0.184 0.016
#> SRR1475345 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR809089 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1446180 1 0.5654 0.4514 0.560 0.008 0.004 0.000 0.132 0.296
#> SRR1406372 2 0.0777 0.5687 0.000 0.972 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1339880 5 0.3645 0.6525 0.024 0.000 0.236 0.000 0.740 0.000
#> SRR1353136 1 0.4158 0.5959 0.720 0.000 0.024 0.020 0.236 0.000
#> SRR1093906 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR614035 2 0.3476 0.0671 0.000 0.732 0.000 0.004 0.004 0.260
#> SRR1351104 4 0.4171 0.6637 0.380 0.000 0.000 0.604 0.012 0.004
#> SRR1363926 2 0.3516 0.4690 0.016 0.760 0.000 0.000 0.004 0.220
#> SRR1399861 1 0.7176 0.3169 0.528 0.216 0.000 0.052 0.116 0.088
#> SRR1338789 1 0.4308 -0.4909 0.516 0.000 0.000 0.468 0.012 0.004
#> SRR1421420 3 0.2841 0.7219 0.012 0.000 0.824 0.000 0.164 0.000
#> SRR1420832 2 0.3810 -0.6719 0.000 0.572 0.000 0.000 0.000 0.428
#> SRR1476231 4 0.3892 0.6717 0.352 0.000 0.000 0.640 0.004 0.004
#> SRR1352870 6 0.7430 -0.5499 0.324 0.120 0.000 0.020 0.132 0.404
#> SRR1315041 2 0.0458 0.5904 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR661877 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1443268 5 0.3816 0.6529 0.032 0.000 0.240 0.000 0.728 0.000
#> SRR1416617 3 0.4403 0.5715 0.048 0.000 0.712 0.000 0.224 0.016
#> SRR1102443 4 0.5024 0.4554 0.440 0.008 0.000 0.500 0.052 0.000
#> SRR655672 2 0.4856 0.4919 0.000 0.676 0.000 0.016 0.228 0.080
#> SRR1420006 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0291 0.5873 0.000 0.992 0.000 0.000 0.004 0.004
#> SRR613819 2 0.0692 0.5934 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR1469432 2 0.2632 0.5115 0.000 0.832 0.000 0.000 0.004 0.164
#> SRR660907 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1465092 2 0.2593 0.5598 0.000 0.844 0.000 0.000 0.148 0.008
#> SRR1470727 1 0.4130 0.6283 0.752 0.000 0.012 0.028 0.196 0.012
#> SRR1339153 3 0.3432 0.6520 0.020 0.000 0.764 0.000 0.216 0.000
#> SRR1472749 3 0.4101 0.4859 0.028 0.000 0.664 0.000 0.308 0.000
#> SRR1414379 2 0.2834 0.5755 0.000 0.852 0.000 0.008 0.120 0.020
#> SRR1431326 4 0.2632 0.6754 0.164 0.000 0.000 0.832 0.004 0.000
#> SRR1487278 2 0.3619 0.3982 0.000 0.680 0.000 0.000 0.004 0.316
#> SRR1098312 1 0.3409 0.6600 0.788 0.000 0.024 0.004 0.184 0.000
#> SRR810273 6 0.3864 0.9558 0.000 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520
#> SRR1376000 2 0.0146 0.5887 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR614467 2 0.5474 0.4675 0.000 0.612 0.000 0.016 0.232 0.140
#> SRR811471 1 0.2833 0.4675 0.836 0.000 0.000 0.148 0.012 0.004
#> SRR1478341 3 0.0405 0.8054 0.000 0.000 0.988 0.004 0.008 0.000
#> SRR1088606 1 0.5521 0.4552 0.564 0.008 0.000 0.000 0.132 0.296
#> SRR1479699 1 0.1257 0.6262 0.952 0.000 0.000 0.020 0.028 0.000
#> SRR1403589 2 0.1010 0.5746 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR812625 2 0.3163 0.1984 0.000 0.764 0.000 0.004 0.000 0.232
#> SRR1359803 1 0.2346 0.6886 0.868 0.000 0.000 0.000 0.124 0.008
#> SRR1338988 6 0.3864 0.9558 0.000 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520
#> SRR1471222 2 0.0547 0.5839 0.000 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1378992 4 0.0891 0.5967 0.024 0.000 0.000 0.968 0.008 0.000
#> SRR659427 1 0.6307 0.1689 0.436 0.008 0.008 0.036 0.428 0.084
#> SRR1096638 4 0.4066 0.6461 0.392 0.000 0.000 0.596 0.012 0.000
#> SRR1466619 2 0.0260 0.5897 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR659307 2 0.6483 0.3421 0.012 0.492 0.000 0.036 0.320 0.140
#> SRR1439994 5 0.3719 0.6399 0.024 0.000 0.248 0.000 0.728 0.000
#> SRR1454931 1 0.2538 0.6865 0.860 0.000 0.000 0.000 0.124 0.016
#> SRR1332928 1 0.5982 0.1087 0.464 0.000 0.000 0.320 0.212 0.004
#> SRR658621 2 0.3502 0.4754 0.000 0.812 0.000 0.004 0.076 0.108
#> SRR1095840 1 0.2110 0.5538 0.900 0.000 0.000 0.084 0.012 0.004
#> SRR1458243 5 0.3645 0.6525 0.024 0.000 0.236 0.000 0.740 0.000
#> SRR1374270 1 0.5740 0.5633 0.684 0.104 0.000 0.032 0.120 0.060
#> SRR1470947 6 0.3857 0.9471 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1365598 2 0.3601 0.3994 0.000 0.684 0.000 0.000 0.004 0.312
#> SRR662787 2 0.3601 -0.2037 0.000 0.684 0.000 0.000 0.004 0.312
#> SRR1408727 2 0.5707 0.4692 0.004 0.608 0.000 0.024 0.228 0.136
#> SRR1456274 4 0.4646 0.4748 0.460 0.000 0.000 0.500 0.040 0.000
#> SRR817744 4 0.4234 0.6434 0.408 0.000 0.000 0.576 0.012 0.004
#> SRR1478744 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1387379 6 0.3866 0.9454 0.000 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1102680 3 0.5833 -0.1384 0.364 0.000 0.444 0.000 0.192 0.000
#> SRR1374198 1 0.3154 0.4043 0.800 0.000 0.000 0.184 0.012 0.004
#> SRR1445856 5 0.5284 0.6083 0.192 0.000 0.184 0.000 0.620 0.004
#> SRR820049 3 0.2946 0.7117 0.012 0.000 0.812 0.000 0.176 0.000
#> SRR1375290 1 0.6155 -0.0675 0.412 0.000 0.324 0.000 0.260 0.004
#> SRR818999 1 0.3990 0.6010 0.760 0.000 0.040 0.000 0.184 0.016
#> SRR1390242 1 0.2631 0.5049 0.856 0.000 0.000 0.128 0.012 0.004
#> SRR1401164 2 0.2730 0.2886 0.000 0.808 0.000 0.000 0.000 0.192
#> SRR1454629 1 0.2623 0.6841 0.852 0.000 0.000 0.000 0.132 0.016
#> SRR1332187 3 0.3686 0.6979 0.036 0.000 0.792 0.000 0.156 0.016
#> SRR603365 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.5871 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.5192 0.4831 0.000 0.640 0.000 0.012 0.228 0.120
#> SRR1488017 4 0.4315 0.5345 0.488 0.000 0.000 0.496 0.012 0.004
#> SRR612947 2 0.3448 -0.0668 0.000 0.716 0.000 0.004 0.000 0.280
#> SRR1480384 5 0.6546 -0.1126 0.340 0.000 0.016 0.260 0.380 0.004
#> SRR1364761 2 0.3607 -0.3576 0.000 0.652 0.000 0.000 0.000 0.348
#> SRR1308086 5 0.3860 0.6546 0.036 0.000 0.236 0.000 0.728 0.000
#> SRR1441868 4 0.1918 0.6496 0.088 0.000 0.000 0.904 0.008 0.000
#> SRR1485380 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1073705 4 0.2009 0.6468 0.084 0.004 0.000 0.904 0.008 0.000
#> SRR615032 6 0.3864 0.9558 0.000 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520
#> SRR1452356 2 0.3606 -0.0610 0.000 0.708 0.000 0.004 0.004 0.284
#> SRR1442983 6 0.3866 0.9520 0.000 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1100346 2 0.5839 0.4585 0.000 0.592 0.000 0.036 0.228 0.144
#> SRR1332816 4 0.0891 0.5967 0.024 0.000 0.000 0.968 0.008 0.000
#> SRR612299 2 0.3878 0.3939 0.008 0.668 0.000 0.000 0.004 0.320
#> SRR1407386 4 0.4314 0.5502 0.484 0.000 0.000 0.500 0.012 0.004
#> SRR1418064 2 0.3601 0.3994 0.000 0.684 0.000 0.000 0.004 0.312
#> SRR1309403 1 0.4743 0.4089 0.692 0.236 0.000 0.020 0.008 0.044
#> SRR1498395 2 0.3847 -0.7965 0.000 0.544 0.000 0.000 0.000 0.456
#> SRR1079998 3 0.3215 0.5013 0.000 0.000 0.756 0.004 0.240 0.000
#> SRR1498885 6 0.3860 0.9530 0.000 0.472 0.000 0.000 0.000 0.528
#> SRR1337215 1 0.4417 0.5014 0.748 0.176 0.000 0.032 0.008 0.036
#> SRR1414749 3 0.0937 0.8042 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1365963 5 0.4050 0.6519 0.048 0.000 0.236 0.000 0.716 0.000
#> SRR1368030 2 0.1429 0.5499 0.000 0.940 0.000 0.004 0.004 0.052
#> SRR1419760 1 0.4003 0.6032 0.804 0.108 0.000 0.036 0.040 0.012
#> SRR1381841 1 0.2538 0.6865 0.860 0.000 0.000 0.000 0.124 0.016
#> SRR821388 2 0.7308 0.3171 0.120 0.456 0.000 0.024 0.284 0.116
#> SRR657623 2 0.3867 0.4782 0.000 0.780 0.000 0.004 0.128 0.088
#> SRR1094241 3 0.0937 0.8042 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR819583 3 0.0937 0.8042 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1096149 5 0.6245 -0.2163 0.216 0.000 0.012 0.384 0.388 0.000
#> SRR1342829 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.3154 0.4033 0.800 0.000 0.000 0.184 0.012 0.004
#> SRR811333 1 0.2892 0.6761 0.840 0.000 0.020 0.000 0.136 0.004
#> SRR1311666 2 0.2793 0.2200 0.000 0.800 0.000 0.000 0.000 0.200
#> SRR1486698 2 0.3752 0.4865 0.000 0.772 0.000 0.000 0.164 0.064
#> SRR1446436 2 0.0405 0.5889 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR815092 1 0.2455 0.5178 0.872 0.000 0.000 0.112 0.012 0.004
#> SRR1500149 2 0.0146 0.5887 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1100564 1 0.2092 0.6901 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124 0.000
#> SRR1403072 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR811653 5 0.5741 0.1690 0.356 0.008 0.056 0.020 0.548 0.012
#> SRR1311348 6 0.3866 0.9520 0.000 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1489438 6 0.3860 0.9485 0.000 0.472 0.000 0.000 0.000 0.528
#> SRR1435442 2 0.4138 0.3883 0.020 0.656 0.000 0.000 0.004 0.320
#> SRR1421444 3 0.2595 0.7414 0.004 0.000 0.836 0.000 0.160 0.000
#> SRR1344010 6 0.3857 0.9471 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1319520 4 0.1918 0.6496 0.088 0.000 0.000 0.904 0.008 0.000
#> SRR1444763 1 0.2982 0.4526 0.820 0.000 0.000 0.164 0.012 0.004
#> SRR1415026 6 0.3860 0.9485 0.000 0.472 0.000 0.000 0.000 0.528
#> SRR1416596 2 0.1858 0.5608 0.000 0.904 0.000 0.000 0.004 0.092
#> SRR1485499 2 0.3464 -0.2309 0.000 0.688 0.000 0.000 0.000 0.312
#> SRR1316078 2 0.3828 -0.7395 0.000 0.560 0.000 0.000 0.000 0.440
#> SRR663465 2 0.3448 -0.0582 0.000 0.716 0.000 0.004 0.000 0.280
#> SRR1310094 2 0.0260 0.5910 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR663537 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1486780 4 0.4171 0.6637 0.380 0.000 0.000 0.604 0.012 0.004
#> SRR1453950 1 0.3344 0.5313 0.804 0.000 0.000 0.152 0.044 0.000
#> SRR1087875 4 0.0891 0.5967 0.024 0.000 0.000 0.968 0.008 0.000
#> SRR613318 2 0.6246 0.4405 0.016 0.568 0.000 0.032 0.240 0.144
#> SRR1332694 1 0.3998 -0.1214 0.644 0.000 0.000 0.340 0.016 0.000
#> SRR1468469 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR818670 2 0.1663 0.5092 0.000 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1120318 1 0.2581 0.6860 0.856 0.000 0.000 0.000 0.128 0.016
#> SRR1311622 5 0.3645 0.6525 0.024 0.000 0.236 0.000 0.740 0.000
#> SRR1500931 3 0.0632 0.8065 0.000 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000
#> SRR1387494 5 0.4888 0.6314 0.116 0.000 0.240 0.000 0.644 0.000
#> SRR1379175 2 0.6680 0.1482 0.252 0.392 0.000 0.020 0.008 0.328
#> SRR1401909 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0146 0.5870 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004 0.000
#> SRR1068832 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.3516 0.4803 0.000 0.760 0.000 0.016 0.004 0.220
#> SRR1085712 6 0.3857 0.9471 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1082283 1 0.1644 0.6444 0.932 0.000 0.000 0.028 0.040 0.000
#> SRR1084276 1 0.4291 0.5766 0.736 0.000 0.064 0.000 0.188 0.012
#> SRR1353262 2 0.1588 0.5734 0.000 0.924 0.000 0.000 0.004 0.072
#> SRR1437035 1 0.2179 0.6368 0.900 0.000 0.000 0.064 0.036 0.000
#> SRR1396877 1 0.2704 0.6771 0.844 0.000 0.000 0.000 0.140 0.016
#> SRR1443026 2 0.3531 -0.4235 0.000 0.672 0.000 0.000 0.000 0.328
#> SRR1417936 4 0.4184 0.5373 0.484 0.000 0.000 0.504 0.012 0.000
#> SRR1436822 2 0.3111 0.5582 0.032 0.856 0.000 0.020 0.004 0.088
#> SRR1101128 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1363886 6 0.3864 0.9503 0.000 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520
#> SRR612983 6 0.3860 0.9530 0.000 0.472 0.000 0.000 0.000 0.528
#> SRR1394366 2 0.4335 0.3825 0.020 0.636 0.000 0.004 0.004 0.336
#> SRR1093218 5 0.4254 0.3425 0.020 0.000 0.404 0.000 0.576 0.000
#> SRR1077090 3 0.3565 0.3690 0.000 0.000 0.692 0.004 0.304 0.000
#> SRR1327430 2 0.1458 0.5894 0.016 0.948 0.000 0.016 0.000 0.020
#> SRR1088958 4 0.0891 0.5967 0.024 0.000 0.000 0.968 0.008 0.000
#> SRR1486931 2 0.0260 0.5912 0.000 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1086820 1 0.2982 0.4467 0.820 0.000 0.000 0.164 0.012 0.004
#> SRR1383000 5 0.6338 -0.1432 0.328 0.000 0.008 0.316 0.348 0.000
#> SRR1355705 2 0.3955 -0.6978 0.000 0.560 0.000 0.004 0.000 0.436
#> SRR614335 2 0.3821 0.5119 0.000 0.740 0.000 0.000 0.220 0.040
#> SRR660534 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR817094 6 0.3866 0.9520 0.000 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1334265 2 0.0363 0.5917 0.000 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1456401 2 0.0458 0.5904 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1086393 1 0.4122 0.3622 0.704 0.000 0.000 0.248 0.048 0.000
#> SRR1351521 3 0.0603 0.8061 0.000 0.000 0.980 0.004 0.016 0.000
#> SRR1093100 4 0.7314 0.2957 0.348 0.076 0.000 0.408 0.136 0.032
#> SRR1309382 1 0.2003 0.6920 0.884 0.000 0.000 0.000 0.116 0.000
#> SRR1089375 1 0.2581 0.6847 0.856 0.000 0.000 0.000 0.128 0.016
#> SRR1499482 2 0.0725 0.5863 0.000 0.976 0.000 0.000 0.012 0.012
#> SRR614719 2 0.5585 0.4636 0.000 0.604 0.000 0.020 0.232 0.144
#> SRR1081473 5 0.5134 0.3948 0.088 0.000 0.388 0.000 0.524 0.000
#> SRR1087415 4 0.4172 0.6342 0.424 0.000 0.000 0.564 0.008 0.004
#> SRR1088217 3 0.1779 0.7960 0.016 0.000 0.920 0.000 0.064 0.000
#> SRR808496 2 0.5452 0.4703 0.000 0.616 0.000 0.016 0.228 0.140
#> SRR1336463 2 0.0146 0.5888 0.000 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR612359 2 0.5817 0.4541 0.000 0.588 0.000 0.032 0.236 0.144
#> SRR1444412 1 0.4391 0.5504 0.720 0.000 0.088 0.000 0.188 0.004
#> SRR1074116 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR821846 3 0.3012 0.7048 0.008 0.000 0.796 0.000 0.196 0.000
#> SRR656095 2 0.3860 -0.8343 0.000 0.528 0.000 0.000 0.000 0.472
#> SRR808914 1 0.3025 0.6865 0.844 0.000 0.000 0.020 0.120 0.016
#> SRR1349099 1 0.3087 0.4329 0.808 0.000 0.000 0.176 0.012 0.004
#> SRR1337886 2 0.2805 0.3261 0.000 0.812 0.000 0.004 0.000 0.184
#> SRR813632 1 0.4193 0.5832 0.724 0.000 0.036 0.004 0.228 0.008
#> SRR1101591 3 0.0146 0.8052 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1089713 1 0.2723 0.6833 0.852 0.000 0.004 0.000 0.128 0.016
#> SRR1453127 3 0.2048 0.7699 0.000 0.000 0.880 0.000 0.120 0.000
#> SRR1498354 3 0.0937 0.8042 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000
#> SRR1313831 1 0.2110 0.5553 0.900 0.000 0.000 0.084 0.012 0.004
#> SRR1315434 3 0.2520 0.7528 0.004 0.000 0.844 0.000 0.152 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.5871 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.2361 0.5480 0.880 0.000 0.000 0.104 0.012 0.004
#> SRR1367807 4 0.0891 0.5967 0.024 0.000 0.000 0.968 0.008 0.000
#> SRR1365791 1 0.5661 0.2965 0.560 0.000 0.296 0.000 0.128 0.016
#> SRR1081519 3 0.3907 0.6795 0.052 0.000 0.780 0.000 0.152 0.016
#> SRR614707 1 0.1636 0.6552 0.936 0.004 0.000 0.024 0.036 0.000
#> SRR1094027 1 0.4165 -0.4475 0.536 0.000 0.000 0.452 0.012 0.000
#> SRR1489092 1 0.5788 0.2917 0.552 0.000 0.292 0.000 0.136 0.020
#> SRR1079502 1 0.4354 0.5813 0.732 0.000 0.060 0.000 0.192 0.016
#> SRR1457814 2 0.7767 0.1821 0.256 0.384 0.000 0.020 0.200 0.140
#> SRR1455127 2 0.0692 0.5822 0.000 0.976 0.000 0.000 0.004 0.020
#> SRR615081 2 0.3756 0.3967 0.004 0.676 0.000 0.000 0.004 0.316
#> SRR1327855 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0458 0.5904 0.000 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1394125 1 0.6032 0.1553 0.496 0.000 0.316 0.000 0.172 0.016
#> SRR1488388 4 0.4209 0.6560 0.396 0.000 0.000 0.588 0.012 0.004
#> SRR1401122 2 0.0972 0.5930 0.000 0.964 0.000 0.000 0.028 0.008
#> SRR612383 2 0.5680 0.4599 0.000 0.596 0.000 0.024 0.236 0.144
#> SRR1477711 1 0.4048 -0.1309 0.644 0.000 0.000 0.340 0.012 0.004
#> SRR1350813 2 0.3558 0.5090 0.000 0.760 0.000 0.000 0.212 0.028
#> SRR612851 2 0.4993 0.4900 0.000 0.664 0.000 0.016 0.228 0.092
#> SRR1086349 4 0.3746 0.6774 0.272 0.000 0.000 0.712 0.012 0.004
#> SRR812837 6 0.3857 0.9471 0.000 0.468 0.000 0.000 0.000 0.532
#> SRR1340010 1 0.4728 0.5080 0.616 0.000 0.004 0.056 0.324 0.000
#> SRR1475885 1 0.3106 0.5889 0.844 0.004 0.000 0.108 0.040 0.004
#> SRR1376334 1 0.1444 0.5844 0.928 0.000 0.000 0.072 0.000 0.000
#> SRR1399821 4 0.3608 0.6781 0.272 0.000 0.000 0.716 0.012 0.000
#> SRR1347042 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR612323 2 0.5982 0.4506 0.004 0.584 0.000 0.036 0.236 0.140
#> SRR612604 2 0.0777 0.5880 0.000 0.972 0.000 0.000 0.004 0.024
#> SRR1389546 2 0.3309 -0.0127 0.000 0.720 0.000 0.000 0.000 0.280
#> SRR1311877 4 0.4389 0.5458 0.468 0.000 0.000 0.512 0.016 0.004
#> SRR1465608 1 0.4436 0.5140 0.636 0.000 0.004 0.036 0.324 0.000
#> SRR1101808 2 0.3248 0.2458 0.000 0.768 0.000 0.004 0.004 0.224
#> SRR1414079 3 0.3219 0.6996 0.012 0.000 0.792 0.000 0.192 0.004
#> SRR1331153 2 0.1471 0.5764 0.000 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1078439 3 0.6095 -0.2065 0.380 0.000 0.392 0.000 0.224 0.004
#> SRR2165527 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1351147 1 0.2815 0.6399 0.888 0.036 0.000 0.024 0.028 0.024
#> SRR1313536 2 0.0713 0.5721 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1070308 2 0.0713 0.5918 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1403110 1 0.1141 0.6729 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052 0.000
#> SRR1400355 2 0.0713 0.5686 0.000 0.972 0.000 0.000 0.000 0.028
#> SRR1401317 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.4200 -0.2858 0.592 0.000 0.000 0.392 0.012 0.004
#> SRR1074622 4 0.6125 0.0563 0.336 0.000 0.000 0.352 0.312 0.000
#> SRR1465847 3 0.3610 0.6506 0.028 0.000 0.768 0.000 0.200 0.004
#> SRR1443376 6 0.3864 0.9558 0.000 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520
#> SRR1471312 3 0.4614 0.5916 0.108 0.000 0.724 0.000 0.152 0.016
#> SRR1075579 4 0.4242 0.6445 0.412 0.000 0.000 0.572 0.012 0.004
#> SRR1090881 1 0.3445 0.6797 0.816 0.004 0.004 0.024 0.144 0.008
#> SRR612251 2 0.5531 0.4682 0.000 0.612 0.000 0.020 0.228 0.140
#> SRR1418581 4 0.1333 0.6159 0.048 0.000 0.000 0.944 0.008 0.000
#> SRR658045 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR613214 2 0.5638 0.4636 0.000 0.604 0.000 0.024 0.228 0.144
#> SRR613078 2 0.3163 0.4636 0.000 0.764 0.000 0.000 0.004 0.232
#> SRR1472998 1 0.5372 0.0285 0.484 0.000 0.112 0.000 0.404 0.000
#> SRR1433452 2 0.1471 0.5767 0.000 0.932 0.000 0.000 0.004 0.064
#> SRR1101957 4 0.4002 0.6408 0.404 0.000 0.000 0.588 0.008 0.000
#> SRR1487993 5 0.3645 0.6525 0.024 0.000 0.236 0.000 0.740 0.000
#> SRR1465983 2 0.3828 -0.7328 0.000 0.560 0.000 0.000 0.000 0.440
#> SRR1380375 1 0.2605 0.6884 0.876 0.000 0.000 0.020 0.092 0.012
#> SRR1367566 3 0.4630 0.5403 0.068 0.000 0.700 0.000 0.216 0.016
#> SRR1316151 2 0.1075 0.5871 0.000 0.952 0.000 0.000 0.000 0.048
#> SRR1417547 2 0.0909 0.5835 0.000 0.968 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR659389 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1490270 2 0.1010 0.5863 0.000 0.960 0.000 0.000 0.004 0.036
#> SRR1398207 1 0.3593 0.6258 0.784 0.000 0.020 0.000 0.180 0.016
#> SRR1358755 3 0.1007 0.8044 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000
#> SRR1078903 2 0.0405 0.5876 0.000 0.988 0.000 0.000 0.004 0.008
#> SRR1323252 6 0.3864 0.9558 0.000 0.480 0.000 0.000 0.000 0.520
#> SRR1451796 2 0.2048 0.4300 0.000 0.880 0.000 0.000 0.000 0.120
#> SRR1369172 1 0.4308 -0.4949 0.516 0.000 0.000 0.468 0.012 0.004
#> SRR615982 2 0.2841 0.5502 0.000 0.824 0.000 0.000 0.164 0.012
#> SRR1480431 2 0.3627 0.5119 0.000 0.752 0.000 0.004 0.224 0.020
#> SRR1429825 2 0.4959 0.4752 0.116 0.716 0.000 0.032 0.004 0.132
#> SRR1102393 6 0.3866 0.9520 0.000 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1071313 1 0.2451 0.6575 0.884 0.000 0.000 0.056 0.060 0.000
#> SRR808351 1 0.6099 -0.0228 0.380 0.000 0.000 0.328 0.292 0.000
#> SRR1317513 1 0.4171 -0.2546 0.604 0.000 0.000 0.380 0.012 0.004
#> SRR1480501 3 0.3367 0.6848 0.104 0.000 0.816 0.000 0.080 0.000
#> SRR1081910 1 0.2191 0.6910 0.876 0.000 0.000 0.000 0.120 0.004
#> SRR1086611 1 0.6963 0.3510 0.488 0.092 0.000 0.020 0.108 0.292
#> SRR1392571 2 0.5507 0.4660 0.000 0.608 0.000 0.016 0.232 0.144
#> SRR1311441 4 0.2915 0.6776 0.184 0.000 0.000 0.808 0.008 0.000
#> SRR808152 4 0.4262 0.6344 0.424 0.000 0.000 0.560 0.012 0.004
#> SRR657313 3 0.1663 0.7914 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1433131 2 0.0508 0.5870 0.000 0.984 0.000 0.000 0.004 0.012
#> SRR1321011 6 0.3866 0.9520 0.000 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1500598 6 0.3866 0.9520 0.000 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1379343 6 0.3862 0.9569 0.000 0.476 0.000 0.000 0.000 0.524
#> SRR1389108 4 0.0891 0.5967 0.024 0.000 0.000 0.968 0.008 0.000
#> SRR1376228 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR1399757 2 0.5727 0.2604 0.308 0.572 0.000 0.080 0.004 0.036
#> SRR1358060 3 0.1387 0.7978 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1464517 5 0.4740 0.6438 0.108 0.000 0.228 0.000 0.664 0.000
#> SRR613557 2 0.5880 0.4508 0.000 0.584 0.000 0.036 0.236 0.144
#> SRR809831 1 0.2623 0.6827 0.852 0.000 0.000 0.000 0.132 0.016
#> SRR1429387 3 0.0146 0.8039 0.000 0.000 0.996 0.004 0.000 0.000
#> SRR816565 1 0.4260 -0.4679 0.512 0.000 0.000 0.472 0.016 0.000
#> SRR1071644 4 0.3608 0.6753 0.248 0.000 0.000 0.736 0.012 0.004
#> SRR1406936 1 0.3737 0.6201 0.772 0.000 0.024 0.000 0.188 0.016
#> SRR1072031 6 0.3866 0.9520 0.000 0.484 0.000 0.000 0.000 0.516
#> SRR1374671 2 0.3618 0.5012 0.000 0.768 0.000 0.000 0.192 0.040
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
The object with results only for a single top-value method and a single partition method can be extracted as:
res = res_list["ATC", "NMF"]
# you can also extract it by
# res = res_list["ATC:NMF"]
A summary of res and all the functions that can be applied to it:
res
#> A 'ConsensusPartition' object with k = 2, 3, 4, 5, 6.
#> On a matrix with 17439 rows and 500 columns.
#> Top rows (1000, 2000, 3000, 4000, 5000) are extracted by 'ATC' method.
#> Subgroups are detected by 'NMF' method.
#> Performed in total 1250 partitions by row resampling.
#> Best k for subgroups seems to be 2.
#>
#> Following methods can be applied to this 'ConsensusPartition' object:
#> [1] "cola_report" "collect_classes" "collect_plots"
#> [4] "collect_stats" "colnames" "compare_signatures"
#> [7] "consensus_heatmap" "dimension_reduction" "functional_enrichment"
#> [10] "get_anno_col" "get_anno" "get_classes"
#> [13] "get_consensus" "get_matrix" "get_membership"
#> [16] "get_param" "get_signatures" "get_stats"
#> [19] "is_best_k" "is_stable_k" "membership_heatmap"
#> [22] "ncol" "nrow" "plot_ecdf"
#> [25] "rownames" "select_partition_number" "show"
#> [28] "suggest_best_k" "test_to_known_factors"
collect_plots() function collects all the plots made from res for all k (number of partitions)
into one single page to provide an easy and fast comparison between different k.
collect_plots(res)
The plots are:
k and the heatmap of
predicted classes for each k.k.k.k.All the plots in panels can be made by individual functions and they are plotted later in this section.
select_partition_number() produces several plots showing different
statistics for choosing “optimized” k. There are following statistics:
k;k, the area increased is defined as \(A_k - A_{k-1}\).The detailed explanations of these statistics can be found in the cola vignette.
Generally speaking, lower PAC score, higher mean silhouette score or higher
concordance corresponds to better partition. Rand index and Jaccard index
measure how similar the current partition is compared to partition with k-1.
If they are too similar, we won't accept k is better than k-1.
select_partition_number(res)
The numeric values for all these statistics can be obtained by get_stats().
get_stats(res)
#> k 1-PAC mean_silhouette concordance area_increased Rand Jaccard
#> 2 2 1.000 0.974 0.990 0.4838 0.515 0.515
#> 3 3 0.881 0.894 0.956 0.3707 0.774 0.581
#> 4 4 0.873 0.871 0.935 0.0982 0.889 0.691
#> 5 5 0.774 0.745 0.852 0.0578 0.912 0.700
#> 6 6 0.755 0.705 0.839 0.0387 0.946 0.778
suggest_best_k() suggests the best \(k\) based on these statistics. The rules are as follows:
suggest_best_k(res)
#> [1] 2
Following shows the table of the partitions (You need to click the show/hide
code output link to see it). The membership matrix (columns with name p*)
is inferred by
clue::cl_consensus()
function with the SE method. Basically the value in the membership matrix
represents the probability to belong to a certain group. The finall class
label for an item is determined with the group with highest probability it
belongs to.
In get_classes() function, the entropy is calculated from the membership
matrix and the silhouette score is calculated from the consensus matrix.
cbind(get_classes(res, k = 2), get_membership(res, k = 2))
#> class entropy silhouette p1 p2
#> SRR661278 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1472057 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR614491 2 0.6623 0.79405 0.172 0.828
#> SRR1069376 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1328073 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1394209 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1474018 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1099809 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1500555 1 0.9491 0.40472 0.632 0.368
#> SRR1354363 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1391619 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR612515 2 0.5629 0.84612 0.132 0.868
#> SRR1092727 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1468553 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1403980 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1420169 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1442800 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1499849 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1500030 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1093053 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1399843 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1380231 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR809470 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR614239 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1457354 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1362906 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1096736 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1478700 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1081543 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1384754 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR612287 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1380317 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1315247 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1105344 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1419476 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1456075 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1417154 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1095985 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1325771 1 0.3274 0.93102 0.940 0.060
#> SRR1360420 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR660272 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR808044 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1076916 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1356266 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1072948 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1472370 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1480176 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR613843 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1469192 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1404555 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1362848 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1407492 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1456375 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1454868 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1474816 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1466400 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1101373 2 0.9977 0.12623 0.472 0.528
#> SRR1090145 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1396166 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1086280 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1454891 2 0.2778 0.93883 0.048 0.952
#> SRR663185 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1323271 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1443161 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR614695 2 0.1184 0.96916 0.016 0.984
#> SRR1092372 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1354071 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1105463 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR811005 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1325871 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1355415 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1320712 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1470075 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1101397 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1092112 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1417588 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1074790 2 0.9686 0.36054 0.396 0.604
#> SRR1432106 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1458314 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1318582 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1072749 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1400333 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1078834 1 0.2423 0.95296 0.960 0.040
#> SRR1417611 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1396840 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1465440 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1400530 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR614984 2 0.9087 0.53234 0.324 0.676
#> SRR1324269 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1500846 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR661505 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1419062 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1480131 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1421284 1 0.8443 0.61897 0.728 0.272
#> SRR1329624 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1315739 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1083286 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1091890 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1327473 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1338195 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1339597 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1454842 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR614887 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1354620 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1105320 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR663052 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1478834 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR812366 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1435330 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1389157 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR613568 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1103092 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1337155 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1446180 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1406372 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1339880 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1353136 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1093906 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1363926 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1399861 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1338789 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1421420 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1352870 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1315041 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1443268 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1416617 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1420006 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1470727 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1339153 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1472749 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1098312 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR810273 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1478341 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1088606 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1479699 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1403589 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR659427 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1096638 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR659307 1 0.7745 0.69859 0.772 0.228
#> SRR1439994 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1454931 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1332928 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR658621 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1458243 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1374270 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1365598 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1408727 2 0.3114 0.93081 0.056 0.944
#> SRR1456274 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR817744 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1102680 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1445856 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR820049 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1375290 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR818999 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1390242 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1454629 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1332187 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR603365 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1436207 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1488017 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1480384 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1364761 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1308086 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1485380 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1100346 2 0.5059 0.87001 0.112 0.888
#> SRR1332816 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR612299 2 0.2948 0.93488 0.052 0.948
#> SRR1407386 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1418064 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1309403 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1498395 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1079998 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1337215 1 0.0376 0.98983 0.996 0.004
#> SRR1414749 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1365963 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1368030 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1419760 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1381841 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR821388 1 0.7745 0.69864 0.772 0.228
#> SRR657623 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1094241 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR819583 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1096149 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1342829 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR811333 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1311666 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1403072 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR811653 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1311348 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1435442 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1421444 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1416596 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR613318 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1468469 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1120318 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1311622 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1500931 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1387494 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1379175 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1401909 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1068832 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1376640 2 0.9933 0.19455 0.452 0.548
#> SRR1085712 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1082283 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1084276 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1353262 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1437035 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1396877 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1443026 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1436822 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1101128 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1394366 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1093218 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1077090 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1327430 2 0.6148 0.82140 0.152 0.848
#> SRR1088958 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1383000 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1355705 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1456401 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1086393 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1351521 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1093100 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1309382 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1499482 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1081473 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1088217 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR808496 2 0.0672 0.97636 0.008 0.992
#> SRR1336463 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR612359 2 0.6712 0.78849 0.176 0.824
#> SRR1444412 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1074116 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR821846 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR808914 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1349099 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR813632 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1101591 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1089713 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1453127 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1498354 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1315434 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1365791 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1081519 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR614707 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1489092 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1079502 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1457814 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1455127 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR615081 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1327855 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1417873 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1394125 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1488388 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR612383 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1477711 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1340010 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1475885 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1376334 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1347042 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR612323 1 0.1414 0.97382 0.980 0.020
#> SRR612604 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1465608 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1101808 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1414079 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1331153 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1078439 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1070308 2 0.7528 0.72930 0.216 0.784
#> SRR1403110 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1401317 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1465847 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1471312 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1090881 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR612251 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1418581 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR613214 2 0.6048 0.82612 0.148 0.852
#> SRR613078 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1472998 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1487993 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1380375 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1367566 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1316151 2 0.0376 0.97988 0.004 0.996
#> SRR1417547 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1490270 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1398207 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1358755 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1429825 1 0.9998 0.00358 0.508 0.492
#> SRR1102393 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1071313 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR808351 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1317513 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1480501 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1081910 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1086611 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1392571 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR657313 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1376228 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1399757 1 0.4161 0.90355 0.916 0.084
#> SRR1358060 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1464517 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR613557 2 0.9815 0.29364 0.420 0.580
#> SRR809831 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1429387 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1406936 1 0.0000 0.99373 1.000 0.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.98335 0.000 1.000
cbind(get_classes(res, k = 3), get_membership(res, k = 3))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3
#> SRR661278 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1404105 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR614491 3 0.1529 0.9109 0.000 0.040 0.960
#> SRR1069376 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR811964 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1328073 3 0.5138 0.6612 0.252 0.000 0.748
#> SRR1394209 1 0.6079 0.3403 0.612 0.000 0.388
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1099809 3 0.1031 0.9303 0.024 0.000 0.976
#> SRR1500555 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354363 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391619 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1307997 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334670 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR612515 3 0.4121 0.7690 0.000 0.168 0.832
#> SRR1092727 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1468553 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1403980 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420169 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1442800 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499849 3 0.0892 0.9328 0.020 0.000 0.980
#> SRR1500030 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093053 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399843 3 0.0237 0.9426 0.004 0.000 0.996
#> SRR1380231 3 0.3941 0.7971 0.156 0.000 0.844
#> SRR809470 3 0.2356 0.8895 0.072 0.000 0.928
#> SRR614239 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR613006 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.3340 0.8445 0.120 0.880 0.000
#> SRR1362906 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079023 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR813608 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1096736 3 0.6299 0.1211 0.476 0.000 0.524
#> SRR1478700 3 0.5016 0.6907 0.240 0.000 0.760
#> SRR1081543 3 0.0237 0.9426 0.004 0.000 0.996
#> SRR1384754 3 0.5363 0.6245 0.276 0.000 0.724
#> SRR612287 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380317 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315247 3 0.1950 0.9095 0.008 0.040 0.952
#> SRR1105344 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480240 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456075 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417154 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1095985 3 0.1643 0.9146 0.044 0.000 0.956
#> SRR1325771 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1360420 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR660272 2 0.3816 0.8151 0.148 0.852 0.000
#> SRR1332993 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR808044 1 0.5905 0.4675 0.648 0.000 0.352
#> SRR1076916 3 0.0424 0.9403 0.008 0.000 0.992
#> SRR1356266 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072948 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472370 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480176 1 0.4235 0.7738 0.824 0.000 0.176
#> SRR613843 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.1163 0.9113 0.972 0.000 0.028
#> SRR1404555 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR659839 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1362848 3 0.5591 0.5649 0.304 0.000 0.696
#> SRR1407492 2 0.1163 0.9484 0.000 0.972 0.028
#> SRR1455082 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR818232 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454868 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1474816 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1342002 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1466400 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR658921 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090145 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379324 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1086280 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454891 2 0.1411 0.9405 0.000 0.964 0.036
#> SRR663185 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR811819 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1318920 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR656758 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR660450 2 0.0237 0.9714 0.004 0.996 0.000
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323271 1 0.6235 0.2496 0.564 0.436 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443161 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR614695 2 0.6140 0.3459 0.404 0.596 0.000
#> SRR1092372 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474577 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406582 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR612779 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1354071 3 0.6126 0.3201 0.400 0.000 0.600
#> SRR1105463 3 0.1289 0.9241 0.032 0.000 0.968
#> SRR811005 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1385319 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1325871 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1355415 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1090861 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1320712 3 0.6309 0.0368 0.496 0.000 0.504
#> SRR1470075 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1091254 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101397 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1321165 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1092112 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417588 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1074790 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.6062 0.4023 0.616 0.000 0.384
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1072749 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078586 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400333 3 0.5291 0.6264 0.268 0.000 0.732
#> SRR1078834 2 0.8196 0.4539 0.108 0.608 0.284
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1396840 1 0.5706 0.5476 0.680 0.000 0.320
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.0747 0.9605 0.016 0.984 0.000
#> SRR614984 3 0.0592 0.9353 0.000 0.012 0.988
#> SRR1324269 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1401491 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319443 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1324349 2 0.5733 0.5326 0.324 0.676 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500846 3 0.6280 0.1258 0.460 0.000 0.540
#> SRR661505 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1419062 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1480131 1 0.4654 0.7333 0.792 0.000 0.208
#> SRR1421284 3 0.5905 0.4569 0.000 0.352 0.648
#> SRR1329624 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315739 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1099189 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1083286 1 0.4346 0.7641 0.816 0.000 0.184
#> SRR1091890 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1347436 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1327473 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338195 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR809698 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR658271 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.6192 0.3033 0.580 0.000 0.420
#> SRR1454842 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1322643 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR614887 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1354620 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR615056 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1391529 1 0.4605 0.7386 0.796 0.000 0.204
#> SRR663052 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1478834 1 0.4555 0.7440 0.800 0.000 0.200
#> SRR812366 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR615383 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389157 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR613568 2 0.1964 0.9193 0.056 0.944 0.000
#> SRR614095 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1103092 1 0.4504 0.7488 0.804 0.000 0.196
#> SRR1337155 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446180 1 0.6180 0.3201 0.584 0.000 0.416
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353136 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093906 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1363926 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399861 3 0.4178 0.7703 0.172 0.000 0.828
#> SRR1338789 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1421420 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1352870 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1315041 2 0.0237 0.9713 0.004 0.996 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1443268 3 0.1031 0.9301 0.024 0.000 0.976
#> SRR1416617 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420006 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1469432 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR660907 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1470727 3 0.5810 0.4863 0.336 0.000 0.664
#> SRR1339153 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1472749 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1414379 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1431326 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487278 2 0.6295 0.1083 0.472 0.528 0.000
#> SRR1098312 3 0.1031 0.9304 0.024 0.000 0.976
#> SRR810273 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR811471 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478341 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1088606 1 0.4750 0.7230 0.784 0.000 0.216
#> SRR1479699 3 0.4399 0.7640 0.188 0.000 0.812
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1359803 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR659427 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096638 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466619 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR659307 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1439994 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1454931 1 0.3941 0.7966 0.844 0.000 0.156
#> SRR1332928 3 0.1411 0.9208 0.036 0.000 0.964
#> SRR658621 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458243 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374270 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1365598 1 0.5216 0.6494 0.740 0.260 0.000
#> SRR662787 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1408727 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456274 1 0.5497 0.5703 0.708 0.000 0.292
#> SRR817744 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1374198 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1445856 3 0.1163 0.9270 0.028 0.000 0.972
#> SRR820049 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1375290 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR818999 3 0.3941 0.7970 0.156 0.000 0.844
#> SRR1390242 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1454629 1 0.5291 0.6433 0.732 0.000 0.268
#> SRR1332187 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR603365 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.1753 0.9277 0.000 0.952 0.048
#> SRR1488017 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR612947 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480384 3 0.1643 0.9142 0.044 0.000 0.956
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1441868 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1485380 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1073705 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR615032 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1332816 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR612299 2 0.0237 0.9714 0.004 0.996 0.000
#> SRR1407386 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1418064 1 0.6154 0.3363 0.592 0.408 0.000
#> SRR1309403 1 0.1753 0.8968 0.952 0.000 0.048
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1337215 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414749 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1365963 3 0.0237 0.9426 0.004 0.000 0.996
#> SRR1368030 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1419760 1 0.5560 0.5576 0.700 0.000 0.300
#> SRR1381841 1 0.3038 0.8496 0.896 0.000 0.104
#> SRR821388 3 0.8042 0.5695 0.200 0.148 0.652
#> SRR657623 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR819583 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1096149 3 0.6180 0.2947 0.416 0.000 0.584
#> SRR1342829 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1353028 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR811333 3 0.0592 0.9379 0.012 0.000 0.988
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR815092 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1100564 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1403072 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR811653 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1435442 1 0.3551 0.8189 0.868 0.132 0.000
#> SRR1421444 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1444763 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1416596 1 0.4750 0.7156 0.784 0.216 0.000
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1453950 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR613318 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1332694 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1468469 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR818670 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1120318 1 0.1753 0.8967 0.952 0.000 0.048
#> SRR1311622 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1500931 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1387494 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1379175 3 0.7466 0.1086 0.444 0.036 0.520
#> SRR1401909 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1440541 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1376640 2 0.6235 0.2163 0.000 0.564 0.436
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.1964 0.8880 0.944 0.000 0.056
#> SRR1084276 3 0.3038 0.8567 0.104 0.000 0.896
#> SRR1353262 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1437035 1 0.4121 0.7830 0.832 0.000 0.168
#> SRR1396877 3 0.5327 0.6192 0.272 0.000 0.728
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436822 2 0.9715 -0.1187 0.380 0.400 0.220
#> SRR1101128 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1394366 1 0.5760 0.4815 0.672 0.328 0.000
#> SRR1093218 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1077090 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1327430 2 0.5905 0.4710 0.352 0.648 0.000
#> SRR1088958 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1383000 3 0.6235 0.2094 0.436 0.000 0.564
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.0237 0.9715 0.004 0.996 0.000
#> SRR1086393 1 0.6267 0.1768 0.548 0.000 0.452
#> SRR1351521 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1093100 3 0.4399 0.7519 0.188 0.000 0.812
#> SRR1309382 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089375 1 0.5988 0.4421 0.632 0.000 0.368
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR614719 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1081473 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1087415 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1088217 3 0.0892 0.9328 0.020 0.000 0.980
#> SRR808496 2 0.0424 0.9675 0.000 0.992 0.008
#> SRR1336463 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR612359 2 0.5968 0.4184 0.000 0.636 0.364
#> SRR1444412 3 0.5098 0.6599 0.248 0.000 0.752
#> SRR1074116 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR821846 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR656095 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR808914 1 0.3551 0.8221 0.868 0.000 0.132
#> SRR1349099 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR813632 1 0.4750 0.7228 0.784 0.000 0.216
#> SRR1101591 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1089713 3 0.2261 0.8932 0.068 0.000 0.932
#> SRR1453127 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1498354 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1313831 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1315434 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR814747 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367807 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365791 3 0.2066 0.9016 0.060 0.000 0.940
#> SRR1081519 3 0.0592 0.9379 0.012 0.000 0.988
#> SRR614707 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094027 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489092 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1079502 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1457814 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR615081 1 0.3192 0.8378 0.888 0.112 0.000
#> SRR1327855 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1417873 2 0.4002 0.8017 0.160 0.840 0.000
#> SRR1394125 3 0.0424 0.9403 0.008 0.000 0.992
#> SRR1488388 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401122 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR612383 2 0.1289 0.9453 0.000 0.968 0.032
#> SRR1477711 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1350813 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR812837 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1475885 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376334 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1399821 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347042 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR612323 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR612604 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465608 3 0.1031 0.9301 0.024 0.000 0.976
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1331153 1 0.2261 0.8736 0.932 0.068 0.000
#> SRR1078439 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR2165527 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1351147 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.6154 0.3310 0.408 0.592 0.000
#> SRR1403110 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1456862 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1074622 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465847 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1075579 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1090881 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR612251 2 0.0237 0.9712 0.000 0.996 0.004
#> SRR1418581 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR613214 3 0.2066 0.8909 0.000 0.060 0.940
#> SRR613078 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1472998 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433452 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1101957 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1487993 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.2537 0.8708 0.920 0.000 0.080
#> SRR1367566 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1316151 1 0.1163 0.9087 0.972 0.028 0.000
#> SRR1417547 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.1031 0.9536 0.024 0.976 0.000
#> SRR1398207 3 0.5591 0.5560 0.304 0.000 0.696
#> SRR1358755 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1078903 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR615982 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.4555 0.7348 0.000 0.800 0.200
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.3116 0.8459 0.892 0.000 0.108
#> SRR808351 1 0.6008 0.4323 0.628 0.000 0.372
#> SRR1317513 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480501 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1081910 3 0.1031 0.9301 0.024 0.000 0.976
#> SRR1086611 1 0.6705 0.7066 0.748 0.108 0.144
#> SRR1392571 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR657313 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1399757 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358060 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1464517 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR613557 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR809831 3 0.3686 0.8169 0.140 0.000 0.860
#> SRR1429387 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR816565 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071644 1 0.0000 0.9297 1.000 0.000 0.000
#> SRR1406936 3 0.0000 0.9449 0.000 0.000 1.000
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.9748 0.000 1.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 4), get_membership(res, k = 4))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4
#> SRR661278 3 0.4502 0.7104 0.236 0.000 0.748 0.016
#> SRR1404105 1 0.1716 0.8974 0.936 0.000 0.000 0.064
#> SRR2164936 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1472057 3 0.0188 0.9349 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR614491 3 0.1211 0.9101 0.000 0.040 0.960 0.000
#> SRR1069376 1 0.1211 0.9063 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR811964 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.0188 0.9080 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1328073 1 0.0779 0.8975 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1394209 1 0.0779 0.8975 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1474018 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1099809 3 0.1022 0.9246 0.000 0.000 0.968 0.032
#> SRR1500555 3 0.0804 0.9315 0.000 0.008 0.980 0.012
#> SRR1354363 1 0.0592 0.8994 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1391619 3 0.1182 0.9279 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR1307997 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663124 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334670 4 0.4877 0.2195 0.408 0.000 0.000 0.592
#> SRR612515 3 0.2198 0.8741 0.000 0.072 0.920 0.008
#> SRR1092727 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.3597 0.8104 0.148 0.836 0.000 0.016
#> SRR1468553 3 0.0000 0.9351 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1403980 3 0.0707 0.9307 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1420169 3 0.0188 0.9349 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1442800 4 0.0592 0.8462 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1499849 3 0.0707 0.9308 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1500030 3 0.2142 0.9043 0.056 0.000 0.928 0.016
#> SRR1093053 3 0.0927 0.9308 0.008 0.000 0.976 0.016
#> SRR1399843 3 0.0592 0.9346 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1380231 4 0.3688 0.7088 0.000 0.000 0.208 0.792
#> SRR809470 4 0.4817 0.3877 0.000 0.000 0.388 0.612
#> SRR614239 2 0.0336 0.9675 0.000 0.992 0.008 0.000
#> SRR613939 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612971 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.0336 0.9032 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR613006 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469570 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457354 2 0.4585 0.4882 0.000 0.668 0.000 0.332
#> SRR1362906 3 0.1510 0.9222 0.028 0.000 0.956 0.016
#> SRR1079023 1 0.2149 0.8833 0.912 0.000 0.000 0.088
#> SRR813608 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.0779 0.8975 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1478700 1 0.0927 0.8954 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1081543 3 0.1182 0.9279 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR1384754 1 0.0779 0.8975 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR612287 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380317 3 0.1182 0.9279 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR1315247 4 0.1637 0.8271 0.000 0.000 0.060 0.940
#> SRR1105344 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658549 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480240 4 0.0707 0.8457 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419476 3 0.2149 0.8829 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1456075 3 0.4290 0.7499 0.212 0.000 0.772 0.016
#> SRR1389474 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.1474 0.9023 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR1334419 1 0.0336 0.9091 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1417154 3 0.1211 0.9232 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR1095985 4 0.4164 0.6319 0.000 0.000 0.264 0.736
#> SRR1325771 1 0.4585 0.5791 0.668 0.000 0.000 0.332
#> SRR1360420 3 0.0188 0.9349 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR660272 2 0.3161 0.8329 0.012 0.864 0.000 0.124
#> SRR1332993 1 0.0707 0.9098 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808044 1 0.0779 0.8975 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1076916 3 0.1940 0.8967 0.000 0.000 0.924 0.076
#> SRR1356266 1 0.4304 0.6639 0.716 0.000 0.000 0.284
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.0469 0.9098 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1072948 3 0.0336 0.9343 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1472370 3 0.0336 0.9343 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1480176 1 0.6432 0.5755 0.636 0.000 0.128 0.236
#> SRR613843 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.1411 0.9058 0.960 0.000 0.020 0.020
#> SRR1404555 3 0.0592 0.9328 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR659839 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1362848 1 0.0927 0.8957 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1407492 2 0.0921 0.9477 0.000 0.972 0.028 0.000
#> SRR1455082 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR658362 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR810921 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456375 3 0.0188 0.9349 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR818232 4 0.0592 0.8462 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1454868 3 0.1722 0.9233 0.008 0.000 0.944 0.048
#> SRR1474816 4 0.4994 0.0987 0.000 0.480 0.000 0.520
#> SRR1342002 1 0.0817 0.9095 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1088437 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1466400 4 0.0592 0.8462 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR658921 4 0.1867 0.8112 0.000 0.072 0.000 0.928
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0469 0.9098 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1090145 4 0.0707 0.8457 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1379324 1 0.1211 0.9062 0.960 0.000 0.000 0.040
#> SRR1345307 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.0000 0.9351 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1086280 3 0.0707 0.9307 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1454891 2 0.2011 0.8909 0.000 0.920 0.080 0.000
#> SRR663185 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811819 4 0.1792 0.8216 0.068 0.000 0.000 0.932
#> SRR1318920 4 0.3266 0.7298 0.168 0.000 0.000 0.832
#> SRR656758 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.3356 0.8060 0.824 0.000 0.000 0.176
#> SRR660450 4 0.3893 0.6857 0.008 0.196 0.000 0.796
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.4661 0.4545 0.000 0.652 0.000 0.348
#> SRR1415153 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323271 2 0.2281 0.8758 0.096 0.904 0.000 0.000
#> SRR1368939 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443161 3 0.1182 0.9279 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR614695 4 0.1629 0.8393 0.024 0.024 0.000 0.952
#> SRR1092372 4 0.0921 0.8433 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1474577 1 0.0469 0.9098 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1406582 1 0.0336 0.9091 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR612779 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.0188 0.9080 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1354071 4 0.4972 0.1841 0.000 0.000 0.456 0.544
#> SRR1105463 3 0.4454 0.5540 0.000 0.000 0.692 0.308
#> SRR811005 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 4 0.0592 0.8462 0.016 0.000 0.000 0.984
#> SRR1325871 3 0.1182 0.9279 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR1355415 3 0.0817 0.9288 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1090861 1 0.2281 0.8780 0.904 0.000 0.000 0.096
#> SRR1320712 1 0.0779 0.8975 0.980 0.000 0.004 0.016
#> SRR1470075 1 0.1940 0.8924 0.924 0.000 0.000 0.076
#> SRR1091254 4 0.3764 0.6560 0.216 0.000 0.000 0.784
#> SRR1101397 3 0.4327 0.7341 0.216 0.000 0.768 0.016
#> SRR1321165 4 0.0707 0.8457 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1092112 3 0.0592 0.9321 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1417588 3 0.0000 0.9351 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1074790 1 0.0921 0.9090 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1432106 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.3448 0.7582 0.828 0.000 0.168 0.004
#> SRR1318582 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1072749 3 0.0000 0.9351 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1078586 1 0.4103 0.7079 0.744 0.000 0.000 0.256
#> SRR1400333 4 0.3528 0.7305 0.000 0.000 0.192 0.808
#> SRR1078834 4 0.1575 0.8397 0.004 0.028 0.012 0.956
#> SRR1417611 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1396840 4 0.2530 0.7951 0.000 0.000 0.112 0.888
#> SRR1465440 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1400530 2 0.2814 0.8382 0.000 0.868 0.000 0.132
#> SRR614984 3 0.2715 0.8946 0.036 0.032 0.916 0.016
#> SRR1324269 3 0.0188 0.9349 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1401491 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319443 4 0.0707 0.8457 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1324349 1 0.1022 0.8881 0.968 0.032 0.000 0.000
#> SRR1345523 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500846 1 0.1406 0.8874 0.960 0.000 0.024 0.016
#> SRR661505 3 0.0188 0.9349 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1419062 3 0.3837 0.7127 0.000 0.000 0.776 0.224
#> SRR1480131 4 0.1118 0.8386 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1421284 3 0.7333 0.0958 0.416 0.100 0.468 0.016
#> SRR1329624 1 0.1867 0.8931 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1315739 3 0.0188 0.9349 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1099189 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1083286 4 0.0707 0.8438 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1091890 3 0.1182 0.9279 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR1347436 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1327473 1 0.0592 0.9099 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1338195 3 0.0592 0.9328 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR809698 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.1557 0.9008 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR658271 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.4452 0.6404 0.732 0.000 0.260 0.008
#> SRR1454842 3 0.1182 0.9279 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR1322643 1 0.0469 0.9098 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR614887 3 0.0336 0.9343 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1354620 3 0.3975 0.6856 0.000 0.000 0.760 0.240
#> SRR615056 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1105320 4 0.4961 0.1231 0.448 0.000 0.000 0.552
#> SRR1391529 4 0.4307 0.6728 0.192 0.000 0.024 0.784
#> SRR663052 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1478834 4 0.1256 0.8426 0.008 0.000 0.028 0.964
#> SRR812366 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.1211 0.9197 0.000 0.000 0.960 0.040
#> SRR615383 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 3 0.0000 0.9351 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR613568 4 0.2647 0.7715 0.000 0.120 0.000 0.880
#> SRR614095 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1103092 4 0.0707 0.8438 0.000 0.000 0.020 0.980
#> SRR1337155 3 0.2149 0.8829 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446180 4 0.1474 0.8313 0.000 0.000 0.052 0.948
#> SRR1406372 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.2796 0.8758 0.092 0.000 0.892 0.016
#> SRR1353136 3 0.1182 0.9279 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR1093906 3 0.0000 0.9351 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR614035 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.0188 0.9080 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1363926 4 0.1174 0.8436 0.020 0.012 0.000 0.968
#> SRR1399861 3 0.5269 0.4647 0.364 0.000 0.620 0.016
#> SRR1338789 1 0.2704 0.8571 0.876 0.000 0.000 0.124
#> SRR1421420 3 0.0000 0.9351 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.0592 0.9099 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1352870 3 0.3074 0.8153 0.000 0.000 0.848 0.152
#> SRR1315041 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1443268 3 0.1182 0.9294 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR1416617 3 0.0000 0.9351 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1102443 1 0.0000 0.9066 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR655672 2 0.0817 0.9518 0.000 0.976 0.024 0.000
#> SRR1420006 3 0.0707 0.9307 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1458267 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613819 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1469432 2 0.4040 0.6592 0.000 0.752 0.000 0.248
#> SRR660907 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1470727 1 0.5168 0.0711 0.504 0.000 0.492 0.004
#> SRR1339153 3 0.0592 0.9328 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1472749 3 0.1182 0.9279 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR1414379 2 0.0336 0.9680 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR1431326 1 0.1302 0.9050 0.956 0.000 0.000 0.044
#> SRR1487278 4 0.1109 0.8389 0.004 0.028 0.000 0.968
#> SRR1098312 3 0.3836 0.8004 0.168 0.000 0.816 0.016
#> SRR810273 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614467 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR811471 1 0.4804 0.4627 0.616 0.000 0.000 0.384
#> SRR1478341 3 0.0188 0.9348 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1088606 4 0.1118 0.8390 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1479699 3 0.4710 0.8068 0.120 0.000 0.792 0.088
#> SRR1403589 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1359803 4 0.0707 0.8457 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1338988 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.0336 0.9091 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR659427 3 0.0927 0.9308 0.008 0.000 0.976 0.016
#> SRR1096638 1 0.0336 0.9092 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1466619 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659307 3 0.0000 0.9351 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1439994 3 0.0937 0.9321 0.012 0.000 0.976 0.012
#> SRR1454931 4 0.0592 0.8443 0.000 0.000 0.016 0.984
#> SRR1332928 3 0.4905 0.3970 0.364 0.000 0.632 0.004
#> SRR658621 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1095840 4 0.3311 0.7177 0.172 0.000 0.000 0.828
#> SRR1458243 3 0.3969 0.7817 0.180 0.000 0.804 0.016
#> SRR1374270 3 0.1182 0.9279 0.016 0.000 0.968 0.016
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1365598 4 0.0817 0.8408 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR662787 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1408727 2 0.1443 0.9420 0.028 0.960 0.004 0.008
#> SRR1456274 1 0.0592 0.8994 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR817744 1 0.2868 0.8466 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1102680 3 0.0336 0.9343 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1374198 4 0.4250 0.5590 0.276 0.000 0.000 0.724
#> SRR1445856 3 0.0895 0.9289 0.020 0.000 0.976 0.004
#> SRR820049 3 0.0000 0.9351 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1375290 3 0.0592 0.9328 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR818999 4 0.4804 0.4015 0.000 0.000 0.384 0.616
#> SRR1390242 1 0.4643 0.5494 0.656 0.000 0.000 0.344
#> SRR1401164 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1454629 4 0.1118 0.8387 0.000 0.000 0.036 0.964
#> SRR1332187 3 0.2589 0.8561 0.000 0.000 0.884 0.116
#> SRR603365 3 0.0000 0.9351 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.3172 0.7865 0.000 0.840 0.160 0.000
#> SRR1488017 1 0.2868 0.8460 0.864 0.000 0.000 0.136
#> SRR612947 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.5039 0.3610 0.592 0.000 0.404 0.004
#> SRR1364761 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.4599 0.6908 0.248 0.000 0.736 0.016
#> SRR1441868 1 0.0592 0.9099 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR1485380 3 0.0188 0.9349 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1073705 1 0.0188 0.9080 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR615032 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1332816 1 0.0469 0.9098 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR612299 4 0.0937 0.8438 0.000 0.012 0.012 0.976
#> SRR1407386 1 0.4661 0.5466 0.652 0.000 0.000 0.348
#> SRR1418064 4 0.1022 0.8369 0.000 0.032 0.000 0.968
#> SRR1309403 4 0.0657 0.8462 0.012 0.000 0.004 0.984
#> SRR1498395 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1079998 3 0.0188 0.9349 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1498885 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1337215 4 0.0921 0.8433 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1414749 3 0.0336 0.9343 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1365963 3 0.0657 0.9334 0.004 0.000 0.984 0.012
#> SRR1368030 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1419760 4 0.5339 0.5943 0.040 0.000 0.272 0.688
#> SRR1381841 4 0.0657 0.8462 0.012 0.000 0.004 0.984
#> SRR821388 3 0.7339 0.1201 0.424 0.100 0.460 0.016
#> SRR657623 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.0336 0.9343 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR819583 3 0.0707 0.9307 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR1096149 1 0.0927 0.8954 0.976 0.000 0.008 0.016
#> SRR1342829 3 0.0000 0.9351 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1353028 1 0.2408 0.8726 0.896 0.000 0.000 0.104
#> SRR811333 3 0.0469 0.9335 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1311666 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1446436 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR815092 4 0.1302 0.8356 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1500149 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1100564 4 0.1637 0.8270 0.060 0.000 0.000 0.940
#> SRR1403072 3 0.0707 0.9307 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR811653 3 0.3495 0.8285 0.140 0.000 0.844 0.016
#> SRR1311348 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1435442 4 0.0804 0.8451 0.008 0.012 0.000 0.980
#> SRR1421444 3 0.0592 0.9328 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0707 0.9098 0.980 0.000 0.000 0.020
#> SRR1444763 4 0.2760 0.7701 0.128 0.000 0.000 0.872
#> SRR1415026 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1416596 4 0.2799 0.7785 0.008 0.108 0.000 0.884
#> SRR1485499 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0921 0.9090 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1453950 1 0.1557 0.9008 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR1087875 1 0.0000 0.9066 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR613318 3 0.1510 0.9222 0.028 0.000 0.956 0.016
#> SRR1332694 1 0.1743 0.9006 0.940 0.000 0.004 0.056
#> SRR1468469 3 0.0707 0.9307 0.000 0.000 0.980 0.020
#> SRR818670 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1120318 4 0.0657 0.8462 0.012 0.000 0.004 0.984
#> SRR1311622 3 0.1888 0.9127 0.044 0.000 0.940 0.016
#> SRR1500931 3 0.3688 0.7373 0.000 0.000 0.792 0.208
#> SRR1387494 3 0.2593 0.8856 0.080 0.000 0.904 0.016
#> SRR1379175 4 0.3547 0.7703 0.000 0.016 0.144 0.840
#> SRR1401909 3 0.1302 0.9173 0.000 0.000 0.956 0.044
#> SRR1440541 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1068832 3 0.0336 0.9343 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1376640 2 0.7149 0.3027 0.000 0.552 0.264 0.184
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.2840 0.8790 0.900 0.000 0.044 0.056
#> SRR1084276 3 0.1557 0.9089 0.000 0.000 0.944 0.056
#> SRR1353262 2 0.3486 0.7579 0.000 0.812 0.000 0.188
#> SRR1437035 1 0.4621 0.7724 0.796 0.000 0.128 0.076
#> SRR1396877 3 0.2814 0.8406 0.000 0.000 0.868 0.132
#> SRR1443026 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.0921 0.9090 0.972 0.000 0.000 0.028
#> SRR1436822 4 0.3616 0.7851 0.000 0.036 0.112 0.852
#> SRR1101128 3 0.0592 0.9321 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1394366 4 0.0707 0.8457 0.020 0.000 0.000 0.980
#> SRR1093218 3 0.0927 0.9308 0.008 0.000 0.976 0.016
#> SRR1077090 3 0.0188 0.9349 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1327430 2 0.3494 0.7909 0.172 0.824 0.000 0.004
#> SRR1088958 1 0.0469 0.9098 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1486931 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086820 1 0.3569 0.7840 0.804 0.000 0.000 0.196
#> SRR1383000 1 0.2730 0.8368 0.896 0.000 0.088 0.016
#> SRR1355705 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614335 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR660534 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1456401 2 0.1389 0.9312 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1086393 1 0.0804 0.9039 0.980 0.000 0.008 0.012
#> SRR1351521 3 0.0336 0.9343 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1093100 1 0.1182 0.8908 0.968 0.000 0.016 0.016
#> SRR1309382 4 0.0921 0.8438 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1089375 4 0.6827 0.4939 0.128 0.000 0.304 0.568
#> SRR1499482 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR614719 2 0.1256 0.9432 0.000 0.964 0.028 0.008
#> SRR1081473 3 0.0000 0.9351 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1087415 1 0.1867 0.8942 0.928 0.000 0.000 0.072
#> SRR1088217 4 0.4585 0.5130 0.000 0.000 0.332 0.668
#> SRR808496 2 0.0707 0.9558 0.000 0.980 0.020 0.000
#> SRR1336463 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612359 2 0.4564 0.5057 0.000 0.672 0.328 0.000
#> SRR1444412 3 0.2675 0.8894 0.044 0.000 0.908 0.048
#> SRR1074116 3 0.0188 0.9349 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR821846 3 0.0592 0.9328 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR656095 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR808914 4 0.0672 0.8458 0.008 0.000 0.008 0.984
#> SRR1349099 4 0.4761 0.4364 0.372 0.000 0.000 0.628
#> SRR1337886 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR813632 1 0.5144 0.6691 0.732 0.000 0.216 0.052
#> SRR1101591 3 0.0188 0.9349 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1089713 4 0.4500 0.5446 0.000 0.000 0.316 0.684
#> SRR1453127 3 0.0469 0.9337 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1498354 3 0.2149 0.8829 0.000 0.000 0.912 0.088
#> SRR1313831 4 0.1022 0.8415 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1315434 3 0.0927 0.9308 0.008 0.000 0.976 0.016
#> SRR814747 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1358539 4 0.1302 0.8356 0.044 0.000 0.000 0.956
#> SRR1367807 1 0.0469 0.9098 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1365791 4 0.1211 0.8386 0.000 0.000 0.040 0.960
#> SRR1081519 3 0.2704 0.8476 0.000 0.000 0.876 0.124
#> SRR614707 4 0.0817 0.8447 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1094027 1 0.0817 0.9095 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1489092 3 0.4500 0.5368 0.000 0.000 0.684 0.316
#> SRR1079502 3 0.0817 0.9288 0.000 0.000 0.976 0.024
#> SRR1457814 3 0.3224 0.8491 0.120 0.000 0.864 0.016
#> SRR1455127 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR615081 4 0.0779 0.8462 0.016 0.004 0.000 0.980
#> SRR1327855 3 0.0188 0.9349 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1417873 2 0.4134 0.6539 0.260 0.740 0.000 0.000
#> SRR1394125 4 0.4522 0.5398 0.000 0.000 0.320 0.680
#> SRR1488388 1 0.0469 0.9098 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1401122 2 0.0336 0.9679 0.008 0.992 0.000 0.000
#> SRR612383 2 0.4817 0.3636 0.000 0.612 0.388 0.000
#> SRR1477711 4 0.4992 -0.0440 0.476 0.000 0.000 0.524
#> SRR1350813 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR612851 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.1637 0.8992 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR812837 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.3495 0.8285 0.140 0.000 0.844 0.016
#> SRR1475885 4 0.1022 0.8418 0.032 0.000 0.000 0.968
#> SRR1376334 4 0.0817 0.8447 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1399821 1 0.0817 0.9096 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1347042 3 0.0469 0.9337 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR612323 3 0.1406 0.9243 0.024 0.000 0.960 0.016
#> SRR612604 2 0.0469 0.9650 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1389546 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.1637 0.8992 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1465608 1 0.5110 0.5011 0.656 0.000 0.328 0.016
#> SRR1101808 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1414079 3 0.0592 0.9328 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1331153 4 0.2563 0.8044 0.020 0.072 0.000 0.908
#> SRR1078439 3 0.0336 0.9343 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR2165527 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1351147 4 0.0817 0.8447 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1313536 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.2759 0.8843 0.044 0.904 0.000 0.052
#> SRR1403110 4 0.0921 0.8441 0.028 0.000 0.000 0.972
#> SRR1400355 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1401317 3 0.0188 0.9349 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1456862 1 0.0817 0.9099 0.976 0.000 0.000 0.024
#> SRR1074622 1 0.0336 0.9092 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1465847 3 0.0188 0.9349 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1443376 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.2281 0.8761 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1075579 1 0.2760 0.8533 0.872 0.000 0.000 0.128
#> SRR1090881 3 0.0927 0.9309 0.008 0.000 0.976 0.016
#> SRR612251 2 0.2676 0.8691 0.000 0.896 0.092 0.012
#> SRR1418581 1 0.0592 0.9099 0.984 0.000 0.000 0.016
#> SRR658045 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR613214 3 0.4170 0.7885 0.028 0.124 0.832 0.016
#> SRR613078 4 0.3390 0.7572 0.000 0.132 0.016 0.852
#> SRR1472998 3 0.0592 0.9328 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1433452 4 0.4985 0.1283 0.000 0.468 0.000 0.532
#> SRR1101957 1 0.0469 0.9098 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1487993 3 0.1888 0.9125 0.044 0.000 0.940 0.016
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.4776 0.6780 0.712 0.000 0.016 0.272
#> SRR1367566 3 0.0336 0.9346 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1316151 4 0.4446 0.6786 0.028 0.196 0.000 0.776
#> SRR1417547 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1490270 2 0.2530 0.8652 0.000 0.888 0.000 0.112
#> SRR1398207 4 0.4072 0.6515 0.000 0.000 0.252 0.748
#> SRR1358755 3 0.0592 0.9321 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1078903 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.3907 0.7392 0.768 0.000 0.000 0.232
#> SRR615982 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1429825 2 0.3048 0.8420 0.000 0.876 0.108 0.016
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.2335 0.8784 0.920 0.000 0.060 0.020
#> SRR808351 1 0.0921 0.8989 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1317513 1 0.2530 0.8664 0.888 0.000 0.000 0.112
#> SRR1480501 3 0.0336 0.9343 0.000 0.000 0.992 0.008
#> SRR1081910 3 0.0592 0.9321 0.000 0.000 0.984 0.016
#> SRR1086611 4 0.0817 0.8447 0.024 0.000 0.000 0.976
#> SRR1392571 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.1557 0.9008 0.944 0.000 0.000 0.056
#> SRR808152 1 0.1474 0.9023 0.948 0.000 0.000 0.052
#> SRR657313 3 0.0188 0.9349 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1433131 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.0000 0.9066 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1376228 3 0.0188 0.9349 0.000 0.000 0.996 0.004
#> SRR1399757 4 0.4948 0.1198 0.440 0.000 0.000 0.560
#> SRR1358060 3 0.0000 0.9351 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR1464517 3 0.2142 0.9044 0.056 0.000 0.928 0.016
#> SRR613557 3 0.0937 0.9294 0.000 0.012 0.976 0.012
#> SRR809831 3 0.2281 0.8769 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1429387 3 0.0000 0.9351 0.000 0.000 1.000 0.000
#> SRR816565 1 0.0469 0.9098 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1071644 1 0.1637 0.8992 0.940 0.000 0.000 0.060
#> SRR1406936 3 0.0469 0.9333 0.000 0.000 0.988 0.012
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.0000 0.9747 0.000 1.000 0.000 0.000
cbind(get_classes(res, k = 5), get_membership(res, k = 5))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5
#> SRR661278 3 0.2770 0.7331 0.076 0.000 0.880 0.000 0.044
#> SRR1404105 1 0.1544 0.8709 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR2164936 2 0.0404 0.9312 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1472057 5 0.3949 0.6782 0.000 0.000 0.332 0.000 0.668
#> SRR614491 3 0.2069 0.7472 0.000 0.076 0.912 0.000 0.012
#> SRR1069376 1 0.1270 0.8725 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR811964 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1361415 2 0.2891 0.8257 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1345715 1 0.1282 0.8527 0.952 0.000 0.004 0.000 0.044
#> SRR1328073 1 0.2446 0.8193 0.900 0.000 0.056 0.000 0.044
#> SRR1394209 3 0.6558 0.0859 0.428 0.000 0.452 0.076 0.044
#> SRR1474018 2 0.2891 0.8257 0.000 0.824 0.000 0.176 0.000
#> SRR1099809 5 0.3359 0.6415 0.072 0.000 0.084 0.000 0.844
#> SRR1500555 3 0.1648 0.7919 0.000 0.020 0.940 0.000 0.040
#> SRR1354363 1 0.1626 0.8463 0.940 0.000 0.016 0.000 0.044
#> SRR1391619 3 0.0404 0.7962 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1307997 2 0.2230 0.8727 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR663124 2 0.0404 0.9312 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1334670 1 0.3882 0.7379 0.756 0.000 0.000 0.020 0.224
#> SRR612515 3 0.2329 0.6973 0.000 0.124 0.876 0.000 0.000
#> SRR1092727 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1364013 2 0.5748 0.4936 0.048 0.644 0.260 0.000 0.048
#> SRR1468553 3 0.2732 0.6824 0.000 0.000 0.840 0.000 0.160
#> SRR1403980 5 0.3895 0.6853 0.000 0.000 0.320 0.000 0.680
#> SRR1420169 5 0.4045 0.6524 0.000 0.000 0.356 0.000 0.644
#> SRR1442800 4 0.3003 0.7467 0.000 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR1359214 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1499849 5 0.3732 0.7039 0.032 0.000 0.176 0.000 0.792
#> SRR1500030 3 0.0510 0.7923 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1093053 3 0.0880 0.7939 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR1399843 3 0.3326 0.7003 0.000 0.000 0.824 0.152 0.024
#> SRR1380231 5 0.2946 0.5757 0.000 0.000 0.044 0.088 0.868
#> SRR809470 4 0.3910 0.7346 0.000 0.000 0.032 0.772 0.196
#> SRR614239 2 0.2563 0.8232 0.000 0.872 0.120 0.000 0.008
#> SRR613939 2 0.1095 0.9209 0.000 0.968 0.012 0.012 0.008
#> SRR612971 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1490204 2 0.2852 0.8291 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR811357 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1471672 1 0.1818 0.8416 0.932 0.000 0.024 0.000 0.044
#> SRR613006 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1469570 2 0.0162 0.9332 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1457354 4 0.4464 0.1135 0.000 0.408 0.000 0.584 0.008
#> SRR1362906 3 0.0609 0.7932 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR1079023 1 0.1792 0.8670 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR813608 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.4031 0.6856 0.772 0.000 0.184 0.000 0.044
#> SRR1478700 1 0.3804 0.7150 0.796 0.000 0.160 0.000 0.044
#> SRR1081543 3 0.0324 0.7962 0.000 0.000 0.992 0.004 0.004
#> SRR1384754 3 0.4547 0.5434 0.252 0.000 0.704 0.000 0.044
#> SRR612287 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380317 3 0.0510 0.7965 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1315247 4 0.3039 0.7464 0.000 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1105344 2 0.0794 0.9257 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR658549 2 0.2189 0.8630 0.000 0.904 0.084 0.000 0.012
#> SRR1480240 4 0.6691 0.4114 0.240 0.000 0.000 0.400 0.360
#> SRR1084816 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0290 0.9325 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1358520 2 0.2086 0.8962 0.048 0.924 0.000 0.020 0.008
#> SRR1419476 5 0.3796 0.6944 0.000 0.000 0.300 0.000 0.700
#> SRR1456075 3 0.3289 0.7105 0.108 0.000 0.844 0.000 0.048
#> SRR1389474 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1367005 1 0.0404 0.8727 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1334419 1 0.1124 0.8565 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1417154 3 0.2305 0.7650 0.000 0.000 0.896 0.092 0.012
#> SRR1095985 4 0.3455 0.7386 0.000 0.000 0.008 0.784 0.208
#> SRR1325771 1 0.2536 0.8464 0.868 0.000 0.000 0.004 0.128
#> SRR1360420 3 0.4278 -0.1868 0.000 0.000 0.548 0.000 0.452
#> SRR660272 2 0.0324 0.9327 0.000 0.992 0.000 0.004 0.004
#> SRR1332993 1 0.1341 0.8720 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1311833 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808044 1 0.4873 0.4593 0.644 0.000 0.312 0.000 0.044
#> SRR1076916 3 0.3519 0.6462 0.000 0.000 0.776 0.216 0.008
#> SRR1356266 1 0.2727 0.8430 0.868 0.000 0.000 0.016 0.116
#> SRR1341983 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.1341 0.8720 0.944 0.000 0.000 0.000 0.056
#> SRR1072948 3 0.1410 0.7845 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR1472370 5 0.3932 0.6809 0.000 0.000 0.328 0.000 0.672
#> SRR1480176 1 0.4410 0.4622 0.556 0.000 0.000 0.004 0.440
#> SRR613843 2 0.0404 0.9312 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1469192 1 0.1671 0.8689 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1404555 3 0.1211 0.7954 0.000 0.000 0.960 0.024 0.016
#> SRR659839 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR659533 2 0.0290 0.9325 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1362848 3 0.4750 0.5260 0.260 0.000 0.692 0.004 0.044
#> SRR1407492 2 0.3730 0.6047 0.000 0.712 0.288 0.000 0.000
#> SRR1455082 2 0.0566 0.9297 0.000 0.984 0.004 0.000 0.012
#> SRR658362 2 0.0404 0.9312 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR810921 2 0.0290 0.9325 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR662823 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1456375 5 0.4030 0.6587 0.000 0.000 0.352 0.000 0.648
#> SRR818232 4 0.5104 0.6722 0.068 0.000 0.000 0.648 0.284
#> SRR1454868 3 0.4517 0.4528 0.000 0.004 0.616 0.372 0.008
#> SRR1474816 4 0.3519 0.5171 0.000 0.216 0.000 0.776 0.008
#> SRR1342002 1 0.1410 0.8718 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1088437 2 0.0162 0.9334 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1466400 4 0.2852 0.7485 0.000 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR658921 4 0.3282 0.7479 0.000 0.008 0.000 0.804 0.188
#> SRR1499873 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0404 0.8726 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1090145 4 0.3196 0.7476 0.004 0.000 0.000 0.804 0.192
#> SRR1379324 1 0.1651 0.8535 0.944 0.000 0.008 0.012 0.036
#> SRR1345307 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1396166 3 0.1121 0.7907 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1086280 3 0.1661 0.7903 0.000 0.000 0.940 0.024 0.036
#> SRR1454891 2 0.1197 0.9034 0.000 0.952 0.048 0.000 0.000
#> SRR663185 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR811819 1 0.4527 0.6626 0.692 0.000 0.000 0.036 0.272
#> SRR1318920 4 0.6599 0.2931 0.344 0.000 0.000 0.436 0.220
#> SRR656758 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1474351 1 0.2329 0.8498 0.876 0.000 0.000 0.000 0.124
#> SRR660450 4 0.5618 0.5499 0.000 0.280 0.000 0.608 0.112
#> SRR1472687 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1334291 2 0.4560 0.2310 0.000 0.508 0.000 0.484 0.008
#> SRR1415153 2 0.2561 0.8518 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1323271 2 0.5061 0.6235 0.040 0.660 0.000 0.288 0.012
#> SRR1368939 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1443161 3 0.1522 0.7857 0.012 0.000 0.944 0.000 0.044
#> SRR614695 4 0.3169 0.7408 0.000 0.004 0.016 0.840 0.140
#> SRR1092372 4 0.4394 0.7214 0.048 0.000 0.000 0.732 0.220
#> SRR1474577 1 0.0865 0.8613 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR1406582 1 0.1124 0.8565 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR612779 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.1124 0.8565 0.960 0.000 0.004 0.000 0.036
#> SRR1354071 5 0.2124 0.6063 0.056 0.000 0.028 0.000 0.916
#> SRR1105463 5 0.1934 0.6207 0.020 0.000 0.040 0.008 0.932
#> SRR811005 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1385319 4 0.5440 0.6445 0.088 0.000 0.000 0.612 0.300
#> SRR1325871 3 0.0404 0.7962 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1355415 5 0.3305 0.7096 0.000 0.000 0.224 0.000 0.776
#> SRR1090861 1 0.1851 0.8662 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1320712 3 0.5612 0.5060 0.248 0.000 0.660 0.048 0.044
#> SRR1470075 1 0.3771 0.7557 0.804 0.000 0.004 0.156 0.036
#> SRR1091254 1 0.4326 0.6774 0.708 0.000 0.000 0.028 0.264
#> SRR1101397 3 0.5195 0.2112 0.420 0.000 0.536 0.000 0.044
#> SRR1321165 4 0.3003 0.7467 0.000 0.000 0.000 0.812 0.188
#> SRR1092112 3 0.1638 0.7819 0.000 0.000 0.932 0.004 0.064
#> SRR1417588 3 0.1908 0.7620 0.000 0.000 0.908 0.000 0.092
#> SRR1074790 1 0.0510 0.8731 0.984 0.000 0.000 0.000 0.016
#> SRR1432106 2 0.0404 0.9310 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR655756 2 0.0290 0.9325 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1458314 1 0.0771 0.8732 0.976 0.000 0.004 0.000 0.020
#> SRR1318582 2 0.2020 0.8837 0.000 0.900 0.000 0.100 0.000
#> SRR1080484 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1072749 5 0.5651 0.6384 0.132 0.000 0.248 0.000 0.620
#> SRR1078586 1 0.3053 0.8153 0.828 0.000 0.000 0.008 0.164
#> SRR1400333 4 0.2170 0.6164 0.000 0.004 0.088 0.904 0.004
#> SRR1078834 4 0.4066 0.7356 0.000 0.044 0.000 0.768 0.188
#> SRR1417611 2 0.3160 0.8114 0.000 0.808 0.000 0.188 0.004
#> SRR1396840 4 0.3074 0.7447 0.000 0.000 0.000 0.804 0.196
#> SRR1465440 2 0.0510 0.9294 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1400530 4 0.4331 0.1411 0.000 0.400 0.000 0.596 0.004
#> SRR614984 3 0.0703 0.7890 0.000 0.024 0.976 0.000 0.000
#> SRR1324269 5 0.6254 0.5229 0.268 0.000 0.196 0.000 0.536
#> SRR1401491 2 0.1851 0.8918 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1319443 4 0.5171 0.6724 0.076 0.000 0.000 0.648 0.276
#> SRR1324349 1 0.5230 0.4496 0.664 0.272 0.020 0.000 0.044
#> SRR1345523 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1500846 1 0.0703 0.8730 0.976 0.000 0.000 0.000 0.024
#> SRR661505 5 0.4015 0.6626 0.000 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR1419062 5 0.2648 0.7013 0.000 0.000 0.152 0.000 0.848
#> SRR1480131 4 0.4181 0.7130 0.020 0.000 0.000 0.712 0.268
#> SRR1421284 3 0.7263 0.1221 0.156 0.396 0.400 0.000 0.048
#> SRR1329624 1 0.1732 0.8679 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1315739 5 0.4030 0.6575 0.000 0.000 0.352 0.000 0.648
#> SRR1099189 2 0.0324 0.9325 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1083286 4 0.5672 0.5709 0.088 0.000 0.000 0.544 0.368
#> SRR1091890 3 0.0000 0.7957 0.000 0.000 1.000 0.000 0.000
#> SRR1347436 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1327473 1 0.0609 0.8699 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1338195 3 0.0609 0.7956 0.000 0.000 0.980 0.000 0.020
#> SRR809698 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1457792 1 0.0404 0.8725 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR658271 2 0.0404 0.9309 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1339597 1 0.3741 0.7028 0.732 0.000 0.004 0.000 0.264
#> SRR1454842 3 0.0290 0.7963 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR1322643 1 0.0955 0.8599 0.968 0.000 0.004 0.000 0.028
#> SRR614887 3 0.1544 0.7801 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1354620 5 0.1942 0.6495 0.012 0.000 0.068 0.000 0.920
#> SRR615056 2 0.0162 0.9332 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1105320 1 0.3362 0.8275 0.844 0.000 0.000 0.080 0.076
#> SRR1391529 5 0.3123 0.4543 0.160 0.000 0.000 0.012 0.828
#> SRR663052 2 0.0404 0.9312 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1478834 5 0.3419 0.4305 0.180 0.000 0.000 0.016 0.804
#> SRR812366 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1435330 3 0.1914 0.7793 0.000 0.000 0.924 0.060 0.016
#> SRR615383 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1389157 3 0.1074 0.7964 0.000 0.004 0.968 0.016 0.012
#> SRR613568 4 0.6118 0.5224 0.000 0.288 0.000 0.548 0.164
#> SRR614095 2 0.2690 0.8423 0.000 0.844 0.000 0.156 0.000
#> SRR1103092 5 0.5901 -0.0851 0.148 0.000 0.000 0.268 0.584
#> SRR1337155 5 0.3123 0.7050 0.000 0.000 0.184 0.004 0.812
#> SRR1475345 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0404 0.9312 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1446180 4 0.2966 0.7475 0.000 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1406372 2 0.1908 0.8891 0.000 0.908 0.000 0.092 0.000
#> SRR1339880 3 0.2074 0.7623 0.036 0.000 0.920 0.000 0.044
#> SRR1353136 3 0.3318 0.6558 0.000 0.000 0.808 0.180 0.012
#> SRR1093906 3 0.2966 0.6454 0.000 0.000 0.816 0.000 0.184
#> SRR614035 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1351104 1 0.1168 0.8570 0.960 0.000 0.008 0.000 0.032
#> SRR1363926 4 0.0960 0.6714 0.004 0.008 0.000 0.972 0.016
#> SRR1399861 3 0.4033 0.6992 0.068 0.004 0.832 0.052 0.044
#> SRR1338789 1 0.0963 0.8734 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036
#> SRR1421420 3 0.2280 0.7333 0.000 0.000 0.880 0.000 0.120
#> SRR1420832 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.1270 0.8726 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1352870 4 0.4540 0.2640 0.000 0.000 0.320 0.656 0.024
#> SRR1315041 2 0.3160 0.8114 0.000 0.808 0.000 0.188 0.004
#> SRR661877 2 0.0404 0.9312 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1443268 3 0.1041 0.7965 0.004 0.000 0.964 0.000 0.032
#> SRR1416617 3 0.2561 0.7050 0.000 0.000 0.856 0.000 0.144
#> SRR1102443 1 0.1408 0.8508 0.948 0.000 0.008 0.000 0.044
#> SRR655672 2 0.0290 0.9311 0.000 0.992 0.008 0.000 0.000
#> SRR1420006 5 0.3999 0.6677 0.000 0.000 0.344 0.000 0.656
#> SRR1458267 2 0.2773 0.8356 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR613819 2 0.3282 0.8082 0.000 0.804 0.000 0.188 0.008
#> SRR1469432 4 0.4415 0.1759 0.000 0.388 0.000 0.604 0.008
#> SRR660907 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1465092 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1470727 1 0.3608 0.7992 0.812 0.000 0.040 0.000 0.148
#> SRR1339153 3 0.1043 0.7918 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR1472749 3 0.0404 0.7952 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1414379 2 0.1787 0.8978 0.032 0.940 0.012 0.000 0.016
#> SRR1431326 1 0.0290 0.8719 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR1487278 4 0.2813 0.7488 0.000 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1098312 3 0.2153 0.7616 0.040 0.000 0.916 0.000 0.044
#> SRR810273 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1376000 2 0.0963 0.9207 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000
#> SRR614467 2 0.0451 0.9314 0.000 0.988 0.004 0.000 0.008
#> SRR811471 1 0.2771 0.8386 0.860 0.000 0.000 0.012 0.128
#> SRR1478341 3 0.1671 0.7749 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076
#> SRR1088606 4 0.3039 0.7459 0.000 0.000 0.000 0.808 0.192
#> SRR1479699 3 0.4141 0.6417 0.020 0.000 0.760 0.208 0.012
#> SRR1403589 2 0.2773 0.8356 0.000 0.836 0.000 0.164 0.000
#> SRR812625 2 0.0324 0.9327 0.000 0.992 0.004 0.000 0.004
#> SRR1359803 4 0.4668 0.6947 0.044 0.000 0.000 0.684 0.272
#> SRR1338988 2 0.0510 0.9295 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000
#> SRR1471222 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1378992 1 0.0865 0.8613 0.972 0.000 0.004 0.000 0.024
#> SRR659427 3 0.4658 -0.3290 0.000 0.012 0.504 0.000 0.484
#> SRR1096638 1 0.0162 0.8711 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1466619 2 0.3635 0.7490 0.000 0.748 0.004 0.248 0.000
#> SRR659307 3 0.4170 0.5840 0.000 0.048 0.760 0.000 0.192
#> SRR1439994 5 0.5744 0.5797 0.104 0.000 0.332 0.000 0.564
#> SRR1454931 4 0.4768 0.6764 0.040 0.000 0.000 0.656 0.304
#> SRR1332928 5 0.6705 0.4554 0.284 0.000 0.244 0.004 0.468
#> SRR658621 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.4080 0.7003 0.728 0.000 0.000 0.020 0.252
#> SRR1458243 3 0.4755 0.5361 0.244 0.000 0.696 0.000 0.060
#> SRR1374270 3 0.0162 0.7961 0.000 0.000 0.996 0.000 0.004
#> SRR1470947 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1365598 4 0.2280 0.7376 0.000 0.000 0.000 0.880 0.120
#> SRR662787 2 0.0290 0.9325 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1408727 3 0.7299 0.1943 0.008 0.328 0.452 0.184 0.028
#> SRR1456274 1 0.1701 0.8472 0.936 0.000 0.016 0.000 0.048
#> SRR817744 1 0.1732 0.8691 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1478744 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0162 0.9332 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1102680 5 0.3913 0.6832 0.000 0.000 0.324 0.000 0.676
#> SRR1374198 1 0.6607 0.1149 0.448 0.000 0.000 0.320 0.232
#> SRR1445856 5 0.5541 0.6507 0.128 0.000 0.236 0.000 0.636
#> SRR820049 3 0.2020 0.7548 0.000 0.000 0.900 0.000 0.100
#> SRR1375290 3 0.1043 0.7919 0.000 0.000 0.960 0.000 0.040
#> SRR818999 5 0.1869 0.5919 0.036 0.000 0.016 0.012 0.936
#> SRR1390242 1 0.3909 0.7376 0.760 0.000 0.000 0.024 0.216
#> SRR1401164 2 0.0290 0.9319 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
#> SRR1454629 4 0.4366 0.6726 0.016 0.000 0.000 0.664 0.320
#> SRR1332187 3 0.5708 0.2775 0.000 0.000 0.556 0.348 0.096
#> SRR603365 3 0.3452 0.5325 0.000 0.000 0.756 0.000 0.244
#> SRR657833 2 0.0162 0.9333 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1436207 2 0.2492 0.8786 0.000 0.908 0.048 0.020 0.024
#> SRR1488017 1 0.1851 0.8657 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR612947 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1480384 1 0.3732 0.7765 0.792 0.000 0.032 0.000 0.176
#> SRR1364761 2 0.2127 0.8783 0.000 0.892 0.000 0.108 0.000
#> SRR1308086 3 0.2376 0.7512 0.052 0.000 0.904 0.000 0.044
#> SRR1441868 1 0.0609 0.8643 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1485380 5 0.4030 0.6575 0.000 0.000 0.352 0.000 0.648
#> SRR1073705 1 0.0880 0.8601 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR615032 2 0.0162 0.9332 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1452356 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.0992 0.9177 0.000 0.968 0.024 0.008 0.000
#> SRR1332816 1 0.1205 0.8547 0.956 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR612299 4 0.2966 0.7478 0.000 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1407386 1 0.2513 0.8493 0.876 0.000 0.000 0.008 0.116
#> SRR1418064 4 0.0807 0.6714 0.000 0.012 0.000 0.976 0.012
#> SRR1309403 5 0.6322 -0.4152 0.156 0.000 0.000 0.408 0.436
#> SRR1498395 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1079998 5 0.3966 0.6747 0.000 0.000 0.336 0.000 0.664
#> SRR1498885 2 0.0162 0.9332 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1337215 4 0.1965 0.7283 0.000 0.000 0.000 0.904 0.096
#> SRR1414749 5 0.4015 0.6626 0.000 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR1365963 3 0.1792 0.7688 0.000 0.000 0.916 0.000 0.084
#> SRR1368030 2 0.0162 0.9332 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1419760 4 0.4848 0.0774 0.008 0.004 0.396 0.584 0.008
#> SRR1381841 4 0.5162 0.6567 0.064 0.000 0.000 0.628 0.308
#> SRR821388 3 0.4442 0.6670 0.088 0.060 0.800 0.000 0.052
#> SRR657623 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.1942 0.7780 0.000 0.000 0.920 0.012 0.068
#> SRR819583 5 0.3774 0.6957 0.000 0.000 0.296 0.000 0.704
#> SRR1096149 1 0.2645 0.8087 0.888 0.000 0.068 0.000 0.044
#> SRR1342829 3 0.4088 0.1687 0.000 0.000 0.632 0.000 0.368
#> SRR1353028 1 0.1908 0.8641 0.908 0.000 0.000 0.000 0.092
#> SRR811333 3 0.4569 0.5826 0.104 0.000 0.748 0.000 0.148
#> SRR1311666 2 0.2561 0.8518 0.000 0.856 0.000 0.144 0.000
#> SRR1486698 2 0.0404 0.9312 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1446436 2 0.3143 0.8018 0.000 0.796 0.000 0.204 0.000
#> SRR815092 4 0.6616 0.3915 0.292 0.000 0.000 0.456 0.252
#> SRR1500149 2 0.1041 0.9161 0.000 0.964 0.000 0.032 0.004
#> SRR1100564 1 0.5203 0.5924 0.648 0.000 0.000 0.080 0.272
#> SRR1403072 5 0.4171 0.5871 0.000 0.000 0.396 0.000 0.604
#> SRR811653 3 0.1469 0.7790 0.016 0.000 0.948 0.000 0.036
#> SRR1311348 2 0.2230 0.8726 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1489438 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1435442 4 0.2813 0.7488 0.000 0.000 0.000 0.832 0.168
#> SRR1421444 3 0.1121 0.7908 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR1344010 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0162 0.8692 0.996 0.000 0.000 0.000 0.004
#> SRR1444763 4 0.5271 0.6721 0.152 0.000 0.000 0.680 0.168
#> SRR1415026 2 0.0404 0.9310 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1416596 4 0.0992 0.6644 0.000 0.024 0.000 0.968 0.008
#> SRR1485499 2 0.2852 0.8290 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR1316078 2 0.2852 0.8290 0.000 0.828 0.000 0.172 0.000
#> SRR663465 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.3086 0.8188 0.000 0.816 0.000 0.180 0.004
#> SRR663537 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1486780 1 0.0404 0.8670 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1453950 1 0.1732 0.8679 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR1087875 1 0.0880 0.8601 0.968 0.000 0.000 0.000 0.032
#> SRR613318 3 0.0404 0.7962 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1332694 1 0.1965 0.8629 0.904 0.000 0.000 0.000 0.096
#> SRR1468469 3 0.2304 0.7519 0.000 0.000 0.892 0.008 0.100
#> SRR818670 2 0.2230 0.8729 0.000 0.884 0.000 0.116 0.000
#> SRR1120318 4 0.6190 0.4420 0.136 0.000 0.000 0.444 0.420
#> SRR1311622 3 0.2588 0.7473 0.060 0.000 0.892 0.000 0.048
#> SRR1500931 5 0.3424 0.7081 0.000 0.000 0.240 0.000 0.760
#> SRR1387494 3 0.1648 0.7745 0.020 0.000 0.940 0.000 0.040
#> SRR1379175 4 0.1340 0.6655 0.004 0.016 0.004 0.960 0.016
#> SRR1401909 5 0.3109 0.7089 0.000 0.000 0.200 0.000 0.800
#> SRR1440541 2 0.3123 0.8152 0.000 0.812 0.000 0.184 0.004
#> SRR1068832 5 0.3949 0.6782 0.000 0.000 0.332 0.000 0.668
#> SRR1376640 2 0.5682 0.5479 0.000 0.616 0.016 0.296 0.072
#> SRR1085712 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1082283 1 0.8083 0.1773 0.432 0.000 0.228 0.156 0.184
#> SRR1084276 5 0.2228 0.6258 0.048 0.000 0.040 0.000 0.912
#> SRR1353262 2 0.4403 0.3858 0.000 0.560 0.000 0.436 0.004
#> SRR1437035 1 0.1952 0.8667 0.912 0.000 0.004 0.000 0.084
#> SRR1396877 5 0.2615 0.5699 0.080 0.000 0.020 0.008 0.892
#> SRR1443026 2 0.0404 0.9311 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000
#> SRR1417936 1 0.1671 0.8691 0.924 0.000 0.000 0.000 0.076
#> SRR1436822 5 0.6255 -0.0522 0.000 0.320 0.004 0.148 0.528
#> SRR1101128 5 0.3966 0.6748 0.000 0.000 0.336 0.000 0.664
#> SRR1363886 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1394366 4 0.2852 0.7485 0.000 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR1093218 3 0.1608 0.7781 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072
#> SRR1077090 5 0.4283 0.4594 0.000 0.000 0.456 0.000 0.544
#> SRR1327430 4 0.7722 -0.0058 0.036 0.392 0.144 0.396 0.032
#> SRR1088958 1 0.0609 0.8647 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR1486931 2 0.1410 0.9083 0.000 0.940 0.000 0.060 0.000
#> SRR1086820 1 0.4820 0.4615 0.632 0.000 0.000 0.332 0.036
#> SRR1383000 1 0.0992 0.8739 0.968 0.000 0.008 0.000 0.024
#> SRR1355705 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR614335 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR660534 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR817094 2 0.0162 0.9332 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1334265 2 0.3280 0.8173 0.012 0.812 0.000 0.176 0.000
#> SRR1456401 2 0.4555 0.2785 0.000 0.520 0.000 0.472 0.008
#> SRR1086393 1 0.1792 0.8682 0.916 0.000 0.000 0.000 0.084
#> SRR1351521 3 0.1478 0.7823 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064
#> SRR1093100 3 0.4645 0.5206 0.268 0.000 0.688 0.000 0.044
#> SRR1309382 1 0.6043 0.3935 0.540 0.000 0.000 0.140 0.320
#> SRR1089375 5 0.4164 0.3472 0.252 0.000 0.008 0.012 0.728
#> SRR1499482 2 0.0162 0.9332 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR614719 3 0.4302 0.1255 0.000 0.480 0.520 0.000 0.000
#> SRR1081473 5 0.4074 0.6404 0.000 0.000 0.364 0.000 0.636
#> SRR1087415 1 0.3883 0.6789 0.764 0.000 0.004 0.216 0.016
#> SRR1088217 5 0.4977 0.0085 0.000 0.000 0.040 0.356 0.604
#> SRR808496 2 0.0404 0.9312 0.000 0.988 0.000 0.000 0.012
#> SRR1336463 2 0.3838 0.7001 0.000 0.716 0.000 0.280 0.004
#> SRR612359 2 0.1195 0.9112 0.000 0.960 0.028 0.000 0.012
#> SRR1444412 5 0.2124 0.6048 0.056 0.000 0.028 0.000 0.916
#> SRR1074116 3 0.3876 0.3455 0.000 0.000 0.684 0.000 0.316
#> SRR821846 3 0.0880 0.7938 0.000 0.000 0.968 0.000 0.032
#> SRR656095 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR808914 5 0.3876 0.3878 0.192 0.000 0.000 0.032 0.776
#> SRR1349099 4 0.4708 0.7281 0.048 0.000 0.032 0.760 0.160
#> SRR1337886 2 0.1282 0.9162 0.000 0.952 0.004 0.044 0.000
#> SRR813632 1 0.2763 0.8334 0.848 0.000 0.004 0.000 0.148
#> SRR1101591 5 0.3983 0.6709 0.000 0.000 0.340 0.000 0.660
#> SRR1089713 5 0.1974 0.6100 0.016 0.000 0.036 0.016 0.932
#> SRR1453127 3 0.1197 0.7892 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048
#> SRR1498354 5 0.2516 0.6947 0.000 0.000 0.140 0.000 0.860
#> SRR1313831 1 0.6767 -0.1235 0.388 0.000 0.000 0.336 0.276
#> SRR1315434 3 0.1121 0.7911 0.000 0.000 0.956 0.000 0.044
#> SRR814747 2 0.3093 0.8276 0.000 0.824 0.000 0.168 0.008
#> SRR1358539 1 0.5895 0.4754 0.588 0.000 0.000 0.152 0.260
#> SRR1367807 1 0.1041 0.8584 0.964 0.000 0.004 0.000 0.032
#> SRR1365791 4 0.3282 0.7466 0.000 0.000 0.008 0.804 0.188
#> SRR1081519 5 0.4058 0.6515 0.000 0.000 0.152 0.064 0.784
#> SRR614707 4 0.2852 0.7485 0.000 0.000 0.000 0.828 0.172
#> SRR1094027 1 0.1608 0.8694 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1489092 5 0.5240 0.3624 0.000 0.000 0.112 0.216 0.672
#> SRR1079502 5 0.3816 0.6929 0.000 0.000 0.304 0.000 0.696
#> SRR1457814 3 0.1281 0.7826 0.012 0.000 0.956 0.000 0.032
#> SRR1455127 2 0.3160 0.8114 0.000 0.808 0.000 0.188 0.004
#> SRR615081 4 0.2966 0.7478 0.000 0.000 0.000 0.816 0.184
#> SRR1327855 5 0.4015 0.6626 0.000 0.000 0.348 0.000 0.652
#> SRR1417873 2 0.5594 0.6896 0.072 0.696 0.004 0.192 0.036
#> SRR1394125 4 0.5490 0.5824 0.000 0.000 0.116 0.636 0.248
#> SRR1488388 1 0.0404 0.8726 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR1401122 2 0.5339 0.7255 0.056 0.724 0.008 0.176 0.036
#> SRR612383 2 0.2513 0.8248 0.000 0.876 0.116 0.000 0.008
#> SRR1477711 1 0.3355 0.7945 0.804 0.000 0.000 0.012 0.184
#> SRR1350813 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR612851 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.1732 0.8684 0.920 0.000 0.000 0.000 0.080
#> SRR812837 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1340010 3 0.1579 0.7783 0.024 0.000 0.944 0.000 0.032
#> SRR1475885 4 0.3282 0.7468 0.000 0.000 0.008 0.804 0.188
#> SRR1376334 4 0.6574 0.4773 0.244 0.000 0.000 0.468 0.288
#> SRR1399821 1 0.2027 0.8419 0.928 0.000 0.024 0.008 0.040
#> SRR1347042 3 0.1410 0.7842 0.000 0.000 0.940 0.000 0.060
#> SRR612323 3 0.0290 0.7963 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR612604 2 0.3990 0.5189 0.000 0.688 0.000 0.308 0.004
#> SRR1389546 2 0.0162 0.9332 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1311877 1 0.1608 0.8698 0.928 0.000 0.000 0.000 0.072
#> SRR1465608 1 0.3400 0.7475 0.828 0.000 0.136 0.000 0.036
#> SRR1101808 2 0.0290 0.9325 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1414079 3 0.0404 0.7962 0.000 0.000 0.988 0.000 0.012
#> SRR1331153 4 0.1251 0.6644 0.000 0.036 0.000 0.956 0.008
#> SRR1078439 3 0.1732 0.7717 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR2165527 2 0.0290 0.9325 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1351147 4 0.5353 0.6625 0.092 0.000 0.000 0.636 0.272
#> SRR1313536 2 0.0162 0.9332 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1070308 2 0.5742 0.0427 0.404 0.508 0.000 0.000 0.088
#> SRR1403110 1 0.5058 0.4996 0.576 0.000 0.000 0.040 0.384
#> SRR1400355 2 0.3003 0.8150 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000
#> SRR1401317 5 0.3949 0.6782 0.000 0.000 0.332 0.000 0.668
#> SRR1456862 1 0.2474 0.8306 0.908 0.000 0.040 0.012 0.040
#> SRR1074622 1 0.1270 0.8736 0.948 0.000 0.000 0.000 0.052
#> SRR1465847 5 0.4150 0.6024 0.000 0.000 0.388 0.000 0.612
#> SRR1443376 2 0.0794 0.9244 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000
#> SRR1471312 3 0.3565 0.6676 0.000 0.000 0.800 0.176 0.024
#> SRR1075579 1 0.1851 0.8659 0.912 0.000 0.000 0.000 0.088
#> SRR1090881 3 0.0290 0.7963 0.000 0.000 0.992 0.000 0.008
#> SRR612251 3 0.4283 0.1829 0.000 0.456 0.544 0.000 0.000
#> SRR1418581 1 0.0290 0.8719 0.992 0.000 0.000 0.000 0.008
#> SRR658045 2 0.0290 0.9325 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR613214 3 0.2362 0.7357 0.000 0.076 0.900 0.000 0.024
#> SRR613078 4 0.6499 0.4149 0.000 0.368 0.000 0.440 0.192
#> SRR1472998 5 0.4297 0.4260 0.000 0.000 0.472 0.000 0.528
#> SRR1433452 4 0.3318 0.5421 0.000 0.192 0.000 0.800 0.008
#> SRR1101957 1 0.1478 0.8709 0.936 0.000 0.000 0.000 0.064
#> SRR1487993 3 0.0510 0.7923 0.000 0.000 0.984 0.000 0.016
#> SRR1465983 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.3910 0.7203 0.720 0.000 0.000 0.008 0.272
#> SRR1367566 3 0.1544 0.7801 0.000 0.000 0.932 0.000 0.068
#> SRR1316151 4 0.2804 0.7191 0.000 0.012 0.016 0.880 0.092
#> SRR1417547 2 0.2605 0.8487 0.000 0.852 0.000 0.148 0.000
#> SRR659389 2 0.0290 0.9325 0.000 0.992 0.000 0.000 0.008
#> SRR1490270 4 0.4310 0.1708 0.000 0.392 0.000 0.604 0.004
#> SRR1398207 5 0.1989 0.6064 0.020 0.000 0.032 0.016 0.932
#> SRR1358755 5 0.3561 0.7053 0.000 0.000 0.260 0.000 0.740
#> SRR1078903 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.0162 0.9332 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000
#> SRR1369172 1 0.1012 0.8726 0.968 0.000 0.000 0.012 0.020
#> SRR615982 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1429825 2 0.3607 0.7520 0.000 0.752 0.000 0.244 0.004
#> SRR1102393 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.0671 0.8691 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR808351 1 0.1410 0.8716 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1317513 1 0.2074 0.8604 0.896 0.000 0.000 0.000 0.104
#> SRR1480501 5 0.3949 0.6782 0.000 0.000 0.332 0.000 0.668
#> SRR1081910 5 0.4836 0.6814 0.096 0.000 0.188 0.000 0.716
#> SRR1086611 4 0.3284 0.7393 0.000 0.000 0.024 0.828 0.148
#> SRR1392571 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0404 0.8726 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012
#> SRR808152 1 0.0609 0.8731 0.980 0.000 0.000 0.000 0.020
#> SRR657313 3 0.3684 0.4499 0.000 0.000 0.720 0.000 0.280
#> SRR1433131 2 0.0566 0.9299 0.000 0.984 0.000 0.004 0.012
#> SRR1321011 2 0.1544 0.9032 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000
#> SRR1500598 2 0.2732 0.8392 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000
#> SRR1379343 2 0.0162 0.9335 0.000 0.996 0.000 0.000 0.004
#> SRR1389108 1 0.1205 0.8547 0.956 0.000 0.004 0.000 0.040
#> SRR1376228 5 0.4210 0.5567 0.000 0.000 0.412 0.000 0.588
#> SRR1399757 1 0.2753 0.8404 0.856 0.000 0.000 0.008 0.136
#> SRR1358060 3 0.3636 0.4696 0.000 0.000 0.728 0.000 0.272
#> SRR1464517 3 0.2304 0.7538 0.048 0.000 0.908 0.000 0.044
#> SRR613557 3 0.1106 0.7914 0.000 0.024 0.964 0.000 0.012
#> SRR809831 5 0.2110 0.5717 0.072 0.000 0.016 0.000 0.912
#> SRR1429387 3 0.1732 0.7718 0.000 0.000 0.920 0.000 0.080
#> SRR816565 1 0.1544 0.8708 0.932 0.000 0.000 0.000 0.068
#> SRR1071644 1 0.1410 0.8716 0.940 0.000 0.000 0.000 0.060
#> SRR1406936 5 0.3913 0.6836 0.000 0.000 0.324 0.000 0.676
#> SRR1072031 2 0.0000 0.9338 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.0290 0.9325 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000
cbind(get_classes(res, k = 6), get_membership(res, k = 6))
#> class entropy silhouette p1 p2 p3 p4 p5 p6
#> SRR661278 3 0.2341 0.7875 0.032 0.000 0.900 0.056 0.012 0.000
#> SRR1404105 1 0.1461 0.8483 0.940 0.000 0.000 0.016 0.044 0.000
#> SRR2164936 2 0.0713 0.8556 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1472057 5 0.1531 0.8115 0.000 0.000 0.068 0.004 0.928 0.000
#> SRR614491 3 0.3782 0.6041 0.000 0.224 0.740 0.000 0.036 0.000
#> SRR1069376 1 0.1138 0.8500 0.960 0.000 0.000 0.012 0.024 0.004
#> SRR811964 2 0.0547 0.8582 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1361415 2 0.3804 0.0470 0.000 0.576 0.000 0.424 0.000 0.000
#> SRR1345715 1 0.2711 0.8159 0.872 0.000 0.056 0.068 0.004 0.000
#> SRR1328073 1 0.3996 0.7573 0.784 0.000 0.112 0.088 0.016 0.000
#> SRR1394209 3 0.6121 0.2188 0.252 0.000 0.428 0.316 0.004 0.000
#> SRR1474018 2 0.3828 -0.0354 0.000 0.560 0.000 0.440 0.000 0.000
#> SRR1099809 5 0.5016 0.5546 0.256 0.000 0.008 0.036 0.664 0.036
#> SRR1500555 3 0.5012 0.7510 0.000 0.064 0.736 0.104 0.084 0.012
#> SRR1354363 1 0.3204 0.7960 0.832 0.000 0.052 0.112 0.004 0.000
#> SRR1391619 3 0.1141 0.8303 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1307997 2 0.2697 0.6804 0.000 0.812 0.000 0.188 0.000 0.000
#> SRR663124 2 0.1572 0.8297 0.000 0.936 0.028 0.036 0.000 0.000
#> SRR1334670 1 0.2769 0.8257 0.880 0.000 0.000 0.032 0.052 0.036
#> SRR612515 3 0.2778 0.6813 0.000 0.168 0.824 0.008 0.000 0.000
#> SRR1092727 2 0.0547 0.8582 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1364013 2 0.5526 0.3628 0.024 0.640 0.236 0.084 0.016 0.000
#> SRR1468553 3 0.3290 0.6891 0.000 0.000 0.744 0.004 0.252 0.000
#> SRR1403980 5 0.2501 0.7964 0.000 0.000 0.108 0.016 0.872 0.004
#> SRR1420169 5 0.1701 0.8102 0.000 0.000 0.072 0.008 0.920 0.000
#> SRR1442800 6 0.0146 0.8004 0.000 0.000 0.000 0.004 0.000 0.996
#> SRR1359214 2 0.0458 0.8603 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1499849 5 0.2281 0.7794 0.048 0.000 0.012 0.028 0.908 0.004
#> SRR1500030 3 0.1334 0.8299 0.000 0.000 0.948 0.020 0.032 0.000
#> SRR1093053 3 0.2121 0.8268 0.000 0.000 0.892 0.012 0.096 0.000
#> SRR1399843 4 0.4604 0.3843 0.000 0.000 0.212 0.704 0.068 0.016
#> SRR1380231 5 0.2879 0.7726 0.016 0.000 0.008 0.080 0.872 0.024
#> SRR809470 6 0.1552 0.7927 0.000 0.000 0.020 0.036 0.004 0.940
#> SRR614239 2 0.3394 0.5392 0.000 0.752 0.236 0.012 0.000 0.000
#> SRR613939 2 0.5116 0.3713 0.000 0.644 0.024 0.060 0.004 0.268
#> SRR612971 2 0.0260 0.8623 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1490204 2 0.3695 0.2295 0.000 0.624 0.000 0.376 0.000 0.000
#> SRR811357 2 0.0000 0.8622 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1471672 1 0.3265 0.7922 0.828 0.000 0.056 0.112 0.004 0.000
#> SRR613006 2 0.3575 0.4634 0.000 0.708 0.000 0.008 0.000 0.284
#> SRR1469570 2 0.0632 0.8572 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1457354 4 0.4613 0.6798 0.024 0.232 0.000 0.696 0.000 0.048
#> SRR1362906 3 0.2058 0.8240 0.000 0.000 0.908 0.056 0.036 0.000
#> SRR1079023 1 0.1924 0.8422 0.920 0.000 0.000 0.028 0.048 0.004
#> SRR813608 2 0.0146 0.8621 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1096736 1 0.5190 0.6121 0.648 0.000 0.204 0.136 0.012 0.000
#> SRR1478700 1 0.4774 0.6718 0.696 0.000 0.160 0.136 0.008 0.000
#> SRR1081543 3 0.1498 0.8278 0.000 0.000 0.940 0.000 0.032 0.028
#> SRR1384754 3 0.4298 0.6722 0.140 0.000 0.740 0.116 0.004 0.000
#> SRR612287 2 0.0260 0.8619 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1380317 3 0.2941 0.8200 0.004 0.000 0.856 0.064 0.076 0.000
#> SRR1315247 6 0.0363 0.8007 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1105344 2 0.2605 0.7632 0.000 0.864 0.000 0.028 0.000 0.108
#> SRR658549 2 0.4917 0.4172 0.000 0.672 0.236 0.076 0.008 0.008
#> SRR1480240 6 0.6813 0.2457 0.324 0.000 0.000 0.060 0.200 0.416
#> SRR1084816 2 0.0363 0.8611 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR612551 2 0.0547 0.8582 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1358520 2 0.2882 0.7533 0.028 0.848 0.004 0.120 0.000 0.000
#> SRR1419476 5 0.2002 0.8108 0.000 0.000 0.076 0.012 0.908 0.004
#> SRR1456075 3 0.4869 0.6613 0.140 0.000 0.708 0.128 0.024 0.000
#> SRR1389474 2 0.0146 0.8621 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1367005 1 0.1610 0.8438 0.916 0.000 0.000 0.084 0.000 0.000
#> SRR1334419 1 0.2065 0.8325 0.912 0.000 0.032 0.052 0.004 0.000
#> SRR1417154 3 0.4388 0.7647 0.000 0.000 0.768 0.108 0.052 0.072
#> SRR1095985 6 0.0806 0.8006 0.000 0.000 0.000 0.008 0.020 0.972
#> SRR1325771 1 0.2818 0.8269 0.876 0.000 0.000 0.048 0.052 0.024
#> SRR1360420 5 0.3547 0.4344 0.000 0.000 0.332 0.000 0.668 0.000
#> SRR660272 2 0.2682 0.7559 0.020 0.876 0.000 0.020 0.000 0.084
#> SRR1332993 1 0.0865 0.8492 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1311833 2 0.0000 0.8622 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR808044 1 0.5373 0.5174 0.600 0.000 0.260 0.132 0.008 0.000
#> SRR1076916 6 0.3938 0.4251 0.000 0.000 0.324 0.016 0.000 0.660
#> SRR1356266 1 0.2605 0.8328 0.884 0.000 0.000 0.012 0.040 0.064
#> SRR1341983 2 0.0458 0.8603 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1456114 1 0.2179 0.8510 0.900 0.000 0.000 0.064 0.036 0.000
#> SRR1072948 3 0.2558 0.8002 0.000 0.000 0.840 0.004 0.156 0.000
#> SRR1472370 5 0.1471 0.8126 0.000 0.000 0.064 0.004 0.932 0.000
#> SRR1480176 1 0.5018 0.4668 0.608 0.000 0.000 0.052 0.320 0.020
#> SRR613843 2 0.1007 0.8457 0.000 0.956 0.000 0.044 0.000 0.000
#> SRR1469192 1 0.1528 0.8469 0.936 0.000 0.000 0.016 0.048 0.000
#> SRR1404555 3 0.4922 0.1253 0.000 0.000 0.504 0.044 0.008 0.444
#> SRR659839 2 0.0632 0.8571 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR659533 2 0.0713 0.8553 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1362848 3 0.3994 0.7039 0.116 0.000 0.776 0.100 0.008 0.000
#> SRR1407492 2 0.4967 0.1206 0.000 0.552 0.392 0.016 0.040 0.000
#> SRR1455082 2 0.2630 0.7740 0.000 0.880 0.012 0.088 0.012 0.008
#> SRR658362 2 0.0713 0.8556 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR810921 2 0.0547 0.8582 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR662823 2 0.0260 0.8623 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1456375 5 0.2531 0.7755 0.000 0.000 0.128 0.008 0.860 0.004
#> SRR818232 6 0.3895 0.7233 0.108 0.000 0.000 0.032 0.060 0.800
#> SRR1454868 4 0.4179 0.5176 0.000 0.012 0.188 0.744 0.000 0.056
#> SRR1474816 4 0.4291 0.6268 0.008 0.128 0.000 0.748 0.000 0.116
#> SRR1342002 1 0.1572 0.8460 0.936 0.000 0.000 0.028 0.036 0.000
#> SRR1088437 2 0.0692 0.8585 0.000 0.976 0.004 0.020 0.000 0.000
#> SRR1466400 6 0.1075 0.7914 0.000 0.000 0.000 0.048 0.000 0.952
#> SRR658921 6 0.1168 0.7970 0.000 0.016 0.000 0.028 0.000 0.956
#> SRR1499873 2 0.0363 0.8622 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1101373 1 0.0870 0.8497 0.972 0.000 0.012 0.012 0.004 0.000
#> SRR1090145 6 0.3159 0.7278 0.020 0.000 0.000 0.152 0.008 0.820
#> SRR1379324 1 0.3674 0.7975 0.820 0.000 0.024 0.100 0.004 0.052
#> SRR1345307 2 0.0547 0.8582 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1396166 3 0.1663 0.8277 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1086280 3 0.1753 0.8279 0.000 0.000 0.912 0.004 0.084 0.000
#> SRR1454891 2 0.1340 0.8390 0.000 0.948 0.040 0.004 0.008 0.000
#> SRR663185 2 0.0458 0.8604 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR811819 1 0.5009 0.6806 0.696 0.000 0.000 0.104 0.168 0.032
#> SRR1318920 6 0.3186 0.7658 0.100 0.000 0.000 0.060 0.004 0.836
#> SRR656758 2 0.0547 0.8582 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1474351 1 0.2386 0.8341 0.900 0.000 0.000 0.024 0.052 0.024
#> SRR660450 6 0.2454 0.6295 0.000 0.160 0.000 0.000 0.000 0.840
#> SRR1472687 2 0.0260 0.8619 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1334291 4 0.4419 0.5477 0.000 0.384 0.000 0.584 0.000 0.032
#> SRR1415153 2 0.3351 0.4858 0.000 0.712 0.000 0.288 0.000 0.000
#> SRR1323271 4 0.4058 0.6679 0.044 0.196 0.000 0.748 0.000 0.012
#> SRR1368939 2 0.0547 0.8582 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1443161 3 0.3612 0.7873 0.004 0.000 0.804 0.092 0.100 0.000
#> SRR614695 6 0.1151 0.7929 0.000 0.000 0.012 0.032 0.000 0.956
#> SRR1092372 6 0.1780 0.7946 0.048 0.000 0.000 0.028 0.000 0.924
#> SRR1474577 1 0.2249 0.8283 0.900 0.000 0.032 0.064 0.004 0.000
#> SRR1406582 1 0.1793 0.8390 0.928 0.000 0.032 0.036 0.004 0.000
#> SRR612779 2 0.0363 0.8611 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1089006 1 0.2461 0.8231 0.888 0.000 0.044 0.064 0.004 0.000
#> SRR1354071 5 0.1411 0.7751 0.060 0.000 0.000 0.000 0.936 0.004
#> SRR1105463 5 0.2898 0.7460 0.056 0.000 0.000 0.016 0.868 0.060
#> SRR811005 2 0.0692 0.8573 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004 0.000
#> SRR1385319 6 0.4204 0.7101 0.124 0.000 0.000 0.040 0.060 0.776
#> SRR1325871 3 0.1075 0.8302 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR1355415 5 0.1578 0.8140 0.000 0.000 0.048 0.004 0.936 0.012
#> SRR1090861 1 0.2187 0.8382 0.912 0.000 0.000 0.024 0.040 0.024
#> SRR1320712 3 0.4201 0.6827 0.132 0.000 0.756 0.104 0.008 0.000
#> SRR1470075 1 0.4699 0.3698 0.496 0.000 0.000 0.468 0.008 0.028
#> SRR1091254 6 0.5567 0.1509 0.424 0.000 0.000 0.052 0.040 0.484
#> SRR1101397 1 0.5923 0.1787 0.476 0.000 0.388 0.108 0.028 0.000
#> SRR1321165 6 0.0547 0.7986 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1092112 3 0.2714 0.8101 0.000 0.000 0.848 0.012 0.136 0.004
#> SRR1417588 3 0.2260 0.8042 0.000 0.000 0.860 0.000 0.140 0.000
#> SRR1074790 1 0.0363 0.8522 0.988 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000
#> SRR1432106 2 0.1141 0.8409 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000 0.000
#> SRR655756 2 0.0790 0.8533 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1458314 1 0.2882 0.8209 0.860 0.000 0.004 0.076 0.060 0.000
#> SRR1318582 2 0.2416 0.7291 0.000 0.844 0.000 0.156 0.000 0.000
#> SRR1080484 2 0.0458 0.8603 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1072749 5 0.3800 0.7322 0.168 0.000 0.048 0.008 0.776 0.000
#> SRR1078586 1 0.2772 0.8252 0.876 0.000 0.000 0.036 0.068 0.020
#> SRR1400333 4 0.4354 0.4405 0.000 0.000 0.068 0.692 0.000 0.240
#> SRR1078834 6 0.1053 0.8003 0.000 0.012 0.004 0.020 0.000 0.964
#> SRR1417611 4 0.3944 0.4545 0.004 0.428 0.000 0.568 0.000 0.000
#> SRR1396840 6 0.0891 0.8016 0.000 0.000 0.000 0.024 0.008 0.968
#> SRR1465440 2 0.1387 0.8287 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1400530 4 0.4911 0.5458 0.000 0.384 0.000 0.548 0.000 0.068
#> SRR614984 3 0.1390 0.8191 0.000 0.032 0.948 0.004 0.016 0.000
#> SRR1324269 5 0.5151 0.3821 0.336 0.000 0.004 0.048 0.592 0.020
#> SRR1401491 2 0.2135 0.7660 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000 0.000
#> SRR1319443 6 0.3720 0.7363 0.092 0.000 0.000 0.036 0.056 0.816
#> SRR1324349 1 0.6535 0.2945 0.540 0.260 0.064 0.124 0.012 0.000
#> SRR1345523 2 0.0692 0.8573 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004 0.000
#> SRR1500846 1 0.2502 0.8350 0.884 0.000 0.012 0.084 0.020 0.000
#> SRR661505 5 0.1644 0.8086 0.000 0.000 0.076 0.004 0.920 0.000
#> SRR1419062 5 0.1913 0.8119 0.000 0.000 0.044 0.016 0.924 0.016
#> SRR1480131 5 0.6714 0.2413 0.052 0.000 0.000 0.280 0.448 0.220
#> SRR1421284 2 0.7356 -0.1962 0.132 0.388 0.348 0.116 0.016 0.000
#> SRR1329624 1 0.1991 0.8411 0.920 0.000 0.000 0.024 0.044 0.012
#> SRR1315739 5 0.1949 0.8047 0.000 0.000 0.088 0.004 0.904 0.004
#> SRR1099189 2 0.0653 0.8594 0.000 0.980 0.004 0.012 0.004 0.000
#> SRR1083286 6 0.6663 0.1202 0.216 0.000 0.000 0.040 0.348 0.396
#> SRR1091890 3 0.1480 0.8306 0.000 0.000 0.940 0.020 0.040 0.000
#> SRR1347436 2 0.0146 0.8619 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1327473 1 0.1434 0.8516 0.940 0.000 0.000 0.048 0.012 0.000
#> SRR1338195 3 0.1327 0.8295 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR809698 2 0.0547 0.8582 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1457792 1 0.0508 0.8506 0.984 0.000 0.000 0.012 0.004 0.000
#> SRR658271 2 0.0865 0.8515 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1339597 1 0.4118 0.5181 0.628 0.000 0.000 0.020 0.352 0.000
#> SRR1454842 3 0.1219 0.8308 0.000 0.000 0.948 0.004 0.048 0.000
#> SRR1322643 1 0.2848 0.8089 0.848 0.000 0.024 0.124 0.004 0.000
#> SRR614887 3 0.2002 0.8286 0.000 0.000 0.908 0.004 0.076 0.012
#> SRR1354620 5 0.1053 0.7949 0.020 0.000 0.000 0.004 0.964 0.012
#> SRR615056 2 0.0865 0.8515 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1105320 1 0.4712 0.6398 0.648 0.000 0.000 0.292 0.044 0.016
#> SRR1391529 5 0.4582 0.5145 0.272 0.000 0.000 0.032 0.672 0.024
#> SRR663052 2 0.0713 0.8556 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1478834 5 0.4919 0.4989 0.272 0.000 0.000 0.036 0.652 0.040
#> SRR812366 2 0.0146 0.8618 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1435330 3 0.1921 0.8303 0.000 0.000 0.920 0.012 0.056 0.012
#> SRR615383 2 0.0000 0.8622 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389157 3 0.2094 0.8307 0.000 0.000 0.908 0.024 0.064 0.004
#> SRR613568 6 0.4083 0.2980 0.000 0.304 0.000 0.028 0.000 0.668
#> SRR614095 2 0.3586 0.5962 0.000 0.756 0.028 0.216 0.000 0.000
#> SRR1103092 5 0.6810 -0.1052 0.232 0.000 0.000 0.048 0.364 0.356
#> SRR1337155 5 0.1826 0.8135 0.000 0.000 0.052 0.004 0.924 0.020
#> SRR1475345 2 0.0260 0.8619 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR809089 2 0.0713 0.8553 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1446180 6 0.0865 0.7968 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000 0.964
#> SRR1406372 2 0.0865 0.8517 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1339880 3 0.1204 0.8112 0.016 0.000 0.960 0.016 0.004 0.004
#> SRR1353136 4 0.3859 0.3158 0.000 0.000 0.288 0.692 0.020 0.000
#> SRR1093906 3 0.3266 0.6732 0.000 0.000 0.728 0.000 0.272 0.000
#> SRR614035 2 0.0806 0.8599 0.000 0.972 0.000 0.020 0.008 0.000
#> SRR1351104 1 0.3319 0.7786 0.800 0.000 0.036 0.164 0.000 0.000
#> SRR1363926 4 0.3806 0.5084 0.032 0.020 0.000 0.780 0.000 0.168
#> SRR1399861 3 0.2039 0.7943 0.020 0.000 0.904 0.076 0.000 0.000
#> SRR1338789 1 0.2579 0.8448 0.872 0.000 0.000 0.088 0.040 0.000
#> SRR1421420 3 0.3789 0.5823 0.000 0.000 0.660 0.008 0.332 0.000
#> SRR1420832 2 0.0260 0.8619 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1476231 1 0.1562 0.8504 0.940 0.000 0.000 0.024 0.032 0.004
#> SRR1352870 4 0.4871 0.4866 0.000 0.004 0.140 0.704 0.012 0.140
#> SRR1315041 4 0.4263 0.3091 0.016 0.480 0.000 0.504 0.000 0.000
#> SRR661877 2 0.0713 0.8556 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1443268 3 0.5445 0.6577 0.160 0.000 0.672 0.076 0.092 0.000
#> SRR1416617 3 0.3337 0.6790 0.000 0.000 0.736 0.004 0.260 0.000
#> SRR1102443 1 0.2358 0.8316 0.900 0.000 0.048 0.040 0.012 0.000
#> SRR655672 2 0.0405 0.8617 0.000 0.988 0.008 0.004 0.000 0.000
#> SRR1420006 5 0.2794 0.7666 0.000 0.000 0.144 0.012 0.840 0.004
#> SRR1458267 2 0.3547 0.3711 0.000 0.668 0.000 0.332 0.000 0.000
#> SRR613819 4 0.3890 0.5145 0.000 0.400 0.004 0.596 0.000 0.000
#> SRR1469432 4 0.3947 0.6783 0.000 0.220 0.000 0.732 0.000 0.048
#> SRR660907 2 0.0146 0.8618 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1465092 2 0.0458 0.8630 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1470727 1 0.3665 0.6778 0.728 0.000 0.000 0.020 0.252 0.000
#> SRR1339153 3 0.2813 0.8240 0.000 0.000 0.864 0.036 0.092 0.008
#> SRR1472749 3 0.2475 0.8235 0.000 0.000 0.892 0.060 0.036 0.012
#> SRR1414379 2 0.2434 0.7949 0.016 0.896 0.056 0.032 0.000 0.000
#> SRR1431326 1 0.0972 0.8494 0.964 0.000 0.008 0.028 0.000 0.000
#> SRR1487278 6 0.1010 0.7955 0.000 0.004 0.000 0.036 0.000 0.960
#> SRR1098312 3 0.1332 0.8178 0.008 0.000 0.952 0.028 0.012 0.000
#> SRR810273 2 0.0547 0.8582 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1376000 2 0.1765 0.8016 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000 0.000
#> SRR614467 2 0.1218 0.8466 0.000 0.956 0.012 0.028 0.004 0.000
#> SRR811471 1 0.2484 0.8317 0.896 0.000 0.000 0.024 0.044 0.036
#> SRR1478341 3 0.1957 0.8181 0.000 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000
#> SRR1088606 6 0.0692 0.8011 0.000 0.000 0.004 0.020 0.000 0.976
#> SRR1479699 3 0.5197 0.4939 0.008 0.000 0.592 0.308 0.000 0.092
#> SRR1403589 2 0.3706 0.2143 0.000 0.620 0.000 0.380 0.000 0.000
#> SRR812625 2 0.0922 0.8584 0.000 0.968 0.000 0.024 0.004 0.004
#> SRR1359803 6 0.2371 0.7847 0.052 0.000 0.000 0.032 0.016 0.900
#> SRR1338988 2 0.1075 0.8437 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1471222 2 0.0603 0.8605 0.000 0.980 0.000 0.004 0.000 0.016
#> SRR1378992 1 0.2052 0.8344 0.912 0.000 0.028 0.056 0.004 0.000
#> SRR659427 5 0.5934 0.5211 0.004 0.116 0.188 0.068 0.624 0.000
#> SRR1096638 1 0.0964 0.8485 0.968 0.000 0.012 0.016 0.004 0.000
#> SRR1466619 2 0.4186 0.3571 0.000 0.656 0.000 0.312 0.000 0.032
#> SRR659307 3 0.4497 0.6821 0.000 0.100 0.712 0.004 0.184 0.000
#> SRR1439994 5 0.5514 0.6190 0.112 0.000 0.168 0.060 0.660 0.000
#> SRR1454931 6 0.3689 0.7427 0.056 0.000 0.000 0.040 0.084 0.820
#> SRR1332928 5 0.5363 0.6404 0.168 0.000 0.052 0.108 0.672 0.000
#> SRR658621 2 0.0508 0.8612 0.000 0.984 0.004 0.012 0.000 0.000
#> SRR1095840 1 0.3989 0.7489 0.788 0.000 0.000 0.032 0.052 0.128
#> SRR1458243 3 0.6002 0.2543 0.340 0.000 0.508 0.120 0.032 0.000
#> SRR1374270 3 0.1572 0.8283 0.000 0.000 0.936 0.036 0.028 0.000
#> SRR1470947 2 0.0363 0.8611 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1365598 6 0.0547 0.7976 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR662787 2 0.0713 0.8556 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1408727 4 0.5507 0.5820 0.000 0.228 0.208 0.564 0.000 0.000
#> SRR1456274 1 0.3888 0.7809 0.800 0.000 0.072 0.108 0.016 0.004
#> SRR817744 1 0.2287 0.8387 0.904 0.000 0.000 0.036 0.048 0.012
#> SRR1478744 2 0.0260 0.8619 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1387379 2 0.0713 0.8559 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1102680 5 0.1732 0.8115 0.000 0.000 0.072 0.004 0.920 0.004
#> SRR1374198 6 0.2940 0.7663 0.112 0.000 0.000 0.036 0.004 0.848
#> SRR1445856 5 0.4166 0.7155 0.156 0.000 0.056 0.024 0.764 0.000
#> SRR820049 3 0.3101 0.7262 0.000 0.000 0.756 0.000 0.244 0.000
#> SRR1375290 3 0.2263 0.8249 0.000 0.000 0.884 0.016 0.100 0.000
#> SRR818999 5 0.3313 0.7239 0.080 0.000 0.000 0.040 0.844 0.036
#> SRR1390242 1 0.4567 0.6454 0.712 0.000 0.000 0.032 0.044 0.212
#> SRR1401164 2 0.2881 0.7608 0.000 0.864 0.000 0.040 0.012 0.084
#> SRR1454629 4 0.6542 0.1323 0.044 0.000 0.000 0.436 0.344 0.176
#> SRR1332187 6 0.3109 0.6563 0.000 0.000 0.224 0.004 0.000 0.772
#> SRR603365 3 0.3862 0.4893 0.000 0.000 0.608 0.004 0.388 0.000
#> SRR657833 2 0.0000 0.8622 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1436207 2 0.3927 0.5843 0.000 0.756 0.012 0.036 0.196 0.000
#> SRR1488017 1 0.1957 0.8414 0.920 0.000 0.000 0.024 0.048 0.008
#> SRR612947 2 0.0260 0.8612 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1480384 1 0.3816 0.6133 0.688 0.000 0.000 0.016 0.296 0.000
#> SRR1364761 2 0.2941 0.6282 0.000 0.780 0.000 0.220 0.000 0.000
#> SRR1308086 3 0.2812 0.7761 0.040 0.000 0.872 0.072 0.016 0.000
#> SRR1441868 1 0.1672 0.8404 0.932 0.000 0.016 0.048 0.004 0.000
#> SRR1485380 5 0.1700 0.8069 0.000 0.000 0.080 0.004 0.916 0.000
#> SRR1073705 1 0.2000 0.8347 0.916 0.000 0.032 0.048 0.004 0.000
#> SRR615032 2 0.0547 0.8588 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1452356 2 0.0260 0.8619 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1442983 2 0.0260 0.8619 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1100346 2 0.4168 0.6071 0.000 0.756 0.148 0.008 0.000 0.088
#> SRR1332816 1 0.2645 0.8209 0.880 0.000 0.056 0.056 0.008 0.000
#> SRR612299 6 0.0363 0.7991 0.000 0.000 0.000 0.012 0.000 0.988
#> SRR1407386 1 0.2620 0.8299 0.888 0.000 0.000 0.032 0.052 0.028
#> SRR1418064 4 0.3702 0.4949 0.008 0.024 0.000 0.760 0.000 0.208
#> SRR1309403 4 0.7246 -0.0784 0.216 0.000 0.000 0.384 0.292 0.108
#> SRR1498395 2 0.0000 0.8622 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1079998 5 0.1588 0.8103 0.000 0.000 0.072 0.004 0.924 0.000
#> SRR1498885 2 0.0865 0.8515 0.000 0.964 0.000 0.036 0.000 0.000
#> SRR1337215 6 0.1204 0.7888 0.000 0.000 0.000 0.056 0.000 0.944
#> SRR1414749 5 0.1753 0.8068 0.000 0.000 0.084 0.004 0.912 0.000
#> SRR1365963 3 0.5374 0.5674 0.028 0.000 0.600 0.076 0.296 0.000
#> SRR1368030 2 0.0790 0.8536 0.000 0.968 0.000 0.032 0.000 0.000
#> SRR1419760 4 0.4512 0.5049 0.004 0.008 0.172 0.728 0.000 0.088
#> SRR1381841 6 0.3167 0.7685 0.080 0.000 0.000 0.040 0.028 0.852
#> SRR821388 3 0.1956 0.7921 0.032 0.008 0.928 0.016 0.016 0.000
#> SRR657623 2 0.0458 0.8603 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1094241 3 0.3432 0.7494 0.000 0.000 0.764 0.020 0.216 0.000
#> SRR819583 5 0.1411 0.8134 0.000 0.000 0.060 0.000 0.936 0.004
#> SRR1096149 1 0.3826 0.7593 0.784 0.000 0.088 0.124 0.004 0.000
#> SRR1342829 5 0.3789 0.1790 0.000 0.000 0.416 0.000 0.584 0.000
#> SRR1353028 1 0.2342 0.8350 0.904 0.000 0.000 0.024 0.040 0.032
#> SRR811333 3 0.6582 0.4769 0.172 0.000 0.572 0.040 0.180 0.036
#> SRR1311666 2 0.3464 0.4258 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000 0.000
#> SRR1486698 2 0.2062 0.7956 0.000 0.900 0.000 0.088 0.008 0.004
#> SRR1446436 2 0.3518 0.5416 0.000 0.732 0.000 0.256 0.000 0.012
#> SRR815092 1 0.5794 0.5049 0.596 0.000 0.000 0.092 0.056 0.256
#> SRR1500149 6 0.4493 0.0836 0.000 0.424 0.000 0.024 0.004 0.548
#> SRR1100564 1 0.5516 0.0583 0.480 0.000 0.000 0.036 0.052 0.432
#> SRR1403072 5 0.2278 0.7781 0.000 0.000 0.128 0.000 0.868 0.004
#> SRR811653 3 0.1078 0.8231 0.008 0.000 0.964 0.016 0.012 0.000
#> SRR1311348 2 0.3151 0.5656 0.000 0.748 0.000 0.252 0.000 0.000
#> SRR1489438 2 0.0260 0.8619 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1435442 6 0.1285 0.7926 0.000 0.000 0.000 0.052 0.004 0.944
#> SRR1421444 3 0.1444 0.8284 0.000 0.000 0.928 0.000 0.072 0.000
#> SRR1344010 2 0.0260 0.8619 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1319520 1 0.0862 0.8491 0.972 0.000 0.008 0.016 0.004 0.000
#> SRR1444763 6 0.2384 0.7796 0.084 0.000 0.000 0.032 0.000 0.884
#> SRR1415026 2 0.1387 0.8287 0.000 0.932 0.000 0.068 0.000 0.000
#> SRR1416596 4 0.4599 0.5712 0.000 0.104 0.000 0.684 0.000 0.212
#> SRR1485499 2 0.3774 0.1076 0.000 0.592 0.000 0.408 0.000 0.000
#> SRR1316078 2 0.3782 0.0895 0.000 0.588 0.000 0.412 0.000 0.000
#> SRR663465 2 0.0458 0.8603 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1310094 2 0.3857 -0.1558 0.000 0.532 0.000 0.468 0.000 0.000
#> SRR663537 2 0.0458 0.8596 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1486780 1 0.0951 0.8484 0.968 0.000 0.008 0.020 0.004 0.000
#> SRR1453950 1 0.1922 0.8433 0.924 0.000 0.000 0.024 0.040 0.012
#> SRR1087875 1 0.1864 0.8386 0.924 0.000 0.032 0.040 0.004 0.000
#> SRR613318 3 0.1141 0.8303 0.000 0.000 0.948 0.000 0.052 0.000
#> SRR1332694 1 0.2151 0.8384 0.912 0.000 0.000 0.024 0.048 0.016
#> SRR1468469 3 0.3804 0.5716 0.000 0.000 0.656 0.008 0.336 0.000
#> SRR818670 2 0.3126 0.5747 0.000 0.752 0.000 0.248 0.000 0.000
#> SRR1120318 6 0.6987 0.1312 0.240 0.000 0.000 0.064 0.328 0.368
#> SRR1311622 3 0.3640 0.7609 0.056 0.000 0.816 0.104 0.024 0.000
#> SRR1500931 5 0.1141 0.8142 0.000 0.000 0.052 0.000 0.948 0.000
#> SRR1387494 3 0.1873 0.8009 0.020 0.000 0.924 0.048 0.008 0.000
#> SRR1379175 4 0.4297 0.5263 0.012 0.032 0.024 0.756 0.000 0.176
#> SRR1401909 5 0.1578 0.8140 0.000 0.000 0.048 0.004 0.936 0.012
#> SRR1440541 4 0.3847 0.3937 0.000 0.456 0.000 0.544 0.000 0.000
#> SRR1068832 5 0.1588 0.8103 0.000 0.000 0.072 0.004 0.924 0.000
#> SRR1376640 2 0.6077 -0.2856 0.000 0.468 0.004 0.384 0.120 0.024
#> SRR1085712 2 0.0260 0.8619 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1082283 6 0.4184 0.7454 0.108 0.000 0.028 0.068 0.008 0.788
#> SRR1084276 5 0.1584 0.7720 0.064 0.000 0.000 0.000 0.928 0.008
#> SRR1353262 4 0.4850 0.4090 0.000 0.448 0.000 0.496 0.000 0.056
#> SRR1437035 1 0.2250 0.8454 0.888 0.000 0.000 0.020 0.092 0.000
#> SRR1396877 5 0.4337 0.6322 0.180 0.000 0.000 0.040 0.744 0.036
#> SRR1443026 2 0.0937 0.8497 0.000 0.960 0.000 0.040 0.000 0.000
#> SRR1417936 1 0.1788 0.8437 0.928 0.000 0.000 0.028 0.040 0.004
#> SRR1436822 5 0.5937 0.0939 0.004 0.220 0.000 0.196 0.564 0.016
#> SRR1101128 5 0.1588 0.8112 0.000 0.000 0.072 0.000 0.924 0.004
#> SRR1363886 2 0.0458 0.8603 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR612983 2 0.0692 0.8573 0.000 0.976 0.000 0.020 0.004 0.000
#> SRR1394366 6 0.0937 0.7935 0.000 0.000 0.000 0.040 0.000 0.960
#> SRR1093218 3 0.2653 0.8068 0.000 0.000 0.844 0.012 0.144 0.000
#> SRR1077090 5 0.2744 0.7490 0.000 0.000 0.144 0.016 0.840 0.000
#> SRR1327430 4 0.3607 0.6057 0.028 0.084 0.032 0.836 0.000 0.020
#> SRR1088958 1 0.1719 0.8417 0.932 0.000 0.032 0.032 0.004 0.000
#> SRR1486931 2 0.1957 0.7788 0.000 0.888 0.000 0.112 0.000 0.000
#> SRR1086820 6 0.3481 0.7200 0.180 0.000 0.008 0.012 0.008 0.792
#> SRR1383000 1 0.2190 0.8480 0.900 0.000 0.000 0.060 0.040 0.000
#> SRR1355705 2 0.0603 0.8591 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004 0.000
#> SRR614335 2 0.0363 0.8627 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR660534 2 0.0547 0.8582 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR817094 2 0.0632 0.8577 0.000 0.976 0.000 0.024 0.000 0.000
#> SRR1334265 2 0.4258 -0.1969 0.016 0.516 0.000 0.468 0.000 0.000
#> SRR1456401 4 0.3766 0.6771 0.000 0.212 0.000 0.748 0.000 0.040
#> SRR1086393 1 0.3127 0.8383 0.852 0.000 0.000 0.084 0.044 0.020
#> SRR1351521 3 0.2118 0.8188 0.000 0.000 0.888 0.008 0.104 0.000
#> SRR1093100 3 0.4505 0.6765 0.120 0.000 0.732 0.136 0.012 0.000
#> SRR1309382 6 0.5819 0.2905 0.364 0.000 0.000 0.044 0.076 0.516
#> SRR1089375 5 0.3986 0.6508 0.192 0.000 0.000 0.036 0.756 0.016
#> SRR1499482 2 0.0458 0.8603 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR614719 2 0.4138 0.2510 0.000 0.616 0.368 0.004 0.012 0.000
#> SRR1081473 5 0.1714 0.8006 0.000 0.000 0.092 0.000 0.908 0.000
#> SRR1087415 1 0.5008 0.2211 0.524 0.000 0.012 0.036 0.004 0.424
#> SRR1088217 6 0.2553 0.7360 0.000 0.000 0.000 0.008 0.144 0.848
#> SRR808496 2 0.0713 0.8553 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1336463 4 0.3927 0.6026 0.000 0.344 0.000 0.644 0.000 0.012
#> SRR612359 2 0.1080 0.8491 0.000 0.960 0.004 0.032 0.004 0.000
#> SRR1444412 5 0.1732 0.7674 0.072 0.000 0.000 0.004 0.920 0.004
#> SRR1074116 5 0.3464 0.4755 0.000 0.000 0.312 0.000 0.688 0.000
#> SRR821846 3 0.1327 0.8295 0.000 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000
#> SRR656095 2 0.0547 0.8582 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR808914 5 0.6796 0.1923 0.300 0.000 0.000 0.064 0.440 0.196
#> SRR1349099 6 0.1924 0.7932 0.004 0.000 0.028 0.048 0.000 0.920
#> SRR1337886 2 0.0891 0.8558 0.000 0.968 0.008 0.024 0.000 0.000
#> SRR813632 1 0.2838 0.8262 0.872 0.000 0.000 0.032 0.072 0.024
#> SRR1101591 5 0.1946 0.8115 0.000 0.000 0.072 0.012 0.912 0.004
#> SRR1089713 5 0.2541 0.7634 0.032 0.000 0.000 0.024 0.892 0.052
#> SRR1453127 3 0.1663 0.8265 0.000 0.000 0.912 0.000 0.088 0.000
#> SRR1498354 5 0.1692 0.8135 0.000 0.000 0.048 0.008 0.932 0.012
#> SRR1313831 1 0.5739 0.1506 0.500 0.000 0.000 0.048 0.060 0.392
#> SRR1315434 3 0.1501 0.8291 0.000 0.000 0.924 0.000 0.076 0.000
#> SRR814747 2 0.3672 0.2706 0.000 0.632 0.000 0.368 0.000 0.000
#> SRR1358539 1 0.4605 0.7203 0.748 0.000 0.000 0.064 0.060 0.128
#> SRR1367807 1 0.1864 0.8375 0.924 0.000 0.032 0.040 0.004 0.000
#> SRR1365791 6 0.0603 0.7991 0.000 0.000 0.016 0.004 0.000 0.980
#> SRR1081519 5 0.5079 0.5110 0.000 0.000 0.080 0.012 0.620 0.288
#> SRR614707 6 0.0632 0.7973 0.000 0.000 0.000 0.024 0.000 0.976
#> SRR1094027 1 0.1552 0.8460 0.940 0.000 0.000 0.020 0.036 0.004
#> SRR1489092 6 0.3855 0.7677 0.028 0.000 0.048 0.076 0.024 0.824
#> SRR1079502 5 0.1555 0.8135 0.000 0.000 0.060 0.004 0.932 0.004
#> SRR1457814 3 0.1088 0.8285 0.000 0.000 0.960 0.016 0.024 0.000
#> SRR1455127 4 0.3634 0.5857 0.000 0.356 0.000 0.644 0.000 0.000
#> SRR615081 6 0.0547 0.7986 0.000 0.000 0.000 0.020 0.000 0.980
#> SRR1327855 5 0.1700 0.8069 0.000 0.000 0.080 0.004 0.916 0.000
#> SRR1417873 4 0.4151 0.6602 0.044 0.264 0.000 0.692 0.000 0.000
#> SRR1394125 6 0.5910 0.4520 0.004 0.000 0.064 0.088 0.240 0.604
#> SRR1488388 1 0.0976 0.8506 0.968 0.000 0.008 0.016 0.008 0.000
#> SRR1401122 4 0.4264 0.2509 0.016 0.484 0.000 0.500 0.000 0.000
#> SRR612383 2 0.3279 0.6668 0.000 0.816 0.148 0.028 0.008 0.000
#> SRR1477711 1 0.3029 0.8198 0.864 0.000 0.000 0.044 0.060 0.032
#> SRR1350813 2 0.0547 0.8582 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR612851 2 0.0291 0.8621 0.000 0.992 0.004 0.004 0.000 0.000
#> SRR1086349 1 0.2002 0.8412 0.920 0.000 0.000 0.028 0.040 0.012
#> SRR812837 2 0.0603 0.8615 0.000 0.980 0.000 0.016 0.004 0.000
#> SRR1340010 3 0.1492 0.8277 0.000 0.000 0.940 0.036 0.024 0.000
#> SRR1475885 6 0.1285 0.7980 0.000 0.000 0.004 0.052 0.000 0.944
#> SRR1376334 6 0.6265 0.1168 0.400 0.000 0.000 0.064 0.092 0.444
#> SRR1399821 1 0.4507 0.7514 0.764 0.000 0.044 0.080 0.004 0.108
#> SRR1347042 3 0.1765 0.8248 0.000 0.000 0.904 0.000 0.096 0.000
#> SRR612323 3 0.1075 0.8302 0.000 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000
#> SRR612604 6 0.3405 0.4243 0.000 0.272 0.000 0.004 0.000 0.724
#> SRR1389546 2 0.0547 0.8594 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1311877 1 0.2074 0.8411 0.912 0.000 0.000 0.036 0.048 0.004
#> SRR1465608 1 0.5141 0.6960 0.708 0.000 0.108 0.108 0.076 0.000
#> SRR1101808 2 0.1151 0.8471 0.000 0.956 0.000 0.032 0.012 0.000
#> SRR1414079 3 0.1411 0.8299 0.000 0.000 0.936 0.000 0.060 0.004
#> SRR1331153 4 0.5748 0.4337 0.004 0.160 0.000 0.496 0.000 0.340
#> SRR1078439 3 0.2520 0.8025 0.000 0.000 0.844 0.004 0.152 0.000
#> SRR2165527 2 0.0713 0.8556 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1351147 6 0.3890 0.7403 0.116 0.000 0.000 0.064 0.024 0.796
#> SRR1313536 2 0.0458 0.8603 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1070308 2 0.5985 0.0219 0.380 0.504 0.000 0.060 0.044 0.012
#> SRR1403110 1 0.5301 0.6376 0.676 0.000 0.000 0.044 0.160 0.120
#> SRR1400355 2 0.3868 -0.2520 0.000 0.508 0.000 0.492 0.000 0.000
#> SRR1401317 5 0.1588 0.8103 0.000 0.000 0.072 0.004 0.924 0.000
#> SRR1456862 1 0.4873 0.7299 0.736 0.000 0.040 0.116 0.008 0.100
#> SRR1074622 1 0.0862 0.8522 0.972 0.000 0.004 0.016 0.008 0.000
#> SRR1465847 5 0.1765 0.8018 0.000 0.000 0.096 0.000 0.904 0.000
#> SRR1443376 2 0.1327 0.8316 0.000 0.936 0.000 0.064 0.000 0.000
#> SRR1471312 3 0.4419 0.4423 0.000 0.000 0.620 0.008 0.024 0.348
#> SRR1075579 1 0.2342 0.8350 0.904 0.000 0.000 0.024 0.040 0.032
#> SRR1090881 3 0.1285 0.8312 0.000 0.000 0.944 0.004 0.052 0.000
#> SRR612251 3 0.3833 0.1254 0.000 0.444 0.556 0.000 0.000 0.000
#> SRR1418581 1 0.0717 0.8493 0.976 0.000 0.008 0.016 0.000 0.000
#> SRR658045 2 0.0547 0.8582 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR613214 3 0.3024 0.7764 0.004 0.048 0.868 0.064 0.012 0.004
#> SRR613078 6 0.2520 0.6479 0.000 0.152 0.000 0.000 0.004 0.844
#> SRR1472998 5 0.2994 0.6784 0.000 0.000 0.208 0.004 0.788 0.000
#> SRR1433452 4 0.4444 0.6570 0.000 0.184 0.000 0.708 0.000 0.108
#> SRR1101957 1 0.1464 0.8473 0.944 0.000 0.000 0.016 0.036 0.004
#> SRR1487993 3 0.1418 0.8297 0.000 0.000 0.944 0.024 0.032 0.000
#> SRR1465983 2 0.0547 0.8582 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1380375 1 0.3649 0.7678 0.796 0.000 0.000 0.036 0.152 0.016
#> SRR1367566 3 0.2667 0.8038 0.000 0.000 0.852 0.020 0.128 0.000
#> SRR1316151 6 0.2068 0.7883 0.000 0.020 0.016 0.048 0.000 0.916
#> SRR1417547 2 0.3464 0.4364 0.000 0.688 0.000 0.312 0.000 0.000
#> SRR659389 2 0.0713 0.8553 0.000 0.972 0.000 0.028 0.000 0.000
#> SRR1490270 4 0.4676 0.4647 0.000 0.428 0.000 0.528 0.000 0.044
#> SRR1398207 5 0.2519 0.7611 0.044 0.000 0.000 0.016 0.892 0.048
#> SRR1358755 5 0.1226 0.8132 0.004 0.000 0.040 0.000 0.952 0.004
#> SRR1078903 2 0.0363 0.8611 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1323252 2 0.0363 0.8611 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1451796 2 0.1075 0.8445 0.000 0.952 0.000 0.048 0.000 0.000
#> SRR1369172 1 0.2071 0.8491 0.916 0.000 0.000 0.044 0.012 0.028
#> SRR615982 2 0.0547 0.8588 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1480431 2 0.0458 0.8594 0.000 0.984 0.000 0.016 0.000 0.000
#> SRR1429825 4 0.4564 0.3324 0.000 0.472 0.000 0.500 0.020 0.008
#> SRR1102393 2 0.0260 0.8619 0.000 0.992 0.000 0.008 0.000 0.000
#> SRR1071313 1 0.1757 0.8438 0.928 0.000 0.012 0.052 0.008 0.000
#> SRR808351 1 0.0865 0.8492 0.964 0.000 0.000 0.000 0.036 0.000
#> SRR1317513 1 0.2419 0.8340 0.896 0.000 0.000 0.028 0.060 0.016
#> SRR1480501 5 0.1387 0.8119 0.000 0.000 0.068 0.000 0.932 0.000
#> SRR1081910 5 0.6746 0.2076 0.364 0.000 0.052 0.040 0.464 0.080
#> SRR1086611 6 0.1408 0.7891 0.000 0.000 0.020 0.036 0.000 0.944
#> SRR1392571 2 0.0146 0.8625 0.000 0.996 0.000 0.004 0.000 0.000
#> SRR1311441 1 0.0891 0.8486 0.968 0.000 0.008 0.024 0.000 0.000
#> SRR808152 1 0.1564 0.8531 0.936 0.000 0.000 0.040 0.024 0.000
#> SRR657313 3 0.3592 0.5731 0.000 0.000 0.656 0.000 0.344 0.000
#> SRR1433131 2 0.0547 0.8598 0.000 0.980 0.000 0.020 0.000 0.000
#> SRR1321011 2 0.2454 0.7239 0.000 0.840 0.000 0.160 0.000 0.000
#> SRR1500598 2 0.3499 0.4046 0.000 0.680 0.000 0.320 0.000 0.000
#> SRR1379343 2 0.0000 0.8622 0.000 1.000 0.000 0.000 0.000 0.000
#> SRR1389108 1 0.2401 0.8251 0.892 0.000 0.044 0.060 0.004 0.000
#> SRR1376228 5 0.2320 0.7712 0.000 0.000 0.132 0.004 0.864 0.000
#> SRR1399757 1 0.3036 0.8218 0.864 0.000 0.000 0.052 0.052 0.032
#> SRR1358060 3 0.4098 0.0720 0.000 0.000 0.496 0.008 0.496 0.000
#> SRR1464517 3 0.3483 0.7637 0.040 0.000 0.820 0.120 0.020 0.000
#> SRR613557 3 0.2136 0.8166 0.000 0.048 0.904 0.000 0.048 0.000
#> SRR809831 5 0.3648 0.6913 0.128 0.000 0.000 0.040 0.808 0.024
#> SRR1429387 3 0.2135 0.8107 0.000 0.000 0.872 0.000 0.128 0.000
#> SRR816565 1 0.2557 0.8449 0.892 0.000 0.004 0.056 0.036 0.012
#> SRR1071644 1 0.1552 0.8463 0.940 0.000 0.000 0.020 0.036 0.004
#> SRR1406936 5 0.1863 0.8141 0.004 0.000 0.060 0.016 0.920 0.000
#> SRR1072031 2 0.0363 0.8611 0.000 0.988 0.000 0.012 0.000 0.000
#> SRR1374671 2 0.1204 0.8386 0.000 0.944 0.000 0.056 0.000 0.000
Heatmaps for the consensus matrix. It visualizes the probability of two samples to be in a same group.
consensus_heatmap(res, k = 2)
consensus_heatmap(res, k = 3)
consensus_heatmap(res, k = 4)
consensus_heatmap(res, k = 5)
consensus_heatmap(res, k = 6)
Heatmaps for the membership of samples in all partitions to see how consistent they are:
membership_heatmap(res, k = 2)
membership_heatmap(res, k = 3)
membership_heatmap(res, k = 4)
membership_heatmap(res, k = 5)
membership_heatmap(res, k = 6)
As soon as we have had the classes for columns, we can look for signatures which are significantly different between classes which can be candidate marks for certain classes. Following are the heatmaps for signatures.
Signature heatmaps where rows are scaled:
get_signatures(res, k = 2)
get_signatures(res, k = 3)
get_signatures(res, k = 4)
get_signatures(res, k = 5)
get_signatures(res, k = 6)
Signature heatmaps where rows are not scaled:
get_signatures(res, k = 2, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 3, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 4, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 5, scale_rows = FALSE)
get_signatures(res, k = 6, scale_rows = FALSE)
Compare the overlap of signatures from different k:
compare_signatures(res)
get_signature() returns a data frame invisibly. TO get the list of signatures, the function
call should be assigned to a variable explicitly. In following code, if plot argument is set
to FALSE, no heatmap is plotted while only the differential analysis is performed.
# code only for demonstration
tb = get_signature(res, k = ..., plot = FALSE)
An example of the output of tb is:
#> which_row fdr mean_1 mean_2 scaled_mean_1 scaled_mean_2 km
#> 1 38 0.042760348 8.373488 9.131774 -0.5533452 0.5164555 1
#> 2 40 0.018707592 7.106213 8.469186 -0.6173731 0.5762149 1
#> 3 55 0.019134737 10.221463 11.207825 -0.6159697 0.5749050 1
#> 4 59 0.006059896 5.921854 7.869574 -0.6899429 0.6439467 1
#> 5 60 0.018055526 8.928898 10.211722 -0.6204761 0.5791110 1
#> 6 98 0.009384629 15.714769 14.887706 0.6635654 -0.6193277 2
...
The columns in tb are:
which_row: row indices corresponding to the input matrix.fdr: FDR for the differential test. mean_x: The mean value in group x.scaled_mean_x: The mean value in group x after rows are scaled.km: Row groups if k-means clustering is applied to rows.UMAP plot which shows how samples are separated.
dimension_reduction(res, k = 2, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 3, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 4, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 5, method = "UMAP")
dimension_reduction(res, k = 6, method = "UMAP")
Following heatmap shows how subgroups are split when increasing k:
collect_classes(res)
If matrix rows can be associated to genes, consider to use functional_enrichment(res,
...) to perform function enrichment for the signature genes. See this vignette for more detailed explanations.
sessionInfo()
#> R version 3.6.0 (2019-04-26)
#> Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
#> Running under: CentOS Linux 7 (Core)
#>
#> Matrix products: default
#> BLAS: /usr/lib64/libblas.so.3.4.2
#> LAPACK: /usr/lib64/liblapack.so.3.4.2
#>
#> locale:
#> [1] LC_CTYPE=en_GB.UTF-8 LC_NUMERIC=C LC_TIME=en_GB.UTF-8
#> [4] LC_COLLATE=en_GB.UTF-8 LC_MONETARY=en_GB.UTF-8 LC_MESSAGES=en_GB.UTF-8
#> [7] LC_PAPER=en_GB.UTF-8 LC_NAME=C LC_ADDRESS=C
#> [10] LC_TELEPHONE=C LC_MEASUREMENT=en_GB.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
#>
#> attached base packages:
#> [1] grid stats graphics grDevices utils datasets methods base
#>
#> other attached packages:
#> [1] genefilter_1.66.0 ComplexHeatmap_2.3.1 markdown_1.1 knitr_1.26
#> [5] GetoptLong_0.1.7 cola_1.3.2
#>
#> loaded via a namespace (and not attached):
#> [1] circlize_0.4.8 shape_1.4.4 xfun_0.11 slam_0.1-46
#> [5] lattice_0.20-38 splines_3.6.0 colorspace_1.4-1 vctrs_0.2.0
#> [9] stats4_3.6.0 blob_1.2.0 XML_3.98-1.20 survival_2.44-1.1
#> [13] rlang_0.4.2 pillar_1.4.2 DBI_1.0.0 BiocGenerics_0.30.0
#> [17] bit64_0.9-7 RColorBrewer_1.1-2 matrixStats_0.55.0 stringr_1.4.0
#> [21] GlobalOptions_0.1.1 evaluate_0.14 memoise_1.1.0 Biobase_2.44.0
#> [25] IRanges_2.18.3 parallel_3.6.0 AnnotationDbi_1.46.1 highr_0.8
#> [29] Rcpp_1.0.3 xtable_1.8-4 backports_1.1.5 S4Vectors_0.22.1
#> [33] annotate_1.62.0 skmeans_0.2-11 bit_1.1-14 microbenchmark_1.4-7
#> [37] brew_1.0-6 impute_1.58.0 rjson_0.2.20 png_0.1-7
#> [41] digest_0.6.23 stringi_1.4.3 polyclip_1.10-0 clue_0.3-57
#> [45] tools_3.6.0 bitops_1.0-6 magrittr_1.5 eulerr_6.0.0
#> [49] RCurl_1.95-4.12 RSQLite_2.1.4 tibble_2.1.3 cluster_2.1.0
#> [53] crayon_1.3.4 pkgconfig_2.0.3 zeallot_0.1.0 Matrix_1.2-17
#> [57] xml2_1.2.2 httr_1.4.1 R6_2.4.1 mclust_5.4.5
#> [61] compiler_3.6.0